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##INFO=<ID=HS,Number=0,Type=Flag,Description="Indicate it is at a hot spot">
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##INFO=<ID=MLLD,Number=A,Type=Float,Description="Mean log-likelihood delta per read.">
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##INFO=<ID=QD,Number=1,Type=Float,Description="QualityByDepth as 4*QUAL/FDP (analogous to GATK)">
##INFO=<ID=RBI,Number=A,Type=Float,Description="Distance of bias parameters from zero.">
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#CHROM	POS	ID	REF	ALT	QUAL	FILTER	INFO	FORMAT	L1N
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chr1	897564	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178055;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.2366;QD=42.1822;RBI=0.0370036;REFB=0;REVB=-0.0324381;RO=1;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126911;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00125017;OID=.;OPOS=897564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:1:0:10:11:1:7:3:1:0:7:4:0:0
chr1	900972	.	T	G	1129.08	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0698158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4743;QD=58.6533;RBI=0.0718844;REFB=0.032957;REVB=-0.0171208;RO=1;SAF=53;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00884626;STB=0.504672;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=-0.00118131;OID=.;OPOS=900972;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:23:53:1:0:23:53:1:0
chr1	901023	.	T	C	1148.24	PASS	AF=1;AO=63;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=51;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9746;QD=59.6488;RBI=0.136569;REFB=0;REVB=0.0323744;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118307;OID=.;OPOS=901023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:63:77:1:26:37:0:0:26:51:0:0
chr1	902128	.	C	T	153.56	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0195373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.874;QD=21.9371;RBI=0.0349355;REFB=-0.0149522;REVB=0.0289618;RO=12;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161227;STB=0.50908;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.00861264;OID=.;OPOS=902128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:9:7:5:7:9:7:5:7
chr1	906272	.	A	C	213.35	PASS	AF=0.428571;AO=17;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0130264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.722;QD=17.4166;RBI=0.0130806;REFB=-0.0208605;REVB=0.00119004;RO=26;SAF=2;SAR=15;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368637;STB=0.759688;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0292757;OID=.;OPOS=906272;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:27:17:21:0.428571:15:2:9:17:19:2:10:17
chr1	909238	.	G	C	715.46	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040442;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.23;QD=57.2367;RBI=0.0630866;REFB=0;REVB=0.0484186;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147716;OID=.;OPOS=909238;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr1	909768	.	A	G	2582.01	PASS	AF=1;AO=165;DP=165;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000832484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.038;QD=61.8445;RBI=0.012938;REFB=0;REVB=-0.0129112;RO=0;SAF=70;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17501e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.81303e-06;OID=.;OPOS=909768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:165:167:0:0:165:167:1:95:70:0:0:96:71:0:0
chr1	911595	.	A	G	1811.38	PASS	AF=1;AO=119;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0860228;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2706;QD=57.9643;RBI=0.0878735;REFB=0;REVB=-0.01794;RO=1;SAF=54;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871488;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0019045;OID=.;OPOS=911595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:125:1:0:119:125:1:65:54:1:0:65:60:0:0
chr1	914333	.	C	G	614.16	PASS	AF=0.913043;AO=41;DP=45;FAO=42;FDP=46;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00646387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.788;QD=53.4048;RBI=0.0150582;REFB=-0.0135403;REVB=0.0136003;RO=1;SAF=4;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1037;STB=0.587582;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.000103732;OID=.;OPOS=914333;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:45:46:1:4:41:42:0.913043:37:4:1:0:38:4:2:2
chr1	914852	.	G	C	748.87	PASS	AF=1;AO=52;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3807;QD=55.4715;RBI=0.228039;REFB=0;REVB=0.227667;RO=0;SAF=46;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00264667;OID=.;OPOS=914852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:52:54:1:6:46:0:0:8:46:0:0
chr1	914876	.	T	C	1540.28	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000734189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.342;QD=63.5166;RBI=0.0196247;REFB=0;REVB=0.0196109;RO=0;SAF=72;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.82448e-06;OID=.;OPOS=914876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:96:97:1:24:72:0:0:24:73:0:0
chr1	914940	.	T	C	1413.64	PASS	AF=1;AO=65;DP=102;FAO=107;FDP=107;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=42;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.18158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.673;QD=52.8465;RBI=0.188066;REFB=0;REVB=0.0489658;RO=0;SAF=6;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241827;OID=.;OPOS=914940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:107:0:0:65:107:1:59:6:0:0:65:42:0:0
chr1	915227	.	A	G	262.93	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0187462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.416;QD=47.8059;RBI=0.0380562;REFB=-0.048995;REVB=0.0331188;RO=0;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.45803e-08;STB=0.514272;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0153571;OID=.;OPOS=915227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:0:1:21:21:0.954545:4:17:0:0:4:17:1:0
chr1	915869	.	TG	T	257.56	PASS	AF=1;AO=27;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.20688;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.4107;QD=32.1955;RBI=0.20702;REFB=0;REVB=0.00761708;RO=3;SAF=2;SAR=25;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526312;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0111709;OID=.;OPOS=915870;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:27:31:32:32:0:2:30:0:0:5:3:2:25:0:3
chr1	916549	.	A	G	1434.13	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8747;QD=63.0388;RBI=0.0517236;REFB=0;REVB=0.00226829;RO=0;SAF=28;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91974e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126043;OID=.;OPOS=916549;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:63:28:0:0:63:28:0:0
chr1	935222	.	C	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=373.671;QD=37.4885;RBI=0.000217931;REFB=0;REVB=-0.000217931;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.56013e-07;OID=.;OPOS=935222;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:8:0:0:0:8:0:0:0
chr1	948921	.	T	C	453.83	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0196231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4684;QD=55.01;RBI=0.0323008;REFB=0.120854;REVB=-0.0256568;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517231;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=-0.00533482;OID=.;OPOS=948921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:14:18:0:0:14:18:0:1
chr1	949654	.	A	G	1008.48	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.641;QD=59.3226;RBI=0.0290974;REFB=0;REVB=0.0162062;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.41329e-05;OID=.;OPOS=949654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:34:33:0:0:34:34:0:0
chr1	981931	.	A	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00503298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5708;QD=60.2302;RBI=0.0103885;REFB=0;REVB=-0.00908789;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.23195e-05;OID=.;OPOS=981931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:26:11:0:0:26:11:0:0
chr1	982994	.	T	C	613.31	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0934972;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.9936;QD=61.3308;RBI=0.106634;REFB=0;REVB=-0.0512739;RO=0;SAF=10;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00224361;OID=.;OPOS=982994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:30:10:0:0:30:10:0:0
chr1	984302	.	T	C	1435.05	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0671362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.31;QD=63.0792;RBI=0.0751701;REFB=0;REVB=0.0338124;RO=0;SAF=36;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63267e-05;OID=.;OPOS=984302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:54:36:0:0:54:37:0:0
chr1	986443	.	C	T	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.316;QD=49.5992;RBI=0.0295773;REFB=0;REVB=-0.0110521;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254;OID=.;OPOS=986443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
chr1	987200	.	C	T	1419.01	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251633;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.042;QD=63.067;RBI=0.0426435;REFB=0;REVB=-0.0344278;RO=0;SAF=46;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108002;OID=.;OPOS=987200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:90:0:0:90:90:1:44:46:0:0:44:46:0:0
chr1	990280	.	C	T	2019.31	PASS	AF=1;AO=121;DP=129;FAO=131;FDP=131;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=81;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8855;QD=61.6583;RBI=0.131581;REFB=0;REVB=0.0593833;RO=0;SAF=78;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13215e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00436746;OID=.;OPOS=990280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:131:0:0:121:131:1:43:78:0:0:50:81:0:0
chr1	990805	.	GG	AC,GA	600.06	PASS	AF=0.0465116,0.906977;AO=2,37;DP=43;FAO=2,39;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=2,22;FSAR=0,17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0387265,0.0503309;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=185.086,216.361;QD=55.8196;RBI=0.0666849,0.0804819;REFB=-0.0240454,-0.0810068;REVB=0.0542875,0.0628024;RO=2;SAF=2,21;SAR=0,16;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.639851,0.00659507;STB=0.992443,0.503175;STBP=0.312,0.873;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0485435,0.000943354;OID=.,.;OPOS=990805,990806;OREF=GG,G;OALT=AC,A;OMAPALT=AC,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:43:43:2:2:2,37:2,39:0.0465116,0.906977:0,16:2,21:1:1:0,17:2,22:1:1
chr1	1007203	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0518046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.85;QD=35.5759;RBI=0.0527102;REFB=0;REVB=0.00972885;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000666297;OID=.;OPOS=1007203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0
chr1	1026707	.	C	A	1054.14	PASS	AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00448054;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.053;QD=56.9804;RBI=0.0243808;REFB=-0.053164;REVB=0.0239656;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.515147;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.000253175;OID=.;OPOS=1026707;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:74:74:0:2:72:72:0.972973:40:32:0:0:40:32:2:0
chr1	1147001	.	TC	GT,T	91.41	PASS	AF=0.0235294,0.317647;AO=5,22;DP=87;FAO=2,27;FDP=85;FR=.;FRO=56;FSAF=1,5;FSAR=1,22;FSRF=41;FSRR=15;FWDB=0.00193836,0.0846633;FXX=0.034087;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=100.335,11.7713;QD=4.30142;RBI=0.0735916,0.0859915;REFB=-0.00613697,-0.110548;REVB=-0.073566,0.015055;RO=43;SAF=1,5;SAR=4,17;SRF=34;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.606319,-0.585543;STB=0.722359,0.84521;STBP=0.677,0;TYPE=mnp,del;VARB=0.137231,0.160941;OID=.,.;OPOS=1147001,1147002;OREF=TC,C;OALT=GT,-;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:82:87:85:43:56:5,22:2,27:0.0235294,0.317647:4,17:1,5:34:9:1,22:1,5:41:15
chr1	1147422	.	C	T	249.53	PASS	AF=0.605263;AO=21;DP=37;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=22;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=0.011532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.026;QD=26.266;RBI=0.0334412;REFB=-0.0223196;REVB=0.03139;RO=15;SAF=21;SAR=0;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.816726;STB=0.549952;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0144206;OID=.;OPOS=1147422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:15:15:21:23:0.605263:0:21:14:1:1:22:14:1
chr1	1149493	.	A	AC,C	36.48	PASS	AF=0.141026,0;AO=16,5;DP=79;FAO=11,0;FDP=78;FR=.;FRO=67;FSAF=10,0;FSAR=1,0;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.0501259,-0.0661066;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=56.0544,74.6217;QD=1.87094;RBI=0.0996463,0.134649;REFB=-0.00186375,0.00117836;REVB=-0.0861208,-0.117304;RO=57;SAF=16,5;SAR=0,0;SRF=21;SRR=36;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.792822,0.622118;STB=0.889819,0.5;STBP=0.01,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.159355,0;OID=.,.;OPOS=1149494,1149493;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:79:78:57:67:16,5:11,0:0.141026,0:0,0:16,5:21:36:1,0:10,0:33:34
chr1	1149494	.	GCCCCCA	GCCCCAC	148.99	PASS	AF=0.306667;AO=19;DP=74;FAO=23;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=22;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.015124;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=23.9226;QD=7.94589;RBI=0.0152126;REFB=-0.0474289;REVB=-0.00163936;RO=38;SAF=19;SAR=0;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.837397;STB=0.939732;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.0611141;OID=.;OPOS=1149499;OREF=CA;OALT=AC;OMAPALT=GCCCCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.306667:19:74:23:75:49:22:1:20:29:99:38:19:0:12:26
chr1	1153113	.	G	A	617.69	PASS	AF=0.571429;AO=54;DP=98;FAO=56;FDP=98;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0486709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.609;QD=25.2118;RBI=0.0487826;REFB=-0.0557693;REVB=-0.00329993;RO=42;SAF=25;SAR=29;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856687;STB=0.553827;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0410288;OID=.;OPOS=1153113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:42:42:54:56:0.571429:29:25:15:27:29:27:15:27
chr1	1156131	.	T	A,C	455.61	PASS	AF=0.0625,0.9375;AO=2,30;DP=32;FAO=2,30;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=1,9;FSAR=1,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214723,0.0125963;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=225.088,87.0597;QD=56.9514;RBI=0.021583,0.0328421;REFB=0,0;REVB=0.00218327,-0.0303304;RO=0;SAF=1,9;SAR=1,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0516677,-0.00951038;OID=.,.;OPOS=1156131,1156131;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:32:32:0:0:2,30:2,30:0.0625,0.9375:1,21:1,9:0:0:1,21:1,9:0:0
chr1	1158562	.	AACACA	AACA,AACACG	170.28	PASS	AF=0.34,0.06;AO=16,3;DP=51;FAO=17,3;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=14,3;FSAR=3,0;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.0111212,-0.00332265;FXX=0.019604;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=78.6532,176.267;QD=13.6226;RBI=0.0392361,0.00671685;REFB=-0.0574491,-0.00356982;REVB=0.037627,0.00583747;RO=27;SAF=13,3;SAR=3,0;SRF=20;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.114319,0.477263;STB=0.587673,0.994985;STBP=0.46,0.222;TYPE=del,snp;VARB=0.0853946,0.0910337;OID=.,.;OPOS=1158563,1158567;OREF=AC,A;OALT=-,G;OMAPALT=AACA,AACACG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.34,0.06:16,3:51:17,3:50:30:14,3:3,0:22:8:99:27:13,3:3,0:20:7
chr1	1158631	.	A	G	840.7	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0520029;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.067;QD=56.0463;RBI=0.0523259;REFB=-0.104513;REVB=-0.00580492;RO=1;SAF=42;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111038;STB=0.50588;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.000393573;OID=.;OPOS=1158631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:61:60:1:1:59:59:0.983333:17:42:1:0:17:42:1:0
chr1	1178245	.	C	T	793.95	PASS	AF=0.517007;AO=76;DP=147;FAO=76;FDP=147;FR=.;FRO=71;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=46;FSRR=25;FWDB=0.0295529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5832;QD=21.6042;RBI=0.0301006;REFB=-0.00221087;REVB=0.00571613;RO=71;SAF=51;SAR=25;SRF=46;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228529;STB=0.512559;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0019734;OID=.;OPOS=1178245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:71:71:76:76:0.517007:25:51:46:25:25:51:46:25
chr1	1178482	.	A	G	807.74	PASS	AF=0.576923;AO=75;DP=130;FAO=75;FDP=130;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.00310366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.148;QD=24.8535;RBI=0.0245817;REFB=-0.0290253;REVB=-0.024385;RO=55;SAF=30;SAR=45;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723178;STB=0.539422;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.024881;OID=.;OPOS=1178482;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:55:55:75:75:0.576923:45:30:27:28:45:30:27:28
chr1	1178925	.	G	A	426.46	PASS	AF=0.488636;AO=43;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.0263832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.0066;QD=19.3847;RBI=0.0358492;REFB=-0.0232224;REVB=0.0242712;RO=45;SAF=16;SAR=27;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230079;STB=0.627847;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0243248;OID=.;OPOS=1178925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:45:45:43:43:0.488636:27:16:28:17:27:16:28:17
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chr1	1246005	.	T	G	36.46	PASS	AF=0.0978261;AO=9;DP=89;FAO=9;FDP=92;FR=.;FRO=83;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=52;FSRR=31;FWDB=-0.004303;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=102.096;QD=1.58513;RBI=0.00597238;REFB=-0.00281632;REVB=0.00414168;RO=80;SAF=4;SAR=5;SRF=49;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196053;STB=0.660046;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0100669;OID=.;OPOS=1246005;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:89:92:80:83:9:9:0.0978261:5:4:49:31:5:4:52:31
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chr1	1254443	.	G	A	363.38	PASS	AF=0.486842;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.00844501;FXX=0.0731618;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.647;QD=19.1254;RBI=0.00972102;REFB=-0.01156;REVB=-0.00481457;RO=39;SAF=23;SAR=14;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030898;STB=0.517232;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0139708;OID=.;OPOS=1254443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:76:39:39:37:37:0.486842:14:23:23:16:14:23:23:16
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chr1	1335068	.	C	G	31.21	PASS	AF=0.0957447;AO=13;DP=94;FAO=9;FDP=94;FR=.;FRO=85;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=58;FSRR=27;FWDB=-0.0232613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.133;QD=1.32813;RBI=0.0477345;REFB=-0.0018696;REVB=-0.0416832;RO=68;SAF=10;SAR=3;SRF=50;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566366;STB=0.771676;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.179248;OID=.;OPOS=1335068;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:94:94:68:85:13:9:0.0957447:3:10:50:18:1:8:58:27
chr1	1361633	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100718;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=132.985;QD=37.4879;RBI=0.0113624;REFB=0;REVB=-0.00525949;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000314104;OID=.;OPOS=1361633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr1	1361641	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0423574;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=142.259;QD=40.7623;RBI=0.0516408;REFB=0;REVB=0.0295401;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000437688;OID=.;OPOS=1361641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0
chr1	1375810	.	C	G	145.23	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.162111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.375;QD=44.6856;RBI=0.164304;REFB=0;REVB=0.026755;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00194064;OID=.;OPOS=1375810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:12:1:0:0:12:1:0:0
chr1	1376214	.	C	G	631.69	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.405;QD=61.6281;RBI=0.0565038;REFB=0;REVB=0.049375;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146613;OID=.;OPOS=1376214;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:18:22:0:0:19:22:0:0
chr1	1376567	.	A	G	767.07	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.513;QD=63.9226;RBI=0.0612664;REFB=0;REVB=0.0457518;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.84695e-05;OID=.;OPOS=1376567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:24:23:0:0:24:24:0:0
chr1	1376804	.	AG	A,GA	33.1	PASS	AF=0.363636,0;AO=7,2;DP=22;FAO=8,0;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=2,0;FSAR=6,0;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.0623147,0.0154665;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=12.2616,143.583;QD=6.01806;RBI=0.252345,0.272991;REFB=-0.0335918,-0.00153652;REVB=-0.24453,-0.272552;RO=12;SAF=3,0;SAR=4,2;SRF=10;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.408238,-0.718987;STB=0.839307,0.5;STBP=0.033,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0378079,0;OID=.,.;OPOS=1376805,1376804;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:22:22:12:14:7,2:8,0:0.363636,0:4,2:3,0:10:2:6,0:2,0:12:2
chr1	1378173	.	G	A	284.13	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.133318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.486;QD=51.6608;RBI=0.133537;REFB=0;REVB=-0.00765045;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000703713;OID=.;OPOS=1378173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:9:12:0:0:9:13:0:0
chr1	1387764	.	G	A	1700.82	PASS	AF=0.959677;AO=116;DP=123;FAO=119;FDP=124;FR=.;FRO=5;FSAF=55;FSAR=64;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0210029;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.968;QD=54.865;RBI=0.0259839;REFB=-0.142928;REVB=0.0152983;RO=4;SAF=55;SAR=61;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301225;STB=0.505583;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.000788656;OID=.;OPOS=1387764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:123:124:4:5:116:119:0.959677:61:55:0:4:64:55:3:2
chr1	1390875	.	C	T	937.22	PASS	AF=0.956522;AO=66;DP=69;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0389487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.227;QD=54.3314;RBI=0.041284;REFB=-0.105498;REVB=0.013688;RO=0;SAF=22;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.531905;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.000531765;OID=.;OPOS=1390875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:69:69:0:3:66:66:0.956522:44:22:0:0:44:22:3:0
chr1	1403814	.	C	T	227.02	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00189978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.264;QD=13.5533;RBI=0.0340841;REFB=-0.0233523;REVB=-0.0340311;RO=40;SAF=14;SAR=13;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330014;STB=0.518833;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0312039;OID=.;OPOS=1403814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:13:14:22:18:13:14:22:18
chr1	1418004	.	T	C	310.08	PASS	AF=0.388889;AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=90;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=16;FWDB=-0.0220153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.1053;QD=13.7815;RBI=0.033787;REFB=-0.00137985;REVB=-0.0256297;RO=53;SAF=15;SAR=20;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28017;STB=0.666578;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0037888;OID=.;OPOS=1418004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:90:53:55:35:35:0.388889:20:15:37:16:20:15:39:16
chr1	1421531	.	C	A	357.08	PASS	AF=0.641509;AO=34;DP=53;FAO=34;FDP=53;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0881604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6663;QD=26.9497;RBI=0.0883062;REFB=-0.050238;REVB=0.00507316;RO=19;SAF=12;SAR=22;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119331;STB=0.565381;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0352136;OID=.;OPOS=1421531;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:19:19:34:34:0.641509:22:12:10:9:22:12:10:9
chr1	1421991	.	G	A	145.83	PASS	AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00108459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.95;QD=25.3615;RBI=0.0270158;REFB=-0.0335873;REVB=0.0269941;RO=8;SAF=9;SAR=6;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186819;STB=0.603646;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0240374;OID=.;OPOS=1421991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:8:8:15:15:0.652174:6:9:7:1:6:9:7:1
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chr1	1451380	.	T	C	208.79	PASS	AF=0.636364;AO=19;DP=30;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0352698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.6779;QD=25.3078;RBI=0.127391;REFB=-0.0690142;REVB=-0.122411;RO=11;SAF=13;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101095;STB=0.555501;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0499142;OID=.;OPOS=1451380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:30:33:11:12:19:21:0.636364:6:13:6:5:6:15:7:5
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chr1	1563759	.	G	T	141.12	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0345228;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.47;QD=20.1599;RBI=0.0366179;REFB=-0.0142625;REVB=0.0122086;RO=12;SAF=8;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913102;STB=0.533289;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0115134;OID=.;OPOS=1563759;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:28:12:13:15:15:0.535714:7:8:5:7:7:8:6:7
chr1	1588670	.	G	A	134.83	PASS	AF=0.166667;AO=25;DP=152;FAO=25;FDP=150;FR=.;FRO=125;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=84;FSRR=41;FWDB=-0.048338;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.046;QD=3.59544;RBI=0.0589146;REFB=-0.0201197;REVB=-0.0336804;RO=116;SAF=13;SAR=12;SRF=79;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211984;STB=0.628076;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.053039;OID=.;OPOS=1588670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:150:116:125:25:25:0.166667:12:13:79:37:12:13:84:41
chr1	1588717	.	G	A	155.98	PASS	AF=0.177914;AO=29;DP=162;FAO=29;FDP=163;FR=.;FRO=134;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=83;FSRR=51;FWDB=-0.0157742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.715;QD=3.82773;RBI=0.0163636;REFB=-0.000355554;REVB=-0.00435212;RO=133;SAF=15;SAR=14;SRF=82;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128965;STB=0.58452;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00206454;OID=.;OPOS=1588717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:163:133:134:29:29:0.177914:14:15:82:51:14:15:83:51
chr1	1588737	.	C	T	128.59	PASS	AF=0.156627;AO=26;DP=166;FAO=26;FDP=166;FR=.;FRO=140;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=85;FSRR=55;FWDB=0.027815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.888;QD=3.0986;RBI=0.0287168;REFB=-0.00697323;REVB=-0.00714;RO=140;SAF=14;SAR=12;SRF=85;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894668;STB=0.558752;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0152504;OID=.;OPOS=1588737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:166:140:140:26:26:0.156627:12:14:85:55:12:14:85:55
chr1	1588743	.	A	T	112.72	PASS	AF=0.144578;AO=24;DP=166;FAO=24;FDP=166;FR=.;FRO=142;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=85;FSRR=57;FWDB=-0.0119487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.533;QD=2.7162;RBI=0.0141693;REFB=-0.00425144;REVB=-0.0076156;RO=142;SAF=12;SAR=12;SRF=85;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126014;STB=0.584269;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0346924;OID=.;OPOS=1588743;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:166:142:142:24:24:0.144578:12:12:85:57:12:12:85:57
chr1	1588744	.	AGCG	A	107.43	PASS	AF=0.141975;AO=23;DP=164;FAO=23;FDP=162;FR=.;FRO=139;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=82;FSRR=57;FWDB=-0.00910054;FXX=0.0121944;HRUN=1;LEN=3;MLLD=320.915;QD=2.65253;RBI=0.00911143;REFB=-0.000430314;REVB=-0.000445409;RO=134;SAF=12;SAR=11;SRF=77;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676863;STB=0.558869;STBP=0.557;TYPE=del;VARB=0.00410711;OID=.;OPOS=1588745;OREF=GCG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.141975:23:164:23:162:139:12:11:82:57:99:134:12:11:77:57
chr1	1599888	.	A	G	258.48	PASS	AF=0.638889;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0276951;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8069;QD=28.7195;RBI=0.056429;REFB=0.0241928;REVB=0.0491652;RO=13;SAF=10;SAR=13;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177353;STB=0.509795;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=-0.0115731;OID=.;OPOS=1599888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:36:13:13:23:23:0.638889:13:10:6:7:13:10:6:7
chr1	1604499	.	G	A	281.71	PASS	AF=0.581395;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.046328;FXX=0.0652032;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.787;QD=26.2052;RBI=0.0511105;REFB=-0.0230671;REVB=-0.021587;RO=17;SAF=17;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745561;STB=0.532333;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.00517928;OID=.;OPOS=1604499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:43:17:18:25:25:0.581395:8:17:10:7:8:17:11:7
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chr1	1635749	.	C	A	702.87	PASS	AF=0.946429;AO=54;DP=58;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00530746;FXX=0.0344768;HRUN=6;LEN=1;MLLD=145.739;QD=50.2049;RBI=0.0497299;REFB=-0.196117;REVB=0.0494458;RO=2;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409266;STB=0.516352;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000866547;OID=.;OPOS=1635749;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:58:56:2:3:54:53:0.946429:22:32:0:2:20:33:1:2
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chr1	1636274	.	C	T	236.51	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.015952;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.641;QD=13.5148;RBI=0.0207434;REFB=-0.0166577;REVB=0.0132597;RO=42;SAF=13;SAR=15;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125549;STB=0.507167;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0227306;OID=.;OPOS=1636274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:42:42:28:28:0.4:15:13:20:22:15:13:20:22
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chr1	1647871	.	T	C	663.72	PASS	AF=0.396825;AO=73;DP=186;FAO=75;FDP=189;FR=.;FRO=114;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=54;FSRR=60;FWDB=0.0434052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8936;QD=14.0469;RBI=0.0485179;REFB=-0.0246053;REVB=0.021679;RO=112;SAF=35;SAR=38;SRF=53;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00671888;STB=0.511855;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0451493;OID=.;OPOS=1647871;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:189:112:114:73:75:0.396825:38:35:53:59:38:37:54:60
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chr1	1650797	.	A	G	284.65	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.0218988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.884;QD=17.7907;RBI=0.021906;REFB=-0.0196632;REVB=-0.000560761;RO=28;SAF=24;SAR=7;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179867;STB=0.591376;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00746691;OID=.;OPOS=1650797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:28:33:31:31:0.484375:7:24:17:11:7:24:21:12
chr1	1650801	.	T	C	265.34	PASS	AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.00918225;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=246.335;QD=15.6085;RBI=0.011707;REFB=-0.0200832;REVB=0.00726222;RO=37;SAF=21;SAR=9;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874102;STB=0.543889;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.021368;OID=.;OPOS=1650801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:37:38:30:30:0.441176:9:21:23:14:9:21:24:14
chr1	1650807	.	T	C	262.32	PASS	AF=0.422535;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.0341904;FXX=0.013887;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.9913;QD=14.7785;RBI=0.0448621;REFB=0.00634018;REVB=0.0290452;RO=39;SAF=21;SAR=9;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388781;STB=0.543659;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=-0.00748862;OID=.;OPOS=1650807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:39:41:30:30:0.422535:9:21:26:13:9:21:26:15
chr1	1650832	.	A	G	450.18	PASS	AF=0.53012;AO=44;DP=83;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0221196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.366;QD=21.6953;RBI=0.0327779;REFB=-0.0104836;REVB=0.0241892;RO=36;SAF=27;SAR=17;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046298;STB=0.500866;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0171085;OID=.;OPOS=1650832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:36:39:44:44:0.53012:17:27:24:12:17:27:24:15
chr1	1650845	.	G	A	389.55	PASS	AF=0.418367;AO=39;DP=97;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.0502343;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.049;QD=15.8999;RBI=0.0511243;REFB=-0.013197;REVB=-0.00949783;RO=55;SAF=23;SAR=16;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468897;STB=0.549847;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0115596;OID=.;OPOS=1650845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:55:57:39:41:0.418367:16:23:30:25:16:25:30:27
chr1	1654038	.	G	A	88.38	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.224;QD=39.28;RBI=0.0666872;REFB=0;REVB=0.0617856;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106195;OID=.;OPOS=1654038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:4:4:0:0:5:4:0:0
chr1	1654058	.	C	T	167.47	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0115419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.687;QD=41.8678;RBI=0.0263997;REFB=-0.0520005;REVB=0.0237429;RO=1;SAF=8;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536101;STB=0.529373;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00152502;OID=.;OPOS=1654058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:7:8:1:0:7:8:1:0
chr1	1654064	.	A	T	158.28	PASS	AF=0.833333;AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=18;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0163831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.314;QD=35.1729;RBI=0.0801653;REFB=0.0461721;REVB=0.0784733;RO=3;SAF=8;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14342;STB=0.578846;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.00198244;OID=.;OPOS=1654064;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:18:18:3:3:15:15:0.833333:7:8:3:0:7:8:3:0
chr1	1654065	.	AGCG	A	175.17	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00941484;FXX=0.111049;HRUN=1;LEN=3;MLLD=312.819;QD=43.7913;RBI=0.01085;REFB=-0.0425023;REVB=0.00539285;RO=1;SAF=8;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536101;STB=0.529373;STBP=0.543;TYPE=del;VARB=0.00400691;OID=.;OPOS=1654066;OREF=GCG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.9375:15:18:15:16:1:8:7:1:0:6:1:8:7:1:0
chr1	1666251	.	G	A	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.002653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2417;QD=21.0128;RBI=0.0117259;REFB=-0.0165641;REVB=-0.0114219;RO=7;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469824;STB=0.526832;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0116638;OID=.;OPOS=1666251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:7:4:3:4:7:4:3:4
chr1	1683565	.	G	A	207.58	PASS	AF=0.45098;AO=22;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0850192;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.513;QD=16.281;RBI=0.0900176;REFB=-0.0314237;REVB=-0.0295785;RO=29;SAF=11;SAR=11;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515473;STB=0.531489;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0368196;OID=.;OPOS=1683565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:28:22:23:0.45098:11:11:13:16:11:12:13:15
chr1	1684472	.	C	T	75.12	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0147457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4781;QD=11.1287;RBI=0.0339387;REFB=0.0194219;REVB=0.0305679;RO=17;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756198;STB=0.545363;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=-0.0302729;OID=.;OPOS=1684472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:4:6:9:8:4:6:9:8
chr1	1686040	.	G	T	292.61	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.0116397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9327;QD=15.4003;RBI=0.0257569;REFB=-0.0250051;REVB=-0.0229768;RO=41;SAF=17;SAR=16;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142356;STB=0.57734;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0395799;OID=.;OPOS=1686040;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:41:43:33:33:0.434211:16:17:27:14:16:17:28:15
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chr1	1859169	.	G	C	54.13	PASS	AF=0.16129;AO=10;DP=62;FAO=10;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0195024;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=32.1594;QD=3.49242;RBI=0.0435218;REFB=-0.0385373;REVB=0.0389076;RO=37;SAF=9;SAR=1;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.57572;STB=0.886942;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.161655;OID=.;OPOS=1859169;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:62:62:37:52:10:10:0.16129:1:9:17:20:1:9:24:28
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chr1	1919593	.	G	A	85.27	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0255466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.486;QD=11.3693;RBI=0.0260016;REFB=-0.0133072;REVB=-0.00484273;RO=19;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380433;STB=0.726859;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0275697;OID=.;OPOS=1919593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:3:8:7:12:3:8:7:12
chr1	1957037	.	T	C	223.12	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0209479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.777;QD=16.5274;RBI=0.0209664;REFB=-0.0130764;REVB=0.000880879;RO=29;SAF=12;SAR=13;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198732;STB=0.611679;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00974241;OID=.;OPOS=1957037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:13:12:20:9:13:12:20:9
chr1	1987993	.	T	C	397.65	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043753;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.198;QD=56.8076;RBI=0.0439618;REFB=0;REVB=0.00427966;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131533;OID=.;OPOS=1987993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0
chr1	2005740	.	T	C	197.3	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0029846;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4023;QD=49.3253;RBI=0.05073;REFB=0;REVB=0.0506421;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00187612;OID=.;OPOS=2005740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:16:0:0:16:16:1:3:13:0:0:3:13:0:0
chr1	2144788	.	A	G	236.11	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00964107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9712;QD=19.2746;RBI=0.0227993;REFB=-0.0093005;REVB=-0.0206605;RO=26;SAF=15;SAR=8;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00172967;STB=0.500978;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.011305;OID=.;OPOS=2144788;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:8:15:17:9:8:15:17:9
chr1	2144982	.	G	T	636.04	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0934976;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.424;QD=62.0529;RBI=0.11567;REFB=0;REVB=0.0681005;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000672364;OID=.;OPOS=2144982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr1	2145281	.	A	G	33.5	PASS	AF=0.444444;AO=2;DP=10;FAO=4;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=4;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0137192;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.558;QD=14.8876;RBI=0.0137192;REFB=0.00837213;REVB=0;RO=4;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0856242;OID=.;OPOS=2145281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:10:9:4:4:2:4:0.444444:0:2:4:0:0:4:4:0
chr1	2340200	.	T	C	747.06	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00285061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.293;QD=63.5797;RBI=0.0622562;REFB=0;REVB=-0.0621909;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000787313;OID=.;OPOS=2340200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:21:25:0:0:22:25:0:0
chr1	2399119	.	A	G	367.65	PASS	AF=0.40566;AO=43;DP=106;FAO=43;FDP=106;FR=.;FRO=63;FSAF=9;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.00854946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.402;QD=13.8737;RBI=0.0136624;REFB=-0.0043023;REVB=-0.0106568;RO=56;SAF=9;SAR=34;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.458548;STB=0.750464;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00756302;OID=.;OPOS=2399119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:56:63:43:43:0.40566:34:9:36:20:34:9:38:25
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chr1	2441358	.	T	C	113.47	PASS	AF=0.291667;AO=13;DP=47;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0159393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.129;QD=9.45547;RBI=0.0254211;REFB=-0.0132142;REVB=-0.0198033;RO=32;SAF=9;SAR=4;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266772;STB=0.678749;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0352998;OID=.;OPOS=2441358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:32:34:13:14:0.291667:4:9:15:17:4:10:16:18
chr1	2452569	.	T	C	1857.04	PASS	AF=0.99187;AO=121;DP=122;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0576379;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2019;QD=60.3915;RBI=0.0609634;REFB=0.000838187;REVB=-0.0198598;RO=1;SAF=48;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00979346;STB=0.50505;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.000156791;OID=.;OPOS=2452569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:122:123:1:1:121:122:0.99187:73:48:1:0:73:49:1:0
chr1	2488153	.	A	G	3749.66	PASS	AF=0.853125;AO=271;DP=320;FAO=273;FDP=320;FR=.;FRO=47;FSAF=148;FSAR=125;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.0133822;FXX=0.00311517;HRUN=4;LEN=1;MLLD=203.015;QD=46.8708;RBI=0.0137544;REFB=-0.0137001;REVB=-0.00317817;RO=45;SAF=147;SAR=124;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217194;STB=0.507942;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.000228354;OID=.;OPOS=2488153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:320:320:45:47:271:273:0.853125:124:147:28:17:125:148:28:19
chr1	2488155	.	A	C	147.37	PASS	AF=0.126935;AO=41;DP=323;FAO=41;FDP=323;FR=.;FRO=282;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=151;FSRR=131;FWDB=-0.136985;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=36.7502;QD=1.82497;RBI=0.139393;REFB=-0.0260292;REVB=-0.0257977;RO=282;SAF=25;SAR=16;SRF=151;SRR=131;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.095714;STB=0.566136;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.22345;OID=.;OPOS=2488155;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:323:323:282:282:41:41:0.126935:16:25:151:131:16:25:151:131
chr1	2490898	.	C	A	292.2	PASS	AF=0.92;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00524089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.804;QD=46.7518;RBI=0.020469;REFB=-0.135432;REVB=-0.0197867;RO=1;SAF=22;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205913;STB=0.521721;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.00214369;OID=.;OPOS=2490898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:24:25:1:2:23:23:0.92:1:22:1:0:1:22:2:0
chr1	2490942	.	C	A	719.43	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.182365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.2015;QD=53.291;RBI=0.215836;REFB=-0.121048;REVB=0.115448;RO=2;SAF=31;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00695;STB=0.511624;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00662573;OID=.;OPOS=2490942;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:54:54:2:1:52:53:0.981481:21:31:1:1:21:32:0:1
chr1	2491205	.	C	T	1974.17	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402984;FXX=0.00781189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.677;QD=62.1787;RBI=0.0415839;REFB=0;REVB=0.0102597;RO=0;SAF=59;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.65266e-05;OID=.;OPOS=2491205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:127:0:0:127:127:1:68:59:0:0:68:59:0:0
chr1	2526746	.	A	G	101.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00950477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.86;QD=40.7612;RBI=0.0317467;REFB=0;REVB=0.0302904;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000964116;OID=.;OPOS=2526746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr1	2535613	.	C	A	1118.08	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0550233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.466;QD=60.4369;RBI=0.138474;REFB=0;REVB=0.127072;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337756;OID=.;OPOS=2535613;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:74:0:0:71:74:1:27:44:0:0:29:45:0:0
chr1	2541269	.	A	G	769.47	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00854859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0215;QD=56.9977;RBI=0.0370727;REFB=0;REVB=-0.0360736;RO=0;SAF=13;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.81937e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000270152;OID=.;OPOS=2541269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:41:13:0:0:41:13:0:0
chr1	2573199	.	A	G	1510.37	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.429;QD=63.5946;RBI=0.0303439;REFB=0;REVB=0.0192854;RO=0;SAF=33;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10899e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.64063e-06;OID=.;OPOS=2573199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:62:33:0:0:62:33:0:0
chr1	2938265	.	C	T	125.87	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00319338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.352;QD=18.6477;RBI=0.0161817;REFB=-0.0204776;REVB=0.0158635;RO=12;SAF=13;SAR=1;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.55387;STB=0.819221;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0263712;OID=.;OPOS=2938265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:12:13:14:14:0.518519:1:13:6:6:1:13:7:6
chr1	2938407	.	CAGA	C	381.97	PASS	AF=0.513158;AO=37;DP=81;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.00721068;FXX=0.0379699;HRUN=1;LEN=3;MLLD=153.92;QD=20.1036;RBI=0.00771791;REFB=-0.00526769;REVB=0.00275179;RO=38;SAF=21;SAR=16;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105632;STB=0.515144;STBP=0.785;TYPE=del;VARB=0.0055871;OID=.;OPOS=2938408;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.513158:37:81:39:76:37:22:17:22:15:99:38:21:16:22:16
chr1	2938697	.	T	G	378.46	PASS	AF=0.465116;AO=38;DP=84;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0157491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.028;QD=17.6025;RBI=0.0162748;REFB=-0.036216;REVB=0.00410324;RO=46;SAF=19;SAR=19;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212263;STB=0.501747;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0352843;OID=.;OPOS=2938697;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:86:46:46:38:40:0.465116:19:19:22:24:21:19:22:24
chr1	2938989	.	G	A	1891.1	PASS	AF=0.483376;AO=189;DP=365;FAO=189;FDP=391;FR=.;FRO=202;FSAF=86;FSAR=103;FSRF=122;FSRR=80;FWDB=0.00308186;FXX=0.00508893;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.413;QD=19.3463;RBI=0.0200829;REFB=-0.0364216;REVB=-0.019845;RO=176;SAF=86;SAR=103;SRF=122;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208244;STB=0.576495;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0255414;OID=.;OPOS=2938989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:365:391:176:202:189:189:0.483376:103:86:122:54:103:86:122:80
chr1	2983963	.	G	A	992.43	PASS	AF=0.492754;AO=102;DP=207;FAO=102;FDP=207;FR=.;FRO=105;FSAF=74;FSAR=28;FSRF=59;FSRR=46;FWDB=0.0389577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3549;QD=19.1775;RBI=0.0462459;REFB=-0.0402366;REVB=0.0249195;RO=105;SAF=74;SAR=28;SRF=59;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172227;STB=0.595198;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0553521;OID=.;OPOS=2983963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:207:207:105:105:102:102:0.492754:28:74:59:46:28:74:59:46
chr1	3301721	.	C	T	247.08	PASS	AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00881126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.91;QD=24.7084;RBI=0.0255801;REFB=-0.00980429;REVB=-0.0240147;RO=17;SAF=17;SAR=6;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274626;STB=0.653704;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00906386;OID=.;OPOS=3301721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:17:17:23:23:0.575:6:17:7:10:6:17:7:10
chr1	3301765	.	C	T	137.68	PASS	AF=0.390244;AO=15;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.00134806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.704;QD=13.4318;RBI=0.00865041;REFB=-0.00654736;REVB=0.00854472;RO=21;SAF=5;SAR=10;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371428;STB=0.717837;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.026196;OID=.;OPOS=3301765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:25:15:16:0.390244:10:5:15:6:11:5:17:8
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chr1	3328358	.	T	C	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.867;QD=53.2755;RBI=0.0153997;REFB=0;REVB=0.0076486;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183523;OID=.;OPOS=3328358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:16:7:0:0:16:7:0:0
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chr1	3354615	.	T	C	597.25	PASS	AF=0.556604;AO=59;DP=106;FAO=59;FDP=106;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=-0.00961337;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.791;QD=22.5377;RBI=0.00962013;REFB=-0.0127653;REVB=0.000360439;RO=47;SAF=26;SAR=33;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124584;STB=0.50682;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0105119;OID=.;OPOS=3354615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:47:47:59:59:0.556604:33:26:20:27:33:26:20:27
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chr1	3389727	.	C	T	1026.36	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.901;QD=59.4992;RBI=0.0452135;REFB=0;REVB=0.0220464;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109019;OID=.;OPOS=3389727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0
chr1	3394456	.	T	C	1043.4	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000495323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.083;QD=59.623;RBI=0.00426328;REFB=0;REVB=0.0042344;RO=0;SAF=47;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79556e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.30355e-06;OID=.;OPOS=3394456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:23:47:0:0:23:47:0:0
chr1	3395039	.	G	A	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.916;QD=59.8558;RBI=0.0346541;REFB=0;REVB=0.0324749;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.34107e-05;OID=.;OPOS=3395039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:37:34:0:0:37:34:0:0
chr1	3413921	.	G	A	214.19	PASS	AF=0.666667;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0298996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.299;QD=28.5586;RBI=0.0828331;REFB=-0.0223256;REVB=0.0772486;RO=10;SAF=19;SAR=1;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313899;STB=0.67834;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0180527;OID=.;OPOS=3413921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:10:10:20:20:0.666667:1:19:8:2:1:19:8:2
chr1	3416449	.	C	A	194.04	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0359611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.9727;QD=16.8734;RBI=0.0426658;REFB=-0.0298959;REVB=0.0229603;RO=26;SAF=14;SAR=6;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368808;STB=0.521032;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0342119;OID=.;OPOS=3416449;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:6:14:19:7:6:14:19:7
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chr1	3703710	.	G	A	345.82	PASS	AF=0.452381;AO=34;DP=79;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=0.0212059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.295;QD=16.4676;RBI=0.0277446;REFB=-0.0489338;REVB=0.0178906;RO=44;SAF=15;SAR=19;SRF=31;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259501;STB=0.646985;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0866131;OID=.;OPOS=3703710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:84:44:46:34:38:0.452381:19:15:31:13:22:16:32:14
chr1	3743319	.	G	A	252.85	PASS	AF=0.447761;AO=24;DP=60;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0158742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.335;QD=15.0955;RBI=0.0209539;REFB=-0.0266127;REVB=0.0136776;RO=35;SAF=15;SAR=9;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147165;STB=0.583362;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0306569;OID=.;OPOS=3743319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:67:35:37:24:30:0.447761:9:15:17:18:11:19:18:19
chr1	3745924	.	G	A	535.31	PASS	AF=0.423358;AO=58;DP=137;FAO=58;FDP=137;FR=.;FRO=79;FSAF=16;FSAR=42;FSRF=19;FSRR=60;FWDB=-0.0139513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4913;QD=15.6296;RBI=0.0245401;REFB=-0.0214008;REVB=-0.0201886;RO=77;SAF=16;SAR=42;SRF=18;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055332;STB=0.526103;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0230326;OID=.;OPOS=3745924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:77:79:58:58:0.423358:42:16:18:59:42:16:19:60
chr1	3753136	.	A	T	421.97	PASS	AF=0.472527;AO=42;DP=92;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.00488282;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.295;QD=18.5483;RBI=0.00765184;REFB=-0.0236438;REVB=0.00589141;RO=48;SAF=16;SAR=26;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136311;STB=0.580455;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0160509;OID=.;OPOS=3753136;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:48:48:42:43:0.472527:26:16:25:23:27:16:25:23
chr1	3755675	.	T	C	348.39	PASS	AF=0.507042;AO=37;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.110704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.297;QD=19.6278;RBI=0.111307;REFB=-0.0428505;REVB=-0.011569;RO=25;SAF=14;SAR=23;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136452;STB=0.632291;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0289732;OID=.;OPOS=3755675;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:25:35:37:36:0.507042:23:14:14:11:23:13:22:13
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chr1	3807450	.	C	A	62.69	PASS	AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0779672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.326;QD=20.8977;RBI=0.0780932;REFB=-0.00824913;REVB=-0.00443383;RO=4;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251651;STB=0.642549;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00631804;OID=.;OPOS=3807450;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:5:3:0:4:5:3:0:4
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chr1	4772716	.	C	T	197.62	PASS	AF=0.47619;AO=18;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00437644;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.826;QD=18.8212;RBI=0.0344019;REFB=0.00609666;REVB=0.0341224;RO=20;SAF=7;SAR=11;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584155;STB=0.553344;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.00609828;OID=.;OPOS=4772716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:22:18:20:0.47619:11:7:9:11:12:8:11:11
chr1	5935162	.	A	T	38.15	PASS	AF=0.4;AO=5;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0128105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.786;QD=10.1734;RBI=0.0412465;REFB=-0.0356612;REVB=0.0392067;RO=9;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046104;STB=0.571184;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0282815;OID=.;OPOS=5935162;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:5:6:0.4:3:2:4:5:4:2:4:5
chr1	5937168	.	G	A	2095.43	PASS	AF=0.985185;AO=129;DP=135;FAO=133;FDP=135;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=99;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1053;QD=62.0867;RBI=0.0985505;REFB=0;REVB=0.0970294;RO=0;SAF=95;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25609e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000456557;OID=.;OPOS=5937168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:135:135:0:0:129:133:0.985185:34:95:0:0:34:99:0:0
chr1	5948677	.	G	A	591.51	PASS	AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0571925;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.036;QD=56.3341;RBI=0.0599865;REFB=0.0132785;REVB=-0.0180942;RO=1;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240441;STB=0.524987;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=-0.000167403;OID=.;OPOS=5948677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:42:42:1:2:40:40:0.952381:19:21:0:1:19:21:0:2
chr1	6157434	.	C	T	725.06	PASS	AF=0.484277;AO=77;DP=158;FAO=77;FDP=159;FR=.;FRO=82;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=51;FSRR=31;FWDB=0.0285738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.0421;QD=18.2406;RBI=0.0285767;REFB=-0.0036771;REVB=0.000405346;RO=80;SAF=38;SAR=39;SRF=49;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109895;STB=0.566122;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00528135;OID=.;OPOS=6157434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:159:80:82:77:77:0.484277:39:38:49:31:39:38:51:31
chr1	6158562	.	A	G	407.94	PASS	AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.046276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.711;QD=17.7365;RBI=0.0484841;REFB=-0.0116887;REVB=-0.0144651;RO=50;SAF=25;SAR=17;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153059;STB=0.508561;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.00867128;OID=.;OPOS=6158562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:50:50:42:42:0.456522:17:25:29:21:17:25:29:21
chr1	6162053	.	CT	CC,C	316.2	PASS	AF=0.958333,0.0416667;AO=20,3;DP=24;FAO=23,1;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0;FSAR=15,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513607,-0.225475;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=41.8966,23.6082;QD=52.7005;RBI=0.0833068,0.282514;REFB=0,0;REVB=-0.0655903,-0.170221;RO=0;SAF=5,3;SAR=15,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.00393308,-0.0135965;OID=.,.;OPOS=6162054,6162054;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.958333,0.0416667:20,3:24:23,1:24:0:8,0:15,1:0:0:4:0:5,3:15,0:0:0
chr1	6162355	.	A	T	123.13	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0393124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.451;QD=16.4168;RBI=0.0424004;REFB=0.00155825;REVB=-0.0158849;RO=16;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666664;STB=0.538406;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.00141574;OID=.;OPOS=6162355;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:8:6:8:8:8:6:8:8
chr1	6162407	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.989;QD=48.737;RBI=0.0469482;REFB=0;REVB=0.00900287;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200025;OID=.;OPOS=6162407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr1	6163065	.	G	A	368.03	PASS	AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0734433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.537;QD=19.6282;RBI=0.0741079;REFB=-0.0129613;REVB=-0.00990245;RO=37;SAF=17;SAR=21;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134372;STB=0.507459;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0173676;OID=.;OPOS=6163065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:37:37:38:38:0.506667:21:17:16:21:21:17:16:21
chr1	6165419	.	C	T	213.5	PASS	AF=0.462963;AO=24;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0047265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.33;QD=15.8148;RBI=0.0105589;REFB=-0.0145857;REVB=-0.0094419;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166439;STB=0.501482;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.0241164;OID=.;OPOS=6165419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:24:25:0.462963:12:12:15:14:12:13:15:14
chr1	6184092	.	A	G	557.01	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2191;QD=60.2171;RBI=0.0507064;REFB=0;REVB=-0.0493214;RO=0;SAF=28;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200548;OID=.;OPOS=6184092;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:9:28:0:0:9:28:0:0
chr1	6190315	.	C	T	369.46	PASS	AF=0.36;AO=45;DP=125;FAO=45;FDP=125;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=52;FSRR=28;FWDB=-0.00706351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.983;QD=11.8226;RBI=0.0105265;REFB=-0.0242204;REVB=0.0078048;RO=78;SAF=24;SAR=21;SRF=50;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121635;STB=0.575725;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0449826;OID=.;OPOS=6190315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:78:80:45:45:0.36:21:24:50:28:21:24:52:28
chr1	6196869	.	A	G	865.46	PASS	AF=0.983871;AO=59;DP=61;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0334382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8799;QD=55.836;RBI=0.0335455;REFB=-0.00201738;REVB=0.0026807;RO=1;SAF=18;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254873;STB=0.512816;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.000893798;OID=.;OPOS=6196869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:62:1:1:59:61:0.983871:41:18:1:0:42:19:1:0
chr1	6202245	.	G	A	576.48	PASS	AF=0.442029;AO=61;DP=138;FAO=61;FDP=138;FR=.;FRO=77;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=51;FSRR=26;FWDB=0.0044383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.994;QD=16.7094;RBI=0.00585402;REFB=-0.0025514;REVB=-0.0038172;RO=77;SAF=40;SAR=21;SRF=51;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00732792;STB=0.504087;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.00345797;OID=.;OPOS=6202245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:77:77:61:61:0.442029:21:40:51:26:21:40:51:26
chr1	6209363	.	T	C	78.36	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.100293;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1117;QD=13.0598;RBI=0.101975;REFB=-0.00777377;REVB=0.0184454;RO=14;SAF=8;SAR=2;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455361;STB=0.771361;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0100751;OID=.;OPOS=6209363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:25:24:14:14:10:10:0.416667:2:8:5:9:2:8:5:9
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chr1	6308929	.	C	A	112.81	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=34;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.012898;FXX=0.0277701;HRUN=10;LEN=1;MLLD=204.253;QD=12.8925;RBI=0.0130226;REFB=-0.00452862;REVB=0.00179737;RO=3;SAF=10;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0986653;STB=0.65647;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0053144;OID=.;OPOS=6308929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:3:21:12:14:0.4:2:10:2:1:3:11:12:9
chr1	6313938	.	C	T	416.66	PASS	AF=0.494118;AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=-0.0470243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.718;QD=19.6075;RBI=0.0481666;REFB=-0.0318276;REVB=0.0104279;RO=43;SAF=21;SAR=21;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1807;STB=0.599954;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0321298;OID=.;OPOS=6313938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:43:43:42:42:0.494118:21:21:30:13:21:21:30:13
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chr1	6614230	.	G	A	331.91	PASS	AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=0.053841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2808;QD=16.1907;RBI=0.0804903;REFB=-0.0168692;REVB=0.0598317;RO=45;SAF=20;SAR=16;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0901216;STB=0.555525;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0280153;OID=.;OPOS=6614230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:45:46:36:36:0.439024:16:20:29:16:16:20:30:16
chr1	6631157	.	T	C	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0587809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8214;QD=11.1977;RBI=0.0600272;REFB=0.0305212;REVB=-0.0121687;RO=22;SAF=1;SAR=11;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.605708;STB=0.871223;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.0569515;OID=.;OPOS=6631157;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:11:1:12:10:11:1:12:10
chr1	6634693	.	T	C	173.99	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00640844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.278;QD=19.3326;RBI=0.0151594;REFB=-0.00546455;REVB=-0.0137382;RO=17;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126496;STB=0.555495;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00404305;OID=.;OPOS=6634693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:18:18:18:0.5:9:9:11:6:9:9:11:7
chr1	6634764	.	A	G	323.4	PASS	AF=0.454545;AO=34;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.0204634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.137;QD=16.8002;RBI=0.021241;REFB=-0.0244253;REVB=0.00569449;RO=42;SAF=12;SAR=22;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23964;STB=0.622417;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0188693;OID=.;OPOS=6634764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:42:42:34:35:0.454545:22:12:25:17:22:13:25:17
chr1	6634901	.	A	C	346.56	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00989756;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.977;QD=21.6602;RBI=0.0120075;REFB=0.0030695;REVB=0.00679847;RO=28;SAF=14;SAR=21;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0532027;STB=0.522568;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=-0.00184768;OID=.;OPOS=6634901;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:28:29:35:35:0.546875:21:14:13:15:21:14:13:16
chr1	6635231	.	A	G	191.24	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00754841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8922;QD=47.8092;RBI=0.0117646;REFB=0;REVB=-0.00902364;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000598448;OID=.;OPOS=6635231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr1	6636662	.	T	C	180.86	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0137043;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.51;QD=22.6078;RBI=0.0226738;REFB=-0.0195171;REVB=0.0180636;RO=14;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556163;STB=0.531215;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0212761;OID=.;OPOS=6636662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:32:14:14:18:18:0.5625:9:9:8:6:9:9:8:6
chr1	7870048	.	T	C	1080.49	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0425946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3122;QD=60.0272;RBI=0.0438262;REFB=0;REVB=0.0103165;RO=0;SAF=45;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172221;OID=.;OPOS=7870048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:27:45:0:0:27:45:0:0
chr1	7887248	.	G	A	929.15	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.054189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.742;QD=55.4715;RBI=0.0611248;REFB=-0.0534705;REVB=0.0282806;RO=2;SAF=38;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242139;STB=0.512817;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.000424957;OID=.;OPOS=7887248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:67:2:2:65:65:0.970149:27:38:2:0:27:38:2:0
chr1	7887493	.	T	C	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.302;QD=64.1538;RBI=0.0985212;REFB=0;REVB=0.0928113;RO=0;SAF=13;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000610047;OID=.;OPOS=7887493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:36:13:0:0:36:13:0:0
chr1	7887769	.	C	T	101.45	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0189002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0002;QD=16.9087;RBI=0.0189829;REFB=-0.0130999;REVB=-0.0017699;RO=12;SAF=5;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214087;STB=0.623086;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.054003;OID=.;OPOS=7887769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:7:5:8:4:7:5:8:4
chr1	7889941	.	C	T	1072.66	PASS	AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0211655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.758;QD=57.2083;RBI=0.030645;REFB=-0.142336;REVB=0.0221617;RO=2;SAF=39;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023638;STB=0.512497;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00120831;OID=.;OPOS=7889941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:75:75:2:2:73:73:0.973333:34:39:2:0:34:39:2:0
chr1	7906476	.	G	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00171846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1775;QD=46.8469;RBI=0.0668753;REFB=0;REVB=-0.0668532;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00219989;OID=.;OPOS=7906476;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr1	7913430	.	G	A	297.16	PASS	AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.00171062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5608;QD=18.287;RBI=0.0542099;REFB=-0.0179224;REVB=-0.0541829;RO=33;SAF=18;SAR=14;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152411;STB=0.585033;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00805308;OID=.;OPOS=7913430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:14:18:13:20:14:18:13:20
chr1	7990367	.	G	A	101.34	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00468762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9415;QD=16.8894;RBI=0.0258261;REFB=-0.000711355;REVB=0.0253972;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218292;STB=0.624804;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00201788;OID=.;OPOS=7990367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:9:3:6:6:9:3
chr1	8031054	.	G	A	1120.34	PASS	AF=0.9625;AO=76;DP=80;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0536049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.913;QD=56.0168;RBI=0.124533;REFB=-0.143658;REVB=0.112405;RO=1;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141235;STB=0.521121;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0027113;OID=.;OPOS=8031054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:80:80:1:3:76:77:0.9625:33:43:0:1:34:43:0:3
chr1	8042970	.	G	T	766.36	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.817;QD=63.8633;RBI=0.0417426;REFB=0;REVB=0.0103583;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227502;OID=.;OPOS=8042970;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0
chr1	8073430	.	AAT	A,ATT	37.05	PASS	AF=0.173077,0;AO=14,4;DP=63;FAO=9,0;FDP=52;FR=.;FRO=43;FSAF=5,0;FSAR=4,0;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.207298,-0.0311725;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=18.9328,16.6583;QD=2.8502;RBI=0.230185,0.0335821;REFB=-0.0527268,0.0217785;REVB=0.100062,0.0124914;RO=37;SAF=9,4;SAR=5,0;SRF=15;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.278162,0.619122;STB=0.611573,0.5;STBP=0.531,1;TYPE=del,snp;VARB=0.163966,0;OID=.,.;OPOS=8073431,8073431;OREF=AT,A;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.173077,0:14,4:63:9,0:52:43:5,0:4,0:18:25:38:37:9,4:5,0:15:22
chr1	8390495	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00396928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.035;QD=35.5759;RBI=0.0443966;REFB=0;REVB=-0.0442188;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000749726;OID=.;OPOS=8390495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr1	8390764	.	T	C	36.93	PASS	AF=0.117647;AO=8;DP=67;FAO=8;FDP=68;FR=.;FRO=60;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=41;FSRR=19;FWDB=0.00184966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.5545;QD=2.17246;RBI=0.0688235;REFB=-0.0151134;REVB=-0.0687986;RO=55;SAF=4;SAR=4;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189364;STB=0.661403;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0614351;OID=.;OPOS=8390764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:67:68:55:60:8:8:0.117647:4:4:36:19:4:4:41:19
chr1	8412935	.	C	T	1854.41	PASS	AF=1;AO=107;DP=109;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.191;QD=61.3028;RBI=0.0310865;REFB=0;REVB=0.0208535;RO=0;SAF=45;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75633e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9498e-05;OID=.;OPOS=8412935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:109:121:0:0:107:121:1:62:45:0:0:70:51:0:0
chr1	8412989	.	A	G	1457.16	PASS	AF=0.980392;AO=97;DP=101;FAO=100;FDP=102;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0125076;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.096;QD=57.1437;RBI=0.018193;REFB=0.128618;REVB=0.0132116;RO=1;SAF=47;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939136;STB=0.50059;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=-0.000986719;OID=.;OPOS=8412989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:101:102:1:2:97:100:0.980392:50:47:0:1:53:47:1:1
chr1	8418644	.	C	A	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.0558376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.025;QD=14.1699;RBI=0.0578678;REFB=-0.0435288;REVB=0.0151934;RO=12;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413137;STB=0.730461;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0319808;OID=.;OPOS=8418644;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:7:3:0:12:7:3:0:12
chr1	8418650	.	T	C	89.54	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0.0757957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.382;QD=15.5714;RBI=0.0860111;REFB=-0.0216749;REVB=-0.0406561;RO=12;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413895;STB=0.730475;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0471708;OID=.;OPOS=8418650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:7:4:0:12:7:4:0:12
chr1	8420317	.	ACCCCCCCG	ACCCCCCG,ACCCCCCGC	34.25	PASS	AF=0.296296,0;AO=16,4;DP=53;FAO=16,0;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=8,0;FSAR=8,0;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0153257,-0.0539258;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=6.83354,24.2399;QD=2.53737;RBI=0.0499428,0.140458;REFB=-0.11909,-0.0491342;REVB=0.0475332,-0.129694;RO=25;SAF=11,0;SAR=5,4;SRF=18;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0403637,-0.715561;STB=0.555487,0.5;STBP=0.593,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.120717,0;OID=.,.;OPOS=8420318,8420324;OREF=C,CG;OALT=-,GC;OMAPALT=ACCCCCCG,ACCCCCCGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.296296,0:16,4:53:16,0:54:38:8,0:8,0:22:16:35:25:11,0:5,4:18:7
chr1	8928125	.	G	T	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511341;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.518;QD=62.35;RBI=0.0579316;REFB=0;REVB=0.0272281;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148485;OID=.;OPOS=8928125;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
chr1	9009444	.	A	C	44.3	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0121728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.147;QD=6.81572;RBI=0.0122648;REFB=-0.00190076;REVB=0.00149896;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136363;STB=0.585974;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00415675;OID=.;OPOS=9009444;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:3:4:13:6:3:4:13:6
chr1	9009451	.	G	C	44.26	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00325696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7538;QD=6.80891;RBI=0.0143096;REFB=0.00691351;REVB=0.0139341;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136363;STB=0.585974;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=-0.0164325;OID=.;OPOS=9009451;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:3:4:13:6:3:4:13:6
chr1	9009470	.	G	C	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.000659541;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.824;QD=6.81341;RBI=0.0148639;REFB=-0.00538283;REVB=0.0148493;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20437;STB=0.627577;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0177538;OID=.;OPOS=9009470;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:3:4:14:5:3:4:14:5
chr1	9011586	.	T	G	970.13	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00715726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1175;QD=58.7955;RBI=0.0399576;REFB=0;REVB=0.0393113;RO=0;SAF=52;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201077;OID=.;OPOS=9011586;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:13:52:0:0:14:52:0:0
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chr1	9011722	.	G	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0092069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.541;QD=51.9167;RBI=0.0117654;REFB=0;REVB=-0.00732519;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.9071e-06;OID=.;OPOS=9011722;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr1	9017204	.	A	G	213.53	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00608055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.509;QD=16.1153;RBI=0.0190829;REFB=-0.0182958;REVB=-0.0180882;RO=29;SAF=14;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311821;STB=0.51767;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0218062;OID=.;OPOS=9017204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:10:14:16:13:10:14:16:13
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chr1	9416151	.	G	A	176.95	PASS	AF=0.338235;AO=23;DP=68;FAO=23;FDP=68;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=9;FWDB=0.0254628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.878;QD=10.4088;RBI=0.0296544;REFB=0.01776;REVB=0.0151995;RO=43;SAF=11;SAR=12;SRF=34;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35116;STB=0.709281;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.013236;OID=.;OPOS=9416151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:43:45:23:23:0.338235:12:11:34:9:12:11:36:9
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chr1	9427869	.	G	A	1405.19	PASS	AF=0.989011;AO=89;DP=92;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0690761;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.298;QD=61.7664;RBI=0.0693525;REFB=-0.0675057;REVB=0.0061858;RO=1;SAF=30;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155337;STB=0.507935;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.000145161;OID=.;OPOS=9427869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:91:1:1:89:90:0.989011:59:30:1:0:59:31:1:0
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chr1	11132217	.	G	A	386.73	PASS	AF=0.527027;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0188714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.897;QD=20.9044;RBI=0.0190002;REFB=-0.000146894;REVB=0.00220924;RO=35;SAF=20;SAR=19;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231641;STB=0.512814;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=8.81294e-05;OID=.;OPOS=11132217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:35:35:39:39:0.527027:19:20:17:18:19:20:17:18
chr1	11137661	.	A	G	209.55	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=40;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00199968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.182;QD=19.9568;RBI=0.0110292;REFB=-0.0194749;REVB=-0.0108464;RO=19;SAF=6;SAR=13;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283814;STB=0.641123;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0174046;OID=.;OPOS=11137661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:42:19:21:19:21:0.5:13:6:12:7:13:8:14:7
chr1	11141187	.	C	G	347.47	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.035927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4451;QD=51.4774;RBI=0.0386567;REFB=-0.0262562;REVB=-0.0142684;RO=1;SAF=11;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403563;STB=0.521722;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00698932;OID=.;OPOS=11141187;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:15:11:1:0:15:11:1:0
chr1	11150682	.	C	T	217.45	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0529444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6302;QD=15.5325;RBI=0.138725;REFB=-0.0338511;REVB=-0.128224;RO=21;SAF=12;SAR=13;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152352;STB=0.515747;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.039377;OID=.;OPOS=11150682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:21:31:25:25:0.446429:13:12:14:7:13:12:14:17
chr1	11159823	.	T	C	794.05	PASS	AF=0.493976;AO=78;DP=162;FAO=82;FDP=166;FR=.;FRO=84;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=54;FSRR=30;FWDB=0.00558529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.703;QD=19.1338;RBI=0.00745373;REFB=-0.0239851;REVB=-0.00493584;RO=83;SAF=40;SAR=38;SRF=54;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129492;STB=0.56043;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0243219;OID=.;OPOS=11159823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:166:83:84:78:82:0.493976:38:40:54:29:39:43:54:30
chr1	11166713	.	T	C	316.77	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00297608;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.6601;QD=20.4365;RBI=0.0201141;REFB=0.0372256;REVB=-0.0198927;RO=29;SAF=21;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0142075;STB=0.507882;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=-0.0335422;OID=.;OPOS=11166713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:12:21:18:11:12:21:18:11
chr1	11167146	.	G	A	695.38	PASS	AF=0.548387;AO=67;DP=125;FAO=68;FDP=124;FR=.;FRO=56;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=-0.0112172;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5883;QD=22.4317;RBI=0.0120553;REFB=-0.0473181;REVB=0.00441657;RO=55;SAF=39;SAR=28;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03082;STB=0.509185;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0355918;OID=.;OPOS=11167146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:124:55:56:67:68:0.548387:28:39:30:25:29:39:31:25
chr1	11171226	.	C	T	34.38	PASS	AF=0.285714;AO=5;DP=20;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0119327;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.2384;QD=6.54906;RBI=0.0467211;REFB=-0.0221335;REVB=-0.0451715;RO=15;SAF=2;SAR=3;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294114;STB=0.726564;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0681211;OID=.;OPOS=11171226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:20:21:15:15:5:6:0.285714:3:2:10:5:4:2:10:5
chr1	11205058	.	C	T	141.32	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=2;FWDB=-0.0179797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9308;QD=13.4586;RBI=0.0546343;REFB=-0.0269808;REVB=-0.051591;RO=26;SAF=7;SAR=9;SRF=24;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505172;STB=0.783449;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0427187;OID=.;OPOS=11205058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:9:7:24:2:9:7:24:2
chr1	11255008	.	T	C	269.49	PASS	AF=0.508772;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0082829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.59;QD=18.9115;RBI=0.0141414;REFB=-0.0184943;REVB=-0.0114618;RO=26;SAF=21;SAR=8;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178571;STB=0.604862;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0275018;OID=.;OPOS=11255008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:26:28:29:29:0.508772:8:21:14:12:8:21:15:13
chr1	11288758	.	G	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00673625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.08;QD=61.3363;RBI=0.00687197;REFB=0;REVB=0.00135903;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.77939e-05;OID=.;OPOS=11288758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr1	11301714	.	A	G	1208.14	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.183;QD=61.1714;RBI=0.0305787;REFB=0;REVB=-0.0194085;RO=0;SAF=50;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000142989;OID=.;OPOS=11301714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:29:50:0:0:29:50:0:0
chr1	11579504	.	G	C	369.61	PASS	AF=0.362903;AO=48;DP=123;FAO=45;FDP=124;FR=.;FRO=79;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=-0.0753172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4893;QD=11.9229;RBI=0.0774007;REFB=-0.0194041;REVB=-0.0178381;RO=70;SAF=27;SAR=21;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209078;STB=0.507243;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0205821;OID=.;OPOS=11579504;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:124:70:79:48:45:0.362903:21:27:38:32:20:25:43:36
chr1	11589911	.	G	A	531.08	PASS	AF=0.509259;AO=55;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=43;FSRF=17;FSRR=36;FWDB=-0.0100071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.111;QD=19.6695;RBI=0.0233556;REFB=-0.0183634;REVB=0.0211031;RO=53;SAF=12;SAR=43;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122654;STB=0.568083;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0169213;OID=.;OPOS=11589911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:53:53:55:55:0.509259:43:12:17:36:43:12:17:36
chr1	11728894	.	G	A	1339.68	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3791;QD=62.3106;RBI=0.0343535;REFB=0;REVB=0.0310578;RO=0;SAF=36;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.43908e-05;OID=.;OPOS=11728894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:50:36:0:0:50:36:0:0
chr1	11740533	.	AG	A	35.67	PASS	AF=0.311111;AO=16;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=5;FWDB=-0.0216747;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.54462;QD=3.17025;RBI=0.21517;REFB=-0.0861925;REVB=0.214076;RO=25;SAF=14;SAR=2;SRF=22;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.571429;SSSB=-0.0120983;STB=0.557712;STBP=0.722;TYPE=del;VARB=0.156251;OID=.;OPOS=11740534;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.311111:16:45:14:45:31:11:3:26:5:35:25:14:2:22:3
chr1	11779748	.	G	C	251.18	PASS	AF=0.379747;AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.00178892;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.609;QD=12.718;RBI=0.0178853;REFB=-0.0213003;REVB=0.0177956;RO=42;SAF=13;SAR=17;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00498337;STB=0.54789;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0521695;OID=.;OPOS=11779748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:42:49:30:30:0.379747:17:13:18:24:17:13:25:24
chr1	11810674	.	G	A	1356.21	PASS	AF=0.947368;AO=90;DP=95;FAO=90;FDP=95;FR=.;FRO=5;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.000265423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.35;QD=57.1035;RBI=0.0684335;REFB=-0.113876;REVB=0.068433;RO=0;SAF=51;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24868e-08;STB=0.530114;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00218732;OID=.;OPOS=11810674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:95:95:0:5:90:90:0.947368:39:51:0:0:39:51:0:5
chr1	11810691	.	C	T	1419.03	PASS	AF=0.980198;AO=97;DP=103;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000351757;FXX=0.0288434;HRUN=4;LEN=1;MLLD=71.4347;QD=56.1993;RBI=0.00788696;REFB=-0.176279;REVB=-0.00787911;RO=1;SAF=48;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00977841;STB=0.509802;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.00349605;OID=.;OPOS=11810691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:103:101:1:2:97:99:0.980198:49:48:1:0:49:50:2:0
chr1	11810765	.	T	A	1951.99	PASS	AF=1;AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.877;QD=61.9678;RBI=0.047222;REFB=0;REVB=-0.0182542;RO=0;SAF=58;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33106e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.15488e-05;OID=.;OPOS=11810765;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:126:126:0:0:126:126:1:68:58:0:0:68:58:0:0
chr1	11810844	.	A	G	1108.58	PASS	AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0234305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.122;QD=57.5884;RBI=0.0270552;REFB=-0.0424897;REVB=0.0135275;RO=2;SAF=34;SAR=41;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027017;STB=0.514282;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.000418035;OID=.;OPOS=11810844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:77:2:2:75:75:0.974026:41:34:2:0:41:34:2:0
chr1	11826629	.	C	CT	205.68	PASS	AF=1;AO=2;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0760949;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=212.739;QD=45.7055;RBI=0.0912245;REFB=0;REVB=-0.0503139;RO=17;SAF=1;SAR=1;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216821;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000218323;OID=.;OPOS=11826630;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:19:18:18:0:5:13:0:0:4:17:1:1:5:12
chr1	11826630	.	C	T	177.51	PASS	AF=0.888889;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0287484;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=252.229;QD=39.4454;RBI=0.0308256;REFB=-0.110155;REVB=0.0111241;RO=2;SAF=4;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064866;STB=0.535668;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.000882521;OID=.;OPOS=11826630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:18:18:2:2:16:16:0.888889:12:4:1:1:12:4:1:1
chr1	11827304	.	A	G	62.25	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.612;QD=35.5742;RBI=0.0306215;REFB=0;REVB=0.00717118;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00062022;OID=.;OPOS=11827304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0
chr1	11828238	.	G	A	273.41	PASS	AF=1;AO=17;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.508;QD=52.0772;RBI=0.112147;REFB=0;REVB=0.102568;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000496833;OID=.;OPOS=11828238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:17:21:1:8:9:0:0:9:12:0:0
chr1	11828319	.	G	A	365.73	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0470658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.242;QD=52.2476;RBI=0.0495709;REFB=-0.140218;REVB=0.0155589;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.51514;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000896056;OID=.;OPOS=11828319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:16:11:0:0:16:11:0:1
chr1	11831615	.	C	T	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.807;QD=57.2376;RBI=0.0208706;REFB=0;REVB=0.0109575;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.63591e-05;OID=.;OPOS=11831615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr1	11832311	.	G	C	773.56	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0571436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1835;QD=53.3492;RBI=0.163322;REFB=-0.127346;REVB=0.152999;RO=1;SAF=35;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132829;STB=0.504586;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.00444832;OID=.;OPOS=11832311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:58:58:1:2:56:56:0.965517:21:35:1:0:21:35:1:1
chr1	11836628	.	T	C,G	805.47	PASS	AF=0.964912,0.0350877;AO=55,2;DP=57;FAO=55,2;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26,1;FSAR=29,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275634,0.0257854;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=232.287,181.743;QD=56.5243;RBI=0.0279188,0.0263202;REFB=0,0;REVB=0.00444025,0.00527882;RO=0;SAF=26,1;SAR=29,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.40922e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00150896,0.0600438;OID=.,.;OPOS=11836628,11836628;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:57:57:0:0:55,2:55,2:0.964912,0.0350877:29,1:26,1:0:0:29,1:26,1:0:0
chr1	11836682	.	C	T	594.29	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5926;QD=60.9523;RBI=0.0366763;REFB=0;REVB=0.00258173;RO=0;SAF=29;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193695;OID=.;OPOS=11836682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:10:29:0:0:10:29:0:0
chr1	11838848	.	G	T	1419.53	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0160663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.637;QD=61.7186;RBI=0.0367129;REFB=-0.12438;REVB=0.0330108;RO=0;SAF=50;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506023;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000631956;OID=.;OPOS=11838848;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:0:1:91:91:0.98913:41:50:0:0:41:50:0:1
chr1	11839966	.	G	A	1054.94	PASS	AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0721794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.66;QD=57.024;RBI=0.0810035;REFB=-0.141734;REVB=0.0367654;RO=2;SAF=26;SAR=46;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201187;STB=0.510635;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00149593;OID=.;OPOS=11839966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:74:74:2:2:72:72:0.972973:46:26:0:2:46:26:0:2
chr1	11839998	.	T	C	1008.45	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0048106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.471;QD=59.3207;RBI=0.0261484;REFB=0;REVB=0.0257021;RO=0;SAF=44;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.0969e-05;OID=.;OPOS=11839998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:24:44:0:0:24:44:0:0
chr1	11844330	.	C	T	1886.87	PASS	AF=0.984127;AO=124;DP=127;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0106626;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.24;QD=59.9005;RBI=0.0169868;REFB=0.00772226;REVB=0.0132235;RO=2;SAF=52;SAR=72;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00249574;STB=0.501314;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=-3.64929e-05;OID=.;OPOS=11844330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:127:126:2:2:124:124:0.984127:72:52:1:1:72:52:1:1
chr1	11849447	.	A	G	665.54	PASS	AF=1;AO=42;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00710055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.832;QD=60.5038;RBI=0.0204804;REFB=0;REVB=0.0192102;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037439;OID=.;OPOS=11849447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:42:44:1:22:20:0:0:22:22:0:0
chr1	11854457	.	G	A	817.65	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00104165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.62;QD=57.3786;RBI=0.0691256;REFB=0;REVB=-0.0691177;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000154469;OID=.;OPOS=11854457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0
chr1	11856378	.	G	A	393.23	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.00973802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.112;QD=19.6615;RBI=0.0278378;REFB=-0.00236981;REVB=-0.026079;RO=39;SAF=24;SAR=16;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124635;STB=0.575719;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00307163;OID=.;OPOS=11856378;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:39:40:40:40:0.5:16:24:18:21:16:24:18:22
chr1	11884554	.	GA	G,GG	593.83	PASS	AF=0.025,0.975;AO=5,35;DP=40;FAO=1,39;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=1,19;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000405308,0.00250698;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=227.853,241.418;QD=59.3825;RBI=0.0153336,0.00693447;REFB=0,0;REVB=0.0153282,0.00646544;RO=0;SAF=4,16;SAR=1,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.1382e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0219961,0.00312124;OID=.,.;OPOS=11884555,11884555;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.025,0.975:5,35:40:1,39:40:0:1,19:0,20:0:0:6:0:4,16:1,19:0:0
chr1	11968273	.	A	G	263.43	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00070536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.566;QD=19.5135;RBI=0.0375701;REFB=0.00294085;REVB=0.0375635;RO=26;SAF=12;SAR=16;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952675;STB=0.553153;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=-0.00189604;OID=.;OPOS=11968273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:16:12:14:12:16:12:14:12
chr1	12004663	.	G	A	415.39	PASS	AF=1;AO=28;DP=30;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218532;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=202.8;QD=50.3505;RBI=0.0290156;REFB=-0.0603927;REVB=0.0190877;RO=2;SAF=10;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0843372;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268244;OID=.;OPOS=12004663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:30:33:2:0:28:33:1:18:10:2:0:19:14:0:0
chr1	12009956	.	G	A	754.37	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4328;QD=56.9334;RBI=0.114656;REFB=0;REVB=0.104342;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170977;OID=.;OPOS=12009956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0
chr1	12026355	.	A	C	173.04	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0363685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.539;QD=18.7068;RBI=0.0363692;REFB=-0.00910139;REVB=-0.000234456;RO=19;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741419;STB=0.542122;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0105044;OID=.;OPOS=12026355;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:8:10:9:10:8:10:9:10
chr1	12065841	.	C	T	388.32	PASS	AF=0.534247;AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0104751;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.092;QD=21.2776;RBI=0.0114488;REFB=-0.0332573;REVB=0.00462035;RO=34;SAF=25;SAR=14;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12383;STB=0.568563;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0312312;OID=.;OPOS=12065841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:34:34:39:39:0.534247:14:25:17:17:14:25:17:17
chr1	12082334	.	A	T	241.36	PASS	AF=0.371795;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=0.058655;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.2816;QD=12.3772;RBI=0.0586566;REFB=-0.00449275;REVB=0.000429434;RO=49;SAF=13;SAR=16;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221334;STB=0.626548;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00879897;OID=.;OPOS=12082334;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:49:49:29:29:0.371795:16:13:32:17:16:13:32:17
chr1	12082461	.	C	T	164.18	PASS	AF=0.355932;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=59;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0141445;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.885;QD=11.1305;RBI=0.0145583;REFB=-0.0245661;REVB=0.00344666;RO=38;SAF=15;SAR=6;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22415;STB=0.631447;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0443598;OID=.;OPOS=12082461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:38:38:21:21:0.355932:6:15:20:18:6:15:20:18
chr1	12082926	.	A	G	270.25	PASS	AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0186358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.69;QD=19.3035;RBI=0.036364;REFB=-0.0305961;REVB=-0.0312257;RO=27;SAF=17;SAR=12;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123256;STB=0.568726;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0272772;OID=.;OPOS=12082926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:12:17:12:15:12:17:12:15
chr1	12175729	.	C	T	638.71	PASS	AF=0.907407;AO=49;DP=54;FAO=49;FDP=54;FR=.;FRO=5;FSAF=38;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0262452;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.761;QD=47.3118;RBI=0.0263244;REFB=-0.177782;REVB=-0.00203991;RO=1;SAF=38;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122265;STB=0.547305;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00145026;OID=.;OPOS=12175729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:54:54:1:5:49:49:0.907407:11:38:1:0:11:38:2:3
chr1	12198297	.	T	C	1109.82	PASS	AF=0.430108;AO=120;DP=280;FAO=120;FDP=279;FR=.;FRO=159;FSAF=66;FSAR=54;FSRF=78;FSRR=81;FWDB=-0.0219688;FXX=0.0035713;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.994;QD=15.9114;RBI=0.044969;REFB=-0.0460428;REVB=-0.0392375;RO=156;SAF=66;SAR=54;SRF=77;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575723;STB=0.533975;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0633052;OID=.;OPOS=12198297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:280:279:156:159:120:120:0.430108:54:66:77:79:54:66:78:81
chr1	12269242	.	C	T	247.34	PASS	AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.0110973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.611;QD=13.741;RBI=0.0152503;REFB=-0.00256579;REVB=-0.0104604;RO=42;SAF=9;SAR=20;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823242;STB=0.541682;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.00320797;OID=.;OPOS=12269242;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:42:43:29:29:0.402778:20:9:16:26:20:9:16:27
chr1	12401868	.	A	C	769.62	PASS	AF=1;AO=46;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.031;QD=55.9721;RBI=0.0686875;REFB=0;REVB=0.0320379;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567716;OID=.;OPOS=12401868;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:46:55:1:19:27:0:0:20:35:0:0
chr1	12628188	.	T	C	924.71	PASS	AF=1;AO=54;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.235;QD=58.7114;RBI=0.209052;REFB=0;REVB=0.208163;RO=0;SAF=36;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000315499;OID=.;OPOS=12628188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:54:63:1:18:36:0:0:27:36:0:0
chr1	12628459	.	G	A	727.76	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0809522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2716;QD=57.0792;RBI=0.090614;REFB=0;REVB=0.040714;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000737373;OID=.;OPOS=12628459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:31:20:0:0:31:20:0:0
chr1	12638964	.	T	C	508.04	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3032;QD=58.0613;RBI=0.0316992;REFB=0;REVB=0.0206678;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296258;OID=.;OPOS=12638964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:15:19:0:0:15:20:0:0
chr1	12639168	.	A	G	410.94	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.468;QD=56.6812;RBI=0.0328628;REFB=0;REVB=0.0197664;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.9674e-05;OID=.;OPOS=12639168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr1	12639309	.	G	C	1328.72	PASS	AF=0.906542;AO=97;DP=107;FAO=97;FDP=107;FR=.;FRO=10;FSAF=60;FSAR=37;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0326829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.108;QD=49.6717;RBI=0.0374274;REFB=-0.100582;REVB=0.0182385;RO=9;SAF=60;SAR=37;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00819923;STB=0.508094;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00196326;OID=.;OPOS=12639309;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:107:107:9:10:97:97:0.906542:37:60:6:3:37:60:7:3
chr1	12776344	.	A	T	495.21	PASS	AF=0.552941;AO=47;DP=85;FAO=47;FDP=85;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00769671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.264;QD=23.3041;RBI=0.0194717;REFB=-0.0367553;REVB=0.017886;RO=37;SAF=24;SAR=23;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457412;STB=0.518789;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.024425;OID=.;OPOS=12776344;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:37:38:47:47:0.552941:23:24:21:16:23:24:21:17
chr1	12779560	.	T	C	444.96	PASS	AF=0.454545;AO=45;DP=99;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=-0.00839839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.243;QD=17.9783;RBI=0.0164238;REFB=0.00214584;REVB=0.0141141;RO=53;SAF=21;SAR=24;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503858;STB=0.522378;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=-0.0027905;OID=.;OPOS=12779560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:53:54:45:45:0.454545:24:21:22:31:24:21:23:31
chr1	12779618	.	T	C	510.19	PASS	AF=0.486486;AO=53;DP=110;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.0111549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.04;QD=18.3853;RBI=0.0137555;REFB=-0.0246715;REVB=0.00804875;RO=56;SAF=24;SAR=29;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00598966;STB=0.5126;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0216387;OID=.;OPOS=12779618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:56:57:53:54:0.486486:29:24:25:31:29:25:25:32
chr1	12785494	.	G	T	182.38	PASS	AF=0.459459;AO=12;DP=36;FAO=17;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00476097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.049;QD=19.7164;RBI=0.0623168;REFB=-0.0116511;REVB=0.0621347;RO=15;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692817;STB=0.58636;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0125008;OID=.;OPOS=12785494;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:15:18:12:17:0.459459:4:8:9:6:5:12:10:8
chr1	12799736	.	C	T	365.15	PASS	AF=0.428571;AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0104001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.425;QD=16.0503;RBI=0.0406752;REFB=-0.0309717;REVB=-0.0393232;RO=52;SAF=22;SAR=17;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848467;STB=0.547797;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0290672;OID=.;OPOS=12799736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:52:52:39:39:0.428571:17:22:25:27:17:22:25:27
chr1	12855835	.	C	G	207.03	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0700152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1639;QD=48.7127;RBI=0.10609;REFB=0;REVB=-0.0797053;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000326869;OID=.;OPOS=12855835;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0
chr1	12855845	.	G	C	223.17	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000672506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.46;QD=49.5932;RBI=0.000761561;REFB=0;REVB=0.000357365;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.44124e-05;OID=.;OPOS=12855845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0
chr1	12856010	.	C	G	77.42	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.0388008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.6297;QD=13.4636;RBI=0.0598153;REFB=-0.00927087;REVB=-0.0455233;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825183;STB=0.548295;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00673393;OID=.;OPOS=12856010;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:3:7:10:3:3:7:10:3
chr1	12856111	.	C	T	64.46	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0268597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.481;QD=9.91657;RBI=0.0370565;REFB=-0.00570889;REVB=-0.0255293;RO=17;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283174;STB=0.517203;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0102984;OID=.;OPOS=12856111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:5:4:8:9:5:4:8:9
chr1	12887549	.	T	C	1102.41	PASS	AF=0.986667;AO=75;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00320253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8296;QD=58.7952;RBI=0.00575184;REFB=0.155273;REVB=-0.00477781;RO=0;SAF=57;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=-0.00322404;OID=.;OPOS=12887549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:0:1:75:74:0.986667:18:57:0:0:18:56:1:0
chr1	12907777	.	T	C	87.12	PASS	AF=0.131944;AO=19;DP=144;FAO=19;FDP=144;FR=.;FRO=125;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=70;FSRR=55;FWDB=-0.00384708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6143;QD=2.41993;RBI=0.0260622;REFB=0.000523477;REVB=0.0257767;RO=123;SAF=13;SAR=6;SRF=69;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162179;STB=0.614128;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.00290986;OID=.;OPOS=12907777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:144:144:123:125:19:19:0.131944:6:13:69:54:6:13:70:55
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chr1	13052789	.	G	A	409.75	PASS	AF=0.294118;AO=54;DP=186;FAO=55;FDP=187;FR=.;FRO=132;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=89;FSRR=43;FWDB=-0.0494484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8875;QD=8.76479;RBI=0.0527057;REFB=-0.0111617;REVB=-0.0182414;RO=129;SAF=31;SAR=23;SRF=89;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147589;STB=0.580968;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0310681;OID=.;OPOS=13052789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:187:129:132:54:55:0.294118:23:31:89:40:24:31:89:43
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chr1	13052907	.	T	C	1991.85	PASS	AF=0.616197;AO=174;DP=284;FAO=175;FDP=284;FR=.;FRO=109;FSAF=95;FSAR=80;FSRF=59;FSRR=50;FWDB=0.02227;FXX=0.00350865;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.454;QD=28.0542;RBI=0.0224213;REFB=-0.0217381;REVB=0.00260057;RO=106;SAF=94;SAR=80;SRF=57;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00176304;STB=0.500608;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0135904;OID=.;OPOS=13052907;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:284:284:106:109:174:175:0.616197:80:94:57:49:80:95:59:50
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chr1	13183243	.	T	C	70.47	PASS	AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0594067;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.542;QD=7.04749;RBI=0.0790984;REFB=-0.0127595;REVB=0.0522246;RO=30;SAF=3;SAR=7;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31724;STB=0.6996;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.084579;OID=.;OPOS=13183243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:40:40:30:30:10:10:0.25:7:3:17:13:7:3:17:13
chr1	13183248	.	TC	AA	82.33	PASS	AF=0.297297;AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0109488;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=190.488;QD=8.90039;RBI=0.0140949;REFB=-0.00705446;REVB=-0.00887634;RO=26;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116253;STB=0.571296;STBP=0.545;TYPE=mnp;VARB=0.0163104;OID=.;OPOS=13183248;OREF=TC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:37:37:26:26:11:11:0.297297:7:4:12:14:7:4:12:14
chr1	13183439	.	T	C	1890.83	PASS	AF=0.75;AO=153;DP=206;FAO=153;FDP=204;FR=.;FRO=51;FSAF=51;FSAR=102;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0026262;FXX=0.00970827;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.996;QD=37.0752;RBI=0.00430542;REFB=-0.00827349;REVB=0.0034117;RO=51;SAF=51;SAR=102;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803019;STB=0.542851;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00235321;OID=.;OPOS=13183439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:206:204:51:51:153:153:0.75:102:51:25:26:102:51:25:26
chr1	13183511	.	T	C	676.19	PASS	AF=0.387755;AO=76;DP=196;FAO=76;FDP=196;FR=.;FRO=120;FSAF=22;FSAR=54;FSRF=59;FSRR=61;FWDB=0.0100633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.115;QD=13.7998;RBI=0.021793;REFB=-0.0127865;REVB=-0.0193304;RO=120;SAF=22;SAR=54;SRF=59;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235545;STB=0.633509;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0194409;OID=.;OPOS=13183511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:196:196:120:120:76:76:0.387755:54:22:59:61:54:22:59:61
chr1	13183528	.	A	C	454.19	PASS	AF=0.325843;AO=58;DP=174;FAO=58;FDP=178;FR=.;FRO=120;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=50;FSRR=70;FWDB=-0.0357908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.659;QD=10.2065;RBI=0.0387391;REFB=-0.0190623;REVB=-0.0148234;RO=116;SAF=19;SAR=39;SRF=48;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108106;STB=0.565076;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0501898;OID=.;OPOS=13183528;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:178:116:120:58:58:0.325843:39:19:48:68:39:19:50:70
chr1	13183532	.	CC	TT	444.92	PASS	AF=0.325714;AO=57;DP=175;FAO=57;FDP=175;FR=.;FRO=118;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=50;FSRR=68;FWDB=-0.0359388;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=2;MLLD=211.205;QD=10.1695;RBI=0.0359909;REFB=-0.00536941;REVB=-0.00193684;RO=117;SAF=18;SAR=39;SRF=49;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130655;STB=0.579263;STBP=0.153;TYPE=mnp;VARB=0.0107985;OID=.;OPOS=13183532;OREF=CC;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:175:117:118:57:57:0.325714:39:18:49:68:39:18:50:68
chr1	13183567	.	C	T	199.32	PASS	AF=0.227941;AO=31;DP=136;FAO=31;FDP=136;FR=.;FRO=105;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=46;FSRR=59;FWDB=-0.0447767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.196;QD=5.86229;RBI=0.0466643;REFB=-0.00653369;REVB=-0.013138;RO=104;SAF=6;SAR=25;SRF=46;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357636;STB=0.720464;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0166333;OID=.;OPOS=13183567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:104:105:31:31:0.227941:25:6:46:58:25:6:46:59
chr1	13183573	.	G	T	96.45	PASS	AF=0.158333;AO=19;DP=120;FAO=19;FDP=120;FR=.;FRO=101;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=42;FSRR=59;FWDB=0.00765594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.086;QD=3.21489;RBI=0.0105604;REFB=-0.00272043;REVB=-0.00727387;RO=101;SAF=5;SAR=14;SRF=42;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212094;STB=0.643046;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0134142;OID=.;OPOS=13183573;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:120:120:101:101:19:19:0.158333:14:5:42:59:14:5:42:59
chr1	13219094	.	G	T	94.24	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0353492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9317;QD=10.4715;RBI=0.0364593;REFB=0.0297034;REVB=-0.00892831;RO=24;SAF=3;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339974;STB=0.705523;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.0550618;OID=.;OPOS=13219094;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:9:3:13:11:9:3:13:11
chr1	13219149	.	G	A	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00289934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.695;QD=12.3963;RBI=0.0819204;REFB=-0.0232042;REVB=-0.081869;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179553;STB=0.608297;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0183304;OID=.;OPOS=13219149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:4:1:2:3:4:1
chr1	13448283	.	A	G	152.4	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000680314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.004;QD=40.6412;RBI=0.0277231;REFB=-0.10574;REVB=0.0277147;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.555473;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00331215;OID=.;OPOS=13448283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:0:1:14:14:0.933333:4:10:0:0:4:10:0:1
chr1	13448351	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9357;QD=45.8064;RBI=0.133825;REFB=0;REVB=0.088745;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00810964;OID=.;OPOS=13448351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
chr1	13695787	.	C	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=300.152;QD=52.6132;RBI=0.0339924;REFB=0;REVB=0.00499375;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133775;OID=.;OPOS=13695787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr1	13695816	.	G	A	426.31	PASS	AF=1;AO=20;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.727;QD=56.841;RBI=0.057806;REFB=0;REVB=0.0548546;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00543112;OID=.;OPOS=13695816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:20:30:1:7:13:0:0:16:14:0:0
chr1	13695974	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.339;QD=33.4276;RBI=0.0540125;REFB=0;REVB=0.00350456;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00298474;OID=.;OPOS=13695974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr1	13802325	.	T	C	433.59	PASS	AF=0.505882;AO=43;DP=86;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.035983;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.889;QD=20.4042;RBI=0.0387129;REFB=-0.0369421;REVB=-0.0142799;RO=42;SAF=17;SAR=26;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158024;STB=0.587611;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0331308;OID=.;OPOS=13802325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:42:42:43:43:0.505882:26:17:24:18:26:17:24:18
chr1	13910417	.	C	T	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262797;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=172.385;QD=60.7162;RBI=0.0263417;REFB=0;REVB=0.00180602;RO=0;SAF=21;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.35427e-05;OID=.;OPOS=13910417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:55:21:0:0:55:21:0:0
chr1	13910681	.	G	C	138.09	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0990648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2038;QD=19.7276;RBI=0.109382;REFB=0.00919785;REVB=0.0463742;RO=13;SAF=10;SAR=5;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238067;STB=0.513496;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=-0.0017703;OID=.;OPOS=13910681;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:5:10:9:4:5:10:9:4
chr1	13940864	.	C	G	1529.46	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233649;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.402;QD=58.8253;RBI=0.0252216;REFB=0;REVB=0.00949793;RO=0;SAF=45;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232783;OID=.;OPOS=13940864;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:101:104:0:0:101:104:1:56:45:0:0:57:47:0:0
chr1	13944235	.	AC	ACTT,TT	490.48	PASS	AF=0.885714,0.114286;AO=28,4;DP=35;FAO=31,4;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20,4;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00944274,-0.0320059;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=2,2;MLLD=36.2979,222.912;QD=56.0548;RBI=0.0153043,0.0345171;REFB=0,0;REVB=-0.012044,0.0129249;RO=1;SAF=18,4;SAR=10,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0251595,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.00112338,0.0225872;OID=.,.;OPOS=13944237,13944235;OREF=-,AC;OALT=TT,TT;OMAPALT=ACTT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:35:35:1:0:28,4:31,4:0.885714,0.114286:10,0:18,4:1:0:11,0:20,4:0:0
chr1	14105139	.	T	A	268.91	PASS	AF=0.461538;AO=28;DP=63;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=31;FWDB=-0.000295321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.034;QD=16.5484;RBI=0.0185706;REFB=-0.0665268;REVB=0.0185682;RO=35;SAF=6;SAR=22;SRF=4;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163416;STB=0.5789;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0974177;OID=.;OPOS=14105139;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:65:35:35:28:30:0.461538:22:6:4:31:24:6:4:31
chr1	14105165	.	AG	A	47.42	PASS	AF=0.355556;AO=19;DP=46;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=25;FWDB=0.0189874;FXX=0.0217344;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.1529;QD=4.21552;RBI=0.0677284;REFB=-0.107537;REVB=-0.0650125;RO=20;SAF=2;SAR=17;SRF=4;SRR=16;SSEN=0.344828;SSEP=0;SSSB=-0.185549;STB=0.556033;STBP=0.718;TYPE=del;VARB=0.121553;OID=.;OPOS=14105166;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.355556:19:46:16:45:29:3:13:4:25:47:20:2:17:4:16
chr1	14105298	.	G	A	81.22	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0163099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2693;QD=18.0479;RBI=0.0730406;REFB=0.0121254;REVB=-0.0711964;RO=8;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201161;STB=0.511605;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=-0.00490447;OID=.;OPOS=14105298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:4:6:5:3:4:6:5:3
chr1	14106394	.	A	ACTC,C	187.34	PASS	AF=0.363636,0.0545455;AO=19,3;DP=55;FAO=20,3;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=13,3;FSAR=7,0;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0178102,-0.00264892;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=180.794,52.3103;QD=13.6245;RBI=0.0217626,0.0620072;REFB=-0.0142993,0.00089343;REVB=0.0125062,0.0619506;RO=32;SAF=12,3;SAR=7,0;SRF=11;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.303978,0.612085;STB=0.684031,0.997343;STBP=0.045,0.025;TYPE=ins,snp;VARB=0.0299956,-0.0699985;OID=.,.;OPOS=14106395,14106394;OREF=-,A;OALT=CTC,C;OMAPALT=ACTC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:19,3:20,3:0.363636,0.0545455:7,0:12,3:11:21:7,0:13,3:11:21
chr1	14109114	.	A	G	669.76	PASS	AF=0.560345;AO=65;DP=116;FAO=65;FDP=116;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0296668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0127;QD=23.095;RBI=0.0297162;REFB=-0.0100446;REVB=-0.00171163;RO=51;SAF=28;SAR=37;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641319;STB=0.535072;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.00743202;OID=.;OPOS=14109114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:51:51:65:65:0.560345:37:28:26:25:37:28:26:25
chr1	14150709	.	C	T	1738.09	PASS	AF=0.983051;AO=116;DP=118;FAO=116;FDP=118;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0086832;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.388;QD=58.9182;RBI=0.0400411;REFB=-0.0801714;REVB=0.0390883;RO=2;SAF=61;SAR=55;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169537;STB=0.508927;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.000142933;OID=.;OPOS=14150709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:118:118:2:2:116:116:0.983051:55:61:0:2:55:61:0:2
chr1	14150714	.	G	A	1639.49	PASS	AF=0.965517;AO=112;DP=117;FAO=112;FDP=116;FR=.;FRO=4;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0587639;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.9862;QD=56.5343;RBI=0.0819173;REFB=-0.115389;REVB=0.0570723;RO=1;SAF=60;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904314;STB=0.518515;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00227137;OID=.;OPOS=14150714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:117:116:1:4:112:112:0.965517:52:60:0:1:52:60:0:4
chr1	14150740	.	G	T	1646.56	PASS	AF=1;AO=110;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.198;QD=59.3353;RBI=0.0191444;REFB=-0.0955304;REVB=0.0126963;RO=0;SAF=62;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52354e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177628;OID=.;OPOS=14150740;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:111:111:0:0:110:111:1:48:62:0:0:49:62:0:0
chr1	14150992	.	T	C	1688.05	PASS	AF=1;AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00930398;FXX=0.0263135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.356;QD=60.8306;RBI=0.0373026;REFB=0;REVB=0.0361237;RO=0;SAF=59;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.04548e-05;OID=.;OPOS=14150992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:111:0:0:111:111:1:52:59:0:0:52:59:0:0
chr1	14450771	.	G	A	765.06	PASS	AF=0.949153;AO=55;DP=58;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00972939;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=154.715;QD=51.8684;RBI=0.00974769;REFB=-0.10076;REVB=-0.000597011;RO=3;SAF=30;SAR=25;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448351;STB=0.523801;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00128614;OID=.;OPOS=14450771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:58:59:3:3:55:56:0.949153:25:30:3:0:26:30:3:0
chr1	14507057	.	A	G	186.19	PASS	AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.00100743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.349;QD=12.4125;RBI=0.0172021;REFB=-0.00210449;REVB=0.0171726;RO=36;SAF=10;SAR=13;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103988;STB=0.501474;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.00285603;OID=.;OPOS=14507057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:37:23:23:0.383333:13:10:16:20:13:10:16:21
chr1	15382640	.	C	T	724.03	PASS	AF=0.463855;AO=72;DP=165;FAO=77;FDP=166;FR=.;FRO=89;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=42;FSRR=47;FWDB=0.0405697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.042;QD=17.4466;RBI=0.0405789;REFB=-0.0111387;REVB=0.000867121;RO=89;SAF=42;SAR=30;SRF=42;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111429;STB=0.575429;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0144242;OID=.;OPOS=15382640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:166:89:89:72:77:0.463855:30:42:42:47:30:47:42:47
chr1	15428270	.	G	A	221.26	PASS	AF=0.468085;AO=20;DP=45;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0786442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.678;QD=18.8307;RBI=0.0964669;REFB=-0.0161128;REVB=0.0558655;RO=25;SAF=8;SAR=12;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795058;STB=0.513606;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0219736;OID=.;OPOS=15428270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:25:25:20:22:0.468085:12:8:12:13:12:10:12:13
chr1	15438990	.	G	A	1376.79	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0085143;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.0299;QD=62.5812;RBI=0.049726;REFB=0;REVB=0.0489917;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149633;OID=.;OPOS=15438990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:45:43:0:0:45:43:0:0
chr1	15490865	.	T	A	1392.86	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.071;QD=62.6003;RBI=0.0604179;REFB=0;REVB=0.0429636;RO=0;SAF=50;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.49151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.21261e-05;OID=.;OPOS=15490865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:38:50:0:0:38:51:0:0
chr1	15497727	.	T	C	550.77	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00288829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.099;QD=59.5432;RBI=0.0309599;REFB=0;REVB=0.0308249;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154286;OID=.;OPOS=15497727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:37:0:0:34:37:1:16:18:0:0:18:19:0:0
chr1	15541607	.	T	C	198.36	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0388941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.973;QD=13.2241;RBI=0.0428605;REFB=-0.0188736;REVB=-0.0180076;RO=35;SAF=13;SAR=11;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874669;STB=0.541632;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0306631;OID=.;OPOS=15541607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:35:36:24:24:0.4:11:13:16:19:11:13:17:19
chr1	15599021	.	C	T	178.18	PASS	AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0150645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1676;QD=14.8479;RBI=0.0327109;REFB=0.00218593;REVB=-0.0290356;RO=29;SAF=15;SAR=4;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474483;STB=0.774984;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00706346;OID=.;OPOS=15599021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:4:15:10:19:4:15:10:19
chr1	15708540	.	A	G	194.34	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0204625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.131;QD=24.2929;RBI=0.02062;REFB=-0.0217941;REVB=0.00254384;RO=13;SAF=5;SAR=14;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407504;STB=0.522797;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0141164;OID=.;OPOS=15708540;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:14:5:4:9:14:5:4:9
chr1	15710411	.	G	C	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0610541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9634;QD=13.5759;RBI=0.0610546;REFB=-0.0185276;REVB=-0.00024344;RO=19;SAF=5;SAR=8;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247318;STB=0.644331;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0288563;OID=.;OPOS=15710411;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:8:5:12:7:8:5:12:7
chr1	15714831	.	C	T	115.21	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.043603;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.2127;QD=30.7226;RBI=0.0436414;REFB=-0.0903681;REVB=0.00182963;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.615195;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0285094;OID=.;OPOS=15714831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:15:15:0:3:12:12:0.8:5:7:0:0:5:7:0:3
chr1	15714842	.	G	C	138.69	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=31;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00873471;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2579;QD=18.4917;RBI=0.0240987;REFB=-0.095706;REVB=0.0224601;RO=15;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103377;STB=0.5342;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0212967;OID=.;OPOS=15714842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:15:15:14:15:0.5:5:9:8:7:6:9:8:7
chr1	15723843	.	G	A	387.76	PASS	AF=0.42268;AO=41;DP=97;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=-0.0293292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.323;QD=15.9903;RBI=0.0448669;REFB=-0.0265283;REVB=-0.0339535;RO=56;SAF=18;SAR=23;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18877;STB=0.606115;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0254603;OID=.;OPOS=15723843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:56:56:41:41:0.42268:23:18:35:21:23:18:35:21
chr1	15754484	.	T	C	1491.7	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203218;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.596;QD=63.4766;RBI=0.0359074;REFB=0;REVB=0.0296034;RO=0;SAF=36;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.99039e-06;OID=.;OPOS=15754484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:58:36:0:0:58:36:0:0
chr1	15755910	.	GC	CG,GCG	75.14	PASS	AF=0.0333333,0.211111;AO=6,16;DP=92;FAO=3,19;FDP=90;FR=.;FRO=68;FSAF=3,18;FSAR=0,1;FSRF=52;FSRR=16;FWDB=-0.0498568,-0.0545913;FXX=0.0217368;HRUN=5,0;LEN=2,1;MLLD=65.2959,56.3119;QD=3.33961;RBI=0.0498901,0.0561041;REFB=-0.0059464,-0.00759984;REVB=0.00182221,-0.0129408;RO=63;SAF=6,16;SAR=0,0;SRF=47;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.497708,0.695174;STB=0.99488,0.813373;STBP=0.234,0.038;TYPE=mnp,ins;VARB=-0.0685662,0.0673167;OID=.,.;OPOS=15755910,15755912;OREF=GC,-;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,GCG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:58:92:90:63:68:6,16:3,19:0.0333333,0.211111:0,0:6,16:47:16:0,1:3,18:52:16
chr1	15788269	.	A	C	1080.76	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7134;QD=60.0421;RBI=0.0289687;REFB=0;REVB=0.0203073;RO=0;SAF=48;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63232e-06;OID=.;OPOS=15788269;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:23:48:0:0:23:49:0:0
chr1	15808198	.	C	T	393.44	PASS	AF=0.431373;AO=44;DP=102;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=0.000438925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.253;QD=15.4291;RBI=0.0685366;REFB=-0.0290853;REVB=-0.0685352;RO=58;SAF=29;SAR=15;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611592;STB=0.534417;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0348844;OID=.;OPOS=15808198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:58:58:44:44:0.431373:15:29:35:23:15:29:35:23
chr1	15808767	.	G	A	118.32	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=-0.0054474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.622;QD=12.7915;RBI=0.0245513;REFB=0.000915621;REVB=0.0239394;RO=23;SAF=6;SAR=8;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410194;STB=0.735013;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.00156215;OID=.;OPOS=15808767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:8:6:19:4:8:6:19:4
chr1	15808872	.	G	A	441.37	PASS	AF=0.6;AO=42;DP=70;FAO=42;FDP=70;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0427917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.897;QD=25.2211;RBI=0.0435791;REFB=-0.00673863;REVB=0.0082468;RO=28;SAF=20;SAR=22;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121397;STB=0.566364;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.00342008;OID=.;OPOS=15808872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:28:28:42:42:0.6:22:20:18:10:22:20:18:10
chr1	15809876	.	G	A	149.52	PASS	AF=0.459459;AO=16;DP=36;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0594464;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.722;QD=16.1637;RBI=0.059584;REFB=-0.0265836;REVB=-0.00404692;RO=20;SAF=1;SAR=15;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.587675;STB=0.855059;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0153384;OID=.;OPOS=15809876;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:20:20:16:17:0.459459:15:1:9:11:16:1:9:11
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chr1	15812432	.	A	G	1195.32	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00916222;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.725;QD=59.7658;RBI=0.0108952;REFB=-0.0697482;REVB=-0.00589566;RO=0;SAF=51;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50877;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.000322168;OID=.;OPOS=15812432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:80:0:1:79:79:0.9875:28:51:0:0:28:51:0:1
chr1	15832543	.	T	C	236.34	PASS	AF=0.469388;AO=22;DP=48;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0699308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3347;QD=19.293;RBI=0.0714865;REFB=-0.00407817;REVB=-0.0148324;RO=26;SAF=6;SAR=16;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338527;STB=0.697582;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00210496;OID=.;OPOS=15832543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:26:26:22:23:0.469388:16:6:16:10:17:6:16:10
chr1	15844615	.	A	G	490.27	PASS	AF=0.458333;AO=52;DP=111;FAO=55;FDP=120;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=-0.00731693;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.544;QD=16.3423;RBI=0.0473587;REFB=-0.0432475;REVB=0.0467901;RO=57;SAF=21;SAR=31;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505318;STB=0.547153;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0413639;OID=.;OPOS=15844615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:120:57:65:52:55:0.458333:31:21:26:31:31:24:34:31
chr1	15850613	.	G	A	185.41	PASS	AF=0.352941;AO=23;DP=67;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=10;FWDB=-0.0220495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.0011;QD=10.9064;RBI=0.0314854;REFB=-0.0278274;REVB=-0.0224756;RO=44;SAF=15;SAR=8;SRF=34;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159818;STB=0.581333;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.039824;OID=.;OPOS=15850613;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:44:44:23:24:0.352941:8:15:34:10:8:16:34:10
chr1	15909850	.	C	G	112.98	PASS	AF=0.291667;AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.00814941;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.2124;QD=9.41518;RBI=0.0242713;REFB=0.000388265;REVB=-0.0228622;RO=33;SAF=11;SAR=3;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215027;STB=0.624805;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-0.00157946;OID=.;OPOS=15909850;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:33:34:14:14:0.291667:3:11:21:12:3:11:22:12
chr1	16069071	.	C	T	938.33	PASS	AF=0.475;AO=93;DP=199;FAO=95;FDP=200;FR=.;FRO=105;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=31;FSRR=74;FWDB=0.0416963;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5682;QD=18.7665;RBI=0.0532715;REFB=-0.0417048;REVB=-0.0331553;RO=106;SAF=52;SAR=41;SRF=32;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244276;STB=0.640508;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0454599;OID=.;OPOS=16069071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:200:106:105:93:95:0.475:41:52:32:74:41:54:31:74
chr1	16070817	.	GC	G	113.93	PASS	AF=0.791667;AO=9;DP=25;FAO=19;FDP=24;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.265461;FXX=0.039984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.6465;QD=18.989;RBI=0.299885;REFB=0.10044;REVB=-0.139505;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.618925;STBP=0.046;TYPE=del;VARB=0.00383178;OID=.;OPOS=16070818;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.791667:9:25:19:24:5:11:8:0:5:14:9:5:4:5:4
chr1	16096932	.	G	GT	378.02	PASS	AF=1;AO=6;DP=38;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140641;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.0736;QD=42.0017;RBI=0.118317;REFB=-0.0354545;REVB=0.117478;RO=31;SAF=6;SAR=0;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.633526;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00930985;OID=.;OPOS=16096933;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:38:36:36:0:26:10:0:0:5:31:6:0:20:11
chr1	16096934	.	C	T	374.47	PASS	AF=0.810811;AO=29;DP=36;FAO=30;FDP=37;FR=.;FRO=7;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.045851;FXX=0.0263089;HRUN=6;LEN=1;MLLD=38.4439;QD=40.4831;RBI=0.0930117;REFB=-0.113997;REVB=0.0809251;RO=7;SAF=19;SAR=10;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14433;STB=0.574422;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0293688;OID=.;OPOS=16096934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:36:37:7:7:29:30:0.810811:10:19:7:0:10:20:7:0
chr1	16259813	.	A	G	127.19	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0461345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0665;QD=11.5624;RBI=0.0461475;REFB=-0.00686918;REVB=-0.0010936;RO=29;SAF=10;SAR=5;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173186;STB=0.603033;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0149671;OID=.;OPOS=16259813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:5:10:15:14:5:10:15:14
chr1	16272250	.	A	G	244.25	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0126708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9282;QD=23.2623;RBI=0.0154116;REFB=-0.0401223;REVB=-0.00877324;RO=18;SAF=14;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131239;STB=0.562313;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.026709;OID=.;OPOS=16272250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:18:19:23:23:0.547619:9:14:8:10:9:14:9:10
chr1	16330816	.	C	T	200.59	PASS	AF=0.313253;AO=26;DP=80;FAO=26;FDP=83;FR=.;FRO=57;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.00819698;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.368;QD=9.66701;RBI=0.0208705;REFB=-0.00596354;REVB=-0.0191934;RO=54;SAF=11;SAR=15;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173014;STB=0.594398;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.012859;OID=.;OPOS=16330816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:83:54:57:26:26:0.313253:15:11:31:23:15:11:32:25
chr1	16332571	.	C	T	240.23	PASS	AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0802467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6409;QD=21.3535;RBI=0.0844339;REFB=-0.0119208;REVB=-0.0262593;RO=21;SAF=17;SAR=6;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287671;STB=0.653704;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0154174;OID=.;OPOS=16332571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:22:23:23:0.511111:6:17:9:12:6:17:10:12
chr1	16341649	.	C	T	1068.42	PASS	AF=0.938272;AO=73;DP=80;FAO=76;FDP=81;FR=.;FRO=5;FSAF=59;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.028865;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=308.392;QD=52.7616;RBI=0.0741846;REFB=-0.188371;REVB=0.0683387;RO=5;SAF=58;SAR=15;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10274;STB=0.548459;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.000996875;OID=.;OPOS=16341649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:80:81:5:5:73:76:0.938272:15:58:1:4:17:59:1:4
chr1	16341733	.	T	C	1286.0	PASS	AF=0.988235;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0443094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.404;QD=60.5178;RBI=0.0493336;REFB=0.0614052;REVB=0.0216906;RO=0;SAF=49;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.000102573;OID=.;OPOS=16341733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:85:0:1:84:84:0.988235:35:49:0:0:35:49:1:0
chr1	16342237	.	A	G	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.753;QD=57.1059;RBI=0.0538059;REFB=0;REVB=0.0523714;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158951;OID=.;OPOS=16342237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0
chr1	16344360	.	A	G	3274.1	PASS	AF=1;AO=204;DP=205;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201483;FXX=0.00469462;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.034;QD=61.7754;RBI=0.0531951;REFB=-0.179075;REVB=0.0492317;RO=1;SAF=122;SAR=82;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00388853;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218336;OID=.;OPOS=16344360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:205:212:1:0:204:212:1:82:122:1:0:83:129:0:0
chr1	16344402	.	G	A	2961.23	PASS	AF=0.995192;AO=196;DP=206;FAO=207;FDP=208;FR=.;FRO=1;FSAF=111;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.131855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1944;QD=56.9467;RBI=0.144854;REFB=-0.22645;REVB=0.0599748;RO=10;SAF=101;SAR=95;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263241;STB=0.50259;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00650822;OID=.;OPOS=16344402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:206:208:10:1:196:207:0.995192:95:101:8:2:96:111:0:1
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chr1	16344625	.	C	G	1302.0	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000872485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8439;QD=62.0001;RBI=0.0171731;REFB=0;REVB=0.0171509;RO=0;SAF=36;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.02751e-05;OID=.;OPOS=16344625;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:48:36:0:0:48:36:0:0
chr1	16344664	.	G	A	396.33	PASS	AF=0.424528;AO=45;DP=106;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=-0.00163011;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.729;QD=14.9557;RBI=0.019415;REFB=-0.0182773;REVB=0.0193464;RO=61;SAF=22;SAR=23;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474283;STB=0.526658;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0316111;OID=.;OPOS=16344664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:61:61:45:45:0.424528:23:22:27:34:23:22:27:34
chr1	16344683	.	C	T	595.01	PASS	AF=0.526316;AO=60;DP=114;FAO=60;FDP=114;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.0298134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.74;QD=20.8774;RBI=0.0302919;REFB=-0.0301712;REVB=-0.00536328;RO=53;SAF=27;SAR=33;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509365;STB=0.523802;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0354472;OID=.;OPOS=16344683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:53:54:60:60:0.526316:33:27:27:26:33:27:27:27
chr1	16345735	.	C	T	422.92	PASS	AF=0.467391;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.0137523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.178;QD=18.3878;RBI=0.0253216;REFB=-0.0153204;REVB=0.0212616;RO=47;SAF=27;SAR=16;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266868;STB=0.637945;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00896467;OID=.;OPOS=16345735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:47:49:43:43:0.467391:16:27:16:31:16:27:18:31
chr1	16351275	.	A	G	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0324163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.484;QD=61.3344;RBI=0.0324412;REFB=0;REVB=0.00127147;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.18755e-05;OID=.;OPOS=16351275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr1	16354394	.	C	T	416.81	PASS	AF=0.606061;AO=40;DP=66;FAO=40;FDP=66;FR=.;FRO=26;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=1;FWDB=-0.0310079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4859;QD=25.2611;RBI=0.0396223;REFB=-0.00879194;REVB=-0.0246665;RO=26;SAF=31;SAR=9;SRF=25;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220816;STB=0.619115;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00483182;OID=.;OPOS=16354394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:26:26:40:40:0.606061:9:31:25:1:9:31:25:1
chr1	16355638	.	T	A	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0102141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.658;QD=12.8606;RBI=0.0343136;REFB=0.00433785;REVB=-0.0327581;RO=7;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358511;STB=0.685728;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.00459464;OID=.;OPOS=16355638;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:8:7:7:0.466667:5:2:5:2:5:2:5:3
chr1	16356501	.	G	A	727.1	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.114778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0655;QD=52.8801;RBI=0.116702;REFB=-0.145324;REVB=0.0211049;RO=1;SAF=32;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144976;STB=0.515146;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00595644;OID=.;OPOS=16356501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:55:55:1:2:53:53:0.963636:21:32:1:0:21:32:2:0
chr1	16358932	.	T	C	651.28	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.159;QD=62.0267;RBI=0.0411179;REFB=0;REVB=0.0343576;RO=0;SAF=8;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8059e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.94179e-05;OID=.;OPOS=16358932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:33:8:0:0:34:8:0:0
chr1	16371067	.	G	T	174.91	PASS	AF=0.343284;AO=22;DP=67;FAO=23;FDP=67;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0335941;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.375;QD=10.4424;RBI=0.0340367;REFB=-0.0218588;REVB=0.00547153;RO=43;SAF=10;SAR=12;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411717;STB=0.530612;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0382007;OID=.;OPOS=16371067;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:43:44:22:23:0.343284:12:10:18:25:12:11:19:25
chr1	16373124	.	A	G	792.14	PASS	AF=1;AO=41;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.641;QD=57.6101;RBI=0.111028;REFB=0;REVB=0.0477921;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361354;OID=.;OPOS=16373124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:55:0:0:41:55:1:24:17:0:0:25:30:0:0
chr1	16374533	.	G	C	684.1	PASS	AF=0.797101;AO=55;DP=70;FAO=55;FDP=69;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=42;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0023916;FXX=0.0142837;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.873;QD=39.6582;RBI=0.012665;REFB=-0.00871157;REVB=-0.0124372;RO=0;SAF=13;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70796e-08;STB=0.632716;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000150548;OID=.;OPOS=16374533;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:70:69:0:14:55:55:0.797101:42:13:0:0:42:13:11:3
chr1	16374994	.	C	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161649;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=199.009;QD=52.6132;RBI=0.023954;REFB=0;REVB=0.0176773;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104061;OID=.;OPOS=16374994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr1	16375063	.	CA	C,GC	277.7	PASS	AF=0.956522,0;AO=4,18;DP=23;FAO=22,0;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=4,0;FSAR=18,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00772175,0.00613039;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=134.761,117.422;QD=48.2951;RBI=0.0125515,0.0144544;REFB=-0.108333,-0.103714;REVB=0.00989521,0.01309;RO=1;SAF=0,4;SAR=4,14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.749895,-0.101506;STB=0.555502,0.5;STBP=0.106,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0023315,0;OID=.,.;OPOS=16375064,16375063;OREF=A,CA;OALT=-,GC;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:4,18:22,0:0.956522,0:4,14:0,4:1:0:18,0:4,0:1:0
chr1	16376191	.	C	T	783.89	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00256942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8451;QD=57.0101;RBI=0.0130792;REFB=0;REVB=0.0128243;RO=0;SAF=46;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.75407e-05;OID=.;OPOS=16376191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:9:46:0:0:9:46:0:0
chr1	16376319	.	T	C	1538.93	PASS	AF=0.981308;AO=104;DP=106;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00777769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.84;QD=57.5301;RBI=0.0288819;REFB=-0.0735477;REVB=0.0278149;RO=0;SAF=51;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509432;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.000545332;OID=.;OPOS=16376319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:106:107:0:2:104:105:0.981308:53:51:0:0:53:52:2:0
chr1	16380196	.	T	C	362.08	PASS	AF=0.414894;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.0439412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.729;QD=15.4077;RBI=0.0449344;REFB=-0.00476334;REVB=-0.00939546;RO=55;SAF=17;SAR=22;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205327;STB=0.615658;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0108985;OID=.;OPOS=16380196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:55:55:39:39:0.414894:22:17:35:20:22:17:35:20
chr1	16380243	.	A	G	398.76	PASS	AF=0.428571;AO=42;DP=98;FAO=42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=-0.00520925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.44;QD=16.2758;RBI=0.0754521;REFB=-0.00433056;REVB=-0.0752721;RO=56;SAF=18;SAR=24;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197578;STB=0.610899;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00987723;OID=.;OPOS=16380243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:56:56:42:42:0.428571:24:18:35:21:24:18:35:21
chr1	16380252	.	C	T	401.37	PASS	AF=0.442105;AO=40;DP=95;FAO=42;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=53;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.0829775;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=36.8855;QD=16.8997;RBI=0.0930743;REFB=-0.0270764;REVB=-0.0421611;RO=30;SAF=19;SAR=21;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588337;STB=0.583833;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0234516;OID=.;OPOS=16380252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:30:53:40:42:0.442105:21:19:12:18:23:19:32:21
chr1	16383682	.	G	C	314.65	PASS	AF=0.281879;AO=42;DP=149;FAO=42;FDP=149;FR=.;FRO=107;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=68;FSRR=39;FWDB=-0.0234551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5597;QD=8.44696;RBI=0.0345566;REFB=-0.00693984;REVB=0.0253775;RO=107;SAF=28;SAR=14;SRF=68;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418371;STB=0.524741;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0178062;OID=.;OPOS=16383682;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:107:107:42:42:0.281879:14:28:68:39:14:28:68:39
chr1	16383742	.	C	G	237.51	PASS	AF=0.203791;AO=40;DP=201;FAO=43;FDP=211;FR=.;FRO=168;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=88;FSRR=80;FWDB=0.00718486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.6686;QD=4.50264;RBI=0.102228;REFB=-0.0124646;REVB=-0.101975;RO=161;SAF=28;SAR=12;SRF=87;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215618;STB=0.645166;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0513961;OID=.;OPOS=16383742;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:201:211:161:168:40:43:0.203791:12:28:87:74:13:30:88:80
chr1	16386008	.	T	C	197.88	PASS	AF=0.526316;AO=9;DP=37;FAO=20;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00764192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6876;QD=20.8292;RBI=0.126284;REFB=-0.0449565;REVB=0.126053;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469885;STB=0.556396;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0509267;OID=.;OPOS=16386008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:15:18:9:20:0.526316:5:4:6:9:11:9:6:12
chr1	16386416	.	G	A	61.94	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.00232943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3939;QD=7.50742;RBI=0.0426869;REFB=-0.0220366;REVB=0.0426233;RO=24;SAF=5;SAR=4;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298435;STB=0.680515;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.061671;OID=.;OPOS=16386416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:33:33:24:24:9:9:0.272727:4:5:19:5:4:5:19:5
chr1	16386447	.	G	C	59.1	PASS	AF=0.321429;AO=8;DP=27;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.00469961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.5281;QD=8.44352;RBI=0.119391;REFB=-0.0140935;REVB=0.119299;RO=19;SAF=5;SAR=3;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.295481;STB=0.705518;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0374783;OID=.;OPOS=16386447;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:27:28:19:19:8:9:0.321429:3:5:16:3:4:5:16:3
chr1	16386495	.	C	T	34.4	PASS	AF=0.352941;AO=5;DP=16;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0164045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.23;QD=8.09443;RBI=0.0207889;REFB=-0.0178058;REVB=0.0127699;RO=11;SAF=2;SAR=3;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339486;STB=0.740006;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.033154;OID=.;OPOS=16386495;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:16:17:11:11:5:6:0.352941:3:2:8:3:4:2:8:3
chr1	16388646	.	T	C	436.62	PASS	AF=0.457143;AO=47;DP=106;FAO=48;FDP=105;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.0159118;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.421;QD=16.633;RBI=0.0276802;REFB=-0.0118285;REVB=0.0226497;RO=58;SAF=34;SAR=13;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155209;STB=0.569201;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0115166;OID=.;OPOS=16388646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:105:58:57:47:48:0.457143:13:34:34:24:14:34:34:23
chr1	16533022	.	C	T	59.39	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1696;QD=15.8382;RBI=0.0492718;REFB=-0.0193847;REVB=0.0492718;RO=7;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0201245;OID=.;OPOS=16533022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:8:0:0:7:8:0:0:7
chr1	16577908	.	G	C	529.95	PASS	AF=0.411348;AO=58;DP=141;FAO=58;FDP=141;FR=.;FRO=83;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=45;FSRR=38;FWDB=-0.0037398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.9245;QD=15.0341;RBI=0.0192009;REFB=-0.00824262;REVB=-0.0188332;RO=83;SAF=30;SAR=28;SRF=45;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261592;STB=0.514701;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.010883;OID=.;OPOS=16577908;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:83:83:58:58:0.411348:28:30:45:38:28:30:45:38
chr1	16632406	.	G	A	159.78	PASS	AF=0.363636;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=-0.0151607;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.371;QD=11.6207;RBI=0.025698;REFB=-0.00980259;REVB=-0.0207495;RO=33;SAF=6;SAR=14;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00386348;STB=0.510906;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0145408;OID=.;OPOS=16632406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:33:35:20:20:0.363636:14:6:10:23:14:6:10:25
chr1	16641899	.	C	T	169.19	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0612195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.486;QD=13.0148;RBI=0.0613172;REFB=-0.00867692;REVB=-0.00345932;RO=31;SAF=5;SAR=15;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955433;STB=0.54873;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0131387;OID=.;OPOS=16641899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:32:20:20:0.384615:15:5:10:21:15:5:10:22
chr1	16723084	.	G	A	411.35	PASS	AF=0.506173;AO=41;DP=83;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.000159183;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.39;QD=20.3135;RBI=0.000502189;REFB=-0.00457365;REVB=0.000476292;RO=39;SAF=11;SAR=30;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121569;STB=0.563145;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00741413;OID=.;OPOS=16723084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:81:39:40:41:41:0.506173:30:11:15:24:30:11:15:25
chr1	16725330	.	G	A	351.56	PASS	AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.00275661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.481;QD=18.5031;RBI=0.00591305;REFB=-0.0296649;REVB=0.00523119;RO=39;SAF=17;SAR=20;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727066;STB=0.540519;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0517208;OID=.;OPOS=16725330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:39:39:37:37:0.486842:20:17:21:18:20:17:21:18
chr1	16736132	.	T	C	215.01	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0186408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.924;QD=21.5008;RBI=0.0323507;REFB=-0.0097618;REVB=-0.0264403;RO=19;SAF=13;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125635;STB=0.570663;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00704941;OID=.;OPOS=16736132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:8:13:9:10:8:13:9:10
chr1	16840663	.	T	C	38.25	PASS	AF=0.0873016;AO=11;DP=125;FAO=11;FDP=126;FR=.;FRO=115;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=66;FSRR=49;FWDB=-0.0380569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.437;QD=1.21431;RBI=0.0412953;REFB=5.20895e-06;REVB=-0.0160305;RO=114;SAF=4;SAR=7;SRF=66;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243204;STB=0.68595;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=-0.00130822;OID=.;OPOS=16840663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:125:126:114:115:11:11:0.0873016:7:4:66:48:7:4:66:49
chr1	16840730	.	C	T	60.04	PASS	AF=0.219512;AO=9;DP=41;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.00559592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.65;QD=5.8574;RBI=0.00654738;REFB=-0.00372762;REVB=-0.00339909;RO=32;SAF=1;SAR=8;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.687066;STB=0.925157;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.022491;OID=.;OPOS=16840730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:41:41:32:32:9:9:0.219512:8:1:24:8:8:1:24:8
chr1	16858909	.	G	C	1859.19	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.672;QD=61.4607;RBI=0.0407121;REFB=0;REVB=-0.0406437;RO=0;SAF=54;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.9692e-05;OID=.;OPOS=16858909;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:67:54:0:0:67:54:0:0
chr1	16860587	.	C	A	214.17	PASS	AF=0.285714;AO=28;DP=98;FAO=28;FDP=98;FR=.;FRO=70;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.0172248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8788;QD=8.74148;RBI=0.0227081;REFB=-0.0184682;REVB=0.0147974;RO=70;SAF=13;SAR=15;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0258366;STB=0.51534;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0283429;OID=.;OPOS=16860587;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:70:70:28:28:0.285714:15:13:34:36:15:13:34:36
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chr1	16860652	.	A	C	212.66	PASS	AF=0.217391;AO=35;DP=161;FAO=35;FDP=161;FR=.;FRO=126;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=58;FSRR=68;FWDB=0.0204315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0233;QD=5.28353;RBI=0.0254369;REFB=0.000153392;REVB=0.0151523;RO=126;SAF=16;SAR=19;SRF=58;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00405957;STB=0.5025;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=-1.26824e-05;OID=.;OPOS=16860652;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:161:126:126:35:35:0.217391:19:16:58:68:19:16:58:68
chr1	16861772	.	A	G	266.2	PASS	AF=0.327103;AO=34;DP=105;FAO=35;FDP=107;FR=.;FRO=72;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=51;FSRR=21;FWDB=-0.0119139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.213;QD=9.95142;RBI=0.0455259;REFB=-0.00140639;REVB=-0.0439394;RO=70;SAF=18;SAR=16;SRF=50;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220354;STB=0.631594;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00307475;OID=.;OPOS=16861772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:107:70:72:34:35:0.327103:16:18:50:20:17:18:51:21
chr1	16861804	.	G	A	216.04	PASS	AF=0.304348;AO=28;DP=92;FAO=28;FDP=92;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.0251409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.969;QD=9.39322;RBI=0.0252465;REFB=-0.0194268;REVB=-0.00230595;RO=64;SAF=15;SAR=13;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152138;STB=0.589306;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0497805;OID=.;OPOS=16861804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:64:64:28:28:0.304348:13:15:26:38:13:15:26:38
chr1	16861847	.	A	T	80.8	PASS	AF=0.141667;AO=17;DP=120;FAO=17;FDP=120;FR=.;FRO=103;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=65;FWDB=-0.0209111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.581;QD=2.69334;RBI=0.0335981;REFB=-0.00621043;REVB=-0.0262975;RO=103;SAF=4;SAR=13;SRF=38;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194956;STB=0.63619;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0409035;OID=.;OPOS=16861847;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:120:120:103:103:17:17:0.141667:13:4:38:65:13:4:38:65
chr1	16861849	.	A	G	80.29	PASS	AF=0.141667;AO=17;DP=120;FAO=17;FDP=120;FR=.;FRO=103;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=65;FWDB=-0.00845903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.912;QD=2.67634;RBI=0.0425268;REFB=-0.00135145;REVB=-0.041677;RO=102;SAF=4;SAR=13;SRF=38;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199624;STB=0.63619;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0265622;OID=.;OPOS=16861849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:120:120:102:103:17:17:0.141667:13:4:38:64:13:4:38:65
chr1	16862282	.	G	A	150.36	PASS	AF=0.351852;AO=19;DP=54;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0215136;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.982;QD=11.1376;RBI=0.0591019;REFB=-0.0191214;REVB=-0.0550473;RO=35;SAF=11;SAR=8;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256984;STB=0.649373;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0480908;OID=.;OPOS=16862282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:35:35:19:19:0.351852:8:11:12:23:8:11:12:23
chr1	16862454	.	T	G	906.77	PASS	AF=0.4;AO=104;DP=260;FAO=104;FDP=260;FR=.;FRO=156;FSAF=61;FSAR=43;FSRF=98;FSRR=58;FWDB=-0.00476041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.376;QD=13.9503;RBI=0.0478487;REFB=-0.00947987;REVB=0.0476113;RO=147;SAF=61;SAR=43;SRF=90;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279428;STB=0.525999;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0417397;OID=.;OPOS=16862454;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:260:260:147:156:104:104:0.4:43:61:90:57:43:61:98:58
chr1	16862461	.	T	A	1526.94	PASS	AF=0.581749;AO=136;DP=264;FAO=153;FDP=263;FR=.;FRO=110;FSAF=89;FSAR=64;FSRF=68;FSRR=42;FWDB=-0.00220675;FXX=0.025925;HRUN=6;LEN=1;MLLD=171.121;QD=23.2234;RBI=0.00244294;REFB=-0.0300824;REVB=-0.00104797;RO=81;SAF=88;SAR=48;SRF=51;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131475;STB=0.515756;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00681182;OID=.;OPOS=16862461;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:264:263:81:110:136:153:0.581749:48:88:51:30:64:89:68:42
chr1	16862472	.	G	C	192.81	PASS	AF=0.140523;AO=43;DP=307;FAO=43;FDP=306;FR=.;FRO=263;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=151;FSRR=112;FWDB=-0.0355773;FXX=0.00325722;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.44;QD=2.52033;RBI=0.0360881;REFB=-0.00171033;REVB=-0.00605016;RO=263;SAF=27;SAR=16;SRF=151;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715495;STB=0.548201;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0125611;OID=.;OPOS=16862472;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:307:306:263:263:43:43:0.140523:16:27:151:112:16:27:151:112
chr1	16862502	.	A	G	2976.32	PASS	AF=0.641414;AO=251;DP=395;FAO=254;FDP=396;FR=.;FRO=142;FSAF=145;FSAR=109;FSRF=87;FSRR=55;FWDB=0.00311185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.277;QD=30.0639;RBI=0.0117783;REFB=-0.00520062;REVB=-0.0113598;RO=142;SAF=145;SAR=106;SRF=87;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242188;STB=0.515365;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.00368352;OID=.;OPOS=16862502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:395:396:142:142:251:254:0.641414:106:145:87:55:109:145:87:55
chr1	16862566	.	G	A	318.04	PASS	AF=0.159806;AO=66;DP=411;FAO=66;FDP=413;FR=.;FRO=347;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=192;FSRR=155;FWDB=-0.0220429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.412;QD=3.08031;RBI=0.0571437;REFB=-0.00744946;REVB=-0.0527211;RO=345;SAF=37;SAR=29;SRF=191;SRR=154;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00916786;STB=0.506207;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0409275;OID=.;OPOS=16862566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:411:413:345:347:66:66:0.159806:29:37:191:154:29:37:192:155
chr1	16863304	.	T	C	38.33	PASS	AF=0.0948276;AO=10;DP=115;FAO=11;FDP=116;FR=.;FRO=105;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=39;FSRR=66;FWDB=0.00652011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.283;QD=1.32174;RBI=0.0135;REFB=-0.00189449;REVB=-0.0118211;RO=105;SAF=3;SAR=7;SRF=39;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898086;STB=0.601955;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0196561;OID=.;OPOS=16863304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:115:116:105:105:10:11:0.0948276:7:3:39:66:8:3:39:66
chr1	16863308	.	G	T	59.66	PASS	AF=0.118644;AO=13;DP=117;FAO=14;FDP=118;FR=.;FRO=104;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=66;FWDB=0.00242669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.176;QD=2.02245;RBI=0.0067735;REFB=-0.0076182;REVB=0.00632388;RO=104;SAF=5;SAR=8;SRF=38;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248201;STB=0.507863;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0272023;OID=.;OPOS=16863308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:117:118:104:104:13:14:0.118644:8:5:38:66:9:5:38:66
chr1	16863314	.	A	G	70.66	PASS	AF=0.133929;AO=12;DP=109;FAO=15;FDP=112;FR=.;FRO=97;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=59;FWDB=0.013934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.315;QD=2.52342;RBI=0.016444;REFB=0.00114912;REVB=0.00873214;RO=96;SAF=5;SAR=7;SRF=37;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392275;STB=0.507453;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.00813111;OID=.;OPOS=16863314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:109:112:96:97:12:15:0.133929:7:5:37:59:9:6:38:59
chr1	16863328	.	T	G	100.21	PASS	AF=0.166667;AO=19;DP=114;FAO=19;FDP=114;FR=.;FRO=95;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=37;FSRR=58;FWDB=-0.0675596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.368;QD=3.51624;RBI=0.0688325;REFB=-0.00553105;REVB=-0.0131759;RO=94;SAF=7;SAR=12;SRF=37;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338166;STB=0.518644;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0463184;OID=.;OPOS=16863328;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:94:95:19:19:0.166667:12:7:37:57:12:7:37:58
chr1	16863352	.	C	T	122.6	PASS	AF=0.194444;AO=21;DP=108;FAO=21;FDP=108;FR=.;FRO=87;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=57;FWDB=-0.0280314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9064;QD=4.54062;RBI=0.0338239;REFB=-0.0246995;REVB=-0.0189287;RO=86;SAF=7;SAR=14;SRF=29;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00550232;STB=0.510335;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0557489;OID=.;OPOS=16863352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:86:87:21:21:0.194444:14:7:29:57:14:7:30:57
chr1	16872420	.	GA	GAA,G	34.1	PASS	AF=0.195876,0;AO=21,12;DP=97;FAO=19,0;FDP=97;FR=.;FRO=78;FSAF=10,0;FSAR=9,0;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=0.0432982,-0.0416888;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=9.67191,11.6642;QD=1.40619;RBI=0.0801937,0.0782921;REFB=-0.0225128,0.0216522;REVB=0.0675003,-0.0662699;RO=61;SAF=10,6;SAR=11,6;SRF=34;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0991446,-0.0715304;STB=0.520153,0.5;STBP=0.838,1;TYPE=ins,del;VARB=-0.0314234,0;OID=.,.;OPOS=16872421,16872421;OREF=-,A;OALT=A,-;OMAPALT=GAA,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.195876,0:21,12:97:19,0:97:78:10,0:9,0:43:35:35:61:10,6:11,6:34:27
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chr1	16872517	.	A	C	152.96	PASS	AF=0.255814;AO=22;DP=86;FAO=22;FDP=86;FR=.;FRO=64;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=48;FWDB=-0.0169483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6679;QD=7.11452;RBI=0.0585113;REFB=-0.00539279;REVB=0.0560029;RO=62;SAF=5;SAR=17;SRF=16;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513601;STB=0.523439;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0177556;OID=.;OPOS=16872517;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:62:64:22:22:0.255814:17:5:16:46:17:5:16:48
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chr1	16903882	.	T	C	43.62	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0401208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.591;QD=6.01607;RBI=0.0431613;REFB=-0.00102589;REVB=0.015913;RO=22;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0888797;STB=0.556809;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.00252145;OID=.;OPOS=16903882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:5:2:5:17:5:2:5:17
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chr1	16909100	.	G	C	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00797307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.485;QD=15.1604;RBI=0.0104338;REFB=-0.00608568;REVB=0.00673004;RO=22;SAF=4;SAR=12;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233392;STB=0.636181;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00805286;OID=.;OPOS=16909100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:12:4:10:12:12:4:10:12
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chr1	17023110	.	G	A	281.34	PASS	AF=0.241573;AO=43;DP=178;FAO=43;FDP=178;FR=.;FRO=135;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=54;FSRR=81;FWDB=-0.0241142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8352;QD=6.32215;RBI=0.0250763;REFB=-0.0168362;REVB=-0.0068794;RO=135;SAF=20;SAR=23;SRF=54;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830335;STB=0.549951;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0352684;OID=.;OPOS=17023110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:178:135:135:43:43:0.241573:23:20:54:81:23:20:54:81
chr1	17023143	.	C	T	459.58	PASS	AF=0.4;AO=52;DP=130;FAO=52;FDP=130;FR=.;FRO=78;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=0.0136291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.142;QD=14.141;RBI=0.0201427;REFB=-0.0151943;REVB=-0.0148316;RO=77;SAF=26;SAR=26;SRF=30;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117015;STB=0.561515;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0277602;OID=.;OPOS=17023143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:77:78:52:52:0.4:26:26:30:47:26:26:31:47
chr1	17023182	.	C	G	332.2	PASS	AF=0.385417;AO=37;DP=96;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.0378682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.036;QD=13.8416;RBI=0.0610596;REFB=-0.00888501;REVB=-0.0478987;RO=59;SAF=19;SAR=18;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00543674;STB=0.503097;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.023493;OID=.;OPOS=17023182;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:59:59:37:37:0.385417:18:19:30:29:18:19:30:29
chr1	17023376	.	C	T	353.4	PASS	AF=0.28655;AO=49;DP=172;FAO=49;FDP=171;FR=.;FRO=122;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=53;FSRR=69;FWDB=-0.0150594;FXX=0.00581362;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.394;QD=8.26668;RBI=0.0317164;REFB=-0.0196003;REVB=0.0279132;RO=120;SAF=24;SAR=25;SRF=51;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787169;STB=0.539568;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0427458;OID=.;OPOS=17023376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:171:120:122:49:49:0.28655:25:24:51:69:25:24:53:69
chr1	17023403	.	G	A	65.55	PASS	AF=0.114286;AO=14;DP=143;FAO=16;FDP=140;FR=.;FRO=124;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=47;FSRR=77;FWDB=-0.0112872;FXX=0.0209776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0731;QD=1.87283;RBI=0.0162162;REFB=-0.00418022;REVB=-0.0116431;RO=120;SAF=5;SAR=9;SRF=45;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.023025;STB=0.565133;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.040081;OID=.;OPOS=17023403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:143:140:120:124:14:16:0.114286:9:5:45:75:11:5:47:77
chr1	17030504	.	T	A	1335.51	PASS	AF=0.382353;AO=156;DP=408;FAO=156;FDP=408;FR=.;FRO=252;FSAF=88;FSAR=68;FSRF=131;FSRR=121;FWDB=-0.000564571;FXX=0.00244493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7199;QD=13.0933;RBI=0.00776797;REFB=-0.0249222;REVB=0.00774743;RO=249;SAF=88;SAR=68;SRF=130;SRR=119;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464275;STB=0.527594;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0188036;OID=.;OPOS=17030504;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:408:408:249:252:156:156:0.382353:68:88:130:119:68:88:131:121
chr1	17030515	.	G	A	1030.94	PASS	AF=0.328283;AO=130;DP=393;FAO=130;FDP=396;FR=.;FRO=266;FSAF=82;FSAR=48;FSRF=127;FSRR=139;FWDB=0.00312511;FXX=0.00251883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4103;QD=10.4135;RBI=0.0172105;REFB=-0.0108728;REVB=-0.0169244;RO=255;SAF=82;SAR=48;SRF=127;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157339;STB=0.604494;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0390444;OID=.;OPOS=17030515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:393:396:255:266:130:130:0.328283:48:82:127:128:48:82:127:139
chr1	17030518	.	CT	TG	1006.58	PASS	AF=0.331565;AO=125;DP=388;FAO=125;FDP=377;FR=.;FRO=252;FSAF=77;FSAR=48;FSRF=126;FSRR=126;FWDB=-0.0608379;FXX=0.0283498;HRUN=1;LEN=2;MLLD=76.3933;QD=10.6799;RBI=0.0860872;REFB=-0.0149203;REVB=-0.0609078;RO=243;SAF=77;SAR=48;SRF=120;SRR=123;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143637;STB=0.578935;STBP=0.026;TYPE=mnp;VARB=0.0290052;OID=.;OPOS=17030518;OREF=CT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:388:377:243:252:125:125:0.331565:48:77:120:123:48:77:126:126
chr1	17030590	.	G	A	978.04	PASS	AF=0.393617;AO=111;DP=283;FAO=111;FDP=282;FR=.;FRO=171;FSAF=52;FSAR=59;FSRF=81;FSRR=90;FWDB=0.0137776;FXX=0.00353344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0217;QD=13.8729;RBI=0.0311279;REFB=-0.00868385;REVB=0.0279128;RO=171;SAF=52;SAR=59;SRF=81;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00565326;STB=0.503174;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.0128151;OID=.;OPOS=17030590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:283:282:171:171:111:111:0.393617:59:52:81:90:59:52:81:90
chr1	17033805	.	C	T	289.98	PASS	AF=0.196911;AO=51;DP=259;FAO=51;FDP=259;FR=.;FRO=208;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=115;FSRR=93;FWDB=-0.0112768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.597;QD=4.47838;RBI=0.0165168;REFB=-0.00751161;REVB=-0.0120681;RO=202;SAF=21;SAR=30;SRF=110;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169968;STB=0.612293;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0346806;OID=.;OPOS=17033805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:259:259:202:208:51:51:0.196911:30:21:110:92:30:21:115:93
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chr1	17034041	.	T	C	32.33	PASS	AF=0.625;AO=4;DP=7;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00450996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.787;QD=16.1643;RBI=0.0272097;REFB=-0.0310624;REVB=0.0268334;RO=3;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.357477;STB=0.666107;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0168977;OID=.;OPOS=17034041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:7:8:3:3:4:5:0.625:2:2:3:0:2:3:3:0
chr1	17034455	.	CGCGCGCGT	C	171.1	PASS	AF=0.208955;AO=27;DP=135;FAO=28;FDP=134;FR=.;FRO=106;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=67;FSRR=39;FWDB=-0.0141021;FXX=0.0218962;HRUN=1;LEN=8;MLLD=292.556;QD=5.1074;RBI=0.0228659;REFB=-0.0116406;REVB=0.0179994;RO=104;SAF=21;SAR=6;SRF=65;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230524;STB=0.649489;STBP=0.106;TYPE=del;VARB=0.0433868;OID=.;OPOS=17034456;OREF=GCGCGCGT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.208955:27:135:28:134:106:22:6:67:39:99:104:21:6:65:39
chr1	17046456	.	T	C	776.84	PASS	AF=0.509677;AO=79;DP=158;FAO=79;FDP=155;FR=.;FRO=76;FSAF=30;FSAR=49;FSRF=34;FSRR=42;FWDB=0.0108636;FXX=0.0189861;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.3732;QD=20.0474;RBI=0.03608;REFB=-0.0115245;REVB=-0.0344056;RO=76;SAF=30;SAR=49;SRF=34;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628791;STB=0.534597;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00886308;OID=.;OPOS=17046456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:155:76:76:79:79:0.509677:49:30:34:42:49:30:34:42
chr1	17052116	.	CG	GC	86.37	PASS	AF=0.064;AO=48;DP=749;FAO=48;FDP=750;FR=.;FRO=702;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=389;FSRR=313;FWDB=-0.00113118;FXX=0.00662243;HRUN=1;LEN=2;MLLD=228.675;QD=0.460635;RBI=0.0427742;REFB=-0.00257731;REVB=-0.0427593;RO=685;SAF=34;SAR=14;SRF=383;SRR=302;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170007;STB=0.652399;STBP=0.025;TYPE=mnp;VARB=0.0404464;OID=.;OPOS=17052116;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:749:750:685:702:48:48:0.064:14:34:383:302:14:34:389:313
chr1	17052136	.	GTTTTTT	GTTTTT,GTTTTTG,TGTTTTT	304.94	PASS	AF=0.0983333,0.055,0.0733333;AO=107,35,58;DP=638;FAO=59,33,44;FDP=600;FR=.;FRO=464;FSAF=18,0,0;FSAR=41,33,44;FSRF=315;FSRR=149;FWDB=0.119434,0.011024,0.000245123;FXX=0.0839682;HRUN=6,6,2;LEN=1,1,2;MLLD=9.6186,22.833,231.179;QD=2.03296;RBI=0.227766,0.0819966,0.0526462;REFB=-0.103911,-0.0563263,-0.00400687;REVB=-0.193941,-0.0812521,-0.0526456;RO=328;SAF=31,1,0;SAR=76,34,58;SRF=275;SRR=53;SSEN=0,0,0;SSEP=0.454545,0,0;SSSB=-0.621336,-0.79038,-0.845925;STB=0.799599,0.999778,0.999827;STBP=0,0,0;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.0340376,0.101876,0.0600799;OID=.,.,.;OPOS=17052137,17052142,17052136;OREF=T,T,GT;OALT=-,G,TG;OMAPALT=GTTTTT,GTTTTTG,TGTTTTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:638:600:328:464:107,35,58:59,33,44:0.0983333,0.055,0.0733333:76,34,58:31,1,0:275:53:41,33,44:18,0,0:315:149
chr1	17053766	.	G	A	1522.72	PASS	AF=0.798611;AO=113;DP=142;FAO=115;FDP=144;FR=.;FRO=29;FSAF=62;FSAR=53;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0203009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.496;QD=42.2977;RBI=0.0329135;REFB=-0.0372687;REVB=0.0259071;RO=28;SAF=60;SAR=53;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515796;STB=0.532215;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0116106;OID=.;OPOS=17053766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:144:28:29:113:115:0.798611:53:60:11:17:53:62:11:18
chr1	17053782	.	C	A,G	1618.95	PASS	AF=0.187097,0.645161;AO=28,100;DP=157;FAO=29,100;FDP=155;FR=.;FRO=26;FSAF=10,56;FSAR=19,44;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0308464,-0.0674145;FXX=0.0189861;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=123.639,62.3052;QD=41.7793;RBI=0.0339347,0.079599;REFB=0.00757265,0.0224426;REVB=-0.0141445,-0.0423236;RO=26;SAF=10,56;SAR=18,44;SRF=13;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.128406,0.0235067;STB=0.577224,0.512522;STBP=0.247,0.574;TYPE=snp,snp;VARB=0.0141278,0.000183933;OID=.,.;OPOS=17053782,17053782;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:157:155:26:26:28,100:29,100:0.187097,0.645161:18,44:10,56:13:13:19,44:10,56:13:13
chr1	17053809	.	C	T	130.64	PASS	AF=0.159509;AO=26;DP=163;FAO=26;FDP=163;FR=.;FRO=137;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=69;FSRR=68;FWDB=-0.0321197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.845;QD=3.20588;RBI=0.049879;REFB=-0.00676534;REVB=-0.0381608;RO=137;SAF=9;SAR=17;SRF=69;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203245;STB=0.634042;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0531189;OID=.;OPOS=17053809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:163:137:137:26:26:0.159509:17:9:69:68:17:9:69:68
chr1	17053812	.	C	T	156.91	PASS	AF=0.197183;AO=27;DP=143;FAO=28;FDP=142;FR=.,HEALED;FRO=114;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=46;FSRR=68;FWDB=-0.105853;FXX=0.0206882;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1101;QD=4.41994;RBI=0.112091;REFB=-0.0372274;REVB=0.0368744;RO=93;SAF=11;SAR=16;SRF=25;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191636;STB=0.520647;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0919328;OID=.;OPOS=17053812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:142:93:114:27:28:0.197183:16:11:25:68:16:12:46:68
chr1	17053826	.	C	T	166.85	PASS	AF=0.198582;AO=28;DP=141;FAO=28;FDP=141;FR=.;FRO=113;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=70;FWDB=-0.0181287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.555;QD=4.73347;RBI=0.047327;REFB=-0.00980884;REVB=-0.0437172;RO=112;SAF=12;SAR=16;SRF=42;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708171;STB=0.539721;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0299849;OID=.;OPOS=17053826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:112:113:28:28:0.198582:16:12:42:70:16:12:43:70
chr1	17053834	.	A	AC	580.05	PASS	AF=0.585938;AO=74;DP=134;FAO=75;FDP=128;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.00306688;FXX=0.022899;HRUN=0;LEN=1;MLLD=298.361;QD=18.1266;RBI=0.00326767;REFB=-0.0155977;REVB=-0.00112777;RO=58;SAF=24;SAR=50;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645494;STB=0.511625;STBP=0.785;TYPE=ins;VARB=0.00748912;OID=.;OPOS=17053835;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.585938:74:134:75:128:53:25:50:19:34:99:58:24:50:23:35
chr1	17053861	.	C	T	696.41	PASS	AF=0.609091;AO=58;DP=100;FAO=67;FDP=110;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=46;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=0.0192097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.137;QD=25.3239;RBI=0.0253732;REFB=-0.0175183;REVB=0.0165766;RO=42;SAF=16;SAR=42;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318495;STB=0.505493;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0129913;OID=.;OPOS=17053861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:110:42:43:58:67:0.609091:42:16:13:29:46:21:14:29
chr1	17084510	.	G	A	467.86	PASS	AF=0.353659;AO=57;DP=164;FAO=58;FDP=164;FR=.;FRO=106;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=57;FSRR=49;FWDB=0.0637155;FXX=0.00606024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4642;QD=11.4112;RBI=0.0855925;REFB=0.00399763;REVB=0.0571525;RO=107;SAF=27;SAR=30;SRF=58;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777929;STB=0.535477;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.00675251;OID=.;OPOS=17084510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:164:107:106:57:58:0.353659:30:27:58:49:30:28:57:49
chr1	17084536	.	TGGAACA	T	161.78	PASS	AF=0.311927;AO=33;DP=113;FAO=34;FDP=109;FR=.;FRO=75;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=-0.0111752;FXX=0.0180164;HRUN=2;LEN=6;MLLD=335.076;QD=5.93685;RBI=0.0129076;REFB=-0.00662852;REVB=0.00645906;RO=75;SAF=9;SAR=24;SRF=39;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0.20438;SSSB=-0.306434;STB=0.693932;STBP=0.008;TYPE=del;VARB=0.0159707;OID=.;OPOS=17084537;OREF=GGAACA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.311927:33:113:34:109:75:9:25:40:35:99:75:9:24:39:36
chr1	17084581	.	T	C	35.38	PASS	AF=0.116667;AO=7;DP=60;FAO=7;FDP=60;FR=.;FRO=53;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-0.06134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.964;QD=2.35837;RBI=0.0613419;REFB=-0.000616409;REVB=0.000486942;RO=52;SAF=4;SAR=3;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299807;STB=0.529329;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.00221464;OID=.;OPOS=17084581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:60:60:52:53:7:7:0.116667:3:4:31:21:3:4:32:21
chr1	17084755	.	T	C	106.1	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0631019;FXX=0.0908265;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.6852;QD=42.4395;RBI=0.0631072;REFB=0;REVB=0.000819281;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00205376;OID=.;OPOS=17084755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:2:8:0:0:2:8:0:0
chr1	17084968	.	G	C	200.05	PASS	AF=0.252033;AO=27;DP=119;FAO=31;FDP=123;FR=.;FRO=92;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=-0.00636173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.615;QD=6.50575;RBI=0.0239839;REFB=-0.0167294;REVB=-0.0231247;RO=91;SAF=16;SAR=11;SRF=45;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123777;STB=0.61086;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0517956;OID=.;OPOS=17084968;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:123:91:92:27:31:0.252033:11:16:45:46:11:20:46:46
chr1	17085006	.	C	T	73.03	PASS	AF=0.112583;AO=16;DP=153;FAO=17;FDP=151;FR=.,HEALED;FRO=133;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=62;FSRR=71;FWDB=-0.0161273;FXX=0.013071;HRUN=5;LEN=1;MLLD=295.509;QD=1.93446;RBI=0.0235534;REFB=-0.00696266;REVB=-0.017166;RO=108;SAF=10;SAR=6;SRF=50;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200066;STB=0.658959;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0543856;OID=.;OPOS=17085006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:153:151:108:133:16:17:0.112583:6:10:50:58:6:11:62:71
chr1	17085412	.	C	T	150.79	PASS	AF=0.15122;AO=31;DP=206;FAO=31;FDP=205;FR=.;FRO=174;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=81;FSRR=93;FWDB=0.00339379;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.998;QD=2.94218;RBI=0.00562637;REFB=-0.00942312;REVB=-0.00448756;RO=168;SAF=16;SAR=15;SRF=76;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816139;STB=0.542857;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0518531;OID=.;OPOS=17085412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:206:205:168:174:31:31:0.15122:15:16:76:92:15:16:81:93
chr1	17085427	.	T	C	190.0	PASS	AF=0.16895;AO=37;DP=220;FAO=37;FDP=219;FR=.;FRO=182;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=87;FSRR=95;FWDB=-0.0190262;FXX=0.00904936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.323;QD=3.47039;RBI=0.0194903;REFB=-0.00597028;REVB=-0.00422768;RO=180;SAF=17;SAR=20;SRF=86;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236702;STB=0.515481;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0428716;OID=.;OPOS=17085427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:220:219:180:182:37:37:0.16895:20:17:86:94:20:17:87:95
chr1	17085502	.	T	C	1122.1	PASS	AF=0.831776;AO=85;DP=103;FAO=89;FDP=107;FR=.;FRO=18;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.000767835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.725;QD=41.9478;RBI=0.00516047;REFB=-0.0389542;REVB=0.00510303;RO=18;SAF=42;SAR=43;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00193139;STB=0.502837;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.00778641;OID=.;OPOS=17085502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:103:107:18:18:85:89:0.831776:43:42:9:9:43:46:9:9
chr1	17085833	.	G	GT	477.95	PASS	AF=1;AO=7;DP=49;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.616;QD=41.5608;RBI=0.1218;REFB=0;REVB=-0.0583265;RO=42;SAF=7;SAR=0;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.625176;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000440218;OID=.;OPOS=17085834;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:7:49:46:46:0:31:15:0:0:9:42:7:0:27:15
chr1	17085834	.	G	T	548.33	PASS	AF=0.866667;AO=39;DP=46;FAO=39;FDP=45;FR=.;FRO=6;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0411241;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.586;QD=48.74;RBI=0.0471857;REFB=-0.168758;REVB=0.0231364;RO=5;SAF=24;SAR=15;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882105;STB=0.555528;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00292668;OID=.;OPOS=17085834;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:46:45:5:6:39:39:0.866667:15:24:5:0:15:24:6:0
chr1	17086052	.	T	C	50.03	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0935116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=37.3474;QD=33.3518;RBI=0.151819;REFB=0;REVB=0.119601;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0183242;OID=.;OPOS=17086052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr1	17086941	.	C	T	275.81	PASS	AF=0.367816;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0040161;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.663;QD=12.6811;RBI=0.0365664;REFB=-0.0106256;REVB=-0.0363451;RO=54;SAF=18;SAR=14;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188308;STB=0.601644;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0196548;OID=.;OPOS=17086941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:54:55:32:32:0.367816:14:18:21:33:14:18:22:33
chr1	17087244	.	AC	A	131.92	PASS	AF=0.404762;AO=32;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=43;FWDB=-0.0822574;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.7191;QD=6.28168;RBI=0.161887;REFB=-0.0392108;REVB=0.139432;RO=44;SAF=12;SAR=20;SRF=5;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0.366667;SSSB=0.317108;STB=0.651011;STBP=0.07;TYPE=del;VARB=0.0703268;OID=.;OPOS=17087245;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.404762:32:84:34:84:50:12:22:7:43:99:44:12:20:5:39
chr1	17087262	.	C	T	158.19	PASS	AF=0.237113;AO=23;DP=97;FAO=23;FDP=97;FR=.;FRO=74;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=54;FWDB=0.0777621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0877;QD=6.52343;RBI=0.0943507;REFB=0.0167187;REVB=0.0534333;RO=74;SAF=6;SAR=17;SRF=20;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149996;STB=0.509209;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=-0.052189;OID=.;OPOS=17087262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:74:74:23:23:0.237113:17:6:20:54:17:6:20:54
chr1	17087365	.	C	G	786.72	PASS	AF=0.649573;AO=60;DP=102;FAO=76;FDP=117;FR=.;FRO=41;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0226146;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.659;QD=26.8965;RBI=0.0246053;REFB=-0.0539711;REVB=0.0096954;RO=41;SAF=43;SAR=17;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243912;STB=0.553134;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0390521;OID=.;OPOS=17087365;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:117:41:41:60:76:0.649573:17:43:17:24:33:43:17:24
chr1	17087465	.	G	A	443.1	PASS	AF=0.298969;AO=58;DP=194;FAO=58;FDP=194;FR=.;FRO=136;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=75;FSRR=61;FWDB=-0.020977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.699;QD=9.13599;RBI=0.0225459;REFB=-0.0173397;REVB=-0.00826346;RO=134;SAF=26;SAR=32;SRF=73;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115358;STB=0.572011;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0397703;OID=.;OPOS=17087465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:194:194:134:136:58:58:0.298969:32:26:73:61:32:26:75:61
chr1	17087521	.	G	A	174.62	PASS	AF=0.181818;AO=32;DP=174;FAO=32;FDP=176;FR=.;FRO=144;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=63;FSRR=81;FWDB=-0.0328412;FXX=0.0056494;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.9576;QD=3.96854;RBI=0.0511663;REFB=-0.00536941;REVB=-0.0392358;RO=140;SAF=15;SAR=17;SRF=61;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427172;STB=0.525735;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0339463;OID=.;OPOS=17087521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:176:140:144:32:32:0.181818:17:15:61:79:17:15:63:81
chr1	17087541	.	GGTGCT	G	98.82	PASS	AF=0.196319;AO=32;DP=166;FAO=32;FDP=163;FR=.;FRO=131;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=49;FSRR=82;FWDB=0.00585026;FXX=0.0121205;HRUN=2;LEN=5;MLLD=282.445;QD=2.42505;RBI=0.0251329;REFB=-0.00147089;REVB=-0.0244425;RO=130;SAF=13;SAR=19;SRF=48;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497696;STB=0.527081;STBP=0.762;TYPE=del;VARB=0.00604512;OID=.;OPOS=17087542;OREF=GTGCT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.196319:32:166:32:163:131:13:19:49:82:98:130:13:19:48:82
chr1	17087582	.	G	A	395.03	PASS	AF=0.342857;AO=47;DP=139;FAO=48;FDP=140;FR=.;FRO=92;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=57;FWDB=0.0199642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.94;QD=11.2866;RBI=0.0227556;REFB=-0.00474799;REVB=0.01092;RO=91;SAF=17;SAR=30;SRF=35;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281495;STB=0.518654;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0100702;OID=.;OPOS=17087582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:140:91:92:47:48:0.342857:30:17:35:56:31:17:35:57
chr1	17185437	.	C	T	32.48	PASS	AF=0.0952381;AO=8;DP=84;FAO=8;FDP=84;FR=.;FRO=76;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=-0.0134319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.934;QD=1.54667;RBI=0.0406098;REFB=-0.00286198;REVB=-0.0383242;RO=72;SAF=7;SAR=1;SRF=38;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.430107;STB=0.839069;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0475851;OID=.;OPOS=17185437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:84:84:72:76:8:8:0.0952381:1:7:38:34:1:7:41:35
chr1	17185500	.	C	T	149.94	PASS	AF=0.222222;AO=24;DP=108;FAO=24;FDP=108;FR=.;FRO=84;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=-0.0148101;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.857;QD=5.55344;RBI=0.0158777;REFB=-0.0107894;REVB=-0.00572399;RO=84;SAF=18;SAR=6;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.379613;STB=0.735649;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0307198;OID=.;OPOS=17185500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:84:84:24:24:0.222222:6:18:38:46:6:18:38:46
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chr1	17186719	.	T	G	164.28	PASS	AF=0.158654;AO=33;DP=207;FAO=33;FDP=208;FR=.;FRO=175;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=83;FSRR=92;FWDB=0.022699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5031;QD=3.15924;RBI=0.0669961;REFB=-0.0104719;REVB=0.0630336;RO=174;SAF=23;SAR=10;SRF=82;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290948;STB=0.688669;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0579569;OID=.;OPOS=17186719;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:207:208:174:175:33:33:0.158654:10:23:82:92:10:23:83:92
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chr1	17197615	.	C	A	120.25	PASS	AF=0.142077;AO=26;DP=183;FAO=26;FDP=183;FR=.;FRO=157;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=82;FSRR=75;FWDB=-0.00472642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.591;QD=2.62834;RBI=0.00504873;REFB=-0.00901612;REVB=0.001775;RO=154;SAF=19;SAR=7;SRF=81;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271523;STB=0.687709;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0356862;OID=.;OPOS=17197615;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:183:154:157:26:26:0.142077:7:19:81:73:7:19:82:75
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chr1	17199076	.	T	A	171.91	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.00585769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.258;QD=26.4481;RBI=0.0387805;REFB=-0.0338654;REVB=0.0383356;RO=8;SAF=6;SAR=11;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297323;STB=0.681208;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0181134;OID=.;OPOS=17199076;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:26:26:8:9:17:17:0.653846:11:6:7:1:11:6:8:1
chr1	17200206	.	C	CT	61.47	PASS	AF=0.160377;AO=22;DP=212;FAO=34;FDP=212;FR=.;FRO=178;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=89;FSRR=89;FWDB=-0.0161293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.5943;QD=1.15979;RBI=0.0695609;REFB=-0.00154826;REVB=0.0676651;RO=181;SAF=19;SAR=3;SRF=90;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46656;STB=0.677588;STBP=0.024;TYPE=ins;VARB=-0.0181686;OID=.;OPOS=17200207;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.160377:22:212:34:212:178:24:10:89:89:61:181:19:3:90:91
chr1	17200227	.	C	A	52.77	PASS	AF=0.069697;AO=23;DP=330;FAO=23;FDP=330;FR=.;FRO=307;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=150;FSRR=157;FWDB=-0.00662177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8776;QD=0.639684;RBI=0.029745;REFB=0.00325444;REVB=-0.0289986;RO=307;SAF=10;SAR=13;SRF=150;SRR=157;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0594845;STB=0.550221;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=-0.0868338;OID=.;OPOS=17200227;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:330:330:307:307:23:23:0.069697:13:10:150:157:13:10:150:157
chr1	17200270	.	T	G	2602.14	PASS	AF=0.538961;AO=248;DP=462;FAO=249;FDP=462;FR=.;FRO=213;FSAF=120;FSAR=129;FSRF=114;FSRR=99;FWDB=0.0272896;FXX=0.00431025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6012;QD=22.5294;RBI=0.0553211;REFB=-0.0271038;REVB=0.0481218;RO=213;SAF=120;SAR=128;SRF=114;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435939;STB=0.524552;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0227903;OID=.;OPOS=17200270;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:462:462:213:213:248:249:0.538961:128:120:114:99:129:120:114:99
chr1	17200289	.	C	T	3026.37	PASS	AF=0.561886;AO=265;DP=486;FAO=286;FDP=509;FR=.;FRO=223;FSAF=140;FSAR=146;FSRF=117;FSRR=106;FWDB=-0.0309164;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.0285;QD=23.7829;RBI=0.122018;REFB=-0.0608165;REVB=0.118037;RO=221;SAF=140;SAR=125;SRF=115;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00666479;STB=0.515397;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0474193;OID=.;OPOS=17200289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:486:509:221:223:265:286:0.561886:125:140:115:106:146:140:117:106
chr1	17250836	.	A	G	50.64	PASS	AF=0.2;AO=8;DP=39;FAO=8;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0141378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.698;QD=5.06439;RBI=0.0423836;REFB=-0.0049668;REVB=-0.0399561;RO=31;SAF=4;SAR=4;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583456;STB=0.549876;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0225967;OID=.;OPOS=17250836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:39:40:31:32:8:8:0.2:4:4:14:17:4:4:14:18
chr1	17264920	.	C	T	224.75	PASS	AF=0.337349;AO=28;DP=83;FAO=28;FDP=83;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=0.0891023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1531;QD=10.8314;RBI=0.0897135;REFB=-0.00202454;REVB=0.0104543;RO=55;SAF=13;SAR=15;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174291;STB=0.600953;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0016923;OID=.;OPOS=17264920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:55:55:28:28:0.337349:15:13:34:21:15:13:34:21
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chr1	17266536	.	G	C	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0269095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.712;QD=11.2569;RBI=0.030224;REFB=-0.0449654;REVB=0.0137611;RO=11;SAF=2;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305926;STB=0.666222;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0399924;OID=.;OPOS=17266536;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:11:12:8:8:0.4:6:2:6:5:6:2:6:6
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chr1	17273396	.	A	G	106.06	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0404045;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.662;QD=10.8784;RBI=0.0406757;REFB=-0.004227;REVB=0.0046889;RO=25;SAF=4;SAR=9;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365364;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00401857;OID=.;OPOS=17273396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:26:13:13:0.333333:9:4:7:18:9:4:8:18
chr1	17273397	.	C	T	106.58	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.00215182;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.128;QD=11.219;RBI=0.0161758;REFB=-0.0113484;REVB=0.0160321;RO=24;SAF=3;SAR=10;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141481;STB=0.605885;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.00829451;OID=.;OPOS=17273397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:25:13:13:0.342105:10:3:8:16:10:3:9:16
chr1	17273401	.	T	C	103.08	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.134779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.826;QD=11.1441;RBI=0.139954;REFB=-0.0254305;REVB=-0.0377055;RO=23;SAF=3;SAR=10;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254963;STB=0.643325;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0862597;OID=.;OPOS=17273401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:24:13:13:0.351351:10:3:10:13:10:3:10:14
chr1	17273444	.	G	A	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0174133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.856;QD=12.73;RBI=0.0257003;REFB=-0.0124102;REVB=0.0189019;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865477;STB=0.551606;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0176819;OID=.;OPOS=17273444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:6:3:5:7:6:3:5:7
chr1	17292566	.	A	AG	105.58	PASS	AF=0.44186;AO=16;DP=45;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0122736;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=48.3491;QD=9.82168;RBI=0.0135784;REFB=-0.0241874;REVB=-0.00580796;RO=27;SAF=15;SAR=1;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.661068;STB=0.72947;STBP=0.014;TYPE=ins;VARB=0.218145;OID=.;OPOS=17292567;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.44186:16:45:19:43:24:15:4:10:14:99:27:15:1:12:15
chr1	17295679	.	T	C	596.47	PASS	AF=1;AO=36;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.584;QD=61.1766;RBI=0.11157;REFB=0;REVB=0.111072;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302443;OID=.;OPOS=17295679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:36:39:1:15:21:0:0:18:21:0:0
chr1	17301780	.	A	G	240.41	PASS	AF=0.647059;AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.00748923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.557;QD=28.2831;RBI=0.0680161;REFB=-0.0395934;REVB=-0.0676025;RO=12;SAF=17;SAR=5;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240121;STB=0.630338;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0238723;OID=.;OPOS=17301780;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:12:12:22:22:0.647059:5:17:12:0:5:17:12:0
chr1	17312743	.	C	T	156.61	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.112656;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3933;QD=22.3727;RBI=0.113556;REFB=-0.0551017;REVB=0.0142728;RO=11;SAF=3;SAR=13;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126261;STB=0.580556;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.032015;OID=.;OPOS=17312743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:28:11:12:16:16:0.571429:13:3:1:10:13:3:1:11
chr1	17313343	.	G	A	65.73	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00948344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8079;QD=11.431;RBI=0.0260813;REFB=-0.00486874;REVB=0.0242961;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288925;STB=0.516093;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0154419;OID=.;OPOS=17313343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:22:23:13:14:9:9:0.391304:6:3:4:9:6:3:5:9
chr1	17313454	.	G	A	68.98	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0373204;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=180.069;QD=15.3295;RBI=0.0445847;REFB=0.00241195;REVB=0.0243923;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213273;STB=0.615147;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=-0.00265547;OID=.;OPOS=17313454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:17:18:8:9:8:9:0.5:4:4:6:2:4:5:7:2
chr1	17313654	.	C	T	91.22	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0135734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.97;QD=17.3761;RBI=0.0366309;REFB=-0.0146602;REVB=0.0340233;RO=10;SAF=1;SAR=10;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211187;STB=0.624731;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0349141;OID=.;OPOS=17313654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:10:1:2:8:10:1:2:8
chr1	17314702	.	C	T	340.49	PASS	AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.00817727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.135;QD=18.1595;RBI=0.0473494;REFB=-0.00304666;REVB=0.0466379;RO=38;SAF=19;SAR=17;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146064;STB=0.587149;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00237478;OID=.;OPOS=17314702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:39:36:36:0.48:17:19:14:24:17:19:14:25
chr1	17314942	.	G	A	146.85	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0687731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0464;QD=11.296;RBI=0.0873982;REFB=0.0146668;REVB=0.0539325;RO=34;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00368238;STB=0.502162;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0226733;OID=.;OPOS=17314942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:10:8:15:19:10:8:15:19
chr1	17319011	.	G	A	86.48	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0155209;FXX=0.09995;HRUN=5;LEN=1;MLLD=197.027;QD=19.2179;RBI=0.0279308;REFB=-0.0534539;REVB=-0.0232213;RO=5;SAF=7;SAR=3;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721239;STB=0.526974;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0393036;OID=.;OPOS=17319011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:20:18:5:8:10:10:0.555556:3:7:4:1:3:7:6:2
chr1	17380497	.	G	T	1675.25	PASS	AF=0.942623;AO=114;DP=125;FAO=115;FDP=122;FR=.;FRO=7;FSAF=68;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0653659;FXX=0.0239981;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.258;QD=54.9261;RBI=0.0657885;REFB=-0.0685153;REVB=0.00744516;RO=7;SAF=67;SAR=47;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065644;STB=0.534647;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00284779;OID=.;OPOS=17380497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:125:122:7:7:114:115:0.942623:47:67:0:7:47:68:0:7
chr1	17394613	.	T	C	1025.93	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00201076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.887;QD=59.474;RBI=0.0276692;REFB=0;REVB=0.0275961;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.10869e-05;OID=.;OPOS=17394613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0
chr1	17394623	.	C	T	965.87	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0659827;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1453;QD=58.5373;RBI=0.0665123;REFB=0;REVB=-0.00837645;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000905143;OID=.;OPOS=17394623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:29:36:0:0:29:37:0:0
chr1	17395480	.	G	A	781.36	PASS	AF=0.982759;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0253113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.239;QD=53.8867;RBI=0.0659776;REFB=-0.136488;REVB=0.0609294;RO=1;SAF=43;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348843;STB=0.517235;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00129486;OID=.;OPOS=17395480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:56:57:0.982759:13:43:0:1:14:43:0:1
chr1	17395521	.	G	A	1231.31	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0321739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.124;QD=60.0639;RBI=0.124932;REFB=-0.0775788;REVB=0.120718;RO=0;SAF=55;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509432;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.000243796;OID=.;OPOS=17395521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:82:0:1:81:81:0.987805:26:55:0:0:26:55:0:1
chr1	17396703	.	T	C	885.4	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.826;QD=58.0587;RBI=0.0251566;REFB=0;REVB=0.00558523;RO=0;SAF=18;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.88183e-05;OID=.;OPOS=17396703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:43:18:0:0:43:18:0:0
chr1	17402255	.	C	T	612.8	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.882;QD=61.2796;RBI=0.116907;REFB=0;REVB=0.0211852;RO=0;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260376;OID=.;OPOS=17402255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:28:12:0:0:28:12:0:0
chr1	17405809	.	G	A	1002.76	PASS	AF=1;AO=67;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281408;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.592;QD=58.9859;RBI=0.0513512;REFB=0;REVB=0.0429539;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.85326e-05;OID=.;OPOS=17405809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:67:68:1:31:36:0:0:31:37:0:0
chr1	17609448	.	G	T	550.0	PASS	AF=0.548387;AO=51;DP=94;FAO=51;FDP=93;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0226548;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4355;QD=23.6558;RBI=0.0424539;REFB=-0.017693;REVB=0.0359039;RO=42;SAF=26;SAR=25;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311229;STB=0.517089;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0063959;OID=.;OPOS=17609448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:42:42:51:51:0.548387:25:26:23:19:25:26:23:19
chr1	17657607	.	C	G	167.09	PASS	AF=0.368421;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.0302883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.688;QD=11.7257;RBI=0.0324614;REFB=-0.0111122;REVB=-0.0116773;RO=35;SAF=10;SAR=11;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225349;STB=0.619097;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0187877;OID=.;OPOS=17657607;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:35:36:21:21:0.368421:11:10:24:11:11:10:24:12
chr1	17661128	.	A	C	76.67	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00524977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5984;QD=12.7791;RBI=0.143767;REFB=-0.00229792;REVB=0.143671;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168645;STB=0.5998;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0189522;OID=.;OPOS=17661128;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:6:4:8:6:6:4:8:6
chr1	17662662	.	T	C	173.08	PASS	AF=0.388889;AO=20;DP=53;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.0134786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.099;QD=12.8206;RBI=0.0455871;REFB=-0.0219644;REVB=-0.0435489;RO=33;SAF=9;SAR=11;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198217;STB=0.597108;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0159334;OID=.;OPOS=17662662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:33:33:20:21:0.388889:11:9:21:12:11:10:21:12
chr1	17666263	.	G	A	174.04	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0118452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4294;QD=19.3379;RBI=0.0354294;REFB=-0.0102394;REVB=0.0333906;RO=18;SAF=12;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202772;STB=0.615253;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0144736;OID=.;OPOS=17666263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:6:12:8:10:6:12:8:10
chr1	17707601	.	T	C	198.38	PASS	AF=0.302326;AO=25;DP=85;FAO=26;FDP=86;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.00503961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.36;QD=9.22715;RBI=0.0195837;REFB=-0.0286258;REVB=0.0189242;RO=60;SAF=16;SAR=9;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0712102;STB=0.523346;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0581746;OID=.;OPOS=17707601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:60:60:25:26:0.302326:9:16:35:25:10:16:35:25
chr1	17718671	.	AG	A	738.19	PASS	AF=1;AO=59;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.6812;QD=45.4271;RBI=0.153767;REFB=0;REVB=0.091359;RO=0;SAF=38;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.445205;SSEP=0;SSSB=3.22967e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0038628;OID=.;OPOS=17718672;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:59:64:65:65:0:44:21:0:0:14:0:38:21:0:0
chr1	17733267	.	ATGT	A	355.02	PASS	AF=0.364407;AO=39;DP=123;FAO=43;FDP=118;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=0.00923931;FXX=0.0327842;HRUN=1;LEN=3;MLLD=190.896;QD=12.0344;RBI=0.0158115;REFB=-0.00819196;REVB=0.0128311;RO=67;SAF=21;SAR=18;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507975;STB=0.509489;STBP=0.89;TYPE=del;VARB=0.0126442;OID=.;OPOS=17733268;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.364407:39:123:43:118:75:23:20:39:36:99:67:21:18:33:34
chr1	17733996	.	G	A	108.71	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0801968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5745;QD=24.1576;RBI=0.105879;REFB=-0.0116872;REVB=0.0691286;RO=6;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147396;STB=0.583194;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0158477;OID=.;OPOS=17733996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:7:5:4:2:7:5:4:2
chr1	17991052	.	T	C	239.12	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.928;QD=50.3409;RBI=0.0122738;REFB=0;REVB=0.00363514;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.52254e-05;OID=.;OPOS=17991052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr1	18023365	.	C	T	842.78	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.09;QD=56.1852;RBI=0.0466573;REFB=0;REVB=0.0431246;RO=0;SAF=38;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000982522;OID=.;OPOS=18023365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:60:0:0:55:60:1:17:38:0:0:22:38:0:0
chr1	18023509	.	T	C	1135.26	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000724521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.867;QD=60.5472;RBI=0.011619;REFB=0;REVB=-0.0115964;RO=0;SAF=48;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.5647e-05;OID=.;OPOS=18023509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:27:48:0:0:27:48:0:0
chr1	18023690	.	A	G	752.64	PASS	AF=1;AO=47;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.841;QD=55.7512;RBI=0.0509541;REFB=0;REVB=0.0170542;RO=0;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187886;OID=.;OPOS=18023690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:47:54:1:30:17:0:0:30:24:0:0
chr1	18807897	.	C	G	65.31	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0200479;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=296.014;QD=10.8851;RBI=0.0253365;REFB=-0.02411;REVB=-0.0154926;RO=15;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227806;STB=0.636074;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0413026;OID=.;OPOS=18807897;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:5:4:10:5:5:4:10:5
chr1	18807953	.	C	A	115.07	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.0258417;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=97.8999;QD=19.1783;RBI=0.0504439;REFB=-0.0120044;REVB=0.043322;RO=10;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.433859;STB=0.758672;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0359038;OID=.;OPOS=18807953;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:10:11:13:13:0.541667:9:4:9:1:9:4:10:1
chr1	18808292	.	C	A	130.69	PASS	AF=0.517241;AO=12;DP=26;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0454709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.565;QD=18.0268;RBI=0.0532278;REFB=-0.0417764;REVB=0.0276694;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259131;STB=0.660189;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0371256;OID=.;OPOS=18808292;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:29:13:14:12:15:0.517241:7:5:2:11:8:7:2:12
chr1	18808465	.	T	A	540.19	PASS	AF=0.54;AO=54;DP=102;FAO=54;FDP=100;FR=.;FRO=46;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00478307;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.237;QD=21.6076;RBI=0.00581425;REFB=-0.0160386;REVB=0.00330572;RO=46;SAF=37;SAR=17;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129773;STB=0.571517;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0149523;OID=.;OPOS=18808465;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:100:46:46:54:54:0.54:17:37:25:21:17:37:25:21
chr1	18808526	.	A	C	723.32	PASS	AF=0.565574;AO=68;DP=122;FAO=69;FDP=122;FR=.;FRO=53;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.00354802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.492;QD=23.7155;RBI=0.0347307;REFB=-0.0286258;REVB=-0.034549;RO=52;SAF=39;SAR=29;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0894879;STB=0.549019;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0232905;OID=.;OPOS=18808526;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:52:53:68:69:0.565574:29:39:24:28:30:39:24:29
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chr1	18810344	.	G	T	139.33	PASS	AF=0.333333;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0147494;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1333;QD=11.6105;RBI=0.0359286;REFB=-0.0253318;REVB=0.0327615;RO=31;SAF=7;SAR=9;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19371;STB=0.602966;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0211329;OID=.;OPOS=18810344;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:31:32:16:16:0.333333:9:7:19:12:9:7:19:13
chr1	18810486	.	A	C	154.34	PASS	AF=0.344828;AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.00551957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.291;QD=10.6444;RBI=0.00587521;REFB=-0.0093608;REVB=-0.00201307;RO=37;SAF=9;SAR=11;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0812799;STB=0.536806;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0236761;OID=.;OPOS=18810486;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:37:38:20:20:0.344828:11:9:14:23:11:9:15:23
chr1	18812176	.	G	A	267.67	PASS	AF=0.392405;AO=31;DP=80;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0051085;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.017;QD=13.5528;RBI=0.0140986;REFB=-0.00988411;REVB=-0.0131405;RO=48;SAF=15;SAR=16;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171707;STB=0.509798;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0197735;OID=.;OPOS=18812176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:48:48:31:31:0.392405:16:15:24:24:16:15:24:24
chr1	18812316	.	C	T	363.35	PASS	AF=0.419355;AO=39;DP=93;FAO=39;FDP=93;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=-0.0149776;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.034;QD=15.6279;RBI=0.0161708;REFB=0.0137382;REVB=0.0060964;RO=51;SAF=19;SAR=20;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121346;STB=0.582376;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=-0.0145197;OID=.;OPOS=18812316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:51:54:39:39:0.419355:20:19:31:20:20:19:34:20
chr1	19018405	.	G	A	583.32	PASS	AF=0.557692;AO=57;DP=103;FAO=58;FDP=104;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0140353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.088;QD=22.4354;RBI=0.0204962;REFB=-0.0120636;REVB=0.0149367;RO=46;SAF=22;SAR=35;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113242;STB=0.56478;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00722925;OID=.;OPOS=19018405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:46:46:57:58:0.557692:35:22:24:22:36:22:24:22
chr1	19018432	.	A	C	444.89	PASS	AF=0.505747;AO=43;DP=86;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0113555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.189;QD=20.4549;RBI=0.0160595;REFB=-0.0160165;REVB=-0.0113562;RO=42;SAF=15;SAR=28;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182663;STB=0.587056;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0124186;OID=.;OPOS=19018432;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:42:43:43:44:0.505747:28:15:23:19:28:16:23:20
chr1	19027239	.	A	G	542.45	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0466136;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6902;QD=60.2719;RBI=0.0466143;REFB=0;REVB=0.000255038;RO=0;SAF=2;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00120883;OID=.;OPOS=19027239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:34:2:0:0:34:2:0:0
chr1	19166294	.	G	A	105.86	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0518846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.943;QD=21.1726;RBI=0.0562159;REFB=-0.0667551;REVB=0.0216382;RO=8;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677961;STB=0.538399;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0326766;OID=.;OPOS=19166294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:8:4:2:6:8:4:2:6
chr1	19186129	.	G	C	981.92	PASS	AF=0.921053;AO=70;DP=76;FAO=70;FDP=76;FR=.;FRO=6;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0328252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.485;QD=51.6802;RBI=0.0329442;REFB=-0.170317;REVB=-0.00279721;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.542845;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0059302;OID=.;OPOS=19186129;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:76:76:0:6:70:70:0.921053:38:32:0:0:38:32:6:0
chr1	19201956	.	A	G	238.28	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0694831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3231;QD=16.1548;RBI=0.106892;REFB=-0.026659;REVB=-0.081228;RO=32;SAF=16;SAR=11;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207391;STB=0.61683;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0408508;OID=.;OPOS=19201956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:11:16:12:20:11:16:12:20
chr1	19202896	.	G	A	300.26	PASS	AF=0.452055;AO=28;DP=72;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.0201955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.028;QD=16.4528;RBI=0.022919;REFB=-0.014374;REVB=0.0108362;RO=29;SAF=20;SAR=8;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506345;STB=0.501967;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0109924;OID=.;OPOS=19202896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:29:40:28:33:0.452055:8:20:22:7:10:23:28:12
chr1	19202917	.	T	C	270.73	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=-0.040001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.052;QD=16.9203;RBI=0.042854;REFB=-0.00685374;REVB=0.015375;RO=29;SAF=18;SAR=12;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0840306;STB=0.577132;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00507086;OID=.;OPOS=19202917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:29:34:30:30:0.46875:12:18:20:9:12:18:25:9
chr1	19202926	.	T	C	253.6	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0100459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.004;QD=17.4898;RBI=0.0308528;REFB=-0.0227092;REVB=-0.0291715;RO=30;SAF=18;SAR=10;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0939025;STB=0.55245;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0313945;OID=.;OPOS=19202926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:10:18:22:8:10:18:22:8
chr1	19203997	.	C	G	670.68	PASS	AF=0.462585;AO=68;DP=147;FAO=68;FDP=147;FR=.;FRO=79;FSAF=46;FSAR=22;FSRF=54;FSRR=25;FWDB=0.00594349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.793;QD=18.2497;RBI=0.00608531;REFB=-0.0192719;REVB=-0.00130612;RO=79;SAF=46;SAR=22;SRF=54;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00784887;STB=0.504355;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0252146;OID=.;OPOS=19203997;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:79:79:68:68:0.462585:22:46:54:25:22:46:54:25
chr1	19401405	.	G	A	781.89	PASS	AF=0.95;AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00234435;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.494;QD=52.1261;RBI=0.0246494;REFB=-0.0797101;REVB=0.0245377;RO=2;SAF=33;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00516834;STB=0.51254;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.000603575;OID=.;OPOS=19401405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:60:60:2:3:57:57:0.95:24:33:1:1:24:33:1:2
chr1	19408294	.	G	GC	65.11	PASS	AF=0.466667;AO=9;DP=29;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.136542;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.8562;QD=8.68145;RBI=0.146839;REFB=0.0673371;REVB=0.0540174;RO=17;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283174;STB=0.571326;STBP=0.515;TYPE=ins;VARB=-0.0755969;OID=.;OPOS=19408295;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.466667:9:29:14:30:16:8:6:7:9:65:17:4:5:8:9
chr1	19411129	.	A	G	1062.41	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9593;QD=59.854;RBI=0.0324244;REFB=0;REVB=-0.0284672;RO=0;SAF=25;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50978e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000333606;OID=.;OPOS=19411129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:46:25:0:0:46:25:0:0
chr1	19413261	.	T	A	1132.2	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.002;QD=59.5893;RBI=0.0334186;REFB=0;REVB=0.00766429;RO=0;SAF=24;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158609;OID=.;OPOS=19413261;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:74:76:1:50:24:0:0:50:26:0:0
chr1	19415304	.	C	T	870.18	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0799605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.028;QD=58.012;RBI=0.095376;REFB=0;REVB=0.0519895;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304975;OID=.;OPOS=19415304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:60:0:0:55:60:1:23:32:0:0:23:37:0:0
chr1	19433449	.	A	G	902.68	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0463085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7248;QD=58.2372;RBI=0.0466914;REFB=0;REVB=0.00596733;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00019297;OID=.;OPOS=19433449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:30:32:0:0:30:32:0:0
chr1	19447843	.	C	G	632.16	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0782963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6322;QD=61.6739;RBI=0.080244;REFB=0;REVB=-0.0175727;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00126339;OID=.;OPOS=19447843;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr1	19510394	.	A	G	724.02	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0117667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.947;QD=59.1036;RBI=0.0117913;REFB=-0.0862609;REVB=-0.000760856;RO=2;SAF=22;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00245737;STB=0.501307;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.000755296;OID=.;OPOS=19510394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:49:49:2:2:47:47:0.959184:25:22:1:1:25:22:1:1
chr1	19565344	.	C	G	316.25	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113765;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.5575;QD=52.7079;RBI=0.129944;REFB=0;REVB=0.0627925;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00802831;OID=.;OPOS=19565344;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:22:24:1:14:8:0:0:14:10:0:0
chr1	19595137	.	C	T	988.26	PASS	AF=1;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0635534;FXX=0.0571347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1713;QD=59.8943;RBI=0.0648754;REFB=0;REVB=0.0130301;RO=0;SAF=41;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00191245;OID=.;OPOS=19595137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:66:0:0:66:66:1:25:41:0:0:25:41:0:0
chr1	19596124	.	C	T	1510.77	PASS	AF=1;AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105735;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6655;QD=59.8325;RBI=0.0139374;REFB=0;REVB=0.00908026;RO=0;SAF=60;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.25502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129177;OID=.;OPOS=19596124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:103:101:0:0:101:101:1:41:60:0:0:41:60:0:0
chr1	19596156	.	G	T	1434.22	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2368;QD=61.0307;RBI=0.0594606;REFB=-0.0813708;REVB=0.0379234;RO=1;SAF=52;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117038;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00225177;OID=.;OPOS=19596156;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:93:94:1:0:92:94:1:40:52:0:1:42:52:0:0
chr1	19609254	.	T	C	1514.04	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176976;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.895;QD=63.7492;RBI=0.0830158;REFB=0;REVB=0.0811074;RO=0;SAF=54;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02781e-05;OID=.;OPOS=19609254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:95:0:0:96:95:1:42:54:0:0:41:54:0:0
chr1	19611241	.	T	C	851.24	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8285;QD=57.711;RBI=0.0671225;REFB=0;REVB=-0.066357;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000549614;OID=.;OPOS=19611241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:31:28:0:0:31:28:0:0
chr1	19612477	.	C	T	1013.17	PASS	AF=1;AO=67;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437786;FXX=0.0422476;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.0165;QD=59.5984;RBI=0.137438;REFB=0;REVB=0.13028;RO=0;SAF=46;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147736;OID=.;OPOS=19612477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:67:68:1:21:46:0:0:22:46:0:0
chr1	19726907	.	A	T	791.21	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000866078;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.343;QD=64.5883;RBI=0.0472099;REFB=0;REVB=0.0472019;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187446;OID=.;OPOS=19726907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0
chr1	19750909	.	G	T	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.567;QD=57.2371;RBI=0.0319778;REFB=0;REVB=0.0242582;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.04966e-05;OID=.;OPOS=19750909;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
chr1	19858684	.	A	G	212.81	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.00338765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.78;QD=20.2673;RBI=0.0747018;REFB=0.00238132;REVB=-0.0746249;RO=21;SAF=10;SAR=11;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294532;STB=0.664288;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=-0.00226831;OID=.;OPOS=19858684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:11:10:17:4:11:10:17:4
chr1	19953118	.	G	T	718.47	PASS	AF=0.978723;AO=36;DP=48;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000781538;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2391;QD=61.1465;RBI=0.0223375;REFB=-0.095127;REVB=0.0223238;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512815;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000248513;OID=.;OPOS=19953118;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:47:0:1:36:46:0.978723:15:21:0:0:19:27:0:1
chr1	20020993	.	AC	GT	308.25	PASS	AF=0.485294;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00971768;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=2;MLLD=194.472;QD=18.1323;RBI=0.0153066;REFB=-0.0156976;REVB=-0.0118262;RO=35;SAF=18;SAR=15;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08131;STB=0.545427;STBP=0.476;TYPE=mnp;VARB=0.0153424;OID=.;OPOS=20020993;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:35:35:33:33:0.485294:15:18:16:19:15:18:16:19
chr1	20097941	.	G	T	99.1	PASS	AF=0.342105;AO=12;DP=37;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0014452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.54;QD=10.4317;RBI=0.0180964;REFB=-0.0458963;REVB=-0.0180386;RO=25;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664102;STB=0.5678;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0629485;OID=.;OPOS=20097941;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:25:25:12:13:0.342105:7:5:9:16:7:6:9:16
chr1	20246876	.	C	T	378.57	PASS	AF=0.527778;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=7;FWDB=-0.0087092;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.091;QD=21.0316;RBI=0.0259851;REFB=-0.0201908;REVB=0.0244821;RO=33;SAF=25;SAR=13;SRF=26;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127455;STB=0.574793;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0231284;OID=.;OPOS=20246876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:33:34:38:38:0.527778:13:25:26:7:13:25:27:7
chr1	20297475	.	G	A	34.01	PASS	AF=0.461538;AO=5;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00293627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.053;QD=10.4635;RBI=0.0699023;REFB=-0.0213065;REVB=0.0698406;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.463402;STB=0.76859;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0357255;OID=.;OPOS=20297475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:13:13:7:7:5:6:0.461538:2:3:7:0:3:3:7:0
chr1	20297566	.	G	A	310.72	PASS	AF=0.441558;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0117423;FXX=0.0128189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.224;QD=16.1413;RBI=0.0119049;REFB=-0.00688498;REVB=0.00196051;RO=42;SAF=14;SAR=20;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246587;STB=0.631503;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00940492;OID=.;OPOS=20297566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:42:43:34:34:0.441558:20:14:28:14:20:14:28:15
chr1	20297723	.	C	T	209.57	PASS	AF=0.44898;AO=21;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0132727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.016;QD=17.1081;RBI=0.0134038;REFB=-0.0293894;REVB=0.00187007;RO=26;SAF=7;SAR=14;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942073;STB=0.546832;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0358657;OID=.;OPOS=20297723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:27:21:22:0.44898:14:7:11:15:14:8:12:15
chr1	20304962	.	C	G	109.93	PASS	AF=0.266667;AO=16;DP=61;FAO=16;FDP=60;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.0187465;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.535;QD=7.32888;RBI=0.0272132;REFB=-0.0129044;REVB=0.0197263;RO=45;SAF=8;SAR=8;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940213;STB=0.566585;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0413071;OID=.;OPOS=20304962;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:45:44:16:16:0.266667:8:8:26:19:8:8:26:18
chr1	20442054	.	T	C	1141.89	PASS	AF=1;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163058;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.524;QD=60.9009;RBI=0.068208;REFB=0;REVB=0.0662303;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.12394e-05;OID=.;OPOS=20442054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:75:0:0:75:75:1:31:44:0:0:31:44:0:0
chr1	20466003	.	G	A	391.29	PASS	AF=0.364341;AO=47;DP=129;FAO=47;FDP=129;FR=.;FRO=82;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=44;FSRR=38;FWDB=0.00560644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.654;QD=12.133;RBI=0.0445782;REFB=-0.00488157;REVB=0.0442243;RO=80;SAF=23;SAR=24;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0669596;STB=0.529981;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.00902414;OID=.;OPOS=20466003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:80:82:47:47:0.364341:24:23:44:36:24:23:44:38
chr1	20474876	.	G	A	44.85	PASS	AF=0.363636;AO=6;DP=21;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.102948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.529;QD=8.15452;RBI=0.103015;REFB=-0.0243492;REVB=-0.00371694;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255261;STB=0.524935;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.134025;OID=.;OPOS=20474876;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:21:22:13:14:6:8:0.363636:5:1:2:11:7:1:2:12
chr1	20490518	.	T	C	955.16	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.249;QD=58.7788;RBI=0.0335964;REFB=0;REVB=0.0141335;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001314;OID=.;OPOS=20490518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:34:31:0:0:34:31:0:0
chr1	20501582	.	G	A	273.21	PASS	AF=0.492063;AO=29;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=3;FWDB=0.00697406;FXX=0.0454477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0934;QD=17.3464;RBI=0.00712471;REFB=0.000171832;REVB=0.0014574;RO=29;SAF=23;SAR=6;SRF=26;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157245;STB=0.590113;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0054736;OID=.;OPOS=20501582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:29:32:29:31:0.492063:6:23:26:3:6:25:29:3
chr1	20517156	.	G	GCACATGATAAGGCCCAAGTCC	146.57	PASS	AF=0.204918;AO=21;DP=126;FAO=25;FDP=122;FR=.;FRO=97;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=0.00413451;FXX=0.0239981;HRUN=1;LEN=21;MLLD=480.579;QD=4.80544;RBI=0.0156897;REFB=-0.0034583;REVB=0.0151351;RO=100;SAF=7;SAR=14;SRF=46;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166861;STB=0.663746;STBP=0.066;TYPE=ins;VARB=0.011425;OID=.;OPOS=20517157;OREF=-;OALT=CACATGATAAGGCCCAAGTCC;OMAPALT=GCACATGATAAGGCCCAAGTCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.204918:21:126:25:122:97:7:18:46:51:99:100:7:14:46:54
chr1	20518226	.	G	A	275.91	PASS	AF=0.376471;AO=32;DP=86;FAO=32;FDP=85;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.00393619;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.359;QD=12.9838;RBI=0.00777032;REFB=-0.00304796;REVB=-0.00669958;RO=53;SAF=19;SAR=13;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19332;STB=0.610596;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00895194;OID=.;OPOS=20518226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:53:53:32:32:0.376471:13:19:22:31:13:19:22:31
chr1	20519808	.	G	A	233.5	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=6;FWDB=0.0475075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.664;QD=15.3114;RBI=0.0494452;REFB=-0.00790149;REVB=0.0137066;RO=34;SAF=14;SAR=13;SRF=28;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309207;STB=0.672303;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.006067;OID=.;OPOS=20519808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:13:14:28:6:13:14:28:6
chr1	20520732	.	T	C	306.05	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0190873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.332;QD=20.4034;RBI=0.0197138;REFB=-0.0210947;REVB=-0.00493043;RO=27;SAF=15;SAR=17;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715829;STB=0.53123;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.011986;OID=.;OPOS=20520732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:27:28:32:32:0.533333:17:15:15:12:17:15:15:13
chr1	20656824	.	A	G	2178.57	PASS	AF=1;AO=138;DP=138;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.055246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.594;QD=63.147;RBI=0.0847744;REFB=0;REVB=0.0643006;RO=0;SAF=73;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.43793e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.58602e-05;OID=.;OPOS=20656824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:138:138:0:0:138:138:1:65:73:0:0:65:73:0:0
chr1	20662938	.	A	G	786.78	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00387096;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=275.517;QD=55.2127;RBI=0.00710283;REFB=-0.102031;REVB=-0.00595532;RO=1;SAF=14;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110967;STB=0.50588;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00170446;OID=.;OPOS=20662938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:42:14:0:1:42:14:0:1
chr1	20671961	.	G	A	446.92	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00882548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.307;QD=57.6672;RBI=0.0231375;REFB=0;REVB=0.0213882;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.67306e-05;OID=.;OPOS=20671961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr1	20680718	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00502979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9756;QD=49.599;RBI=0.0214147;REFB=0;REVB=0.0208156;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000503392;OID=.;OPOS=20680718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0
chr1	20972048	.	G	A	742.69	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0127022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8014;QD=53.0493;RBI=0.0145224;REFB=-0.054467;REVB=0.00703959;RO=2;SAF=22;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409266;STB=0.521731;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00243783;OID=.;OPOS=20972048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:56:2:2:54:54:0.964286:32:22:2:0:32:22:2:0
chr1	20972111	.	G	A	411.67	PASS	AF=0.494253;AO=41;DP=88;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0124387;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.621;QD=18.9273;RBI=0.0197323;REFB=-0.0309762;REVB=-0.0153181;RO=40;SAF=17;SAR=24;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0770716;STB=0.541044;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.022544;OID=.;OPOS=20972111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:40:44:41:43:0.494253:24:17:20:20:24:19:23:21
chr1	20977000	.	A	C	206.07	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00612246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.82;QD=16.8218;RBI=0.0121249;REFB=-0.00399212;REVB=-0.0104656;RO=28;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130437;STB=0.574398;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.00869491;OID=.;OPOS=20977000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:10:11:11:17:10:11:11:17
chr1	20987873	.	G	C	941.0	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0390285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.185;QD=57.0303;RBI=0.0469806;REFB=-0.0656536;REVB=0.0261524;RO=1;SAF=32;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014534;STB=0.50769;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00058446;OID=.;OPOS=20987873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:33:32:1:0:33:32:1:0
chr1	20992819	.	G	C	294.02	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.00202341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.556;QD=17.5533;RBI=0.0159841;REFB=0.00994529;REVB=0.0158555;RO=35;SAF=16;SAR=16;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146973;STB=0.58204;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=-0.010386;OID=.;OPOS=20992819;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:16:16:12:23:16:16:12:23
chr1	20998445	.	GT	GG,G,TG	671.1	PASS	AF=0.01,0.92,0.07;AO=18,18,6;DP=102;FAO=1,92,7;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=1,49,0;FSAR=0,43,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.514751,0.997356,0.123618;FXX=0.0196059;HRUN=5,5,2;LEN=1,1,2;MLLD=11.4324,9.1865,158.629;QD=26.8438;RBI=0.524299,0.998519,0.140237;REFB=0.0566566,0.0214783,0.000769824;REVB=-0.0996024,0.0481823,-0.0662193;RO=48;SAF=1,2,0;SAR=17,16,6;SRF=42;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.815655,-0.767805,-0.805772;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=-0.0703864,0.0473054,0.103613;OID=.,.,.;OPOS=20998446,20998446,20998445;OREF=T,T,GT;OALT=G,-,TG;OMAPALT=GG,G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:25:102:100:48:0:18,18,6:1,92,7:0.01,0.92,0.07:17,16,6:1,2,0:42:6:0,43,7:1,49,0:0:0
chr1	21011346	.	A	G	556.44	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.221;QD=60.1559;RBI=0.0190829;REFB=0;REVB=-0.0156258;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.14478e-05;OID=.;OPOS=21011346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:10:26:0:0:10:27:0:0
chr1	21011622	.	C	A,CGACA	330.3	PASS	AF=0.09375,0.75;AO=3,21;DP=33;FAO=3,24;FDP=32;FR=.;FRO=5;FSAF=2,11;FSAR=1,13;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00780672,0.04017;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,4;MLLD=98.8885,217.91;QD=41.2878;RBI=0.00970341,0.040501;REFB=0.00249304,-0.0250647;REVB=-0.00576291,-0.00516716;RO=6;SAF=2,8;SAR=1,13;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.167835,-0.0504888;STB=0.665555,0.510136;STBP=0.618,0.869;TYPE=snp,ins;VARB=0.01743,0.00473551;OID=.,.;OPOS=21011622,21011623;OREF=C,-;OALT=A,GACA;OMAPALT=A,CGACA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:28:33:32:6:5:3,21:3,24:0.09375,0.75:1,13:2,8:3:3:1,13:2,11:2:3
chr1	21024901	.	C	T	620.08	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0110095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.953;QD=59.0549;RBI=0.020519;REFB=-0.166905;REVB=0.0173153;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00102099;OID=.;OPOS=21024901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:0:1:41:41:0.97619:19:22:0:0:19:22:1:0
chr1	21031046	.	C	T	2301.98	PASS	AF=1;AO=144;DP=147;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00936786;FXX=0.0204068;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.75;QD=63.9439;RBI=0.00936788;REFB=0;REVB=-1.42807e-05;RO=0;SAF=80;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.61589e-05;OID=.;OPOS=21031046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:144:0:0:144:144:1:64:80:0:0:64:80:0:0
chr1	21042094	.	G	A	856.82	PASS	AF=0.537975;AO=84;DP=156;FAO=85;FDP=158;FR=.;FRO=73;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=-0.0164007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.412;QD=21.6915;RBI=0.0166681;REFB=-0.0245723;REVB=0.00297371;RO=71;SAF=41;SAR=43;SRF=44;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110119;STB=0.556435;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0116535;OID=.;OPOS=21042094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:158:71:73:84:85:0.537975:43:41:44:27:43:42:45:28
chr1	21044161	.	A	G	170.17	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.112408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6329;QD=17.0172;RBI=0.113028;REFB=-0.00452111;REVB=-0.0118272;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436846;STB=0.524972;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.00299939;OID=.;OPOS=21044161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:9:9:10:12:9:9:10:12
chr1	21050958	.	C	T	1339.77	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.68;QD=62.3147;RBI=0.0663512;REFB=0;REVB=0.0624338;RO=0;SAF=61;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110505;OID=.;OPOS=21050958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:25:61:0:0:25:61:0:0
chr1	21133550	.	A	G	237.61	PASS	AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0343855;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.188;QD=13.7747;RBI=0.0352888;REFB=-0.00419681;REVB=-0.00793312;RO=41;SAF=8;SAR=20;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177467;STB=0.601775;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00590567;OID=.;OPOS=21133550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:41:41:28:28:0.405797:20:8:18:23:20:8:18:23
chr1	21167404	.	A	G	808.28	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.519;QD=55.7434;RBI=0.0258588;REFB=-0.0974756;REVB=-0.00380545;RO=1;SAF=24;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192443;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291462;OID=.;OPOS=21167404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:58:58:1:0:57:58:1:33:24:1:0:33:25:0:0
chr1	21307703	.	T	C	285.18	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0119021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.553;QD=23.7652;RBI=0.0122061;REFB=-0.0110861;REVB=-0.00270742;RO=21;SAF=23;SAR=3;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353306;STB=0.694873;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00781972;OID=.;OPOS=21307703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:22:26:26:0.541667:3:23:13:8:3:23:14:8
chr1	21573722	.	G	A	269.21	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00411647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.9991;QD=16.567;RBI=0.0208087;REFB=-0.0017906;REVB=0.0203975;RO=35;SAF=14;SAR=16;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728516;STB=0.540956;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00241156;OID=.;OPOS=21573722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:16:14:19:16:16:14:19:16
chr1	21795388	.	A	G	746.85	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.034;QD=63.5615;RBI=0.0505549;REFB=0;REVB=0.0140714;RO=0;SAF=17;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135682;OID=.;OPOS=21795388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:30:17:0:0:30:17:0:0
chr1	21808159	.	G	A	165.55	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.0216832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.537;QD=14.3958;RBI=0.0272092;REFB=-0.00240119;REVB=0.0164371;RO=27;SAF=15;SAR=3;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200506;STB=0.610973;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.00485309;OID=.;OPOS=21808159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:28:18:18:0.391304:3:15:19:8:3:15:20:8
chr1	21808207	.	A	C	57.37	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0419592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.693;QD=12.7483;RBI=0.0429802;REFB=-0.00416855;REVB=0.0093126;RO=10;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341689;STB=0.705344;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.00919295;OID=.;OPOS=21808207;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:2:6:4:6:2:6:4:6
chr1	21809750	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0951138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7329;QD=35.5755;RBI=0.0960281;REFB=0;REVB=-0.0132195;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00938047;OID=.;OPOS=21809750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr1	21889635	.	T	C	1116.89	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0449346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4386;QD=60.3726;RBI=0.0635659;REFB=0;REVB=0.0449612;RO=0;SAF=52;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53902e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.61604e-07;OID=.;OPOS=21889635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:22:52:0:0:22:52:0:0
chr1	21904267	.	A	G	587.94	PASS	AF=0.545455;AO=54;DP=99;FAO=54;FDP=99;FR=.;FRO=45;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0204578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8458;QD=23.7553;RBI=0.0307112;REFB=-0.00943994;REVB=0.0229055;RO=44;SAF=37;SAR=17;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144514;STB=0.585838;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00420231;OID=.;OPOS=21904267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:44:45:54:54:0.545455:17:37:23:21:17:37:23:22
chr1	21935433	.	G	T	144.48	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=54;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00407226;FXX=0.0370302;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.358;QD=11.114;RBI=0.00407226;REFB=-0.016665;REVB=3.45433e-06;RO=31;SAF=8;SAR=10;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0078536;STB=0.502162;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0377024;OID=.;OPOS=21935433;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:52:31:34:18:18:0.346154:10:8:14:17:10:8:15:19
chr1	21940555	.	C	T	114.05	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0587127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7094;QD=18.2485;RBI=0.0617999;REFB=0.011185;REVB=-0.0192885;RO=12;SAF=11;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378293;STB=0.720916;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.0161716;OID=.;OPOS=21940555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:2:11:6:6:2:11:6:6
chr1	21943820	.	G	A	326.58	PASS	AF=0.413793;AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=13;FWDB=0.0121234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.535;QD=15.0153;RBI=0.0591501;REFB=0.00759189;REVB=0.0578944;RO=51;SAF=21;SAR=15;SRF=38;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179573;STB=0.600763;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.0124535;OID=.;OPOS=21943820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:51:51:36:36:0.413793:15:21:38:13:15:21:38:13
chr1	22050648	.	AC	A,AA	300.77	PASS	AF=0.0869565,0.913043;AO=3,20;DP=23;FAO=2,21;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=1,8;FSAR=1,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511029,0.0410513;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=221.577,241.191;QD=52.3081;RBI=0.0523484,0.0420376;REFB=0,0;REVB=0.0113512,0.00905269;RO=0;SAF=2,7;SAR=1,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0651142,0.00520839;OID=.,.;OPOS=22050649,22050649;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0869565,0.913043:3,20:23:2,21:23:0:1,8:1,13:0:0:7:0:2,7:1,13:0:0
chr1	22109370	.	G	A	295.94	PASS	AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.0186006;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.296;QD=15.1764;RBI=0.0297801;REFB=-0.00771981;REVB=0.0232566;RO=45;SAF=10;SAR=23;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246224;STB=0.639847;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00726889;OID=.;OPOS=22109370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:45:45:33:33:0.423077:23:10:24:21:23:10:24:21
chr1	22141030	.	C	T	102.39	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0709943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.217;QD=11.7014;RBI=0.073904;REFB=-0.0151968;REVB=0.0205331;RO=21;SAF=5;SAR=8;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33535;STB=0.705592;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0373298;OID=.;OPOS=22141030;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:22:13:13:0.371429:8:5:15:6:8:5:16:6
chr1	22149935	.	T	C	1557.26	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.086;QD=63.5618;RBI=0.0195459;REFB=0;REVB=0.00667328;RO=0;SAF=59;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.53094e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.52107e-05;OID=.;OPOS=22149935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:98:0:0:91:98:1:32:59:0:0:35:63:0:0
chr1	22150120	.	C	T	199.76	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0203699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.192;QD=19.976;RBI=0.0399223;REFB=-0.0252565;REVB=0.0343345;RO=20;SAF=8;SAR=12;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176923;STB=0.5999;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0367125;OID=.;OPOS=22150120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:12:8:12:8:12:8:12:8
chr1	22150160	.	G	T	183.89	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00905228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.91;QD=17.9407;RBI=0.0101643;REFB=-0.0193387;REVB=0.00462271;RO=22;SAF=7;SAR=12;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127723;STB=0.572866;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.016761;OID=.;OPOS=22150160;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:12:7:11:11:12:7:11:11
chr1	22154845	.	A	G	332.34	PASS	AF=0.682927;AO=28;DP=41;FAO=28;FDP=41;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0102092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8842;QD=32.4238;RBI=0.05439;REFB=0.00555435;REVB=-0.0534233;RO=12;SAF=13;SAR=15;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110741;STB=0.547792;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=-0.0038357;OID=.;OPOS=22154845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:12:13:28:28:0.682927:15:13:8:4:15:13:8:5
chr1	22159008	.	C	A	257.27	PASS	AF=0.348315;AO=28;DP=87;FAO=31;FDP=89;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.08057;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=40.7215;QD=11.5625;RBI=0.120415;REFB=0.00741775;REVB=0.0894888;RO=29;SAF=25;SAR=3;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.401347;STB=0.735667;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.0105026;OID=.;OPOS=22159008;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:89:29:58:28:31:0.348315:3:25:18:11:4:27:36:22
chr1	22161275	.	G	A	152.37	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0146778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.453;QD=21.0164;RBI=0.0177383;REFB=-0.0167586;REVB=-0.00996032;RO=13;SAF=13;SAR=3;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139462;STB=0.57951;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0116917;OID=.;OPOS=22161275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:3:13:9:4:3:13:9:4
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chr1	22165901	.	A	G	136.87	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.00154139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.868;QD=18.2489;RBI=0.0301365;REFB=-0.0115679;REVB=0.030097;RO=15;SAF=6;SAR=9;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339805;STB=0.692071;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0166249;OID=.;OPOS=22165901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:9:6:12:3:9:6:12:3
chr1	22165987	.	G	A	213.75	PASS	AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0506916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5737;QD=15.0001;RBI=0.0522814;REFB=-0.00480012;REVB=0.0127947;RO=29;SAF=9;SAR=16;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12143;STB=0.563824;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00536354;OID=.;OPOS=22165987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:32:25:25:0.438596:16:9:14:15:16:9:15:17
chr1	22174426	.	T	G	332.9	PASS	AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0102421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.873;QD=19.0226;RBI=0.0110712;REFB=-0.0150347;REVB=0.00420368;RO=33;SAF=15;SAR=20;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18018;STB=0.585317;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0107459;OID=.;OPOS=22174426;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:33:35:35:35:0.5:20:15:21:12:20:15:21:14
chr1	22180292	.	TAAAAAAAC	TAAAAAA,TAAAAAAC	52.73	PASS	AF=0,0.415385;AO=12,9;DP=71;FAO=0,27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=0,19;FSAR=0,8;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.267605,-0.0654562;FXX=0.0844951;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=15.5236,7.52742;QD=3.24488;RBI=0.269206,0.22166;REFB=-0.00656323,-0.0748133;REVB=0.0293176,0.211775;RO=32;SAF=11,6;SAR=1,3;SRF=17;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.567289,0.16911;STB=0.5,0.513503;STBP=1,0.878;TYPE=del,del;VARB=0.0345152,0.089544;OID=.,.;OPOS=22180299,22180293;OREF=AC,A;OALT=-,-;OMAPALT=TAAAAAA,TAAAAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.415385:12,9:71:0,27:65:38:0,19:0,8:26:12:52:32:11,6:1,3:17:15
chr1	22191454	.	G	A	717.35	PASS	AF=0.963636;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.072226;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.162;QD=52.1705;RBI=0.177168;REFB=-0.142043;REVB=0.161778;RO=1;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018468;STB=0.500343;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00308003;OID=.;OPOS=22191454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:54:55:1:2:52:53:0.963636:25:27:0:1:26:27:1:1
chr1	22199245	.	C	T	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0213014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.8393;QD=13.4856;RBI=0.0216673;REFB=-0.0251036;REVB=0.00396558;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498364;STB=0.505605;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0417248;OID=.;OPOS=22199245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:10:11:9:9:0.45:5:4:5:5:5:4:5:6
chr1	22202227	.	C	T	95.66	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0498138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.1071;QD=11.5957;RBI=0.0601095;REFB=-0.0202166;REVB=-0.0336413;RO=21;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166256;STB=0.599822;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0194008;OID=.;OPOS=22202227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:9:3:8:13:9:3:8:13
chr1	22206649	.	T	C	626.35	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0146749;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.7899;QD=58.2647;RBI=0.0179922;REFB=-0.065615;REVB=0.0104099;RO=1;SAF=21;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218287;STB=0.511622;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00134801;OID=.;OPOS=22206649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:21:21:1:0:21:21:1:0
chr1	22206942	.	G	A	1124.31	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201931;FXX=0.0263123;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.399;QD=60.7736;RBI=0.0267215;REFB=0;REVB=0.0175009;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.68055e-05;OID=.;OPOS=22206942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:74:0:0:74:74:1:33:41:0:0:33:41:0:0
chr1	22207235	.	T	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0335425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.018;QD=56.9381;RBI=0.0336013;REFB=0;REVB=0.00198758;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.52898e-05;OID=.;OPOS=22207235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0
chr1	22214127	.	A	G	511.74	PASS	AF=0.515789;AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0266407;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.3777;QD=21.5468;RBI=0.114696;REFB=-0.0418649;REVB=-0.111559;RO=43;SAF=16;SAR=33;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126803;STB=0.578914;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0566809;OID=.;OPOS=22214127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:95:43:46:49:49:0.515789:33:16:20:23:33:16:22:24
chr1	22216574	.	C	A	97.91	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00638787;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.663;QD=13.5055;RBI=0.00639431;REFB=-0.0185817;REVB=-0.00028673;RO=17;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170437;STB=0.599834;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0289796;OID=.;OPOS=22216574;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:5:7:7:10:5:7:7:10
chr1	22216604	.	C	G	36.61	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0849314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.537;QD=7.32291;RBI=0.0931089;REFB=0.00142368;REVB=0.0381565;RO=14;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157893;STB=0.59968;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.000920773;OID=.;OPOS=22216604;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:3:3:5:9:3:3:5:9
chr1	22217108	.	G	A	673.93	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0318202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.4388;QD=59.9047;RBI=0.0345111;REFB=-0.152335;REVB=-0.0133599;RO=1;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154053;STB=0.508193;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.00436543;OID=.;OPOS=22217108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:30:14:0:1:30:14:0:1
chr1	22307340	.	C	T	94.61	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.5798;QD=37.8451;RBI=0.0623544;REFB=0;REVB=0.034572;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0167204;OID=.;OPOS=22307340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:4:5:0:0:4:6:0:0
chr1	22307358	.	C	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00406278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.8136;QD=43.486;RBI=0.0190064;REFB=0;REVB=0.0185671;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460037;OID=.;OPOS=22307358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr1	22307538	.	C	T	750.94	PASS	AF=0.98;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0291813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.655;QD=60.0748;RBI=0.0336783;REFB=-0.129438;REVB=-0.016813;RO=2;SAF=26;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348198;STB=0.509087;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000945757;OID=.;OPOS=22307538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:50:50:2:1:48:49:0.98:22:26:2:0:22:27:1:0
chr1	22310262	.	G	C	797.94	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0499025;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1321;QD=56.9959;RBI=0.102456;REFB=0;REVB=-0.0894817;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00151327;OID=.;OPOS=22310262;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
chr1	22310725	.	G	C	1189.31	PASS	AF=0.9875;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00858471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8644;QD=59.4656;RBI=0.127227;REFB=-0.0406885;REVB=0.126937;RO=1;SAF=38;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122936;STB=0.506492;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0035013;OID=.;OPOS=22310725;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:80:1:1:78:79:0.9875:40:38:1:0:41:38:1:0
chr1	22310824	.	T	C	1190.42	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.041;QD=61.0472;RBI=0.0216082;REFB=0;REVB=0.0102333;RO=0;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.27841e-05;OID=.;OPOS=22310824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:47:31:0:0:47:31:0:0
chr1	22313161	.	T	C	651.1	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00909724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.047;QD=62.0098;RBI=0.0099406;REFB=0;REVB=0.00400696;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.68109e-05;OID=.;OPOS=22313161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
chr1	22314015	.	GA	G,GG	747.24	PASS	AF=0.933333,0;AO=51,4;DP=59;FAO=56,0;FDP=60;FR=.;FRO=4;FSAF=20,0;FSAR=36,0;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00516203,-0.00598882;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=254.637,244.442;QD=49.8161;RBI=0.0326826,0.0267036;REFB=-0.000301836,0.00437166;REVB=0.0322724,0.0260234;RO=4;SAF=19,1;SAR=32,3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0185227,-0.223593;STB=0.510306,0.5;STBP=0.593,1;TYPE=del,snp;VARB=2.62699e-05,-0.0127137;OID=.,.;OPOS=22314016,22314016;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.933333,0:51,4:59:56,0:60:4:20,0:36,0:2:2:16:4:19,1:32,3:2:2
chr1	22314240	.	A	T	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00133998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.074;QD=24.327;RBI=0.0707448;REFB=-0.00561537;REVB=0.0707321;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174483;STB=0.599732;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.00327305;OID=.;OPOS=22314240;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:4:3:0:2:4:3:0:2
chr1	22315737	.	C	CT	167.21	PASS	AF=1;AO=2;DP=18;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0952698;FXX=0.062461;HRUN=0;LEN=1;MLLD=150.782;QD=44.5892;RBI=0.127059;REFB=-0.000146299;REVB=-0.0840692;RO=16;SAF=0;SAR=2;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450392;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00082347;OID=.;OPOS=22315738;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:2:18:15:15:0:4:11:0:0:3:16:0:2:4:12
chr1	22315738	.	C	T	158.57	PASS	AF=0.833333;AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=18;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0299594;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=210.266;QD=35.238;RBI=0.0312073;REFB=-0.050723;REVB=0.00873669;RO=3;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109327;STB=0.559925;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00207644;OID=.;OPOS=22315738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:18:18:3:3:15:15:0.833333:11:4:0:3:11:4:0:3
chr1	22324705	.	T	C	1048.93	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0280452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.863;QD=58.274;RBI=0.0292086;REFB=-0.175557;REVB=0.00816155;RO=1;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133193;STB=0.50704;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=1.01165e-05;OID=.;OPOS=22324705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:35:36:0:1:35:36:0:1
chr1	22329062	.	CCG	CGT,GTG	233.85	PASS	AF=0.0740741,0.703704;AO=3,18;DP=28;FAO=2,19;FDP=27;FR=.;FRO=6;FSAF=1,8;FSAR=1,11;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0157959,0.0139634;FXX=0.0357015;HRUN=3,3;LEN=2,2;MLLD=141.86,162.392;QD=34.6446;RBI=0.0214174,0.0396698;REFB=-0.0666574,-0.0265904;REVB=-0.0144635,0.0371311;RO=5;SAF=1,8;SAR=2,10;SRF=1;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.152533,0.0991674;STB=0.748118,0.563812;STBP=0.721,0.335;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0352709,0.00933346;OID=.,.;OPOS=22329063,22329062;OREF=CG,CC;OALT=GT,GT;OMAPALT=CGT,GTG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:37:28:27:5:6:3,18:2,19:0.0740741,0.703704:2,10:1,8:1:4:1,11:1,8:1:5
chr1	22332008	.	T	C	33.43	PASS	AF=0.0987654;AO=7;DP=80;FAO=8;FDP=81;FR=.;FRO=73;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.0109972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.509;QD=1.65075;RBI=0.0284629;REFB=-0.00388494;REVB=0.0262526;RO=73;SAF=6;SAR=1;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426361;STB=0.865727;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0239059;OID=.;OPOS=22332008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:80:81:73:73:7:8:0.0987654:1:6:35:38:1:7:35:38
chr1	22336277	.	C	G	575.77	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0506219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0137;QD=60.6071;RBI=0.055571;REFB=0;REVB=-0.0229251;RO=0;SAF=28;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011225;OID=.;OPOS=22336277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:10:28:0:0:10:28:0:0
chr1	22336305	.	C	T	453.65	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0106532;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.39;QD=54.9874;RBI=0.0218458;REFB=-0.0977598;REVB=0.0190722;RO=1;SAF=24;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548081;STB=0.529393;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00555865;OID=.;OPOS=22336305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:8:24:0:1:8:24:0:1
chr1	22336308	.	G	A	453.83	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0017121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.631;QD=55.0092;RBI=0.0181754;REFB=-0.0691661;REVB=0.0180946;RO=1;SAF=24;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548081;STB=0.529393;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00354279;OID=.;OPOS=22336308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:8:24:0:1:8:24:0:1
chr1	22445209	.	C	T	103.5	PASS	AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00124375;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.678;QD=9.85724;RBI=0.015533;REFB=-0.0189346;REVB=-0.0154831;RO=29;SAF=5;SAR=8;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751011;STB=0.545384;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0364937;OID=.;OPOS=22445209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:29:29:13:13:0.309524:8:5:13:16:8:5:13:16
chr1	22816926	.	A	AC,C	37.62	PASS	AF=0.266667,0.0333333;AO=7,2;DP=31;FAO=8,1;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=6,1;FSAR=2,0;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0270585,-0.0318248;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=48.7275,102.72;QD=5.01657;RBI=0.0300048,0.0324432;REFB=-0.0112766,-0.00330173;REVB=-0.0129662,0.00630427;RO=21;SAF=5,2;SAR=2,0;SRF=10;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.283315,0.514114;STB=0.708546,0.990169;STBP=0.221,0.464;TYPE=ins,snp;VARB=0.146421,0.0964452;OID=.,.;OPOS=22816927,22816926;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:31:30:21:21:7,2:8,1:0.266667,0.0333333:2,0:5,2:10:11:2,0:6,1:10:11
chr1	22835677	.	A	G	1624.38	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.56;QD=60.1624;RBI=0.0540781;REFB=0;REVB=0.0317119;RO=0;SAF=46;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67537e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.85361e-05;OID=.;OPOS=22835677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:62:46:0:0:62:46:0:0
chr1	22846709	.	G	A	766.43	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.568;QD=63.8694;RBI=0.0346468;REFB=0;REVB=0.0304801;RO=0;SAF=34;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.01704e-05;OID=.;OPOS=22846709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:14:34:0:0:14:34:0:0
chr1	22850893	.	G	T	301.74	PASS	AF=0.5625;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00086578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7653;QD=25.1453;RBI=0.0739148;REFB=0.0219487;REVB=0.0739097;RO=21;SAF=14;SAR=13;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145559;STB=0.580587;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=-0.013311;OID=.;OPOS=22850893;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:21:27:27:0.5625:13:14:7:14:13:14:7:14
chr1	22852715	.	G	C	355.79	PASS	AF=0.638298;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=47;FR=.;FRO=17;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0214037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1683;QD=30.2803;RBI=0.0415016;REFB=0.00867748;REVB=-0.0355565;RO=17;SAF=22;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0698808;STB=0.538435;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=-0.00332476;OID=.;OPOS=22852715;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:17:17:30:30:0.638298:8:22:11:6:8:22:11:6
chr1	22853141	.	G	A	64.07	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0731541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5703;QD=9.49122;RBI=0.103355;REFB=-0.0174134;REVB=-0.0730122;RO=18;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128484;STB=0.578767;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0304408;OID=.;OPOS=22853141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:6:3:8:10:6:3:8:10
chr1	22965438	.	A	G	2207.75	PASS	AF=1;AO=124;DP=134;FAO=141;FDP=141;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=63;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.828;QD=62.6312;RBI=0.0293689;REFB=0;REVB=0.0146426;RO=0;SAF=50;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.85113e-05;OID=.;OPOS=22965438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:134:141:0:0:124:141:1:74:50:0:0:78:63:0:0
chr1	22970642	.	C	T	984.6	PASS	AF=0.483412;AO=102;DP=212;FAO=102;FDP=211;FR=.;FRO=109;FSAF=63;FSAR=39;FSRF=58;FSRR=51;FWDB=0.0130081;FXX=0.00471676;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.2025;QD=18.6655;RBI=0.0134381;REFB=-0.0166383;REVB=-0.0033719;RO=104;SAF=63;SAR=39;SRF=57;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0663773;STB=0.54576;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0147954;OID=.;OPOS=22970642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:212:211:104:109:102:102:0.483412:39:63:57:47:39:63:58:51
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chr1	23413027	.	T	C	727.69	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.068;QD=63.2774;RBI=0.0166472;REFB=0;REVB=0.0120649;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.70088e-05;OID=.;OPOS=23413027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:23:21:0:0:24:22:0:0
chr1	23418153	.	C	T	1208.45	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.324;QD=61.1873;RBI=0.0458906;REFB=0;REVB=-0.042236;RO=0;SAF=26;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77523e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000452028;OID=.;OPOS=23418153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:53:26:0:0:53:26:0:0
chr1	23419261	.	G	A,C	399.68	PASS	AF=0.931034,0.0689655;AO=27,2;DP=29;FAO=27,2;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13,2;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409972,-0.0158738;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=57.1049,158.383;QD=55.1288;RBI=0.0547648,0.0160729;REFB=0,0;REVB=0.03631,0.00252184;RO=0;SAF=13,2;SAR=14,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.39874e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00367448,0.231595;OID=.,.;OPOS=23419261,23419261;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:29:29:0:0:27,2:27,2:0.931034,0.0689655:14,0:13,2:0:0:14,0:13,2:0:0
chr1	23419374	.	G	T	949.09	PASS	AF=0.970588;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0283694;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.874;QD=55.8289;RBI=0.0383526;REFB=-0.105384;REVB=-0.0258089;RO=2;SAF=31;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00168916;STB=0.500894;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00259674;OID=.;OPOS=23419374;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:68:68:2:2:66:66:0.970588:35:31:1:1:35:31:1:1
chr1	23419383	.	C	T	1069.43	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00166194;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.246;QD=58.5988;RBI=0.0810962;REFB=-0.0250404;REVB=-0.0810792;RO=1;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122839;STB=0.506492;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-3.17677e-05;OID=.;OPOS=23419383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:74:73:1:1:72:72:0.986301:38:34:0:1:38:34:0:1
chr1	23419855	.	T	C	327.39	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106357;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8596;QD=54.5649;RBI=0.106357;REFB=0;REVB=0.000348544;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106678;OID=.;OPOS=23419855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr1	23521095	.	A	G	172.99	PASS	AF=0.360656;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=0.00863727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9658;QD=11.3435;RBI=0.0998998;REFB=-0.0102495;REVB=-0.0995257;RO=38;SAF=4;SAR=18;SRF=8;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.050445;STB=0.549248;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0215106;OID=.;OPOS=23521095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:38:39:22:22:0.360656:18:4:8:30:18:4:9:30
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chr1	23689283	.	C	T	93.33	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.0267677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0453;QD=9.8238;RBI=0.0406061;REFB=-0.0190802;REVB=-0.0305344;RO=26;SAF=6;SAR=6;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311901;STB=0.683945;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0236784;OID=.;OPOS=23689283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:6:6:20:6:6:6:20:6
chr1	23696152	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00393747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.586;QD=45.8067;RBI=0.00614791;REFB=0;REVB=0.00472156;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.41979e-06;OID=.;OPOS=23696152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
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chr1	23698120	.	C	G	348.61	PASS	AF=0.690476;AO=29;DP=42;FAO=29;FDP=42;FR=.;FRO=13;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00348248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.425;QD=33.2006;RBI=0.0208128;REFB=-0.0157471;REVB=-0.0205194;RO=12;SAF=17;SAR=12;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0448858;STB=0.534223;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0074791;OID=.;OPOS=23698120;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:12:13:29:29:0.690476:12:17:8:4:12:17:9:4
chr1	23710805	.	A	G	753.39	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.104767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.246;QD=61.5012;RBI=0.107477;REFB=0.0110607;REVB=0.0239816;RO=1;SAF=20;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229399;STB=0.51219;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.000536886;OID=.;OPOS=23710805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:28:20:1:0:28:20:1:0
chr1	23833599	.	A	AT	412.61	PASS	AF=0.987654;AO=51;DP=88;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0730068;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.53697;QD=20.3758;RBI=0.192778;REFB=0.187116;REVB=0.178419;RO=26;SAF=39;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147866;STB=0.504672;STBP=0.614;TYPE=ins;VARB=0.00912808;OID=.;OPOS=23833600;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.987654:51:88:80:81:1:53:27:1:0:6:26:39:12:15:11
chr1	23833611	.	G	T	1313.59	PASS	AF=0.956044;AO=88;DP=92;FAO=87;FDP=91;FR=.;FRO=4;FSAF=54;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00270407;FXX=0.0108684;HRUN=6;LEN=1;MLLD=224.081;QD=57.7403;RBI=0.0028488;REFB=-0.103679;REVB=-0.000896478;RO=2;SAF=54;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270559;STB=0.528565;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.000193981;OID=.;OPOS=23833611;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:92:91:2:4:88:87:0.956044:34:54:0:2:33:54:0:4
chr1	23835794	.	A	G	804.8	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.102;QD=64.384;RBI=0.0294781;REFB=0;REVB=-0.0103001;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000194528;OID=.;OPOS=23835794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:25:25:0:0:25:25:0:0
chr1	23836364	.	A	G	88.18	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9647;QD=39.1902;RBI=0.0381694;REFB=0;REVB=0.0267298;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000771248;OID=.;OPOS=23836364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr1	23847464	.	C	A	949.25	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00809579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.728;QD=58.4153;RBI=0.0120555;REFB=0;REVB=-0.00893269;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02424e-06;OID=.;OPOS=23847464;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:36:28:0:0:36:29:0:0
chr1	23885498	.	T	C	1495.72	PASS	AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000803502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.493;QD=62.3216;RBI=0.00630586;REFB=-0.0744826;REVB=0.00625446;RO=0;SAF=30;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36051e-08;STB=0.503816;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.000405674;OID=.;OPOS=23885498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:96:96:0:1:95:95:0.989583:65:30:0:0:65:30:0:1
chr1	23965704	.	A	C	508.13	PASS	AF=0.5;AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.00817434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.3685;QD=20.7401;RBI=0.0104301;REFB=-0.00453016;REVB=0.00647821;RO=48;SAF=32;SAR=17;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105753;STB=0.564845;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00380664;OID=.;OPOS=23965704;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:48:49:49:49:0.5:17:32:26:22:17:32:26:23
chr1	23966894	.	T	TAAG	222.64	PASS	AF=0.52381;AO=20;DP=43;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0119177;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=3;MLLD=171.773;QD=21.2034;RBI=0.0646524;REFB=-0.00610582;REVB=-0.0635445;RO=23;SAF=10;SAR=10;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185001;STB=0.575155;STBP=0.337;TYPE=ins;VARB=0.00470364;OID=.;OPOS=23966895;OREF=-;OALT=AAG;OMAPALT=TAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.52381:20:43:22:42:20:12:10:14:6:99:23:10:10:16:7
chr1	24018277	.	C	G	1331.58	PASS	AF=0.977528;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0192557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0078;QD=59.8463;RBI=0.0204069;REFB=-0.161745;REVB=0.00675716;RO=1;SAF=40;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997538;STB=0.510414;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00263521;OID=.;OPOS=24018277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:89:89:1:2:87:87:0.977528:47:40:0:1:47:40:0:2
chr1	24121597	.	GCCCC	GCCC,GCCCT,GCCCTC	183.82	PASS	AF=0.4,0.52,0;AO=5,8,3;DP=26;FAO=10,13,0;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=1,4,0;FSAR=9,9,0;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.146914,-0.00036068,-0.00733222;FXX=0.107105;HRUN=7,7,0;LEN=1,1,1;MLLD=7.09278,191.432,182.178;QD=29.4106;RBI=0.313887,0.00755465,0.00783235;REFB=0.0466656,0.0157252,0.0165953;REVB=0.277383,0.00754603,0.00275397;RO=4;SAF=0,3,1;SAR=5,5,2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0.251651,0.413613;STB=0.549906,0.549926,0.5;STBP=0.627,0.403,1;TYPE=del,snp,ins;VARB=-0.287406,0.00972214,0;OID=.,.,.;OPOS=24121598,24121601,24121601;OREF=C,C,-;OALT=-,T,T;OMAPALT=GCCC,GCCCT,GCCCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.4,0.52,0:5,8,3:26:10,13,0:25:2:1,4,0:9,9,0:0:2:63:4:0,3,1:5,5,2:0:4
chr1	24134721	.	T	C	269.04	PASS	AF=0.648649;AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0245656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1306;QD=29.0856;RBI=0.0251323;REFB=0.021584;REVB=0.00530678;RO=12;SAF=14;SAR=10;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151383;STB=0.570077;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=-0.00778301;OID=.;OPOS=24134721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:12:13:24:24:0.648649:10:14:4:8:10:14:5:8
chr1	24201094	.	G	C	223.98	PASS	AF=0.373333;AO=27;DP=72;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0833856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3972;QD=11.9457;RBI=0.113287;REFB=-0.0108261;REVB=0.0766862;RO=45;SAF=15;SAR=12;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485443;STB=0.502391;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0187888;OID=.;OPOS=24201094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:75:45:47:27:28:0.373333:12:15:23:22:13:15:25:22
chr1	24201109	.	C	T	233.55	PASS	AF=0.394737;AO=25;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.00505906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.663;QD=12.2923;RBI=0.0403377;REFB=-0.0272442;REVB=-0.0400192;RO=42;SAF=12;SAR=13;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00414623;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0388632;OID=.;OPOS=24201109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:42:46:25:30:0.394737:13:12:20:22:15:15:23:23
chr1	24201162	.	G	A	580.23	PASS	AF=0.671053;AO=48;DP=73;FAO=51;FDP=76;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.03079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7925;QD=30.5385;RBI=0.0354935;REFB=-0.067188;REVB=0.0176569;RO=25;SAF=21;SAR=27;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241141;STB=0.523355;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0426966;OID=.;OPOS=24201162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:76:25:25:48:51:0.671053:27:21:10:15:27:24:10:15
chr1	24201262	.	A	G	150.47	PASS	AF=0.369565;AO=16;DP=45;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00459079;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.0639;QD=13.0845;RBI=0.0534328;REFB=-0.0392453;REVB=-0.0532352;RO=29;SAF=10;SAR=6;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775601;STB=0.567491;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0587378;OID=.;OPOS=24201262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:29:29:16:17:0.369565:6:10:20:9:7:10:20:9
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chr1	24201448	.	C	T	119.03	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.028697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5068;QD=16.4185;RBI=0.0454377;REFB=-0.0154875;REVB=0.0352288;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124945;STB=0.551651;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.033145;OID=.;OPOS=24201448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:15:14:14:0.482759:7:7:9:5:7:7:9:6
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chr1	24288476	.	T	C	676.09	PASS	AF=0.630435;AO=32;DP=95;FAO=58;FDP=92;FR=.;FRO=34;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0339012;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.902;QD=29.3951;RBI=0.0358488;REFB=-0.0373137;REVB=0.011655;RO=18;SAF=15;SAR=17;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160502;STB=0.504503;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.017947;OID=.;OPOS=24288476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:92:18:34:32:58:0.630435:17:15:8:10:30:28:16:18
chr1	24288529	.	TAAAC	T	313.27	PASS	AF=0.655172;AO=34;DP=60;FAO=38;FDP=58;FR=.;FRO=20;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00246211;FXX=0.0937354;HRUN=3;LEN=4;MLLD=208.896;QD=21.605;RBI=0.00527544;REFB=-0.0106083;REVB=-0.00466565;RO=19;SAF=18;SAR=16;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326444;STB=0.507459;STBP=0.906;TYPE=del;VARB=0.0126843;OID=.;OPOS=24288530;OREF=AAAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.655172:34:60:38:58:20:22:16:12:8:99:19:18:16:11:8
chr1	24289057	.	G	C	218.52	PASS	AF=0.714286;AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.166012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.9558;QD=31.2176;RBI=0.168478;REFB=0.0126265;REVB=-0.0287229;RO=7;SAF=9;SAR=11;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102149;STB=0.514374;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=-0.0112521;OID=.;OPOS=24289057;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:7:8:20:20:0.714286:11:9:3:4:11:9:4:4
chr1	24289891	.	ATGAATG	A,ATGAATGA	52.69	PASS	AF=0.416667,0.25;AO=5,2;DP=13;FAO=5,3;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=1,3;FSAR=4,0;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00456649,0.142447;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=6,1;MLLD=273.878,57.6186;QD=17.5629;RBI=0.00671425,0.142545;REFB=-0.025446,-0.00535269;REVB=0.00492223,0.00528281;RO=6;SAF=1,2;SAR=4,0;SRF=2;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.158244,0.658493;STB=0.666163,0.997134;STBP=0.725,0.019;TYPE=del,ins;VARB=0.0308791,0.106701;OID=.,.;OPOS=24289892,24289898;OREF=TGAATG,-;OALT=-,A;OMAPALT=A,ATGAATGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.416667,0.25:5,2:13:5,3:12:4:1,3:4,0:0:4:27:6:1,2:4,0:2:4
chr1	24406647	.	G	A	431.74	PASS	AF=0.552632;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.00717781;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.834;QD=22.723;RBI=0.00763768;REFB=-0.00726787;REVB=-0.00261019;RO=33;SAF=23;SAR=19;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17013;STB=0.599209;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00657826;OID=.;OPOS=24406647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:33:34:42:42:0.552632:19:23:11:22:19:23:11:23
chr1	24409191	.	C	T	493.73	PASS	AF=0.453782;AO=54;DP=120;FAO=54;FDP=119;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.0400412;FXX=0.00833264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.3034;QD=16.5958;RBI=0.0402864;REFB=-0.00824578;REVB=-0.00443831;RO=63;SAF=24;SAR=30;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030958;STB=0.526306;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0121448;OID=.;OPOS=24409191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:119:63:65:54:54:0.453782:30:24:30:33:30:24:32:33
chr1	24413159	.	T	C	118.6	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=4;FWDB=-0.0247523;FXX=0.0652032;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.587;QD=11.0324;RBI=0.0536838;REFB=-0.0244286;REVB=0.0476368;RO=29;SAF=11;SAR=3;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142723;STB=0.583677;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0339233;OID=.;OPOS=24413159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:43:29:29:14:14:0.325581:3:11:25:4:3:11:25:4
chr1	24416059	.	T	C	892.97	PASS	AF=1;AO=40;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0957798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8283;QD=56.6964;RBI=0.1018;REFB=0;REVB=0.0344899;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000564355;OID=.;OPOS=24416059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:40:63:1:19:21:0:0:23:40:0:0
chr1	24416070	.	G	C	823.49	PASS	AF=0.910448;AO=61;DP=67;FAO=61;FDP=67;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0617419;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.947;QD=49.1638;RBI=0.0642478;REFB=-0.020563;REVB=0.0177686;RO=2;SAF=35;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262099;STB=0.539461;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.000110592;OID=.;OPOS=24416070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:67:67:2:6:61:61:0.910448:26:35:2:0:26:35:6:0
chr1	24418768	.	T	C	407.72	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191622;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0252;QD=56.2378;RBI=0.0223764;REFB=0;REVB=-0.0115549;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270308;OID=.;OPOS=24418768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:27:29:1:19:8:0:0:20:9:0:0
chr1	24419496	.	A	G	755.77	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0554264;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.037;QD=57.0389;RBI=0.0556795;REFB=0;REVB=0.0053029;RO=0;SAF=19;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127939;OID=.;OPOS=24419496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:34:19:0:0:34:19:0:0
chr1	24421474	.	G	A	1271.12	PASS	AF=0.965517;AO=84;DP=88;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00322205;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.525;QD=58.4425;RBI=0.00328541;REFB=-0.097394;REVB=0.000642164;RO=3;SAF=38;SAR=46;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359324;STB=0.518983;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.00229231;OID=.;OPOS=24421474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:88:87:3:3:84:84:0.965517:46:38:3:0:46:38:3:0
chr1	24421950	.	C	G	706.56	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.0211;QD=62.8053;RBI=0.0667618;REFB=0;REVB=0.0585015;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119096;OID=.;OPOS=24421950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:28:15:0:0:30:15:0:0
chr1	24447468	.	G	C	433.32	PASS	AF=0.511905;AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=84;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0785567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.6308;QD=20.6342;RBI=0.117495;REFB=-0.0169274;REVB=0.0873719;RO=41;SAF=19;SAR=24;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909364;STB=0.550233;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0169975;OID=.;OPOS=24447468;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:41:41:43:43:0.511905:24:19:14:27:24:19:14:27
chr1	24448084	.	G	A	143.63	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0123739;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.634;QD=11.4903;RBI=0.0211053;REFB=-0.0344972;REVB=0.0170974;RO=31;SAF=9;SAR=8;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853542;STB=0.549238;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0541523;OID=.;OPOS=24448084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:50:31:33:17:17:0.34:8:9:14:17:8:9:15:18
chr1	24460797	.	T	G	173.41	PASS	AF=0.319444;AO=23;DP=72;FAO=23;FDP=72;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.007531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5176;QD=9.634;RBI=0.0778079;REFB=-0.00981781;REVB=-0.0774425;RO=48;SAF=9;SAR=14;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173432;STB=0.595299;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0183036;OID=.;OPOS=24460797;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:48:49:23:23:0.319444:14:9:26:22:14:9:26:23
chr1	24465113	.	C	T	194.32	PASS	AF=0.380952;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0341941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.081;QD=12.3375;RBI=0.0356145;REFB=-0.0219565;REVB=0.00995789;RO=39;SAF=13;SAR=11;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243314;STB=0.514007;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0328799;OID=.;OPOS=24465113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:39:39:24:24:0.380952:11:13:22:17:11:13:22:17
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chr1	24680915	.	C	T	938.7	PASS	AF=1;AO=60;DP=63;FAO=66;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=37.9711;QD=56.8911;RBI=0.0846997;REFB=0;REVB=0.0824474;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140535;OID=.;OPOS=24680915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:66:0:0:60:66:1:24:36:0:0:25:41:0:0
chr1	24706113	.	G	A	1626.18	PASS	AF=1;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193138;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0275;QD=60.2287;RBI=0.0481724;REFB=0;REVB=0.0441312;RO=0;SAF=62;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67537e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000181429;OID=.;OPOS=24706113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:108:0:0:108:108:1:46:62:0:0:46:62:0:0
chr1	24706269	.	A	G	1558.35	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163111;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.659;QD=64.262;RBI=0.0278008;REFB=0;REVB=0.022513;RO=0;SAF=58;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00041091;OID=.;OPOS=24706269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:39:58:0:0:39:58:0:0
chr1	24706292	.	T	C	1132.61	PASS	AF=0.986842;AO=74;DP=77;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0417788;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.274;QD=59.6112;RBI=0.0469281;REFB=-0.00675828;REVB=0.0213724;RO=1;SAF=38;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122874;STB=0.506327;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000220402;OID=.;OPOS=24706292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:76:1:1:74:75:0.986842:36:38:1:0:36:39:1:0
chr1	24718075	.	T	C	1204.77	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3216;QD=61.0009;RBI=0.0854971;REFB=0;REVB=0.0807554;RO=0;SAF=41;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000837883;OID=.;OPOS=24718075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:37:41:0:0:38:41:0:0
chr1	24785393	.	C	T	327.46	PASS	AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.00343148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5622;QD=20.4661;RBI=0.00504126;REFB=-0.0402776;REVB=-0.00369313;RO=30;SAF=17;SAR=17;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141207;STB=0.57808;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0398874;OID=.;OPOS=24785393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:30:30:34:34:0.53125:17:17:20:10:17:17:20:10
chr1	24859617	.	G	A	566.91	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294366;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.189;QD=59.6742;RBI=0.136251;REFB=0;REVB=0.133033;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0006947;OID=.;OPOS=24859617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:15:22:0:0:16:22:0:0
chr1	24859665	.	G	A	715.32	PASS	AF=0.915254;AO=54;DP=59;FAO=54;FDP=59;FR=.;FRO=5;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0208455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=300.44;QD=48.4964;RBI=0.021206;REFB=-0.0428964;REVB=-0.00389401;RO=2;SAF=24;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00378168;STB=0.513303;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00291703;OID=.;OPOS=24859665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:59:59:2:5:54:54:0.915254:30:24:1:1:30:24:3:2
chr1	24861704	.	G	A	432.95	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.306;QD=55.8648;RBI=0.020401;REFB=0;REVB=0.0128546;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000327419;OID=.;OPOS=24861704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:29:31:1:18:11:0:0:19:12:0:0
chr1	25255850	.	C	G	99.25	PASS	AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0063477;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.1924;QD=26.4663;RBI=0.0494101;REFB=-0.0180728;REVB=-0.0490006;RO=4;SAF=3;SAR=8;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136379;STB=0.507678;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.00359339;OID=.;OPOS=25255850;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:8:3:1:3:8:3:1:3
chr1	25291010	.	A	T	1298.6	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0076085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.248;QD=61.838;RBI=0.0135127;REFB=0;REVB=0.0111671;RO=0;SAF=53;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.08146e-05;OID=.;OPOS=25291010;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:30:53:0:0:31:53:0:0
chr1	25634143	.	T	C	223.5	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=21;FWDB=0.010321;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.28;QD=18.6251;RBI=0.0240268;REFB=-0.00177847;REVB=0.0216971;RO=26;SAF=7;SAR=15;SRF=5;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148268;STB=0.583264;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00209944;OID=.;OPOS=25634143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:26:26:22:22:0.458333:15:7:5:21:15:7:5:21
chr1	26131654	.	G	A	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9388;QD=59.6793;RBI=0.021745;REFB=0;REVB=0.0167328;RO=0;SAF=57;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24443e-05;OID=.;OPOS=26131654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:13:57:0:0:13:57:0:0
chr1	26138262	.	T	C	774.57	PASS	AF=1;AO=41;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.223467;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.526;QD=56.3326;RBI=0.22428;REFB=0;REVB=-0.0190814;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00429241;OID=.;OPOS=26138262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:41:55:1:25:16:0:0:25:30:0:0
chr1	26140573	.	C	A	1280.77	PASS	AF=0.965909;AO=85;DP=88;FAO=85;FDP=88;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.024739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6596;QD=58.217;RBI=0.028268;REFB=-0.0365692;REVB=0.013677;RO=3;SAF=48;SAR=37;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00669804;STB=0.503538;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0100792;OID=.;OPOS=26140573;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:88:88:3:3:85:85:0.965909:37:48:2:1:37:48:2:1
chr1	26142947	.	G	A	138.95	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00956882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.892;QD=12.0826;RBI=0.0175646;REFB=-0.0166455;REVB=-0.0147293;RO=29;SAF=4;SAR=12;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280271;STB=0.658325;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.059821;OID=.;OPOS=26142947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:30:16:16:0.347826:12:4:14:15:12:4:14:16
chr1	26144674	.	G	A	180.9	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0130956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.494;QD=12.9216;RBI=0.0132968;REFB=-0.0209457;REVB=-0.00230456;RO=34;SAF=5;SAR=17;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349467;STB=0.703039;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.021913;OID=.;OPOS=26144674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:34:22:22:0.392857:17:5:18:16:17:5:18:16
chr1	26146884	.	C	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7084;QD=33.4284;RBI=0.0318768;REFB=0;REVB=0.0086892;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00240834;OID=.;OPOS=26146884;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr1	26158962	.	A	G	632.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.751;QD=61.7102;RBI=0.0261117;REFB=0;REVB=0.00732683;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34233e-05;OID=.;OPOS=26158962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:39:41:1:16:23:0:0:16:25:0:0
chr1	26290745	.	G	C	764.3	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00693852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.904;QD=63.6917;RBI=0.0553101;REFB=0;REVB=0.0548732;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.23141e-05;OID=.;OPOS=26290745;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:48:0:0:44:48:1:17:27:0:0:19:29:0:0
chr1	26357656	.	C	A	686.93	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.376;QD=61.0608;RBI=0.0481794;REFB=0;REVB=0.0470139;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000494688;OID=.;OPOS=26357656;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:45:0:0:41:45:1:19:22:0:0:21:24:0:0
chr1	26378002	.	C	T	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.428;QD=58.1406;RBI=0.0769537;REFB=0;REVB=0.0716283;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000375611;OID=.;OPOS=26378002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr1	26385003	.	T	C	436.89	PASS	AF=0.441441;AO=39;DP=112;FAO=49;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=62;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.0284614;FXX=0.00892777;HRUN=5;LEN=1;MLLD=41.5451;QD=15.7439;RBI=0.122233;REFB=0.00167882;REVB=-0.118873;RO=46;SAF=28;SAR=11;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122;STB=0.536923;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-0.00508444;OID=.;OPOS=26385003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:111:46:62:39:49:0.441441:11:28:28:18:19:30:34:28
chr1	26393974	.	C	T	279.35	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00296904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.982;QD=18.9387;RBI=0.0406308;REFB=-0.00863253;REVB=-0.0405222;RO=29;SAF=14;SAR=16;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162928;STB=0.509085;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0103657;OID=.;OPOS=26393974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:16:14:13:16:16:14:13:16
chr1	26450714	.	A	G	76.14	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0158469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.589;QD=12.1821;RBI=0.0240891;REFB=0.000665397;REVB=0.0181428;RO=15;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20027;STB=0.618812;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=-0.000556654;OID=.;OPOS=26450714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:4:6:6:9:4:6:6:9
chr1	26488019	.	G	A	323.6	PASS	AF=1;AO=20;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.366;QD=53.9329;RBI=0.192325;REFB=0;REVB=0.191711;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00080783;OID=.;OPOS=26488019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:20:24:1:5:15:0:0:9:15:0:0
chr1	26496651	.	T	C	384.72	PASS	AF=1;AO=24;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0321526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3949;QD=54.9601;RBI=0.0344529;REFB=0;REVB=0.0123779;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.51023e-05;OID=.;OPOS=26496651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:28:0:0:24:28:1:15:9:0:0:15:13:0:0
chr1	26670336	.	GCCCCA	GCCCA,GCCCAC	127.75	PASS	AF=0.396694,0.00826446;AO=58,5;DP=122;FAO=48,1;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=40,1;FSAR=8,0;FSRF=33;FSRR=39;FWDB=-0.148661,-0.125924;FXX=0.00819605;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=7.01182,49.7168;QD=4.22323;RBI=0.149205,0.126325;REFB=-0.224449,-0.0304618;REVB=0.0127251,0.0100582;RO=52;SAF=51,5;SAR=7,0;SRF=12;SRR=40;SSEN=0.5,0;SSEP=0,0;SSSB=0.620765,0.711926;STB=0.762865,0.990846;STBP=0.001,0.251;TYPE=del,mnp;VARB=0.185723,0.0192013;OID=.,.;OPOS=26670337,26670340;OREF=C,CA;OALT=-,AC;OMAPALT=GCCCA,GCCCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.396694,0.00826446:58,5:122:48,1:121:72:40,1:8,0:33:39:99:52:51,5:7,0:12:40
chr1	26694245	.	T	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00743847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.686;QD=57.2021;RBI=0.0212278;REFB=0;REVB=0.0198818;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.818e-05;OID=.;OPOS=26694245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr1	26694260	.	T	C	375.15	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.10585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.309;QD=55.5775;RBI=0.117818;REFB=0;REVB=0.0517382;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00052971;OID=.;OPOS=26694260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:12:14:0:0:13:14:0:0
chr1	26700793	.	GCT	CGC,GC,GCC	623.89	PASS	AF=0,0.0487805,0.95122;AO=2,8,31;DP=41;FAO=0,2,39;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,7;FSAR=0,2,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527365,0.0650773,0.0643664;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=3,1,1;MLLD=173.598,199.258,211.227;QD=60.867;RBI=0.0577088,0.0694494,0.0682141;REFB=0,0,0;REVB=0.0234343,0.0242522,0.0225859;RO=0;SAF=2,3,2;SAR=0,5,29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-4.46938e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,0.0423852,1.56011e-05;OID=.,.,.;OPOS=26700793,26700795,26700795;OREF=GCT,T,T;OALT=CGC,-,C;OMAPALT=CGC,GC,GCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:9:41:41:0:0:2,8,31:0,2,39:0,0.0487805,0.95122:0,5,29:2,3,2:0:0:0,2,32:0,0,7:0:0
chr1	26755919	.	A	G	490.11	PASS	AF=0.971429;AO=33;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0176659;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=336.632;QD=56.012;RBI=0.0347149;REFB=-0.0858694;REVB=0.0298838;RO=1;SAF=31;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148398;STB=0.507688;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00025227;OID=.;OPOS=26755919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:33:34:0.971429:2:31:1:0:2:32:1:0
chr1	26786627	.	G	A	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0280823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.264;QD=61.6825;RBI=0.0312876;REFB=0;REVB=0.0137948;RO=0;SAF=11;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.37341e-05;OID=.;OPOS=26786627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:30:11:0:0:30:11:0:0
chr1	26879376	.	T	C	82.05	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0801899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3562;QD=32.8203;RBI=0.12576;REFB=0.0250578;REVB=0.0968767;RO=1;SAF=1;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28888;STB=0.666218;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=-0.0187561;OID=.;OPOS=26879376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:8:1:1:0:8:1:1:0
chr1	26879920	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.037556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.594;QD=50.4135;RBI=0.0381205;REFB=0;REVB=0.00653614;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000168742;OID=.;OPOS=26879920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr1	26887592	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.114;QD=50.4134;RBI=0.0474262;REFB=0;REVB=0.0323501;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000327843;OID=.;OPOS=26887592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr1	26900620	.	C	G	260.19	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.00933799;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=293.957;QD=20.8152;RBI=0.00935369;REFB=-0.00354111;REVB=0.000541701;RO=16;SAF=8;SAR=15;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820839;STB=0.547492;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00267998;OID=.;OPOS=26900620;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:16:25:23:25:0.5:15:8:4:12:17:8:6:19
chr1	26900735	.	C	G	1062.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000516981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3743;QD=59.8552;RBI=0.00611095;REFB=0;REVB=0.00608905;RO=0;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70466e-05;OID=.;OPOS=26900735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:32:39:0:0:32:39:0:0
chr1	26901319	.	G	A,C	945.44	PASS	AF=0.939394,0.0606061;AO=56,4;DP=62;FAO=62,4;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=43,4;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0924153,0.0513848;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=81.896,45.8657;QD=57.2993;RBI=0.0969532,0.103931;REFB=0,0;REVB=0.0293142,0.0903398;RO=0;SAF=38,4;SAR=18,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.76069e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00117725,0.0343662;OID=.,.;OPOS=26901319,26901319;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:62:66:0:0:56,4:62,4:0.939394,0.0606061:18,0:38,4:0:0:19,0:43,4:0:0
chr1	27210721	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.655;QD=59.4352;RBI=0.0443652;REFB=0;REVB=0.0194672;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.83816e-05;OID=.;OPOS=27210721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0
chr1	27426796	.	T	C	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7277;QD=58.1402;RBI=0.0517447;REFB=0;REVB=-0.0505046;RO=0;SAF=25;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000602687;OID=.;OPOS=27426796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:7:25:0:0:7:25:0:0
chr1	27427041	.	T	C	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0637006;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7769;QD=58.5852;RBI=0.0840202;REFB=0;REVB=-0.0547871;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00214378;OID=.;OPOS=27427041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:25:8:0:0:25:8:0:0
chr1	27687466	.	G	T	116.02	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.155322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.2596;QD=11.3194;RBI=0.170911;REFB=-0.0347615;REVB=0.0713123;RO=25;SAF=4;SAR=10;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139864;STB=0.56442;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0722987;OID=.;OPOS=27687466;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:27:14:14:0.341463:10:4:10:15:10:4:10:17
chr1	27697345	.	A	G	224.37	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0452246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9532;QD=19.9438;RBI=0.0663857;REFB=-0.0673275;REVB=-0.0485983;RO=23;SAF=16;SAR=6;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167839;STB=0.595257;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0678078;OID=.;OPOS=27697345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:6:16:13:10:6:16:13:10
chr1	27697359	.	C	G	182.12	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.00225508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.517;QD=16.9416;RBI=0.00799593;REFB=-0.00362264;REVB=0.00767134;RO=24;SAF=9;SAR=10;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268539;STB=0.652026;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00209974;OID=.;OPOS=27697359;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:10:9:18:6:10:9:18:6
chr1	27875824	.	C	T	88.18	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6544;QD=39.1916;RBI=0.0689163;REFB=0;REVB=-0.0677505;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00561411;OID=.;OPOS=27875824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr1	27876482	.	C	A	1343.76	PASS	AF=0.967391;AO=87;DP=93;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0720741;FXX=0.0212743;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.848;QD=58.4243;RBI=0.0720786;REFB=-0.10842;REVB=-0.000806724;RO=4;SAF=12;SAR=75;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602525;STB=0.512028;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.00134448;OID=.;OPOS=27876482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:93:92:4:3:87:89:0.967391:75:12:2:2:76:13:1:2
chr1	28020307	.	G	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1379;QD=52.6132;RBI=0.0533035;REFB=0;REVB=0.0122182;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106028;OID=.;OPOS=28020307;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr1	28209305	.	A	G	184.83	PASS	AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00742526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.596;QD=12.12;RBI=0.00742753;REFB=-0.00644804;REVB=-0.000183921;RO=38;SAF=13;SAR=10;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137739;STB=0.507953;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0101252;OID=.;OPOS=28209305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:10:13:21:17:10:13:21:17
chr1	28209362	.	T	C	118.32	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0408813;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.542;QD=12.1349;RBI=0.0425895;REFB=-0.0151184;REVB=-0.0119408;RO=25;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993992;STB=0.558739;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0158758;OID=.;OPOS=28209362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:25:25:14:14:0.358974:8:6:13:12:8:6:13:12
chr1	28209366	.	A	G	92.88	PASS	AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.153275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.9402;QD=10.0407;RBI=0.244389;REFB=-0.0291521;REVB=-0.190349;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268155;STB=0.513491;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0506821;OID=.;OPOS=28209366;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:37:37:14:25:12:12:0.324324:6:6:11:3:6:6:13:12
chr1	28268835	.	A	C	244.51	PASS	AF=0.459016;AO=26;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00705943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.3868;QD=16.0334;RBI=0.0366109;REFB=-0.00329175;REVB=0.0359238;RO=35;SAF=9;SAR=17;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257234;STB=0.671255;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00736088;OID=.;OPOS=28268835;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:33:26:28:0.459016:17:9:21:14:19:9:21:12
chr1	28282292	.	T	C	432.67	PASS	AF=0.463158;AO=43;DP=94;FAO=44;FDP=95;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.00224465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.311;QD=18.2179;RBI=0.013009;REFB=-0.00554947;REVB=-0.0128138;RO=47;SAF=27;SAR=16;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935747;STB=0.58099;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0089703;OID=.;OPOS=28282292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:47:51:43:44:0.463158:16:27:25:22:16:28:25:26
chr1	28586397	.	G	A	254.24	PASS	AF=0.509091;AO=24;DP=52;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0251608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.3936;QD=18.4898;RBI=0.0280622;REFB=-0.0390214;REVB=0.0124267;RO=26;SAF=7;SAR=17;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208439;STB=0.64937;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0500838;OID=.;OPOS=28586397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:55:26:27:24:28:0.509091:17:7:13:13:21:7:14:13
chr1	28638859	.	A	T	1877.5	PASS	AF=0.976378;AO=123;DP=127;FAO=124;FDP=127;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0330937;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.639;QD=59.1338;RBI=0.0454425;REFB=-0.00795264;REVB=0.0311421;RO=2;SAF=57;SAR=66;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141776;STB=0.510947;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.000107163;OID=.;OPOS=28638859;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:127:127:2:3:123:124:0.976378:66:57:0:2:67:57:0:3
chr1	28792948	.	CAAA	CAA,CAAC	83.72	PASS	AF=0.333333,0.1;AO=7,3;DP=31;FAO=10,3;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=9,3;FSAR=1,0;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.117099,0.0667154;FXX=0.0322477;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=16.5497,22.7816;QD=11.1628;RBI=0.245684,0.150297;REFB=-0.0702601,-0.0803032;REVB=0.215982,0.134678;RO=16;SAF=6,3;SAR=1,0;SRF=10;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.343725,0.575361;STB=0.790488,0.995689;STBP=0.062,0.125;TYPE=del,snp;VARB=0.0841437,0.0199118;OID=.,.;OPOS=28792949,28792951;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=CAA,CAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333,0.1:7,3:31:10,3:30:17:9,3:1,0:10:7:62:16:6,3:1,0:10:6
chr1	29095664	.	T	TA	85.86	PASS	AF=0.705882;AO=9;DP=19;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0331912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.7997;QD=20.2016;RBI=0.138014;REFB=-0.0934381;REVB=0.133964;RO=10;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225517;STB=0.505042;STBP=0.998;TYPE=ins;VARB=0.0769656;OID=.;OPOS=29095665;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.705882:9:19:12:17:5:7:5:3:2:21:10:4:5:7:3
chr1	29138975	.	G	T	223.08	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.332;QD=49.573;RBI=0.0360455;REFB=0;REVB=0.0355942;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.0791e-05;OID=.;OPOS=29138975;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:8:9:0:0:9:9:0:0
chr1	29189597	.	C	T	1519.06	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.229;QD=58.4254;RBI=0.0296342;REFB=0;REVB=0.0239125;RO=0;SAF=47;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000774372;OID=.;OPOS=29189597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:100:104:0:0:100:104:1:53:47:0:0:57:47:0:0
chr1	29446332	.	ATTTTTTTT	ATTTTTTT,ATTTTTTTA	280.52	PASS	AF=0.945946,0;AO=38,7;DP=74;FAO=70,0;FDP=74;FR=.;FRO=4;FSAF=32,0;FSAR=38,0;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.121648,-0.0246485;FXX=0.0133316;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.93824,9.86511;QD=15.1635;RBI=0.274781,0.321427;REFB=0.0212827,-0.0247581;REVB=-0.246387,-0.32048;RO=11;SAF=25,0;SAR=13,7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0509829,-0.769917;STB=0.515899,0.5;STBP=0.249,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0366372,-0.0472939;OID=.,.;OPOS=29446333,29446340;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=ATTTTTTT,ATTTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.945946,0:38,7:74:70,0:74:4:32,0:38,0:3:1:12:11:25,0:13,7:6:5
chr1	29446811	.	A	G	583.03	PASS	AF=0.84;AO=43;DP=47;FAO=42;FDP=50;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00688095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6094;QD=46.6423;RBI=0.00688327;REFB=-0.0330801;REVB=-0.000179009;RO=3;SAF=12;SAR=31;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00820797;STB=0.517233;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0580901;OID=.;OPOS=29446811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:47:50:3:8:43:42:0.84:31:12:1:2:30:12:3:5
chr1	29475648	.	T	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169918;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.954;QD=53.2772;RBI=0.0396167;REFB=0;REVB=0.0357877;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014718;OID=.;OPOS=29475648;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr1	29529699	.	T	C	756.1	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253052;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.608;QD=57.0639;RBI=0.0521205;REFB=0;REVB=0.0455653;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184713;OID=.;OPOS=29529699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0
chr1	29542637	.	A	G	1133.8	PASS	AF=0.939759;AO=78;DP=83;FAO=78;FDP=83;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00640425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9918;QD=54.641;RBI=0.035788;REFB=-0.0545449;REVB=-0.0352103;RO=5;SAF=33;SAR=45;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664937;STB=0.535202;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0168472;OID=.;OPOS=29542637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:83:83:5:5:78:78:0.939759:45:33:5:0:45:33:5:0
chr1	29630455	.	C	T	1457.52	PASS	AF=0.905172;AO=105;DP=116;FAO=105;FDP=116;FR=.;FRO=11;FSAF=46;FSAR=59;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0317122;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.795;QD=50.2593;RBI=0.0471512;REFB=-0.0953526;REVB=0.0348937;RO=11;SAF=46;SAR=59;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00299361;STB=0.501583;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.00213274;OID=.;OPOS=29630455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:116:116:11:11:105:105:0.905172:59:46:5:6:59:46:5:6
chr1	29631909	.	A	G	1048.03	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0407613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.55;QD=58.2237;RBI=0.0408302;REFB=-0.0463294;REVB=0.00237198;RO=0;SAF=43;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30751e-08;STB=0.508769;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.000298221;OID=.;OPOS=29631909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:0:1:71:71:0.986111:28:43:0:0:28:43:0:1
chr1	31188089	.	C	T	270.77	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0229582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.56;QD=16.9231;RBI=0.0311711;REFB=-0.0173711;REVB=-0.0210845;RO=34;SAF=18;SAR=12;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151022;STB=0.584849;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0139191;OID=.;OPOS=31188089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:12:18:15:19:12:18:15:19
chr1	31188901	.	A	G	1711.48	PASS	AF=1;AO=111;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00225723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.624;QD=60.5835;RBI=0.00340184;REFB=0;REVB=-0.00254508;RO=0;SAF=64;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.00296e-07;OID=.;OPOS=31188901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:113:0:0:111:113:1:47:64:0:0:47:66:0:0
chr1	31215364	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.603;QD=59.0187;RBI=0.0247203;REFB=0;REVB=-0.0112198;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000113044;OID=.;OPOS=31215364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0
chr1	31346057	.	A	G	150.38	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=0.0071666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8382;QD=10.195;RBI=0.0553914;REFB=0.0075088;REVB=-0.0549258;RO=39;SAF=12;SAR=8;SRF=29;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177454;STB=0.602846;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.0237925;OID=.;OPOS=31346057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:8:12:29:10:8:12:29:10
chr1	31347320	.	G	A	298.33	PASS	AF=0.390805;AO=34;DP=87;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.00740193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9281;QD=13.7163;RBI=0.0437561;REFB=-0.0242088;REVB=0.0431254;RO=52;SAF=13;SAR=21;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14757;STB=0.590077;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0507379;OID=.;OPOS=31347320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:52:53:34:34:0.390805:21:13:27:25:21:13:28:25
chr1	31426815	.	A	G	889.05	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0796332;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.492;QD=58.2984;RBI=0.0807957;REFB=0;REVB=0.0136567;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360657;OID=.;OPOS=31426815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:36:25:0:0:36:25:0:0
chr1	31438914	.	C	T	582.4	PASS	AF=0.556604;AO=51;DP=99;FAO=59;FDP=106;FR=.;FRO=47;FSAF=44;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.00516553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0281;QD=21.9774;RBI=0.0794992;REFB=-0.0168208;REVB=0.0793312;RO=46;SAF=42;SAR=9;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29673;STB=0.591138;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0145125;OID=.;OPOS=31438914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:106:46:47:51:59:0.556604:9:42:26:20:15:44:27:20
chr1	31445932	.	C	G	671.52	PASS	AF=1;AO=41;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.394;QD=62.4665;RBI=0.0582532;REFB=0;REVB=0.0554909;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213524;OID=.;OPOS=31445932;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:41:43:1:20:21:0:0:22:21:0:0
chr1	31653733	.	T	C	673.99	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522006;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.325;QD=62.6968;RBI=0.0662238;REFB=0;REVB=0.0407516;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.19149e-05;OID=.;OPOS=31653733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0
chr1	31732788	.	C	T	539.81	PASS	AF=0.504505;AO=54;DP=111;FAO=56;FDP=111;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.0163978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.644;QD=19.4526;RBI=0.0202122;REFB=-0.000967414;REVB=-0.0118171;RO=55;SAF=26;SAR=28;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412793;STB=0.513929;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.00174218;OID=.;OPOS=31732788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:55:55:54:56:0.504505:28:26:24:31:30:26:24:31
chr1	31733830	.	T	C	199.34	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0543752;FXX=0.0677851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.019;QD=14.4977;RBI=0.0553584;REFB=-0.0261425;REVB=-0.0103873;RO=30;SAF=18;SAR=5;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.35198;STB=0.689601;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0429331;OID=.;OPOS=31733830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:30:32:23:23:0.418182:5:18:14:16:5:18:16:16
chr1	31733926	.	A	G	579.88	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207903;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.079;QD=61.04;RBI=0.0218565;REFB=0;REVB=0.00674304;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.32826e-05;OID=.;OPOS=31733926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:13:25:0:0:13:25:0:0
chr1	31837196	.	G	T	651.52	PASS	AF=0.449367;AO=70;DP=158;FAO=71;FDP=158;FR=.;FRO=87;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=45;FSRR=42;FWDB=-0.0166153;FXX=0.00628891;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.574;QD=16.4941;RBI=0.0208626;REFB=-0.0185359;REVB=-0.0126167;RO=84;SAF=32;SAR=38;SRF=42;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04219;STB=0.5289;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0208605;OID=.;OPOS=31837196;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:84:87:70:71:0.449367:38:32:42:42:38:33:45:42
chr1	31837320	.	T	C	354.45	PASS	AF=0.387387;AO=38;DP=106;FAO=43;FDP=111;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=0.0170132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8896;QD=12.7731;RBI=0.0173305;REFB=-0.0168233;REVB=0.0033012;RO=66;SAF=22;SAR=16;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546744;STB=0.553398;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0396453;OID=.;OPOS=31837320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:111:66:68:38:43:0.387387:16:22:35:31:16:27:37:31
chr1	31882730	.	G	A	156.74	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.0174484;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=112.286;QD=24.1131;RBI=0.0174766;REFB=-0.020977;REVB=0.000993992;RO=10;SAF=14;SAR=2;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240337;STB=0.63145;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00985052;OID=.;OPOS=31882730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:26:26:10:10:16:16:0.615385:2:14:10:0:2:14:10:0
chr1	31883295	.	T	C	518.78	PASS	AF=0.482759;AO=53;DP=112;FAO=56;FDP=116;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0130678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0344;QD=17.8889;RBI=0.0162879;REFB=-0.0460672;REVB=-0.00972259;RO=59;SAF=25;SAR=28;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133945;STB=0.507432;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.0394624;OID=.;OPOS=31883295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:116:59:60:53:56:0.482759:28:25:27:32:30:26:27:33
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chr1	31973440	.	G	A	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.232;QD=60.9776;RBI=0.0328333;REFB=0;REVB=0.0181241;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118905;OID=.;OPOS=31973440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:16:23:0:0:16:23:0:0
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chr1	32092918	.	T	TTCC	85.42	PASS	AF=0.22807;AO=13;DP=60;FAO=13;FDP=57;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0371667;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=3;MLLD=294.758;QD=5.99453;RBI=0.0375201;REFB=-0.00743686;REVB=0.00513796;RO=46;SAF=9;SAR=4;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243115;STB=0.669156;STBP=0.187;TYPE=ins;VARB=0.022297;OID=.;OPOS=32092919;OREF=-;OALT=TCC;OMAPALT=TTCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.22807:13:60:13:57:44:9:4:21:23:85:46:9:4:23:23
chr1	32096265	.	A	G	419.41	PASS	AF=0.518519;AO=41;DP=80;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.00128084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8019;QD=20.7117;RBI=0.0104121;REFB=0.0111589;REVB=-0.010333;RO=39;SAF=24;SAR=17;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19767;STB=0.601351;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.00942213;OID=.;OPOS=32096265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:39:39:41:42:0.518519:17:24:14:25:18:24:14:25
chr1	32118159	.	ACA	AAA,AA,AC	236.55	PASS	AF=0,0.513514,0.27027;AO=6,9,13;DP=46;FAO=0,19,10;FDP=37;FR=.;FRO=8;FSAF=0,8,8;FSAR=0,11,2;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0242695,0.023875,-0.117558;FXX=0.177738;HRUN=1,1,8;LEN=1,1,1;MLLD=164.176,164.246,7.8273;QD=25.5732;RBI=0.0369731,0.0405097,0.118739;REFB=-0.0391481,-0.0417899,-0.0764259;REVB=0.0278927,0.0327264,-0.0167061;RO=11;SAF=0,1,10;SAR=6,8,3;SRF=4;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.720817,-0.370366,0.354326;STB=0.5,0.552791,0.76135;STBP=1,0.44,0.027;TYPE=snp,del,del;VARB=0.0309113,0.0397295,-0.0776746;OID=.,.,.;OPOS=32118160,32118160,32118161;OREF=C,C,A;OALT=A,-,-;OMAPALT=AAA,AA,AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.513514,0.27027:6,9,13:46:0,19,10:37:8:0,8,8:0,11,2:2:6:46:11:0,1,10:6,8,3:4:7
chr1	32127953	.	G	A	201.34	PASS	AF=0.678571;AO=19;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.00075814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.775;QD=28.7634;RBI=0.0247591;REFB=-0.0109316;REVB=0.0247475;RO=9;SAF=12;SAR=7;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237543;STB=0.63144;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00650376;OID=.;OPOS=32127953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:9:9:19:19:0.678571:7:12:2:7:7:12:2:7
chr1	32131163	.	C	G	378.83	PASS	AF=0.535211;AO=35;DP=70;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.000103674;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.719;QD=21.3426;RBI=0.0105973;REFB=-0.025129;REVB=0.0105968;RO=33;SAF=23;SAR=12;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766018;STB=0.527458;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0202611;OID=.;OPOS=32131163;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:33:33:35:38:0.535211:12:23:19:14:14:24:19:14
chr1	32148571	.	A	G	481.25	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00773651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.826;QD=58.3337;RBI=0.0400738;REFB=0;REVB=0.03932;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128903;OID=.;OPOS=32148571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:18:13:0:0:19:14:0:0
chr1	32150144	.	CGGGG	CGG,CGGG,CGGGC	156.78	PASS	AF=0.0789474,0.657895,0;AO=4,16,3;DP=38;FAO=3,25,0;FDP=38;FR=.;FRO=10;FSAF=0,7,0;FSAR=3,18,0;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=0.1632,0.296773,-3.0593e-05;FXX=0.0256345;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=16.1541,10.6011,10.5507;QD=16.5034;RBI=0.163217,0.296803,0.0801728;REFB=-0.0313033,-0.0605257,0.00733382;REVB=0.00232781,0.00428378,0.0801728;RO=12;SAF=0,0,3;SAR=4,16,0;SRF=3;SRR=9;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.62617,-0.813884,0.725474;STB=0.5,0.60862,0.5;STBP=1,0.114,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0243113,0.0556168,0;OID=.,.,.;OPOS=32150145,32150145,32150148;OREF=GG,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=CGG,CGGG,CGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0789474,0.657895,0:4,16,3:38:3,25,0:38:10:0,7,0:3,18,0:0:10:45:12:0,0,3:4,16,0:3:9
chr1	32158374	.	T	C	229.53	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=45;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0041028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.06;QD=19.9591;RBI=0.0314568;REFB=-0.00397229;REVB=-0.0311881;RO=20;SAF=12;SAR=10;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270984;STB=0.590477;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00670716;OID=.;OPOS=32158374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:20:23:22:23:0.5:10:12:17:3:10:13:17:6
chr1	32163574	.	CGGGG	CGG,CGGG,CGGGC	1267.35	PASS	AF=0.405405,0.540541,0.0202703;AO=40,46,7;DP=144;FAO=60,80,3;FDP=148;FR=.;FRO=5;FSAF=23,56,3;FSAR=37,24,0;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0438226,-0.0928631,0.0178857;FXX=0.0389585;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=16.0757,12.3068,6.44945;QD=34.2528;RBI=0.129136,0.272456,0.0567383;REFB=0.138752,0.243013,0.0979114;REVB=-0.121473,-0.256142,-0.0538455;RO=9;SAF=13,34,6;SAR=27,12,1;SRF=6;SRR=3;SSEN=0.555556,0.555556,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.126367,0.0282486,0.267754;STB=0.501355,0.520656,0.995834;STBP=0.994,0.149,0.105;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0112722,-0.0246576,-0.0116413;OID=.,.,.;OPOS=32163575,32163575,32163578;OREF=GG,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=CGG,CGGG,CGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.405405,0.540541,0.0202703:40,46,7:144:60,80,3:148:5:23,56,3:37,24,0:2:3:99:9:13,34,6:27,12,1:6:3
chr1	32164206	.	T	G	411.93	PASS	AF=0.539474;AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=76;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0579159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.79;QD=21.6807;RBI=0.101705;REFB=-0.0448901;REVB=-0.0836044;RO=35;SAF=18;SAR=23;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180514;STB=0.599444;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0428424;OID=.;OPOS=32164206;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:35:35:41:41:0.539474:23:18:23:12:23:18:23:12
chr1	32165495	.	G	T	373.76	PASS	AF=0.527778;AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=72;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0994002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9022;QD=20.7642;RBI=0.100229;REFB=-0.00893556;REVB=0.0128654;RO=34;SAF=19;SAR=19;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100461;STB=0.555527;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0100495;OID=.;OPOS=32165495;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:34:34:38:38:0.527778:19:19:13:21:19:19:13:21
chr1	32193647	.	T	C	283.65	PASS	AF=0.526316;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0299797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.45;QD=19.9052;RBI=0.0300651;REFB=-0.0372149;REVB=-0.00226524;RO=27;SAF=14;SAR=16;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755796;STB=0.542028;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.034333;OID=.;OPOS=32193647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:27:27:30:30:0.526316:16:14:15:12:16:14:15:12
chr1	32280610	.	T	C	2350.97	PASS	AF=1;AO=146;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0239383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8072;QD=63.972;RBI=0.0480684;REFB=0;REVB=-0.0416837;RO=0;SAF=83;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03072e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000125426;OID=.;OPOS=32280610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:147:0:0:146:147:1:63:83:0:0:63:84:0:0
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chr1	32557486	.	A	G	1541.34	PASS	AF=1;AO=96;DP=98;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104615;FXX=0.0303;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0422;QD=64.2225;RBI=0.0127131;REFB=0;REVB=0.00722361;RO=0;SAF=40;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00099518;OID=.;OPOS=32557486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:96:0:0:96:96:1:56:40:0:0:56:40:0:0
chr1	32672908	.	T	G	179.12	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0129848;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.368;QD=21.0733;RBI=0.0318937;REFB=-0.0253932;REVB=-0.0291308;RO=16;SAF=13;SAR=5;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293214;STB=0.516511;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0196821;OID=.;OPOS=32672908;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:34:16:16:18:18:0.529412:5:13:12:4:5:13:12:4
chr1	32672932	.	G	A	234.27	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.037583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6055;QD=18.7413;RBI=0.0433289;REFB=-0.013525;REVB=0.0215618;RO=27;SAF=18;SAR=5;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261162;STB=0.649539;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0290234;OID=.;OPOS=32672932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:5:18:15:12:5:18:15:12
chr1	32694819	.	A	G	247.08	PASS	AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00305503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2267;QD=24.7081;RBI=0.0163946;REFB=0.0132455;REVB=0.0161074;RO=17;SAF=16;SAR=7;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271446;STB=0.651448;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.00981081;OID=.;OPOS=32694819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:17:17:23:23:0.575:7:16:6:11:7:16:6:11
chr1	32706791	.	G	T	568.01	PASS	AF=0.75;AO=48;DP=65;FAO=48;FDP=64;FR=.;FRO=16;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0323319;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.771;QD=35.5004;RBI=0.0405113;REFB=-0.0269569;REVB=0.0244093;RO=16;SAF=19;SAR=29;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499405;STB=0.526907;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.00632816;OID=.;OPOS=32706791;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:16:16:48:48:0.75:29:19:8:8:29:19:8:8
chr1	32713199	.	A	G	134.09	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00769462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8022;QD=16.2533;RBI=0.0777718;REFB=0.00254444;REVB=-0.0773902;RO=18;SAF=8;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840217;STB=0.548323;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=-0.00630676;OID=.;OPOS=32713199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:7:8:8:10:7:8:8:10
chr1	32829281	.	G	A	169.51	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.00117355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.422;QD=16.5375;RBI=0.00117881;REFB=-0.041196;REVB=0.000111212;RO=23;SAF=15;SAR=3;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298009;STB=0.673936;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0393101;OID=.;OPOS=32829281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:3:15:14:9:3:15:14:9
chr1	33065947	.	G	C,T	619.5	PASS	AF=0.95122,0.0487805;AO=39,2;DP=41;FAO=39,2;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=19,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231616,0.00816555;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=199.422,11.2433;QD=60.4385;RBI=0.025114,0.0447573;REFB=0,0;REVB=0.0097086,0.0440062;RO=0;SAF=20,1;SAR=19,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.3303e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00220855,0.0942153;OID=.,.;OPOS=33065947,33065947;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:41:41:0:0:39,2:39,2:0.95122,0.0487805:19,1:20,1:0:0:19,1:20,1:0:0
chr1	33133968	.	T	C	639.72	PASS	AF=0.934783;AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0107198;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=229.463;QD=55.6281;RBI=0.0153901;REFB=-0.15578;REVB=0.0110427;RO=3;SAF=17;SAR=26;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00794253;STB=0.504235;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.00136452;OID=.;OPOS=33133968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:46:46:3:3:43:43:0.934783:26:17:1:2:26:17:1:2
chr1	33160878	.	C	T	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00661051;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=348.175;QD=57.6807;RBI=0.0513324;REFB=0;REVB=0.050905;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.98107e-05;OID=.;OPOS=33160878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0
chr1	33161212	.	T	C	755.66	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00269903;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3483;QD=57.031;RBI=0.0330032;REFB=0;REVB=0.0328926;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181146;OID=.;OPOS=33161212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0
chr1	33231380	.	T	G	172.1	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=2;FWDB=-0.041549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4198;QD=18.1156;RBI=0.144634;REFB=-0.00589967;REVB=-0.138538;RO=20;SAF=14;SAR=4;SRF=18;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185321;STB=0.603674;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.000225713;OID=.;OPOS=33231380;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:4:14:18:2:4:14:18:2
chr1	33231403	.	G	T	90.61	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.0125468;FXX=0.0689417;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.295;QD=13.4232;RBI=0.0540652;REFB=-0.0324792;REVB=0.0525892;RO=16;SAF=7;SAR=4;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290291;STB=0.666419;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0767703;OID=.;OPOS=33231403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:28:27:16:16:11:11:0.407407:4:7:14:2:4:7:14:2
chr1	33235626	.	G	A	306.93	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=27;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0138083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.543;QD=20.4618;RBI=0.0493583;REFB=-0.0191378;REVB=0.0473875;RO=26;SAF=27;SAR=5;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195244;STB=0.642755;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0241861;OID=.;OPOS=33235626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:28:32:32:0.533333:5:27:18:8:5:27:18:10
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chr1	33324088	.	C	G	224.81	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.011479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.166;QD=19.9831;RBI=0.0741814;REFB=-0.011313;REVB=-0.0732879;RO=22;SAF=10;SAR=12;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404908;STB=0.512184;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0110614;OID=.;OPOS=33324088;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:22:23:22:22:0.488889:12:10:11:11:12:10:11:12
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chr1	34663411	.	C	G	189.13	PASS	AF=0.347222;AO=23;DP=70;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0184427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.157;QD=10.5072;RBI=0.0395607;REFB=-0.0184888;REVB=-0.0349988;RO=46;SAF=18;SAR=5;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334319;STB=0.680933;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0344738;OID=.;OPOS=34663411;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:46:47:23:25:0.347222:5:18:24:22:6:19:24:23
chr1	34667863	.	C	A	190.01	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.00948314;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.445;QD=20.542;RBI=0.0256996;REFB=-0.00536663;REVB=-0.023886;RO=17;SAF=7;SAR=12;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0684209;STB=0.54854;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0085842;OID=.;OPOS=34667863;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:18:19:19:0.513514:12:7:5:12:12:7:5:13
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chr1	35223881	.	G	A	205.5	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.000615388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.401;QD=14.6783;RBI=0.022958;REFB=-0.0277546;REVB=0.0229498;RO=32;SAF=8;SAR=16;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795645;STB=0.545416;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0352669;OID=.;OPOS=35223881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:16:8:13:19:16:8:13:19
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chr1	35260929	.	G	A	273.42	PASS	AF=0.372093;AO=32;DP=86;FAO=32;FDP=86;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.000824868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=308.166;QD=12.7171;RBI=0.0129085;REFB=-0.00747042;REVB=0.0128821;RO=53;SAF=11;SAR=21;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16597;STB=0.601745;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0126437;OID=.;OPOS=35260929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:53:54:32:32:0.372093:21:11:26:27:21:11:27:27
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chr1	35563206	.	C	G	152.05	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0669648;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.094;QD=20.9721;RBI=0.0884266;REFB=-0.0299933;REVB=-0.0577492;RO=13;SAF=5;SAR=11;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00444403;STB=0.502509;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.052249;OID=.;OPOS=35563206;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:11:5:4:9:11:5:4:9
chr1	35757843	.	A	T	116.67	PASS	AF=0.294118;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0240079;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7882;QD=9.15018;RBI=0.0244631;REFB=-0.0175008;REVB=-0.00469728;RO=37;SAF=4;SAR=11;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332073;STB=0.709391;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0489849;OID=.;OPOS=35757843;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:37:36:15:15:0.294118:11:4:20:17:11:4:20:16
chr1	35900615	.	A	G	702.84	PASS	AF=0.625;AO=59;DP=97;FAO=60;FDP=96;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=0.0435167;FXX=0.0303;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.643;QD=29.2851;RBI=0.043646;REFB=-0.0342619;REVB=0.00335613;RO=36;SAF=27;SAR=32;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128114;STB=0.571808;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0264249;OID=.;OPOS=35900615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:36:36:59:60:0.625:32:27:10:26:32:28:10:26
chr1	35921764	.	G	C	712.8	PASS	AF=0.598214;AO=68;DP=113;FAO=67;FDP=112;FR=.;FRO=45;FSAF=47;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0133232;FXX=0.00884877;HRUN=6;LEN=1;MLLD=276.314;QD=25.457;RBI=0.022226;REFB=-0.0238308;REVB=-0.0177902;RO=44;SAF=48;SAR=20;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292424;STB=0.654548;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0113784;OID=.;OPOS=35921764;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:112:44:45:68:67:0.598214:20:48:14:30:20:47:15:30
chr1	36031342	.	T	A	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.788;QD=14.6518;RBI=0.00970825;REFB=-0.0451465;REVB=0.00970825;RO=5;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174712;OID=.;OPOS=36031342;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:6:0:0:5:6:0:0:5
chr1	36225948	.	T	C	1277.96	PASS	AF=0.976744;AO=84;DP=87;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0158124;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.3386;QD=59.4401;RBI=0.0273533;REFB=-0.178952;REVB=0.0223198;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.512817;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00169326;OID=.;OPOS=36225948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:87:86:0:2:84:84:0.976744:38:46:0:0:38:46:0:2
chr1	36359669	.	A	G	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.883;QD=57.1775;RBI=0.0116154;REFB=0;REVB=-0.0115711;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.58394e-05;OID=.;OPOS=36359669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:27:24:0:0:27:24:0:0
chr1	36553673	.	A	G	885.33	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.447;QD=58.0545;RBI=0.0508208;REFB=0;REVB=0.0166045;RO=0;SAF=40;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186387;OID=.;OPOS=36553673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:21:40:0:0:21:40:0:0
chr1	36557619	.	G	A	491.98	PASS	AF=0.410448;AO=54;DP=133;FAO=55;FDP=134;FR=.;FRO=79;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=0.0221413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1689;QD=14.6858;RBI=0.0225448;REFB=-0.000487054;REVB=0.00424658;RO=79;SAF=25;SAR=29;SRF=34;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346509;STB=0.5251;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.00107117;OID=.;OPOS=36557619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:134:79:79:54:55:0.410448:29:25:34:45:29:26:34:45
chr1	36559558	.	C	T	315.62	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0159571;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.9792;QD=17.5346;RBI=0.0426866;REFB=-0.000184768;REVB=-0.0395919;RO=38;SAF=15;SAR=19;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105045;STB=0.558789;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=-0.000735062;OID=.;OPOS=36559558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:19:15:21:17:19:15:21:17
chr1	36565739	.	C	T	292.18	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0549634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0627;QD=17.1868;RBI=0.0586073;REFB=-0.0326503;REVB=-0.0203431;RO=32;SAF=17;SAR=15;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560024;STB=0.501844;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0374603;OID=.;OPOS=36565739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:32:36:32:32:0.470588:15:17:15:17:15:17:19:17
chr1	36565799	.	T	TAGC	104.3	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0370885;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=3;MLLD=253.227;QD=17.3833;RBI=0.0383311;REFB=-0.0497174;REVB=0.0096808;RO=27;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235721;STB=0.666419;STBP=0.136;TYPE=ins;VARB=0.0456164;OID=.;OPOS=36565800;OREF=-;OALT=AGC;OMAPALT=TAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:12:40:12:24:12:6:6:2:10:99:27:6:6:8:19
chr1	36642420	.	T	C	1044.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.53;QD=59.6787;RBI=0.0450158;REFB=0;REVB=0.0115391;RO=0;SAF=18;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.79117e-05;OID=.;OPOS=36642420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:52:18:0:0:52:18:0:0
chr1	36643700	.	GAGA	G	30.33	PASS	AF=0.3125;AO=4;DP=17;FAO=5;FDP=16;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.0409816;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=3;MLLD=221.506;QD=7.58373;RBI=0.0555828;REFB=-0.0168368;REVB=0.0375493;RO=12;SAF=3;SAR=1;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318171;STB=0.742177;STBP=0.417;TYPE=del;VARB=0.0267973;OID=.;OPOS=36643701;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.3125:4:17:5:16:11:3:2:10:1:30:12:3:1:11:1
chr1	36752433	.	C	T	439.36	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0175915;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.6;QD=54.9198;RBI=0.0519564;REFB=-0.0296297;REVB=0.0488877;RO=1;SAF=19;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239259;STB=0.512812;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00197127;OID=.;OPOS=36752433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:32:1:1:31:31:0.96875:12:19:1:0:12:19:1:0
chr1	36773405	.	T	G	1492.04	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.851;QD=63.4913;RBI=0.0711047;REFB=0;REVB=0.0634726;RO=0;SAF=63;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.23917e-05;OID=.;OPOS=36773405;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:94:0:0:92:94:1:29:63:0:0:30:64:0:0
chr1	36794192	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1751;QD=37.4885;RBI=0.0300432;REFB=0;REVB=0.0255376;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000755251;OID=.;OPOS=36794192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr1	36794475	.	T	C	209.62	PASS	AF=0.477273;AO=20;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.088552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6396;QD=19.0567;RBI=0.114818;REFB=-0.0128533;REVB=-0.0730872;RO=23;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188537;STB=0.591313;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0101753;OID=.;OPOS=36794475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:23:23:20:21:0.477273:9:11:8:15:10:11:8:15
chr1	36794484	.	C	A	208.97	PASS	AF=0.477273;AO=20;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0068961;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.79;QD=18.9974;RBI=0.0322228;REFB=-0.0175116;REVB=0.0314762;RO=23;SAF=10;SAR=10;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226708;STB=0.635853;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0186219;OID=.;OPOS=36794484;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:23:23:20:21:0.477273:10:10:6:17:10:11:6:17
chr1	36807481	.	C	T	510.14	PASS	AF=0.55814;AO=47;DP=85;FAO=48;FDP=86;FR=.;FRO=38;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0526331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5674;QD=23.7274;RBI=0.0561514;REFB=-0.0185863;REVB=0.0195636;RO=38;SAF=32;SAR=15;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686529;STB=0.529902;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0150659;OID=.;OPOS=36807481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:38:38:47:48:0.55814:15:32:23:15:16:32:23:15
chr1	36888462	.	A	G	789.11	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196001;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7253;QD=64.4174;RBI=0.0296444;REFB=0;REVB=0.0222403;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000511518;OID=.;OPOS=36888462;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:18:31:0:0:18:31:0:0
chr1	36889005	.	G	A	1102.51	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00355372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.717;QD=58.8006;RBI=0.00393023;REFB=-0.038274;REVB=-0.00167863;RO=1;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133249;STB=0.50704;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.000569221;OID=.;OPOS=36889005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:35:39:0:1:35:39:0:1
chr1	36893968	.	A	G	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00225666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.614;QD=59.4322;RBI=0.074094;REFB=0;REVB=0.0740596;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304985;OID=.;OPOS=36893968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0
chr1	36926853	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.487;QD=43.4862;RBI=0.0616491;REFB=0;REVB=0.0512728;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000725867;OID=.;OPOS=36926853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0
chr1	36927733	.	G	A	737.7	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6245;QD=61.4747;RBI=0.0765534;REFB=-0.0632998;REVB=0.074431;RO=1;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208969;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00221186;OID=.;OPOS=36927733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:48:48:1:0:47:48:1:22:25:0:1:23:25:0:0
chr1	37307457	.	T	C	836.5	PASS	AF=0.608;AO=76;DP=125;FAO=76;FDP=125;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=51;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=0.00988669;FXX=0.00793588;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.704;QD=26.7682;RBI=0.0199421;REFB=-0.00793484;REVB=0.0173188;RO=48;SAF=25;SAR=51;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366781;STB=0.516847;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0030044;OID=.;OPOS=37307457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:48:49:76:76:0.608:51:25:18:30:51:25:18:31
chr1	37325477	.	A	C	429.1	PASS	AF=0.378788;AO=48;DP=129;FAO=50;FDP=132;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=53;FSRR=29;FWDB=0.000902144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.576;QD=13.0029;RBI=0.0241376;REFB=-0.0161939;REVB=0.0241207;RO=81;SAF=24;SAR=24;SRF=52;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157127;STB=0.590874;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0331731;OID=.;OPOS=37325477;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:132:81:82:48:50:0.378788:24:24:52:29:25:25:53:29
chr1	38002158	.	AT	A	36.51	PASS	AF=0.340426;AO=15;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.123437;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.57946;QD=3.1076;RBI=0.183196;REFB=-0.070656;REVB=-0.135367;RO=29;SAF=4;SAR=11;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424267;STB=0.714025;STBP=0.047;TYPE=del;VARB=0.0998773;OID=.;OPOS=38002159;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.340426:15:47:16:47:31:5:11:20:11:36:29:4:11:19:10
chr1	38006359	.	A	G	618.9	PASS	AF=0.934783;AO=41;DP=44;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0167863;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=81.3464;QD=53.8171;RBI=0.0189526;REFB=0.00246762;REVB=-0.0087989;RO=3;SAF=19;SAR=22;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068503;STB=0.536568;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00021257;OID=.;OPOS=38006359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:44:46:3:3:41:43:0.934783:22:19:3:0:24:19:3:0
chr1	38019747	.	C	T	76.95	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0264094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.88;QD=13.9904;RBI=0.0264192;REFB=-0.0445049;REVB=-0.00072025;RO=11;SAF=1;SAR=9;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167219;STB=0.58676;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0960427;OID=.;OPOS=38019747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:22:22:11:12:10:10:0.454545:9:1:2:9:9:1:2:10
chr1	38023316	.	C	T	185.21	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0134817;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.008;QD=13.7189;RBI=0.0136559;REFB=-0.00302847;REVB=0.00217374;RO=32;SAF=4;SAR=18;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359336;STB=0.709329;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00247829;OID=.;OPOS=38023316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:32:32:22:22:0.407407:18:4:15:17:18:4:15:17
chr1	38077404	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=379.369;QD=33.4285;RBI=0.0143248;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.89489e-05;OID=.;OPOS=38077404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
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chr1	38077420	.	A	ACC,C	282.54	PASS	AF=0.136364,0.863636;AO=3,19;DP=22;FAO=3,19;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=3,19;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018427,-0.0152635;FXX=0;HRUN=0,2;LEN=2,1;MLLD=237.754,74.9491;QD=51.3699;RBI=0.018427,0.0152635;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=0;SAF=3,19;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0138779,-0.0229757;OID=.,.;OPOS=38077421,38077420;OREF=-,A;OALT=CC,C;OMAPALT=ACC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:22:22:0:0:3,19:3,19:0.136364,0.863636:0,0:3,19:0:0:0,0:3,19:0:0
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chr1	38338795	.	A	G	207.85	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0538787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.47;QD=17.6896;RBI=0.0539187;REFB=-0.00325447;REVB=0.00207682;RO=26;SAF=8;SAR=13;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362158;STB=0.520588;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.00517229;OID=.;OPOS=38338795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:13:8:9:17:13:8:9:17
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chr1	38442547	.	G	A	305.88	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.579;QD=53.1963;RBI=0.027217;REFB=0;REVB=-0.0246461;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000213779;OID=.;OPOS=38442547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:11:11:0:0:12:11:0:0
chr1	38449910	.	T	C	221.78	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0243739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0829;QD=14.543;RBI=0.0362696;REFB=-0.00927;REVB=-0.0268588;RO=35;SAF=16;SAR=10;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141102;STB=0.508015;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0107682;OID=.;OPOS=38449910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:10:16:22:13:10:16:22:13
chr1	38450367	.	A	G	601.67	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599184;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5375;QD=60.1674;RBI=0.0607259;REFB=0;REVB=0.0098698;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00357541;OID=.;OPOS=38450367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:38:40:1:14:24:0:0:14:26:0:0
chr1	38462897	.	G	GA	90.82	PASS	AF=1;AO=2;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260008;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=312.978;QD=36.3267;RBI=0.0260008;REFB=0;REVB=0;RO=8;SAF=2;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00955262;OID=.;OPOS=38462898;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:10:10:10:0:10:0:0:0:4:8:2:0:8:0
chr1	38462898	.	T	A	73.16	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00938927;FXX=0.0999001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=343.253;QD=32.5155;RBI=0.00938927;REFB=-0.00487566;REVB=0;RO=1;SAF=8;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.68328e-06;OID=.;OPOS=38462898;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:10:9:1:1:8:8:0.888889:0:8:1:0:0:8:1:0
chr1	38462905	.	C	G	101.79	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.104065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.5276;QD=40.7151;RBI=0.104065;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=10;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00616693;OID=.;OPOS=38462905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:0:10:0:0:0:10:0:0
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chr1	38862336	.	T	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00652698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.7242;QD=55.6556;RBI=0.011662;REFB=0;REVB=0.00966441;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.61552e-05;OID=.;OPOS=38862336;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0
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chr1	39340862	.	A	G	60.51	PASS	AF=0.230769;AO=9;DP=39;FAO=9;FDP=39;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0943917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8966;QD=6.20609;RBI=0.0948065;REFB=-0.0087641;REVB=-0.00885918;RO=30;SAF=4;SAR=5;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054457;STB=0.534807;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0335074;OID=.;OPOS=39340862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:39:39:30:30:9:9:0.230769:5:4:12:18:5:4:12:18
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chr1	39812822	.	C	A	613.25	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.0804;QD=61.3252;RBI=0.0355803;REFB=0;REVB=-0.0216035;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000491253;OID=.;OPOS=39812822;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr1	39880681	.	G	A	632.01	PASS	AF=0.580952;AO=60;DP=104;FAO=61;FDP=105;FR=.;FRO=44;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.011955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8284;QD=24.0767;RBI=0.0140967;REFB=-0.0347998;REVB=0.00746959;RO=44;SAF=37;SAR=23;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0574322;STB=0.526511;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0223244;OID=.;OPOS=39880681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:44:44:60:61:0.580952:23:37:24:20:24:37:24:20
chr1	40098328	.	T	C	340.31	PASS	AF=0.928571;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0339425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.815;QD=48.6153;RBI=0.0339609;REFB=-0.124727;REVB=-0.00111881;RO=2;SAF=4;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183856;STB=0.599914;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00099193;OID=.;OPOS=40098328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:28:28:2:2:26:26:0.928571:22:4:2:0:22:4:2:0
chr1	40145297	.	C	T	240.05	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0344116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9601;QD=16.5555;RBI=0.0516785;REFB=-0.0164664;REVB=-0.0385553;RO=30;SAF=15;SAR=12;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522405;STB=0.52122;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0357456;OID=.;OPOS=40145297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:31:27:27:0.465517:12:15:15:15:12:15:16:15
chr1	40149642	.	G	T	2749.18	PASS	AF=1;AO=171;DP=171;FAO=176;FDP=176;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.454;QD=62.4813;RBI=0.0548243;REFB=0;REVB=0.0476488;RO=0;SAF=106;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.33877e-05;OID=.;OPOS=40149642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:171:176:0:0:171:176:1:65:106:0:0:68:108:0:0
chr1	40150156	.	G	A	397.25	PASS	AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.013434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1997;QD=20.6361;RBI=0.0555146;REFB=-0.018499;REVB=0.0538647;RO=36;SAF=31;SAR=9;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229486;STB=0.637079;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0207924;OID=.;OPOS=40150156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:36:37:40:40:0.519481:9:31:20:16:9:31:20:17
chr1	40230336	.	C	G	35.9	PASS	AF=0.193548;AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0133693;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.323;QD=4.63212;RBI=0.0261363;REFB=-0.00662703;REVB=-0.0224581;RO=19;SAF=3;SAR=3;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153245;STB=0.644719;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0323229;OID=.;OPOS=40230336;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:31:31:19:25:6:6:0.193548:3:3:12:7:3:3:17:8
chr1	40230531	.	C	T	41.28	PASS	AF=0.166667;AO=7;DP=42;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0352682;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=215.9;QD=3.93155;RBI=0.0371974;REFB=-0.00742221;REVB=-0.0118238;RO=35;SAF=4;SAR=3;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14704;STB=0.599734;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0422061;OID=.;OPOS=40230531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:42:42:35:35:7:7:0.166667:3:4:24:11:3:4:24:11
chr1	40315888	.	A	T	408.38	PASS	AF=0.619048;AO=39;DP=63;FAO=39;FDP=63;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00737522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.656;QD=25.9288;RBI=0.0202686;REFB=-0.0366246;REVB=-0.0188791;RO=23;SAF=15;SAR=24;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356281;STB=0.529247;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0202612;OID=.;OPOS=40315888;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:23:24:39:39:0.619048:24:15:10:13:24:15:11:13
chr1	40349131	.	G	A	289.7	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00630017;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.689;QD=18.997;RBI=0.00663978;REFB=-0.0149584;REVB=-0.00209633;RO=30;SAF=14;SAR=17;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163053;STB=0.509085;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0144995;OID=.;OPOS=40349131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:17:14:13:17:17:14:13:17
chr1	40363054	.	G	C	731.08	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0928916;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5528;QD=63.5725;RBI=0.135501;REFB=0;REVB=0.0986488;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00206178;OID=.;OPOS=40363054;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:15:31:0:0:15:31:0:0
chr1	40533266	.	T	G	305.87	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.673;QD=53.1955;RBI=0.0610789;REFB=0;REVB=0.0115369;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346513;OID=.;OPOS=40533266;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:23:0:0:20:23:1:13:7:0:0:16:7:0:0
chr1	40533286	.	AT	A,AG	127.58	PASS	AF=0.25,0.75;AO=3,9;DP=12;FAO=3,9;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=3,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=85.8962,99.7389;QD=42.5259;RBI=0.0222772,0.0288402;REFB=0,0;REVB=0.0222772,0.0288402;RO=0;SAF=0,0;SAR=3,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0413651,0.00721727;OID=.,.;OPOS=40533287,40533287;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=A,AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.25,0.75:3,9:12:3,9:12:0:0,0:3,9:0:0:15:0:0,0:3,9:0:0
chr1	40533314	.	A	AG	131.64	PASS	AF=1;AO=2;DP=15;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126724;FXX=0.199867;HRUN=0;LEN=1;MLLD=55.4953;QD=43.8815;RBI=0.0194897;REFB=0;REVB=-0.0148074;RO=12;SAF=0;SAR=2;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.440425;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00123693;OID=.;OPOS=40533315;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:15:12:12:0:1:11:0:0:3:12:0:2:1:11
chr1	40533315	.	T	G	130.55	PASS	AF=0.923077;AO=11;DP=14;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00380075;FXX=0.133244;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.4569;QD=40.168;RBI=0.0185961;REFB=-0.122363;REVB=-0.0182036;RO=1;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428878;STB=0.521703;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00453825;OID=.;OPOS=40533315;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:14:13:1:1:11:12:0.923077:10:1:0:1:11:1:0:1
chr1	40533320	.	T	G	95.19	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0135443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.409;QD=34.6146;RBI=0.0652001;REFB=0.0648425;REVB=0.0637777;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529355;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=-0.00276844;OID=.;OPOS=40533320;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:11:0:1:10:10:0.909091:8:2:0:0:8:2:0:1
chr1	40533326	.	T	G	135.35	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029492;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0489;QD=45.1177;RBI=0.0526177;REFB=0;REVB=0.0435757;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00511588;OID=.;OPOS=40533326;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr1	40533346	.	AT	AG,GG	104.37	PASS	AF=0.8,0.2;AO=8,2;DP=11;FAO=8,2;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2,2;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00601053,0.0345363;FXX=0.0908265;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=165.07,96.0357;QD=41.748;RBI=0.0236541,0.0346193;REFB=0,0;REVB=0.0228777,0.00239578;RO=0;SAF=2,2;SAR=6,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.58669e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00187616,0.00137875;OID=.,.;OPOS=40533347,40533346;OREF=T,AT;OALT=G,GG;OMAPALT=AG,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:11:10:0:0:8,2:8,2:0.8,0.2:6,0:2,2:0:0:6,0:2,2:0:0
chr1	40555274	.	C	G	102.27	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00710378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.01;QD=17.0446;RBI=0.00857231;REFB=-0.0364583;REVB=0.00479799;RO=11;SAF=6;SAR=6;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267683;STB=0.624804;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00974035;OID=.;OPOS=40555274;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:24:24:11:12:12:12:0.5:6:6:9:2:6:6:9:3
chr1	40734121	.	G	GT	34.39	PASS	AF=0.241379;AO=8;DP=31;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0509076;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=29.2782;QD=4.74397;RBI=0.052308;REFB=-0.0354172;REVB=0.0120225;RO=23;SAF=2;SAR=6;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.452256;STB=0.864368;STBP=0.045;TYPE=ins;VARB=0.167563;OID=.;OPOS=40734122;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.241379:8:31:7:29:22:1:6:14:8:34:23:2:6:15:8
chr1	40737589	.	T	C	817.7	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.0003;QD=57.3826;RBI=0.119436;REFB=0;REVB=0.111585;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000991105;OID=.;OPOS=40737589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:24:33:0:0:24:33:0:0
chr1	40737662	.	G	A	332.43	PASS	AF=0.479452;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0106046;FXX=0.0266631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.325;QD=18.2152;RBI=0.0338117;REFB=-0.0128739;REVB=-0.0321057;RO=37;SAF=21;SAR=14;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179125;STB=0.606497;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0249595;OID=.;OPOS=40737662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:37:38:35:35:0.479452:14:21:15:22:14:21:15:23
chr1	40773149	.	T	C	416.75	PASS	AF=0.482759;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=6.41517e-05;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.283;QD=19.1607;RBI=0.00567935;REFB=-0.0359882;REVB=0.00567898;RO=45;SAF=28;SAR=14;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677873;STB=0.537797;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0266484;OID=.;OPOS=40773149;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:45:45:42:42:0.482759:14:28:27:18:14:28:27:18
chr1	40776752	.	C	A	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0231968;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.407;QD=9.1998;RBI=0.0330841;REFB=-0.0234602;REVB=0.0235895;RO=13;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194284;STB=0.619384;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0440506;OID=.;OPOS=40776752;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:3:4:5:8:3:4:5:8
chr1	40777800	.	T	G	174.08	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00197933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9857;QD=27.8529;RBI=0.0285027;REFB=0.0249502;REVB=-0.0284339;RO=8;SAF=13;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186774;STB=0.604519;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=-0.0138523;OID=.;OPOS=40777800;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:8:8:17:17:0.68:4:13:4:4:4:13:4:4
chr1	40840353	.	A	G	343.75	PASS	AF=0.870968;AO=26;DP=31;FAO=27;FDP=31;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.043134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3834;QD=44.355;RBI=0.0587779;REFB=0.00795784;REVB=0.0399286;RO=4;SAF=12;SAR=14;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132075;STB=0.566618;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.00385609;OID=.;OPOS=40840353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:31:31:4:4:26:27:0.870968:14:12:4:0:14:13:4:0
chr1	40881041	.	C	G	2031.47	PASS	AF=0.950704;AO=135;DP=141;FAO=135;FDP=142;FR=.;FRO=7;FSAF=74;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0891048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1715;QD=57.2244;RBI=0.123279;REFB=-0.0846241;REVB=0.0851935;RO=4;SAF=74;SAR=61;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164224;STB=0.520085;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00458798;OID=.;OPOS=40881041;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:141:142:4:7:135:135:0.950704:61:74:1:3:61:74:1:6
chr1	40923019	.	G	A	987.33	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.112;QD=58.9449;RBI=0.0329528;REFB=0;REVB=0.00694612;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.09644e-05;OID=.;OPOS=40923019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:37:30:0:0:37:30:0:0
chr1	41013015	.	C	T	192.91	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.000918619;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.038;QD=23.3829;RBI=0.00168553;REFB=-0.00923191;REVB=0.0014132;RO=14;SAF=4;SAR=15;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268771;STB=0.651997;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00522822;OID=.;OPOS=41013015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:15:4:7:7:15:4:7:7
chr1	41292377	.	G	A	310.7	PASS	AF=0.384615;AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.0121547;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2136;QD=13.6569;RBI=0.0124181;REFB=0.00269024;REVB=-0.002544;RO=55;SAF=15;SAR=20;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674322;STB=0.544278;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.00512636;OID=.;OPOS=41292377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:55:56:35:35:0.384615:20:15:27:28:20:15:28:28
chr1	41327873	.	G	C	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.017873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.737;QD=12.396;RBI=0.017873;REFB=-0.0117401;REVB=0;RO=5;SAF=5;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0181965;OID=.;OPOS=41327873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:0:5:5:0:0:5:5:0
chr1	41482976	.	A	G	313.77	PASS	AF=0.406977;AO=35;DP=86;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0136399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0554;QD=14.594;RBI=0.0141789;REFB=-0.0124775;REVB=0.00387228;RO=51;SAF=14;SAR=21;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136408;STB=0.57742;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0147572;OID=.;OPOS=41482976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:51:51:35:35:0.406977:21:14:27:24:21:14:27:24
chr1	41976017	.	C	T	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00700215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.718;QD=53.2763;RBI=0.0192286;REFB=0;REVB=0.0179083;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.88551e-05;OID=.;OPOS=41976017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr1	41976328	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0638679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.861;QD=33.4285;RBI=0.0860072;REFB=0;REVB=0.0576033;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00172896;OID=.;OPOS=41976328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr1	41978566	.	T	G	1922.65	PASS	AF=0.992248;AO=106;DP=115;FAO=128;FDP=129;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=72;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0987383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.1184;QD=59.617;RBI=0.100352;REFB=0;REVB=0.0179256;RO=0;SAF=53;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00648602;OID=.;OPOS=41978566;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:115:129:0:0:106:128:0.992248:53:53:0:0:56:72:0:0
chr1	41978825	.	C	G	1364.46	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504664;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.115;QD=62.7338;RBI=0.0601606;REFB=0;REVB=0.0327483;RO=0;SAF=50;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.09195e-05;OID=.;OPOS=41978825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:87:0:0:85:87:1:35:50:0:0:35:52:0:0
chr1	41979156	.	A	G	62.25	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0652545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.564;QD=35.5741;RBI=0.0652721;REFB=0;REVB=-0.00151523;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000948025;OID=.;OPOS=41979156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr1	42046612	.	C	CT	42.71	PASS	AF=0.538462;AO=3;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0463328;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=175.641;QD=13.1422;RBI=0.0542616;REFB=-0.0419321;REVB=0.0282418;RO=10;SAF=2;SAR=1;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411706;STB=0.627576;STBP=0.445;TYPE=ins;VARB=0.0298493;OID=.;OPOS=42046613;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.538462:3:13:7:13:6:4:3:5:1:37:10:2:1:7:3
chr1	42046812	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=4;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.798;QD=33.4281;RBI=0.0142622;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=4;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000506095;OID=.;OPOS=42046812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:4:6:1:0:4:0:0:0:6:0:0
chr1	42048745	.	T	C	370.06	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00704792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5908;QD=52.8651;RBI=0.0821788;REFB=-0.082891;REVB=0.081876;RO=0;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00358701;OID=.;OPOS=42048745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:27:28:0:0:27:28:1:20:7:0:0:21:7:0:0
chr1	42049032	.	G	A	3263.29	PASS	AF=1;AO=210;DP=212;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=113;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380009;FXX=0.00943352;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.939;QD=62.1579;RBI=0.0550627;REFB=0;REVB=0.0398476;RO=0;SAF=97;SAR=113;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86378e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.39286e-06;OID=.;OPOS=42049032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:212:210:0:0:210:210:1:113:97:0:0:113:97:0:0
chr1	42049140	.	C	G	1830.42	PASS	AF=1;AO=119;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0706182;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.572;QD=59.5259;RBI=0.0706441;REFB=0;REVB=-0.00191241;RO=2;SAF=76;SAR=43;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012335;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.4749e-05;OID=.;OPOS=42049140;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:123:123:2:0:119:123:1:43:76:2:0:44:79:0:0
chr1	42050366	.	C	T	288.5	PASS	AF=0.533333;AO=30;DP=61;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0162409;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8599;QD=19.2331;RBI=0.0850159;REFB=-0.0400575;REVB=-0.0834502;RO=28;SAF=8;SAR=22;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586268;STB=0.504828;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0462752;OID=.;OPOS=42050366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:28:28:30:32:0.533333:22:8:9:19:22:10:9:19
chr1	42630364	.	G	A	700.46	PASS	AF=0.507353;AO=69;DP=136;FAO=69;FDP=136;FR=.;FRO=67;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=0.0396898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9284;QD=20.6017;RBI=0.0437264;REFB=-0.0149455;REVB=0.0183498;RO=66;SAF=35;SAR=34;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474594;STB=0.529541;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0142072;OID=.;OPOS=42630364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:66:67:69:69:0.507353:34:35:37:29:34:35:38:29
chr1	42693597	.	A	G	1036.95	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.654;QD=59.2546;RBI=0.038936;REFB=0;REVB=0.0151614;RO=0;SAF=40;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178885;OID=.;OPOS=42693597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:69:70:1:29:40:0:0:29:41:0:0
chr1	42880516	.	T	C	105.72	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0314781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.0522;QD=11.4289;RBI=0.0317173;REFB=-0.0173415;REVB=-0.0038881;RO=24;SAF=9;SAR=4;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342971;STB=0.703394;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0277186;OID=.;OPOS=42880516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:4:9:9:15:4:9:9:15
chr1	42898843	.	A	G	253.2	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=4;FWDB=-0.00347181;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=217.424;QD=19.1095;RBI=0.0065249;REFB=0.000791093;REVB=0.00552456;RO=26;SAF=21;SAR=6;SRF=22;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0922975;STB=0.551246;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=-0.00055672;OID=.;OPOS=42898843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:26:27:27:0.509434:6:21:22:4:6:21:22:4
chr1	42925688	.	T	G	450.16	PASS	AF=0.556962;AO=43;DP=79;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0521616;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8119;QD=22.7927;RBI=0.0535302;REFB=-0.03371;REVB=0.0120271;RO=29;SAF=19;SAR=24;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209957;STB=0.536837;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.027313;OID=.;OPOS=42925688;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:29:35:43:44:0.556962:24:19:12:17:25:19:18:17
chr1	42986956	.	T	C	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00228278;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=331.566;QD=17.2298;RBI=0.00414715;REFB=-0.0011075;REVB=0.00346233;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376076;STB=0.713847;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.000719609;OID=.;OPOS=42986956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:4:4:0:6:4:4:0:6
chr1	43034740	.	T	C	145.06	PASS	AF=0.6;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0639273;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9058;QD=23.2091;RBI=0.0695596;REFB=-0.0296189;REVB=0.0274197;RO=10;SAF=9;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726419;STB=0.540928;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0249992;OID=.;OPOS=43034740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:26:25:10:10:15:15:0.6:6:9:5:5:6:9:5:5
chr1	43201534	.	G	A	366.46	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0571316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.74;QD=52.3516;RBI=0.0680908;REFB=-0.213407;REVB=0.0370452;RO=1;SAF=18;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251379;STB=0.513504;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00371084;OID=.;OPOS=43201534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:28:28:1:1:27:27:0.964286:9:18:1:0:9:18:1:0
chr1	43212111	.	C	T	447.01	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.326;QD=57.6783;RBI=0.0466533;REFB=0;REVB=-0.0128703;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239534;OID=.;OPOS=43212111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr1	43212431	.	A	G	2129.3	PASS	AF=1;AO=98;DP=142;FAO=141;FDP=141;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=82;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540578;FXX=0.0208319;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.582;QD=60.4056;RBI=0.0582301;REFB=0;REVB=0.0216447;RO=0;SAF=55;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.423e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00501337;OID=.;OPOS=43212431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:141:0:0:98:141:1:43:55:0:0:59:82:0:0
chr1	43212869	.	A	T	658.69	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0525972;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.166;QD=52.695;RBI=0.0576011;REFB=-0.0283904;REVB=0.0234823;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519992;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=4.59654e-05;OID=.;OPOS=43212869;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:50:0:2:48:48:0.96:24:24:0:0:24:24:2:0
chr1	43213436	.	G	A	110.9	PASS	AF=0.271186;AO=16;DP=59;FAO=16;FDP=59;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0791875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.279;QD=7.51869;RBI=0.0809348;REFB=-0.000623597;REVB=-0.016727;RO=42;SAF=8;SAR=8;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853141;STB=0.54232;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00109355;OID=.;OPOS=43213436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:42:43:16:16:0.271186:8:8:24:18:8:8:24:19
chr1	43215571	.	A	G	905.88	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00520833;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7577;QD=58.4437;RBI=0.0566279;REFB=0;REVB=0.0563879;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102888;OID=.;OPOS=43215571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0
chr1	43309842	.	G	C	1008.48	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000150155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.504;QD=59.3226;RBI=0.00504167;REFB=0;REVB=0.00503943;RO=0;SAF=23;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.01157e-05;OID=.;OPOS=43309842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:45:23:0:0:45:23:0:0
chr1	43408966	.	G	A	319.0	PASS	AF=0.432099;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.00471227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.487;QD=15.7533;RBI=0.005933;REFB=-0.0132357;REVB=0.00360485;RO=46;SAF=17;SAR=18;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799422;STB=0.545045;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0174244;OID=.;OPOS=43408966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:46:46:35:35:0.432099:18:17:26:20:18:17:26:20
chr1	43457145	.	C	T	216.28	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0520407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5146;QD=48.0624;RBI=0.0824307;REFB=0;REVB=-0.0639264;RO=0;SAF=13;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00209625;OID=.;OPOS=43457145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:4:13:0:0:4:14:0:0
chr1	43457170	.	T	C	223.64	PASS	AF=1;AO=15;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00815603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.121;QD=49.6979;RBI=0.0204648;REFB=0;REVB=0.0187693;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353197;OID=.;OPOS=43457170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:15:18:1:4:11:0:0:4:14:0:0
chr1	43675467	.	G	A	851.07	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3046;QD=57.7;RBI=0.112581;REFB=0;REVB=0.111269;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129321;OID=.;OPOS=43675467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:31:28:0:0:31:28:0:0
chr1	43719778	.	G	A	460.26	PASS	AF=0.564103;AO=44;DP=79;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0271395;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4231;QD=23.6032;RBI=0.0358667;REFB=-0.0179546;REVB=0.0234493;RO=35;SAF=24;SAR=20;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211473;STB=0.50588;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0151354;OID=.;OPOS=43719778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:35:34:44:44:0.564103:20:24:20:15:20:24:19:15
chr1	43771016	.	TA	T	348.42	PASS	AF=1;AO=27;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230552;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=25.709;QD=46.4554;RBI=0.0284318;REFB=0;REVB=0.016638;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00161163;OID=.;OPOS=43771017;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:27:29:30:30:0:12:18:0:0:6:0:11:16:0:0
chr1	43779477	.	G	C	258.96	PASS	AF=0.309735;AO=35;DP=113;FAO=35;FDP=113;FR=.;FRO=78;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=44;FWDB=-0.00905012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8961;QD=9.16685;RBI=0.0217999;REFB=-0.0197288;REVB=-0.0198326;RO=78;SAF=18;SAR=17;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923996;STB=0.553955;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0393239;OID=.;OPOS=43779477;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:78:78:35:35:0.309735:17:18:34:44:17:18:34:44
chr1	43779564	.	T	C	1371.67	PASS	AF=1;AO=86;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.594;QD=62.3485;RBI=0.0546149;REFB=0;REVB=0.0523697;RO=0;SAF=36;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.18258e-05;OID=.;OPOS=43779564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:86:88:1:50:36:0:0:50:38:0:0
chr1	43828736	.	G	A	293.85	PASS	AF=0.339286;AO=37;DP=112;FAO=38;FDP=112;FR=.;FRO=74;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=50;FSRR=24;FWDB=0.0481003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.2444;QD=10.4946;RBI=0.0481328;REFB=-0.0338086;REVB=-0.00176994;RO=74;SAF=24;SAR=13;SRF=50;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345952;STB=0.531811;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0629213;OID=.;OPOS=43828736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:74:74:37:38:0.339286:13:24:50:24:14:24:50:24
chr1	43893383	.	G	GC	30.53	PASS	AF=0.188406;AO=14;DP=70;FAO=13;FDP=69;FR=.;FRO=56;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.000615136;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=15.5692;QD=1.76962;RBI=0.0158848;REFB=-0.051462;REVB=-0.0158729;RO=56;SAF=5;SAR=9;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222378;STB=0.622035;STBP=0.34;TYPE=ins;VARB=0.112239;OID=.;OPOS=43893384;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.188406:14:70:13:69:56:5:8:30:26:30:56:5:9:30:26
chr1	44035352	.	C	T	305.15	PASS	AF=0.419753;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0110479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.929;QD=15.069;RBI=0.017939;REFB=-0.034145;REVB=0.0141334;RO=46;SAF=20;SAR=14;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465116;STB=0.533314;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0430138;OID=.;OPOS=44035352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:46:47:34:34:0.419753:14:20:25:21:14:20:25:22
chr1	44058265	.	C	A	802.77	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00354834;FXX=0.0169463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.732;QD=55.3637;RBI=0.0795426;REFB=-0.120607;REVB=0.0794634;RO=0;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506491;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.000443811;OID=.;OPOS=44058265;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:58:0:1:57:57:0.982759:19:38:0:0:19:38:1:0
chr1	44071221	.	G	A,C	719.03	PASS	AF=0.9375,0.0416667;AO=45,2;DP=48;FAO=45,2;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=28,2;FSAR=17,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0243692,0.0139017;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=124.355,121.178;QD=59.9195;RBI=0.0493505,0.0147057;REFB=-0.164434,-0.126042;REVB=0.042914,-0.00479588;RO=0;SAF=28,2;SAR=17,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.514279,0.993266;STBP=0.289,0.227;TYPE=snp,snp;VARB=0.000397291,0.0240865;OID=.,.;OPOS=44071221,44071221;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:48:48:0:1:45,2:45,2:0.9375,0.0416667:17,0:28,2:0:0:17,0:28,2:0:1
chr1	44072018	.	C	T	1866.07	PASS	AF=0.961538;AO=125;DP=130;FAO=125;FDP=130;FR=.;FRO=5;FSAF=67;FSAR=58;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0100946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1588;QD=57.4174;RBI=0.0114777;REFB=-0.205508;REVB=-0.00546222;RO=5;SAF=68;SAR=57;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0041213;STB=0.51022;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.00587447;OID=.;OPOS=44072018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:130:130:5:5:125:125:0.961538:57:68:3:2:58:67:4:1
chr1	44072066	.	C	T	1470.66	PASS	AF=0.980583;AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.023516;FXX=0.00961446;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.04;QD=57.1129;RBI=0.0272466;REFB=-0.127123;REVB=0.0137613;RO=2;SAF=52;SAR=49;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178954;STB=0.509432;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.000298591;OID=.;OPOS=44072066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:104:103:2:2:101:101:0.980583:49:52:2:0:49:52:2:0
chr1	44083507	.	T	C	1153.54	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.478;QD=60.7125;RBI=0.044904;REFB=0;REVB=0.0433395;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.59272e-05;OID=.;OPOS=44083507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
chr1	44083519	.	G	A	1115.88	PASS	AF=0.962025;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0325889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5647;QD=56.5001;RBI=0.0326295;REFB=-0.0301143;REVB=0.0016268;RO=3;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388441;STB=0.520543;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0118797;OID=.;OPOS=44083519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:79:79:3:3:76:76:0.962025:35:41:0:3:35:41:0:3
chr1	44084739	.	C	T	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00556069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0704;QD=59.4317;RBI=0.0239289;REFB=0;REVB=0.0232738;RO=0;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000393435;OID=.;OPOS=44084739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:26:9:0:0:26:9:0:0
chr1	44086831	.	C	T	590.03	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282036;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.692;QD=60.5162;RBI=0.0675363;REFB=0;REVB=-0.0613654;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000173296;OID=.;OPOS=44086831;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:40:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr1	44137257	.	C	A	1061.42	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.217;QD=59.7984;RBI=0.037697;REFB=0;REVB=0.0257636;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.36016e-06;OID=.;OPOS=44137257;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:27:44:0:0:27:44:0:0
chr1	44290530	.	A	G	540.78	PASS	AF=0.442748;AO=58;DP=131;FAO=58;FDP=131;FR=.;FRO=73;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=32;FWDB=0.0567351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7771;QD=16.5122;RBI=0.0567694;REFB=-0.0148687;REVB=0.00197397;RO=73;SAF=37;SAR=21;SRF=41;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802232;STB=0.544858;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0181863;OID=.;OPOS=44290530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:73:73:58:58:0.442748:21:37:41:32:21:37:41:32
chr1	44395786	.	C	T	207.81	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.00384711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.933;QD=17.6858;RBI=0.00432976;REFB=-0.0237566;REVB=0.0019866;RO=26;SAF=11;SAR=10;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166326;STB=0.594176;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0256013;OID=.;OPOS=44395786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:10:11:18:8:10:11:18:8
chr1	44396196	.	A	G	126.88	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.04761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.7604;QD=19.5201;RBI=0.0500275;REFB=-0.011561;REVB=-0.0153635;RO=11;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731378;STB=0.555479;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.004396;OID=.;OPOS=44396196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:11:12:14:14:0.538462:5:9:8:3:5:9:9:3
chr1	44401384	.	A	G	750.94	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.752;QD=56.6744;RBI=0.0724237;REFB=0;REVB=0.0601694;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417162;OID=.;OPOS=44401384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:53:0:0:50:53:1:23:27:0:0:24:29:0:0
chr1	44401680	.	A	AC,C	329.43	PASS	AF=0.705882,0;AO=24,3;DP=55;FAO=36,0;FDP=51;FR=.;FRO=15;FSAF=30,0;FSAR=6,0;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=0.265453,-0.00960969;FXX=0.0192271;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=19.409,59.9275;QD=25.8376;RBI=0.279767,0.0294729;REFB=-0.116757,-0.0127826;REVB=0.0883426,-0.0278622;RO=26;SAF=21,3;SAR=3,0;SRF=10;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.542232,0.614866;STB=0.747876,0.5;STBP=0,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0736908,0;OID=.,.;OPOS=44401681,44401680;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:55:51:26:15:24,3:36,0:0.705882,0:3,0:21,3:10:16:6,0:30,0:2:13
chr1	44415415	.	C	T	182.29	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00693381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.589;QD=16.9572;RBI=0.00693384;REFB=-0.016149;REVB=2.01655e-05;RO=23;SAF=9;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129043;STB=0.560912;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0227717;OID=.;OPOS=44415415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:23:24:19:19:0.44186:10:9:14:9:10:9:14:10
chr1	44415424	.	A	G	262.32	PASS	AF=0.568182;AO=22;DP=42;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00937036;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.599;QD=23.847;RBI=0.0436923;REFB=-0.0492696;REVB=-0.0426757;RO=19;SAF=9;SAR=13;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545875;STB=0.50273;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0490413;OID=.;OPOS=44415424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:19:19:22:25:0.568182:13:9:9:10:13:12:9:10
chr1	44440769	.	G	C	149.52	PASS	AF=0.714286;AO=14;DP=20;FAO=15;FDP=21;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0321701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.542;QD=28.4808;RBI=0.0410526;REFB=-0.0286757;REVB=0.0255029;RO=6;SAF=6;SAR=8;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0526313;STB=0.538411;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0129912;OID=.;OPOS=44440769;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:21:6:6:14:15:0.714286:8:6:2:4:8:7:2:4
chr1	44441533	.	A	G	175.18	PASS	AF=0.3;AO=17;DP=72;FAO=24;FDP=80;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.0172364;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0174;QD=8.75907;RBI=0.0183721;REFB=-0.0286169;REVB=0.00635917;RO=49;SAF=11;SAR=6;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121459;STB=0.516722;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0360683;OID=.;OPOS=44441533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:80:49:56:17:24:0.3:6:11:27:22:11:13:29:27
chr1	44445667	.	T	C	696.58	PASS	AF=0.631579;AO=57;DP=92;FAO=60;FDP=95;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0329738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.01;QD=29.3295;RBI=0.0783126;REFB=-0.0527862;REVB=0.0710323;RO=35;SAF=24;SAR=33;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184023;STB=0.605007;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0192186;OID=.;OPOS=44445667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:95:35:35:57:60:0.631579:33:24:24:11:36:24:24:11
chr1	44447413	.	G	C	372.82	PASS	AF=0.520548;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0178736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.64;QD=20.4286;RBI=0.0178866;REFB=-0.0328285;REVB=-0.000681824;RO=31;SAF=21;SAR=17;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108354;STB=0.532206;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0388525;OID=.;OPOS=44447413;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:31:35:38:38:0.520548:17:21:13:18:17:21:17:18
chr1	44451232	.	A	AT	32.03	PASS	AF=0.428571;AO=3;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0587667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=12.6454;QD=4.57539;RBI=0.0661315;REFB=-0.0626211;REVB=0.0303289;RO=25;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.745447;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0307696;OID=.;OPOS=44451233;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.428571:3:28:12:28:16:3:9:4:12:32:25:3:0:4:21
chr1	44451234	.	C	T	73.86	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0413691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.161;QD=10.5512;RBI=0.053476;REFB=-0.0316488;REVB=0.0338863;RO=18;SAF=1;SAR=9;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.398055;STB=0.749375;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0559706;OID=.;OPOS=44451234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:28:28:18:18:10:10:0.357143:9:1:6:12:9:1:6:12
chr1	44457305	.	G	A	382.68	PASS	AF=0.575758;AO=37;DP=65;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=5;FWDB=0.0260582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1232;QD=23.1925;RBI=0.0608001;REFB=-0.00462731;REVB=0.0549329;RO=28;SAF=18;SAR=19;SRF=23;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261927;STB=0.645598;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00937015;OID=.;OPOS=44457305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:28:28:37:38:0.575758:19:18:23:5:20:18:23:5
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chr1	44595410	.	A	G	94.06	PASS	AF=0.611111;AO=10;DP=19;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0136713;FXX=0.0526039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.3497;QD=20.9012;RBI=0.028494;REFB=-0.0620668;REVB=-0.0250001;RO=7;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153826;STB=0.599822;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0391987;OID=.;OPOS=44595410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:19:18:7:7:10:11:0.611111:5:5:2:5:5:6:2:5
chr1	44595426	.	G	A	89.56	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0139212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.249;QD=15.5752;RBI=0.0578163;REFB=-0.0191076;REVB=-0.0561153;RO=12;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126336;STB=0.573634;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0244476;OID=.;OPOS=44595426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:7:4:6:6:7:4:6:6
chr1	44596379	.	CCAA	C	167.12	PASS	AF=0.376623;AO=28;DP=76;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.00987137;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=212.783;QD=8.68178;RBI=0.00990638;REFB=-0.0198021;REVB=-0.000832154;RO=38;SAF=9;SAR=19;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377753;STB=0.561444;STBP=0.427;TYPE=del;VARB=0.0303692;OID=.;OPOS=44596380;OREF=CAA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.376623:28:76:29:77:48:10:19:21:27:99:38:9:19:11:27
chr1	44680719	.	G	C	232.18	PASS	AF=0.409091;AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0168809;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6469;QD=14.0716;RBI=0.0175106;REFB=-0.00172533;REVB=0.00465374;RO=39;SAF=8;SAR=19;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140505;STB=0.508015;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.00251693;OID=.;OPOS=44680719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:66:39:39:27:27:0.409091:19:8:12:27:19:8:12:27
chr1	44685834	.	CCG	C	85.17	PASS	AF=0.517241;AO=12;DP=34;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0190185;FXX=0.147016;HRUN=3;LEN=2;MLLD=25.3353;QD=11.7469;RBI=0.107558;REFB=-0.120759;REVB=-0.105863;RO=16;SAF=8;SAR=4;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443658;STB=0.738838;STBP=0.014;TYPE=del;VARB=0.110244;OID=.;OPOS=44685835;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.517241:12:34:15:29:14:10:5:2:12:83:16:8:4:3:13
chr1	44788398	.	A	T	283.41	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.816;QD=51.5283;RBI=0.0869983;REFB=0;REVB=-0.0744489;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.21174e-05;OID=.;OPOS=44788398;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:22:0:0:20:22:1:9:11:0:0:9:13:0:0
chr1	45120696	.	C	T	183.93	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00648727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.742;QD=17.9443;RBI=0.0127561;REFB=-0.00630498;REVB=-0.0109833;RO=22;SAF=12;SAR=7;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517297;STB=0.529381;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0165352;OID=.;OPOS=45120696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:7:12:15:7:7:12:15:7
chr1	45187511	.	T	C	530.39	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00527213;FXX=0.0263089;HRUN=5;LEN=1;MLLD=274.617;QD=57.3393;RBI=0.017144;REFB=-0.106656;REVB=0.0163132;RO=1;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199188;STB=0.510632;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00235549;OID=.;OPOS=45187511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:37:1:1:36:36:0.972973:23:13:0:1:23:13:0:1
chr1	45196743	.	G	A	153.61	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00799671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.174;QD=21.9446;RBI=0.0262425;REFB=-0.0134959;REVB=-0.0249944;RO=12;SAF=14;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.410454;STB=0.736485;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0102353;OID=.;OPOS=45196743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:2:14:6:6:2:14:6:6
chr1	45196754	.	A	G	157.2	PASS	AF=0.586207;AO=16;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0323546;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=72.414;QD=21.6825;RBI=0.105256;REFB=-0.00905416;REVB=0.10016;RO=12;SAF=14;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.410454;STB=0.740396;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.01429;OID=.;OPOS=45196754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:29:29:12:12:16:17:0.586207:2:14:6:6:2:15:6:6
chr1	45196770	.	A	G	393.03	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228435;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.189;QD=56.1467;RBI=0.0234567;REFB=0;REVB=-0.00532806;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02782e-05;OID=.;OPOS=45196770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:7:21:0:0:7:21:0:0
chr1	45196837	.	G	C	68.09	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0215254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.79;QD=14.3339;RBI=0.0382327;REFB=-0.0107047;REVB=-0.0315974;RO=10;SAF=7;SAR=2;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36564;STB=0.717431;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0204581;OID=.;OPOS=45196837;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:2:7:4:6:2:7:4:6
chr1	45218895	.	A	T	413.8	PASS	AF=0.482759;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0235146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3673;QD=19.0254;RBI=0.0286883;REFB=-0.0203135;REVB=-0.0164342;RO=43;SAF=23;SAR=19;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137989;STB=0.564617;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0241704;OID=.;OPOS=45218895;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:43:45:42:42:0.482759:19:23:17:26:19:23:19:26
chr1	45224998	.	A	C	183.07	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.00546807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.527;QD=13.314;RBI=0.0217949;REFB=-0.00937905;REVB=0.0210978;RO=32;SAF=5;SAR=17;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287184;STB=0.677244;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0226137;OID=.;OPOS=45224998;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:32:33:22:22:0.4:17:5:15:17:17:5:16:17
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chr1	45244051	.	T	TG	121.48	PASS	AF=0.534884;AO=16;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.155256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=12.5722;QD=11.3;RBI=0.156978;REFB=-0.0318197;REVB=-0.0231823;RO=25;SAF=11;SAR=5;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403637;STB=0.523056;STBP=0.785;TYPE=ins;VARB=0.0410931;OID=.;OPOS=45244052;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.534884:16:43:23:43:20:17:6:14:6:70:25:11:5:18:7
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chr1	45270024	.	G	C	330.57	PASS	AF=0.37963;AO=42;DP=107;FAO=41;FDP=108;FR=.;FRO=67;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=28;FWDB=-0.0212102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2536;QD=12.2433;RBI=0.0889691;REFB=-0.00522544;REVB=0.0864039;RO=60;SAF=17;SAR=25;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218592;STB=0.603182;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.028877;OID=.;OPOS=45270024;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:60:67:42:41:0.37963:25:17:37:23:24:17:39:28
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chr1	45474008	.	T	C	603.86	PASS	AF=0.392638;AO=63;DP=163;FAO=64;FDP=163;FR=.,HEALED;FRO=92;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=47;FSRR=45;FWDB=0.00478984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.164;QD=14.8187;RBI=0.0118682;REFB=-0.00479466;REVB=0.0108587;RO=92;SAF=26;SAR=37;SRF=47;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10459;STB=0.56243;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00606545;OID=.;OPOS=45474008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:163:92:92:63:64:0.392638:37:26:47:45:38:26:47:45
chr1	45479709	.	A	G	384.75	PASS	AF=0.465116;AO=38;DP=84;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0110271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.34;QD=17.8955;RBI=0.01609;REFB=-0.0057265;REVB=-0.0117171;RO=46;SAF=21;SAR=17;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0090264;STB=0.503519;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00613728;OID=.;OPOS=45479709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:86:46:46:38:40:0.465116:17:21:25:21:18:22:25:21
chr1	45479772	.	G	T	393.11	PASS	AF=0.445652;AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.100526;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.5442;QD=17.0916;RBI=0.125586;REFB=0.00548246;REVB=0.0752756;RO=51;SAF=22;SAR=19;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103714;STB=0.558111;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=-0.00411706;OID=.;OPOS=45479772;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:51:51:41:41:0.445652:19:22:22:29:19:22:22:29
chr1	45671966	.	A	G	67.36	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0348847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.421;QD=14.968;RBI=0.0413741;REFB=-0.0370935;REVB=-0.0222458;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15636;STB=0.636106;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0351224;OID=.;OPOS=45671966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:8:9:8:9:0.5:2:6:7:1:3:6:8:1
chr1	45793371	.	TGGGC	TGG,TGGC	1279.31	PASS	AF=0,0.985714;AO=40,78;DP=134;FAO=0,138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=0,100;FSAR=0,38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0417415,-0.169794;FXX=0.0070917;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=157.234,14.3808;QD=36.5518;RBI=0.0435437,0.198212;REFB=0.0592221,-0.0459129;REVB=0.0123976,0.102265;RO=4;SAF=22,66;SAR=18,12;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0.336364,0.336364;SSSB=-0.0344709,0.0168045;STB=0.5,0.50495;STBP=1,0.432;TYPE=del,del;VARB=0,0.00487778;OID=.,.;OPOS=45793374,45793372;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGG,TGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,0.985714:40,78:134:0,138:140:2:0,100:0,38:2:0:15:4:22,66:18,12:3:1
chr1	45797505	.	C	G	288.83	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.0473097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.064;QD=16.2719;RBI=0.0601736;REFB=-0.0317923;REVB=-0.037184;RO=39;SAF=19;SAR=13;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750873;STB=0.542143;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0254193;OID=.;OPOS=45797505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:13:19:26:13:13:19:26:13
chr1	45805566	.	G	C	443.25	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.060614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.421;QD=57.1936;RBI=0.0669372;REFB=0;REVB=0.0283996;RO=0;SAF=5;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39272e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116266;OID=.;OPOS=45805566;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:31:0:0:28:31:1:23:5:0:0:25:6:0:0
chr1	45805624	.	G	A	180.1	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0283893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1192;QD=23.2381;RBI=0.0359752;REFB=-0.0240709;REVB=0.0220967;RO=13;SAF=1;SAR=17;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.569767;STB=0.831663;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.01001;OID=.;OPOS=45805624;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:17:1:6:7:17:1:6:7
chr1	45810091	.	A	G	294.11	PASS	AF=0.619048;AO=25;DP=41;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0258373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.289;QD=28.0108;RBI=0.026266;REFB=-0.005435;REVB=-0.00472605;RO=16;SAF=11;SAR=14;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173339;STB=0.58539;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00359376;OID=.;OPOS=45810091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:16:16:25:26:0.619048:14:11:11:5:14:12:11:5
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chr1	45973928	.	G	A	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0207755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.927;QD=16.8839;RBI=0.0210339;REFB=-0.0211262;REVB=0.003287;RO=17;SAF=4;SAR=11;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21177;STB=0.622468;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0215764;OID=.;OPOS=45973928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:11:4:8:9:11:4:8:9
chr1	46073489	.	G	A	222.33	PASS	AF=0.6;AO=19;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0297387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1591;QD=25.4088;RBI=0.0316078;REFB=0.00357605;REVB=0.010708;RO=10;SAF=10;SAR=9;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201634;STB=0.576852;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.00379099;OID=.;OPOS=46073489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:10:14:19:21:0.6:9:10:2:8:11:10:4:10
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chr1	46078884	.	C	T	183.07	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0246416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.513;QD=13.3141;RBI=0.0262022;REFB=-0.0029421;REVB=-0.00890775;RO=33;SAF=15;SAR=7;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214624;STB=0.623801;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00208128;OID=.;OPOS=46078884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:33:33:22:22:0.4:7:15:16:17:7:15:16:17
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chr1	46195375	.	T	C	491.52	PASS	AF=0.589744;AO=46;DP=78;FAO=46;FDP=78;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0042088;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.104;QD=25.2063;RBI=0.0250514;REFB=-0.00207998;REVB=0.0246953;RO=32;SAF=22;SAR=24;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156267;STB=0.58533;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0014739;OID=.;OPOS=46195375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:32:32:46:46:0.589744:24:22:22:10:24:22:22:10
chr1	46379518	.	A	G	1158.81	PASS	AF=0.987179;AO=76;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0390211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.929;QD=59.426;RBI=0.0402981;REFB=-0.144298;REVB=0.0100642;RO=1;SAF=43;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108787;STB=0.505746;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000728703;OID=.;OPOS=46379518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:78:78:1:1:76:77:0.987179:33:43:1:0:34:43:1:0
chr1	46476587	.	T	G	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00607196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.615;QD=59.8382;RBI=0.0199841;REFB=0;REVB=0.0190394;RO=0;SAF=2;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155764;OID=.;OPOS=46476587;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:34:2:0:0:34:2:0:0
chr1	46493460	.	T	G	202.09	PASS	AF=0.287234;AO=27;DP=94;FAO=27;FDP=94;FR=.;FRO=67;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=39;FWDB=0.0246335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.865;QD=8.59949;RBI=0.0479824;REFB=-0.000762708;REVB=0.0411765;RO=67;SAF=18;SAR=9;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296674;STB=0.675927;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00393477;OID=.;OPOS=46493460;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:67:67:27:27:0.287234:9:18:28:39:9:18:28:39
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chr1	46498375	.	A	G	223.55	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0245337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6731;QD=14.9036;RBI=0.0706118;REFB=-0.0337587;REVB=-0.0662127;RO=34;SAF=15;SAR=11;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481196;STB=0.527323;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0372211;OID=.;OPOS=46498375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:11:15:18:16:11:15:18:16
chr1	46506146	.	T	C	327.92	PASS	AF=0.53125;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.006684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.622;QD=20.4951;RBI=0.0122312;REFB=-0.000990877;REVB=0.0102433;RO=30;SAF=18;SAR=16;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117585;STB=0.565018;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000923346;OID=.;OPOS=46506146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:30:30:34:34:0.53125:16:18:20:10:16:18:20:10
chr1	46521517	.	G	A	125.33	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0246126;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.798;QD=15.6661;RBI=0.0583382;REFB=-0.0194434;REVB=-0.052892;RO=18;SAF=6;SAR=8;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22794;STB=0.631397;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0138939;OID=.;OPOS=46521517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:8:6:12:6:8:6:12:6
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chr1	46660295	.	T	C	99.91	PASS	AF=0.382353;AO=11;DP=31;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0163318;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.8787;QD=11.7541;RBI=0.0231116;REFB=-0.0357926;REVB=0.0163529;RO=20;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00493524;STB=0.567464;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0429727;OID=.;OPOS=46660295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:34:20:21:11:13:0.382353:5:6:11:9:7:6:12:9
chr1	46807597	.	G	A	257.33	PASS	AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0214893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.479;QD=13.7243;RBI=0.0226056;REFB=-0.00510559;REVB=0.00701606;RO=45;SAF=20;SAR=10;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281674;STB=0.660607;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00944679;OID=.;OPOS=46807597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:45:45:30:30:0.4:10:20:18:27:10:20:18:27
chr1	46870761	.	C	A	76.14	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0248838;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.946;QD=12.1824;RBI=0.0257743;REFB=-0.0153257;REVB=0.00671642;RO=15;SAF=1;SAR=9;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214855;STB=0.631268;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0218449;OID=.;OPOS=46870761;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:9:1:3:12:9:1:3:12
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chr1	46972694	.	C	T	953.31	PASS	AF=0.970588;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.019952;FXX=0.0555478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.115;QD=56.0773;RBI=0.0326141;REFB=-0.0780878;REVB=0.0257991;RO=1;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129424;STB=0.501808;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.000964234;OID=.;OPOS=46972694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:67:68:1:2:65:66:0.970588:36:29:0:1:37:29:1:1
chr1	47059934	.	T	C	1463.34	PASS	AF=0.979167;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0263456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.7416;QD=60.9724;RBI=0.0362651;REFB=-0.142526;REVB=0.0249211;RO=1;SAF=50;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106543;STB=0.500667;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00169933;OID=.;OPOS=47059934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:96:96:1:2:94:94:0.979167:44:50:0:1:44:50:1:1
chr1	47078637	.	T	C	1808.64	PASS	AF=1;AO=118;DP=119;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0653926;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.825;QD=61.3097;RBI=0.0684424;REFB=0;REVB=0.0202032;RO=0;SAF=59;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150334;OID=.;OPOS=47078637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:118:0:0:118:118:1:59:59:0:0:59:59:0:0
chr1	47080679	.	G	A	355.32	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1991;QD=54.6651;RBI=0.0386459;REFB=0;REVB=0.0141868;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000466917;OID=.;OPOS=47080679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr1	47131319	.	A	T	1298.09	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.67;QD=61.8139;RBI=0.010602;REFB=0;REVB=-0.00194885;RO=0;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.09919e-05;OID=.;OPOS=47131319;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:84:0:0:79:84:1:42:37:0:0:42:42:0:0
chr1	47138819	.	T	G	392.71	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0335884;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.068;QD=56.1021;RBI=0.035674;REFB=0;REVB=0.0120187;RO=0;SAF=3;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000135853;OID=.;OPOS=47138819;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:25:3:0:0:25:3:0:0
chr1	47280746	.	GAT	G	273.76	PASS	AF=0.354839;AO=31;DP=91;FAO=33;FDP=93;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=21;FWDB=-0.000733985;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=299.62;QD=11.7747;RBI=0.0229856;REFB=-0.0143045;REVB=0.0229738;RO=58;SAF=15;SAR=16;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173458;STB=0.605901;STBP=0.145;TYPE=del;VARB=0.0196574;OID=.;OPOS=47280747;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.354839:31:91:33:93:60:16:17:39:21:99:58:15:16:37:21
chr1	47280859	.	G	A	455.15	PASS	AF=0.345455;AO=56;DP=166;FAO=57;FDP=165;FR=.;FRO=108;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=76;FSRR=32;FWDB=0.00315008;FXX=0.0119753;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.963;QD=11.034;RBI=0.0144499;REFB=-0.00943735;REVB=-0.0141023;RO=108;SAF=32;SAR=24;SRF=76;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160189;STB=0.585993;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0207446;OID=.;OPOS=47280859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:165:108:108:56:57:0.345455:24:32:76:32:24:33:76:32
chr1	47280884	.	C	T	443.69	PASS	AF=0.343558;AO=54;DP=161;FAO=56;FDP=163;FR=.;FRO=107;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=76;FSRR=31;FWDB=0.00364148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.658;QD=10.8881;RBI=0.0147264;REFB=-0.00298316;REVB=0.014269;RO=106;SAF=28;SAR=26;SRF=76;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233699;STB=0.617068;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0131549;OID=.;OPOS=47280884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:163:106:107:54:56:0.343558:26:28:76:30:26:30:76:31
chr1	47282772	.	C	T	289.76	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00939098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.907;QD=19.0008;RBI=0.00941773;REFB=-0.0218276;REVB=-0.00070929;RO=29;SAF=15;SAR=16;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309654;STB=0.524904;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0198758;OID=.;OPOS=47282772;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:30:31:31:0.508197:16:15:13:16:16:15:13:17
chr1	47395973	.	G	A	708.43	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9663;QD=62.9713;RBI=0.0257239;REFB=0;REVB=-0.0200946;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00033669;OID=.;OPOS=47395973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:26:19:0:0:26:19:0:0
chr1	47571902	.	C	T	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00318643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.714;QD=54.5175;RBI=0.0170366;REFB=0;REVB=0.0167359;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60923e-05;OID=.;OPOS=47571902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0
chr1	47571905	.	C	T	339.3	PASS	AF=1;AO=21;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7059;QD=54.2877;RBI=0.104606;REFB=0;REVB=0.0911819;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0072626;OID=.;OPOS=47571905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:21:25:1:8:13:0:0:8:17:0:0
chr1	47607281	.	C	T	910.44	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.869;QD=57.8057;RBI=0.0164678;REFB=0;REVB=-0.00148048;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000489836;OID=.;OPOS=47607281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:27:35:0:0:27:36:0:0
chr1	47607785	.	G	A	469.02	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00378607;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.426;QD=58.6269;RBI=0.0442933;REFB=0;REVB=0.0441311;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.33405e-05;OID=.;OPOS=47607785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr1	47607851	.	A	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.852;QD=61.6834;RBI=0.0287787;REFB=0;REVB=0.00173887;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.49436e-05;OID=.;OPOS=47607851;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
chr1	47608983	.	G	T	482.83	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6437;QD=58.5251;RBI=0.0321127;REFB=0;REVB=-0.0185147;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000835354;OID=.;OPOS=47608983;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:22:11:0:0:22:11:0:0
chr1	47609489	.	T	C	1401.86	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.22;QD=62.305;RBI=0.0472236;REFB=0;REVB=-0.0366589;RO=0;SAF=33;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422512;OID=.;OPOS=47609489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:90:0:0:87:90:1:54:33:0:0:54:36:0:0
chr1	47610065	.	A	C	177.83	PASS	AF=0.338235;AO=23;DP=68;FAO=23;FDP=68;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.00363181;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.8282;QD=10.4604;RBI=0.0193651;REFB=-0.00536328;REVB=0.0190215;RO=45;SAF=4;SAR=19;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301388;STB=0.67955;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0105364;OID=.;OPOS=47610065;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:45:45:23:23:0.338235:19:4:17:28:19:4:17:28
chr1	47610590	.	A	C	174.93	PASS	AF=0.257732;AO=24;DP=100;FAO=25;FDP=97;FR=.;FRO=72;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=45;FWDB=-0.0240282;FXX=0.029997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.768;QD=7.21353;RBI=0.0276739;REFB=-0.0180932;REVB=-0.0137293;RO=72;SAF=8;SAR=16;SRF=27;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563307;STB=0.545334;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0463016;OID=.;OPOS=47610590;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:97:72:72:24:25:0.257732:16:8:27:45:17:8:27:45
chr1	47611598	.	T	C	1820.04	PASS	AF=1;AO=114;DP=116;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327392;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0105;QD=61.1777;RBI=0.0329197;REFB=0;REVB=-0.00344224;RO=0;SAF=59;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214386;OID=.;OPOS=47611598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:119:0:0:114:119:1:55:59:0:0:57:62:0:0
chr1	47685455	.	T	C	327.2	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274091;FXX=0.039984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.976;QD=54.5336;RBI=0.0278606;REFB=0;REVB=0.00499557;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172916;OID=.;OPOS=47685455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr1	47717189	.	A	G	592.37	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00896581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.014;QD=60.7556;RBI=0.0101109;REFB=0;REVB=-0.00467384;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.64069e-05;OID=.;OPOS=47717189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:13:25:0:0:13:26:0:0
chr1	47842431	.	G	A	885.04	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5357;QD=58.0352;RBI=0.0636387;REFB=0;REVB=-0.0510293;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012274;OID=.;OPOS=47842431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0
chr1	47842665	.	TAAAA	TAAA,TAAAT,TTAAA	816.05	PASS	AF=0.0606061,0.0151515,0.924242;AO=10,12,40;DP=65;FAO=4,1,61;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0,27;FSAR=3,1,34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.155759,-0.293992,0.18759;FXX=0.0149231;HRUN=4,4,4;LEN=1,1,1;MLLD=14.6731,6.09059,19.8629;QD=49.4577;RBI=0.187239,0.295259,0.196575;REFB=0,0,0;REVB=-0.103911,-0.0273253,-0.0587526;RO=0;SAF=4,11,10;SAR=6,1,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.325513,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.23983e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.109496,0.116748,0.0384338;OID=.,.,.;OPOS=47842666,47842669,47842666;OREF=A,A,A;OALT=-,T,T;OMAPALT=TAAA,TAAAT,TTAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.0606061,0.0151515,0.924242:10,12,40:65:4,1,61:66:0:1,0,27:3,1,34:0:0:11:0:4,11,10:6,1,30:0:0
chr1	47883019	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.133183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.132;QD=46.848;RBI=0.134918;REFB=0;REVB=0.0215688;RO=0;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000543961;OID=.;OPOS=47883019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:14:1:0:0:14:1:0:0
chr1	47883024	.	A	G	150.32	PASS	AF=1;AO=7;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000329092;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.6509;QD=42.9488;RBI=0.0478531;REFB=0;REVB=0.047852;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00263715;OID=.;OPOS=47883024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:14:0:0:7:14:1:7:0:0:0:14:0:0:0
chr1	47906338	.	G	A	2446.85	PASS	AF=1;AO=160;DP=160;FAO=160;FDP=160;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.23;QD=61.1713;RBI=0.0176066;REFB=0;REVB=0.00852602;RO=0;SAF=79;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29815e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.31179e-05;OID=.;OPOS=47906338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:160:160:0:0:160:160:1:81:79:0:0:81:79:0:0
chr1	48459907	.	C	T	238.63	PASS	AF=0.628571;AO=22;DP=35;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0236419;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.218;QD=27.2722;RBI=0.0237275;REFB=-0.046517;REVB=0.00201436;RO=13;SAF=8;SAR=14;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121731;STB=0.567505;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0257085;OID=.;OPOS=48459907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:13:13:22:22:0.628571:14:8:7:6:14:8:7:6
chr1	48697733	.	T	G	1535.54	PASS	AF=1;AO=103;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00385464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=321.207;QD=58.4968;RBI=0.020226;REFB=-0.0859386;REVB=0.0198553;RO=1;SAF=54;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00958531;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231378;OID=.;OPOS=48697733;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:105:105:1:0:103:105:1:49:54:0:1:51:54:0:0
chr1	48713394	.	C	T	642.38	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0154958;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.824;QD=59.7558;RBI=0.0651279;REFB=-0.0753507;REVB=0.0632576;RO=1;SAF=30;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375076;STB=0.51999;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.000745176;OID=.;OPOS=48713394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:43:1:1:42:42:0.976744:12:30:0:1:12:30:0:1
chr1	48764419	.	C	T	245.95	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0102705;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.822;QD=16.1278;RBI=0.0105724;REFB=-0.00890332;REVB=0.00250887;RO=33;SAF=7;SAR=21;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133495;STB=0.5757;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0135615;OID=.;OPOS=48764419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:21:7:12:21:21:7:12:21
chr1	49100210	.	G	T	493.74	PASS	AF=0.494845;AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.00975708;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.723;QD=20.3605;RBI=0.0421016;REFB=-0.0435087;REVB=-0.0409554;RO=49;SAF=30;SAR=18;SRF=16;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268913;STB=0.648794;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0380028;OID=.;OPOS=49100210;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:49:49:48:48:0.494845:18:30:16:33:18:30:16:33
chr1	49224584	.	G	T	249.59	PASS	AF=0.733333;AO=22;DP=29;FAO=22;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0136706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.891;QD=33.2787;RBI=0.0155313;REFB=-0.0688255;REVB=-0.0073713;RO=7;SAF=15;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12202;STB=0.553641;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0193953;OID=.;OPOS=49224584;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:29:30:7:8:22:22:0.733333:7:15:3:4:7:15:4:4
chr1	50661411	.	C	T	595.68	PASS	AF=0.901961;AO=45;DP=51;FAO=46;FDP=51;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=37;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0830829;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=94.0175;QD=46.7199;RBI=0.0865477;REFB=0.0424664;REVB=0.024243;RO=6;SAF=8;SAR=37;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253049;STB=0.608644;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00071432;OID=.;OPOS=50661411;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:51:51:6:5:45:46:0.901961:37:8:6:0:37:9:5:0
chr1	50666515	.	C	T	1041.18	PASS	AF=0.925926;AO=72;DP=76;FAO=75;FDP=81;FR=.;FRO=6;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00534139;FXX=0.0121936;HRUN=6;LEN=1;MLLD=53.2595;QD=51.4161;RBI=0.0769288;REFB=-0.0136486;REVB=0.0767431;RO=4;SAF=42;SAR=30;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00850491;STB=0.50803;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00892987;OID=.;OPOS=50666515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:76:81:4:6:72:75:0.925926:30:42:2:2:33:42:4:2
chr1	51873951	.	G	A	1120.23	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141733;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.501;QD=60.5532;RBI=0.0142613;REFB=0;REVB=-0.00158207;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.73076e-05;OID=.;OPOS=51873951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:38:36:0:0:38:36:0:0
chr1	52264064	.	A	G	247.34	PASS	AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.0317775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5934;QD=13.7409;RBI=0.0481301;REFB=-0.00350123;REVB=0.0361483;RO=43;SAF=10;SAR=19;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00463769;STB=0.502644;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.00894608;OID=.;OPOS=52264064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:19:10:15:28:19:10:15:28
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chr1	52266350	.	C	T	433.9	PASS	AF=0.73913;AO=34;DP=46;FAO=34;FDP=46;FR=.;FRO=12;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0178056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.807;QD=37.73;RBI=0.0178061;REFB=-0.00916866;REVB=-0.000127172;RO=11;SAF=20;SAR=14;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22206;STB=0.629648;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00658459;OID=.;OPOS=52266350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:46:46:11:12:34:34:0.73913:14:20:1:10:14:20:1:11
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chr1	52498861	.	A	T	266.15	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0232317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7386;QD=21.2923;RBI=0.0284934;REFB=-0.00329107;REVB=-0.0164974;RO=25;SAF=12;SAR=13;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107791;STB=0.560339;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.00202328;OID=.;OPOS=52498861;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:13:12:9:16:13:12:9:16
chr1	52518164	.	A	G	323.82	PASS	AF=0.4;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0422916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3686;QD=14.3919;RBI=0.0428748;REFB=-0.0148305;REVB=-0.00704722;RO=54;SAF=23;SAR=13;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20768;STB=0.618059;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0216601;OID=.;OPOS=52518164;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:54:54:36:36:0.4:13:23:24:30:13:23:24:30
chr1	52851608	.	G	A	263.53	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=-0.0208712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5855;QD=17.5684;RBI=0.0248334;REFB=-0.00592928;REVB=-0.013457;RO=30;SAF=22;SAR=7;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.473214;STB=0.770438;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00706531;OID=.;OPOS=52851608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:30:31:29:29:0.483333:7:22:7:23:7:22:7:24
chr1	52882406	.	A	G	461.27	PASS	AF=0.443478;AO=51;DP=115;FAO=51;FDP=115;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.0333057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.815;QD=16.0441;RBI=0.0334307;REFB=-0.00843229;REVB=-0.00288775;RO=64;SAF=19;SAR=32;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160908;STB=0.590082;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0149515;OID=.;OPOS=52882406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:64:64:51:51:0.443478:32:19:34:30:32:19:34:30
chr1	52882970	.	A	G	147.5	PASS	AF=0.352941;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.000577156;FXX=0.0727141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.08;QD=11.5688;RBI=0.012704;REFB=-0.00499168;REVB=0.0126909;RO=25;SAF=5;SAR=13;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402187;STB=0.744958;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0153921;OID=.;OPOS=52882970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:25:33:18:18:0.352941:13:5:17:8:13:5:22:11
chr1	52991638	.	C	T	201.99	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.150944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.809;QD=21.2618;RBI=0.151087;REFB=-0.0130844;REVB=-0.0065717;RO=16;SAF=5;SAR=15;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634919;STB=0.58056;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.00555869;OID=.;OPOS=52991638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:18:20:20:0.526316:15:5:5:11:15:5:7:11
chr1	53072454	.	T	C	262.97	PASS	AF=0.364706;AO=31;DP=86;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0470785;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.789;QD=12.3748;RBI=0.0480158;REFB=-0.0110761;REVB=-0.00944114;RO=52;SAF=16;SAR=15;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00339007;STB=0.513299;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0159551;OID=.;OPOS=53072454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:52:54:31:31:0.364706:15:16:27:25:15:16:29:25
chr1	53236718	.	ATTTTTAG	ATTTTAG,ATTTTTA	51.93	PASS	AF=0.392857,0;AO=9,4;DP=28;FAO=11,0;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=6,0;FSAR=5,0;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=-0.0480525,-0.310207;FXX=0;HRUN=5,4;LEN=1,1;MLLD=14.4963,14.0596;QD=7.41864;RBI=0.050578,0.384672;REFB=-0.0490105,0.0587767;REVB=-0.0157826,-0.227474;RO=11;SAF=4,2;SAR=5,2;SRF=10;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.425923,-0.488976;STB=0.675404,0.5;STBP=0.192,1;TYPE=del,del;VARB=0.0669086,0;OID=.,.;OPOS=53236719,53236725;OREF=T,G;OALT=-,-;OMAPALT=ATTTTAG,ATTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.392857,0:9,4:28:11,0:28:17:6,0:5,0:14:3:52:11:4,2:5,2:10:1
chr1	53250650	.	G	A	1137.71	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0375763;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8256;QD=59.1018;RBI=0.0877215;REFB=-0.120638;REVB=0.0792659;RO=1;SAF=52;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193061;STB=0.510201;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00230442;OID=.;OPOS=53250650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:24:52:0:1:24:52:0:1
chr1	53519270	.	C	T	582.04	PASS	AF=0.546296;AO=58;DP=108;FAO=59;FDP=108;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.000114036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4765;QD=21.5569;RBI=0.0325512;REFB=0.0070525;REVB=-0.032551;RO=46;SAF=26;SAR=32;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647863;STB=0.524487;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=-0.00969582;OID=.;OPOS=53519270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:46:49:58:59:0.546296:32:26:17:29:33:26:19:30
chr1	53532535	.	G	C	279.39	PASS	AF=0.410256;AO=31;DP=77;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.00313472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.551;QD=14.3275;RBI=0.0483263;REFB=0.00216054;REVB=0.0482246;RO=46;SAF=17;SAR=14;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0879341;STB=0.559121;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=-0.00368111;OID=.;OPOS=53532535;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:46:46:31:32:0.410256:14:17:29:17:15:17:29:17
chr1	53535478	.	G	A	300.64	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0111539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.635;QD=21.4743;RBI=0.0269995;REFB=0.00564021;REVB=0.0245878;RO=25;SAF=20;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106162;STB=0.558892;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=-0.00608434;OID=.;OPOS=53535478;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:11:20:13:12:11:20:13:12
chr1	53537266	.	G	A	754.69	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0442134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1074;QD=54.8866;RBI=0.0512225;REFB=-0.050134;REVB=0.0258636;RO=0;SAF=39;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516123;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.00100643;OID=.;OPOS=53537266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:0:1:54:54:0.981818:15:39:0:0:15:39:0:1
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chr1	53544439	.	G	A	381.77	PASS	AF=0.606557;AO=30;DP=62;FAO=37;FDP=61;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00782712;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.79;QD=25.0338;RBI=0.0373662;REFB=-0.0548201;REVB=0.0365373;RO=24;SAF=10;SAR=20;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207666;STB=0.548646;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0421031;OID=.;OPOS=53544439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:24:24:30:37:0.606557:20:10:14:10:20:17:14:10
chr1	53544513	.	C	T	440.48	PASS	AF=0.5375;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=0.033786;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4035;QD=22.0238;RBI=0.0617234;REFB=0.00252616;REVB=0.0516554;RO=36;SAF=23;SAR=20;SRF=27;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182119;STB=0.591675;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.00129694;OID=.;OPOS=53544513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:36:37:43:43:0.5375:20:23:27:9:20:23:27:10
chr1	53544597	.	T	C	499.82	PASS	AF=0.465517;AO=53;DP=116;FAO=54;FDP=116;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=41;FSRR=21;FWDB=-0.041771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.43;QD=17.2351;RBI=0.0419217;REFB=-0.0306872;REVB=-0.00355152;RO=61;SAF=24;SAR=29;SRF=41;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208775;STB=0.604893;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0287522;OID=.;OPOS=53544597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:61:62:53:54:0.465517:29:24:41:20:29:25:41:21
chr1	53553702	.	A	G	1116.83	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00670477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.489;QD=60.3692;RBI=0.0101966;REFB=0;REVB=0.00768227;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.04228e-05;OID=.;OPOS=53553702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:36:38:0:0:36:38:0:0
chr1	53553754	.	T	C	398.88	PASS	AF=0.526316;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0198859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.924;QD=20.9934;RBI=0.0455314;REFB=-0.0291429;REVB=0.0409592;RO=35;SAF=17;SAR=23;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170981;STB=0.600472;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0256159;OID=.;OPOS=53553754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:35:36:40:40:0.526316:23:17:22:13:23:17:23:13
chr1	53555783	.	A	C	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0085808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.947;QD=21.8421;RBI=0.0085808;REFB=-0.037791;REVB=0;RO=2;SAF=6;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0139643;OID=.;OPOS=53555783;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:0:6:2:0:0:6:2:0
chr1	53558270	.	A	G	723.45	PASS	AF=1;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0718108;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9626;QD=56.7411;RBI=0.104436;REFB=0;REVB=0.0758289;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000458345;OID=.;OPOS=53558270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0
chr1	53558366	.	T	C	207.32	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.00455031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.018;QD=24.3901;RBI=0.0105779;REFB=-0.0235723;REVB=0.0095492;RO=14;SAF=12;SAR=8;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279025;STB=0.655023;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00890966;OID=.;OPOS=53558366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:8:12:3:11:8:12:3:11
chr1	53600078	.	A	G	206.93	PASS	AF=0.351351;AO=25;DP=72;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=0.0144482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.971;QD=11.1852;RBI=0.0412948;REFB=-0.00155866;REVB=-0.0386848;RO=46;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124586;STB=0.556919;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.00216111;OID=.;OPOS=53600078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:74:46:48:25:26:0.351351:13:12:17:29:14:12:18:30
chr1	53676448	.	G	A	226.01	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0388525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.031;QD=20.5464;RBI=0.0413587;REFB=-0.00949984;REVB=-0.0141784;RO=22;SAF=4;SAR=18;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310344;STB=0.677237;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0120821;OID=.;OPOS=53676448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:18:4:10:12:18:4:10:12
chr1	53679878	.	T	C	225.92	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0297674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6633;QD=20.5384;RBI=0.0303869;REFB=-0.0208582;REVB=-0.00610463;RO=22;SAF=13;SAR=9;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851245;STB=0.547784;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0405973;OID=.;OPOS=53679878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:9:13:15:7:9:13:15:7
chr1	53684524	.	GC	G,GG	462.84	PASS	AF=1,0;AO=12,19;DP=31;FAO=32,0;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00735864,-0.0166189;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=272.922,268.695;QD=57.8555;RBI=0.0103128,0.024951;REFB=0,0;REVB=-0.0072252,-0.0186108;RO=0;SAF=5,7;SAR=7,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000686701,-0.010996;OID=.,.;OPOS=53684525,53684525;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:12,19:31:32,0:32:0:12,0:20,0:0:0:4:0:5,7:7,12:0:0
chr1	53712727	.	C	T	166.43	PASS	AF=0.4;AO=17;DP=44;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00864035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.539;QD=14.7941;RBI=0.0163005;REFB=-0.0173453;REVB=-0.0138221;RO=27;SAF=10;SAR=7;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151563;STB=0.566429;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0270276;OID=.;OPOS=53712727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:27:27:17:18:0.4:7:10:12:15:8:10:12:15
chr1	53716416	.	G	A	390.05	PASS	AF=0.412844;AO=45;DP=109;FAO=45;FDP=109;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=54;FSRR=10;FWDB=-0.0374786;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.224;QD=14.3138;RBI=0.0438481;REFB=-0.03703;REVB=0.0227599;RO=63;SAF=31;SAR=14;SRF=54;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22605;STB=0.61526;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0372177;OID=.;OPOS=53716416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:63:64:45:45:0.412844:14:31:54:9:14:31:54:10
chr1	53732315	.	G	T	305.77	PASS	AF=0.368421;AO=35;DP=95;FAO=35;FDP=95;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=-0.00126625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.111;QD=12.8744;RBI=0.00258736;REFB=-0.00822477;REVB=-0.00225633;RO=60;SAF=23;SAR=12;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299107;STB=0.671136;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0174125;OID=.;OPOS=53732315;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:60:60:35:35:0.368421:12:23:23:37:12:23:23:37
chr1	54060016	.	G	C	133.85	PASS	AF=0.666667;AO=13;DP=20;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.000276559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.247;QD=25.4946;RBI=0.0558955;REFB=-0.0282355;REVB=0.0558949;RO=7;SAF=12;SAR=1;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204873;STB=0.605935;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0149215;OID=.;OPOS=54060016;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:21:7:7:13:14:0.666667:1:12:7:0:1:13:7:0
chr1	54060248	.	T	C	431.52	PASS	AF=0.494382;AO=42;DP=87;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00386593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.978;QD=19.3941;RBI=0.0255196;REFB=-0.00339922;REVB=-0.025225;RO=44;SAF=13;SAR=29;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167025;STB=0.592712;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00446868;OID=.;OPOS=54060248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:89:44:45:42:44:0.494382:29:13:21:23:30:14:22:23
chr1	54387367	.	C	T	196.16	PASS	AF=0.555556;AO=18;DP=35;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0175992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.276;QD=21.795;RBI=0.0177639;REFB=-0.0158033;REVB=-0.00241316;RO=16;SAF=11;SAR=7;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246085;STB=0.604294;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0163282;OID=.;OPOS=54387367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:16:16:18:20:0.555556:7:11:5:11:9:11:5:11
chr1	54605319	.	G	GC	145.11	PASS	AF=0.708333;AO=8;DP=25;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.00798426;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.908;QD=24.1847;RBI=0.0272658;REFB=-0.00575383;REVB=-0.0260706;RO=16;SAF=7;SAR=1;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232832;STB=0.612787;STBP=0.175;TYPE=ins;VARB=0.00317509;OID=.;OPOS=54605320;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.708333:8:25:17:24:7:12:5:7:0:38:16:7:1:12:4
chr1	54605320	.	G	C	64.88	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.0108398;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=220.087;QD=10.3805;RBI=0.048828;REFB=0.0149512;REVB=0.0476095;RO=16;SAF=5;SAR=4;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3728;STB=0.716607;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.0195169;OID=.;OPOS=54605320;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:4:5:14:2:4:5:14:2
chr1	54606804	.	C	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00735767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.415;QD=52.6132;RBI=0.0512726;REFB=0;REVB=0.0507419;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246216;OID=.;OPOS=54606804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr1	54607051	.	A	G	465.5	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.986;QD=58.1871;RBI=0.0503387;REFB=0;REVB=0.00886687;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.92026e-05;OID=.;OPOS=54607051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:30:32:1:21:9:0:0:22:10:0:0
chr1	54637167	.	T	C	176.28	PASS	AF=0.588235;AO=16;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0345746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2505;QD=20.739;RBI=0.057354;REFB=-0.0183083;REVB=0.0457611;RO=14;SAF=13;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120218;STB=0.529576;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0287086;OID=.;OPOS=54637167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:16:20:0.588235:3:13:10:4:7:13:10:4
chr1	54637202	.	C	T	209.52	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00961848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5098;QD=18.6241;RBI=0.0633105;REFB=-0.0313996;REVB=-0.0625756;RO=24;SAF=11;SAR=10;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136018;STB=0.576852;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0363967;OID=.;OPOS=54637202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:10:11:16:8:10:11:16:8
chr1	54637417	.	G	A	448.09	PASS	AF=0.457944;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.0708556;FXX=0.0092584;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.391;QD=16.7511;RBI=0.0708992;REFB=-0.0302427;REVB=0.002485;RO=54;SAF=32;SAR=17;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978319;STB=0.567943;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0411432;OID=.;OPOS=54637417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:54:58:49:49:0.457944:17:32:30:24:17:32:31:27
chr1	54637697	.	A	G	296.77	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.0033247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.66;QD=15.6192;RBI=0.00787102;REFB=-0.0175611;REVB=-0.00713438;RO=43;SAF=22;SAR=11;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679678;STB=0.538438;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0282548;OID=.;OPOS=54637697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:11:22:26:17:11:22:26:17
chr1	54637915	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4655;QD=42.1813;RBI=0.0564058;REFB=0;REVB=-0.0272855;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117553;OID=.;OPOS=54637915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr1	54661150	.	C	T	85.94	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0179403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.7071;QD=12.2774;RBI=0.0244408;REFB=-0.036737;REVB=0.0165981;RO=16;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246768;STB=0.666349;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0552512;OID=.;OPOS=54661150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:28:28:16:17:11:11:0.392857:3:8:8:8:3:8:8:9
chr1	54683856	.	C	G	1545.96	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4891;QD=62.4629;RBI=0.0820758;REFB=0;REVB=0.0807566;RO=0;SAF=53;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.69587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127674;OID=.;OPOS=54683856;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:99:0:0:95:99:1:42:53:0:0:46:53:0:0
chr1	54683925	.	G	A	389.09	PASS	AF=0.481928;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0184165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.844;QD=18.7511;RBI=0.0184674;REFB=-0.0277289;REVB=0.00137047;RO=41;SAF=15;SAR=25;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837102;STB=0.536259;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0248389;OID=.;OPOS=54683925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:83:41:43:40:40:0.481928:25:15:19:22:25:15:19:24
chr1	54686374	.	T	C	1381.22	PASS	AF=1;AO=87;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.577;QD=62.0774;RBI=0.0204381;REFB=0;REVB=-0.015989;RO=0;SAF=49;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000139873;OID=.;OPOS=54686374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:87:89:1:38:49:0:0:38:51:0:0
chr1	54686464	.	C	T	868.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7669;QD=57.8842;RBI=0.0110539;REFB=0;REVB=-0.00457785;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.99271e-05;OID=.;OPOS=54686464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr1	54704563	.	G	A	41.13	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0231389;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.9957;QD=16.4536;RBI=0.0589242;REFB=0.0204692;REVB=-0.0541909;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119263;STB=0.571183;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=-0.00444181;OID=.;OPOS=54704563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:2:4:2:2:2:4:2:2
chr1	54704567	.	A	G	78.4	PASS	AF=1;AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237804;FXX=0.110988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.353;QD=39.2011;RBI=0.0272871;REFB=0;REVB=0.013382;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445815;OID=.;OPOS=54704567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:7:8:1:3:4:0:0:4:4:0:0
chr1	54704629	.	C	T	176.12	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0117552;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.219;QD=19.0403;RBI=0.0640111;REFB=-0.0115169;REVB=-0.0629224;RO=19;SAF=6;SAR=12;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193773;STB=0.608588;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0102948;OID=.;OPOS=54704629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:19:19:18:18:0.486486:12:6:3:16:12:6:3:16
chr1	55076113	.	G	A	363.4	PASS	AF=0.438202;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0195121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.131;QD=16.3326;RBI=0.0378441;REFB=-0.00714117;REVB=0.0324261;RO=50;SAF=24;SAR=15;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778414;STB=0.543805;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00606365;OID=.;OPOS=55076113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:50:50:39:39:0.438202:15:24:27:23:15:24:27:23
chr1	55080524	.	G	A	278.98	PASS	AF=0.535714;AO=29;DP=55;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.0179101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.685;QD=19.9269;RBI=0.0345342;REFB=-0.00251076;REVB=0.029527;RO=26;SAF=7;SAR=22;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316322;STB=0.522712;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.00384197;OID=.;OPOS=55080524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:26:26:29:30:0.535714:22:7:7:19:23:7:7:19
chr1	55118566	.	C	G	1334.32	PASS	AF=1;AO=65;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412884;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.805;QD=62.0615;RBI=0.082663;REFB=0;REVB=0.0716131;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112967;OID=.;OPOS=55118566;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:86:0:0:65:86:1:33:32:0:0:45:41:0:0
chr1	55119144	.	A	G	772.85	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0148223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.922;QD=61.8282;RBI=0.0352326;REFB=-0.189677;REVB=0.0319631;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.511107;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00113825;OID=.;OPOS=55119144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:50:50:0:1:49:49:0.98:22:27:0:0:22:27:0:1
chr1	55119289	.	G	C	635.46	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00178929;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.18;QD=61.9957;RBI=0.0102856;REFB=0;REVB=-0.0101287;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.41886e-05;OID=.;OPOS=55119289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:16:25:0:0:16:25:0:0
chr1	55119546	.	A	G	1104.62	PASS	AF=0.986301;AO=47;DP=65;FAO=72;FDP=73;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.6;QD=60.5269;RBI=0.128527;REFB=0;REVB=0.0190339;RO=0;SAF=14;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00221437;OID=.;OPOS=55119546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:65:73:0:0:47:72:0.986301:33:14:0:0:35:37:0:0
chr1	55139741	.	A	G	1693.41	PASS	AF=0.991228;AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00703476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.497;QD=59.418;RBI=0.0152234;REFB=-0.11899;REVB=0.0135005;RO=1;SAF=58;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811651;STB=0.504273;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.000145054;OID=.;OPOS=55139741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:114:114:1:1:113:113:0.991228:55:58:1:0:55:58:1:0
chr1	55158208	.	C	T	168.58	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00383104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.065;QD=16.0554;RBI=0.00389022;REFB=-0.0327034;REVB=0.000675956;RO=24;SAF=10;SAR=8;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113876;STB=0.565147;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0400265;OID=.;OPOS=55158208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:8:10:16:8:8:10:16:8
chr1	55158224	.	T	C	104.99	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=25;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0469156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.9642;QD=16.1519;RBI=0.0907284;REFB=-0.0477958;REVB=0.0776568;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244233;STB=0.618013;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0589593;OID=.;OPOS=55158224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:26:13:13:12:13:0.5:6:6:10:3:6:7:10:3
chr1	55167773	.	T	A	2302.77	PASS	AF=1;AO=142;DP=146;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0040946;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6148;QD=60.5993;RBI=0.106005;REFB=0;REVB=0.105926;RO=0;SAF=71;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113697;OID=.;OPOS=55167773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:146:152:0:0:142:152:1:71:71:0:0:81:71:0:0
chr1	55168298	.	G	A	314.2	PASS	AF=0.453333;AO=33;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0131595;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.993;QD=16.7575;RBI=0.0145968;REFB=-0.0216662;REVB=0.0063161;RO=40;SAF=15;SAR=18;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116973;STB=0.565349;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0309738;OID=.;OPOS=55168298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:41:33:34:0.453333:18:15:23:17:19:15:23:18
chr1	55168394	.	A	G	571.82	PASS	AF=0.58427;AO=52;DP=89;FAO=52;FDP=89;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00167784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.606;QD=25.7;RBI=0.00590217;REFB=-0.0150315;REVB=-0.00565866;RO=37;SAF=26;SAR=26;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308322;STB=0.516847;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.00712521;OID=.;OPOS=55168394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:37:37:52:52:0.58427:26:26:17:20:26:26:17:20
chr1	55182300	.	T	A	1503.03	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5533;QD=59.5258;RBI=0.0250978;REFB=0;REVB=-0.015703;RO=0;SAF=48;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000530583;OID=.;OPOS=55182300;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:52:48:0:0:53:48:0:0
chr1	55188382	.	C	T	846.94	PASS	AF=0.573529;AO=78;DP=136;FAO=78;FDP=136;FR=.;FRO=58;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0119623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.053;QD=24.9099;RBI=0.0487176;REFB=-0.00686211;REVB=-0.0472261;RO=57;SAF=35;SAR=43;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468011;STB=0.521997;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.00595533;OID=.;OPOS=55188382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:57:58:78:78:0.573529:43:35:29:28:43:35:29:29
chr1	55251689	.	T	C	1219.88	PASS	AF=1;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00746864;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.259;QD=60.241;RBI=0.0521046;REFB=-0.122918;REVB=0.0515665;RO=1;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126242;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302378;OID=.;OPOS=55251689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:82:81:1:0:80:81:1:37:43:0:1:38:43:0:0
chr1	55266797	.	G	C	475.6	PASS	AF=0.455357;AO=50;DP=113;FAO=51;FDP=112;FR=.,HEALED;FRO=60;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.047217;FXX=0.00884877;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.9524;QD=16.9858;RBI=0.119309;REFB=-0.0684355;REVB=0.109568;RO=40;SAF=24;SAR=26;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126656;STB=0.515917;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0431656;OID=.;OPOS=55266797;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:112:40:60:50:51:0.455357:26:24:13:27:27:24:30:30
chr1	55273580	.	G	T	146.85	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.0129358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.12;QD=11.2962;RBI=0.0282569;REFB=-0.0102448;REVB=0.025122;RO=34;SAF=12;SAR=6;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130236;STB=0.575679;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0252316;OID=.;OPOS=55273580;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:6:12:26:8:6:12:26:8
chr1	55277599	.	T	C	698.97	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0572273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1119;QD=54.8212;RBI=0.0634082;REFB=0.0396099;REVB=-0.0273063;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.00270462;OID=.;OPOS=55277599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:0:1:50:50:0.980392:25:25:0:0:25:25:0:1
chr1	55307501	.	A	G	464.07	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00716021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.8403;QD=58.0092;RBI=0.0444607;REFB=0;REVB=-0.0438803;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000971216;OID=.;OPOS=55307501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:12:20:0:0:12:20:0:0
chr1	55446697	.	G	A	407.6	PASS	AF=0.56338;AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=71;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.0177465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.823;QD=22.9634;RBI=0.0247082;REFB=-0.0404772;REVB=0.0171918;RO=29;SAF=26;SAR=14;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337522;STB=0.52912;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0308104;OID=.;OPOS=55446697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:71:29:31:40:40:0.56338:14:26:20:9:14:26:22:9
chr1	55457710	.	G	A	420.26	PASS	AF=0.494253;AO=42;DP=87;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=0.0107172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.534;QD=19.3223;RBI=0.0133056;REFB=-0.0158947;REVB=-0.0078854;RO=44;SAF=15;SAR=27;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631858;STB=0.530244;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.018176;OID=.;OPOS=55457710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:44:44:42:43:0.494253:27:15:13:31:28:15:13:31
chr1	55505587	.	CGG	CGC,CG	629.92	PASS	AF=0.12069,0.87931;AO=7,21;DP=58;FAO=7,51;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=0,34;FSAR=7,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263263,0.717303;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=212.595,15.8799;QD=43.4427;RBI=0.084322,0.717356;REFB=0.0402112,-0.0210296;REVB=-0.080107,0.00877014;RO=29;SAF=0,6;SAR=7,15;SRF=28;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0.364706;SSSB=-0.866663,-0.615332;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0507467,-0.0029869;OID=.,.;OPOS=55505589,55505588;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=CGC,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.12069,0.87931:7,21:58:7,51:58:0:0,34:7,17:0:0:36:29:0,6:7,15:28:1
chr1	55523033	.	A	G	1482.06	PASS	AF=0.979381;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0191745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3079;QD=61.1158;RBI=0.0356892;REFB=-0.0571855;REVB=-0.0301008;RO=1;SAF=57;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00824724;STB=0.508619;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00503739;OID=.;OPOS=55523033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:96:97:1:2:95:95:0.979381:38:57:1:0:38:57:2:0
chr1	55524197	.	A	G	902.68	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0092403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.734;QD=58.2373;RBI=0.00935451;REFB=0;REVB=-0.00145729;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.94507e-05;OID=.;OPOS=55524197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:36:26:0:0:36:26:0:0
chr1	55524237	.	G	A	1175.41	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275733;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.449;QD=61.0604;RBI=0.0538251;REFB=0;REVB=0.0462262;RO=0;SAF=33;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199973;OID=.;OPOS=55524237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:44:33:0:0:44:33:0:0
chr1	55529187	.	G	A	1420.27	PASS	AF=0.935185;AO=101;DP=108;FAO=101;FDP=108;FR=.;FRO=7;FSAF=49;FSAR=52;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0543203;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.851;QD=52.6026;RBI=0.0582948;REFB=-0.0905008;REVB=0.0211561;RO=7;SAF=49;SAR=52;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105905;STB=0.505594;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00288585;OID=.;OPOS=55529187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:108:108:7:7:101:101:0.935185:52:49:4:3:52:49:4:3
chr1	55539557	.	A	G	251.65	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0177817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.368;QD=20.5426;RBI=0.0277657;REFB=-0.0206014;REVB=-0.0213248;RO=25;SAF=13;SAR=11;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535512;STB=0.530096;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0252893;OID=.;OPOS=55539557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:11:13:15:10:11:13:15:10
chr1	55541174	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.675;QD=57.6806;RBI=0.0472958;REFB=0;REVB=0.0233908;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000345996;OID=.;OPOS=55541174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr1	55638075	.	G	A	1400.43	PASS	AF=0.989011;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0184149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.099;QD=61.5575;RBI=0.0245495;REFB=-0.0811533;REVB=-0.0162349;RO=0;SAF=52;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504672;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-2.54365e-06;OID=.;OPOS=55638075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:91:0:1:89:90:0.989011:37:52:0:0:37:53:1:0
chr1	55842312	.	G	C	1679.39	PASS	AF=0.928571;AO=117;DP=126;FAO=117;FDP=126;FR=.;FRO=9;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0113164;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.286;QD=53.3139;RBI=0.0331899;REFB=-0.0590539;REVB=0.0312011;RO=9;SAF=57;SAR=60;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208408;STB=0.511001;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.000538287;OID=.;OPOS=55842312;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:126:126:9:9:117:117:0.928571:60:57:3:6:60:57:3:6
chr1	55864258	.	C	T	1171.9	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0088457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.876;QD=60.8779;RBI=0.0157521;REFB=0;REVB=-0.0130339;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106339;OID=.;OPOS=55864258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:40:37:0:0:40:37:0:0
chr1	56961955	.	T	C	250.69	PASS	AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.034525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.394;QD=14.5327;RBI=0.0352205;REFB=0.00256586;REVB=-0.00696478;RO=40;SAF=19;SAR=10;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875245;STB=0.549804;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.00431844;OID=.;OPOS=56961955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:40:40:29:29:0.42029:10:19:23:17:10:19:23:17
chr1	57180867	.	A	G	261.8	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0196306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.274;QD=17.1669;RBI=0.0215801;REFB=-0.0149896;REVB=-0.0089633;RO=32;SAF=15;SAR=14;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131077;STB=0.507356;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0130359;OID=.;OPOS=57180867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:14:15:17:15:14:15:17:15
chr1	57209695	.	T	C	289.69	PASS	AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0272598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.015;QD=16.5537;RBI=0.0665541;REFB=0.0223469;REVB=-0.0607154;RO=38;SAF=23;SAR=9;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346031;STB=0.69493;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=-0.0169602;OID=.;OPOS=57209695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:9:23:14:24:9:23:14:24
chr1	57257817	.	T	C	1688.86	PASS	AF=0.974359;AO=114;DP=117;FAO=114;FDP=117;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00965712;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=315.647;QD=57.7388;RBI=0.024321;REFB=-0.0217578;REVB=0.0223216;RO=3;SAF=53;SAR=61;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227776;STB=0.511998;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.000238613;OID=.;OPOS=57257817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:117:117:3:3:114:114:0.974359:61:53:0:3:61:53:0:3
chr1	57340727	.	C	A	679.88	PASS	AF=0.485915;AO=68;DP=140;FAO=69;FDP=142;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=31;FSRR=42;FWDB=0.0305625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.548;QD=19.1516;RBI=0.0306312;REFB=-0.0119732;REVB=0.00204999;RO=71;SAF=32;SAR=36;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447355;STB=0.520266;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0119917;OID=.;OPOS=57340727;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:142:71:73:68:69:0.485915:36:32:30:41:37:32:31:42
chr1	57406565	.	C	G	505.0	PASS	AF=0.433071;AO=55;DP=128;FAO=55;FDP=127;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=-0.0187304;FXX=0.00781189;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.685;QD=15.9055;RBI=0.0275382;REFB=-0.0075587;REVB=0.0201872;RO=68;SAF=25;SAR=30;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133707;STB=0.521731;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0082789;OID=.;OPOS=57406565;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:127:68:72:55:55:0.433071:30:25:30:38:30:25:30:42
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chr1	58971831	.	G	A	223.74	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.000370984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.24;QD=12.7851;RBI=0.00175496;REFB=-0.00286284;REVB=0.0017153;RO=43;SAF=21;SAR=6;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226312;STB=0.631266;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00385788;OID=.;OPOS=58971831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:43:43:27:27:0.385714:6:21:26:17:6:21:26:17
chr1	59031326	.	T	A	394.7	PASS	AF=0.506329;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.0273796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.06;QD=19.9849;RBI=0.0318885;REFB=-0.037252;REVB=0.0163473;RO=37;SAF=24;SAR=16;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695868;STB=0.534742;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0307947;OID=.;OPOS=59031326;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:79:37:39:40:40:0.506329:16:24:25:12:16:24:26:13
chr1	59031475	.	T	A	281.26	PASS	AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0475057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.984;QD=21.2269;RBI=0.0476774;REFB=0.0120142;REVB=0.00404245;RO=24;SAF=9;SAR=20;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296387;STB=0.664778;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00445361;OID=.;OPOS=59031475;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:20:9:16:8:20:9:16:8
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chr1	59127086	.	G	A	232.07	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.00510574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.063;QD=14.7348;RBI=0.0283599;REFB=-0.0178381;REVB=0.0278965;RO=36;SAF=16;SAR=11;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00962579;STB=0.505464;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0245317;OID=.;OPOS=59127086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:11:16:21:15:11:16:21:15
chr1	59160885	.	A	G	775.06	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0700972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.098;QD=62.0048;RBI=0.098184;REFB=-0.122845;REVB=0.0687493;RO=1;SAF=30;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154304;STB=0.508193;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00235726;OID=.;OPOS=59160885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:50:50:1:1:49:49:0.98:19:30:1:0:19:30:1:0
chr1	59213743	.	G	A	53.94	PASS	AF=0.4375;AO=4;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=8;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0202906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2336;QD=13.486;RBI=0.0408905;REFB=-0.0080787;REVB=0.035501;RO=5;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320004;STB=0.838983;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.187038;OID=.;OPOS=59213743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:16:16:5:8:4:7:0.4375:1:3:2:3:1:6:2:6
chr1	59248813	.	G	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.519;QD=47.8217;RBI=0.0986731;REFB=0;REVB=0.0972298;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000484166;OID=.;OPOS=59248813;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr1	59249031	.	T	G	3526.82	PASS	AF=1;AO=218;DP=218;FAO=225;FDP=225;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.407;QD=62.699;RBI=0.0691532;REFB=0;REVB=0.0382007;RO=0;SAF=124;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63483e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37321e-05;OID=.;OPOS=59249031;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:19:218:225:0:0:218:225:1:94:124:0:0:97:128:0:0
chr1	59249347	.	G	C	3867.53	PASS	AF=0.987903;AO=245;DP=248;FAO=245;FDP=248;FR=.;FRO=3;FSAF=131;FSAR=114;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0225878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.079;QD=62.3795;RBI=0.0226826;REFB=-0.0809989;REVB=-0.00207082;RO=3;SAF=131;SAR=114;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107887;STB=0.50566;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.000585645;OID=.;OPOS=59249347;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:248:248:3:3:245:245:0.987903:114:131:3:0:114:131:3:0
chr1	59364918	.	G	A	611.41	PASS	AF=0.921569;AO=46;DP=51;FAO=47;FDP=51;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00332544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8922;QD=47.9534;RBI=0.0961286;REFB=-0.16287;REVB=0.0960711;RO=3;SAF=17;SAR=29;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760095;STB=0.532373;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00921947;OID=.;OPOS=59364918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:51:51:3:4:46:47:0.921569:29:17:3:0:30:17:3:1
chr1	59844471	.	G	A	561.3	PASS	AF=0.5;AO=58;DP=116;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.00450412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.622;QD=19.355;RBI=0.00517213;REFB=0.00104258;REVB=0.00254242;RO=58;SAF=31;SAR=27;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093433;STB=0.551584;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.00115637;OID=.;OPOS=59844471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:58:58:58:58:0.5:27:31:25:33:27:31:25:33
chr1	60330883	.	C	G	324.06	PASS	AF=0.622222;AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.10215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3301;QD=28.8052;RBI=0.110771;REFB=-0.043938;REVB=-0.0428427;RO=17;SAF=18;SAR=10;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240627;STB=0.632493;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0320595;OID=.;OPOS=60330883;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:17:17:28:28:0.622222:10:18:5:12:10:18:5:12
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chr1	60466814	.	T	C	222.55	PASS	AF=0.380282;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=32;FWDB=-0.0167895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0968;QD=12.5381;RBI=0.0467514;REFB=0.0152344;REVB=0.0436326;RO=44;SAF=8;SAR=19;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309776;STB=0.517754;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=-0.0258186;OID=.;OPOS=60466814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:44:44:27:27:0.380282:19:8:12:32:19:8:12:32
chr1	60506762	.	G	A	187.9	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0261608;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.725;QD=14.1812;RBI=0.0441137;REFB=-0.00896797;REVB=-0.0355195;RO=30;SAF=11;SAR=11;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168925;STB=0.603683;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0134516;OID=.;OPOS=60506762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:31:22:22:0.415094:11:11:20:10:11:11:21:10
chr1	61869783	.	G	A	1311.58	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.042477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0256;QD=61.7216;RBI=0.0452375;REFB=0;REVB=-0.0155607;RO=0;SAF=51;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000297516;OID=.;OPOS=61869783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:33:51:0:0:33:52:0:0
chr1	62232031	.	C	T	2111.58	PASS	AF=1;AO=133;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.87;QD=62.5655;RBI=0.0344369;REFB=0;REVB=0.0185799;RO=0;SAF=71;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78083e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.33195e-05;OID=.;OPOS=62232031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:135:135:0:0:133:135:1:62:71:0:0:64:71:0:0
chr1	62232130	.	T	C	1190.41	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4315;QD=61.0467;RBI=0.0334601;REFB=0;REVB=0.00861052;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000180573;OID=.;OPOS=62232130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:33:45:0:0:33:45:0:0
chr1	62261168	.	A	G	743.28	PASS	AF=0.49359;AO=76;DP=157;FAO=77;FDP=156;FR=.;FRO=79;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=40;FWDB=0.0531168;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6783;QD=19.0585;RBI=0.0641293;REFB=0.0173573;REVB=0.0359329;RO=77;SAF=37;SAR=39;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00608874;STB=0.500083;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=-0.0156564;OID=.;OPOS=62261168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:156:77:79:76:77:0.49359:39:37:38:39:39:38:39:40
chr1	62318192	.	G	A	432.81	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329638;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.225;QD=57.7085;RBI=0.0383758;REFB=0;REVB=0.0196493;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.61413e-05;OID=.;OPOS=62318192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr1	62330080	.	T	G	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.119;QD=64.1539;RBI=0.0632944;REFB=0;REVB=0.0439134;RO=0;SAF=15;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.01675e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125327;OID=.;OPOS=62330080;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:34:15:0:0:34:15:0:0
chr1	62380270	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00646611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.604;QD=45.8067;RBI=0.0175592;REFB=0;REVB=0.0163253;RO=0;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107425;OID=.;OPOS=62380270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:11:2:0:0:12:2:0:0
chr1	62380298	.	G	A	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0695433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.509;QD=39.2068;RBI=0.0695436;REFB=0;REVB=0.000219926;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000376467;OID=.;OPOS=62380298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0
chr1	62456014	.	G	A	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.559;QD=64.1532;RBI=0.0360279;REFB=0;REVB=0.0321509;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.57356e-05;OID=.;OPOS=62456014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0
chr1	62516683	.	G	C	379.57	PASS	AF=0.43956;AO=40;DP=91;FAO=40;FDP=91;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.0182891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.389;QD=16.6846;RBI=0.0290186;REFB=-0.0125976;REVB=0.0225296;RO=51;SAF=17;SAR=23;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237615;STB=0.632963;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0217438;OID=.;OPOS=62516683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:51:51:40:40:0.43956:23:17:34:17:23:17:34:17
chr1	62538372	.	A	G	417.75	PASS	AF=0.733333;AO=33;DP=45;FAO=33;FDP=45;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0757154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.214;QD=37.1332;RBI=0.0777327;REFB=-0.0330234;REVB=0.0175941;RO=12;SAF=13;SAR=20;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120515;STB=0.56518;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0131283;OID=.;OPOS=62538372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:45:45:12:12:33:33:0.733333:20:13:2:10:20:13:2:10
chr1	62579823	.	G	A	1320.23	PASS	AF=0.988636;AO=78;DP=80;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0307446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4438;QD=60.0106;RBI=0.109483;REFB=0.00337265;REVB=0.105078;RO=2;SAF=52;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350194;STB=0.507041;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0012135;OID=.;OPOS=62579823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:88:2:1:78:87:0.988636:26:52:0:2:35:52:0:1
chr1	62579907	.	C	A,T	1149.18	PASS	AF=0.0759494,0.924051;AO=6,70;DP=79;FAO=6,73;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=6,32;FSAR=0,41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162711,-0.013142;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=85.5022,108.056;QD=58.1862;RBI=0.0490144,0.0375877;REFB=0,0;REVB=-0.0462348,0.0352154;RO=0;SAF=6,32;SAR=0,38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.111859,0.000988656;OID=.,.;OPOS=62579907,62579907;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:22:79:79:0:0:6,70:6,73:0.0759494,0.924051:0,38:6,32:0:0:0,41:6,32:0:0
chr1	62603421	.	C	T	2325.72	PASS	AF=0.993197;AO=146;DP=150;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=76;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0170055;FXX=0.0199987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.907;QD=63.2849;RBI=0.0210298;REFB=-0.0368972;REVB=-0.0123719;RO=1;SAF=70;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00674565;STB=0.503546;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=2.47234e-05;OID=.;OPOS=62603421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:150:147:1:1:146:146:0.993197:76:70:1:0:76:70:1:0
chr1	62603544	.	C	T	1091.23	PASS	AF=0.974026;AO=74;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.111881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9248;QD=56.6873;RBI=0.113269;REFB=-0.19961;REVB=0.0176794;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.500173;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.00643775;OID=.;OPOS=62603544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:77:0:2:74:75:0.974026:38:36:0:0:38:37:1:1
chr1	62644118	.	A	G	726.94	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0408;QD=57.0149;RBI=0.0399463;REFB=0;REVB=0.0344027;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00156238;OID=.;OPOS=62644118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:49:51:1:20:29:0:0:21:30:0:0
chr1	62672546	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00713195;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=316.309;QD=50.4131;RBI=0.00850331;REFB=0;REVB=0.0046305;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69933e-05;OID=.;OPOS=62672546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr1	62713224	.	C	G	2702.74	PASS	AF=0.988827;AO=174;DP=178;FAO=177;FDP=179;FR=.;FRO=2;FSAF=90;FSAR=87;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00800468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.125;QD=60.3963;RBI=0.0124574;REFB=-0.041205;REVB=0.00954523;RO=3;SAF=89;SAR=85;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00574879;STB=0.500095;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.000308162;OID=.;OPOS=62713224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:178:179:3:2:174:177:0.988827:85:89:1:2:87:90:1:1
chr1	62713246	.	G	A	815.76	PASS	AF=0.459459;AO=85;DP=185;FAO=85;FDP=185;FR=.;FRO=100;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=58;FSRR=42;FWDB=-0.0144232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9333;QD=17.638;RBI=0.0318158;REFB=-0.0124222;REVB=0.0283587;RO=99;SAF=42;SAR=43;SRF=58;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0890801;STB=0.546368;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0192362;OID=.;OPOS=62713246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:185:185:99:100:85:85:0.459459:43:42:58:41:43:42:58:42
chr1	62728784	.	A	G	1212.1	PASS	AF=1;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242084;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7955;QD=61.3722;RBI=0.0584581;REFB=0;REVB=-0.05321;RO=0;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00091537;OID=.;OPOS=62728784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:80:79:0:0:79:79:1:34:45:0:0:34:45:0:0
chr1	62728838	.	T	C	1568.21	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3835;QD=64.0085;RBI=0.0508603;REFB=0;REVB=0.0454754;RO=0;SAF=56;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202633;OID=.;OPOS=62728838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:42:56:0:0:42:56:0:0
chr1	62728861	.	T	C	1482.65	PASS	AF=1;AO=98;DP=99;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00402919;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.248;QD=58.1433;RBI=0.00801561;REFB=0;REVB=-0.00692934;RO=0;SAF=53;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105286;OID=.;OPOS=62728861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:102:0:0:98:102:1:45:53:0:0:46:56:0:0
chr1	62728918	.	G	A	1094.23	PASS	AF=0.949367;AO=75;DP=79;FAO=75;FDP=79;FR=.;FRO=4;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0185295;FXX=0.0124984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.858;QD=55.404;RBI=0.0447251;REFB=-0.157804;REVB=0.0407061;RO=3;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0341688;STB=0.511033;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00102074;OID=.;OPOS=62728918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:79:79:3:4:75:75:0.949367:40:35:0:3:40:35:1:3
chr1	62738904	.	T	C	1798.54	PASS	AF=0.991667;AO=118;DP=119;FAO=119;FDP=120;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0192714;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.9;QD=59.9513;RBI=0.068735;REFB=-0.0348503;REVB=0.0659781;RO=1;SAF=71;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664312;STB=0.503496;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.000243873;OID=.;OPOS=62738904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:119:120:1:1:118:119:0.991667:47:71:1:0:48:71:1:0
chr1	62739198	.	G	A	769.45	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9096;QD=56.9966;RBI=0.0742467;REFB=0;REVB=0.0467686;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000739429;OID=.;OPOS=62739198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:20:34:0:0:20:34:0:0
chr1	62740065	.	A	G	355.17	PASS	AF=1;AO=22;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.394;QD=54.6418;RBI=0.0196675;REFB=0;REVB=0.0162125;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149327;OID=.;OPOS=62740065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:22:26:1:9:13:0:0:12:14:0:0
chr1	62740446	.	T	C	590.68	PASS	AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000826941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7572;QD=56.2549;RBI=0.0391535;REFB=-0.185216;REVB=0.0391448;RO=2;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046837;STB=0.524987;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00817952;OID=.;OPOS=62740446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:42:42:2:2:40:40:0.952381:19:21:0:2:19:21:0:2
chr1	62740449	.	T	C	591.9	PASS	AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0391288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.641;QD=56.3718;RBI=0.0398819;REFB=-0.128196;REVB=0.0077139;RO=2;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046837;STB=0.524987;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00303901;OID=.;OPOS=62740449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:42:42:2:2:40:40:0.952381:19:21:0:2:19:21:0:2
chr1	63881552	.	C	T	458.17	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00489732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.835;QD=57.2707;RBI=0.0231387;REFB=0;REVB=-0.0226145;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.97546e-06;OID=.;OPOS=63881552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:13:18:0:0:13:19:0:0
chr1	63991267	.	T	C	955.18	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.964;QD=58.78;RBI=0.0522151;REFB=0;REVB=-0.04704;RO=0;SAF=42;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119525;OID=.;OPOS=63991267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:23:42:0:0:23:42:0:0
chr1	64015217	.	G	A	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7736;QD=57.2016;RBI=0.0203367;REFB=0;REVB=-0.0143323;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06538e-06;OID=.;OPOS=64015217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0
chr1	64114301	.	T	C	281.8	PASS	AF=0.54717;AO=28;DP=52;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0728907;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5329;QD=21.2677;RBI=0.0739225;REFB=-0.0213561;REVB=-0.0123078;RO=23;SAF=17;SAR=11;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276093;STB=0.648756;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0190235;OID=.;OPOS=64114301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:23:24:28:29:0.54717:11:17:6:17:12:17:6:18
chr1	64121441	.	G	A	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0194688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.856;QD=10.1734;RBI=0.02004;REFB=0.00807597;REVB=0.00475038;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318047;STB=0.695017;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=-0.0138446;OID=.;OPOS=64121441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:6:3:4:2:6:3
chr1	64121569	.	A	C	175.15	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.00728042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.958;QD=20.0175;RBI=0.0134838;REFB=0.0109044;REVB=-0.0113493;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113292;STB=0.575083;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=-0.00539894;OID=.;OPOS=64121569;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:17:18:18:0.514286:8:10:11:5:8:10:12:5
chr1	64121684	.	G	A	130.59	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0101627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.267;QD=22.7116;RBI=0.0925994;REFB=-0.0267634;REVB=0.0920401;RO=8;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282875;STB=0.674468;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0288524;OID=.;OPOS=64121684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:8:9:14:14:0.608696:8:6:7:1:8:6:8:1
chr1	64125793	.	G	A	934.6	PASS	AF=0.559006;AO=89;DP=160;FAO=90;FDP=161;FR=.;FRO=71;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.0364189;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.02;QD=23.2199;RBI=0.0365697;REFB=-0.0198934;REVB=-0.00331755;RO=69;SAF=46;SAR=43;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425265;STB=0.525315;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0163101;OID=.;OPOS=64125793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:161:69:71:89:90:0.559006:43:46:32:37:43:47:33:38
chr1	64515379	.	C	T	778.64	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283866;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.621;QD=56.6283;RBI=0.0698077;REFB=0;REVB=0.0637755;RO=1;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165303;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000940325;OID=.;OPOS=64515379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:1:0:53:55:1:28:25:0:1:29:26:0:0
chr1	64608329	.	G	T	376.0	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.964;QD=55.7035;RBI=0.0308229;REFB=0;REVB=0.0214251;RO=0;SAF=4;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014234;OID=.;OPOS=64608329;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:22:4:0:0:23:4:0:0
chr1	64643277	.	C	T	389.07	PASS	AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00537728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8841;QD=18.7502;RBI=0.0362746;REFB=-0.00871503;REVB=-0.0358738;RO=43;SAF=24;SAR=16;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08389;STB=0.546774;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0100808;OID=.;OPOS=64643277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:43:43:40:40:0.481928:16:24:22:21:16:24:22:21
chr1	64936616	.	C	CG	32.94	PASS	AF=0.141176;AO=16;DP=84;FAO=12;FDP=85;FR=.;FRO=73;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=30;FSRR=43;FWDB=-0.0728674;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=18.2155;QD=1.54996;RBI=0.277223;REFB=-0.0362646;REVB=-0.267475;RO=68;SAF=11;SAR=5;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3235;STB=0.921223;STBP=0.004;TYPE=ins;VARB=0.142487;OID=.;OPOS=64936617;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.141176:16:84:12:85:73:11:1:30:43:32:68:11:5:29:39
chr1	65016349	.	A	T	483.23	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.5478;QD=58.573;RBI=0.0947076;REFB=0;REVB=0.0909175;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141054;OID=.;OPOS=65016349;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
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chr1	65158724	.	C	T	905.97	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0160293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.585;QD=56.6229;RBI=0.0188963;REFB=-0.0758419;REVB=-0.0100065;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.000465543;OID=.;OPOS=65158724;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:0:1:63:63:0.984375:26:37:0:0:26:37:1:0
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chr1	65860687	.	A	C	577.53	PASS	AF=0.48;AO=60;DP=125;FAO=60;FDP=125;FR=.;FRO=65;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=0.00950739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8084;QD=18.481;RBI=0.0225533;REFB=-0.011267;REVB=0.0204515;RO=65;SAF=28;SAR=32;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339342;STB=0.518791;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.017583;OID=.;OPOS=65860687;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:65:65:60:60:0.48:32:28:28:37:32:28:28:37
chr1	65867519	.	G	A	321.42	PASS	AF=0.420455;AO=31;DP=82;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=-0.0149033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.675;QD=14.61;RBI=0.0340609;REFB=-0.0164482;REVB=-0.0306274;RO=50;SAF=5;SAR=26;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274012;STB=0.589858;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0440436;OID=.;OPOS=65867519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:88:50:51:31:37:0.420455:26:5:17:33:29:8:17:34
chr1	65879252	.	A	G	163.62	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0425413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5629;QD=20.452;RBI=0.0545455;REFB=-0.0265042;REVB=0.0341386;RO=14;SAF=5;SAR=12;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801704;STB=0.555494;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0246314;OID=.;OPOS=65879252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:14:15:17:17:0.53125:12:5:3:11:12:5:3:12
chr1	65886398	.	T	C	443.68	PASS	AF=0.466019;AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.061575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.424;QD=17.2303;RBI=0.0615859;REFB=-0.0275173;REVB=-0.00115759;RO=55;SAF=25;SAR=23;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111712;STB=0.562093;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0296546;OID=.;OPOS=65886398;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:55:55:48:48:0.466019:23:25:35:20:23:25:35:20
chr1	65886448	.	T	C	571.8	PASS	AF=0.416667;AO=65;DP=156;FAO=65;FDP=156;FR=.;FRO=91;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=54;FSRR=37;FWDB=-0.0145232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.353;QD=14.6614;RBI=0.0794565;REFB=-0.0180089;REVB=-0.0781179;RO=89;SAF=31;SAR=34;SRF=52;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110474;STB=0.567648;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0320215;OID=.;OPOS=65886448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:156:89:91:65:65:0.416667:34:31:52:37:34:31:54:37
chr1	66036441	.	A	G	411.04	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468329;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.8125;QD=56.6957;RBI=0.0473649;REFB=0;REVB=-0.00707912;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000791408;OID=.;OPOS=66036441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr1	66058513	.	A	G	257.55	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00224634;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.108;QD=18.0738;RBI=0.00571205;REFB=-0.00998586;REVB=-0.00525181;RO=28;SAF=10;SAR=18;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132737;STB=0.56688;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00917136;OID=.;OPOS=66058513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:28:29:28:28:0.491228:18:10:14:14:18:10:14:15
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chr1	67244243	.	A	T	633.56	PASS	AF=0.456376;AO=68;DP=152;FAO=68;FDP=149;FR=.;FRO=81;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=55;FWDB=0.0146873;FXX=0.0197355;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.506;QD=17.0082;RBI=0.0235063;REFB=-0.00412747;REVB=0.0183529;RO=80;SAF=41;SAR=27;SRF=25;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277402;STB=0.650122;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00339708;OID=.;OPOS=67244243;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:149:80:81:68:68:0.456376:27:41:25:55:27:41:26:55
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chr1	67288045	.	C	T	760.56	PASS	AF=0.8;AO=59;DP=75;FAO=60;FDP=75;FR=.;FRO=15;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=0.0132442;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.757;QD=40.5633;RBI=0.0159728;REFB=0.0206093;REVB=0.0089286;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.592562;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.000553914;OID=.;OPOS=67288045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:75:75:0:15:59:60:0.8:32:27:0:0:32:28:14:1
chr1	67313249	.	G	A	222.52	PASS	AF=0.325581;AO=28;DP=86;FAO=28;FDP=86;FR=.;FRO=58;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.0108546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.568;QD=10.3496;RBI=0.0155189;REFB=-0.013289;REVB=-0.0110912;RO=58;SAF=12;SAR=16;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380153;STB=0.522169;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0184121;OID=.;OPOS=67313249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:58:58:28:28:0.325581:16:12:23:35:16:12:23:35
chr1	67390416	.	G	C	1767.52	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00582661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.169;QD=60.9489;RBI=0.00623734;REFB=0;REVB=-0.00222599;RO=0;SAF=65;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.59247e-06;OID=.;OPOS=67390416;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:51:65:0:0:51:65:0:0
chr1	67390468	.	C	G	1398.09	PASS	AF=0.968085;AO=91;DP=94;FAO=91;FDP=94;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0106991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=322.805;QD=59.4931;RBI=0.0177967;REFB=-0.193734;REVB=0.0142214;RO=2;SAF=41;SAR=50;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225584;STB=0.517643;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.000546777;OID=.;OPOS=67390468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:94:94:2:3:91:91:0.968085:50:41:2:0:50:41:3:0
chr1	67558739	.	C	T	365.06	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0112916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7504;QD=52.1519;RBI=0.0124366;REFB=-0.0499825;REVB=0.00521245;RO=1;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488676;STB=0.526296;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00220521;OID=.;OPOS=67558739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:9:18:0:1:9:18:0:1
chr1	67560956	.	C	T	2331.71	PASS	AF=1;AO=146;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0612231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.876;QD=63.8825;RBI=0.0623221;REFB=0;REVB=-0.0116521;RO=0;SAF=84;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.04697e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.5963e-05;OID=.;OPOS=67560956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:146:146:0:0:146:146:1:62:84:0:0:62:84:0:0
chr1	67568351	.	C	T	239.84	PASS	AF=0.647059;AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0164849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.305;QD=28.216;RBI=0.0236943;REFB=-0.0162108;REVB=0.0170196;RO=11;SAF=13;SAR=9;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243624;STB=0.646468;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0108511;OID=.;OPOS=67568351;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:11:12:22:22:0.647059:9:13:2:9:9:13:2:10
chr1	67579386	.	A	G	264.58	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0040058;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3343;QD=50.3953;RBI=0.0769451;REFB=0;REVB=0.0768407;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00282514;OID=.;OPOS=67579386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:12:8:0:0:13:8:0:0
chr1	67633812	.	G	T	286.5	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0259783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.7;QD=24.3829;RBI=0.029019;REFB=-0.0118599;REVB=-0.0129319;RO=21;SAF=18;SAR=8;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669024;STB=0.537284;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00732865;OID=.;OPOS=67633812;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:8:18:13:8:8:18:13:8
chr1	67685387	.	T	C	176.64	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00765224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.613;QD=14.1316;RBI=0.00879999;REFB=-0.0109029;REVB=0.00434547;RO=30;SAF=10;SAR=9;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785663;STB=0.533863;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.00939383;OID=.;OPOS=67685387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:31:19:19:0.38:9:10:18:12:9:10:18:13
chr1	67733346	.	G	A	175.77	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.00316045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.898;QD=11.9167;RBI=0.00369319;REFB=-0.00196754;REVB=-0.00191082;RO=36;SAF=6;SAR=16;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0782586;STB=0.558768;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.00334374;OID=.;OPOS=67733346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:36:37:22:22:0.372881:16:6:12:24:16:6:13:24
chr1	67795319	.	T	C	556.64	PASS	AF=0.530612;AO=52;DP=98;FAO=52;FDP=98;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.0304444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.895;QD=22.7199;RBI=0.0304451;REFB=-0.0194895;REVB=-0.000197655;RO=45;SAF=19;SAR=33;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182394;STB=0.605705;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0124002;OID=.;OPOS=67795319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:45:46:52:52:0.530612:33:19:26:19:33:19:27:19
chr1	67852335	.	G	A	232.05	PASS	AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0102098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.456;QD=23.8002;RBI=0.0103985;REFB=-0.0190828;REVB=0.00197235;RO=17;SAF=10;SAR=12;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14948;STB=0.583259;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0122174;OID=.;OPOS=67852335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:12:10:11:6:12:10:11:6
chr1	67861520	.	C	A	52.92	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0546732;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.3234;QD=21.1671;RBI=0.06088;REFB=-0.00676993;REVB=0.026781;RO=3;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168825;STB=0.599677;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00528438;OID=.;OPOS=67861520;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:1:6:2:1:1:6:2:1
chr1	68006815	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.717;QD=52.613;RBI=0.0377858;REFB=0;REVB=0.0252191;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.10503e-05;OID=.;OPOS=68006815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr1	68462247	.	A	G	675.49	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00510997;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.277;QD=62.836;RBI=0.0196529;REFB=0;REVB=0.0189769;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105394;OID=.;OPOS=68462247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0
chr1	68591253	.	C	T	304.02	PASS	AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0286904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.7856;QD=19.9354;RBI=0.0286912;REFB=0.00169417;REVB=-0.000218986;RO=29;SAF=15;SAR=17;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158627;STB=0.587942;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=-0.00502408;OID=.;OPOS=68591253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:29:32:32:0.52459:17:15:19:10:17:15:19:10
chr1	68624878	.	C	T	532.53	PASS	AF=0.504587;AO=55;DP=111;FAO=55;FDP=109;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=14;FWDB=-0.0365144;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9108;QD=19.5424;RBI=0.0534091;REFB=-0.0217431;REVB=0.0389773;RO=54;SAF=24;SAR=31;SRF=40;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268347;STB=0.647469;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0223749;OID=.;OPOS=68624878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:109:54:54:55:55:0.504587:31:24:40:14:31:24:40:14
chr1	68903942	.	C	T	1339.5	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.031142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3998;QD=62.3025;RBI=0.0313233;REFB=0;REVB=0.00336533;RO=0;SAF=29;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.1326e-05;OID=.;OPOS=68903942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:57:29:0:0:57:29:0:0
chr1	70034372	.	G	A	503.9	PASS	AF=0.822222;AO=37;DP=46;FAO=37;FDP=45;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0898471;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.378;QD=44.791;RBI=0.0933473;REFB=-0.0698128;REVB=0.0253222;RO=8;SAF=13;SAR=24;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371841;STB=0.519989;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.00198093;OID=.;OPOS=70034372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:46:45:8:8:37:37:0.822222:24:13:2:6:24:13:2:6
chr1	70611347	.	A	G	715.66	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00130191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.792;QD=56.1303;RBI=0.0397595;REFB=0;REVB=0.0397382;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000561642;OID=.;OPOS=70611347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:51:0:0:48:51:1:18:30:0:0:21:30:0:0
chr1	70831841	.	C	T	200.79	PASS	AF=0.367647;AO=23;DP=66;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.00710144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.371;QD=11.8109;RBI=0.0123039;REFB=-0.0236228;REVB=-0.0100477;RO=43;SAF=8;SAR=15;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110927;STB=0.527251;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0322972;OID=.;OPOS=70831841;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:68:43:43:23:25:0.367647:15:8:19:24:15:10:19:24
chr1	71331497	.	GA	G,GG	267.75	PASS	AF=0.0952381,0.904762;AO=3,19;DP=22;FAO=2,19;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14;FSAR=2,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636322,0.053612;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=225.238,239.242;QD=51.0001;RBI=0.0746852,0.0674696;REFB=0,0;REVB=0.0391003,0.0409622;RO=0;SAF=2,12;SAR=1,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0399882,-0.00219296;OID=.,.;OPOS=71331498,71331498;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0952381,0.904762:3,19:22:2,19:21:0:0,14:2,5:0:0:10:0:2,12:1,7:0:0
chr1	71419499	.	C	T	613.22	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0087594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.144;QD=61.3224;RBI=0.0208271;REFB=0;REVB=0.0188955;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.53699e-05;OID=.;OPOS=71419499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:17:22:0:0:17:23:0:0
chr1	72058552	.	G	A	1443.98	PASS	AF=0.978947;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0243895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4282;QD=60.799;RBI=0.0490519;REFB=0.101785;REVB=-0.0425586;RO=2;SAF=71;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411595;STB=0.521734;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.0177502;OID=.;OPOS=72058552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:95:95:2:2:93:93:0.978947:22:71:0:2:22:71:0:2
chr1	74575182	.	C	T	1575.57	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363741;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.558;QD=60.0217;RBI=0.0366904;REFB=0;REVB=-0.00480714;RO=0;SAF=43;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.77621e-05;OID=.;OPOS=74575182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:101:105:0:0:101:105:1:58:43:0:0:61:44:0:0
chr1	74665493	.	G	A	676.76	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0369745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.429;QD=60.1567;RBI=0.0419014;REFB=-0.125445;REVB=0.0197132;RO=1;SAF=20;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229092;STB=0.51219;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.000713178;OID=.;OPOS=74665493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:24:20:1:0:24:20:1:0
chr1	74671519	.	A	G	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.387;QD=57.0008;RBI=0.0422699;REFB=0;REVB=0.0343703;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.47149e-05;OID=.;OPOS=74671519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:22:32:0:0:22:32:0:0
chr1	74941210	.	C	T	179.02	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.059501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.918;QD=12.563;RBI=0.0632816;REFB=-0.00416764;REVB=-0.0215451;RO=34;SAF=7;SAR=15;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0752306;STB=0.555504;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00500983;OID=.;OPOS=74941210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:34:35:22:22:0.385965:15:7:13:21:15:7:14:21
chr1	74941293	.	G	A	199.53	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0193411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.886;QD=19.9532;RBI=0.0202815;REFB=-0.0106224;REVB=-0.00610413;RO=20;SAF=5;SAR=15;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159666;STB=0.590812;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0106957;OID=.;OPOS=74941293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:15:5:8:12:15:5:8:12
chr1	75035240	.	C	T	226.38	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0106342;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.66;QD=18.1101;RBI=0.034502;REFB=-0.0117499;REVB=-0.0328223;RO=27;SAF=7;SAR=17;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261082;STB=0.63738;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0161271;OID=.;OPOS=75035240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:27:26:24:24:0.48:17:7:15:12:17:7:14:12
chr1	75036812	.	C	T	1358.61	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00846693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.223;QD=62.465;RBI=0.0505641;REFB=0;REVB=0.0498502;RO=0;SAF=52;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.64677e-05;OID=.;OPOS=75036812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:34:52:0:0:34:53:0:0
chr1	75037845	.	A	G	149.03	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0694679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3972;QD=18.6288;RBI=0.0694958;REFB=-0.0294869;REVB=-0.00197054;RO=16;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552398;STB=0.531457;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0335492;OID=.;OPOS=75037845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:9:7:8:8:9:7:8:8
chr1	75038228	.	A	C	224.92	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0468878;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.653;QD=19.9928;RBI=0.05271;REFB=-0.0160827;REVB=-0.0240808;RO=23;SAF=3;SAR=19;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298712;STB=0.671842;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0162005;OID=.;OPOS=75038228;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:19:3:8:15:19:3:8:15
chr1	75097426	.	G	C	418.03	PASS	AF=0.5;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0136116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.566;QD=19.9062;RBI=0.0144485;REFB=-0.010446;REVB=-0.00484592;RO=41;SAF=22;SAR=20;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754178;STB=0.547489;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0135929;OID=.;OPOS=75097426;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:41:42:42:42:0.5:20:22:18:23:20:22:18:24
chr1	75172001	.	T	A	500.06	PASS	AF=0.504854;AO=46;DP=104;FAO=52;FDP=103;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.00622156;FXX=0.00961446;HRUN=5;LEN=1;MLLD=155.324;QD=19.4199;RBI=0.0374808;REFB=-0.0105607;REVB=-0.0369608;RO=41;SAF=21;SAR=25;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476841;STB=0.523943;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.01603;OID=.;OPOS=75172001;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:103:41:51:46:52:0.504854:25:21:21:20:28:24:26:25
chr1	75175886	.	T	C	731.06	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.397;QD=56.2356;RBI=0.0256504;REFB=0;REVB=0.00881546;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.09711e-05;OID=.;OPOS=75175886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:29:22:0:0:29:23:0:0
chr1	75190452	.	C	T	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146247;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.506;QD=57.2011;RBI=0.0303249;REFB=0;REVB=-0.0265653;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.11959e-05;OID=.;OPOS=75190452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
chr1	75214441	.	A	G	89.57	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0315879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.534;QD=15.5774;RBI=0.0406687;REFB=-0.0149763;REVB=0.0256154;RO=12;SAF=9;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347389;STB=0.705461;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0213478;OID=.;OPOS=75214441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:2:9:6:6:2:9:6:6
chr1	75672376	.	A	G	2566.35	PASS	AF=1;AO=165;DP=165;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0524218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.46;QD=61.8396;RBI=0.0524275;REFB=0;REVB=-0.000776411;RO=0;SAF=76;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1215e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5287e-05;OID=.;OPOS=75672376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:165:166:0:0:165:166:1:89:76:0:0:89:77:0:0
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chr1	76257892	.	A	T	287.58	PASS	AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.00492285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.484;QD=15.9766;RBI=0.10344;REFB=-0.00398596;REVB=-0.103323;RO=40;SAF=15;SAR=17;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128852;STB=0.572494;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00635712;OID=.;OPOS=76257892;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:40:40:32:32:0.444444:17:15:24:16:17:15:24:16
chr1	76344705	.	T	C	320.5	PASS	AF=0.595745;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0474484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.141;QD=27.2768;RBI=0.0493982;REFB=-0.0135336;REVB=0.0137416;RO=19;SAF=14;SAR=14;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578017;STB=0.531892;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.00833696;OID=.;OPOS=76344705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:19:19:28:28:0.595745:14:14:11:8:14:14:11:8
chr1	76344711	.	A	T	712.2	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115909;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.62;QD=63.3066;RBI=0.0190056;REFB=0;REVB=-0.015062;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.63301e-05;OID=.;OPOS=76344711;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr1	77093180	.	C	A	784.96	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00445822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.874;QD=57.0878;RBI=0.014566;REFB=0;REVB=-0.013867;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.80539e-05;OID=.;OPOS=77093180;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0
chr1	77555481	.	C	T	118.08	PASS	AF=0.305085;AO=16;DP=57;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.0332087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.494;QD=8.00511;RBI=0.0342642;REFB=-0.0107007;REVB=-0.00843885;RO=39;SAF=8;SAR=8;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166945;STB=0.555924;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0243627;OID=.;OPOS=77555481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:59:39:41:16:18:0.305085:8:8:25:14:8:10:26:15
chr1	77558057	.	G	C	155.48	PASS	AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.00871558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0993;QD=15.1686;RBI=0.0220542;REFB=-0.0311345;REVB=0.020259;RO=24;SAF=8;SAR=9;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281822;STB=0.660844;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0236112;OID=.;OPOS=77558057;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:9:8:18:6:9:8:18:6
chr1	77634948	.	G	A	1350.85	PASS	AF=1;AO=85;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00279237;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.863;QD=62.1079;RBI=0.0129032;REFB=0;REVB=0.0125975;RO=0;SAF=46;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205599;OID=.;OPOS=77634948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:87:0:0:85:87:1:39:46:0:0:41:46:0:0
chr1	77685042	.	T	C	1104.76	PASS	AF=0.462151;AO=116;DP=248;FAO=116;FDP=251;FR=.;FRO=135;FSAF=74;FSAR=42;FSRF=76;FSRR=59;FWDB=-0.0106447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.757;QD=17.6058;RBI=0.0528874;REFB=-0.0307692;REVB=-0.0518051;RO=132;SAF=74;SAR=42;SRF=76;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635275;STB=0.542609;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0331526;OID=.;OPOS=77685042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:248:251:132:135:116:116:0.462151:42:74:76:56:42:74:76:59
chr1	77763542	.	G	A	1367.75	PASS	AF=0.978022;AO=87;DP=89;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00632914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.475;QD=60.1207;RBI=0.0104556;REFB=0.0802415;REVB=0.00832236;RO=0;SAF=54;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50877;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.000719644;OID=.;OPOS=77763542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:89:91:0:2:87:89:0.978022:33:54:0:0:33:56:2:0
chr1	78024284	.	T	C	753.58	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0332417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.013;QD=61.5166;RBI=0.0336381;REFB=-0.149774;REVB=0.00514895;RO=1;SAF=34;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136387;STB=0.507243;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.000446181;OID=.;OPOS=78024284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:14:34:1:0:14:34:1:0
chr1	78024345	.	C	CTAT	637.6	PASS	AF=0.8;AO=52;DP=65;FAO=52;FDP=65;FR=.;FRO=13;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.00585766;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=268.009;QD=39.2371;RBI=0.0212329;REFB=-0.0371004;REVB=0.0204089;RO=13;SAF=34;SAR=18;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483614;STB=0.525887;STBP=0.451;TYPE=ins;VARB=0.0106988;OID=.;OPOS=78024346;OREF=-;OALT=TAT;OMAPALT=CTAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.8:52:65:52:65:13:34:18:10:3:77:13:34:18:10:3
chr1	78162073	.	A	G	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00558745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.243;QD=55.0974;RBI=0.0687328;REFB=0;REVB=0.0685053;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00038159;OID=.;OPOS=78162073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr1	78195557	.	C	T	119.54	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00890283;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=106.978;QD=13.6619;RBI=0.114413;REFB=-0.0156857;REVB=-0.114066;RO=18;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892394;STB=0.545388;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0273335;OID=.;OPOS=78195557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:35:18:21:14:14:0.4:5:9:10:8:5:9:12:9
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chr1	78392446	.	G	A	276.6	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00589159;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.694;QD=46.1003;RBI=0.0107226;REFB=-0.0479004;REVB=0.00895893;RO=2;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921477;STB=0.549954;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00400339;OID=.;OPOS=78392446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:25:24:2:2:22:22:0.916667:9:13:0:2:9:13:0:2
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chr1	79095526	.	G	A	162.23	PASS	AF=0.305556;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.00521042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.893;QD=9.01286;RBI=0.0141716;REFB=-0.00903879;REVB=-0.013179;RO=49;SAF=13;SAR=9;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233779;STB=0.630481;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0344853;OID=.;OPOS=79095526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:49:50:22:22:0.305556:9:13:19:30:9:13:20:30
chr1	79095581	.	T	C	351.88	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0280445;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1314;QD=23.4584;RBI=0.0310944;REFB=-0.0492685;REVB=0.01343;RO=26;SAF=11;SAR=24;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936102;STB=0.558105;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0363474;OID=.;OPOS=79095581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:26:25:35:35:0.583333:24:11:11:15:24:11:11:14
chr1	79102726	.	C	T	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0165587;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.43;QD=19.6463;RBI=0.0292734;REFB=-0.0197004;REVB=-0.02414;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32916;STB=0.699704;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0122452;OID=.;OPOS=79102726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:7:8:11:11:0.578947:5:6:7:0:5:6:8:0
chr1	79128570	.	G	GT	274.58	PASS	AF=0.385827;AO=47;DP=136;FAO=49;FDP=127;FR=.;FRO=78;FSAF=36;FSAR=13;FSRF=61;FSRR=17;FWDB=-0.0271174;FXX=0.00781189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.986;QD=8.64807;RBI=0.0368917;REFB=-0.0254126;REVB=-0.0250128;RO=89;SAF=34;SAR=13;SRF=71;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112929;STB=0.538644;STBP=0.605;TYPE=ins;VARB=0.039682;OID=.;OPOS=79128571;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.385827:47:136:49:127:78:36:13:61:17:99:89:34:13:71:18
chr1	79392756	.	C	A	611.51	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.794;QD=61.1509;RBI=0.0248896;REFB=0;REVB=0.0136395;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.70587e-05;OID=.;OPOS=79392756;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:40:0:0:36:40:1:10:26:0:0:11:29:0:0
chr1	82421596	.	C	T	279.6	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0397466;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.913;QD=48.626;RBI=0.057126;REFB=-0.0505605;REVB=0.0410315;RO=1;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0709088;STB=0.538425;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00191848;OID=.;OPOS=82421596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:6:16:0:1:6:16:0:1
chr1	82452681	.	A	G	288.49	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0203735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0036;QD=16.2527;RBI=0.020831;REFB=-0.0408935;REVB=-0.00434156;RO=37;SAF=19;SAR=13;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204208;STB=0.613903;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.043603;OID=.;OPOS=82452681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:37:39:32:32:0.450704:13:19:14:23:13:19:15:24
chr1	82457662	.	G	A	1218.82	PASS	AF=0.975904;AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0606204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.503;QD=58.7384;RBI=0.0633591;REFB=0.0191776;REVB=-0.0184269;RO=2;SAF=46;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00315386;STB=0.501666;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=-0.000372122;OID=.;OPOS=82457662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:83:83:2:2:81:81:0.975904:35:46:1:1:35:46:1:1
chr1	84335412	.	C	T	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.523;QD=56.9569;RBI=0.0159547;REFB=0;REVB=0.00669237;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.87542e-05;OID=.;OPOS=84335412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0
chr1	84640691	.	T	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111913;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.559;QD=49.5992;RBI=0.0330368;REFB=0;REVB=0.0310835;RO=0;SAF=16;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116722;OID=.;OPOS=84640691;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:2:16:0:0:2:16:0:0
chr1	84810815	.	A	G	405.79	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.727;QD=55.9707;RBI=0.043849;REFB=0;REVB=0.0126875;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157908;OID=.;OPOS=84810815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:17:11:0:0:18:11:0:0
chr1	84853957	.	A	T	1285.69	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00748619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3165;QD=61.2231;RBI=0.131798;REFB=0;REVB=0.131586;RO=0;SAF=59;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000511598;OID=.;OPOS=84853957;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:24:59:0:0:25:59:0:0
chr1	84864256	.	G	A,C	735.27	PASS	AF=0.0754717,0.924528;AO=2,49;DP=52;FAO=4,49;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=0,25;FSAR=4,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00920132,0.00790553;FXX=0.036357;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=136.728,69.1628;QD=55.4921;RBI=0.0352183,0.019349;REFB=0,0;REVB=-0.0339951,0.0176603;RO=0;SAF=0,25;SAR=2,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.19187,-0.000887531;OID=.,.;OPOS=84864256,84864256;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:52:53:0:0:2,49:4,49:0.0754717,0.924528:2,24:0,25:0:0:4,24:0,25:0:0
chr1	84867610	.	G	A	185.84	PASS	AF=0.389831;AO=18;DP=54;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.00659194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.69;QD=12.5993;RBI=0.00664314;REFB=-0.0214154;REVB=-0.000823163;RO=33;SAF=11;SAR=7;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00585061;STB=0.528676;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0335192;OID=.;OPOS=84867610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:59:33:36:18:23:0.389831:7:11:20:13:10:13:22:14
chr1	84880380	.	T	C	555.82	PASS	AF=0.95;AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0961596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2606;QD=55.5815;RBI=0.112647;REFB=-0.120377;REVB=0.0586737;RO=1;SAF=6;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718031;STB=0.571388;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00810355;OID=.;OPOS=84880380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:39:40:1:2:37:38:0.95:31:6:1:0:32:6:2:0
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chr1	85016177	.	A	G	1661.84	PASS	AF=0.991071;AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0408047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.552;QD=59.3514;RBI=0.0432898;REFB=-0.309561;REVB=0.0144562;RO=0;SAF=71;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503448;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.00116313;OID=.;OPOS=85016177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:112:0:1:110:111:0.991071:39:71:0:0:39:72:1:0
chr1	85031630	.	G	A	2412.18	PASS	AF=1;AO=156;DP=156;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214001;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.381;QD=61.4569;RBI=0.02287;REFB=0;REVB=0.00806659;RO=0;SAF=85;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.99165e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27506e-05;OID=.;OPOS=85031630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:156:157:0:0:156:157:1:71:85:0:0:72:85:0:0
chr1	85039893	.	G	A	774.31	PASS	AF=0.493827;AO=74;DP=156;FAO=80;FDP=162;FR=.;FRO=82;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=40;FWDB=0.0121702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.662;QD=19.1187;RBI=0.0169034;REFB=-0.0297369;REVB=0.0117308;RO=82;SAF=39;SAR=35;SRF=42;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141156;STB=0.506492;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0223209;OID=.;OPOS=85039893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:162:82:82:74:80:0.493827:35:39:42:40:38:42:42:40
chr1	85039955	.	G	A	812.47	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486938;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.94;QD=57.0154;RBI=0.06068;REFB=0;REVB=0.0362074;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172287;OID=.;OPOS=85039955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:57:0:0:52:57:1:24:28:0:0:27:30:0:0
chr1	85113203	.	T	C	309.19	PASS	AF=0.384615;AO=35;DP=91;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=0.00145322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6596;QD=13.5905;RBI=0.00426534;REFB=-0.00338473;REVB=-0.00401014;RO=56;SAF=17;SAR=18;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150043;STB=0.585318;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00727369;OID=.;OPOS=85113203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:56:56:35:35:0.384615:18:17:35:21:18:17:35:21
chr1	85113229	.	A	G	198.14	PASS	AF=0.317073;AO=25;DP=81;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.0318435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9379;QD=9.66521;RBI=0.0340382;REFB=-0.0111914;REVB=0.0120247;RO=55;SAF=11;SAR=14;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185185;STB=0.598439;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.013525;OID=.;OPOS=85113229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:55:56:25:26:0.317073:14:11:33:22:14:12:34:22
chr1	85121255	.	A	G	429.06	PASS	AF=0.440367;AO=47;DP=108;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.0689869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.175;QD=15.7452;RBI=0.0689909;REFB=-0.0050366;REVB=0.000741316;RO=61;SAF=18;SAR=29;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0792094;STB=0.536388;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00551953;OID=.;OPOS=85121255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:109:61:61:47:48:0.440367:29:18:28:33:29:19:28:33
chr1	85488030	.	G	A	888.52	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0201537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5715;QD=56.4139;RBI=0.0250793;REFB=-0.157701;REVB=-0.0149265;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.00213018;OID=.;OPOS=85488030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:30:32:0:0:30:32:0:1
chr1	85537655	.	C	CA	48.94	PASS	AF=0.175676;AO=20;DP=75;FAO=13;FDP=74;FR=.;FRO=61;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=0.00405001;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=101.527;QD=2.64547;RBI=0.0352851;REFB=-0.001324;REVB=-0.0350519;RO=54;SAF=3;SAR=17;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.552059;STB=0.910041;STBP=0.003;TYPE=ins;VARB=0.0212696;OID=.;OPOS=85537656;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.175676:20:75:13:74:61:1:12:33:28:48:54:3:17:32:22
chr1	85559452	.	A	G	685.03	PASS	AF=0.59633;AO=65;DP=109;FAO=65;FDP=109;FR=.;FRO=44;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=0.0428898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7524;QD=25.1388;RBI=0.045226;REFB=-0.0419786;REVB=-0.0143476;RO=44;SAF=45;SAR=20;SRF=32;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030857;STB=0.516773;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0302527;OID=.;OPOS=85559452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:44:44:65:65:0.59633:20:45:32:12:20:45:32:12
chr1	85594466	.	G	A	78.3	PASS	AF=0.392857;AO=10;DP=27;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0095164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.772;QD=11.1855;RBI=0.0320095;REFB=-0.0230379;REVB=0.0305622;RO=16;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334607;STB=0.66849;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.01735;OID=.;OPOS=85594466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:27:28:16:17:10:11:0.392857:3:7:6:10:4:7:6:11
chr1	85599563	.	A	C	97.29	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.128564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.967;QD=12.9724;RBI=0.135108;REFB=-0.0148754;REVB=-0.0415395;RO=18;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196261;STB=0.615195;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0358461;OID=.;OPOS=85599563;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:5:7:7:11:5:7:7:11
chr1	85624549	.	C	T	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0589778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.237;QD=56.9568;RBI=0.0610663;REFB=0;REVB=-0.0158339;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108435;OID=.;OPOS=85624549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
chr1	85624864	.	G	A	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.036;QD=63.583;RBI=0.0179295;REFB=0;REVB=0.00237166;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.42286e-05;OID=.;OPOS=85624864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0
chr1	85648620	.	C	T	655.34	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.441;QD=60.962;RBI=0.0344529;REFB=0;REVB=0.00659639;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138844;OID=.;OPOS=85648620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:22:19:0:0:22:21:0:0
chr1	85666156	.	T	G	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00910437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.032;QD=59.3228;RBI=0.0402717;REFB=0;REVB=-0.0392291;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.43253e-05;OID=.;OPOS=85666156;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:33:35:0:0:33:35:0:0
chr1	85729987	.	A	G	954.85	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.345;QD=58.7601;RBI=0.0498543;REFB=0;REVB=0.0387564;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254519;OID=.;OPOS=85729987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:23:41:0:0:23:42:0:0
chr1	85733374	.	C	T	685.71	PASS	AF=0.928571;AO=51;DP=55;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0446698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8624;QD=48.9794;RBI=0.0452719;REFB=0.0381124;REVB=0.00735899;RO=4;SAF=28;SAR=23;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410642;STB=0.522152;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.0398471;OID=.;OPOS=85733374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:55:56:4:4:51:52:0.928571:23:28:1:3:23:29:1:3
chr1	85785751	.	T	C	632.9	PASS	AF=0.450331;AO=68;DP=151;FAO=68;FDP=151;FR=.;FRO=83;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=0.00252017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.713;QD=16.7656;RBI=0.0247294;REFB=-0.0245178;REVB=0.0246007;RO=83;SAF=30;SAR=38;SRF=36;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00746179;STB=0.504151;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.0282428;OID=.;OPOS=85785751;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:83:83:68:68:0.450331:38:30:36:47:38:30:36:47
chr1	85786977	.	G	A	46.37	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=-0.0372352;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=230.391;QD=9.76118;RBI=0.0372352;REFB=-0.0236895;REVB=0;RO=11;SAF=7;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0318144;OID=.;OPOS=85786977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:11:12:7:7:0.368421:0:7:11:0:0:7:12:0
chr1	85824449	.	C	T	157.01	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.00418111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.781;QD=16.1031;RBI=0.0380096;REFB=-0.0242707;REVB=-0.0377789;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733111;STB=0.542119;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0320562;OID=.;OPOS=85824449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:9:8:12:10:9:8:12:10
chr1	86202016	.	C	T	1499.54	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00062983;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.33;QD=63.8103;RBI=0.00692816;REFB=0;REVB=0.00689947;RO=0;SAF=51;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.47785e-05;OID=.;OPOS=86202016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:94:0:0:94:94:1:43:51:0:0:43:51:0:0
chr1	86202102	.	C	A	503.22	PASS	AF=0.527473;AO=48;DP=87;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.0232087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.402;QD=22.1197;RBI=0.023977;REFB=-0.0307079;REVB=0.00602099;RO=39;SAF=23;SAR=25;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120049;STB=0.550877;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0202599;OID=.;OPOS=86202102;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:91:39:43:48:48:0.527473:25:23:13:26:25:23:16:27
chr1	86249206	.	T	C	409.79	PASS	AF=0.518987;AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0137227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.068;QD=20.7488;RBI=0.014507;REFB=-0.00364829;REVB=-0.00470543;RO=38;SAF=19;SAR=22;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318703;STB=0.517638;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.002945;OID=.;OPOS=86249206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:38:38:41:41:0.518987:22:19:19:19:22:19:19:19
chr1	86375654	.	C	G	921.17	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.353;QD=58.4872;RBI=0.0371069;REFB=0;REVB=-0.0066324;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.82821e-05;OID=.;OPOS=86375654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:63:0:0:59:63:1:28:31:0:0:28:35:0:0
chr1	86487981	.	G	A	1172.68	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.838;QD=60.9187;RBI=0.0373755;REFB=0;REVB=0.0208156;RO=0;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.85938e-05;OID=.;OPOS=86487981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:29:47:0:0:30:47:0:0
chr1	86487992	.	A	AACAG	387.29	PASS	AF=0.59375;AO=36;DP=70;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=2;FWDB=-0.00863801;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=4;MLLD=237.55;QD=24.2058;RBI=0.0145248;REFB=-0.0446252;REVB=0.0116771;RO=32;SAF=14;SAR=22;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372465;STB=0.696109;STBP=0.001;TYPE=ins;VARB=0.0219586;OID=.;OPOS=86487993;OREF=-;OALT=ACAG;OMAPALT=AACAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.59375:36:70:38:64:26:16:22:24:2:99:32:14:22:27:5
chr1	86557967	.	G	A	116.16	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.030781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.942;QD=11.3327;RBI=0.0356526;REFB=-0.00351979;REVB=-0.0179899;RO=27;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615589;STB=0.536533;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.00613531;OID=.;OPOS=86557967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:7:7:12:15:7:7:12:15
chr1	86590915	.	G	A	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00907958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.558;QD=61.3351;RBI=0.021051;REFB=0;REVB=0.0189923;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.62383e-05;OID=.;OPOS=86590915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr1	86591563	.	T	C	428.62	PASS	AF=0.44;AO=43;DP=100;FAO=44;FDP=100;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-9.00746e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.044;QD=17.1447;RBI=0.0209024;REFB=-0.00850234;REVB=0.0209022;RO=54;SAF=25;SAR=18;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11813;STB=0.548424;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00914718;OID=.;OPOS=86591563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:54:56:43:44:0.44:18:25:25:29:19:25:27:29
chr1	86622060	.	C	T	100.09	PASS	AF=0.269231;AO=13;DP=51;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.002961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.3;QD=7.69884;RBI=0.00454235;REFB=-0.00893261;REVB=-0.00344462;RO=38;SAF=7;SAR=6;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146632;STB=0.533285;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0296318;OID=.;OPOS=86622060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:38:38:13:14:0.269231:6:7:20:18:6:8:20:18
chr1	86818572	.	T	C	769.32	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.345;QD=56.9868;RBI=0.0634088;REFB=0;REVB=0.0498293;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.82085e-05;OID=.;OPOS=86818572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0
chr1	86820267	.	C	T	1539.51	PASS	AF=0.990476;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0184665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.259;QD=58.6478;RBI=0.0259225;REFB=-0.0283285;REVB=-0.0181925;RO=0;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.000535518;OID=.;OPOS=86820267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:105:0:1:104:104:0.990476:49:55:0:0:49:55:1:0
chr1	86822204	.	C	T	287.92	PASS	AF=0.445946;AO=31;DP=72;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=10;FWDB=0.00200399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7971;QD=15.5634;RBI=0.0444653;REFB=-0.0159904;REVB=0.0444202;RO=40;SAF=18;SAR=13;SRF=30;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180502;STB=0.605477;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0544557;OID=.;OPOS=86822204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:74:40:41:31:33:0.445946:13:18:30:10:14:19:31:10
chr1	86838158	.	C	T	3781.52	PASS	AF=1;AO=237;DP=237;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=167;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00827793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.472;QD=63.289;RBI=0.0283713;REFB=0;REVB=-0.0271369;RO=0;SAF=165;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.32942e-06;OID=.;OPOS=86838158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:237:239:0:0:237:239:1:72:165:0:0:72:167:0:0
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chr1	86852621	.	A	G	736.0	PASS	AF=0.564516;AO=70;DP=124;FAO=70;FDP=124;FR=.;FRO=54;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.0135614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.224;QD=23.7418;RBI=0.0159901;REFB=-0.0378419;REVB=-0.00847183;RO=53;SAF=46;SAR=24;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.077558;STB=0.539141;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0291465;OID=.;OPOS=86852621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:53:54:70:70:0.564516:24:46:30:23:24:46:31:23
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chr1	86951076	.	G	A,GA	58.49	PASS	AF=0.0151515,0.166667;AO=7,8;DP=68;FAO=1,11;FDP=66;FR=.;FRO=54;FSAF=0,5;FSAR=1,6;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.0263277,-0.0101401;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=185.156,89.4814;QD=3.54488;RBI=0.0272652,0.0102146;REFB=-0.0127201,-0.00472751;REVB=-0.00708808,0.00123075;RO=52;SAF=0,6;SAR=7,2;SRF=27;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.649423,0.28844;STB=0.98966,0.522431;STBP=0.481,0.956;TYPE=snp,ins;VARB=0.264754,0.153057;OID=.,.;OPOS=86951076,86951077;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:56:68:66:52:54:7,8:1,11:0.0151515,0.166667:7,2:0,6:27:25:1,6:0,5:26:28
chr1	86952324	.	A	G	1968.13	PASS	AF=0.93007;AO=133;DP=143;FAO=133;FDP=143;FR=.;FRO=10;FSAF=74;FSAR=59;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.049611;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.2834;QD=55.0527;RBI=0.0504204;REFB=-0.143712;REVB=0.00899852;RO=1;SAF=74;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798815;STB=0.510194;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00561038;OID=.;OPOS=86952324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:143:143:1:10:133:133:0.93007:59:74:0:1:59:74:7:3
chr1	86959173	.	T	C	2623.47	PASS	AF=0.994152;AO=170;DP=171;FAO=170;FDP=171;FR=.;FRO=1;FSAF=100;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0128519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.467;QD=61.3678;RBI=0.0270721;REFB=0.0423459;REVB=-0.0238271;RO=1;SAF=100;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00675066;STB=0.503546;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-3.03483e-05;OID=.;OPOS=86959173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:171:171:1:1:170:170:0.994152:70:100:0:1:70:100:0:1
chr1	86965419	.	T	C	275.12	PASS	AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00947333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.582;QD=15.4997;RBI=0.01273;REFB=-0.0177249;REVB=-0.00850343;RO=40;SAF=21;SAR=10;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234261;STB=0.63268;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0203809;OID=.;OPOS=86965419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:40:40:31:31:0.43662:10:21:18:22:10:21:18:22
chr1	86965595	.	C	T	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0673542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.7709;QD=8.24618;RBI=0.0678845;REFB=0.00244471;REVB=-0.00846868;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11411;STB=0.571224;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=-0.0174551;OID=.;OPOS=86965595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:3:4:7:8:3:4:7:8
chr1	87031656	.	A	C	130.62	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.00954353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.297;QD=13.7491;RBI=0.00957708;REFB=-0.013957;REVB=0.000800954;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204049;STB=0.627084;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0306332;OID=.;OPOS=87031656;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:23:15:15:0.394737:8:7:6:16:8:7:6:17
chr1	87045896	.	TCCTACA	T,TCCTACT	185.03	PASS	AF=0.36,0.06;AO=15,5;DP=52;FAO=18,3;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11,1;FSAR=7,2;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0156759,-0.0135776;FXX=0.019604;HRUN=2,1;LEN=6,1;MLLD=233.776,156.226;QD=14.8025;RBI=0.0157584,0.0208213;REFB=-0.0186925,-0.0226754;REVB=-0.00161064,-0.0157853;RO=25;SAF=8,4;SAR=7,1;SRF=14;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0285998,0.309732;STB=0.537855,0.692622;STBP=0.7,0.548;TYPE=del,snp;VARB=0.0226282,0.0375821;OID=.,.;OPOS=87045897,87045902;OREF=CCTACA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TCCTACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.36,0.06:15,5:52:18,3:50:29:11,1:7,2:16:13:99:25:8,4:7,1:14:11
chr1	87101375	.	C	G	84.33	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00182855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.338;QD=10.5417;RBI=0.0182651;REFB=-0.0189458;REVB=0.0181733;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642199;STB=0.512173;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0485726;OID=.;OPOS=87101375;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:19:21:11:11:0.34375:7:4:8:11:7:4:8:13
chr1	87101649	.	T	C	420.22	PASS	AF=0.506024;AO=42;DP=83;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.00868978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2486;QD=20.2514;RBI=0.0406365;REFB=0.00120137;REVB=0.0396965;RO=41;SAF=17;SAR=25;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118696;STB=0.565842;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.000465206;OID=.;OPOS=87101649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:41:41:42:42:0.506024:25:17:22:19:25:17:22:19
chr1	87599697	.	G	A	239.35	PASS	AF=0.511111;AO=22;DP=46;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00849668;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0589;QD=21.2754;RBI=0.0139907;REFB=0.00726834;REVB=0.0111151;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040868;STB=0.533951;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.00736718;OID=.;OPOS=87599697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:22:22:22:23:0.511111:10:12:13:9:11:12:13:9
chr1	89225976	.	T	C	357.57	PASS	AF=0.610169;AO=35;DP=59;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0319047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7687;QD=24.2419;RBI=0.106123;REFB=0.00501771;REVB=0.101214;RO=24;SAF=17;SAR=18;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0512355;STB=0.514656;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=3.00321e-05;OID=.;OPOS=89225976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:23:35:36:0.610169:18:17:10:14:19:17:10:13
chr1	89271574	.	T	C	270.6	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.0111962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.947;QD=16.9125;RBI=0.0146528;REFB=-0.0441565;REVB=0.00945242;RO=32;SAF=16;SAR=14;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230465;STB=0.610238;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0417647;OID=.;OPOS=89271574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:32:34:30:30:0.46875:14:16:9:23:14:16:11:23
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chr1	89479758	.	T	C	256.05	PASS	AF=0.460317;AO=28;DP=62;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00169388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.292;QD=16.2569;RBI=0.00925529;REFB=-0.025031;REVB=0.00909897;RO=34;SAF=13;SAR=15;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119945;STB=0.55673;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0264661;OID=.;OPOS=89479758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:34:34:28:29:0.460317:15:13:20:14:15:14:20:14
chr1	89486037	.	C	T	220.7	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0481841;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4079;QD=18.0164;RBI=0.0482834;REFB=-0.0359468;REVB=0.00309572;RO=27;SAF=12;SAR=10;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262375;STB=0.514912;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0478666;OID=.;OPOS=89486037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:10:12:14:13:10:12:14:13
chr1	89518623	.	C	T	1144.76	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.996;QD=59.4682;RBI=0.0217607;REFB=0;REVB=-0.0182328;RO=0;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000818336;OID=.;OPOS=89518623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:77:0:0:74:77:1:41:33:0:0:42:35:0:0
chr1	89522646	.	G	C	508.0	PASS	AF=0.411765;AO=56;DP=136;FAO=56;FDP=136;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=-0.0126656;FXX=0.00729874;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.7;QD=14.941;RBI=0.0203818;REFB=-0.0228001;REVB=-0.0159687;RO=77;SAF=32;SAR=24;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407384;STB=0.512816;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0372957;OID=.;OPOS=89522646;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:77:80:56:56:0.411765:24:32:41:36:24:32:44:36
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chr1	89582690	.	G	C	1559.01	PASS	AF=0.981481;AO=106;DP=108;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00874022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.994;QD=57.7409;RBI=0.0434991;REFB=-0.0463468;REVB=0.0426119;RO=2;SAF=48;SAR=58;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160826;STB=0.508473;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.000498939;OID=.;OPOS=89582690;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:108:108:2:2:106:106:0.981481:58:48:0:2:58:48:0:2
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chr1	89652102	.	A	T	444.29	PASS	AF=0.494382;AO=40;DP=87;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.00628697;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.516;QD=19.9682;RBI=0.00765213;REFB=-0.00881669;REVB=-0.00436224;RO=44;SAF=19;SAR=21;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06609;STB=0.528077;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0117221;OID=.;OPOS=89652102;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:89:44:45:40:44:0.494382:21:19:24:20:22:22:25:20
chr1	89732237	.	G	A	139.53	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.026661;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.843;QD=12.4027;RBI=0.0467492;REFB=-0.0195518;REVB=-0.0384015;RO=29;SAF=9;SAR=7;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499272;STB=0.529375;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0333453;OID=.;OPOS=89732237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:7:9:15:14:7:9:15:14
chr1	90171835	.	CG	GT,TG	638.3	PASS	AF=0.047619,0.952381;AO=2,40;DP=42;FAO=2,40;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0,27;FSAR=2,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00397419,0.00685841;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=46.6533,87.7447;QD=60.7906;RBI=0.00862497,0.00725616;REFB=0,0;REVB=0.0076548,-0.0023694;RO=0;SAF=0,27;SAR=2,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0381065,-0.0114357;OID=.,.;OPOS=90171835,90171835;OREF=CG,C;OALT=GT,T;OMAPALT=GT,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:42:42:0:0:2,40:2,40:0.047619,0.952381:2,13:0,27:0:0:2,13:0,27:0:0
chr1	90178743	.	A	G	556.75	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1478;QD=60.1889;RBI=0.109601;REFB=0;REVB=-0.0200959;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131671;OID=.;OPOS=90178743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:20:16:0:0:21:16:0:0
chr1	90179704	.	A	G	329.81	PASS	AF=0.428571;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=0.0102086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.286;QD=15.705;RBI=0.0114789;REFB=-0.0163724;REVB=-0.00524882;RO=48;SAF=25;SAR=11;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564233;STB=0.531897;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0260662;OID=.;OPOS=90179704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:48:48:36:36:0.428571:11:25:31:17:11:25:31:17
chr1	90486412	.	T	G	2049.86	PASS	AF=0.992481;AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.028382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.586;QD=61.65;RBI=0.0293613;REFB=-0.145529;REVB=0.00751984;RO=1;SAF=75;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00826558;STB=0.504347;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00025567;OID=.;OPOS=90486412;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:133:133:1:1:132:132:0.992481:57:75:0:1:57:75:0:1
chr1	90493026	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5531;QD=43.486;RBI=0.0209969;REFB=0;REVB=0.00849667;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000491243;OID=.;OPOS=90493026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0
chr1	91381679	.	G	A	158.55	PASS	AF=0.64;AO=15;DP=26;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0190974;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.889;QD=25.3683;RBI=0.0537659;REFB=0.00105279;REVB=-0.0502599;RO=8;SAF=6;SAR=9;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636683;STB=0.526282;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=-0.000265965;OID=.;OPOS=91381679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:25:8:9:15:16:0.64:9:6:4:4:10:6:4:5
chr1	91404734	.	G	GT,T	33.83	PASS	AF=0.107438,0;AO=18,5;DP=120;FAO=13,0;FDP=121;FR=.;FRO=108;FSAF=12,0;FSAR=1,0;FSRF=57;FSRR=51;FWDB=-0.116519,-0.0986955;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=71.4495,129.883;QD=1.11818;RBI=0.116788,0.102943;REFB=-0.00932895,-0.00563237;REVB=-0.00792575,-0.0292647;RO=97;SAF=17,5;SAR=1,0;SRF=47;SRR=50;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.630342,0.473701;STB=0.899748,0.5;STBP=0.004,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.152157,0;OID=.,.;OPOS=91404735,91404734;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:120:121:97:108:18,5:13,0:0.107438,0:1,0:17,5:47:50:1,0:12,0:57:51
chr1	91404770	.	C	CT,T	37.81	PASS	AF=0.166667,0;AO=17,4;DP=95;FAO=16,0;FDP=96;FR=.;FRO=80;FSAF=14,0;FSAR=2,0;FSRF=28;FSRR=52;FWDB=-0.10088,-0.031192;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=16.8101,131.661;QD=1.57528;RBI=0.106735,0.04055;REFB=-0.077448,0.00235903;REVB=-0.0348662,-0.0259107;RO=74;SAF=12,4;SAR=5,0;SRF=26;SRR=48;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.426812,0.544326;STB=0.89955,0.5;STBP=0.001,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.174305,0;OID=.,.;OPOS=91404771,91404770;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:95:96:74:80:17,4:16,0:0.166667,0:5,0:12,4:26:48:2,0:14,0:28:52
chr1	91405204	.	CTTTTTTT	CTTTTTTA,CTTTTTT,TCTTTTTT,TTTTTTTT	100.07	PASS	AF=0,0.627907,0,0;AO=2,21,4,2;DP=43;FAO=0,27,0,0;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=0,7,0,0;FSAR=0,20,0,0;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0601947,0.245786,0.0510136,-0.0014465;FXX=0.0227221;HRUN=7,7,1,1;LEN=1,1,2,1;MLLD=142.927,7.06888,10.6593,147.984;QD=9.30853;RBI=0.0717413,0.279556,0.174259,0.0218373;REFB=-0.00939972,-0.0716778,-0.0227287,0.0014264;REVB=-0.039031,-0.133195,-0.166625,-0.0217894;RO=13;SAF=2,4,0,1;SAR=0,17,4,1;SRF=9;SRR=4;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.490041,-0.400097,-0.736642,-0.204413;STB=0.5,0.628582,0.5,0.5;STBP=1,0.028,1,1;TYPE=snp,del,mnp,snp;VARB=0.00284584,0.115063,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=91405211,91405205,91405204,91405204;OREF=T,T,CT,C;OALT=A,-,TC,T;OMAPALT=CTTTTTTA,CTTTTTT,TCTTTTTT,TTTTTTTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:37:43:43:13:16:2,21,4,2:0,27,0,0:0,0.627907,0,0:0,17,4,1:2,4,0,1:9:4:0,20,0,0:0,7,0,0:9:7
chr1	91728053	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.075;QD=57.8847;RBI=0.012974;REFB=0;REVB=0.00205463;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83349e-05;OID=.;OPOS=91728053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:29:31:0:0:29:31:0:0
chr1	91781413	.	T	G	1718.09	PASS	AF=0.991304;AO=113;DP=115;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0507618;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.992;QD=59.7596;RBI=0.05872;REFB=-0.0845327;REVB=0.0295174;RO=1;SAF=47;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00999513;STB=0.505154;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.000487384;OID=.;OPOS=91781413;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:115:115:1:1:113:114:0.991304:66:47:1:0:66:48:1:0
chr1	91844045	.	GAAAAAAAAGC	AGAAAAAAAGC,GAAAAAAAGC,GAAAAAAAGCA	55.75	PASS	AF=0,0.288462,0.00961538;AO=5,33,5;DP=115;FAO=0,30,1;FDP=104;FR=.;FRO=73;FSAF=0,15,1;FSAR=0,15,0;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=-0.151412,-0.124119,-0.124041;FXX=0.0370336;HRUN=1,8,8;LEN=2,1,3;MLLD=23.1141,6.65587,24.0747;QD=2.14428;RBI=0.155524,0.125448,0.124204;REFB=-0.0369944,-0.0954914,-0.0439215;REVB=-0.0355266,0.0182112,0.00635869;RO=53;SAF=5,13,5;SAR=0,20,0;SRF=14;SRR=39;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.689436,0.153192,0.689436;STB=0.5,0.601877,0.9928;STBP=1,0.175,0.247;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0,0.088459,0.0529552;OID=.,.,.;OPOS=91844045,91844046,91844053;OREF=GA,A,AGC;OALT=AG,-,GCA;OMAPALT=AGAAAAAAAGC,GAAAAAAAGC,GAAAAAAAGCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:56:115:104:53:73:5,33,5:0,30,1:0,0.288462,0.00961538:0,20,0:5,13,5:14:39:0,15,0:0,15,1:26:47
chr1	91851253	.	T	C	619.95	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0102943;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=290.252;QD=59.0424;RBI=0.01423;REFB=-0.0422015;REVB=0.00982455;RO=1;SAF=17;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267986;STB=0.514279;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00027244;OID=.;OPOS=91851253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:24:17:1:0:24:17:1:0
chr1	91853111	.	A	C	3739.54	PASS	AF=0.979675;AO=236;DP=246;FAO=241;FDP=246;FR=.;FRO=5;FSAF=137;FSAR=104;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0234388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.774;QD=60.8055;RBI=0.0334201;REFB=0.0218162;REVB=0.0238228;RO=1;SAF=132;SAR=104;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00359699;STB=0.50896;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.00211022;OID=.;OPOS=91853111;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:246:246:1:5:236:241:0.979675:104:132:1:0:104:137:5:0
chr1	91859795	.	T	C	1445.43	PASS	AF=0.959184;AO=94;DP=99;FAO=94;FDP=98;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0789207;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2421;QD=58.9972;RBI=0.0837574;REFB=-0.0970266;REVB=0.0280503;RO=1;SAF=29;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00723976;STB=0.509094;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.00190843;OID=.;OPOS=91859795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:99:98:1:4:94:94:0.959184:65:29:0:1:65:29:2:2
chr1	91870410	.	G	C	813.99	PASS	AF=0.449735;AO=85;DP=189;FAO=85;FDP=189;FR=.;FRO=104;FSAF=55;FSAR=30;FSRF=57;FSRR=47;FWDB=-0.0740406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.166;QD=17.2273;RBI=0.0740873;REFB=-0.0234893;REVB=0.00262891;RO=104;SAF=55;SAR=30;SRF=57;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103505;STB=0.55759;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0398361;OID=.;OPOS=91870410;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:189:104:104:85:85:0.449735:30:55:57:47:30:55:57:47
chr1	91980447	.	A	G	127.22	PASS	AF=0.28125;AO=18;DP=64;FAO=18;FDP=64;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=11;FWDB=0.00877931;FXX=0.0302984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=297.931;QD=7.95124;RBI=0.011732;REFB=0.00602106;REVB=0.00778222;RO=46;SAF=10;SAR=8;SRF=35;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261861;STB=0.654395;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.0171732;OID=.;OPOS=91980447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:46:46:18:18:0.28125:8:10:35:11:8:10:35:11
chr1	92107937	.	C	T	939.0	PASS	AF=1;AO=62;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00913574;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0936;QD=57.7844;RBI=0.0399218;REFB=0;REVB=0.0388624;RO=0;SAF=42;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014215;OID=.;OPOS=92107937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:62:65:1:20:42:0:0:22:43:0:0
chr1	92108119	.	A	G	473.1	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0913852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.014;QD=55.6587;RBI=0.0913931;REFB=-0.162722;REVB=-0.00120097;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.512813;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00320812;OID=.;OPOS=92108119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:34:34:0:1:33:33:0.970588:14:19:0:0:14:19:1:0
chr1	92108899	.	C	T	411.45	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.041;QD=56.7523;RBI=0.0162366;REFB=0;REVB=0.0114807;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.2364e-05;OID=.;OPOS=92108899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:14:14:0:0:14:15:0:0
chr1	92174260	.	A	G	278.89	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00229681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.47;QD=16.4054;RBI=0.00539459;REFB=0.00134984;REVB=-0.00488122;RO=35;SAF=12;SAR=19;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149019;STB=0.570138;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-0.00111072;OID=.;OPOS=92174260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:37:31:31:0.455882:19:12:19:16:19:12:19:18
chr1	92185657	.	C	T	757.28	PASS	AF=0.981818;AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.01055;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.872;QD=55.0749;RBI=0.011914;REFB=-0.121706;REVB=-0.0055353;RO=1;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269038;STB=0.513508;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=-4.47947e-05;OID=.;OPOS=92185657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:53:54:0.981818:17:36:0:1:18:36:0:1
chr1	92262874	.	T	C	306.0	PASS	AF=0.435897;AO=33;DP=77;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.0189926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.009;QD=15.6921;RBI=0.0245657;REFB=-0.0165705;REVB=-0.0155806;RO=43;SAF=18;SAR=15;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149585;STB=0.567528;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0257002;OID=.;OPOS=92262874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:43:44:33:34:0.435897:15:18:17:26:16:18:18:26
chr1	92295565	.	C	T	267.39	PASS	AF=0.88;AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0207539;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.313;QD=42.7817;RBI=0.0320847;REFB=0.00943694;REVB=0.0244684;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555506;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-3.34192e-05;OID=.;OPOS=92295565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:25:25:0:3:22:22:0.88:10:12:0:0:10:12:3:0
chr1	92327045	.	G	A	298.75	PASS	AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.00573943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0915;QD=23.8997;RBI=0.0229177;REFB=0.00822173;REVB=-0.0221874;RO=23;SAF=15;SAR=12;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135165;STB=0.575166;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=-0.00749044;OID=.;OPOS=92327045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:23:23:27:27:0.54:12:15:9:14:12:15:9:14
chr1	92428495	.	C	A	1530.05	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.226;QD=63.7519;RBI=0.0283004;REFB=0;REVB=0.0238192;RO=0;SAF=51;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21377e-05;OID=.;OPOS=92428495;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:45:51:0:0:45:51:0:0
chr1	92457843	.	C	T	1864.24	PASS	AF=1;AO=120;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126515;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.71;QD=61.6277;RBI=0.0159884;REFB=0;REVB=0.00977587;RO=0;SAF=53;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119982;OID=.;OPOS=92457843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:120:121:1:67:53:0:0:67:54:0:0
chr1	92646021	.	G	A	518.5	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.465;QD=59.2568;RBI=0.0156919;REFB=0;REVB=0.0022483;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96094e-05;OID=.;OPOS=92646021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:24:10:0:0:24:11:0:0
chr1	92647223	.	A	G	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.151;QD=59.0181;RBI=0.0437898;REFB=0;REVB=0.0363628;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016896;OID=.;OPOS=92647223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:11:23:0:0:11:23:0:0
chr1	92647532	.	C	A	745.71	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2352;QD=63.4644;RBI=0.024007;REFB=0;REVB=-0.0214135;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127135;OID=.;OPOS=92647532;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:30:16:0:0:30:17:0:0
chr1	92889408	.	C	T	697.61	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00333083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5111;QD=62.0101;RBI=0.0278426;REFB=0;REVB=-0.0276426;RO=0;SAF=13;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132868;OID=.;OPOS=92889408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:30:13:0:0:31:14:0:0
chr1	92946479	.	G	A	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00404771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5895;QD=55.6546;RBI=0.0792199;REFB=0;REVB=0.0791165;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120544;OID=.;OPOS=92946479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr1	92974595	.	G	A	1380.18	PASS	AF=1;AO=89;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331188;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.842;QD=60.6671;RBI=0.0331356;REFB=-0.152557;REVB=0.00105382;RO=1;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108942;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000599605;OID=.;OPOS=92974595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:91:1:0:89:91:1:43:46:0:1:45:46:0:0
chr1	92977989	.	T	A	100.57	PASS	AF=0.371429;AO=11;DP=34;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.000985913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.934;QD=11.4933;RBI=0.0169267;REFB=-0.0411337;REVB=0.016898;RO=22;SAF=8;SAR=3;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170215;STB=0.570619;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0400293;OID=.;OPOS=92977989;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:22:22:11:13:0.371429:3:8:13:9:4:9:13:9
chr1	92979124	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00398948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.36;QD=46.848;RBI=0.0122611;REFB=0;REVB=-0.0115939;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110157;OID=.;OPOS=92979124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0
chr1	92979354	.	A	G	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00325783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.246;QD=60.6093;RBI=0.00384131;REFB=0;REVB=0.00203523;RO=0;SAF=7;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24948e-05;OID=.;OPOS=92979354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:31:7:0:0:31:7:0:0
chr1	93089823	.	T	C	885.12	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0887479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.8797;QD=58.0407;RBI=0.113809;REFB=0;REVB=0.0712475;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157534;OID=.;OPOS=93089823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:30:30:0:0:30:31:0:0
chr1	93160892	.	C	T	78.63	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0105577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.9478;QD=14.9779;RBI=0.0192902;REFB=-0.00551909;REVB=-0.0161446;RO=11;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122307;STB=0.571288;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0105471;OID=.;OPOS=93160892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:5:5:7:4:5:5:7:4
chr1	93160902	.	T	C	229.38	PASS	AF=0.95;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0457387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.5733;QD=45.8766;RBI=0.0729013;REFB=-0.0459062;REVB=0.0567677;RO=1;SAF=11;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399301;STB=0.519979;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00129175;OID=.;OPOS=93160902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:19:20:1:1:18:19:0.95:7:11:1:0:7:12:1:0
chr1	93306317	.	G	A	1675.07	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4376;QD=60.363;RBI=0.0568525;REFB=0;REVB=0.0537661;RO=0;SAF=48;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243265;OID=.;OPOS=93306317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:111:0:0:108:111:1:60:48:0:0:62:49:0:0
chr1	93307908	.	T	A	1011.83	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00668792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.39;QD=57.819;RBI=0.00779344;REFB=-0.11942;REVB=0.00400118;RO=1;SAF=34;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013701;STB=0.507244;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.000581064;OID=.;OPOS=93307908;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:35:34:1:0:35:34:1:0
chr1	93580581	.	G	C	1170.56	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000330061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.094;QD=60.8083;RBI=0.058904;REFB=0;REVB=0.0589031;RO=0;SAF=34;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.74736e-05;OID=.;OPOS=93580581;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:77:0:0:74:77:1:40:34:0:0:43:34:0:0
chr1	93581024	.	T	C	269.43	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.00223289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.621;QD=23.4288;RBI=0.0114929;REFB=-0.0051008;REVB=-0.0112739;RO=21;SAF=14;SAR=11;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214984;STB=0.618787;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0345837;OID=.;OPOS=93581024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:11:14:17:4:11:14:17:4
chr1	93603183	.	C	CAT,T	213.78	PASS	AF=0.363636,0.0454545;AO=22,4;DP=65;FAO=24,3;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=19,3;FSAR=5,0;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0439297,-0.0479559;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=2,1;MLLD=139.963,52.4943;QD=12.9561;RBI=0.10665,0.167343;REFB=-0.0137664,-0.0270493;REVB=-0.0971829,-0.160324;RO=38;SAF=18,3;SAR=4,1;SRF=17;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.447368,0.322584;STB=0.740046,0.996841;STBP=0.007,0.045;TYPE=ins,snp;VARB=0.0298573,0.0122935;OID=.,.;OPOS=93603184,93603183;OREF=-,C;OALT=AT,T;OMAPALT=CAT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:38:39:22,4:24,3:0.363636,0.0454545:4,1:18,3:17:21:5,0:19,3:17:22
chr1	93617546	.	T	C	920.07	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0747845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7378;QD=58.417;RBI=0.0908684;REFB=0;REVB=0.0516172;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115935;OID=.;OPOS=93617546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0
chr1	93646433	.	T	C	377.99	PASS	AF=0.642857;AO=36;DP=56;FAO=36;FDP=56;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0425317;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.454;QD=26.9995;RBI=0.0425712;REFB=-0.0244661;REVB=0.0018335;RO=20;SAF=17;SAR=19;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113897;STB=0.562091;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0126854;OID=.;OPOS=93646433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:20:20:36:36:0.642857:19:17:6:14:19:17:6:14
chr1	93672688	.	C	T	148.21	PASS	AF=0.37037;AO=18;DP=58;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00600401;FXX=0.0689536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.066;QD=10.9787;RBI=0.00919375;REFB=-0.00581297;REVB=-0.00696253;RO=33;SAF=9;SAR=9;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151123;STB=0.604294;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0128993;OID=.;OPOS=93672688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:54:33:34:18:20:0.37037:9:9:21:12:11:9:21:13
chr1	93672723	.	A	C	915.9	PASS	AF=0.942857;AO=65;DP=70;FAO=66;FDP=70;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0255637;FXX=0.0140825;HRUN=5;LEN=1;MLLD=87.4185;QD=52.3372;RBI=0.0400104;REFB=-0.138102;REVB=0.0307787;RO=3;SAF=29;SAR=36;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00951301;STB=0.51101;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.000884204;OID=.;OPOS=93672723;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:70:70:3:4:65:66:0.942857:36:29:1:2:37:29:1:3
chr1	93720070	.	C	G	253.84	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0136092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.675;QD=21.6029;RBI=0.0264797;REFB=-0.0162398;REVB=-0.0227148;RO=18;SAF=15;SAR=9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0997102;STB=0.5307;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0168663;OID=.;OPOS=93720070;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:23:24:24:0.510638:9:15:9:9:9:15:13:10
chr1	93851295	.	T	C	723.73	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0327273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.654;QD=54.6213;RBI=0.0441135;REFB=-0.0497396;REVB=0.0295792;RO=1;SAF=30;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154433;STB=0.508194;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00292815;OID=.;OPOS=93851295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:22:30:1:0:22:30:1:0
chr1	94341267	.	A	G	251.44	PASS	AF=0.489796;AO=23;DP=47;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.00810866;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.104;QD=20.526;RBI=0.016312;REFB=-0.0292005;REVB=-0.0141538;RO=24;SAF=12;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057389;STB=0.55174;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0287217;OID=.;OPOS=94341267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:24:25:23:24:0.489796:11:12:11:13:11:13:11:14
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chr1	94387597	.	C	T	663.28	PASS	AF=0.546218;AO=61;DP=115;FAO=65;FDP=119;FR=.;FRO=54;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.0107188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.474;QD=22.2951;RBI=0.0117712;REFB=-0.0141448;REVB=-0.00486501;RO=53;SAF=32;SAR=29;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766151;STB=0.550952;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0112825;OID=.;OPOS=94387597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:119:53:54:61:65:0.546218:29:32:23:30:30:35:23:31
chr1	94471075	.	A	G	1184.89	PASS	AF=0.975309;AO=78;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0217168;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5548;QD=58.5129;RBI=0.0365897;REFB=-0.0419487;REVB=0.029448;RO=2;SAF=43;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262774;STB=0.513885;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00237094;OID=.;OPOS=94471075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:81:81:2:2:78:79:0.975309:35:43:0:2:35:44:0:2
chr1	94544233	.	G	A	128.83	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.00307884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.21;QD=12.5691;RBI=0.00864576;REFB=0.00807896;REVB=-0.00807898;RO=26;SAF=11;SAR=4;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.446073;STB=0.760671;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.00657543;OID=.;OPOS=94544233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:4:11:8:18:4:11:8:18
chr1	94544234	.	T	C	296.15	PASS	AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0409682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.803;QD=28.8927;RBI=0.0409699;REFB=0.0272424;REVB=-0.000370731;RO=15;SAF=8;SAR=18;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29014;STB=0.660105;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00738298;OID=.;OPOS=94544234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:18:8:11:4:18:8:11:4
chr1	94578548	.	T	C	635.72	PASS	AF=1;AO=35;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116506;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.111;QD=62.021;RBI=0.118411;REFB=0;REVB=0.0211528;RO=0;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00183002;OID=.;OPOS=94578548;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:35:41:1:26:9:0:0:32:9:0:0
chr1	94639337	.	A	G	411.56	PASS	AF=1;AO=26;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=399.449;QD=56.7662;RBI=0.0245089;REFB=0;REVB=0.0116153;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223825;OID=.;OPOS=94639337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:26:29:1:10:16:0:0:9:20:0:0
chr1	94639447	.	C	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.466;QD=48.7373;RBI=0.020404;REFB=0;REVB=-0.000603869;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123504;OID=.;OPOS=94639447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0
chr1	94998750	.	G	A	682.14	PASS	AF=0.482517;AO=68;DP=142;FAO=69;FDP=143;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=47;FSRR=27;FWDB=-0.060826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8995;QD=19.0808;RBI=0.0683766;REFB=0.0116284;REVB=-0.0312339;RO=73;SAF=36;SAR=32;SRF=46;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0953505;STB=0.551823;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.0106513;OID=.;OPOS=94998750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:143:73:74:68:69:0.482517:32:36:46:27:32:37:47:27
chr1	95001600	.	A	C	1264.65	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.56;QD=61.69;RBI=0.035395;REFB=0;REVB=0.0101472;RO=0;SAF=52;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.09171e-05;OID=.;OPOS=95001600;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:30:52:0:0:30:52:0:0
chr1	95330372	.	G	A	1061.93	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00813673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.592;QD=59.827;RBI=0.0106891;REFB=0;REVB=0.00693178;RO=0;SAF=26;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.00425e-06;OID=.;OPOS=95330372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:45:26:0:0:45:26:0:0
chr1	95709821	.	T	C	662.0	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0638737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4305;QD=60.1816;RBI=0.091595;REFB=-0.112098;REVB=0.065649;RO=1;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159212;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00536909;OID=.;OPOS=95709821;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:44:44:1:0:43:44:1:29:14:0:1:30:14:0:0
chr1	95709939	.	T	G	1274.76	PASS	AF=0.988506;AO=83;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0091959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.007;QD=58.6096;RBI=0.0314159;REFB=0.0125158;REVB=0.0300399;RO=1;SAF=30;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00885353;STB=0.504672;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000336337;OID=.;OPOS=95709939;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:1:1:83:86:0.988506:53:30:0:1:53:33:0:1
chr1	97161710	.	A	G	33.5	PASS	AF=0.153846;AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0274181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.417;QD=3.43625;RBI=0.0280273;REFB=-0.0135794;REVB=0.00581199;RO=33;SAF=1;SAR=5;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288003;STB=0.713471;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0770562;OID=.;OPOS=97161710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:39:39:33:33:6:6:0.153846:5:1:12:21:5:1:12:21
chr1	97189091	.	G	A	850.1	PASS	AF=0.953125;AO=61;DP=64;FAO=61;FDP=64;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0613632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4516;QD=53.1313;RBI=0.062325;REFB=-0.0722546;REVB=0.0109072;RO=2;SAF=46;SAR=15;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200828;STB=0.515784;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0092364;OID=.;OPOS=97189091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:64:64:2:3:61:61:0.953125:15:46:2:0:15:46:3:0
chr1	98348885	.	G	A	1264.75	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00401867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.968;QD=61.6951;RBI=0.0123181;REFB=0;REVB=0.0116441;RO=0;SAF=49;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.31511e-05;OID=.;OPOS=98348885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:33:49:0:0:33:49:0:0
chr1	99127392	.	T	C	432.83	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0458082;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.977;QD=57.7101;RBI=0.0465507;REFB=0;REVB=0.00828111;RO=0;SAF=23;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000707467;OID=.;OPOS=99127392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:7:23:0:0:7:23:0:0
chr1	99225627	.	G	A	1587.57	PASS	AF=0.990741;AO=106;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.020327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.404;QD=58.7989;RBI=0.032052;REFB=-0.108331;REVB=-0.0247819;RO=1;SAF=66;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00713735;STB=0.503703;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000457033;OID=.;OPOS=99225627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:108:108:1:1:106:107:0.990741:40:66:1:0:40:67:1:0
chr1	100203648	.	C	T	448.4	PASS	AF=0.438596;AO=50;DP=114;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=-0.00331209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9763;QD=15.7333;RBI=0.00967276;REFB=0.000757002;REVB=-0.00908803;RO=64;SAF=16;SAR=34;SRF=24;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061639;STB=0.534577;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=-0.0013474;OID=.;OPOS=100203648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:64:64:50:50:0.438596:34:16:24:40:34:16:24:40
chr1	100203693	.	G	A	580.9	PASS	AF=0.458647;AO=61;DP=133;FAO=61;FDP=133;FR=.;FRO=72;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=-0.0228262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.727;QD=17.4707;RBI=0.0228741;REFB=-0.0168924;REVB=0.00147839;RO=72;SAF=23;SAR=38;SRF=30;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405458;STB=0.522566;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0245394;OID=.;OPOS=100203693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:72:72:61:61:0.458647:38:23:30:42:38:23:30:42
chr1	100327026	.	C	T	156.97	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00266749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.55;QD=16.0996;RBI=0.00319501;REFB=-0.014291;REVB=-0.00175858;RO=22;SAF=10;SAR=7;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428787;STB=0.524662;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0237397;OID=.;OPOS=100327026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:7:10:12:10:7:10:12:10
chr1	100336361	.	C	T	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.703;QD=60.7162;RBI=0.0149594;REFB=0;REVB=0.0106645;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.96361e-06;OID=.;OPOS=100336361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0
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chr1	100584686	.	G	GT	60.19	PASS	AF=0.333333;AO=17;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0461971;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=38.3772;QD=5.73226;RBI=0.0520343;REFB=-0.0112543;REVB=-0.0239458;RO=24;SAF=16;SAR=1;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.656762;STB=0.877721;STBP=0.003;TYPE=ins;VARB=0.132624;OID=.;OPOS=100584687;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:17:42:14:42:28:13:1:14:14:60:24:16:1:11:13
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chr1	100672060	.	T	C	2007.9	PASS	AF=1;AO=128;DP=128;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.934;QD=62.2606;RBI=0.0460467;REFB=0;REVB=0.0430588;RO=0;SAF=63;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1359e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81165e-05;OID=.;OPOS=100672060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:129:0:0:128:129:1:65:63:0:0:65:64:0:0
chr1	101005855	.	T	C	321.8	PASS	AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.015043;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.949;QD=23.8368;RBI=0.016854;REFB=-0.0228074;REVB=0.00760044;RO=22;SAF=17;SAR=15;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044455;STB=0.52446;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0141111;OID=.;OPOS=101005855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:22:32:32:0.592593:15:17:13:9:15:17:13:9
chr1	101006577	.	A	G	402.12	PASS	AF=0.540541;AO=40;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0321033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6529;QD=21.7362;RBI=0.042308;REFB=0.0128176;REVB=0.0275562;RO=34;SAF=16;SAR=24;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849736;STB=0.546938;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=-0.00902521;OID=.;OPOS=101006577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:34:34:40:40:0.540541:24:16:17:17:24:16:17:17
chr1	101007055	.	C	T	158.09	PASS	AF=0.328125;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00780216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.641;QD=9.88034;RBI=0.0087785;REFB=-0.00824608;REVB=0.00402348;RO=43;SAF=10;SAR=11;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0669453;STB=0.539339;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0166569;OID=.;OPOS=101007055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:43:43:21:21:0.328125:11:10:23:20:11:10:23:20
chr1	101203827	.	G	A	1090.64	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.747;QD=59.761;RBI=0.0327501;REFB=0;REVB=0.0110345;RO=0;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188965;OID=.;OPOS=101203827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:40:31:0:0:41:32:0:0
chr1	103354115	.	T	C	426.17	PASS	AF=0.404959;AO=49;DP=121;FAO=49;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=29;FWDB=0.0775675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1469;QD=14.0883;RBI=0.0797772;REFB=0.0226415;REVB=-0.0186461;RO=72;SAF=27;SAR=22;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495503;STB=0.527928;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=-0.0322942;OID=.;OPOS=103354115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:72:72:49:49:0.404959:22:27:43:29:22:27:43:29
chr1	103405892	.	G	A	318.43	PASS	AF=0.375;AO=36;DP=96;FAO=36;FDP=96;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.00361327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2989;QD=13.2681;RBI=0.0375089;REFB=-0.00107009;REVB=-0.0373344;RO=60;SAF=17;SAR=19;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121706;STB=0.506957;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.00163487;OID=.;OPOS=103405892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:60:60:36:36:0.375:19:17:29:31:19:17:29:31
chr1	103444679	.	T	G	1263.51	PASS	AF=0.965517;AO=84;DP=87;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0480329;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.24;QD=58.0924;RBI=0.0496637;REFB=0.0532049;REVB=0.0126222;RO=3;SAF=47;SAR=37;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368637;STB=0.519476;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=-0.000409714;OID=.;OPOS=103444679;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:87:87:3:3:84:84:0.965517:37:47:0:3:37:47:0:3
chr1	107600869	.	G	A	368.62	PASS	AF=0.5;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00776795;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.514;QD=19.401;RBI=0.0133962;REFB=-0.0144937;REVB=-0.010914;RO=37;SAF=22;SAR=16;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103446;STB=0.51343;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0146146;OID=.;OPOS=107600869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:37:38:38:38:0.5:16:22:21:16:16:22:21:17
chr1	107979396	.	A	C	2292.14	PASS	AF=0.986486;AO=145;DP=147;FAO=146;FDP=148;FR=.;FRO=2;FSAF=86;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00396257;FXX=0.00671096;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.078;QD=61.9498;RBI=0.0361346;REFB=-0.010108;REVB=0.0359167;RO=2;SAF=85;SAR=60;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00229775;STB=0.501242;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.000185247;OID=.;OPOS=107979396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:147:148:2:2:145:146:0.986486:60:85:1:1:60:86:1:1
chr1	108023589	.	A	C	91.23	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.119951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.662;QD=17.3766;RBI=0.121652;REFB=-0.0559645;REVB=0.020275;RO=9;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00796806;STB=0.521699;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0392653;OID=.;OPOS=108023589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:9:10:11:11:0.52381:6:5:4:5:6:5:5:5
chr1	108113510	.	G	T	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0299677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.937;QD=10.1734;RBI=0.0300121;REFB=-0.0280872;REVB=0.00163195;RO=9;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.572962;STB=0.849948;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0475436;OID=.;OPOS=108113510;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:1:5:2:7:1:5:2:7
chr1	108113526	.	C	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0892696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.29;QD=45.8063;RBI=0.104162;REFB=0;REVB=0.053671;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00324742;OID=.;OPOS=108113526;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr1	108113856	.	G	A	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00205056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.136;QD=63.5826;RBI=0.0183739;REFB=0;REVB=0.0182592;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.69906e-05;OID=.;OPOS=108113856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr1	108113865	.	G	A	728.78	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00696069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.533;QD=57.1594;RBI=0.0277672;REFB=0;REVB=-0.0268806;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.77544e-05;OID=.;OPOS=108113865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:26:24:0:0:26:25:0:0
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chr1	108185309	.	G	A	484.77	PASS	AF=0.505376;AO=47;DP=94;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=-0.0043481;FXX=0.0106372;HRUN=5;LEN=1;MLLD=288.646;QD=20.8503;RBI=0.0162815;REFB=-0.00393104;REVB=-0.0156902;RO=46;SAF=24;SAR=23;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677243;STB=0.537461;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0029591;OID=.;OPOS=108185309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:46:46:47:47:0.505376:23:24:20:26:23:24:20:26
chr1	108313258	.	C	T	162.37	PASS	AF=0.255556;AO=23;DP=91;FAO=23;FDP=90;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=0.0124585;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8683;QD=7.21625;RBI=0.0179683;REFB=0.0034959;REVB=0.0129478;RO=65;SAF=16;SAR=7;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29041;STB=0.656517;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.00612554;OID=.;OPOS=108313258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:90:65:67:23:23:0.255556:7:16:30:35:7:16:33:34
chr1	108771721	.	T	C	104.15	PASS	AF=0.153285;AO=20;DP=136;FAO=21;FDP=137;FR=.;FRO=116;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=48;FSRR=68;FWDB=-0.0673581;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.15;QD=3.04077;RBI=0.0674154;REFB=-0.00741636;REVB=-0.00278012;RO=113;SAF=9;SAR=11;SRF=47;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043903;STB=0.512808;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0328337;OID=.;OPOS=108771721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:137:113:116:20:21:0.153285:11:9:47:66:12:9:48:68
chr1	109010230	.	G	A	102.61	PASS	AF=0.232877;AO=17;DP=74;FAO=17;FDP=73;FR=.;FRO=56;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=41;FWDB=0.0106583;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6415;QD=5.62257;RBI=0.0650352;REFB=-0.0161106;REVB=-0.0641559;RO=54;SAF=10;SAR=7;SRF=15;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372233;STB=0.732591;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0379457;OID=.;OPOS=109010230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:54:56:17:17:0.232877:7:10:15:39:7:10:15:41
chr1	109013193	.	ATTTTTTTTC	ATTTTTTC,ATTTTTTCTC,ATTTTTTTC,ATTTTTTTCT	55.3	PASS	AF=0,0.0512821,0.410256,0.025641;AO=4,2,9,3;DP=39;FAO=0,2,16,1;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=0,1,7,1;FSAR=0,1,9,0;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0414369,-0.0410302,-0.0791204,-0.169346;FXX=0;HRUN=8,8,8,8;LEN=2,1,1,2;MLLD=13.0033,211.74,6.74491,19.4839;QD=5.67165;RBI=0.0504817,0.0413922,0.095723,0.190123;REFB=-0.0231276,-0.00166497,-0.044052,-0.0207694;REVB=0.0288337,-0.00546237,0.0538783,-0.0864209;RO=15;SAF=2,1,3,3;SAR=2,1,6,0;SRF=5;SRR=10;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.191181,0.173623,0,0.682659;STB=0.5,0.590036,0.52125,0.991549;STBP=1,0.768,0.832,0.252;TYPE=del,snp,del,mnp;VARB=0.066045,0.0330129,-0.058808,0.0781825;OID=.,.,.,.;OPOS=109013194,109013200,109013194,109013201;OREF=TT,T,T,TC;OALT=-,C,-,CT;OMAPALT=ATTTTTTC,ATTTTTTCTC,ATTTTTTTC,ATTTTTTTCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0.0512821,0.410256,0.025641:4,2,9,3:39:0,2,16,1:39:20:0,1,7,1:0,1,9,0:8:12:40:15:2,1,3,3:2,1,6,0:5:10
chr1	109172200	.	T	C	321.17	PASS	AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.01073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.684;QD=16.2618;RBI=0.057293;REFB=-0.00437633;REVB=0.0562793;RO=43;SAF=21;SAR=14;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155794;STB=0.581586;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00602492;OID=.;OPOS=109172200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:43:44:35:35:0.443038:14:21:19:24:14:21:20:24
chr1	109173710	.	G	A	181.16	PASS	AF=0.413043;AO=18;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.0133159;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4369;QD=15.7528;RBI=0.0518435;REFB=0.0132719;REVB=-0.0501043;RO=27;SAF=12;SAR=6;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440337;STB=0.513355;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=-0.0298931;OID=.;OPOS=109173710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:18:19:0.413043:6:12:19:8:6:13:19:8
chr1	109265028	.	C	CT	1616.88	PASS	AF=1;AO=13;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0832025;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=57.7486;QD=53.0124;RBI=0.0836336;REFB=0;REVB=-0.00848058;RO=110;SAF=13;SAR=0;SRF=68;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.606448;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00017951;OID=.;OPOS=109265029;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:13:123:122:122:0:80:42:0:0:10:110:13:0:68:42
chr1	109265029	.	G	T	1917.44	PASS	AF=0.992063;AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=83;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00188076;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.1186;QD=60.8712;RBI=0.0073955;REFB=-0.121239;REVB=-0.00715236;RO=1;SAF=83;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00569076;STB=0.502994;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.000256426;OID=.;OPOS=109265029;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:126:126:1:1:125:125:0.992063:42:83:1:0:42:83:1:0
chr1	109268441	.	G	A	1764.04	PASS	AF=1;AO=114;DP=117;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.972;QD=59.7978;RBI=0.0687709;REFB=0;REVB=0.0611502;RO=0;SAF=75;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00220243;OID=.;OPOS=109268441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:118:0:0:114:118:1:39:75:0:0:42:76:0:0
chr1	109268573	.	T	C	1501.53	PASS	AF=0.980952;AO=99;DP=103;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.104066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3088;QD=57.2013;RBI=0.104342;REFB=-0.0748373;REVB=0.00757318;RO=1;SAF=45;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104245;STB=0.500838;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.000555769;OID=.;OPOS=109268573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:103:105:1:2:99:103:0.980952:54:45:1:0:56:47:1:1
chr1	109273456	.	A	G	570.81	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.133;QD=60.0853;RBI=0.123569;REFB=0;REVB=0.0403982;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000755496;OID=.;OPOS=109273456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:19:17:0:0:19:19:0:0
chr1	109289353	.	C	G	274.16	PASS	AF=0.956522;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.010912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4529;QD=47.6802;RBI=0.0679403;REFB=-0.0294865;REVB=0.0670583;RO=0;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.45803e-08;STB=0.513501;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0118467;OID=.;OPOS=109289353;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:23:0:1:21:22:0.956522:4:17:0:0:4:18:1:0
chr1	109338861	.	G	C	806.09	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0306641;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.665;QD=55.5922;RBI=0.0466798;REFB=0.0582422;REVB=0.0351955;RO=1;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145113;STB=0.50769;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.00123328;OID=.;OPOS=109338861;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:58:1:1:57:57:0.982759:32:25:0:1:32:25:0:1
chr1	109366286	.	C	T	235.12	PASS	AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0294228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3649;QD=13.6299;RBI=0.0294651;REFB=0.0140933;REVB=-0.0015786;RO=41;SAF=8;SAR=20;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251809;STB=0.644336;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.0171465;OID=.;OPOS=109366286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:41:41:28:28:0.405797:20:8:21:20:20:8:21:20
chr1	109369915	.	G	T	597.6	PASS	AF=0.606742;AO=47;DP=82;FAO=54;FDP=89;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00351838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.005;QD=26.8584;RBI=0.00479616;REFB=-0.0112007;REVB=0.00325948;RO=33;SAF=23;SAR=24;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491776;STB=0.513622;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00325411;OID=.;OPOS=109369915;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:89:33:35:47:54:0.606742:24:23:14:19:29:25:15:20
chr1	109395105	.	C	T	972.87	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.391;QD=58.962;RBI=0.0577611;REFB=0;REVB=0.0221107;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134594;OID=.;OPOS=109395105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:38:28:0:0:38:28:0:0
chr1	109477470	.	G	A	823.25	PASS	AF=0.557971;AO=76;DP=138;FAO=77;FDP=138;FR=.;FRO=61;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=17;FSRR=44;FWDB=0.0164939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7628;QD=23.8622;RBI=0.074457;REFB=-0.0273825;REVB=0.0726071;RO=60;SAF=37;SAR=39;SRF=17;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165843;STB=0.595183;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0134216;OID=.;OPOS=109477470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:60:61:76:77:0.557971:39:37:17:43:39:38:17:44
chr1	109486196	.	A	G	184.22	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0253931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.97;QD=18.8947;RBI=0.0319917;REFB=-0.00847619;REVB=0.0194593;RO=20;SAF=14;SAR=5;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193465;STB=0.610468;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0105872;OID=.;OPOS=109486196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:5:14:11:9:5:14:11:9
chr1	109656946	.	T	C	1513.41	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=4.2258e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.493;QD=59.9372;RBI=0.0561367;REFB=0;REVB=0.0561367;RO=0;SAF=51;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10484e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.40884e-05;OID=.;OPOS=109656946;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:50:51:0:0:50:51:0:0
chr1	109704618	.	A	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.804;QD=46.848;RBI=0.034383;REFB=0;REVB=0.00516664;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291803;OID=.;OPOS=109704618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0
chr1	109735298	.	T	C	837.94	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0282604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.551;QD=55.8629;RBI=0.029809;REFB=-0.169475;REVB=0.00948282;RO=0;SAF=40;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.7823e-08;STB=0.506171;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.000597427;OID=.;OPOS=109735298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:60:0:1:59:59:0.983333:19:40:0:0:19:40:1:0
chr1	109735416	.	A	C	533.31	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.103;QD=59.2571;RBI=0.0511091;REFB=0;REVB=0.0134164;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119879;OID=.;OPOS=109735416;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:36:0:0:34:36:1:12:22:0:0:14:22:0:0
chr1	109737063	.	C	T	339.63	PASS	AF=1;AO=21;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00163985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.158;QD=54.3411;RBI=0.0730339;REFB=0;REVB=0.0730154;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000418725;OID=.;OPOS=109737063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:21:25:1:10:11:0:0:11:14:0:0
chr1	109737090	.	G	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0216074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.72;QD=57.6796;RBI=0.0306853;REFB=0;REVB=0.0217878;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.16555e-06;OID=.;OPOS=109737090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr1	109737132	.	T	C	481.17	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00871908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.355;QD=58.3239;RBI=0.0100701;REFB=0;REVB=0.00503823;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136871;OID=.;OPOS=109737132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:17:15:0:0:17:16:0:0
chr1	109737172	.	C	T	436.14	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.934;QD=56.2765;RBI=0.0233743;REFB=0;REVB=-0.00179812;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00213006;OID=.;OPOS=109737172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:16:14:0:0:16:15:0:0
chr1	109742485	.	G	A	954.24	PASS	AF=0.957143;AO=66;DP=70;FAO=67;FDP=70;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0244551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.942;QD=54.5282;RBI=0.0680518;REFB=-0.0627857;REVB=0.0635059;RO=3;SAF=37;SAR=29;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00884326;STB=0.504347;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.000669008;OID=.;OPOS=109742485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:70:70:3:3:66:67:0.957143:29:37:2:1:29:38:2:1
chr1	109745618	.	T	C	1082.94	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2904;QD=59.339;RBI=0.0348651;REFB=0;REVB=0.0175121;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258977;OID=.;OPOS=109745618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:73:0:0:70:73:1:40:30:0:0:40:33:0:0
chr1	109771063	.	T	C	826.93	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189414;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.306;QD=56.0631;RBI=0.129936;REFB=-0.112915;REVB=0.128548;RO=1;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177973;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000485436;OID=.;OPOS=109771063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:60:59:1:0:58:59:1:26:32:0:1:27:32:0:0
chr1	109794252	.	T	C	919.03	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00023352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7401;QD=58.3511;RBI=0.0134696;REFB=0;REVB=-0.0134676;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.37458e-05;OID=.;OPOS=109794252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:31:32:0:0:31:32:0:0
chr1	109795608	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0781235;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.0691;QD=44.6896;RBI=0.100452;REFB=0;REVB=-0.0631447;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00573168;OID=.;OPOS=109795608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0
chr1	109806834	.	C	T	236.53	PASS	AF=0.75;AO=21;DP=28;FAO=21;FDP=28;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0127737;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=304.422;QD=33.7904;RBI=0.0164556;REFB=0.00493413;REVB=-0.010374;RO=7;SAF=3;SAR=18;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299269;STB=0.666481;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.00114107;OID=.;OPOS=109806834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:7:7:21:21:0.75:18:3:4:3:18:3:4:3
chr1	109807099	.	G	A	203.71	PASS	AF=0.329114;AO=26;DP=77;FAO=26;FDP=79;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=-0.00609256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.516;QD=10.3145;RBI=0.0375942;REFB=-0.00928699;REVB=-0.0370973;RO=51;SAF=18;SAR=8;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358841;STB=0.708096;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0227214;OID=.;OPOS=109807099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:79:51:53:26:26:0.329114:8:18:19:32:8:18:20:33
chr1	109810544	.	C	A	917.47	PASS	AF=0.5;AO=87;DP=179;FAO=92;FDP=184;FR=.;FRO=92;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=52;FSRR=40;FWDB=0.0450591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.858;QD=19.945;RBI=0.0450694;REFB=-0.0337932;REVB=-0.000964324;RO=89;SAF=37;SAR=50;SRF=51;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135674;STB=0.570754;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0352166;OID=.;OPOS=109810544;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:184:89:92:87:92:0.5:50:37:51:38:53:39:52:40
chr1	109816176	.	AG	CC,CG	267.06	PASS	AF=0.0952381,0.904762;AO=2,19;DP=21;FAO=2,19;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=0,5;FSAR=2,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000144384,-0.00792486;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=111.31,143.507;QD=50.8688;RBI=0.0103614,0.010756;REFB=0,0;REVB=0.0103604,0.00727236;RO=0;SAF=0,5;SAR=2,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.120684,-0.00268153;OID=.,.;OPOS=109816176,109816176;OREF=AG,A;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:21:21:0:0:2,19:2,19:0.0952381,0.904762:2,14:0,5:0:0:2,14:0,5:0:0
chr1	109818263	.	G	A	1445.6	PASS	AF=0.978947;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0260977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.088;QD=60.8675;RBI=0.0261162;REFB=-0.20355;REVB=-0.000984395;RO=1;SAF=48;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00977519;STB=0.50034;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.000534675;OID=.;OPOS=109818263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:95:95:1:2:93:93:0.978947:45:48:1:0:45:48:1:1
chr1	109825360	.	C	T	365.07	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00575684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.744;QD=52.1521;RBI=0.029538;REFB=-0.0800442;REVB=0.0289716;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516117;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00108884;OID=.;OPOS=109825360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:15:12:0:0:15:12:0:1
chr1	109836835	.	A	G	150.12	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0109054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.575;QD=19.3697;RBI=0.011422;REFB=-0.0133833;REVB=-0.00339642;RO=15;SAF=4;SAR=12;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018692;STB=0.510625;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0101702;OID=.;OPOS=109836835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:12:4:4:11:12:4:4:11
chr1	109836842	.	C	G	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0216833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.921;QD=21.2676;RBI=0.0581719;REFB=0.00207056;REVB=-0.0539797;RO=14;SAF=6;SAR=10;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804595;STB=0.533859;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=-0.000769435;OID=.;OPOS=109836842;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:16:17:0.548387:10:6:4:10:11:6:4:10
chr1	109838918	.	C	T	800.49	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00807932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7736;QD=57.1778;RBI=0.0332806;REFB=0;REVB=0.032285;RO=0;SAF=45;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251998;OID=.;OPOS=109838918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:11:45:0:0:11:45:0:0
chr1	109839433	.	A	G	1801.58	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00710596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.954;QD=61.0706;RBI=0.0201698;REFB=0;REVB=-0.0188766;RO=0;SAF=63;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.99301e-06;OID=.;OPOS=109839433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:118:0:0:117:118:1:54:63:0:0:54:64:0:0
chr1	109856306	.	G	A	339.96	PASS	AF=0.330769;AO=43;DP=130;FAO=43;FDP=130;FR=.;FRO=87;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=60;FSRR=27;FWDB=-0.0326312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4403;QD=10.4604;RBI=0.0461854;REFB=-0.0218064;REVB=-0.0326848;RO=84;SAF=25;SAR=18;SRF=58;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132532;STB=0.576237;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0382856;OID=.;OPOS=109856306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:84:87:43:43:0.330769:18:25:58:26:18:25:60:27
chr1	109856384	.	CAAAAAAG	ACAAAAAG,CAAAAAGC,CAAAAG	743.54	PASS	AF=0.0363636,0.0181818,0.945455;AO=2,2,35;DP=47;FAO=2,1,52;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1,18;FSAR=2,0,34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.076802,0.175852,0.096975;FXX=0.0350816;HRUN=1,6,6;LEN=2,2,2;MLLD=8.78448,6.33365,27.0751;QD=54.0753;RBI=0.121771,0.175863,0.1095;REFB=0,0,0;REVB=-0.0944962,0.00204032,-0.0508545;RO=0;SAF=0,2,13;SAR=2,0,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,4.39865e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,mnp,del;VARB=0.0521334,-0.0991399,0.00487167;OID=.,.,.;OPOS=109856384,109856390,109856385;OREF=CA,AG,AA;OALT=AC,GC,-;OMAPALT=ACAAAAAG,CAAAAAGC,CAAAAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/3:7:47:55:0:0:2,2,35:2,1,52:0.0363636,0.0181818,0.945455:2,0,22:0,2,13:0:0:2,0,34:0,1,18:0:0
chr1	109884775	.	T	G	1921.93	PASS	AF=0.984375;AO=126;DP=128;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0540494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2264;QD=60.0603;RBI=0.0861762;REFB=-0.0248862;REVB=0.0671192;RO=2;SAF=67;SAR=59;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139712;STB=0.507352;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00189549;OID=.;OPOS=109884775;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:128:128:2:2:126:126:0.984375:59:67:2:0:59:67:2:0
chr1	109897103	.	A	G	1472.74	PASS	AF=1;AO=92;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207169;FXX=0.0204061;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.6245;QD=61.364;RBI=0.0756642;REFB=-0.10206;REVB=0.0727728;RO=1;SAF=49;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108971;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00191164;OID=.;OPOS=109897103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:95:96:1:0:92:96:1:43:49:0:1:47:49:0:0
chr1	110134793	.	G	GT,T	36.01	PASS	AF=0.264706,0;AO=6,3;DP=36;FAO=9,0;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=6,0;FSAR=3,0;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.132636,-0.00969381;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,1;MLLD=11.6999,203.609;QD=4.23666;RBI=0.226504,0.0102669;REFB=-0.0435264,0.00427502;REVB=0.183608,0.00338221;RO=25;SAF=4,2;SAR=2,1;SRF=18;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0740925,-0.0673225;STB=0.545357,0.5;STBP=0.815,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0959158,0;OID=.,.;OPOS=110134794,110134793;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:36:34:25:25:6,3:9,0:0.264706,0:2,1:4,2:18:7:3,0:6,0:18:7
chr1	110136458	.	A	G	803.07	PASS	AF=0.967213;AO=58;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0333649;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.761;QD=52.6606;RBI=0.0434677;REFB=-0.00488891;REVB=0.0278608;RO=3;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533028;STB=0.518512;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00024661;OID=.;OPOS=110136458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:61:61:3:2:58:59:0.967213:25:33:0:3:26:33:0:2
chr1	110148974	.	C	T	1589.71	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0088069;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.14;QD=59.989;RBI=0.0281231;REFB=0;REVB=-0.0267085;RO=0;SAF=56;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.68722e-05;OID=.;OPOS=110148974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:50:56:0:0:50:56:0:0
chr1	110170896	.	T	C,G	1263.62	PASS	AF=0.952941,0.0352941;AO=81,4;DP=85;FAO=81,3;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=48,3;FSAR=33,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.021817,-0.012644;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=90.7096,111.563;QD=59.4645;RBI=0.0293435,0.0148635;REFB=-0.066964,-0.0467828;REVB=0.0196228,0.00781375;RO=0;SAF=48,4;SAR=33,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.28649e-08,0;STB=0.505153,0.5;STBP=0.5,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000728555,0.175299;OID=.,.;OPOS=110170896,110170896;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:85:85:0:1:81,4:81,3:0.952941,0.0352941:33,0:48,4:0:0:33,0:48,3:1:0
chr1	110201699	.	T	C	1504.61	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226761;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.1621;QD=57.8695;RBI=0.0555477;REFB=-0.0143358;REVB=-0.0507084;RO=0;SAF=45;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146612;OID=.;OPOS=110201699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:101:104:0:0:100:104:1:55:45:0:0:55:49:0:0
chr1	110201809	.	G	T	1248.5	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114957;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.929;QD=61.6541;RBI=0.0159193;REFB=0;REVB=-0.0110124;RO=0;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.46938e-06;OID=.;OPOS=110201809;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:50:31:0:0:50:31:0:0
chr1	110201812	.	A	G	1190.45	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.481;QD=61.0486;RBI=0.0561449;REFB=0;REVB=0.0442184;RO=0;SAF=32;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5329e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175246;OID=.;OPOS=110201812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:46:32:0:0:46:32:0:0
chr1	110210780	.	C	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.727;QD=50.4123;RBI=0.068507;REFB=0;REVB=0.0364354;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00050749;OID=.;OPOS=110210780;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr1	110279701	.	C	T	508.34	PASS	AF=0.972222;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0463456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.278;QD=56.4823;RBI=0.0822235;REFB=0.0396039;REVB=-0.0679175;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519988;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.000348955;OID=.;OPOS=110279701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:36:0:1:34:35:0.972222:11:23:0:0:12:23:0:1
chr1	110282972	.	G	T	911.98	PASS	AF=0.916667;AO=66;DP=72;FAO=66;FDP=72;FR=.;FRO=6;FSAF=19;FSAR=47;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0531775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.504;QD=50.6653;RBI=0.0535219;REFB=-0.191883;REVB=0.00606195;RO=1;SAF=19;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00994854;STB=0.552925;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00298873;OID=.;OPOS=110282972;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:72:72:1:6:66:66:0.916667:47:19:0:1:47:19:5:1
chr1	110295772	.	T	C	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00963363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.156;QD=57.5453;RBI=0.0896147;REFB=0;REVB=0.0890953;RO=0;SAF=40;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109471;OID=.;OPOS=110295772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:18:40:0:0:18:40:0:0
chr1	110300441	.	G	A	734.21	PASS	AF=1;AO=45;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00794994;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.172;QD=62.4857;RBI=0.0347254;REFB=0;REVB=0.0338031;RO=0;SAF=36;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.003242;OID=.;OPOS=110300441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:45:47:1:9:36:0:0:10:37:0:0
chr1	110300504	.	A	G	769.49	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7319;QD=56.9991;RBI=0.0574646;REFB=0;REVB=-0.0463933;RO=0;SAF=45;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000802754;OID=.;OPOS=110300504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:9:45:0:0:9:45:0:0
chr1	110466230	.	AGGGGGCA	ACGGGGCA,AGGGGCA,AGGGGCAG,AGGGGCGA	67.75	PASS	AF=0,0.542857,0,0;AO=2,9,2,4;DP=35;FAO=0,19,0,0;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=0,14,0,0;FSAR=0,5,0,0;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.13504,-0.0533672,-0.161038,-0.0991664;FXX=0;HRUN=5,5,5,5;LEN=1,1,3,2;MLLD=34.3431,9.50034,18.052,80.4807;QD=7.74321;RBI=0.135155,0.132258,0.17936,0.0994236;REFB=-0.033678,-0.144274,-0.112083,-0.00801564;REVB=0.00558648,0.121013,0.0789724,0.00714547;RO=14;SAF=2,6,2,4;SAR=0,3,0,0;SRF=2;SRR=12;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.731324,0.496607,0.731324,0.792716;STB=0.5,0.701974,0.5,0.5;STBP=1,0.015,1,1;TYPE=snp,del,mnp,mnp;VARB=0,0.166865,0.100326,0;OID=.,.,.,.;OPOS=110466231,110466231,110466235,110466235;OREF=G,G,GCA,GC;OALT=C,-,CAG,CG;OMAPALT=ACGGGGCA,AGGGGCA,AGGGGCAG,AGGGGCGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.542857,0,0:2,9,2,4:35:0,19,0,0:35:16:0,14,0,0:0,5,0,0:5:11:67:14:2,6,2,4:0,3,0,0:2:12
chr1	110466466	.	T	C	152.68	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0443641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6;QD=13.5719;RBI=0.101101;REFB=-0.017008;REVB=-0.0908478;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293769;STB=0.51074;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0259436;OID=.;OPOS=110466466;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:28:17:17:0.377778:10:7:10:16:10:7:12:16
chr1	110466555	.	G	A	355.16	PASS	AF=0.416667;AO=40;DP=99;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.0117336;FXX=0.0588178;HRUN=4;LEN=1;MLLD=153.976;QD=14.7983;RBI=0.0120674;REFB=-0.0208542;REVB=0.00281859;RO=52;SAF=20;SAR=20;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773729;STB=0.520823;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0241917;OID=.;OPOS=110466555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:96:52:56:40:40:0.416667:20:20:22:30:20:20:26:30
chr1	110466709	.	T	C	3929.81	PASS	AF=1;AO=254;DP=255;FAO=254;FDP=254;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=133;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0369596;FXX=0.00392141;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.124;QD=61.8868;RBI=0.0440907;REFB=0.0357478;REVB=-0.0240411;RO=1;SAF=121;SAR=133;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00392349;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000804516;OID=.;OPOS=110466709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:255:254:1:0:254:254:1:133:121:1:0:133:121:0:0
chr1	110466810	.	C	A	643.7	PASS	AF=0.46;AO=69;DP=156;FAO=69;FDP=150;FR=.;FRO=81;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=44;FWDB=0.0137575;FXX=0.0384591;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0323;QD=17.1654;RBI=0.027313;REFB=-0.0160674;REVB=0.0235952;RO=77;SAF=38;SAR=31;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792976;STB=0.55071;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0163583;OID=.;OPOS=110466810;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:150:77:81:69:69:0.46:31:38:36:41:31:38:37:44
chr1	110467745	.	A	G	1120.91	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00807539;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.754;QD=60.5898;RBI=0.0257304;REFB=0;REVB=-0.0244303;RO=0;SAF=44;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.78353e-05;OID=.;OPOS=110467745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:29:44:0:0:29:45:0:0
chr1	110884839	.	AAG	AA,A	425.73	PASS	AF=1,0;AO=32,5;DP=42;FAO=42,0;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141021,0.0910236;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=17.5119,5.98446;QD=40.5453;RBI=0.141295,0.174682;REFB=0,0;REVB=0.00880099,-0.149093;RO=1;SAF=15,0;SAR=17,5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.285418,0;SSSB=-0.0301077,-0.767767;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0047571,0;OID=.,.;OPOS=110884841,110884840;OREF=G,AG;OALT=-,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:32,5:42:42,0:42:0:19,0:23,0:0:0:8:1:15,0:17,5:1:0
chr1	110921715	.	T	G	497.02	PASS	AF=0.416667;AO=55;DP=132;FAO=55;FDP=132;FR=.;FRO=77;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=0.135823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1655;QD=15.0611;RBI=0.15225;REFB=0.00687855;REVB=0.0687901;RO=77;SAF=36;SAR=19;SRF=40;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146686;STB=0.582628;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.00855151;OID=.;OPOS=110921715;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:77:77:55:55:0.416667:19:36:40:37:19:36:40:37
chr1	110949720	.	C	T	437.88	PASS	AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.020895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7673;QD=21.6239;RBI=0.0242907;REFB=-0.0272763;REVB=-0.0123871;RO=38;SAF=22;SAR=21;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545568;STB=0.530106;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0173635;OID=.;OPOS=110949720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:38:38:43:43:0.530864:21:22:17:21:21:22:17:21
chr1	110950439	.	C	T	513.89	PASS	AF=0.459677;AO=52;DP=119;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=42;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=0.0415488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7045;QD=16.5769;RBI=0.0433436;REFB=-0.0319913;REVB=-0.0123438;RO=62;SAF=38;SAR=14;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201227;STB=0.614591;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0560722;OID=.;OPOS=110950439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:124:62:67:52:57:0.459677:14:38:34:28:15:42:37:30
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chr1	111060669	.	T	C	322.26	PASS	AF=0.507463;AO=21;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0125092;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.995;QD=19.2394;RBI=0.0228564;REFB=-0.00136205;REVB=0.0191294;RO=33;SAF=3;SAR=18;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334422;STB=0.553161;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.00170475;OID=.;OPOS=111060669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:33:33:21:34:0.507463:18:3:12:21:18:16:12:21
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chr1	111773568	.	G	C	350.82	PASS	AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0265238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0882;QD=20.6363;RBI=0.0419216;REFB=-0.0445055;REVB=0.0324639;RO=32;SAF=19;SAR=17;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765638;STB=0.542391;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0413211;OID=.;OPOS=111773568;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:17:19:14:18:17:19:14:18
chr1	111783982	.	C	T	317.68	PASS	AF=0.413043;AO=25;DP=95;FAO=38;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=54;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=16;FWDB=0.0573155;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3783;QD=13.8121;RBI=0.0844297;REFB=-0.0244095;REVB=-0.0619945;RO=55;SAF=17;SAR=8;SRF=38;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014738;STB=0.633418;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0327127;OID=.;OPOS=111783982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:92:55:54:25:38:0.413043:8:17:38:17:20:18:38:16
chr1	111783996	.	A	G	1549.16	PASS	AF=0.947368;AO=107;DP=115;FAO=108;FDP=114;FR=.;FRO=6;FSAF=61;FSAR=47;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00535248;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.115;QD=54.3564;RBI=0.0335481;REFB=-0.00420195;REVB=0.0331183;RO=0;SAF=61;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73491e-08;STB=0.514425;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.000566054;OID=.;OPOS=111783996;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:115:114:0:6:107:108:0.947368:46:61:0:0:47:61:5:1
chr1	111833488	.	C	CCT	1407.51	PASS	AF=0.978495;AO=89;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.000415867;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=286.002;QD=60.5381;RBI=0.0231277;REFB=-0.0568624;REVB=0.023124;RO=2;SAF=43;SAR=46;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215303;STB=0.511109;STBP=0.158;TYPE=ins;VARB=0.000327761;OID=.;OPOS=111833489;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.978495:89:93:91:93:2:44:47:2:0:4:2:43:46:2:0
chr1	111833517	.	G	A	1457.26	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0286799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7158;QD=62.0109;RBI=0.0478711;REFB=-0.1255;REVB=0.038329;RO=0;SAF=43;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504949;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.000787974;OID=.;OPOS=111833517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:0:1:93:93:0.989362:50:43:0:0:50:43:0:1
chr1	111857154	.	T	C	509.34	PASS	AF=0.545455;AO=48;DP=89;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=28;FWDB=0.012634;FXX=0.0329634;HRUN=4;LEN=1;MLLD=229.823;QD=23.1518;RBI=0.0132287;REFB=-0.0116978;REVB=0.00392179;RO=40;SAF=31;SAR=17;SRF=12;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284062;STB=0.656097;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00939575;OID=.;OPOS=111857154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:40:40:48:48:0.545455:17:31:12:28:17:31:12:28
chr1	111858444	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.03;QD=57.2025;RBI=0.0229976;REFB=0;REVB=0.0119231;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197651;OID=.;OPOS=111858444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0
chr1	111861841	.	A	G	282.39	PASS	AF=0.362637;AO=33;DP=91;FAO=33;FDP=91;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=0.0144995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.798;QD=12.4129;RBI=0.0185523;REFB=-0.0184342;REVB=0.0115737;RO=55;SAF=16;SAR=17;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730722;STB=0.545427;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0225793;OID=.;OPOS=111861841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:55:58:33:33:0.362637:17:16:23:32:17:16:24:34
chr1	111861974	.	T	C	234.41	PASS	AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0101911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.249;QD=13.0229;RBI=0.0112467;REFB=-0.00985503;REVB=-0.00475724;RO=44;SAF=22;SAR=6;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25356;STB=0.646943;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.016229;OID=.;OPOS=111861974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:44:44:28:28:0.388889:6:22:26:18:6:22:26:18
chr1	111862952	.	T	G	439.39	PASS	AF=0.483516;AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0498785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4893;QD=19.314;RBI=0.0647567;REFB=0.00134585;REVB=-0.0412985;RO=47;SAF=27;SAR=17;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582491;STB=0.532419;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=-0.00266956;OID=.;OPOS=111862952;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:47:47:44:44:0.483516:17:27:26:21:17:27:26:21
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chr1	111957097	.	C	G	790.32	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.947;QD=56.4513;RBI=0.022758;REFB=0;REVB=0.0191532;RO=0;SAF=43;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.98168e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000459227;OID=.;OPOS=111957097;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:12:43:0:0:12:44:0:0
chr1	111957311	.	G	C	126.95	PASS	AF=0.340909;AO=6;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0222477;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=92.7806;QD=11.5407;RBI=0.024849;REFB=0.00351757;REVB=-0.0110684;RO=23;SAF=4;SAR=2;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223454;STB=0.65541;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.0088259;OID=.;OPOS=111957311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:29:6:15:0.340909:2:4:11:12:11:4:14:15
chr1	111957688	.	T	C	233.47	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00287607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.298;QD=16.9796;RBI=0.0189821;REFB=-0.0304244;REVB=0.0187629;RO=29;SAF=16;SAR=10;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158196;STB=0.589166;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0264205;OID=.;OPOS=111957688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:29:26:26:0.472727:10:16:13:16:10:16:13:16
chr1	111957693	.	A	G	775.12	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4857;QD=56.372;RBI=0.0268501;REFB=0;REVB=0.0174562;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00154214;OID=.;OPOS=111957693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:55:0:0:52:55:1:24:28:0:0:25:30:0:0
chr1	111962256	.	G	T	588.77	PASS	AF=0.595506;AO=48;DP=84;FAO=53;FDP=89;FR=.;FRO=36;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0190608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.598;QD=26.4617;RBI=0.052376;REFB=-0.047387;REVB=0.0487846;RO=36;SAF=29;SAR=19;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147952;STB=0.552712;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0267838;OID=.;OPOS=111962256;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:89:36:36:48:53:0.595506:19:29:15:21:24:29:15:21
chr1	111964262	.	G	A	249.8	PASS	AF=0.482759;AO=26;DP=55;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.000712695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.645;QD=17.2277;RBI=0.00345046;REFB=-0.0148105;REVB=-0.00337605;RO=29;SAF=21;SAR=5;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195911;STB=0.554307;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0271712;OID=.;OPOS=111964262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:58:29:30:26:28:0.482759:5:21:19:10:7:21:20:10
chr1	111968121	.	C	T	152.81	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=24;FWDB=0.0237936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.266;QD=13.5831;RBI=0.0264954;REFB=-0.0226079;REVB=-0.0116564;RO=28;SAF=6;SAR=11;SRF=4;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274593;STB=0.656098;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0177974;OID=.;OPOS=111968121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:11:6:4:24:11:6:4:24
chr1	111969294	.	A	G	857.11	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0339472;FXX=0.0161264;HRUN=5;LEN=1;MLLD=269.133;QD=56.2036;RBI=0.0346736;REFB=0.00435496;REVB=-0.00706046;RO=1;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159958;STB=0.508194;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-3.16656e-05;OID=.;OPOS=111969294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:29:31:0:1:30:30:0:1
chr1	111969307	.	G	C	187.4	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0287085;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.604;QD=14.6982;RBI=0.0332093;REFB=-0.0297303;REVB=-0.0166937;RO=30;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395583;STB=0.522705;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0432356;OID=.;OPOS=111969307;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:12:9:14:16:12:9:14:16
chr1	111969719	.	A	G	352.14	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.409;QD=54.1757;RBI=0.0707525;REFB=0;REVB=0.0462565;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291436;OID=.;OPOS=111969719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:24:26:1:11:13:0:0:11:15:0:0
chr1	111991768	.	G	A	144.88	PASS	AF=0.380952;AO=11;DP=36;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0125133;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=165.265;QD=13.7984;RBI=0.0252255;REFB=-0.00277761;REVB=0.021903;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.72674;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0021312;OID=.;OPOS=111991768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:42:0:26:11:16:0.380952:10:1:0:0:11:5:18:8
chr1	111991845	.	C	A	2290.96	PASS	AF=0.974684;AO=154;DP=158;FAO=154;FDP=158;FR=.;FRO=4;FSAF=94;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0129386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.872;QD=57.9989;RBI=0.030231;REFB=-0.186831;REVB=0.0273223;RO=4;SAF=94;SAR=60;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181551;STB=0.50955;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.000663459;OID=.;OPOS=111991845;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:158:158:4:4:154:154:0.974684:60:94:1:3:60:94:1:3
chr1	111992019	.	T	A	278.95	PASS	AF=0.366071;AO=37;DP=107;FAO=41;FDP=112;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=41;FWDB=0.012079;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=38.381;QD=9.96262;RBI=0.0127745;REFB=-0.0115219;REVB=-0.0041574;RO=59;SAF=21;SAR=16;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154379;STB=0.602548;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0739732;OID=.;OPOS=111992019;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:112:59:71:37:41:0.366071:16:21:25:34:17:24:30:41
chr1	111992095	.	C	T	1542.52	PASS	AF=0.981308;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0364309;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6897;QD=57.6643;RBI=0.0519771;REFB=0.0129554;REVB=-0.0370731;RO=1;SAF=41;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114334;STB=0.502148;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=-0.00168767;OID=.;OPOS=111992095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:107:107:1:2:105:105:0.981308:64:41:1:0:64:41:1:1
chr1	112029193	.	A	G	474.13	PASS	AF=0.918919;AO=34;DP=37;FAO=34;FDP=37;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.015659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.648;QD=51.2576;RBI=0.0309454;REFB=0.0618019;REVB=0.0266911;RO=3;SAF=11;SAR=23;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111653;STB=0.559964;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.00250121;OID=.;OPOS=112029193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:37:37:3:3:34:34:0.918919:23:11:3:0:23:11:3:0
chr1	112042632	.	A	G	1208.59	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1505;QD=61.1945;RBI=0.0576548;REFB=0;REVB=0.0499175;RO=0;SAF=35;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000590591;OID=.;OPOS=112042632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:44:35:0:0:44:35:0:0
chr1	112251902	.	C	T	186.85	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.00476552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.729;QD=19.6682;RBI=0.0174646;REFB=-0.00174604;REVB=0.0168019;RO=19;SAF=9;SAR=10;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23132;STB=0.630007;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.000839735;OID=.;OPOS=112251902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:10:9:14:5:10:9:14:5
chr1	112269872	.	G	A	224.24	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.00258234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.164;QD=19.9322;RBI=0.0270773;REFB=-0.00482503;REVB=0.0269539;RO=23;SAF=8;SAR=14;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331526;STB=0.686112;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0103372;OID=.;OPOS=112269872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:14:8:17:6:14:8:17:6
chr1	112308953	.	T	C	154.94	PASS	AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0502132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.101;QD=22.9535;RBI=0.0539486;REFB=-0.00427602;REVB=0.0197251;RO=11;SAF=9;SAR=7;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143451;STB=0.580545;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.00282092;OID=.;OPOS=112308953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:11:11:16:16:0.592593:7:9:4:7:7:9:4:7
chr1	112308972	.	G	A	194.33	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0121093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.607;QD=24.2909;RBI=0.0203076;REFB=-0.00739484;REVB=-0.0163022;RO=12;SAF=13;SAR=6;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25187;STB=0.627447;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00186064;OID=.;OPOS=112308972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:12:13:19:19:0.59375:6:13:4:8:6:13:5:8
chr1	112539061	.	A	G	727.81	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.184;QD=63.288;RBI=0.0859004;REFB=0;REVB=0.0850753;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00043602;OID=.;OPOS=112539061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:26:19:0:0:27:19:0:0
chr1	112991698	.	T	C	288.3	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.88;QD=52.4173;RBI=0.056571;REFB=0;REVB=0.0183562;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278994;OID=.;OPOS=112991698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:22:0:0:20:22:1:9:11:0:0:11:11:0:0
chr1	112999227	.	G	A	785.82	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.052423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2776;QD=64.1483;RBI=0.0692318;REFB=0;REVB=-0.0452204;RO=0;SAF=34;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.01675e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00120782;OID=.;OPOS=112999227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:15:34:0:0:15:34:0:0
chr1	113000946	.	GGTCA	G	245.79	PASS	AF=0.833333;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=30;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0391643;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=276.849;QD=32.7718;RBI=0.0452343;REFB=-0.0340776;REVB=0.022634;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.562448;STBP=0.189;TYPE=del;VARB=0.00617266;OID=.;OPOS=113000947;OREF=GTCA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.833333:24:24:25:30:5:7:18:3:2:20:0:7:17:0:0
chr1	113063125	.	A	G	337.76	PASS	AF=0.411111;AO=37;DP=90;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.00370673;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.932;QD=15.0115;RBI=0.0306325;REFB=-0.0154562;REVB=-0.0304074;RO=49;SAF=24;SAR=13;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830365;STB=0.574266;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0181659;OID=.;OPOS=113063125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:49:53:37:37:0.411111:13:24:28:21:13:24:28:25
chr1	113083439	.	C	T	55.09	PASS	AF=0.470588;AO=7;DP=15;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0042508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.3149;QD=12.9613;RBI=0.018574;REFB=0.00506005;REVB=-0.0180811;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162992;STB=0.519951;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=-0.00191438;OID=.;OPOS=113083439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:15:17:8:9:7:8:0.470588:6:1:2:6:6:2:2:7
chr1	113098523	.	C	T	271.73	PASS	AF=0.363636;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=19;FWDB=0.0131455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.291;QD=12.3514;RBI=0.015055;REFB=-0.00262111;REVB=-0.00733814;RO=54;SAF=15;SAR=17;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235516;STB=0.620714;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00489743;OID=.;OPOS=113098523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:54:56:32:32:0.363636:17:15:37:17:17:15:37:19
chr1	113197203	.	A	G	494.16	PASS	AF=0.473214;AO=53;DP=112;FAO=53;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=0.0331237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4827;QD=17.6484;RBI=0.0420089;REFB=-0.0230044;REVB=0.0258374;RO=59;SAF=34;SAR=19;SRF=38;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00263885;STB=0.501466;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0248319;OID=.;OPOS=113197203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:59:59:53:53:0.473214:19:34:38:21:19:34:38:21
chr1	113236681	.	C	T	612.48	PASS	AF=0.578431;AO=59;DP=102;FAO=59;FDP=102;FR=.;FRO=43;FSAF=41;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.0147785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.767;QD=24.0188;RBI=0.0151548;REFB=-0.0189608;REVB=0.00335614;RO=43;SAF=41;SAR=18;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059337;STB=0.532456;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0224049;OID=.;OPOS=113236681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:43:43:59:59:0.578431:18:41:27:16:18:41:27:16
chr1	113237171	.	A	G	65.89	PASS	AF=0.391304;AO=10;DP=22;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.00527059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.734;QD=11.4592;RBI=0.00729862;REFB=-0.0205723;REVB=0.00504883;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151473;STB=0.646176;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.03929;OID=.;OPOS=113237171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:22:23:12:14:10:9:0.391304:4:6:9:3:4:5:11:3
chr1	113241052	.	T	C	259.15	PASS	AF=0.360465;AO=30;DP=85;FAO=31;FDP=86;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=16;FWDB=-0.00834565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.609;QD=12.0535;RBI=0.0120025;REFB=-0.0115947;REVB=0.00862617;RO=55;SAF=15;SAR=15;SRF=39;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236455;STB=0.624452;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0259638;OID=.;OPOS=113241052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:55:55:30:31:0.360465:15:15:39:16:15:16:39:16
chr1	113243048	.	C	T	260.15	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0382156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.61;QD=16.7837;RBI=0.0383436;REFB=-0.029622;REVB=-0.0031305;RO=33;SAF=22;SAR=7;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205986;STB=0.616736;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0184263;OID=.;OPOS=113243048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:7:22:19:14:7:22:19:14
chr1	113255389	.	C	T	1082.84	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00610168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.84;QD=59.3338;RBI=0.0223612;REFB=0;REVB=0.0215126;RO=0;SAF=46;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.50978e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.72336e-05;OID=.;OPOS=113255389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:25:46:0:0:27:46:0:0
chr1	113456546	.	A	T	676.88	PASS	AF=0.469388;AO=66;DP=145;FAO=69;FDP=147;FR=.;FRO=78;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=47;FSRR=31;FWDB=-0.00420483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.212;QD=18.4184;RBI=0.0198636;REFB=-0.0417163;REVB=-0.0194135;RO=75;SAF=41;SAR=25;SRF=44;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348353;STB=0.519935;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0353769;OID=.;OPOS=113456546;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:147:75:78:66:69:0.469388:25:41:44:31:25:44:47:31
chr1	113456734	.	C	T	117.75	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0174935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.042;QD=12.3947;RBI=0.071023;REFB=-0.00151308;REVB=-0.0688349;RO=24;SAF=5;SAR=9;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283311;STB=0.666433;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00263673;OID=.;OPOS=113456734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:9:5:15:9:9:5:15:9
chr1	113657092	.	A	C	447.48	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.873;QD=57.7395;RBI=0.0272518;REFB=0;REVB=0.0237369;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010766;OID=.;OPOS=113657092;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:11:19:0:0:11:20:0:0
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chr1	114449662	.	T	C	691.59	PASS	AF=0.57265;AO=67;DP=117;FAO=67;FDP=117;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.00598184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.381;QD=23.6439;RBI=0.0182881;REFB=-0.0105444;REVB=0.0172822;RO=50;SAF=26;SAR=41;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212568;STB=0.615957;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00702725;OID=.;OPOS=114449662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:50:50:67:67:0.57265:41:26:33:17:41:26:33:17
chr1	114505000	.	G	A	505.36	PASS	AF=0.602564;AO=47;DP=76;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0154776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.473;QD=25.9161;RBI=0.0652347;REFB=-0.00313619;REVB=-0.063372;RO=29;SAF=26;SAR=21;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728722;STB=0.545435;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.000740428;OID=.;OPOS=114505000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:78:29:31:47:47:0.602564:21:26:19:10:22:25:20:11
chr1	114515717	.	G	A	72.22	PASS	AF=0.636364;AO=6;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.015555;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.532;QD=26.261;RBI=0.0494409;REFB=-0.019543;REVB=0.0469302;RO=2;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144764;STB=0.571243;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0188408;OID=.;OPOS=114515717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:11:11:2:2:6:7:0.636364:1:5:2:0:1:6:2:0
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chr1	115590976	.	CCACACACAC	CCACACAC,CCACACACAT	444.24	PASS	AF=0.336364,0.145455;AO=18,15;DP=100;FAO=37,16;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=26,9;FSAR=11,7;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.00655358,0.0061332;FXX=0.0677909;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=129.253,100.223;QD=16.1541;RBI=0.0229108,0.0851378;REFB=-0.0401347,0.000508145;REVB=-0.0219535,-0.0849166;RO=47;SAF=14,8;SAR=4,7;SRF=17;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.487608,0.208963;STB=0.656163,0.582521;STBP=0.018,0.492;TYPE=del,snp;VARB=0.069444,0.0372644;OID=.,.;OPOS=115590977,115590985;OREF=CA,C;OALT=-,T;OMAPALT=CCACACAC,CCACACACAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.336364,0.145455:18,15:100:37,16:110:57:26,9:11,7:26:31:99:47:14,8:4,7:17:30
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chr1	116236351	.	T	G	324.8	PASS	AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00430138;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=319.98;QD=17.0949;RBI=0.00439228;REFB=-0.0106046;REVB=0.00088897;RO=41;SAF=10;SAR=25;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23526;STB=0.632573;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0135863;OID=.;OPOS=116236351;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:25:10:21:20:25:10:21:20
chr1	116239751	.	A	G	721.56	PASS	AF=0.458333;AO=77;DP=167;FAO=77;FDP=168;FR=.;FRO=91;FSAF=30;FSAR=47;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=-0.0274157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.466;QD=17.1801;RBI=0.0278298;REFB=-0.0245893;REVB=0.00478308;RO=88;SAF=30;SAR=47;SRF=46;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130273;STB=0.58168;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0193505;OID=.;OPOS=116239751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:168:88:91:77:77:0.458333:47:30:46:42:47:30:49:42
chr1	116243877	.	G	A	217.63	PASS	AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0342668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0648;QD=22.9084;RBI=0.047145;REFB=0.00618185;REVB=-0.0323796;RO=17;SAF=8;SAR=13;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259015;STB=0.514498;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=-0.00750712;OID=.;OPOS=116243877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:17:17:21:21:0.552632:13:8:7:10:13:8:7:10
chr1	116260532	.	A	T	399.3	PASS	AF=0.432692;AO=45;DP=104;FAO=45;FDP=104;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=0.0114075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.702;QD=15.3576;RBI=0.0125091;REFB=-0.0102455;REVB=-0.00513283;RO=58;SAF=24;SAR=21;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888116;STB=0.544022;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0115761;OID=.;OPOS=116260532;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:58:59:45:45:0.432692:21:24:36:22:21:24:36:23
chr1	116310967	.	T	C	339.16	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.0083133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.872;QD=17.8505;RBI=0.00884166;REFB=-0.0153691;REVB=0.00301064;RO=40;SAF=20;SAR=16;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115836;STB=0.56453;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.020632;OID=.;OPOS=116310967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:16:20:27:13:16:20:27:13
chr1	116382158	.	GAGGGG	GAGGG,GGGGG,GGGGGG,GGGGGT	296.21	PASS	AF=0.294118,0.392157,0,0.0392157;AO=14,9,9,2;DP=50;FAO=15,20,0,2;FDP=51;FR=.;FRO=14;FSAF=11,10,0,0;FSAR=4,10,0,2;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.158755,0.00563165,0.00328959,0.00656034;FXX=0;HRUN=5,1,1,1;LEN=1,1,1,5;MLLD=7.35214,154.119,153.833,110.537;QD=23.2321;RBI=0.241025,0.00643766,0.00846195,0.0108218;REFB=-0.153575,-0.0201158,-0.0148592,-0.014751;REVB=0.181356,-0.00311899,-0.00779636,0.00860654;RO=14;SAF=11,2,7,0;SAR=3,7,2,2;SRF=5;SRR=9;SSEN=0.414179,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.403655,-0.172341,0.435168,-0.497441;STB=0.690557,0.558765,0.5,0.993186;STBP=0.049,0.448,1,0.296;TYPE=del,del,snp,mnp;VARB=0.176624,0.00801794,-0.00876666,0.0188924;OID=.,.,.,.;OPOS=116382160,116382159,116382159,116382159;OREF=G,A,A,AGGGG;OALT=-,-,G,GGGGT;OMAPALT=GAGGG,GGGGG,GGGGGG,GGGGGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.294118,0.392157,0,0.0392157:14,9,9,2:50:15,20,0,2:51:14:11,10,0,0:4,10,0,2:5:9:99:14:11,2,7,0:3,7,2,2:5:9
chr1	116382318	.	A	G	659.37	PASS	AF=0.532787;AO=64;DP=122;FAO=65;FDP=122;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.0306004;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7071;QD=21.6187;RBI=0.0559137;REFB=-0.0373873;REVB=-0.046797;RO=57;SAF=34;SAR=30;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.056423;STB=0.534472;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0258151;OID=.;OPOS=116382318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:57:57:64:65:0.532787:30:34:34:23:31:34:34:23
chr1	116382511	.	A	T	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4487;QD=59.1422;RBI=0.0254213;REFB=0;REVB=0.0175289;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223857;OID=.;OPOS=116382511;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:38:29:0:0:38:29:0:0
chr1	116382778	.	T	C	1116.94	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6681;QD=60.3752;RBI=0.0576274;REFB=0;REVB=0.028944;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000391254;OID=.;OPOS=116382778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0
chr1	116383300	.	T	C	57.12	PASS	AF=0.875;AO=6;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00677833;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=64.3926;QD=28.5582;RBI=0.0104431;REFB=-0.163588;REVB=-0.00794432;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5554;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0161757;OID=.;OPOS=116383300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:0:1:6:7:0.875:3:3:0:0:4:3:0:1
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chr1	116384580	.	C	T	324.17	PASS	AF=0.430233;AO=35;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0126406;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.2033;QD=15.0778;RBI=0.0129119;REFB=-0.0330919;REVB=0.00263271;RO=51;SAF=21;SAR=14;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338672;STB=0.513611;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0546416;OID=.;OPOS=116384580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:51:49:35:37:0.430233:14:21:29:22:15:22:28:21
chr1	116385122	.	T	C	86.85	PASS	AF=0.714286;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00436772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.49;QD=24.8132;RBI=0.0632302;REFB=0.00826917;REVB=0.0630792;RO=4;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253827;STB=0.642594;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=-0.00293537;OID=.;OPOS=116385122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:14:14:4:4:10:10:0.714286:5:5:4:0:5:5:4:0
chr1	116385288	.	C	T	152.36	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0225899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.741;QD=21.0152;RBI=0.0579369;REFB=-0.00804475;REVB=0.0533515;RO=13;SAF=10;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132778;STB=0.575126;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00660321;OID=.;OPOS=116385288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:6:10:6:7:6:10:6:7
chr1	116385467	.	A	G	146.33	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0104527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.378;QD=16.7233;RBI=0.0250599;REFB=-0.00593574;REVB=-0.0227758;RO=19;SAF=11;SAR=5;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557722;STB=0.531876;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.00943891;OID=.;OPOS=116385467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:5:11:14:5:5:11:14:5
chr1	116386011	.	G	A	464.54	PASS	AF=0.632353;AO=43;DP=68;FAO=43;FDP=68;FR=.;FRO=25;FSAF=35;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00781376;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.452;QD=27.3259;RBI=0.0108306;REFB=0.01131;REVB=-0.00749982;RO=25;SAF=35;SAR=8;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134412;STB=0.573733;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=-0.0106497;OID=.;OPOS=116386011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:25:25:43:43:0.632353:8:35:17:8:8:35:17:8
chr1	116386105	.	G	A	466.75	PASS	AF=0.422764;AO=52;DP=123;FAO=52;FDP=123;FR=.;FRO=71;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=42;FSRR=29;FWDB=-0.00125544;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8163;QD=15.179;RBI=0.0489476;REFB=-0.00287068;REVB=-0.0489315;RO=70;SAF=33;SAR=19;SRF=42;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376849;STB=0.52641;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.00413538;OID=.;OPOS=116386105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:70:71:52:52:0.422764:19:33:42:28:19:33:42:29
chr1	116386139	.	G	A	2649.97	PASS	AF=1;AO=145;DP=173;FAO=173;FDP=173;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=88;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0468932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.4354;QD=61.271;RBI=0.0635634;REFB=0;REVB=0.0429107;RO=0;SAF=77;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00698779;OID=.;OPOS=116386139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:173:173:0:0:145:173:1:68:77:0:0:85:88:0:0
chr1	116386243	.	C	T	1102.28	PASS	AF=0.480687;AO=111;DP=231;FAO=112;FDP=233;FR=.;FRO=121;FSAF=51;FSAR=61;FSRF=40;FSRR=81;FWDB=-0.0668355;FXX=0.00851028;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6013;QD=18.9233;RBI=0.0714401;REFB=-0.0105845;REVB=-0.0252329;RO=119;SAF=50;SAR=61;SRF=38;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126487;STB=0.566079;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0128837;OID=.;OPOS=116386243;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:231:233:119:121:111:112:0.480687:61:50:38:81:61:51:40:81
chr1	116534852	.	C	T	1169.48	PASS	AF=0.578378;AO=107;DP=185;FAO=107;FDP=185;FR=.;FRO=78;FSAF=47;FSAR=60;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=0.0102294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.737;QD=25.2861;RBI=0.0258827;REFB=-0.0302853;REVB=0.0237755;RO=77;SAF=47;SAR=60;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0821685;STB=0.547381;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0236398;OID=.;OPOS=116534852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:185:185:77:78:107:107:0.578378:60:47:42:35:60:47:43:35
chr1	116569530	.	G	C	2310.21	PASS	AF=1;AO=143;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0876;QD=63.2933;RBI=0.0463926;REFB=0;REVB=0.0444064;RO=0;SAF=77;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.14598e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000796401;OID=.;OPOS=116569530;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:146:146:0:0:143:146:1:66:77:0:0:67:79:0:0
chr1	116609185	.	G	A	717.18	PASS	AF=0.518519;AO=69;DP=133;FAO=70;FDP=135;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=-0.0185151;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.262;QD=21.2498;RBI=0.0377923;REFB=-0.00728221;REVB=0.0329462;RO=64;SAF=33;SAR=36;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736401;STB=0.53276;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.00691216;OID=.;OPOS=116609185;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:135:64:65:69:70:0.518519:36:33:36:28:36:34:36:29
chr1	116610388	.	A	G	785.16	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0568106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5948;QD=57.1028;RBI=0.0641825;REFB=0;REVB=0.0298653;RO=0;SAF=16;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000599889;OID=.;OPOS=116610388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:39:16:0:0:39:16:0:0
chr1	116670774	.	A	G	246.58	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00102431;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.68;QD=23.4838;RBI=0.0117274;REFB=-0.0145307;REVB=0.0116826;RO=18;SAF=15;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081333;STB=0.535683;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.00973108;OID=.;OPOS=116670774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:18:19:23:23:0.547619:8:15:10:8:8:15:11:8
chr1	116769830	.	A	C	215.11	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0173843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0834;QD=21.5107;RBI=0.0183946;REFB=0.0144182;REVB=-0.00601222;RO=19;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17051;STB=0.595654;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.013471;OID=.;OPOS=116769830;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:12:9:12:7:12:9:12:7
chr1	117102649	.	C	T	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0679113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2023;QD=58.1416;RBI=0.0707781;REFB=0;REVB=-0.0199397;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00154121;OID=.;OPOS=117102649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr1	117122130	.	T	C	1159.16	PASS	AF=0.862745;AO=86;DP=104;FAO=88;FDP=102;FR=.;FRO=14;FSAF=57;FSAR=31;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.017079;FXX=0.0285687;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.063;QD=45.4573;RBI=0.0171572;REFB=0.00401348;REVB=-0.00163578;RO=0;SAF=56;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10353e-08;STB=0.542589;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.000378246;OID=.;OPOS=117122130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:104:102:0:14:86:88:0.862745:30:56:0:0:31:57:5:9
chr1	117142613	.	C	T	41.53	PASS	AF=0.118421;AO=9;DP=76;FAO=9;FDP=76;FR=.;FRO=67;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=0.011004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0485;QD=2.18583;RBI=0.0816492;REFB=-0.00136409;REVB=0.0809043;RO=67;SAF=7;SAR=2;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289419;STB=0.717432;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.013543;OID=.;OPOS=117142613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:76:76:67:67:9:9:0.118421:2:7:37:30:2:7:37:30
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chr1	117150933	.	G	A	190.99	PASS	AF=0.347826;AO=24;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=0.00907011;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.491;QD=11.072;RBI=0.0268094;REFB=-0.0202577;REVB=-0.0252285;RO=42;SAF=11;SAR=13;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252729;STB=0.647572;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0179816;OID=.;OPOS=117150933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:45:24:24:0.347826:13:11:29:13:13:11:31:14
chr1	117156418	.	G	A	173.24	PASS	AF=0.315068;AO=22;DP=73;FAO=23;FDP=73;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=16;FWDB=-0.0133454;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.697;QD=9.49271;RBI=0.0174557;REFB=-0.0178265;REVB=-0.0112517;RO=50;SAF=16;SAR=6;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0669558;STB=0.512524;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0508902;OID=.;OPOS=117156418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:50:50:22:23:0.315068:6:16:34:16:7:16:34:16
chr1	117156459	.	C	T	161.99	PASS	AF=0.235294;AO=23;DP=101;FAO=24;FDP=102;FR=.;FRO=78;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=50;FSRR=28;FWDB=0.0572563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8173;QD=6.35242;RBI=0.0575836;REFB=-0.0151066;REVB=-0.00613134;RO=77;SAF=16;SAR=7;SRF=49;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834161;STB=0.559159;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0501159;OID=.;OPOS=117156459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:77:78:23:24:0.235294:7:16:49:28:7:17:50:28
chr1	117156490	.	T	C	142.79	PASS	AF=0.206897;AO=24;DP=112;FAO=24;FDP=116;FR=.;FRO=92;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=58;FSRR=34;FWDB=-0.040383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7656;QD=4.92387;RBI=0.0613982;REFB=-0.0169081;REVB=-0.0462487;RO=87;SAF=17;SAR=7;SRF=54;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123917;STB=0.570315;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0552407;OID=.;OPOS=117156490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:116:87:92:24:24:0.206897:7:17:54:33:7:17:58:34
chr1	117156584	.	TG	CA	44.95	PASS	AF=0.130435;AO=8;DP=68;FAO=9;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=60;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=-0.0407141;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=203.697;QD=2.60601;RBI=0.07129;REFB=-0.00503538;REVB=-0.0585203;RO=34;SAF=3;SAR=5;SRF=30;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.599468;STB=0.660046;STBP=0.344;TYPE=mnp;VARB=0.0455774;OID=.;OPOS=117156584;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:68:69:34:60:8:9:0.130435:5:3:30:4:5:4:38:22
chr1	117487710	.	AT	GA	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217277;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=236.862;QD=58.1419;RBI=0.0281128;REFB=0;REVB=0.0178392;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000144206;OID=.;OPOS=117487710;OREF=AT;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr1	117503940	.	G	A	325.67	PASS	AF=0.404494;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.00238978;FXX=0.0111099;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.39;QD=14.6369;RBI=0.0106464;REFB=-0.00275061;REVB=-0.0103748;RO=52;SAF=22;SAR=14;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163286;STB=0.504585;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.00380166;OID=.;OPOS=117503940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:52:53:36:36:0.404494:14:22:31:21:14:22:32:21
chr1	117529458	.	G	A	518.48	PASS	AF=0.478261;AO=54;DP=115;FAO=55;FDP=115;FR=.;FRO=60;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=-0.0137496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.989;QD=18.0339;RBI=0.0190589;REFB=-0.00846074;REVB=0.0131982;RO=58;SAF=36;SAR=18;SRF=40;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243864;STB=0.516334;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.00885415;OID=.;OPOS=117529458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:58:60:54:55:0.478261:18:36:40:18:18:37:42:18
chr1	117530273	.	A	G	53.68	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0789006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8558;QD=7.95217;RBI=0.079958;REFB=0.0128906;REVB=-0.0129606;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149147;STB=0.592369;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.0103221;OID=.;OPOS=117530273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:4:4:7:12:4:4:7:12
chr1	117559726	.	A	G	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000475466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.353;QD=59.143;RBI=0.0212918;REFB=0;REVB=-0.0212865;RO=0;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.1728e-05;OID=.;OPOS=117559726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:32:35:0:0:32:35:0:0
chr1	117560818	.	A	G	175.14	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0037644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4768;QD=20.0161;RBI=0.0323601;REFB=0.0063343;REVB=0.0321404;RO=17;SAF=6;SAR=12;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0986999;STB=0.555497;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=-0.00558262;OID=.;OPOS=117560818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:12:6:4:13:12:6:4:13
chr1	117560929	.	C	A	555.06	PASS	AF=0.525253;AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=99;FR=.;FRO=47;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=37;FWDB=-0.00235402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.865;QD=22.4268;RBI=0.00559358;REFB=-0.00393449;REVB=0.00507412;RO=46;SAF=33;SAR=19;SRF=10;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345788;STB=0.693363;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00697333;OID=.;OPOS=117560929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:46:47:52:52:0.525253:19:33:10:36:19:33:10:37
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chr1	117715026	.	C	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00463715;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.619;QD=61.684;RBI=0.0104331;REFB=0;REVB=0.00934589;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2343e-05;OID=.;OPOS=117715026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr1	117785931	.	G	A,T	767.18	PASS	AF=0.98,0.02;AO=45,2;DP=47;FAO=49,1;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=32,0;FSAR=17,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198981,-0.0281141;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=107.717,20.4779;QD=61.3747;RBI=0.0263581,0.0286467;REFB=0,0;REVB=0.0172863,0.00549838;RO=0;SAF=28,1;SAR=17,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000242982,0.0647832;OID=.,.;OPOS=117785931,117785931;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:47:50:0:0:45,2:49,1:0.98,0.02:17,1:28,1:0:0:17,1:32,0:0:0
chr1	117785979	.	T	C	609.93	PASS	AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0278508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8611;QD=56.7374;RBI=0.0535908;REFB=0.023695;REVB=0.0457855;RO=2;SAF=24;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375076;STB=0.51999;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.00302671;OID=.;OPOS=117785979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:43:43:2:2:41:41:0.953488:17:24:2:0:17:24:2:0
chr1	118065841	.	A	G	584.68	PASS	AF=0.552381;AO=58;DP=105;FAO=58;FDP=105;FR=.;FRO=47;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.00678957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.894;QD=22.2734;RBI=0.0162159;REFB=-0.0277537;REVB=-0.0147261;RO=46;SAF=31;SAR=27;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249894;STB=0.518022;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0238326;OID=.;OPOS=118065841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:46:47:58:58:0.552381:27:31:26:20:27:31:27:20
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chr1	118165691	.	C	G	450.39	PASS	AF=0.522727;AO=40;DP=82;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0192453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.778;QD=20.4723;RBI=0.0743964;REFB=-0.0270206;REVB=0.071864;RO=42;SAF=22;SAR=18;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462167;STB=0.510381;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0310778;OID=.;OPOS=118165691;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:88:42:42:40:46:0.522727:18:22:21:21:24:22:21:21
chr1	118165973	.	C	T	1536.6	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357172;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.978;QD=63.3651;RBI=0.0373317;REFB=0;REVB=0.0108601;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144977;OID=.;OPOS=118165973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:97:0:0:95:97:1:44:51:0:0:45:52:0:0
chr1	118166096	.	C	T	711.11	PASS	AF=0.59292;AO=64;DP=111;FAO=67;FDP=113;FR=.;FRO=46;FSAF=43;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0325902;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.101;QD=25.172;RBI=0.0335191;REFB=-0.0445895;REVB=-0.00783634;RO=47;SAF=40;SAR=24;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753575;STB=0.551574;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0344737;OID=.;OPOS=118166096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:113:47:46:64:67:0.59292:24:40:25:22:24:43:24:22
chr1	118166750	.	A	G,T	562.81	PASS	AF=0.974359,0.025641;AO=35,3;DP=39;FAO=38,1;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18,0;FSAR=20,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00485221,-0.0146825;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=75.3269,134.004;QD=57.7245;RBI=0.00672461,0.0371619;REFB=-0.110764,-0.0911922;REVB=0.0046558,-0.0341384;RO=1;SAF=16,2;SAR=19,1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0239852,0.266641;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00450402,0.127647;OID=.,.;OPOS=118166750,118166750;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:39:39:1:0:35,3:38,1:0.974359,0.025641:19,1:16,2:0:1:20,1:18,0:0:0
chr1	118166904	.	CCT	C	200.98	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.00676059;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=261.355;QD=14.617;RBI=0.0263054;REFB=-0.0194811;REVB=0.0254218;RO=28;SAF=16;SAR=12;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099546;STB=0.567521;STBP=0.343;TYPE=del;VARB=0.0176768;OID=.;OPOS=118166905;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.509091:28:56:28:55:27:16:12:19:8:99:28:16:12:19:9
chr1	118167653	.	C	T	246.67	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00214335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.733;QD=15.9143;RBI=0.0257439;REFB=-0.00349485;REVB=-0.0256545;RO=33;SAF=18;SAR=10;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00676758;STB=0.514915;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.00459405;OID=.;OPOS=118167653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:34:28:28:0.451613:10:18:21:12:10:18:21:13
chr1	118168612	.	C	CAAA	69.41	PASS	AF=0.342857;AO=11;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0103113;FXX=0.0789266;HRUN=2;LEN=3;MLLD=51.6682;QD=7.93275;RBI=0.010424;REFB=0.0044181;REVB=-0.00152901;RO=23;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225056;STB=0.653587;STBP=0.21;TYPE=ins;VARB=-0.0104424;OID=.;OPOS=118168613;OREF=-;OALT=AAA;OMAPALT=CAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.342857:11:35:12:35:23:8:4:10:13:69:23:7:4:10:13
chr1	118168826	.	C	T	116.31	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.0014972;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.425;QD=11.0772;RBI=0.0112635;REFB=-0.00772107;REVB=0.0111636;RO=27;SAF=11;SAR=3;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699158;STB=0.565321;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0205501;OID=.;OPOS=118168826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:27:28:14:14:0.333333:3:11:20:7:3:11:20:8
chr1	118494625	.	C	T	531.24	PASS	AF=0.509259;AO=55;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.00700071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7567;QD=19.6755;RBI=0.0434728;REFB=-0.00470351;REVB=-0.0429054;RO=53;SAF=38;SAR=17;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239543;STB=0.63261;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00331379;OID=.;OPOS=118494625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:53:53:55:55:0.509259:17:38:23:30:17:38:23:30
chr1	118530796	.	C	T	344.01	PASS	AF=0.440476;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0117773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.313;QD=16.3816;RBI=0.0237696;REFB=-0.0137443;REVB=-0.0206468;RO=47;SAF=25;SAR=12;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152691;STB=0.586159;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0141178;OID=.;OPOS=118530796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:47:47:37:37:0.440476:12:25:25:22:12:25:25:22
chr1	118537074	.	A	G	1738.52	PASS	AF=1;AO=101;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=64;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00783179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.601;QD=60.4704;RBI=0.0322462;REFB=0;REVB=0.0312807;RO=0;SAF=56;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460276;OID=.;OPOS=118537074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:115:0:0:101:115:1:45:56:0:0:51:64:0:0
chr1	118624123	.	C	T	515.45	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.187;QD=58.9088;RBI=0.0190795;REFB=0;REVB=0.0159726;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.84325e-05;OID=.;OPOS=118624123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:17:17:0:0:17:18:0:0
chr1	118629599	.	G	A	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00322151;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.345;QD=59.6793;RBI=0.0249252;REFB=0;REVB=0.0247162;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.96535e-05;OID=.;OPOS=118629599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:34:36:0:0:34:36:0:0
chr1	118644430	.	A	G	974.55	PASS	AF=1;AO=65;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00802103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2738;QD=58.1821;RBI=0.043728;REFB=0;REVB=-0.042986;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000363268;OID=.;OPOS=118644430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:65:67:1:38:27:0:0:38:29:0:0
chr1	118657952	.	C	T	1826.09	PASS	AF=1;AO=121;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.989;QD=58.9062;RBI=0.0396093;REFB=-0.0147957;REVB=-0.0061513;RO=3;SAF=54;SAR=67;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256562;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487453;OID=.;OPOS=118657952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:124:124:3:0:121:124:1:67:54:3:0:67:57:0:0
chr1	118807059	.	T	C	1197.01	PASS	AF=0.9875;AO=78;DP=81;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00537701;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.473;QD=59.8507;RBI=0.0114733;REFB=-0.117002;REVB=0.0101353;RO=1;SAF=43;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108815;STB=0.505746;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=9.62582e-05;OID=.;OPOS=118807059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:80:1:1:78:79:0.9875:35:43:1:0:36:43:1:0
chr1	119427454	.	G	A	362.2	PASS	AF=0.463415;AO=38;DP=83;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0132621;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.37;QD=17.6683;RBI=0.020878;REFB=-0.0146994;REVB=-0.0161247;RO=43;SAF=21;SAR=17;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0831965;STB=0.552604;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0186327;OID=.;OPOS=119427454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:43:44:38:38:0.463415:17:21:20:23:17:21:20:24
chr1	119923724	.	T	C	797.19	PASS	AF=0.582677;AO=74;DP=127;FAO=74;FDP=127;FR=.;FRO=53;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.000818775;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.709;QD=25.1082;RBI=0.00869184;REFB=-0.0133705;REVB=0.00865318;RO=52;SAF=44;SAR=30;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470999;STB=0.520457;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00983297;OID=.;OPOS=119923724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:52:53:74:74:0.582677:30:44:34:18:30:44:34:19
chr1	120057158	.	C	T	254.25	PASS	AF=0.329787;AO=31;DP=94;FAO=31;FDP=94;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=-0.00270787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.682;QD=10.819;RBI=0.0101841;REFB=-0.0100712;REVB=0.00981748;RO=63;SAF=18;SAR=13;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845262;STB=0.549205;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0160957;OID=.;OPOS=120057158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:63:63:31:31:0.329787:13:18:32:31:13:18:32:31
chr1	120057246	.	C	A	746.57	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.046343;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.4541;QD=63.5378;RBI=0.113874;REFB=0;REVB=-0.104017;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00198189;OID=.;OPOS=120057246;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr1	120164738	.	C	T	1444.02	PASS	AF=0.980769;AO=99;DP=102;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0427616;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.1972;QD=55.5394;RBI=0.145094;REFB=-0.146321;REVB=0.138649;RO=3;SAF=43;SAR=56;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0131553;STB=0.510867;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.003912;OID=.;OPOS=120164738;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:102:104:3:2:99:102:0.980769:56:43:2:1:57:45:2:0
chr1	120166681	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0284082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.749;QD=51.9167;RBI=0.0305181;REFB=0;REVB=-0.0111503;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000239218;OID=.;OPOS=120166681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr1	120267544	.	C	T	191.03	PASS	AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0114455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2958;QD=13.4053;RBI=0.0592365;REFB=-0.00386867;REVB=-0.0581203;RO=33;SAF=11;SAR=12;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00678824;STB=0.512966;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00431773;OID=.;OPOS=120267544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:34:23:23:0.403509:12:11:16:17:12:11:17:17
chr1	120285546	.	G	A	2299.43	PASS	AF=0.993506;AO=150;DP=154;FAO=153;FDP=154;FR=.;FRO=1;FSAF=86;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00690028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.013;QD=59.7256;RBI=0.00996995;REFB=-0.00266585;REVB=0.00719625;RO=2;SAF=84;SAR=66;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00152322;STB=0.50289;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=2.40442e-05;OID=.;OPOS=120285546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:154:154:2:1:150:153:0.993506:66:84:1:1:67:86:1:0
chr1	120291724	.	G	A	787.8	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355794;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.576;QD=64.3104;RBI=0.0467776;REFB=0;REVB=0.0303685;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320601;OID=.;OPOS=120291724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0
chr1	120378678	.	C	T	375.19	PASS	AF=0.40367;AO=44;DP=109;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=-0.00852772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6416;QD=13.7685;RBI=0.00875165;REFB=0.00445593;REVB=0.00196707;RO=64;SAF=19;SAR=25;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00606571;STB=0.508686;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=-0.00389036;OID=.;OPOS=120378678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:64:65:44:44:0.40367:25:19:28:36:25:19:29:36
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chr1	120387120	.	G	A	310.75	PASS	AF=0.388889;AO=34;DP=89;FAO=35;FDP=90;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0600414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6935;QD=13.8113;RBI=0.0680944;REFB=0.0118679;REVB=0.0321228;RO=55;SAF=17;SAR=17;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491789;STB=0.536441;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-0.0206933;OID=.;OPOS=120387120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:55:55:34:35:0.388889:17:17:25:30:17:18:25:30
chr1	120539331	.	C	T	345.07	PASS	AF=0.346774;AO=43;DP=124;FAO=43;FDP=124;FR=.;FRO=81;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.0155461;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.9;QD=11.1313;RBI=0.024681;REFB=-0.0132232;REVB=0.0191696;RO=81;SAF=23;SAR=20;SRF=41;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326847;STB=0.518788;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.0215867;OID=.;OPOS=120539331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:81:81:43:43:0.346774:20:23:41:40:20:23:41:40
chr1	120927147	.	C	G	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0234593;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.597;QD=12.3961;RBI=0.0236504;REFB=0.0197477;REVB=0.00300072;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162496;STB=0.599599;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.0159782;OID=.;OPOS=120927147;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:2:3:2:3:2:3
chr1	121116688	.	A	G	336.16	PASS	AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0219331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6196;QD=17.2389;RBI=0.0656897;REFB=-0.0124777;REVB=0.0619199;RO=41;SAF=17;SAR=19;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380447;STB=0.51497;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.00758911;OID=.;OPOS=121116688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:41:42:36:36:0.461538:19:17:21:20:19:17:21:21
chr1	142667306	.	C	T	69.76	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.154772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.869;QD=17.4393;RBI=0.156575;REFB=-0.0174711;REVB=-0.0236911;RO=7;SAF=2;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092312;STB=0.553081;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.012062;OID=.;OPOS=142667306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:7:2:1:6:7:2:1:6
chr1	144014051	.	G	A	303.26	PASS	AF=0.277027;AO=41;DP=148;FAO=41;FDP=148;FR=.;FRO=107;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=62;FSRR=45;FWDB=0.0494061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9527;QD=8.19624;RBI=0.0494288;REFB=-0.00221403;REVB=-0.00149739;RO=107;SAF=18;SAR=23;SRF=62;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170233;STB=0.600474;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00686354;OID=.;OPOS=144014051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:148:107:107:41:41:0.277027:23:18:62:45:23:18:62:45
chr1	144014068	.	T	C	561.4	PASS	AF=0.527778;AO=57;DP=108;FAO=57;FDP=108;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.0307728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.001;QD=20.7924;RBI=0.0357225;REFB=-0.0166396;REVB=0.0181419;RO=51;SAF=31;SAR=26;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728986;STB=0.540045;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0121224;OID=.;OPOS=144014068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:51:51:57:57:0.527778:26:31:32:19:26:31:32:19
chr1	144534038	.	A	G	187.86	PASS	AF=0.182796;AO=33;DP=186;FAO=34;FDP=186;FR=.;FRO=152;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=98;FSRR=54;FWDB=-0.0175143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.036;QD=4.04008;RBI=0.0281678;REFB=-0.00899289;REVB=-0.0220606;RO=148;SAF=14;SAR=19;SRF=97;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292062;STB=0.662157;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0335385;OID=.;OPOS=144534038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:186:148:152:33:34:0.182796:19:14:97:51:19:15:98:54
chr1	144534045	.	T	C	1291.28	PASS	AF=0.586735;AO=115;DP=197;FAO=115;FDP=196;FR=.;FRO=81;FSAF=70;FSAR=45;FSRF=49;FSRR=32;FWDB=0.00363023;FXX=0.0101005;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.004;QD=26.3527;RBI=0.0459752;REFB=-0.0264553;REVB=0.0458316;RO=81;SAF=70;SAR=45;SRF=49;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0030031;STB=0.501628;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.020268;OID=.;OPOS=144534045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:197:196:81:81:115:115:0.586735:45:70:49:32:45:70:49:32
chr1	144534053	.	G	A	44.87	PASS	AF=0.0742358;AO=17;DP=230;FAO=17;FDP=229;FR=.;FRO=212;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=133;FSRR=79;FWDB=-0.0377112;FXX=0.00434764;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4984;QD=0.783784;RBI=0.0500802;REFB=-0.00129334;REVB=0.0329529;RO=213;SAF=9;SAR=8;SRF=133;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109099;STB=0.591872;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0170799;OID=.;OPOS=144534053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:230:229:213:212:17:17:0.0742358:8:9:133:80:8:9:133:79
chr1	144534076	.	G	A	428.48	PASS	AF=0.22623;AO=69;DP=308;FAO=69;FDP=305;FR=.;FRO=236;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=155;FSRR=81;FWDB=0.0023432;FXX=0.00973994;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.709;QD=5.61942;RBI=0.00633884;REFB=-0.00221178;REVB=0.00588985;RO=226;SAF=40;SAR=29;SRF=153;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131044;STB=0.562389;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00601417;OID=.;OPOS=144534076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:308:305:226:236:69:69:0.22623:29:40:153:73:29:40:155:81
chr1	144534082	.	TC	CT,TT	3502.04	PASS	AF=0.2,0.663492;AO=63,190;DP=327;FAO=63,209;FDP=315;FR=.;FRO=43;FSAF=47,131;FSAR=16,78;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-3.38072e-05,-0.0210623;FXX=0.0366961;HRUN=4,2;LEN=2,1;MLLD=224.994,53.8301;QD=44.4704;RBI=0.0306944,0.0232938;REFB=0.00271226,-0.00106678;REVB=-0.0306944,0.00994898;RO=41;SAF=47,122;SAR=16,68;SRF=25;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.121319,0.0117459;STB=0.570407,0.504029;STBP=0.119,0.772;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0099028,0.0229944;OID=.,.;OPOS=144534082,144534083;OREF=TC,C;OALT=CT,T;OMAPALT=CT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:327:315:41:43:63,190:63,209:0.2,0.663492:16,68:47,122:25:16:16,78:47,131:26:17
chr1	144534084	.	C	G	87.63	PASS	AF=0.10241;AO=24;DP=332;FAO=34;FDP=332;FR=.;FRO=298;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=186;FSRR=112;FWDB=-0.00800115;FXX=0.032069;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.649;QD=1.05574;RBI=0.0321391;REFB=-0.00103029;REVB=-0.0311272;RO=284;SAF=15;SAR=9;SRF=174;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148656;STB=0.533659;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.121861;OID=.;OPOS=144534084;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:332:332:284:298:24:34:0.10241:9:15:174:110:14:20:186:112
chr1	144534092	.	G	A	2662.72	PASS	AF=0.62069;AO=234;DP=378;FAO=234;FDP=377;FR=.;FRO=143;FSAF=137;FSAR=97;FSRF=91;FSRR=52;FWDB=0.010629;FXX=0.00264543;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.693;QD=28.2517;RBI=0.0108042;REFB=-0.0106323;REVB=0.00193761;RO=103;SAF=137;SAR=97;SRF=73;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736789;STB=0.52002;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0142693;OID=.;OPOS=144534092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:378:377:103:143:234:234:0.62069:97:137:73:30:97:137:91:52
chr1	144534096	.	T	C	2992.66	PASS	AF=0.642317;AO=256;DP=400;FAO=255;FDP=397;FR=.;FRO=142;FSAF=151;FSAR=104;FSRF=83;FSRR=59;FWDB=0.0101385;FXX=0.00749981;HRUN=5;LEN=1;MLLD=228.861;QD=30.1528;RBI=0.0103372;REFB=-0.010171;REVB=0.00201722;RO=131;SAF=151;SAR=105;SRF=79;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00863659;STB=0.502829;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.00552837;OID=.;OPOS=144534096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:400:397:131:142:256:255:0.642317:105:151:79:52:104:151:83:59
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chr1	144621509	.	A	G	61.81	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0033163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.798;QD=7.27138;RBI=0.0290608;REFB=-0.00106874;REVB=0.028871;RO=24;SAF=8;SAR=1;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.554197;STB=0.847616;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0102113;OID=.;OPOS=144621509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:24:25:9:9:0.264706:1:8:11:13:1:8:12:13
chr1	144621522	.	A	C	51.53	PASS	AF=0.155172;AO=9;DP=58;FAO=9;FDP=58;FR=.;FRO=49;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.034458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.966;QD=3.554;RBI=0.0470122;REFB=0.000459366;REVB=0.0319811;RO=49;SAF=8;SAR=1;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.534343;STB=0.87362;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0011465;OID=.;OPOS=144621522;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:58:58:49:49:9:9:0.155172:1:8:23:26:1:8:23:26
chr1	144621526	.	G	A	44.3	PASS	AF=0.128571;AO=9;DP=73;FAO=9;FDP=70;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.0165807;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3343;QD=2.53133;RBI=0.0396319;REFB=0.00139227;REVB=-0.0359968;RO=62;SAF=8;SAR=1;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.472978;STB=0.848947;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=-0.0315086;OID=.;OPOS=144621526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:73:70:62:61:9:9:0.128571:1:8:33:29:1:8:33:28
chr1	144621555	.	A	G	51.31	PASS	AF=0.109091;AO=12;DP=111;FAO=12;FDP=110;FR=.;FRO=98;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=59;FSRR=39;FWDB=-0.00160622;FXX=0.0265463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.099;QD=1.86573;RBI=0.0849937;REFB=-7.82581e-05;REVB=-0.0849785;RO=90;SAF=8;SAR=4;SRF=54;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864408;STB=0.561985;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=-0.000746972;OID=.;OPOS=144621555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:111:110:90:98:12:12:0.109091:4:8:54:36:4:8:59:39
chr1	144811836	.	G	A	582.41	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00211319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.259;QD=58.2409;RBI=0.0517874;REFB=-0.0716769;REVB=0.0517442;RO=1;SAF=22;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208334;STB=0.511105;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00618672;OID=.;OPOS=144811836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:17:22:1:0:17:22:1:0
chr1	144811924	.	T	G	1931.95	PASS	AF=1;AO=123;DP=124;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1203;QD=61.3318;RBI=0.0531057;REFB=0;REVB=0.0360018;RO=0;SAF=64;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266339;OID=.;OPOS=144811924;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:126:0:0:123:126:1:59:64:0:0:60:66:0:0
chr1	144852390	.	C	T	78.04	PASS	AF=0.175;AO=14;DP=80;FAO=14;FDP=80;FR=.;FRO=66;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=25;FWDB=-0.0158014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.694;QD=3.90175;RBI=0.021013;REFB=-0.00364323;REVB=0.0138513;RO=66;SAF=5;SAR=9;SRF=41;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321994;STB=0.708624;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0292603;OID=.;OPOS=144852390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:80:80:66:66:14:14:0.175:9:5:41:25:9:5:41:25
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chr1	144852518	.	C	T	39.34	PASS	AF=0.134615;AO=7;DP=52;FAO=7;FDP=52;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.00889775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9188;QD=3.02621;RBI=0.0503844;REFB=0.00145404;REVB=-0.0495925;RO=45;SAF=3;SAR=4;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984039;STB=0.571225;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=-0.0171404;OID=.;OPOS=144852518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:52:52:45:45:7:7:0.134615:4:3:23:22:4:3:23:22
chr1	144852522	.	C	T	39.34	PASS	AF=0.134615;AO=7;DP=52;FAO=7;FDP=52;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.000481911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.695;QD=3.02623;RBI=0.0152875;REFB=-0.00340789;REVB=-0.0152799;RO=45;SAF=3;SAR=4;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984039;STB=0.571225;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0295371;OID=.;OPOS=144852522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:52:52:45:45:7:7:0.134615:4:3:23:22:4:3:23:22
chr1	144854180	.	T	C	427.87	PASS	AF=0.205128;AO=72;DP=350;FAO=72;FDP=351;FR=.;FRO=279;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=143;FSRR=136;FWDB=-0.0161403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0038;QD=4.87604;RBI=0.0170886;REFB=-0.0132441;REVB=0.00561365;RO=277;SAF=43;SAR=29;SRF=142;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110131;STB=0.568081;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0497534;OID=.;OPOS=144854180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:350:351:277:279:72:72:0.205128:29:43:142:135:29:43:143:136
chr1	144854528	.	A	G	286.47	PASS	AF=0.336364;AO=37;DP=108;FAO=37;FDP=110;FR=.;FRO=73;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=-0.00183958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.638;QD=10.4169;RBI=0.0329985;REFB=-0.00959728;REVB=0.0329471;RO=71;SAF=22;SAR=15;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365386;STB=0.513177;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.020215;OID=.;OPOS=144854528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:110:71:73:37:37:0.336364:15:22:40:31:15:22:42:31
chr1	144854537	.	T	C	312.55	PASS	AF=0.336134;AO=40;DP=119;FAO=40;FDP=119;FR=.;FRO=79;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=46;FSRR=33;FWDB=-0.00341522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.933;QD=10.506;RBI=0.0102228;REFB=-0.0162724;REVB=-0.0096354;RO=77;SAF=22;SAR=18;SRF=45;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398924;STB=0.521728;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0360628;OID=.;OPOS=144854537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:77:79:40:40:0.336134:18:22:45:32:18:22:46:33
chr1	144854581	.	T	C	138.6	PASS	AF=0.145;AO=29;DP=199;FAO=29;FDP=200;FR=.;FRO=171;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=93;FSRR=78;FWDB=0.0167227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3672;QD=2.77201;RBI=0.0168782;REFB=-0.00846983;REVB=-0.00228552;RO=170;SAF=15;SAR=14;SRF=93;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381684;STB=0.522806;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0417369;OID=.;OPOS=144854581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:200:170:171:29:29:0.145:14:15:93:77:14:15:93:78
chr1	144854594	.	G	T	154.96	PASS	AF=0.154206;AO=32;DP=214;FAO=33;FDP=214;FR=.;FRO=181;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=95;FSRR=86;FWDB=-0.0358356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.329;QD=2.89635;RBI=0.0372875;REFB=-0.00933036;REVB=0.0103038;RO=180;SAF=17;SAR=15;SRF=94;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115869;STB=0.50822;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.044282;OID=.;OPOS=144854594;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:214:214:180:181:32:33:0.154206:15:17:94:86:16:17:95:86
chr1	144854597	.	TC	CC,CT	1738.95	PASS	AF=0.826087,0;AO=64,101;DP=201;FAO=171,0;FDP=207;FR=.;FRO=36;FSAF=87,0;FSAR=84,0;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0795581,0.000968387;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=80.4159,95.345;QD=33.603;RBI=0.0980609,0.0201698;REFB=-0.107483,-0.0392104;REVB=0.0573275,-0.0201466;RO=34;SAF=37,48;SAR=27,53;SRF=17;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0508777,-0.0116861;STB=0.503306,0.5;STBP=0.835,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0491577,0;OID=.,.;OPOS=144854597,144854597;OREF=T,TC;OALT=C,CT;OMAPALT=CC,CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:201:207:34:36:64,101:171,0:0.826087,0:27,53:37,48:17:17:84,0:87,0:19:17
chr1	144855782	.	C	T	114.26	PASS	AF=0.216867;AO=18;DP=83;FAO=18;FDP=83;FR=.;FRO=65;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0658225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.386;QD=5.50647;RBI=0.0687013;REFB=-0.0213215;REVB=-0.0196792;RO=62;SAF=8;SAR=10;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0112995;STB=0.513498;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0590427;OID=.;OPOS=144855782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:62:65:18:18:0.216867:10:8:27:35:10:8:30:35
chr1	144855812	.	T	C	211.7	PASS	AF=0.4;AO=25;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=26;FWDB=0.000472002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7344;QD=13.0276;RBI=0.00570194;REFB=-0.00450972;REVB=0.00568237;RO=38;SAF=11;SAR=14;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135773;STB=0.578255;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00512082;OID=.;OPOS=144855812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:39:25:26:0.4:14:11:12:26:14:12:13:26
chr1	144865850	.	G	T	1238.06	PASS	AF=0.498039;AO=124;DP=252;FAO=127;FDP=255;FR=.;FRO=128;FSAF=58;FSAR=69;FSRF=80;FSRR=48;FWDB=-0.0225788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.26;QD=19.4206;RBI=0.0256496;REFB=-0.0054446;REVB=0.0121697;RO=127;SAF=56;SAR=68;SRF=80;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163141;STB=0.583872;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00504817;OID=.;OPOS=144865850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:252:255:127:128:124:127:0.498039:68:56:80:47:69:58:80:48
chr1	144866643	.	G	A	485.05	PASS	AF=0.415385;AO=54;DP=130;FAO=54;FDP=130;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=47;FSRR=29;FWDB=0.00806828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.532;QD=14.9248;RBI=0.00808822;REFB=-0.0204082;REVB=-0.00056752;RO=75;SAF=28;SAR=26;SRF=46;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0988308;STB=0.558718;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0218243;OID=.;OPOS=144866643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:75:76:54:54:0.415385:26:28:46:29:26:28:47:29
chr1	144866662	.	T	C	925.8	PASS	AF=0.711712;AO=78;DP=110;FAO=79;FDP=111;FR=.;FRO=32;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0111165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1337;QD=33.3623;RBI=0.0162961;REFB=-0.0225316;REVB=-0.0119158;RO=31;SAF=43;SAR=35;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0505604;STB=0.519958;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00822292;OID=.;OPOS=144866662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:31:32:78:79:0.711712:35:43:20:11:35:44:20:12
chr1	144868170	.	C	T	381.25	PASS	AF=0.394737;AO=45;DP=114;FAO=45;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=42;FWDB=-0.00254087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207;QD=13.3772;RBI=0.00626336;REFB=-0.0109022;REVB=-0.00572483;RO=69;SAF=18;SAR=27;SRF=27;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00969971;STB=0.505492;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.016296;OID=.;OPOS=144868170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:69:69:45:45:0.394737:27:18:27:42:27:18:27:42
chr1	144871738	.	C	A	194.35	PASS	AF=0.27957;AO=26;DP=92;FAO=26;FDP=93;FR=.;FRO=67;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=43;FSRR=24;FWDB=0.00843252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.367;QD=8.35931;RBI=0.0108659;REFB=-0.0173792;REVB=0.00685275;RO=66;SAF=13;SAR=13;SRF=43;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183773;STB=0.602075;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0525335;OID=.;OPOS=144871738;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:66:67:26:26:0.27957:13:13:43:23:13:13:43:24
chr1	144871755	.	A	T	128.21	PASS	AF=0.253333;AO=19;DP=76;FAO=19;FDP=75;FR=.;FRO=56;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=19;FWDB=-0.0063647;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.399;QD=6.83768;RBI=0.013986;REFB=-0.00667948;REVB=-0.0124539;RO=54;SAF=3;SAR=16;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.582653;STB=0.858701;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0394374;OID=.;OPOS=144871755;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:54:56:19:19:0.253333:16:3:35:19:16:3:37:19
chr1	144871782	.	A	G	175.8	PASS	AF=0.315789;AO=22;DP=73;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.0202872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.084;QD=9.25258;RBI=0.0203888;REFB=-0.0197857;REVB=-0.00203268;RO=46;SAF=3;SAR=19;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.589622;STB=0.903398;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0405261;OID=.;OPOS=144871782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:76:46:52:22:24:0.315789:19:3:29:17:22:2:33:19
chr1	144873887	.	C	T	1154.28	PASS	AF=0.483333;AO=116;DP=240;FAO=116;FDP=240;FR=.;FRO=124;FSAF=86;FSAR=30;FSRF=103;FSRR=21;FWDB=-0.00576549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.367;QD=19.238;RBI=0.0174523;REFB=-0.00886623;REVB=0.0164724;RO=121;SAF=86;SAR=30;SRF=103;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144307;STB=0.563832;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0099268;OID=.;OPOS=144873887;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:240:240:121:124:116:116:0.483333:30:86:103:18:30:86:103:21
chr1	144874760	.	T	C	433.96	PASS	AF=0.396825;AO=50;DP=125;FAO=50;FDP=126;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=-0.00201525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.08;QD=13.7766;RBI=0.0266007;REFB=-0.0138598;REVB=-0.0265243;RO=75;SAF=28;SAR=22;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143364;STB=0.504503;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0403198;OID=.;OPOS=144874760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:126:75:76:50:50:0.396825:22:28:41:34:22:28:42:34
chr1	144874815	.	T	C	140.72	PASS	AF=0.215686;AO=22;DP=103;FAO=22;FDP=102;FR=.;FRO=80;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=45;FSRR=35;FWDB=-0.0237396;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.647;QD=5.51826;RBI=0.0248554;REFB=-0.0120737;REVB=0.0073634;RO=78;SAF=11;SAR=11;SRF=43;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644149;STB=0.548975;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0344008;OID=.;OPOS=144874815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:102:78:80:22:22:0.215686:11:11:43:35:11:11:45:35
chr1	144874835	.	G	A	72.0	PASS	AF=0.136364;AO=15;DP=110;FAO=15;FDP=110;FR=.;FRO=95;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=47;FSRR=48;FWDB=-0.0167231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.482;QD=2.61811;RBI=0.0526808;REFB=-0.0113081;REVB=-0.049956;RO=94;SAF=6;SAR=9;SRF=47;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125101;STB=0.582307;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0561373;OID=.;OPOS=144874835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:110:110:94:95:15:15:0.136364:9:6:47:47:9:6:47:48
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chr1	144877176	.	C	T	766.88	PASS	AF=0.455056;AO=81;DP=178;FAO=81;FDP=178;FR=.;FRO=97;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=54;FSRR=43;FWDB=0.00893986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.899;QD=17.2333;RBI=0.0575773;REFB=-0.00259238;REVB=-0.0568791;RO=95;SAF=40;SAR=41;SRF=54;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725996;STB=0.534231;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.00333331;OID=.;OPOS=144877176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:178:95:97:81:81:0.455056:41:40:54:41:41:40:54:43
chr1	144879157	.	C	T	51.48	PASS	AF=0.101266;AO=7;DP=80;FAO=8;FDP=79;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=63;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=41;FSRR=22;FWDB=0.0390614;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9277;QD=2.60655;RBI=0.259122;REFB=-0.0355954;REVB=-0.256161;RO=40;SAF=7;SAR=0;SRF=40;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.769532;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.141164;OID=.;OPOS=144879157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:80:79:40:63:7:8:0.101266:0:7:40:0:1:7:41:22
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chr1	144879375	.	T	C	578.21	PASS	AF=0.415094;AO=66;DP=159;FAO=66;FDP=159;FR=.;FRO=93;FSAF=20;FSAR=46;FSRF=30;FSRR=63;FWDB=-0.0692524;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9369;QD=14.5461;RBI=0.0704802;REFB=-0.0163475;REVB=0.0130985;RO=90;SAF=20;SAR=46;SRF=29;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231446;STB=0.513389;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0225248;OID=.;OPOS=144879375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:90:93:66:66:0.415094:46:20:29:61:46:20:30:63
chr1	144880864	.	T	A	81.84	PASS	AF=0.163043;AO=15;DP=91;FAO=15;FDP=92;FR=.;FRO=77;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=-0.0139826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.73;QD=3.55845;RBI=0.0515784;REFB=-0.00460287;REVB=-0.0496469;RO=76;SAF=8;SAR=7;SRF=42;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244208;STB=0.52114;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0220173;OID=.;OPOS=144880864;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:91:92:76:77:15:15:0.163043:7:8:42:34:7:8:43:34
chr1	144882581	.	A	G	974.16	PASS	AF=0.470046;AO=101;DP=215;FAO=102;FDP=217;FR=.;FRO=115;FSAF=57;FSAR=45;FSRF=53;FSRR=62;FWDB=-0.00587272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.7936;QD=17.9568;RBI=0.0114124;REFB=-0.0248274;REVB=-0.00978545;RO=114;SAF=57;SAR=44;SRF=53;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957114;STB=0.551985;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0250122;OID=.;OPOS=144882581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:215:217:114:115:101:102:0.470046:44:57:53:61:45:57:53:62
chr1	144882823	.	C	T	373.2	PASS	AF=0.371901;AO=44;DP=120;FAO=45;FDP=121;FR=.;FRO=76;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=17;FSRR=59;FWDB=-0.0115817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.949;QD=12.3373;RBI=0.0116217;REFB=-0.0155001;REVB=-0.000963455;RO=76;SAF=12;SAR=32;SRF=17;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714374;STB=0.535647;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0251741;OID=.;OPOS=144882823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:76:76:44:45:0.371901:32:12:17:59:33:12:17:59
chr1	144886197	.	A	T	756.31	PASS	AF=0.581967;AO=71;DP=122;FAO=71;FDP=122;FR=.;FRO=51;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=-0.0169072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.572;QD=24.797;RBI=0.0176804;REFB=-0.0188743;REVB=-0.00517163;RO=51;SAF=41;SAR=30;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552834;STB=0.530078;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0109999;OID=.;OPOS=144886197;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:51:51:71:71:0.581967:30:41:33:18:30:41:33:18
chr1	144892089	.	G	T	193.18	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0302102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7736;QD=16.4405;RBI=0.0368775;REFB=0.0152575;REVB=-0.0211493;RO=27;SAF=6;SAR=14;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300025;STB=0.672313;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=-0.0221054;OID=.;OPOS=144892089;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:14:6:16:11:14:6:16:11
chr1	144892149	.	G	A	232.25	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0135096;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.152;QD=16.2984;RBI=0.0166037;REFB=-0.0101168;REVB=-0.00965256;RO=29;SAF=14;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780541;STB=0.55886;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0202566;OID=.;OPOS=144892149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:57:29:31:26:26:0.45614:12:14:18:11:12:14:20:11
chr1	144909956	.	G	A	62.99	PASS	AF=0.174603;AO=11;DP=62;FAO=11;FDP=63;FR=.;FRO=52;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=37;FWDB=-0.0801408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.3998;QD=3.99916;RBI=0.0839962;REFB=-0.0231067;REVB=-0.0251559;RO=51;SAF=3;SAR=8;SRF=15;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325633;STB=0.516099;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.048882;OID=.;OPOS=144909956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:62:63:51:52:11:11:0.174603:8:3:15:36:8:3:15:37
chr1	144912153	.	A	G	2837.64	PASS	AF=1;AO=175;DP=175;FAO=181;FDP=181;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00358967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.653;QD=62.7102;RBI=0.0310677;REFB=0;REVB=0.0308596;RO=0;SAF=99;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23348e-05;OID=.;OPOS=144912153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:175:181:0:0:175:181:1:76:99:0:0:82:99:0:0
chr1	144912233	.	C	T	673.05	PASS	AF=0.468966;AO=68;DP=145;FAO=68;FDP=145;FR=.;FRO=77;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=-0.00981291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.44;QD=18.567;RBI=0.0103764;REFB=0.016346;REVB=-0.00337298;RO=76;SAF=23;SAR=45;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198341;STB=0.613817;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.0142584;OID=.;OPOS=144912233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:76:77:68:68:0.468966:45:23:41:35:45:23:42:35
chr1	144915561	.	G	A	944.75	PASS	AF=0.419753;AO=102;DP=244;FAO=102;FDP=243;FR=.;FRO=141;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=75;FSRR=66;FWDB=-0.0128727;FXX=0.00409819;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.014;QD=15.5514;RBI=0.0195668;REFB=-0.0116017;REVB=-0.0147361;RO=141;SAF=45;SAR=57;SRF=75;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944524;STB=0.552717;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0172273;OID=.;OPOS=144915561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:244:243:141:141:102:102:0.419753:57:45:75:66:57:45:75:66
chr1	144915624	.	G	A	635.26	PASS	AF=0.228571;AO=40;DP=176;FAO=40;FDP=175;FR=.,HEALED;FRO=99;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=60;FSRR=39;FWDB=0.0324511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.029;QD=14.5202;RBI=0.0333223;REFB=-0.0143195;REVB=-0.00756967;RO=99;SAF=15;SAR=25;SRF=60;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274964;STB=0.661297;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00958394;OID=.;OPOS=144915624;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:175:99:99:40:40:0.228571:25:15:60:39:25:15:60:39
chr1	144916748	.	C	G	659.28	PASS	AF=0.541667;AO=65;DP=120;FAO=65;FDP=120;FR=.;FRO=55;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=0.0397557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2278;QD=21.9761;RBI=0.0467584;REFB=-0.0448255;REVB=0.0246138;RO=55;SAF=27;SAR=38;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169115;STB=0.592659;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0413253;OID=.;OPOS=144916748;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:55:55:65:65:0.541667:38:27:34:21:38:27:34:21
chr1	144917546	.	A	G	531.21	PASS	AF=0.482759;AO=56;DP=116;FAO=56;FDP=116;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=0.0422898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5988;QD=18.3177;RBI=0.0432629;REFB=-0.00877599;REVB=0.00912413;RO=60;SAF=23;SAR=33;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191129;STB=0.605838;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0103765;OID=.;OPOS=144917546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:60:60:56:56:0.482759:33:23:37:23:33:23:37:23
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chr1	144918957	.	T	A	277.0	PASS	AF=0.390244;AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=-0.00516475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.371;QD=13.5123;RBI=0.0214119;REFB=-0.00670192;REVB=0.0207797;RO=50;SAF=13;SAR=19;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00693056;STB=0.503953;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.00930656;OID=.;OPOS=144918957;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:50:50:32:32:0.390244:19:13:20:30:19:13:20:30
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chr1	144931330	.	C	T	430.95	PASS	AF=0.418803;AO=49;DP=117;FAO=49;FDP=117;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=-0.012863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.068;QD=14.7334;RBI=0.0332971;REFB=0.00599152;REVB=0.0307121;RO=68;SAF=34;SAR=15;SRF=37;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167938;STB=0.594863;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=-0.00648861;OID=.;OPOS=144931330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:68:68:49:49:0.418803:15:34:37:31:15:34:37:31
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chr1	144952220	.	C	T	39.51	PASS	AF=0.111111;AO=9;DP=81;FAO=9;FDP=81;FR=.;FRO=72;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=58;FSRR=14;FWDB=-0.00706251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.802;QD=1.95102;RBI=0.00715694;REFB=-0.00818213;REVB=0.00115875;RO=72;SAF=6;SAR=3;SRF=58;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217064;STB=0.652782;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0335474;OID=.;OPOS=144952220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:81:81:72:72:9:9:0.111111:3:6:58:14:3:6:58:14
chr1	144994658	.	C	A	394.4	PASS	AF=0.376;AO=46;DP=125;FAO=47;FDP=125;FR=.;FRO=78;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=0.0103865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.332;QD=12.6209;RBI=0.0124799;REFB=-0.0121223;REVB=0.00691873;RO=78;SAF=34;SAR=12;SRF=43;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232531;STB=0.619771;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0287098;OID=.;OPOS=144994658;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:78:78:46:47:0.376:12:34:43:35:13:34:43:35
chr1	145014103	.	G	C	186.84	PASS	AF=0.342857;AO=24;DP=70;FAO=24;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0149054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.593;QD=10.6764;RBI=0.022705;REFB=-0.00911716;REVB=0.0171274;RO=46;SAF=18;SAR=6;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260195;STB=0.653089;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0229169;OID=.;OPOS=145014103;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:46:46:24:24:0.342857:6:18:25:21:6:18:25:21
chr1	145014186	.	GAAAAAAAAAAAAC	GAAAAAAAAAA,GAAAAAAAAAAAC,GAAAAAAAAAACAA,GAAAAAAGAAAAAC	218.85	PASS	AF=0,0.72093,0.0465116,0.232558;AO=8,6,2,8;DP=47;FAO=0,31,2,10;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14,1,5;FSAR=0,17,1,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00984196,0.00289625,0.00114904,-0.0229457;FXX=0.0652032;HRUN=12,12,12,12;LEN=3,1,3,1;MLLD=177.237,4.59488,13.0464,144.941;QD=20.3581;RBI=0.0181766,0.428726,0.0784291,0.0741095;REFB=0.0182265,-0.000231265,0.0327489,0.0182748;REVB=-0.0152815,-0.428716,-0.0784207,-0.0704679;RO=5;SAF=1,2,1,4;SAR=7,4,1,4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.528386,-0.344857,-0.306614,-0.199671;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,mnp,snp;VARB=0,0.0433026,0.081732,0.0398586;OID=.,.,.,.;OPOS=145014197,145014187,145014197,145014193;OREF=AAC,A,AAC,A;OALT=-,-,CAA,G;OMAPALT=GAAAAAAAAAA,GAAAAAAAAAAAC,GAAAAAAAAAACAA,GAAAAAAGAAAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/4:0,0.72093,0.0465116,0.232558:8,6,2,8:47:0,31,2,10:43:0:0,14,1,5:0,17,1,5:0:0:66:5:1,2,1,4:7,4,1,4:4:1
chr1	145014263	.	C	T	238.72	PASS	AF=0.386667;AO=26;DP=72;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.00780349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6717;QD=12.7317;RBI=0.0169146;REFB=-0.0174912;REVB=0.0150069;RO=46;SAF=10;SAR=16;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267317;STB=0.672907;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0257728;OID=.;OPOS=145014263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:75:46:46:26:29:0.386667:16:10:29:17:19:10:29:17
chr1	145015877	.	G	T	69.54	PASS	AF=0.0945946;AO=21;DP=222;FAO=21;FDP=222;FR=.;FRO=201;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=114;FSRR=87;FWDB=-0.0607616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6645;QD=1.25298;RBI=0.0620549;REFB=0.000717089;REVB=-0.0126031;RO=199;SAF=7;SAR=14;SRF=113;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275255;STB=0.705351;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.0107051;OID=.;OPOS=145015877;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:222:222:199:201:21:21:0.0945946:14:7:113:86:14:7:114:87
chr1	145018023	.	G	T	200.34	PASS	AF=0.378788;AO=23;DP=64;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.0103902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9449;QD=12.1418;RBI=0.0127437;REFB=-0.0124441;REVB=-0.00737859;RO=38;SAF=12;SAR=11;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136597;STB=0.571373;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0477338;OID=.;OPOS=145018023;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:66:38:41:23:25:0.378788:11:12:15:23:13:12:15:26
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chr1	145039562	.	C	T	277.84	PASS	AF=0.395062;AO=32;DP=81;FAO=32;FDP=81;FR=.;FRO=49;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.000432602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2329;QD=13.7203;RBI=0.00790979;REFB=-0.0348945;REVB=-0.00789795;RO=48;SAF=9;SAR=23;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248092;STB=0.648865;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0530953;OID=.;OPOS=145039562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:48:49:32:32:0.395062:23:9:24:24:23:9:25:24
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chr1	145075854	.	G	C	128.46	PASS	AF=0.375;AO=14;DP=39;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0335149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.367;QD=12.846;RBI=0.0345945;REFB=-0.0213733;REVB=-0.0085752;RO=23;SAF=5;SAR=9;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107662;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0336204;OID=.;OPOS=145075854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:23:25:14:15:0.375:9:5:8:15:9:6:10:15
chr1	145103928	.	G	A	475.02	PASS	AF=0.298643;AO=62;DP=217;FAO=66;FDP=221;FR=.;FRO=155;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=89;FSRR=66;FWDB=-0.05315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.913;QD=8.59761;RBI=0.0614178;REFB=-0.0112049;REVB=-0.0307771;RO=154;SAF=34;SAR=28;SRF=89;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364684;STB=0.509692;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0299043;OID=.;OPOS=145103928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:217:221:154:155:62:66:0.298643:28:34:89:65:29:37:89:66
chr1	145103947	.	T	C	532.44	PASS	AF=0.304348;AO=70;DP=231;FAO=70;FDP=230;FR=.;FRO=160;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=90;FSRR=70;FWDB=-0.0178706;FXX=0.012875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.462;QD=9.25975;RBI=0.0203059;REFB=-0.0113273;REVB=0.00964214;RO=151;SAF=42;SAR=28;SRF=88;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211009;STB=0.526874;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0243889;OID=.;OPOS=145103947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:231:230:151:160:70:70:0.304348:28:42:88:63:28:42:90:70
chr1	145109549	.	G	T	364.27	PASS	AF=0.147601;AO=80;DP=543;FAO=80;FDP=542;FR=.;FRO=462;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=255;FSRR=207;FWDB=-0.0183274;FXX=0.0036764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.912;QD=2.68832;RBI=0.0183297;REFB=0.000131149;REVB=0.000289291;RO=458;SAF=42;SAR=38;SRF=252;SRR=206;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328112;STB=0.523075;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=-0.000744275;OID=.;OPOS=145109549;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:543:542:458:462:80:80:0.147601:38:42:252:206:38:42:255:207
chr1	145109583	.	C	A	1753.92	PASS	AF=0.386029;AO=197;DP=535;FAO=210;FDP=544;FR=.;FRO=334;FSAF=108;FSAR=102;FSRF=184;FSRR=150;FWDB=-0.00527787;FXX=0.0091073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1242;QD=12.8965;RBI=0.0625105;REFB=-0.00206077;REVB=0.0622873;RO=316;SAF=104;SAR=93;SRF=181;SRR=135;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495803;STB=0.522524;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00322666;OID=.;OPOS=145109583;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:535:544:316:334:197:210:0.386029:93:104:181:135:102:108:184:150
chr1	145109661	.	G	A	229.88	PASS	AF=0.145773;AO=49;DP=341;FAO=50;FDP=343;FR=.;FRO=293;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=115;FSRR=178;FWDB=-0.0159994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.774;QD=2.68086;RBI=0.016804;REFB=-0.00342054;REVB=0.00513741;RO=291;SAF=28;SAR=21;SRF=113;SRR=178;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23272;STB=0.640239;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0255668;OID=.;OPOS=145109661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:341:343:291:293:49:50:0.145773:21:28:113:178:22:28:115:178
chr1	145112414	.	T	C	89.97	PASS	AF=0.141791;AO=19;DP=134;FAO=19;FDP=134;FR=.;FRO=115;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=46;FSRR=69;FWDB=0.0178102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.02;QD=2.68566;RBI=0.0178288;REFB=-0.00804425;REVB=-0.000813447;RO=115;SAF=8;SAR=11;SRF=46;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273923;STB=0.518619;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0386402;OID=.;OPOS=145112414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:134:134:115:115:19:19:0.141791:11:8:46:69:11:8:46:69
chr1	145112420	.	C	T	176.42	PASS	AF=0.217054;AO=28;DP=130;FAO=28;FDP=129;FR=.;FRO=101;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=58;FWDB=0.0425393;FXX=0.0227256;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.812;QD=5.47039;RBI=0.05246;REFB=-0.0130133;REVB=-0.0306994;RO=100;SAF=8;SAR=20;SRF=43;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197748;STB=0.620348;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0506345;OID=.;OPOS=145112420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:129:100:101:28:28:0.217054:20:8:43:57:20:8:43:58
chr1	145112428	.	C	T	94.83	PASS	AF=0.154472;AO=19;DP=122;FAO=19;FDP=123;FR=.;FRO=104;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=44;FSRR=60;FWDB=-0.0578417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.01;QD=3.08391;RBI=0.0581459;REFB=-0.00185613;REVB=-0.00594023;RO=103;SAF=8;SAR=11;SRF=43;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00464643;STB=0.501753;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0134469;OID=.;OPOS=145112428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:122:123:103:104:19:19:0.154472:11:8:43:60:11:8:44:60
chr1	145112485	.	C	T	117.26	PASS	AF=0.184211;AO=21;DP=118;FAO=21;FDP=114;FR=.;FRO=93;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=59;FWDB=-0.0559404;FXX=0.0338954;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4508;QD=4.11426;RBI=0.0561417;REFB=-0.00454315;REVB=0.00474975;RO=96;SAF=10;SAR=11;SRF=37;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117168;STB=0.591133;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0253141;OID=.;OPOS=145112485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:114:96:93:21:21:0.184211:11:10:37:59:11:10:34:59
chr1	145112501	.	C	T	73.98	PASS	AF=0.140187;AO=15;DP=108;FAO=15;FDP=107;FR=.;FRO=92;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=57;FWDB=-0.0532394;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.131;QD=2.76553;RBI=0.061275;REFB=-0.00284576;REVB=-0.0303346;RO=92;SAF=6;SAR=9;SRF=35;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256629;STB=0.517624;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0310135;OID=.;OPOS=145112501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:108:107:92:92:15:15:0.140187:9:6:35:57:9:6:35:57
chr1	145115810	.	A	G	1360.89	PASS	AF=0.421965;AO=144;DP=345;FAO=146;FDP=346;FR=.;FRO=200;FSAF=77;FSAR=69;FSRF=106;FSRR=94;FWDB=0.00326958;FXX=0.0114282;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.507;QD=15.7328;RBI=0.00721911;REFB=-0.0069941;REVB=0.00643626;RO=199;SAF=77;SAR=67;SRF=105;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00741004;STB=0.501509;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00785478;OID=.;OPOS=145115810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:345:346:199:200:144:146:0.421965:67:77:105:94:69:77:106:94
chr1	145115820	.	T	C	435.11	PASS	AF=0.213018;AO=72;DP=338;FAO=72;FDP=338;FR=.;FRO=266;FSAF=35;FSAR=37;FSRF=135;FSRR=131;FWDB=-0.0187387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.384;QD=5.14919;RBI=0.0303757;REFB=2.37498e-05;REVB=0.023907;RO=264;SAF=35;SAR=37;SRF=134;SRR=130;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275642;STB=0.51684;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-0.000288819;OID=.;OPOS=145115820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:338:338:264:266:72:72:0.213018:37:35:134:130:37:35:135:131
chr1	145116147	.	T	TA	91.51	PASS	AF=0.181416;AO=34;DP=229;FAO=41;FDP=226;FR=.;FRO=185;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=114;FSRR=71;FWDB=0.11785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.6916;QD=1.61961;RBI=0.135005;REFB=-0.0021365;REVB=-0.0658613;RO=187;SAF=23;SAR=11;SRF=119;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568938;STB=0.583756;STBP=0.271;TYPE=ins;VARB=0.00743134;OID=.;OPOS=145116148;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.181416:34:229:41:226:185:29:12:114:71:91:187:23:11:119:68
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chr1	145281613	.	C	A	178.51	PASS	AF=0.211679;AO=29;DP=137;FAO=29;FDP=137;FR=.;FRO=108;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=59;FSRR=49;FWDB=0.0110143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.378;QD=5.21189;RBI=0.0110178;REFB=0.00495932;REVB=-0.000276121;RO=108;SAF=8;SAR=21;SRF=59;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345826;STB=0.715153;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.0124288;OID=.;OPOS=145281613;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:108:108:29:29:0.211679:21:8:59:49:21:8:59:49
chr1	145281633	.	C	A	203.57	PASS	AF=0.214765;AO=32;DP=149;FAO=32;FDP=149;FR=.;FRO=117;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=65;FSRR=52;FWDB=-0.037803;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.606;QD=5.46495;RBI=0.0420369;REFB=-0.0154157;REVB=-0.0183858;RO=116;SAF=11;SAR=21;SRF=64;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262931;STB=0.665175;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0410997;OID=.;OPOS=145281633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:116:117:32:32:0.214765:21:11:64:52:21:11:65:52
chr1	145281656	.	A	T	165.67	PASS	AF=0.212598;AO=27;DP=128;FAO=27;FDP=127;FR=.;FRO=100;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=51;FSRR=49;FWDB=-0.0280497;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6008;QD=5.21802;RBI=0.0372913;REFB=-0.0090053;REVB=-0.0245735;RO=100;SAF=9;SAR=18;SRF=51;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227139;STB=0.641605;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0248151;OID=.;OPOS=145281656;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:127:100:100:27:27:0.212598:18:9:51:49:18:9:51:49
chr1	145290409	.	G	A	42.55	PASS	AF=0.0777202;AO=14;DP=192;FAO=15;FDP=193;FR=.;FRO=178;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=106;FSRR=72;FWDB=-0.0213283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.363;QD=0.881938;RBI=0.0213375;REFB=-0.000792228;REVB=-0.000626232;RO=170;SAF=3;SAR=11;SRF=98;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392414;STB=0.83805;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00488995;OID=.;OPOS=145290409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:192:193:170:178:14:15:0.0777202:11:3:98:72:12:3:106:72
chr1	145290498	.	T	G	84.15	PASS	AF=0.125;AO=19;DP=152;FAO=19;FDP=152;FR=.;FRO=133;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=82;FSRR=51;FWDB=0.0235794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.179;QD=2.21435;RBI=0.0240028;REFB=-0.00144508;REVB=-0.00448867;RO=133;SAF=6;SAR=13;SRF=82;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361815;STB=0.74845;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0135758;OID=.;OPOS=145290498;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:152:152:133:133:19:19:0.125:13:6:82:51:13:6:82:51
chr1	145293425	.	C	A	150.26	PASS	AF=0.148148;AO=32;DP=216;FAO=32;FDP=216;FR=.;FRO=184;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=97;FSRR=87;FWDB=0.0010147;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.039;QD=2.78252;RBI=0.0169745;REFB=0.00216026;REVB=0.0169442;RO=182;SAF=20;SAR=12;SRF=95;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133863;STB=0.585052;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.00989562;OID=.;OPOS=145293425;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:216:182:184:32:32:0.148148:12:20:95:87:12:20:97:87
chr1	145293469	.	G	C	197.02	PASS	AF=0.11465;AO=54;DP=469;FAO=54;FDP=471;FR=.;FRO=417;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=222;FSRR=195;FWDB=-0.000890361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0947;QD=1.67323;RBI=0.0212853;REFB=-0.00339897;REVB=-0.0212667;RO=410;SAF=33;SAR=21;SRF=218;SRR=192;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101326;STB=0.57099;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0332952;OID=.;OPOS=145293469;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:469:471:410:417:54:54:0.11465:21:33:218:192:21:33:222:195
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chr1	145293498	.	G	C	136.02	PASS	AF=0.0923695;AO=46;DP=503;FAO=46;FDP=498;FR=.;FRO=452;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=239;FSRR=213;FWDB=-0.00126204;FXX=0.0119045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.868;QD=1.09252;RBI=0.0290305;REFB=-0.0062082;REVB=0.029003;RO=438;SAF=26;SAR=20;SRF=233;SRR=205;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405422;STB=0.533354;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0350746;OID=.;OPOS=145293498;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:503:498:438:452:46:46:0.0923695:20:26:233:205:20:26:239:213
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chr1	145293515	.	A	G	288.12	PASS	AF=0.13786;AO=67;DP=486;FAO=67;FDP=486;FR=.;FRO=419;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=220;FSRR=199;FWDB=-0.000622965;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.097;QD=2.37135;RBI=0.0155013;REFB=-0.00701698;REVB=-0.0154887;RO=416;SAF=42;SAR=25;SRF=220;SRR=196;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128304;STB=0.58952;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0447184;OID=.;OPOS=145293515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:486:486:416:419:67:67:0.13786:25:42:220:196:25:42:220:199
chr1	145293566	.	G	A	1142.32	PASS	AF=0.345;AO=138;DP=400;FAO=138;FDP=400;FR=.;FRO=262;FSAF=71;FSAR=67;FSRF=142;FSRR=120;FWDB=-0.00499829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.161;QD=11.4232;RBI=0.00551118;REFB=-0.00389063;REVB=0.00232169;RO=262;SAF=71;SAR=67;SRF=142;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317239;STB=0.518039;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.00622256;OID=.;OPOS=145293566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:400:400:262:262:138:138:0.345:67:71:142:120:67:71:142:120
chr1	145296372	.	A	G	363.28	PASS	AF=0.453488;AO=38;DP=86;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0555526;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.398;QD=16.8969;RBI=0.0556002;REFB=-0.0145032;REVB=0.0023009;RO=47;SAF=13;SAR=25;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881828;STB=0.554593;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0175655;OID=.;OPOS=145296372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:47:47:38:39:0.453488:25:13:20:27:26:13:20:27
chr1	145296478	.	G	T	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00413094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.896;QD=14.6523;RBI=0.00418677;REFB=-0.0469095;REVB=-0.000681438;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120202;STB=0.571205;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0304151;OID=.;OPOS=145296478;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:2:4:4:1:2:4:4:1
chr1	145311083	.	A	C	1810.53	PASS	AF=0.618321;AO=149;DP=249;FAO=162;FDP=262;FR=.;FRO=100;FSAF=133;FSAR=29;FSRF=85;FSRR=15;FWDB=0.00952567;FXX=0.00380214;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.555;QD=27.6416;RBI=0.0464694;REFB=-0.0126185;REVB=0.0454826;RO=99;SAF=132;SAR=17;SRF=85;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477655;STB=0.519301;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0090226;OID=.;OPOS=145311083;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:249:262:99:100:149:162:0.618321:17:132:85:14:29:133:85:15
chr1	145311110	.	G	C	325.05	PASS	AF=0.209924;AO=55;DP=262;FAO=55;FDP=262;FR=.;FRO=207;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=180;FSRR=27;FWDB=0.00741732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.103;QD=4.96263;RBI=0.00759101;REFB=-0.00832312;REVB=-0.00161453;RO=204;SAF=38;SAR=17;SRF=177;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317435;STB=0.689052;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0212263;OID=.;OPOS=145311110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:262:262:204:207:55:55:0.209924:17:38:177:27:17:38:180:27
chr1	145311828	.	C	G	137.62	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0271397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.392;QD=39.3193;RBI=0.0506833;REFB=-0.133694;REVB=-0.0428046;RO=1;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533084;STB=0.529367;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00267233;OID=.;OPOS=145311828;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:14:1:1:13:13:0.928571:8:5:0:1:8:5:0:1
chr1	145368461	.	A	C	125.02	PASS	AF=0.157233;AO=25;DP=158;FAO=25;FDP=159;FR=.;FRO=134;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=59;FSRR=75;FWDB=-0.00831289;FXX=0.00624961;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.857;QD=3.14526;RBI=0.0208755;REFB=-0.0116498;REVB=-0.019149;RO=132;SAF=15;SAR=10;SRF=59;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193688;STB=0.63265;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0488188;OID=.;OPOS=145368461;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:159:132:134:25:25:0.157233:10:15:59:73:10:15:59:75
chr1	145368518	.	C	T	35.28	PASS	AF=0.0679612;AO=14;DP=204;FAO=14;FDP=206;FR=.;FRO=192;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=79;FSRR=113;FWDB=-0.0496085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3419;QD=0.685088;RBI=0.0828318;REFB=0.000277546;REVB=-0.0663333;RO=188;SAF=8;SAR=6;SRF=76;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181109;STB=0.645663;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.0115877;OID=.;OPOS=145368518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:204:206:188:192:14:14:0.0679612:6:8:76:112:6:8:79:113
chr1	145379371	.	TCACCATTA	T	50.0	PASS	AO=64;DP=273;LEN=8;RO=209;SAF=22;SAR=36;SRF=107;SRR=108;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=145379372;OREF=CACCATTA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:273:209:64:36:22:107:108
chr1	145399229	.	C	T	84.66	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0165714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.87;QD=10.9241;RBI=0.103865;REFB=-0.0179037;REVB=-0.102534;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202063;STB=0.621079;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0646161;OID=.;OPOS=145399229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:7:4:11:9:7:4:11:9
chr1	145442253	.	CG	C,CC	751.64	PASS	AF=0.0344828,0.965517;AO=8,47;DP=58;FAO=2,56;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=2,34;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437832,0.0479503;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=37.9277,44.9674;QD=51.837;RBI=0.0928225,0.0861791;REFB=-0.0495052,-0.0493396;REVB=-0.0818477,-0.0716073;RO=1;SAF=7,26;SAR=1,21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0589957,-0.0177461;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0650084,0.0459905;OID=.,.;OPOS=145442254,145442254;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0344828,0.965517:8,47:58:2,56:58:0:2,34:0,22:0:0:5:1:7,26:1,21:1:0
chr1	145532549	.	T	C	1425.43	PASS	AF=0.978723;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0100986;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=268.907;QD=60.6567;RBI=0.015092;REFB=-0.0600571;REVB=0.0112155;RO=2;SAF=41;SAR=51;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182262;STB=0.509613;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.000152364;OID=.;OPOS=145532549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:94:94:2:2:92:92:0.978723:51:41:0:2:51:41:0:2
chr1	145533175	.	T	C	217.84	PASS	AF=0.40625;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00139514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.906;QD=13.615;RBI=0.00683372;REFB=-0.0169492;REVB=-0.00668979;RO=36;SAF=14;SAR=12;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956379;STB=0.553915;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0168728;OID=.;OPOS=145533175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:36:38:26:26:0.40625:12:14:16:20:12:14:17:21
chr1	145561594	.	C	T	68.26	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.000699192;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.852;QD=14.3713;RBI=0.102792;REFB=-0.0158614;REVB=-0.102789;RO=8;SAF=8;SAR=1;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219741;STB=0.599746;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0210932;OID=.;OPOS=145561594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:8:10:9:9:0.473684:1:8:6:2:1:8:8:2
chr1	145562293	.	G	C	146.07	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0107909;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0685;QD=15.3753;RBI=0.019766;REFB=-0.0320123;REVB=0.0165605;RO=22;SAF=15;SAR=1;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.533837;STB=0.822629;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.059704;OID=.;OPOS=145562293;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:1:15:14:8:1:15:14:8
chr1	145562881	.	T	C	457.04	PASS	AF=0.556962;AO=44;DP=79;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=-0.0371599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.901;QD=23.1413;RBI=0.0401788;REFB=0.00144973;REVB=0.0152798;RO=35;SAF=25;SAR=19;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122517;STB=0.567135;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=-0.00182851;OID=.;OPOS=145562881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:35:35:44:44:0.556962:19:25:25:10:19:25:25:10
chr1	145586309	.	C	T	2008.34	PASS	AF=1;AO=129;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.117;QD=62.2741;RBI=0.0493481;REFB=0;REVB=0.0460583;RO=0;SAF=72;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.68828e-05;OID=.;OPOS=145586309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:129:0:0:129:129:1:57:72:0:0:57:72:0:0
chr1	145586403	.	G	T	2404.14	PASS	AF=1;AO=156;DP=156;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000233959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=342.833;QD=61.252;RBI=0.00875185;REFB=0;REVB=0.00874872;RO=0;SAF=102;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.54493e-06;OID=.;OPOS=145586403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:156:157:0:0:156:157:1:54:102:0:0:55:102:0:0
chr1	146246193	.	G	A	54.14	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=23;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.104317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.648;QD=9.02277;RBI=0.106004;REFB=0.00551154;REVB=-0.0188358;RO=16;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.418932;STB=0.768678;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=-0.00599136;OID=.;OPOS=146246193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:23:24:16:16:7:8:0.333333:3:4:3:13:3:5:3:13
chr1	146395447	.	A	G	338.42	PASS	AF=0.39;AO=39;DP=100;FAO=39;FDP=100;FR=.;FRO=61;FSAF=31;FSAR=8;FSRF=43;FSRR=18;FWDB=-0.00022048;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.11;QD=13.5369;RBI=0.00175587;REFB=-0.0196238;REVB=-0.00174198;RO=61;SAF=31;SAR=8;SRF=43;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133404;STB=0.576496;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0235146;OID=.;OPOS=146395447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:61:61:39:39:0.39:8:31:43:18:8:31:43:18
chr1	146494510	.	T	C	184.15	PASS	AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.053743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.906;QD=11.8804;RBI=0.0646466;REFB=-0.0317212;REVB=0.0359288;RO=38;SAF=9;SAR=14;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281874;STB=0.653716;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0412429;OID=.;OPOS=146494510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:38:39:23:23:0.370968:14:9:25:13:14:9:25:14
chr1	146672906	.	C	T	1936.74	PASS	AF=0.992126;AO=125;DP=127;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.016378;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.155;QD=60.9998;RBI=0.0232087;REFB=0.0212518;REVB=-0.0164439;RO=1;SAF=68;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00826295;STB=0.504347;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.000253876;OID=.;OPOS=146672906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:127:127:1:1:125:126:0.992126:57:68:0:1:57:69:0:1
chr1	146728162	.	T	TA	467.08	PASS	AF=1;AO=41;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0538986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.6031;QD=44.4835;RBI=0.169953;REFB=0;REVB=-0.16118;RO=1;SAF=21;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218198;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00572625;OID=.;OPOS=146728163;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:41:43:42:42:0:21:21:0:0:9:1:21:20:1:0
chr1	146751782	.	A	C	1189.82	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00446676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.814;QD=61.0165;RBI=0.0454728;REFB=0;REVB=0.0452529;RO=0;SAF=46;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5329e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.48085e-05;OID=.;OPOS=146751782;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:32:46:0:0:32:46:0:0
chr1	146767149	.	G	T	1177.38	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233224;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.573;QD=61.1626;RBI=0.0367177;REFB=0;REVB=-0.0283594;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.48916e-05;OID=.;OPOS=146767149;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:33:44:0:0:33:44:0:0
chr1	147091972	.	C	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00126746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.77;QD=59.8384;RBI=0.0199794;REFB=0;REVB=0.0199392;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.12269e-05;OID=.;OPOS=147091972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr1	147119273	.	G	A	923.3	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110568;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.515;QD=58.6223;RBI=0.0111492;REFB=0;REVB=-0.0014327;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.33816e-05;OID=.;OPOS=147119273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0
chr1	147121977	.	C	T	1500.23	PASS	AF=1;AO=99;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000231802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.121;QD=59.415;RBI=0.00709047;REFB=0;REVB=0.00708668;RO=0;SAF=55;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205733;OID=.;OPOS=147121977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:99:101:1:44:55:0:0:46:55:0:0
chr1	147124310	.	T	G	1661.36	PASS	AF=0.991071;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0148961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3669;QD=59.3344;RBI=0.0483013;REFB=-0.0371687;REVB=0.045947;RO=1;SAF=53;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00887364;STB=0.504672;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000469196;OID=.;OPOS=147124310;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:112:112:1:1:111:111:0.991071:58:53:1:0:58:53:1:0
chr1	147229299	.	G	A	115.84	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0803467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5033;QD=42.1227;RBI=0.0898689;REFB=0;REVB=-0.0402595;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00603352;OID=.;OPOS=147229299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0
chr1	147735828	.	C	T	488.19	PASS	AF=0.971429;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0314039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1607;QD=55.7932;RBI=0.0521026;REFB=0.0491453;REVB=-0.041575;RO=1;SAF=9;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490904;STB=0.5263;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=-0.0210322;OID=.;OPOS=147735828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:35:1:1:33:34:0.971429:24:9:1:0:25:9:1:0
chr1	147781062	.	A	G	882.12	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00170351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.338;QD=57.8442;RBI=0.0141446;REFB=0;REVB=-0.0140416;RO=0;SAF=39;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.90492e-05;OID=.;OPOS=147781062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:21:39:0:0:22:39:0:0
chr1	147806874	.	G	C	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.455;QD=58.6004;RBI=0.0230135;REFB=0;REVB=0.0121351;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.18335e-05;OID=.;OPOS=147806874;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:31:33:0:0:31:33:0:0
chr1	147806880	.	T	C	836.74	PASS	AF=0.983333;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0125349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.931;QD=55.7825;RBI=0.0680537;REFB=-0.050367;REVB=0.0668893;RO=1;SAF=31;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149748;STB=0.507934;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000596057;OID=.;OPOS=147806880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:60:1:1:58:59:0.983333:27:31:1:0:28:31:1:0
chr1	147825732	.	C	G	100.3	PASS	AF=0.26;AO=13;DP=50;FAO=13;FDP=50;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0176033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.082;QD=8.02407;RBI=0.0176098;REFB=-0.0120539;REVB=0.000477014;RO=36;SAF=5;SAR=8;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139242;STB=0.576683;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0317325;OID=.;OPOS=147825732;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:36:37:13:13:0.26:8:5:18:18:8:5:18:19
chr1	147825763	.	G	A	81.24	PASS	AF=0.255814;AO=11;DP=44;FAO=11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0353647;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.345;QD=7.55724;RBI=0.0408105;REFB=-0.0161336;REVB=-0.0203674;RO=32;SAF=3;SAR=8;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249543;STB=0.657233;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0345458;OID=.;OPOS=147825763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:44:43:32:32:11:11:0.255814:8:3:15:17:8:3:15:17
chr1	147825765	.	G	A	80.0	PASS	AF=0.25;AO=11;DP=44;FAO=11;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0245291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.839;QD=7.27304;RBI=0.0265751;REFB=-8.05254e-05;REVB=-0.0102254;RO=33;SAF=3;SAR=8;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267995;STB=0.669281;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=-0.000788605;OID=.;OPOS=147825765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:44:44:33:33:11:11:0.25:8:3:16:17:8:3:16:17
chr1	147825769	.	G	A	351.07	PASS	AF=0.707317;AO=29;DP=41;FAO=29;FDP=41;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00389119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.684;QD=34.2508;RBI=0.0115709;REFB=-0.005815;REVB=0.010897;RO=12;SAF=13;SAR=16;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06281;STB=0.534223;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00227611;OID=.;OPOS=147825769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:41:12:12:29:29:0.707317:16:13:4:8:16:13:4:8
chr1	148342488	.	T	C	68.93	PASS	AF=0.104167;AO=19;DP=191;FAO=20;FDP=192;FR=.;FRO=172;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=90;FSRR=82;FWDB=0.0216957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7208;QD=1.43596;RBI=0.021974;REFB=-0.000655448;REVB=-0.00348598;RO=169;SAF=5;SAR=14;SRF=89;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317304;STB=0.745826;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00591851;OID=.;OPOS=148342488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:191:192:169:172:19:20:0.104167:14:5:89:80:15:5:90:82
chr1	149155848	.	C	T	361.81	PASS	AF=1;AO=20;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.082997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1757;QD=53.6014;RBI=0.100912;REFB=0;REVB=0.0574001;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00378107;OID=.;OPOS=149155848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:20:27:1:8:12:0:0:13:14:0:0
chr1	149211947	.	C	G	62.69	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00336103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6249;QD=8.08962;RBI=0.00810664;REFB=0.00241289;REVB=-0.00737707;RO=22;SAF=2;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343623;STB=0.716021;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=-0.00600137;OID=.;OPOS=149211947;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:7:2:11:11:7:2:11:11
chr1	149211962	.	T	C	152.77	PASS	AF=0.377778;AO=13;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0116087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.381;QD=13.5796;RBI=0.0173913;REFB=-0.0211383;REVB=-0.0129497;RO=24;SAF=8;SAR=5;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127938;STB=0.533294;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0273608;OID=.;OPOS=149211962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:28:13:17:0.377778:5:8:12:12:7:10:15:13
chr1	149211967	.	G	A	165.19	PASS	AF=0.391304;AO=17;DP=44;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00396165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.094;QD=14.364;RBI=0.0126668;REFB=-0.0108101;REVB=-0.0120313;RO=27;SAF=10;SAR=7;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746002;STB=0.547211;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0176484;OID=.;OPOS=149211967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:46:27:28:17:18:0.391304:7:10:14:13:7:11:15:13
chr1	149211975	.	C	A	180.88	PASS	AF=0.403846;AO=20;DP=51;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0276655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7516;QD=13.9136;RBI=0.0390021;REFB=-0.0214304;REVB=-0.0274916;RO=31;SAF=12;SAR=8;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0898566;STB=0.563028;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0309851;OID=.;OPOS=149211975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:31:31:20:21:0.403846:8:12:16:15:8:13:16:15
chr1	149211992	.	G	A	257.14	PASS	AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0145513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.709;QD=16.0712;RBI=0.014732;REFB=-0.0102634;REVB=0.00230062;RO=32;SAF=20;SAR=9;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189349;STB=0.618472;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00794344;OID=.;OPOS=149211992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:32:35:29:29:0.453125:9:20:16:16:9:20:17:18
chr1	149211998	.	T	G	265.4	PASS	AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0221678;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0368;QD=15.3856;RBI=0.0237714;REFB=-0.00747315;REVB=0.00858287;RO=38;SAF=22;SAR=8;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228433;STB=0.624366;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0191037;OID=.;OPOS=149211998;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:38:39:30:30:0.434783:8:22:20:18:8:22:21:18
chr1	149215180	.	T	C	487.11	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323982;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.22;QD=59.0434;RBI=0.0516579;REFB=0;REVB=0.0402355;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289033;OID=.;OPOS=149215180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0
chr1	149224130	.	G	A	48.34	PASS	AF=0.104348;AO=12;DP=116;FAO=12;FDP=115;FR=.;FRO=103;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=71;FSRR=32;FWDB=-0.027987;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4869;QD=1.68134;RBI=0.0724592;REFB=-0.00577567;REVB=0.0668361;RO=100;SAF=7;SAR=5;SRF=68;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125193;STB=0.600769;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.10003;OID=.;OPOS=149224130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:116:115:100:103:12:12:0.104348:5:7:68:32:5:7:71:32
chr1	149224185	.	C	A	417.57	PASS	AF=0.28125;AO=25;DP=106;FAO=27;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0270084;FXX=0.0943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.767;QD=17.3987;RBI=0.0272962;REFB=0.000243371;REVB=0.00395331;RO=39;SAF=11;SAR=14;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321898;STB=0.517748;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=-0.00907441;OID=.;OPOS=149224185;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:96:39:42:25:27:0.28125:14:11:16:23:14:13:19:23
chr1	149286406	.	T	C	58.96	PASS	AF=0.139344;AO=10;DP=112;FAO=17;FDP=122;FR=.;FRO=105;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=68;FWDB=-0.0862653;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.1932;QD=1.93318;RBI=0.0875808;REFB=-0.0241204;REVB=-0.0151224;RO=102;SAF=5;SAR=5;SRF=36;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173028;STB=0.553691;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.148721;OID=.;OPOS=149286406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:112:122:102:105:10:17:0.139344:5:5:36:66:10:7:37:68
chr1	149286469	.	C	G	372.23	PASS	AF=0.645833;AO=31;DP=48;FAO=31;FDP=48;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.0279071;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.535;QD=31.0193;RBI=0.0313046;REFB=-0.0196114;REVB=0.0141835;RO=17;SAF=3;SAR=28;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129123;STB=0.571377;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.00754801;OID=.;OPOS=149286469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:17:17:31:31:0.645833:28:3:3:14:28:3:3:14
chr1	149287392	.	T	G	762.82	PASS	AF=0.532847;AO=73;DP=137;FAO=73;FDP=137;FR=.;FRO=64;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.0178393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.291;QD=22.2721;RBI=0.0305632;REFB=-0.0126394;REVB=-0.0248166;RO=64;SAF=32;SAR=41;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0529377;STB=0.529024;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00831095;OID=.;OPOS=149287392;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:64:64:73:73:0.532847:41:32:32:32:41:32:32:32
chr1	149294658	.	G	A	802.72	PASS	AF=1;AO=44;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0964897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.889;QD=57.3373;RBI=0.0967527;REFB=0;REVB=0.00712867;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293366;OID=.;OPOS=149294658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:44:56:1:29:15:0:0:30:26:0:0
chr1	149294693	.	G	C	894.24	PASS	AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0286799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.611;QD=55.0305;RBI=0.0287059;REFB=0.018382;REVB=-0.00122068;RO=2;SAF=32;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285993;STB=0.515147;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-4.92822e-05;OID=.;OPOS=149294693;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:65:65:2:2:63:63:0.969231:31:32:2:0:31:32:2:0
chr1	149294742	.	C	T	132.41	PASS	AF=0.320755;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.0146023;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.433;QD=9.9929;RBI=0.0191307;REFB=-0.0163365;REVB=-0.0123594;RO=36;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127291;STB=0.575195;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0410775;OID=.;OPOS=149294742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:36:36:17:17:0.320755:9:8:13:23:9:8:13:23
chr1	149294744	.	C	T	132.4	PASS	AF=0.320755;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.00420049;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.873;QD=9.99266;RBI=0.0186257;REFB=-0.0099575;REVB=-0.0181458;RO=36;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127291;STB=0.575195;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0323358;OID=.;OPOS=149294744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:36:36:17:17:0.320755:9:8:13:23:9:8:13:23
chr1	149298542	.	CAAA	AAAC	63.86	PASS	AF=0.363636;AO=2;DP=12;FAO=4;FDP=11;FR=.,HEALED,HEALED,HEALED;FRO=3;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.080543;FXX=0.153728;HRUN=1;LEN=4;MLLD=48.8052;QD=23.2229;RBI=0.12384;REFB=-0.0200542;REVB=-0.0940702;RO=1;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25849;STB=0.545217;STBP=0.984;TYPE=mnp;VARB=-0.0492571;OID=.;OPOS=149298542;OREF=CAAA;OALT=AAAC;OMAPALT=AAAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:12:11:1:3:2:4:0.363636:1:1:0:1:3:1:1:2
chr1	149298554	.	C	A	100.05	PASS	AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0280548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1045;QD=26.6786;RBI=0.0736702;REFB=-0.0277462;REVB=0.0681192;RO=4;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0591994;STB=0.533274;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0120941;OID=.;OPOS=149298554;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:15:15:4:4:11:11:0.733333:7:4:1:3:7:4:1:3
chr1	149298562	.	GC	AT	83.57	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.000125269;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=237.612;QD=20.8931;RBI=0.034661;REFB=0.00373732;REVB=-0.0346608;RO=6;SAF=5;SAR=5;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219729;STB=0.624765;STBP=0.22;TYPE=mnp;VARB=-0.00202534;OID=.;OPOS=149298562;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:5:5:1:5:5:5:1:5
chr1	149298603	.	G	A	86.72	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0601001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6254;QD=11.9609;RBI=0.086979;REFB=-0.0265854;REVB=-0.0628754;RO=17;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254927;STB=0.662304;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.028475;OID=.;OPOS=149298603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:29:17:18:11:11:0.37931:5:6:5:12:5:6:5:13
chr1	149334339	.	G	C	1447.96	PASS	AF=0.61215;AO=131;DP=216;FAO=131;FDP=214;FR=.;FRO=83;FSAF=57;FSAR=74;FSRF=39;FSRR=44;FWDB=0.00993204;FXX=0.00925883;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.925;QD=27.0647;RBI=0.0106049;REFB=-0.0123149;REVB=0.00371718;RO=83;SAF=57;SAR=74;SRF=39;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252901;STB=0.513664;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.006183;OID=.;OPOS=149334339;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:214:83:83:131:131:0.61215:74:57:39:44:74:57:39:44
chr1	149664423	.	A	G	1026.09	PASS	AF=0.776786;AO=77;DP=102;FAO=87;FDP=112;FR=.;FRO=25;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0763007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1097;QD=36.6461;RBI=0.0767887;REFB=-0.0256999;REVB=0.00864392;RO=25;SAF=36;SAR=41;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681933;STB=0.541418;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0141194;OID=.;OPOS=149664423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:112:25:25:77:87:0.776786:41:36:8:17:43:44:8:17
chr1	149676401	.	A	G	59.16	PASS	AF=0.2;AO=8;DP=45;FAO=9;FDP=45;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.0219156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.794;QD=5.25878;RBI=0.0302176;REFB=-0.00538483;REVB=-0.020804;RO=36;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170731;STB=0.651857;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0177181;OID=.;OPOS=149676401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:45:45:36:36:8:9:0.2:4:4:13:23:4:5:13:23
chr1	149680227	.	A	G	712.98	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145558;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.595;QD=55.92;RBI=0.0148585;REFB=0;REVB=-0.00298414;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240415;OID=.;OPOS=149680227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:23:27:0:0:23:28:0:0
chr1	149680262	.	A	G	194.0	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00319655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8772;QD=16.8695;RBI=0.0198504;REFB=-0.00149513;REVB=0.0195913;RO=26;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380046;STB=0.521717;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.00419284;OID=.;OPOS=149680262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:10:10:14:12:10:10:14:12
chr1	149684119	.	TA	T	320.77	PASS	AF=1;AO=22;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.328;QD=51.3238;RBI=0.0207298;REFB=0;REVB=-0.010527;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000104127;OID=.;OPOS=149684120;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:22:24:25:25:0:7:18:0:0:4:0:7:15:0:0
chr1	149906413	.	T	C	1568.7	PASS	AF=1;AO=97;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398506;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.779;QD=64.0286;RBI=0.0649138;REFB=0;REVB=0.051242;RO=0;SAF=41;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.55487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220872;OID=.;OPOS=149906413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:98:0:0:97:98:1:56:41:0:0:57:41:0:0
chr1	149907186	.	A	AC,C	67.52	PASS	AF=0.526316,0;AO=4,5;DP=19;FAO=10,0;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=3,0;FSAR=7,0;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.0121866,-0.0463122;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=18.661,18.8814;QD=14.2144;RBI=0.0562594,0.0493113;REFB=-0.121922,-0.079645;REVB=-0.0549237,-0.0169348;RO=10;SAF=0,2;SAR=4,3;SRF=1;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.611521,0.376774;STB=0.695364,0.5;STBP=0.156,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0794431,0;OID=.,.;OPOS=149907187,149907186;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:19:19:10:9:4,5:10,0:0.526316,0:4,3:0,2:1:9:7,0:3,0:0:9
chr1	149914216	.	GAAAAAAAT	GAAAAAAT,GAAAAAATA,GAAAAATAT	83.24	PASS	AF=0.277778,0.0555556,0.037037;AO=15,6,2;DP=54;FAO=15,3,2;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=5,3,1;FSAR=10,0,1;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0835,-0.187337,-0.0232664;FXX=0.0526223;HRUN=7,7,7;LEN=1,2,1;MLLD=9.37523,18.3099,236.389;QD=6.16595;RBI=0.174373,0.20834,0.0394492;REFB=-0.0781195,-0.0358862,-0.0025232;REVB=-0.153081,-0.0911612,-0.0318577;RO=19;SAF=8,6,1;SAR=7,0,1;SRF=9;SRR=10;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0577034,0.723919,0.0256614;STB=0.675443,0.995883,0.582529;STBP=0.12,0.119,0.838;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.0577866,0.0557577,0.0261631;OID=.,.,.;OPOS=149914217,149914223,149914222;OREF=A,AT,A;OALT=-,TA,T;OMAPALT=GAAAAAAT,GAAAAAATA,GAAAAATAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.277778,0.0555556,0.037037:15,6,2:54:15,3,2:54:34:5,3,1:10,0,1:20:14:59:19:8,6,1:7,0,1:9:10
chr1	149914683	.	G	A	54.65	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0819625;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.1927;QD=24.289;RBI=0.148263;REFB=-0.171679;REVB=-0.123547;RO=2;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955799;STB=0.55539;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0441414;OID=.;OPOS=149914683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:5:2:1:1:5:2:1:1
chr1	150199039	.	CTCCTCTTCCTCT	CTCCTCT,CTCCTCTTCCTCC	640.35	PASS	AF=0.652174,0.347826;AO=27,18;DP=50;FAO=30,16;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=13,12;FSAR=17,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554235,0.0773317;FXX=0.09802;HRUN=2,2;LEN=6,1;MLLD=134.843,46.1523;QD=55.6828;RBI=0.0678628,0.0900801;REFB=0,0;REVB=0.0391611,-0.0461978;RO=0;SAF=10,14;SAR=17,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0355201,-0.0090968;OID=.,.;OPOS=150199040,150199051;OREF=TCCTCT,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTCCTCT,CTCCTCTTCCTCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.652174,0.347826:27,18:50:30,16:46:0:13,12:17,4:0:0:99:0:10,14:17,4:0:0
chr1	150199057	.	C	T	66.02	PASS	AF=0.208333;AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0521552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5278;QD=5.50207;RBI=0.0589376;REFB=-0.0360776;REVB=-0.0274497;RO=36;SAF=7;SAR=3;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310415;STB=0.6996;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.100321;OID=.;OPOS=150199057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:48:48:36:38:10:10:0.208333:3:7:16:20:3:7:17:21
chr1	150199123	.	G	T	282.26	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.889;QD=51.3195;RBI=0.0551675;REFB=0;REVB=0.0396364;RO=0;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00278271;OID=.;OPOS=150199123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:15:6:0:0:15:7:0:0
chr1	150278741	.	G	GTC	291.16	PASS	AF=0.827586;AO=24;DP=29;FAO=24;FDP=29;FR=.;FRO=5;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00796702;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=321.118;QD=40.1598;RBI=0.0327516;REFB=-0.00971603;REVB=0.0317679;RO=5;SAF=16;SAR=8;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124889;STB=0.567515;STBP=0.175;TYPE=ins;VARB=0.00128494;OID=.;OPOS=150278742;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=GTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.827586:24:29:24:29:5:16:8:5:0:26:5:16:8:5:0
chr1	150526044	.	G	C	289.3	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0226377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2025;QD=18.9705;RBI=0.0487563;REFB=-0.0151821;REVB=-0.0431823;RO=30;SAF=17;SAR=14;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133803;STB=0.507458;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0138885;OID=.;OPOS=150526044;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:14:17:16:14:14:17:16:14
chr1	150528018	.	A	AC,C	40.96	PASS	AF=0.162162,0;AO=10,6;DP=72;FAO=12,0;FDP=74;FR=.;FRO=62;FSAF=4,0;FSAR=8,0;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.0453492,-0.0773628;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=88.3288,124.867;QD=2.21392;RBI=0.045719,0.0959638;REFB=-0.00547451,0.00219149;REVB=-0.00580288,-0.0567807;RO=55;SAF=5,2;SAR=5,4;SRF=32;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.101167,-0.275528;STB=0.689955,0.5;STBP=0.185,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.125481,0;OID=.,.;OPOS=150528019,150528018;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:72:74:55:62:10,6:12,0:0.162162,0:5,4:5,2:32:23:8,0:4,0:35:27
chr1	150531008	.	T	C,G	747.3	PASS	AF=0.944444,0.0555556;AO=48,3;DP=51;FAO=51,3;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0;FSAR=29,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100476,-0.00354628;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=120.729,75.2228;QD=55.3559;RBI=0.0495678,0.03168;REFB=0,0;REVB=0.0485387,-0.0314809;RO=0;SAF=22,0;SAR=26,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.46901e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00122311,0.216817;OID=.,.;OPOS=150531008,150531008;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:51:54:0:0:48,3:51,3:0.944444,0.0555556:26,3:22,0:0:0:29,3:22,0:0:0
chr1	150531044	.	CCCCCCG	CCCCCAC,CCCCCCA,GCCCCCA	768.54	PASS	AF=0.0175439,0.964912,0;AO=7,27,2;DP=57;FAO=1,55,0;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=1,22,0;FSAR=0,33,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0232187,0.0308078,0.0187676;FXX=0;HRUN=6,1,6;LEN=2,1,7;MLLD=47.0831,65.2965,45.005;QD=53.9328;RBI=0.129799,0.122011,0.0360049;REFB=0.0624671,-0.111594,-0.13902;REVB=-0.127706,0.118058,-0.0307267;RO=0;SAF=1,18,1;SAR=6,9,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.989913,0.50746,0.5;STBP=0.496,0.524,1;TYPE=mnp,snp,mnp;VARB=0.120153,0.000838001,0;OID=.,.,.;OPOS=150531049,150531050,150531044;OREF=CG,G,CCCCCCG;OALT=AC,A,GCCCCCA;OMAPALT=CCCCCAC,CCCCCCA,GCCCCCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:57:57:0:1:7,27,2:1,55,0:0.0175439,0.964912,0:6,9,1:1,18,1:0:0:0,33,0:1,22,0:0:1
chr1	150531170	.	C	T	695.83	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0122246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.076;QD=60.5068;RBI=0.0122287;REFB=-0.0277972;REVB=-0.000318252;RO=1;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170902;STB=0.509087;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00036611;OID=.;OPOS=150531170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:27:18:0:1:27:18:0:1
chr1	150596095	.	G	A	61.81	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=-0.0630593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.066;QD=7.27127;RBI=0.0652327;REFB=-0.00252492;REVB=-0.016698;RO=23;SAF=7;SAR=2;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444974;STB=0.796831;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0190944;OID=.;OPOS=150596095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:23:25:9:9:0.264706:2:7:9:14:2:7:9:16
chr1	150679033	.	G	A	257.98	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0407912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2165;QD=18.4275;RBI=0.0409301;REFB=-0.0328002;REVB=-0.00336909;RO=28;SAF=17;SAR=11;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129449;STB=0.572486;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0229681;OID=.;OPOS=150679033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:11:17:13:15:11:17:13:15
chr1	150727539	.	G	A	205.16	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=6;FWDB=-0.0679371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7944;QD=15.7814;RBI=0.0729074;REFB=0.0294586;REVB=0.0264582;RO=29;SAF=18;SAR=5;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152888;STB=0.508677;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=-0.0263886;OID=.;OPOS=150727539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:5:18:23:6:5:18:23:6
chr1	150771703	.	T	C	1208.93	PASS	AF=1;AO=77;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.55;QD=61.2118;RBI=0.0343911;REFB=0;REVB=-0.00486943;RO=0;SAF=47;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49054e-05;OID=.;OPOS=150771703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:77:79:1:30:47:0:0:30:49:0:0
chr1	150779755	.	C	T	1349.7	PASS	AF=0.977778;AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0329527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2175;QD=59.9869;RBI=0.0334331;REFB=0.00548347;REVB=-0.00564726;RO=2;SAF=46;SAR=42;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201556;STB=0.510636;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=-0.000785677;OID=.;OPOS=150779755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:90:90:2:2:88:88:0.977778:42:46:2:0:42:46:2:0
chr1	150808889	.	C	G	369.29	PASS	AF=0.610169;AO=36;DP=59;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.0213415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.106;QD=25.0363;RBI=0.0343505;REFB=-0.0462054;REVB=0.0269165;RO=23;SAF=22;SAR=14;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983203;STB=0.553724;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.036378;OID=.;OPOS=150808889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:23:23:36:36:0.610169:14:22:17:6:14:22:17:6
chr1	150937766	.	ATTTTT	AATTTT,ATTTT,ATTTTA	2013.43	PASS	AF=0.00609756,0.0304878,0.963415;AO=6,47,70;DP=165;FAO=1,5,158;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=0,2,89;FSAR=1,3,69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0588019,0.0450324,0.0635509;FXX=0.00606024;HRUN=5,5,5;LEN=1,1,1;MLLD=7.45486,15.8568,19.2558;QD=49.1081;RBI=0.063453,0.0642529,0.271492;REFB=0.0221794,-0.0319096,0.00706259;REVB=-0.023846,0.0458313,0.263949;RO=4;SAF=1,13,47;SAR=5,34,23;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.297985,-0.0402303,0.0196715;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=0.0316074,-0.0856209,0.0367043;OID=.,.,.;OPOS=150937767,150937767,150937771;OREF=T,T,T;OALT=A,-,A;OMAPALT=AATTTT,ATTTT,ATTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0.00609756,0.0304878,0.963415:6,47,70:165:1,5,158:164:0:0,2,89:1,3,69:0:0:6:4:1,13,47:5,34,23:2:2
chr1	150940357	.	GC	TT	117.5	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.000656423;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=156.351;QD=21.3631;RBI=0.0137742;REFB=-0.0258966;REVB=-0.0137586;RO=8;SAF=4;SAR=9;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518484;STB=0.512176;STBP=0.977;TYPE=mnp;VARB=0.0153905;OID=.;OPOS=150940357;OREF=GC;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:22:22:8:9:13:13:0.590909:9:4:3:5:9:4:3:6
chr1	150960350	.	A	C	1008.49	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.129;QD=59.323;RBI=0.043604;REFB=0;REVB=0.0376444;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.92032e-05;OID=.;OPOS=150960350;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:36:31:0:0:37:31:0:0
chr1	150969567	.	A	G	1024.97	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00155401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.952;QD=59.4187;RBI=0.0469034;REFB=0;REVB=0.0468777;RO=0;SAF=18;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.70988e-05;OID=.;OPOS=150969567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:67:69:1:49:18:0:0:51:18:0:0
chr1	150969992	.	T	C	144.52	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.198;QD=44.4684;RBI=0.0919321;REFB=0;REVB=0.0863311;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000614539;OID=.;OPOS=150969992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:3:9:0:0:3:10:0:0
chr1	150970577	.	G	T	726.7	PASS	AF=1;AO=41;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2095;QD=61.8469;RBI=0.0268159;REFB=0;REVB=0.00232063;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000837135;OID=.;OPOS=150970577;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:41:47:1:16:25:0:0:17:30:0:0
chr1	150975108	.	T	C	246.49	PASS	AF=0.709677;AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0337788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5003;QD=31.8046;RBI=0.0356772;REFB=-0.0332612;REVB=0.0114828;RO=9;SAF=15;SAR=7;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743868;STB=0.540945;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0313733;OID=.;OPOS=150975108;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:9:9:22:22:0.709677:7:15:5:4:7:15:5:4
chr1	151006539	.	C	A	70.45	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0108621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1104;QD=17.6119;RBI=0.0312045;REFB=-0.0385129;REVB=0.0292529;RO=7;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041038;STB=0.523757;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0691382;OID=.;OPOS=151006539;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:6:3:2:5:6:3:2:5
chr1	151019180	.	A	G	195.26	PASS	AF=0.454545;AO=21;DP=43;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0424345;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.465;QD=17.7505;RBI=0.0608043;REFB=0.0126438;REVB=0.0435486;RO=22;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144454;STB=0.568115;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=-0.0121789;OID=.;OPOS=151019180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:22:24:21:20:0.454545:10:11:8:14:10:10:9:15
chr1	151040435	.	G	A	732.83	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00483213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4918;QD=62.3684;RBI=0.0246527;REFB=0;REVB=-0.0241745;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.54153e-05;OID=.;OPOS=151040435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:22:22:0:0:23:24:0:0
chr1	151104950	.	G	A	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00114849;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.853;QD=59.4345;RBI=0.097168;REFB=0;REVB=0.0971612;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017475;OID=.;OPOS=151104950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0
chr1	151108137	.	T	G	835.83	PASS	AF=0.983607;AO=57;DP=59;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0113392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.1633;QD=54.8084;RBI=0.0154099;REFB=-0.0148972;REVB=-0.0104349;RO=1;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159856;STB=0.508194;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00741067;OID=.;OPOS=151108137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:61:1:1:57:60:0.983607:29:28:0:1:30:30:0:1
chr1	151209063	.	C	T	182.76	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00366567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.818;QD=17.4059;RBI=0.0773163;REFB=-0.015953;REVB=-0.0772293;RO=22;SAF=6;SAR=13;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225554;STB=0.641405;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.040264;OID=.;OPOS=151209063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:23:19:19:0.452381:13:6:12:10:13:6:13:10
chr1	151239051	.	T	C	303.48	PASS	AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00860693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.743;QD=22.0713;RBI=0.0100495;REFB=-0.0186205;REVB=-0.00518775;RO=24;SAF=18;SAR=13;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972762;STB=0.553811;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0154358;OID=.;OPOS=151239051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:13:18:11:13:13:18:11:13
chr1	151254041	.	T	C	251.56	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0238779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.724;QD=17.0546;RBI=0.0244255;REFB=-0.00708994;REVB=0.00514308;RO=31;SAF=12;SAR=16;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218981;STB=0.512306;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0115309;OID=.;OPOS=151254041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:16:12:14:17:16:12:14:17
chr1	151288391	.	A	G	874.69	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.589;QD=57.3566;RBI=0.0470881;REFB=0;REVB=0.0353741;RO=0;SAF=42;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41114e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385595;OID=.;OPOS=151288391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:18:42:0:0:18:43:0:0
chr1	151316161	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=377.565;QD=42.1826;RBI=0.0159491;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=11;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.87271e-05;OID=.;OPOS=151316161;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:0:11:0:0:0:11:0:0
chr1	151374025	.	T	C	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00216759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.123;QD=60.6092;RBI=0.032466;REFB=0;REVB=0.0323936;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.29302e-05;OID=.;OPOS=151374025;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:17:21:0:0:17:21:0:0
chr1	151675414	.	A	G	182.87	PASS	AF=0.941176;AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00484672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2271;QD=43.0287;RBI=0.0260416;REFB=-0.221707;REVB=-0.0255866;RO=2;SAF=10;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394328;STB=0.545396;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.00549073;OID=.;OPOS=151675414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:2:1:15:16:0.941176:5:10:1:1:5:11:0:1
chr1	151686983	.	T	A	359.21	PASS	AF=0.47619;AO=36;DP=79;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.0345296;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.1034;QD=17.105;RBI=0.0347;REFB=-0.0422339;REVB=0.003435;RO=43;SAF=18;SAR=18;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147073;STB=0.559494;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0596424;OID=.;OPOS=151686983;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:84:43:44:36:40:0.47619:18:18:28:15:20:20:27:17
chr1	151733335	.	T	G	48.85	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0693015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.1604;QD=13.9584;RBI=0.0867051;REFB=0.000464175;REVB=0.0521063;RO=7;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439386;STB=0.768342;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00849404;OID=.;OPOS=151733335;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:6:1:4:3:6:1:4:3
chr1	151735545	.	A	G	370.46	PASS	AF=0.666667;AO=34;DP=51;FAO=34;FDP=51;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0519069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.216;QD=29.0554;RBI=0.0672226;REFB=0.0115805;REVB=-0.0427148;RO=17;SAF=17;SAR=17;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179622;STB=0.509798;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=-0.00582954;OID=.;OPOS=151735545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:17:17:34:34:0.666667:17:17:9:8:17:17:9:8
chr1	151740666	.	T	C	1093.72	PASS	AF=0.949367;AO=75;DP=79;FAO=75;FDP=79;FR=.;FRO=4;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0866619;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.952;QD=55.3785;RBI=0.0867218;REFB=-0.180595;REVB=0.00322322;RO=4;SAF=48;SAR=27;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650912;STB=0.534473;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00999563;OID=.;OPOS=151740666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:79:79:4:4:75:75:0.949367:27:48:0:4:27:48:0:4
chr1	151747970	.	A	G	415.35	PASS	AF=0.488372;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=13;FWDB=-0.0410186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.1112;QD=19.3184;RBI=0.0472768;REFB=-0.018237;REVB=-0.0235069;RO=44;SAF=23;SAR=19;SRF=31;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148595;STB=0.582255;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0155421;OID=.;OPOS=151747970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:44:44:42:42:0.488372:19:23:31:13:19:23:31:13
chr1	151772813	.	G	A	512.25	PASS	AF=0.482456;AO=53;DP=113;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=0.0149077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.693;QD=17.9736;RBI=0.027357;REFB=-0.0211381;REVB=-0.0229383;RO=58;SAF=27;SAR=26;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10615;STB=0.561582;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0235353;OID=.;OPOS=151772813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:58:59:53:55:0.482456:26:27:23:35:27:28:23:36
chr1	151773851	.	T	A	82.5	PASS	AF=0.275;AO=9;DP=38;FAO=11;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=-0.00101964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3485;QD=8.25031;RBI=0.0438429;REFB=-0.0295251;REVB=-0.043831;RO=23;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185999;STB=0.533271;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.02032;OID=.;OPOS=151773851;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:38:40:23:29:9:11:0.275:6:3:8:15:8:3:9:20
chr1	151814234	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00452825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.149;QD=62.671;RBI=0.00606248;REFB=0;REVB=0.00403095;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17178e-05;OID=.;OPOS=151814234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
chr1	151820298	.	G	C	708.53	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6047;QD=62.9807;RBI=0.0306657;REFB=0;REVB=0.0127527;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000512462;OID=.;OPOS=151820298;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0
chr1	151820324	.	T	C	629.98	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.136;QD=61.461;RBI=0.0809785;REFB=0;REVB=0.0782553;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000434754;OID=.;OPOS=151820324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:39:41:1:20:19:0:0:21:20:0:0
chr1	151825991	.	G	T	901.33	PASS	AF=0.928571;AO=65;DP=70;FAO=65;FDP=70;FR=.;FRO=5;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00362064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.542;QD=51.5045;RBI=0.0521574;REFB=-0.0739239;REVB=0.0520316;RO=3;SAF=22;SAR=43;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318232;STB=0.504891;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.000769262;OID=.;OPOS=151825991;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:70:70:3:5:65:65:0.928571:43:22:0:3:43:22:2:3
chr1	151845569	.	A	G	817.69	PASS	AF=1;AO=41;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.893;QD=57.3816;RBI=0.0822917;REFB=0;REVB=0.0736499;RO=0;SAF=41;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283732;OID=.;OPOS=151845569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:41:57:1:0:41:0:0:16:41:0:0
chr1	151845650	.	G	C	747.04	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1161;QD=63.5782;RBI=0.0407066;REFB=0;REVB=0.037707;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313065;OID=.;OPOS=151845650;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:20:27:0:0:20:27:0:0
chr1	151862661	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0311709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1107;QD=43.4857;RBI=0.0327873;REFB=0;REVB=-0.0101674;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00190069;OID=.;OPOS=151862661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr1	151867560	.	G	A	938.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00649729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.125;QD=58.6311;RBI=0.0110846;REFB=0;REVB=0.0089807;RO=0;SAF=41;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91172e-05;OID=.;OPOS=151867560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:22:41:0:0:23:41:0:0
chr1	152058192	.	G	A	1200.99	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0344401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.114;QD=58.5848;RBI=0.0656718;REFB=-0.145281;REVB=0.0559165;RO=2;SAF=55;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363722;STB=0.519226;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00173075;OID=.;OPOS=152058192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:2:2:80:80:0.97561:25:55:0:2:25:55:0:2
chr1	152079989	.	T	G	1018.12	PASS	AF=0.972222;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0266867;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.82;QD=56.5623;RBI=0.0293575;REFB=0.148376;REVB=0.0122345;RO=2;SAF=46;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377745;STB=0.519994;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.000383679;OID=.;OPOS=152079989;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:72:72:2:2:70:70:0.972222:24:46:0:2:24:46:0:2
chr1	152081921	.	G	C	729.03	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1195;QD=57.1789;RBI=0.0346823;REFB=0;REVB=0.0220805;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251485;OID=.;OPOS=152081921;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:22:28:0:0:22:29:0:0
chr1	152085505	.	A	C	1404.86	PASS	AF=0.978495;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=93;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.04053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.713;QD=60.424;RBI=0.0877912;REFB=-0.145724;REVB=0.0778756;RO=2;SAF=60;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295966;STB=0.515622;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0077974;OID=.;OPOS=152085505;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:93:93:2:2:91:91:0.978495:31:60:0:2:31:60:0:2
chr1	152129087	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223628;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.453;QD=59.0187;RBI=0.0507333;REFB=0;REVB=0.0455387;RO=0;SAF=6;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73777e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200481;OID=.;OPOS=152129087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:28:6:0:0:28:6:0:0
chr1	152129094	.	A	G	513.19	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.657;QD=58.6501;RBI=0.0564603;REFB=0;REVB=0.0285157;RO=0;SAF=5;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.47732e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000424117;OID=.;OPOS=152129094;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:35:0:0:33:35:1:28:5:0:0:29:6:0:0
chr1	152129115	.	T	C	104.77	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=23;FWDB=-0.0978023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9991;QD=10.746;RBI=0.100751;REFB=-0.0408956;REVB=0.0241963;RO=26;SAF=1;SAR=12;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128209;STB=0.578177;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.0506297;OID=.;OPOS=152129115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:12:1:3:23:12:1:3:23
chr1	152185750	.	G	A	1883.52	PASS	AF=0.991935;AO=123;DP=125;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=95;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0906477;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5485;QD=60.7588;RBI=0.094868;REFB=-0.0975131;REVB=0.0279809;RO=0;SAF=95;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508771;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.000987548;OID=.;OPOS=152185750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:125:124:0:1:123:123:0.991935:28:95:0:0:28:95:0:1
chr1	152188413	.	C	T	98.77	PASS	AF=0.25;AO=14;DP=59;FAO=15;FDP=60;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0223997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.488;QD=6.58464;RBI=0.024977;REFB=-0.0113871;REVB=-0.0110501;RO=45;SAF=9;SAR=5;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241436;STB=0.666444;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0336271;OID=.;OPOS=152188413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:59:60:45:45:14:15:0.25:5:9:20:25:5:10:20:25
chr1	152190835	.	G	A	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00684544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.777;QD=59.018;RBI=0.013756;REFB=0;REVB=-0.0119317;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.40487e-05;OID=.;OPOS=152190835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:11:23:0:0:11:23:0:0
chr1	152190945	.	C	T	2386.01	PASS	AF=1;AO=142;DP=142;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.954;QD=64.054;RBI=0.0354579;REFB=0;REVB=0.0300096;RO=0;SAF=92;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.4897e-05;OID=.;OPOS=152190945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:142:149:0:0:142:149:1:50:92:0:0:53:96:0:0
chr1	152192555	.	T	C	740.4	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00128135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.531;QD=56.9537;RBI=0.00367786;REFB=0;REVB=0.00344744;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45929e-05;OID=.;OPOS=152192555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:19:33:0:0:19:33:0:0
chr1	152192687	.	T	C	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.535;QD=59.6794;RBI=0.0451899;REFB=0;REVB=0.0417327;RO=0;SAF=44;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103288;OID=.;OPOS=152192687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:26:44:0:0:26:44:0:0
chr1	152192978	.	T	C	1566.62	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.639;QD=63.9435;RBI=0.0731437;REFB=0;REVB=-0.0700876;RO=0;SAF=53;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.29459e-05;OID=.;OPOS=152192978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:45:53:0:0:45:53:0:0
chr1	152193052	.	A	G	1357.36	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000928662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1704;QD=62.4075;RBI=0.00359094;REFB=0;REVB=-0.00346878;RO=0;SAF=42;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.53175e-06;OID=.;OPOS=152193052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:44:42:0:0:45:42:0:0
chr1	152193547	.	G	A	905.96	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0212626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.098;QD=56.6223;RBI=0.0313452;REFB=-0.0504971;REVB=0.0230309;RO=1;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145288;STB=0.50769;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000574552;OID=.;OPOS=152193547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:32:31:0:1:32:31:0:1
chr1	152275453	.	G	A	59.46	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.023493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.099;QD=15.8556;RBI=0.0384745;REFB=0.0227207;REVB=-0.030469;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.470049;STB=0.768677;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.014658;OID=.;OPOS=152275453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:5:3:7:0:5:3:7:0
chr1	152276149	.	C	T	1948.25	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222785;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.347;QD=59.9463;RBI=0.0381178;REFB=0;REVB=0.0309295;RO=0;SAF=52;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61425e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151507;OID=.;OPOS=152276149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:130:0:0:124:130:1:72:52:0:0:78:52:0:0
chr1	152276659	.	TG	CC	379.99	PASS	AF=0.878788;AO=29;DP=33;FAO=29;FDP=33;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.026593;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=217.359;QD=46.0591;RBI=0.0268399;REFB=0.00132092;REVB=-0.00363208;RO=4;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080874;STB=0.54345;STBP=0.272;TYPE=mnp;VARB=-0.000139756;OID=.;OPOS=152276659;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:33:33:4:4:29:29:0.878788:21:8:0:4:21:8:0:4
chr1	152276671	.	C	T	508.24	PASS	AF=0.9;AO=36;DP=41;FAO=36;FDP=40;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0209345;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.631;QD=50.8238;RBI=0.0425697;REFB=-0.00642449;REVB=-0.0370665;RO=4;SAF=11;SAR=25;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692249;STB=0.537017;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=5.79657e-05;OID=.;OPOS=152276671;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:41:40:4:4:36:36:0.9:25:11:0:4:25:11:0:4
chr1	152276772	.	C	A	1917.74	PASS	AF=0.992063;AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0318486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.481;QD=60.8807;RBI=0.0873685;REFB=-0.0702313;REVB=0.0813568;RO=0;SAF=54;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.48324e-08;STB=0.504586;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00017214;OID=.;OPOS=152276772;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:126:126:0:1:125:125:0.992063:71:54:0:0:71:54:1:0
chr1	152276871	.	A	G	1408.75	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0522314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.862;QD=62.6112;RBI=0.0528883;REFB=0;REVB=-0.00831;RO=0;SAF=48;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.05419e-05;OID=.;OPOS=152276871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:90:0:0:88:90:1:40:48:0:0:40:50:0:0
chr1	152276889	.	A	G,T	1311.38	PASS	AF=0.953488,0.0465116;AO=82,4;DP=86;FAO=82,4;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=43,2;FSAR=39,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387345,-0.0396103;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=110.449,104.929;QD=60.9945;RBI=0.0442926,0.0421269;REFB=0,0;REVB=-0.0214819,-0.0143424;RO=0;SAF=43,2;SAR=39,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.10525e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000631318,0.0241914;OID=.,.;OPOS=152276889,152276889;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:86:86:0:0:82,4:82,4:0.953488,0.0465116:39,2:43,2:0:0:39,2:43,2:0:0
chr1	152277055	.	C	G	1014.31	PASS	AF=0.935065;AO=71;DP=76;FAO=72;FDP=77;FR=.;FRO=5;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0279295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.522;QD=52.6913;RBI=0.0311022;REFB=-0.054482;REVB=0.0136853;RO=5;SAF=37;SAR=34;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150516;STB=0.507396;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.00539028;OID=.;OPOS=152277055;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:76:77:5:5:71:72:0.935065:34:37:2:3:35:37:2:3
chr1	152277168	.	A	G	1730.66	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.029;QD=60.725;RBI=0.056127;REFB=0;REVB=0.0464928;RO=0;SAF=59;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.64297e-05;OID=.;OPOS=152277168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:55:59:0:0:55:59:0:0
chr1	152277345	.	C	T	1282.06	PASS	AF=0.965909;AO=85;DP=88;FAO=85;FDP=88;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0701844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9112;QD=58.2752;RBI=0.0972708;REFB=-0.126949;REVB=0.067348;RO=2;SAF=37;SAR=48;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00286387;STB=0.508004;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0138518;OID=.;OPOS=152277345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:88:88:2:3:85:85:0.965909:48:37:1:1:48:37:2:1
chr1	152277396	.	T	C	1279.91	PASS	AF=0.988235;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0323896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1981;QD=60.2312;RBI=0.0527872;REFB=0.0400766;REVB=0.0416822;RO=1;SAF=37;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126284;STB=0.506492;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.000673342;OID=.;OPOS=152277396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:85:1:1:83:84:0.988235:46:37:1:0:46:38:1:0
chr1	152277717	.	C	A	793.84	PASS	AF=1;AO=38;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.897;QD=64.8029;RBI=0.0644164;REFB=0;REVB=0.00406821;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294447;OID=.;OPOS=152277717;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:38:49:1:12:26:0:0:12:37:0:0
chr1	152278555	.	T	C	338.45	PASS	AF=0.627451;AO=32;DP=51;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0365587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1496;QD=26.5448;RBI=0.0445655;REFB=-0.0387964;REVB=0.0254861;RO=18;SAF=26;SAR=6;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140939;STB=0.57138;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.025846;OID=.;OPOS=152278555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:18:19:32:32:0.627451:6:26:12:6:6:26:13:6
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chr1	152278762	.	A	C	62.43	PASS	AF=0.0846774;AO=21;DP=249;FAO=21;FDP=248;FR=.;FRO=227;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=112;FSRR=115;FWDB=-0.0105745;FXX=0.0040159;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.056;QD=1.00695;RBI=0.0235732;REFB=-0.00351553;REVB=-0.0210683;RO=226;SAF=11;SAR=10;SRF=112;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328281;STB=0.527805;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0628612;OID=.;OPOS=152278762;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:249:248:226:227:21:21:0.0846774:10:11:112:114:10:11:112:115
chr1	152278775	.	T	A	57.38	PASS	AF=0.0816327;AO=20;DP=246;FAO=20;FDP=245;FR=.;FRO=225;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=110;FSRR=115;FWDB=-0.0387921;FXX=0.00809684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.503;QD=0.936843;RBI=0.0553976;REFB=8.68124e-05;REVB=0.0395483;RO=220;SAF=11;SAR=9;SRF=108;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682519;STB=0.555998;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=-0.00423206;OID=.;OPOS=152278775;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:246:245:220:225:20:20:0.0816327:9:11:108:112:9:11:110:115
chr1	152278788	.	G	A	59.37	PASS	AF=0.0813953;AO=21;DP=258;FAO=21;FDP=258;FR=.;FRO=237;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=121;FSRR=116;FWDB=0.0287451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.496;QD=0.920397;RBI=0.0321926;REFB=-0.0017771;REVB=-0.0144941;RO=234;SAF=11;SAR=10;SRF=120;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126901;STB=0.512183;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0283077;OID=.;OPOS=152278788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:258:258:234:237:21:21:0.0813953:10:11:120:114:10:11:121:116
chr1	152278809	.	G	A	39.1	PASS	AF=0.0686695;AO=16;DP=230;FAO=16;FDP=233;FR=.;FRO=217;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=111;FSRR=106;FWDB=-0.0280693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.667;QD=0.671159;RBI=0.031443;REFB=-0.00490149;REVB=0.0141695;RO=214;SAF=10;SAR=6;SRF=108;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131895;STB=0.606583;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0409984;OID=.;OPOS=152278809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:230:233:214:217:16:16:0.0686695:6:10:108:106:6:10:111:106
chr1	152278856	.	T	G	416.33	PASS	AF=0.374046;AO=49;DP=131;FAO=49;FDP=131;FR=.;FRO=82;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=47;FSRR=35;FWDB=0.00687073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.012;QD=12.7124;RBI=0.0102164;REFB=-0.0272211;REVB=0.0075609;RO=79;SAF=31;SAR=18;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860505;STB=0.539203;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0386396;OID=.;OPOS=152278856;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:79:82:49:49:0.374046:18:31:44:35:18:31:47:35
chr1	152279019	.	G	A	259.13	PASS	AF=0.283465;AO=34;DP=124;FAO=36;FDP=127;FR=.;FRO=91;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=50;FSRR=41;FWDB=-0.00328658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.462;QD=8.1617;RBI=0.00342398;REFB=-0.00314095;REVB=-0.00096022;RO=86;SAF=21;SAR=13;SRF=46;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10276;STB=0.566827;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0112887;OID=.;OPOS=152279019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:127:86:91:34:36:0.283465:13:21:46:40:13:23:50:41
chr1	152279729	.	C	T	2142.6	PASS	AF=0.948718;AO=148;DP=157;FAO=148;FDP=156;FR=.;FRO=8;FSAF=85;FSAR=63;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0523823;FXX=0.00636902;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.794;QD=54.9385;RBI=0.0535844;REFB=-0.16075;REVB=-0.0112864;RO=4;SAF=85;SAR=63;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218523;STB=0.522469;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00207987;OID=.;OPOS=152279729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:157:156:4:8:148:148:0.948718:63:85:4:0:63:85:8:0
chr1	152279841	.	G	C	1040.69	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.513;QD=59.4682;RBI=0.0902781;REFB=0;REVB=0.0896849;RO=0;SAF=53;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293062;OID=.;OPOS=152279841;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:16:53:0:0:17:53:0:0
chr1	152279920	.	A	G	1442.72	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.805;QD=62.727;RBI=0.0466331;REFB=0;REVB=-0.0144093;RO=0;SAF=32;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.53094e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.51715e-05;OID=.;OPOS=152279920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:59:32:0:0:59:33:0:0
chr1	152280032	.	T	C	1949.69	PASS	AF=0.977099;AO=128;DP=132;FAO=128;FDP=131;FR=.;FRO=3;FSAF=79;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0190295;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.3776;QD=59.5325;RBI=0.0478239;REFB=-0.136586;REVB=0.0438748;RO=2;SAF=79;SAR=49;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189977;STB=0.514849;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00733675;OID=.;OPOS=152280032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:132:131:2:3:128:128:0.977099:49:79:0:2:49:79:0:3
chr1	152280113	.	G	A	811.94	PASS	AF=0.68932;AO=71;DP=101;FAO=71;FDP=103;FR=.;FRO=32;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=28;FSRR=4;FWDB=0.0138825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.549;QD=31.5317;RBI=0.0210369;REFB=-0.0496309;REVB=0.015806;RO=30;SAF=41;SAR=30;SRF=26;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168873;STB=0.597549;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0214303;OID=.;OPOS=152280113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:103:30:32:71:71:0.68932:30:41:26:4:30:41:28:4
chr1	152280126	.	C	T	173.62	PASS	AF=0.269663;AO=24;DP=87;FAO=24;FDP=89;FR=.;FRO=65;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.000925568;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.18;QD=7.80303;RBI=0.015149;REFB=-0.0113952;REVB=-0.0151207;RO=63;SAF=21;SAR=3;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505635;STB=0.804584;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0191364;OID=.;OPOS=152280126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:89:63:65:24:24:0.269663:3:21:33:30:3:21:35:30
chr1	152280133	.	C	T	155.74	PASS	AF=0.269231;AO=20;DP=79;FAO=21;FDP=78;FR=.,HEALED;FRO=55;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.00409213;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.52;QD=7.98656;RBI=0.0042677;REFB=-0.0196522;REVB=-0.0012115;RO=45;SAF=17;SAR=3;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.498804;STB=0.734625;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.062136;OID=.;OPOS=152280133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:45:55:20:21:0.269231:3:17:21:24:4:17:29:26
chr1	152280142	.	C	G	61.29	PASS	AF=0.171875;AO=11;DP=65;FAO=11;FDP=64;FR=.;FRO=53;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0190984;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2178;QD=3.83063;RBI=0.109513;REFB=-0.0100133;REVB=-0.107834;RO=50;SAF=8;SAR=3;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332567;STB=0.714302;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.080879;OID=.;OPOS=152280142;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:65:64:50:53:11:11:0.171875:3:8:23:27:3:8:25:28
chr1	152280147	.	TG	CC	44.31	PASS	AF=0.166667;AO=11;DP=61;FAO=10;FDP=60;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0361988;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=2;MLLD=270.289;QD=2.95421;RBI=0.0362574;REFB=-0.0173475;REVB=-0.00206033;RO=44;SAF=9;SAR=2;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.536584;STB=0.893028;STBP=0.005;TYPE=mnp;VARB=0.192509;OID=.;OPOS=152280147;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:61:60:44:50:11:10:0.166667:2:9:16:28:1:9:22:28
chr1	152280164	.	T	C	40.54	PASS	AF=0.148936;AO=7;DP=47;FAO=7;FDP=47;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0107391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2097;QD=3.45035;RBI=0.0296279;REFB=-0.00428066;REVB=0.0276131;RO=40;SAF=6;SAR=1;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.512989;STB=0.861258;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0677892;OID=.;OPOS=152280164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:47:47:40:40:7:7:0.148936:1:6:17:23:1:6:17:23
chr1	152280170	.	C	G	546.11	PASS	AF=0.866667;AO=39;DP=45;FAO=39;FDP=45;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0962876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4839;QD=48.5434;RBI=0.0963112;REFB=-0.0666262;REVB=0.00212769;RO=6;SAF=16;SAR=23;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147143;STB=0.578907;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0111356;OID=.;OPOS=152280170;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:45:45:6:6:39:39:0.866667:23:16:6:0:23:16:6:0
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chr1	152280788	.	T	G	351.71	PASS	AF=0.371681;AO=40;DP=116;FAO=42;FDP=113;FR=.,HEALED;FRO=71;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=-0.0515761;FXX=0.0258598;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.396;QD=12.4499;RBI=0.0531092;REFB=-0.029184;REVB=-0.0126686;RO=43;SAF=19;SAR=21;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746272;STB=0.545815;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0330926;OID=.;OPOS=152280788;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:113:43:71:40:42:0.371681:21:19:17:26:22:20:39:32
chr1	152280864	.	A	G	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.079;QD=57.5452;RBI=0.0363594;REFB=0;REVB=0.0076645;RO=0;SAF=19;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01452e-05;OID=.;OPOS=152280864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:39:19:0:0:39:19:0:0
chr1	152280900	.	T	G	445.93	PASS	AF=0.565789;AO=43;DP=76;FAO=43;FDP=76;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.0209995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7268;QD=23.4702;RBI=0.034618;REFB=-0.00964901;REVB=-0.0275214;RO=33;SAF=19;SAR=24;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13835;STB=0.575724;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00608009;OID=.;OPOS=152280900;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:33:33:43:43:0.565789:24:19:9:24:24:19:9:24
chr1	152281007	.	AA	GG	999.05	PASS	AF=0.474886;AO=100;DP=210;FAO=104;FDP=219;FR=.;FRO=115;FSAF=45;FSAR=59;FSRF=55;FSRR=60;FWDB=-0.00465903;FXX=0.00454525;HRUN=2;LEN=2;MLLD=94.4224;QD=18.2475;RBI=0.0203308;REFB=-0.0259562;REVB=-0.0197898;RO=110;SAF=44;SAR=56;SRF=53;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400488;STB=0.524207;STBP=0.498;TYPE=mnp;VARB=0.0293891;OID=.;OPOS=152281007;OREF=AA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:219:110:115:100:104:0.474886:56:44:53:57:59:45:55:60
chr1	152281039	.	G	A	1204.07	PASS	AF=0.48;AO=120;DP=250;FAO=120;FDP=250;FR=.;FRO=130;FSAF=59;FSAR=61;FSRF=57;FSRR=73;FWDB=0.00374933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.085;QD=19.2651;RBI=0.0535868;REFB=-0.0212145;REVB=0.0534555;RO=128;SAF=59;SAR=61;SRF=57;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435279;STB=0.527695;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0272012;OID=.;OPOS=152281039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:250:250:128:130:120:120:0.48:61:59:57:71:61:59:57:73
chr1	152281228	.	C	G	805.45	PASS	AF=0.572519;AO=74;DP=130;FAO=75;FDP=131;FR=.;FRO=56;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.120591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6256;QD=24.5938;RBI=0.120616;REFB=-0.034393;REVB=-0.0024996;RO=52;SAF=32;SAR=42;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371227;STB=0.525855;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.023549;OID=.;OPOS=152281228;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:131:52:56:74:75:0.572519:42:32:25:27:42:33:28:28
chr1	152281290	.	A	G	278.96	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0170701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.465;QD=16.4093;RBI=0.0173369;REFB=-0.0158412;REVB=-0.00302926;RO=37;SAF=15;SAR=16;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286567;STB=0.516119;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0198218;OID=.;OPOS=152281290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:37:37:31:31:0.455882:16:15:19:18:16:15:19:18
chr1	152281304	.	A	C	260.21	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0214188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.488;QD=16.7875;RBI=0.0217352;REFB=-0.0252349;REVB=0.003695;RO=31;SAF=19;SAR=10;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164179;STB=0.578399;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0260294;OID=.;OPOS=152281304;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:31:33:29:29:0.467742:10:19:15:16:10:19:17:16
chr1	152281479	.	G	T	3043.59	PASS	AF=0.985294;AO=198;DP=201;FAO=201;FDP=204;FR=.;FRO=3;FSAF=120;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0197231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4354;QD=59.6782;RBI=0.060035;REFB=-0.0192709;REVB=0.0567028;RO=2;SAF=118;SAR=80;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011756;STB=0.50909;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.000179532;OID=.;OPOS=152281479;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:201:204:2:3:198:201:0.985294:80:118:0:2:81:120:0:3
chr1	152281523	.	A	C	774.8	PASS	AF=0.37551;AO=85;DP=231;FAO=92;FDP=245;FR=.;FRO=153;FSAF=64;FSAR=28;FSRF=91;FSRR=62;FWDB=-0.0194307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.4734;QD=12.6497;RBI=0.0287999;REFB=-0.0109828;REVB=-0.0212575;RO=146;SAF=56;SAR=29;SRF=90;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515166;STB=0.570281;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0208911;OID=.;OPOS=152281523;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:231:245:146:153:85:92:0.37551:29:56:90:56:28:64:91:62
chr1	152281534	.	A	T	692.46	PASS	AF=0.341085;AO=87;DP=259;FAO=88;FDP=258;FR=.;FRO=170;FSAF=61;FSAR=27;FSRF=96;FSRR=74;FWDB=-0.000182094;FXX=0.00386085;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.088;QD=10.7358;RBI=0.0150772;REFB=0.00195191;REVB=-0.0150761;RO=168;SAF=61;SAR=26;SRF=96;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164046;STB=0.592382;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=-0.00633666;OID=.;OPOS=152281534;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:259:258:168:170:87:88:0.341085:26:61:96:72:27:61:96:74
chr1	152281690	.	C	T	2921.91	PASS	AF=0.975;AO=195;DP=203;FAO=195;FDP=200;FR=.;FRO=5;FSAF=90;FSAR=105;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0143516;FXX=0.0147776;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.883;QD=58.4382;RBI=0.0145292;REFB=-0.103949;REVB=0.00226446;RO=5;SAF=90;SAR=105;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257182;STB=0.513512;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00111932;OID=.;OPOS=152281690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:203:200:5:5:195:195:0.975:105:90:5:0:105:90:5:0
chr1	152281948	.	G	A	1511.11	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143036;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.512;QD=59.8458;RBI=0.048878;REFB=0;REVB=0.0467382;RO=0;SAF=40;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48979e-05;OID=.;OPOS=152281948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:101:0:0:101:101:1:61:40:0:0:61:40:0:0
chr1	152282267	.	G	A	1049.6	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272427;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.142;QD=59.9772;RBI=0.0582578;REFB=0;REVB=0.0514957;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365826;OID=.;OPOS=152282267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:71:70:0:0:70:70:1:35:35:0:0:35:35:0:0
chr1	152282311	.	C	T	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8529;QD=56.9999;RBI=0.0213442;REFB=0;REVB=-0.0187622;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000251753;OID=.;OPOS=152282311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0
chr1	152282917	.	G	T	1641.39	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.708;QD=60.2344;RBI=0.0124886;REFB=0;REVB=0.00657867;RO=0;SAF=67;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7257e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.02096e-06;OID=.;OPOS=152282917;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:42:67:0:0:42:67:0:0
chr1	152283236	.	T	C	703.8	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.959;QD=55.1996;RBI=0.0482008;REFB=-0.0808533;REVB=0.0341777;RO=1;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140538;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000752559;OID=.;OPOS=152283236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:51:51:1:0:50:51:1:33:17:0:1:34:17:0:0
chr1	152283283	.	C	G,T	728.39	PASS	AF=0.0384615,0.961538;AO=2,50;DP=53;FAO=2,50;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=2,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00847845,0.0327118;FXX=0.0188644;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=110.015,84.1131;QD=56.0302;RBI=0.00849367,0.0347802;REFB=0,0;REVB=-0.000508152,0.0118152;RO=0;SAF=0,20;SAR=2,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.104543,6.6481e-06;OID=.,.;OPOS=152283283,152283283;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:53:52:0:0:2,50:2,50:0.0384615,0.961538:2,30:0,20:0:0:2,30:0,20:0:0
chr1	152283862	.	G	C	646.69	PASS	AF=0.941176;AO=47;DP=50;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0213652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.304;QD=50.7209;RBI=0.0506139;REFB=-0.0115448;REVB=0.0458834;RO=3;SAF=19;SAR=28;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030483;STB=0.516533;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.000356206;OID=.;OPOS=152283862;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:50:51:3:3:47:48:0.941176:28:19:2:1:29:19:2:1
chr1	152283975	.	A	G	1260.63	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.822;QD=61.4942;RBI=0.0569091;REFB=0;REVB=0.0400952;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.65317e-05;OID=.;OPOS=152283975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:42:40:0:0:42:40:0:0
chr1	152284854	.	A	G	2381.23	PASS	AF=0.987421;AO=155;DP=159;FAO=157;FDP=159;FR=.;FRO=2;FSAF=92;FSAR=65;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00559964;FXX=0.0185174;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.39;QD=59.9051;RBI=0.0232125;REFB=0.0157612;REVB=0.0225269;RO=2;SAF=91;SAR=64;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103401;STB=0.505376;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.000145643;OID=.;OPOS=152284854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:159:159:2:2:155:157:0.987421:64:91:2:0:65:92:2:0
chr1	152285099	.	C	T	523.74	PASS	AF=1;AO=31;DP=38;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.326;QD=59.8562;RBI=0.053884;REFB=0;REVB=0.0438751;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230809;OID=.;OPOS=152285099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:35:0:0:31:35:1:16:15:0:0:15:20:0:0
chr1	152285930	.	G	A	2370.29	PASS	AF=1;AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00759957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.385;QD=64.062;RBI=0.0149222;REFB=0;REVB=-0.012842;RO=0;SAF=83;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.53475e-06;OID=.;OPOS=152285930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:148:148:0:0:148:148:1:65:83:0:0:65:83:0:0
chr1	152286002	.	T	C	1563.68	PASS	AF=1;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0655217;FXX=0.0280348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.3773;QD=60.1414;RBI=0.0721544;REFB=0;REVB=0.0302185;RO=0;SAF=63;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05495e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000347719;OID=.;OPOS=152286002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:104:0:0:104:104:1:41:63:0:0:41:63:0:0
chr1	152286032	.	C	T	1578.77	PASS	AF=0.990654;AO=106;DP=108;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0288785;FXX=0.0092584;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.976;QD=59.0194;RBI=0.0432793;REFB=-0.104426;REVB=-0.0322355;RO=0;SAF=61;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81716e-08;STB=0.505493;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.000120402;OID=.;OPOS=152286032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:108:107:0:1:106:106:0.990654:45:61:0:0:45:61:0:1
chr1	152286367	.	C	A	868.23	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.587;QD=57.882;RBI=0.0360799;REFB=0;REVB=-0.0252421;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40246e-06;OID=.;OPOS=152286367;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:32:28:0:0:32:28:0:0
chr1	152323132	.	G	T	1373.65	PASS	AF=1;AO=86;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000391255;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.238;QD=62.4386;RBI=0.0110576;REFB=0;REVB=0.0110507;RO=0;SAF=53;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35579e-05;OID=.;OPOS=152323132;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:88:0:0:86:88:1:33:53:0:0:33:55:0:0
chr1	152325732	.	G	A	1616.42	PASS	AF=0.990826;AO=104;DP=107;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0615728;FXX=0.0267833;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.676;QD=59.3183;RBI=0.0625277;REFB=-0.0502315;REVB=0.0108861;RO=1;SAF=61;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0077163;STB=0.503875;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00021727;OID=.;OPOS=152325732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:107:109:1:1:104:108:0.990826:43:61:1:0:44:64:1:0
chr1	152326843	.	C	T	611.93	PASS	AF=0.535088;AO=61;DP=115;FAO=61;FDP=114;FR=.;FRO=53;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.0135461;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.34;QD=21.4712;RBI=0.0465002;REFB=-0.0237944;REVB=-0.0444834;RO=53;SAF=40;SAR=21;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478623;STB=0.526307;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0167209;OID=.;OPOS=152326843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:114:53:53:61:61:0.535088:21:40:32:21:21:40:32:21
chr1	152327469	.	C	T	393.31	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.268;QD=56.1875;RBI=0.0571344;REFB=0;REVB=0.0553627;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000315244;OID=.;OPOS=152327469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr1	152327502	.	A	G	171.86	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00146926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.506;QD=45.8303;RBI=0.0216246;REFB=0;REVB=0.0215746;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000452939;OID=.;OPOS=152327502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:5:9:0:0:6:9:0:0
chr1	152327526	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.56;QD=35.5758;RBI=0.0833317;REFB=0;REVB=0.0822412;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00234973;OID=.;OPOS=152327526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr1	152327633	.	T	C	62.25	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.997;QD=35.574;RBI=0.0299815;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000993463;OID=.;OPOS=152327633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:0:7:0:0:0:7:0:0
chr1	152327652	.	G	T	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00750444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=387.442;QD=39.2068;RBI=0.00833745;REFB=0;REVB=0.00363271;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.16269e-05;OID=.;OPOS=152327652;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
chr1	152327656	.	G	A	88.32	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=368.803;QD=39.2537;RBI=0.0250722;REFB=0;REVB=0.00464101;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170276;OID=.;OPOS=152327656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:2:6:0:0:2:7:0:0
chr1	152327658	.	T	A	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.099;QD=39.2068;RBI=0.0330631;REFB=0;REVB=0.00998662;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000321356;OID=.;OPOS=152327658;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
chr1	152327667	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232587;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.196;QD=47.8223;RBI=0.0260151;REFB=0;REVB=0.011654;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154418;OID=.;OPOS=152327667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr1	152328411	.	A	G	397.71	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0743094;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.737;QD=56.8157;RBI=0.0776263;REFB=0;REVB=0.0224487;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000494283;OID=.;OPOS=152328411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr1	152329435	.	C	T	789.35	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150387;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.805;QD=64.437;RBI=0.0170946;REFB=0;REVB=-0.00812802;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125606;OID=.;OPOS=152329435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0
chr1	152331240	.	G	A	1570.1	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.301;QD=64.0859;RBI=0.046747;REFB=0;REVB=0.0362434;RO=0;SAF=43;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27788e-05;OID=.;OPOS=152331240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:98:0:0:94:98:1:51:43:0:0:54:44:0:0
chr1	152382120	.	C	T	739.99	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1146;QD=56.9226;RBI=0.0655328;REFB=0;REVB=0.0502696;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106975;OID=.;OPOS=152382120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:21:31:0:0:21:31:0:0
chr1	152488146	.	G	A	166.82	PASS	AF=0.4;AO=17;DP=44;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00823917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.726;QD=14.8288;RBI=0.0123779;REFB=-0.0146554;REVB=-0.00923738;RO=27;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277166;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.019174;OID=.;OPOS=152488146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:27:27:17:18:0.4:9:8:12:15:10:8:12:15
chr1	152552285	.	C	A	61.64	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0187149;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=56.026;QD=7.25138;RBI=0.110378;REFB=0.00257384;REVB=0.108779;RO=25;SAF=5;SAR=4;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101922;STB=0.563621;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=-0.00691407;OID=.;OPOS=152552285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:4:5:16:9:4:5:16:9
chr1	152659471	.	T	G	122.3	PASS	AF=0.306122;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.00894882;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.601;QD=9.98372;RBI=0.0280351;REFB=-0.00739118;REVB=-0.0265685;RO=33;SAF=10;SAR=5;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.488711;STB=0.774687;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0154016;OID=.;OPOS=152659471;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:49:33:34:15:15:0.306122:5:10:7:26:5:10:8:26
chr1	152681835	.	G	T	352.88	PASS	AF=0.383929;AO=43;DP=112;FAO=43;FDP=112;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=37;FWDB=-0.000563455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.7199;QD=12.6028;RBI=0.00145032;REFB=-0.0171832;REVB=-0.00133639;RO=69;SAF=24;SAR=19;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102241;STB=0.558113;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0702521;OID=.;OPOS=152681835;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:69:69:43:43:0.383929:19:24:32:37:19:24:32:37
chr1	152692074	.	G	C	325.33	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0242788;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.632;QD=19.137;RBI=0.0246366;REFB=-0.00333719;REVB=0.00418357;RO=33;SAF=17;SAR=17;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402297;STB=0.514697;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0046331;OID=.;OPOS=152692074;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:33:34:34:34:0.5:17:17:18:15:17:17:18:16
chr1	152692472	.	A	C	236.84	PASS	AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00501693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.438;QD=26.3157;RBI=0.0111931;REFB=-0.0117877;REVB=-0.0100058;RO=14;SAF=14;SAR=8;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00492302;STB=0.50273;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0094448;OID=.;OPOS=152692472;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:14:14:22:22:0.611111:8:14:9:5:8:14:9:5
chr1	152692588	.	A	G	244.28	PASS	AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=0.010519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2589;QD=13.0284;RBI=0.0490466;REFB=-0.0132955;REVB=-0.0479053;RO=46;SAF=14;SAR=15;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181184;STB=0.603222;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0153307;OID=.;OPOS=152692588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:15:14:30:16:15:14:30:16
chr1	152692781	.	G	T	223.63	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.000369417;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.194;QD=18.6355;RBI=0.0050606;REFB=-0.0198935;REVB=0.0050471;RO=23;SAF=11;SAR=11;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985473;STB=0.562444;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0205409;OID=.;OPOS=152692781;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:23:26:22:22:0.458333:11:11:14:9:11:11:16:10
chr1	152692862	.	G	C	60.16	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00873586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.649;QD=10.9381;RBI=0.0169782;REFB=-0.0101059;REVB=0.0145583;RO=13;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278721;STB=0.666296;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0216753;OID=.;OPOS=152692862;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:22:22:13:13:9:9:0.409091:3:6:5:8:3:6:5:8
chr1	152732436	.	G	C	161.01	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0580261;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.062;QD=16.5143;RBI=0.0580414;REFB=-0.0395386;REVB=0.00133151;RO=21;SAF=4;SAR=13;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064498;STB=0.560709;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0467324;OID=.;OPOS=152732436;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:39:21:22:17:17:0.435897:13:4:6:15:13:4:7:15
chr1	152733301	.	T	A	173.03	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00273389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.802;QD=18.706;RBI=0.035976;REFB=-0.00981397;REVB=-0.035872;RO=19;SAF=15;SAR=3;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309412;STB=0.678784;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00820994;OID=.;OPOS=152733301;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:3:15:11:8:3:15:11:8
chr1	152734187	.	G	A	207.93	PASS	AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=31;FWDB=-0.00507232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.363;QD=13.4147;RBI=0.0270025;REFB=-0.0133873;REVB=-0.0265218;RO=33;SAF=10;SAR=15;SRF=4;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318109;STB=0.657036;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0483244;OID=.;OPOS=152734187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:37:25:25:0.403226:15:10:4:29:15:10:6:31
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chr1	152760628	.	T	C	125.71	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.000573321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.871;QD=10.699;RBI=0.0171962;REFB=-0.0123016;REVB=-0.0171866;RO=32;SAF=9;SAR=6;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299155;STB=0.517834;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.02398;OID=.;OPOS=152760628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:32:32:15:15:0.319149:6:9:20:12:6:9:20:12
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chr1	152760644	.	C	T	167.16	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0203404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.637;QD=15.1967;RBI=0.0255891;REFB=-0.0103739;REVB=-0.0155264;RO=26;SAF=10;SAR=8;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0625797;STB=0.536043;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.00874869;OID=.;OPOS=152760644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:8:10:16:10:8:10:16:10
chr1	152760647	.	C	A	153.37	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.012951;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.872;QD=13.9429;RBI=0.015902;REFB=0.0162474;REVB=-0.00922745;RO=27;SAF=9;SAR=8;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107119;STB=0.562091;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.00360197;OID=.;OPOS=152760647;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:8:9:17:10:8:9:17:10
chr1	152760651	.	C	T	153.4	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=3.15858e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.263;QD=13.945;RBI=0.0167163;REFB=-0.00970768;REVB=0.0167163;RO=27;SAF=9;SAR=8;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107119;STB=0.562091;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00517693;OID=.;OPOS=152760651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:8:9:17:10:8:9:17:10
chr1	152770613	.	T	G	74.68	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.000840132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.532;QD=10.668;RBI=0.0231647;REFB=0.000765576;REVB=-0.0231494;RO=18;SAF=8;SAR=2;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583487;STB=0.534817;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=-0.00164685;OID=.;OPOS=152770613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:2:8:15:3:2:8:15:3
chr1	152770828	.	A	G	100.64	PASS	AF=0.188889;AO=17;DP=90;FAO=17;FDP=90;FR=.;FRO=73;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=-0.0383219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.564;QD=4.47271;RBI=0.0567698;REFB=-0.000797903;REVB=-0.0418836;RO=72;SAF=10;SAR=7;SRF=33;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162773;STB=0.60947;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0032545;OID=.;OPOS=152770828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:72:73:17:17:0.188889:7:10:33:39:7:10:33:40
chr1	152882610	.	A	G	162.1	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.00866114;FXX=0.0277701;HRUN=4;LEN=1;MLLD=165.641;QD=18.5258;RBI=0.0170483;REFB=-0.0361849;REVB=-0.0146844;RO=14;SAF=6;SAR=11;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127426;STB=0.576838;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0334695;OID=.;OPOS=152882610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:14:18:17:17:0.485714:11:6:3:11:11:6:4:14
chr1	152883680	.	A	G	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.00598801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.492;QD=17.2298;RBI=0.0537423;REFB=-0.0647212;REVB=-0.0534077;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376076;STB=0.713847;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0611694;OID=.;OPOS=152883680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:4:4:0:6:4:4:0:6
chr1	152883711	.	G	C	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0252535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.67;QD=16.4545;RBI=0.0381005;REFB=-0.0215415;REVB=0.028529;RO=4;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168827;STB=0.599679;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0125414;OID=.;OPOS=152883711;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:3:3:1:3:3:3:1:3
chr1	152884111	.	G	A	265.6	PASS	AF=0.434783;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=0.0471653;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.587;QD=15.3972;RBI=0.0666268;REFB=0.00616079;REVB=-0.0470591;RO=36;SAF=12;SAR=18;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304552;STB=0.687035;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=-0.00960909;OID=.;OPOS=152884111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:36:39:30:30:0.434783:18:12:26:10:18:12:29:10
chr1	152884246	.	GA	TG	219.41	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0280306;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=2;MLLD=236.492;QD=22.5038;RBI=0.0282764;REFB=-0.00609842;REVB=-0.00371976;RO=17;SAF=8;SAR=13;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238952;STB=0.503872;STBP=0.991;TYPE=mnp;VARB=0.00501033;OID=.;OPOS=152884246;OREF=GA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:17:18:21:21:0.538462:13:8:6:11:13:8:7:11
chr1	152944594	.	C	T	1264.38	PASS	AF=1;AO=81;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282496;FXX=0.0459717;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0284;QD=60.9339;RBI=0.0611989;REFB=0;REVB=0.0542887;RO=0;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000662706;OID=.;OPOS=152944594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:81:83:1:38:43:0:0:38:45:0:0
chr1	152957832	.	C	A	144.77	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000589246;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.0437;QD=44.5449;RBI=0.0808406;REFB=0;REVB=0.0808384;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00382254;OID=.;OPOS=152957832;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr1	152957887	.	G	A	194.43	PASS	AF=0.85;AO=17;DP=21;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00882013;FXX=0.0908678;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.741;QD=38.8868;RBI=0.012956;REFB=0.00649655;REVB=0.00949024;RO=3;SAF=8;SAR=9;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377357;STB=0.520686;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=-0.00081611;OID=.;OPOS=152957887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:21:20:3:3:17:17:0.85:9:8:1:2:9:8:1:2
chr1	152958238	.	A	G	1034.86	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0248181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4791;QD=56.7048;RBI=0.0248353;REFB=-0.0224476;REVB=-0.00092558;RO=2;SAF=33;SAR=38;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277951;STB=0.514702;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.00706108;OID=.;OPOS=152958238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:38:33:2:0:38:33:2:0
chr1	152958267	.	T	C	868.0	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00220345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7181;QD=57.8664;RBI=0.069411;REFB=0;REVB=-0.069376;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000664956;OID=.;OPOS=152958267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:31:29:0:0:31:29:0:0
chr1	152975495	.	G	A	805.54	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0041941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.08;QD=64.4431;RBI=0.0274426;REFB=0;REVB=0.0271203;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.48531e-05;OID=.;OPOS=152975495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:28:21:0:0:29:21:0:0
chr1	152975715	.	C	T	57.13	PASS	AF=0.875;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0740793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8882;QD=28.5645;RBI=0.0747504;REFB=-0.013426;REVB=0.00999426;RO=1;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789211;STB=0.54533;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00702846;OID=.;OPOS=152975715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:8:1:1:6:7:0.875:5:1:0:1:5:2:0:1
chr1	152975829	.	A	G	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0908512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5709;QD=54.5166;RBI=0.0914868;REFB=0;REVB=0.0107652;RO=0;SAF=21;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00222508;OID=.;OPOS=152975829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:4:21:0:0:4:21:0:0
chr1	152975936	.	C	G	148.12	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=0.0153579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.573;QD=17.9533;RBI=0.0353781;REFB=0.019953;REVB=0.0318707;RO=17;SAF=12;SAR=4;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177849;STB=0.599891;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=-0.0130078;OID=.;OPOS=152975936;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:4:12:15:2:4:12:15:2
chr1	152975941	.	C	G	501.03	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.27;QD=58.9452;RBI=0.0137449;REFB=0;REVB=0.00326323;RO=0;SAF=28;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73777e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.13634e-05;OID=.;OPOS=152975941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:6:28:0:0:6:28:0:0
chr1	152976108	.	C	T	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000419002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.35;QD=62.0211;RBI=0.0294614;REFB=0;REVB=-0.0294584;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.82827e-05;OID=.;OPOS=152976108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:16:26:0:0:16:26:0:0
chr1	152976114	.	G	C	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.228;QD=61.3361;RBI=0.0233182;REFB=0;REVB=0.0162761;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.88234e-05;OID=.;OPOS=152976114;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr1	152976306	.	T	G	836.01	PASS	AF=0.926471;AO=61;DP=68;FAO=63;FDP=68;FR=.;FRO=5;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0419566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.692;QD=49.1769;RBI=0.062283;REFB=-0.0808938;REVB=0.0460306;RO=4;SAF=33;SAR=28;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538511;STB=0.533323;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0067514;OID=.;OPOS=152976306;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:68:68:4:5:61:63:0.926471:28:33:4:0:28:35:5:0
chr1	153004847	.	CTT	CCT,CTC,CT	183.2	PASS	AF=0.75,0.25,0;AO=8,4,3;DP=16;FAO=12,4,0;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0,0;FSAR=3,4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107859,-0.117245,-0.136033;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=1,1,1;MLLD=26.8542,17.7189,21.0481;QD=45.8007;RBI=0.125478,0.117494,0.149916;REFB=0,0,0;REVB=-0.0641186,-0.00763596,-0.0630052;RO=0;SAF=5,0,3;SAR=3,4,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=4.46938e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,snp,del;VARB=0.026373,0.0356841,-0.00688545;OID=.,.,.;OPOS=153004848,153004849,153004848;OREF=T,T,T;OALT=C,C,-;OMAPALT=CCT,CTC,CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.75,0.25,0:8,4,3:16:12,4,0:16:0:9,0,0:3,4,0:0:0:21:0:5,0,3:3,4,0:0:0
chr1	153004853	.	C	T	115.82	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0485597;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.084;QD=30.8843;RBI=0.0500414;REFB=-0.065837;REVB=0.0120869;RO=3;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206702;STB=0.615195;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00182158;OID=.;OPOS=153004853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:15:15:3:3:12:12:0.8:7:5:3:0:7:5:3:0
chr1	153004983	.	C	T	93.64	PASS	AF=0.833333;AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0170327;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.915;QD=31.2144;RBI=0.0342286;REFB=-0.203165;REVB=0.0296898;RO=1;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126911;STB=0.538382;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.00494244;OID=.;OPOS=153004983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:12:12:1:2:10:10:0.833333:3:7:0:1:3:7:1:1
chr1	153005156	.	C	T	340.7	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.189;QD=54.5119;RBI=0.0400033;REFB=0;REVB=-0.0322853;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000175699;OID=.;OPOS=153005156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr1	153029137	.	C	T	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0158302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2885;QD=12.3963;RBI=0.0158302;REFB=0.000416293;REVB=0;RO=5;SAF=5;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00107226;OID=.;OPOS=153029137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:0:5:5:0:0:5:5:0
chr1	153085029	.	G	T	649.7	PASS	AF=0.507812;AO=65;DP=128;FAO=65;FDP=128;FR=.;FRO=63;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=0.0138305;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.116;QD=20.303;RBI=0.0350382;REFB=-0.0280576;REVB=-0.032193;RO=63;SAF=44;SAR=21;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576628;STB=0.531819;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0244624;OID=.;OPOS=153085029;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:63:63:65:65:0.507812:21:44:39:24:21:44:39:24
chr1	153113139	.	G	A	64.57	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.084854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.4383;QD=10.332;RBI=0.0919086;REFB=-0.0259201;REVB=0.0353127;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190233;STB=0.612681;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0537836;OID=.;OPOS=153113139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:6:3:3:13:6:3:3:13
chr1	153191019	.	C	T	300.61	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00585875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.661;QD=21.4722;RBI=0.0167392;REFB=-0.0315974;REVB=-0.0156804;RO=23;SAF=11;SAR=20;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167266;STB=0.576872;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.025099;OID=.;OPOS=153191019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:23:25:31:31:0.553571:20:11:13:10:20:11:13:12
chr1	153276449	.	T	C	158.36	PASS	AF=0.363636;AO=18;DP=53;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.0198494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.158;QD=11.5167;RBI=0.0344318;REFB=-0.0230565;REVB=-0.0281345;RO=35;SAF=6;SAR=12;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242871;STB=0.510719;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0389423;OID=.;OPOS=153276449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:35:35:18:20:0.363636:12:6:11:24:14:6:11:24
chr1	153279598	.	C	T	502.15	PASS	AF=0.465517;AO=53;DP=116;FAO=54;FDP=116;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.0393086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.623;QD=17.3156;RBI=0.0419943;REFB=0.00535164;REVB=-0.0147769;RO=62;SAF=26;SAR=27;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715323;STB=0.53447;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.00408277;OID=.;OPOS=153279598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:62:62:53:54:0.465517:27:26:35:27:27:27:35:27
chr1	153304140	.	AG	A	358.09	PASS	AF=0.652174;AO=30;DP=46;FAO=30;FDP=46;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0174779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.548;QD=31.138;RBI=0.029004;REFB=-0.0276354;REVB=0.0231463;RO=16;SAF=15;SAR=15;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0171615;OID=.;OPOS=153304141;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.652174:30:46:30:46:16:15:15:8:8:99:16:15:15:8:8
chr1	153314153	.	C	A	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00515394;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.383;QD=59.6794;RBI=0.0227169;REFB=0;REVB=0.0221245;RO=0;SAF=21;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.0379e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96717e-05;OID=.;OPOS=153314153;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:49:21:0:0:49:21:0:0
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chr1	153320334	.	T	C	198.42	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00597017;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=291.491;QD=44.0923;RBI=0.00598045;REFB=0.0450557;REVB=-0.000350445;RO=1;SAF=6;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703222;STB=0.538415;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.000240842;OID=.;OPOS=153320334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:11:6:1:0:11:6:1:0
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chr1	153431406	.	C	G	1970.93	PASS	AF=1;AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.706;QD=62.0765;RBI=0.0715225;REFB=0;REVB=-0.056063;RO=0;SAF=57;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.19882e-05;OID=.;OPOS=153431406;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:127:0:0:127:127:1:70:57:0:0:70:57:0:0
chr1	153509890	.	T	C	139.91	PASS	AF=0.30303;AO=19;DP=66;FAO=20;FDP=66;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0354309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7757;QD=8.47906;RBI=0.0412662;REFB=-0.0158181;REVB=0.0211554;RO=46;SAF=8;SAR=11;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425979;STB=0.504583;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0383862;OID=.;OPOS=153509890;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:46:46:19:20:0.30303:11:8:21:25:11:9:21:25
chr1	153580070	.	G	A	541.8	PASS	AF=0.525773;AO=51;DP=97;FAO=51;FDP=97;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.0340309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.564;QD=22.3423;RBI=0.0340606;REFB=-0.000385652;REVB=-0.00142393;RO=45;SAF=18;SAR=33;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229546;STB=0.519677;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.000370356;OID=.;OPOS=153580070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:45:46:51:51:0.525773:33:18:17:28:33:18:18:28
chr1	153588279	.	G	A	265.38	PASS	AF=0.447761;AO=24;DP=61;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00926292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.183;QD=15.8437;RBI=0.0729706;REFB=-0.0189686;REVB=0.0723803;RO=33;SAF=15;SAR=9;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145113;STB=0.563594;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0224003;OID=.;OPOS=153588279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:67:33:37:24:30:0.447761:9:15:16:17:12:18:18:19
chr1	153588340	.	C	T	391.65	PASS	AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0161964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.668;QD=22.0649;RBI=0.0223402;REFB=-0.0225465;REVB=0.0153871;RO=32;SAF=18;SAR=21;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570063;STB=0.531437;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0174007;OID=.;OPOS=153588340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:32:32:39:39:0.549296:21:18:17:15:21:18:17:15
chr1	153604029	.	C	T	213.14	PASS	AF=0.472727;AO=23;DP=52;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=4;FWDB=-0.0290861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.8565;QD=15.5007;RBI=0.0329897;REFB=-0.0184904;REVB=-0.0155666;RO=29;SAF=6;SAR=17;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.547682;STB=0.753414;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.03935;OID=.;OPOS=153604029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:55:29:29:23:26:0.472727:17:6:25:4:17:9:25:4
chr1	153676713	.	C	A	385.35	PASS	AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0475104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.051;QD=17.9232;RBI=0.0488629;REFB=-0.0157547;REVB=0.0114168;RO=45;SAF=19;SAR=21;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139081;STB=0.582618;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0127416;OID=.;OPOS=153676713;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:45:46:40:40:0.465116:21:19:28:17:21:19:29:17
chr1	153730101	.	G	A	564.13	PASS	AF=0.441176;AO=60;DP=136;FAO=60;FDP=136;FR=.;FRO=76;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=-0.0261769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0606;QD=16.5921;RBI=0.0282693;REFB=0.00321737;REVB=-0.0106734;RO=76;SAF=30;SAR=30;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263423;STB=0.514701;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=-0.00550349;OID=.;OPOS=153730101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:76:76:60:60:0.441176:30:30:40:36:30:30:40:36
chr1	153743234	.	T	C	163.64	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0497727;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.824;QD=20.4553;RBI=0.0497727;REFB=-0.022882;REVB=6.44679e-07;RO=15;SAF=6;SAR=11;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099476;STB=0.556352;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0144153;OID=.;OPOS=153743234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:11:6:7:8:11:6:7:8
chr1	153907278	.	CCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGT	CCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,CCTGCTGCTGCTGCTGCTGT,CCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGC	149.54	PASS	AF=0.206897,0.344828,0.137931;AO=6,9,3;DP=30;FAO=6,10,4;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=6,1,3;FSAR=0,9,1;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.142688,-0.025782,-0.0297744;FXX=0.0333222;HRUN=2,1,1;LEN=1,9,10;MLLD=14.5655,200.047,184.176;QD=20.6265;RBI=0.192417,0.0284733,0.085449;REFB=-0.171019,-0.0898401,-0.0804999;REVB=-0.129091,-0.0120838,-0.0800938;RO=5;SAF=6,1,3;SAR=0,8,0;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.773282,-0.313638,0.698233;STB=0.998,0.705371,0.776449;STBP=0.003,0.161,0.219;TYPE=del,del,mnp;VARB=0.210773,0.0611686,0.113069;OID=.,.,.;OPOS=153907306,153907279,153907297;OREF=T,CTGCTGCTG,CTGCTGCTGT;OALT=-,-,TTGCTGCTGC;OMAPALT=CCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,CCTGCTGCTGCTGCTGCTGT,CCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGCTGCTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.206897,0.344828,0.137931:6,9,3:30:6,10,4:29:9:6,1,3:0,9,1:3:6:70:5:6,1,3:0,8,0:2:3
chr1	153909069	.	G	C	182.29	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0691252;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.772;QD=23.5217;RBI=0.0873926;REFB=0.0072904;REVB=0.0534712;RO=13;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0863657;STB=0.548334;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=-0.00343059;OID=.;OPOS=153909069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:31:13:13:18:18:0.580645:9:9:8:5:9:9:8:5
chr1	153913699	.	T	G	226.93	PASS	AF=0.440678;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.0227078;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.332;QD=15.3851;RBI=0.0227108;REFB=-0.0396632;REVB=0.000366052;RO=32;SAF=14;SAR=12;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856398;STB=0.555514;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0193956;OID=.;OPOS=153913699;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:59:32:33:26:26:0.440678:12:14:20:12:12:14:21:12
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chr1	153926078	.	T	C	86.77	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00311797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.304;QD=12.8551;RBI=0.0128293;REFB=-0.013157;REVB=-0.0124446;RO=14;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236675;STB=0.680509;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0292241;OID=.;OPOS=153926078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:26:27:14:16:11:11:0.407407:3:8:7:7:3:8:7:9
chr1	153932212	.	G	C	386.59	PASS	AF=0.527027;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0399998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7241;QD=20.8966;RBI=0.043416;REFB=-0.0100677;REVB=-0.0168808;RO=34;SAF=17;SAR=22;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791678;STB=0.550739;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.00857761;OID=.;OPOS=153932212;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:34:35:39:39:0.527027:22:17:18:16:22:17:19:16
chr1	153941514	.	C	T	138.95	PASS	AF=0.535714;AO=14;DP=27;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0384295;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.944;QD=19.8494;RBI=0.0467518;REFB=-0.0319679;REVB=0.0266252;RO=13;SAF=10;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165626;STB=0.564015;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0279665;OID=.;OPOS=153941514;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:28:13:13:14:15:0.535714:4:10:7:6:5:10:7:6
chr1	153994647	.	C	T	539.09	PASS	AF=0.555556;AO=49;DP=90;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.00668138;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.008;QD=23.9595;RBI=0.0066853;REFB=-0.0188649;REVB=0.000228991;RO=38;SAF=26;SAR=23;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599416;STB=0.526943;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0110002;OID=.;OPOS=153994647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:38:40:49:50:0.555556:23:26:23:15:23:27:24:16
chr1	154089438	.	T	C	1466.8	PASS	AF=1;AO=97;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159551;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9668;QD=59.2648;RBI=0.0688514;REFB=0;REVB=0.0669772;RO=0;SAF=60;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.7108e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00306807;OID=.;OPOS=154089438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:97:99:1:37:60:0:0:38:61:0:0
chr1	154108387	.	G	A	1259.19	PASS	AF=0.965517;AO=83;DP=89;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0096708;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.339;QD=57.8938;RBI=0.0295848;REFB=-0.00221356;REVB=-0.0279595;RO=3;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326307;STB=0.517237;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.000371126;OID=.;OPOS=154108387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:89:87:3:3:83:84:0.965517:42:41:0:3:42:42:0:3
chr1	154310048	.	C	G	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.147;QD=58.9625;RBI=0.0383819;REFB=0;REVB=-0.0169352;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.47692e-05;OID=.;OPOS=154310048;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:33:33:0:0:33:33:0:0
chr1	154317153	.	C	T	739.52	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0482076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.48;QD=54.7789;RBI=0.0540999;REFB=-0.0495031;REVB=0.0245526;RO=1;SAF=29;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159704;STB=0.508471;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000216544;OID=.;OPOS=154317153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:24:29:1:0:24:29:1:0
chr1	154323615	.	AT	A	60.83	PASS	AF=0.446429;AO=22;DP=60;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.152344;FXX=0.0819538;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.62097;QD=4.34475;RBI=0.218945;REFB=-0.0834443;REVB=-0.157252;RO=26;SAF=11;SAR=11;SRF=21;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.34252;SSSB=-0.297532;STB=0.585734;STBP=0.29;TYPE=del;VARB=0.0929636;OID=.;OPOS=154323616;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.446429:22:60:25:56:31:14:11:22:9:60:26:11:11:21:5
chr1	154426970	.	A	C	105.82	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0131274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.334;QD=11.4395;RBI=0.0141993;REFB=-0.00359407;REVB=-0.00541215;RO=24;SAF=9;SAR=4;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130276;STB=0.577857;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00831556;OID=.;OPOS=154426970;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:4:9:14:10:4:9:14:10
chr1	154437896	.	T	C	842.03	PASS	AF=1;AO=49;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.782;QD=57.0866;RBI=0.0187826;REFB=0;REVB=0.00356387;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.65889e-05;OID=.;OPOS=154437896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:49:59:1:29:20:0:0:35:24:0:0
chr1	154438880	.	T	C	960.54	PASS	AF=0.945946;AO=69;DP=74;FAO=70;FDP=74;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0407066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9719;QD=51.9208;RBI=0.06019;REFB=-0.181195;REVB=0.0443374;RO=2;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325689;STB=0.532249;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0106178;OID=.;OPOS=154438880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:74:74:2:4:69:70:0.945946:28:41:0:2:29:41:0:4
chr1	154474130	.	C	CG	250.51	PASS	AF=1;AO=4;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.789;QD=38.5404;RBI=0.107202;REFB=0;REVB=-0.0843865;RO=22;SAF=3;SAR=1;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.420767;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00246675;OID=.;OPOS=154474131;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:26:26:26:0:11:15:0:0:5:22:3:1:8:14
chr1	154474131	.	C	G	357.57	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198525;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.222;QD=55.0106;RBI=0.0238261;REFB=0;REVB=0.0131743;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.22018e-05;OID=.;OPOS=154474131;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr1	154516571	.	T	C	466.61	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.185;QD=56.5584;RBI=0.0477812;REFB=0;REVB=0.0027698;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257356;OID=.;OPOS=154516571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:33:0:0:30:33:1:20:10:0:0:22:11:0:0
chr1	154561925	.	C	T	229.95	PASS	AF=0.480769;AO=22;DP=49;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0353601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.308;QD=17.688;RBI=0.0397647;REFB=0.00339957;REVB=-0.0181905;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351417;STB=0.518504;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=-0.00581058;OID=.;OPOS=154561925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:52:27:27:22:25:0.480769:13:9:12:15:13:12:12:15
chr1	154574820	.	T	C	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00475872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.36;QD=60.9786;RBI=0.0119169;REFB=0;REVB=0.0109255;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.09889e-05;OID=.;OPOS=154574820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr1	154575040	.	C	T	552.57	PASS	AF=0.816327;AO=40;DP=49;FAO=40;FDP=49;FR=.;FRO=9;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.000976433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.09;QD=45.108;RBI=0.00238404;REFB=-0.209163;REVB=0.00217491;RO=5;SAF=15;SAR=25;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091659;STB=0.595806;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0219999;OID=.;OPOS=154575040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:49:49:5:9:40:40:0.816327:25:15:4:1:25:15:8:1
chr1	154600372	.	A	G	145.21	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0722013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0105;QD=44.679;RBI=0.0722587;REFB=0;REVB=0.00287935;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129219;OID=.;OPOS=154600372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr1	154744807	.	C	G	171.21	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.00465856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.985;QD=17.5603;RBI=0.0283431;REFB=-0.0320889;REVB=-0.0279576;RO=21;SAF=2;SAR=16;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.440411;STB=0.758268;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0241214;OID=.;OPOS=154744807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:16:2:9:12:16:2:9:12
chr1	154744852	.	A	G	246.92	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0542484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.22;QD=49.3837;RBI=0.0542496;REFB=0;REVB=0.000361899;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00180254;OID=.;OPOS=154744852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:15:4:0:0:16:4:0:0
chr1	154917314	.	G	A	1446.03	PASS	AF=1;AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160476;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.528;QD=62.8707;RBI=0.0478823;REFB=0;REVB=0.045113;RO=0;SAF=44;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000345069;OID=.;OPOS=154917314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:92:0:0:91:92:1:47:44:0:0:48:44:0:0
chr1	154919080	.	C	T	798.99	PASS	AF=0.936508;AO=58;DP=62;FAO=59;FDP=63;FR=.;FRO=4;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00778925;FXX=0.0156226;HRUN=5;LEN=1;MLLD=96.6433;QD=50.7296;RBI=0.0475901;REFB=-0.0899797;REVB=0.0469483;RO=4;SAF=35;SAR=23;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509194;STB=0.526307;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00099323;OID=.;OPOS=154919080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:62:63:4:4:58:59:0.936508:23:35:4:0:23:36:4:0
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chr1	154942694	.	G	C	45.04	PASS	AF=0.189189;AO=7;DP=38;FAO=7;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0757794;FXX=0.0263089;HRUN=5;LEN=1;MLLD=34.2018;QD=4.86968;RBI=0.0964421;REFB=-0.0317457;REVB=0.0596537;RO=24;SAF=6;SAR=1;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.497682;STB=0.819519;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.102316;OID=.;OPOS=154942694;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:38:37:24:30:7:7:0.189189:1:6:11:13:1:6:15:15
chr1	154987526	.	C	T	214.22	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0335932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.7724;QD=45.0988;RBI=0.137957;REFB=-0.0282473;REVB=0.133805;RO=1;SAF=13;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340316;STB=0.518498;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00785393;OID=.;OPOS=154987526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:5:13:1:0:5:13:1:0
chr1	154988957	.	A	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.553;QD=58.5875;RBI=0.0271409;REFB=0;REVB=0.0165157;RO=0;SAF=1;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100061;OID=.;OPOS=154988957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:32:1:0:0:32:1:0:0
chr1	155006091	.	A	G	704.91	PASS	AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0109257;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.646;QD=58.7426;RBI=0.0304441;REFB=-0.0262455;REVB=-0.0284161;RO=1;SAF=34;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136301;STB=0.512755;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=8.30964e-05;OID=.;OPOS=155006091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:48:48:1:2:46:46:0.958333:12:34:1:0:12:34:1:1
chr1	155006999	.	C	T	599.33	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0717246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.3285;QD=59.9328;RBI=0.118308;REFB=0;REVB=0.0940873;RO=1;SAF=17;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267496;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00226384;OID=.;OPOS=155006999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:1:0:37:40:1:20:17:1:0:21:19:0:0
chr1	155019710	.	A	C	1434.5	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.726;QD=62.3696;RBI=0.0227222;REFB=0;REVB=-0.0103206;RO=0;SAF=45;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33321e-05;OID=.;OPOS=155019710;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:47:45:0:0:47:45:0:0
chr1	155026942	.	A	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.403;QD=55.098;RBI=0.0519403;REFB=0;REVB=0.0129383;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369173;OID=.;OPOS=155026942;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr1	155033317	.	T	C	452.57	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111399;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.626;QD=58.3955;RBI=0.0125958;REFB=0;REVB=-0.00587855;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50496e-05;OID=.;OPOS=155033317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:11:20:0:0:11:20:0:0
chr1	155059851	.	A	G	434.45	PASS	AF=0.941176;AO=31;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.026274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.385;QD=51.1121;RBI=0.0557256;REFB=-0.080552;REVB=0.0491428;RO=2;SAF=25;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132388;STB=0.562459;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00236225;OID=.;OPOS=155059851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:34:34:2:2:31:32:0.941176:6:25:0:2:7:25:0:2
chr1	155106697	.	G	A	689.34	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000952448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.15;QD=62.6674;RBI=0.00766681;REFB=0;REVB=0.00760742;RO=1;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199809;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.8508e-05;OID=.;OPOS=155106697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:1:0:43:44:1:23:20:0:1:24:20:0:0
chr1	155149718	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.458;QD=59.8385;RBI=0.03727;REFB=0;REVB=0.0305643;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99397e-05;OID=.;OPOS=155149718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr1	155162067	.	C	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.796;QD=48.7373;RBI=0.0625916;REFB=0;REVB=0.0590419;RO=0;SAF=16;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392872;OID=.;OPOS=155162067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:1:16:0:0:1:16:0:0
chr1	155178782	.	A	T	784.41	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9973;QD=57.048;RBI=0.0513524;REFB=0;REVB=0.0485731;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000560353;OID=.;OPOS=155178782;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0
chr1	155186729	.	T	C	2318.64	PASS	AF=0.963415;AO=154;DP=160;FAO=158;FDP=164;FR=.;FRO=6;FSAF=81;FSAR=77;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0736394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4984;QD=56.5521;RBI=0.0746033;REFB=0.0084882;REVB=0.0119541;RO=4;SAF=81;SAR=73;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010819;STB=0.511745;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.00148092;OID=.;OPOS=155186729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:160:164:4:6:154:158:0.963415:73:81:3:1:77:81:5:1
chr1	155186742	.	G	A	2252.61	PASS	AF=0.97973;AO=139;DP=144;FAO=145;FDP=148;FR=.;FRO=3;FSAF=82;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0056129;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.381;QD=60.8813;RBI=0.0761374;REFB=-0.0703733;REVB=0.0759302;RO=3;SAF=81;SAR=58;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102769;STB=0.504782;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.00262542;OID=.;OPOS=155186742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:144:148:3:3:139:145:0.97973:58:81:1:2:63:82:1:2
chr1	155217436	.	GGA	ATT,GTT	393.45	PASS	AF=0.862069,0.137931;AO=24,4;DP=29;FAO=25,4;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0;FSAR=9,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516591,-0.0328301;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=3,2;MLLD=195.424,79.5922;QD=54.2696;RBI=0.0552251,0.0535179;REFB=0,0;REVB=0.0195231,0.0422653;RO=0;SAF=15,0;SAR=9,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.00404823,-0.0233369;OID=.,.;OPOS=155217436,155217437;OREF=GGA,GA;OALT=ATT,TT;OMAPALT=ATT,GTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:29:29:0:0:24,4:25,4:0.862069,0.137931:9,4:15,0:0:0:9,4:16,0:0:0
chr1	155230131	.	C	T	400.23	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00662567;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=245.347;QD=53.364;RBI=0.0265845;REFB=-0.128204;REVB=0.0257457;RO=1;SAF=6;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714284;STB=0.538434;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.000777556;OID=.;OPOS=155230131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:23:6:1:0:23:6:1:0
chr1	155238134	.	G	T	205.8	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0574165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.761;QD=23.5204;RBI=0.057516;REFB=0.0145571;REVB=0.00338271;RO=15;SAF=12;SAR=8;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203275;STB=0.613523;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=-0.0193611;OID=.;OPOS=155238134;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:8:12:5:10:8:12:5:10
chr1	155257609	.	G	A	137.27	PASS	AF=0.301587;AO=19;DP=63;FAO=19;FDP=63;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0257552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.702;QD=8.71565;RBI=0.0269384;REFB=-0.0100115;REVB=-0.0078962;RO=44;SAF=13;SAR=6;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0913175;STB=0.554672;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0194011;OID=.;OPOS=155257609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:44:44:19:19:0.301587:6:13:27:17:6:13:27:17
chr1	155258752	.	G	A	847.4	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0319803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8328;QD=57.4505;RBI=0.0319807;REFB=0;REVB=0.000155474;RO=0;SAF=42;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000136593;OID=.;OPOS=155258752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:17:42:0:0:17:42:0:0
chr1	155258756	.	C	T	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0031394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.542;QD=57.3849;RBI=0.0422429;REFB=0;REVB=0.0421261;RO=0;SAF=40;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.57065e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155225;OID=.;OPOS=155258756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:17:40:0:0:17:40:0:0
chr1	155260383	.	G	T	374.04	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.895;QD=55.414;RBI=0.0513468;REFB=0;REVB=0.0340058;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194709;OID=.;OPOS=155260383;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0
chr1	155294274	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.372;QD=48.7373;RBI=0.0346083;REFB=0;REVB=-0.0200163;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000780151;OID=.;OPOS=155294274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr1	155408635	.	T	C	755.21	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.248;QD=55.9412;RBI=0.115215;REFB=0;REVB=0.102939;RO=0;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00314785;OID=.;OPOS=155408635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:19:34:0:0:19:35:0:0
chr1	155581311	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.403;QD=45.8068;RBI=0.0273342;REFB=0;REVB=0.023443;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.048e-05;OID=.;OPOS=155581311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr1	155583937	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.105;QD=42.1826;RBI=0.0106556;REFB=0;REVB=0.0106556;RO=0;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.85331e-05;OID=.;OPOS=155583937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:11:0:0:0:11:0:0:0
chr1	155658085	.	T	C	393.22	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262632;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.325;QD=56.174;RBI=0.0263048;REFB=0;REVB=0.00147991;RO=0;SAF=24;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.86964e-05;OID=.;OPOS=155658085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:4:24:0:0:4:24:0:0
chr1	155735012	.	T	C	666.9	PASS	AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00446166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.958;QD=57.9912;RBI=0.0276041;REFB=-0.0804222;REVB=0.0272411;RO=2;SAF=24;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03755;STB=0.519991;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00322966;OID=.;OPOS=155735012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:46:46:2:2:44:44:0.956522:20:24:2:0:20:24:2:0
chr1	155755097	.	G	A	632.2	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.176;QD=61.678;RBI=0.0126182;REFB=0;REVB=0.00258591;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.61974e-05;OID=.;OPOS=155755097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:16:25:0:0:16:25:0:0
chr1	155837865	.	G	C	594.37	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5803;QD=60.9609;RBI=0.128475;REFB=0;REVB=0.00407235;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162219;OID=.;OPOS=155837865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr1	155838267	.	T	C	364.7	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00929133;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.886;QD=56.1073;RBI=0.0404581;REFB=0;REVB=0.0393767;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000314334;OID=.;OPOS=155838267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:11:15:0:0
chr1	155869050	.	A	G	157.02	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0108602;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.5091;QD=16.1048;RBI=0.0389456;REFB=-0.00823352;REVB=0.0374008;RO=22;SAF=10;SAR=7;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302287;STB=0.672324;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0123413;OID=.;OPOS=155869050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:7:10:6:16:7:10:6:16
chr1	155880573	.	C	G	735.23	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00873067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.383;QD=62.5723;RBI=0.0637787;REFB=0;REVB=0.0631783;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125291;OID=.;OPOS=155880573;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:19:25:0:0:22:25:0:0
chr1	155904177	.	T	C	1677.11	PASS	AF=1;AO=110;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.57;QD=60.4365;RBI=0.0279894;REFB=0;REVB=-0.00188415;RO=0;SAF=66;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.46988e-05;OID=.;OPOS=155904177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:110:111:1:44:66:0:0:45:66:0:0
chr1	155912486	.	T	C	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00621777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8831;QD=48.7342;RBI=0.0250309;REFB=0;REVB=-0.0242464;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000792743;OID=.;OPOS=155912486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr1	155920077	.	G	A	175.54	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=4;FWDB=-0.00976988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2717;QD=13.768;RBI=0.0282541;REFB=-0.00271221;REVB=0.0265112;RO=31;SAF=9;SAR=11;SRF=27;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.437193;STB=0.745567;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00452657;OID=.;OPOS=155920077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:11:9:27:4:11:9:27:4
chr1	156107534	.	C	T	201.48	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0661921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4081;QD=13.8953;RBI=0.069066;REFB=0.00271491;REVB=-0.0197157;RO=32;SAF=14;SAR=10;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176723;STB=0.616382;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.00433849;OID=.;OPOS=156107534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:32:34:24:24:0.413793:10:14:13:19:10:14:13:21
chr1	156127935	.	TG	GT,T	67.06	PASS	AF=0,0.666667;AO=3,7;DP=18;FAO=0,12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=0,7;FSAR=0,5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0745364,0.0753961;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=16.4956,11.4289;QD=14.9018;RBI=0.161282,0.291344;REFB=-0.0431565,-0.127094;REVB=0.143025,0.281419;RO=6;SAF=3,4;SAR=0,3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0.320144;SSEP=0,0;SSSB=0.672276,0.0560707;STB=0.5,0.528799;STBP=1,0.747;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.117005;OID=.,.;OPOS=156127935,156127936;OREF=TG,G;OALT=GT,-;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:25:18:18:6:6:3,7:0,12:0,0.666667:0,3:3,4:3:3:0,5:0,7:4:2
chr1	156351699	.	G	A	1908.99	PASS	AF=0.948148;AO=128;DP=135;FAO=128;FDP=135;FR=.;FRO=7;FSAF=70;FSAR=58;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0406799;FXX=0.0073524;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.42;QD=56.5628;RBI=0.077794;REFB=-0.0635508;REVB=0.0663103;RO=4;SAF=70;SAR=58;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172038;STB=0.501285;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.000412867;OID=.;OPOS=156351699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:135:135:4:7:128:128:0.948148:58:70:1:3:58:70:4:3
chr1	156354293	.	A	C,G	1498.81	PASS	AF=0.105769,0.894231;AO=11,93;DP=104;FAO=11,93;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=0,49;FSAR=11,44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146951,0.0217869;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=90.6155,108.153;QD=57.6466;RBI=0.0323358,0.0235987;REFB=0,0;REVB=-0.0288038,0.00906791;RO=0;SAF=0,49;SAR=11,44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.84593e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.177198,0.00344299;OID=.,.;OPOS=156354293,156354293;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:44:104:104:0:0:11,93:11,93:0.105769,0.894231:11,44:0,49:0:0:11,44:0,49:0:0
chr1	156354367	.	A	G	1080.51	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0868427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7708;QD=60.0286;RBI=0.0872614;REFB=0;REVB=0.00853809;RO=0;SAF=21;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84448e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000680955;OID=.;OPOS=156354367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:51:21:0:0:51:21:0:0
chr1	156446903	.	T	C	393.94	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.097082;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.055;QD=54.3362;RBI=0.115314;REFB=0;REVB=0.0622291;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00412252;OID=.;OPOS=156446903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:29:29:0:0:28:29:1:9:19:0:0:9:20:0:0
chr1	156450740	.	G	A	380.78	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.972;QD=54.3973;RBI=0.0496974;REFB=0;REVB=0.0303793;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000354043;OID=.;OPOS=156450740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:26:28:1:9:17:0:0:9:19:0:0
chr1	156499969	.	T	C	333.46	PASS	AF=0.430233;AO=36;DP=85;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0649752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1276;QD=15.5096;RBI=0.0653396;REFB=-0.03748;REVB=0.00689103;RO=49;SAF=17;SAR=19;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448361;STB=0.517757;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0402165;OID=.;OPOS=156499969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:49:49:36:37:0.430233:19:17:21:28:20:17:21:28
chr1	156518379	.	G	A	251.6	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0114181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.07;QD=20.5384;RBI=0.0170055;REFB=-0.015462;REVB=0.0126021;RO=25;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543959;STB=0.530587;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0151056;OID=.;OPOS=156518379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:12:12:14:11:12:12:14:11
chr1	156526387	.	C	G	478.37	PASS	AF=0.460177;AO=52;DP=113;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=46;FSRR=15;FWDB=-0.0323681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.579;QD=16.9334;RBI=0.0429834;REFB=-0.00753621;REVB=-0.0282821;RO=61;SAF=28;SAR=24;SRF=46;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215643;STB=0.619204;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00914913;OID=.;OPOS=156526387;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:61:61:52:52:0.460177:24:28:46:15:24:28:46:15
chr1	156526444	.	T	C	1139.3	PASS	AF=0.987013;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0152174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.042;QD=59.1844;RBI=0.0337269;REFB=0.040609;REVB=0.0300988;RO=0;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71047e-08;STB=0.506848;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.00111145;OID=.;OPOS=156526444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:77:0:1:75:76:0.987013:40:35:0:0:40:36:1:0
chr1	156532977	.	T	C	300.41	PASS	AF=0.888889;AO=24;DP=27;FAO=24;FDP=27;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0863563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5751;QD=44.5044;RBI=0.0925524;REFB=0.0274563;REVB=-0.0332946;RO=3;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1108;STB=0.55995;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.00663821;OID=.;OPOS=156532977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:27:27:3:3:24:24:0.888889:11:13:0:3:11:13:0:3
chr1	156536221	.	G	C	838.75	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00177789;FXX=0.0169463;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.988;QD=57.8448;RBI=0.0380106;REFB=0;REVB=-0.037969;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00045569;OID=.;OPOS=156536221;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0
chr1	156536251	.	T	C	1098.73	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.933;QD=60.2044;RBI=0.0310559;REFB=0;REVB=0.0281311;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.58683e-05;OID=.;OPOS=156536251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:32:41:0:0:32:41:0:0
chr1	156551848	.	A	G	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0306066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.193;QD=13.2053;RBI=0.0312768;REFB=-0.0469016;REVB=-0.00644025;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275357;STB=0.66611;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0310894;OID=.;OPOS=156551848;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:2:4:2:4:2:4:2:4
chr1	156556321	.	G	A	383.13	PASS	AF=0.965517;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0382313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.647;QD=52.845;RBI=0.0470219;REFB=-0.147051;REVB=0.0273757;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523792;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00238205;OID=.;OPOS=156556321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:29:0:1:27:28:0.965517:10:17:0:0:10:18:0:1
chr1	156561651	.	G	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.587;QD=45.8066;RBI=0.0638689;REFB=0;REVB=0.0569494;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00059288;OID=.;OPOS=156561651;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0
chr1	156563375	.	G	A	435.85	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0285545;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=291.618;QD=54.4816;RBI=0.054799;REFB=0.0992478;REVB=0.0467715;RO=0;SAF=25;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16261e-08;STB=0.509798;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=-0.00015702;OID=.;OPOS=156563375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:0:1:31:31:0.96875:6:25:0:0:6:25:1:0
chr1	156563726	.	A	C	2235.48	PASS	AF=1;AO=139;DP=139;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.356;QD=63.418;RBI=0.0221734;REFB=0;REVB=0.00152542;RO=0;SAF=79;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.34473e-05;OID=.;OPOS=156563726;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:139:141:0:0:139:141:1:60:79:0:0:62:79:0:0
chr1	156563813	.	G	A	1307.92	PASS	AF=0.988095;AO=62;DP=86;FAO=83;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.459;QD=62.2821;RBI=0.113181;REFB=0;REVB=0.0362115;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.08792e-05;OID=.;OPOS=156563813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:84:0:0:62:83:0.988095:39:23:0:0:39:44:0:0
chr1	156563852	.	C	T	1008.48	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00394131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.8461;QD=59.3224;RBI=0.0102216;REFB=0;REVB=0.00943119;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.06216e-05;OID=.;OPOS=156563852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:33:35:0:0:33:35:0:0
chr1	156564922	.	C	T	220.89	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0376815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134;QD=18.0317;RBI=0.0378135;REFB=-0.0156592;REVB=-0.00315632;RO=25;SAF=6;SAR=16;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287599;STB=0.684651;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0209987;OID=.;OPOS=156564922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:27:22:22:0.44898:16:6:14:11:16:6:16:11
chr1	156565049	.	A	AAC	190.01	PASS	AF=1;AO=14;DP=18;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00309495;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=318.921;QD=47.5029;RBI=0.0420738;REFB=0;REVB=0.0419598;RO=2;SAF=4;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0576353;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00011881;OID=.;OPOS=156565050;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=AAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:14:18:16:16:0:5:11:0:0:4:2:4:10:1:1
chr1	156565510	.	TTG	T	151.94	PASS	AF=0.952381;AO=11;DP=23;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.185822;FXX=0;HRUN=8;LEN=2;MLLD=15.8651;QD=28.9413;RBI=0.25026;REFB=-0.0480369;REVB=0.167631;RO=10;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578471;STB=0.516113;STBP=0.64;TYPE=del;VARB=0.022249;OID=.;OPOS=156565511;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.952381:11:23:20:21:1:15:5:1:0:7:10:7:4:7:3
chr1	156595447	.	G	A	859.2	PASS	AF=0.9;AO=65;DP=72;FAO=63;FDP=70;FR=.;FRO=7;FSAF=57;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00596972;FXX=0.0277739;HRUN=6;LEN=1;MLLD=226.232;QD=49.0973;RBI=0.0229905;REFB=-0.195084;REVB=0.0222019;RO=6;SAF=59;SAR=6;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0342022;STB=0.513509;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.000968448;OID=.;OPOS=156595447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:72:70:6:7:65:63:0.9:6:59:5:1:6:57:6:1
chr1	156639753	.	G	A	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00137319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=283.038;QD=56.7065;RBI=0.0050742;REFB=0;REVB=0.00488486;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.14977e-05;OID=.;OPOS=156639753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr1	156640156	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030248;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=265.408;QD=42.1826;RBI=0.0356779;REFB=0;REVB=0.0189201;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180322;OID=.;OPOS=156640156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:7:4:0:0:7:4:0:0
chr1	156640385	.	C	G	258.02	PASS	AF=0.585366;AO=21;DP=38;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0105883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.733;QD=25.1726;RBI=0.020095;REFB=-0.0340035;REVB=0.0170791;RO=15;SAF=11;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923117;STB=0.560925;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0260231;OID=.;OPOS=156640385;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:41:15:17:21:24:0.585366:10:11:6:9:12:12:6:11
chr1	156640678	.	G	A	656.65	PASS	AF=0.977273;AO=40;DP=42;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0550711;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.889;QD=59.6958;RBI=0.0571069;REFB=0.0975789;REVB=0.015112;RO=1;SAF=4;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128548;STB=0.506326;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=-0.000465967;OID=.;OPOS=156640678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:44:1:1:40:43:0.977273:36:4:0:1:39:4:0:1
chr1	156705593	.	G	C	1509.42	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.229;QD=59.7792;RBI=0.0350056;REFB=0;REVB=0.015516;RO=0;SAF=65;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.31105e-05;OID=.;OPOS=156705593;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:100:101:1:35:65:0:0:35:66:0:0
chr1	156713512	.	C	T	272.58	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.052443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4334;QD=45.4295;RBI=0.0679842;REFB=-0.143615;REVB=-0.0432618;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503813;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0164374;OID=.;OPOS=156713512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:0:2:22:22:0.916667:10:12:0:0:10:12:1:1
chr1	156713558	.	G	A	232.25	PASS	AF=0.564103;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0170998;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=216.524;QD=23.8208;RBI=0.0218921;REFB=-0.0148237;REVB=-0.0136697;RO=17;SAF=14;SAR=8;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22272;STB=0.624299;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00771823;OID=.;OPOS=156713558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:17:17:22:22:0.564103:8:14:6:11:8:14:6:11
chr1	156752048	.	C	G	218.73	PASS	AF=0.714286;AO=19;DP=27;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0397836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4254;QD=31.2473;RBI=0.0409971;REFB=0.028316;REVB=0.00990106;RO=8;SAF=7;SAR=12;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00378494;STB=0.507455;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=-0.00970813;OID=.;OPOS=156752048;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:28:8:8:19:20:0.714286:12:7:3:5:12:8:3:5
chr1	156760887	.	C	A	277.67	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.00546799;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.265;QD=20.5679;RBI=0.0193066;REFB=-0.0208635;REVB=-0.0185161;RO=25;SAF=14;SAR=15;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136756;STB=0.575785;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0183291;OID=.;OPOS=156760887;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:25:25:29:29:0.537037:15:14:8:17:15:14:8:17
chr1	156784982	.	T	C	274.57	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=24;FWDB=0.0140348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.809;QD=19.969;RBI=0.0147025;REFB=-0.010329;REVB=-0.00438024;RO=25;SAF=7;SAR=22;SRF=1;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269198;STB=0.619162;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00844689;OID=.;OPOS=156784982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:25:26:29:29:0.527273:22:7:1:24:22:7:2:24
chr1	156785617	.	G	A	218.06	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0212051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.682;QD=15.5754;RBI=0.0444171;REFB=-0.0124372;REVB=0.0390285;RO=31;SAF=19;SAR=6;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103146;STB=0.558774;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0150198;OID=.;OPOS=156785617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:6:19:21:10:6:19:21:10
chr1	156846233	.	G	A	1433.37	PASS	AF=0.96875;AO=91;DP=94;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00735764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.175;QD=59.7236;RBI=0.0281642;REFB=-0.209894;REVB=0.0271862;RO=3;SAF=51;SAR=40;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270659;STB=0.514283;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00131497;OID=.;OPOS=156846233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:94:96:3:3:91:93:0.96875:40:51:3:0:42:51:3:0
chr1	156873727	.	G	A	2223.4	PASS	AF=1;AO=140;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1168;QD=63.075;RBI=0.0804618;REFB=0;REVB=0.0784599;RO=0;SAF=90;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.68063e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232719;OID=.;OPOS=156873727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:141:0:0:140:141:1:50:90:0:0:51:90:0:0
chr1	156877457	.	T	C	539.96	PASS	AF=0.904762;AO=38;DP=42;FAO=38;FDP=42;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0453376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8968;QD=51.425;RBI=0.0479527;REFB=-0.00453872;REVB=0.0156194;RO=4;SAF=20;SAR=18;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00469151;STB=0.502511;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0042415;OID=.;OPOS=156877457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:42:42:4:4:38:38:0.904762:18:20:2:2:18:20:2:2
chr1	156877797	.	C	A	715.04	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00829534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.6308;QD=60.8542;RBI=0.0274568;REFB=-0.15206;REVB=0.0261737;RO=1;SAF=25;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184352;STB=0.5098;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0025747;OID=.;OPOS=156877797;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:21:25:1:0:21:25:1:0
chr1	156878531	.	T	C	651.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0822794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4278;QD=62.0202;RBI=0.117356;REFB=0;REVB=-0.0836806;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00222804;OID=.;OPOS=156878531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
chr1	156878737	.	T	C	320.25	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0617525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.12;QD=53.3742;RBI=0.0619067;REFB=0;REVB=-0.00436607;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215807;OID=.;OPOS=156878737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:10:13:0:0:10:14:0:0
chr1	156879579	.	C	CT	582.89	PASS	AF=1;AO=5;DP=50;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315932;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=127.192;QD=48.5738;RBI=0.101316;REFB=0;REVB=-0.0962644;RO=45;SAF=5;SAR=0;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.575755;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000960806;OID=.;OPOS=156879580;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:50:48:48:0:28:20:0:0:4:45:5:0:25:20
chr1	156879580	.	C	T	594.98	PASS	AF=0.891304;AO=41;DP=48;FAO=41;FDP=46;FR=.;FRO=5;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.00575193;FXX=0.041658;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.396;QD=51.7375;RBI=0.0105405;REFB=-0.145771;REVB=0.00883275;RO=3;SAF=21;SAR=20;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062438;STB=0.553166;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00206526;OID=.;OPOS=156879580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:48:46:3:5:41:41:0.891304:20:21:3:0:20:21:5:0
chr1	156880065	.	GA	AG,GAG	36.74	PASS	AF=0.0555556,0.166667;AO=3,4;DP=36;FAO=2,6;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=2,5;FSAR=0,1;FSRF=23;FSRR=5;FWDB=0.0208712,0.0740859;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=2,1;MLLD=34.8581,20.6532;QD=4.0824;RBI=0.0263257,0.108713;REFB=-0.0141866,-0.0187393;REVB=-0.0160447,-0.07956;RO=28;SAF=3,4;SAR=0,0;SRF=22;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.459277,0.523933;STB=0.991766,0.517183;STBP=0.399,0.995;TYPE=mnp,ins;VARB=0.0733114,0.0624562;OID=.,.;OPOS=156880065,156880067;OREF=GA,-;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,GAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:24:36:36:28:28:3,4:2,6:0.0555556,0.166667:0,0:3,4:22:6:0,1:2,5:23:5
chr1	156882993	.	T	TC	142.77	PASS	AF=0.9;AO=3;DP=28;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0617525;FXX=0.230681;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.3673;QD=28.5541;RBI=0.129152;REFB=-0.0801366;REVB=-0.113432;RO=24;SAF=2;SAR=1;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179144;STB=0.541621;STBP=0.336;TYPE=ins;VARB=0.0251695;OID=.;OPOS=156882994;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.9:3:28:18:20:2:7:11:0:2:6:24:2:1:12:12
chr1	156882996	.	G	C	342.66	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00712841;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8746;QD=54.8252;RBI=0.0354296;REFB=0;REVB=0.0347051;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00200278;OID=.;OPOS=156882996;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:23:25:1:11:12:0:0:13:12:0:0
chr1	156883215	.	C	A	1475.72	PASS	AF=0.990291;AO=97;DP=100;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0850123;FXX=0.00961446;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.6654;QD=57.3095;RBI=0.115278;REFB=-0.0661097;REVB=0.0778589;RO=3;SAF=39;SAR=58;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350877;STB=0.505881;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00219869;OID=.;OPOS=156883215;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:103:3:1:97:102:0.990291:58:39:3:0:60:42:1:0
chr1	156884584	.	C	T	536.68	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.383;QD=59.6315;RBI=0.0573126;REFB=0;REVB=0.0341086;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266237;OID=.;OPOS=156884584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:36:0:0:34:36:1:23:11:0:0:23:13:0:0
chr1	156890672	.	T	C	3655.26	PASS	AF=1;AO=231;DP=233;FAO=231;FDP=231;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124055;FXX=0.00858332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.338;QD=63.2945;RBI=0.0256702;REFB=0;REVB=-0.0224736;RO=0;SAF=128;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21544e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.51722e-05;OID=.;OPOS=156890672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:233:231:0:0:231:231:1:103:128:0:0:103:128:0:0
chr1	156902222	.	G	A	740.42	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.67;QD=56.9552;RBI=0.0199282;REFB=0;REVB=0.0126873;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.16063e-06;OID=.;OPOS=156902222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:30:22:0:0:30:22:0:0
chr1	156902259	.	G	A	871.39	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.044408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.355;QD=56.2185;RBI=0.0546913;REFB=-0.147073;REVB=0.0319228;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506664;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00190739;OID=.;OPOS=156902259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:0:1:61:61:0.983871:37:24:0:0:37:24:0:1
chr1	156902281	.	T	G	937.54	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.486;QD=58.5964;RBI=0.04337;REFB=0;REVB=0.029969;RO=0;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110603;OID=.;OPOS=156902281;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:37:27:0:0:37:27:0:0
chr1	156904644	.	A	G	1000.47	PASS	AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0449535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.175;QD=56.3643;RBI=0.0458661;REFB=-0.0755369;REVB=0.009104;RO=1;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108681;STB=0.51136;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.000757428;OID=.;OPOS=156904644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:71:71:1:2:69:69:0.971831:43:26:0:1:43:26:0:2
chr1	156904818	.	G	A	1700.11	PASS	AF=0.982759;AO=113;DP=116;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=76;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0383664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2107;QD=58.6246;RBI=0.0542994;REFB=-0.133321;REVB=0.0384245;RO=3;SAF=76;SAR=37;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187659;STB=0.503225;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.00210839;OID=.;OPOS=156904818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:116:116:3:2:113:114:0.982759:37:76:1:2:38:76:1:1
chr1	156907081	.	T	C	605.08	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0043262;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.814;QD=59.0323;RBI=0.0369951;REFB=-0.113535;REVB=0.0367413;RO=1;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323178;STB=0.517233;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00347513;OID=.;OPOS=156907081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:41:1:1:40:40:0.97561:14:26:0:1:14:26:0:1
chr1	156909695	.	G	A	1244.77	PASS	AF=0.965116;AO=83;DP=86;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0152068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.446;QD=57.8963;RBI=0.0189067;REFB=-0.00197724;REVB=-0.0112346;RO=3;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030529;STB=0.516125;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=8.52074e-05;OID=.;OPOS=156909695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:86:86:3:3:83:83:0.965116:45:38:0:3:45:38:0:3
chr1	156939067	.	G	A	1135.16	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3983;QD=60.5421;RBI=0.0321173;REFB=0;REVB=0.00460765;RO=0;SAF=46;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89405e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002837;OID=.;OPOS=156939067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:29:46:0:0:29:46:0:0
chr1	157062696	.	G	T	204.43	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0428461;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.1087;QD=22.7147;RBI=0.0497121;REFB=-0.00275175;REVB=0.0252092;RO=14;SAF=12;SAR=8;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332026;STB=0.517224;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.00225029;OID=.;OPOS=157062696;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:14:16:20:20:0.555556:8:12:9:5:8:12:9:7
chr1	157062739	.	C	G	121.58	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0300809;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.262;QD=15.1969;RBI=0.0319418;REFB=-0.0142626;REVB=0.0107433;RO=18;SAF=10;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548562;STB=0.531868;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0109429;OID=.;OPOS=157062739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:4:10:12:6:4:10:12:6
chr1	157508882	.	C	T	384.98	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0486756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5035;QD=53.1;RBI=0.136137;REFB=-0.144724;REVB=0.127137;RO=1;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054642;STB=0.52939;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.00479908;OID=.;OPOS=157508882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:29:29:1:1:28:28:0.965517:8:20:0:1:8:20:0:1
chr1	157509025	.	C	T	958.28	PASS	AF=0.985075;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00358076;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.511;QD=57.211;RBI=0.0215675;REFB=-0.0782039;REVB=-0.0212682;RO=1;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178214;STB=0.509088;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.000268153;OID=.;OPOS=157509025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:67:1:1:65:66:0.985075:26:39:0:1:27:39:0:1
chr1	157514091	.	C	T	600.69	PASS	AF=0.586957;AO=54;DP=91;FAO=54;FDP=92;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0252702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3098;QD=26.1171;RBI=0.0541442;REFB=0.0071743;REVB=-0.0478854;RO=37;SAF=28;SAR=26;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164401;STB=0.503225;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=-0.00773932;OID=.;OPOS=157514091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:37:38:54:54:0.586957:26:28:20:17:26:28:20:18
chr1	157514097	.	A	G	1453.43	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.715;QD=63.1925;RBI=0.0389334;REFB=0;REVB=0.0173144;RO=0;SAF=48;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.29143e-05;OID=.;OPOS=157514097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:44:48:0:0:44:48:0:0
chr1	157517127	.	C	T	81.94	PASS	AF=0.289474;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0419849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.222;QD=8.62545;RBI=0.0429463;REFB=-0.00430782;REVB=-0.00903593;RO=27;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32941;STB=0.69736;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0115774;OID=.;OPOS=157517127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:38:38:27:27:11:11:0.289474:5:6:7:20:5:6:7:20
chr1	157557701	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.386;QD=50.4132;RBI=0.0123638;REFB=0;REVB=0.000730028;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134888;OID=.;OPOS=157557701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr1	157567751	.	A	G	326.09	PASS	AF=1;AO=16;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00444151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.361;QD=54.3478;RBI=0.114581;REFB=0;REVB=0.114495;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013182;OID=.;OPOS=157567751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:16:24:1:6:10:0:0:13:11:0:0
chr1	157668194	.	A	C	270.75	PASS	AF=0.375;AO=31;DP=86;FAO=33;FDP=88;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.0117755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.407;QD=12.3066;RBI=0.0135786;REFB=-0.0255236;REVB=0.00676141;RO=55;SAF=10;SAR=21;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234207;STB=0.646628;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0464111;OID=.;OPOS=157668194;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:88:55:55:31:33:0.375:21:10:29:26:23:10:29:26
chr1	157738445	.	TCCCCCG	TCCCCC,TCCCC,TCCCCG	60.02	PASS	AF=0,0.309524,0;AO=5,10,5;DP=41;FAO=0,13,0;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=0,5,0;FSAR=0,8,0;FSRF=4;FSRR=25;FWDB=0.0609265,-0.0314745,-0.124575;FXX=0.0232504;HRUN=5,5,5;LEN=1,2,1;MLLD=12.8571,23.8751,11.636;QD=5.71651;RBI=0.0636285,0.0337204,0.124698;REFB=-0.0258299,-0.0552195,-0.0818046;REVB=-0.0183452,-0.0121006,-0.00554936;RO=16;SAF=0,3,0;SAR=5,7,5;SRF=2;SRR=14;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.616978,0.246078,-0.616978;STB=0.5,0.695968,0.5;STBP=1,0.191,1;TYPE=del,del,del;VARB=0,0.118627,0;OID=.,.,.;OPOS=157738451,157738450,157738446;OREF=G,CG,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=TCCCCC,TCCCC,TCCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.309524,0:5,10,5:41:0,13,0:42:29:0,5,0:0,8,0:4:25:57:16:0,3,0:5,7,5:2:14
chr1	157771880	.	C	T	858.13	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.736;QD=57.2085;RBI=0.0601906;REFB=0;REVB=0.0318514;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249271;OID=.;OPOS=157771880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:60:0:0:57:60:1:28:29:0:0:30:30:0:0
chr1	157802979	.	C	T	612.23	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.398;QD=61.2229;RBI=0.0524608;REFB=0;REVB=0.0488632;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000383583;OID=.;OPOS=157802979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:24:15:0:0:25:15:0:0
chr1	157809162	.	C	A	34.37	PASS	AF=0.145833;AO=9;DP=44;FAO=7;FDP=48;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0908121;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=31.4711;QD=2.86458;RBI=0.103595;REFB=-0.00807015;REVB=-0.0498509;RO=35;SAF=6;SAR=3;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.3479;STB=0.74645;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0629655;OID=.;OPOS=157809162;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:44:48:35:41:9:7:0.145833:3:6:13:22:2:5:17:24
chr1	158066834	.	A	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.668;QD=60.978;RBI=0.0494787;REFB=0;REVB=0.0228916;RO=0;SAF=12;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000501419;OID=.;OPOS=158066834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:27:12:0:0:27:12:0:0
chr1	158224904	.	C	T	391.7	PASS	AF=0.493827;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.00340104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.3666;QD=19.3434;RBI=0.029336;REFB=-0.0171855;REVB=-0.0291382;RO=41;SAF=23;SAR=17;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556563;STB=0.530896;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0245545;OID=.;OPOS=158224904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:41:41:40:40:0.493827:17:23:26:15:17:23:26:15
chr1	158225019	.	C	G	608.77	PASS	AF=0.563636;AO=56;DP=100;FAO=62;FDP=110;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0253405;FXX=0.0090082;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.6189;QD=22.137;RBI=0.0255997;REFB=-0.0266013;REVB=-0.00363318;RO=44;SAF=20;SAR=36;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447485;STB=0.51736;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0208332;OID=.;OPOS=158225019;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:110:44:48:56:62:0.563636:36:20:18:26:36:26:22:26
chr1	158324425	.	A	G	851.72	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.167;QD=57.7435;RBI=0.0545549;REFB=0;REVB=-0.00288351;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.47658e-05;OID=.;OPOS=158324425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:30:28:0:0:30:29:0:0
chr1	158368309	.	T	G	95.99	PASS	AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.000562141;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=285.901;QD=22.5856;RBI=0.00863387;REFB=0.00459459;REVB=0.00861555;RO=6;SAF=9;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140261;STB=0.580485;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=-0.00231614;OID=.;OPOS=158368309;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:2:9:4:2:2:9:4:2
chr1	158368541	.	A	G	668.86	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.427;QD=62.2197;RBI=0.0291491;REFB=0;REVB=0.00704393;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.23225e-05;OID=.;OPOS=158368541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chr1	158368846	.	T	C	753.46	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00139869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.492;QD=61.5066;RBI=0.00587489;REFB=-0.0569508;REVB=-0.00570597;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.518511;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.000414892;OID=.;OPOS=158368846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:0:1:48:48:0.979592:35:13:0:0:35:13:1:0
chr1	158368964	.	C	T	138.82	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.00153993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.832;QD=12.0711;RBI=0.0222976;REFB=-0.0172775;REVB=0.0222443;RO=29;SAF=6;SAR=10;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334593;STB=0.702889;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0220263;OID=.;OPOS=158368964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:30:16:16:0.347826:10:6:20:9:10:6:21:9
chr1	158368974	.	A	G	137.14	PASS	AF=0.327273;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=-0.0499963;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4378;QD=9.97383;RBI=0.0554551;REFB=-0.0131285;REVB=0.0239924;RO=37;SAF=9;SAR=9;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170068;STB=0.618058;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0446906;OID=.;OPOS=158368974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:37:37:18:18:0.327273:9:9:24:13:9:9:25:12
chr1	158369064	.	A	G	229.53	PASS	AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.00473551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.111;QD=22.3934;RBI=0.0529772;REFB=-0.0344121;REVB=0.0527651;RO=19;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273541;STB=0.652045;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0290756;OID=.;OPOS=158369064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:12:10:15:4:12:10:15:4
chr1	158390252	.	T	G	1482.28	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185636;FXX=0.0196059;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.738;QD=59.291;RBI=0.0218131;REFB=0;REVB=0.0114545;RO=0;SAF=49;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010152;OID=.;OPOS=158390252;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:50:49:0:0:50:50:0:0
chr1	158390501	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.568;QD=53.277;RBI=0.042796;REFB=0;REVB=0.0341789;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.78195e-05;OID=.;OPOS=158390501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr1	158436299	.	T	C	575.44	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.195;QD=60.5729;RBI=0.0923271;REFB=0;REVB=0.0911544;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131046;OID=.;OPOS=158436299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:19:17:0:0:20:18:0:0
chr1	158450238	.	G	A	348.93	PASS	AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0335801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.978;QD=22.8809;RBI=0.0399832;REFB=-0.0230255;REVB=-0.0217034;RO=26;SAF=16;SAR=19;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0925284;STB=0.550953;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0175356;OID=.;OPOS=158450238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:19:16:15:11:19:16:15:11
chr1	158450314	.	A	G	214.23	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.032651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4289;QD=45.1019;RBI=0.0341711;REFB=0.00478772;REVB=-0.0100784;RO=1;SAF=4;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101506;STB=0.55549;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.00163881;OID=.;OPOS=158450314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:14:4:1:0:14:4:1:0
chr1	158450382	.	C	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-8.37616e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.374;QD=61.684;RBI=0.015552;REFB=0;REVB=0.015552;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76013e-05;OID=.;OPOS=158450382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr1	158517142	.	C	T	279.33	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=5;FWDB=-0.0111119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.873;QD=18.9374;RBI=0.0122359;REFB=-0.0145241;REVB=-0.00512294;RO=28;SAF=21;SAR=9;SRF=24;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176625;STB=0.579351;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0203445;OID=.;OPOS=158517142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:28:29:30:30:0.508475:9:21:24:4:9:21:24:5
chr1	158517353	.	G	A	111.42	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.00399551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.7;QD=15.9166;RBI=0.00402879;REFB=-0.0216072;REVB=0.000516758;RO=15;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314671;STB=0.680587;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0204191;OID=.;OPOS=158517353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:8:5:11:4:8:5:11:4
chr1	158533140	.	A	G	732.09	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0689412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.8775;QD=56.3148;RBI=0.156856;REFB=0;REVB=-0.140893;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00237443;OID=.;OPOS=158533140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0
chr1	158533224	.	A	G	738.84	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0334854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.0132;QD=61.5703;RBI=0.0382324;REFB=0;REVB=0.018451;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83716e-05;OID=.;OPOS=158533224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:30:16:0:0:32:16:0:0
chr1	158549264	.	G	A	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.475;QD=56.7066;RBI=0.0174596;REFB=0;REVB=-0.000440093;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67199e-05;OID=.;OPOS=158549264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0
chr1	158549420	.	C	T	632.19	PASS	AF=0.914894;AO=43;DP=47;FAO=43;FDP=47;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.081714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4606;QD=53.8037;RBI=0.0833387;REFB=-0.120529;REVB=-0.0163756;RO=2;SAF=23;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390966;STB=0.502981;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0187246;OID=.;OPOS=158549420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:47:47:2:4:43:43:0.914894:20:23:2:0:20:23:2:2
chr1	158549492	.	C	T	754.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00273094;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=311.612;QD=56.9383;RBI=0.0343026;REFB=0;REVB=0.0341937;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.64979e-05;OID=.;OPOS=158549492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:24:28:0:0:25:28:0:0
chr1	158549511	.	A	G	801.43	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.159;QD=57.2451;RBI=0.0243868;REFB=0;REVB=0.0161971;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.20019e-05;OID=.;OPOS=158549511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:28:27:0:0:28:28:0:0
chr1	158577109	.	A	C	162.77	PASS	AF=0.35;AO=21;DP=60;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0399611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.6174;QD=10.8513;RBI=0.064528;REFB=-0.0104149;REVB=-0.0506654;RO=39;SAF=8;SAR=13;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635645;STB=0.537154;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0528014;OID=.;OPOS=158577109;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:39:39:21:21:0.35:13:8:17:22:13:8:17:22
chr1	158582646	.	T	C	890.21	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255732;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.488;QD=58.3747;RBI=0.0298606;REFB=0;REVB=0.0154166;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235218;OID=.;OPOS=158582646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0
chr1	158584091	.	A	G	670.04	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0732016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.813;QD=62.3289;RBI=0.0748948;REFB=0;REVB=0.0158353;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029055;OID=.;OPOS=158584091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0
chr1	158587390	.	C	T	671.58	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00298482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.509;QD=52.6727;RBI=0.0293281;REFB=-0.0607317;REVB=-0.0291758;RO=2;SAF=27;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335887;STB=0.51785;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00280624;OID=.;OPOS=158587390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:2:2:49:49:0.960784:22:27:2:0:22:27:2:0
chr1	158587858	.	G	A	194.09	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0251449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6897;QD=16.8778;RBI=0.0945014;REFB=0.0223227;REVB=-0.0910947;RO=25;SAF=15;SAR=5;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214174;STB=0.637353;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.0323473;OID=.;OPOS=158587858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:25:26:20:20:0.434783:5:15:14:11:5:15:14:12
chr1	158592935	.	G	A	90.82	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0212726;FXX=0.0434594;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.477;QD=16.5118;RBI=0.0227359;REFB=-0.0365181;REVB=0.00802481;RO=11;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155766;STB=0.590003;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0259784;OID=.;OPOS=158592935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:22:22:11:11:11:11:0.5:6:5:7:4:6:5:7:4
chr1	158597507	.	G	C	432.39	PASS	AF=0.52381;AO=40;DP=80;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0166366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.586;QD=20.5898;RBI=0.0252478;REFB=-0.0136313;REVB=-0.0189915;RO=40;SAF=14;SAR=26;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955413;STB=0.519991;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0136991;OID=.;OPOS=158597507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:84:40:40:40:44:0.52381:26:14:18:22:26:18:18:22
chr1	158606449	.	G	T	261.2	PASS	AF=0.364706;AO=31;DP=85;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=18;FWDB=-0.00976635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.402;QD=12.2917;RBI=0.0420076;REFB=-0.0135998;REVB=-0.0408565;RO=54;SAF=18;SAR=13;SRF=36;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997193;STB=0.557107;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0263919;OID=.;OPOS=158606449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:54:54:31:31:0.364706:13:18:36:18:13:18:36:18
chr1	158607935	.	T	G	273.91	PASS	AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.085152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2927;QD=15.2169;RBI=0.0851737;REFB=0.0165028;REVB=-0.00192239;RO=41;SAF=15;SAR=16;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175527;STB=0.598869;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=-0.0203253;OID=.;OPOS=158607935;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:16:15:27:14:16:15:27:14
chr1	158612236	.	A	G	3971.95	PASS	AF=0.992278;AO=257;DP=261;FAO=257;FDP=259;FR=.;FRO=2;FSAF=137;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0117402;FXX=0.00766254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.127;QD=61.3429;RBI=0.0486092;REFB=-0.112503;REVB=0.0471701;RO=1;SAF=137;SAR=120;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00395612;STB=0.504132;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.000242099;OID=.;OPOS=158612236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:261:259:1:2:257:257:0.992278:120:137:0:1:120:137:0:2
chr1	158619727	.	GA	CA,GC	1546.49	PASS	AF=0.0560748,0.943925;AO=5,73;DP=107;FAO=6,101;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=1,64;FSAR=5,37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0405576,0.00295431;FXX=0.0092584;HRUN=3,2;LEN=1,1;MLLD=96.3733,132.391;QD=57.8127;RBI=0.042241,0.0147753;REFB=-0.00169883,-0.110042;REVB=0.011806,0.014477;RO=0;SAF=0,56;SAR=5,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.45227e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0067389,0.00180738;OID=.,.;OPOS=158619727,158619728;OREF=G,A;OALT=C,C;OMAPALT=CA,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:107:107:0:0:5,73:6,101:0.0560748,0.943925:5,17:0,56:0:0:5,37:1,64:0:0
chr1	158626378	.	C	T	267.54	PASS	AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0275633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.394;QD=13.7201;RBI=0.0298921;REFB=-0.0011434;REVB=-0.0115673;RO=47;SAF=14;SAR=17;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0051283;STB=0.502922;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.00175299;OID=.;OPOS=158626378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:47:47:31:31:0.397436:17:14:21:26:17:14:21:26
chr1	158631171	.	A	C	444.43	PASS	AF=0.558442;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0322759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.5;QD=23.0872;RBI=0.0362114;REFB=-0.0261314;REVB=-0.0164175;RO=34;SAF=24;SAR=19;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0233015;STB=0.512815;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0212854;OID=.;OPOS=158631171;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:34:34:43:43:0.558442:19:24:18:16:19:24:18:16
chr1	158647495	.	A	T	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00522713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.347;QD=62.9829;RBI=0.0397629;REFB=0;REVB=-0.0394178;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010819;OID=.;OPOS=158647495;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr1	158647522	.	A	G	265.48	PASS	AF=0.491525;AO=28;DP=58;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0226674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5048;QD=17.9987;RBI=0.059831;REFB=0.00684124;REVB=0.0553709;RO=30;SAF=18;SAR=10;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1966;STB=0.615765;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.00239263;OID=.;OPOS=158647522;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:30:30:28:29:0.491525:10:18:13:17:10:19:13:17
chr1	158653225	.	G	A	372.45	PASS	AF=0.408163;AO=40;DP=98;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.00271923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.877;QD=15.202;RBI=0.00457421;REFB=4.04944e-05;REVB=0.00367821;RO=57;SAF=24;SAR=16;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599072;STB=0.529397;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=-5.47356e-05;OID=.;OPOS=158653225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:57:58:40:40:0.408163:16:24:31:26:16:24:32:26
chr1	158655036	.	G	A	1044.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1627;QD=58.0341;RBI=0.111053;REFB=0;REVB=-0.0392492;RO=0;SAF=19;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00245956;OID=.;OPOS=158655036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:64:72:0:0:64:72:1:45:19:0:0:45:27:0:0
chr1	158656281	.	T	C	759.11	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00997912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.64;QD=53.2708;RBI=0.0101895;REFB=-0.231273;REVB=0.00205971;RO=0;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67221e-08;STB=0.523801;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00096312;OID=.;OPOS=158656281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:0:2:55:55:0.964912:20:35:0:0:20:35:0:2
chr1	158687163	.	G	A	348.7	PASS	AF=0.4625;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0155657;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.418;QD=17.435;RBI=0.0183893;REFB=-0.00798982;REVB=-0.00979153;RO=42;SAF=14;SAR=23;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073153;STB=0.535619;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.00877088;OID=.;OPOS=158687163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:42:43:37:37:0.4625:23:14:19:23:23:14:19:24
chr1	158687224	.	G	A	167.0	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0555323;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.4015;QD=17.5786;RBI=0.062862;REFB=-0.0305338;REVB=-0.0294584;RO=18;SAF=8;SAR=10;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0492501;STB=0.555494;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0294843;OID=.;OPOS=158687224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:20:18:18:0.473684:10:8:9:9:10:8:11:9
chr1	158735595	.	C	T	1358.58	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.92;QD=62.4635;RBI=0.0233659;REFB=0;REVB=0.011861;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90486e-05;OID=.;OPOS=158735595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:45:41:0:0:45:42:0:0
chr1	158735691	.	T	C	1245.36	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5837;QD=61.4994;RBI=0.0219593;REFB=0;REVB=-0.00885355;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148981;OID=.;OPOS=158735691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:37:43:0:0:37:44:0:0
chr1	158735740	.	A	G	1194.29	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0535669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9927;QD=59.7145;RBI=0.0562956;REFB=-0.0655163;REVB=-0.0173142;RO=1;SAF=46;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141287;STB=0.507461;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00172024;OID=.;OPOS=158735740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:33:46:0:1:33:46:0:1
chr1	158735892	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.941;QD=59.4353;RBI=0.0338287;REFB=0;REVB=-0.00516813;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152196;OID=.;OPOS=158735892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0
chr1	158736215	.	G	A	615.4	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0726556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.5141;QD=60.0394;RBI=0.0732989;REFB=0;REVB=0.00969007;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00095557;OID=.;OPOS=158736215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:41:0:0:37:41:1:15:22:0:0:15:26:0:0
chr1	158736445	.	C	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00909839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.811;QD=57.1775;RBI=0.0333328;REFB=0;REVB=0.0320671;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41039e-05;OID=.;OPOS=158736445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:17:34:0:0:17:34:0:0
chr1	158986477	.	G	C	122.68	PASS	AF=0.293103;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.161649;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8348;QD=8.46069;RBI=0.161972;REFB=-0.0332877;REVB=-0.0102326;RO=40;SAF=6;SAR=11;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104345;STB=0.547891;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0294656;OID=.;OPOS=158986477;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:40:41:17:17:0.293103:11:6:11:29:11:6:12:29
chr1	158990247	.	A	G	418.31	PASS	AF=0.447917;AO=43;DP=96;FAO=43;FDP=96;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-8.26484e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=278.34;QD=17.4295;RBI=0.00870966;REFB=-0.0151245;REVB=0.00870926;RO=53;SAF=17;SAR=26;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114303;STB=0.564072;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0201949;OID=.;OPOS=158990247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:53:53:43:43:0.447917:26:17:27:26:26:17:27:26
chr1	159002377	.	C	A	187.36	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0179914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3418;QD=14.6951;RBI=0.018963;REFB=-0.00617521;REVB=-0.00599188;RO=30;SAF=13;SAR=8;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158106;STB=0.590822;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00603945;OID=.;OPOS=159002377;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:8:13:14:16:8:13:14:16
chr1	159002389	.	T	A	187.77	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00206463;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.673;QD=14.1716;RBI=0.00323619;REFB=-0.0201578;REVB=0.00249203;RO=31;SAF=13;SAR=9;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20631;STB=0.617891;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0200139;OID=.;OPOS=159002389;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:31:31:22:22:0.415094:9:13:12:19:9:13:12:19
chr1	159169641	.	T	C	758.86	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0168571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.79;QD=53.2532;RBI=0.0188838;REFB=0.107295;REVB=0.00851108;RO=2;SAF=24;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0376688;STB=0.519993;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.00248129;OID=.;OPOS=159169641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:2:2:55:55:0.964912:31:24:2:0:31:24:2:0
chr1	159175428	.	C	T	130.63	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0248853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4074;QD=13.7508;RBI=0.0274758;REFB=-0.0274179;REVB=-0.0116465;RO=23;SAF=7;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570906;STB=0.533289;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0448422;OID=.;OPOS=159175428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:8:7:12:11:8:7:12:11
chr1	159273892	.	A	G	394.28	PASS	AF=0.450549;AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.00266183;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.786;QD=17.3312;RBI=0.00334815;REFB=-0.0149035;REVB=0.00203096;RO=50;SAF=24;SAR=17;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123568;STB=0.569238;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0182186;OID=.;OPOS=159273892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:50:50:41:41:0.450549:17:24:23:27:17:24:23:27
chr1	159283494	.	T	C	708.5	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6233;QD=62.978;RBI=0.0513606;REFB=0;REVB=-0.0385638;RO=0;SAF=35;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64128e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000781186;OID=.;OPOS=159283494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:10:35:0:0:10:35:0:0
chr1	159283746	.	T	C	486.19	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0549453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.363;QD=57.199;RBI=0.0572041;REFB=0;REVB=0.0159162;RO=0;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000953618;OID=.;OPOS=159283746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:32:34:1:9:23:0:0:11:23:0:0
chr1	159409734	.	G	T	742.71	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0760328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0657;QD=53.051;RBI=0.124483;REFB=-0.0449024;REVB=-0.0985654;RO=1;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149611;STB=0.515619;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00260159;OID=.;OPOS=159409734;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:56:1:2:54:54:0.964286:31:23:0:1:31:23:0:2
chr1	159558258	.	A	G	961.45	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.082;QD=58.2698;RBI=0.0192437;REFB=0;REVB=-0.0161786;RO=0;SAF=40;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.35676e-05;OID=.;OPOS=159558258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:64:66:1:24:40:0:0:25:41:0:0
chr1	159683438	.	C	G	1537.2	PASS	AF=0.4875;AO=156;DP=320;FAO=156;FDP=320;FR=.;FRO=164;FSAF=44;FSAR=112;FSRF=71;FSRR=93;FWDB=-0.0105232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.765;QD=19.215;RBI=0.0182712;REFB=-0.0244662;REVB=-0.0149365;RO=164;SAF=44;SAR=112;SRF=71;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15974;STB=0.588116;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0320207;OID=.;OPOS=159683438;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:320:320:164:164:156:156:0.4875:112:44:71:93:112:44:71:93
chr1	159750898	.	TG	GC,TGC	40.35	PASS	AF=0.0444444,0.177778;AO=2,6;DP=48;FAO=2,8;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=2,6;FSAR=0,2;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=0.00070812,0.0496655;FXX=0.0217344;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=199.84,14.7125;QD=3.58624;RBI=0.0106293,0.0573282;REFB=-0.00634939,-0.051981;REVB=-0.0106057,-0.0286332;RO=38;SAF=2,6;SAR=0,0;SRF=8;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.605258,0.771426;STB=0.997573,0.873128;STBP=0.011,0.069;TYPE=mnp,ins;VARB=0.165618,0.147292;OID=.,.;OPOS=159750898,159750900;OREF=TG,-;OALT=GC,C;OMAPALT=GC,TGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:31:48:45:38:35:2,6:2,8:0.0444444,0.177778:0,0:2,6:8:30:0,2:2,6:7:28
chr1	159824967	.	G	C	990.58	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.476;QD=59.1392;RBI=0.0741587;REFB=0;REVB=0.0544571;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273462;OID=.;OPOS=159824967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:31:36:0:0:31:36:0:0
chr1	159898054	.	AGGGGGCT	AGGGGCT,AGGGGGCTG,AGGGGGGC	46.15	PASS	AF=0,0.258065,0.0645161;AO=4,4,2;DP=32;FAO=0,8,2;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=0,6,0;FSAR=0,2,2;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0805274,0.0552931,-0.0120204;FXX=0.0312402;HRUN=5,1,1;LEN=1,1,2;MLLD=11.9338,16.3853,147.615;QD=5.95479;RBI=0.080973,0.0563675,0.0328546;REFB=-0.100309,-0.0960329,-0.00325588;REVB=0.00848364,0.0109532,-0.0305768;RO=14;SAF=2,2,0;SAR=2,2,2;SRF=4;SRR=10;SSEN=0.3125,0,0;SSEP=0.315927,0,0;SSSB=0.247161,0.247161,-0.475704;STB=0.5,0.786211,0.993116;STBP=1,0.09,0.321;TYPE=del,ins,mnp;VARB=0.0483737,0.145533,0.182545;OID=.,.,.;OPOS=159898055,159898062,159898060;OREF=G,-,CT;OALT=-,G,GC;OMAPALT=AGGGGCT,AGGGGGCTG,AGGGGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.258065,0.0645161:4,4,2:32:0,8,2:31:21:0,6,0:0,2,2:7:14:35:14:2,2,0:2,2,2:4:10
chr1	159898100	.	A	G	240.74	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00156412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.484;QD=21.8855;RBI=0.0881634;REFB=-0.0154877;REVB=-0.0881495;RO=19;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896243;STB=0.54668;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0141304;OID=.;OPOS=159898100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:21:23:23:0.522727:11:12:12:7:11:12:13:8
chr1	159923111	.	T	G	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.993;QD=57.0003;RBI=0.0431758;REFB=0;REVB=0.0291981;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328113;OID=.;OPOS=159923111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0
chr1	160098543	.	G	A	719.52	PASS	AF=0.552;AO=69;DP=124;FAO=69;FDP=125;FR=.;FRO=56;FSAF=45;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.0171973;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.8618;QD=23.0247;RBI=0.023253;REFB=-0.0127519;REVB=-0.015651;RO=55;SAF=45;SAR=24;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195242;STB=0.611118;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0104546;OID=.;OPOS=160098543;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:125:55:56:69:69:0.552:24:45:23:32:24:45:23:33
chr1	160112138	.	A	G	210.25	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.119752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3273;QD=19.1132;RBI=0.121119;REFB=-0.0312541;REVB=0.0181441;RO=23;SAF=10;SAR=11;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202773;STB=0.613933;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.060161;OID=.;OPOS=160112138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:11:10:6:17:11:10:6:17
chr1	160124875	.	G	A	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0266324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.525;QD=53.9111;RBI=0.026712;REFB=0;REVB=-0.00206019;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156927;OID=.;OPOS=160124875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr1	160133955	.	G	A	301.04	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=54;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0150649;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.595;QD=21.5029;RBI=0.0179701;REFB=-0.00785294;REVB=0.00979647;RO=23;SAF=25;SAR=6;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280849;STB=0.663599;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00776894;OID=.;OPOS=160133955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:56:23:25:31:31:0.553571:6:25:12:11:6:25:13:12
chr1	160134205	.	C	T	215.5	PASS	AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.0226059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.261;QD=13.0605;RBI=0.0269918;REFB=-0.0127854;REVB=-0.014749;RO=40;SAF=18;SAR=8;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080274;STB=0.546138;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0209537;OID=.;OPOS=160134205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:8:18:25:15:8:18:25:15
chr1	160136350	.	G	A	538.6	PASS	AF=0.566667;AO=50;DP=90;FAO=51;FDP=90;FR=.;FRO=39;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0243306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3334;QD=23.9377;RBI=0.0436616;REFB=-0.0276419;REVB=0.0362541;RO=40;SAF=31;SAR=19;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382373;STB=0.508193;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0232415;OID=.;OPOS=160136350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:40:39:50:51:0.566667:19:31:23:17:20:31:23:16
chr1	160141196	.	C	T	1170.75	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0349;QD=60.8182;RBI=0.0321583;REFB=0;REVB=0.0259391;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018974;OID=.;OPOS=160141196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:75:77:1:36:39:0:0:38:39:0:0
chr1	160303416	.	G	A	232.39	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00443619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.179;QD=18.5912;RBI=0.00947228;REFB=-0.0256883;REVB=0.00836924;RO=27;SAF=12;SAR=11;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00307392;STB=0.501741;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0292142;OID=.;OPOS=160303416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:11:12:14:13:11:12:14:13
chr1	160341142	.	T	C	105.86	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0301628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.196;QD=21.1726;RBI=0.0324609;REFB=-0.0101472;REVB=-0.0119966;RO=8;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222221;STB=0.624812;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0144683;OID=.;OPOS=160341142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:7:5:1:7:7:5:1:7
chr1	160341245	.	TCA	T,TCT	203.39	PASS	AF=0.339286,0.107143;AO=15,7;DP=56;FAO=19,6;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=15,5;FSAR=4,1;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0215016,-0.0659554;FXX=0.0175408;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=173.567,99.4098;QD=14.5275;RBI=0.0254167,0.0668865;REFB=-0.0290453,-0.0158242;REVB=-0.0135532,-0.0111218;RO=31;SAF=13,5;SAR=2,2;SRF=13;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.551361,0.348447;STB=0.746331,0.839595;STBP=0.008,0.101;TYPE=del,snp;VARB=0.0398022,0.0783624;OID=.,.;OPOS=160341246,160341247;OREF=CA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.339286,0.107143:15,7:56:19,6:56:31:15,5:4,1:13:18:99:31:13,5:2,2:13:18
chr1	160342015	.	T	G	337.67	PASS	AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.00353269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.291;QD=17.5411;RBI=0.027022;REFB=-0.0269018;REVB=-0.0267901;RO=40;SAF=13;SAR=23;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373082;STB=0.511402;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0273721;OID=.;OPOS=160342015;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:40:41:36:36:0.467532:23:13:13:27:23:13:14:27
chr1	160461060	.	C	T	136.64	PASS	AF=0.327273;AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0311534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7515;QD=9.93757;RBI=0.0393606;REFB=0.0123771;REVB=-0.0240566;RO=37;SAF=10;SAR=8;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139342;STB=0.582239;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=-0.0814993;OID=.;OPOS=160461060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:37:37:18:18:0.327273:8:10:16:21:8:10:16:21
chr1	160585554	.	C	G	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.573;QD=59.8371;RBI=0.0316544;REFB=0;REVB=0.00750293;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.04837e-05;OID=.;OPOS=160585554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0
chr1	160616703	.	G	T	130.93	PASS	AF=0.6;AO=14;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0143865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.235;QD=20.9486;RBI=0.0198925;REFB=-0.0216027;REVB=0.0137382;RO=9;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385229;STB=0.631413;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.015729;OID=.;OPOS=160616703;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:25:25:9:10:14:15:0.6:8:6:9:0:8:7:8:2
chr1	160650913	.	A	G	395.69	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000584806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3947;QD=54.5775;RBI=0.0470171;REFB=0;REVB=0.0470135;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00239622;OID=.;OPOS=160650913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:13:15:0:0:14:15:0:0
chr1	160793442	.	A	G	163.76	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.00922224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4705;QD=13.3681;RBI=0.0253665;REFB=0.00483454;REVB=-0.0236307;RO=28;SAF=7;SAR=11;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227155;STB=0.639668;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.0182455;OID=.;OPOS=160793442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:31:18:18:0.367347:11:7:17:11:11:7:19:12
chr1	160793560	.	A	G	188.69	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0182538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.923;QD=14.2406;RBI=0.0204116;REFB=-0.0242059;REVB=0.00913421;RO=31;SAF=9;SAR=13;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268907;STB=0.653133;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0183469;OID=.;OPOS=160793560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:13:9:21:10:13:9:21:10
chr1	160793962	.	G	C	422.86	PASS	AF=0.467391;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0066305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.18;QD=18.3851;RBI=0.044581;REFB=-0.00818623;REVB=0.0440852;RO=49;SAF=23;SAR=20;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101211;STB=0.556425;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00924973;OID=.;OPOS=160793962;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:49:49:43:43:0.467391:20:23:21:28:20:23:21:28
chr1	160851826	.	A	T	1918.54	PASS	AF=0.992063;AO=124;DP=125;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00366684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8653;QD=60.9061;RBI=0.00427707;REFB=-0.0853731;REVB=-0.00220174;RO=1;SAF=70;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0087171;STB=0.504586;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000501103;OID=.;OPOS=160851826;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:125:126:1:1:124:125:0.992063:54:70:0:1:54:71:0:1
chr1	160851894	.	G	A	1529.97	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.81;QD=63.7489;RBI=0.0267488;REFB=0;REVB=-0.0141586;RO=0;SAF=45;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.56937e-05;OID=.;OPOS=160851894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:51:45:0:0:51:45:0:0
chr1	160920966	.	C	T	1026.39	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0659635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.307;QD=59.5007;RBI=0.0661766;REFB=0;REVB=0.00530644;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111919;OID=.;OPOS=160920966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:38:31:0:0:38:31:0:0
chr1	160971146	.	A	G	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00681266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.435;QD=59.0167;RBI=0.0551184;REFB=0;REVB=-0.0546958;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000227278;OID=.;OPOS=160971146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr1	160990875	.	TC	CA	630.49	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115667;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=96.8022;QD=61.5114;RBI=0.0156468;REFB=0;REVB=0.0105372;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00016908;OID=.;OPOS=160990875;OREF=TC;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:39:41:1:21:18:0:0:23:18:0:0
chr1	160990878	.	C	T	632.26	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.904;QD=61.6837;RBI=0.0493473;REFB=0;REVB=0.0471097;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229265;OID=.;OPOS=160990878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:22:18:0:0:23:18:0:0
chr1	161018286	.	TCCCCA	TCCCA,TCCCAC	94.3	PASS	AF=0.538462,0.384615;AO=4,4;DP=13;FAO=7,5;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=4,4;FSAR=3,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.182606,0.144149;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=12.473,20.2553;QD=29.0139;RBI=0.536581,0.212784;REFB=0.0154411,-0.0105242;REVB=0.504553,0.156519;RO=4;SAF=4,4;SAR=0,0;SRF=0;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0.272727,0;SSSB=0.794086,0.794086;STB=0.571224,0.66592;STBP=0.543,0.23;TYPE=del,mnp;VARB=0.123514,0.0299105;OID=.,.;OPOS=161018287,161018290;OREF=C,CA;OALT=-,AC;OMAPALT=TCCCA,TCCCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.538462,0.384615:4,4:13:7,5:13:1:4,4:3,1:0:1:26:4:4,4:0,0:0:4
chr1	161068836	.	A	C	250.21	PASS	AF=0.35;AO=18;DP=57;FAO=21;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00232839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.537;QD=16.6809;RBI=0.0373226;REFB=-0.0234255;REVB=0.0372499;RO=27;SAF=12;SAR=6;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423964;STB=0.519981;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0132768;OID=.;OPOS=161068836;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:60:27:29:18:21:0.35:6:12:17:10:8:13:17:12
chr1	161141432	.	C	G	157.78	PASS	AF=0.447368;AO=16;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0262274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1244;QD=16.6079;RBI=0.0330595;REFB=0.0145312;REVB=-0.020126;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384175;STB=0.503102;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=-0.0129444;OID=.;OPOS=161141432;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:21:21:16:17:0.447368:9:7:10:11:9:8:10:11
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chr1	161163021	.	G	A	246.8	PASS	AF=0.466667;AO=27;DP=59;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.000697561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.002;QD=16.4532;RBI=0.00623606;REFB=-0.00991194;REVB=-0.00619693;RO=32;SAF=10;SAR=17;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676627;STB=0.524674;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00824467;OID=.;OPOS=161163021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:32:32:27:28:0.466667:17:10:14:18:17:11:14:18
chr1	161163037	.	T	C	818.6	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.049516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2764;QD=54.5735;RBI=0.203319;REFB=0;REVB=0.197197;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000669936;OID=.;OPOS=161163037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:49:60:0:0:48:60:1:25:23:0:0:35:25:0:0
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chr1	161202605	.	G	A	123.97	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0145194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.95;QD=17.099;RBI=0.0285155;REFB=-0.00581098;REVB=0.0245423;RO=15;SAF=9;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413564;STB=0.523775;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.00458073;OID=.;OPOS=161202605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:5:9:9:6:5:9:9:6
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chr1	161409996	.	T	C	181.48	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.106791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.0067;QD=24.1974;RBI=0.112151;REFB=-0.00597995;REVB=-0.0342569;RO=12;SAF=6;SAR=12;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00923081;OID=.;OPOS=161409996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:12:6:4:8:12:6:4:8
chr1	161410044	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220655;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=318.731;QD=33.4285;RBI=0.0497583;REFB=0;REVB=-0.0445982;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000184015;OID=.;OPOS=161410044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr1	161479745	.	A	G	585.03	PASS	AF=0.5;AO=60;DP=120;FAO=60;FDP=120;FR=.;FRO=60;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=0.00370606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.984;QD=19.5011;RBI=0.0330879;REFB=-0.0207182;REVB=0.0328797;RO=60;SAF=37;SAR=23;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158879;STB=0.508774;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0181705;OID=.;OPOS=161479745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:60:60:60:60:0.5:23:37:36:24:23:37:36:24
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chr1	161559571	.	C	T	109.45	PASS	AF=0.277778;AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0233812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5162;QD=8.10704;RBI=0.0356702;REFB=-0.000857515;REVB=0.0269385;RO=39;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130564;STB=0.578846;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.00214609;OID=.;OPOS=161559571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:39:39:15:15:0.277778:8:7:14:25:8:7:14:25
chr1	161565479	.	G	A	58.66	PASS	AF=0.157143;AO=11;DP=68;FAO=11;FDP=70;FR=.;FRO=59;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=-0.0040043;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.826;QD=3.35183;RBI=0.0291222;REFB=-0.00348474;REVB=-0.0288456;RO=57;SAF=10;SAR=1;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.581966;STB=0.898424;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0214289;OID=.;OPOS=161565479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:68:70:57:59:11:11:0.157143:1:10:26:31:1:10:27:32
chr1	161565761	.	AT	A	68.11	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0519888;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.8325;QD=11.3512;RBI=0.104734;REFB=0.0529295;REVB=0.0909198;RO=12;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=7;SSEN=0.347639;SSEP=0;SSSB=0.115026;STB=0.586311;STBP=0.468;TYPE=del;VARB=-0.0206723;OID=.;OPOS=161565762;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.458333:11:24:11:24:13:6:5:5:8:65:12:6:5:5:7
chr1	161574654	.	G	A	901.97	PASS	AF=0.625;AO=80;DP=129;FAO=80;FDP=128;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=62;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.0010809;FXX=0.022899;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.079;QD=28.1865;RBI=0.0025455;REFB=-0.0021043;REVB=0.0023046;RO=44;SAF=18;SAR=62;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636556;STB=0.534474;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00176734;OID=.;OPOS=161574654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:128:44:48:80:80:0.625:62:18:13:31:62:18:14:34
chr1	161582570	.	GG	AC	278.08	PASS	AF=0.310924;AO=37;DP=118;FAO=37;FDP=119;FR=.;FRO=82;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=48;FWDB=0.00372803;FXX=0.00833264;HRUN=3;LEN=2;MLLD=300.404;QD=9.34729;RBI=0.0115661;REFB=-0.00921929;REVB=-0.0109489;RO=81;SAF=20;SAR=17;SRF=34;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141414;STB=0.586068;STBP=0.221;TYPE=mnp;VARB=0.0195593;OID=.;OPOS=161582570;OREF=GG;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:119:81:82:37:37:0.310924:17:20:34:47:17:20:34:48
chr1	161591542	.	G	A	189.57	PASS	AF=0.431373;AO=19;DP=48;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0538425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.124;QD=14.8679;RBI=0.0565424;REFB=-0.0348136;REVB=0.0172634;RO=29;SAF=6;SAR=13;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184928;STB=0.599906;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0346311;OID=.;OPOS=161591542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:51:29:29:19:22:0.431373:13:6:14:15:15:7:14:15
chr1	161591548	.	C	T	189.47	PASS	AF=0.352941;AO=15;DP=50;FAO=18;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0151627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.99;QD=14.8603;RBI=0.0175073;REFB=-0.0111838;REVB=-0.00875206;RO=28;SAF=6;SAR=9;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324758;STB=0.537855;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0224915;OID=.;OPOS=161591548;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:28:29:15:18:0.352941:9:6:12:16:11:7:13:16
chr1	161599693	.	T	C	250.6	PASS	AF=0.814815;AO=21;DP=27;FAO=22;FDP=27;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0505272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4137;QD=37.1252;RBI=0.0948564;REFB=-0.0420354;REVB=0.0802791;RO=3;SAF=4;SAR=17;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157288;STB=0.562439;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0173087;OID=.;OPOS=161599693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:27:27:3:5:21:22:0.814815:17:4:2:1:18:4:2:3
chr1	161600995	.	C	T	784.05	PASS	AF=0.585366;AO=66;DP=121;FAO=72;FDP=123;FR=.;FRO=51;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=0.0667666;FXX=0.0390594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.946;QD=25.4976;RBI=0.0667999;REFB=-0.0212673;REVB=-0.00210622;RO=55;SAF=21;SAR=45;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757064;STB=0.509801;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0132636;OID=.;OPOS=161600995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:123:55:51:66:72:0.585366:45:21:22:33:45:27:18:33
chr1	161680258	.	G	A	2287.35	PASS	AF=0.993421;AO=150;DP=152;FAO=151;FDP=152;FR=.;FRO=1;FSAF=102;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0131155;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4843;QD=60.1934;RBI=0.0233788;REFB=-0.0266751;REVB=0.0193534;RO=1;SAF=102;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00464085;STB=0.502439;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.000148795;OID=.;OPOS=161680258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:152:152:1:1:150:151:0.993421:48:102:1:0:49:102:1:0
chr1	161683136	.	G	A	222.68	PASS	AF=0.380282;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.0164873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.156;QD=12.5453;RBI=0.0208079;REFB=-0.0043584;REVB=0.0126939;RO=44;SAF=19;SAR=8;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560003;STB=0.532253;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0091653;OID=.;OPOS=161683136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:44:44:27:27:0.380282:8:19:29:15:8:19:29:15
chr1	161695639	.	G	T	199.15	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575236;FXX=0.111049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.715;QD=49.7879;RBI=0.0816088;REFB=0;REVB=0.0578881;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00439245;OID=.;OPOS=161695639;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr1	161696088	.	T	C	62.25	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.087;QD=35.571;RBI=0.0331153;REFB=0;REVB=0.0105037;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283497;OID=.;OPOS=161696088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:2:4:0:0:2:5:0:0
chr1	161696782	.	G	C	63.55	PASS	AF=0.310345;AO=8;DP=28;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0701976;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.887;QD=8.76598;RBI=0.0746097;REFB=-0.0230086;REVB=-0.0252763;RO=20;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569244;STB=0.503867;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.054177;OID=.;OPOS=161696782;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:29:20:20:8:9:0.310345:4:4:11:9:4:5:11:9
chr1	161697319	.	G	A	576.65	PASS	AF=0.504274;AO=59;DP=118;FAO=59;FDP=117;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=0.00270535;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.565;QD=19.7146;RBI=0.026319;REFB=-0.00524535;REVB=0.0261796;RO=56;SAF=31;SAR=28;SRF=37;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120916;STB=0.556219;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00636583;OID=.;OPOS=161697319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:117:56:58:59:59:0.504274:28:31:37:19:28:31:37:21
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chr1	161721707	.	C	T	295.27	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0180833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2283;QD=20.3632;RBI=0.0690394;REFB=-0.00297359;REVB=-0.0666291;RO=27;SAF=20;SAR=11;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289805;STB=0.66069;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00473631;OID=.;OPOS=161721707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:11:20:8:19:11:20:8:19
chr1	161748056	.	C	T	103.66	PASS	AF=0.382353;AO=12;DP=33;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00235543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3578;QD=12.1952;RBI=0.0714327;REFB=-0.0993451;REVB=-0.0713938;RO=21;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256805;STB=0.666405;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0379946;OID=.;OPOS=161748056;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:21:21:12:13:0.382353:8:4:12:9:9:4:12:9
chr1	161753802	.	T	C	121.19	PASS	AF=0.424242;AO=13;DP=32;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00169902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.004;QD=14.6897;RBI=0.00460618;REFB=-0.0119675;REVB=-0.00428138;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656314;STB=0.51513;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0179953;OID=.;OPOS=161753802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:19:19:13:14:0.424242:7:6:10:9:7:7:10:9
chr1	161753841	.	G	A	121.57	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0339318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.158;QD=15.1968;RBI=0.0409334;REFB=-0.0359596;REVB=0.0228949;RO=17;SAF=6;SAR=8;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163226;STB=0.509078;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0551694;OID=.;OPOS=161753841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:18:14:14:0.4375:8:6:7:10:8:6:8:10
chr1	161761276	.	G	C	215.99	PASS	AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0407714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.362;QD=15.1572;RBI=0.0414265;REFB=-0.00521684;REVB=0.00733796;RO=32;SAF=8;SAR=17;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275333;STB=0.656525;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00883884;OID=.;OPOS=161761276;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:17:8:19:13:17:8:19:13
chr1	161761312	.	C	T	213.39	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00120502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1745;QD=16.1049;RBI=0.0317768;REFB=-0.00293556;REVB=-0.031754;RO=29;SAF=9;SAR=15;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236192;STB=0.633692;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00258463;OID=.;OPOS=161761312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:15:9:18:11:15:9:18:11
chr1	161823011	.	T	A	191.54	PASS	AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00816587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.191;QD=22.5346;RBI=0.027252;REFB=-0.0106886;REVB=0.0259999;RO=15;SAF=11;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365105;STB=0.520483;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.00862677;OID=.;OPOS=161823011;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:8:11:8:7:8:11:8:7
chr1	161928327	.	A	G	359.36	PASS	AF=0.457831;AO=37;DP=82;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00341114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.656;QD=17.3183;RBI=0.0118133;REFB=-0.0201563;REVB=-0.0113101;RO=44;SAF=20;SAR=17;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.083243;STB=0.546642;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0222353;OID=.;OPOS=161928327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:44:45:37:38:0.457831:17:20:20:24:17:21:21:24
chr1	161953402	.	G	A	491.69	PASS	AF=0.54023;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0183675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5884;QD=22.6065;RBI=0.0244813;REFB=-0.0436307;REVB=-0.0161855;RO=38;SAF=23;SAR=24;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300469;STB=0.50489;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0496855;OID=.;OPOS=161953402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:38:40:47:47:0.54023:24:23:20:18:24:23:20:20
chr1	161967681	.	A	G	322.49	PASS	AF=0.53125;AO=33;DP=63;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.00336844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5412;QD=20.1556;RBI=0.069102;REFB=-0.0159365;REVB=-0.0690199;RO=30;SAF=16;SAR=17;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985494;STB=0.560404;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.018513;OID=.;OPOS=161967681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:30:30:33:34:0.53125:17:16:18:12:18:16:18:12
chr1	161976234	.	A	G	106.66	PASS	AF=0.545455;AO=11;DP=25;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00293411;FXX=0.153787;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.435;QD=19.3923;RBI=0.0159644;REFB=-0.0149142;REVB=0.0156925;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197016;STB=0.583194;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0178722;OID=.;OPOS=161976234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:25:22:10:10:11:12:0.545455:7:4:6:4:7:5:6:4
chr1	161993121	.	C	CG	46.6	PASS	AF=0.152381;AO=28;DP=105;FAO=16;FDP=105;FR=.;FRO=89;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=64;FSRR=25;FWDB=-0.06593;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=18.7764;QD=1.77521;RBI=0.104953;REFB=-0.0172143;REVB=-0.0816607;RO=75;SAF=18;SAR=10;SRF=53;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0876749;STB=0.685514;STBP=0.127;TYPE=ins;VARB=0.0687123;OID=.;OPOS=161993122;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.152381:28:105:16:105:89:8:8:64:25:46:75:18:10:53:22
chr1	162313735	.	C	T	467.89	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044791;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.557;QD=58.4861;RBI=0.118021;REFB=0;REVB=0.109192;RO=0;SAF=27;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000946594;OID=.;OPOS=162313735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:5:27:0:0:5:27:0:0
chr1	162344102	.	C	T	1463.57	PASS	AF=0.979167;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0378457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.691;QD=60.9822;RBI=0.0464469;REFB=-0.0446304;REVB=0.0269261;RO=2;SAF=46;SAR=48;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201665;STB=0.510636;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.000931812;OID=.;OPOS=162344102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:96:96:2:2:94:94:0.979167:48:46:2:0:48:46:2:0
chr1	162345091	.	G	A	2296.56	PASS	AF=1;AO=144;DP=145;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384443;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.1;QD=63.7933;RBI=0.0917869;REFB=0;REVB=0.0833478;RO=0;SAF=102;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9188e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191988;OID=.;OPOS=162345091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:145:144:0:0:144:144:1:42:102:0:0:42:102:0:0
chr1	162354803	.	G	C	592.34	PASS	AF=0.42;AO=63;DP=150;FAO=63;FDP=150;FR=.;FRO=87;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=48;FSRR=39;FWDB=-0.0214379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.613;QD=15.7958;RBI=0.040672;REFB=-0.0274899;REVB=-0.0345633;RO=87;SAF=33;SAR=30;SRF=48;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289996;STB=0.516247;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0352858;OID=.;OPOS=162354803;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:87:87:63:63:0.42:30:33:48:39:30:33:48:39
chr1	162737116	.	C	G	402.53	PASS	AF=0.436893;AO=44;DP=102;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=17;FSRR=41;FWDB=-0.00306339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7207;QD=15.6323;RBI=0.0158251;REFB=-0.000413251;REVB=-0.0155257;RO=57;SAF=10;SAR=34;SRF=16;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0727225;STB=0.554227;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.000685613;OID=.;OPOS=162737116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:57:58:44:45:0.436893:34:10:16:41:35:10:17:41
chr1	162740327	.	T	C	1540.34	PASS	AF=1;AO=106;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0097855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5768;QD=57.0498;RBI=0.0431951;REFB=0;REVB=0.0420721;RO=1;SAF=50;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839996;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101019;OID=.;OPOS=162740327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:1:0:106:108:1:56:50:0:1:58:50:0:0
chr1	162765475	.	G	C	104.28	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.661;QD=37.9208;RBI=0.0517886;REFB=0;REVB=-0.0420922;RO=1;SAF=2;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176689;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000809426;OID=.;OPOS=162765475;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:11:11:1:0:10:11:1:8:2:1:0:8:3:0:0
chr1	163309219	.	A	T	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00281254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.256;QD=64.4145;RBI=0.0174495;REFB=0;REVB=0.0172213;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.31629e-05;OID=.;OPOS=163309219;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:31:19:0:0:31:19:0:0
chr1	163479278	.	G	A	1552.68	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00272912;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.151;QD=64.028;RBI=0.00921134;REFB=0;REVB=0.00879777;RO=0;SAF=53;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.30279e-05;OID=.;OPOS=163479278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:44:53:0:0:44:53:0:0
chr1	164529120	.	G	A	64.89	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00776679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.442;QD=10.3816;RBI=0.0140988;REFB=-0.00156488;REVB=-0.0117666;RO=16;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124271;STB=0.575055;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.00241129;OID=.;OPOS=164529120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:4:5:7:9:4:5:7:9
chr1	164608825	.	G	A	1887.17	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.83;QD=61.3712;RBI=0.0192404;REFB=0;REVB=0.0110784;RO=0;SAF=49;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169313;OID=.;OPOS=164608825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:123:0:0:122:123:1:73:49:0:0:73:50:0:0
chr1	164672441	.	G	A	236.58	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0293452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0893;QD=19.7151;RBI=0.0325117;REFB=-0.0286596;REVB=0.0139954;RO=25;SAF=19;SAR=4;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197365;STB=0.612794;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.031581;OID=.;OPOS=164672441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:4:19:17:8:4:19:17:8
chr1	165173216	.	A	G	1208.94	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5812;QD=61.2121;RBI=0.0576363;REFB=0;REVB=0.0431253;RO=0;SAF=72;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000612076;OID=.;OPOS=165173216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:7:72:0:0:7:72:0:0
chr1	165218792	.	G	A	946.61	PASS	AF=0.970588;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0625858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8924;QD=55.6827;RBI=0.0751637;REFB=-0.0102652;REVB=0.0416244;RO=2;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0277737;STB=0.514701;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.000165141;OID=.;OPOS=165218792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:68:68:2:2:66:66:0.970588:33:33:0:2:33:33:0:2
chr1	165377552	.	G	A	250.68	PASS	AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0227067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.634;QD=14.5321;RBI=0.0227999;REFB=0.0256394;REVB=0.00205979;RO=39;SAF=15;SAR=14;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185659;STB=0.610652;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=-0.0463033;OID=.;OPOS=165377552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:39:40:29:29:0.42029:14:15:13:26:14:15:13:27
chr1	165389129	.	G	A	449.02	PASS	AF=0.462264;AO=49;DP=106;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=42;FSRR=15;FWDB=-0.00422529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.69;QD=16.9442;RBI=0.00851782;REFB=-0.0126393;REVB=-0.00739596;RO=57;SAF=33;SAR=16;SRF=42;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716597;STB=0.539795;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0151792;OID=.;OPOS=165389129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:57:57:49:49:0.462264:16:33:42:15:16:33:42:15
chr1	165601466	.	G	A	1093.61	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00595124;FXX=0.0263123;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.917;QD=59.1142;RBI=0.0112054;REFB=0.0665319;REVB=-0.00949445;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506022;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=3.81992e-05;OID=.;OPOS=165601466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:0:1:73:73:0.986486:41:32:0:0:41:32:0:1
chr1	165624799	.	G	T	172.13	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.014147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5013;QD=18.1188;RBI=0.0165454;REFB=-0.00623825;REVB=-0.00857981;RO=19;SAF=11;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302987;STB=0.533296;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.00748652;OID=.;OPOS=165624799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:20:18:18:0.473684:7:11:11:8:7:11:11:9
chr1	165630698	.	A	G	738.91	PASS	AF=0.981818;AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0788459;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8018;QD=53.7389;RBI=0.0795809;REFB=-0.110292;REVB=-0.0107912;RO=1;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171308;STB=0.509088;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00837511;OID=.;OPOS=165630698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:53:54:0.981818:27:26:0:1:27:27:0:1
chr1	165652273	.	A	G	802.5	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2232;QD=64.2001;RBI=0.0499011;REFB=0;REVB=-0.0107348;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339877;OID=.;OPOS=165652273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:24:25:0:0:25:25:0:0
chr1	165737704	.	C	G	317.17	PASS	AF=0.892857;AO=25;DP=28;FAO=25;FDP=28;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.000557536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=296.384;QD=45.3104;RBI=0.0160923;REFB=-0.0190935;REVB=0.0160826;RO=2;SAF=16;SAR=9;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206975;STB=0.534926;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.000267921;OID=.;OPOS=165737704;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:28:28:2:3:25:25:0.892857:9:16:1:1:9:16:1:2
chr1	165737719	.	C	T	134.97	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.00405023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6085;QD=16.8711;RBI=0.0269914;REFB=0.0480238;REVB=0.0266858;RO=16;SAF=8;SAR=7;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200709;STB=0.625378;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=-0.0505793;OID=.;OPOS=165737719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:17:15:15:0.46875:7:8:12:4:7:8:13:4
chr1	165859549	.	T	G	542.09	PASS	AF=0.439394;AO=58;DP=133;FAO=58;FDP=132;FR=.;FRO=74;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=0.0291404;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.739;QD=16.427;RBI=0.0373147;REFB=-0.00111157;REVB=-0.0233072;RO=74;SAF=28;SAR=30;SRF=42;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849643;STB=0.547429;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.00235696;OID=.;OPOS=165859549;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:132:74:74:58:58:0.439394:30:28:42:32:30:28:42:32
chr1	166039898	.	C	G	1002.9	PASS	AF=0.568862;AO=94;DP=166;FAO=95;FDP=167;FR=.;FRO=72;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=0.0032975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.886;QD=24.0217;RBI=0.0152961;REFB=-0.0344299;REVB=-0.0149364;RO=70;SAF=45;SAR=49;SRF=39;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0614733;STB=0.530724;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0109622;OID=.;OPOS=166039898;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:167:70:72:94:95:0.568862:49:45:39:31:49:46:40:32
chr1	166818566	.	A	G	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.311;QD=57.5453;RBI=0.0136624;REFB=0;REVB=0.0133335;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.38957e-06;OID=.;OPOS=166818566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:27:31:0:0:27:31:0:0
chr1	166822566	.	A	G	1048.28	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310966;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1517;QD=59.9019;RBI=0.0328442;REFB=0;REVB=0.0105709;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246446;OID=.;OPOS=166822566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0
chr1	166958601	.	T	C	2242.44	PASS	AF=0.993007;AO=142;DP=144;FAO=142;FDP=143;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0346629;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.423;QD=62.7256;RBI=0.0375993;REFB=-0.0168104;REVB=0.0145668;RO=1;SAF=72;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674472;STB=0.503546;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000217383;OID=.;OPOS=166958601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:144:143:1:1:142:142:0.993007:70:72:0:1:70:72:0:1
chr1	166958710	.	T	G	1828.35	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00631036;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.506;QD=61.4572;RBI=0.0192403;REFB=0;REVB=0.018176;RO=0;SAF=63;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.34538e-05;OID=.;OPOS=166958710;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:56:63:0:0:56:63:0:0
chr1	166958973	.	G	A,GA	59.71	PASS	AF=0,0.234043;AO=2,6;DP=46;FAO=0,11;FDP=47;FR=.;FRO=36;FSAF=0,9;FSAR=0,2;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=-0.0704182,0.0209236;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=160.767,76.8001;QD=5.08152;RBI=0.0709957,0.0353152;REFB=-2.66031e-07,-0.00716447;REVB=-0.00903694,-0.0284493;RO=37;SAF=2,4;SAR=0,2;SRF=13;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.503641,0.359928;STB=0.5,0.847241;STBP=1,0.02;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.106198;OID=.,.;OPOS=166958973,166958974;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:60:46:47:37:36:2,6:0,11:0,0.234043:0,2:2,4:13:24:0,2:0,9:12:24
chr1	167095163	.	G	C	1826.85	PASS	AF=0.991736;AO=118;DP=119;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00188848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.5054;QD=60.3918;RBI=0.0285405;REFB=-0.105901;REVB=0.028478;RO=1;SAF=65;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00887722;STB=0.504504;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00106776;OID=.;OPOS=167095163;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:119:121:1:1:118:120:0.991736:53:65:0:1:55:65:0:1
chr1	167095765	.	G	A	1031.91	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131848;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.613;QD=59.8211;RBI=0.0323293;REFB=0;REVB=0.0295186;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121199;OID=.;OPOS=167095765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:35:34:0:0:35:34:0:0
chr1	167095877	.	G	A	303.67	PASS	AF=0.37;AO=35;DP=99;FAO=37;FDP=100;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=40;FWDB=0.00157835;FXX=0.0196059;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4524;QD=12.1467;RBI=0.0172741;REFB=-0.045097;REVB=0.0172018;RO=64;SAF=13;SAR=22;SRF=24;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00428687;STB=0.5266;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.10402;OID=.;OPOS=167095877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:64:63:35:37:0.37:22:13:24:40:22:15:23:40
chr1	167095881	.	G	A	1492.99	PASS	AF=0.98;AO=95;DP=100;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0922138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.939;QD=59.7197;RBI=0.0970385;REFB=-0.190001;REVB=0.0302171;RO=1;SAF=37;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00810635;STB=0.508332;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00238841;OID=.;OPOS=167095881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:100:100:1:2:95:98:0.98:58:37:0:1:59:39:0:2
chr1	167097739	.	C	A	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.602;QD=50.4109;RBI=0.0189432;REFB=0;REVB=0.00382839;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193373;OID=.;OPOS=167097739;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr1	167510996	.	G	A	728.91	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0385501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.418;QD=57.1692;RBI=0.0465881;REFB=0;REVB=0.0261599;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.19678e-05;OID=.;OPOS=167510996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:17:34:0:0:17:34:0:0
chr1	167511035	.	C	G	801.31	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00706863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1041;QD=57.2365;RBI=0.0198083;REFB=0;REVB=0.0185042;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198814;OID=.;OPOS=167511035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:20:36:0:0:20:36:0:0
chr1	167684723	.	C	G	585.2	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4263;QD=60.0205;RBI=0.0419991;REFB=0;REVB=0.0192979;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031095;OID=.;OPOS=167684723;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:23:14:0:0:25:14:0:0
chr1	167806283	.	T	A,TA	159.33	PASS	AF=0,0.406593;AO=11,20;DP=92;FAO=0,37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=0,23;FSAR=0,14;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.0114942,0.0120414;FXX=0.0215031;HRUN=1,4;LEN=1,1;MLLD=260.236,10.7307;QD=7.00338;RBI=0.0123984,0.020752;REFB=-0.00295903,-0.182673;REVB=0.00464806,0.0169012;RO=60;SAF=8,11;SAR=3,9;SRF=37;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.153386,-0.0837988;STB=0.5,0.518138;STBP=1,0.779;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.185568;OID=.,.;OPOS=167806283,167806284;OREF=T,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:92:91:60:54:11,20:0,37:0,0.406593:3,9:8,11:37:23:0,14:0,23:32:22
chr1	167817639	.	A	G	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00127455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.665;QD=58.419;RBI=0.0127824;REFB=0;REVB=-0.0127187;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.38529e-05;OID=.;OPOS=167817639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0
chr1	167825485	.	T	C	585.68	PASS	AF=0.465649;AO=61;DP=130;FAO=61;FDP=131;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=29;FWDB=-0.0343655;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.368;QD=17.8833;RBI=0.0345962;REFB=-0.0262925;REVB=0.00398886;RO=64;SAF=25;SAR=36;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127673;STB=0.593821;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0286163;OID=.;OPOS=167825485;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:131:64:70:61:61:0.465649:36:25:35:29:36:25:41:29
chr1	167849414	.	A	G	236.11	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0271481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.499;QD=19.2745;RBI=0.0275387;REFB=-0.0267538;REVB=-0.00462189;RO=25;SAF=16;SAR=7;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169038;STB=0.525645;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0247227;OID=.;OPOS=167849414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:26:23:23:0.469388:7:16:17:8:7:16:17:9
chr1	167865921	.	G	T	126.81	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0680664;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.188;QD=18.1159;RBI=0.0682325;REFB=-0.019371;REVB=-0.00475874;RO=14;SAF=3;SAR=11;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403655;STB=0.732978;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00894567;OID=.;OPOS=167865921;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:11:3:9:5:11:3:9:5
chr1	167893759	.	G	A	464.69	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.552;QD=58.0856;RBI=0.0250908;REFB=0;REVB=-0.0120857;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.8604e-06;OID=.;OPOS=167893759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:30:32:1:11:19:0:0:11:21:0:0
chr1	167905028	.	C	T	304.06	PASS	AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0475469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9174;QD=19.9384;RBI=0.0484315;REFB=-0.00271315;REVB=-0.00921447;RO=29;SAF=6;SAR=26;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257123;STB=0.644527;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00222125;OID=.;OPOS=167905028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:29:32:32:0.52459:26:6:12:17:26:6:12:17
chr1	167906239	.	A	C	1138.44	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160505;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.12;QD=60.7168;RBI=0.0422399;REFB=0;REVB=0.0390715;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.76198e-05;OID=.;OPOS=167906239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:31:44:0:0:31:44:0:0
chr1	167967958	.	A	G	69.94	PASS	AF=0.238095;AO=10;DP=42;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0423966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.955;QD=6.66136;RBI=0.0474813;REFB=0.000201233;REVB=-0.0213774;RO=32;SAF=4;SAR=6;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120938;STB=0.576768;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=-0.000204084;OID=.;OPOS=167967958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:42:42:32:32:10:10:0.238095:6:4:16:16:6:4:16:16
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chr1	168034974	.	G	A	235.61	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=51;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0159111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2271;QD=18.1236;RBI=0.0748019;REFB=-0.00642128;REVB=-0.0730901;RO=26;SAF=14;SAR=11;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875473;STB=0.539847;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.00540119;OID=.;OPOS=168034974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:26:26:25:26:0.5:11:14:17:9:11:15:17:9
chr1	168059866	.	A	G	786.92	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048429;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.367;QD=57.2302;RBI=0.0503206;REFB=0;REVB=-0.0136671;RO=0;SAF=37;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.93439e-06;OID=.;OPOS=168059866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:17:37:0:0:18:37:0:0
chr1	168105581	.	A	AG,G	285.72	PASS	AF=0.426966,0;AO=54,8;DP=190;FAO=76,0;FDP=178;FR=.;FRO=102;FSAF=36,0;FSAR=40,0;FSRF=63;FSRR=39;FWDB=0.0986576,0.0310637;FXX=0.0111105;HRUN=5,1;LEN=1,1;MLLD=8.23489,114.054;QD=6.42068;RBI=0.106666,0.0404849;REFB=-0.0241475,-0.00497255;REVB=0.0405509,-0.0259628;RO=110;SAF=27,0;SAR=27,8;SRF=63;SRR=47;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0847085,-0.581448;STB=0.581989,0.5;STBP=0.074,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0285314,0;OID=.,.;OPOS=168105582,168105581;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:190:178:110:102:54,8:76,0:0.426966,0:27,8:27,0:63:47:40,0:36,0:63:39
chr1	168511284	.	T	C	141.87	PASS	AF=0.333333;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=5;FWDB=0.0354825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.974;QD=11.1267;RBI=0.035484;REFB=-0.00766314;REVB=0.000330875;RO=33;SAF=11;SAR=6;SRF=28;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277175;STB=0.664662;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0175567;OID=.;OPOS=168511284;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:33:34:17:17:0.333333:6:11:28:5:6:11:29:5
chr1	168513129	.	C	T	493.21	PASS	AF=0.486239;AO=48;DP=104;FAO=53;FDP=109;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.00283741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.446;QD=18.0995;RBI=0.0296854;REFB=-0.0180135;REVB=0.0295495;RO=56;SAF=26;SAR=22;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064111;STB=0.53126;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0231259;OID=.;OPOS=168513129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:109:56:56:48:53:0.486239:22:26:34:22:24:29:34:22
chr1	168545949	.	G	A	460.74	PASS	AF=0.47619;AO=48;DP=103;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=0.0325837;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.715;QD=17.5521;RBI=0.0347635;REFB=-0.0238168;REVB=0.0121163;RO=54;SAF=17;SAR=31;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218224;STB=0.503175;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0241474;OID=.;OPOS=168545949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:105:54:55:48:50:0.47619:31:17:18:36:33:17:19:36
chr1	169101935	.	C	T	331.2	PASS	AF=0.530303;AO=34;DP=65;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.00101278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3242;QD=20.0728;RBI=0.00158836;REFB=-0.0434673;REVB=-0.00122358;RO=28;SAF=5;SAR=29;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189544;STB=0.626348;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0157033;OID=.;OPOS=169101935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:28:31:34:35:0.530303:29:5:8:20:29:6:11:20
chr1	169256524	.	T	C	295.6	PASS	AF=0.428571;AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0209614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.844;QD=15.356;RBI=0.0248905;REFB=-0.0371466;REVB=0.0134221;RO=44;SAF=19;SAR=14;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145259;STB=0.58204;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0360656;OID=.;OPOS=169256524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:44:44:33:33:0.428571:14:19:19:25:14:19:19:25
chr1	169272451	.	A	T	1415.46	PASS	AF=0.968421;AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.064802;FXX=0.0104156;HRUN=5;LEN=1;MLLD=96.3515;QD=59.5982;RBI=0.0652797;REFB=-0.10688;REVB=0.00788267;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51456;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.000569907;OID=.;OPOS=169272451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:95:95:0:3:92:92:0.968421:42:50:0:0:42:50:3:0
chr1	169272453	.	G	A	1437.76	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.039328;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.0906;QD=63.1981;RBI=0.048385;REFB=0;REVB=-0.0281854;RO=0;SAF=53;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000282382;OID=.;OPOS=169272453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:38:53:0:0:38:53:0:0
chr1	169391154	.	A	G	1896.87	PASS	AF=0.984375;AO=125;DP=128;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=83;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0271727;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.646;QD=59.2773;RBI=0.0280527;REFB=-0.138049;REVB=0.00697111;RO=3;SAF=82;SAR=43;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000526102;STB=0.502753;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.000232577;OID=.;OPOS=169391154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:128:128:3:2:125:126:0.984375:43:82:2:1:43:83:1:1
chr1	169433273	.	C	T	92.61	PASS	AF=0.237288;AO=14;DP=59;FAO=14;FDP=59;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.00109702;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.98;QD=6.27886;RBI=0.0768014;REFB=-0.00078829;REVB=-0.0767936;RO=44;SAF=7;SAR=7;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832298;STB=0.559239;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00325343;OID=.;OPOS=169433273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:59:59:44:45:14:14:0.237288:7:7:25:19:7:7:26:19
chr1	169435027	.	C	T	902.28	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0479;QD=58.2119;RBI=0.0359825;REFB=0;REVB=-0.0149174;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160184;OID=.;OPOS=169435027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:30:32:0:0:30:32:0:0
chr1	169438025	.	A	G	246.79	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.00904932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9384;QD=17.9482;RBI=0.00932714;REFB=0.000366211;REVB=-0.00225953;RO=27;SAF=13;SAR=14;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197839;STB=0.599661;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=-0.000747068;OID=.;OPOS=169438025;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:28:27:27:0.490909:14:13:19:8:14:13:19:9
chr1	169498975	.	T	C	318.38	PASS	AF=0.485714;AO=33;DP=69;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0210374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4212;QD=18.193;RBI=0.0489608;REFB=0.00673213;REVB=0.0442107;RO=36;SAF=14;SAR=19;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453971;STB=0.51612;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=-0.0029695;OID=.;OPOS=169498975;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:36:36:33:34:0.485714:19:14:17:19:19:15:17:19
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chr1	169511755	.	T	C	228.34	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00767766;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.645;QD=21.7465;RBI=0.00856458;REFB=0.00328953;REVB=0.00379547;RO=19;SAF=4;SAR=18;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265202;STB=0.642711;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.00295584;OID=.;OPOS=169511755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:20:22:22:0.52381:18:4:8:11:18:4:8:12
chr1	169512027	.	T	C	263.8	PASS	AF=0.43662;AO=30;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00689521;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4115;QD=14.862;RBI=0.0237475;REFB=-0.0182979;REVB=0.0227244;RO=39;SAF=12;SAR=18;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630654;STB=0.550949;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0375063;OID=.;OPOS=169512027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:39:40:30:31:0.43662:18:12:18:21:19:12:19:21
chr1	169512093	.	A	G	223.88	PASS	AF=0.433333;AO=25;DP=59;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.00234833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.508;QD=14.925;RBI=0.0446386;REFB=-0.00151049;REVB=0.0445768;RO=34;SAF=14;SAR=11;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059742;STB=0.523791;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.001119;OID=.;OPOS=169512093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:34:34:25:26:0.433333:11:14:21:13:11:15:21:13
chr1	169512120	.	G	A	313.09	PASS	AF=0.459459;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.015303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.088;QD=16.9237;RBI=0.0307278;REFB=-0.00764737;REVB=-0.0266461;RO=40;SAF=17;SAR=17;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120612;STB=0.567529;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00600619;OID=.;OPOS=169512120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:40:40:34:34:0.459459:17:17:25:15:17:17:25:15
chr1	169519049	.	T	C	1171.05	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0849;QD=60.8337;RBI=0.0295081;REFB=0;REVB=0.0147734;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163546;OID=.;OPOS=169519049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:35:41:0:0:36:41:0:0
chr1	169521849	.	T	C	492.32	PASS	AF=0.527473;AO=46;DP=89;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.0375177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.2086;QD=21.6403;RBI=0.0409911;REFB=-0.0336428;REVB=0.0165133;RO=43;SAF=29;SAR=17;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245479;STB=0.640731;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0301969;OID=.;OPOS=169521849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:91:43:43:46:48:0.527473:17:29:15:28:17:31:15:28
chr1	169566313	.	C	T	1283.44	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.279;QD=61.8526;RBI=0.0218167;REFB=0;REVB=0.0156134;RO=0;SAF=51;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45964e-05;OID=.;OPOS=169566313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:32:51:0:0:32:51:0:0
chr1	169580885	.	C	T	144.89	PASS	AF=0.444444;AO=15;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.00292914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4459;QD=16.0992;RBI=0.011496;REFB=-0.00491248;REVB=-0.0111165;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259769;STB=0.668724;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00643214;OID=.;OPOS=169580885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:20:15:16:0.444444:8:7:14:5:9:7:15:5
chr1	169762807	.	T	G	188.68	PASS	AF=0.692308;AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00419576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.707;QD=29.0274;RBI=0.0197999;REFB=-0.0407155;REVB=0.0193503;RO=8;SAF=10;SAR=8;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111088;STB=0.561337;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0221814;OID=.;OPOS=169762807;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:8:8:18:18:0.692308:8:10:6:2:8:10:6:2
chr1	169768033	.	T	C	118.89	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0124576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9543;QD=13.2094;RBI=0.084324;REFB=-0.00978845;REVB=0.0833987;RO=22;SAF=8;SAR=6;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25965;STB=0.650958;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0165482;OID=.;OPOS=169768033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:6:8:7:15:6:8:7:15
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chr1	169823718	.	T	C	399.24	PASS	AF=0.476744;AO=40;DP=85;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=-0.0426044;FXX=0.0227247;HRUN=4;LEN=1;MLLD=66.8669;QD=18.5694;RBI=0.0426068;REFB=-0.0158205;REVB=-0.000458057;RO=37;SAF=21;SAR=19;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219884;STB=0.604694;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.018988;OID=.;OPOS=169823718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:37:45:40:41:0.476744:19:21:10:27:20:21:14:31
chr1	169927228	.	T	TG	745.61	PASS	AF=1;AO=63;DP=68;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0841077;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.2987;QD=45.884;RBI=0.153805;REFB=0;REVB=0.12877;RO=4;SAF=48;SAR=15;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396709;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00389552;OID=.;OPOS=169927229;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:63:68:65:65:0:49:16:0:0:14:4:48:15:2:2
chr1	169951997	.	C	T	287.96	PASS	AF=0.565217;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.00360495;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=322.253;QD=25.0397;RBI=0.00899295;REFB=-0.0120144;REVB=0.00823878;RO=20;SAF=9;SAR=17;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347122;STB=0.692039;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00789956;OID=.;OPOS=169951997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:20:20:26:26:0.565217:17:9:16:4:17:9:16:4
chr1	170501385	.	A	C	459.27	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.433;QD=55.6691;RBI=0.0747311;REFB=0;REVB=0.0337327;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000776802;OID=.;OPOS=170501385;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:30:33:1:18:12:0:0:20:13:0:0
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chr1	170928671	.	T	C	1067.35	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.871;QD=59.2973;RBI=0.0715874;REFB=0;REVB=0.051832;RO=0;SAF=25;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000559526;OID=.;OPOS=170928671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:45:25:0:0:45:27:0:0
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chr1	171083174	.	C	T	596.73	PASS	AF=0.568421;AO=54;DP=96;FAO=54;FDP=95;FR=.;FRO=41;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0334655;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6995;QD=25.1253;RBI=0.0814327;REFB=-0.00630907;REVB=-0.0742385;RO=41;SAF=29;SAR=25;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000358015;STB=0.500196;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00266116;OID=.;OPOS=171083174;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:95:41:41:54:54:0.568421:25:29:22:19:25:29:22:19
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chr1	171112490	.	C	T	104.83	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.011005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.744;QD=10.7521;RBI=0.0856045;REFB=-0.00239062;REVB=-0.0848942;RO=26;SAF=3;SAR=10;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577501;STB=0.534704;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0031727;OID=.;OPOS=171112490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:10:3:7:19:10:3:7:19
chr1	171115567	.	G	A	362.82	PASS	AF=0.458824;AO=28;DP=85;FAO=39;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.0536321;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.0773;QD=17.0737;RBI=0.0600403;REFB=-0.0363106;REVB=0.0269896;RO=43;SAF=21;SAR=7;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182073;STB=0.593657;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0538829;OID=.;OPOS=171115567;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:43:46:28:39:0.458824:7:21:26:17:11:28:26:20
chr1	171115645	.	G	T	385.82	PASS	AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0440655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.592;QD=17.9451;RBI=0.0446645;REFB=-0.00310203;REVB=-0.00729029;RO=46;SAF=28;SAR=12;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164391;STB=0.59226;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0035108;OID=.;OPOS=171115645;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:12:28:25:21:12:28:25:21
chr1	171118840	.	G	A	852.57	PASS	AF=0.440758;AO=93;DP=211;FAO=93;FDP=211;FR=.;FRO=118;FSAF=32;FSAR=61;FSRF=53;FSRR=65;FWDB=-0.0403464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.65;QD=16.1624;RBI=0.0416985;REFB=-0.0170658;REVB=0.0105327;RO=118;SAF=32;SAR=61;SRF=53;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112227;STB=0.562534;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0177239;OID=.;OPOS=171118840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:211:211:118:118:93:93:0.440758:61:32:53:65:61:32:53:65
chr1	171121173	.	A	G	519.19	PASS	AF=0.448;AO=56;DP=124;FAO=56;FDP=125;FR=.;FRO=69;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=0.0148699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.289;QD=16.6142;RBI=0.0148792;REFB=-0.0213713;REVB=-0.000526913;RO=67;SAF=30;SAR=26;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309912;STB=0.524487;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0247641;OID=.;OPOS=171121173;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:125:67:69:56:56:0.448:26:30:38:29:26:30:40:29
chr1	171121268	.	G	A	539.76	PASS	AF=0.439394;AO=58;DP=131;FAO=58;FDP=132;FR=.;FRO=74;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=46;FSRR=28;FWDB=-0.0222659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9708;QD=16.3563;RBI=0.0236238;REFB=-0.00227643;REVB=-0.00789369;RO=73;SAF=34;SAR=24;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313068;STB=0.5206;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.00164006;OID=.;OPOS=171121268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:132:73:74:58:58:0.439394:24:34:45:28:24:34:46:28
chr1	171168584	.	CA	TG	439.49	PASS	AF=0.5375;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.00359603;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=352.779;QD=21.9743;RBI=0.00374766;REFB=-0.0110659;REVB=0.00105525;RO=37;SAF=24;SAR=19;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829517;STB=0.545751;STBP=0.393;TYPE=mnp;VARB=0.00924991;OID=.;OPOS=171168584;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:37:37:43:43:0.5375:19:24:17:20:19:24:17:20
chr1	171178152	.	A	G	397.79	PASS	AF=0.465909;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.000227625;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.394;QD=18.0814;RBI=0.0153802;REFB=-0.00874497;REVB=0.0153785;RO=45;SAF=21;SAR=20;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407767;STB=0.521922;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.00818039;OID=.;OPOS=171178152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:45:47:41:41:0.465909:20:21:25:20:20:21:26:21
chr1	171303565	.	C	T	223.6	PASS	AF=0.478261;AO=21;DP=45;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00656604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.81;QD=19.4433;RBI=0.0221762;REFB=-0.0291075;REVB=-0.0211819;RO=24;SAF=8;SAR=13;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114699;STB=0.548149;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0291059;OID=.;OPOS=171303565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:24:24:21:22:0.478261:13:8:12:12:13:9:12:12
chr1	171461787	.	G	A	670.9	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.428;QD=62.4094;RBI=0.0509515;REFB=0;REVB=0.0151343;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000437202;OID=.;OPOS=171461787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:26:16:0:0:26:17:0:0
chr1	171509327	.	G	A	487.11	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0512177;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8878;QD=59.0437;RBI=0.0919019;REFB=0;REVB=-0.0763067;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00193352;OID=.;OPOS=171509327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr1	171511039	.	C	G	510.32	PASS	AF=0.923077;AO=36;DP=39;FAO=36;FDP=39;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0389253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2592;QD=52.3408;RBI=0.0393284;REFB=-0.0271959;REVB=-0.00561669;RO=3;SAF=10;SAR=26;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00989323;STB=0.505297;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00792399;OID=.;OPOS=171511039;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:39:39:3:3:36:36:0.923077:26:10:1:2:26:10:1:2
chr1	171514731	.	C	G	297.47	PASS	AF=1;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00293285;FXX=0.0832986;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.469;QD=54.0851;RBI=0.00408817;REFB=0;REVB=0.00284807;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158688;OID=.;OPOS=171514731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr1	171526570	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9776;QD=40.7627;RBI=0.0467266;REFB=0;REVB=-0.0451358;RO=0;SAF=9;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00165481;OID=.;OPOS=171526570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:1:9:0:0:1:9:0:0
chr1	171556165	.	G	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00261388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.829;QD=62.6711;RBI=0.00524697;REFB=0;REVB=0.00454954;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76742e-06;OID=.;OPOS=171556165;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr1	171558516	.	C	T	365.28	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0461345;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.806;QD=52.1822;RBI=0.0629635;REFB=-0.139587;REVB=0.0428488;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516117;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00137926;OID=.;OPOS=171558516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:12:15:0:0:12:15:1:0
chr1	171607856	.	G	A	157.02	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0150908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.11;QD=16.1047;RBI=0.0342274;REFB=-0.00736916;REVB=-0.0307211;RO=21;SAF=13;SAR=4;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120553;STB=0.560709;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0176094;OID=.;OPOS=171607856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:21:22:17:17:0.435897:4:13:14:7:4:13:15:7
chr1	171751236	.	T	C	132.74	PASS	AF=0.301587;AO=18;DP=63;FAO=19;FDP=63;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0439194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1797;QD=8.42773;RBI=0.0448592;REFB=-0.0114557;REVB=-0.00913418;RO=40;SAF=8;SAR=10;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228834;STB=0.523784;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0213767;OID=.;OPOS=171751236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:40:44:18:19:0.301587:10:8:17:23:11:8:20:24
chr1	171753039	.	A	G	379.6	PASS	AF=0.550725;AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0162017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.365;QD=22.006;RBI=0.0201648;REFB=-0.0148482;REVB=-0.0120051;RO=31;SAF=23;SAR=15;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152642;STB=0.584251;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0133429;OID=.;OPOS=171753039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:31:31:38:38:0.550725:15:23:13:18:15:23:13:18
chr1	171755170	.	G	A	324.0	PASS	AF=0.622222;AO=28;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0249113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.964;QD=28.8001;RBI=0.0266788;REFB=-0.00998982;REVB=-0.00954934;RO=17;SAF=11;SAR=17;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213815;STB=0.61761;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00735591;OID=.;OPOS=171755170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:17:17:28:28:0.622222:17:11:12:5:17:11:12:5
chr1	171810960	.	A	G	729.0	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.713;QD=57.1762;RBI=0.038646;REFB=0;REVB=0.00611776;RO=0;SAF=16;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.9572e-05;OID=.;OPOS=171810960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:34:16:0:0:35:16:0:0
chr1	172356437	.	A	G	827.2	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4358;QD=57.0482;RBI=0.0371468;REFB=0;REVB=0.0125924;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257428;OID=.;OPOS=172356437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:24:33:0:0:24:34:0:0
chr1	172410967	.	G	A	415.4	PASS	AF=0.911765;AO=31;DP=34;FAO=31;FDP=34;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0271886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0386;QD=48.8707;RBI=0.0394835;REFB=-0.0154181;REVB=-0.0286308;RO=3;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132481;STB=0.57138;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00757203;OID=.;OPOS=172410967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:34:34:3:3:31:31:0.911765:9:22:0:3:9:22:0:3
chr1	172411496	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00544569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=357.951;QD=40.7629;RBI=0.064336;REFB=0;REVB=0.0641051;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183611;OID=.;OPOS=172411496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:2:8:0:0:2:8:0:0
chr1	172412995	.	T	C	676.78	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00961202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3212;QD=60.1578;RBI=0.0158535;REFB=0.0312767;REVB=-0.0126072;RO=1;SAF=35;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132374;STB=0.507039;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=-0.0103333;OID=.;OPOS=172412995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:9:35:1:0:9:35:1:0
chr1	172434812	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0030196;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.735;QD=56.1916;RBI=0.00478368;REFB=0;REVB=-0.00371021;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.28311e-05;OID=.;OPOS=172434812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:10:18:0:0:10:18:0:0
chr1	172437592	.	G	A	1242.02	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.971;QD=61.3344;RBI=0.0279482;REFB=0;REVB=-0.00791699;RO=0;SAF=49;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6597e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.23182e-05;OID=.;OPOS=172437592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:81:0:0:78:81:1:29:49:0:0:30:51:0:0
chr1	173429995	.	G	A	544.95	PASS	AF=0.620253;AO=49;DP=80;FAO=49;FDP=79;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0306646;FXX=0.0246883;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.57;QD=27.5922;RBI=0.0310681;REFB=-0.0222969;REVB=0.00499083;RO=30;SAF=26;SAR=23;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113891;STB=0.561992;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0147758;OID=.;OPOS=173429995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:30:30:49:49:0.620253:23:26:11:19:23:26:11:19
chr1	173457017	.	C	T	528.81	PASS	AF=0.509259;AO=54;DP=107;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=-7.70231e-05;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.989;QD=19.5854;RBI=0.00174745;REFB=-0.00850264;REVB=-0.00174575;RO=53;SAF=33;SAR=21;SRF=32;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00690641;STB=0.50746;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0084587;OID=.;OPOS=173457017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:53:53:54:55:0.509259:21:33:32:21:21:34:32:21
chr1	173474429	.	T	C	236.38	PASS	AF=0.4;AO=27;DP=69;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.054982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4533;QD=13.5075;RBI=0.0560556;REFB=0.00590897;REVB=-0.0109184;RO=42;SAF=18;SAR=9;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208779;STB=0.602436;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=-0.00915299;OID=.;OPOS=173474429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:42:42:27:28:0.4:9:18:20:22:10:18:20:22
chr1	173516871	.	G	C	242.63	PASS	AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.0132289;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.497;QD=14.2724;RBI=0.0137536;REFB=-0.0324727;REVB=0.00376267;RO=40;SAF=22;SAR=6;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444261;STB=0.754235;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0206489;OID=.;OPOS=173516871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:6:22:15:25:6:22:15:25
chr1	173516903	.	A	G	241.41	PASS	AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.0303598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7662;QD=12.875;RBI=0.0367014;REFB=-0.0346852;REVB=0.020622;RO=46;SAF=23;SAR=6;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.486946;STB=0.779464;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0576803;OID=.;OPOS=173516903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:6:23:16:30:6:23:16:30
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chr1	176103053	.	TAC	T	169.85	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.00293361;FXX=0.0508388;HRUN=1;LEN=2;MLLD=296.846;QD=12.1318;RBI=0.0402049;REFB=-0.00876392;REVB=-0.0400978;RO=34;SAF=14;SAR=7;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273799;STB=0.666508;STBP=0.063;TYPE=del;VARB=0.0134384;OID=.;OPOS=176103054;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375:21:59:21:56:35:14:7:14:21:99:34:14:7:14:20
chr1	176852009	.	A	G	184.37	PASS	AF=0.328767;AO=24;DP=73;FAO=24;FDP=73;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=36;FSRR=13;FWDB=-0.00251059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.708;QD=10.1022;RBI=0.0201049;REFB=-0.00100313;REVB=-0.0199475;RO=48;SAF=20;SAR=4;SRF=35;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180197;STB=0.602742;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00081603;OID=.;OPOS=176852009;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:48:49:24:24:0.328767:4:20:35:13:4:20:36:13
chr1	176863836	.	G	C	446.86	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0009;QD=57.6591;RBI=0.0375379;REFB=0;REVB=0.0204217;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000663849;OID=.;OPOS=176863836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:9:22:0:0:9:22:0:0
chr1	176863867	.	T	C	437.7	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0382975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2439;QD=56.4772;RBI=0.0714947;REFB=0;REVB=0.0603721;RO=0;SAF=23;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000482369;OID=.;OPOS=176863867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:8:23:0:0:8:23:0:0
chr1	176992553	.	A	G	555.85	PASS	AF=0.487395;AO=57;DP=121;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0279933;FXX=0.0245881;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.991;QD=18.6841;RBI=0.0301029;REFB=-0.0109021;REVB=-0.0110706;RO=60;SAF=35;SAR=22;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136583;STB=0.507661;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0111664;OID=.;OPOS=176992553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:119:60:61:57:58:0.487395:22:35:36:24:22:36:37:24
chr1	177001896	.	C	G	62.47	PASS	AF=0.409091;AO=7;DP=20;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0105774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.6;QD=11.3584;RBI=0.0105983;REFB=-0.0126977;REVB=0.000666426;RO=13;SAF=2;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478256;STB=0.685902;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0262049;OID=.;OPOS=177001896;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:20:22:13:13:7:9:0.409091:5:2:10:3:5:4:10:3
chr1	177902388	.	G	A	410.17	PASS	AF=0.506173;AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0068578;FXX=0.0121936;HRUN=5;LEN=1;MLLD=150.954;QD=20.2556;RBI=0.0511702;REFB=-0.0277058;REVB=-0.0507085;RO=32;SAF=20;SAR=21;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401499;STB=0.531065;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0259071;OID=.;OPOS=177902388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:81:32:40:41:41:0.506173:21:20:14:18:21:20:17:23
chr1	177908852	.	C	T	542.06	PASS	AF=0.509091;AO=56;DP=110;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=-0.00554982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.779;QD=19.7112;RBI=0.0173806;REFB=-0.00537634;REVB=0.0164708;RO=51;SAF=27;SAR=29;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125473;STB=0.581096;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00478626;OID=.;OPOS=177908852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:51:54:56:56:0.509091:29:27:32:19:29:27:35:19
chr1	177915474	.	A	C	1084.17	PASS	AF=0.961039;AO=74;DP=77;FAO=74;FDP=77;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00211311;FXX=0.0128189;HRUN=5;LEN=1;MLLD=97.3562;QD=56.3203;RBI=0.0312564;REFB=-0.0730844;REVB=0.0311849;RO=3;SAF=47;SAR=27;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00250669;STB=0.501326;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.000379082;OID=.;OPOS=177915474;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:77:77:3:3:74:74:0.961039:27:47:2:1:27:47:2:1
chr1	177929554	.	C	T	210.67	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.00937952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.541;QD=19.1519;RBI=0.0171863;REFB=-0.0137091;REVB=-0.0144012;RO=23;SAF=3;SAR=18;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.559375;STB=0.819812;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0119112;OID=.;OPOS=177929554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:18:3:16:7:18:3:16:7
chr1	177929940	.	G	A	287.99	PASS	AF=0.568627;AO=27;DP=50;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0223255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2086;QD=22.5873;RBI=0.0308656;REFB=-0.0395869;REVB=0.0213134;RO=23;SAF=12;SAR=15;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17035;STB=0.565993;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0188603;OID=.;OPOS=177929940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:23:22:27:29:0.568627:15:12:15:8:15:14:14:8
chr1	177929987	.	T	C	1029.67	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138236;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.713;QD=59.6912;RBI=0.0154133;REFB=0;REVB=-0.00681755;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00717e-05;OID=.;OPOS=177929987;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:35:34:0:0:35:34:0:0
chr1	178062359	.	G	A	240.14	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0994073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.342;QD=16.5616;RBI=0.0997269;REFB=0.00395824;REVB=-0.00797802;RO=31;SAF=15;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00687579;STB=0.503873;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=-0.00457253;OID=.;OPOS=178062359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:12:15:17:14:12:15:17:14
chr1	178442309	.	TCCCC	TCCCA,TCCC	65.17	PASS	AF=0.0645161,0.290323;AO=4,21;DP=63;FAO=4,18;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=4,13;FSAR=0,5;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0508232,-0.123847;FXX=0.0158705;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=231.222,9.79585;QD=4.20449;RBI=0.0508233,0.158211;REFB=-0.0148447,-0.114292;REVB=9.41868e-05,0.0984515;RO=33;SAF=4,16;SAR=0,5;SRF=7;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0,0.458333;SSSB=0.731473,0.546681;STB=0.998073,0.76163;STBP=0.01,0.014;TYPE=snp,del;VARB=0.151947,0.149738;OID=.,.;OPOS=178442313,178442310;OREF=C,C;OALT=A,-;OMAPALT=TCCCA,TCCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0645161,0.290323:4,21:63:4,18:62:40:4,13:0,5:13:27:42:33:4,16:0,5:7:26
chr1	178483231	.	G	A	682.09	PASS	AF=0.961538;AO=49;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0536597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.759;QD=52.4681;RBI=0.0650771;REFB=-0.094677;REVB=0.0368194;RO=2;SAF=27;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335887;STB=0.517235;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00551124;OID=.;OPOS=178483231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:52:2:2:49:50:0.961538:22:27:2:0:22:28:2:0
chr1	178489978	.	T	G	858.61	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00396842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.652;QD=57.2404;RBI=0.0126356;REFB=0;REVB=0.0119962;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114162;OID=.;OPOS=178489978;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:35:24:0:0:35:25:0:0
chr1	178492447	.	T	A	1023.74	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499237;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.333;QD=59.3472;RBI=0.0503631;REFB=0;REVB=-0.00663793;RO=0;SAF=44;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000540513;OID=.;OPOS=178492447;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:69:0:0:69:69:1:25:44:0:0:25:44:0:0
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chr1	179064321	.	A	C	215.59	PASS	AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0248061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.286;QD=15.1292;RBI=0.0297973;REFB=-0.0260616;REVB=0.0165088;RO=31;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066703;STB=0.528729;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.021753;OID=.;OPOS=179064321;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:32:25:25:0.438596:13:12:17:14:13:12:17:15
chr1	179068851	.	A	G	107.15	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0230141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3387;QD=22.5581;RBI=0.15533;REFB=0.0100524;REVB=-0.153615;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162618;STB=0.592433;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=-0.0133062;OID=.;OPOS=179068851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:8:4:4:3:8:4:4:3
chr1	179072728	.	T	C	497.84	PASS	AF=0.481818;AO=53;DP=109;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=0.0192087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.262;QD=18.1032;RBI=0.0193313;REFB=-0.00820597;REVB=0.00217378;RO=56;SAF=32;SAR=21;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130887;STB=0.568417;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00684166;OID=.;OPOS=179072728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:56:57:53:53:0.481818:21:32:26:30:21:32:27:30
chr1	179084080	.	T	G	197.68	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0301007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2506;QD=18.827;RBI=0.0524332;REFB=-0.0103761;REVB=0.0429324;RO=22;SAF=15;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259733;STB=0.648489;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0130123;OID=.;OPOS=179084080;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:5:15:11:11:5:15:11:11
chr1	179310262	.	C	T	341.44	PASS	AF=0.486486;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0277938;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7656;QD=18.4563;RBI=0.0341418;REFB=-0.00944461;REVB=0.0198285;RO=38;SAF=20;SAR=16;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00272389;STB=0.501519;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.00518674;OID=.;OPOS=179310262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:38:38:36:36:0.486486:16:20:21:17:16:20:21:17
chr1	179347832	.	T	C	342.5	PASS	AF=0.38;AO=38;DP=100;FAO=38;FDP=100;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=0.00823514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.284;QD=13.6999;RBI=0.00837354;REFB=-0.00923102;REVB=0.00151612;RO=62;SAF=19;SAR=19;SRF=39;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140676;STB=0.579959;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0199583;OID=.;OPOS=179347832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:62:62:38:38:0.38:19:19:39:23:19:19:39:23
chr1	179504043	.	C	G	30.42	PASS	AF=0.238095;AO=6;DP=21;FAO=5;FDP=21;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.188907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6648;QD=5.79505;RBI=0.190093;REFB=-0.0364686;REVB=-0.0212007;RO=14;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606052;STB=0.665927;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0499122;OID=.;OPOS=179504043;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:21:21:14:16:6:5:0.238095:4:2:4:10:4:1:6:10
chr1	179504130	.	G	A	172.12	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0435421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.5;QD=18.1181;RBI=0.0438592;REFB=-0.000262354;REVB=0.00526408;RO=20;SAF=9;SAR=9;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924797;STB=0.552574;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=-2.78999e-05;OID=.;OPOS=179504130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:9:9:12:8:9:9:12:8
chr1	179520151	.	C	T	1098.71	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.499;QD=60.2036;RBI=0.0176905;REFB=0;REVB=0.00724838;RO=0;SAF=47;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2476e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.74341e-05;OID=.;OPOS=179520151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:26:47:0:0:26:47:0:0
chr1	179520422	.	T	C	227.14	PASS	AF=0.8;AO=20;DP=25;FAO=20;FDP=25;FR=.;FRO=5;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0429607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2124;QD=36.3421;RBI=0.0430125;REFB=0.0129936;REVB=0.0021108;RO=5;SAF=13;SAR=7;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199229;STB=0.510906;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=-0.00821317;OID=.;OPOS=179520422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:25:25:5:5:20:20:0.8:7:13:3:2:7:13:3:2
chr1	179520506	.	G	A	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0199442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.632;QD=14.0961;RBI=0.034341;REFB=-0.00601384;REVB=-0.027956;RO=14;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387176;STB=0.723767;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0252735;OID=.;OPOS=179520506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:7:4:11:3:7:4:11:3
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chr1	179604864	.	C	T	1491.29	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00156329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.078;QD=63.4593;RBI=0.0916735;REFB=0;REVB=0.0916602;RO=0;SAF=47;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156393;OID=.;OPOS=179604864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:47:47:0:0:47:47:0:0
chr1	179609049	.	T	C	998.28	PASS	AF=0.533333;AO=96;DP=179;FAO=96;FDP=180;FR=.;FRO=84;FSAF=50;FSAR=46;FSRF=50;FSRR=34;FWDB=0.0314492;FXX=0.00552456;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.228;QD=22.1841;RBI=0.0401729;REFB=-0.0246325;REVB=0.0249961;RO=81;SAF=50;SAR=46;SRF=50;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813345;STB=0.534877;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0216897;OID=.;OPOS=179609049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:180:81:84:96:96:0.533333:46:50:50:31:46:50:50:34
chr1	179621224	.	G	A	61.53	PASS	AF=0.257143;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0181428;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.387;QD=7.03172;RBI=0.0315784;REFB=-0.00447957;REVB=-0.0258464;RO=24;SAF=3;SAR=6;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373424;STB=0.703267;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0189183;OID=.;OPOS=179621224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:35:35:24:26:9:9:0.257143:6:3:16:8:6:3:16:10
chr1	179632536	.	A	G	430.16	PASS	AF=0.488889;AO=42;DP=89;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=-0.0188744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.426;QD=19.118;RBI=0.0209092;REFB=-0.0223715;REVB=0.00899719;RO=45;SAF=14;SAR=28;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503922;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0220726;OID=.;OPOS=179632536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:45:46:42:44:0.488889:28:14:15:30:29:15:16:30
chr1	179852074	.	T	C	1434.42	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.357;QD=63.0513;RBI=0.0227609;REFB=0;REVB=-0.0021053;RO=0;SAF=34;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.483e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.28469e-05;OID=.;OPOS=179852074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:56:34:0:0:57:34:0:0
chr1	179858444	.	G	A	1556.78	PASS	AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.02866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1974;QD=58.7465;RBI=0.0544846;REFB=-0.118377;REVB=0.0463376;RO=1;SAF=50;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855071;STB=0.504504;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.000712338;OID=.;OPOS=179858444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:106:106:1:1:105:105:0.990566:55:50:0:1:55:50:0:1
chr1	179876988	.	C	G	1319.61	PASS	AF=0.932692;AO=93;DP=104;FAO=97;FDP=104;FR=.;FRO=7;FSAF=62;FSAR=35;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0121026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.074;QD=50.754;RBI=0.0154753;REFB=0.0443227;REVB=0.00964427;RO=6;SAF=58;SAR=35;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465595;STB=0.516042;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-0.00173624;OID=.;OPOS=179876988;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:104:104:6:7:93:97:0.932692:35:58:6:0:35:62:6:1
chr1	179887125	.	G	A	601.15	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0199915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.483;QD=58.6485;RBI=0.028195;REFB=0.122672;REVB=-0.0198821;RO=1;SAF=19;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240441;STB=0.512814;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-0.00138738;OID=.;OPOS=179887125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:21:19:1:0:21:19:1:0
chr1	179989742	.	G	C	323.47	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5093;QD=53.9109;RBI=0.0383148;REFB=0;REVB=0.0344305;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178438;OID=.;OPOS=179989742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:6:17:0:0:6:18:0:0
chr1	180145088	.	A	G	1049.3	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000171768;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.305;QD=59.9601;RBI=0.0305882;REFB=0;REVB=0.0305877;RO=0;SAF=45;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122387;OID=.;OPOS=180145088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:25:45:0:0:25:45:0:0
chr1	180243524	.	A	G	246.82	PASS	AF=0.375;AO=29;DP=80;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=0.00204539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.331;QD=12.3409;RBI=0.0480415;REFB=-0.0367639;REVB=0.047998;RO=48;SAF=24;SAR=5;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398879;STB=0.716604;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0486261;OID=.;OPOS=180243524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:48:50:29:30:0.375:5:24:25:23:6:24:25:25
chr1	180854067	.	A	G	610.92	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000805034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.809;QD=61.092;RBI=0.0229544;REFB=0;REVB=0.0229403;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.77352e-06;OID=.;OPOS=180854067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:17:21:0:0:17:23:0:0
chr1	180885430	.	T	C	777.87	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.566;QD=56.5722;RBI=0.0170047;REFB=0;REVB=-0.0121572;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12064e-06;OID=.;OPOS=180885430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:27:27:0:0:27:28:0:0
chr1	180897569	.	C	T	153.43	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00353114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.852;QD=13.948;RBI=0.0232795;REFB=-0.00948747;REVB=0.0230101;RO=27;SAF=6;SAR=11;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252606;STB=0.646886;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.019823;OID=.;OPOS=180897569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:11:6:16:11:11:6:16:11
chr1	180905448	.	G	T	272.77	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.00651605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.387;QD=24.2461;RBI=0.00800201;REFB=-0.0209944;REVB=0.00464471;RO=20;SAF=20;SAR=5;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596409;STB=0.533306;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0166079;OID=.;OPOS=180905448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:5:20:15:5:5:20:15:5
chr1	180905694	.	C	T	135.54	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.148966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0519;QD=27.107;RBI=0.150361;REFB=-0.00811122;REVB=0.0204375;RO=6;SAF=3;SAR=11;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888882;STB=0.549925;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0097587;OID=.;OPOS=180905694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:11:3:2:4:11:3:2:4
chr1	180913597	.	A	G	647.01	PASS	AF=1;AO=37;DP=40;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.0145;QD=60.1868;RBI=0.0576994;REFB=0;REVB=0.052314;RO=1;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322723;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00156551;OID=.;OPOS=180913597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:43:1:0:37:43:1:14:23:0:1:18:25:0:0
chr1	180944532	.	T	TAA	99.26	PASS	AF=0.375;AO=14;DP=50;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.011753;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=27.4202;QD=8.27177;RBI=0.0119228;REFB=-0.0260756;REVB=0.00200517;RO=33;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284919;STB=0.668739;STBP=0.085;TYPE=ins;VARB=0.0421931;OID=.;OPOS=180944533;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=TAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375:14:50:18:48:30:11:7:10:20:99:33:9:5:13:20
chr1	180953853	.	A	G	234.91	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0235447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.066;QD=18.7926;RBI=0.0350406;REFB=0.000810485;REVB=0.0259517;RO=27;SAF=9;SAR=14;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225392;STB=0.627476;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.00083417;OID=.;OPOS=180953853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:14:9:17:10:14:9:17:10
chr1	181018236	.	A	G	190.53	PASS	AF=0.487805;AO=19;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0139391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.332;QD=18.5879;RBI=0.0156331;REFB=-0.0320536;REVB=-0.00707793;RO=21;SAF=12;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123789;STB=0.510194;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0164669;OID=.;OPOS=181018236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:19:20:0.487805:7:12:13:8:8:12:13:8
chr1	181024404	.	G	A	837.25	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219206;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.014;QD=57.7414;RBI=0.0274441;REFB=0;REVB=0.0165127;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.80542e-05;OID=.;OPOS=181024404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:35:23:0:0:35:23:0:0
chr1	181058313	.	G	A	55.96	PASS	AF=0.666667;AO=7;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0138317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.795;QD=18.6534;RBI=0.176597;REFB=-0.044298;REVB=0.176055;RO=4;SAF=5;SAR=2;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250326;STB=0.642549;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0536902;OID=.;OPOS=181058313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:12:12:4:4:7:8:0.666667:2:5:4:0:3:5:4:0
chr1	181702034	.	C	T	117.59	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00748505;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.508;QD=12.3778;RBI=0.0156807;REFB=-0.0187059;REVB=0.0137789;RO=24;SAF=10;SAR=4;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285454;STB=0.669041;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0438952;OID=.;OPOS=181702034;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:4:10:11:13:4:10:11:13
chr1	181752923	.	AAGCTT	A	50.0	PASS	AO=65;DP=118;LEN=5;RO=53;SAF=40;SAR=39;SRF=19;SRR=20;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=181752924;OREF=AGCTT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:118:53:65:39:40:19:20
chr1	181759657	.	G	A	323.91	PASS	AF=0.395604;AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=17;FWDB=-0.0150128;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1347;QD=14.238;RBI=0.0205352;REFB=-0.00842189;REVB=-0.0140111;RO=54;SAF=20;SAR=16;SRF=38;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162699;STB=0.584338;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0173943;OID=.;OPOS=181759657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:54:55:36:36:0.395604:16:20:38:16:16:20:38:17
chr1	181768186	.	T	C	356.09	PASS	AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.0143616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2081;QD=16.5621;RBI=0.0153959;REFB=0.0238049;REVB=-0.00554777;RO=48;SAF=22;SAR=16;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00447049;STB=0.502511;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.0301802;OID=.;OPOS=181768186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:48:48:38:38:0.44186:16:22:28:20:16:22:28:20
chr1	182026813	.	G	C	128.04	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.031621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.109;QD=20.4866;RBI=0.03192;REFB=-0.0167106;REVB=0.00435854;RO=11;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105797;STB=0.559915;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0261254;OID=.;OPOS=182026813;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:25:25:11:11:14:14:0.56:7:7:4:7:7:7:4:7
chr1	182027022	.	C	T	371.1	PASS	AF=0.458824;AO=41;DP=83;FAO=39;FDP=85;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0059316;FXX=0.0116266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.3191;QD=17.4634;RBI=0.0106026;REFB=-0.0340706;REVB=0.00878813;RO=42;SAF=18;SAR=23;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00967329;STB=0.537496;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.040166;OID=.;OPOS=182027022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:85:42:46:41:39:0.458824:23:18:18:24:23:16:22:24
chr1	182356399	.	A	G	902.55	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9255;QD=58.2292;RBI=0.0747357;REFB=0;REVB=0.0220626;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371182;OID=.;OPOS=182356399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:27:35:0:0:27:35:0:0
chr1	182369078	.	G	A	709.76	PASS	AF=0.981132;AO=50;DP=51;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0221036;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.824;QD=53.5669;RBI=0.040657;REFB=-0.147038;REVB=0.0341236;RO=1;SAF=20;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229535;STB=0.511623;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.00108235;OID=.;OPOS=182369078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:51:53:1:1:50:52:0.981132:30:20:1:0:31:21:1:0
chr1	182369233	.	A	G	748.91	PASS	AF=0.982456;AO=54;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000528887;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1594;QD=52.5548;RBI=0.105711;REFB=-0.120936;REVB=0.10571;RO=3;SAF=47;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164925;STB=0.526306;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.012174;OID=.;OPOS=182369233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:57:57:3:1:54:56:0.982456:7:47:0:3:9:47:0:1
chr1	182496829	.	A	G	1156.46	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141286;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1746;QD=60.8664;RBI=0.0235797;REFB=0;REVB=0.0188782;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217475;OID=.;OPOS=182496829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:35:41:0:0:35:41:0:0
chr1	182551337	.	A	C	570.27	PASS	AF=0.522523;AO=58;DP=111;FAO=58;FDP=111;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.00648829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.587;QD=20.5502;RBI=0.00888817;REFB=-0.0223476;REVB=0.00607468;RO=53;SAF=32;SAR=26;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291995;STB=0.516063;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0216212;OID=.;OPOS=182551337;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:53:53:58:58:0.522523:26:32:31:22:26:32:31:22
chr1	182568204	.	G	C	1244.99	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.141;QD=61.4808;RBI=0.0270098;REFB=0;REVB=0.00398768;RO=0;SAF=48;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28649e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32665e-05;OID=.;OPOS=182568204;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:33:48:0:0:33:48:0:0
chr1	182569626	.	T	C	717.2	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0668988;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.073;QD=62.365;RBI=0.0669707;REFB=0;REVB=0.00310279;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00293091;OID=.;OPOS=182569626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:25:20:0:0:25:21:0:0
chr1	182775319	.	C	T	288.32	PASS	AF=0.565217;AO=25;DP=45;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.00388491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.356;QD=25.0713;RBI=0.0386496;REFB=-0.0418918;REVB=0.0384538;RO=20;SAF=17;SAR=8;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305533;STB=0.653728;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.03497;OID=.;OPOS=182775319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:20:20:25:26:0.565217:8:17:6:14:9:17:6:14
chr1	182778367	.	G	A	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=317.163;QD=57.6807;RBI=0.0184038;REFB=0;REVB=0.00654821;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1825e-05;OID=.;OPOS=182778367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0
chr1	182850727	.	T	C	1355.48	PASS	AF=0.977778;AO=88;DP=92;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0572275;FXX=0.0217368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6403;QD=60.2434;RBI=0.0909601;REFB=-0.0690087;REVB=0.0707019;RO=2;SAF=41;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197362;STB=0.510414;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0126336;OID=.;OPOS=182850727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:92:90:2:2:88:88:0.977778:47:41:0:2:47:41:0:2
chr1	182993025	.	C	T	1912.34	PASS	AF=0.977273;AO=126;DP=131;FAO=129;FDP=132;FR=.;FRO=3;FSAF=72;FSAR=57;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0179561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.009;QD=57.9498;RBI=0.0548525;REFB=-0.0466377;REVB=0.0518303;RO=5;SAF=72;SAR=54;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126524;STB=0.502501;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.016334;OID=.;OPOS=182993025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:131:132:5:3:126:129:0.977273:54:72:2:3:57:72:2:1
chr1	183072590	.	T	C	1133.41	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9801;QD=59.6534;RBI=0.0531173;REFB=0;REVB=-0.0191806;RO=0;SAF=29;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000288536;OID=.;OPOS=183072590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:47:29:0:0:47:29:0:0
chr1	183085755	.	A	G	1513.31	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.689;QD=59.9332;RBI=0.0527282;REFB=0;REVB=0.01638;RO=0;SAF=45;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117809;OID=.;OPOS=183085755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:56:45:0:0:56:45:0:0
chr1	183086757	.	A	C	1607.09	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.694;QD=64.2836;RBI=0.0260518;REFB=0;REVB=-0.00524974;RO=0;SAF=50;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.47206e-05;OID=.;OPOS=183086757;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:50:50:0:0:50:50:0:0
chr1	183093875	.	T	C	1814.62	PASS	AF=0.983607;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=122;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0135797;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.578;QD=59.4959;RBI=0.0326525;REFB=-0.141354;REVB=0.0296948;RO=2;SAF=55;SAR=65;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01439;STB=0.507574;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.000426208;OID=.;OPOS=183093875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:122:122:2:2:120:120:0.983607:65:55:0:2:65:55:0:2
chr1	183094547	.	T	C	1031.66	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359382;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.684;QD=59.8062;RBI=0.046676;REFB=0;REVB=0.0297841;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.48113e-05;OID=.;OPOS=183094547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:30:39:0:0:30:39:0:0
chr1	183105534	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0377923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.659;QD=40.7623;RBI=0.0909076;REFB=0;REVB=0.0826797;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000937577;OID=.;OPOS=183105534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0
chr1	183105705	.	G	A	708.5	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.833;QD=62.9779;RBI=0.0405733;REFB=0;REVB=-0.0117328;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120462;OID=.;OPOS=183105705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0
chr1	183112041	.	G	C	1302.89	PASS	AF=1;AO=83;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274549;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8512;QD=61.3125;RBI=0.062449;REFB=0;REVB=0.0560902;RO=0;SAF=39;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011862;OID=.;OPOS=183112041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:83:85:1:44:39:0:0:45:40:0:0
chr1	183112412	.	A	G	737.92	PASS	AF=0.981818;AO=52;DP=53;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.110698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8747;QD=53.6672;RBI=0.112233;REFB=-0.0155322;REVB=0.0184929;RO=1;SAF=26;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177719;STB=0.508769;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00356915;OID=.;OPOS=183112412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:55:1:1:52:54:0.981818:26:26:1:0:26:28:1:0
chr1	183112504	.	G	GC	854.54	PASS	AF=0.971831;AO=9;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00953457;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=90.7459;QD=48.1432;RBI=0.0195921;REFB=-0.0258105;REVB=0.0171155;RO=62;SAF=9;SAR=0;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.681637;STB=0.515147;STBP=0.16;TYPE=ins;VARB=0.0016371;OID=.;OPOS=183112505;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.971831:9:71:69:71:2:37:32:0:2:6:62:9:0:28:34
chr1	183112505	.	T	C	733.79	PASS	AF=0.816901;AO=58;DP=71;FAO=58;FDP=71;FR=.;FRO=13;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.0168899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.626;QD=41.3405;RBI=0.0270892;REFB=-0.0908875;REVB=0.0211791;RO=12;SAF=26;SAR=32;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149466;STB=0.572509;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00769162;OID=.;OPOS=183112505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:71:71:12:13:58:58:0.816901:32:26:11:1:32:26:11:2
chr1	183112566	.	T	C	1248.58	PASS	AF=0.987952;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.02501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.037;QD=60.1725;RBI=0.0256256;REFB=-0.131725;REVB=0.00558294;RO=0;SAF=39;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506328;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.000155296;OID=.;OPOS=183112566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:81:83:0:1:81:82:0.987952:42:39:0:0:43:39:1:0
chr1	183112764	.	A	G	607.89	PASS	AF=0.877551;AO=42;DP=48;FAO=43;FDP=49;FR=.;FRO=6;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0287114;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.674;QD=49.6239;RBI=0.0414849;REFB=-0.0790139;REVB=0.0299441;RO=3;SAF=32;SAR=10;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0706823;STB=0.562031;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00133378;OID=.;OPOS=183112764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:48:49:3:6:42:43:0.877551:10:32:1:2:11:32:2:4
chr1	183114634	.	G	A	937.25	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118925;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=134.008;QD=58.5778;RBI=0.0547283;REFB=0;REVB=-0.0534205;RO=0;SAF=17;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.73405e-05;OID=.;OPOS=183114634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:46:17:0:0:47:17:0:0
chr1	183155482	.	C	A	376.74	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.00848314;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.668;QD=18.6046;RBI=0.00917037;REFB=-0.0243624;REVB=-0.0034831;RO=41;SAF=28;SAR=11;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115487;STB=0.559968;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0217544;OID=.;OPOS=183155482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:41:42:39:39:0.481481:11:28:25:16:11:28:26:16
chr1	183486859	.	G	A	1507.18	PASS	AF=0.990291;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00912582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.647;QD=58.5312;RBI=0.0188174;REFB=-0.0683413;REVB=-0.0164565;RO=0;SAF=52;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50495;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-2.04107e-05;OID=.;OPOS=183486859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:103:103:0:1:102:102:0.990291:50:52:0:0:50:52:0:1
chr1	183542387	.	T	C	324.45	PASS	AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0368101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4898;QD=17.0764;RBI=0.0517589;REFB=-0.00818986;REVB=-0.0363868;RO=41;SAF=26;SAR=9;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314595;STB=0.677417;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00833437;OID=.;OPOS=183542387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:9:26:18:23:9:26:18:23
chr1	184020945	.	G	A	287.37	PASS	AF=0.388235;AO=33;DP=85;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=6;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=0.0120933;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.236;QD=13.5232;RBI=0.147083;REFB=-0.0253838;REVB=0.146585;RO=52;SAF=27;SAR=6;SRF=36;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192104;STB=0.611036;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0331036;OID=.;OPOS=184020945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:52:52:33:33:0.388235:6:27:36:16:6:27:36:16
chr1	184023529	.	A	C	437.59	PASS	AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.00858158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.933;QD=19.0254;RBI=0.064006;REFB=-0.00475577;REVB=0.0634281;RO=45;SAF=21;SAR=23;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111482;STB=0.565915;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00572467;OID=.;OPOS=184023529;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:45:48:44:44:0.478261:23:21:27:18:23:21:29:19
chr1	184322912	.	C	T	229.08	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279745;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.868;QD=50.9063;RBI=0.0412335;REFB=0;REVB=0.0302924;RO=0;SAF=4;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115118;OID=.;OPOS=184322912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:18:0:0:18:18:1:14:4:0:0:14:4:0:0
chr1	184660205	.	T	A	210.22	PASS	AF=0.409836;AO=24;DP=59;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00292838;FXX=0.0161264;HRUN=5;LEN=1;MLLD=250.025;QD=13.7851;RBI=0.0105984;REFB=-0.0155288;REVB=-0.0101858;RO=33;SAF=14;SAR=10;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100723;STB=0.535591;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0228916;OID=.;OPOS=184660205;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:61:33:36:24:25:0.409836:10:14:16:17:11:14:18:18
chr1	184662181	.	C	T	180.63	PASS	AF=0.353846;AO=20;DP=64;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.0110715;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.493;QD=11.1155;RBI=0.0159772;REFB=-0.0186064;REVB=0.0115192;RO=43;SAF=12;SAR=8;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156023;STB=0.514044;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0340305;OID=.;OPOS=184662181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:43:42:20:23:0.353846:8:12:20:23:11:12:21:21
chr1	184663537	.	A	C	236.23	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=-0.0111702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.39;QD=17.4982;RBI=0.0212536;REFB=-0.0282538;REVB=0.0180815;RO=28;SAF=10;SAR=16;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991601;STB=0.555514;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0279177;OID=.;OPOS=184663537;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:16:10:8:20:16:10:8:20
chr1	184663581	.	T	C	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0384967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.037;QD=16.627;RBI=0.0388907;REFB=-0.00631819;REVB=0.00552165;RO=14;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034656;STB=0.519969;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.00920445;OID=.;OPOS=184663581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:6:7:7:7:6:7:7:7
chr1	184675814	.	G	A	356.14	PASS	AF=0.44186;AO=38;DP=86;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0228183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.807;QD=16.5647;RBI=0.0234688;REFB=-0.00746838;REVB=-0.0054874;RO=48;SAF=23;SAR=15;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167324;STB=0.594046;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00649462;OID=.;OPOS=184675814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:48:48:38:38:0.44186:15:23:21:27:15:23:21:27
chr1	184677464	.	G	A	270.0	PASS	AF=0.355556;AO=32;DP=90;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.0350519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9084;QD=12;RBI=0.0393434;REFB=-0.0360357;REVB=-0.0178681;RO=58;SAF=21;SAR=11;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637454;STB=0.536819;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0511437;OID=.;OPOS=184677464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:58:58:32:32:0.355556:11:21:35:23:11:21:35:23
chr1	184706212	.	GT	G	176.18	PASS	AF=0.4;AO=29;DP=74;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0896152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.4803;QD=9.39635;RBI=0.16659;REFB=0.0103257;REVB=-0.140432;RO=44;SAF=17;SAR=12;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162606;STB=0.59352;STBP=0.197;TYPE=del;VARB=-0.0233851;OID=.;OPOS=184706213;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:29:74:30:75:45:18:12:20:25:99:44:17:12:19:25
chr1	184764067	.	C	G	175.77	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0235689;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.834;QD=11.9169;RBI=0.0259139;REFB=-0.00893226;REVB=0.0107721;RO=34;SAF=8;SAR=14;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116998;STB=0.596126;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0110588;OID=.;OPOS=184764067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:37:22:22:0.372881:14:8:16:18:14:8:19:18
chr1	184764681	.	G	A	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=-0.000747124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.942;QD=20.4558;RBI=0.000782348;REFB=0.00135395;REVB=-0.000232108;RO=15;SAF=7;SAR=9;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412238;STB=0.731474;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.00120125;OID=.;OPOS=184764681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:15:15:16:17:0.53125:9:7:14:1:10:7:14:1
chr1	184764824	.	C	T	334.05	PASS	AF=0.557377;AO=33;DP=60;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0275832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6116;QD=21.9049;RBI=0.0790043;REFB=-0.0335996;REVB=0.0740328;RO=27;SAF=23;SAR=10;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00650094;STB=0.513896;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.027121;OID=.;OPOS=184764824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:27:27:33:34:0.557377:10:23:19:8:11:23:19:8
chr1	184765072	.	A	G	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0015343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=371.841;QD=19.1086;RBI=0.00270819;REFB=0.0233998;REVB=0.00223164;RO=6;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0136872;OID=.;OPOS=184765072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:6:3:2:4:6:3:2:4
chr1	184777177	.	C	A	296.24	PASS	AF=0.452055;AO=31;DP=71;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.000343653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.125;QD=16.2323;RBI=0.00885134;REFB=-0.0331795;REVB=0.00884467;RO=40;SAF=5;SAR=26;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475095;STB=0.721409;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0459218;OID=.;OPOS=184777177;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:73:40:40:31:33:0.452055:26:5:23:17:26:7:23:17
chr1	184792365	.	T	C	189.63	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.00343866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2702;QD=15.1701;RBI=0.0130695;REFB=0.0150084;REVB=0.012609;RO=29;SAF=12;SAR=8;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600513;STB=0.520988;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=-0.0239991;OID=.;OPOS=184792365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:29:30:20:20:0.4:8:12:19:10:8:12:19:11
chr1	184801065	.	T	C	341.92	PASS	AF=0.644444;AO=29;DP=45;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0251609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3855;QD=30.3932;RBI=0.126805;REFB=0.0123377;REVB=0.124284;RO=16;SAF=12;SAR=17;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568903;STB=0.531228;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=-0.00386781;OID=.;OPOS=184801065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:16:16:29:29:0.644444:17:12:8:8:17:12:8:8
chr1	184868431	.	C	T	308.81	PASS	AF=0.777778;AO=23;DP=36;FAO=28;FDP=36;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.1715;QD=34.3122;RBI=0.197648;REFB=-0.254263;REVB=0.197648;RO=13;SAF=0;SAR=23;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0506361;OID=.;OPOS=184868431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:36:36:13:8:23:28:0.777778:23:0:0:13:28:0:0:8
chr1	185984517	.	T	C	171.78	PASS	AF=0.354839;AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0139751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.677;QD=11.0825;RBI=0.016355;REFB=-0.0181224;REVB=-0.00849599;RO=40;SAF=8;SAR=14;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998248;STB=0.558228;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0393738;OID=.;OPOS=185984517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:40:40:22:22:0.354839:14:8:18:22:14:8:18:22
chr1	186026474	.	T	C	1624.19	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1584;QD=60.155;RBI=0.0448301;REFB=0;REVB=0.0406099;RO=0;SAF=56;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.59964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109808;OID=.;OPOS=186026474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:52:56:0:0:52:56:0:0
chr1	186031041	.	C	T	789.24	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0735245;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.842;QD=64.4274;RBI=0.0745794;REFB=0;REVB=0.0124997;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000217608;OID=.;OPOS=186031041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0
chr1	186050417	.	A	G	531.96	PASS	AF=0.486957;AO=54;DP=114;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.0191244;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.214;QD=18.5028;RBI=0.0193999;REFB=0.00363076;REVB=0.0032577;RO=60;SAF=18;SAR=36;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271332;STB=0.651373;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00414701;OID=.;OPOS=186050417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:115:60:59:54:56:0.486957:36:18:37:23:38:18:36:23
chr1	186052064	.	C	A	46.34	PASS	AF=0.0845771;AO=21;DP=200;FAO=17;FDP=201;FR=.;FRO=184;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=112;FSRR=72;FWDB=-0.0868406;FXX=0.00495025;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3212;QD=0.922279;RBI=0.12099;REFB=-0.0066515;REVB=-0.0842454;RO=162;SAF=2;SAR=19;SRF=108;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.639933;STB=0.907217;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.108842;OID=.;OPOS=186052064;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:200:201:162:184:21:17:0.0845771:19:2:108:54:15:2:112:72
chr1	186099099	.	C	T	327.52	PASS	AF=0.466667;AO=34;DP=76;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.00532037;FXX=0.0131562;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.051;QD=17.4678;RBI=0.0238642;REFB=-0.0160567;REVB=0.0232635;RO=39;SAF=16;SAR=18;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00865901;STB=0.509573;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0155867;OID=.;OPOS=186099099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:39:40:34:35:0.466667:18:16:18:21:19:16:19:21
chr1	186101539	.	A	G	238.34	PASS	AF=0.4375;AO=27;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00255747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.649;QD=14.896;RBI=0.0329786;REFB=-0.0210293;REVB=0.0328793;RO=36;SAF=16;SAR=11;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665201;STB=0.524869;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0223956;OID=.;OPOS=186101539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:36:27:28:0.4375:11:16:19:17:12:16:19:17
chr1	186277088	.	G	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00760799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.406;QD=33.4285;RBI=0.00803486;REFB=0;REVB=0.00258408;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000250099;OID=.;OPOS=186277088;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr1	186326757	.	TA	T	556.3	PASS	AF=1;AO=50;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341304;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=15.9894;QD=40.4582;RBI=0.0354554;REFB=0;REVB=-0.00960212;RO=0;SAF=12;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00128634;OID=.;OPOS=186326758;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:50:55:55:55:0:13:42:0:0:11:0:12:38:0:0
chr1	186344126	.	G	A	471.67	PASS	AF=0.511111;AO=46;DP=90;FAO=46;FDP=90;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0217505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.023;QD=20.9631;RBI=0.0230016;REFB=-0.0202232;REVB=0.0074824;RO=44;SAF=25;SAR=21;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00175995;STB=0.500973;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0416572;OID=.;OPOS=186344126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:44:44:46:46:0.511111:21:25:24:20:21:25:24:20
chr1	186839861	.	G	A	484.12	PASS	AF=0.538462;AO=33;DP=93;FAO=49;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0452284;FXX=0.0215031;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.004;QD=21.2802;RBI=0.0452363;REFB=-0.00255435;REVB=0.000846438;RO=36;SAF=7;SAR=26;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181545;STB=0.501625;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0022297;OID=.;OPOS=186839861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:91:36:42:33:49:0.538462:26:7:13:23:29:20:17:25
chr1	186839879	.	AAG	A	199.2	PASS	AF=0.390805;AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.00416868;FXX=0.0744602;HRUN=2;LEN=2;MLLD=251.083;QD=9.15882;RBI=0.00545418;REFB=-0.0109962;REVB=0.00351713;RO=52;SAF=12;SAR=22;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143877;STB=0.503691;STBP=0.977;TYPE=del;VARB=0.0185091;OID=.;OPOS=186839880;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.390805:34:94:34:87:53:12:22:19:34:99:52:12:22:19:33
chr1	186946912	.	G	A	1556.83	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00712467;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.6177;QD=62.2731;RBI=0.0853615;REFB=-0.0191673;REVB=-0.0850636;RO=0;SAF=49;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000290279;OID=.;OPOS=186946912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:100:0:1:99:99:0.99:50:49:0:0:50:49:1:0
chr1	187610537	.	AC	GG	1272.29	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000369965;FXX=0.0238067;HRUN=2;LEN=2;MLLD=336.284;QD=62.063;RBI=0.0224958;REFB=0;REVB=0.0224927;RO=0;SAF=43;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=1.83375e-05;OID=.;OPOS=187610537;OREF=AC;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:82:0:0:82:82:1:39:43:0:0:39:43:0:0
chr1	187610852	.	A	C	494.07	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0489512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.942;QD=58.1261;RBI=0.0510108;REFB=0;REVB=0.0143486;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0001384;OID=.;OPOS=187610852;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:11:22:0:0:11:23:0:0
chr1	190950209	.	G	A	508.98	PASS	AF=0.504762;AO=52;DP=104;FAO=53;FDP=105;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0136527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.403;QD=19.3896;RBI=0.0169837;REFB=-0.0313092;REVB=-0.0101019;RO=52;SAF=25;SAR=27;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0297862;OID=.;OPOS=190950209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:52:52:52:53:0.504762:27:25:25:27:27:26:25:27
chr1	192781172	.	C	G	1245.96	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000870147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.601;QD=61.5287;RBI=0.0217636;REFB=0;REVB=-0.0217462;RO=0;SAF=36;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.02019e-05;OID=.;OPOS=192781172;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:45:36:0:0:45:36:0:0
chr1	192844886	.	G	A	689.35	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.544;QD=62.6682;RBI=0.0430389;REFB=0;REVB=0.0055884;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200848;OID=.;OPOS=192844886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr1	193054154	.	G	A	394.28	PASS	AF=0.450549;AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.00803387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.322;QD=17.3308;RBI=0.0226928;REFB=-0.00456368;REVB=-0.0212231;RO=50;SAF=13;SAR=28;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227955;STB=0.62809;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0046367;OID=.;OPOS=193054154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:50:50:41:41:0.450549:28:13:27:23:28:13:27:23
chr1	193074651	.	T	A	282.82	PASS	AF=0.342857;AO=36;DP=105;FAO=36;FDP=105;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=45;FSRR=24;FWDB=0.0212637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5479;QD=10.7741;RBI=0.0212675;REFB=-0.0159825;REVB=-0.000402648;RO=69;SAF=21;SAR=15;SRF=45;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0820999;STB=0.547238;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0317487;OID=.;OPOS=193074651;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:69:69:36:36:0.342857:15:21:45:24:15:21:45:24
chr1	194457292	.	T	C	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148455;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.627;QD=58.4197;RBI=0.039824;REFB=0;REVB=0.0369534;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.38653e-05;OID=.;OPOS=194457292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:27:36:0:0:27:36:0:0
chr1	196227526	.	A	G	1514.81	PASS	AF=0.989691;AO=97;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00146496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.989;QD=62.4666;RBI=0.0052348;REFB=-0.00435833;REVB=-0.00502564;RO=0;SAF=41;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.55487e-08;STB=0.504504;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=1.17645e-05;OID=.;OPOS=196227526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:97:0:1:97:96:0.989691:56:41:0:0:55:41:0:1
chr1	196642233	.	G	A	126.67	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0359011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6636;QD=11.2599;RBI=0.0400216;REFB=-0.00601798;REVB=-0.0176871;RO=29;SAF=6;SAR=9;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650601;STB=0.547109;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00800043;OID=.;OPOS=196642233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:29:30:15:15:0.333333:9:6:10:19:9:6:10:20
chr1	196646704	.	T	C	547.29	PASS	AF=0.46875;AO=57;DP=125;FAO=60;FDP=128;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.00975775;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.379;QD=17.1028;RBI=0.0117849;REFB=-0.00790514;REVB=0.0066084;RO=68;SAF=26;SAR=31;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014199;STB=0.520036;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0117803;OID=.;OPOS=196646704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:128:68:68:57:60:0.46875:31:26:32:36:34:26:32:36
chr1	196654324	.	A	C	1504.63	PASS	AF=0.972222;AO=101;DP=108;FAO=105;FDP=108;FR=.;FRO=3;FSAF=63;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00652046;FXX=0.0181802;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.5065;QD=55.7269;RBI=0.0124462;REFB=-0.124939;REVB=-0.0106015;RO=3;SAF=59;SAR=42;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140813;STB=0.507691;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00332323;OID=.;OPOS=196654324;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:108:108:3:3:101:105:0.972222:42:59:1:2:42:63:1:2
chr1	196659237	.	C	T	1156.71	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160209;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.709;QD=60.8795;RBI=0.0228271;REFB=0;REVB=-0.0162606;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204913;OID=.;OPOS=196659237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:31:44:0:0:32:44:0:0
chr1	196695742	.	A	G	1674.06	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.446;QD=60.3264;RBI=0.0748726;REFB=0;REVB=0.068938;RO=0;SAF=64;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229979;OID=.;OPOS=196695742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:47:64:0:0:47:64:0:0
chr1	196709774	.	G	T	1718.74	PASS	AF=1;AO=113;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0312207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0855;QD=60.3068;RBI=0.0323801;REFB=0;REVB=-0.00858706;RO=0;SAF=77;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000161972;OID=.;OPOS=196709774;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:114:114:0:0:113:114:1:36:77:0:0:36:78:0:0
chr1	196757392	.	C	T	1222.79	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=83;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0374232;FXX=0.03571;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.608;QD=60.3846;RBI=0.0377814;REFB=0.0194504;REVB=0.00519066;RO=1;SAF=40;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116896;STB=0.506171;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000105759;OID=.;OPOS=196757392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:81:1:1:80:80:0.987654:40:40:0:1:40:40:0:1
chr1	196757874	.	G	A	800.86	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1547;QD=57.2043;RBI=0.0361683;REFB=0;REVB=-0.0334505;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.36698e-05;OID=.;OPOS=196757874;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:35:21:0:0:35:21:0:0
chr1	196757881	.	G	T	902.03	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.187;QD=58.1952;RBI=0.0358694;REFB=0;REVB=-0.0055834;RO=0;SAF=18;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.30456e-05;OID=.;OPOS=196757881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:62:0:0:58:62:1:40:18:0:0:41:21:0:0
chr1	196874356	.	G	A,T	2525.15	PASS	AF=0.0292398,0.959064;AO=6,163;DP=171;FAO=5,164;FDP=171;FR=.;FRO=2;FSAF=0,99;FSAR=5,65;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0585497,0.0284155;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=12.017,167.063;QD=59.0678;RBI=0.0904997,0.0394717;REFB=0.0563142,-0.0619768;REVB=-0.0690082,0.0273966;RO=2;SAF=0,99;SAR=6,64;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0146355;STB=0.5,0.507575;STBP=1,0.121;TYPE=snp,snp;VARB=0.173781,0.000698859;OID=.,.;OPOS=196874356,196874356;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:171:171:2:2:6,163:5,164:0.0292398,0.959064:6,64:0,99:0:2:5,65:0,99:0:2
chr1	196876458	.	A	G	1850.75	PASS	AF=0.97619;AO=123;DP=126;FAO=123;FDP=126;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.014711;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=104.395;QD=58.7541;RBI=0.0216242;REFB=-0.142539;REVB=0.0158491;RO=0;SAF=75;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506893;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.00146019;OID=.;OPOS=196876458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:126:126:0:3:123:123:0.97619:48:75:0:0:48:75:1:2
chr1	196884258	.	A	T	309.95	PASS	AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0201664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.224;QD=28.8322;RBI=0.0234959;REFB=-0.0144551;REVB=-0.0120571;RO=16;SAF=18;SAR=9;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650009;STB=0.535689;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00510561;OID=.;OPOS=196884258;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:9:18:12:4:9:18:12:4
chr1	196920148	.	C	T	557.13	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00699915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.352;QD=60.2307;RBI=0.0565602;REFB=0;REVB=-0.0561255;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000131551;OID=.;OPOS=196920148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:13:23:0:0:13:24:0:0
chr1	197009798	.	A	G	902.18	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0759418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7635;QD=58.2052;RBI=0.0803397;REFB=0;REVB=0.0262169;RO=0;SAF=42;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000515195;OID=.;OPOS=197009798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:19:42:0:0:20:42:0:0
chr1	197030201	.	T	C	501.97	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00931486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.619;QD=59.0553;RBI=0.0313764;REFB=0;REVB=0.0299619;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.76927e-05;OID=.;OPOS=197030201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:16:17:0:0:17:17:0:0
chr1	197031021	.	C	T	1447.7	PASS	AF=0.980198;AO=99;DP=102;FAO=99;FDP=101;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0172081;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.657;QD=57.3346;RBI=0.0182524;REFB=-0.146945;REVB=-0.0060855;RO=1;SAF=58;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00810884;STB=0.50175;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.00102193;OID=.;OPOS=197031021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:102:101:1:2:99:99:0.980198:41:58:1:0:41:58:1:1
chr1	197070776	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0068273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.727;QD=45.8061;RBI=0.00977414;REFB=0;REVB=-0.0069944;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.55887e-06;OID=.;OPOS=197070776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr1	197070815	.	T	C	198.2	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00482132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.449;QD=44.0441;RBI=0.110514;REFB=-0.0612946;REVB=0.110409;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.529377;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00136394;OID=.;OPOS=197070815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:0:1:17:17:0.944444:9:8:0:0:9:8:1:0
chr1	197070901	.	A	G	919.88	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00225266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0429;QD=58.405;RBI=0.0704564;REFB=0;REVB=0.0704204;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000629022;OID=.;OPOS=197070901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:27:36:0:0:27:36:0:0
chr1	197091537	.	A	T	769.04	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3571;QD=56.9662;RBI=0.0334086;REFB=0;REVB=0.0287703;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189192;OID=.;OPOS=197091537;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0
chr1	197112533	.	G	A	572.46	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0351379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.691;QD=60.2594;RBI=0.0351382;REFB=0;REVB=-0.000134858;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000150572;OID=.;OPOS=197112533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:13:24:0:0:13:25:0:0
chr1	197127491	.	A	C	1572.83	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.5466;QD=59.9172;RBI=0.0384273;REFB=0;REVB=0.0296798;RO=0;SAF=55;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41919e-05;OID=.;OPOS=197127491;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:50:55:0:0:50:55:0:0
chr1	197128726	.	G	A	1017.75	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0705193;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.7943;QD=58.1573;RBI=0.0967728;REFB=0;REVB=0.0662722;RO=1;SAF=35;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133153;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00194015;OID=.;OPOS=197128726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:70:1:0:69:70:1:34:35:1:0:34:36:0:0
chr1	197390368	.	A	G	1302.16	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.772;QD=62.0077;RBI=0.0220443;REFB=0;REVB=-0.00914046;RO=0;SAF=51;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78729e-05;OID=.;OPOS=197390368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:33:51:0:0:33:51:0:0
chr1	197446702	.	G	T	270.11	PASS	AF=0.355556;AO=32;DP=90;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=38;FWDB=0.00534533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.69;QD=12.0047;RBI=0.0597366;REFB=0.00577294;REVB=-0.059497;RO=58;SAF=14;SAR=18;SRF=20;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107274;STB=0.561567;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.011424;OID=.;OPOS=197446702;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:58:58:32:32:0.355556:18:14:20:38:18:14:20:38
chr1	197480927	.	C	T	415.87	PASS	AF=0.494118;AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0328822;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.7924;QD=19.5703;RBI=0.0416597;REFB=-0.0245556;REVB=0.0255791;RO=39;SAF=23;SAR=19;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599298;STB=0.553373;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0266071;OID=.;OPOS=197480927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:39:43:42:42:0.494118:19:23:24:15:19:23:28:15
chr1	197742171	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0466914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.426;QD=57.2025;RBI=0.0466915;REFB=0;REVB=0.000105178;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000264897;OID=.;OPOS=197742171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0
chr1	197896728	.	T	C	126.69	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00548137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.686;QD=11.2609;RBI=0.0355647;REFB=-0.000784453;REVB=0.0351397;RO=30;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00177892;OID=.;OPOS=197896728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:8:7:14:16:8:7:14:16
chr1	197898320	.	C	T	128.84	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0185656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.423;QD=12.5693;RBI=0.0220315;REFB=0.00615983;REVB=-0.011862;RO=26;SAF=5;SAR=10;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605125;STB=0.535666;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=-0.00984527;OID=.;OPOS=197898320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:10:5:10:16:10:5:10:16
chr1	198703306	.	C	T	97.92	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00342853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.834;QD=13.5057;RBI=0.040771;REFB=-0.00553245;REVB=-0.0406266;RO=16;SAF=11;SAR=1;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.559342;STB=0.851996;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.006243;OID=.;OPOS=198703306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:16:17:12:12:0.413793:1:11:8:8:1:11:8:9
chr1	198704294	.	C	T	656.71	PASS	AF=0.373737;AO=73;DP=199;FAO=74;FDP=198;FR=.,HEALED;FRO=122;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=70;FSRR=52;FWDB=-0.00751779;FXX=0.00502487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.536;QD=13.2669;RBI=0.0300302;REFB=-0.042945;REVB=-0.029074;RO=101;SAF=32;SAR=41;SRF=68;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240212;STB=0.579107;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0333991;OID=.;OPOS=198704294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:198:101:122:73:74:0.373737:41:32:68:33:41:33:70:52
chr1	199977636	.	C	A	1513.91	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.566;QD=58.2274;RBI=0.0456537;REFB=0;REVB=0.0159183;RO=0;SAF=59;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.20828e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281275;OID=.;OPOS=199977636;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:94:104:0:0:93:104:1:34:59:0:0:35:69:0:0
chr1	199977724	.	G	T	975.98	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0636845;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2775;QD=59.1501;RBI=0.0754792;REFB=0;REVB=0.0405142;RO=0;SAF=56;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61997e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00070471;OID=.;OPOS=199977724;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:10:56:0:0:10:56:0:0
chr1	200146493	.	GAAT	GAA,GA,GAT	181.12	PASS	AF=0.512821,0.461538,0.025641;AO=9,6,8;DP=41;FAO=20,18,1;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=12,8,0;FSAR=8,10,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.246428,0.150344,0.0294969;FXX=0.0714116;HRUN=10,2,2;LEN=1,2,1;MLLD=4.04372,25.2567,25.3099;QD=18.5768;RBI=0.310642,0.151586,0.184165;REFB=-0.0470057,-0.0288354,0.000738483;REVB=0.189134,-0.0193675,-0.181788;RO=6;SAF=4,3,2;SAR=5,3,6;SRF=6;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.377547,-0.43181,-0.51888;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.178485,-0.0199687,0.0222367;OID=.,.,.;OPOS=200146496,200146495,200146494;OREF=T,AT,A;OALT=-,-,-;OMAPALT=GAA,GA,GAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.512821,0.461538,0.025641:9,6,8:41:20,18,1:39:0:12,8,0:8,10,1:0:0:68:6:4,3,2:5,3,6:6:0
chr1	200182721	.	G	C	293.75	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583803;FXX=0.0434594;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4887;QD=53.4083;RBI=0.0745061;REFB=0;REVB=0.0462915;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00485202;OID=.;OPOS=200182721;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr1	200182725	.	G	A	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0271123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.607;QD=9.11067;RBI=0.0298732;REFB=-0.0210738;REVB=-0.0125431;RO=14;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149874;STB=0.624707;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0285051;OID=.;OPOS=200182725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:14:16:8:8:0.333333:4:4:5:9:4:4:5:11
chr1	200182732	.	AC	GT	72.09	PASS	AF=0.416667;AO=9;DP=23;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0532594;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=209.133;QD=12.0143;RBI=0.0587477;REFB=-0.0544488;REVB=-0.0247936;RO=14;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268092;STB=0.526264;STBP=0.848;TYPE=mnp;VARB=0.0884557;OID=.;OPOS=200182732;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:23:24:14:14:9:10:0.416667:6:3:5:9:6:4:5:9
chr1	200182834	.	A	G	1452.91	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.414;QD=63.1698;RBI=0.0651376;REFB=0;REVB=0.0342385;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283473;OID=.;OPOS=200182834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:45:47:0:0:45:47:0:0
chr1	200183398	.	C	A	919.63	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.429;QD=57.4769;RBI=0.0380713;REFB=0;REVB=-0.0118435;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153716;OID=.;OPOS=200183398;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:62:64:1:34:28:0:0:34:30:0:0
chr1	200311868	.	C	G	353.82	PASS	AF=0.486842;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.00553664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.6735;QD=18.622;RBI=0.0383428;REFB=-0.0421874;REVB=-0.037941;RO=36;SAF=19;SAR=18;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373872;STB=0.526002;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0404566;OID=.;OPOS=200311868;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:76:36:39:37:37:0.486842:18:19:20:16:18:19:22:17
chr1	200534248	.	C	T	557.09	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.656;QD=60.2259;RBI=0.0495649;REFB=0;REVB=-0.0239955;RO=0;SAF=10;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.49156e-05;OID=.;OPOS=200534248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:26:10:0:0:27:10:0:0
chr1	200558363	.	T	C	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134963;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=309.945;QD=57.7124;RBI=0.0308841;REFB=0;REVB=0.0277791;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26879e-05;OID=.;OPOS=200558363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0
chr1	200618238	.	T	C	1123.97	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.953;QD=59.9452;RBI=0.0388332;REFB=0;REVB=0.0306001;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102023;OID=.;OPOS=200618238;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:33:40:0:0:35:40:0:0
chr1	200635550	.	T	C	731.84	PASS	AF=0.979592;AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000857492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.985;QD=59.7419;RBI=0.0764542;REFB=-0.090284;REVB=0.0764494;RO=0;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508193;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000466036;OID=.;OPOS=200635550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:0:1:47:48:0.979592:17:30:0:0:18:30:1:0
chr1	200635560	.	T	C	690.13	PASS	AF=0.980392;AO=47;DP=49;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.028071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.99;QD=54.1278;RBI=0.0295844;REFB=0.00468154;REVB=0.00934106;RO=1;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268575;STB=0.513508;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=4.63558e-05;OID=.;OPOS=200635560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:49:51:1:1:47:50:0.980392:17:30:0:1:18:32:0:1
chr1	200776641	.	C	T	344.66	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=30;FSRF=9;FSRR=27;FWDB=-0.03758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.004;QD=19.1479;RBI=0.0404088;REFB=-0.0198758;REVB=-0.0148533;RO=36;SAF=6;SAR=30;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121502;STB=0.568141;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0179339;OID=.;OPOS=200776641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:36:36:36:0.5:30:6:9:27:30:6:9:27
chr1	200880702	.	C	T	187.5	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.00788568;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.6998;QD=20.2698;RBI=0.0370254;REFB=-0.0124817;REVB=0.0361759;RO=18;SAF=1;SAR=18;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.47;STB=0.776577;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0249239;OID=.;OPOS=200880702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:18:1:5:13:18:1:5:13
chr1	200880869	.	A	C	317.89	PASS	AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=3;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=-0.0598924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8706;QD=15.5067;RBI=0.0626982;REFB=-0.0153056;REVB=-0.0185463;RO=47;SAF=3;SAR=32;SRF=12;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352191;STB=0.704698;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0161959;OID=.;OPOS=200880869;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:47:47:35:35:0.426829:32:3:12:35:32:3:12:35
chr1	200880978	.	C	T	175.66	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0891805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4837;QD=46.8426;RBI=0.0897159;REFB=0;REVB=-0.00978676;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00285833;OID=.;OPOS=200880978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0
chr1	200942434	.	C	T	191.27	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195631;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=79.2887;QD=47.8176;RBI=0.105594;REFB=0;REVB=0.103766;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00240972;OID=.;OPOS=200942434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr1	200957691	.	G	C	66.51	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0762647;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.759;QD=26.605;RBI=0.0896617;REFB=-0.0537817;REVB=0.0471478;RO=2;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12621;STB=0.571264;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00383211;OID=.;OPOS=200957691;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:6:2:0:2:6:2:0:2
chr1	201122947	.	T	G	689.33	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0431461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4913;QD=62.666;RBI=0.0471335;REFB=0;REVB=0.0189733;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000235109;OID=.;OPOS=201122947;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:18:26:0:0:18:26:0:0
chr1	201123019	.	C	T	289.6	PASS	AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0704181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.472;QD=46.3362;RBI=0.0756374;REFB=-0.019288;REVB=0.02761;RO=2;SAF=12;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00321753;STB=0.501741;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000522148;OID=.;OPOS=201123019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:25:25:2:2:23:23:0.92:11:12:1:1:11:12:1:1
chr1	201166383	.	G	A	272.02	PASS	AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0189465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9689;QD=17.2709;RBI=0.0193309;REFB=-0.0361163;REVB=-0.00383557;RO=33;SAF=14;SAR=16;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157586;STB=0.588178;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.044074;OID=.;OPOS=201166383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:33:33:30:30:0.47619:16:14:21:12:16:14:21:12
chr1	201166435	.	T	C	253.61	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.00951307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.388;QD=17.4905;RBI=0.00953317;REFB=-0.020632;REVB=-0.000618854;RO=30;SAF=16;SAR=12;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911281;STB=0.550985;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.021695;OID=.;OPOS=201166435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:12:16:20:10:12:16:20:10
chr1	201175227	.	C	A	1481.21	PASS	AF=0.989583;AO=92;DP=94;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0549927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2607;QD=61.7171;RBI=0.0554869;REFB=-0.0318488;REVB=0.00738922;RO=1;SAF=55;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854209;STB=0.504424;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000151449;OID=.;OPOS=201175227;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:96:1:1:92:95:0.989583:37:55:1:0:39:56:1:0
chr1	201175274	.	A	G	344.4	PASS	AF=0.316901;AO=38;DP=135;FAO=45;FDP=142;FR=.;FRO=97;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=52;FSRR=45;FWDB=-0.00153163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.441;QD=9.70137;RBI=0.00829765;REFB=-0.027831;REVB=0.00815507;RO=95;SAF=12;SAR=26;SRF=50;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260439;STB=0.641085;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0511024;OID=.;OPOS=201175274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:142:95:97:38:45:0.316901:26:12:50:45:30:15:52:45
chr1	201175715	.	G	T	929.29	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0189854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.821;QD=55.48;RBI=0.0452121;REFB=-0.0544046;REVB=0.0410327;RO=2;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0295018;STB=0.51562;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.000368639;OID=.;OPOS=201175715;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:67:2:2:65:65:0.970149:31:34:0:2:31:34:0:2
chr1	201176018	.	A	G	340.42	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0040235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.818;QD=54.4677;RBI=0.165554;REFB=0;REVB=-0.165505;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00083307;OID=.;OPOS=201176018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0
chr1	201176108	.	G	A	206.19	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0168757;FXX=0.0270197;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.807;QD=22.9098;RBI=0.0378618;REFB=-0.021852;REVB=0.0338929;RO=15;SAF=10;SAR=10;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179521;STB=0.611005;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00848755;OID=.;OPOS=201176108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:15:16:20:20:0.555556:10:10:11:4:10:10:12:4
chr1	201176968	.	A	G	68.64	PASS	AF=0.27027;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0197671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.5141;QD=7.42035;RBI=0.0201371;REFB=3.49531e-05;REVB=0.00384216;RO=27;SAF=9;SAR=1;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.479636;STB=0.81127;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00103355;OID=.;OPOS=201176968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:37:37:27:27:10:10:0.27027:1:9:16:11:1:9:16:11
chr1	201177246	.	T	C	288.87	PASS	AF=0.492063;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.0313811;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4463;QD=18.3411;RBI=0.0331249;REFB=0.0102198;REVB=-0.010606;RO=31;SAF=17;SAR=14;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088483;STB=0.555869;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=-0.00693515;OID=.;OPOS=201177246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:63:31:32:31:31:0.492063:14:17:20:11:14:17:21:11
chr1	201177278	.	C	T	341.99	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00160754;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.824;QD=17.9993;RBI=0.00910059;REFB=-0.0186989;REVB=0.00895749;RO=37;SAF=16;SAR=20;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630875;STB=0.555525;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0212929;OID=.;OPOS=201177278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:76:37:40:36:36:0.473684:20:16:19:18:20:16:22:18
chr1	201177538	.	G	T	154.94	PASS	AF=0.789474;AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00189357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.644;QD=32.6186;RBI=0.0100899;REFB=-0.0236355;REVB=0.00991063;RO=4;SAF=7;SAR=8;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127122;STB=0.507033;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00444538;OID=.;OPOS=201177538;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:19:19:4:4:15:15:0.789474:8:7:2:2:8:7:2:2
chr1	201181217	.	A	G	222.85	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.00661518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.276;QD=18.9661;RBI=0.0579684;REFB=-0.0192436;REVB=0.0575897;RO=25;SAF=15;SAR=7;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270212;STB=0.653323;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0247036;OID=.;OPOS=201181217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:7:15:10:15:7:15:10:15
chr1	201181223	.	A	G	747.08	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0423856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.221;QD=63.5813;RBI=0.04461;REFB=0;REVB=0.0139111;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118688;OID=.;OPOS=201181223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:22:25:0:0:22:25:0:0
chr1	201181672	.	C	T	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0495924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.874;QD=14.6534;RBI=0.116849;REFB=-0.0157419;REVB=-0.105804;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335325;STB=0.699474;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0198977;OID=.;OPOS=201181672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:2:6:3:5:2:6:3:5
chr1	201181920	.	G	T	146.46	PASS	AF=0.244898;AO=10;DP=49;FAO=12;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=0.0804718;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=31.3323;QD=11.9557;RBI=0.108229;REFB=-0.0166558;REVB=0.0723722;RO=28;SAF=8;SAR=2;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025677;STB=0.555457;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.132329;OID=.;OPOS=201181920;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:49:49:28:28:10:12:0.244898:2:8:22:6:2:10:22:6
chr1	201183363	.	C	T	446.85	PASS	AF=0.434783;AO=50;DP=115;FAO=50;FDP=115;FR=.;FRO=65;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.00100619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.888;QD=15.5426;RBI=0.00105006;REFB=-0.0253639;REVB=0.000300352;RO=65;SAF=19;SAR=31;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116245;STB=0.565222;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0321416;OID=.;OPOS=201183363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:65:65:50:50:0.434783:31:19:32:33:31:19:32:33
chr1	201183402	.	T	C	634.6	PASS	AF=0.442953;AO=65;DP=150;FAO=66;FDP=149;FR=.;FRO=83;FSAF=20;FSAR=46;FSRF=37;FSRR=46;FWDB=-0.0051309;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.195;QD=17.0363;RBI=0.0237524;REFB=0.00382336;REVB=-0.0231917;RO=81;SAF=19;SAR=46;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180396;STB=0.587601;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.0078924;OID=.;OPOS=201183402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:149:81:83:65:66:0.442953:46:19:37:44:46:20:37:46
chr1	201184275	.	C	T	412.86	PASS	AF=0.532468;AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.011932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.733;QD=21.4474;RBI=0.0131505;REFB=-0.00309085;REVB=-0.00552832;RO=35;SAF=22;SAR=19;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00526335;STB=0.504135;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.00271788;OID=.;OPOS=201184275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:35:36:41:41:0.532468:19:22:19:16:19:22:19:17
chr1	201187764	.	T	C	1051.44	PASS	AF=1;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187655;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.654;QD=60.0825;RBI=0.0233745;REFB=0;REVB=0.0139363;RO=0;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.58581e-05;OID=.;OPOS=201187764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:69:70:1:36:33:0:0:36:34:0:0
chr1	201195119	.	C	T	2213.7	PASS	AF=0.96;AO=144;DP=150;FAO=144;FDP=150;FR=.;FRO=6;FSAF=81;FSAR=63;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.052566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.897;QD=59.032;RBI=0.0831054;REFB=-0.0709917;REVB=0.0643687;RO=5;SAF=81;SAR=63;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154149;STB=0.504237;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00164294;OID=.;OPOS=201195119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:150:150:5:6:144:144:0.96:63:81:4:1:63:81:4:2
chr1	201197471	.	T	C	180.9	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=0.0103314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8185;QD=12.9217;RBI=0.0144506;REFB=-0.0183078;REVB=0.0101035;RO=33;SAF=7;SAR=15;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561338;STB=0.538428;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.055966;OID=.;OPOS=201197471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:33:34:22:22:0.392857:15:7:9:24:15:7:9:25
chr1	201285759	.	A	G	1324.87	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00927066;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.438;QD=60.9137;RBI=0.0145483;REFB=0.200066;REVB=0.011212;RO=1;SAF=40;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116972;STB=0.506171;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.000406364;OID=.;OPOS=201285759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:1:1:86:86:0.988506:46:40:1:0:46:40:1:0
chr1	201286771	.	C	T	524.18	PASS	AF=0.495495;AO=55;DP=111;FAO=55;FDP=111;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.019051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2448;QD=18.8894;RBI=0.0190626;REFB=-0.0331291;REVB=-0.000662988;RO=56;SAF=25;SAR=30;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902333;STB=0.5499;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0260354;OID=.;OPOS=201286771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:56:56:55:55:0.495495:30:25:31:25:30:25:31:25
chr1	201288955	.	G	A	314.61	PASS	AF=0.416667;AO=35;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0867651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.1379;QD=14.9815;RBI=0.130478;REFB=-0.0442201;REVB=0.0974496;RO=48;SAF=17;SAR=18;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0067037;STB=0.502381;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0613745;OID=.;OPOS=201288955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:48:49:35:35:0.416667:18:17:23:25:18:17:24:25
chr1	201299263	.	A	G	1512.68	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.613;QD=59.908;RBI=0.0269053;REFB=0;REVB=-0.0180873;RO=0;SAF=70;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82367e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.24035e-06;OID=.;OPOS=201299263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:31:70:0:0:31:70:0:0
chr1	201355522	.	T	C	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00983931;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.339;QD=61.3363;RBI=0.0100992;REFB=0;REVB=-0.00227631;RO=0;SAF=35;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.21177e-05;OID=.;OPOS=201355522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:5:35:0:0:5:35:0:0
chr1	201355943	.	C	T	1641.14	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.644;QD=60.2252;RBI=0.0308686;REFB=0;REVB=0.0278955;RO=0;SAF=66;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.88475e-05;OID=.;OPOS=201355943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:42:66:0:0:43:66:0:0
chr1	201386916	.	C	T	131.99	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0270119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.233;QD=14.6654;RBI=0.0271774;REFB=0.000648167;REVB=-0.00299446;RO=21;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123809;STB=0.571338;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00148582;OID=.;OPOS=201386916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:9:6:6:15:9:6:6:15
chr1	201845432	.	C	T	311.13	PASS	AF=0.568627;AO=26;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0152123;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.245;QD=24.4023;RBI=0.0187054;REFB=0.00286306;REVB=0.0108847;RO=14;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306666;STB=0.562742;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=-0.00345923;OID=.;OPOS=201845432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:14:19:26:29:0.568627:14:12:0:14:17:12:5:14
chr1	201845882	.	GAAAAAAAAAAAAAAA	GAAAAAAAAAAAAAAG,GAAAAAAAAAAAAAA	65.82	PASS	AF=0.684211,0.315789;AO=2,7;DP=25;FAO=13,6;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1;FSAR=13,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0350987,-0.605073;FXX=0.344709;HRUN=15,15;LEN=1,1;MLLD=47.6923,3.38568;QD=13.8561;RBI=0.0407008,0.702613;REFB=-0.0716019,-0.0485015;REVB=-0.0206066,-0.357144;RO=2;SAF=0,0;SAR=2,7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.209825,-0.1398;OID=.,.;OPOS=201845897,201845883;OREF=A,A;OALT=G,-;OMAPALT=GAAAAAAAAAAAAAAG,GAAAAAAAAAAAAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.684211,0.315789:2,7:25:13,6:19:0:0,1:13,5:0:0:25:2:0,0:2,7:0:2
chr1	201851701	.	T	C	429.2	PASS	AF=0.602941;AO=41;DP=68;FAO=41;FDP=68;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0150826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.47;QD=25.2469;RBI=0.0165657;REFB=-0.0222107;REVB=-0.00685119;RO=27;SAF=12;SAR=29;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658519;STB=0.536116;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0117187;OID=.;OPOS=201851701;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:27:27:41:41:0.602941:29:12:10:17:29:12:10:17
chr1	201860626	.	A	G	747.0	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.571;QD=63.5741;RBI=0.129687;REFB=0;REVB=0.0148105;RO=0;SAF=13;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.94744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000708306;OID=.;OPOS=201860626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:33:13:0:0:33:14:0:0
chr1	201861016	.	C	G	101.52	PASS	AF=0.265306;AO=13;DP=50;FAO=13;FDP=49;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00171857;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.788;QD=8.28744;RBI=0.00421226;REFB=-0.00530701;REVB=0.00384573;RO=35;SAF=5;SAR=8;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187757;STB=0.624809;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0112686;OID=.;OPOS=201861016;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:35:36:13:13:0.265306:8:5:19:16:8:5:20:16
chr1	201865763	.	A	G	664.65	PASS	AF=1;AO=38;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.115;QD=61.8278;RBI=0.0332986;REFB=0;REVB=0.00537613;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000366205;OID=.;OPOS=201865763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:43:0:0:38:43:1:14:24:0:0:16:27:0:0
chr1	201952574	.	T	C	182.01	PASS	AF=0.315789;AO=24;DP=76;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=0.0208167;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=321.484;QD=9.57947;RBI=0.0277063;REFB=0.00250366;REVB=-0.0182839;RO=52;SAF=10;SAR=14;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291851;STB=0.67008;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.00589617;OID=.;OPOS=201952574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:52:52:24:24:0.315789:14:10:35:17:14:10:35:17
chr1	201952598	.	G	A	349.84	PASS	AF=0.413043;AO=38;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=17;FWDB=-0.00507265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.691;QD=15.2103;RBI=0.0493735;REFB=-0.0032078;REVB=0.0491122;RO=53;SAF=23;SAR=15;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103018;STB=0.550097;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0047513;OID=.;OPOS=201952598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:53:54:38:38:0.413043:15:23:37:16:15:23:37:17
chr1	201970562	.	T	C	2333.43	PASS	AF=1;AO=146;DP=147;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00213455;FXX=0.00680226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.613;QD=63.9296;RBI=0.00787329;REFB=0;REVB=-0.00757842;RO=0;SAF=65;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00316e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.26603e-06;OID=.;OPOS=201970562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:146:0:0:146:146:1:81:65:0:0:81:65:0:0
chr1	201973565	.	G	A	527.95	PASS	AF=0.466667;AO=55;DP=121;FAO=56;FDP=120;FR=.;FRO=64;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.00429534;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.718;QD=17.5984;RBI=0.00430324;REFB=-0.0235477;REVB=0.000260706;RO=63;SAF=35;SAR=20;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112522;STB=0.562477;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0260448;OID=.;OPOS=201973565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:120:63:64:55:56:0.466667:20:35:33:30:20:36:34:30
chr1	201981862	.	T	C	624.47	PASS	AF=1;AO=36;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0573285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.287;QD=60.9236;RBI=0.059301;REFB=0;REVB=0.0151673;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.75379e-05;OID=.;OPOS=201981862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:36:41:1:22:14:0:0:23:18:0:0
chr1	202092360	.	G	A	582.49	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00502007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.119;QD=58.2486;RBI=0.0294382;REFB=-0.162235;REVB=-0.0290071;RO=1;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028395;STB=0.515144;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.000864222;OID=.;OPOS=202092360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:16:23:0:1:16:23:0:1
chr1	202092415	.	A	G	595.06	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000479622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.541;QD=61.0318;RBI=0.0233748;REFB=0;REVB=0.0233699;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.28431e-05;OID=.;OPOS=202092415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:15:23:0:0:16:23:0:0
chr1	202092580	.	T	C	1245.88	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.517;QD=61.5251;RBI=0.0524793;REFB=0;REVB=0.0502815;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.2647e-05;OID=.;OPOS=202092580;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:41:40:0:0:41:40:0:0
chr1	202129826	.	T	C	2781.96	PASS	AF=0.994444;AO=170;DP=172;FAO=179;FDP=180;FR=.;FRO=1;FSAF=112;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0542125;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.513;QD=61.8213;RBI=0.0565578;REFB=-0.0822557;REVB=0.0161177;RO=0;SAF=103;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06075e-08;STB=0.502222;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000148883;OID=.;OPOS=202129826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:172:180:0:1:170:179:0.994444:67:103:0:0:67:112:1:0
chr1	202155543	.	A	C	2301.69	PASS	AF=1;AO=144;DP=144;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.948;QD=60.9719;RBI=0.0665395;REFB=0;REVB=0.041825;RO=0;SAF=80;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.18753e-05;OID=.;OPOS=202155543;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:144:151:0:0:144:151:1:64:80:0:0:65:86:0:0
chr1	202156628	.	A	C	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.425;QD=57.7119;RBI=0.0218805;REFB=0;REVB=0.0185579;RO=0;SAF=20;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92838e-05;OID=.;OPOS=202156628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:39:20:0:0:39:20:0:0
chr1	202163261	.	G	A	224.71	PASS	AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0510651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.6428;QD=13.0269;RBI=0.0533671;REFB=-0.0398808;REVB=0.0155049;RO=42;SAF=13;SAR=14;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00562994;STB=0.503223;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0586359;OID=.;OPOS=202163261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:42:27:27:0.391304:14:13:20:22:14:13:20:22
chr1	202200799	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00961509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.675;QD=51.1844;RBI=0.0152991;REFB=0;REVB=-0.0119002;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.99898e-05;OID=.;OPOS=202200799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0
chr1	202276494	.	C	T	1859.85	PASS	AF=0.969466;AO=125;DP=131;FAO=127;FDP=131;FR=.;FRO=4;FSAF=81;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.019934;FXX=0.00757518;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.981;QD=56.7893;RBI=0.0399231;REFB=-0.175534;REVB=0.0345903;RO=5;SAF=80;SAR=45;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188985;STB=0.512722;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00103051;OID=.;OPOS=202276494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:131:131:5:4:125:127:0.969466:45:80:2:3:46:81:1:3
chr1	202287206	.	T	C	1781.82	PASS	AF=1;AO=87;DP=119;FAO=118;FDP=118;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=67;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.063;QD=60.4007;RBI=0.0200956;REFB=0;REVB=0.0128866;RO=0;SAF=52;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449414;OID=.;OPOS=202287206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:118:0:0:87:118:1:35:52:0:0:51:67:0:0
chr1	202287537	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.305;QD=59.8387;RBI=0.137918;REFB=0;REVB=0.135727;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000577607;OID=.;OPOS=202287537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0
chr1	202287813	.	T	C	175.6	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.923;QD=46.8263;RBI=0.0526594;REFB=0;REVB=0.0449635;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000474291;OID=.;OPOS=202287813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0
chr1	202531741	.	C	T	1676.89	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0011863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.144;QD=60.4284;RBI=0.0439596;REFB=0;REVB=0.0439436;RO=0;SAF=55;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62515e-05;OID=.;OPOS=202531741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:111:0:0:106:111:1:51:55:0:0:56:55:0:0
chr1	202574784	.	G	A	259.07	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0166492;FXX=0.0344768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.788;QD=18.5049;RBI=0.022075;REFB=-0.00825695;REVB=0.0144951;RO=28;SAF=11;SAR=17;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0074947;OID=.;OPOS=202574784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:56:28:28:28:28:0.5:17:11:11:17:17:11:11:17
chr1	202705455	.	G	C	1841.93	PASS	AF=0.953846;AO=124;DP=130;FAO=124;FDP=130;FR=.;FRO=6;FSAF=79;FSAR=45;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0693851;FXX=0.00763301;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.1278;QD=56.6746;RBI=0.0874155;REFB=-0.178089;REVB=0.0531712;RO=6;SAF=79;SAR=45;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129291;STB=0.506815;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00753178;OID=.;OPOS=202705455;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:130:130:6:6:124:124:0.953846:45:79:3:3:45:79:3:3
chr1	202715284	.	G	A	465.11	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.132;QD=58.1388;RBI=0.0414673;REFB=0;REVB=-0.0283122;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59458e-05;OID=.;OPOS=202715284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr1	202718202	.	G	A	905.76	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277698;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7474;QD=58.4362;RBI=0.0509233;REFB=0;REVB=-0.0426851;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000357411;OID=.;OPOS=202718202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0
chr1	202733238	.	C	T	483.34	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0053609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.965;QD=58.587;RBI=0.0134571;REFB=0;REVB=0.0123432;RO=0;SAF=6;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.2422e-05;OID=.;OPOS=202733238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:26:6:0:0:27:6:0:0
chr1	202795782	.	T	C	183.98	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0250414;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.61;QD=15.9985;RBI=0.0252783;REFB=-0.0193047;REVB=-0.00345235;RO=27;SAF=11;SAR=8;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173827;STB=0.599896;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0387266;OID=.;OPOS=202795782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:46:27:27:19:19:0.413043:8:11:11:16:8:11:11:16
chr1	202861342	.	A	G	384.0	PASS	AF=0.527027;AO=38;DP=73;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00783901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.172;QD=20.7568;RBI=0.0168041;REFB=-0.00815126;REVB=0.0148637;RO=35;SAF=11;SAR=27;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235867;STB=0.618562;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00582176;OID=.;OPOS=202861342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:35:35:38:39:0.527027:27:11:19:16:27:12:19:16
chr1	202884063	.	C	T	163.95	PASS	AF=0.53125;AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0133956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.544;QD=20.4939;RBI=0.0154193;REFB=-0.0115828;REVB=-0.00763645;RO=15;SAF=13;SAR=3;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.449115;STB=0.716267;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00960864;OID=.;OPOS=202884063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:15:15:16:17:0.53125:3:13:5:10:4:13:5:10
chr1	202888947	.	T	C	179.44	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0310147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.515;QD=15.6037;RBI=0.031796;REFB=-0.0139404;REVB=-0.0070053;RO=27;SAF=13;SAR=6;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216105;STB=0.624864;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.01607;OID=.;OPOS=202888947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:6:13:13:14:6:13:13:14
chr1	202932154	.	G	A	356.58	PASS	AF=0.4;AO=41;DP=104;FAO=42;FDP=105;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=41;FSRR=22;FWDB=-0.00135618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.995;QD=13.584;RBI=0.018318;REFB=-0.0191455;REVB=-0.0182678;RO=63;SAF=30;SAR=11;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103435;STB=0.563605;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0276792;OID=.;OPOS=202932154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:63:63:41:42:0.4:11:30:41:22:11:31:41:22
chr1	202935911	.	T	C	280.19	PASS	AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0257975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.79;QD=16.7276;RBI=0.0264344;REFB=-0.00495439;REVB=0.00576756;RO=36;SAF=17;SAR=14;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0992344;STB=0.555733;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00677683;OID=.;OPOS=202935911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:14:17:16:20:14:17:16:20
chr1	203004367	.	C	T	1179.76	PASS	AF=0.460674;AO=123;DP=269;FAO=123;FDP=267;FR=.;FRO=144;FSAF=63;FSAR=60;FSRF=72;FSRR=72;FWDB=0.0420901;FXX=0.0255465;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.284;QD=17.6743;RBI=0.0454361;REFB=-0.0322884;REVB=0.0171131;RO=139;SAF=63;SAR=60;SRF=68;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221027;STB=0.506578;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0375034;OID=.;OPOS=203004367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:269:267:139:144:123:123:0.460674:60:63:68:71:60:63:72:72
chr1	203008174	.	G	C	730.46	PASS	AF=1;AO=29;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.741;QD=54.1085;RBI=0.0596178;REFB=0;REVB=0.0538552;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181529;OID=.;OPOS=203008174;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:29:54:1:9:20:0:0:22:32:0:0
chr1	203008286	.	C	G	515.34	PASS	AF=0.526882;AO=49;DP=93;FAO=49;FDP=93;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.0990908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.344;QD=22.1651;RBI=0.099446;REFB=-0.0371455;REVB=-0.00839762;RO=41;SAF=21;SAR=28;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0900001;STB=0.544873;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0277162;OID=.;OPOS=203008286;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:41:44:49:49:0.526882:28:21:22:19:28:21:23:21
chr1	203023240	.	G	GGC	232.48	PASS	AF=0.337209;AO=29;DP=90;FAO=29;FDP=86;FR=.;FRO=57;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.0117461;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=39.606;QD=10.8128;RBI=0.0120108;REFB=-0.0378443;REVB=0.00250758;RO=61;SAF=13;SAR=16;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107299;STB=0.551688;STBP=0.506;TYPE=ins;VARB=0.0734213;OID=.;OPOS=203023241;OREF=-;OALT=GC;OMAPALT=GGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.337209:29:90:29:86:57:13:16:30:27:99:61:13:16:33:28
chr1	203040816	.	G	C	633.0	PASS	AF=0.602151;AO=56;DP=93;FAO=56;FDP=93;FR=.;FRO=37;FSAF=39;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00230705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.6;QD=27.2259;RBI=0.00241499;REFB=-0.0288519;REVB=0.000713926;RO=37;SAF=39;SAR=17;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147417;STB=0.580574;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0184163;OID=.;OPOS=203040816;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:37:37:56:56:0.602151:17:39:19:18:17:39:19:18
chr1	203053768	.	T	C,G	1653.34	PASS	AF=0.972973,0.027027;AO=107,4;DP=111;FAO=108,3;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=78,0;FSAR=30,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199089,-0.0141575;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=155.144,34.1499;QD=59.5797;RBI=0.0418443,0.0175426;REFB=0,0;REVB=0.0368046,0.0103589;RO=0;SAF=77,1;SAR=30,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00120909,0.0682473;OID=.,.;OPOS=203053768,203053768;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:111:111:0:0:107,4:108,3:0.972973,0.027027:30,3:77,1:0:0:30,3:78,0:0:0
chr1	203098275	.	T	G	323.58	PASS	AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0125382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.473;QD=16.8095;RBI=0.0543457;REFB=-0.0235435;REVB=0.0528796;RO=41;SAF=16;SAR=19;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996767;STB=0.562095;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.028022;OID=.;OPOS=203098275;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:41:42:35:35:0.454545:19:16:23:18:19:16:24:18
chr1	203135840	.	CT	C	349.65	PASS	AF=0.470149;AO=57;DP=133;FAO=63;FDP=134;FR=.;FRO=71;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=0.050774;FXX=0.0147048;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.5302;QD=10.4374;RBI=0.0731577;REFB=-0.0156802;REVB=0.0526693;RO=69;SAF=27;SAR=30;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00450771;STB=0.50699;STBP=0.897;TYPE=del;VARB=0.0260699;OID=.;OPOS=203135841;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.470149:57:133:63:134:71:31:32:34:37:99:69:27:30:33:36
chr1	203137784	.	A	ACT	360.47	PASS	AF=0.407767;AO=40;DP=103;FAO=42;FDP=103;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=43;FSRR=18;FWDB=-0.00615831;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=282.624;QD=13.9989;RBI=0.00715901;REFB=-0.0101526;REVB=0.00365055;RO=61;SAF=28;SAR=12;SRF=43;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00625039;STB=0.510077;STBP=0.881;TYPE=ins;VARB=0.0145535;OID=.;OPOS=203137785;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=ACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.407767:40:103:42:103:61:29:13:43:18:99:61:28:12:43:18
chr1	203148633	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00067036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.223;QD=53.2767;RBI=0.0129127;REFB=0;REVB=-0.0128953;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000214295;OID=.;OPOS=203148633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr1	203152801	.	T	C	453.75	PASS	AF=0.54321;AO=44;DP=81;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=0.0128744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.677;QD=22.4073;RBI=0.0159485;REFB=-0.00739897;REVB=-0.00941294;RO=36;SAF=12;SAR=32;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604027;STB=0.528912;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00685351;OID=.;OPOS=203152801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:36:37:44:44:0.54321:32:12:12:24:32:12:12:25
chr1	203155703	.	A	T	166.07	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0381438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.016;QD=22.1427;RBI=0.0398162;REFB=0.011498;REVB=0.0114185;RO=13;SAF=6;SAR=11;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205673;STB=0.615861;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.0263933;OID=.;OPOS=203155703;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:11:6:8:5:11:6:8:5
chr1	203309880	.	G	A	388.43	PASS	AF=0.44086;AO=34;DP=94;FAO=41;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=52;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=-0.00426756;FXX=0.0106372;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.499;QD=16.7066;RBI=0.00480742;REFB=-0.029666;REVB=-0.00221343;RO=31;SAF=18;SAR=16;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163743;STB=0.50331;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0273652;OID=.;OPOS=203309880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:31:52:34:41:0.44086:16:18:17:14:16:25:32:20
chr1	203309966	.	G	C	1320.86	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0695324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3403;QD=62.1583;RBI=0.0727877;REFB=0;REVB=-0.0215242;RO=0;SAF=48;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213311;OID=.;OPOS=203309966;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:85:0:0:83:85:1:35:48:0:0:35:50:0:0
chr1	203317162	.	C	T	479.46	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.29;QD=56.407;RBI=0.0758397;REFB=0;REVB=0.0705446;RO=0;SAF=27;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107758;OID=.;OPOS=203317162;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:34:0:0:30:34:1:3:27:0:0:3:31:0:0
chr1	203472112	.	T	C	203.86	PASS	AF=0.396825;AO=21;DP=59;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=31;FWDB=0.0251756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=359.594;QD=12.9434;RBI=0.0255576;REFB=-0.00435277;REVB=-0.00440236;RO=38;SAF=13;SAR=8;SRF=7;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.457115;STB=0.755432;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0120977;OID=.;OPOS=203472112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:63:38:38:21:25:0.396825:8:13:7:31:9:16:7:31
chr1	203652352	.	C	A	236.84	PASS	AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00638983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.363;QD=26.3156;RBI=0.0243641;REFB=-0.0518295;REVB=-0.0235112;RO=14;SAF=10;SAR=12;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0693794;STB=0.538427;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0233494;OID=.;OPOS=203652352;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:14:14:22:22:0.611111:12:10:5:9:12:10:5:9
chr1	203652444	.	A	G	754.42	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000802276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.613;QD=56.9372;RBI=0.0181387;REFB=0;REVB=-0.018121;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.52926e-05;OID=.;OPOS=203652444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:32:21:0:0:32:21:0:0
chr1	203667409	.	T	C	1788.64	PASS	AF=1;AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00948852;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.1634;QD=61.1502;RBI=0.0159428;REFB=0;REVB=-0.0128117;RO=0;SAF=53;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09512e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000665262;OID=.;OPOS=203667409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:117:0:0:117:117:1:64:53:0:0:64:53:0:0
chr1	203670013	.	G	T	192.98	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.0472639;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=269.528;QD=13.7844;RBI=0.0487632;REFB=-0.00954655;REVB=-0.0119991;RO=33;SAF=4;SAR=19;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111326;STB=0.564296;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0118871;OID=.;OPOS=203670013;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:19:4:8:25:19:4:8:25
chr1	203768328	.	T	C	1513.4	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.4543;QD=59.9368;RBI=0.0493067;REFB=0;REVB=-0.0200536;RO=0;SAF=66;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53132e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145094;OID=.;OPOS=203768328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:35:66:0:0:35:66:0:0
chr1	203769532	.	G	A	556.78	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.933;QD=60.1922;RBI=0.0616005;REFB=0;REVB=0.0575668;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200693;OID=.;OPOS=203769532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:16:20:0:0:17:20:0:0
chr1	203787700	.	T	C	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0560674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.646;QD=57.0001;RBI=0.0574409;REFB=0;REVB=-0.0124859;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.12877e-05;OID=.;OPOS=203787700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0
chr1	204095920	.	G	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327495;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=252.193;QD=48.7373;RBI=0.0442302;REFB=0;REVB=0.0297284;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026547;OID=.;OPOS=204095920;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:13:4:0:0:13:4:0:0
chr1	204110334	.	A	G	854.04	PASS	AF=0.983607;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0505858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1771;QD=56.0027;RBI=0.0807678;REFB=-0.0519008;REVB=0.0629644;RO=1;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184984;STB=0.509801;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00320876;OID=.;OPOS=204110334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:59:60:0.983607:25:34:0:1:25:35:0:1
chr1	204110547	.	C	T	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=-0.0421506;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.196;QD=11.2569;RBI=0.0423059;REFB=-0.0122451;REVB=0.00362145;RO=12;SAF=2;SAR=6;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.65454;STB=0.874342;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0162237;OID=.;OPOS=204110547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:6:2:12:0:6:2:12:0
chr1	204188371	.	A	G	312.81	PASS	AF=0.595745;AO=27;DP=46;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.16792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.8394;QD=26.6221;RBI=0.167928;REFB=-0.147922;REVB=0.00158624;RO=19;SAF=21;SAR=6;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344692;STB=0.670458;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.123388;OID=.;OPOS=204188371;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:19:19:27:28:0.595745:6:21:7:12:7:21:7:12
chr1	204190412	.	C	G	101.16	PASS	AF=0.270833;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0174773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.134;QD=8.42976;RBI=0.021356;REFB=-0.00911324;REVB=-0.0122728;RO=35;SAF=9;SAR=4;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120341;STB=0.574349;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0257091;OID=.;OPOS=204190412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:35:35:13:13:0.270833:4:9:21:14:4:9:21:14
chr1	204198209	.	A	G	426.13	PASS	AF=0.577465;AO=41;DP=72;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0148808;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.14;QD=24.0074;RBI=0.058497;REFB=-0.0224073;REVB=-0.0565726;RO=30;SAF=18;SAR=23;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215219;STB=0.511816;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0173354;OID=.;OPOS=204198209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:30:30:41:41:0.577465:23:18:14:16:23:18:14:16
chr1	204199614	.	C	T	312.66	PASS	AF=0.561404;AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.10328;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4723;QD=21.9413;RBI=0.103601;REFB=-0.0458519;REVB=0.00814482;RO=25;SAF=18;SAR=14;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063068;STB=0.53481;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0368086;OID=.;OPOS=204199614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:25:25:32:32:0.561404:14:18:16:9:14:18:16:9
chr1	204230581	.	G	A	1117.89	PASS	AF=0.908046;AO=78;DP=86;FAO=79;FDP=87;FR=.;FRO=8;FSAF=36;FSAR=43;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.020527;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.224;QD=51.3971;RBI=0.029593;REFB=-0.0876937;REVB=0.0213165;RO=5;SAF=36;SAR=42;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00704889;STB=0.504102;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.00135193;OID=.;OPOS=204230581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:86:87:5:8:78:79:0.908046:42:36:2:3:43:36:4:4
chr1	204237416	.	C	T	1647.49	PASS	AF=1;AO=108;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231787;FXX=0.0180164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.608;QD=60.4582;RBI=0.0313868;REFB=0;REVB=0.0211631;RO=0;SAF=58;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.47315e-05;OID=.;OPOS=204237416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:109:0:0:108:109:1:50:58:0:0:50:59:0:0
chr1	204242838	.	A	C	374.0	PASS	AF=0.394737;AO=38;DP=108;FAO=45;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.00322325;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.582;QD=13.1229;RBI=0.0246543;REFB=-0.0166996;REVB=0.0244427;RO=69;SAF=26;SAR=12;SRF=40;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127733;STB=0.512722;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0242971;OID=.;OPOS=204242838;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:114:69:69:38:45:0.394737:12:26:40:29:18:27:40:29
chr1	204379617	.	T	C	1606.6	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00725587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.269;QD=64.264;RBI=0.00845924;REFB=0;REVB=0.00434868;RO=0;SAF=42;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.70199e-06;OID=.;OPOS=204379617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:58:42:0:0:58:42:0:0
chr1	204394056	.	C	T	438.12	PASS	AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0518681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3384;QD=19.0487;RBI=0.0519012;REFB=0.0194354;REVB=0.00185394;RO=47;SAF=22;SAR=22;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296386;STB=0.510865;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=-0.0205351;OID=.;OPOS=204394056;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:47:48:44:44:0.478261:22:22:25:22:22:22:25:23
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chr1	204425028	.	G	A	302.8	PASS	AF=0.472222;AO=30;DP=68;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00289623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.621;QD=16.8221;RBI=0.0305221;REFB=-0.0319647;REVB=0.0303844;RO=32;SAF=16;SAR=14;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270479;STB=0.513881;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0412269;OID=.;OPOS=204425028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:72:32:38:30:34:0.472222:14:16:18:14:17:17:18:20
chr1	204436066	.	G	A	414.96	PASS	AF=0.585714;AO=37;DP=66;FAO=41;FDP=70;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.007881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.549;QD=23.7119;RBI=0.0111955;REFB=-0.033587;REVB=0.00795169;RO=26;SAF=16;SAR=21;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221856;STB=0.510199;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0402944;OID=.;OPOS=204436066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:70:26:29:37:41:0.585714:21:16:12:14:25:16:12:17
chr1	204438334	.	C	T	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.573;QD=53.2766;RBI=0.0412947;REFB=0;REVB=0.0282867;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264013;OID=.;OPOS=204438334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0
chr1	204438643	.	G	T	563.79	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0353717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.878;QD=57.8245;RBI=0.0361208;REFB=-0.116299;REVB=0.00731814;RO=1;SAF=17;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267628;STB=0.514278;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000553937;OID=.;OPOS=204438643;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:21:17:1:0:21:17:1:0
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chr1	204531567	.	C	T	282.67	PASS	AF=0.641026;AO=25;DP=39;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00352928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.834;QD=28.9919;RBI=0.0503236;REFB=-0.0211999;REVB=0.0501997;RO=14;SAF=9;SAR=16;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187973;STB=0.603689;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0157172;OID=.;OPOS=204531567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:14:14:25:25:0.641026:16:9:9:5:16:9:9:5
chr1	204587047	.	G	A	189.87	PASS	AF=0.358209;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=0.0470359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.729;QD=11.3353;RBI=0.0478163;REFB=0.0044664;REVB=0.00860346;RO=41;SAF=13;SAR=11;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158532;STB=0.58697;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=-0.00632668;OID=.;OPOS=204587047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:41:43:24:24:0.358209:11:13:28:13:11:13:29:14
chr1	204587569	.	G	C	114.72	PASS	AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0202381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.63;QD=10.4289;RBI=0.0204554;REFB=-0.0173402;REVB=-0.00297387;RO=30;SAF=7;SAR=7;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15241;STB=0.590784;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0315507;OID=.;OPOS=204587569;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:7:7:19:11:7:7:19:11
chr1	204588140	.	G	A	55.01	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.057101;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=126.392;QD=9.5674;RBI=0.0572758;REFB=-0.0218965;REVB=-0.00447168;RO=15;SAF=1;SAR=7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.550847;STB=0.842438;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0474413;OID=.;OPOS=204588140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:7:1:9:6:7:1:9:6
chr1	204589101	.	G	A	82.88	PASS	AF=0.297297;AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0212217;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.971;QD=8.95992;RBI=0.0288396;REFB=-0.0347327;REVB=-0.0195285;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020408;STB=0.522348;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0778226;OID=.;OPOS=204589101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:37:37:19:26:11:11:0.297297:6:5:9:10:6:5:11:15
chr1	204589623	.	G	A	150.21	PASS	AF=0.344828;AO=19;DP=55;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=0.00809094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.169;QD=10.3592;RBI=0.00909429;REFB=-0.00688661;REVB=0.00415243;RO=33;SAF=13;SAR=6;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969026;STB=0.505698;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.027332;OID=.;OPOS=204589623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:58:33:38:19:20:0.344828:6:13:25:8:7:13:25:13
chr1	204590044	.	G	A	432.06	PASS	AF=0.448598;AO=47;DP=106;FAO=48;FDP=107;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.00443183;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.585;QD=16.1518;RBI=0.00690823;REFB=-0.0120104;REVB=0.00529929;RO=59;SAF=26;SAR=21;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0782956;STB=0.548631;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0267756;OID=.;OPOS=204590044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:59:59:47:48:0.448598:21:26:28:31:21:27:28:31
chr1	204591237	.	A	G	393.11	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00128973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.342;QD=19.6554;RBI=0.00576862;REFB=-0.0202629;REVB=0.0056226;RO=40;SAF=20;SAR=20;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0450112;STB=0.524988;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0175925;OID=.;OPOS=204591237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:40:40:40:40:0.5:20:20:18:22:20:20:18:22
chr1	204943947	.	C	A	297.86	PASS	AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.0080076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.963;QD=20.9023;RBI=0.0183178;REFB=0.000134824;REVB=-0.0164748;RO=24;SAF=10;SAR=21;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335188;STB=0.699874;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.000301936;OID=.;OPOS=204943947;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:24:26:31:31:0.54386:21:10:18:6:21:10:20:6
chr1	204966690	.	G	A	990.62	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.031712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.952;QD=59.1416;RBI=0.0537892;REFB=0;REVB=0.0434468;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.18248e-05;OID=.;OPOS=204966690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:35:32:0:0:35:32:0:0
chr1	204970302	.	T	C	459.32	PASS	AF=0.452174;AO=46;DP=108;FAO=52;FDP=115;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.00939899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.75;QD=15.9765;RBI=0.00941231;REFB=-0.0109224;REVB=-0.000500506;RO=61;SAF=25;SAR=21;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525659;STB=0.525459;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0137932;OID=.;OPOS=204970302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:115:61:63:46:52:0.452174:21:25:30:31:24:28:31:32
chr1	204978533	.	A	G	757.07	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00961029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.898;QD=63.0895;RBI=0.0126012;REFB=0;REVB=0.0081506;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.50823e-06;OID=.;OPOS=204978533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:27:20:0:0:28:20:0:0
chr1	205052939	.	G	A	669.99	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.094;QD=62.3251;RBI=0.0735558;REFB=0;REVB=-0.0723302;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00011567;OID=.;OPOS=205052939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:13:29:0:0:13:30:0:0
chr1	205053219	.	C	T	1054.58	PASS	AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0239654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.942;QD=57.0042;RBI=0.0340227;REFB=-0.154925;REVB=0.0241496;RO=2;SAF=46;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201187;STB=0.510635;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00142788;OID=.;OPOS=205053219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:74:74:2:2:72:72:0.972973:26:46:2:0:26:46:2:0
chr1	205056844	.	T	TA,TTA	187.57	PASS	AF=0,0.85;AO=2,14;DP=20;FAO=0,17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=0,12;FSAR=0,5;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00623206,0.0100722;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=1,2;MLLD=273.346,286.242;QD=37.5143;RBI=0.00629121,0.0104265;REFB=-0.03957,-0.0473615;REVB=-0.000860668,0.00269489;RO=4;SAF=1,10;SAR=1,4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0995427;STB=0.5,0.56368;STBP=1,0.274;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.0114791;OID=.,.;OPOS=205056845,205056845;OREF=-,-;OALT=A,TA;OMAPALT=TA,TTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.85:2,14:20:0,17:20:3:0,12:0,5:1:2:14:4:1,10:1,4:2:2
chr1	205068857	.	T	C	937.6	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7783;QD=58.5998;RBI=0.0296604;REFB=0;REVB=0.00812573;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199675;OID=.;OPOS=205068857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:23:41:0:0:23:41:0:0
chr1	205130413	.	A	G	728.61	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9651;QD=54.9892;RBI=0.0631688;REFB=-0.0855166;REVB=-0.0528839;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00203906;OID=.;OPOS=205130413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:53:53:0:0:52:53:1:28:24:0:0:28:25:0:0
chr1	205225457	.	G	A	959.88	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105124;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.955;QD=59.0697;RBI=0.0387473;REFB=0;REVB=0.0372941;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003828;OID=.;OPOS=205225457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:25:39:0:0:26:39:0:0
chr1	205238275	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.002;QD=51.9165;RBI=0.0784772;REFB=0;REVB=0.0716604;RO=0;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.45803e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449943;OID=.;OPOS=205238275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:4:17:0:0:4:17:0:0
chr1	205238530	.	C	T	85.91	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0791553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.1194;QD=38.1836;RBI=0.0791553;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0124577;OID=.;OPOS=205238530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:0:8:0:0:0:9:0:0
chr1	205240251	.	C	T	663.91	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.29;QD=61.7593;RBI=0.0500168;REFB=0;REVB=0.0357054;RO=1;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240543;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154157;OID=.;OPOS=205240251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:1:0:41:43:1:19:22:0:1:20:23:0:0
chr1	205272918	.	G	A	89.0	PASS	AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00499143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.186;QD=27.3838;RBI=0.126008;REFB=0.0672063;REVB=0.125909;RO=3;SAF=8;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079881;STB=0.545359;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=-0.00801944;OID=.;OPOS=205272918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:2:8:2:1:2:8:2:1
chr1	205275421	.	A	G	805.17	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.862;QD=64.4136;RBI=0.0389041;REFB=0;REVB=0.033382;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179457;OID=.;OPOS=205275421;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0
chr1	205277781	.	C	T	324.85	PASS	AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=28;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0468286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9085;QD=17.0974;RBI=0.0715896;REFB=0.00782667;REVB=-0.0541494;RO=41;SAF=28;SAR=7;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331095;STB=0.687779;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.0118348;OID=.;OPOS=205277781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:7:28:21:20:7:28:21:20
chr1	205492756	.	A	G	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0286824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.392;QD=17.3213;RBI=0.0358107;REFB=-0.0239746;REVB=-0.0214412;RO=18;SAF=10;SAR=6;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405633;STB=0.728911;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0218548;OID=.;OPOS=205492756;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:6:10:3:15:6:10:3:15
chr1	205498454	.	ACCCCCA	ACCCCA,ACCCCAC	30.71	PASS	AF=0.227273,0.136364;AO=3,2;DP=22;FAO=5,3;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=2,3;FSAR=3,0;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0723828,-0.0466534;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=12.5146,22.0285;QD=5.58429;RBI=0.0775222,0.0771597;REFB=-0.0888461,-0.0441345;REVB=-0.0277565,-0.0614579;RO=13;SAF=2,2;SAR=1,0;SRF=2;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.349206,0;SSSB=0.543225,0.72547;STB=0.650644,0.997649;STBP=0.522,0.012;TYPE=del,mnp;VARB=0.0936172,0.0872245;OID=.,.;OPOS=205498455,205498459;OREF=C,CA;OALT=-,AC;OMAPALT=ACCCCA,ACCCCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.227273,0.136364:3,2:22:5,3:22:14:2,3:3,0:3:11:17:13:2,2:1,0:2:11
chr1	205501843	.	A	G	910.88	PASS	AF=1;AO=61;DP=64;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238676;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5226;QD=58.7665;RBI=0.0246723;REFB=0;REVB=0.00624992;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00194332;OID=.;OPOS=205501843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:62:0:0:61:62:1:35:26:0:0:35:27:0:0
chr1	205554085	.	G	C	387.29	PASS	AF=0.393939;AO=39;DP=100;FAO=39;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=56;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=40;FSRR=16;FWDB=-0.115523;FXX=0.009999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.0895;QD=15.6482;RBI=0.12699;REFB=-0.0606121;REVB=0.052734;RO=41;SAF=27;SAR=12;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0358565;STB=0.515377;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0512439;OID=.;OPOS=205554085;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:99:41:56:39:39:0.393939:12:27:27:14:12:27:40:16
chr1	205554095	.	A	C	364.55	PASS	AF=0.414894;AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=16;FWDB=-0.00806125;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.83;QD=15.5126;RBI=0.0201427;REFB=-0.02661;REVB=0.0184593;RO=55;SAF=24;SAR=15;SRF=39;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105776;STB=0.559473;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0412225;OID=.;OPOS=205554095;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:94:55:55:39:39:0.414894:15:24:39:16:15:24:39:16
chr1	205570406	.	T	A	1340.59	PASS	AF=0.988636;AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0557934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8353;QD=60.9358;RBI=0.0640918;REFB=-0.111605;REVB=-0.0315413;RO=0;SAF=54;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.000725525;OID=.;OPOS=205570406;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:87:88:0:1:86:87:0.988636:32:54:0:0:32:55:0:1
chr1	205588637	.	C	T	340.68	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00265899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7729;QD=54.5084;RBI=0.0342056;REFB=0;REVB=-0.0341021;RO=0;SAF=4;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000219872;OID=.;OPOS=205588637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:21:4:0:0:21:4:0:0
chr1	205589574	.	C	T	468.85	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0653282;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.1401;QD=58.6062;RBI=0.0674987;REFB=0;REVB=0.0169795;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000544533;OID=.;OPOS=205589574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr1	205626995	.	C	G	375.53	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.092;QD=55.6348;RBI=0.0395613;REFB=0;REVB=0.0302226;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010276;OID=.;OPOS=205626995;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr1	205627101	.	ACCCCCCCT	ACCCCCCT,ACCCCCCTC,ACCCCCT	235.85	PASS	AF=0.934783,0,0;AO=30,3,7;DP=46;FAO=43,0,0;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=25,0,0;FSAR=18,0,0;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.058225,-0.0863872,-0.0369836;FXX=0;HRUN=7,7,7;LEN=1,2,2;MLLD=7.96599,109.451,10.2804;QD=20.5084;RBI=0.138176,0.0869688,0.0741707;REFB=-0.0324255,0.0140984,-0.0231748;REVB=-0.125309,-0.0100413,-0.0642923;RO=5;SAF=15,3,5;SAR=15,0,2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0264757,0.698233,0.237226;STB=0.538444,0.5,0.5;STBP=0.075,1,1;TYPE=del,mnp,del;VARB=0.0302424,0.0517175,-0.0248026;OID=.,.,.;OPOS=205627102,205627108,205627102;OREF=C,CT,CC;OALT=-,TC,-;OMAPALT=ACCCCCCT,ACCCCCCTC,ACCCCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.934783,0,0:30,3,7:46:43,0,0:46:3:25,0,0:18,0,0:0:3:10:5:15,3,5:15,0,2:2:3
chr1	205738166	.	T	C	273.51	PASS	AF=1;AO=18;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0977001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.477;QD=52.0974;RBI=0.100714;REFB=0;REVB=0.0244528;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000537278;OID=.;OPOS=205738166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:18:21:1:11:7:0:0:12:9:0:0
chr1	205779231	.	G	A	692.58	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019537;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.438;QD=62.9616;RBI=0.031117;REFB=0;REVB=0.0242193;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47108e-05;OID=.;OPOS=205779231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:16:28:0:0:16:28:0:0
chr1	205810947	.	C	T	504.88	PASS	AF=0.49;AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=0.00253335;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.7478;QD=20.1952;RBI=0.039172;REFB=0.0307237;REVB=-0.03909;RO=51;SAF=28;SAR=21;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198969;STB=0.610125;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.0277629;OID=.;OPOS=205810947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:51:51:49:49:0.49:21:28:18:33:21:28:18:33
chr1	205812912	.	A	G	115.56	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1832;QD=30.815;RBI=0.0460917;REFB=-0.0217299;REVB=0.0460917;RO=3;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00448163;OID=.;OPOS=205812912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:15:15:3:3:12:12:0.8:12:0:0:3:12:0:0:3
chr1	205814497	.	T	C	205.13	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0138558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.53;QD=15.7794;RBI=0.0526601;REFB=-0.00942221;REVB=-0.0508045;RO=27;SAF=10;SAR=13;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631228;STB=0.531705;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.012838;OID=.;OPOS=205814497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:27:29:23:23:0.442308:13:10:10:17:13:10:11:18
chr1	205817018	.	T	C	284.86	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0168494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.739;QD=23.7382;RBI=0.017365;REFB=-0.00459491;REVB=-0.00420005;RO=21;SAF=7;SAR=19;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334297;STB=0.69651;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00975477;OID=.;OPOS=205817018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:22:26:26:0.541667:19:7:14:7:19:7:15:7
chr1	205819039	.	C	T	178.18	PASS	AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.0302334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.633;QD=14.8481;RBI=0.0583502;REFB=-0.0271526;REVB=0.0499069;RO=29;SAF=12;SAR=7;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121702;STB=0.507035;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0561051;OID=.;OPOS=205819039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:7:12:18:11:7:12:18:11
chr1	205819104	.	G	A	195.6	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00566844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.221;QD=12.6191;RBI=0.00663059;REFB=-0.0038621;REVB=-0.00343999;RO=38;SAF=15;SAR=9;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108383;STB=0.562447;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0128578;OID=.;OPOS=205819104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:38:38:24:24:0.387097:9:15:20:18:9:15:20:18
chr1	206516261	.	C	T	542.27	PASS	AF=0.513761;AO=56;DP=109;FAO=56;FDP=109;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=16;FSRR=37;FWDB=0.0222693;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8272;QD=19.8996;RBI=0.0628739;REFB=-0.0211852;REVB=0.058798;RO=50;SAF=20;SAR=36;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035091;STB=0.529743;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0213634;OID=.;OPOS=206516261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:50:53:56:56:0.513761:36:20:16:34:36:20:16:37
chr1	206566904	.	T	C	675.87	PASS	AF=0.515385;AO=66;DP=129;FAO=67;FDP=130;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=-0.0182488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.704;QD=20.7959;RBI=0.0299885;REFB=-0.0218847;REVB=0.0237969;RO=63;SAF=32;SAR=34;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204833;STB=0.514701;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0152548;OID=.;OPOS=206566904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:130:63:63:66:67:0.515385:34:32:32:31:35:32:32:31
chr1	206603535	.	G	A	538.42	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.599;QD=59.824;RBI=0.0345173;REFB=0;REVB=0.0104584;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.63554e-05;OID=.;OPOS=206603535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr1	206635570	.	C	T	2079.9	PASS	AF=0.978261;AO=135;DP=138;FAO=135;FDP=138;FR=.;FRO=3;FSAF=63;FSAR=72;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.000438598;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.925;QD=60.2871;RBI=0.00807176;REFB=-0.202074;REVB=-0.00805983;RO=0;SAF=63;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511626;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.000402927;OID=.;OPOS=206635570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:138:138:0:3:135:135:0.978261:72:63:0:0:72:63:3:0
chr1	206647742	.	A	G	1044.28	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0344448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.674;QD=59.673;RBI=0.0664192;REFB=0;REVB=-0.0567896;RO=0;SAF=42;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00073539;OID=.;OPOS=206647742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:27:42:0:0:28:42:0:0
chr1	206647787	.	T	C	1135.26	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0085151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.79;QD=60.547;RBI=0.0465672;REFB=0;REVB=0.0457821;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.63524e-05;OID=.;OPOS=206647787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:34:41:0:0:34:41:0:0
chr1	206651107	.	G	A	367.16	PASS	AF=0.411765;AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=0.0120634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.664;QD=14.3984;RBI=0.0146817;REFB=-0.024736;REVB=0.00836818;RO=60;SAF=19;SAR=23;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0843022;STB=0.547596;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0342762;OID=.;OPOS=206651107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:60:60:42:42:0.411765:23:19:32:28:23:19:32:28
chr1	206658354	.	C	T	126.44	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0037986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3124;QD=11.2395;RBI=0.0709734;REFB=-0.013069;REVB=-0.0708716;RO=30;SAF=6;SAR=9;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150051;STB=0.589166;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.037468;OID=.;OPOS=206658354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:9:6:16:14:9:6:16:14
chr1	206665896	.	C	G	731.42	PASS	AF=0.903226;AO=55;DP=62;FAO=56;FDP=62;FR=.;FRO=6;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0331228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.882;QD=47.1884;RBI=0.0335353;REFB=-0.0690023;REVB=0.00524375;RO=6;SAF=20;SAR=35;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605857;STB=0.502512;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.00109377;OID=.;OPOS=206665896;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:62:62:6:6:55:56:0.903226:35:20:2:4:36:20:2:4
chr1	206669465	.	C	T	282.81	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.0114832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5533;QD=17.4039;RBI=0.0839625;REFB=-0.0164753;REVB=-0.0831735;RO=34;SAF=18;SAR=13;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123167;STB=0.568707;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0176104;OID=.;OPOS=206669465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:13:18:24:10:13:18:24:10
chr1	206757857	.	C	A	361.98	PASS	AF=0.469136;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.019663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2626;QD=17.8754;RBI=0.0291131;REFB=-0.0113128;REVB=0.0214695;RO=43;SAF=25;SAR=13;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123722;STB=0.569321;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0122197;OID=.;OPOS=206757857;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:43:43:38:38:0.469136:13:25:23:20:13:25:23:20
chr1	206758077	.	T	A	88.2	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0729305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2032;QD=39.2;RBI=0.0729475;REFB=0;REVB=-0.00157672;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00127456;OID=.;OPOS=206758077;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0
chr1	206773659	.	A	G	1249.47	PASS	AF=0.988235;AO=66;DP=77;FAO=84;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=64;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0321354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.447;QD=58.7985;RBI=0.112697;REFB=-0.146558;REVB=0.108018;RO=0;SAF=53;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512192;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.000597275;OID=.;OPOS=206773659;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:77:85:0:1:66:84:0.988235:13:53:0:0:20:64:0:1
chr1	207110936	.	T	C	186.93	PASS	AF=0.342857;AO=24;DP=70;FAO=24;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0372354;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.794;QD=10.682;RBI=0.037906;REFB=-0.0195068;REVB=0.00709863;RO=46;SAF=14;SAR=10;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00420407;STB=0.502449;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0367312;OID=.;OPOS=207110936;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:46:46:24:24:0.342857:10:14:27:19:10:14:27:19
chr1	207132345	.	A	G	72.46	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0225903;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.587;QD=8.52519;RBI=0.0236985;REFB=0.00110994;REVB=-0.00716216;RO=23;SAF=4;SAR=6;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28045;STB=0.654873;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.00291236;OID=.;OPOS=207132345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:34:23:24:10:10:0.294118:6:4:15:8:6:4:15:9
chr1	207140440	.	C	T	221.73	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00918157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.088;QD=12.3183;RBI=0.014929;REFB=-0.00685568;REVB=-0.0117718;RO=45;SAF=8;SAR=19;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199752;STB=0.615553;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00983935;OID=.;OPOS=207140440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:45:45:27:27:0.375:19:8:21:24:19:8:21:24
chr1	207143422	.	A	G	151.52	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00848732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.78;QD=12.8956;RBI=0.0088153;REFB=-0.00833221;REVB=-0.00238219;RO=30;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024103;STB=0.514122;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0115869;OID=.;OPOS=207143422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:10:7:13:17:10:7:13:17
chr1	207195779	.	A	G	438.59	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0756426;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.4308;QD=56.5921;RBI=0.102083;REFB=0;REVB=0.0685501;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.29692e-05;OID=.;OPOS=207195779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:16:15:0:0
chr1	207263829	.	A	G	805.17	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.979;QD=64.4139;RBI=0.039501;REFB=0;REVB=0.00370306;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.93608e-05;OID=.;OPOS=207263829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0
chr1	207297680	.	T	C	853.87	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00139576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.418;QD=55.9918;RBI=0.00705798;REFB=-0.09714;REVB=0.00691859;RO=1;SAF=39;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011949;STB=0.506327;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-1.60281e-05;OID=.;OPOS=207297680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:21:39:1:0:21:39:1:0
chr1	207653395	.	C	A	851.06	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00680477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.009;QD=57.6987;RBI=0.0213112;REFB=0;REVB=0.0201956;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.85661e-05;OID=.;OPOS=207653395;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0
chr1	207679307	.	A	G	724.14	PASS	AF=0.415789;AO=79;DP=189;FAO=79;FDP=190;FR=.;FRO=111;FSAF=38;FSAR=41;FSRF=62;FSRR=49;FWDB=0.00202315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.794;QD=15.245;RBI=0.0137581;REFB=-0.00911667;REVB=-0.0136086;RO=107;SAF=38;SAR=41;SRF=61;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915635;STB=0.545201;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0164063;OID=.;OPOS=207679307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:190:107:111:79:79:0.415789:41:38:61:46:41:38:62:49
chr1	207760773	.	C	T	375.43	PASS	AF=0.46988;AO=39;DP=83;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.00445902;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.195;QD=18.0928;RBI=0.0330255;REFB=-0.0181646;REVB=-0.0327231;RO=44;SAF=22;SAR=17;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0612663;STB=0.534229;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0217402;OID=.;OPOS=207760773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:44:44:39:39:0.46988:17:22:22:22:17:22:22:22
chr1	207782915	.	TA	T,TT	1959.77	PASS	AF=0.0465116,0.953488;AO=17,111;DP=129;FAO=6,123;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=4,72;FSAR=2,51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173975,-0.0193648;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=61.2417,69.9728;QD=60.768;RBI=0.0176037,0.0210147;REFB=0,0;REVB=-0.00268681,0.00816209;RO=0;SAF=2,73;SAR=15,38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.95117e-08,-3.7808e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0122996,0.0323124;OID=.,.;OPOS=207782916,207782916;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0465116,0.953488:17,111:129:6,123:129:0:4,72:2,51:0:0:7:0:2,73:15,38:0:0
chr1	207795320	.	A	G	853.41	PASS	AF=0.480663;AO=85;DP=179;FAO=87;FDP=181;FR=.;FRO=94;FSAF=45;FSAR=42;FSRF=44;FSRR=50;FWDB=0.000310697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7652;QD=18.8598;RBI=0.0252508;REFB=-0.0213164;REVB=0.0252489;RO=94;SAF=45;SAR=40;SRF=44;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582542;STB=0.525508;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.02402;OID=.;OPOS=207795320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:181:94:94:85:87:0.480663:40:45:44:50:42:45:44:50
chr1	207812791	.	A	G	309.58	PASS	AF=0.435897;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.0165697;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.114;QD=15.8757;RBI=0.0167433;REFB=-0.0143781;REVB=-0.00240461;RO=44;SAF=16;SAR=18;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131737;STB=0.574004;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0162738;OID=.;OPOS=207812791;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:44:44:34:34:0.435897:18:16:15:29:18:16:15:29
chr1	207851611	.	A	G	427.65	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0629138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.525;QD=57.0204;RBI=0.0753618;REFB=0;REVB=0.041488;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000388129;OID=.;OPOS=207851611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:30:0:0:28:30:1:10:18:0:0:10:20:0:0
chr1	207857254	.	A	G	382.28	PASS	AF=0.39823;AO=45;DP=113;FAO=45;FDP=113;FR=.;FRO=68;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=0.0490036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2865;QD=13.5321;RBI=0.0513976;REFB=-0.0113056;REVB=0.0155034;RO=68;SAF=21;SAR=24;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589425;STB=0.533319;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0124875;OID=.;OPOS=207857254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:68:68:45:45:0.39823:24:21:28:40:24:21:28:40
chr1	207875116	.	GAGA	G	43.43	PASS	AF=0.205882;AO=7;DP=34;FAO=7;FDP=34;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0100119;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=3;MLLD=337.565;QD=5.10998;RBI=0.01782;REFB=-0.0052475;REVB=-0.0147416;RO=24;SAF=5;SAR=2;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261582;STB=0.689102;STBP=0.321;TYPE=del;VARB=0.0160713;OID=.;OPOS=207875117;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.205882:7:34:7:34:27:5:2:13:14:43:24:5:2:12:12
chr1	207881557	.	A	G	2219.79	PASS	AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234533;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.34;QD=63.4225;RBI=0.028764;REFB=0;REVB=0.0166526;RO=0;SAF=69;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.29942e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.92111e-05;OID=.;OPOS=207881557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:71:69:0:0:71:69:0:0
chr1	207884105	.	C	A	1624.16	PASS	AF=0.990991;AO=106;DP=110;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0539918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3757;QD=58.5284;RBI=0.056294;REFB=0.0490064;REVB=-0.0159342;RO=1;SAF=47;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00797668;STB=0.504201;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.000148637;OID=.;OPOS=207884105;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:111:1:1:106:110:0.990991:59:47:0:1:59:51:0:1
chr1	207884107	.	G	A	1611.82	PASS	AF=0.981982;AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=111;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0129253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.7;QD=58.0836;RBI=0.0133831;REFB=0.0253508;REVB=0.00347056;RO=2;SAF=50;SAR=59;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00142134;STB=0.500749;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-0.000144218;OID=.;OPOS=207884107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:111:111:2:2:109:109:0.981982:59:50:1:1:59:50:1:1
chr1	207885881	.	C	T	1970.94	PASS	AF=1;AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000361724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.104;QD=62.0768;RBI=0.0711666;REFB=0;REVB=-0.0711657;RO=0;SAF=78;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.93786e-05;OID=.;OPOS=207885881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:127:0:0:127:127:1:49:78:0:0:49:78:0:0
chr1	207886150	.	C	T	1548.13	PASS	AF=1;AO=96;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.259;QD=63.1889;RBI=0.0413952;REFB=0;REVB=0.00954114;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.88331e-05;OID=.;OPOS=207886150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:96:98:1:49:47:0:0:51:47:0:0
chr1	207888739	.	G	T	2532.51	PASS	AF=0.988095;AO=166;DP=170;FAO=166;FDP=168;FR=.;FRO=2;FSAF=93;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0215013;FXX=0.011764;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.522;QD=60.2979;RBI=0.0227915;REFB=0.0266838;REVB=0.00755956;RO=1;SAF=93;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00508994;STB=0.500727;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=-3.13839e-05;OID=.;OPOS=207888739;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:170:168:1:2:166:166:0.988095:73:93:1:0:73:93:1:1
chr1	207941190	.	AG	A,AT	729.38	PASS	AF=0.0638298,0.93617;AO=17,30;DP=48;FAO=3,44;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=3,18;FSAR=0,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168294,0.0200541;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=128.497,136.238;QD=62.0747;RBI=0.036909,0.0206069;REFB=0,0;REVB=-0.0328488,0.0047409;RO=0;SAF=8,13;SAR=9,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.126e-08,-5.63861e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0611522,0.0035412;OID=.,.;OPOS=207941191,207941191;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0638298,0.93617:17,30:48:3,44:47:0:3,18:0,26:0:0:8:0:8,13:9,17:0:0
chr1	208196163	.	C	T	386.73	PASS	AF=0.527027;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=34;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.00238118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.349;QD=20.904;RBI=0.0290839;REFB=-0.0210036;REVB=-0.0289863;RO=34;SAF=34;SAR=5;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.534017;STB=0.796008;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0235625;OID=.;OPOS=208196163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:34:35:39:39:0.527027:5:34:12:22:5:34:13:22
chr1	208199100	.	T	A	463.52	PASS	AF=0.46789;AO=45;DP=102;FAO=51;FDP=109;FR=.;FRO=58;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.0764163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.416;QD=17.0098;RBI=0.0773084;REFB=-0.00472402;REVB=-0.0117108;RO=57;SAF=29;SAR=16;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191731;STB=0.61142;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00820886;OID=.;OPOS=208199100;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:109:57:58:45:51:0.46789:16:29:26:31:17:34:27:31
chr1	208199999	.	T	C	143.26	PASS	AF=0.271429;AO=27;DP=67;FAO=19;FDP=70;FR=.;FRO=51;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.00518845;FXX=0.102551;HRUN=17;LEN=1;MLLD=139.277;QD=8.18619;RBI=0.0190929;REFB=0.000760924;REVB=-0.0183744;RO=40;SAF=11;SAR=16;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249626;STB=0.856369;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00271974;OID=.;OPOS=208199999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:70:40:51:27:19:0.271429:16:11:26:14:16:3:34:17
chr1	208207839	.	G	A,C	551.92	PASS	AF=0.947368,0.0526316;AO=35,2;DP=37;FAO=36,2;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=23,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468164,-0.0123821;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=89.6784,101.999;QD=58.0966;RBI=0.0786788,0.0178901;REFB=0,0;REVB=0.0632342,-0.0129127;RO=0;SAF=12,0;SAR=23,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00106701,0.0980843;OID=.,.;OPOS=208207839,208207839;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:37:38:0:0:35,2:36,2:0.947368,0.0526316:23,2:12,0:0:0:23,2:13,0:0:0
chr1	208252777	.	G	C	274.22	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0178857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.29;QD=24.9293;RBI=0.0206673;REFB=-0.0279057;REVB=0.0103556;RO=19;SAF=17;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170902;STB=0.595252;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0191567;OID=.;OPOS=208252777;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:8:17:9:10:8:17:9:10
chr1	208390086	.	G	C	328.02	PASS	AF=0.37;AO=37;DP=100;FAO=37;FDP=100;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=-0.00128295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.533;QD=13.1208;RBI=0.00252141;REFB=-0.0261051;REVB=-0.00217061;RO=63;SAF=25;SAR=12;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500329;STB=0.528685;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0351396;OID=.;OPOS=208390086;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:63:63:37:37:0.37:12:25:40:23:12:25:40:23
chr1	208391098	.	T	C	147.62	PASS	AF=0.345455;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0419046;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.035;QD=10.7363;RBI=0.0420147;REFB=-0.0158;REVB=-0.00304024;RO=36;SAF=10;SAR=9;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00163537;STB=0.500959;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0173097;OID=.;OPOS=208391098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:36:36:19:19:0.345455:9:10:19:17:9:10:19:17
chr1	208391254	.	C	T	48.21	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0089649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.241;QD=12.8565;RBI=0.0277846;REFB=-0.0266737;REVB=0.0262986;RO=7;SAF=1;SAR=6;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.52454;STB=0.838983;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0491314;OID=.;OPOS=208391254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:8:7:7:0.466667:6:1:5:2:6:1:6:2
chr1	209605636	.	TAGCAGCAGCAGC	T	97.83	PASS	AF=0.647059;AO=9;DP=11;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00326499;FXX=0.105208;HRUN=1;LEN=12;MLLD=253.419;QD=23.0192;RBI=0.00332827;REFB=0.0260371;REVB=-0.000645944;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.574334;STBP=0.43;TYPE=del;VARB=-0.0163163;OID=.;OPOS=209605637;OREF=AGCAGCAGCAGC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.647059:9:11:11:17:6:6:5:2:4:39:0:5:4:0:0
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chr1	209788703	.	T	C	375.95	PASS	AF=0.567164;AO=37;DP=68;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00267756;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.274;QD=22.445;RBI=0.028589;REFB=-0.0326185;REVB=-0.0284633;RO=31;SAF=22;SAR=15;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039184;STB=0.539187;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.015279;OID=.;OPOS=209788703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:31:29:37:38:0.567164:15:22:17:14:15:23:15:14
chr1	209791929	.	G	T	572.13	PASS	AF=0.429577;AO=61;DP=142;FAO=61;FDP=142;FR=.;FRO=81;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.00662657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.379;QD=16.1162;RBI=0.0332028;REFB=-0.00392309;REVB=-0.0325348;RO=81;SAF=25;SAR=36;SRF=41;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.099381;STB=0.555641;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00497663;OID=.;OPOS=209791929;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:81:81:61:61:0.429577:36:25:41:40:36:25:41:40
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chr1	209797253	.	T	C	79.21	PASS	AF=0.234043;AO=11;DP=47;FAO=11;FDP=47;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0457021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.577;QD=6.74085;RBI=0.0467505;REFB=-0.011034;REVB=-0.00984535;RO=36;SAF=4;SAR=7;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199465;STB=0.626228;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0431865;OID=.;OPOS=209797253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:47:47:36:36:11:11:0.234043:7:4:19:17:7:4:19:17
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chr1	209799253	.	A	G	561.82	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0483777;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8393;QD=60.7374;RBI=0.0618053;REFB=0;REVB=0.0384642;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000718024;OID=.;OPOS=209799253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr1	209800230	.	C	T	486.22	PASS	AF=0.418605;AO=53;DP=128;FAO=54;FDP=129;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=-0.0120013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.537;QD=15.0766;RBI=0.016735;REFB=-0.0216337;REVB=0.0116631;RO=75;SAF=28;SAR=25;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472241;STB=0.521278;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.018841;OID=.;OPOS=209800230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:129:75:75:53:54:0.418605:25:28:43:32:25:29:43:32
chr1	209807815	.	T	C	176.64	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.011458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4917;QD=14.1314;RBI=0.0219878;REFB=0.00221608;REVB=0.0187663;RO=31;SAF=11;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102072;STB=0.559259;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=-0.00476116;OID=.;OPOS=209807815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:8:11:15:16:8:11:15:16
chr1	209807972	.	G	A	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.00274912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.8694;QD=14.0964;RBI=0.00279746;REFB=-0.0274832;REVB=0.000517806;RO=14;SAF=9;SAR=2;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498728;STB=0.529356;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0401022;OID=.;OPOS=209807972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:2:9:11:3:2:9:11:3
chr1	209811886	.	T	G	39.15	PASS	AF=0.26087;AO=4;DP=24;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0531437;FXX=0.11534;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.771;QD=6.80881;RBI=0.0701056;REFB=-0.0377236;REVB=0.0457225;RO=18;SAF=3;SAR=1;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144429;STB=0.512777;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.108283;OID=.;OPOS=209811886;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:24:23:18:17:4:6:0.26087:1:3:15:3:1:5:14:3
chr1	209823354	.	G	A	244.08	PASS	AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0041895;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9933;QD=21.6958;RBI=0.0149406;REFB=-0.0140207;REVB=-0.0143411;RO=22;SAF=10;SAR=13;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572308;STB=0.532136;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0153033;OID=.;OPOS=209823354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:13:10:11:11:13:10:11:11
chr1	209849399	.	AG	A	76.42	PASS	AF=0.354839;AO=13;DP=37;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.032037;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.238;QD=9.86015;RBI=0.065105;REFB=-0.0146504;REVB=-0.0566771;RO=23;SAF=10;SAR=3;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340636;STB=0.657925;STBP=0.249;TYPE=del;VARB=0.0196447;OID=.;OPOS=209849400;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.354839:13:37:11:31:20:8:3:10:10:76:23:10:3:11:12
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chr1	209933528	.	G	A	263.5	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0364807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2532;QD=19.5188;RBI=0.0513125;REFB=-0.0280708;REVB=-0.0360851;RO=26;SAF=20;SAR=8;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267025;STB=0.649606;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0261731;OID=.;OPOS=209933528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:8:20:11:15:8:20:11:15
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chr1	209948711	.	A	C	89.56	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00800551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.46;QD=15.5759;RBI=0.0182516;REFB=-0.00732998;REVB=0.0164023;RO=12;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114818;STB=0.566257;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00674395;OID=.;OPOS=209948711;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:4:7:9:3:4:7:9:3
chr1	209950760	.	C	G	2664.35	PASS	AF=1;AO=171;DP=172;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024106;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.977;QD=62.3241;RBI=0.0459665;REFB=0;REVB=0.0391385;RO=0;SAF=81;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.28086e-05;OID=.;OPOS=209950760;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:172:171:0:0:171:171:1:90:81:0:0:90:81:0:0
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chr1	209968684	.	C	A	482.91	PASS	AF=0.490385;AO=51;DP=106;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=40;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.00935526;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.595;QD=18.5736;RBI=0.0116434;REFB=-0.0254756;REVB=-0.00693169;RO=53;SAF=40;SAR=11;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229303;STB=0.628217;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0221302;OID=.;OPOS=209968684;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:104:53:53:51:51:0.490385:11:40:31:22:11:40:31:22
chr1	210004199	.	C	G	275.07	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.00982718;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0085;QD=17.7467;RBI=0.0180836;REFB=0.0111292;REVB=-0.0151803;RO=32;SAF=12;SAR=18;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233444;STB=0.630488;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=-0.0120885;OID=.;OPOS=210004199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:18:12:21:11:18:12:21:11
chr1	210006603	.	C	T	284.14	PASS	AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.00272448;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=220.273;QD=15.3591;RBI=0.0152967;REFB=-0.0124339;REVB=0.0150521;RO=42;SAF=11;SAR=21;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298178;STB=0.668237;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0119359;OID=.;OPOS=210006603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:42:42:32:32:0.432432:21:11:27:15:21:11:27:15
chr1	210335028	.	T	C	116.9	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00465378;FXX=0.039984;HRUN=7;LEN=1;MLLD=119.363;QD=19.4832;RBI=0.0625035;REFB=-0.00770126;REVB=0.06233;RO=11;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582442;STB=0.533281;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.00946169;OID=.;OPOS=210335028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:24:24:11:11:13:13:0.541667:5:8:6:5:5:8:6:5
chr1	210335066	.	G	A	431.93	PASS	AF=0.56;AO=42;DP=75;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.00669477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.649;QD=23.0362;RBI=0.0097472;REFB=0.00535726;REVB=-0.00708434;RO=33;SAF=22;SAR=20;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115428;STB=0.563351;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.0032529;OID=.;OPOS=210335066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:33:33:42:42:0.56:20:22:22:11:20:22:22:11
chr1	210337043	.	A	G	246.21	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.159602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.8923;QD=46.8967;RBI=0.162461;REFB=0.0369296;REVB=0.0303429;RO=1;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438656;STB=0.523786;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0010261;OID=.;OPOS=210337043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:10:10:0:1:10:10:0:1
chr1	210407030	.	CG	CT,TT	693.38	PASS	AF=0.955556,0.0444444;AO=42,2;DP=45;FAO=43,2;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20,2;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271665,-0.0105343;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=101.727,114.332;QD=61.6341;RBI=0.0705701,0.0136242;REFB=0,0;REVB=0.0651315,-0.00863994;RO=0;SAF=20,2;SAR=22,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00136533,0.0420357;OID=.,.;OPOS=210407031,210407030;OREF=G,CG;OALT=T,TT;OMAPALT=CT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:45:45:0:0:42,2:43,2:0.955556,0.0444444:22,0:20,2:0:0:23,0:20,2:0:0
chr1	210547505	.	C	G	1434.44	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115159;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=297.663;QD=63.0525;RBI=0.0180597;REFB=0;REVB=0.0139117;RO=0;SAF=57;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22566e-05;OID=.;OPOS=210547505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:34:57:0:0:34:57:0:0
chr1	210547517	.	C	T	497.74	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=102;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=0.00838547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9789;QD=19.1437;RBI=0.0221891;REFB=-0.00754617;REVB=0.0205436;RO=52;SAF=30;SAR=20;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334264;STB=0.5102;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00733376;OID=.;OPOS=210547517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:104:52:52:50:52:0.5:20:30:33:19:20:32:33:19
chr1	210577873	.	G	C	1695.23	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00888828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.61;QD=60.5438;RBI=0.0257457;REFB=0;REVB=-0.0241628;RO=0;SAF=71;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.30501e-05;OID=.;OPOS=210577873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:41:71:0:0:41:71:0:0
chr1	210577884	.	G	A	400.23	PASS	AF=0.418182;AO=46;DP=110;FAO=46;FDP=110;FR=.;FRO=64;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=0.00240564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.561;QD=14.5538;RBI=0.0211731;REFB=-0.00564794;REVB=-0.021036;RO=63;SAF=29;SAR=17;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226062;STB=0.50638;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.00554909;OID=.;OPOS=210577884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:63:64:46:46:0.418182:17:29:41:22:17:29:41:23
chr1	210857457	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0975218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.987;QD=37.4885;RBI=0.0976189;REFB=0;REVB=0.00435304;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141922;OID=.;OPOS=210857457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr1	211380770	.	T	C	534.22	PASS	AF=0.459677;AO=56;DP=122;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=-0.00607176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.724;QD=17.2328;RBI=0.011485;REFB=-0.0221744;REVB=0.0097488;RO=66;SAF=36;SAR=20;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11449;STB=0.56132;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0270932;OID=.;OPOS=211380770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:124:66:67:56:57:0.459677:20:36:35:31:21:36:35:32
chr1	211447625	.	G	A	537.58	PASS	AF=0.42963;AO=58;DP=136;FAO=58;FDP=135;FR=.;FRO=77;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=-0.00303324;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8732;QD=15.9282;RBI=0.0219885;REFB=0.0103405;REVB=-0.0217783;RO=75;SAF=25;SAR=33;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129945;STB=0.57257;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.0162151;OID=.;OPOS=211447625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:135:75:77:58:58:0.42963:33:25:42:33:33:25:43:34
chr1	211836789	.	T	C	62.09	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.00416657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.569;QD=7.52635;RBI=0.00481814;REFB=-0.0152592;REVB=-0.00241954;RO=23;SAF=6;SAR=3;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072486;STB=0.533258;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0339834;OID=.;OPOS=211836789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:33:33:23:24:9:9:0.272727:3:6:14:9:3:6:15:9
chr1	211840498	.	T	C	271.7	PASS	AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0137198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.55;QD=20.8999;RBI=0.0147054;REFB=-0.0212844;REVB=-0.00529282;RO=24;SAF=14;SAR=14;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103816;STB=0.557652;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0195135;OID=.;OPOS=211840498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:24:28:28:0.538462:14:14:9:15:14:14:9:15
chr1	211846876	.	A	G	944.22	PASS	AF=1;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00151313;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8976;QD=59.0136;RBI=0.00727098;REFB=0;REVB=0.00711179;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000474648;OID=.;OPOS=211846876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:64:0:0:64:64:1:33:31:0:0:33:31:0:0
chr1	211922603	.	G	A	1265.27	PASS	AF=0.988095;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0303276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.895;QD=60.2508;RBI=0.0311944;REFB=-0.143187;REVB=0.00730258;RO=1;SAF=43;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108864;STB=0.505617;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000658816;OID=.;OPOS=211922603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:84:1:1:82:83:0.988095:39:43:1:0:39:44:1:0
chr1	212273639	.	C	T	950.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00882799;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.615;QD=58.4678;RBI=0.0113426;REFB=0;REVB=-0.00712186;RO=0;SAF=42;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000751449;OID=.;OPOS=212273639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:65:0:0:63:65:1:21:42:0:0:21:44:0:0
chr1	212274413	.	A	C	347.82	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0534334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.982;QD=51.5287;RBI=0.0540963;REFB=-0.164291;REVB=-0.00844281;RO=1;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343929;STB=0.518504;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00125247;OID=.;OPOS=212274413;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:13:13:0:1:13:13:0:1
chr1	212515613	.	C	T	208.32	PASS	AF=0.356164;AO=26;DP=73;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0642378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.417;QD=11.4146;RBI=0.0643937;REFB=-0.0048579;REVB=-0.00447798;RO=47;SAF=17;SAR=9;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187822;STB=0.609035;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0134561;OID=.;OPOS=212515613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:47:47:26:26:0.356164:9:17:23:24:9:17:23:24
chr1	212526288	.	C	T	767.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.731;QD=56.8472;RBI=0.0390578;REFB=0;REVB=-0.0253191;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92243e-06;OID=.;OPOS=212526288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:52:54:1:22:30:0:0:23:31:0:0
chr1	212534377	.	T	A	247.05	PASS	AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.00703436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.661;QD=24.7051;RBI=0.0288244;REFB=-0.0378658;REVB=0.0279528;RO=17;SAF=15;SAR=8;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459736;STB=0.525526;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.046123;OID=.;OPOS=212534377;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:17:17:23:23:0.575:8:15:12:5:8:15:12:5
chr1	212534448	.	T	C	205.16	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0762516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.144;QD=15.7816;RBI=0.0789024;REFB=-0.0124271;REVB=0.0202802;RO=29;SAF=13;SAR=10;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210125;STB=0.511935;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.0169565;OID=.;OPOS=212534448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:10:13:17:12:10:13:17:12
chr1	212560327	.	A	G	360.24	PASS	AF=0.964286;AO=25;DP=27;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0359858;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2515;QD=51.4622;RBI=0.0620984;REFB=0.0675771;REVB=0.0506086;RO=1;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711625;STB=0.533308;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00176967;OID=.;OPOS=212560327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:28:1:1:25:27:0.964286:6:19:0:1:7:20:0:1
chr1	212619339	.	T	C	279.32	PASS	AF=0.508475;AO=28;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0125461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.709;QD=18.9367;RBI=0.0150402;REFB=-0.0109313;REVB=-0.00829474;RO=29;SAF=20;SAR=8;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165419;STB=0.560934;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0164589;OID=.;OPOS=212619339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:28:30:0.508475:8:20:16:13:10:20:16:13
chr1	212788567	.	C	T	167.44	PASS	AF=0.333333;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.00666393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7494;QD=10.1477;RBI=0.0103087;REFB=0.00691425;REVB=-0.00786514;RO=44;SAF=13;SAR=9;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541762;STB=0.531672;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=-0.0158467;OID=.;OPOS=212788567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:44:44:22:22:0.333333:9:13:28:16:9:13:28:16
chr1	212798601	.	C	A	213.52	PASS	AF=0.512195;AO=20;DP=40;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00588866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180;QD=20.8315;RBI=0.009598;REFB=0.00860772;REVB=-0.00757926;RO=20;SAF=10;SAR=10;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511617;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=-0.0122337;OID=.;OPOS=212798601;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:20:20:20:21:0.512195:10:10:10:10:11:10:10:10
chr1	212799870	.	A	G	1348.41	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2978;QD=61.9957;RBI=0.0333029;REFB=0;REVB=-0.0268707;RO=0;SAF=61;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.56037e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144473;OID=.;OPOS=212799870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:87:0:0:85:87:1:24:61:0:0:25:62:0:0
chr1	212799949	.	C	T	363.02	PASS	AF=0.521127;AO=36;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.00327695;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.899;QD=20.4519;RBI=0.0428848;REFB=-0.0147123;REVB=-0.0427594;RO=34;SAF=20;SAR=16;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819927;STB=0.55175;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0165085;OID=.;OPOS=212799949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:34:34:36:37:0.521127:16:20:22:12:17:20:22:12
chr1	212870410	.	G	A	365.91	PASS	AF=0.6;AO=36;DP=60;FAO=36;FDP=60;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00505927;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=114.707;QD=24.3942;RBI=0.0133757;REFB=-0.0167525;REVB=-0.012382;RO=24;SAF=21;SAR=15;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122058;STB=0.567002;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0187197;OID=.;OPOS=212870410;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:24:24:36:36:0.6:15:21:10:14:15:21:10:14
chr1	212900487	.	A	G	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040206;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.647;QD=58.2395;RBI=0.0427421;REFB=0;REVB=0.0145039;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.33073e-05;OID=.;OPOS=212900487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0
chr1	212911836	.	T	C	446.0	PASS	AF=0.511628;AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0117579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.175;QD=20.7442;RBI=0.017838;REFB=-0.00121183;REVB=0.0134144;RO=41;SAF=20;SAR=24;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716164;STB=0.545434;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00159192;OID=.;OPOS=212911836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:41:42:44:44:0.511628:24:20:22:19:24:20:23:19
chr1	213009383	.	G	A	362.68	PASS	AF=0.528571;AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=-0.0170599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.712;QD=20.7245;RBI=0.021197;REFB=-0.0123981;REVB=-0.0125807;RO=32;SAF=10;SAR=27;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115912;STB=0.501465;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0114099;OID=.;OPOS=213009383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:32:33:37:37:0.528571:27:10:9:23:27:10:9:24
chr1	213068404	.	T	C	130.45	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.103;QD=43.4837;RBI=0.0284129;REFB=0;REVB=0.026299;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123604;OID=.;OPOS=213068404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr1	214492286	.	G	A	358.0	PASS	AF=0.506849;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.076491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7607;QD=19.6166;RBI=0.0775437;REFB=0.02299;REVB=0.0127337;RO=36;SAF=19;SAR=18;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187283;STB=0.603523;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.0222586;OID=.;OPOS=214492286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:36:36:37:37:0.506849:18:19:26:10:18:19:26:10
chr1	214542819	.	T	C	132.7	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0300422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8873;QD=15.1656;RBI=0.0372953;REFB=-0.00701431;REVB=0.0221;RO=20;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820866;STB=0.547465;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0127176;OID=.;OPOS=214542819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:7:8:9:11:7:8:9:11
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chr1	214571251	.	A	C	94.48	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.138953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9609;QD=20.9959;RBI=0.148118;REFB=0.0582257;REVB=0.0512947;RO=7;SAF=10;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.497773;STB=0.792976;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.0155549;OID=.;OPOS=214571251;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:1:10:3:4:1:10:3:4
chr1	214778910	.	G	A	124.15	PASS	AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00289773;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.604;QD=27.5881;RBI=0.00714943;REFB=-0.0162035;REVB=0.00653587;RO=4;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200337;STB=0.573803;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.00896306;OID=.;OPOS=214778910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:18:18:4:5:13:13:0.722222:6:7:4:0:6:7:4:1
chr1	214779031	.	C	A	324.4	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0473823;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.001;QD=28.2086;RBI=0.0657033;REFB=-0.013644;REVB=0.0455175;RO=18;SAF=15;SAR=13;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254147;STB=0.514009;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0112319;OID=.;OPOS=214779031;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:18:18:28:28:0.608696:13:15:9:9:13:15:9:9
chr1	214782129	.	G	A	58.62	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0141782;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=222.113;QD=14.6539;RBI=0.0174445;REFB=-0.0453745;REVB=0.0101632;RO=8;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108737;STB=0.564352;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0423335;OID=.;OPOS=214782129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:3:5:4:4:3:5:4:4
chr1	214787130	.	G	A	388.82	PASS	AF=0.59375;AO=38;DP=64;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=30;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.00848309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.7708;QD=24.3011;RBI=0.108758;REFB=0.00573833;REVB=-0.108426;RO=26;SAF=30;SAR=8;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625487;STB=0.534423;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-0.00420336;OID=.;OPOS=214787130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:26:26:38:38:0.59375:8:30:19:7:8:30:19:7
chr1	214811244	.	C	G	151.2	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0755368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4326;QD=20.1597;RBI=0.0794648;REFB=-0.0175866;REVB=-0.0246749;RO=14;SAF=5;SAR=11;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176743;STB=0.598847;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0172069;OID=.;OPOS=214811244;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:11:5:2:12:11:5:2:12
chr1	214813487	.	A	G	94.4	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=35;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0183332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.037;QD=10.4893;RBI=0.030471;REFB=-0.00678735;REVB=0.0243388;RO=24;SAF=4;SAR=7;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137716;STB=0.53056;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0177693;OID=.;OPOS=214813487;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:36:24:24:11:12:0.333333:7:4:9:15:8:4:9:15
chr1	214813782	.	A	G	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0354646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4986;QD=12.7822;RBI=0.0355655;REFB=-0.00130757;REVB=-0.00267695;RO=14;SAF=1;SAR=9;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467302;STB=0.786787;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00372336;OID=.;OPOS=214813782;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:9:1:6:8:9:1:6:8
chr1	214813941	.	C	G	95.27	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0309195;FXX=0.0832986;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.25;QD=17.3216;RBI=0.0351676;REFB=-0.00244484;REVB=-0.0167555;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197016;STB=0.593048;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.00120911;OID=.;OPOS=214813941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:24:22:10:11:11:11:0.5:7:4:6:4:7:4:6:5
chr1	214814571	.	C	T	105.86	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0133098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.626;QD=21.1727;RBI=0.0184799;REFB=-0.0186179;REVB=-0.0128201;RO=8;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.585362;STB=0.832777;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00414991;OID=.;OPOS=214814571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:2:10:0:8:2:10:0:8
chr1	214814733	.	T	G	85.72	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0237217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.552;QD=11.8239;RBI=0.0272007;REFB=-0.0190505;REVB=-0.0133101;RO=18;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307581;STB=0.683863;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0509256;OID=.;OPOS=214814733;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:3:8:8:10:3:8:8:10
chr1	214814778	.	G	A	153.43	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0311987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.639;QD=13.9481;RBI=0.0507169;REFB=-0.00700612;REVB=-0.0399856;RO=27;SAF=12;SAR=5;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285067;STB=0.666465;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0116897;OID=.;OPOS=214814778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:5:12:12:15:5:12:12:15
chr1	214814995	.	C	T	281.98	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0314368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.909;QD=22.5581;RBI=0.0700523;REFB=-0.0230267;REVB=-0.0626024;RO=23;SAF=16;SAR=10;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728211;STB=0.526296;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0180654;OID=.;OPOS=214814995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:23:24:26:26:0.52:10:16:16:7:10:16:16:8
chr1	214815916	.	T	C	121.58	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0171766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.593;QD=15.1969;RBI=0.0240106;REFB=-0.00542904;REVB=-0.0167772;RO=18;SAF=11;SAR=3;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411139;STB=0.74002;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0140867;OID=.;OPOS=214815916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:3:11:7:11:3:11:7:11
chr1	214816142	.	T	G	331.44	PASS	AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0161206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.399;QD=18.6728;RBI=0.0269976;REFB=-0.0217428;REVB=-0.0216563;RO=36;SAF=19;SAR=16;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391044;STB=0.521797;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0245501;OID=.;OPOS=214816142;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:36:36:35:35:0.492958:16:19:18:18:16:19:18:18
chr1	214816224	.	G	A	643.61	PASS	AF=0.557522;AO=63;DP=113;FAO=63;FDP=113;FR=.;FRO=50;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.000579052;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.03;QD=22.7828;RBI=0.0285602;REFB=-0.0394479;REVB=-0.0285543;RO=50;SAF=31;SAR=32;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04215;STB=0.523052;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0262657;OID=.;OPOS=214816224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:50:50:63:63:0.557522:32:31:22:28:32:31:22:28
chr1	214816297	.	A	G	242.55	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.012496;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.037;QD=14.9261;RBI=0.0157405;REFB=-0.0309824;REVB=-0.00957144;RO=37;SAF=13;SAR=15;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494606;STB=0.528033;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0310509;OID=.;OPOS=214816297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:15:13:19:18:15:13:19:18
chr1	214818215	.	G	A	123.26	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0120781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.605;QD=16.4347;RBI=0.0158811;REFB=-0.0108563;REVB=-0.0103116;RO=16;SAF=6;SAR=8;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112138;STB=0.564268;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.00831197;OID=.;OPOS=214818215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:8:6:5:11:8:6:5:11
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chr1	214819980	.	C	T	157.88	PASS	AF=0.548387;AO=16;DP=30;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00165701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.609;QD=20.3718;RBI=0.0386901;REFB=-0.0139935;REVB=-0.0386546;RO=13;SAF=15;SAR=1;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.556075;STB=0.823013;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0102003;OID=.;OPOS=214819980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:13:14:16:17:0.548387:1:15:7:6:1:16:8:6
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chr1	214820494	.	G	A	58.36	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.00344994;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.61;QD=11.1166;RBI=0.064784;REFB=-0.0224174;REVB=0.0646921;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243254;STB=0.587912;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0134052;OID=.;OPOS=214820494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:20:21:12:12:6:6:0.285714:1:5:8:4:1:5:9:3
chr1	214820524	.	T	C	35.94	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0294589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8411;QD=6.25129;RBI=0.0609132;REFB=-0.00330523;REVB=-0.0533159;RO=17;SAF=5;SAR=1;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206131;STB=0.637776;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00608602;OID=.;OPOS=214820524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:1:5:12:5:1:5:12:5
chr1	214826196	.	G	A	90.59	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0187975;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.99;QD=15.0987;RBI=0.0299671;REFB=-0.0277367;REVB=-0.0233384;RO=14;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250796;STB=0.50381;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0246739;OID=.;OPOS=214826196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:25:24:14:13:11:11:0.458333:6:5:6:8:6:5:6:7
chr1	214830617	.	A	G	244.27	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0107705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.502;QD=23.2639;RBI=0.0107906;REFB=-0.00614343;REVB=0.000657078;RO=19;SAF=16;SAR=7;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595207;STB=0.533304;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.00410604;OID=.;OPOS=214830617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:7:16:12:7:7:16:12:7
chr1	214837110	.	C	G	283.76	PASS	AF=0.555556;AO=29;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0312075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.035;QD=21.0191;RBI=0.0336572;REFB=-0.0141437;REVB=-0.0126056;RO=25;SAF=16;SAR=13;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109602;STB=0.545772;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0138217;OID=.;OPOS=214837110;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:24:29:30:0.555556:13:16:17:8:13:17:16:8
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chr1	216373416	.	A	C	135.06	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.034906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.776;QD=16.882;RBI=0.0351664;REFB=-0.0076243;REVB=0.00427168;RO=17;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104939;STB=0.559923;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0122085;OID=.;OPOS=216373416;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:9:6:5:12:9:6:5:12
chr1	216496947	.	G	A	373.01	PASS	AF=0.464286;AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.00197809;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.284;QD=17.7624;RBI=0.0141394;REFB=-0.00590205;REVB=-0.0140003;RO=45;SAF=10;SAR=29;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0913705;STB=0.551303;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.00652219;OID=.;OPOS=216496947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:45:45:39:39:0.464286:29:10:15:30:29:10:15:30
chr1	216592003	.	T	C	461.88	PASS	AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=-0.00792934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.86;QD=21.4826;RBI=0.00886514;REFB=-0.0164026;REVB=0.00396437;RO=41;SAF=19;SAR=26;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24238;STB=0.633445;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0144468;OID=.;OPOS=216592003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:26:19:29:12:26:19:29:12
chr1	216595306	.	C	T	413.96	PASS	AF=0.43;AO=43;DP=100;FAO=43;FDP=100;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=-0.00303716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.069;QD=16.5583;RBI=0.0203387;REFB=-0.00196369;REVB=-0.0201107;RO=56;SAF=29;SAR=14;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356282;STB=0.52726;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00153472;OID=.;OPOS=216595306;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:56:57:43:43:0.43:14:29:36:20:14:29:36:21
chr1	216692669	.	C	T	573.01	PASS	AF=0.731343;AO=49;DP=68;FAO=49;FDP=67;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=31;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0248753;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.363;QD=34.2093;RBI=0.0253695;REFB=-0.00171431;REVB=0.00498284;RO=17;SAF=18;SAR=31;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813061;STB=0.552844;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.000449784;OID=.;OPOS=216692669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:17:18:49:49:0.731343:31:18:9:8:31:18:10:8
chr1	217915324	.	C	T	184.83	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.0137237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.381;QD=18.4834;RBI=0.0235337;REFB=-0.0547642;REVB=-0.0191179;RO=21;SAF=9;SAR=10;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26503;STB=0.649205;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0299953;OID=.;OPOS=217915324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:10:9:16:5:10:9:16:5
chr1	217947738	.	G	A	1874.55	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.09;QD=61.4605;RBI=0.031816;REFB=0;REVB=0.0256097;RO=0;SAF=70;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0618e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7569e-05;OID=.;OPOS=217947738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:122:0:0:119:122:1:49:70:0:0:50:72:0:0
chr1	218520044	.	A	T	43.8	PASS	AF=0.133333;AO=18;DP=89;FAO=12;FDP=90;FR=.;FRO=78;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=-0.0218443;FXX=0.0109878;HRUN=6;LEN=1;MLLD=34.1232;QD=1.94673;RBI=0.0281505;REFB=-0.0150337;REVB=-0.017756;RO=65;SAF=16;SAR=2;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.584136;STB=0.893026;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.181927;OID=.;OPOS=218520044;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:89:90:65:78:18:12:0.133333:2:16:29:36:1:11:40:38
chr1	219383867	.	T	C	317.46	PASS	AF=0.892857;AO=25;DP=28;FAO=25;FDP=28;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00959337;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=225.033;QD=45.3519;RBI=0.0554063;REFB=-0.0836041;REVB=0.0545695;RO=3;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145562;STB=0.578882;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.000703383;OID=.;OPOS=219383867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:28:28:3:3:25:25:0.892857:8:17:0:3:8:17:0:3
chr1	219383905	.	A	G	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00638951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.098;QD=60.6103;RBI=0.0218578;REFB=0;REVB=0.020903;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.56572e-05;OID=.;OPOS=219383905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0
chr1	220087867	.	C	T	180.08	PASS	AF=0.353846;AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=-0.0288165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.107;QD=11.0817;RBI=0.0849955;REFB=-0.0155971;REVB=-0.0799615;RO=42;SAF=14;SAR=9;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158412;STB=0.591167;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0332257;OID=.;OPOS=220087867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:42:42:23:23:0.353846:9:14:31:11:9:14:31:11
chr1	220101267	.	GCCCT	GCCTC	152.87	PASS	AF=0.941176;AO=4;DP=18;FAO=16;FDP=17;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=1;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.142897;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=38.861;QD=35.9692;RBI=0.251252;REFB=-0.204617;REVB=0.206659;RO=3;SAF=4;SAR=0;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.74182;STB=0.555483;STBP=0.158;TYPE=mnp;VARB=0.100962;OID=.;OPOS=220101270;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=GCCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.941176:4:18:16:17:1:12:4:0:1:4:3:4:0:1:2
chr1	220136115	.	A	G	1447.79	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.077442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5096;QD=62.9473;RBI=0.0801912;REFB=0;REVB=0.0208172;RO=0;SAF=48;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000244123;OID=.;OPOS=220136115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:91:92:1:43:48:0:0:43:49:0:0
chr1	220197625	.	G	T	1094.2	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00861851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2294;QD=59.9564;RBI=0.0388657;REFB=0;REVB=0.0378981;RO=0;SAF=47;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160111;OID=.;OPOS=220197625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:25:47:0:0:25:48:0:0
chr1	220578892	.	AAACACACACACACACACACACACACACAC	AAACACACACACACACACACACACACA,AAACACACACACACACACACACACACAC,AACACACACACACACACACACACACAC	358.97	PASS	AF=0,1,0;AO=9,4,8;DP=25;FAO=0,26,0;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10,0;FSAR=0,16,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104335,0.116808,0.104133;FXX=0.0370233;HRUN=1,1,3;LEN=3,2,3;MLLD=181.243,195.144,180.262;QD=55.2266;RBI=0.134603,0.150602,0.129908;REFB=0,0,0;REVB=0.0850421,0.0950617,0.0776686;RO=0;SAF=8,0,2;SAR=1,4,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-5.58669e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0,0.00145533,0;OID=.,.,.;OPOS=220578919,220578894,220578893;OREF=CAC,AC,AAC;OALT=-,-,-;OMAPALT=AAACACACACACACACACACACACACA,AAACACACACACACACACACACACACAC,AACACACACACACACACACACACACAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1,0:9,4,8:25:0,26,0:26:0:0,10,0:0,16,0:0:0:4:0:8,0,2:1,4,6:0:0
chr1	220603310	.	TGTGA	AGAGA,T,TGTGT	101.71	PASS	AF=0.6,0.4,0;AO=4,2,7;DP=15;FAO=6,4,0;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6,0,0;FSAR=0,4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.202071,0.0138128,-0.00369691;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=3,4,1;MLLD=82.5597,59.7146,49.1644;QD=40.6838;RBI=0.229943,0.534224,0.12838;REFB=0,0,0;REVB=-0.109733,0.534045,0.128327;RO=0;SAF=4,1,1;SAR=0,1,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0.0109721,0.0221046,0;OID=.,.,.;OPOS=220603310,220603311,220603314;OREF=TGT,GTGA,A;OALT=AGA,-,T;OMAPALT=AGAGA,T,TGTGT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:22:15:10:0:0:4,2,7:6,4,0:0.6,0.4,0:0,1,6:4,1,1:0:0:0,4,0:6,0,0:0:0
chr1	220607685	.	G	A	787.61	PASS	AF=1;AO=46;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0413558;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6795;QD=64.2949;RBI=0.0456385;REFB=0;REVB=-0.0193021;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000399153;OID=.;OPOS=220607685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:46:49:1:25:21:0:0:28:21:0:0
chr1	220789355	.	ATTTTTTTA	AATTTTTAA,AATTTTTTA,ATTTTT,ATTTTTTA,ATTTTTTAA	413.05	PASS	AF=0.0625,0,0.270833,0.645833,0.0208333;AO=4,8,9,9,15;DP=63;FAO=3,0,13,31,1;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,8,15,1;FSAR=3,0,5,16,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.056868,-0.120684,-0.0710727,-0.12566,-0.043897;FXX=0.058812;HRUN=7,7,7,7,7;LEN=7,1,3,1,1;MLLD=15.005,7.28543,15.6703,10.2652,7.62731;QD=34.421;RBI=0.0597033,0.123444,0.0781499,0.135148,0.0520555;REFB=0,0,0,0,0;REVB=-0.01818,-0.0259566,0.0324973,0.0497445,-0.027979;RO=3;SAF=0,6,8,4,10;SAR=4,2,1,5,5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.705357,0.226465,0.387747,0.0496942,0.108364;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=mnp,snp,del,del,snp;VARB=0.0823507,-0.0327152,0.0383386,-0.0487424,0.0901566;OID=.,.,.,.,.;OPOS=220789356,220789356,220789361,220789356,220789362;OREF=TTTTTTT,T,TTA,T,T;OALT=ATTTTTA,A,-,-,A;OMAPALT=AATTTTTAA,AATTTTTTA,ATTTTT,ATTTTTTA,ATTTTTTAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	3/4:0.0625,0,0.270833,0.645833,0.0208333:4,8,9,9,15:63:3,0,13,31,1:48:0:0,0,8,15,1:3,0,5,16,0:0:0:69:3:0,6,8,4,10:4,2,1,5,5:1:2
chr1	220970028	.	A	C,G	1031.69	PASS	AF=0.0985915,0.901408;AO=7,64;DP=71;FAO=7,64;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=7,24;FSAR=0,40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0357221,0.00599255;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=141.36,59.0643;QD=58.1234;RBI=0.0359917,0.0193478;REFB=0,0;REVB=0.00439695,0.0183964;RO=0;SAF=7,24;SAR=0,40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.3845e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.191819,-0.00424713;OID=.,.;OPOS=220970028,220970028;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:29:71:71:0:0:7,64:7,64:0.0985915,0.901408:0,40:7,24:0:0:0,40:7,24:0:0
chr1	221055463	.	G	A	326.17	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0117226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.425;QD=20.072;RBI=0.0204489;REFB=-0.00532247;REVB=-0.0167552;RO=31;SAF=28;SAR=6;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21902;STB=0.622956;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0038489;OID=.;OPOS=221055463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:6:28:20:11:6:28:20:11
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chr1	221057662	.	G	A	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00219149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.55;QD=18.2512;RBI=0.0276883;REFB=-0.0307537;REVB=-0.0276014;RO=15;SAF=10;SAR=5;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182502;STB=0.604508;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.023151;OID=.;OPOS=221057662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:5:10:7:8:5:10:7:8
chr1	221509332	.	G	A	1117.22	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.622;QD=60.3902;RBI=0.0509038;REFB=0;REVB=0.0446134;RO=1;SAF=55;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270021;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.80959e-05;OID=.;OPOS=221509332;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:1:0:72:74:1:17:55:0:1:19:55:0:0
chr1	221912361	.	T	C	343.63	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0123781;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.182;QD=21.477;RBI=0.0128477;REFB=-0.00491051;REVB=-0.00344174;RO=28;SAF=20;SAR=15;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143386;STB=0.586617;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00656325;OID=.;OPOS=221912361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:28:29:35:35:0.546875:15:20:11:17:15:20:11:18
chr1	222649341	.	A	C	396.92	PASS	AF=1;AO=21;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8869;QD=56.7025;RBI=0.275291;REFB=0;REVB=0.274024;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00595337;OID=.;OPOS=222649341;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:21:28:1:7:14:0:0:14:14:0:0
chr1	222649491	.	C	G	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0969085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4519;QD=10.0339;RBI=0.109318;REFB=-0.0021739;REVB=-0.0505884;RO=7;SAF=1;SAR=4;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.569741;STB=0.847251;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.0121813;OID=.;OPOS=222649491;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:4:1:6:1:4:1:6:1
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chr1	222802803	.	T	G	114.06	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.00141875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.324;QD=18.2489;RBI=0.0174933;REFB=0.00117557;REVB=-0.0174356;RO=11;SAF=3;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216462;STB=0.610503;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.00110791;OID=.;OPOS=222802803;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:11:12:13:13:0.52:10:3:5:6:10:3:5:7
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chr1	222825403	.	G	A	114.06	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0386987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.277;QD=18.2489;RBI=0.0431341;REFB=0.00126281;REVB=-0.0190515;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205785;STB=0.616277;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.00284104;OID=.;OPOS=222825403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:8:5:2:10:8:5:2:10
chr1	222833601	.	T	C	1361.5	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00990836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.942;QD=61.1909;RBI=0.0112509;REFB=0.0687328;REVB=0.00532986;RO=1;SAF=52;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129808;STB=0.506848;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.000254099;OID=.;OPOS=222833601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:89:1:1:88:88:0.988764:36:52:0:1:36:52:0:1
chr1	222838216	.	C	T	95.51	PASS	AF=0.25;AO=11;DP=53;FAO=14;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00564199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.944;QD=6.82185;RBI=0.00763014;REFB=-0.019038;REVB=-0.00513683;RO=35;SAF=4;SAR=7;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15022;STB=0.517832;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.0532935;OID=.;OPOS=222838216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:53:56:35:42:11:14:0.25:7:4:17:18:7:7:22:20
chr1	222886119	.	A	G	937.57	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0750701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0056;QD=58.5984;RBI=0.0930414;REFB=0;REVB=-0.0549654;RO=0;SAF=42;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000853358;OID=.;OPOS=222886119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:22:42:0:0:22:42:0:0
chr1	222919895	.	T	G	115.79	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0141792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.582;QD=11.876;RBI=0.0337025;REFB=0.00333206;REVB=0.0305747;RO=25;SAF=3;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364743;STB=0.718031;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.004023;OID=.;OPOS=222919895;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:11:3:13:12:11:3:13:12
chr1	222923351	.	A	G	162.89	PASS	AF=0.261364;AO=23;DP=88;FAO=23;FDP=88;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.00360748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3313;QD=7.40399;RBI=0.00857477;REFB=0.00109832;REVB=-0.007779;RO=65;SAF=14;SAR=9;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143423;STB=0.58675;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=-0.00330969;OID=.;OPOS=222923351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:65:65:23:23:0.261364:9:14:32:33:9:14:32:33
chr1	223178561	.	A	C	429.18	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.607;QD=57.2243;RBI=0.0452287;REFB=0;REVB=0.0367951;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.19813e-05;OID=.;OPOS=223178561;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:16:13:0:0:17:13:0:0
chr1	223283910	.	A	G	816.71	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.74;QD=57.3132;RBI=0.0125752;REFB=0;REVB=0.00207433;RO=0;SAF=41;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.01624e-05;OID=.;OPOS=223283910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:15:41:0:0:16:41:0:0
chr1	223715248	.	GT	G	297.78	PASS	AF=0.573034;AO=47;DP=90;FAO=51;FDP=89;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=36;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.222539;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.8348;QD=13.3833;RBI=0.222564;REFB=0.0605103;REVB=-0.00328538;RO=30;SAF=12;SAR=35;SRF=5;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874665;STB=0.502391;STBP=0.96;TYPE=del;VARB=-0.0201829;OID=.;OPOS=223715249;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.573034:47:90:51:89:38:15:36:11:27:99:30:12:35:5:25
chr1	223717484	.	G	A	788.51	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138341;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6568;QD=57.3464;RBI=0.0422857;REFB=0;REVB=0.0399587;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190215;OID=.;OPOS=223717484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:53:55:1:30:23:0:0:32:23:0:0
chr1	223718651	.	G	A	285.97	PASS	AF=0.426667;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0138133;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.868;QD=15.2516;RBI=0.0140104;REFB=-0.0145629;REVB=0.0023418;RO=41;SAF=18;SAR=14;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746785;STB=0.529393;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0208293;OID=.;OPOS=223718651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:41:43:32:32:0.426667:14:18:20:21:14:18:22:21
chr1	223718670	.	G	A	267.37	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00183689;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.632;QD=15.9624;RBI=0.0231353;REFB=-0.010406;REVB=-0.0230623;RO=36;SAF=17;SAR=13;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650359;STB=0.529628;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0124684;OID=.;OPOS=223718670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:36:37:30:30:0.447761:13:17:18:18:13:17:19:18
chr1	223722780	.	G	A	167.07	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00719644;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.727;QD=12.8514;RBI=0.0352136;REFB=-0.00233106;REVB=-0.0344704;RO=32;SAF=13;SAR=7;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131882;STB=0.576534;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.00843051;OID=.;OPOS=223722780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:7:13:17:15:7:13:17:15
chr1	223813586	.	G	T	320.47	PASS	AF=0.595745;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.00507113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.6029;QD=27.2743;RBI=0.00550223;REFB=-0.0176001;REVB=-0.00213498;RO=19;SAF=9;SAR=19;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0970159;STB=0.553309;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0133376;OID=.;OPOS=223813586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:19:19:28:28:0.595745:19:9:4:15:19:9:4:15
chr1	223816383	.	G	A	33.76	PASS	AF=0.162162;AO=6;DP=37;FAO=6;FDP=37;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0468035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1416;QD=3.64927;RBI=0.0649735;REFB=-0.00639559;REVB=-0.0450664;RO=29;SAF=3;SAR=3;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102922;STB=0.594291;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0278272;OID=.;OPOS=223816383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:37:37:29:31:6:6:0.162162:3:3:12:17:3:3:12:19
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chr1	223877829	.	A	T	58.04	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0293682;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=244.719;QD=13.6565;RBI=0.0342719;REFB=-0.0165266;REVB=-0.0176655;RO=8;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128818;STB=0.620366;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0161536;OID=.;OPOS=223877829;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:9:8:8:0.470588:6:2:3:5:6:2:4:5
chr1	223900408	.	C	G	1008.39	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0292;QD=59.3168;RBI=0.039828;REFB=0;REVB=0.035856;RO=0;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257857;OID=.;OPOS=223900408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:28:40:0:0:28:40:0:0
chr1	223905532	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.3176;QD=50.4129;RBI=0.0317816;REFB=0;REVB=-0.0070095;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000464268;OID=.;OPOS=223905532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr1	223934720	.	G	A	1254.56	PASS	AF=0.965517;AO=83;DP=86;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00114467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.588;QD=57.6811;RBI=0.0316492;REFB=-0.0313191;REVB=-0.0316285;RO=3;SAF=44;SAR=39;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311989;STB=0.516125;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.000228726;OID=.;OPOS=223934720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:86:87:3:3:83:84:0.965517:39:44:3:0:39:45:3:0
chr1	223951841	.	T	C	1310.52	PASS	AF=0.988372;AO=84;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.017526;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.982;QD=60.9544;RBI=0.0350228;REFB=-0.0817033;REVB=0.0303222;RO=0;SAF=49;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504949;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000450574;OID=.;OPOS=223951841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:0:1:84:85:0.988372:35:49:0:0:35:50:1:0
chr1	224346959	.	G	A	416.09	PASS	AF=0.546667;AO=33;DP=73;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=-0.030083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.936;QD=22.1914;RBI=0.0323891;REFB=-0.0273556;REVB=-0.0120029;RO=29;SAF=21;SAR=12;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115792;STB=0.53964;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.017519;OID=.;OPOS=224346959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:75:29:34:33:41:0.546667:12:21:22:7:14:27:25:9
chr1	224492746	.	C	T	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.93;QD=60.2303;RBI=0.104107;REFB=0;REVB=-0.0971255;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000405814;OID=.;OPOS=224492746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:16:21:0:0:16:21:0:0
chr1	224495852	.	C	T	2023.49	PASS	AF=0.992481;AO=127;DP=129;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0566392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3031;QD=60.857;RBI=0.0859988;REFB=-0.0732658;REVB=-0.0647132;RO=2;SAF=63;SAR=64;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00011588;STB=0.503703;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00176885;OID=.;OPOS=224495852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:129:133:2:1:127:132:0.992481:64:63:1:1:67:65:0:1
chr1	224505570	.	T	A,TAA,TAAA	620.19	PASS	AF=0.097561,0.902439,0;AO=4,30,5;DP=42;FAO=4,37,0;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=0,19,0;FSAR=4,18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327258,-0.140569,-0.0952429;FXX=0.0238039;HRUN=1,2,2;LEN=1,2,3;MLLD=213.828,38.3274,23.1145;QD=60.5062;RBI=0.0387953,0.167351,0.112714;REFB=0,0,0;REVB=0.020835,0.0908109,0.060276;RO=2;SAF=0,14,5;SAR=4,16,0;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.725637,-0.00389373,0.749526;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,ins,ins;VARB=0.0632392,-0.00408464,0;OID=.,.,.;OPOS=224505570,224505571,224505571;OREF=T,-,-;OALT=A,AA,AAA;OMAPALT=A,TAA,TAAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:42:41:2:0:4,30,5:4,37,0:0.097561,0.902439,0:4,16,0:0,14,5:1:1:4,18,0:0,19,0:0:0
chr1	224517842	.	C	T	396.36	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.118239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.1712;QD=54.6698;RBI=0.138032;REFB=0;REVB=0.0712202;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00459371;OID=.;OPOS=224517842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:29:0:0:27:29:1:12:15:0:0:12:17:0:0
chr1	224575373	.	G	A	946.91	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00659904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.051;QD=58.2712;RBI=0.0701473;REFB=0;REVB=0.0698362;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016436;OID=.;OPOS=224575373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:26:38:0:0:27:38:0:0
chr1	225230608	.	C	T	923.14	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0187274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.578;QD=56.8083;RBI=0.0246747;REFB=-0.00699547;REVB=0.0160662;RO=0;SAF=47;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23474e-08;STB=0.505262;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0008986;OID=.;OPOS=225230608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:17:47:0:0:17:47:1:0
chr1	225266966	.	C	G	1138.28	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174793;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8446;QD=60.7082;RBI=0.0454192;REFB=0;REVB=-0.0419211;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156895;OID=.;OPOS=225266966;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:74:75:1:33:41:0:0:34:41:0:0
chr1	225268343	.	A	G	137.59	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0994322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.3286;QD=39.3123;RBI=0.106237;REFB=-0.0112209;REVB=0.0374114;RO=1;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394551;STB=0.521706;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00810489;OID=.;OPOS=225268343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:14:1:1:13:13:0.928571:11:2:0:1:11:2:0:1
chr1	225268346	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.574;QD=45.8067;RBI=0.0231023;REFB=0;REVB=0.0132453;RO=0;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.12889e-05;OID=.;OPOS=225268346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:11:2:0:0:12:2:0:0
chr1	225270409	.	A	T	289.5	PASS	AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0440506;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=164.686;QD=46.3206;RBI=0.0513083;REFB=-0.0671072;REVB=0.0263074;RO=1;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440445;STB=0.545415;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00299821;OID=.;OPOS=225270409;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:25:25:1:2:23:23:0.92:10:13:0:1:10:13:0:2
chr1	225273247	.	TG	T,TT	655.01	PASS	AF=0.0465116,0.953488;AO=7,36;DP=44;FAO=2,41;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=1,26;FSAR=1,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129059,0.0108808;FXX=0.0227221;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=187.189,199.351;QD=60.9308;RBI=0.0182644,0.0122015;REFB=0,0;REVB=-0.012924,0.00552143;RO=0;SAF=4,23;SAR=3,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.21415e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00813219,0.0047258;OID=.,.;OPOS=225273248,225273248;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0465116,0.953488:7,36:44:2,41:43:0:1,26:1,15:0:0:6:0:4,23:3,13:0:0
chr1	225328430	.	T	G	687.34	PASS	AF=0.7125;AO=57;DP=80;FAO=57;FDP=80;FR=.;FRO=23;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.054397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0858;QD=34.3667;RBI=0.196654;REFB=-0.0418744;REVB=0.188981;RO=22;SAF=39;SAR=18;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0260493;STB=0.518512;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0124164;OID=.;OPOS=225328430;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:22:23:57:57:0.7125:18:39:16:6:18:39:17:6
chr1	225328432	.	G	T	131.04	PASS	AF=0.240964;AO=20;DP=82;FAO=20;FDP=83;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=41;FSRR=22;FWDB=-0.0277976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9202;QD=6.31513;RBI=0.0759077;REFB=-0.0237277;REVB=-0.0706348;RO=62;SAF=18;SAR=2;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450145;STB=0.7851;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0695243;OID=.;OPOS=225328432;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:62:63:20:20:0.240964:2:18:40:22:2:18:41:22
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chr1	225528183	.	C	A	197.35	PASS	AF=0.42623;AO=21;DP=56;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0121129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.073;QD=12.9412;RBI=0.0122614;REFB=-0.0160175;REVB=-0.0019029;RO=35;SAF=11;SAR=10;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410746;STB=0.552691;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0195813;OID=.;OPOS=225528183;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:61:35:35:21:26:0.42623:10:11:17:18:11:15:17:18
chr1	225533684	.	A	G	412.77	PASS	AF=0.442308;AO=46;DP=104;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=0.00404573;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.279;QD=15.8759;RBI=0.0173383;REFB=-0.00232632;REVB=0.0168597;RO=58;SAF=30;SAR=16;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524182;STB=0.529399;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00319435;OID=.;OPOS=225533684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:58:58:46:46:0.442308:16:30:35:23:16:30:35:23
chr1	225534219	.	T	C	231.64	PASS	AF=0.421875;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00936461;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.766;QD=14.4773;RBI=0.0422727;REFB=-0.0117285;REVB=-0.0412224;RO=36;SAF=14;SAR=13;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655511;STB=0.528434;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.022998;OID=.;OPOS=225534219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:36:37:27:27:0.421875:13:14:21:15:13:14:21:16
chr1	225534348	.	G	A	194.91	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=21;FWDB=0.00964108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.355;QD=17.3255;RBI=0.032307;REFB=-0.0522475;REVB=-0.0308349;RO=25;SAF=5;SAR=15;SRF=4;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126442;STB=0.571363;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0608244;OID=.;OPOS=225534348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:15:5:4:21:15:5:4:21
chr1	225565015	.	T	C	1017.08	PASS	AF=0.959459;AO=67;DP=72;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0132246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9453;QD=54.9771;RBI=0.0153764;REFB=-0.0293497;REVB=-0.00784492;RO=2;SAF=42;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219715;STB=0.501436;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.00246816;OID=.;OPOS=225565015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:72:74:2:3:67:71:0.959459:25:42:2:0:26:45:2:1
chr1	225565073	.	C	T	1075.54	PASS	AF=0.973333;AO=73;DP=76;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00663336;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.479;QD=57.3622;RBI=0.0257853;REFB=0.00186877;REVB=0.0249174;RO=2;SAF=43;SAR=30;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214917;STB=0.511361;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-4.11396e-05;OID=.;OPOS=225565073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:76:75:2:2:73:73:0.973333:30:43:2:0:30:43:2:0
chr1	225569241	.	T	A,G	1250.93	PASS	AF=0.0777778,0.877778;AO=7,79;DP=90;FAO=7,79;FDP=90;FR=.;FRO=4;FSAF=0,45;FSAR=7,34;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00814019,0.00891383;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=173.656,220.579;QD=55.597;RBI=0.0249633,0.039218;REFB=-0.146134,-0.133897;REVB=0.0235988,0.0381916;RO=2;SAF=0,45;SAR=7,34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0270302;STB=0.5,0.527771;STBP=1,0.042;TYPE=snp,snp;VARB=0.0627738,0.000151254;OID=.,.;OPOS=225569241,225569241;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:25:90:90:2:4:7,79:7,79:0.0777778,0.877778:7,34:0,45:0:2:7,34:0,45:0:4
chr1	225601646	.	AC	A,AT	187.53	PASS	AF=0.1875,0.8125;AO=2,14;DP=16;FAO=3,13;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=1,6;FSAR=2,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622511,0.0368782;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=139.735,154.205;QD=46.8816;RBI=0.0630567,0.0494139;REFB=0,0;REVB=0.010047,0.0328896;RO=0;SAF=0,7;SAR=2,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0313099,-0.00434963;OID=.,.;OPOS=225601647,225601647;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.1875,0.8125:2,14:16:3,13:16:0:1,6:2,7:0:0:12:0:0,7:2,7:0:0
chr1	225607144	.	C	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.604;QD=57.1771;RBI=0.016996;REFB=0;REVB=-0.00135209;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31099e-05;OID=.;OPOS=225607144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:29:22:0:0:29:22:0:0
chr1	225609884	.	A	G	1868.36	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00265443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.732;QD=61.2577;RBI=0.0111784;REFB=0;REVB=0.0108587;RO=0;SAF=53;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.16236e-06;OID=.;OPOS=225609884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:122:0:0:118:122:1:65:53:0:0:67:55:0:0
chr1	225611661	.	C	T	1396.73	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.755;QD=62.7744;RBI=0.0429388;REFB=0;REVB=-0.014375;RO=0;SAF=51;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.10986e-05;OID=.;OPOS=225611661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:37:51:0:0:38:51:0:0
chr1	225682560	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00664767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.177;QD=51.1841;RBI=0.00772845;REFB=0;REVB=-0.00394175;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.46279e-05;OID=.;OPOS=225682560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr1	226019653	.	G	A	197.7	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00583401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.803;QD=18.8287;RBI=0.0105161;REFB=-0.00908419;REVB=-0.00874943;RO=22;SAF=9;SAR=11;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170758;STB=0.596603;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0102228;OID=.;OPOS=226019653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:11:9:14:8:11:9:14:8
chr1	226026406	.	A	AC,G	263.74	PASS	AF=0.153846,0.730769;AO=4,19;DP=28;FAO=4,19;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=0,3;FSAR=4,16;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0228288,0.0280954;FXX=0.0714031;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=26.3304,232.757;QD=40.5757;RBI=0.0387208,0.030612;REFB=0.0268745,-0.0549026;REVB=0.0312754,0.012155;RO=4;SAF=0,3;SAR=4,16;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.719948,-0.175466;STB=0.995652,0.542326;STBP=0.213,0.545;TYPE=ins,snp;VARB=0.0865546,0.0128997;OID=.,.;OPOS=226026407,226026406;OREF=-,A;OALT=C,G;OMAPALT=AC,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:22:28:26:4:3:4,19:4,19:0.153846,0.730769:4,16:0,3:2:2:4,16:0,3:1:2
chr1	226032229	.	C	T	237.69	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.00497209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.531;QD=18.6424;RBI=0.00510302;REFB=-0.0284371;REVB=-0.00114853;RO=25;SAF=21;SAR=4;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119297;STB=0.590713;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.031747;OID=.;OPOS=226032229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:26:25:25:0.490196:4:21:19:6:4:21:19:7
chr1	226034909	.	G	A	252.63	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0032823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.102;QD=21.0528;RBI=0.0140361;REFB=-0.0477239;REVB=-0.0136469;RO=24;SAF=13;SAR=11;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037479;STB=0.521035;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0437271;OID=.;OPOS=226034909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:11:13:14:10:11:13:14:10
chr1	226055595	.	G	A	294.1	PASS	AF=0.619048;AO=25;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00761045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1958;QD=28.0092;RBI=0.0275046;REFB=-0.0870512;REVB=0.0264308;RO=16;SAF=9;SAR=16;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147644;STB=0.569234;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0222728;OID=.;OPOS=226055595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:16:16:25:26:0.619048:16:9:9:7:16:10:9:7
chr1	226352498	.	T	G	1146.27	PASS	AF=0.880435;AO=62;DP=92;FAO=81;FDP=92;FR=.;FRO=11;FSAF=51;FSAR=30;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0409859;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=239.693;QD=49.8376;RBI=0.0424335;REFB=-0.0654424;REVB=0.010989;RO=0;SAF=42;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510727;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.00112537;OID=.;OPOS=226352498;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:92:92:0:11:62:81:0.880435:20:42:0:0:30:51:6:5
chr1	226474132	.	G	A	1138.97	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233392;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.95;QD=60.7453;RBI=0.0245463;REFB=0;REVB=-0.00760274;RO=0;SAF=23;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.05939e-05;OID=.;OPOS=226474132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:51:23:0:0:50:25:0:0
chr1	226570840	.	T	C	278.65	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00355536;FXX=0.039984;HRUN=6;LEN=1;MLLD=127.341;QD=46.4408;RBI=0.00373537;REFB=0.015493;REVB=-0.00114562;RO=1;SAF=17;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837163;STB=0.583252;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.000211284;OID=.;OPOS=226570840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:24:24:1:2:22:22:0.916667:5:17:0:1:5:17:0:2
chr1	226573364	.	A	G	117.28	PASS	AF=0.378378;AO=13;DP=36;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0023706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.559;QD=12.6792;RBI=0.0173052;REFB=-0.010254;REVB=0.017142;RO=23;SAF=4;SAR=9;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404072;STB=0.745931;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0263759;OID=.;OPOS=226573364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:23:23:13:14:0.378378:9:4:16:7:10:4:16:7
chr1	226589833	.	T	C	51.55	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00095441;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.877;QD=18.7441;RBI=0.00095441;REFB=-0.0391489;REVB=0;RO=4;SAF=7;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0130972;OID=.;OPOS=226589833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:0:7:4:0:0:7:4:0
chr1	226613233	.	T	C	70.78	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0064087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.296;QD=7.2598;RBI=0.0100388;REFB=-0.00331649;REVB=0.00772695;RO=29;SAF=5;SAR=5;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613067;STB=0.538385;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.00500258;OID=.;OPOS=226613233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:5:5:16:13:5:5:16:13
chr1	226613287	.	A	G	379.86	PASS	AF=0.966667;AO=18;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.131943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.728;QD=50.6484;RBI=0.201179;REFB=-0.0810182;REVB=0.151868;RO=1;SAF=12;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367456;STB=0.518506;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00228035;OID=.;OPOS=226613287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:30:30:1:1:18:29:0.966667:6:12:1:0:16:13:1:0
chr1	226923505	.	G	T	710.01	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000902903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.202;QD=54.6162;RBI=0.0212117;REFB=-0.015102;REVB=0.0211924;RO=1;SAF=24;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192158;STB=0.5102;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.000270708;OID=.;OPOS=226923505;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:27:24:1:0:27:24:1:0
chr1	226923938	.	A	C	626.11	PASS	AF=0.512195;AO=63;DP=123;FAO=63;FDP=123;FR=.;FRO=60;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.0440879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.785;QD=20.3614;RBI=0.0456785;REFB=-0.011582;REVB=-0.0119493;RO=60;SAF=38;SAR=25;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785101;STB=0.543274;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00938315;OID=.;OPOS=226923938;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:60:60:63:63:0.512195:25:38:31:29:25:38:31:29
chr1	226924642	.	C	T	170.32	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=0.0286984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9865;QD=17.0322;RBI=0.114861;REFB=-0.0214437;REVB=0.111218;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=19;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318032;STB=0.678196;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0389008;OID=.;OPOS=226924642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:8:10:19:3:8:10:19:3
chr1	227069677	.	T	C	709.11	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.092;QD=63.0315;RBI=0.0334845;REFB=0;REVB=0.0261624;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.33116e-05;OID=.;OPOS=227069677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:22:23:0:0
chr1	227069737	.	C	T	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.178;QD=54.5177;RBI=0.0476696;REFB=0;REVB=0.0149115;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247594;OID=.;OPOS=227069737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr1	227071525	.	C	T	726.4	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00433402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.599;QD=63.1654;RBI=0.00434751;REFB=0;REVB=-0.000342204;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.36965e-05;OID=.;OPOS=227071525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr1	227172290	.	C	T	347.35	PASS	AF=0.514286;AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00637913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6878;QD=19.8487;RBI=0.0131959;REFB=-0.00775244;REVB=0.0115515;RO=34;SAF=19;SAR=17;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0532475;STB=0.529536;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.00678416;OID=.;OPOS=227172290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:34:34:36:36:0.514286:17:19:20:14:17:19:20:14
chr1	227174210	.	T	C	533.17	PASS	AF=0.543478;AO=50;DP=92;FAO=50;FDP=92;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0059497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.483;QD=23.1815;RBI=0.0248931;REFB=-0.0126433;REVB=0.0241716;RO=41;SAF=17;SAR=33;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1082;STB=0.566299;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00890723;OID=.;OPOS=227174210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:41:42:50:50:0.543478:33:17:19:22:33:17:20:22
chr1	227177542	.	G	A	216.21	PASS	AF=0.492537;AO=20;DP=69;FAO=33;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0178095;FXX=0.0289813;HRUN=6;LEN=1;MLLD=17.9652;QD=12.9082;RBI=0.0578663;REFB=-0.0187979;REVB=0.0550576;RO=21;SAF=14;SAR=6;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334495;STB=0.652968;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0294688;OID=.;OPOS=227177542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:67:21:33:20:33:0.492537:6:14:7:14:11:22:12:21
chr1	227177731	.	A	T	238.25	PASS	AF=0.349398;AO=30;DP=84;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.00431775;FXX=0.0119033;HRUN=5;LEN=1;MLLD=262.814;QD=11.4821;RBI=0.0127383;REFB=-0.0168704;REVB=0.0119842;RO=54;SAF=20;SAR=10;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172615;STB=0.592655;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.026405;OID=.;OPOS=227177731;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:54:54:30:29:0.349398:10:20:28:26:10:19:28:26
chr1	227178127	.	A	G	138.91	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.02058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.247;QD=19.8437;RBI=0.0335885;REFB=-0.00144627;REVB=0.0265452;RO=13;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00420983;STB=0.502389;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00159735;OID=.;OPOS=227178127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:8:7:6:7:8:7:6:7
chr1	227178948	.	G	A	472.33	PASS	AF=0.878049;AO=34;DP=40;FAO=36;FDP=41;FR=.;FRO=5;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0489742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2381;QD=46.0811;RBI=0.0803081;REFB=0.00040336;REVB=-0.0636468;RO=5;SAF=19;SAR=15;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382073;STB=0.515595;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.000771698;OID=.;OPOS=227178948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:40:41:5:5:34:36:0.878049:15:19:2:3:17:19:2:3
chr1	227178962	.	T	C	104.79	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00962805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.16;QD=10.748;RBI=0.0156254;REFB=-0.00569374;REVB=-0.0123067;RO=25;SAF=7;SAR=6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239501;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00899457;OID=.;OPOS=227178962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:26:13:13:0.333333:6:7:14:11:6:7:14:12
chr1	227182033	.	G	A	312.07	PASS	AF=0.96;AO=18;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0357651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.298;QD=49.9305;RBI=0.0800841;REFB=-0.0261603;REVB=0.0716542;RO=1;SAF=11;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399301;STB=0.519983;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000852728;OID=.;OPOS=227182033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:18:24:0.96:7:11:1:0:12:12:1:0
chr1	227182575	.	A	G	882.29	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8767;QD=57.8548;RBI=0.0247331;REFB=0;REVB=-0.00128816;RO=0;SAF=20;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.03236e-05;OID=.;OPOS=227182575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:40:20:0:0:40:21:0:0
chr1	227216662	.	T	C	897.1	PASS	AF=0.928571;AO=64;DP=70;FAO=65;FDP=70;FR=.;FRO=5;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0137492;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.6175;QD=51.2628;RBI=0.0567489;REFB=-0.084177;REVB=0.0550581;RO=6;SAF=36;SAR=28;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102314;STB=0.512278;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00373672;OID=.;OPOS=227216662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:70:70:6:5:64:65:0.928571:28:36:3:3:28:37:2:3
chr1	227216775	.	C	T	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0060993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.315;QD=57.7122;RBI=0.00720945;REFB=0;REVB=0.00384378;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.10145e-05;OID=.;OPOS=227216775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0
chr1	227300599	.	T	A	135.08	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0117996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.343;QD=16.885;RBI=0.0163377;REFB=-0.00699371;REVB=0.0113;RO=16;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265245;STB=0.63811;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0137859;OID=.;OPOS=227300599;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:17:15:15:0.46875:5:10:6:10:5:10:7:10
chr1	227504794	.	T	C	518.42	PASS	AF=0.538462;AO=49;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0069562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.538;QD=22.7875;RBI=0.00696346;REFB=-0.00481459;REVB=0.000317888;RO=42;SAF=26;SAR=23;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143282;STB=0.507883;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00416037;OID=.;OPOS=227504794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:42:42:49:49:0.538462:23:26:23:19:23:26:23:19
chr1	227681475	.	T	C	2247.46	PASS	AF=1;AO=132;DP=134;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0782082;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.664;QD=61.1553;RBI=0.138392;REFB=-0.0543786;REVB=0.114175;RO=1;SAF=68;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00736893;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00354102;OID=.;OPOS=227681475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:147:1:0:132:147:1:64:68:0:1:65:82:0:0
chr1	227935762	.	G	A	423.76	PASS	AF=0.525;AO=42;DP=80;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0477318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9463;QD=21.1879;RBI=0.0501554;REFB=-0.0207902;REVB=-0.0154024;RO=37;SAF=19;SAR=23;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165277;STB=0.584476;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.019228;OID=.;OPOS=227935762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:37:38:42:42:0.525:23:19:24:13:23:19:24:14
chr1	227947155	.	C	T	195.1	PASS	AF=0.380952;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0491456;FXX=0.0156226;HRUN=5;LEN=1;MLLD=177.281;QD=12.3875;RBI=0.0502801;REFB=0.000508096;REVB=0.0106209;RO=38;SAF=13;SAR=11;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183213;STB=0.596252;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=-0.000542687;OID=.;OPOS=227947155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:38:39:24:24:0.380952:11:13:14:24:11:13:15:24
chr1	228033197	.	A	G	909.66	PASS	AF=0.984375;AO=64;DP=65;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00422938;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1156;QD=56.8535;RBI=0.0304212;REFB=-0.0422046;REVB=0.0301257;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000851695;OID=.;OPOS=228033197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:64:0:1:64:63:0.984375:28:36:0:0:28:35:1:0
chr1	228033272	.	C	T	296.21	PASS	AF=0.339286;AO=36;DP=109;FAO=38;FDP=112;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=35;FWDB=0.00105966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.086;QD=10.579;RBI=0.0211992;REFB=-0.0255957;REVB=-0.0211727;RO=71;SAF=25;SAR=11;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226081;STB=0.631025;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0465747;OID=.;OPOS=228033272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:112:71:74:36:38:0.339286:11:25:36:35:11:27:39:35
chr1	228328049	.	C	T	52.92	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00108636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=384.701;QD=21.1692;RBI=0.00108636;REFB=-0.0141506;REVB=0;RO=3;SAF=7;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00747043;OID=.;OPOS=228328049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:0:7:3:0:0:7:3:0
chr1	228347352	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212656;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.8;QD=44.6898;RBI=0.0237305;REFB=0;REVB=0.0105313;RO=0;SAF=12;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.06713e-05;OID=.;OPOS=228347352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:1:12:0:0:1:12:0:0
chr1	228352160	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.849;QD=52.6123;RBI=0.0873476;REFB=0;REVB=0.086032;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000744333;OID=.;OPOS=228352160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0
chr1	228391808	.	G	T	505.42	PASS	AF=0.44;AO=55;DP=126;FAO=55;FDP=125;FR=.;FRO=70;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=-0.0296792;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0619;QD=16.1733;RBI=0.0404622;REFB=-0.00490262;REVB=-0.0275016;RO=70;SAF=34;SAR=21;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149355;STB=0.583574;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.00957724;OID=.;OPOS=228391808;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:125:70:70:55:55:0.44:21:34:33:37:21:34:33:37
chr1	228399482	.	C	G	1198.65	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0132874;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.308;QD=59.9324;RBI=0.0221277;REFB=-0.123839;REVB=0.017694;RO=0;SAF=60;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504131;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00053039;OID=.;OPOS=228399482;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:80:0:1:79:79:0.9875:19:60:0:0:19:60:1:0
chr1	228399766	.	T	C	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.605;QD=57.6805;RBI=0.0388584;REFB=0;REVB=0.0301417;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125055;OID=.;OPOS=228399766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr1	228402047	.	A	G	2335.78	PASS	AF=0.993548;AO=151;DP=154;FAO=154;FDP=155;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00361051;FXX=0.00640985;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3699;QD=60.2783;RBI=0.0403572;REFB=0.035968;REVB=-0.0401954;RO=1;SAF=77;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0061376;STB=0.503144;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-0.000368846;OID=.;OPOS=228402047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:154:155:1:1:151:154:0.993548:74:77:1:0:75:79:1:0
chr1	228402121	.	A	G	1795.56	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0765321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.999;QD=60.8665;RBI=0.0765348;REFB=0;REVB=0.00064542;RO=0;SAF=56;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.03539e-05;OID=.;OPOS=228402121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:118:0:0:117:118:1:61:56:0:0:62:56:0:0
chr1	228444565	.	T	A	436.1	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.28;QD=56.2707;RBI=0.0578293;REFB=0;REVB=0.0496366;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350397;OID=.;OPOS=228444565;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:31:0:0:29:31:1:18:11:0:0:20:11:0:0
chr1	228461129	.	A	G	245.32	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0157012;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9633;QD=22.302;RBI=0.0261359;REFB=0.00652054;REVB=0.0208939;RO=21;SAF=8;SAR=15;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195315;STB=0.609659;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.0124453;OID=.;OPOS=228461129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:21:21:23:23:0.522727:15:8:12:9:15:8:12:9
chr1	228464248	.	T	G	236.86	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00547479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.093;QD=19.7386;RBI=0.0116618;REFB=-0.0251173;REVB=-0.0102968;RO=25;SAF=12;SAR=11;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035428;STB=0.519983;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0272741;OID=.;OPOS=228464248;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:11:12:14:11:11:12:14:11
chr1	228464276	.	T	C	152.5	PASS	AF=0.386364;AO=16;DP=43;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0142443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.487;QD=13.8637;RBI=0.0143195;REFB=-0.0209438;REVB=0.00146487;RO=27;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740772;STB=0.562091;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0296886;OID=.;OPOS=228464276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:27:27:16:17:0.386364:7:9:17:10:8:9:17:10
chr1	228467711	.	G	A	651.07	PASS	AF=0.461039;AO=70;DP=149;FAO=71;FDP=154;FR=.;FRO=83;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=47;FWDB=0.00727583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.698;QD=16.9109;RBI=0.00884021;REFB=-0.0507312;REVB=-0.00502111;RO=78;SAF=36;SAR=34;SRF=35;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623333;STB=0.539463;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0440565;OID=.;OPOS=228467711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:154:78:83:70:71:0.461039:34:36:35:43:35:36:36:47
chr1	228468244	.	G	A	428.2	PASS	AF=0.525;AO=42;DP=80;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0356631;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0018;QD=21.4102;RBI=0.0488655;REFB=0.0629947;REVB=0.0334062;RO=34;SAF=24;SAR=18;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634262;STB=0.503648;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=-0.0251781;OID=.;OPOS=228468244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:34:38:42:42:0.525:18:24:22:12:18:24:22:16
chr1	228469821	.	G	A	482.89	PASS	AF=0.490385;AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.00532939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.423;QD=18.5728;RBI=0.00699567;REFB=-0.00536612;REVB=-0.00453178;RO=52;SAF=29;SAR=22;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631149;STB=0.540083;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00678329;OID=.;OPOS=228469821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:52:53:51:51:0.490385:22:29:26:26:22:29:26:27
chr1	228469870	.	C	T	479.07	PASS	AF=0.494624;AO=45;DP=94;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0296083;FXX=0.0510152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.698;QD=20.6049;RBI=0.0302434;REFB=-0.0308671;REVB=0.00616529;RO=43;SAF=28;SAR=17;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121374;STB=0.561577;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0355586;OID=.;OPOS=228469870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:43:47:45:46:0.494624:17:28:21:22:18:28:23:24
chr1	228469903	.	AG	TT	309.96	PASS	AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0145434;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=209.583;QD=18.7852;RBI=0.0203137;REFB=-0.00869948;REVB=-0.0141822;RO=33;SAF=17;SAR=16;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814091;STB=0.545344;STBP=0.507;TYPE=mnp;VARB=0.00963867;OID=.;OPOS=228469903;OREF=AG;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:33:33:33:33:0.5:16:17:14:19:16:17:14:19
chr1	228476366	.	GA	TT	77.38	PASS	AF=0.434783;AO=8;DP=21;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0339397;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=125.589;QD=13.4577;RBI=0.0492862;REFB=-0.0466683;REVB=0.0357383;RO=13;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16722;STB=0.548295;STBP=0.759;TYPE=mnp;VARB=0.106027;OID=.;OPOS=228476366;OREF=GA;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:21:23:13:13:8:10:0.434783:3:5:10:3:3:7:10:3
chr1	228476414	.	GGC	ACG,AGC	171.68	PASS	AF=0,0.461538;AO=2,9;DP=41;FAO=0,18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=0,10;FSAR=0,8;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00100448,0.00894787;FXX=0.0487686;HRUN=2,2;LEN=3,1;MLLD=114.121,113.663;QD=17.6086;RBI=0.0369277,0.0110674;REFB=-0.0563301,-0.0732564;REVB=-0.0369141,-0.00651324;RO=13;SAF=0,7;SAR=2,2;SRF=12;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.778926,-0.249493;STB=0.5,0.508661;STBP=1,0.93;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0261524;OID=.,.;OPOS=228476414,228476414;OREF=GGC,G;OALT=ACG,A;OMAPALT=ACG,AGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:41:39:13:21:2,9:0,18:0,0.461538:2,2:0,7:12:1:0,8:0,10:12:9
chr1	228480282	.	A	G	151.52	PASS	AF=0.361702;AO=16;DP=46;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0133857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.424;QD=12.8954;RBI=0.0141793;REFB=-0.00429062;REVB=0.00467705;RO=30;SAF=8;SAR=8;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036845;STB=0.50251;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.00690388;OID=.;OPOS=228480282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:30:30:16:17:0.361702:8:8:16:14:8:9:16:14
chr1	228494696	.	G	A	455.35	PASS	AF=0.54321;AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00108663;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.915;QD=22.4863;RBI=0.0132389;REFB=-0.0419813;REVB=0.0131942;RO=38;SAF=27;SAR=17;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758053;STB=0.534638;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0375344;OID=.;OPOS=228494696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:38:37:44:44:0.54321:17:27:20:18:17:27:20:17
chr1	228503677	.	A	G	289.59	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0231887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.251;QD=18.9894;RBI=0.0924322;REFB=-0.0337006;REVB=-0.0894763;RO=30;SAF=19;SAR=12;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188389;STB=0.605027;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0347149;OID=.;OPOS=228503677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:12:19:12:18:12:19:12:18
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chr1	228505204	.	G	A	387.32	PASS	AF=0.584615;AO=37;DP=65;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=23;FWDB=0.00637628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1927;QD=23.8352;RBI=0.0436739;REFB=-0.0390361;REVB=0.0432059;RO=26;SAF=26;SAR=11;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405142;STB=0.716425;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.024094;OID=.;OPOS=228505204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:26:27:37:38:0.584615:11:26:4:22:12:26:4:23
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chr1	228505750	.	C	T	218.59	PASS	AF=0.469388;AO=20;DP=47;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=0.00234473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.1412;QD=17.8438;RBI=0.0189005;REFB=-0.00225382;REVB=0.0187544;RO=25;SAF=5;SAR=15;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013082;STB=0.5103;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0102853;OID=.;OPOS=228505750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:25:26:20:23:0.469388:15:5:6:19:18:5:6:20
chr1	228509427	.	A	G	387.07	PASS	AF=0.481928;AO=38;DP=79;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=-0.0558627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.6839;QD=18.6538;RBI=0.0561352;REFB=-0.0335422;REVB=0.00552452;RO=41;SAF=19;SAR=19;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1479;STB=0.602461;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.028793;OID=.;OPOS=228509427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:83:41:43:38:40:0.481928:19:19:27:14:21:19:29:14
chr1	228509589	.	G	A	991.42	PASS	AF=0.513228;AO=97;DP=189;FAO=97;FDP=189;FR=.;FRO=92;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=66;FSRR=26;FWDB=-0.0106754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2684;QD=20.9824;RBI=0.0324274;REFB=-0.00903344;REVB=0.0306198;RO=92;SAF=53;SAR=44;SRF=66;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156106;STB=0.585273;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0139054;OID=.;OPOS=228509589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:189:92:92:97:97:0.513228:44:53:66:26:44:53:66:26
chr1	228520973	.	C	G	356.52	PASS	AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0711544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5127;QD=19.8066;RBI=0.0721072;REFB=-0.0519061;REVB=-0.011683;RO=34;SAF=16;SAR=21;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134325;STB=0.581108;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0384012;OID=.;OPOS=228520973;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:34:35:37:37:0.513889:21:16:20:14:21:16:21:14
chr1	228524961	.	C	A	660.82	PASS	AF=0.503817;AO=66;DP=131;FAO=66;FDP=131;FR=.;FRO=65;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=0.0036578;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.01;QD=20.1778;RBI=0.0082884;REFB=-0.0138352;REVB=0.00743761;RO=65;SAF=39;SAR=27;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103815;STB=0.557256;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0142346;OID=.;OPOS=228524961;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:65:65:66:66:0.503817:27:39:31:34:27:39:31:34
chr1	228526665	.	T	C	952.47	PASS	AF=0.413127;AO=107;DP=260;FAO=107;FDP=259;FR=.;FRO=152;FSAF=67;FSAR=40;FSRF=90;FSRR=62;FWDB=0.0107407;FXX=0.00766254;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.405;QD=14.7099;RBI=0.023314;REFB=-0.0302442;REVB=-0.0206925;RO=151;SAF=67;SAR=40;SRF=89;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406243;STB=0.521118;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0381385;OID=.;OPOS=228526665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:260:259:151:152:107:107:0.413127:40:67:89:62:40:67:90:62
chr1	228528563	.	C	G	311.84	PASS	AF=0.357798;AO=39;DP=109;FAO=39;FDP=109;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=0.0156958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.781;QD=11.4436;RBI=0.0235494;REFB=-0.0146004;REVB=-0.0175561;RO=70;SAF=23;SAR=16;SRF=43;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285674;STB=0.516373;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0214145;OID=.;OPOS=228528563;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:70:70:39:39:0.357798:16:23:43:27:16:23:43:27
chr1	228547901	.	C	T	369.65	PASS	AF=0.458824;AO=38;DP=84;FAO=39;FDP=85;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=13;FWDB=0.00560083;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.555;QD=17.3955;RBI=0.0217619;REFB=-0.00650927;REVB=0.0210289;RO=46;SAF=22;SAR=16;SRF=33;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142881;STB=0.586165;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0101899;OID=.;OPOS=228547901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:46:46:38:39:0.458824:16:22:33:13:17:22:33:13
chr1	228555660	.	C	T	188.88	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.119319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4427;QD=20.9864;RBI=0.120103;REFB=-0.0287218;REVB=0.0137009;RO=17;SAF=6;SAR=13;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0809967;STB=0.545409;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0192005;OID=.;OPOS=228555660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:13:6:4:13:13:6:4:13
chr1	228558891	.	CCGGG	CCGG,CCGGC,CGG	625.92	PASS	AF=1,0,0;AO=38,3,7;DP=61;FAO=61,0,0;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29,0,0;FSAR=32,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.208326,-0.0440557,-0.0576836;FXX=0;HRUN=3,3,3;LEN=1,1,2;MLLD=14.4935,5.14915,7.24158;QD=41.0441;RBI=0.214756,0.0446309,0.102605;REFB=-0.0626839,-0.045367,-0.0156988;REVB=-0.0521599,0.00714223,-0.0848551;RO=6;SAF=13,3,6;SAR=25,0,1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0.384615,0,0.416667;SSSB=-0.0886985,0.637446,0.23478;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.00920887,0,-0.0293155;OID=.,.,.;OPOS=228558893,228558895,228558892;OREF=G,G,CG;OALT=-,C,-;OMAPALT=CCGG,CCGGC,CGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0,0:38,3,7:61:61,0,0:61:0:29,0,0:32,0,0:0:0:3:6:13,3,6:25,0,1:4:2
chr1	228559994	.	C	T	600.3	PASS	AF=0.55;AO=55;DP=100;FAO=55;FDP=100;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0443415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.152;QD=24.012;RBI=0.0456153;REFB=-0.0237058;REVB=0.0107043;RO=45;SAF=24;SAR=31;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0979822;STB=0.553754;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0241911;OID=.;OPOS=228559994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:45:45:55:55:0.55:31:24:25:20:31:24:25:20
chr1	228560139	.	A	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.514;QD=53.9112;RBI=0.029195;REFB=0;REVB=0.0075905;RO=0;SAF=20;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154835;OID=.;OPOS=228560139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:4:20:0:0:4:20:0:0
chr1	228560700	.	T	C	876.16	PASS	AF=0.375912;AO=103;DP=274;FAO=103;FDP=274;FR=.;FRO=171;FSAF=50;FSAR=53;FSRF=67;FSRR=104;FWDB=-0.0112374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0755;QD=12.7907;RBI=0.0818803;REFB=-0.0178344;REVB=-0.0811055;RO=169;SAF=50;SAR=53;SRF=67;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0986052;STB=0.558668;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0227688;OID=.;OPOS=228560700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:274:274:169:171:103:103:0.375912:53:50:67:102:53:50:67:104
chr1	228612838	.	G	T	712.33	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0362532;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.636;QD=63.3181;RBI=0.0369521;REFB=0;REVB=0.00715309;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123594;OID=.;OPOS=228612838;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:26:19:0:0:26:19:0:0
chr1	228699477	.	T	C	252.33	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0386659;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6349;QD=17.1072;RBI=0.047244;REFB=-0.0210457;REVB=-0.0271466;RO=31;SAF=22;SAR=6;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238049;STB=0.635152;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0274421;OID=.;OPOS=228699477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:31:31:28:28:0.474576:6:22:18:13:6:22:18:13
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chr1	229317393	.	C	CT	37.45	PASS	AF=0.272727;AO=7;DP=34;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0534761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.1022;QD=4.53966;RBI=0.122096;REFB=-0.00309704;REVB=0.109762;RO=27;SAF=7;SAR=0;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.739406;STB=0.868689;STBP=0.012;TYPE=ins;VARB=0.021669;OID=.;OPOS=229317394;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.272727:7:34:9:33:24:8:1:10:14:37:27:7:0:11:16
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chr1	229546425	.	C	T	425.62	PASS	AF=0.472527;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=7;FSRF=36;FSRR=12;FWDB=0.0232071;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.175;QD=18.7085;RBI=0.0368761;REFB=-0.0227726;REVB=-0.0286579;RO=48;SAF=36;SAR=7;SRF=36;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134657;STB=0.575719;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0202826;OID=.;OPOS=229546425;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:48:48:43:43:0.472527:7:36:36:12:7:36:36:12
chr1	229663064	.	GAGGAA	G	217.4	PASS	AF=0.863636;AO=17;DP=22;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0477812;FXX=0.0832986;HRUN=1;LEN=5;MLLD=186.559;QD=39.5268;RBI=0.0675091;REFB=-0.0716722;REVB=0.047691;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.551672;STBP=0.309;TYPE=del;VARB=0.0136225;OID=.;OPOS=229663065;OREF=AGGAA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.863636:17:22:19:22:3:6:13:0:3:15:0:6:11:0:0
chr1	229738236	.	G	A	218.55	PASS	AF=0.470588;AO=23;DP=50;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00349598;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=117.412;QD=17.1411;RBI=0.0383414;REFB=-0.00743962;REVB=0.0381817;RO=27;SAF=11;SAR=12;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00307392;STB=0.512305;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00976001;OID=.;OPOS=229738236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:27:27:23:24:0.470588:12:11:13:14:13:11:13:14
chr1	229750036	.	C	T	297.44	PASS	AF=0.382022;AO=33;DP=88;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.00969094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.132;QD=13.3682;RBI=0.0142072;REFB=-0.0172842;REVB=-0.010389;RO=55;SAF=16;SAR=17;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530799;STB=0.539303;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0230806;OID=.;OPOS=229750036;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:55:55:33:34:0.382022:17:16:24:31:17:17:24:31
chr1	230384937	.	T	C	148.63	PASS	AF=0.345455;AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00508621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.844;QD=10.8094;RBI=0.0325274;REFB=-0.00927843;REVB=0.0321272;RO=36;SAF=8;SAR=11;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578512;STB=0.533945;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0118844;OID=.;OPOS=230384937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:36:36:19:19:0.345455:11:8:17:19:11:8:17:19
chr1	230415293	.	C	T	213.75	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0175882;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.403;QD=19.8835;RBI=0.0175991;REFB=-0.00290673;REVB=-0.000617071;RO=22;SAF=5;SAR=16;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.415161;STB=0.7354;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00434775;OID=.;OPOS=230415293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:16:5:15:7:16:5:15:7
chr1	230417557	.	T	C	365.08	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0239668;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=273.319;QD=52.1538;RBI=0.0260533;REFB=-0.00863442;REVB=0.010216;RO=0;SAF=22;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511103;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.000154645;OID=.;OPOS=230417557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:5:22:0:0:5:22:1:0
chr1	230417560	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.1247;QD=56.1912;RBI=0.0836486;REFB=0;REVB=-0.0731819;RO=0;SAF=23;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39272e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000745952;OID=.;OPOS=230417560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:5:23:0:0:5:23:0:0
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chr1	230841687	.	T	C	1029.28	PASS	AF=1;AO=68;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244105;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.172;QD=59.6684;RBI=0.0594904;REFB=0;REVB=-0.0542516;RO=0;SAF=31;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00038683;OID=.;OPOS=230841687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:68:69:1:37:31:0:0:38:31:0:0
chr1	230845794	.	A	G	413.97	PASS	AF=0.539474;AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=76;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0136632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.052;QD=21.7877;RBI=0.024136;REFB=-0.013922;REVB=-0.0198963;RO=34;SAF=22;SAR=19;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054307;STB=0.523461;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00986839;OID=.;OPOS=230845794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:34:35:41:41:0.539474:19:22:16:18:19:22:17:18
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chr1	230974609	.	C	T	536.69	PASS	AF=0.491228;AO=54;DP=113;FAO=56;FDP=114;FR=.;FRO=58;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.00813512;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.919;QD=18.8313;RBI=0.0108376;REFB=-0.00687909;REVB=-0.00716061;RO=58;SAF=35;SAR=19;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0953922;STB=0.549054;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.00650249;OID=.;OPOS=230974609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:58:58:54:56:0.491228:19:35:32:26:20:36:32:26
chr1	231057247	.	A	T	1073.25	PASS	AF=1;AO=67;DP=69;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0841312;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.704;QD=57.2399;RBI=0.0872775;REFB=0;REVB=0.0232231;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0069757;OID=.;OPOS=231057247;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:75:0:0:67:75:1:37:30:0:0:43:32:0:0
chr1	231057248	.	C	T	39.66	PASS	AF=0.116883;AO=7;DP=74;FAO=9;FDP=77;FR=.;FRO=68;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=36;FWDB=0.000365368;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.4161;QD=2.0602;RBI=0.0173481;REFB=-0.0246227;REVB=-0.0173443;RO=67;SAF=1;SAR=6;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389122;STB=0.85627;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0975568;OID=.;OPOS=231057248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:74:77:67:68:7:9:0.116883:6:1:31:36:8:1:32:36
chr1	231298898	.	C	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.49;QD=33.4285;RBI=0.0232237;REFB=0;REVB=-0.00561991;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00051011;OID=.;OPOS=231298898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr1	231339713	.	C	T	1622.15	PASS	AF=0.468144;AO=167;DP=360;FAO=169;FDP=361;FR=.;FRO=192;FSAF=103;FSAR=66;FSRF=126;FSRR=66;FWDB=0.00358986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.754;QD=17.974;RBI=0.012539;REFB=-0.0114839;REVB=-0.0120141;RO=189;SAF=102;SAR=65;SRF=123;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410029;STB=0.526434;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.012988;OID=.;OPOS=231339713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:360:361:189:192:167:169:0.468144:65:102:123:66:66:103:126:66
chr1	231353589	.	A	G	421.95	PASS	AF=0.577465;AO=39;DP=70;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00563142;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.548;QD=23.7717;RBI=0.0172675;REFB=-0.0163702;REVB=-0.0163234;RO=29;SAF=22;SAR=17;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0635359;STB=0.525975;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0105196;OID=.;OPOS=231353589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:29:30:39:41:0.577465:17:22:14:15:18:23:15:15
chr1	231355912	.	G	T	289.71	PASS	AF=0.402439;AO=32;DP=77;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0845652;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=42.2703;QD=14.1323;RBI=0.0988356;REFB=-0.0112425;REVB=0.0511585;RO=44;SAF=20;SAR=12;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285524;STB=0.617576;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0116749;OID=.;OPOS=231355912;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:82:44:49:32:33:0.402439:12:20:15:29:13:20:20:29
chr1	231355918	.	CG	GT	296.61	PASS	AF=0.426829;AO=28;DP=77;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.0208844;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=2;MLLD=301.293;QD=14.4689;RBI=0.0209135;REFB=-0.00353416;REVB=0.00110404;RO=47;SAF=17;SAR=11;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284712;STB=0.662016;STBP=0.011;TYPE=mnp;VARB=0.00719223;OID=.;OPOS=231355918;OREF=CG;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:82:47:47:28:35:0.426829:11:17:16:31:13:22:16:31
chr1	231357102	.	G	C	412.81	PASS	AF=0.442308;AO=46;DP=104;FAO=46;FDP=104;FR=.;FRO=58;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=-0.00320471;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=301.449;QD=15.8772;RBI=0.0125537;REFB=-0.000625996;REVB=-0.0121377;RO=58;SAF=31;SAR=15;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310441;STB=0.673837;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.000453598;OID=.;OPOS=231357102;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:58:58:46:46:0.442308:15:31:21:37:15:31:21:37
chr1	231401902	.	G	A	1226.74	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132243;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.071;QD=61.337;RBI=0.018749;REFB=0;REVB=-0.0132907;RO=0;SAF=42;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.18673e-05;OID=.;OPOS=231401902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:80:0:0:80:80:1:38:42:0:0:38:42:0:0
chr1	231408091	.	A	G	140.63	PASS	AF=0.316667;AO=19;DP=60;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0101666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.351;QD=9.3754;RBI=0.0168181;REFB=-0.00365328;REVB=-0.0133973;RO=40;SAF=12;SAR=7;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971217;STB=0.567201;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.00581491;OID=.;OPOS=231408091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:40:41:19:19:0.316667:7:12:22:18:7:12:22:19
chr1	231480426	.	GTTTTTTA	GTTTTT,GTTTTTA,GTTTTTAA	90.38	PASS	AF=0.218182,0,0;AO=21,17,5;DP=113;FAO=24,0,0;FDP=110;FR=.;FRO=86;FSAF=13,0,0;FSAR=11,0,0;FSRF=54;FSRR=32;FWDB=0.00247148,-0.187656,-0.208453;FXX=0;HRUN=6,6,6;LEN=2,1,1;MLLD=18.9303,9.98347,15.018;QD=3.28661;RBI=0.127122,0.207285,0.212719;REFB=-0.0432244,-0.050724,-0.0106269;REVB=-0.127098,-0.0880472,0.0423903;RO=53;SAF=10,15,5;SAR=11,2,0;SRF=31;SRR=22;SSEN=0,0,0;SSEP=0.368071,0.368071,0;SSSB=-0.12962,0.46385,0.539519;STB=0.568617,0.5,0.5;STBP=0.477,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.13279,0.0105226,0;OID=.,.,.;OPOS=231480432,231480427,231480432;OREF=TA,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=GTTTTT,GTTTTTA,GTTTTTAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.218182,0,0:21,17,5:113:24,0,0:110:86:13,0,0:11,0,0:54:32:89:53:10,15,5:11,2,0:31:22
chr1	231488524	.	C	T	192.61	PASS	AF=0.324675;AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=77;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0734601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6271;QD=10.0058;RBI=0.0787485;REFB=0.00381156;REVB=-0.0283714;RO=51;SAF=9;SAR=16;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131268;STB=0.584249;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.0105927;OID=.;OPOS=231488524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:51:52:25:25:0.324675:16:9:24:27:16:9:25:27
chr1	231903010	.	C	T	486.1	PASS	AF=0.605263;AO=44;DP=74;FAO=46;FDP=76;FR=.;FRO=30;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0144692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.343;QD=25.5842;RBI=0.0448036;REFB=-0.03414;REVB=-0.0424028;RO=30;SAF=25;SAR=19;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00114319;STB=0.508232;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0205703;OID=.;OPOS=231903010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:30:30:44:46:0.605263:19:25:17:13:19:27:17:13
chr1	232533832	.	T	C	227.14	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.00402475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.866;QD=21.129;RBI=0.0146743;REFB=0.0024624;REVB=0.0141116;RO=21;SAF=18;SAR=4;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125085;STB=0.507036;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.00178778;OID=.;OPOS=232533832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:4:18:17:4:4:18:17:4
chr1	232534957	.	T	C	728.93	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0466833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.598;QD=57.171;RBI=0.0727357;REFB=0;REVB=0.0557777;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89975e-05;OID=.;OPOS=232534957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0
chr1	232539219	.	C	T	211.9	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.00794968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2427;QD=12.284;RBI=0.0355841;REFB=-0.0119616;REVB=-0.0346847;RO=43;SAF=12;SAR=14;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985068;STB=0.556518;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0293111;OID=.;OPOS=232539219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:43:43:26:26:0.376812:14:12:16:27:14:12:16:27
chr1	232574921	.	T	C	272.04	PASS	AF=0.407895;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0134724;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0962;QD=14.318;RBI=0.0193066;REFB=0.000392734;REVB=0.013829;RO=45;SAF=13;SAR=18;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141797;STB=0.580593;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=-0.00159497;OID=.;OPOS=232574921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:76:45:45:31:31:0.407895:18:13:25:20:18:13:25:20
chr1	232650750	.	A	G	1742.04	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379267;FXX=0.0254216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.348;QD=60.5928;RBI=0.0385923;REFB=0;REVB=-0.00713676;RO=0;SAF=63;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358297;OID=.;OPOS=232650750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:113:115:0:0:113:115:1:50:63:0:0:50:65:0:0
chr1	232650867	.	C	T	299.43	PASS	AF=0.430769;AO=25;DP=64;FAO=28;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.00382438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.494;QD=18.4267;RBI=0.0227959;REFB=-0.0340702;REVB=-0.0224728;RO=30;SAF=14;SAR=11;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140187;STB=0.582034;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.042823;OID=.;OPOS=232650867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:30:32:25:28:0.430769:11:14:21:9:12:16:23:9
chr1	232940863	.	G	A	627.64	PASS	AF=0.448276;AO=65;DP=144;FAO=65;FDP=145;FR=.;FRO=80;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=35;FWDB=-0.0240445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.191;QD=17.3141;RBI=0.0252182;REFB=-0.0238949;REVB=-0.00760377;RO=79;SAF=40;SAR=25;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598168;STB=0.530377;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0382727;OID=.;OPOS=232940863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:145:79:80:65:65:0.448276:25:40:44:35:25:40:45:35
chr1	232940953	.	T	C	335.83	PASS	AF=0.402174;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.0100067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.842;QD=14.6012;RBI=0.0265334;REFB=-0.0220309;REVB=-0.0245741;RO=55;SAF=25;SAR=12;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221575;STB=0.626075;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0245306;OID=.;OPOS=232940953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:55:55:37:37:0.402174:12:25:26:29:12:25:26:29
chr1	232941153	.	C	T	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.508;QD=16.4544;RBI=0.0137551;REFB=-0.0011555;REVB=-0.0137551;RO=4;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000379633;OID=.;OPOS=232941153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:6:0:0:4:6:0:0:4
chr1	232941677	.	G	T	433.16	PASS	AF=0.522727;AO=36;DP=78;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=6;FWDB=-0.00223393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.3213;QD=19.6889;RBI=0.0557617;REFB=-0.0163119;REVB=0.0557169;RO=42;SAF=29;SAR=7;SRF=36;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842044;STB=0.578481;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.019382;OID=.;OPOS=232941677;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:88:42:42:36:46:0.522727:7:29:36:6:12:34:36:6
chr1	232942251	.	A	G	63.35	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0594176;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.469;QD=8.73789;RBI=0.0604725;REFB=-0.0255385;REVB=-0.0112463;RO=20;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110878;STB=0.567426;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0410426;OID=.;OPOS=232942251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:6:3:5:15:6:3:5:15
chr1	232942546	.	A	G	135.95	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0189674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.028;QD=17.5419;RBI=0.0406787;REFB=-0.00324871;REVB=0.035986;RO=16;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254966;STB=0.645381;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00378031;OID=.;OPOS=232942546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:9:6:11:5:9:6:11:5
chr1	232943219	.	A	G	178.54	PASS	AF=0.73913;AO=17;DP=23;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0425977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6549;QD=31.0497;RBI=0.0919844;REFB=0.0220846;REVB=0.0815264;RO=6;SAF=9;SAR=8;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652751;STB=0.53604;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=-0.00566534;OID=.;OPOS=232943219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:6:6:17:17:0.73913:8:9:4:2:8:9:4:2
chr1	232944569	.	C	T	251.92	PASS	AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00843989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.709;QD=27.235;RBI=0.0167185;REFB=-0.0155308;REVB=-0.0144318;RO=14;SAF=14;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0764437;STB=0.542336;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0132776;OID=.;OPOS=232944569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:14:14:23:23:0.621622:9:14:7:7:9:14:7:7
chr1	232945039	.	G	A	107.7	PASS	AF=0.366667;AO=8;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00688407;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.746;QD=14.3599;RBI=0.00713438;REFB=0.00365247;REVB=0.00187322;RO=16;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135949;STB=0.507233;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.00240957;OID=.;OPOS=232945039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:30:30:16:16:8:11:0.366667:4:4:6:10:7:4:6:10
chr1	232945255	.	C	G	37.45	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0258592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4122;QD=8.81107;RBI=0.0501519;REFB=0.00230608;REVB=-0.0429711;RO=11;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.561709;STB=0.847941;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.00519154;OID=.;OPOS=232945255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:1:5:3:8:1:5:3:8
chr1	232967889	.	T	C	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00803918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.408;QD=57.5451;RBI=0.0233208;REFB=0;REVB=0.0218913;RO=0;SAF=20;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05578e-05;OID=.;OPOS=232967889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:38:20:0:0:38:20:0:0
chr1	233086456	.	T	C	127.88	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.012668;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5416;QD=18.2691;RBI=0.0199226;REFB=-0.0428783;REVB=-0.0153763;RO=13;SAF=4;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22989;STB=0.651947;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0411423;OID=.;OPOS=233086456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:28:13:14:14:14:0.5:10:4:7:6:10:4:8:6
chr1	233086483	.	GCC	G,GC,GGC	205.22	PASS	AF=0.258065,0.709677,0;AO=5,13,4;DP=27;FAO=8,22,0;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=2,7,0;FSAR=6,15,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0218201,0.0401966,0.0386105;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=13.5076,10.0507,5.94339;QD=26.48;RBI=0.0829969,0.154201,0.0393516;REFB=-0.0603265,-0.0770361,-0.050174;REVB=-0.0800773,-0.148869,0.00760104;RO=2;SAF=1,4,2;SAR=4,9,2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.190062,-0.0529323,0;STB=0.599732,0.533302,0.5;STBP=0.267,0.265,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0601521,0.0256055,0.0740979;OID=.,.,.;OPOS=233086484,233086484,233086484;OREF=CC,C,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=G,GC,GGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.258065,0.709677,0:5,13,4:27:8,22,0:31:1:2,7,0:6,15,0:1:0:26:2:1,4,2:4,9,2:1:1
chr1	233120192	.	G	A	247.52	PASS	AF=0.348837;AO=30;DP=86;FAO=30;FDP=86;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.0750932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.138;QD=11.5124;RBI=0.0763307;REFB=-0.0175912;REVB=0.0136891;RO=53;SAF=12;SAR=18;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143069;STB=0.599933;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.024561;OID=.;OPOS=233120192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:53:56:30:30:0.348837:18:12:28:25:18:12:31:25
chr1	233121791	.	G	A	221.77	PASS	AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00780149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.917;QD=25.3452;RBI=0.0235464;REFB=-0.0341853;REVB=-0.0222165;RO=14;SAF=12;SAR=9;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106914;STB=0.559267;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0152845;OID=.;OPOS=233121791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:9:12:10:4:9:12:10:4
chr1	233122127	.	C	T	114.04	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=-0.00458868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.06;QD=18.2465;RBI=0.0209898;REFB=-0.00242788;REVB=-0.0204821;RO=12;SAF=10;SAR=3;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339403;STB=0.687292;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00152825;OID=.;OPOS=233122127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:3:10:12:0:3:10:12:0
chr1	233134086	.	C	T	411.53	PASS	AF=0.393443;AO=46;DP=120;FAO=48;FDP=122;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=0.0192575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.375;QD=13.4927;RBI=0.0193262;REFB=-0.021298;REVB=0.00162769;RO=72;SAF=25;SAR=21;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282398;STB=0.503124;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0370944;OID=.;OPOS=233134086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:122:72:74:46:48:0.393443:21:25:41:31:21:27:42:32
chr1	233515413	.	G	A	135.94	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00761253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.359;QD=17.5407;RBI=0.0265323;REFB=-0.0152594;REVB=-0.0254168;RO=16;SAF=6;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348757;STB=0.519973;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0194417;OID=.;OPOS=233515413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:9:6:7:9:9:6:7:9
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chr1	233520852	.	TATTTTTTT	ATATTTTTT,TATTTTTT,TATTTTTTA,TTATTTTTT	33.19	PASS	AF=0,0.227273,0.0454545,0.0227273;AO=2,12,2,2;DP=45;FAO=0,10,2,1;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=0,5,0,0;FSAR=0,5,2,1;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0183722,-0.0419734,-0.0131176,-0.0695062;FXX=0.0222173;HRUN=1,7,7,1;LEN=3,1,1,2;MLLD=80.2626,7.45417,23.2731,23.3189;QD=3.01691;RBI=0.0371395,0.102629,0.0429846,0.0696888;REFB=-0.0161275,-0.161526,-0.0763796,-0.0778606;REVB=-0.032277,0.093653,0.0409342,-0.00504198;RO=24;SAF=2,8,0,0;SAR=0,4,2,2;SRF=14;SRR=10;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.453997,0.0993944,-0.525765,-0.525765;STB=0.5,0.609547,0.996084,0.992595;STBP=1,0.486,0.072,0.252;TYPE=mnp,del,snp,mnp;VARB=0.0371606,0.156073,-0.0423144,0.082553;OID=.,.,.,.;OPOS=233520852,233520854,233520860,233520853;OREF=TAT,T,T,AT;OALT=ATA,-,A,TA;OMAPALT=ATATTTTTT,TATTTTTT,TATTTTTTA,TTATTTTTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:23:45:44:24:31:2,12,2,2:0,10,2,1:0,0.227273,0.0454545,0.0227273:0,4,2,2:2,8,0,0:14:10:0,5,2,1:0,5,0,0:20:11
chr1	233759918	.	T	C	210.24	PASS	AF=0.366197;AO=26;DP=71;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00034438;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.247;QD=11.8442;RBI=0.00301408;REFB=-0.00682522;REVB=-0.00299434;RO=45;SAF=13;SAR=13;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365881;STB=0.521111;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0127324;OID=.;OPOS=233759918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:45:45:26:26:0.366197:13:13:24:21:13:13:24:21
chr1	233785786	.	A	C	1607.02	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.269;QD=60.0755;RBI=0.0315606;REFB=0;REVB=0.0297181;RO=0;SAF=55;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.01384e-05;OID=.;OPOS=233785786;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:52:55:0:0:52:55:0:0
chr1	234040898	.	G	A	711.29	PASS	AF=0.598214;AO=67;DP=112;FAO=67;FDP=112;FR=.;FRO=45;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.0120753;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.728;QD=25.4032;RBI=0.0139205;REFB=-0.0239211;REVB=-0.00692581;RO=45;SAF=37;SAR=30;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358219;STB=0.519475;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0149909;OID=.;OPOS=234040898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:45:45:67:67:0.598214:30:37:27:18:30:37:27:18
chr1	234041317	.	C	T	239.34	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0100248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.829;QD=20.8117;RBI=0.0158697;REFB=-0.00306178;REVB=-0.0123026;RO=23;SAF=13;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153781;STB=0.586392;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00566748;OID=.;OPOS=234041317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:10:13:9:14:10:13:9:14
chr1	234041422	.	G	C	275.58	PASS	AF=0.491803;AO=31;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0137049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0936;QD=18.0709;RBI=0.0530005;REFB=-0.0136388;REVB=0.0511979;RO=30;SAF=15;SAR=16;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102242;STB=0.540956;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0148941;OID=.;OPOS=234041422;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:31:31:30:0.491803:16:15:18:12:15:15:18:13
chr1	234509259	.	G	C	79.94	PASS	AF=0.25;AO=11;DP=44;FAO=11;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0625416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.538;QD=7.26744;RBI=0.0634211;REFB=-0.0226329;REVB=-0.010525;RO=32;SAF=5;SAR=6;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201677;STB=0.612047;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0598343;OID=.;OPOS=234509259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:44:44:32:33:11:11:0.25:6:5:20:12:6:5:20:13
chr1	234529552	.	C	T	94.89	PASS	AF=0.227273;AO=15;DP=66;FAO=15;FDP=66;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.00611911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.345;QD=5.75061;RBI=0.0565482;REFB=-0.0160502;REVB=-0.0562162;RO=51;SAF=11;SAR=4;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245477;STB=0.65541;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0441607;OID=.;OPOS=234529552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:66:66:51:51:15:15:0.227273:4:11:28:23:4:11:28:23
chr1	234529570	.	G	A	78.11	PASS	AF=0.22;AO=11;DP=50;FAO=11;FDP=50;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0216102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.447;QD=6.249;RBI=0.0326313;REFB=0.00206255;REVB=-0.02445;RO=39;SAF=7;SAR=4;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122933;STB=0.578801;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=-0.0307803;OID=.;OPOS=234529570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:50:50:39:39:11:11:0.22:4:7:21:18:4:7:21:18
chr1	234546245	.	C	T	314.46	PASS	AF=0.642857;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=42;FR=.;FRO=15;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00721418;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7416;QD=29.9482;RBI=0.0634497;REFB=-0.00317973;REVB=-0.0630383;RO=15;SAF=20;SAR=7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111438;STB=0.561507;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00106717;OID=.;OPOS=234546245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:15:15:27:27:0.642857:7:20:9:6:7:20:9:6
chr1	234569192	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00952513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.87;QD=63.8714;RBI=0.0443523;REFB=0;REVB=0.0433174;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140913;OID=.;OPOS=234569192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:18:30:0:0:18:30:0:0
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chr1	234573080	.	T	C	224.82	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0180091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.58;QD=19.984;RBI=0.0180476;REFB=-0.00909411;REVB=-0.0011782;RO=22;SAF=14;SAR=8;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279322;STB=0.646454;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00831437;OID=.;OPOS=234573080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:22:23:22:22:0.488889:8:14:7:15:8:14:8:15
chr1	234603322	.	A	T	306.94	PASS	AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0100701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.679;QD=18.0551;RBI=0.0117713;REFB=0.00421598;REVB=0.00609555;RO=35;SAF=14;SAR=19;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186709;STB=0.604178;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=-0.00476519;OID=.;OPOS=234603322;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:19:14:22:13:19:14:22:13
chr1	235040004	.	G	A	380.76	PASS	AF=0.5;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.00358086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.034;QD=19.5263;RBI=0.0138487;REFB=-0.0278884;REVB=-0.0133778;RO=38;SAF=27;SAR=12;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0871599;STB=0.557492;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0305856;OID=.;OPOS=235040004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:38:39:39:39:0.5:12:27:23:15:12:27:23:16
chr1	235652513	.	T	C	747.78	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4152;QD=56.4359;RBI=0.0977563;REFB=0;REVB=0.092306;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138236;OID=.;OPOS=235652513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:22:29:0:0:24:29:0:0
chr1	235705001	.	G	T	888.58	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.038381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3645;QD=56.4175;RBI=0.0487156;REFB=-0.0636925;REVB=-0.0300018;RO=0;SAF=43;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.32015e-08;STB=0.505745;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.000727731;OID=.;OPOS=235705001;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:19:43:0:0:19:43:1:0
chr1	235715523	.	A	G	800.92	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8805;QD=57.2083;RBI=0.0264894;REFB=0;REVB=0.00858604;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.87467e-05;OID=.;OPOS=235715523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:30:26:0:0:30:26:0:0
chr1	236139141	.	AAAAAAAG	AAAAAAGT,TAAAAAAG	68.89	PASS	AF=0.1,0.8;AO=2,4;DP=10;FAO=1,8;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=1,5;FSAR=0,3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0625335,0.0901711;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=10.427,20.3245;QD=27.5553;RBI=0.251149,0.189463;REFB=-0.0789445,-0.0309194;REVB=-0.243239,0.16663;RO=1;SAF=1,4;SAR=1,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.25849,0;STB=0.5,0.545344;STBP=1,0.618;TYPE=mnp,snp;VARB=0.109169,0.00895434;OID=.,.;OPOS=236139147,236139141;OREF=AG,A;OALT=GT,T;OMAPALT=AAAAAAGT,TAAAAAAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:10:10:1:1:2,4:1,8:0.1,0.8:1,0:1,4:1:0:0,3:1,5:1:0
chr1	236141174	.	T	C	255.69	PASS	AF=0.375;AO=30;DP=81;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.00360241;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.662;QD=12.7847;RBI=0.00887344;REFB=-0.00426475;REVB=-0.00810929;RO=51;SAF=21;SAR=9;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179509;STB=0.60862;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00776889;OID=.;OPOS=236141174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:51:50:30:30:0.375:9:21:28:23:9:21:27:23
chr1	236144951	.	A	G	236.04	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.299139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.093;QD=15.7356;RBI=0.299144;REFB=0.0548228;REVB=0.00180628;RO=28;SAF=11;SAR=7;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227155;STB=0.655615;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.0627223;OID=.;OPOS=236144951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:33:18:27:0.45:7:11:11:17:7:20:16:17
chr1	236175309	.	A	T	331.99	PASS	AF=0.439024;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.00035076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.716;QD=16.1946;RBI=0.0141547;REFB=-0.00393813;REVB=0.0141504;RO=45;SAF=19;SAR=17;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0497358;STB=0.533406;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00666526;OID=.;OPOS=236175309;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:45:46:36:36:0.439024:17:19:26:19:17:19:27:19
chr1	236175327	.	C	A	386.71	PASS	AF=0.527027;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0164175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.871;QD=20.9035;RBI=0.0181531;REFB=-0.00118576;REVB=0.00774602;RO=35;SAF=22;SAR=17;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184069;STB=0.510185;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00114545;OID=.;OPOS=236175327;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:35:35:39:39:0.527027:17:22:19:16:17:22:19:16
chr1	236175339	.	T	C	350.88	PASS	AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0566897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.105;QD=20.6401;RBI=0.0573647;REFB=-0.00475386;REVB=-0.00877425;RO=32;SAF=19;SAR=17;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00295856;STB=0.501638;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.00303531;OID=.;OPOS=236175339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:17:19:17:15:17:19:17:15
chr1	236208773	.	C	T	343.29	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=29;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00687402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.305;QD=21.4558;RBI=0.0150059;REFB=-0.0124743;REVB=-0.0133388;RO=29;SAF=29;SAR=6;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361197;STB=0.70229;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00623698;OID=.;OPOS=236208773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:6:29:14:15:6:29:14:15
chr1	236228288	.	C	A	194.91	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.00201601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.501;QD=17.3255;RBI=0.0193061;REFB=-0.0222302;REVB=0.0192006;RO=25;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22143;STB=0.6257;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0301545;OID=.;OPOS=236228288;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:9:11:8:17:9:11:8:17
chr1	236381825	.	G	C	868.09	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00508469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.9485;QD=57.8728;RBI=0.101008;REFB=0;REVB=0.10088;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000958318;OID=.;OPOS=236381825;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:32:28:0:0:32:28:0:0
chr1	236415347	.	T	C	283.52	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0173543;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.001;QD=49.3082;RBI=0.0213132;REFB=-0.102356;REVB=0.0123726;RO=1;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298327;STB=0.516115;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00240493;OID=.;OPOS=236415347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:23:1:1:22:22:0.956522:15:7:0:1:15:7:0:1
chr1	236557771	.	G	A	994.23	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0302581;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.481;QD=57.6368;RBI=0.0549991;REFB=-0.120447;REVB=0.0459276;RO=1;SAF=33;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141074;STB=0.50746;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.000433072;OID=.;OPOS=236557771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:35:33:1:0:35:33:1:0
chr1	236557804	.	G	A	1048.47	PASS	AF=0.972973;AO=69;DP=71;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0571936;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7349;QD=56.6741;RBI=0.0842138;REFB=0.04097;REVB=0.0618131;RO=2;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255372;STB=0.512497;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.00109262;OID=.;OPOS=236557804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:71:74:2:2:69:72:0.972973:36:33:0:2:39:33:0:2
chr1	236700807	.	T	A	379.54	PASS	AF=1;AO=26;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00412374;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.85;QD=56.2274;RBI=0.0656091;REFB=0;REVB=0.0654794;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013737;OID=.;OPOS=236700807;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:26:27:1:8:18:0:0:8:19:0:0
chr1	236700823	.	T	C	375.66	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.171;QD=55.6539;RBI=0.0413426;REFB=0;REVB=0.0130549;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171855;OID=.;OPOS=236700823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:11:15:0:0:11:16:0:0
chr1	236700857	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00456872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.62;QD=59.0185;RBI=0.0751204;REFB=0;REVB=-0.0749814;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200639;OID=.;OPOS=236700857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0
chr1	236702209	.	CA	TG	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00467666;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=220.692;QD=58.7817;RBI=0.0165373;REFB=0;REVB=0.0158623;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=4.32743e-05;OID=.;OPOS=236702209;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:33:32:0:0:33:32:0:0
chr1	236702374	.	G	A	1061.9	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00398442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.706;QD=59.8252;RBI=0.0307687;REFB=0;REVB=0.0305096;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.41261e-05;OID=.;OPOS=236702374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:36:34:0:0:37:34:0:0
chr1	236706780	.	C	T	1641.87	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.501;QD=60.252;RBI=0.0621466;REFB=0;REVB=-0.0570577;RO=0;SAF=65;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.98225e-05;OID=.;OPOS=236706780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:43:65:0:0:43:66:0:0
chr1	236706862	.	G	C	2069.66	PASS	AF=0.985294;AO=135;DP=136;FAO=134;FDP=136;FR=.;FRO=2;FSAF=76;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0145134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.792;QD=60.8724;RBI=0.0286114;REFB=-0.038399;REVB=0.0246572;RO=1;SAF=77;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00812536;STB=0.501005;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00478437;OID=.;OPOS=236706862;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:136:136:1:2:135:134:0.985294:58:77:0:1:58:76:1:1
chr1	236711323	.	T	C	1106.07	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0416921;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.71;QD=58.9903;RBI=0.0651354;REFB=-0.117664;REVB=0.0500438;RO=1;SAF=40;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011681;STB=0.506171;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00447353;OID=.;OPOS=236711323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:75:1:1:74:74:0.986667:34:40:1:0:34:40:1:0
chr1	236714064	.	A	C	428.71	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010562;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.258;QD=57.1619;RBI=0.103734;REFB=0;REVB=0.103195;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000624064;OID=.;OPOS=236714064;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr1	236716959	.	C	T	2388.75	PASS	AF=0.993671;AO=157;DP=159;FAO=157;FDP=158;FR=.;FRO=1;FSAF=83;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00782299;FXX=0.00628891;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.503;QD=60.4747;RBI=0.047166;REFB=0.0270282;REVB=0.0465127;RO=1;SAF=83;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00569788;STB=0.502994;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000116415;OID=.;OPOS=236716959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:159:158:1:1:157:157:0.993671:74:83:1:0:74:83:1:0
chr1	236717926	.	T	C	544.85	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0680475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0943;QD=57.3529;RBI=0.0700208;REFB=0.0178745;REVB=-0.0165061;RO=1;SAF=18;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253062;STB=0.513506;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.00177629;OID=.;OPOS=236717926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:19:18:1:0:19:18:1:0
chr1	236718620	.	T	C	1062.32	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.107;QD=59.8489;RBI=0.039756;REFB=0;REVB=0.0383228;RO=0;SAF=45;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000404861;OID=.;OPOS=236718620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:26:45:0:0:26:45:0:0
chr1	236719135	.	T	C	464.94	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0270748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1928;QD=58.1177;RBI=0.0627444;REFB=0;REVB=0.0566022;RO=0;SAF=26;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000539762;OID=.;OPOS=236719135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:6:26:0:0:6:26:0:0
chr1	236719193	.	A	G	157.11	PASS	AF=1;AO=11;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0980823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.386;QD=44.8896;RBI=0.0984248;REFB=0;REVB=0.00820463;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00340037;OID=.;OPOS=236719193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:11:14:1:7:4:0:0:8:6:0:0
chr1	236721610	.	G	A	554.94	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00503627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.7886;QD=59.9932;RBI=0.0675634;REFB=0;REVB=0.0673755;RO=1;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373615;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119347;OID=.;OPOS=236721610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:37:1:0:34:37:1:12:22:0:1:13:24:0:0
chr1	236721660	.	T	C	870.99	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0382562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.929;QD=56.1927;RBI=0.0583757;REFB=-0.0799504;REVB=0.0440929;RO=1;SAF=32;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145233;STB=0.50769;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00241059;OID=.;OPOS=236721660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:29:32:1:0:29:32:1:0
chr1	236721731	.	T	C	841.03	PASS	AF=0.911765;AO=62;DP=68;FAO=62;FDP=68;FR=.;FRO=6;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0445832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1458;QD=49.4723;RBI=0.0710914;REFB=-0.195141;REVB=0.0553745;RO=5;SAF=28;SAR=34;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491642;STB=0.533766;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0168544;OID=.;OPOS=236721731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:68:68:5:6:62:62:0.911765:34:28:4:1:34:28:5:1
chr1	236724504	.	G	A	223.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.229;QD=49.6177;RBI=0.0244176;REFB=0;REVB=0.0220316;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100062;OID=.;OPOS=236724504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:16:18:1:9:7:0:0:11:7:0:0
chr1	236744712	.	C	A	475.81	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.04;QD=57.6744;RBI=0.0182119;REFB=0;REVB=-0.0117589;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000878088;OID=.;OPOS=236744712;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:17:15:0:0:17:16:0:0
chr1	236746443	.	C	T	853.61	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00259932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.9823;QD=55.9744;RBI=0.0262981;REFB=-0.0262671;REVB=-0.0261694;RO=1;SAF=30;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154718;STB=0.508194;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00154448;OID=.;OPOS=236746443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:30:30:1:0:30:30:1:0
chr1	236748505	.	T	C	716.65	PASS	AF=0.901639;AO=54;DP=61;FAO=55;FDP=61;FR=.;FRO=6;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0469639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.894;QD=46.9933;RBI=0.0470802;REFB=-0.0421352;REVB=0.00330775;RO=6;SAF=25;SAR=29;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695296;STB=0.5373;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00659874;OID=.;OPOS=236748505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:61:61:6:6:54:55:0.901639:29:25:5:1:30:25:5:1
chr1	236749649	.	T	C	731.36	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0196526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9451;QD=60.9466;RBI=0.0338298;REFB=0.0783881;REVB=-0.027536;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512815;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.000760087;OID=.;OPOS=236749649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:0:1:47:47:0.979167:28:19:0:0:28:19:1:0
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chr1	236758887	.	T	A,C	747.64	PASS	AF=0.0416667,0.958333;AO=2,46;DP=48;FAO=2,46;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=2,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00981203,-0.00612121;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=111.267,260.213;QD=62.3034;RBI=0.0245453,0.0509658;REFB=0,0;REVB=-0.0224988,0.0505969;RO=0;SAF=0,20;SAR=2,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.183584,-0.000268507;OID=.,.;OPOS=236758887,236758887;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:48:48:0:0:2,46:2,46:0.0416667,0.958333:2,26:0,20:0:0:2,26:0,20:0:0
chr1	236767330	.	A	G	1259.83	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.269;QD=61.4549;RBI=0.0213216;REFB=0;REVB=-0.00157949;RO=0;SAF=47;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.16565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.54593e-05;OID=.;OPOS=236767330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:35:47:0:0:35:47:0:0
chr1	236882303	.	T	C	862.7	PASS	AF=0.968254;AO=61;DP=64;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0262096;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.954;QD=54.7749;RBI=0.0318803;REFB=-0.00971692;REVB=0.0181497;RO=2;SAF=28;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00247062;STB=0.501309;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000295294;OID=.;OPOS=236882303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:64:63:2:2:61:61:0.968254:33:28:1:1:33:28:1:1
chr1	236883421	.	C	T	1264.08	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00420729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.437;QD=61.6625;RBI=0.0196111;REFB=0;REVB=-0.0191544;RO=0;SAF=41;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.94045e-05;OID=.;OPOS=236883421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:40:41:0:0:41:41:0:0
chr1	236899899	.	TCC	TC,T	798.98	PASS	AF=1,0;AO=73,10;DP=87;FAO=86,0;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=45,0;FSAR=41,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0696092,-0.0364804;FXX=0.0227247;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=14.769,8.33538;QD=37.1618;RBI=0.180581,0.0946349;REFB=0,0;REVB=-0.166625,-0.0873209;RO=1;SAF=39,5;SAR=34,5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.013709,0.0811734;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.00386904,0;OID=.,.;OPOS=236899900,236899900;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=TC,T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:73,10:87:86,0:86:0:45,0:41,0:0:0:15:1:39,5:34,5:0:1
chr1	236925844	.	G	A	716.86	PASS	AF=0.405;AO=81;DP=199;FAO=81;FDP=200;FR=.;FRO=119;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=40;FSRR=79;FWDB=-0.00757165;FXX=0.00497488;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.335;QD=14.3371;RBI=0.0220246;REFB=-0.00861644;REVB=-0.0206822;RO=117;SAF=33;SAR=48;SRF=39;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0824547;STB=0.544629;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.01188;OID=.;OPOS=236925844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:200:117:119:81:81:0.405:48:33:39:78:48:33:40:79
chr1	236926445	.	T	C	697.12	PASS	AF=0.962264;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00668007;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.137;QD=52.6125;RBI=0.0270865;REFB=-0.0306301;REVB=0.0262498;RO=2;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294058;STB=0.515619;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.000870732;OID=.;OPOS=236926445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:53:2:2:50:51:0.962264:31:19:0:2:31:20:0:2
chr1	237054569	.	A	G	775.33	PASS	AF=0.557252;AO=73;DP=132;FAO=73;FDP=131;FR=.;FRO=58;FSAF=52;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=-0.0103238;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.118;QD=23.6741;RBI=0.0135053;REFB=-0.00485249;REVB=0.00870694;RO=58;SAF=52;SAR=21;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258591;STB=0.634538;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00272245;OID=.;OPOS=237054569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:131:58:58:73:73:0.557252:21:52:24:34:21:52:25:33
chr1	237058744	.	C	A	304.97	PASS	AF=0.472973;AO=30;DP=69;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0608381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.836;QD=16.485;RBI=0.0608406;REFB=-0.0357381;REVB=0.00055101;RO=39;SAF=16;SAR=14;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971263;STB=0.571388;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0485344;OID=.;OPOS=237058744;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:74:39:39:30:35:0.472973:14:16:17:22:15:20:17:22
chr1	237058748	.	C	T	345.64	PASS	AF=0.507042;AO=33;DP=69;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0395918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.793;QD=19.4724;RBI=0.0608805;REFB=-0.0490405;REVB=0.0462485;RO=32;SAF=13;SAR=20;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123254;STB=0.590786;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0448918;OID=.;OPOS=237058748;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:71:32:35:33:36:0.507042:20:13:17:15:22:14:20:15
chr1	237058828	.	C	T	107.74	PASS	AF=0.382353;AO=12;DP=33;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.078489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.63;QD=12.6754;RBI=0.0873384;REFB=-0.0299053;REVB=-0.0383076;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149667;STB=0.610951;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0705587;OID=.;OPOS=237058828;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:21:21:12:13:0.382353:7:5:6:15:7:6:6:15
chr1	237058835	.	A	G	88.22	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.00866101;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.542;QD=11.3834;RBI=0.0120088;REFB=0.00638977;REVB=-0.00831859;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762243;STB=0.545375;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=-0.00380024;OID=.;OPOS=237058835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:31:31:20:20:11:11:0.354839:7:4:6:14:7:4:6:14
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chr1	237063504	.	A	G	159.73	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.028835;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4626;QD=12.5278;RBI=0.029311;REFB=-0.0167154;REVB=0.00526085;RO=32;SAF=10;SAR=9;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955434;STB=0.555497;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0139991;OID=.;OPOS=237063504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:9:10:14:18:9:10:14:18
chr1	237066853	.	C	T	115.52	PASS	AF=0.288462;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.00900684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.452;QD=8.88629;RBI=0.0418734;REFB=-0.00527095;REVB=-0.0408933;RO=36;SAF=10;SAR=5;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104465;STB=0.55548;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0116265;OID=.;OPOS=237066853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:36:37:15:15:0.288462:5:10:21:15:5:10:22:15
chr1	237433625	.	C	T	2370.32	PASS	AF=1;AO=148;DP=148;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.845;QD=64.0628;RBI=0.0445062;REFB=0;REVB=-0.0255094;RO=0;SAF=82;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.79046e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.9382e-06;OID=.;OPOS=237433625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:148:148:0:0:148:148:1:66:82:0:0:66:82:0:0
chr1	237532872	.	A	G	212.06	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0115744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.187;QD=14.3766;RBI=0.0342046;REFB=-0.0184081;REVB=-0.0321867;RO=34;SAF=16;SAR=9;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146134;STB=0.583382;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0131934;OID=.;OPOS=237532872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:9:16:17:17:9:16:17:17
chr1	237617757	.	C	T	1098.67	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.678;QD=60.2013;RBI=0.0205275;REFB=0;REVB=0.00935517;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.5914e-05;OID=.;OPOS=237617757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:35:38:0:0:35:38:0:0
chr1	237711797	.	A	G	631.09	PASS	AF=0.548673;AO=62;DP=115;FAO=62;FDP=113;FR=.;FRO=51;FSAF=45;FSAR=17;FSRF=41;FSRR=10;FWDB=0.02873;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0622;QD=22.3396;RBI=0.0634906;REFB=-0.022253;REVB=0.0566184;RO=50;SAF=45;SAR=17;SRF=40;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0792566;STB=0.54612;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0187651;OID=.;OPOS=237711797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:113:50:51:62:62:0.548673:17:45:40:10:17:45:41:10
chr1	237766753	.	A	G	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0606426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.555;QD=54.5173;RBI=0.131043;REFB=0;REVB=-0.116167;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00024078;OID=.;OPOS=237766753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:8:17:0:0:8:17:0:0
chr1	237774123	.	GC	CG	39.52	PASS	AF=0.11;AO=12;DP=101;FAO=11;FDP=100;FR=.;FRO=89;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=47;FSRR=42;FWDB=-0.00238549;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=2;MLLD=106.732;QD=1.58075;RBI=0.0223407;REFB=-0.00281361;REVB=-0.022213;RO=79;SAF=9;SAR=3;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254182;STB=0.778986;STBP=0.079;TYPE=mnp;VARB=0.0735302;OID=.;OPOS=237774123;OREF=GC;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:101:100:79:89:12:11:0.11:3:9:44:35:2:9:47:42
chr1	237777828	.	A	G	198.67	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.0172027;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3313;QD=19.3829;RBI=0.0287676;REFB=0.0326833;REVB=0.0230574;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246527;STB=0.637851;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=-0.0319128;OID=.;OPOS=237777828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:9:11:17:4:9:11:17:4
chr1	237778084	.	G	A	151.0	PASS	AF=0.351852;AO=19;DP=54;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00859311;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=242.92;QD=11.1852;RBI=0.010618;REFB=-0.0197483;REVB=-0.00623705;RO=35;SAF=7;SAR=12;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164301;STB=0.596319;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0333934;OID=.;OPOS=237778084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:35:35:19:19:0.351852:12:7:18:17:12:7:18:17
chr1	237801770	.	T	C	1510.31	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0769462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1629;QD=63.5921;RBI=0.0819646;REFB=0;REVB=0.0282396;RO=0;SAF=28;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405638;OID=.;OPOS=237801770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:67:28:0:0:67:28:0:0
chr1	237814783	.	C	T	255.63	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0784584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5667;QD=51.1256;RBI=0.0865636;REFB=0;REVB=-0.0365725;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00315472;OID=.;OPOS=237814783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:6:14:0:0:6:14:0:0
chr1	237863718	.	T	G	727.5	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0406721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.723;QD=63.2609;RBI=0.0419388;REFB=0;REVB=-0.0102296;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000199697;OID=.;OPOS=237863718;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0
chr1	237881770	.	C	T	2317.89	PASS	AF=0.993243;AO=146;DP=147;FAO=147;FDP=148;FR=.;FRO=1;FSAF=83;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0127185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.747;QD=62.6456;RBI=0.0383587;REFB=-0.0102612;REVB=-0.0361888;RO=0;SAF=82;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.01612e-08;STB=0.502994;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-2.40401e-05;OID=.;OPOS=237881770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:147:148:0:1:146:147:0.993243:64:82:0:0:64:83:1:0
chr1	237890437	.	C	T	1640.93	PASS	AF=0.965812;AO=111;DP=117;FAO=113;FDP=117;FR=.;FRO=4;FSAF=61;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00828067;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5176;QD=56.1001;RBI=0.0171237;REFB=-0.0477074;REVB=0.0149883;RO=2;SAF=60;SAR=51;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182513;STB=0.509954;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0032078;OID=.;OPOS=237890437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:117:117:2:4:111:113:0.965812:51:60:0:2:52:61:1:3
chr1	237997087	.	A	G	183.21	PASS	AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0813974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5832;QD=11.8197;RBI=0.0826206;REFB=-0.0134396;REVB=0.0141644;RO=37;SAF=18;SAR=5;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.447094;STB=0.759592;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0203436;OID=.;OPOS=237997087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:37:39:23:23:0.370968:5:18:14:23:5:18:15:24
chr1	238107035	.	C	G	144.77	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00603223;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.091;QD=15.6509;RBI=0.0101692;REFB=-0.00698299;REVB=-0.00818689;RO=21;SAF=6;SAR=10;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367177;STB=0.709436;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0085105;OID=.;OPOS=238107035;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:10:6:16:5:10:6:16:5
chr1	238114860	.	G	A	174.63	PASS	AF=0.275862;AO=24;DP=87;FAO=24;FDP=87;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=-0.0258649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.439;QD=8.02911;RBI=0.0271596;REFB=-0.0192238;REVB=-0.0082855;RO=63;SAF=19;SAR=5;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29175;STB=0.677627;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0298761;OID=.;OPOS=238114860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:63:63:24:24:0.275862:5:19:37:26:5:19:37:26
chr1	238114934	.	G	A	171.56	PASS	AF=0.258065;AO=24;DP=92;FAO=24;FDP=93;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=-0.0131107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5428;QD=7.37873;RBI=0.0353982;REFB=0.0072173;REVB=-0.0328807;RO=68;SAF=17;SAR=7;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265432;STB=0.666523;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-0.0128108;OID=.;OPOS=238114934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:68:69:24:24:0.258065:7:17:34:34:7:17:34:35
chr1	238114936	.	A	G	135.32	PASS	AF=0.228261;AO=22;DP=90;FAO=21;FDP=92;FR=.;FRO=71;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.0219201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.151;QD=5.88346;RBI=0.0249532;REFB=0.00161539;REVB=-0.0119236;RO=67;SAF=17;SAR=5;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381963;STB=0.626742;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.00287911;OID=.;OPOS=238114936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:92:67:71:22:21:0.228261:5:17:32:35:7:14:36:35
chr1	240074848	.	A	T	84.6	PASS	AF=0.454545;AO=7;DP=24;FAO=10;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-3.28689e-08;FXX=0.119952;HRUN=12;LEN=1;MLLD=18.186;QD=15.3811;RBI=0.0945696;REFB=-0.0697078;REVB=-0.0945696;RO=5;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00140418;OID=.;OPOS=240074848;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:24:22:5:6:7:10:0.454545:7:0:0:5:10:0:0:6
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chr1	240076975	.	G	A	145.18	PASS	AF=0.444444;AO=15;DP=35;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0347373;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.5163;QD=16.1314;RBI=0.0797519;REFB=0.0162476;REVB=0.0717891;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514687;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=-0.00770201;OID=.;OPOS=240076975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:20:20:15:16:0.444444:9:6:8:12:10:6:8:12
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chr1	240077246	.	C	G	249.68	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0083255;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.7;QD=18.495;RBI=0.0149378;REFB=-0.0157483;REVB=0.0124026;RO=27;SAF=6;SAR=21;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169471;STB=0.595668;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0292951;OID=.;OPOS=240077246;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:21:6:10:17:21:6:10:17
chr1	240256822	.	C	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=327.466;QD=49.5992;RBI=0.0248457;REFB=0;REVB=0.0248457;RO=0;SAF=0;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.07899e-05;OID=.;OPOS=240256822;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:18:0:0:0:18:0:0:0
chr1	240341268	.	A	G	502.38	PASS	AF=0.613333;AO=46;DP=77;FAO=46;FDP=75;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.0614136;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.754;QD=26.7936;RBI=0.0865157;REFB=0.0185977;REVB=0.0609371;RO=29;SAF=23;SAR=23;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855599;STB=0.546647;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=-0.00952377;OID=.;OPOS=240341268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:75:29:29:46:46:0.613333:23:23:11:18:23:23:11:18
chr1	240370629	.	C	G	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0341504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.835;QD=15.882;RBI=0.0341882;REFB=-0.015965;REVB=0.00160882;RO=10;SAF=4;SAR=6;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188678;STB=0.608497;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0423936;OID=.;OPOS=240370629;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:6:4:2:8:6:4:2:8
chr1	240497265	.	A	C	453.32	PASS	AF=0.45045;AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=0.0335814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.306;QD=16.3357;RBI=0.0358163;REFB=0.00479165;REVB=-0.0124535;RO=59;SAF=21;SAR=29;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103026;STB=0.566748;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=-0.00442938;OID=.;OPOS=240497265;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:59:61:50:50:0.45045:29:21:31:28:29:21:33:28
chr1	240939511	.	C	G	203.0	PASS	AF=0.512195;AO=20;DP=37;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0191895;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.508;QD=19.8053;RBI=0.0247679;REFB=-0.0269079;REVB=-0.0156592;RO=16;SAF=11;SAR=9;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605442;STB=0.537348;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0235581;OID=.;OPOS=240939511;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:41:16:20:20:21:0.512195:9:11:10:6:10:11:12:8
chr1	241712134	.	C	T	2409.02	PASS	AF=1;AO=148;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0016102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.813;QD=64.2405;RBI=0.00871401;REFB=0;REVB=-0.00856395;RO=1;SAF=79;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00684316;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.91673e-06;OID=.;OPOS=241712134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:150:1:0:148:150:1:69:79:0:1:71:79:0:0
chr1	241907817	.	T	C	334.42	PASS	AF=0.507246;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.0119034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.493;QD=19.3866;RBI=0.0205656;REFB=-0.00896914;REVB=0.0167706;RO=32;SAF=21;SAR=14;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244261;STB=0.63421;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00840209;OID=.;OPOS=241907817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:32:34:35:35:0.507246:14:21:10:22:14:21:11:23
chr1	242030151	.	A	G	693.68	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00887184;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.29;QD=63.0617;RBI=0.0651278;REFB=0;REVB=0.0645208;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000783879;OID=.;OPOS=242030151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:28:16:0:0:28:16:0:0
chr1	242042301	.	G	A	199.64	PASS	AF=0.25;AO=29;DP=119;FAO=30;FDP=120;FR=.;FRO=90;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=60;FSRR=30;FWDB=0.00355243;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.487;QD=6.6547;RBI=0.0260277;REFB=-0.00948182;REVB=-0.0257841;RO=90;SAF=18;SAR=11;SRF=60;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621608;STB=0.527288;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0352935;OID=.;OPOS=242042301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:120:90:90:29:30:0.25:11:18:60:30:11:19:60:30
chr1	242042545	.	A	G	337.6	PASS	AF=0.486486;AO=34;DP=72;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0193185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.286;QD=18.2487;RBI=0.0203278;REFB=-0.0166316;REVB=-0.00632571;RO=38;SAF=14;SAR=20;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0843308;STB=0.528685;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0141065;OID=.;OPOS=242042545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:74:38:38:34:36:0.486486:20:14:19:19:20:16:19:19
chr1	242045275	.	C	T	2008.92	PASS	AF=1;AO=129;DP=130;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00954755;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.093;QD=62.292;RBI=0.0109937;REFB=0;REVB=-0.0054502;RO=0;SAF=63;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.0775e-06;OID=.;OPOS=242045275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:129:0:0:129:129:1:66:63:0:0:66:63:0:0
chr1	242053042	.	A	G	717.23	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.258;QD=56.253;RBI=0.0297183;REFB=0;REVB=0.0276539;RO=1;SAF=23;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200269;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.26946e-05;OID=.;OPOS=242053042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:1:0:50:51:1:27:23:1:0:27:24:0:0
chr1	242222754	.	A	G	306.77	PASS	AF=0.368421;AO=35;DP=96;FAO=35;FDP=95;FR=.;FRO=60;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=0.044655;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.564;QD=12.9167;RBI=0.0450507;REFB=0.00107745;REVB=-0.00595785;RO=60;SAF=19;SAR=16;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138359;STB=0.579154;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00212342;OID=.;OPOS=242222754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:95:60:60:35:35:0.368421:16:19:25:35:16:19:25:35
chr1	242253024	.	T	C	214.63	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0325665;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.821;QD=20.4412;RBI=0.0326365;REFB=-0.01414;REVB=0.00213714;RO=21;SAF=8;SAR=13;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289819;STB=0.662821;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0108296;OID=.;OPOS=242253024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:21:21:21:21:0.5:13:8:15:6:13:8:15:6
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chr1	242687390	.	G	A	197.7	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.00532488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.472;QD=18.8287;RBI=0.0715533;REFB=-0.0216992;REVB=0.0713549;RO=21;SAF=13;SAR=7;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116316;STB=0.545655;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0197611;OID=.;OPOS=242687390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:22:20:20:0.47619:7:13:16:5:7:13:16:6
chr1	243493907	.	A	T	569.9	PASS	AF=0.53;AO=53;DP=100;FAO=53;FDP=100;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.0321994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.386;QD=22.7958;RBI=0.0327339;REFB=0.0124992;REVB=-0.00589137;RO=44;SAF=21;SAR=32;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125006;STB=0.574675;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.00789394;OID=.;OPOS=243493907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:44:47:53:53:0.53:32:21:24:20:32:21:26:21
chr1	243579112	.	G	A	365.16	PASS	AF=0.964286;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.106646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0819;QD=52.1659;RBI=0.107467;REFB=-0.0996612;REVB=-0.0132635;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518505;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0361879;OID=.;OPOS=243579112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:28:0:1:26:27:0.964286:13:13:0:0:13:14:0:1
chr1	244219563	.	A	G	538.52	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.458;QD=59.8351;RBI=0.0415261;REFB=0;REVB=0.0389435;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.2267e-05;OID=.;OPOS=244219563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr1	244267292	.	T	C	68.14	PASS	AF=0.473684;AO=8;DP=18;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00973961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.702;QD=14.3443;RBI=0.0233246;REFB=-0.021567;REVB=0.0211938;RO=9;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149044;STB=0.581216;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0292761;OID=.;OPOS=244267292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:18:19:9:10:8:9:0.473684:4:4:6:3:5:4:6:4
chr1	244773784	.	T	C	71.38	PASS	AF=0.27027;AO=9;DP=36;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0263207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.414;QD=7.71664;RBI=0.0434615;REFB=-0.00324558;REVB=0.0345849;RO=26;SAF=3;SAR=6;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200736;STB=0.560318;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.00317098;OID=.;OPOS=244773784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:36:37:26:27:9:10:0.27027:6:3:13:13:6:4:13:14
chr1	244773803	.	T	C	69.94	PASS	AF=0.238095;AO=10;DP=42;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0166256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8289;QD=6.66076;RBI=0.0192167;REFB=-0.0171394;REVB=0.00963695;RO=32;SAF=5;SAR=5;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375095;STB=0.523762;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0447002;OID=.;OPOS=244773803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:42:42:32:32:10:10:0.238095:5:5:15:17:5:5:15:17
chr1	245027349	.	C	T	447.01	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0871107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5486;QD=57.6784;RBI=0.0886365;REFB=0;REVB=0.0163755;RO=0;SAF=2;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193211;OID=.;OPOS=245027349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:29:2:0:0:29:2:0:0
chr1	245133489	.	T	G	54.27	PASS	AF=1;AO=5;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012244;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.686;QD=36.1819;RBI=0.0142363;REFB=0;REVB=-0.00726347;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.29206e-06;OID=.;OPOS=245133489;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:6:6:0:0:5:6:1:4:1:0:0:5:1:0:0
chr1	245133623	.	T	C,TCCTCC	227.32	PASS	AF=0.25,0.75;AO=6,14;DP=21;FAO=5,15;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5,10;FSAR=0,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040147,-0.0414642;FXX=0.0475964;HRUN=1,2;LEN=1,5;MLLD=115.191,159.868;QD=45.4634;RBI=0.0417385,0.0437001;REFB=0,0;REVB=0.0114155,0.0137994;RO=1;SAF=6,10;SAR=0,4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.782178,0.100543;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.166605,0.00453892;OID=.,.;OPOS=245133623,245133624;OREF=T,-;OALT=C,CCTCC;OMAPALT=C,TCCTCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:21:20:1:0:6,14:5,15:0.25,0.75:0,4:6,10:0:1:0,5:5,10:0:0
chr1	245133662	.	G	C	375.6	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023206;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.6829;QD=55.6443;RBI=0.0408613;REFB=0;REVB=0.0336323;RO=0;SAF=20;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000665225;OID=.;OPOS=245133662;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:7:20:0:0:7:20:0:0
chr1	245297243	.	G	A	219.9	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0715061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0972;QD=17.9507;RBI=0.0882771;REFB=-0.0157403;REVB=-0.0517661;RO=27;SAF=13;SAR=9;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177218;STB=0.600648;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0153677;OID=.;OPOS=245297243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:9:13:11:16:9:13:11:16
chr1	245703990	.	G	T	1892.77	PASS	AF=1;AO=101;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=76;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.575;QD=61.5536;RBI=0.030086;REFB=0;REVB=0.0109173;RO=0;SAF=60;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.25502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00024516;OID=.;OPOS=245703990;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:101:123:1:41:60:0:0:47:76:0:0
chr1	245704130	.	G	C	632.2	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.045;QD=61.6782;RBI=0.0564855;REFB=0;REVB=0.0238725;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109016;OID=.;OPOS=245704130;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:38:41:1:24:14:0:0:26:15:0:0
chr1	245861571	.	C	T	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00739453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.182;QD=57.3852;RBI=0.0255488;REFB=0;REVB=0.0244554;RO=0;SAF=15;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08575e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.63307e-05;OID=.;OPOS=245861571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:42:15:0:0:42:15:0:0
chr1	246670481	.	C	G	4232.06	PASS	AF=0.992727;AO=271;DP=275;FAO=273;FDP=275;FR=.;FRO=2;FSAF=143;FSAR=130;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0947392;FXX=0.00362306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0111;QD=61.5572;RBI=0.0948196;REFB=-0.106008;REVB=0.00390391;RO=0;SAF=141;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63214e-08;STB=0.503472;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00141876;OID=.;OPOS=246670481;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:275:275:0:2:271:273:0.992727:130:141:0:0:130:143:2:0
chr1	246714587	.	G	A	233.59	PASS	AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00803336;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=305.089;QD=15.0704;RBI=0.00971926;REFB=-0.0025489;REVB=-0.00547074;RO=34;SAF=13;SAR=14;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01824;STB=0.518505;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.00285701;OID=.;OPOS=246714587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:34:35:27:27:0.435484:14:13:17:17:14:13:18:17
chr1	246720798	.	G	A	594.37	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2196;QD=60.9607;RBI=0.0517316;REFB=0;REVB=-0.0505726;RO=0;SAF=10;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000870048;OID=.;OPOS=246720798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:28:10:0:0:28:11:0:0
chr1	246755124	.	T	C	785.86	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00309581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.1702;QD=64.1522;RBI=0.0231372;REFB=0;REVB=0.0229291;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167857;OID=.;OPOS=246755124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0
chr1	246829616	.	T	C	642.62	PASS	AF=0.492424;AO=65;DP=132;FAO=65;FDP=132;FR=.;FRO=67;FSAF=54;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=0.0184701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.825;QD=19.4732;RBI=0.0205306;REFB=-0.0111865;REVB=-0.00896457;RO=66;SAF=54;SAR=11;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405167;STB=0.72412;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0220504;OID=.;OPOS=246829616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:66:67:65:65:0.492424:11:54:31:35:11:54:32:35
chr1	246922390	.	A	G	322.62	PASS	AF=0.5;AO=33;DP=66;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0130181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.622;QD=18.9775;RBI=0.0134477;REFB=-0.0147997;REVB=0.00337194;RO=33;SAF=11;SAR=22;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116619;STB=0.564112;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0404564;OID=.;OPOS=246922390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:68:33:34:33:34:0.5:22:11:15:18:23:11:15:19
chr1	246939856	.	G	A,T	1371.34	PASS	AF=0.967391,0.0326087;AO=82,3;DP=85;FAO=89,3;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=46,2;FSAR=43,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00163051,-0.0132077;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=78.8424,24.9611;QD=59.6234;RBI=0.0515891,0.0575275;REFB=0,0;REVB=0.0515633,0.0559908;RO=0;SAF=43,2;SAR=39,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.10525e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.001972,-0.0376237;OID=.,.;OPOS=246939856,246939856;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:85:92:0:0:82,3:89,3:0.967391,0.0326087:39,1:43,2:0:0:43,1:46,2:0:0
chr1	246939943	.	T	C	337.47	PASS	AF=0.411111;AO=37;DP=88;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0107815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8926;QD=14.9985;RBI=0.0342741;REFB=-0.00179991;REVB=-0.0325342;RO=51;SAF=17;SAR=20;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316388;STB=0.518375;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.00244287;OID=.;OPOS=246939943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:90:51:53:37:37:0.411111:20:17:25:26:20:17:26:27
chr1	246942171	.	G	A	266.57	PASS	AF=0.392405;AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=-0.0183224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4856;QD=13.4971;RBI=0.0208453;REFB=0.0317067;REVB=0.00994066;RO=48;SAF=17;SAR=14;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176424;STB=0.599939;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=-0.0509886;OID=.;OPOS=246942171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:48:48:31:31:0.392405:14:17:34:14:14:17:34:14
chr1	247048834	.	T	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.758;QD=56.7062;RBI=0.0180767;REFB=0;REVB=-0.0110205;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000228935;OID=.;OPOS=247048834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr1	247150740	.	T	C	986.69	PASS	AF=0.933333;AO=70;DP=76;FAO=70;FDP=75;FR=.;FRO=5;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0899247;FXX=0.0131562;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.3725;QD=52.6233;RBI=0.148645;REFB=-0.212626;REVB=0.11836;RO=5;SAF=41;SAR=29;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495081;STB=0.526247;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0165279;OID=.;OPOS=247150740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:76:75:5:5:70:70:0.933333:29:41:1:4:29:41:1:4
chr1	247162658	.	C	T	740.77	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.683;QD=56.982;RBI=0.0572475;REFB=0;REVB=0.0202344;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124634;OID=.;OPOS=247162658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:26:25:0:0:26:26:0:0
chr1	247241864	.	C	G	605.49	PASS	AF=0.425;AO=68;DP=160;FAO=68;FDP=160;FR=.;FRO=92;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=50;FSRR=42;FWDB=-0.00872439;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.675;QD=15.1372;RBI=0.0087314;REFB=-0.0195267;REVB=-0.000349842;RO=91;SAF=40;SAR=28;SRF=49;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052006;STB=0.526308;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0269377;OID=.;OPOS=247241864;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:160:91:92:68:68:0.425:28:40:49:42:28:40:50:42
chr1	247419509	.	T	C	505.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4802;QD=57.751;RBI=0.0391638;REFB=0;REVB=0.0241616;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122136;OID=.;OPOS=247419509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:35:0:0:33:35:1:18:15:0:0:19:16:0:0
chr1	247419664	.	C	T	214.42	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.009035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.114;QD=45.1409;RBI=0.0211641;REFB=-0.187102;REVB=-0.0191386;RO=1;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437188;STB=0.523783;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00241807;OID=.;OPOS=247419664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:19:19:1:1:18:18:0.947368:10:8:0:1:10:8:0:1
chr1	247587531	.	A	G	464.11	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0597414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.022;QD=58.0136;RBI=0.066075;REFB=0;REVB=0.0282289;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260288;OID=.;OPOS=247587531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:14:17:0:0:14:18:0:0
chr1	247614617	.	C	T	732.93	PASS	AF=0.981481;AO=51;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0209269;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6315;QD=54.2912;RBI=0.0595104;REFB=0.0506449;REVB=-0.0557095;RO=2;SAF=41;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224201;STB=0.505745;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-0.00177451;OID=.;OPOS=247614617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:2:1:51:53:0.981481:10:41:2:0:10:43:1:0
chr1	247614693	.	C	T	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0340408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.528;QD=55.6558;RBI=0.0443459;REFB=0;REVB=0.0284216;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.74321e-05;OID=.;OPOS=247614693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0
chr1	247615261	.	GA	G	2042.45	PASS	AF=1;AO=167;DP=172;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0665715;FXX=0.01156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.3402;QD=47.7767;RBI=0.118073;REFB=0;REVB=-0.0975164;RO=0;SAF=75;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000176551;OID=.;OPOS=247615262;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:167:172:171:171:0:79:92:0:0:37:0:75:92:0:0
chr1	247694949	.	G	C	352.45	PASS	AF=0.480519;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.000399445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.7;QD=18.3092;RBI=0.0342824;REFB=-0.00169278;REVB=0.03428;RO=40;SAF=15;SAR=22;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135479;STB=0.575631;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00170405;OID=.;OPOS=247694949;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:40:40:37:37:0.480519:22:15:22:18:22:15:22:18
chr1	247694958	.	G	A	366.62	PASS	AF=0.481481;AO=38;DP=80;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0239522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1758;QD=18.1048;RBI=0.0678774;REFB=-0.0078996;REVB=0.0635109;RO=42;SAF=17;SAR=21;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942408;STB=0.557992;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0179274;OID=.;OPOS=247694958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:42:42:38:39:0.481481:21:17:23:19:22:17:23:19
chr1	247695612	.	G	A	1026.31	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164442;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.271;QD=59.4964;RBI=0.0209127;REFB=0;REVB=0.0129201;RO=0;SAF=43;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.46165e-05;OID=.;OPOS=247695612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:26:43:0:0:26:43:0:0
chr1	247695756	.	T	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.219;QD=57.2022;RBI=0.0439629;REFB=0;REVB=0.0157775;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182171;OID=.;OPOS=247695756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr1	247729206	.	CTTTTTTTTTTTTTTTT	CTTTCTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTTTA	204.55	PASS	AF=0.225806,0.225806,0.354839;AO=3,4,3;DP=33;FAO=7,7,11;FDP=31;FR=.;FRO=6;FSAF=2,5,11;FSAR=5,2,0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0366471,-0.158333,-0.322936;FXX=0.0605877;HRUN=16,16,16;LEN=1,4,1;MLLD=209.012,10.3443,14.9639;QD=26.394;RBI=0.259981,0.440475,0.848659;REFB=-0.0226802,-0.0846315,-0.145631;REVB=-0.257385,-0.411034,-0.784815;RO=1;SAF=1,2,3;SAR=2,2,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.266641,-0.166656,0;STB=0.79926,0.6871,0.5;STBP=0.058,0.334,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=0.0361224,0.0746376,-0.232421;OID=.,.,.;OPOS=247729210,247729207,247729222;OREF=T,TTTT,T;OALT=C,-,A;OMAPALT=CTTTCTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.225806,0.225806,0.354839:3,4,3:33:7,7,11:31:6:2,5,11:5,2,0:6:0:62:1:1,2,3:2,2,0:1:0
chr1	247752019	.	G	C	523.24	PASS	AF=0.661972;AO=47;DP=71;FAO=47;FDP=71;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0453993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1689;QD=29.4785;RBI=0.0493955;REFB=-0.00160236;REVB=0.0194633;RO=24;SAF=15;SAR=32;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201197;STB=0.609476;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.000700654;OID=.;OPOS=247752019;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:24:24:47:47:0.661972:32:15:15:9:32:15:15:9
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chr1	247769752	.	A	G	494.72	PASS	AF=0.546512;AO=46;DP=85;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0493937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.271;QD=23.0103;RBI=0.0502326;REFB=-0.0584601;REVB=0.00914233;RO=39;SAF=24;SAR=22;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569463;STB=0.52641;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0374633;OID=.;OPOS=247769752;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:39:39:46:47:0.546512:22:24:23:16:22:25:23:16
chr1	247835674	.	G	A	313.01	PASS	AF=0.459459;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0439636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.288;QD=16.9194;RBI=0.0450796;REFB=-1.41658e-06;REVB=-0.00996878;RO=38;SAF=17;SAR=17;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993407;STB=0.540517;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.000409642;OID=.;OPOS=247835674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:74:38:40:34:34:0.459459:17:17:15:23:17:17:17:23
chr1	247835908	.	T	A	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=-0.01728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.816;QD=17.3212;RBI=0.0376244;REFB=0.000253027;REVB=0.0334215;RO=18;SAF=5;SAR=11;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.456793;STB=0.758327;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.000171475;OID=.;OPOS=247835908;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:11:5:15:3:11:5:15:3
chr1	247835950	.	T	C	97.3	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0140471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1673;QD=12.9736;RBI=0.0315215;REFB=-0.0112279;REVB=0.0282185;RO=18;SAF=10;SAR=2;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.529409;STB=0.813408;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0086828;OID=.;OPOS=247835950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:2:10:6:12:2:10:6:12
chr1	247836008	.	G	A	132.71	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0303539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.243;QD=15.1664;RBI=0.0303643;REFB=-0.031923;REVB=0.000793989;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243281;STB=0.640267;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0278558;OID=.;OPOS=247836008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:9:6:13:7:9:6:13:7
chr1	247836207	.	T	A	164.4	PASS	AF=0.375;AO=17;DP=46;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0103402;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.719;QD=13.7002;RBI=0.0112405;REFB=-0.0189021;REVB=-0.00440784;RO=23;SAF=10;SAR=7;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236387;STB=0.649837;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0275107;OID=.;OPOS=247836207;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:48:23:30:17:18:0.375:7:10:8:15:7:11:11:19
chr1	247875415	.	A	G	315.06	PASS	AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.0465119;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5749;QD=25.7192;RBI=0.0574705;REFB=0.00262676;REVB=-0.0337564;RO=21;SAF=13;SAR=15;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228283;STB=0.625813;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.00385437;OID=.;OPOS=247875415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:15:13:16:5:15:13:16:5
chr1	247875608	.	C	G	266.57	PASS	AF=0.392405;AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0156886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.174;QD=13.4974;RBI=0.0158279;REFB=-0.0236267;REVB=-0.00209515;RO=48;SAF=18;SAR=13;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866391;STB=0.549473;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.037551;OID=.;OPOS=247875608;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:48:48:31:31:0.392405:13:18:24:24:13:18:24:24
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chr1	247921100	.	T	G	74.46	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0789692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.73;QD=22.9108;RBI=0.0802288;REFB=0.0220599;REVB=0.014161;RO=4;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300734;STB=0.517203;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=-0.00487632;OID=.;OPOS=247921100;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:5:4:2:2:5:4:2:2
chr1	247921352	.	C	T	785.84	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.106;QD=64.1505;RBI=0.045113;REFB=0;REVB=0.0394779;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199762;OID=.;OPOS=247921352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0
chr1	247921716	.	AC	A,AA	956.22	PASS	AF=0.030303,0.969697;AO=10,56;DP=66;FAO=2,64;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22;FSAR=2,42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00962849,0.0108519;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=368.292,379.713;QD=57.9527;RBI=0.00976449,0.0108803;REFB=0,0;REVB=0.00162401,-0.000786269;RO=0;SAF=6,16;SAR=4,40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.01924e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0182748,0.00129073;OID=.,.;OPOS=247921717,247921717;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.030303,0.969697:10,56:66:2,64:66:0:0,22:2,42:0:0:6:0:6,16:4,40:0:0
chr1	247921789	.	AGT	A,AGTGT	127.53	PASS	AF=0.45,0.3;AO=6,5;DP=21;FAO=9,6;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=3,3;FSAR=6,3;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0335774,-0.0128253;FXX=0.0908678;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=54.6638,44.535;QD=25.5052;RBI=0.0346905,0.0162767;REFB=-0.193046,-0.110364;REVB=-0.00871722,0.010022;RO=5;SAF=1,3;SAR=5,2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.601011,-0.389209;STB=0.666296,0.635942;STBP=0.143,0.376;TYPE=del,ins;VARB=0.0985216,0.280045;OID=.,.;OPOS=247921790,247921790;OREF=GT,-;OALT=-,GT;OMAPALT=A,AGTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.45,0.3:6,5:21:9,6:20:5:3,3:6,3:4:1:45:5:1,3:5,2:5:0
chr1	247921888	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00249206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2559;QD=55.0981;RBI=0.0119723;REFB=0;REVB=-0.0117101;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000198023;OID=.;OPOS=247921888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr1	247978319	.	A	G	923.43	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00765672;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.05;QD=56.8266;RBI=0.0404793;REFB=-0.154681;REVB=0.0397486;RO=1;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149923;STB=0.507934;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.000737816;OID=.;OPOS=247978319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:31:33:0:1:31:33:0:1
chr1	247978541	.	AAGG	A	255.5	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143013;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=331.473;QD=51.0999;RBI=0.0205552;REFB=0;REVB=0.0147644;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000112223;OID=.;OPOS=247978542;OREF=AGG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:20:20:20:0:8:12:0:0:4:0:8:12:0:0
chr1	248004614	.	G	A	601.04	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0344511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.34;QD=58.6377;RBI=0.045655;REFB=-0.105139;REVB=-0.0299584;RO=1;SAF=14;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323178;STB=0.517233;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.00596977;OID=.;OPOS=248004614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:26:14:1:0:26:14:1:0
chr1	248004687	.	C	G	364.32	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.08317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.996;QD=53.9739;RBI=0.0873277;REFB=0;REVB=0.0266247;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000496084;OID=.;OPOS=248004687;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:25:27:1:17:8:0:0:18:9:0:0
chr1	248004775	.	C	T	253.44	PASS	AF=1;AO=17;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.543;QD=50.6877;RBI=0.0997992;REFB=0;REVB=0.0914109;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140928;OID=.;OPOS=248004775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:17:20:1:8:9:0:0:9:11:0:0
chr1	248004848	.	G	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0647111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9627;QD=40.7623;RBI=0.0821623;REFB=0;REVB=0.0506273;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00661846;OID=.;OPOS=248004848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr1	248004877	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.211;QD=40.7622;RBI=0.0526286;REFB=0;REVB=0.0238697;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127727;OID=.;OPOS=248004877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr1	248004884	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000808379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.364;QD=40.7629;RBI=0.0298634;REFB=0;REVB=0.0298524;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407973;OID=.;OPOS=248004884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr1	248005213	.	G	C	453.15	PASS	AF=0.969697;AO=31;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0443167;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2137;QD=54.9275;RBI=0.0676396;REFB=-0.011189;REVB=0.0510993;RO=1;SAF=18;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252169;STB=0.513505;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00168004;OID=.;OPOS=248005213;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:31:32:0.969697:13:18:1:0:14:18:1:0
chr1	248028219	.	G	A	84.16	PASS	AF=0.714286;AO=8;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00958915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=338.676;QD=24.0449;RBI=0.0131123;REFB=-0.00964917;REVB=0.00894317;RO=2;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459355;STB=0.517207;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00394944;OID=.;OPOS=248028219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:14:14:2:4:8:10:0.714286:3:5:1:1:3:7:3:1
chr1	248059423	.	C	T	460.54	PASS	AF=0.571429;AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0167905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.968;QD=23.9243;RBI=0.0176536;REFB=-0.0260488;REVB=0.00545232;RO=32;SAF=27;SAR=17;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922263;STB=0.503417;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0173627;OID=.;OPOS=248059423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:32:33:44:44:0.571429:17:27:20:12:17:27:20:13
chr1	248059456	.	G	A	579.85	PASS	AF=0.517544;AO=59;DP=114;FAO=59;FDP=114;FR=.;FRO=55;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=-0.0268242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4977;QD=20.3457;RBI=0.0355774;REFB=0.00338404;REVB=0.0233712;RO=54;SAF=34;SAR=25;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311487;STB=0.511759;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=-0.00422772;OID=.;OPOS=248059456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:54:55:59:59:0.517544:25:34:33:21:25:34:33:22
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chr1	248059804	.	C	T	346.91	PASS	AF=0.507042;AO=34;DP=69;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0108229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.216;QD=19.544;RBI=0.0131556;REFB=-0.024048;REVB=0.0074788;RO=34;SAF=20;SAR=14;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13257;STB=0.562613;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0207755;OID=.;OPOS=248059804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:71:34:35:34:36:0.507042:14:20:15:19:15:21:16:19
chr1	248059856	.	T	C	417.78	PASS	AF=0.5;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0653583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3051;QD=19.8945;RBI=0.0653615;REFB=-0.0099792;REVB=-0.000646266;RO=42;SAF=19;SAR=23;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.010211;OID=.;OPOS=248059856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:42:42:42:42:0.5:23:19:19:23:23:19:19:23
chr1	248060029	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0588909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.727;QD=55.0986;RBI=0.0637547;REFB=0;REVB=0.0244237;RO=0;SAF=5;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001806;OID=.;OPOS=248060029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:21:5:0:0:21:5:0:0
chr1	248060279	.	C	T	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.070205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6149;QD=14.1699;RBI=0.0733134;REFB=-0.0151724;REVB=-0.0211214;RO=12;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773769;STB=0.545364;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0132;OID=.;OPOS=248060279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:5:5:7:5:5:5:7:5
chr1	248060380	.	C	G	206.22	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=41;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0543223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6397;QD=19.6401;RBI=0.0557054;REFB=-0.0295208;REVB=-0.012336;RO=19;SAF=10;SAR=10;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113857;STB=0.571039;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0448321;OID=.;OPOS=248060380;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:19:21:20:21:0.5:10:10:7:12:10:11:8:13
chr1	248084464	.	T	C	367.28	PASS	AF=0.438202;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0035184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.102;QD=16.5069;RBI=0.0068618;REFB=-0.011339;REVB=-0.00589111;RO=49;SAF=17;SAR=22;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134022;STB=0.569585;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.01468;OID=.;OPOS=248084464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:49:50:39:39:0.438202:22:17:28:21:22:17:28:22
chr1	248084511	.	T	C	785.72	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00222843;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.845;QD=64.1407;RBI=0.0140087;REFB=0;REVB=0.0138303;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11294e-05;OID=.;OPOS=248084511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:18:31:0:0:18:31:0:0
chr1	248085124	.	G	A	1166.51	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7547;QD=60.598;RBI=0.090792;REFB=0;REVB=-0.0901412;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000333648;OID=.;OPOS=248085124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:76:77:1:38:38:0:0:38:39:0:0
chr1	248112627	.	T	C	513.96	PASS	AF=0.466102;AO=55;DP=118;FAO=55;FDP=118;FR=.;FRO=63;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=31;FWDB=0.0210377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.688;QD=17.4225;RBI=0.0285441;REFB=-0.0147846;REVB=0.0192919;RO=63;SAF=29;SAR=26;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185953;STB=0.510339;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0171298;OID=.;OPOS=248112627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:63:63:55:55:0.466102:26:29:32:31:26:29:32:31
chr1	248112745	.	G	T	638.82	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0125245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.708;QD=59.425;RBI=0.018735;REFB=-0.187914;REVB=-0.0139334;RO=1;SAF=22;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208598;STB=0.511106;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0042766;OID=.;OPOS=248112745;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:20:22:1:0:20:22:1:0
chr1	248112762	.	TG	CA	560.85	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00565606;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=2;MLLD=262.467;QD=60.6325;RBI=0.00652025;REFB=0;REVB=0.00324387;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-1.96752e-06;OID=.;OPOS=248112762;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr1	248112771	.	C	T	611.01	PASS	AF=1;AO=34;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.866;QD=61.1011;RBI=0.0774194;REFB=0;REVB=0.0761851;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000766973;OID=.;OPOS=248112771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:34:40:1:15:19:0:0:20:20:0:0
chr1	248112809	.	A	G	670.24	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0016819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.319;QD=62.3483;RBI=0.00742659;REFB=0;REVB=0.00723363;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.99887e-05;OID=.;OPOS=248112809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0
chr1	248112836	.	A	G	465.11	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0612526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9644;QD=58.1386;RBI=0.0959999;REFB=0;REVB=0.0739195;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144979;OID=.;OPOS=248112836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0
chr1	248113026	.	T	A	785.67	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=346.17;QD=64.136;RBI=0.0645955;REFB=0;REVB=0.0157674;RO=0;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27986e-05;OID=.;OPOS=248113026;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:32:14:0:0:34:15:0:0
chr1	248113040	.	A	G	728.97	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6853;QD=57.1743;RBI=0.034388;REFB=0;REVB=-0.028195;RO=0;SAF=15;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.746e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000542174;OID=.;OPOS=248113040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:36:15:0:0:36:15:0:0
chr1	248128929	.	G	A	126.19	PASS	AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.00731771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.683;QD=10.9731;RBI=0.0322886;REFB=-0.0216089;REVB=-0.0314484;RO=31;SAF=11;SAR=4;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157202;STB=0.594461;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0451147;OID=.;OPOS=248128929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:4:11:19:12:4:11:19:12
chr1	248129240	.	G	A	574.15	PASS	AF=0.54717;AO=58;DP=108;FAO=58;FDP=106;FR=.;FRO=48;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.000687892;FXX=0.0185168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1782;QD=21.6661;RBI=0.0200717;REFB=-0.0241462;REVB=-0.0200599;RO=47;SAF=32;SAR=26;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857522;STB=0.551706;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0187337;OID=.;OPOS=248129240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:106:47:48:58:58:0.54717:26:32:21:26:26:32:21:27
chr1	248224690	.	C	T	286.49	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0167239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.624;QD=24.3824;RBI=0.0183517;REFB=-0.0177748;REVB=-0.00755615;RO=21;SAF=8;SAR=18;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209189;STB=0.511619;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0139172;OID=.;OPOS=248224690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:18:8:6:15:18:8:6:15
chr1	248264018	.	C	T	1676.82	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.574;QD=60.426;RBI=0.037969;REFB=0;REVB=0.0345539;RO=0;SAF=54;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40739e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.81778e-05;OID=.;OPOS=248264018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:57:54:0:0:57:54:0:0
chr1	248308979	.	T	A	955.65	PASS	AF=0.469767;AO=100;DP=214;FAO=101;FDP=215;FR=.;FRO=114;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=67;FSRR=47;FWDB=-0.0159735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.447;QD=17.7795;RBI=0.0159738;REFB=-0.013473;REVB=8.56649e-05;RO=113;SAF=54;SAR=46;SRF=66;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427746;STB=0.523161;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0136797;OID=.;OPOS=248308979;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:214:215:113:114:100:101:0.469767:46:54:66:47:46:55:67:47
chr1	248343543	.	C	T	2193.38	PASS	AF=0.979167;AO=139;DP=144;FAO=141;FDP=144;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=89;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00821159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6729;QD=60.9271;RBI=0.0803104;REFB=-0.165334;REVB=0.0798895;RO=3;SAF=50;SAR=89;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133233;STB=0.50664;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00455482;OID=.;OPOS=248343543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:144:144:3:3:139:141:0.979167:89:50:2:1:89:52:2:1
chr1	248343945	.	C	G	2046.07	PASS	AF=1;AO=129;DP=129;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.464;QD=62.4755;RBI=0.047954;REFB=0;REVB=0.0467663;RO=0;SAF=75;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.72405e-05;OID=.;OPOS=248343945;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:131:0:0:129:131:1:54:75:0:0:55:76:0:0
chr1	248343990	.	T	C	2197.62	PASS	AF=1;AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.864;QD=63.241;RBI=0.0407126;REFB=0;REVB=0.0314771;RO=0;SAF=85;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58833e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.19673e-05;OID=.;OPOS=248343990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:139:139:0:0:139:139:1:54:85:0:0:54:85:0:0
chr1	248366702	.	G	A	2231.04	PASS	AF=1;AO=137;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.075411;FXX=0.0208319;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.241;QD=63.292;RBI=0.0863466;REFB=0;REVB=0.0420586;RO=0;SAF=79;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.59527e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241526;OID=.;OPOS=248366702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:141:0:0:137:141:1:58:79:0:0:61:80:0:0
chr1	248367014	.	TG	CA	676.96	PASS	AF=0.39;AO=78;DP=201;FAO=78;FDP=200;FR=.;FRO=122;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=58;FSRR=64;FWDB=-0.0711991;FXX=0.00497488;HRUN=2;LEN=2;MLLD=179.105;QD=13.5392;RBI=0.0750006;REFB=-0.0230791;REVB=0.0235748;RO=118;SAF=44;SAR=34;SRF=54;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113989;STB=0.554228;STBP=0.223;TYPE=mnp;VARB=0.0399589;OID=.;OPOS=248367014;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:201:200:118:122:78:78:0.39:34:44:54:64:34:44:58:64
chr1	248402758	.	C	T	1598.54	PASS	AF=1;AO=81;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.716;QD=59.2053;RBI=0.0296618;REFB=0;REVB=0.0196966;RO=0;SAF=41;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116997;OID=.;OPOS=248402758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:108:0:0:81:108:1:40:41:0:0:49:59:0:0
chr1	248436611	.	G	A	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.391;QD=57.2376;RBI=0.0555398;REFB=0;REVB=0.0541714;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282867;OID=.;OPOS=248436611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr1	248436616	.	A	G	817.18	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00366396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.273;QD=57.3461;RBI=0.0502595;REFB=0;REVB=0.0501257;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108573;OID=.;OPOS=248436616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:25:31:0:0:26:31:0:0
chr1	248436805	.	T	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00672171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.093;QD=56.1916;RBI=0.0691275;REFB=0;REVB=0.0687999;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153117;OID=.;OPOS=248436805;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr1	248457979	.	C	A	1062.2	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.707;QD=59.8423;RBI=0.0554442;REFB=0;REVB=0.054257;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.41544e-05;OID=.;OPOS=248457979;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:36:35:0:0:36:35:0:0
chr1	248458676	.	T	C	755.26	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00883052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.739;QD=54.9282;RBI=0.0398845;REFB=-0.151332;REVB=0.0388947;RO=1;SAF=19;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132766;STB=0.50704;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00178038;OID=.;OPOS=248458676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:35:19:0:1:35:19:0:1
chr1	248458689	.	A	G	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00640796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=338.581;QD=59.6795;RBI=0.00968495;REFB=0;REVB=0.00726198;RO=0;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05448e-05;OID=.;OPOS=248458689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:43:27:0:0:43:27:0:0
chr1	248458717	.	C	G	1415.23	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00776783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.873;QD=62.8993;RBI=0.0195062;REFB=0;REVB=-0.0178928;RO=0;SAF=39;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.24868e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.73221e-05;OID=.;OPOS=248458717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:51:39:0:0:51:39:0:0
chr1	248487100	.	G	T	376.85	PASS	AF=0.365854;AO=45;DP=124;FAO=45;FDP=123;FR=.;FRO=78;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=52;FSRR=26;FWDB=0.00488279;FXX=0.0238076;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.483;QD=12.2554;RBI=0.0141743;REFB=-0.0118021;REVB=0.0133068;RO=74;SAF=22;SAR=23;SRF=50;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204341;STB=0.612183;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0163294;OID=.;OPOS=248487100;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:123:74:78:45:45:0.365854:23:22:50:24:23:22:52:26
chr1	248487300	.	C	T	2702.08	PASS	AF=1;AO=173;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00269315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.058;QD=62.1168;RBI=0.0564599;REFB=0;REVB=0.0563957;RO=0;SAF=98;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000343481;OID=.;OPOS=248487300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:173:174:0:0:173:174:1:75:98:0:0:76:98:0:0
chr1	248487338	.	C	A	3136.36	PASS	AF=1;AO=203;DP=204;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=121;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219218;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.607;QD=61.8003;RBI=0.0346438;REFB=0;REVB=0.0268259;RO=0;SAF=121;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.26681e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.39138e-07;OID=.;OPOS=248487338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:204:203:0:0:203:203:1:82:121:0:0:82:121:0:0
chr1	248487638	.	A	G	1731.27	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00966213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.585;QD=60.7462;RBI=0.0156233;REFB=0;REVB=0.0122772;RO=0;SAF=67;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3323e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.41261e-06;OID=.;OPOS=248487638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:114:114:0:0:114:114:1:47:67:0:0:47:67:0:0
chr1	248487768	.	A	G	826.93	PASS	AF=0.967213;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0583306;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=65.2301;QD=54.2246;RBI=0.0630434;REFB=0.00216956;REVB=0.0239168;RO=0;SAF=46;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513143;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=-7.2534e-06;OID=.;OPOS=248487768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:61:61:0:2:59:59:0.967213:13:46:0:0:13:46:1:1
chr1	248512094	.	C	T	333.96	PASS	AF=0.393617;AO=37;DP=94;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.00207117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.244;QD=14.2112;RBI=0.0185361;REFB=-0.011512;REVB=-0.01842;RO=56;SAF=25;SAR=12;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231248;STB=0.627169;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0220693;OID=.;OPOS=248512094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:56:57:37:37:0.393617:12:25:26:30:12:25:27:30
chr1	248512498	.	A	G	305.42	PASS	AF=0.492537;AO=32;DP=66;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0070612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.307;QD=18.2338;RBI=0.00793596;REFB=-0.0144328;REVB=0.00362201;RO=34;SAF=25;SAR=7;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191798;STB=0.587849;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0130722;OID=.;OPOS=248512498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:34:34:32:33:0.492537:7:25:21:13:8:25:21:13
chr1	248512637	.	C	T	493.74	PASS	AF=0.494845;AO=47;DP=96;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.00845729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.635;QD=20.3604;RBI=0.00847317;REFB=-0.0338265;REVB=0.000518552;RO=49;SAF=23;SAR=24;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941491;STB=0.546373;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0302066;OID=.;OPOS=248512637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:49:49:47:48:0.494845:24:23:29:20:24:24:29:20
chr1	248512749	.	G	A	271.67	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.00628865;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.577;QD=14.6846;RBI=0.00767714;REFB=-0.016205;REVB=0.00440356;RO=41;SAF=20;SAR=11;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210546;STB=0.632603;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0186174;OID=.;OPOS=248512749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:74:41:43:31:31:0.418919:11:20:18:23:11:20:18:25
chr1	248512767	.	G	T	213.48	PASS	AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0158893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.268;QD=12.7449;RBI=0.0161549;REFB=-0.019952;REVB=-0.00291725;RO=40;SAF=17;SAR=9;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292508;STB=0.660448;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0495038;OID=.;OPOS=248512767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:40:41:26:26:0.38806:9:17:15:25:9:17:16:25
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chr1	248525330	.	A	G	139.6	PASS	AF=0.2;AO=24;DP=120;FAO=24;FDP=120;FR=.;FRO=96;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=67;FWDB=-0.0408871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.47;QD=4.65322;RBI=0.0419561;REFB=-0.0205181;REVB=-0.00941072;RO=95;SAF=10;SAR=14;SRF=28;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167074;STB=0.59727;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0664545;OID=.;OPOS=248525330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:95:96:24:24:0.2:14:10:28:67:14:10:29:67
chr1	248525647	.	C	A	230.38	PASS	AF=0.368421;AO=28;DP=76;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=-0.0168509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.9;QD=12.1255;RBI=0.0283538;REFB=-0.00924249;REVB=-0.0228031;RO=47;SAF=6;SAR=22;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.537118;STB=0.80271;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0344064;OID=.;OPOS=248525647;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:47:48:28:28:0.368421:22:6:34:13:22:6:34:14
chr1	248525650	.	C	T	231.77	PASS	AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=-0.0531612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.183;QD=12.3609;RBI=0.0567506;REFB=-0.018858;REVB=-0.0198624;RO=47;SAF=6;SAR=22;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.537118;STB=0.807129;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0325362;OID=.;OPOS=248525650;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:47:47:28:28:0.373333:22:6:34:13:22:6:34:13
chr1	248525657	.	G	A	201.62	PASS	AF=0.357143;AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=13;FWDB=-0.0374122;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.612;QD=11.5213;RBI=0.0374525;REFB=-0.0102331;REVB=-0.00173759;RO=43;SAF=5;SAR=20;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.536424;STB=0.817435;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0164562;OID=.;OPOS=248525657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:70:43:45:25:25:0.357143:20:5:30:13:20:5:32:13
chr1	248525780	.	C	T	421.33	PASS	AF=0.443396;AO=47;DP=106;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.0107379;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.532;QD=15.8991;RBI=0.0129493;REFB=-0.0303811;REVB=0.00723748;RO=58;SAF=32;SAR=15;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205539;STB=0.611416;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0338619;OID=.;OPOS=248525780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:58:59:47:47:0.443396:15:32:28:30:15:32:29:30
chr1	248550970	.	A	G	186.98	PASS	AF=0.342857;AO=24;DP=70;FAO=24;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.0102894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.809;QD=10.6845;RBI=0.0567012;REFB=0.00606522;REVB=0.0557598;RO=46;SAF=8;SAR=16;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329614;STB=0.691433;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.0249456;OID=.;OPOS=248550970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:46:46:24:24:0.342857:16:8:29:17:16:8:29:17
chr1	248550976	.	T	G	192.88	PASS	AF=0.324675;AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=77;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.00720797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.428;QD=10.0197;RBI=0.00904994;REFB=-0.00756561;REVB=0.00547236;RO=51;SAF=9;SAR=16;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260093;STB=0.657635;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0120177;OID=.;OPOS=248550976;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:51:52:25:25:0.324675:16:9:30:21:16:9:31:21
chr1	248551203	.	T	C	123.12	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.148443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9547;QD=16.4157;RBI=0.148565;REFB=-0.00157518;REVB=-0.00601551;RO=15;SAF=5;SAR=9;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162948;STB=0.611489;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.007423;OID=.;OPOS=248551203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:16:14:14:0.466667:9:5:8:7:9:5:9:7
chr1	248551560	.	C	T	480.45	PASS	AF=0.494737;AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.0357251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8633;QD=20.2294;RBI=0.0359871;REFB=0.01007;REVB=0.00433486;RO=48;SAF=22;SAR=25;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123526;STB=0.568406;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=-0.0112088;OID=.;OPOS=248551560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:48:48:47:47:0.494737:25:22:29:19:25:22:29:19
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chr1	248551701	.	T	C	453.84	PASS	AF=0.435897;AO=50;DP=116;FAO=51;FDP=117;FR=.;FRO=66;FSAF=42;FSAR=9;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=-0.0135211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2977;QD=15.5159;RBI=0.0136754;REFB=-0.0246085;REVB=-0.00204884;RO=66;SAF=41;SAR=9;SRF=42;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25383;STB=0.646994;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0299511;OID=.;OPOS=248551701;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:117:66:66:50:51:0.435897:9:41:42:24:9:42:42:24
chr1	248616401	.	G	A	2940.38	PASS	AF=0.743671;AO=233;DP=315;FAO=235;FDP=316;FR=.;FRO=81;FSAF=78;FSAR=157;FSRF=36;FSRR=45;FWDB=0.0176516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.059;QD=37.2199;RBI=0.0180928;REFB=-0.016033;REVB=0.00397131;RO=78;SAF=76;SAR=157;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057509;STB=0.531821;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00529091;OID=.;OPOS=248616401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:315:316:78:81:233:235:0.743671:157:76:34:44:157:78:36:45
chr1	248616408	.	C	T	2916.65	PASS	AF=0.735849;AO=234;DP=318;FAO=234;FDP=318;FR=.;FRO=84;FSAF=78;FSAR=156;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=-0.00862163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5426;QD=36.6874;RBI=0.036576;REFB=0.000901913;REVB=-0.0355453;RO=84;SAF=78;SAR=156;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064814;STB=0.534559;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.00049944;OID=.;OPOS=248616408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:318:318:84:84:234:234:0.735849:156:78:38:46:156:78:38:46
chr1	248616466	.	G	T	286.33	PASS	AF=0.234043;AO=44;DP=188;FAO=44;FDP=188;FR=.;FRO=144;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=52;FSRR=92;FWDB=-0.0274745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.165;QD=6.09222;RBI=0.0286493;REFB=-0.00575713;REVB=-0.00811994;RO=144;SAF=22;SAR=22;SRF=52;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176836;STB=0.606337;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0202592;OID=.;OPOS=248616466;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:188:144:144:44:44:0.234043:22:22:52:92:22:22:52:92
chr1	248637046	.	G	A	137.98	PASS	AF=0.875;AO=13;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.105516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.963;QD=34.4937;RBI=0.108019;REFB=-0.0520319;REVB=0.0231173;RO=3;SAF=6;SAR=7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691109;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00857864;OID=.;OPOS=248637046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:16:16:3:2:13:14:0.875:7:6:2:1:7:7:1:1
chr1	248637362	.	C	T	1029.68	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351327;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.273;QD=59.6917;RBI=0.0390569;REFB=0;REVB=0.0170626;RO=0;SAF=48;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192657;OID=.;OPOS=248637362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:21:48:0:0:21:48:0:0
chr1	248637416	.	GC	CT	386.47	PASS	AF=0.424528;AO=43;DP=106;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=22;FWDB=-0.0128603;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=2;MLLD=241.174;QD=14.5837;RBI=0.0266853;REFB=-0.0196058;REVB=-0.0233821;RO=61;SAF=26;SAR=17;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380904;STB=0.510529;STBP=0.867;TYPE=mnp;VARB=0.0262637;OID=.;OPOS=248637416;OREF=GC;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:61:61:43:45:0.424528:17:26:39:22:17:28:39:22
chr1	248637480	.	A	G	156.43	PASS	AF=0.179012;AO=29;DP=164;FAO=29;FDP=162;FR=.;FRO=133;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=84;FSRR=49;FWDB=-0.0315567;FXX=0.0181807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.155;QD=3.86244;RBI=0.0317602;REFB=-0.00493757;REVB=0.00358927;RO=129;SAF=14;SAR=15;SRF=80;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176321;STB=0.621222;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.022979;OID=.;OPOS=248637480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:162:129:133:29:29:0.179012:15:14:80:49:15:14:84:49
chr1	248637482	.	G	T	160.04	PASS	AF=0.183544;AO=30;DP=162;FAO=29;FDP=158;FR=.;FRO=129;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=79;FSRR=50;FWDB=0.00419372;FXX=0.0246898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7332;QD=4.05172;RBI=0.0131864;REFB=0.00397527;REVB=0.0125018;RO=131;SAF=14;SAR=16;SRF=82;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20347;STB=0.605136;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.0204711;OID=.;OPOS=248637482;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:158:131:129:30:29:0.183544:16:14:82:49:15:14:79:50
chr1	248637543	.	C	T	628.28	PASS	AF=0.382979;AO=72;DP=188;FAO=72;FDP=188;FR=.;FRO=116;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=78;FSRR=38;FWDB=-0.017248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.533;QD=13.3676;RBI=0.0336739;REFB=-0.0176556;REVB=0.0289213;RO=115;SAF=33;SAR=39;SRF=77;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227878;STB=0.630097;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0232363;OID=.;OPOS=248637543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:188:115:116:72:72:0.382979:39:33:77:38:39:33:78:38
chr1	248652011	.	A	T	64.54	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0303188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1593;QD=25.8178;RBI=0.149158;REFB=-0.0833127;REVB=-0.146044;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.583115;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.00216421;OID=.;OPOS=248652011;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:10:10:0:2:7:7:0.7:5:2:0:0:5:2:0:2
chr1	248652023	.	G	A	54.69	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0859134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.7834;QD=24.3059;RBI=0.0873718;REFB=0.0296062;REVB=-0.015897;RO=2;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145918;STB=0.583115;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=-0.00429553;OID=.;OPOS=248652023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:5:2:0:2:5:2:0:2
chr1	248652058	.	G	A	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0548951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.711;QD=26.0262;RBI=0.0575151;REFB=0.00849916;REVB=0.0171613;RO=1;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962265;STB=0.555378;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=-0.00181658;OID=.;OPOS=248652058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:4:2:0:1:4:2:0:1
chr1	248652061	.	C	T	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0421245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.599;QD=26.0266;RBI=0.0421409;REFB=-0.078103;REVB=-0.00117793;RO=1;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962265;STB=0.555378;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00557749;OID=.;OPOS=248652061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:4:2:0:1:4:2:0:1
chr1	248685253	.	T	C	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.237;QD=57.8846;RBI=0.0160631;REFB=0;REVB=0.00988134;RO=0;SAF=41;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31043e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42875e-05;OID=.;OPOS=248685253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:19:41:0:0:19:41:0:0
chr1	248722611	.	C	G	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.1;QD=37.4865;RBI=0.0322419;REFB=0;REVB=0.0296148;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000427868;OID=.;OPOS=248722611;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0
chr1	248722620	.	T	TA	125.76	PASS	AF=0.866667;AO=3;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.1047;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=168.012;QD=33.537;RBI=0.106823;REFB=-0.119459;REVB=0.0211916;RO=12;SAF=0;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.613239;STB=0.555473;STBP=0.397;TYPE=ins;VARB=0.00590181;OID=.;OPOS=248722621;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.866667:3:15:13:15:2:5:8:0:2:10:12:0:3:5:7
chr1	248722621	.	G	A	85.09	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.0317141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.436;QD=22.6897;RBI=0.0336028;REFB=-0.169986;REVB=0.011107;RO=5;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295997;STB=0.666369;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.024711;OID=.;OPOS=248722621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:15:15:5:5:10:10:0.666667:5:5:0:5:5:5:0:5
chr1	248722624	.	C	T	133.08	PASS	AF=0.866667;AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0626372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.67;QD=35.4875;RBI=0.0626525;REFB=-0.0760235;REVB=0.00138251;RO=2;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100543;STB=0.555473;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0125783;OID=.;OPOS=248722624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:15:15:2:2:13:13:0.866667:8:5:0:2:8:5:0:2
chr1	248722659	.	C	T	172.11	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.00047548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9827;QD=26.4787;RBI=0.0660623;REFB=0.0464068;REVB=0.0660606;RO=9;SAF=6;SAR=11;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133928;STB=0.507454;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=-0.0245647;OID=.;OPOS=248722659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:11:6:3:6:11:6:3:6
chr1	248722671	.	T	A	417.97	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00514696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.241;QD=53.932;RBI=0.0119873;REFB=-0.00344323;REVB=0.0108261;RO=1;SAF=13;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345091;STB=0.518506;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000417771;OID=.;OPOS=248722671;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:17:13:1:0:17:13:1:0
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chr1	248722752	.	A	G	85.28	PASS	AF=0.212121;AO=14;DP=63;FAO=14;FDP=66;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.0738366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9253;QD=5.16873;RBI=0.0739537;REFB=-0.0286455;REVB=-0.00415928;RO=49;SAF=8;SAR=6;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223741;STB=0.615223;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0978657;OID=.;OPOS=248722752;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:63:66:49:52:14:14:0.212121:6:8:19:30:6:8:22:30
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chr1	248737293	.	GC	AG	149.47	PASS	AF=0.415094;AO=21;DP=54;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0163906;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=2;MLLD=179.604;QD=11.2806;RBI=0.0661529;REFB=-0.0932757;REVB=0.0640902;RO=31;SAF=1;SAR=20;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.61276;STB=0.781798;STBP=0.01;TYPE=mnp;VARB=0.100722;OID=.;OPOS=248737293;OREF=GC;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:31:31:21:22:0.415094:20:1:12:19:20:2:12:19
chr1	248737319	.	G	A	110.17	PASS	AF=0.239437;AO=17;DP=71;FAO=17;FDP=71;FR=.;FRO=54;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=0.0236418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9126;QD=6.20676;RBI=0.0696946;REFB=-0.0123797;REVB=0.0655622;RO=54;SAF=3;SAR=14;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255641;STB=0.661946;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0503901;OID=.;OPOS=248737319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:54:54:17:17:0.239437:14:3:18:36:14:3:18:36
chr1	248737329	.	C	T	158.51	PASS	AF=0.285714;AO=22;DP=77;FAO=22;FDP=77;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=43;FWDB=-0.00545918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2558;QD=8.23416;RBI=0.0295843;REFB=-0.00932227;REVB=0.0290763;RO=55;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301251;STB=0.67554;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0170891;OID=.;OPOS=248737329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:55:55:22:22:0.285714:12:10:12:43:12:10:12:43
chr1	248737343	.	C	T	355.04	PASS	AF=0.436782;AO=38;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.00681445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.755;QD=16.3237;RBI=0.0127676;REFB=-0.0263283;REVB=-0.010797;RO=48;SAF=11;SAR=27;SRF=15;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027394;STB=0.524825;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0290234;OID=.;OPOS=248737343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:48:49:38:38:0.436782:27:11:15:33:27:11:16:33
chr1	248737348	.	G	A	803.95	PASS	AF=0.714286;AO=65;DP=91;FAO=65;FDP=91;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=49;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0140885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7709;QD=35.3384;RBI=0.0158159;REFB=0.0183408;REVB=-0.00718733;RO=26;SAF=16;SAR=49;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117955;STB=0.563678;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.00604468;OID=.;OPOS=248737348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:26:26:65:65:0.714286:49:16:11:15:49:16:11:15
chr1	248737454	.	A	G	102.95	PASS	AF=0.139241;AO=22;DP=158;FAO=22;FDP=158;FR=.;FRO=136;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=57;FSRR=79;FWDB=0.0208113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.151;QD=2.60624;RBI=0.0208114;REFB=-0.00484208;REVB=6.48168e-05;RO=134;SAF=14;SAR=8;SRF=55;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279997;STB=0.681812;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0425764;OID=.;OPOS=248737454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:134:136:22:22:0.139241:8:14:55:79:8:14:57:79
chr1	248737511	.	A	G	158.84	PASS	AF=0.277108;AO=21;DP=75;FAO=23;FDP=83;FR=.;FRO=60;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=0.0736428;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=39.131;QD=7.65503;RBI=0.0895683;REFB=-0.00747151;REVB=-0.0509826;RO=53;SAF=7;SAR=14;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358226;STB=0.67886;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0109472;OID=.;OPOS=248737511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:83:53:60:21:23:0.277108:14:7:34:19:15:8:36:24
chr1	248737595	.	A	G	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214166;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=227.243;QD=51.1827;RBI=0.0230161;REFB=0;REVB=-0.00843027;RO=0;SAF=2;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.54002e-05;OID=.;OPOS=248737595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:18:2:0:0:18:2:0:0
chr1	248789504	.	T	C	207.43	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.398;QD=48.8063;RBI=0.0460326;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=16;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000571362;OID=.;OPOS=248789504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:0:16:0:0:0:17:0:0
chr1	248789753	.	G	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539903;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.18;QD=50.4135;RBI=0.0574382;REFB=0;REVB=0.0196008;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000380806;OID=.;OPOS=248789753;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr1	248790167	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2468;QD=44.6896;RBI=0.0536175;REFB=0;REVB=0.016382;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00150228;OID=.;OPOS=248790167;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr1	248790199	.	T	C	194.0	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213839;FXX=0.0587889;HRUN=4;LEN=1;MLLD=170.197;QD=48.501;RBI=0.036242;REFB=0;REVB=-0.0292611;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000571599;OID=.;OPOS=248790199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr1	248801592	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.276;QD=45.8067;RBI=0.0753172;REFB=0;REVB=0.054584;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181808;OID=.;OPOS=248801592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr1	248801602	.	T	TCA	149.37	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197383;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=2;MLLD=310.51;QD=45.9593;RBI=0.0743305;REFB=0;REVB=0.0716619;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000383497;OID=.;OPOS=248801603;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=TCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:13:14:13:13:0:7:6:0:0:4:0:7:6:0:0
chr1	248801610	.	GC	AT	149.39	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00215112;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=2;MLLD=168.817;QD=45.9661;RBI=0.0457561;REFB=0;REVB=0.0457055;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000590571;OID=.;OPOS=248801610;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr1	248801633	.	A	G	137.61	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0235629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=325.217;QD=39.318;RBI=0.0351306;REFB=-0.0458017;REVB=0.0260567;RO=1;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695995;STB=0.538402;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.00275459;OID=.;OPOS=248801633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:14:1:1:13:13:0.928571:7:6:1:0:7:6:1:0
chr1	248801897	.	G	A	115.54	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0620021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4435;QD=30.8114;RBI=0.067445;REFB=0.0668336;REVB=0.0265436;RO=3;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117832;STB=0.565118;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=-0.0108348;OID=.;OPOS=248801897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:15:15:3:3:12:12:0.8:10:2:0:3:10:2:0:3
chr1	248813280	.	C	T	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=345.626;QD=53.9112;RBI=0.0332182;REFB=0;REVB=-0.0138128;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.34174e-05;OID=.;OPOS=248813280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr1	248813542	.	G	A	272.89	PASS	AF=0.916667;AO=20;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0188665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.166;QD=45.4824;RBI=0.0310056;REFB=0.0439281;REVB=0.0246049;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.549954;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.00172639;OID=.;OPOS=248813542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:0:2:20:22:0.916667:9:11:0:0:9:13:0:2
chr1	248813723	.	C	T	62.25	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4036;QD=35.5696;RBI=0.154836;REFB=0;REVB=0.154087;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0135549;OID=.;OPOS=248813723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:2:4:0:0:3:4:0:0
chr1	248814052	.	T	A	133.84	PASS	AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0253268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.655;QD=25.4936;RBI=0.0389645;REFB=-0.0355734;REVB=0.0296106;RO=7;SAF=8;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168706;STB=0.59446;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0191793;OID=.;OPOS=248814052;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:7:7:14:14:0.666667:6:8:2:5:6:8:2:5
chr1	248814080	.	A	C	266.75	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000490466;FXX=0.0434594;HRUN=5;LEN=1;MLLD=309.492;QD=48.499;RBI=0.0116165;REFB=-0.0495659;REVB=0.0116062;RO=1;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401224;STB=0.521719;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00175766;OID=.;OPOS=248814080;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:11:10:0:1:11:10:0:1
chr1	248814126	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00925161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.574;QD=48.7369;RBI=0.0298639;REFB=0;REVB=0.0283947;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320855;OID=.;OPOS=248814126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr1	248844959	.	T	C	244.0	PASS	AF=0.482143;AO=21;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00222688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.314;QD=17.4286;RBI=0.00251839;REFB=-0.021575;REVB=-0.00117613;RO=26;SAF=11;SAR=10;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518669;STB=0.555514;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0171821;OID=.;OPOS=248844959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:26:29:21:27:0.482143:10:11:15:11:15:12:16:13
chr1	248845356	.	G	T	452.62	PASS	AF=0.646154;AO=42;DP=65;FAO=42;FDP=65;FR=.;FRO=23;FSAF=39;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0266543;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.46;QD=27.8532;RBI=0.027144;REFB=0.0132004;REVB=-0.00513271;RO=23;SAF=39;SAR=3;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363721;STB=0.702579;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00436532;OID=.;OPOS=248845356;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:23:23:42:42:0.646154:3:39:16:7:3:39:16:7
chr1	248845411	.	G	A	231.35	PASS	AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=9;FWDB=0.0045138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.056;QD=12.3388;RBI=0.00551489;REFB=-0.023293;REVB=-0.00316854;RO=47;SAF=18;SAR=10;SRF=38;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213386;STB=0.620767;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0357243;OID=.;OPOS=248845411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:47:47:28:28:0.373333:10:18:38:9:10:18:38:9
chr1	248845458	.	C	T	151.54	PASS	AF=0.333333;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.00104584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.045;QD=10.1027;RBI=0.0307243;REFB=-0.0175256;REVB=-0.0307065;RO=39;SAF=13;SAR=7;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421135;STB=0.535806;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0256973;OID=.;OPOS=248845458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:39:40:20:20:0.333333:7:13:24:15:7:13:24:16
chr1	248845471	.	T	C	769.01	PASS	AF=1;AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00455981;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.119;QD=64.0843;RBI=0.0528756;REFB=0;REVB=0.0526787;RO=1;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268575;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000497059;OID=.;OPOS=248845471;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:1:0:47:48:1:17:30:0:1:18:30:0:0
chr1	248845499	.	A	G	670.23	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.18;QD=62.3471;RBI=0.0900151;REFB=0;REVB=0.0734182;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000863887;OID=.;OPOS=248845499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0
chr1	249105163	.	T	C	1789.19	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000334289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1569;QD=60.6503;RBI=0.0301762;REFB=0;REVB=0.0301744;RO=0;SAF=56;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23074e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.63476e-05;OID=.;OPOS=249105163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:118:0:0:114:118:1:58:56:0:0:61:57:0:0
chr1	249111262	.	C	T	85.58	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0508279;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2977;QD=10.6971;RBI=0.065271;REFB=0.00224402;REVB=-0.0409491;RO=21;SAF=3;SAR=8;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.42004;STB=0.750938;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.00902498;OID=.;OPOS=249111262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:33:32:21:21:11:11:0.34375:8:3:14:7:8:3:14:7
chr1	249142930	.	GA	G,GG	244.17	PASS	AF=0.491525,0.0169492;AO=29,3;DP=61;FAO=29,1;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=18,0;FSAR=11,1;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.190539,-0.161794;FXX=0.0327815;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=19.8974,22.1106;QD=16.5541;RBI=0.201962,0.199704;REFB=-0.0114638,0.00199476;REVB=-0.0669584,-0.117065;RO=25;SAF=19,2;SAR=10,1;SRF=14;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.48263,0;SSSB=0.0849208,0.117477;STB=0.5,0.992109;STBP=1,0.231;TYPE=del,snp;VARB=-0.000224337,-0.0100638;OID=.,.;OPOS=249142931,249142931;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.491525,0.0169492:29,3:61:29,1:59:29:18,0:11,1:18:11:99:25:19,2:10,1:14:11
chr1	249142936	.	A	G	287.94	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0153159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6648;QD=18.5766;RBI=0.0837134;REFB=0.00231206;REVB=-0.0823004;RO=31;SAF=18;SAR=13;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029835;STB=0.516638;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=-0.00339585;OID=.;OPOS=249142936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:13:18:19:12:13:18:19:12
chr1	249143646	.	G	T	1534.16	PASS	AF=1;AO=97;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00928451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.614;QD=61.3664;RBI=0.0586319;REFB=-0.152744;REVB=0.0578922;RO=2;SAF=59;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243037;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00077038;OID=.;OPOS=249143646;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:100:100:2:0:97:100:1:38:59:0:2:41:59:0:0
chr1	249168107	.	G	C	501.57	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.652;QD=59.0087;RBI=0.0255689;REFB=0;REVB=0.00906486;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127543;OID=.;OPOS=249168107;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr1	249168433	.	G	A	708.71	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.748;QD=62.9967;RBI=0.0572495;REFB=0;REVB=0.0549955;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384692;OID=.;OPOS=249168433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:45:0:0:42:45:1:14:28:0:0:14:31:0:0
chr1	249168436	.	G	A	708.54	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.719;QD=62.9813;RBI=0.0372606;REFB=0;REVB=0.0304359;RO=0;SAF=31;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016251;OID=.;OPOS=249168436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:14:31:0:0:14:31:0:0
chr1	249168516	.	A	G	590.54	PASS	AF=0.955556;AO=38;DP=42;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0574871;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.864;QD=52.4921;RBI=0.098214;REFB=-0.122466;REVB=-0.0796319;RO=4;SAF=17;SAR=21;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098277;STB=0.521729;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0219871;OID=.;OPOS=249168516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:42:45:4:2:38:43:0.955556:21:17:4:0:21:22:2:0
chr1	249206974	.	A	C	85.23	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0697157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1906;QD=11.3645;RBI=0.0985926;REFB=-0.0423578;REVB=0.0697152;RO=19;SAF=5;SAR=6;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241378;STB=0.642612;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0754065;OID=.;OPOS=249206974;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:6:5:13:6:6:5:13:6
chr1	249211729	.	C	G	229.58	PASS	AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.02917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1097;QD=22.3979;RBI=0.0494363;REFB=-0.0225588;REVB=-0.0399131;RO=19;SAF=6;SAR=16;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273013;STB=0.653699;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0268755;OID=.;OPOS=249211729;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:16:6:11:8:16:6:11:8
chr2	242800	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00115147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.849;QD=42.1819;RBI=0.0534407;REFB=0;REVB=0.0534283;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000724628;OID=.;OPOS=242800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr2	243504	.	C	T	344.66	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243725;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.9563;QD=55.1462;RBI=0.0245944;REFB=0;REVB=-0.0032968;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181093;OID=.;OPOS=243504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr2	269352	.	G	A	994.11	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00245817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.617;QD=57.6294;RBI=0.00247828;REFB=-0.0776591;REVB=0.000315051;RO=1;SAF=38;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122766;STB=0.506492;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000408077;OID=.;OPOS=269352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:30:38:1:0:30:38:1:0
chr2	676177	.	C	G	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.291;QD=58.4194;RBI=0.0447602;REFB=0;REVB=0.00318664;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.87813e-05;OID=.;OPOS=676177;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:31:32:0:0:31:32:0:0
chr2	1079320	.	C	T	1719.45	PASS	AF=0.982906;AO=115;DP=117;FAO=115;FDP=117;FR=.;FRO=2;FSAF=63;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0707943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0019;QD=58.7847;RBI=0.0781455;REFB=-0.0321679;REVB=-0.033089;RO=2;SAF=63;SAR=52;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179115;STB=0.509432;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.000708871;OID=.;OPOS=1079320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:117:117:2:2:115:115:0.982906:52:63:0:2:52:63:0:2
chr2	1099075	.	TTAT	CTTT,TTCT,TTTC,TTTT	1690.94	PASS	AF=0.0551181,0.629921,0.212598,0.0866142;AO=7,38,15,17;DP=112;FAO=7,80,27,11;FDP=127;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=3,55,9,2;FSAR=4,25,18,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415355,0.0532987,0.057706,0.0159323;FXX=0;HRUN=11,1,1,1;LEN=3,1,2,1;MLLD=50.2639,48.7338,66.3275,90.9078;QD=53.2579;RBI=0.106725,0.0940423,0.112092,0.0401057;REFB=0,0,0,0;REVB=0.0983112,0.0774803,0.0960975,0.0368052;RO=0;SAF=4,26,2,2;SAR=3,12,13,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,-4.05056e-08,0,-4.95117e-08;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,snp,mnp,snp;VARB=-0.0401884,-0.00979493,-0.0272866,0.0620643;OID=.,.,.,.;OPOS=1099075,1099077,1099077,1099077;OREF=TTA,A,AT,A;OALT=CTT,C,TC,T;OMAPALT=CTTT,TTCT,TTTC,TTTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:99:112:127:0:0:7,38,15,17:7,80,27,11:0.0551181,0.629921,0.212598,0.0866142:3,12,13,15:4,26,2,2:0:0:4,25,18,9:3,55,9,2:0:0
chr2	1099079	.	T	C	117.73	PASS	AF=0.171875;AO=23;DP=129;FAO=22;FDP=128;FR=.;FRO=106;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=62;FSRR=44;FWDB=-0.0107492;FXX=0.00775134;HRUN=11;LEN=1;MLLD=150.093;QD=3.6792;RBI=0.0152586;REFB=-0.00621632;REVB=-0.0108295;RO=106;SAF=9;SAR=14;SRF=62;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242999;STB=0.678514;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0125726;OID=.;OPOS=1099079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:128:106:106:23:22:0.171875:14:9:62:44:14:8:62:44
chr2	1168781	.	C	A	529.23	PASS	AF=0.561798;AO=49;DP=86;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=0.00798839;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=233.619;QD=23.7855;RBI=0.0225392;REFB=-0.0214711;REVB=0.0210761;RO=35;SAF=29;SAR=20;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0986622;STB=0.555003;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0132764;OID=.;OPOS=1168781;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:89:35:39:49:50:0.561798:20:29:25:10:20:30:28:11
chr2	1204796	.	C	T	256.21	PASS	AF=0.533333;AO=23;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0010921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0624;QD=22.7745;RBI=0.0858066;REFB=-0.0436951;REVB=0.0857997;RO=21;SAF=15;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233789;STB=0.614429;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0833335;OID=.;OPOS=1204796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:23:24:0.533333:8:15:8:13:9:15:8:13
chr2	1271230	.	A	G	334.25	PASS	AF=0.384615;AO=40;DP=104;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=-0.079762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.733;QD=12.8558;RBI=0.0800012;REFB=-0.014426;REVB=-0.00618218;RO=63;SAF=31;SAR=9;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242453;STB=0.635917;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0383291;OID=.;OPOS=1271230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:63:64:40:40:0.384615:9:31:37:26:9:31:38:26
chr2	1320143	.	C	T	610.05	PASS	AF=0.56701;AO=55;DP=98;FAO=55;FDP=97;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0304044;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0853;QD=25.1566;RBI=0.0433944;REFB=-0.0275868;REVB=-0.0309621;RO=40;SAF=19;SAR=36;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661288;STB=0.5496;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0382738;OID=.;OPOS=1320143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:40:42:55:55:0.56701:36:19:17:23:36:19:19:23
chr2	1481155	.	G	T	191.43	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.82;QD=47.8575;RBI=0.125164;REFB=0;REVB=0.0286711;RO=0;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112363;OID=.;OPOS=1481155;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:14:1:0:0:14:2:0:0
chr2	1520676	.	T	C	318.35	PASS	AF=0.478873;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.00703592;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6813;QD=17.9349;RBI=0.0236096;REFB=-0.0276727;REVB=-0.0225368;RO=36;SAF=22;SAR=12;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263245;STB=0.640516;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0243517;OID=.;OPOS=1520676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:36:37:34:34:0.478873:12:22:13:23:12:22:14:23
chr2	1544617	.	G	A	442.23	PASS	AF=0.488889;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.000379727;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.324;QD=19.6546;RBI=0.0131426;REFB=-0.0106012;REVB=0.0131371;RO=45;SAF=21;SAR=23;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0510336;STB=0.533789;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00979615;OID=.;OPOS=1544617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:90:45:46:44:44:0.488889:23:21:24:21:23:21:25:21
chr2	1546327	.	C	G	262.01	PASS	AF=0.369048;AO=31;DP=84;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.0157143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5061;QD=12.4769;RBI=0.0386328;REFB=-0.0033644;REVB=0.0352924;RO=52;SAF=10;SAR=21;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355185;STB=0.69776;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00584785;OID=.;OPOS=1546327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:52:53:31:31:0.369048:21:10:34:18:21:10:34:19
chr2	1637648	.	T	C	240.84	PASS	AF=0.666667;AO=20;DP=31;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0212974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.283;QD=29.1933;RBI=0.0385379;REFB=-0.0300313;REVB=0.0321184;RO=11;SAF=13;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716039;STB=0.550412;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0141837;OID=.;OPOS=1637648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:31:33:11:11:20:22:0.666667:7:13:6:5:7:15:6:5
chr2	1647171	.	T	C	1302.15	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0042174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.35;QD=62.007;RBI=0.00878619;REFB=0;REVB=0.00770783;RO=0;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.542e-06;OID=.;OPOS=1647171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:39:45:0:0:39:45:0:0
chr2	1652822	.	T	G	1713.24	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0211702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.353;QD=60.6457;RBI=0.0225023;REFB=0;REVB=-0.00762712;RO=0;SAF=63;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.10658e-05;OID=.;OPOS=1652822;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:50:63:0:0:50:63:0:0
chr2	1664654	.	A	G	708.95	PASS	AF=0.59292;AO=67;DP=113;FAO=67;FDP=113;FR=.;FRO=46;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0107326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.876;QD=25.0954;RBI=0.0346715;REFB=-0.0199645;REVB=0.0329685;RO=42;SAF=39;SAR=28;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0929692;STB=0.551626;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0132584;OID=.;OPOS=1664654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:42:46:67:67:0.59292:28:39:19:23:28:39:21:25
chr2	1842968	.	T	C	2042.04	PASS	AF=1;AO=127;DP=127;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.256;QD=62.3525;RBI=0.0359731;REFB=0;REVB=0.0168967;RO=0;SAF=22;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.63011e-05;OID=.;OPOS=1842968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:131:0:0:127:131:1:105:22:0:0:106:25:0:0
chr2	1926437	.	G	T	1090.03	PASS	AF=0.938272;AO=75;DP=80;FAO=76;FDP=81;FR=.;FRO=5;FSAF=48;FSAR=28;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0074699;FXX=0.0121936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.569;QD=53.8286;RBI=0.0242691;REFB=-0.192178;REVB=0.0230909;RO=5;SAF=47;SAR=28;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04772;STB=0.524746;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.000973681;OID=.;OPOS=1926437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:80:81:5:5:75:76:0.938272:28:47:5:0:28:48:5:0
chr2	3212704	.	C	A	48.83	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0020164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.44;QD=13.9524;RBI=0.0313037;REFB=-0.0185019;REVB=0.0312386;RO=7;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135151;STB=0.581152;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0123616;OID=.;OPOS=3212704;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:5:2:3:4:5:2:3:4
chr2	3392075	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0879105;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.023;QD=50.4133;RBI=0.0880188;REFB=0;REVB=-0.00436641;RO=0;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000651373;OID=.;OPOS=3392075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:17:2:0:0:17:2:0:0
chr2	3392295	.	A	G	483.73	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0125566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.6;QD=58.6336;RBI=0.0212305;REFB=0;REVB=0.0171192;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40051e-05;OID=.;OPOS=3392295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:15:17:0:0:16:17:0:0
chr2	3392513	.	TT	CA,TC	379.26	PASS	AF=0.892857,0.107143;AO=24,3;DP=28;FAO=25,3;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8,1;FSAR=17,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235998,0.0261627;FXX=0.0344709;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=154.315,103.855;QD=54.1806;RBI=0.0256803,0.0263512;REFB=0,0;REVB=-0.0101255,-0.00314641;RO=0;SAF=7,1;SAR=17,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00223142,0.0136498;OID=.,.;OPOS=3392513,3392514;OREF=TT,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:28:28:0:0:24,3:25,3:0.892857,0.107143:17,2:7,1:0:0:17,2:8,1:0:0
chr2	3425514	.	G	C	1415.4	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0032397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.3;QD=62.9068;RBI=0.00323971;REFB=0;REVB=8.02062e-06;RO=0;SAF=50;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.04158e-06;OID=.;OPOS=3425514;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:40:50:0:0:40:50:0:0
chr2	3460889	.	G	A	147.67	PASS	AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00307466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.774;QD=26.8493;RBI=0.0657977;REFB=0.001634;REVB=0.0657258;RO=7;SAF=11;SAR=4;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219534;STB=0.620553;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.000949757;OID=.;OPOS=3460889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:4:11:7:0:4:11:7:0
chr2	3469463	.	G	C	344.38	PASS	AF=0.445783;AO=36;DP=80;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0140332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.989;QD=16.5968;RBI=0.0194934;REFB=-0.0200021;REVB=0.0135301;RO=44;SAF=13;SAR=23;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162436;STB=0.592811;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.020156;OID=.;OPOS=3469463;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:83:44:46:36:37:0.445783:23:13:23:21:23:14:25:21
chr2	3470115	.	T	C	335.03	PASS	AF=0.45;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0196808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0541;QD=16.7515;RBI=0.0270982;REFB=-0.0214741;REVB=-0.0186274;RO=42;SAF=18;SAR=18;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045763;STB=0.537479;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0309817;OID=.;OPOS=3470115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:44:36:36:0.45:18:18:23:19:18:18:25:19
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chr2	3483205	.	C	T	413.08	PASS	AF=1;AO=23;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.219;QD=56.9769;RBI=0.0836353;REFB=0;REVB=0.0260557;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000528033;OID=.;OPOS=3483205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:23:29:1:10:13:0:0:10:19:0:0
chr2	3488502	.	A	G	1749.66	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.691;QD=60.8578;RBI=0.0522765;REFB=0;REVB=0.0390464;RO=0;SAF=68;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.64899e-05;OID=.;OPOS=3488502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:115:0:0:114:115:1:46:68:0:0:47:68:0:0
chr2	3504548	.	A	G	528.42	PASS	AF=0.576471;AO=49;DP=85;FAO=49;FDP=85;FR=.;FRO=36;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.00152611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1649;QD=24.8669;RBI=0.0775463;REFB=-0.00186197;REVB=-0.0775313;RO=36;SAF=31;SAR=18;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170527;STB=0.593481;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.000885521;OID=.;OPOS=3504548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:36:36:49:49:0.576471:18:31:15:21:18:31:15:21
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chr2	3597974	.	T	C	189.34	PASS	AF=0.465116;AO=19;DP=44;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.019796;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.14;QD=17.6131;RBI=0.0216117;REFB=0.00579417;REVB=0.0086709;RO=24;SAF=13;SAR=6;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22926;STB=0.648627;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.00739813;OID=.;OPOS=3597974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:24:23:19:20:0.465116:6:13:11:13:6:14:10:13
chr2	3605468	.	A	G	754.67	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.154016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6056;QD=54.8854;RBI=0.157507;REFB=-0.155724;REVB=0.0329805;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509088;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00158753;OID=.;OPOS=3605468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:0:1:54:54:0.981818:27:27:0:0:27:27:1:0
chr2	3652616	.	G	C	1945.9	PASS	AF=0.992126;AO=123;DP=124;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=89;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0466657;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.312;QD=61.2883;RBI=0.0645707;REFB=-0.0876894;REVB=0.0446283;RO=1;SAF=89;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00530887;STB=0.502793;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.000701841;OID=.;OPOS=3652616;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:124:127:1:1:123:126:0.992126:34:89:1:0:37:89:1:0
chr2	3653844	.	T	C	486.92	PASS	AF=1;AO=27;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0846661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.691;QD=59.0202;RBI=0.09352;REFB=0;REVB=0.0397197;RO=0;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000493131;OID=.;OPOS=3653844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:27:33:1:21:6:0:0:21:12:0:0
chr2	3687900	.	C	G	594.27	PASS	AF=0.491935;AO=61;DP=124;FAO=61;FDP=124;FR=.;FRO=63;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=35;FWDB=0.00880581;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=206.721;QD=19.17;RBI=0.0134925;REFB=0.00426341;REVB=0.0102228;RO=63;SAF=40;SAR=21;SRF=28;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199793;STB=0.61065;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.00592093;OID=.;OPOS=3687900;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:63:63:61:61:0.491935:21:40:28:35:21:40:28:35
chr2	3749151	.	GGAAGAAGAAGC	GGAAGAAGAAG,GGAAGAAGC	535.16	PASS	AF=0.0982143,0.535714;AO=12,57;DP=113;FAO=11,60;FDP=112;FR=.;FRO=41;FSAF=0,36;FSAR=11,24;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.0445831,0.0046247;FXX=0.00884877;HRUN=2,2;LEN=1,3;MLLD=22.075,228.311;QD=19.1128;RBI=0.222797,0.0318936;REFB=-0.0803895,-0.0288188;REVB=-0.218291,0.0315565;RO=38;SAF=0,36;SAR=12,21;SRF=25;SRR=13;SSEN=0.455837,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.796273,-0.0208871;STB=0.999092,0.514518;STBP=0,0.766;TYPE=del,del;VARB=0.146884,0.024741;OID=.,.;OPOS=3749162,3749152;OREF=C,GAA;OALT=-,-;OMAPALT=GGAAGAAGAAG,GGAAGAAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0982143,0.535714:12,57:113:11,60:112:41:0,36:11,24:26:15:99:38:0,36:12,21:25:13
chr2	3800383	.	C	T	1491.09	PASS	AF=0.989583;AO=94;DP=97;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00831955;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.607;QD=62.1289;RBI=0.118053;REFB=0.143557;REVB=-0.11776;RO=0;SAF=52;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505881;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-0.00114109;OID=.;OPOS=3800383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:96:0:1:94:95:0.989583:42:52:0:0:42:53:0:1
chr2	5834513	.	C	CA	36.91	PASS	AF=0.378378;AO=9;DP=44;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00885633;FXX=0.0263089;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.40119;QD=3.99074;RBI=0.120473;REFB=-0.0288692;REVB=-0.120147;RO=26;SAF=5;SAR=4;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202753;STB=0.50632;STBP=0.966;TYPE=ins;VARB=-0.00409354;OID=.;OPOS=5834514;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.378378:9:44:14:37:23:9:5:15:8:36:26:5:4:14:12
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chr2	5838030	.	G	A	222.37	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=40;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0224108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.807;QD=20.215;RBI=0.0228063;REFB=-0.0165381;REVB=-0.00422918;RO=22;SAF=6;SAR=12;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330109;STB=0.681653;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00988426;OID=.;OPOS=5838030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:44:22:22:18:22:0.5:12:6:15:7:15:7:15:7
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chr2	7137067	.	A	G	823.57	PASS	AF=0.55;AO=77;DP=140;FAO=77;FDP=140;FR=.;FRO=63;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=21;FSRR=42;FWDB=0.0136626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.027;QD=23.5305;RBI=0.0476664;REFB=-0.00950638;REVB=0.0456664;RO=63;SAF=37;SAR=40;SRF=21;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122223;STB=0.566662;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00503323;OID=.;OPOS=7137067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:140:63:63:77:77:0.55:40:37:21:42:40:37:21:42
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chr2	10045024	.	G	A	2304.82	PASS	AF=1;AO=142;DP=147;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.609;QD=62.2924;RBI=0.0422505;REFB=0;REVB=0.0230703;RO=0;SAF=87;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40284e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.73825e-05;OID=.;OPOS=10045024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:147:148:0:0:142:148:1:55:87:0:0:60:88:0:0
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chr2	10126330	.	G	A	363.03	PASS	AF=0.450549;AO=35;DP=88;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=30;FWDB=0.0115611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.674;QD=15.9573;RBI=0.0129337;REFB=-0.0147385;REVB=0.00579844;RO=48;SAF=16;SAR=19;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085506;STB=0.561468;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.020174;OID=.;OPOS=10126330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:91:48:50:35:41:0.450549:19:16:18:30:20:21:20:30
chr2	10188649	.	A	T	115.52	PASS	AF=0.288462;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=9;FWDB=-0.00792329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.107;QD=8.88631;RBI=0.0163663;REFB=-0.0189124;REVB=-0.0143206;RO=37;SAF=9;SAR=6;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204947;STB=0.621703;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0556041;OID=.;OPOS=10188649;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:37:37:15:15:0.288462:6:9:28:9:6:9:28:9
chr2	10580967	.	G	A	1012.62	PASS	AF=0.925926;AO=71;DP=78;FAO=75;FDP=81;FR=.;FRO=6;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0321353;FXX=0.0121936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.973;QD=50.0059;RBI=0.0321635;REFB=-0.0883372;REVB=0.00134593;RO=4;SAF=40;SAR=31;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319257;STB=0.527176;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.002034;OID=.;OPOS=10580967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:78:81:4:6:71:75:0.925926:31:40:1:3:35:40:1:5
chr2	10712278	.	C	T	1062.74	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5042;QD=59.8726;RBI=0.0731945;REFB=0;REVB=0.0724909;RO=0;SAF=51;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.34984e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00046424;OID=.;OPOS=10712278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:19:51:0:0:19:52:0:0
chr2	10784491	.	A	G	747.68	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9581;QD=63.6323;RBI=0.125736;REFB=0;REVB=0.124542;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131909;OID=.;OPOS=10784491;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:28:18:0:0:29:18:0:0
chr2	10808776	.	C	A,CAA	2198.64	PASS	AF=0.0211268,0.971831;AO=6,131;DP=149;FAO=3,138;FDP=142;FR=.;FRO=1;FSAF=2,82;FSAR=1,56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0911402,0.0267189;FXX=0.0206882;HRUN=1,0;LEN=1,2;MLLD=41.255,150.761;QD=61.9336;RBI=0.0960619,0.0359751;REFB=0.0473958,-0.0405028;REVB=-0.0303537,0.0240895;RO=6;SAF=5,77;SAR=1,54;SRF=4;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.202122,-0.00677424;STB=0.665547,0.504424;STBP=0.558,0.309;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0110367,0.00131963;OID=.,.;OPOS=10808776,10808777;OREF=C,-;OALT=A,AA;OMAPALT=A,CAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:149:142:6:1:6,131:3,138:0.0211268,0.971831:1,54:5,77:4:2:1,56:2,82:0:1
chr2	10908893	.	A	G	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00922725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.056;QD=59.8386;RBI=0.0236006;REFB=0;REVB=0.021722;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000514921;OID=.;OPOS=10908893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chr2	10928906	.	T	C	91.51	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00582307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.492;QD=17.4297;RBI=0.0158163;REFB=-0.00546627;REVB=0.0147053;RO=10;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119431;STB=0.568841;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0022152;OID=.;OPOS=10928906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:21:21:10:10:11:11:0.52381:5:6:4:6:5:6:4:6
chr2	10929035	.	T	C	50.64	PASS	AF=0.2;AO=8;DP=40;FAO=8;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0612486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6214;QD=5.06435;RBI=0.0636499;REFB=-0.00499228;REVB=-0.0173182;RO=31;SAF=3;SAR=5;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389686;STB=0.755273;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0169075;OID=.;OPOS=10929035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:40:40:31:32:8:8:0.2:5:3:22:9:5:3:23:9
chr2	10930903	.	T	C	356.03	PASS	AF=0.638298;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=47;FR=.;FRO=17;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0279444;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.605;QD=30.3004;RBI=0.0293208;REFB=-0.0439449;REVB=-0.00887821;RO=17;SAF=21;SAR=9;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166163;STB=0.591486;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0217399;OID=.;OPOS=10930903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:17:17:30:30:0.638298:9:21:8:9:9:21:8:9
chr2	10933249	.	C	T	342.24	PASS	AF=0.625;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.00406278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.208;QD=28.5198;RBI=0.014408;REFB=-0.0477051;REVB=0.0138233;RO=18;SAF=24;SAR=6;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129123;STB=0.571377;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0440015;OID=.;OPOS=10933249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:18:18:30:30:0.625:6:24:12:6:6:24:12:6
chr2	10942687	.	C	T	431.98	PASS	AF=0.453608;AO=44;DP=95;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.00629775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1375;QD=17.8136;RBI=0.0847041;REFB=-0.028284;REVB=-0.0844696;RO=51;SAF=27;SAR=17;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139729;STB=0.588864;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0311429;OID=.;OPOS=10942687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:97:51:53:44:44:0.453608:17:27:24:27:17:27:24:29
chr2	11053020	.	A	G	785.84	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8633;QD=64.1498;RBI=0.030326;REFB=0;REVB=0.0269247;RO=0;SAF=32;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205008;OID=.;OPOS=11053020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:17:32:0:0:17:32:0:0
chr2	11053740	.	C	T	1753.05	PASS	AF=0.991453;AO=113;DP=115;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=86;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0113342;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8273;QD=59.9332;RBI=0.0122146;REFB=-0.0421221;REVB=0.00455307;RO=1;SAF=85;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166527;STB=0.508195;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.000294139;OID=.;OPOS=11053740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:115:117:1:1:113:116:0.991453:28:85:0:1:30:86:0:1
chr2	11264830	.	G	A	2015.3	PASS	AF=0.984962;AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=72;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0509929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9682;QD=60.6106;RBI=0.0567517;REFB=-0.057243;REVB=0.0249094;RO=2;SAF=72;SAR=59;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158361;STB=0.508332;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00292974;OID=.;OPOS=11264830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:133:133:2:2:131:131:0.984962:59:72:0:2:59:72:0:2
chr2	11323295	.	C	T	757.53	PASS	AF=0.51773;AO=73;DP=141;FAO=73;FDP=141;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=-0.0115146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.586;QD=21.4902;RBI=0.0164834;REFB=-0.0291117;REVB=-0.0117948;RO=67;SAF=34;SAR=39;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114013;STB=0.565856;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0326426;OID=.;OPOS=11323295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:67:68:73:73:0.51773:39:34:40:27:39:34:41:27
chr2	11702661	.	A	C	381.68	PASS	AF=0.335714;AO=48;DP=139;FAO=47;FDP=140;FR=.;FRO=93;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=60;FSRR=33;FWDB=0.0111631;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.6534;QD=10.9051;RBI=0.0584275;REFB=-0.0299265;REVB=-0.0573511;RO=86;SAF=23;SAR=25;SRF=55;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179489;STB=0.603046;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0406013;OID=.;OPOS=11702661;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:140:86:93:48:47:0.335714:25:23:55:31:24:23:60:33
chr2	11706693	.	T	C	657.89	PASS	AF=0.532258;AO=50;DP=124;FAO=66;FDP=124;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.0121585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7779;QD=21.2221;RBI=0.0375497;REFB=-0.0380541;REVB=-0.0355268;RO=45;SAF=12;SAR=38;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210075;STB=0.574689;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0300603;OID=.;OPOS=11706693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:45:58:50:66:0.532258:38:12:20:25:44:22:28:30
chr2	11738091	.	T	C	480.85	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0628735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.094;QD=58.2843;RBI=0.0723381;REFB=0;REVB=0.0357732;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00045301;OID=.;OPOS=11738091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:14:18:0:0:14:19:0:0
chr2	11752635	.	T	C	1559.43	PASS	AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636557;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1524;QD=59.978;RBI=0.0637239;REFB=0;REVB=0.00294657;RO=0;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000521128;OID=.;OPOS=11752635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:49:55:0:0:49:55:0:0
chr2	11774324	.	G	A	357.24	PASS	AF=0.447059;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.00703733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.871;QD=16.8115;RBI=0.0111559;REFB=0.000906566;REVB=0.00865619;RO=46;SAF=22;SAR=16;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299662;STB=0.509549;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=-0.0021862;OID=.;OPOS=11774324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:46:47:38:38:0.447059:16:22:28:18:16:22:28:19
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chr2	11853913	.	G	A	138.08	PASS	AF=0.266667;AO=20;DP=75;FAO=20;FDP=75;FR=.;FRO=55;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=0.0160741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4567;QD=7.36438;RBI=0.0520345;REFB=-0.00705697;REVB=-0.0494895;RO=55;SAF=7;SAR=13;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.337685;STB=0.70251;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0232359;OID=.;OPOS=11853913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:55:55:20:20:0.266667:13:7:35:20:13:7:35:20
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chr2	12882822	.	ATC	A	730.77	PASS	AF=0.510638;AO=66;DP=143;FAO=72;FDP=141;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=47;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=-0.00046159;FXX=0.0275843;HRUN=1;LEN=2;MLLD=316.023;QD=20.7312;RBI=0.0076569;REFB=-0.0122071;REVB=-0.00764297;RO=65;SAF=19;SAR=47;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174217;STB=0.567779;STBP=0.119;TYPE=del;VARB=0.0107965;OID=.;OPOS=12882823;OREF=TC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.510638:66:143:72:141:69:25:47:33:36:99:65:19:47:30:35
chr2	14779829	.	A	G	223.3	PASS	AF=0.470588;AO=23;DP=49;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=2;FWDB=0.00925438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.099;QD=17.5138;RBI=0.0239681;REFB=-0.0139976;REVB=0.0221094;RO=26;SAF=20;SAR=3;SRF=24;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123477;STB=0.567851;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0172504;OID=.;OPOS=14779829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:26:27:23:24:0.470588:3:20:24:2:3:21:25:2
chr2	14780038	.	T	G	488.91	PASS	AF=0.45;AO=52;DP=119;FAO=54;FDP=120;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.0594732;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2396;QD=16.2969;RBI=0.0805409;REFB=-0.0142528;REVB=0.0543117;RO=67;SAF=23;SAR=29;SRF=41;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169382;STB=0.588203;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0180428;OID=.;OPOS=14780038;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:120:67:66:52:54:0.45:29:23:41:26:30:24:40:26
chr2	15735648	.	T	C	231.32	PASS	AF=0.318681;AO=29;DP=91;FAO=29;FDP=91;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=0.00568404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.382;QD=10.1677;RBI=0.0078913;REFB=-0.00994708;REVB=-0.00547396;RO=62;SAF=17;SAR=12;SRF=23;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246688;STB=0.643557;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0222485;OID=.;OPOS=15735648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:62:62:29:29:0.318681:12:17:23:39:12:17:23:39
chr2	15743344	.	T	C	724.61	PASS	AF=0.503546;AO=71;DP=141;FAO=71;FDP=141;FR=.;FRO=70;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=35;FSRR=35;FWDB=0.020777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9737;QD=20.5562;RBI=0.0501902;REFB=0.00515959;REVB=0.0456878;RO=69;SAF=44;SAR=27;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103742;STB=0.561184;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.00665205;OID=.;OPOS=15743344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:69:70:71:71:0.503546:27:44:35:34:27:44:35:35
chr2	15747393	.	C	T	689.28	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.213;QD=62.6618;RBI=0.0209355;REFB=0;REVB=0.00836224;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.43232e-05;OID=.;OPOS=15747393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
chr2	15771096	.	G	T	131.85	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.00266529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.309;QD=17.5793;RBI=0.0106733;REFB=-0.0137008;REVB=-0.0103352;RO=14;SAF=8;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245508;STB=0.631406;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0152259;OID=.;OPOS=15771096;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:15:14:15:0.5:6:8:4:10:6:9:5:10
chr2	15840623	.	A	G	648.37	PASS	AF=0.567568;AO=63;DP=111;FAO=63;FDP=111;FR=.;FRO=48;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.00965461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.669;QD=23.3648;RBI=0.011674;REFB=-0.00166897;REVB=-0.00656281;RO=48;SAF=34;SAR=29;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315085;STB=0.517216;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.00143276;OID=.;OPOS=15840623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:48:48:63:63:0.567568:29:34:24:24:29:34:24:24
chr2	16090820	.	T	C	120.36	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00285714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0858;QD=24.072;RBI=0.0556091;REFB=-0.00018557;REVB=-0.0555356;RO=7;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287624;STB=0.661413;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.00250909;OID=.;OPOS=16090820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:8:5:6:1:8:5:6:1
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chr2	17698678	.	A	G	1749.89	PASS	AF=0.991453;AO=116;DP=118;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00219183;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.318;QD=59.8254;RBI=0.00732566;REFB=0.0338304;REVB=0.00699008;RO=0;SAF=53;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14374e-08;STB=0.504672;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.000123249;OID=.;OPOS=17698678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:118:117:0:1:116:116:0.991453:63:53:0:0:63:53:1:0
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chr2	17942775	.	T	A	899.66	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0736;QD=58.0425;RBI=0.0576371;REFB=0;REVB=0.045588;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.9964e-05;OID=.;OPOS=17942775;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0
chr2	17954027	.	G	A	754.56	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0699556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6093;QD=54.8768;RBI=0.0758242;REFB=0.0564921;REVB=-0.0292493;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.00217603;OID=.;OPOS=17954027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:55:0:1:54:54:0.981818:30:24:0:0:30:24:0:1
chr2	17954421	.	C	G	1066.14	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0384012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2549;QD=58.4186;RBI=0.0743907;REFB=-0.0351751;REVB=0.0637129;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506492;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000651934;OID=.;OPOS=17954421;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:73:0:1:72:72:0.986301:34:38:0:0:34:38:1:0
chr2	17962450	.	A	G	833.47	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00834036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5156;QD=57.4805;RBI=0.014141;REFB=0;REVB=-0.0114195;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000194171;OID=.;OPOS=17962450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:35:23:0:0:35:23:0:0
chr2	17962518	.	C	A,T	712.53	PASS	AF=0.0392157,0.960784;AO=2,48;DP=50;FAO=2,49;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=0,18;FSAR=2,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00107292,-0.00551524;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=139.505,99.5662;QD=55.8846;RBI=0.00799328,0.037317;REFB=0,0;REVB=0.00792095,-0.0369071;RO=0;SAF=0,18;SAR=2,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.73384e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0824048,-0.00235237;OID=.,.;OPOS=17962518,17962518;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:50:51:0:0:2,48:2,49:0.0392157,0.960784:2,30:0,18:0:0:2,31:0,18:0:0
chr2	17962993	.	CAAGTT	C	33.14	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.00669945;FXX=0;HRUN=2;LEN=5;MLLD=318.02;QD=5.76263;RBI=0.0166007;REFB=-0.0088531;REVB=-0.0151888;RO=17;SAF=5;SAR=1;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206131;STB=0.637776;STBP=0.534;TYPE=del;VARB=0.0229344;OID=.;OPOS=17962994;OREF=AAGTT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.26087:6:23:6:23:17:5:1:12:5:33:17:5:1:12:5
chr2	18112473	.	G	A	2171.2	PASS	AF=0.992857;AO=134;DP=135;FAO=139;FDP=140;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00890682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2912;QD=62.0342;RBI=0.123035;REFB=0.0161952;REVB=0.122712;RO=1;SAF=76;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0062138;STB=0.503268;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.000793071;OID=.;OPOS=18112473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:135:140:1:1:134:139:0.992857:58:76:1:0:63:76:1:0
chr2	18113623	.	A	G	357.55	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.562;QD=55.0069;RBI=0.10533;REFB=0;REVB=0.104035;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00085129;OID=.;OPOS=18113623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr2	18113789	.	G	A	855.08	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433432;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.412;QD=57.9717;RBI=0.0449819;REFB=0;REVB=0.0120309;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100974;OID=.;OPOS=18113789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0
chr2	20101487	.	G	A	311.61	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00213321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.671;QD=16.6194;RBI=0.0209933;REFB=-0.0392988;REVB=0.0208846;RO=40;SAF=19;SAR=15;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0569861;STB=0.538984;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0438833;OID=.;OPOS=20101487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:41:34:34:0.453333:15:19:20:20:15:19:20:21
chr2	20135283	.	T	C	328.65	PASS	AF=0.385417;AO=37;DP=95;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.00577363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9603;QD=13.6935;RBI=0.0077567;REFB=-0.0161273;REVB=0.00517992;RO=58;SAF=22;SAR=15;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292317;STB=0.520883;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0250251;OID=.;OPOS=20135283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:58:59:37:37:0.385417:15:22:36:22:15:22:37:22
chr2	20205680	.	C	T	300.33	PASS	AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7986;QD=16.4563;RBI=0.0801373;REFB=0.0176147;REVB=0.0420802;RO=40;SAF=10;SAR=23;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251882;STB=0.642145;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=-0.0198628;OID=.;OPOS=20205680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:40:40:33:33:0.452055:23:10:22:18:23:10:22:18
chr2	20205848	.	G	A	383.3	PASS	AF=0.567164;AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0172868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.698;QD=22.8838;RBI=0.0173334;REFB=-0.0138723;REVB=0.00127008;RO=29;SAF=11;SAR=27;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196783;STB=0.608786;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00962466;OID=.;OPOS=20205848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:29:29:38:38:0.567164:27:11:15:14:27:11:15:14
chr2	20240668	.	C	A	200.24	PASS	AF=0.413793;AO=23;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0307301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9454;QD=13.8093;RBI=0.0642434;REFB=-0.00420788;REVB=-0.056417;RO=34;SAF=10;SAR=13;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879557;STB=0.53889;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00852043;OID=.;OPOS=20240668;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:34:23:24:0.413793:13:10:12:22:14:10:12:22
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chr2	20648211	.	G	T	75.92	PASS	AF=0.555556;AO=9;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.00788073;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.159;QD=16.8716;RBI=0.00788073;REFB=0.00283115;REVB=0;RO=8;SAF=9;SAR=0;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000166408;OID=.;OPOS=20648211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:18:18:8:8:9:10:0.555556:0:9:8:0:0:10:8:0
chr2	20680665	.	C	A	368.36	PASS	AF=0.903226;AO=28;DP=31;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00375158;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=273.789;QD=47.5297;RBI=0.0452226;REFB=-0.125758;REVB=0.0450667;RO=2;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773479;STB=0.527426;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00407658;OID=.;OPOS=20680665;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:31:31:2:3:28:28:0.903226:11:17:0:2:11:17:1:2
chr2	20680693	.	G	A	375.65	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0271602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6742;QD=55.6515;RBI=0.0400277;REFB=0;REVB=0.0294031;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.80768e-05;OID=.;OPOS=20680693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0
chr2	20818454	.	T	A	584.69	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.187;QD=59.9686;RBI=0.0271345;REFB=0;REVB=0.0148631;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000868565;OID=.;OPOS=20818454;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:13:24:0:0:14:25:0:0
chr2	20818458	.	G	A	563.65	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0200086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.233;QD=57.8103;RBI=0.0373059;REFB=0.0178197;REVB=-0.0314863;RO=1;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346745;STB=0.518509;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.000187944;OID=.;OPOS=20818458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:13:25:0:1:13:25:0:1
chr2	20823724	.	T	C	322.52	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000191148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.979;QD=53.7532;RBI=0.0375015;REFB=0;REVB=0.037501;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165625;OID=.;OPOS=20823724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0
chr2	20824559	.	C	T	1121.26	PASS	AF=0.884615;AO=81;DP=104;FAO=92;FDP=104;FR=.;FRO=12;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0301238;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=31.9785;QD=43.1252;RBI=0.0372192;REFB=-0.112723;REVB=-0.0218592;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.536127;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0332847;OID=.;OPOS=20824559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:104:104:0:12:81:92:0.884615:41:40:0:0:44:48:10:2
chr2	20838318	.	G	A	1685.42	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4365;QD=59.6608;RBI=0.0294202;REFB=0;REVB=-0.0160111;RO=0;SAF=45;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75633e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.53658e-05;OID=.;OPOS=20838318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:113:0:0:107:113:1:62:45:0:0:63:50:0:0
chr2	21231524	.	G	A	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.104;QD=58.7817;RBI=0.0397997;REFB=0;REVB=0.0380791;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.91594e-05;OID=.;OPOS=21231524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:37:28:0:0:37:28:0:0
chr2	21232803	.	T	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.791;QD=62.3506;RBI=0.0170684;REFB=0;REVB=0.00323616;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71284e-05;OID=.;OPOS=21232803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0
chr2	21235202	.	C	T	429.39	PASS	AF=0.408333;AO=49;DP=121;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=32;FSRR=39;FWDB=-0.0239845;FXX=0.0163921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.079;QD=14.3131;RBI=0.02596;REFB=-0.00158909;REVB=-0.00993306;RO=70;SAF=13;SAR=36;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224552;STB=0.624224;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00251328;OID=.;OPOS=21235202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:120:70:71:49:49:0.408333:36:13:32:38:36:13:32:39
chr2	21235475	.	T	C	1669.92	PASS	AF=1;AO=110;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.504;QD=60.1774;RBI=0.0488898;REFB=0;REVB=0.0443316;RO=0;SAF=54;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.46761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.07048e-05;OID=.;OPOS=21235475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:110:111:1:56:54:0:0:57:54:0:0
chr2	21250914	.	G	A	717.51	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00366232;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.656;QD=56.2757;RBI=0.00649582;REFB=0;REVB=-0.00536498;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000693899;OID=.;OPOS=21250914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:31:19:0:0:32:19:0:0
chr2	21260084	.	G	A	1103.46	PASS	AF=0.530612;AO=103;DP=191;FAO=104;FDP=196;FR=.;FRO=92;FSAF=68;FSAR=36;FSRF=48;FSRR=44;FWDB=-0.0106356;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.15;QD=22.5196;RBI=0.0293064;REFB=-0.0269546;REVB=-0.0273084;RO=88;SAF=67;SAR=36;SRF=44;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133211;STB=0.565711;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0315211;OID=.;OPOS=21260084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:196:88:92:103:104:0.530612:36:67:44:44:36:68:48:44
chr2	21360583	.	A	G	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.002171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.064;QD=62.3505;RBI=0.0168292;REFB=0;REVB=0.0166886;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.16424e-05;OID=.;OPOS=21360583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr2	23865260	.	T	C	3113.2	PASS	AF=1;AO=203;DP=204;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=130;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02588;FXX=0.00490172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.415;QD=61.3439;RBI=0.0374868;REFB=-0.0780287;REVB=0.0271198;RO=0;SAF=130;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46104e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000472179;OID=.;OPOS=23865260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:204:203:0:0:203:203:1:73:130:0:0:73:130:0:0
chr2	23865908	.	G	C	113.9	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00464688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.2722;QD=18.2242;RBI=0.00860834;REFB=-0.00899352;REVB=-0.00724638;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281085;STB=0.516104;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00216928;OID=.;OPOS=23865908;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:5:8:7:5:5:8:7:5
chr2	23919375	.	C	T	1026.76	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.253;QD=59.5224;RBI=0.0206164;REFB=0;REVB=0.00439128;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6454e-05;OID=.;OPOS=23919375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:38:30:0:0:38:31:0:0
chr2	23926659	.	T	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0304972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0678;QD=56.9378;RBI=0.0333025;REFB=0;REVB=-0.0133783;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000220694;OID=.;OPOS=23926659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:22:31:0:0:22:31:0:0
chr2	23973799	.	T	C	1008.48	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0692;QD=59.3222;RBI=0.0684797;REFB=0;REVB=-0.0495986;RO=0;SAF=43;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.11616e-05;OID=.;OPOS=23973799;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:25:43:0:0:25:43:0:0
chr2	24055058	.	G	C,T	616.5	PASS	AF=0.95122,0.0487805;AO=39,2;DP=41;FAO=39,2;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26,0;FSAR=13,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182974,-0.0137483;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=66.9738,156.01;QD=60.1458;RBI=0.0243984,0.0243509;REFB=0,0;REVB=-0.0161395,-0.0200986;RO=0;SAF=26,0;SAR=13,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00279686,0.240977;OID=.,.;OPOS=24055058,24055058;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:41:41:0:0:39,2:39,2:0.95122,0.0487805:13,2:26,0:0:0:13,2:26,0:0:0
chr2	24108652	.	T	C	806.37	PASS	AF=0.982759;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0189185;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.795;QD=55.6116;RBI=0.0376938;REFB=-0.0594646;REVB=0.0326024;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.000433756;OID=.;OPOS=24108652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:0:1:56:57:0.982759:28:28:0:0:29:28:1:0
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chr2	24384424	.	T	C	360.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0729655;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.6189;QD=53.4347;RBI=0.0783936;REFB=0;REVB=0.0286637;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00650191;OID=.;OPOS=24384424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:8:19:0:0:8:19:0:0
chr2	24387178	.	G	C,GC	242.48	PASS	AF=0,1;AO=2,16;DP=23;FAO=0,20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13;FSAR=0,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0737608,0.165575;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=149.102,24.2867;QD=48.4954;RBI=0.0775885,0.167796;REFB=0,0;REVB=0.0240692,0.0272099;RO=4;SAF=2,9;SAR=0,7;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.165516;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0113;OID=.,.;OPOS=24387178,24387179;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:23:20:4:0:2,16:0,20:0,1:0,7:2,9:4:0:0,7:0,13:0:0
chr2	24390517	.	G	A	837.18	PASS	AF=0.535484;AO=81;DP=154;FAO=83;FDP=155;FR=.;FRO=72;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=0.0120759;FXX=0.00640985;HRUN=4;LEN=1;MLLD=115.11;QD=21.6046;RBI=0.0143475;REFB=-0.00323155;REVB=0.00774755;RO=71;SAF=41;SAR=40;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713056;STB=0.546995;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.00333073;OID=.;OPOS=24390517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:155:71:72:81:83:0.535484:40:41:30:41:40:43:30:42
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chr2	24974945	.	T	G	689.09	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000947574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.71;QD=62.6444;RBI=0.026066;REFB=0;REVB=0.0260488;RO=0;SAF=10;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74446e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.83201e-05;OID=.;OPOS=24974945;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:34:10:0:0:34:10:0:0
chr2	24991569	.	C	G	412.56	PASS	AF=0.47191;AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.0364277;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4971;QD=18.5421;RBI=0.0367633;REFB=-0.0157075;REVB=-0.004956;RO=47;SAF=16;SAR=26;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853405;STB=0.547649;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.00982196;OID=.;OPOS=24991569;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:47:47:42:42:0.47191:26:16:22:25:26:16:22:25
chr2	25022589	.	C	A	137.38	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0135646;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.834;QD=17.1724;RBI=0.0183643;REFB=-0.00280362;REVB=-0.0123794;RO=15;SAF=1;SAR=14;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.466663;STB=0.796219;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00925928;OID=.;OPOS=25022589;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:32:15:17:15:15:0.46875:14:1:5:10:14:1:6:11
chr2	25046090	.	T	C	91.98	PASS	AF=0.55;AO=10;DP=19;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.00934198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.73;QD=18.3958;RBI=0.028073;REFB=-0.0346653;REVB=0.0264731;RO=9;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20428;STB=0.599839;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0169727;OID=.;OPOS=25046090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:20:9:9:10:11:0.55:3:7:8:1:3:8:8:1
chr2	25047408	.	A	G	212.28	PASS	AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.00508182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.964;QD=27.3906;RBI=0.0433802;REFB=-0.0298902;REVB=0.0430815;RO=11;SAF=7;SAR=13;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188271;STB=0.604544;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0131284;OID=.;OPOS=25047408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:13:7:7:4:13:7:7:4
chr2	25050977	.	T	C	317.43	PASS	AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0144253;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.755;QD=25.9125;RBI=0.047382;REFB=-0.0360637;REVB=-0.0451327;RO=21;SAF=15;SAR=13;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461096;STB=0.525529;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.02737;OID=.;OPOS=25050977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:13:15:10:11:13:15:10:11
chr2	25061752	.	G	A	255.62	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0207657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0676;QD=17.9385;RBI=0.0217468;REFB=-0.00310371;REVB=-0.0064584;RO=29;SAF=17;SAR=11;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265149;STB=0.648113;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00428224;OID=.;OPOS=25061752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:11:17:9:20:11:17:9:20
chr2	25064157	.	G	C	512.47	PASS	AF=0.510417;AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=96;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0143253;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8908;QD=21.3529;RBI=0.0154218;REFB=-0.00766174;REVB=0.00571132;RO=45;SAF=23;SAR=26;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412008;STB=0.532121;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0111393;OID=.;OPOS=25064157;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:45:47:49:49:0.510417:26:23:19:26:26:23:19:28
chr2	25141538	.	A	G	255.84	PASS	AF=0.397436;AO=30;DP=75;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.0195769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.0728;QD=13.1201;RBI=0.128634;REFB=-0.0147894;REVB=-0.127135;RO=44;SAF=12;SAR=18;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243505;STB=0.636871;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0191708;OID=.;OPOS=25141538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:78:44:47:30:31:0.397436:18:12:28:16:19:12:29:18
chr2	25181488	.	T	C	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0538205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9316;QD=16.199;RBI=0.0601192;REFB=0.0154125;REVB=0.0267895;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23409;STB=0.635921;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=-0.00102988;OID=.;OPOS=25181488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:4:1:0:3:4:1:0:3
chr2	25194741	.	G	A	890.41	PASS	AF=0.5;AO=86;DP=176;FAO=87;FDP=174;FR=.,HEALED;FRO=84;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=52;FSRR=32;FWDB=0.0212747;FXX=0.0224706;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.438;QD=20.4693;RBI=0.0214125;REFB=-0.0480504;REVB=0.00242519;RO=60;SAF=48;SAR=38;SRF=52;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245769;STB=0.528062;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0329106;OID=.;OPOS=25194741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:174:60:84:86:87:0.5:38:48:52:8:38:49:52:32
chr2	25281086	.	A	T	307.24	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0404801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.988;QD=15.5563;RBI=0.0416774;REFB=-0.0127982;REVB=-0.0099179;RO=45;SAF=14;SAR=20;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167136;STB=0.594298;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0224597;OID=.;OPOS=25281086;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:20:14:26:19:20:14:26:19
chr2	25314186	.	T	C	804.92	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.63;QD=64.3934;RBI=0.0519196;REFB=0;REVB=-0.0308174;RO=0;SAF=34;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12017e-05;OID=.;OPOS=25314186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:16:34:0:0:16:34:0:0
chr2	25376562	.	TCCGT	TCC,TCGT	110.46	PASS	AF=0.448276,0;AO=12,4;DP=29;FAO=13,0;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=3,0;FSAR=10,0;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0305711,0.0546988;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=2,1;MLLD=256.164,20.62;QD=15.2361;RBI=0.0308187,0.216619;REFB=-0.025759,-0.100811;REVB=0.0038987,-0.2096;RO=11;SAF=3,0;SAR=9,4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.198673,-0.67888;STB=0.559344,0.5;STBP=0.634,1;TYPE=del,del;VARB=0.0318364,0;OID=.,.;OPOS=25376565,25376563;OREF=GT,C;OALT=-,-;OMAPALT=TCC,TCGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.448276,0:12,4:29:13,0:29:16:3,0:10,0:5:11:99:11:3,0:9,4:5:6
chr2	25377176	.	T	C	746.04	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.54;QD=63.4931;RBI=0.0634507;REFB=0;REVB=0.0563099;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136641;OID=.;OPOS=25377176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr2	25384169	.	G	A	270.04	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00748767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.703;QD=22.982;RBI=0.0122753;REFB=-0.0464414;REVB=-0.00972711;RO=22;SAF=11;SAR=14;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263821;STB=0.51472;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0374359;OID=.;OPOS=25384169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:14:11:9:13:14:11:9:13
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chr2	26149968	.	C	T	726.42	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.151;QD=63.1669;RBI=0.0182304;REFB=0;REVB=0.0120714;RO=0;SAF=35;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.88351e-05;OID=.;OPOS=26149968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:11:35:0:0:11:35:0:0
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chr2	26321526	.	T	C	708.07	PASS	AF=0.980769;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0449996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.897;QD=54.4671;RBI=0.0463161;REFB=-0.209522;REVB=0.0109642;RO=1;SAF=27;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017117;STB=0.509087;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00208694;OID=.;OPOS=26321526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:50:51:0.980769:23:27:1:0:24:27:1:0
chr2	26358110	.	G	C	160.31	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0022;QD=45.8028;RBI=0.0412581;REFB=0;REVB=0.0285741;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.92367e-05;OID=.;OPOS=26358110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr2	26399214	.	G	A	343.16	PASS	AF=0.328244;AO=41;DP=134;FAO=43;FDP=131;FR=.;FRO=88;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=-0.00427966;FXX=0.036762;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.694;QD=10.478;RBI=0.0140182;REFB=-0.0116001;REVB=0.013349;RO=88;SAF=25;SAR=16;SRF=51;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368483;STB=0.501275;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0344281;OID=.;OPOS=26399214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:131:88:88:41:43:0.328244:16:25:51:37:18:25:51:37
chr2	26477124	.	TG	CT,TGACT	170.58	PASS	AF=0.0384615,0.365385;AO=2,18;DP=52;FAO=2,19;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=0,14;FSAR=2,5;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0367105,0.0118352;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,3;MLLD=159.321,165.574;QD=13.1212;RBI=0.0367141,0.0150468;REFB=0.00376633,-0.0165852;REVB=-0.000512858,0.00929153;RO=30;SAF=0,13;SAR=2,5;SRF=18;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.505428,0.149526;STB=0.995785,0.59047;STBP=0.108,0.386;TYPE=mnp,ins;VARB=0.017413,0.0273276;OID=.,.;OPOS=26477124,26477126;OREF=TG,-;OALT=CT,ACT;OMAPALT=CT,TGACT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:52:52:30:31:2,18:2,19:0.0384615,0.365385:2,5:0,13:18:12:2,5:0,14:19:12
chr2	26502875	.	T	C	192.9	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00675381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.608;QD=23.3814;RBI=0.0394601;REFB=0.00981839;REVB=-0.0388779;RO=14;SAF=11;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167309;STB=0.593553;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.00324062;OID=.;OPOS=26502875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:8:11:5:9:8:11:5:9
chr2	26505858	.	A	G	381.55	PASS	AF=0.493151;AO=34;DP=78;FAO=36;FDP=73;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=31;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0366695;FXX=0.0394685;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5283;QD=20.9069;RBI=0.0605623;REFB=-0.0216817;REVB=0.048199;RO=25;SAF=20;SAR=14;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114911;STB=0.501278;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0275792;OID=.;OPOS=26505858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:73:25:31:34:36:0.493151:14:20:11:14:15:21:18:13
chr2	26512957	.	G	C	206.91	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0295976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6091;QD=17.2425;RBI=0.029905;REFB=-0.0282875;REVB=-0.00427686;RO=26;SAF=15;SAR=6;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110682;STB=0.555501;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0366505;OID=.;OPOS=26512957;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:27:21:21:0.4375:6:15:16:10:6:15:17:10
chr2	26532443	.	T	C	477.38	PASS	AF=0.481132;AO=51;DP=106;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=40;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=0.0398187;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.077;QD=18.0145;RBI=0.0403307;REFB=-0.0198178;REVB=-0.00640617;RO=55;SAF=40;SAR=11;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179498;STB=0.600442;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0335757;OID=.;OPOS=26532443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:55:55:51:51:0.481132:11:40:35:20:11:40:35:20
chr2	26534322	.	G	A	62.82	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00515946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.828;QD=9.30599;RBI=0.0421204;REFB=-0.0129256;REVB=0.0418032;RO=16;SAF=1;SAR=8;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.689456;STB=0.895146;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0269857;OID=.;OPOS=26534322;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:27:27:16:18:9:9:0.333333:8:1:13:3:8:1:13:5
chr2	26534801	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.167;QD=59.0186;RBI=0.0933937;REFB=0;REVB=0.0857315;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376701;OID=.;OPOS=26534801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0
chr2	26534813	.	A	G	138.82	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=31;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0444893;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1757;QD=18.5098;RBI=0.0842229;REFB=-0.0270047;REVB=-0.0715137;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167883;STB=0.631406;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0332854;OID=.;OPOS=26534813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:14:15:16:15:0.5:9:7:9:5:9:6:10:5
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chr2	26536727	.	C	T	196.72	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0044328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5369;QD=25.3832;RBI=0.0693453;REFB=-0.0297063;REVB=0.0692035;RO=11;SAF=4;SAR=15;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328585;STB=0.673268;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.069274;OID=.;OPOS=26536727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:30:31:11:12:19:19:0.612903:15:4:7:4:15:4:7:5
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chr2	26613056	.	C	T	1197.91	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0202871;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.495;QD=59.8954;RBI=0.0803433;REFB=-0.103013;REVB=-0.0777398;RO=0;SAF=32;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45895e-08;STB=0.505262;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000430414;OID=.;OPOS=26613056;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:80:0:1:79:79:0.9875:47:32:0:0:47:32:0:1
chr2	26614583	.	T	TA,TAA	383.17	PASS	AF=1,0;AO=41,12;DP=70;FAO=61,0;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=26,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.130467,-0.0735893;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=8.91456,7.92702;QD=25.1259;RBI=0.177528,0.0989595;REFB=-0.00562299,-0.0074117;REVB=-0.120393,-0.0661635;RO=14;SAF=23,6;SAR=18,6;SRF=10;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0741289,-0.199941;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.0112816,-0.0739167;OID=.,.;OPOS=26614584,26614584;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=TA,TAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:41,12:70:61,0:61:0:35,0:26,0:0:0:6:14:23,6:18,6:10:4
chr2	26667128	.	C	T	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0316178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5223;QD=11.6342;RBI=0.0863087;REFB=0.00514927;REVB=-0.0803088;RO=16;SAF=8;SAR=2;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754431;STB=0.545359;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=-0.014152;OID=.;OPOS=26667128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:2:8:12:4:2:8:12:4
chr2	26667615	.	T	C	1156.63	PASS	AF=0.940476;AO=79;DP=87;FAO=79;FDP=84;FR=.;FRO=5;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.014577;FXX=0.0344788;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.3586;QD=55.0774;RBI=0.0388551;REFB=-0.0766615;REVB=0.0360171;RO=2;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230796;STB=0.506328;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00399821;OID=.;OPOS=26667615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:87:84:2:5:79:79:0.940476:40:39:0:2:40:39:3:2
chr2	26667779	.	C	T	216.02	PASS	AF=0.438596;AO=24;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0258921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.991;QD=15.1592;RBI=0.0262343;REFB=-0.0313899;REVB=0.00422394;RO=32;SAF=17;SAR=7;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283143;STB=0.667516;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0288256;OID=.;OPOS=26667779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:32:32:24:25:0.438596:7:17:14:18:7:18:14:18
chr2	26676322	.	A	G	508.35	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0166308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7171;QD=56.4832;RBI=0.0966677;REFB=-0.0450219;REVB=0.0952264;RO=1;SAF=17;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267214;STB=0.514278;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.012544;OID=.;OPOS=26676322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:18:17:1:0:18:17:1:0
chr2	26676395	.	G	T	199.36	PASS	AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0144066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.389;QD=27.4979;RBI=0.0152987;REFB=-0.0205065;REVB=-0.00514788;RO=10;SAF=11;SAR=8;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783325;STB=0.543351;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0115318;OID=.;OPOS=26676395;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:8:11:7:3:8:11:7:3
chr2	26683029	.	G	A	126.08	PASS	AF=0.307692;AO=14;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.010959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6164;QD=9.69809;RBI=0.0249803;REFB=-0.0177696;REVB=-0.0224481;RO=27;SAF=6;SAR=8;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066706;STB=0.554389;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0419817;OID=.;OPOS=26683029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:27:36:14:16:0.307692:8:6:10:17:9:7:13:23
chr2	26693967	.	C	T	197.7	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0124051;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.273;QD=18.8287;RBI=0.0124234;REFB=-0.00273925;REVB=0.000674455;RO=22;SAF=8;SAR=12;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256086;STB=0.644719;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00193824;OID=.;OPOS=26693967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:12:8:15:7:12:8:15:7
chr2	26699126	.	C	G	1717.06	PASS	AF=0.991304;AO=114;DP=116;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0137268;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.953;QD=59.724;RBI=0.0756376;REFB=-0.0988569;REVB=0.0743816;RO=0;SAF=77;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6832e-08;STB=0.506665;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.000361301;OID=.;OPOS=26699126;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:116:115:0:1:114:114:0.991304:37:77:0:0:37:77:0:1
chr2	26699855	.	G	C	751.12	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126161;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.051;QD=56.6882;RBI=0.0144117;REFB=0;REVB=0.00696643;RO=0;SAF=36;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000314615;OID=.;OPOS=26699855;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:16:36:0:0:16:37:0:0
chr2	26700700	.	G	A	1261.07	PASS	AF=0.988235;AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0120101;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.182;QD=59.3447;RBI=0.0278984;REFB=-0.175562;REVB=0.0251809;RO=0;SAF=36;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506848;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.000401215;OID=.;OPOS=26700700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:85:0:1:83:84:0.988235:47:36:0:0:48:36:1:0
chr2	26739423	.	T	C	391.63	PASS	AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0139459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.097;QD=22.0638;RBI=0.0279215;REFB=-0.0174251;REVB=-0.0241893;RO=31;SAF=21;SAR=18;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697879;STB=0.531437;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.015492;OID=.;OPOS=26739423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:31:32:39:39:0.549296:18:21:14:17:18:21:15:17
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chr2	26804219	.	T	A	58.44	PASS	AF=0.0949721;AO=17;DP=178;FAO=17;FDP=179;FR=.;FRO=162;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=73;FSRR=89;FWDB=-0.0511549;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1344;QD=1.30589;RBI=0.0516056;REFB=-0.0454288;REVB=-0.00680527;RO=160;SAF=5;SAR=12;SRF=73;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200056;STB=0.649366;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0606767;OID=.;OPOS=26804219;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:178:179:160:162:17:17:0.0949721:12:5:73:87:12:5:73:89
chr2	26804247	.	T	C	2588.98	PASS	AF=1;AO=167;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4348;QD=61.6424;RBI=0.0160699;REFB=0;REVB=0.00353531;RO=0;SAF=66;SAR=101;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1679e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384509;OID=.;OPOS=26804247;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:168:168:0:0:167:168:1:101:66:0:0:101:67:0:0
chr2	26951449	.	G	A	619.67	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0254916;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=156.724;QD=59.0166;RBI=0.0257233;REFB=-0.0243126;REVB=-0.00344529;RO=1;SAF=35;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719402;STB=0.538442;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.000208429;OID=.;OPOS=26951449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:6:35:0:1:6:35:0:1
chr2	27169842	.	C	A	818.2	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.166936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.535;QD=57.4174;RBI=0.167128;REFB=0;REVB=0.00800832;RO=0;SAF=20;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000437413;OID=.;OPOS=27169842;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:36:20:0:0:36:21:0:0
chr2	27246285	.	C	T	1116.9	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.586;QD=60.3732;RBI=0.0517823;REFB=0;REVB=-0.0098357;RO=0;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.56618e-05;OID=.;OPOS=27246285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:41:33:0:0:41:33:0:0
chr2	27261329	.	A	G	775.09	PASS	AF=1;AO=36;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00770628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.9;QD=63.2724;RBI=0.0317157;REFB=0;REVB=-0.0307652;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.20977e-05;OID=.;OPOS=27261329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:36:49:1:18:18:0:0:25:24:0:0
chr2	27290525	.	A	G	1254.91	PASS	AF=0.965517;AO=83;DP=86;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0141204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.991;QD=57.6968;RBI=0.0235725;REFB=-0.154412;REVB=0.0188753;RO=2;SAF=39;SAR=44;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236664;STB=0.518514;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0025756;OID=.;OPOS=27290525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:86:87:2:3:83:84:0.965517:44:39:2:0:45:39:3:0
chr2	27303755	.	A	G	766.3	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.512;QD=63.8579;RBI=0.049154;REFB=0;REVB=0.0294189;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.65295e-05;OID=.;OPOS=27303755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:27:21:0:0:27:21:0:0
chr2	27324036	.	G	A	663.46	PASS	AF=0.961538;AO=47;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=39;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0227385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.343;QD=51.0355;RBI=0.110454;REFB=-0.112794;REVB=0.108088;RO=2;SAF=39;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103981;STB=0.515412;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.000538964;OID=.;OPOS=27324036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:52:52:2:2:47:50:0.961538:8:39:0:2:11:39:1:1
chr2	27324654	.	G	A	263.99	PASS	AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0352509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4408;QD=15.5286;RBI=0.0526137;REFB=0.0238221;REVB=0.0390586;RO=38;SAF=18;SAR=12;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10058;STB=0.556848;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.0222468;OID=.;OPOS=27324654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:38:38:30:30:0.441176:12:18:19:19:12:18:19:19
chr2	27324724	.	G	C	230.29	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0227608;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.941;QD=46.0582;RBI=0.0241463;REFB=-0.0632469;REVB=0.00806159;RO=1;SAF=7;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0612242;STB=0.533298;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00220114;OID=.;OPOS=27324724;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:12:7:1:0:12:7:1:0
chr2	27324751	.	G	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00896796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.368;QD=51.1844;RBI=0.0127449;REFB=0;REVB=-0.00905589;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.0444e-07;OID=.;OPOS=27324751;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr2	27351948	.	T	G	740.26	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.93;QD=56.9428;RBI=0.0700361;REFB=0;REVB=0.0466436;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305392;OID=.;OPOS=27351948;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:28:24:0:0:28:24:0:0
chr2	27424636	.	G	A	481.91	PASS	AF=0.554217;AO=45;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.124632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3367;QD=23.2247;RBI=0.139396;REFB=-0.0292864;REVB=0.0624344;RO=37;SAF=18;SAR=27;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948225;STB=0.56774;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0277968;OID=.;OPOS=27424636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:37:37:45:46:0.554217:27:18:19:18:28:18:20:17
chr2	27428295	.	A	G	1226.4	PASS	AF=0.988095;AO=74;DP=78;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0680022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.1593;QD=58.4002;RBI=0.0680092;REFB=-0.175308;REVB=-0.000978477;RO=1;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119765;STB=0.506328;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00723753;OID=.;OPOS=27428295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:84:1:1:74:83:0.988095:39:35:0:1:39:44:0:1
chr2	27435250	.	A	G	1426.27	PASS	AF=1;AO=85;DP=88;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00700212;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.064;QD=62.6931;RBI=0.0704346;REFB=0;REVB=0.0700856;RO=0;SAF=61;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.56037e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273542;OID=.;OPOS=27435250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:88:91:0:0:85:91:1:24:61:0:0:29:62:0:0
chr2	27440784	.	C	CT	746.75	PASS	AF=1;AO=10;DP=67;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0523806;FXX=0.0447694;HRUN=0;LEN=1;MLLD=117.817;QD=46.6718;RBI=0.0525834;REFB=0;REVB=-0.00461383;RO=57;SAF=4;SAR=6;SRF=42;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407625;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000321014;OID=.;OPOS=27440785;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:67:64:64:0:45:19:0:0:5:57:4:6:42:15
chr2	27440785	.	C	T	593.99	PASS	AF=0.735294;AO=50;DP=69;FAO=50;FDP=68;FR=.;FRO=18;FSAF=40;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0385662;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.621;QD=34.9408;RBI=0.0558349;REFB=-0.142554;REVB=0.0403755;RO=13;SAF=40;SAR=10;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213558;STB=0.671457;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0114444;OID=.;OPOS=27440785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:13:18:50:50:0.735294:10:40:5:8:10:40:5:13
chr2	27460968	.	A	G	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00942516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.536;QD=16.8836;RBI=0.0366747;REFB=-0.00752683;REVB=0.0354429;RO=17;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112057;STB=0.56423;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00867198;OID=.;OPOS=27460968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:7:8:7:10:7:8:7:10
chr2	27462076	.	C	T	215.11	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00463219;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=222.757;QD=21.5109;RBI=0.00853066;REFB=-0.0176119;REVB=0.00716345;RO=19;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866726;STB=0.548647;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0102382;OID=.;OPOS=27462076;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:10:11:8:11:10:11:8:11
chr2	27466368	.	C	T	257.97	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0306921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.395;QD=18.4262;RBI=0.0307189;REFB=-0.0351112;REVB=0.00128513;RO=28;SAF=18;SAR=10;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0433567;OID=.;OPOS=27466368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:10:18:18:10:10:18:18:10
chr2	27550967	.	A	G	163.15	PASS	AF=0.309859;AO=21;DP=71;FAO=22;FDP=71;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=37;FWDB=0.00343433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.623;QD=9.19144;RBI=0.0728161;REFB=-0.00322474;REVB=-0.072735;RO=44;SAF=9;SAR=12;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190764;STB=0.649747;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00460329;OID=.;OPOS=27550967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:44:49:21:22:0.309859:12:9:12:32:12:10:12:37
chr2	27558252	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0578907;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=143.15;QD=33.4285;RBI=0.0987794;REFB=0;REVB=0.0800378;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000505978;OID=.;OPOS=27558252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr2	27599875	.	T	G	182.85	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=0.00855029;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.568;QD=16.623;RBI=0.00876227;REFB=-0.00505236;REVB=-0.00191574;RO=24;SAF=4;SAR=15;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00322473;STB=0.509081;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.00696791;OID=.;OPOS=27599875;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:24:25:19:19:0.431818:15:4:5:19:15:4:5:20
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chr2	27801403	.	C	G	156.22	PASS	AF=0.425;AO=16;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0377145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9293;QD=15.6218;RBI=0.0534623;REFB=-0.0560523;REVB=-0.0378924;RO=23;SAF=5;SAR=11;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380391;STB=0.691212;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0532995;OID=.;OPOS=27801403;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:16:17:0.425:11:5:16:7:11:6:16:7
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chr2	27801759	.	A	G	35.85	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0187977;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.92;QD=5.73608;RBI=0.0368099;REFB=-0.00527646;REVB=-0.0316483;RO=17;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161893;STB=0.571184;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0377442;OID=.;OPOS=27801759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:17:19:6:6:0.24:4:2:8:9:4:2:8:11
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chr2	29092850	.	G	T	792.43	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0303893;FXX=0.0172384;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.267;QD=55.6088;RBI=0.0384555;REFB=-0.00982844;REVB=0.0235651;RO=1;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149682;STB=0.507934;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000184271;OID=.;OPOS=29092850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:58:57:1:1:56:56:0.982456:31:25:0:1:31:25:0:1
chr2	29129418	.	A	G	834.38	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3263;QD=57.5436;RBI=0.0482777;REFB=0;REVB=0.0456708;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297294;OID=.;OPOS=29129418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:23:35:0:0:23:35:0:0
chr2	29135468	.	C	G	918.84	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00887702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.213;QD=58.3393;RBI=0.0288587;REFB=0;REVB=0.0274595;RO=0;SAF=22;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39507e-05;OID=.;OPOS=29135468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:40:22:0:0:41:22:0:0
chr2	29170623	.	G	T	1460.21	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.207;QD=62.8049;RBI=0.0611597;REFB=0;REVB=0.0120911;RO=0;SAF=29;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.52941e-05;OID=.;OPOS=29170623;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:84:93:0:0:84:93:1:55:29:0:0:59:34:0:0
chr2	29222070	.	G	A	164.37	PASS	AF=0.418605;AO=15;DP=41;FAO=18;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=4;FWDB=-0.0158887;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.038;QD=15.2902;RBI=0.022341;REFB=-0.0520973;REVB=-0.0157057;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310618;STB=0.673749;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0731159;OID=.;OPOS=29222070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:43:19:25:15:18:0.418605:8:7:15:4:8:10:21:4
chr2	29225502	.	T	G	119.76	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=25;FWDB=-0.0644363;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.269;QD=11.976;RBI=0.0682496;REFB=-0.0139635;REVB=0.0224937;RO=26;SAF=3;SAR=11;SRF=1;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374743;STB=0.710326;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0255448;OID=.;OPOS=29225502;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:40:26:26:14:14:0.35:11:3:1:25:11:3:1:25
chr2	29225504	.	T	C	142.7	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=25;FWDB=0.00192319;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.84;QD=13.5906;RBI=0.0112567;REFB=0.000206868;REVB=-0.0110912;RO=22;SAF=3;SAR=13;SRF=1;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290681;STB=0.686583;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=-0.000415287;OID=.;OPOS=29225504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:22:26:16:16:0.380952:13:3:1:21:13:3:1:25
chr2	29226389	.	A	G	182.23	PASS	AF=0.4;AO=19;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0393989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6977;QD=13.2531;RBI=0.155095;REFB=-0.0362356;REVB=-0.150007;RO=25;SAF=12;SAR=7;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524828;STB=0.588152;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0461813;OID=.;OPOS=29226389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:25:33:19:22:0.4:7:12:17:8:7:15:18:15
chr2	29226417	.	C	T	163.76	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.130636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1035;QD=13.3678;RBI=0.130641;REFB=-0.0201642;REVB=0.00120674;RO=31;SAF=13;SAR=5;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172535;STB=0.601424;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0244163;OID=.;OPOS=29226417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:5:13:18:13:5:13:18:13
chr2	29226512	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.17041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.656;QD=45.8066;RBI=0.170529;REFB=0;REVB=0.00637539;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00118028;OID=.;OPOS=29226512;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:12:2:0:0:12:2:0:0
chr2	29240060	.	A	G	1136.4	PASS	AF=0.461538;AO=120;DP=263;FAO=120;FDP=260;FR=.;FRO=140;FSAF=64;FSAR=56;FSRF=69;FSRR=71;FWDB=-0.0142493;FXX=0.0114064;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.711;QD=17.4831;RBI=0.0256742;REFB=-0.0257603;REVB=0.021357;RO=139;SAF=64;SAR=56;SRF=68;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429148;STB=0.521825;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0338546;OID=.;OPOS=29240060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:263:260:139:140:120:120:0.461538:56:64:68:71:56:64:69:71
chr2	29240673	.	G	A	497.49	PASS	AF=0.354651;AO=60;DP=165;FAO=61;FDP=172;FR=.;FRO=111;FSAF=9;FSAR=52;FSRF=29;FSRR=82;FWDB=-0.00223195;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.32;QD=11.5695;RBI=0.00315801;REFB=-0.0183268;REVB=-0.00223415;RO=104;SAF=9;SAR=51;SRF=28;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212327;STB=0.620948;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0317111;OID=.;OPOS=29240673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:172:104:111:60:61:0.354651:51:9:28:76:52:9:29:82
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chr2	29416366	.	G	C	1491.51	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0507119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3498;QD=63.4686;RBI=0.057424;REFB=0;REVB=-0.0269409;RO=0;SAF=52;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000349091;OID=.;OPOS=29416366;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:41:52:0:0:42:52:0:0
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chr2	29416572	.	T	C	989.94	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.059;QD=59.1006;RBI=0.0623783;REFB=0;REVB=0.061172;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258845;OID=.;OPOS=29416572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:30:36:0:0:31:36:0:0
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chr2	29444076	.	G	T	1040.52	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494186;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.592;QD=59.4581;RBI=0.051372;REFB=0;REVB=0.0140315;RO=0;SAF=14;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000278867;OID=.;OPOS=29444076;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:70:0:0:70:70:1:56:14:0:0:56:14:0:0
chr2	29444095	.	C	T	888.4	PASS	AF=0.984127;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0191406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.904;QD=56.406;RBI=0.0205675;REFB=-0.0430751;REVB=-0.00752736;RO=1;SAF=14;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00993967;STB=0.505153;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0020467;OID=.;OPOS=29444095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:63:1:1:61:62:0.984127:47:14:0:1:48:14:0:1
chr2	29445458	.	G	T	411.69	PASS	AF=1;AO=26;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0688261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.563;QD=56.7842;RBI=0.0885351;REFB=0;REVB=0.0556905;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000685682;OID=.;OPOS=29445458;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:26:29:1:11:15:0:0:13:16:0:0
chr2	29543663	.	T	C	1349.54	PASS	AF=0.967391;AO=88;DP=91;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0221631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.327;QD=58.6756;RBI=0.0482386;REFB=0.0202112;REVB=-0.0428458;RO=3;SAF=58;SAR=30;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000526309;STB=0.500137;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.00192443;OID=.;OPOS=29543663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:91:92:3:3:88:89:0.967391:30:58:2:1:30:59:2:1
chr2	29903931	.	T	A	728.91	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5492;QD=57.169;RBI=0.143396;REFB=0;REVB=0.138963;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00164791;OID=.;OPOS=29903931;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0
chr2	29940529	.	A	T	697.26	PASS	AF=0.938776;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0359156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.274;QD=56.9194;RBI=0.036095;REFB=-0.127598;REVB=-0.00359473;RO=1;SAF=21;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218604;STB=0.512929;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.00103233;OID=.;OPOS=29940529;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:49:49:1:3:46:46:0.938776:25:21:1:0:25:21:2:1
chr2	30381505	.	T	C	587.29	PASS	AF=0.541284;AO=59;DP=109;FAO=59;FDP=109;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0276698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.767;QD=21.5518;RBI=0.0416891;REFB=-0.0201651;REVB=0.0311827;RO=50;SAF=29;SAR=30;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404974;STB=0.522218;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0176386;OID=.;OPOS=30381505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:50:50:59:59:0.541284:30:29:27:23:30:29:27:23
chr2	30862980	.	C	T	129.4	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0193135;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.631;QD=12.9402;RBI=0.0697765;REFB=-0.00886882;REVB=-0.0670504;RO=25;SAF=6;SAR=9;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251641;STB=0.646868;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0170662;OID=.;OPOS=30862980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:9:6:16:9:9:6:16:9
chr2	30863092	.	C	T	421.74	PASS	AF=0.625;AO=40;DP=64;FAO=40;FDP=64;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00921315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.888;QD=26.3588;RBI=0.0121113;REFB=-0.00253926;REVB=0.00786134;RO=24;SAF=24;SAR=16;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413008;STB=0.522569;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.000536016;OID=.;OPOS=30863092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:24:24:40:40:0.625:16:24:13:11:16:24:13:11
chr2	30863108	.	A	G	519.01	PASS	AF=0.643836;AO=47;DP=73;FAO=47;FDP=73;FR=.;FRO=26;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0172479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9195;QD=28.439;RBI=0.0296357;REFB=-0.013376;REVB=0.0240995;RO=26;SAF=29;SAR=18;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104726;STB=0.556998;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.00774002;OID=.;OPOS=30863108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:26:26:47:47:0.643836:18:29:12:14:18:29:12:14
chr2	30863708	.	G	A	376.53	PASS	AF=0.381356;AO=45;DP=118;FAO=45;FDP=118;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=-0.0113167;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.921;QD=12.7636;RBI=0.011997;REFB=-0.00219998;REVB=-0.00398263;RO=72;SAF=26;SAR=19;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699892;STB=0.535862;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00350509;OID=.;OPOS=30863708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:72:73:45:45:0.381356:19:26:37:35:19:26:38:35
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chr2	31490716	.	C	G	980.37	PASS	AF=0.945205;AO=69;DP=73;FAO=69;FDP=73;FR=.;FRO=4;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0503851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.129;QD=53.7188;RBI=0.0514196;REFB=-0.108594;REVB=0.0102627;RO=4;SAF=40;SAR=29;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449579;STB=0.523803;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00581055;OID=.;OPOS=31490716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:73:73:4:4:69:69:0.945205:29:40:4:0:29:40:4:0
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chr2	31589847	.	G	A	414.12	PASS	AF=0.532468;AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0260874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.884;QD=21.5128;RBI=0.0260931;REFB=-0.00254302;REVB=-0.000544526;RO=35;SAF=13;SAR=28;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175837;STB=0.604944;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00171664;OID=.;OPOS=31589847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:35:36:41:41:0.532468:28:13:18:17:28:13:19:17
chr2	31805706	.	G	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.845;QD=52.6125;RBI=0.0608435;REFB=0;REVB=0.0495399;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000829143;OID=.;OPOS=31805706;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr2	31805880	.	A	AG	305.3	PASS	AF=1;AO=34;DP=50;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.234304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=7.86023;QD=25.4413;RBI=0.260269;REFB=0;REVB=0.113319;RO=15;SAF=21;SAR=13;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702256;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0127981;OID=.;OPOS=31805881;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:34:50:48:48:0:31:17:0:0:7:15:21:13:11:4
chr2	32475109	.	G	A	1581.2	PASS	AF=0.981651;AO=107;DP=110;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0250402;FXX=0.00909008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.094;QD=58.0255;RBI=0.0376891;REFB=0.0356673;REVB=0.0281684;RO=0;SAF=64;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501871;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-0.000130303;OID=.;OPOS=32475109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:110:109:0:2:107:107:0.981651:43:64:0:0:43:64:1:1
chr2	32476390	.	T	G	612.96	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.657;QD=59.8009;RBI=0.0618347;REFB=0;REVB=0.0128248;RO=1;SAF=24;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191432;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259146;OID=.;OPOS=32476390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:1:0:40:41:1:16:24:1:0:16:25:0:0
chr2	32481795	.	T	A	1008.91	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0654086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.3353;QD=58.4878;RBI=0.0654087;REFB=0;REVB=-5.71785e-05;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000913569;OID=.;OPOS=32481795;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:65:69:0:0:65:69:1:29:36:0:0:30:39:0:0
chr2	32667182	.	G	C	801.03	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.543;QD=57.2166;RBI=0.0485707;REFB=0;REVB=0.0331502;RO=0;SAF=19;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.65905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.71324e-05;OID=.;OPOS=32667182;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:37:19:0:0:37:19:0:0
chr2	32690189	.	A	G	184.79	PASS	AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.0152508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.061;QD=12.1176;RBI=0.0159385;REFB=-0.0327907;REVB=-0.00463127;RO=37;SAF=18;SAR=5;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115093;STB=0.561347;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0392156;OID=.;OPOS=32690189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:37:38:23:23:0.377049:5:18:26:11:5:18:27:11
chr2	32713706	.	A	T	376.99	PASS	AF=0.46988;AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.000134739;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.658;QD=18.1679;RBI=0.00501734;REFB=0.00441396;REVB=0.00501553;RO=44;SAF=19;SAR=20;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767768;STB=0.542853;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=-0.00380368;OID=.;OPOS=32713706;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:44:44:39:39:0.46988:20:19:25:19:20:19:25:19
chr2	32822957	.	G	A	290.34	PASS	AF=0.402439;AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=-0.0205791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.034;QD=14.1627;RBI=0.0543433;REFB=-0.0217847;REVB=-0.0502961;RO=48;SAF=16;SAR=17;SRF=18;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115448;STB=0.570538;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0299353;OID=.;OPOS=32822957;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:48:49:33:33:0.402439:17:16:18:30:17:16:18:31
chr2	32843292	.	TTTA	T,TT,TTTT	222.59	PASS	AF=0.714286,0.047619,0.142857;AO=7,3,5;DP=20;FAO=15,1,3;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=9,1,2;FSAR=6,0,1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0135891,-0.014948,-0.0165307;FXX=0.0869187;HRUN=4,4,1;LEN=3,2,1;MLLD=145.132,145.314,143.791;QD=42.3975;RBI=0.298205,0.294655,0.253518;REFB=-0.408251,-0.417546,-0.381469;REVB=0.297895,0.294275,0.252978;RO=1;SAF=4,2,4;SAR=3,1,1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.124421,0.266641,0.277405;STB=0.571332,0.993266,0.74849;STBP=0.133,0.226,0.313;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0005415,0.0171069,0.000238664;OID=.,.,.;OPOS=32843293,32843294,32843295;OREF=TTA,TA,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.714286,0.047619,0.142857:7,3,5:20:15,1,3:21:2:9,1,2:6,0,1:0:2:18:1:4,2,4:3,1,1:0:1
chr2	32855615	.	A	G	902.66	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7747;QD=58.2364;RBI=0.0308732;REFB=0;REVB=0.0111142;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00032195;OID=.;OPOS=32855615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0
chr2	32983526	.	C	T	372.25	PASS	AF=0.413462;AO=43;DP=105;FAO=43;FDP=104;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=44;FWDB=-0.00581187;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1059;QD=14.3175;RBI=0.0224539;REFB=-0.0197544;REVB=-0.0216887;RO=61;SAF=20;SAR=23;SRF=17;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199178;STB=0.611544;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00958068;OID=.;OPOS=32983526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:61:61:43:43:0.413462:23:20:17:44:23:20:17:44
chr2	33037617	.	A	G	92.57	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0169113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.005;QD=9.25675;RBI=0.0279389;REFB=-0.0119892;REVB=-0.0222393;RO=28;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030363;STB=0.518487;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0354709;OID=.;OPOS=33037617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:8:4:10:18:8:4:10:18
chr2	33484666	.	C	G	241.94	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0369066;FXX=0.020829;HRUN=5;LEN=1;MLLD=67.2304;QD=20.5909;RBI=0.0370962;REFB=-0.0157039;REVB=0.00374607;RO=22;SAF=17;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194227;STB=0.616097;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.023512;OID=.;OPOS=33484666;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:22:24:23:23:0.489362:6:17:12:10:6:17:13:11
chr2	33505139	.	C	A	746.7	PASS	AF=0.525547;AO=71;DP=136;FAO=72;FDP=137;FR=.;FRO=65;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=-0.00865774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6325;QD=21.8015;RBI=0.0091155;REFB=0.0110346;REVB=-0.00285236;RO=65;SAF=43;SAR=28;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328831;STB=0.513725;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=-0.00930084;OID=.;OPOS=33505139;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:137:65:65:71:72:0.525547:28:43:37:28:29:43:37:28
chr2	33557974	.	A	G	411.28	PASS	AF=0.967742;AO=29;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0438525;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.239;QD=53.0687;RBI=0.0440626;REFB=-0.0192699;REVB=-0.0042977;RO=1;SAF=24;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0843371;STB=0.545422;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.000390557;OID=.;OPOS=33557974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:29:30:0.967742:5:24:0:1:5:25:0:1
chr2	33558041	.	T	C	249.17	PASS	AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0151828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.721;QD=16.6111;RBI=0.0154447;REFB=-0.0133218;REVB=0.00283195;RO=31;SAF=11;SAR=17;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261922;STB=0.65374;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0171017;OID=.;OPOS=33558041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:32:28:28:0.466667:17:11:21:10:17:11:22:10
chr2	33585796	.	T	C	1828.22	PASS	AF=1;AO=119;DP=121;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0750373;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3504;QD=61.4527;RBI=0.0815346;REFB=0;REVB=0.0318951;RO=0;SAF=66;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.00457e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274432;OID=.;OPOS=33585796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:119:0:0:119:119:1:53:66:0:0:53:66:0:0
chr2	33764286	.	T	C	1323.99	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0781547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.951;QD=61.5807;RBI=0.0891476;REFB=0;REVB=0.0428851;RO=0;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000421369;OID=.;OPOS=33764286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:84:86:1:39:45:0:0:41:45:0:0
chr2	33952413	.	T	C	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00445882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5283;QD=58.1395;RBI=0.00690045;REFB=0;REVB=0.00526641;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.66608e-05;OID=.;OPOS=33952413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr2	33952456	.	C	G	368.09	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148857;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.912;QD=54.5314;RBI=0.0425297;REFB=0;REVB=0.0398395;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161225;OID=.;OPOS=33952456;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr2	33952621	.	G	A	206.1	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0196846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.433;QD=16.8246;RBI=0.0360204;REFB=-0.0325084;REVB=0.0301659;RO=28;SAF=10;SAR=11;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120359;STB=0.568564;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0237228;OID=.;OPOS=33952621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:11:10:10:18:11:10:10:18
chr2	36704144	.	C	T	1339.72	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.237;QD=62.3127;RBI=0.0628092;REFB=0;REVB=-0.0617904;RO=0;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.65233e-05;OID=.;OPOS=36704144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:41:45:0:0:41:45:0:0
chr2	36756288	.	T	C	433.13	PASS	AF=0.406504;AO=49;DP=123;FAO=50;FDP=123;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=29;FWDB=-0.037964;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=126.999;QD=14.0855;RBI=0.04212;REFB=0.00147681;REVB=0.0182437;RO=72;SAF=28;SAR=21;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279012;STB=0.525886;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=-0.0031655;OID=.;OPOS=36756288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:72:73:49:50:0.406504:21:28:43:29:22:28:44:29
chr2	36776555	.	G	T	291.52	PASS	AF=0.714286;AO=25;DP=35;FAO=25;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0699636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.366;QD=33.3163;RBI=0.0717089;REFB=-0.0160208;REVB=-0.0157245;RO=10;SAF=15;SAR=10;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157379;STB=0.586138;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0108945;OID=.;OPOS=36776555;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:35:10:10:25:25:0.714286:10:15:3:7:10:15:3:7
chr2	36781401	.	T	C	149.84	PASS	AF=0.287671;AO=21;DP=73;FAO=21;FDP=73;FR=.;FRO=52;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=0.0148701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4108;QD=8.21026;RBI=0.0203841;REFB=-0.011647;REVB=0.0139424;RO=52;SAF=10;SAR=11;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740504;STB=0.544229;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0358445;OID=.;OPOS=36781401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:52:52:21:21:0.287671:11:10:28:24:11:10:28:24
chr2	36782886	.	G	A	104.84	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.00903691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.291;QD=10.7525;RBI=0.061093;REFB=-0.00952538;REVB=-0.0604209;RO=26;SAF=6;SAR=7;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255481;STB=0.650946;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0389123;OID=.;OPOS=36782886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:7:6:18:8:7:6:18:8
chr2	36808732	.	T	G	117.19	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0414638;FXX=0.0238039;HRUN=5;LEN=1;MLLD=127.028;QD=11.4332;RBI=0.041488;REFB=-0.00611472;REVB=0.00141626;RO=26;SAF=6;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787773;STB=0.559355;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.022622;OID=.;OPOS=36808732;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:26:27:14:14:0.341463:8:6:13:13:8:6:14:13
chr2	37028486	.	T	C	359.92	PASS	AF=0.457831;AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0162477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.4518;QD=17.3454;RBI=0.0330497;REFB=-0.0370901;REVB=-0.0287802;RO=43;SAF=24;SAR=14;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161473;STB=0.603038;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0347642;OID=.;OPOS=37028486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:43:45:38:38:0.457831:14:24:20:23:14:24:20:25
chr2	37035934	.	A	G	282.99	PASS	AF=0.366667;AO=33;DP=90;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.0335321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5435;QD=12.5771;RBI=0.0359121;REFB=-0.0190295;REVB=0.0128561;RO=57;SAF=21;SAR=12;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046739;STB=0.526865;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.0356259;OID=.;OPOS=37035934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:57:57:33:33:0.366667:12:21:34:23:12:21:34:23
chr2	37035945	.	C	A	335.8	PASS	AF=0.402174;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.0223228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.402;QD=14.6;RBI=0.0223798;REFB=-0.00683711;REVB=-0.00159625;RO=55;SAF=24;SAR=13;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751053;STB=0.54269;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0113839;OID=.;OPOS=37035945;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:55:55:37:37:0.402174:13:24:32:23:13:24:32:23
chr2	37041439	.	C	T	285.18	PASS	AF=0.432432;AO=31;DP=73;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0711142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.3789;QD=15.4149;RBI=0.0712426;REFB=0.0101482;REVB=-0.00427548;RO=42;SAF=14;SAR=17;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981495;STB=0.546846;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.00892289;OID=.;OPOS=37041439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:42:42:31:32:0.432432:17:14:15:27:18:14:15:27
chr2	37094945	.	A	G	179.69	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472543;FXX=0.062461;HRUN=6;LEN=1;MLLD=149.432;QD=47.9159;RBI=0.0642195;REFB=0;REVB=0.0434876;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000952197;OID=.;OPOS=37094945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:6:8:0:0:7:8:0:0
chr2	37230728	.	T	C	923.25	PASS	AF=1;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294461;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.789;QD=58.6192;RBI=0.0524209;REFB=0;REVB=0.0433691;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160296;OID=.;OPOS=37230728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:62:63:1:27:35:0:0:27:36:0:0
chr2	37241050	.	G	A	1514.83	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0164556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.505;QD=62.4672;RBI=0.0197713;REFB=-0.0750075;REVB=-0.0109599;RO=1;SAF=55;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854504;STB=0.504504;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000891396;OID=.;OPOS=37241050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:41:55:1:0:41:55:1:0
chr2	37306343	.	G	A	1826.4	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00164518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.134;QD=60.8799;RBI=0.0083268;REFB=0;REVB=0.00816266;RO=0;SAF=52;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10611e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75915e-06;OID=.;OPOS=37306343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:120:0:0:117:120:1:65:52:0:0:66:54:0:0
chr2	37317869	.	C	T	1227.34	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.472;QD=61.3669;RBI=0.0554089;REFB=0;REVB=-0.0539417;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.11599e-05;OID=.;OPOS=37317869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:37:43:0:0:37:43:0:0
chr2	37365640	.	G	A,T	596.34	PASS	AF=0.925,0.075;AO=36,4;DP=40;FAO=37,3;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0;FSAR=15,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00154495,-0.0279675;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=102.563,106.655;QD=59.6341;RBI=0.0183558,0.0422744;REFB=0,0;REVB=0.0182907,-0.0317008;RO=0;SAF=22,0;SAR=14,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00297225,0.116916;OID=.,.;OPOS=37365640,37365640;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:40:40:0:0:36,4:37,3:0.925,0.075:14,4:22,0:0:0:15,3:22,0:0:0
chr2	37406644	.	A	G	1323.81	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401705;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.684;QD=62.2969;RBI=0.0408819;REFB=0;REVB=0.00759385;RO=0;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.3247e-05;OID=.;OPOS=37406644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:43:42:0:0:43:42:0:0
chr2	37406679	.	GCA	AGG,GAA,GGA	1060.37	PASS	AF=0.0136986,0.0410959,0.945205;AO=3,3,55;DP=73;FAO=1,3,69;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=0,3,33;FSAR=1,0,36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000163641,0.00785217,0.00860777;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=3,1,1;MLLD=94.89,142.194,176.313;QD=58.1027;RBI=0.0181031,0.0609791,0.0314118;REFB=0,0,0;REVB=-0.0181024,0.0604714,0.0302094;RO=0;SAF=0,3,28;SAR=3,0,27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-3.4002e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,snp,snp;VARB=0.0945578,-0.0321835,0.00261898;OID=.,.,.;OPOS=37406679,37406680,37406680;OREF=GCA,C,C;OALT=AGG,A,G;OMAPALT=AGG,GAA,GGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:8:73:73:0:0:3,3,55:1,3,69:0.0136986,0.0410959,0.945205:3,0,27:0,3,28:0:0:1,0,36:0,3,33:0:0
chr2	37456032	.	C	T	223.12	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.298;QD=49.5831;RBI=0.0519441;REFB=0;REVB=-0.0285873;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00158266;OID=.;OPOS=37456032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0
chr2	37458668	.	G	A	1253.78	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0561149;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.383;QD=60.4232;RBI=0.0561422;REFB=-0.0319146;REVB=0.00174991;RO=1;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111424;STB=0.505881;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00131594;OID=.;OPOS=37458668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:83:1:1:82:82:0.987952:42:40:0:1:42:40:0:1
chr2	37477794	.	C	A	190.04	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0671277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=40.7521;QD=47.5104;RBI=0.0746871;REFB=0;REVB=0.0327418;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00401957;OID=.;OPOS=37477794;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr2	37505105	.	T	G	1772.29	PASS	AF=0.991525;AO=117;DP=119;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.033378;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9712;QD=60.0775;RBI=0.0437117;REFB=-0.0227765;REVB=0.0282245;RO=0;SAF=68;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15086e-08;STB=0.50505;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.000399219;OID=.;OPOS=37505105;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:119:118:0:1:117:117:0.991525:49:68:0:0:49:68:0:1
chr2	37506939	.	A	G	1712.62	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00382926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.722;QD=60.6239;RBI=0.00848758;REFB=0;REVB=-0.00757469;RO=0;SAF=56;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.41671e-06;OID=.;OPOS=37506939;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:113:0:0:112:113:1:56:56:0:0:57:56:0:0
chr2	37579937	.	C	T	1428.57	PASS	AF=0.978723;AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00828262;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.4802;QD=60.7901;RBI=0.0384742;REFB=-0.0467111;REVB=0.0375721;RO=2;SAF=56;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166288;STB=0.50877;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000464424;OID=.;OPOS=37579937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:95:94:2:2:92:92:0.978723:36:56:2:0:36:56:2:0
chr2	37579971	.	C	T	1852.2	PASS	AF=0.99187;AO=119;DP=120;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00976265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8577;QD=60.2341;RBI=0.0253753;REFB=-0.00715456;REVB=-0.0234221;RO=1;SAF=65;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00725184;STB=0.503649;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=6.06865e-06;OID=.;OPOS=37579971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:120:123:1:1:119:122:0.99187:54:65:1:0:54:68:1:0
chr2	37599963	.	A	C	218.33	PASS	AF=0.468085;AO=21;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.067071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.635;QD=18.5811;RBI=0.0675312;REFB=-0.0161598;REVB=-0.00787041;RO=25;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15601;STB=0.597614;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0196452;OID=.;OPOS=37599963;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:25:21:22:0.468085:10:11:9:16:10:12:9:16
chr2	37872508	.	G	A	460.44	PASS	AF=0.469388;AO=46;DP=98;FAO=46;FDP=98;FR=.;FRO=52;FSAF=35;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.042199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.085;QD=18.7936;RBI=0.0427024;REFB=-0.0022352;REVB=-0.00653725;RO=52;SAF=35;SAR=11;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282537;STB=0.658623;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00355689;OID=.;OPOS=37872508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:52:52:46:46:0.469388:11:35:26:26:11:35:26:26
chr2	38179134	.	G	A	743.84	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.6103;QD=63.3052;RBI=0.0265014;REFB=0;REVB=-0.0117484;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000189853;OID=.;OPOS=38179134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:24:22:0:0:24:23:0:0
chr2	38298150	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00359547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.227;QD=62.6709;RBI=0.0110139;REFB=0;REVB=0.0104105;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8984e-05;OID=.;OPOS=38298150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:29:15:0:0:29:15:0:0
chr2	38298203	.	C	G	501.58	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8354;QD=59.0093;RBI=0.0319559;REFB=0;REVB=0.00132153;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000474711;OID=.;OPOS=38298203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr2	38302390	.	G	C	141.33	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0207453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5696;QD=21.7426;RBI=0.160488;REFB=-0.00283451;REVB=0.159142;RO=11;SAF=14;SAR=1;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372686;STB=0.717569;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00868056;OID=.;OPOS=38302390;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:1:14:8:3:1:14:8:3
chr2	38536626	.	T	G	113.07	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00873335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.998;QD=17.3957;RBI=0.0100832;REFB=-0.00914177;REVB=0.00503982;RO=13;SAF=7;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133159;STB=0.576354;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.00795622;OID=.;OPOS=38536626;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:6:7:5:8:6:7:5:8
chr2	38604351	.	A	G	157.88	PASS	AF=0.282051;AO=22;DP=78;FAO=22;FDP=78;FR=.;FRO=56;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=-0.075562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6864;QD=8.09618;RBI=0.143208;REFB=-0.0466893;REVB=-0.121651;RO=56;SAF=9;SAR=13;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234168;STB=0.639465;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0854333;OID=.;OPOS=38604351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:56:56:22:22:0.282051:13:9:34:22:13:9:34:22
chr2	38916970	.	A	T	1534.85	PASS	AF=0.981481;AO=105;DP=108;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0230853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.39;QD=56.8462;RBI=0.0327785;REFB=-0.200789;REVB=0.0232701;RO=2;SAF=57;SAR=48;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193602;STB=0.509998;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.000476607;OID=.;OPOS=38916970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:108:108:2:2:105:106:0.981481:48:57:0:2:49:57:0:2
chr2	39008949	.	G	A	245.7	PASS	AF=0.386667;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.0224717;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.433;QD=13.1041;RBI=0.0373491;REFB=-0.000197841;REVB=-0.0298325;RO=46;SAF=8;SAR=21;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914625;STB=0.552594;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00097684;OID=.;OPOS=39008949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:46:46:29:29:0.386667:21:8:16:30:21:8:16:30
chr2	39025555	.	G	A	1218.22	PASS	AF=0.975904;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.037352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.923;QD=58.7093;RBI=0.0377116;REFB=-0.0439898;REVB=0.00519522;RO=2;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262835;STB=0.51351;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00318212;OID=.;OPOS=39025555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:83:2:2:80:81:0.975904:35:45:0:2:36:45:0:2
chr2	39050141	.	A	C	474.17	PASS	AF=0.918919;AO=34;DP=37;FAO=34;FDP=37;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0135719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.956;QD=51.2615;RBI=0.0369389;REFB=-0.0168934;REVB=0.0343553;RO=1;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301451;STB=0.545428;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.000236593;OID=.;OPOS=39050141;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:37:37:1:3:34:34:0.918919:15:19:0:1:15:19:0:3
chr2	39053069	.	A	G	538.19	PASS	AF=0.5;AO=55;DP=111;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.011922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.742;QD=19.221;RBI=0.0126358;REFB=-0.013173;REVB=-0.0041866;RO=56;SAF=22;SAR=33;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269639;STB=0.518561;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0155714;OID=.;OPOS=39053069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:112:56:56:55:56:0.5:33:22:24:32:34:22:24:32
chr2	39082344	.	T	C	972.89	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.182;QD=58.9627;RBI=0.0211479;REFB=0;REVB=-0.00804083;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.82487e-05;OID=.;OPOS=39082344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:28:38:0:0:28:38:0:0
chr2	39209426	.	A	G	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0429516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1224;QD=21.8421;RBI=0.0686073;REFB=0.0318976;REVB=0.0534989;RO=2;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209294;STB=0.624528;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=-0.00389031;OID=.;OPOS=39209426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:1:5:1:1:1:5:1:1
chr2	39212563	.	GTTT	AGTT,GTTTG,GTTTGT,GTT	221.18	PASS	AF=0,0.16129,0.354839,0.483871;AO=4,7,4,7;DP=31;FAO=0,5,11,15;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4,6,14;FSAR=0,1,5,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0336551,-0.00458523,-0.00402037,-0.0776602;FXX=0;HRUN=1,0,0,11;LEN=2,1,2,1;MLLD=11.6497,258.744,259.449,3.96985;QD=28.5398;RBI=0.426368,0.0505943,0.0329557,0.987091;REFB=-0.0351677,-0.00668871,-0.00643787,-0.0354335;REVB=0.425037,0.0503861,0.0327096,0.984031;RO=1;SAF=4,7,3,7;SAR=0,0,1,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,-0.119989,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,ins,ins,del;VARB=0,-0.00633081,0.0155418,0.0398735;OID=.,.,.,.;OPOS=39212563,39212567,39212566,39212564;OREF=GT,-,-,T;OALT=AG,G,TG,-;OMAPALT=AGTT,GTTTG,GTTTGT,GTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	3/4:47:31:31:1:0:4,7,4,7:0,5,11,15:0,0.16129,0.354839,0.483871:0,0,1,0:4,7,3,7:1:0:0,1,5,1:0,4,6,14:0:0
chr2	39477170	.	T	C	739.07	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0240689;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=316.236;QD=54.7462;RBI=0.0460493;REFB=-0.0433482;REVB=0.0392584;RO=1;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229721;STB=0.51219;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.000541346;OID=.;OPOS=39477170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:20:33:0:1:20:33:0:1
chr2	39507417	.	T	A	190.55	PASS	AF=0.944444;AO=16;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0339379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.828;QD=42.3454;RBI=0.0731865;REFB=0.0819198;REVB=0.064842;RO=1;SAF=9;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481057;STB=0.523782;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.00174985;OID=.;OPOS=39507417;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:16:17:0.944444:7:9:1:0:7:10:1:0
chr2	39583446	.	A	G	1339.55	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00620273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.9632;QD=62.3045;RBI=0.0306821;REFB=0;REVB=0.0300485;RO=0;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127927;OID=.;OPOS=39583446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:41:45:0:0:41:45:0:0
chr2	40392104	.	G	A	382.5	PASS	AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0428696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.24;QD=17.3863;RBI=0.0429558;REFB=-0.0205175;REVB=0.00272011;RO=48;SAF=16;SAR=24;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788016;STB=0.544164;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0320035;OID=.;OPOS=40392104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:48:48:40:40:0.454545:24:16:23:25:24:16:23:25
chr2	40403104	.	A	G	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.563;QD=60.6101;RBI=0.0444677;REFB=0;REVB=0.0328612;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246882;OID=.;OPOS=40403104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr2	42165754	.	C	T	96.18	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0432479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4151;QD=12.0222;RBI=0.0447593;REFB=0.0155639;REVB=-0.0115329;RO=20;SAF=4;SAR=8;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18246;STB=0.608509;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=-0.0281128;OID=.;OPOS=42165754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:8:4:10:10:8:4:10:10
chr2	42275819	.	T	C	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0299298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.514;QD=23.218;RBI=0.0299298;REFB=-0.0966326;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0105478;OID=.;OPOS=42275819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:0:5:1:0:0:5:1:0
chr2	42281364	.	G	C	177.69	PASS	AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00189636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7682;QD=14.5055;RBI=0.0126212;REFB=0.00405909;REVB=-0.0124779;RO=30;SAF=12;SAR=7;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107572;STB=0.562433;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-0.0105423;OID=.;OPOS=42281364;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:30:30:19:19:0.387755:7:12:16:14:7:12:16:14
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chr2	42515437	.	A	G	283.61	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0372611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4072;QD=23.152;RBI=0.0902073;REFB=0.00141187;REVB=0.0821521;RO=23;SAF=9;SAR=17;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117456;STB=0.565672;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=-6.40483e-05;OID=.;OPOS=42515437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:17:9:11:12:17:9:11:12
chr2	42560975	.	A	G	767.06	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0739464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9515;QD=56.8191;RBI=0.0991397;REFB=0;REVB=0.0660349;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000828764;OID=.;OPOS=42560975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:24:29:0:0:24:30:0:0
chr2	42577803	.	T	C,TAAATACACAC	176.83	PASS	AF=0.227273,0.545455;AO=5,11;DP=23;FAO=5,12;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=0,8;FSAR=5,4;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0175887,-0.00801304;FXX=0.0434594;HRUN=1,2;LEN=1,10;MLLD=109.514,156.088;QD=32.15;RBI=0.165477,0.0354523;REFB=0.00656605,-0.0662981;REVB=0.164539,0.0345349;RO=5;SAF=0,8;SAR=5,3;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.812479,-0.213785;STB=0.997996,0.618873;STBP=0,0.239;TYPE=snp,ins;VARB=0.0223996,-0.00122347;OID=.,.;OPOS=42577803,42577804;OREF=T,-;OALT=C,AAATACACAC;OMAPALT=C,TAAATACACAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:34:23:22:5:5:5,11:5,12:0.227273,0.545455:5,3:0,8:5:0:5,4:0,8:5:0
chr2	42588195	.	T	C	768.56	PASS	AF=0.503185;AO=77;DP=155;FAO=79;FDP=157;FR=.;FRO=78;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=45;FSRR=33;FWDB=-0.0939259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9859;QD=19.5811;RBI=0.132348;REFB=-0.0291988;REVB=-0.0932414;RO=76;SAF=44;SAR=33;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00519006;STB=0.510068;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0225044;OID=.;OPOS=42588195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:157:76:78:77:79:0.503185:33:44:43:33:35:44:45:33
chr2	42922983	.	AT	A	36.22	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.106673;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.17125;QD=6.29917;RBI=0.107554;REFB=-0.0734001;REVB=0.0137391;RO=12;SAF=8;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327406;STB=0.719518;STBP=0.104;TYPE=del;VARB=0.0523888;OID=.;OPOS=42922984;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.434783:10:23:10:23:13:8:2:6:7:36:12:8:2:6:6
chr2	42990101	.	G	C	646.21	PASS	AF=0.5625;AO=63;DP=112;FAO=63;FDP=112;FR=.;FRO=49;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=-0.00497521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.471;QD=23.0788;RBI=0.0127767;REFB=-0.0209965;REVB=0.0117683;RO=49;SAF=39;SAR=24;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122714;STB=0.567169;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0165687;OID=.;OPOS=42990101;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:49:49:63:63:0.5625:24:39:23:26:24:39:23:26
chr2	42990336	.	T	G	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.996;QD=63.8714;RBI=0.0403113;REFB=0;REVB=0.0256643;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.25104e-05;OID=.;OPOS=42990336;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:27:21:0:0:27:21:0:0
chr2	42990522	.	C	T	425.79	PASS	AF=0.538462;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0819694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.645;QD=21.8356;RBI=0.0848937;REFB=-0.0607807;REVB=0.0220897;RO=36;SAF=26;SAR=16;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102565;STB=0.556648;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0458422;OID=.;OPOS=42990522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:36:36:42:42:0.538462:16:26:18:18:16:26:18:18
chr2	43015704	.	T	A	207.35	PASS	AF=0.42;AO=20;DP=49;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00184032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.512;QD=16.5877;RBI=0.0450861;REFB=-0.0151764;REVB=0.0450485;RO=29;SAF=8;SAR=12;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121904;STB=0.551675;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0280555;OID=.;OPOS=43015704;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:29:29:20:21:0.42:12:8:15:14:12:9:15:14
chr2	43015719	.	T	C	769.98	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283537;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.619;QD=64.1647;RBI=0.0322903;REFB=0;REVB=0.0154509;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.18049e-05;OID=.;OPOS=43015719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr2	43015757	.	G	A	689.12	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.347;QD=62.6469;RBI=0.0267741;REFB=0;REVB=0.0129537;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.20292e-05;OID=.;OPOS=43015757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr2	43037672	.	C	T	479.35	PASS	AF=0.541176;AO=46;DP=85;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=0.0370714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5075;QD=22.5575;RBI=0.0414073;REFB=0.0200203;REVB=0.0184466;RO=39;SAF=20;SAR=26;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191419;STB=0.605218;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.0188398;OID=.;OPOS=43037672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:39:39:46:46:0.541176:26:20:26:13:26:20:26:13
chr2	43793725	.	G	A	224.62	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.0108955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.186;QD=17.6173;RBI=0.0410077;REFB=-0.00226602;REVB=-0.0395337;RO=25;SAF=8;SAR=16;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312283;STB=0.67518;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00393746;OID=.;OPOS=43793725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:27:24:24:0.470588:16:8:17:8:16:8:18:9
chr2	43797619	.	C	T	368.46	PASS	AF=0.443182;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0149889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.849;QD=16.7481;RBI=0.0156369;REFB=-0.0142704;REVB=0.00445485;RO=46;SAF=29;SAR=10;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242023;STB=0.656872;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0144425;OID=.;OPOS=43797619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:46:49:39:39:0.443182:10:29:24:22:10:29:24:25
chr2	43801712	.	A	G	204.79	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.114358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4084;QD=15.7529;RBI=0.1188;REFB=-0.0380027;REVB=-0.032183;RO=29;SAF=21;SAR=2;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.683145;STB=0.892419;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0513985;OID=.;OPOS=43801712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:2:21:8:21:2:21:8:21
chr2	43804229	.	T	C	219.79	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0483441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5466;QD=17.5833;RBI=0.093674;REFB=-0.0188352;REVB=-0.080235;RO=27;SAF=7;SAR=15;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366509;STB=0.698747;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0174913;OID=.;OPOS=43804229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:28:22:22:0.44:15:7:19:8:15:7:19:9
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chr2	43992575	.	C	A	236.02	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.00698642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.645;QD=19.2674;RBI=0.0243289;REFB=-0.0303137;REVB=0.0233042;RO=26;SAF=15;SAR=8;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349981;STB=0.696909;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0219248;OID=.;OPOS=43992575;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:8:15:7:19:8:15:7:19
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chr2	43995001	.	C	T	298.79	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0132847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.9543;QD=18.6746;RBI=0.0216073;REFB=-0.00729358;REVB=-0.0170409;RO=31;SAF=18;SAR=14;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163169;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0120275;OID=.;OPOS=43995001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:31:32:32:32:0.5:14:18:18:13:14:18:18:14
chr2	44004010	.	T	C	178.04	PASS	AF=0.343284;AO=23;DP=67;FAO=23;FDP=67;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0169305;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.865;QD=10.6295;RBI=0.0171888;REFB=-0.00481501;REVB=0.00296877;RO=44;SAF=15;SAR=8;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295696;STB=0.672068;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0114359;OID=.;OPOS=44004010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:44:44:23:23:0.343284:8:15:17:27:8:15:17:27
chr2	44021826	.	T	A	203.07	PASS	AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0305862;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.78;QD=12.3074;RBI=0.0307754;REFB=-0.0103922;REVB=-0.00340718;RO=41;SAF=9;SAR=16;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116144;STB=0.567034;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0175172;OID=.;OPOS=44021826;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:41:41:25:25:0.378788:16:9:19:22:16:9:19:22
chr2	44066174	.	T	G	1183.29	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1637;QD=60.6815;RBI=0.0882643;REFB=0;REVB=0.0734854;RO=0;SAF=49;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000480444;OID=.;OPOS=44066174;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:62:78:0:0:61:78:1:12:49:0:0:17:61:0:0
chr2	44071743	.	A	G	816.43	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271715;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.807;QD=57.2931;RBI=0.0285984;REFB=0;REVB=0.00892061;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025017;OID=.;OPOS=44071743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:28:28:0:0:29:28:0:0
chr2	44080009	.	T	TC	37.42	PASS	AF=0.27027;AO=9;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.012993;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=27.6749;QD=4.04575;RBI=0.0230478;REFB=-0.0334311;REVB=0.0190364;RO=28;SAF=0;SAR=9;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.771218;STB=0.883577;STBP=0.007;TYPE=ins;VARB=0.143287;OID=.;OPOS=44080010;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.27027:9:37:10:37:27:1:9:16:11:37:28:0:9:17:11
chr2	44101538	.	C	T	1458.32	PASS	AF=1;AO=71;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=61;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0933262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=34.1762;QD=55.555;RBI=0.178529;REFB=0;REVB=-0.152193;RO=0;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.012245;OID=.;OPOS=44101538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:104:105:0:0:71:105:1:33:38:0:0:44:61:0:0
chr2	44104925	.	T	C	877.53	PASS	AF=1;AO=48;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110749;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.834;QD=58.5022;RBI=0.133125;REFB=0;REVB=0.0738722;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000644271;OID=.;OPOS=44104925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:48:60:1:24:24:0:0:25:35:0:0
chr2	44116883	.	A	AG	69.46	PASS	AF=0.247423;AO=24;DP=98;FAO=24;FDP=97;FR=.;FRO=73;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=57;FSRR=16;FWDB=-0.0248966;FXX=0.010203;HRUN=0;LEN=1;MLLD=84.2246;QD=2.86431;RBI=0.0271639;REFB=-0.00451014;REVB=0.0108645;RO=69;SAF=14;SAR=10;SRF=56;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31594;STB=0.686757;STBP=0.071;TYPE=ins;VARB=0.114026;OID=.;OPOS=44116884;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.247423:24:98:24:97:73:13:11:57:16:69:69:14:10:56:13
chr2	44201376	.	T	C	476.25	PASS	AF=0.528736;AO=46;DP=87;FAO=46;FDP=87;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.00870664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.227;QD=21.8964;RBI=0.00875017;REFB=-0.0206047;REVB=0.000871749;RO=41;SAF=24;SAR=22;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117966;STB=0.564927;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0189821;OID=.;OPOS=44201376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:41:41:46:46:0.528736:22:24:27:14:22:24:27:14
chr2	44209477	.	C	T	215.76	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0299803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3018;QD=16.2841;RBI=0.0304494;REFB=-0.00674346;REVB=-0.00532425;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116742;STB=0.565984;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0046051;OID=.;OPOS=44209477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:12:12:18:11:12:12:18:11
chr2	44471474	.	GTTTTTTT	GTTTTTTA,GTTTTTT	39.24	PASS	AF=0.0130719,0.114379;AO=12,57;DP=317;FAO=4,35;FDP=306;FR=.;FRO=267;FSAF=0,12;FSAR=4,23;FSRF=118;FSRR=149;FWDB=-0.0436002,-0.127458;FXX=0.0496879;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=201.263,7.57973;QD=0.512981;RBI=0.0439288,0.255589;REFB=-0.00500416,-0.157647;REVB=0.00536275,0.22154;RO=181;SAF=0,38;SAR=12,19;SRF=68;SRR=113;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.491316,0.357447;STB=0.99719,0.591557;STBP=0.036,0.264;TYPE=snp,del;VARB=0.187646,0.16931;OID=.,.;OPOS=44471481,44471475;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=GTTTTTTA,GTTTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0130719,0.114379:12,57:317:4,35:306:267:0,12:4,23:118:149:33:181:0,38:12,19:68:113
chr2	45149003	.	C	T	163.76	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0160157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=348.666;QD=13.3679;RBI=0.0160301;REFB=-0.00239924;REVB=-0.000679783;RO=31;SAF=9;SAR=9;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174736;STB=0.510193;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.00396901;OID=.;OPOS=45149003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:9:9:16:15:9:9:16:15
chr2	45171842	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.41;QD=59.4349;RBI=0.0487786;REFB=0;REVB=0.0471186;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289365;OID=.;OPOS=45171842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:11:24:0:0:11:24:0:0
chr2	46206082	.	CTTTTTTTAA	CTTTTTT,CTTTTTTA,CTTTTTTAA,CTTTTTTTA	73.22	PASS	AF=0,0.344828,0.137931,0;AO=4,4,5,3;DP=30;FAO=0,10,4,0;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=0,4,4,0;FSAR=0,6,0,0;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0165809,0.00396733,-0.0533748,0.0744393;FXX=0;HRUN=7,7,7,7;LEN=3,2,1,1;MLLD=22.3741,18.1255,10.9784,9.7726;QD=10.0994;RBI=0.263435,0.271395,0.242131,0.675495;REFB=0.0108685,0.0223881,0.0279039,0.0141184;REVB=-0.262912,-0.271366,0.236175,-0.671381;RO=10;SAF=0,4,5,1;SAR=4,0,0,2;SRF=10;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.836524,0,0,-0.702869;STB=0.5,0.726876,0.995792,0.5;STBP=1,0.108,0.238,1;TYPE=del,del,del,del;VARB=0,-0.0278007,0.00733472,0;OID=.,.,.,.;OPOS=46206089,46206089,46206083,46206090;OREF=TAA,TA,T,A;OALT=-,-,-,-;OMAPALT=CTTTTTT,CTTTTTTA,CTTTTTTAA,CTTTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.344828,0.137931,0:4,4,5,3:30:0,10,4,0:29:15:0,4,4,0:0,6,0,0:12:3:48:10:0,4,5,1:4,0,0,2:10:0
chr2	46414169	.	G	A	333.28	PASS	AF=0.444444;AO=35;DP=80;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0186804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.551;QD=16.4583;RBI=0.0241658;REFB=-0.00597505;REVB=-0.0153306;RO=45;SAF=23;SAR=12;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139881;STB=0.503349;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.00672531;OID=.;OPOS=46414169;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:45:45:35:36:0.444444:12:23:29:16:13:23:29:16
chr2	46414434	.	C	A	149.16	PASS	AF=0.322581;AO=20;DP=62;FAO=20;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0023748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.421;QD=9.62342;RBI=0.00429203;REFB=-0.00453412;REVB=0.00357516;RO=42;SAF=11;SAR=9;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249174;STB=0.514691;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0107049;OID=.;OPOS=46414434;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:42:42:20:20:0.322581:9:11:24:18:9:11:24:18
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chr2	46739715	.	C	T	305.5	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0276614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.113;QD=17.7104;RBI=0.029087;REFB=-0.0174266;REVB=-0.00899458;RO=35;SAF=21;SAR=12;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143018;STB=0.573725;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0130848;OID=.;OPOS=46739715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:35:36:33:33:0.478261:12:21:17:18:12:21:18:18
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chr2	47596853	.	C	CG	194.31	PASS	AF=0.44;AO=34;DP=76;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.00348832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.1908;QD=10.3632;RBI=0.0595505;REFB=0.00110191;REVB=-0.0594483;RO=42;SAF=21;SAR=13;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713314;STB=0.552131;STBP=0.452;TYPE=ins;VARB=-0.00117514;OID=.;OPOS=47596854;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.44:34:76:33:75:42:21:12:23:19:99:42:21:13:23:19
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chr2	47604866	.	C	T	579.43	PASS	AF=0.346734;AO=68;DP=198;FAO=69;FDP=199;FR=.;FRO=130;FSAF=22;FSAR=47;FSRF=53;FSRR=77;FWDB=-0.0287436;FXX=0.00499975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6183;QD=11.6468;RBI=0.0898204;REFB=-0.0156154;REVB=-0.0850971;RO=128;SAF=21;SAR=47;SRF=51;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113467;STB=0.56371;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0234648;OID=.;OPOS=47604866;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:198:199:128:130:68:69:0.346734:47:21:51:77:47:22:53:77
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chr2	48030639	.	ACCCCCCCC	ACCCCCCC,ACCCCCCCT	74.34	PASS	AF=0.163399,0.111111;AO=32,15;DP=154;FAO=25,17;FDP=153;FR=.;FRO=111;FSAF=10,16;FSAR=15,1;FSRF=50;FSRR=61;FWDB=-0.0740557,0.0292488;FXX=0.00649309;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.62345,23.1342;QD=1.94365;RBI=0.0849127,0.0559485;REFB=-0.0583781,-0.0246356;REVB=-0.041544,-0.0476943;RO=71;SAF=7,15;SAR=25,0;SRF=32;SRR=39;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.311969,0.744145;STB=0.542135,0.93709;STBP=0.594,0;TYPE=del,snp;VARB=0.00257339,-0.042374;OID=.,.;OPOS=48030640,48030647;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=ACCCCCCC,ACCCCCCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.163399,0.111111:32,15:154:25,17:153:111:10,16:15,1:50:61:35:71:7,15:25,0:32:39
chr2	48602252	.	C	T	592.17	PASS	AF=0.546296;AO=59;DP=108;FAO=59;FDP=108;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=0.000831185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.572;QD=21.9323;RBI=0.00937941;REFB=-0.0201364;REVB=0.00934251;RO=48;SAF=31;SAR=28;SRF=33;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134329;STB=0.567785;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0184246;OID=.;OPOS=48602252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:48:49:59:59:0.546296:28:31:33:15:28:31:33:16
chr2	48756682	.	C	G	1718.43	PASS	AF=1;AO=107;DP=111;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0780105;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.4391;QD=58.2519;RBI=0.155067;REFB=-0.0760181;REVB=0.134015;RO=3;SAF=49;SAR=58;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239145;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0069688;OID=.;OPOS=48756682;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:111:118:3:0:107:118:1:58:49:0:3:69:49:0:0
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chr2	48808152	.	G	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0037301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.268;QD=57.2025;RBI=0.00734952;REFB=0;REVB=0.0063326;RO=0;SAF=21;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118643;OID=.;OPOS=48808152;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:9:21:0:0:9:21:0:0
chr2	48808594	.	C	T	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.32;QD=57.2377;RBI=0.0272456;REFB=0;REVB=-0.00121548;RO=0;SAF=37;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21233e-05;OID=.;OPOS=48808594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:19:37:0:0:19:37:0:0
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chr2	48808898	.	C	T	805.11	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.27;QD=64.4085;RBI=0.0359882;REFB=0;REVB=0.0341078;RO=0;SAF=30;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.00155e-05;OID=.;OPOS=48808898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:20:30:0:0:20:30:0:0
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chr2	49191041	.	C	T	220.93	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0866577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.657;QD=18.0348;RBI=0.0866586;REFB=-0.0149114;REVB=0.000397314;RO=27;SAF=10;SAR=12;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463131;STB=0.526292;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.014878;OID=.;OPOS=49191041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:12:10:11:16:12:10:11:16
chr2	50148971	.	C	CT	86.54	PASS	AF=0.548387;AO=6;DP=37;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0592146;FXX=0.114253;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.62;QD=11.166;RBI=0.0614243;REFB=-0.0292745;REVB=-0.0163275;RO=31;SAF=0;SAR=6;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.642583;STB=0.58452;STBP=0.323;TYPE=ins;VARB=0.0318058;OID=.;OPOS=50148972;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.548387:6:37:17:31:14:8:9:4:10:86:31:0:6:12:19
chr2	50148972	.	C	T	194.44	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0171274;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.934;QD=21.0207;RBI=0.0171502;REFB=-0.0266697;REVB=0.000883212;RO=16;SAF=8;SAR=12;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128079;STB=0.581318;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0240692;OID=.;OPOS=50148972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:17:20:20:0.540541:12:8:4:12:12:8:4:13
chr2	50201110	.	A	G	338.2	PASS	AF=0.430233;AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.0429542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8487;QD=15.7302;RBI=0.0439658;REFB=-0.0190035;REVB=0.00937688;RO=48;SAF=17;SAR=20;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103078;STB=0.552042;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0270963;OID=.;OPOS=50201110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:48:49:37:37:0.430233:20:17:27:21:20:17:27:22
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chr2	54557360	.	A	G	307.09	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0571584;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.384;QD=17.8021;RBI=0.0585175;REFB=-0.014651;REVB=0.0125386;RO=36;SAF=18;SAR=15;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.094047;STB=0.5526;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0212016;OID=.;OPOS=54557360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:15:18:16:20:15:18:16:20
chr2	54587596	.	C	T	97.21	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0196329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1205;QD=12.9608;RBI=0.0316111;REFB=-0.00437885;REVB=0.0247751;RO=16;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184269;STB=0.633127;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.010795;OID=.;OPOS=54587596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:16:18:12:12:0.4:6:6:11:5:6:6:13:5
chr2	54756740	.	C	T	55.03	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0183964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.01;QD=9.56965;RBI=0.0218143;REFB=-0.0157971;REVB=-0.0117234;RO=15;SAF=3;SAR=5;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368003;STB=0.721148;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0235327;OID=.;OPOS=54756740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:5:3:11:4:5:3:11:4
chr2	55040426	.	A	G	451.92	PASS	AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0103693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.809;QD=19.4373;RBI=0.011604;REFB=-0.0292813;REVB=0.00520878;RO=47;SAF=23;SAR=22;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200031;STB=0.516476;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0395365;OID=.;OPOS=55040426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:47:48:45:45:0.483871:22:23:23:24:22:23:23:25
chr2	55138129	.	CT	CA,C	38.56	PASS	AF=0,0.2;AO=3,18;DP=75;FAO=0,15;FDP=75;FR=.;FRO=60;FSAF=0,9;FSAR=0,6;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=0.00143711,0.0717171;FXX=0.0131562;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=74.9589,8.80932;QD=2.05674;RBI=0.0546986,0.121093;REFB=-0.0112892,-0.0622596;REVB=-0.0546797,0.0975712;RO=46;SAF=1,11;SAR=2,7;SRF=24;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.175602,0.108542;STB=0.5,0.580537;STBP=1,0.528;TYPE=snp,del;VARB=0,0.0964835;OID=.,.;OPOS=55138130,55138130;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=CA,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.2:3,18:75:0,15:75:60:0,9:0,6:30:30:39:46:1,11:2,7:24:22
chr2	55186394	.	A	C	786.96	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0075633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.057;QD=55.2255;RBI=0.0150333;REFB=-0.135338;REVB=0.0129921;RO=1;SAF=31;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149682;STB=0.507934;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000440747;OID=.;OPOS=55186394;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:57:57:1:1:56:56:0.982456:25:31:1:0:25:31:1:0
chr2	55277337	.	CG	C	47.23	PASS	AF=0.423077;AO=31;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=0;FSRF=30;FSRR=0;FWDB=-0.0506984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=33.3764;QD=3.63318;RBI=0.0506984;REFB=-0.0351489;REVB=0;RO=20;SAF=31;SAR=0;SRF=20;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.292861;OID=.;OPOS=55277338;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.423077:31:52:22:52:30:22:0:30:0:47:20:31:0:20:0
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chr2	55407754	.	C	T	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.96;QD=57.5444;RBI=0.0424846;REFB=0;REVB=0.0193628;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136271;OID=.;OPOS=55407754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:24:34:0:0:24:34:0:0
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chr2	55490819	.	G	T	187.68	PASS	AF=0.389831;AO=22;DP=58;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.0166726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2262;QD=12.7239;RBI=0.0183419;REFB=-0.0130792;REVB=-0.00764517;RO=36;SAF=17;SAR=5;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145676;STB=0.592936;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0181855;OID=.;OPOS=55490819;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:36:36:22:23:0.389831:5:17:24:12:5:18:24:12
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chr2	55522422	.	A	G	1568.47	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.131;QD=64.0192;RBI=0.047798;REFB=0;REVB=0.046312;RO=0;SAF=47;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110712;OID=.;OPOS=55522422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:51:47:0:0:51:47:0:0
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chr2	55771161	.	A	G	411.06	PASS	AF=0.45098;AO=44;DP=101;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=18;FWDB=0.0754593;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3816;QD=16.1202;RBI=0.0755026;REFB=0.00290331;REVB=0.00255849;RO=55;SAF=22;SAR=22;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171929;STB=0.609091;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=-0.00237825;OID=.;OPOS=55771161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:55:56:44:46:0.45098:22:22:37:18:24:22:38:18
chr2	55805440	.	T	C	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.663;QD=58.14;RBI=0.0512427;REFB=0;REVB=0.030939;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012045;OID=.;OPOS=55805440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr2	55883317	.	G	T	255.17	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00900366;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.895;QD=17.5977;RBI=0.0333439;REFB=-0.0149049;REVB=0.0321053;RO=29;SAF=17;SAR=11;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114913;STB=0.556634;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0160775;OID=.;OPOS=55883317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:29:30:28:28:0.482759:11:17:14:15:11:17:15:15
chr2	55912120	.	T	C	374.27	PASS	AF=0.631579;AO=34;DP=55;FAO=36;FDP=57;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0532951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.9;QD=26.2647;RBI=0.0907048;REFB=-0.0554263;REVB=0.0733961;RO=21;SAF=20;SAR=14;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120443;STB=0.515266;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.030311;OID=.;OPOS=55912120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:21:21:34:36:0.631579:14:20:12:9:14:22:12:9
chr2	58316814	.	A	G	224.61	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0187204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.967;QD=17.6165;RBI=0.0248668;REFB=-0.0106767;REVB=0.0163678;RO=27;SAF=7;SAR=17;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228265;STB=0.629517;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0120427;OID=.;OPOS=58316814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:17:7:14:13:17:7:14:13
chr2	58388696	.	A	G	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00441636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.787;QD=21.2676;RBI=0.0203328;REFB=0.00900456;REVB=0.0198474;RO=14;SAF=10;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717644;STB=0.540492;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=-0.00620733;OID=.;OPOS=58388696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:7:10:7:7:7:10:7:7
chr2	60614572	.	G	A	538.45	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00469398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.965;QD=59.8273;RBI=0.00776083;REFB=0;REVB=0.00618038;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.43132e-06;OID=.;OPOS=60614572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:23:13:0:0:23:13:0:0
chr2	60614577	.	A	G	538.26	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.704;QD=59.8061;RBI=0.0492799;REFB=0;REVB=-0.0134235;RO=0;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124161;OID=.;OPOS=60614577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:23:12:0:0:23:13:0:0
chr2	60687959	.	A	G	1005.5	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00464701;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.344;QD=59.1473;RBI=0.0103868;REFB=0;REVB=0.00928925;RO=0;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3108e-05;OID=.;OPOS=60687959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:31:37:0:0:31:37:0:0
chr2	60867976	.	C	T	791.83	PASS	AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.040527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5035;QD=53.6833;RBI=0.0433237;REFB=-0.0708504;REVB=0.0153135;RO=2;SAF=33;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277265;STB=0.514701;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00265567;OID=.;OPOS=60867976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:59:59:2:2:57:57:0.966102:24:33:2:0:24:33:2:0
chr2	61315632	.	ATTTTTG	ATTTGTA,ATTTTG,ATTTTGT	495.69	PASS	AF=0,0.704762,0.00952381;AO=4,54,11;DP=104;FAO=0,74,1;FDP=105;FR=.;FRO=30;FSAF=0,44,0;FSAR=0,30,1;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.134447,-0.135442,-0.0841964;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=3,1,2;MLLD=116.59,11.5067,13.8253;QD=18.8836;RBI=0.140402,0.137286,0.165961;REFB=-0.00270421,-0.075562,0.0100399;REVB=-0.0404586,-0.0224241,-0.143018;RO=28;SAF=4,36,0;SAR=0,18,11;SRF=11;SRR=17;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.656079,0.180945,-0.749351;STB=0.5,0.556946,0.988011;STBP=1,0.092,0.471;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0,0.0600447,0.0489472;OID=.,.,.;OPOS=61315636,61315633,61315637;OREF=TTG,T,TG;OALT=GTA,-,GT;OMAPALT=ATTTGTA,ATTTTG,ATTTTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.704762,0.00952381:4,54,11:104:0,74,1:105:30:0,44,0:0,30,1:12:18:89:28:4,36,0:0,18,11:11:17
chr2	61415473	.	G	C	286.5	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.011459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.071;QD=24.3828;RBI=0.0257781;REFB=0.001389;REVB=0.0230912;RO=21;SAF=16;SAR=10;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440506;STB=0.524457;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=-0.000947764;OID=.;OPOS=61415473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:10:16:14:7:10:16:14:7
chr2	61450454	.	A	G	1021.25	PASS	AF=0.972222;AO=70;DP=73;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.030264;FXX=0.0136968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.4044;QD=56.7364;RBI=0.0425184;REFB=-0.0650927;REVB=0.0298648;RO=1;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129528;STB=0.51351;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.00060894;OID=.;OPOS=61450454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:72:1:2:70:70:0.972222:36:34:0:1:36:34:0:2
chr2	61522123	.	T	C	1025.43	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4538;QD=59.4453;RBI=0.109204;REFB=0;REVB=0.0199688;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00110252;OID=.;OPOS=61522123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:33:35:0:0:34:35:0:0
chr2	61575308	.	A	G	789.94	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026849;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.928;QD=57.4505;RBI=0.0391338;REFB=0;REVB=-0.0284707;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97742e-06;OID=.;OPOS=61575308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:23:31:0:0:23:32:0:0
chr2	61577435	.	T	C	689.31	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00979922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.42;QD=62.6649;RBI=0.0741155;REFB=0;REVB=0.0734648;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141588;OID=.;OPOS=61577435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr2	62066927	.	A	G	1361.95	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205802;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.056;QD=62.6184;RBI=0.0243502;REFB=0;REVB=0.0130149;RO=0;SAF=52;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000546497;OID=.;OPOS=62066927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:35:52:0:0:35:52:0:0
chr2	62069358	.	T	C	210.33	PASS	AF=0.313953;AO=27;DP=86;FAO=27;FDP=86;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0369986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.949;QD=9.78262;RBI=0.0377067;REFB=-0.00617105;REVB=0.00727333;RO=59;SAF=14;SAR=13;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907823;STB=0.553225;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0130781;OID=.;OPOS=62069358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:59:59:27:27:0.313953:13:14:26:33:13:14:26:33
chr2	62081012	.	A	C	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.861;QD=59.143;RBI=0.0371628;REFB=0;REVB=0.0120001;RO=0;SAF=22;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.37997e-05;OID=.;OPOS=62081012;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:45:22:0:0:45:22:0:0
chr2	62112222	.	G	A	132.97	PASS	AF=0.369565;AO=16;DP=43;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0119022;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=65.4413;QD=11.5629;RBI=0.0252576;REFB=-0.0120435;REVB=-0.0222774;RO=18;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218222;STB=0.566931;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0104943;OID=.;OPOS=62112222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:46:18:29:16:17:0.369565:6:10:7:11:7:10:14:15
chr2	62450631	.	A	G	835.36	PASS	AF=1;AO=59;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2507;QD=54.7775;RBI=0.148687;REFB=-0.126423;REVB=0.140114;RO=2;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304178;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0022521;OID=.;OPOS=62450631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:61:61:2:0:59:61:1:30:29:0:2:32:29:0:0
chr2	62450743	.	T	C	1662.33	PASS	AF=0.973913;AO=112;DP=117;FAO=112;FDP=115;FR=.;FRO=3;FSAF=56;FSAR=56;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00149919;FXX=0.0254216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.322;QD=57.8203;RBI=0.0498964;REFB=-0.0546861;REVB=0.0498738;RO=0;SAF=56;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513041;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.000351352;OID=.;OPOS=62450743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:117:115:0:3:112:112:0.973913:56:56:0:0:56:56:3:0
chr2	62451422	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.047;QD=58.5871;RBI=0.0221429;REFB=0;REVB=0.0134301;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.39265e-05;OID=.;OPOS=62451422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0
chr2	62729674	.	T	C	171.18	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0188983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.015;QD=12.4495;RBI=0.0674929;REFB=-0.00959895;REVB=0.0647932;RO=33;SAF=10;SAR=11;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412301;STB=0.514717;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0129386;OID=.;OPOS=62729674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:33:34:21:21:0.381818:11:10:17:16:11:10:17:17
chr2	62733253	.	C	T	1771.58	PASS	AF=0.508824;AO=173;DP=340;FAO=173;FDP=340;FR=.;FRO=167;FSAF=97;FSAR=76;FSRF=63;FSRR=104;FWDB=0.0361957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.8363;QD=20.8422;RBI=0.0410396;REFB=-0.0231135;REVB=0.0193422;RO=161;SAF=97;SAR=76;SRF=59;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170217;STB=0.589456;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0270868;OID=.;OPOS=62733253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:340:340:161:167:173:173:0.508824:76:97:59:102:76:97:63:104
chr2	62738931	.	G	C	238.54	PASS	AF=0.379747;AO=27;DP=77;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.018178;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7084;QD=12.0778;RBI=0.0356195;REFB=-0.0191365;REVB=-0.0306319;RO=47;SAF=16;SAR=11;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444254;STB=0.523794;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0370725;OID=.;OPOS=62738931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:79:47:49:27:30:0.379747:11:16:26:21:14:16:28:21
chr2	63395979	.	G	A	180.08	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.000929755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.775;QD=23.236;RBI=0.00533989;REFB=-0.0187341;REVB=0.00525833;RO=13;SAF=11;SAR=7;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279326;STB=0.655972;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0092426;OID=.;OPOS=63395979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:7:11:3:10:7:11:3:10
chr2	63436117	.	T	C	131.0	PASS	AF=0.405405;AO=13;DP=35;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0283138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=341.29;QD=14.1621;RBI=0.0314789;REFB=-0.02213;REVB=-0.0137567;RO=22;SAF=2;SAR=11;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131564;STB=0.602494;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0283478;OID=.;OPOS=63436117;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:37:22:22:13:15:0.405405:11:2:5:17:13:2:5:17
chr2	63849491	.	T	C	1695.23	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00214859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.146;QD=60.544;RBI=0.0260723;REFB=0;REVB=0.0259836;RO=0;SAF=50;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17338e-05;OID=.;OPOS=63849491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:62:50:0:0:62:50:0:0
chr2	64069732	.	G	A	223.17	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000679413;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.293;QD=49.5941;RBI=0.0241734;REFB=0;REVB=0.0241639;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177121;OID=.;OPOS=64069732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:9:8:0:0:10:8:0:0
chr2	64321823	.	A	G	68.09	PASS	AF=0.277778;AO=6;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.034997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.1837;QD=7.56573;RBI=0.0493979;REFB=-0.0293481;REVB=0.034862;RO=24;SAF=4;SAR=2;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245612;STB=0.555446;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0931816;OID=.;OPOS=64321823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:36:36:24:26:6:10:0.277778:2:4:11:13:5:5:11:15
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chr2	64861275	.	TAAAAAT	TAAAA,TAAAAT,TAAAATT	393.51	PASS	AF=0.8,0,0;AO=16,9,4;DP=59;FAO=44,0,0;FDP=55;FR=.;FRO=11;FSAF=24,0,0;FSAR=20,0,0;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.126316,0.157201,0.0323412;FXX=0.017854;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=23.8414,12.3782,10.3954;QD=28.6189;RBI=0.13393,0.20642,0.103469;REFB=-0.10313,-0.128446,-0.0328758;REVB=-0.0445162,-0.13378,-0.0982844;RO=11;SAF=2,7,3;SAR=14,2,1;SRF=8;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.532113,0.0645154,0.0319232;STB=0.518386,0.5,0.5;STBP=0.614,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0320997,0,0;OID=.,.,.;OPOS=64861280,64861276,64861280;OREF=AT,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=TAAAA,TAAAAT,TAAAATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.8,0,0:16,9,4:59:44,0,0:55:11:24,0,0:20,0,0:7:4:58:11:2,7,3:14,2,1:8:3
chr2	65044680	.	C	T	1008.99	PASS	AF=0.985714;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.012631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.743;QD=57.6564;RBI=0.0182267;REFB=-0.148327;REVB=0.0131403;RO=1;SAF=27;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171824;STB=0.508769;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000282567;OID=.;OPOS=65044680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:70:1:1:68:69:0.985714:41:27:1:0:41:28:1:0
chr2	65311555	.	C	T	650.9	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.424;QD=61.9909;RBI=0.0291782;REFB=0;REVB=-0.00151766;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74936e-05;OID=.;OPOS=65311555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:27:14:0:0:27:15:0:0
chr2	65495887	.	G	A	2167.3	PASS	AF=1;AO=141;DP=148;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158315;FXX=0.0463545;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.046;QD=60.2029;RBI=0.0405885;REFB=-0.0841197;REVB=0.0373737;RO=0;SAF=78;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28678e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152851;OID=.;OPOS=65495887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:148:144:0:0:141:144:1:63:78:0:0:66:78:0:0
chr2	65496018	.	C	G	235.13	PASS	AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=-0.0324791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.933;QD=14.2505;RBI=0.0335333;REFB=-0.0195274;REVB=-0.00834225;RO=35;SAF=12;SAR=16;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0874126;STB=0.551534;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.024092;OID=.;OPOS=65496018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:35:38:28:28:0.424242:16:12:12:23:16:12:13:25
chr2	65496144	.	A	G	1208.87	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6051;QD=61.2086;RBI=0.0268645;REFB=0;REVB=0.0204965;RO=0;SAF=51;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000219345;OID=.;OPOS=65496144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:28:51:0:0:28:51:0:0
chr2	65496187	.	G	A	288.79	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0574856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0299;QD=16.2701;RBI=0.0592455;REFB=-0.000353088;REVB=-0.0143333;RO=38;SAF=25;SAR=7;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265325;STB=0.659869;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.000415835;OID=.;OPOS=65496187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:38:39:32:32:0.450704:7:25:21:17:7:25:21:18
chr2	65497571	.	C	A	501.54	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0435137;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.104;QD=59.0043;RBI=0.0437813;REFB=0;REVB=-0.00483323;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000160748;OID=.;OPOS=65497571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr2	65540905	.	C	G	850.56	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.125;QD=57.6651;RBI=0.0297252;REFB=0;REVB=-0.0109959;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.32831e-05;OID=.;OPOS=65540905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:29:28:0:0:29:30:0:0
chr2	65561392	.	C	T	646.7	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.446;QD=61.5903;RBI=0.0442022;REFB=0;REVB=0.0241639;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.66597e-05;OID=.;OPOS=65561392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:22:19:0:0:22:20:0:0
chr2	67630980	.	G	A	121.39	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=-0.022862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.654;QD=15.1731;RBI=0.0238394;REFB=-0.00474492;REVB=-0.00675623;RO=18;SAF=10;SAR=4;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.457182;STB=0.762361;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0162121;OID=.;OPOS=67630980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:4:10:4:14:4:10:4:14
chr2	67631831	.	G	A	235.53	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0268084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.092;QD=25.4622;RBI=0.026989;REFB=-0.0199865;REVB=-0.00311674;RO=14;SAF=13;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140711;STB=0.503813;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0140115;OID=.;OPOS=67631831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:14:15:22:22:0.594595:9:13:8:6:9:13:9:6
chr2	67632125	.	C	T	335.82	PASS	AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0236848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7846;QD=22.3882;RBI=0.0247701;REFB=0.00608217;REVB=0.00725183;RO=26;SAF=12;SAR=22;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180851;STB=0.59994;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.00498368;OID=.;OPOS=67632125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:22:12:15:11:22:12:15:11
chr2	68388823	.	A	G	203.35	PASS	AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0120412;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.9988;QD=14.2702;RBI=0.0130239;REFB=-0.00173887;REVB=0.00496313;RO=32;SAF=13;SAR=11;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210912;STB=0.502207;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.00257355;OID=.;OPOS=68388823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:32:33:24:24:0.421053:11:13:18:14:11:13:18:15
chr2	68407926	.	A	G	128.84	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0177984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.934;QD=12.5692;RBI=0.0182438;REFB=-0.0103348;REVB=0.00400703;RO=26;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189876;STB=0.611502;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.023007;OID=.;OPOS=68407926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:6:9:11:15:6:9:11:15
chr2	68415767	.	G	A	299.52	PASS	AF=0.386364;AO=34;DP=89;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=15;FWDB=-0.0507662;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.189;QD=13.6145;RBI=0.0511504;REFB=-0.00935168;REVB=0.00625758;RO=53;SAF=16;SAR=18;SRF=38;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261922;STB=0.652091;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0111919;OID=.;OPOS=68415767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:53:54:34:34:0.386364:18:16:38:15:18:16:39:15
chr2	68511584	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00417855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.54;QD=51.1846;RBI=0.0365277;REFB=0;REVB=0.0362879;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134162;OID=.;OPOS=68511584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr2	68546374	.	T	C	1141.76	PASS	AF=0.930233;AO=78;DP=84;FAO=80;FDP=86;FR=.;FRO=6;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00087499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.724;QD=53.1053;RBI=0.00888246;REFB=-0.164639;REVB=0.00883926;RO=5;SAF=44;SAR=34;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189356;STB=0.516172;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.00226174;OID=.;OPOS=68546374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:84:86:5:6:78:80:0.930233:34:44:2:3:35:45:2:4
chr2	68607947	.	GA	G,TA	541.88	PASS	AF=0.370968,0.516129;AO=22,32;DP=62;FAO=23,32;FDP=62;FR=.;FRO=7;FSAF=0,10;FSAR=23,22;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0829063,0.0104378;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=18.796,184.052;QD=34.9601;RBI=0.0829487,0.0105249;REFB=-0.202409,0.0101856;REVB=-0.00265162,-0.00135095;RO=8;SAF=0,10;SAR=22,22;SRF=3;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.850819,-0.0265877;STB=0.999212,0.523794;STBP=0.003,0.57;TYPE=del,snp;VARB=0.120212,0.00329844;OID=.,.;OPOS=68607948,68607947;OREF=A,G;OALT=-,T;OMAPALT=G,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:62:62:8:7:22,32:23,32:0.370968,0.516129:22,22:0,10:3:5:23,22:0,10:3:4
chr2	68613710	.	G	A	237.38	PASS	AF=0.345238;AO=29;DP=85;FAO=29;FDP=84;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.000977598;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2198;QD=11.3039;RBI=0.0117116;REFB=-0.00555142;REVB=-0.0116707;RO=54;SAF=16;SAR=13;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120182;STB=0.563429;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00802198;OID=.;OPOS=68613710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:54:55:29:29:0.345238:13:16:24:30:13:16:25:30
chr2	68622914	.	G	A	610.99	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.449;QD=61.0988;RBI=0.0299836;REFB=0;REVB=0.0178673;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.18899e-05;OID=.;OPOS=68622914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:19:20:0:0:19:21:0:0
chr2	68882468	.	T	C	825.51	PASS	AF=0.967213;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00204363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.771;QD=54.1316;RBI=0.0230068;REFB=0.0944856;REVB=0.0229158;RO=2;SAF=28;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325115;STB=0.517236;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=-0.000312661;OID=.;OPOS=68882468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:61:61:2:2:59:59:0.967213:31:28:2:0:31:28:2:0
chr2	69002760	.	C	T	138.04	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0096301;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.486;QD=18.4051;RBI=0.0693752;REFB=-0.00435371;REVB=-0.0687036;RO=15;SAF=11;SAR=3;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117773;STB=0.592483;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00445545;OID=.;OPOS=69002760;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:14:15:0.5:3:11:13:2:4:11:13:2
chr2	69040500	.	G	A	533.11	PASS	AF=0.590361;AO=49;DP=83;FAO=49;FDP=83;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0149512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.763;QD=25.6922;RBI=0.0196218;REFB=-0.00964682;REVB=0.0127074;RO=34;SAF=16;SAR=33;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222896;STB=0.51219;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.00516227;OID=.;OPOS=69040500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:34:34:49:49:0.590361:33:16:12:22:33:16:12:22
chr2	69049939	.	G	T	199.33	PASS	AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.00897249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.699;QD=27.494;RBI=0.0111667;REFB=-0.0410159;REVB=0.00664748;RO=10;SAF=12;SAR=7;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265927;STB=0.647328;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0155725;OID=.;OPOS=69049939;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:7:12:2:8:7:12:2:8
chr2	69049941	.	T	C	74.15	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00802702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.039;QD=10.2271;RBI=0.0208344;REFB=-0.0083469;REVB=0.019226;RO=19;SAF=2;SAR=8;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475763;STB=0.788143;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0405122;OID=.;OPOS=69049941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:8:2:12:7:8:2:12:7
chr2	69204629	.	T	C	440.41	PASS	AF=0.465347;AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.0353407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.927;QD=17.4419;RBI=0.0435663;REFB=-0.0152558;REVB=0.0254767;RO=53;SAF=25;SAR=22;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093008;STB=0.556465;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0124762;OID=.;OPOS=69204629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:53:54:47:47:0.465347:22:25:23:30:22:25:23:31
chr2	69204671	.	A	T	1795.36	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.007;QD=60.8598;RBI=0.0433945;REFB=0;REVB=0.0137463;RO=0;SAF=52;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161299;OID=.;OPOS=69204671;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:118:0:0:114:118:1:62:52:0:0:62:56:0:0
chr2	69240651	.	G	A	164.37	PASS	AF=0.551724;AO=14;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0171102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.159;QD=22.6722;RBI=0.0365909;REFB=-0.0169227;REVB=0.032344;RO=12;SAF=10;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191435;STB=0.587265;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0103068;OID=.;OPOS=69240651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:12:12:14:16:0.551724:4:10:6:6:5:11:6:6
chr2	69300243	.	G	A	508.08	PASS	AF=0.602564;AO=47;DP=78;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0117633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.855;QD=26.0554;RBI=0.0164774;REFB=0.00390501;REVB=0.0115382;RO=31;SAF=32;SAR=15;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154332;STB=0.584524;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-0.0017294;OID=.;OPOS=69300243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:31:31:47:47:0.602564:15:32:15:16:15:32:15:16
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chr2	69741609	.	C	T	156.42	PASS	AF=0.472222;AO=14;DP=33;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.00581655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.123;QD=17.3795;RBI=0.0238976;REFB=-0.0549088;REVB=0.0231789;RO=19;SAF=12;SAR=2;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121279;STB=0.555494;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.050431;OID=.;OPOS=69741609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:36:19:19:14:17:0.472222:2:12:15:4:5:12:15:4
chr2	69741753	.	CTGTTGTTGT	CTGTTGT,CTGTTGTTGC	286.54	PASS	AF=0.451613,0.0483871;AO=27,4;DP=65;FAO=28,3;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=18,2;FSAR=10,1;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.024795,0.00966894;FXX=0.0461467;HRUN=2,2;LEN=3,1;MLLD=120.91,107.558;QD=18.4862;RBI=0.0536062,0.0782559;REFB=-0.0537564,-0.0365285;REVB=-0.0475271,-0.0776563;RO=25;SAF=17,4;SAR=10,0;SRF=14;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0629878,0.605891;STB=0.586403,0.665561;STBP=0.234,0.673;TYPE=del,snp;VARB=0.0577133,0.0478722;OID=.,.;OPOS=69741754,69741762;OREF=TGT,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTGTTGT,CTGTTGTTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.451613,0.0483871:27,4:65:28,3:62:31:18,2:10,1:15:16:99:25:17,4:10,0:14:11
chr2	69741801	.	C	T	216.68	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.0317662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.416;QD=13.3342;RBI=0.0317742;REFB=-0.00373151;REVB=0.000714548;RO=39;SAF=11;SAR=15;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276973;STB=0.657325;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00625581;OID=.;OPOS=69741801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:15:11:27:12:15:11:27:12
chr2	69741854	.	T	G	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487759;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.161;QD=58.7816;RBI=0.04993;REFB=0;REVB=0.0106728;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.4964e-05;OID=.;OPOS=69741854;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:34:31:0:0:34:31:0:0
chr2	69746296	.	C	T	113.77	PASS	AF=0.378378;AO=13;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=2;FWDB=0.0258566;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2914;QD=12.2999;RBI=0.0470038;REFB=-0.0175344;REVB=0.039253;RO=22;SAF=12;SAR=1;SRF=20;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493596;STB=0.534194;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0357582;OID=.;OPOS=69746296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:23:13:14:0.378378:1:12:20:2:1:13:21:2
chr2	70033584	.	C	T	505.5	PASS	AF=0.49;AO=49;DP=100;FAO=49;FDP=100;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=0.0235815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1608;QD=20.2198;RBI=0.0260987;REFB=-0.00185254;REVB=-0.0111828;RO=51;SAF=24;SAR=25;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144805;STB=0.580058;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00203518;OID=.;OPOS=70033584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:51:51:49:49:0.49:25:24:17:34:25:24:17:34
chr2	70037739	.	C	G	238.42	PASS	AF=0.522727;AO=22;DP=42;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.039429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4379;QD=21.6742;RBI=0.0535924;REFB=-0.042558;REVB=-0.0362973;RO=20;SAF=5;SAR=17;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.420872;STB=0.732119;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0298828;OID=.;OPOS=70037739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:20:21:22:23:0.522727:17:5:14:6:18:5:14:7
chr2	70071305	.	T	C	903.42	PASS	AF=0.377698;AO=102;DP=274;FAO=105;FDP=278;FR=.;FRO=173;FSAF=62;FSAR=43;FSRF=81;FSRR=92;FWDB=-0.00996985;FXX=0.0035841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.286;QD=12.9989;RBI=0.0158473;REFB=-0.00917949;REVB=0.0123182;RO=169;SAF=59;SAR=43;SRF=79;SRR=90;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122938;STB=0.576471;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.01388;OID=.;OPOS=70071305;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:274:278:169:173:102:105:0.377698:43:59:79:90:43:62:81:92
chr2	70139909	.	G	A	504.84	PASS	AF=0.5;AO=49;DP=98;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0256464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8334;QD=20.6057;RBI=0.0262102;REFB=-0.011456;REVB=-0.00540682;RO=49;SAF=23;SAR=26;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552833;STB=0.5306;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0233703;OID=.;OPOS=70139909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:49:49:49:49:0.5:26:23:26:23:26:23:26:23
chr2	70162534	.	T	G	261.37	PASS	AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0359255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0862;QD=14.7253;RBI=0.0404781;REFB=0.00974801;REVB=0.0186503;RO=40;SAF=15;SAR=15;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252219;STB=0.507038;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=-0.0134747;OID=.;OPOS=70162534;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:40:41:30:30:0.422535:15:15:19:21:15:15:20:21
chr2	70168022	.	G	A	235.97	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=-0.0245579;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.598;QD=17.4794;RBI=0.0269093;REFB=-0.0286886;REVB=0.0110008;RO=25;SAF=15;SAR=11;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131805;STB=0.594526;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0294855;OID=.;OPOS=70168022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:54:25:28:26:26:0.481481:11:15:18:7:11:15:21:7
chr2	70182805	.	T	C	533.07	PASS	AF=0.543478;AO=50;DP=92;FAO=50;FDP=92;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.00511886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.096;QD=23.1767;RBI=0.0126704;REFB=-0.00949744;REVB=-0.0115904;RO=42;SAF=30;SAR=20;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373985;STB=0.52054;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0206688;OID=.;OPOS=70182805;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:42:42:50:50:0.543478:20:30:27:15:20:30:27:15
chr2	70188676	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7637;QD=33.4285;RBI=0.0483939;REFB=0;REVB=0.0336745;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0062739;OID=.;OPOS=70188676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr2	70191360	.	C	T	402.1	PASS	AF=0.540541;AO=40;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00733812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.943;QD=21.7349;RBI=0.00734284;REFB=-0.0318129;REVB=-0.000263248;RO=34;SAF=18;SAR=22;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905586;STB=0.549975;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0270094;OID=.;OPOS=70191360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:34:34:40:40:0.540541:22:18:19:15:22:18:19:15
chr2	70524577	.	G	A	245.61	PASS	AF=0.560976;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0229625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.505;QD=23.9622;RBI=0.0235265;REFB=-0.000731325;REVB=0.00512032;RO=17;SAF=14;SAR=9;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309972;STB=0.527004;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.000911168;OID=.;OPOS=70524577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:17:18:23:23:0.560976:9:14:11:6:9:14:12:6
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chr2	70674582	.	A	T	178.71	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0235595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3277;QD=22.3386;RBI=0.0385694;REFB=-0.00818536;REVB=0.0305377;RO=14;SAF=7;SAR=11;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.25027;STB=0.640258;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00439208;OID=.;OPOS=70674582;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:11:7:10:4:11:7:10:4
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chr2	71004494	.	A	T	271.29	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00284977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.005;QD=51.6737;RBI=0.0253891;REFB=0;REVB=-0.0252287;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.81447e-05;OID=.;OPOS=71004494;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
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chr2	71058835	.	A	G	311.44	PASS	AF=0.333333;AO=37;DP=120;FAO=40;FDP=120;FR=.;FRO=80;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=51;FSRR=29;FWDB=-0.018721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4618;QD=10.3813;RBI=0.0805443;REFB=-0.0166035;REVB=-0.0783384;RO=80;SAF=19;SAR=18;SRF=51;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146926;STB=0.559596;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0316278;OID=.;OPOS=71058835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:80:80:37:40:0.333333:18:19:51:29:18:22:51:29
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chr2	71062833	.	G	GC	771.41	PASS	AF=1;AO=64;DP=69;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.136024;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.6716;QD=46.0545;RBI=0.151091;REFB=0;REVB=0.0657726;RO=5;SAF=27;SAR=37;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524357;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00218684;OID=.;OPOS=71062834;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:64:69:67:67:0:30:37:0:0:14:5:27:37:4:1
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chr2	71366957	.	C	A	196.33	PASS	AF=0.633333;AO=18;DP=29;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.00947719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.305;QD=26.1772;RBI=0.00982768;REFB=-0.0305262;REVB=0.00260121;RO=11;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228392;STB=0.610996;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0219317;OID=.;OPOS=71366957;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:29:30:11:11:18:19:0.633333:11:7:8:3:11:8:8:3
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chr2	71417065	.	G	T	775.25	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.044459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.445;QD=53.4658;RBI=0.04456;REFB=0.0923531;REVB=-0.00299808;RO=2;SAF=32;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285591;STB=0.515146;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=-0.00371381;OID=.;OPOS=71417065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:2:2:56:56:0.965517:24:32:2:0:24:32:2:0
chr2	71417134	.	C	T	203.19	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.000164113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2315;QD=21.9666;RBI=0.0121966;REFB=-0.018491;REVB=0.0121955;RO=17;SAF=16;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226288;STB=0.628429;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0151515;OID=.;OPOS=71417134;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:4:16:10:7:4:16:10:7
chr2	71576412	.	A	G	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0268045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5581;QD=12.73;RBI=0.0282736;REFB=0.00847345;REVB=-0.00899516;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196246;STB=0.615148;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=-0.010207;OID=.;OPOS=71576412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:3:9:5:4:3:9
chr2	71615534	.	C	T	395.17	PASS	AF=0.565217;AO=38;DP=69;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0131114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.286;QD=22.9082;RBI=0.0142562;REFB=0.00888313;REVB=-0.00559727;RO=30;SAF=19;SAR=19;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266789;STB=0.520049;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=-0.00585283;OID=.;OPOS=71615534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:30:30:38:39:0.565217:19:19:14:16:19:20:14:16
chr2	71615571	.	C	T	936.81	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0882268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9629;QD=58.5509;RBI=0.088285;REFB=0;REVB=0.00320712;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233253;OID=.;OPOS=71615571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:64:0:0:62:64:1:31:31:0:0:31:33:0:0
chr2	71620563	.	A	G	361.99	PASS	AF=0.469136;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.00216305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.418;QD=17.8761;RBI=0.0071916;REFB=-0.00846066;REVB=0.00685859;RO=43;SAF=20;SAR=18;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0360502;STB=0.520145;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0109057;OID=.;OPOS=71620563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:43:43:38:38:0.469136:18:20:21:22:18:20:21:22
chr2	71631109	.	A	G	179.2	PASS	AF=0.296296;AO=24;DP=82;FAO=24;FDP=81;FR=.;FRO=57;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=-0.0424858;FXX=0.0121936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=206.022;QD=8.84952;RBI=0.0445653;REFB=-0.0107902;REVB=-0.0134544;RO=56;SAF=8;SAR=16;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0540366;STB=0.52725;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.02218;OID=.;OPOS=71631109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:56:57:24:24:0.296296:16:8:21:35:16:8:21:36
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chr2	71654450	.	A	G	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0207593;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=270.351;QD=12.0162;RBI=0.0209203;REFB=0.00251944;REVB=0.0025906;RO=7;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0631528;STB=0.538334;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=-0.00243419;OID=.;OPOS=71654450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:3:3:4:3:3:3:4:3
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chr2	73226090	.	G	A	193.17	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0455535;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0444;QD=13.7979;RBI=0.0615283;REFB=-0.02377;REVB=-0.0413596;RO=33;SAF=12;SAR=11;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100107;STB=0.557226;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0305456;OID=.;OPOS=73226090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:33:33:23:23:0.410714:11:12:14:19:11:12:14:19
chr2	73316540	.	A	T	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0135378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.192;QD=14.6525;RBI=0.0140041;REFB=-0.0130543;REVB=-0.0035838;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229845;STB=0.635942;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0080659;OID=.;OPOS=73316540;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:3:3:1:4:3:3:1:4
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chr2	73490412	.	A	G	55.02	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.031631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1781;QD=9.56949;RBI=0.0360457;REFB=-0.0146704;REVB=0.017285;RO=15;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129171;STB=0.578129;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0233599;OID=.;OPOS=73490412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:15:15:8:8:0.347826:5:3:4:11:5:3:4:11
chr2	73492614	.	A	T	282.96	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0267997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.25;QD=17.4129;RBI=0.0268068;REFB=-0.0130952;REVB=-0.000617068;RO=33;SAF=23;SAR=8;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23592;STB=0.627185;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.019309;OID=.;OPOS=73492614;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:33:34:31:31:0.476923:8:23:17:16:8:23:18:16
chr2	73519220	.	A	C	66.82	PASS	AF=0.0822785;AO=16;DP=163;FAO=13;FDP=158;FR=.,HEALED;FRO=139;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=75;FSRR=64;FWDB=-0.0649452;FXX=0.0246898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3972;QD=1.69171;RBI=0.106863;REFB=-0.00478865;REVB=-0.0848631;RO=125;SAF=12;SAR=4;SRF=75;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203051;STB=0.723961;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.143499;OID=.;OPOS=73519220;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:163:158:125:139:16:13:0.0822785:4:12:75:50:3:10:75:64
chr2	73675227	.	T	C,TCTC	1933.3	PASS	AF=0,1;AO=6,118;DP=140;FAO=0,126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=0,38;FSAR=0,88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00476868,0.028093;FXX=0.0526276;HRUN=2,1;LEN=1,3;MLLD=54.5752,267.597;QD=61.3746;RBI=0.0321142,0.0467363;REFB=0,0;REVB=0.0317581,0.0373506;RO=13;SAF=4,31;SAR=2,87;SRF=6;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.224315,-0.0469775;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,5.16784e-05;OID=.,.;OPOS=73675227,73675228;OREF=T,-;OALT=C,CTC;OMAPALT=C,TCTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:9:140:126:13:0:6,118:0,126:0,1:2,87:4,31:6:7:0,88:0,38:0:0
chr2	73675669	.	T	G	145.23	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0320589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6911;QD=44.6854;RBI=0.0328477;REFB=0;REVB=-0.00715513;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00170387;OID=.;OPOS=73675669;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
chr2	73675844	.	C	T	392.11	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.696;QD=54.0834;RBI=0.0513709;REFB=0;REVB=0.00486801;RO=1;SAF=13;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344248;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000271515;OID=.;OPOS=73675844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:1:0:27:29:1:14:13:1:0:14:15:0:0
chr2	73828538	.	G	A	130.44	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.37;QD=43.4783;RBI=0.123462;REFB=0;REVB=0.106686;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00755996;OID=.;OPOS=73828538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr2	73900014	.	G	A	253.27	PASS	AF=0.42029;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.024213;FXX=0.028165;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.544;QD=14.6824;RBI=0.0243032;REFB=-0.00948068;REVB=0.00209187;RO=40;SAF=12;SAR=17;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145566;STB=0.508259;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.00963075;OID=.;OPOS=73900014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:69:40:40:29:29:0.42029:17:12:16:24:17:12:16:24
chr2	73927931	.	A	G	1084.38	PASS	AF=0.986486;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0466204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.504;QD=58.6153;RBI=0.0632827;REFB=-0.0413096;REVB=0.042793;RO=1;SAF=26;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178409;STB=0.509088;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.000190182;OID=.;OPOS=73927931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:74:1:1:72:73:0.986486:46:26:1:0:46:27:1:0
chr2	73928098	.	C	G	701.0	PASS	AF=0.945455;AO=52;DP=55;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.026331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.548;QD=50.9817;RBI=0.0642012;REFB=-0.157954;REVB=0.0585532;RO=1;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154433;STB=0.513547;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.00106236;OID=.;OPOS=73928098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:55:55:1:3:52:52:0.945455:30:22:0:1:30:22:2:1
chr2	73928365	.	CG	CC,C	188.3	PASS	AF=0.9375,0.0625;AO=12,4;DP=16;FAO=15,1;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3,0;FSAR=12,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0362768,-0.0771901;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=39.7355,28.4945;QD=47.0754;RBI=0.085211,0.084796;REFB=0,0;REVB=0.0771032,0.0351006;RO=0;SAF=2,1;SAR=10,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.017983,-0.0429042;OID=.,.;OPOS=73928366,73928366;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.9375,0.0625:12,4:16:15,1:16:0:3,0:12,1:0:0:5:0:2,1:10,3:0:0
chr2	73957124	.	A	G	714.65	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0195669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.771;QD=60.8208;RBI=0.0215866;REFB=-0.0278279;REVB=-0.00911675;RO=1;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218604;STB=0.511623;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00279574;OID=.;OPOS=73957124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:21:25:0:1:21:25:0:1
chr2	74007136	.	T	C	778.11	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.574;QD=56.5895;RBI=0.0140871;REFB=0;REVB=0.00728386;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.78578e-06;OID=.;OPOS=74007136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:30:24:0:0:30:25:0:0
chr2	74135797	.	T	C	760.24	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499962;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.26;QD=56.3137;RBI=0.0526958;REFB=0;REVB=0.0166501;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361669;OID=.;OPOS=74135797;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:28:25:0:0:29:25:0:0
chr2	74135898	.	A	G	842.5	PASS	AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0345052;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=278.593;QD=54.3548;RBI=0.0345423;REFB=-0.012985;REVB=0.00160062;RO=2;SAF=20;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230134;STB=0.512191;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.000521657;OID=.;OPOS=74135898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:62:62:2:2:60:60:0.967742:40:20:0:2:40:20:0:2
chr2	74185876	.	A	T	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.785;QD=62.6711;RBI=0.011561;REFB=0;REVB=0.00538758;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79896e-05;OID=.;OPOS=74185876;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr2	74334462	.	G	A	749.89	PASS	AF=0.444444;AO=79;DP=178;FAO=80;FDP=180;FR=.;FRO=100;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=37;FSRR=63;FWDB=-0.000795387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.421;QD=16.6642;RBI=0.0175948;REFB=-0.0217243;REVB=-0.0175769;RO=94;SAF=39;SAR=40;SRF=35;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119239;STB=0.572205;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0268849;OID=.;OPOS=74334462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:180:94:100:79:80:0.444444:40:39:35:59:40:40:37:63
chr2	74362090	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0302008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.051;QD=56.1911;RBI=0.0302908;REFB=0;REVB=-0.00233368;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000356702;OID=.;OPOS=74362090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:19:9:0:0:19:9:0:0
chr2	74362459	.	T	TAGC	283.82	PASS	AF=0.75;AO=24;DP=34;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.029879;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=3;MLLD=260.863;QD=35.478;RBI=0.045185;REFB=-0.0352264;REVB=0.0338958;RO=9;SAF=12;SAR=12;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138629;STB=0.562449;STBP=0.25;TYPE=ins;VARB=0.00778525;OID=.;OPOS=74362460;OREF=-;OALT=AGC;OMAPALT=TAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.75:24:34:24:32:8:12:12:6:2:53:9:12:12:7:2
chr2	74441799	.	A	G	194.71	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.00710995;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.493;QD=15.8945;RBI=0.00711035;REFB=-0.0363188;REVB=7.53534e-05;RO=27;SAF=5;SAR=15;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595028;STB=0.51998;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0190807;OID=.;OPOS=74441799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:29:20:20:0.408163:15:5:8:19:15:5:8:21
chr2	74448655	.	T	C	124.88	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=-0.0375289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.864;QD=17.8403;RBI=0.0377779;REFB=-0.000950975;REVB=0.00433023;RO=14;SAF=10;SAR=4;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.522027;STB=0.794025;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.000612544;OID=.;OPOS=74448655;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:4:10:1:13:4:10:1:13
chr2	74466594	.	G	A	221.52	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00503998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.104;QD=18.0831;RBI=0.03582;REFB=-0.00554037;REVB=0.0354636;RO=25;SAF=8;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150844;STB=0.607448;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00431323;OID=.;OPOS=74466594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:27:22:22:0.44898:14:8:13:12:14:8:15:12
chr2	74641624	.	G	C	1153.09	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0536965;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.8281;QD=60.6888;RBI=0.0546512;REFB=0;REVB=-0.0101702;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000457961;OID=.;OPOS=74641624;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:38:38:0:0:38:38:0:0
chr2	74682512	.	C	T	1114.32	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.346;QD=60.2334;RBI=0.0597895;REFB=0;REVB=0.0483076;RO=0;SAF=30;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159705;OID=.;OPOS=74682512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:42:30:0:0:44:30:0:0
chr2	74687409	.	AC	A	38.55	PASS	AF=0.481481;AO=11;DP=28;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.224595;FXX=0.0357015;HRUN=8;LEN=1;MLLD=8.25593;QD=5.71086;RBI=0.254073;REFB=-0.120625;REVB=0.118787;RO=14;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.394267;STB=0.599821;STBP=0.557;TYPE=del;VARB=0.148608;OID=.;OPOS=74687410;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.481481:11:28:13:27:14:1:12:2:12:38:14:2:9:0:14
chr2	74687549	.	CTCA	CCA,CCAC,CCCA	700.08	PASS	AF=0.866667,0,0.133333;AO=14,6,15;DP=41;FAO=39,0,6;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0,5;FSAR=22,0,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0577522,0.0207272,0.0489967;FXX=0.0217344;HRUN=1,1,1;LEN=1,3,1;MLLD=190.632,170.395,189.593;QD=62.229;RBI=0.0698978,0.0443677,0.061974;REFB=0,0,0;REVB=0.039375,0.0392285,0.0379487;RO=0;SAF=2,6,10;SAR=12,0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=-0.000483896,0.0846216,0.00213251;OID=.,.,.;OPOS=74687550,74687550,74687550;OREF=T,TCA,T;OALT=-,CAC,C;OMAPALT=CCA,CCAC,CCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.866667,0,0.133333:14,6,15:41:39,0,6:45:0:17,0,5:22,0,1:0:0:30:0:2,6,10:12,0,5:0:0
chr2	74690039	.	G	A	2458.3	PASS	AF=0.904762;AO=168;DP=194;FAO=171;FDP=189;FR=.;FRO=18;FSAF=76;FSAR=95;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0299428;FXX=0.0257719;HRUN=7;LEN=1;MLLD=248.973;QD=52.0276;RBI=0.0300123;REFB=-0.022107;REVB=0.00204004;RO=9;SAF=72;SAR=96;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0314623;STB=0.510688;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.000228993;OID=.;OPOS=74690039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:194:189:9:18:168:171:0.904762:96:72:1:8:95:76:10:8
chr2	74690378	.	C	T	805.02	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00911616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.889;QD=64.4018;RBI=0.0140002;REFB=0;REVB=0.0106255;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.8811e-05;OID=.;OPOS=74690378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:48:50:1:26:22:0:0:26:24:0:0
chr2	74699777	.	GC	GA,TA	633.79	PASS	AF=0.954545,0.0227273;AO=39,2;DP=44;FAO=42,1;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=22,1;FSAR=20,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.076582,0.00932939;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=212.049,137.422;QD=57.6173;RBI=0.0767337,0.00994572;REFB=-0.110204,-0.0529017;REVB=0.00482268,0.00344672;RO=1;SAF=19,2;SAR=20,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0240334,0;STB=0.511106,0.5;STBP=0.502,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00180539,0.0939414;OID=.,.;OPOS=74699778,74699777;OREF=C,GC;OALT=A,TA;OMAPALT=GA,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:44:44:1:1:39,2:42,1:0.954545,0.0227273:20,0:19,2:1:0:20,0:22,1:1:0
chr2	74710491	.	C	T	241.44	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.049;QD=48.2881;RBI=0.0415134;REFB=0;REVB=0.032584;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231965;OID=.;OPOS=74710491;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:19:20:1:8:11:0:0:8:12:0:0
chr2	74725144	.	T	C	820.59	PASS	AF=1;AO=49;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6765;QD=57.5854;RBI=0.117297;REFB=0;REVB=0.116744;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133239;OID=.;OPOS=74725144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:49:57:1:22:27:0:0:29:28:0:0
chr2	74725178	.	G	A	825.02	PASS	AF=0.952381;AO=60;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0674966;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.5582;QD=52.3825;RBI=0.0675168;REFB=-0.244736;REVB=0.00165089;RO=2;SAF=32;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028583;STB=0.522381;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.011945;OID=.;OPOS=74725178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:63:2:3:60:60:0.952381:28:32:2:0:28:32:3:0
chr2	74733388	.	A	AG	202.41	PASS	AF=0.443182;AO=37;DP=94;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.0842313;FXX=0.0329634;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.7259;QD=9.20026;RBI=0.108124;REFB=-0.0272778;REVB=-0.0677926;RO=54;SAF=18;SAR=19;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0831674;STB=0.544104;STBP=0.495;TYPE=ins;VARB=0.0198841;OID=.;OPOS=74733389;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.443182:37:94:39:88:49:19:20:20:29:99:54:18:19:22:32
chr2	74746322	.	A	T	836.97	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0125274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.796;QD=55.7981;RBI=0.0207905;REFB=0.000393275;REVB=-0.0165925;RO=1;SAF=32;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145176;STB=0.50769;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-6.5504e-06;OID=.;OPOS=74746322;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:27:32:1:0:27:32:1:0
chr2	74756175	.	G	GC	227.93	PASS	AF=1;AO=2;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677395;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=254.261;QD=45.5864;RBI=0.0801154;REFB=0;REVB=-0.0427766;RO=18;SAF=1;SAR=1;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0547932;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0021896;OID=.;OPOS=74756176;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:20:20:20:0:9:11:0:0:4:18:1:1:8:10
chr2	74756176	.	G	C	208.62	PASS	AF=0.9;AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00484144;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.768;QD=41.7231;RBI=0.0189568;REFB=-0.106486;REVB=0.0183282;RO=2;SAF=8;SAR=10;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102827;STB=0.505612;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00111741;OID=.;OPOS=74756176;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:20:20:2:2:18:18:0.9:10:8:1:1:10:8:1:1
chr2	74758666	.	G	A	658.98	PASS	AF=0.532787;AO=65;DP=122;FAO=65;FDP=122;FR=.;FRO=57;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=0.00542047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.4932;QD=21.6058;RBI=0.0169237;REFB=-0.0165019;REVB=-0.0160321;RO=55;SAF=45;SAR=20;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.070415;STB=0.541534;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.01253;OID=.;OPOS=74758666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:55:57:65:65:0.532787:20:45:34:21:20:45:35:22
chr2	74761539	.	T	A	391.73	PASS	AF=0.493827;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0236925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.745;QD=19.3448;RBI=0.0691559;REFB=-0.021681;REVB=0.0649709;RO=40;SAF=21;SAR=19;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452489;STB=0.530711;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0231951;OID=.;OPOS=74761539;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:40:41:40:40:0.493827:19:21:23:17:19:21:24:17
chr2	74763258	.	C	G	285.7	PASS	AF=0.37931;AO=33;DP=87;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=13;FWDB=0.00432984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8679;QD=13.1354;RBI=0.043202;REFB=0.0135459;REVB=-0.0429845;RO=53;SAF=14;SAR=19;SRF=41;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366726;STB=0.699825;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.0242389;OID=.;OPOS=74763258;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:53:54:33:33:0.37931:19:14:41:12:19:14:41:13
chr2	75113657	.	C	T	75.14	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=0.0327471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.244;QD=11.1312;RBI=0.0327471;REFB=-0.0176688;REVB=0;RO=17;SAF=10;SAR=0;SRF=17;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0274846;OID=.;OPOS=75113657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:0:10:17:0:0:10:17:0
chr2	75113789	.	C	G	265.08	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0117456;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.366;QD=17.9712;RBI=0.0322467;REFB=0.0149515;REVB=0.0300315;RO=30;SAF=9;SAR=20;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241037;STB=0.513504;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=-0.0160394;OID=.;OPOS=75113789;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:20:9:10:20:20:9:10:20
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chr2	75118737	.	C	T	167.9	PASS	AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0538189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1708;QD=15.6187;RBI=0.0617853;REFB=-0.00183979;REVB=-0.030347;RO=25;SAF=13;SAR=5;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298632;STB=0.672825;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.00330969;OID=.;OPOS=75118737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:5:13:11:14:5:13:11:14
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chr2	75196731	.	A	G	308.08	PASS	AF=0.492537;AO=32;DP=66;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.0395509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.97;QD=18.3929;RBI=0.0402811;REFB=-0.0039404;REVB=-0.00763499;RO=34;SAF=19;SAR=13;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321413;STB=0.667743;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00826126;OID=.;OPOS=75196731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:34:34:32:33:0.492537:13:19:8:26:14:19:8:26
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chr2	75744918	.	T	C	109.96	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00167304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2158;QD=14.6618;RBI=0.0217569;REFB=0.0107323;REVB=-0.0216925;RO=17;SAF=11;SAR=2;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391998;STB=0.732918;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.00909288;OID=.;OPOS=75744918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:2:11:9:8:2:11:9:8
chr2	76672457	.	G	T	70.58	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0101407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.925;QD=17.6449;RBI=0.0101889;REFB=-0.0294422;REVB=-0.000989848;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121106;STB=0.507027;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0490347;OID=.;OPOS=76672457;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:4:5:4:3:4:5:4:3
chr2	77744565	.	A	G	666.96	PASS	AF=0.386139;AO=78;DP=202;FAO=78;FDP=202;FR=.;FRO=124;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=73;FSRR=51;FWDB=0.0244421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.684;QD=13.2072;RBI=0.0306604;REFB=-0.0106149;REVB=-0.0185107;RO=123;SAF=42;SAR=36;SRF=73;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604694;STB=0.53117;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0161264;OID=.;OPOS=77744565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:202:202:123:124:78:78:0.386139:36:42:73:50:36:42:73:51
chr2	79109771	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.152;QD=52.6119;RBI=0.0449945;REFB=0;REVB=0.0381403;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000375904;OID=.;OPOS=79109771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0
chr2	79254261	.	T	C	1989.64	PASS	AF=0.992366;AO=129;DP=131;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.032222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8185;QD=60.7524;RBI=0.0327408;REFB=-0.114323;REVB=-0.00580578;RO=1;SAF=78;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00605428;STB=0.503144;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00116161;OID=.;OPOS=79254261;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:131:131:1:1:129:130:0.992366:51:78:1:0:51:79:1:0
chr2	79255325	.	G	C	497.41	PASS	AF=0.972222;AO=34;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00739139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.276;QD=55.2676;RBI=0.0404274;REFB=-0.0919968;REVB=-0.039746;RO=0;SAF=26;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509086;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.000445602;OID=.;OPOS=79255325;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:0:1:34:35:0.972222:8:26:0:0:8:27:1:0
chr2	79312414	.	G	A	583.12	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.384;QD=59.8071;RBI=0.0273206;REFB=0;REVB=-0.0253736;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.14159e-05;OID=.;OPOS=79312414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:16:22:0:0:16:23:0:0
chr2	79350347	.	A	G	754.37	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8049;QD=56.9337;RBI=0.0331366;REFB=0;REVB=0.00931684;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255569;OID=.;OPOS=79350347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:26:27:0:0:26:27:0:0
chr2	80529956	.	T	C	1135.42	PASS	AF=0.974684;AO=76;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00956038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.1;QD=57.4895;RBI=0.0265747;REFB=-0.0666519;REVB=0.0247955;RO=2;SAF=43;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215001;STB=0.511108;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.000792472;OID=.;OPOS=80529956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:79:79:2:2:76:77:0.974684:33:43:2:0:33:44:2:0
chr2	80801346	.	T	C	345.82	PASS	AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00644759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5589;QD=22.3108;RBI=0.0142475;REFB=0.020087;REVB=-0.0127051;RO=26;SAF=15;SAR=20;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855592;STB=0.555524;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=-0.0261581;OID=.;OPOS=80801346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:26:27:35:35:0.564516:20:15:14:12:20:15:15:12
chr2	82194270	.	A	G	629.16	PASS	AF=0.954545;AO=41;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0293967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.869;QD=57.1962;RBI=0.036482;REFB=-0.0430107;REVB=0.0216048;RO=2;SAF=17;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00765436;STB=0.50331;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00240051;OID=.;OPOS=82194270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:44:2:2:41:42:0.954545:24:17:1:1:24:18:1:1
chr2	83042810	.	GGAAC	G	130.69	PASS	AF=0.396226;AO=19;DP=54;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00196179;FXX=0.086192;HRUN=2;LEN=4;MLLD=287.493;QD=9.86347;RBI=0.0172831;REFB=-0.000673499;REVB=0.0171714;RO=27;SAF=8;SAR=11;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623899;STB=0.533182;STBP=0.717;TYPE=del;VARB=0.00152565;OID=.;OPOS=83042811;OREF=GAAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.396226:19:54:21:53:32:10:11:17:15:99:27:8:11:13:14
chr2	84756049	.	G	A	1673.33	PASS	AF=0.99115;AO=111;DP=114;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0155733;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.013;QD=59.2331;RBI=0.0479616;REFB=-0.0152336;REVB=0.0453629;RO=2;SAF=60;SAR=51;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0013709;STB=0.504131;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000519933;OID=.;OPOS=84756049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:114:113:2:1:111:112:0.99115:51:60:1:1:52:60:1:0
chr2	84771480	.	G	A	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0685637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.992;QD=58.061;RBI=0.0693289;REFB=0;REVB=-0.010272;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000415615;OID=.;OPOS=84771480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:34:27:0:0:34:27:0:0
chr2	84771567	.	C	T	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000466089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.718;QD=57.1061;RBI=0.00909057;REFB=0;REVB=0.00907862;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.44778e-05;OID=.;OPOS=84771567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:30:25:0:0:30:25:0:0
chr2	84800605	.	C	A	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0383708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.611;QD=63.5823;RBI=0.0400394;REFB=0;REVB=0.011438;RO=0;SAF=33;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.65668e-05;OID=.;OPOS=84800605;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:14:33:0:0:14:33:0:0
chr2	84897516	.	T	TG	393.66	PASS	AF=1;AO=4;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498454;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=96.0267;QD=52.4876;RBI=0.0974269;REFB=0;REVB=0.0837104;RO=25;SAF=2;SAR=2;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114302;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000715697;OID=.;OPOS=84897517;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:29:30:30:0:18:12:0:0:4:25:2:2:15:10
chr2	84897517	.	A	G	328.87	PASS	AF=0.866667;AO=26;DP=30;FAO=26;FDP=30;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00341912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.526;QD=43.8499;RBI=0.0559621;REFB=-0.0153786;REVB=0.0558576;RO=4;SAF=16;SAR=10;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297872;STB=0.516116;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.000560324;OID=.;OPOS=84897517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:30:30:4:4:26:26:0.866667:10:16:2:2:10:16:2:2
chr2	85546615	.	C	T	809.25	PASS	AF=1;AO=51;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.709;QD=56.7895;RBI=0.0365763;REFB=0;REVB=0.0276346;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.91071e-05;OID=.;OPOS=85546615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:57:0:0:51:57:1:28:23:0:0:29:28:0:0
chr2	85549527	.	T	C	61.45	PASS	AF=0.178571;AO=10;DP=56;FAO=10;FDP=56;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0139968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.909;QD=4.38929;RBI=0.0275504;REFB=-0.00198208;REVB=0.02373;RO=46;SAF=5;SAR=5;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267689;STB=0.517822;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.01139;OID=.;OPOS=85549527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:56:56:46:46:10:10:0.178571:5:5:22:24:5:5:22:24
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chr2	85554080	.	G	A	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0341568;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=317.531;QD=13.2052;RBI=0.0347755;REFB=-0.0148613;REVB=0.00653078;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0180206;OID=.;OPOS=85554080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:3:3:3:3:3:3:3:3
chr2	85570388	.	G	T	103.09	PASS	AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0105059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.029;QD=9.59008;RBI=0.0133534;REFB=-0.0173007;REVB=-0.00824252;RO=30;SAF=9;SAR=4;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117185;STB=0.571315;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0386536;OID=.;OPOS=85570388;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:4:9:18:12:4:9:18:12
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chr2	85573033	.	G	A	1036.1	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00159298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4301;QD=56.7726;RBI=0.0478015;REFB=-0.0848905;REVB=0.047775;RO=2;SAF=33;SAR=38;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0018323;STB=0.500969;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00248713;OID=.;OPOS=85573033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:2:2:71:71:0.972603:38:33:1:1:38:33:1:1
chr2	85573042	.	C	T	482.79	PASS	AF=0.608108;AO=45;DP=74;FAO=45;FDP=74;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00629581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.639;QD=26.097;RBI=0.00671483;REFB=0.00713702;REVB=-0.0023349;RO=29;SAF=21;SAR=24;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011584;STB=0.506326;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=-0.0067799;OID=.;OPOS=85573042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:29:29:45:45:0.608108:24:21:14:15:24:21:14:15
chr2	85573049	.	G	A	246.3	PASS	AF=0.39726;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.00348414;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=336.237;QD=13.4957;RBI=0.0117707;REFB=-0.00840756;REVB=-0.0112433;RO=44;SAF=14;SAR=15;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298547;STB=0.517034;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0148485;OID=.;OPOS=85573049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:44:44:29:29:0.39726:15:14:20:24:15:14:20:24
chr2	85596906	.	A	G	208.95	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0391857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7775;QD=18.1691;RBI=0.0477964;REFB=-0.0381559;REVB=-0.0273675;RO=23;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00191448;STB=0.523787;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0379487;OID=.;OPOS=85596906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:46:23:25:21:21:0.456522:11:10:11:12:11:10:13:12
chr2	85622059	.	T	C	157.97	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00191062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.874;QD=11.2834;RBI=0.00192496;REFB=-0.00159128;REVB=-0.00023452;RO=36;SAF=16;SAR=4;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319978;STB=0.689445;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.00658727;OID=.;OPOS=85622059;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:4:16:20:16:4:16:20:16
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chr2	85625892	.	T	C	245.55	PASS	AF=0.39726;AO=28;DP=71;FAO=29;FDP=73;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00891203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.2142;QD=13.4548;RBI=0.0424481;REFB=-0.0178112;REVB=0.041502;RO=43;SAF=18;SAR=10;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119295;STB=0.547026;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0315401;OID=.;OPOS=85625892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:73:43:44:28:29:0.39726:10:18:23:20:11:18:24:20
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chr2	85818886	.	C	T	349.13	PASS	AF=0.404255;AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.0120715;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.53;QD=14.8567;RBI=0.0121953;REFB=-0.0144435;REVB=0.00173345;RO=56;SAF=24;SAR=14;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104635;STB=0.559409;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0275654;OID=.;OPOS=85818886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:56:56:38:38:0.404255:14:24:30:26:14:24:30:26
chr2	85894308	.	G	T	238.74	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.00318271;FXX=0.0185151;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.624;QD=18.0179;RBI=0.00909715;REFB=-0.00261466;REVB=0.00852223;RO=26;SAF=8;SAR=18;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410418;STB=0.529594;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.00182355;OID=.;OPOS=85894308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:27:26:26:0.490566:18:8:7:19:18:8:7:20
chr2	85895338	.	T	G	1258.66	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.793;QD=61.3978;RBI=0.0342822;REFB=0;REVB=0.0274606;RO=0;SAF=25;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57876e-05;OID=.;OPOS=85895338;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:78:82:0:0:78:82:1:53:25:0:0:55:27:0:0
chr2	85924729	.	C	T	2279.27	PASS	AF=1;AO=149;DP=150;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376931;FXX=0.0132442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.836;QD=61.1883;RBI=0.0470509;REFB=0;REVB=0.0281605;RO=0;SAF=82;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.67496e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.8111e-05;OID=.;OPOS=85924729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:149:0:0:149:149:1:67:82:0:0:67:82:0:0
chr2	85925529	.	A	G	635.86	PASS	AF=0.787879;AO=52;DP=67;FAO=52;FDP=66;FR=.;FRO=14;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=0.0659237;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.065;QD=38.537;RBI=0.0970076;REFB=-0.030036;REVB=-0.0711655;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.612861;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0031635;OID=.;OPOS=85925529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:67:66:0:14:52:52:0.787879:28:24:0:0:28:24:14:0
chr2	85925756	.	C	G	836.61	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0289041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8176;QD=55.774;RBI=0.0289079;REFB=-0.111715;REVB=0.00046858;RO=0;SAF=22;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506664;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00145264;OID=.;OPOS=85925756;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:60:0:1:59:59:0.983333:37:22:0:0:37:22:0:1
chr2	85925847	.	AC	AG,GG	1148.35	PASS	AF=0.961039,0.038961;AO=72,3;DP=77;FAO=74,3;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=31,0;FSAR=43,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0979189,9.54317e-05;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=154.001,194.616;QD=59.6544;RBI=0.102065,0.020153;REFB=0,0;REVB=0.0287963,0.0201527;RO=0;SAF=30,0;SAR=42,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.1178e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.000174724,0.00546053;OID=.,.;OPOS=85925848,85925847;OREF=C,AC;OALT=G,GG;OMAPALT=AG,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:77:77:0:0:72,3:74,3:0.961039,0.038961:42,3:30,0:0:0:43,3:31,0:0:0
chr2	86088311	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0040435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.696;QD=56.1916;RBI=0.0165224;REFB=0;REVB=0.01602;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.56361e-05;OID=.;OPOS=86088311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr2	86094686	.	C	T	1098.5	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.169;QD=60.1918;RBI=0.0273154;REFB=0;REVB=0.0120828;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.73458e-05;OID=.;OPOS=86094686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:33:40:0:0:33:40:0:0
chr2	86315741	.	C	T	997.91	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.646;QD=58.7006;RBI=0.0508809;REFB=0;REVB=-0.00842269;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.02565e-05;OID=.;OPOS=86315741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:35:32:0:0:35:33:0:0
chr2	86317037	.	G	C	1102.26	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183794;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.797;QD=60.3977;RBI=0.0188123;REFB=0;REVB=0.00401235;RO=0;SAF=30;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.21675e-05;OID=.;OPOS=86317037;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:43:30:0:0:43:30:0:0
chr2	86363074	.	A	G	920.07	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2776;QD=58.4174;RBI=0.0514129;REFB=0;REVB=0.028066;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285831;OID=.;OPOS=86363074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0
chr2	86385728	.	C	T	526.88	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0185222;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.53;QD=56.9601;RBI=0.0238843;REFB=-0.106082;REVB=0.0150794;RO=1;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199188;STB=0.510632;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000461689;OID=.;OPOS=86385728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:23:13:0:1:23:13:0:1
chr2	86400824	.	G	A	676.96	PASS	AF=0.93617;AO=43;DP=47;FAO=44;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0326166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.125;QD=57.6139;RBI=0.0327733;REFB=-0.00239142;REVB=0.00320097;RO=2;SAF=16;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113745;STB=0.505195;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=-0.00102067;OID=.;OPOS=86400824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:47:47:2:2:43:44:0.93617:27:16:1:1:27:17:1:1
chr2	86440718	.	T	C	1134.94	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.427;QD=60.5303;RBI=0.129647;REFB=0;REVB=-0.014304;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.60068e-05;OID=.;OPOS=86440718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:34:41:0:0:34:41:0:0
chr2	86441334	.	C	CTGTT	467.7	PASS	AF=0.853659;AO=32;DP=42;FAO=35;FDP=41;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.03449;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=279.634;QD=45.6289;RBI=0.038064;REFB=-0.029766;REVB=0.0161029;RO=7;SAF=13;SAR=19;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103811;STB=0.530709;STBP=0.344;TYPE=ins;VARB=0.0036582;OID=.;OPOS=86441335;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=CTGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.853659:32:42:35:41:6:16:19:4:2:33:7:13:19:5:2
chr2	86481835	.	C	T	785.77	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.549;QD=64.1445;RBI=0.0236117;REFB=0;REVB=0.0187174;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.73581e-06;OID=.;OPOS=86481835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0
chr2	86683642	.	A	G	255.9	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.183659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9475;QD=51.1791;RBI=0.199776;REFB=0;REVB=0.0786116;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00702611;OID=.;OPOS=86683642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr2	86691250	.	G	A	2555.57	PASS	AF=0.994048;AO=166;DP=168;FAO=167;FDP=168;FR=.;FRO=1;FSAF=105;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00787862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.466;QD=60.8468;RBI=0.0183589;REFB=-0.062488;REVB=0.0165824;RO=1;SAF=105;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00773732;STB=0.504;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.000459179;OID=.;OPOS=86691250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:168:168:1:1:166:167:0.994048:61:105:0:1:62:105:0:1
chr2	86947802	.	C	A	436.9	PASS	AF=0.473118;AO=44;DP=93;FAO=44;FDP=93;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.0114751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.264;QD=18.7912;RBI=0.0260228;REFB=-0.0336167;REVB=-0.0233561;RO=48;SAF=26;SAR=18;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128863;STB=0.500505;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.0364664;OID=.;OPOS=86947802;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:48:49:44:44:0.473118:18:26:29:19:18:26:29:20
chr2	86979093	.	G	A	1539.92	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6561;QD=59.8029;RBI=0.0533163;REFB=0;REVB=0.0504414;RO=0;SAF=71;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91425e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191773;OID=.;OPOS=86979093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:101:103:0:0:101:103:1:30:71:0:0:32:71:0:0
chr2	87015633	.	T	TGA	775.26	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0256551;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=311.009;QD=53.4662;RBI=0.0446601;REFB=-0.0426656;REVB=0.036556;RO=2;SAF=36;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254762;STB=0.513509;STBP=0.302;TYPE=ins;VARB=0.00170242;OID=.;OPOS=87015634;OREF=-;OALT=GA;OMAPALT=TGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.965517:56:58:56:58:2:36:20:2:0:7:2:36:20:2:0
chr2	87069379	.	G	A	319.3	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00505076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0679;QD=53.2165;RBI=0.0161614;REFB=0;REVB=0.0153519;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00056805;OID=.;OPOS=87069379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:6:17:0:0:6:18:0:0
chr2	87276811	.	T	C	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.03312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.9;QD=10.1733;RBI=0.0577661;REFB=0.00217148;REVB=-0.0473284;RO=8;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.542893;STB=0.849948;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00660735;OID=.;OPOS=87276811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:8:9:6:6:0.4:5:1:6:2:5:1:7:2
chr2	88315954	.	C	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00567387;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=346.943;QD=46.848;RBI=0.0148751;REFB=0;REVB=0.0137505;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.21137e-05;OID=.;OPOS=88315954;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr2	88315993	.	A	G	130.44	PASS	AF=1;AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5651;QD=43.4804;RBI=0.0368762;REFB=0;REVB=0.0155522;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135157;OID=.;OPOS=88315993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:11:12:1:6:5:0:0:6:6:0:0
chr2	88316016	.	G	A	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00685199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.472;QD=12.0153;RBI=0.0749738;REFB=-0.0215018;REVB=-0.0746601;RO=7;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631528;STB=0.538334;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0266305;OID=.;OPOS=88316016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:3:3:3:4:3:3:3:4
chr2	88387403	.	C	A	689.34	PASS	AF=1;AO=38;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00983254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.089;QD=62.6672;RBI=0.091801;REFB=0;REVB=0.0912729;RO=0;SAF=29;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00047202;OID=.;OPOS=88387403;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:38:44:1:9:29:0:0:15:29:0:0
chr2	88396120	.	G	A	53.4	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=0.0208726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.405;QD=7.62906;RBI=0.0356663;REFB=-0.00776227;REVB=-0.0289209;RO=20;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0805494;STB=0.549882;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0138141;OID=.;OPOS=88396120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:6:2:4:16:6:2:4:16
chr2	88396123	.	C	G	53.12	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=0.0197015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.667;QD=7.32719;RBI=0.0249474;REFB=-0.0104314;REVB=-0.0153044;RO=21;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980895;STB=0.560834;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0209041;OID=.;OPOS=88396123;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:6:2:4:17:6:2:4:17
chr2	88396174	.	T	C	115.42	PASS	AF=0.288462;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0589653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3965;QD=8.87837;RBI=0.0667021;REFB=-0.0170023;REVB=-0.0311812;RO=36;SAF=7;SAR=8;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125893;STB=0.583227;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0373059;OID=.;OPOS=88396174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:36:37:15:15:0.288462:8:7:13:23:8:7:13:24
chr2	88407959	.	T	C	240.87	PASS	AF=0.309278;AO=29;DP=98;FAO=30;FDP=97;FR=.;FRO=67;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.0321151;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9613;QD=9.93278;RBI=0.0325913;REFB=-0.013935;REVB=-0.00555061;RO=59;SAF=18;SAR=11;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131698;STB=0.628446;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0244653;OID=.;OPOS=88407959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:59:67:29:30:0.309278:11:18:30:29:11:19:30:37
chr2	88411605	.	A	T	420.06	PASS	AF=0.388889;AO=49;DP=126;FAO=49;FDP=126;FR=.;FRO=77;FSAF=39;FSAR=10;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=-6.19515e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7723;QD=13.3352;RBI=0.0357878;REFB=-0.00960516;REVB=0.0357878;RO=76;SAF=39;SAR=10;SRF=42;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312796;STB=0.684127;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00830617;OID=.;OPOS=88411605;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:76:77:49:49:0.388889:10:39:42:34:10:39:42:35
chr2	88472791	.	G	A	1110.08	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=77;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0409687;FXX=0.0259707;HRUN=3;LEN=1;MLLD=301.737;QD=59.2042;RBI=0.0409687;REFB=-0.102651;REVB=-4.09299e-05;RO=0;SAF=55;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504503;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.000154441;OID=.;OPOS=88472791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:75:0:1:74:74:0.986667:19:55:0:0:19:55:1:0
chr2	88874891	.	C	A	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.955;QD=57.1062;RBI=0.0539119;REFB=0;REVB=0.0449757;RO=0;SAF=23;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102844;OID=.;OPOS=88874891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:32:23:0:0:32:23:0:0
chr2	88879131	.	T	C	240.14	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00922145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.777;QD=16.5617;RBI=0.0284653;REFB=-0.00988566;REVB=0.0269302;RO=31;SAF=18;SAR=9;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210618;STB=0.618957;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00730708;OID=.;OPOS=88879131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:9:18:14:17:9:18:14:17
chr2	88895123	.	T	C	851.24	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00857547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.731;QD=57.7112;RBI=0.0555296;REFB=0;REVB=0.0548634;RO=0;SAF=44;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124969;OID=.;OPOS=88895123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:15:44:0:0:15:44:0:0
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chr2	89197190	.	C	T	836.56	PASS	AF=0.376426;AO=99;DP=265;FAO=99;FDP=263;FR=.;FRO=164;FSAF=58;FSAR=41;FSRF=95;FSRR=69;FWDB=-0.000265361;FXX=0.00754688;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.541;QD=12.7234;RBI=0.00591023;REFB=-0.0162233;REVB=-0.00590427;RO=164;SAF=58;SAR=41;SRF=95;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748877;STB=0.504227;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0249867;OID=.;OPOS=89197190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:265:263:164:164:99:99:0.376426:41:58:95:69:41:58:95:69
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chr2	95542415	.	CA	CG,TG	105.13	PASS	AF=0.0944882,0.0787402;AO=12,10;DP=127;FAO=12,10;FDP=127;FR=.;FRO=105;FSAF=7,1;FSAR=5,9;FSRF=45;FSRR=60;FWDB=0.000732374,-0.0148438;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=143.221,133.513;QD=3.31108;RBI=0.0287195,0.0155135;REFB=-0.00182492,-0.000826531;REVB=-0.0287102,0.0045086;RO=105;SAF=7,1;SAR=5,9;SRF=45;SRR=60;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.182364,-0.422558;STB=0.636143,0.856328;STBP=0.362,0.029;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00643184,0.000380891;OID=.,.;OPOS=95542416,95542415;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:127:127:105:105:12,10:12,10:0.0944882,0.0787402:5,9:7,1:45:60:5,9:7,1:45:60
chr2	95542419	.	G	A	118.95	PASS	AF=0.176;AO=22;DP=126;FAO=22;FDP=125;FR=.;FRO=103;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=43;FSRR=60;FWDB=-0.0488271;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9449;QD=3.80651;RBI=0.0538713;REFB=-0.00335939;REVB=-0.0227602;RO=102;SAF=8;SAR=14;SRF=42;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644018;STB=0.546664;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.00797502;OID=.;OPOS=95542419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:125:102:103:22:22:0.176:14:8:42:60:14:8:43:60
chr2	95542476	.	C	T	133.58	PASS	AF=0.181818;AO=24;DP=133;FAO=24;FDP=132;FR=.;FRO=108;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=48;FSRR=60;FWDB=0.0380085;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.337;QD=4.04799;RBI=0.0387391;REFB=-0.0136454;REVB=-0.00748817;RO=108;SAF=10;SAR=14;SRF=48;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360866;STB=0.523176;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0534898;OID=.;OPOS=95542476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:132:108:108:24:24:0.181818:14:10:48:60:14:10:48:60
chr2	95542482	.	C	A	38.25	PASS	AF=0.0873016;AO=11;DP=126;FAO=11;FDP=126;FR=.;FRO=115;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=55;FSRR=60;FWDB=-0.000274075;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.503;QD=1.21438;RBI=0.00579132;REFB=-0.00353213;REVB=-0.00578483;RO=115;SAF=2;SAR=9;SRF=55;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353972;STB=0.787467;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.027755;OID=.;OPOS=95542482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:126:126:115:115:11:11:0.0873016:9:2:55:60:9:2:55:60
chr2	95815034	.	GT	GG,G	57.78	PASS	AF=0.0416667,0.479167;AO=3,16;DP=46;FAO=2,23;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=2,15;FSAR=0,8;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.130655,0.000204118;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=20.0666,6.7565;QD=4.81519;RBI=0.188104,0.0826513;REFB=-0.093712,-0.112856;REVB=0.135323,0.0826511;RO=21;SAF=3,9;SAR=0,7;SRF=15;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.518235,-0.156131;STB=0.993271,0.5;STBP=0.297,1;TYPE=snp,del;VARB=0.120446,0.0725859;OID=.,.;OPOS=95815035,95815035;OREF=T,T;OALT=G,-;OMAPALT=GG,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0416667,0.479167:3,16:46:2,23:48:23:2,15:0,8:15:8:56:21:3,9:0,7:15:6
chr2	95847040	.	TGCG	T	441.81	PASS	AF=1;AO=26;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106551;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=239.969;QD=57.0072;RBI=0.047819;REFB=0;REVB=0.0466168;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000170698;OID=.;OPOS=95847041;OREF=GCG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:26:30:31:31:0:19:12:0:0:4:0:16:10:0:0
chr2	95848354	.	G	A	817.4	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0341672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9202;QD=57.3614;RBI=0.0370592;REFB=0;REVB=0.014352;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000165208;OID=.;OPOS=95848354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0
chr2	95947085	.	A	G	1590.01	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00498116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.691;QD=60.0005;RBI=0.0247397;REFB=0;REVB=0.024233;RO=0;SAF=50;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.73304e-05;OID=.;OPOS=95947085;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:106:0:0:103:106:1:53:50:0:0:55:51:0:0
chr2	96195632	.	T	C	1542.06	PASS	AF=0.955357;AO=107;DP=113;FAO=107;FDP=112;FR=.;FRO=5;FSAF=71;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0285908;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.213;QD=55.0736;RBI=0.0340569;REFB=-0.107691;REVB=0.0185052;RO=4;SAF=71;SAR=36;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124581;STB=0.51306;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00566965;OID=.;OPOS=96195632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:113:112:4:5:107:107:0.955357:36:71:2:2:36:71:2:3
chr2	96195730	.	C	T	207.53	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.077457;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5368;QD=14.0696;RBI=0.0811666;REFB=-0.0196978;REVB=-0.0242575;RO=33;SAF=20;SAR=5;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308782;STB=0.672116;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0445824;OID=.;OPOS=96195730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:33:34:25:25:0.423729:5:20:18:15:5:20:19:15
chr2	96196322	.	A	G	359.48	PASS	AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00957912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.221;QD=19.9708;RBI=0.0111512;REFB=-0.0123311;REVB=-0.0057088;RO=35;SAF=17;SAR=20;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978589;STB=0.554278;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.00794858;OID=.;OPOS=96196322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:35:35:37:37:0.513889:20:17:20:15:20:17:20:15
chr2	96217197	.	C	G	467.73	PASS	AF=0.494624;AO=46;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.00124671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=312.833;QD=20.1174;RBI=0.00891716;REFB=-0.00882694;REVB=-0.00882958;RO=47;SAF=29;SAR=17;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935372;STB=0.551954;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.00829355;OID=.;OPOS=96217197;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:47:47:46:46:0.494624:17:29:25:22:17:29:25:22
chr2	96217234	.	C	G	378.07	PASS	AF=0.4875;AO=38;DP=79;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0103496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.088;QD=18.9035;RBI=0.0173877;REFB=-0.0319041;REVB=-0.013972;RO=41;SAF=26;SAR=12;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237341;STB=0.636291;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0255012;OID=.;OPOS=96217234;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:41:41:38:39:0.4875:12:26:18:23:12:27:18:23
chr2	96517452	.	T	C	77.16	PASS	AF=0.170732;AO=14;DP=82;FAO=14;FDP=82;FR=.;FRO=68;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=46;FSRR=22;FWDB=0.0211402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.552;QD=3.76406;RBI=0.0305309;REFB=0.00226418;REVB=-0.0220279;RO=66;SAF=5;SAR=9;SRF=45;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.391304;STB=0.747246;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.0149136;OID=.;OPOS=96517452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:82:82:66:68:14:14:0.170732:9:5:45:21:9:5:46:22
chr2	96517471	.	A	G	99.83	PASS	AF=0.184783;AO=17;DP=92;FAO=17;FDP=92;FR=.;FRO=75;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=47;FSRR=28;FWDB=-0.0482215;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.0022;QD=4.34063;RBI=0.0482294;REFB=-0.00837764;REVB=-0.000871581;RO=75;SAF=6;SAR=11;SRF=47;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33515;STB=0.713351;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00424966;OID=.;OPOS=96517471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:75:75:17:17:0.184783:11:6:47:28:11:6:47:28
chr2	96517474	.	G	A	90.68	PASS	AF=0.173913;AO=16;DP=92;FAO=16;FDP=92;FR=.;FRO=76;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=47;FSRR=29;FWDB=-0.0264633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.916;QD=3.94258;RBI=0.0286857;REFB=-0.00226142;REVB=-0.0110708;RO=75;SAF=6;SAR=10;SRF=47;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309123;STB=0.693489;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0181386;OID=.;OPOS=96517474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:92:92:75:76:16:16:0.173913:10:6:47:28:10:6:47:29
chr2	96517484	.	T	G	100.19	PASS	AF=0.186813;AO=17;DP=91;FAO=17;FDP=91;FR=.;FRO=74;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=0.0918095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9766;QD=4.40401;RBI=0.118844;REFB=-0.0042308;REVB=0.0754649;RO=74;SAF=8;SAR=9;SRF=44;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155925;STB=0.599886;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0226239;OID=.;OPOS=96517484;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:74:74:17:17:0.186813:9:8:44:30:9:8:44:30
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chr2	96517518	.	A	G	281.44	PASS	AF=0.358696;AO=32;DP=92;FAO=33;FDP=92;FR=.;FRO=59;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.0631857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5929;QD=12.2364;RBI=0.0661011;REFB=-0.0139662;REVB=0.0194143;RO=57;SAF=13;SAR=19;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153326;STB=0.605996;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0402053;OID=.;OPOS=96517518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:57:59:32:33:0.358696:19:13:31:26:20:13:33:26
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chr2	96523096	.	T	C	834.31	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00703119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.063;QD=57.5383;RBI=0.0234724;REFB=0;REVB=-0.0223945;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.42251e-05;OID=.;OPOS=96523096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:24:34:0:0:24:34:0:0
chr2	96525643	.	T	C	81.18	PASS	AF=0.213115;AO=13;DP=62;FAO=13;FDP=61;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.00643743;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.217;QD=5.32347;RBI=0.0133223;REFB=-0.00360277;REVB=0.0116637;RO=48;SAF=9;SAR=4;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170706;STB=0.609581;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0143464;OID=.;OPOS=96525643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:62:61:48:48:13:13:0.213115:4:9:27:21:4:9:27:21
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chr2	96525723	.	C	T	58.74	PASS	AF=0.121495;AO=13;DP=107;FAO=13;FDP=107;FR=.;FRO=94;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=58;FSRR=36;FWDB=0.00994974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.795;QD=2.19582;RBI=0.0378657;REFB=0.000576196;REVB=-0.0365351;RO=93;SAF=7;SAR=6;SRF=58;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107277;STB=0.570071;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=-0.0622266;OID=.;OPOS=96525723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:107:107:93:94:13:13:0.121495:6:7:58:35:6:7:58:36
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chr2	96525755	.	A	T	54.1	PASS	AF=0.111111;AO=12;DP=119;FAO=13;FDP=117;FR=.;FRO=104;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=61;FSRR=43;FWDB=-0.0373954;FXX=0.0249979;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.828;QD=1.84954;RBI=0.0493296;REFB=-0.00437488;REVB=-0.0321714;RO=105;SAF=6;SAR=6;SRF=62;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108441;STB=0.54321;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0469114;OID=.;OPOS=96525755;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:119:117:105:104:12:13:0.111111:6:6:62:43:6:7:61:43
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chr2	96583735	.	A	C	107.09	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0103247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.012;QD=12.5991;RBI=0.0578066;REFB=-0.0181734;REVB=0.0568771;RO=21;SAF=6;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164083;STB=0.596268;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0354144;OID=.;OPOS=96583735;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:7:6:13:8:7:6:13:8
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chr2	96617090	.	A	G	53.99	PASS	AF=0.153846;AO=10;DP=64;FAO=10;FDP=65;FR=.;FRO=55;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=-0.00387011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.363;QD=3.32218;RBI=0.0105744;REFB=0.000869925;REVB=-0.0098407;RO=54;SAF=6;SAR=4;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101302;STB=0.577484;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=-0.00823922;OID=.;OPOS=96617090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:64:65:54:55:10:10:0.153846:4:6:28:26:4:6:28:27
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chr2	96617111	.	G	A	53.29	PASS	AF=0.1375;AO=11;DP=79;FAO=11;FDP=80;FR=.;FRO=69;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=-0.0390342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.209;QD=2.66449;RBI=0.039269;REFB=-0.00184658;REVB=-0.00428788;RO=68;SAF=6;SAR=5;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198328;STB=0.507995;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0137738;OID=.;OPOS=96617111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:79:80:68:69:11:11:0.1375:5:6:36:32:5:6:37:32
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chr2	96944553	.	G	A	169.68	PASS	AF=0.586207;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0061632;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.438;QD=23.4044;RBI=0.0339243;REFB=0.0186001;REVB=0.0333598;RO=13;SAF=12;SAR=5;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139639;STB=0.566937;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.0133742;OID=.;OPOS=96944553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:29:13:12:17:17:0.586207:5:12:11:2:5:12:10:2
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chr2	97166296	.	A	G	119.38	PASS	AF=0.619048;AO=11;DP=19;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.110576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6556;QD=22.7382;RBI=0.113911;REFB=-0.0708656;REVB=-0.0273609;RO=7;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172885;STB=0.581968;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0262504;OID=.;OPOS=97166296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:19:21:7:8:11:13:0.619048:7:4:1:6:7:6:2:6
chr2	97217273	.	AGCCCCCAT	ACGCCCCAT,AGCCCCACT,AGCCCCAT,AGCCCCATG,CAGCCCCAT	489.29	PASS	AF=0,0.0792079,0.742574,0,0;AO=4,10,39,5,8;DP=104;FAO=0,8,75,0,0;FDP=101;FR=.;FRO=18;FSAF=0,8,16,0,0;FSAR=0,0,59,0,0;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0127853,-0.0512433,0.103765,-0.0187121,0.036501;FXX=0.0194156;HRUN=1,5,5,5,1;LEN=2,2,1,3,3;MLLD=58.9503,163.076,9.94992,159.93,13.3276;QD=19.3778;RBI=0.0559513,0.0550095,0.141001,0.0195778,0.0379763;REFB=-0.0194002,-0.0132453,-0.171008,-0.02372,-0.0457646;REVB=-0.0544709,-0.0200042,0.0954676,-0.00575737,0.0104824;RO=24;SAF=0,10,5,0,2;SAR=4,0,34,5,6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0,0,0.5625,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.630762,0.768326,-0.387082,-0.670484,-0.309225;STB=0.5,0.998077,0.613637,0.5,0.5;STBP=1,0.026,0,1,1;TYPE=mnp,mnp,del,mnp,mnp;VARB=0,0.0851749,0.15256,0,0;OID=.,.,.,.,.;OPOS=97217274,97217279,97217275,97217279,97217273;OREF=GC,CA,C,CAT,AGC;OALT=CG,AC,-,ATG,CAG;OMAPALT=ACGCCCCAT,AGCCCCACT,AGCCCCAT,AGCCCCATG,CAGCCCCAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:43:104:101:24:18:4,10,39,5,8:0,8,75,0,0:0,0.0792079,0.742574,0,0:4,0,34,5,6:0,10,5,0,2:12:12:0,0,59,0,0:0,8,16,0,0:12:6
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chr2	99787009	.	C	T	334.51	PASS	AF=0.591837;AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=49;FR=.;FRO=20;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0260426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.523;QD=27.3071;RBI=0.0372337;REFB=0.00534098;REVB=-0.0266107;RO=19;SAF=22;SAR=7;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11569;STB=0.556921;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.00475782;OID=.;OPOS=99787009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:19:20:29:29:0.591837:7:22:12:7:7:22:13:7
chr2	99804642	.	T	C	708.67	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.639;QD=62.9926;RBI=0.0609179;REFB=0;REVB=0.0554749;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117166;OID=.;OPOS=99804642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:16:28:0:0:16:29:0:0
chr2	99812070	.	G	A	855.23	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00835819;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6808;QD=57.9815;RBI=0.0310313;REFB=0;REVB=-0.0298844;RO=0;SAF=38;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22967e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000909866;OID=.;OPOS=99812070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:21:38:0:0:21:38:0:0
chr2	100343557	.	C	T	972.86	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00653328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.01;QD=58.9609;RBI=0.00998523;REFB=0;REVB=0.00755123;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.18098e-05;OID=.;OPOS=100343557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:28:37:0:0:29:37:0:0
chr2	100897573	.	G	A	1026.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.265;QD=59.5018;RBI=0.0354401;REFB=0;REVB=0.0181376;RO=0;SAF=42;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.78443e-05;OID=.;OPOS=100897573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:27:42:0:0:27:42:0:0
chr2	100915772	.	A	G	710.16	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0715808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5371;QD=54.6279;RBI=0.0717002;REFB=-0.0549262;REVB=-0.00413619;RO=1;SAF=7;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.010585;STB=0.505616;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00501019;OID=.;OPOS=100915772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:44:7:0:1:44:7:0:1
chr2	100916306	.	A	G	937.59	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000867502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.087;QD=58.5992;RBI=0.00200628;REFB=0;REVB=-0.00180903;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.6967e-07;OID=.;OPOS=100916306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:34:30:0:0:34:30:0:0
chr2	100916315	.	A	G	342.23	PASS	AF=0.618182;AO=32;DP=53;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00368074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.504;QD=24.8895;RBI=0.107553;REFB=-0.0195691;REVB=0.10749;RO=20;SAF=22;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212896;STB=0.604333;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00580085;OID=.;OPOS=100916315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:20:21:32:34:0.618182:10:22:8:12:12:22:8:13
chr2	100917109	.	C	T	3166.54	PASS	AF=1;AO=206;DP=207;FAO=206;FDP=206;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128177;FXX=0.00483068;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.533;QD=61.4863;RBI=0.0243474;REFB=-0.0439754;REVB=0.0207003;RO=1;SAF=132;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00639338;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018547;OID=.;OPOS=100917109;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:207:206:1:0:206:206:1:74:132:0:1:74:132:0:0
chr2	101010082	.	G	C	1266.23	PASS	AF=0.965517;AO=83;DP=86;FAO=84;FDP=87;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0235819;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.037;QD=58.2176;RBI=0.0236315;REFB=-0.126859;REVB=0.00153005;RO=3;SAF=54;SAR=29;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255853;STB=0.51351;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.000842641;OID=.;OPOS=101010082;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:86:87:3:3:83:84:0.965517:29:54:3:0:30:54:3:0
chr2	101031561	.	G	T	831.96	PASS	AF=0.952381;AO=60;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0379297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9256;QD=52.8229;RBI=0.0442328;REFB=-0.0171066;REVB=0.0227569;RO=3;SAF=31;SAR=29;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164631;STB=0.508732;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00499349;OID=.;OPOS=101031561;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:63:63:3:3:60:60:0.952381:29:31:1:2:29:31:1:2
chr2	101096960	.	C	T	1508.88	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.88;QD=63.5318;RBI=0.0201699;REFB=0;REVB=0.0173681;RO=0;SAF=50;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25082e-05;OID=.;OPOS=101096960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:45:50:0:0:45:50:0:0
chr2	101186088	.	C	T	1577.13	PASS	AF=1;AO=102;DP=105;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00647146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.0806;QD=58.4122;RBI=0.00771247;REFB=0;REVB=0.00419551;RO=0;SAF=45;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08171e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000834086;OID=.;OPOS=101186088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:108:0:0:102:108:1:57:45:0:0:57:51:0:0
chr2	101437561	.	G	A	1375.02	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.861;QD=62.501;RBI=0.0384345;REFB=0;REVB=0.0143083;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.13932e-05;OID=.;OPOS=101437561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:88:0:0:85:88:1:44:41:0:0:45:43:0:0
chr2	101437601	.	C	G	1097.45	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00510473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.776;QD=60.1343;RBI=0.0265401;REFB=0;REVB=0.0260446;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22438e-05;OID=.;OPOS=101437601;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:36:36:0:0:36:37:0:0
chr2	101591304	.	A	G	261.42	PASS	AF=0.360465;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=86;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.0369484;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2862;QD=12.1592;RBI=0.0490337;REFB=-0.0205938;REVB=-0.0322354;RO=55;SAF=13;SAR=18;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179235;STB=0.603061;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.035571;OID=.;OPOS=101591304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:55:55:31:31:0.360465:18:13:32:23:18:13:32:23
chr2	101612051	.	G	A	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0201474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.413;QD=13.4866;RBI=0.0322899;REFB=-0.0104571;REVB=-0.0252333;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645154;STB=0.538373;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0155821;OID=.;OPOS=101612051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:7:2:3:8:7:2:3:8
chr2	101612615	.	T	C	72.93	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0295014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.152;QD=20.8361;RBI=0.0583114;REFB=-0.00483771;REVB=-0.050298;RO=5;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38587;STB=0.723607;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00167478;OID=.;OPOS=101612615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:7:2:4:1:7:2:4:1
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chr2	101638888	.	A	G	429.13	PASS	AF=0.602941;AO=41;DP=68;FAO=41;FDP=68;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.037749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.187;QD=25.2432;RBI=0.0388105;REFB=-0.01826;REVB=-0.00901485;RO=27;SAF=22;SAR=19;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0400435;STB=0.521916;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0120031;OID=.;OPOS=101638888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:27:27:41:41:0.602941:19:22:13:14:19:22:13:14
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chr2	101898412	.	G	C	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.128;QD=61.6832;RBI=0.0532476;REFB=0;REVB=-0.0434166;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.59961e-05;OID=.;OPOS=101898412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0
chr2	102038849	.	T	A	245.9	PASS	AF=0.340909;AO=29;DP=88;FAO=30;FDP=88;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=19;FWDB=0.0123576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.918;QD=11.1772;RBI=0.0146764;REFB=-0.0111662;REVB=0.00791758;RO=56;SAF=19;SAR=10;SRF=39;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052957;STB=0.528127;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0377062;OID=.;OPOS=102038849;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:56:58:29:30:0.340909:10:19:39:17:11:19:39:19
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chr2	102068872	.	T	A	230.71	PASS	AF=0.421875;AO=17;DP=63;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00386684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.91;QD=14.4191;RBI=0.0662167;REFB=-0.0162556;REVB=-0.0661037;RO=35;SAF=5;SAR=12;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230643;STB=0.54004;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0320837;OID=.;OPOS=102068872;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:35:37:17:27:0.421875:12:5:17:18:12:15:18:19
chr2	102508274	.	A	G	40.33	PASS	AF=0.318182;AO=6;DP=21;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0112353;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=85.8343;QD=7.33212;RBI=0.0116094;REFB=-0.00801254;REVB=-0.00292317;RO=15;SAF=4;SAR=2;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154555;STB=0.633402;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0466783;OID=.;OPOS=102508274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:21:22:15:15:6:7:0.318182:2:4:8:7:2:5:8:7
chr2	102781629	.	G	A	258.61	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0112004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.205;QD=16.4199;RBI=0.01307;REFB=-0.0142301;REVB=0.00673609;RO=32;SAF=9;SAR=20;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998232;STB=0.577562;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0206663;OID=.;OPOS=102781629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:32:34:29:29:0.460317:20:9:13:19:20:9:15:19
chr2	102791086	.	C	T	610.19	PASS	AF=0.62069;AO=54;DP=87;FAO=54;FDP=87;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.000471235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.996;QD=28.0549;RBI=0.0490467;REFB=-0.00253949;REVB=-0.0490445;RO=33;SAF=26;SAR=28;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00235018;STB=0.501278;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.00178947;OID=.;OPOS=102791086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:33:33:54:54:0.62069:28:26:16:17:28:26:16:17
chr2	102851470	.	G	A	467.93	PASS	AF=0.54878;AO=45;DP=82;FAO=45;FDP=82;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0194258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.373;QD=22.8257;RBI=0.0194343;REFB=-0.00812705;REVB=0.000575941;RO=37;SAF=24;SAR=21;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028257;STB=0.515541;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.00461544;OID=.;OPOS=102851470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:37:37:45:45:0.54878:21:24:21:16:21:24:21:16
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chr2	103001402	.	C	T	170.34	PASS	AF=0.463415;AO=17;DP=38;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0203913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.758;QD=16.619;RBI=0.0232552;REFB=-0.0354987;REVB=0.0111804;RO=19;SAF=3;SAR=14;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245058;STB=0.661458;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0328446;OID=.;OPOS=103001402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:41:19:22:17:19:0.463415:14:3:7:12:16:3:8:14
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chr2	105713697	.	A	G	118.37	PASS	AF=0.378378;AO=13;DP=36;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0639685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5085;QD=12.7971;RBI=0.0642508;REFB=-0.0232615;REVB=-0.00601619;RO=23;SAF=7;SAR=6;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34437;STB=0.710847;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0293226;OID=.;OPOS=105713697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:23:23:13:14:0.378378:6:7:5:18:6:8:5:18
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chr2	105885961	.	T	C	552.66	PASS	AF=0.5;AO=57;DP=116;FAO=57;FDP=114;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=-0.0382987;FXX=0.0172399;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4772;QD=19.3916;RBI=0.039608;REFB=-0.0324871;REVB=-0.0100997;RO=57;SAF=28;SAR=29;SRF=35;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111051;STB=0.561269;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0326192;OID=.;OPOS=105885961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:114:57:57:57:57:0.5:29:28:35:22:29:28:35:22
chr2	105915128	.	G	A	323.36	PASS	AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=9;FWDB=-0.00651953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.948;QD=17.0191;RBI=0.0849405;REFB=-0.00793025;REVB=0.0846899;RO=41;SAF=23;SAR=12;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139093;STB=0.577387;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00903511;OID=.;OPOS=105915128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:41:41:35:35:0.460526:12:23:32:9:12:23:32:9
chr2	105924510	.	A	G	1135.25	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00177349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.476;QD=60.5465;RBI=0.130576;REFB=0;REVB=-0.130564;RO=0;SAF=47;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0003743;OID=.;OPOS=105924510;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:28:47:0:0:28:47:0:0
chr2	105953938	.	G	GC	1453.49	PASS	AF=0.989474;AO=92;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0132652;FXX=0.0206164;HRUN=0;LEN=1;MLLD=179.188;QD=61.1997;RBI=0.0263721;REFB=-0.0939755;REVB=0.022793;RO=2;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0206008;STB=0.505375;STBP=0.33;TYPE=ins;VARB=0.00070162;OID=.;OPOS=105953939;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.989474:92:95:94:95:1:48:46:0:1:4:2:47:45:0:2
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chr2	106710045	.	A	C	322.24	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00924311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0002;QD=28.0208;RBI=0.0627537;REFB=0.0110263;REVB=0.0620692;RO=18;SAF=20;SAR=8;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128985;STB=0.571375;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=-0.00633844;OID=.;OPOS=106710045;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:8:20:10:8:8:20:10:8
chr2	106710108	.	C	T	732.53	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00229674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.986;QD=56.3483;RBI=0.0174796;REFB=0;REVB=0.017328;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26289e-05;OID=.;OPOS=106710108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:25:26:0:0:25:27:0:0
chr2	106742139	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.829;QD=56.7059;RBI=0.0542103;REFB=0;REVB=-0.0277656;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134786;OID=.;OPOS=106742139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr2	107084739	.	A	G	1575.12	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245507;FXX=0.00943307;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.041;QD=60.0048;RBI=0.0465164;REFB=0;REVB=0.0395099;RO=0;SAF=64;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99239e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.90471e-05;OID=.;OPOS=107084739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:41:64:0:0:41:64:0:0
chr2	107107511	.	C	T	254.4	PASS	AF=0.384615;AO=30;DP=78;FAO=30;FDP=78;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.00653608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.61;QD=13.0463;RBI=0.0109288;REFB=-0.00395383;REVB=-0.00875886;RO=48;SAF=13;SAR=17;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182961;STB=0.510464;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.00574447;OID=.;OPOS=107107511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:48:48:30:30:0.384615:17:13:20:28:17:13:20:28
chr2	107107567	.	G	C	906.56	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023504;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.3562;QD=58.4877;RBI=0.0442021;REFB=0;REVB=-0.0374351;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000160121;OID=.;OPOS=107107567;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0
chr2	107450525	.	T	C	428.92	PASS	AF=0.342282;AO=51;DP=150;FAO=51;FDP=149;FR=.;FRO=98;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=50;FSRR=48;FWDB=-0.000766111;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.369;QD=11.5146;RBI=0.0502395;REFB=-0.003711;REVB=0.0502336;RO=96;SAF=33;SAR=18;SRF=50;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148991;STB=0.5931;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00596734;OID=.;OPOS=107450525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:149:96:98:51:51:0.342282:18:33:50:46:18:33:50:48
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chr2	108479195	.	G	A	98.43	PASS	AF=0.382353;AO=9;DP=30;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0229979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6124;QD=11.5796;RBI=0.0288757;REFB=-0.0241121;REVB=-0.0174616;RO=20;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22771;STB=0.669353;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0465033;OID=.;OPOS=108479195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:30:34:20:21:9:13:0.382353:4:5:7:13:5:8:7:14
chr2	108863767	.	A	C	486.85	PASS	AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0429477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.877;QD=21.6377;RBI=0.0492695;REFB=-0.0145859;REVB=0.024145;RO=43;SAF=15;SAR=32;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197177;STB=0.60917;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0146359;OID=.;OPOS=108863767;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:43:43:47:47:0.522222:32:15:23:20:32:15:23:20
chr2	108875198	.	G	A	285.54	PASS	AF=0.333333;AO=37;DP=110;FAO=37;FDP=111;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=0.0110934;FXX=0.00892777;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.975;QD=10.2896;RBI=0.0196338;REFB=-0.00569624;REVB=-0.0161994;RO=73;SAF=22;SAR=15;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101934;STB=0.56379;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00958561;OID=.;OPOS=108875198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:73:74:37:37:0.333333:15:22:37:36:15:22:37:37
chr2	108875244	.	T	C	280.55	PASS	AF=0.321739;AO=37;DP=115;FAO=37;FDP=115;FR=.;FRO=78;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=41;FSRR=37;FWDB=-0.024985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.182;QD=9.75842;RBI=0.0253466;REFB=0.000405581;REVB=0.00426629;RO=78;SAF=23;SAR=14;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114847;STB=0.566904;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=-0.00163438;OID=.;OPOS=108875244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:78:78:37:37:0.321739:14:23:41:37:14:23:41:37
chr2	108875471	.	G	T	462.19	PASS	AF=0.360759;AO=57;DP=156;FAO=57;FDP=158;FR=.;FRO=101;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=61;FSRR=40;FWDB=-0.0601395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9005;QD=11.7011;RBI=0.0750379;REFB=-0.00677475;REVB=-0.0448768;RO=99;SAF=38;SAR=19;SRF=61;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617003;STB=0.543763;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0108218;OID=.;OPOS=108875471;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:158:99:101:57:57:0.360759:19:38:61:38:19:38:61:40
chr2	108877062	.	T	A	1293.43	PASS	AF=0.977011;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=87;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00373317;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=324.854;QD=59.4681;RBI=0.0100945;REFB=-0.114215;REVB=0.00937878;RO=2;SAF=42;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215219;STB=0.511361;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.000736142;OID=.;OPOS=108877062;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:87:87:2:2:85:85:0.977011:43:42:0:2:43:42:0:2
chr2	109099572	.	C	G	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=2.6363e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.135;QD=62.021;RBI=0.0036202;REFB=0;REVB=0.00362011;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.42807e-06;OID=.;OPOS=109099572;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr2	109106381	.	A	G	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00139136;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.843;QD=58.0611;RBI=0.0104296;REFB=0;REVB=0.0103363;RO=0;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86874e-05;OID=.;OPOS=109106381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:33:28:0:0:33:28:0:0
chr2	109389463	.	G	A	990.03	PASS	AF=0.958333;AO=70;DP=71;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00100898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8691;QD=55.0014;RBI=0.032161;REFB=-0.0416359;REVB=-0.0321452;RO=1;SAF=23;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02011;STB=0.533323;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0113724;OID=.;OPOS=109389463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:71:72:1:3:70:69:0.958333:47:23:1:0:48:21:3:0
chr2	109429146	.	T	A	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00140765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5821;QD=56.9557;RBI=0.0746405;REFB=0;REVB=-0.0746273;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000438243;OID=.;OPOS=109429146;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:21:31:0:0:21:31:0:0
chr2	109510937	.	G	A	1234.49	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0532026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8294;QD=60.9627;RBI=0.0547705;REFB=0;REVB=0.0130109;RO=0;SAF=35;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000151457;OID=.;OPOS=109510937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:45:35:0:0:46:35:0:0
chr2	109512234	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00684944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.062;QD=49.5991;RBI=0.0237461;REFB=0;REVB=-0.0227368;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.70028e-05;OID=.;OPOS=109512234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr2	109513601	.	A	G	1921.99	PASS	AF=1;AO=124;DP=126;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149366;FXX=0.0158718;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.327;QD=61.9995;RBI=0.0280454;REFB=0;REVB=0.0237369;RO=0;SAF=58;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000177069;OID=.;OPOS=109513601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:126:124:0:0:124:124:1:66:58:0:0:66:58:0:0
chr2	109513654	.	G	A	1752.73	PASS	AF=1;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114834;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.832;QD=60.9644;RBI=0.0171847;REFB=0;REVB=0.0127845;RO=0;SAF=48;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.56031e-05;OID=.;OPOS=109513654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:115:0:0:115:115:1:67:48:0:0:67:48:0:0
chr2	109526969	.	G	A	1230.54	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470004;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.307;QD=61.5269;RBI=0.050744;REFB=0;REVB=-0.0191288;RO=0;SAF=30;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.10863e-05;OID=.;OPOS=109526969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:80:0:0:80:80:1:50:30:0:0:50:30:0:0
chr2	109527373	.	A	G	1227.34	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00152811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5412;QD=61.3672;RBI=0.00156643;REFB=0;REVB=-0.00034436;RO=0;SAF=41;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.30699e-06;OID=.;OPOS=109527373;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:39:41:0:0:39:41:0:0
chr2	109745176	.	G	A	1188.87	PASS	AF=0.94186;AO=81;DP=86;FAO=81;FDP=86;FR=.;FRO=5;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0281963;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.997;QD=55.2965;RBI=0.0354216;REFB=-0.0945842;REVB=0.0214397;RO=4;SAF=34;SAR=47;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525086;STB=0.534238;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0022275;OID=.;OPOS=109745176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:86:86:4:5:81:81:0.94186:47:34:4:0:47:34:5:0
chr2	110855123	.	G	T	458.32	PASS	AF=1;AO=30;DP=33;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185443;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.414;QD=59.1381;RBI=0.132807;REFB=0;REVB=0.131506;RO=0;SAF=27;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000510292;OID=.;OPOS=110855123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:31:0:0:30:31:1:3:27:0:0:4:27:0:0
chr2	110922703	.	C	T	283.75	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00251303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.09;QD=23.1634;RBI=0.0243032;REFB=-0.0452916;REVB=-0.024173;RO=23;SAF=18;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156356;STB=0.587559;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0353471;OID=.;OPOS=110922703;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:8:18:12:11:8:18:12:11
chr2	111907691	.	T	C	1008.41	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1763;QD=59.3184;RBI=0.0459135;REFB=0;REVB=0.044477;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029393;OID=.;OPOS=111907691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:39:29:0:0:39:29:0:0
chr2	111908163	.	T	C	327.49	PASS	AF=0.472973;AO=34;DP=73;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0410331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.564;QD=17.702;RBI=0.0444765;REFB=-0.00716162;REVB=-0.0171593;RO=39;SAF=27;SAR=7;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319052;STB=0.684094;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0125009;OID=.;OPOS=111908163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:39:39:34:35:0.472973:7:27:20:19:7:28:20:19
chr2	111908262	.	G	A	390.1	PASS	AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.00832327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.146;QD=16.6;RBI=0.0248234;REFB=-0.0176608;REVB=-0.0233864;RO=52;SAF=32;SAR=9;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388346;STB=0.715894;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0198522;OID=.;OPOS=111908262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:52:53:41:41:0.43617:9:32:22:30:9:32:23:30
chr2	111924648	.	G	T	223.83	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.01588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.506;QD=19.4632;RBI=0.0171373;REFB=-0.0188185;REVB=0.0064431;RO=24;SAF=12;SAR=10;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074684;STB=0.542131;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0212691;OID=.;OPOS=111924648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:10:12:15:9:10:12:15:9
chr2	112526866	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00935998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.858;QD=42.1825;RBI=0.0190184;REFB=0;REVB=-0.0165557;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000404435;OID=.;OPOS=112526866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr2	112582766	.	CTT	C	634.37	PASS	AF=1;AO=49;DP=54;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00795208;FXX=0.0545355;HRUN=2;LEN=2;MLLD=274.134;QD=48.7975;RBI=0.0122514;REFB=0;REVB=0.0093199;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000418663;OID=.;OPOS=112582767;OREF=TT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:49:54:52:52:0:29:23:0:0:11:0:28:21:0:0
chr2	112605302	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.272;QD=45.8068;RBI=0.0596325;REFB=0;REVB=-0.0581622;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00053905;OID=.;OPOS=112605302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
chr2	112641149	.	G	C	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00434472;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.575;QD=51.182;RBI=0.010934;REFB=0;REVB=-0.0100337;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.48123e-05;OID=.;OPOS=112641149;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr2	112641256	.	GA	AG	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0471146;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=219.074;QD=40.7629;RBI=0.0500088;REFB=0;REVB=-0.016766;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000295489;OID=.;OPOS=112641256;OREF=GA;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr2	112641266	.	G	C	101.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.9832;QD=40.7588;RBI=0.0334024;REFB=0;REVB=0.0157726;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145166;OID=.;OPOS=112641266;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr2	112641283	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00207829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0061;QD=42.1826;RBI=0.0420193;REFB=0;REVB=-0.0419679;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00186597;OID=.;OPOS=112641283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr2	112732883	.	G	A	139.52	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0263428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8697;QD=12.402;RBI=0.0387609;REFB=0.00731588;REVB=-0.0284334;RO=28;SAF=10;SAR=6;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999205;STB=0.549071;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=-0.0145259;OID=.;OPOS=112732883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:29:16:16:0.355556:6:10:15:13:6:10:16:13
chr2	112832535	.	CAAT	C	94.05	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-3.08099e-07;FXX=0.0384541;HRUN=2;LEN=3;MLLD=285.734;QD=7.52371;RBI=0.0123883;REFB=-0.0123126;REVB=0.0123883;RO=33;SAF=8;SAR=9;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184601;STB=0.608268;STBP=0.306;TYPE=del;VARB=0.025778;OID=.;OPOS=112832536;OREF=AAT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.34:17:51:17:50:33:8:9:21:12:94:33:8:9:21:12
chr2	113089267	.	T	C	482.72	PASS	AF=0.490385;AO=51;DP=105;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0020112;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9999;QD=18.5662;RBI=0.00207503;REFB=-0.0129206;REVB=-0.000510713;RO=53;SAF=26;SAR=25;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000340232;STB=0.500189;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0140729;OID=.;OPOS=113089267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:53:53:51:51:0.490385:25:26:27:26:25:26:27:26
chr2	113090047	.	T	C	355.37	PASS	AF=0.4625;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.0602049;FXX=0.0588166;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4554;QD=17.7684;RBI=0.0625801;REFB=0.0119822;REVB=0.0170776;RO=47;SAF=22;SAR=15;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106004;STB=0.58244;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=-0.0133475;OID=.;OPOS=113090047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:80:47:43:37:37:0.4625:15:22:23:24:15:22:19:24
chr2	113091685	.	T	G	256.74	PASS	AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0422896;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0111;QD=15.7996;RBI=0.0647425;REFB=-0.0045422;REVB=0.0490222;RO=33;SAF=7;SAR=22;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29094;STB=0.690558;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0068712;OID=.;OPOS=113091685;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:33:36:29:29:0.446154:22:7:17:16:22:7:20:16
chr2	113308516	.	T	A	240.13	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0257706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7773;QD=16.5608;RBI=0.028087;REFB=0.00729127;REVB=-0.0111692;RO=31;SAF=14;SAR=13;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032854;STB=0.518505;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=-0.0132096;OID=.;OPOS=113308516;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:13:14:15:16:13:14:15:16
chr2	113309473	.	C	T	283.21	PASS	AF=0.366667;AO=33;DP=90;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0276061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.03;QD=12.5871;RBI=0.0276477;REFB=-0.0109324;REVB=0.0015175;RO=57;SAF=17;SAR=16;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0263845;STB=0.515142;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0138568;OID=.;OPOS=113309473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:57:57:33:33:0.366667:16:17:28:29:16:17:28:29
chr2	113332421	.	T	C	241.22	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0431781;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.793;QD=20.9756;RBI=0.0448061;REFB=0.00717584;REVB=0.0119682;RO=23;SAF=14;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155866;STB=0.587709;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.00698668;OID=.;OPOS=113332421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:23:23:23:23:0.5:9:14:10:13:9:14:10:13
chr2	113344047	.	T	C	239.38	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2608;QD=50.396;RBI=0.0575675;REFB=0;REVB=-0.0272776;RO=0;SAF=2;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203872;OID=.;OPOS=113344047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:17:2:0:0:17:2:0:0
chr2	113346413	.	C	G	386.53	PASS	AF=0.431579;AO=39;DP=94;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=16;FWDB=0.0158474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.074;QD=16.2749;RBI=0.0159758;REFB=-0.00479458;REVB=0.00202075;RO=54;SAF=20;SAR=19;SRF=38;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19882;STB=0.596814;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0076145;OID=.;OPOS=113346413;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:54:54:39:41:0.431579:19:20:38:16:19:22:38:16
chr2	113482779	.	A	C	340.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0043103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3713;QD=54.5158;RBI=0.0266794;REFB=0;REVB=-0.0263289;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00013262;OID=.;OPOS=113482779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0
chr2	113484319	.	G	A	289.6	PASS	AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0174195;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.015;QD=46.3354;RBI=0.0186452;REFB=-0.165854;REVB=0.00664855;RO=1;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319244;STB=0.533305;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00176379;OID=.;OPOS=113484319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:25:25:1:2:23:23:0.92:14:9:0:1:14:9:0:2
chr2	113498566	.	A	G	1490.94	PASS	AF=0.989796;AO=92;DP=95;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0849733;FXX=0.0101;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.759;QD=60.8545;RBI=0.0892621;REFB=-0.0861077;REVB=0.0273361;RO=3;SAF=46;SAR=46;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00997054;STB=0.505375;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.00203369;OID=.;OPOS=113498566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:95:98:3:1:92:97:0.989796:46:46:2:1:46:51:0:1
chr2	113513825	.	T	C	1157.72	PASS	AF=0.987179;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0312002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1041;QD=59.37;RBI=0.0612842;REFB=-0.0483303;REVB=0.0527475;RO=1;SAF=35;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133285;STB=0.50704;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000713643;OID=.;OPOS=113513825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:78:1:1:76:77:0.987179:41:35:1:0:42:35:1:0
chr2	113591114	.	G	A	638.61	PASS	AF=0.477941;AO=65;DP=136;FAO=65;FDP=136;FR=.;FRO=71;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=-0.00125545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.508;QD=18.7825;RBI=0.0220514;REFB=-0.0125851;REVB=-0.0220156;RO=70;SAF=34;SAR=31;SRF=29;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101681;STB=0.559621;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0135139;OID=.;OPOS=113591114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:70:71:65:65:0.477941:31:34:29:41:31:34:29:42
chr2	113671378	.	G	T	203.22	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0518295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6621;QD=21.97;RBI=0.0560783;REFB=0.0144935;REVB=0.021412;RO=17;SAF=14;SAR=6;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0650805;STB=0.536389;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=-0.0108217;OID=.;OPOS=113671378;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:6:14:13:4:6:14:13:4
chr2	113671410	.	A	G	176.27	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0156019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7094;QD=20.738;RBI=0.0159147;REFB=0.00750354;REVB=0.00313979;RO=16;SAF=11;SAR=7;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068284;STB=0.53842;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=-0.00439794;OID=.;OPOS=113671410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:7:11:11:5:7:11:11:5
chr2	113763575	.	A	G	1242.76	PASS	AF=1;AO=61;DP=85;FAO=81;FDP=81;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255611;FXX=0.0470533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.135;QD=61.3707;RBI=0.0562799;REFB=0;REVB=0.0501404;RO=0;SAF=40;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000571087;OID=.;OPOS=113763575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:81:0:0:61:81:1:21:40:0:0:37:44:0:0
chr2	113789316	.	C	T	891.29	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00710672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.683;QD=57.5027;RBI=0.0251482;REFB=0;REVB=-0.0241232;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.56839e-05;OID=.;OPOS=113789316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:28:33:0:0:29:33:0:0
chr2	113831945	.	T	C	800.44	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.152;QD=56.1709;RBI=0.0767701;REFB=0;REVB=0.07292;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119252;OID=.;OPOS=113831945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:57:0:0:54:57:1:20:34:0:0:23:34:0:0
chr2	113832333	.	C	A	1577.82	PASS	AF=0.990909;AO=103;DP=104;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0130659;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.259;QD=57.3754;RBI=0.0267857;REFB=-0.0792379;REVB=0.0233829;RO=1;SAF=69;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00682791;STB=0.503311;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.00189888;OID=.;OPOS=113832333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:104:110:1:1:103:109:0.990909:34:69:1:0:34:75:1:0
chr2	113870725	.	T	G	489.43	PASS	AF=0.485981;AO=52;DP=107;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.022925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.992;QD=18.2963;RBI=0.0284667;REFB=-0.0236597;REVB=-0.0168759;RO=53;SAF=24;SAR=28;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609031;STB=0.5338;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0245958;OID=.;OPOS=113870725;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:53:55:52:52:0.485981:28:24:28:25:28:24:29:26
chr2	113890304	.	T	C	457.78	PASS	AF=0.475728;AO=49;DP=103;FAO=49;FDP=103;FR=.;FRO=54;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.00428549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.828;QD=17.7778;RBI=0.0466813;REFB=-0.00848245;REVB=-0.0464841;RO=53;SAF=32;SAR=17;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140753;STB=0.574259;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0115975;OID=.;OPOS=113890304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:53:54:49:49:0.475728:17:32:27:26:17:32:28:26
chr2	113940681	.	T	C	178.73	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0138212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2531;QD=22.3406;RBI=0.0173671;REFB=0.0158149;REVB=-0.0105161;RO=14;SAF=15;SAR=3;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063222;STB=0.535673;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=-0.0135064;OID=.;OPOS=113940681;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:3:15:11:3:3:15:11:3
chr2	113940839	.	G	C	174.42	PASS	AF=0.323944;AO=23;DP=71;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.00592738;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=316.781;QD=9.82672;RBI=0.00593263;REFB=-0.0115594;REVB=0.000249616;RO=48;SAF=18;SAR=5;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378643;STB=0.724623;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0294265;OID=.;OPOS=113940839;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:48:48:23:23:0.323944:5:18:23:25:5:18:23:25
chr2	113943470	.	A	G	96.27	PASS	AF=0.521739;AO=9;DP=21;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0100224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1071;QD=16.742;RBI=0.10273;REFB=-0.0157137;REVB=0.10224;RO=10;SAF=7;SAR=2;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286347;STB=0.562393;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0148991;OID=.;OPOS=113943470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:21:23:10:11:9:12:0.521739:2:7:5:5:4:8:6:5
chr2	113955074	.	G	A	1153.56	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0305691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.498;QD=60.7135;RBI=0.0541312;REFB=0;REVB=0.0446734;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.88868e-05;OID=.;OPOS=113955074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:38:38:0:0:38:38:0:0
chr2	113956371	.	G	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.028;QD=47.8224;RBI=0.0681058;REFB=0;REVB=0.0652928;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000413913;OID=.;OPOS=113956371;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr2	114358772	.	G	A	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0101889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.165;QD=16.454;RBI=0.0102253;REFB=-0.0144967;REVB=-0.000861474;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.42622;STB=0.749247;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0269349;OID=.;OPOS=114358772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:2:4:0:4:2:4:0:4
chr2	114391721	.	T	C	702.28	PASS	AF=0.638298;AO=59;DP=93;FAO=60;FDP=94;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0299387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.074;QD=29.8843;RBI=0.029953;REFB=0.000570393;REVB=-0.000926331;RO=31;SAF=24;SAR=35;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0780831;STB=0.546281;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.000386167;OID=.;OPOS=114391721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:31:34:59:60:0.638298:35:24:9:22:35:25:10:24
chr2	114392716	.	C	T	253.09	PASS	AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0101081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.758;QD=15.1099;RBI=0.0322902;REFB=-0.0116738;REVB=-0.0306673;RO=38;SAF=11;SAR=18;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0708549;STB=0.540165;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0127371;OID=.;OPOS=114392716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:18:11:17:21:18:11:17:21
chr2	114763169	.	C	G	456.99	PASS	AF=0.475728;AO=49;DP=104;FAO=49;FDP=103;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.0282016;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.069;QD=17.7471;RBI=0.0435142;REFB=-0.00710475;REVB=-0.0331385;RO=52;SAF=31;SAR=18;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546354;STB=0.522316;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0114681;OID=.;OPOS=114763169;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:103:52:54:49:49:0.475728:18:31:30:22:18:31:32:22
chr2	116099725	.	A	T	632.16	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0464149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7323;QD=61.6743;RBI=0.0475002;REFB=0;REVB=-0.0100957;RO=1;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240441;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000819734;OID=.;OPOS=116099725;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:1:0:40:41:1:19:21:0:1:20:21:0:0
chr2	116510817	.	G	C	1021.6	PASS	AF=0.486111;AO=105;DP=216;FAO=105;FDP=216;FR=.;FRO=111;FSAF=46;FSAR=59;FSRF=48;FSRR=63;FWDB=-0.0171913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.657;QD=18.9185;RBI=0.0172115;REFB=-0.0234105;REVB=-0.000833528;RO=111;SAF=46;SAR=59;SRF=48;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00537129;STB=0.502957;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0219047;OID=.;OPOS=116510817;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:216:111:111:105:105:0.486111:59:46:48:63:59:46:48:63
chr2	116525960	.	G	A	788.74	PASS	AF=0.982456;AO=55;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00819131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.689;QD=55.3501;RBI=0.0479393;REFB=-0.176568;REVB=0.0472343;RO=1;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229835;STB=0.512191;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.00145311;OID=.;OPOS=116525960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:57:57:1:1:55:56:0.982456:20:35:0:1:20:36:0:1
chr2	116600388	.	A	G	226.48	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.044208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2039;QD=15.6191;RBI=0.0533764;REFB=-0.0534019;REVB=0.0299115;RO=32;SAF=8;SAR=18;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107035;STB=0.560782;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0245038;OID=.;OPOS=116600388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:18:8:13:19:18:8:13:19
chr2	118575215	.	C	G	64.88	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00366683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.289;QD=10.3809;RBI=0.0220563;REFB=-0.0192743;REVB=-0.0217494;RO=15;SAF=3;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0750523;STB=0.571265;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0485099;OID=.;OPOS=118575215;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:24:25:15:16:9:9:0.36:6:3:6:9:6:3:7:9
chr2	118578793	.	C	CA	49.59	PASS	AF=0.175439;AO=10;DP=61;FAO=10;FDP=57;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=-0.00350251;FXX=0.0172384;HRUN=0;LEN=1;MLLD=84.4112;QD=3.47971;RBI=0.083781;REFB=0.00237341;REVB=-0.0837077;RO=50;SAF=9;SAR=1;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369243;STB=0.777686;STBP=0.099;TYPE=ins;VARB=-0.0559788;OID=.;OPOS=118578794;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.175439:10:61:10:57:47:9:1:32:15:49:50:9:1:35:15
chr2	118731573	.	G	A	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.231;QD=64.1539;RBI=0.0249969;REFB=0;REVB=0.0138828;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130468;OID=.;OPOS=118731573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0
chr2	118774025	.	C	T	551.02	PASS	AF=0.973684;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.020325;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.098;QD=58.0016;RBI=0.0274828;REFB=-0.0833018;REVB=0.0184986;RO=1;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021769;STB=0.511622;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.000886912;OID=.;OPOS=118774025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:38:1:1:36:37:0.973684:21:15:0:1:21:16:0:1
chr2	118774082	.	T	C	858.31	PASS	AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0542856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.076;QD=54.4957;RBI=0.0606881;REFB=-0.0989157;REVB=0.0271315;RO=0;SAF=21;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512191;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00100199;OID=.;OPOS=118774082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:63:0:2:61:61:0.968254:40:21:0:0:40:21:0:2
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chr2	119927405	.	G	C	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0265253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.189;QD=19.1085;RBI=0.0270603;REFB=-0.0179549;REVB=0.00535401;RO=6;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341797;STB=0.699519;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0183647;OID=.;OPOS=119927405;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:2:7:2:4:2:7:2:4
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chr2	120021785	.	T	C	1641.89	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8126;QD=60.253;RBI=0.0241884;REFB=0;REVB=-0.00728536;RO=0;SAF=64;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.67011e-05;OID=.;OPOS=120021785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:45:64:0:0:45:64:0:0
chr2	120060082	.	T	C	125.71	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0614239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2892;QD=10.6988;RBI=0.103465;REFB=-0.017112;REVB=0.083259;RO=32;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285797;STB=0.669207;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0405635;OID=.;OPOS=120060082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:32:32:15:15:0.319149:6:9:11:21:6:9:11:21
chr2	120078778	.	T	C	773.72	PASS	AF=0.386957;AO=88;DP=230;FAO=89;FDP=230;FR=.;FRO=141;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=74;FSRR=67;FWDB=0.0465426;FXX=0.00432882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.825;QD=13.456;RBI=0.0474881;REFB=-0.0188063;REVB=0.00942865;RO=139;SAF=50;SAR=38;SRF=74;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039405;STB=0.522884;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0445369;OID=.;OPOS=120078778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:230:230:139:141:88:89:0.386957:38:50:74:65:39:50:74:67
chr2	120125029	.	A	G	435.85	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0151085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.132;QD=54.4809;RBI=0.0694767;REFB=0.00772519;REVB=0.0678141;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.513505;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=7.11488e-05;OID=.;OPOS=120125029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:32:0:1:31:31:0.96875:13:18:0:0:13:18:1:0
chr2	120125053	.	C	G	47.59	PASS	AF=0.214286;AO=3;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.0178216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.1053;QD=6.79849;RBI=0.0525648;REFB=0.00993763;REVB=0.0494514;RO=19;SAF=3;SAR=0;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.539081;STB=0.647587;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=-0.179048;OID=.;OPOS=120125053;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:28:28:19:20:3:6:0.214286:0:3:13:6:1:5:14:6
chr2	120125058	.	C	T	55.19	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.00211403;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.3622;QD=8.49103;RBI=0.0209546;REFB=0.000195334;REVB=-0.0208477;RO=18;SAF=5;SAR=3;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196438;STB=0.619299;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.00164975;OID=.;OPOS=120125058;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:27:26:18:18:8:8:0.307692:3:5:14:4:3:5:14:4
chr2	120194576	.	ATT	ATG,AT	1257.78	PASS	AF=0.075,0.925;AO=7,40;DP=119;FAO=9,111;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=9,50;FSAR=0,61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0487738,0.166384;FXX=0.00826378;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=133.507,14.039;QD=41.9261;RBI=0.1045,0.86211;REFB=0,0;REVB=0.09242,0.845901;RO=59;SAF=7,35;SAR=0,5;SRF=5;SRR=54;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.834984,0.740597;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.158283,-0.0146409;OID=.,.;OPOS=120194578,120194577;OREF=T,T;OALT=G,-;OMAPALT=ATG,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.075,0.925:7,40:119:9,111:120:0:9,50:0,61:0:0:24:59:7,35:0,5:5:54
chr2	120194651	.	A	AGTGTGC	683.39	PASS	AF=1;AO=47;DP=62;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0573715;FXX=0.039208;HRUN=0;LEN=6;MLLD=305.856;QD=55.7867;RBI=0.0573767;REFB=0;REVB=-0.000772803;RO=13;SAF=13;SAR=34;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220817;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000957638;OID=.;OPOS=120194652;OREF=-;OALT=GTGTGC;OMAPALT=AGTGTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:47:62:49:49:0:15:34:0:0:4:13:13:34:10:3
chr2	120199140	.	A	G	397.08	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430161;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.856;QD=56.7263;RBI=0.0446994;REFB=0;REVB=-0.0121512;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129023;OID=.;OPOS=120199140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr2	120303820	.	A	T	213.92	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0351143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.0791;QD=21.3922;RBI=0.0381557;REFB=0.00741429;REVB=-0.0149279;RO=19;SAF=10;SAR=11;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276819;STB=0.653622;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.00864858;OID=.;OPOS=120303820;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:11:10:3:16:11:10:3:16
chr2	120369300	.	T	C	716.3	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00465975;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.532;QD=57.3037;RBI=0.00543361;REFB=0;REVB=-0.00279477;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39935e-05;OID=.;OPOS=120369300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:31:19:0:0:31:19:0:0
chr2	120388412	.	G	A	834.36	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9976;QD=57.5419;RBI=0.0260384;REFB=0;REVB=-0.0236604;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.78258e-05;OID=.;OPOS=120388412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0
chr2	120438523	.	A	G	911.76	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0126753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.25;QD=55.258;RBI=0.0358558;REFB=-0.0443853;REVB=0.0335407;RO=2;SAF=38;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242098;STB=0.512816;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.000937826;OID=.;OPOS=120438523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:26:38:2:0:26:38:2:0
chr2	120438696	.	A	G	1029.61	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052582;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.6631;QD=59.6877;RBI=0.0527096;REFB=0;REVB=0.00366498;RO=0;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268087;OID=.;OPOS=120438696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:36:33:0:0:36:33:0:0
chr2	120439230	.	C	G	686.99	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1222;QD=62.4537;RBI=0.0158868;REFB=0;REVB=-0.00911115;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148135;OID=.;OPOS=120439230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:44:0:0:42:44:1:17:25:0:0:18:26:0:0
chr2	120439459	.	C	A	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0359598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.551;QD=61.6833;RBI=0.0365463;REFB=0;REVB=0.00652134;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000137814;OID=.;OPOS=120439459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr2	120704166	.	G	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00307283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.726;QD=55.0987;RBI=0.00660859;REFB=0;REVB=-0.00585074;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.94863e-06;OID=.;OPOS=120704166;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr2	120830815	.	A	G	317.83	PASS	AF=0.961538;AO=23;DP=24;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.108721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6027;QD=48.8974;RBI=0.120424;REFB=-0.091206;REVB=0.0517849;RO=1;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615783;STB=0.526294;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0123267;OID=.;OPOS=120830815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:26:1:1:23:25:0.961538:7:16:0:1:9:16:0:1
chr2	120885310	.	G	A	1030.58	PASS	AF=0.985915;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0288569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.618;QD=58.0611;RBI=0.0290285;REFB=-0.126371;REVB=0.00315225;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=-3.13027e-05;OID=.;OPOS=120885310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:71:0:1:69:70:0.985915:34:35:0:0:34:36:0:1
chr2	120980428	.	G	C	1013.65	PASS	AF=0.925;AO=74;DP=80;FAO=74;FDP=80;FR=.;FRO=6;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00139707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6939;QD=50.6826;RBI=0.015419;REFB=-0.0174313;REVB=0.0153556;RO=5;SAF=42;SAR=32;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444389;STB=0.530367;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0186334;OID=.;OPOS=120980428;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:80:80:5:6:74:74:0.925:32:42:1:4:32:42:1:5
chr2	121106850	.	C	T	955.02	PASS	AF=0.608696;AO=84;DP=141;FAO=84;FDP=138;FR=.;FRO=54;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0296611;FXX=0.028167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.166;QD=27.6819;RBI=0.029738;REFB=-0.0204082;REVB=0.00213675;RO=50;SAF=50;SAR=34;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671577;STB=0.552619;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0114629;OID=.;OPOS=121106850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:138:50:54:84:84:0.608696:34:50:25:25:34:50:25:29
chr2	121712938	.	A	G	71.88	PASS	AF=0.193548;AO=12;DP=61;FAO=12;FDP=62;FR=.;FRO=50;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.00524724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.083;QD=4.63743;RBI=0.00540042;REFB=-0.00171439;REVB=0.00127712;RO=49;SAF=2;SAR=10;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453311;STB=0.80406;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0038042;OID=.;OPOS=121712938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:61:62:49:50:12:12:0.193548:10:2:25:24:10:2:26:24
chr2	121726447	.	G	A	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0797511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.235;QD=62.3496;RBI=0.102705;REFB=0;REVB=0.0647149;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000370413;OID=.;OPOS=121726447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0
chr2	121747093	.	G	A	152.13	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0300214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.421;QD=13.2288;RBI=0.0348437;REFB=-0.0406332;REVB=0.0176862;RO=28;SAF=7;SAR=10;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169694;STB=0.588131;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0781661;OID=.;OPOS=121747093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:29:17:17:0.369565:10:7:16:12:10:7:16:13
chr2	121948235	.	C	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.426;QD=42.1822;RBI=0.0613303;REFB=0;REVB=-0.0560327;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000107136;OID=.;OPOS=121948235;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr2	121948239	.	A	C	101.85	PASS	AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0072486;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=120.603;QD=29.1002;RBI=0.0984171;REFB=-0.103227;REVB=0.0981498;RO=3;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119933;STB=0.567442;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00218385;OID=.;OPOS=121948239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:14:14:3:3:11:11:0.785714:4:7:1:2:4:7:1:2
chr2	121948262	.	A	G	120.37	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.000955253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.459;QD=24.0732;RBI=0.00515861;REFB=-0.0422857;REVB=0.00506939;RO=7;SAF=4;SAR=9;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261482;STB=0.647765;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0164064;OID=.;OPOS=121948262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:9:4:5:2:9:4:5:2
chr2	121948307	.	A	G	76.13	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0344278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.029;QD=12.1807;RBI=0.0472486;REFB=-0.0433242;REVB=-0.0323599;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306545;STB=0.682555;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0624454;OID=.;OPOS=121948307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:3:7:6:9:3:7:6:9
chr2	121980405	.	TC	T	463.92	PASS	AF=1;AO=38;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00165414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.7193;QD=45.26;RBI=0.0546507;REFB=0;REVB=-0.0546256;RO=1;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228522;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.0011653;OID=.;OPOS=121980406;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:38:41:41:41:0:18:23:0:0:8:1:18:20:0:1
chr2	121981950	.	A	G	388.11	PASS	AF=0.637931;AO=37;DP=58;FAO=37;FDP=58;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0104805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.163;QD=26.7665;RBI=0.0249902;REFB=0.00106213;REVB=-0.0226864;RO=21;SAF=18;SAR=19;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562385;STB=0.53071;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=-0.000433485;OID=.;OPOS=121981950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:21:21:37:37:0.637931:19:18:12:9:19:18:12:9
chr2	121989489	.	G	A	436.92	PASS	AF=0.413223;AO=49;DP=120;FAO=50;FDP=121;FR=.;FRO=71;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=46;FWDB=0.0782199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.379;QD=14.4438;RBI=0.0783006;REFB=0.00243163;REVB=-0.00355416;RO=71;SAF=25;SAR=24;SRF=25;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165879;STB=0.586743;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.00190281;OID=.;OPOS=121989489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:71:71:49:50:0.413223:24:25:25:46:25:25:25:46
chr2	122096257	.	C	T	423.87	PASS	AF=0.472527;AO=42;DP=90;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.0179031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.117;QD=18.6314;RBI=0.0298554;REFB=-0.039107;REVB=0.0238919;RO=48;SAF=23;SAR=19;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116524;STB=0.570508;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.042307;OID=.;OPOS=122096257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:48:48:42:43:0.472527:19:23:32:16:20:23:32:16
chr2	122098360	.	G	A	477.87	PASS	AF=0.484536;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=11;FWDB=-0.000666371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.57;QD=19.7059;RBI=0.00171412;REFB=-0.0108964;REVB=0.00157929;RO=50;SAF=33;SAR=14;SRF=39;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902926;STB=0.549898;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.00992288;OID=.;OPOS=122098360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:50:50:47:47:0.484536:14:33:39:11:14:33:39:11
chr2	122216419	.	A	G	668.22	PASS	AF=0.623656;AO=58;DP=93;FAO=58;FDP=93;FR=.;FRO=35;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.030885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.931;QD=28.7406;RBI=0.0403643;REFB=0.00822737;REVB=0.0259883;RO=35;SAF=37;SAR=21;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144684;STB=0.507857;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=-0.00573169;OID=.;OPOS=122216419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:35:35:58:58:0.623656:21:37:23:12:21:37:23:12
chr2	122288498	.	A	G	237.85	PASS	AF=0.353659;AO=29;DP=82;FAO=29;FDP=82;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.00488707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.139;QD=11.6024;RBI=0.0204474;REFB=-0.0134296;REVB=-0.0198548;RO=50;SAF=16;SAR=13;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570558;STB=0.515244;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0283415;OID=.;OPOS=122288498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:50:53:29:29:0.353659:13:16:25:25:13:16:28:25
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chr2	122484976	.	G	A	164.25	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0151268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.435;QD=13.6879;RBI=0.0295903;REFB=-0.00296493;REVB=-0.0254316;RO=30;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598383;STB=0.534845;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0128643;OID=.;OPOS=122484976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:8:10:15:15:8:10:15:15
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chr2	125192068	.	T	C	267.55	PASS	AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.00212864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.205;QD=13.7204;RBI=0.0223929;REFB=-0.00139093;REVB=0.0222915;RO=47;SAF=23;SAR=8;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310566;STB=0.678163;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00158674;OID=.;OPOS=125192068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:47:47:31:31:0.397436:8:23:22:25:8:23:22:25
chr2	125746817	.	A	G	222.8	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0343826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5039;QD=18.9615;RBI=0.0798515;REFB=0.00674984;REVB=0.0720701;RO=24;SAF=9;SAR=13;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046491;STB=0.538426;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=-0.0058006;OID=.;OPOS=125746817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:25:22:22:0.468085:13:9:11:13:13:9:12:13
chr2	127453664	.	A	C	157.25	PASS	AF=0.396226;AO=13;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0307317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.9594;QD=11.868;RBI=0.0307909;REFB=-0.072328;REVB=0.00190779;RO=24;SAF=11;SAR=2;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444473;STB=0.591897;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.127044;OID=.;OPOS=127453664;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:24:32:13:21:0.396226:2:11:12:12:8:13:15:17
chr2	127816695	.	C	T	133.94	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0180894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3215;QD=16.235;RBI=0.0764235;REFB=0.00665192;REVB=0.0742518;RO=18;SAF=10;SAR=5;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607709;STB=0.534838;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=-0.00401224;OID=.;OPOS=127816695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:5:10:13:5:5:10:13:5
chr2	127821207	.	G	A	376.22	PASS	AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.00989162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.742;QD=21.1954;RBI=0.0275457;REFB=-0.019841;REVB=0.0257084;RO=31;SAF=16;SAR=22;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558915;STB=0.527593;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0203057;OID=.;OPOS=127821207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:31:33:38:38:0.535211:22:16:11:20:22:16:12:21
chr2	127826533	.	A	G	621.19	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00106849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.966;QD=59.1611;RBI=0.0338304;REFB=0;REVB=0.0338135;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015495;OID=.;OPOS=127826533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:42:42:0:0:42:42:1:26:16:0:0:26:16:0:0
chr2	127839434	.	C	T	192.39	PASS	AF=0.324675;AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=77;FR=.;FRO=52;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=35;FWDB=-0.0298007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.166;QD=9.99401;RBI=0.0503373;REFB=-0.0221765;REVB=0.040568;RO=52;SAF=5;SAR=20;SRF=17;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194032;STB=0.615283;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0310103;OID=.;OPOS=127839434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:52:52:25:25:0.324675:20:5:17:35:20:5:17:35
chr2	127944952	.	ATG	ATGA,TGA	41.23	PASS	AF=0.19403,0;AO=8,3;DP=69;FAO=13,0;FDP=67;FR=.;FRO=54;FSAF=12,0;FSAR=1,0;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.040908,-0.0365456;FXX=0;HRUN=0,4;LEN=1,3;MLLD=48.8819,55.446;QD=2.46132;RBI=0.0426187,0.0398358;REFB=-0.00741955,-0.00573391;REVB=-0.0119537,-0.0158526;RO=55;SAF=7,3;SAR=1,0;SRF=32;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.408279,0.41964;STB=0.869402,0.5;STBP=0.008,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.140645,0.0226646;OID=.,.;OPOS=127944955,127944952;OREF=-,ATG;OALT=A,TGA;OMAPALT=ATGA,TGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:69:67:55:54:8,3:13,0:0.19403,0:1,0:7,3:32:23:1,0:12,0:31:23
chr2	127953054	.	A	C	220.92	PASS	AF=0.583333;AO=20;DP=35;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.022398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.486;QD=24.5465;RBI=0.0317442;REFB=-0.0384654;REVB=0.022495;RO=15;SAF=10;SAR=10;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127962;STB=0.559944;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0281258;OID=.;OPOS=127953054;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:15:15:20:21:0.583333:10:10:5:10:11:10:5:10
chr2	128065066	.	CTTTTTTT	ACTTTTTT,CTTTTTT,CTTTTTTA,TCTTTTTT	208.56	PASS	AF=0,0.964286,0,0;AO=3,16,3,5;DP=66;FAO=0,54,0,0;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=0,15,0,0;FSAR=0,39,0,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0242058,-0.0796474,0.0301032,0.0166892;FXX=0.176445;HRUN=1,7,7,1;LEN=2,1,1,2;MLLD=97.3299,7.17192,12.7244,24.4109;QD=14.8971;RBI=0.0266719,0.279121,0.05315,0.0219251;REFB=-0.0051222,0.0062948,-0.0228206,0.0137688;REVB=-0.0112014,0.267516,0.0438032,-0.014219;RO=20;SAF=0,10,0,0;SAR=3,6,3,5;SRF=3;SRR=17;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.487768,0.436467,-0.487768,-0.598357;STB=0.5,0.531238,0.5,0.5;STBP=1,0.051,1,1;TYPE=mnp,del,snp,mnp;VARB=0,0.0216946,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=128065066,128065067,128065073,128065066;OREF=CT,T,T,CT;OALT=AC,-,A,TC;OMAPALT=ACTTTTTT,CTTTTTT,CTTTTTTA,TCTTTTTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:14:66:56:20:2:3,16,3,5:0,54,0,0:0,0.964286,0,0:3,6,3,5:0,10,0,0:3:17:0,39,0,0:0,15,0,0:2:0
chr2	128065075	.	TAAAAAA	TAAAAA,TAAAAAT,TATAAAA	156.87	PASS	AF=0.507246,0.0434783,0;AO=17,4,4;DP=68;FAO=35,3,0;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=13,3,0;FSAR=22,0,0;FSRF=7;FSRR=24;FWDB=-0.166555,-0.0490515,-0.0530901;FXX=0.028165;HRUN=6,6,6;LEN=1,1,1;MLLD=9.5219,101.875,179.974;QD=9.09377;RBI=0.186822,0.0492453,0.0540055;REFB=-0.0432766,-0.00236247,0.00145191;REVB=0.0846273,-0.0043645,-0.00990127;RO=24;SAF=4,4,3;SAR=13,0,1;SRF=5;SRR=19;SSEN=0,0,0;SSEP=0.456311,0,0;SSSB=0.0389656,0.752287,0.568831;STB=0.576067,0.998042,0.5;STBP=0.247,0.006,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0717288,0.113717,0;OID=.,.,.;OPOS=128065076,128065081,128065077;OREF=A,A,A;OALT=-,T,T;OMAPALT=TAAAAA,TAAAAAT,TATAAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.507246,0.0434783,0:17,4,4:68:35,3,0:69:31:13,3,0:22,0,0:7:24:99:24:4,4,3:13,0,1:5:19
chr2	128180872	.	G	T	525.16	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00371883;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.257;QD=60.0182;RBI=0.16084;REFB=0;REVB=0.160797;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122403;OID=.;OPOS=128180872;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
chr2	128321770	.	G	A	1663.51	PASS	AF=0.982759;AO=112;DP=117;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0275409;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.716;QD=57.3624;RBI=0.0332545;REFB=0.0288455;REVB=0.0186375;RO=2;SAF=48;SAR=64;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00242758;STB=0.501074;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=-9.61204e-05;OID=.;OPOS=128321770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:117:116:2:2:112:114:0.982759:64:48:1:1:64:50:1:1
chr2	128381808	.	C	T	748.84	PASS	AF=0.38326;AO=87;DP=227;FAO=87;FDP=227;FR=.;FRO=140;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=68;FSRR=72;FWDB=-0.00846475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.917;QD=13.1953;RBI=0.0179497;REFB=-0.00852314;REVB=-0.0158285;RO=128;SAF=52;SAR=35;SRF=68;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721017;STB=0.569832;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0190561;OID=.;OPOS=128381808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:227:227:128:140:87:87:0.38326:35:52:68:60:35:52:68:72
chr2	128385224	.	C	G	461.05	PASS	AF=0.535714;AO=44;DP=82;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=36;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.0221055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.8986;QD=21.955;RBI=0.0353324;REFB=-0.0158056;REVB=-0.0275631;RO=38;SAF=35;SAR=9;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130461;STB=0.586625;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0140014;OID=.;OPOS=128385224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:84:38:39:44:45:0.535714:9:35:26:12:9:36:26:13
chr2	128385244	.	T	C	353.41	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0136919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.425;QD=18.6005;RBI=0.0234442;REFB=-0.00740797;REVB=-0.0190306;RO=35;SAF=26;SAR=10;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394752;STB=0.532854;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00703667;OID=.;OPOS=128385244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:35:38:36:38:0.5:10:26:24:11:10:28:26:12
chr2	128390835	.	CGGGGC	CGGG,CGGGC	430.06	PASS	AF=0.0175439,0.982456;AO=11,32;DP=57;FAO=1,56;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=1,35;FSAR=0,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.108114,0.0729105;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=7.46364,11.4131;QD=30.1795;RBI=0.161034,0.29424;REFB=-0.0257151,-0.0289076;REVB=0.119345,0.285063;RO=10;SAF=10,23;SAR=1,9;SRF=3;SRR=7;SSEN=0.418605,0.418605;SSEP=0,0;SSSB=0.609152,0.204421;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.0269933,0.0152096;OID=.,.;OPOS=128390839,128390836;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=CGGG,CGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0.0175439,0.982456:11,32:57:1,56:57:0:1,35:0,21:0:0:5:10:10,23:1,9:3:7
chr2	128394758	.	T	C	616.48	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327837;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.903;QD=61.6478;RBI=0.0510353;REFB=0;REVB=0.039113;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120019;OID=.;OPOS=128394758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr2	128394876	.	C	T	42.2	PASS	AF=0.12;AO=9;DP=78;FAO=9;FDP=75;FR=.;FRO=66;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=-0.0211206;FXX=0.0384566;HRUN=7;LEN=1;MLLD=274.525;QD=2.25053;RBI=0.0267408;REFB=0.00263404;REVB=-0.0164009;RO=66;SAF=3;SAR=6;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30188;STB=0.71749;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.0196479;OID=.;OPOS=128394876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:78:75:66:66:9:9:0.12:6:3:39:27:6:3:39:27
chr2	128394877	.	C	T	873.07	PASS	AF=0.835443;AO=66;DP=80;FAO=66;FDP=79;FR=.;FRO=13;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.020738;FXX=0.0124984;HRUN=7;LEN=1;MLLD=245.404;QD=44.2062;RBI=0.0235968;REFB=-0.114155;REVB=0.011258;RO=13;SAF=40;SAR=26;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942737;STB=0.550299;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00270113;OID=.;OPOS=128394877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:80:79:13:13:66:66:0.835443:26:40:4:9:26:40:4:9
chr2	128394955	.	A	G	278.84	PASS	AF=0.455882;AO=30;DP=67;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0393028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.384;QD=16.4023;RBI=0.041393;REFB=-0.0301167;REVB=-0.0129871;RO=37;SAF=19;SAR=11;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223904;STB=0.61283;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0364485;OID=.;OPOS=128394955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:37:37:30:31:0.455882:11:19:15:22:12:19:15:22
chr2	128396037	.	C	CAACA	355.46	PASS	AF=0.486842;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0299415;FXX=0.0256377;HRUN=2;LEN=4;MLLD=228.921;QD=18.7087;RBI=0.038187;REFB=-0.0299687;REVB=-0.0237014;RO=43;SAF=21;SAR=16;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135486;STB=0.511622;STBP=0.845;TYPE=ins;VARB=0.0324974;OID=.;OPOS=128396038;OREF=-;OALT=AACA;OMAPALT=CAACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.486842:37:81:37:76:39:21:16:23:16:99:43:21:16:25:18
chr2	128396059	.	C	G	359.26	PASS	AF=0.457831;AO=37;DP=82;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.00763868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.059;QD=17.3138;RBI=0.0238417;REFB=-0.0169524;REVB=0.0225849;RO=45;SAF=20;SAR=17;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103476;STB=0.564627;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0236555;OID=.;OPOS=128396059;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:45:45:37:38:0.457831:17:20:29:16:18:20:29:16
chr2	128400608	.	C	T	331.88	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00824508;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9694;QD=18.9645;RBI=0.0385527;REFB=-0.0431581;REVB=-0.0376607;RO=34;SAF=18;SAR=18;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514616;STB=0.514301;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0224282;OID=.;OPOS=128400608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:34:35:36:35:0.5:18:18:15:19:18:17:16:19
chr2	128401091	.	A	G	240.48	PASS	AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00724192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.676;QD=21.3758;RBI=0.0074517;REFB=-0.0178616;REVB=0.0017557;RO=22;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605424;STB=0.533951;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0208197;OID=.;OPOS=128401091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:12:11:9:13:12:11:9:13
chr2	128412554	.	A	G	156.89	PASS	AF=0.435897;AO=15;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0328181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.381;QD=16.0912;RBI=0.0459055;REFB=-0.0202917;REVB=-0.0320982;RO=22;SAF=4;SAR=11;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645949;STB=0.521714;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.034306;OID=.;OPOS=128412554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:15:17:0.435897:11:4:7:15:11:6:7:15
chr2	128460956	.	G	A	765.57	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.208;QD=63.7972;RBI=0.0383493;REFB=0;REVB=0.0139847;RO=0;SAF=37;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30556e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115013;OID=.;OPOS=128460956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:48:0:0:45:48:1:8:37:0:0:8:40:0:0
chr2	128495645	.	G	A	255.55	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0307942;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.26;QD=22.7153;RBI=0.0323832;REFB=-0.00154478;REVB=-0.0100194;RO=20;SAF=11;SAR=13;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174554;STB=0.582165;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.00133839;OID=.;OPOS=128495645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:21:24:24:0.533333:13:11:5:15:13:11:6:15
chr2	128526579	.	T	TTAAA	123.44	PASS	AF=0.684211;AO=8;DP=64;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0112304;FXX=0.049975;HRUN=2;LEN=4;MLLD=141.3;QD=25.9868;RBI=0.0397117;REFB=-0.109799;REVB=0.0380907;RO=55;SAF=3;SAR=5;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202568;STB=0.639787;STBP=0.105;TYPE=ins;VARB=0.0420465;OID=.;OPOS=128526580;OREF=-;OALT=TAAA;OMAPALT=TTAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.684211:8:64:13:19:6:5:8:5:1:32:55:3:5:30:25
chr2	128608184	.	C	T	263.15	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0220893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.309;QD=26.3153;RBI=0.0248805;REFB=-0.0301172;REVB=0.0114501;RO=15;SAF=9;SAR=15;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823801;STB=0.554751;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0629889;OID=.;OPOS=128608184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:15:16:24:24:0.6:15:9:4:11:15:9:4:12
chr2	128757995	.	A	C	413.68	PASS	AF=0.427273;AO=47;DP=110;FAO=47;FDP=110;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=-0.000210515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.913;QD=15.0429;RBI=0.0112126;REFB=-0.0187277;REVB=-0.0112106;RO=62;SAF=19;SAR=28;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049244;STB=0.532896;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0240848;OID=.;OPOS=128757995;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:62:63:47:47:0.427273:28:19:28:34:28:19:29:34
chr2	128849114	.	T	C	474.62	PASS	AF=0.628571;AO=44;DP=70;FAO=44;FDP=70;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.0347981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.304;QD=27.1214;RBI=0.0454298;REFB=-0.0357729;REVB=0.0292055;RO=26;SAF=17;SAR=27;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573918;STB=0.531236;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0212207;OID=.;OPOS=128849114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:26:26:44:44:0.628571:27:17:8:18:27:17:8:18
chr2	128870808	.	T	C	120.83	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.00705031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.587;QD=14.6456;RBI=0.0172384;REFB=-0.0103133;REVB=-0.0157307;RO=19;SAF=8;SAR=6;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232159;STB=0.632857;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0193461;OID=.;OPOS=128870808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:6:8:15:4:6:8:15:4
chr2	128878014	.	G	A	270.26	PASS	AF=0.538462;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.102333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8966;QD=20.7891;RBI=0.102385;REFB=0.0048258;REVB=-0.00324256;RO=21;SAF=9;SAR=19;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238315;STB=0.607479;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.0142202;OID=.;OPOS=128878014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:21:24:28:28:0.538462:19:9:13:8:19:9:13:11
chr2	128934400	.	T	C	606.24	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.502;QD=60.6236;RBI=0.047762;REFB=0;REVB=0.0459923;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128777;OID=.;OPOS=128934400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:17:22:0:0:18:22:0:0
chr2	128939817	.	G	A	1661.28	PASS	AF=1;AO=109;DP=110;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.073331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.0584;QD=59.3316;RBI=0.0909664;REFB=-0.0728392;REVB=0.0538279;RO=1;SAF=66;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109111;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142296;OID=.;OPOS=128939817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:110:112:1:0:109:112:1:43:66:0:1:44:68:0:0
chr2	129023201	.	G	T	34.06	PASS	AF=0.0826446;AO=10;DP=121;FAO=10;FDP=121;FR=.;FRO=111;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=61;FSRR=50;FWDB=-0.0351108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.495;QD=1.12583;RBI=0.035232;REFB=-0.000245192;REVB=-0.00291965;RO=110;SAF=6;SAR=4;SRF=61;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522465;STB=0.547202;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.00204681;OID=.;OPOS=129023201;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:121:121:110:111:10:10:0.0826446:4:6:61:49:4:6:61:50
chr2	129023277	.	GTTTTG	GTTTCT,GTTTTC	434.48	PASS	AF=0,0.573529;AO=3,29;DP=69;FAO=0,39;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=0,21;FSAR=0,18;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=-0.138151,-0.0515289;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=2,1;MLLD=39.3633,46.5865;QD=25.5575;RBI=0.147591,0.0749418;REFB=-0.0560879,-0.0255019;REVB=0.0519372,0.0544155;RO=16;SAF=3,12;SAR=0,17;SRF=0;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.854465,0.295393;STB=0.5,0.62915;STBP=1,0.007;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0403683;OID=.,.;OPOS=129023281,129023282;OREF=TG,G;OALT=CT,C;OMAPALT=GTTTCT,GTTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.573529:3,29:69:0,39:68:15:0,21:0,18:1:14:93:16:3,12:0,17:0:16
chr2	129075877	.	G	T	92.98	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.00372504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.448;QD=9.53618;RBI=0.00436354;REFB=-0.00370851;REVB=0.00227257;RO=27;SAF=6;SAR=6;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235721;STB=0.640809;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0115353;OID=.;OPOS=129075877;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:6:6:19:8:6:6:19:8
chr2	130738163	.	G	A	169.72	PASS	AF=0.45;AO=17;DP=39;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0061616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.931;QD=16.972;RBI=0.0203286;REFB=-0.0111346;REVB=0.0193723;RO=22;SAF=12;SAR=5;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279872;STB=0.526996;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0163377;OID=.;OPOS=130738163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:22:22:17:18:0.45:5:12:15:7:5:13:15:7
chr2	130738329	.	C	A	73.41	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0121117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.72;QD=9.47168;RBI=0.0982905;REFB=0.0096846;REVB=0.0975414;RO=20;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222398;STB=0.644895;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=-0.0153961;OID=.;OPOS=130738329;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:20:21:10:10:0.322581:5:5:6:14:5:5:6:15
chr2	130739164	.	A	G	352.44	PASS	AF=0.480519;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.006245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.599;QD=18.3088;RBI=0.00653348;REFB=0.00364173;REVB=-0.00191996;RO=39;SAF=24;SAR=13;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222582;STB=0.618403;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00457709;OID=.;OPOS=130739164;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:39:40:37:37:0.480519:13:24:16:23:13:24:17:23
chr2	130739444	.	TGAAGACGGAAGACGGAAGA	TGAAGACGGAAGA,TGAAGACGGAAGACGGAAAC	259.12	PASS	AF=0.9,0.1;AO=16,2;DP=21;FAO=18,2;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6,2;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401391,0.0428649;FXX=0.0908678;HRUN=1,1;LEN=7,2;MLLD=256.669,354.517;QD=51.8232;RBI=0.0492962,0.0733652;REFB=0,0;REVB=0.0286176,-0.0595404;RO=0;SAF=5,2;SAR=11,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.36667e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00163721,-0.00452228;OID=.,.;OPOS=130739445,130739462;OREF=GAAGACG,GA;OALT=-,AC;OMAPALT=TGAAGACGGAAGA,TGAAGACGGAAGACGGAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.9,0.1:16,2:21:18,2:20:0:6,2:12,0:0:0:11:0:5,2:11,0:0:0
chr2	130739646	.	TTAAC	T	75.05	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00139133;FXX=0.111049;HRUN=3;LEN=4;MLLD=279.402;QD=18.7621;RBI=0.03887;REFB=-0.0261644;REVB=-0.0388451;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238988;STB=0.608447;STBP=0.402;TYPE=del;VARB=0.0331589;OID=.;OPOS=130739647;OREF=TAAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5625:9:18:9:16:7:6:3:3:4:51:8:6:3:3:5
chr2	130739802	.	A	G	196.23	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0171772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.434;QD=18.2543;RBI=0.0179824;REFB=-0.0123755;REVB=0.00532093;RO=23;SAF=5;SAR=15;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113971;STB=0.565149;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.00586932;OID=.;OPOS=130739802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:15:5:8:15:15:5:8:15
chr2	130739891	.	T	A	363.28	PASS	AF=0.475;AO=36;DP=78;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.0012345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.803;QD=18.1642;RBI=0.00198977;REFB=-0.00905047;REVB=-0.00156051;RO=42;SAF=16;SAR=20;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053663;STB=0.527763;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.00801441;OID=.;OPOS=130739891;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:80:42:42:36:38:0.475:20:16:21:21:21:17:21:21
chr2	130740230	.	C	T	271.27	PASS	AF=0.402597;AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.025259;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.38;QD=14.0921;RBI=0.0409115;REFB=-0.00654358;REVB=-0.0321828;RO=46;SAF=18;SAR=13;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542501;STB=0.530823;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00942882;OID=.;OPOS=130740230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:77:46:46:31:31:0.402597:13:18:29:17:13:18:29:17
chr2	130866805	.	C	G	34.01	PASS	AF=0.171429;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00970066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7707;QD=3.88707;RBI=0.0129142;REFB=-0.00196817;REVB=0.00852484;RO=29;SAF=3;SAR=3;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615238;STB=0.542716;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0124159;OID=.;OPOS=130866805;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:35:35:29:29:6:6:0.171429:3:3:13:16:3:3:13:16
chr2	130949411	.	G	T	113.36	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00287621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.686;QD=41.2206;RBI=0.0188656;REFB=0;REVB=0.0186451;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130646;OID=.;OPOS=130949411;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:10:11:1:8:2:0:0:9:2:0:0
chr2	130951548	.	G	A	1190.46	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.205;QD=61.0492;RBI=0.0529093;REFB=0;REVB=0.0490437;RO=0;SAF=51;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123438;OID=.;OPOS=130951548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:27:51:0:0:27:51:0:0
chr2	130951566	.	G	A	1120.41	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173639;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.463;QD=60.5625;RBI=0.0659766;REFB=0;REVB=0.0636507;RO=0;SAF=51;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305881;OID=.;OPOS=130951566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:23:51:0:0:23:51:0:0
chr2	131097236	.	G	A	249.47	PASS	AF=0.402778;AO=28;DP=71;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.00657102;FXX=0.0136968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.295;QD=13.8592;RBI=0.0154152;REFB=-0.0204131;REVB=0.0139445;RO=42;SAF=18;SAR=10;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203064;STB=0.594109;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0309797;OID=.;OPOS=131097236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:42:43:28:29:0.402778:10:18:19:23:11:18:20:23
chr2	131128207	.	G	A	736.06	PASS	AF=0.529851;AO=68;DP=130;FAO=71;FDP=134;FR=.;FRO=63;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=0.0441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5242;QD=21.9721;RBI=0.0595259;REFB=-0.00940276;REVB=0.0399815;RO=62;SAF=35;SAR=33;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856354;STB=0.532249;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.010325;OID=.;OPOS=131128207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:134:62:63:68:71:0.529851:33:35:38:24:33:38:38:25
chr2	131266530	.	C	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0661577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.572;QD=37.4885;RBI=0.066583;REFB=0;REVB=-0.00751403;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000901122;OID=.;OPOS=131266530;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr2	131369330	.	C	T	79.69	PASS	AF=0.244444;AO=11;DP=45;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0353778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.893;QD=7.08388;RBI=0.0648399;REFB=-0.0140488;REVB=-0.0543381;RO=34;SAF=7;SAR=4;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609465;STB=0.538391;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.040915;OID=.;OPOS=131369330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:45:45:34:34:11:11:0.244444:4:7:20:14:4:7:20:14
chr2	131414176	.	C	T	323.67	PASS	AF=0.4;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=-0.057413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5638;QD=14.3855;RBI=0.1391;REFB=-0.0232857;REVB=-0.126698;RO=52;SAF=17;SAR=19;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188442;STB=0.604595;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0297182;OID=.;OPOS=131414176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:52:54:36:36:0.4:19:17:34:18:19:17:35:19
chr2	131487673	.	A	C	1026.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00170408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.864;QD=59.5018;RBI=0.0138649;REFB=0;REVB=-0.0137598;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.46149e-05;OID=.;OPOS=131487673;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:34:35:0:0:34:35:0:0
chr2	131520663	.	T	C	998.36	PASS	AF=1;AO=64;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00369819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.305;QD=58.7269;RBI=0.0165568;REFB=0;REVB=0.0161385;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.59319e-05;OID=.;OPOS=131520663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:64:68:1:34:30:0:0:36:32:0:0
chr2	131672950	.	A	G	296.41	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.118236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.414;QD=49.4018;RBI=0.128333;REFB=-0.244194;REVB=0.0498951;RO=1;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319244;STB=0.517226;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00278588;OID=.;OPOS=131672950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:1:1:23:23:0.958333:14:9:0:1:14:9:0:1
chr2	131674285	.	A	G	671.28	PASS	AF=0.943396;AO=50;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.017651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.012;QD=50.6628;RBI=0.0260097;REFB=-0.0231253;REVB=0.0191037;RO=2;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348399;STB=0.508317;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.000123545;OID=.;OPOS=131674285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:53:53:2:3:50:50:0.943396:26:24:0:2:26:24:1:2
chr2	132044992	.	T	C	43.69	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0182851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5921;QD=21.8429;RBI=0.14546;REFB=-0.116197;REVB=-0.144307;RO=1;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789211;STB=0.624528;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0251515;OID=.;OPOS=132044992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:1:2:6:6:0.75:1:5:1:0:1:5:1:1
chr2	132137239	.	C	T	1520.38	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00185187;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.048;QD=63.3493;RBI=0.0428244;REFB=0;REVB=0.0427844;RO=0;SAF=56;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.61993e-05;OID=.;OPOS=132137239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:95:96:1:39:56:0:0:39:57:0:0
chr2	132140090	.	A	C	1862.0	PASS	AF=0.954545;AO=125;DP=133;FAO=126;FDP=132;FR=.;FRO=6;FSAF=70;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0188502;FXX=0.00751823;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.0913;QD=56.4242;RBI=0.137302;REFB=-0.226105;REVB=0.136002;RO=4;SAF=70;SAR=55;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033303;STB=0.510202;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00966183;OID=.;OPOS=132140090;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:133:132:4:6:125:126:0.954545:55:70:0:4:56:70:2:4
chr2	132140200	.	C	A,G	2764.04	PASS	AF=0.950549,0.043956;AO=172,8;DP=182;FAO=173,8;FDP=182;FR=.;FRO=1;FSAF=67,8;FSAR=106,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00423907,-0.00241198;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=223.379,156.412;QD=60.7481;RBI=0.00841043,0.00925722;REFB=-0.0960903,-0.0683515;REVB=0.00726399,0.00893747;RO=1;SAF=66,8;SAR=106,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00715695,0;STB=0.503703,0.5;STBP=0.268,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00010313,0.00885538;OID=.,.;OPOS=132140200,132140200;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:182:182:1:1:172,8:173,8:0.950549,0.043956:106,0:66,8:1:0:106,0:67,8:1:0
chr2	132141767	.	A	G	803.95	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00765124;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.403;QD=57.4251;RBI=0.0241185;REFB=0;REVB=0.0228727;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.37235e-05;OID=.;OPOS=132141767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr2	132200256	.	T	C	165.01	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00215904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.082;QD=14.0432;RBI=0.0722354;REFB=-0.0113163;REVB=-0.0722032;RO=29;SAF=7;SAR=11;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208556;STB=0.621042;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0308801;OID=.;OPOS=132200256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:11:7:17:12:11:7:17:12
chr2	132200307	.	G	A	102.05	PASS	AF=0.270833;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0302965;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.059;QD=8.50447;RBI=0.0303274;REFB=-0.0213927;REVB=-0.00136876;RO=32;SAF=10;SAR=3;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307128;STB=0.666389;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0598479;OID=.;OPOS=132200307;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:32:35:13:13:0.270833:3:10:17:15:3:10:20:15
chr2	132200345	.	C	T	180.09	PASS	AF=0.353846;AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.00937505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.862;QD=11.0821;RBI=0.0339314;REFB=-0.0268603;REVB=-0.0326106;RO=42;SAF=16;SAR=7;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372907;STB=0.52172;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0405274;OID=.;OPOS=132200345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:42:42:23:23:0.353846:7:16:28:14:7:16:28:14
chr2	132200529	.	A	G	161.24	PASS	AF=0.314286;AO=22;DP=65;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.104172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.4423;QD=9.2135;RBI=0.114107;REFB=-0.0100414;REVB=-0.0465665;RO=43;SAF=12;SAR=10;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120275;STB=0.526292;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0126995;OID=.;OPOS=132200529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:70:43:48:22:22:0.314286:10:12:23:20:10:12:28:20
chr2	132200568	.	C	T	237.68	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00383334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.519;QD=18.6416;RBI=0.0311709;REFB=-0.0150828;REVB=0.0309343;RO=26;SAF=16;SAR=9;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607617;STB=0.534196;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0149754;OID=.;OPOS=132200568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:9:16:15:11:9:16:15:11
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chr2	132200995	.	C	T	42.63	PASS	AF=0.205882;AO=7;DP=34;FAO=7;FDP=34;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0501627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5153;QD=5.01566;RBI=0.0535968;REFB=-0.00765491;REVB=0.0188764;RO=27;SAF=1;SAR=6;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.417836;STB=0.786946;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0254111;OID=.;OPOS=132200995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:34:34:27:27:7:7:0.205882:6:1:12:15:6:1:12:15
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chr2	132201862	.	C	G	403.25	PASS	AF=0.4375;AO=42;DP=96;FAO=42;FDP=96;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.000595026;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.767;QD=16.802;RBI=0.00272702;REFB=-0.00139873;REVB=-0.00266131;RO=54;SAF=15;SAR=27;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166236;STB=0.593513;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00195835;OID=.;OPOS=132201862;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:54:54:42:42:0.4375:27:15:28:26:27:15:28:26
chr2	132201889	.	C	A	404.03	PASS	AF=0.451613;AO=41;DP=93;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.0472702;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0541;QD=17.3774;RBI=0.0490606;REFB=-0.0336877;REVB=0.0131327;RO=50;SAF=13;SAR=28;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151166;STB=0.580113;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0297184;OID=.;OPOS=132201889;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:50:51:41:42:0.451613:28:13:23:27:28:14:24:27
chr2	132201930	.	T	C	353.72	PASS	AF=0.486842;AO=25;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0633165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2242;QD=18.6167;RBI=0.0633212;REFB=0.000540576;REVB=-0.000770264;RO=36;SAF=10;SAR=15;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104857;STB=0.650264;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00125255;OID=.;OPOS=132201930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:36:39:25:37:0.486842:15:10:18:18:27:10:21:18
chr2	132229720	.	T	C	127.68	PASS	AF=0.290323;AO=18;DP=62;FAO=18;FDP=62;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=33;FWDB=-0.0108999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.092;QD=8.23762;RBI=0.0158445;REFB=-0.0042699;REVB=0.0114996;RO=43;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427446;STB=0.740511;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0146841;OID=.;OPOS=132229720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:43:44:18:18:0.290323:7:11:10:33:7:11:11:33
chr2	132237983	.	A	G	82.39	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00657369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.455;QD=36.6167;RBI=0.0713715;REFB=0;REVB=0.0710681;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00484983;OID=.;OPOS=132237983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:3:5:0:0:4:5:0:0
chr2	132248379	.	T	G	787.3	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.065252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.78;QD=55.249;RBI=0.085119;REFB=-0.157913;REVB=-0.0546573;RO=1;SAF=28;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165422;STB=0.508769;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00139329;OID=.;OPOS=132248379;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:57:57:1:1:56:56:0.982456:28:28:1:0:28:28:1:0
chr2	132248581	.	ACTT	ACT,ACTC,CACT	455.32	PASS	AF=0.205882,0.764706,0.0294118;AO=6,23,3;DP=34;FAO=7,26,1;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=2,10,0;FSAR=5,16,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0688261,-0.141084,-0.0786227;FXX=0;HRUN=2,2,1;LEN=1,1,3;MLLD=21.3062,26.7741,7.16108;QD=53.5667;RBI=0.133195,0.177457,0.109668;REFB=0,0,0;REVB=-0.114034,-0.107641,-0.076456;RO=0;SAF=2,9,0;SAR=4,14,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,4.84921e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,mnp;VARB=-0.0207069,0.0298257,-0.0123518;OID=.,.,.;OPOS=132248583,132248584,132248581;OREF=T,T,ACT;OALT=-,C,CAC;OMAPALT=ACT,ACTC,CACT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:34:34:0:0:6,23,3:7,26,1:0.205882,0.764706,0.0294118:4,14,3:2,9,0:0:0:5,16,1:2,10,0:0:0
chr2	132266142	.	G	C	2076.26	PASS	AF=1;AO=132;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00778678;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.029;QD=62.4439;RBI=0.0182476;REFB=0;REVB=0.0165028;RO=0;SAF=69;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.68899e-05;OID=.;OPOS=132266142;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:133:0:0:132:133:1:63:69:0:0:64:69:0:0
chr2	132274474	.	G	A	1858.78	PASS	AF=0.991935;AO=122;DP=125;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0378794;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.22;QD=59.9607;RBI=0.0646695;REFB=-0.0644025;REVB=0.0524146;RO=1;SAF=55;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0085593;STB=0.504424;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000382907;OID=.;OPOS=132274474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:125:124:1:1:122:123:0.991935:67:55:1:0:67:56:1:0
chr2	132275343	.	G	T	1435.33	PASS	AF=0.95283;AO=100;DP=106;FAO=101;FDP=106;FR=.;FRO=5;FSAF=58;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00878135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6324;QD=54.1632;RBI=0.014334;REFB=-0.0756246;REVB=0.0113292;RO=5;SAF=57;SAR=43;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156028;STB=0.517952;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0163881;OID=.;OPOS=132275343;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:106:106:5:5:100:101:0.95283:43:57:2:3:43:58:1:4
chr2	132275396	.	T	C	1632.36	PASS	AF=1;AO=107;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170513;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.041;QD=60.4579;RBI=0.0232173;REFB=0;REVB=0.0157575;RO=0;SAF=47;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71637e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17055e-05;OID=.;OPOS=132275396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:108:0:0:107:108:1:60:47:0:0:60:48:0:0
chr2	132276741	.	T	C	124.08	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00575814;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9226;QD=14.5982;RBI=0.159474;REFB=-0.0424118;REVB=-0.15937;RO=17;SAF=4;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297983;STB=0.663474;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.041321;OID=.;OPOS=132276741;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:20:14:14:0.411765:10:4:10:7:10:4:11:9
chr2	132277686	.	C	T	289.31	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2137;QD=52.6014;RBI=0.0295634;REFB=0;REVB=-0.0256482;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172777;OID=.;OPOS=132277686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr2	132277962	.	T	C	1025.87	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.119585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3479;QD=59.4706;RBI=0.119613;REFB=0;REVB=-0.00257569;RO=0;SAF=40;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00093229;OID=.;OPOS=132277962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:29:40:0:0:29:40:0:0
chr2	132277984	.	G	A	920.89	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.096018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.515;QD=58.4692;RBI=0.0973815;REFB=0;REVB=0.0162389;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.25065e-05;OID=.;OPOS=132277984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:28:34:0:0:28:35:0:0
chr2	132286046	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.383;QD=39.2068;RBI=0.0690481;REFB=0;REVB=0.0588316;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00126093;OID=.;OPOS=132286046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr2	132286061	.	A	G	101.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1989;QD=40.7605;RBI=0.062007;REFB=0;REVB=-0.0427026;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127593;OID=.;OPOS=132286061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr2	132287143	.	A	T	265.35	PASS	AF=0.392405;AO=31;DP=79;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=0.0028312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.789;QD=13.4356;RBI=0.0163544;REFB=-0.0144232;REVB=-0.0161075;RO=48;SAF=6;SAR=25;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201619;STB=0.616509;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0245722;OID=.;OPOS=132287143;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:48:48:31:31:0.392405:25:6:16:32:25:6:16:32
chr2	132287824	.	C	T	885.38	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.989;QD=58.0574;RBI=0.0517957;REFB=0;REVB=0.0454418;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108851;OID=.;OPOS=132287824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:25:36:0:0:25:36:0:0
chr2	132909843	.	T	C	481.65	PASS	AF=0.468468;AO=52;DP=111;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=0.0315182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.966;QD=17.3567;RBI=0.0326415;REFB=0.00103806;REVB=0.00848935;RO=59;SAF=35;SAR=17;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488665;STB=0.52722;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=-0.000650634;OID=.;OPOS=132909843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:59:59:52:52:0.468468:17:35:37:22:17:35:37:22
chr2	133010786	.	C	T	253.94	PASS	AF=0.38961;AO=29;DP=76;FAO=30;FDP=77;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.00922554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0323;QD=13.1919;RBI=0.0105826;REFB=0.00524221;REVB=-0.00518474;RO=47;SAF=15;SAR=14;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851815;STB=0.558403;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=-0.0117298;OID=.;OPOS=133010786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:47:47:29:30:0.38961:14:15:28:19:15:15:28:19
chr2	133010796	.	C	T	54.49	PASS	AF=0.139241;AO=11;DP=79;FAO=11;FDP=79;FR=.;FRO=68;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=28;FWDB=-0.0422196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4854;QD=2.7588;RBI=0.0448972;REFB=-0.00606091;REVB=0.0152731;RO=68;SAF=5;SAR=6;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163831;STB=0.613436;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0300527;OID=.;OPOS=133010796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:79:79:68:68:11:11:0.139241:6:5:40:28:6:5:40:28
chr2	133010802	.	T	C	48.87	PASS	AF=0.133333;AO=10;DP=75;FAO=10;FDP=75;FR=.;FRO=65;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=0.0161146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4109;QD=2.60624;RBI=0.0167818;REFB=0.0059969;REVB=0.00468464;RO=65;SAF=5;SAR=5;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123025;STB=0.586499;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=-0.0360123;OID=.;OPOS=133010802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:75:75:65:65:10:10:0.133333:5:5:39:26:5:5:39:26
chr2	133010834	.	TG	CA	48.04	PASS	AF=0.12987;AO=10;DP=77;FAO=10;FDP=77;FR=.;FRO=67;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=-0.0324832;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=280.875;QD=2.49576;RBI=0.040516;REFB=-0.00855973;REVB=-0.0242155;RO=67;SAF=6;SAR=4;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410103;STB=0.529353;STBP=0.866;TYPE=mnp;VARB=0.0456695;OID=.;OPOS=133010834;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:77:77:67:67:10:10:0.12987:4:6:38:29:4:6:38:29
chr2	133010838	.	G	C	49.3	PASS	AF=0.135135;AO=10;DP=74;FAO=10;FDP=74;FR=.;FRO=64;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=-0.0424623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.224;QD=2.66488;RBI=0.0443934;REFB=-0.000958405;REVB=-0.0129507;RO=64;SAF=6;SAR=4;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660839;STB=0.546867;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0240873;OID=.;OPOS=133010838;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:74:74:64:64:10:10:0.135135:4:6:35:29:4:6:35:29
chr2	133010847	.	CA	TG	50.69	PASS	AF=0.140845;AO=10;DP=71;FAO=10;FDP=71;FR=.;FRO=61;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=-0.0314474;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=208.093;QD=2.85572;RBI=0.0483418;REFB=-0.00421196;REVB=-0.036715;RO=61;SAF=6;SAR=4;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0735019;STB=0.55162;STBP=0.674;TYPE=mnp;VARB=0.0278768;OID=.;OPOS=133010847;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:71:71:61:61:10:10:0.140845:4:6:33:28:4:6:33:28
chr2	133011929	.	C	T	41.64	PASS	AF=0.175;AO=7;DP=40;FAO=7;FDP=40;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0179597;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.3506;QD=4.16429;RBI=0.0256397;REFB=-0.0061449;REVB=0.0182988;RO=33;SAF=6;SAR=1;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39655;STB=0.781689;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0160494;OID=.;OPOS=133011929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:40:40:33:33:7:7:0.175:1:6:19:14:1:6:19:14
chr2	133011953	.	T	C	62.8	PASS	AF=0.222222;AO=11;DP=44;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0127598;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.5869;QD=5.5823;RBI=0.0232362;REFB=-0.0127637;REVB=-0.0194192;RO=33;SAF=10;SAR=1;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.635332;STB=0.88651;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0371757;OID=.;OPOS=133011953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:44:45:33:35:11:10:0.222222:1:10:13:20:1:9:15:20
chr2	133011994	.	T	C	37.87	PASS	AF=0.127273;AO=7;DP=55;FAO=7;FDP=55;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=-0.0023953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.153;QD=2.75434;RBI=0.00317094;REFB=-0.00413544;REVB=0.00207784;RO=48;SAF=6;SAR=1;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.557166;STB=0.892046;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0238656;OID=.;OPOS=133011994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:55:55:48:48:7:7:0.127273:1:6:17:31:1:6:17:31
chr2	133012006	.	G	A	39.33	PASS	AF=0.127273;AO=7;DP=56;FAO=7;FDP=55;FR=.;FRO=48;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.00923144;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5695;QD=2.86014;RBI=0.00923334;REFB=-0.012594;REVB=0.000187164;RO=46;SAF=4;SAR=3;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187133;STB=0.632287;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0187894;OID=.;OPOS=133012006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:56:55:46:48:7:7:0.127273:3:4:19:27:3:4:20:28
chr2	133012007	.	T	C	37.22	PASS	AF=0.125;AO=6;DP=56;FAO=7;FDP=56;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=-0.0309082;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.123;QD=2.65872;RBI=0.0752424;REFB=-0.0120851;REVB=-0.068601;RO=47;SAF=5;SAR=1;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.547373;STB=0.894958;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0756736;OID=.;OPOS=133012007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:56:56:47:49:6:7:0.125:1:5:15:32:1:6:17:32
chr2	133012011	.	G	C	55.82	PASS	AF=0.172414;AO=9;DP=57;FAO=10;FDP=58;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0114985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.412;QD=3.84975;RBI=0.0127613;REFB=-0.0186871;REVB=-0.00553474;RO=48;SAF=4;SAR=5;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346563;STB=0.56883;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0478394;OID=.;OPOS=133012011;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:57:58:48:48:9:10:0.172414:5:4:20:28:5:5:20:28
chr2	133012012	.	C	A	240.03	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0266396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.811;QD=16.5537;RBI=0.027502;REFB=-0.0142955;REVB=0.00683314;RO=31;SAF=10;SAR=17;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111398;STB=0.562867;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0403977;OID=.;OPOS=133012012;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:17:10:15:16:17:10:15:16
chr2	133012034	.	CGGG	GGGC,GGGG	297.4	PASS	AF=0,0.55102;AO=2,25;DP=49;FAO=0,27;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=0,11;FSAR=0,16;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0804774,0.0886385;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=107.814,111.775;QD=24.2771;RBI=0.12184,0.161137;REFB=-0.0883326,-0.0975728;REVB=0.0914794,0.134567;RO=9;SAF=2,9;SAR=0,16;SRF=5;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.565098,-0.0994628;STB=0.5,0.51203;STBP=1,0.86;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.090534;OID=.,.;OPOS=133012034,133012034;OREF=CGGG,C;OALT=GGGC,G;OMAPALT=GGGC,GGGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:49:49:9:21:2,25:0,27:0,0.55102:0,16:2,9:5:4:0,16:0,11:8:13
chr2	133012078	.	C	T	32.18	PASS	AF=0.104478;AO=7;DP=67;FAO=7;FDP=67;FR=.;FRO=60;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=-0.0316602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2741;QD=1.92134;RBI=0.0605076;REFB=-0.00077983;REVB=-0.0515635;RO=58;SAF=4;SAR=3;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.063238;STB=0.534384;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00953865;OID=.;OPOS=133012078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:67:67:58:60:7:7:0.104478:3:4:30:28:3:4:32:28
chr2	133012079	.	G	A	281.63	PASS	AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.00106166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.293;QD=17.0685;RBI=0.0236082;REFB=-0.0118009;REVB=0.0235843;RO=35;SAF=15;SAR=16;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109517;STB=0.561364;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0150803;OID=.;OPOS=133012079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:35:35:31:31:0.469697:16:15:21:14:16:15:21:14
chr2	133012080	.	A	AC	284.64	PASS	AF=0.606557;AO=36;DP=66;FAO=37;FDP=61;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0102489;FXX=0.061529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.567;QD=18.6647;RBI=0.0529085;REFB=0.05947;REVB=0.0519063;RO=28;SAF=18;SAR=18;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566776;STB=0.511085;STBP=0.843;TYPE=ins;VARB=-0.0395404;OID=.;OPOS=133012081;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.606557:36:66:37:61:24:19:18:13:11:99:28:18:18:16:12
chr2	133012099	.	G	A	277.58	PASS	AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.000665514;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.589;QD=16.0916;RBI=0.00294266;REFB=-0.00865129;REVB=-0.00286641;RO=38;SAF=16;SAR=15;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875969;STB=0.549264;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0112627;OID=.;OPOS=133012099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:38:38:31:31:0.449275:15:16:23:15:15:16:23:15
chr2	133012111	.	T	C	126.17	PASS	AF=0.28125;AO=18;DP=65;FAO=18;FDP=64;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0120617;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.183;QD=7.88563;RBI=0.0167207;REFB=0.00412926;REVB=-0.01158;RO=44;SAF=11;SAR=7;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525231;STB=0.534134;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=-0.0195696;OID=.;OPOS=133012111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:44:46:18:18:0.28125:7:11:25:19:7:11:26:20
chr2	133012126	.	A	C	31.33	PASS	AF=0.107692;AO=6;DP=64;FAO=7;FDP=65;FR=.;FRO=58;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=0.00713697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.255;QD=1.92813;RBI=0.00724302;REFB=0.000363458;REVB=-0.00123487;RO=58;SAF=3;SAR=3;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097432;STB=0.513475;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=-0.00247674;OID=.;OPOS=133012126;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:64:65:58:58:6:7:0.107692:3:3:34:24:3:4:34:24
chr2	133012147	.	A	G	30.04	PASS	AF=0.107143;AO=6;DP=56;FAO=6;FDP=56;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.00608312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.255;QD=2.1454;RBI=0.0295891;REFB=0.000139585;REVB=-0.028957;RO=50;SAF=5;SAR=1;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26851;STB=0.718863;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.000877167;OID=.;OPOS=133012147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:56:56:50:50:6:6:0.107143:1:5:32:18:1:5:32:18
chr2	133012170	.	CC	AA	214.11	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=-0.0136676;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=192.489;QD=14.7663;RBI=0.0192062;REFB=-0.000379013;REVB=-0.0134935;RO=33;SAF=16;SAR=9;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134048;STB=0.575606;STBP=0.385;TYPE=mnp;VARB=0.000457871;OID=.;OPOS=133012170;OREF=CC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:9:16:25:8:9:16:25:8
chr2	133012172	.	T	C	35.87	PASS	AF=0.118644;AO=7;DP=59;FAO=7;FDP=59;FR=.;FRO=52;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=-0.00878005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.476;QD=2.43219;RBI=0.0267633;REFB=-0.00615234;REVB=-0.0252821;RO=51;SAF=6;SAR=1;SRF=35;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270361;STB=0.707634;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0196988;OID=.;OPOS=133012172;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:59:59:51:52:7:7:0.118644:1:6:35:16:1:6:36:16
chr2	133012182	.	C	T	185.05	PASS	AF=0.431373;AO=18;DP=48;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=5;FWDB=0.0254555;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.237;QD=14.5138;RBI=0.0265516;REFB=-0.0272508;REVB=-0.00754999;RO=29;SAF=9;SAR=9;SRF=24;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355773;STB=0.666536;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.026443;OID=.;OPOS=133012182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:51:29:29:18:22:0.431373:9:9:24:5:10:12:24:5
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chr2	133012401	.	G	A	170.49	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=0.0067545;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.248;QD=12.1777;RBI=0.00679484;REFB=0.00505064;REVB=-0.000739313;RO=35;SAF=10;SAR=11;SRF=7;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309344;STB=0.675765;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.0102096;OID=.;OPOS=133012401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:11:10:7:28:11:10:7:28
chr2	133012414	.	G	A	277.6	PASS	AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=31;FWDB=-0.0011188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.022;QD=16.0925;RBI=0.0149299;REFB=-0.0135108;REVB=-0.014888;RO=37;SAF=15;SAR=16;SRF=7;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291893;STB=0.666887;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0207517;OID=.;OPOS=133012414;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:37:38:31:31:0.449275:16:15:7:30:16:15:7:31
chr2	133012432	.	G	C	31.63	PASS	AF=0.091954;AO=7;DP=86;FAO=8;FDP=87;FR=.;FRO=79;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=49;FWDB=-0.0280323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.653;QD=1.45437;RBI=0.0290132;REFB=-0.0026388;REVB=-0.0074803;RO=78;SAF=2;SAR=5;SRF=30;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119344;STB=0.504576;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0343025;OID=.;OPOS=133012432;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:86:87:78:79:7:8:0.091954:5:2:30:48:5:3:30:49
chr2	133012439	.	A	AGAAC,C	460.83	PASS	AF=0.330882,0.0735294;AO=44,10;DP=137;FAO=45,10;FDP=136;FR=.;FRO=81;FSAF=40,10;FSAR=5,0;FSRF=31;FSRR=50;FWDB=-0.0147723,-0.0408303;FXX=0.00729874;HRUN=2,2;LEN=4,1;MLLD=235.022,83.6382;QD=13.5538;RBI=0.0233623,0.0416741;REFB=0.000254392,0.000941967;REVB=-0.0180991,-0.00834382;RO=81;SAF=40,10;SAR=4,0;SRF=31;SRR=50;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.659979,0.691687;STB=0.860882,0.9991;STBP=0,0;TYPE=ins,snp;VARB=0.00105698,-0.0551784;OID=.,.;OPOS=133012440,133012439;OREF=-,A;OALT=GAAC,C;OMAPALT=AGAAC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:136:81:81:44,10:45,10:0.330882,0.0735294:4,0:40,10:31:50:5,0:40,10:31:50
chr2	133012457	.	C	T	89.32	PASS	AF=0.0895522;AO=30;DP=334;FAO=30;FDP=335;FR=.;FRO=305;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=165;FSRR=140;FWDB=0.00420487;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.388;QD=1.06648;RBI=0.016774;REFB=-0.00371425;REVB=-0.0162384;RO=301;SAF=13;SAR=17;SRF=161;SRR=140;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120371;STB=0.597134;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0208885;OID=.;OPOS=133012457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:334:335:301:305:30:30:0.0895522:17:13:161:140:17:13:165:140
chr2	133012458	.	GT	AC	3148.2	PASS	AF=0.745509;AO=246;DP=335;FAO=249;FDP=334;FR=.;FRO=85;FSAF=144;FSAR=105;FSRF=35;FSRR=50;FWDB=-0.010419;FXX=0.00890181;HRUN=1;LEN=2;MLLD=217.784;QD=37.703;RBI=0.0190262;REFB=-0.0283153;REVB=0.0159198;RO=85;SAF=142;SAR=104;SRF=35;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806726;STB=0.542864;STBP=0.01;TYPE=mnp;VARB=0.00685689;OID=.;OPOS=133012458;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:335:334:85:85:246:249:0.745509:104:142:35:50:105:144:35:50
chr2	133012465	.	C	T	76.69	PASS	AF=0.078534;AO=30;DP=383;FAO=30;FDP=382;FR=.;FRO=352;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=183;FSRR=169;FWDB=0.0292746;FXX=0.0026109;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.817;QD=0.803011;RBI=0.0320273;REFB=-0.00152449;REVB=-0.0129903;RO=352;SAF=13;SAR=17;SRF=183;SRR=169;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0991196;STB=0.579425;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0274995;OID=.;OPOS=133012465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:383:382:352:352:30:30:0.078534:17:13:183:169:17:13:183:169
chr2	133012504	.	A	G	4359.98	PASS	AF=0.810811;AO=328;DP=405;FAO=330;FDP=407;FR=.;FRO=77;FSAF=189;FSAR=141;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=-0.010679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.589;QD=42.8499;RBI=0.0106994;REFB=-0.00703033;REVB=0.000660318;RO=76;SAF=188;SAR=140;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359266;STB=0.520211;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00138095;OID=.;OPOS=133012504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:405:407:76:77:328:330:0.810811:140:188:36:40:141:189:36:41
chr2	133012508	.	TG	CA,CG	4816.71	PASS	AF=0.0643564,0.816832;AO=23,323;DP=394;FAO=26,330;FDP=404;FR=.;FRO=48;FSAF=11,192;FSAR=15,138;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0127464,0.0101815;FXX=0.00737083;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=170.786,205.564;QD=47.6902;RBI=0.0217602,0.0441411;REFB=0.000668327,-0.00899456;REVB=0.0176363,0.0429509;RO=47;SAF=11,190;SAR=12,133;SRF=22;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.011676,0.029702;STB=0.536814,0.513335;STBP=0.683,0.196;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00621716,0.000651535;OID=.,.;OPOS=133012508,133012508;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:394:404:47:48:23,323:26,330:0.0643564,0.816832:12,133:11,190:22:25:15,138:11,192:23:25
chr2	133012516	.	T	G	4228.38	PASS	AF=0.813268;AO=308;DP=379;FAO=331;FDP=407;FR=.;FRO=76;FSAF=194;FSAR=137;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.0393097;FXX=0.00973212;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.3862;QD=41.5566;RBI=0.0428359;REFB=-0.0614535;REVB=0.0170194;RO=70;SAF=192;SAR=116;SRF=35;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0454008;STB=0.523965;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.010311;OID=.;OPOS=133012516;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:379:407:70:76:308:331:0.813268:116:192:35:35:137:194:35:41
chr2	133012523	.	A	G	4635.1	PASS	AF=0.83455;AO=341;DP=411;FAO=343;FDP=411;FR=.;FRO=68;FSAF=202;FSAR=141;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.00545143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.983;QD=45.1105;RBI=0.0182765;REFB=-0.0218998;REVB=0.0174445;RO=68;SAF=200;SAR=141;SRF=33;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326217;STB=0.517593;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00198167;OID=.;OPOS=133012523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:411:411:68:68:341:343:0.83455:141:200:33:35:141:202:33:35
chr2	133012541	.	C	A	35.45	PASS	AF=0.0544554;AO=22;DP=404;FAO=22;FDP=404;FR=.;FRO=382;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=227;FSRR=155;FWDB=-0.0346752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1656;QD=0.351019;RBI=0.0360229;REFB=-0.000962107;REVB=0.00976138;RO=380;SAF=10;SAR=12;SRF=225;SRR=155;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13993;STB=0.629927;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00546202;OID=.;OPOS=133012541;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:404:404:380:382:22:22:0.0544554:12:10:225:155:12:10:227:155
chr2	133012542	.	T	C	4704.14	PASS	AF=0.853598;AO=339;DP=402;FAO=344;FDP=403;FR=.;FRO=59;FSAF=206;FSAR=138;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.0125127;FXX=0.00247519;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.95;QD=46.6912;RBI=0.0142019;REFB=-0.00243873;REVB=-0.00671759;RO=60;SAF=203;SAR=136;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242215;STB=0.513692;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.000318293;OID=.;OPOS=133012542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:402:403:60:59:339:344:0.853598:136:203:31:29:138:206:30:29
chr2	133012571	.	T	C	4680.65	PASS	AF=0.874016;AO=332;DP=381;FAO=333;FDP=381;FR=.;FRO=48;FSAF=212;FSAR=121;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.00952105;FXX=0.00261773;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.961;QD=49.1407;RBI=0.0122009;REFB=-0.024128;REVB=0.00762969;RO=48;SAF=211;SAR=121;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452043;STB=0.523957;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00368245;OID=.;OPOS=133012571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:381:381:48:48:332:333:0.874016:121:211:22:26:121:212:22:26
chr2	133012612	.	T	C	1781.09	PASS	AF=0.839506;AO=119;DP=173;FAO=136;FDP=162;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=66;FSAR=70;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0403878;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.225;QD=43.9776;RBI=0.0404313;REFB=-0.0160153;REVB=-0.00187503;RO=27;SAF=48;SAR=71;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148069;STB=0.503816;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0048478;OID=.;OPOS=133012612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:162:27:26:119:136:0.839506:71:48:12:15:70:66:12:14
chr2	133012633	.	AC	ACTT,GC,TT	70.38	PASS	AF=0.227273,0.0909091,0.136364;AO=3,2,3;DP=22;FAO=5,2,3;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=1,2,0;FSAR=4,0,3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0264427,0.0156036,0.00392865;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,2;MLLD=39.3901,138.973,235.019;QD=12.7957;RBI=0.0390022,0.0223429,0.00634535;REFB=-0.00508982,0.00171311,-0.00235002;REVB=0.0286698,-0.0159916,-0.00498289;RO=12;SAF=1,2,0;SAR=2,0,3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.267894,0.532086,-0.664653;STB=0.77933,0.993622,0.996456;STBP=0.166,0.196,0.058;TYPE=ins,snp,mnp;VARB=0.112622,-0.0038275,-0.0342165;OID=.,.,.;OPOS=133012635,133012633,133012633;OREF=-,A,AC;OALT=TT,G,TT;OMAPALT=ACTT,GC,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:22:22:12:12:3,2,3:5,2,3:0.227273,0.0909091,0.136364:2,0,3:1,2,0:7:5:4,0,3:1,2,0:7:5
chr2	133012642	.	TT	CC	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.01098;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=245.394;QD=18.645;RBI=0.0400295;REFB=-0.0253335;REVB=0.0384941;RO=13;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157376;STB=0.590032;STBP=0.333;TYPE=mnp;VARB=0.0210895;OID=.;OPOS=133012642;OREF=TT;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:9:5:7:6:9:5:7:6
chr2	133012655	.	A	G	458.43	PASS	AF=0.777778;AO=35;DP=45;FAO=35;FDP=45;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00516252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.155;QD=40.749;RBI=0.013545;REFB=-0.0179918;REVB=0.0125226;RO=10;SAF=9;SAR=26;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121815;STB=0.566057;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00798016;OID=.;OPOS=133012655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:45:45:10:10:35:35:0.777778:26:9:5:5:26:9:5:5
chr2	133012674	.	A	G	632.97	PASS	AF=0.923077;AO=48;DP=52;FAO=48;FDP=52;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0309671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2517;QD=48.6899;RBI=0.0314672;REFB=0.00560555;REVB=-0.00558789;RO=4;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056934;STB=0.530291;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=-0.000134054;OID=.;OPOS=133012674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:52:52:4:4:48:48:0.923077:31:17:0:4:31:17:0:4
chr2	133012680	.	A	G	519.57	PASS	AF=0.785714;AO=44;DP=56;FAO=44;FDP=56;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0130316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2728;QD=37.1124;RBI=0.0448756;REFB=-0.0360882;REVB=-0.0429418;RO=12;SAF=14;SAR=30;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443683;STB=0.523886;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00767703;OID=.;OPOS=133012680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:56:56:12:12:44:44:0.785714:30:14:5:7:30:14:5:7
chr2	133012688	.	A	G	544.49	PASS	AF=0.793103;AO=44;DP=56;FAO=46;FDP=58;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0107092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.839;QD=37.551;RBI=0.038858;REFB=-0.050472;REVB=0.0373532;RO=12;SAF=14;SAR=30;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443683;STB=0.520999;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0121507;OID=.;OPOS=133012688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:56:58:12:12:44:46:0.793103:30:14:5:7:31:15:5:7
chr2	133012691	.	T	C	699.18	PASS	AF=0.913793;AO=53;DP=58;FAO=53;FDP=58;FR=.;FRO=5;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00464532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.391;QD=48.2196;RBI=0.00480908;REFB=-0.0133303;REVB=-0.00124426;RO=5;SAF=19;SAR=34;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281484;STB=0.514973;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00215855;OID=.;OPOS=133012691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:58:58:5:5:53:53:0.913793:34:19:1:4:34:19:1:4
chr2	133012712	.	T	C	866.84	PASS	AF=0.926471;AO=63;DP=68;FAO=63;FDP=68;FR=.;FRO=5;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0141468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.899;QD=50.9904;RBI=0.0743254;REFB=0.00726861;REVB=0.0729666;RO=5;SAF=24;SAR=39;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267583;STB=0.514196;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=8.00127e-05;OID=.;OPOS=133012712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:68:68:5:5:63:63:0.926471:39:24:1:4:39:24:1:4
chr2	133012716	.	A	G	894.92	PASS	AF=0.941176;AO=64;DP=69;FAO=64;FDP=68;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.00872032;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.667;QD=52.6424;RBI=0.0109717;REFB=-0.00291611;REVB=-0.00665837;RO=4;SAF=25;SAR=39;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460156;STB=0.524383;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.000422918;OID=.;OPOS=133012716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:69:68:4:4:64:64:0.941176:39:25:0:4:39:25:0:4
chr2	133012797	.	C	CCG	431.76	PASS	AF=0.780488;AO=30;DP=66;FAO=32;FDP=41;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0232131;FXX=0.163232;HRUN=1;LEN=2;MLLD=100.311;QD=42.1232;RBI=0.0451014;REFB=-0.0312241;REVB=0.038669;RO=32;SAF=7;SAR=23;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475891;STB=0.566966;STBP=0.157;TYPE=ins;VARB=0.0288957;OID=.;OPOS=133012798;OREF=-;OALT=CG;OMAPALT=CCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.780488:30:66:32:41:9:7:25:4:5:65:32:7:23:24:8
chr2	133012799	.	AAACT	CTTGC	487.54	PASS	AF=0.714286;AO=30;DP=46;FAO=30;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=7;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0134704;FXX=0.10636;HRUN=3;LEN=5;MLLD=199.368;QD=46.432;RBI=0.0134707;REFB=-0.0177123;REVB=-9.22172e-05;RO=5;SAF=7;SAR=23;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125299;STB=0.558212;STBP=0.169;TYPE=mnp;VARB=0.000939748;OID=.;OPOS=133012799;OREF=AAACT;OALT=CTTGC;OMAPALT=CTTGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:46:42:5:6:30:30:0.714286:23:7:3:2:23:7:3:3
chr2	133012807	.	A	G	448.73	PASS	AF=0.714286;AO=35;DP=50;FAO=35;FDP=49;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0180902;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.463;QD=36.6307;RBI=0.0258544;REFB=-0.0158173;REVB=0.0184714;RO=14;SAF=9;SAR=26;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110679;STB=0.560309;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00755746;OID=.;OPOS=133012807;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:14:14:35:35:0.714286:26:9:6:8:26:9:6:8
chr2	133012832	.	T	C	490.13	PASS	AF=0.732143;AO=40;DP=56;FAO=41;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0139429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7753;QD=35.0094;RBI=0.0267377;REFB=-0.00191762;REVB=-0.0228145;RO=13;SAF=13;SAR=27;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687181;STB=0.53148;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=-0.0103764;OID=.;OPOS=133012832;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:56:56:13:13:40:41:0.732143:27:13:6:7:27:14:6:7
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chr2	133012901	.	T	C	164.81	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0121544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.895;QD=21.2657;RBI=0.0139702;REFB=-0.0207537;REVB=0.0068874;RO=14;SAF=10;SAR=7;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184004;STB=0.603652;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0112924;OID=.;OPOS=133012901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:7:10:5:9:7:10:5:9
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chr2	133012994	.	A	G	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0299223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.204;QD=9.76042;RBI=0.0356836;REFB=-0.0396263;REVB=0.0194417;RO=12;SAF=4;SAR=3;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073775;STB=0.545324;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0303284;OID=.;OPOS=133012994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:3:4:6:6:3:4:6:6
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chr2	133013144	.	A	G	368.03	PASS	AF=0.62;AO=30;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00532974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7208;QD=29.4423;RBI=0.0132167;REFB=-0.00983383;REVB=-0.0120945;RO=17;SAF=16;SAR=14;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0800132;STB=0.536059;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00617851;OID=.;OPOS=133013144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:17:19:30:31:0.62:14:16:7:10:15:16:8:11
chr2	133013145	.	C	T	73.29	PASS	AF=0.203704;AO=10;DP=52;FAO=11;FDP=54;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0205626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.16;QD=5.42903;RBI=0.0335339;REFB=-0.0136035;REVB=-0.0264897;RO=39;SAF=5;SAR=5;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156709;STB=0.545372;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0302311;OID=.;OPOS=133013145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:52:54:39:43:10:11:0.203704:5:5:19:20:6:5:22:21
chr2	133013175	.	T	G	586.06	PASS	AF=0.777778;AO=49;DP=63;FAO=49;FDP=63;FR=.;FRO=14;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0517146;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.3565;QD=37.2103;RBI=0.051873;REFB=-0.00192749;REVB=0.00405163;RO=13;SAF=27;SAR=22;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950189;STB=0.543136;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.000904798;OID=.;OPOS=133013175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:63:63:13:14:49:49:0.777778:22:27:4:9:22:27:5:9
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chr2	133013318	.	A	G	231.34	PASS	AF=0.415385;AO=26;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.00132312;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1554;QD=14.2361;RBI=0.0117576;REFB=-0.0189408;REVB=-0.0116829;RO=37;SAF=14;SAR=12;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108829;STB=0.578174;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0272312;OID=.;OPOS=133013318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:38:26:27:0.415385:12:14:16:21:12:15:16:22
chr2	133013324	.	C	A	70.31	PASS	AF=0.1875;AO=12;DP=64;FAO=12;FDP=64;FR=.;FRO=52;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.000266162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.158;QD=4.39422;RBI=0.00322778;REFB=-0.00519813;REVB=0.00321679;RO=52;SAF=7;SAR=5;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196942;STB=0.627997;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.032067;OID=.;OPOS=133013324;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:64:64:52:52:12:12:0.1875:5:7:22:30:5:7:22:30
chr2	133013327	.	G	T	74.52	PASS	AF=0.20339;AO=12;DP=60;FAO=12;FDP=59;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0189118;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.415;QD=5.05232;RBI=0.0621087;REFB=0.0055286;REVB=-0.0591594;RO=47;SAF=7;SAR=5;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218464;STB=0.639664;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.0270115;OID=.;OPOS=133013327;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:60:59:47:47:12:12:0.20339:5:7:19:28:5:7:19:28
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chr2	133013343	.	T	C	68.59	PASS	AF=0.192982;AO=11;DP=57;FAO=11;FDP=57;FR=.;FRO=46;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0144819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.873;QD=4.81365;RBI=0.0159299;REFB=0.00794062;REVB=0.00663599;RO=44;SAF=3;SAR=8;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313894;STB=0.7055;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=-0.0245064;OID=.;OPOS=133013343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:57:57:44:46:11:11:0.192982:8:3:23:21:8:3:24:22
chr2	133013351	.	G	A	79.43	PASS	AF=0.226415;AO=11;DP=52;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00874943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4755;QD=5.99494;RBI=0.0184085;REFB=0.000662645;REVB=0.0161963;RO=41;SAF=7;SAR=4;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183514;STB=0.640787;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00130515;OID=.;OPOS=133013351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:52:53:41:41:11:12:0.226415:4:7:20:21:4:8:20:21
chr2	133013378	.	A	G	229.06	PASS	AF=0.380952;AO=18;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0233094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.204;QD=14.5437;RBI=0.0233387;REFB=-0.0429727;REVB=0.00116845;RO=35;SAF=6;SAR=12;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208692;STB=0.558356;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0574544;OID=.;OPOS=133013378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:18:24:0.380952:12:6:18:17:14:10:18:17
chr2	133013388	.	C	T	82.61	PASS	AF=0.197183;AO=14;DP=71;FAO=14;FDP=71;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=0.00203329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4126;QD=4.65411;RBI=0.00207909;REFB=-0.00105073;REVB=-0.000433969;RO=57;SAF=6;SAR=8;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567408;STB=0.536533;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.00575478;OID=.;OPOS=133013388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:71:71:57:57:14:14:0.197183:8:6:27:30:8:6:27:30
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chr2	133013449	.	G	A	47.2	PASS	AF=0.150943;AO=8;DP=53;FAO=8;FDP=53;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0481543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.124;QD=3.56249;RBI=0.0488097;REFB=0.000457779;REVB=-0.00797147;RO=45;SAF=5;SAR=3;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139577;STB=0.597839;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=-0.00468377;OID=.;OPOS=133013449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:53:53:45:45:8:8:0.150943:3:5:23:22:3:5:23:22
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chr2	133013680	.	G	A	223.56	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=0.00575925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.308;QD=14.9039;RBI=0.02644;REFB=0.00282619;REVB=-0.0258051;RO=34;SAF=16;SAR=10;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131571;STB=0.574176;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=-0.00863758;OID=.;OPOS=133013680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:10:16:25:9:10:16:25:9
chr2	133013687	.	T	C	58.64	PASS	AF=0.169492;AO=10;DP=59;FAO=10;FDP=59;FR=.;FRO=49;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=37;FSRR=12;FWDB=0.0300369;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.289;QD=3.97551;RBI=0.0343699;REFB=-0.007334;REVB=0.0167056;RO=49;SAF=4;SAR=6;SRF=37;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.429472;STB=0.773155;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.013557;OID=.;OPOS=133013687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:59:59:49:49:10:10:0.169492:6:4:37:12:6:4:37:12
chr2	133013695	.	CA	CG,TG	191.74	PASS	AF=0.258621,0.155172;AO=15,9;DP=59;FAO=15,9;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=13,2;FSAR=2,7;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=0.00842779,0.000304805;FXX=0.0169463;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=103.816,217.685;QD=13.2232;RBI=0.0156631,0.0444652;REFB=0.00295838,0.00402784;REVB=-0.0132024,-0.0444641;RO=33;SAF=13,2;SAR=2,7;SRF=25;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.213309,-0.586507;STB=0.65273,0.854558;STBP=0.254,0.034;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00942218,0.00559583;OID=.,.;OPOS=133013696,133013695;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:33:34:15,9:15,9:0.258621,0.155172:2,7:13,2:25:8:2,7:13,2:25:9
chr2	133013704	.	G	A	109.85	PASS	AF=0.266667;AO=16;DP=60;FAO=16;FDP=60;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.0373792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.431;QD=7.32356;RBI=0.0581739;REFB=-0.0135686;REVB=-0.0445758;RO=44;SAF=14;SAR=2;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395348;STB=0.749625;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0425295;OID=.;OPOS=133013704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:44:44:16:16:0.266667:2:14:28:16:2:14:28:16
chr2	133013756	.	GA	AA,AG	99.74	PASS	AF=0.259259,0;AO=14,2;DP=54;FAO=14,0;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=11,0;FSAR=3,0;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.0230413,-0.0202689;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=62.7581,184.113;QD=7.38817;RBI=0.0263191,0.0294168;REFB=-0.00988129,0.00309624;REVB=-0.0127198,-0.0213195;RO=38;SAF=11,2;SAR=3,0;SRF=25;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.192061,0.3622;STB=0.606731,0.5;STBP=0.394,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0283328,0;OID=.,.;OPOS=133013756,133013756;OREF=G,GA;OALT=A,AG;OMAPALT=AA,AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:38:40:14,2:14,0:0.259259,0:3,0:11,2:25:13:3,0:11,0:27:13
chr2	133014602	.	G	C	47.12	PASS	AF=0.411765;AO=6;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00709545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.5639;QD=11.0868;RBI=0.0552058;REFB=-0.0607109;REVB=-0.054748;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203317;STB=0.578732;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.023129;OID=.;OPOS=133014602;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:6:7:0.411765:3:3:7:3:3:4:7:3
chr2	133014612	.	A	C	51.06	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0101831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.102;QD=11.3462;RBI=0.021882;REFB=-0.0318213;REVB=-0.0193681;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763832;STB=0.545344;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.102301;OID=.;OPOS=133014612;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:18:18:10:10:8:8:0.444444:3:5:7:3:3:5:7:3
chr2	133014640	.	C	T	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0525708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.303;QD=9.44497;RBI=0.0543027;REFB=0.00228802;REVB=0.0136049;RO=9;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162993;STB=0.624609;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=-5.57469e-05;OID=.;OPOS=133014640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:9:10:6:6:0.375:3:3:6:3:3:3:7:3
chr2	133036280	.	A	C	35.18	PASS	AF=0.116667;AO=7;DP=59;FAO=7;FDP=60;FR=.;FRO=53;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.0436555;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9634;QD=2.34521;RBI=0.0472312;REFB=-0.00413655;REVB=-0.0180273;RO=52;SAF=3;SAR=4;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392121;STB=0.521677;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0342165;OID=.;OPOS=133036280;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:59:60:52:53:7:7:0.116667:4:3:24:28:4:3:24:29
chr2	133036619	.	CC	TG	41.49	PASS	AF=0.109091;AO=5;DP=57;FAO=6;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=47;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.0123013;FXX=0.0350816;HRUN=2;LEN=2;MLLD=189.039;QD=3.01743;RBI=0.0171534;REFB=-0.000580216;REVB=0.0119547;RO=46;SAF=1;SAR=4;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454152;STB=0.737367;STBP=0.285;TYPE=mnp;VARB=0.00951463;OID=.;OPOS=133036619;OREF=CC;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:57:55:46:47:5:6:0.109091:4:1:29:17:4:2:29:18
chr2	133036630	.	A	G	34.89	PASS	AF=0.114754;AO=7;DP=61;FAO=7;FDP=61;FR=.;FRO=54;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.00251417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0059;QD=2.28761;RBI=0.0328792;REFB=-0.00391518;REVB=0.0327829;RO=54;SAF=1;SAR=6;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.508505;STB=0.8751;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0322973;OID=.;OPOS=133036630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:61:61:54:54:7:7:0.114754:6:1:32:22:6:1:32:22
chr2	133036632	.	G	A	34.88	PASS	AF=0.114754;AO=7;DP=61;FAO=7;FDP=61;FR=.;FRO=54;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.0193264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.861;QD=2.28746;RBI=0.0238728;REFB=-0.00631353;REVB=-0.0140144;RO=54;SAF=1;SAR=6;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.508505;STB=0.8751;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0843873;OID=.;OPOS=133036632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:61:61:54:54:7:7:0.114754:6:1:32:22:6:1:32:22
chr2	133036650	.	T	G	197.72	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.00877815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7428;QD=13.636;RBI=0.0818269;REFB=-0.0150139;REVB=0.0813547;RO=34;SAF=11;SAR=13;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162373;STB=0.592517;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0409076;OID=.;OPOS=133036650;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:13:11:21:13:13:11:21:13
chr2	133036661	.	A	AT	91.03	PASS	AF=0.241379;AO=16;DP=65;FAO=14;FDP=58;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.00361494;FXX=0.0333278;HRUN=0;LEN=1;MLLD=58.7369;QD=6.27781;RBI=0.0187506;REFB=-0.00565078;REVB=0.0183988;RO=48;SAF=7;SAR=9;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225738;STB=0.688736;STBP=0.12;TYPE=ins;VARB=0.00933304;OID=.;OPOS=133036662;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.241379:16:65:14:58:44:5:9:27:17:91:48:7:9:30:18
chr2	133036666	.	AC	A	129.81	PASS	AF=0.292308;AO=19;DP=66;FAO=19;FDP=65;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=0.0138977;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=34.2759;QD=7.98818;RBI=0.02552;REFB=-0.0104029;REVB=-0.0214038;RO=45;SAF=11;SAR=8;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528479;STB=0.521716;STBP=0.837;TYPE=del;VARB=0.00904096;OID=.;OPOS=133036667;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.292308:19:66:19:65:46:11:8:28:18:99:45:11:8:28:17
chr2	133036669	.	G	T	165.62	PASS	AF=0.323529;AO=22;DP=68;FAO=22;FDP=68;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.010377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.809;QD=9.74224;RBI=0.0292522;REFB=-0.00723001;REVB=-0.0273497;RO=46;SAF=12;SAR=10;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0999019;STB=0.558531;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00649092;OID=.;OPOS=133036669;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:46:46:22:22:0.323529:10:12:29:17:10:12:29:17
chr2	133036693	.	T	G	409.1	PASS	AF=0.571429;AO=40;DP=70;FAO=40;FDP=70;FR=.;FRO=30;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0105225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.759;QD=23.377;RBI=0.0148833;REFB=-0.0107226;REVB=0.0105257;RO=30;SAF=25;SAR=15;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00694284;STB=0.503815;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.00529199;OID=.;OPOS=133036693;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:30:30:40:40:0.571429:15:25:19:11:15:25:19:11
chr2	133036695	.	C	A	37.77	PASS	AF=0.115942;AO=8;DP=67;FAO=8;FDP=69;FR=.;FRO=61;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=-0.00964992;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.635;QD=2.18936;RBI=0.0288149;REFB=0.00184215;REVB=-0.027151;RO=59;SAF=7;SAR=1;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364137;STB=0.808001;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.0361984;OID=.;OPOS=133036695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:67:69:59:61:8:8:0.115942:1:7:37:22:1:7:36:25
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chr2	133036704	.	T	C	221.96	PASS	AF=0.385714;AO=25;DP=68;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=-0.0122185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.943;QD=12.6835;RBI=0.0207533;REFB=-0.00309648;REVB=-0.0167753;RO=42;SAF=15;SAR=10;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216799;STB=0.516298;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00369988;OID=.;OPOS=133036704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:70:42:43:25:27:0.385714:10:15:26:16:10:17:26:17
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chr2	133036858	.	C	G	33.85	PASS	AF=0.166667;AO=6;DP=36;FAO=6;FDP=36;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0481203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.249;QD=3.76142;RBI=0.0647038;REFB=-0.00576674;REVB=-0.0432553;RO=30;SAF=5;SAR=1;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474883;STB=0.832224;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0322025;OID=.;OPOS=133036858;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:36:36:30:30:6:6:0.166667:1:5:13:17:1:5:13:17
chr2	133036913	.	C	T	111.6	PASS	AF=0.419355;AO=12;DP=30;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0544488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.064;QD=14.3997;RBI=0.0548322;REFB=-0.0272614;REVB=-0.0064723;RO=17;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144712;STB=0.618857;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0566488;OID=.;OPOS=133036913;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:17:18:12:13:0.419355:4:8:9:8:4:9:9:9
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chr2	133037311	.	C	A	142.56	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0332378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2348;QD=14.2558;RBI=0.0375801;REFB=-0.0104827;REVB=-0.017536;RO=24;SAF=6;SAR=10;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86862e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0179278;OID=.;OPOS=133037311;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:10:6:9:15:10:6:9:15
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chr2	133038188	.	T	C	80.62	PASS	AF=0.261905;AO=11;DP=42;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0527034;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.9772;QD=7.67763;RBI=0.0853748;REFB=-0.00333896;REVB=-0.0671655;RO=31;SAF=8;SAR=3;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299409;STB=0.687429;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00309694;OID=.;OPOS=133038188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:42:42:31:31:11:11:0.261905:3:8:15:16:3:8:15:16
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chr2	133038234	.	C	T	78.15	PASS	AF=0.22;AO=11;DP=50;FAO=11;FDP=50;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0119774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.756;QD=6.25188;RBI=0.0223924;REFB=-0.00756257;REVB=-0.0189199;RO=39;SAF=8;SAR=3;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301819;STB=0.693976;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0156572;OID=.;OPOS=133038234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:50:50:39:39:11:11:0.22:3:8:19:20:3:8:19:20
chr2	133038264	.	G	A	109.2	PASS	AF=0.27451;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0304757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2768;QD=8.56433;RBI=0.0467746;REFB=0.00247283;REVB=0.0354837;RO=37;SAF=10;SAR=4;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336846;STB=0.705918;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.00295698;OID=.;OPOS=133038264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:37:37:14:14:0.27451:4:10:16:21:4:10:16:21
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chr2	133038280	.	A	C	90.53	PASS	AF=0.25;AO=11;DP=47;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0257209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.869;QD=7.54375;RBI=0.0326246;REFB=-0.0132279;REVB=-0.0200698;RO=34;SAF=7;SAR=4;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298641;STB=0.684628;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00689392;OID=.;OPOS=133038280;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:47:48:34:36:11:12:0.25:4:7:13:21:4:8:15:21
chr2	133038365	.	GC	GT,TC	351.55	PASS	AF=0.341463,0.390244;AO=12,13;DP=41;FAO=14,16;FDP=41;FR=.;FRO=11;FSAF=4,13;FSAR=10,3;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0104248,-0.0244263;FXX=0;HRUN=1,4;LEN=1,1;MLLD=116.166,62.8728;QD=34.2979;RBI=0.0138755,0.0251019;REFB=-0.023131,-0.0387686;REVB=-0.00915725,-0.00578461;RO=9;SAF=2,12;SAR=10,1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.368393,0.474473;STB=0.624812,0.645758;STBP=0.191,0.117;TYPE=snp,snp;VARB=0.0863882,0.00279676;OID=.,.;OPOS=133038366,133038365;OREF=C,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:41:41:9:11:12,13:14,16:0.341463,0.390244:10,1:2,12:5:4:10,3:4,13:6:5
chr2	133038378	.	A	G	129.2	PASS	AF=0.371429;AO=8;DP=32;FAO=13;FDP=35;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=19;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.00578165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.759;QD=14.7662;RBI=0.00683273;REFB=-0.0109762;REVB=0.00364125;RO=16;SAF=7;SAR=1;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.608567;STB=0.828618;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0289471;OID=.;OPOS=133038378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:35:16:19:8:13:0.371429:1:7:5:11:2:11:6:13
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chr2	133038400	.	GAAAAA	GAAAAC,GAAAA	90.22	PASS	AF=0,0.5;AO=2,13;DP=31;FAO=0,15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=0,11;FSAR=0,4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0639093,0.0452225;FXX=0.0322477;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=74.2326,16.2257;QD=12.0295;RBI=0.0747543,0.0721947;REFB=0.00437916,-0.0232719;REVB=-0.038779,-0.0562761;RO=14;SAF=2,8;SAR=0,5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.608678,0.230409;STB=0.5,0.706139;STBP=1,0.037;TYPE=snp,del;VARB=0,0.0339172;OID=.,.;OPOS=133038405,133038401;OREF=A,A;OALT=C,-;OMAPALT=GAAAAC,GAAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.5:2,13:31:0,15:30:15:0,11:0,4:5:10:90:14:2,8:0,5:5:9
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chr2	133038438	.	C	T	78.32	PASS	AF=0.214286;AO=12;DP=56;FAO=12;FDP=56;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.0123461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1046;QD=5.59407;RBI=0.0429146;REFB=-0.0062151;REVB=0.0411004;RO=44;SAF=8;SAR=4;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127859;STB=0.582137;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0277392;OID=.;OPOS=133038438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:56:56:44:44:12:12:0.214286:4:8:25:19:4:8:25:19
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chr2	133038724	.	T	C	257.94	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=1;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0223907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.783;QD=18.4243;RBI=0.022658;REFB=-0.0206555;REVB=-0.00347053;RO=25;SAF=1;SAR=27;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.701718;STB=0.8996;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0297803;OID=.;OPOS=133038724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:28:28:28:0.5:27:1:13:12:27:1:13:15
chr2	133038728	.	CTA	CGA,GGA,GGC	327.88	PASS	AF=0.76,0.16,0.08;AO=19,4,2;DP=26;FAO=19,4,2;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0,0;FSAR=8,4,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0220211,-0.0128959,-0.00754507;FXX=0.0384468;HRUN=1,2,2;LEN=1,2,3;MLLD=78.8529,60.8626,108.92;QD=52.4604;RBI=0.0308725,0.0190693,0.00820702;REFB=0,0,0;REVB=0.0216375,0.0140476,0.00322911;RO=0;SAF=11,0,0;SAR=8,4,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-3.41338e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,mnp,mnp;VARB=0.0108333,-0.0214705,0.00854076;OID=.,.,.;OPOS=133038729,133038728,133038728;OREF=T,CT,CTA;OALT=G,GG,GGC;OMAPALT=CGA,GGA,GGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:22:26:25:0:0:19,4,2:19,4,2:0.76,0.16,0.08:8,4,2:11,0,0:0:0:8,4,2:11,0,0:0:0
chr2	133038886	.	A	G	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.011;QD=50.4099;RBI=0.0406101;REFB=0;REVB=0.0271572;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000438974;OID=.;OPOS=133038886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:5:14:0:0:5:14:0:0
chr2	133038904	.	T	G	55.07	PASS	AF=0.363636;AO=7;DP=21;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00954367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.27;QD=10.0128;RBI=0.019999;REFB=-0.0135955;REVB=0.017575;RO=14;SAF=6;SAR=1;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237013;STB=0.672562;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0474942;OID=.;OPOS=133038904;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:22:14:14:7:8:0.363636:1:6:10:4:1:7:10:4
chr2	133039048	.	A	G	35.98	PASS	AF=0.189189;AO=6;DP=37;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0194839;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.602;QD=3.88941;RBI=0.0197898;REFB=-0.0133301;REVB=-0.00346647;RO=29;SAF=5;SAR=1;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269911;STB=0.741459;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0882495;OID=.;OPOS=133039048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:37:37:29:30:6:7:0.189189:1:5:19:10:1:6:19:11
chr2	133039090	.	T	C	65.43	PASS	AF=0.277778;AO=9;DP=35;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0150252;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.834;QD=7.26996;RBI=0.018037;REFB=-0.00786288;REVB=0.0099788;RO=26;SAF=8;SAR=1;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.432863;STB=0.797652;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0262633;OID=.;OPOS=133039090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:35:36:26:26:9:10:0.277778:1:8:16:10:1:9:16:10
chr2	133039101	.	A	G	32.59	PASS	AF=0.12766;AO=6;DP=47;FAO=6;FDP=47;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0372729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.215;QD=2.77363;RBI=0.0688449;REFB=-0.00668125;REVB=-0.0578822;RO=41;SAF=5;SAR=1;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307895;STB=0.73823;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0406099;OID=.;OPOS=133039101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:47:47:41:41:6:6:0.12766:1:5:25:16:1:5:25:16
chr2	133039105	.	T	C	32.59	PASS	AF=0.12766;AO=6;DP=47;FAO=6;FDP=47;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0554518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8214;QD=2.77371;RBI=0.0723792;REFB=-0.00313974;REVB=0.0465172;RO=41;SAF=5;SAR=1;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307895;STB=0.73823;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0138493;OID=.;OPOS=133039105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:47:47:41:41:6:6:0.12766:1:5:25:16:1:5:25:16
chr2	133039156	.	TG	CA,CG	168.25	PASS	AF=0.133333,0.288889;AO=6,13;DP=45;FAO=6,13;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=5,12;FSAR=1,1;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0197731,-0.0180518;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=167.843,164.077;QD=14.9553;RBI=0.0591777,0.0553882;REFB=-0.0125872,-0.00360866;REVB=-0.0557765,-0.0523639;RO=25;SAF=5,12;SAR=1,1;SRF=11;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.472353,0.631319;STB=0.832224,0.892333;STBP=0.106,0.003;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0270449,0.00293511;OID=.,.;OPOS=133039156,133039156;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:45:45:25:26:6,13:6,13:0.133333,0.288889:1,1:5,12:11:14:1,1:5,12:11:15
chr2	133039164	.	C	T	58.75	PASS	AF=0.191489;AO=9;DP=47;FAO=9;FDP=47;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0218745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.744;QD=4.99981;RBI=0.0281525;REFB=-0.00239878;REVB=-0.017722;RO=37;SAF=8;SAR=1;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44907;STB=0.804223;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0131143;OID=.;OPOS=133039164;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:47:47:37:38:9:9:0.191489:1:8:22:15:1:8:23:15
chr2	133039166	.	T	C	101.52	PASS	AF=0.276596;AO=13;DP=47;FAO=13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0550145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3414;QD=8.6397;RBI=0.0951556;REFB=0.00210516;REVB=-0.0776401;RO=33;SAF=12;SAR=1;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.55319;STB=0.860304;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.0120467;OID=.;OPOS=133039166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:33:34:13:13:0.276596:1:12:19:14:1:12:19:15
chr2	133039221	.	C	T	85.97	PASS	AF=0.236364;AO=13;DP=55;FAO=13;FDP=55;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0297973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9718;QD=6.25261;RBI=0.0302294;REFB=-0.000664648;REVB=-0.00509338;RO=42;SAF=9;SAR=4;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18662;STB=0.617722;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.00308434;OID=.;OPOS=133039221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:55:55:42:42:13:13:0.236364:4:9:23:19:4:9:23:19
chr2	133174764	.	C	T	251.69	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00185857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.8608;QD=17.064;RBI=0.0616886;REFB=-0.000206737;REVB=0.0616606;RO=31;SAF=13;SAR=15;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0730345;STB=0.540975;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.00123487;OID=.;OPOS=133174764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:15:13:12:19:15:13:12:19
chr2	133174999	.	A	G	420.57	PASS	AF=0.457447;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=-0.0322025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.498;QD=17.8964;RBI=0.0349312;REFB=-0.0211188;REVB=-0.0135345;RO=51;SAF=22;SAR=21;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132294;STB=0.573737;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.025222;OID=.;OPOS=133174999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:51:51:43:43:0.457447:21:22:33:18:21:22:33:18
chr2	133281214	.	A	G	349.26	PASS	AF=0.618182;AO=34;DP=55;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.021855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.519;QD=25.4009;RBI=0.0235865;REFB=-0.0120954;REVB=0.00887043;RO=20;SAF=24;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222973;STB=0.615314;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.012457;OID=.;OPOS=133281214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:20:21:34:34:0.618182:10:24:8:12:10:24:9:12
chr2	133403017	.	C	T	118.4	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.0281346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2561;QD=13.1553;RBI=0.0709543;REFB=-0.0450218;REVB=-0.065138;RO=21;SAF=10;SAR=4;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.54047;STB=0.796733;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.116746;OID=.;OPOS=133403017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:22:14:14:0.388889:4:10:3:18:4:10:4:18
chr2	133489401	.	A	G	801.74	PASS	AF=0.526316;AO=79;DP=152;FAO=80;FDP=152;FR=.;FRO=72;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=26;FSRR=46;FWDB=-0.030739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0307;QD=21.0984;RBI=0.0559529;REFB=-0.00064694;REVB=-0.046753;RO=72;SAF=37;SAR=42;SRF=26;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943401;STB=0.548639;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=5.13124e-05;OID=.;OPOS=133489401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:152:72:72:79:80:0.526316:42:37:26:46:43:37:26:46
chr2	133489601	.	A	G	346.26	PASS	AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.00190947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5379;QD=16.8907;RBI=0.00415548;REFB=-0.016257;REVB=0.00369079;RO=42;SAF=20;SAR=17;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0989737;STB=0.533004;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0154758;OID=.;OPOS=133489601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:42:45:37:37:0.45122:17:20:27:15:17:20:27:18
chr2	133539566	.	G	A	2219.67	PASS	AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256397;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.928;QD=63.4192;RBI=0.0278585;REFB=0;REVB=0.010895;RO=0;SAF=65;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32058e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.25574e-05;OID=.;OPOS=133539566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:75:65:0:0:75:65:0:0
chr2	133541107	.	T	A	236.43	PASS	AF=0.345238;AO=29;DP=84;FAO=29;FDP=84;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.00816977;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.932;QD=11.2584;RBI=0.0219253;REFB=-0.024429;REVB=-0.0203464;RO=54;SAF=19;SAR=10;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159607;STB=0.599248;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0440427;OID=.;OPOS=133541107;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:54:55:29:29:0.345238:10:19:28:26:10:19:28:27
chr2	133541444	.	T	C	2586.45	PASS	AF=0.994083;AO=168;DP=168;FAO=168;FDP=169;FR=.;FRO=1;FSAF=87;FSAR=81;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0044411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.205;QD=61.2178;RBI=0.0060126;REFB=-0.0034507;REVB=0.00405314;RO=0;SAF=87;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99687e-08;STB=0.502857;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=3.72342e-06;OID=.;OPOS=133541444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:168:169:0:1:168:168:0.994083:81:87:0:0:81:87:1:0
chr2	133541454	.	A	G	2195.63	PASS	AF=0.980132;AO=148;DP=152;FAO=148;FDP=151;FR=.;FRO=3;FSAF=86;FSAR=62;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0100334;FXX=0.00657851;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.293;QD=58.1623;RBI=0.0117896;REFB=-0.100049;REVB=-0.00619075;RO=1;SAF=86;SAR=62;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00549866;STB=0.50857;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=2.63172e-05;OID=.;OPOS=133541454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:152:151:1:3:148:148:0.980132:62:86:1:0:62:86:3:0
chr2	133541575	.	C	T	294.1	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0178278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.959;QD=17.5583;RBI=0.0216638;REFB=-0.0250158;REVB=0.0123081;RO=34;SAF=16;SAR=16;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813212;STB=0.53729;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0257329;OID=.;OPOS=133541575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:34:35:32:32:0.477612:16:16:20:14:16:16:20:15
chr2	133542014	.	T	C	1410.15	PASS	AF=1;AO=68;DP=86;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6185;QD=62.6735;RBI=0.136836;REFB=0;REVB=0.125371;RO=0;SAF=48;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108098;OID=.;OPOS=133542014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:90:0:0:68:90:1:20:48:0:0:41:49:0:0
chr2	133542545	.	G	A	153.61	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0523494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.936;QD=21.9445;RBI=0.0580298;REFB=0.00590344;REVB=-0.02504;RO=12;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332431;STB=0.687265;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.00415547;OID=.;OPOS=133542545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:11:5:9:3:11:5:9:3
chr2	133542574	.	C	T	176.27	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00191444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.992;QD=20.7378;RBI=0.0268444;REFB=-0.0156302;REVB=-0.0267761;RO=15;SAF=15;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.421056;STB=0.731415;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0254602;OID=.;OPOS=133542574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:16:18:18:0.529412:3:15:6:9:3:15:7:9
chr2	133554288	.	A	G	582.38	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.124592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4704;QD=58.238;RBI=0.124923;REFB=-0.0337408;REVB=0.00908119;RO=1;SAF=19;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240334;STB=0.512814;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0030463;OID=.;OPOS=133554288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:20:19:1:0:20:19:1:0
chr2	134884697	.	G	C	186.84	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=2;FWDB=0.0114796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6222;QD=19.6668;RBI=0.0140058;REFB=-0.0492808;REVB=-0.00802371;RO=19;SAF=12;SAR=7;SRF=17;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274914;STB=0.652598;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0298509;OID=.;OPOS=134884697;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:7:12:17:2:7:12:17:2
chr2	134884700	.	G	A	186.56	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00715726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.115;QD=19.638;RBI=0.0245562;REFB=-0.0133231;REVB=-0.02349;RO=19;SAF=17;SAR=2;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386867;STB=0.724825;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0224209;OID=.;OPOS=134884700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:2:17:12:7:2:17:12:7
chr2	135185942	.	C	T	445.53	PASS	AF=0.617647;AO=42;DP=67;FAO=42;FDP=68;FR=.;FRO=26;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0356432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9312;QD=26.2077;RBI=0.0543819;REFB=-0.0141869;REVB=-0.0410725;RO=25;SAF=25;SAR=17;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319834;STB=0.523449;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.00388053;OID=.;OPOS=135185942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:25:26:42:42:0.617647:17:25:16:9:17:25:17:9
chr2	135628585	.	G	A	170.61	PASS	AF=0.349206;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0144702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.492;QD=10.8322;RBI=0.0148721;REFB=-0.0124447;REVB=0.00343427;RO=41;SAF=13;SAR=9;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142595;STB=0.583137;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0265503;OID=.;OPOS=135628585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:41:41:22:22:0.349206:9:13:19:22:9:13:19:22
chr2	135710322	.	A	G	632.18	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.138376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8691;QD=61.6763;RBI=0.138408;REFB=0;REVB=0.00296041;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0019842;OID=.;OPOS=135710322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:16:25:0:0:16:25:0:0
chr2	135711515	.	A	AT	89.54	PASS	AF=1;AO=4;DP=14;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492002;FXX=0.28551;HRUN=0;LEN=1;MLLD=56.0908;QD=35.8144;RBI=0.0829419;REFB=0;REVB=0.0667735;RO=10;SAF=2;SAR=2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217427;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00830657;OID=.;OPOS=135711516;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:14:10:10:0:6:4:0:0:3:10:2:2:7:3
chr2	135711516	.	C	A,T	156.41	PASS	AF=0.285714,0.714286;AO=4,10;DP=14;FAO=4,10;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2,7;FSAR=2,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00176713,0.0252744;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=118.279,88.3221;QD=44.6898;RBI=0.0551907,0.0650937;REFB=0,0;REVB=-0.0551624,0.0599866;RO=0;SAF=2,7;SAR=2,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.090713,0.00278301;OID=.,.;OPOS=135711516,135711516;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:21:14:14:0:0:4,10:4,10:0.285714,0.714286:2,3:2,7:0:0:2,3:2,7:0:0
chr2	135711657	.	G	A	640.07	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.681;QD=60.9592;RBI=0.0603271;REFB=0;REVB=0.0331693;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203496;OID=.;OPOS=135711657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:42:0:0:39:42:1:23:16:0:0:23:19:0:0
chr2	135740876	.	A	G	93.08	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00901108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.133;QD=9.30813;RBI=0.00942924;REFB=-0.0184794;REVB=-0.00277687;RO=28;SAF=8;SAR=4;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347068;STB=0.709343;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.046447;OID=.;OPOS=135740876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:40:40:28:28:12:12:0.3:4:8:10:18:4:8:10:18
chr2	135745392	.	G	A	239.34	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0167333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.623;QD=20.8119;RBI=0.0251126;REFB=-0.0156186;REVB=-0.0187253;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120584;STB=0.564916;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.013735;OID=.;OPOS=135745392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:23:22:23:0.5:10:12:9:13:11:12:9:14
chr2	135745545	.	C	T	156.22	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0798784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.6469;QD=15.6216;RBI=0.0852207;REFB=-0.00436307;REVB=-0.0296988;RO=23;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211591;STB=0.512181;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.00997927;OID=.;OPOS=135745545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:10:7:9:14:10:7:9:14
chr2	135745722	.	A	G	45.98	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0194895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.352;QD=9.19571;RBI=0.0424548;REFB=-0.0116835;REVB=-0.037717;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118161;STB=0.57355;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0497986;OID=.;OPOS=135745722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:2:5:8:5:2:5:8:5
chr2	135911422	.	T	C	742.6	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.063134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.2944;QD=59.408;RBI=0.0703064;REFB=-0.155875;REVB=0.030937;RO=1;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149366;STB=0.506349;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00587457;OID=.;OPOS=135911422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:1:2:48:48:0.96:31:17:0:1:31:17:1:1
chr2	136407479	.	A	G	1139.99	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295845;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.023;QD=60.7993;RBI=0.0323409;REFB=0;REVB=0.0130647;RO=0;SAF=62;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128503;OID=.;OPOS=136407479;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:13:62:0:0:13:62:0:0
chr2	136481627	.	A	AC	48.11	PASS	AF=0.217949;AO=16;DP=79;FAO=17;FDP=78;FR=.;FRO=61;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.0415254;FXX=0.0370325;HRUN=0;LEN=1;MLLD=105.514;QD=2.46741;RBI=0.0467482;REFB=-0.00487876;REVB=-0.0214717;RO=60;SAF=6;SAR=10;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963674;STB=0.511614;STBP=0.94;TYPE=ins;VARB=0.147055;OID=.;OPOS=136481628;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.217949:16:79:17:78:61:7:10:26:35:48:60:6:10:27:33
chr2	136481785	.	T	G	141.34	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0547361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.13;QD=21.7441;RBI=0.054797;REFB=-0.0385254;REVB=-0.00258453;RO=11;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420945;STB=0.523778;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0124363;OID=.;OPOS=136481785;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:9:6:5:6:9:6:5:6
chr2	136482180	.	T	C	423.82	PASS	AF=0.68;AO=34;DP=50;FAO=34;FDP=50;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.012567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.983;QD=33.9052;RBI=0.0279204;REFB=-0.013652;REVB=0.0249323;RO=16;SAF=14;SAR=20;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896896;STB=0.548897;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00917221;OID=.;OPOS=136482180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:16:16:34:34:0.68:20:14:9:7:20:14:9:7
chr2	136511842	.	C	A	351.18	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0586508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.011;QD=23.412;RBI=0.0589966;REFB=-0.013029;REVB=0.00637768;RO=24;SAF=15;SAR=20;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145025;STB=0.571388;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00790417;OID=.;OPOS=136511842;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:24:25:35:35:0.583333:20:15:15:9:20:15:15:10
chr2	136546110	.	A	G	140.64	PASS	AF=0.316667;AO=19;DP=60;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=10;FWDB=-0.0528181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9829;QD=9.3757;RBI=0.063406;REFB=-0.0114911;REVB=0.0350794;RO=41;SAF=15;SAR=4;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553468;STB=0.532959;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0148889;OID=.;OPOS=136546110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:41:41:19:19:0.316667:4:15:31:10:4:15:31:10
chr2	136555659	.	T	C	279.34	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0015865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.176;QD=18.9386;RBI=0.017476;REFB=-0.0203269;REVB=0.0174039;RO=29;SAF=14;SAR=16;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162928;STB=0.509085;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0211453;OID=.;OPOS=136555659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:16:14:13:16:16:14:13:16
chr2	136561557	.	G	A	1322.03	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00374183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.677;QD=62.2132;RBI=0.0103098;REFB=0;REVB=-0.00960675;RO=0;SAF=49;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.57342e-05;OID=.;OPOS=136561557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:85:0:0:82:85:1:33:49:0:0:35:50:0:0
chr2	136567841	.	G	A	326.17	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.00576933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.441;QD=20.0721;RBI=0.00737515;REFB=-0.0212633;REVB=-0.00459431;RO=31;SAF=14;SAR=20;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251858;STB=0.639352;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0252141;OID=.;OPOS=136567841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:20:14:22:9:20:14:22:9
chr2	136575198	.	CG	CT,GT	92.72	PASS	AF=0.52381,0;AO=9,2;DP=21;FAO=11,0;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=7,0;FSAR=4,0;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00741668,-0.00808972;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=194.138,189.303;QD=17.6601;RBI=0.0388375,0.0527643;REFB=0.0174783,0.0261002;REVB=0.0381228,-0.0521404;RO=8;SAF=7,0;SAR=2,2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.355772,-0.55315;STB=0.613825,0.5;STBP=0.313,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0115926,0;OID=.,.;OPOS=136575199,136575198;OREF=G,CG;OALT=T,GT;OMAPALT=CT,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:21:21:8:10:9,2:11,0:0.52381,0:2,2:7,0:3:5:4,0:7,0:4:6
chr2	136575534	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.865;QD=33.4272;RBI=0.0372218;REFB=0;REVB=0.0298754;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143045;OID=.;OPOS=136575534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr2	136590746	.	C	T	304.95	PASS	AF=0.357798;AO=39;DP=109;FAO=39;FDP=109;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=0.00611418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.016;QD=11.1909;RBI=0.0211416;REFB=-0.0071102;REVB=0.0202382;RO=69;SAF=26;SAR=13;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21599;STB=0.628863;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0110167;OID=.;OPOS=136590746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:69:70:39:39:0.357798:13:26:33:36:13:26:33:37
chr2	136623717	.	C	T	126.19	PASS	AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0183648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.157;QD=10.9729;RBI=0.0209171;REFB=-0.00171224;REVB=-0.010013;RO=31;SAF=10;SAR=5;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177104;STB=0.605915;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00447195;OID=.;OPOS=136623717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:5:10:16:15:5:10:16:15
chr2	136624155	.	G	A	143.51	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0211378;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.355;QD=14.0013;RBI=0.0281121;REFB=-0.0145308;REVB=-0.0185334;RO=25;SAF=11;SAR=5;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265318;STB=0.654974;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0254292;OID=.;OPOS=136624155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:25:25:16:16:0.390244:5:11:11:14:5:11:11:14
chr2	136700927	.	T	C	165.73	PASS	AF=0.391304;AO=17;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0069005;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.761;QD=14.411;RBI=0.0197845;REFB=-0.019278;REVB=-0.0185421;RO=28;SAF=11;SAR=6;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854415;STB=0.562429;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0294996;OID=.;OPOS=136700927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:17:18:0.391304:6:11:16:12:6:12:16:12
chr2	136743080	.	G	C	260.47	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0264626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.083;QD=18.943;RBI=0.0399321;REFB=-0.0447633;REVB=0.0299049;RO=27;SAF=14;SAR=14;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488099;STB=0.527253;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.0409471;OID=.;OPOS=136743080;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:14:14:12:15:14:14:12:15
chr2	136873549	.	A	T	33.72	PASS	AF=0.103448;AO=11;DP=86;FAO=9;FDP=87;FR=.;FRO=78;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=46;FSRR=32;FWDB=-0.0221284;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=42.5331;QD=1.55052;RBI=0.0222505;REFB=-0.00547158;REVB=-0.00232785;RO=66;SAF=9;SAR=2;SRF=40;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305859;STB=0.829339;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0257652;OID=.;OPOS=136873549;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:86:87:66:78:11:9:0.103448:2:9:40:26:1:8:46:32
chr2	137639841	.	A	G	586.49	PASS	AF=0.427586;AO=62;DP=145;FAO=62;FDP=145;FR=.;FRO=83;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=44;FSRR=39;FWDB=0.0363327;FXX=0.00684885;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.06;QD=16.1789;RBI=0.0412071;REFB=-0.011821;REVB=0.0194413;RO=82;SAF=28;SAR=34;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074179;STB=0.544954;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0121542;OID=.;OPOS=137639841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:82:83:62:62:0.427586:34:28:43:39:34:28:44:39
chr2	137988626	.	C	T	835.73	PASS	AF=0.475138;AO=85;DP=180;FAO=86;FDP=181;FR=.;FRO=95;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=60;FSRR=35;FWDB=-0.0108406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0591;QD=18.4691;RBI=0.0437604;REFB=-0.00284057;REVB=0.0423964;RO=94;SAF=44;SAR=41;SRF=59;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105267;STB=0.563163;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0024672;OID=.;OPOS=137988626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:181:94:95:85:86:0.475138:41:44:59:35:42:44:60:35
chr2	138237038	.	C	T	141.87	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.069934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9213;QD=16.6903;RBI=0.130623;REFB=-0.00657942;REVB=-0.110325;RO=16;SAF=11;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176129;STB=0.576514;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.00578661;OID=.;OPOS=138237038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:18:16:16:0.470588:5:11:8:8:5:11:10:8
chr2	139045852	.	A	G	101.9	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00847321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.62;QD=8.86098;RBI=0.024023;REFB=-0.0167192;REVB=-0.0224791;RO=33;SAF=8;SAR=5;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222674;STB=0.635555;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0495297;OID=.;OPOS=139045852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:5:8:14:19:5:8:14:19
chr2	139045972	.	T	C	55.74	PASS	AF=0.219512;AO=9;DP=41;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0101676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5461;QD=5.4384;RBI=0.0484535;REFB=-0.0110555;REVB=0.0473746;RO=32;SAF=5;SAR=4;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470404;STB=0.53032;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0422148;OID=.;OPOS=139045972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:41:41:32:32:9:9:0.219512:4:5:19:13:4:5:19:13
chr2	139326879	.	G	C	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000784252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.141;QD=57.1057;RBI=0.0266704;REFB=0;REVB=-0.0266588;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.22448e-05;OID=.;OPOS=139326879;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0
chr2	139429068	.	G	A	1121.62	PASS	AF=0.986842;AO=74;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.010502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.675;QD=59.0326;RBI=0.0319854;REFB=-0.146702;REVB=0.0302121;RO=1;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111316;STB=0.505881;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00086494;OID=.;OPOS=139429068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:76:1:1:74:75:0.986842:42:32:0:1:42:33:0:1
chr2	139621308	.	C	T	659.54	PASS	AF=0.566372;AO=64;DP=113;FAO=64;FDP=113;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0165172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.9808;QD=23.3467;RBI=0.0591232;REFB=-0.0245101;REVB=-0.0567691;RO=45;SAF=25;SAR=39;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595808;STB=0.553175;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.020954;OID=.;OPOS=139621308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:45:49:64:64:0.566372:39:25:21:24:39:25:25:24
chr2	139621319	.	A	ATCT	319.39	PASS	AF=0.375;AO=38;DP=112;FAO=39;FDP=104;FR=.;FRO=65;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=-0.0240372;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=3;MLLD=215.728;QD=12.2842;RBI=0.0293184;REFB=-0.0290326;REVB=-0.0167864;RO=71;SAF=17;SAR=21;SRF=32;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00381335;STB=0.525883;STBP=0.657;TYPE=ins;VARB=0.0418065;OID=.;OPOS=139621320;OREF=-;OALT=TCT;OMAPALT=ATCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375:38:112:39:104:65:17:22:31:34:99:71:17:21:32:39
chr2	139621326	.	G	A	488.15	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=101;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.0278258;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9097;QD=19.5261;RBI=0.0284241;REFB=-0.0185512;REVB=-0.00580105;RO=50;SAF=20;SAR=30;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0739645;STB=0.540967;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0249488;OID=.;OPOS=139621326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:50:50:50:50:0.5:30:20:24:26:30:20:24:26
chr2	140979107	.	C	T	1237.53	PASS	AF=0.90099;AO=89;DP=101;FAO=91;FDP=101;FR=.;FRO=10;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.018667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.985;QD=49.0109;RBI=0.0307172;REFB=-0.00700513;REVB=-0.0243944;RO=0;SAF=41;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30324e-08;STB=0.523659;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.000684749;OID=.;OPOS=140979107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:101:101:0:10:89:91:0.90099:48:41:0:0:49:42:7:3
chr2	141274576	.	T	C	867.28	PASS	AF=0.926471;AO=63;DP=68;FAO=63;FDP=68;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0581104;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.092;QD=51.0163;RBI=0.0581483;REFB=-0.186828;REVB=0.00209784;RO=1;SAF=23;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200866;STB=0.549004;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00149581;OID=.;OPOS=141274576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:68:68:1:5:63:63:0.926471:40:23:1:0:40:23:5:0
chr2	141571329	.	T	C	1080.37	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.74;QD=60.0207;RBI=0.0255621;REFB=0;REVB=0.00334346;RO=0;SAF=45;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.27338e-05;OID=.;OPOS=141571329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:25:45:0:0:26:46:0:0
chr2	141625673	.	G	A	425.03	PASS	AF=0.451923;AO=46;DP=107;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.0110272;FXX=0.0280348;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.043;QD=16.3472;RBI=0.0114151;REFB=-0.00710575;REVB=0.00295074;RO=57;SAF=32;SAR=14;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12806;STB=0.561377;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0113475;OID=.;OPOS=141625673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:104:57:57:46:47:0.451923:14:32:33:24:15:32:33:24
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chr2	141709419	.	T	G	197.2	PASS	AF=0.352113;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=0.034535;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5316;QD=11.1099;RBI=0.040318;REFB=-0.0130486;REVB=-0.0208056;RO=45;SAF=16;SAR=9;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060165;STB=0.539969;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0248034;OID=.;OPOS=141709419;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:45:46:25:25:0.352113:9:16:31:14:9:16:32:14
chr2	141750164	.	A	T	228.05	PASS	AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.00575694;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.899;QD=13.8211;RBI=0.0334119;REFB=-0.013401;REVB=-0.0329122;RO=39;SAF=14;SAR=13;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101124;STB=0.55752;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0206601;OID=.;OPOS=141750164;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:39:39:27:27:0.409091:13:14:24:15:13:14:24:15
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chr2	141816621	.	A	G	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.219;QD=63.8712;RBI=0.0712904;REFB=0;REVB=0.0567779;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144218;OID=.;OPOS=141816621;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:17:31:0:0:17:31:0:0
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chr2	148716374	.	T	C	163.72	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0612276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0245;QD=13.365;RBI=0.0613034;REFB=-0.0156247;REVB=-0.00304918;RO=29;SAF=5;SAR=13;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236007;STB=0.66083;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0225869;OID=.;OPOS=148716374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:31:18:18:0.367347:13:5:14:15:13:5:16:15
chr2	149803531	.	C	T	102.71	PASS	AF=0.235294;AO=16;DP=68;FAO=16;FDP=68;FR=.;FRO=52;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=-0.0840088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2944;QD=6.04202;RBI=0.113997;REFB=0.000305522;REVB=-0.077058;RO=49;SAF=6;SAR=10;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307079;STB=0.703988;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=-0.00771392;OID=.;OPOS=149803531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:49:52:16:16:0.235294:10:6:31:18:10:6:34:18
chr2	149838032	.	C	T	831.17	PASS	AF=0.485714;AO=84;DP=174;FAO=85;FDP=175;FR=.;FRO=90;FSAF=57;FSAR=28;FSRF=61;FSRR=29;FWDB=-0.00749372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.453;QD=18.9981;RBI=0.0129214;REFB=-0.0174158;REVB=-0.0105265;RO=90;SAF=57;SAR=27;SRF=61;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000852163;STB=0.504196;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0190258;OID=.;OPOS=149838032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:175:90:90:84:85:0.485714:27:57:61:29:28:57:61:29
chr2	150432976	.	C	T	255.68	PASS	AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00269691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.195;QD=29.2201;RBI=0.0140922;REFB=-0.0142142;REVB=-0.0138317;RO=12;SAF=13;SAR=10;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409757;STB=0.522593;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.00701458;OID=.;OPOS=150432976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:12:12:23:23:0.657143:10:13:6:6:10:13:6:6
chr2	151219274	.	G	A	109.55	PASS	AF=0.277778;AO=15;DP=54;FAO=15;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=-0.0239127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1718;QD=8.11458;RBI=0.0268862;REFB=-0.00718961;REVB=-0.0122903;RO=37;SAF=9;SAR=6;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16742;STB=0.612767;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0171854;OID=.;OPOS=151219274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:37:39:15:15:0.277778:6:9:27:10:6:9:29:10
chr2	151219315	.	C	T	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.714;QD=57.8843;RBI=0.048076;REFB=0;REVB=0.0321609;RO=0;SAF=38;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000252976;OID=.;OPOS=151219315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:22:38:0:0:22:38:0:0
chr2	152117957	.	T	C	263.61	PASS	AF=0.330097;AO=34;DP=104;FAO=34;FDP=103;FR=.;FRO=69;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=42;FSRR=27;FWDB=-0.0333572;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.985;QD=10.2371;RBI=0.0422887;REFB=-0.0167096;REVB=-0.0259929;RO=69;SAF=22;SAR=12;SRF=43;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297952;STB=0.527659;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0349935;OID=.;OPOS=152117957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:103:69:69:34:34:0.330097:12:22:43:26:12:22:42:27
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chr2	152988610	.	C	CT,T	714.18	PASS	AF=1,0;AO=49,2;DP=53;FAO=53,0;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34,0;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0621198,-0.112248;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=23.294,4.37682;QD=53.9007;RBI=0.0804878,0.123192;REFB=0,0;REVB=-0.0511802,-0.0507601;RO=1;SAF=31,1;SAR=18,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.014941,-0.25849;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00247819,0;OID=.,.;OPOS=152988611,152988610;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:1:0:49,2:53,0:1,0:18,1:31,1:1:0:19,0:34,0:0:0
chr2	153378459	.	T	C	1103.42	PASS	AF=0.961538;AO=75;DP=79;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.066286;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.396;QD=56.5854;RBI=0.0671879;REFB=-0.0510048;REVB=-0.0109716;RO=2;SAF=33;SAR=42;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00298944;STB=0.508824;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.00232293;OID=.;OPOS=153378459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:79:78:2:3:75:75:0.961538:42:33:1:1:42:33:2:1
chr2	153399253	.	GA	AG,G,GG	1144.33	PASS	AF=0.0674157,0.898876,0.0337079;AO=6,32,8;DP=86;FAO=6,80,3;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=0,38,0;FSAR=6,42,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368078,0.951364,0.470757;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=168.174,20.9884,7.08011;QD=51.4307;RBI=0.0811416,0.954519,0.480669;REFB=0,0,0;REVB=-0.0723129,0.0775438,0.0971093;RO=40;SAF=0,0,0;SAR=6,32,8;SRF=38;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.856675,-0.892552,-0.865717;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0.0900142,0.0519572,0.0184251;OID=.,.,.;OPOS=153399253,153399254,153399254;OREF=GA,A,A;OALT=AG,-,G;OMAPALT=AG,G,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:86:89:40:0:6,32,8:6,80,3:0.0674157,0.898876,0.0337079:6,32,8:0,0,0:38:2:6,42,3:0,38,0:0:0
chr2	153405594	.	G	A	1062.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.902;QD=59.8552;RBI=0.01803;REFB=0;REVB=-0.00541116;RO=0;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.12903e-05;OID=.;OPOS=153405594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:30:41:0:0:30:41:0:0
chr2	153476066	.	G	GCCA	115.25	PASS	AF=1;AO=9;DP=30;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.0832639;HRUN=5;LEN=3;MLLD=250.991;QD=41.9079;RBI=0.0474914;REFB=0;REVB=0.0474914;RO=19;SAF=0;SAR=9;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.814565;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000393664;OID=.;OPOS=153476067;OREF=-;OALT=CCA;OMAPALT=GCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:9:30:11:11:0:0:11:0:0:4:19:0:9:14:5
chr2	153511027	.	T	C	1272.86	PASS	AF=0.988095;AO=82;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.038277;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.898;QD=60.6123;RBI=0.0614324;REFB=-0.12401;REVB=0.04805;RO=1;SAF=38;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122993;STB=0.506492;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000633097;OID=.;OPOS=153511027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:84:84:1:1:82:83:0.988095:44:38:1:0:45:38:1:0
chr2	153577013	.	G	A	972.85	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.251;QD=58.9608;RBI=0.0288006;REFB=0;REVB=-0.00952511;RO=0;SAF=42;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1333e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.84398e-05;OID=.;OPOS=153577013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:24:42:0:0:24:42:0:0
chr2	155265623	.	G	A	155.61	PASS	AF=0.338462;AO=19;DP=62;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0284526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.921;QD=9.57624;RBI=0.0367722;REFB=-0.0107617;REVB=-0.0232947;RO=37;SAF=8;SAR=11;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497195;STB=0.538427;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0239707;OID=.;OPOS=155265623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:65:37:43:19:22:0.338462:11:8:14:23:11:11:19:24
chr2	155307336	.	G	C,T	1500.48	PASS	AF=0.932039,0.0679612;AO=96,7;DP=103;FAO=96,7;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=59,3;FSAR=37,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000739913,-0.0134307;FXX=0.00961446;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=166.841,137.742;QD=58.271;RBI=0.0248556,0.0138407;REFB=0,0;REVB=0.0248445,0.00334389;RO=0;SAF=59,2;SAR=37,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.78952e-08,-3.27427e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000498768,0.0400843;OID=.,.;OPOS=155307336,155307336;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:103:103:0:0:96,7:96,7:0.932039,0.0679612:37,5:59,2:0:0:37,4:59,3:0:0
chr2	156120552	.	A	G	1013.14	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00285826;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.003;QD=59.5964;RBI=0.021713;REFB=0;REVB=0.0215241;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.65672e-05;OID=.;OPOS=156120552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:38:30:0:0:38:30:0:0
chr2	156168039	.	T	G	975.76	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0957009;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.183;QD=59.1372;RBI=0.097193;REFB=0;REVB=0.0169653;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000271762;OID=.;OPOS=156168039;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:66:0:0:61:66:1:27:34:0:0:28:38:0:0
chr2	157189011	.	G	C	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.478;QD=59.0173;RBI=0.060307;REFB=0;REVB=0.0345328;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000604722;OID=.;OPOS=157189011;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0
chr2	157257361	.	G	A	1169.47	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.997;QD=60.7518;RBI=0.0503286;REFB=0;REVB=-0.0458457;RO=0;SAF=32;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.06449e-05;OID=.;OPOS=157257361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:77:0:0:75:77:1:43:32:0:0:44:33:0:0
chr2	157257364	.	G	GT,T	73.38	PASS	AF=0.375,0;AO=10,13;DP=74;FAO=27,0;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=21,0;FSAR=6,0;FSRF=11;FSRR=34;FWDB=-0.0979942,0.00556126;FXX=0.0136968;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=10.2594,199.055;QD=4.07687;RBI=0.0980689,0.0111925;REFB=-0.133087,0.0028593;REVB=0.00382723,0.00971313;RO=51;SAF=7,12;SAR=3,1;SRF=14;SRR=37;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.491543,0.720714;STB=0.813737,0.5;STBP=0,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.121669,0;OID=.,.;OPOS=157257365,157257364;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:74:72:51:45:10,13:27,0:0.375,0:3,1:7,12:14:37:6,0:21,0:11:34
chr2	157406249	.	G	A	715.41	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0128609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2205;QD=60.8861;RBI=0.0506882;REFB=-0.17196;REVB=0.0490295;RO=1;SAF=31;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014927;STB=0.507933;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.00326383;OID=.;OPOS=157406249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:47:47:1:1:46:46:0.978723:15:31:1:0:15:31:1:0
chr2	158114824	.	C	T	124.88	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.000957964;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=334.974;QD=17.8403;RBI=0.00216864;REFB=-0.00829216;REVB=-0.00194558;RO=14;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188032;STB=0.606997;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00837815;OID=.;OPOS=158114824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:7:7:10:4:7:7:10:4
chr2	158155446	.	ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCG	ACGGAAGACCGGAAGACCG,ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCA	663.0	PASS	AF=0.55102,0.44898;AO=23,14;DP=52;FAO=27,22;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=14,7;FSAR=13,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268397,0.064257;FXX=0.0754575;HRUN=2,2;LEN=8,1;MLLD=198.918,247.225;QD=54.1228;RBI=0.0268521,0.0648908;REFB=0,0;REVB=0.000815332,-0.00904715;RO=0;SAF=12,6;SAR=11,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0164921,0.0269163;OID=.,.;OPOS=158155447,158155472;OREF=CGGAAGAC,G;OALT=-,A;OMAPALT=ACGGAAGACCGGAAGACCG,ACGGAAGACCGGAAGACCGGAAGACCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.55102,0.44898:23,14:52:27,22:49:0:14,7:13,15:0:0:99:0:12,6:11,8:0:0
chr2	158155480	.	A	G	154.91	PASS	AF=0.36;AO=17;DP=49;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0276488;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.561;QD=12.3931;RBI=0.0294764;REFB=-0.0172759;REVB=0.0102179;RO=32;SAF=4;SAR=13;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408964;STB=0.74855;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0216754;OID=.;OPOS=158155480;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:32:32:17:18:0.36:13:4:19:13:14:4:19:13
chr2	158155548	.	G	T	275.67	PASS	AF=0.705882;AO=24;DP=34;FAO=24;FDP=34;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0189492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.725;QD=32.4313;RBI=0.0266744;REFB=0.00702972;REVB=0.0187737;RO=10;SAF=11;SAR=13;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022448;STB=0.512305;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=-0.00278735;OID=.;OPOS=158155548;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:10:10:24:24:0.705882:13:11:5:5:13:11:5:5
chr2	158155576	.	G	A	393.1	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00146179;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=243.172;QD=50.7226;RBI=0.00168518;REFB=-0.202918;REVB=0.000838457;RO=1;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344827;STB=0.53569;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00172732;OID=.;OPOS=158155576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:31:31:1:2:29:29:0.935484:13:16:0:1:13:16:0:2
chr2	158157361	.	C	T	1170.33	PASS	AF=0.55122;AO=113;DP=205;FAO=113;FDP=205;FR=.;FRO=92;FSAF=74;FSAR=39;FSRF=50;FSRR=42;FWDB=0.000840071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.714;QD=22.8356;RBI=0.0121751;REFB=-0.00504828;REVB=-0.012146;RO=92;SAF=74;SAR=39;SRF=50;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0979417;STB=0.553453;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.003573;OID=.;OPOS=158157361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:205:205:92:92:113:113:0.55122:39:74:50:42:39:74:50:42
chr2	158291188	.	A	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315873;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=371.776;QD=51.1846;RBI=0.037946;REFB=0;REVB=0.0210271;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.22453e-05;OID=.;OPOS=158291188;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0
chr2	158386938	.	C	T	299.05	PASS	AF=0.445946;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=-0.00782748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.143;QD=16.1647;RBI=0.0180866;REFB=-0.0229345;REVB=-0.0163051;RO=41;SAF=19;SAR=14;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273329;STB=0.652989;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0130671;OID=.;OPOS=158386938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:41:41:33:33:0.445946:14:19:12:29:14:19:12:29
chr2	158443889	.	G	A	213.27	PASS	AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.000420537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.406;QD=12.5453;RBI=0.0427954;REFB=-0.0142749;REVB=0.0427934;RO=41;SAF=14;SAR=12;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024204;STB=0.50569;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0174488;OID=.;OPOS=158443889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:41:42:26:26:0.382353:12:14:23:18:12:14:23:19
chr2	158626980	.	C	T	1462.41	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.158;QD=62.2302;RBI=0.0190197;REFB=0;REVB=0.0111446;RO=0;SAF=37;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.41537e-05;OID=.;OPOS=158626980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:94:0:0:89:94:1:52:37:0:0:55:39:0:0
chr2	158636910	.	G	A	1456.42	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185523;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.279;QD=63.3227;RBI=0.0431597;REFB=0;REVB=0.0389688;RO=0;SAF=39;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.76156e-05;OID=.;OPOS=158636910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:92:0:0:92:92:1:53:39:0:0:53:39:0:0
chr2	158958551	.	G	GA	77.2	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0141953;FXX=0.0370233;HRUN=0;LEN=1;MLLD=315.734;QD=11.877;RBI=0.0237784;REFB=-0.00563553;REVB=-0.0190764;RO=16;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397865;STB=0.523762;STBP=0.847;TYPE=ins;VARB=0.0073527;OID=.;OPOS=158958552;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.384615:10:26:10:26:16:6:4:9:7:77:16:6:4:9:7
chr2	158958605	.	G	T	140.07	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.116553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7584;QD=20.7513;RBI=0.117352;REFB=-0.0114826;REVB=-0.0136724;RO=12;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138827;STB=0.578839;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0033985;OID=.;OPOS=158958605;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:5:10:6:6:5:10:6:6
chr2	159166069	.	T	C	753.05	PASS	AF=0.979592;AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0604063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7974;QD=61.4732;RBI=0.123518;REFB=-0.0198299;REVB=0.10774;RO=1;SAF=13;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347981;STB=0.517234;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00255187;OID=.;OPOS=159166069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:47:48:0.979592:34:13:1:0:34:14:1:0
chr2	159537868	.	A	G	537.39	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.973;QD=58.0963;RBI=0.0896246;REFB=0;REVB=0.0867407;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125069;OID=.;OPOS=159537868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:37:0:0:34:37:1:15:19:0:0:18:19:0:0
chr2	159663599	.	T	C	1044.08	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00727195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.751;QD=59.6616;RBI=0.0105822;REFB=0;REVB=0.00768775;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.15341e-07;OID=.;OPOS=159663599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:30:40:0:0:30:40:0:0
chr2	160019863	.	A	G	733.97	PASS	AF=0.979167;AO=42;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.010185;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.772;QD=61.1644;RBI=0.0926096;REFB=-0.00168895;REVB=-0.0920479;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511623;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.000564631;OID=.;OPOS=160019863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:0:1:42:47:0.979167:26:16:0:0:26:21:1:0
chr2	160035207	.	T	C	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.891;QD=58.2393;RBI=0.0563558;REFB=0;REVB=0.00273292;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.02479e-05;OID=.;OPOS=160035207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:36:26:0:0:36:26:0:0
chr2	160084473	.	A	C	320.85	PASS	AF=0.4375;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0478292;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.5579;QD=16.0425;RBI=0.0566906;REFB=-0.0295434;REVB=0.0304333;RO=46;SAF=11;SAR=24;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154642;STB=0.579844;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0405503;OID=.;OPOS=160084473;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:46:45:35:35:0.4375:24:11:21:25:24:11:20:25
chr2	160086653	.	CA	TG	425.15	PASS	AF=0.398374;AO=49;DP=124;FAO=49;FDP=123;FR=.;FRO=74;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=45;FSRR=29;FWDB=-0.0265995;FXX=0.00806387;HRUN=2;LEN=2;MLLD=161.491;QD=13.8261;RBI=0.0320853;REFB=-0.0220682;REVB=-0.0179426;RO=73;SAF=28;SAR=21;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491163;STB=0.522664;STBP=0.681;TYPE=mnp;VARB=0.0286696;OID=.;OPOS=160086653;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:123:73:74:49:49:0.398374:21:28:45:28:21:28:45:29
chr2	160086692	.	A	G	577.15	PASS	AF=0.418919;AO=61;DP=147;FAO=62;FDP=148;FR=.;FRO=86;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=50;FSRR=36;FWDB=0.0348695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.073;QD=15.5986;RBI=0.04427;REFB=-0.00620647;REVB=0.0272754;RO=84;SAF=37;SAR=24;SRF=49;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249717;STB=0.509248;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.00658243;OID=.;OPOS=160086692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:148:84:86:61:62:0.418919:24:37:49:35:25:37:50:36
chr2	160136337	.	G	A	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00576751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.725;QD=57.2026;RBI=0.0468378;REFB=0;REVB=0.0464814;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193214;OID=.;OPOS=160136337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr2	160182302	.	C	T	138.45	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0121305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0962;QD=12.5861;RBI=0.0303826;REFB=-0.0286172;REVB=-0.027856;RO=27;SAF=11;SAR=5;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111959;STB=0.556889;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0236692;OID=.;OPOS=160182302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:28:16:16:0.363636:5:11:16:11:5:11:17:11
chr2	160604452	.	C	T	594.45	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.863;QD=60.9695;RBI=0.0567566;REFB=0;REVB=0.0541036;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230734;OID=.;OPOS=160604452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr2	160605267	.	CT	C,CC	771.22	PASS	AF=0.0727273,0.927273;AO=13,42;DP=55;FAO=4,51;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=1,28;FSAR=3,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029576,0.0275251;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=335.832,343.953;QD=56.0886;RBI=0.0297443,0.0278715;REFB=0,0;REVB=0.00315983,0.00438094;RO=0;SAF=6,23;SAR=7,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00255428,0.00562245;OID=.,.;OPOS=160605268,160605268;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0727273,0.927273:13,42:55:4,51:55:0:1,28:3,23:0:0:10:0:6,23:7,19:0:0
chr2	160673526	.	A	G	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6294;QD=54.5172;RBI=0.0354725;REFB=0;REVB=0.0104455;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108487;OID=.;OPOS=160673526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr2	160676427	.	C	A	804.99	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.563;QD=64.3993;RBI=0.0232926;REFB=0;REVB=0.00517906;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.33576e-05;OID=.;OPOS=160676427;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:31:19:0:0:31:19:0:0
chr2	160710153	.	T	G	140.08	PASS	AF=0.333333;AO=18;DP=54;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0213709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.316;QD=10.3759;RBI=0.0261592;REFB=-0.0173012;REVB=0.0150861;RO=35;SAF=12;SAR=6;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810965;STB=0.540495;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.016427;OID=.;OPOS=160710153;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:35:36:18:18:0.333333:6:12:21:14:6:12:22:14
chr2	160710922	.	T	C	2963.1	PASS	AF=0.994709;AO=188;DP=189;FAO=188;FDP=189;FR=.;FRO=1;FSAF=106;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0225219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.18;QD=62.7111;RBI=0.0440508;REFB=-0.058789;REVB=0.0378582;RO=1;SAF=106;SAR=82;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00577158;STB=0.50303;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.000193992;OID=.;OPOS=160710922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:189:189:1:1:188:188:0.994709:82:106:0:1:82:106:0:1
chr2	160711045	.	G	C	680.98	PASS	AF=0.523438;AO=66;DP=128;FAO=67;FDP=128;FR=.;FRO=61;FSAF=17;FSAR=50;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=0.0229988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.183;QD=21.2807;RBI=0.0233988;REFB=-0.0191257;REVB=-0.00430781;RO=61;SAF=17;SAR=49;SRF=24;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142567;STB=0.580876;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0229892;OID=.;OPOS=160711045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:61:61:66:67:0.523438:49:17:24:37:50:17:24:37
chr2	160729005	.	C	T	293.52	PASS	AF=0.525424;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.0640682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6728;QD=19.8999;RBI=0.0640952;REFB=-0.0102265;REVB=0.0018594;RO=28;SAF=14;SAR=17;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113822;STB=0.563089;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00749908;OID=.;OPOS=160729005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:28:28:31:31:0.525424:17:14:9:19:17:14:9:19
chr2	160737663	.	T	A	305.31	PASS	AF=0.419753;AO=33;DP=80;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.00285904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.477;QD=15.077;RBI=0.00887706;REFB=-0.00581675;REVB=0.00840405;RO=45;SAF=16;SAR=17;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267715;STB=0.518508;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00708859;OID=.;OPOS=160737663;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:45:47:33:34:0.419753:17:16:23:22:17:17:25:22
chr2	160808075	.	C	T	255.48	PASS	AF=0.439394;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0440673;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.455;QD=15.4838;RBI=0.0489479;REFB=0.00857723;REVB=-0.0213065;RO=37;SAF=13;SAR=16;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111888;STB=0.506325;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=-0.0116782;OID=.;OPOS=160808075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:37:37:29:29:0.439394:16:13:17:20:16:13:17:20
chr2	160833188	.	A	G	2016.28	PASS	AF=1;AO=127;DP=129;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446683;FXX=0.015266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.53;QD=62.5202;RBI=0.0521084;REFB=0;REVB=0.0268334;RO=0;SAF=76;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.42534e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.40219e-05;OID=.;OPOS=160833188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:129:0:0:127:129:1:51:76:0:0:51:78:0:0
chr2	160885418	.	G	C	367.31	PASS	AF=0.487179;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0296119;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.737;QD=18.8362;RBI=0.0308962;REFB=-0.00693003;REVB=-0.00881546;RO=40;SAF=13;SAR=25;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197255;STB=0.610122;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00747306;OID=.;OPOS=160885418;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:40:40:38:38:0.487179:25:13:22:18:25:13:22:18
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chr2	160901517	.	A	G	443.37	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=-0.00348322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.719;QD=20.1531;RBI=0.0258939;REFB=0.0279186;REVB=0.0256586;RO=44;SAF=16;SAR=28;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0240698;OID=.;OPOS=160901517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:44:44:44:44:0.5:28:16:16:28:28:16:16:28
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chr2	163078171	.	C	CA	46.72	PASS	AF=0.275;AO=12;DP=41;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.0562824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=12.8106;QD=4.67151;RBI=0.158085;REFB=-0.0698621;REVB=-0.147727;RO=28;SAF=2;SAR=10;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.645787;STB=0.858339;STBP=0.013;TYPE=ins;VARB=0.118629;OID=.;OPOS=163078172;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.275:12:41:11:40:29:2:9:21:8:46:28:2:10:22:6
chr2	163353469	.	T	C	449.24	PASS	AF=0.475248;AO=48;DP=101;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.0216903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5589;QD=17.7915;RBI=0.0256826;REFB=-0.0181969;REVB=0.0137524;RO=53;SAF=25;SAR=23;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249207;STB=0.513854;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0185617;OID=.;OPOS=163353469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:53:53:48:48:0.475248:23:25:29:24:23:25:29:24
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chr2	163374577	.	G	A	487.1	PASS	AF=0.481481;AO=52;DP=107;FAO=52;FDP=108;FR=.;FRO=56;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=-0.0421923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1441;QD=18.0409;RBI=0.0443591;REFB=-0.026701;REVB=-0.0136944;RO=55;SAF=36;SAR=16;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113941;STB=0.559785;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0233245;OID=.;OPOS=163374577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:55:56:52:52:0.481481:16:36:32:23:16:36:33:23
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chr2	166170127	.	T	C	1935.92	PASS	AF=0.992126;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0678284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3077;QD=60.9739;RBI=0.0720846;REFB=0.0559673;REVB=0.0244029;RO=1;SAF=71;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00856097;STB=0.504504;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-7.31754e-05;OID=.;OPOS=166170127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:127:127:1:1:126:126:0.992126:55:71:0:1:55:71:0:1
chr2	166770120	.	A	G	421.27	PASS	AF=0.444444;AO=43;DP=98;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=-0.00842262;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.8134;QD=17.0211;RBI=0.017818;REFB=0.0166811;REVB=0.0157016;RO=55;SAF=15;SAR=28;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252559;STB=0.631616;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.0198426;OID=.;OPOS=166770120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:55:55:43:44:0.444444:28:15:33:22:28:16:33:22
chr2	166773971	.	G	A	63.69	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.128628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0517;QD=9.09828;RBI=0.128631;REFB=-0.011854;REVB=0.000928041;RO=19;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204999;STB=0.624732;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.019526;OID=.;OPOS=166773971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:4:5:7:12:4:5:7:12
chr2	166788336	.	T	C	1418.75	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251925;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.932;QD=63.0558;RBI=0.0436727;REFB=0;REVB=0.0356742;RO=0;SAF=65;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69099e-05;OID=.;OPOS=166788336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:90:0:0:91:90:1:26:65:0:0:25:65:0:0
chr2	166797646	.	C	T	375.91	PASS	AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0257945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.747;QD=21.1778;RBI=0.0580556;REFB=-0.0122132;REVB=-0.0520106;RO=33;SAF=20;SAR=18;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348725;STB=0.519278;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.00843302;OID=.;OPOS=166797646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:18:20:16:17:18:20:16:17
chr2	166892788	.	C	T	1116.74	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.253;QD=60.3646;RBI=0.0569726;REFB=0;REVB=-0.0118163;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105004;OID=.;OPOS=166892788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0
chr2	166897864	.	A	G	1542.28	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452452;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.568;QD=59.8942;RBI=0.0781117;REFB=0;REVB=0.0636734;RO=0;SAF=58;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000458815;OID=.;OPOS=166897864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:45:58:0:0:45:58:0:0
chr2	166903445	.	T	C	1612.91	PASS	AF=1;AO=106;DP=109;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00614359;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5973;QD=60.2959;RBI=0.00652378;REFB=0;REVB=0.00219453;RO=0;SAF=57;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155625;OID=.;OPOS=166903445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:107:0:0:106:107:1:49:57:0:0:49:58:0:0
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chr2	168108357	.	A	G	77.3	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0839688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9433;QD=13.4428;RBI=0.084147;REFB=-0.00622643;REVB=0.00547297;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160312;STB=0.535642;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00313711;OID=.;OPOS=168108357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:12:13:10:10:0.434783:4:6:7:5:4:6:7:6
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chr2	169462973	.	C	T	438.56	PASS	AF=0.42735;AO=48;DP=114;FAO=50;FDP=117;FR=.;FRO=67;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=32;FWDB=-0.0546119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.1522;QD=14.9933;RBI=0.0566191;REFB=0.0101011;REVB=-0.0149423;RO=66;SAF=19;SAR=29;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139819;STB=0.559012;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.0131323;OID=.;OPOS=169462973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:117:66:67:48:50:0.42735:29:19:35:31:29:21:35:32
chr2	169629494	.	G	A	454.84	PASS	AF=0.494505;AO=45;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0110308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.187;QD=19.993;RBI=0.0170144;REFB=-0.00344778;REVB=-0.0129541;RO=46;SAF=20;SAR=25;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508986;STB=0.528243;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00367441;OID=.;OPOS=169629494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:46:46:45:45:0.494505:25:20:23:23:25:20:23:23
chr2	169707428	.	C	T	1190.43	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00880882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9986;QD=61.0478;RBI=0.0203305;REFB=0;REVB=-0.0183231;RO=0;SAF=44;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000210342;OID=.;OPOS=169707428;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:34:44:0:0:34:44:0:0
chr2	169721377	.	G	A	657.01	PASS	AF=0.942308;AO=50;DP=52;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00377334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2435;QD=50.5389;RBI=0.0119664;REFB=-0.00823715;REVB=0.0113559;RO=2;SAF=31;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00918946;STB=0.50331;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.00344906;OID=.;OPOS=169721377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:52:52:2:3:50:49:0.942308:19:31:1:1:19:30:2:1
chr2	169789016	.	T	C	346.12	PASS	AF=0.507042;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.013982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.128;QD=19.4997;RBI=0.0220486;REFB=-0.0122241;REVB=0.0170483;RO=34;SAF=17;SAR=19;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272884;STB=0.507459;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0155629;OID=.;OPOS=169789016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:34:35:36:36:0.507042:19:17:15:19:19:17:16:19
chr2	169826877	.	C	T	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00901425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.779;QD=14.6571;RBI=0.0142843;REFB=-0.00874044;REVB=-0.0110808;RO=16;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522596;STB=0.550186;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.00523445;OID=.;OPOS=169826877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:17:13:13:0.433333:5:8:9:7:5:8:9:8
chr2	169830328	.	A	G	416.04	PASS	AF=0.446602;AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=-0.017952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4256;QD=16.157;RBI=0.0195909;REFB=-0.019736;REVB=-0.00784403;RO=57;SAF=23;SAR=23;SRF=37;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147869;STB=0.582489;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0230923;OID=.;OPOS=169830328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:57:57:46:46:0.446602:23:23:37:20:23:23:37:20
chr2	169952233	.	T	C	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336179;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.22;QD=64.4142;RBI=0.0342615;REFB=0;REVB=0.00660951;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.04285e-05;OID=.;OPOS=169952233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0
chr2	169995790	.	G	A	600.29	PASS	AF=0.586957;AO=54;DP=92;FAO=54;FDP=92;FR=.;FRO=38;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=0.0199677;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.735;QD=26.0996;RBI=0.0203789;REFB=-0.0125313;REVB=0.0040732;RO=38;SAF=27;SAR=27;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179677;STB=0.597791;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00649262;OID=.;OPOS=169995790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:38:38:54:54:0.586957:27:27:28:10:27:27:28:10
chr2	169997051	.	G	A	131.72	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0677708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9613;QD=22.9085;RBI=0.0678489;REFB=-0.0148108;REVB=0.00325354;RO=8;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125035;STB=0.51019;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0225788;OID=.;OPOS=169997051;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:23:23:8:9:14:14:0.608696:5:9:5:3:5:9:6:3
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chr2	170103351	.	G	T	297.74	PASS	AF=0.345455;AO=37;DP=109;FAO=38;FDP=110;FR=.;FRO=72;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=-0.0263167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0739;QD=10.8268;RBI=0.0437532;REFB=-0.01476;REVB=0.0349539;RO=72;SAF=15;SAR=22;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186665;STB=0.613858;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0271736;OID=.;OPOS=170103351;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:72:72:37:38:0.345455:22:15:41:31:23:15:41:31
chr2	170115588	.	T	C	417.76	PASS	AF=0.546667;AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0130062;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.443;QD=22.2806;RBI=0.0179617;REFB=-0.0117719;REVB=-0.012388;RO=35;SAF=21;SAR=20;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121644;STB=0.561328;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00663076;OID=.;OPOS=170115588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:35:34:41:41:0.546667:20:21:23:12:20:21:22:12
chr2	170129528	.	G	A	1044.59	PASS	AF=0.986301;AO=71;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00583796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3348;QD=57.2379;RBI=0.0536784;REFB=-0.140799;REVB=-0.05336;RO=1;SAF=44;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106271;STB=0.505493;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00636794;OID=.;OPOS=170129528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:73:1:1:71:72:0.986301:27:44:1:0:27:45:1:0
chr2	170150671	.	G	A	154.07	PASS	AF=0.472222;AO=16;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00532312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3739;QD=17.1193;RBI=0.0532026;REFB=-0.0215953;REVB=0.0529356;RO=19;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0965432;STB=0.533294;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0227835;OID=.;OPOS=170150671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:16:17:0.472222:6:10:10:9:7:10:10:9
chr2	170175334	.	T	C	366.2	PASS	AF=0.433333;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.000769761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.824;QD=16.2757;RBI=0.0189061;REFB=-0.00656041;REVB=-0.0188904;RO=51;SAF=14;SAR=25;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232128;STB=0.630666;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0104496;OID=.;OPOS=170175334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:51:51:39:39:0.433333:25:14:30:21:25:14:30:21
chr2	170218847	.	C	G	474.93	PASS	AF=0.970588;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0465447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.121;QD=55.8742;RBI=0.0603895;REFB=-0.221505;REVB=0.038477;RO=1;SAF=24;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190623;STB=0.509798;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.00235834;OID=.;OPOS=170218847;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:33:34:1:1:32:33:0.970588:8:24:1:0:8:25:1:0
chr2	170403030	.	T	C	483.44	PASS	AF=0.472727;AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=110;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=37;FSRF=24;FSRR=34;FWDB=-0.0217055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.537;QD=17.5794;RBI=0.0283355;REFB=-0.0148626;REVB=0.0182145;RO=58;SAF=15;SAR=37;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134968;STB=0.575329;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00900372;OID=.;OPOS=170403030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:58:58:52:52:0.472727:37:15:24:34:37:15:24:34
chr2	170411693	.	T	C	724.37	PASS	AF=0.901639;AO=55;DP=61;FAO=55;FDP=61;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0253438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.338;QD=47.4999;RBI=0.0253439;REFB=0.0237398;REVB=-6.85909e-05;RO=6;SAF=35;SAR=20;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742518;STB=0.53946;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.000309959;OID=.;OPOS=170411693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:61:61:6:6:55:55:0.901639:20:35:6:0:20:35:6:0
chr2	170463679	.	A	G	55.81	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0101203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.235;QD=10.6313;RBI=0.0305036;REFB=-0.00350899;REVB=-0.0287759;RO=13;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162774;STB=0.599733;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0305828;OID=.;OPOS=170463679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:6:2:5:8:6:2:5:8
chr2	170493103	.	T	A	207.32	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0534165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.58;QD=24.3901;RBI=0.0534214;REFB=-0.0121712;REVB=0.000728098;RO=13;SAF=10;SAR=10;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191267;STB=0.58815;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.00478013;OID=.;OPOS=170493103;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:14:20:20:0.588235:10:10:10:3:10:10:10:4
chr2	170550839	.	A	G	486.25	PASS	AF=0.516484;AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=31;FWDB=0.00429732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.715;QD=21.3735;RBI=0.00604745;REFB=-0.00808252;REVB=-0.00425496;RO=44;SAF=27;SAR=20;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240539;STB=0.632467;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00698611;OID=.;OPOS=170550839;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:44:44:47:47:0.516484:20:27:13:31:20:27:13:31
chr2	170605981	.	C	T	803.44	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0264443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2752;QD=55.4098;RBI=0.0271761;REFB=-0.125583;REVB=0.00626398;RO=1;SAF=27;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017147;STB=0.509088;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00234847;OID=.;OPOS=170605981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:30:27:1:0:30:27:1:0
chr2	170672843	.	G	A	83.87	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0158611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.7507;QD=10.1657;RBI=0.0816717;REFB=0.00501547;REVB=0.0801167;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159505;STB=0.532104;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=-0.00608133;OID=.;OPOS=170672843;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:32:33:20:22:11:11:0.333333:7:4:7:13:7:4:9:13
chr2	170885930	.	C	A	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.703;QD=57.1062;RBI=0.020681;REFB=0;REVB=0.0168458;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.89967e-06;OID=.;OPOS=170885930;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0
chr2	170976590	.	A	G	265.4	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0241938;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.127;QD=48.2545;RBI=0.0261375;REFB=0.00794731;REVB=0.00989084;RO=1;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318424;STB=0.517225;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=-4.58032e-05;OID=.;OPOS=170976590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:22:1:1:21:21:0.954545:14:7:0:1:14:7:0:1
chr2	171055772	.	A	G	147.24	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=0.0204563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9888;QD=11.1125;RBI=0.0472712;REFB=-0.0389659;REVB=0.0426158;RO=34;SAF=10;SAR=9;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236316;STB=0.636233;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0847144;OID=.;OPOS=171055772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:34:34:19:19:0.358491:9:10:25:9:9:10:25:9
chr2	171070912	.	T	C	449.81	PASS	AF=0.438596;AO=51;DP=115;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=46;FSRR=18;FWDB=0.00484686;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.167;QD=15.7827;RBI=0.0234639;REFB=-0.00878077;REVB=-0.0229578;RO=63;SAF=36;SAR=15;SRF=45;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010059;STB=0.512653;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0085336;OID=.;OPOS=171070912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:114:63:64:51:50:0.438596:15:36:45:18:15:35:46:18
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chr2	171355198	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.152;QD=57.6806;RBI=0.0378877;REFB=0;REVB=0.00313506;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125091;OID=.;OPOS=171355198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0
chr2	171356274	.	G	A	1472.73	PASS	AF=1;AO=73;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0528122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.1143;QD=62.0098;RBI=0.0741776;REFB=0;REVB=0.0520882;RO=1;SAF=31;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150135;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117174;OID=.;OPOS=171356274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:95:95:1:0:73:95:1:42:31:1:0:62:33:0:0
chr2	171570151	.	C	T	261.55	PASS	AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.00190513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.667;QD=14.7352;RBI=0.0676299;REFB=-0.0185689;REVB=-0.0676031;RO=40;SAF=13;SAR=17;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240323;STB=0.627803;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0309286;OID=.;OPOS=171570151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:40:41:30:30:0.422535:17:13:27:13:17:13:27:14
chr2	171572940	.	G	A	274.53	PASS	AF=0.625;AO=24;DP=40;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.015486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.956;QD=27.4529;RBI=0.028147;REFB=-0.0184331;REVB=-0.023504;RO=15;SAF=19;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177162;STB=0.60265;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0386031;OID=.;OPOS=171572940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:15:15:24:25:0.625:5:19:9:6:5:20:9:6
chr2	171649402	.	C	T	617.91	PASS	AF=0.585106;AO=54;DP=92;FAO=55;FDP=94;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.00832971;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1167;QD=26.2941;RBI=0.0290537;REFB=-0.0137206;REVB=-0.027834;RO=38;SAF=18;SAR=36;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935061;STB=0.560583;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00967816;OID=.;OPOS=171649402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:94:38:39:54:55:0.585106:36:18:17:21:37:18:18:21
chr2	171822466	.	C	T	207.03	PASS	AF=0.904762;AO=18;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0303826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.262;QD=39.4335;RBI=0.0545969;REFB=-0.188825;REVB=0.0453621;RO=2;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0916027;STB=0.545407;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0034296;OID=.;OPOS=171822466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:21:21:2:2:18:19:0.904762:9:9:0:2:10:9:0:2
chr2	171910337	.	T	C	96.19	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0535701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4323;QD=12.0236;RBI=0.054645;REFB=-0.00332758;REVB=0.010785;RO=20;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195799;STB=0.511608;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.00834019;OID=.;OPOS=171910337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:4:8:13:7:4:8:13:7
chr2	171916495	.	C	A	132.86	PASS	AF=0.454545;AO=13;DP=32;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.079877;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.5101;QD=16.1047;RBI=0.0798792;REFB=0.00766364;REVB=-0.000600109;RO=19;SAF=5;SAR=8;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345886;STB=0.697433;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=-0.00555811;OID=.;OPOS=171916495;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:19:18:13:15:0.454545:8:5:14:5:9:6:14:4
chr2	172174150	.	AA	GC,TC	300.13	PASS	AF=0.913043,0.0869565;AO=21,2;DP=23;FAO=21,2;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=8,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283694,0.00636327;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,2;MLLD=181.752,25.6677;QD=52.1967;RBI=0.0316756,0.00998985;REFB=0,0;REVB=0.0140898,-0.00770103;RO=0;SAF=13,0;SAR=8,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=-0.000544729,0.0545303;OID=.,.;OPOS=172174150,172174150;OREF=AA,AA;OALT=GC,TC;OMAPALT=GC,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:23:23:0:0:21,2:21,2:0.913043,0.0869565:8,2:13,0:0:0:8,2:13,0:0:0
chr2	172174194	.	C	T	199.37	PASS	AF=0.655172;AO=19;DP=29;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0619345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.734;QD=27.4994;RBI=0.0619766;REFB=0.0344706;REVB=0.00228414;RO=10;SAF=6;SAR=13;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304278;STB=0.668937;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.0087509;OID=.;OPOS=172174194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:10:10:19:19:0.655172:13:6:8:2:13:6:8:2
chr2	172180771	.	A	G	1860.03	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.763;QD=61.4885;RBI=0.0309089;REFB=0;REVB=0.0142725;RO=0;SAF=62;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.84183e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.18796e-05;OID=.;OPOS=172180771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:121:0:0:120:121:1:58:62:0:0:58:63:0:0
chr2	172216969	.	T	C	100.94	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0468432;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.9269;QD=16.1501;RBI=0.0484583;REFB=-0.017498;REVB=0.0124063;RO=12;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784743;STB=0.529362;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0501694;OID=.;OPOS=172216969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:24:25:12:13:12:12:0.48:8:4:5:7:8:4:5:8
chr2	172291616	.	C	T	329.76	PASS	AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0205305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.146;QD=20.9369;RBI=0.0214079;REFB=-0.00514617;REVB=-0.00606611;RO=29;SAF=18;SAR=16;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105803;STB=0.558457;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.00465458;OID=.;OPOS=172291616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:29:29:34:34:0.539683:16:18:19:10:16:18:19:10
chr2	172338658	.	G	A	457.01	PASS	AF=0.556962;AO=43;DP=79;FAO=44;FDP=79;FR=.;FRO=35;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0148255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.499;QD=23.1399;RBI=0.0333371;REFB=-0.00521179;REVB=-0.0298591;RO=35;SAF=32;SAR=11;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141747;STB=0.581356;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00451398;OID=.;OPOS=172338658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:35:35:43:44:0.556962:11:32:21:14:11:33:21:14
chr2	172378818	.	A	G	411.05	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.101143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.429;QD=56.6962;RBI=0.102587;REFB=0;REVB=0.0171537;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000837379;OID=.;OPOS=172378818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr2	172379781	.	G	A	490.14	PASS	AF=0.972222;AO=34;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.010629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.45;QD=54.4595;RBI=0.0427644;REFB=-0.190143;REVB=0.0414224;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514278;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00134887;OID=.;OPOS=172379781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:36:36:0:1:34:35:0.972222:16:18:0:0:17:18:0:1
chr2	172411273	.	G	A	108.54	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0312939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1308;QD=13.567;RBI=0.0377165;REFB=-0.0284881;REVB=-0.021053;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224007;STB=0.630141;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0261578;OID=.;OPOS=172411273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:7:6:13:6:7:6:13:6
chr2	172693780	.	G	A	217.82	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.0113877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8791;QD=16.7551;RBI=0.0121901;REFB=0.00805905;REVB=-0.00434937;RO=28;SAF=8;SAR=16;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521126;STB=0.529388;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=-0.00691863;OID=.;OPOS=172693780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:16:8:8:20:16:8:8:20
chr2	172709215	.	G	C	164.51	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00878787;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.643;QD=47.0034;RBI=0.019326;REFB=0;REVB=-0.0172124;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.0465e-05;OID=.;OPOS=172709215;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:14:0:0:14:14:1:11:3:0:0:11:3:0:0
chr2	172725301	.	A	G	866.06	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.173;QD=57.7373;RBI=0.0269421;REFB=0;REVB=0.0133312;RO=0;SAF=20;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.68295e-05;OID=.;OPOS=172725301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:40:20:0:0:40:20:0:0
chr2	172964638	.	C	A	175.68	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000363326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.392;QD=46.8472;RBI=0.00963653;REFB=0;REVB=0.00962968;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17065e-05;OID=.;OPOS=172964638;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:9:5:0:0:9:6:0:0
chr2	172966250	.	T	C	639.91	PASS	AF=0.543103;AO=63;DP=115;FAO=63;FDP=116;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.00190444;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.553;QD=22.066;RBI=0.0342112;REFB=-0.0110323;REVB=0.0341581;RO=52;SAF=31;SAR=32;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00932429;STB=0.509307;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0105514;OID=.;OPOS=172966250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:116:52:53:63:63:0.543103:32:31:25:27:32:31:25:28
chr2	173352103	.	C	T	36.15	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.00436918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.154;QD=6.57359;RBI=0.0102513;REFB=-0.00729595;REVB=-0.00927363;RO=16;SAF=5;SAR=1;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143816;STB=0.594887;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0142837;OID=.;OPOS=173352103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:1:5:12:4:1:5:12:4
chr2	173352446	.	GTTTTTTTA	GTTTTTTAG	62.14	PASS	AF=0.0824742;AO=8;DP=98;FAO=8;FDP=97;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=77;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=47;FSRR=30;FWDB=0.0752597;FXX=0;HRUN=7;LEN=2;MLLD=29.3482;QD=2.56243;RBI=0.191074;REFB=-0.0826242;REVB=0.175629;RO=51;SAF=4;SAR=4;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591667;STB=0.59976;STBP=0.613;TYPE=mnp;VARB=0.0889241;OID=.;OPOS=173352453;OREF=TA;OALT=AG;OMAPALT=GTTTTTTAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.0824742:8:98:8:97:77:4:4:47:30:29:51:4:4:28:23
chr2	173686663	.	G	T	124.78	PASS	AF=0.306122;AO=15;DP=49;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=4;FWDB=-0.00999292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.558;QD=10.1862;RBI=0.013455;REFB=0.00343088;REVB=0.00900986;RO=33;SAF=12;SAR=3;SRF=29;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160749;STB=0.599885;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.00549397;OID=.;OPOS=173686663;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:33:34:15:15:0.306122:3:12:29:4:3:12:30:4
chr2	173850188	.	ATTTTTG	ATTTTGT	55.37	PASS	AF=0.159574;AO=7;DP=97;FAO=15;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=79;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=33;FSRR=46;FWDB=-0.261157;FXX=0.0105252;HRUN=5;LEN=2;MLLD=68.9569;QD=2.35609;RBI=0.261158;REFB=-0.0120824;REVB=0.000688668;RO=51;SAF=7;SAR=0;SRF=12;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.756568;STB=0.932756;STBP=0.001;TYPE=mnp;VARB=0.226933;OID=.;OPOS=173850193;OREF=TG;OALT=GT;OMAPALT=ATTTTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.159574:7:97:15:94:79:14:1:33:46:54:51:7:0:12:39
chr2	173917425	.	G	A	1065.72	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037966;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.05;QD=60.0404;RBI=0.0387263;REFB=0;REVB=-0.00763593;RO=0;SAF=29;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.93436e-05;OID=.;OPOS=173917425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:42:29:0:0:42:29:0:0
chr2	174068513	.	G	C	1015.16	PASS	AF=1;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161951;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.048;QD=59.7154;RBI=0.0448629;REFB=0;REVB=-0.0418378;RO=0;SAF=52;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11257e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191081;OID=.;OPOS=174068513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:68:0:0:68:68:1:16:52:0:0:16:52:0:0
chr2	174091088	.	T	C	1083.2	PASS	AF=0.986486;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00699044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.9924;QD=58.5513;RBI=0.0108448;REFB=0.0117672;REVB=-0.00829113;RO=1;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141159;STB=0.507461;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.000255988;OID=.;OPOS=174091088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:72:73:0.986486:33:39:0:1:33:40:0:1
chr2	174097106	.	A	G	734.83	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00103191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.784;QD=54.4315;RBI=0.0383577;REFB=-0.147222;REVB=0.0383438;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.000721313;OID=.;OPOS=174097106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:54:0:1:52:53:0.981481:24:28:0:0:25:28:0:1
chr2	174103160	.	T	C	836.36	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0220693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2475;QD=55.7573;RBI=0.0238759;REFB=-0.0567318;REVB=0.0091108;RO=1;SAF=30;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154685;STB=0.508194;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000913934;OID=.;OPOS=174103160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:60:1:1:59:59:0.983333:29:30:1:0:29:30:1:0
chr2	174128513	.	C	T	342.5	PASS	AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.00471182;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2323;QD=18.2665;RBI=0.0254561;REFB=-0.0309219;REVB=0.0250162;RO=39;SAF=20;SAR=16;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181493;STB=0.587149;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0198076;OID=.;OPOS=174128513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:39:39:36:36:0.48:16:20:14:25:17:19:14:25
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chr2	175424779	.	T	G	165.6	PASS	AF=0.362069;AO=21;DP=59;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.0175056;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.523;QD=11.4204;RBI=0.0176567;REFB=-0.0109076;REVB=-0.00230485;RO=33;SAF=8;SAR=13;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112716;STB=0.551733;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.015474;OID=.;OPOS=175424779;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:33:37:21:21:0.362069:13:8:16:17:13:8:17:20
chr2	175424825	.	A	T	177.28	PASS	AF=0.527778;AO=16;DP=31;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0261255;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=57.4621;QD=19.6976;RBI=0.0528316;REFB=-0.0806362;REVB=0.0459199;RO=7;SAF=8;SAR=8;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117373;STB=0.553879;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0341761;OID=.;OPOS=175424825;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:36:7:17:16:19:0.527778:8:8:5:2:10:9:10:7
chr2	175425476	.	G	A	818.46	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00410027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.755;QD=57.4354;RBI=0.0198352;REFB=0;REVB=0.0194067;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.4399e-05;OID=.;OPOS=175425476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:29:26:0:0:30:27:0:0
chr2	175425642	.	T	C	278.88	PASS	AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.013682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.558;QD=13.9441;RBI=0.014246;REFB=-0.0155877;REVB=-0.00396868;RO=48;SAF=14;SAR=18;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0223811;STB=0.512731;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0282404;OID=.;OPOS=175425642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:18:14:20:28:18:14:20:28
chr2	175426274	.	C	G	839.59	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0671573;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.1831;QD=56.9211;RBI=0.0696131;REFB=0;REVB=0.0183271;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00348855;OID=.;OPOS=175426274;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:59:0:0:56:59:1:29:27:0:0:29:30:0:0
chr2	175436576	.	A	C	92.21	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0122997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.456;QD=18.4416;RBI=0.0173567;REFB=-0.0512829;REVB=0.0122464;RO=9;SAF=10;SAR=1;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234231;STB=0.637996;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0456903;OID=.;OPOS=175436576;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:1:10:7:2:1:10:7:2
chr2	175436940	.	G	A	347.75	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0203553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.91;QD=51.5191;RBI=0.0482513;REFB=-0.0861165;REVB=0.0437476;RO=1;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441872;STB=0.523791;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000933283;OID=.;OPOS=175436940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:10:16:0:1:10:16:0:1
chr2	175614716	.	G	A	620.13	PASS	AF=0.467153;AO=64;DP=137;FAO=64;FDP=137;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=45;FWDB=0.0386221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.218;QD=18.1059;RBI=0.0386422;REFB=-0.0302677;REVB=-0.00124692;RO=72;SAF=31;SAR=33;SRF=28;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0916383;STB=0.553935;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0422212;OID=.;OPOS=175614716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:72:73:64:64:0.467153:33:31:28:44:33:31:28:45
chr2	176032376	.	G	A	414.42	PASS	AF=0.364964;AO=49;DP=134;FAO=50;FDP=137;FR=.;FRO=87;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=47;FSRR=40;FWDB=0.0109324;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7393;QD=12.0997;RBI=0.0322885;REFB=-0.0210957;REVB=-0.0303814;RO=84;SAF=20;SAR=29;SRF=47;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167508;STB=0.589407;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.043206;OID=.;OPOS=176032376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:137:84:87:49:50:0.364964:29:20:47:37:30:20:47:40
chr2	176794417	.	T	C	283.71	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.01007;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.1478;QD=23.1603;RBI=0.0253616;REFB=-0.0324149;REVB=-0.0232767;RO=23;SAF=16;SAR=10;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440145;STB=0.524571;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0363763;OID=.;OPOS=176794417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:10:16:13:10:10:16:13:10
chr2	176957822	.	G	A	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0187151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.585;QD=24.3281;RBI=0.115769;REFB=-0.0645991;REVB=0.114246;RO=2;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145918;STB=0.583115;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00990933;OID=.;OPOS=176957822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:2:5:2:0:2:5:2:0
chr2	176984192	.	TAA	ATA,TA,TAT	377.35	PASS	AF=0,0.432836,0.238806;AO=4,9,14;DP=59;FAO=0,29,16;FDP=67;FR=.;FRO=22;FSAF=0,14,0;FSAR=0,15,16;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.116125,-0.057471,-0.0667094;FXX=0.0563301;HRUN=1,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=30.0275,14.831,78.291;QD=22.5283;RBI=0.22627,0.105535,0.0757663;REFB=0.0125556,-0.0409865,0.0140532;REVB=-0.194199,-0.0885145,-0.0359221;RO=19;SAF=0,0,0;SAR=4,9,14;SRF=14;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.738328,-0.814565,-0.841887;STB=0.5,0.604769,0.999276;STBP=1,0.103,0;TYPE=mnp,del,snp;VARB=-0.093705,-0.0234545,0.0806144;OID=.,.,.;OPOS=176984192,176984193,176984194;OREF=TA,A,A;OALT=AT,-,T;OMAPALT=ATA,TA,TAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:59:67:19:22:4,9,14:0,29,16:0,0.432836,0.238806:4,9,14:0,0,0:14:5:0,15,16:0,14,0:16:6
chr2	176988290	.	C	CGCA	469.52	PASS	AF=0.833333;AO=34;DP=44;FAO=35;FDP=42;FR=.;FRO=7;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0213556;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=271.657;QD=44.7157;RBI=0.0607101;REFB=-0.0958592;REVB=0.05683;RO=10;SAF=19;SAR=15;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0606497;STB=0.577735;STBP=0.046;TYPE=ins;VARB=0.0151542;OID=.;OPOS=176988291;OREF=-;OALT=GCA;OMAPALT=CGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.833333:34:44:35:42:7:19:16:7:0:41:10:19:15:7:3
chr2	177036754	.	T	C	182.87	PASS	AF=0.85;AO=15;DP=18;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0858438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7752;QD=36.5733;RBI=0.0862294;REFB=-0.0106135;REVB=-0.00814535;RO=3;SAF=7;SAR=8;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405554;STB=0.529377;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0173761;OID=.;OPOS=177036754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:18:20:3:3:15:17:0.85:8:7:1:2:8:9:1:2
chr2	177055381	.	T	TTA	35.29	PASS	AF=0.142857;AO=9;DP=59;FAO=7;FDP=49;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0108629;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=2;MLLD=21.3155;QD=2.88109;RBI=0.109751;REFB=-0.0320739;REVB=-0.109212;RO=42;SAF=3;SAR=6;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207108;STB=0.520651;STBP=0.965;TYPE=ins;VARB=0.1678;OID=.;OPOS=177055382;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.142857:9:59:7:49:42:3:4:19:23:35:42:3:6:21:21
chr2	178085137	.	G	A	697.22	PASS	AF=0.980392;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0215997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.58;QD=54.6842;RBI=0.0290847;REFB=-0.0384195;REVB=0.0194774;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0023191;OID=.;OPOS=178085137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:51:0:1:49:50:0.980392:25:24:0:0:25:25:1:0
chr2	178417142	.	C	T	1328.76	PASS	AF=0.988889;AO=84;DP=89;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0307093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4423;QD=59.0558;RBI=0.0398247;REFB=-0.155337;REVB=0.0253564;RO=1;SAF=45;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104104;STB=0.505153;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00293384;OID=.;OPOS=178417142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:89:90:1:1:84:89:0.988889:39:45:1:0:41:48:1:0
chr2	178417225	.	C	T	1301.9	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.139;QD=61.9951;RBI=0.0417816;REFB=0;REVB=0.01938;RO=0;SAF=50;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06517e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137242;OID=.;OPOS=178417225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:34:50:0:0:34:50:0:0
chr2	178481818	.	G	T	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.381;QD=57.2368;RBI=0.0208239;REFB=0;REVB=0.0129717;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.31109e-06;OID=.;OPOS=178481818;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:30:26:0:0:30:26:0:0
chr2	178482094	.	C	T	83.1	PASS	AF=1;AO=7;DP=10;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00620672;FXX=0.1998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.204;QD=41.5525;RBI=0.0219825;REFB=0;REVB=0.0210881;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113214;OID=.;OPOS=178482094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:10:8:0:0:7:8:1:2:5:0:0:3:5:0:0
chr2	178482737	.	G	A	193.79	PASS	AF=0.416667;AO=19;DP=49;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=-0.006743;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.115;QD=16.1491;RBI=0.0114334;REFB=-0.0223132;REVB=-0.00923338;RO=28;SAF=8;SAR=11;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274382;STB=0.665075;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0445589;OID=.;OPOS=178482737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:28:28:19:20:0.416667:11:8:5:23:11:9:5:23
chr2	178483621	.	G	A	451.99	PASS	AF=0.446429;AO=50;DP=112;FAO=50;FDP=112;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=0.0590594;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.9677;QD=16.1426;RBI=0.091031;REFB=-0.00608117;REVB=0.0692722;RO=60;SAF=23;SAR=27;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1201;STB=0.566474;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0066256;OID=.;OPOS=178483621;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:60:62:50:50:0.446429:27:23:35:25:27:23:36:26
chr2	178491217	.	G	A	1026.35	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00777821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.646;QD=59.4984;RBI=0.021083;REFB=0;REVB=0.0195957;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.3047e-05;OID=.;OPOS=178491217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:34:35:0:0:34:35:0:0
chr2	178493294	.	A	C	87.41	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0036578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2136;QD=13.4471;RBI=0.0556428;REFB=-0.0398205;REVB=-0.0555225;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143835;STB=0.585202;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0578903;OID=.;OPOS=178493294;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:3:8:9:6:3:8:9:6
chr2	178493301	.	G	T	129.3	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0135825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.959;QD=21.5505;RBI=0.013648;REFB=-0.0341923;REVB=-0.00133572;RO=10;SAF=9;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465572;STB=0.526279;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0160352;OID=.;OPOS=178493301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:5:9:7:3:5:9:7:3
chr2	178494173	.	G	GGGA	561.24	PASS	AF=0.424837;AO=58;DP=154;FAO=65;FDP=153;FR=.;FRO=88;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=53;FSRR=35;FWDB=0.00879087;FXX=0.00649309;HRUN=4;LEN=3;MLLD=274.933;QD=14.673;RBI=0.0163383;REFB=-0.021526;REVB=-0.0137717;RO=91;SAF=36;SAR=22;SRF=54;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310015;STB=0.510489;STBP=0.834;TYPE=ins;VARB=0.0303561;OID=.;OPOS=178494174;OREF=-;OALT=GGA;OMAPALT=GGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.424837:58:154:65:153:88:38:27:53:35:99:91:36:22:54:37
chr2	178682603	.	T	C	175.27	PASS	AF=0.328571;AO=23;DP=70;FAO=23;FDP=70;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=0.0240063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.275;QD=10.0155;RBI=0.0247304;REFB=-0.00889723;REVB=0.00594041;RO=47;SAF=8;SAR=15;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325546;STB=0.689913;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0250953;OID=.;OPOS=178682603;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:47:47:23:23:0.328571:15:8:30:17:15:8:30:17
chr2	178682655	.	A	G	151.55	PASS	AF=0.333333;AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0262606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.278;QD=10.1036;RBI=0.0292319;REFB=-0.00421485;REVB=0.0128406;RO=40;SAF=5;SAR=15;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425;STB=0.74975;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00537881;OID=.;OPOS=178682655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:40:40:20:20:0.333333:15:5:25:15:15:5:25:15
chr2	178936373	.	T	G	751.41	PASS	AF=1;AO=39;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0526053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.772;QD=63.9496;RBI=0.0526069;REFB=0;REVB=-0.00040922;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144718;OID=.;OPOS=178936373;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:39:47:1:17:22:0:0:17:30:0:0
chr2	178936614	.	C	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.056;QD=48.7373;RBI=0.019405;REFB=0;REVB=0.00657976;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109662;OID=.;OPOS=178936614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr2	179203797	.	G	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.1786;QD=54.5164;RBI=0.0641088;REFB=0;REVB=-0.0609349;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000679158;OID=.;OPOS=179203797;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:14:11:0:0:14:11:0:0
chr2	179260382	.	A	G	288.5	PASS	AF=0.34;AO=34;DP=99;FAO=34;FDP=100;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=43;FSRR=23;FWDB=-0.0180074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.786;QD=11.5401;RBI=0.0219885;REFB=-0.00906093;REVB=0.0126185;RO=65;SAF=20;SAR=14;SRF=42;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690341;STB=0.543748;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0218736;OID=.;OPOS=179260382;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:65:66:34:34:0.34:14:20:42:23:14:20:43:23
chr2	179358665	.	A	G	1134.67	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7896;QD=60.5159;RBI=0.0570811;REFB=0;REVB=0.0486674;RO=0;SAF=30;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000408368;OID=.;OPOS=179358665;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:45:30:0:0:45:30:0:0
chr2	179367086	.	A	G	651.12	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0317044;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.1738;QD=62.0109;RBI=0.0411228;REFB=0;REVB=0.02619;RO=0;SAF=33;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27702e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.50923e-05;OID=.;OPOS=179367086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:9:33:0:0:9:33:0:0
chr2	179393111	.	A	G	773.01	PASS	AF=0.617391;AO=71;DP=115;FAO=71;FDP=115;FR=.;FRO=44;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0131695;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.05;QD=26.8873;RBI=0.0161511;REFB=-0.0202042;REVB=0.00934996;RO=44;SAF=33;SAR=38;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249055;STB=0.51351;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0122731;OID=.;OPOS=179393111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:44:44:71:71:0.617391:38:33:22:22:38:33:22:22
chr2	179395560	.	G	A	392.92	PASS	AF=0.445652;AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.00289553;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.41;QD=17.0836;RBI=0.0491918;REFB=-0.0105564;REVB=0.0491066;RO=51;SAF=20;SAR=21;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411049;STB=0.523041;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.0125981;OID=.;OPOS=179395560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:51:51:41:41:0.445652:21:20:27:24:21:20:27:24
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chr2	179395958	.	T	C	801.29	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00276982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.172;QD=57.2353;RBI=0.0497061;REFB=0;REVB=0.0496289;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.08562e-05;OID=.;OPOS=179395958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
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chr2	179398509	.	C	A	528.81	PASS	AF=0.44186;AO=57;DP=128;FAO=57;FDP=129;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=48;FWDB=0.00338383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.201;QD=16.397;RBI=0.00921874;REFB=-0.0155723;REVB=-0.00857524;RO=71;SAF=26;SAR=31;SRF=24;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120034;STB=0.569899;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0136553;OID=.;OPOS=179398509;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:129:71:72:57:57:0.44186:31:26:24:47:31:26:24:48
chr2	179400895	.	C	T	524.33	PASS	AF=0.46281;AO=56;DP=121;FAO=56;FDP=121;FR=.;FRO=65;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=-0.0067931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.295;QD=17.3333;RBI=0.0182766;REFB=-0.0294616;REVB=0.0169672;RO=65;SAF=30;SAR=26;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779027;STB=0.543268;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0286139;OID=.;OPOS=179400895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:65:65:56:56:0.46281:26:30:40:25:26:30:40:25
chr2	179404628	.	T	A	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00942187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.759;QD=12.782;RBI=0.0238469;REFB=-0.0100707;REVB=-0.0219067;RO=13;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11072;STB=0.541584;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0151813;OID=.;OPOS=179404628;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:13:14:10:10:0.416667:5:5:5:8:5:5:6:8
chr2	179406191	.	C	T	692.45	PASS	AF=0.446429;AO=75;DP=168;FAO=75;FDP=168;FR=.;FRO=93;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=51;FSRR=42;FWDB=-0.0215706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.216;QD=16.4868;RBI=0.0219563;REFB=-0.017319;REVB=-0.00409695;RO=93;SAF=43;SAR=32;SRF=51;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252537;STB=0.514051;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0223761;OID=.;OPOS=179406191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:93:93:75:75:0.446429:32:43:51:42:32:43:51:42
chr2	179413110	.	G	A	218.9	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00614347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.493;QD=23.6647;RBI=0.0284926;REFB=-0.00774247;REVB=-0.0278224;RO=16;SAF=12;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558936;STB=0.53122;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.00586986;OID=.;OPOS=179413110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:9:12:8:8:9:12:8:8
chr2	179421693	.	GA	AG,GG	1135.55	PASS	AF=0.0379747,0.949367;AO=3,74;DP=79;FAO=3,75;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=3,35;FSAR=0,40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.021199,0.0581263;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=88.1161,73.2007;QD=57.496;RBI=0.0218467,0.0724561;REFB=0.0246792,-0.1519;REVB=0.00528001,0.0432575;RO=2;SAF=3,35;SAR=0,39;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.692188,-0.00134881;STB=0.5,0.50704;STBP=1,0.325;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0539525,0.00323346;OID=.,.;OPOS=179421693,179421694;OREF=GA,A;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:79:79:2:1:3,74:3,75:0.0379747,0.949367:0,39:3,35:1:1:0,40:3,35:1:0
chr2	179427186	.	A	G	1325.39	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200694;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5073;QD=62.3711;RBI=0.024732;REFB=0;REVB=0.0144531;RO=0;SAF=50;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.31805e-05;OID=.;OPOS=179427186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:35:50:0:0:35:50:0:0
chr2	179427536	.	T	C	1478.08	PASS	AF=0.990099;AO=100;DP=102;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0248706;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.482;QD=58.5379;RBI=0.0669949;REFB=-0.036656;REVB=0.0622074;RO=0;SAF=62;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506492;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=9.15244e-05;OID=.;OPOS=179427536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:102:101:0:1:100:100:0.990099:38:62:0:0:38:62:0:1
chr2	179430997	.	G	A	1467.55	PASS	AF=0.962264;AO=102;DP=106;FAO=102;FDP=106;FR=.;FRO=4;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0134566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.465;QD=55.3792;RBI=0.0165991;REFB=-0.198373;REVB=0.00971847;RO=1;SAF=55;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00998794;STB=0.520404;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.000976812;OID=.;OPOS=179430997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:106:106:1:4:102:102:0.962264:47:55:0:1:47:55:0:4
chr2	179431797	.	A	T	110.43	PASS	AF=0.481481;AO=12;DP=26;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.0140218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.488;QD=16.3595;RBI=0.0175389;REFB=-0.0124125;REVB=0.0105357;RO=14;SAF=3;SAR=9;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.529032;STB=0.806012;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0105928;OID=.;OPOS=179431797;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:14:14:12:13:0.481481:9:3:12:2:10:3:12:2
chr2	179434516	.	C	T	119.66	PASS	AF=0.451613;AO=12;DP=29;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.00827598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.259;QD=15.4397;RBI=0.0225187;REFB=-0.0104459;REVB=-0.0209428;RO=17;SAF=5;SAR=7;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28299;STB=0.61275;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0143763;OID=.;OPOS=179434516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:31:17:17:12:14:0.451613:7:5:12:5:7:7:12:5
chr2	179436020	.	G	A	216.47	PASS	AF=0.462963;AO=24;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00484268;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.602;QD=16.0347;RBI=0.00986538;REFB=-0.020817;REVB=0.00859501;RO=28;SAF=18;SAR=6;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329132;STB=0.672754;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0188977;OID=.;OPOS=179436020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:29:24:25:0.462963:6:18:12:16:7:18:12:17
chr2	179444768	.	C	G	2259.0	PASS	AF=1;AO=141;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265676;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.889;QD=63.6338;RBI=0.0354216;REFB=0;REVB=0.0234276;RO=0;SAF=64;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.79495e-05;OID=.;OPOS=179444768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:141:142:1:77:64:0:0:77:65:0:0
chr2	179444939	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00335701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.317;QD=42.1825;RBI=0.0622501;REFB=0;REVB=-0.0621595;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000619635;OID=.;OPOS=179444939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr2	179447848	.	T	C	1565.28	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.818;QD=63.8888;RBI=0.0332124;REFB=0;REVB=-0.00162559;RO=0;SAF=48;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95206e-05;OID=.;OPOS=179447848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:49:48:0:0:49:49:0:0
chr2	179451420	.	G	A	1445.53	PASS	AF=1;AO=90;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=40.4984;QD=62.1732;RBI=0.0358715;REFB=0;REVB=-0.0231914;RO=0;SAF=50;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.21981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000188123;OID=.;OPOS=179451420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:90:93:1:40:50:0:0:41:52:0:0
chr2	179454394	.	A	G	1026.38	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.577;QD=59.5005;RBI=0.0445369;REFB=0;REVB=0.0405534;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.02488e-05;OID=.;OPOS=179454394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:38:31:0:0:38:31:0:0
chr2	179455207	.	T	C	1542.5	PASS	AF=0.981308;AO=104;DP=106;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.035995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.811;QD=57.6635;RBI=0.0954272;REFB=-0.167312;REVB=0.0883782;RO=2;SAF=68;SAR=36;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256288;STB=0.513155;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0011492;OID=.;OPOS=179455207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:106:107:2:2:104:105:0.981308:36:68:0:2:37:68:0:2
chr2	179457147	.	G	A	202.03	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.023107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6338;QD=21.2666;RBI=0.0807431;REFB=-0.00298389;REVB=-0.0773661;RO=18;SAF=14;SAR=6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853248;STB=0.548143;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00235899;OID=.;OPOS=179457147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:6:14:11:7:6:14:11:7
chr2	179458591	.	C	T	111.24	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0411898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.871;QD=15.8911;RBI=0.0414685;REFB=-0.0224254;REVB=-0.00479924;RO=15;SAF=2;SAR=11;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170123;STB=0.599828;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0355008;OID=.;OPOS=179458591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:11:2:4:11:11:2:4:11
chr2	179459099	.	G	C	428.64	PASS	AF=0.44;AO=43;DP=100;FAO=44;FDP=100;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=-0.008298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.276;QD=17.1454;RBI=0.0206335;REFB=-0.0216752;REVB=0.0188914;RO=56;SAF=19;SAR=24;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135916;STB=0.514699;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0290299;OID=.;OPOS=179459099;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:56:56:43:44:0.44:24:19:24:32:24:20:24:32
chr2	179464527	.	T	C	1305.81	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0140563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.63;QD=60.7352;RBI=0.0166223;REFB=-0.0224739;REVB=0.00887254;RO=1;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011146;STB=0.505881;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.000543114;OID=.;OPOS=179464527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:1:1:85:85:0.988372:42:43:0:1:42:43:0:1
chr2	179543217	.	C	T	1943.79	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0827442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8393;QD=61.7076;RBI=0.102596;REFB=0;REVB=-0.0606568;RO=0;SAF=76;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000283724;OID=.;OPOS=179543217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:125:126:0:0:125:126:1:49:76:0:0:49:77:0:0
chr2	179549988	.	G	A	144.77	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0231691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.31;QD=15.6505;RBI=0.0232133;REFB=0.00670123;REVB=-0.00143146;RO=21;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149081;STB=0.586098;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=-0.00924106;OID=.;OPOS=179549988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:6:10:10:11:6:10:10:11
chr2	179558366	.	T	C	820.41	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117204;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.474;QD=57.5727;RBI=0.0137723;REFB=0;REVB=0.00723234;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.34517e-05;OID=.;OPOS=179558366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:24:33:0:0:24:33:0:0
chr2	179578730	.	G	A	2034.51	PASS	AF=0.985075;AO=132;DP=134;FAO=132;FDP=134;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0310986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.861;QD=60.7318;RBI=0.0444202;REFB=-0.112446;REVB=0.031718;RO=2;SAF=57;SAR=75;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012505;STB=0.506578;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.00186304;OID=.;OPOS=179578730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:134:134:2:2:132:132:0.985075:75:57:0:2:75:57:0:2
chr2	179579093	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.52;QD=63.8715;RBI=0.0185107;REFB=0;REVB=0.00428154;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89328e-05;OID=.;OPOS=179579093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0
chr2	179579212	.	T	C	1358.1	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00990873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.183;QD=62.4412;RBI=0.0250872;REFB=0;REVB=0.0230474;RO=0;SAF=42;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.00681e-05;OID=.;OPOS=179579212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:45:42:0:0:45:42:0:0
chr2	179579822	.	T	A	1525.55	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7209;QD=59.8256;RBI=0.0443252;REFB=0;REVB=0.0327111;RO=0;SAF=44;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000377774;OID=.;OPOS=179579822;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:58:44:0:0:58:44:0:0
chr2	179582327	.	C	T	784.23	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00334631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.608;QD=57.0349;RBI=0.0352337;REFB=0;REVB=0.0350744;RO=0;SAF=34;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74711e-05;OID=.;OPOS=179582327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:55:0:0:52:55:1:18:34:0:0:21:34:0:0
chr2	179582537	.	G	T	976.4	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279419;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.425;QD=59.1758;RBI=0.0403921;REFB=0;REVB=-0.029168;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000217051;OID=.;OPOS=179582537;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:33:33:0:0:33:33:0:0
chr2	179583496	.	T	G	871.32	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0163212;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=312.588;QD=56.2142;RBI=0.0309057;REFB=-0.119496;REVB=0.0262447;RO=1;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171613;STB=0.509088;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.000312756;OID=.;OPOS=179583496;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:27:34:0:1:27:34:0:1
chr2	179585266	.	C	T	1153.58	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00362823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7192;QD=60.715;RBI=0.0410478;REFB=0;REVB=-0.0408871;RO=0;SAF=38;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000274606;OID=.;OPOS=179585266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:38:38:0:0:38:38:0:0
chr2	179585393	.	A	G	115.91	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0103825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.069;QD=42.1508;RBI=0.0260429;REFB=0;REVB=0.0238839;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.36614e-05;OID=.;OPOS=179585393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr2	179587130	.	C	G	1189.73	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.144;QD=61.0118;RBI=0.109882;REFB=0;REVB=0.000821709;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111015;OID=.;OPOS=179587130;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:78:0:0:76:78:1:39:37:0:0:39:39:0:0
chr2	179600563	.	G	A	1877.81	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00601072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.801;QD=61.5674;RBI=0.0224004;REFB=0;REVB=-0.0215789;RO=0;SAF=68;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.72266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.27605e-05;OID=.;OPOS=179600563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:54:68:0:0:54:68:0:0
chr2	179605180	.	C	T	538.51	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.364;QD=59.8344;RBI=0.0112184;REFB=0;REVB=-0.00260717;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.11184e-05;OID=.;OPOS=179605180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr2	179611896	.	TGGGGGT	GTGGGGT,TGGGGCT,TGGGGT,TGGGGTC	34.92	PASS	AF=0.030303,0.010101,0.141414,0;AO=5,5,20,4;DP=100;FAO=3,1,14,0;FDP=99;FR=.;FRO=81;FSAF=2,0,5,0;FSAR=1,1,9,0;FSRF=54;FSRR=27;FWDB=-0.0171217,-0.0225591,-0.0768119,-0.0386935;FXX=0.0480723;HRUN=1,5,5,5;LEN=2,1,1,2;MLLD=45.0143,74.9257,10.0635,35.2786;QD=1.41081;RBI=0.0691243,0.110729,0.155667,0.111556;REFB=-0.0325647,-0.020818,-0.158222,-0.0432014;REVB=-0.0669703,-0.108407,-0.135396,-0.10463;RO=55;SAF=5,0,7,0;SAR=0,5,13,4;SRF=44;SRR=11;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.464477,-0.726494,-0.511041,-0.693082;STB=0.5,0.993255,0.746525,0.5;STBP=1,0.263,0.069,1;TYPE=mnp,snp,del,mnp;VARB=-0.140259,0.0927564,0.15296,0.0806927;OID=.,.,.,.;OPOS=179611896,179611901,179611897,179611901;OREF=TG,G,G,GT;OALT=GT,C,-,TC;OMAPALT=GTGGGGT,TGGGGCT,TGGGGT,TGGGGTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:20:100:99:55:81:5,5,20,4:3,1,14,0:0.030303,0.010101,0.141414,0:0,5,13,4:5,0,7,0:44:11:1,1,9,0:2,0,5,0:54:27
chr2	179614952	.	A	G	1112.76	PASS	AF=0.974026;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0228339;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.945;QD=57.8059;RBI=0.0349342;REFB=-0.205701;REVB=0.0264388;RO=1;SAF=45;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103994;STB=0.502702;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00134895;OID=.;OPOS=179614952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:78:77:1:2:75:75:0.974026:30:45:1:0:30:45:1:1
chr2	179615887	.	T	C	487.38	PASS	AF=0.971429;AO=32;DP=32;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0867444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7938;QD=55.7;RBI=0.135591;REFB=-0.157901;REVB=0.104213;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514277;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00725814;OID=.;OPOS=179615887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:32:35:0:1:32:34:0.971429:15:17:0:0:17:17:0:1
chr2	179615931	.	C	G	708.53	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00464853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.032;QD=62.9802;RBI=0.00652342;REFB=0;REVB=0.00457671;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.50524e-05;OID=.;OPOS=179615931;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0
chr2	179615994	.	T	C	827.34	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.342;QD=57.0579;RBI=0.0422524;REFB=0;REVB=0.00553792;RO=1;SAF=29;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159856;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.89833e-05;OID=.;OPOS=179615994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:1:0:57:58:1:28:29:1:0:28:30:0:0
chr2	179620951	.	C	T	785.86	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.049;QD=64.1517;RBI=0.0304007;REFB=0;REVB=0.0223631;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.42028e-05;OID=.;OPOS=179620951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0
chr2	179621477	.	C	T	1552.23	PASS	AF=0.989899;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0433303;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.923;QD=62.7164;RBI=0.047488;REFB=-0.0870247;REVB=0.0194317;RO=1;SAF=43;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109017;STB=0.505617;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.000200725;OID=.;OPOS=179621477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:98:99:1:1:97:98:0.989899:54:43:1:0:54:44:1:0
chr2	179623758	.	C	T	2216.77	PASS	AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.999;QD=63.3362;RBI=0.0265178;REFB=0;REVB=0.00524227;RO=0;SAF=69;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.29942e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26123e-05;OID=.;OPOS=179623758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:71:69:0:0:71:69:0:0
chr2	179629363	.	T	C	1100.67	PASS	AF=1;AO=73;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0670583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.913;QD=58.7022;RBI=0.0689628;REFB=0;REVB=0.0160953;RO=0;SAF=27;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297441;OID=.;OPOS=179629363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:73:75:1:46:27:0:0:46:29:0:0
chr2	179629461	.	C	T	834.36	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.261;QD=57.5421;RBI=0.0468943;REFB=0;REVB=0.00557978;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133444;OID=.;OPOS=179629461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:27:31:0:0:27:31:0:0
chr2	179644035	.	G	A	1209.9	PASS	AF=0.987654;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0354927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.317;QD=59.7481;RBI=0.0486239;REFB=-0.151392;REVB=0.0332348;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000491893;OID=.;OPOS=179644035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:79:81:0:1:78:80:0.987654:33:45:0:0:34:46:1:0
chr2	179659912	.	G	A	1324.88	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0235096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.457;QD=60.9138;RBI=0.0511535;REFB=-0.115078;REVB=0.0454311;RO=1;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111471;STB=0.505881;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.000823873;OID=.;OPOS=179659912;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:1:1:86:86:0.988506:42:44:0:1:42:44:0:1
chr2	179702268	.	A	G	645.09	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.058;QD=61.437;RBI=0.0469307;REFB=0;REVB=0.0436237;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.65661e-05;OID=.;OPOS=179702268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:42:0:0:38:42:1:17:21:0:0:21:21:0:0
chr2	179839833	.	A	G	701.72	PASS	AF=0.980769;AO=50;DP=53;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0534226;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7727;QD=53.9786;RBI=0.0662428;REFB=-0.10826;REVB=0.0391679;RO=1;SAF=26;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177622;STB=0.509087;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00433905;OID=.;OPOS=179839833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:52:1:1:50:51:0.980769:24:26:1:0:24:27:1:0
chr2	180047908	.	T	C	725.17	PASS	AF=0.96;AO=46;DP=48;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0121233;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.6806;QD=58.0134;RBI=0.0261945;REFB=-0.115397;REVB=0.0232202;RO=2;SAF=23;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391372;STB=0.520825;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00689042;OID=.;OPOS=180047908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:48:50:2:2:46:48:0.96:23:23:2:0:25:23:2:0
chr2	180810180	.	C	T	286.39	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0147832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.145;QD=24.3739;RBI=0.0261731;REFB=-0.0307751;REVB=-0.0215983;RO=21;SAF=14;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267013;STB=0.51484;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.016724;OID=.;OPOS=180810180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:12:14:12:9:12:14:12:9
chr2	180810202	.	C	T	129.37	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0414324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.65;QD=12.9368;RBI=0.0415346;REFB=0.00963632;REVB=-0.00291149;RO=25;SAF=5;SAR=10;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322089;STB=0.688278;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.0125923;OID=.;OPOS=180810202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:10:5:16:9:10:5:16:9
chr2	180810264	.	A	T	579.46	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151678;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.082;QD=60.9962;RBI=0.0151715;REFB=0;REVB=-0.000338018;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.7768e-05;OID=.;OPOS=180810264;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0
chr2	180835792	.	T	A	398.81	PASS	AF=0.465909;AO=39;DP=86;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0373931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.984;QD=18.1277;RBI=0.0374715;REFB=-0.00334987;REVB=0.00242301;RO=47;SAF=23;SAR=16;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160116;STB=0.585324;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00381673;OID=.;OPOS=180835792;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:88:47:47:39:41:0.465909:16:23:20:27:17:24:20:27
chr2	182347072	.	T	C	208.08	PASS	AF=0.403226;AO=24;DP=60;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.0305065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0399;QD=13.4244;RBI=0.0469964;REFB=-0.0129875;REVB=0.0357493;RO=36;SAF=12;SAR=12;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145818;STB=0.584016;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0202399;OID=.;OPOS=182347072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:62:36:37:24:25:0.403226:12:12:23:13:13:12:23:14
chr2	182374534	.	A	G	306.55	PASS	AF=0.608696;AO=25;DP=44;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.141525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.361;QD=26.6568;RBI=0.141539;REFB=-0.000557486;REVB=0.00202485;RO=18;SAF=11;SAR=14;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826897;STB=0.55185;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.00138094;OID=.;OPOS=182374534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:46:18:18:25:28:0.608696:14:11:6:12:15:13:6:12
chr2	182374567	.	A	G	44.79	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.00797775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.403;QD=7.46499;RBI=0.01982;REFB=-0.0131048;REVB=0.0181435;RO=17;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0725222;STB=0.54533;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0227776;OID=.;OPOS=182374567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:5:2:4:13:5:2:4:13
chr2	182392143	.	G	C	495.25	PASS	AF=0.473214;AO=52;DP=112;FAO=53;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=0.00327204;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3379;QD=17.6876;RBI=0.024897;REFB=-0.0142187;REVB=0.0246811;RO=59;SAF=31;SAR=21;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180652;STB=0.603734;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0250877;OID=.;OPOS=182392143;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:59:59:52:53:0.473214:21:31:24:35:21:32:24:35
chr2	182395345	.	G	A	336.5	PASS	AF=0.402174;AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=42;FSRR=13;FWDB=-0.00618353;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.766;QD=14.6303;RBI=0.00720223;REFB=0.00826161;REVB=-0.0036927;RO=55;SAF=19;SAR=18;SRF=42;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268995;STB=0.650786;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.00781138;OID=.;OPOS=182395345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:55:55:37:37:0.402174:18:19:42:13:18:19:42:13
chr2	182399097	.	T	C	170.57	PASS	AF=0.349206;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0955548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0004;QD=10.8297;RBI=0.0989663;REFB=-0.0062788;REVB=0.0257606;RO=41;SAF=14;SAR=8;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246464;STB=0.643548;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0137432;OID=.;OPOS=182399097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:41:41:22:22:0.349206:8:14:17:24:8:14:17:24
chr2	182399638	.	A	G	1648.24	PASS	AF=1;AO=109;DP=112;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213367;FXX=0.0267833;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1714;QD=60.4859;RBI=0.0367992;REFB=0;REVB=0.0299821;RO=0;SAF=51;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.9523e-05;OID=.;OPOS=182399638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:109:0:0:109:109:1:58:51:0:0:58:51:0:0
chr2	182400905	.	T	G	1636.4	PASS	AF=0.973684;AO=110;DP=114;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=52;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0685325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.057;QD=57.4174;RBI=0.0705597;REFB=-0.222244;REVB=0.0167919;RO=3;SAF=58;SAR=52;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239189;STB=0.512394;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00094409;OID=.;OPOS=182400905;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:114:114:3:3:110:111:0.973684:52:58:3:0:52:59:3:0
chr2	182401109	.	T	TGATACA	90.76	PASS	AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.00558716;FXX=0;HRUN=1;LEN=6;MLLD=276.026;QD=8.06779;RBI=0.00602007;REFB=-0.00763788;REVB=-0.00224162;RO=33;SAF=7;SAR=5;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117165;STB=0.57237;STBP=0.566;TYPE=ins;VARB=0.0255903;OID=.;OPOS=182401110;OREF=-;OALT=GATACA;OMAPALT=TGATACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.266667:12:45:12:45:33:7:5:16:17:90:33:7:5:16:17
chr2	182403851	.	G	A	834.36	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.857;QD=57.5422;RBI=0.0308046;REFB=0;REVB=0.0199721;RO=0;SAF=36;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.07814e-06;OID=.;OPOS=182403851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:22:36:0:0:22:36:0:0
chr2	182413259	.	A	G	222.31	PASS	AF=0.419355;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.00619617;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.986;QD=14.3426;RBI=0.0270779;REFB=-0.00120253;REVB=0.0263595;RO=36;SAF=11;SAR=15;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217391;STB=0.638583;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00227097;OID=.;OPOS=182413259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:62:36:36:26:26:0.419355:15:11:23:13:15:11:24:12
chr2	182521578	.	G	A	402.72	PASS	AF=0.547945;AO=38;DP=71;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=0.0148374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7833;QD=22.0667;RBI=0.0295234;REFB=-0.0152036;REVB=0.0255242;RO=30;SAF=13;SAR=25;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379759;STB=0.523652;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.00869336;OID=.;OPOS=182521578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:73:30:33:38:40:0.547945:25:13:9:21:26:14:10:23
chr2	182543455	.	T	C	195.8	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.00715239;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.874;QD=17.8002;RBI=0.0105724;REFB=-0.0573568;REVB=0.00778582;RO=23;SAF=14;SAR=6;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00485629;STB=0.505429;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0291523;OID=.;OPOS=182543455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:23:24:20:20:0.454545:6:14:16:7:6:14:17:7
chr2	182925120	.	T	C	74.05	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00142783;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.213;QD=17.4242;RBI=0.0199394;REFB=-0.0283435;REVB=0.0198882;RO=8;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315978;STB=0.518476;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0214088;OID=.;OPOS=182925120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:17:17:8:8:9:9:0.529412:2:7:6:2:2:7:6:2
chr2	182926144	.	T	C	184.82	PASS	AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=8;FWDB=-0.0203843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7163;QD=12.1194;RBI=0.0248652;REFB=-0.0081985;REVB=-0.0142394;RO=38;SAF=10;SAR=13;SRF=30;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374185;STB=0.712168;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0165317;OID=.;OPOS=182926144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:13:10:30:8:13:10:30:8
chr2	183007502	.	A	G	708.37	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5183;QD=62.9665;RBI=0.0562514;REFB=0;REVB=0.0502756;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000879681;OID=.;OPOS=183007502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0
chr2	183738620	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00544121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5683;QD=45.8049;RBI=0.015442;REFB=0;REVB=0.0144516;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382242;OID=.;OPOS=183738620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr2	183789649	.	C	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.777;QD=56.1916;RBI=0.0302059;REFB=0;REVB=0.0249156;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131858;OID=.;OPOS=183789649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr2	183799558	.	G	C	1135.01	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.069;QD=60.534;RBI=0.0631032;REFB=0;REVB=0.0241663;RO=0;SAF=36;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291156;OID=.;OPOS=183799558;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:39:36:0:0:39:36:0:0
chr2	183961650	.	A	C	1198.73	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.028791;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.817;QD=59.9365;RBI=0.0351339;REFB=0.0338508;REVB=0.0201362;RO=1;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011984;STB=0.506328;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=-0.000242513;OID=.;OPOS=183961650;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:80:1:1:79:79:0.9875:39:40:0:1:39:40:0:1
chr2	183961668	.	A	G	1016.89	PASS	AF=0.985714;AO=68;DP=71;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00162707;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.434;QD=58.108;RBI=0.0203434;REFB=-0.0609126;REVB=0.0202782;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508472;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=9.80282e-05;OID=.;OPOS=183961668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:70:0:1:68:69:0.985714:40:28:0:0:40:29:1:0
chr2	184814072	.	T	C	961.88	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0195138;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.452;QD=57.4257;RBI=0.0267563;REFB=-0.0768681;REVB=0.018306;RO=0;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00049196;OID=.;OPOS=184814072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:67:0:1:66:66:0.985075:26:40:0:0:26:40:1:0
chr2	185469503	.	C	T	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.269;QD=58.061;RBI=0.0462742;REFB=0;REVB=-0.00122465;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.77379e-05;OID=.;OPOS=185469503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:25:36:0:0:25:36:0:0
chr2	185800905	.	A	T	554.34	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.366;QD=58.3511;RBI=0.0454468;REFB=0;REVB=0.0282206;RO=1;SAF=17;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267496;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000845129;OID=.;OPOS=185800905;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:38:38:1:0:37:38:1:20:17:1:0:20:18:0:0
chr2	185801747	.	G	A	379.67	PASS	AF=1;AO=13;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.118384;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.221;QD=56.2479;RBI=0.118521;REFB=0;REVB=-0.00569463;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000198483;OID=.;OPOS=185801747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:13:27:1:10:3:0:0:16:11:0:0
chr2	185801755	.	A	G	357.84	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.144;QD=55.0528;RBI=0.0422881;REFB=0;REVB=0.0204567;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025314;OID=.;OPOS=185801755;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:13:11:0:0:15:11:0:0
chr2	185802211	.	C	CACA	95.32	PASS	AF=0.714286;AO=9;DP=19;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0470057;FXX=0.124922;HRUN=1;LEN=3;MLLD=224.687;QD=27.2343;RBI=0.0472501;REFB=-0.0182402;REVB=0.00479996;RO=8;SAF=1;SAR=8;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.6405;STB=0.689234;STBP=0.072;TYPE=ins;VARB=0.00408859;OID=.;OPOS=185802212;OREF=-;OALT=ACA;OMAPALT=CACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.714286:9:19:10:14:4:2:8:3:1:19:8:1:8:7:1
chr2	185802242	.	AC	A,AA	234.79	PASS	AF=0.105263,0.894737;AO=2,17;DP=19;FAO=2,17;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0,9;FSAR=2,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035652,0.033339;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=200.007,218.298;QD=49.4299;RBI=0.0421879,0.0367461;REFB=0,0;REVB=0.0225556,0.0154527;RO=0;SAF=0,9;SAR=2,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.126e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0128768,-0.000783043;OID=.,.;OPOS=185802243,185802243;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.105263,0.894737:2,17:19:2,17:19:0:0,9:2,8:0:0:9:0:0,9:2,8:0:0
chr2	185802363	.	A	G	1358.58	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.423;QD=62.4634;RBI=0.0400164;REFB=0;REVB=0.0157163;RO=0;SAF=49;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.97072e-05;OID=.;OPOS=185802363;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:37:49:0:0:38:49:0:0
chr2	186526579	.	G	A	556.51	PASS	AF=0.453846;AO=59;DP=129;FAO=59;FDP=130;FR=.;FRO=71;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=0.000894548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.902;QD=17.1234;RBI=0.0488519;REFB=-0.00232027;REVB=-0.0488437;RO=69;SAF=27;SAR=32;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00815974;STB=0.503936;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00176744;OID=.;OPOS=186526579;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:130:69:71:59:59:0.453846:32:27:31:38:32:27:33:38
chr2	186603605	.	A	AG	57.79	PASS	AF=0.421053;AO=15;DP=42;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0224748;FXX=0.0256345;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.45621;QD=6.08299;RBI=0.106601;REFB=-0.0359576;REVB=0.104205;RO=26;SAF=14;SAR=1;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.440868;STB=0.65094;STBP=0.238;TYPE=ins;VARB=0.0446521;OID=.;OPOS=186603606;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.421053:15:42:16:38:22:14:2:16:6:57:26:14:1:19:7
chr2	186625770	.	A	G	127.36	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00214814;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=223.07;QD=11.5781;RBI=0.0121071;REFB=-0.00315749;REVB=0.0119151;RO=29;SAF=12;SAR=3;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324432;STB=0.695363;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00374689;OID=.;OPOS=186625770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:3:12:16:13:3:12:16:13
chr2	186627943	.	T	C	464.61	PASS	AF=0.529412;AO=45;DP=83;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0102189;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.9757;QD=21.8641;RBI=0.0342118;REFB=-0.0262294;REVB=-0.03265;RO=38;SAF=17;SAR=28;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126627;STB=0.57109;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0366163;OID=.;OPOS=186627943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:85:38:40:45:45:0.529412:28:17:20:18:28:17:21:19
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chr2	186654867	.	G	C	143.34	PASS	AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.0164456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.028;QD=9.88516;RBI=0.0308118;REFB=0.0119422;REVB=0.0260559;RO=37;SAF=6;SAR=13;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339885;STB=0.713056;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0201139;OID=.;OPOS=186654867;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:37:39:19:19:0.327586:13:6:23:14:13:6:25:14
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chr2	186656657	.	C	T	335.57	PASS	AF=0.444444;AO=35;DP=79;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.00801086;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9131;QD=16.5715;RBI=0.0936203;REFB=-0.0221251;REVB=-0.0932769;RO=43;SAF=17;SAR=18;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0202307;STB=0.530847;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0285068;OID=.;OPOS=186656657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:43:45:35:36:0.444444:18:17:20:23:18:18:20:25
chr2	186656956	.	T	C	158.05	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0166377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.188;QD=25.2872;RBI=0.0206378;REFB=-0.0222994;REVB=0.0122109;RO=9;SAF=6;SAR=10;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119544;STB=0.566925;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0143162;OID=.;OPOS=186656956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:10:6:5:4:10:6:5:4
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chr2	186658056	.	G	A	235.22	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00783437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.498;QD=25.4295;RBI=0.0213948;REFB=0.00428784;REVB=-0.0199087;RO=15;SAF=4;SAR=18;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222193;STB=0.624873;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=-0.00286143;OID=.;OPOS=186658056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:18:4:6:9:18:4:6:9
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chr2	186658565	.	G	T	188.04	PASS	AF=0.434783;AO=19;DP=45;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0267179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.042;QD=16.3514;RBI=0.0412346;REFB=-0.018466;REVB=-0.0314078;RO=25;SAF=13;SAR=6;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285815;STB=0.681232;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0348897;OID=.;OPOS=186658565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:25:26:19:20:0.434783:6:13:10:15:6:14:10:16
chr2	186659359	.	G	T	241.11	PASS	AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=0.0179488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.801;QD=14.6127;RBI=0.02149;REFB=0.00725705;REVB=-0.0118177;RO=38;SAF=15;SAR=13;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210213;STB=0.618284;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=-0.0068254;OID=.;OPOS=186659359;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:13:15:28:10:13:15:28:10
chr2	186661673	.	A	G	324.49	PASS	AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0480478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.566;QD=19.6662;RBI=0.0491388;REFB=-0.00168267;REVB=-0.0102969;RO=32;SAF=22;SAR=12;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133929;STB=0.574582;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00162708;OID=.;OPOS=186661673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:12:22:16:16:12:22:16:16
chr2	186664473	.	T	C	466.97	PASS	AF=0.349398;AO=57;DP=167;FAO=58;FDP=166;FR=.;FRO=108;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=47;FSRR=61;FWDB=0.00560549;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.281;QD=11.2524;RBI=0.00566802;REFB=-0.00715496;REVB=-0.000839599;RO=108;SAF=25;SAR=32;SRF=47;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00395922;STB=0.50275;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0178562;OID=.;OPOS=186664473;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:166:108:108:57:58:0.349398:32:25:47:61:33:25:47:61
chr2	186664963	.	C	A	131.95	PASS	AF=0.416667;AO=14;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0599619;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=88.5213;QD=14.6607;RBI=0.0601635;REFB=-0.00685807;REVB=-0.00492107;RO=16;SAF=8;SAR=6;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239999;STB=0.571338;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00307411;OID=.;OPOS=186664963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:21:14:15:0.416667:6:8:13:3:6:9:15:6
chr2	186665432	.	G	A	344.26	PASS	AF=0.443182;AO=25;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=49;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0373691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.5681;QD=15.6481;RBI=0.0754834;REFB=-0.0142577;REVB=0.0655843;RO=40;SAF=11;SAR=14;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247981;STB=0.583291;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0235292;OID=.;OPOS=186665432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:40:49:25:39:0.443182:14:11:27:13:21:18:30:19
chr2	186665824	.	A	G	242.38	PASS	AF=0.666667;AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00990756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.369;QD=29.3799;RBI=0.0105609;REFB=0.00890286;REVB=0.00365696;RO=11;SAF=9;SAR=13;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282188;STB=0.515567;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.00345977;OID=.;OPOS=186665824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:11:11:22:22:0.666667:13:9:5:6:13:9:5:6
chr2	186667121	.	T	C	218.58	PASS	AF=0.714286;AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0308968;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.862;QD=31.2263;RBI=0.0316546;REFB=-0.0206066;REVB=-0.00688476;RO=7;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221037;STB=0.633212;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00731803;OID=.;OPOS=186667121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:7:8:20:20:0.714286:11:9:0:7:11:9:0:8
chr2	186668935	.	A	G	198.51	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0446247;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8629;QD=13.0171;RBI=0.0454782;REFB=-0.00498837;REVB=-0.00876925;RO=36;SAF=12;SAR=12;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581527;STB=0.54095;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.00757896;OID=.;OPOS=186668935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:37:24:24:0.393443:12:12:16:20:12:12:16:21
chr2	186670104	.	A	C	1065.98	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0604992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0516;QD=58.4096;RBI=0.0748187;REFB=-0.124424;REVB=0.0440193;RO=1;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160282;STB=0.508472;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00305824;OID=.;OPOS=186670104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:29:43:0:1:29:43:0:1
chr2	186670780	.	T	A	276.94	PASS	AF=0.54902;AO=27;DP=50;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0066969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.58;QD=21.7204;RBI=0.0225755;REFB=-0.0226236;REVB=0.0215593;RO=23;SAF=9;SAR=18;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198991;STB=0.615526;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0186716;OID=.;OPOS=186670780;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:23:23:27:28:0.54902:18:9:13:10:19:9:13:10
chr2	186670979	.	T	C	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00156741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.696;QD=57.6803;RBI=0.00824921;REFB=0;REVB=0.00809893;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.34064e-05;OID=.;OPOS=186670979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr2	186671357	.	G	A	203.22	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.00816059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.284;QD=21.9697;RBI=0.0768972;REFB=-0.00157402;REVB=-0.0764629;RO=16;SAF=18;SAR=2;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321775;STB=0.677202;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.000856639;OID=.;OPOS=186671357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:17:20:20:0.540541:2:18:11:5:2:18:12:5
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chr2	186697876	.	A	G	868.2	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0447366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.7147;QD=57.8799;RBI=0.0652219;REFB=0;REVB=0.0474609;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000541833;OID=.;OPOS=186697876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0
chr2	187487160	.	G	A	1472.52	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0830517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.065;QD=63.334;RBI=0.0831645;REFB=0;REVB=0.00433006;RO=0;SAF=32;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35236e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.44763e-05;OID=.;OPOS=187487160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:61:32:0:0:61:32:0:0
chr2	187532417	.	G	A	1269.81	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160104;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3691;QD=61.9418;RBI=0.0656454;REFB=0;REVB=0.0636631;RO=0;SAF=74;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000418125;OID=.;OPOS=187532417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:82:0:0:82:82:1:8:74:0:0:8:74:0:0
chr2	187558960	.	G	A	162.39	PASS	AF=0.882353;AO=15;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.028404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.623;QD=38.2096;RBI=0.0896284;REFB=-0.118214;REVB=0.0850086;RO=2;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150929;STB=0.583219;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00698374;OID=.;OPOS=187558960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:17:17:2:2:15:15:0.882353:5:10:0:2:5:10:0:2
chr2	187559047	.	G	A,GCAA	872.65	PASS	AF=0.308642,0.555556;AO=31,32;DP=87;FAO=25,45;FDP=81;FR=.;FRO=11;FSAF=18,22;FSAR=7,23;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.00564266,-0.00296597;FXX=0.03571;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=84.9757,135.169;QD=43.0939;RBI=0.0059715,0.0176495;REFB=-0.0795886,-0.0800918;REVB=0.00195429,0.0173985;RO=23;SAF=19,16;SAR=12,16;SRF=17;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.105622,-0.181983;STB=0.50276,0.546731;STBP=0.973,0.165;TYPE=snp,ins;VARB=0.0447572,0.0280429;OID=.,.;OPOS=187559047,187559048;OREF=G,-;OALT=A,CAA;OMAPALT=A,GCAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:87:81:23:11:31,32:25,45:0.308642,0.555556:12,16:19,16:17:6:7,23:18,22:8:3
chr2	188250301	.	T	A	1712.08	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00861618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.028;QD=60.6045;RBI=0.0308678;REFB=0;REVB=0.0296409;RO=0;SAF=49;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.60789e-05;OID=.;OPOS=188250301;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:113:0:0:112:113:1:63:49:0:0:63:50:0:0
chr2	189460553	.	T	C	1618.06	PASS	AF=0.973684;AO=110;DP=113;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=62;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.000765756;FXX=0.0086949;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.7014;QD=56.7739;RBI=0.0257618;REFB=0.0306416;REVB=-0.0257504;RO=1;SAF=62;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00759585;STB=0.506;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=-0.000229393;OID=.;OPOS=189460553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:113:114:1:3:110:111:0.973684:48:62:1:0:49:62:1:2
chr2	189866199	.	T	A	3173.33	PASS	AF=0.995;AO=195;DP=196;FAO=199;FDP=200;FR=.;FRO=1;FSAF=119;FSAR=80;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0154944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.996;QD=63.4666;RBI=0.044609;REFB=0.0134397;REVB=0.0418317;RO=1;SAF=119;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00398541;STB=0.502092;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-6.17346e-05;OID=.;OPOS=189866199;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:196:200:1:1:195:199:0.995:76:119:1:0:80:119:1:0
chr2	189875421	.	T	G	1135.2	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.685;QD=60.5439;RBI=0.022892;REFB=0;REVB=0.0194271;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.07374e-05;OID=.;OPOS=189875421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:38:37:0:0:38:37:0:0
chr2	189907937	.	A	G	1229.42	PASS	AF=0.987952;AO=80;DP=81;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00566659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6149;QD=59.2493;RBI=0.00915144;REFB=-0.0459094;REVB=0.00718601;RO=0;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506023;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00302202;OID=.;OPOS=189907937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:81:83:0:1:80:82:0.987952:41:39:0:0:41:41:1:0
chr2	189932831	.	T	C	1577.81	PASS	AF=1;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00447955;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.901;QD=60.1069;RBI=0.00751812;REFB=0;REVB=0.00603786;RO=0;SAF=61;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.44551e-07;OID=.;OPOS=189932831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:105:0:0:105:105:1:44:61:0:0:44:61:0:0
chr2	189962072	.	A	T	749.78	PASS	AF=0.444444;AO=80;DP=180;FAO=80;FDP=180;FR=.;FRO=100;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=51;FSRR=49;FWDB=0.0191679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.535;QD=16.6618;RBI=0.0200171;REFB=-0.00740006;REVB=-0.00576858;RO=100;SAF=49;SAR=31;SRF=51;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104859;STB=0.55839;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0105052;OID=.;OPOS=189962072;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:180:100:100:80:80:0.444444:31:49:51:49:31:49:51:49
chr2	189974958	.	G	T	233.15	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.081061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8286;QD=24.5423;RBI=0.0832701;REFB=-0.00821446;REVB=0.0190531;RO=16;SAF=14;SAR=8;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200143;STB=0.611548;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00410193;OID=.;OPOS=189974958;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:8:14:6:10:8:14:6:10
chr2	189997838	.	G	A	784.33	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0388294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.3141;QD=64.0267;RBI=0.0388294;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=48;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000360287;OID=.;OPOS=189997838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:0:48:0:0:0:49:0:0
chr2	190323530	.	A	G	495.52	PASS	AF=0.552941;AO=47;DP=85;FAO=47;FDP=85;FR=.;FRO=38;FSAF=35;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.0124184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.148;QD=23.3185;RBI=0.0148307;REFB=-0.00181626;REVB=-0.00810752;RO=38;SAF=35;SAR=12;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34797;STB=0.692057;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00289487;OID=.;OPOS=190323530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:38:38:47:47:0.552941:12:35:13:25:12:35:13:25
chr2	190430177	.	A	G	1997.83	PASS	AF=1;AO=127;DP=127;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3944;QD=61.9482;RBI=0.0556354;REFB=0;REVB=0.0467666;RO=0;SAF=87;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02135e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00065726;OID=.;OPOS=190430177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:129:0:0:127:129:1:40:87:0:0:42:87:0:0
chr2	190531426	.	G	A	877.41	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.034;QD=57.5349;RBI=0.0387861;REFB=0;REVB=0.00492874;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.14684e-05;OID=.;OPOS=190531426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:37:23:0:0:37:24:0:0
chr2	190575815	.	C	T	92.19	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=6;FWDB=-0.0101901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.034;QD=8.99448;RBI=0.110244;REFB=-0.000949209;REVB=-0.109772;RO=29;SAF=5;SAR=7;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425127;STB=0.750616;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=-0.000248687;OID=.;OPOS=190575815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:7:5:23:6:7:5:23:6
chr2	190595258	.	G	T	909.43	PASS	AF=0.984848;AO=63;DP=65;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.106573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.5374;QD=55.1169;RBI=0.106826;REFB=-0.0468972;REVB=0.00734945;RO=2;SAF=28;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0032653;STB=0.508769;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00309548;OID=.;OPOS=190595258;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:65:66:2:1:63:65:0.984848:35:28:1:1:37:28:1:0
chr2	190602513	.	T	C	795.63	PASS	AF=0.983051;AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0286245;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=49.466;QD=53.941;RBI=0.0887808;REFB=-0.130248;REVB=0.0840397;RO=1;SAF=28;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016546;STB=0.508472;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00240138;OID=.;OPOS=190602513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:57:58:0.983051:29:28:1:0:29:29:0:1
chr2	190617643	.	A	G,T	1499.43	PASS	AF=0.886598,0.113402;AO=80,14;DP=96;FAO=86,11;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=50,1;FSAR=36,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292604,-0.0608462;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=135.227,34.5669;QD=61.832;RBI=0.0451867,0.0737282;REFB=0,0;REVB=0.0344335,-0.0416364;RO=0;SAF=46,4;SAR=34,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.3274e-08,-3.63386e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00101288,0.19072;OID=.,.;OPOS=190617643,190617643;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:48:96:97:0:0:80,14:86,11:0.886598,0.113402:34,10:46,4:0:0:36,10:50,1:0:0
chr2	190618249	.	T	A	763.15	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.723;QD=63.5956;RBI=0.0262198;REFB=0;REVB=0.0231756;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151018;OID=.;OPOS=190618249;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:20:27:0:0:21:27:0:0
chr2	190636411	.	C	G	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.683;QD=61.683;RBI=0.0359656;REFB=0;REVB=0.0306825;RO=0;SAF=29;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.33927e-05;OID=.;OPOS=190636411;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:12:29:0:0:12:29:0:0
chr2	190788844	.	T	TC,TCG	216.53	PASS	AF=0.888889,0.111111;AO=10,3;DP=18;FAO=16,2;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11,2;FSAR=5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145362,0.0115662;FXX=0;HRUN=0,0;LEN=1,2;MLLD=75.104,71.4023;QD=48.1183;RBI=0.14608,0.212641;REFB=0,0;REVB=0.145355,0.212326;RO=5;SAF=9,3;SAR=1,0;SRF=1;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.54297,0.743083;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.00264813,0.00610792;OID=.,.;OPOS=190788845,190788845;OREF=-,-;OALT=C,CG;OMAPALT=TC,TCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.888889,0.111111:10,3:18:16,2:18:0:11,2:5,0:0:0:9:5:9,3:1,0:1:4
chr2	190815211	.	G	A	612.05	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0578674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.243;QD=61.2045;RBI=0.0591038;REFB=0;REVB=0.0120257;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136492;OID=.;OPOS=190815211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:22:17:0:0:22:18:0:0
chr2	191064753	.	C	T	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.0197337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.089;QD=15.1603;RBI=0.0351253;REFB=-0.00987727;REVB=0.029058;RO=22;SAF=5;SAR=11;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165134;STB=0.594156;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0178655;OID=.;OPOS=191064753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:11:5:4:18:11:5:4:18
chr2	191065236	.	TTTTG	T	150.02	PASS	AF=0.488889;AO=21;DP=47;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00470863;FXX=0.062487;HRUN=5;LEN=4;MLLD=322.684;QD=13.3354;RBI=0.00473734;REFB=-0.00599653;REVB=-0.000520696;RO=24;SAF=16;SAR=5;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279615;STB=0.639866;STBP=0.093;TYPE=del;VARB=0.00507263;OID=.;OPOS=191065237;OREF=TTTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.488889:21:47:22:45:23:16:6:11:12:99:24:16:5:12:12
chr2	191065595	.	G	T	64.18	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0236296;FXX=0.0302939;HRUN=4;LEN=1;MLLD=93.6819;QD=8.02244;RBI=0.0240137;REFB=-0.00136428;REVB=-0.00427791;RO=23;SAF=2;SAR=7;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179616;STB=0.61376;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0123556;OID=.;OPOS=191065595;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:33:32:23:23:9:9:0.28125:7:2:8:15:7:2:8:15
chr2	191065782	.	A	AGAT	73.38	PASS	AF=0.27027;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0110045;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=3;MLLD=249.26;QD=7.93245;RBI=0.0184457;REFB=-0.00990895;REVB=-0.0148036;RO=26;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187387;STB=0.505607;STBP=0.988;TYPE=ins;VARB=0.0264184;OID=.;OPOS=191065783;OREF=-;OALT=GAT;OMAPALT=AGAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.27027:10:37:10:37:27:4:6:11:16:73:26:4:6:10:16
chr2	191066683	.	C	T	399.01	PASS	AF=0.471264;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0130669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.413;QD=18.3452;RBI=0.0332257;REFB=-0.00528253;REVB=-0.0305483;RO=46;SAF=22;SAR=19;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0065693;STB=0.503664;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.006486;OID=.;OPOS=191066683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:46:46:41:41:0.471264:19:22:25:21:19:22:25:21
chr2	191066769	.	C	T	632.77	PASS	AF=1;AO=33;DP=43;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00144533;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.248;QD=61.7335;RBI=0.110759;REFB=0;REVB=0.11075;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.82561e-05;OID=.;OPOS=191066769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:41:0:0:33:41:1:12:21:0:0:20:21:0:0
chr2	191066913	.	T	C	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0521726;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.405;QD=11.1978;RBI=0.0522187;REFB=-0.024375;REVB=0.00219275;RO=22;SAF=8;SAR=4;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233847;STB=0.639763;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0451726;OID=.;OPOS=191066913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:4:8:10:12:4:8:10:12
chr2	191066970	.	C	T	182.92	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.0146712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3531;QD=17.4205;RBI=0.0349569;REFB=-0.0279053;REVB=0.0317292;RO=23;SAF=14;SAR=5;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00283396;STB=0.501616;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0504573;OID=.;OPOS=191066970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:5:14:17:6:5:14:17:6
chr2	191067233	.	T	C	245.47	PASS	AF=0.48;AO=18;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00645572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.606;QD=19.6372;RBI=0.0422699;REFB=-0.0111606;REVB=0.041774;RO=25;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155977;STB=0.517227;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0194504;OID=.;OPOS=191067233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:26:18:24:0.48:10:8:15:10:10:14:16:10
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chr2	191068061	.	A	T	150.17	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.0655095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.8856;QD=20.023;RBI=0.0676119;REFB=0.0146803;REVB=-0.0167293;RO=14;SAF=13;SAR=3;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179486;STB=0.599893;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.011027;OID=.;OPOS=191068061;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:3:13:13:1:3:13:13:1
chr2	191161622	.	T	C	270.12	PASS	AF=0.355556;AO=32;DP=90;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0463583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.282;QD=12.0053;RBI=0.0493841;REFB=-0.00602338;REVB=0.0170206;RO=58;SAF=15;SAR=17;SRF=29;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0349727;STB=0.520154;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0113086;OID=.;OPOS=191161622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:58:58:32:32:0.355556:17:15:29:29:17:15:29:29
chr2	191224927	.	C	T	305.19	PASS	AF=0.441558;AO=33;DP=76;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=0.00197941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4566;QD=15.8541;RBI=0.00614381;REFB=-0.0329071;REVB=0.00581621;RO=43;SAF=11;SAR=22;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116599;STB=0.552643;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0361119;OID=.;OPOS=191224927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:43:43:33:34:0.441558:22:11:19:24:22:12:19:24
chr2	191224981	.	G	T	955.06	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00848537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2708;QD=58.7731;RBI=0.0145228;REFB=0;REVB=0.0117861;RO=0;SAF=25;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.72367e-05;OID=.;OPOS=191224981;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:39:25:0:0:39:26:0:0
chr2	191231458	.	G	A	1604.83	PASS	AF=0.918699;AO=112;DP=123;FAO=113;FDP=123;FR=.;FRO=10;FSAF=60;FSAR=53;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0291184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0042;QD=52.1896;RBI=0.0296213;REFB=-0.00159024;REVB=0.00543504;RO=10;SAF=60;SAR=52;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413475;STB=0.522012;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.00218583;OID=.;OPOS=191231458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:123:123:10:10:112:113:0.918699:52:60:8:2:53:60:8:2
chr2	191231503	.	G	A	551.87	PASS	AF=0.440299;AO=59;DP=134;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=51;FSRR=24;FWDB=-0.0219296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.255;QD=16.4737;RBI=0.0482802;REFB=-0.00746231;REVB=-0.0430124;RO=75;SAF=25;SAR=34;SRF=51;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252653;STB=0.640509;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0145892;OID=.;OPOS=191231503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:75:75:59:59:0.440299:34:25:51:24:34:25:51:24
chr2	191235901	.	A	C	1383.85	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00978186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1464;QD=60.1676;RBI=0.124086;REFB=0;REVB=0.1237;RO=1;SAF=54;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014141;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00396411;OID=.;OPOS=191235901;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:92:1:0:87:92:1:33:54:0:1:38:54:0:0
chr2	191301013	.	TCCCCT	TCCC,TCCCT	88.62	PASS	AF=0.733333,0;AO=5,3;DP=14;FAO=11,0;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=5,0;FSAR=6,0;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.157956,0.00798759;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=23.2486,12.552;QD=23.6316;RBI=0.18626,0.281674;REFB=-0.0985948,-0.0512878;REVB=0.0987062,0.281561;RO=4;SAF=2,3;SAR=3,0;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0.272727,0.272727;SSSB=0.118169,0.729277;STB=0.555457,0.5;STBP=0.516,1;TYPE=del,del;VARB=0.0577013,0;OID=.,.;OPOS=191301017,191301014;OREF=CT,C;OALT=-,-;OMAPALT=TCCC,TCCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.733333,0:5,3:14:11,0:15:4:5,0:6,0:1:3:21:4:2,3:3,0:1:3
chr2	191301368	.	A	G	99.87	PASS	AF=1;AO=9;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.23984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.846;QD=39.9476;RBI=0.246261;REFB=0;REVB=0.0558673;RO=1;SAF=2;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175672;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0171499;OID=.;OPOS=191301368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:1:0:9:10:1:7:2:1:0:7:3:0:0
chr2	191354491	.	T	C	1102.45	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00142977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.845;QD=58.7972;RBI=0.0342353;REFB=-0.144713;REVB=0.0342054;RO=1;SAF=25;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00955829;STB=0.505049;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.000543378;OID=.;OPOS=191354491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:49:25:0:1:49:25:0:1
chr2	191379268	.	G	A	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0697706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4585;QD=62.0188;RBI=0.0740527;REFB=0;REVB=-0.0248168;RO=0;SAF=36;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0006831;OID=.;OPOS=191379268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:6:36:0:0:6:36:0:0
chr2	191402685	.	A	C	124.77	PASS	AF=0.306122;AO=15;DP=49;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.0458227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3484;QD=10.1855;RBI=0.046356;REFB=0.015337;REVB=-0.00701122;RO=33;SAF=10;SAR=5;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515131;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=-0.0312432;OID=.;OPOS=191402685;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:33:34:15:15:0.306122:5:10:22:11:5:10:22:12
chr2	191402698	.	A	C	144.64	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0195364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.0339;QD=11.1262;RBI=0.0203048;REFB=0.0110797;REVB=-0.00553318;RO=33;SAF=12;SAR=6;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51427;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=-0.0191501;OID=.;OPOS=191402698;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:33:34:18:18:0.346154:6:12:22:11:6:12:22:12
chr2	191402702	.	T	C	153.42	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.011995;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8885;QD=13.0571;RBI=0.0301042;REFB=0.00190969;REVB=-0.0276113;RO=30;SAF=12;SAR=5;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367311;STB=0.521448;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=-0.00199122;OID=.;OPOS=191402702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:5:12:22:8:5:12:22:8
chr2	191402710	.	T	C	176.65	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.0129631;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.921;QD=14.132;RBI=0.0226716;REFB=-0.0145878;REVB=0.0186;RO=31;SAF=13;SAR=6;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0739298;STB=0.54267;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0277304;OID=.;OPOS=191402710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:6:13:23:8:6:13:23:8
chr2	191402712	.	TA	CG	164.13	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.00263737;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=118.159;QD=12.8732;RBI=0.0160593;REFB=0.0132601;REVB=0.0158412;RO=32;SAF=13;SAR=6;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440261;STB=0.525521;STBP=0.82;TYPE=mnp;VARB=-0.0214254;OID=.;OPOS=191402712;OREF=TA;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:6:13:23:9:6:13:23:9
chr2	191402748	.	A	T	175.77	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=-0.00839018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.359;QD=11.9168;RBI=0.00901579;REFB=-0.00510966;REVB=-0.00329988;RO=37;SAF=13;SAR=9;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972881;STB=0.556048;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0132033;OID=.;OPOS=191402748;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:9:13:25:12:9:13:25:12
chr2	191402761	.	G	A	158.4	PASS	AF=0.372549;AO=18;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.0445435;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.36;QD=12.4236;RBI=0.0446063;REFB=-0.032992;REVB=-0.00236689;RO=32;SAF=13;SAR=5;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854301;STB=0.541622;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0236827;OID=.;OPOS=191402761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:18:19:0.372549:5:13:21:11:6:13:20:12
chr2	191402775	.	T	C	150.91	PASS	AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0298101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.746;QD=12.576;RBI=0.0413926;REFB=-0.03072;REVB=-0.0287178;RO=30;SAF=12;SAR=5;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1293;STB=0.568162;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0114378;OID=.;OPOS=191402775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:31:17:17:0.354167:5:12:18:12:5:12:19:12
chr2	191402778	.	T	C	126.21	PASS	AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0432285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.365;QD=10.9743;RBI=0.0445384;REFB=-0.0141459;REVB=-0.0107225;RO=31;SAF=12;SAR=3;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262565;STB=0.659105;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00811015;OID=.;OPOS=191402778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:3:12:19:12:3:12:19:12
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chr2	191828203	.	A	T	733.19	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283902;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4275;QD=63.7559;RBI=0.0475772;REFB=0;REVB=0.0381783;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193798;OID=.;OPOS=191828203;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:18:28:0:0:18:28:0:0
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chr2	191874667	.	A	G	256.44	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0189602;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.526;QD=22.7947;RBI=0.0189604;REFB=-0.0271182;REVB=8.95663e-05;RO=21;SAF=18;SAR=6;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0387947;STB=0.521721;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.0279144;OID=.;OPOS=191874667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:6:18:15:6:6:18:15:6
chr2	192160839	.	A	T	316.78	PASS	AF=0.367347;AO=36;DP=98;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=0.0352313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.846;QD=12.9299;RBI=0.0355875;REFB=-0.00863008;REVB=-0.0050225;RO=62;SAF=21;SAR=15;SRF=39;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524954;STB=0.530019;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.00995015;OID=.;OPOS=192160839;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:62:62:36:36:0.367347:15:21:39:23:15:21:39:23
chr2	192160875	.	C	T	275.56	PASS	AF=0.351064;AO=32;DP=93;FAO=33;FDP=94;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=41;FSRR=20;FWDB=-0.00604599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.328;QD=11.7259;RBI=0.00616661;REFB=-0.0130829;REVB=0.00121372;RO=61;SAF=20;SAR=12;SRF=41;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0580997;STB=0.54574;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.022086;OID=.;OPOS=192160875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:61:61:32:33:0.351064:12:20:41:20:13:20:41:20
chr2	192214966	.	T	C	359.99	PASS	AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0603473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6598;QD=22.8563;RBI=0.0610675;REFB=-0.00297488;REVB=-0.00935126;RO=27;SAF=15;SAR=21;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0802412;STB=0.544211;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.00286372;OID=.;OPOS=192214966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:27:27:36:36:0.571429:21:15:14:13:21:15:14:13
chr2	192250726	.	G	A	665.39	PASS	AF=0.977778;AO=42;DP=43;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0657496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.009;QD=59.1461;RBI=0.0657729;REFB=-0.00429687;REVB=0.00175036;RO=0;SAF=8;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67012e-08;STB=0.507039;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.000297982;OID=.;OPOS=192250726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:45:0:1:42:44:0.977778:34:8:0:0:35:9:0:1
chr2	192279327	.	T	C	1290.29	PASS	AF=1;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181615;FXX=0.0235266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.299;QD=62.1825;RBI=0.0508888;REFB=0;REVB=0.0475377;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.80895e-05;OID=.;OPOS=192279327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:83:0:0:83:83:1:43:40:0:0:43:40:0:0
chr2	192699639	.	A	AG	1154.91	PASS	AF=1;AO=97;DP=107;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.146338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.2783;QD=44.8508;RBI=0.15931;REFB=0;REVB=0.0629671;RO=6;SAF=47;SAR=50;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384476;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00251112;OID=.;OPOS=192699640;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:97:107:103:103:0:51:52:0:0:22:6:47:50:5:1
chr2	192701393	.	A	G	1765.92	PASS	AF=0.991597;AO=117;DP=120;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=77;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0556464;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3351;QD=59.3587;RBI=0.0582954;REFB=-0.0724243;REVB=0.0173735;RO=2;SAF=40;SAR=77;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231501;STB=0.506023;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.000554035;OID=.;OPOS=192701393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:120:119:2:1:117:118:0.991597:77:40:2:0:77:41:1:0
chr2	192814811	.	A	T	218.07	PASS	AF=0.355263;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=76;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.0421617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.322;QD=11.4775;RBI=0.054786;REFB=-0.0218557;REVB=-0.0349842;RO=49;SAF=11;SAR=16;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247067;STB=0.642345;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0616971;OID=.;OPOS=192814811;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:49:49:27:27:0.355263:16:11:31:18:16:11:31:18
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chr2	196673533	.	A	G	510.78	PASS	AF=1;AO=29;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.6152;QD=58.3746;RBI=0.237607;REFB=0;REVB=0.235841;RO=1;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03211;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00491238;OID=.;OPOS=196673533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:1:0:29:35:1:14:15:0:1:20:15:0:0
chr2	196726471	.	G	A	227.63	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.00670717;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.654;QD=15.6984;RBI=0.0108925;REFB=-0.0280124;REVB=0.00858256;RO=32;SAF=14;SAR=12;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213051;STB=0.61948;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0259662;OID=.;OPOS=196726471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:12:14:24:8:12:14:24:8
chr2	196762444	.	T	C	191.63	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0264577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2756;QD=15.6429;RBI=0.0267125;REFB=0.00179595;REVB=0.00368061;RO=29;SAF=4;SAR=16;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.457511;STB=0.764938;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00259899;OID=.;OPOS=196762444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:16:4:18:11:16:4:18:11
chr2	196791276	.	T	G	600.72	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0600419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5884;QD=58.607;RBI=0.06525;REFB=-0.0258455;REVB=-0.0255448;RO=2;SAF=19;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468167;STB=0.512189;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00279977;OID=.;OPOS=196791276;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:2:1:39:40:0.97561:20:19:2:0:20:20:1:0
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chr2	196866420	.	C	T	1320.95	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.804;QD=62.1623;RBI=0.0139796;REFB=0;REVB=-0.00494232;RO=0;SAF=56;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.20959e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.12903e-06;OID=.;OPOS=196866420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:29:56:0:0:29:56:0:0
chr2	196915991	.	A	G	1148.35	PASS	AF=0.987179;AO=56;DP=84;FAO=77;FDP=78;FR=.,HEALED,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141651;FXX=0.0370325;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.5241;QD=58.8899;RBI=0.143713;REFB=0;REVB=0.0242582;RO=0;SAF=20;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00905051;OID=.;OPOS=196915991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:78:0:0:56:77:0.987179:36:20:0:0:40:37:0:0
chr2	197004439	.	A	G	1896.41	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451151;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.812;QD=61.672;RBI=0.0519814;REFB=0;REVB=0.0258204;RO=0;SAF=61;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.55703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.99239e-05;OID=.;OPOS=197004439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:62:61:0:0:62:61:0:0
chr2	197021276	.	T	C	1096.04	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.789;QD=60.057;RBI=0.0635663;REFB=0;REVB=0.00310074;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.79104e-05;OID=.;OPOS=197021276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:34:37:0:0:35:38:0:0
chr2	197021372	.	T	A	799.23	PASS	AF=0.983051;AO=57;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00139188;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.363;QD=54.1854;RBI=0.0147721;REFB=-0.126142;REVB=0.0147063;RO=1;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154619;STB=0.509088;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.000184711;OID=.;OPOS=197021372;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:57:58:0.983051:30:27:0:1:31:27:1:0
chr2	197065023	.	A	G	479.26	PASS	AF=0.61039;AO=44;DP=77;FAO=47;FDP=77;FR=.;FRO=30;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0115543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.747;QD=24.8964;RBI=0.0115574;REFB=-0.000120897;REVB=-0.000265103;RO=31;SAF=27;SAR=17;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260601;STB=0.529711;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000296095;OID=.;OPOS=197065023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:31:30:44:47:0.61039:17:27:18:13:17:30:17:13
chr2	197065221	.	A	G	278.92	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0031148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.859;QD=16.407;RBI=0.0449404;REFB=-0.0276076;REVB=0.0448324;RO=36;SAF=15;SAR=16;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118256;STB=0.572473;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0172503;OID=.;OPOS=197065221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:37:31:31:0.455882:16:15:13:23:16:15:13:24
chr2	197118729	.	C	T	715.52	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00215865;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.796;QD=57.2419;RBI=0.0244624;REFB=0;REVB=-0.024367;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.21377e-05;OID=.;OPOS=197118729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0
chr2	197154234	.	A	G	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0561466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.508;QD=63.8719;RBI=0.06413;REFB=0;REVB=0.0309874;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.03239e-05;OID=.;OPOS=197154234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0
chr2	197184321	.	C	T	964.65	PASS	AF=0.971014;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0287461;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.766;QD=55.9215;RBI=0.0438898;REFB=-0.0269033;REVB=-0.0331659;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51562;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=8.56906e-05;OID=.;OPOS=197184321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:69:0:2:67:67:0.971014:36:31:0:0:36:31:2:0
chr2	197504545	.	C	G	453.19	PASS	AF=0.589041;AO=38;DP=69;FAO=43;FDP=73;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0119714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.136;QD=24.8321;RBI=0.0857196;REFB=-0.0774795;REVB=0.0848795;RO=27;SAF=14;SAR=24;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329322;STB=0.668295;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0502904;OID=.;OPOS=197504545;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:73:27:30:38:43:0.589041:24:14:22:5:29:14:22:8
chr2	197537115	.	T	G	139.41	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.061465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8809;QD=12.3917;RBI=0.0614667;REFB=0.0150141;REVB=-0.000452048;RO=29;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368734;STB=0.714041;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=-0.0272817;OID=.;OPOS=197537115;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:29:29:16:16:0.355556:6:10:8:21:6:10:8:21
chr2	197597283	.	G	A	310.38	PASS	AF=0.402299;AO=33;DP=86;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.053564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.94;QD=14.2704;RBI=0.0558751;REFB=-0.0378845;REVB=0.0159038;RO=52;SAF=17;SAR=16;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036839;STB=0.520015;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0491377;OID=.;OPOS=197597283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:52:52:33:35:0.402299:16:17:25:27:17:18:25:27
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chr2	197860140	.	C	T	182.11	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0799839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1369;QD=16.94;RBI=0.101035;REFB=0.00435117;REVB=-0.0617311;RO=23;SAF=12;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15049;STB=0.575676;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=-0.0120854;OID=.;OPOS=197860140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:23:24:19:19:0.44186:7:12:11:12:7:12:12:12
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chr2	198327314	.	G	A	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.0235476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4576;QD=11.5972;RBI=0.0263432;REFB=0.00680961;REVB=-0.0118099;RO=21;SAF=6;SAR=6;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285111;STB=0.66642;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-0.0127155;OID=.;OPOS=198327314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:6:6:16:5:6:6:16:5
chr2	198362018	.	T	C	117.2	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0362558;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=166.138;QD=12.0208;RBI=0.0410603;REFB=-0.00642265;REVB=-0.0192734;RO=23;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20862;STB=0.615228;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0111221;OID=.;OPOS=198362018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:25:14:14:0.358974:7:7:7:16:7:7:8:17
chr2	198363504	.	A	G	255.75	PASS	AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.00494975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.064;QD=15.7383;RBI=0.0209381;REFB=-0.0172226;REVB=0.0203447;RO=35;SAF=17;SAR=12;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101772;STB=0.563087;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0226752;OID=.;OPOS=198363504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:36:29:29:0.446154:12:17:24:11:12:17:25:11
chr2	198508951	.	G	A	309.42	PASS	AF=0.365385;AO=38;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=0.00940509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9568;QD=11.9007;RBI=0.0537551;REFB=0.000258002;REVB=0.0529259;RO=66;SAF=20;SAR=18;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123914;STB=0.507096;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.000366048;OID=.;OPOS=198508951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:66:66:38:38:0.365385:18:20:34:32:18:20:34:32
chr2	198572076	.	A	ATTC,C	194.04	PASS	AF=0.681818,0.136364;AO=14,3;DP=22;FAO=15,3;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=5,3;FSAR=10,0;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0553664,0.017033;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=3,1;MLLD=153.502,64.5023;QD=35.2808;RBI=0.0580738,0.0193731;REFB=-0.0480894,-0.113781;REVB=-0.017525,0.00923004;RO=4;SAF=4,3;SAR=10,0;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.204045,0.642277;STB=0.592465,0.99422;STBP=0.143,0.295;TYPE=ins,snp;VARB=0.0130032,0.0835981;OID=.,.;OPOS=198572077,198572076;OREF=-,A;OALT=TTC,C;OMAPALT=ATTC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:22:22:4:4:14,3:15,3:0.681818,0.136364:10,0:4,3:3:1:10,0:5,3:3:1
chr2	198572461	.	C	T	567.11	PASS	AF=0.460674;AO=37;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=33;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=0.00312802;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.625;QD=25.488;RBI=0.0433245;REFB=-0.0274779;REVB=0.0432114;RO=36;SAF=33;SAR=4;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318667;STB=0.574663;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0198006;OID=.;OPOS=198572461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:36:36:37:41:0.460674:4:33:25:11:8:33:25:11
chr2	200136583	.	T	A	902.67	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.497;QD=58.2368;RBI=0.0348194;REFB=0;REVB=-0.0108339;RO=0;SAF=42;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.64552e-05;OID=.;OPOS=200136583;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:20:42:0:0:20:42:0:0
chr2	201173767	.	T	G	137.41	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0126811;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.074;QD=11.2171;RBI=0.028976;REFB=-0.00967363;REVB=0.0260538;RO=33;SAF=4;SAR=12;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289995;STB=0.673926;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0125637;OID=.;OPOS=201173767;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:33:33:16:16:0.326531:12:4:16:17:12:4:16:17
chr2	201344434	.	A	G	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00441891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.6791;QD=11.1976;RBI=0.0537641;REFB=0.00222037;REVB=0.0535822;RO=22;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0887244;STB=0.553101;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=-0.00342478;OID=.;OPOS=201344434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:4:8:13:9:4:8:13:9
chr2	201344491	.	G	A	145.1	PASS	AF=0.30303;AO=20;DP=66;FAO=20;FDP=66;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0220228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1139;QD=8.79375;RBI=0.0478612;REFB=-0.00876929;REVB=-0.0424934;RO=46;SAF=12;SAR=8;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118392;STB=0.570481;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0153132;OID=.;OPOS=201344491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:46:46:20:20:0.30303:8:12:23:23:8:12:23:23
chr2	201344732	.	C	T	359.41	PASS	AF=0.469136;AO=37;DP=79;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.00413827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3881;QD=17.7484;RBI=0.00475697;REFB=-0.0218045;REVB=0.00234595;RO=42;SAF=26;SAR=11;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658428;STB=0.537088;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0308469;OID=.;OPOS=201344732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:42:43:37:38:0.469136:11:26:27:15:11:27:28:15
chr2	201354935	.	C	G	268.37	PASS	AF=0.413333;AO=30;DP=76;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.00698807;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.241;QD=14.3132;RBI=0.0211764;REFB=-0.0202947;REVB=-0.0199901;RO=45;SAF=17;SAR=13;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219429;STB=0.619942;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0553915;OID=.;OPOS=201354935;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:45:44:30:31:0.413333:13:17:16:29:14:17:15:29
chr2	201437328	.	C	A	278.87	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=0.0138028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8258;QD=21.8721;RBI=0.0140102;REFB=-0.0170125;REVB=0.00240187;RO=23;SAF=17;SAR=11;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196655;STB=0.608224;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0144127;OID=.;OPOS=201437328;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:11:17:19:4:11:17:19:4
chr2	201437334	.	T	C,G	733.34	PASS	AF=0.980769,0.0192308;AO=50,2;DP=52;FAO=51,1;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=37,1;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187042,0.0213643;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=263.057,225.534;QD=56.4106;RBI=0.0297513,0.0336125;REFB=0,0;REVB=0.0231364,0.0259492;RO=0;SAF=36,2;SAR=14,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000344984,0.018374;OID=.,.;OPOS=201437334,201437334;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:52:52:0:0:50,2:51,1:0.980769,0.0192308:14,0:36,2:0:0:14,0:37,1:0:0
chr2	201468732	.	C	G	175.84	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00629009;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.056;QD=18.0345;RBI=0.0700256;REFB=-0.00570865;REVB=0.0697425;RO=17;SAF=8;SAR=10;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172565;STB=0.61785;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.024971;OID=.;OPOS=201468732;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:17:21:18:18:0.461538:10:8:11:6:10:8:14:7
chr2	201677996	.	GA	G	30.61	PASS	AF=0.244898;AO=18;DP=49;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.127576;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.3948;QD=2.49859;RBI=0.200274;REFB=-0.05714;REVB=-0.154383;RO=30;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165687;STB=0.631893;STBP=0.302;TYPE=del;VARB=0.0843872;OID=.;OPOS=201677997;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.244898:18:49:12:49:37:7:5:15:22:30:30:10:8:12:18
chr2	202122995	.	A	G	998.26	PASS	AF=0.945946;AO=70;DP=74;FAO=70;FDP=74;FR=.;FRO=4;FSAF=54;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.000467128;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=303.303;QD=53.96;RBI=0.0218263;REFB=-0.0290313;REVB=0.0218213;RO=4;SAF=54;SAR=16;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00309404;STB=0.501639;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.000356577;OID=.;OPOS=202122995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:74:74:4:4:70:70:0.945946:16:54:3:1:16:54:3:1
chr2	202215492	.	C	G	613.24	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0092507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.378;QD=61.3242;RBI=0.0120277;REFB=0;REVB=-0.00768708;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.29296e-05;OID=.;OPOS=202215492;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr2	202245244	.	A	G	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00116862;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.157;QD=63.2868;RBI=0.00275831;REFB=0;REVB=0.00249851;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.61118e-06;OID=.;OPOS=202245244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0
chr2	202260049	.	G	A	632.08	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0510194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.739;QD=61.6665;RBI=0.0517811;REFB=0;REVB=0.00884862;RO=0;SAF=31;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000125325;OID=.;OPOS=202260049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:10:31:0:0:10:31:0:0
chr2	202264156	.	C	T	1933.44	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0362951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.109;QD=61.87;RBI=0.0423396;REFB=0;REVB=-0.0218015;RO=0;SAF=61;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111189;OID=.;OPOS=202264156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:64:61:0:0:64:61:0:0
chr2	202337730	.	A	G	1516.61	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00166654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.661;QD=63.1922;RBI=0.0304881;REFB=0;REVB=0.0304426;RO=0;SAF=57;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.04353e-05;OID=.;OPOS=202337730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:38:57:0:0:38:58:0:0
chr2	202342402	.	G	T	1280.42	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.781;QD=61.707;RBI=0.0525818;REFB=0;REVB=0.0362662;RO=0;SAF=42;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.6281e-05;OID=.;OPOS=202342402;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:83:0:0:80:83:1:38:42:0:0:39:44:0:0
chr2	202357949	.	A	C	561.1	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0711013;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1718;QD=57.5482;RBI=0.0752178;REFB=0;REVB=0.0245421;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00555492;OID=.;OPOS=202357949;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:37:39:0:0:37:39:1:13:24:0:0:13:26:0:0
chr2	202469361	.	C	T	214.27	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0720664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.226;QD=45.1086;RBI=0.0730156;REFB=0.0214002;REVB=0.0117355;RO=1;SAF=1;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262699;STB=0.51427;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=8.20694e-05;OID=.;OPOS=202469361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:17:1:0:1:17:1:0:1
chr2	202507353	.	G	C	211.63	PASS	AF=0.423729;AO=24;DP=58;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=32;FWDB=0.0391886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.568;QD=14.348;RBI=0.0447305;REFB=-0.00797873;REVB=-0.0215655;RO=34;SAF=4;SAR=20;SRF=2;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241105;STB=0.649907;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0161378;OID=.;OPOS=202507353;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:34:34:24:25:0.423729:20:4:2:32:20:5:2:32
chr2	202512449	.	C	T	315.02	PASS	AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0057298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.892;QD=20.0009;RBI=0.0121709;REFB=-0.0225704;REVB=-0.0107378;RO=30;SAF=13;SAR=20;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231711;STB=0.628494;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.011507;OID=.;OPOS=202512449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:30:30:33:33:0.52381:20:13:20:10:20:13:20:10
chr2	202557702	.	C	T	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.5;QD=60.6099;RBI=0.0400048;REFB=0;REVB=-0.0125898;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227898;OID=.;OPOS=202557702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr2	202575821	.	G	A	222.64	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.746;QD=49.4752;RBI=0.0213022;REFB=0;REVB=0.0179097;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103973;OID=.;OPOS=202575821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
chr2	202593280	.	G	A	190.28	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00581684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.091;QD=21.7464;RBI=0.013113;REFB=-0.0152933;REVB=0.0117522;RO=16;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262645;STB=0.64691;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0131367;OID=.;OPOS=202593280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:11:8:12:4:11:8:12:4
chr2	202625615	.	C	T	1102.08	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00460396;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.173;QD=60.3878;RBI=0.027361;REFB=0;REVB=-0.0269709;RO=0;SAF=48;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.43583e-05;OID=.;OPOS=202625615;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:25:48:0:0:25:48:0:0
chr2	202633582	.	A	G	240.37	PASS	AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00886544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.095;QD=21.3663;RBI=0.043996;REFB=-0.0153859;REVB=0.0430935;RO=21;SAF=19;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247058;STB=0.65851;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0121513;OID=.;OPOS=202633582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:22:23:23:0.511111:4:19:13:8:4:19:13:9
chr2	202741256	.	A	T	1222.27	PASS	AF=1;AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398305;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.865;QD=61.1134;RBI=0.0422384;REFB=0;REVB=-0.0140576;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.13381e-05;OID=.;OPOS=202741256;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:79:80:1:36:43:0:0:36:44:0:0
chr2	202741269	.	G	A	1194.55	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0131986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.099;QD=59.7276;RBI=0.0173942;REFB=-0.0774;REVB=-0.0113294;RO=1;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133333;STB=0.50704;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00015545;OID=.;OPOS=202741269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:35:44:0:1:35:44:0:1
chr2	202899995	.	T	C,TC	65.3	PASS	AF=0,0.352941;AO=2,6;DP=34;FAO=0,12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=0,2;FSAR=0,10;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.011281,-0.118932;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=208.728,15.1458;QD=7.68232;RBI=0.0170807,0.164202;REFB=0.00360566,-0.067051;REVB=-0.0128253,0.113214;RO=24;SAF=1,0;SAR=1,6;SRF=16;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.163262,-0.749995;STB=0.5,0.832778;STBP=1,0.011;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.108386;OID=.,.;OPOS=202899995,202899996;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:66:34:34:24:22:2,6:0,12:0,0.352941:1,6:1,0:16:8:0,10:0,2:15:7
chr2	202901910	.	G	A	245.61	PASS	AF=0.298246;AO=31;DP=111;FAO=34;FDP=114;FR=.;FRO=80;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=45;FWDB=-0.0238345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.01;QD=8.61799;RBI=0.0276798;REFB=-0.0106586;REVB=0.0140745;RO=79;SAF=18;SAR=13;SRF=35;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165659;STB=0.564197;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0250715;OID=.;OPOS=202901910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:114:79:80:31:34:0.298246:13:18:35:44:16:18:35:45
chr2	202939654	.	T	C	410.0	PASS	AF=0.438095;AO=46;DP=105;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0127373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.94;QD=15.619;RBI=0.0162375;REFB=-0.011523;REVB=-0.0100706;RO=59;SAF=19;SAR=27;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146809;STB=0.582295;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0219654;OID=.;OPOS=202939654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:59:59:46:46:0.438095:27:19:33:26:27:19:33:26
chr2	202939836	.	G	C	277.42	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=0.0341438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.066;QD=18.4949;RBI=0.0376719;REFB=-0.0321412;REVB=0.0159178;RO=29;SAF=14;SAR=16;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203693;STB=0.601746;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0266281;OID=.;OPOS=202939836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:30:30:30:0.5:16:14:7:22:16:14:8:22
chr2	202964517	.	G	C	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0963074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2332;QD=12.0505;RBI=0.0968655;REFB=0.0146974;REVB=0.0103828;RO=13;SAF=2;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.464536;STB=0.77716;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=-0.00750524;OID=.;OPOS=202964517;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:7:2:9:4:7:2:9:4
chr2	203139844	.	T	C	31.75	PASS	AF=0.555556;AO=4;DP=8;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0274587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.289;QD=14.1095;RBI=0.0275566;REFB=0.00227456;REVB=0.00232058;RO=4;SAF=3;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223593;STB=0.54527;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=5.88575e-05;OID=.;OPOS=203139844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:8:9:4:4:4:5:0.555556:1:3:2:2:2:3:2:2
chr2	203155936	.	A	C	367.45	PASS	AF=0.544118;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.0471919;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1665;QD=21.6147;RBI=0.0984699;REFB=-0.0347549;REVB=0.0864248;RO=30;SAF=27;SAR=10;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300597;STB=0.511459;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0431209;OID=.;OPOS=203155936;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:30:31:37:37:0.544118:10:27:21:9:10:27:22:9
chr2	203167713	.	G	A	33.67	PASS	AF=0.181818;AO=6;DP=33;FAO=6;FDP=33;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.01798;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.051;QD=4.08177;RBI=0.0189198;REFB=-0.00441317;REVB=0.00588902;RO=23;SAF=1;SAR=5;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.577132;STB=0.840471;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.101094;OID=.;OPOS=203167713;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:33:33:23:27:6:6:0.181818:5:1:16:7:5:1:16:11
chr2	203640713	.	T	C	189.07	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.00313242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.717;QD=21.0075;RBI=0.0230384;REFB=-0.00893363;REVB=0.0228245;RO=17;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204108;STB=0.614131;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.010054;OID=.;OPOS=203640713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:9:10:13:4:9:10:13:4
chr2	204062061	.	A	G	1822.2	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00852742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.022;QD=61.2503;RBI=0.0198445;REFB=0;REVB=0.0179189;RO=0;SAF=59;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.14177e-06;OID=.;OPOS=204062061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:119:0:0:119:119:1:60:59:0:0:60:59:0:0
chr2	204090887	.	C	G	739.07	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0226636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.659;QD=54.746;RBI=0.0253279;REFB=-0.0455478;REVB=0.0113078;RO=1;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219051;STB=0.511624;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00185811;OID=.;OPOS=204090887;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:21:32:0:1:21:32:0:1
chr2	204116690	.	C	T	743.6	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00210094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.114;QD=56.1204;RBI=0.0792677;REFB=0;REVB=-0.0792399;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335352;OID=.;OPOS=204116690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:24:28:0:0:24:29:0:0
chr2	204206977	.	C	T	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.517;QD=56.9378;RBI=0.0319608;REFB=0;REVB=-0.0299968;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.40322e-05;OID=.;OPOS=204206977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr2	204298783	.	A	C	228.9	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.0398892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6514;QD=16.0634;RBI=0.0413652;REFB=-0.0421687;REVB=-0.0109512;RO=31;SAF=18;SAR=8;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380103;STB=0.714125;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0537075;OID=.;OPOS=204298783;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:8:18:9:22:8:18:9:22
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chr2	204298787	.	A	C	142.29	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.117964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.994;QD=12.3732;RBI=0.126484;REFB=-0.0596904;REVB=-0.045635;RO=29;SAF=14;SAR=3;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.553154;STB=0.823149;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.093448;OID=.;OPOS=204298787;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:3:14:9:20:3:14:9:20
chr2	204299540	.	A	G	277.58	PASS	AF=0.449275;AO=29;DP=68;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.00950242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.016;QD=16.0918;RBI=0.0249983;REFB=-0.014983;REVB=-0.0231218;RO=38;SAF=15;SAR=14;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169349;STB=0.576581;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0153302;OID=.;OPOS=204299540;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:38:38:29:31:0.449275:14:15:26:12:14:17:26:12
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chr2	205969220	.	G	A	1118.1	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00341906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=334.196;QD=60.438;RBI=0.00356439;REFB=0;REVB=-0.00100741;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.56489e-06;OID=.;OPOS=205969220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:74:0:0:71:74:1:31:40:0:0:32:42:0:0
chr2	205986321	.	A	G	239.61	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00572311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2528;QD=18.0834;RBI=0.0128727;REFB=-0.0131489;REVB=-0.0115305;RO=25;SAF=14;SAR=12;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544984;STB=0.508765;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0225925;OID=.;OPOS=205986321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:27:26:26:0.490566:12:14:15:10:12:14:15:12
chr2	205990353	.	C	T	315.66	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0223565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.347;QD=17.5364;RBI=0.0238755;REFB=-0.0239199;REVB=0.00838012;RO=37;SAF=17;SAR=17;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125912;STB=0.513881;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0269721;OID=.;OPOS=205990353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:37:38:34:34:0.472222:17:17:18:19:17:17:18:20
chr2	206166580	.	G	A	377.38	PASS	AF=0.407407;AO=43;DP=111;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=0.0233659;FXX=0.0357111;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9654;QD=13.9769;RBI=0.0331526;REFB=0.000841818;REVB=-0.0235187;RO=68;SAF=15;SAR=28;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121383;STB=0.551606;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=-0.000979162;OID=.;OPOS=206166580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:108:68:64:43:44:0.407407:28:15:31:37:29:15:27:37
chr2	206218963	.	G	A	187.79	PASS	AF=0.294118;AO=25;DP=86;FAO=25;FDP=85;FR=.;FRO=60;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.0193385;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.594;QD=8.83697;RBI=0.0193981;REFB=-0.0125239;REVB=0.00151867;RO=60;SAF=14;SAR=11;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110885;STB=0.565737;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0297124;OID=.;OPOS=206218963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:60:60:25:25:0.294118:11:14:28:32:11:14:28:32
chr2	206219012	.	TA	CC	284.88	PASS	AF=0.370787;AO=33;DP=89;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=37;FWDB=0.000298148;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=180.449;QD=12.8036;RBI=0.0144377;REFB=-0.0129508;REVB=-0.0144347;RO=53;SAF=17;SAR=16;SRF=19;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168769;STB=0.609956;STBP=0.135;TYPE=mnp;VARB=0.0209823;OID=.;OPOS=206219012;OREF=TA;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:53:56:33:33:0.370787:16:17:19:34:16:17:19:37
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chr2	206592695	.	T	C	1073.66	PASS	AF=0.548387;AO=101;DP=184;FAO=102;FDP=186;FR=.;FRO=84;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=40;FSRR=44;FWDB=-0.0308578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.495;QD=23.0894;RBI=0.0334115;REFB=-0.0347077;REVB=0.0128111;RO=83;SAF=54;SAR=47;SRF=39;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536051;STB=0.528505;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0185465;OID=.;OPOS=206592695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:186:83:84:101:102:0.548387:47:54:39:44:47:55:40:44
chr2	206608039	.	T	C	888.56	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0118059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.2981;QD=56.4166;RBI=0.055489;REFB=-0.0460731;REVB=-0.0542186;RO=0;SAF=23;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75648e-08;STB=0.510635;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00239121;OID=.;OPOS=206608039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:0:1:62:62:0.984127:39:23:0:0:39:23:1:0
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chr2	207008763	.	C	A	230.72	PASS	AF=0.421875;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0199223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.04;QD=14.42;RBI=0.0479268;REFB=-0.0314334;REVB=0.0435899;RO=37;SAF=19;SAR=8;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181086;STB=0.603478;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0277095;OID=.;OPOS=207008763;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:37:37:27:27:0.421875:8:19:20:17:8:19:20:17
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chr2	207041441	.	G	A	34.57	PASS	AF=0.193548;AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.00616752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.582;QD=4.46096;RBI=0.041601;REFB=-0.0116857;REVB=-0.0411413;RO=25;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179101;STB=0.512155;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0257047;OID=.;OPOS=207041441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:31:31:25:25:6:6:0.193548:4:2:8:17:4:2:8:17
chr2	207086148	.	T	C	1302.11	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00416885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.992;QD=62.0052;RBI=0.0470883;REFB=0;REVB=0.0469033;RO=0;SAF=49;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.85787e-05;OID=.;OPOS=207086148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:35:49:0:0:35:49:0:0
chr2	207172627	.	A	G	345.98	PASS	AF=0.607143;AO=33;DP=55;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0201693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.663;QD=24.7131;RBI=0.0773774;REFB=-0.0244453;REVB=0.0747024;RO=21;SAF=21;SAR=12;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248248;STB=0.630496;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0173036;OID=.;OPOS=207172627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:21:22:33:34:0.607143:12:21:6:15:12:22:7:15
chr2	207172770	.	A	G	213.25	PASS	AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.00303898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.823;QD=12.5439;RBI=0.00305962;REFB=-0.00861634;REVB=-0.000354848;RO=41;SAF=7;SAR=19;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412546;STB=0.730592;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0208143;OID=.;OPOS=207172770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:41:42:26:26:0.382353:19:7:27:14:19:7:27:15
chr2	207174316	.	T	C	191.33	PASS	AF=0.421053;AO=21;DP=54;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.00223849;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.647;QD=13.4263;RBI=0.0112735;REFB=-0.00922802;REVB=-0.011049;RO=32;SAF=11;SAR=10;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10716;STB=0.513584;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0126963;OID=.;OPOS=207174316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:57:32:33:21:24:0.421053:10:11:20:12:10:14:20:13
chr2	207472683	.	C	CTA	542.95	PASS	AF=0.415493;AO=58;DP=144;FAO=59;FDP=142;FR=.;FRO=83;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=46;FSRR=37;FWDB=-0.00342781;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=2;MLLD=243.211;QD=15.2943;RBI=0.00562926;REFB=-0.0120925;REVB=-0.00446528;RO=83;SAF=29;SAR=29;SRF=47;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694193;STB=0.536596;STBP=0.502;TYPE=ins;VARB=0.0163791;OID=.;OPOS=207472684;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=CTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.415493:58:144:59:142:83:29:30:46:37:99:83:29:29:47:36
chr2	207603234	.	T	G	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0550216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.7505;QD=13.4415;RBI=0.055026;REFB=-0.010223;REVB=0.000703292;RO=13;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825183;STB=0.548295;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0370668;OID=.;OPOS=207603234;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:7:3:3:10:7:3:3:10
chr2	207621759	.	A	G	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00643716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.0264;QD=57.1774;RBI=0.0187272;REFB=0;REVB=0.0175861;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180313;OID=.;OPOS=207621759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0
chr2	207820276	.	G	A	314.77	PASS	AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0293966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.984;QD=22.4834;RBI=0.0295859;REFB=0.00485067;REVB=-0.00334142;RO=22;SAF=17;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105555;STB=0.522458;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=-0.00299378;OID=.;OPOS=207820276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:22:24:32:32:0.571429:15:17:12:10:15:17:14:10
chr2	207824384	.	T	G	152.9	PASS	AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00016369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6289;QD=11.9921;RBI=0.0410499;REFB=-0.00536444;REVB=0.0410496;RO=33;SAF=11;SAR=7;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657909;STB=0.53842;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0102571;OID=.;OPOS=207824384;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:7:11:22:11:7:11:22:11
chr2	207825656	.	A	T	339.08	PASS	AF=0.473684;AO=35;DP=75;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.0494298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4675;QD=17.8464;RBI=0.050203;REFB=-0.0338391;REVB=0.00877699;RO=40;SAF=21;SAR=14;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509045;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0252232;OID=.;OPOS=207825656;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:40:40:35:36:0.473684:14:21:24:16:15:21:24:16
chr2	207833983	.	A	G	1128.53	PASS	AF=0.555556;AO=105;DP=189;FAO=105;FDP=189;FR=.;FRO=84;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=0.0109829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4466;QD=23.8842;RBI=0.0169515;REFB=-0.00297797;REVB=-0.0129125;RO=82;SAF=54;SAR=51;SRF=49;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673158;STB=0.530761;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.00295724;OID=.;OPOS=207833983;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:189:82:84:105:105:0.555556:51:54:49:33:51:54:49:35
chr2	207988613	.	C	T	1717.47	PASS	AF=0.982906;AO=115;DP=117;FAO=115;FDP=117;FR=.;FRO=2;FSAF=75;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.022413;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=84.3827;QD=58.717;RBI=0.0250174;REFB=-0.135793;REVB=0.0111141;RO=2;SAF=75;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231475;STB=0.512193;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.000664127;OID=.;OPOS=207988613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:117:117:2:2:115:115:0.982906:40:75:0:2:40:75:0:2
chr2	207998800	.	C	T	417.39	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161821;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.395;QD=57.5705;RBI=0.0702964;REFB=0;REVB=0.0684086;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000583774;OID=.;OPOS=207998800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:9:19:0:0:9:20:0:0
chr2	208477852	.	G	A	1510.34	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00954773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.41;QD=63.5934;RBI=0.0116899;REFB=0;REVB=0.00674501;RO=0;SAF=42;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.6709e-06;OID=.;OPOS=208477852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:53:42:0:0:53:42:0:0
chr2	208477956	.	C	T	1453.49	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.17;QD=63.1954;RBI=0.0368351;REFB=0;REVB=0.0334523;RO=0;SAF=44;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3097e-05;OID=.;OPOS=208477956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:48:44:0:0:48:44:0:0
chr2	208478055	.	A	G	478.98	PASS	AF=0.541176;AO=46;DP=85;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0899706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.172;QD=22.5404;RBI=0.0907397;REFB=0.0013594;REVB=0.0117892;RO=38;SAF=19;SAR=27;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136907;STB=0.581205;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=-2.11637e-05;OID=.;OPOS=208478055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:38:39:46:46:0.541176:27:19:22:16:27:19:23:16
chr2	208489101	.	C	A	83.96	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0253144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.606;QD=10.1768;RBI=0.0255866;REFB=0.00475008;REVB=0.00372253;RO=22;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340994;STB=0.703356;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=-0.00328106;OID=.;OPOS=208489101;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:4:7:7:15:4:7:7:15
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chr2	208633413	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.556;QD=43.485;RBI=0.0440428;REFB=0;REVB=0.0171168;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000806664;OID=.;OPOS=208633413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0
chr2	208633627	.	C	T	3485.93	PASS	AF=1;AO=216;DP=218;FAO=226;FDP=226;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030302;FXX=0.00440509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.177;QD=61.698;RBI=0.0303374;REFB=-0.0370099;REVB=-0.00146591;RO=0;SAF=102;SAR=114;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51235e-05;OID=.;OPOS=208633627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:218:226:0:0:216:226:1:114:102:0:0:115:111:0:0
chr2	208841964	.	A	G	240.67	PASS	AF=0.482143;AO=26;DP=55;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00321398;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.726;QD=17.1909;RBI=0.00807042;REFB=-0.0128101;REVB=0.00740285;RO=29;SAF=14;SAR=12;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111235;STB=0.552807;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0174303;OID=.;OPOS=208841964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:29:29:26:27:0.482143:12:14:19:10:12:15:19:10
chr2	208842153	.	C	T	297.05	PASS	AF=0.58;AO=29;DP=49;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00256902;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.576;QD=23.7639;RBI=0.0232451;REFB=0.00168969;REVB=-0.0231027;RO=17;SAF=14;SAR=15;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110223;STB=0.557045;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=-0.00171291;OID=.;OPOS=208842153;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:17:21:29:29:0.58:15:14:11:6:15:14:13:8
chr2	208918917	.	C	T	248.26	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0459162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.0608;QD=16.2795;RBI=0.0685989;REFB=0.0130686;REVB=-0.0509658;RO=32;SAF=24;SAR=4;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483071;STB=0.78386;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.0302463;OID=.;OPOS=208918917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:33:28:28:0.459016:4:24:14:18:4:24:14:19
chr2	208938866	.	G	T	208.77	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0027654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.504;QD=18.1541;RBI=0.0325089;REFB=-0.0250486;REVB=-0.0323911;RO=23;SAF=16;SAR=5;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215792;STB=0.630408;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0316688;OID=.;OPOS=208938866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:25:21:21:0.456522:5:16:13:10:5:16:14:11
chr2	208989037	.	A	G	1659.56	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0415718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.605;QD=60.3478;RBI=0.0428491;REFB=0;REVB=-0.0103842;RO=0;SAF=67;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63972e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112517;OID=.;OPOS=208989037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:43:67:0:0:43:67:0:0
chr2	209033173	.	A	G	520.73	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.120909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.491;QD=59.5115;RBI=0.122702;REFB=0;REVB=0.0208977;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382533;OID=.;OPOS=209033173;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:35:0:0:33:35:1:22:11:0:0:23:12:0:0
chr2	209036712	.	T	C	1589.15	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00175521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=368.766;QD=59.9679;RBI=0.00708173;REFB=0;REVB=0.00686077;RO=0;SAF=60;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11034e-06;OID=.;OPOS=209036712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:106:0:0:105:106:1:45:60:0:0:46:60:0:0
chr2	209036778	.	A	G	1355.51	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.02;QD=62.3224;RBI=0.0836543;REFB=0;REVB=0.0735094;RO=0;SAF=48;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274407;OID=.;OPOS=209036778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:39:48:0:0:39:48:0:0
chr2	209184979	.	AG	A,AA	572.53	PASS	AF=0.0263158,0.973684;AO=4,33;DP=38;FAO=1,37;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=1,19;FSAR=0,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.037764,-0.0326928;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=100.145,121.304;QD=60.2665;RBI=0.0612042,0.0947635;REFB=0,0;REVB=-0.0481646,0.0889455;RO=0;SAF=0,19;SAR=4,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.71297e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00183026,0.000709214;OID=.,.;OPOS=209184980,209184980;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0263158,0.973684:4,33:38:1,37:38:0:1,19:0,18:0:0:3:0:0,19:4,14:0:0
chr2	209184999	.	C	T	120.73	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.017402;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.207;QD=14.634;RBI=0.0182506;REFB=0.00366041;REVB=-0.00550035;RO=19;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249257;STB=0.643871;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=-0.00776762;OID=.;OPOS=209184999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:6:8:6:13:6:8:6:13
chr2	209190330	.	T	C	628.41	PASS	AF=0.606383;AO=55;DP=95;FAO=57;FDP=94;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.0896012;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.33;QD=26.7409;RBI=0.101082;REFB=-0.092922;REVB=0.0467883;RO=36;SAF=22;SAR=33;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134475;STB=0.593634;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0570164;OID=.;OPOS=209190330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:36:37:55:57:0.606383:33:22:21:15:35:22:23:14
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chr2	209190528	.	C	G	178.21	PASS	AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00341334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9361;QD=14.8508;RBI=0.0462639;REFB=-0.00524041;REVB=-0.0461378;RO=28;SAF=8;SAR=11;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296365;STB=0.657962;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0105111;OID=.;OPOS=209190528;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:29:19:19:0.395833:11:8:20:8:11:8:20:9
chr2	209191082	.	C	A	35.92	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0286725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5852;QD=6.24652;RBI=0.0286873;REFB=-0.020307;REVB=0.000923186;RO=17;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161893;STB=0.605698;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0522738;OID=.;OPOS=209191082;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:2:4:9:8:2:4:9:8
chr2	209191099	.	T	C	152.33	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0292222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4681;QD=40.6204;RBI=0.0472052;REFB=-0.022311;REVB=-0.0370728;RO=1;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060556;STB=0.533286;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0447043;OID=.;OPOS=209191099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:7:7:0:1:7:7:0:1
chr2	209209827	.	G	A	73.06	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.00650971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.969;QD=9.13233;RBI=0.0110893;REFB=-0.00968668;REVB=-0.00897749;RO=21;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0221961;STB=0.526264;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.0256561;OID=.;OPOS=209209827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:21:22:10:10:0.3125:6:4:8:13:6:4:8:14
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chr2	209214770	.	A	G	214.11	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.00156979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.88;QD=14.7662;RBI=0.0166881;REFB=-0.0181736;REVB=0.0166141;RO=33;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117542;STB=0.566615;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.020175;OID=.;OPOS=209214770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:13:12:12:21:13:12:12:21
chr2	209215586	.	A	G	291.55	PASS	AF=0.354167;AO=34;DP=96;FAO=34;FDP=96;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=-0.00865236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1462;QD=12.1477;RBI=0.00983459;REFB=-0.00790384;REVB=0.00467502;RO=61;SAF=20;SAR=14;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162225;STB=0.588183;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.00949642;OID=.;OPOS=209215586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:61:62:34:34:0.354167:14:20:27:34:14:20:28:34
chr2	209220157	.	G	T	857.83	PASS	AF=0.444976;AO=93;DP=209;FAO=93;FDP=209;FR=.;FRO=116;FSAF=29;FSAR=64;FSRF=47;FSRR=69;FWDB=-0.019607;FXX=0.00476168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.421;QD=16.4178;RBI=0.0297637;REFB=-0.0285856;REVB=-0.0223929;RO=116;SAF=29;SAR=64;SRF=47;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10361;STB=0.557721;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0383844;OID=.;OPOS=209220157;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:209:209:116:116:93:93:0.444976:64:29:47:69:64:29:47:69
chr2	209220238	.	G	C	892.92	PASS	AF=0.459596;AO=90;DP=197;FAO=91;FDP=198;FR=.;FRO=107;FSAF=29;FSAR=62;FSRF=37;FSRR=70;FWDB=0.0956903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3176;QD=18.0387;RBI=0.104929;REFB=-0.0167172;REVB=0.0430523;RO=106;SAF=29;SAR=61;SRF=36;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192816;STB=0.516663;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0253763;OID=.;OPOS=209220238;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:197:198:106:107:90:91:0.459596:61:29:36:70:62:29:37:70
chr2	209224874	.	CAA	CA,CAC	193.04	PASS	AF=0.444444,0.0222222;AO=17,2;DP=45;FAO=20,1;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=5,0;FSAR=15,1;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.125185,-0.106227;FXX=0.0217344;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=27.3294,30.6045;QD=17.1595;RBI=0.128965,0.108149;REFB=0.00642244,-0.00521192;REVB=0.0309919,-0.0202978;RO=24;SAF=3,0;SAR=14,2;SRF=9;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.269936,-0.439015;STB=0.583245,0.987486;STBP=0.358,0.474;TYPE=del,snp;VARB=-0.0217587,0.106116;OID=.,.;OPOS=209224875,209224876;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=CA,CAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.444444,0.0222222:17,2:45:20,1:45:24:5,0:15,1:9:15:99:24:3,0:14,2:9:15
chr2	209358027	.	C	T	707.77	PASS	AF=0.616822;AO=66;DP=107;FAO=66;FDP=107;FR=.;FRO=41;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.0407202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.395;QD=26.4588;RBI=0.040946;REFB=-0.0413058;REVB=0.00429392;RO=40;SAF=37;SAR=29;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128801;STB=0.565185;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0240692;OID=.;OPOS=209358027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:40:41:66:66:0.616822:29:37:15:25:29:37:16:25
chr2	210586685	.	T	C	1357.73	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.355;QD=62.4244;RBI=0.0403607;REFB=0;REVB=0.00643177;RO=0;SAF=46;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60118e-05;OID=.;OPOS=210586685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:87:0:0:85:87:1:39:46:0:0:40:47:0:0
chr2	210685100	.	G	A	336.6	PASS	AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00812626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.005;QD=17.2616;RBI=0.0308855;REFB=-0.00724979;REVB=-0.0297973;RO=42;SAF=20;SAR=16;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388161;STB=0.521727;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0107591;OID=.;OPOS=210685100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:42:42:36:36:0.461538:16:20:25:17:16:20:25:17
chr2	210685367	.	C	T	35.94	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0277571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9508;QD=6.25088;RBI=0.115278;REFB=-0.00025178;REVB=-0.111887;RO=16;SAF=4;SAR=2;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267262;STB=0.533225;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=-0.00958422;OID=.;OPOS=210685367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:16:17:6:6:0.26087:2:4:11:5:2:4:12:5
chr2	210843383	.	G	A	1221.69	PASS	AF=1;AO=78;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162158;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.045;QD=61.0847;RBI=0.0185184;REFB=0;REVB=0.00894317;RO=0;SAF=30;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000399045;OID=.;OPOS=210843383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:78:80:1:48:30:0:0:49:31:0:0
chr2	210860289	.	G	A	448.76	PASS	AF=0.438596;AO=50;DP=114;FAO=50;FDP=114;FR=.;FRO=64;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=0.00936504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.417;QD=15.746;RBI=0.0102918;REFB=0.00646952;REVB=0.00426818;RO=64;SAF=23;SAR=27;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705386;STB=0.53943;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.00949147;OID=.;OPOS=210860289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:64:64:50:50:0.438596:27:23:25:39:27:23:25:39
chr2	211098113	.	C	T	1337.49	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246253;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.202;QD=62.209;RBI=0.0281657;REFB=0;REVB=0.0136713;RO=0;SAF=52;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.67284e-05;OID=.;OPOS=211098113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:84:86:1:32:52:0:0:33:53:0:0
chr2	211296239	.	G	A	187.02	PASS	AF=0.487805;AO=19;DP=40;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00736509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.767;QD=18.2459;RBI=0.0597052;REFB=-0.0305716;REVB=-0.0592492;RO=21;SAF=15;SAR=4;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249438;STB=0.649833;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0148826;OID=.;OPOS=211296239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:21:21:19:20:0.487805:4:15:12:9:4:16:12:9
chr2	211342502	.	G	A	851.14	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0217971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.971;QD=57.7042;RBI=0.0303093;REFB=0;REVB=0.0210603;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.94977e-07;OID=.;OPOS=211342502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:26:33:0:0:26:33:0:0
chr2	211421452	.	A	ATCT,T	310.06	PASS	AF=0.4125,0.025;AO=32,3;DP=81;FAO=33,2;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=20,0;FSAR=13,2;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.00797394,-0.00457939;FXX=0.0123442;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=230.943,117.579;QD=15.5028;RBI=0.00973756,0.0821482;REFB=-0.0168199,-0.0024156;REVB=-0.00558895,0.0820204;RO=45;SAF=20,1;SAR=12,2;SRF=28;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00304938,-0.268275;STB=0.509798,0.995985;STBP=0.903,0.107;TYPE=ins,snp;VARB=0.0175454,0.023166;OID=.,.;OPOS=211421453,211421452;OREF=-,A;OALT=TCT,T;OMAPALT=ATCT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:45:45:32,3:33,2:0.4125,0.025:12,2:20,1:28:17:13,2:20,0:28:17
chr2	211540507	.	C	A	169.35	PASS	AF=0.377049;AO=16;DP=53;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0057165;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.4986;QD=11.1047;RBI=0.0385932;REFB=-0.0780264;REVB=0.0381675;RO=37;SAF=8;SAR=8;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142134;STB=0.514006;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0620904;OID=.;OPOS=211540507;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:61:37:38:16:23:0.377049:8:8:23:14:8:15:24:14
chr2	212241725	.	C	T	215.19	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0115481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.967;QD=21.5192;RBI=0.0156672;REFB=-0.0219154;REVB=0.0105878;RO=19;SAF=7;SAR=14;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806612;STB=0.54541;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0201161;OID=.;OPOS=212241725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:14:7:8:11:14:7:8:11
chr2	212242745	.	G	C	190.9	PASS	AF=0.363636;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.023231;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.31;QD=11.57;RBI=0.0662659;REFB=-0.0110561;REVB=0.0620604;RO=40;SAF=14;SAR=10;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222776;STB=0.626762;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0123248;OID=.;OPOS=212242745;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:42:24:24:0.363636:10:14:15:25:10:14:16:26
chr2	212244403	.	G	A	420.59	PASS	AF=0.457447;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0180957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.816;QD=17.8974;RBI=0.0263115;REFB=-0.0175911;REVB=-0.0191008;RO=50;SAF=21;SAR=22;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304355;STB=0.522245;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0210285;OID=.;OPOS=212244403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:50:51:43:43:0.457447:22:21:26:24:22:21:27:24
chr2	213866714	.	G	A	1358.67	PASS	AF=0.988764;AO=86;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00507007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.947;QD=61.064;RBI=0.0138951;REFB=0.0315433;REVB=0.0129371;RO=0;SAF=42;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=5.43048e-05;OID=.;OPOS=213866714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:89:0:1:86:88:0.988764:44:42:0:0:45:43:1:0
chr2	213886454	.	A	T	1072.66	PASS	AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00789947;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=247.262;QD=57.2084;RBI=0.0448642;REFB=-0.160738;REVB=0.0441633;RO=2;SAF=36;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255518;STB=0.51351;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00035515;OID=.;OPOS=213886454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:75:75:2:2:73:73:0.973333:37:36:2:0:37:36:2:0
chr2	214012405	.	AA	AC,CA	998.35	PASS	AF=0.421687,0.493976;AO=7,35;DP=79;FAO=35,41;FDP=83;FR=.;FRO=7;FSAF=27,15;FSAR=8,26;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00552745,-0.0015564;FXX=0;HRUN=9,9;LEN=1,1;MLLD=144.785,103.537;QD=48.1132;RBI=0.00777437,0.0138952;REFB=-0.0229686,-0.0117125;REVB=0.005467,0.0138078;RO=2;SAF=7,11;SAR=0,24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.804017,0.0374036;STB=0.544927,0.531739;STBP=0.256,0.312;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00436084,0.0223976;OID=.,.;OPOS=214012406,214012405;OREF=A,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:79:83:2:7:7,35:35,41:0.421687,0.493976:0,24:7,11:0:2:8,26:27,15:4:3
chr2	214637044	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.577;QD=51.1846;RBI=0.0225928;REFB=0;REVB=-0.00131667;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103402;OID=.;OPOS=214637044;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:16:3:0:0:16:4:0:0
chr2	214794743	.	A	C	1482.54	PASS	AF=0.979381;AO=95;DP=97;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0269544;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.838;QD=61.1356;RBI=0.0280882;REFB=-0.0582078;REVB=0.00789998;RO=2;SAF=50;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00103148;STB=0.500544;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.000777063;OID=.;OPOS=214794743;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:97:97:2:2:95:95:0.979381:45:50:1:1:45:50:1:1
chr2	215102929	.	T	A	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=337.128;QD=58.5878;RBI=0.0213822;REFB=0;REVB=-0.00590388;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36839e-05;OID=.;OPOS=215102929;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr2	215595645	.	C	T	954.94	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.182;QD=58.7655;RBI=0.0255775;REFB=0;REVB=0.0227162;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.90364e-05;OID=.;OPOS=215595645;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:25:40:0:0:25:40:0:0
chr2	215617262	.	C	T	489.45	PASS	AF=0.485981;AO=52;DP=107;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0148597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8801;QD=18.2972;RBI=0.0274067;REFB=-0.00481892;REVB=-0.0230286;RO=55;SAF=26;SAR=26;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059007;STB=0.532698;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00528056;OID=.;OPOS=215617262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:55:55:52:52:0.485981:26:26:31:24:26:26:31:24
chr2	215632255	.	CA	TG	1476.13	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319235;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=2;MLLD=223.483;QD=63.4893;RBI=0.0572393;REFB=0;REVB=0.0475102;RO=0;SAF=49;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=1.47458e-05;OID=.;OPOS=215632255;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:93:0:0:93:93:1:44:49:0:0:44:49:0:0
chr2	215645464	.	C	G	1127.42	PASS	AF=0.974359;AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0270914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.808;QD=57.8162;RBI=0.0304087;REFB=-0.158052;REVB=0.0138109;RO=1;SAF=37;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012618;STB=0.513154;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.000210416;OID=.;OPOS=215645464;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:78:78:1:2:76:76:0.974359:39:37:1:0:39:37:2:0
chr2	215674224	.	G	A	3005.15	PASS	AF=0.989637;AO=191;DP=193;FAO=191;FDP=193;FR=.;FRO=2;FSAF=130;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0234932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.202;QD=62.2829;RBI=0.0384983;REFB=-0.0115993;REVB=0.030499;RO=0;SAF=130;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502149;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=8.24381e-05;OID=.;OPOS=215674224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:193:193:0:2:191:191:0.989637:61:130:0:0:61:130:1:1
chr2	215796568	.	T	C	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00749284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.339;QD=61.336;RBI=0.0172932;REFB=0;REVB=0.0155856;RO=0;SAF=29;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.74749e-05;OID=.;OPOS=215796568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:11:29:0:0:11:29:0:0
chr2	215820013	.	G	A	264.8	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00164036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.845;QD=20.7687;RBI=0.0253314;REFB=-0.0154314;REVB=-0.0252782;RO=23;SAF=22;SAR=5;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272181;STB=0.646937;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0109071;OID=.;OPOS=215820013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:24:27:27:0.529412:5:22:13:10:5:22:14:10
chr2	215865575	.	T	C	326.0	PASS	AF=0.373737;AO=36;DP=98;FAO=37;FDP=99;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.0208722;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3716;QD=13.1717;RBI=0.0499886;REFB=-0.0159859;REVB=0.0454225;RO=60;SAF=24;SAR=12;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224222;STB=0.634443;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0314561;OID=.;OPOS=215865575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:60:62:36:37:0.373737:12:24:28:32:12:25:29:33
chr2	215876166	.	A	T	558.29	PASS	AF=0.906977;AO=39;DP=43;FAO=39;FDP=43;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0049303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.6064;QD=51.9339;RBI=0.0643599;REFB=-0.00472128;REVB=-0.0641708;RO=4;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103746;STB=0.555527;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00274505;OID=.;OPOS=215876166;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:43:43:4:4:39:39:0.906977:16:23:0:4:16:23:0:4
chr2	215940242	.	T	C	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00636412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.842;QD=60.9786;RBI=0.019147;REFB=0;REVB=0.0180584;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.96959e-05;OID=.;OPOS=215940242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr2	216190020	.	C	G	323.3	PASS	AF=0.4375;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0025925;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.031;QD=16.165;RBI=0.0313962;REFB=-0.00774116;REVB=-0.031289;RO=44;SAF=19;SAR=16;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253165;STB=0.519844;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0126451;OID=.;OPOS=216190020;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:44:45:35:35:0.4375:16:19:25:19:16:19:26:19
chr2	216212339	.	T	C	219.98	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0368112;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.6239;QD=13.9672;RBI=0.037087;REFB=-0.0109689;REVB=-0.00451502;RO=37;SAF=11;SAR=15;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066033;STB=0.537672;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.00846665;OID=.;OPOS=216212339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:15:11:18:19:15:11:18:19
chr2	216229692	.	A	G	194.28	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0340876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.554;QD=14.3909;RBI=0.0386543;REFB=-0.0185348;REVB=-0.018226;RO=31;SAF=7;SAR=16;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582431;STB=0.533304;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0350463;OID=.;OPOS=216229692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:16:7:11:20:16:7:11:20
chr2	216235089	.	C	T	1190.44	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00449013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.391;QD=61.0483;RBI=0.0385784;REFB=0;REVB=-0.0383162;RO=0;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000133084;OID=.;OPOS=216235089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:42:36:0:0:42:36:0:0
chr2	216242917	.	T	A	176.81	PASS	AF=0.385965;AO=21;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.00570577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7471;QD=12.4075;RBI=0.00775405;REFB=0.006215;REVB=0.00525066;RO=33;SAF=11;SAR=10;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220606;STB=0.606467;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=-0.00657342;OID=.;OPOS=216242917;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:35:21:22:0.385965:10:11:24:9:10:12:25:10
chr2	216249587	.	C	T	786.59	PASS	AF=1;AO=44;DP=51;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304416;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.954;QD=64.2111;RBI=0.139924;REFB=0;REVB=0.136572;RO=1;SAF=34;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044666;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000547838;OID=.;OPOS=216249587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:49:1:0:44:49:1:10:34:0:1:14:35:0:0
chr2	216272900	.	T	G	714.5	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.314;QD=62.1308;RBI=0.0537282;REFB=0;REVB=0.0476356;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212046;OID=.;OPOS=216272900;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:46:0:0:43:46:1:19:24:0:0:22:24:0:0
chr2	216272907	.	A	T	708.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.66;QD=61.6123;RBI=0.0637314;REFB=0;REVB=0.0537974;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144873;OID=.;OPOS=216272907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:39:46:1:17:22:0:0:23:23:0:0
chr2	216272908	.	G	T	32.74	PASS	AF=0.130435;AO=6;DP=46;FAO=6;FDP=46;FR=.;FRO=40;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0643832;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=66.1758;QD=2.84661;RBI=0.0673027;REFB=-0.0587156;REVB=0.0196075;RO=40;SAF=1;SAR=5;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450148;STB=0.832224;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.042034;OID=.;OPOS=216272908;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:46:46:40:40:6:6:0.130435:5:1:22:18:5:1:22:18
chr2	216300482	.	T	A	923.04	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0630298;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5663;QD=58.6061;RBI=0.0644175;REFB=0;REVB=0.0132988;RO=0;SAF=24;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000165572;OID=.;OPOS=216300482;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:39:24:0:0:39:24:0:0
chr2	216878008	.	C	G	178.92	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=-0.0375029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.6159;QD=15.5585;RBI=0.0435926;REFB=-0.0424155;REVB=0.0222228;RO=26;SAF=9;SAR=10;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170097;STB=0.583249;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0466;OID=.;OPOS=216878008;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:27:19:19:0.413043:10:9:8:18:10:9:9:18
chr2	216923679	.	C	T	206.32	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.00523177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.213;QD=14.7374;RBI=0.0824519;REFB=-0.0112754;REVB=0.0822857;RO=31;SAF=6;SAR=12;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362729;STB=0.722691;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0303723;OID=.;OPOS=216923679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:31:32:18:24:0.428571:12:6:21:10:17:7:22:10
chr2	217012900	.	C	CG	586.67	PASS	AF=1;AO=5;DP=45;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0707506;FXX=0.0243843;HRUN=0;LEN=1;MLLD=83.8985;QD=58.6668;RBI=0.0818729;REFB=0;REVB=0.0412011;RO=37;SAF=4;SAR=1;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144802;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000398459;OID=.;OPOS=217012901;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:45:40:40:0:28:12:0:0:4:37:4:1:26:11
chr2	217012901	.	A	G	449.6	PASS	AF=0.85;AO=33;DP=39;FAO=34;FDP=40;FR=.;FRO=6;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00304737;FXX=0.0243843;HRUN=5;LEN=1;MLLD=98.3989;QD=44.9599;RBI=0.0798726;REFB=-0.037337;REVB=0.0798144;RO=6;SAF=24;SAR=9;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389533;STB=0.523452;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00459624;OID=.;OPOS=217012901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:39:40:6:6:33:34:0.85:9:24:5:1:10:24:5:1
chr2	217148417	.	C	A	253.74	PASS	AF=0.638889;AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0421717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.35;QD=28.1931;RBI=0.0502334;REFB=-0.0285102;REVB=-0.0272937;RO=13;SAF=15;SAR=8;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130913;STB=0.572454;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0200716;OID=.;OPOS=217148417;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:13:13:23:23:0.638889:8:15:6:7:8:15:6:7
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chr2	218604246	.	G	GC	490.74	PASS	AF=1;AO=5;DP=42;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11375;FXX=0.0476077;HRUN=0;LEN=1;MLLD=104.2;QD=49.0741;RBI=0.11585;REFB=0;REVB=0.0219586;RO=37;SAF=0;SAR=5;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.581279;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00206782;OID=.;OPOS=218604247;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:42:40:40:0:14:26:0:0:4:37:0:5:14:23
chr2	218604247	.	A	C,G	630.03	PASS	AF=0.880952,0.119048;AO=37,5;DP=42;FAO=37,5;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0;FSAR=23,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127449,0.0159195;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=145.85,12.5378;QD=60.003;RBI=0.127862,0.0379989;REFB=0,0;REVB=0.0102743,0.0345035;RO=0;SAF=14,0;SAR=23,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.91909e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00255391,0.0370333;OID=.,.;OPOS=218604247,218604247;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:25:42:42:0:0:37,5:37,5:0.880952,0.119048:23,5:14,0:0:0:23,5:14,0:0:0
chr2	218664633	.	T	G	419.12	PASS	AF=0.506024;AO=42;DP=83;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00022582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.774;QD=20.1985;RBI=0.00604782;REFB=0.00415673;REVB=0.0060436;RO=41;SAF=18;SAR=24;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118128;STB=0.565486;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.00423515;OID=.;OPOS=218664633;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:41:41:42:42:0.506024:24:18:23:18:24:18:23:18
chr2	218674697	.	C	T	130.18	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0185266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.157;QD=13.7031;RBI=0.0208625;REFB=-0.000696601;REVB=-0.00959222;RO=22;SAF=3;SAR=12;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393032;STB=0.743835;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.000886881;OID=.;OPOS=218674697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:23:15:15:0.394737:12:3:12:10:12:3:13:10
chr2	218682474	.	A	G	470.93	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=96;FAO=47;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=12;FWDB=-0.0380665;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.158;QD=20.0394;RBI=0.042131;REFB=-0.0323239;REVB=0.0180543;RO=33;SAF=16;SAR=20;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265874;STB=0.632286;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0259155;OID=.;OPOS=218682474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:94:33:46:36:47:0.5:20:16:25:8:25:22:34:12
chr2	218682771	.	A	G	117.53	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.00840087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.592;QD=12.3718;RBI=0.0305383;REFB=-0.00881911;REVB=-0.02936;RO=23;SAF=5;SAR=9;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468;STB=0.754929;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0392254;OID=.;OPOS=218682771;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:24:14:14:0.368421:9:5:19:4:9:5:19:5
chr2	218683154	.	A	G	255.86	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00334814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.299;QD=51.1728;RBI=0.0255377;REFB=0;REVB=0.0253173;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205639;OID=.;OPOS=218683154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr2	218683257	.	A	G	103.32	PASS	AF=0.288889;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0195851;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.307;QD=9.18415;RBI=0.0202469;REFB=-0.00792689;REVB=0.00513425;RO=33;SAF=6;SAR=7;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629486;STB=0.549412;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0182762;OID=.;OPOS=218683257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:33:32:13:13:0.288889:7:6:17:16:7:6:17:15
chr2	218683368	.	C	T	210.61	PASS	AF=0.477273;AO=20;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0181044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.498;QD=19.1462;RBI=0.0451488;REFB=-0.0386717;REVB=0.04136;RO=22;SAF=9;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129545;STB=0.571361;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0322244;OID=.;OPOS=218683368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:22:23:20:21:0.477273:11:9:13:9:12:9:13:10
chr2	218694551	.	A	G	687.11	PASS	AF=0.436047;AO=75;DP=172;FAO=75;FDP=172;FR=.;FRO=97;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=34;FSRR=63;FWDB=0.0412606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.006;QD=15.9792;RBI=0.0413142;REFB=-0.00133913;REVB=-0.00210434;RO=97;SAF=33;SAR=42;SRF=34;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0931938;STB=0.551826;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00220342;OID=.;OPOS=218694551;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:172:97:97:75:75:0.436047:42:33:34:63:42:33:34:63
chr2	218712918	.	C	T	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00929898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0031;QD=39.2068;RBI=0.0128167;REFB=0;REVB=0.00882021;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.99855e-05;OID=.;OPOS=218712918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr2	218745685	.	G	A	506.72	PASS	AF=0.494949;AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=0.0572314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.495;QD=20.4734;RBI=0.0574348;REFB=-0.00673874;REVB=0.00482963;RO=50;SAF=35;SAR=14;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347974;STB=0.693135;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0120994;OID=.;OPOS=218745685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:50:50:49:49:0.494949:14:35:17:33:14:35:17:33
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chr2	219110625	.	G	A	170.39	PASS	AF=0.409091;AO=17;DP=43;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=26;FSRR=0;FWDB=-0.0130844;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=378.179;QD=15.49;RBI=0.194274;REFB=0.0030323;REVB=0.193833;RO=25;SAF=16;SAR=1;SRF=25;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401447;STB=0.723989;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.00403981;OID=.;OPOS=219110625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:25:26:17:18:0.409091:1:16:25:0:2:16:26:0
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chr2	219140282	.	G	A	485.71	PASS	AF=0.559524;AO=36;DP=84;FAO=47;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=35;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0762259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9343;QD=23.1291;RBI=0.0773651;REFB=-0.0258188;REVB=0.013228;RO=37;SAF=24;SAR=12;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172027;STB=0.630388;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0515763;OID=.;OPOS=219140282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:37:37:36:47:0.559524:12:24:18:19:12:35:18:19
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chr2	219144815	.	T	C	919.01	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00788749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.552;QD=58.35;RBI=0.0559498;REFB=0;REVB=0.055391;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113657;OID=.;OPOS=219144815;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:27:35:0:0:27:36:0:0
chr2	219210382	.	C	CCT	207.3	PASS	AF=0.446809;AO=19;DP=48;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0240869;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=2;MLLD=283.168;QD=17.6424;RBI=0.0275084;REFB=-0.00255078;REVB=0.0132867;RO=28;SAF=8;SAR=11;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148183;STB=0.569556;STBP=0.399;TYPE=ins;VARB=0.00499498;OID=.;OPOS=219210383;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.446809:19:48:21:47:26:9:12:8:18:99:28:8:11:8:20
chr2	219229428	.	G	A	541.41	PASS	AF=0.478992;AO=57;DP=119;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=19;FWDB=0.00386875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.172;QD=18.1987;RBI=0.0197668;REFB=-0.00680002;REVB=0.0193846;RO=61;SAF=36;SAR=21;SRF=43;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753191;STB=0.535322;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.00766734;OID=.;OPOS=219229428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:61:62:57:57:0.478992:21:36:43:18:21:36:43:19
chr2	219231807	.	C	G,T	437.64	PASS	AF=0.0625,0.9375;AO=2,29;DP=32;FAO=2,30;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=2,19;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0395674,-0.00796308;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=11.7778,183.364;QD=54.7054;RBI=0.0934303,0.00955445;REFB=0,0;REVB=-0.0846383,-0.00527987;RO=0;SAF=2,18;SAR=0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.245099,-0.000289547;OID=.,.;OPOS=219231807,219231807;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:32:32:0:0:2,29:2,30:0.0625,0.9375:0,11:2,18:0:0:0,11:2,19:0:0
chr2	219252630	.	C	T	104.63	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0480785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.146;QD=19.9287;RBI=0.0656941;REFB=-0.0175176;REVB=-0.044768;RO=9;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0977979;STB=0.555467;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0120828;OID=.;OPOS=219252630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:8:4:2:7:8:4:2:7
chr2	219254622	.	A	G	1135.23	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00910394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.274;QD=60.5457;RBI=0.00929925;REFB=0;REVB=0.00189584;RO=0;SAF=48;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67858e-05;OID=.;OPOS=219254622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:27:48:0:0:27:48:0:0
chr2	219259732	.	G	A	271.63	PASS	AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0634981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9041;QD=20.8943;RBI=0.0739505;REFB=-0.000630217;REVB=-0.0379034;RO=24;SAF=13;SAR=15;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00496446;STB=0.50276;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.001256;OID=.;OPOS=219259732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:24:28:28:0.538462:15:13:11:13:15:13:11:13
chr2	219265094	.	T	C	712.29	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2818;QD=61.9385;RBI=0.045644;REFB=0;REVB=0.0231093;RO=0;SAF=10;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74446e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000636424;OID=.;OPOS=219265094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:34:10:0:0:35:11:0:0
chr2	219267781	.	C	T	202.01	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00282847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.315;QD=21.2637;RBI=0.0534828;REFB=-0.00989617;REVB=-0.053408;RO=18;SAF=17;SAR=3;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.468273;STB=0.767436;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00221561;OID=.;OPOS=219267781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:3:17:7:11:3:17:7:11
chr2	219269391	.	TGGGGGGC	TGGGGG,TGGGGGC	50.31	PASS	AF=0,0.444444;AO=4,11;DP=35;FAO=0,16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=0,11;FSAR=0,5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.175834,-0.137359;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=19.1144,10.8571;QD=5.59023;RBI=0.183238,0.15067;REFB=-0.0271459,-0.103693;REVB=-0.0515628,0.0619199;RO=16;SAF=3,8;SAR=1,3;SRF=8;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0.526316,0.526316;SSSB=0.293573,0.246768;STB=0.5,0.583225;STBP=1,0.386;TYPE=del,del;VARB=0.0358736,0.106664;OID=.,.;OPOS=219269397,219269392;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGGGGG,TGGGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.444444:4,11:35:0,16:36:20:0,11:0,5:11:9:49:16:3,8:1,3:8:8
chr2	219319657	.	A	G	1395.83	PASS	AF=0.989011;AO=86;DP=89;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0130263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.856;QD=61.3554;RBI=0.0300175;REFB=-0.0308004;REVB=0.0270438;RO=1;SAF=64;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00734653;STB=0.503759;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00102636;OID=.;OPOS=219319657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:91:1:1:86:90:0.989011:22:64:1:0:24:66:1:0
chr2	219492924	.	T	C	796.1	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00821686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.9029;QD=63.6876;RBI=0.0196702;REFB=0;REVB=0.0178717;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000402737;OID=.;OPOS=219492924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:23:26:0:0:23:27:0:0
chr2	219508988	.	T	C	1320.95	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.896;QD=62.1623;RBI=0.0643935;REFB=0;REVB=-0.00389773;RO=0;SAF=33;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.652e-05;OID=.;OPOS=219508988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:52:33:0:0:52:33:0:0
chr2	219509618	.	C	A	1064.08	PASS	AF=1;AO=69;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4187;QD=59.1154;RBI=0.0189947;REFB=0;REVB=0.0130658;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000576305;OID=.;OPOS=219509618;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:69:72:1:30:39:0:0:31:41:0:0
chr2	219563807	.	C	T	150.43	PASS	AF=0.516129;AO=14;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.064316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2457;QD=19.4107;RBI=0.0728736;REFB=-0.043807;REVB=-0.0342638;RO=12;SAF=10;SAR=4;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376074;STB=0.697443;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0333726;OID=.;OPOS=219563807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:12:15:14:16:0.516129:4:10:3:9:6:10:3:12
chr2	219692696	.	G	C	620.88	PASS	AF=0.565657;AO=56;DP=100;FAO=56;FDP=99;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=-0.025968;FXX=0.009999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.6257;QD=25.0861;RBI=0.0262084;REFB=-0.0238992;REVB=-0.00354184;RO=40;SAF=23;SAR=33;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0685503;STB=0.528029;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.013225;OID=.;OPOS=219692696;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:99:40:43:56:56:0.565657:33:23:13:27:33:23:15:28
chr2	219695487	.	G	C	152.79	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0292661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1315;QD=10.3583;RBI=0.0292821;REFB=-0.0441041;REVB=-0.000969967;RO=38;SAF=11;SAR=9;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328457;STB=0.526652;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.041455;OID=.;OPOS=219695487;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:38:39:20:20:0.338983:9:11:22:16:9:11:23:16
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chr2	219903258	.	T	G	281.4	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0130679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.049;QD=19.4069;RBI=0.01946;REFB=-0.0147736;REVB=-0.0144195;RO=28;SAF=18;SAR=12;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0390504;STB=0.521725;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0140854;OID=.;OPOS=219903258;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:12:18:18:10:12:18:18:10
chr2	219903723	.	C	T	286.45	PASS	AF=0.432432;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0137215;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.654;QD=15.4838;RBI=0.0143688;REFB=-0.0198597;REVB=-0.00426394;RO=42;SAF=15;SAR=17;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064882;STB=0.536604;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0212296;OID=.;OPOS=219903723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:42:42:32:32:0.432432:17:15:17:25:17:15:17:25
chr2	219920037	.	A	G	1801.33	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.683;QD=60.0443;RBI=0.046556;REFB=0;REVB=0.0245439;RO=0;SAF=42;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.19359e-05;OID=.;OPOS=219920037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:111:120:0:0:111:120:1:69:42:0:0:74:46:0:0
chr2	219920412	.	A	G	211.76	PASS	AF=0.423729;AO=24;DP=58;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0125961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.106;QD=14.3567;RBI=0.0138094;REFB=-0.0264902;REVB=0.00566014;RO=34;SAF=16;SAR=8;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318576;STB=0.662973;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0341861;OID=.;OPOS=219920412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:34:34:24:25:0.423729:8:16:12:22:9:16:12:22
chr2	219923410	.	G	GAGA	254.98	PASS	AF=0.379747;AO=27;DP=81;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=45;FSRR=4;FWDB=0.0161896;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=3;MLLD=182.545;QD=12.9102;RBI=0.0411374;REFB=-0.0197829;REVB=0.0378178;RO=52;SAF=20;SAR=7;SRF=47;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286775;STB=0.669913;STBP=0.104;TYPE=ins;VARB=0.0344373;OID=.;OPOS=219923411;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=GAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.379747:27:81:30:79:49:22:8:45:4:99:52:20:7:47:5
chr2	219940484	.	C	T	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.636;QD=56.9562;RBI=0.018804;REFB=0;REVB=-0.0104704;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92818e-05;OID=.;OPOS=219940484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:30:22:0:0:30:22:0:0
chr2	219941063	.	G	A	492.99	PASS	AF=0.510638;AO=47;DP=93;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.0486995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.702;QD=20.9781;RBI=0.0487131;REFB=-0.0277439;REVB=0.00115139;RO=44;SAF=18;SAR=29;SRF=31;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276998;STB=0.644677;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0170441;OID=.;OPOS=219941063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:44:46:47:48:0.510638:29:18:31:13:30:18:31:15
chr2	219967380	.	T	C	613.1	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7456;QD=61.3099;RBI=0.0255453;REFB=0;REVB=0.0210325;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.6546e-05;OID=.;OPOS=219967380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr2	220037393	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0652268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.389;QD=49.5992;RBI=0.0652277;REFB=0;REVB=0.000345458;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222043;OID=.;OPOS=220037393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr2	220045454	.	G	A	1799.56	PASS	AF=0.960938;AO=122;DP=128;FAO=123;FDP=128;FR=.;FRO=5;FSAF=63;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0136345;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7387;QD=56.2361;RBI=0.0269019;REFB=-0.156306;REVB=0.0231908;RO=5;SAF=62;SAR=60;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00808397;STB=0.504384;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.00605828;OID=.;OPOS=220045454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:128:128:5:5:122:123:0.960938:60:62:2:3:60:63:2:3
chr2	220072766	.	G	T	594.49	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0906828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6857;QD=60.9738;RBI=0.0935613;REFB=0;REVB=0.0230296;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00186659;OID=.;OPOS=220072766;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:14:25:0:0:14:25:0:0
chr2	220082427	.	C	T	205.91	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0693831;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.62;QD=22.8788;RBI=0.0700572;REFB=-0.0301041;REVB=-0.00969513;RO=16;SAF=9;SAR=11;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163997;STB=0.591342;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0326324;OID=.;OPOS=220082427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:16:16:20:20:0.555556:11:9:4:12:11:9:4:12
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chr2	220084902	.	G	A	961.3	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0683739;FXX=0.0289813;HRUN=5;LEN=1;MLLD=125.86;QD=57.3908;RBI=0.0736505;REFB=-0.0139094;REVB=0.0273753;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506847;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00011745;OID=.;OPOS=220084902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:67:0:1:66:66:0.985075:30:36:0:0:30:36:1:0
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chr2	220118531	.	G	C	585.98	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.110138;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7403;QD=58.598;RBI=0.110238;REFB=-0.149104;REVB=-0.00468784;RO=1;SAF=31;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550239;STB=0.529396;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00185407;OID=.;OPOS=220118531;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:8:31:0:1:8:31:0:1
chr2	220136155	.	T	C	1629.36	PASS	AF=1;AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1589;QD=59.7931;RBI=0.0301795;REFB=0;REVB=-0.0256128;RO=0;SAF=69;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89526e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.80926e-05;OID=.;OPOS=220136155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:108:109:1:39:69:0:0:39:70:0:0
chr2	220136351	.	G	A	310.39	PASS	AF=0.383178;AO=35;DP=99;FAO=41;FDP=107;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=41;FWDB=0.0072362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.8324;QD=11.6035;RBI=0.0252153;REFB=-0.0128535;REVB=-0.0241547;RO=64;SAF=18;SAR=17;SRF=23;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173833;STB=0.610933;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0181213;OID=.;OPOS=220136351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:107:64:66:35:41:0.383178:17:18:23:41:18:23:25:41
chr2	220136371	.	T	C	1099.51	PASS	AF=0.938272;AO=76;DP=82;FAO=76;FDP=81;FR=.;FRO=5;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0404771;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.342;QD=54.2966;RBI=0.0442662;REFB=-0.0495431;REVB=0.0179193;RO=5;SAF=29;SAR=47;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225591;STB=0.511939;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00204047;OID=.;OPOS=220136371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:82:81:5:5:76:76:0.938272:47:29:1:4:47:29:1:4
chr2	220250147	.	A	C,G	581.55	PASS	AF=0.025641,0.974359;AO=2,37;DP=39;FAO=1,38;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=1,25;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217351,0.0391595;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=99.9247,152.897;QD=59.6466;RBI=0.0237199,0.0788972;REFB=0,0;REVB=-0.00949827,-0.068493;RO=0;SAF=2,24;SAR=0,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.141444,0.000252325;OID=.,.;OPOS=220250147,220250147;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:39:39:0:0:2,37:1,38:0.025641,0.974359:0,13:2,24:0:0:0,13:1,25:0:0
chr2	220283259	.	A	G	175.68	PASS	AF=1;AO=13;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.409;QD=46.8474;RBI=0.208201;REFB=0;REVB=-0.205875;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00945483;OID=.;OPOS=220283259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:13:15:1:5:8:0:0:5:10:0:0
chr2	220283277	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.781;QD=48.7369;RBI=0.0583214;REFB=0;REVB=0.0459146;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000384234;OID=.;OPOS=220283277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr2	220315970	.	G	A	766.5	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0628638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.331;QD=56.7777;RBI=0.0631595;REFB=0;REVB=0.00610435;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302434;OID=.;OPOS=220315970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:30:23:0:0:31:23:0:0
chr2	220330803	.	GT	CG,GC	419.59	PASS	AF=0.0333333,0.966667;AO=2,26;DP=30;FAO=1,29;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=1,11;FSAR=0,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028972,0.00740299;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=66.8935,57.3289;QD=55.9449;RBI=0.0539286,0.0336181;REFB=0,0;REVB=-0.0454854,-0.0327929;RO=0;SAF=2,10;SAR=0,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,7.71087e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.109585,-0.000550258;OID=.,.;OPOS=220330803,220330804;OREF=GT,T;OALT=CG,C;OMAPALT=CG,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:30:30:0:0:2,26:1,29:0.0333333,0.966667:0,16:2,10:0:0:0,18:1,11:0:0
chr2	220333950	.	T	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.482;QD=57.1775;RBI=0.0337189;REFB=0;REVB=0.015175;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.06854e-05;OID=.;OPOS=220333950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0
chr2	220362899	.	C	G	557.05	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.177939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6981;QD=60.2218;RBI=0.184291;REFB=0;REVB=0.0479677;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.003147;OID=.;OPOS=220362899;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:23:14:0:0:23:14:0:0
chr2	220379560	.	C	G	945.03	PASS	AF=0.943662;AO=67;DP=71;FAO=67;FDP=71;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00544347;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=192.924;QD=53.2412;RBI=0.00674882;REFB=0.0021373;REVB=0.00398939;RO=4;SAF=32;SAR=35;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554862;STB=0.529403;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-6.13532e-05;OID=.;OPOS=220379560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:71:71:4:4:67:67:0.943662:35:32:4:0:35:32:4:0
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chr2	220402665	.	C	A	87.47	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.00413165;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.753;QD=13.4574;RBI=0.0620238;REFB=0.00359462;REVB=0.061886;RO=15;SAF=10;SAR=1;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334158;STB=0.70376;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.00154451;OID=.;OPOS=220402665;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:1:10:11:4:1:10:11:4
chr2	220402671	.	G	T	101.0	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.0111046;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.366;QD=16.8335;RBI=0.0794077;REFB=-0.00712168;REVB=-0.0786274;RO=12;SAF=8;SAR=4;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2754;STB=0.65496;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0122934;OID=.;OPOS=220402671;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:4:8:11:1:4:8:11:1
chr2	220402680	.	T	C	100.62	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.045445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.6429;QD=16.099;RBI=0.0466036;REFB=-0.01208;REVB=-0.0103268;RO=13;SAF=8;SAR=4;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10868;STB=0.562401;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00977563;OID=.;OPOS=220402680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:4:8:10:3:4:8:10:3
chr2	220404381	.	A	G	322.86	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.633;QD=51.6579;RBI=0.0329587;REFB=0;REVB=-0.0198801;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00427178;OID=.;OPOS=220404381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:25:0:0:23:25:1:16:7:0:0:18:7:0:0
chr2	220404648	.	C	T	448.54	PASS	AF=0.423729;AO=50;DP=122;FAO=50;FDP=118;FR=.;FRO=68;FSAF=39;FSAR=11;FSRF=48;FSRR=20;FWDB=-9.55048e-05;FXX=0.0327842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7998;QD=15.2048;RBI=0.00258457;REFB=-0.0427085;REVB=-0.0025828;RO=64;SAF=39;SAR=11;SRF=48;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042533;STB=0.558147;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0470283;OID=.;OPOS=220404648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:118:64:68:50:50:0.423729:11:39:48:16:11:39:48:20
chr2	220404726	.	G	A	324.44	PASS	AF=0.389474;AO=36;DP=93;FAO=37;FDP=95;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.000753347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.333;QD=13.6608;RBI=0.0105858;REFB=-0.0308382;REVB=0.010559;RO=55;SAF=25;SAR=11;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246244;STB=0.642089;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.035763;OID=.;OPOS=220404726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:95:55:58:36:37:0.389474:11:25:26:29:11:26:28:30
chr2	220405230	.	G	A	620.08	PASS	AF=0.584158;AO=59;DP=101;FAO=59;FDP=101;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00838458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.691;QD=24.5577;RBI=0.0102999;REFB=-0.0184186;REVB=0.00598219;RO=42;SAF=24;SAR=35;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090606;STB=0.549471;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0112421;OID=.;OPOS=220405230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:42:42:59:59:0.584158:35:24:22:20:35:24:22:20
chr2	220405321	.	T	C	1510.71	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.836;QD=63.6088;RBI=0.0254927;REFB=0;REVB=0.00174126;RO=0;SAF=39;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9561e-05;OID=.;OPOS=220405321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:56:39:0:0:56:39:0:0
chr2	220406722	.	T	C	490.98	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.673;QD=57.7621;RBI=0.0415078;REFB=0;REVB=0.0380464;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.34505e-05;OID=.;OPOS=220406722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:15:18:0:0:16:18:0:0
chr2	220412256	.	T	C	936.71	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0518334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.0086;QD=58.5444;RBI=0.064249;REFB=0;REVB=-0.0379635;RO=0;SAF=40;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00080808;OID=.;OPOS=220412256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:24:40:0:0:24:40:0:0
chr2	220414016	.	C	T	358.08	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0505068;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.826;QD=55.0885;RBI=0.0696278;REFB=0;REVB=0.047928;RO=0;SAF=3;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320146;OID=.;OPOS=220414016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:23:3:0:0:23:3:0:0
chr2	220414019	.	T	C	106.72	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.000313966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.3328;QD=16.4183;RBI=0.161218;REFB=-0.114749;REVB=0.161218;RO=12;SAF=1;SAR=13;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221076;STB=0.62881;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.172781;OID=.;OPOS=220414019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:26:26:12:12:14:14:0.538462:13:1:2:10:13:1:2:10
chr2	220415595	.	GGAGA	GGA,GGAG	133.1	PASS	AF=0.7,0;AO=4,3;DP=22;FAO=14,0;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=7,0;FSAR=7,0;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0154111,0.0153808;FXX=0.130378;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=222.463,219.985;QD=26.6208;RBI=0.0370929,0.0255928;REFB=-0.021421,-0.0226952;REVB=0.0337399,0.0204553;RO=4;SAF=2,0;SAR=2,3;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.201109,-0.729277;STB=0.599863,0.5;STBP=0.174,1;TYPE=del,del;VARB=0.0114322,-0.002822;OID=.,.;OPOS=220415596,220415599;OREF=GA,A;OALT=-,-;OMAPALT=GGA,GGAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.7,0:4,3:22:14,0:20:6:7,0:7,0:5:1:41:4:2,0:2,3:3:1
chr2	220417266	.	C	T	385.5	PASS	AF=0.612903;AO=37;DP=62;FAO=38;FDP=62;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0584095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3652;QD=24.8709;RBI=0.0585105;REFB=-0.00438972;REVB=0.00343622;RO=23;SAF=15;SAR=22;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143121;STB=0.573971;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00597182;OID=.;OPOS=220417266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:23:24:37:38:0.612903:22:15:14:9:23:15:14:10
chr2	220419236	.	T	C	2128.19	PASS	AF=1;AO=130;DP=133;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.382;QD=62.1369;RBI=0.0474539;REFB=0;REVB=0.0361231;RO=0;SAF=79;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000444849;OID=.;OPOS=220419236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:137:0:0:130:137:1:51:79:0:0:58:79:0:0
chr2	220419339	.	T	C	2216.71	PASS	AF=1;AO=140;DP=140;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.705;QD=63.3346;RBI=0.0556979;REFB=0;REVB=-0.0513806;RO=0;SAF=79;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.21368e-05;OID=.;OPOS=220419339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:140:0:0:140:140:1:61:79:0:0:61:79:0:0
chr2	220420956	.	A	G	539.15	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00233833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.499;QD=59.9059;RBI=0.0201482;REFB=0;REVB=0.020012;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122297;OID=.;OPOS=220420956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:34:36:1:19:15:0:0:19:17:0:0
chr2	220421417	.	C	G	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.212;QD=58.9627;RBI=0.0200797;REFB=0;REVB=-0.0152109;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.59324e-06;OID=.;OPOS=220421417;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:35:31:0:0:35:31:0:0
chr2	220422774	.	A	G	778.81	PASS	AF=0.443299;AO=74;DP=181;FAO=86;FDP=194;FR=.;FRO=108;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=59;FSRR=49;FWDB=0.00983114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.851;QD=16.058;RBI=0.0197478;REFB=-0.0147466;REVB=0.0171267;RO=104;SAF=38;SAR=36;SRF=57;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361251;STB=0.512867;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.017753;OID=.;OPOS=220422774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:194:104:108:74:86:0.443299:36:38:57:47:41:45:59:49
chr2	220430203	.	C	T	1180.91	PASS	AF=1;AO=78;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00739003;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8537;QD=59.0455;RBI=0.124969;REFB=-0.105766;REVB=0.12475;RO=0;SAF=49;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6597e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00315924;OID=.;OPOS=220430203;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:80:80:0:0:78:80:1:29:49:0:0:31:49:0:0
chr2	220435034	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245951;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.907;QD=59.4356;RBI=0.0448627;REFB=0;REVB=0.0375199;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015941;OID=.;OPOS=220435034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr2	220435375	.	G	A	127.96	PASS	AF=0.866667;AO=12;DP=14;FAO=13;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.063377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.834;QD=34.1218;RBI=0.0755559;REFB=-0.137203;REVB=0.0411346;RO=2;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179011;STB=0.59984;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0100723;OID=.;OPOS=220435375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:14:15:2:2:12:13:0.866667:4:8:0:2:4:9:0:2
chr2	220462640	.	G	T	1608.4	PASS	AF=0.964912;AO=110;DP=114;FAO=110;FDP=114;FR=.;FRO=4;FSAF=60;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.027511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.242;QD=56.4352;RBI=0.0404482;REFB=-0.194745;REVB=0.0296514;RO=1;SAF=60;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939993;STB=0.510431;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.000528419;OID=.;OPOS=220462640;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:114:114:1:4:110:110:0.964912:50:60:0:1:50:60:1:3
chr2	220466199	.	G	T	684.39	PASS	AF=0.978261;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0322614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.041;QD=59.5125;RBI=0.0330469;REFB=-0.144397;REVB=0.00716253;RO=0;SAF=37;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9155e-08;STB=0.506664;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.000724303;OID=.;OPOS=220466199;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:44:46:0:1:44:45:0.978261:7:37:0:0:8:37:1:0
chr2	220471116	.	C	G	528.18	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0293023;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.838;QD=57.1007;RBI=0.0296029;REFB=-0.1742;REVB=0.00420774;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.510632;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000910696;OID=.;OPOS=220471116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:37:37:0:1:36:36:0.972973:23:13:0:0:23:13:0:1
chr2	220473355	.	G	A	1144.93	PASS	AF=0.95122;AO=78;DP=83;FAO=78;FDP=82;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.013817;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.213;QD=55.8503;RBI=0.0345998;REFB=-0.0464142;REVB=0.0317212;RO=3;SAF=43;SAR=35;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318811;STB=0.509814;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.000432859;OID=.;OPOS=220473355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:83:82:3:4:78:78:0.95122:35:43:3:0:35:43:3:1
chr2	220476443	.	C	T	1345.67	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.07347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.39;QD=61.8698;RBI=0.0734738;REFB=0;REVB=0.000754763;RO=0;SAF=30;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102002;OID=.;OPOS=220476443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:87:0:0:82:87:1:52:30:0:0:52:35:0:0
chr2	220479312	.	T	C	770.33	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.086;QD=57.0617;RBI=0.0523303;REFB=0;REVB=0.0392078;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150174;OID=.;OPOS=220479312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:54:0:0:51:54:1:24:27:0:0:25:29:0:0
chr2	220494110	.	GCCCCCCCA	CGCCCCCCC,GCCCCCC,GCCCCCCC,GCCCCCCCC	189.16	PASS	AF=0,0,1,0;AO=2,2,7,3;DP=16;FAO=0,0,16,0;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,10,0;FSAR=0,0,6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247974,0.0407048,0.0186727,-0.000579296;FXX=0;HRUN=1,7,1,1;LEN=9,2,1,1;MLLD=137.508,188.445,194.956,192.151;QD=47.291;RBI=0.0301934,0.0481465,0.0287477,0.0185509;REFB=0,0,0,0;REVB=0.0172259,0.0257139,0.0218577,0.0185419;RO=0;SAF=0,2,3,3;SAR=2,0,4,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,del,del,snp;VARB=0,-0.0301755,0.000464489,0.0025568;OID=.,.,.,.;OPOS=220494110,220494117,220494118,220494118;OREF=GCCCCCCCA,CA,A,A;OALT=CGCCCCCCC,-,-,C;OMAPALT=CGCCCCCCC,GCCCCCC,GCCCCCCC,GCCCCCCCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	3/3:3:16:16:0:0:2,2,7,3:0,0,16,0:0,0,1,0:2,0,4,0:0,2,3,3:0:0:0,0,6,0:0,0,10,0:0:0
chr2	220500423	.	A	G	1625.59	PASS	AF=0.990909;AO=108;DP=110;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0261361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6378;QD=59.1124;RBI=0.0261718;REFB=-0.0143358;REVB=-0.00136821;RO=2;SAF=66;SAR=42;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220628;STB=0.505746;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00145106;OID=.;OPOS=220500423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:110:2:1:108:109:0.990909:42:66:0:2:43:66:0:1
chr2	220500426	.	A	G	1608.24	PASS	AF=0.973451;AO=104;DP=109;FAO=110;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00744792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.9913;QD=56.9288;RBI=0.00877446;REFB=-0.14259;REVB=0.00463892;RO=3;SAF=63;SAR=41;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220584;STB=0.511109;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00112475;OID=.;OPOS=220500426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:109:113:3:3:104:110:0.973451:41:63:3:0:44:66:3:0
chr2	220502367	.	A	C	715.15	PASS	AF=0.94;AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=50;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0205014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.691;QD=57.2123;RBI=0.0206726;REFB=-0.119571;REVB=0.00265541;RO=1;SAF=17;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268575;STB=0.540523;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00222524;OID=.;OPOS=220502367;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:50:50:1:3:47:47:0.94:30:17:1:0:30:17:3:0
chr2	220502410	.	G	C	31.4	PASS	AF=0.125;AO=6;DP=49;FAO=6;FDP=48;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=-0.0901061;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.704;QD=2.61669;RBI=0.138236;REFB=-0.0136055;REVB=-0.104834;RO=42;SAF=5;SAR=1;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.58131;STB=0.90014;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.103;OID=.;OPOS=220502410;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:49:48:42:42:6:6:0.125:1:5:12:30:1:5:12:30
chr2	220505265	.	T	C	1031.8	PASS	AF=0.959459;AO=71;DP=76;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0178389;FXX=0.0263123;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.054;QD=55.773;RBI=0.0219781;REFB=-0.0178137;REVB=0.0128378;RO=3;SAF=26;SAR=45;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514857;STB=0.527265;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.000524522;OID=.;OPOS=220505265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:76:74:3:3:71:71:0.959459:45:26:3:0:45:26:3:0
chr2	220771223	.	C	T	2037.1	PASS	AF=0.950704;AO=135;DP=142;FAO=135;FDP=142;FR=.;FRO=7;FSAF=79;FSAR=56;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0184773;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.499;QD=57.3831;RBI=0.0207362;REFB=-0.00289162;REVB=0.00941165;RO=2;SAF=79;SAR=56;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118816;STB=0.506568;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=1.24289e-05;OID=.;OPOS=220771223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:142:142:2:7:135:135:0.950704:56:79:2:0:56:79:5:2
chr2	220771290	.	G	A	1959.55	PASS	AF=0.984615;AO=128;DP=130;FAO=128;FDP=130;FR=.;FRO=2;FSAF=69;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00354343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.268;QD=60.2938;RBI=0.00471589;REFB=-0.139938;REVB=0.00311186;RO=1;SAF=69;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798641;STB=0.508332;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.000213012;OID=.;OPOS=220771290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:130:130:1:2:128:128:0.984615:59:69:0:1:59:69:0:2
chr2	222310917	.	T	A	65.79	PASS	AF=0.165049;AO=27;DP=98;FAO=17;FDP=103;FR=.;FRO=86;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=43;FSRR=43;FWDB=-0.0552803;FXX=0.00961446;HRUN=7;LEN=1;MLLD=32.1071;QD=2.5551;RBI=0.0662359;REFB=-0.00443946;REVB=-0.0364867;RO=63;SAF=25;SAR=2;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.63111;STB=0.852898;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0382292;OID=.;OPOS=222310917;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:98:103:63:86:27:17:0.165049:2:25:31:32:2:15:43:43
chr2	223064663	.	A	AT,T	38.62	PASS	AF=0.173913,0.0217391;AO=5,2;DP=46;FAO=8,1;FDP=46;FR=.;FRO=37;FSAF=1,0;FSAR=7,1;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.0414927,-0.00955047;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=19.9199,110.295;QD=3.35828;RBI=0.0578449,0.00989241;REFB=-0.0348527,-0.00472949;REVB=-0.0403037,-0.00257844;RO=39;SAF=0,0;SAR=5,2;SRF=24;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.663155,-0.475994;STB=0.887968,0.992215;STBP=0.028,0.231;TYPE=ins,snp;VARB=0.160747,0.0416438;OID=.,.;OPOS=223064664,223064663;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:46:46:39:37:5,2:8,1:0.173913,0.0217391:5,2:0,0:24:15:7,1:1,0:23:14
chr2	223161889	.	A	G	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1971;QD=64.4142;RBI=0.0371653;REFB=0;REVB=-0.0011111;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206304;OID=.;OPOS=223161889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr2	223423362	.	A	G	1126.53	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0703918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2246;QD=60.0817;RBI=0.0906907;REFB=0;REVB=0.0571821;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000474057;OID=.;OPOS=223423362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:36:39:0:0:36:39:0:0
chr2	223436607	.	C	T	1190.5	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2491;QD=61.0513;RBI=0.0341605;REFB=0;REVB=-0.0184705;RO=0;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.76537e-05;OID=.;OPOS=223436607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:77:78:1:41:36:0:0:42:36:0:0
chr2	223553193	.	CAAAAAT	AACAAAT,CAAAA,CAAAAT	70.39	PASS	AF=0.0363636,0.0909091,0.218182;AO=3,7,11;DP=55;FAO=2,5,12;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=0,5,9;FSAR=2,0,3;FSRF=36;FSRR=0;FWDB=-0.0215831,-0.0708736,-0.0154912;FXX=0.0350816;HRUN=1,5,5;LEN=3,2,1;MLLD=265.919,25.578,10.8061;QD=5.11951;RBI=0.0644438,0.0801833,0.11447;REFB=-0.00660345,-0.0540615,-0.116326;REVB=-0.0607221,0.0375006,-0.113417;RO=28;SAF=0,7,10;SAR=3,0,1;SRF=28;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.876206,0,-0.52836;STB=0.999468,0.5,0.8331;STBP=0,1,0.442;TYPE=mnp,del,del;VARB=0.158597,0.132944,0.0357586;OID=.,.,.;OPOS=223553193,223553198,223553194;OREF=CAA,AT,A;OALT=AAC,-,-;OMAPALT=AACAAAT,CAAAA,CAAAAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:30:55:55:28:36:3,7,11:2,5,12:0.0363636,0.0909091,0.218182:3,0,1:0,7,10:28:0:2,0,3:0,5,9:36:0
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chr2	223785740	.	A	G	153.43	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=0.0166502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.553;QD=13.9482;RBI=0.0189356;REFB=0.00176409;REVB=-0.0090181;RO=27;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16096;STB=0.592493;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=-0.00585317;OID=.;OPOS=223785740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:11:6:6:21:11:6:6:21
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chr2	223917812	.	T	C	1576.27	PASS	AF=1;AO=103;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341039;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.321;QD=59.4819;RBI=0.0530358;REFB=0;REVB=0.0406168;RO=0;SAF=66;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.92459e-05;OID=.;OPOS=223917812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:103:106:1:37:66:0:0:39:67:0:0
chr2	223917983	.	T	G	215.57	PASS	AF=0.538462;AO=19;DP=37;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.031118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.651;QD=22.1102;RBI=0.0331566;REFB=-0.0251805;REVB=-0.0114467;RO=18;SAF=7;SAR=12;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164361;STB=0.58201;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0173488;OID=.;OPOS=223917983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:39:18:18:19:21:0.538462:12:7:10:8:13:8:10:8
chr2	223918080	.	C	G	574.77	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.793;QD=60.502;RBI=0.0463409;REFB=0;REVB=-0.0237349;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250449;OID=.;OPOS=223918080;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr2	223918363	.	T	C	513.39	PASS	AF=0.972973;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0288968;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.6928;QD=55.5013;RBI=0.0311083;REFB=-0.136531;REVB=-0.0115196;RO=1;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207916;STB=0.511105;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00200022;OID=.;OPOS=223918363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:37:1:1:35:36:0.972973:22:13:0:1:22:14:0:1
chr2	224620181	.	G	T	689.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00660297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.509;QD=62.6692;RBI=0.0520451;REFB=0;REVB=-0.0516246;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111486;OID=.;OPOS=224620181;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:30:14:0:0:30:14:0:0
chr2	224640803	.	C	CAA	234.8	PASS	AF=0.682927;AO=25;DP=42;FAO=28;FDP=41;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.0100068;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=36.7588;QD=22.9072;RBI=0.0305908;REFB=-0.041236;REVB=0.0289078;RO=14;SAF=16;SAR=9;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162229;STB=0.591179;STBP=0.126;TYPE=ins;VARB=0.0209552;OID=.;OPOS=224640804;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.682927:25:42:28:41:13:16:12:11:2:71:14:16:9:12:2
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chr2	226516913	.	A	G	180.48	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0151533;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.727;QD=15.3598;RBI=0.0154296;REFB=-0.0144386;REVB=0.00290664;RO=28;SAF=9;SAR=10;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173955;STB=0.599898;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0209761;OID=.;OPOS=226516913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:28:28:19:19:0.404255:10:9:18:10:10:9:18:10
chr2	227661043	.	T	C	297.46	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=61;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0171619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.22;QD=18.5911;RBI=0.0198999;REFB=-0.0141006;REVB=0.0100736;RO=31;SAF=20;SAR=9;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130852;STB=0.51899;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0155282;OID=.;OPOS=227661043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:64:31:32:29:32:0.5:9:20:21:10:9:23:22:10
chr2	227872182	.	G	A	329.12	PASS	AF=0.530303;AO=32;DP=63;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00092334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7912;QD=19.9466;RBI=0.026217;REFB=-0.0015965;REVB=0.0262008;RO=28;SAF=15;SAR=17;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0562914;STB=0.529395;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.00161079;OID=.;OPOS=227872182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:66:28:31:32:35:0.530303:17:15:15:13:18:17:17:14
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chr2	227886773	.	A	G	512.79	PASS	AF=0.554217;AO=34;DP=85;FAO=46;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00192955;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.214;QD=24.7126;RBI=0.012321;REFB=-0.0177934;REVB=-0.0121689;RO=33;SAF=22;SAR=12;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175386;STB=0.634694;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0114396;OID=.;OPOS=227886773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:83:33:35:34:46:0.554217:12:22:15:18:15:31:13:22
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chr2	227915832	.	G	A	843.46	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02374;FXX=0.0491723;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.085;QD=58.1697;RBI=0.0299973;REFB=0;REVB=0.0183372;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00063119;OID=.;OPOS=227915832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:58:0:0:58:58:1:26:32:0:0:26:32:0:0
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chr2	228135631	.	C	T	155.53	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0152841;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.813;QD=14.4679;RBI=0.0203356;REFB=-0.014969;REVB=-0.0134139;RO=26;SAF=5;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30209;STB=0.675844;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0194503;OID=.;OPOS=228135631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:26:26:17:17:0.395349:12:5:15:11:12:5:15:11
chr2	228177479	.	C	T	1307.92	PASS	AF=0.977273;AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0630166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.277;QD=59.4509;RBI=0.0632224;REFB=0.0322062;REVB=-0.0050971;RO=2;SAF=50;SAR=35;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185709;STB=0.509613;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.000225717;OID=.;OPOS=228177479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:87:88:2:2:85:86:0.977273:35:50:2:0:35:51:2:0
chr2	228177825	.	C	G	707.31	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.415;QD=53.382;RBI=0.0798713;REFB=0;REVB=0.078331;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00333918;OID=.;OPOS=228177825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:53:0:0:49:53:1:28:21:0:0:32:21:0:0
chr2	228179238	.	G	A	2460.22	PASS	AF=1;AO=156;DP=159;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0429657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6033;QD=61.1234;RBI=0.0429701;REFB=0;REVB=-0.000614086;RO=0;SAF=83;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012529;OID=.;OPOS=228179238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:159:161:0:0:156:161:1:73:83:0:0:77:84:0:0
chr2	228416712	.	A	G	376.06	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.348;QD=55.7118;RBI=0.0485164;REFB=0;REVB=0.0103274;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00041067;OID=.;OPOS=228416712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:8:18:0:0:9:18:0:0
chr2	228476140	.	C	T	409.78	PASS	AF=0.532468;AO=40;DP=74;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00924113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9416;QD=21.2873;RBI=0.0247652;REFB=0.00413131;REVB=0.0229765;RO=34;SAF=32;SAR=8;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28237;STB=0.630845;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.00223339;OID=.;OPOS=228476140;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:77:34:36:40:41:0.532468:8:32:18:16:9:32:20:16
chr2	228476253	.	C	G	1080.37	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0386248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.254;QD=60.0205;RBI=0.0388765;REFB=0;REVB=-0.00441746;RO=0;SAF=49;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000301896;OID=.;OPOS=228476253;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:23:49:0:0:23:49:0:0
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chr2	228883721	.	T	C	122.33	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0464038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.321;QD=15.7844;RBI=0.0470518;REFB=0.00275075;REVB=0.00778204;RO=17;SAF=4;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297983;STB=0.672821;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=-0.00168982;OID=.;OPOS=228883721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:10:4:10:7:10:4:10:7
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chr2	230045545	.	T	C	757.26	PASS	AF=0.541353;AO=73;DP=135;FAO=72;FDP=133;FR=.;FRO=61;FSAF=45;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.00767148;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.116;QD=22.7747;RBI=0.0077931;REFB=-0.0338513;REVB=-0.00137139;RO=60;SAF=45;SAR=28;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0988605;STB=0.563089;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0126584;OID=.;OPOS=230045545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:133:60:61:73:72:0.541353:28:45:30:30:27:45:30:31
chr2	230045554	.	G	C	750.94	PASS	AF=0.537313;AO=72;DP=134;FAO=72;FDP=134;FR=.;FRO=62;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.00547694;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.608;QD=22.4161;RBI=0.0117621;REFB=-0.0139133;REVB=-0.0104091;RO=62;SAF=44;SAR=28;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109872;STB=0.560255;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0140751;OID=.;OPOS=230045554;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:62:62:72:72:0.537313:28:44:30:32:28:44:30:32
chr2	230045564	.	T	C	810.39	PASS	AF=0.581395;AO=75;DP=130;FAO=75;FDP=129;FR=.;FRO=54;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.0203081;FXX=0.00769172;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.875;QD=25.1285;RBI=0.0312236;REFB=-0.0253197;REVB=0.023717;RO=53;SAF=48;SAR=27;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133078;STB=0.569192;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0312906;OID=.;OPOS=230045564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:129:53:54:75:75:0.581395:27:48:25:28:27:48:26:28
chr2	230045568	.	T	C	813.45	PASS	AF=0.590551;AO=75;DP=127;FAO=75;FDP=127;FR=.;FRO=52;FSAF=49;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.00762705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.153;QD=25.6206;RBI=0.0202344;REFB=-0.0112321;REVB=-0.0187419;RO=51;SAF=49;SAR=26;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142747;STB=0.582284;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0121462;OID=.;OPOS=230045568;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:51:52:75:75:0.590551:26:49:24:27:26:49:24:28
chr2	230045615	.	G	A	746.59	PASS	AF=0.673913;AO=62;DP=93;FAO=62;FDP=92;FR=.;FRO=30;FSAF=47;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00471164;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.912;QD=32.4602;RBI=0.00592039;REFB=-0.0222625;REVB=0.0035849;RO=29;SAF=47;SAR=15;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174002;STB=0.602529;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00902328;OID=.;OPOS=230045615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:29:30:62:62:0.673913:15:47:15:14:15:47:15:15
chr2	230045628	.	GT	G	84.13	PASS	AF=0.4375;AO=13;DP=33;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0625274;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=23.0004;QD=10.5166;RBI=0.068129;REFB=0.00278355;REVB=0.0270535;RO=17;SAF=1;SAR=12;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0.308261;SSSB=-0.593217;STB=0.85462;STBP=0.007;TYPE=del;VARB=-0.00502027;OID=.;OPOS=230045629;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4375:13:33:14:32:18:1:13:9:9:84:17:1:12:9:8
chr2	230092723	.	G	A	441.65	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=-0.0253089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7199;QD=20.075;RBI=0.0345107;REFB=-0.0282597;REVB=-0.0234616;RO=44;SAF=26;SAR=18;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242438;STB=0.634087;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0163671;OID=.;OPOS=230092723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:44:44:44:44:0.5:18:26:14:30:18:26:14:30
chr2	230723777	.	G	C	180.91	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=0.0264557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.891;QD=12.9219;RBI=0.0435752;REFB=-0.0233099;REVB=0.034625;RO=34;SAF=5;SAR=17;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0937222;STB=0.554296;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0567757;OID=.;OPOS=230723777;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:34:22:22:0.392857:17:5:10:24:17:5:10:24
chr2	230841074	.	C	T	319.49	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304336;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.347;QD=53.2484;RBI=0.0304626;REFB=0;REVB=0.00132962;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0086516;OID=.;OPOS=230841074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:14:9:0:0:14:10:0:0
chr2	231050715	.	A	G	1181.54	PASS	AF=0.975309;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=81;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0524152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.6453;QD=58.3475;RBI=0.0524153;REFB=-0.0120869;REVB=0.000101863;RO=2;SAF=56;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039392;STB=0.520828;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00168722;OID=.;OPOS=231050715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:81:81:2:2:79:79:0.975309:23:56:0:2:23:56:0:2
chr2	231072709	.	C	T	669.55	PASS	AF=0.918367;AO=45;DP=49;FAO=45;FDP=49;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0118895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.2743;QD=54.6571;RBI=0.0173645;REFB=-0.0075586;REVB=-0.0126556;RO=4;SAF=26;SAR=19;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0669983;STB=0.535699;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0070949;OID=.;OPOS=231072709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:49:49:4:4:45:45:0.918367:19:26:4:0:19:26:4:0
chr2	231077110	.	C	T	400.01	PASS	AF=0.476744;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0213818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2836;QD=18.6052;RBI=0.0243279;REFB=0.0101514;REVB=-0.0116047;RO=45;SAF=16;SAR=25;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115656;STB=0.564531;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.0117641;OID=.;OPOS=231077110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:45:45:41:41:0.476744:25:16:23:22:25:16:23:22
chr2	231077725	.	A	G	326.52	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423692;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2418;QD=54.4199;RBI=0.0486319;REFB=0;REVB=0.0238729;RO=0;SAF=4;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000328417;OID=.;OPOS=231077725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:20:4:0:0:20:4:0:0
chr2	231149108	.	G	A	1117.3	PASS	AF=0.986842;AO=46;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0483741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.8933;QD=58.8053;RBI=0.162446;REFB=-0.0787124;REVB=0.155077;RO=1;SAF=24;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191868;STB=0.508195;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00201985;OID=.;OPOS=231149108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:76:1:1:46:75:0.986842:22:24:1:0:45:30:1:0
chr2	231406680	.	T	C	273.67	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00813321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.251;QD=17.9456;RBI=0.00976432;REFB=-0.0309571;REVB=0.00540303;RO=31;SAF=19;SAR=11;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110584;STB=0.56196;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0310229;OID=.;OPOS=231406680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:11:19:16:15:11:19:16:15
chr2	231451851	.	A	G	194.89	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0403913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.863;QD=17.3239;RBI=0.0410832;REFB=-0.0113345;REVB=-0.00750814;RO=25;SAF=9;SAR=11;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13024;STB=0.57396;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0296934;OID=.;OPOS=231451851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:11:9:8:17:11:9:8:17
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chr2	231738269	.	G	A	116.09	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.000417456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.586;QD=11.3261;RBI=0.0318466;REFB=-0.0126899;REVB=0.0318439;RO=26;SAF=8;SAR=6;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120419;STB=0.583215;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0357613;OID=.;OPOS=231738269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:27:14:14:0.341463:6:8:12:14:6:8:12:15
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chr2	231861044	.	C	T	585.13	PASS	AF=0.930233;AO=40;DP=43;FAO=40;FDP=43;FR=.;FRO=3;FSAF=34;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0653932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.737;QD=54.4304;RBI=0.0779713;REFB=-0.237684;REVB=0.0424648;RO=1;SAF=34;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135993;STB=0.521116;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.00229524;OID=.;OPOS=231861044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:43:43:1:3:40:40:0.930233:6:34:1:0:6:34:3:0
chr2	231861071	.	T	C	262.84	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0186975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.055;QD=26.2836;RBI=0.0259899;REFB=-0.0141741;REVB=0.0180522;RO=15;SAF=19;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177162;STB=0.590314;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0193851;OID=.;OPOS=231861071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:15:16:24:24:0.6:5:19:9:6:5:19:10:6
chr2	231865090	.	T	C	726.06	PASS	AF=0.379464;AO=84;DP=224;FAO=85;FDP=224;FR=.;FRO=139;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=82;FSRR=57;FWDB=-0.0420008;FXX=0.00444425;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8733;QD=12.9653;RBI=0.0841519;REFB=3.06777e-05;REVB=-0.072921;RO=139;SAF=46;SAR=38;SRF=82;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473686;STB=0.530605;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=-0.000705621;OID=.;OPOS=231865090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:224:224:139:139:84:85:0.379464:38:46:82:57:39:46:82:57
chr2	232035429	.	G	A	508.36	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0231854;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.3067;QD=56.4844;RBI=0.0604649;REFB=0.111133;REVB=-0.055843;RO=1;SAF=12;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373832;STB=0.519988;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.0224186;OID=.;OPOS=232035429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:23:12:1:0:23:12:1:0
chr2	232072912	.	T	C	548.58	PASS	AF=0.523364;AO=55;DP=107;FAO=56;FDP=107;FR=.;FRO=51;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.0148636;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.477;QD=20.5075;RBI=0.0155138;REFB=-0.0143804;REVB=0.00444406;RO=51;SAF=34;SAR=21;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148431;STB=0.584695;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0201224;OID=.;OPOS=232072912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:51:51:55:56:0.523364:21:34:23:28:21:35:23:28
chr2	232087474	.	AT	GA	960.94	PASS	AF=1;AO=68;DP=70;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0707893;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=251.138;QD=52.6545;RBI=0.152539;REFB=0;REVB=0.135119;RO=0;SAF=42;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000557486;OID=.;OPOS=232087474;OREF=AT;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:73:0:0:68:73:1:26:42:0:0:28:45:0:0
chr2	232091479	.	C	T	246.27	PASS	AF=0.509804;AO=24;DP=50;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0161844;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.79;QD=19.315;RBI=0.054686;REFB=-0.0276596;REVB=0.0522362;RO=26;SAF=15;SAR=9;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00942901;STB=0.50793;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.018609;OID=.;OPOS=232091479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:26:25:24:26:0.509804:9:15:16:10:10:16:15:10
chr2	232225535	.	C	CG	1303.56	PASS	AF=1;AO=93;DP=172;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.18685;FXX=0.00609719;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.0609;QD=31.9891;RBI=0.196424;REFB=0;REVB=-0.0605757;RO=72;SAF=43;SAR=50;SRF=46;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140715;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00162988;OID=.;OPOS=232225536;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:93:172:163:163:0:87:76:0:0:24:72:43:50:46:26
chr2	232326417	.	C	T	276.54	PASS	AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=10;FWDB=-0.00254595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4706;QD=14.1816;RBI=0.0281938;REFB=-0.0372814;REVB=-0.0280786;RO=46;SAF=18;SAR=14;SRF=36;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243123;STB=0.636287;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0492072;OID=.;OPOS=232326417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:14:18:36:10:14:18:36:10
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chr2	232458443	.	T	C	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.23;QD=64.4143;RBI=0.0212413;REFB=0;REVB=-0.00954058;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26444e-05;OID=.;OPOS=232458443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0
chr2	232672932	.	C	T	679.66	PASS	AF=1;AO=25;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.579;QD=60.4145;RBI=0.0454935;REFB=0;REVB=0.0130897;RO=0;SAF=1;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103103;OID=.;OPOS=232672932;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:25:45:1:24:1:0:0:32:13:0:0
chr2	232672933	.	G	T	49.06	PASS	AF=0.173913;AO=6;DP=44;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.0141873;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1454;QD=4.26599;RBI=0.0195816;REFB=-0.0310067;REVB=-0.0134966;RO=37;SAF=1;SAR=5;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209328;STB=0.733168;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.038452;OID=.;OPOS=232672933;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:44:46:37:38:6:8:0.173913:5:1:11:26:7:1:12:26
chr2	233201328	.	A	G	161.26	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0405063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.227;QD=18.9718;RBI=0.0778075;REFB=-0.0308103;REVB=-0.0664323;RO=17;SAF=12;SAR=5;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060353;STB=0.534371;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0394448;OID=.;OPOS=233201328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:5:12:11:6:5:12:11:6
chr2	233243586	.	C	T	544.41	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0469401;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.732;QD=57.3068;RBI=0.0477662;REFB=-0.0631123;REVB=-0.00884493;RO=1;SAF=23;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019929;STB=0.510633;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0014062;OID=.;OPOS=233243586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:14:23:1:0:14:23:1:0
chr2	233244586	.	C	G	706.13	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6475;QD=55.3828;RBI=0.115508;REFB=-0.0460087;REVB=-0.0497456;RO=1;SAF=27;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017117;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00287735;OID=.;OPOS=233244586;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:51:51:1:0:50:51:1:23:27:1:0:23:28:0:0
chr2	233245026	.	G	A	181.85	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621767;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5483;QD=48.4926;RBI=0.12535;REFB=0;REVB=0.108842;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0102505;OID=.;OPOS=233245026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:11:4:0:0:11:4:0:0
chr2	233245141	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.989;QD=43.4861;RBI=0.0783129;REFB=0;REVB=0.0592697;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000765123;OID=.;OPOS=233245141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr2	233273244	.	C	A	236.04	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.9967;QD=47.2074;RBI=0.0730928;REFB=-0.0859409;REVB=0.0375771;RO=1;SAF=13;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340907;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00379705;OID=.;OPOS=233273244;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:20:20:1:0:19:20:1:6:13:1:0:6:14:0:0
chr2	233274145	.	G	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00569387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.2336;QD=33.4284;RBI=0.0115021;REFB=0;REVB=0.00999396;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133969;OID=.;OPOS=233274145;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr2	233274475	.	C	A	214.16	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00957249;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.1638;QD=45.0857;RBI=0.100905;REFB=-0.142082;REVB=0.10045;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.516111;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0143463;OID=.;OPOS=233274475;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:0:1:18:18:0.947368:3:15:0:0:3:15:1:0
chr2	233349588	.	G	A	989.03	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00875219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.947;QD=59.0466;RBI=0.0257347;REFB=0;REVB=-0.0242007;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119504;OID=.;OPOS=233349588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:35:32:0:0:35:32:0:0
chr2	233385396	.	G	A	2368.52	PASS	AF=1;AO=151;DP=155;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0566466;FXX=0.0182916;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3577;QD=58.8453;RBI=0.078173;REFB=0;REVB=0.0538719;RO=0;SAF=62;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00245944;OID=.;OPOS=233385396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:155:161:0:0:151:161:1:89:62:0:0:90:71:0:0
chr2	233386583	.	T	C	444.77	PASS	AF=0.42735;AO=49;DP=113;FAO=50;FDP=117;FR=.;FRO=67;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.0037625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.276;QD=15.2058;RBI=0.0073263;REFB=-0.0151741;REVB=-0.00628635;RO=62;SAF=24;SAR=25;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543118;STB=0.518511;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0194316;OID=.;OPOS=233386583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:117:62:67:49:50:0.42735:25:24:27:35:26:24:30:37
chr2	233406178	.	G	A	451.92	PASS	AF=0.536585;AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.032543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8883;QD=22.0449;RBI=0.0934853;REFB=-0.00990378;REVB=0.0876382;RO=38;SAF=29;SAR=15;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140998;STB=0.577924;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.00937493;OID=.;OPOS=233406178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:38:38:44:44:0.536585:15:29:19:19:15:29:19:19
chr2	233413825	.	G	A	54.32	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0462893;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.0155;QD=8.6913;RBI=0.069202;REFB=0.0158527;REVB=-0.0514413;RO=17;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171013;STB=0.605793;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-0.0771392;OID=.;OPOS=233413825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:3:5:8:9:3:5:8:9
chr2	233413915	.	A	G	39.61	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00827715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.996;QD=13.205;RBI=0.0113383;REFB=-0.00151985;REVB=0.00774899;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138347;STB=0.583063;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.00283035;OID=.;OPOS=233413915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:3:3:4:2:3:3:4:2
chr2	233498669	.	G	T	1472.58	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.867;QD=63.3368;RBI=0.032921;REFB=0;REVB=0.0124498;RO=0;SAF=45;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50439e-05;OID=.;OPOS=233498669;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:48:45:0:0:48:45:0:0
chr2	233514636	.	G	T	884.84	PASS	AF=0.954545;AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0627401;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.718;QD=53.6264;RBI=0.0666883;REFB=-0.141398;REVB=0.0226057;RO=2;SAF=38;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242055;STB=0.518981;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00218103;OID=.;OPOS=233514636;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:66:66:2:3:63:63:0.954545:25:38:2:0:25:38:3:0
chr2	233514638	.	G	C	912.37	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0257178;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=272.015;QD=55.2952;RBI=0.0349951;REFB=-0.0928282;REVB=0.0237329;RO=1;SAF=39;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119581;STB=0.512496;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000194903;OID=.;OPOS=233514638;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:66:66:1:2:64:64:0.969697:25:39:1:0:25:39:2:0
chr2	233537125	.	A	G	188.7	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.017017;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.308;QD=14.2416;RBI=0.0208463;REFB=-0.0125127;REVB=0.0120412;RO=31;SAF=9;SAR=13;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20631;STB=0.617891;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0184017;OID=.;OPOS=233537125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:13:9:19:12:13:9:19:12
chr2	233659553	.	C	A	1599.29	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000940433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4138;QD=59.2331;RBI=0.000943869;REFB=0;REVB=8.04676e-05;RO=1;SAF=61;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00771784;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.2143e-05;OID=.;OPOS=233659553;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:108:108:1:0:107:108:1:46:61:1:0:46:62:0:0
chr2	233708806	.	A	G	351.77	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427422;FXX=0.0740466;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.143;QD=56.2835;RBI=0.0970775;REFB=0;REVB=0.0871615;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138643;OID=.;OPOS=233708806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr2	233721961	.	T	C	30.11	PASS	AF=0.097561;AO=4;DP=39;FAO=4;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=1;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.023323;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=200.271;QD=2.93752;RBI=0.0236284;REFB=-0.00210702;REVB=-0.00378631;RO=33;SAF=1;SAR=3;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.379481;STB=0.776453;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0180116;OID=.;OPOS=233721961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:39:41:33:35:4:4:0.097561:3:1:20:13:3:1:20:15
chr2	233721963	.	TTC	T,TT,TTT	166.75	PASS	AF=0.485714,0.0857143,0;AO=8,4,6;DP=36;FAO=17,3,0;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=4,2,0;FSAR=13,1,0;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0604884,0.0413715,-0.0194768;FXX=0.0277701;HRUN=5,6,6;LEN=2,1,1;MLLD=25.2607,13.2596,15.2767;QD=19.0574;RBI=0.231519,0.283426,0.0777885;REFB=-0.0764854,-0.0932543,-0.016031;REVB=0.223477,0.28039,0.0753107;RO=16;SAF=2,3,1;SAR=6,1,5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0.323529,0.542857,0;SSEP=0,0.621622,0;SSSB=-0.405711,0.162709,-0.515236;STB=0.764394,0.635592,0.5;STBP=0.002,0.787,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0986507,0.126863,0;OID=.,.,.;OPOS=233721964,233721965,233721965;OREF=TC,C,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.485714,0.0857143,0:8,4,6:36:17,3,0:35:15:4,2,0:13,1,0:12:3:99:16:2,3,1:6,1,5:10:6
chr2	233723182	.	G	A	725.19	PASS	AF=1;AO=46;DP=48;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106278;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.001;QD=56.8776;RBI=0.0558408;REFB=0;REVB=0.0548202;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.95792e-05;OID=.;OPOS=233723182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:51:0:0:46:51:1:18:28:0:0:22:29:0:0
chr2	233740177	.	G	A	600.7	PASS	AF=0.977273;AO=39;DP=42;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0447903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5028;QD=54.6088;RBI=0.0470991;REFB=-0.0535362;REVB=0.0145656;RO=2;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584765;STB=0.513507;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00238222;OID=.;OPOS=233740177;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:42:44:2:1:39:43:0.977273:15:24:0:2:18:25:0:1
chr2	233740227	.	A	G	403.96	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.347;QD=55.7189;RBI=0.033602;REFB=0;REVB=0.0307602;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145147;OID=.;OPOS=233740227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:9:19:0:0:10:19:0:0
chr2	233744021	.	G	A	763.91	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8104;QD=63.6588;RBI=0.0388666;REFB=0;REVB=-0.0307293;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.17863e-05;OID=.;OPOS=233744021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:25:22:0:0:25:23:0:0
chr2	233757679	.	G	A	972.87	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.084;QD=58.9615;RBI=0.03444;REFB=0;REVB=0.0267561;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134205;OID=.;OPOS=233757679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:38:28:0:0:38:28:0:0
chr2	233757697	.	A	G	801.31	PASS	AF=0.982759;AO=55;DP=56;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0569583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9971;QD=55.2627;RBI=0.0578482;REFB=-0.122907;REVB=0.0101075;RO=1;SAF=25;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184819;STB=0.509088;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00214531;OID=.;OPOS=233757697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:56:58:1:1:55:57:0.982759:30:25:1:0:30:27:1:0
chr2	233834975	.	A	G	773.17	PASS	AF=0.521127;AO=74;DP=142;FAO=74;FDP=142;FR=.;FRO=68;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=0.010911;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.738;QD=21.7794;RBI=0.0209693;REFB=-0.0362874;REVB=-0.017907;RO=68;SAF=32;SAR=42;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110415;STB=0.560624;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0247613;OID=.;OPOS=233834975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:68:68:74:74:0.521127:42:32:38:30:42:32:38:30
chr2	233897503	.	G	A	176.26	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0247421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.838;QD=20.7358;RBI=0.0625361;REFB=-0.038416;REVB=-0.0574334;RO=15;SAF=9;SAR=9;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134807;STB=0.58814;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0253914;OID=.;OPOS=233897503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:15:16:18:18:0.529412:9:9:5:10:9:9:5:11
chr2	234055004	.	T	C	453.43	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00680293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4708;QD=54.9608;RBI=0.0134852;REFB=-0.114567;REVB=0.0116434;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512188;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00558233;OID=.;OPOS=234055004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:20:12:0:0:20:12:0:1
chr2	234066969	.	C	G	420.31	PASS	AF=1;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292127;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0629;QD=57.9734;RBI=0.0292313;REFB=0;REVB=-0.00104131;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0029916;OID=.;OPOS=234066969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0
chr2	234113057	.	G	A	307.51	PASS	AF=0.722222;AO=26;DP=36;FAO=26;FDP=36;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0184587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.973;QD=34.1682;RBI=0.0241717;REFB=-0.0193437;REVB=-0.015606;RO=10;SAF=12;SAR=14;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832665;STB=0.54542;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00704946;OID=.;OPOS=234113057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:36:36:10:10:26:26:0.722222:14:12:3:7:14:12:3:7
chr2	234113301	.	C	T	93.0	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0190281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.422;QD=19.5785;RBI=0.0629316;REFB=0.00496911;REVB=0.059986;RO=8;SAF=5;SAR=6;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154763;STB=0.588082;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=-0.00120767;OID=.;OPOS=234113301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:6:5:2:6:6:5:2:6
chr2	234183368	.	A	G	401.21	PASS	AF=0.471264;AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0171599;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5022;QD=18.4463;RBI=0.021878;REFB=-0.0193967;REVB=0.0135714;RO=46;SAF=19;SAR=22;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552983;STB=0.530849;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0378213;OID=.;OPOS=234183368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:87:46:46:41:41:0.471264:22:19:24:22:22:19:24:22
chr2	234184417	.	G	A	381.38	PASS	AF=0.493671;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=9;FWDB=0.0161652;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.414;QD=19.3105;RBI=0.01661;REFB=0.0178422;REVB=0.00381806;RO=40;SAF=24;SAR=15;SRF=31;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160853;STB=0.588823;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=-0.0127076;OID=.;OPOS=234184417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:40:40:39:39:0.493671:15:24:31:9:15:24:31:9
chr2	234227523	.	A	G	902.53	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.688;QD=58.2279;RBI=0.030686;REFB=0;REVB=0.00891895;RO=0;SAF=20;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.80939e-05;OID=.;OPOS=234227523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:42:20:0:0:42:20:0:0
chr2	234235820	.	C	T	228.45	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00871318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.597;QD=21.7574;RBI=0.0167664;REFB=-0.0101118;REVB=0.0143246;RO=20;SAF=13;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524711;STB=0.529385;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0225664;OID=.;OPOS=234235820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:9:13:13:7:9:13:13:7
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chr2	234255547	.	G	A	377.82	PASS	AF=0.4875;AO=38;DP=79;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=32;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=0.0135631;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7507;QD=18.8911;RBI=0.0245834;REFB=-0.0108548;REVB=-0.0205033;RO=39;SAF=7;SAR=31;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13305;STB=0.587391;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0110385;OID=.;OPOS=234255547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:39:41:38:39:0.4875:31:7:11:28:32:7:12:29
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chr2	234394487	.	G	A	156.13	PASS	AF=0.318182;AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0391423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.093;QD=9.4621;RBI=0.0449731;REFB=0.00728778;REVB=0.0221464;RO=44;SAF=11;SAR=10;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105403;STB=0.553906;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=-0.00932958;OID=.;OPOS=234394487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:44:45:21:21:0.318182:10:11:19:25:10:11:20:25
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chr2	234408547	.	C	T	111.1	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0172294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.552;QD=15.8711;RBI=0.0614235;REFB=-0.0162883;REVB=-0.0589576;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127637;STB=0.573658;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0108805;OID=.;OPOS=234408547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:6:7:6:9:6:7:6:9
chr2	234420361	.	C	T	144.75	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=0;FWDB=-0.0329111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.606;QD=15.649;RBI=0.0618206;REFB=-0.0141532;REVB=-0.052332;RO=20;SAF=5;SAR=11;SRF=20;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.599422;STB=0.838402;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0586654;OID=.;OPOS=234420361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:21:16:16:0.432432:11:5:20:0:11:5:21:0
chr2	234432017	.	A	G	579.26	PASS	AF=0.597701;AO=52;DP=89;FAO=52;FDP=87;FR=.;FRO=35;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00931438;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.618;QD=26.6327;RBI=0.0124853;REFB=-0.0205282;REVB=-0.00831414;RO=36;SAF=34;SAR=18;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123177;STB=0.51115;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0090822;OID=.;OPOS=234432017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:87:36:35:52:52:0.597701:18:34:23:13:18:34:22:13
chr2	234433124	.	G	A	169.49	PASS	AF=0.375;AO=20;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0129196;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9476;QD=12.1067;RBI=0.0697058;REFB=-0.00286912;REVB=-0.0684981;RO=35;SAF=4;SAR=16;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.459016;STB=0.734751;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0194757;OID=.;OPOS=234433124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:35:20:21:0.375:16:4:21:14:16:5:21:14
chr2	234449316	.	G	A	79.37	PASS	AF=0.305556;AO=10;DP=35;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.00966587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.512;QD=8.81903;RBI=0.0249089;REFB=-0.00554314;REVB=-0.022957;RO=25;SAF=2;SAR=8;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.622819;STB=0.824628;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0514003;OID=.;OPOS=234449316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:35:36:25:25:10:11:0.305556:8:2:20:5:8:3:20:5
chr2	234460046	.	A	G	153.58	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0115691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.483;QD=21.9397;RBI=0.0130513;REFB=-0.0338343;REVB=0.00604101;RO=12;SAF=10;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.098321;STB=0.555485;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.0308201;OID=.;OPOS=234460046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:6:10:6:6:6:10:6:6
chr2	234465572	.	A	T	218.91	PASS	AF=0.36;AO=27;DP=75;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.00619774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.158;QD=11.6753;RBI=0.0100356;REFB=-0.021458;REVB=0.00789316;RO=48;SAF=14;SAR=13;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488967;STB=0.528225;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0534076;OID=.;OPOS=234465572;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:48:48:27:27:0.36:13:14:27:21:13:14:27:21
chr2	234469664	.	T	C	516.7	PASS	AF=0.635135;AO=47;DP=74;FAO=47;FDP=74;FR=.;FRO=27;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00621915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.064;QD=27.9299;RBI=0.0205024;REFB=-0.0105399;REVB=-0.0195364;RO=27;SAF=28;SAR=19;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102933;STB=0.556051;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00910813;OID=.;OPOS=234469664;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:27:27:47:47:0.635135:19:28:12:15:19:28:12:15
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chr2	234627937	.	T	C	2258.46	PASS	AF=0.993197;AO=139;DP=143;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=103;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0387423;FXX=0.0199987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2529;QD=61.4547;RBI=0.0750673;REFB=-0.098513;REVB=0.0642972;RO=0;SAF=99;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502415;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.010319;OID=.;OPOS=234627937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:143:147:0:1:139:146:0.993197:40:99:0:0:43:103:1:0
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chr2	234702459	.	T	C	1706.2	PASS	AF=0.991304;AO=113;DP=114;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00646757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.832;QD=59.3459;RBI=0.0339444;REFB=-0.106104;REVB=0.0333226;RO=0;SAF=49;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34554e-08;STB=0.503816;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000228114;OID=.;OPOS=234702459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:114:115:0:1:113:114:0.991304:64:49:0:0:65:49:0:1
chr2	234703136	.	T	C	557.34	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3749;QD=58.6672;RBI=0.0255046;REFB=0;REVB=0.00756652;RO=1;SAF=25;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183679;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00093456;OID=.;OPOS=234703136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:1:0:37:38:1:12:25:1:0:12:26:0:0
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chr2	234704690	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.321;QD=42.1818;RBI=0.0618688;REFB=0;REVB=0.0469587;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000674612;OID=.;OPOS=234704690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0
chr2	234708868	.	G	C	1157.64	PASS	AF=0.987179;AO=75;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.018359;FXX=0.0370325;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.923;QD=59.3661;RBI=0.0570184;REFB=-0.098773;REVB=0.0539819;RO=0;SAF=49;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509431;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.000842313;OID=.;OPOS=234708868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:0:1:75:77:0.987179:26:49:0:0:26:51:0:1
chr2	234710831	.	G	C	937.35	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.767;QD=58.584;RBI=0.06011;REFB=0;REVB=0.0484796;RO=0;SAF=35;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166133;OID=.;OPOS=234710831;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:64:0:0:61:64:1:26:35:0:0:28:36:0:0
chr2	234713706	.	T	C	2260.01	PASS	AF=1;AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149554;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.95;QD=63.6623;RBI=0.0213571;REFB=0;REVB=0.0152467;RO=0;SAF=66;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.80459e-05;OID=.;OPOS=234713706;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:142:142:1:76:66:0:0:76:66:0:0
chr2	234716426	.	G	A	1153.11	PASS	AF=0.962963;AO=78;DP=81;FAO=78;FDP=81;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0397593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.455;QD=56.9436;RBI=0.0406761;REFB=-0.00320306;REVB=0.00858744;RO=3;SAF=29;SAR=49;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219686;STB=0.511617;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=5.14999e-05;OID=.;OPOS=234716426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:81:81:3:3:78:78:0.962963:49:29:2:1:49:29:2:1
chr2	234725502	.	T	C	1102.51	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00126869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5723;QD=58.8008;RBI=0.0241596;REFB=-0.119504;REVB=0.0241263;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.000137277;OID=.;OPOS=234725502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:0:1:74:74:0.986667:42:32:0:0:42:32:1:0
chr2	234727333	.	C	G	1042.71	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.955;QD=58.7443;RBI=0.0773941;REFB=0;REVB=0.0755573;RO=0;SAF=42;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159286;OID=.;OPOS=234727333;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:71:0:0:68:71:1:26:42:0:0:29:42:0:0
chr2	234728078	.	T	C	1320.91	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0368844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.099;QD=62.1606;RBI=0.0408158;REFB=0;REVB=0.0174778;RO=0;SAF=51;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130354;OID=.;OPOS=234728078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:34:51:0:0:34:51:0:0
chr2	234732317	.	A	G	340.5	PASS	AF=0.507042;AO=30;DP=75;FAO=36;FDP=71;FR=.,HEALED,HEALED,HEALED;FRO=35;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=-0.0737522;FXX=0.0273935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.7958;QD=19.183;RBI=0.0789906;REFB=-0.101246;REVB=-0.0282865;RO=14;SAF=13;SAR=17;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0808549;STB=0.622053;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0508449;OID=.;OPOS=234732317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:71:14:35:30:36:0.507042:17:13:8:6:17:19:27:8
chr2	234737275	.	G	C	499.91	PASS	AF=0.377358;AO=59;DP=158;FAO=60;FDP=159;FR=.;FRO=99;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=51;FSRR=48;FWDB=-0.0823423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.9;QD=12.5762;RBI=0.0852086;REFB=-0.00440432;REVB=-0.0219148;RO=99;SAF=36;SAR=23;SRF=51;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107093;STB=0.553828;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0105424;OID=.;OPOS=234737275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:159:99:99:59:60:0.377358:23:36:51:48:24:36:51:48
chr2	234737372	.	C	A	375.48	PASS	AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.00219837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.617;QD=18.3163;RBI=0.00796013;REFB=-0.0229081;REVB=0.00765055;RO=41;SAF=22;SAR=17;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1591;STB=0.599702;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0273332;OID=.;OPOS=234737372;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:41:43:39:39:0.47561:17:22:16:25:17:22:16:27
chr2	234740136	.	G	A	274.82	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0283785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.661;QD=18.0212;RBI=0.0393709;REFB=-0.0167138;REVB=-0.0272898;RO=31;SAF=19;SAR=11;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437349;STB=0.524418;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0170602;OID=.;OPOS=234740136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:11:19:21:10:11:19:21:10
chr2	234740157	.	G	A	215.24	PASS	AF=0.45283;AO=22;DP=51;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0131674;FXX=0.0535619;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.126;QD=16.2443;RBI=0.0147825;REFB=-0.0069144;REVB=0.00671892;RO=25;SAF=16;SAR=6;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097583;STB=0.534167;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.00988783;OID=.;OPOS=234740157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:53:25:29:22:24:0.45283:6:16:16:9:7:17:19:10
chr2	234749258	.	T	C	51.94	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0236204;FXX=0.117578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.147;QD=13.8507;RBI=0.0250234;REFB=-0.0132467;REVB=0.00826113;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392579;STB=0.788741;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0100752;OID=.;OPOS=234749258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:17:15:10:8:7:7:0.466667:5:2:7:3:5:2:7:1
chr2	234749354	.	G	A	140.07	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0755644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.844;QD=12.7334;RBI=0.0776433;REFB=-0.0128639;REVB=0.0178466;RO=28;SAF=8;SAR=8;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387096;STB=0.522699;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.024094;OID=.;OPOS=234749354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:8:8:15:13:8:8:15:13
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chr2	238166147	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.739;QD=46.848;RBI=0.0151597;REFB=0;REVB=0.00639706;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.33017e-05;OID=.;OPOS=238166147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0
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chr2	238443226	.	A	G	223.12	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.0117519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.708;QD=16.5272;RBI=0.0737821;REFB=-0.0118223;REVB=-0.0728402;RO=29;SAF=15;SAR=10;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127101;STB=0.571374;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0147175;OID=.;OPOS=238443226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:10:15:21:8:10:15:21:8
chr2	238449007	.	T	C	115.63	PASS	AF=0.261538;AO=17;DP=65;FAO=17;FDP=65;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=0.0261646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.371;QD=7.11536;RBI=0.0408386;REFB=-0.0356037;REVB=-0.0313561;RO=47;SAF=6;SAR=11;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166333;STB=0.500989;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0754121;OID=.;OPOS=238449007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:47:48:17:17:0.261538:11:6:16:31:11:6:17:31
chr2	238449023	.	T	C	145.09	PASS	AF=0.298507;AO=20;DP=68;FAO=20;FDP=67;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=30;FWDB=0.0261801;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.045;QD=8.66183;RBI=0.0316281;REFB=-0.0288967;REVB=-0.0177465;RO=47;SAF=8;SAR=12;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475766;STB=0.528274;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0580682;OID=.;OPOS=238449023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:47:47:20:20:0.298507:12:8:17:30:12:8:17:30
chr2	238449107	.	A	G	156.13	PASS	AF=0.318182;AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=-0.038665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1872;QD=9.46224;RBI=0.0422131;REFB=-0.0104627;REVB=-0.01694;RO=44;SAF=6;SAR=15;SRF=13;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135936;STB=0.520813;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0142652;OID=.;OPOS=238449107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:44:45:21:21:0.318182:15:6:13:31:15:6:14:31
chr2	238503559	.	C	G	319.65	PASS	AF=0.375;AO=36;DP=97;FAO=36;FDP=96;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=46;FSRR=14;FWDB=-0.0258086;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.687;QD=13.3186;RBI=0.0419321;REFB=-0.0156561;REVB=0.0330487;RO=60;SAF=25;SAR=11;SRF=46;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976613;STB=0.555447;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0355266;OID=.;OPOS=238503559;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:60:60:36:36:0.375:11:25:46:14:11:25:46:14
chr2	238991733	.	C	A	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.242;QD=63.8719;RBI=0.040934;REFB=0;REVB=0.0390486;RO=0;SAF=35;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.61818e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.01391e-05;OID=.;OPOS=238991733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:13:35:0:0:13:35:0:0
chr2	239025630	.	T	C	370.76	PASS	AF=0.323699;AO=44;DP=161;FAO=56;FDP=173;FR=.;FRO=117;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=69;FSRR=48;FWDB=0.0198683;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9178;QD=8.57247;RBI=0.0199322;REFB=-0.0136644;REVB=0.00159512;RO=98;SAF=13;SAR=31;SRF=52;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287372;STB=0.595998;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0447152;OID=.;OPOS=239025630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:173:98:117:44:56:0.323699:31:13:52:46:31:25:69:48
chr2	239025645	.	C	T	418.71	PASS	AF=0.347222;AO=50;DP=144;FAO=50;FDP=144;FR=.;FRO=94;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=48;FWDB=-0.00762651;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.768;QD=11.6308;RBI=0.021226;REFB=-0.0139493;REVB=-0.0198085;RO=94;SAF=22;SAR=28;SRF=46;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565248;STB=0.532425;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.0345984;OID=.;OPOS=239025645;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:94:94:50:50:0.347222:28:22:46:48:28:22:46:48
chr2	239036270	.	C	T	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.00770876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.984;QD=13.8498;RBI=0.0109795;REFB=-0.0241821;REVB=-0.00781826;RO=24;SAF=4;SAR=12;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243225;STB=0.633623;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.035355;OID=.;OPOS=239036270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:25:16:16:0.390244:12:4:11:13:12:4:11:14
chr2	239038912	.	T	C	646.42	PASS	AF=0.481752;AO=65;DP=137;FAO=66;FDP=137;FR=.;FRO=71;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=-0.064488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1276;QD=18.8734;RBI=0.106795;REFB=0.0204537;REVB=-0.0851265;RO=72;SAF=22;SAR=43;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173714;STB=0.602009;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.0263427;OID=.;OPOS=239038912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:72:71:65:66:0.481752:43:22:37:35:44:22:37:34
chr2	239039637	.	T	C	101.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.120501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.982;QD=40.7614;RBI=0.123174;REFB=0;REVB=0.0255216;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00269539;OID=.;OPOS=239039637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr2	239039841	.	A	G	169.63	PASS	AF=0.463415;AO=16;DP=38;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.0655024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.721;QD=16.5495;RBI=0.0798741;REFB=-0.0736698;REVB=0.045709;RO=19;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34263;STB=0.613928;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.018918;OID=.;OPOS=239039841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:41:19:22:16:19:0.463415:7:9:17:2:7:12:18:4
chr2	239039896	.	G	C	1909.43	PASS	AF=0.948529;AO=127;DP=135;FAO=129;FDP=136;FR=.;FRO=7;FSAF=84;FSAR=45;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0226499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8779;QD=56.1596;RBI=0.0890711;REFB=-0.128628;REVB=-0.0861431;RO=7;SAF=82;SAR=45;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388513;STB=0.519997;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.00482241;OID=.;OPOS=239039896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:135:136:7:7:127:129:0.948529:45:82:7:0:45:84:7:0
chr2	239040187	.	T	C	191.27	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.557;QD=47.8168;RBI=0.0288267;REFB=0;REVB=0.024912;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.74543e-05;OID=.;OPOS=239040187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr2	239050033	.	C	T	115.99	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.5563;QD=42.1786;RBI=0.153731;REFB=0;REVB=0.100629;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0074995;OID=.;OPOS=239050033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:11:0:0:10:11:1:6:4:0:0:7:4:0:0
chr2	239051550	.	T	C	1851.54	PASS	AF=0.991935;AO=121;DP=124;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=66;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0493218;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.9988;QD=59.7273;RBI=0.0557307;REFB=-0.0462591;REVB=0.0259473;RO=0;SAF=56;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504347;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.000437413;OID=.;OPOS=239051550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:124:124:0:1:121:123:0.991935:65:56:0:0:66:57:1:0
chr2	239059484	.	T	C	1528.21	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147624;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.27;QD=59.9298;RBI=0.0397607;REFB=0;REVB=0.0369187;RO=0;SAF=49;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284183;OID=.;OPOS=239059484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:102:0:0:99:102:1:50:49:0:0:53:49:0:0
chr2	239075812	.	C	T	185.75	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0150889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.091;QD=19.0507;RBI=0.0151668;REFB=-0.0437679;REVB=0.00153534;RO=20;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161163;STB=0.591302;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0365109;OID=.;OPOS=239075812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:11:8:12:8:11:8:12:8
chr2	239075935	.	A	G	791.38	PASS	AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.031824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.583;QD=53.6531;RBI=0.0709354;REFB=-0.000504571;REVB=-0.0633961;RO=2;SAF=24;SAR=33;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00516834;STB=0.502741;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-0.00107126;OID=.;OPOS=239075935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:59:59:2:2:57:57:0.966102:33:24:1:1:33:24:1:1
chr2	239149078	.	G	A	131.37	PASS	AF=0.32;AO=15;DP=46;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0438917;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.3327;QD=10.5099;RBI=0.0454738;REFB=-0.0284359;REVB=0.0118905;RO=29;SAF=15;SAR=0;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.781634;STB=0.875315;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0908473;OID=.;OPOS=239149078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:50:29:34:15:16:0.32:0:15:18:11:1:15:19:15
chr2	239162038	.	A	G	40.3	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0682407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7061;QD=14.6556;RBI=0.0979143;REFB=-0.00987874;REVB=-0.0702169;RO=4;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297985;STB=0.739831;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=-0.00457864;OID=.;OPOS=239162038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:4:5:6:6:0.545455:1:5:2:2:1:5:2:3
chr2	239229372	.	C	A	57.93	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0140138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.924;QD=13.631;RBI=0.0592763;REFB=-0.0109382;REVB=-0.057596;RO=9;SAF=7;SAR=1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398438;STB=0.743945;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0260511;OID=.;OPOS=239229372;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:1:7:5:4:1:7:5:4
chr2	239261866	.	G	A	368.62	PASS	AF=0.5;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0139934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.529;QD=19.4012;RBI=0.0250734;REFB=-0.0100641;REVB=0.0208053;RO=38;SAF=29;SAR=9;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316938;STB=0.67747;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00756711;OID=.;OPOS=239261866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:38:38:38:38:0.5:9:29:17:21:9:29:17:21
chr2	239321367	.	A	T	414.35	PASS	AF=0.462366;AO=40;DP=90;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0128503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.259;QD=17.8216;RBI=0.0147853;REFB=-0.00124267;REVB=0.00731258;RO=50;SAF=16;SAR=24;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120267;STB=0.5815;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00115046;OID=.;OPOS=239321367;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:93:50:50:40:43:0.462366:24:16:26:24:27:16:26:24
chr2	239969974	.	G	C	359.0	PASS	AF=0.513889;AO=36;DP=70;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0249052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5024;QD=19.9444;RBI=0.0314181;REFB=-0.0435581;REVB=0.0191528;RO=34;SAF=20;SAR=16;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125406;STB=0.567531;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0455851;OID=.;OPOS=239969974;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:34:35:36:37:0.513889:16:20:14:20:16:21:15:20
chr2	239972883	.	C	T	424.08	PASS	AF=1;AO=20;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00219185;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.835;QD=56.5438;RBI=0.00945609;REFB=0;REVB=-0.00919856;RO=0;SAF=17;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106871;OID=.;OPOS=239972883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:20:30:1:3:17:0:0:8:22:0:0
chr2	240003870	.	G	A	569.82	PASS	AF=0.42069;AO=61;DP=142;FAO=61;FDP=145;FR=.;FRO=84;FSAF=46;FSAR=15;FSRF=55;FSRR=29;FWDB=-0.00399083;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.859;QD=15.7191;RBI=0.014692;REFB=-0.00256469;REVB=0.0141396;RO=81;SAF=46;SAR=15;SRF=54;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111857;STB=0.571888;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00382173;OID=.;OPOS=240003870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:145:81:84:61:61:0.42069:15:46:54:27:15:46:55:29
chr2	240061403	.	C	T	453.95	PASS	AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0127403;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.444;QD=19.5248;RBI=0.0349883;REFB=-0.0375043;REVB=0.0325863;RO=47;SAF=20;SAR=25;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100015;STB=0.550217;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0330963;OID=.;OPOS=240061403;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:47:48:45:45:0.483871:25:20:26:21:25:20:26:22
chr2	240084053	.	T	A	44.05	PASS	AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=20;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.036;QD=6.52641;RBI=0.00607274;REFB=-0.00226029;REVB=-0.00607274;RO=19;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00767252;OID=.;OPOS=240084053;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:27:27:19:20:7:7:0.259259:7:0:0:19:7:0:0:20
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chr2	240923050	.	C	T	675.79	PASS	AF=0.45625;AO=73;DP=160;FAO=73;FDP=160;FR=.;FRO=87;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=44;FSRR=43;FWDB=0.00984816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.903;QD=16.8948;RBI=0.00984831;REFB=-0.0152134;REVB=5.44686e-05;RO=86;SAF=40;SAR=33;SRF=43;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469045;STB=0.523049;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0197936;OID=.;OPOS=240923050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:160:86:87:73:73:0.45625:33:40:43:43:33:40:44:43
chr2	240946766	.	T	C	419.77	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.2655;QD=55.969;RBI=0.0385733;REFB=0;REVB=0.0177125;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114268;OID=.;OPOS=240946766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:15:14:0:0:15:15:0:0
chr2	240961728	.	T	C	1102.1	PASS	AF=0.987342;AO=59;DP=80;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0403207;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.414;QD=55.8025;RBI=0.0880214;REFB=-0.0318719;REVB=0.0782432;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.507245;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.000306738;OID=.;OPOS=240961728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:79:0:1:59:78:0.987342:25:34:0:0:44:34:1:0
chr2	240981262	.	A	C	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.303;QD=57.3858;RBI=0.0625459;REFB=0;REVB=0.0572187;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152463;OID=.;OPOS=240981262;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0
chr2	240981375	.	T	A	728.31	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00152012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.165;QD=53.9487;RBI=0.0574672;REFB=0.0147985;REVB=0.0574471;RO=1;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229661;STB=0.51219;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.000686924;OID=.;OPOS=240981375;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:52:53:0.981481:20:32:0:1:20:33:0:1
chr2	240984789	.	C	T	834.94	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.863;QD=57.5823;RBI=0.034643;REFB=0;REVB=0.0115112;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148987;OID=.;OPOS=240984789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:29:28:0:0:29:29:0:0
chr2	240985347	.	G	A	785.19	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00569891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.967;QD=57.1044;RBI=0.017917;REFB=0;REVB=0.0169865;RO=0;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.92258e-05;OID=.;OPOS=240985347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:20:35:0:0:20:35:0:0
chr2	241066280	.	C	T	628.96	PASS	AF=0.954545;AO=44;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0858058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.8096;QD=57.1781;RBI=0.0868001;REFB=-0.0479618;REVB=0.0131006;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00324527;OID=.;OPOS=241066280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:44:0:2:44:42:0.954545:22:22:0:0:21:21:1:1
chr2	241066325	.	A	C	144.49	PASS	AF=0.410256;AO=13;DP=40;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0503745;FXX=0.0249938;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.293;QD=14.8197;RBI=0.0503745;REFB=-0.00516077;REVB=-1.83036e-05;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381561;STB=0.538414;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.00979491;OID=.;OPOS=241066325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:20:23:13:16:0.410256:8:5:7:13:8:8:10:13
chr2	241390002	.	A	G	834.75	PASS	AF=0.416309;AO=86;DP=224;FAO=97;FDP=233;FR=.;FRO=136;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=75;FSRR=61;FWDB=0.0327529;FXX=0.00427332;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3185;QD=14.3305;RBI=0.0685747;REFB=-0.00242445;REVB=0.0602473;RO=134;SAF=51;SAR=35;SRF=74;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452444;STB=0.509039;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0198205;OID=.;OPOS=241390002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:224:233:134:136:86:97:0.416309:35:51:74:60:45:52:75:61
chr2	241390098	.	T	G	34.2	PASS	AF=0.0859375;AO=11;DP=128;FAO=11;FDP=128;FR=.;FRO=117;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=48;FSRR=69;FWDB=-0.0479579;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1728;QD=1.06876;RBI=0.0944538;REFB=-0.00363154;REVB=-0.081373;RO=116;SAF=3;SAR=8;SRF=48;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173394;STB=0.638232;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.126861;OID=.;OPOS=241390098;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:128:128:116:117:11:11:0.0859375:8:3:48:68:8:3:48:69
chr2	241492255	.	G	T	955.01	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00495084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.21;QD=58.7698;RBI=0.0220737;REFB=0;REVB=-0.0215113;RO=0;SAF=50;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.3654e-05;OID=.;OPOS=241492255;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:15:50:0:0:15:50:0:0
chr2	241537421	.	G	A	726.76	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110341;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.077;QD=63.1964;RBI=0.0291304;REFB=0;REVB=0.0269598;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105162;OID=.;OPOS=241537421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:46:0:0:43:46:1:26:17:0:0:26:20:0:0
chr2	241538074	.	A	G	727.78	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.46;QD=63.2854;RBI=0.0499084;REFB=0;REVB=-0.0484394;RO=0;SAF=15;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000228352;OID=.;OPOS=241538074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:31:15:0:0:31:15:0:0
chr2	241558397	.	G	A	1601.16	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00592563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.072;QD=64.0464;RBI=0.0110272;REFB=0;REVB=-0.00929975;RO=0;SAF=39;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.51546e-05;OID=.;OPOS=241558397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:60:39:0:0:61:39:0:0
chr2	241570249	.	A	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.298;QD=52.6127;RBI=0.0273518;REFB=0;REVB=-0.0206223;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.0995e-05;OID=.;OPOS=241570249;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr2	241570391	.	A	G	784.86	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.508;QD=64.0701;RBI=0.0465849;REFB=0;REVB=0.0398745;RO=0;SAF=37;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.75312e-05;OID=.;OPOS=241570391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:11:37:0:0:11:38:0:0
chr2	241621799	.	GC	G	134.83	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0682059;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.044;QD=26.9655;RBI=0.0889459;REFB=-0.0235186;REVB=-0.0570905;RO=6;SAF=6;SAR=8;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147485;STB=0.581978;STBP=0.31;TYPE=del;VARB=0.00176219;OID=.;OPOS=241621800;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.7:14:21:14:20:6:6:8:1:5:36:6:6:8:1:5
chr2	241622195	.	T	C	64.98	PASS	AF=0.188679;AO=10;DP=53;FAO=10;FDP=53;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=0.00167579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.508;QD=4.90405;RBI=0.018602;REFB=-0.0183731;REVB=0.0185263;RO=43;SAF=9;SAR=1;SRF=31;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350075;STB=0.74461;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0521529;OID=.;OPOS=241622195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:53:53:43:43:10:10:0.188679:1:9:31:12:1:9:31:12
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chr2	241627928	.	A	G	339.18	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.0207791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.221;QD=17.8517;RBI=0.035644;REFB=-0.0348773;REVB=-0.0289608;RO=36;SAF=23;SAR=13;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551081;STB=0.520822;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0320725;OID=.;OPOS=241627928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:36:40:36:36:0.473684:13:23:25:11:13:23:27:13
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chr2	241812461	.	G	A	246.89	PASS	AF=0.402778;AO=28;DP=70;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0153359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8099;QD=13.716;RBI=0.0278896;REFB=0.0138022;REVB=0.0232947;RO=42;SAF=17;SAR=11;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11449;STB=0.580589;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.0171418;OID=.;OPOS=241812461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:42:43:28:29:0.402778:11:17:21:21:11:18:21:22
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chr2	241816871	.	G	T	200.65	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00317486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1951;QD=20.579;RBI=0.0352911;REFB=-0.0104125;REVB=-0.035148;RO=19;SAF=10;SAR=10;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113857;STB=0.564039;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.00865484;OID=.;OPOS=241816871;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:10:10:12:7:10:10:12:7
chr2	241817516	.	A	G	635.68	PASS	AF=0.503937;AO=64;DP=127;FAO=64;FDP=127;FR=.;FRO=63;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.000595176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.036;QD=20.0215;RBI=0.0109422;REFB=-0.00775915;REVB=0.010926;RO=63;SAF=29;SAR=35;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106211;STB=0.558538;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00940518;OID=.;OPOS=241817516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:63:63:64:64:0.503937:35:29:36:27:35:29:36:27
chr2	241826517	.	C	T	521.84	PASS	AF=0.519608;AO=49;DP=98;FAO=53;FDP=102;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.0103532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.532;QD=20.4642;RBI=0.0177229;REFB=-0.0185682;REVB=0.0143844;RO=45;SAF=27;SAR=22;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168347;STB=0.613145;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0196314;OID=.;OPOS=241826517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:102:45:49:49:53:0.519608:22:27:16:29:22:31:17:32
chr2	241827798	.	T	C	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.00435749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.411;QD=14.6579;RBI=0.00490082;REFB=-0.00820328;REVB=0.00224282;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230989;STB=0.632005;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.00621279;OID=.;OPOS=241827798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:8:5:3:14:8:5:3:14
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chr2	241828033	.	CA	C,CG	434.16	PASS	AF=0.0967742,0.903226;AO=4,28;DP=33;FAO=3,28;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=2,10;FSAR=1,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0642111,-0.00514367;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=98.0688,112.748;QD=56.0204;RBI=0.0726064,0.0206819;REFB=0,0;REVB=0.0338914,0.0200321;RO=0;SAF=2,10;SAR=2,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.052975,0.00320281;OID=.,.;OPOS=241828034,241828034;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0967742,0.903226:4,28:33:3,28:31:0:2,10:1,18:0:0:9:0:2,10:2,18:0:0
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chr2	241831005	.	C	T	945.17	PASS	AF=0.482759;AO=98;DP=202;FAO=98;FDP=203;FR=.;FRO=105;FSAF=67;FSAR=31;FSRF=67;FSRR=38;FWDB=0.0322755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9394;QD=18.6241;RBI=0.0326595;REFB=-0.0130927;REVB=0.00499386;RO=104;SAF=67;SAR=31;SRF=66;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517883;STB=0.526712;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0176305;OID=.;OPOS=241831005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:202:203:104:105:98:98:0.482759:31:67:66:38:31:67:67:38
chr2	241831296	.	C	G	261.92	PASS	AF=0.543478;AO=23;DP=44;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.1014;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.6755;QD=22.7758;RBI=0.11532;REFB=-0.0385506;REVB=0.0549244;RO=21;SAF=11;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791788;STB=0.541633;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0359838;OID=.;OPOS=241831296;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:46:21:21:23:25:0.543478:12:11:12:9:13:12:12:9
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chr2	241834944	.	T	C	315.23	PASS	AF=0.34188;AO=40;DP=118;FAO=40;FDP=117;FR=.;FRO=77;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=54;FSRR=23;FWDB=0.00563755;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.295;QD=10.7772;RBI=0.0146415;REFB=0.00146844;REVB=-0.0135127;RO=77;SAF=21;SAR=19;SRF=54;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205901;STB=0.61763;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.0028665;OID=.;OPOS=241834944;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:117:77:77:40:40:0.34188:19:21:54:23:19:21:54:23
chr2	241835379	.	G	A	128.2	PASS	AF=0.454545;AO=14;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0425996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.506;QD=15.5392;RBI=0.0442473;REFB=-0.0441862;REVB=0.0119621;RO=18;SAF=3;SAR=11;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453017;STB=0.721012;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0424475;OID=.;OPOS=241835379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:14:15:0.454545:11:3:12:6:11:4:12:6
chr2	241865156	.	T	C	3115.64	PASS	AF=1;AO=199;DP=199;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.004812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.863;QD=61.3918;RBI=0.00594351;REFB=0;REVB=0.00348856;RO=0;SAF=114;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.24011e-05;OID=.;OPOS=241865156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:199:203:0:0:199:203:1:85:114:0:0:89:114:0:0
chr2	241872597	.	A	G	648.24	PASS	AF=0.503876;AO=65;DP=129;FAO=65;FDP=129;FR=.;FRO=64;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=-0.0135753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.954;QD=20.1004;RBI=0.0258271;REFB=-0.0171403;REVB=0.0219715;RO=64;SAF=33;SAR=32;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0634936;STB=0.534979;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0176571;OID=.;OPOS=241872597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:64:64:65:65:0.503876:32:33:37:27:32:33:37:27
chr2	241872722	.	G	A	247.68	PASS	AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.00599003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.284;QD=13.7598;RBI=0.00655788;REFB=-0.0367377;REVB=-0.00266933;RO=43;SAF=18;SAR=11;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431229;STB=0.524606;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0439751;OID=.;OPOS=241872722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:11:18:25:18:11:18:25:18
chr2	241898824	.	A	G	413.7	PASS	AF=0.445545;AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=19;FWDB=-0.0151461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.199;QD=16.384;RBI=0.0154173;REFB=-0.0071791;REVB=0.00287923;RO=56;SAF=25;SAR=20;SRF=37;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107127;STB=0.559794;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00991645;OID=.;OPOS=241898824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:56:56:45:45:0.445545:20:25:37:19:20:25:37:19
chr2	241904001	.	G	C	620.78	PASS	AF=0.464052;AO=65;DP=139;FAO=71;FDP=153;FR=.;FRO=82;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=50;FSRR=32;FWDB=0.00539088;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=44.0463;QD=16.2296;RBI=0.00854869;REFB=-0.0541713;REVB=0.00663463;RO=74;SAF=40;SAR=25;SRF=43;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344317;STB=0.502314;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0593842;OID=.;OPOS=241904001;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:153:74:82:65:71:0.464052:25:40:43:31:28:43:50:32
chr2	241922430	.	T	C	1881.81	PASS	AF=1;AO=121;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.144;QD=61.1971;RBI=0.0193793;REFB=0;REVB=-0.0157584;RO=0;SAF=61;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122493;OID=.;OPOS=241922430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:123:0:0:121:123:1:60:61:0:0:60:63:0:0
chr2	241925343	.	T	C	116.51	PASS	AF=0.233766;AO=18;DP=77;FAO=18;FDP=77;FR=.;FRO=59;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0302824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.079;QD=6.05241;RBI=0.0307762;REFB=-0.00719184;REVB=-0.00549068;RO=57;SAF=11;SAR=7;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127675;STB=0.566935;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0265499;OID=.;OPOS=241925343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:57:59:18:18:0.233766:7:11:29:28:7:11:31:28
chr2	241929228	.	A	G	1530.03	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-9.85787e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.17;QD=63.7512;RBI=0.0307196;REFB=0;REVB=0.0307194;RO=0;SAF=53;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04672e-05;OID=.;OPOS=241929228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:43:53:0:0:43:53:0:0
chr2	241973223	.	C	T	334.28	PASS	AF=0.611111;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0105763;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7116;QD=24.7616;RBI=0.0561946;REFB=-0.0189518;REVB=0.0551904;RO=20;SAF=18;SAR=15;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998974;STB=0.545427;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0232906;OID=.;OPOS=241973223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:20:21:33:33:0.611111:15:18:8:12:15:18:9:12
chr2	241979550	.	T	C	1080.48	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.193;QD=60.0267;RBI=0.0340608;REFB=0;REVB=0.0283257;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32964e-05;OID=.;OPOS=241979550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:34:38:0:0:34:38:0:0
chr2	241991875	.	G	A	601.13	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.078063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.265;QD=58.6467;RBI=0.0785223;REFB=-0.0886216;REVB=0.00848048;RO=1;SAF=20;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228628;STB=0.511622;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00265348;OID=.;OPOS=241991875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:39:40:0.97561:19:20:1:0:19:21:1:0
chr2	242002306	.	G	A	137.8	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0164506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.424;QD=16.2123;RBI=0.0174031;REFB=-0.0363746;REVB=0.00567862;RO=15;SAF=4;SAR=10;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998555;STB=0.588122;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0303455;OID=.;OPOS=242002306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:18:14:14:0.411765:10:4:3:12:10:4:3:15
chr2	242003487	.	C	T	3296.01	PASS	AF=0.995575;AO=203;DP=209;FAO=225;FDP=226;FR=.;FRO=1;FSAF=106;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.152299;FXX=0.00440509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.816;QD=58.3365;RBI=0.161858;REFB=-0.0745793;REVB=0.0548018;RO=2;SAF=97;SAR=106;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000412788;STB=0.502092;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00594346;OID=.;OPOS=242003487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:209:226:2:1:203:225:0.995575:106:97:1:1:119:106:0:1
chr2	242003488	.	G	T	66.55	PASS	AF=0.0913043;AO=19;DP=228;FAO=21;FDP=230;FR=.;FRO=209;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=98;FSRR=111;FWDB=0.041423;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.2681;QD=1.15731;RBI=0.0431431;REFB=-0.0145325;REVB=-0.0120606;RO=209;SAF=8;SAR=11;SRF=98;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557079;STB=0.536978;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0135831;OID=.;OPOS=242003488;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:228:230:209:209:19:21:0.0913043:11:8:98:111:12:9:98:111
chr2	242004866	.	A	G	744.51	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00847026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.164;QD=56.1893;RBI=0.0292156;REFB=0;REVB=0.0279608;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101038;OID=.;OPOS=242004866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:53:0:0:50:53:1:26:24:0:0:29:24:0:0
chr2	242011084	.	T	C	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0496615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.356;QD=19.1341;RBI=0.073623;REFB=-0.0844199;REVB=-0.0543515;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171367;STB=0.59965;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0222314;OID=.;OPOS=242011084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:4:1:0:2:4:1:0:2
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chr2	242028762	.	T	C	136.77	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=47;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0126468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.771;QD=11.3972;RBI=0.012774;REFB=-0.00889554;REVB=0.00179799;RO=32;SAF=7;SAR=8;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143159;STB=0.564438;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0190958;OID=.;OPOS=242028762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:32:32:15:16:0.333333:8:7:11:21:9:7:11:21
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chr2	242054403	.	G	A	462.59	PASS	AF=0.517241;AO=44;DP=88;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00565919;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.297;QD=21.2685;RBI=0.00609764;REFB=-0.0263551;REVB=0.00227043;RO=41;SAF=31;SAR=13;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0947077;STB=0.564344;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0207081;OID=.;OPOS=242054403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:41:42:44:45:0.517241:13:31:25:16:13:32:25:17
chr2	242062162	.	C	T	129.27	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0298337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9221;QD=21.5456;RBI=0.0493541;REFB=0.0544993;REVB=0.0393164;RO=10;SAF=6;SAR=8;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12611;STB=0.571326;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=-0.00880407;OID=.;OPOS=242062162;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:8:6:6:4:8:6:6:4
chr2	242066314	.	T	C	160.84	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.000704979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.536;QD=18.3821;RBI=0.0164922;REFB=-0.0313323;REVB=0.0164771;RO=18;SAF=3;SAR=14;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.482716;STB=0.777425;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0175148;OID=.;OPOS=242066314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:14:3:12:6:14:3:12:6
chr2	242066789	.	A	G	308.35	PASS	AF=0.540984;AO=31;DP=60;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.042772;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3758;QD=20.2195;RBI=0.0428897;REFB=-0.00797285;REVB=0.003175;RO=27;SAF=16;SAR=15;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183866;STB=0.588474;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0225062;OID=.;OPOS=242066789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:27:28:31:33:0.540984:15:16:8:19:16:17:9:19
chr2	242075362	.	G	A	426.91	PASS	AF=0.538462;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.02707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3829;QD=21.893;RBI=0.0332013;REFB=-0.00300589;REVB=0.0192234;RO=35;SAF=14;SAR=28;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603634;STB=0.542036;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00292773;OID=.;OPOS=242075362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:35:36:42:42:0.538462:28:14:14:21:28:14:15:21
chr2	242082262	.	T	C	754.85	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0247073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.319;QD=54.8983;RBI=0.0474115;REFB=-0.157552;REVB=0.0404648;RO=1;SAF=35;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132766;STB=0.50704;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.000989669;OID=.;OPOS=242082262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:19:35:1:0:19:35:1:0
chr2	242122391	.	T	C	651.19	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000702683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.149;QD=62.0184;RBI=0.0422031;REFB=0;REVB=-0.0421973;RO=0;SAF=17;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.7693e-05;OID=.;OPOS=242122391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:25:17:0:0:25:17:0:0
chr2	242122820	.	G	A	252.33	PASS	AF=0.422535;AO=29;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0957484;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9581;QD=14.2158;RBI=0.0957545;REFB=0.0058471;REVB=0.00108321;RO=42;SAF=16;SAR=13;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00430745;STB=0.517591;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=-0.00832975;OID=.;OPOS=242122820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:42:41:29:30:0.422535:13:16:23:19:13:17:22:19
chr2	242122844	.	C	T	340.3	PASS	AF=0.473684;AO=35;DP=77;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0102412;FXX=0.0129853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.947;QD=17.9106;RBI=0.0102871;REFB=-0.00902338;REVB=-0.000971485;RO=31;SAF=19;SAR=16;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131407;STB=0.516215;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0142118;OID=.;OPOS=242122844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:31:40:35:36:0.473684:16:19:12:19:16:20:21:19
chr2	242129515	.	G	A	786.88	PASS	AF=0.401786;AO=88;DP=222;FAO=90;FDP=224;FR=.;FRO=134;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=65;FSRR=69;FWDB=0.00849808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.004;QD=14.0514;RBI=0.0139926;REFB=-0.0196448;REVB=0.0111165;RO=130;SAF=45;SAR=43;SRF=63;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284299;STB=0.508927;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0231053;OID=.;OPOS=242129515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:222:224:130:134:88:90:0.401786:43:45:63:67:45:45:65:69
chr2	242168976	.	T	C	1232.4	PASS	AF=1;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388773;FXX=0.0243873;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.552;QD=61.6202;RBI=0.040057;REFB=0;REVB=0.0096497;RO=0;SAF=49;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.85194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.13612e-05;OID=.;OPOS=242168976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:80:0:0:80:80:1:31:49:0:0:31:49:0:0
chr2	242203916	.	A	C	1308.24	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00435117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.275;QD=61.5642;RBI=0.0206735;REFB=0;REVB=0.0202104;RO=0;SAF=58;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.05907e-05;OID=.;OPOS=242203916;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:85:0:0:82:85:1:24:58:0:0:27:58:0:0
chr2	242572846	.	A	G	820.11	PASS	AF=0.983051;AO=59;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0378141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.824;QD=55.6006;RBI=0.0384565;REFB=0.0139369;REVB=0.00699986;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.00101771;OID=.;OPOS=242572846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:0:1:59:58:0.983051:35:24:0:0:35:23:1:0
chr2	242573211	.	T	C	318.98	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.305;QD=53.1624;RBI=0.0490053;REFB=0;REVB=-0.0218957;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000465756;OID=.;OPOS=242573211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0
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chr2	242610773	.	T	A	1592.41	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455717;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.706;QD=60.0909;RBI=0.0635913;REFB=0;REVB=0.0443517;RO=0;SAF=57;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.77656e-05;OID=.;OPOS=242610773;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:106:0:0:106:106:1:49:57:0:0:49:57:0:0
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chr2	242618050	.	A	G	283.18	PASS	AF=0.415584;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.0122997;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.256;QD=14.7108;RBI=0.0136055;REFB=-0.00879165;REVB=0.00581618;RO=43;SAF=11;SAR=21;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265322;STB=0.650272;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0229732;OID=.;OPOS=242618050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:43:45:32:32:0.415584:21:11:26:17:21:11:27:18
chr2	242674803	.	G	A	238.56	PASS	AF=0.628571;AO=22;DP=35;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0196905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.807;QD=27.2641;RBI=0.0402562;REFB=-0.0423552;REVB=-0.0351119;RO=13;SAF=15;SAR=7;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105714;STB=0.558684;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.023424;OID=.;OPOS=242674803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:13:13:22:22:0.628571:7:15:7:6:7:15:7:6
chr2	242680430	.	A	G	195.89	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0092921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.236;QD=25.2764;RBI=0.0119073;REFB=0.00138787;REVB=0.00744579;RO=12;SAF=8;SAR=11;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556201;STB=0.531002;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=-0.000767228;OID=.;OPOS=242680430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:11:8:6:6:11:8:6:6
chr2	242684132	.	C	T	435.69	PASS	AF=0.468085;AO=44;DP=94;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=16;FWDB=-0.020207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.029;QD=18.54;RBI=0.0274937;REFB=-0.0284256;REVB=0.0186436;RO=50;SAF=30;SAR=14;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00199628;STB=0.501113;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0296138;OID=.;OPOS=242684132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:50:50:44:44:0.468085:14:30:34:16:14:30:34:16
chr2	242716380	.	A	T	56.18	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0129394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.683;QD=11.2362;RBI=0.0416506;REFB=-0.032365;REVB=-0.0395897;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930819;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0556453;OID=.;OPOS=242716380;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:10:12:8:8:0.4:4:4:6:4:4:4:6:6
chr2	242758179	.	C	T	192.84	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0349671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.47;QD=14.8342;RBI=0.0520848;REFB=-0.0116623;REVB=0.0386022;RO=30;SAF=8;SAR=14;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074053;STB=0.542396;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0137249;OID=.;OPOS=242758179;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:14:8:13:17:14:8:13:17
chr2	242758203	.	T	C	220.85	PASS	AF=0.411765;AO=16;DP=50;FAO=21;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00452513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.619;QD=17.3215;RBI=0.0179883;REFB=-0.0296671;REVB=0.0174098;RO=27;SAF=10;SAR=6;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194495;STB=0.517911;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.023243;OID=.;OPOS=242758203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:27:27:16:21:0.411765:6:10:12:15:11:10:12:15
chr2	242758326	.	G	A	283.09	PASS	AF=0.485294;AO=28;DP=72;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.09214;FXX=0.0684838;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.842;QD=16.6522;RBI=0.0921884;REFB=-0.0154578;REVB=-0.00298724;RO=33;SAF=13;SAR=15;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12803;STB=0.603114;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0150364;OID=.;OPOS=242758326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:68:33:35:28:33:0.485294:15:13:11:22:15:18:12:23
chr2	242813124	.	T	C	613.24	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0268229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0927;QD=61.3242;RBI=0.0836314;REFB=0;REVB=0.0792132;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000438292;OID=.;OPOS=242813124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr2	242814027	.	C	T	178.22	PASS	AF=0.395833;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=0.0165976;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=275.276;QD=14.8515;RBI=0.0185201;REFB=-0.00914562;REVB=0.0082166;RO=29;SAF=5;SAR=14;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795883;STB=0.545677;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0170367;OID=.;OPOS=242814027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:29:29:19:19:0.395833:14:5:6:23:14:5:6:23
chr2	242814283	.	C	T	352.45	PASS	AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0568844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8287;QD=18.55;RBI=0.0571201;REFB=-0.0155738;REVB=-0.00518343;RO=39;SAF=28;SAR=9;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210002;STB=0.617928;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0152846;OID=.;OPOS=242814283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:39:39:37:37:0.486842:9:28:22:17:9:28:22:17
chr2	242814360	.	T	C	423.75	PASS	AF=0.525;AO=42;DP=80;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0262513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6108;QD=21.1875;RBI=0.0494102;REFB=-0.0783963;REVB=-0.0418598;RO=37;SAF=31;SAR=11;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144575;STB=0.589392;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0515072;OID=.;OPOS=242814360;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:37:38:42:42:0.525:11:31:22:15:11:31:22:16
chr2	242814463	.	A	T	455.93	PASS	AF=0.55;AO=43;DP=82;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.024479;FXX=0.0361402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1106;QD=22.7967;RBI=0.0262169;REFB=-0.0181781;REVB=0.00938638;RO=36;SAF=27;SAR=16;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014792;STB=0.51219;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0239711;OID=.;OPOS=242814463;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:80:36:36:43:44:0.55:16:27:22:14:16:28:22:14
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chr3	361508	.	C	T	257.75	PASS	AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0906031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7254;QD=19.8266;RBI=0.0914467;REFB=0.00772164;REVB=-0.0123924;RO=24;SAF=19;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151888;STB=0.57754;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.0204016;OID=.;OPOS=361508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:25:27:27:0.519231:8:19:13:11:8:19:14:11
chr3	391100	.	A	G	1619.08	PASS	AF=0.973451;AO=110;DP=114;FAO=110;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=62;FSAR=48;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0243677;FXX=0.00877116;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.815;QD=57.3126;RBI=0.0254482;REFB=-0.167983;REVB=0.00733663;RO=3;SAF=62;SAR=48;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022414;STB=0.511809;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0002882;OID=.;OPOS=391100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:114:113:3:3:110:110:0.973451:48:62:3:0:48:62:3:0
chr3	439963	.	A	G	1522.98	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0291946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.7549;QD=58.5762;RBI=0.0295623;REFB=-0.125286;REVB=0.00464828;RO=1;SAF=61;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00771574;STB=0.504064;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.000857412;OID=.;OPOS=439963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:104:1:1:103:103:0.990385:42:61:1:0:42:61:1:0
chr3	440028	.	T	C	1026.37	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.966;QD=59.4996;RBI=0.0405991;REFB=0;REVB=0.0262921;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.52297e-05;OID=.;OPOS=440028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0
chr3	450391	.	T	C	277.96	PASS	AF=0.956522;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00945269;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.365;QD=48.3413;RBI=0.0134197;REFB=-0.102457;REVB=0.00952554;RO=1;SAF=6;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0708105;STB=0.538425;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00257519;OID=.;OPOS=450391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:22:23:1:1:21:22:0.956522:15:6:1:0:16:6:1:0
chr3	450534	.	T	C	1138.88	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0400662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2853;QD=59.1624;RBI=0.0550288;REFB=-0.0784924;REVB=0.0377209;RO=1;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160369;STB=0.508472;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00842098;OID=.;OPOS=450534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:29:47:0:1:29:47:0:1
chr3	1107455	.	T	A,C	954.43	PASS	AF=0.0454545,0.954545;AO=3,62;DP=65;FAO=3,63;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=2,39;FSAR=1,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-1.6726e-05,-0.000462429;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=161.098,200.324;QD=57.8444;RBI=0.0142277,0.0204591;REFB=0,0;REVB=0.0142276,0.0204539;RO=0;SAF=2,39;SAR=1,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.75648e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0870153,-0.00251902;OID=.,.;OPOS=1107455,1107455;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:65:66:0:0:3,62:3,63:0.0454545,0.954545:1,23:2,39:0:0:1,24:2,39:0:0
chr3	1107550	.	A	T	171.66	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.135851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.802;QD=26.4097;RBI=0.136057;REFB=-0.0339931;REVB=-0.00748331;RO=9;SAF=8;SAR=9;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15699;STB=0.587057;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0154215;OID=.;OPOS=1107550;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:9:8:2:7:9:8:2:7
chr3	1262474	.	T	C	378.91	PASS	AF=0.411215;AO=44;DP=107;FAO=44;FDP=107;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.0635141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.268;QD=14.1649;RBI=0.0637186;REFB=0.00489089;REVB=0.00510137;RO=62;SAF=22;SAR=22;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016728;STB=0.504671;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=-0.00833044;OID=.;OPOS=1262474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:62:63:44:44:0.411215:22:22:30:32:22:22:31:32
chr3	1424850	.	T	G	1673.69	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.262;QD=59.7747;RBI=0.0403476;REFB=0;REVB=0.0364992;RO=0;SAF=65;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45654e-05;OID=.;OPOS=1424850;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:112:0:0:104:112:1:39:65:0:0:41:71:0:0
chr3	3067791	.	A	G	461.37	PASS	AF=0.469388;AO=46;DP=98;FAO=46;FDP=98;FR=.;FRO=52;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=0.00322684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.941;QD=18.8312;RBI=0.0398572;REFB=-0.00539663;REVB=0.0397264;RO=51;SAF=24;SAR=22;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818928;STB=0.549979;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.00719533;OID=.;OPOS=3067791;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:51:52:46:46:0.469388:22:24:31:20:22:24:32:20
chr3	3081750	.	A	T	2771.32	PASS	AF=1;AO=177;DP=177;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=112;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7416;QD=62.6286;RBI=0.0141267;REFB=0;REVB=-0.00728205;RO=0;SAF=112;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.3585e-06;OID=.;OPOS=3081750;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:177:177:0:0:177:177:1:65:112:0:0:65:112:0:0
chr3	3081825	.	T	C	2980.19	PASS	AF=1;AO=188;DP=188;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.897;QD=63.4083;RBI=0.063255;REFB=0;REVB=0.0619208;RO=0;SAF=101;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.23035e-05;OID=.;OPOS=3081825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:188:188:0:0:188:188:1:87:101:0:0:87:101:0:0
chr3	3098041	.	G	C	1573.11	PASS	AF=0.990654;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0231184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.0942;QD=58.8078;RBI=0.0449012;REFB=-0.0237543;REVB=-0.0384923;RO=1;SAF=64;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111654;STB=0.505881;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=8.23701e-05;OID=.;OPOS=3098041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:107:107:1:1:106:106:0.990654:42:64:0:1:42:64:0:1
chr3	3099460	.	T	C	188.88	PASS	AF=0.352941;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0420669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.003;QD=11.1104;RBI=0.0437495;REFB=-0.0148244;REVB=0.0120163;RO=43;SAF=7;SAR=17;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279956;STB=0.670337;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0156939;OID=.;OPOS=3099460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:43:44:24:24:0.352941:17:7:23:20:17:7:24:20
chr3	3115478	.	T	C	937.59	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.987;QD=58.5993;RBI=0.0285554;REFB=0;REVB=0.00758725;RO=0;SAF=40;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.15213e-05;OID=.;OPOS=3115478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:24:40:0:0:24:40:0:0
chr3	3115482	.	T	A	373.6	PASS	AF=0.578125;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00177702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.305;QD=23.35;RBI=0.00186046;REFB=-0.00714927;REVB=-0.00055092;RO=27;SAF=23;SAR=14;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00653924;STB=0.503595;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.00487445;OID=.;OPOS=3115482;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:27:27:37:37:0.578125:14:23:17:10:14:23:17:10
chr3	3115514	.	C	A	661.76	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0086091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.107;QD=60.1598;RBI=0.0271766;REFB=-0.0959718;REVB=0.025777;RO=0;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018483;OID=.;OPOS=3115514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:43:44:0:0:43:44:1:13:30:0:0:14:30:0:0
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chr3	3887876	.	T	C	138.12	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.00356545;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.588;QD=17.8214;RBI=0.00585618;REFB=0.0195824;REVB=0.00464569;RO=16;SAF=7;SAR=8;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200709;STB=0.613893;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-0.0109864;OID=.;OPOS=3887876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:31:16:16:15:15:0.483871:8:7:4:12:8:7:4:12
chr3	3889222	.	G	T	254.01	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=3.62734e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.758;QD=50.802;RBI=0.0334733;REFB=0;REVB=0.0334733;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207581;OID=.;OPOS=3889222;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:19:20:1:12:7:0:0:13:7:0:0
chr3	4403837	.	A	G	70.78	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=6;FWDB=-0.00349885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.908;QD=7.25972;RBI=0.0258873;REFB=-0.0108886;REVB=0.0256498;RO=29;SAF=5;SAR=5;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360975;STB=0.717595;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0233018;OID=.;OPOS=4403837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:5:5:23:6:5:5:23:6
chr3	4712413	.	G	A	210.81	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00189298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.333;QD=14.0542;RBI=0.0071756;REFB=-0.0246495;REVB=0.0069214;RO=32;SAF=19;SAR=6;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128896;STB=0.612806;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0272858;OID=.;OPOS=4712413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:32:35:25:25:0.416667:6:19:21:11:6:19:21:14
chr3	4716811	.	A	C	266.95	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0271537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.622;QD=20.1471;RBI=0.0315043;REFB=-0.0115557;REVB=0.0159749;RO=25;SAF=12;SAR=16;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00985787;STB=0.505491;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.00820829;OID=.;OPOS=4716811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:16:12:11:14:16:12:11:14
chr3	4738837	.	A	G	174.98	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00730738;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=88.4012;QD=19.9974;RBI=0.0240726;REFB=-0.0229676;REVB=0.0229367;RO=16;SAF=12;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147069;STB=0.571347;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0189799;OID=.;OPOS=4738837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:17:18:18:0.514286:6:12:8:8:6:12:9:8
chr3	4767262	.	T	C	321.32	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.0193984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.801;QD=18.9014;RBI=0.0196081;REFB=0.00214039;REVB=-0.00285966;RO=33;SAF=18;SAR=16;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150821;STB=0.574388;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=-0.00162627;OID=.;OPOS=4767262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:33:34:34:34:0.5:16:18:23:10:16:18:23:11
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chr3	4842231	.	C	T	603.77	PASS	AF=0.484375;AO=62;DP=128;FAO=62;FDP=128;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=0.00331008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.488;QD=18.8677;RBI=0.00687661;REFB=-0.0113483;REVB=-0.00602753;RO=65;SAF=30;SAR=32;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930722;STB=0.547269;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0128835;OID=.;OPOS=4842231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:65:66:62:62:0.484375:32:30:38:27:32:30:38:28
chr3	4856180	.	T	C	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7955;QD=62.0216;RBI=0.0316719;REFB=0;REVB=0.027514;RO=0;SAF=30;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000444664;OID=.;OPOS=4856180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:12:30:0:0:12:30:0:0
chr3	4856234	.	G	A	223.31	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00217852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.845;QD=49.6252;RBI=0.018204;REFB=0;REVB=0.0180732;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.19732e-05;OID=.;OPOS=4856234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:5:12:0:0:5:13:0:0
chr3	4920353	.	A	AC	106.74	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=45;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.131922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.6992;QD=9.70343;RBI=0.13208;REFB=-0.0273153;REVB=-0.0064569;RO=24;SAF=11;SAR=8;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0777901;STB=0.593134;STBP=0.237;TYPE=ins;VARB=-0.021988;OID=.;OPOS=4920354;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:19:45:22:44:22:14:8:10:12:99:24:11:8:12:12
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chr3	5244678	.	G	A	648.38	PASS	AF=0.567568;AO=63;DP=111;FAO=63;FDP=111;FR=.;FRO=48;FSAF=41;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.00543632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.931;QD=23.3651;RBI=0.0128088;REFB=0.000120457;REVB=0.0115979;RO=48;SAF=41;SAR=22;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138856;STB=0.507583;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=-9.12604e-05;OID=.;OPOS=5244678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:48:48:63:63:0.567568:22:41:32:16:22:41:32:16
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chr3	8701430	.	T	C	186.74	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0120966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.444;QD=19.6568;RBI=0.0234819;REFB=-0.0397846;REVB=0.0201264;RO=18;SAF=10;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736315;STB=0.553018;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0359452;OID=.;OPOS=8701430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:19:19:19:0.5:9:10:11:7:9:10:12:7
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chr3	9781169	.	C	T	294.38	PASS	AF=0.4125;AO=32;DP=79;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=-0.0128482;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.938;QD=14.7191;RBI=0.0206844;REFB=-0.018933;REVB=0.01621;RO=45;SAF=14;SAR=18;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18859;STB=0.623807;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0270161;OID=.;OPOS=9781169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:45:47:32:33:0.4125:18:14:28:17:19:14:30:17
chr3	9798773	.	C	G	680.05	PASS	AF=0.961538;AO=49;DP=51;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00828848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.648;QD=52.3114;RBI=0.00829578;REFB=-0.0282756;REVB=-0.000347988;RO=2;SAF=26;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348301;STB=0.51785;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=7.12843e-05;OID=.;OPOS=9798773;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:51:52:2:2:49:50:0.961538:23:26:2:0:23:27:2:0
chr3	9870869	.	C	T	205.16	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00313837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.21;QD=15.7819;RBI=0.0155982;REFB=-0.0106528;REVB=-0.0152792;RO=29;SAF=11;SAR=12;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719429;STB=0.540866;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0144812;OID=.;OPOS=9870869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:12:11:16:13:12:11:16:13
chr3	9908749	.	G	C	1400.68	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00886627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1181;QD=61.5683;RBI=0.0870237;REFB=-0.0826302;REVB=0.0865708;RO=1;SAF=45;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104166;STB=0.505493;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00171966;OID=.;OPOS=9908749;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:45:45:0:1:45:45:0:1
chr3	9934605	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.188;QD=51.9161;RBI=0.0849354;REFB=0;REVB=0.0826248;RO=0;SAF=18;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365671;OID=.;OPOS=9934605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:3:18:0:0:3:18:0:0
chr3	9970031	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00490621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.5175;QD=49.5992;RBI=0.00957333;REFB=0;REVB=0.00822057;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000391169;OID=.;OPOS=9970031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr3	9975247	.	C	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=338.187;QD=33.4285;RBI=0.0405332;REFB=0;REVB=-0.0391755;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156097;OID=.;OPOS=9975247;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr3	9976159	.	A	G	950.03	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.775;QD=58.4632;RBI=0.0202221;REFB=0;REVB=0.0163263;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.53126e-05;OID=.;OPOS=9976159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:30:34:0:0:31:34:0:0
chr3	9979713	.	C	G	131.45	PASS	AF=0.394737;AO=16;DP=39;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0187979;FXX=0.0256345;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.3844;QD=13.8369;RBI=0.0233516;REFB=0.00500931;REVB=-0.0138541;RO=22;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285167;STB=0.636506;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.0131617;OID=.;OPOS=9979713;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:22:23:16:15:0.394737:7:9:6:16:7:8:7:16
chr3	9987417	.	TAAAAG	TAAAAA,TAAAAAG,TAAAAGA,TAAAG	36.13	PASS	AF=0,0.16,0.16,0;AO=2,4,4,3;DP=27;FAO=0,4,4,0;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=0,3,3,0;FSAR=0,1,1,0;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00946202,-0.0568593,-0.101237,0.0565784;FXX=0.0740466;HRUN=1,4,0,4;LEN=1,1,1,1;MLLD=253.568,11.2473,25.1359,17.4925;QD=5.78028;RBI=0.0160417,0.126985,0.101825,0.132858;REFB=-0.00761462,-0.113568,-0.0235849,0.12456;REVB=-0.012954,0.113544,-0.0109296,-0.120209;RO=13;SAF=0,4,3,0;SAR=2,0,1,3;SRF=4;SRR=9;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.490041,0.736642,0.464525,-0.576447;STB=0.5,0.798631,0.798631,0.5;STBP=1,0.247,0.247,1;TYPE=snp,ins,ins,del;VARB=0,0.190106,0.0472928,0;OID=.,.,.,.;OPOS=9987422,9987418,9987423,9987418;OREF=G,-,-,A;OALT=A,A,A,-;OMAPALT=TAAAAA,TAAAAAG,TAAAAGA,TAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0.16,0.16,0:2,4,4,3:27:0,4,4,0:25:17:0,3,3,0:0,1,1,0:6:11:25:13:0,4,3,0:2,0,1,3:4:9
chr3	9991388	.	G	C	1301.97	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0032501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1393;QD=61.9987;RBI=0.0200853;REFB=0;REVB=0.0198206;RO=0;SAF=48;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.72473e-05;OID=.;OPOS=9991388;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:36:48:0:0:36:48:0:0
chr3	10088266	.	G	T	72.08	PASS	AF=0.159091;AO=13;DP=87;FAO=14;FDP=88;FR=.;FRO=74;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=-0.00193989;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.297;QD=3.27639;RBI=0.00957018;REFB=-0.000830139;REVB=0.00937151;RO=69;SAF=10;SAR=3;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370462;STB=0.761437;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00339427;OID=.;OPOS=10088266;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:87:88:69:74:13:14:0.159091:3:10:33:36:3:11:36:38
chr3	10088299	.	C	T	81.13	PASS	AF=0.159574;AO=15;DP=94;FAO=15;FDP=94;FR=.;FRO=79;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=0.00304607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.289;QD=3.45225;RBI=0.00311775;REFB=-0.00894475;REVB=0.000664698;RO=79;SAF=12;SAR=3;SRF=40;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388297;STB=0.763265;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0232026;OID=.;OPOS=10088299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:94:94:79:79:15:15:0.159574:3:12:40:39:3:12:40:39
chr3	10088308	.	T	C	74.35	PASS	AF=0.155556;AO=14;DP=91;FAO=14;FDP=90;FR=.;FRO=76;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=0.0143333;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.962;QD=3.3045;RBI=0.0154134;REFB=0.00215226;REVB=-0.00566808;RO=77;SAF=11;SAR=3;SRF=37;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391019;STB=0.769963;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.00681362;OID=.;OPOS=10088308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:91:90:77:76:14:14:0.155556:3:11:37:40:3:11:36:40
chr3	10088343	.	A	G	58.61	PASS	AF=0.157143;AO=11;DP=70;FAO=11;FDP=70;FR=.;FRO=59;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0454648;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.663;QD=3.3494;RBI=0.0473184;REFB=-0.00206402;REVB=-0.0131143;RO=59;SAF=8;SAR=3;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315722;STB=0.715393;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0124787;OID=.;OPOS=10088343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:70:70:59:59:11:11:0.157143:3:8:28:31:3:8:28:31
chr3	10089723	.	G	A	140.68	PASS	AF=0.307692;AO=19;DP=64;FAO=20;FDP=65;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0625317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.882;QD=8.65704;RBI=0.0635455;REFB=-0.0102131;REVB=-0.0113059;RO=44;SAF=8;SAR=11;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398814;STB=0.511616;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0214114;OID=.;OPOS=10089723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:44:45:19:20:0.307692:11:8:20:24:11:9:21:24
chr3	10089738	.	A	G	108.64	PASS	AF=0.262295;AO=16;DP=61;FAO=16;FDP=61;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0375267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0107;QD=7.12358;RBI=0.0523303;REFB=-0.022392;REVB=0.036472;RO=43;SAF=7;SAR=9;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333903;STB=0.538096;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0370261;OID=.;OPOS=10089738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:43:45:16:16:0.262295:9:7:20:23:9:7:22:23
chr3	10183274	.	C	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0429225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5175;QD=37.4882;RBI=0.0429999;REFB=0;REVB=-0.00257889;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00324306;OID=.;OPOS=10183274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
chr3	10188339	.	TTAAAAAG	TAAAAG,TAAAG,TTAAAAG,TTAAAAGA,TTAAAG	164.84	PASS	AF=0.807692,0,0,0,0;AO=6,4,5,2,3;DP=25;FAO=21,0,0,0,0;FDP=26;FR=.;FRO=5;FSAF=6,0,0,0,0;FSAR=15,0,0,0,0;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00334175,-1.73686e-05,0.00958707,-0.219286,0.0044615;FXX=0;HRUN=5,5,5,5,5;LEN=2,3,1,2,2;MLLD=26.7221,24.4,14.2929,16.587,14.5893;QD=25.3607;RBI=0.00840217,0.0444626,0.208409,0.241352,0.113428;REFB=-0.0450797,-0.0296279,-0.0472157,0.0442065,-0.0264314;REVB=-0.00770903,-0.0444626,-0.208188,-0.10082,-0.113341;RO=4;SAF=3,0,0,2,0;SAR=3,4,5,0,3;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.344363,-0.794086,-0.804028,0,-0.782218;STB=0.609646,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=0.042,1,1,1,1;TYPE=del,del,del,mnp,del;VARB=0.00806171,0.068061,0,0,0.0905332;OID=.,.,.,.,.;OPOS=10188340,10188340,10188341,10188345,10188341;OREF=TA,TAA,A,AG,AA;OALT=-,-,-,GA,-;OMAPALT=TAAAAG,TAAAG,TTAAAAG,TTAAAAGA,TTAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.807692,0,0,0,0:6,4,5,2,3:25:21,0,0,0,0:26:5:6,0,0,0,0:15,0,0,0,0:4:1:28:4:3,0,0,2,0:3,4,5,0,3:4:0
chr3	10276163	.	T	A	1259.82	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.346;QD=60.7143;RBI=0.022934;REFB=0;REVB=0.0118184;RO=0;SAF=30;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000751729;OID=.;OPOS=10276163;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:77:83:0:0:77:83:1:47:30:0:0:52:31:0:0
chr3	10291216	.	CTTC	CTC,CTCG	63.54	PASS	AF=0.296296,0.0740741;AO=8,2;DP=29;FAO=8,2;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=7,2;FSAR=1,0;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.00790166,-0.0270216;FXX=0.0689417;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=21.4668,123.453;QD=9.4136;RBI=0.06787,0.032628;REFB=-0.0337033,-0.00383354;REVB=-0.0674084,-0.0182871;RO=16;SAF=7,2;SAR=1,0;SRF=4;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.644352,0.656611;STB=0.89818,0.996849;STBP=0.016,0.038;TYPE=del,mnp;VARB=0.0202961,0.124652;OID=.,.;OPOS=10291217,10291218;OREF=T,TC;OALT=-,CG;OMAPALT=CTC,CTCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.296296,0.0740741:8,2:29:8,2:27:17:7,2:1,0:4:13:52:16:7,2:1,0:4:12
chr3	10302172	.	G	A	100.75	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0451998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.21;QD=16.1192;RBI=0.045489;REFB=-0.00991806;REVB=0.00512086;RO=13;SAF=9;SAR=3;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403987;STB=0.734295;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0182805;OID=.;OPOS=10302172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:3:9:4:9:3:9:4:9
chr3	10368948	.	G	A	290.28	PASS	AF=0.33945;AO=37;DP=111;FAO=37;FDP=109;FR=.;FRO=72;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=47;FSRR=25;FWDB=-0.0142619;FXX=0.0180164;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.641;QD=10.6526;RBI=0.0167212;REFB=-0.0147802;REVB=0.00872906;RO=69;SAF=23;SAR=14;SRF=46;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550706;STB=0.522098;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0297774;OID=.;OPOS=10368948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:109:69:72:37:37:0.33945:14:23:46:23:14:23:47:25
chr3	10379923	.	C	T	2153.86	PASS	AF=0.978873;AO=139;DP=142;FAO=139;FDP=142;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=70;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0373602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.698;QD=60.672;RBI=0.0643785;REFB=-0.116264;REVB=0.0524291;RO=1;SAF=69;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00684088;STB=0.510637;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.000450599;OID=.;OPOS=10379923;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:142:142:1:3:139:139:0.978873:70:69:1:0:70:69:3:0
chr3	10413601	.	G	A	723.14	PASS	AF=0.479167;AO=65;DP=142;FAO=69;FDP=144;FR=.,HEALED;FRO=70;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=0.0342683;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2153;QD=20.0871;RBI=0.0376838;REFB=-0.021206;REVB=0.0156767;RO=48;SAF=30;SAR=35;SRF=38;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254181;STB=0.554564;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0190202;OID=.;OPOS=10413601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:144:48:70:65:69:0.479167:35:30:38:10:39:30:38:32
chr3	10413715	.	G	A	179.42	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.00582729;FXX=0.0540395;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.597;QD=20.5047;RBI=0.00715025;REFB=-0.00513719;REVB=-0.00414353;RO=16;SAF=6;SAR=12;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0939211;STB=0.571347;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00508652;OID=.;OPOS=10413715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:16:17:18:18:0.514286:12:6:7:9:12:6:8:9
chr3	10420087	.	T	C	990.31	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.119;QD=59.123;RBI=0.0451798;REFB=0;REVB=0.0387163;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148109;OID=.;OPOS=10420087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:27:40:0:0:27:40:0:0
chr3	10885920	.	T	C	587.76	PASS	AF=0.439716;AO=62;DP=140;FAO=62;FDP=141;FR=.;FRO=79;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=33;FWDB=-0.00538111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.017;QD=16.674;RBI=0.0292169;REFB=-0.0136418;REVB=-0.028717;RO=78;SAF=34;SAR=28;SRF=46;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419084;STB=0.519233;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0196803;OID=.;OPOS=10885920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:141:78:79:62:62:0.439716:28:34:46:32:28:34:46:33
chr3	11302884	.	G	A	99.95	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00568978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.183;QD=15.3766;RBI=0.0112771;REFB=-0.00678082;REVB=-0.00973654;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103751;STB=0.576798;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.014213;OID=.;OPOS=11302884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:26:13:14:12:12:0.461538:6:6:8:5:6:6:9:5
chr3	11302933	.	A	G	483.17	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00931608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5972;QD=58.5656;RBI=0.10321;REFB=0;REVB=0.102789;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000528856;OID=.;OPOS=11302933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr3	11303874	.	T	C	1476.02	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224793;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.044;QD=63.4849;RBI=0.0224895;REFB=0;REVB=0.000679561;RO=0;SAF=45;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000334675;OID=.;OPOS=11303874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:48:45:0:0:48:45:0:0
chr3	11596348	.	C	T	197.43	PASS	AF=0.245902;AO=30;DP=122;FAO=30;FDP=122;FR=.;FRO=92;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=60;FSRR=32;FWDB=0.0268273;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.564;QD=6.47297;RBI=0.0302157;REFB=-0.00445881;REVB=0.0139026;RO=82;SAF=9;SAR=21;SRF=51;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385037;STB=0.752179;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0125563;OID=.;OPOS=11596348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:82:92:30:30:0.245902:21:9:51:31:21:9:60:32
chr3	11643465	.	T	C	789.33	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000719951;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.776;QD=64.4349;RBI=0.0505697;REFB=0;REVB=0.0505646;RO=0;SAF=32;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.36597e-05;OID=.;OPOS=11643465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:17:32:0:0:17:32:0:0
chr3	11734610	.	A	C	272.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9695;QD=51.9137;RBI=0.0797182;REFB=0;REVB=0.0750799;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00252043;OID=.;OPOS=11734610;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0
chr3	11848923	.	CCACT	C	112.64	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=17;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0378709;FXX=0.0526039;HRUN=3;LEN=4;MLLD=296.268;QD=25.0302;RBI=0.0383836;REFB=-0.0262423;REVB=-0.00625257;RO=5;SAF=1;SAR=9;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0.302174;SSSB=-0.327428;STB=0.687107;STBP=0.13;TYPE=del;VARB=0.0128846;OID=.;OPOS=11848924;OREF=CACT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:10:17:12:18:6:1:11:2:4:36:5:1:9:2:3
chr3	11880760	.	T	C	213.46	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00556536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.046;QD=16.1105;RBI=0.0190237;REFB=-0.0109779;REVB=0.0181914;RO=29;SAF=11;SAR=13;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569455;STB=0.532257;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0146717;OID=.;OPOS=11880760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:13:11:15:14:13:11:15:14
chr3	11887991	.	C	G	397.6	PASS	AF=0.465909;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0103712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.377;QD=18.0726;RBI=0.0256773;REFB=-0.0112161;REVB=-0.0234896;RO=44;SAF=18;SAR=23;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014611;STB=0.504214;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0138082;OID=.;OPOS=11887991;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:44:47:41:41:0.465909:23:18:20:24:23:18:21:26
chr3	11994493	.	C	T	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0341993;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=327.874;QD=7.76205;RBI=0.0382849;REFB=-0.00802897;REVB=0.0172088;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298785;STB=0.683679;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0146497;OID=.;OPOS=11994493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:3:3:10:3:3:3:10:3
chr3	12229015	.	A	G	748.7	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1162;QD=56.5054;RBI=0.0183189;REFB=0;REVB=-0.00681713;RO=0;SAF=5;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57138e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000776082;OID=.;OPOS=12229015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:46:5:0:0:48:5:0:0
chr3	12232074	.	A	G	833.82	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257;QD=57.5045;RBI=0.0432907;REFB=0;REVB=0.000111393;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90475e-05;OID=.;OPOS=12232074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:28:29:0:0:29:29:0:0
chr3	12475557	.	C	T	55.41	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0112817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.105;QD=10.0745;RBI=0.0187909;REFB=-0.0081514;REVB=0.0150273;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386833;STB=0.74415;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00992438;OID=.;OPOS=12475557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:13:14:8:8:0.363636:5:3:10:3:5:3:11:3
chr3	12552628	.	A	C	218.2	PASS	AF=0.44;AO=20;DP=48;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0152937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.957;QD=17.4562;RBI=0.0201071;REFB=-0.010452;REVB=-0.0130537;RO=28;SAF=19;SAR=1;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.580092;STB=0.855103;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0130849;OID=.;OPOS=12552628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:50:28:28:20:22:0.44:1:19:18:10:1:21:18:10
chr3	12574142	.	T	C	37.44	PASS	AF=0.0846154;AO=11;DP=112;FAO=11;FDP=130;FR=.;FRO=119;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=81;FSRR=38;FWDB=-0.00266219;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=172.785;QD=1.15199;RBI=0.00513815;REFB=-0.00144283;REVB=-0.00439468;RO=97;SAF=3;SAR=8;SRF=80;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.614266;STB=0.829147;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0158395;OID=.;OPOS=12574142;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:112:130:97:119:11:11:0.0846154:8:3:80:17:8:3:81:38
chr3	12581734	.	G	C	184.92	PASS	AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.00983028;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.102;QD=12.1261;RBI=0.0513904;REFB=-0.0247897;REVB=-0.0504414;RO=38;SAF=17;SAR=6;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279973;STB=0.662876;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0366736;OID=.;OPOS=12581734;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:6:17:19:19:6:17:19:19
chr3	12598701	.	C	T	518.08	PASS	AF=0.523364;AO=48;DP=98;FAO=56;FDP=107;FR=.;FRO=51;FSAF=37;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.0125848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.54;QD=19.3675;RBI=0.0164673;REFB=-0.0495655;REVB=0.0106204;RO=48;SAF=32;SAR=16;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619044;STB=0.537582;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0274193;OID=.;OPOS=12598701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:107:48:51:48:56:0.523364:16:32:29:19:19:37:30:21
chr3	12613866	.	T	C	250.23	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0365667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.999;QD=20.0182;RBI=0.0479937;REFB=-0.00836145;REVB=-0.0310849;RO=25;SAF=8;SAR=16;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104174;STB=0.550681;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0175453;OID=.;OPOS=12613866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:26:24:24:0.48:16:8:11:14:16:8:11:15
chr3	12645007	.	C	T	35.2	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0526825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.755;QD=5.21555;RBI=0.0605847;REFB=-0.00455026;REVB=-0.0299176;RO=21;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257094;STB=0.666173;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0154792;OID=.;OPOS=12645007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:3:3:6:15:3:3:6:15
chr3	12810755	.	G	C	629.76	PASS	AF=0.451389;AO=65;DP=144;FAO=65;FDP=144;FR=.;FRO=79;FSAF=20;FSAR=45;FSRF=23;FSRR=56;FWDB=-0.0500928;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.9538;QD=17.4932;RBI=0.0618584;REFB=-0.0100068;REVB=-0.0362929;RO=79;SAF=20;SAR=45;SRF=24;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00451481;STB=0.510743;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0107462;OID=.;OPOS=12810755;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:79:79:65:65:0.451389:45:20:24:55:45:20:23:56
chr3	12838293	.	G	C	489.88	PASS	AF=0.597403;AO=42;DP=73;FAO=46;FDP=77;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=0.0281164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8532;QD=25.4483;RBI=0.0333528;REFB=-0.0488482;REVB=0.0179408;RO=30;SAF=23;SAR=19;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19861;STB=0.601374;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0359415;OID=.;OPOS=12838293;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:77:30:31:42:46:0.597403:19:23:24:6:20:26:25:6
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chr3	12875443	.	G	A	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0164459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.969;QD=12.6375;RBI=0.0171715;REFB=0.00897863;REVB=0.00493891;RO=21;SAF=9;SAR=4;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274105;STB=0.516105;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=-0.00836059;OID=.;OPOS=12875443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:4:9:15:6:4:9:15:6
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chr3	13361391	.	A	G	1511.94	PASS	AF=0.971963;AO=102;DP=105;FAO=104;FDP=107;FR=.;FRO=3;FSAF=61;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00886871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.609;QD=56.521;RBI=0.0254798;REFB=-0.0505408;REVB=0.0238865;RO=3;SAF=60;SAR=42;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00438949;STB=0.502317;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.00149528;OID=.;OPOS=13361391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:105:107:3:3:102:104:0.971963:42:60:2:1:43:61:2:1
chr3	13364837	.	G	A	351.88	PASS	AF=0.422222;AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=-0.0191225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.29;QD=15.6391;RBI=0.0192202;REFB=-0.0186498;REVB=-0.00193561;RO=52;SAF=14;SAR=24;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287819;STB=0.661985;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0159559;OID=.;OPOS=13364837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:52:52:38:38:0.422222:24:14:34:18:24:14:34:18
chr3	13364876	.	G	T	528.95	PASS	AF=0.531915;AO=50;DP=94;FAO=50;FDP=94;FR=.;FRO=44;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.012798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1743;QD=22.5084;RBI=0.0769426;REFB=-0.0488437;REVB=0.0758708;RO=44;SAF=33;SAR=17;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200302;STB=0.610527;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0415511;OID=.;OPOS=13364876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:44:44:50:50:0.531915:17:33:19:25:17:33:19:25
chr3	13367406	.	C	T	380.62	PASS	AF=0.444444;AO=40;DP=90;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.00745414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.063;QD=16.9166;RBI=0.00822572;REFB=-0.0261997;REVB=0.00347826;RO=49;SAF=27;SAR=13;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131123;STB=0.569241;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0390177;OID=.;OPOS=13367406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:49:50:40:40:0.444444:13:27:27:22:13:27:28:22
chr3	13368892	.	G	A	449.9	PASS	AF=0.478723;AO=45;DP=94;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=0.00494708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.003;QD=19.1445;RBI=0.0308022;REFB=-0.0054017;REVB=0.0304023;RO=48;SAF=18;SAR=27;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0556615;STB=0.526304;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0101757;OID=.;OPOS=13368892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:48:49:45:45:0.478723:27:18:22:26:27:18:22:27
chr3	13379400	.	C	T	91.1	PASS	AF=0.272727;AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=0.058101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1796;QD=8.28169;RBI=0.0807088;REFB=0.0140761;REVB=0.0560195;RO=32;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384109;STB=0.729888;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.0307347;OID=.;OPOS=13379400;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:44:44:32:32:12:12:0.272727:5:7:8:24:5:7:8:24
chr3	13383540	.	A	G	290.01	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0196609;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.437;QD=16.3388;RBI=0.0310608;REFB=-0.0122079;REVB=-0.0240463;RO=38;SAF=22;SAR=10;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115553;STB=0.57442;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0158026;OID=.;OPOS=13383540;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:38:39:32:32:0.450704:10:22:22:16:10:22:22:17
chr3	13395475	.	G	C	247.51	PASS	AF=0.348837;AO=30;DP=86;FAO=30;FDP=86;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=45;FSRR=11;FWDB=-0.00860067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2175;QD=11.5122;RBI=0.0946486;REFB=-0.0147482;REVB=0.094257;RO=56;SAF=14;SAR=16;SRF=45;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37814;STB=0.71395;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0292786;OID=.;OPOS=13395475;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:56:56:30:30:0.348837:16:14:45:11:16:14:45:11
chr3	13395579	.	C	A	152.89	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=9;FWDB=-0.00393188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9166;QD=10.3654;RBI=0.0169562;REFB=0.000455504;REVB=-0.016494;RO=37;SAF=7;SAR=13;SRF=30;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.480912;STB=0.757257;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.000501681;OID=.;OPOS=13395579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:37:39:20:20:0.338983:13:7:30:7:13:7:30:9
chr3	13407556	.	T	C	538.91	PASS	AF=0.514019;AO=54;DP=107;FAO=55;FDP=107;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=17;FSRR=35;FWDB=-0.0257258;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.996;QD=20.1462;RBI=0.0350324;REFB=-0.0248463;REVB=0.0237792;RO=52;SAF=14;SAR=40;SRF=17;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748914;STB=0.544309;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0190467;OID=.;OPOS=13407556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:52:52:54:55:0.514019:40:14:17:35:41:14:17:35
chr3	13421150	.	C	T	323.98	PASS	AF=0.460526;AO=33;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0306573;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.617;QD=17.0514;RBI=0.0349333;REFB=-0.0112501;REVB=0.0167472;RO=40;SAF=16;SAR=17;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111998;STB=0.553608;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0237245;OID=.;OPOS=13421150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:40:41:33:35:0.460526:17:16:24:16:18:17:24:17
chr3	13611850	.	T	C	232.37	PASS	AF=0.378378;AO=28;DP=74;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0183937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.718;QD=12.5604;RBI=0.0186401;REFB=-0.00723873;REVB=0.00302098;RO=45;SAF=18;SAR=10;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741283;STB=0.53701;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0136834;OID=.;OPOS=13611850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:45:46:28:28:0.378378:10:18:26:19:10:18:27:19
chr3	13612020	.	T	C	781.08	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.717;QD=56.806;RBI=0.0440907;REFB=0;REVB=0.0333536;RO=0;SAF=37;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85968e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.18415e-05;OID=.;OPOS=13612020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:18:37:0:0:18:37:0:0
chr3	13612296	.	C	T	176.65	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.0105659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.8616;QD=14.1319;RBI=0.0195614;REFB=-0.00958774;REVB=0.0164623;RO=31;SAF=13;SAR=6;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319506;STB=0.518499;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0252234;OID=.;OPOS=13612296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:6:13:22:9:6:13:22:9
chr3	13612936	.	A	G	2004.92	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.231;QD=61.6897;RBI=0.0307934;REFB=0;REVB=0.0239259;RO=0;SAF=62;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.10992e-05;OID=.;OPOS=13612936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:121:130:0:0:121:130:1:59:62:0:0:66:64:0:0
chr3	13670481	.	A	G	712.66	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2747;QD=55.8946;RBI=0.0609479;REFB=0;REVB=0.0482532;RO=1;SAF=25;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184579;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000992287;OID=.;OPOS=13670481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:1:0:50:51:1:25:25:1:0:25:26:0:0
chr3	13670536	.	A	G	711.85	PASS	AF=1;AO=41;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.150951;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0191;QD=60.5832;RBI=0.161547;REFB=0;REVB=0.0575427;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202543;OID=.;OPOS=13670536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:41:47:1:21:20:0:0:25:22:0:0
chr3	13670776	.	T	C	419.52	PASS	AF=1;AO=10;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00327857;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.195;QD=52.4402;RBI=0.029383;REFB=0;REVB=0.0291995;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165567;OID=.;OPOS=13670776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:33:32:0:0:10:32:1:10:0:0:0:23:9:0:0
chr3	13679203	.	G	A	322.83	PASS	AF=0.421687;AO=33;DP=84;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0126524;FXX=0.0348797;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.492;QD=15.5581;RBI=0.0127388;REFB=-0.0257549;REVB=0.00148102;RO=34;SAF=10;SAR=23;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166296;STB=0.602153;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0307516;OID=.;OPOS=13679203;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:34:48:33:35:0.421687:23:10:16:18:24:11:23:25
chr3	13679335	.	C	T	290.14	PASS	AF=0.392857;AO=33;DP=85;FAO=33;FDP=84;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.0213959;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.837;QD=13.816;RBI=0.0262106;REFB=-0.0394741;REVB=0.0151397;RO=48;SAF=21;SAR=12;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103081;STB=0.543352;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0337883;OID=.;OPOS=13679335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:48:51:33:33:0.392857:12:21:26:22:12:21:29:22
chr3	13679688	.	T	A	404.82	PASS	AF=0.321212;AO=53;DP=165;FAO=53;FDP=165;FR=.;FRO=112;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=44;FSRR=68;FWDB=0.00953376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.33;QD=9.81389;RBI=0.0180377;REFB=-0.0121607;REVB=-0.0153122;RO=107;SAF=33;SAR=20;SRF=39;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293698;STB=0.653409;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0303681;OID=.;OPOS=13679688;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:107:112:53:53:0.321212:20:33:39:68:20:33:44:68
chr3	13679695	.	C	A	393.69	PASS	AF=0.317073;AO=52;DP=164;FAO=52;FDP=164;FR=.;FRO=112;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=44;FSRR=68;FWDB=0.00639372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6774;QD=9.60209;RBI=0.0512334;REFB=-0.00468477;REVB=-0.0508328;RO=112;SAF=33;SAR=19;SRF=44;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28105;STB=0.662375;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0114416;OID=.;OPOS=13679695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:164:112:112:52:52:0.317073:19:33:44:68:19:33:44:68
chr3	13679708	.	C	A	383.95	PASS	AF=0.314815;AO=52;DP=161;FAO=51;FDP=162;FR=.;FRO=111;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=68;FWDB=-0.0294262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5483;QD=9.48033;RBI=0.0296322;REFB=0.00368365;REVB=0.00348801;RO=109;SAF=32;SAR=20;SRF=42;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26533;STB=0.648232;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.00993396;OID=.;OPOS=13679708;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:162:109:111:52:51:0.314815:20:32:42:67:20:31:43:68
chr3	13833957	.	C	T	666.03	PASS	AF=0.536585;AO=62;DP=119;FAO=66;FDP=123;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.106228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.0412;QD=21.6595;RBI=0.106558;REFB=-0.0285939;REVB=-0.00837367;RO=57;SAF=24;SAR=38;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149951;STB=0.502677;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0250731;OID=.;OPOS=13833957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:123:57:57:62:66:0.536585:38:24:23:34:39:27:23:34
chr3	13896140	.	A	G	1813.97	PASS	AF=1;AO=117;DP=119;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00111436;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.861;QD=61.4905;RBI=0.0274754;REFB=0;REVB=0.0274527;RO=0;SAF=63;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010829;OID=.;OPOS=13896140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:118:0:0:117:118:1:54:63:0:0:54:64:0:0
chr3	13896284	.	C	T	2541.77	PASS	AF=0.982353;AO=167;DP=171;FAO=167;FDP=170;FR=.;FRO=3;FSAF=97;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0371885;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.478;QD=59.8062;RBI=0.0400756;REFB=-0.0263104;REVB=0.0149353;RO=3;SAF=97;SAR=70;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199549;STB=0.510488;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.000123156;OID=.;OPOS=13896284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:171:170:3:3:167:167:0.982353:70:97:0:3:70:97:0:3
chr3	14106499	.	G	A	183.85	PASS	AF=0.403509;AO=21;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.00215481;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.238;QD=12.902;RBI=0.00560835;REFB=0.0037019;REVB=0.00517788;RO=34;SAF=10;SAR=11;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213394;STB=0.617149;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=-0.00387742;OID=.;OPOS=14106499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:34:34:21:23:0.403509:11:10:23:11:12:11:23:11
chr3	14123156	.	T	C	168.69	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.022006;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.698;QD=16.0653;RBI=0.0220759;REFB=-0.00837117;REVB=0.00175617;RO=24;SAF=14;SAR=4;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275604;STB=0.660183;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0145068;OID=.;OPOS=14123156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:4:14:13:11:4:14:13:11
chr3	14175262	.	T	C	819.61	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0021628;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.784;QD=56.5245;RBI=0.0509895;REFB=0;REVB=0.0509436;RO=0;SAF=41;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362253;OID=.;OPOS=14175262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:58:0:0:58:58:1:17:41:0:0:17:41:0:0
chr3	14187449	.	G	T	1172.01	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.62;QD=60.8835;RBI=0.0596823;REFB=0;REVB=0.0530726;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.63275e-05;OID=.;OPOS=14187449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:35:42:0:0:35:42:0:0
chr3	14197987	.	A	T	255.61	PASS	AF=1;AO=17;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.47;QD=51.1216;RBI=0.056607;REFB=0;REVB=0.0498819;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000731596;OID=.;OPOS=14197987;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:17:20:1:6:11:0:0:8:12:0:0
chr3	14220023	.	G	C	1120.6	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5166;QD=59.7656;RBI=0.0265695;REFB=0;REVB=0.0236405;RO=0;SAF=28;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1195e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000447821;OID=.;OPOS=14220023;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:45:28:0:0:45:30:0:0
chr3	14436184	.	GT	G	798.97	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.856;QD=56.0684;RBI=0.0391341;REFB=0;REVB=0.0139362;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00162159;OID=.;OPOS=14436185;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:55:55:57:57:0:33:24:0:0:4:0:31:24:0:0
chr3	14485484	.	C	A	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0435602;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=239.417;QD=21.8424;RBI=0.0441311;REFB=0.0179033;REVB=0.00707572;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772509;STB=0.545299;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=-0.00172306;OID=.;OPOS=14485484;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:4:2:1:1:4:2:1:1
chr3	14526667	.	C	T	57.12	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0748086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9338;QD=10.8804;RBI=0.0764204;REFB=-0.0755233;REVB=-0.0156125;RO=11;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224141;STB=0.648251;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.100792;OID=.;OPOS=14526667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:21:21:11:13:8:8:0.380952:2:6:6:5:2:6:7:6
chr3	14551444	.	A	G	429.25	PASS	AF=0.494253;AO=42;DP=86;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0144308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.2464;QD=19.7355;RBI=0.0170318;REFB=-0.00213673;REVB=0.0090461;RO=44;SAF=25;SAR=17;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109884;STB=0.565494;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.00196714;OID=.;OPOS=14551444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:44:44:42:43:0.494253:17:25:21:23:17:26:21:23
chr3	14552994	.	A	G	166.81	PASS	AF=0.486486;AO=17;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00908601;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.9195;QD=18.033;RBI=0.0344439;REFB=0.00503815;REVB=0.0332239;RO=15;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0519842;STB=0.567494;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=-0.00295094;OID=.;OPOS=14552994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:15:19:17:18:0.486486:9:8:8:7:9:9:12:7
chr3	14555216	.	T	C	191.03	PASS	AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0437756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4864;QD=13.4055;RBI=0.0608982;REFB=-0.0202592;REVB=-0.0423354;RO=34;SAF=8;SAR=15;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102807;STB=0.559105;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0189711;OID=.;OPOS=14555216;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:15:8:15:19:15:8:15:19
chr3	14555811	.	A	G	92.22	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0290369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.305;QD=18.4436;RBI=0.0375668;REFB=-0.0144757;REVB=-0.0238353;RO=8;SAF=9;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200183;STB=0.5998;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0117497;OID=.;OPOS=14555811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:8:9:11:11:0.55:2:9:5:3:2:9:6:3
chr3	14559395	.	C	T	856.55	PASS	AF=0.590909;AO=73;DP=129;FAO=78;FDP=132;FR=.;FRO=54;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0428477;FXX=0.0149243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.276;QD=25.9562;RBI=0.0445367;REFB=-0.0504633;REVB=0.0121489;RO=56;SAF=33;SAR=40;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240909;STB=0.500586;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0313828;OID=.;OPOS=14559395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:132:56:54:73:78:0.590909:40:33:27:29:42:36:25:29
chr3	14561627	.	A	AG	452.71	PASS	AF=1;AO=41;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.283287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=12.2992;QD=35.5064;RBI=0.284466;REFB=0;REVB=0.02587;RO=11;SAF=21;SAR=20;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847811;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00793515;OID=.;OPOS=14561628;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:41:52:51:51:0:28:23:0:0:9:11:21:20:8:3
chr3	14563258	.	A	G	88.51	PASS	AF=0.236364;AO=13;DP=55;FAO=13;FDP=55;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00600506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4985;QD=6.43712;RBI=0.0359743;REFB=-0.00997305;REVB=-0.0354696;RO=42;SAF=8;SAR=5;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848078;STB=0.553231;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.024013;OID=.;OPOS=14563258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:55:55:42:42:13:13:0.236364:5:8:23:19:5:8:23:19
chr3	14712473	.	G	A	706.74	PASS	AF=0.548387;AO=68;DP=125;FAO=68;FDP=124;FR=.;FRO=56;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=43;FSRR=13;FWDB=-0.0168877;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.118;QD=22.798;RBI=0.0257641;REFB=-0.00378373;REVB=-0.0194576;RO=51;SAF=39;SAR=29;SRF=38;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141356;STB=0.592106;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00357648;OID=.;OPOS=14712473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:124:51:56:68:68:0.548387:29:39:38:13:29:39:43:13
chr3	14724413	.	G	A	372.47	PASS	AF=0.464286;AO=39;DP=84;FAO=39;FDP=84;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.012644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.473;QD=17.7366;RBI=0.0204437;REFB=-0.0131715;REVB=0.0160647;RO=45;SAF=22;SAR=17;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114608;STB=0.56407;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0167603;OID=.;OPOS=14724413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:45:45:39:39:0.464286:17:22:20:25:17:22:20:25
chr3	14745857	.	G	A	48.21	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0275988;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.114;QD=12.8553;RBI=0.058994;REFB=0.00391812;REVB=-0.0521402;RO=8;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172968;STB=0.603481;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=-0.00618771;OID=.;OPOS=14745857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:4:3:5:3:4:3:5:3
chr3	14755572	.	A	G	468.08	PASS	AF=0.54878;AO=44;DP=81;FAO=45;FDP=82;FR=.;FRO=37;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0187651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.334;QD=22.8332;RBI=0.019674;REFB=-0.0107806;REVB=0.0059106;RO=36;SAF=26;SAR=18;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982863;STB=0.552215;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00982912;OID=.;OPOS=14755572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:36:37:44:45:0.54878:18:26:17:19:18:27:18:19
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chr3	15492807	.	G	A	275.43	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00193719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3288;QD=18.0608;RBI=0.0934791;REFB=-0.0358421;REVB=0.093459;RO=28;SAF=8;SAR=22;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163052;STB=0.624603;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0397728;OID=.;OPOS=15492807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:28:31:30:30:0.491803:22:8:12:16:22:8:15:16
chr3	15509327	.	C	G	299.62	PASS	AF=0.386364;AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=35;FWDB=-0.00290661;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.873;QD=13.6192;RBI=0.0119134;REFB=-0.0137668;REVB=-0.0115534;RO=50;SAF=19;SAR=15;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185754;STB=0.624929;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0197355;OID=.;OPOS=15509327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:50:54:34:34:0.386364:15:19:19:31:15:19:19:35
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chr3	15516481	.	T	C	214.1	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.00509888;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.7535;QD=14.7654;RBI=0.0279496;REFB=0.00378134;REVB=0.0274806;RO=33;SAF=14;SAR=11;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165017;STB=0.593633;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.00503725;OID=.;OPOS=15516481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:11:14:13:20:11:14:13:20
chr3	15548131	.	A	G	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0144294;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.587;QD=15.7005;RBI=0.0145187;REFB=-0.00248292;REVB=0.00160758;RO=19;SAF=11;SAR=4;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117088;STB=0.56798;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00404272;OID=.;OPOS=15548131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:4:11:12:7:4:11:12:7
chr3	15548227	.	G	A	234.89	PASS	AF=0.388889;AO=27;DP=71;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0214369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.189;QD=13.0493;RBI=0.0216211;REFB=-0.00879635;REVB=-0.00281657;RO=44;SAF=18;SAR=9;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186991;STB=0.590098;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0105278;OID=.;OPOS=15548227;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:44:44:27:28:0.388889:9:18:22:22:10:18:22:22
chr3	15643043	.	A	G	575.13	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.399;QD=60.5398;RBI=0.0589395;REFB=0;REVB=0.0514902;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250331;OID=.;OPOS=15643043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0
chr3	15643175	.	G	A	102.29	PASS	AF=0.288889;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0087984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.213;QD=9.09221;RBI=0.0110823;REFB=-0.00898589;REVB=0.00673831;RO=31;SAF=8;SAR=5;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369356;STB=0.507235;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.017438;OID=.;OPOS=15643175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:31:32:13:13:0.288889:5:8:20:11:5:8:20:12
chr3	15686776	.	T	C	428.39	PASS	AF=0.411765;AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=47;FSRR=23;FWDB=-0.0281416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.832;QD=14.3997;RBI=0.0302222;REFB=-0.0161561;REVB=0.0110198;RO=69;SAF=22;SAR=27;SRF=47;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238239;STB=0.628704;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.026892;OID=.;OPOS=15686776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:69:70:49:49:0.411765:27:22:47:22:27:22:47:23
chr3	15710011	.	T	C	35.58	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00493621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.932;QD=5.93039;RBI=0.0156525;REFB=-0.01715;REVB=0.0148538;RO=18;SAF=2;SAR=4;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311994;STB=0.70205;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0432115;OID=.;OPOS=15710011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:24:24:18:18:6:6:0.25:4:2:11:7:4:2:11:7
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chr3	15753641	.	A	G	113.53	PASS	AF=0.304348;AO=14;DP=46;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0525592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.9095;QD=9.87239;RBI=0.052851;REFB=-0.0194367;REVB=-0.00554647;RO=31;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20529;STB=0.630261;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0435479;OID=.;OPOS=15753641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:31:32:14:14:0.304348:7:7:10:21:7:7:10:22
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chr3	16261420	.	C	T	220.41	PASS	AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0259503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.074;QD=24.4899;RBI=0.0278507;REFB=-0.0268989;REVB=-0.0101116;RO=15;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191306;STB=0.606201;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0329749;OID=.;OPOS=16261420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:11:10:11:4:11:10:11:4
chr3	16268974	.	T	A	502.04	PASS	AF=0.454545;AO=53;DP=116;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=0.00770891;FXX=0.0241916;HRUN=4;LEN=1;MLLD=100.85;QD=16.5962;RBI=0.00846371;REFB=-0.00684088;REVB=-0.00349387;RO=63;SAF=19;SAR=34;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563113;STB=0.515634;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0120463;OID=.;OPOS=16268974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:121:63:66:53:55:0.454545:34:19:26:37:34:21:27:39
chr3	16268986	.	C	A	494.94	PASS	AF=0.457627;AO=51;DP=115;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=0.0092685;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.1;QD=16.7777;RBI=0.0152853;REFB=-0.0350411;REVB=-0.0121546;RO=64;SAF=20;SAR=31;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467486;STB=0.51679;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0362085;OID=.;OPOS=16268986;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:118:64:64:51:54:0.457627:31:20:28:36:32:22:28:36
chr3	16358584	.	T	C	1592.69	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228648;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.07;QD=60.1016;RBI=0.024845;REFB=0;REVB=0.00971981;RO=0;SAF=62;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.40922e-05;OID=.;OPOS=16358584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:106:0:0:106:106:1:44:62:0:0:44:62:0:0
chr3	16364919	.	A	C	1200.34	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0330979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.436;QD=58.5533;RBI=0.0835188;REFB=0.0111039;REVB=0.0766807;RO=1;SAF=65;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00722968;STB=0.507574;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=-0.000132541;OID=.;OPOS=16364919;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:1:2:80:80:0.97561:15:65:1:0:15:65:2:0
chr3	16535229	.	C	T	156.43	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00046736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.118;QD=24.0668;RBI=0.00604194;REFB=-0.014939;REVB=0.00602384;RO=10;SAF=3;SAR=13;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278322;STB=0.658006;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0082765;OID=.;OPOS=16535229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:13:3:5:5:13:3:5:5
chr3	16646745	.	C	G	519.29	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7117;QD=59.3472;RBI=0.0363139;REFB=0;REVB=0.0341571;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000494843;OID=.;OPOS=16646745;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:11:24:0:0:11:24:0:0
chr3	16926766	.	C	T	154.94	PASS	AF=0.789474;AO=15;DP=19;FAO=15;FDP=19;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0133586;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.476;QD=32.6186;RBI=0.0174383;REFB=-0.0669293;REVB=0.011209;RO=4;SAF=11;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106638;STB=0.559239;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0138974;OID=.;OPOS=16926766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:19:19:4:4:15:15:0.789474:4:11:2:2:4:11:2:2
chr3	17051450	.	C	A	34.15	PASS	AF=0.176471;AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0109944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.576;QD=4.01746;RBI=0.0359954;REFB=-0.00998912;REVB=-0.0342752;RO=28;SAF=5;SAR=1;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321534;STB=0.730831;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0677421;OID=.;OPOS=17051450;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:34:34:28:28:6:6:0.176471:1:5:17:11:1:5:17:11
chr3	17053499	.	A	G	317.54	PASS	AF=0.478873;AO=33;DP=70;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.0337086;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7177;QD=17.8895;RBI=0.0596672;REFB=-0.024862;REVB=-0.0492332;RO=37;SAF=14;SAR=19;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209395;STB=0.593208;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0265394;OID=.;OPOS=17053499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:37:37:33:34:0.478873:19:14:24:13:19:15:23:14
chr3	17741409	.	C	G	842.26	PASS	AF=1;AO=56;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381558;FXX=0.0491723;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1209;QD=58.0871;RBI=0.0534855;REFB=0;REVB=0.0374812;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000773083;OID=.;OPOS=17741409;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:56:58:1:22:34:0:0:24:34:0:0
chr3	18055231	.	A	C	806.39	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148919;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.669;QD=57.5993;RBI=0.0355603;REFB=0;REVB=0.0322918;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170924;OID=.;OPOS=18055231;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:29:26:0:0:30:26:0:0
chr3	18427924	.	G	T	1676.32	PASS	AF=0.928;AO=118;DP=127;FAO=116;FDP=125;FR=.;FRO=9;FSAF=66;FSAR=50;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00801646;FXX=0.0234357;HRUN=6;LEN=1;MLLD=203.767;QD=53.6423;RBI=0.0444584;REFB=-0.0296224;REVB=0.0437297;RO=5;SAF=68;SAR=50;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138845;STB=0.517209;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.000119374;OID=.;OPOS=18427924;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:127:125:5:9:118:116:0.928:50:68:2:3:50:66:3:6
chr3	19930130	.	A	T	523.57	PASS	AF=0.536082;AO=46;DP=91;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.0280553;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.388;QD=21.5906;RBI=0.0328399;REFB=-0.0393439;REVB=-0.0170692;RO=44;SAF=29;SAR=17;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0056315;STB=0.51493;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0275763;OID=.;OPOS=19930130;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:97:44:45:46:52:0.536082:17:29:28:16:17:35:29:16
chr3	19959756	.	G	A	564.16	PASS	AF=0.55914;AO=52;DP=93;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.00208161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.57;QD=24.2649;RBI=0.0189291;REFB=-0.0125185;REVB=-0.0188143;RO=41;SAF=23;SAR=29;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191628;STB=0.604868;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0101972;OID=.;OPOS=19959756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:41:41:52:52:0.55914:29:23:28:13:29:23:28:13
chr3	19961330	.	C	T	301.18	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.00838741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.193;QD=16.732;RBI=0.012893;REFB=-0.0185034;REVB=0.00979182;RO=39;SAF=25;SAR=8;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081251;STB=0.545823;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0367789;OID=.;OPOS=19961330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:8:25:27:12:8:25:27:12
chr3	19962044	.	G	A	325.43	PASS	AF=0.409091;AO=36;DP=88;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=0.0130889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4652;QD=14.7922;RBI=0.0637915;REFB=0.0339816;REVB=-0.0624342;RO=52;SAF=29;SAR=7;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234568;STB=0.634597;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=-0.0505945;OID=.;OPOS=19962044;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:52:52:36:36:0.409091:7:29:33:19:7:29:33:19
chr3	20156433	.	ATTT	ATTC,ATT,GATT	320.28	PASS	AF=0.0666667,0.866667,0;AO=3,23,2;DP=44;FAO=3,39,0;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=3,12,0;FSAR=0,27,0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.10711,-0.0451903,0.0106115;FXX=0;HRUN=4,4,1;LEN=1,1,2;MLLD=195.52,10.5895,9.53506;QD=28.4697;RBI=0.109661,0.50647,0.292329;REFB=0.00423709,-0.0250984,0.0484014;REVB=0.0235139,0.504449,0.292136;RO=16;SAF=3,12,0;SAR=0,11,2;SRF=3;SRR=13;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.745916,0.24585,-0.433373;STB=0.5,0.555526,0.5;STBP=1,0.029,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.146968,0.00903192,0;OID=.,.,.;OPOS=20156436,20156434,20156433;OREF=T,T,AT;OALT=C,-,GA;OMAPALT=ATTC,ATT,GATT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:44:45:16:3:3,23,2:3,39,0:0.0666667,0.866667,0:0,11,2:3,12,0:3:13:0,27,0:3,12,0:3:0
chr3	20216519	.	T	A	96.74	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0978231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.96;QD=12.4824;RBI=0.0980846;REFB=-0.00460614;REVB=-0.00715747;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32414;STB=0.688831;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0216515;OID=.;OPOS=20216519;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:5:7:5:14:5:7:5:14
chr3	21462754	.	A	G	375.37	PASS	AF=0.378151;AO=45;DP=117;FAO=45;FDP=119;FR=.;FRO=74;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=48;FSRR=26;FWDB=-0.0261261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.903;QD=12.6176;RBI=0.0396591;REFB=-0.0182367;REVB=-0.0298374;RO=71;SAF=29;SAR=16;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124627;STB=0.502856;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0236596;OID=.;OPOS=21462754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:119:71:74:45:45:0.378151:16:29:45:26:16:29:48:26
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chr3	21462880	.	A	G	259.35	PASS	AF=0.407895;AO=29;DP=74;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.015295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.69;QD=13.6497;RBI=0.0319107;REFB=-0.0321361;REVB=0.0280064;RO=44;SAF=12;SAR=17;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115709;STB=0.587572;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0453326;OID=.;OPOS=21462880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:44:45:29:31:0.407895:17:12:23:21:19:12:24:21
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chr3	27307155	.	C	T	1062.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5494;QD=59.8555;RBI=0.0818427;REFB=0;REVB=-0.0778854;RO=0;SAF=35;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000539896;OID=.;OPOS=27307155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:36:35:0:0:36:35:0:0
chr3	27326097	.	G	T	209.3	PASS	AF=0.361111;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=72;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00510314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.452;QD=11.628;RBI=0.0217391;REFB=-0.0143646;REVB=-0.0211316;RO=46;SAF=17;SAR=9;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221308;STB=0.628161;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0258736;OID=.;OPOS=27326097;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:46:46:26:26:0.361111:9:17:21:25:9:17:21:25
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chr3	27332177	.	T	C	210.0	PASS	AF=0.313953;AO=27;DP=85;FAO=27;FDP=86;FR=.;FRO=59;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=-0.00310857;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.2815;QD=9.76747;RBI=0.0486677;REFB=-0.0135542;REVB=-0.0485683;RO=56;SAF=16;SAR=11;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251282;STB=0.511537;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0275181;OID=.;OPOS=27332177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:56:59:27:27:0.313953:11:16:32:24:11:16:34:25
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chr3	27442336	.	G	A	191.45	PASS	AF=0.403509;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0163821;FXX=0.0172384;HRUN=4;LEN=1;MLLD=243.351;QD=13.4349;RBI=0.0178061;REFB=-0.0100581;REVB=-0.0069773;RO=33;SAF=18;SAR=5;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.371809;STB=0.72341;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0139347;OID=.;OPOS=27442336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:57:33:34:23:23:0.403509:5:18:15:18:5:18:15:19
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chr3	31270258	.	T	C	1016.03	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0615793;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.799;QD=58.0591;RBI=0.0859768;REFB=-0.133149;REVB=0.06;RO=1;SAF=33;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141097;STB=0.507461;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.00328457;OID=.;OPOS=31270258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:70:1:1:69:69:0.985714:36:33:1:0:36:33:1:0
chr3	31712393	.	C	T	1437.42	PASS	AF=1;AO=66;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=58;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285974;FXX=0.0198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0858;QD=58.0776;RBI=0.0408502;REFB=0;REVB=0.0291707;RO=0;SAF=56;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61997e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000917193;OID=.;OPOS=31712393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:66:99:1:10:56:0:0:41:58:0:0
chr3	31725316	.	G	A	610.07	PASS	AF=0.459854;AO=63;DP=138;FAO=63;FDP=137;FR=.;FRO=74;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=37;FWDB=-0.0247459;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9077;QD=17.8122;RBI=0.0711197;REFB=-0.0390008;REVB=0.0666757;RO=71;SAF=27;SAR=36;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.048638;STB=0.538935;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0398395;OID=.;OPOS=31725316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:137:71:74:63:63:0.459854:36:27:34:37:36:27:37:37
chr3	31839242	.	T	C	746.45	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.83;QD=63.5277;RBI=0.0292704;REFB=0;REVB=0.0140035;RO=0;SAF=29;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113133;OID=.;OPOS=31839242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:18:29:0:0:18:29:0:0
chr3	31839284	.	A	G	183.89	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.012342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.99;QD=17.9402;RBI=0.013345;REFB=0.00289136;REVB=-0.00507588;RO=22;SAF=14;SAR=5;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20486;STB=0.617515;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=-0.00196393;OID=.;OPOS=31839284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:5:14:12:10:5:14:12:10
chr3	31839325	.	A	T	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0154961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.878;QD=11.8306;RBI=0.0394974;REFB=-0.0240225;REVB=-0.0363306;RO=18;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307581;STB=0.683863;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0298429;OID=.;OPOS=31839325;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:3:8:8:10:3:8:8:10
chr3	32031962	.	A	G	133.85	PASS	AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0232825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.13;QD=25.4947;RBI=0.0422264;REFB=0.0323904;REVB=0.0352277;RO=7;SAF=5;SAR=9;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132373;STB=0.574359;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=-0.00526434;OID=.;OPOS=32031962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:7:7:14:14:0.666667:9:5:4:3:9:5:4:3
chr3	32208621	.	T	C	339.92	PASS	AF=0.586207;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0176055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.395;QD=23.4428;RBI=0.0176825;REFB=-0.0129016;REVB=-0.00164799;RO=24;SAF=21;SAR=13;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153383;STB=0.584486;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0137427;OID=.;OPOS=32208621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:24:24:34:34:0.586207:13:21:10:14:13:21:10:14
chr3	32209927	.	A	G	631.62	PASS	AF=0.580952;AO=60;DP=105;FAO=61;FDP=105;FR=.;FRO=44;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0233181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.379;QD=24.0618;RBI=0.0245013;REFB=-0.0105527;REVB=0.0075218;RO=43;SAF=34;SAR=26;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11339;STB=0.559717;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00691363;OID=.;OPOS=32209927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:43:44:60:61:0.580952:26:34:18:25:26:35:19:25
chr3	32214179	.	A	T	354.63	PASS	AF=0.436782;AO=37;DP=87;FAO=38;FDP=87;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=-0.0338764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7397;QD=16.3047;RBI=0.041688;REFB=-0.00731427;REVB=-0.0242956;RO=48;SAF=10;SAR=27;SRF=17;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100595;STB=0.538058;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.011397;OID=.;OPOS=32214179;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:48:49:37:38:0.436782:27:10:17:31:27:11:17:32
chr3	32214212	.	A	C	308.45	PASS	AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=32;FWDB=0.00996108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6242;QD=16.0236;RBI=0.0116947;REFB=-0.0239131;REVB=0.00612731;RO=42;SAF=8;SAR=26;SRF=11;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354657;STB=0.515648;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.03129;OID=.;OPOS=32214212;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:42:43:34:34:0.441558:26:8:11:31:26:8:11:32
chr3	32815231	.	A	T	338.16	PASS	AF=1;AO=20;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=350.756;QD=54.1052;RBI=0.0390247;REFB=0;REVB=0.0224669;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000378256;OID=.;OPOS=32815231;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:20:25:1:15:5:0:0:16:9:0:0
chr3	32927509	.	G	T	793.28	PASS	AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0655691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.404;QD=53.7819;RBI=0.101157;REFB=-0.0460819;REVB=0.0770284;RO=1;SAF=25;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184904;STB=0.519224;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00130018;OID=.;OPOS=32927509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:59:59:1:2:57:57:0.966102:32:25:1:0:32:25:2:0
chr3	33055721	.	A	G	1695.25	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.846;QD=60.5445;RBI=0.0154264;REFB=0;REVB=-0.00126932;RO=0;SAF=52;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.15902e-05;OID=.;OPOS=33055721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:60:52:0:0:60:52:0:0
chr3	33118631	.	G	A	1119.49	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00405844;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.402;QD=60.5132;RBI=0.0595419;REFB=0;REVB=0.0594034;RO=0;SAF=59;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.86739e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.57212e-05;OID=.;OPOS=33118631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:15:59:0:0:15:59:0:0
chr3	33138544	.	A	G	1880.95	PASS	AF=0.991935;AO=123;DP=124;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0387175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.417;QD=60.6759;RBI=0.0696085;REFB=-0.137837;REVB=0.0578472;RO=1;SAF=64;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798452;STB=0.504201;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000199759;OID=.;OPOS=33138544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:124:124:1:1:123:123:0.991935:59:64:0:1:59:64:0:1
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chr3	33161898	.	C	T	1302.15	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00387525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.682;QD=62.0071;RBI=0.0289483;REFB=0;REVB=-0.0286877;RO=0;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.22231e-05;OID=.;OPOS=33161898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:39:45:0:0:39:45:0:0
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chr3	37407664	.	G	T	210.48	PASS	AF=0.461538;AO=23;DP=51;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0332954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.986;QD=16.191;RBI=0.0333097;REFB=-0.0117963;REVB=-0.000977856;RO=27;SAF=8;SAR=15;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300623;STB=0.666528;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0145997;OID=.;OPOS=37407664;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:27:28:23:24:0.461538:15:8:18:9:16:8:18:10
chr3	37535984	.	C	G	699.49	PASS	AF=1;AO=27;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0571409;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.15;QD=63.5897;RBI=0.0616716;REFB=0;REVB=0.0232014;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186625;OID=.;OPOS=37535984;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:27:44:1:6:21:0:0:8:36:0:0
chr3	37574951	.	G	A	1043.86	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.072352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4634;QD=59.6489;RBI=0.082206;REFB=0;REVB=-0.0390259;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000868585;OID=.;OPOS=37574951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:40:30:0:0:40:30:0:0
chr3	37670876	.	G	C	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0228943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8667;QD=6.81338;RBI=0.0239897;REFB=-0.00867461;REVB=-0.00716616;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170567;STB=0.60839;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0244113;OID=.;OPOS=37670876;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:3:4:8:11:3:4:8:11
chr3	37778481	.	G	C	274.73	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=66;FAO=29;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00226738;FXX=0.121194;HRUN=8;LEN=1;MLLD=239.06;QD=18.9468;RBI=0.0418285;REFB=-0.00154755;REVB=-0.041767;RO=13;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127272;STB=0.577305;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=-0.00326381;OID=.;OPOS=37778481;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:58:13:26:17:29:0.5:8:9:9:4:12:17:11:15
chr3	38080952	.	T	G	1164.41	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2703;QD=60.4889;RBI=0.130508;REFB=0;REVB=0.119014;RO=0;SAF=50;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000723595;OID=.;OPOS=38080952;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:77:0:0:74:77:1:24:50:0:0:24:53:0:0
chr3	38081031	.	A	T	1295.02	PASS	AF=1;AO=83;DP=86;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246976;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9403;QD=61.6678;RBI=0.0376872;REFB=0;REVB=0.0284668;RO=0;SAF=52;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000475517;OID=.;OPOS=38081031;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:84:0:0:83:84:1:31:52:0:0:31:53:0:0
chr3	38125705	.	G	A	1910.38	PASS	AF=1;AO=123;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126912;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2142;QD=61.6252;RBI=0.0454019;REFB=0;REVB=-0.043592;RO=0;SAF=73;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000217473;OID=.;OPOS=38125705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:124:0:0:123:124:1:50:73:0:0:51:73:0:0
chr3	38151731	.	T	C	976.38	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00974108;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.447;QD=57.4341;RBI=0.0102405;REFB=-0.141021;REVB=0.00315889;RO=1;SAF=26;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178273;STB=0.509431;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00152366;OID=.;OPOS=38151731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:41:26:1:0:41:26:1:0
chr3	38170810	.	C	G	761.67	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0853806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.94;QD=63.4722;RBI=0.0860872;REFB=0;REVB=0.0110067;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376553;OID=.;OPOS=38170810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0
chr3	38316867	.	G	A	479.29	PASS	AF=0.575;AO=44;DP=78;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.00873137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.875;QD=23.9647;RBI=0.0143896;REFB=-0.0221745;REVB=0.0114379;RO=31;SAF=29;SAR=15;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116405;STB=0.512862;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0148326;OID=.;OPOS=38316867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:80:31:34:44:46:0.575:15:29:20:11:15:31:22:12
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chr3	38350519	.	G	A	2166.51	PASS	AF=0.980132;AO=140;DP=145;FAO=148;FDP=151;FR=.;FRO=3;FSAF=69;FSAR=79;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.157076;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.151;QD=57.3911;RBI=0.158494;REFB=-0.12794;REVB=0.0211552;RO=1;SAF=62;SAR=78;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00760704;STB=0.510637;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.000186569;OID=.;OPOS=38350519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:145:151:1:3:140:148:0.980132:78:62:1:0:79:69:3:0
chr3	38350543	.	A	G	2293.33	PASS	AF=1;AO=144;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00889321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.377;QD=63.7036;RBI=0.00954786;REFB=0;REVB=-0.00347455;RO=0;SAF=73;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.24418e-05;OID=.;OPOS=38350543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:144:144:0:0:144:144:1:71:73:0:0:71:73:0:0
chr3	38355225	.	G	A	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0167028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.901;QD=14.2616;RBI=0.0217081;REFB=-0.00550567;REVB=-0.0138657;RO=24;SAF=6;SAR=10;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891363;STB=0.551882;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0138714;OID=.;OPOS=38355225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:10:6:11:13:10:6:11:13
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chr3	38401839	.	T	C	736.78	PASS	AF=0.947368;AO=53;DP=58;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0149448;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.209;QD=51.704;RBI=0.036753;REFB=-0.0473759;REVB=0.0335774;RO=3;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462792;STB=0.524581;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.00399439;OID=.;OPOS=38401839;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:58:57:3:3:53:54:0.947368:29:24:0:3:29:25:0:3
chr3	38404472	.	C	A	1510.75	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.089;QD=62.9478;RBI=0.0375936;REFB=0;REVB=0.0205369;RO=0;SAF=67;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9988e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000550637;OID=.;OPOS=38404472;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:96:0:0:93:96:1:26:67:0:0:27:69:0:0
chr3	38406773	.	G	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0753953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.718;QD=57.2026;RBI=0.0806729;REFB=0;REVB=0.0286996;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320841;OID=.;OPOS=38406773;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr3	38408361	.	G	A	941.09	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00999079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.822;QD=57.0355;RBI=0.0180182;REFB=-0.134868;REVB=0.0149946;RO=1;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013692;STB=0.507244;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.000131788;OID=.;OPOS=38408361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:34:31:0:1:34:31:0:1
chr3	38442490	.	G	A	356.2	PASS	AF=0.638298;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=47;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0255068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.584;QD=30.3147;RBI=0.0257065;REFB=-0.0155775;REVB=0.00319809;RO=15;SAF=11;SAR=19;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220082;STB=0.517386;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.00898867;OID=.;OPOS=38442490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:15:17:30:30:0.638298:19:11:5:10:19:11:7:10
chr3	38442504	.	G	A	128.84	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0319873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.531;QD=12.5695;RBI=0.0387058;REFB=-0.00307761;REVB=-0.0217934;RO=26;SAF=6;SAR=9;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173508;STB=0.510191;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.00694996;OID=.;OPOS=38442504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:9:6:10:16:9:6:10:16
chr3	38519424	.	A	G	775.26	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0111344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.219;QD=53.4662;RBI=0.013702;REFB=-0.0602177;REVB=-0.00798558;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.514281;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00112835;OID=.;OPOS=38519424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:0:2:56:56:0.965517:22:34:0:0:22:34:2:0
chr3	38524742	.	C	T	714.21	PASS	AF=0.518797;AO=69;DP=134;FAO=69;FDP=133;FR=.;FRO=64;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=34;FWDB=0.00603625;FXX=0.029195;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.064;QD=21.4798;RBI=0.0099718;REFB=-0.0171602;REVB=-0.00793729;RO=64;SAF=44;SAR=25;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152356;STB=0.583871;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0173331;OID=.;OPOS=38524742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:133:64:64:69:69:0.518797:25:44:30:34:25:44:30:34
chr3	38524873	.	GA	G,GG	32.73	PASS	AF=0.277778,0.111111;AO=5,2;DP=19;FAO=5,2;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=1,1;FSAR=4,1;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0779172,-0.0465159;FXX=0.0526039;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=13.2916,38.171;QD=7.27428;RBI=0.173431,0.11721;REFB=-0.0439777,-0.0408321;REVB=0.154943,0.107584;RO=11;SAF=1,1;SAR=4,1;SRF=3;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.108645,0.246437;STB=0.571122,0.690673;STBP=0.818,0.719;TYPE=del,snp;VARB=0.0500973,0.0971475;OID=.,.;OPOS=38524874,38524874;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.277778,0.111111:5,2:19:5,2:18:11:1,1:4,1:3:8:22:11:1,1:4,1:3:8
chr3	38525567	.	T	C	311.62	PASS	AF=0.447368;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=8;FWDB=-0.026225;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.0149;QD=16.4013;RBI=0.0327386;REFB=-0.0061571;REVB=0.0195977;RO=41;SAF=26;SAR=8;SRF=33;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563306;STB=0.535694;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.00669088;OID=.;OPOS=38525567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:41:42:34:34:0.447368:8:26:33:8:8:26:34:8
chr3	38525588	.	G	A	383.6	PASS	AF=0.513158;AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=8;FWDB=0.0403483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0991;QD=20.1896;RBI=0.0446875;REFB=-0.0236831;REVB=0.019209;RO=37;SAF=30;SAR=9;SRF=29;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182056;STB=0.510081;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0243758;OID=.;OPOS=38525588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:37:37:39:39:0.513158:9:30:29:8:9:30:29:8
chr3	38529818	.	C	T	138.27	PASS	AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0470423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.993;QD=11.7674;RBI=0.047892;REFB=-0.00588893;REVB=-0.00898151;RO=29;SAF=4;SAR=12;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347302;STB=0.707594;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.013867;OID=.;OPOS=38529818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:31:16:16:0.340426:12:4:16:13:12:4:17:14
chr3	38529825	.	C	T	140.08	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00552491;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.267;QD=12.1806;RBI=0.0063926;REFB=-0.0193588;REVB=-0.0032157;RO=30;SAF=4;SAR=12;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332317;STB=0.697415;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0246321;OID=.;OPOS=38529825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:30:30:16:16:0.347826:12:4:16:14:12:4:16:14
chr3	38532511	.	G	A	487.71	PASS	AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0517373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.596;QD=21.6758;RBI=0.0517984;REFB=-0.0238652;REVB=-0.0025149;RO=43;SAF=17;SAR=30;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173985;STB=0.596177;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0170623;OID=.;OPOS=38532511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:43:43:47:47:0.522222:30:17:24:19:30:17:24:19
chr3	38534140	.	A	T	73.25	PASS	AF=0.179487;AO=4;DP=47;FAO=7;FDP=39;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=19;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.131902;FXX=0.20404;HRUN=8;LEN=1;MLLD=126.474;QD=7.51232;RBI=0.13264;REFB=-0.00648844;REVB=-0.0139746;RO=15;SAF=2;SAR=2;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191181;STB=0.772481;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0128421;OID=.;OPOS=38534140;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:47:39:15:19:4:7:0.179487:2:2:5:10:2:5:6:13
chr3	38534296	.	T	C	69.08	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0584451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9492;QD=15.352;RBI=0.0594464;REFB=-0.0656985;REVB=0.0108647;RO=8;SAF=3;SAR=7;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.42614;STB=0.813304;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0501487;OID=.;OPOS=38534296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:18:18:8:9:10:9:0.5:7:3:7:1:7:2:8:1
chr3	38589666	.	T	C,TCCCTCCTTTTCCTACTCTCTTCTC,TCCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC	92.59	PASS	AF=0.0344828,0.137931,0.241379;AO=2,5,6;DP=30;FAO=1,4,7;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=1,1,4;FSAR=0,3,3;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0343711,-0.0212791,-0.0209387;FXX=0.0333222;HRUN=2,3,3;LEN=1,24,25;MLLD=63.6227,381.495,381.588;QD=12.7705;RBI=0.0379184,0.0216902,0.0211718;REFB=-0.0363289,-0.0170735,-0.0179587;REVB=-0.0160137,0.00420337,0.00313289;RO=17;SAF=1,1,4;SAR=1,4,2;SRF=11;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.150121,-0.491989,0.0247213;STB=0.986962,0.798631,0.555401;STBP=0.46,0.245,0.728;TYPE=snp,ins,ins;VARB=0.0457777,-0.00843776,0.0337629;OID=.,.,.;OPOS=38589666,38589667,38589667;OREF=T,-,-;OALT=C,CCCTCCTTTTCCTACTCTCTTCTC,CCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC;OMAPALT=C,TCCCTCCTTTTCCTACTCTCTTCTC,TCCCTCCTTTTTCCTACTCTCTTCTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:43:30:29:17:17:2,5,6:1,4,7:0.0344828,0.137931,0.241379:1,4,2:1,1,4:11:6:0,3,3:1,1,4:11:6
chr3	38590358	.	C	CT	144.12	PASS	AF=0.512821;AO=18;DP=41;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0352531;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.3403;QD=14.7814;RBI=0.0593042;REFB=-0.0349878;REVB=0.0476887;RO=19;SAF=3;SAR=15;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309412;STB=0.571353;STBP=0.432;TYPE=ins;VARB=0.0340328;OID=.;OPOS=38590359;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.512821:18:41:20:39:19:5:15:7:12:99:19:3:15:8:11
chr3	38590422	.	T	C	159.57	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0697115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8546;QD=17.7297;RBI=0.0697133;REFB=0.0214263;REVB=0.000499032;RO=19;SAF=4;SAR=13;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301802;STB=0.673853;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.010507;OID=.;OPOS=38590422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:13:4:10:9:13:4:10:9
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chr3	38622467	.	T	C	862.92	PASS	AF=1;AO=59;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297427;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2831;QD=57.5283;RBI=0.0767764;REFB=0;REVB=0.0707813;RO=1;SAF=54;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00866019;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155061;OID=.;OPOS=38622467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:1:0:59:60:1:5:54:1:0:5:55:0:0
chr3	38674712	.	T	C	4096.86	PASS	AF=1;AO=262;DP=263;FAO=262;FDP=262;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00421462;FXX=0.00380214;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.253;QD=62.5474;RBI=0.0338287;REFB=0;REVB=0.0335651;RO=0;SAF=144;SAR=118;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.50917e-05;OID=.;OPOS=38674712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:22:263:262:0:0:262:262:1:118:144:0:0:118:144:0:0
chr3	38739574	.	T	C	1686.44	PASS	AF=1;AO=110;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264479;FXX=0.0260847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.619;QD=60.2299;RBI=0.0852159;REFB=0;REVB=0.0810077;RO=0;SAF=73;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000451576;OID=.;OPOS=38739574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:110:112:1:37:73:0:0:38:74:0:0
chr3	38739845	.	A	G	763.91	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.112;QD=63.6593;RBI=0.0358857;REFB=0;REVB=0.0197813;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274043;OID=.;OPOS=38739845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr3	38748833	.	T	C	1098.89	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319042;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.2341;QD=60.2134;RBI=0.0558997;REFB=0;REVB=0.045901;RO=0;SAF=48;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000532498;OID=.;OPOS=38748833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:24:48:0:0:25:48:0:0
chr3	38766675	.	A	G	1051.6	PASS	AF=1;AO=67;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.326;QD=59.2452;RBI=0.0627711;REFB=0;REVB=0.0142612;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.20473e-05;OID=.;OPOS=38766675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:71:0:0:67:71:1:30:37:0:0:32:39:0:0
chr3	38768334	.	T	C	1440.33	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136609;FXX=0.00990001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.098;QD=57.6133;RBI=0.0136987;REFB=0;REVB=0.00101619;RO=0;SAF=40;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000678573;OID=.;OPOS=38768334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:100:0:0:95:100:1:55:40:0:0:55:45:0:0
chr3	38945560	.	A	G	345.9	PASS	AF=0.422222;AO=37;DP=89;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.00851955;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.225;QD=15.3734;RBI=0.0234198;REFB=-0.0103614;REVB=-0.0218152;RO=52;SAF=22;SAR=15;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118739;STB=0.557096;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.010112;OID=.;OPOS=38945560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:52:52:37:38:0.422222:15:22:25:27:16:22:25:27
chr3	39077433	.	T	C	246.63	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.000587338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.255;QD=15.9118;RBI=0.0345022;REFB=-0.00971871;REVB=0.0344972;RO=33;SAF=16;SAR=12;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094986;STB=0.542827;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0160013;OID=.;OPOS=39077433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:34:28:28:0.451613:12:16:22:11:12:16:22:12
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chr3	39185248	.	A	G	340.6	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3194;QD=54.4966;RBI=0.027506;REFB=0;REVB=-0.0210123;RO=0;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000445108;OID=.;OPOS=39185248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:5:19:0:0:5:20:0:0
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chr3	40231383	.	C	T	483.63	PASS	AF=0.582278;AO=40;DP=80;FAO=46;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0229601;FXX=0.0246883;HRUN=6;LEN=1;MLLD=167.496;QD=24.4875;RBI=0.0235869;REFB=-0.0328893;REVB=-0.00540147;RO=20;SAF=23;SAR=17;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466264;STB=0.508376;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0249227;OID=.;OPOS=40231383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:20:33:40:46:0.582278:17:23:10:10:20:26:18:15
chr3	40231834	.	G	C	53.7	PASS	AF=0.108527;AO=14;DP=127;FAO=14;FDP=129;FR=.;FRO=115;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=60;FSRR=55;FWDB=-0.0550816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.211;QD=1.66496;RBI=0.076019;REFB=-0.000880855;REVB=-0.0523919;RO=112;SAF=1;SAR=13;SRF=58;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.562483;STB=0.920394;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0141992;OID=.;OPOS=40231834;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:127:129:112:115:14:14:0.108527:13:1:58:54:13:1:60:55
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chr3	40275461	.	C	T	256.44	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.018459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.386;QD=22.7947;RBI=0.0296682;REFB=-0.011103;REVB=0.0232264;RO=21;SAF=5;SAR=19;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349852;STB=0.697443;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00654091;OID=.;OPOS=40275461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:19:5:12:9:19:5:12:9
chr3	40286017	.	T	C	1807.62	PASS	AF=1;AO=115;DP=116;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0591095;FXX=0.0327842;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5378;QD=61.2752;RBI=0.0595581;REFB=0;REVB=0.00729664;RO=0;SAF=60;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000974958;OID=.;OPOS=40286017;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:118:0:0:115:118:1:55:60:0:0:56:62:0:0
chr3	40301474	.	AAGC	AAGA,A	600.82	PASS	AF=0,0.850746;AO=15,39;DP=59;FAO=0,57;FDP=67;FR=.;FRO=10;FSAF=0,35;FSAR=0,22;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0823581,0.0526143;FXX=0.0147037;HRUN=1,2;LEN=1,3;MLLD=49.48,175.584;QD=35.8697;RBI=0.0827012,0.0558925;REFB=-0.00155089,-0.0108159;REVB=-0.00752619,-0.0188603;RO=0;SAF=8,20;SAR=7,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.3303e-08;STB=0.5,0.502207;STBP=1,0.92;TYPE=snp,del;VARB=0,0.00349039;OID=.,.;OPOS=40301477,40301475;OREF=C,AGC;OALT=A,-;OMAPALT=AAGA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.850746:15,39:59:0,57:67:10:0,35:0,22:6:4:57:0:8,20:7,19:0:0
chr3	40301661	.	A	G	369.73	PASS	AF=0.610169;AO=35;DP=59;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0133974;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.563;QD=25.0666;RBI=0.0213555;REFB=-0.0281631;REVB=0.0166304;RO=23;SAF=20;SAR=15;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601614;STB=0.527844;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0158022;OID=.;OPOS=40301661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:23:23:35:36:0.610169:15:20:15:8:15:21:15:8
chr3	40498845	.	C	T	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.0879;QD=60.6099;RBI=0.0378427;REFB=0;REVB=0.0137332;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000416914;OID=.;OPOS=40498845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0
chr3	40499182	.	C	T	1320.19	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0670757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4887;QD=62.1265;RBI=0.0773621;REFB=0;REVB=0.0385454;RO=0;SAF=57;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000536521;OID=.;OPOS=40499182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:28:57:0:0:28:57:0:0
chr3	40519429	.	T	C	726.42	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00992295;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.8286;QD=63.167;RBI=0.0250364;REFB=0;REVB=-0.022986;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000425032;OID=.;OPOS=40519429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0
chr3	40557443	.	C	A	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00789772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7461;QD=11.1971;RBI=0.0531392;REFB=0.00269132;REVB=0.052549;RO=22;SAF=5;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911075;STB=0.554364;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=-0.00196159;OID=.;OPOS=40557443;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:7:5:11:11:7:5:11:11
chr3	40559078	.	G	C	216.68	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0113641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.24;QD=13.3341;RBI=0.025359;REFB=0.00393783;REVB=0.0226701;RO=39;SAF=16;SAR=10;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281609;STB=0.516117;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=-0.00530742;OID=.;OPOS=40559078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:10:16:23:16:10:16:23:16
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chr3	41723280	.	G	A	152.14	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00192689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7583;QD=13.2293;RBI=0.0255537;REFB=-0.0335126;REVB=0.025481;RO=29;SAF=12;SAR=5;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104418;STB=0.561329;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0353334;OID=.;OPOS=41723280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:5:12:18:11:5:12:18:11
chr3	41756965	.	C	T	296.72	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=0.00416318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.943;QD=15.6169;RBI=0.00838341;REFB=-0.00758454;REVB=-0.00727664;RO=43;SAF=18;SAR=15;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126627;STB=0.571386;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.012092;OID=.;OPOS=41756965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:15:18:18:25:15:18:18:25
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chr3	41841716	.	A	C	1134.68	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.638;QD=60.5164;RBI=0.125059;REFB=0;REVB=0.120352;RO=0;SAF=37;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00065373;OID=.;OPOS=41841716;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:36:37:0:0:38:37:0:0
chr3	41877414	.	T	C	226.44	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.00273724;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.437;QD=17.0897;RBI=0.0041139;REFB=-0.0211265;REVB=-0.00307111;RO=28;SAF=9;SAR=16;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116548;STB=0.565315;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0248099;OID=.;OPOS=41877414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:16:9:7:21:16:9:7:21
chr3	41910571	.	T	C	571.0	PASS	AF=1;AO=28;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4116;QD=60.1048;RBI=0.0417135;REFB=0;REVB=-0.0046908;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143162;OID=.;OPOS=41910571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:28:38:1:16:12:0:0:18:20:0:0
chr3	41910572	.	G	C	70.44	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.025074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7644;QD=7.22475;RBI=0.0252937;REFB=-0.0856348;REVB=-0.00332654;RO=29;SAF=8;SAR=2;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.432806;STB=0.773622;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0512346;OID=.;OPOS=41910572;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:2:8:13:16:2:8:13:16
chr3	41925398	.	C	T	405.43	PASS	AF=0.461538;AO=41;DP=90;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0252117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.123;QD=17.8212;RBI=0.0260082;REFB=-0.0100771;REVB=-0.0063869;RO=49;SAF=10;SAR=31;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290027;STB=0.666581;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0172646;OID=.;OPOS=41925398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:49:49:41:42:0.461538:31:10:25:24:32:10:25:24
chr3	41925423	.	T	C	1264.28	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00847767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.8803;QD=61.6724;RBI=0.012044;REFB=0;REVB=0.00855494;RO=0;SAF=27;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.16176e-05;OID=.;OPOS=41925423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:81:82:1:54:27:0:0:55:27:0:0
chr3	41937000	.	C	T	261.8	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0263274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.823;QD=17.1671;RBI=0.0265658;REFB=-0.00334878;REVB=0.00355064;RO=32;SAF=18;SAR=11;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0567525;STB=0.531893;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.00443956;OID=.;OPOS=41937000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:11:18:18:14:11:18:18:14
chr3	41939993	.	T	A	722.05	PASS	AF=1;AO=29;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115826;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=30.1392;QD=60.1707;RBI=0.163055;REFB=0;REVB=0.114766;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.011116;OID=.;OPOS=41939993;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:29:48:1:13:16:0:0:22:26:0:0
chr3	41942255	.	A	G	519.17	PASS	AF=0.592593;AO=48;DP=81;FAO=48;FDP=81;FR=.;FRO=33;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0231149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.017;QD=25.6381;RBI=0.025631;REFB=-0.0053838;REVB=0.0110748;RO=33;SAF=29;SAR=19;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022009;STB=0.512033;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0035601;OID=.;OPOS=41942255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:33:33:48:48:0.592593:19:29:19:14:19:29:19:14
chr3	41957466	.	T	G	238.18	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00200947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.289;QD=20.2707;RBI=0.071341;REFB=-0.027395;REVB=0.0713127;RO=24;SAF=17;SAR=6;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124288;STB=0.570405;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.010899;OID=.;OPOS=41957466;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:6:17:15:9:6:17:15:9
chr3	41960006	.	T	C	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.00137037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.135;QD=13.5768;RBI=0.0745124;REFB=-0.0106252;REVB=0.0744998;RO=19;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247318;STB=0.644331;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0117482;OID=.;OPOS=41960006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:5:8:7:12:5:8:7:12
chr3	41996136	.	T	C	165.41	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00729518;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.864;QD=12.0298;RBI=0.0268939;REFB=-0.0145393;REVB=0.0258856;RO=34;SAF=16;SAR=5;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21905;STB=0.627967;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0323552;OID=.;OPOS=41996136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:34:34:21:21:0.381818:5:16:20:14:5:16:20:14
chr3	42236415	.	A	G	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0547938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2732;QD=63.2861;RBI=0.0831277;REFB=0;REVB=-0.0625129;RO=0;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00144788;OID=.;OPOS=42236415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:32:14:0:0:32:14:0:0
chr3	42244321	.	G	A	1414.31	PASS	AF=0.958763;AO=92;DP=99;FAO=93;FDP=97;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0235675;FXX=0.029997;HRUN=4;LEN=1;MLLD=166.446;QD=58.3222;RBI=0.046422;REFB=-0.103024;REVB=0.0399947;RO=4;SAF=50;SAR=42;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00345522;STB=0.502013;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.000769302;OID=.;OPOS=42244321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:99:97:4:4:92:93:0.958763:42:50:2:2:42:51:2:2
chr3	42568929	.	T	C	36.86	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0380195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2574;QD=7.76086;RBI=0.0621753;REFB=0.0101614;REVB=-0.0491964;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538331;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=-0.0577373;OID=.;OPOS=42568929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:18:19:9:13:6:6:0.315789:2:4:6:3:2:4:8:5
chr3	42599091	.	G	A	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.00704996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.168;QD=12.8686;RBI=0.0332599;REFB=0.000627253;REVB=-0.0325041;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.489301;STB=0.76877;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=-0.00138006;OID=.;OPOS=42599091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:15:16:11:11:0.407407:3:8:3:12:3:8:4:12
chr3	42610374	.	A	G	271.38	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=24;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.00419599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.516;QD=23.5981;RBI=0.0078137;REFB=-0.0123725;REVB=-0.00659147;RO=21;SAF=24;SAR=1;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.48572;STB=0.782287;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0107382;OID=.;OPOS=42610374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:1:24:16:5:1:24:16:5
chr3	42610515	.	G	A	50.63	PASS	AF=0.380952;AO=7;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0332645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1557;QD=9.64465;RBI=0.0333595;REFB=-0.0188549;REVB=0.00251559;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.478256;STB=0.799314;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.037563;OID=.;OPOS=42610515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:21:21:13:13:7:8:0.380952:2:5:3:10:2:6:3:10
chr3	42636141	.	G	A	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0115707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.62;QD=8.69795;RBI=0.0155323;REFB=-0.0261434;REVB=-0.0103621;RO=14;SAF=2;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885977;STB=0.555391;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.030902;OID=.;OPOS=42636141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:5:2:5:9:5:2:5:9
chr3	42700456	.	C	T	367.0	PASS	AF=0.411765;AO=32;DP=98;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=0.0161316;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.384;QD=14.3923;RBI=0.0167307;REFB=-0.00770654;REVB=-0.00443725;RO=46;SAF=20;SAR=12;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179542;STB=0.508463;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0126285;OID=.;OPOS=42700456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:102:46:60:32:42:0.411765:12:20:28:18:19:23:32:28
chr3	42700630	.	A	G	355.82	PASS	AF=0.349206;AO=44;DP=126;FAO=44;FDP=126;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=55;FSRR=27;FWDB=-0.0096024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.951;QD=11.2959;RBI=0.0192783;REFB=-0.00298533;REVB=-0.0167166;RO=82;SAF=25;SAR=19;SRF=55;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121227;STB=0.569258;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0038047;OID=.;OPOS=42700630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:82:82:44:44:0.349206:19:25:55:27:19:25:55:27
chr3	42728144	.	A	G	820.42	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0490425;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.311;QD=57.5732;RBI=0.0501652;REFB=0;REVB=-0.0105537;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000274189;OID=.;OPOS=42728144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:22:35:0:0:22:35:0:0
chr3	42733468	.	T	C	1190.37	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.049998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.851;QD=61.0445;RBI=0.0582039;REFB=0;REVB=0.0297974;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.53956e-05;OID=.;OPOS=42733468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:38:40:0:0:38:40:0:0
chr3	42735150	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.3;QD=51.9166;RBI=0.0175984;REFB=0;REVB=-0.00495738;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.81956e-05;OID=.;OPOS=42735150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr3	42735274	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.455;QD=45.8068;RBI=0.0361471;REFB=0;REVB=-0.0343736;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00039601;OID=.;OPOS=42735274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr3	42907112	.	A	C	788.29	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.237;QD=56.3065;RBI=0.0378626;REFB=0;REVB=0.0269437;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.80038e-05;OID=.;OPOS=42907112;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:56:0:0:53:56:1:27:26:0:0:28:28:0:0
chr3	42908146	.	A	T	660.75	PASS	AF=0.462069;AO=66;DP=145;FAO=67;FDP=145;FR=.;FRO=78;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=52;FSRR=26;FWDB=0.0488584;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.409;QD=18.2275;RBI=0.0521336;REFB=-0.0248439;REVB=-0.018187;RO=78;SAF=32;SAR=34;SRF=52;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176894;STB=0.593402;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0276996;OID=.;OPOS=42908146;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:78:78:66:67:0.462069:34:32:52:26:34:33:52:26
chr3	42908775	.	A	C	320.18	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.816;QD=53.364;RBI=0.0129754;REFB=0;REVB=0.0129754;RO=0;SAF=0;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.70468e-05;OID=.;OPOS=42908775;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:24:0:0:22:24:1:22:0:0:0:24:0:0:0
chr3	42917047	.	A	G	1496.02	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000970571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.251;QD=59.2483;RBI=0.045723;REFB=0;REVB=0.0457127;RO=0;SAF=47;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.97642e-05;OID=.;OPOS=42917047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:101:0:0:93:101:1:46:47:0:0:53:48:0:0
chr3	42956273	.	T	C	563.93	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0469969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.118;QD=57.8387;RBI=0.088613;REFB=-0.0595365;REVB=0.0751237;RO=1;SAF=15;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302093;STB=0.51612;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00147686;OID=.;OPOS=42956273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:23:15:1:0:23:15:1:0
chr3	43073761	.	G	A	303.17	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00535587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6696;QD=52.7246;RBI=0.106894;REFB=0;REVB=0.10676;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103502;OID=.;OPOS=43073761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:6:16:0:0:6:17:0:0
chr3	43074430	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00724299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.405;QD=57.6807;RBI=0.0233392;REFB=0;REVB=0.0221869;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.96768e-05;OID=.;OPOS=43074430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr3	43074434	.	C	T	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00723401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.106;QD=57.6799;RBI=0.0606127;REFB=0;REVB=0.0601795;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000594279;OID=.;OPOS=43074434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr3	43074582	.	A	AG	32.19	PASS	AF=0.183099;AO=10;DP=71;FAO=13;FDP=71;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=0.0282928;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.673;QD=1.81378;RBI=0.0712104;REFB=0.00722499;REVB=-0.0653485;RO=60;SAF=9;SAR=1;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.438401;STB=0.629705;STBP=0.355;TYPE=ins;VARB=-0.0947427;OID=.;OPOS=43074583;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.183099:10:71:13:71:58:10:3:37:21:32:60:9:1:37:23
chr3	43074871	.	A	G	2269.62	PASS	AF=1;AO=123;DP=146;FAO=144;FDP=144;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=94;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00848655;FXX=0.0399973;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.083;QD=63.0449;RBI=0.0139894;REFB=0;REVB=0.0111213;RO=0;SAF=90;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.80318e-05;OID=.;OPOS=43074871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:146:144:0:0:123:144:1:33:90:0:0:50:94:0:0
chr3	43074872	.	C	G	108.34	PASS	AF=0.142857;AO=20;DP=158;FAO=23;FDP=161;FR=.;FRO=138;FSAF=2;FSAR=21;FSRF=101;FSRR=37;FWDB=-0.0183412;FXX=0.00617246;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.5827;QD=2.69175;RBI=0.0284465;REFB=-0.0184557;REVB=0.021744;RO=138;SAF=2;SAR=18;SRF=101;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.687266;STB=0.948808;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0142573;OID=.;OPOS=43074872;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:161:138:138:20:23:0.142857:18:2:101:37:21:2:101:37
chr3	43095101	.	A	G	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-1.23268e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.768;QD=60.6102;RBI=0.0103156;REFB=0;REVB=0.0103156;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.08207e-05;OID=.;OPOS=43095101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:12:26:0:0:12:26:0:0
chr3	43097710	.	A	G	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00828972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.6;QD=58.4188;RBI=0.02827;REFB=0;REVB=0.0270273;RO=0;SAF=60;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58776e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.14128e-05;OID=.;OPOS=43097710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:3:60:0:0:3:60:0:0
chr3	43121559	.	C	T	831.63	PASS	AF=1;AO=56;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.014;QD=57.3535;RBI=0.0477783;REFB=0;REVB=0.0466683;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.47751e-05;OID=.;OPOS=43121559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:56:58:1:27:29:0:0:29:29:0:0
chr3	43122966	.	G	A	983.69	PASS	AF=0.958904;AO=70;DP=73;FAO=70;FDP=73;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.138269;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.8712;QD=53.9006;RBI=0.139179;REFB=-0.146721;REVB=-0.0158905;RO=2;SAF=34;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269982;STB=0.506847;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00792022;OID=.;OPOS=43122966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:73:73:2:3:70:70:0.958904:36:34:2:0:35:35:2:1
chr3	43390387	.	C	CT	69.48	PASS	AF=0.3125;AO=14;DP=66;FAO=20;FDP=64;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=0.0142177;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.2425;QD=4.3428;RBI=0.150421;REFB=0.0301146;REVB=-0.149748;RO=45;SAF=11;SAR=3;SRF=34;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522846;STB=0.610049;STBP=0.284;TYPE=ins;VARB=-0.0970651;OID=.;OPOS=43390388;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.3125:14:66:20:64:44:16:4:30:14:69:45:11:3:34:11
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chr3	43602803	.	C	T	151.3	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=0.00803741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.267;QD=12.8766;RBI=0.00962844;REFB=-0.0231289;REVB=-0.00530159;RO=30;SAF=8;SAR=9;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229133;STB=0.63251;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0163021;OID=.;OPOS=43602803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:9:8:8:22:9:8:8:22
chr3	43607136	.	T	C	148.14	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00305819;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=300.203;QD=17.9561;RBI=0.0138337;REFB=-0.0187274;REVB=0.0134915;RO=17;SAF=11;SAR=5;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0993111;STB=0.556889;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0234362;OID=.;OPOS=43607136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:5:11:10:7:5:11:10:7
chr3	44434424	.	G	A	411.45	PASS	AF=0.518987;AO=41;DP=78;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0228664;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4142;QD=20.8326;RBI=0.0240795;REFB=-0.0360565;REVB=-0.00754668;RO=36;SAF=16;SAR=25;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475877;STB=0.541381;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0301512;OID=.;OPOS=44434424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:36:38:41:41:0.518987:25:16:16:20:25:16:18:20
chr3	44449318	.	A	T	47.06	PASS	AF=0.106383;AO=5;DP=47;FAO=5;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0823462;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=29.9062;QD=4.00505;RBI=0.0880367;REFB=-0.00561629;REVB=0.0311378;RO=37;SAF=4;SAR=1;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.459989;STB=0.833551;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.0959676;OID=.;OPOS=44449318;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:47:47:37:38:5:5:0.106383:1:4:14:23:1:4:15:23
chr3	44540791	.	TTC	T,TTT	716.45	PASS	AF=0.946429,0;AO=48,3;DP=55;FAO=53,0;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=28,0;FSAR=25,0;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0137446,0.0108994;FXX=0.0344768;HRUN=5,1;LEN=2,1;MLLD=312.691,293.96;QD=51.1747;RBI=0.0144818,0.0113421;REFB=-0.0338938,-0.0291753;REVB=-0.00456162,-0.00313799;RO=0;SAF=25,1;SAR=23,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.50744,0.5;STBP=0.679,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0017834,0;OID=.,.;OPOS=44540792,44540793;OREF=TC,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.946429,0:48,3:55:53,0:56:3:28,0:25,0:2:1:12:0:25,1:23,2:0:0
chr3	44761736	.	C	T	476.78	PASS	AF=0.479592;AO=47;DP=98;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.0762756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.787;QD=19.4606;RBI=0.0763009;REFB=-0.0244198;REVB=-0.00196584;RO=51;SAF=17;SAR=30;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0305496;STB=0.516993;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0218991;OID=.;OPOS=44761736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:51:51:47:47:0.479592:30:17:20:31:30:17:20:31
chr3	44841824	.	A	G	196.11	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0115145;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8021;QD=12.652;RBI=0.0154649;REFB=-0.00859083;REVB=0.0103237;RO=35;SAF=17;SAR=7;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187641;STB=0.621239;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0362501;OID=.;OPOS=44841824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:35:38:24:24:0.387097:7:17:19:16:7:17:20:18
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chr3	44884647	.	C	A	322.89	PASS	AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.00970585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.317;QD=19.277;RBI=0.0199729;REFB=-0.0327033;REVB=-0.017456;RO=32;SAF=13;SAR=21;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126879;STB=0.575511;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0349273;OID=.;OPOS=44884647;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:32:33:34:34:0.507463:21:13:8:24:21:13:8:25
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chr3	44943389	.	G	A	219.54	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00735083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.619;QD=17.5629;RBI=0.053965;REFB=-0.0047602;REVB=0.053462;RO=26;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0879897;STB=0.551613;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00520975;OID=.;OPOS=44943389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:28:22:22:0.44:13:9:13:13:13:9:14:14
chr3	44948479	.	C	T	139.53	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=-0.0134923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.135;QD=12.4025;RBI=0.0206585;REFB=-0.0198748;REVB=0.015644;RO=28;SAF=8;SAR=8;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315789;STB=0.666481;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0295863;OID=.;OPOS=44948479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:29:16:16:0.355556:8:8:22:6:8:8:22:7
chr3	44948590	.	G	A	195.57	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.00220572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.435;QD=12.6176;RBI=0.00285475;REFB=-0.00739768;REVB=-0.0018123;RO=37;SAF=10;SAR=14;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158953;STB=0.583264;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00544442;OID=.;OPOS=44948590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:37:38:24:24:0.387097:14:10:21:16:14:10:21:17
chr3	44968319	.	CTTTTTC	CCTTTTC,CTTTC,CTTTTC,CTTTTCT	252.75	PASS	AF=0,0,0.880952,0;AO=2,9,20,2;DP=41;FAO=0,0,37,0;FDP=42;FR=.;FRO=5;FSAF=0,0,32,0;FSAR=0,0,5,0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0340856,-0.0851048,-0.156554,-0.0872131;FXX=0.0232504;HRUN=5,5,5,5;LEN=1,2,1,2;MLLD=9.39452,12.3091,10.5234,66.5081;QD=24.0713;RBI=0.227458,0.0907543,0.165373,0.0872384;REFB=-0.0372549,-0.0234693,-0.0378436,0.0200457;REVB=0.224889,0.0315201,0.0532821,-0.00210417;RO=6;SAF=2,9,18,2;SAR=0,0,2,0;SRF=5;SRR=1;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.524163,0.772566,0.0724812,0.524163;STB=0.5,0.5,0.536213,0.5;STBP=1,1,0.402,1;TYPE=snp,del,del,mnp;VARB=0,0.0284833,-0.0288589,0.0333524;OID=.,.,.,.;OPOS=44968320,44968320,44968320,44968324;OREF=T,TT,T,TC;OALT=C,-,-,CT;OMAPALT=CCTTTTC,CTTTC,CTTTTC,CTTTTCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0,0.880952,0:2,9,20,2:41:0,0,37,0:42:5:0,0,32,0:0,0,5,0:5:0:13:6:2,9,18,2:0,0,2,0:5:1
chr3	45052775	.	G	C	761.89	PASS	AF=0.490683;AO=79;DP=161;FAO=79;FDP=161;FR=.;FRO=82;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=50;FSRR=32;FWDB=-0.012866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.188;QD=18.9291;RBI=0.0211339;REFB=-0.0230089;REVB=0.0167662;RO=80;SAF=46;SAR=33;SRF=50;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404314;STB=0.514449;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0231867;OID=.;OPOS=45052775;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:161:80:82:79:79:0.490683:33:46:50:30:33:46:50:32
chr3	45077123	.	G	A	137.86	PASS	AF=0.327273;AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.012042;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.791;QD=10.0263;RBI=0.0120506;REFB=-0.0187407;REVB=-0.000455734;RO=37;SAF=11;SAR=7;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113043;STB=0.566935;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0271951;OID=.;OPOS=45077123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:37:37:18:18:0.327273:7:11:19:18:7:11:19:18
chr3	45127515	.	T	C	1245.46	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9775;QD=60.7543;RBI=0.124896;REFB=0;REVB=0.0684056;RO=0;SAF=22;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161037;OID=.;OPOS=45127515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:59:22:0:0:59:23:0:0
chr3	45134822	.	T	C	1120.77	PASS	AF=0.986842;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00173643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.794;QD=58.9878;RBI=0.0401512;REFB=0.00196581;REVB=-0.0401136;RO=1;SAF=44;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106316;STB=0.505616;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-4.2437e-05;OID=.;OPOS=45134822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:76:1:1:74:75:0.986842:30:44:1:0:31:44:1:0
chr3	45152071	.	C	T	645.1	PASS	AF=0.461538;AO=66;DP=143;FAO=66;FDP=143;FR=.;FRO=77;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=-0.0049014;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.957;QD=18.0446;RBI=0.00848928;REFB=-0.010827;REVB=-0.00693139;RO=77;SAF=40;SAR=26;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0986096;STB=0.554816;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0162664;OID=.;OPOS=45152071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:77:77:66:66:0.461538:26:40:39:38:26:40:39:38
chr3	45187785	.	C	G	94.88	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.147757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.6245;QD=11.1622;RBI=0.147909;REFB=-0.0198944;REVB=0.00670611;RO=22;SAF=4;SAR=8;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138041;STB=0.58127;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0277405;OID=.;OPOS=45187785;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:34:34:22:22:12:12:0.352941:8:4:5:17:8:4:5:17
chr3	45527218	.	T	C	1362.45	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00748391;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.771;QD=62.6414;RBI=0.00970777;REFB=0;REVB=0.00618318;RO=0;SAF=30;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04997e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.56146e-05;OID=.;OPOS=45527218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:57:30:0:0:57:30:0:0
chr3	45533224	.	G	A	1292.24	PASS	AF=1;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185327;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.739;QD=62.2766;RBI=0.0209865;REFB=0;REVB=0.00984753;RO=0;SAF=35;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374792;OID=.;OPOS=45533224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:83:0:0:83:83:1:48:35:0:0:48:35:0:0
chr3	45559519	.	T	C	1565.59	PASS	AF=1;AO=94;DP=97;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00827302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.536;QD=63.256;RBI=0.0401259;REFB=0;REVB=0.0392638;RO=0;SAF=43;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.23951e-07;OID=.;OPOS=45559519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:99:0:0:94:99:1:51:43:0:0:52:47:0:0
chr3	45565554	.	A	G	2457.71	PASS	AF=0.993827;AO=160;DP=162;FAO=161;FDP=162;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0510425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.602;QD=60.6842;RBI=0.0631248;REFB=-0.0940165;REVB=-0.0371404;RO=1;SAF=75;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00556507;STB=0.502924;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=3.68216e-05;OID=.;OPOS=45565554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:162:162:1:1:160:161:0.993827:85:75:0:1:85:76:0:1
chr3	45637253	.	C	T	738.46	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000356479;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.061;QD=54.7009;RBI=0.0225008;REFB=0.165312;REVB=0.022498;RO=1;SAF=25;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184728;STB=0.5098;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.000367017;OID=.;OPOS=45637253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:28:25:1:0:28:25:1:0
chr3	45637439	.	T	C	4024.3	PASS	AF=1;AO=211;DP=247;FAO=249;FDP=249;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=129;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.105;QD=64.6474;RBI=0.0622783;REFB=0;REVB=0.0574492;RO=0;SAF=126;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.90907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.40932e-05;OID=.;OPOS=45637439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:21:247:249:0:0:211:249:1:85:126:0:0:120:129:0:0
chr3	45817418	.	A	G	1283.12	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.478;QD=61.837;RBI=0.0411483;REFB=0;REVB=0.00818619;RO=0;SAF=47;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101687;OID=.;OPOS=45817418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:36:47:0:0:36:47:0:0
chr3	45957055	.	G	A	591.38	PASS	AF=0.5625;AO=53;DP=95;FAO=54;FDP=96;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=0.00809388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.042;QD=24.6408;RBI=0.0127683;REFB=-0.0107406;REVB=0.00987514;RO=41;SAF=28;SAR=25;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124714;STB=0.565194;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00571845;OID=.;OPOS=45957055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:41:42:53:54:0.5625:25:28:28:13:26:28:28:14
chr3	45959515	.	A	T	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00598754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.629;QD=57.8848;RBI=0.00820784;REFB=0;REVB=0.00561409;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.46031e-05;OID=.;OPOS=45959515;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:25:35:0:0:25:35:0:0
chr3	45959759	.	T	C	851.38	PASS	AF=1;AO=32;DP=52;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0758915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.311;QD=57.7208;RBI=0.0824581;REFB=0;REVB=0.0322463;RO=0;SAF=7;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00369208;OID=.;OPOS=45959759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:52:59:0:0:32:59:1:25:7:0:0:33:26:0:0
chr3	45989044	.	T	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00563069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.792;QD=57.6806;RBI=0.0412908;REFB=0;REVB=0.0409051;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185888;OID=.;OPOS=45989044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:9:22:0:0:9:22:0:0
chr3	45996761	.	G	A	2190.29	PASS	AF=1;AO=137;DP=138;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0060895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.158;QD=63.0298;RBI=0.0100541;REFB=0;REVB=-0.0080002;RO=0;SAF=75;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.52807e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.78125e-07;OID=.;OPOS=45996761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:138:139:0:0:137:139:1:62:75:0:0:63:76:0:0
chr3	46008790	.	G	A	2068.24	PASS	AF=1;AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0683359;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8839;QD=62.674;RBI=0.0755297;REFB=0;REVB=0.0321706;RO=0;SAF=69;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.58934e-05;OID=.;OPOS=46008790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:132:0:0:132:132:1:63:69:0:0:63:69:0:0
chr3	46009864	.	C	G	941.39	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.6461;QD=57.0542;RBI=0.117951;REFB=0;REVB=0.0219266;RO=1;SAF=33;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140928;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00211004;OID=.;OPOS=46009864;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:66:1:0:62:66:1:29:33:1:0:29:37:0:0
chr3	46010077	.	C	T	1544.94	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233469;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.973;QD=63.0589;RBI=0.0290144;REFB=0;REVB=0.0172266;RO=0;SAF=44;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.74815e-05;OID=.;OPOS=46010077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:97:98:1:53:44:0:0:54:44:0:0
chr3	46021218	.	G	T	817.71	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.715;QD=57.3835;RBI=0.0251534;REFB=0;REVB=0.00971251;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.45691e-05;OID=.;OPOS=46021218;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
chr3	46399798	.	T	C	205.36	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0340235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.49;QD=14.6686;RBI=0.0341239;REFB=-0.0215054;REVB=0.00261535;RO=32;SAF=5;SAR=19;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309579;STB=0.678407;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0322916;OID=.;OPOS=46399798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:19:5:15:17:19:5:15:17
chr3	46416470	.	G	T	930.59	PASS	AF=0.957143;AO=66;DP=70;FAO=67;FDP=70;FR=.;FRO=3;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0139885;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8532;QD=53.1766;RBI=0.0693034;REFB=-0.138702;REVB=0.0678769;RO=4;SAF=41;SAR=25;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148062;STB=0.517642;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00794322;OID=.;OPOS=46416470;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:70:70:4:3:66:67:0.957143:25:41:3:1:26:41:3:0
chr3	46417312	.	G	T	594.96	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.614;QD=61.0212;RBI=0.0277034;REFB=0;REVB=0.0113709;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67335e-05;OID=.;OPOS=46417312;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:15:23:0:0:15:24:0:0
chr3	46449978	.	A	C	1363.83	PASS	AF=0.978261;AO=88;DP=93;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00982952;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.295;QD=59.2971;RBI=0.0226154;REFB=-0.0112779;REVB=0.0203675;RO=2;SAF=49;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236783;STB=0.512192;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.000173965;OID=.;OPOS=46449978;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:93:92:2:2:88:90:0.978261:39:49:0:2:40:50:0:2
chr3	46450070	.	T	A	939.31	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0277553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.669;QD=56.9277;RBI=0.0577934;REFB=-0.110512;REVB=0.0506924;RO=1;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014534;STB=0.50769;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00380248;OID=.;OPOS=46450070;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:32:33:0:1:32:33:0:1
chr3	46480801	.	A	G	95.2	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0173821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.088;QD=11.2001;RBI=0.0289897;REFB=-0.0310294;REVB=-0.0232005;RO=22;SAF=6;SAR=6;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148529;STB=0.588093;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0511889;OID=.;OPOS=46480801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:6:6:14:8:6:6:14:8
chr3	46480958	.	C	G	396.57	PASS	AF=0.460674;AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.022123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.486;QD=17.8234;RBI=0.0281439;REFB=-0.0127831;REVB=-0.0173969;RO=48;SAF=13;SAR=28;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105738;STB=0.559292;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0171831;OID=.;OPOS=46480958;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:48:48:41:41:0.460674:28:13:20:28:28:13:20:28
chr3	46484964	.	G	A	894.78	PASS	AF=1;AO=52;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2707;QD=57.7275;RBI=0.0716828;REFB=0;REVB=0.0658854;RO=0;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000607154;OID=.;OPOS=46484964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:52:62:1:30:22:0:0:31:31:0:0
chr3	46501213	.	T	C	1425.42	PASS	AF=0.978723;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0271559;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.937;QD=60.6563;RBI=0.0448636;REFB=-0.0686383;REVB=0.0357113;RO=1;SAF=53;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119999;STB=0.512497;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00093837;OID=.;OPOS=46501213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:94:94:1:2:92:92:0.978723:39:53:0:1:39:53:0:2
chr3	46501268	.	C	T	272.67	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.00566994;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.003;QD=14.7389;RBI=0.0147936;REFB=-0.0266992;REVB=0.0136639;RO=42;SAF=15;SAR=16;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056375;STB=0.52446;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0337972;OID=.;OPOS=46501268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:42:43:31:31:0.418919:16:15:18:24:16:15:19:24
chr3	46501284	.	C	CCTT	858.8	PASS	AF=1;AO=53;DP=74;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122354;FXX=0.0476115;HRUN=2;LEN=3;MLLD=251.014;QD=57.253;RBI=0.0321301;REFB=0;REVB=0.0297093;RO=15;SAF=22;SAR=31;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495617;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000178843;OID=.;OPOS=46501285;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:53:74:60:60:0:26:34:0:0:5:15:22:31:8:7
chr3	46580588	.	A	G	422.07	PASS	AF=0.467391;AO=42;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=0.00124778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.515;QD=18.351;RBI=0.0027845;REFB=-0.0297649;REVB=0.00248927;RO=49;SAF=20;SAR=22;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125994;STB=0.5756;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0318066;OID=.;OPOS=46580588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:49:49:42:43:0.467391:22:20:17:32:22:21:17:32
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chr3	46620614	.	T	C	569.75	PASS	AF=0.458015;AO=60;DP=131;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=0.0110337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7987;QD=17.397;RBI=0.0404864;REFB=-0.00549086;REVB=0.0389539;RO=71;SAF=23;SAR=37;SRF=36;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123187;STB=0.568614;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00367565;OID=.;OPOS=46620614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:71:71:60:60:0.458015:37:23:36:35:37:23:36:35
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chr3	46722692	.	G	T	563.77	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0324483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.5737;QD=57.8225;RBI=0.044304;REFB=0.000347901;REVB=0.0301655;RO=1;SAF=23;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199387;STB=0.510633;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.000450282;OID=.;OPOS=46722692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:15:23:1:0:15:23:1:0
chr3	46729757	.	C	G	152.87	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.00816235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6409;QD=10.3641;RBI=0.0401348;REFB=0.00265505;REVB=0.039296;RO=39;SAF=12;SAR=8;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0708676;STB=0.541625;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-0.00384535;OID=.;OPOS=46729757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:8:12:21:18:8:12:21:18
chr3	46755937	.	C	T	519.99	PASS	AF=0.544444;AO=49;DP=90;FAO=49;FDP=90;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=10;FWDB=0.0329946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.835;QD=23.1105;RBI=0.0440256;REFB=-0.0268732;REVB=0.0291481;RO=41;SAF=27;SAR=22;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175908;STB=0.596225;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0160054;OID=.;OPOS=46755937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:41:41:49:49:0.544444:22:27:31:10:22:27:31:10
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chr3	47058157	.	G	A,GA	54.68	PASS	AF=0,0.325;AO=4,8;DP=45;FAO=0,13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=0,11;FSAR=0,2;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=-0.00531271,-0.0789888;FXX=0.0908884;HRUN=1,4;LEN=1,1;MLLD=191.919,11.9459;QD=5.46814;RBI=0.0715485,0.191098;REFB=-0.00801473,-0.116033;REVB=0.071351,0.174009;RO=33;SAF=4,8;SAR=0,0;SRF=26;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.499699,0.644978;STB=0.5,0.538399;STBP=1,0.85;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.101665;OID=.,.;OPOS=47058157,47058158;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:55:45:40:33:27:4,8:0,13:0,0.325:0,0:4,8:26:7:0,2:0,11:22:5
chr3	47161214	.	T	C	63.7	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0166642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.364;QD=9.09958;RBI=0.016727;REFB=-0.0160956;REVB=0.00144884;RO=19;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323733;STB=0.697248;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.026796;OID=.;OPOS=47161214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:6:3:12:7:6:3:12:7
chr3	47162661	.	A	G	57.34	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0241412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.847;QD=12.743;RBI=0.0602037;REFB=0.00222232;REVB=0.0551515;RO=9;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926992;STB=0.599733;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.00221525;OID=.;OPOS=47162661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:9:10:8:8:0.444444:2:6:6:3:2:6:6:4
chr3	47162886	.	C	T	191.54	PASS	AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0131027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.74;QD=22.5343;RBI=0.0219711;REFB=0.00432417;REVB=-0.0176366;RO=15;SAF=5;SAR=14;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068284;STB=0.53842;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=-0.00881249;OID=.;OPOS=47162886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:14:5:5:10:14:5:5:10
chr3	47288905	.	G	A	527.23	PASS	AF=0.515464;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.00508151;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.319;QD=21.7413;RBI=0.00947571;REFB=-0.0167546;REVB=0.00799796;RO=46;SAF=24;SAR=26;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394139;STB=0.516123;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.017276;OID=.;OPOS=47288905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:46:47:50:50:0.515464:26:24:20:26:26:24:21:26
chr3	47386060	.	G	C	560.78	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014814;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0108;QD=60.6245;RBI=0.0649081;REFB=0;REVB=0.063195;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000737467;OID=.;OPOS=47386060;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:15:21:0:0:16:21:0:0
chr3	47448825	.	G	A	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0548591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2514;QD=9.11008;RBI=0.0548624;REFB=0.00019875;REVB=-0.000603377;RO=16;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0741896;STB=0.545344;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.00118655;OID=.;OPOS=47448825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:5:3:5:11:5:3:5:11
chr3	47449058	.	T	C	115.91	PASS	AF=1;AO=6;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.16;QD=42.1496;RBI=0.0668039;REFB=0;REVB=0.0368262;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000501345;OID=.;OPOS=47449058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:6:11:1:3:3:0:0:4:7:0:0
chr3	47454399	.	G	A	61.39	PASS	AF=1;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158869;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=32.3754;QD=35.078;RBI=0.0926888;REFB=0;REVB=0.0913171;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0177928;OID=.;OPOS=47454399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:7:7:0:0:6:7:1:5:1:0:0:6:1:0:0
chr3	47455294	.	G	GGCCCC	156.78	PASS	AF=0.369565;AO=15;DP=48;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0110664;FXX=0.041658;HRUN=2;LEN=5;MLLD=224.199;QD=13.6334;RBI=0.0155757;REFB=-0.0146368;REVB=0.0109606;RO=32;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218503;STB=0.629574;STBP=0.181;TYPE=ins;VARB=0.0278088;OID=.;OPOS=47455295;OREF=-;OALT=GCCCC;OMAPALT=GGCCCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.369565:15:48:17:46:29:10:7:11:18:99:32:9:6:13:19
chr3	47462199	.	GT	CG,G,GC	761.51	PASS	AF=0.0185185,0,0.981481;AO=2,7,45;DP=54;FAO=1,0,53;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,31;FSAR=1,0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0409586,-0.00249387,0.00346698;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=55.4114,127.643,142.308;QD=56.4083;RBI=0.0410156,0.0192832,0.0450272;REFB=0,0,0;REVB=0.00216114,0.0191212,0.0448936;RO=0;SAF=0,3,28;SAR=2,4,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=-0.00526138,0,0.00152029;OID=.,.,.;OPOS=47462199,47462200,47462200;OREF=GT,T,T;OALT=CG,-,C;OMAPALT=CG,G,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/3:4:54:54:0:0:2,7,45:1,0,53:0.0185185,0,0.981481:2,4,17:0,3,28:0:0:1,0,22:0,0,31:0:0
chr3	47539702	.	T	C	613.26	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00619783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.073;QD=61.3259;RBI=0.0915069;REFB=0;REVB=0.0912967;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277588;OID=.;OPOS=47539702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0
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chr3	47618953	.	C	A	180.9	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0209363;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.14;QD=12.9215;RBI=0.0217499;REFB=-0.0136249;REVB=0.00589311;RO=34;SAF=11;SAR=11;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062041;STB=0.535682;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0220047;OID=.;OPOS=47618953;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:34:22:22:0.392857:11:11:19:15:11:11:19:15
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chr3	48663323	.	C	CG	43.22	PASS	AF=0.241935;AO=14;DP=61;FAO=15;FDP=62;FR=.;FRO=47;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=-0.00205482;FXX=0.0158705;HRUN=0;LEN=1;MLLD=56.6632;QD=2.78818;RBI=0.0328182;REFB=-0.00265717;REVB=-0.0327538;RO=47;SAF=2;SAR=12;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.621478;STB=0.887072;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.146375;OID=.;OPOS=48663324;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.241935:14:61:15:62:47:2:13:32:15:43:47:2:12:32:15
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chr3	48731961	.	A	G	279.23	PASS	AF=0.884615;AO=21;DP=25;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.107656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.956;QD=42.9578;RBI=0.107776;REFB=0.070237;REVB=0.00508644;RO=3;SAF=8;SAR=13;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116317;STB=0.507036;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=-0.000167238;OID=.;OPOS=48731961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:25:26:3:3:21:23:0.884615:13:8:1:2:14:9:1:2
chr3	48995487	.	C	T	393.11	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.651;QD=56.1588;RBI=0.0252481;REFB=0;REVB=-0.0208289;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.88073e-05;OID=.;OPOS=48995487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr3	49053218	.	CA	C,CG	1081.02	PASS	AF=0.027027,0.972973;AO=17,54;DP=73;FAO=2,72;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=2,39;FSAR=0,33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465129,0.0368775;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=158.035,117.53;QD=58.4337;RBI=0.046519,0.037174;REFB=0,0;REVB=-0.000754951,0.00468612;RO=0;SAF=12,26;SAR=5,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.52846e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.031093,-9.58166e-05;OID=.,.;OPOS=49053219,49053219;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.027027,0.972973:17,54:73:2,72:74:0:2,39:0,33:0:0:4:0:12,26:5,28:0:0
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chr3	49168218	.	G	A	472.41	PASS	AF=0.472222;AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=41;FSRR=16;FWDB=0.0300689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9389;QD=17.4966;RBI=0.0327069;REFB=-0.0215619;REVB=0.0128685;RO=57;SAF=31;SAR=20;SRF=41;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114461;STB=0.563356;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.025729;OID=.;OPOS=49168218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:57:57:51:51:0.472222:20:31:41:16:20:31:41:16
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chr3	49200692	.	T	A	520.68	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.662;QD=59.5062;RBI=0.142957;REFB=0;REVB=0.131369;RO=0;SAF=31;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00177657;OID=.;OPOS=49200692;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:3:31:0:0:4:31:0:0
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chr3	49298139	.	G	A	780.35	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292702;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.006;QD=63.7022;RBI=0.0681058;REFB=0;REVB=0.0614951;RO=0;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127201;OID=.;OPOS=49298139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:47:49:1:17:30:0:0:18:31:0:0
chr3	49298205	.	T	C	744.78	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.922;QD=55.169;RBI=0.0390235;REFB=-0.0744256;REVB=0.0196392;RO=0;SAF=37;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33586e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103918;OID=.;OPOS=49298205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:54:54:0:0:53:54:1:16:37:0:0:16:38:0:0
chr3	49548008	.	C	G	1219.78	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2446;QD=60.989;RBI=0.0547359;REFB=0;REVB=0.0334168;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290787;OID=.;OPOS=49548008;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:78:80:0:0:78:80:1:41:37:0:0:42:38:0:0
chr3	49569944	.	A	AC	35.11	PASS	AF=0.15;AO=36;DP=124;FAO=18;FDP=120;FR=.;FRO=102;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=68;FSRR=34;FWDB=-0.0498533;FXX=0.0322555;HRUN=0;LEN=1;MLLD=93.6799;QD=1.17049;RBI=0.0657412;REFB=-0.00418134;REVB=-0.0428551;RO=86;SAF=25;SAR=11;SRF=53;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104499;STB=0.597599;STBP=0.412;TYPE=ins;VARB=0.155791;OID=.;OPOS=49569945;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.15:36:124:18:120:102:10:8:68:34:35:86:25:11:53:33
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chr3	49690198	.	C	CA	1173.47	PASS	AF=0.989691;AO=11;DP=106;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.105137;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=117.765;QD=48.3907;RBI=0.109669;REFB=-0.101268;REVB=0.0312009;RO=95;SAF=11;SAR=0;SRF=52;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.621711;STB=0.504672;STBP=0.518;TYPE=ins;VARB=0.000864242;OID=.;OPOS=49690199;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.989691:11:106:96:97:1:53:43:1:0:4:95:11:0:52:43
chr3	49690199	.	G	A,C	1383.95	PASS	AF=0.876289,0.0927835;AO=85,9;DP=97;FAO=85,9;FDP=97;FR=.;FRO=3;FSAF=42,9;FSAR=43,0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0624778,0.0223749;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=132.78,12.5001;QD=57.0699;RBI=0.0631799,0.0228896;REFB=-0.0722956,-0.0343703;REVB=-0.00939271,-0.00482699;RO=3;SAF=42,9;SAR=43,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0326374,0;STB=0.517237,0.5;STBP=0.149,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00689513,0.216218;OID=.,.;OPOS=49690199,49690199;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:31:97:97:3:3:85,9:85,9:0.876289,0.0927835:43,0:42,9:3:0:43,0:42,9:3:0
chr3	49701298	.	G	A	1286.02	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00347477;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.42;QD=61.977;RBI=0.0139029;REFB=0;REVB=0.0134617;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07501e-05;OID=.;OPOS=49701298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:42:41:0:0:42:41:0:0
chr3	49708769	.	T	C	1259.35	PASS	AF=0.896907;AO=89;DP=96;FAO=87;FDP=97;FR=.;FRO=10;FSAF=27;FSAR=60;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0117202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.4518;QD=51.932;RBI=0.0164812;REFB=-0.0152549;REVB=0.0115874;RO=6;SAF=28;SAR=61;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.091364;STB=0.56736;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0350386;OID=.;OPOS=49708769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:96:97:6:10:89:87:0.896907:61:28:6:0:60:27:9:1
chr3	49723784	.	C	A	134.67	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4565;QD=44.8889;RBI=0.0643189;REFB=0;REVB=0.0643189;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00201464;OID=.;OPOS=49723784;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:12:0:0:12:12:1:12:0:0:0:12:0:0:0
chr3	49724808	.	T	C	1485.39	PASS	AF=0.979381;AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.000708195;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.4372;QD=61.2531;RBI=0.0240764;REFB=-0.094417;REVB=-0.024066;RO=1;SAF=57;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00824724;STB=0.508619;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000699757;OID=.;OPOS=49724808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:98:97:1:2:95:95:0.979381:38:57:1:0:38:57:2:0
chr3	49739507	.	G	C	444.9	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0025808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.511;QD=57.4068;RBI=0.00314813;REFB=0;REVB=-0.00180283;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.64943e-05;OID=.;OPOS=49739507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:18:12:0:0:18:13:0:0
chr3	49760039	.	T	C	797.46	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.695;QD=56.9617;RBI=0.0474201;REFB=0;REVB=0.0150986;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151045;OID=.;OPOS=49760039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:30:25:0:0:30:26:0:0
chr3	49928691	.	T	C	230.28	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0180208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4636;QD=46.0566;RBI=0.0711216;REFB=-0.0423523;REVB=0.0688006;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.518499;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00423587;OID=.;OPOS=49928691;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:20:20:0:1:19:19:0.95:6:13:0:0:6:13:1:0
chr3	49949166	.	TGGGGGGC	CTGGGGGC,TCGGGGGC,TGGGGGC,TGGGGGCG	268.63	PASS	AF=0,0,0.857143,0.119048;AO=6,3,15,2;DP=45;FAO=0,0,36,5;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=0,0,8,5;FSAR=0,0,28,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0575517,-0.171005,0.0186108,-0.13567;FXX=0.0232504;HRUN=1,6,6,6;LEN=2,1,1,2;MLLD=10.3766,20.9082,9.45355,44.412;QD=25.584;RBI=0.210743,0.171178,0.367551,0.196062;REFB=-0.109095,0.0625947,-0.0441165,0.03284;REVB=0.202732,0.00769544,0.367079,0.141542;RO=14;SAF=0,3,8,2;SAR=6,0,7,0;SRF=2;SRR=12;SSEN=0,0,0.708333,0;SSEP=0,0,0.576923,0;SSSB=-0.666635,0.770458,0.328705,0.731324;STB=0.5,0.5,0.529395,0.5;STBP=1,1,0.117,1;TYPE=mnp,snp,del,mnp;VARB=0,0,0.0825699,-0.107149;OID=.,.,.,.;OPOS=49949166,49949167,49949167,49949172;OREF=TG,G,G,GC;OALT=CT,C,-,CG;OMAPALT=CTGGGGGC,TCGGGGGC,TGGGGGC,TGGGGGCG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	3/4:21:45:42:14:1:6,3,15,2:0,0,36,5:0,0,0.857143,0.119048:6,0,7,0:0,3,8,2:2:12:0,0,28,0:0,0,8,5:1:0
chr3	50114515	.	C	T	483.3	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.109;QD=56.8593;RBI=0.0317945;REFB=0;REVB=-0.0239442;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000776474;OID=.;OPOS=50114515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:34:0:0:32:34:1:11:21:0:0:12:22:0:0
chr3	50129399	.	C	T	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.465;QD=49.5983;RBI=0.0187692;REFB=0;REVB=-9.61334e-05;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.55164e-05;OID=.;OPOS=50129399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr3	50144951	.	T	C	306.21	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0928618;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.0451;QD=51.0345;RBI=0.117637;REFB=0;REVB=0.0722157;RO=0;SAF=4;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00939855;OID=.;OPOS=50144951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:24:0:0:22:24:1:18:4:0:0:20:4:0:0
chr3	50153356	.	T	C	954.34	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0146;QD=58.7285;RBI=0.0441903;REFB=0;REVB=0.0417302;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000401922;OID=.;OPOS=50153356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:30:35:0:0:30:35:0:0
chr3	50197092	.	C	T	746.97	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.087598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2108;QD=63.5718;RBI=0.0942536;REFB=0;REVB=0.0347896;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000616998;OID=.;OPOS=50197092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr3	50222926	.	T	A	767.83	PASS	AF=0.949153;AO=56;DP=60;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00466776;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.862;QD=52.0563;RBI=0.0380417;REFB=-0.0517724;REVB=0.0377543;RO=3;SAF=36;SAR=20;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00248408;STB=0.501319;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.00298768;OID=.;OPOS=50222926;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:60:59:3:3:56:56:0.949153:20:36:2:1:20:36:2:1
chr3	50251833	.	A	AG	347.83	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0942228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.0117;QD=42.161;RBI=0.109368;REFB=0;REVB=0.0555289;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00560545;OID=.;OPOS=50251834;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:32:32:33:33:0:19:14:0:0:7:0:18:14:0:0
chr3	50311899	.	AC	A,AG,AT	749.11	PASS	AF=0.145455,0.0727273,0.781818;AO=7,5,43;DP=56;FAO=8,4,43;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=3,0,23;FSAR=5,4,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00679435,0.00820107,0.00786092;FXX=0.017854;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=193.716,24.9405,210.303;QD=54.4806;RBI=0.0244371,0.0125303,0.0248564;REFB=0,0,0;REVB=0.0234736,-0.00947376,0.0235806;RO=0;SAF=3,0,23;SAR=4,5,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.0219937,0.133552,0.00187605;OID=.,.,.;OPOS=50311900,50311900,50311900;OREF=C,C,C;OALT=-,G,T;OMAPALT=A,AG,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.145455,0.0727273,0.781818:7,5,43:56:8,4,43:55:0:3,0,23:5,4,20:0:0:42:0:3,0,23:4,5,20:0:0
chr3	50326020	.	G	A,C	744.08	PASS	AF=0.9375,0.0625;AO=44,4;DP=48;FAO=45,3;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25,3;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202994,0.00590725;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=159.112,118.452;QD=62.0069;RBI=0.0219786,0.00642672;REFB=0,0;REVB=0.00842567,-0.00253123;RO=0;SAF=24,4;SAR=20,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=5.30465e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000298793,0.1003;OID=.,.;OPOS=50326020,50326020;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:48:48:0:0:44,4:45,3:0.9375,0.0625:20,0:24,4:0:0:20,0:25,3:0:0
chr3	50327429	.	A	G	272.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00919258;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.7614;QD=51.9147;RBI=0.052084;REFB=0;REVB=-0.0512664;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0016692;OID=.;OPOS=50327429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr3	50329826	.	A	G	393.33	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.917;QD=56.1896;RBI=0.0717001;REFB=0;REVB=0.0645393;RO=0;SAF=20;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000554298;OID=.;OPOS=50329826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:7:20:0:0:7:21:0:0
chr3	50334231	.	T	A	316.49	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00660191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.449;QD=52.7481;RBI=0.00660191;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=22;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000404265;OID=.;OPOS=50334231;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:22:24:1:0:22:0:0:0:24:0:0
chr3	50336661	.	T	C	1080.5	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.046;QD=60.0279;RBI=0.023683;REFB=0;REVB=0.00687067;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.64408e-05;OID=.;OPOS=50336661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:35:37:0:0:35:37:0:0
chr3	50355730	.	T	G	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.621;QD=58.5839;RBI=0.0477734;REFB=0;REVB=0.0464899;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181985;OID=.;OPOS=50355730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr3	50357869	.	A	C	785.81	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9136;QD=64.1473;RBI=0.0273504;REFB=0;REVB=-0.0132494;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.58522e-05;OID=.;OPOS=50357869;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:26:22:0:0:27:22:0:0
chr3	50367867	.	A	C	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00365575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.854;QD=63.8712;RBI=0.01397;REFB=0;REVB=-0.0134832;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.3726e-05;OID=.;OPOS=50367867;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:17:31:0:0:17:31:0:0
chr3	50401841	.	G	A	637.49	PASS	AF=0.852459;AO=51;DP=61;FAO=52;FDP=61;FR=.;FRO=9;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.196829;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=37.5723;QD=41.8024;RBI=0.211762;REFB=-0.0929402;REVB=0.0781105;RO=3;SAF=15;SAR=36;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853014;STB=0.541531;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0172222;OID=.;OPOS=50401841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:61:61:3:9:51:52:0.852459:36:15:3:0:36:16:5:4
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chr3	50597092	.	G	A	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0088464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.194;QD=61.3342;RBI=0.0556588;REFB=0;REVB=0.0549512;RO=0;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203741;OID=.;OPOS=50597092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:28:12:0:0:28:12:0:0
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chr3	51431352	.	TG	T	36.33	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.129461;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.76003;QD=9.68932;RBI=0.271209;REFB=-0.0566194;REVB=0.238315;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145035;STB=0.571265;STBP=0.578;TYPE=del;VARB=0.125992;OID=.;OPOS=51431353;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6:6:15:9:15:6:3:6:3:3:19:6:2:4:3:3
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chr3	52022942	.	C	CG	32.88	PASS	AF=0.177419;AO=12;DP=65;FAO=11;FDP=62;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.0269283;FXX=0.0312451;HRUN=0;LEN=1;MLLD=67.368;QD=2.12102;RBI=0.0269659;REFB=-0.00666511;REVB=-0.00142472;RO=49;SAF=7;SAR=5;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263212;STB=0.868876;STBP=0.012;TYPE=ins;VARB=0.101302;OID=.;OPOS=52022943;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.177419:12:65:11:62:51:9:2:16:35:32:49:7:5:18:31
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chr3	52291078	.	G	A	2246.06	PASS	AF=1;AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8718;QD=63.2694;RBI=0.0427977;REFB=0;REVB=0.0365317;RO=0;SAF=97;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2663e-05;OID=.;OPOS=52291078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:142:142:1:45:97:0:0:45:97:0:0
chr3	52430526	.	G	A	906.36	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0173735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.048;QD=56.6472;RBI=0.0175883;REFB=-0.0363542;REVB=0.0027405;RO=1;SAF=30;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154807;STB=0.508194;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.000202876;OID=.;OPOS=52430526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:33:30:1:0:33:30:1:0
chr3	52430698	.	A	G	619.95	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0154641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.831;QD=59.0424;RBI=0.0288909;REFB=-0.0168213;REVB=0.0244037;RO=1;SAF=26;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177076;STB=0.509429;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=8.80373e-05;OID=.;OPOS=52430698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:15:26:1:0:15:26:1:0
chr3	52453893	.	C	T	1141.28	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301336;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.231;QD=60.8682;RBI=0.057753;REFB=0;REVB=0.0492684;RO=0;SAF=43;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107326;OID=.;OPOS=52453893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:75:0:0:69:75:1:26:43:0:0:29:46:0:0
chr3	52477080	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00912188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.74;QD=62.6711;RBI=0.0124079;REFB=0;REVB=0.0084111;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.02384e-05;OID=.;OPOS=52477080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:15:29:0:0:15:29:0:0
chr3	52492707	.	T	C	998.6	PASS	AF=1;AO=55;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.893;QD=58.741;RBI=0.0419753;REFB=0;REVB=0.000894844;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.59828e-05;OID=.;OPOS=52492707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:55:68:1:29:26:0:0:35:33:0:0
chr3	52510592	.	G	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00254826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.071;QD=61.3362;RBI=0.0190517;REFB=0;REVB=0.0188805;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.49117e-05;OID=.;OPOS=52510592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr3	52514519	.	A	G	131.99	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00573059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2112;QD=14.6656;RBI=0.108723;REFB=-0.00426043;REVB=-0.108572;RO=21;SAF=11;SAR=4;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277964;STB=0.662422;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00194934;OID=.;OPOS=52514519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:4:11:10:11:4:11:10:11
chr3	52523404	.	G	GT	576.6	PASS	AF=1;AO=10;DP=55;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.191978;FXX=0.020404;HRUN=0;LEN=1;MLLD=22.7602;QD=48.0496;RBI=0.201187;REFB=0;REVB=-0.0601735;RO=45;SAF=10;SAR=0;SRF=40;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.624993;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0154137;OID=.;OPOS=52523405;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:55:48:48:0:44:4:0:0:3:45:10:0:40:5
chr3	52523405	.	C	T	521.7	PASS	AF=0.836735;AO=36;DP=49;FAO=41;FDP=49;FR=.;FRO=8;FSAF=36;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.245186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=31.606;QD=42.5878;RBI=0.248677;REFB=-0.224077;REVB=-0.0415251;RO=13;SAF=31;SAR=5;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161629;STB=0.549977;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.052268;OID=.;OPOS=52523405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:49:49:13:8:36:41:0.836735:5:31:13:0:5:36:8:0
chr3	52525475	.	T	A	682.01	PASS	AF=0.492754;AO=68;DP=138;FAO=68;FDP=138;FR=.;FRO=70;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.00103825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.478;QD=19.7684;RBI=0.00448932;REFB=-0.0216031;REVB=0.00436762;RO=70;SAF=36;SAR=32;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794034;STB=0.543817;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.024933;OID=.;OPOS=52525475;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:70:70:68:68:0.492754:32:36:31:39:32:36:31:39
chr3	52540773	.	T	C	1568.47	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.023;QD=64.019;RBI=0.023288;REFB=0;REVB=0.00335757;RO=0;SAF=43;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.423e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.86936e-05;OID=.;OPOS=52540773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:55:43:0:0:55:43:0:0
chr3	52544470	.	A	G	754.61	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00551275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.204;QD=54.8808;RBI=0.00645222;REFB=-0.149091;REVB=0.00335272;RO=1;SAF=22;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020938;STB=0.511107;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00147473;OID=.;OPOS=52544470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:32:22:1:0:32:22:1:0
chr3	52554304	.	G	C	499.13	PASS	AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0587738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6461;QD=53.9603;RBI=0.0694225;REFB=-0.165617;REVB=0.0369475;RO=2;SAF=19;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467253;STB=0.524986;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00938741;OID=.;OPOS=52554304;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:37:37:2:2:35:35:0.945946:16:19:2:0:16:19:2:0
chr3	52745087	.	T	C	490.1	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0165414;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.761;QD=56.0115;RBI=0.0233069;REFB=0.00205785;REVB=0.0164192;RO=0;SAF=10;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523795;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=4.16471e-05;OID=.;OPOS=52745087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:0:1:34:34:0.971429:24:10:0:0:24:10:1:0
chr3	52867715	.	G	C	1616.4	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00292925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.66;QD=59.8667;RBI=0.0251366;REFB=0;REVB=0.0249654;RO=0;SAF=62;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.30301e-05;OID=.;OPOS=52867715;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:108:0:0:106:108:1:44:62:0:0:46:62:0:0
chr3	52874446	.	C	T	586.53	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4686;QD=60.1571;RBI=0.0416285;REFB=0;REVB=0.0282091;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00296797;OID=.;OPOS=52874446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:37:39:1:12:25:0:0:12:27:0:0
chr3	52929974	.	G	A	194.53	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.028267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.75;QD=17.2915;RBI=0.0336915;REFB=-0.00571375;REVB=-0.0183328;RO=25;SAF=13;SAR=7;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244683;STB=0.63968;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0225491;OID=.;OPOS=52929974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:7:13:10:15:7:13:10:15
chr3	52939210	.	T	C	449.25	PASS	AF=0.517647;AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0191878;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.275;QD=21.1414;RBI=0.0220711;REFB=-0.0179399;REVB=-0.0109068;RO=41;SAF=21;SAR=23;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334911;STB=0.51851;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0164977;OID=.;OPOS=52939210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:41:41:44:44:0.517647:23:21:18:23:23:21:18:23
chr3	53003179	.	A	C	31.6	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0237723;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=269.978;QD=14.0438;RBI=0.0601753;REFB=-0.0208396;REVB=0.0552806;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251123;STB=0.651584;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0228863;OID=.;OPOS=53003179;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:3:2:3:1:3:2:3:1
chr3	53125922	.	T	C	148.14	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.037076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9388;QD=17.9558;RBI=0.0379686;REFB=0.0210505;REVB=-0.00818449;RO=17;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132974;STB=0.575665;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.0147679;OID=.;OPOS=53125922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:8:8:11:6:8:8:11:6
chr3	53215799	.	G	A	263.72	PASS	AF=0.518519;AO=27;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0604852;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6118;QD=19.5349;RBI=0.0778158;REFB=-0.0526745;REVB=0.0489575;RO=26;SAF=13;SAR=14;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119713;STB=0.574022;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0366787;OID=.;OPOS=53215799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:27:28:0.518519:14:13:9:17:14:14:9:17
chr3	53215875	.	A	C	327.87	PASS	AF=0.578947;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0281377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.068;QD=23.0081;RBI=0.0283486;REFB=-0.0111634;REVB=-0.00345145;RO=24;SAF=15;SAR=18;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0616887;STB=0.53396;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.00913331;OID=.;OPOS=53215875;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:24:24:33:33:0.578947:18:15:9:15:18:15:9:15
chr3	53220215	.	G	A	236.17	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00394036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.143;QD=19.2793;RBI=0.0227173;REFB=-0.0323459;REVB=0.0223729;RO=25;SAF=13;SAR=10;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00489109;STB=0.506324;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.015861;OID=.;OPOS=53220215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:25:26:23:23:0.469388:10:13:14:11:10:13:15:11
chr3	53222761	.	C	T	171.78	PASS	AF=0.354839;AO=22;DP=62;FAO=22;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0116766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.459;QD=11.0826;RBI=0.011989;REFB=-0.00363065;REVB=-0.00271897;RO=39;SAF=7;SAR=15;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222486;STB=0.638169;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.00817394;OID=.;OPOS=53222761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:39:40:22:22:0.354839:15:7:20:19:15:7:21:19
chr3	53223927	.	C	G	730.71	PASS	AF=0.947368;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.036528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.9815;QD=51.2781;RBI=0.0830501;REFB=-0.0264907;REVB=-0.0745857;RO=2;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448139;STB=0.534871;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.000912433;OID=.;OPOS=53223927;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:56:57:2:3:54:54:0.947368:20:34:0:2:20:34:0:3
chr3	53224002	.	T	C	727.67	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.045479;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6496;QD=63.2755;RBI=0.0465755;REFB=0;REVB=-0.0100469;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000711068;OID=.;OPOS=53224002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:16:30:0:0:16:30:0:0
chr3	53226554	.	CAT	C	109.0	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0122727;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=174.219;QD=24.2211;RBI=0.0260341;REFB=-0.128857;REVB=0.0229598;RO=6;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0626622;OID=.;OPOS=53226555;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:10:18:12:18:6:6:6:3:3:37:6:5:5:3:3
chr3	53321631	.	A	C	400.53	PASS	AF=0.533333;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.016801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.341;QD=21.3616;RBI=0.0235119;REFB=-0.00823094;REVB=0.016448;RO=35;SAF=26;SAR=14;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120608;STB=0.566773;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00834123;OID=.;OPOS=53321631;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:35:35:40:40:0.533333:14:26:18:17:14:26:18:17
chr3	53324819	.	ATGGCAC	A	147.57	PASS	AF=0.875;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0231793;FXX=0;HRUN=1;LEN=6;MLLD=342.623;QD=36.8926;RBI=0.0252196;REFB=0.00824315;REVB=-0.0099372;RO=0;SAF=1;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.535665;STBP=0.631;TYPE=del;VARB=-0.00180994;OID=.;OPOS=53324820;OREF=TGGCAC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.875:14:14:14:16:2:1:13:0:2:10:0:1:13:0:0
chr3	53700550	.	T	C	583.95	PASS	AF=0.495868;AO=60;DP=122;FAO=60;FDP=121;FR=.;FRO=61;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=41;FWDB=0.0077414;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.552;QD=19.3041;RBI=0.024033;REFB=-0.0227051;REVB=0.022752;RO=61;SAF=34;SAR=26;SRF=20;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215292;STB=0.618647;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0164011;OID=.;OPOS=53700550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:121:61:61:60:60:0.495868:26:34:20:41:26:34:20:41
chr3	53766026	.	T	C	989.47	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0551;QD=59.0727;RBI=0.0287388;REFB=0;REVB=0.0255739;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201878;OID=.;OPOS=53766026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:33:33:0:0:34:33:0:0
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chr3	53882663	.	G	A	684.81	PASS	AF=0.957447;AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00816022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1163;QD=58.282;RBI=0.0108311;REFB=-0.0944314;REVB=-0.00712197;RO=0;SAF=36;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513508;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.000878263;OID=.;OPOS=53882663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:47:47:0:2:45:45:0.957447:9:36:0:0:9:36:2:0
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chr3	53883722	.	C	G	580.57	PASS	AF=0.491935;AO=60;DP=123;FAO=61;FDP=124;FR=.;FRO=63;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=0.0278369;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.0089;QD=18.7279;RBI=0.0570495;REFB=-0.00054414;REVB=-0.0497971;RO=63;SAF=35;SAR=25;SRF=26;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157744;STB=0.590134;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.000820047;OID=.;OPOS=53883722;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:124:63:63:60:61:0.491935:25:35:26:37:25:36:26:37
chr3	53899276	.	C	T	289.72	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0138504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.269;QD=18.998;RBI=0.0166458;REFB=-0.0170728;REVB=0.00923309;RO=30;SAF=16;SAR=15;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151978;STB=0.508469;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0155642;OID=.;OPOS=53899276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:15:16:16:14:15:16:16:14
chr3	53905308	.	T	C	316.72	PASS	AF=0.421687;AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.0410042;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.5019;QD=15.2636;RBI=0.0515893;REFB=0.003205;REVB=0.0313066;RO=47;SAF=19;SAR=16;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544095;STB=0.535918;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.00298961;OID=.;OPOS=53905308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:47:48:35:35:0.421687:16:19:28:19:16:19:29:19
chr3	53906513	.	G	A	391.15	PASS	AF=0.43299;AO=40;DP=95;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.0206219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.905;QD=16.13;RBI=0.0251712;REFB=-0.0139539;REVB=-0.0144335;RO=53;SAF=20;SAR=20;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668917;STB=0.525761;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0181688;OID=.;OPOS=53906513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:97:53:55:40:42:0.43299:20:20:30:23:21:21:30:25
chr3	53925775	.	C	T	592.69	PASS	AF=0.658228;AO=52;DP=79;FAO=52;FDP=79;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0248063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.815;QD=30.0097;RBI=0.043823;REFB=-0.0369853;REVB=0.0361262;RO=27;SAF=25;SAR=27;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238018;STB=0.512903;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.01735;OID=.;OPOS=53925775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:27:27:52:52:0.658228:27:25:14:13:27:25:14:13
chr3	53925849	.	C	T	445.04	PASS	AF=0.617647;AO=42;DP=68;FAO=42;FDP=68;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0171341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.24;QD=26.1789;RBI=0.0192122;REFB=-0.0199718;REVB=-0.00869096;RO=25;SAF=14;SAR=28;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163518;STB=0.59789;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00735446;OID=.;OPOS=53925849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:25:26:42:42:0.617647:28:14:14:11:28:14:15:11
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chr3	56106226	.	C	T	270.85	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=0.0275824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2557;QD=16.9279;RBI=0.0427416;REFB=-0.0257376;REVB=-0.0326505;RO=34;SAF=14;SAR=16;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252041;STB=0.640569;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0281588;OID=.;OPOS=56106226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:16:14:25:9:16:14:25:9
chr3	56114861	.	T	C	399.45	PASS	AF=0.38843;AO=47;DP=121;FAO=47;FDP=121;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=43;FSRR=31;FWDB=0.0296163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.087;QD=13.2049;RBI=0.0418246;REFB=-0.0121056;REVB=0.0295325;RO=74;SAF=30;SAR=17;SRF=43;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0653165;STB=0.537097;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0123822;OID=.;OPOS=56114861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:74:74:47:47:0.38843:17:30:43:31:17:30:43:31
chr3	56219179	.	GAAGCT	G	290.14	PASS	AF=0.454545;AO=45;DP=103;FAO=45;FDP=99;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=42;FSRR=12;FWDB=-0.00867072;FXX=0.0388312;HRUN=2;LEN=5;MLLD=273.097;QD=11.7227;RBI=0.0138506;REFB=-0.0215419;REVB=-0.0108008;RO=49;SAF=29;SAR=16;SRF=37;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117995;STB=0.583128;STBP=0.173;TYPE=del;VARB=0.0249952;OID=.;OPOS=56219180;OREF=AAGCT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.454545:45:103:45:99:54:29:16:42:12:99:49:29:16:37:12
chr3	56219210	.	T	C	430.13	PASS	AF=0.460784;AO=47;DP=107;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=14;FWDB=0.048203;FXX=0.0467246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6358;QD=16.8677;RBI=0.0513684;REFB=-0.0315225;REVB=0.0177534;RO=49;SAF=28;SAR=19;SRF=37;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158174;STB=0.586543;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0331123;OID=.;OPOS=56219210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:102:49:55:47:47:0.460784:19:28:37:12:19:28:41:14
chr3	56591298	.	T	A	55.88	PASS	AF=0.15873;AO=10;DP=65;FAO=10;FDP=63;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=0.000214506;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.958;QD=3.54817;RBI=0.0195897;REFB=0.0012534;REVB=-0.0195886;RO=46;SAF=6;SAR=4;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111925;STB=0.55395;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=-0.00756726;OID=.;OPOS=56591298;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:65:63:46:53:10:10:0.15873:4:6:28:18:4:6:35:18
chr3	56597954	.	C	T	150.12	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0052882;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=341.121;QD=19.3697;RBI=0.012783;REFB=-0.00593653;REVB=-0.0116379;RO=15;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283782;STB=0.516109;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.00521804;OID=.;OPOS=56597954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:8:8:7:8:8:8:7:8
chr3	56627048	.	A	G	2258.43	PASS	AF=0.993056;AO=143;DP=144;FAO=143;FDP=144;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0115606;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.908;QD=62.7343;RBI=0.0304469;REFB=-0.139179;REVB=0.0281667;RO=0;SAF=72;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12165e-08;STB=0.503496;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=7.6777e-05;OID=.;OPOS=56627048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:144:144:0:1:143:143:0.993056:71:72:0:0:71:72:0:1
chr3	56627598	.	A	G	1209.81	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.849;QD=61.256;RBI=0.0632712;REFB=0;REVB=0.0154488;RO=0;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179726;OID=.;OPOS=56627598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:79:0:0:76:79:1:31:45:0:0:31:48:0:0
chr3	56650051	.	A	ACTT	803.53	PASS	AF=0.895522;AO=58;DP=67;FAO=60;FDP=67;FR=.;FRO=7;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0113734;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=3;MLLD=205.918;QD=47.9719;RBI=0.0497114;REFB=-0.0619994;REVB=0.0483928;RO=7;SAF=37;SAR=21;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487297;STB=0.526896;STBP=0.244;TYPE=ins;VARB=0.00690212;OID=.;OPOS=56650052;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=ACTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.895522:58:67:60:67:7:37:23:6:1:32:7:37:21:6:1
chr3	56653424	.	A	T	318.42	PASS	AF=0.581818;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0129188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.117;QD=23.1581;RBI=0.0165439;REFB=-0.0370236;REVB=-0.0103346;RO=23;SAF=19;SAR=13;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890051;STB=0.549102;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0137592;OID=.;OPOS=56653424;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:23:23:32:32:0.581818:13:19:11:12:13:19:11:12
chr3	56653427	.	T	C	303.48	PASS	AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0122031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.4328;QD=22.0711;RBI=0.01921;REFB=-0.011048;REVB=0.0148361;RO=24;SAF=18;SAR=13;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0645161;STB=0.535691;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.00421576;OID=.;OPOS=56653427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:13:18:12:12:13:18:12:12
chr3	56667682	.	G	C	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7628;QD=62.9798;RBI=0.0422517;REFB=0;REVB=0.0295242;RO=0;SAF=13;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000710893;OID=.;OPOS=56667682;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:32:13:0:0:32:13:0:0
chr3	56716922	.	T	G	991.65	PASS	AF=0.985507;AO=67;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00435031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7454;QD=57.4872;RBI=0.00587791;REFB=0.00776808;REVB=-0.0039528;RO=1;SAF=56;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410256;STB=0.521733;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=-0.0012666;OID=.;OPOS=56716922;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:67:68:0.985507:11:56:0:1:11:57:0:1
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chr3	56763328	.	T	C	248.16	PASS	AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.0230314;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.4711;QD=25.4519;RBI=0.0259473;REFB=-0.0210525;REVB=-0.0119506;RO=16;SAF=8;SAR=15;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33617;STB=0.686117;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0124361;OID=.;OPOS=56763328;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:15:8:13:3:15:8:13:3
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chr3	57563120	.	GA	G	644.96	PASS	AF=1;AO=57;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.110342;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=16.1264;QD=37.3889;RBI=0.168272;REFB=-0.0408018;REVB=0.127044;RO=4;SAF=29;SAR=28;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319261;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00814258;OID=.;OPOS=57563121;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:57:68:69:69:0:35:34:0:0:7:4:29:28:1:3
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chr3	58081888	.	T	C	837.29	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0705318;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2748;QD=57.7444;RBI=0.0939433;REFB=0;REVB=0.0620533;RO=0;SAF=41;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183688;OID=.;OPOS=58081888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:17:41:0:0:17:41:0:0
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chr3	58112488	.	C	T	375.66	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0976732;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.158;QD=55.6528;RBI=0.0980764;REFB=0;REVB=0.00888416;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00036178;OID=.;OPOS=58112488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0
chr3	58118555	.	G	A	805.15	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.047;QD=64.4117;RBI=0.0621562;REFB=0;REVB=0.0612336;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355984;OID=.;OPOS=58118555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:32:18:0:0:32:18:0:0
chr3	58120469	.	C	T	710.24	PASS	AF=0.518797;AO=69;DP=136;FAO=69;FDP=133;FR=.;FRO=64;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=0.00712792;FXX=0.0220572;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.857;QD=21.3605;RBI=0.0127169;REFB=-0.00955232;REVB=0.0105314;RO=62;SAF=43;SAR=26;SRF=26;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177881;STB=0.605337;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0078613;OID=.;OPOS=58120469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:133:62:64:69:69:0.518797:26:43:26:36:26:43:26:38
chr3	58154327	.	C	T	325.82	PASS	AF=0.37037;AO=40;DP=108;FAO=40;FDP=108;FR=.;FRO=68;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=0.00838615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.607;QD=12.0675;RBI=0.0168773;REFB=-0.00868569;REVB=0.0146464;RO=68;SAF=27;SAR=13;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247171;STB=0.641563;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0125599;OID=.;OPOS=58154327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:68:68:40:40:0.37037:13:27:31:37:13:27:31:37
chr3	58179028	.	T	C	746.74	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04748;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.7038;QD=55.3137;RBI=0.051018;REFB=0;REVB=0.0186676;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00534995;OID=.;OPOS=58179028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:54:0:0:49:54:1:21:28:0:0:21:33:0:0
chr3	58191266	.	C	T	804.74	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187807;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.843;QD=57.4811;RBI=0.0188688;REFB=0;REVB=0.00182187;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62134e-06;OID=.;OPOS=58191266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:34:22:0:0:34:22:0:0
chr3	58280206	.	TTA	T,TTT	163.69	PASS	AF=0.545455,0;AO=14,5;DP=43;FAO=18,0;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=4,0;FSAR=14,0;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.116039,0.00518378;FXX=0.108079;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=31.4842,15.4562;QD=19.8409;RBI=0.150063,0.0243089;REFB=-0.0338386,-0.0109764;REVB=0.0951522,0.0237498;RO=20;SAF=2,0;SAR=12,5;SRF=15;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.61237,-0.766227;STB=0.720327,0.5;STBP=0.013,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0300954,0;OID=.,.;OPOS=58280207,58280208;OREF=TA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.545455,0:14,5:43:18,0:33:15:4,0:14,0:10:5:99:20:2,0:12,5:15:5
chr3	58302236	.	A	G	463.72	PASS	AF=0.479167;AO=46;DP=96;FAO=46;FDP=96;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.00369594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.098;QD=19.3215;RBI=0.011858;REFB=-0.0230384;REVB=0.0112673;RO=49;SAF=26;SAR=20;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00586984;STB=0.502761;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0249886;OID=.;OPOS=58302236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:49:50:46:46:0.479167:20:26:28:21:20:26:28:22
chr3	58305033	.	A	C	346.81	PASS	AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00531881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.104;QD=22.3751;RBI=0.0173997;REFB=-0.0115708;REVB=-0.0165668;RO=27;SAF=15;SAR=20;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0423297;STB=0.523351;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.00908502;OID=.;OPOS=58305033;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:20:15:13:14:20:15:13:14
chr3	58305079	.	T	C	301.49	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0147768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.09;QD=16.7492;RBI=0.020423;REFB=-0.0175289;REVB=0.0140977;RO=39;SAF=18;SAR=15;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105403;STB=0.559158;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0159274;OID=.;OPOS=58305079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:15:18:17:22:15:18:17:22
chr3	58305235	.	G	T	88.98	PASS	AF=0.25;AO=11;DP=47;FAO=12;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.00387789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.566;QD=7.41473;RBI=0.0490122;REFB=0.00148521;REVB=0.0488586;RO=28;SAF=8;SAR=3;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911486;STB=0.599822;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=-0.0036947;OID=.;OPOS=58305235;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:47:48:28:36:11:12:0.25:3:8:22:6:3:9:23:13
chr3	58395891	.	C	G	162.54	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0935991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.64;QD=19.7018;RBI=0.0936051;REFB=-0.0280055;REVB=-0.00105717;RO=16;SAF=11;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131229;STB=0.574537;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0180804;OID=.;OPOS=58395891;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:6:11:8:8:6:11:8:8
chr3	58409173	.	A	T	132.31	PASS	AF=0.454545;AO=14;DP=32;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00528339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.996;QD=16.0376;RBI=0.0129497;REFB=-0.0291316;REVB=-0.0118229;RO=17;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135697;STB=0.610954;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0213382;OID=.;OPOS=58409173;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:17:18:14:15:0.454545:4:10:10:7:4:11:10:8
chr3	58416538	.	T	C	1492.85	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.436;QD=63.5256;RBI=0.0315796;REFB=0;REVB=0.024342;RO=0;SAF=53;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.38031e-05;OID=.;OPOS=58416538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:87:94:0:0:87:94:1:34:53:0:0:35:59:0:0
chr3	58484521	.	T	C	537.99	PASS	AF=0.432836;AO=57;DP=133;FAO=58;FDP=134;FR=.;FRO=76;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=0.06985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9835;QD=16.0594;RBI=0.0792487;REFB=-0.00632581;REVB=0.0374346;RO=76;SAF=24;SAR=33;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544949;STB=0.524483;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.00963405;OID=.;OPOS=58484521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:134:76:76:57:58:0.432836:33:24:36:40:33:25:36:40
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chr3	58520306	.	G	C	820.57	PASS	AF=0.983333;AO=48;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0121064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6933;QD=54.7045;RBI=0.0397355;REFB=-0.0977785;REVB=-0.0378463;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509801;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00519694;OID=.;OPOS=58520306;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:60:0:1:48:59:0.983333:25:23:0:0:25:34:0:1
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chr3	58572625	.	G	A	43.92	PASS	AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00340656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.89;QD=6.50677;RBI=0.0270502;REFB=-0.00500536;REVB=0.0268349;RO=20;SAF=5;SAR=2;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0856982;STB=0.555391;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0400945;OID=.;OPOS=58572625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:27:27:20:20:7:7:0.259259:2:5:13:7:2:5:13:7
chr3	58834824	.	A	G	253.29	PASS	AF=0.6;AO=23;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.116879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9335;QD=25.3291;RBI=0.181887;REFB=-0.0792476;REVB=-0.139363;RO=12;SAF=11;SAR=12;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013527;STB=0.549959;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0489244;OID=.;OPOS=58834824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:12:16:23:24:0.6:12:11:6:6:12:12:6:10
chr3	58834890	.	C	T	335.63	PASS	AF=0.45;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.00825092;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.901;QD=16.7816;RBI=0.011045;REFB=-0.00920632;REVB=-0.00734265;RO=41;SAF=17;SAR=19;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10234;STB=0.547593;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0119102;OID=.;OPOS=58834890;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:80:41:44:36:36:0.45:19:17:15:26:19:17:17:27
chr3	59908126	.	A	G	74.28	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0715935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.302;QD=10.246;RBI=0.0717279;REFB=-0.00505354;REVB=0.00438952;RO=17;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136659;STB=0.616207;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0123389;OID=.;OPOS=59908126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:27:29:17:19:10:10:0.344828:6:4:9:8:6:4:11:8
chr3	60519224	.	G	A	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00191524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1602;QD=61.3337;RBI=0.0525403;REFB=0;REVB=0.0525054;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000767995;OID=.;OPOS=60519224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr3	62229553	.	C	T	701.02	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0588516;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.6345;QD=60.9579;RBI=0.059323;REFB=0.0907188;REVB=-0.00746319;RO=1;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199954;STB=0.510634;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.00244042;OID=.;OPOS=62229553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:23:22:0:1:23:22:0:1
chr3	62384314	.	A	G	540.77	PASS	AF=1;AO=29;DP=38;FAO=36;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019191;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.788;QD=60.0859;RBI=0.0277359;REFB=0;REVB=0.0200246;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203125;OID=.;OPOS=62384314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:36:0:0:29:36:1:14:15:0:0:18:18:0:0
chr3	62431415	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.79;QD=43.4861;RBI=0.0210501;REFB=0;REVB=0.0117387;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.92199e-05;OID=.;OPOS=62431415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr3	62452995	.	A	G	191.48	PASS	AF=0.512821;AO=19;DP=37;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.040734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.7375;QD=19.6385;RBI=0.0479439;REFB=-0.030667;REVB=0.0252855;RO=17;SAF=13;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189871;STB=0.614057;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0311392;OID=.;OPOS=62452995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:39:17:19:19:20:0.512821:6:13:8:9:7:13:8:11
chr3	62556622	.	A	G	330.46	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0152747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.639;QD=50.8392;RBI=0.0464855;REFB=-0.111442;REVB=0.0439043;RO=1;SAF=10;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044143;STB=0.52379;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00059185;OID=.;OPOS=62556622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:15:10:1:0:15:10:1:0
chr3	63264201	.	G	A	417.47	PASS	AF=0.374046;AO=46;DP=126;FAO=49;FDP=131;FR=.;FRO=82;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=61;FSRR=21;FWDB=-0.0125556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.578;QD=12.747;RBI=0.122793;REFB=-0.0295003;REVB=0.122149;RO=80;SAF=31;SAR=15;SRF=59;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834985;STB=0.577981;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0499615;OID=.;OPOS=63264201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:131:80:82:46:49:0.374046:15:31:59:21:18:31:61:21
chr3	63817430	.	G	C	223.97	PASS	AF=0.433333;AO=25;DP=59;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0035273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4785;QD=14.9312;RBI=0.0173993;REFB=-0.0308053;REVB=-0.017038;RO=34;SAF=23;SAR=2;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.606245;STB=0.804722;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0147956;OID=.;OPOS=63817430;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:34:34:25:26:0.433333:2:23:16:18:3:23:16:18
chr3	63967900	.	A	G	322.83	PASS	AF=0.363636;AO=40;DP=110;FAO=40;FDP=110;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-5.41171e-05;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=298.829;QD=11.7393;RBI=0.00895635;REFB=-0.0105026;REVB=-0.00895619;RO=70;SAF=28;SAR=12;SRF=34;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249736;STB=0.643604;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0186076;OID=.;OPOS=63967900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:70:70:40:40:0.363636:12:28:34:36:12:28:34:36
chr3	63981215	.	A	G	171.41	PASS	AF=0.461538;AO=17;DP=38;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00516301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.42;QD=17.58;RBI=0.0113141;REFB=-0.0192072;REVB=0.0100673;RO=21;SAF=8;SAR=9;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187863;STB=0.589647;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0149117;OID=.;OPOS=63981215;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:21:21:17:18:0.461538:9:8:14:7:9:9:14:7
chr3	63981479	.	T	C	208.67	PASS	AF=0.666667;AO=19;DP=29;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0142309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.34;QD=27.8226;RBI=0.0149082;REFB=-0.0280649;REVB=0.00444244;RO=10;SAF=1;SAR=18;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306765;STB=0.580555;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.01509;OID=.;OPOS=63981479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:29:30:10:10:19:20:0.666667:18:1:2:8:18:2:2:8
chr3	63982082	.	G	A	65.32	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0244769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.346;QD=10.8859;RBI=0.0321635;REFB=-0.00370194;REVB=-0.0208656;RO=15;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920876;STB=0.555432;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0049383;OID=.;OPOS=63982082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:4:5:7:8:4:5:7:8
chr3	64133350	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.926;QD=39.2067;RBI=0.0429787;REFB=0;REVB=0.00576107;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000708396;OID=.;OPOS=64133350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr3	64497464	.	T	C	1368.2	PASS	AF=0.978022;AO=87;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0523069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.628;QD=60.1405;RBI=0.0579146;REFB=-0.0642722;REVB=0.0248616;RO=1;SAF=36;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920098;STB=0.501905;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.000402108;OID=.;OPOS=64497464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:91:91:1:2:87:89:0.978022:51:36:0:1:52:37:1:1
chr3	64502188	.	C	T	718.13	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0264469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6125;QD=62.4461;RBI=0.0336538;REFB=0;REVB=0.0208119;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00377784;OID=.;OPOS=64502188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:23:22:0:0:24:22:0:0
chr3	64532476	.	G	C	1126.71	PASS	AF=0.908046;AO=79;DP=87;FAO=79;FDP=87;FR=.;FRO=8;FSAF=52;FSAR=27;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.00742686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2059;QD=51.803;RBI=0.0306491;REFB=-0.120386;REVB=-0.0297356;RO=0;SAF=52;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.535706;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.00653921;OID=.;OPOS=64532476;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:87:87:0:8:79:79:0.908046:27:52:0:0:27:52:8:0
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chr3	66374361	.	G	C	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0246318;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.7404;QD=17.3208;RBI=0.0795344;REFB=-0.00700483;REVB=0.0756241;RO=18;SAF=3;SAR=13;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12351;STB=0.571332;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0100466;OID=.;OPOS=66374361;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:13:3:5:13:13:3:5:13
chr3	66396845	.	G	A	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00861823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.729;QD=10.1731;RBI=0.0294073;REFB=-0.0071498;REVB=-0.0281161;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114905;STB=0.571184;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.00951258;OID=.;OPOS=66396845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:4:5:4:2:4:5
chr3	66419956	.	C	T	165.67	PASS	AF=0.362069;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0256813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.371;QD=11.4255;RBI=0.0328917;REFB=-0.0139894;REVB=-0.0205508;RO=36;SAF=12;SAR=9;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254865;STB=0.637555;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0122845;OID=.;OPOS=66419956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:37:21:21:0.362069:9:12:12:24:9:12:13:24
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chr3	66433676	.	A	G	269.32	PASS	AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0515131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0453;QD=14.1746;RBI=0.0812406;REFB=-0.0145966;REVB=-0.0628207;RO=45;SAF=17;SAR=14;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850781;STB=0.548356;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0178946;OID=.;OPOS=66433676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:14:17:21:24:14:17:21:24
chr3	66434643	.	T	C	560.66	PASS	AF=0.535354;AO=52;DP=98;FAO=53;FDP=99;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0173479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.53;QD=22.653;RBI=0.0179463;REFB=-0.023898;REVB=-0.00459568;RO=45;SAF=16;SAR=36;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672316;STB=0.536218;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0292343;OID=.;OPOS=66434643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:45:46:52:53:0.535354:36:16:17:28:37:16:17:29
chr3	66436550	.	G	C	575.96	PASS	AF=0.508621;AO=58;DP=116;FAO=59;FDP=116;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=42;FSRR=15;FWDB=-0.0157644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.175;QD=19.8607;RBI=0.0165417;REFB=-0.0274147;REVB=0.00501109;RO=56;SAF=31;SAR=27;SRF=41;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180131;STB=0.597814;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0257205;OID=.;OPOS=66436550;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:56:57:58:59:0.508621:27:31:41:15:27:32:42:15
chr3	66444615	.	G	A	70.57	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0559956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0234;QD=17.6435;RBI=0.0621661;REFB=-0.00509752;REVB=-0.0270021;RO=7;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123424;STB=0.571275;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.00608278;OID=.;OPOS=66444615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:5:4:2:5:5:4:2:5
chr3	67048762	.	T	C	171.91	PASS	AF=0.4;AO=17;DP=47;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0302964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0302;QD=13.7524;RBI=0.0336156;REFB=-0.0584356;REVB=0.0145648;RO=29;SAF=5;SAR=12;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319821;STB=0.701916;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0720156;OID=.;OPOS=67048762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:50:29:30:17:20:0.4:12:5:17:12:15:5:17:13
chr3	67048763	.	CGGGGC	CCGGGC,CGGC,CGGG	283.79	PASS	AF=0.0714286,0.404762,0.261905;AO=3,11,12;DP=41;FAO=3,17,11;FDP=42;FR=.;FRO=11;FSAF=0,6,4;FSAR=3,11,7;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0716007,-0.176019,-0.399057;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=1,2,2;MLLD=11.1968,21.3016,11.5698;QD=27.0272;RBI=0.0736001,0.176256,0.405116;REFB=-0.125005,-0.0880854,-0.211895;REVB=0.0170385,0.0091394,0.0697997;RO=6;SAF=0,2,6;SAR=3,9,6;SRF=0;SRR=6;SSEN=0,0.445946,0.445946;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0.224874,0.298628;STB=0.99573,0.54255,0.547738;STBP=0.109,0.604,0.661;TYPE=snp,del,del;VARB=0.0987374,-0.0056166,0.179387;OID=.,.,.;OPOS=67048764,67048764,67048767;OREF=G,GG,GC;OALT=C,-,-;OMAPALT=CCGGGC,CGGC,CGGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0714286,0.404762,0.261905:3,11,12:41:3,17,11:42:11:0,6,4:3,11,7:5:6:79:6:0,2,6:3,9,6:0:6
chr3	67411103	.	C	T	198.04	PASS	AF=0.352113;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.0275266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.853;QD=11.1573;RBI=0.0361672;REFB=-0.0172235;REVB=-0.0234596;RO=45;SAF=15;SAR=10;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520654;STB=0.520694;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.039045;OID=.;OPOS=67411103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:45:46:25:25:0.352113:10:15:29:16:10:15:29:17
chr3	67411166	.	A	G	207.63	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0081761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.549;QD=15.1004;RBI=0.0133433;REFB=-0.0102215;REVB=-0.0105449;RO=31;SAF=8;SAR=16;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157233;STB=0.589667;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0178944;OID=.;OPOS=67411166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:16:8:15:16:16:8:15:16
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chr3	69024687	.	C	CT,CTT,CTTT	57.32	PASS	AF=0,0.340909,0;AO=8,7,5;DP=43;FAO=0,15,0;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=0,7,0;FSAR=0,8,0;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.191643,-0.105407,-0.0727004;FXX=0;HRUN=6,6,6;LEN=1,2,3;MLLD=7.40616,13.3146,15.8234;QD=5.21051;RBI=0.40358,0.21636,0.147598;REFB=-0.0297509,-0.0157182,-0.0120999;REVB=-0.355176,-0.188947,-0.128451;RO=23;SAF=3,3,4;SAR=5,4,1;SRF=12;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.172077,-0.109374,0.347454;STB=0.5,0.533289,0.5;STBP=1,0.768,1;TYPE=ins,ins,ins;VARB=-0.0330269,-0.0291121,0.0508543;OID=.,.,.;OPOS=69024688,69024688,69024688;OREF=-,-,-;OALT=T,TT,TTT;OMAPALT=CT,CTT,CTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.340909,0:8,7,5:43:0,15,0:44:29:0,7,0:0,8,0:15:14:41:23:3,3,4:5,4,1:12:11
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chr3	69091716	.	T	C	208.76	PASS	AF=0.456522;AO=20;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00684308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.171;QD=18.1528;RBI=0.00947719;REFB=0.00612364;REVB=0.00655662;RO=24;SAF=7;SAR=13;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149279;STB=0.605957;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.00662533;OID=.;OPOS=69091716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:25:20:21:0.456522:13:7:12:12:14:7:13:12
chr3	69096614	.	G	A	107.42	PASS	AF=0.272727;AO=15;DP=55;FAO=15;FDP=55;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0241546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.439;QD=7.81224;RBI=0.0525818;REFB=-0.0179902;REVB=-0.0467055;RO=40;SAF=8;SAR=7;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991118;STB=0.560306;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0479113;OID=.;OPOS=69096614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:40:40:15:15:0.272727:7:8:18:22:7:8:18:22
chr3	69151152	.	C	A	788.01	PASS	AF=0.393013;AO=90;DP=229;FAO=90;FDP=229;FR=.;FRO=139;FSAF=63;FSAR=27;FSRF=78;FSRR=61;FWDB=-0.036706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1024;QD=13.7644;RBI=0.0367125;REFB=0.017046;REVB=0.000687457;RO=138;SAF=63;SAR=27;SRF=77;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16748;STB=0.592856;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.0257874;OID=.;OPOS=69151152;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:229:229:138:139:90:90:0.393013:27:63:77:61:27:63:78:61
chr3	69154386	.	T	A	249.55	PASS	AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.00603023;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=372.888;QD=14.2598;RBI=0.0132113;REFB=-0.00505333;REVB=-0.0117548;RO=41;SAF=15;SAR=14;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121455;STB=0.568834;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00742401;OID=.;OPOS=69154386;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:41:41:29:29:0.414286:14:15:26:15:14:15:26:15
chr3	69158231	.	T	C	350.54	PASS	AF=0.445783;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.00298683;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.242;QD=16.8937;RBI=0.0396998;REFB=-0.0339543;REVB=-0.0395873;RO=43;SAF=21;SAR=16;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120643;STB=0.549711;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0470314;OID=.;OPOS=69158231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:43:46:37:37:0.445783:16:21:19:24:16:21:22:24
chr3	69230061	.	G	A	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.359;QD=58.5854;RBI=0.0239387;REFB=0;REVB=0.00552802;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000113107;OID=.;OPOS=69230061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr3	69230801	.	G	A	714.64	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0240435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.426;QD=60.8203;RBI=0.122015;REFB=-0.042592;REVB=0.119623;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.508193;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00064871;OID=.;OPOS=69230801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:0:1:46:46:0.978723:16:30:0:0:16:30:1:0
chr3	69245454	.	T	C	1044.31	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0038079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.274;QD=59.6748;RBI=0.00947058;REFB=0;REVB=-0.00867132;RO=0;SAF=43;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.49884e-05;OID=.;OPOS=69245454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:27:43:0:0:27:43:0:0
chr3	69246152	.	A	G	1249.33	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0526531;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7499;QD=60.2088;RBI=0.0533737;REFB=-0.0422304;REVB=0.00874096;RO=1;SAF=56;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00838273;STB=0.504424;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00332646;OID=.;OPOS=69246152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:1:1:82:82:0.987952:26:56:1:0:26:56:1:0
chr3	70016904	.	C	T	960.73	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.538;QD=57.3568;RBI=0.0448725;REFB=0;REVB=0.0187807;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251405;OID=.;OPOS=70016904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:67:0:0:59:67:1:29:30:0:0:31:36:0:0
chr3	72426901	.	A	G	5536.87	PASS	AF=1;AO=352;DP=354;FAO=356;FDP=356;FR=.;FRO=0;FSAF=208;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.755;QD=62.212;RBI=0.160978;REFB=-0.0381348;REVB=0.100199;RO=1;SAF=205;SAR=147;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00232191;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000578566;OID=.;OPOS=72426901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:27:354:356:1:0:352:356:1:147:205:1:0:148:208:0:0
chr3	72495777	.	C	G	638.67	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0569908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6457;QD=59.4109;RBI=0.0642402;REFB=0.0349091;REVB=0.0296452;RO=1;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323448;STB=0.517233;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=-0.0127991;OID=.;OPOS=72495777;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:14:28:0:1:14:28:0:1
chr3	72495945	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.512;QD=53.2772;RBI=0.040125;REFB=0;REVB=0.0127155;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241309;OID=.;OPOS=72495945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
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chr3	73112489	.	A	G	31.6	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00655404;FXX=0;HRUN=22;LEN=1;MLLD=253.513;QD=14.0438;RBI=0.00661298;REFB=0.000617427;REVB=-0.000880935;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.425125;STB=0.760793;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.000105884;OID=.;OPOS=73112489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:4:1:3:1:4:1:3:1
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chr3	73433369	.	G	A	53.97	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0461196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2786;QD=8.30234;RBI=0.0837628;REFB=-0.0299663;REVB=0.0699228;RO=18;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124219;STB=0.576735;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0708473;OID=.;OPOS=73433369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:18:18:8:8:0.307692:4:4:11:7:4:4:11:7
chr3	73433494	.	T	C	37.8	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0346748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.697;QD=9.45054;RBI=0.0417183;REFB=-0.0153705;REVB=0.0231964;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100718;STB=0.562295;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0376124;OID=.;OPOS=73433494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:3:3:6:4:3:3:6:4
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chr3	75679973	.	A	G	254.94	PASS	AF=0.323529;AO=33;DP=103;FAO=33;FDP=102;FR=.;FRO=69;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=-0.0103151;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.592;QD=9.99756;RBI=0.0116716;REFB=-0.0106179;REVB=-0.00546111;RO=68;SAF=18;SAR=15;SRF=26;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187278;STB=0.61261;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0341523;OID=.;OPOS=75679973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:102:68:69:33:33:0.323529:15:18:26:42:15:18:26:43
chr3	75680006	.	T	C	206.45	PASS	AF=0.27027;AO=30;DP=111;FAO=30;FDP=111;FR=.;FRO=81;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=51;FWDB=0.0127471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.76;QD=7.43968;RBI=0.0176129;REFB=-0.00561033;REVB=-0.0121543;RO=79;SAF=14;SAR=16;SRF=29;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12341;STB=0.571208;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0142434;OID=.;OPOS=75680006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:79:81:30:30:0.27027:16:14:29:50:16:14:30:51
chr3	75680010	.	TG	CA,CG	243.12	PASS	AF=0.0900901,0.225225;AO=10,25;DP=111;FAO=10,25;FDP=111;FR=.;FRO=76;FSAF=3,15;FSAR=7,10;FSRF=26;FSRR=50;FWDB=-0.0171448,-0.0332696;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=97.4859,85.0846;QD=8.76116;RBI=0.0176912,0.0345015;REFB=-0.00464227,-0.00271706;REVB=0.004363,0.00913711;RO=76;SAF=3,15;SAR=7,10;SRF=26;SRR=50;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0576176,0.31147;STB=0.542693,0.686884;STBP=0.801,0.037;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00515473,0.0120772;OID=.,.;OPOS=75680010,75680010;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:111:111:76:76:10,25:10,25:0.0900901,0.225225:7,10:3,15:26:50:7,10:3,15:26:50
chr3	75713669	.	G	A	34.02	PASS	AF=0.171429;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.114812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2459;QD=3.88793;RBI=0.119159;REFB=0.0034784;REVB=-0.0318914;RO=27;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257563;STB=0.722046;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=-0.0295261;OID=.;OPOS=75713669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:35:35:27:29:6:6:0.171429:5:1:9:18:5:1:11:18
chr3	75714298	.	A	G	590.31	PASS	AF=0.473684;AO=59;DP=129;FAO=63;FDP=133;FR=.;FRO=70;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=0.00240787;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.566;QD=17.7536;RBI=0.00678146;REFB=-0.00836512;REVB=0.00633958;RO=69;SAF=36;SAR=23;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129932;STB=0.579229;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0108163;OID=.;OPOS=75714298;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:133:69:70:59:63:0.473684:23:36:33:36:24:39:33:37
chr3	75714311	.	G	A	127.01	PASS	AF=0.164384;AO=25;DP=146;FAO=24;FDP=146;FR=.;FRO=122;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=64;FSRR=58;FWDB=0.00653807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.888;QD=3.47967;RBI=0.0315235;REFB=-0.00737595;REVB=-0.0308381;RO=115;SAF=16;SAR=9;SRF=62;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13242;STB=0.622537;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00588293;OID=.;OPOS=75714311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:146:115:122:25:24:0.164384:9:16:62:53:8:16:64:58
chr3	75714337	.	T	G	858.95	PASS	AF=0.54902;AO=84;DP=154;FAO=84;FDP=153;FR=.;FRO=69;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=0.00924115;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.371;QD=22.4562;RBI=0.01052;REFB=-0.0184837;REVB=-0.00502708;RO=69;SAF=50;SAR=34;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980872;STB=0.553609;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0134884;OID=.;OPOS=75714337;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:153:69:69:84:84:0.54902:34:50:33:36:34:50:33:36
chr3	75714345	.	G	T	226.44	PASS	AF=0.230263;AO=35;DP=153;FAO=35;FDP=152;FR=.;FRO=117;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=61;FSRR=56;FWDB=-0.0186864;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.474;QD=5.95894;RBI=0.0245201;REFB=-0.0117155;REVB=-0.0158762;RO=115;SAF=20;SAR=15;SRF=59;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.073993;STB=0.538877;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0239811;OID=.;OPOS=75714345;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:152:115:117:35:35:0.230263:15:20:59:56:15:20:61:56
chr3	75714702	.	A	G	589.69	PASS	AF=0.55102;AO=53;DP=98;FAO=54;FDP=98;FR=.;FRO=44;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0131457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.324;QD=24.0688;RBI=0.0576708;REFB=-0.00684538;REVB=0.0561526;RO=44;SAF=29;SAR=24;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951822;STB=0.555535;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00429869;OID=.;OPOS=75714702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:44:44:53:54:0.55102:24:29:19:25:24:30:19:25
chr3	75714709	.	G	T	38.0	PASS	AF=0.0917431;AO=10;DP=109;FAO=10;FDP=109;FR=.;FRO=99;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=53;FSRR=46;FWDB=-0.00882479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.468;QD=1.39439;RBI=0.00946617;REFB=0.000364527;REVB=-0.0034251;RO=93;SAF=7;SAR=3;SRF=50;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195416;STB=0.655511;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=-0.0248748;OID=.;OPOS=75714709;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:109:109:93:99:10:10:0.0917431:3:7:50:43:3:7:53:46
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chr3	75714831	.	G	A	229.32	PASS	AF=0.168539;AO=45;DP=263;FAO=45;FDP=267;FR=.;FRO=222;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=96;FSRR=126;FWDB=-0.0222772;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.58;QD=3.43551;RBI=0.0225488;REFB=-0.00556227;REVB=-0.00348945;RO=218;SAF=16;SAR=29;SRF=94;SRR=124;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10202;STB=0.567009;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0341135;OID=.;OPOS=75714831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:263:267:218:222:45:45:0.168539:29:16:94:124:29:16:96:126
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chr3	75714840	.	A	G	1183.05	PASS	AF=0.44964;AO=124;DP=275;FAO=125;FDP=278;FR=.;FRO=153;FSAF=51;FSAR=74;FSRF=63;FSRR=90;FWDB=-0.00908916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8257;QD=17.0223;RBI=0.0278312;REFB=-0.00924131;REVB=0.0263052;RO=151;SAF=51;SAR=73;SRF=62;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000711001;STB=0.502143;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0127842;OID=.;OPOS=75714840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:275:278:151:153:124:125:0.44964:73:51:62:89:74:51:63:90
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chr3	75714929	.	G	A	459.0	PASS	AF=0.237288;AO=70;DP=295;FAO=70;FDP=295;FR=.;FRO=225;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=98;FSRR=127;FWDB=-0.0534991;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.043;QD=6.22375;RBI=0.0660838;REFB=-0.0284745;REVB=-0.0387932;RO=225;SAF=37;SAR=33;SRF=98;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117586;STB=0.570582;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.056558;OID=.;OPOS=75714929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:295:295:225:225:70:70:0.237288:33:37:98:127:33:37:98:127
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chr3	75714976	.	C	T	503.9	PASS	AF=0.321782;AO=64;DP=201;FAO=65;FDP=202;FR=.;FRO=137;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=63;FSRR=74;FWDB=0.0389712;FXX=0.00980344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.596;QD=9.97811;RBI=0.0391157;REFB=-0.00884616;REVB=0.00335922;RO=135;SAF=28;SAR=36;SRF=61;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170926;STB=0.509379;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0188915;OID=.;OPOS=75714976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:201:202:135:137:64:65:0.321782:36:28:61:74:36:29:63:74
chr3	75714980	.	C	A	260.39	PASS	AF=0.211055;AO=41;DP=199;FAO=42;FDP=199;FR=.;FRO=157;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=69;FSRR=88;FWDB=0.00911288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.163;QD=5.23386;RBI=0.0332692;REFB=-0.0108385;REVB=0.0319968;RO=156;SAF=21;SAR=20;SRF=68;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0975663;STB=0.566222;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0175697;OID=.;OPOS=75714980;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:199:156:157:41:42:0.211055:20:21:68:88:20:22:69:88
chr3	75715118	.	G	A	77.44	PASS	AF=0.19697;AO=13;DP=67;FAO=13;FDP=66;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0113232;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.311;QD=4.69333;RBI=0.0117638;REFB=-0.0112593;REVB=0.00318941;RO=51;SAF=11;SAR=2;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.491354;STB=0.820373;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0403067;OID=.;OPOS=75715118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:67:66:51:53:13:13:0.19697:2:11:24:27:2:11:25:28
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chr3	75786036	.	A	C	195.51	PASS	AF=0.202454;AO=33;DP=151;FAO=33;FDP=163;FR=.;FRO=130;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=83;FSRR=47;FWDB=-0.0159805;FXX=0.0121205;HRUN=6;LEN=1;MLLD=182.131;QD=4.79766;RBI=0.0348469;REFB=-0.00782345;REVB=-0.0309666;RO=99;SAF=25;SAR=8;SRF=61;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205653;STB=0.614039;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0237646;OID=.;OPOS=75786036;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:163:99:130:33:33:0.202454:8:25:61:38:8:25:83:47
chr3	75786042	.	G	A	279.24	PASS	AF=0.264706;AO=41;DP=167;FAO=45;FDP=170;FR=.;FRO=125;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=83;FSRR=42;FWDB=-0.00687406;FXX=0.00584761;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.732;QD=6.57038;RBI=0.00754087;REFB=-0.013416;REVB=-0.00310034;RO=126;SAF=25;SAR=16;SRF=83;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658056;STB=0.515825;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0336645;OID=.;OPOS=75786042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:170:126:125:41:45:0.264706:16:25:83:43:16:29:83:42
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chr3	75786071	.	C	A	155.31	PASS	AF=0.149321;AO=33;DP=221;FAO=33;FDP=221;FR=.;FRO=188;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=117;FSRR=71;FWDB=-0.00614203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.779;QD=2.81111;RBI=0.0155302;REFB=-0.00187969;REVB=-0.014264;RO=187;SAF=20;SAR=13;SRF=116;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019249;STB=0.514582;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0116773;OID=.;OPOS=75786071;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:221:221:187:188:33:33:0.149321:13:20:116:71:13:20:117:71
chr3	75786073	.	C	G	374.24	PASS	AF=0.253394;AO=56;DP=220;FAO=56;FDP=221;FR=.;FRO=165;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=101;FSRR=64;FWDB=0.0215176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9186;QD=6.77352;RBI=0.0381056;REFB=0.000561298;REVB=-0.0314489;RO=163;SAF=35;SAR=21;SRF=100;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0152377;STB=0.5102;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=-0.00230658;OID=.;OPOS=75786073;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:220:221:163:165:56:56:0.253394:21:35:100:63:21:35:101:64
chr3	75786079	.	CG	CA,TA	659.81	PASS	AF=0.25,0.173913;AO=46,34;DP=223;FAO=46,32;FDP=184;FR=.;FRO=106;FSAF=28,20;FSAR=18,12;FSRF=61;FSRR=45;FWDB=0.000323387,-0.0156148;FXX=0.17488;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=143.89,124.531;QD=14.3437;RBI=0.00625203,0.0215325;REFB=-0.0140079,-0.0179164;REVB=0.00624366,-0.0148265;RO=105;SAF=28,21;SAR=18,13;SRF=60;SRR=45;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0460127,0.0599295;STB=0.524054,0.539748;STBP=0.702,0.634;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0173287,0.0258529;OID=.,.;OPOS=75786080,75786079;OREF=G,CG;OALT=A,TA;OMAPALT=CA,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:223:184:105:106:46,34:46,32:0.25,0.173913:18,13:28,21:60:45:18,12:28,20:61:45
chr3	75786132	.	T	C	216.66	PASS	AF=0.172996;AO=41;DP=238;FAO=41;FDP=237;FR=.;FRO=196;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=108;FSRR=88;FWDB=-0.0166455;FXX=0.0042015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.332;QD=3.65676;RBI=0.0212001;REFB=-0.00377556;REVB=-0.013129;RO=194;SAF=23;SAR=18;SRF=107;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123129;STB=0.508336;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0267095;OID=.;OPOS=75786132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:238:237:194:196:41:41:0.172996:18:23:107:87:18:23:108:88
chr3	75786163	.	C	T	247.82	PASS	AF=0.209424;AO=42;DP=192;FAO=40;FDP=191;FR=.;FRO=151;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=71;FSRR=80;FWDB=-0.0213538;FXX=0.0103622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.056;QD=5.1899;RBI=0.0478028;REFB=-0.00576079;REVB=-0.0427683;RO=149;SAF=21;SAR=21;SRF=71;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298959;STB=0.503805;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0356031;OID=.;OPOS=75786163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:192:191:149:151:42:40:0.209424:21:21:71:78:21:19:71:80
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chr3	75786202	.	TG	CA	172.43	PASS	AF=0.21374;AO=28;DP=131;FAO=28;FDP=131;FR=.;FRO=103;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=38;FSRR=65;FWDB=0.00813548;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=2;MLLD=310.412;QD=5.26496;RBI=0.00956779;REFB=-0.00447034;REVB=0.00503553;RO=102;SAF=16;SAR=12;SRF=38;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248192;STB=0.655214;STBP=0.08;TYPE=mnp;VARB=0.0117191;OID=.;OPOS=75786202;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:102:103:28:28:0.21374:12:16:38:64:12:16:38:65
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chr3	75786261	.	C	T	81.47	PASS	AF=0.191781;AO=14;DP=73;FAO=14;FDP=73;FR=.;FRO=59;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.0192906;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.921;QD=4.46432;RBI=0.020051;REFB=-0.0124527;REVB=-0.00546935;RO=59;SAF=4;SAR=10;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207196;STB=0.63539;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0243565;OID=.;OPOS=75786261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:73:73:59:59:14:14:0.191781:10:4:26:33:10:4:26:33
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chr3	75786415	.	C	T	33.72	PASS	AF=0.1;AO=8;DP=80;FAO=8;FDP=80;FR=.;FRO=72;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=-0.0117982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.728;QD=1.68604;RBI=0.0667279;REFB=-0.00215497;REVB=-0.0656766;RO=72;SAF=7;SAR=1;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419417;STB=0.837099;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0495192;OID=.;OPOS=75786415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:80:80:72:72:8:8:0.1:1:7:39:33:1:7:39:33
chr3	75786440	.	C	T	537.02	PASS	AF=0.568182;AO=50;DP=87;FAO=50;FDP=88;FR=.;FRO=38;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.084558;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.4794;QD=24.4098;RBI=0.0931167;REFB=-0.00602827;REVB=-0.0389955;RO=36;SAF=27;SAR=23;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985362;STB=0.55164;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00294461;OID=.;OPOS=75786440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:36:38:50:50:0.568182:23:27:24:12:23:27:25:13
chr3	75786453	.	C	T	38.77	PASS	AF=0.107143;AO=9;DP=84;FAO=9;FDP=84;FR=.;FRO=75;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=-0.0032619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.419;QD=1.84637;RBI=0.0320949;REFB=-0.0133763;REVB=-0.0319287;RO=74;SAF=6;SAR=3;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13792;STB=0.599772;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0587479;OID=.;OPOS=75786453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:84:84:74:75:9:9:0.107143:3:6:41:33:3:6:42:33
chr3	75786499	.	CA	CG,TG	33.14	PASS	AF=0.0571429,0.0571429;AO=4,4;DP=71;FAO=4,4;FDP=70;FR=.;FRO=62;FSAF=2,3;FSAR=2,1;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.0213024,-0.0178084;FXX=0.0140825;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=176.652,253.638;QD=1.89381;RBI=0.0290574,0.0241727;REFB=-0.00347033,-0.00395972;REVB=-0.0197622,-0.0163456;RO=61;SAF=2,3;SAR=2,1;SRF=32;SRR=29;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0238197,0.223188;STB=0.530153,0.713177;STBP=0.922,0.428;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0428645,0.0524155;OID=.,.;OPOS=75786500,75786499;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:14:71:70:61:62:4,4:4,4:0.0571429,0.0571429:2,1:2,3:32:29:2,1:2,3:33:29
chr3	75786515	.	GG	AG,AT	47.59	PASS	AF=0.102941,0.0441176;AO=7,4;DP=69;FAO=7,3;FDP=68;FR=.;FRO=58;FSAF=5,2;FSAR=2,1;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=0.00434172,-0.00105981;FXX=0.0144907;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=203.023,205;QD=2.79948;RBI=0.00452622,0.00370576;REFB=-0.00154699,-0.000728666;REVB=-0.0012791,-0.00355098;RO=58;SAF=5,3;SAR=2,1;SRF=33;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.178976,0.188059;STB=0.639393,0.597035;STBP=0.509,0.726;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00744496,0.0261199;OID=.,.;OPOS=75786515,75786515;OREF=G,GG;OALT=A,AT;OMAPALT=AG,AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:69:68:58:58:7,4:7,3:0.102941,0.0441176:2,1:5,3:33:25:2,1:5,2:33:25
chr3	75786555	.	C	CTG	131.83	PASS	AF=0.36;AO=13;DP=77;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.000309787;FXX=0.350604;HRUN=0;LEN=2;MLLD=196.891;QD=10.5466;RBI=0.00776144;REFB=-0.0115766;REVB=0.00775525;RO=57;SAF=11;SAR=2;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425875;STB=0.507454;STBP=0.973;TYPE=ins;VARB=0.00780652;OID=.;OPOS=75786556;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.36:13:77:18:50:32:12:6:21:11:99:57:11:2:31:26
chr3	75786556	.	A	C	180.5	PASS	AF=0.328571;AO=23;DP=77;FAO=23;FDP=70;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=14;FWDB=-0.00789841;FXX=0.0908973;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.517;QD=10.3142;RBI=0.00812318;REFB=0.000963903;REVB=-0.00189769;RO=48;SAF=10;SAR=13;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30912;STB=0.674167;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=-0.0169402;OID=.;OPOS=75786556;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:70:48:47:23:23:0.328571:13:10:34:14:13:10:33:14
chr3	75786623	.	G	T	107.72	PASS	AF=0.226667;AO=17;DP=75;FAO=17;FDP=75;FR=.;FRO=58;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=0.0074274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.962;QD=5.74487;RBI=0.0102097;REFB=-0.00253182;REVB=-0.00700519;RO=58;SAF=5;SAR=12;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410997;STB=0.753083;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0202846;OID=.;OPOS=75786623;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:58:58:17:17:0.226667:12:5:37:21:12:5:37:21
chr3	75786628	.	G	C	162.21	PASS	AF=0.305556;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0192015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.788;QD=9.01167;RBI=0.0194784;REFB=-0.00836154;REVB=0.00327272;RO=49;SAF=10;SAR=12;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135708;STB=0.572799;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.0156557;OID=.;OPOS=75786628;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:49:50:22:22:0.305556:12:10:28:21:12:10:28:22
chr3	75786662	.	A	T	59.56	PASS	AF=0.136364;AO=12;DP=86;FAO=12;FDP=88;FR=.;FRO=76;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=37;FSRR=39;FWDB=-0.003234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.116;QD=2.7072;RBI=0.0139807;REFB=-0.00373741;REVB=-0.0136015;RO=73;SAF=8;SAR=4;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232108;STB=0.656226;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0497571;OID=.;OPOS=75786662;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:86:88:73:76:12:12:0.136364:4:8:35:38:4:8:37:39
chr3	75786670	.	G	A	117.81	PASS	AF=0.218391;AO=18;DP=87;FAO=19;FDP=87;FR=.;FRO=68;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=-0.0219764;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.996;QD=5.41655;RBI=0.0237196;REFB=-0.00746899;REVB=-0.00892517;RO=67;SAF=6;SAR=12;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29002;STB=0.688958;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0261058;OID=.;OPOS=75786670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:67:68:18:19:0.218391:12:6:38:29:13:6:38:30
chr3	75786672	.	C	T	62.01	PASS	AF=0.149425;AO=9;DP=83;FAO=13;FDP=87;FR=.;FRO=74;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=36;FSRR=38;FWDB=0.00507133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.847;QD=2.85125;RBI=0.0168533;REFB=-0.00666646;REVB=-0.0160722;RO=71;SAF=7;SAR=2;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345132;STB=0.60976;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0363038;OID=.;OPOS=75786672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:83:87:71:74:9:13:0.149425:2:7:35:36:5:8:36:38
chr3	75786681	.	G	A	401.52	PASS	AF=0.482353;AO=40;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00966556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.356;QD=18.8951;RBI=0.0112442;REFB=-0.0189553;REVB=0.00574528;RO=44;SAF=21;SAR=19;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448158;STB=0.518063;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0173706;OID=.;OPOS=75786681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:44:44:40:41:0.482353:19:21:21:23:20:21:21:23
chr3	75786684	.	G	T	85.88	PASS	AF=0.178571;AO=15;DP=85;FAO=15;FDP=84;FR=.;FRO=69;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=-0.0190364;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.216;QD=4.08975;RBI=0.0193209;REFB=-0.00678472;REVB=-0.00330339;RO=70;SAF=9;SAR=6;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161181;STB=0.599867;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0331464;OID=.;OPOS=75786684;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:85:84:70:69:15:15:0.178571:6:9:33:37:6:9:33:36
chr3	75786737	.	A	T	343.26	PASS	AF=0.486486;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0151912;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.954;QD=18.5548;RBI=0.016851;REFB=0.000589752;REVB=-0.00729272;RO=36;SAF=17;SAR=19;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755242;STB=0.52642;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=-0.00113791;OID=.;OPOS=75786737;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:36:38:36:36:0.486486:19:17:14:22:19:17:16:22
chr3	75786740	.	CA	CG,GG	149.18	PASS	AF=0.22973,0.0675676;AO=17,5;DP=73;FAO=17,5;FDP=74;FR=.;FRO=52;FSAF=6,3;FSAR=11,2;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.00942514,0.00883066;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=142.2,139.684;QD=8.06358;RBI=0.0136117,0.0205967;REFB=0.00695789,-0.00285237;REVB=0.00982061,0.0186076;RO=51;SAF=6,3;SAR=11,2;SRF=23;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.124525,0.161559;STB=0.570577,0.640829;STBP=0.539,0.508;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0124669,0.0172451;OID=.,.;OPOS=75786741,75786740;OREF=A,CA;OALT=G,GG;OMAPALT=CG,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:51:52:17,5:17,5:0.22973,0.0675676:11,2:6,3:23:28:11,2:6,3:23:29
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chr3	75786753	.	C	T	245.74	PASS	AF=0.444444;AO=27;DP=62;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0046733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.539;QD=15.6023;RBI=0.0143259;REFB=-0.0117162;REVB=0.0135422;RO=34;SAF=8;SAR=19;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296357;STB=0.680618;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0224806;OID=.;OPOS=75786753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:34:35:27:28:0.444444:19:8:20:14:20:8:21:14
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chr3	75786827	.	A	T	143.24	PASS	AF=0.289855;AO=18;DP=68;FAO=20;FDP=69;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00676954;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.214;QD=8.30395;RBI=0.0119596;REFB=-0.0148823;REVB=0.00985926;RO=50;SAF=11;SAR=7;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112109;STB=0.528356;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0225528;OID=.;OPOS=75786827;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:50:49:18:20:0.289855:7:11:26:24:9:11:25:24
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chr3	75786845	.	T	C	545.47	PASS	AF=0.695652;AO=39;DP=72;FAO=48;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0350806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.654;QD=31.6211;RBI=0.0445987;REFB=-0.061447;REVB=0.0275389;RO=22;SAF=26;SAR=13;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236305;STB=0.583146;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0250164;OID=.;OPOS=75786845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:69:22:21:39:48:0.695652:13:26:7:15:19:29:7:14
chr3	75786854	.	A	T	66.81	PASS	AF=0.147727;AO=15;DP=88;FAO=13;FDP=88;FR=.;FRO=75;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=40;FWDB=-0.0312548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.062;QD=3.03659;RBI=0.0489331;REFB=-0.00190939;REVB=-0.0376509;RO=71;SAF=6;SAR=9;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117653;STB=0.504387;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0127;OID=.;OPOS=75786854;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:88:88:71:75:15:13:0.147727:9:6:35:36:7:6:35:40
chr3	75786866	.	G	T	141.94	PASS	AF=0.214953;AO=23;DP=107;FAO=23;FDP=107;FR=.;FRO=84;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=38;FSRR=46;FWDB=-0.0229076;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.034;QD=5.30609;RBI=0.0500982;REFB=-0.01237;REVB=-0.0445541;RO=84;SAF=11;SAR=12;SRF=38;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0327325;STB=0.520374;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0382869;OID=.;OPOS=75786866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:84:84:23:23:0.214953:12:11:38:46:12:11:38:46
chr3	75786888	.	C	T	305.69	PASS	AF=0.314961;AO=40;DP=127;FAO=40;FDP=127;FR=.;FRO=87;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=55;FWDB=0.0187801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.392;QD=9.62792;RBI=0.0349403;REFB=-0.0100889;REVB=-0.029464;RO=87;SAF=20;SAR=20;SRF=32;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156219;STB=0.590507;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0170732;OID=.;OPOS=75786888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:87:87:40:40:0.314961:20:20:32:55:20:20:32:55
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chr3	75786919	.	A	T	172.5	PASS	AF=0.172973;AO=33;DP=183;FAO=32;FDP=185;FR=.;FRO=153;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=73;FSRR=80;FWDB=-0.000344252;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.373;QD=3.72976;RBI=0.0213584;REFB=-0.00176889;REVB=-0.0213556;RO=144;SAF=16;SAR=17;SRF=67;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251597;STB=0.506943;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0139333;OID=.;OPOS=75786919;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:185:144:153:33:32:0.172973:17:16:67:77:17:15:73:80
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chr3	75787199	.	A	C	87.32	PASS	AF=0.154545;AO=17;DP=110;FAO=17;FDP=110;FR=.;FRO=93;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=42;FSRR=51;FWDB=-0.0384099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.736;QD=3.17514;RBI=0.0416577;REFB=-0.00426422;REVB=-0.0161259;RO=92;SAF=13;SAR=4;SRF=41;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400707;STB=0.764395;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0294185;OID=.;OPOS=75787199;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:110:110:92:93:17:17:0.154545:4:13:41:51:4:13:42:51
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chr3	75787576	.	A	G	133.17	PASS	AF=0.164474;AO=25;DP=153;FAO=25;FDP=152;FR=.;FRO=127;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=78;FSRR=49;FWDB=0.00674898;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.399;QD=3.50434;RBI=0.0136443;REFB=-0.00942712;REVB=0.0118583;RO=122;SAF=20;SAR=5;SRF=74;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289465;STB=0.687732;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0283818;OID=.;OPOS=75787576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:152:122:127:25:25:0.164474:5:20:74:48:5:20:78:49
chr3	75787583	.	AC	GA,GC	118.38	PASS	AF=0.0993377,0.0662252;AO=15,10;DP=150;FAO=15,10;FDP=151;FR=.;FRO=126;FSAF=11,8;FSAR=4,2;FSRF=78;FSRR=48;FWDB=0.0124006,-0.0149082;FXX=0.00657851;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=167.793,90.2801;QD=3.13601;RBI=0.0241094,0.0190318;REFB=-0.00540201,-0.0116362;REVB=-0.0206758,-0.0118303;RO=124;SAF=11,8;SAR=4,2;SRF=77;SRR=47;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.152146,0.223943;STB=0.616215,0.698861;STBP=0.393,0.244;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0367789,0.0527481;OID=.,.;OPOS=75787583,75787583;OREF=AC,A;OALT=GA,G;OMAPALT=GA,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:150:151:124:126:15,10:15,10:0.0993377,0.0662252:4,2:11,8:77:47:4,2:11,8:78:48
chr3	75787620	.	T	C	235.99	PASS	AF=0.238095;AO=35;DP=147;FAO=35;FDP=147;FR=.;FRO=112;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=69;FSRR=43;FWDB=0.0562696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4168;QD=6.42154;RBI=0.0567341;REFB=-0.00334086;REVB=0.00724503;RO=111;SAF=23;SAR=12;SRF=68;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603214;STB=0.533961;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.00737122;OID=.;OPOS=75787620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:111:112:35:35:0.238095:12:23:68:43:12:23:69:43
chr3	75787637	.	C	T	219.32	PASS	AF=0.240876;AO=33;DP=136;FAO=33;FDP=137;FR=.;FRO=104;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=65;FSRR=39;FWDB=-0.0178887;FXX=0.0143875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.211;QD=6.40334;RBI=0.0334536;REFB=-0.0137297;REVB=-0.028269;RO=99;SAF=19;SAR=14;SRF=62;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652284;STB=0.538685;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0532238;OID=.;OPOS=75787637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:137:99:104:33:33:0.240876:14:19:62:37:14:19:65:39
chr3	75787645	.	GAA	G	114.03	PASS	AF=0.258333;AO=22;DP=127;FAO=31;FDP=120;FR=.;FRO=89;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=56;FSRR=33;FWDB=-0.0609772;FXX=0.0769172;HRUN=4;LEN=2;MLLD=31.7625;QD=3.80107;RBI=0.0702715;REFB=0.00170257;REVB=-0.0349266;RO=69;SAF=13;SAR=9;SRF=43;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418058;STB=0.561192;STBP=0.473;TYPE=del;VARB=-0.0122741;OID=.;OPOS=75787646;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.258333:22:127:31:120:89:17:14:56:33:99:69:13:9:43:26
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chr3	75787863	.	AT	TA	281.29	PASS	AF=0.193798;AO=50;DP=259;FAO=50;FDP=258;FR=.;FRO=208;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=110;FSRR=98;FWDB=-0.0108179;FXX=0.00769201;HRUN=1;LEN=2;MLLD=215.586;QD=4.36108;RBI=0.0207461;REFB=-0.00900765;REVB=-0.0177024;RO=207;SAF=32;SAR=18;SRF=110;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143645;STB=0.592177;STBP=0.147;TYPE=mnp;VARB=0.0275551;OID=.;OPOS=75787863;OREF=AT;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:259:258:207:208:50:50:0.193798:18:32:110:97:18:32:110:98
chr3	75787869	.	CA	TG	1340.34	PASS	AF=0.520325;AO=128;DP=246;FAO=128;FDP=246;FR=.;FRO=118;FSAF=83;FSAR=45;FSRF=59;FSRR=59;FWDB=-0.00793637;FXX=0.00404842;HRUN=1;LEN=2;MLLD=136.192;QD=21.7942;RBI=0.0245733;REFB=-0.0176592;REVB=-0.0232564;RO=118;SAF=83;SAR=45;SRF=59;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136184;STB=0.574612;STBP=0.02;TYPE=mnp;VARB=0.0124593;OID=.;OPOS=75787869;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:246:246:118:118:128:128:0.520325:45:83:59:59:45:83:59:59
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chr3	75787880	.	A	G	327.23	PASS	AF=0.212851;AO=53;DP=247;FAO=53;FDP=249;FR=.;FRO=196;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=111;FSRR=85;FWDB=-0.0252497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.983;QD=5.25664;RBI=0.0392552;REFB=-0.00233554;REVB=-0.030057;RO=193;SAF=33;SAR=20;SRF=109;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076753;STB=0.546082;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0148079;OID=.;OPOS=75787880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:247:249:193:196:53:53:0.212851:20:33:109:84:20:33:111:85
chr3	75787897	.	T	C	93.41	PASS	AF=0.110132;AO=25;DP=228;FAO=25;FDP=227;FR=.;FRO=202;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=117;FSRR=85;FWDB=0.00413867;FXX=0.00438577;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.093;QD=1.64605;RBI=0.00623406;REFB=-0.00201467;REVB=0.00466207;RO=200;SAF=13;SAR=12;SRF=115;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684725;STB=0.552954;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0182913;OID=.;OPOS=75787897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:228:227:200:202:25:25:0.110132:12:13:115:85:12:13:117:85
chr3	75787918	.	C	T	201.94	PASS	AF=0.17757;AO=38;DP=214;FAO=38;FDP=214;FR=.;FRO=176;FSAF=31;FSAR=7;FSRF=93;FSRR=83;FWDB=-0.0299506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.614;QD=3.77458;RBI=0.039866;REFB=-0.00209928;REVB=-0.0263109;RO=173;SAF=31;SAR=7;SRF=92;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400896;STB=0.762562;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0132779;OID=.;OPOS=75787918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:214:214:173:176:38:38:0.17757:7:31:92:81:7:31:93:83
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chr3	75787962	.	G	C	106.24	PASS	AF=0.153285;AO=21;DP=137;FAO=21;FDP=137;FR=.;FRO=116;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=56;FSRR=60;FWDB=-0.0126406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.208;QD=3.10179;RBI=0.0169881;REFB=-0.000808132;REVB=0.0113495;RO=116;SAF=9;SAR=12;SRF=56;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691397;STB=0.546174;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0108002;OID=.;OPOS=75787962;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:116:116:21:21:0.153285:12:9:56:60:12:9:56:60
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chr3	75788199	.	T	C	187.43	PASS	AF=0.239669;AO=29;DP=121;FAO=29;FDP=121;FR=.;FRO=92;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=46;FSRR=46;FWDB=-0.00244683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.73;QD=6.19586;RBI=0.0167017;REFB=-0.0109167;REVB=0.0165215;RO=92;SAF=16;SAR=13;SRF=46;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647348;STB=0.539401;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.038788;OID=.;OPOS=75788199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:92:92:29:29:0.239669:13:16:46:46:13:16:46:46
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chr3	75788230	.	C	T	31.05	PASS	AF=0.0818182;AO=9;DP=111;FAO=9;FDP=110;FR=.;FRO=101;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=52;FSRR=49;FWDB=-0.0333967;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.072;QD=1.12902;RBI=0.0367314;REFB=-0.000723202;REVB=-0.0152924;RO=99;SAF=5;SAR=4;SRF=51;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0454226;STB=0.537442;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0198623;OID=.;OPOS=75788230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:111:110:99:101:9:9:0.0818182:4:5:51:48:4:5:52:49
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chr3	75788291	.	AT	AA,GA	192.86	PASS	AF=0.122807,0.298246;AO=7,17;DP=57;FAO=7,17;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=4,9;FSAR=3,8;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.033377,0.019802;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=103.369,230.512;QD=13.534;RBI=0.0335205,0.0244456;REFB=0.017221,0.00410133;REVB=-0.00309809,0.0143342;RO=33;SAF=4,9;SAR=3,8;SRF=20;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0429905,-0.0867302;STB=0.529329,0.55101;STBP=0.894,0.619;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0308561,-0.00113313;OID=.,.;OPOS=75788292,75788291;OREF=T,AT;OALT=A,GA;OMAPALT=AA,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:57:57:33:33:7,17:7,17:0.122807,0.298246:3,8:4,9:20:13:3,8:4,9:20:13
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chr3	75790516	.	T	A	58.36	PASS	AF=0.134831;AO=12;DP=89;FAO=12;FDP=89;FR=.;FRO=77;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=43;FWDB=0.0198191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.819;QD=2.62281;RBI=0.0203965;REFB=-0.00382328;REVB=-0.00481872;RO=77;SAF=8;SAR=4;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273907;STB=0.690865;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0428007;OID=.;OPOS=75790516;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:89:89:77:77:12:12:0.134831:4:8:34:43:4:8:34:43
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chr3	75790822	.	A	G	443.62	PASS	AF=0.734694;AO=35;DP=49;FAO=36;FDP=49;FR=.;FRO=13;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0264232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.655;QD=36.2139;RBI=0.0431939;REFB=-0.0480201;REVB=0.0341692;RO=14;SAF=23;SAR=12;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772103;STB=0.531233;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0275589;OID=.;OPOS=75790822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:49:49:14:13:35:36:0.734694:12:23:11:3:12:24:10:3
chr3	75790838	.	C	T	41.5	PASS	AF=0.170732;AO=7;DP=41;FAO=7;FDP=41;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.083175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7991;QD=4.04887;RBI=0.0832528;REFB=-0.0108159;REVB=-0.00359951;RO=34;SAF=6;SAR=1;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326492;STB=0.73506;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0423757;OID=.;OPOS=75790838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:41:41:34:34:7:7:0.170732:1:6:22:12:1:6:22:12
chr3	75986663	.	C	A	1923.68	PASS	AF=0.517808;AO=165;DP=340;FAO=189;FDP=365;FR=.;FRO=176;FSAF=101;FSAR=88;FSRF=93;FSRR=83;FWDB=0.00981853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.446;QD=21.0814;RBI=0.0584809;REFB=-0.0449404;REVB=0.0576507;RO=174;SAF=94;SAR=71;SRF=91;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0442003;STB=0.502897;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0288069;OID=.;OPOS=75986663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:340:365:174:176:165:189:0.517808:71:94:91:83:88:101:93:83
chr3	75986686	.	A	G	1900.25	PASS	AF=0.498681;AO=188;DP=377;FAO=189;FDP=379;FR=.;FRO=190;FSAF=101;FSAR=88;FSRF=99;FSRR=91;FWDB=0.0146236;FXX=0.00524921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3147;QD=20.0554;RBI=0.0197093;REFB=-0.0276694;REVB=-0.0132139;RO=186;SAF=100;SAR=88;SRF=98;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00458986;STB=0.506712;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0221773;OID=.;OPOS=75986686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:377:379:186:190:188:189:0.498681:88:100:98:88:88:101:99:91
chr3	75986695	.	G	A	205.58	PASS	AF=0.128535;AO=50;DP=381;FAO=50;FDP=389;FR=.;FRO=339;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=174;FSRR=165;FWDB=-0.0123295;FXX=0.00511496;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.755;QD=2.11396;RBI=0.0185488;REFB=-0.00358835;REVB=-0.0138579;RO=328;SAF=29;SAR=21;SRF=168;SRR=160;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869924;STB=0.558535;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0250565;OID=.;OPOS=75986695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:381:389:328:339:50:50:0.128535:21:29:168:160:21:29:174:165
chr3	75986717	.	G	A	473.33	PASS	AF=0.20297;AO=82;DP=408;FAO=82;FDP=404;FR=.;FRO=322;FSAF=48;FSAR=34;FSRF=158;FSRR=164;FWDB=0.00389034;FXX=0.00980368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.318;QD=4.68643;RBI=0.00395047;REFB=-0.010362;REVB=0.000686643;RO=319;SAF=48;SAR=34;SRF=157;SRR=162;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120719;STB=0.575702;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0449596;OID=.;OPOS=75986717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:408:404:319:322:82:82:0.20297:34:48:157:162:34:48:158:164
chr3	75986719	.	G	C	1712.41	PASS	AF=0.453634;AO=178;DP=398;FAO=181;FDP=399;FR=.;FRO=218;FSAF=87;FSAR=94;FSRF=119;FSRR=99;FWDB=0.00732995;FXX=0.0196555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9055;QD=17.167;RBI=0.0457266;REFB=-0.0120019;REVB=0.0451353;RO=200;SAF=85;SAR=93;SRF=108;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059986;STB=0.535579;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0133774;OID=.;OPOS=75986719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:398:399:200:218:178:181:0.453634:93:85:108:92:94:87:119:99
chr3	77860987	.	A	G	251.52	PASS	AF=0.474576;AO=27;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.000730166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8285;QD=17.0524;RBI=0.0382578;REFB=-0.00454084;REVB=-0.0382509;RO=32;SAF=17;SAR=10;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15777;STB=0.602903;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00415716;OID=.;OPOS=77860987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:31:27:28:0.474576:10:17:15:17:10:18:14:17
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chr3	80677187	.	T	C	696.02	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194642;FXX=0.0217344;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.394;QD=61.8689;RBI=0.0223662;REFB=0;REVB=0.0110179;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301359;OID=.;OPOS=80677187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:25:18:0:0:25:20:0:0
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chr3	81698130	.	T	C	282.53	PASS	AF=0.415584;AO=31;DP=76;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.0080349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.471;QD=14.6767;RBI=0.00906834;REFB=-0.00749931;REVB=0.00420419;RO=45;SAF=19;SAR=12;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220517;STB=0.630986;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0162561;OID=.;OPOS=81698130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:45:45:31:32:0.415584:12:19:18:27:12:20:18:27
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chr3	81810702	.	A	AG	429.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=53;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.5436;QD=39.0192;RBI=0.125632;REFB=0;REVB=0.0743673;RO=11;SAF=27;SAR=15;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358697;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00532568;OID=.;OPOS=81810703;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:42:53:44:44:0:27:17:0:0:9:11:27:15:8:3
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chr3	86411485	.	A	G	223.81	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.00261234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.032;QD=19.4616;RBI=0.0444488;REFB=-0.0149767;REVB=-0.044372;RO=21;SAF=13;SAR=9;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159634;STB=0.564797;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0165093;OID=.;OPOS=86411485;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:24:22:22:0.478261:9:13:16:5:9:13:17:7
chr3	86411527	.	G	A	111.41	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00625824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3288;QD=15.9154;RBI=0.0502555;REFB=-0.0150509;REVB=-0.0498643;RO=15;SAF=9;SAR=4;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277322;STB=0.660763;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0311989;OID=.;OPOS=86411527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:4:9:6:9:4:9:6:9
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chr3	87295049	.	T	C	911.44	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.145;QD=57.8693;RBI=0.0443411;REFB=0;REVB=0.0265882;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182612;OID=.;OPOS=87295049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:33:29:0:0:33:30:0:0
chr3	87791778	.	C	T	274.29	PASS	AF=0.376471;AO=32;DP=85;FAO=32;FDP=85;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.031912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2441;QD=12.9078;RBI=0.0491936;REFB=-0.0158971;REVB=-0.0374385;RO=53;SAF=27;SAR=5;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285902;STB=0.666904;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0297921;OID=.;OPOS=87791778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:53:53:32:32:0.376471:5:27:35:18:5:27:35:18
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chr3	88105818	.	T	C	602.87	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5043;QD=60.2872;RBI=0.155493;REFB=0;REVB=0.148879;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0032285;OID=.;OPOS=88105818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:37:40:1:13:24:0:0:15:25:0:0
chr3	88105879	.	TACTTC	T,TACTTA	286.01	PASS	AF=0.818182,0.181818;AO=18,4;DP=23;FAO=18,4;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13,2;FSAR=5,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371068,0.0127654;FXX=0.0434594;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=249.7,100.162;QD=52.0013;RBI=0.0372751,0.0176547;REFB=0,0;REVB=0.00353829,-0.0121956;RO=0;SAF=13,2;SAR=5,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00897274,-0.0237896;OID=.,.;OPOS=88105880,88105884;OREF=ACTTC,C;OALT=-,A;OMAPALT=T,TACTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.818182,0.181818:18,4:23:18,4:22:0:13,2:5,2:0:0:21:0:13,2:5,2:0:0
chr3	88189341	.	T	C	1192.78	PASS	AF=0.975904;AO=78;DP=81;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0123104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9188;QD=57.4836;RBI=0.0834415;REFB=-0.14252;REVB=0.0825284;RO=1;SAF=42;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129667;STB=0.512497;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00515338;OID=.;OPOS=88189341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:81:83:1:2:78:81:0.975904:36:42:0:1:39:42:0:2
chr3	88190768	.	C	A	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00140418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.805;QD=57.2376;RBI=0.0047838;REFB=0;REVB=-0.00457308;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.51502e-06;OID=.;OPOS=88190768;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:24:32:0:0:24:32:0:0
chr3	88190809	.	C	T	1227.39	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.09;QD=61.3696;RBI=0.0163797;REFB=0;REVB=-0.00301921;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.13863e-05;OID=.;OPOS=88190809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:35:44:0:0:35:45:0:0
chr3	88191144	.	A	T	243.48	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106943;FXX=0.049975;HRUN=5;LEN=1;MLLD=338.293;QD=51.2597;RBI=0.0109437;REFB=0;REVB=0.002323;RO=0;SAF=15;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.30755e-05;OID=.;OPOS=88191144;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:19:0:0:19:19:1:4:15:0:0:4:15:0:0
chr3	88191170	.	TGGGGA	TGGG,TGGGA	223.12	PASS	AF=0,0.958333;AO=11,12;DP=25;FAO=0,23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=0,18;FSAR=0,5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0419284,-0.0242203;FXX=0.039984;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=165.339,17.5945;QD=37.187;RBI=0.0459732,0.105941;REFB=-0.0568631,0.0604496;REVB=0.0188559,-0.103135;RO=1;SAF=7,11;SAR=4,1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0994753,0.293687;STB=0.5,0.545413;STBP=1,0.148;TYPE=del,del;VARB=0,-0.0150306;OID=.,.;OPOS=88191174,88191171;OREF=GA,G;OALT=-,-;OMAPALT=TGGG,TGGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.958333:11,12:25:0,23:24:1:0,18:0,5:0:1:4:1:7,11:4,1:0:1
chr3	88192423	.	A	G	689.14	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0758183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.952;QD=62.6493;RBI=0.0801425;REFB=0;REVB=0.0259694;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00048903;OID=.;OPOS=88192423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0
chr3	88192484	.	T	C	716.59	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6998;QD=56.2031;RBI=0.0963586;REFB=0;REVB=0.0768977;RO=1;SAF=11;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122265;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100554;OID=.;OPOS=88192484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:1:0:49:51:1:38:11:0:1:39:12:0:0
chr3	88199298	.	T	C	271.28	PASS	AF=0.956522;AO=21;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0121753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.523;QD=47.1792;RBI=0.0502355;REFB=-0.19113;REVB=-0.0487377;RO=1;SAF=11;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401224;STB=0.519982;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00273166;OID=.;OPOS=88199298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:21:22:0.956522:10:11:1:0:10:12:1:0
chr3	89521693	.	T	C	211.77	PASS	AF=0.313953;AO=27;DP=87;FAO=27;FDP=86;FR=.;FRO=59;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=-0.00182043;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.536;QD=9.84966;RBI=0.0107053;REFB=-0.00111054;REVB=0.0105494;RO=58;SAF=13;SAR=14;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415872;STB=0.518505;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.00244767;OID=.;OPOS=89521693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:58:59:27:27:0.313953:14:13:30:28:14:13:30:29
chr3	89521725	.	T	C	182.77	PASS	AF=0.32;AO=24;DP=75;FAO=24;FDP=75;FR=.;FRO=51;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0279788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.327;QD=9.74776;RBI=0.028471;REFB=0.00143528;REVB=0.00527139;RO=51;SAF=10;SAR=14;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130673;STB=0.576773;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=-0.00279042;OID=.;OPOS=89521725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:51:51:24:24:0.32:14:10:27:24:14:10:27:24
chr3	89530956	.	G	A	492.18	PASS	AF=0.597403;AO=45;DP=76;FAO=46;FDP=77;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0100313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6555;QD=25.5676;RBI=0.0239447;REFB=-0.0205376;REVB=-0.0217422;RO=31;SAF=21;SAR=24;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608993;STB=0.53701;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.012237;OID=.;OPOS=89530956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:31:31:45:46:0.597403:24:21:17:14:25:21:17:14
chr3	93593119	.	T	C	727.06	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.255;QD=63.2222;RBI=0.109969;REFB=0;REVB=0.106042;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000607136;OID=.;OPOS=93593119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:21:24:0:0:22:24:0:0
chr3	96327750	.	C	T	191.18	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0628811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.292;QD=47.7952;RBI=0.0655266;REFB=0;REVB=0.0184309;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000703816;OID=.;OPOS=96327750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:11:5:0:0:11:5:0:0
chr3	97365038	.	G	A	1513.4	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00417121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.722;QD=59.9368;RBI=0.00442186;REFB=0;REVB=0.00146759;RO=0;SAF=72;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.1493e-06;OID=.;OPOS=97365038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:29:72:0:0:29:72:0:0
chr3	97365074	.	A	G	1525.61	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3711;QD=59.8277;RBI=0.0533715;REFB=0;REVB=0.0492389;RO=0;SAF=67;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46464e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290076;OID=.;OPOS=97365074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:35:67:0:0:35:67:0:0
chr3	97611743	.	A	G	740.01	PASS	AF=0.448864;AO=79;DP=175;FAO=79;FDP=176;FR=.;FRO=97;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=52;FWDB=-0.00594705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.917;QD=16.8184;RBI=0.0085386;REFB=-0.0193773;REVB=-0.00612702;RO=94;SAF=49;SAR=30;SRF=44;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151541;STB=0.587576;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0242221;OID=.;OPOS=97611743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:176:94:97:79:79:0.448864:30:49:44:50:30:49:45:52
chr3	97660106	.	A	C	698.52	PASS	AF=0.981132;AO=47;DP=48;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0948928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.664;QD=52.7188;RBI=0.096148;REFB=-0.0531626;REVB=0.0154855;RO=1;SAF=28;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016502;STB=0.508194;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0011254;OID=.;OPOS=97660106;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:48:53:1:1:47:52:0.981132:19:28:1:0:22:30:1:0
chr3	97664725	.	C	T	867.87	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0649975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.849;QD=57.8581;RBI=0.0657792;REFB=0;REVB=0.0101108;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119934;OID=.;OPOS=97664725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr3	97673268	.	A	C	1693.22	PASS	AF=1;AO=110;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010774;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.471;QD=60.472;RBI=0.0231625;REFB=0;REVB=0.0205041;RO=0;SAF=57;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.15156e-06;OID=.;OPOS=97673268;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:112:0:0:110:112:1:53:57:0:0:53:59:0:0
chr3	97726747	.	T	A	1339.76	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.686;QD=62.3144;RBI=0.0345882;REFB=0;REVB=0.0225286;RO=0;SAF=37;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.57358e-06;OID=.;OPOS=97726747;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:48:37:0:0:48:38:0:0
chr3	97851998	.	A	C	1230.85	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281464;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1291;QD=61.5423;RBI=0.0281892;REFB=0;REVB=-0.00155215;RO=0;SAF=42;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176189;OID=.;OPOS=97851998;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:80:0:0:80:80:1:38:42:0:0:38:42:0:0
chr3	97852058	.	A	G	115.19	PASS	AF=0.285714;AO=16;DP=56;FAO=16;FDP=56;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.0449576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2446;QD=8.22771;RBI=0.0480803;REFB=0.00151521;REVB=0.0170449;RO=40;SAF=9;SAR=7;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107314;STB=0.564438;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=-0.00152515;OID=.;OPOS=97852058;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:40:40:16:16:0.285714:7:9:26:14:7:9:26:14
chr3	97852066	.	T	C	117.21	PASS	AF=0.290909;AO=16;DP=55;FAO=16;FDP=55;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.0121874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.772;QD=8.52466;RBI=0.027104;REFB=-0.0118659;REVB=-0.0242094;RO=39;SAF=9;SAR=7;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955761;STB=0.557307;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0323801;OID=.;OPOS=97852066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:39:39:16:16:0.290909:7:9:25:14:7:9:25:14
chr3	97852083	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.965;QD=61.3362;RBI=0.0311869;REFB=0;REVB=-0.0032067;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.0676e-05;OID=.;OPOS=97852083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr3	97852229	.	T	A	236.61	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=26;FSAR=1;FSRF=26;FSRR=7;FWDB=0.00215529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.653;QD=15.7738;RBI=0.00959924;REFB=0.00197309;REVB=0.00935415;RO=33;SAF=26;SAR=1;SRF=26;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.504949;STB=0.799679;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.00153377;OID=.;OPOS=97852229;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:1:26:26:7:1:26:26:7
chr3	97868419	.	G	A	1518.82	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0146847;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.524;QD=62.6315;RBI=0.044637;REFB=0.12234;REVB=-0.0421524;RO=1;SAF=52;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903306;STB=0.504761;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000315362;OID=.;OPOS=97868419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:44:52:1:0:44:52:1:0
chr3	97868616	.	C	T	1375.86	PASS	AF=0.967742;AO=91;DP=93;FAO=90;FDP=93;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0232843;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.6749;QD=59.1769;RBI=0.0242315;REFB=-0.0953549;REVB=-0.00670862;RO=2;SAF=52;SAR=39;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017881;STB=0.514283;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00213835;OID=.;OPOS=97868616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:93:93:2:3:91:90:0.967742:39:52:2:0:39:51:3:0
chr3	97868653	.	A	C	278.35	PASS	AF=0.410256;AO=31;DP=77;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0213469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.435;QD=14.2745;RBI=0.0231587;REFB=-0.0167473;REVB=0.00897975;RO=46;SAF=13;SAR=18;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130453;STB=0.581269;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0206115;OID=.;OPOS=97868653;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:46:46:31:32:0.410256:18:13:25:21:19:13:25:21
chr3	97868795	.	A	G	733.92	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.97;QD=62.4612;RBI=0.0554287;REFB=0;REVB=0.0194219;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192993;OID=.;OPOS=97868795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:23:23:0:0:23:24:0:0
chr3	97868970	.	T	A	2484.93	PASS	AF=0.993939;AO=163;DP=165;FAO=164;FDP=165;FR=.;FRO=1;FSAF=107;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.101341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6155;QD=60.2406;RBI=0.101486;REFB=-0.107667;REVB=-0.00542221;RO=2;SAF=106;SAR=57;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00889334;STB=0.502325;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.000850737;OID=.;OPOS=97868970;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:165:165:2:1:163:164:0.993939:57:106:2:0:57:107:1:0
chr3	97887865	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.140435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.548;QD=62.6708;RBI=0.141887;REFB=0;REVB=0.0202488;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000337728;OID=.;OPOS=97887865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr3	97887985	.	T	A	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.865;QD=62.9818;RBI=0.0472614;REFB=0;REVB=0.0353983;RO=0;SAF=32;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304213;OID=.;OPOS=97887985;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:13:32:0:0:13:32:0:0
chr3	97888042	.	A	T	689.22	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276861;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.847;QD=62.6568;RBI=0.0319413;REFB=0;REVB=0.0159289;RO=0;SAF=32;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171907;OID=.;OPOS=97888042;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:12:32:0:0:12:32:0:0
chr3	97888197	.	C	T	766.24	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.602;QD=63.8534;RBI=0.0693048;REFB=0;REVB=-0.0561832;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.55706e-05;OID=.;OPOS=97888197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0
chr3	97888337	.	C	T	511.82	PASS	AF=0.923077;AO=36;DP=39;FAO=36;FDP=39;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0160776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.657;QD=52.4938;RBI=0.019414;REFB=-0.184959;REVB=0.0108818;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.540518;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00175189;OID=.;OPOS=97888337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:39:39:0:3:36:36:0.923077:19:17:0:0:19:17:3:0
chr3	97957349	.	G	A	813.31	PASS	AF=1;AO=41;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0555109;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.073;QD=57.0746;RBI=0.0616964;REFB=0;REVB=0.0269255;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121005;OID=.;OPOS=97957349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:57:0:0:41:57:1:15:26:0:0:20:37:0:0
chr3	97983257	.	C	G	1529.99	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00550103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.365;QD=63.7494;RBI=0.0133146;REFB=0;REVB=-0.012125;RO=0;SAF=69;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.61219e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.39738e-05;OID=.;OPOS=97983257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:27:69:0:0:27:69:0:0
chr3	97983265	.	C	A	480.21	PASS	AF=0.494737;AO=46;DP=94;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=9;FWDB=0.0113158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.876;QD=20.2195;RBI=0.0122113;REFB=-0.0278932;REVB=0.00459021;RO=48;SAF=30;SAR=16;SRF=39;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17348;STB=0.600576;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0224862;OID=.;OPOS=97983265;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:48:48:46:47:0.494737:16:30:39:9:17:30:39:9
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chr3	97983391	.	C	G,T	1680.13	PASS	AF=0.534483,0.465517;AO=61,53;DP=114;FAO=62,54;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=27,30;FSAR=35,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188997,-0.0229295;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=186.023,182.652;QD=57.9356;RBI=0.0190658,0.0265664;REFB=0,0;REVB=-0.00251141,-0.0134168;RO=0;SAF=27,30;SAR=34,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.72004e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00100504,-0.00121729;OID=.,.;OPOS=97983391,97983391;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:114:116:0:0:61,53:62,54:0.534483,0.465517:34,23:27,30:0:0:35,24:27,30:0:0
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chr3	97983561	.	G	C	1116.28	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00905053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.444;QD=60.3392;RBI=0.0111723;REFB=0;REVB=-0.00655043;RO=0;SAF=34;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26995e-06;OID=.;OPOS=97983561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:40:34:0:0:40:34:0:0
chr3	97983711	.	T	C	858.25	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.021089;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.2;QD=56.2787;RBI=0.0628644;REFB=-0.0846657;REVB=0.0592215;RO=1;SAF=30;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154718;STB=0.508194;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00457658;OID=.;OPOS=97983711;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:30:30:1:0:30:30:1:0
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chr3	97983981	.	G	A	484.56	PASS	AF=0.51087;AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0180564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9418;QD=21.0677;RBI=0.0199525;REFB=-0.028387;REVB=-0.00848937;RO=44;SAF=32;SAR=15;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108186;STB=0.555645;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0271044;OID=.;OPOS=97983981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:44:45:47:47:0.51087:15:32:25:19:15:32:26:19
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chr3	98189413	.	C	A	43.83	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.0184248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1512;QD=6.26112;RBI=0.0401881;REFB=-0.00111406;REVB=0.0357157;RO=21;SAF=4;SAR=3;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242602;STB=0.651796;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0182119;OID=.;OPOS=98189413;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:21:21:7:7:0.25:3:4:16:5:3:4:16:5
chr3	98250986	.	C	T	337.89	PASS	AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0819607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0661;QD=28.7561;RBI=0.0834032;REFB=0.00841693;REVB=0.0154448;RO=18;SAF=12;SAR=17;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0996468;STB=0.554858;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.00342534;OID=.;OPOS=98250986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:17:12:10:8:17:12:10:8
chr3	98304467	.	T	C	471.92	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00120437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.436;QD=55.5194;RBI=0.0333292;REFB=0.0270928;REVB=0.0333074;RO=1;SAF=16;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283046;STB=0.515142;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.00120674;OID=.;OPOS=98304467;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:17:16:1:0:17:16:1:0
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chr3	98501128	.	A	G	99.23	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.020223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.701;QD=14.7002;RBI=0.0202953;REFB=-0.00788642;REVB=0.00171134;RO=15;SAF=4;SAR=8;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256705;STB=0.649747;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.00824497;OID=.;OPOS=98501128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:8:4:9:6:8:4:9:6
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chr3	100084432	.	G	A	475.06	PASS	AF=0.474747;AO=47;DP=99;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=0.00301168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.304;QD=19.1943;RBI=0.0421199;REFB=-0.0271391;REVB=-0.0420121;RO=52;SAF=32;SAR=15;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00841054;STB=0.50468;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0340832;OID=.;OPOS=100084432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:52:52:47:47:0.474747:15:32:35:17:15:32:35:17
chr3	100170628	.	A	G	236.59	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00680563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4962;QD=15.7726;RBI=0.0473231;REFB=0.0113332;REVB=0.0468311;RO=33;SAF=17;SAR=10;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201372;STB=0.613863;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=-0.012591;OID=.;OPOS=100170628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:10:17:14:19:10:17:14:19
chr3	100170634	.	TC	CC,CT	165.44	PASS	AF=0.362069,0;AO=21,3;DP=59;FAO=21,0;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=15,0;FSAR=6,0;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.0183933,-0.0320662;FXX=0.0169463;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=50.3537,194.702;QD=11.4094;RBI=0.0193917,0.0321785;REFB=-0.011783,0.00571275;REVB=0.00614194,0.00268583;RO=34;SAF=15,0;SAR=6,3;SRF=14;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.330033,-0.494208;STB=0.714082,0.5;STBP=0.018,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0195117,0;OID=.,.;OPOS=100170634,100170634;OREF=T,TC;OALT=C,CT;OMAPALT=CC,CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:34:37:21,3:21,0:0.362069,0:6,3:15,0:14:20:6,0:15,0:14:23
chr3	100174722	.	G	A	708.49	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.812;QD=62.9764;RBI=0.0491356;REFB=0;REVB=0.0438929;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146688;OID=.;OPOS=100174722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:26:19:0:0:26:19:0:0
chr3	100287764	.	T	C	665.23	PASS	AF=0.515625;AO=66;DP=128;FAO=66;FDP=128;FR=.;FRO=62;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.0263059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.376;QD=20.7885;RBI=0.0265525;REFB=-0.0137076;REVB=0.0036105;RO=62;SAF=44;SAR=22;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112032;STB=0.561779;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.016361;OID=.;OPOS=100287764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:62:62:66:66:0.515625:22:44:34:28:22:44:34:28
chr3	100368546	.	A	G	607.63	PASS	AF=0.496;AO=61;DP=124;FAO=62;FDP=125;FR=.;FRO=63;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.0192691;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.364;QD=19.4441;RBI=0.0192881;REFB=-0.0253507;REVB=0.000855836;RO=63;SAF=34;SAR=27;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118171;STB=0.560228;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0249059;OID=.;OPOS=100368546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:125:63:63:61:62:0.496:27:34:27:36:28:34:27:36
chr3	100374740	.	T	C	403.78	PASS	AF=0.590909;AO=39;DP=66;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0168554;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6066;QD=24.4716;RBI=0.0365803;REFB=-0.0339036;REVB=-0.0324656;RO=27;SAF=15;SAR=24;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102568;STB=0.556326;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0248194;OID=.;OPOS=100374740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:27:27:39:39:0.590909:24:15:14:13:24:15:14:13
chr3	100467018	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.144;QD=51.1846;RBI=0.0310643;REFB=0;REVB=0.02576;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155479;OID=.;OPOS=100467018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr3	100468407	.	C	CAGTT,T	674.4	PASS	AF=0.888889,0.0740741;AO=48,3;DP=53;FAO=48,4;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=32,4;FSAR=16,0;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0223886,-0.0496956;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=275.834,80.2801;QD=49.9558;RBI=0.0324202,0.100466;REFB=0.0107698,0.0486321;REVB=0.0234482,-0.0873139;RO=2;SAF=32,3;SAR=16,0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0552325,0.74993;STB=0.529399,0.996649;STBP=0.072,0.028;TYPE=ins,snp;VARB=0.00127602,-0.0484226;OID=.,.;OPOS=100468408,100468407;OREF=-,C;OALT=AGTT,T;OMAPALT=CAGTT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:18:53:54:2:2:48,3:48,4:0.888889,0.0740741:16,0:32,3:0:2:16,0:32,4:0:2
chr3	100539887	.	C	T	388.31	PASS	AF=0.431579;AO=40;DP=94;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.0202492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.078;QD=16.3499;RBI=0.0216379;REFB=-0.0150184;REVB=-0.00762661;RO=53;SAF=12;SAR=28;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109765;STB=0.545536;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0175471;OID=.;OPOS=100539887;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:53:54:40:41:0.431579:28:12:21:32:28:13:21:33
chr3	100544675	.	G	A	228.35	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00349808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.08;QD=21.7474;RBI=0.0112918;REFB=-0.0320228;REVB=0.0107363;RO=19;SAF=7;SAR=15;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224919;STB=0.638884;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.022868;OID=.;OPOS=100544675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:20:22:22:0.52381:15:7:11:8:15:7:12:8
chr3	100553578	.	C	T	940.78	PASS	AF=0.394161;AO=106;DP=272;FAO=108;FDP=274;FR=.;FRO=166;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=100;FSRR=66;FWDB=-0.0782649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.247;QD=13.734;RBI=0.07837;REFB=-0.0130705;REVB=-0.00405695;RO=164;SAF=61;SAR=45;SRF=98;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245559;STB=0.517641;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0196184;OID=.;OPOS=100553578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:272:274:164:166:106:108:0.394161:45:61:98:66:46:62:100:66
chr3	100558416	.	T	C	592.26	PASS	AF=0.563107;AO=58;DP=102;FAO=58;FDP=103;FR=.;FRO=45;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.0123641;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.663;QD=23.0003;RBI=0.012431;REFB=-0.0229049;REVB=0.00128855;RO=44;SAF=33;SAR=25;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728767;STB=0.544979;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0160663;OID=.;OPOS=100558416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:44:45:58:58:0.563107:25:33:21:23:25:33:21:24
chr3	100617680	.	C	T	603.4	PASS	AF=0.556604;AO=59;DP=106;FAO=59;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=47;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.0416715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.143;QD=22.77;RBI=0.0437092;REFB=-0.0592735;REVB=-0.01319;RO=29;SAF=35;SAR=24;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0897939;STB=0.510974;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0424495;OID=.;OPOS=100617680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:29:47:59:59:0.556604:24:35:13:16:24:35:29:18
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chr3	100963154	.	G	A	298.32	PASS	AF=0.386364;AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=-0.00132977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.121;QD=13.5602;RBI=0.00796295;REFB=-0.0176278;REVB=0.00785113;RO=54;SAF=13;SAR=21;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280802;STB=0.659595;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0167052;OID=.;OPOS=100963154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:54:54:34:34:0.386364:21:13:35:19:21:13:35:19
chr3	101043906	.	G	A	776.9	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00988737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9498;QD=56.5017;RBI=0.0384181;REFB=0;REVB=0.037124;RO=0;SAF=35;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011345;OID=.;OPOS=101043906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:55:0:0:53:55:1:18:35:0:0:20:35:0:0
chr3	101080694	.	T	C	1080.55	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.301;QD=60.0305;RBI=0.0336224;REFB=0;REVB=0.0222068;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.12227e-05;OID=.;OPOS=101080694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:39:33:0:0:39:33:0:0
chr3	101085413	.	G	A	811.11	PASS	AF=0.983607;AO=58;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0156785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.557;QD=53.1873;RBI=0.0157248;REFB=0.0103107;REVB=-0.00120571;RO=3;SAF=27;SAR=31;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495731;STB=0.508472;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.000235769;OID=.;OPOS=101085413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:61:61:3:1:58:60:0.983607:31:27:3:0:31:29:1:0
chr3	101219889	.	G	C	803.73	PASS	AF=0.983051;AO=53;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00847115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.034;QD=54.49;RBI=0.0580666;REFB=0.0240484;REVB=0.0574453;RO=2;SAF=37;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247893;STB=0.506491;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=-0.000412278;OID=.;OPOS=101219889;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:2:1:53:58:0.983051:16:37:2:0:20:38:1:0
chr3	101221069	.	T	C	767.31	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00149778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3664;QD=56.8378;RBI=0.078042;REFB=0;REVB=-0.0780277;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000848927;OID=.;OPOS=101221069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr3	101231921	.	T	C	1137.58	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0135383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.624;QD=59.0952;RBI=0.0323063;REFB=-0.0240135;REVB=0.0293327;RO=0;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505616;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=8.47186e-05;OID=.;OPOS=101231921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:77:0:1:76:76:0.987013:31:45:0:0:32:44:1:0
chr3	101334753	.	C	A	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.98;QD=64.415;RBI=0.0246041;REFB=0;REVB=0.015638;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.50228e-06;OID=.;OPOS=101334753;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:19:31:0:0:19:31:0:0
chr3	101484335	.	G	A	1890.63	PASS	AF=0.992;AO=122;DP=124;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0484503;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.0591;QD=60.5002;RBI=0.106214;REFB=-0.0712407;REVB=-0.0945201;RO=1;SAF=57;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00725298;STB=0.503816;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=2.31464e-05;OID=.;OPOS=101484335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:124:125:1:1:122:124:0.992:65:57:0:1:65:59:0:1
chr3	101571550	.	A	G	465.09	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00835655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.587;QD=58.1357;RBI=0.210674;REFB=0;REVB=0.210508;RO=0;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133772;OID=.;OPOS=101571550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:9:23:0:0:9:23:0:0
chr3	101576175	.	T	C	1587.28	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4889;QD=64.1324;RBI=0.0294019;REFB=0;REVB=0.000232714;RO=0;SAF=53;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173348;OID=.;OPOS=101576175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:99:0:0:97:99:1:44:53:0:0:44:55:0:0
chr3	103879569	.	G	A	4352.32	PASS	AF=1;AO=268;DP=269;FAO=277;FDP=277;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=145;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0713122;FXX=0.00359699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.282;QD=62.8494;RBI=0.0715248;REFB=-0.0301022;REVB=0.00551171;RO=0;SAF=126;SAR=142;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.7451e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.61934e-05;OID=.;OPOS=103879569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:269:277:0:0:268:277:1:142:126:0:0:145:132:0:0
chr3	103879597	.	AAT	A,AA,AAA	1571.36	PASS	AF=0.201835,0.605505,0.192661;AO=17,16,59;DP=117;FAO=22,66,21;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=4,36,6;FSAR=18,30,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0820741,0.0823736,0.0790736;FXX=0.0267833;HRUN=2,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=178.698,180.68,178.596;QD=57.6645;RBI=0.0933676,0.0895008,0.0826851;REFB=0,0,0;REVB=0.0445125,0.0349998,0.0241698;RO=19;SAF=1,2,20;SAR=16,14,39;SRF=17;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.772275,-0.689686,-0.256134;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.00355891,-0.000893489,0.0187844;OID=.,.,.;OPOS=103879598,103879599,103879599;OREF=AT,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=A,AA,AAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.201835,0.605505,0.192661:17,16,59:117:22,66,21:109:0:4,36,6:18,30,15:0:0:16:19:1,2,20:16,14,39:17:2
chr3	103879609	.	G	A	37.02	PASS	AF=0.0843373;AO=7;DP=84;FAO=7;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=73;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=51;FWDB=-0.0265352;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.384;QD=1.78414;RBI=0.0280148;REFB=-0.00626805;REVB=-0.00898422;RO=69;SAF=1;SAR=6;SRF=21;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244335;STB=0.706996;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0167368;OID=.;OPOS=103879609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:84:83:69:73:7:7:0.0843373:6:1:21:48:6:1:22:51
chr3	105260596	.	TA	AC,CA	718.11	PASS	AF=0.0392157,0.960784;AO=2,49;DP=51;FAO=2,49;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=2,27;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190886,0.00281062;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=95.4031,209.915;QD=56.3224;RBI=0.0323056,0.0197367;REFB=0,0;REVB=0.0260629,0.0195355;RO=0;SAF=2,27;SAR=0,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.30731e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00189281,0.000660486;OID=.,.;OPOS=105260596,105260596;OREF=TA,T;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:51:51:0:0:2,49:2,49:0.0392157,0.960784:0,22:2,27:0:0:0,22:2,27:0:0
chr3	105266274	.	T	C	179.7	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0115839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.087;QD=15.6258;RBI=0.0153445;REFB=-0.0297155;REVB=0.0100632;RO=26;SAF=14;SAR=5;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260962;STB=0.66316;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0359854;OID=.;OPOS=105266274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:27:19:19:0.413043:5:14:13:13:5:14:13:14
chr3	105294502	.	G	A	391.65	PASS	AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0175722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=355.35;QD=22.0649;RBI=0.017983;REFB=-0.00718802;REVB=0.00382172;RO=31;SAF=19;SAR=20;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491549;STB=0.519845;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00540411;OID=.;OPOS=105294502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:31:32:39:39:0.549296:20:19:17:14:20:19:17:15
chr3	105421034	.	C	T	712.63	PASS	AF=0.539062;AO=69;DP=128;FAO=69;FDP=128;FR=.;FRO=59;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=-0.042314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.815;QD=22.2697;RBI=0.0426122;REFB=-0.0137459;REVB=0.00503273;RO=59;SAF=38;SAR=31;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021767;STB=0.511923;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.00984015;OID=.;OPOS=105421034;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:59:59:69:69:0.539062:31:38:34:25:31:38:34:25
chr3	105422844	.	C	T	958.16	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106415;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.5403;QD=58.9637;RBI=0.0542571;REFB=0;REVB=-0.0532033;RO=0;SAF=43;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000197824;OID=.;OPOS=105422844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:22:43:0:0:22:43:0:0
chr3	106613060	.	T	G	333.61	PASS	AF=0.6;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0176049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7292;QD=24.2625;RBI=0.0215758;REFB=0.00822278;REVB=-0.0124733;RO=22;SAF=22;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060506;STB=0.533313;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=-0.00565881;OID=.;OPOS=106613060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:22:22:33:33:0.6:11:22:13:9:11:22:13:9
chr3	106617500	.	C	T	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.452;QD=62.9828;RBI=0.0600133;REFB=0;REVB=-0.000167462;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.39545e-05;OID=.;OPOS=106617500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0
chr3	107096547	.	G	A	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00716249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.457;QD=57.1775;RBI=0.0114818;REFB=0;REVB=0.00897393;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.98096e-06;OID=.;OPOS=107096547;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0
chr3	107646728	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.486;QD=53.2772;RBI=0.0595063;REFB=0;REVB=0.0575184;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000238618;OID=.;OPOS=107646728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0
chr3	107646807	.	G	T	750.49	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.321;QD=62.5408;RBI=0.0372347;REFB=0;REVB=0.0122042;RO=0;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00054007;OID=.;OPOS=107646807;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:15:32:0:0:16:32:0:0
chr3	107646895	.	T	C	592.52	PASS	AF=0.886792;AO=47;DP=53;FAO=47;FDP=53;FR=.;FRO=6;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0248714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.0594;QD=44.7181;RBI=0.105127;REFB=0.00789884;REVB=-0.102142;RO=5;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104079;STB=0.546539;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.00425405;OID=.;OPOS=107646895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:53:53:5:6:47:47:0.886792:20:27:0:5:20:27:1:5
chr3	107764851	.	C	T	62.58	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0480339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1746;QD=8.07489;RBI=0.0492811;REFB=-0.0145288;REVB=-0.011017;RO=21;SAF=8;SAR=1;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377889;STB=0.734989;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0645833;OID=.;OPOS=107764851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:21:22:9:9:0.290323:1:8:14:7:1:8:15:7
chr3	107765249	.	T	C	850.88	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000550612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.757;QD=57.6867;RBI=0.0746002;REFB=0;REVB=-0.0745981;RO=0;SAF=36;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00038284;OID=.;OPOS=107765249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:23:36:0:0:23:36:0:0
chr3	107765392	.	G	A	488.46	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.114245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1199;QD=55.8237;RBI=0.120292;REFB=-0.0551867;REVB=0.0376605;RO=1;SAF=22;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207798;STB=0.511105;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00326132;OID=.;OPOS=107765392;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:12:22:1:0:12:22:1:0
chr3	108072425	.	C	T	485.37	PASS	AF=0.441667;AO=54;DP=120;FAO=53;FDP=120;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.00410097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.604;QD=16.1789;RBI=0.0334048;REFB=-0.0102619;REVB=-0.0331522;RO=65;SAF=33;SAR=21;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148305;STB=0.598816;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00846758;OID=.;OPOS=108072425;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:65:67:54:53:0.441667:21:33:30:35:20:33:30:37
chr3	108072524	.	G	A	335.38	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.0212206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.891;QD=16.9811;RBI=0.0291744;REFB=-0.00984;REVB=-0.0200208;RO=43;SAF=19;SAR=17;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.006918;STB=0.503879;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0115216;OID=.;OPOS=108072524;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:43:43:36:36:0.455696:17:19:23:20:17:19:23:20
chr3	108135680	.	C	T	428.68	PASS	AF=0.545455;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0168336;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.337;QD=22.2691;RBI=0.0222348;REFB=-0.0399949;REVB=0.0145264;RO=34;SAF=18;SAR=24;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0634262;STB=0.526705;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0338018;OID=.;OPOS=108135680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:34:35:42:42:0.545455:24:18:12:22:24:18:13:22
chr3	108159977	.	G	A	258.79	PASS	AF=0.434783;AO=28;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.00814936;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3193;QD=15.0023;RBI=0.00963567;REFB=-0.0229624;REVB=-0.0051414;RO=39;SAF=12;SAR=16;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192031;STB=0.532142;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0447872;OID=.;OPOS=108159977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:39:39:28:30:0.434783:16:12:16:23:16:14:16:23
chr3	108229350	.	C	T	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.115073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7992;QD=14.7983;RBI=0.142464;REFB=-0.022755;REVB=-0.0839902;RO=13;SAF=9;SAR=2;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323019;STB=0.691913;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0279853;OID=.;OPOS=108229350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:2:9:7:6:2:9:7:6
chr3	108298260	.	C	T	169.13	PASS	AF=0.384615;AO=19;DP=49;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.053093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.166;QD=13.0097;RBI=0.0532849;REFB=-0.0160204;REVB=-0.00451813;RO=30;SAF=4;SAR=15;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.434169;STB=0.773908;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.013244;OID=.;OPOS=108298260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:52:30:32:19:20:0.384615:15:4:18:12:16:4:20:12
chr3	108403086	.	T	C	1494.74	PASS	AF=1;AO=80;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=55;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.638;QD=63.6061;RBI=0.0416491;REFB=0;REVB=0.0143547;RO=0;SAF=46;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198539;OID=.;OPOS=108403086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:80:94:1:34:46:0:0:39:55:0:0
chr3	108557820	.	T	C	285.69	PASS	AF=0.37931;AO=33;DP=86;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.00179825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.476;QD=13.135;RBI=0.0058058;REFB=-0.00709004;REVB=0.00552029;RO=53;SAF=21;SAR=12;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587465;STB=0.540814;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0162941;OID=.;OPOS=108557820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:53:54:33:33:0.37931:12:21:31:22:12:21:31:23
chr3	108703587	.	C	T	768.35	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00383443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1705;QD=56.9148;RBI=0.0403884;REFB=0;REVB=0.0402059;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029144;OID=.;OPOS=108703587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:22:31:0:0:23:31:0:0
chr3	108754238	.	A	T	957.32	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00962649;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=298.587;QD=57.1534;RBI=0.0132359;REFB=0.0261658;REVB=0.00908398;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.507934;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.000372331;OID=.;OPOS=108754238;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:0:1:66:66:0.985075:31:35:0:0:31:35:0:1
chr3	108867128	.	A	G	853.98	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0131792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1676;QD=55.999;RBI=0.0201416;REFB=-0.124758;REVB=0.0152314;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.510201;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00276158;OID=.;OPOS=108867128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:0:1:60:60:0.983607:24:36:0:0:24:36:0:1
chr3	109047928	.	C	T	215.1	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0271042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.305;QD=21.5101;RBI=0.0272746;REFB=-0.0156545;REVB=0.00304432;RO=19;SAF=14;SAR=7;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329041;STB=0.518501;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0140567;OID=.;OPOS=109047928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:7:14:12:7:7:14:12:7
chr3	109178707	.	C	G	400.84	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352221;FXX=0.0666445;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.591;QD=57.2634;RBI=0.0449913;REFB=0;REVB=0.0279933;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013247;OID=.;OPOS=109178707;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:28:0:0:29:28:1:12:17:0:0:12:16:0:0
chr3	109178758	.	C	T	354.58	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.794;QD=54.5509;RBI=0.0165643;REFB=0;REVB=-0.00745432;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357314;OID=.;OPOS=109178758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:13:12:0:0:13:13:0:0
chr3	109321666	.	TG	T,TT	83.93	PASS	AF=0.625,0;AO=7,2;DP=15;FAO=10,0;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=7,0;FSAR=3,0;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0173707,0.0245552;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=148.089,145.304;QD=20.9818;RBI=0.0176682,0.0247508;REFB=-0.0336067,-0.0235613;REVB=0.0032286,0.00310563;RO=5;SAF=4,2;SAR=3,0;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0206743,0.589598;STB=0.514676,0.5;STBP=0.967,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0202162,0.0247584;OID=.,.;OPOS=109321667,109321667;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.625,0:7,2:15:10,0:16:6:7,0:3,0:4:2:34:5:4,2:3,0:3:2
chr3	110611137	.	G	A	650.95	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0583019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7463;QD=61.9953;RBI=0.0583522;REFB=0;REVB=-0.00242132;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000587108;OID=.;OPOS=110611137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:13:29:0:0:13:29:0:0
chr3	110793050	.	G	A	1434.85	PASS	AF=1;AO=89;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00257352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.541;QD=62.385;RBI=0.0307331;REFB=0;REVB=0.0306252;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.93569e-05;OID=.;OPOS=110793050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:89:92:1:43:46:0:0:46:46:0:0
chr3	111286375	.	G	C	213.07	PASS	AF=0.371429;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=-0.0108968;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.196;QD=12.1751;RBI=0.0132729;REFB=-0.00187046;REVB=-0.00757834;RO=46;SAF=18;SAR=8;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0043448;STB=0.526296;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0028558;OID=.;OPOS=111286375;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:70:46:44:26:26:0.371429:8:18:32:14:8:18:32:12
chr3	111313457	.	T	C	258.49	PASS	AF=0.416667;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.0560593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1996;QD=14.3604;RBI=0.0599825;REFB=-0.022215;REVB=0.0213367;RO=41;SAF=16;SAR=14;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104169;STB=0.564686;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0328004;OID=.;OPOS=111313457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:42:30:30:0.416667:14:16:26:15:14:16:27:15
chr3	111313854	.	C	T	190.75	PASS	AF=1;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.195918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.732;QD=47.687;RBI=0.198392;REFB=0;REVB=0.0312318;RO=1;SAF=5;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826301;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00201236;OID=.;OPOS=111313854;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:1:0:15:16:1:10:5:1:0:10:6:0:0
chr3	111356083	.	G	C	2317.07	PASS	AF=0.993289;AO=115;DP=149;FAO=148;FDP=149;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=63;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0648731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.1591;QD=62.2031;RBI=0.0694741;REFB=0;REVB=0.0248621;RO=0;SAF=46;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0153429;OID=.;OPOS=111356083;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:149:149:0:0:115:148:0.993289:69:46:0:0:85:63:0:0
chr3	111604541	.	G	C	786.92	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.01499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.869;QD=55.2225;RBI=0.0207303;REFB=-0.0168285;REVB=-0.0143193;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509088;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=1.84341e-05;OID=.;OPOS=111604541;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:0:1:56:56:0.982456:29:27:0:0:29:27:1:0
chr3	111672825	.	C	T	249.52	PASS	AF=0.509804;AO=25;DP=50;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.025122;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.7097;QD=19.57;RBI=0.0370833;REFB=-0.0266805;REVB=0.0272775;RO=25;SAF=16;SAR=9;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507457;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0286001;OID=.;OPOS=111672825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:25:25:25:26:0.509804:9:16:16:9:9:17:16:9
chr3	111677526	.	G	A	579.41	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300809;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.879;QD=60.9906;RBI=0.0507099;REFB=0;REVB=-0.0408244;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.71982e-05;OID=.;OPOS=111677526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0
chr3	111688578	.	C	T	325.79	PASS	AF=0.423529;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0344097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4993;QD=15.3311;RBI=0.034513;REFB=-0.0124385;REVB=0.00266818;RO=45;SAF=21;SAR=15;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280637;STB=0.507038;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0124079;OID=.;OPOS=111688578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:45:49:36:36:0.423529:15:21:25:20:15:21:28:21
chr3	111694438	.	T	C	1118.69	PASS	AF=1;AO=72;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268058;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.296;QD=59.6637;RBI=0.036901;REFB=0;REVB=0.0253601;RO=0;SAF=31;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143364;OID=.;OPOS=111694438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:72:75:1:41:31:0:0:41:34:0:0
chr3	111719786	.	A	T	624.69	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.765;QD=60.9449;RBI=0.0274359;REFB=0;REVB=0.00585773;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127069;OID=.;OPOS=111719786;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:38:41:1:23:15:0:0:24:17:0:0
chr3	111765834	.	G	A	382.65	PASS	AF=0.965517;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00804184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.289;QD=52.7787;RBI=0.0276227;REFB=-0.116644;REVB=0.0264261;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516118;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00118486;OID=.;OPOS=111765834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:29:0:1:27:28:0.965517:12:15:0:0:13:15:1:0
chr3	111799845	.	A	T	3634.02	PASS	AF=1;AO=229;DP=230;FAO=230;FDP=230;FR=.;FRO=0;FSAF=123;FSAR=107;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.078417;FXX=0.00432882;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.5381;QD=63.2003;RBI=0.0790915;REFB=0;REVB=-0.0103069;RO=0;SAF=123;SAR=106;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.50233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121016;OID=.;OPOS=111799845;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:230:230:0:0:229:230:1:106:123:0:0:107:123:0:0
chr3	111812290	.	C	T	294.73	PASS	AF=0.342342;AO=36;DP=109;FAO=38;FDP=111;FR=.;FRO=73;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=0.0134478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.8877;QD=10.6207;RBI=0.0601815;REFB=-0.0107469;REVB=0.0586598;RO=73;SAF=9;SAR=27;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304899;STB=0.687098;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0216552;OID=.;OPOS=111812290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:111:73:73:36:38:0.342342:27:9:36:37:29:9:36:37
chr3	111828423	.	G	A	1431.69	PASS	AF=0.970588;AO=98;DP=102;FAO=99;FDP=102;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0390025;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.393;QD=56.1446;RBI=0.0392751;REFB=-0.0663786;REVB=-0.00461939;RO=3;SAF=50;SAR=48;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00996014;STB=0.50535;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000908769;OID=.;OPOS=111828423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:102:102:3:3:98:99:0.970588:48:50:1:2:48:51:1:2
chr3	111918215	.	CA	CG,TG	734.7	PASS	AF=0.62963,0.333333;AO=33,18;DP=56;FAO=34,18;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17,10;FSAR=17,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00458385,-0.00992961;FXX=0.0357079;HRUN=4,2;LEN=1,2;MLLD=88.3241,170.945;QD=54.4224;RBI=0.0328235,0.0142178;REFB=0,0;REVB=-0.0325019,-0.0101759;RO=0;SAF=16,10;SAR=17,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.60901e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00054722,0.00215225;OID=.,.;OPOS=111918216,111918215;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:56:54:0:0:33,18:34,18:0.62963,0.333333:17,8:16,10:0:0:17,8:17,10:0:0
chr3	111921116	.	C	A	362.17	PASS	AF=0.431579;AO=38;DP=95;FAO=41;FDP=95;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.0403461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2293;QD=15.2494;RBI=0.044459;REFB=-0.0235015;REVB=0.0186761;RO=54;SAF=12;SAR=26;SRF=31;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273949;STB=0.634398;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0362556;OID=.;OPOS=111921116;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:54:54:38:41:0.431579:26:12:31:23:27:14:31:23
chr3	111921225	.	G	T	732.15	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.341;QD=56.3188;RBI=0.0343178;REFB=0;REVB=0.0303627;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143894;OID=.;OPOS=111921225;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:52:0:0:49:52:1:26:23:0:0:29:23:0:0
chr3	111923123	.	G	A	731.41	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00530647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.572;QD=56.2624;RBI=0.00874133;REFB=0;REVB=0.00694638;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000587402;OID=.;OPOS=111923123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:23:28:0:0:24:28:0:0
chr3	111962851	.	T	C	223.24	PASS	AF=0.329412;AO=28;DP=85;FAO=28;FDP=85;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=0.0167298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.416;QD=10.5056;RBI=0.019212;REFB=-0.00451198;REVB=0.00944518;RO=57;SAF=12;SAR=16;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716059;STB=0.541637;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.00772206;OID=.;OPOS=111962851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:57:57:28:28:0.329412:16:12:21:36:16:12:21:36
chr3	111981849	.	C	T	537.98	PASS	AF=0.906977;AO=38;DP=43;FAO=39;FDP=43;FR=.;FRO=4;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0470704;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.8343;QD=50.0445;RBI=0.0504821;REFB=-0.131768;REVB=-0.0182432;RO=5;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881742;STB=0.537019;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0147164;OID=.;OPOS=111981849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:43:43:5:4:38:39:0.906977:24:14:0:5:25:14:0:4
chr3	111981878	.	T	C	630.61	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0854143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.721;QD=61.5232;RBI=0.0879528;REFB=0;REVB=0.0209784;RO=0;SAF=13;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00033934;OID=.;OPOS=111981878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:39:41:1:26:13:0:0:27:14:0:0
chr3	111981924	.	T	C	378.95	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148195;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2484;QD=56.1412;RBI=0.0157132;REFB=0;REVB=-0.00522378;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.61679e-05;OID=.;OPOS=111981924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:17:10:0:0:17:10:0:0
chr3	111985107	.	T	C	973.45	PASS	AF=0.516304;AO=95;DP=184;FAO=95;FDP=184;FR=.;FRO=89;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=50;FSRR=39;FWDB=0.0176908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.509;QD=21.1619;RBI=0.033995;REFB=-0.0140038;REVB=0.0290292;RO=89;SAF=49;SAR=46;SRF=50;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406952;STB=0.522303;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0108728;OID=.;OPOS=111985107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:184:89:89:95:95:0.516304:46:49:50:39:46:49:50:39
chr3	111996554	.	T	C	194.97	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.019028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.948;QD=14.1797;RBI=0.0215093;REFB=-0.0335862;REVB=0.0100292;RO=32;SAF=11;SAR=12;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855785;STB=0.548854;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0642202;OID=.;OPOS=111996554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:12:11:18:14:12:11:18:14
chr3	112059768	.	C	G	632.11	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.105;QD=61.6696;RBI=0.108002;REFB=0;REVB=0.0106117;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358939;OID=.;OPOS=112059768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
chr3	112066562	.	G	A	301.51	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0334212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.107;QD=16.7506;RBI=0.0337626;REFB=-0.0120947;REVB=0.00478923;RO=39;SAF=22;SAR=11;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228318;STB=0.628492;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0189517;OID=.;OPOS=112066562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:11:22:17:22:11:22:17:22
chr3	112081560	.	T	TTA	1062.82	PASS	AF=0.914634;AO=65;DP=100;FAO=75;FDP=82;FR=.;FRO=7;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0937962;FXX=0.03529;HRUN=3;LEN=2;MLLD=212.673;QD=51.8449;RBI=0.115925;REFB=-0.146711;REVB=0.0681233;RO=25;SAF=28;SAR=37;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162485;STB=0.52589;STBP=0.15;TYPE=ins;VARB=0.0167216;OID=.;OPOS=112081561;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.914634:65:100:75:82:7:33:42:1:6:27:25:28:37:10:15
chr3	112185025	.	G	A	1148.35	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.929;QD=60.4392;RBI=0.0192927;REFB=0;REVB=-0.0034874;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51952e-05;OID=.;OPOS=112185025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:34:41:0:0:35:41:0:0
chr3	112190137	.	G	T	1026.4	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.75;QD=59.5014;RBI=0.0734548;REFB=0;REVB=0.0689627;RO=0;SAF=26;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119174;OID=.;OPOS=112190137;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:43:26:0:0:43:26:0:0
chr3	112545910	.	GT	G,GG,TG	346.88	PASS	AF=0.552239,0,0.0149254;AO=29,3,3;DP=66;FAO=37,0,1;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=21,0,0;FSAR=16,0,1;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0360483,0.033591,0.041753;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,2;MLLD=236.773,234.166,226.846;QD=20.7095;RBI=0.036321,0.0337267,0.0418562;REFB=-0.000644979,0.000885399,-0.000377348;REVB=-0.00444282,-0.00302282,-0.00293858;RO=29;SAF=15,2,2;SAR=14,1,1;SRF=14;SRR=15;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0308283,0.190963,0.190963;STB=0.537552,0.5,0.989535;STBP=0.502,1,0.45;TYPE=del,snp,mnp;VARB=-0.00277774,-0.0281237,0.08958;OID=.,.,.;OPOS=112545911,112545911,112545910;OREF=T,T,GT;OALT=-,G,TG;OMAPALT=G,GG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:29:29:29,3,3:37,0,1:0.552239,0,0.0149254:14,1,1:15,2,2:14:15:16,0,1:21,0,0:14:15
chr3	112642568	.	C	G	293.04	PASS	AF=0.304688;AO=39;DP=128;FAO=39;FDP=128;FR=.;FRO=89;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=54;FWDB=-0.0247604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2518;QD=9.15754;RBI=0.0568902;REFB=0.00398519;REVB=0.0512193;RO=89;SAF=25;SAR=14;SRF=35;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29026;STB=0.669206;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=-0.00680703;OID=.;OPOS=112642568;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:89:89:39:39:0.304688:14:25:35:54:14:25:35:54
chr3	112642572	.	T	C	128.31	PASS	AF=0.198198;AO=22;DP=111;FAO=22;FDP=111;FR=.;FRO=89;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=54;FWDB=0.101691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.108;QD=4.62367;RBI=0.108319;REFB=-0.0192526;REVB=0.037309;RO=88;SAF=8;SAR=14;SRF=35;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.045754;STB=0.525282;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0398589;OID=.;OPOS=112642572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:88:89:22:22:0.198198:14:8:35:53:14:8:35:54
chr3	112643403	.	G	T	61.73	PASS	AF=0.666667;AO=7;DP=11;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00190744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.188;QD=20.5755;RBI=0.0543974;REFB=-0.0403464;REVB=0.0543639;RO=4;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31972;STB=0.699397;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00809758;OID=.;OPOS=112643403;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:12:4:4:7:8:0.666667:1:6:2:2:1:7:2:2
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chr3	112647988	.	C	T	168.69	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00506366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.373;QD=16.0652;RBI=0.00950297;REFB=-0.0165853;REVB=0.00804151;RO=24;SAF=11;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711626;STB=0.540938;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0157048;OID=.;OPOS=112647988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:7:11:13:11:7:11:13:11
chr3	112648125	.	G	T	389.97	PASS	AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0320185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.92;QD=21.6649;RBI=0.034966;REFB=-0.0319942;REVB=0.0140512;RO=33;SAF=21;SAR=18;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567513;STB=0.531302;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.00935127;OID=.;OPOS=112648125;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:33:33:39:39:0.541667:18:21:20:13:18:21:20:13
chr3	112648127	.	T	G	312.11	PASS	AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0708089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.245;QD=17.3394;RBI=0.0861411;REFB=-0.0651679;REVB=0.049055;RO=33;SAF=21;SAR=18;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567513;STB=0.531302;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0754082;OID=.;OPOS=112648127;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:33:33:39:39:0.541667:18:21:20:13:18:21:20:13
chr3	112648222	.	T	C	471.81	PASS	AF=0.511111;AO=46;DP=90;FAO=46;FDP=90;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0849389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2748;QD=20.9695;RBI=0.0942256;REFB=0.0145132;REVB=0.0407903;RO=44;SAF=18;SAR=28;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781452;STB=0.543265;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=-0.0120874;OID=.;OPOS=112648222;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:44:44:46:46:0.511111:28:18:21:23:28:18:21:23
chr3	112935113	.	G	C	657.09	PASS	AF=0.942308;AO=47;DP=51;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0616311;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2976;QD=50.5456;RBI=0.145195;REFB=-0.161635;REVB=0.131466;RO=3;SAF=11;SAR=36;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154525;STB=0.508925;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.00941645;OID=.;OPOS=112935113;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:51:52:3:3:47:49:0.942308:36:11:1:2:38:11:1:2
chr3	112935138	.	C	G	785.19	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.685;QD=57.1047;RBI=0.0239079;REFB=0;REVB=-0.0190437;RO=0;SAF=11;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.11828e-05;OID=.;OPOS=112935138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:44:11:0:0:44:11:0:0
chr3	112991312	.	C	T	192.53	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0861273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4947;QD=23.3366;RBI=0.0913745;REFB=0.0167959;REVB=0.0305187;RO=14;SAF=10;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181401;STB=0.601162;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.00376365;OID=.;OPOS=112991312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:9:10:4:10:9:10:4:10
chr3	112991959	.	C	T	313.67	PASS	AF=0.34188;AO=40;DP=117;FAO=40;FDP=117;FR=.;FRO=77;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=40;FSRR=37;FWDB=0.0560309;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.8317;QD=10.7239;RBI=0.067934;REFB=-0.0129644;REVB=0.0384131;RO=74;SAF=26;SAR=14;SRF=37;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174395;STB=0.589288;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0252947;OID=.;OPOS=112991959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:74:77:40:40:0.34188:14:26:37:37:14:26:40:37
chr3	112993367	.	G	A	439.44	PASS	AF=0.441441;AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=111;FR=.;FRO=62;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=0.016351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.019;QD=15.8358;RBI=0.0190083;REFB=-0.00440145;REVB=-0.00969329;RO=60;SAF=19;SAR=30;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126568;STB=0.509059;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.00404125;OID=.;OPOS=112993367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:60:62:49:49:0.441441:30:19:24:36:30:19:25:37
chr3	112997554	.	A	G	817.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015308;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.3093;QD=57.3844;RBI=0.0336953;REFB=0;REVB=-0.0300173;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000464975;OID=.;OPOS=112997554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:33:24:0:0:33:24:0:0
chr3	112998265	.	A	G	350.56	PASS	AF=0.401961;AO=27;DP=105;FAO=41;FDP=102;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=-0.00862964;FXX=0.0285687;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.258;QD=13.7474;RBI=0.00865488;REFB=-0.000681043;REVB=0.000660415;RO=47;SAF=16;SAR=11;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316205;STB=0.580514;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00133209;OID=.;OPOS=112998265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:102:47:61:27:41:0.401961:11:16:14:33:20:21:23:38
chr3	112998268	.	G	A	616.08	PASS	AF=0.584158;AO=59;DP=102;FAO=59;FDP=101;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.040954;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.016;QD=24.3991;RBI=0.0410071;REFB=-0.00836754;REVB=-0.00208663;RO=42;SAF=23;SAR=36;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104481;STB=0.557064;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0104356;OID=.;OPOS=112998268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:42:42:59:59:0.584158:36:23:22:20:36:23:22:20
chr3	113010466	.	T	C	448.47	PASS	AF=0.288991;AO=61;DP=216;FAO=63;FDP=218;FR=.;FRO=155;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=101;FSRR=54;FWDB=-0.0183159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.972;QD=8.22882;RBI=0.0235288;REFB=-0.0165664;REVB=-0.0147694;RO=155;SAF=27;SAR=34;SRF=101;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252122;STB=0.654685;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0482199;OID=.;OPOS=113010466;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:218:155:155:61:63:0.288991:34:27:101:54:36:27:101:54
chr3	113015660	.	G	A	378.67	PASS	AF=0.356589;AO=46;DP=129;FAO=46;FDP=129;FR=.;FRO=83;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=53;FSRR=30;FWDB=-0.0261401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.357;QD=11.7415;RBI=0.0277008;REFB=-0.0147113;REVB=0.00916659;RO=79;SAF=21;SAR=25;SRF=51;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207575;STB=0.615592;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0292444;OID=.;OPOS=113015660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:79:83:46:46:0.356589:25:21:51:28:25:21:53:30
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chr3	113046640	.	A	G	306.75	PASS	AF=0.574074;AO=31;DP=54;FAO=31;FDP=54;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0146035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.168;QD=22.7221;RBI=0.0192155;REFB=-0.0260574;REVB=0.0124888;RO=23;SAF=19;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00341483;STB=0.501886;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.0139518;OID=.;OPOS=113046640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:23:23:31:31:0.574074:12:19:14:9:12:19:14:9
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chr3	113164109	.	A	G	397.18	PASS	AF=1;AO=25;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0711338;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.2114;QD=56.7406;RBI=0.169736;REFB=0;REVB=0.154112;RO=0;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00558321;OID=.;OPOS=113164109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:25:28:1:6:19:0:0:8:20:0:0
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chr3	113233563	.	C	T	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0813147;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0419;QD=16.199;RBI=0.099403;REFB=-0.0442151;REVB=0.0571741;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436878;STB=0.526212;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0247454;OID=.;OPOS=113233563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:3:2:1:2:3:2:1:2
chr3	113286405	.	C	T	278.84	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00556771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.352;QD=21.8696;RBI=0.0191938;REFB=-0.00364278;REVB=0.0183686;RO=23;SAF=17;SAR=11;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071339;STB=0.539654;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00258738;OID=.;OPOS=113286405;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:11:17:12:11:11:17:12:11
chr3	113351719	.	T	C	118.91	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0316375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.438;QD=13.2125;RBI=0.0318619;REFB=-0.00941276;REVB=0.0037745;RO=22;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700618;STB=0.540926;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0129879;OID=.;OPOS=113351719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:8:6:8:14:8:6:8:14
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chr3	113373787	.	G	C	455.7	PASS	AF=0.605634;AO=43;DP=71;FAO=43;FDP=71;FR=.;FRO=28;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0113483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.544;QD=25.673;RBI=0.0305812;REFB=-0.013578;REVB=-0.0283977;RO=28;SAF=26;SAR=17;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513379;STB=0.528084;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.00949447;OID=.;OPOS=113373787;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:28:28:43:43:0.605634:17:26:15:13:17:26:15:13
chr3	113373930	.	A	G	1190.38	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9192;QD=61.0449;RBI=0.0473519;REFB=0;REVB=0.0306873;RO=0;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000443203;OID=.;OPOS=113373930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:47:31:0:0:47:31:0:0
chr3	113374633	.	C	A	306.58	PASS	AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00799783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.563;QD=27.2513;RBI=0.0198821;REFB=-0.0327297;REVB=-0.0182026;RO=18;SAF=17;SAR=10;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0976214;STB=0.55399;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0204791;OID=.;OPOS=113374633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:10:17:9:9:10:17:9:9
chr3	113376110	.	TTGCTGC	T,TTGC	133.87	PASS	AF=0.538462,0.461538;AO=3,4;DP=14;FAO=7,6;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=7,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-6.99715e-09,1.23714e-09;FXX=0.0713776;HRUN=2,1;LEN=6,3;MLLD=59.1453,63.2477;QD=41.1898;RBI=0.0894982,0.119956;REFB=0,0;REVB=0.0894982,0.119956;RO=0;SAF=0,0;SAR=3,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.11722,0.0800355;OID=.,.;OPOS=113376111,113376111;OREF=TGCTGC,TGC;OALT=-,-;OMAPALT=T,TTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.538462,0.461538:3,4:14:7,6:13:0:0,0:7,6:0:0:39:0:0,0:3,4:0:0
chr3	113557787	.	AGCC	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00624549;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=376.847;QD=46.848;RBI=0.0121117;REFB=0;REVB=0.0103772;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=5.4212e-05;OID=.;OPOS=113557788;OREF=GCC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:15:15:15:15:0:6:9:0:0:4:0:6:9:0:0
chr3	113673125	.	A	G	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7978;QD=61.6835;RBI=0.0504781;REFB=0;REVB=-0.0273255;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170134;OID=.;OPOS=113673125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr3	113679589	.	C	A	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.418;QD=64.1538;RBI=0.0216342;REFB=0;REVB=-0.0018284;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.30959e-05;OID=.;OPOS=113679589;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr3	113753801	.	C	T	922.98	PASS	AF=0.984615;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0695665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3175;QD=56.7989;RBI=0.0712031;REFB=-0.106398;REVB=0.0151785;RO=0;SAF=47;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515147;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00298913;OID=.;OPOS=113753801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:65:0:1:63:64:0.984615:16:47:0:0:16:48:0:1
chr3	113858350	.	C	T	1501.11	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000363208;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.303;QD=58.8669;RBI=0.0424122;REFB=0;REVB=0.0424106;RO=0;SAF=48;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00059428;OID=.;OPOS=113858350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:102:0:0:99:102:1:51:48:0:0:53:49:0:0
chr3	113955164	.	T	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.869;QD=62.6711;RBI=0.0158159;REFB=0;REVB=0.00655673;RO=0;SAF=14;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.8607e-06;OID=.;OPOS=113955164;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:30:14:0:0:30:14:0:0
chr3	113955265	.	G	A	1541.94	PASS	AF=0.990476;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.025442;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.416;QD=58.7405;RBI=0.0265126;REFB=0.0341109;REVB=-0.00745809;RO=0;SAF=48;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=-0.000498398;OID=.;OPOS=113955265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:106:105:0:1:104:104:0.990476:56:48:0:0:56:48:0:1
chr3	113955320	.	C	T	1353.24	PASS	AF=0.98913;AO=83;DP=84;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0366261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0153;QD=58.8364;RBI=0.0507109;REFB=-0.0771956;REVB=0.0350731;RO=1;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123005;STB=0.505375;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00309932;OID=.;OPOS=113955320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:84:92:1:1:83:91:0.98913:38:45:0:1:46:45:0:1
chr3	113955820	.	G	C	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173095;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.523;QD=60.7162;RBI=0.0175496;REFB=0;REVB=0.00289258;RO=0;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40693e-05;OID=.;OPOS=113955820;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:41:35:0:0:41:35:0:0
chr3	115440007	.	T	G	318.77	PASS	AF=0.432099;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=0.0295441;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.2787;QD=15.7419;RBI=0.0381478;REFB=0.00668539;REVB=-0.0241329;RO=45;SAF=23;SAR=12;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105932;STB=0.510632;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=-0.00839602;OID=.;OPOS=115440007;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:45:46:35:35:0.432099:12:23:30:15:12:23:31:15
chr3	116301660	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.599;QD=35.5759;RBI=0.0428057;REFB=0;REVB=0.000772462;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000839827;OID=.;OPOS=116301660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr3	116683964	.	G	C	4848.4	PASS	AF=1;AO=310;DP=311;FAO=311;FDP=311;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=148;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112903;FXX=0.00320503;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.003;QD=62.3588;RBI=0.0287337;REFB=-0.0714965;REVB=0.0264227;RO=1;SAF=162;SAR=148;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00321197;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05419e-05;OID=.;OPOS=116683964;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:21:311:311:1:0:310:311:1:148:162:0:1:148:163:0:0
chr3	118269774	.	A	G	380.83	PASS	AF=0.5;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.037086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.801;QD=19.5297;RBI=0.0402143;REFB=-0.0253397;REVB=-0.0155505;RO=39;SAF=18;SAR=21;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921083;STB=0.551155;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0239868;OID=.;OPOS=118269774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:39:39:39:39:0.5:21:18:22:17:21:18:22:17
chr3	118621664	.	C	A	473.33	PASS	AF=0.494624;AO=46;DP=95;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=-0.00826186;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.576;QD=20.3582;RBI=0.00977643;REFB=-0.0356975;REVB=0.00522687;RO=47;SAF=14;SAR=32;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00698891;STB=0.503874;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0342386;OID=.;OPOS=118621664;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:93:47:47:46:46:0.494624:32:14:14:33:32:14:14:33
chr3	118649060	.	G	T	1270.81	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327106;FXX=0.0238067;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.417;QD=61.9905;RBI=0.0524195;REFB=0;REVB=0.0409612;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27332e-05;OID=.;OPOS=118649060;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:82:0:0:82:82:1:42:40:0:0:42:40:0:0
chr3	118865801	.	C	A,T	685.46	PASS	AF=0.0377358,0.924528;AO=2,49;DP=53;FAO=2,49;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=2,25;FSAR=0,24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0347633,0.0486655;FXX=0.0185151;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=124.511,154.035;QD=51.7325;RBI=0.0352497,0.0526067;REFB=-0.104228,-0.152595;REVB=0.00583586,0.0199784;RO=1;SAF=2,25;SAR=0,24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0184525;STB=0.5,0.519223;STBP=1,0.245;TYPE=snp,snp;VARB=0.179795,0.000198567;OID=.,.;OPOS=118865801,118865801;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:53:53:1:2:2,49:2,49:0.0377358,0.924528:0,24:2,25:1:0:0,24:2,25:2:0
chr3	118867047	.	C	G	685.61	PASS	AF=0.944444;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0322228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.038;QD=50.7857;RBI=0.0517057;REFB=-0.0822976;REVB=0.0404372;RO=3;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761219;STB=0.540524;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.000417998;OID=.;OPOS=118867047;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:54:54:3:3:51:51:0.944444:17:34:0:3:17:34:0:3
chr3	118909159	.	A	G	581.29	PASS	AF=0.975;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0543481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.9231;QD=58.1293;RBI=0.0550874;REFB=-0.139038;REVB=0.00899458;RO=1;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199387;STB=0.510633;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00375112;OID=.;OPOS=118909159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:40:1:1:38:39:0.975:23:15:0:1:23:16:0:1
chr3	118945796	.	G	C	759.39	PASS	AF=0.55814;AO=72;DP=129;FAO=72;FDP=129;FR=.;FRO=57;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.00136037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.171;QD=23.5471;RBI=0.0181771;REFB=-0.0262046;REVB=0.0181262;RO=57;SAF=40;SAR=32;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238681;STB=0.51304;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0181546;OID=.;OPOS=118945796;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:57:57:72:72:0.55814:32:40:30:27:32:40:30:27
chr3	119118104	.	A	G	375.65	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.306;QD=55.6524;RBI=0.0448489;REFB=0;REVB=0.0313911;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334859;OID=.;OPOS=119118104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr3	119128398	.	G	A	155.99	PASS	AF=0.350877;AO=20;DP=55;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0111529;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=282.822;QD=10.9469;RBI=0.0340016;REFB=-0.0171117;REVB=-0.0321204;RO=35;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224;STB=0.609945;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0271101;OID=.;OPOS=119128398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:35:37:20:20:0.350877:9:11:12:23:9:11:14:23
chr3	119133183	.	G	A	666.74	PASS	AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0131829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1702;QD=57.9772;RBI=0.0337883;REFB=0.0373747;REVB=0.0311105;RO=2;SAF=24;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03755;STB=0.519991;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=-0.00778167;OID=.;OPOS=119133183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:46:46:2:2:44:44:0.956522:20:24:2:0:20:24:2:0
chr3	119196166	.	T	C	237.09	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=71;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=0.0429316;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4995;QD=13.5482;RBI=0.0632847;REFB=-0.00579504;REVB=0.0464954;RO=41;SAF=14;SAR=14;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296262;STB=0.657042;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00575795;OID=.;OPOS=119196166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:41:42:28:28:0.4:14:14:32:9:14:14:32:10
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chr3	119331892	.	C	G	184.78	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0106306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.384;QD=18.4777;RBI=0.0711644;REFB=-0.0112765;REVB=-0.0703659;RO=21;SAF=5;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263901;STB=0.650994;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0347859;OID=.;OPOS=119331892;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:14:5:11:10:14:5:11:10
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chr3	119361415	.	A	G	300.61	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.00839474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4981;QD=21.472;RBI=0.0338619;REFB=-0.0483503;REVB=-0.0328048;RO=25;SAF=16;SAR=15;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189893;STB=0.604746;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0392757;OID=.;OPOS=119361415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:15:16:7:18:15:16:7:18
chr3	119367390	.	T	C	778.8	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00184894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.102;QD=63.5756;RBI=0.048978;REFB=0;REVB=0.0489431;RO=0;SAF=35;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.61818e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137383;OID=.;OPOS=119367390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:13:35:0:0:14:35:0:0
chr3	119378872	.	G	A	572.04	PASS	AF=0.429577;AO=61;DP=142;FAO=61;FDP=142;FR=.;FRO=81;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=45;FSRR=36;FWDB=-0.0126928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5408;QD=16.1137;RBI=0.0128971;REFB=-0.00857099;REVB=0.00228622;RO=80;SAF=30;SAR=31;SRF=45;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716914;STB=0.53632;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0106579;OID=.;OPOS=119378872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:80:81:61:61:0.429577:31:30:45:35:31:30:45:36
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chr3	119434527	.	G	C	1607.13	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.312;QD=64.2853;RBI=0.0318808;REFB=0;REVB=0.0136707;RO=0;SAF=59;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.3262e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.42697e-05;OID=.;OPOS=119434527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:41:59:0:0:41:59:0:0
chr3	119459576	.	G	GT,T	66.19	PASS	AF=0.392857,0;AO=7,2;DP=28;FAO=11,0;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=5,0;FSAR=6,0;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.0347839,-0.00633651;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=14.2625,274.772;QD=9.45615;RBI=0.04922,0.00786314;REFB=-0.13004,-0.0104976;REVB=-0.0348237,-0.00465592;RO=19;SAF=2,1;SAR=5,1;SRF=5;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.03226,0.252086;STB=0.675404,0.5;STBP=0.198,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.147228,0;OID=.,.;OPOS=119459577,119459576;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:28:28:19:17:7,2:11,0:0.392857,0:5,1:2,1:5:14:6,0:5,0:3:14
chr3	119533910	.	T	C	1513.39	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302283;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0676;QD=63.7219;RBI=0.0311318;REFB=0;REVB=0.00744582;RO=0;SAF=72;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1561e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.34994e-05;OID=.;OPOS=119533910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:95:0:0:95:95:1:23:72:0:0:23:72:0:0
chr3	120068022	.	C	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.712;QD=33.4285;RBI=0.0667746;REFB=0;REVB=0.032944;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00226342;OID=.;OPOS=120068022;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr3	120389316	.	T	A	1420.18	PASS	AF=0.978723;AO=92;DP=96;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.021532;FXX=0.0208312;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.304;QD=60.433;RBI=0.021603;REFB=-0.0406789;REVB=0.00175016;RO=1;SAF=56;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00839106;STB=0.502424;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.000156282;OID=.;OPOS=120389316;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:96:94:1:2:92:92:0.978723:36:56:1:0:36:56:1:1
chr3	120500093	.	C	T	580.57	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00297587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8202;QD=59.5453;RBI=0.0558926;REFB=0;REVB=0.0558133;RO=0;SAF=10;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00332658;OID=.;OPOS=120500093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:27:10:0:0:28:11:0:0
chr3	121137976	.	C	T	748.25	PASS	AF=0.982143;AO=53;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0212227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.498;QD=53.4466;RBI=0.0241845;REFB=-0.0159683;REVB=0.0115969;RO=2;SAF=29;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00325731;STB=0.5102;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.00105059;OID=.;OPOS=121137976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:56:56:2:1:53:55:0.982143:24:29:1:1:24:31:0:1
chr3	121138015	.	C	T	834.09	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3828;QD=57.5236;RBI=0.0271315;REFB=0;REVB=-0.0238226;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.53572e-05;OID=.;OPOS=121138015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:56:58:1:27:29:0:0:27:31:0:0
chr3	121143384	.	C	CT	1425.7	PASS	AF=1;AO=106;DP=132;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0902027;FXX=0.0239981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.8063;QD=46.7443;RBI=0.0903649;REFB=0;REVB=-0.00541333;RO=25;SAF=40;SAR=66;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684221;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000907102;OID=.;OPOS=121143385;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:106:132:122:122:0:47:75:0:0:26:25:40:66:14:11
chr3	121154974	.	T	C	1406.13	PASS	AF=0.958333;AO=92;DP=97;FAO=92;FDP=96;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0276823;FXX=0.0103082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.6098;QD=58.5889;RBI=0.0294508;REFB=-0.0319441;REVB=-0.0100518;RO=2;SAF=51;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00221718;STB=0.50229;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.000803403;OID=.;OPOS=121154974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:97:96:2:4:92:92:0.958333:41:51:1:1:41:51:2:2
chr3	121208176	.	T	C	867.36	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0844092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3047;QD=57.8239;RBI=0.133408;REFB=0;REVB=0.103309;RO=0;SAF=46;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0015867;OID=.;OPOS=121208176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:14:46:0:0:14:46:0:0
chr3	121208833	.	G	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0027525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.509;QD=57.2021;RBI=0.0489097;REFB=0;REVB=-0.0488322;RO=0;SAF=23;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000240822;OID=.;OPOS=121208833;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:7:23:0:0:7:23:0:0
chr3	121238749	.	G	A	832.57	PASS	AF=0.952381;AO=60;DP=63;FAO=60;FDP=63;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00772938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.067;QD=52.8613;RBI=0.0927731;REFB=0.0446454;REVB=-0.0924505;RO=1;SAF=26;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178047;STB=0.511274;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=-0.00317268;OID=.;OPOS=121238749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:63:63:1:3:60:60:0.952381:34:26:1:0:34:26:2:1
chr3	121263720	.	C	A	1280.6	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0142868;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.341;QD=60.9808;RBI=0.0160866;REFB=-0.0209677;REVB=-0.00739368;RO=0;SAF=55;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504503;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00212139;OID=.;OPOS=121263720;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:84:0:1:83:83:0.988095:28:55:0:0:28:55:1:0
chr3	121340536	.	T	C	1788.73	PASS	AF=1;AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0773048;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4188;QD=61.153;RBI=0.0818286;REFB=0;REVB=-0.0268305;RO=0;SAF=66;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000427123;OID=.;OPOS=121340536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:117:0:0:117:117:1:51:66:0:0:51:66:0:0
chr3	121350966	.	C	G	288.97	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0685197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.918;QD=52.5401;RBI=0.0730713;REFB=0;REVB=0.0253864;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000737986;OID=.;OPOS=121350966;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr3	121351315	.	G	A	154.13	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0623685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.65;QD=26.8047;RBI=0.0697952;REFB=-0.0383809;REVB=0.0313297;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414852;STB=0.732972;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0706989;OID=.;OPOS=121351315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:23:23:7:7:12:12:0.521739:8:4:7:0:8:4:7:0
chr3	121353254	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.9;QD=51.9166;RBI=0.0341002;REFB=0;REVB=0.0132798;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191516;OID=.;OPOS=121353254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0
chr3	121354583	.	G	A	902.0	PASS	AF=0.955224;AO=63;DP=66;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0115793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.54;QD=53.8506;RBI=0.0674807;REFB=-0.205768;REVB=0.0664798;RO=3;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377377;STB=0.519475;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00140621;OID=.;OPOS=121354583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:66:67:3:3:63:64:0.955224:36:27:0:3:37:27:0:3
chr3	121372875	.	A	G	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6565;QD=56.1898;RBI=0.0292343;REFB=0;REVB=0.0169369;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000893729;OID=.;OPOS=121372875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0
chr3	121373058	.	T	C	524.21	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000643126;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5415;QD=59.9094;RBI=0.00323234;REFB=0;REVB=0.00316771;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000799061;OID=.;OPOS=121373058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr3	121373111	.	T	C	313.34	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00010427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.069;QD=50.134;RBI=0.048468;REFB=-0.00074724;REVB=0.0484678;RO=1;SAF=7;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616508;STB=0.533305;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.000238257;OID=.;OPOS=121373111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:17:7:1:0:17:7:1:0
chr3	121374361	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.579;QD=51.1844;RBI=0.0458625;REFB=0;REVB=0.0376085;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000917701;OID=.;OPOS=121374361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:7:13:0:0:7:13:0:0
chr3	121414061	.	C	T	724.13	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0325659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.651;QD=54.6514;RBI=0.0419912;REFB=-0.0163219;REVB=0.0265089;RO=1;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171263;STB=0.509087;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000335459;OID=.;OPOS=121414061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:27:25:0:1:27:25:0:1
chr3	121415720	.	T	C	740.0	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.39;QD=56.9229;RBI=0.0276812;REFB=0;REVB=0.025705;RO=0;SAF=36;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104006;OID=.;OPOS=121415720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:16:36:0:0:16:36:0:0
chr3	121435624	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=367.875;QD=33.4285;RBI=0.0277967;REFB=0;REVB=-0.0187008;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83079e-05;OID=.;OPOS=121435624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr3	121563355	.	T	C	1510.66	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0569556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5225;QD=63.6068;RBI=0.0648383;REFB=0;REVB=0.0309848;RO=0;SAF=52;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000526436;OID=.;OPOS=121563355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:95:0:0:94:95:1:42:52:0:0:42:53:0:0
chr3	121641693	.	G	A	517.35	PASS	AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00189453;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2791;QD=54.4581;RBI=0.00600876;REFB=0.0145598;REVB=-0.00570228;RO=2;SAF=16;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00553034;STB=0.502957;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=-0.00147217;OID=.;OPOS=121641693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:38:2:2:36:36:0.947368:20:16:1:1:20:16:1:1
chr3	121642048	.	A	T	1033.21	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0653621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.504;QD=58.209;RBI=0.11845;REFB=-0.124237;REVB=-0.0987837;RO=1;SAF=47;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00995486;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00352215;OID=.;OPOS=121642048;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:71:71:1:0:70:71:1:23:47:1:0:23:48:0:0
chr3	121643170	.	A	T	868.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0046439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.221;QD=57.8834;RBI=0.0472609;REFB=0;REVB=-0.0470322;RO=0;SAF=50;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.37846e-05;OID=.;OPOS=121643170;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:9:50:0:0:9:51:0:0
chr3	121643804	.	C	T	1820.3	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198407;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=64.175;QD=60.6766;RBI=0.0741991;REFB=0;REVB=-0.0714973;RO=0;SAF=73;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000131296;OID=.;OPOS=121643804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:120:0:0:119:120:1:46:73:0:0:46:74:0:0
chr3	121646641	.	A	G	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.368;QD=57.3856;RBI=0.0596125;REFB=0;REVB=0.0112066;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187552;OID=.;OPOS=121646641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:35:22:0:0:35:22:0:0
chr3	121647286	.	C	T	1108.19	PASS	AF=0.974026;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0393026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.244;QD=57.5685;RBI=0.0401939;REFB=0.0109008;REVB=-0.00841746;RO=2;SAF=29;SAR=46;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201268;STB=0.510635;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.000360952;OID=.;OPOS=121647286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:77:2:2:75:75:0.974026:46:29:0:2:46:29:0:2
chr3	121647396	.	C	T	196.87	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=-0.0231365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9207;QD=12.9095;RBI=0.0231475;REFB=-0.00503653;REVB=0.000713259;RO=35;SAF=10;SAR=14;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0800906;STB=0.541277;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00789417;OID=.;OPOS=121647396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:37:24:24:0.393443:14:10:12:23:14:10:13:24
chr3	121648168	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.42;QD=55.0987;RBI=0.0200032;REFB=0;REVB=0.00676675;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.29811e-05;OID=.;OPOS=121648168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr3	121712051	.	A	C	568.31	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3964;QD=59.8219;RBI=0.0568645;REFB=0;REVB=0.055708;RO=0;SAF=28;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0020216;OID=.;OPOS=121712051;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:9:28:0:0:9:29:0:0
chr3	121825197	.	G	A	2115.33	PASS	AF=1;AO=134;DP=134;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271813;FXX=0.0073524;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.034;QD=62.6763;RBI=0.0390723;REFB=0;REVB=-0.0280682;RO=0;SAF=78;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.79668e-07;OID=.;OPOS=121825197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:135:0:0:134:135:1:56:78:0:0:57:78:0:0
chr3	121836966	.	TGA	T	508.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023133;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=2;MLLD=133.869;QD=58.0599;RBI=0.0349598;REFB=0;REVB=0.0262117;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000400429;OID=.;OPOS=121836967;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:31:36:35:35:0:22:13:0:0:4:0:19:12:0:0
chr3	121838319	.	G	A	636.75	PASS	AF=0.496124;AO=64;DP=131;FAO=64;FDP=129;FR=.;FRO=65;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=52;FSRR=13;FWDB=-0.0137983;FXX=0.015266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.611;QD=19.7441;RBI=0.0145691;REFB=-0.00901639;REVB=0.00467614;RO=63;SAF=37;SAR=27;SRF=52;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239672;STB=0.618818;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0116764;OID=.;OPOS=121838319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:129:63:65:64:64:0.496124:27:37:52:11:27:37:52:13
chr3	122003045	.	G	C	1565.02	PASS	AF=1;AO=88;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.436;QD=59.62;RBI=0.0402701;REFB=0;REVB=0.0367457;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115812;OID=.;OPOS=122003045;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:88:105:1:45:43:0:0:56:49:0:0
chr3	122003769	.	A	G	575.69	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.867;QD=60.5986;RBI=0.0518879;REFB=0;REVB=0.0296358;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193237;OID=.;OPOS=122003769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0
chr3	122003832	.	G	C	972.7	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.714;QD=58.9517;RBI=0.0379773;REFB=0;REVB=-0.0303459;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.07922e-05;OID=.;OPOS=122003832;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:31:35:0:0:31:35:0:0
chr3	122140919	.	T	C	105.82	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00201971;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.007;QD=11.4396;RBI=0.0299663;REFB=-0.00809157;REVB=-0.0298982;RO=24;SAF=2;SAR=11;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.444473;STB=0.76953;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0164337;OID=.;OPOS=122140919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:11:2:12:12:11:2:12:12
chr3	122144347	.	C	G	343.23	PASS	AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0157633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.195;QD=18.8068;RBI=0.0861374;REFB=-0.00782669;REVB=0.0846828;RO=37;SAF=15;SAR=21;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137528;STB=0.576616;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00893501;OID=.;OPOS=122144347;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:37:37:36:36:0.493151:21:15:21:16:21:15:21:16
chr3	122144873	.	G	A	81.28	PASS	AF=0.34375;AO=9;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0315844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.471;QD=10.1606;RBI=0.0322552;REFB=-0.0076554;REVB=0.00654391;RO=20;SAF=7;SAR=2;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236225;STB=0.544827;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0120033;OID=.;OPOS=122144873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:32:32:20:21:9:11:0.34375:2:7:12:8:4:7:12:9
chr3	122145470	.	C	A	414.57	PASS	AF=0.539474;AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=76;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0113533;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=337.939;QD=21.8195;RBI=0.013684;REFB=0.0147284;REVB=-0.00763902;RO=35;SAF=17;SAR=24;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223571;STB=0.62312;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.00934616;OID=.;OPOS=122145470;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:35:35:41:41:0.539474:24:17:24:11:24:17:24:11
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chr3	122259606	.	T	C	809.77	PASS	AF=0.640351;AO=73;DP=115;FAO=73;FDP=114;FR=.;FRO=41;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0442831;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.709;QD=28.4129;RBI=0.095462;REFB=-0.0454163;REVB=0.0845695;RO=41;SAF=38;SAR=35;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00556014;STB=0.503008;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0194707;OID=.;OPOS=122259606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:114:41:41:73:73:0.640351:35:38:21:20:35:38:21:20
chr3	122259640	.	T	C	767.4	PASS	AF=0.657143;AO=67;DP=104;FAO=69;FDP=105;FR=.;FRO=36;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00323841;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.175;QD=29.2344;RBI=0.0378878;REFB=-0.0174284;REVB=0.0377491;RO=34;SAF=31;SAR=36;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319947;STB=0.501674;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.00433971;OID=.;OPOS=122259640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:34:36:67:69:0.657143:36:31:14:20:38:31:16:20
chr3	122288210	.	G	A	202.99	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0189565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.0751;QD=21.9452;RBI=0.152555;REFB=-0.0448574;REVB=-0.151372;RO=16;SAF=15;SAR=5;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689287;STB=0.509082;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0352339;OID=.;OPOS=122288210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:16:17:20:20:0.540541:5:15:13:3:5:15:13:4
chr3	122290579	.	C	A,T	1320.64	PASS	AF=0.0444444,0.933333;AO=6,82;DP=90;FAO=4,84;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=0,29;FSAR=4,55;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.067756,-0.0129548;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=25.9812,169.051;QD=58.695;RBI=0.0949828,0.0136172;REFB=0.0288577,-0.0706718;REVB=-0.0665646,-0.00419559;RO=2;SAF=3,26;SAR=3,56;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.215133,0.0166127;STB=0.5,0.508926;STBP=1,0.337;TYPE=snp,snp;VARB=0.251285,-0.000277453;OID=.,.;OPOS=122290579,122290579;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:90:90:2:2:6,82:4,84:0.0444444,0.933333:3,56:3,26:0:2:4,55:0,29:0:2
chr3	122296638	.	G	A	1026.84	PASS	AF=0.426415;AO=111;DP=263;FAO=113;FDP=265;FR=.;FRO=152;FSAF=56;FSAR=57;FSRF=77;FSRR=75;FWDB=0.0464374;FXX=0.0111936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2647;QD=15.4994;RBI=0.0464508;REFB=-0.0254128;REVB=0.00111499;RO=151;SAF=55;SAR=56;SRF=77;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149295;STB=0.50631;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0377713;OID=.;OPOS=122296638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:263:265:151:152:111:113:0.426415:56:55:77:74:57:56:77:75
chr3	122354034	.	GAAA	GAA,GA,GAAG	152.9	PASS	AF=0.304348,0.0434783,0.434783;AO=3,5,8;DP=25;FAO=7,1,10;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=1,0,5;FSAR=6,1,5;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0684051,0.0383219,0.0270473;FXX=0.079968;HRUN=5,5,5;LEN=1,2,1;MLLD=7.57054,15.2473,216.448;QD=26.5913;RBI=0.39742,0.222845,0.0672837;REFB=-0.103669,-0.0631643,-0.0257034;REVB=-0.391489,-0.219526,-0.0616079;RO=5;SAF=0,0,4;SAR=3,5,4;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0.381818,0.381818,0;SSSB=-0.794084,-0.812479,-0.33733;STB=0.809829,0.993343,0.599808;STBP=0.035,0.233,0.33;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0518586,0.0464952,0.0173387;OID=.,.,.;OPOS=122354035,122354035,122354037;OREF=A,AA,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=GAA,GA,GAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.304348,0.0434783,0.434783:3,5,8:25:7,1,10:23:5:1,0,5:6,1,5:4:1:55:5:0,0,4:3,5,4:5:0
chr3	122354792	.	G	A	285.8	PASS	AF=0.37931;AO=33;DP=87;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0247538;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.543;QD=13.1403;RBI=0.0256256;REFB=-0.00441198;REVB=-0.00662749;RO=54;SAF=19;SAR=14;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122545;STB=0.57009;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00683021;OID=.;OPOS=122354792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:54:54:33:33:0.37931:14:19:25:29:14:19:25:29
chr3	122418750	.	G	A	191.68	PASS	AF=0.487805;AO=19;DP=40;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0171954;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.3243;QD=18.7006;RBI=0.0371105;REFB=-0.005016;REVB=-0.0328863;RO=21;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845586;STB=0.561038;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0100205;OID=.;OPOS=122418750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:21:21:19:20:0.487805:8:11:14:7:9:11:14:7
chr3	122419083	.	C	A	294.21	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0105789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.558;QD=17.5646;RBI=0.0109182;REFB=-0.0177482;REVB=0.00270075;RO=35;SAF=17;SAR=15;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955372;STB=0.553455;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0191668;OID=.;OPOS=122419083;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:15:17:15:20:15:17:15:20
chr3	122437321	.	T	C	834.38	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4529;QD=57.5435;RBI=0.0339483;REFB=0;REVB=0.0271432;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000372661;OID=.;OPOS=122437321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:23:35:0:0:23:35:0:0
chr3	122439754	.	C	G	72.93	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0144196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.575;QD=20.8379;RBI=0.0187107;REFB=-0.00157852;REVB=0.0119233;RO=5;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313638;STB=0.685212;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00101343;OID=.;OPOS=122439754;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:8:1:2:3:8:1:2:3
chr3	122459290	.	G	GAGA	121.92	PASS	AF=0.4375;AO=13;DP=33;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0138019;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=3;MLLD=234.466;QD=15.2397;RBI=0.0397547;REFB=-0.0223356;REVB=-0.037282;RO=18;SAF=11;SAR=2;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46486;STB=0.782148;STBP=0.014;TYPE=ins;VARB=0.0245906;OID=.;OPOS=122459291;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=GAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4375:13:33:14:32:18:12:2:8:10:99:18:11:2:8:10
chr3	122459477	.	A	G	480.38	PASS	AF=0.412214;AO=49;DP=126;FAO=54;FDP=131;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=0.0136515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.969;QD=14.6681;RBI=0.0442173;REFB=-0.0128708;REVB=-0.0420572;RO=76;SAF=17;SAR=32;SRF=42;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224321;STB=0.588868;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0296776;OID=.;OPOS=122459477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:131:76:77:49:54:0.412214:32:17:42:34:32:22:43:34
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chr3	122630323	.	T	G	169.79	PASS	AF=0.245098;AO=25;DP=103;FAO=25;FDP=102;FR=.;FRO=77;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=43;FWDB=0.00298109;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.312;QD=6.65847;RBI=0.0158178;REFB=0.00178971;REVB=0.0155343;RO=77;SAF=7;SAR=18;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217151;STB=0.633364;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=-0.00621868;OID=.;OPOS=122630323;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:102:77:77:25:25:0.245098:18:7:34:43:18:7:34:43
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chr3	122880179	.	C	T	295.61	PASS	AF=0.377778;AO=34;DP=90;FAO=34;FDP=90;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0251874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.9824;QD=13.1383;RBI=0.0507111;REFB=-0.0468964;REVB=-0.0440137;RO=56;SAF=12;SAR=22;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164917;STB=0.594538;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0492099;OID=.;OPOS=122880179;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:56:56:34:34:0.377778:22:12:28:28:22:12:28:28
chr3	122991021	.	A	T	282.27	PASS	AF=0.438356;AO=30;DP=71;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00479902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.986;QD=15.4669;RBI=0.0078113;REFB=-0.0183865;REVB=-0.00616326;RO=41;SAF=17;SAR=13;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807042;STB=0.56024;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0215176;OID=.;OPOS=122991021;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:73:41:41:30:32:0.438356:13:17:20:21:13:19:20:21
chr3	122991038	.	C	T	993.82	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00904061;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.365;QD=59.3327;RBI=0.0196029;REFB=0;REVB=0.0173937;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4792e-05;OID=.;OPOS=122991038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:32:34:0:0:33:34:0:0
chr3	123218524	.	TTAAAA	T	244.4	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0219498;FXX=0;HRUN=2;LEN=5;MLLD=342.634;QD=16.2931;RBI=0.0223226;REFB=-0.0109746;REVB=0.00406244;RO=25;SAF=17;SAR=15;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872393;STB=0.535692;STBP=0.552;TYPE=del;VARB=0.00971377;OID=.;OPOS=123218525;OREF=TAAAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.533333:32:60:32:60:28:17:15:17:11:99:25:17:15:16:9
chr3	123286645	.	A	G	76.96	PASS	AF=0.259259;AO=14;DP=50;FAO=14;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0061942;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=17.6109;QD=5.70045;RBI=0.0793008;REFB=-0.0536181;REVB=0.0790585;RO=26;SAF=11;SAR=3;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271934;STB=0.699689;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.114752;OID=.;OPOS=123286645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:50:54:26:40:14:14:0.259259:3:11:15:11:3:11:22:18
chr3	123331774	.	T	TTAAG	54.1	PASS	AF=0.296296;AO=7;DP=30;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0450254;FXX=0;HRUN=3;LEN=4;MLLD=295.809;QD=8.01476;RBI=0.0456652;REFB=0.002626;REVB=0.00761681;RO=22;SAF=1;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.499735;STB=0.803716;STBP=0.07;TYPE=ins;VARB=-0.00391332;OID=.;OPOS=123331775;OREF=-;OALT=TAAG;OMAPALT=TTAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.296296:7:30:8:27:19:1:7:9:10:54:22:1:6:12:10
chr3	123357037	.	A	G	763.71	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.075516;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.204;QD=62.3441;RBI=0.0755539;REFB=0;REVB=0.00239472;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000955142;OID=.;OPOS=123357037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:46:49:1:25:21:0:0:26:23:0:0
chr3	123368013	.	A	G	429.0	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0610486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.518;QD=57.2001;RBI=0.0660427;REFB=0;REVB=0.0251934;RO=0;SAF=5;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000426394;OID=.;OPOS=123368013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:25:5:0:0:25:5:0:0
chr3	123418913	.	G	A	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00609505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.57;QD=57.5451;RBI=0.00649372;REFB=0;REVB=0.00224027;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.29576e-05;OID=.;OPOS=123418913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:27:31:0:0:27:31:0:0
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chr3	123451773	.	G	C	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.958;QD=58.7811;RBI=0.0467156;REFB=0;REVB=0.030749;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130902;OID=.;OPOS=123451773;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:32:33:0:0:32:33:0:0
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chr3	124044949	.	C	T	2239.25	PASS	AF=1;AO=105;DP=147;FAO=146;FDP=146;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=96;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110024;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0243;QD=61.3492;RBI=0.112089;REFB=0;REVB=0.0214132;RO=0;SAF=56;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.8178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00626095;OID=.;OPOS=124044949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:146:0:0:105:146:1:49:56:0:0:50:96:0:0
chr3	124181454	.	C	T	102.7	PASS	AF=0.295455;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0420286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.415;QD=9.33596;RBI=0.0431799;REFB=-0.0179406;REVB=0.00990475;RO=30;SAF=2;SAR=11;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289809;STB=0.67316;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0441155;OID=.;OPOS=124181454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:30:31:13:13:0.295455:11:2:10:20:11:2:10:21
chr3	124351316	.	G	A	159.6	PASS	AF=0.363636;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0252138;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.5135;QD=11.6073;RBI=0.0446263;REFB=0.000142534;REVB=-0.0368209;RO=35;SAF=15;SAR=5;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254082;STB=0.649324;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.00225632;OID=.;OPOS=124351316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:35:35:20:20:0.363636:5:15:19:16:5:15:19:16
chr3	124351424	.	T	C	408.16	PASS	AF=0.429907;AO=42;DP=106;FAO=46;FDP=107;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.019961;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.683;QD=15.2584;RBI=0.0202026;REFB=-0.0368127;REVB=0.0031147;RO=58;SAF=22;SAR=20;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422322;STB=0.517066;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0360122;OID=.;OPOS=124351424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:58:61:42:46:0.429907:20:22:28:30:22:24:30:31
chr3	124376653	.	G	A	330.03	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=-0.00998404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.924;QD=18.335;RBI=0.0104213;REFB=-0.00645307;REVB=-0.00298688;RO=37;SAF=22;SAR=13;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047136;STB=0.526256;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.00773969;OID=.;OPOS=124376653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:37:37:35:35:0.486111:13:22:25:12:13:22:25:12
chr3	124412634	.	G	T	149.64	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.00051233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.244;QD=11.9716;RBI=0.0149859;REFB=-0.00675423;REVB=-0.0149772;RO=33;SAF=10;SAR=7;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0926827;STB=0.554393;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00910472;OID=.;OPOS=124412634;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:7:10:22:11:7:10:22:11
chr3	124515308	.	A	G	136.77	PASS	AF=0.4;AO=13;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.00966184;FXX=0.017854;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.244;QD=9.94701;RBI=0.0617855;REFB=-0.0216049;REVB=0.0610254;RO=32;SAF=11;SAR=2;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.557032;STB=0.563579;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0237181;OID=.;OPOS=124515308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:33:13:22:0.4:2:11:12:20:11:11:13:20
chr3	124515314	.	G	A	153.83	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0131035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6893;QD=11.6101;RBI=0.0744252;REFB=-0.0259589;REVB=-0.0732626;RO=33;SAF=7;SAR=12;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295291;STB=0.52938;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0179244;OID=.;OPOS=124515314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:34:19:19:0.358491:12:7:13:20:12:7:14:20
chr3	124515395	.	G	A	131.31	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0435825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.032;QD=14.1952;RBI=0.0448857;REFB=-0.0208004;REVB=0.0107373;RO=22;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175409;STB=0.510191;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0227787;OID=.;OPOS=124515395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:10:5:7:15:10:5:7:15
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chr3	124646594	.	A	G	444.43	PASS	AF=0.558442;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=77;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0140122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.981;QD=23.0871;RBI=0.0157229;REFB=-0.00630934;REVB=-0.00713217;RO=33;SAF=26;SAR=17;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726486;STB=0.53423;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00559778;OID=.;OPOS=124646594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:33:34:43:43:0.558442:17:26:17:16:17:26:18:16
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chr3	124688791	.	A	T	76.56	PASS	AF=0.625;AO=8;DP=14;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0642794;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=36.119;QD=19.1395;RBI=0.0929173;REFB=-0.0573022;REVB=0.0670953;RO=6;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21129;STB=0.644839;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0320225;OID=.;OPOS=124688791;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:14:16:6:6:8:10:0.625:6:2:3:3:8:2:3:3
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chr3	124746347	.	T	C	226.16	PASS	AF=0.345679;AO=28;DP=81;FAO=28;FDP=81;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.0159079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.933;QD=11.1682;RBI=0.0188969;REFB=0.00381896;REVB=0.0101996;RO=53;SAF=12;SAR=16;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916309;STB=0.553153;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-0.00546847;OID=.;OPOS=124746347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:53:53:28:28:0.345679:16:12:27:26:16:12:27:26
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chr3	124802888	.	C	T	241.17	PASS	AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.0201109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.482;QD=14.616;RBI=0.0204734;REFB=-0.000284269;REVB=0.00383548;RO=38;SAF=15;SAR=13;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713831;STB=0.540453;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.00029038;OID=.;OPOS=124802888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:13:15:23:15:13:15:23:15
chr3	124837684	.	T	C	1635.4	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0377703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9329;QD=60.0147;RBI=0.0592751;REFB=0;REVB=0.0456831;RO=0;SAF=63;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.69741e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.41544e-05;OID=.;OPOS=124837684;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:109:0:0:108:109:1:45:63:0:0:45:64:0:0
chr3	124839470	.	G	A	1253.11	PASS	AF=0.92;AO=79;DP=103;FAO=92;FDP=100;FR=.;FRO=8;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0112956;FXX=0.0291234;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.617;QD=50.1245;RBI=0.0194996;REFB=-0.0708744;REVB=0.0158948;RO=0;SAF=42;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511747;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.000425497;OID=.;OPOS=124839470;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:103:100:0:8:79:92:0.92:37:42:0:0:44:48:3:5
chr3	124951821	.	C	T	140.69	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00424756;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.481;QD=17.5867;RBI=0.0168794;REFB=-0.0040195;REVB=-0.0163363;RO=14;SAF=8;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885829;STB=0.56423;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0078087;OID=.;OPOS=124951821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:32:14:17:15:15:0.46875:7:8:6:8:7:8:7:10
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chr3	126152474	.	C	T	307.23	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00656517;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.479;QD=15.5562;RBI=0.0112282;REFB=-0.0121521;REVB=0.00910884;RO=41;SAF=14;SAR=20;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987726;STB=0.569674;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00870687;OID=.;OPOS=126152474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:41:45:34:34:0.43038:20:14:21:20:20:14:24:21
chr3	126169230	.	C	T	1466.19	PASS	AF=0.989474;AO=93;DP=94;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0129465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.445;QD=61.7344;RBI=0.0150829;REFB=-0.0148953;REVB=-0.00773834;RO=0;SAF=66;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509089;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=4.53091e-05;OID=.;OPOS=126169230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:95:0:1:93:94:0.989474:27:66:0:0:27:67:0:1
chr3	126169472	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0871142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.947;QD=44.6898;RBI=0.0918172;REFB=0;REVB=0.029009;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000796966;OID=.;OPOS=126169472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:9:3:0:0:10:3:0:0
chr3	126179277	.	C	T	246.81	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.00571272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.563;QD=17.9495;RBI=0.0475078;REFB=-0.0174398;REVB=-0.0471631;RO=27;SAF=19;SAR=8;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0762606;STB=0.536023;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.019459;OID=.;OPOS=126179277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:28:27:27:0.490909:8:19:17:10:8:19:18:10
chr3	126329910	.	A	G	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.349;QD=58.5849;RBI=0.0671649;REFB=0;REVB=0.0549061;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000418462;OID=.;OPOS=126329910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr3	126708453	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.554;QD=62.6708;RBI=0.0572427;REFB=0;REVB=0.0499181;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107176;OID=.;OPOS=126708453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr3	126708459	.	C	T	650.88	PASS	AF=0.956522;AO=40;DP=42;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0849208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.7664;QD=56.5984;RBI=0.150363;REFB=-0.0595089;REVB=0.124086;RO=1;SAF=22;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208425;STB=0.521729;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0053236;OID=.;OPOS=126708459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:42:46:1:2:40:44:0.956522:18:22:1:0:22:22:2:0
chr3	126722304	.	C	T	837.28	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02878;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.988;QD=57.7435;RBI=0.0488953;REFB=0;REVB=0.039528;RO=0;SAF=18;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.52311e-05;OID=.;OPOS=126722304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:40:18:0:0:40:18:0:0
chr3	126733554	.	G	A	245.13	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=6;FWDB=-0.00225298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9497;QD=15.5639;RBI=0.0637235;REFB=-0.0067499;REVB=0.0636836;RO=35;SAF=22;SAR=6;SRF=29;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654977;STB=0.536817;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.00803308;OID=.;OPOS=126733554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:6:22:29:6:6:22:29:6
chr3	126741674	.	G	A	645.78	PASS	AF=0.892857;AO=50;DP=56;FAO=50;FDP=56;FR=.;FRO=6;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.064141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.105;QD=46.1268;RBI=0.0772592;REFB=-0.28159;REVB=0.0430687;RO=3;SAF=16;SAR=34;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416577;STB=0.560415;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00534546;OID=.;OPOS=126741674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:56:56:3:6:50:50:0.892857:34:16:2:1:34:16:5:1
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chr3	126754711	.	G	A	1318.93	PASS	AF=1;AO=80;DP=83;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0854177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6937;QD=61.3458;RBI=0.114826;REFB=0;REVB=0.0767381;RO=1;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126242;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567596;OID=.;OPOS=126754711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:86:1:0:80:86:1:37:43:0:1:41:45:0:0
chr3	126916371	.	T	C	402.26	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.250322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7968;QD=55.4845;RBI=0.251307;REFB=0;REVB=0.0222287;RO=1;SAF=8;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054642;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00545145;OID=.;OPOS=126916371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:1:0:28:29:1:20:8:1:0:20:9:0:0
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chr3	126916436	.	G	C	35.53	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0447649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2568;QD=5.68509;RBI=0.0705989;REFB=-0.00468988;REVB=-0.0545922;RO=19;SAF=4;SAR=2;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280568;STB=0.683606;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0570181;OID=.;OPOS=126916436;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:2:4:8:11:2:4:8:11
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chr3	127641968	.	C	A	289.35	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.042;QD=52.609;RBI=0.0224559;REFB=0;REVB=0.0184196;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.05431e-05;OID=.;OPOS=127641968;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0
chr3	127642814	.	G	C	562.69	PASS	AF=0.6;AO=50;DP=85;FAO=51;FDP=85;FR=.;FRO=34;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00392148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5607;QD=26.4793;RBI=0.00413786;REFB=-0.0249822;REVB=-0.00132056;RO=34;SAF=28;SAR=22;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0882778;STB=0.551208;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00955197;OID=.;OPOS=127642814;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:34:34:50:51:0.6:22:28:15:19:22:29:15:19
chr3	127682473	.	A	AGTGTGTT	114.21	PASS	AF=0.184211;AO=18;DP=124;FAO=21;FDP=114;FR=.;FRO=93;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=0.0120393;FXX=0.0256388;HRUN=0;LEN=7;MLLD=351.788;QD=4.00736;RBI=0.020882;REFB=0.000123909;REVB=0.0170621;RO=102;SAF=11;SAR=7;SRF=64;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218562;STB=0.564388;STBP=0.532;TYPE=ins;VARB=-0.000436818;OID=.;OPOS=127682474;OREF=-;OALT=GTGTGTT;OMAPALT=AGTGTGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.184211:18:124:21:114:93:11:10:56:37:99:102:11:7:64:38
chr3	127682477	.	AC	GT	101.61	PASS	AF=0.169643;AO=19;DP=115;FAO=19;FDP=112;FR=.;FRO=93;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=-0.00400002;FXX=0.0260847;HRUN=1;LEN=2;MLLD=236.353;QD=3.62886;RBI=0.0297072;REFB=-0.00768491;REVB=-0.0294367;RO=93;SAF=11;SAR=8;SRF=56;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303957;STB=0.519863;STBP=0.872;TYPE=mnp;VARB=0.0344248;OID=.;OPOS=127682477;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:112:93:93:19:19:0.169643:8:11:56:37:8:11:56:37
chr3	127983495	.	T	C	596.56	PASS	AF=1;AO=29;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.08418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.188;QD=61.1858;RBI=0.0867902;REFB=0;REVB=-0.0211252;RO=0;SAF=7;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000601326;OID=.;OPOS=127983495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:29:39:1:22:7:0:0:22:17:0:0
chr3	128181537	.	C	T	348.46	PASS	AF=0.4625;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.00598969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.326;QD=17.4228;RBI=0.0263712;REFB=-0.00217156;REVB=0.025682;RO=42;SAF=18;SAR=19;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0580507;STB=0.538441;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0023311;OID=.;OPOS=128181537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:43:37:37:0.4625:19:18:23:19:19:18:24:19
chr3	128182074	.	G	A	300.43	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0445997;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.292;QD=21.4592;RBI=0.0496012;REFB=-0.0223437;REVB=0.021706;RO=25;SAF=17;SAR=14;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422041;STB=0.52335;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.0163597;OID=.;OPOS=128182074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:25:25:31:31:0.553571:14:17:15:10:14:17:15:10
chr3	128204951	.	C	T	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.028;QD=39.2067;RBI=0.0360835;REFB=0;REVB=0.0115203;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00089592;OID=.;OPOS=128204951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr3	128205860	.	G	C	174.93	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027602;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.7054;QD=46.6486;RBI=0.0419184;REFB=0;REVB=-0.0315481;RO=0;SAF=1;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000143858;OID=.;OPOS=128205860;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:13:1:0:0:14:1:0:0
chr3	128292844	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.050275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.208;QD=35.5759;RBI=0.102587;REFB=0;REVB=0.0894237;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000471374;OID=.;OPOS=128292844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr3	128580574	.	T	C	471.56	PASS	AF=0.479592;AO=45;DP=96;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0394786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.8;QD=19.2473;RBI=0.0396893;REFB=-0.0293648;REVB=-0.00408411;RO=50;SAF=23;SAR=22;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273344;STB=0.520824;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0321738;OID=.;OPOS=128580574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:98:50:51:45:47:0.479592:22:23:27:23:24:23:27:24
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chr3	128627021	.	A	G	44.54	PASS	AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=14;FWDB=0.00998364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.048;QD=7.12563;RBI=0.0126529;REFB=-0.00309529;REVB=-0.00777323;RO=18;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.390256;STB=0.738564;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0114144;OID=.;OPOS=128627021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:3:4:4:14:3:4:4:14
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chr3	128890350	.	G	A	297.16	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00315196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.199;QD=51.6796;RBI=0.0224031;REFB=0;REVB=0.0221803;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158026;OID=.;OPOS=128890350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:22:23:1:11:11:0:0:12:11:0:0
chr3	129034578	.	G	A	209.28	PASS	AF=0.356164;AO=26;DP=72;FAO=26;FDP=73;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=33;FWDB=0.0234512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9792;QD=11.4672;RBI=0.0236032;REFB=-0.00224026;REVB=-0.00267351;RO=46;SAF=16;SAR=10;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333704;STB=0.696216;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00338211;OID=.;OPOS=129034578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:46:47:26:26:0.356164:10:16:14:32:10:16:14:33
chr3	129130197	.	T	C	141.34	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00453995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.106;QD=21.7439;RBI=0.00748753;REFB=-0.00787109;REVB=0.00595416;RO=11;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110469;STB=0.562416;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00764461;OID=.;OPOS=129130197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:9:6:6:5:9:6:6:5
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chr3	129137127	.	G	A	225.62	PASS	AF=0.397059;AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00505535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.35;QD=13.2719;RBI=0.0132187;REFB=-0.00878417;REVB=0.0122139;RO=41;SAF=17;SAR=10;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15266;STB=0.587448;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0111771;OID=.;OPOS=129137127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:41:41:27:27:0.397059:10:17:20:21:10:17:20:21
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chr3	129155451	.	C	T	456.2	PASS	AF=0.489362;AO=45;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0596518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.534;QD=19.4126;RBI=0.0596587;REFB=-0.0213093;REVB=-0.000906696;RO=48;SAF=25;SAR=20;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658925;STB=0.531296;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0178171;OID=.;OPOS=129155451;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:48:48:45:46:0.489362:20:25:30:18:20:26:30:18
chr3	129210977	.	G	C	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0263182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.814;QD=16.8984;RBI=0.0313525;REFB=-0.0249349;REVB=-0.0170391;RO=9;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787205;STB=0.545367;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0190714;OID=.;OPOS=129210977;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:3:7:7:2:3:7:7:2
chr3	129262077	.	G	A	192.0	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=-0.0195378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7345;QD=11.8154;RBI=0.0195482;REFB=-0.0263014;REVB=0.000635436;RO=41;SAF=21;SAR=3;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266253;STB=0.657563;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0322722;OID=.;OPOS=129262077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:3:21:30:11:3:21:30:11
chr3	129274363	.	G	A	677.92	PASS	AF=0.515385;AO=67;DP=130;FAO=67;FDP=130;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=23;FSRR=40;FWDB=0.00434525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.936;QD=20.859;RBI=0.0140054;REFB=-0.0132747;REVB=-0.0133142;RO=63;SAF=24;SAR=43;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00656621;STB=0.503612;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.0100368;OID=.;OPOS=129274363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:63:63:67:67:0.515385:43:24:23:40:43:24:23:40
chr3	129275206	.	C	T	398.61	PASS	AF=0.414414;AO=46;DP=111;FAO=46;FDP=111;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=0.0199342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2685;QD=14.3645;RBI=0.0330375;REFB=-0.00599591;REVB=-0.0263459;RO=64;SAF=16;SAR=30;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178862;STB=0.605769;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00771173;OID=.;OPOS=129275206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:64:65:46:46:0.414414:30:16:33:31:30:16:34:31
chr3	129279570	.	T	C	94.22	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0106883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4245;QD=10.4687;RBI=0.0109908;REFB=-0.021993;REVB=-0.00256104;RO=24;SAF=5;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138666;STB=0.583194;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0595683;OID=.;OPOS=129279570;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:7:5:13:11:7:5:13:11
chr3	129279597	.	C	T	367.31	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00854894;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.884;QD=56.5094;RBI=0.0397274;REFB=0;REVB=0.0387967;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013135;OID=.;OPOS=129279597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:10:15:0:0:11:15:0:0
chr3	129281718	.	C	T	345.12	PASS	AF=0.391753;AO=38;DP=97;FAO=38;FDP=97;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.00436472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.634;QD=14.2318;RBI=0.00467732;REFB=-0.0134958;REVB=0.00168121;RO=59;SAF=18;SAR=20;SRF=32;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733702;STB=0.54169;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0159868;OID=.;OPOS=129281718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:59:59:38:38:0.391753:20:18:32:27:20:18:32:27
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chr3	129308209	.	G	A	251.48	PASS	AF=0.320388;AO=33;DP=104;FAO=33;FDP=103;FR=.;FRO=70;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=0.00299602;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.394;QD=9.76633;RBI=0.00668593;REFB=-0.000629567;REVB=-0.00597708;RO=70;SAF=15;SAR=18;SRF=43;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184737;STB=0.607267;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.000966814;OID=.;OPOS=129308209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:103:70:70:33:33:0.320388:18:15:43:27:18:15:43:27
chr3	129366963	.	G	T	324.29	PASS	AF=0.395604;AO=37;DP=91;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=-0.0354144;FXX=0.0108684;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.1374;QD=14.2545;RBI=0.0432975;REFB=-0.000380535;REVB=0.0249096;RO=53;SAF=18;SAR=19;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238658;STB=0.522285;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=-0.00306448;OID=.;OPOS=129366963;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:53:55:37:36:0.395604:19:18:27:26:19:17:28:27
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chr3	129538635	.	A	G,T	339.44	PASS	AF=0.923077,0.0769231;AO=24,2;DP=26;FAO=24,2;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18,0;FSAR=6,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220661,-0.0243799;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=93.0321,159.98;QD=52.2221;RBI=0.0668157,0.0249631;REFB=0,0;REVB=0.0630668,0.00536422;RO=0;SAF=18,0;SAR=6,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00085619,0.232371;OID=.,.;OPOS=129538635,129538635;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:26:26:0:0:24,2:24,2:0.923077,0.0769231:6,2:18,0:0:0:6,2:18,0:0:0
chr3	129546729	.	T	C	848.51	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200195;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.492;QD=57.5263;RBI=0.0474271;REFB=0;REVB=0.0429947;RO=0;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190489;OID=.;OPOS=129546729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:21:36:0:0:23:36:0:0
chr3	129546995	.	T	C	146.36	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0216031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8515;QD=16.7269;RBI=0.0312249;REFB=-0.00827294;REVB=0.0225455;RO=18;SAF=4;SAR=12;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307288;STB=0.666444;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0151233;OID=.;OPOS=129546995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:19:16:16:0.457143:12:4:10:8:12:4:10:9
chr3	129695954	.	T	C	545.0	PASS	AF=0.973684;AO=35;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0215711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0781;QD=57.3688;RBI=0.0788263;REFB=0.0240344;REVB=0.0758173;RO=1;SAF=25;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183486;STB=0.509799;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=-0.00149542;OID=.;OPOS=129695954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:38:1:1:35:37:0.973684:10:25:1:0:12:25:1:0
chr3	129696041	.	A	G	828.71	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.021064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.415;QD=55.2472;RBI=0.0275346;REFB=0.0247905;REVB=0.0177331;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=8.1003e-05;OID=.;OPOS=129696041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:60:0:1:59:59:0.983333:36:23:0:0:36:23:1:0
chr3	129800823	.	T	G	124.15	PASS	AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00525747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.73;QD=9.93158;RBI=0.0203238;REFB=-0.00480603;REVB=0.019632;RO=35;SAF=7;SAR=8;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446778;STB=0.526846;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.00973841;OID=.;OPOS=129800823;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:8:7:15:20:8:7:15:20
chr3	129800888	.	G	A	181.97	PASS	AF=0.359375;AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00124218;FXX=0.0153822;HRUN=6;LEN=1;MLLD=215.201;QD=11.3731;RBI=0.00467136;REFB=-0.0135963;REVB=0.00450318;RO=41;SAF=8;SAR=15;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186127;STB=0.608295;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0194361;OID=.;OPOS=129800888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:41:41:23:23:0.359375:15:8:21:20:15:8:21:20
chr3	129800895	.	G	A	229.43	PASS	AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0131234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.175;QD=14.1189;RBI=0.0131237;REFB=-0.0109059;REVB=8.12617e-05;RO=38;SAF=9;SAR=18;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204813;STB=0.616932;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0300781;OID=.;OPOS=129800895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:18:9:20:18:18:9:20:18
chr3	130098349	.	G	A	2092.6	PASS	AF=0.985401;AO=135;DP=138;FAO=135;FDP=137;FR=.;FRO=2;FSAF=73;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0343321;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3932;QD=61.0978;RBI=0.0361368;REFB=0.0269511;REVB=-0.011277;RO=1;SAF=73;SAR=62;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00760554;STB=0.500599;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=-0.00332717;OID=.;OPOS=130098349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:138:137:1:2:135:135:0.985401:62:73:0:1:62:73:1:1
chr3	130103709	.	G	A	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0685825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0951;QD=61.6816;RBI=0.0758992;REFB=0;REVB=-0.0325134;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00125697;OID=.;OPOS=130103709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
chr3	130103723	.	G	A	202.01	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00343972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.438;QD=21.2646;RBI=0.0106812;REFB=-2.25959e-05;REVB=-0.0101122;RO=18;SAF=7;SAR=13;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178195;STB=0.600441;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=-7.34029e-05;OID=.;OPOS=130103723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:13:7:10:8:13:7:10:8
chr3	130104062	.	T	C	1139.08	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0169634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.377;QD=59.1729;RBI=0.0170195;REFB=-0.0920725;REVB=-0.00138104;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506023;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.00115948;OID=.;OPOS=130104062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:35:41:0:0:35:41:1:0
chr3	130104206	.	A	G	733.18	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202874;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.813;QD=56.3987;RBI=0.0326734;REFB=0;REVB=-0.025612;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000552488;OID=.;OPOS=130104206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:20:32:0:0:20:32:0:0
chr3	130110550	.	A	G	393.39	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00881637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.612;QD=56.1988;RBI=0.0187101;REFB=0;REVB=-0.0165027;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.31252e-05;OID=.;OPOS=130110550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:8:20:0:0:8:20:0:0
chr3	130114082	.	C	G	358.19	PASS	AF=0.397959;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.0368878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.445;QD=14.6201;RBI=0.037459;REFB=-0.0144626;REVB=-0.006517;RO=59;SAF=23;SAR=16;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175558;STB=0.599532;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0204146;OID=.;OPOS=130114082;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:59:59:39:39:0.397959:16:23:25:34:16:23:25:34
chr3	130116684	.	G	A	283.05	PASS	AF=0.421053;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0280487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.523;QD=14.8973;RBI=0.0291084;REFB=-0.0161844;REVB=0.00778241;RO=44;SAF=17;SAR=15;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0380075;STB=0.52151;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0250379;OID=.;OPOS=130116684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:44:32:32:0.421053:15:17:25:19:15:17:25:19
chr3	130162395	.	A	G	789.05	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013327;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.5933;QD=56.3609;RBI=0.069429;REFB=0;REVB=-0.0681379;RO=0;SAF=37;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00164273;OID=.;OPOS=130162395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:17:37:0:0:19:37:0:0
chr3	130174334	.	G	A	1116.94	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.54;QD=60.3749;RBI=0.0256846;REFB=0;REVB=0.0113084;RO=0;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70772e-05;OID=.;OPOS=130174334;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:34:40:0:0:34:40:0:0
chr3	130187817	.	T	C	1267.95	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165312;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.237;QD=61.8511;RBI=0.0347517;REFB=0;REVB=0.030568;RO=0;SAF=58;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.00659e-05;OID=.;OPOS=130187817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:24:58:0:0:24:58:0:0
chr3	130190630	.	G	A	1227.49	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0413411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8725;QD=61.3744;RBI=0.0418414;REFB=0;REVB=0.00645162;RO=0;SAF=54;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012869;OID=.;OPOS=130190630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:26:54:0:0:26:54:0:0
chr3	130190720	.	AT	A	123.11	PASS	AF=0.48;AO=21;DP=51;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.0862917;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.1285;QD=9.84888;RBI=0.0872354;REFB=0.0134863;REVB=-0.0127968;RO=25;SAF=11;SAR=10;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231244;STB=0.658375;STBP=0.044;TYPE=del;VARB=-0.00295649;OID=.;OPOS=130190721;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.48:21:51:24:50:26:11:13:20:6:99:25:11:10:19:6
chr3	130286067	.	A	G	56.27	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0127799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.684;QD=11.2538;RBI=0.018792;REFB=-0.0182116;REVB=0.0137773;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.432428;STB=0.74953;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0269542;OID=.;OPOS=130286067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:4:4:11:1:4:4:11:1
chr3	130287194	.	AG	A	32.0	PASS	AF=0.28;AO=9;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=18;FWDB=-0.13501;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.692;QD=5.11969;RBI=0.226384;REFB=-0.0103256;REVB=-0.181719;RO=12;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0.221239;SSSB=0.412314;STB=0.845682;STBP=0.369;TYPE=del;VARB=-0.0197973;OID=.;OPOS=130287195;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.28:9:25:7:25:18:3:4:0:18:31:12:2:7:0:12
chr3	130308840	.	ATTTTTTTA	ATTTTTT,ATTTTTTA,ATTTTTTAA	171.63	PASS	AF=0.410256,0.384615,0;AO=12,8,4;DP=41;FAO=16,15,0;FDP=39;FR=.;FRO=8;FSAF=5,6,0;FSAR=11,9,0;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0206712,0.0547407,0.0487046;FXX=0.0487686;HRUN=7,7,7;LEN=2,1,1;MLLD=15.2122,9.68228,8.19946;QD=17.6033;RBI=0.0252323,0.181263,0.180216;REFB=0.0125546,-0.0518569,-0.0620897;REVB=-0.0144697,0.1728,0.17351;RO=9;SAF=2,6,4;SAR=10,2,0;SRF=3;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.189337,0.380371,0.738373;STB=0.524661,0.555484,0.5;STBP=0.786,0.517,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0120589,0.168765,0;OID=.,.,.;OPOS=130308847,130308841,130308847;OREF=TA,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=ATTTTTT,ATTTTTTA,ATTTTTTAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.410256,0.384615,0:12,8,4:41:16,15,0:39:8:5,6,0:11,9,0:2:6:49:9:2,6,4:10,2,0:3:6
chr3	130718472	.	G	A	276.7	PASS	AF=0.432432;AO=30;DP=72;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.043696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5666;QD=14.9566;RBI=0.0437794;REFB=-0.024444;REVB=-0.00269969;RO=38;SAF=19;SAR=11;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161429;STB=0.580595;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0524109;OID=.;OPOS=130718472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:74:38:42:30:32:0.432432:11:19:18:20:13:19:19:23
chr3	130852185	.	TG	CA	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350091;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=317.501;QD=54.5177;RBI=0.0370531;REFB=0;REVB=0.0121366;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=9.27848e-05;OID=.;OPOS=130852185;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0
chr3	131947937	.	A	G	786.68	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.020956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4379;QD=55.2054;RBI=0.0307363;REFB=-0.109521;REVB=0.0224847;RO=1;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171432;STB=0.509088;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00257496;OID=.;OPOS=131947937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:27:29:0:1:27:29:0:1
chr3	132063904	.	G	A	103.5	PASS	AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0274117;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=193.276;QD=9.85725;RBI=0.02857;REFB=-0.0040422;REVB=0.00805253;RO=29;SAF=6;SAR=7;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063689;STB=0.538402;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0103199;OID=.;OPOS=132063904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:29:29:13:13:0.309524:7:6:15:14:7:6:15:14
chr3	132218623	.	G	T	1396.46	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.475;QD=62.7621;RBI=0.0232366;REFB=0;REVB=0.00739205;RO=0;SAF=59;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.18141e-05;OID=.;OPOS=132218623;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:30:59:0:0:30:59:0:0
chr3	132257747	.	G	A	575.34	PASS	AF=0.438849;AO=61;DP=139;FAO=61;FDP=139;FR=.;FRO=78;FSAF=21;FSAR=40;FSRF=32;FSRR=46;FWDB=-0.0269823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6159;QD=16.5566;RBI=0.0274042;REFB=-0.0171175;REVB=-0.00478989;RO=77;SAF=21;SAR=40;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063055;STB=0.539976;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0306486;OID=.;OPOS=132257747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:77:78:61:61:0.438849:40:21:31:46:40:21:32:46
chr3	132295809	.	G	A	132.12	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0336702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.562;QD=24.0224;RBI=0.092386;REFB=-0.0382773;REVB=0.0860319;RO=8;SAF=6;SAR=8;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126876;STB=0.571326;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0243564;OID=.;OPOS=132295809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:8:6:5:3:8:6:5:3
chr3	132337477	.	C	A	440.47	PASS	AF=0.449541;AO=49;DP=109;FAO=49;FDP=109;FR=.;FRO=60;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=46;FSRR=14;FWDB=-0.00487255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0469;QD=16.1639;RBI=0.115793;REFB=-0.00437958;REVB=-0.115691;RO=60;SAF=34;SAR=15;SRF=46;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088011;STB=0.548929;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.00433825;OID=.;OPOS=132337477;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:60:60:49:49:0.449541:15:34:46:14:15:34:46:14
chr3	132360883	.	C	T	1052.6	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.149;QD=58.478;RBI=0.0130319;REFB=-0.0944586;REVB=0.00205132;RO=1;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150093;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019665;OID=.;OPOS=132360883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:72:72:1:0:71:72:1:31:40:0:1:32:40:0:0
chr3	132401600	.	C	T	178.92	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0040085;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.7647;QD=15.2273;RBI=0.00606614;REFB=0.0028128;REVB=0.00455303;RO=28;SAF=6;SAR=13;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269508;STB=0.655796;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.00284868;OID=.;OPOS=132401600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:13:6:16:12:13:6:16:12
chr3	132409455	.	C	T	818.16	PASS	AF=0.571429;AO=76;DP=133;FAO=76;FDP=133;FR=.;FRO=57;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.0252078;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.967;QD=24.6064;RBI=0.0265605;REFB=-0.00656603;REVB=-0.00836836;RO=56;SAF=37;SAR=39;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0935464;STB=0.546897;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00288611;OID=.;OPOS=132409455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:56:57:76:76:0.571429:39:37:34:22:39:37:34:23
chr3	132436967	.	A	G	263.15	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.024844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.7142;QD=47.8463;RBI=0.0527863;REFB=-0.152841;REVB=0.0465744;RO=1;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614156;STB=0.533301;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00539094;OID=.;OPOS=132436967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:22:22:1:1:21:21:0.954545:7:14:0:1:7:14:0:1
chr3	133098661	.	G	C	440.35	PASS	AF=0.461538;AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=-0.0530356;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.155;QD=16.9364;RBI=0.0542159;REFB=-0.0175574;REVB=0.0112508;RO=56;SAF=28;SAR=20;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.098583;STB=0.554993;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0230835;OID=.;OPOS=133098661;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:56:56:48:48:0.461538:20:28:27:29:20:28:27:29
chr3	133114893	.	C	T	453.82	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0388955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.009;QD=55.0089;RBI=0.0403057;REFB=0.0949198;REVB=0.0105684;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512188;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.000827671;OID=.;OPOS=133114893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:12:20:0:0:12:20:1:0
chr3	133320116	.	A	AT,T	35.44	PASS	AF=0.255319,0;AO=12,2;DP=50;FAO=12,0;FDP=47;FR=.;FRO=35;FSAF=2,0;FSAR=10,0;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0395378,-0.016276;FXX=0.040808;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=7.92152,86.7419;QD=3.01634;RBI=0.0733422,0.0199137;REFB=-0.205315,-0.0261837;REVB=-0.0617725,0.0114738;RO=34;SAF=1,0;SAR=11,2;SRF=17;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.587746,-0.438814;STB=0.738679,0.5;STBP=0.072,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.192056,0;OID=.,.;OPOS=133320117,133320116;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:50:47:34:35:12,2:12,0:0.255319,0:11,2:1,0:17:17:10,0:2,0:15:20
chr3	133329943	.	G	A	889.09	PASS	AF=0.984127;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00234938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.549;QD=56.4502;RBI=0.043202;REFB=0.000179029;REVB=0.043138;RO=1;SAF=26;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178082;STB=0.509431;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=6.63453e-05;OID=.;OPOS=133329943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:63:1:1:61:62:0.984127:35:26:1:0:36:26:1:0
chr3	133368362	.	T	G	1554.18	PASS	AF=0.963964;AO=107;DP=111;FAO=107;FDP=111;FR=.;FRO=4;FSAF=61;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0160778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.152;QD=56.0065;RBI=0.0490296;REFB=-0.109638;REVB=0.0463186;RO=3;SAF=61;SAR=46;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124701;STB=0.502574;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.00111587;OID=.;OPOS=133368362;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:111:111:3:4:107:107:0.963964:46:61:1:2:46:61:2:2
chr3	133465283	.	A	G	1153.44	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0657735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4315;QD=60.7076;RBI=0.0838161;REFB=0;REVB=-0.0519517;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000828162;OID=.;OPOS=133465283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:31:44:0:0:31:45:0:0
chr3	133474328	.	G	A	1370.11	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=91;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0259686;FXX=0.0219756;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.117;QD=61.5781;RBI=0.0331217;REFB=-0.155963;REVB=0.0205591;RO=1;SAF=38;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00938395;STB=0.504949;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00036016;OID=.;OPOS=133474328;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:89:1:1:88:88:0.988764:50:38:0:1:50:38:0:1
chr3	133483696	.	T	C	798.71	PASS	AF=0.921875;AO=59;DP=64;FAO=59;FDP=64;FR=.;FRO=5;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0077927;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=223.119;QD=49.9192;RBI=0.0172242;REFB=-0.172429;REVB=0.0153605;RO=1;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145176;STB=0.53622;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00103989;OID=.;OPOS=133483696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:64:64:1:5:59:59:0.921875:32:27:0:1:32:27:0:5
chr3	133485133	.	A	G	1032.68	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022846;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4471;QD=59.8657;RBI=0.0299072;REFB=0;REVB=0.0193003;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000610862;OID=.;OPOS=133485133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0
chr3	133547245	.	G	A	144.48	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0498423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.421;QD=24.0792;RBI=0.0529789;REFB=-0.0318671;REVB=0.0179586;RO=9;SAF=10;SAR=5;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864865;STB=0.548325;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.024775;OID=.;OPOS=133547245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:24:24:9:9:15:15:0.625:5:10:7:2:5:10:7:2
chr3	133547692	.	G	A	441.73	PASS	AF=0.494382;AO=43;DP=88;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.00490793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.42;QD=19.8528;RBI=0.0128839;REFB=-0.0193715;REVB=0.0119125;RO=43;SAF=30;SAR=13;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485272;STB=0.535421;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0314573;OID=.;OPOS=133547692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:43:45:43:44:0.494382:13:30:28:15:13:31:29:16
chr3	133698349	.	C	T	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114351;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.055;QD=60.7162;RBI=0.0313055;REFB=0;REVB=0.0291423;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.0763e-05;OID=.;OPOS=133698349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:35:41:0:0:35:41:0:0
chr3	133941320	.	C	T	233.63	PASS	AF=0.4375;AO=26;DP=62;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.00398614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1237;QD=14.6017;RBI=0.0419358;REFB=-0.00454333;REVB=0.0417459;RO=36;SAF=13;SAR=13;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850411;STB=0.566619;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0119173;OID=.;OPOS=133941320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:36:36:26:28:0.4375:13:13:21:15:15:13:21:15
chr3	134075522	.	A	G	1556.51	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282147;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.994;QD=59.8658;RBI=0.0284505;REFB=0;REVB=-0.00365552;RO=0;SAF=58;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62159e-05;OID=.;OPOS=134075522;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:46:58:0:0:46:58:0:0
chr3	134077470	.	C	G	1880.21	PASS	AF=0.991935;AO=123;DP=124;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0056922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.986;QD=60.652;RBI=0.0158035;REFB=-0.0709933;REVB=0.0147428;RO=0;SAF=67;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.60146e-08;STB=0.504424;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=5.31646e-05;OID=.;OPOS=134077470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:124:124:0:1:123:123:0.991935:56:67:0:0:56:67:0:1
chr3	134278270	.	C	T	143.56	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.00643899;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.563;QD=11.485;RBI=0.00764109;REFB=-0.00441924;REVB=-0.00411408;RO=33;SAF=7;SAR=10;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0563281;STB=0.533131;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.00437802;OID=.;OPOS=134278270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:33:33:17:17:0.34:10:7:12:21:10:7:12:21
chr3	134280395	.	T	A	1153.39	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.057;QD=60.7045;RBI=0.0306322;REFB=0;REVB=-0.0107238;RO=0;SAF=51;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47623e-05;OID=.;OPOS=134280395;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:25:51:0:0:25:51:0:0
chr3	134322163	.	C	A	255.75	PASS	AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0030895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.28;QD=15.7383;RBI=0.013649;REFB=-0.00611402;REVB=-0.0132948;RO=36;SAF=11;SAR=18;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121301;STB=0.568579;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.00704018;OID=.;OPOS=134322163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:36:36:29:29:0.446154:18:11:18:18:18:11:18:18
chr3	134322742	.	A	G	193.22	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00397676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.445;QD=16.4438;RBI=0.0242152;REFB=0.00153893;REVB=0.0238864;RO=27;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185573;STB=0.510628;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=-0.00209071;OID=.;OPOS=134322742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:10:10:13:14:10:10:13:14
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chr3	134499419	.	G	A	1098.72	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0469245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9077;QD=60.2037;RBI=0.0521124;REFB=0;REVB=-0.0226668;RO=0;SAF=41;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000438103;OID=.;OPOS=134499419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:31:41:0:0:32:41:0:0
chr3	134851781	.	T	C,TC	33.78	PASS	AF=0,0.2;AO=9,9;DP=64;FAO=0,11;FDP=55;FR=.;FRO=44;FSAF=0,2;FSAR=0,9;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.046784,-0.10311;FXX=0.126964;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=64.6614,58.9736;QD=2.45698;RBI=0.0923964,0.103483;REFB=-0.0287424,-0.0170353;REVB=-0.0796766,-0.00878028;RO=44;SAF=0,1;SAR=9,8;SRF=20;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.69257,-0.483377;STB=0.5,0.763317;STBP=1,0.085;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.107823;OID=.,.;OPOS=134851781,134851782;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:34:64:55:44:44:9,9:0,11:0,0.2:9,8:0,1:20:24:0,9:0,2:21:23
chr3	134851785	.	GGC	CGG,G,TGG	647.84	PASS	AF=0,0.88,0.12;AO=4,11,3;DP=54;FAO=0,44,6;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21,0;FSAR=0,23,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035631,0.513288,0.0518829;FXX=0.0384541;HRUN=3,3,3;LEN=3,2,3;MLLD=85.7876,27.8293,92.8637;QD=51.8273;RBI=0.0469218,0.720182,0.086782;REFB=0,0,0;REVB=-0.03053,0.505171,0.069565;RO=33;SAF=0,6,0;SAR=4,5,3;SRF=13;SRR=20;SSEN=0,0.3349,0;SSEP=0,0.401631,0;SSSB=-0.555261,0.18014,-0.492108;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0,0.0254113,0.231154;OID=.,.,.;OPOS=134851785,134851786,134851785;OREF=GGC,GC,GGC;OALT=CGG,-,TGG;OMAPALT=CGG,G,TGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:31:54:50:33:0:4,11,3:0,44,6:0,0.88,0.12:4,5,3:0,6,0:13:20:0,23,6:0,21,0:0:0
chr3	134898742	.	C	T	692.99	PASS	AF=0.424581;AO=76;DP=179;FAO=76;FDP=179;FR=.;FRO=103;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=56;FSRR=47;FWDB=-0.0253283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.977;QD=15.4859;RBI=0.0270992;REFB=-0.0145631;REVB=0.00963543;RO=103;SAF=45;SAR=31;SRF=56;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510149;STB=0.528527;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0171292;OID=.;OPOS=134898742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:179:103:103:76:76:0.424581:31:45:56:47:31:45:56:47
chr3	134920337	.	G	A	447.46	PASS	AF=0.517647;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0257578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.632;QD=21.0568;RBI=0.0384615;REFB=-0.00899824;REVB=0.0285626;RO=41;SAF=24;SAR=20;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00779253;STB=0.504308;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.00916992;OID=.;OPOS=134920337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:41:41:44:44:0.517647:20:24:22:19:20:24:22:19
chr3	136573440	.	A	G	800.69	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.056983;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.4253;QD=57.192;RBI=0.0782705;REFB=0;REVB=0.0536583;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.17551e-05;OID=.;OPOS=136573440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0
chr3	136573585	.	GA	AG,G	79.56	PASS	AF=0.09375,0.53125;AO=3,14;DP=34;FAO=3,17;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=0,12;FSAR=3,5;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0853666,-0.191519;FXX=0.0588062;HRUN=1,7;LEN=2,1;MLLD=25.047,7.35225;QD=9.94453;RBI=0.160127,0.25753;REFB=-0.0910991,-0.174685;REVB=0.135474,0.172169;RO=12;SAF=0,11;SAR=3,3;SRF=3;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.569201,0.451681;STB=0.995574,0.628663;STBP=0.137,0.118;TYPE=mnp,del;VARB=0.0457588,0.179133;OID=.,.;OPOS=136573585,136573586;OREF=GA,A;OALT=AG,-;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:37:34:32:12:12:3,14:3,17:0.09375,0.53125:3,3:0,11:3:9:3,5:0,12:5:7
chr3	136574501	.	A	G	1320.58	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0835166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4945;QD=62.1449;RBI=0.0848398;REFB=0;REVB=-0.0149254;RO=0;SAF=49;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000438064;OID=.;OPOS=136574501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:36:49:0:0:36:49:0:0
chr3	136574578	.	T	TTAA	747.8	PASS	AF=1;AO=52;DP=56;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02244;FXX=0.036357;HRUN=2;LEN=3;MLLD=276.601;QD=56.4375;RBI=0.0352064;REFB=0;REVB=0.0271281;RO=2;SAF=32;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00847738;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-7.27733e-05;OID=.;OPOS=136574579;OREF=-;OALT=TAA;OMAPALT=TTAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:52:56:53:53:0:32:21:0:0:4:2:32:20:1:1
chr3	136649462	.	AC	AT,GT	654.72	PASS	AF=0.953488,0.0465116;AO=40,2;DP=43;FAO=41,2;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0;FSAR=19,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334052,0.0333857;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=164.529,112.41;QD=60.9038;RBI=0.0400173,0.0411067;REFB=0,0;REVB=0.0220334,0.0239824;RO=0;SAF=22,0;SAR=18,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.19993e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00199893,0.0345514;OID=.,.;OPOS=136649463,136649462;OREF=C,AC;OALT=T,GT;OMAPALT=AT,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:43:43:0:0:40,2:41,2:0.953488,0.0465116:18,2:22,0:0:0:19,2:22,0:0:0
chr3	137786442	.	T	C	563.73	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0107175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.509;QD=57.8186;RBI=0.0145653;REFB=0.0102949;REVB=-0.00986318;RO=1;SAF=21;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217908;STB=0.511622;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-0.000929442;OID=.;OPOS=137786442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:17:21:1:0:17:21:1:0
chr3	137787047	.	C	G,T	552.3	PASS	AF=0.0789474,0.921053;AO=3,35;DP=38;FAO=3,35;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=3,24;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0355055,0.0164401;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=113.508,81.9046;QD=58.137;RBI=0.0363984,0.0176271;REFB=0,0;REVB=-0.00801256,0.006359;RO=0;SAF=3,24;SAR=0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.210193,-0.000322312;OID=.,.;OPOS=137787047,137787047;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:38:38:0:0:3,35:3,35:0.0789474,0.921053:0,11:3,24:0:0:0,11:3,24:0:0
chr3	137787192	.	T	C	885.39	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00734581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7818;QD=58.0584;RBI=0.0285654;REFB=0;REVB=0.0276047;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190261;OID=.;OPOS=137787192;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0
chr3	137787963	.	T	G	2140.67	PASS	AF=1;AO=136;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.648;QD=62.9608;RBI=0.0239003;REFB=0;REVB=0.00347324;RO=0;SAF=77;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.20292e-05;OID=.;OPOS=137787963;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:136:136:0:0:136:136:1:59:77:0:0:59:77:0:0
chr3	137807259	.	G	A	1025.02	PASS	AF=1;AO=67;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.287;QD=59.4217;RBI=0.0424311;REFB=0;REVB=0.0380698;RO=0;SAF=47;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8478e-05;OID=.;OPOS=137807259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:67:69:1:20:47:0:0:21:48:0:0
chr3	137843106	.	T	C	619.95	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00878088;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=335.378;QD=59.0424;RBI=0.0211589;REFB=-0.0390211;REVB=0.0192508;RO=1;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284198;STB=0.515144;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000740824;OID=.;OPOS=137843106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:16:25:0:1:16:25:0:1
chr3	137843476	.	G	T	594.21	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0784404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.1662;QD=60.9445;RBI=0.0785607;REFB=0;REVB=0.00434546;RO=0;SAF=28;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000232774;OID=.;OPOS=137843476;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:11:28:0:0:11:28:0:0
chr3	137850003	.	A	G	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121068;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.274;QD=62.3485;RBI=0.044344;REFB=0;REVB=0.0426593;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.70178e-05;OID=.;OPOS=137850003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0
chr3	137880743	.	G	A	358.12	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9642;QD=55.096;RBI=0.0312866;REFB=0;REVB=-0.0271127;RO=0;SAF=24;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.21284e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00019401;OID=.;OPOS=137880743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:2:24:0:0:2:24:0:0
chr3	137881265	.	T	A	436.23	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.034161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.238;QD=54.5287;RBI=0.0430412;REFB=-0.123099;REVB=0.0261834;RO=1;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372894;STB=0.519987;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000843278;OID=.;OPOS=137881265;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:12:19:0:1:12:19:0:1
chr3	138033181	.	C	T	577.69	PASS	AF=0.930233;AO=40;DP=43;FAO=40;FDP=43;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0291857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.5794;QD=53.7385;RBI=0.0336167;REFB=-0.101786;REVB=0.0166818;RO=2;SAF=28;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323315;STB=0.525411;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0449518;OID=.;OPOS=138033181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:43:43:2:3:40:40:0.930233:12:28:2:0:12:28:3:0
chr3	138121692	.	C	G	298.44	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.0129769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9866;QD=18.6527;RBI=0.0130406;REFB=-0.0156856;REVB=0.0012875;RO=32;SAF=18;SAR=14;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145798;STB=0.580923;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0157548;OID=.;OPOS=138121692;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:14:18:23:9:14:18:23:9
chr3	138122781	.	A	G	284.26	PASS	AF=0.306452;AO=38;DP=124;FAO=38;FDP=124;FR=.;FRO=86;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=62;FSRR=24;FWDB=0.000204614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.158;QD=9.16967;RBI=0.03982;REFB=-0.00796495;REVB=-0.0398195;RO=86;SAF=23;SAR=15;SRF=62;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150184;STB=0.586974;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0240471;OID=.;OPOS=138122781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:86:86:38:38:0.306452:15:23:62:24:15:23:62:24
chr3	138187568	.	C	T	3090.43	PASS	AF=1;AO=194;DP=198;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.007453;FXX=0.00505025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.71;QD=62.7497;RBI=0.00829965;REFB=-0.0110883;REVB=0.003652;RO=2;SAF=109;SAR=85;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011072;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306557;OID=.;OPOS=138187568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:198:197:2:0:194:197:1:85:109:0:2:86:111:0:0
chr3	138191232	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292314;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=298.077;QD=45.8068;RBI=0.0497482;REFB=0;REVB=0.0402544;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235065;OID=.;OPOS=138191232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0
chr3	138289163	.	T	C	907.95	PASS	AF=0.955882;AO=64;DP=67;FAO=65;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0115028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.913;QD=53.4087;RBI=0.0813611;REFB=-0.155515;REVB=0.0805438;RO=3;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449152;STB=0.523802;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00209005;OID=.;OPOS=138289163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:67:68:3:3:64:65:0.955882:30:34:0:3:30:35:0:3
chr3	138289221	.	C	T	1510.69	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00258562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3497;QD=63.6081;RBI=0.00340294;REFB=0;REVB=-0.00221238;RO=0;SAF=51;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11391e-06;OID=.;OPOS=138289221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:95:0:0:94:95:1:43:51:0:0:44:51:0:0
chr3	138329862	.	G	A	683.09	PASS	AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00580378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.105;QD=52.5453;RBI=0.0162354;REFB=-0.0125144;REVB=0.0151626;RO=1;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218873;STB=0.522718;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00012072;OID=.;OPOS=138329862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:52:1:2:50:50:0.961538:21:29:0:1:21:29:0:2
chr3	138724757	.	C	G	137.03	PASS	AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=0.000714946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8447;QD=11.662;RBI=0.0529443;REFB=-0.028697;REVB=0.0529395;RO=31;SAF=11;SAR=5;SRF=25;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168375;STB=0.597897;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.0603185;OID=.;OPOS=138724757;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:31:31:16:16:0.340426:5:11:25:6:5:11:25:6
chr3	138762707	.	C	G	398.28	PASS	AF=0.519481;AO=39;DP=75;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=-0.0174658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1939;QD=20.6896;RBI=0.0183086;REFB=-0.056813;REVB=0.00549082;RO=32;SAF=24;SAR=15;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915445;STB=0.552461;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0252371;OID=.;OPOS=138762707;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:77:32:37:39:40:0.519481:15:24:23:9:16:24:26:11
chr3	138763160	.	G	A	119.54	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0259169;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.635;QD=13.6616;RBI=0.0262761;REFB=-0.012125;REVB=-0.00432988;RO=21;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980542;STB=0.557295;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00743207;OID=.;OPOS=138763160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:8:6:11:10:8:6:11:10
chr3	138763627	.	GTGCTGCTGCTG	GTGCTGCT,GTGCTGCTG,GTGCTGGCTG	1419.36	PASS	AF=0,1,0;AO=18,60,14;DP=105;FAO=0,98,0;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=0,62,0;FSAR=0,36,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311318,0.0274816,0.0205008;FXX=0.0754646;HRUN=1,1,1;LEN=4,3,2;MLLD=245.324,256.844,238.211;QD=57.9332;RBI=0.069022,0.0799254,0.0668058;REFB=0,0,0;REVB=0.0616023,0.0750522,0.0635825;RO=0;SAF=7,41,12;SAR=11,19,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.31043e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.0269529,0.000169069,0;OID=.,.,.;OPOS=138763635,138763628,138763633;OREF=GCTG,TGC,CT;OALT=-,-,-;OMAPALT=GTGCTGCT,GTGCTGCTG,GTGCTGGCTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1,0:18,60,14:105:0,98,0:98:0:0,62,0:0,36,0:0:0:8:0:7,41,12:11,19,2:0:0
chr3	139102120	.	C	A	843.24	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000862673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.21;QD=57.1691;RBI=0.00456513;REFB=0;REVB=0.00448288;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023363;OID=.;OPOS=139102120;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:31:26:0:0:32:27:0:0
chr3	139303248	.	G	A	424.7	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0308122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.551;QD=56.6272;RBI=0.0631558;REFB=0;REVB=0.0551295;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105304;OID=.;OPOS=139303248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:30:0:0:28:30:1:16:12:0:0:18:12:0:0
chr3	139318241	.	A	T	798.95	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.825;QD=63.9161;RBI=0.0192751;REFB=0;REVB=0.00814086;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04595e-05;OID=.;OPOS=139318241;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:50:0:0:47:50:1:19:28:0:0:22:28:0:0
chr3	139328739	.	C	T	358.05	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.401;QD=55.0838;RBI=0.0205375;REFB=0;REVB=0.017868;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269941;OID=.;OPOS=139328739;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:8:18:0:0:8:18:0:0
chr3	140167536	.	A	G	1539.6	PASS	AF=0.990476;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0162418;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=304.327;QD=58.6515;RBI=0.0162731;REFB=-0.0483374;REVB=-0.00100957;RO=1;SAF=49;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00958601;STB=0.50505;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=4.41104e-05;OID=.;OPOS=140167536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:105:1:1:104:104:0.990476:55:49:1:0:55:49:1:0
chr3	140401693	.	A	G	364.9	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.076849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.743;QD=52.1292;RBI=0.0778785;REFB=-0.0578552;REVB=-0.0126209;RO=1;SAF=15;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299926;STB=0.516117;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.011744;OID=.;OPOS=140401693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:12:15:1:0:12:15:1:0
chr3	141162128	.	C	G	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0142784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.847;QD=27.1547;RBI=0.0358609;REFB=-0.02314;REVB=0.0328958;RO=6;SAF=6;SAR=8;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127659;STB=0.571326;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00889067;OID=.;OPOS=141162128;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:8:6:4:2:8:6:4:2
chr3	141162185	.	T	G	66.5	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000382217;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=207.032;QD=26.6014;RBI=0.00772369;REFB=-0.0455763;REVB=0.00771423;RO=2;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233526;STB=0.635964;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00810196;OID=.;OPOS=141162185;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:7:1:1:1:7:1:1:1
chr3	141326602	.	T	C	513.09	PASS	AF=0.490909;AO=53;DP=109;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.0143528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.713;QD=18.6579;RBI=0.0145367;REFB=-0.010024;REVB=-0.00230516;RO=56;SAF=29;SAR=24;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438918;STB=0.528445;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.00781466;OID=.;OPOS=141326602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:56:56:53:54:0.490909:24:29:28:28:24:30:28:28
chr3	141327474	.	G	A	163.5	PASS	AF=0.362069;AO=17;DP=58;FAO=21;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0169599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4889;QD=11.2759;RBI=0.0210707;REFB=-0.00232616;REVB=0.0125036;RO=35;SAF=2;SAR=15;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412004;STB=0.574638;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0332892;OID=.;OPOS=141327474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:36:17:21:0.362069:15:2:13:22:15:6:14:22
chr3	141331222	.	G	A	818.71	PASS	AF=0.477273;AO=84;DP=178;FAO=84;FDP=176;FR=.;FRO=92;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=32;FSRR=60;FWDB=-0.0400788;FXX=0.0112353;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3103;QD=18.6071;RBI=0.0485183;REFB=-0.0146759;REVB=-0.0273444;RO=92;SAF=44;SAR=40;SRF=32;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165822;STB=0.591377;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0160019;OID=.;OPOS=141331222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:176:92:92:84:84:0.477273:40:44:32:60:40:44:32:60
chr3	141923506	.	C	A,T	568.14	PASS	AF=0.05,0.925;AO=2,36;DP=39;FAO=2,37;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=0,15;FSAR=2,22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00920284,0.0413352;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=149.075,129.75;QD=56.8141;RBI=0.0131765,0.0429436;REFB=-0.109352,-0.16804;REVB=-0.0094302,0.0116429;RO=1;SAF=1,14;SAR=1,22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.25849,-0.0322556;STB=0.993266,0.51612;STBP=0.232,0.283;TYPE=snp,snp;VARB=0.147465,0.000337102;OID=.,.;OPOS=141923506,141923506;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:39:40:1:1:2,36:2,37:0.05,0.925:1,22:1,14:1:0:2,22:0,15:1:0
chr3	141932356	.	G	A	753.79	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.857;QD=56.8899;RBI=0.0178721;REFB=0;REVB=0.00784841;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76022e-05;OID=.;OPOS=141932356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:19:33:0:0:19:34:0:0
chr3	142139172	.	T	C	118.65	PASS	AF=0.278689;AO=17;DP=61;FAO=17;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0273238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.361;QD=7.78035;RBI=0.0273299;REFB=0.00088104;REVB=-0.000574819;RO=44;SAF=4;SAR=13;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383907;STB=0.733585;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.00200076;OID=.;OPOS=142139172;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:44:44:17:17:0.278689:13:4:24:20:13:4:24:20
chr3	142168331	.	C	T	152.48	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0139576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4695;QD=10.3377;RBI=0.0246923;REFB=-0.0120548;REVB=-0.020369;RO=39;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130364;STB=0.576197;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0255297;OID=.;OPOS=142168331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:10:10:15:24:10:10:15:24
chr3	142222284	.	A	G	360.74	PASS	AF=0.463415;AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=0.017585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.65;QD=17.5971;RBI=0.0184413;REFB=-0.0285979;REVB=0.0055544;RO=44;SAF=15;SAR=23;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188077;STB=0.605208;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0332277;OID=.;OPOS=142222284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:44:44:38:38:0.463415:23:15:26:18:23:15:26:18
chr3	142277536	.	A	G	352.45	PASS	AF=0.387387;AO=42;DP=111;FAO=43;FDP=111;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=0.0772504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.676;QD=12.701;RBI=0.0784382;REFB=-0.018582;REVB=-0.0135987;RO=69;SAF=22;SAR=20;SRF=31;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081188;STB=0.5572;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0370962;OID=.;OPOS=142277536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:69:68:42:43:0.387387:20:22:31:38:20:23:30:38
chr3	142277575	.	A	T	317.77	PASS	AF=0.371134;AO=35;DP=97;FAO=36;FDP=97;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=0.00652882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.515;QD=13.104;RBI=0.0115563;REFB=-0.00687532;REVB=-0.00953536;RO=61;SAF=17;SAR=18;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478503;STB=0.536063;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00691386;OID=.;OPOS=142277575;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:61:61:35:36:0.371134:18:17:27:34:18:18:27:34
chr3	142281612	.	A	G	255.66	PASS	AF=0.657143;AO=23;DP=35;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.0107565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.915;QD=29.2177;RBI=0.0270584;REFB=-0.0230577;REVB=-0.0248285;RO=11;SAF=12;SAR=11;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252071;STB=0.648529;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0136097;OID=.;OPOS=142281612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:11:12:23:23:0.657143:11:12:1:10:11:12:1:11
chr3	142392596	.	T	TC	112.87	PASS	AF=0.4;AO=25;DP=66;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0608756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=17.7867;QD=6.94587;RBI=0.0619019;REFB=-0.0154922;REVB=0.0112254;RO=40;SAF=9;SAR=16;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173051;STB=0.51636;STBP=0.851;TYPE=ins;VARB=0.0162745;OID=.;OPOS=142392597;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:25:66:26:65:39:10:16:14:25:99:40:9:16:15:25
chr3	142408606	.	G	A	421.3	PASS	AF=0.443396;AO=47;DP=106;FAO=47;FDP=106;FR=.;FRO=59;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.00040082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197;QD=15.8981;RBI=0.00831933;REFB=-0.00597644;REVB=0.00830967;RO=59;SAF=17;SAR=30;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133669;STB=0.574967;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00750626;OID=.;OPOS=142408606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:59:59:47:47:0.443396:30:17:29:30:30:17:29:30
chr3	142503605	.	G	A	765.68	PASS	AF=0.47619;AO=79;DP=165;FAO=80;FDP=168;FR=.;FRO=88;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=47;FWDB=0.0161902;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.007;QD=18.2305;RBI=0.0162391;REFB=-0.0168632;REVB=-0.00125912;RO=85;SAF=43;SAR=36;SRF=39;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080209;STB=0.544089;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0224078;OID=.;OPOS=142503605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:168:85:88:79:80:0.47619:36:43:39:46:36:44:41:47
chr3	142523349	.	G	A	453.17	PASS	AF=0.46;AO=45;DP=100;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=8;FSAR=38;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=-0.0307103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.625;QD=18.1269;RBI=0.0362294;REFB=-0.0170333;REVB=-0.019221;RO=54;SAF=7;SAR=38;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300242;STB=0.648707;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0226499;OID=.;OPOS=142523349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:54:54:45:46:0.46:38:7:20:34:38:8:20:34
chr3	142524858	.	G	A	426.71	PASS	AF=0.34;AO=51;DP=150;FAO=51;FDP=150;FR=.;FRO=99;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=46;FSRR=53;FWDB=-0.0158609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6726;QD=11.379;RBI=0.0394731;REFB=-0.0132288;REVB=-0.0361463;RO=98;SAF=34;SAR=17;SRF=46;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231005;STB=0.636309;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0202652;OID=.;OPOS=142524858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:98:99:51:51:0.34:17:34:46:52:17:34:46:53
chr3	142730774	.	T	G	593.68	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0468642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6479;QD=60.89;RBI=0.047215;REFB=0;REVB=0.00574552;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000360452;OID=.;OPOS=142730774;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr3	142779294	.	C	T	708.02	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0554284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.064;QD=62.9351;RBI=0.0557052;REFB=0;REVB=-0.00554636;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158755;OID=.;OPOS=142779294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0
chr3	145782812	.	T	C	651.12	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.678;QD=62.0112;RBI=0.0833112;REFB=0;REVB=0.0499292;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000756077;OID=.;OPOS=145782812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr3	145803138	.	T	C	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7279;QD=59.8367;RBI=0.0576658;REFB=0;REVB=-0.0375676;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105193;OID=.;OPOS=145803138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr3	145803142	.	T	A	464.9	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324385;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.804;QD=58.1118;RBI=0.0334269;REFB=0;REVB=0.00806856;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.42188e-05;OID=.;OPOS=145803142;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:12:20:0:0:12:20:0:0
chr3	145809661	.	C	T	1457.4	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0221287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.015;QD=62.0169;RBI=0.0494235;REFB=-0.0782791;REVB=-0.0441928;RO=1;SAF=60;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141488;STB=0.507461;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.000909527;OID=.;OPOS=145809661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:1:1:93:93:0.989362:33:60:0:1:33:60:0:1
chr3	146177815	.	C	T	2037.86	PASS	AF=0.977941;AO=132;DP=135;FAO=133;FDP=136;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0171726;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7472;QD=59.9371;RBI=0.0578706;REFB=-0.0415171;REVB=-0.055264;RO=2;SAF=45;SAR=87;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108006;STB=0.508379;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.000706022;OID=.;OPOS=146177815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:135:136:2:3:132:133:0.977941:87:45:0:2:88:45:0:3
chr3	146234853	.	C	T	221.14	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0184249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.47;QD=12.2854;RBI=0.0295216;REFB=-0.0111564;REVB=-0.0230661;RO=45;SAF=15;SAR=12;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243502;STB=0.514008;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0293455;OID=.;OPOS=146234853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:45:45:27:27:0.375:12:15:24:21:12:15:24:21
chr3	146289323	.	T	C	183.03	PASS	AF=0.486486;AO=15;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0399599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.428;QD=19.7869;RBI=0.0449088;REFB=-0.00694656;REVB=0.0204941;RO=18;SAF=8;SAR=7;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240435;STB=0.585896;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0122271;OID=.;OPOS=146289323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:15:18:0.486486:7:8:5:13:10:8:5:13
chr3	148459395	.	C	T	149.1	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0392385;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8087;QD=18.637;RBI=0.0494923;REFB=0.00784972;REVB=0.0301634;RO=16;SAF=10;SAR=6;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596367;STB=0.533857;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-0.00805878;OID=.;OPOS=148459395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:6:10:11:5:6:10:11:5
chr3	148459988	.	A	C	206.96	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.00161436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.249;QD=17.2465;RBI=0.00248118;REFB=-0.0212016;REVB=0.00188417;RO=26;SAF=15;SAR=6;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691984;STB=0.531884;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0307687;OID=.;OPOS=148459988;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:27:21:21:0.4375:6:15:17:9:6:15:18:9
chr3	148460467	.	C	A	2159.66	PASS	AF=1;AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.409;QD=63.0557;RBI=0.0426794;REFB=0;REVB=0.0296822;RO=0;SAF=70;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48945e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91033e-05;OID=.;OPOS=148460467;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:137:137:0:0:137:137:1:67:70:0:0:67:70:0:0
chr3	148562310	.	G	A	218.93	PASS	AF=0.36;AO=27;DP=75;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0111696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.471;QD=11.6765;RBI=0.0253828;REFB=0.0109958;REVB=-0.0227931;RO=47;SAF=19;SAR=8;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248292;STB=0.650974;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.0119283;OID=.;OPOS=148562310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:47:48:27:27:0.36:8:19:23:24:8:19:23:25
chr3	148597612	.	C	T	692.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135029;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.132;QD=62.9417;RBI=0.019577;REFB=0;REVB=-0.014175;RO=0;SAF=33;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.96218e-06;OID=.;OPOS=148597612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:11:33:0:0:11:33:0:0
chr3	148727133	.	G	A	220.66	PASS	AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0156358;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.744;QD=23.2269;RBI=0.0169719;REFB=-0.0132107;REVB=0.00660042;RO=15;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224783;STB=0.622109;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0106299;OID=.;OPOS=148727133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:15:17:21:21:0.552632:12:9:11:4:12:9:12:5
chr3	148759325	.	T	C	347.49	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0345321;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2061;QD=19.3048;RBI=0.0348092;REFB=-0.0385977;REVB=-0.00438334;RO=35;SAF=18;SAR=18;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0887459;STB=0.555525;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0377094;OID=.;OPOS=148759325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:72:35:36:36:36:0.5:18:18:21:14:18:18:22:14
chr3	148786108	.	C	T	990.64	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0048971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.944;QD=59.1429;RBI=0.0117308;REFB=0;REVB=-0.0106597;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.62851e-06;OID=.;OPOS=148786108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:31:36:0:0:31:36:0:0
chr3	148863151	.	A	G	162.55	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00890074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.204;QD=19.7024;RBI=0.0138646;REFB=-0.00900138;REVB=-0.0106303;RO=15;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259921;STB=0.66059;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0110304;OID=.;OPOS=148863151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:16:17:17:0.515152:11:6:10:5:11:6:11:5
chr3	148895648	.	G	A	841.75	PASS	AF=0.483146;AO=85;DP=177;FAO=86;FDP=178;FR=.;FRO=92;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=44;FSRR=48;FWDB=-0.0215042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4872;QD=18.9158;RBI=0.022275;REFB=-0.00734108;REVB=-0.00580891;RO=90;SAF=43;SAR=42;SRF=42;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365543;STB=0.517237;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0079805;OID=.;OPOS=148895648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:178:90:92:85:86:0.483146:42:43:42:48:42:44:44:48
chr3	148916235	.	T	A	866.62	PASS	AF=0.953846;AO=61;DP=65;FAO=62;FDP=65;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00793565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3171;QD=53.3303;RBI=0.03234;REFB=-0.0176014;REVB=-0.0313513;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523802;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00204688;OID=.;OPOS=148916235;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:65:65:0:3:61:62:0.953846:31:30:0:0:32:30:3:0
chr3	149051067	.	T	C	373.95	PASS	AF=0.513514;AO=37;DP=73;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.00351386;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.361;QD=20.2132;RBI=0.00351448;REFB=0.00648334;REVB=6.58962e-05;RO=36;SAF=16;SAR=21;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133686;STB=0.565923;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.00725564;OID=.;OPOS=149051067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:36:36:37:38:0.513514:21:16:21:15:21:17:21:15
chr3	149093238	.	A	G	805.57	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00769534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.894;QD=64.4457;RBI=0.0188155;REFB=0;REVB=0.0171699;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.09786e-05;OID=.;OPOS=149093238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:20:29:0:0:20:30:0:0
chr3	149238595	.	C	A,CTTAA	230.98	PASS	AF=0.0266667,0.36;AO=4,22;DP=76;FAO=2,27;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=0,13;FSAR=2,14;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0129209,-0.0166743;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=1,4;MLLD=150.857,178.962;QD=12.3187;RBI=0.0232532,0.0212906;REFB=-0.0018798,-0.0130776;REVB=-0.019333,0.0132385;RO=47;SAF=1,10;SAR=3,12;SRF=28;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.347656,-0.162117;STB=0.995657,0.56618;STBP=0.1,0.427;TYPE=snp,ins;VARB=0.0119078,0.0230568;OID=.,.;OPOS=149238595,149238596;OREF=C,-;OALT=A,TTAA;OMAPALT=A,CTTAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:76:75:47:46:4,22:2,27:0.0266667,0.36:3,12:1,10:28:19:2,14:0,13:27:19
chr3	149374873	.	G	T	166.08	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00930685;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.276;QD=22.1439;RBI=0.0614055;REFB=-0.0327659;REVB=0.0606961;RO=13;SAF=13;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324502;STB=0.683978;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.012748;OID=.;OPOS=149374873;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:4:13:5:8:4:13:5:8
chr3	149459341	.	A	G	1174.19	PASS	AF=1;AO=74;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283163;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109;QD=60.9971;RBI=0.061145;REFB=0;REVB=0.0541932;RO=0;SAF=46;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237459;OID=.;OPOS=149459341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:74:77:1:28:46:0:0:30:47:0:0
chr3	149459413	.	C	T	400.24	PASS	AF=0.435644;AO=44;DP=101;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=-0.0288177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.377;QD=15.851;RBI=0.0320172;REFB=-0.0190729;REVB=-0.0139514;RO=57;SAF=25;SAR=19;SRF=37;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0841734;STB=0.547123;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0299329;OID=.;OPOS=149459413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:57:57:44:44:0.435644:19:25:37:20:19:25:37:20
chr3	149469159	.	C	G	210.21	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.00633853;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5785;QD=15.5714;RBI=0.0197463;REFB=-0.0149053;REVB=0.0187013;RO=30;SAF=14;SAR=10;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241036;STB=0.636253;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0185834;OID=.;OPOS=149469159;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:10:14:10:20:10:14:10:20
chr3	149479301	.	C	T	297.24	PASS	AF=0.355769;AO=37;DP=104;FAO=37;FDP=104;FR=.;FRO=67;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=43;FSRR=24;FWDB=-0.02282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.341;QD=11.4322;RBI=0.0291571;REFB=-0.00616093;REVB=-0.0181489;RO=66;SAF=21;SAR=16;SRF=42;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079364;STB=0.54933;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0145493;OID=.;OPOS=149479301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:66:67:37:37:0.355769:16:21:42:24:16:21:43:24
chr3	149485531	.	A	C	406.82	PASS	AF=0.451613;AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.000174536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.263;QD=17.4974;RBI=0.000355904;REFB=-0.00309974;REVB=-0.000310169;RO=51;SAF=17;SAR=25;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142068;STB=0.57956;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00907002;OID=.;OPOS=149485531;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:51:51:42:42:0.451613:25:17:28:23:25:17:28:23
chr3	149678534	.	C	T	657.18	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00512545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.553;QD=59.7435;RBI=0.0486019;REFB=0.003558;REVB=0.0483309;RO=0;SAF=34;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507459;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=2.93429e-05;OID=.;OPOS=149678534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:44:0:1:43:43:0.977273:9:34:0:0:10:33:1:0
chr3	150280445	.	C	G	1080.39	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0441771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2164;QD=60.0215;RBI=0.0665431;REFB=0;REVB=0.0497631;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.46327e-05;OID=.;OPOS=150280445;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:38:34:0:0:38:34:0:0
chr3	150403635	.	T	C	274.96	PASS	AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00327293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.793;QD=13.2509;RBI=0.0589619;REFB=-0.00582306;REVB=0.058871;RO=51;SAF=15;SAR=17;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06517;STB=0.537223;STBP=0.604;TYPE=snp;VARB=0.0130685;OID=.;OPOS=150403635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:51:51:32:32:0.385542:17:15:27:24:17:15:27:24
chr3	150403749	.	T	C	613.25	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7157;QD=61.3249;RBI=0.0490696;REFB=0;REVB=0.010431;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00082165;OID=.;OPOS=150403749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:24:16:0:0:24:16:0:0
chr3	150421419	.	G	A	490.39	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.015449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.054;QD=56.0446;RBI=0.0380797;REFB=-0.182713;REVB=0.0348051;RO=1;SAF=15;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301451;STB=0.51612;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00144812;OID=.;OPOS=150421419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:19:15:1:0:19:15:1:0
chr3	150690439	.	T	A	132.69	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0689773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.876;QD=15.1642;RBI=0.0692317;REFB=-0.0316733;REVB=-0.00593076;RO=20;SAF=9;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0172797;OID=.;OPOS=150690439;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:6:9:12:8:6:9:12:8
chr3	151112568	.	G	A	156.94	PASS	AF=0.318182;AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.00884178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.654;QD=9.51142;RBI=0.0533314;REFB=-0.0130037;REVB=-0.0525934;RO=44;SAF=12;SAR=9;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565022;STB=0.541445;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.024884;OID=.;OPOS=151112568;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:44:45:21:21:0.318182:9:12:23:21:9:12:23:22
chr3	151150965	.	GTTT	GTTG,GTTGT,GTT	160.41	PASS	AF=0.461538,0,0.5;AO=5,3,7;DP=29;FAO=12,0,13;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=10,0,11;FSAR=2,0,2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.020994,-0.0201107,-0.20616;FXX=0.103413;HRUN=13,0,13;LEN=1,1,1;MLLD=254.501,253.322,3.39203;QD=24.6778;RBI=0.115753,0.132639,0.406147;REFB=-0.0141089,-0.0128141,-0.106527;REVB=-0.113833,-0.131105,-0.349933;RO=2;SAF=4,3,6;SAR=1,0,1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.171367,0,-0.125389;STB=0.523771,0.5,0.521706;STBP=0.669,1,0.663;TYPE=snp,ins,del;VARB=0.0142485,0.0194921,-0.115248;OID=.,.,.;OPOS=151150968,151150968,151150966;OREF=T,-,T;OALT=G,G,-;OMAPALT=GTTG,GTTGT,GTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.461538,0,0.5:5,3,7:29:12,0,13:26:1:10,0,11:2,0,2:1:0:71:2:4,3,6:1,0,1:2:0
chr3	151154666	.	T	C	312.84	PASS	AF=0.402299;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=0.00503012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.327;QD=14.3834;RBI=0.00546619;REFB=-0.00496454;REVB=-0.0021394;RO=50;SAF=21;SAR=14;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885283;STB=0.546316;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00493858;OID=.;OPOS=151154666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:50:52:35:35:0.402299:14:21:34:16:14:21:35:17
chr3	151155758	.	A	C	137.36	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.00637016;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.898;QD=11.2134;RBI=0.0821563;REFB=-0.00528849;REVB=0.081909;RO=31;SAF=11;SAR=5;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235363;STB=0.66037;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00870399;OID=.;OPOS=151155758;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:33:16:16:0.326531:5:11:15:16:5:11:15:18
chr3	151161428	.	T	C	185.09	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=59;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=0.00223881;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.456;QD=11.5682;RBI=0.0654491;REFB=-0.0284776;REVB=-0.0654107;RO=41;SAF=10;SAR=8;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154546;STB=0.505877;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0524533;OID=.;OPOS=151161428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:64:41:40:18:24:0.375:8:10:28:13:8:16:27:13
chr3	151165678	.	T	C	365.07	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00338171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.597;QD=52.1524;RBI=0.0409905;REFB=-0.09429;REVB=0.0408507;RO=1;SAF=7;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06184;STB=0.533308;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00115281;OID=.;OPOS=151165678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:20:7:1:0:20:7:1:0
chr3	151166422	.	C	T	538.49	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.256;QD=59.8316;RBI=0.0550739;REFB=0;REVB=0.0204601;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160649;OID=.;OPOS=151166422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:16:19:0:0:16:20:0:0
chr3	151171439	.	A	C	980.33	PASS	AF=0.9375;AO=60;DP=76;FAO=75;FDP=80;FR=.;FRO=5;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00452519;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=174.871;QD=49.0163;RBI=0.0361154;REFB=-0.137381;REVB=0.0358308;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523674;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00162057;OID=.;OPOS=151171439;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:76:80:0:5:60:75:0.9375:28:32:0:0:32:43:1:4
chr3	151171542	.	A	G	689.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.816;QD=62.6693;RBI=0.0376229;REFB=0;REVB=4.69958e-05;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103125;OID=.;OPOS=151171542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
chr3	151283691	.	C	A	881.21	PASS	AF=1;AO=57;DP=60;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0691237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.884;QD=55.9499;RBI=0.0693976;REFB=0.00109812;REVB=0.00615983;RO=1;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154619;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103783;OID=.;OPOS=151283691;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:60:63:1:0:57:63:1:30:27:0:1:33:30:0:0
chr3	151463421	.	G	T	421.98	PASS	AF=0.453608;AO=41;DP=96;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.0133213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.428;QD=17.4014;RBI=0.0218511;REFB=-0.0105796;REVB=0.0173209;RO=53;SAF=23;SAR=18;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520942;STB=0.519765;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0124202;OID=.;OPOS=151463421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:53:53:41:44:0.453608:18:23:27:26:20:24:27:26
chr3	151986434	.	GCC	GC,GCG	765.85	PASS	AF=0.75,0.236111;AO=23,17;DP=72;FAO=54,17;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=21,17;FSAR=33,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0886867,-0.0444629;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=15.0834,181.247;QD=42.547;RBI=0.771509,0.0451683;REFB=0.0311646,0.0348314;REVB=0.766395,0.00795116;RO=31;SAF=18,17;SAR=5,0;SRF=4;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.604529,0.867087;STB=0.511624,0.5;STBP=0.284,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0161689,0.101197;OID=.,.;OPOS=151986435,151986436;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GC,GCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.75,0.236111:23,17:72:54,17:72:1:21,17:33,0:1:0:99:31:18,17:5,0:4:27
chr3	151986684	.	C	G	55.36	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=-0.0296062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9861;QD=10.0654;RBI=0.0359826;REFB=-0.0106188;REVB=-0.0204506;RO=14;SAF=6;SAR=2;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307039;STB=0.678239;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0226601;OID=.;OPOS=151986684;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:2:6:13:1:2:6:13:1
chr3	152181040	.	T	C	53.66	PASS	AF=0.363636;AO=6;DP=21;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0207522;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.011;QD=9.75562;RBI=0.0363534;REFB=-0.0322275;REVB=0.0298482;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367359;STB=0.512165;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0429655;OID=.;OPOS=152181040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:21:22:12:14:6:8:0.363636:3:3:10:2:3:5:9:5
chr3	152554357	.	A	G	419.67	PASS	AF=0.45098;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=0.00283358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.778;QD=16.4578;RBI=0.00984917;REFB=-0.00725367;REVB=0.00943276;RO=56;SAF=22;SAR=24;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143616;STB=0.580118;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.010738;OID=.;OPOS=152554357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:56:56:46:46:0.45098:24:22:35:21:24:22:35:21
chr3	152555521	.	CTTTG	C	123.62	PASS	AF=0.566667;AO=14;DP=29;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0157966;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=4;MLLD=243.223;QD=16.4832;RBI=0.0158089;REFB=-0.00685841;REVB=-0.000624651;RO=10;SAF=12;SAR=2;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.490824;STB=0.683978;STBP=0.039;TYPE=del;VARB=0.00519431;OID=.;OPOS=152555522;OREF=TTTG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.566667:14:29:17:30:13:13:4:5:8:82:10:12:2:3:7
chr3	152852044	.	C	T	297.8	PASS	AF=0.613636;AO=25;DP=42;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=-0.0233965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4451;QD=27.073;RBI=0.0764909;REFB=-0.0219924;REVB=0.0728249;RO=17;SAF=17;SAR=8;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.362344;STB=0.67093;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.00817583;OID=.;OPOS=152852044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:17:17:25:27:0.613636:8:17:3:14:10:17:3:14
chr3	152852067	.	C	T	174.08	PASS	AF=0.388889;AO=19;DP=52;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0115788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5322;QD=12.8945;RBI=0.0865491;REFB=-0.0196876;REVB=0.0857711;RO=33;SAF=5;SAR=14;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.379125;STB=0.733714;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0729903;OID=.;OPOS=152852067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:54:33:33:19:21:0.388889:14:5:20:13:16:5:20:13
chr3	152852070	.	T	C	769.77	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.409;QD=57.0203;RBI=0.0298296;REFB=0;REVB=0.0241474;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17363e-05;OID=.;OPOS=152852070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:28:25:0:0:29:25:0:0
chr3	152852188	.	T	C	1306.7	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176142;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.157;QD=62.2236;RBI=0.0250665;REFB=0;REVB=0.0178344;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37938e-05;OID=.;OPOS=152852188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:38:45:0:0:39:45:0:0
chr3	152883036	.	G	A	344.81	PASS	AF=0.555556;AO=35;DP=63;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00316991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.104;QD=21.8924;RBI=0.00974848;REFB=-0.023595;REVB=-0.00921871;RO=26;SAF=10;SAR=25;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271083;STB=0.652083;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0196474;OID=.;OPOS=152883036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:26:28:35:35:0.555556:25:10:16:10:25:10:17:11
chr3	152885497	.	GTTTTTG	GTTTTG,GTTTTGT	128.07	PASS	AF=0.442308,0;AO=18,2;DP=53;FAO=23,0;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=20,0;FSAR=3,0;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0719909,-0.146006;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=11.8688,67.8175;QD=9.85182;RBI=0.156158,0.147611;REFB=-0.0621433,-0.00773887;REVB=0.138573,0.0217092;RO=29;SAF=17,2;SAR=1,0;SRF=12;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.692276,0.502779;STB=0.793024,0.5;STBP=0.002,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.117757,0.0537754;OID=.,.;OPOS=152885498,152885502;OREF=T,TG;OALT=-,GT;OMAPALT=GTTTTG,GTTTTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.442308,0:18,2:53:23,0:52:29:20,0:3,0:13:16:99:29:17,2:1,0:12:17
chr3	152885599	.	A	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356377;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.429;QD=57.2026;RBI=0.0474974;REFB=0;REVB=0.0314;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168428;OID=.;OPOS=152885599;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0
chr3	152885818	.	G	A	332.93	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.000940986;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.908;QD=19.5841;RBI=0.0195985;REFB=-0.0209983;REVB=0.0195759;RO=33;SAF=25;SAR=10;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109304;STB=0.560939;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0219036;OID=.;OPOS=152885818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:33:33:35:35:0.514706:10:25:20:13:10:25:20:13
chr3	152917590	.	C	T	133.81	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00358061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.988;QD=16.2191;RBI=0.0194914;REFB=-0.0138434;REVB=-0.0191596;RO=18;SAF=6;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148075;STB=0.585251;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0163345;OID=.;OPOS=152917590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:9:6:10:8:9:6:10:8
chr3	153202348	.	G	A	329.75	PASS	AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.00249245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.335;QD=20.9362;RBI=0.00725615;REFB=-0.0302223;REVB=0.00681465;RO=29;SAF=28;SAR=6;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269494;STB=0.651062;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0273142;OID=.;OPOS=153202348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:29:29:34:34:0.539683:6:28:17:12:6:28:17:12
chr3	153725166	.	G	A	1208.96	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0063153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.039;QD=61.2132;RBI=0.0178504;REFB=0;REVB=-0.0166959;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.09765e-05;OID=.;OPOS=153725166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:36:43:0:0:36:43:0:0
chr3	153725172	.	C	G,T	1230.45	PASS	AF=0.0243902,0.97561;AO=6,75;DP=81;FAO=2,80;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=2,44;FSAR=0,36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100478,-0.00628832;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=30.5589,71.1475;QD=60.0221;RBI=0.14461,0.0887887;REFB=0,0;REVB=-0.144261,-0.0885657;RO=0;SAF=2,43;SAR=4,32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.152309,0.00106669;OID=.,.;OPOS=153725172,153725172;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:81:82:0:0:6,75:2,80:0.0243902,0.97561:4,32:2,43:0:0:0,36:2,44:0:0
chr3	153725251	.	T	C	1545.57	PASS	AF=0.972727;AO=105;DP=107;FAO=107;FDP=110;FR=.;FRO=3;FSAF=53;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0283541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4596;QD=56.2024;RBI=0.0292098;REFB=0.0214652;REVB=0.00701841;RO=2;SAF=52;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175692;STB=0.513511;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=-0.00577199;OID=.;OPOS=153725251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:107:110:2:3:105:107:0.972727:53:52:0:2:54:53:0:3
chr3	153839866	.	G	C	1894.88	PASS	AF=0.954887;AO=127;DP=133;FAO=127;FDP=133;FR=.;FRO=6;FSAF=66;FSAR=61;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0303824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.741;QD=56.9889;RBI=0.031073;REFB=-0.100049;REVB=0.00651486;RO=6;SAF=66;SAR=61;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126084;STB=0.506643;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00171793;OID=.;OPOS=153839866;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:133:133:6:6:127:127:0.954887:61:66:4:2:61:66:4:2
chr3	153839959	.	CT	TC	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448716;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=59.9382;QD=59.017;RBI=0.050812;REFB=0;REVB=-0.0238411;RO=0;SAF=5;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000349634;OID=.;OPOS=153839959;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:29:5:0:0:29:5:0:0
chr3	154018887	.	G	C	417.6	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0256494;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.329;QD=53.8836;RBI=0.0293191;REFB=-0.0357254;REVB=0.0142028;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.514276;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.000210415;OID=.;OPOS=154018887;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:17:13:0:0:17:13:0:1
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chr3	155200562	.	C	T	460.9	PASS	AF=0.40458;AO=51;DP=129;FAO=53;FDP=131;FR=.;FRO=78;FSAF=38;FSAR=15;FSRF=49;FSRR=29;FWDB=-0.0224672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4504;QD=14.0733;RBI=0.031966;REFB=-0.0147584;REVB=-0.0227388;RO=72;SAF=36;SAR=15;SRF=45;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0963871;STB=0.561615;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0240239;OID=.;OPOS=155200562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:131:72:78:51:53:0.40458:15:36:45:27:15:38:49:29
chr3	155241740	.	A	G	772.41	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145585;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.974;QD=64.3674;RBI=0.0145711;REFB=0;REVB=0.000606318;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.62263e-05;OID=.;OPOS=155241740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr3	155485302	.	C	T	405.64	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.681;QD=55.9502;RBI=0.0259751;REFB=0;REVB=0.00534274;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00159349;OID=.;OPOS=155485302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:11:17:0:0:11:18:0:0
chr3	156249214	.	T	C	543.29	PASS	AF=0.581395;AO=50;DP=86;FAO=50;FDP=86;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0150216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8569;QD=25.2692;RBI=0.0150774;REFB=0.0207909;REVB=-0.00129592;RO=36;SAF=22;SAR=28;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617964;STB=0.533764;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=-0.0128516;OID=.;OPOS=156249214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:36:36:50:50:0.581395:28:22:13:23:28:22:13:23
chr3	156266765	.	A	G	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.048165;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.559;QD=16.6272;RBI=0.0481815;REFB=-0.00673921;REVB=0.00126146;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106228;STB=0.561308;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0100056;OID=.;OPOS=156266765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:8:5:7:7:8:5:7:7
chr3	156266774	.	C	T	102.49	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0269359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4002;QD=17.8241;RBI=0.0467762;REFB=-0.0112415;REVB=-0.0382423;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253906;STB=0.645157;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00939945;OID=.;OPOS=156266774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:5:7:3:8:5:7:3:8
chr3	156544584	.	C	T	2147.16	PASS	AF=0.992857;AO=137;DP=138;FAO=139;FDP=140;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=75;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00537111;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.6011;QD=61.3474;RBI=0.0501759;REFB=0.029089;REVB=0.0498876;RO=1;SAF=64;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00737039;STB=0.503875;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.000320598;OID=.;OPOS=156544584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:138:140:1:1:137:139:0.992857:73:64:1:0:75:64:1:0
chr3	156763370	.	G	A	90.87	PASS	AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.00403728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.287;QD=8.07706;RBI=0.00428407;REFB=-0.0129329;REVB=-0.00143303;RO=32;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419999;STB=0.73651;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0124387;OID=.;OPOS=156763370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:45:45:32:33:12:12:0.266667:5:7:7:25:5:7:8:25
chr3	156871332	.	C	A	321.34	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0354255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.067;QD=18.9023;RBI=0.0354476;REFB=-0.0084715;REVB=0.00125336;RO=33;SAF=19;SAR=15;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703244;STB=0.545187;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00992046;OID=.;OPOS=156871332;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:33:34:34:34:0.5:15:19:21:12:15:19:22:12
chr3	156877276	.	CAA	C,CGA	254.92	PASS	AF=0.52381,0.047619;AO=22,2;DP=43;FAO=22,2;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=8,1;FSAR=14,1;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.00635248,-0.119701;FXX=0.0454442;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=199.918,74.2887;QD=24.2784;RBI=0.0216057,0.121032;REFB=-0.0241675,-0.0231568;REVB=0.0206507,-0.0179005;RO=18;SAF=8,1;SAR=14,1;SRF=7;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0217906,0.111109;STB=0.512184,0.599046;STBP=0.882,0.76;TYPE=del,snp;VARB=0.0182355,0.0124616;OID=.,.;OPOS=156877277,156877277;OREF=AA,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.52381,0.047619:22,2:43:22,2:42:18:8,1:14,1:7:11:99:18:8,1:14,1:7:11
chr3	156983414	.	T	C	392.27	PASS	AF=0.427083;AO=41;DP=92;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=0.0101288;FXX=0.0103082;HRUN=4;LEN=1;MLLD=161.043;QD=16.3447;RBI=0.0152758;REFB=-0.0215826;REVB=-0.0114349;RO=51;SAF=19;SAR=22;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319362;STB=0.515609;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0283643;OID=.;OPOS=156983414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:96:51:55:41:41:0.427083:22:19:22:29:22:19:24:31
chr3	157081324	.	A	G	631.53	PASS	AF=0.558559;AO=61;DP=110;FAO=62;FDP=111;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0398507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5691;QD=22.758;RBI=0.0488796;REFB=-0.0221142;REVB=0.0283044;RO=49;SAF=29;SAR=32;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283255;STB=0.518771;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0147505;OID=.;OPOS=157081324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:49:49:61:62:0.558559:32:29:25:24:33:29:25:24
chr3	157155314	.	C	A	419.42	PASS	AF=0.506024;AO=42;DP=83;FAO=42;FDP=83;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=7;FWDB=0.00895008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.761;QD=20.2132;RBI=0.0126413;REFB=-0.00809737;REVB=-0.00892745;RO=41;SAF=25;SAR=17;SRF=34;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229065;STB=0.625648;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0085354;OID=.;OPOS=157155314;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:41:41:42:42:0.506024:17:25:34:7:17:25:34:7
chr3	157161190	.	CAAAAAAAA	CAAAAAAAAT,CAAAAAAA,CAAAAAAAT	216.94	PASS	AF=0.326087,0.0652174,0.173913;AO=7,12,11;DP=46;FAO=15,3,8;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=6,2,6;FSAR=9,1,2;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0160589,0.0422102,-0.0113737;FXX=0;HRUN=0,8,8;LEN=1,1,1;MLLD=82.2819,6.26979,82.7379;QD=18.8645;RBI=0.0231739,0.140793,0.0132332;REFB=-0.0153581,-0.170084,-0.0356966;REVB=0.0167075,-0.134316,-0.00676436;RO=12;SAF=3,6,6;SAR=4,6,5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.073775,0,0.0408741;STB=0.558061,0.64607,0.691801;STBP=0.562,0.682,0.235;TYPE=ins,del,snp;VARB=0.0190274,0.120106,0.0504675;OID=.,.,.;OPOS=157161199,157161191,157161198;OREF=-,A,A;OALT=T,-,T;OMAPALT=CAAAAAAAAT,CAAAAAAA,CAAAAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.326087,0.0652174,0.173913:7,12,11:46:15,3,8:46:20:6,2,6:9,1,2:10:10:85:12:3,6,6:4,6,5:6:6
chr3	157815088	.	G	A	1153.08	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.875;QD=60.6886;RBI=0.018385;REFB=0;REVB=0.0103219;RO=0;SAF=33;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.02338e-05;OID=.;OPOS=157815088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:43:33:0:0:43:33:0:0
chr3	157815217	.	A	T	519.62	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0171988;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.4295;QD=56.1746;RBI=0.0182271;REFB=0.0840822;REVB=-0.00603572;RO=1;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021769;STB=0.511621;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.0041074;OID=.;OPOS=157815217;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:21:15:0:1:21:15:0:1
chr3	158952248	.	A	AT	81.96	PASS	AF=0.174757;AO=13;DP=105;FAO=18;FDP=103;FR=.;FRO=85;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=0.00394525;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=194.577;QD=3.18294;RBI=0.0269154;REFB=-0.000294968;REVB=-0.0266247;RO=90;SAF=13;SAR=0;SRF=53;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.648677;STB=0.908029;STBP=0.001;TYPE=ins;VARB=0.0391733;OID=.;OPOS=158952249;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.174757:13:105:18:103:85:17:1:48:37:81:90:13:0:53:37
chr3	158952315	.	C	A	990.64	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.324;QD=59.1429;RBI=0.0109813;REFB=0;REVB=0.00313909;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45542e-05;OID=.;OPOS=158952315;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:30:37:0:0:30:37:0:0
chr3	159744438	.	C	T	245.83	PASS	AF=0.459016;AO=26;DP=59;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.00842902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.724;QD=16.1199;RBI=0.0315884;REFB=-0.0228139;REVB=0.030443;RO=33;SAF=14;SAR=12;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19189;STB=0.588176;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.022772;OID=.;OPOS=159744438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:61:33:33:26:28:0.459016:12:14:24:9:12:16:24:9
chr3	159744440	.	C	T	248.16	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.0147054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.952;QD=16.2728;RBI=0.0265701;REFB=-0.00411214;REVB=0.0221296;RO=33;SAF=16;SAR=12;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157469;STB=0.588176;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.00260259;OID=.;OPOS=159744440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:12:16:24:9:12:16:24:9
chr3	160120562	.	TA	AT,T	42.25	PASS	AF=0,0.257143;AO=3,23;DP=72;FAO=0,18;FDP=70;FR=.;FRO=52;FSAF=0,8;FSAR=0,10;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.0301927,-0.153401;FXX=0.0277739;HRUN=1,6;LEN=2,1;MLLD=57.7312,8.65241;QD=2.41441;RBI=0.0331315,0.177811;REFB=-0.0150218,-0.112027;REVB=0.0136417,0.0899147;RO=36;SAF=0,13;SAR=3,10;SRF=14;SRR=22;SSEN=0,0.314286;SSEP=0,0;SSSB=-0.477316,0.185273;STB=0.5,0.545405;STBP=1,0.674;TYPE=mnp,del;VARB=0.10382,0.125616;OID=.,.;OPOS=160120562,160120563;OREF=TA,A;OALT=AT,-;OMAPALT=AT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:43:72:70:36:52:3,23:0,18:0,0.257143:3,10:0,13:14:22:0,10:0,8:20:32
chr3	160132242	.	GT	G	46.26	PASS	AF=0.466667;AO=6;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=-0.148468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.4724;QD=12.3355;RBI=0.156029;REFB=-0.0496586;REVB=0.0479819;RO=9;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.840898;STB=0.899038;STBP=0.026;TYPE=del;VARB=0.0501944;OID=.;OPOS=160132243;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.466667:6:15:7:15:8:6:1:0:8:42:9:6:0:0:9
chr3	160414759	.	G	A	389.76	PASS	AF=0.379032;AO=46;DP=121;FAO=47;FDP=124;FR=.;FRO=77;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=-0.00650978;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.323;QD=12.5728;RBI=0.0459568;REFB=-0.012576;REVB=-0.0454934;RO=75;SAF=26;SAR=20;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0057801;STB=0.510143;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0195862;OID=.;OPOS=160414759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:124:75:77:46:47:0.379032:20:26:42:33:20:27:43:34
chr3	160436316	.	A	G	151.53	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.00601693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.844;QD=12.8961;RBI=0.00950788;REFB=0.000595517;REVB=0.00736181;RO=29;SAF=8;SAR=9;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309889;STB=0.664848;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=-0.000619397;OID=.;OPOS=160436316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:30:17:17:0.361702:9:8:22:7:9:8:22:8
chr3	160967354	.	G	A	304.82	PASS	AF=0.402299;AO=34;DP=86;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.020111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3405;QD=14.0148;RBI=0.053128;REFB=-0.0115828;REVB=-0.0491745;RO=47;SAF=18;SAR=16;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106195;STB=0.531478;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0164537;OID=.;OPOS=160967354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:47:52:34:35:0.402299:16:18:20:27:17:18:24:28
chr3	161062631	.	T	C	186.09	PASS	AF=0.338028;AO=24;DP=71;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=0.00417137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.481;QD=10.4839;RBI=0.0100417;REFB=-0.0160435;REVB=0.00913435;RO=47;SAF=15;SAR=9;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349656;STB=0.520429;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.037622;OID=.;OPOS=161062631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:47:47:24:24:0.338028:9:15:28:19:9:15:28:19
chr3	161062848	.	G	A	216.68	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0160993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.953;QD=13.3343;RBI=0.018317;REFB=-0.0127795;REVB=0.00873638;RO=39;SAF=13;SAR=13;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121267;STB=0.569179;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0145155;OID=.;OPOS=161062848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:13:13:24:15:13:13:24:15
chr3	161221705	.	A	C	383.87	PASS	AF=0.465116;AO=39;DP=85;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.02199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0373;QD=17.8544;RBI=0.0302844;REFB=0.00330331;REVB=0.0208227;RO=45;SAF=26;SAR=13;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114275;STB=0.548362;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=-0.00701928;OID=.;OPOS=161221705;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:45:46:39:40:0.465116:13:26:25:20:14:26:26:20
chr3	164697153	.	T	C	346.36	PASS	AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.00958683;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8392;QD=21.3142;RBI=0.0540063;REFB=-0.0276633;REVB=0.0531486;RO=28;SAF=18;SAR=17;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0975585;STB=0.567885;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0174965;OID=.;OPOS=164697153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:28:30:35:35:0.538462:17:18:11:17:17:18:11:19
chr3	164714532	.	C	T	1540.15	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5455;QD=63.5112;RBI=0.0211221;REFB=0;REVB=-0.00521094;RO=0;SAF=49;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.26652e-05;OID=.;OPOS=164714532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:96:97:1:47:49:0:0:47:50:0:0
chr3	164730804	.	T	C	436.82	PASS	AF=0.473118;AO=44;DP=93;FAO=44;FDP=93;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.0167331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0984;QD=18.788;RBI=0.0299225;REFB=-0.00123447;REVB=0.0248064;RO=49;SAF=23;SAR=21;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657551;STB=0.536593;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.000942169;OID=.;OPOS=164730804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:49:49:44:44:0.473118:21:23:29:20:21:23:29:20
chr3	164764719	.	C	A	679.05	PASS	AF=0.418994;AO=75;DP=179;FAO=75;FDP=179;FR=.;FRO=104;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=61;FSRR=43;FWDB=0.0154495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.993;QD=15.1742;RBI=0.0183541;REFB=-0.00997437;REVB=-0.00990888;RO=104;SAF=41;SAR=34;SRF=61;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419658;STB=0.523465;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0102819;OID=.;OPOS=164764719;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:179:104:104:75:75:0.418994:34:41:61:43:34:41:61:43
chr3	164773057	.	G	A	398.6	PASS	AF=0.565217;AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00769296;FXX=0.0142837;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.379;QD=23.1071;RBI=0.0086235;REFB=-0.0395968;REVB=-0.00389657;RO=30;SAF=17;SAR=22;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155166;STB=0.585322;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0200311;OID=.;OPOS=164773057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:30:30:39:39:0.565217:22:17:19:11:22:17:19:11
chr3	164783165	.	T	C	833.68	PASS	AF=0.541667;AO=77;DP=144;FAO=78;FDP=144;FR=.;FRO=66;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.0149035;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.67;QD=23.1576;RBI=0.0153609;REFB=0.00707606;REVB=0.00372065;RO=66;SAF=35;SAR=42;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025688;STB=0.516674;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=-0.00589783;OID=.;OPOS=164783165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:66:66:77:78:0.541667:42:35:32:34:43:35:32:34
chr3	164793758	.	C	A	794.2	PASS	AF=0.393162;AO=87;DP=230;FAO=92;FDP=234;FR=.;FRO=142;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=70;FSRR=72;FWDB=-0.0189721;FXX=0.00425514;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.633;QD=13.5761;RBI=0.0190665;REFB=-0.00850561;REVB=-0.0018957;RO=142;SAF=39;SAR=48;SRF=70;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493088;STB=0.528861;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0130075;OID=.;OPOS=164793758;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:230:234:142:142:87:92:0.393162:48:39:70:72:51:41:70:72
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chr3	164905688	.	G	A	200.95	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00448213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.921;QD=15.1662;RBI=0.0390708;REFB=-0.0207957;REVB=-0.0388128;RO=27;SAF=17;SAR=6;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1637;STB=0.631848;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0232613;OID=.;OPOS=164905688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:30:23:23:0.433962:6:17:16:11:6:17:16:14
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chr3	169514585	.	A	T	632.0	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00643989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.312;QD=61.6587;RBI=0.00861698;REFB=0;REVB=0.00572539;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.77419e-06;OID=.;OPOS=169514585;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:15:25:0:0:16:25:0:0
chr3	169514601	.	G	GT	51.4	PASS	AF=0.463415;AO=15;DP=43;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.114792;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.82281;QD=5.01471;RBI=0.144787;REFB=-0.0777222;REVB=0.0882383;RO=24;SAF=11;SAR=4;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223804;STB=0.580917;STBP=0.403;TYPE=ins;VARB=0.0908411;OID=.;OPOS=169514602;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.463415:15:43:19:41:22:13:6:12:10:51:24:11:4:13:11
chr3	169518455	.	T	C	754.07	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0176;QD=56.9108;RBI=0.0803039;REFB=0;REVB=0.0550347;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000663314;OID=.;OPOS=169518455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:21:30:0:0:22:31:0:0
chr3	169540397	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.056574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3354;QD=43.486;RBI=0.0637574;REFB=0;REVB=-0.0294005;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00402955;OID=.;OPOS=169540397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr3	169558025	.	C	T	550.3	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0306107;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=105.55;QD=55.0302;RBI=0.0306982;REFB=-0.0580216;REVB=-0.00231574;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.524987;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00100329;OID=.;OPOS=169558025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:0:2:38:38:0.95:19:19:0:0:19:19:0:2
chr3	169713483	.	C	T	326.48	PASS	AF=0.568966;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=58;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0329223;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2719;QD=22.5161;RBI=0.0352624;REFB=-0.0547453;REVB=-0.0126316;RO=25;SAF=15;SAR=18;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107306;STB=0.55907;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0284565;OID=.;OPOS=169713483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:25:25:33:33:0.568966:18:15:8:17:18:15:8:17
chr3	169802930	.	G	T	59.81	PASS	AF=0.214286;AO=10;DP=42;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0181414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.242;QD=5.69643;RBI=0.035943;REFB=-0.005215;REVB=-0.0310289;RO=32;SAF=5;SAR=5;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228923;STB=0.589974;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0169284;OID=.;OPOS=169802930;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:42:42:32:33:10:9:0.214286:5:5:22:10:4:5:22:11
chr3	169894680	.	G	A	236.25	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0140449;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.924;QD=17.5;RBI=0.0362634;REFB=-0.0195402;REVB=-0.0334332;RO=28;SAF=21;SAR=5;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206716;STB=0.617547;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.017551;OID=.;OPOS=169894680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:5:21:18:10:5:21:18:10
chr3	170078232	.	C	T	446.4	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.396;QD=55.8004;RBI=0.0314245;REFB=0;REVB=0.0109828;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000983484;OID=.;OPOS=170078232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:30:32:1:10:20:0:0:10:22:0:0
chr3	170216617	.	T	C	506.59	PASS	AF=0.602564;AO=46;DP=77;FAO=47;FDP=78;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0429702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3774;QD=25.9788;RBI=0.0430091;REFB=-0.0487919;REVB=-0.00182813;RO=31;SAF=18;SAR=28;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164448;STB=0.592451;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0432899;OID=.;OPOS=170216617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:31:31:46:47:0.602564:28:18:19:12:29:18:19:12
chr3	170584178	.	C	T	421.46	PASS	AF=0.569444;AO=41;DP=72;FAO=41;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0018429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.301;QD=23.4142;RBI=0.00838395;REFB=-0.0244009;REVB=-0.0081789;RO=31;SAF=18;SAR=23;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354738;STB=0.519498;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.0144635;OID=.;OPOS=170584178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:31:31:41:41:0.569444:23:18:15:16:23:18:15:16
chr3	170585935	.	C	CA	83.64	PASS	AF=0.392157;AO=15;DP=53;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0232713;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=12.7514;QD=6.55995;RBI=0.0709719;REFB=-0.108555;REVB=0.0670482;RO=38;SAF=3;SAR=12;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505148;STB=0.72392;STBP=0.015;TYPE=ins;VARB=0.161104;OID=.;OPOS=170585936;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.392157:15:53:20:51:31:6:14:21:10:83:38:3:12:24:14
chr3	170609123	.	C	G	384.17	PASS	AF=0.45977;AO=40;DP=87;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.043157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8459;QD=17.663;RBI=0.0436734;REFB=-0.0107301;REVB=0.00669607;RO=47;SAF=17;SAR=23;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144087;STB=0.580568;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0178102;OID=.;OPOS=170609123;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:47:47:40:40:0.45977:23:17:27:20:23:17:27:20
chr3	170715830	.	G	A	268.68	PASS	AF=0.508475;AO=28;DP=58;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.0120429;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8965;QD=18.2158;RBI=0.0123461;REFB=-0.00664498;REVB=0.00271962;RO=29;SAF=14;SAR=14;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204577;STB=0.624921;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0046688;OID=.;OPOS=170715830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:29:29:28:30:0.508475:14:14:21:8:16:14:21:8
chr3	170825905	.	C	G	1298.53	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.58;QD=61.8347;RBI=0.0519754;REFB=0;REVB=0.0242403;RO=0;SAF=53;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116986;OID=.;OPOS=170825905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:84:0:0:82:84:1:29:53:0:0:30:54:0:0
chr3	170893070	.	G	A	660.45	PASS	AF=0.925926;AO=50;DP=54;FAO=50;FDP=54;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0224959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.366;QD=48.9225;RBI=0.0225428;REFB=-0.0202529;REVB=-0.0014537;RO=4;SAF=41;SAR=9;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122483;STB=0.565489;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.000161797;OID=.;OPOS=170893070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:54:54:4:4:50:50:0.925926:9:41:1:3:9:41:1:3
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chr3	171969077	.	C	G	274.22	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.00120077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.716;QD=24.9292;RBI=0.00516472;REFB=0.00360833;REVB=0.00502319;RO=19;SAF=13;SAR=12;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158156;STB=0.587635;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=-0.00182506;OID=.;OPOS=171969077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:12:13:6:13:12:13:6:13
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chr3	172046861	.	T	C	1320.92	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0571823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.457;QD=62.161;RBI=0.0577907;REFB=0;REVB=0.00836327;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000124457;OID=.;OPOS=172046861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:44:41:0:0:44:41:0:0
chr3	172118162	.	A	G	705.16	PASS	AF=0.552846;AO=68;DP=123;FAO=68;FDP=123;FR=.;FRO=55;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=18;FWDB=0.00135995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.006;QD=22.9321;RBI=0.0338299;REFB=-0.022873;REVB=0.0338026;RO=55;SAF=40;SAR=28;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723956;STB=0.539528;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0149966;OID=.;OPOS=172118162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:55:55:68:68:0.552846:28:40:37:18:28:40:37:18
chr3	172224303	.	A	G	91.59	PASS	AF=0.309524;AO=10;DP=37;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=3.03434e-05;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=117.093;QD=8.72239;RBI=0.0142669;REFB=-0.00279445;REVB=0.0142668;RO=18;SAF=4;SAR=6;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334551;STB=0.692012;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00322318;OID=.;OPOS=172224303;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:37:42:18:29:10:13:0.309524:6:4:13:5:9:4:17:12
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chr3	172514294	.	G	A	695.5	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00521014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2644;QD=60.4785;RBI=0.0395375;REFB=-0.0956043;REVB=0.0391927;RO=1;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240908;STB=0.512815;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00178177;OID=.;OPOS=172514294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:19:26:0:1:19:26:0:1
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chr3	174581888	.	T	C	319.87	PASS	AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00454532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.882;QD=23.694;RBI=0.00601357;REFB=-0.0138373;REVB=-0.0039374;RO=21;SAF=20;SAR=12;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0045667;STB=0.504947;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.00801127;OID=.;OPOS=174581888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:21:22:32:32:0.592593:12:20:13:8:12:20:14:8
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chr3	174814920	.	A	G	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0056289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.584;QD=58.2394;RBI=0.0179322;REFB=0;REVB=0.0170258;RO=0;SAF=41;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79729e-05;OID=.;OPOS=174814920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:21:41:0:0:21:41:0:0
chr3	174951756	.	T	C	696.37	PASS	AF=1;AO=43;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126691;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.861;QD=61.8992;RBI=0.0379726;REFB=0;REVB=0.0357968;RO=0;SAF=34;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334561;OID=.;OPOS=174951756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:43:45:1:9:34:0:0:10:35:0:0
chr3	175165079	.	C	T	432.51	PASS	AF=0.888889;AO=32;DP=36;FAO=32;FDP=36;FR=.;FRO=4;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00883238;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.617;QD=48.057;RBI=0.00972293;REFB=-0.203084;REVB=0.00406501;RO=2;SAF=18;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490904;STB=0.507038;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.00557089;OID=.;OPOS=175165079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:36:36:2:4:32:32:0.888889:14:18:2:0:14:18:2:2
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chr3	175327309	.	G	A	1940.05	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00483055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.787;QD=61.5888;RBI=0.0301599;REFB=0;REVB=-0.0297706;RO=0;SAF=67;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102359;OID=.;OPOS=175327309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:125:126:0:0:125:126:1:58:67:0:0:58:68:0:0
chr3	175345143	.	C	G	1607.13	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.502;QD=64.2853;RBI=0.0280557;REFB=0;REVB=0.0234565;RO=0;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3128e-05;OID=.;OPOS=175345143;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:54:46:0:0:54:46:0:0
chr3	175473047	.	T	C	2079.32	PASS	AF=0.985401;AO=134;DP=137;FAO=135;FDP=137;FR=.;FRO=2;FSAF=78;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00328642;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.458;QD=60.7101;RBI=0.00335112;REFB=-0.143901;REVB=0.000655319;RO=2;SAF=78;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00235712;STB=0.501163;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.00123334;OID=.;OPOS=175473047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:137:137:2:2:134:135:0.985401:56:78:1:1:57:78:1:1
chr3	175521611	.	A	G	922.16	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.246;QD=57.6352;RBI=0.0362019;REFB=0;REVB=0.00718281;RO=0;SAF=28;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.174e-05;OID=.;OPOS=175521611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:64:0:0:56:64:1:28:28:0:0:29:35:0:0
chr3	176742003	.	A	G	31.41	PASS	AF=0.101449;AO=7;DP=69;FAO=7;FDP=69;FR=.;FRO=62;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.00697444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.389;QD=1.82077;RBI=0.041174;REFB=-0.00423615;REVB=-0.040579;RO=60;SAF=3;SAR=4;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139627;STB=0.620073;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0752722;OID=.;OPOS=176742003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:69:69:60:62:7:7:0.101449:4:3:33:27:4:3:35:27
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chr3	178742690	.	T	C	708.53	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.733;QD=62.9806;RBI=0.0264831;REFB=0;REVB=0.0241989;RO=0;SAF=13;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.83199e-05;OID=.;OPOS=178742690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:31:13:0:0:32:13:0:0
chr3	178815528	.	G	A	2177.65	PASS	AF=1;AO=135;DP=135;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1165;QD=62.6662;RBI=0.0189895;REFB=0;REVB=0.0160096;RO=0;SAF=64;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=9.26516e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113901;OID=.;OPOS=178815528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:135:139:0:0:135:139:1:71:64:0:0:74:65:0:0
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chr3	179096508	.	C	G	1105.97	PASS	AF=0.916667;AO=77;DP=86;FAO=77;FDP=84;FR=.;FRO=7;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=-0.00398883;FXX=0.0232531;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4192;QD=52.6652;RBI=0.00856916;REFB=0.0165277;REVB=0.00758418;RO=7;SAF=46;SAR=31;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956461;STB=0.550711;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00195336;OID=.;OPOS=179096508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:86:84:7:7:77:77:0.916667:31:46:0:7:31:46:0:7
chr3	179114529	.	GATTAATTAA	GATTAA,GATTAATAAG	172.89	PASS	AF=0.384615,0.102564;AO=14,4;DP=40;FAO=15,4;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=10,0;FSAR=5,4;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=-0.0132805,0.0808663;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=4,3;MLLD=233.018,60.6884;QD=17.7325;RBI=0.0384009,0.0811726;REFB=-0.0142226,0.0124651;REVB=0.0360314,-0.00704485;RO=19;SAF=10,0;SAR=4,4;SRF=15;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0963034,-0.760437;STB=0.590798,0.998334;STBP=0.449,0.001;TYPE=del,mnp;VARB=0.0201256,0.125242;OID=.,.;OPOS=179114530,179114536;OREF=ATTA,TAA;OALT=-,AAG;OMAPALT=GATTAA,GATTAATAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.384615,0.102564:14,4:40:15,4:39:20:10,0:5,4:16:4:99:19:10,0:4,4:15:4
chr3	179137273	.	A	G	564.7	PASS	AF=0.508772;AO=57;DP=113;FAO=58;FDP=114;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.0143639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.266;QD=19.8139;RBI=0.0172646;REFB=-0.0243097;REVB=0.00957843;RO=55;SAF=25;SAR=32;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184977;STB=0.510201;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0231638;OID=.;OPOS=179137273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:55:56:57:58:0.508772:32:25:23:32:33:25:23:33
chr3	179293184	.	T	C	515.26	PASS	AF=0.448;AO=56;DP=125;FAO=56;FDP=125;FR=.;FRO=69;FSAF=43;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=0.0116611;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=278.927;QD=16.4882;RBI=0.0117154;REFB=-0.0114049;REVB=-0.00112722;RO=68;SAF=43;SAR=13;SRF=34;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300128;STB=0.673343;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0145373;OID=.;OPOS=179293184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:68:69:56:56:0.448:13:43:34:34:13:43:34:35
chr3	179298999	.	C	T	1936.89	PASS	AF=1;AO=123;DP=124;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00036551;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.385;QD=61.9806;RBI=0.0288517;REFB=0;REVB=-0.0288494;RO=0;SAF=61;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.55703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.12061e-05;OID=.;OPOS=179298999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:125:0:0:123:125:1:62:61:0:0:64:61:0:0
chr3	180666557	.	A	T	251.08	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0089239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.4;QD=19.6925;RBI=0.0282722;REFB=-0.0099838;REVB=0.0268269;RO=25;SAF=13;SAR=13;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122813;STB=0.568576;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0100565;OID=.;OPOS=180666557;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:13:13:16:9:13:13:16:9
chr3	182631792	.	C	A	399.65	PASS	AF=0.436893;AO=44;DP=103;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.0312745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5835;QD=15.5203;RBI=0.0691933;REFB=-0.0258713;REVB=-0.0617221;RO=58;SAF=20;SAR=24;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0808925;STB=0.538146;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0267651;OID=.;OPOS=182631792;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:58:58:44:45:0.436893:24:20:31:27:24:21:31:27
chr3	182790249	.	G	A	1148.66	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.666;QD=60.4558;RBI=0.0233793;REFB=0;REVB=0.0187756;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.18813e-05;OID=.;OPOS=182790249;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:44:31:0:0:45:31:0:0
chr3	182853670	.	T	C	329.75	PASS	AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00594712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.462;QD=20.9366;RBI=0.0194579;REFB=-0.00381635;REVB=0.0185268;RO=29;SAF=19;SAR=15;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822091;STB=0.545428;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00628581;OID=.;OPOS=182853670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:29:29:34:34:0.539683:15:19:19:10:15:19:19:10
chr3	182871962	.	C	T	436.38	PASS	AF=0.4;AO=50;DP=125;FAO=50;FDP=125;FR=.;FRO=75;FSAF=5;FSAR=45;FSRF=14;FSRR=61;FWDB=-0.0789718;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.952;QD=13.9642;RBI=0.0796726;REFB=-0.00793597;REVB=-0.0105443;RO=72;SAF=5;SAR=45;SRF=15;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240342;STB=0.617274;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.010552;OID=.;OPOS=182871962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:72:75:50:50:0.4:45:5:15:57:45:5:14:61
chr3	182925403	.	GT	G,GC	835.21	PASS	AF=0.116667,0.883333;AO=9,51;DP=61;FAO=7,53;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=7,34;FSAR=0,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218988,0.0161066;FXX=0.0163908;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=56.4591,73.3454;QD=55.6808;RBI=0.0266488,0.0603494;REFB=0,0;REVB=0.0151854,0.0581604;RO=0;SAF=8,33;SAR=1,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-8.62909e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0125491,0.00532528;OID=.,.;OPOS=182925404,182925404;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.116667,0.883333:9,51:61:7,53:60:0:7,34:0,19:0:0:29:0:8,33:1,18:0:0
chr3	183017965	.	T	A	194.83	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0729278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5029;QD=17.3186;RBI=0.0753701;REFB=-0.0376173;REVB=-0.019031;RO=25;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584098;STB=0.5333;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0304244;OID=.;OPOS=183017965;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:10:10:14:11:10:10:14:11
chr3	183027542	.	T	G	144.38	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00473983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.021;QD=15.6082;RBI=0.0233339;REFB=0.0122375;REVB=0.0228474;RO=20;SAF=12;SAR=4;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222029;STB=0.645958;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=-0.0127352;OID=.;OPOS=183027542;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:21:16:16:0.432432:4:12:11:9:4:12:11:10
chr3	183211906	.	A	G	1120.44	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134423;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.586;QD=60.5641;RBI=0.0181193;REFB=0;REVB=-0.0121497;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40787e-05;OID=.;OPOS=183211906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:74:0:0:74:74:1:35:39:0:0:35:39:0:0
chr3	183212026	.	C	T	152.78	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=24;FWDB=-0.0632461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.517;QD=13.5806;RBI=0.0684457;REFB=-0.0171732;REVB=-0.0261674;RO=27;SAF=7;SAR=10;SRF=4;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312584;STB=0.683732;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0253439;OID=.;OPOS=183212026;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:27:28:17:17:0.377778:10:7:4:23:10:7:4:24
chr3	183226114	.	G	T	356.7	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.021867;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.711;QD=19.2813;RBI=0.0234686;REFB=-0.0268304;REVB=0.00852089;RO=37;SAF=10;SAR=27;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167843;STB=0.593855;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0232772;OID=.;OPOS=183226114;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:27:10:16:21:27:10:16:21
chr3	183368216	.	A	T	332.97	PASS	AF=0.439024;AO=34;DP=80;FAO=36;FDP=82;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.0154216;FXX=0.0120467;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.871;QD=16.2423;RBI=0.0264416;REFB=-0.00966893;REVB=0.0214786;RO=46;SAF=12;SAR=22;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110782;STB=0.539194;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0166401;OID=.;OPOS=183368216;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:82:46:46:34:36:0.439024:22:12:21:25:22:14:21:25
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chr3	183396973	.	G	T	275.89	PASS	AF=0.581395;AO=24;DP=42;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0128179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.204;QD=25.6639;RBI=0.0347617;REFB=-0.0303589;REVB=0.0323122;RO=18;SAF=10;SAR=14;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149805;STB=0.571372;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0207916;OID=.;OPOS=183396973;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:18:18:24:25:0.581395:14:10:11:7:14:11:11:7
chr3	183442219	.	A	G	140.08	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0215318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.654;QD=12.7344;RBI=0.0226266;REFB=-0.0104858;REVB=-0.00695298;RO=27;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0740772;STB=0.529034;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0193874;OID=.;OPOS=183442219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:28:16:16:0.363636:9:7:10:17:9:7:11:17
chr3	183465483	.	G	A	434.93	PASS	AF=0.518072;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0177961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.311;QD=20.9604;RBI=0.0179012;REFB=-0.00724998;REVB=-0.0019361;RO=40;SAF=26;SAR=17;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491769;STB=0.527218;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.00772858;OID=.;OPOS=183465483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:40:40:43:43:0.518072:17:26:22:18:17:26:22:18
chr3	183476685	.	G	A	159.76	PASS	AF=0.472222;AO=16;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.00214435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2544;QD=17.7509;RBI=0.0169721;REFB=-0.0351813;REVB=-0.016836;RO=19;SAF=3;SAR=13;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.493005;STB=0.743813;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0263088;OID=.;OPOS=183476685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:16:17:0.472222:13:3:13:6:13:4:13:6
chr3	183508590	.	A	G	165.55	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00606599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9988;QD=14.3957;RBI=0.00992738;REFB=-0.0102951;REVB=0.00785854;RO=27;SAF=8;SAR=10;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190232;STB=0.597979;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0219403;OID=.;OPOS=183508590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:28:18:18:0.391304:10:8:17:10:10:8:17:11
chr3	183508714	.	G	A	340.51	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0159785;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.73;QD=17.9217;RBI=0.0194937;REFB=-0.0283615;REVB=0.0111666;RO=38;SAF=13;SAR=23;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203295;STB=0.614179;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0510195;OID=.;OPOS=183508714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:38:40:36:36:0.473684:23:13:22:16:23:13:23:17
chr3	183521133	.	A	G	849.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.568;QD=57.6085;RBI=0.0383667;REFB=0;REVB=-0.0119432;RO=0;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118749;OID=.;OPOS=183521133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:19:38:0:0:20:39:0:0
chr3	183524193	.	T	C	293.56	PASS	AF=0.525424;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.027769;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=93.7865;QD=19.9023;RBI=0.0475581;REFB=0.00406394;REVB=0.0386091;RO=27;SAF=14;SAR=17;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025196;STB=0.523062;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=-0.00324265;OID=.;OPOS=183524193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:27:28:31:31:0.525424:17:14:13:14:17:14:14:14
chr3	183530331	.	G	C	333.15	PASS	AF=0.492958;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0111987;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.546;QD=18.769;RBI=0.0112188;REFB=-0.0247706;REVB=-0.000671085;RO=36;SAF=21;SAR=14;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105518;STB=0.505879;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0228424;OID=.;OPOS=183530331;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:36:36:35:35:0.492958:14:21:22:14:14:21:22:14
chr3	183533964	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0095312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1149;QD=52.6131;RBI=0.0999599;REFB=0;REVB=-0.0995044;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00295967;OID=.;OPOS=183533964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0
chr3	183637722	.	T	G	240.46	PASS	AF=0.522727;AO=22;DP=42;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.114444;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.7404;QD=21.86;RBI=0.114448;REFB=0.00295583;REVB=0.000872939;RO=20;SAF=10;SAR=12;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179248;STB=0.615905;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.000521377;OID=.;OPOS=183637722;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:20:21:22:23:0.522727:12:10:5:15:12:11:5:16
chr3	183660585	.	G	A	262.67	PASS	AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.00109068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7964;QD=15.0096;RBI=0.080872;REFB=-0.0107727;REVB=0.0808647;RO=40;SAF=16;SAR=14;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588454;STB=0.533311;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0105427;OID=.;OPOS=183660585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:14:16:19:21:14:16:19:21
chr3	183682960	.	G	A	95.41	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.029708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.444;QD=11.5654;RBI=0.0328481;REFB=0.00995196;REVB=0.0140155;RO=21;SAF=7;SAR=5;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130543;STB=0.507759;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.0123583;OID=.;OPOS=183682960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:5:7:12:9:5:7:12:9
chr3	183685534	.	A	G	635.19	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666365;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7183;QD=61.9697;RBI=0.182955;REFB=0;REVB=0.170388;RO=0;SAF=34;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.21163e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00524626;OID=.;OPOS=183685534;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:6:34:0:0:7:34:0:0
chr3	183696402	.	A	G	1234.67	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0843657;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.56;QD=61.7336;RBI=0.0854435;REFB=0;REVB=-0.0135288;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014116;OID=.;OPOS=183696402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:76:80:0:0:76:80:1:42:34:0:0:41:39:0:0
chr3	183699516	.	T	C	105.32	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=2;FWDB=-0.0139485;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.432;QD=11.0866;RBI=0.0188503;REFB=-0.00596514;REVB=0.0126797;RO=25;SAF=7;SAR=6;SRF=23;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.463064;STB=0.76243;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00964803;OID=.;OPOS=183699516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:6:7:23:2:6:7:23:2
chr3	183753777	.	G	A	56.11	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.147947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3909;QD=11.2228;RBI=0.147975;REFB=-0.00440963;REVB=0.00284253;RO=10;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245631;STB=0.576728;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=-0.000660397;OID=.;OPOS=183753777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:10:12:8:8:0.4:5:3:4:6:5:3:6:6
chr3	183754294	.	G	C	371.19	PASS	AF=0.560606;AO=36;DP=67;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00848442;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4178;QD=22.4962;RBI=0.00933947;REFB=-0.000779997;REVB=0.00390388;RO=29;SAF=25;SAR=11;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036743;STB=0.510199;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.000666364;OID=.;OPOS=183754294;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:29:29:36:37:0.560606:11:25:19:10:12:25:19:10
chr3	183754585	.	C	T	251.45	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0100362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1239;QD=20.5265;RBI=0.0702454;REFB=0.00460057;REVB=-0.0695248;RO=24;SAF=11;SAR=13;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037189;STB=0.53149;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=-0.00780684;OID=.;OPOS=183754585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:25:24:24:0.489796:13:11:12:12:13:11:13:12
chr3	183755822	.	G	A	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00318836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7553;QD=62.6704;RBI=0.0157115;REFB=0;REVB=0.0153846;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209271;OID=.;OPOS=183755822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0
chr3	183756637	.	C	T	296.48	PASS	AF=0.484848;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0126917;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.879;QD=17.9682;RBI=0.0139083;REFB=-0.0250653;REVB=0.00568858;RO=34;SAF=21;SAR=11;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150621;STB=0.584439;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.023166;OID=.;OPOS=183756637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:34:34:32:32:0.484848:11:21:17:17:11:21:17:17
chr3	183756702	.	G	A	191.03	PASS	AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=-0.00564336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.919;QD=13.4055;RBI=0.00671561;REFB=-0.0165385;REVB=0.00364033;RO=33;SAF=14;SAR=9;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169104;STB=0.582022;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.032565;OID=.;OPOS=183756702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:34:23:23:0.403509:9:14:25:8:9:14:25:9
chr3	183774762	.	CC	AC,AT	1352.8	PASS	AF=0.965909,0.0340909;AO=78,3;DP=82;FAO=85,3;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43,2;FSAR=42,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183395,-0.00230394;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=50.0196,79.2377;QD=61.4909;RBI=0.040647,0.0285562;REFB=0,0;REVB=0.0362745,-0.0284631;RO=0;SAF=41,2;SAR=37,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.4281e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.000516206,0.0836599;OID=.,.;OPOS=183774762,183774762;OREF=C,CC;OALT=A,AT;OMAPALT=AC,AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:82:88:0:0:78,3:85,3:0.965909,0.0340909:37,1:41,2:0:0:42,1:43,2:0:0
chr3	183778010	.	G	C	940.94	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0215978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.796;QD=57.0269;RBI=0.0457421;REFB=-0.121248;REVB=0.0403221;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000436359;OID=.;OPOS=183778010;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:0:1:65:65:0.984848:25:40:0:0:25:40:1:0
chr3	183818416	.	G	A	540.41	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015069;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.082;QD=60.046;RBI=0.0267658;REFB=0;REVB=-0.0221209;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000292836;OID=.;OPOS=183818416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:27:9:0:0:27:9:0:0
chr3	183823575	.	GT	G,GC	981.93	PASS	AF=0.769231,0.230769;AO=31,42;DP=78;FAO=60,18;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=24,18;FSAR=36,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0317137,-0.0778882;FXX=0.0126566;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=95.319,91.4523;QD=50.3555;RBI=0.171639,0.218144;REFB=0,0;REVB=0.168684,0.203765;RO=2;SAF=0,42;SAR=31,0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.887316;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000728819,0.0281929;OID=.,.;OPOS=183823576,183823576;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.769231,0.230769:31,42:78:60,18:78:0:24,18:36,0:0:0:99:2:0,42:31,0:0:2
chr3	183861243	.	A	G	180.9	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0211474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.31;QD=13.9151;RBI=0.0281323;REFB=-0.00787747;REVB=0.018553;RO=31;SAF=13;SAR=8;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416544;STB=0.523969;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.00839019;OID=.;OPOS=183861243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:8:13:18:13:8:13:18:13
chr3	183863081	.	TAAAAG	TAAA,TAAAG	99.3	PASS	AF=0.416667,0;AO=14,4;DP=32;FAO=15,0;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=8,0;FSAR=7,0;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.00983651,-0.230082;FXX=0.0270197;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=223.46,13.8967;QD=11.033;RBI=0.0138724,0.280826;REFB=-0.0370312,0.00249594;REVB=-0.00978192,-0.161013;RO=10;SAF=7,1;SAR=7,3;SRF=8;SRR=2;SSEN=0.324176,0.324176;SSEP=0,0;SSSB=-0.222321,-0.539296;STB=0.550496,0.5;STBP=0.627,1;TYPE=del,del;VARB=0.0429367,0;OID=.,.;OPOS=183863085,183863082;OREF=AG,A;OALT=-,-;OMAPALT=TAAA,TAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.416667,0:14,4:32:15,0:36:21:8,0:7,0:13:8:99:10:7,1:7,3:8:2
chr3	183900680	.	G	C	194.91	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00298205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2031;QD=17.3249;RBI=0.0976745;REFB=-0.00330783;REVB=0.097629;RO=24;SAF=7;SAR=13;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299605;STB=0.679563;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00933985;OID=.;OPOS=183900680;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:25:20:20:0.444444:13:7:16:8:13:7:17:8
chr3	183900729	.	T	C	121.57	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0193063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.036;QD=15.1968;RBI=0.0194983;REFB=-0.00523511;REVB=-0.00272972;RO=18;SAF=4;SAR=10;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323285;STB=0.687798;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00646282;OID=.;OPOS=183900729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:10:4:11:7:10:4:11:7
chr3	183906578	.	C	T	117.28	PASS	AF=0.590909;AO=12;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0266542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.352;QD=21.3238;RBI=0.0508213;REFB=0.0133467;REVB=-0.0432707;RO=9;SAF=9;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404344;STB=0.692011;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=-0.00873398;OID=.;OPOS=183906578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:12:13:0.590909:3:9:2:7:4:9:2:7
chr3	183907032	.	G	C	624.81	PASS	AF=0.419753;AO=68;DP=170;FAO=68;FDP=162;FR=.;FRO=94;FSAF=44;FSAR=24;FSRF=41;FSRR=53;FWDB=-0.00924605;FXX=0.0742815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.135;QD=15.4273;RBI=0.0093785;REFB=-0.0043633;REVB=0.00157062;RO=77;SAF=44;SAR=24;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189022;STB=0.624134;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00904072;OID=.;OPOS=183907032;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:162:77:94:68:68:0.419753:24:44:35:42:24:44:41:53
chr3	183975365	.	C	T	456.34	PASS	AF=0.916667;AO=33;DP=36;FAO=33;FDP=36;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0320598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.704;QD=50.7043;RBI=0.0551547;REFB=-0.169093;REVB=0.04488;RO=3;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10338;STB=0.555521;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00437325;OID=.;OPOS=183975365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:36:36:3:3:33:33:0.916667:12:21:0:3:12:21:0:3
chr3	183976103	.	C	T	393.09	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0201974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.183;QD=19.6543;RBI=0.0238215;REFB=-0.0180023;REVB=-0.0126303;RO=40;SAF=26;SAR=14;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485829;STB=0.527013;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0241418;OID=.;OPOS=183976103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:40:40:40:40:0.5:14:26:24:16:14:26:24:16
chr3	183996068	.	C	T	1525.68	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00233119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.27;QD=59.8307;RBI=0.0285361;REFB=0;REVB=0.0284408;RO=0;SAF=50;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.98913e-05;OID=.;OPOS=183996068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:52:50:0:0:52:50:0:0
chr3	184020542	.	G	T	398.81	PASS	AF=0.471264;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0197894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.36;QD=18.3361;RBI=0.0462265;REFB=-0.0168634;REVB=0.0417764;RO=45;SAF=19;SAR=22;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0863478;STB=0.542276;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0201295;OID=.;OPOS=184020542;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:45:46:41:41:0.471264:22:19:25:20:22:19:25:21
chr3	184037533	.	A	G	593.8	PASS	AF=1;AO=29;DP=41;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100485;FXX=0.0714116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4371;QD=60.9022;RBI=0.0587996;REFB=0;REVB=0.0579346;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000726526;OID=.;OPOS=184037533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:41:39:0:0:29:39:1:18:11:0:0:22:17:0:0
chr3	184039666	.	A	G	435.83	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.026642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8199;QD=54.4783;RBI=0.0811023;REFB=0.0194799;REVB=0.0766015;RO=1;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239259;STB=0.512812;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=3.28968e-05;OID=.;OPOS=184039666;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:19:12:0:1:19:12:0:1
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chr3	184573555	.	C	T	217.62	PASS	AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00450161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.343;QD=22.9072;RBI=0.026822;REFB=0.00233835;REVB=-0.0264416;RO=16;SAF=11;SAR=10;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162899;STB=0.575989;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.00205474;OID=.;OPOS=184573555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:17:21:21:0.552632:10:11:5:11:10:11:6:11
chr3	184633247	.	A	C	145.46	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00605327;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.717;QD=16.1623;RBI=0.0244645;REFB=-0.0236015;REVB=0.0237038;RO=20;SAF=4;SAR=12;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222029;STB=0.628859;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0446724;OID=.;OPOS=184633247;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:12:4:9:11:12:4:9:11
chr3	184647413	.	T	A,C	961.05	PASS	AF=0.0606061,0.939394;AO=4,62;DP=66;FAO=4,62;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=2,34;FSAR=2,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102662,0.00614554;FXX=0.0294074;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=175.003,224.523;QD=58.2453;RBI=0.0252682,0.00628848;REFB=0,0;REVB=-0.0230887,-0.00133318;RO=0;SAF=2,34;SAR=2,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0130097,0.000240016;OID=.,.;OPOS=184647413,184647413;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:66:66:0:0:4,62:4,62:0.0606061,0.939394:2,28:2,34:0:0:2,28:2,34:0:0
chr3	184700356	.	A	C	206.71	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00777809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.793;QD=48.6367;RBI=0.0647493;REFB=0;REVB=0.0642805;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255849;OID=.;OPOS=184700356;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:6:10:0:0:7:10:0:0
chr3	184700426	.	C	T	138.58	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.109475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0204;QD=19.7964;RBI=0.109729;REFB=-0.0338002;REVB=-0.00745006;RO=13;SAF=3;SAR=12;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268385;STB=0.654316;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0337658;OID=.;OPOS=184700426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:12:3:6:7:12:3:6:7
chr3	184795895	.	A	G	117.95	PASS	AF=0.35;AO=13;DP=41;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=22;FWDB=0.0399184;FXX=0.0243843;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.445;QD=11.7951;RBI=0.0402749;REFB=-0.00958441;REVB=0.00534719;RO=26;SAF=3;SAR=10;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133036;STB=0.562418;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0181962;OID=.;OPOS=184795895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:26:26:13:14:0.35:10:3:4:22:11:3:4:22
chr3	184798067	.	T	C	791.85	PASS	AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0143806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.443;QD=53.6845;RBI=0.0665258;REFB=-0.0287206;REVB=0.0649529;RO=2;SAF=38;SAR=19;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024177;STB=0.512816;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.000952158;OID=.;OPOS=184798067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:59:59:2:2:57:57:0.966102:19:38:2:0:19:38:2:0
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chr3	185046975	.	T	C	1419.88	PASS	AF=0.970297;AO=97;DP=100;FAO=98;FDP=101;FR=.;FRO=3;FSAF=60;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0265084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.486;QD=56.2328;RBI=0.0306875;REFB=-0.206896;REVB=0.0154604;RO=0;SAF=59;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.66457e-08;STB=0.518983;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.000744491;OID=.;OPOS=185046975;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:100:101:0:3:97:98:0.970297:38:59:0:0:38:60:0:3
chr3	185146702	.	C	T	474.92	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0880345;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3299;QD=57.566;RBI=0.0920848;REFB=0;REVB=0.0270102;RO=0;SAF=7;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00537537;OID=.;OPOS=185146702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:30:33:1:23:7:0:0:23:10:0:0
chr3	185300589	.	T	C	455.34	PASS	AF=0.55;AO=44;DP=80;FAO=44;FDP=80;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0265281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.707;QD=22.7669;RBI=0.0284904;REFB=-0.0250172;REVB=0.0103906;RO=36;SAF=18;SAR=26;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029696;STB=0.516348;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.022073;OID=.;OPOS=185300589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:36:36:44:44:0.55:26:18:16:20:26:18:16:20
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chr3	185348402	.	C	T	389.31	PASS	AF=0.427083;AO=41;DP=96;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.0766121;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.2695;QD=16.2213;RBI=0.0816673;REFB=-0.00575252;REVB=-0.0282865;RO=53;SAF=14;SAR=27;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229544;STB=0.639478;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0071257;OID=.;OPOS=185348402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:53:55:41:41:0.427083:27:14:30:23:27:14:32:23
chr3	185765391	.	A	C	201.67	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0439252;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=191.47;QD=21.2281;RBI=0.0449187;REFB=-0.0122577;REVB=0.00939467;RO=17;SAF=10;SAR=10;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0722218;STB=0.52629;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.00816718;OID=.;OPOS=185765391;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:17:18:20:20:0.526316:10:10:7:10:10:10:8:10
chr3	185866733	.	T	C	248.02	PASS	AF=0.262774;AO=36;DP=136;FAO=36;FDP=137;FR=.;FRO=101;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=60;FWDB=0.0266554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.489;QD=7.24145;RBI=0.027107;REFB=-0.0127516;REVB=-0.00492753;RO=99;SAF=13;SAR=23;SRF=41;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688404;STB=0.535094;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0362103;OID=.;OPOS=185866733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:137:99:101:36:36:0.262774:23:13:41:58:23:13:41:60
chr3	185867550	.	G	C	272.95	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0334171;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.893;QD=45.4923;RBI=0.0334568;REFB=-0.0844733;REVB=0.00162852;RO=2;SAF=2;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440443;STB=0.523789;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00354927;OID=.;OPOS=185867550;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:2:2:22:22:0.916667:20:2:0:2:20:2:0:2
chr3	186006566	.	T	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.065;QD=56.9383;RBI=0.0651587;REFB=0;REVB=-0.0639338;RO=0;SAF=46;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.737e-05;OID=.;OPOS=186006566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:7:46:0:0:7:46:0:0
chr3	186006618	.	G	C	328.03	PASS	AF=0.636364;AO=21;DP=45;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0273403;FXX=0.0222173;HRUN=6;LEN=1;MLLD=177.367;QD=29.8204;RBI=0.0353294;REFB=-0.035642;REVB=-0.0223757;RO=11;SAF=18;SAR=3;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411919;STB=0.715415;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.014694;OID=.;OPOS=186006618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:11:16:21:28:0.636364:3:18:4:7:4:24:7:9
chr3	186015283	.	A	G	774.22	PASS	AF=0.90625;AO=57;DP=63;FAO=58;FDP=64;FR=.;FRO=6;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0013913;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=272.051;QD=48.3886;RBI=0.00836817;REFB=-0.109557;REVB=0.0082517;RO=6;SAF=36;SAR=21;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723857;STB=0.538449;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.000610588;OID=.;OPOS=186015283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:63:64:6:6:57:58:0.90625:21:36:6:0:22:36:6:0
chr3	186337713	.	T	C	100.74	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.100756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.902;QD=16.1188;RBI=0.100881;REFB=-0.0265403;REVB=0.00501266;RO=13;SAF=9;SAR=3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218591;STB=0.627678;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0326367;OID=.;OPOS=186337713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:3:9:7:6:3:9:7:6
chr3	186338382	.	G	C	169.15	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0378095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.936;QD=12.0819;RBI=0.039472;REFB=0.000608988;REVB=0.0113351;RO=35;SAF=15;SAR=6;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231971;STB=0.635224;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.00180753;OID=.;OPOS=186338382;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:6:15:18:17:6:15:18:17
chr3	186338425	.	A	C	230.12	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0118949;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.697;QD=16.1485;RBI=0.0137417;REFB=-0.00733645;REVB=-0.00688087;RO=32;SAF=14;SAR=12;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981795;STB=0.564467;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00969768;OID=.;OPOS=186338425;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:57:32:31:26:26:0.45614:12:14:14:18:12:14:13:18
chr3	186370333	.	G	T	213.49	PASS	AF=0.440678;AO=24;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0526792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5826;QD=14.4738;RBI=0.0654447;REFB=-0.00705387;REVB=-0.0388318;RO=33;SAF=15;SAR=9;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457654;STB=0.507953;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.00756124;OID=.;OPOS=186370333;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:33:33:24:26:0.440678:9:15:22:11:9:17:22:11
chr3	186395180	.	T	C	327.82	PASS	AF=1;AO=20;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.6773;QD=50.4343;RBI=0.119024;REFB=0;REVB=0.0536099;RO=0;SAF=18;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0108466;OID=.;OPOS=186395180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:20:26:1:2:18:0:0:3:23:0:0
chr3	186395436	.	C	T	170.6	PASS	AF=0.62963;AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00129623;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=144.342;QD=25.2743;RBI=0.0106238;REFB=0.00407554;REVB=0.0105444;RO=9;SAF=9;SAR=8;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121332;STB=0.584318;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=-0.00218523;OID=.;OPOS=186395436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:27:27:9:10:17:17:0.62963:8:9:3:6:8:9:3:7
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chr3	186435370	.	G	A	453.05	PASS	AF=0.475248;AO=48;DP=102;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=-0.0102701;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.393;QD=17.9427;RBI=0.0117465;REFB=-0.0181305;REVB=-0.00570135;RO=51;SAF=25;SAR=23;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136769;STB=0.58382;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0205129;OID=.;OPOS=186435370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:51:53:48:48:0.475248:23:25:34:17:23:25:36:17
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chr3	186459927	.	T	C	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0242583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9473;QD=18.2508;RBI=0.0375957;REFB=0.0194584;REVB=-0.0287224;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118644;STB=0.56748;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.0245625;OID=.;OPOS=186459927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:7:8:10:5:7:8:10:5
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chr3	186504148	.	T	C	420.08	PASS	AF=0.34965;AO=47;DP=141;FAO=50;FDP=143;FR=.;FRO=93;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=49;FSRR=44;FWDB=0.0135387;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.747;QD=11.7504;RBI=0.0616694;REFB=-0.000106342;REVB=-0.0601649;RO=90;SAF=30;SAR=17;SRF=47;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136997;STB=0.590805;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00010891;OID=.;OPOS=186504148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:143:90:93:47:50:0.34965:17:30:47:43:17:33:49:44
chr3	186504369	.	C	CA	46.49	PASS	AF=0.166667;AO=20;DP=91;FAO=15;FDP=90;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.00638692;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=57.2184;QD=2.0662;RBI=0.060565;REFB=-0.00929468;REVB=-0.0602273;RO=70;SAF=17;SAR=3;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505811;STB=0.838224;STBP=0.01;TYPE=ins;VARB=0.163684;OID=.;OPOS=186504370;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.166667:20:91:15:90:75:13:2:37:38:46:70:17:3:33:37
chr3	186509517	.	G	A	275.22	PASS	AF=0.449275;AO=30;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0245845;FXX=0.0416609;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.073;QD=15.9546;RBI=0.02459;REFB=-0.0176432;REVB=0.000518703;RO=34;SAF=16;SAR=14;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806824;STB=0.561566;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0152924;OID=.;OPOS=186509517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:34:38:30:31:0.449275:14:16:21:13:14:17:25:13
chr3	186570892	.	T	G	360.8	PASS	AF=0.493506;AO=37;DP=76;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.0240594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.413;QD=18.7428;RBI=0.0241521;REFB=-0.0293561;REVB=-0.00211399;RO=39;SAF=28;SAR=9;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766989;STB=0.547144;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0309177;OID=.;OPOS=186570892;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:39:39:37:38:0.493506:9:28:27:12:9:29:27:12
chr3	186760725	.	CG	C,TG	205.46	PASS	AF=0.444444,0.555556;AO=3,10;DP=18;FAO=8,10;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0;FSAR=0,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.444842,0.0562213;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=22.7808,101.524;QD=45.6577;RBI=0.477075,0.0980437;REFB=0,0;REVB=0.172382,0.0803227;RO=5;SAF=3,0;SAR=0,10;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.294643,0;SSSB=0,-0.840897;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0642641,0.000830556;OID=.,.;OPOS=186760726,186760725;OREF=G,C;OALT=-,T;OMAPALT=C,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:58:18:18:5:0:3,10:8,10:0.444444,0.555556:0,10:3,0:5:0:0,10:8,0:0:0
chr3	186917751	.	C	G	422.95	PASS	AF=0.577465;AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.014905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2825;QD=23.8281;RBI=0.0185216;REFB=-0.0447839;REVB=-0.0109951;RO=30;SAF=17;SAR=24;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923779;STB=0.55074;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0295894;OID=.;OPOS=186917751;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:30:30:41:41:0.577465:24:17:16:14:24:17:16:14
chr3	186937466	.	C	T	335.29	PASS	AF=0.372727;AO=41;DP=110;FAO=41;FDP=110;FR=.;FRO=69;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=-0.0659554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9162;QD=12.1924;RBI=0.0725819;REFB=-0.015445;REVB=-0.0302988;RO=69;SAF=21;SAR=20;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00543985;STB=0.503104;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0342623;OID=.;OPOS=186937466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:69:69:41:41:0.372727:20:21:35:34:20:21:35:34
chr3	186937568	.	A	G	742.75	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00423099;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.401;QD=56.0564;RBI=0.0157386;REFB=-0.0815321;REVB=0.0151592;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255799;OID=.;OPOS=186937568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:53:53:0:0:53:53:1:22:31:0:0:22:31:0:0
chr3	186953808	.	C	T	273.46	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=59;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00284475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.836;QD=18.2306;RBI=0.00538504;REFB=0.00568972;REVB=-0.00457232;RO=30;SAF=19;SAR=10;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117102;STB=0.55229;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=-0.00516105;OID=.;OPOS=186953808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:30:30:29:30:0.5:10:19:16:14:11:19:16:14
chr3	186954285	.	A	G	744.05	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0561;QD=63.3237;RBI=0.0818119;REFB=0;REVB=0.0773839;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000398091;OID=.;OPOS=186954285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:25:21:0:0:26:21:0:0
chr3	187088812	.	C	T	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.703;QD=57.2375;RBI=0.0416184;REFB=0;REVB=0.00695086;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116794;OID=.;OPOS=187088812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:30:26:0:0:30:26:0:0
chr3	187088903	.	C	A	465.1	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3006;QD=58.1376;RBI=0.0279219;REFB=0;REVB=-0.0191746;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00071228;OID=.;OPOS=187088903;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:22:10:0:0:22:10:0:0
chr3	187088926	.	G	A	487.17	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00365311;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.079;QD=59.0509;RBI=0.0223004;REFB=0;REVB=0.0219992;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000327589;OID=.;OPOS=187088926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:22:11:0:0:22:11:0:0
chr3	187089031	.	C	A	777.57	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021366;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.807;QD=57.5976;RBI=0.038312;REFB=0;REVB=0.031801;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000370075;OID=.;OPOS=187089031;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0
chr3	187416634	.	C	A	1239.29	PASS	AF=0.97619;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0534127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4471;QD=59.0139;RBI=0.0541207;REFB=-0.145335;REVB=-0.00872576;RO=1;SAF=51;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00919621;STB=0.509613;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00426457;OID=.;OPOS=187416634;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:84:84:1:2:82:82:0.97619:31:51:1:0:31:51:2:0
chr3	187416719	.	T	C	972.7	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00294365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.503;QD=58.9513;RBI=0.00909657;REFB=0;REVB=-0.00860712;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.58093e-06;OID=.;OPOS=187416719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:34:31:0:0:34:32:0:0
chr3	187447032	.	G	A	722.69	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0270055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.818;QD=58.9953;RBI=0.0302336;REFB=-0.0304879;REVB=0.0135933;RO=0;SAF=38;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512815;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.000291706;OID=.;OPOS=187447032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:49:0:2:47:47:0.959184:9:38:0:0:9:38:2:0
chr3	187897059	.	G	A,C	1294.43	PASS	AF=0.837209,0.162791;AO=72,14;DP=87;FAO=72,14;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=23,14;FSAR=49,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409206,-0.0102882;FXX=0.0114929;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=53.883,181.616;QD=60.2059;RBI=0.041906,0.0279273;REFB=0,0;REVB=0.00903445,-0.0259632;RO=0;SAF=23,14;SAR=49,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00122903,0.0257547;OID=.,.;OPOS=187897059,187897059;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:74:87:86:0:0:72,14:72,14:0.837209,0.162791:49,0:23,14:0:0:49,0:23,14:0:0
chr3	187897283	.	G	A	137.98	PASS	AF=0.736842;AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0218567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.708;QD=29.0494;RBI=0.0802862;REFB=0.0047071;REVB=0.0772538;RO=4;SAF=5;SAR=9;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608722;STB=0.512178;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=-0.000713116;OID=.;OPOS=187897283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:19:19:4:5:14:14:0.736842:9:5:2:2:9:5:2:3
chr3	187897424	.	A	C	148.11	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0781113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.339;QD=17.953;RBI=0.0788354;REFB=-0.00506405;REVB=-0.0106607;RO=16;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054861;STB=0.545398;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0037188;OID=.;OPOS=187897424;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:16:17:16:16:0.484848:8:8:9:7:8:8:10:7
chr3	187897614	.	C	G	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.297;QD=58.1416;RBI=0.0120269;REFB=0;REVB=-0.00568291;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.5971e-05;OID=.;OPOS=187897614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr3	187897954	.	T	A	1685.01	PASS	AF=0.915385;AO=121;DP=130;FAO=119;FDP=130;FR=.;FRO=11;FSAF=67;FSAR=52;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.101991;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.935;QD=51.8465;RBI=0.113104;REFB=-0.158878;REVB=0.0488902;RO=4;SAF=69;SAR=52;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111572;STB=0.522057;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0154368;OID=.;OPOS=187897954;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:130:130:4:11:121:119:0.915385:52:69:3:1:52:67:9:2
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chr3	187898593	.	G	A	95.99	PASS	AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0148515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0018;QD=22.5852;RBI=0.018718;REFB=-0.00425578;REVB=-0.0113928;RO=6;SAF=8;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461225;STB=0.526267;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.00411664;OID=.;OPOS=187898593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:3:8:4:2:3:8:4:2
chr3	188327461	.	C	T	145.39	PASS	AF=0.256098;AO=21;DP=81;FAO=21;FDP=82;FR=.;FRO=61;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0123222;FXX=0.0120467;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.995;QD=7.09197;RBI=0.0155761;REFB=-0.004927;REVB=-0.00952779;RO=60;SAF=6;SAR=15;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254212;STB=0.661605;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0130836;OID=.;OPOS=188327461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:60:61:21:21:0.256098:15:6:29:31:15:6:30:31
chr3	188464248	.	G	GT	371.61	PASS	AF=0.535088;AO=55;DP=113;FAO=61;FDP=114;FR=.;FRO=53;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=14;FWDB=-0.0928395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=16.9722;QD=13.0391;RBI=0.127324;REFB=0.0262591;REVB=-0.0871335;RO=52;SAF=32;SAR=23;SRF=40;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176121;STB=0.549984;STBP=0.34;TYPE=ins;VARB=-0.0346645;OID=.;OPOS=188464249;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.535088:55:113:61:114:53:39:22:39:14:99:52:32:23:40:12
chr3	188590446	.	A	G	616.24	PASS	AF=0.397727;AO=71;DP=175;FAO=70;FDP=176;FR=.;FRO=106;FSAF=53;FSAR=17;FSRF=75;FSRR=31;FWDB=-0.0197244;FXX=0.0056494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.307;QD=14.0055;RBI=0.0241601;REFB=-0.0176514;REVB=-0.013952;RO=103;SAF=54;SAR=17;SRF=72;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084259;STB=0.538972;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0280372;OID=.;OPOS=188590446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:176:103:106:71:70:0.397727:17:54:72:31:17:53:75:31
chr3	189033292	.	C	G	468.59	PASS	AF=0.433333;AO=52;DP=120;FAO=52;FDP=120;FR=.;FRO=68;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=0.0271893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.398;QD=15.6196;RBI=0.034852;REFB=-0.0352396;REVB=-0.0218038;RO=68;SAF=30;SAR=22;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186838;STB=0.510467;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0512664;OID=.;OPOS=189033292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:68:68:52:52:0.433333:22:30:38:30:22:30:38:30
chr3	189614076	.	ATTTTTTTTTTC	ATTTTTTTTTCT,TATTTTTTTTTC	97.01	PASS	AF=0,0.416667;AO=2,8;DP=34;FAO=0,15;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=0,5;FSAR=0,10;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.201068,0.0137873;FXX=0;HRUN=10,1;LEN=2,2;MLLD=15.9922,15.0678;QD=10.7789;RBI=0.230843,0.0277071;REFB=0.0142117,-0.0467808;REVB=-0.113403,0.0240331;RO=15;SAF=2,2;SAR=0,6;SRF=10;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.482498,-0.43557;STB=0.5,0.666444;STBP=1,0.108;TYPE=mnp,mnp;VARB=0,0.0657336;OID=.,.;OPOS=189614086,189614076;OREF=TC,AT;OALT=CT,TA;OMAPALT=ATTTTTTTTTCT,TATTTTTTTTTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:92:34:36:15:21:2,8:0,15:0,0.416667:0,6:2,2:10:5:0,10:0,5:13:8
chr3	189615080	.	A	G	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0701829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.088;QD=11.091;RBI=0.0701972;REFB=-0.0286177;REVB=0.00141717;RO=6;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158244;STB=0.599562;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0784593;OID=.;OPOS=189615080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:4:1:2:4:4:1:2:4
chr3	189713205	.	T	C	594.79	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7389;QD=61.0042;RBI=0.035401;REFB=0;REVB=0.00904776;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000279433;OID=.;OPOS=189713205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:37:39:1:24:13:0:0:25:14:0:0
chr3	190023552	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.66;QD=42.1826;RBI=0.0521114;REFB=0;REVB=0.0417527;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022004;OID=.;OPOS=190023552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr3	190024457	.	A	G	920.07	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.65;QD=58.4171;RBI=0.0296081;REFB=0;REVB=0.0210572;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.21595e-05;OID=.;OPOS=190024457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0
chr3	190030680	.	A	G	315.11	PASS	AF=0.393258;AO=35;DP=90;FAO=35;FDP=89;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.00126727;FXX=0.0430061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.378;QD=14.1623;RBI=0.031558;REFB=-0.0095437;REVB=0.0315326;RO=46;SAF=16;SAR=19;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130124;STB=0.581587;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0189424;OID=.;OPOS=190030680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:46:54:35:35:0.393258:19:16:27:19:19:16:32:22
chr3	190333162	.	TG	T,TT	1270.22	PASS	AF=1,0;AO=66,18;DP=85;FAO=85,0;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=52,0;FSAR=33,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00135285,-0.00227198;FXX=0.0116266;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=337.931,323.945;QD=59.7749;RBI=0.00774177,0.00779534;REFB=0,0;REVB=-0.00762265,-0.00745691;RO=1;SAF=41,11;SAR=25,7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0185226,0.0611153;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000242352,0;OID=.,.;OPOS=190333163,190333163;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:66,18:85:85,0:85:0:52,0:33,0:0:0:7:1:41,11:25,7:0:1
chr3	190345193	.	GA	G	103.91	PASS	AF=0.571429;AO=22;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0916101;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.95309;QD=7.42201;RBI=0.299095;REFB=-0.0969239;REVB=0.28472;RO=27;SAF=12;SAR=10;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262375;STB=0.548967;STBP=0.446;TYPE=del;VARB=0.115453;OID=.;OPOS=190345194;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.571429:22:56:32:56:24:15:17:14:10:80:27:12:10:14:13
chr3	190578566	.	A	G	361.3	PASS	AF=0.433333;AO=38;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.000467477;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.357;QD=16.0576;RBI=0.0181158;REFB=-0.0109858;REVB=0.0181097;RO=50;SAF=21;SAR=17;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734231;STB=0.527383;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0133757;OID=.;OPOS=190578566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:50:51:38:39:0.433333:17:21:24:26:18:21:25:26
chr3	190999917	.	C	A	195.47	PASS	AF=0.393443;AO=21;DP=58;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00671859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2259;QD=12.8177;RBI=0.099086;REFB=-0.0425902;REVB=-0.098858;RO=37;SAF=18;SAR=3;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.436099;STB=0.77321;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0255519;OID=.;OPOS=190999917;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:61:37:37:21:24:0.393443:3:18:20:17:3:21:20:17
chr3	191047532	.	A	G	2179.47	PASS	AF=1;AO=135;DP=135;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.648;QD=63.173;RBI=0.0770438;REFB=0;REVB=0.0671953;RO=0;SAF=62;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.651e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.23741e-05;OID=.;OPOS=191047532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:135:138:0:0:135:138:1:73:62:0:0:76:62:0:0
chr3	191074873	.	C	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00696401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.089;QD=60.9786;RBI=0.0124994;REFB=0;REVB=0.0103796;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91155e-05;OID=.;OPOS=191074873;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr3	191093053	.	T	C	280.67	PASS	AF=0.625;AO=24;DP=39;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0011328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.632;QD=28.0666;RBI=0.00409213;REFB=-0.0256245;REVB=0.00393221;RO=15;SAF=14;SAR=10;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119436;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00904252;OID=.;OPOS=191093053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:15:15:24:25:0.625:10:14:9:6:10:15:9:6
chr3	191093080	.	A	G	213.9	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0307149;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.903;QD=25.9267;RBI=0.0321034;REFB=-0.00926352;REVB=0.0093392;RO=12;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116779;STB=0.524975;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00777297;OID=.;OPOS=191093080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:12:13:20:20:0.606061:8:12:7:5:8:12:7:6
chr3	191093175	.	T	A	174.88	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0449893;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.0456;QD=18.9063;RBI=0.0467765;REFB=-0.00957688;REVB=-0.0128061;RO=20;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104911;STB=0.571785;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0251919;OID=.;OPOS=191093175;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:20:19:18:18:0.486486:7:11:10:10:7:11:9:10
chr3	191093310	.	A	G	146.05	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0298298;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.158;QD=22.4695;RBI=0.0638083;REFB=-0.0465128;REVB=-0.0564064;RO=6;SAF=10;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555479;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0272232;OID=.;OPOS=191093310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:6:11:15:15:0.576923:5:10:4:2:5:10:6:5
chr3	191097966	.	T	C	789.57	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00752766;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.79;QD=57.4233;RBI=0.0512795;REFB=0;REVB=0.050724;RO=0;SAF=38;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000383319;OID=.;OPOS=191097966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:17:38:0:0:17:38:0:0
chr3	191100561	.	C	A	803.23	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00867008;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8679;QD=57.3734;RBI=0.00983046;REFB=0;REVB=0.00463331;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.28979e-05;OID=.;OPOS=191100561;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:21:35:0:0:21:35:0:0
chr3	191179193	.	A	G	239.22	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0229316;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.694;QD=20.8016;RBI=0.0230027;REFB=0.0077638;REVB=0.00180676;RO=23;SAF=16;SAR=7;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168116;STB=0.594955;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=-0.0109771;OID=.;OPOS=191179193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:7:16:12:11:7:16:12:11
chr3	191810914	.	TA	CG	186.2	PASS	AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=-0.00474413;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=180.57;QD=12.4136;RBI=0.0066002;REFB=-0.000356318;REVB=-0.00458867;RO=37;SAF=17;SAR=6;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489731;STB=0.528311;STBP=0.774;TYPE=mnp;VARB=0.000330106;OID=.;OPOS=191810914;OREF=TA;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:37:37:23:23:0.383333:6:17:26:11:6:17:26:11
chr3	192515557	.	G	A	728.98	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00745262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.783;QD=57.1752;RBI=0.0103657;REFB=0;REVB=-0.00720465;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.40895e-07;OID=.;OPOS=192515557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0
chr3	192994543	.	A	G	594.11	PASS	AF=0.521739;AO=60;DP=115;FAO=60;FDP=115;FR=.;FRO=55;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=17;FWDB=0.0419833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.082;QD=20.6646;RBI=0.0503093;REFB=-0.0197266;REVB=0.0277206;RO=55;SAF=39;SAR=21;SRF=38;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0396313;STB=0.521774;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0141535;OID=.;OPOS=192994543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:55:55:60:60:0.521739:21:39:38:17:21:39:38:17
chr3	193031926	.	C	T	556.45	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0532881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7285;QD=60.1562;RBI=0.0533768;REFB=0;REVB=0.0030766;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000640873;OID=.;OPOS=193031926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
chr3	193036794	.	G	C	441.31	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.859;QD=56.9428;RBI=0.0351324;REFB=0;REVB=0.0138274;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205704;OID=.;OPOS=193036794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:16:14:0:0:16:15:0:0
chr3	193042776	.	T	C	766.89	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0357074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.283;QD=56.8069;RBI=0.0391153;REFB=0;REVB=-0.0159682;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112703;OID=.;OPOS=193042776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0
chr3	193080344	.	C	T	1062.42	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000926591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.829;QD=59.8547;RBI=0.0137016;REFB=0;REVB=-0.0136702;RO=0;SAF=43;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.27426e-05;OID=.;OPOS=193080344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:27:43:0:0:28:43:0:0
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chr3	193096529	.	C	T	276.32	PASS	AF=0.442857;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0091993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.667;QD=15.7894;RBI=0.0324003;REFB=-0.0125231;REVB=-0.0310669;RO=39;SAF=23;SAR=8;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366558;STB=0.707554;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0190802;OID=.;OPOS=193096529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:39:39:31:31:0.442857:8:23:15:24:8:23:15:24
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chr3	194063300	.	T	C,G	1515.29	PASS	AF=0.948454,0.0515464;AO=92,5;DP=97;FAO=92,5;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=40,1;FSAR=52,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173522,-0.0232442;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=67.0538,201.032;QD=62.4862;RBI=0.0196723,0.0310876;REFB=0,0;REVB=0.00926827,-0.0206433;RO=0;SAF=40,1;SAR=52,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.0217e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00570057,0.0467632;OID=.,.;OPOS=194063300,194063300;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:97:97:0:0:92,5:92,5:0.948454,0.0515464:52,4:40,1:0:0:52,4:40,1:0:0
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chr3	194337901	.	T	C,G	1561.51	PASS	AF=0.954545,0.0272727;AO=103,4;DP=109;FAO=105,3;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=67,2;FSAR=38,1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0118021,-0.0160477;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=138.151,99.4197;QD=56.782;RBI=0.0162782,0.0189772;REFB=-0.0329582,-0.0287583;REVB=-0.0112112,-0.0101294;RO=2;SAF=65,3;SAR=38,1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00507821,0.161039;STB=0.50279,0.570936;STBP=0.749,0.906;TYPE=snp,snp;VARB=0.000655733,0.0381223;OID=.,.;OPOS=194337901,194337901;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:109:110:2:2:103,4:105,3:0.954545,0.0272727:38,1:65,3:1:1:38,1:67,2:1:1
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chr3	194353875	.	G	T	116.04	PASS	AF=1;AO=9;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.315;QD=42.196;RBI=0.197941;REFB=0;REVB=0.151656;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.018036;OID=.;OPOS=194353875;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:9:11:1:3:6:0:0:3:8:0:0
chr3	194373832	.	TG	CA	2117.52	PASS	AF=1;AO=134;DP=137;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385842;FXX=0.0145975;HRUN=2;LEN=2;MLLD=347.296;QD=62.7412;RBI=0.039411;REFB=0;REVB=0.00803065;RO=0;SAF=71;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=2.53506e-05;OID=.;OPOS=194373832;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:137:135:0:0:134:135:1:63:71:0:0:64:71:0:0
chr3	194387300	.	C	T	360.45	PASS	AF=1;AO=20;DP=28;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0934862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.383;QD=55.4544;RBI=0.097006;REFB=0;REVB=0.0258939;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137224;OID=.;OPOS=194387300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:26:0:0:20:26:1:9:11:0:0:8:18:0:0
chr3	194842876	.	CA	TG	146.29	PASS	AF=0.31746;AO=19;DP=63;FAO=20;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.00140528;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=251.657;QD=9.28798;RBI=0.00148892;REFB=-0.00558847;REVB=-0.000491998;RO=40;SAF=8;SAR=11;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175281;STB=0.573387;STBP=0.45;TYPE=mnp;VARB=0.0124155;OID=.;OPOS=194842876;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:40:43:19:20:0.31746:11:8:23:17:11:9:24:19
chr3	194842911	.	A	G	102.69	PASS	AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0168288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.079;QD=9.33569;RBI=0.018255;REFB=-0.00384241;REVB=0.00707349;RO=30;SAF=7;SAR=6;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443735;STB=0.515765;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.00486347;OID=.;OPOS=194842911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:30:31:13:13:0.295455:6:7:15:15:6:7:16:15
chr3	195076877	.	C	G	242.45	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=0.0103046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.331;QD=14.9203;RBI=0.0407393;REFB=-0.0273423;REVB=0.0394146;RO=37;SAF=15;SAR=13;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264259;STB=0.64855;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.020454;OID=.;OPOS=195076877;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:13:15:10:27:13:15:10:27
chr3	195133640	.	C	T	244.26	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0197946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.542;QD=23.2628;RBI=0.020184;REFB=-0.0384625;REVB=-0.00394554;RO=19;SAF=9;SAR=14;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194543;STB=0.608601;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0188543;OID=.;OPOS=195133640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:14:9:12:7:14:9:12:7
chr3	195242526	.	C	T	202.02	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.7;QD=47.5344;RBI=0.0597744;REFB=0;REVB=0.0291369;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000489733;OID=.;OPOS=195242526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:4:12:0:0:4:13:0:0
chr3	195345828	.	AG	GA	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281718;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=107.448;QD=57.6775;RBI=0.0314237;REFB=0;REVB=0.0139211;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000267698;OID=.;OPOS=195345828;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chr3	195345953	.	C	T	279.01	PASS	AF=0.851852;AO=23;DP=27;FAO=23;FDP=27;FR=.;FRO=4;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0681898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.728;QD=41.334;RBI=0.0760538;REFB=0.0563424;REVB=0.0336799;RO=4;SAF=12;SAR=11;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062558;STB=0.533951;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=-0.0035393;OID=.;OPOS=195345953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:27:27:4:4:23:23:0.851852:11:12:3:1:11:12:3:1
chr3	195346352	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2952;QD=33.4277;RBI=0.106908;REFB=0;REVB=0.0997599;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00766568;OID=.;OPOS=195346352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr3	195346476	.	A	AT	410.6	PASS	AF=0.790323;AO=7;DP=61;FAO=49;FDP=62;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.114414;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=16.3927;QD=26.4901;RBI=0.142408;REFB=-0.147736;REVB=0.084791;RO=54;SAF=2;SAR=5;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195649;STB=0.614011;STBP=0.001;TYPE=ins;VARB=0.0731999;OID=.;OPOS=195346477;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.790323:7:61:49:62:13:16:33:11:2:44:54:2:5:24:30
chr3	195346477	.	C	T	443.62	PASS	AF=0.666667;AO=41;DP=63;FAO=42;FDP=63;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.0364829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=40.5311;QD=28.1664;RBI=0.0509272;REFB=-0.0637048;REVB=0.0355327;RO=21;SAF=13;SAR=28;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199183;STB=0.625837;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0242482;OID=.;OPOS=195346477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:21:21:41:42:0.666667:28:13:13:8:29:13:14:7
chr3	195346861	.	T	C	62.85	PASS	AF=0.123894;AO=14;DP=113;FAO=14;FDP=113;FR=.;FRO=99;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=-0.0476474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.54;QD=2.22478;RBI=0.051589;REFB=-0.00183208;REVB=0.0197774;RO=96;SAF=5;SAR=9;SRF=38;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506578;STB=0.55266;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0179596;OID=.;OPOS=195346861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:113:113:96:99:14:14:0.123894:9:5:38:58:9:5:41:58
chr3	195391083	.	C	G	900.87	PASS	AF=0.955224;AO=62;DP=65;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0723263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5894;QD=53.7835;RBI=0.0723719;REFB=-0.0530086;REVB=-0.00256887;RO=3;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533446;STB=0.528293;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00360455;OID=.;OPOS=195391083;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:65:67:3:3:62:64:0.955224:25:37:0:3:25:39:0:3
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chr3	195400848	.	G	A	49.55	PASS	AF=0.173913;AO=7;DP=45;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.00711356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.093;QD=4.30893;RBI=0.027528;REFB=-0.00161762;REVB=0.026593;RO=38;SAF=5;SAR=2;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399392;STB=0.795236;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00972451;OID=.;OPOS=195400848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:45:46:38:38:7:8:0.173913:2:5:14:24:2:6:14:24
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chr3	195451880	.	AG	GA	199.56	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384382;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=93.5916;QD=46.9546;RBI=0.0387553;REFB=0;REVB=0.00494769;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00164214;OID=.;OPOS=195451880;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:9:7:0:0:10:7:0:0
chr3	195452770	.	G	A	193.2	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.00583961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.877;QD=16.4424;RBI=0.0448525;REFB=-0.0215605;REVB=-0.0444707;RO=27;SAF=7;SAR=13;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222387;STB=0.512748;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0291176;OID=.;OPOS=195452770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:13:7:10:17:13:7:10:17
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chr3	195452951	.	G	C	933.29	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9764;QD=58.3309;RBI=0.0856593;REFB=0;REVB=-0.0842859;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000861277;OID=.;OPOS=195452951;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:30:34:0:0:30:34:0:0
chr3	195452987	.	G	A	197.58	PASS	AF=0.352113;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0598476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7611;QD=11.1313;RBI=0.0621189;REFB=-0.027657;REVB=-0.0166441;RO=43;SAF=15;SAR=10;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728691;STB=0.551682;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0591305;OID=.;OPOS=195452987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:43:46:25:25:0.352113:10:15:23:20:10:15:24:22
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chr3	195453064	.	T	G	1399.39	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0115777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9596;QD=61.5118;RBI=0.0349743;REFB=-0.0250917;REVB=-0.0330024;RO=1;SAF=50;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00938573;STB=0.504949;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00249905;OID=.;OPOS=195453064;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:40:50:1:0:40:50:1:0
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chr3	195453257	.	G	A	298.77	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0249075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.259;QD=18.6734;RBI=0.0335271;REFB=-0.0326308;REVB=0.0224429;RO=32;SAF=11;SAR=21;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146802;STB=0.582083;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.031539;OID=.;OPOS=195453257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:21:11:16:16:21:11:16:16
chr3	195456561	.	C	G	191.08	PASS	AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.00361899;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=204.475;QD=13.4089;RBI=0.0053721;REFB=-0.0064579;REVB=0.00397019;RO=31;SAF=15;SAR=8;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0077502;STB=0.540947;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00620784;OID=.;OPOS=195456561;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:34:23:23:0.403509:8:15:20:11:8:15:20:14
chr3	195477791	.	G	A	2172.3	PASS	AF=1;AO=119;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=80;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.629;QD=63.4249;RBI=0.0545626;REFB=0;REVB=0.0413052;RO=0;SAF=73;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152553;OID=.;OPOS=195477791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:137:137:0:0:119:137:1:46:73:0:0:57:80:0:0
chr3	195479256	.	T	C	1044.39	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0284571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7897;QD=59.6795;RBI=0.120702;REFB=0;REVB=0.1173;RO=1;SAF=37;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126057;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000751182;OID=.;OPOS=195479256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:1:0:69:70:1:32:37:1:0:32:38:0:0
chr3	195489009	.	C	A	3049.9	PASS	AF=1;AO=191;DP=192;FAO=192;FDP=192;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159193;FXX=0.00518108;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.959;QD=63.5396;RBI=0.0409039;REFB=0;REVB=0.037679;RO=0;SAF=103;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.66746e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.0752e-05;OID=.;OPOS=195489009;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:192:192:0:0:191:192:1:88:103:0:0:88:104:0:0
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chr3	195495916	.	G	C	976.11	PASS	AF=0.75;AO=80;DP=105;FAO=81;FDP=108;FR=.;FRO=27;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=23;FSRR=4;FWDB=0.0407617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.736;QD=36.152;RBI=0.0419204;REFB=-0.0599477;REVB=0.0097879;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.578781;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00376207;OID=.;OPOS=195495916;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:108:0:27:80:81:0.75:37:43:0:0:37:44:23:4
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chr3	195497743	.	T	C	754.37	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.749;QD=56.9333;RBI=0.0643998;REFB=0;REVB=-0.0617878;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.38212e-05;OID=.;OPOS=195497743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0
chr3	195501149	.	C	T	876.43	PASS	AF=0.891892;AO=58;DP=67;FAO=66;FDP=74;FR=.;FRO=8;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.193735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.441;QD=47.3745;RBI=0.193737;REFB=-0.104855;REVB=-0.000822986;RO=8;SAF=20;SAR=38;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240754;STB=0.519387;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0131672;OID=.;OPOS=195501149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:67:74:8:8:58:66:0.891892:38:20:2:6:38:28:2:6
chr3	195505664	.	G	A	805.14	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.682;QD=64.4115;RBI=0.0156097;REFB=0;REVB=0.00714158;RO=0;SAF=37;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.32377e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.14864e-05;OID=.;OPOS=195505664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:13:37:0:0:13:37:0:0
chr3	195505788	.	G	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.81;QD=42.1826;RBI=0.0873792;REFB=0;REVB=0.0861235;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137884;OID=.;OPOS=195505788;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0
chr3	195510827	.	C	T	57.08	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0325069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.788;QD=28.539;RBI=0.0359028;REFB=-0.0982442;REVB=0.015242;RO=1;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173072;STB=0.599698;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00382867;OID=.;OPOS=195510827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:5:2:1:0:5:2:1:0
chr3	195512343	.	G	A	52.92	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00848472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.329;QD=21.1692;RBI=0.0471502;REFB=-0.0116343;REVB=-0.0463805;RO=3;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2378;STB=0.636015;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0092617;OID=.;OPOS=195512343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:3:4:3:0:3:4:3:0
chr3	195512373	.	G	GGAT	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0118603;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=240.033;QD=9.7602;RBI=0.0168955;REFB=-0.0275383;REVB=-0.0120329;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351603;STB=0.69515;STBP=0.283;TYPE=ins;VARB=0.0351904;OID=.;OPOS=195512374;OREF=-;OALT=GAT;OMAPALT=GGAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.368421:7:20:7:19:12:3:4:9:3:46:13:3:4:10:3
chr3	195512405	.	G	T	53.7	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0239912;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.54;QD=7.95612;RBI=0.0383218;REFB=-0.0256612;REVB=-0.0298829;RO=18;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0618928;STB=0.518472;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.057516;OID=.;OPOS=195512405;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:18:19:8:8:0.296296:4:4:8:10:4:4:9:10
chr3	195513426	.	G	T	34.82	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0284304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.726;QD=23.2114;RBI=0.0463856;REFB=-0.0385414;REVB=-0.0366516;RO=1;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277405;STB=0.66592;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00754885;OID=.;OPOS=195513426;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:1:4:0:1:1:4:0:1
chr3	195515593	.	TC	T,TG	1235.45	PASS	AF=0.121951,0.878049;AO=10,68;DP=83;FAO=10,72;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=4,58;FSAR=6,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0333007,-0.0571362;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=104.104,116.905;QD=60.2659;RBI=0.0485864,0.0735178;REFB=0,0;REVB=0.0353794,0.0462636;RO=1;SAF=2,56;SAR=8,12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.176689,-0.00836737;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00558141,0.0129138;OID=.,.;OPOS=195515594,195515594;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.121951,0.878049:10,68:83:10,72:82:0:4,58:6,14:0:0:26:1:2,56:8,12:1:0
chr3	195515617	.	G	C	411.43	PASS	AF=0.488372;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=9;FWDB=0.0390697;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.91;QD=19.1363;RBI=0.116808;REFB=-0.0272687;REVB=0.110081;RO=43;SAF=26;SAR=16;SRF=34;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174655;STB=0.600202;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.03142;OID=.;OPOS=195515617;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:43:44:42:42:0.488372:16:26:34:9:16:26:35:9
chr3	195516087	.	G	T	486.02	PASS	AF=0.567901;AO=46;DP=81;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0190223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.671;QD=24.0009;RBI=0.0238136;REFB=-0.0187699;REVB=-0.0143261;RO=35;SAF=22;SAR=24;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956491;STB=0.55244;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0170742;OID=.;OPOS=195516087;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:35:35:46:46:0.567901:24:22:21:14:24:22:21:14
chr3	195516630	.	G	T	685.68	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0221803;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.904;QD=54.8545;RBI=0.0224797;REFB=-0.055169;REVB=0.00365654;RO=1;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165122;STB=0.508768;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00022386;OID=.;OPOS=195516630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:50:1:1:49:49:0.98:28:21:0:1:28:21:0:1
chr3	195516878	.	T	C	649.37	PASS	AF=1;AO=27;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.07209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.662;QD=60.4068;RBI=0.0996706;REFB=0;REVB=0.0688278;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0124526;OID=.;OPOS=195516878;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:27:43:1:11:16:0:0:21:22:0:0
chr3	195517258	.	G	A,T	1043.33	PASS	AF=0.972603,0.0136986;AO=68,3;DP=72;FAO=71,1;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=46,0;FSAR=25,1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000814866,-0.0651683;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=159.64,22.9579;QD=57.1689;RBI=0.00857692,0.0787754;REFB=-0.0906469,-0.012928;REVB=0.00853813,-0.0442567;RO=0;SAF=43,2;SAR=25,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.505375,0.989913;STBP=0.509,0.496;TYPE=snp,snp;VARB=0.000351952,0.124312;OID=.,.;OPOS=195517258,195517258;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:72:73:0:1:68,3:71,1:0.972603,0.0136986:25,1:43,2:0:0:25,1:46,0:1:0
chr3	195517321	.	G	A	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0061381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.916;QD=58.6003;RBI=0.0124315;REFB=0;REVB=0.0108105;RO=0;SAF=56;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.29057e-05;OID=.;OPOS=195517321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:8:56:0:0:8:56:0:0
chr3	195517553	.	A	C	505.92	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0236474;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.575;QD=56.2132;RBI=0.0638186;REFB=-0.240291;REVB=0.0592758;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.517231;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00329154;OID=.;OPOS=195517553;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:37:36:0:1:35:35:0.972222:14:21:0:0:14:21:0:1
chr3	195518112	.	T	A,TGTCTCCTGCGTAACA	107.59	PASS	AF=0.0434783,0.163043;AO=4,14;DP=92;FAO=4,15;FDP=92;FR=.;FRO=73;FSAF=4,3;FSAR=0,12;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=0.0116042,-0.0150904;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,15;MLLD=145.315,457.584;QD=4.67759;RBI=0.0148569,0.0158589;REFB=-0.00579891,-0.00379609;REVB=0.00927745,-0.0048769;RO=73;SAF=4,2;SAR=0,12;SRF=43;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.43204,-0.548742;STB=0.996964,0.813753;STBP=0.057,0.017;TYPE=snp,ins;VARB=0.000156323,0.0113507;OID=.,.;OPOS=195518112,195518113;OREF=T,-;OALT=A,GTCTCCTGCGTAACA;OMAPALT=A,TGTCTCCTGCGTAACA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:83:92:92:73:73:4,14:4,15:0.0434783,0.163043:0,12:4,2:43:30:0,12:4,3:43:30
chr3	195518330	.	C	G	95.77	PASS	AF=0.6875;AO=10;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0393023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.322;QD=23.9414;RBI=0.0394461;REFB=-0.00979417;REVB=-0.00336527;RO=5;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671499;STB=0.547855;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.00934292;OID=.;OPOS=195518330;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:16:16:5:5:10:11:0.6875:3:7:3:2:3:8:3:2
chr3	195594858	.	G	A	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00843189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.274;QD=12.3956;RBI=0.0744804;REFB=-0.0280606;REVB=0.0740016;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179553;STB=0.608297;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.101206;OID=.;OPOS=195594858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:4:1:2:3:4:1
chr3	195597245	.	G	C	480.67	PASS	AF=0.592105;AO=33;DP=75;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.00399467;FXX=0.0129853;HRUN=6;LEN=1;MLLD=179.768;QD=25.2985;RBI=0.0090396;REFB=-0.0209841;REVB=0.00810906;RO=22;SAF=10;SAR=23;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264144;STB=0.505432;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0126443;OID=.;OPOS=195597245;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:22:31:33:45:0.592105:23:10:6:16:31:14:10:21
chr3	195615376	.	A	G	168.11	PASS	AF=0.439024;AO=17;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0599868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.042;QD=16.4012;RBI=0.0613504;REFB=-0.00309041;REVB=0.0128629;RO=23;SAF=9;SAR=8;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0359294;STB=0.505488;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0040789;OID=.;OPOS=195615376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:17:18:0.439024:8:9:13:10:8:10:13:10
chr3	195647997	.	T	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.141256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.496;QD=35.5759;RBI=0.143018;REFB=0;REVB=-0.0223853;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0072355;OID=.;OPOS=195647997;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr3	195668478	.	A	G	562.33	PASS	AF=0.974359;AO=36;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0609701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2748;QD=57.6744;RBI=0.0638659;REFB=-0.0881672;REVB=0.0190133;RO=1;SAF=24;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191068;STB=0.509799;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00163508;OID=.;OPOS=195668478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:36:38:0.974359:12:24:1:0:13:25:1:0
chr3	195692347	.	G	A	90.8	PASS	AF=0.105932;AO=24;DP=235;FAO=25;FDP=236;FR=.;FRO=211;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=109;FSRR=102;FWDB=0.00362344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.525;QD=1.53891;RBI=0.00711374;REFB=-4.94539e-05;REVB=-0.00612177;RO=210;SAF=17;SAR=7;SRF=109;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235528;STB=0.649635;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.000360771;OID=.;OPOS=195692347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:235:236:210:211:24:25:0.105932:7:17:109:101:8:17:109:102
chr3	195701278	.	C	T	198.66	PASS	AF=0.201183;AO=34;DP=171;FAO=34;FDP=169;FR=.;FRO=135;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=79;FSRR=56;FWDB=0.0177191;FXX=0.0116952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.195;QD=4.70201;RBI=0.0179973;REFB=-0.000119972;REVB=0.0031519;RO=133;SAF=12;SAR=22;SRF=78;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293183;STB=0.681312;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.000518877;OID=.;OPOS=195701278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:171:169:133:135:34:34:0.201183:22:12:78:55:22:12:79:56
chr3	195701285	.	G	T	205.53	PASS	AF=0.197802;AO=35;DP=181;FAO=36;FDP=182;FR=.;FRO=146;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=80;FSRR=66;FWDB=0.0125728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.658;QD=4.51715;RBI=0.0135194;REFB=-0.000146168;REVB=-0.00496973;RO=143;SAF=13;SAR=22;SRF=78;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221882;STB=0.648886;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.000657145;OID=.;OPOS=195701285;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:182:143:146:35:36:0.197802:22:13:78:65:23:13:80:66
chr3	195701304	.	C	T	339.02	PASS	AF=0.245283;AO=50;DP=212;FAO=52;FDP=212;FR=.;FRO=160;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=87;FSRR=73;FWDB=0.0264655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.189;QD=6.39659;RBI=0.0375717;REFB=-0.00209234;REVB=0.0266684;RO=160;SAF=21;SAR=29;SRF=87;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155626;STB=0.605166;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0108556;OID=.;OPOS=195701304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:212:212:160:160:50:52:0.245283:29:21:87:73:31:21:87:73
chr3	195701310	.	C	CAA	181.36	PASS	AF=0.234742;AO=47;DP=221;FAO=50;FDP=213;FR=.;FRO=163;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=91;FSRR=72;FWDB=0.00112331;FXX=0.0138882;HRUN=1;LEN=2;MLLD=36.2717;QD=3.40585;RBI=0.00704852;REFB=-0.00184589;REVB=-0.00695844;RO=169;SAF=20;SAR=27;SRF=94;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165727;STB=0.604913;STBP=0.097;TYPE=ins;VARB=0.0039337;OID=.;OPOS=195701311;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=CAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.234742:47:221:50:213:163:21:29:91:72:99:169:20:27:94:75
chr3	195701331	.	G	A	379.02	PASS	AF=0.248908;AO=57;DP=229;FAO=57;FDP=229;FR=.;FRO=172;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=95;FSRR=77;FWDB=-0.0174484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.351;QD=6.62044;RBI=0.0805993;REFB=-0.000589552;REVB=0.078688;RO=170;SAF=24;SAR=33;SRF=95;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171589;STB=0.597956;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00408684;OID=.;OPOS=195701331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:229:229:170:172:57:57:0.248908:33:24:95:75:33:24:95:77
chr3	195701388	.	GC	AA	545.32	PASS	AF=0.338235;AO=69;DP=206;FAO=69;FDP=204;FR=.;FRO=135;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=66;FSRR=69;FWDB=-0.00907378;FXX=0.00970827;HRUN=2;LEN=2;MLLD=167.389;QD=10.6925;RBI=0.0187197;REFB=-0.0123912;REVB=0.0163735;RO=129;SAF=30;SAR=39;SRF=62;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527458;STB=0.536072;STBP=0.479;TYPE=mnp;VARB=0.0271927;OID=.;OPOS=195701388;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:206:204:129:135:69:69:0.338235:39:30:62:67:39:30:66:69
chr3	195710989	.	G	A	817.79	PASS	AF=0.494048;AO=74;DP=170;FAO=83;FDP=168;FR=.;FRO=85;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=29;FSRR=56;FWDB=-0.0151795;FXX=0.0175428;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.297;QD=19.4713;RBI=0.0279322;REFB=-0.0125155;REVB=0.0234476;RO=64;SAF=27;SAR=47;SRF=12;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171336;STB=0.548266;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0527523;OID=.;OPOS=195710989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:168:64:85:74:83:0.494048:47:27:12:52:47:36:29:56
chr3	195710993	.	A	G	823.96	PASS	AF=0.469613;AO=85;DP=180;FAO=85;FDP=181;FR=.;FRO=96;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=38;FSRR=58;FWDB=-0.00687612;FXX=0.0054942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.625;QD=18.2091;RBI=0.0138216;REFB=-0.00214566;REVB=-0.0119898;RO=94;SAF=39;SAR=46;SRF=37;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627999;STB=0.533817;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00214142;OID=.;OPOS=195710993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:181:94:96:85:85:0.469613:46:39:37:57:46:39:38:58
chr3	195711016	.	G	A	875.1	PASS	AF=0.44186;AO=95;DP=215;FAO=95;FDP=215;FR=.;FRO=120;FSAF=35;FSAR=60;FSRF=55;FSRR=65;FWDB=-0.0181882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.793;QD=16.2809;RBI=0.0306518;REFB=-0.00731762;REVB=-0.0246723;RO=120;SAF=35;SAR=60;SRF=55;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941794;STB=0.552418;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0104513;OID=.;OPOS=195711016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:215:215:120:120:95:95:0.44186:60:35:55:65:60:35:55:65
chr3	195798320	.	G	C	192.9	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0597112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4482;QD=23.3815;RBI=0.124584;REFB=0.00368855;REVB=-0.109342;RO=14;SAF=12;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103608;STB=0.558077;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=-0.00533956;OID=.;OPOS=195798320;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:7:12:7:7:7:12:7:7
chr3	195925458	.	A	C	131.32	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0535132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6466;QD=14.1964;RBI=0.0607486;REFB=0.013108;REVB=-0.0287529;RO=21;SAF=1;SAR=14;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.4471;STB=0.793802;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0141142;OID=.;OPOS=195925458;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:22:15:15:0.405405:14:1:6:15:14:1:7:15
chr3	195938177	.	A	G	769.26	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0426934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9168;QD=56.9825;RBI=0.0427329;REFB=0;REVB=0.00183672;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000367735;OID=.;OPOS=195938177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0
chr3	195941216	.	C	G	1549.24	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00383492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.253;QD=63.8864;RBI=0.0421365;REFB=0;REVB=0.0419616;RO=0;SAF=49;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.61825e-05;OID=.;OPOS=195941216;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:48:49:0:0:48:49:0:0
chr3	195955762	.	G	A	576.23	PASS	AF=0.406061;AO=67;DP=165;FAO=67;FDP=165;FR=.;FRO=98;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=63;FSRR=35;FWDB=0.0157294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.141;QD=13.9691;RBI=0.018887;REFB=-0.0120167;REVB=-0.0104549;RO=96;SAF=41;SAR=26;SRF=62;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378354;STB=0.519495;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.0173809;OID=.;OPOS=195955762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:96:98:67:67:0.406061:26:41:62:34:26:41:63:35
chr3	195956827	.	T	C	598.55	PASS	AF=0.728571;AO=50;DP=70;FAO=51;FDP=70;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0428828;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5498;QD=34.2027;RBI=0.0519659;REFB=-0.0331692;REVB=-0.0293516;RO=19;SAF=19;SAR=31;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131493;STB=0.566184;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0121281;OID=.;OPOS=195956827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:19:19:50:51:0.728571:31:19:12:7:31:20:12:7
chr3	196054439	.	T	G	785.17	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0043409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.495;QD=57.1033;RBI=0.00595671;REFB=0;REVB=0.00407909;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.89563e-07;OID=.;OPOS=196054439;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0
chr3	196199204	.	G	T	339.13	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=82;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.0549264;FXX=0.0365809;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9882;QD=17.171;RBI=0.0667441;REFB=-0.00485096;REVB=-0.0379191;RO=46;SAF=12;SAR=24;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315439;STB=0.660927;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00412667;OID=.;OPOS=196199204;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:79:46:43:36:36:0.455696:24:12:30:16:24:12:27:16
chr3	196281208	.	T	C	270.39	PASS	AF=0.413333;AO=10;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.00514298;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.17;QD=14.4209;RBI=0.0120281;REFB=-0.0183398;REVB=0.0108732;RO=44;SAF=2;SAR=8;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.389638;STB=0.657035;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0241935;OID=.;OPOS=196281208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:44:44:10:31:0.413333:8:2:22:22:8:23:22:22
chr3	196294104	.	C	G	1186.16	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00683696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.032;QD=60.8286;RBI=0.00915904;REFB=0;REVB=0.00609458;RO=0;SAF=52;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.01424e-06;OID=.;OPOS=196294104;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:78:0:0:76:78:1:24:52:0:0:25:53:0:0
chr3	196386964	.	C	G	1607.05	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.22;QD=60.0767;RBI=0.0406382;REFB=0;REVB=0.0358563;RO=0;SAF=41;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93175e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24886e-05;OID=.;OPOS=196386964;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:106:107:1:65:41:0:0:66:41:0:0
chr3	196435534	.	T	C	868.39	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584438;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.204;QD=56.9434;RBI=0.0606128;REFB=0;REVB=0.01607;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.80438e-05;OID=.;OPOS=196435534;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:27:34:0:0:27:34:0:0
chr3	196438826	.	G	T	632.19	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5887;QD=61.6768;RBI=0.0534887;REFB=0;REVB=-0.0409313;RO=0;SAF=29;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.56458e-05;OID=.;OPOS=196438826;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:12:29:0:0:12:29:0:0
chr3	196443803	.	T	C	5315.2	PASS	AF=1;AO=320;DP=322;FAO=339;FDP=339;FR=.;FRO=0;FSAF=154;FSAR=185;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0964602;FXX=0.00586493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3265;QD=62.7162;RBI=0.108591;REFB=-0.142068;REVB=0.049874;RO=1;SAF=146;SAR=174;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00273368;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170064;OID=.;OPOS=196443803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:322:339:1:0:320:339:1:174:146:0:1:185:154:0:0
chr3	196448103	.	C	T	422.46	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00419956;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.263;QD=56.3285;RBI=0.00619671;REFB=0;REVB=-0.00455663;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000462237;OID=.;OPOS=196448103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:29:30:1:12:17:0:0:13:17:0:0
chr3	196511870	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0376334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.262;QD=43.4859;RBI=0.0386275;REFB=0;REVB=0.00870704;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00118319;OID=.;OPOS=196511870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr3	196511920	.	C	T	74.48	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0323984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.539;QD=22.9155;RBI=0.0326838;REFB=-0.0704867;REVB=0.00431037;RO=4;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514675;STB=0.529348;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0222714;OID=.;OPOS=196511920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:6:3:1:3:6:3:1:3
chr3	196557130	.	A	G	34.01	PASS	AF=0.153846;AO=5;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.00296717;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.514;QD=3.48813;RBI=0.0160404;REFB=-0.0079867;REVB=-0.0157636;RO=34;SAF=2;SAR=3;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115698;STB=0.631132;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0409737;OID=.;OPOS=196557130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:39:39:34:33:5:6:0.153846:3:2:17:17:4:2:16:17
chr3	196674749	.	C	T	698.96	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0631426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0381;QD=54.8203;RBI=0.0686003;REFB=-0.132097;REVB=0.0268142;RO=1;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192104;STB=0.5102;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.00964451;OID=.;OPOS=196674749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:24:26:0:1:24:26:0:1
chr3	196674879	.	A	G	803.36	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0435485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4711;QD=55.4042;RBI=0.0437143;REFB=0.016904;REVB=0.00380361;RO=0;SAF=19;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512816;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.000753273;OID=.;OPOS=196674879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:38:19:0:0:38:19:1:0
chr3	196674916	.	A	C	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.516;QD=57.0006;RBI=0.0506531;REFB=0;REVB=0.0472174;RO=0;SAF=20;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139312;OID=.;OPOS=196674916;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:34:20:0:0:34:20:0:0
chr3	196674972	.	CTG	CGC,TCG	519.81	PASS	AF=0.0571429,0.942857;AO=2,33;DP=37;FAO=2,33;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=2,12;FSAR=0,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00475365,-0.00131896;FXX=0.0540395;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=119.882,196.893;QD=59.4073;RBI=0.0214628,0.025539;REFB=0,0;REVB=-0.0209298,0.0255049;RO=0;SAF=2,12;SAR=0,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0783828,-0.00983846;OID=.,.;OPOS=196674973,196674972;OREF=TG,CT;OALT=GC,TC;OMAPALT=CGC,TCG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:37:35:0:0:2,33:2,33:0.0571429,0.942857:0,21:2,12:0:0:0,21:2,12:0:0
chr3	196675453	.	C	G	282.83	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.012159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2147;QD=23.0885;RBI=0.0574061;REFB=0.00927137;REVB=-0.0561036;RO=23;SAF=19;SAR=7;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00898037;STB=0.505006;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=-0.00923052;OID=.;OPOS=196675453;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:7:19:17:6:7:19:17:6
chr3	196770355	.	TAAGG	T	347.77	PASS	AF=0.409722;AO=58;DP=146;FAO=59;FDP=144;FR=.;FRO=85;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=40;FSRR=45;FWDB=-0.0154742;FXX=0.00689608;HRUN=2;LEN=4;MLLD=197.024;QD=9.66022;RBI=0.0166043;REFB=-0.0250083;REVB=-0.00602103;RO=84;SAF=29;SAR=29;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250335;STB=0.522345;STBP=0.672;TYPE=del;VARB=0.0371784;OID=.;OPOS=196770356;OREF=AAGG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.409722:58:146:59:144:85:30:29:40:45:99:84:29:29:40:44
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chr3	197687282	.	T	TC	49.06	PASS	AF=0.419355;AO=10;DP=32;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.1485;FXX=0.0312402;HRUN=0;LEN=1;MLLD=21.1805;QD=6.33092;RBI=0.148838;REFB=-0.0519985;REVB=-0.0100208;RO=21;SAF=9;SAR=1;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.526382;STB=0.751109;STBP=0.035;TYPE=ins;VARB=0.157842;OID=.;OPOS=197687283;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.419355:10:32:13:31:18:11:2:9:9:49:21:9:1:11:10
chr3	197880130	.	GGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA	GGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA,GGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC	32.92	PASS	AF=0.4,0;AO=4,2;DP=15;FAO=6,0;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=5,0;FSAR=1,0;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.00219444,-0.128148;FXX=0.062461;HRUN=1,2;LEN=6,1;MLLD=218.966,16.2782;QD=8.77781;RBI=0.0118141,0.165022;REFB=-0.0470087,-0.18567;REVB=0.0116085,-0.103973;RO=7;SAF=4,2;SAR=0,0;SRF=6;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.645224,0.50628;STB=0.565019,0.5;STBP=0.812,1;TYPE=del,del;VARB=0.0557463,0.0305756;OID=.,.;OPOS=197880131,197880172;OREF=GCAGCA,A;OALT=-,-;OMAPALT=GGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA,GGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4,0:4,2:15:6,0:15:9:5,0:1,0:8:1:32:7:4,2:0,0:6:1
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chr4	67726	.	TG	GT,TGT	117.67	PASS	AF=0,0.237838;AO=11,48;DP=191;FAO=0,44;FDP=185;FR=.;FRO=141;FSAF=0,39;FSAR=0,5;FSRF=65;FSRR=76;FWDB=-0.0677281,-0.0802592;FXX=0.00537606;HRUN=5,0;LEN=2,1;MLLD=64.608,60.0841;QD=2.54414;RBI=0.0736528,0.0865881;REFB=-0.00481452,-0.00619974;REVB=-0.028942,-0.0324957;RO=129;SAF=11,43;SAR=0,5;SRF=53;SRR=76;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.626277,0.633306;STB=0.5,0.85848;STBP=1,0;TYPE=mnp,ins;VARB=0.033122,0.118011;OID=.,.;OPOS=67726,67728;OREF=TG,-;OALT=GT,T;OMAPALT=GT,TGT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:191:185:129:141:11,48:0,44:0,0.237838:0,5:11,43:53:76:0,5:0,39:65:76
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chr4	86738	.	A	G	330.89	PASS	AF=0.961538;AO=23;DP=24;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0377728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.857;QD=50.9066;RBI=0.0788566;REFB=-0.072757;REVB=0.0692213;RO=1;SAF=11;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402265;STB=0.521722;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000413218;OID=.;OPOS=86738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:26:1:1:23:25:0.961538:12:11:1:0:14:11:1:0
chr4	87277	.	G	C	289.36	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234303;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0745;QD=52.6111;RBI=0.0396409;REFB=0;REVB=-0.0319754;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000221806;OID=.;OPOS=87277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr4	87313	.	G	GA	281.04	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0693342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.9045;QD=44.9665;RBI=0.114185;REFB=0;REVB=0.0907246;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000981414;OID=.;OPOS=87314;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:25:25:25:25:0:16:9:0:0:5:0:16:9:0:0
chr4	648643	.	G	A	344.64	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257661;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.881;QD=55.1427;RBI=0.0259996;REFB=0;REVB=0.00347645;RO=0;SAF=4;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177088;OID=.;OPOS=648643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:21:4:0:0:21:4:0:0
chr4	663908	.	A	G	318.76	PASS	AF=0.540984;AO=33;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0106791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.179;QD=20.9021;RBI=0.0158994;REFB=-0.00997483;REVB=0.0117791;RO=28;SAF=16;SAR=17;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106434;STB=0.558847;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0129291;OID=.;OPOS=663908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:28:28:33:33:0.540984:17:16:10:18:17:16:10:18
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chr4	762285	.	A	G	429.88	PASS	AF=0.461538;AO=46;DP=102;FAO=48;FDP=104;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0129206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.161;QD=16.534;RBI=0.0129872;REFB=-0.00153816;REVB=0.00131344;RO=56;SAF=24;SAR=22;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00381759;STB=0.501604;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.00256705;OID=.;OPOS=762285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:104:56:56:46:48:0.461538:22:24:29:27:23:25:29:27
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chr4	843720	.	T	C	392.78	PASS	AF=0.445652;AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0106857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5457;QD=17.0775;RBI=0.0185041;REFB=-0.0325589;REVB=0.0151069;RO=48;SAF=20;SAR=21;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117645;STB=0.512189;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0554378;OID=.;OPOS=843720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:92:48:51:41:41:0.445652:21:20:24:24:21:20:26:25
chr4	845577	.	CGA	CGAC,CGC,GAC	38.2	PASS	AF=0.128571,0,0.0428571;AO=9,5,4;DP=70;FAO=9,0,3;FDP=70;FR=.;FRO=58;FSAF=8,0,3;FSAR=1,0,0;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.083464,-0.0760052,-0.0516439;FXX=0;HRUN=0,1,4;LEN=1,1,3;MLLD=32.9458,107.604,48.6913;QD=2.1826;RBI=0.159991,0.129306,0.0648979;REFB=-0.0356261,-0.0075866,-0.02428;REVB=-0.136495,-0.10461,-0.039302;RO=50;SAF=6,3,4;SAR=3,2,0;SRF=29;SRR=21;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.112007,0.0225916,0.501426;STB=0.842885,0.5,0.9962;STBP=0.045,1,0.073;TYPE=ins,snp,mnp;VARB=0.154998,0.050657,0.141333;OID=.,.,.;OPOS=845580,845579,845577;OREF=-,A,CGA;OALT=C,C,GAC;OMAPALT=CGAC,CGC,GAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:70:70:50:58:9,5,4:9,0,3:0.128571,0,0.0428571:3,2,0:6,3,4:29:21:1,0,0:8,0,3:32:26
chr4	858941	.	T	C	785.24	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1823;QD=64.1011;RBI=0.0787176;REFB=0;REVB=0.0701959;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00092431;OID=.;OPOS=858941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0
chr4	860192	.	A	G	184.59	PASS	AF=0.425532;AO=18;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=3;FWDB=-0.0382124;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.013;QD=15.7093;RBI=0.0909052;REFB=-0.015725;REVB=-0.0824838;RO=27;SAF=13;SAR=5;SRF=24;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248192;STB=0.618947;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0238087;OID=.;OPOS=860192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:18:20:0.425532:5:13:24:3:5:15:24:3
chr4	946226	.	T	C	40.76	PASS	AF=0.666667;AO=5;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00648488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.183;QD=18.1172;RBI=0.0118897;REFB=-0.0144778;REVB=0.00996546;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.496916;STB=0.79893;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.000807404;OID=.;OPOS=946226;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:5:6:0.666667:1:4:0:3:1:5:0:3
chr4	961373	.	G	A	3181.56	PASS	AF=1;AO=195;DP=196;FAO=199;FDP=199;FR=.;FRO=0;FSAF=147;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.435;QD=63.951;RBI=0.0486196;REFB=0;REVB=0.0399499;RO=0;SAF=144;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.3532e-05;OID=.;OPOS=961373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:196:199:0:0:195:199:1:51:144:0:0:52:147:0:0
chr4	962665	.	GCCCCC	GCCCC,GCCCCG	52.63	PASS	AF=0.190476,0.0714286;AO=12,6;DP=85;FAO=16,6;FDP=84;FR=.;FRO=62;FSAF=9,6;FSAR=7,0;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.00940507,0.0381826;FXX=0.0344788;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=9.18222,13.5452;QD=2.50619;RBI=0.0601248,0.194476;REFB=-0.103369,-0.0883715;REVB=-0.0593847,0.19069;RO=44;SAF=11,6;SAR=1,0;SRF=29;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.464991,0.58262;STB=0.511349,0.998044;STBP=0.938,0.018;TYPE=del,snp;VARB=0.0511494,0.138263;OID=.,.;OPOS=962666,962670;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GCCCC,GCCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.190476,0.0714286:12,6:85:16,6:84:62:9,6:7,0:34:28:37:44:11,6:1,0:29:15
chr4	982852	.	G	A	3123.39	PASS	AF=1;AO=202;DP=203;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=122;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520491;FXX=0.00487781;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.863;QD=61.243;RBI=0.0564757;REFB=0;REVB=0.021918;RO=1;SAF=82;SAR=120;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00395298;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112425;OID=.;OPOS=982852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:203:204:1:0:202:204:1:120:82:0:1:122:82:0:0
chr4	983060	.	T	C	1227.99	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00354473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.937;QD=61.3994;RBI=0.0458123;REFB=0;REVB=0.045675;RO=0;SAF=54;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012581;OID=.;OPOS=983060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:25:54:0:0:26:54:0:0
chr4	983809	.	C	T	1194.1	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0567809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2192;QD=59.7049;RBI=0.0674777;REFB=-0.0784208;REVB=0.0364578;RO=1;SAF=59;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230769;STB=0.512192;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00197368;OID=.;OPOS=983809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:20:59:0:1:20:59:0:1
chr4	985727	.	A	G	2314.58	PASS	AF=1;AO=151;DP=151;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0081208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.037;QD=60.9101;RBI=0.0692608;REFB=0;REVB=0.0687831;RO=0;SAF=92;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.10962e-05;OID=.;OPOS=985727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:151:152:0:0:151:152:1:59:92:0:0:60:92:0:0
chr4	1050653	.	G	A	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113434;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.676;QD=53.9112;RBI=0.0138257;REFB=0;REVB=0.00790427;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.77579e-05;OID=.;OPOS=1050653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0
chr4	1052125	.	T	C	74.68	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00319819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9215;QD=10.6682;RBI=0.0075084;REFB=0.000845166;REVB=0.00679321;RO=18;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00122124;OID=.;OPOS=1052125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:5:5:9:9:5:5:9:9
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chr4	1087326	.	TG	CC,TGCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC	61.23	PASS	AF=0.0769231,0.269231;AO=2,7;DP=26;FAO=2,7;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=2,7;FSAR=0,0;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=-0.0326647,-0.00114102;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=2,21;MLLD=189.247,691.084;QD=9.4203;RBI=0.0326647,0.00114102;REFB=-0.0174702,-0.0129807;REVB=0,0;RO=17;SAF=2,7;SAR=0,0;SRF=17;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,ins;VARB=0.0169078,0.0376761;OID=.,.;OPOS=1087326,1087328;OREF=TG,-;OALT=CC,CTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC;OMAPALT=CC,TGCTGCCCAGGCTGGAGCCAGCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:46:26:26:17:17:2,7:2,7:0.0769231,0.269231:0,0:2,7:17:0:0,0:2,7:17:0
chr4	1087329	.	C	T	75.14	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=0.00758004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.528;QD=11.1312;RBI=0.00758004;REFB=-0.000264649;REVB=0;RO=17;SAF=10;SAR=0;SRF=17;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000750572;OID=.;OPOS=1087329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:0:10:17:0:0:10:17:0
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chr4	1102195	.	A	G	138.81	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0197241;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.374;QD=18.5085;RBI=0.0197684;REFB=-0.00019846;REVB=0.00132352;RO=15;SAF=8;SAR=7;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231787;STB=0.631413;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.000349996;OID=.;OPOS=1102195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:15:15:15:15:0.5:7:8:4:11:7:8:4:11
chr4	1164277	.	C	G	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00190412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.721;QD=54.5169;RBI=0.0145002;REFB=0;REVB=0.0143746;RO=0;SAF=22;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.65945e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138007;OID=.;OPOS=1164277;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:3:22:0:0:3:22:0:0
chr4	1164441	.	C	CG,G	51.12	PASS	AF=0.153846,0.0576923;AO=7,3;DP=54;FAO=8,3;FDP=52;FR=.;FRO=41;FSAF=6,3;FSAR=2,0;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0293471,-0.0434614;FXX=0;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=36.117,49.1895;QD=3.93241;RBI=0.0294168,0.0468027;REFB=-0.0275945,-0.0132883;REVB=-0.00202448,-0.0173666;RO=43;SAF=6,3;SAR=1,0;SRF=19;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.496514,0.520789;STB=0.756939,0.996834;STBP=0.149,0.053;TYPE=ins,snp;VARB=0.171909,0.0882558;OID=.,.;OPOS=1164442,1164441;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:54:52:43:41:7,3:8,3:0.153846,0.0576923:1,0:6,3:19:24:2,0:6,3:18:23
chr4	1164551	.	CA	C,CG	772.48	PASS	AF=0.0204082,0.979592;AO=5,42;DP=48;FAO=1,48;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=1,35;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055212,0.0545235;FXX=0.019996;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=165.026,182.872;QD=63.0598;RBI=0.0572929,0.0558029;REFB=0,0;REVB=0.0153009,0.0118805;RO=0;SAF=5,29;SAR=0,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.36943e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0355754,0.005038;OID=.,.;OPOS=1164552,1164552;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0204082,0.979592:5,42:48:1,48:49:0:1,35:0,13:0:0:6:0:5,29:0,13:0:0
chr4	1165130	.	G	T	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.321;QD=62.0193;RBI=0.0750159;REFB=0;REVB=0.0670311;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000694939;OID=.;OPOS=1165130;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr4	1165681	.	T	G,TG	36.96	PASS	AF=0,0.204545;AO=2,6;DP=45;FAO=0,9;FDP=44;FR=.;FRO=35;FSAF=0,2;FSAR=0,7;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0535036,-0.064519;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=144.407,127.249;QD=3.35995;RBI=0.0597455,0.0661225;REFB=-0.0149714,-0.00254056;REVB=-0.0265875,-0.0144737;RO=37;SAF=0,1;SAR=2,5;SRF=20;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.44477,-0.446142;STB=0.5,0.744113;STBP=1,0.149;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.184784;OID=.,.;OPOS=1165681,1165682;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:37:45:44:37:35:2,6:0,9:0,0.204545:2,5:0,1:20:17:0,7:0,2:18:17
chr4	1165741	.	A	G	861.17	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0020693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.77;QD=57.4116;RBI=0.0119329;REFB=0;REVB=0.0117521;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.05466e-05;OID=.;OPOS=1165741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:60:0:0:57:60:1:30:27:0:0:31:29:0:0
chr4	1194630	.	T	C	373.43	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.178;QD=55.3235;RBI=0.0310672;REFB=0;REVB=0.0224182;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.18311e-06;OID=.;OPOS=1194630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:25:27:1:15:10:0:0:16:11:0:0
chr4	1215585	.	T	C	332.22	PASS	AF=0.538462;AO=32;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0109815;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8534;QD=20.4444;RBI=0.0556033;REFB=-0.020479;REVB=0.0545081;RO=26;SAF=15;SAR=17;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874147;STB=0.508798;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0230222;OID=.;OPOS=1215585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:26:30:32:35:0.538462:17:15:15:11:17:18:16:14
chr4	1244416	.	A	G	1555.88	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.255;QD=59.8417;RBI=0.0266264;REFB=0;REVB=-0.0197239;RO=0;SAF=45;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.63093e-05;OID=.;OPOS=1244416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:104:0:0:103:104:1:58:45:0:0:58:46:0:0
chr4	1330759	.	T	C	110.29	PASS	AF=0.378378;AO=12;DP=35;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0124726;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7799;QD=11.9232;RBI=0.0148668;REFB=-0.0891897;REVB=0.00809057;RO=23;SAF=7;SAR=5;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0792193;STB=0.50632;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0578151;OID=.;OPOS=1330759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:37:23:23:12:14:0.378378:5:7:15:8:5:9:15:8
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chr4	1374695	.	C	A	459.18	PASS	AF=0.458716;AO=50;DP=106;FAO=50;FDP=109;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=0.00476693;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.04;QD=16.8506;RBI=0.0168055;REFB=-0.012386;REVB=-0.0161152;RO=55;SAF=30;SAR=20;SRF=38;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0913188;STB=0.525087;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0139304;OID=.;OPOS=1374695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:109:55:59:50:50:0.458716:20:30:38:17:20:30:38:21
chr4	1374774	.	C	T	311.6	PASS	AF=0.540984;AO=32;DP=59;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0220833;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.5734;QD=20.433;RBI=0.0220898;REFB=-0.0335108;REVB=0.000538181;RO=27;SAF=20;SAR=12;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121889;STB=0.549868;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0222437;OID=.;OPOS=1374774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:61:27:28:32:33:0.540984:12:20:13:14:13:20:14:14
chr4	1377615	.	A	G	233.01	PASS	AF=0.511111;AO=22;DP=44;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.000208189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.41;QD=20.7119;RBI=0.0257333;REFB=-0.042318;REVB=0.0257325;RO=21;SAF=13;SAR=9;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159634;STB=0.562448;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0281797;OID=.;OPOS=1377615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:21:22:22:23:0.511111:9:13:16:5:9:14:16:6
chr4	1619865	.	T	C	805.16	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1617;QD=64.4131;RBI=0.0468143;REFB=0;REVB=0.032798;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000566101;OID=.;OPOS=1619865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr4	1685211	.	T	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00341749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.782;QD=57.1772;RBI=0.0476898;REFB=0;REVB=0.0475672;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015174;OID=.;OPOS=1685211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:31:20:0:0:31:20:0:0
chr4	1701317	.	G	A	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00528117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.885;QD=56.9379;RBI=0.0142727;REFB=0;REVB=-0.0132597;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.27806e-05;OID=.;OPOS=1701317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0
chr4	1719390	.	A	C	373.26	PASS	AF=0.449438;AO=39;DP=88;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=-0.0159587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.603;QD=16.7757;RBI=0.017624;REFB=-0.00848;REVB=-0.00747816;RO=49;SAF=21;SAR=18;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0741608;STB=0.53484;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.00877183;OID=.;OPOS=1719390;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:49:49:39:40:0.449438:18:21:30:19:18:22:30:19
chr4	1737502	.	C	T	717.5	PASS	AF=0.946429;AO=54;DP=56;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0158556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.51;QD=51.2503;RBI=0.0339163;REFB=-0.0233709;REVB=0.0299819;RO=2;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324755;STB=0.526306;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=7.4988e-05;OID=.;OPOS=1737502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:56:56:2:3:54:53:0.946429:28:26:0:2:27:26:0:3
chr4	1739342	.	A	AC,C	39.03	PASS	AF=0.209302,0;AO=11,2;DP=45;FAO=9,0;FDP=43;FR=.;FRO=34;FSAF=1,0;FSAR=8,0;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.030948,-0.0266972;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=47.9333,99.3454;QD=3.63023;RBI=0.0525868,0.0331276;REFB=-0.00642433,-0.0175228;REVB=-0.0425158,-0.0196137;RO=31;SAF=3,0;SAR=8,2;SRF=15;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.265126,-0.445343;STB=0.824963,0.5;STBP=0.061,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.103547,0;OID=.,.;OPOS=1739343,1739342;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:45:43:31:34:11,2:9,0:0.209302,0:8,2:3,0:15:16:8,0:1,0:15:19
chr4	1739518	.	CGCCATCCCTGCCATC	CGCCATC,CGCCAT	388.27	PASS	AF=0.757576,0.242424;AO=23,10;DP=40;FAO=25,8;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=6,7;FSAR=19,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00919167,0.00400248;FXX=0.195074;HRUN=3,3;LEN=9,10;MLLD=293.679,283.804;QD=47.063;RBI=0.014409,0.0145994;REFB=0,0;REVB=0.0110965,0.0140401;RO=0;SAF=4,9;SAR=19,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.446729,0.446729;SSSB=0,3.8593e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.00363066,0.0158183;OID=.,.;OPOS=1739519,1739524;OREF=GCCATCCCT,CCCTGCCATC;OALT=-,-;OMAPALT=CGCCATC,CGCCAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.757576,0.242424:23,10:40:25,8:33:0:6,7:19,1:0:0:24:0:4,9:19,1:0:0
chr4	1739592	.	A	G	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.641;QD=62.982;RBI=0.0687047;REFB=0;REVB=-0.0661791;RO=0;SAF=32;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000131523;OID=.;OPOS=1739592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:13:32:0:0:13:32:0:0
chr4	1805478	.	C	T	421.24	PASS	AF=0.462366;AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.0379147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5227;QD=18.1178;RBI=0.039645;REFB=0.00797263;REVB=-0.0115844;RO=48;SAF=23;SAR=20;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462581;STB=0.524447;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=-0.00701996;OID=.;OPOS=1805478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:48:50:43:43:0.462366:20:23:28:20:20:23:29:21
chr4	1807894	.	G	A	727.62	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0374;QD=63.271;RBI=0.0705243;REFB=0;REVB=0.039308;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127854;OID=.;OPOS=1807894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr4	1809127	.	CGT	C,TGC	1266.18	PASS	AF=0.916667,0.0714286;AO=62,10;DP=93;FAO=77,6;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=12,4;FSAR=65,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0716179,-0.0605258;FXX=0.134007;HRUN=1,1;LEN=2,3;MLLD=82.6037,70.3653;QD=60.2943;RBI=0.0972779,0.0697831;REFB=-0.1132,-0.0231716;REVB=0.0658321,-0.034732;RO=1;SAF=6,4;SAR=56,6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00835876,0.0687795;STB=0.503816,0.599655;STBP=0.647,0.333;TYPE=del,mnp;VARB=0.00749449,0.09882;OID=.,.;OPOS=1809128,1809127;OREF=GT,CGT;OALT=-,TGC;OMAPALT=C,TGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:93:84:1:1:62,10:77,6:0.916667,0.0714286:56,6:6,4:0:1:65,2:12,4:0:1
chr4	1815990	.	G	A	477.52	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.19;QD=56.1788;RBI=0.0489248;REFB=-0.107575;REVB=0.0476079;RO=1;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345796;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000761481;OID=.;OPOS=1815990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:34:34:1:0:33:34:1:13:20:0:1:14:20:0:0
chr4	1818594	.	C	T	1404.74	PASS	AF=1;AO=76;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.854;QD=61.7468;RBI=0.0500169;REFB=0;REVB=0.0252093;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.66953e-05;OID=.;OPOS=1818594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:91:0:0:76:91:1:42:34:0:0:47:44:0:0
chr4	1952803	.	C	T	140.1	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0241259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4688;QD=12.736;RBI=0.0505201;REFB=-0.00814831;REVB=0.0443871;RO=27;SAF=9;SAR=7;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202162;STB=0.624858;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0340221;OID=.;OPOS=1952803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:27:28:16:16:0.363636:7:9:20:7:7:9:21:7
chr4	1954945	.	A	G	1513.36	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325269;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.072;QD=59.935;RBI=0.0326436;REFB=0;REVB=0.00275762;RO=0;SAF=52;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003178;OID=.;OPOS=1954945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:100:101:1:48:52:0:0:49:52:0:0
chr4	1986542	.	C	T	490.99	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.987;QD=57.7639;RBI=0.0774857;REFB=0;REVB=0.0563757;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00274738;OID=.;OPOS=1986542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:10:23:0:0:11:23:0:0
chr4	2257022	.	C	CG	51.23	PASS	AF=0.333333;AO=18;DP=58;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.00568052;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=56.9665;QD=3.59477;RBI=0.0519673;REFB=-0.0106704;REVB=-0.0516559;RO=40;SAF=14;SAR=4;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.422474;STB=0.816936;STBP=0.004;TYPE=ins;VARB=0.15977;OID=.;OPOS=2257023;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:18:58:19:57:38:16:3:15:23:51:40:14:4:17:23
chr4	2306053	.	A	G	211.01	PASS	AF=0.488372;AO=20;DP=42;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00707395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.748;QD=19.6289;RBI=0.0338424;REFB=-0.00274961;REVB=-0.0330948;RO=19;SAF=6;SAR=14;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294619;STB=0.6561;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00499879;OID=.;OPOS=2306053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:19:22:20:21:0.488372:14:6:12:7:14:7:14:8
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chr4	2744087	.	G	A	884.28	PASS	AF=0.954545;AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0113134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.1308;QD=53.5928;RBI=0.0238451;REFB=-0.139273;REVB=0.0209904;RO=3;SAF=30;SAR=33;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122834;STB=0.50651;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.00502222;OID=.;OPOS=2744087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:66:66:3:3:63:63:0.954545:33:30:1:2:33:30:1:2
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chr4	2826400	.	T	C	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0618365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.835;QD=57.3853;RBI=0.0681643;REFB=0;REVB=-0.0286813;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000741393;OID=.;OPOS=2826400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0
chr4	2826912	.	C	G	207.45	PASS	AF=0.351351;AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.0184384;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.324;QD=11.2138;RBI=0.0304901;REFB=-0.0305304;REVB=-0.0242831;RO=47;SAF=13;SAR=13;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178377;STB=0.594524;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0311653;OID=.;OPOS=2826912;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:47:48:26:26:0.351351:13:13:31:16:13:13:31:17
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chr4	2906707	.	G	T	1098.92	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.271;QD=60.215;RBI=0.0199012;REFB=0;REVB=0.0118554;RO=0;SAF=43;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.00995e-05;OID=.;OPOS=2906707;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:73:0:0:70:73:1:27:43:0:0:28:45:0:0
chr4	2916762	.	C	G	1026.26	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.079;QD=59.4932;RBI=0.0859876;REFB=0;REVB=-0.0700935;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.21846e-05;OID=.;OPOS=2916762;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:40:28:0:0:40:29:0:0
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chr4	3213832	.	G	A	287.94	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.00514938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.06;QD=18.5769;RBI=0.00821899;REFB=-0.028972;REVB=-0.00640591;RO=31;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289507;STB=0.516152;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.022994;OID=.;OPOS=3213832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:16:15:14:17:16:15:14:17
chr4	3215835	.	T	C	509.34	PASS	AF=0.633803;AO=38;DP=72;FAO=45;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=20;FWDB=0.0797472;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.762;QD=28.6951;RBI=0.0800868;REFB=-0.052104;REVB=0.00736764;RO=25;SAF=14;SAR=24;SRF=5;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136832;STB=0.596858;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0281915;OID=.;OPOS=3215835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:25:25:38:45:0.633803:24:14:5:20:24:21:5:20
chr4	3219613	.	A	C	2064.93	PASS	AF=1;AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168108;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.244;QD=62.5735;RBI=0.0610104;REFB=0;REVB=0.0586487;RO=0;SAF=61;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.9826e-05;OID=.;OPOS=3219613;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:132:132:0:0:132:132:1:71:61:0:0:71:61:0:0
chr4	3227419	.	A	G	659.11	PASS	AF=0.532787;AO=65;DP=122;FAO=65;FDP=122;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.000931402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.513;QD=21.6103;RBI=0.0152271;REFB=-0.00834582;REVB=-0.0151986;RO=57;SAF=34;SAR=31;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271274;STB=0.514887;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.00857973;OID=.;OPOS=3227419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:57:57:65:65:0.532787:31:34:28:29:31:34:28:29
chr4	3231661	.	G	A	223.09	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0288152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.428;QD=16.5253;RBI=0.0425496;REFB=-0.00253143;REVB=0.0313075;RO=29;SAF=9;SAR=16;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882944;STB=0.549959;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00338432;OID=.;OPOS=3231661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:16:9:13:16:16:9:13:16
chr4	3234980	.	G	A	950.67	PASS	AF=0.648438;AO=82;DP=127;FAO=83;FDP=128;FR=.;FRO=45;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0387626;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.93;QD=29.7085;RBI=0.039792;REFB=-0.00601885;REVB=0.0089926;RO=44;SAF=46;SAR=36;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398151;STB=0.519629;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00462824;OID=.;OPOS=3234980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:128:44:45:82:83:0.648438:36:46:22:22:36:47:23:22
chr4	3257593	.	C	T	131.24	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.000383549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.645;QD=14.1881;RBI=0.000459522;REFB=-0.0286891;REVB=0.000253082;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204049;STB=0.617501;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0403037;OID=.;OPOS=3257593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:8:7:6:16:8:7:6:16
chr4	3263138	.	G	A	358.95	PASS	AF=0.506849;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0111901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.097;QD=19.6684;RBI=0.0240065;REFB=-0.0342298;REVB=0.0212389;RO=35;SAF=18;SAR=19;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992694;STB=0.561267;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0389492;OID=.;OPOS=3263138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:35:36:37:37:0.506849:19:18:21:14:19:18:22:14
chr4	3318413	.	A	G	293.26	PASS	AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=0.0244727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.847;QD=23.0005;RBI=0.0372689;REFB=-0.0311102;REVB=0.0281079;RO=22;SAF=10;SAR=19;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193491;STB=0.605995;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0259377;OID=.;OPOS=3318413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:22:22:29:29:0.568627:19:10:3:19:19:10:3:19
chr4	3319271	.	C	T	339.13	PASS	AF=0.530303;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=30;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=0.009461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.479;QD=20.5535;RBI=0.0346009;REFB=-0.0294799;REVB=-0.0332823;RO=31;SAF=30;SAR=5;SRF=25;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815122;STB=0.545427;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0302081;OID=.;OPOS=3319271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:31:31:35:35:0.530303:5:30:25:6:5:30:25:6
chr4	3417845	.	G	C	885.41	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.791;QD=58.0594;RBI=0.0144541;REFB=0;REVB=0.000304957;RO=0;SAF=40;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.35539e-05;OID=.;OPOS=3417845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:21:40:0:0:21:40:0:0
chr4	3424231	.	C	T	177.92	PASS	AF=0.338235;AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=68;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.00143965;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.569;QD=10.4658;RBI=0.0256949;REFB=-0.0101242;REVB=0.0256545;RO=45;SAF=11;SAR=12;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137461;STB=0.580084;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0222952;OID=.;OPOS=3424231;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:45:45:23:23:0.338235:12:11:27:18:12:11:27:18
chr4	3444503	.	G	A	61.52	PASS	AF=0.227273;AO=9;DP=43;FAO=10;FDP=44;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.00821243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.7993;QD=5.59267;RBI=0.0127324;REFB=-0.0270568;REVB=-0.00972983;RO=34;SAF=4;SAR=5;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279301;STB=0.636111;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0909324;OID=.;OPOS=3444503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:43:44:34:34:9:10:0.227273:5:4:23:11:5:5:23:11
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chr4	3447016	.	C	G	170.47	PASS	AF=0.62963;AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0331739;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.853;QD=25.2554;RBI=0.129615;REFB=-0.0229721;REVB=-0.125298;RO=10;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195324;STB=0.510904;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0128753;OID=.;OPOS=3447016;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:10:10:17:17:0.62963:9:8:5:5:9:8:5:5
chr4	3447962	.	C	T	276.86	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0636809;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.716;QD=22.6008;RBI=0.0686295;REFB=-0.0411048;REVB=0.025588;RO=23;SAF=10;SAR=16;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189249;STB=0.605597;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0306051;OID=.;OPOS=3447962;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:23:23:26:26:0.530612:16:10:14:9:16:10:14:9
chr4	3449652	.	G	A	423.78	PASS	AF=0.525;AO=42;DP=80;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0314659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2048;QD=21.1888;RBI=0.0436165;REFB=-0.00294744;REVB=-0.0302042;RO=36;SAF=13;SAR=29;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148665;STB=0.59789;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00326073;OID=.;OPOS=3449652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:36:38:42:42:0.525:29:13:17:19:29:13:19:19
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chr4	3590730	.	G	A	181.19	PASS	AF=0.359375;AO=23;DP=64;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0129591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.194;QD=11.3244;RBI=0.0189083;REFB=-0.0119635;REVB=0.013769;RO=41;SAF=12;SAR=11;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434904;STB=0.525217;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0158904;OID=.;OPOS=3590730;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:41:41:23:23:0.359375:11:12:23:18:11:12:23:18
chr4	3590817	.	T	C	238.34	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0152632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.175;QD=16.1586;RBI=0.0268684;REFB=-0.0618619;REVB=0.0221122;RO=32;SAF=17;SAR=10;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0608192;STB=0.534222;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0805434;OID=.;OPOS=3590817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:10:17:22:10:10:17:22:10
chr4	3590823	.	GACACACACACACACACAC	GACACACACACACAC,GACACACACACACACAC,GACACACACACACACACAG	362.17	PASS	AF=0.555556,0.296296,0.148148;AO=15,7,2;DP=33;FAO=15,8,4;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13,7,2;FSAR=2,1,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422372,0.0300824,0.0376882;FXX=0.156201;HRUN=1,1,1;LEN=4,2,1;MLLD=111.109,50.1988,42.6732;QD=53.6541;RBI=0.0521635,0.0686832,0.0734436;REFB=0,0,0;REVB=0.0306112,-0.0617449,0.0630363;RO=1;SAF=13,7,2;SAR=2,0,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.180145,0.794046,0.697199;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0474224,0.0891732,0.209314;OID=.,.,.;OPOS=3590824,3590824,3590841;OREF=ACAC,AC,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=GACACACACACACAC,GACACACACACACACAC,GACACACACACACACACAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.555556,0.296296,0.148148:15,7,2:33:15,8,4:27:0:13,7,2:2,1,2:0:0:63:1:13,7,2:2,0,0:0:1
chr4	3590878	.	C	T	584.69	PASS	AF=0.462121;AO=61;DP=132;FAO=61;FDP=132;FR=.;FRO=71;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=0.00188888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.834;QD=17.7178;RBI=0.0911153;REFB=-0.0361913;REVB=0.0910957;RO=71;SAF=31;SAR=30;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534888;STB=0.529709;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0548379;OID=.;OPOS=3590878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:71:71:61:61:0.462121:30:31:40:31:30:31:40:31
chr4	3590911	.	A	C	887.07	PASS	AF=0.456731;AO=95;DP=208;FAO=95;FDP=208;FR=.;FRO=113;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=52;FSRR=61;FWDB=0.000825869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3099;QD=17.059;RBI=0.0490388;REFB=-0.00429573;REVB=0.0490318;RO=113;SAF=48;SAR=47;SRF=52;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441973;STB=0.524479;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00482942;OID=.;OPOS=3590911;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:208:208:113:113:95:95:0.456731:47:48:52:61:47:48:52:61
chr4	3591015	.	A	C	916.89	PASS	AF=0.375887;AO=106;DP=288;FAO=106;FDP=282;FR=.;FRO=176;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=79;FSRR=97;FWDB=-0.0335199;FXX=0.0208326;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.2058;QD=13.0056;RBI=0.0366125;REFB=-0.0089944;REVB=-0.0147272;RO=167;SAF=58;SAR=48;SRF=76;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100004;STB=0.561179;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0180892;OID=.;OPOS=3591015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:288:282:167:176:106:106:0.375887:48:58:76:91:48:58:79:97
chr4	3591049	.	C	T	609.01	PASS	AF=0.330645;AO=81;DP=240;FAO=82;FDP=248;FR=.;FRO=166;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=70;FSRR=96;FWDB=0.0163102;FXX=0.0040159;HRUN=5;LEN=1;MLLD=31.5125;QD=9.82277;RBI=0.0526913;REFB=-0.0215015;REVB=0.0501034;RO=159;SAF=38;SAR=43;SRF=70;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336547;STB=0.536299;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0438796;OID=.;OPOS=3591049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:240:248:159:166:81:82:0.330645:43:38:70:89:43:39:70:96
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chr4	4239587	.	G	T	98.87	PASS	AF=0.180851;AO=17;DP=93;FAO=17;FDP=94;FR=.;FRO=77;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=0.0122178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9755;QD=4.20738;RBI=0.0193834;REFB=-0.00265203;REVB=0.015048;RO=76;SAF=10;SAR=7;SRF=42;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457718;STB=0.524938;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0236028;OID=.;OPOS=4239587;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:93:94:76:77:17:17:0.180851:7:10:42:34:7:10:43:34
chr4	4276132	.	T	C	711.39	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.129638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.338;QD=54.7221;RBI=0.138109;REFB=-0.15546;REVB=0.0476258;RO=1;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192158;STB=0.5102;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00143937;OID=.;OPOS=4276132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:52:52:1:1:51:51:0.980769:24:27:0:1:24:27:0:1
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chr4	4304605	.	G	A	322.8	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.819;QD=53.7994;RBI=0.0576203;REFB=0;REVB=0.0308164;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105572;OID=.;OPOS=4304605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:13:10:0:0:13:11:0:0
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chr4	4322665	.	T	C	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.716;QD=57.2377;RBI=0.0465885;REFB=0;REVB=-0.0144696;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.65665e-05;OID=.;OPOS=4322665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:30:26:0:0:30:26:0:0
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chr4	5721021	.	A	C	491.02	PASS	AF=0.484848;AO=47;DP=98;FAO=48;FDP=99;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.0245371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.639;QD=19.8393;RBI=0.0379819;REFB=-0.00384693;REVB=0.0289923;RO=51;SAF=29;SAR=18;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282754;STB=0.508545;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.00309423;OID=.;OPOS=5721021;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:51:51:47:48:0.484848:18:29:30:21:19:29:30:21
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chr4	5990110	.	C	A	1600.14	PASS	AF=0.956522;AO=110;DP=116;FAO=110;FDP=115;FR=.;FRO=5;FSAF=67;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0113502;FXX=0.0170926;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.629;QD=55.6571;RBI=0.0209796;REFB=-0.149357;REVB=0.0176442;RO=3;SAF=67;SAR=43;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00304748;STB=0.500415;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.00064062;OID=.;OPOS=5990110;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:116:115:3:5:110:110:0.956522:43:67:2:1:43:67:3:2
chr4	5990339	.	G	A	885.08	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.575;QD=57.1018;RBI=0.0254918;REFB=0;REVB=0.0125462;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113889;OID=.;OPOS=5990339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:62:0:0:58:62:1:26:32:0:0:30:32:0:0
chr4	5990551	.	G	A	537.43	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1397;QD=59.714;RBI=0.0228367;REFB=0;REVB=-0.019928;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.63776e-05;OID=.;OPOS=5990551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr4	5990599	.	T	C	160.31	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.114;QD=45.8026;RBI=0.0236724;REFB=0;REVB=-0.0164807;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.31029e-06;OID=.;OPOS=5990599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr4	5990791	.	A	G	560.1	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175692;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.312;QD=60.5515;RBI=0.0275471;REFB=0;REVB=0.0212171;RO=0;SAF=29;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000241008;OID=.;OPOS=5990791;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:8:29:0:0:8:29:0:0
chr4	5991384	.	T	C	340.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0858589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.869;QD=54.5159;RBI=0.0858616;REFB=0;REVB=-0.000689375;RO=0;SAF=3;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.65945e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000743607;OID=.;OPOS=5991384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:22:3:0:0:22:3:0:0
chr4	5991448	.	G	A	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0537641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7342;QD=19.1082;RBI=0.0710583;REFB=0.0218945;REVB=0.0464619;RO=6;SAF=1;SAR=8;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280298;STB=0.66622;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.00756167;OID=.;OPOS=5991448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:8:1:2:4:8:1:2:4
chr4	5991476	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.954;QD=33.4284;RBI=0.0459786;REFB=0;REVB=0.0424915;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000696676;OID=.;OPOS=5991476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr4	6293696	.	C	G	3726.6	PASS	AF=1;AO=235;DP=236;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=128;FSAR=108;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518232;FXX=0.00421923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.115;QD=63.1627;RBI=0.0519112;REFB=-0.0215632;REVB=0.00302029;RO=1;SAF=127;SAR=108;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00373797;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.0591e-05;OID=.;OPOS=6293696;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:236:236:1:0:235:236:1:108:127:1:0:108:128:0:0
chr4	6302519	.	G	A	582.48	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0132562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.298;QD=58.2475;RBI=0.0626592;REFB=-0.14095;REVB=-0.0612409;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509799;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0027347;OID=.;OPOS=6302519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:0:1:39:39:0.975:25:14:0:0:25:14:0:1
chr4	6302707	.	C	T	793.11	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.121;QD=63.4485;RBI=0.0532383;REFB=0;REVB=0.0244264;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216711;OID=.;OPOS=6302707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:48:50:1:19:29:0:0:19:31:0:0
chr4	6303022	.	C	T	1116.96	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000853496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.018;QD=60.3763;RBI=0.0356756;REFB=0;REVB=-0.0356654;RO=0;SAF=55;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.84626e-05;OID=.;OPOS=6303022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:18:55:0:0:18:56:0:0
chr4	6303248	.	G	A	181.41	PASS	AF=0.353846;AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=65;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.00407416;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.54;QD=11.1635;RBI=0.00724174;REFB=-0.0203856;REVB=0.00598699;RO=42;SAF=9;SAR=14;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040303;STB=0.523384;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0339691;OID=.;OPOS=6303248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:42:42:23:23:0.353846:14:9:15:27:14:9:15:27
chr4	6303955	.	G	A	818.78	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.84;QD=57.4586;RBI=0.0515909;REFB=0;REVB=0.0158988;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100837;OID=.;OPOS=6303955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:54:57:0:0:54:57:1:23:31:0:0:25:32:0:0
chr4	6304087	.	A	G	727.96	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133223;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.687;QD=57.095;RBI=0.0205202;REFB=0;REVB=-0.0156075;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111805;OID=.;OPOS=6304087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:30:21:0:0:30:21:0:0
chr4	6304118	.	G	A	264.09	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=-0.00194838;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.919;QD=17.0379;RBI=0.010817;REFB=-0.0294896;REVB=0.0106401;RO=34;SAF=15;SAR=14;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241757;STB=0.629055;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0202388;OID=.;OPOS=6304118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:34:33:29:29:0.467742:14:15:9:25:14:15:9:24
chr4	6304242	.	T	C	687.35	PASS	AF=0.981132;AO=49;DP=51;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0221331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.1538;QD=51.8756;RBI=0.0314342;REFB=-0.0669893;REVB=0.0223212;RO=2;SAF=22;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00380022;STB=0.508471;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00258258;OID=.;OPOS=6304242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:53:2:1:49:52:0.981132:27:22:1:1:29:23:0:1
chr4	6304286	.	C	T	1008.44	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.914;QD=59.3198;RBI=0.0135399;REFB=0;REVB=-6.4029e-05;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.57943e-05;OID=.;OPOS=6304286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:40:28:0:0:40:28:0:0
chr4	6304344	.	G	A	394.32	PASS	AF=0.424528;AO=45;DP=106;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.00651605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.904;QD=14.88;RBI=0.00652161;REFB=-0.0131069;REVB=0.000269204;RO=57;SAF=21;SAR=24;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942431;STB=0.533319;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0176526;OID=.;OPOS=6304344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:57:61:45:45:0.424528:24:21:32:25:24:21:32:29
chr4	6325086	.	G	A	1315.28	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278523;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.076;QD=61.8953;RBI=0.0469694;REFB=0;REVB=0.0378202;RO=0;SAF=38;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144367;OID=.;OPOS=6325086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:85:0:0:82:85:1:44:38:0:0:45:40:0:0
chr4	6382919	.	C	CT,T	655.47	PASS	AF=0.106383,0.87234;AO=7,36;DP=47;FAO=5,41;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=2,18;FSAR=3,23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.017682,0.025187;FXX=0;HRUN=0,4;LEN=1,1;MLLD=191.693,201.364;QD=55.7844;RBI=0.0183645,0.0252431;REFB=-0.0766076,-0.0890052;REVB=-0.00495979,-0.00168196;RO=3;SAF=2,16;SAR=5,20;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.367917,-0.080007;STB=0.599598,0.513507;STBP=0.517,0.311;TYPE=ins,snp;VARB=0.00606222,-0.000827557;OID=.,.;OPOS=6382920,6382919;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:47:47:3:1:7,36:5,41:0.106383,0.87234:5,20:2,16:3:0:3,23:2,18:1:0
chr4	6594947	.	A	C	904.25	PASS	AF=0.942857;AO=61;DP=66;FAO=66;FDP=70;FR=.;FRO=4;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0222153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1983;QD=51.6714;RBI=0.0243532;REFB=-0.000970669;REVB=0.00997784;RO=4;SAF=27;SAR=34;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00673485;STB=0.501737;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.00253907;OID=.;OPOS=6594947;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:66:70:4:4:61:66:0.942857:34:27:2:2:35:31:2:2
chr4	6600002	.	GA	AG	72.46	PASS	AF=0.127273;AO=26;DP=223;FAO=28;FDP=220;FR=.,HEALED;FRO=192;FSAF=25;FSAR=3;FSRF=76;FSRR=116;FWDB=-0.111733;FXX=0.00452468;HRUN=4;LEN=2;MLLD=24.8467;QD=1.31737;RBI=0.11413;REFB=-0.0332978;REVB=-0.0232711;RO=167;SAF=26;SAR=0;SRF=55;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.763563;STB=0.907294;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.0826545;OID=.;OPOS=6600002;OREF=GA;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:223:220:167:192:26:28:0.127273:0:26:55:112:3:25:76:116
chr4	6600011	.	C	CG	841.72	PASS	AF=1;AO=30;DP=208;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.120672;FXX=0.421781;HRUN=0;LEN=1;MLLD=108.651;QD=27.5972;RBI=0.125659;REFB=0;REVB=0.0350524;RO=175;SAF=29;SAR=1;SRF=67;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.714135;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00240738;OID=.;OPOS=6600012;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:30:208:122:122:0:83:39:0:0:22:175:29:1:67:108
chr4	6600012	.	A	G	3257.14	PASS	AF=1;AO=203;DP=206;FAO=210;FDP=210;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611728;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.455;QD=62.0407;RBI=0.0656777;REFB=0;REVB=0.023905;RO=0;SAF=95;SAR=108;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.64953e-05;OID=.;OPOS=6600012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:206:210:0:0:203:210:1:108:95:0:0:109:101:0:0
chr4	6606864	.	A	C,G	633.35	PASS	AF=0.113636,0.863636;AO=5,37;DP=44;FAO=5,38;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=1,20;FSAR=4,18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00521106,0.040404;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=19.1243,83.7737;QD=57.5774;RBI=0.0218405,0.0609437;REFB=-0.102981,-0.0963513;REVB=0.0212097,0.0456252;RO=2;SAF=1,19;SAR=4,18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.413629,-0.0467732;STB=0.66592,0.512189;STBP=0.243,0.527;TYPE=snp,snp;VARB=0.183062,-0.00397265;OID=.,.;OPOS=6606864,6606864;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:24:44:44:2:1:5,37:5,38:0.113636,0.863636:4,18:1,19:2:0:4,18:1,20:1:0
chr4	6619165	.	A	G	645.94	PASS	AF=0.977273;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0341463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.07;QD=58.7214;RBI=0.0344098;REFB=-0.10409;REVB=0.00425021;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512189;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00179152;OID=.;OPOS=6619165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:44:0:1:42:43:0.977273:19:23:0:0:20:23:0:1
chr4	6619204	.	G	A	313.67	PASS	AF=0.658537;AO=27;DP=41;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0445067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5963;QD=30.6019;RBI=0.0918098;REFB=0.00892679;REVB=0.0803007;RO=14;SAF=11;SAR=16;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588612;STB=0.532323;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=-0.0027729;OID=.;OPOS=6619204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:14:14:27:27:0.658537:16:11:7:7:16:11:7:7
chr4	6698667	.	T	C	970.73	PASS	AF=0.985294;AO=65;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0219622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.248;QD=57.1017;RBI=0.0426042;REFB=-0.0419634;REVB=0.0365073;RO=1;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122705;STB=0.506171;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000293912;OID=.;OPOS=6698667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:1:1:65:67:0.985294:38:27:0:1:40:27:0:1
chr4	6698706	.	A	C	1026.33	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6426;QD=59.4977;RBI=0.015251;REFB=0;REVB=-0.0104468;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.46179e-06;OID=.;OPOS=6698706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:42:27:0:0:42:27:0:0
chr4	6718775	.	G	T	190.28	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=36;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=0.015796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.033;QD=19.0279;RBI=0.0205083;REFB=-0.00709548;REVB=0.0130797;RO=20;SAF=11;SAR=5;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20143;STB=0.571363;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00962283;OID=.;OPOS=6718775;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:40:20:20:16:20:0.5:5:11:17:3:5:15:17:3
chr4	6719092	.	TAGTC	T	61.09	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=41;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=-0.0130255;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=4;MLLD=351.295;QD=6.10926;RBI=0.0410744;REFB=-0.00553807;REVB=-0.0389543;RO=32;SAF=5;SAR=4;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.345553;STB=0.705519;STBP=0.247;TYPE=del;VARB=0.0227402;OID=.;OPOS=6719093;OREF=AGTC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.225:9:41:9:40:31:5:4:25:6:61:32:5:4:26:6
chr4	6884329	.	T	C	320.2	PASS	AF=0.8125;AO=24;DP=31;FAO=26;FDP=32;FR=.;FRO=6;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00849649;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=173.483;QD=40.0249;RBI=0.0353054;REFB=0.0369077;REVB=0.0342678;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538432;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=-0.00115731;OID=.;OPOS=6884329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:31:32:0:6:24:26:0.8125:11:13:0:0:12:14:2:4
chr4	6925237	.	C	G	522.97	PASS	AF=0.459016;AO=56;DP=122;FAO=56;FDP=122;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=-0.0232913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.217;QD=17.1465;RBI=0.0241336;REFB=-0.00834806;REVB=0.0063204;RO=66;SAF=21;SAR=35;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804703;STB=0.544856;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00883589;OID=.;OPOS=6925237;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:66:66:56:56:0.459016:35:21:30:36:35:21:30:36
chr4	7044357	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=4;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0356552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.608;QD=33.4285;RBI=0.0360859;REFB=0;REVB=0.00555897;RO=0;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.86674e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000823062;OID=.;OPOS=7044357;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:4:6:1:3:1:0:0:4:2:0:0
chr4	7044600	.	G	A	544.71	PASS	AF=0.60241;AO=49;DP=81;FAO=50;FDP=83;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0229294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8898;QD=26.2509;RBI=0.0338396;REFB=-0.0772297;REVB=0.024887;RO=31;SAF=20;SAR=29;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015544;STB=0.510666;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0581215;OID=.;OPOS=7044600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:83:31:33:49:50:0.60241:29:20:12:19:29:21:13:20
chr4	7057106	.	G	C	650.16	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.741;QD=61.9196;RBI=0.0460845;REFB=0;REVB=0.0113627;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142088;OID=.;OPOS=7057106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:42:0:0:40:42:1:20:20:0:0:21:21:0:0
chr4	7114091	.	C	T	318.76	PASS	AF=0.540984;AO=32;DP=61;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=-0.0132164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.367;QD=20.902;RBI=0.0138198;REFB=-0.0148344;REVB=-0.00403912;RO=28;SAF=12;SAR=20;SRF=5;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186836;STB=0.60821;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0120177;OID=.;OPOS=7114091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:28:28:32:33:0.540984:20:12:5:23:20:13:5:23
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chr4	7435379	.	A	G	1514.83	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0111239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5334;QD=62.467;RBI=0.101363;REFB=-0.0497847;REVB=-0.100751;RO=1;SAF=55;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114259;STB=0.506023;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.000205937;OID=.;OPOS=7435379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:41:55:0:1:41:55:0:1
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chr4	7461826	.	C	CCCA	123.49	PASS	AF=0.4375;AO=15;DP=34;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=-0.00111409;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=3;MLLD=209.89;QD=15.4368;RBI=0.0144976;REFB=-0.0233089;REVB=0.0144547;RO=19;SAF=11;SAR=4;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146986;STB=0.588122;STBP=0.488;TYPE=ins;VARB=0.031303;OID=.;OPOS=7461827;OREF=-;OALT=CCA;OMAPALT=CCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4375:15:34:14:32:18:10:4:15:3:99:19:11:4:16:3
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chr4	7714490	.	T	C	1272.05	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0143799;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1204;QD=60.5739;RBI=0.031259;REFB=-0.00983931;REVB=-0.027755;RO=1;SAF=29;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00869117;STB=0.504586;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.000690399;OID=.;OPOS=7714490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:84:1:1:83:83:0.988095:54:29:0:1:54:29:0:1
chr4	7716932	.	T	C	895.43	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.355;QD=56.8529;RBI=0.067249;REFB=0;REVB=0.0543474;RO=1;SAF=26;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177894;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124101;OID=.;OPOS=7716932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:63:1:0:56:63:1:30:26:1:0:32:31:0:0
chr4	7770723	.	G	T	707.86	PASS	AF=0.48951;AO=70;DP=143;FAO=70;FDP=143;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=0.0405194;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.695;QD=19.8003;RBI=0.0406993;REFB=-0.0180782;REVB=0.00382239;RO=72;SAF=32;SAR=38;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267371;STB=0.518454;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0190799;OID=.;OPOS=7770723;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:72:73:70:70:0.48951:38:32:35:37:38:32:36:37
chr4	7780582	.	C	T	193.65	PASS	AF=0.526316;AO=17;DP=37;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00260399;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.233;QD=20.3837;RBI=0.0299527;REFB=-0.0114325;REVB=0.0298393;RO=15;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00326109;STB=0.521717;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0348701;OID=.;OPOS=7780582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:15:18:17:20:0.526316:9:8:7:8:12:8:8:10
chr4	7783163	.	G	A	1329.99	PASS	AF=0.977528;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0488618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.597;QD=59.7748;RBI=0.0782958;REFB=-0.132262;REVB=0.061178;RO=2;SAF=54;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017225;STB=0.509089;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00134574;OID=.;OPOS=7783163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:89:89:2:2:87:87:0.977528:33:54:2:0:33:54:2:0
chr4	7802292	.	G	A	559.81	PASS	AF=0.491525;AO=58;DP=118;FAO=58;FDP=118;FR=.;FRO=60;FSAF=43;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=28;FWDB=0.00829378;FXX=0.00840265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.163;QD=18.9766;RBI=0.0085783;REFB=-0.00980328;REVB=-0.00219098;RO=60;SAF=43;SAR=15;SRF=32;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218621;STB=0.621677;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.012079;OID=.;OPOS=7802292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:60:60:58:58:0.491525:15:43:32:28:15:43:32:28
chr4	7857230	.	C	T	773.66	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5728;QD=63.1563;RBI=0.0441091;REFB=0;REVB=-0.0362786;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000448969;OID=.;OPOS=7857230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:47:49:1:20:27:0:0:20:29:0:0
chr4	7941901	.	A	C	611.75	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020809;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.294;QD=61.175;RBI=0.0208228;REFB=0;REVB=-0.000760403;RO=0;SAF=28;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.82332e-05;OID=.;OPOS=7941901;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:38:40:1:10:28:0:0:11:29:0:0
chr4	8021417	.	A	G	348.39	PASS	AF=0.461538;AO=27;DP=67;FAO=30;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00161733;FXX=0.0298463;HRUN=8;LEN=1;MLLD=249.227;QD=21.4395;RBI=0.03448;REFB=-0.0290123;REVB=-0.034442;RO=18;SAF=16;SAR=11;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148012;STB=0.579778;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0154642;OID=.;OPOS=8021417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:67:65:18:18:27:30:0.461538:11:16:7:11:12:18:7:11
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chr4	8031471	.	A	G	1077.51	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.656;QD=59.8618;RBI=0.0212826;REFB=0;REVB=-0.0180549;RO=0;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.92884e-05;OID=.;OPOS=8031471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:44:27:0:0:44:28:0:0
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chr4	8207083	.	A	G	154.06	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0551714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9549;QD=14.331;RBI=0.0624341;REFB=-0.0441733;REVB=-0.0292257;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092905;STB=0.553953;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0466145;OID=.;OPOS=8207083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:10:7:13:13:10:7:13:13
chr4	8228731	.	T	C	1791.86	PASS	AF=0.975806;AO=115;DP=115;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=50;FSAR=71;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.084848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.176;QD=57.802;RBI=0.0871271;REFB=-0.126104;REVB=0.019798;RO=0;SAF=45;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514561;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00264916;OID=.;OPOS=8228731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:115:124:0:3:115:121:0.975806:70:45:0:0:71:50:3:0
chr4	8228894	.	T	C	1497.96	PASS	AF=1;AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134412;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.143;QD=59.9184;RBI=0.0144954;REFB=0;REVB=-0.00542703;RO=0;SAF=56;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.99677e-05;OID=.;OPOS=8228894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:100:0:0:99:100:1:43:56:0:0:43:57:0:0
chr4	8228948	.	T	C	1510.45	PASS	AF=1;AO=95;DP=99;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00984874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2537;QD=58.6584;RBI=0.0165702;REFB=0;REVB=-0.0133256;RO=0;SAF=46;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.54876e-05;OID=.;OPOS=8228948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:99:103:0:0:95:103:1:49:46:0:0:52:51:0:0
chr4	8229218	.	A	G	1859.36	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.922;QD=61.4665;RBI=0.0133475;REFB=0;REVB=-0.00643228;RO=0;SAF=55;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.77649e-05;OID=.;OPOS=8229218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:66:55:0:0:66:55:0:0
chr4	8229326	.	T	C	736.61	PASS	AF=1;AO=48;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0620621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.74;QD=56.6626;RBI=0.0687165;REFB=0;REVB=-0.0295001;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000324272;OID=.;OPOS=8229326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:48:52:1:28:20:0:0:29:23:0:0
chr4	8229713	.	A	G	167.47	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.718;QD=41.8673;RBI=0.0154059;REFB=0.0343373;REVB=0.0154059;RO=1;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000283738;OID=.;OPOS=8229713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:15:0:0:1:15:0:0:1
chr4	8229774	.	C	T	130.44	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0927139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.516;QD=43.4798;RBI=0.0968021;REFB=0;REVB=0.0278346;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00323991;OID=.;OPOS=8229774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0
chr4	8230069	.	CT	C,CC	548.2	PASS	AF=0.0810811,0.918919;AO=4,34;DP=38;FAO=3,34;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,15;FSAR=3,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397785,0.0283154;FXX=0.0263089;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=143.662,166.051;QD=59.2646;RBI=0.0479913,0.0508559;REFB=0,0;REVB=0.0268484,0.0422441;RO=0;SAF=0,15;SAR=4,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.40663e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0585527,-0.00127949;OID=.,.;OPOS=8230070,8230070;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0810811,0.918919:4,34:38:3,34:37:0:0,15:3,19:0:0:10:0:0,15:4,19:0:0
chr4	8238151	.	C	T	2643.14	PASS	AF=0.912195;AO=187;DP=205;FAO=187;FDP=205;FR=.;FRO=18;FSAF=107;FSAR=80;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=3.68549e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.308;QD=51.5735;RBI=0.047737;REFB=-0.144487;REVB=0.047737;RO=18;SAF=107;SAR=80;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310316;STB=0.516358;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00113489;OID=.;OPOS=8238151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:205:205:18:18:187:187:0.912195:80:107:7:11:80:107:7:11
chr4	8242466	.	A	G	3229.91	PASS	AF=1;AO=201;DP=203;FAO=212;FDP=212;FR=.;FRO=0;FSAF=132;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.315;QD=60.9417;RBI=0.0471309;REFB=0;REVB=0.0259292;RO=0;SAF=127;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106814;OID=.;OPOS=8242466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:203:212:0:0:201:212:1:74:127:0:0:80:132:0:0
chr4	8394836	.	G	C	817.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.179;QD=57.3844;RBI=0.0153245;REFB=0;REVB=0.00154791;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.17984e-05;OID=.;OPOS=8394836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:26:31:0:0:26:31:0:0
chr4	8443041	.	C	T	680.09	PASS	AF=0.391753;AO=73;DP=191;FAO=76;FDP=194;FR=.;FRO=118;FSAF=26;FSAR=50;FSRF=62;FSRR=56;FWDB=-0.00461203;FXX=0.00512794;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.386;QD=14.0225;RBI=0.0513373;REFB=-0.00516837;REVB=0.0511297;RO=118;SAF=26;SAR=47;SRF=62;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188965;STB=0.614838;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00821581;OID=.;OPOS=8443041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:194:118:118:73:76:0.391753:47:26:62:56:50:26:62:56
chr4	8454639	.	A	G	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00629146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.086;QD=64.1539;RBI=0.0266446;REFB=0;REVB=0.0258912;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.1826e-05;OID=.;OPOS=8454639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0
chr4	8582742	.	C	T	420.51	PASS	AF=0.344156;AO=51;DP=151;FAO=53;FDP=154;FR=.;FRO=101;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=58;FSRR=43;FWDB=0.0317398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6267;QD=10.9224;RBI=0.0318432;REFB=-0.016224;REVB=0.00256442;RO=100;SAF=31;SAR=20;SRF=57;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451255;STB=0.520053;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0331837;OID=.;OPOS=8582742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:154:100:101:51:53:0.344156:20:31:57:43:21:32:58:43
chr4	8582856	.	T	G	490.74	PASS	AF=0.398551;AO=55;DP=138;FAO=55;FDP=138;FR=.;FRO=83;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=-0.0384754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7489;QD=14.2244;RBI=0.0414564;REFB=-0.024112;REVB=-0.015436;RO=82;SAF=31;SAR=24;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119198;STB=0.563613;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0287534;OID=.;OPOS=8582856;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:82:83:55:55:0.398551:24:31:37:45:24:31:38:45
chr4	8588901	.	C	T	267.1	PASS	AF=0.346535;AO=30;DP=96;FAO=35;FDP=101;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=0.000152715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.0859;QD=10.5782;RBI=0.0354222;REFB=-0.00479495;REVB=0.0354218;RO=65;SAF=15;SAR=15;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269721;STB=0.54774;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0125117;OID=.;OPOS=8588901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:101:65:66:30:35:0.346535:15:15:34:31:19:16:35:31
chr4	8594574	.	T	C	87.64	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.054;QD=38.9507;RBI=0.184744;REFB=0;REVB=0.183075;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00238098;OID=.;OPOS=8594574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:8:9:1:0:8:0:0:1:8:0:0
chr4	8601298	.	G	A	271.87	PASS	AF=0.517857;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0550515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2929;QD=19.4194;RBI=0.0567829;REFB=-0.0158334;REVB=0.0139151;RO=26;SAF=15;SAR=14;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144898;STB=0.570504;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0121064;OID=.;OPOS=8601298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:26:27:29:29:0.517857:14:15:9:17:14:15:10:17
chr4	8602884	.	T	C	428.97	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.62;QD=57.1964;RBI=0.0675871;REFB=0;REVB=-0.0645719;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00131215;OID=.;OPOS=8602884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr4	8602935	.	A	G	728.51	PASS	AF=1;AO=34;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.886;QD=57.1379;RBI=0.0210734;REFB=0;REVB=0.00913267;RO=0;SAF=30;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00046761;OID=.;OPOS=8602935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:34:51:1:4:30:0:0:21:30:0:0
chr4	8605818	.	C	T	603.08	PASS	AF=0.516949;AO=61;DP=118;FAO=61;FDP=118;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=0.0991653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3097;QD=20.4434;RBI=0.0993359;REFB=-0.0190765;REVB=-0.00581909;RO=55;SAF=30;SAR=31;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0478723;STB=0.534213;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0298459;OID=.;OPOS=8605818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:55:57:61:61:0.516949:31:30:24:31:31:30:24:33
chr4	8613786	.	C	T	300.31	PASS	AF=0.390805;AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.00480939;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.537;QD=13.8075;RBI=0.0156496;REFB=-0.0100927;REVB=0.0148923;RO=53;SAF=9;SAR=25;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301088;STB=0.67262;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0345297;OID=.;OPOS=8613786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:53:53:34:34:0.390805:25:9:28:25:25:9:28:25
chr4	8613867	.	G	A	165.75	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0073521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.991;QD=14.4129;RBI=0.00780492;REFB=-0.019925;REVB=0.00261979;RO=27;SAF=4;SAR=14;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192114;STB=0.604812;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0250669;OID=.;OPOS=8613867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:28:18:18:0.391304:14:4:10:17:14:4:10:18
chr4	8616096	.	T	C	896.95	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161372;FXX=0.0158705;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.787;QD=57.8675;RBI=0.0847311;REFB=0;REVB=-0.0831803;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108215;OID=.;OPOS=8616096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:62:62:0:0:62:62:1:26:36:0:0:26:36:0:0
chr4	8616179	.	T	C	1286.83	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131958;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1831;QD=62.0157;RBI=0.013212;REFB=0;REVB=-0.000654372;RO=0;SAF=47;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.43676e-06;OID=.;OPOS=8616179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:81:83:1:34:47:0:0:34:49:0:0
chr4	8621194	.	A	C,G	863.64	PASS	AF=0.0327869,0.967213;AO=3,58;DP=61;FAO=2,59;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=1,23;FSAR=1,36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188897,-0.00464921;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=227.264,94.7677;QD=56.6319;RBI=0.0195864,0.0434317;REFB=0,0;REVB=-0.00517761,0.0431822;RO=0;SAF=2,22;SAR=1,36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.122102,-0.000834154;OID=.,.;OPOS=8621194,8621194;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:61:61:0:0:3,58:2,59:0.0327869,0.967213:1,36:2,22:0:0:1,36:1,23:0:0
chr4	8951816	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.049265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=374.477;QD=37.4885;RBI=0.0495736;REFB=0;REVB=0.00552285;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224947;OID=.;OPOS=8951816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr4	9386295	.	C	A	136.71	PASS	AF=0.316667;AO=16;DP=57;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.00695943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.387;QD=9.11401;RBI=0.00965575;REFB=-0.00324052;REVB=-0.00669327;RO=35;SAF=13;SAR=3;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389489;STB=0.669446;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00518093;OID=.;OPOS=9386295;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:60:35:41:16:19:0.316667:3:13:18:17:6:13:18:23
chr4	9387462	.	C	T	454.84	PASS	AF=0.494505;AO=45;DP=91;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.0135267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.971;QD=19.9929;RBI=0.0160104;REFB=-0.0243958;REVB=-0.00856517;RO=46;SAF=16;SAR=29;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00770242;STB=0.504272;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0249414;OID=.;OPOS=9387462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:46:46:45:45:0.494505:29:16:16:30:29:16:16:30
chr4	9388034	.	T	C	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0183028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.432;QD=16.1985;RBI=0.0206693;REFB=0.0524102;REVB=0.00960351;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361596;STB=0.713517;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=-0.0290665;OID=.;OPOS=9388034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:3:2:3:0:3:2:3:0
chr4	9388888	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.518;QD=51.1846;RBI=0.039946;REFB=0;REVB=0.0270479;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146044;OID=.;OPOS=9388888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr4	9390660	.	A	G	50.3	PASS	AF=1;AO=4;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.139348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.66;QD=33.534;RBI=0.143826;REFB=0;REVB=0.0356084;RO=0;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.86674e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00250374;OID=.;OPOS=9390660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:4:6:1:3:1:0:0:5:1:0:0
chr4	9557815	.	TAGAAGG	T	87.75	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174461;FXX=0;HRUN=1;LEN=6;MLLD=337.45;QD=38.9996;RBI=0.0323172;REFB=0;REVB=0.0272036;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000226522;OID=.;OPOS=9557816;OREF=AGAAGG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:8:9:9:9:0:4:5:0:0:4:0:4:4:0:0
chr4	9784631	.	C	T	212.61	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.00735818;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.859;QD=14.4143;RBI=0.0272131;REFB=-0.0297147;REVB=-0.0261994;RO=29;SAF=16;SAR=9;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197752;STB=0.549316;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0293089;OID=.;OPOS=9784631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:59:29:34:25:25:0.423729:9:16:18:11:9:16:19:15
chr4	9982330	.	A	G	322.84	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000968578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4131;QD=53.807;RBI=0.0210861;REFB=0;REVB=0.0210638;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197592;OID=.;OPOS=9982330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:12:11:0:0:13:11:0:0
chr4	9998440	.	C	T	741.17	PASS	AF=0.979592;AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00718389;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.199;QD=60.5034;RBI=0.0930679;REFB=-0.0987071;REVB=0.0927902;RO=2;SAF=44;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232094;STB=0.55553;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.000765007;OID=.;OPOS=9998440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:49:49:2:1:47:48:0.979592:3:44:0:2:4:44:0:1
chr4	9998493	.	A	G	1552.59	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250111;FXX=0.010203;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.445;QD=64.0243;RBI=0.0344227;REFB=0;REVB=0.023651;RO=0;SAF=63;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-9.76468e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.55571e-05;OID=.;OPOS=9998493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:34:63:0:0:34:63:0:0
chr4	10022981	.	C	T	129.98	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0674702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.078;QD=13.3313;RBI=0.0675359;REFB=-0.0145584;REVB=0.00297839;RO=24;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628468;STB=0.536793;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0233876;OID=.;OPOS=10022981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:9:6:11:13:9:6:11:13
chr4	10027542	.	C	T	137.38	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.0205202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.511;QD=11.2145;RBI=0.0474913;REFB=-0.00268273;REVB=0.0428292;RO=33;SAF=6;SAR=10;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321785;STB=0.689431;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00776497;OID=.;OPOS=10027542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:33:33:16:16:0.326531:10:6:22:11:10:6:22:11
chr4	10090178	.	T	C	1188.46	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00656308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.822;QD=60.1752;RBI=0.0151814;REFB=0;REVB=-0.0136894;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.96426e-05;OID=.;OPOS=10090178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:79:0:0:77:79:1:38:39:0:0:38:41:0:0
chr4	10094671	.	G	A	114.02	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.00925555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195;QD=18.2425;RBI=0.0185094;REFB=-0.0170996;REVB=-0.0160291;RO=12;SAF=4;SAR=9;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249545;STB=0.63982;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0134385;OID=.;OPOS=10094671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:9:4:1:11:9:4:1:11
chr4	10099340	.	T	C	354.88	PASS	AF=0.422222;AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.027037;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.412;QD=15.7724;RBI=0.0270963;REFB=-0.0187006;REVB=-0.0017923;RO=52;SAF=16;SAR=22;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619486;STB=0.534976;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0245799;OID=.;OPOS=10099340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:90:52:52:38:38:0.422222:22:16:25:27:22:16:25:27
chr4	10442602	.	C	CTACTT	132.07	PASS	AF=0.326923;AO=16;DP=54;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0191454;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=5;MLLD=268.029;QD=10.1593;RBI=0.0332701;REFB=-0.0221021;REVB=-0.0272095;RO=35;SAF=14;SAR=2;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366034;STB=0.73393;STBP=0.046;TYPE=ins;VARB=0.0456682;OID=.;OPOS=10442603;OREF=-;OALT=TACTT;OMAPALT=CTACTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.326923:16:54:17:52:35:15:2:23:12:99:35:14:2:23:12
chr4	10442700	.	C	T	525.8	PASS	AF=0.563218;AO=49;DP=88;FAO=49;FDP=87;FR=.;FRO=38;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0580861;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.087;QD=24.1746;RBI=0.0712126;REFB=0.00429623;REVB=-0.0411976;RO=38;SAF=33;SAR=16;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373335;STB=0.520496;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=-0.00582749;OID=.;OPOS=10442700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:38:38:49:49:0.563218:16:33:24:14:16:33:24:14
chr4	10446385	.	C	T	833.01	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.065;QD=57.4487;RBI=0.0163118;REFB=0;REVB=0.0119439;RO=0;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.99318e-05;OID=.;OPOS=10446385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:21:36:0:0:22:36:0:0
chr4	10446906	.	A	G	769.69	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.76;QD=57.0142;RBI=0.0486114;REFB=0;REVB=0.0227095;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180659;OID=.;OPOS=10446906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:28:24:0:0:28:26:0:0
chr4	10447985	.	AT	AA,A	580.63	PASS	AF=0.0952381,0.904762;AO=6,34;DP=42;FAO=4,38;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=2,22;FSAR=2,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.136095,-0.144795;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=11.5425,23.7403;QD=55.2982;RBI=0.139234,0.168517;REFB=0,0;REVB=-0.0294,-0.0862104;RO=0;SAF=4,18;SAR=2,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0333439,-0.00039128;OID=.,.;OPOS=10447986,10447986;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0952381,0.904762:6,34:42:4,38:42:0:2,22:2,16:0:0:14:0:4,18:2,16:0:0
chr4	10502937	.	T	G	1080.21	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.594;QD=60.0115;RBI=0.0217301;REFB=0;REVB=0.014208;RO=0;SAF=49;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.11165e-06;OID=.;OPOS=10502937;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:23:49:0:0:23:49:0:0
chr4	10669522	.	A	C	329.01	PASS	AF=0.356522;AO=41;DP=115;FAO=41;FDP=115;FR=.;FRO=74;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=31;FSRR=43;FWDB=0.00465853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.232;QD=11.444;RBI=0.0153801;REFB=-0.0183352;REVB=0.0146576;RO=73;SAF=8;SAR=33;SRF=30;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298278;STB=0.679058;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0265812;OID=.;OPOS=10669522;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:73:74:41:41:0.356522:33:8:30:43:33:8:31:43
chr4	13545792	.	G	C,T	444.74	PASS	AF=0.0322581,0.967742;AO=2,29;DP=31;FAO=1,30;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=0,15;FSAR=1,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000121818,0.0289552;FXX=0.0312402;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=148.281,103.917;QD=57.3858;RBI=0.0321092,0.0822052;REFB=0,0;REVB=-0.032109,0.0769369;RO=0;SAF=1,14;SAR=1,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.92057e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0975245,0.000788996;OID=.,.;OPOS=13545792,13545792;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:31:31:0:0:2,29:1,30:0.0322581,0.967742:1,15:1,14:0:0:1,15:0,15:0:0
chr4	13548796	.	T	G	393.14	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00428572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6542;QD=56.163;RBI=0.0810552;REFB=0;REVB=0.0809418;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000843434;OID=.;OPOS=13548796;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr4	13606575	.	A	T	43.64	PASS	AF=0.129412;AO=8;DP=81;FAO=11;FDP=85;FR=.;FRO=74;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=45;FSRR=29;FWDB=-0.033157;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.437;QD=2.05383;RBI=0.0545643;REFB=-0.00137676;REVB=-0.0433345;RO=65;SAF=5;SAR=3;SRF=44;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675185;STB=0.616643;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.194789;OID=.;OPOS=13606575;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:81:85:65:74:8:11:0.129412:3:5:44:21:3:8:45:29
chr4	13606576	.	A	T	917.09	PASS	AF=0.833333;AO=68;DP=82;FAO=70;FDP=84;FR=.;FRO=14;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0006318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.1086;QD=43.6711;RBI=0.00829012;REFB=-0.000266891;REVB=0.00826601;RO=9;SAF=43;SAR=25;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0617781;STB=0.517723;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00132597;OID=.;OPOS=13606576;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:82:84:9:14:68:70:0.833333:25:43:8:1:27:43:10:4
chr4	15095619	.	G	GAGGGAGGAC	148.09	PASS	AF=0.220183;AO=23;DP=111;FAO=24;FDP=109;FR=.;FRO=85;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=50;FSRR=35;FWDB=-0.0226128;FXX=0;HRUN=1;LEN=9;MLLD=291.798;QD=5.43444;RBI=0.0452089;REFB=-0.00671423;REVB=-0.0391473;RO=87;SAF=14;SAR=9;SRF=50;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444109;STB=0.503934;STBP=0.978;TYPE=ins;VARB=0.0207693;OID=.;OPOS=15095620;OREF=-;OALT=AGGGAGGAC;OMAPALT=GAGGGAGGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.220183:23:111:24:109:85:14:10:50:35:99:87:14:9:50:37
chr4	15095629	.	G	A	95.05	PASS	AF=0.166667;AO=17;DP=102;FAO=17;FDP=102;FR=.;FRO=85;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=47;FSRR=38;FWDB=-0.0116595;FXX=0.0097078;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.714;QD=3.7276;RBI=0.0208351;REFB=-0.00928835;REVB=-0.0172672;RO=84;SAF=12;SAR=5;SRF=47;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196408;STB=0.636084;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0408993;OID=.;OPOS=15095629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:102:102:84:85:17:17:0.166667:5:12:47:37:5:12:47:38
chr4	15444077	.	G	A	347.6	PASS	AF=0.514286;AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.00789033;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9855;QD=19.8628;RBI=0.0318386;REFB=0.00913072;REVB=-0.0308454;RO=34;SAF=14;SAR=22;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248745;STB=0.637856;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.00936797;OID=.;OPOS=15444077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:34:34:36:36:0.514286:22:14:23:11:22:14:23:11
chr4	15482360	.	C	T	345.14	PASS	AF=0.375;AO=42;DP=112;FAO=42;FDP=112;FR=.;FRO=70;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=0.00219214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.164;QD=12.3265;RBI=0.0205071;REFB=-0.00453648;REVB=0.0203896;RO=69;SAF=21;SAR=21;SRF=29;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870726;STB=0.553546;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.00556219;OID=.;OPOS=15482360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:69:70:42:42:0.375:21:21:29:40:21:21:29:41
chr4	15516389	.	C	T	830.94	PASS	AF=0.485714;AO=85;DP=175;FAO=85;FDP=175;FR=.;FRO=90;FSAF=57;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=41;FWDB=-0.0465567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2973;QD=18.9929;RBI=0.0503526;REFB=0.000622716;REVB=-0.0191797;RO=90;SAF=57;SAR=28;SRF=49;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126404;STB=0.569901;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.0011636;OID=.;OPOS=15516389;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:175:90:90:85:85:0.485714:28:57:49:41:28:57:49:41
chr4	15518357	.	A	C	183.52	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0603215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.481;QD=17.904;RBI=0.0613497;REFB=-0.0051333;REVB=0.0111848;RO=22;SAF=6;SAR=13;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141531;STB=0.580917;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.00687307;OID=.;OPOS=15518357;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:13:6:10:12:13:6:10:12
chr4	15689928	.	G	A	183.99	PASS	AF=0.454545;AO=18;DP=43;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0157784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.635;QD=16.7262;RBI=0.0879406;REFB=-0.0232118;REVB=-0.0865135;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0970462;STB=0.572326;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0331488;OID=.;OPOS=15689928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:22:24:18:20:0.454545:10:8:12:10:11:9:14:10
chr4	15709252	.	G	A	625.83	PASS	AF=0.477612;AO=64;DP=134;FAO=64;FDP=134;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=42;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=0.00140462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.92;QD=18.6816;RBI=0.0059765;REFB=-0.00156573;REVB=-0.00580909;RO=58;SAF=22;SAR=42;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811723;STB=0.59296;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00125215;OID=.;OPOS=15709252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:58:70:64:64:0.477612:42:22:25:33:42:22:36:34
chr4	15713446	.	C	T	477.66	PASS	AF=0.534884;AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0340113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.621;QD=22.2168;RBI=0.0384913;REFB=-0.00610827;REVB=-0.0180225;RO=40;SAF=32;SAR=14;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445339;STB=0.524579;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.00764816;OID=.;OPOS=15713446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:40:40:46:46:0.534884:14:32:26:14:14:32:26:14
chr4	15724487	.	T	G	398.54	PASS	AF=0.414414;AO=46;DP=111;FAO=46;FDP=111;FR=.;FRO=65;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=0.0180568;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.136;QD=14.3618;RBI=0.0198624;REFB=-0.014563;REVB=-0.0082744;RO=63;SAF=34;SAR=12;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292764;STB=0.667159;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0287066;OID=.;OPOS=15724487;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:63:65:46:46:0.414414:12:34:30:33:12:34:31:34
chr4	15733454	.	A	C	389.09	PASS	AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.0100014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.156;QD=18.7515;RBI=0.0108471;REFB=-0.018689;REVB=0.00419892;RO=43;SAF=28;SAR=12;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768272;STB=0.542914;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0193911;OID=.;OPOS=15733454;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:43:43:40:40:0.481928:12:28:27:16:12:28:27:16
chr4	15739390	.	T	G	198.71	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00730833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.48;QD=19.3863;RBI=0.0228382;REFB=0.00214245;REVB=0.0216373;RO=21;SAF=6;SAR=14;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835471;STB=0.547437;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=-0.00263777;OID=.;OPOS=15739390;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:14:6:8:13:14:6:8:13
chr4	15850152	.	C	CT,T	91.11	PASS	AF=0.256098,0;AO=18,3;DP=85;FAO=21,0;FDP=82;FR=.;FRO=61;FSAF=20,0;FSAR=1,0;FSRF=39;FSRR=22;FWDB=-0.0608544,0.00294627;FXX=0.0120467;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=18.6819,244.057;QD=4.44416;RBI=0.0714417,0.00408893;REFB=-0.0205352,-0.00163637;REVB=0.0374253,0.00283528;RO=62;SAF=17,3;SAR=1,0;SRF=40;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.562604,0.376278;STB=0.885827,0.5;STBP=0.001,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0141203,0;OID=.,.;OPOS=15850153,15850152;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:85:82:62:61:18,3:21,0:0.256098,0:1,0:17,3:40:22:1,0:20,0:39:22
chr4	15937731	.	T	C	1252.97	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.5644;QD=58.2778;RBI=0.112714;REFB=0;REVB=0.0259626;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139326;OID=.;OPOS=15937731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:75:86:0:0:75:86:1:38:37:0:0:41:45:0:0
chr4	15964485	.	G	A	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00111099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.31;QD=14.0785;RBI=0.0068196;REFB=-0.00169947;REVB=-0.0067285;RO=16;SAF=1;SAR=11;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.517443;STB=0.814148;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0118692;OID=.;OPOS=15964485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:11:1:7:9:11:1:7:9
chr4	15964501	.	G	A	108.68	PASS	AF=0.433333;AO=12;DP=29;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0139315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8974;QD=14.4903;RBI=0.0354033;REFB=-0.0330778;REVB=0.032547;RO=15;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159493;STB=0.596717;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0606888;OID=.;OPOS=15964501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:15:17:12:13:0.433333:6:6:5:10:7:6:5:12
chr4	15964573	.	A	G	851.24	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.481;QD=57.7115;RBI=0.0197807;REFB=0;REVB=-0.00395043;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03673e-05;OID=.;OPOS=15964573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0
chr4	15964763	.	C	T	173.13	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0143502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.839;QD=18.7169;RBI=0.0243375;REFB=-0.0188629;REVB=0.0196567;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237684;STB=0.513498;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0239107;OID=.;OPOS=15964763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:9:9:10:9:9:9:10:9
chr4	15977823	.	A	C	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0329449;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=243.209;QD=17.157;RBI=0.0399391;REFB=-0.0177271;REVB=-0.0225779;RO=19;SAF=7;SAR=10;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201429;STB=0.601147;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0247257;OID=.;OPOS=15977823;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:20:17:17:0.459459:10:7:12:7:10:7:12:8
chr4	15977828	.	C	G	144.74	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0633279;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.965;QD=15.6474;RBI=0.063376;REFB=-0.0166649;REVB=0.00246775;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131328;STB=0.575663;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0148454;OID=.;OPOS=15977828;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:9:7:12:9:9:7:12:9
chr4	16037352	.	C	T	256.29	PASS	AF=0.394737;AO=31;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=-0.0254632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.164;QD=13.4888;RBI=0.025742;REFB=-0.00326132;REVB=0.00377859;RO=44;SAF=13;SAR=18;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161221;STB=0.561758;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.00528584;OID=.;OPOS=16037352;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:46:31:30:0.394737:18:13:12:32:18:12:14:32
chr4	16504764	.	TA	AA,TAA,T	31.87	PASS	AF=0,0.424242,0;AO=5,7,5;DP=33;FAO=0,14,0;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=0,7,0;FSAR=0,7,0;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00989351,0.13,-0.125522;FXX=0;HRUN=1,7,7;LEN=1,1,1;MLLD=310.891,6.52679,12.8083;QD=3.86286;RBI=0.0348173,0.187944,0.1809;REFB=-0.0050983,-0.0829966,0.0636464;REVB=0.0333821,0.135731,-0.130265;RO=16;SAF=5,1,3;SAR=0,6,2;SRF=9;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.686156,-0.502797,0.0437048;STB=0.5,0.54539,0.5;STBP=1,0.638,1;TYPE=snp,ins,del;VARB=0,0.112495,0;OID=.,.,.;OPOS=16504764,16504765,16504765;OREF=T,-,A;OALT=A,A,-;OMAPALT=AA,TAA,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:35:33:33:16:19:5,7,5:0,14,0:0,0.424242,0:0,6,2:5,1,3:9:7:0,7,0:0,7,0:11:8
chr4	16675898	.	C	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480502;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.05;QD=47.8224;RBI=0.0504188;REFB=0;REVB=0.0152718;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000518773;OID=.;OPOS=16675898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:3:13:0:0:3:13:0:0
chr4	17488286	.	T	G	117.75	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0159223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.416;QD=12.3948;RBI=0.0183055;REFB=-0.00805221;REVB=-0.00903169;RO=24;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.013868;OID=.;OPOS=17488286;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:7:7:12:12:7:7:12:12
chr4	17488346	.	G	A	105.32	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0323154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.634;QD=11.0866;RBI=0.0323533;REFB=-0.00150497;REVB=-0.00156597;RO=23;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648377;STB=0.538402;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.00327238;OID=.;OPOS=17488346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:25:13:13:0.342105:6:7:11:12:6:7:12:13
chr4	17488351	.	T	C	105.77	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.013489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.869;QD=11.4346;RBI=0.0167404;REFB=-0.000828331;REVB=-0.00991409;RO=24;SAF=7;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420088;STB=0.524961;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.00194878;OID=.;OPOS=17488351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:6:7:12:12:6:7:12:12
chr4	17503433	.	C	T	223.52	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0090075;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4144;QD=14.6571;RBI=0.0362978;REFB=-0.0105591;REVB=-0.0351624;RO=35;SAF=10;SAR=16;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243747;STB=0.638299;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0120799;OID=.;OPOS=17503433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:35:35:26:26:0.42623:16:10:22:13:16:10:22:13
chr4	17517099	.	A	G	214.22	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0413481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4076;QD=45.0979;RBI=0.0418987;REFB=0.00782899;REVB=0.00677024;RO=1;SAF=14;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0316909;STB=0.517223;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=-0.00180232;OID=.;OPOS=17517099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:4:14:1:0:4:14:1:0
chr4	17586703	.	T	C	913.54	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00683458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.091;QD=58.0028;RBI=0.020313;REFB=0;REVB=0.0191287;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.13673e-05;OID=.;OPOS=17586703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0
chr4	17627294	.	A	G	732.21	PASS	AF=0.979167;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0348097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.006;QD=61.0178;RBI=0.0494067;REFB=0.0239345;REVB=0.0350615;RO=1;SAF=30;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015416;STB=0.507933;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=5.22752e-05;OID=.;OPOS=17627294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:48:1:1:46:47:0.979167:16:30:1:0:16:31:1:0
chr4	17627332	.	T	C	357.48	PASS	AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0146402;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=348.832;QD=49.3069;RBI=0.0148635;REFB=0.0299633;REVB=-0.00256652;RO=2;SAF=22;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404292;STB=0.521723;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=-0.000781209;OID=.;OPOS=17627332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:5:22:2:0:5:22:2:0
chr4	17634213	.	A	G	865.75	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.3826;QD=57.7168;RBI=0.146608;REFB=0;REVB=0.14495;RO=0;SAF=38;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00167859;OID=.;OPOS=17634213;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:60:0:0:56:60:1:18:38:0:0:22:38:0:0
chr4	17660082	.	C	T	1249.14	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460588;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0543;QD=61.6858;RBI=0.0502569;REFB=0;REVB=0.0201082;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116201;OID=.;OPOS=17660082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:43:38:0:0:43:38:0:0
chr4	17694943	.	A	G	619.79	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0108401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0339;QD=59.0278;RBI=0.0179179;REFB=-0.0331948;REVB=0.0142669;RO=1;SAF=21;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218198;STB=0.511622;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00122703;OID=.;OPOS=17694943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:20:21:1:0:20:21:1:0
chr4	17711076	.	T	C	738.54	PASS	AF=0.489796;AO=71;DP=149;FAO=72;FDP=147;FR=.,HEALED;FRO=75;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=49;FSRR=26;FWDB=-0.0610197;FXX=0.0134219;HRUN=4;LEN=1;MLLD=202.894;QD=20.0964;RBI=0.0615167;REFB=-0.0299519;REVB=-0.00780424;RO=56;SAF=37;SAR=34;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262665;STB=0.564702;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.02669;OID=.;OPOS=17711076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:147:56:75:71:72:0.489796:34:37:31:25:34:38:49:26
chr4	17802388	.	C	T	133.47	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0134919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.107;QD=15.7024;RBI=0.014962;REFB=-0.0167834;REVB=-0.00646764;RO=19;SAF=3;SAR=12;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267316;STB=0.656484;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00912386;OID=.;OPOS=17802388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:12:3:8:11:12:3:8:11
chr4	17805379	.	G	A	174.58	PASS	AF=0.275862;AO=24;DP=87;FAO=24;FDP=87;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=-0.0102101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9159;QD=8.02646;RBI=0.0113014;REFB=-0.000757711;REVB=0.0048452;RO=62;SAF=13;SAR=11;SRF=22;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223496;STB=0.637027;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00352094;OID=.;OPOS=17805379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:62:63:24:24:0.275862:11:13:22:40:11:13:22:41
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chr4	17829990	.	G	C	789.57	PASS	AF=0.531915;AO=75;DP=140;FAO=75;FDP=141;FR=.;FRO=66;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.0259451;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5223;QD=22.3991;RBI=0.0502703;REFB=-0.0164234;REVB=0.0430575;RO=65;SAF=40;SAR=35;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217898;STB=0.508537;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0147396;OID=.;OPOS=17829990;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:141:65:66:75:75:0.531915:35:40:33:32:35:40:34:32
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chr4	19183454	.	A	G	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.00250537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.79;QD=11.8306;RBI=0.0333317;REFB=-0.010734;REVB=-0.0332374;RO=18;SAF=5;SAR=6;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392632;STB=0.72693;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0117183;OID=.;OPOS=19183454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:6:5:15:3:6:5:15:3
chr4	20520993	.	T	C	546.28	PASS	AF=0.906977;AO=38;DP=42;FAO=39;FDP=43;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0107279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.747;QD=50.8164;RBI=0.0499195;REFB=-0.128583;REVB=0.0487532;RO=1;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302093;STB=0.532261;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.00757418;OID=.;OPOS=20520993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:42:43:1:4:38:39:0.906977:15:23:0:1:16:23:1:3
chr4	20621987	.	G	A	254.66	PASS	AF=0.379747;AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.00326371;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.025;QD=12.8941;RBI=0.033022;REFB=-0.0197809;REVB=-0.0328603;RO=47;SAF=14;SAR=16;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242869;STB=0.527009;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.028796;OID=.;OPOS=20621987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:47:49:30:30:0.379747:16:14:23:24:16:14:25:24
chr4	20622009	.	C	T	268.93	PASS	AF=0.359551;AO=31;DP=88;FAO=32;FDP=89;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0417636;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.8932;QD=12.0868;RBI=0.0531199;REFB=-0.00550302;REVB=0.0328258;RO=57;SAF=14;SAR=17;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642281;STB=0.54581;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0103329;OID=.;OPOS=20622009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:57:57:31:32:0.359551:17:14:29:28:18:14:29:28
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chr4	20731688	.	A	G	553.16	PASS	AF=0.579545;AO=50;DP=87;FAO=51;FDP=88;FR=.;FRO=37;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0104834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.73;QD=25.1438;RBI=0.0106504;REFB=-0.0116466;REVB=-0.00187882;RO=35;SAF=36;SAR=14;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129575;STB=0.58968;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00843047;OID=.;OPOS=20731688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:35:37:50:51:0.579545:14:36:20:15:14:37:20:17
chr4	20733708	.	C	A,CA	414.01	PASS	AF=0,0.888889;AO=5,31;DP=58;FAO=0,48;FDP=54;FR=.;FRO=6;FSAF=0,26;FSAR=0,22;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0144894,0.101232;FXX=0.0181785;HRUN=1,5;LEN=1,1;MLLD=241.495,13.3146;QD=30.667;RBI=0.0384121,0.275081;REFB=-0.00197002,0.0820761;REVB=-0.0355745,-0.255777;RO=19;SAF=0,16;SAR=5,15;SRF=14;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.763434,-0.154086;STB=0.5,0.504656;STBP=1,0.912;TYPE=snp,ins;VARB=0,-0.00178413;OID=.,.;OPOS=20733708,20733709;OREF=C,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:16:58:54:19:6:5,31:0,48:0,0.888889:5,15:0,16:14:5:0,22:0,26:3:3
chr4	20751278	.	A	G	203.34	PASS	AF=0.378788;AO=24;DP=65;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.0109274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.349;QD=12.3234;RBI=0.0113725;REFB=-0.0100631;REVB=0.00315025;RO=41;SAF=13;SAR=11;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130586;STB=0.58673;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0179022;OID=.;OPOS=20751278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:41:41:24:25:0.378788:11:13:27:14:12:13:27:14
chr4	20852166	.	A	G	290.06	PASS	AF=0.565217;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.000296332;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.299;QD=25.2225;RBI=0.0147704;REFB=0.00111891;REVB=0.0147674;RO=20;SAF=17;SAR=9;SRF=17;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181755;STB=0.59993;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=-0.00201907;OID=.;OPOS=20852166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:20:20:26:26:0.565217:9:17:17:3:9:17:17:3
chr4	20852244	.	A	G	312.06	PASS	AF=0.515625;AO=31;DP=62;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=0.115009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7952;QD=19.5036;RBI=0.115242;REFB=0.00197426;REVB=-0.00733021;RO=30;SAF=21;SAR=10;SRF=25;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169416;STB=0.580202;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-9.43933e-05;OID=.;OPOS=20852244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:30:31:31:33:0.515625:10:21:25:5:11:22:25:6
chr4	21950259	.	A	G	3115.4	PASS	AF=1;AO=190;DP=191;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000110014;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.615;QD=60.7882;RBI=0.0320192;REFB=0;REVB=0.032019;RO=0;SAF=86;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.72978e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.81585e-05;OID=.;OPOS=21950259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:191:205:0:0:190:205:1:104:86:0:0:119:86:0:0
chr4	22416195	.	C	G	244.06	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=51;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0636148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8674;QD=18.7741;RBI=0.0709117;REFB=-0.0412317;REVB=0.0313308;RO=26;SAF=10;SAR=15;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126906;STB=0.578252;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0252725;OID=.;OPOS=22416195;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:26:26:25:26:0.5:15:10:14:12:16:10:14:12
chr4	22425877	.	A	G	390.36	PASS	AF=0.431373;AO=44;DP=101;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=33;FWDB=0.0278337;FXX=0.0192289;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.321;QD=15.3082;RBI=0.0351495;REFB=-0.0315288;REVB=-0.0214656;RO=57;SAF=22;SAR=22;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794328;STB=0.539198;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0322533;OID=.;OPOS=22425877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:57:58:44:44:0.431373:22:22:24:33:22:22:25:33
chr4	22439914	.	A	C	1484.72	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.163;QD=63.1796;RBI=0.0278891;REFB=0;REVB=0.0259704;RO=0;SAF=50;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.16272e-05;OID=.;OPOS=22439914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:44:50:0:0:44:50:0:0
chr4	22444692	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00708947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.355;QD=46.848;RBI=0.0293501;REFB=0;REVB=0.0284811;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257122;OID=.;OPOS=22444692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:11:4:0:0:11:4:0:0
chr4	22457478	.	C	T	1171.88	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0620301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1998;QD=60.877;RBI=0.0693759;REFB=0;REVB=-0.031069;RO=0;SAF=33;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000666257;OID=.;OPOS=22457478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:44:33:0:0:44:33:0:0
chr4	22820504	.	A	T	174.09	PASS	AF=0.315068;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=73;FR=.;FRO=50;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.00234871;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.659;QD=9.53934;RBI=0.00921514;REFB=-0.00640994;REVB=-0.0089108;RO=49;SAF=7;SAR=16;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332363;STB=0.701248;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0171243;OID=.;OPOS=22820504;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:49:50:23:23:0.315068:16:7:29:20:16:7:30:20
chr4	23815522	.	C	T	913.2	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.581;QD=57.0752;RBI=0.0738326;REFB=0;REVB=0.0410399;RO=1;SAF=36;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129378;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000415898;OID=.;OPOS=23815522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:64:64:1:0:63:64:1:27:36:1:0:27:37:0:0
chr4	23815662	.	C	T	1324.84	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00322694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.952;QD=60.9123;RBI=0.0080106;REFB=-0.132314;REVB=-0.00733189;RO=1;SAF=46;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101887;STB=0.505375;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000608146;OID=.;OPOS=23815662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:1:1:86:86:0.988506:40:46:1:0:40:46:1:0
chr4	23815924	.	T	C	1422.1	PASS	AF=0.98913;AO=90;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0105522;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.418;QD=61.8302;RBI=0.0513539;REFB=-0.00640651;REVB=0.0502581;RO=0;SAF=40;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21981e-08;STB=0.506023;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000162409;OID=.;OPOS=23815924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:0:1:90:91:0.98913:50:40:0:0:50:41:1:0
chr4	23886323	.	G	T	254.09	PASS	AF=0.509091;AO=27;DP=54;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0127866;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.524;QD=18.4792;RBI=0.0204724;REFB=-0.0256867;REVB=0.0159881;RO=26;SAF=12;SAR=15;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149116;STB=0.580588;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0278152;OID=.;OPOS=23886323;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:26:27:27:28:0.509091:15:12:16:10:15:13:17:10
chr4	24534687	.	T	C	240.33	PASS	AF=0.345238;AO=29;DP=85;FAO=29;FDP=84;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.00368805;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5296;QD=11.4442;RBI=0.00771594;REFB=-0.0104719;REVB=0.00677746;RO=51;SAF=12;SAR=17;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247934;STB=0.502957;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0112245;OID=.;OPOS=24534687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:51:55:29:29:0.345238:17:12:20:31:17:12:23:32
chr4	24801315	.	G	A	469.36	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0643591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.516;QD=56.8923;RBI=0.157345;REFB=0;REVB=0.14358;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160191;OID=.;OPOS=24801315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:32:33:1:16:16:0:0:17:16:0:0
chr4	24801949	.	C	T	76.36	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.153716;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.712;QD=25.4523;RBI=0.234944;REFB=0.040968;REVB=0.17768;RO=3;SAF=7;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157021;STB=0.588061;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00518056;OID=.;OPOS=24801949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:12:3:3:9:9:0.75:2:7:3:0:2:7:3:0
chr4	24801976	.	T	C	167.43	PASS	AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.00729684;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.783;QD=23.0931;RBI=0.0137503;REFB=-0.0103337;REVB=0.0116544;RO=12;SAF=11;SAR=6;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0857078;STB=0.547891;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0066523;OID=.;OPOS=24801976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:6:11:9:3:6:11:9:3
chr4	24802323	.	G	C	418.41	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00631086;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.257;QD=53.9881;RBI=0.017475;REFB=-0.129312;REVB=0.0162957;RO=1;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300657;STB=0.516118;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.000588608;OID=.;OPOS=24802323;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:15:15:0:1:15:15:0:1
chr4	24802412	.	T	C	216.68	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.022486;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.225;QD=13.3343;RBI=0.0230672;REFB=-0.0255542;REVB=-0.00514531;RO=37;SAF=10;SAR=16;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795448;STB=0.563058;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0371342;OID=.;OPOS=24802412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:39:26:26:0.4:16:10:17:20:16:10:19:20
chr4	25001439	.	T	C	2139.04	PASS	AF=1;AO=134;DP=137;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0595924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2367;QD=61.555;RBI=0.0604833;REFB=-0.05702;REVB=0.0103425;RO=1;SAF=62;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00760521;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000416327;OID=.;OPOS=25001439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:137:139:1:0:134:139:1:72:62:1:0:76:63:0:0
chr4	25005193	.	G	A	1156.65	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123984;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.721;QD=60.8761;RBI=0.0241465;REFB=0;REVB=0.0207203;RO=0;SAF=51;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.19274e-06;OID=.;OPOS=25005193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:25:51:0:0:25:51:0:0
chr4	25127399	.	T	C	87.13	PASS	AF=0.232143;AO=13;DP=56;FAO=13;FDP=56;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=13;FWDB=0.00257851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.815;QD=6.22324;RBI=0.0359984;REFB=0.000143217;REVB=0.0359059;RO=43;SAF=8;SAR=5;SRF=30;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110647;STB=0.568762;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=9.28938e-05;OID=.;OPOS=25127399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:56:56:43:43:13:13:0.232143:5:8:30:13:5:8:30:13
chr4	25363901	.	T	A	314.53	PASS	AF=0.36;AO=35;DP=99;FAO=36;FDP=100;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=42;FWDB=0.0288432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2258;QD=12.5813;RBI=0.0607331;REFB=0.00522059;REVB=0.0534469;RO=62;SAF=24;SAR=11;SRF=20;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.392624;STB=0.70119;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00820325;OID=.;OPOS=25363901;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:62:64:35:36:0.36:11:24:20:42:12:24:22:42
chr4	25678199	.	A	G	801.4	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.188;QD=57.2431;RBI=0.0340174;REFB=0;REVB=0.00686189;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148302;OID=.;OPOS=25678199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:24:31:0:0:24:32:0:0
chr4	25760693	.	A	G	213.24	PASS	AF=0.446809;AO=18;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.021799;FXX=0.020829;HRUN=5;LEN=1;MLLD=74.1549;QD=18.1477;RBI=0.064055;REFB=-0.0423221;REVB=-0.0602316;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=17;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401113;STB=0.547126;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0408331;OID=.;OPOS=25760693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:26:18:21:0.446809:9:9:17:1:9:12:17:9
chr4	25915648	.	G	A	62.39	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=32;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0179564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.364;QD=7.79846;RBI=0.0194578;REFB=-0.0253365;REVB=0.00749501;RO=23;SAF=4;SAR=5;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391836;STB=0.524421;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.040309;OID=.;OPOS=25915648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:32:32:23:23:9:9:0.28125:5:4:11:12:5:4:11:12
chr4	25915826	.	G	A	163.13	PASS	AF=0.418605;AO=15;DP=40;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=4;FWDB=0.00623491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.172;QD=15.1752;RBI=0.0101933;REFB=-0.0201766;REVB=-0.00806405;RO=25;SAF=6;SAR=9;SRF=21;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.449857;STB=0.721185;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0166935;OID=.;OPOS=25915826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:43:25:25:15:18:0.418605:9:6:21:4:10:8:21:4
chr4	26673761	.	T	A	330.72	PASS	AF=0.376147;AO=36;DP=107;FAO=41;FDP=109;FR=.;FRO=68;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.0101815;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=37.4412;QD=12.1366;RBI=0.0939654;REFB=-0.0150755;REVB=-0.0934122;RO=32;SAF=29;SAR=7;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319827;STB=0.690192;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0131932;OID=.;OPOS=26673761;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:109:32:68:36:41:0.376147:7:29:16:16:9:32:35:33
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chr4	27004011	.	G	A	785.72	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0827;QD=64.1402;RBI=0.061534;REFB=0;REVB=-0.0475699;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102776;OID=.;OPOS=27004011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:30:19:0:0:30:19:0:0
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chr4	36163128	.	G	A	238.22	PASS	AF=0.349398;AO=28;DP=83;FAO=29;FDP=83;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.0144112;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.479;QD=11.4804;RBI=0.0163429;REFB=-0.0195038;REVB=-0.00770762;RO=55;SAF=14;SAR=14;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725507;STB=0.524983;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.028963;OID=.;OPOS=36163128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:55:54:28:29:0.349398:14:14:31:24:14:15:30:24
chr4	36258197	.	T	C	3621.28	PASS	AF=0.991416;AO=231;DP=234;FAO=231;FDP=233;FR=.;FRO=2;FSAF=114;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.014428;FXX=0.00427332;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.143;QD=62.1679;RBI=0.0432906;REFB=-0.0686533;REVB=0.0408155;RO=2;SAF=114;SAR=117;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00807575;STB=0.504237;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.000407929;OID=.;OPOS=36258197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:234:233:2:2:231:231:0.991416:117:114:0:2:117:114:0:2
chr4	36292018	.	T	A	921.15	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0658981;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7308;QD=56.6858;RBI=0.0681339;REFB=-0.0564649;REVB=0.0173111;RO=1;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140981;STB=0.50746;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00130697;OID=.;OPOS=36292018;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:33:31:0:1:33:31:0:1
chr4	37327583	.	A	C	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00546345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.929;QD=17.321;RBI=0.0532257;REFB=-0.00161345;REVB=0.0529446;RO=18;SAF=13;SAR=3;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12351;STB=0.571332;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00185861;OID=.;OPOS=37327583;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:3:13:13:5:3:13:13:5
chr4	37435524	.	C	T	302.98	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.0182854;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.99;QD=16.832;RBI=0.0253335;REFB=-0.0299801;REVB=0.0175337;RO=38;SAF=19;SAR=14;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162621;STB=0.580712;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0213314;OID=.;OPOS=37435524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:38:39:33:33:0.458333:14:19:28:10:14:19:28:11
chr4	37593173	.	G	A	149.65	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.014542;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.067;QD=11.9718;RBI=0.0229614;REFB=-0.00670403;REVB=-0.0177694;RO=33;SAF=5;SAR=12;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348776;STB=0.70564;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00980559;OID=.;OPOS=37593173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:12:5:20:13:12:5:20:13
chr4	37612486	.	T	A	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.022;QD=59.838;RBI=0.0352403;REFB=0;REVB=0.0335654;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.22854e-05;OID=.;OPOS=37612486;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:10:26:0:0:10:26:0:0
chr4	37836302	.	T	C	1081.48	PASS	AF=0.533679;AO=100;DP=189;FAO=103;FDP=193;FR=.;FRO=90;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=53;FSRR=37;FWDB=0.0402056;FXX=0.00515437;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.1659;QD=22.4142;RBI=0.0540026;REFB=0.00222788;REVB=0.0360526;RO=88;SAF=48;SAR=52;SRF=52;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0947515;STB=0.557105;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=-0.000692835;OID=.;OPOS=37836302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:193:88:90:100:103:0.533679:52:48:52:36:55:48:53:37
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chr4	37962186	.	G	C	411.02	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00152034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7059;QD=56.6928;RBI=0.0496704;REFB=0;REVB=0.0496471;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000821555;OID=.;OPOS=37962186;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr4	38016395	.	T	G	606.85	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0499752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.083;QD=60.6851;RBI=0.0528153;REFB=0;REVB=0.0170859;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108651;OID=.;OPOS=38016395;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:21:17:0:0:21:19:0:0
chr4	38023302	.	C	G	498.28	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00926164;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=284.049;QD=56.946;RBI=0.027906;REFB=0;REVB=0.0263242;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138421;OID=.;OPOS=38023302;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:35:35:0:0:34:35:1:17:17:0:0:18:17:0:0
chr4	38062233	.	T	A	591.75	PASS	AF=0.952381;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00570906;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=175.252;QD=56.3574;RBI=0.0091417;REFB=0.0472995;REVB=0.00713984;RO=2;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046837;STB=0.524987;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=-0.000567692;OID=.;OPOS=38062233;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:42:42:2:2:40:40:0.952381:19:21:0:2:19:21:0:2
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chr4	38690459	.	TA	T,TC	96.72	PASS	AF=0.513889,0;AO=27,3;DP=72;FAO=37,0;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=28,0;FSAR=9,0;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.243641,-0.0567914;FXX=0.0136968;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=7.18719,137.994;QD=5.37323;RBI=0.260265,0.0570978;REFB=-0.177449,-0.0248464;REVB=0.0915268,-0.00590709;RO=31;SAF=19,3;SAR=8,0;SRF=8;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.41251,0.665535;STB=0.701582,0.5;STBP=0.002,1;TYPE=del,snp;VARB=0.153302,0;OID=.,.;OPOS=38690460,38690460;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=T,TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.513889,0:27,3:72:37,0:72:35:28,0:9,0:13:22:98:31:19,3:8,0:8:23
chr4	38774785	.	A	G	230.05	PASS	AF=0.480769;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.00923086;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.9463;QD=17.6964;RBI=0.0205011;REFB=-0.0279166;REVB=0.0183054;RO=25;SAF=12;SAR=13;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142116;STB=0.596255;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0328934;OID=.;OPOS=38774785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:25:27:25:25:0.480769:13:12:16:9:13:12:18:9
chr4	38774889	.	T	C	745.28	PASS	AF=0.517986;AO=72;DP=140;FAO=72;FDP=139;FR=.;FRO=67;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=38;FWDB=0.014911;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.073;QD=21.4469;RBI=0.0306866;REFB=0.00822929;REVB=0.0268204;RO=67;SAF=38;SAR=34;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0831342;STB=0.545659;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.00618925;OID=.;OPOS=38774889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:139:67:67:72:72:0.517986:34:38:29:38:34:38:29:38
chr4	38775040	.	A	G	610.07	PASS	AF=0.572917;AO=55;DP=96;FAO=55;FDP=96;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0408885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9698;QD=25.4194;RBI=0.0504438;REFB=-0.00133355;REVB=0.0295417;RO=41;SAF=27;SAR=28;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927123;STB=0.550663;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00126986;OID=.;OPOS=38775040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:41:41:55:55:0.572917:28:27:25:16:28:27:25:16
chr4	38776070	.	C	T	144.7	PASS	AF=0.333333;AO=19;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=-0.057042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5491;QD=10.1541;RBI=0.108367;REFB=-0.0103251;REVB=-0.0921386;RO=38;SAF=12;SAR=7;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373074;STB=0.716838;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0170768;OID=.;OPOS=38776070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:38:38:19:19:0.333333:7:12:11:27:7:12:11:27
chr4	38776180	.	C	A	202.42	PASS	AF=0.666667;AO=19;DP=28;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0129597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7244;QD=26.9897;RBI=0.0417437;REFB=-0.0226103;REVB=-0.0396811;RO=9;SAF=9;SAR=10;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148089;STB=0.566601;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00925388;OID=.;OPOS=38776180;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:28:30:9:10:19:20:0.666667:10:9:2:7:10:10:3:7
chr4	38776491	.	T	G	292.44	PASS	AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.00950568;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.325;QD=14.6222;RBI=0.0151408;REFB=-0.0122394;REVB=0.011785;RO=45;SAF=16;SAR=17;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0640944;STB=0.522386;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0179502;OID=.;OPOS=38776491;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:45:47:33:33:0.4125:17:16:19:26:17:16:21:26
chr4	38798648	.	C	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00519403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.643;QD=62.6711;RBI=0.00693402;REFB=0;REVB=0.00459376;RO=0;SAF=37;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9155e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.76325e-05;OID=.;OPOS=38798648;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:7:37:0:0:7:37:0:0
chr4	38798935	.	C	T	93.35	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0076552;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.311;QD=17.7806;RBI=0.0107756;REFB=-0.0207485;REVB=0.00758364;RO=10;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274137;STB=0.657836;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00772294;OID=.;OPOS=38798935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:22:21:10:10:11:11:0.52381:7:4:7:3:7:4:7:3
chr4	38799710	.	T	C	260.93	PASS	AF=0.676471;AO=23;DP=34;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.101787;FXX=0.0285633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.0983;QD=30.6972;RBI=0.102052;REFB=0.0261725;REVB=0.00735074;RO=11;SAF=12;SAR=11;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927057;STB=0.550976;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=-0.00788712;OID=.;OPOS=38799710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:34:34:11:11:23:23:0.676471:11:12:4:7:11:12:4:7
chr4	38830350	.	A	G	728.93	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0960097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0615;QD=57.1708;RBI=0.0960104;REFB=0;REVB=0.000356277;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116177;OID=.;OPOS=38830350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:23:27:0:0:23:28:0:0
chr4	38916610	.	G	A	595.09	PASS	AF=0.526316;AO=60;DP=114;FAO=60;FDP=114;FR=.;FRO=54;FSAF=44;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0173617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.945;QD=20.8805;RBI=0.025977;REFB=-0.00749835;REVB=-0.019323;RO=53;SAF=44;SAR=16;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278318;STB=0.650333;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00430497;OID=.;OPOS=38916610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:53:54:60:60:0.526316:16:44:23:30:16:44:24:30
chr4	38916631	.	T	C	430.56	PASS	AF=0.418803;AO=49;DP=117;FAO=49;FDP=117;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=43;FSRR=25;FWDB=0.00886335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.431;QD=14.7199;RBI=0.0218728;REFB=-0.00306109;REVB=0.0199965;RO=65;SAF=23;SAR=26;SRF=43;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194088;STB=0.59394;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.00604428;OID=.;OPOS=38916631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:65:68:49:49:0.418803:26:23:43:22:26:23:43:25
chr4	38937372	.	T	C	483.27	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00516592;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.7094;QD=58.5776;RBI=0.0060232;REFB=0;REVB=-0.00309712;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.75123e-05;OID=.;OPOS=38937372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr4	38995374	.	T	C	665.36	PASS	AF=0.482014;AO=67;DP=139;FAO=67;FDP=139;FR=.;FRO=72;FSAF=49;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=0.0196891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.858;QD=19.147;RBI=0.0234445;REFB=-0.0213699;REVB=-0.0127272;RO=72;SAF=49;SAR=18;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201379;STB=0.612015;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0175019;OID=.;OPOS=38995374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:72:72:67:67:0.482014:18:49:39:33:18:49:39:33
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chr4	39094738	.	G	A	213.53	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.000441638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.285;QD=16.1153;RBI=0.0149702;REFB=-0.0111469;REVB=-0.0149637;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116742;STB=0.565984;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0111883;OID=.;OPOS=39094738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:12:12:18:11:12:12:18:11
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chr4	39122697	.	C	T	395.15	PASS	AF=0.565217;AO=39;DP=69;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=-0.00574165;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.628;QD=22.9074;RBI=0.0113026;REFB=-0.00266542;REVB=0.00973558;RO=30;SAF=15;SAR=24;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131001;STB=0.571741;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00187815;OID=.;OPOS=39122697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:30:30:39:39:0.565217:24:15:7:23:24:15:7:23
chr4	39207318	.	A	G	429.39	PASS	AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.0412481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6007;QD=17.349;RBI=0.055513;REFB=-0.0246068;REVB=0.0371522;RO=55;SAF=15;SAR=29;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242386;STB=0.635962;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0176797;OID=.;OPOS=39207318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:55:55:44:44:0.444444:29:15:32:23:29:15:32:23
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chr4	39230312	.	T	C	39.62	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=11;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0462243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.031;QD=13.2052;RBI=0.0464032;REFB=-0.0169892;REVB=-0.00407108;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158244;STB=0.624529;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.017232;OID=.;OPOS=39230312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:11:12:6:6:5:6:0.5:1:4:4:2:1:5:4:2
chr4	39299266	.	A	G	112.9	PASS	AF=0.75;AO=12;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0264848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.158;QD=28.2245;RBI=0.103916;REFB=-0.0459548;REVB=0.100485;RO=4;SAF=7;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378887;STB=0.521241;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.00432916;OID=.;OPOS=39299266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:16:16:4:4:12:12:0.75:5:7:2:2:5:7:2:2
chr4	39302029	.	T	C	115.18	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0297343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.064;QD=10.7142;RBI=0.0313441;REFB=0.00122168;REVB=-0.00991575;RO=29;SAF=10;SAR=4;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273039;STB=0.664092;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=-0.0077372;OID=.;OPOS=39302029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:4:10:14:15:4:10:14:15
chr4	39408762	.	C	G	510.26	PASS	AF=0.61039;AO=47;DP=77;FAO=47;FDP=77;FR=.;FRO=30;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0028759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.524;QD=26.5069;RBI=0.00685726;REFB=-0.0125438;REVB=0.00622505;RO=30;SAF=29;SAR=18;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863219;STB=0.547149;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0118936;OID=.;OPOS=39408762;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:30:30:47:47:0.61039:18:29:15:15:18:29:15:15
chr4	39448542	.	C	G	224.32	PASS	AF=0.904762;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0626648;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.955;QD=42.727;RBI=0.062668;REFB=-0.186529;REVB=-0.000638062;RO=2;SAF=10;SAR=9;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00460898;STB=0.50251;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00417734;OID=.;OPOS=39448542;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:21:21:2:2:19:19:0.904762:9:10:1:1:9:10:1:1
chr4	39450229	.	C	A	340.53	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00414304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.715;QD=54.4848;RBI=0.0245219;REFB=0;REVB=0.0241693;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.48506e-05;OID=.;OPOS=39450229;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr4	39458051	.	A	G	670.06	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.887;QD=62.3314;RBI=0.11713;REFB=0;REVB=0.112895;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00034813;OID=.;OPOS=39458051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:18:25:0:0:18:25:0:0
chr4	39459724	.	T	C	1410.57	PASS	AF=1;AO=89;DP=92;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00856934;FXX=0.0217368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.857;QD=62.692;RBI=0.0395266;REFB=0;REVB=0.0385865;RO=0;SAF=66;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43768e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83664e-05;OID=.;OPOS=39459724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:92:90:0:0:89:90:1:23:66:0:0:23:67:0:0
chr4	39460490	.	C	G	1434.42	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.744;QD=63.0515;RBI=0.0238992;REFB=0;REVB=0.0166057;RO=0;SAF=45;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.0821e-05;OID=.;OPOS=39460490;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:46:45:0:0:46:45:0:0
chr4	39472842	.	T	A	526.75	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0242065;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.687;QD=56.9464;RBI=0.0988552;REFB=-0.175419;REVB=0.0958457;RO=1;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346393;STB=0.518508;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0012549;OID=.;OPOS=39472842;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:13:23:0:1:13:23:0:1
chr4	39501086	.	G	A	347.58	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0998812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7847;QD=51.493;RBI=0.0999625;REFB=-0.0812195;REVB=0.00403222;RO=1;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371368;STB=0.519985;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0275859;OID=.;OPOS=39501086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:12:14:0:1:12:14:0:1
chr4	39510264	.	A	G	289.16	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0498996;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.557;QD=18.961;RBI=0.0501472;REFB=-0.00118712;REVB=0.00497724;RO=30;SAF=22;SAR=9;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110813;STB=0.562002;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00168283;OID=.;OPOS=39510264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:9:22:18:12:9:22:18:12
chr4	39515736	.	A	G	105.22	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0354954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2303;QD=11.0759;RBI=0.0429414;REFB=-0.00660444;REVB=0.024167;RO=25;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151886;STB=0.590225;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0255244;OID=.;OPOS=39515736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:6:7:10:15:6:7:10:15
chr4	39921942	.	A	G	708.51	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.042;QD=62.9785;RBI=0.0447459;REFB=0;REVB=0.0285477;RO=0;SAF=19;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130634;OID=.;OPOS=39921942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:26:19:0:0:26:19:0:0
chr4	40045139	.	T	C	1588.32	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00674601;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.171;QD=64.1745;RBI=0.0503721;REFB=0;REVB=0.0499184;RO=0;SAF=54;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40252e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1075e-05;OID=.;OPOS=40045139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:99:0:0:98:99:1:44:54:0:0:44:55:0:0
chr4	40079556	.	C	T	670.43	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.717;QD=62.3654;RBI=0.0174035;REFB=0;REVB=0.0128951;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21872e-06;OID=.;OPOS=40079556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:16:26:0:0:16:27:0:0
chr4	40121562	.	G	A	1190.41	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.584;QD=61.0468;RBI=0.0493748;REFB=0;REVB=-0.0377126;RO=0;SAF=58;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.85021e-06;OID=.;OPOS=40121562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:20:58:0:0:20:58:0:0
chr4	40138676	.	A	G	790.74	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00445377;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1304;QD=55.4908;RBI=0.0541947;REFB=0.0214504;REVB=0.0540114;RO=1;SAF=35;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132829;STB=0.50704;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000614225;OID=.;OPOS=40138676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:57:1:1:56:56:0.982456:21:35:1:0:21:35:1:0
chr4	40155927	.	T	C	740.42	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.139;QD=56.9553;RBI=0.0305822;REFB=0;REVB=0.0178531;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.87131e-05;OID=.;OPOS=40155927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:19:33:0:0:19:33:0:0
chr4	40245990	.	A	C	61.75	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.0225576;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.0475;QD=7.26433;RBI=0.0236131;REFB=0.00717527;REVB=0.00698091;RO=25;SAF=7;SAR=2;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293022;STB=0.518477;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=-0.0218526;OID=.;OPOS=40245990;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:2:7:19:6:2:7:19:6
chr4	40337908	.	T	C	722.21	PASS	AF=0.642105;AO=61;DP=97;FAO=61;FDP=95;FR=.;FRO=34;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0151648;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.139;QD=30.4086;RBI=0.0155458;REFB=-0.0264182;REVB=-0.00342081;RO=35;SAF=35;SAR=26;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0790874;STB=0.558233;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0173174;OID=.;OPOS=40337908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:95:35:34:61:61:0.642105:26:35:16:19:26:35:14:20
chr4	40356422	.	A	G	344.25	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335913;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1084;QD=55.0797;RBI=0.0403116;REFB=0;REVB=0.0222858;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407945;OID=.;OPOS=40356422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:19:6:0:0:19:6:0:0
chr4	40438576	.	A	G	1212.77	PASS	AF=0.975904;AO=76;DP=76;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0336441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.857;QD=58.4466;RBI=0.0460249;REFB=0.0182125;REVB=0.0314064;RO=0;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516662;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-1.07575e-05;OID=.;OPOS=40438576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:76:83:0:2:76:81:0.975904:29:47:0:0:29:52:0:2
chr4	40440215	.	T	C	346.81	PASS	AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00501953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.92;QD=22.375;RBI=0.00661006;REFB=-0.0355503;REVB=-0.00430083;RO=27;SAF=19;SAR=16;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193149;STB=0.510652;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.025772;OID=.;OPOS=40440215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:16:19:14:13:16:19:14:13
chr4	40440854	.	G	C	74.96	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9948;QD=37.4786;RBI=0.0204537;REFB=0;REVB=0.0204537;RO=0;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000531569;OID=.;OPOS=40440854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:8:0:0:0:8:0:0:0
chr4	40778146	.	C	T	496.73	PASS	AF=0.378378;AO=56;DP=149;FAO=56;FDP=148;FR=.;FRO=92;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=55;FSRR=37;FWDB=0.000826323;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.375;QD=13.4252;RBI=0.0119305;REFB=-0.0148847;REVB=-0.0119019;RO=92;SAF=22;SAR=34;SRF=54;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211603;STB=0.626271;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0264572;OID=.;OPOS=40778146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:148:92:92:56:56:0.378378:34:22:54:38:34:22:55:37
chr4	40778162	.	T	G	436.89	PASS	AF=0.364286;AO=50;DP=141;FAO=51;FDP=140;FR=.;FRO=89;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=52;FSRR=37;FWDB=0.0103199;FXX=0.0140835;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.586;QD=12.4827;RBI=0.0147864;REFB=-0.00950556;REVB=-0.0105895;RO=87;SAF=20;SAR=30;SRF=50;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193768;STB=0.621334;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.018568;OID=.;OPOS=40778162;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:140:87:89:50:51:0.364286:30:20:50:37:31:20:52:37
chr4	40810747	.	A	G	871.27	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00135947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.215;QD=56.2108;RBI=0.00846843;REFB=0.0516419;REVB=0.0083586;RO=1;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209702;STB=0.511107;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=1.3921e-05;OID=.;OPOS=40810747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:22:39:0:1:22:39:0:1
chr4	41015823	.	G	A,T	1175.67	PASS	AF=0.4125,0.5875;AO=33,47;DP=80;FAO=33,47;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=11,15;FSAR=22,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0591992,0.00613951;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=40.0626,212.402;QD=58.7837;RBI=0.0603662,0.00698227;REFB=0,0;REVB=0.0118123,0.00332543;RO=0;SAF=11,15;SAR=22,32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00212597,0.0138339;OID=.,.;OPOS=41015823,41015823;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:80:80:0:0:33,47:33,47:0.4125,0.5875:22,32:11,15:0:0:22,32:11,15:0:0
chr4	41015899	.	C	T	972.75	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00124291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.59;QD=58.9548;RBI=0.0279336;REFB=0;REVB=0.027906;RO=0;SAF=22;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57344e-05;OID=.;OPOS=41015899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:43:22:0:0:44:22:0:0
chr4	41016484	.	T	C	135.21	PASS	AF=0.583333;AO=13;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0105435;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=222.169;QD=22.5342;RBI=0.017936;REFB=-0.0559804;REVB=-0.0145098;RO=6;SAF=5;SAR=8;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671703;STB=0.51019;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0196197;OID=.;OPOS=41016484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:24:24:6:9:13:14:0.583333:8:5:3:3:9:5:3:6
chr4	41259633	.	C	A	513.29	PASS	AF=0.923077;AO=34;DP=37;FAO=36;FDP=39;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.026585;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1002;QD=52.645;RBI=0.135334;REFB=-0.119545;REVB=0.132697;RO=3;SAF=26;SAR=8;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146567;STB=0.571387;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0131964;OID=.;OPOS=41259633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:37:39:3:3:34:36:0.923077:8:26:0:3:9:27:0:3
chr4	41615660	.	C	T	251.98	PASS	AF=0.322917;AO=31;DP=96;FAO=31;FDP=96;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=44;FSRR=21;FWDB=-0.0103745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.961;QD=10.4993;RBI=0.0133243;REFB=-0.00697742;REVB=0.00836101;RO=65;SAF=14;SAR=17;SRF=44;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2586;STB=0.649448;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0535316;OID=.;OPOS=41615660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:65:65:31:31:0.322917:17:14:44:21:17:14:44:21
chr4	41628818	.	A	G	357.16	PASS	AF=0.4;AO=42;DP=105;FAO=42;FDP=105;FR=.;FRO=63;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.0104781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.406;QD=13.606;RBI=0.0384731;REFB=-0.0087324;REVB=-0.0370187;RO=63;SAF=30;SAR=12;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267262;STB=0.652098;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0110919;OID=.;OPOS=41628818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:63:63:42:42:0.4:12:30:30:33:12:30:30:33
chr4	41631718	.	C	T	267.07	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.0519971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.024;QD=20.1561;RBI=0.058742;REFB=-0.00654829;REVB=-0.0273299;RO=25;SAF=14;SAR=14;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18704;STB=0.603703;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0030265;OID=.;OPOS=41631718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:14:14:18:7:14:14:18:7
chr4	41633322	.	C	A	514.29	PASS	AF=0.495413;AO=54;DP=109;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.0194038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.229;QD=18.8728;RBI=0.0356112;REFB=-0.0407723;REVB=0.0298606;RO=55;SAF=21;SAR=33;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619504;STB=0.534306;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0381301;OID=.;OPOS=41633322;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:55:55:54:54:0.495413:33:21:25:30:33:21:25:30
chr4	41673554	.	CT	C,CTT,TT	155.21	PASS	AF=0,0.375839,0;AO=18,33,12;DP=150;FAO=0,56,0;FDP=149;FR=.;FRO=93;FSAF=0,31,0;FSAR=0,25,0;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=-0.21203,0.201286,-0.0122126;FXX=0.00666622;HRUN=8,8,1;LEN=1,1,1;MLLD=11.7018,7.47918,196.137;QD=4.16682;RBI=0.221205,0.207077,0.0157446;REFB=0.0704873,-0.0805596,0.0042143;REVB=0.0630471,-0.0486288,-0.0099371;RO=80;SAF=12,17,1;SAR=6,16,11;SRF=55;SRR=25;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0300838,-0.210662,-0.666061;STB=0.5,0.530865,0.5;STBP=1,0.596,1;TYPE=del,ins,snp;VARB=0.0455581,0.143454,0;OID=.,.,.;OPOS=41673555,41673555,41673554;OREF=T,-,C;OALT=-,T,T;OMAPALT=C,CTT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:150:149:80:93:18,33,12:0,56,0:0,0.375839,0:6,16,11:12,17,1:55:25:0,25,0:0,31,0:56:37
chr4	41984118	.	C	T	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.636;QD=57.7124;RBI=0.0194544;REFB=0;REVB=0.00523728;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.06317e-05;OID=.;OPOS=41984118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:36:23:0:0:36:23:0:0
chr4	41985101	.	A	G	3292.62	PASS	AF=1;AO=213;DP=214;FAO=213;FDP=213;FR=.;FRO=0;FSAF=111;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563323;FXX=0.00467268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.5;QD=61.8332;RBI=0.0710191;REFB=-0.139428;REVB=0.043248;RO=1;SAF=111;SAR=102;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00427281;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013268;OID=.;OPOS=41985101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:214:213:1:0:213:213:1:102:111:1:0:102:111:0:0
chr4	41985478	.	A	G	754.36	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.892;QD=56.933;RBI=0.0525452;REFB=0;REVB=0.0335082;RO=0;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151973;OID=.;OPOS=41985478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:19:34:0:0:19:34:0:0
chr4	41985688	.	TC	T,TT	1144.6	PASS	AF=0.0384615,0.961538;AO=19,57;DP=79;FAO=3,75;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=3,39;FSAR=0,36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.116399,0.166064;FXX=0.0126566;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=21.6912,40.1665;QD=58.6975;RBI=0.220892,0.200286;REFB=0,0;REVB=-0.187736,-0.11197;RO=0;SAF=19,22;SAR=0,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0421429,0.0117485;OID=.,.;OPOS=41985689,41985689;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0384615,0.961538:19,57:79:3,75:78:0:3,39:0,36:0:0:9:0:19,22:0,35:0:0
chr4	41986857	.	A	G	1250.37	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00901731;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9381;QD=61.7467;RBI=0.0621641;REFB=0;REVB=0.0615067;RO=0;SAF=42;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259552;OID=.;OPOS=41986857;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:39:42:0:0:39:42:0:0
chr4	41987892	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00567555;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.383;QD=57.8849;RBI=0.0287812;REFB=0;REVB=0.0282161;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.51922e-05;OID=.;OPOS=41987892;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:29:31:0:0:29:31:0:0
chr4	41988385	.	TACACAG	TACA,TACAG	731.34	PASS	AF=0,1;AO=9,39;DP=51;FAO=0,52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=0,25;FSAR=0,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129475,0.0332227;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=133.947,141.104;QD=56.257;RBI=0.0554212,0.0336928;REFB=0,0;REVB=-0.0538876,-0.00560902;RO=0;SAF=7,17;SAR=2,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.000312006;OID=.,.;OPOS=41988389,41988386;OREF=CAG,AC;OALT=-,-;OMAPALT=TACA,TACAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:9,39:51:0,52:52:0:0,25:0,27:0:0:4:0:7,17:2,22:0:0
chr4	41992677	.	C	G	4288.4	PASS	AF=0.972222;AO=279;DP=288;FAO=280;FDP=288;FR=.;FRO=8;FSAF=151;FSAR=129;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0463078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8946;QD=59.5611;RBI=0.0637206;REFB=-0.194309;REVB=0.043771;RO=5;SAF=150;SAR=129;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0046435;STB=0.504588;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.00315577;OID=.;OPOS=41992677;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:288:288:5:8:279:280:0.972222:129:150:2:3:129:151:3:5
chr4	42003671	.	A	G	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00651231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.345;QD=60.9772;RBI=0.00661391;REFB=0;REVB=-0.00115479;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.46154e-06;OID=.;OPOS=42003671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr4	42020142	.	A	G	1520.69	PASS	AF=0.979798;AO=97;DP=99;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.04075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.711;QD=61.4422;RBI=0.0436696;REFB=-0.10353;REVB=0.0156993;RO=1;SAF=33;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00735372;STB=0.507691;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.00194884;OID=.;OPOS=42020142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:99:99:1:2:97:97:0.979798:64:33:0:1:64:33:0:2
chr4	42022464	.	C	A	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.806;QD=63.5823;RBI=0.0269164;REFB=0;REVB=0.00949484;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.81152e-05;OID=.;OPOS=42022464;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr4	42895423	.	C	T	658.34	PASS	AF=0.561404;AO=64;DP=108;FAO=64;FDP=114;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0547021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8217;QD=23.0995;RBI=0.0759348;REFB=-0.0380627;REVB=-0.0526666;RO=44;SAF=24;SAR=40;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147732;STB=0.56559;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0269393;OID=.;OPOS=42895423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:114:44:50:64:64:0.561404:40:24:25:19:40:24:26:24
chr4	44295839	.	G	A	220.38	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0262006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.026;QD=16.0276;RBI=0.0263143;REFB=-0.0137455;REVB=-0.00244334;RO=29;SAF=12;SAR=13;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00262555;STB=0.510908;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0124471;OID=.;OPOS=44295839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:29:30:25:25:0.454545:13:12:14:15:13:12:15:15
chr4	44626641	.	A	G	257.37	PASS	AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.0116097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.624;QD=13.7266;RBI=0.01169;REFB=-0.0157957;REVB=0.00136758;RO=45;SAF=18;SAR=12;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745215;STB=0.542345;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0182445;OID=.;OPOS=44626641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:45:45:30:30:0.4:12:18:30:15:12:18:30:15
chr4	44682465	.	T	C	312.6	PASS	AF=0.522388;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.00736148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.9835;QD=18.6624;RBI=0.0106785;REFB=-0.0590306;REVB=-0.00773551;RO=30;SAF=24;SAR=11;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0495316;STB=0.51612;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0746054;OID=.;OPOS=44682465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:30:32:35:35:0.522388:11:24:19:11:11:24:21:11
chr4	44699484	.	T	G	228.94	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0126304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.88;QD=16.0662;RBI=0.0131799;REFB=-0.0345818;REVB=0.00376589;RO=29;SAF=12;SAR=14;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179962;STB=0.615914;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0619581;OID=.;OPOS=44699484;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:31:26:26:0.45614:14:12:19:10:14:12:21:10
chr4	44704757	.	C	T	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.051;QD=64.4151;RBI=0.0525351;REFB=0;REVB=-0.0192543;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.5336e-05;OID=.;OPOS=44704757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0
chr4	46086060	.	T	C	727.28	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0568692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3008;QD=63.2416;RBI=0.0568887;REFB=0;REVB=0.00149008;RO=0;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000420674;OID=.;OPOS=46086060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:28:18:0:0:28:18:0:0
chr4	46995366	.	G	T	186.71	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00649868;FXX=0.0526223;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3864;QD=13.8302;RBI=0.0254189;REFB=-0.023342;REVB=-0.0245741;RO=31;SAF=12;SAR=10;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363894;STB=0.528984;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0498223;OID=.;OPOS=46995366;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:54:31:32:22:22:0.407407:10:12:18:13:10:12:19:13
chr4	47034626	.	C	G	134.45	PASS	AF=0.287879;AO=19;DP=66;FAO=19;FDP=66;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.010061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.518;QD=8.14855;RBI=0.027943;REFB=-0.0225086;REVB=0.0260689;RO=47;SAF=9;SAR=10;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186312;STB=0.51117;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0646086;OID=.;OPOS=47034626;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:47:47:19:19:0.287879:10:9:23:24:10:9:23:24
chr4	47322190	.	T	C	358.11	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.641;QD=55.0941;RBI=0.0562624;REFB=0;REVB=0.0532949;RO=0;SAF=20;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.14057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000352504;OID=.;OPOS=47322190;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:6:20:0:0:6:20:0:0
chr4	47322219	.	C	A	126.9	PASS	AF=0.538462;AO=13;DP=25;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0633559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.163;QD=19.5225;RBI=0.0633569;REFB=-0.0256986;REVB=-0.00036586;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123714;STB=0.555479;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0121225;OID=.;OPOS=47322219;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:26:12:12:13:14:0.538462:5:8:9:3:5:9:9:3
chr4	47514685	.	C	T	342.93	PASS	AF=0.358974;AO=42;DP=115;FAO=42;FDP=117;FR=.;FRO=75;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=49;FSRR=26;FWDB=-0.0236559;FXX=0.0168053;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.623;QD=11.7241;RBI=0.0292527;REFB=-0.00720048;REVB=0.0172081;RO=71;SAF=21;SAR=21;SRF=47;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179205;STB=0.598246;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0218342;OID=.;OPOS=47514685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:117:71:75:42:42:0.358974:21:21:47:24:21:21:49:26
chr4	47560163	.	C	A	244.23	PASS	AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.013451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.779;QD=13.0253;RBI=0.0256608;REFB=0.000906753;REVB=-0.0218528;RO=46;SAF=14;SAR=15;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157891;STB=0.590058;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.00257586;OID=.;OPOS=47560163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:15:14:29:17:15:14:29:17
chr4	47584046	.	G	A	551.38	PASS	AF=0.370787;AO=65;DP=179;FAO=66;FDP=178;FR=.;FRO=112;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=60;FSRR=52;FWDB=-0.0408056;FXX=0.00558628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.463;QD=12.3905;RBI=0.0448658;REFB=-0.00941912;REVB=-0.0186505;RO=107;SAF=23;SAR=42;SRF=55;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180426;STB=0.609925;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0131458;OID=.;OPOS=47584046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:178:107:112:65:66:0.370787:42:23:55:52:42:24:60:52
chr4	47589203	.	G	A	290.12	PASS	AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00146077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.395;QD=16.578;RBI=0.0161381;REFB=-0.0111036;REVB=-0.0160718;RO=37;SAF=17;SAR=15;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941476;STB=0.545426;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0111938;OID=.;OPOS=47589203;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:37:38:32:32:0.457143:15:17:16:21:15:17:17:21
chr4	47667064	.	T	C	563.42	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0131772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7748;QD=57.7868;RBI=0.110473;REFB=-0.0547228;REVB=0.109685;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.519989;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00231293;OID=.;OPOS=47667064;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:0:1:38:38:0.974359:12:26:0:0:12:26:0:1
chr4	47839929	.	C	T	1607.08	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7521;QD=64.2833;RBI=0.0789036;REFB=0;REVB=0.0745279;RO=0;SAF=47;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331387;OID=.;OPOS=47839929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:53:47:0:0:53:47:0:0
chr4	47887536	.	T	C	1480.66	PASS	AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0152227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.952;QD=58.6401;RBI=0.0156747;REFB=-0.0598331;REVB=0.00373724;RO=0;SAF=43;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504347;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=1.38275e-05;OID=.;OPOS=47887536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:101:101:0:1:100:100:0.990099:57:43:0:0:57:43:0:1
chr4	47887991	.	G	A	1508.15	PASS	AF=0.980952;AO=103;DP=105;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0352068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.325;QD=57.4535;RBI=0.0364764;REFB=0.0426867;REVB=-0.00954009;RO=2;SAF=54;SAR=49;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000879162;STB=0.500463;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-0.000772249;OID=.;OPOS=47887991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:105:105:2:2:103:103:0.980952:49:54:1:1:49:54:1:1
chr4	47901476	.	G	A	885.41	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0413172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.33;QD=58.0595;RBI=0.0418344;REFB=0;REVB=-0.00655824;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0001663;OID=.;OPOS=47901476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:22:39:0:0:22:39:0:0
chr4	47945295	.	C	T	130.45	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4922;QD=43.4822;RBI=0.0768711;REFB=0;REVB=-0.0728269;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00331411;OID=.;OPOS=47945295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr4	47945455	.	C	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00601935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.394;QD=42.1826;RBI=0.00958749;REFB=0;REVB=-0.0074624;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000171823;OID=.;OPOS=47945455;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr4	48069696	.	G	C	937.33	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0359101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5529;QD=58.5833;RBI=0.0650736;REFB=0;REVB=0.0542682;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146317;OID=.;OPOS=48069696;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0
chr4	48069725	.	G	A	700.91	PASS	AF=0.981132;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0204566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.862;QD=52.8986;RBI=0.0658238;REFB=-0.0867773;REVB=0.0625644;RO=2;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361869;STB=0.50943;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00157909;OID=.;OPOS=48069725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:53:53:2:1:51:52:0.981132:25:26:0:2:26:26:0:1
chr4	48170669	.	A	G	483.12	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.394;QD=58.5604;RBI=0.0275357;REFB=0;REVB=-0.017938;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41583e-06;OID=.;OPOS=48170669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
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chr4	48426066	.	A	T	182.12	PASS	AF=0.365079;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0211149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6019;QD=11.5634;RBI=0.0212886;REFB=0.00186767;REVB=0.00271398;RO=38;SAF=12;SAR=11;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164888;STB=0.608129;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=-0.00435357;OID=.;OPOS=48426066;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:38:40:23:23:0.365079:11:12:14:24:11:12:14:26
chr4	48492434	.	G	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.191;QD=35.5748;RBI=0.041278;REFB=0;REVB=0.041278;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00149003;OID=.;OPOS=48492434;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0
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chr4	48582909	.	G	A	300.35	PASS	AF=0.533333;AO=27;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0259983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5529;QD=20.0234;RBI=0.0271535;REFB=-0.00263505;REVB=-0.0078358;RO=17;SAF=19;SAR=8;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29702;STB=0.599933;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00280578;OID=.;OPOS=48582909;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:17:28:27:32:0.533333:8:19:5:12:8:24:16:12
chr4	48588742	.	C	T	163.6	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.00997057;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=279.165;QD=13.3547;RBI=0.0105647;REFB=-0.00624039;REVB=0.00349289;RO=31;SAF=4;SAR=14;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990181;STB=0.558214;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.00854634;OID=.;OPOS=48588742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:14:4:9:22:14:4:9:22
chr4	48625210	.	AAAC	A,AA,AAA,AAAA	262.52	PASS	AF=0.0454545,0,0.909091,0;AO=3,3,10,6;DP=23;FAO=1,0,20,0;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=0,0,12,0;FSAR=1,0,8,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0236923,0.0277327,0.0310364,0.0290582;FXX=0.0434594;HRUN=8,8,1,1;LEN=3,2,1,1;MLLD=257.883,263.519,265.198,259.311;QD=47.7307;RBI=0.034742,0.0384169,0.0412011,0.0402445;REFB=0.0935633,-0.0525222,-0.163678,-0.175436;REVB=-0.0254102,-0.026585,-0.0270974,-0.0278432;RO=1;SAF=2,2,7,2;SAR=1,1,3,4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.163246,-0.163246,-0.0596689,-0.171372;STB=0.989913,0.5,0.51998,0.5;STBP=0.496,1,0.531,1;TYPE=del,del,del,snp;VARB=-0.0275701,0.0227318,-0.00302539,0;OID=.,.,.,.;OPOS=48625211,48625212,48625213,48625213;OREF=AAC,AC,C,C;OALT=-,-,-,A;OMAPALT=A,AA,AAA,AAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.0454545,0,0.909091,0:3,3,10,6:23:1,0,20,0:22:1:0,0,12,0:1,0,8,0:1:0:6:1:2,2,7,2:1,1,3,4:1:0
chr4	48988450	.	C	A	514.22	PASS	AF=0.459016;AO=55;DP=120;FAO=56;FDP=122;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=-0.00185882;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.0853;QD=16.8597;RBI=0.0124088;REFB=-0.0308893;REVB=-0.0122688;RO=65;SAF=26;SAR=29;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190751;STB=0.511159;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0240437;OID=.;OPOS=48988450;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:122:65:66:55:56:0.459016:29:26:32:33:30:26:32:34
chr4	49063872	.	C	A	408.5	PASS	AF=0.549296;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0151553;FXX=0.0657808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.479;QD=23.0142;RBI=0.01822;REFB=-0.00982091;REVB=0.0101137;RO=32;SAF=17;SAR=22;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00133079;STB=0.500734;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00760847;OID=.;OPOS=49063872;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:32:32:39:39:0.549296:22:17:14:18:22:17:14:18
chr4	52714354	.	A	ATTTC,C	153.76	PASS	AF=0.322581,0.0322581;AO=14,3;DP=64;FAO=20,2;FDP=62;FR=.;FRO=40;FSAF=11,2;FSAR=9,0;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.00406808,0.00157884;FXX=0.0312451;HRUN=5,1;LEN=4,1;MLLD=177.053,148.739;QD=9.91974;RBI=0.0145479,0.00781536;REFB=-0.00531522,-0.00153481;REVB=-0.0139675,-0.00765422;RO=37;SAF=8,2;SAR=6,1;SRF=24;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0956251,0.0197084;STB=0.568193,0.993409;STBP=0.51,0.318;TYPE=ins,snp;VARB=0.0139741,0.0664991;OID=.,.;OPOS=52714355,52714354;OREF=-,A;OALT=TTTC,C;OMAPALT=ATTTC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:62:37:40:14,3:20,2:0.322581,0.0322581:6,1:8,2:24:13:9,0:11,2:26:14
chr4	52752812	.	A	T	422.7	PASS	AF=0.424779;AO=48;DP=113;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=23;FWDB=0.00538931;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.883;QD=14.9628;RBI=0.00618968;REFB=-0.0124131;REVB=0.00304424;RO=65;SAF=26;SAR=22;SRF=42;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109095;STB=0.561115;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0159259;OID=.;OPOS=52752812;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:65:65:48:48:0.424779:22:26:42:23:22:26:42:23
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chr4	52938243	.	T	C	362.33	PASS	AF=0.62069;AO=35;DP=56;FAO=36;FDP=58;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00265563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9608;QD=24.9882;RBI=0.0233763;REFB=-0.0164699;REVB=-0.023225;RO=21;SAF=17;SAR=18;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911451;STB=0.551696;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.00781686;OID=.;OPOS=52938243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:21:22:35:36:0.62069:18:17:13:8:18:18:14:8
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chr4	53611668	.	T	C	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0195973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.279;QD=12.3959;RBI=0.0856417;REFB=-0.0137556;REVB=0.0833693;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0183829;OID=.;OPOS=53611668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:3:2:2:3:3:2:2:3
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chr4	53729429	.	G	A	103.49	PASS	AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.00279034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.135;QD=9.85591;RBI=0.0523164;REFB=0.00752577;REVB=0.052242;RO=29;SAF=2;SAR=11;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.523758;STB=0.819086;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.0269817;OID=.;OPOS=53729429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:29:29:13:13:0.309524:11:2:17:12:11:2:17:12
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chr4	54966667	.	C	T	954.77	PASS	AF=0.896104;AO=69;DP=78;FAO=69;FDP=77;FR=.;FRO=8;FSAF=21;FSAR=48;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0637294;FXX=0.0128189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.376;QD=49.5987;RBI=0.0642235;REFB=-0.125504;REVB=0.0079513;RO=5;SAF=21;SAR=48;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100139;STB=0.579976;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00713257;OID=.;OPOS=54966667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:78:77:5:8:69:69:0.896104:48:21:5:0:48:21:8:0
chr4	54966830	.	G	A	341.74	PASS	AF=0.928571;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0056018;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.025;QD=48.8195;RBI=0.0232132;REFB=-0.247708;REVB=-0.0225271;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538432;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00212515;OID=.;OPOS=54966830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:28:28:0:2:26:26:0.928571:14:12:0:0:14:12:2:0
chr4	54966919	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.125781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.186;QD=48.7372;RBI=0.125819;REFB=0;REVB=-0.00306842;RO=0;SAF=3;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53656e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000844309;OID=.;OPOS=54966919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:14:3:0:0:14:3:0:0
chr4	55130078	.	T	C	192.89	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0267332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.624;QD=23.38;RBI=0.036988;REFB=-0.0252635;REVB=0.0255626;RO=14;SAF=8;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501505;STB=0.528024;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0324938;OID=.;OPOS=55130078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:11:8:5:9:11:8:5:9
chr4	55133726	.	T	G	292.94	PASS	AF=0.525424;AO=30;DP=57;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.0313647;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.7271;QD=19.8604;RBI=0.0342399;REFB=0.00370973;REVB=0.0137339;RO=27;SAF=12;SAR=18;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224906;STB=0.621283;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.00168969;OID=.;OPOS=55133726;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:59:27:28:30:31:0.525424:18:12:18:9:18:13:19:9
chr4	55141055	.	A	G	2288.31	PASS	AF=1;AO=113;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.509;QD=62.6935;RBI=0.0466934;REFB=0;REVB=0.0308398;RO=0;SAF=48;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43127e-05;OID=.;OPOS=55141055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:146:146:0:0:113:146:1:65:48:0:0:91:55:0:0
chr4	55161391	.	T	C	2197.72	PASS	AF=1;AO=137;DP=137;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.15;QD=63.2437;RBI=0.0201218;REFB=0;REVB=0.0101712;RO=0;SAF=84;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12818e-05;OID=.;OPOS=55161391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:137:139:0:0:137:139:1:53:84:0:0:53:86:0:0
chr4	55161517	.	A	G	2335.46	PASS	AF=1;AO=152;DP=152;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00328389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.128;QD=61.0578;RBI=0.0113643;REFB=0;REVB=0.0108795;RO=0;SAF=63;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67227e-06;OID=.;OPOS=55161517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:152:153:0:0:152:153:1:89:63:0:0:90:63:0:0
chr4	55593464	.	A	C	443.33	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0105395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.176;QD=20.1512;RBI=0.0105614;REFB=-0.0123021;REVB=0.000679843;RO=43;SAF=28;SAR=16;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136457;STB=0.570783;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0149576;OID=.;OPOS=55593464;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:43:44:44:44:0.5:16:28:21:22:16:28:22:22
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chr4	55972974	.	T	A	92.41	PASS	AF=0.363636;AO=10;DP=32;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=1;FWDB=-0.0103306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.7899;QD=11.2018;RBI=0.0538174;REFB=-0.0204665;REVB=-0.0528166;RO=21;SAF=9;SAR=1;SRF=20;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199294;STB=0.584784;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0261235;OID=.;OPOS=55972974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:32:33:21:21:10:12:0.363636:1:9:20:1:1:11:20:1
chr4	56291620	.	CAA	C	235.08	PASS	AF=0.402062;AO=37;DP=95;FAO=39;FDP=97;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.0466968;FXX=0.0396;HRUN=2;LEN=2;MLLD=75.9371;QD=9.69391;RBI=0.0472943;REFB=-0.0250661;REVB=-0.00749383;RO=58;SAF=17;SAR=20;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803952;STB=0.543559;STBP=0.469;TYPE=del;VARB=0.0179437;OID=.;OPOS=56291621;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.402062:37:95:39:97:58:18:21:31:27:99:58:17:20:31:27
chr4	56300685	.	C	T	112.57	PASS	AF=0.285714;AO=14;DP=49;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0304112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.196;QD=9.1893;RBI=0.0311265;REFB=-0.0220998;REVB=0.00663467;RO=35;SAF=3;SAR=11;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190937;STB=0.617794;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0357511;OID=.;OPOS=56300685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:35:35:14:14:0.285714:11:3:12:23:11:3:12:23
chr4	56301049	.	G	GA	213.35	PASS	AF=0.523077;AO=31;DP=68;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.0967099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.5956;QD=13.1291;RBI=0.0967994;REFB=-0.00701732;REVB=-0.00416323;RO=35;SAF=17;SAR=14;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133373;STB=0.574188;STBP=0.249;TYPE=ins;VARB=0.00935267;OID=.;OPOS=56301050;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.523077:31:68:34:65:31:19:15:22:9:99:35:17:14:24:11
chr4	56306111	.	G	A	258.55	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.0218633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2899;QD=16.4158;RBI=0.0364532;REFB=-0.0230267;REVB=-0.0291691;RO=34;SAF=11;SAR=18;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0891082;STB=0.549967;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0269565;OID=.;OPOS=56306111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:18:11:10:24:18:11:10:24
chr4	56309992	.	A	G	169.68	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0650285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.428;QD=17.4033;RBI=0.0677807;REFB=-0.0156517;REVB=-0.0191187;RO=21;SAF=12;SAR=6;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142722;STB=0.581725;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0348132;OID=.;OPOS=56309992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:6:12:11:10:6:12:11:10
chr4	56318462	.	G	A	128.9	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0730781;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3109;QD=12.5757;RBI=0.0743759;REFB=0.00875865;REVB=0.0138334;RO=27;SAF=13;SAR=2;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.436857;STB=0.750715;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.0333963;OID=.;OPOS=56318462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:27:26:15:15:0.365854:2:13:15:12:2:13:15:11
chr4	56367796	.	T	G	130.7	PASS	AF=0.387097;AO=10;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00745071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.91;QD=16.8643;RBI=0.0170153;REFB=-0.0299646;REVB=0.0152973;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0644098;STB=0.512175;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0469004;OID=.;OPOS=56367796;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:31:31:16:16:10:12:0.387097:5:5:7:9:7:5:7:9
chr4	56756531	.	T	C	762.92	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.031;QD=63.577;RBI=0.0564713;REFB=0;REVB=0.0509265;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340193;OID=.;OPOS=56756531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:28:19:0:0:29:19:0:0
chr4	56771089	.	G	A	885.28	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.584;QD=58.0513;RBI=0.0491553;REFB=0;REVB=0.0337525;RO=0;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010049;OID=.;OPOS=56771089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:38:23:0:0:38:23:0:0
chr4	57154737	.	T	C	351.85	PASS	AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0195822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.11;QD=21.006;RBI=0.0322066;REFB=-0.0329559;REVB=0.0255695;RO=29;SAF=16;SAR=20;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591029;STB=0.533315;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0374872;OID=.;OPOS=57154737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:29:31:36:36:0.537313:20:16:15:14:20:16:16:15
chr4	57180563	.	G	C	122.47	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0224248;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.636;QD=14.845;RBI=0.0228917;REFB=-0.0368145;REVB=-0.00459944;RO=19;SAF=5;SAR=9;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105562;STB=0.560893;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0375664;OID=.;OPOS=57180563;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:9:5:5:14:9:5:5:14
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chr4	57181995	.	C	T	253.43	PASS	AF=0.379747;AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=37;FWDB=0.00129039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.015;QD=12.8321;RBI=0.0383329;REFB=0.0114113;REVB=0.0383111;RO=48;SAF=10;SAR=20;SRF=11;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133499;STB=0.564316;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=-0.0172295;OID=.;OPOS=57181995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:48:49:30:30:0.379747:20:10:11:37:20:10:12:37
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chr4	68374597	.	C	T	1389.6	PASS	AF=0.989011;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00302661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2761;QD=61.0812;RBI=0.0318555;REFB=-0.0958279;REVB=-0.0317114;RO=1;SAF=42;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111504;STB=0.505746;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00146559;OID=.;OPOS=68374597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:91:1:1:89:90:0.989011:47:42:1:0:47:43:1:0
chr4	68376708	.	T	C	747.05	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.855;QD=63.5785;RBI=0.0477235;REFB=0;REVB=0.0239986;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360175;OID=.;OPOS=68376708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:31:16:0:0:31:16:0:0
chr4	68380215	.	G	A	1459.77	PASS	AF=0.979167;AO=91;DP=93;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0188151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6039;QD=60.8239;RBI=0.0408299;REFB=-0.0241251;REVB=0.0362364;RO=2;SAF=41;SAR=50;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225584;STB=0.511902;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00334264;OID=.;OPOS=68380215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:93:96:2:2:91:94:0.979167:50:41:2:0:53:41:2:0
chr4	68384008	.	C	T	455.81	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.574;QD=56.9763;RBI=0.0224327;REFB=0;REVB=0.00893658;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.51831e-06;OID=.;OPOS=68384008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:19:12:0:0:19:13:0:0
chr4	68436883	.	T	C	368.19	PASS	AF=0.443182;AO=27;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.0521477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1244;QD=16.7357;RBI=0.0655617;REFB=-0.017006;REVB=0.0397361;RO=49;SAF=9;SAR=18;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159305;STB=0.538442;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0168723;OID=.;OPOS=68436883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:49:49:27:39:0.443182:18:9:23:26:18:21:23:26
chr4	68780399	.	A	G	2515.41	PASS	AF=0.993939;AO=164;DP=166;FAO=164;FDP=165;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0487034;FXX=0.00602373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.605;QD=60.9796;RBI=0.065782;REFB=-0.0572721;REVB=0.0442182;RO=0;SAF=80;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503105;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000305066;OID=.;OPOS=68780399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:166:165:0:1:164:164:0.993939:84:80:0:0:84:80:1:0
chr4	68784774	.	T	C	1560.92	PASS	AF=1;AO=96;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00489427;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.566;QD=63.7112;RBI=0.0213641;REFB=0;REVB=-0.020796;RO=0;SAF=60;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00169911;OID=.;OPOS=68784774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:96:98:1:36:60:0:0:37:61:0:0
chr4	68812283	.	C	T	789.26	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547121;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.895;QD=64.4292;RBI=0.0599194;REFB=0;REVB=0.024432;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143912;OID=.;OPOS=68812283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0
chr4	68995529	.	C	T	1434.32	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8922;QD=63.0472;RBI=0.0257208;REFB=0;REVB=0.0163068;RO=0;SAF=40;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.20939e-05;OID=.;OPOS=68995529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:51:40:0:0:51:40:0:0
chr4	69078113	.	T	C	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.078;QD=63.5819;RBI=0.0134118;REFB=0;REVB=0.00130884;RO=0;SAF=33;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.63101e-05;OID=.;OPOS=69078113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:14:33:0:0:14:33:0:0
chr4	69094507	.	T	A	768.46	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00203145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.232;QD=56.923;RBI=0.0149164;REFB=0;REVB=-0.0147774;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.70286e-05;OID=.;OPOS=69094507;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0
chr4	69094575	.	T	G	803.15	PASS	AF=0.982759;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0371264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.629;QD=55.3896;RBI=0.0376343;REFB=0.0157101;REVB=0.00616169;RO=1;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136677;STB=0.507244;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=9.39018e-06;OID=.;OPOS=69094575;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:56:57:0.982759:34:22:0:1:34:23:0:1
chr4	69095197	.	T	C	754.25	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000779064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.954;QD=62.854;RBI=0.0409448;REFB=0;REVB=0.0409373;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212163;OID=.;OPOS=69095197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:31:16:0:0:32:16:0:0
chr4	69203080	.	T	C	176.06	PASS	AF=0.42;AO=17;DP=46;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00459047;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.697;QD=14.085;RBI=0.0184152;REFB=-0.0363803;REVB=-0.0178338;RO=27;SAF=6;SAR=11;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178843;STB=0.599904;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0580184;OID=.;OPOS=69203080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:50:27:29:17:21:0.42:11:6:14:13:13:8:16:13
chr4	69203551	.	A	T	613.29	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.35;QD=61.3285;RBI=0.0327481;REFB=0;REVB=0.0181695;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123532;OID=.;OPOS=69203551;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0
chr4	69340500	.	A	G	449.57	PASS	AF=0.517647;AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0237387;FXX=0.0116266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.649;QD=21.156;RBI=0.0238329;REFB=-0.00434565;REVB=-0.00211659;RO=38;SAF=18;SAR=26;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0330239;STB=0.502761;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0041898;OID=.;OPOS=69340500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:85:38:41:44:44:0.517647:26:18:17:21:26:18:17:24
chr4	69417570	.	A	G	937.59	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00907503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.712;QD=58.5995;RBI=0.010769;REFB=0;REVB=0.00579792;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.87082e-05;OID=.;OPOS=69417570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:29:35:0:0:29:35:0:0
chr4	69433938	.	A	C	73.16	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0358836;FXX=0.0999001;HRUN=7;LEN=1;MLLD=243.788;QD=32.5175;RBI=0.0359586;REFB=-0.033078;REVB=0.00232135;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.666169;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.000746735;OID=.;OPOS=69433938;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:10:9:0:1:8:8:0.888889:1:7:0:0:1:7:0:1
chr4	69512847	.	T	G	86.6	PASS	AF=0.215385;AO=14;DP=64;FAO=14;FDP=65;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.00935237;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=240.788;QD=5.32933;RBI=0.0126684;REFB=-0.00626933;REVB=-0.0085452;RO=37;SAF=11;SAR=3;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203185;STB=0.619532;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0202392;OID=.;OPOS=69512847;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:64:65:37:51:14:14:0.215385:3:11:24:13:3:11:34:17
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chr4	69687987	.	C	A	1052.14	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0244228;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.798;QD=58.4523;RBI=0.0260883;REFB=0.0378993;REVB=-0.00917221;RO=1;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141139;STB=0.507461;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=-0.000887878;OID=.;OPOS=69687987;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:33:38:0:1:33:38:0:1
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chr4	69964337	.	AT	TC	455.61	PASS	AF=1;AO=31;DP=34;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0530192;FXX=0.0882094;HRUN=1;LEN=2;MLLD=128.573;QD=58.7886;RBI=0.0583742;REFB=0;REVB=0.0244235;RO=0;SAF=23;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000555332;OID=.;OPOS=69964337;OREF=AT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:34:31:0:0:31:31:1:8:23:0:0:8:23:0:0
chr4	69972949	.	C	G	2698.47	PASS	AF=0.994286;AO=174;DP=175;FAO=174;FDP=175;FR=.;FRO=1;FSAF=94;FSAR=80;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00152895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.908;QD=61.6792;RBI=0.00310427;REFB=-0.109494;REVB=0.00270163;RO=1;SAF=94;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00503722;STB=0.502645;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.000139437;OID=.;OPOS=69972949;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:175:175:1:1:174:174:0.994286:80:94:1:0:80:94:1:0
chr4	70066319	.	G	T	443.15	PASS	AF=0.7;AO=35;DP=50;FAO=35;FDP=50;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.014772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.373;QD=35.4516;RBI=0.0198982;REFB=-0.00842107;REVB=0.0133314;RO=13;SAF=15;SAR=20;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206302;STB=0.590858;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00340573;OID=.;OPOS=70066319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:13:15:35:35:0.7:20:15:11:2:20:15:11:4
chr4	70070366	.	A	T	347.43	PASS	AF=0.45679;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.0602597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5719;QD=17.1568;RBI=0.0666018;REFB=-0.0202328;REVB=-0.028365;RO=43;SAF=22;SAR=15;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570824;STB=0.536823;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.0222616;OID=.;OPOS=70070366;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:43:44:37:37:0.45679:15:22:28:15:15:22:29:15
chr4	70146230	.	G	A	331.61	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0348349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.056;QD=51.0163;RBI=0.0551485;REFB=-0.102532;REVB=0.0427538;RO=1;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403161;STB=0.521722;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0026852;OID=.;OPOS=70146230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:26:26:1:1:25:25:0.961538:11:14:0:1:11:14:0:1
chr4	70146719	.	G	C	887.45	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.002852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.0718;QD=57.255;RBI=0.0500371;REFB=0;REVB=-0.0499557;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000637653;OID=.;OPOS=70146719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:62:0:0:60:62:1:23:37:0:0:23:39:0:0
chr4	70296603	.	A	G	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3056;QD=53.2751;RBI=0.140478;REFB=0;REVB=-0.132876;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00223989;OID=.;OPOS=70296603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr4	70296662	.	C	T	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.01257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.575;QD=11.634;RBI=0.0137019;REFB=0.00589464;REVB=0.00545315;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129195;STB=0.576773;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=-0.00772782;OID=.;OPOS=70296662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:5:5:10:6:5:5:10:6
chr4	70355211	.	T	C	1116.48	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413697;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.739;QD=60.3503;RBI=0.0414427;REFB=0;REVB=-0.00245844;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.08953e-05;OID=.;OPOS=70355211;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:41:32:0:0:41:33:0:0
chr4	70505162	.	G	A	360.89	PASS	AF=0.405941;AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.0437151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4743;QD=14.2928;RBI=0.0437181;REFB=-0.0298358;REVB=-0.00051256;RO=58;SAF=21;SAR=20;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041091;STB=0.532414;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0382263;OID=.;OPOS=70505162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:58:60:41:41:0.405941:20:21:32:26:20:21:34:26
chr4	70513139	.	C	T	766.38	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.4659;QD=63.8653;RBI=0.109544;REFB=0;REVB=-0.10533;RO=0;SAF=37;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00163791;OID=.;OPOS=70513139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:11:37:0:0:11:37:0:0
chr4	70599952	.	C	T	726.86	PASS	AF=0.382883;AO=85;DP=222;FAO=85;FDP=222;FR=.;FRO=137;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=86;FSRR=51;FWDB=-0.0223492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1848;QD=13.0966;RBI=0.0501839;REFB=-0.00882502;REVB=-0.0449326;RO=137;SAF=46;SAR=39;SRF=86;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0964065;STB=0.554251;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0131596;OID=.;OPOS=70599952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:222:222:137:137:85:85:0.382883:39:46:86:51:39:46:86:51
chr4	70802218	.	T	C	157.04	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.00280625;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.027;QD=16.1065;RBI=0.0236348;REFB=-0.0106435;REVB=-0.0234676;RO=22;SAF=14;SAR=3;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799701;STB=0.546284;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0161804;OID=.;OPOS=70802218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:3:14:17:5:3:14:17:5
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chr4	70821025	.	A	G	195.4	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0149055;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.6674;QD=12.6062;RBI=0.0539712;REFB=-0.0089103;REVB=0.0518722;RO=36;SAF=14;SAR=10;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880828;STB=0.535489;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0180833;OID=.;OPOS=70821025;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:36:38:24:24:0.387097:10:14:18:18:10:14:20:18
chr4	70898907	.	C	T	715.75	PASS	AF=0.635417;AO=58;DP=93;FAO=61;FDP=96;FR=.;FRO=35;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00248364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.922;QD=29.8228;RBI=0.0124215;REFB=-0.027006;REVB=0.0121707;RO=33;SAF=27;SAR=31;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0534583;STB=0.536707;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.0173401;OID=.;OPOS=70898907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:96:33:35:58:61:0.635417:31:27:18:15:34:27:19:16
chr4	70944452	.	G	A,T	2594.07	PASS	AF=0.970588,0.0294118;AO=164,6;DP=170;FAO=165,5;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=91,0;FSAR=74,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00303262,0.0129268;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=211.031,98.0614;QD=61.0369;RBI=0.0122989,0.0256465;REFB=0,0;REVB=0.0119191,-0.0221504;RO=0;SAF=91,0;SAR=73,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.17809e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000338536,0.0846922;OID=.,.;OPOS=70944452,70944452;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:170:170:0:0:164,6:165,5:0.970588,0.0294118:73,6:91,0:0:0:74,5:91,0:0:0
chr4	71062256	.	C	T	427.12	PASS	AF=0.436364;AO=48;DP=109;FAO=48;FDP=110;FR=.;FRO=62;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=42;FWDB=-0.0131838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.993;QD=15.5315;RBI=0.112895;REFB=-0.0380971;REVB=-0.112123;RO=61;SAF=22;SAR=26;SRF=20;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13339;STB=0.578021;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0454932;OID=.;OPOS=71062256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:61:62:48:48:0.436364:26:22:20:41:26:22:20:42
chr4	71062426	.	C	T	474.58	PASS	AF=0.522727;AO=46;DP=87;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.00753104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.983;QD=21.5716;RBI=0.0448881;REFB=-0.00262821;REVB=-0.0442519;RO=41;SAF=18;SAR=28;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635927;STB=0.530181;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.00223711;OID=.;OPOS=71062426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:41:42:46:46:0.522727:28:18:19:22:28:18:19:23
chr4	71068489	.	T	C	285.1	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=2;FWDB=0.000643207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.646;QD=23.7579;RBI=0.0434964;REFB=-0.024618;REVB=0.0434917;RO=22;SAF=15;SAR=11;SRF=20;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298526;STB=0.663686;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0212383;OID=.;OPOS=71068489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:11:15:20:2:11:15:20:2
chr4	71115060	.	G	A	147.57	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0426112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7143;QD=17.3616;RBI=0.0446295;REFB=-0.0160722;REVB=-0.0132695;RO=18;SAF=14;SAR=2;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.416489;STB=0.744313;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0170355;OID=.;OPOS=71115060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:2:14:10:8:2:14:10:8
chr4	71115152	.	T	C	165.87	PASS	AF=0.571429;AO=15;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0370371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.9896;QD=23.6958;RBI=0.0371614;REFB=-0.0141988;REVB=0.00303723;RO=10;SAF=14;SAR=1;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.539909;STB=0.709828;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0364212;OID=.;OPOS=71115152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:28:28:10:11:15:16:0.571429:1:14:5:5:2:14:6:5
chr4	71201388	.	C	T	582.36	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00859321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0527;QD=58.2356;RBI=0.054247;REFB=0.0182789;REVB=0.0535621;RO=1;SAF=31;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550239;STB=0.529396;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=6.79181e-06;OID=.;OPOS=71201388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:8:31:0:1:8:31:0:1
chr4	71201597	.	C	T	257.67	PASS	AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0095342;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.43;QD=15.8566;RBI=0.0142802;REFB=-0.0051834;REVB=-0.0106313;RO=35;SAF=14;SAR=15;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858497;STB=0.540227;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.00731711;OID=.;OPOS=71201597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:36:29:29:0.446154:15:14:20:15:15:14:20:16
chr4	71232388	.	G	A	375.71	PASS	AF=0.587302;AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0161986;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.546;QD=23.8548;RBI=0.0269133;REFB=-0.0297422;REVB=0.0214926;RO=26;SAF=25;SAR=12;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112153;STB=0.561763;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0218802;OID=.;OPOS=71232388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:26:26:37:37:0.587302:12:25:14:12:12:25:14:12
chr4	71232430	.	T	C	673.11	PASS	AF=0.978261;AO=44;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.019326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.0978;QD=58.5312;RBI=0.0198802;REFB=-0.11425;REVB=-0.00466127;RO=1;SAF=19;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240823;STB=0.5098;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00356833;OID=.;OPOS=71232430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:44:45:0.978261:25:19:1:0:25:20:0:1
chr4	71255767	.	A	G	103.92	PASS	AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00285201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.651;QD=10.1388;RBI=0.0189905;REFB=-0.0047763;REVB=0.0187752;RO=28;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249126;STB=0.649222;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0175496;OID=.;OPOS=71255767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:5:8:11:17:5:8:11:17
chr4	71275232	.	C	T	197.68	PASS	AF=0.309524;AO=25;DP=81;FAO=26;FDP=84;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=-0.0047982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.725;QD=9.41336;RBI=0.0119164;REFB=-0.0187167;REVB=-0.0109077;RO=56;SAF=17;SAR=8;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048848;STB=0.542586;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0371995;OID=.;OPOS=71275232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:84:56:58:25:26:0.309524:8:17:36:20:8:18:37:21
chr4	71339723	.	G	A	128.84	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0235929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6554;QD=12.5692;RBI=0.0361597;REFB=-0.012016;REVB=-0.0274024;RO=26;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173508;STB=0.510191;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0194005;OID=.;OPOS=71339723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:6:9:16:10:6:9:16:10
chr4	71339728	.	C	T	130.94	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0139454;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7558;QD=13.0935;RBI=0.0391516;REFB=-0.0310229;REVB=-0.0365838;RO=24;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745361;STB=0.526281;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0298511;OID=.;OPOS=71339728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:25:15:15:0.375:6:9:16:8:6:9:16:9
chr4	71346701	.	C	G	75.79	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.018444;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=131.529;QD=10.4532;RBI=0.0208129;REFB=-0.0166566;REVB=0.00964337;RO=17;SAF=2;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.432252;STB=0.764147;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0389243;OID=.;OPOS=71346701;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:29:17:19:10:10:0.344828:8:2:10:7:8:2:11:8
chr4	71384488	.	C	T	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.818;QD=58.2396;RBI=0.0345103;REFB=0;REVB=0.0126265;RO=0;SAF=40;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20228e-05;OID=.;OPOS=71384488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:22:40:0:0:22:40:0:0
chr4	71396989	.	C	T	270.69	PASS	AF=0.47619;AO=27;DP=60;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0604412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6234;QD=17.1866;RBI=0.0627586;REFB=-0.0174346;REVB=0.0168971;RO=31;SAF=11;SAR=16;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16427;STB=0.572584;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.019594;OID=.;OPOS=71396989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:63:31:33:27:30:0.47619:16:11:18:13:16:14:20:13
chr4	71472426	.	A	G	56.77	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0541095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.076;QD=11.9522;RBI=0.055535;REFB=-0.0572257;REVB=0.0125021;RO=11;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117224;STB=0.507025;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0420794;OID=.;OPOS=71472426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:5:3:4:7:5:3:4:7
chr4	71555754	.	G	T	556.43	PASS	AF=0.680556;AO=49;DP=72;FAO=49;FDP=72;FR=.;FRO=23;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0322451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.049;QD=30.9127;RBI=0.0327252;REFB=-0.0306802;REVB=0.00558481;RO=22;SAF=29;SAR=20;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131627;STB=0.564693;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0144046;OID=.;OPOS=71555754;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:22:23:49:49:0.680556:20:29:8:14:20:29:9:14
chr4	71657772	.	G	A,C	803.23	PASS	AF=0.947368,0.0526316;AO=54,3;DP=58;FAO=54,3;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34,0;FSAR=20,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000637869,0.023614;FXX=0.0172384;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=146.239,13.8391;QD=56.3673;RBI=0.039718,0.0681597;REFB=0,0;REVB=0.0397129,-0.0639385;RO=0;SAF=34,0;SAR=20,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.77753e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00123413,0.186285;OID=.,.;OPOS=71657772,71657772;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:58:57:0:0:54,3:54,3:0.947368,0.0526316:20,3:34,0:0:0:20,3:34,0:0:0
chr4	71704965	.	C	T	178.24	PASS	AF=0.37931;AO=18;DP=54;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0150747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.112;QD=12.2922;RBI=0.0498615;REFB=-0.0395011;REVB=0.0475281;RO=36;SAF=9;SAR=9;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942777;STB=0.551678;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0754742;OID=.;OPOS=71704965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:58:36:36:18:22:0.37931:9:9:21:15:11:11:21:15
chr4	71849697	.	C	T	729.63	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168575;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.863;QD=63.4458;RBI=0.019395;REFB=0;REVB=-0.00959103;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.39352e-05;OID=.;OPOS=71849697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr4	71849888	.	G	T	283.85	PASS	AF=0.457143;AO=31;DP=69;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0148271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.598;QD=16.2197;RBI=0.0162443;REFB=-0.0356284;REVB=0.00663592;RO=38;SAF=10;SAR=21;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157639;STB=0.574481;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0336745;OID=.;OPOS=71849888;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:38:38:31:32:0.457143:21:10:18:20:21:11:18:20
chr4	72420841	.	ATTTTTTT	ATTTTTT,ATTTTTTC	47.04	PASS	AF=0.333333,0.0555556;AO=11,2;DP=37;FAO=12,2;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=5,0;FSAR=7,2;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.142166,0.112043;FXX=0.0270197;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=7.80572,26.1525;QD=5.22706;RBI=0.274665,0.209474;REFB=-0.134869,-0.0872432;REVB=0.23501,0.176991;RO=20;SAF=5,0;SAR=6,2;SRF=12;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.155624,-0.555074;STB=0.639198,0.995857;STBP=0.269,0.092;TYPE=del,snp;VARB=0.148045,0.165103;OID=.,.;OPOS=72420842,72420848;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=ATTTTTT,ATTTTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333,0.0555556:11,2:37:12,2:36:22:5,0:7,2:14:8:37:20:5,0:6,2:12:8
chr4	72425863	.	C	T	132.24	PASS	AF=0.416667;AO=14;DP=35;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0313155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.01;QD=14.6929;RBI=0.0580759;REFB=-0.019978;REVB=-0.0489096;RO=20;SAF=10;SAR=4;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131049;STB=0.578837;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.025994;OID=.;OPOS=72425863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:20:21:14:15:0.416667:4:10:12:8:4:11:13:8
chr4	72433642	.	TG	T,TT	101.1	PASS	AF=0.263158,0;AO=12,7;DP=61;FAO=15,0;FDP=57;FR=.;FRO=42;FSAF=5,0;FSAR=10,0;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.00496614,-0.00754056;FXX=0.0499917;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=241.82,244.419;QD=7.09443;RBI=0.00632671,0.00754146;REFB=-0.0164366,-0.0148232;REVB=0.00391978,-0.000116267;RO=39;SAF=5,3;SAR=7,4;SRF=16;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00802159,0.0225867;STB=0.574897,0.5;STBP=0.501,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0401088,0.0215248;OID=.,.;OPOS=72433643,72433643;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.263158,0:12,7:61:15,0:57:42:5,0:10,0:18:24:96:39:5,3:7,4:16:23
chr4	72436804	.	G	A	389.2	PASS	AF=0.42268;AO=41;DP=98;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=-0.0151033;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.763;QD=16.0497;RBI=0.0151365;REFB=-0.0213047;REVB=-0.0010009;RO=54;SAF=25;SAR=16;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239498;STB=0.633948;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0290853;OID=.;OPOS=72436804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:54:56:41:41:0.42268:16:25:20:34:16:25:21:35
chr4	72618296	.	T	C	1917.61	PASS	AF=0.992063;AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0431735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.489;QD=60.8765;RBI=0.0590043;REFB=-0.102906;REVB=0.0402188;RO=1;SAF=75;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00629357;STB=0.503311;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000808527;OID=.;OPOS=72618296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:126:126:1:1:125:125:0.992063:50:75:1:0:50:75:1:0
chr4	72618323	.	G	T	577.57	PASS	AF=0.445255;AO=61;DP=137;FAO=61;FDP=137;FR=.;FRO=76;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=44;FSRR=32;FWDB=-0.0123533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2214;QD=16.8633;RBI=0.0292791;REFB=0.0109031;REVB=0.0265455;RO=76;SAF=43;SAR=18;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140275;STB=0.578552;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=-0.0100202;OID=.;OPOS=72618323;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:76:76:61:61:0.445255:18:43:44:32:18:43:44:32
chr4	72649774	.	G	A	194.04	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0399998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3814;QD=16.8733;RBI=0.0484125;REFB=-0.0374546;REVB=0.0272724;RO=26;SAF=10;SAR=10;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152564;STB=0.586872;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0333458;OID=.;OPOS=72649774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:10:10:9:17:10:10:9:17
chr4	73013235	.	C	A	170.31	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00309489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.435;QD=17.031;RBI=0.0149026;REFB=-0.0275088;REVB=-0.0145777;RO=22;SAF=5;SAR=13;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0470828;STB=0.526996;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.025306;OID=.;OPOS=73013235;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:13:5:7:15:13:5:7:15
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chr4	73433122	.	GA	G	167.51	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.148762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=26.5464;QD=15.9535;RBI=0.193159;REFB=-0.0311294;REVB=-0.123208;RO=19;SAF=15;SAR=8;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018252;STB=0.510195;STBP=0.904;TYPE=del;VARB=0.0113011;OID=.;OPOS=73433123;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.547619:23:42:23:42:19:15:8:12:7:99:19:15:8:12:7
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chr4	73991006	.	T	C	766.44	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.464;QD=63.8696;RBI=0.0235441;REFB=0;REVB=0.00866409;RO=0;SAF=15;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154189;OID=.;OPOS=73991006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:32:15:0:0:33:15:0:0
chr4	74285239	.	C	T	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0164824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2496;QD=9.44433;RBI=0.0490647;REFB=-0.0435299;REVB=0.0462133;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203317;STB=0.624609;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0392745;OID=.;OPOS=74285239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:3:3:7:3:3:3:7:3
chr4	74302071	.	T	A	305.51	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00686983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.859;QD=17.7107;RBI=0.011263;REFB=-0.0226124;REVB=0.00892529;RO=36;SAF=15;SAR=18;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00950429;STB=0.505316;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0229678;OID=.;OPOS=74302071;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:18:15:16:20:18:15:16:20
chr4	74302870	.	T	C	326.52	PASS	AF=0.413793;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.0352892;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.5897;QD=15.0126;RBI=0.0437238;REFB=-0.0183013;REVB=-0.0258155;RO=48;SAF=24;SAR=12;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.023503;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0232591;OID=.;OPOS=74302870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:87:48:51:36:36:0.413793:12:24:31:17:12:24:34:17
chr4	74318330	.	A	G	659.55	PASS	AF=0.956522;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0545555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.491;QD=57.3521;RBI=0.0888041;REFB=-0.203082;REVB=0.0700703;RO=2;SAF=16;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113745;STB=0.505195;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.00415761;OID=.;OPOS=74318330;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:45:46:2:2:43:44:0.956522:27:16:1:1:27:17:1:1
chr4	74347503	.	TAA	TA,T	329.19	PASS	AF=0.912281,0;AO=36,6;DP=58;FAO=52,0;FDP=57;FR=.;FRO=5;FSAF=30,0;FSAR=22,0;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.111061,0.0564697;FXX=0.0172384;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=11.2495,11.0379;QD=23.1014;RBI=0.128625,0.0661203;REFB=-0.0466551,-0.0277049;REVB=-0.0648825,-0.0343957;RO=11;SAF=24,0;SAR=12,6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0.328125,0.328125;SSEP=0,0;SSSB=0.0993931,-0.736639;STB=0.515812,0.5;STBP=0.437,1;TYPE=del,del;VARB=0.0297941,0.0142735;OID=.,.;OPOS=74347504,74347504;OREF=A,AA;OALT=-,-;OMAPALT=TA,T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.912281,0:36,6:58:52,0:57:5:30,0:22,0:2:3:6:11:24,0:12,6:5:6
chr4	74447510	.	A	C	1010.24	PASS	AF=0.911392;AO=72;DP=79;FAO=72;FDP=79;FR=.;FRO=7;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.00729657;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=224.739;QD=51.1514;RBI=0.00740602;REFB=-0.00641873;REVB=-0.00126854;RO=7;SAF=40;SAR=32;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453778;STB=0.524073;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.000186573;OID=.;OPOS=74447510;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:79:79:7:7:72:72:0.911392:32:40:2:5:32:40:2:5
chr4	74714098	.	G	A	1703.33	PASS	AF=1;AO=111;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0599759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.229;QD=60.2948;RBI=0.0618514;REFB=0;REVB=0.0151158;RO=0;SAF=37;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.93572e-05;OID=.;OPOS=74714098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:113:0:0:111:113:1:74:37:0:0:75:38:0:0
chr4	74863997	.	T	C	756.44	PASS	AF=0.982759;AO=53;DP=56;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00143596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.951;QD=52.1683;RBI=0.0686775;REFB=-0.133357;REVB=0.0686625;RO=2;SAF=16;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159754;STB=0.506327;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.00760293;OID=.;OPOS=74863997;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:58:2:1:53:57:0.982759:37:16:1:1:39:18:0:1
chr4	74904296	.	G	T	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0618805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.928;QD=11.0908;RBI=0.0646921;REFB=-0.0144262;REVB=-0.0188646;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.429493;STB=0.7681;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0280218;OID=.;OPOS=74904296;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:1:4:2:4:1:4:2:4
chr4	75023609	.	T	C	814.78	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0569436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.711;QD=57.1777;RBI=0.0591804;REFB=0;REVB=-0.0161166;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0004106;OID=.;OPOS=75023609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:27:29:0:0:28:29:0:0
chr4	75023709	.	C	T	1460.97	PASS	AF=0.971154;AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=104;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0420676;FXX=0.0095229;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.161;QD=56.1912;RBI=0.0455839;REFB=-0.180721;REVB=0.0175559;RO=1;SAF=42;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111615;STB=0.502451;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0015721;OID=.;OPOS=75023709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:104:104:1:3:101:101:0.971154:59:42:1:0:59:42:1:2
chr4	75046465	.	C	G	1048.63	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00869014;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3175;QD=59.9215;RBI=0.00964908;REFB=0;REVB=0.00419358;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000592599;OID=.;OPOS=75046465;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0
chr4	75168785	.	A	G	363.68	PASS	AF=0.41;AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=38;FWDB=0.0548224;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.094;QD=14.5474;RBI=0.055958;REFB=-0.0231692;REVB=-0.0112162;RO=58;SAF=9;SAR=32;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188007;STB=0.603719;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0514216;OID=.;OPOS=75168785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:58:59:41:41:0.41:32:9:21:37:32:9:21:38
chr4	75248434	.	A	G	1029.61	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042877;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.639;QD=59.6873;RBI=0.0430283;REFB=0;REVB=-0.00360513;RO=0;SAF=40;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.48773e-05;OID=.;OPOS=75248434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:29:40:0:0:29:40:0:0
chr4	75254282	.	G	A	1527.71	PASS	AF=1;AO=102;DP=104;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018952;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.525;QD=59.9103;RBI=0.0203934;REFB=0;REVB=-0.00753081;RO=0;SAF=47;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431141;OID=.;OPOS=75254282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:104:102:0:0:102:102:1:55:47:0:0:55:47:0:0
chr4	75485872	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00443996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.561;QD=43.4861;RBI=0.0102739;REFB=0;REVB=0.00926499;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.14452e-05;OID=.;OPOS=75485872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0
chr4	75937970	.	TC	T,TT	254.16	PASS	AF=0.227273,0.772727;AO=6,15;DP=23;FAO=5,17;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=1,10;FSAR=4,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000596406,0.0156646;FXX=0.0434594;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=58.6063,69.948;QD=46.2104;RBI=0.0663035,0.0646777;REFB=0,0;REVB=0.0663009,0.062752;RO=0;SAF=0,10;SAR=6,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0191745,0.0277549;OID=.,.;OPOS=75937971,75937971;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.227273,0.772727:6,15:23:5,17:22:0:1,10:4,7:0:0:15:0:0,10:6,5:0:0
chr4	75938179	.	G	A	375.63	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2293;QD=55.6491;RBI=0.0534449;REFB=0;REVB=0.0390321;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000755468;OID=.;OPOS=75938179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:15:11:0:0:16:11:0:0
chr4	75938236	.	A	G	363.0	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00962698;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.918;QD=55.8464;RBI=0.0449666;REFB=0;REVB=0.043924;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000576527;OID=.;OPOS=75938236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:11:14:0:0:12:14:0:0
chr4	76407217	.	A	ACT,T	831.74	PASS	AF=0.948276,0.0517241;AO=54,3;DP=67;FAO=55,3;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32,3;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176482,0.0112269;FXX=0.0793525;HRUN=0,1;LEN=2,1;MLLD=248.093,80.7287;QD=57.3613;RBI=0.0294793,0.032169;REFB=0,0;REVB=-0.023613,0.0301464;RO=9;SAF=32,3;SAR=22,0;SRF=4;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0406975,0.670564;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00152575,0.0156206;OID=.,.;OPOS=76407218,76407217;OREF=-,A;OALT=CT,T;OMAPALT=ACT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:67:58:9:0:54,3:55,3:0.948276,0.0517241:22,0:32,3:4:5:23,0:32,3:0:0
chr4	76407219	.	T	C	258.62	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00284771;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.523;QD=16.4202;RBI=0.0271232;REFB=-0.00109544;REVB=0.0269733;RO=32;SAF=18;SAR=11;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864879;STB=0.566882;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0014496;OID=.;OPOS=76407219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:32:34:29:29:0.460317:11:18:17:15:11:18:17:17
chr4	76720885	.	T	C	1102.11	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00407956;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.789;QD=58.7794;RBI=0.0133145;REFB=0.0088201;REVB=0.0126741;RO=1;SAF=35;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133249;STB=0.50704;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=3.28418e-05;OID=.;OPOS=76720885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:39:35:1:0:39:35:1:0
chr4	76722353	.	G	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1324;QD=55.6557;RBI=0.0681992;REFB=0;REVB=-0.0387672;RO=0;SAF=20;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000380969;OID=.;OPOS=76722353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:7:20:0:0:7:20:0:0
chr4	76787673	.	T	C	936.53	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6642;QD=58.5333;RBI=0.129672;REFB=0;REVB=0.128608;RO=0;SAF=42;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103536;OID=.;OPOS=76787673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:63:64:1:21:42:0:0:22:42:0:0
chr4	76793228	.	A	G	1338.26	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.697;QD=62.2446;RBI=0.189118;REFB=0;REVB=-0.188067;RO=0;SAF=58;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000120045;OID=.;OPOS=76793228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:28:58:0:0:28:58:0:0
chr4	76794345	.	T	G	1676.68	PASS	AF=0.99115;AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00654615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.222;QD=59.3514;RBI=0.0163867;REFB=-0.0694771;REVB=0.0150224;RO=0;SAF=47;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.8673e-08;STB=0.505262;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.000237394;OID=.;OPOS=76794345;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:113:113:0:1:112:112:0.99115:65:47:0:0:65:47:1:0
chr4	76804137	.	T	C	155.95	PASS	AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00735555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.115;QD=10.9435;RBI=0.00793742;REFB=-0.00104785;REVB=-0.00298303;RO=35;SAF=12;SAR=8;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126087;STB=0.557085;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00184201;OID=.;OPOS=76804137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:37:20:20:0.350877:8:12:17:18:8:12:19:18
chr4	76805902	.	C	T	1305.56	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00808893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9337;QD=60.7239;RBI=0.0275388;REFB=0.00658397;REVB=-0.0263241;RO=1;SAF=54;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00869298;STB=0.504586;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-8.34672e-05;OID=.;OPOS=76805902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:1:1:85:85:0.988372:31:54:1:0:31:54:1:0
chr4	76807217	.	TC	CG,TG	544.86	PASS	AF=0.0491803,0.721311;AO=3,44;DP=62;FAO=3,44;FDP=61;FR=.;FRO=14;FSAF=1,12;FSAR=2,32;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00285275,-0.0337224;FXX=0.0161264;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=103.727,66.8982;QD=35.7286;RBI=0.0161518,0.0797483;REFB=0.0385367,-0.0163644;REVB=-0.0158978,-0.0722676;RO=13;SAF=1,12;SAR=2,32;SRF=6;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.144625,-0.0957832;STB=0.582763,0.545433;STBP=0.91,0.261;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0596004,0.00766908;OID=.,.;OPOS=76807217,76807218;OREF=TC,C;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:92:62:61:13:14:3,44:3,44:0.0491803,0.721311:2,32:1,12:6:7:2,32:1,12:6:8
chr4	76807249	.	C	G	441.35	PASS	AF=0.6;AO=42;DP=70;FAO=42;FDP=70;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=34;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0150379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.0769;QD=25.2197;RBI=0.0212984;REFB=-0.00923359;REVB=-0.0150826;RO=28;SAF=8;SAR=34;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263238;STB=0.645492;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0146307;OID=.;OPOS=76807249;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:28:28:42:42:0.6:34:8:13:15:34:8:13:15
chr4	76807252	.	C	A	411.59	PASS	AF=0.57971;AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=69;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0654305;FXX=0.0142837;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5731;QD=23.8602;RBI=0.071394;REFB=-0.0377068;REVB=-0.0285648;RO=29;SAF=8;SAR=32;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273759;STB=0.651767;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0271026;OID=.;OPOS=76807252;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:29:29:40:40:0.57971:32:8:14:15:32:8:14:15
chr4	76807270	.	C	T	423.32	PASS	AF=0.585714;AO=40;DP=69;FAO=41;FDP=70;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0111535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.977;QD=24.1895;RBI=0.0111639;REFB=-0.0219038;REVB=-0.000479922;RO=29;SAF=7;SAR=33;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363598;STB=0.682659;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0160865;OID=.;OPOS=76807270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:29:29:40:41:0.585714:33:7:16:13:33:8:16:13
chr4	76807288	.	A	G	380.67	PASS	AF=0.493671;AO=39;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=32;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.0432489;FXX=0.0124984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.932;QD=19.2746;RBI=0.0434877;REFB=-0.0322575;REVB=0.00455104;RO=40;SAF=7;SAR=32;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45709;STB=0.756692;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0191327;OID=.;OPOS=76807288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:40:40:39:39:0.493671:32:7:25:15:32:7:25:15
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chr4	76807304	.	A	G	401.5	PASS	AF=0.482353;AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.0063453;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.609;QD=18.8943;RBI=0.0178832;REFB=0.00181531;REVB=0.0167196;RO=44;SAF=8;SAR=33;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.432068;STB=0.742637;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00209437;OID=.;OPOS=76807304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:44:44:41:41:0.482353:33:8:27:17:33:8:27:17
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chr4	76807325	.	T	A	229.69	PASS	AF=0.363636;AO=28;DP=77;FAO=28;FDP=77;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.0304632;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=261.12;QD=11.9317;RBI=0.0304951;REFB=-0.0158858;REVB=-0.00139442;RO=49;SAF=7;SAR=21;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369512;STB=0.714127;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0214671;OID=.;OPOS=76807325;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:49:49:28:28:0.363636:21:7:28:21:21:7:28:21
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chr4	76809386	.	A	G	2207.91	PASS	AF=1;AO=139;DP=142;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390975;FXX=0.0211253;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2166;QD=63.5371;RBI=0.0547134;REFB=0;REVB=0.0382745;RO=0;SAF=80;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46196e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.47443e-05;OID=.;OPOS=76809386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:139:0:0:139:139:1:59:80:0:0:59:80:0:0
chr4	76836137	.	A	G	262.18	PASS	AF=0.32;AO=32;DP=100;FAO=32;FDP=100;FR=.;FRO=68;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0251473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4332;QD=10.4873;RBI=0.0270962;REFB=-0.00915521;REVB=-0.0100903;RO=68;SAF=12;SAR=20;SRF=30;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801336;STB=0.546845;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0356994;OID=.;OPOS=76836137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:68:68:32:32:0.32:20:12:30:38:20:12:30:38
chr4	76878511	.	C	CT,T	36.38	PASS	AF=0.245283,0;AO=7,7;DP=56;FAO=13,0;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=5,0;FSAR=8,0;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.0272638,-0.0175055;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=11.5006,116.301;QD=2.74589;RBI=0.162667,0.0405239;REFB=-0.0843781,-0.00501018;REVB=-0.160366,-0.0365478;RO=42;SAF=6,0;SAR=1,7;SRF=29;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.273005,-0.739276;STB=0.708848,0.5;STBP=0.122,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00295313,0;OID=.,.;OPOS=76878512,76878511;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:56:53:42:40:7,7:13,0:0.245283,0:1,7:6,0:29:13:8,0:5,0:27:13
chr4	76878716	.	G	C	221.83	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0110481;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.414;QD=12.3236;RBI=0.0136747;REFB=-0.0169537;REVB=-0.0080583;RO=44;SAF=17;SAR=10;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441127;STB=0.534102;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0151961;OID=.;OPOS=76878716;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:44:45:27:27:0.375:10:17:26:18:10:17:26:19
chr4	76881233	.	G	T	225.18	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.0323179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.883;QD=13.0537;RBI=0.167188;REFB=-0.0401108;REVB=-0.164034;RO=34;SAF=12;SAR=14;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204819;STB=0.559396;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0519893;OID=.;OPOS=76881233;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:34:41:26:26:0.376812:14:12:15:19:14:12:15:26
chr4	76911852	.	C	T	167.12	PASS	AF=0.409091;AO=17;DP=43;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0163278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5963;QD=15.1925;RBI=0.0595967;REFB=-0.0348717;REVB=0.0573164;RO=26;SAF=5;SAR=12;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265831;STB=0.624858;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0394176;OID=.;OPOS=76911852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:26:26:17:18:0.409091:12:5:14:12:12:6:14:12
chr4	76942943	.	C	G	1208.9	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00835162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5347;QD=61.21;RBI=0.00843521;REFB=0;REVB=-0.00118457;RO=0;SAF=52;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.21285e-05;OID=.;OPOS=76942943;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:27:52:0:0:27:52:0:0
chr4	76943137	.	G	C	1208.09	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0656194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4355;QD=61.1691;RBI=0.0819384;REFB=0;REVB=0.0490713;RO=0;SAF=27;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000803435;OID=.;OPOS=76943137;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:52:27:0:0:52:27:0:0
chr4	76955913	.	CT	C,CC	674.22	PASS	AF=0.0909091,0.909091;AO=5,38;DP=43;FAO=4,40;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=2,21;FSAR=2,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375694,0.039118;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=263.183,282.916;QD=61.2927;RBI=0.056221,0.0535472;REFB=0,0;REVB=0.0418251,0.0365662;RO=0;SAF=3,19;SAR=2,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0100774,-0.000514161;OID=.,.;OPOS=76955914,76955914;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0909091,0.909091:5,38:43:4,40:44:0:2,21:2,19:0:0:16:0:3,19:2,19:0:0
chr4	76956188	.	T	C	713.95	PASS	AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00657652;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.802;QD=52.8854;RBI=0.0250834;REFB=-0.152754;REVB=0.024206;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.522718;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.000285715;OID=.;OPOS=76956188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:54:54:0:2:52:52:0.962963:21:31:0:0:21:31:0:2
chr4	77021433	.	C	T	167.92	PASS	AF=0.34375;AO=20;DP=62;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=0.0013377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.977;QD=10.495;RBI=0.0058864;REFB=-0.00974906;REVB=-0.00573239;RO=42;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299685;STB=0.640507;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0253168;OID=.;OPOS=77021433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:42:42:20:22:0.34375:9:11:12:30:11:11:12:30
chr4	77033590	.	C	T	1751.32	PASS	AF=1;AO=112;DP=114;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144808;FXX=0.00854628;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.106;QD=60.3904;RBI=0.0222685;REFB=0;REVB=0.0169173;RO=0;SAF=60;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116211;OID=.;OPOS=77033590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:116:0:0:112:116:1:52:60:0:0:53:63:0:0
chr4	77105911	.	A	G	97.65	PASS	AF=0.6875;AO=11;DP=16;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0208263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.341;QD=24.4133;RBI=0.0337153;REFB=-0.0193267;REVB=-0.026514;RO=5;SAF=10;SAR=1;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.548501;STB=0.81895;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0116834;OID=.;OPOS=77105911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:16:16:5:5:11:11:0.6875:1:10:1:4:1:10:1:4
chr4	77192868	.	G	A	728.93	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9835;QD=57.1707;RBI=0.0178333;REFB=0;REVB=-0.00176774;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192583;OID=.;OPOS=77192868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0
chr4	77201487	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0731176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.498;QD=59.0185;RBI=0.07782;REFB=0;REVB=-0.0266416;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233686;OID=.;OPOS=77201487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr4	78638730	.	T	C	408.33	PASS	AF=0.5;AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=0.0140154;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0098;QD=19.9188;RBI=0.11311;REFB=-0.0177394;REVB=0.112238;RO=41;SAF=32;SAR=9;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614149;STB=0.534206;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.036009;OID=.;OPOS=78638730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:41:41:41:41:0.5:9:32:30:11:9:32:30:11
chr4	78669454	.	A	G	212.8	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.000443278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.088;QD=20.267;RBI=0.00834401;REFB=-0.00376514;REVB=0.00833222;RO=21;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849174;STB=0.547899;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00304669;OID=.;OPOS=78669454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:12:9:11:10:12:9:11:10
chr4	78740132	.	G	C	32.38	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0969945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.0595;QD=16.1911;RBI=0.10265;REFB=-0.0725175;REVB=0.0336006;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165639;STB=0.599599;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.037145;OID=.;OPOS=78740132;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:3:2:2:1:3:2:2:1
chr4	78987157	.	A	G	367.0	PASS	AF=0.382609;AO=44;DP=115;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.0050077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.308;QD=12.7651;RBI=0.00505969;REFB=-0.0198256;REVB=-0.00072343;RO=70;SAF=17;SAR=27;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944288;STB=0.549875;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.0431401;OID=.;OPOS=78987157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:70:71:44:44:0.382609:27:17:33:37:27:17:33:38
chr4	78989672	.	G	C	415.39	PASS	AF=0.431193;AO=47;DP=109;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=43;FWDB=0.0213065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.683;QD=15.2437;RBI=0.0387663;REFB=-0.014558;REVB=0.0323861;RO=61;SAF=20;SAR=27;SRF=18;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138117;STB=0.570701;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0226156;OID=.;OPOS=78989672;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:61:62:47:47:0.431193:27:20:18:43:27:20:19:43
chr4	78989716	.	T	C	443.79	PASS	AF=0.45;AO=45;DP=100;FAO=45;FDP=100;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=38;FWDB=-0.0168415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.873;QD=17.7515;RBI=0.0168426;REFB=-0.0141744;REVB=-0.000186176;RO=54;SAF=18;SAR=27;SRF=16;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10838;STB=0.553169;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0195905;OID=.;OPOS=78989716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:54:55:45:45:0.45:27:18:16:38:27:18:17:38
chr4	79186047	.	G	A	327.04	PASS	AF=0.45;AO=34;DP=79;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0865258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9795;QD=16.3519;RBI=0.0913577;REFB=-0.0196058;REVB=0.0293177;RO=44;SAF=16;SAR=18;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294578;STB=0.515291;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.018037;OID=.;OPOS=79186047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:44:44:34:36:0.45:18:16:22:22:19:17:22:22
chr4	79186171	.	G	A	853.19	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109959;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4453;QD=57.8432;RBI=0.046474;REFB=0;REVB=0.0451544;RO=0;SAF=10;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.25974e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144152;OID=.;OPOS=79186171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:49:10:0:0:49:10:0:0
chr4	79205699	.	T	A	511.22	PASS	AF=0.458333;AO=55;DP=120;FAO=55;FDP=120;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=0.00135266;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.425;QD=17.0405;RBI=0.0191438;REFB=-0.0323065;REVB=-0.019096;RO=65;SAF=27;SAR=28;SRF=25;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103784;STB=0.557695;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0386391;OID=.;OPOS=79205699;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:65:65:55:55:0.458333:28:27:25:40:28:27:25:40
chr4	79238649	.	T	C	684.66	PASS	AF=0.5;AO=68;DP=136;FAO=68;FDP=136;FR=.;FRO=68;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=43;FSRR=25;FWDB=0.00340277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.234;QD=20.1371;RBI=0.00495804;REFB=0.00285912;REVB=-0.00360602;RO=68;SAF=29;SAR=39;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18528;STB=0.602029;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.00264331;OID=.;OPOS=79238649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:68:68:68:68:0.5:39:29:43:25:39:29:43:25
chr4	79240063	.	A	G	289.65	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0213612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5614;QD=18.9932;RBI=0.0753332;REFB=2.76587e-05;REVB=-0.0722411;RO=30;SAF=19;SAR=12;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190868;STB=0.510631;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=-0.0014731;OID=.;OPOS=79240063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:12:19:19:11:12:19:19:11
chr4	79293964	.	G	A	396.34	PASS	AF=0.622951;AO=38;DP=61;FAO=38;FDP=61;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0177227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.253;QD=25.9897;RBI=0.0178915;REFB=-0.0285989;REVB=0.00245213;RO=23;SAF=19;SAR=19;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014984;STB=0.508192;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0131349;OID=.;OPOS=79293964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:23:23:38:38:0.622951:19:19:11:12:19:19:11:12
chr4	79372930	.	C	T	165.73	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.00264757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.628;QD=14.411;RBI=0.0241809;REFB=-0.00378913;REVB=-0.0240356;RO=28;SAF=9;SAR=9;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150511;STB=0.586863;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0093429;OID=.;OPOS=79372930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:9:9:18:10:9:9:18:10
chr4	79387442	.	C	T	216.68	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0245516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.318;QD=13.3343;RBI=0.0365537;REFB=-0.0137165;REVB=0.0270812;RO=39;SAF=10;SAR=16;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188773;STB=0.607993;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0223093;OID=.;OPOS=79387442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:16:10:22:17:16:10:22:17
chr4	79387464	.	A	G	896.27	PASS	AF=0.984615;AO=61;DP=63;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0156449;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.8886;QD=55.155;RBI=0.0165703;REFB=-0.104174;REVB=-0.00546021;RO=1;SAF=29;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159989;STB=0.50769;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00323453;OID=.;OPOS=79387464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:65:1:1:61:64:0.984615:32:29:1:0:32:32:1:0
chr4	79387586	.	A	G	301.94	PASS	AF=0.574468;AO=26;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0849184;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.5876;QD=25.6969;RBI=0.0884489;REFB=-0.00980276;REVB=-0.0247404;RO=21;SAF=10;SAR=16;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440506;STB=0.509331;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.00396848;OID=.;OPOS=79387586;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:20:26:27:0.574468:16:10:7:14:17:10:7:13
chr4	79432455	.	A	C	512.09	PASS	AF=0.445312;AO=57;DP=129;FAO=57;FDP=128;FR=.;FRO=71;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=39;FSRR=32;FWDB=0.00945283;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.456;QD=16.0028;RBI=0.0454908;REFB=-0.0104594;REVB=-0.0444978;RO=70;SAF=41;SAR=16;SRF=39;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179869;STB=0.605872;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0126946;OID=.;OPOS=79432455;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:128:70:71:57:57:0.445312:16:41:39:31:16:41:39:32
chr4	79437155	.	C	T	335.31	PASS	AF=0.372727;AO=41;DP=110;FAO=41;FDP=110;FR=.;FRO=69;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=0.0108369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.3568;QD=12.1931;RBI=0.0270924;REFB=0.00305262;REVB=-0.0248306;RO=69;SAF=26;SAR=15;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143318;STB=0.58196;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00462032;OID=.;OPOS=79437155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:69:69:41:41:0.372727:15:26:35:34:15:26:35:34
chr4	79443850	.	G	A	255.68	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0150156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.84;QD=17.9428;RBI=0.0154335;REFB=-0.00867551;REVB=0.00356689;RO=28;SAF=14;SAR=14;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638389;STB=0.526297;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.00874771;OID=.;OPOS=79443850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:28:29:28:28:0.491228:14:14:12:16:14:14:13:16
chr4	79447763	.	T	C	450.59	PASS	AF=0.53012;AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=83;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.00348827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.824;QD=21.7151;RBI=0.00373147;REFB=-0.0153992;REVB=0.00132509;RO=38;SAF=23;SAR=21;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129246;STB=0.576532;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.017041;OID=.;OPOS=79447763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:38:39:44:44:0.53012:21:23:14:24:21:23:14:25
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chr4	79455733	.	C	T	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2078;QD=57.3854;RBI=0.0189176;REFB=0;REVB=0.0160521;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212628;OID=.;OPOS=79455733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:24:33:0:0:24:33:0:0
chr4	79845007	.	C	A	542.27	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104669;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.791;QD=60.2516;RBI=0.026131;REFB=0;REVB=0.0239432;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.18697e-05;OID=.;OPOS=79845007;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
chr4	80329343	.	T	C	760.2	PASS	AF=0.904762;AO=57;DP=64;FAO=57;FDP=63;FR=.;FRO=6;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.073764;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.103;QD=48.2664;RBI=0.0779461;REFB=-0.086468;REVB=0.0251886;RO=5;SAF=21;SAR=36;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0689057;STB=0.530025;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00189846;OID=.;OPOS=80329343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:64:63:5:6:57:57:0.904762:36:21:4:1:36:21:4:2
chr4	80827062	.	T	C	1688.92	PASS	AF=0.966387;AO=115;DP=119;FAO=115;FDP=119;FR=.;FRO=4;FSAF=64;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00752733;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=324.577;QD=56.7703;RBI=0.0151566;REFB=-0.180107;REVB=0.0131553;RO=4;SAF=64;SAR=51;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357934;STB=0.518865;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.000472955;OID=.;OPOS=80827062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:119:119:4:4:115:115:0.966387:51:64:0:4:51:64:0:4
chr4	80905989	.	GC	G,GG	285.2	PASS	AF=0.590909,0.409091;AO=14,8;DP=22;FAO=13,9;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13,9;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362634,0.0307991;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=290.543,289.813;QD=51.8548;RBI=0.0362634,0.0307991;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=0;SAF=14,8;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0219195,0.0244739;OID=.,.;OPOS=80905990,80905990;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.590909,0.409091:14,8:22:13,9:22:0:13,9:0,0:0:0:25:0:14,8:0,0:0:0
chr4	80977078	.	T	G	1275.17	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.095;QD=60.7223;RBI=0.0666747;REFB=0;REVB=0.0531716;RO=1;SAF=43;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108864;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000534905;OID=.;OPOS=80977078;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:84:84:1:0:82:84:1:39:43:1:0:39:45:0:0
chr4	81124596	.	G	C	959.24	PASS	AF=0.607143;AO=85;DP=140;FAO=85;FDP=140;FR=.;FRO=55;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.0109573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4392;QD=27.4069;RBI=0.0472299;REFB=-0.00543862;REVB=0.0459413;RO=55;SAF=48;SAR=37;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126336;STB=0.506848;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0044202;OID=.;OPOS=81124596;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:140:55:55:85:85:0.607143:37:48:32:23:37:48:32:23
chr4	81283914	.	A	G	146.36	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00965293;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.867;QD=16.7267;RBI=0.0352165;REFB=-0.0122431;REVB=-0.0338677;RO=18;SAF=4;SAR=12;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208812;STB=0.610022;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0194261;OID=.;OPOS=81283914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:19:16:16:0.457143:12:4:8:10:12:4:8:11
chr4	81529518	.	T	C	859.25	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.261;QD=57.2835;RBI=0.0837114;REFB=0;REVB=0.0804475;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320961;OID=.;OPOS=81529518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:31:27:0:0:31:29:0:0
chr4	81884722	.	G	A	1264.75	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.622;QD=61.6953;RBI=0.0150202;REFB=0;REVB=-0.00764451;RO=0;SAF=46;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14462e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.45192e-06;OID=.;OPOS=81884722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:36:46:0:0:36:46:0:0
chr4	81967187	.	AC	A,AT	628.75	PASS	AF=0.0952381,0.904762;AO=9,32;DP=42;FAO=4,38;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=4,17;FSAR=0,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0804446,0.0848872;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=221.528,241.673;QD=59.8809;RBI=0.0805758,0.0848917;REFB=0,0;REVB=0.00459605,0.000871484;RO=0;SAF=9,11;SAR=0,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00710258,0.00314501;OID=.,.;OPOS=81967188,81967188;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0952381,0.904762:9,32:42:4,38:42:0:4,17:0,21:0:0:10:0:9,11:0,21:0:0
chr4	81974809	.	T	C	385.7	PASS	AF=0.90625;AO=29;DP=32;FAO=29;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0655039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.009;QD=48.2122;RBI=0.0724607;REFB=-0.0226386;REVB=0.0309806;RO=3;SAF=11;SAR=18;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111288;STB=0.559958;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.000945703;OID=.;OPOS=81974809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:32:32:3:3:29:29:0.90625:18:11:3:0:18:11:3:0
chr4	81975088	.	G	A	307.04	PASS	AF=1;AO=21;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3033;QD=53.399;RBI=0.0389502;REFB=0;REVB=0.035509;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000308429;OID=.;OPOS=81975088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:21:23:1:6:15:0:0:7:16:0:0
chr4	81977690	.	C	T	549.59	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.893;QD=59.4149;RBI=0.0306471;REFB=0;REVB=0.0141232;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.42881e-05;OID=.;OPOS=81977690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr4	81977730	.	A	T	637.68	PASS	AF=0.907407;AO=49;DP=54;FAO=49;FDP=54;FR=.;FRO=5;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0217735;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.064;QD=47.2356;RBI=0.0245256;REFB=-0.170736;REVB=-0.011288;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526863;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.00348316;OID=.;OPOS=81977730;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:54:54:0:5:49:49:0.907407:25:24:0:0:25:24:1:4
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chr4	83551119	.	T	C	141.32	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.140789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.752;QD=13.4586;RBI=0.140939;REFB=-0.0165765;REVB=-0.00651904;RO=26;SAF=6;SAR=10;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781197;STB=0.545399;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0220405;OID=.;OPOS=83551119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:10:6:8:18:10:6:8:18
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chr4	83788344	.	A	T	1005.09	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.427;QD=59.123;RBI=0.04419;REFB=0;REVB=0.03742;RO=0;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.8153e-05;OID=.;OPOS=83788344;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:32:35:0:0:32:36:0:0
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chr4	83838217	.	G	A	1445.67	PASS	AF=0.989247;AO=91;DP=94;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0194476;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3025;QD=62.1795;RBI=0.0265902;REFB=-0.02006;REVB=-0.0181336;RO=1;SAF=37;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126384;STB=0.506492;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=2.02212e-05;OID=.;OPOS=83838217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:93:1:1:91:92:0.989247:54:37:1:0:54:38:1:0
chr4	83839799	.	A	G	879.95	PASS	AF=0.96875;AO=62;DP=65;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0137331;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.498;QD=54.9965;RBI=0.0137339;REFB=-0.0219453;REVB=0.000147218;RO=2;SAF=28;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00287932;STB=0.501525;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.000827317;OID=.;OPOS=83839799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:65:64:2:2:62:62:0.96875:34:28:1:1:34:28:1:1
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chr4	83849057	.	G	A	184.6	PASS	AF=0.423077;AO=20;DP=54;FAO=22;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0351926;FXX=0.0370302;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.1062;QD=14.1998;RBI=0.136921;REFB=-0.0691656;REVB=-0.132321;RO=23;SAF=8;SAR=12;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156045;STB=0.609276;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0690972;OID=.;OPOS=83849057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:52:23:30:20:22:0.423077:12:8:13:10:13:9:18:12
chr4	83900043	.	A	G	1180.64	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186531;FXX=0.0253133;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.479;QD=61.3321;RBI=0.0186765;REFB=0;REVB=-0.00093533;RO=0;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331276;OID=.;OPOS=83900043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:41:36:0:0:41:36:0:0
chr4	84191031	.	A	G	557.11	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00660736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.075;QD=60.2283;RBI=0.00695953;REFB=0;REVB=-0.00218584;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40117e-05;OID=.;OPOS=84191031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:16:21:0:0:16:21:0:0
chr4	84230619	.	T	C	124.78	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.00611738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7916;QD=17.8251;RBI=0.027765;REFB=-0.0135603;REVB=0.0270827;RO=15;SAF=12;SAR=1;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.680495;STB=0.906327;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0152437;OID=.;OPOS=84230619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:14:13:14:0.5:1:12:4:11:1:13:3:11
chr4	84361141	.	CTTTTT	CTTT,CTTTTG,CTTTT	132.19	PASS	AF=0.446154,0,0.0153846;AO=13,3,12;DP=65;FAO=29,0,1;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=26,0,1;FSAR=3,0,0;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.126267,-0.204907,-0.247536;FXX=0;HRUN=6,6,6;LEN=2,1,1;MLLD=12.1183,55.2963,5.82655;QD=8.13455;RBI=0.269415,0.211444,0.526299;REFB=-0.0437617,-0.00956321,-0.0839481;REVB=0.237994,0.0521701,0.464453;RO=25;SAF=13,3,8;SAR=0,0,4;SRF=13;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.79061,0.561636,0.171304;STB=0.797295,0.5,0.989645;STBP=0,1,0.469;TYPE=del,snp,del;VARB=0.0904112,0,-0.00512471;OID=.,.,.;OPOS=84361142,84361146,84361142;OREF=TT,T,T;OALT=-,G,-;OMAPALT=CTTT,CTTTTG,CTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.446154,0,0.0153846:13,3,12:65:29,0,1:65:35:26,0,1:3,0,0:18:17:99:25:13,3,8:0,0,4:13:12
chr4	84364751	.	A	G	261.99	PASS	AF=0.434783;AO=28;DP=67;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0155277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.273;QD=15.1881;RBI=0.0350963;REFB=-0.0103281;REVB=0.0314745;RO=39;SAF=18;SAR=10;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163844;STB=0.605988;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0109868;OID=.;OPOS=84364751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:69:39:39:28:30:0.434783:10:18:19:20:10:20:19:20
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chr4	84557407	.	G	C	86.3	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=1;FWDB=0.0181739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.894;QD=12.3289;RBI=0.0398064;REFB=-0.00461511;REVB=0.0354155;RO=17;SAF=10;SAR=1;SRF=16;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111918;STB=0.565111;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.00763374;OID=.;OPOS=84557407;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:1:10:16:1:1:10:16:1
chr4	85154910	.	T	C	88.04	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0246545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6628;QD=14.0857;RBI=0.0337108;REFB=0.0119211;REVB=0.0229906;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140078;STB=0.596848;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=-0.00508149;OID=.;OPOS=85154910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:13:14:11:11:0.44:5:6:9:4:5:6:10:4
chr4	85762385	.	T	C	610.92	PASS	AF=0.420732;AO=67;DP=164;FAO=69;FDP=164;FR=.;FRO=95;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=55;FSRR=40;FWDB=-0.0186249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.304;QD=14.9005;RBI=0.0186439;REFB=-0.0204677;REVB=-0.000842719;RO=94;SAF=33;SAR=34;SRF=54;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852803;STB=0.541581;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0347431;OID=.;OPOS=85762385;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:164:94:95:67:69:0.420732:34:33:54:40:34:35:55:40
chr4	86021741	.	C	T	852.06	PASS	AF=1;AO=44;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0526235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.218;QD=57.7671;RBI=0.053315;REFB=0;REVB=0.00855949;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244281;OID=.;OPOS=86021741;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:44:59:1:17:27:0:0:19:40:0:0
chr4	86021765	.	C	T	1021.37	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0761357;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.3184;QD=58.3639;RBI=0.0826256;REFB=-0.0912955;REVB=0.0320989;RO=1;SAF=42;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111236;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00306964;OID=.;OPOS=86021765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:70:70:1:0:69:70:1:27:42:1:0:27:43:0:0
chr4	86021967	.	C	T	676.75	PASS	AF=0.961538;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0132649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.094;QD=52.0577;RBI=0.0252764;REFB=-0.0457997;REVB=0.021516;RO=1;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017757;STB=0.51785;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00106469;OID=.;OPOS=86021967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:52:1:2:49:50:0.961538:26:23:0:1:27:23:0:2
chr4	87024409	.	T	C	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0543072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.312;QD=58.1418;RBI=0.0544974;REFB=0;REVB=0.00454915;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136516;OID=.;OPOS=87024409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0
chr4	87684031	.	A	G	253.17	PASS	AF=0.519231;AO=26;DP=51;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.00313966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9394;QD=19.4748;RBI=0.0250602;REFB=-0.00671656;REVB=0.0248627;RO=24;SAF=12;SAR=14;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245337;STB=0.632676;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0321587;OID=.;OPOS=87684031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:24:25:26:27:0.519231:14:12:18:6:14:13:19:6
chr4	87690998	.	A	G	384.77	PASS	AF=0.444444;AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.0083716;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.511;QD=17.1011;RBI=0.0261058;REFB=-0.0204422;REVB=0.0247271;RO=49;SAF=23;SAR=17;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00358524;STB=0.502843;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0307305;OID=.;OPOS=87690998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:49:50:40:40:0.444444:17:23:28:21:17:23:29:21
chr4	87706506	.	T	G	297.31	PASS	AF=0.382022;AO=34;DP=89;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.0159211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3113;QD=13.3621;RBI=0.0538996;REFB=-0.00100927;REVB=0.0514945;RO=55;SAF=23;SAR=11;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170859;STB=0.597973;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.00286696;OID=.;OPOS=87706506;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:55:55:34:34:0.382022:11:23:29:26:11:23:29:26
chr4	87809387	.	G	T	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00967527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.885;QD=61.6824;RBI=0.0122392;REFB=0;REVB=0.00749577;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.12947e-05;OID=.;OPOS=87809387;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
chr4	88056925	.	A	G,T	234.06	PASS	AF=0.842105,0.157895;AO=16,3;DP=19;FAO=16,3;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12,3;FSAR=4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00245143,-0.00633713;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=248.806,173.877;QD=49.2748;RBI=0.00591179,0.00751235;REFB=0,0;REVB=-0.00537957,0.00403437;RO=0;SAF=12,3;SAR=4,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.07465e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0104562,0.0381458;OID=.,.;OPOS=88056925,88056925;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:19:19:0:0:16,3:16,3:0.842105,0.157895:4,0:12,3:0:0:4,0:12,3:0:0
chr4	88057353	.	G	A	141.04	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0378497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0252;QD=13.4326;RBI=0.046099;REFB=-0.00979125;REVB=-0.0263157;RO=25;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147043;STB=0.571341;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0134568;OID=.;OPOS=88057353;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:26:16:16:0.380952:8:8:9:16:8:8:10:16
chr4	88059415	.	G	A	455.12	PASS	AF=0.511364;AO=44;DP=86;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=11;FWDB=-0.0393662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7144;QD=20.6873;RBI=0.0429774;REFB=-0.0158913;REVB=0.0172441;RO=42;SAF=19;SAR=25;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265539;STB=0.653459;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0151294;OID=.;OPOS=88059415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:88:42:43:44:45:0.511364:25:19:31:11:26:19:32:11
chr4	88059642	.	GGTGTGTGT	G	125.84	PASS	AF=0.486486;AO=15;DP=22;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=1;FWDB=0.0217312;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=8;MLLD=210.304;QD=13.6048;RBI=0.0708592;REFB=-0.0417174;REVB=0.0674446;RO=1;SAF=5;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826301;STB=0.810005;STBP=0.002;TYPE=del;VARB=0.0168491;OID=.;OPOS=88059643;OREF=GTGTGTGT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.486486:15:22:18:37:19:5:13:18:1:99:1:5:10:1:0
chr4	88061624	.	ATATAT	A	36.15	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00811748;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=210.477;QD=6.57359;RBI=0.00851645;REFB=-0.00858941;REVB=-0.00257614;RO=14;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187917;STB=0.624574;STBP=0.521;TYPE=del;VARB=0.0137873;OID=.;OPOS=88061625;OREF=TATAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.272727:6:22:6:22:16:4:2:8:8:36:14:4:2:7:7
chr4	88062161	.	CA	AA,CAA,C	30.15	PASS	AF=0,0.318182,0.136364;AO=2,4,2;DP=20;FAO=0,7,3;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=0,4,2;FSAR=0,3,1;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00112838,0.0701841,-0.0684231;FXX=0;HRUN=1,7,7;LEN=1,1,1;MLLD=256.791,9.30914,12.0503;QD=5.4814;RBI=0.00182531,0.0769704,0.0748927;REFB=-0.00858382,-0.0321895,0.0343556;REVB=-0.00143475,0.0316012,-0.0304501;RO=12;SAF=2,1,1;SAR=0,3,1;SRF=6;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.561268,-0.288654,0;STB=0.5,0.59674,0.694385;STBP=1,0.56,0.519;TYPE=snp,ins,del;VARB=0,0.107699,0.0415499;OID=.,.,.;OPOS=88062161,88062162,88062162;OREF=C,-,A;OALT=A,A,-;OMAPALT=AA,CAA,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:27:20:22:12:12:2,4,2:0,7,3:0,0.318182,0.136364:0,3,1:2,1,1:6:6:0,3,1:0,4,2:5:7
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chr4	88116518	.	A	G	365.05	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0479444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1347;QD=52.1494;RBI=0.0641982;REFB=-0.0733991;REVB=-0.0426937;RO=1;SAF=14;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320562;STB=0.517229;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00364841;OID=.;OPOS=88116518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:13:14:1:0:13:14:1:0
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chr4	88415636	.	G	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.07;QD=57.2024;RBI=0.0408856;REFB=0;REVB=-0.0387209;RO=0;SAF=21;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105464;OID=.;OPOS=88415636;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:9:21:0:0:9:21:0:0
chr4	88416188	.	G	T	1572.99	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.040919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.264;QD=59.9234;RBI=0.0414038;REFB=0;REVB=-0.00631733;RO=0;SAF=44;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.2058e-05;OID=.;OPOS=88416188;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:61:44:0:0:61:44:0:0
chr4	88416223	.	A	G	1775.51	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.104;QD=60.7012;RBI=0.0438931;REFB=0;REVB=-0.000802486;RO=0;SAF=39;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100497;OID=.;OPOS=88416223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:117:0:0:114:117:1:75:39:0:0:75:42:0:0
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chr4	88534235	.	A	G	103.49	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0215751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.944;QD=18.8157;RBI=0.0339346;REFB=-0.0417087;REVB=0.026193;RO=10;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240072;STB=0.636153;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0254012;OID=.;OPOS=88534235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:6:6:2:8:6:6:2:8
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chr4	88732531	.	T	C	127.24	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6156;QD=42.4133;RBI=0.0623839;REFB=0;REVB=0.0547909;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00890459;OID=.;OPOS=88732531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:4:7:0:0:5:7:0:0
chr4	88732692	.	G	A	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00803972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8297;QD=57.6773;RBI=0.0627333;REFB=0;REVB=0.062216;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131386;OID=.;OPOS=88732692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0
chr4	88732746	.	A	G	804.09	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.834;QD=64.327;RBI=0.0885048;REFB=0;REVB=0.0761328;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000323765;OID=.;OPOS=88732746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:17:33:0:0:17:33:0:0
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chr4	88815148	.	G	A	607.95	PASS	AF=0.496;AO=62;DP=125;FAO=62;FDP=125;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.016801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.659;QD=19.4543;RBI=0.0169352;REFB=-0.0169707;REVB=-0.00212747;RO=61;SAF=32;SAR=30;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371799;STB=0.527941;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0171987;OID=.;OPOS=88815148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:61:63:62:62:0.496:30:32:34:27:30:32:36:27
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chr4	88898941	.	C	T	679.04	PASS	AF=0.912281;AO=51;DP=57;FAO=52;FDP=57;FR=.;FRO=5;FSAF=40;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0347289;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.5457;QD=47.6521;RBI=0.0418285;REFB=-0.00608133;REVB=-0.0233137;RO=4;SAF=40;SAR=11;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00689717;STB=0.503815;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.00529022;OID=.;OPOS=88898941;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:57:57:4:5:51:52:0.912281:11:40:3:1:12:40:4:1
chr4	88902692	.	T	C	710.26	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00203074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.147;QD=54.6352;RBI=0.0731962;REFB=-0.0315505;REVB=0.0731681;RO=1;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165215;STB=0.508768;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000549336;OID=.;OPOS=88902692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:28:23:0:1:28:23:0:1
chr4	88903853	.	C	T	1106.07	PASS	AF=0.95;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=80;FR=.;FRO=4;FSAF=31;FSAR=45;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0322754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.331;QD=55.3033;RBI=0.0357963;REFB=-0.0239824;REVB=0.0154813;RO=3;SAF=31;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191556;STB=0.517587;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.000226919;OID=.;OPOS=88903853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:79:80:3:4:76:76:0.95:45:31:2:1:45:31:3:1
chr4	89053718	.	T	C	340.51	PASS	AF=0.586207;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00477454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9454;QD=23.4832;RBI=0.0505298;REFB=-0.039552;REVB=-0.0503037;RO=23;SAF=12;SAR=22;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129633;STB=0.564064;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0281068;OID=.;OPOS=89053718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:23:24:34:34:0.586207:22:12:12:11:22:12:12:12
chr4	89061114	.	C	T	219.96	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.00527923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.055;QD=17.5965;RBI=0.0121567;REFB=0.00255281;REVB=-0.0109505;RO=28;SAF=6;SAR=16;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277022;STB=0.658672;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.00599094;OID=.;OPOS=89061114;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:16:6:15:13:16:6:15:13
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chr4	89319296	.	T	C	272.34	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0579018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.1355;QD=51.875;RBI=0.0933314;REFB=0;REVB=0.0731993;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0004576;OID=.;OPOS=89319296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:8:12:0:0:9:12:0:0
chr4	89397091	.	A	G	1514.07	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154879;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.823;QD=63.7504;RBI=0.0430253;REFB=0;REVB=0.0401411;RO=0;SAF=41;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183485;OID=.;OPOS=89397091;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:54:41:0:0:54:41:0:0
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chr4	89443162	.	G	A	238.21	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0984742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6505;QD=16.1496;RBI=0.0986499;REFB=-0.00263263;REVB=-0.005885;RO=28;SAF=13;SAR=14;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113772;STB=0.577444;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00312534;OID=.;OPOS=89443162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:28:32:27:27:0.457627:14:13:17:11:14:13:20:12
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chr4	89618837	.	T	C	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.24;QD=57.3851;RBI=0.0310585;REFB=0;REVB=0.00946717;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.63791e-05;OID=.;OPOS=89618837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
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chr4	90034686	.	A	G	226.59	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00056363;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.617;QD=17.1013;RBI=0.034376;REFB=-0.0112569;REVB=0.0343714;RO=28;SAF=13;SAR=12;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05214;STB=0.529388;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0134231;OID=.;OPOS=90034686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:28:28:25:25:0.471698:12:13:13:15:12:13:13:15
chr4	90168415	.	A	T	557.14	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.091;QD=60.2308;RBI=0.0475414;REFB=0;REVB=0.0458799;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.31108e-05;OID=.;OPOS=90168415;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:12:25:0:0:12:25:0:0
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chr4	90169925	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0725985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.947;QD=56.7063;RBI=0.0816709;REFB=0;REVB=0.0374111;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000485629;OID=.;OPOS=90169925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr4	90170118	.	A	G	481.36	PASS	AF=0.573171;AO=43;DP=79;FAO=47;FDP=82;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0665633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.3949;QD=23.4808;RBI=0.0684348;REFB=-0.0227233;REVB=-0.0158947;RO=35;SAF=29;SAR=14;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186564;STB=0.569805;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0246621;OID=.;OPOS=90170118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:82:35:35:43:47:0.573171:14:29:16:19:18:29:16:19
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chr4	91585060	.	A	T	406.22	PASS	AF=0.482759;AO=41;DP=86;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.00694402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.657;QD=18.677;RBI=0.0336072;REFB=-0.0267532;REVB=0.032882;RO=44;SAF=17;SAR=24;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163533;STB=0.600717;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0312629;OID=.;OPOS=91585060;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:44:45:41:42:0.482759:24:17:26:18:25:17:27:18
chr4	92185834	.	GC	AG,CG,GA	307.46	PASS	AF=0,0,0.406977;AO=4,5,34;DP=86;FAO=0,0,35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=0,0,28;FSAR=0,0,7;FSRF=43;FSRR=8;FWDB=-0.0751886,-0.0546868,-0.0334394;FXX=0;HRUN=2,2,1;LEN=2,2,1;MLLD=93.6036,67.9321,112.253;QD=14.3003;RBI=0.0753195,0.0667086,0.0467942;REFB=-0.0309076,-0.0339709,-0.0230037;REVB=-0.0044396,-0.0382019,-0.0327339;RO=35;SAF=4,5,28;SAR=0,0,6;SRF=28;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.487506,0.537376,0.0357519;STB=0.5,0.5,0.541962;STBP=1,1,0.64;TYPE=mnp,mnp,snp;VARB=0,0,0.0507312;OID=.,.,.;OPOS=92185834,92185834,92185835;OREF=GC,GC,C;OALT=AG,CG,A;OMAPALT=AG,CG,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:99:86:86:35:51:4,5,34:0,0,35:0,0,0.406977:0,0,6:4,5,28:28:7:0,0,7:0,0,28:43:8
chr4	92240278	.	A	T	1622.8	PASS	AF=1;AO=58;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=69;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0909505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.9771;QD=56.4451;RBI=0.277085;REFB=0;REVB=0.261733;RO=0;SAF=42;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83285e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.012261;OID=.;OPOS=92240278;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:115:115:0:0:58:115:1:16:42:0:0:46:69:0:0
chr4	92240802	.	C	T	946.23	PASS	AF=0.985075;AO=64;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0181534;FXX=0.042851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4984;QD=56.4911;RBI=0.0234808;REFB=-0.0820833;REVB=-0.0148931;RO=1;SAF=34;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136897;STB=0.50704;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00344295;OID=.;OPOS=92240802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:68:67:1:1:64:66:0.985075:30:34:1:0:31:35:1:0
chr4	92246344	.	G	A	2052.17	PASS	AF=0.992481;AO=132;DP=134;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0445867;FXX=0.00746213;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.955;QD=61.7194;RBI=0.0549647;REFB=-0.033019;REVB=0.0321425;RO=1;SAF=68;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693874;STB=0.503649;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000222012;OID=.;OPOS=92246344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:134:133:1:1:132:132:0.992481:64:68:1:0:64:68:1:0
chr4	94316763	.	T	G	438.79	PASS	AF=0.483516;AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0623852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4954;QD=19.2874;RBI=0.0627212;REFB=0.02038;REVB=0.00648388;RO=47;SAF=29;SAR=15;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203065;STB=0.61315;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.019251;OID=.;OPOS=94316763;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:47:47:44:44:0.483516:15:29:21:26:15:29:21:26
chr4	95134165	.	C	G	181.97	PASS	AF=0.409836;AO=20;DP=60;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.00292192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0167;QD=11.9322;RBI=0.0138012;REFB=-0.0118893;REVB=0.0134883;RO=31;SAF=7;SAR=13;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243847;STB=0.576963;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00581579;OID=.;OPOS=95134165;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:31:36:20:25:0.409836:13:7:18:13:13:12:22:14
chr4	95169682	.	G	T	319.53	PASS	AF=0.492754;AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.046424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3439;QD=18.5232;RBI=0.0518806;REFB=0.00553309;REVB=0.0231606;RO=34;SAF=17;SAR=17;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792277;STB=0.536211;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=-0.00467131;OID=.;OPOS=95169682;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:34:35:34:34:0.492754:17:17:14:20:17:17:15:20
chr4	95170839	.	G	A	345.04	PASS	AF=0.391753;AO=38;DP=97;FAO=38;FDP=97;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0137072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.048;QD=14.2286;RBI=0.0180085;REFB=-0.0171698;REVB=-0.0116798;RO=59;SAF=15;SAR=23;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14117;STB=0.580319;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0328555;OID=.;OPOS=95170839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:59:59:38:38:0.391753:23:15:31:28:23:15:31:28
chr4	95173779	.	T	C	263.5	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00279539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8745;QD=19.5187;RBI=0.0202654;REFB=-0.00262637;REVB=0.0200716;RO=26;SAF=18;SAR=10;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161216;STB=0.590098;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00208751;OID=.;OPOS=95173779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:10:18:12:14:10:18:12:14
chr4	95186055	.	A	G	434.91	PASS	AF=0.518072;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.00270313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.749;QD=20.9595;RBI=0.002826;REFB=-0.00622594;REVB=-0.00082423;RO=39;SAF=18;SAR=25;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0819939;STB=0.539754;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00545218;OID=.;OPOS=95186055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:39:40:43:43:0.518072:25:18:20:19:25:18:20:20
chr4	95197520	.	C	T	401.53	PASS	AF=0.482353;AO=41;DP=85;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0166403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.324;QD=18.8955;RBI=0.0173053;REFB=-0.00403595;REVB=-0.00475152;RO=43;SAF=25;SAR=16;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0176277;STB=0.502111;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.00565479;OID=.;OPOS=95197520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:43:44:41:41:0.482353:16:25:27:16:16:25:27:17
chr4	95211610	.	T	C	236.26	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0104231;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.736;QD=17.5008;RBI=0.0208996;REFB=-0.00825324;REVB=-0.018115;RO=28;SAF=18;SAR=8;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253039;STB=0.642744;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00805016;OID=.;OPOS=95211610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:8:18:12:16:8:18:12:16
chr4	95496882	.	C	T	232.02	PASS	AF=0.536585;AO=15;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0140789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.857;QD=22.6357;RBI=0.0456469;REFB=-0.0341574;REVB=0.0434215;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577034;STB=0.533303;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.038443;OID=.;OPOS=95496882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:15:22:0.536585:8:7:10:9:12:10:10:9
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chr4	95531417	.	A	G	801.31	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.245;QD=57.2364;RBI=0.033465;REFB=0;REVB=0.0144645;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103148;OID=.;OPOS=95531417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:21:35:0:0:21:35:0:0
chr4	95539267	.	G	A	885.42	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.045;QD=58.06;RBI=0.0185325;REFB=0;REVB=0.0149875;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.48071e-05;OID=.;OPOS=95539267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0
chr4	95578588	.	G	A	1687.9	PASS	AF=0.991304;AO=110;DP=113;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=73;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0263676;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.647;QD=58.7097;RBI=0.0349868;REFB=-0.0252526;REVB=0.0229962;RO=0;SAF=70;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74501e-08;STB=0.503401;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00157105;OID=.;OPOS=95578588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:113:115:0:1:110:114:0.991304:40:70:0:0:41:73:1:0
chr4	95588075	.	G	A	1231.63	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269798;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.751;QD=60.8211;RBI=0.0289308;REFB=0;REVB=0.0104444;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135024;OID=.;OPOS=95588075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:81:0:0:79:81:1:39:40:0:0:41:40:0:0
chr4	95588158	.	C	G	183.95	PASS	AF=0.45;AO=17;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00285313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.07;QD=18.3946;RBI=0.0080178;REFB=0.00126465;REVB=-0.00749298;RO=19;SAF=9;SAR=8;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955401;STB=0.523783;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=-0.00214992;OID=.;OPOS=95588158;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:20:17:18:0.45:8:9:12:7:8:10:12:8
chr4	96169733	.	G	T	720.17	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00661305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0543;QD=56.4836;RBI=0.0658172;REFB=0;REVB=-0.0654841;RO=0;SAF=30;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000366185;OID=.;OPOS=96169733;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:20:30:0:0:20:31:0:0
chr4	96256616	.	A	G	927.9	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0857179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1164;QD=57.9939;RBI=0.0986009;REFB=0;REVB=0.0487297;RO=0;SAF=42;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114821;OID=.;OPOS=96256616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:62:64:1:20:42:0:0:22:42:0:0
chr4	96256673	.	G	A	1062.27	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00058698;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.9842;QD=59.8463;RBI=0.0692399;REFB=0;REVB=-0.0692374;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000194616;OID=.;OPOS=96256673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:31:40:0:0:31:40:0:0
chr4	97270063	.	C	A	403.31	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.781;QD=55.629;RBI=0.0683142;REFB=0;REVB=0.0647735;RO=1;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371713;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334691;OID=.;OPOS=97270063;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:1:0:27:29:1:12:15:0:1:14:15:0:0
chr4	99218108	.	G	GA	138.59	PASS	AF=0.466667;AO=19;DP=46;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0158473;FXX=0.0217344;HRUN=0;LEN=1;MLLD=189.446;QD=12.3194;RBI=0.0167738;REFB=-0.0145944;REVB=0.00549779;RO=24;SAF=14;SAR=5;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173408;STB=0.615266;STBP=0.208;TYPE=ins;VARB=0.021181;OID=.;OPOS=99218109;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.466667:19:46:21:45:24:16:5:14:10:99:24:14:5:14:10
chr4	99802070	.	A	C	76.4	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00771341;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.463;QD=25.4671;RBI=0.0202372;REFB=-0.0391588;REVB=0.0187096;RO=3;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0496942;STB=0.528239;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0133795;OID=.;OPOS=99802070;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:12:3:3:9:9:0.75:5:4:1:2:5:4:1:2
chr4	99850126	.	A	G	328.92	PASS	AF=0.5;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00702099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6366;QD=18.7953;RBI=0.0151747;REFB=0.00184608;REVB=-0.0134528;RO=32;SAF=25;SAR=10;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175864;STB=0.64454;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.00568265;OID=.;OPOS=99850126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:32:35:35:35:0.5:10:25:17:15:9:26:17:18
chr4	99952710	.	A	G	553.75	PASS	AF=0.533333;AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=105;FR=.;FRO=49;FSAF=37;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.00270356;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.635;QD=21.095;RBI=0.0102871;REFB=-0.0125983;REVB=0.00992546;RO=49;SAF=37;SAR=19;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262919;STB=0.514463;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0103563;OID=.;OPOS=99952710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:105:49:49:56:56:0.533333:19:37:31:18:19:37:31:18
chr4	100045574	.	T	C	651.2	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.725;QD=62.0189;RBI=0.0518725;REFB=0;REVB=0.00672348;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256363;OID=.;OPOS=100045574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr4	100045616	.	C	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0415099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.278;QD=59.8391;RBI=0.0446561;REFB=0;REVB=-0.016465;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000642861;OID=.;OPOS=100045616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr4	100045647	.	A	G	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.69;QD=56.1903;RBI=0.143376;REFB=0;REVB=0.0835098;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202925;OID=.;OPOS=100045647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0
chr4	100048414	.	T	C	1491.28	PASS	AF=1;AO=69;DP=98;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023033;FXX=0.0510152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.234;QD=64.1409;RBI=0.103272;REFB=0;REVB=0.100671;RO=0;SAF=32;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00077844;OID=.;OPOS=100048414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:93:0:0:69:93:1:37:32:0:0:39:54:0:0
chr4	100052733	.	C	A	699.93	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=5.16859e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.058;QD=60.8631;RBI=0.030556;REFB=0;REVB=0.030556;RO=0;SAF=30;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000611856;OID=.;OPOS=100052733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:46:0:0:41:46:1:11:30:0:0:16:30:0:0
chr4	100062819	.	A	G	545.24	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0351276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.833;QD=57.3932;RBI=0.0445055;REFB=-0.0013714;REVB=0.0273276;RO=1;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217802;STB=0.511622;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.000206228;OID=.;OPOS=100062819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:21:16:0:1:21:16:0:1
chr4	100064247	.	G	T	363.08	PASS	AF=0.396396;AO=42;DP=109;FAO=44;FDP=111;FR=.;FRO=67;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.0382384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7525;QD=13.0841;RBI=0.0407278;REFB=-0.0231407;REVB=-0.0140206;RO=67;SAF=23;SAR=19;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1077;STB=0.572564;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0283012;OID=.;OPOS=100064247;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:111:67:67:42:44:0.396396:19:23:30:37:19:25:30:37
chr4	100064305	.	C	G	1442.76	PASS	AF=1;AO=95;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00848455;FXX=0.0297;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.592;QD=58.888;RBI=0.0179476;REFB=0;REVB=0.0158155;RO=0;SAF=41;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00211595;OID=.;OPOS=100064305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:95:98:1:54:41:0:0:54:44:0:0
chr4	100140306	.	A	T	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00619064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.803;QD=57.1062;RBI=0.0439247;REFB=0;REVB=0.0434862;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174822;OID=.;OPOS=100140306;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:24:31:0:0:24:31:0:0
chr4	100203447	.	A	C	874.07	PASS	AF=0.494382;AO=87;DP=176;FAO=88;FDP=178;FR=.;FRO=90;FSAF=51;FSAR=37;FSRF=48;FSRR=42;FWDB=0.00416082;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.196;QD=19.6419;RBI=0.00871905;REFB=-0.00595199;REVB=-0.0076622;RO=89;SAF=50;SAR=37;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043458;STB=0.523786;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00521781;OID=.;OPOS=100203447;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:178:89:90:87:88:0.494382:37:50:47:42:37:51:48:42
chr4	100235053	.	A	G	2140.06	PASS	AF=0.978873;AO=136;DP=140;FAO=139;FDP=142;FR=.;FRO=3;FSAF=81;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.011817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8174;QD=60.2835;RBI=0.0200097;REFB=-0.000844851;REVB=-0.0161477;RO=3;SAF=78;SAR=58;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239499;STB=0.512603;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.000237251;OID=.;OPOS=100235053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:140:142:3:3:136:139:0.978873:58:78:0:3:58:81:0:3
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chr4	100443781	.	CT	C,CC	726.07	PASS	AF=0.0196078,0.980392;AO=14,34;DP=48;FAO=1,50;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=0,27;FSAR=1,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111189,0.107665;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=266.744,274.73;QD=56.9467;RBI=0.112436,0.108805;REFB=0,0;REVB=0.0166956,0.0157106;RO=0;SAF=10,14;SAR=4,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.63386e-08,-4.48532e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.024899,0.00204389;OID=.,.;OPOS=100443782,100443782;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0196078,0.980392:14,34:48:1,50:51:0:0,27:1,23:0:0:7:0:10,14:4,20:0:0
chr4	100443853	.	A	G	110.59	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0339781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8694;QD=15.2538;RBI=0.0482017;REFB=0.0124238;REVB=-0.0341891;RO=14;SAF=2;SAR=11;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.095395;STB=0.636124;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.010943;OID=.;OPOS=100443853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:16:13:13:0.448276:11:2:3:11:11:2:5:11
chr4	100457117	.	A	ACAGT	436.02	PASS	AF=0.61194;AO=39;DP=71;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0104889;FXX=0.0563301;HRUN=1;LEN=4;MLLD=267.355;QD=26.031;RBI=0.0204692;REFB=-0.0145998;REVB=0.0175775;RO=26;SAF=24;SAR=15;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502296;STBP=0.971;TYPE=ins;VARB=0.0099555;OID=.;OPOS=100457118;OREF=-;OALT=CAGT;OMAPALT=ACAGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.61194:39:71:41:67:26:25:16:16:10:99:26:24:15:16:10
chr4	100504575	.	G	C	262.32	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0241262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8902;QD=20.9855;RBI=0.0411399;REFB=-0.0533679;REVB=0.033323;RO=25;SAF=14;SAR=11;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731331;STB=0.540951;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0358448;OID=.;OPOS=100504575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:11:14:16:9:11:14:16:9
chr4	100510859	.	T	C	918.88	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.311;QD=58.3414;RBI=0.0718417;REFB=0;REVB=0.0350105;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246248;OID=.;OPOS=100510859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:61:63:1:22:39:0:0:22:41:0:0
chr4	100510903	.	A	G	308.15	PASS	AF=0.542373;AO=32;DP=59;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.0473225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0024;QD=20.8915;RBI=0.0553372;REFB=0.0349816;REVB=0.0286843;RO=27;SAF=21;SAR=11;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796814;STB=0.544002;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=-0.0283942;OID=.;OPOS=100510903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:27:27:32:32:0.542373:11:21:20:7:11:21:20:7
chr4	100512412	.	T	C	441.65	PASS	AF=0.445455;AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=110;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=0.0201157;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.512;QD=16.0601;RBI=0.0218988;REFB=-0.0120593;REVB=-0.00865542;RO=59;SAF=29;SAR=20;SRF=23;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196464;STB=0.61788;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0199386;OID=.;OPOS=100512412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:110:59:61:49:49:0.445455:20:29:23:36:20:29:23:38
chr4	100516022	.	C	G	937.6	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.821;QD=58.6003;RBI=0.0220574;REFB=0;REVB=-0.0182041;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.15459e-05;OID=.;OPOS=100516022;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:63:64:1:26:37:0:0:27:37:0:0
chr4	100570681	.	T	A	206.2	PASS	AF=0.4;AO=25;DP=64;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.01088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.9222;QD=12.6894;RBI=0.0496795;REFB=-0.00249229;REVB=0.0484735;RO=39;SAF=17;SAR=8;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187161;STB=0.615098;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00763311;OID=.;OPOS=100570681;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:39:39:25:26:0.4:8:17:20:19:8:18:20:19
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chr4	100574816	.	TCCCCC	TCCCCG,TCCCC	210.51	PASS	AF=0.6,0.32;AO=12,7;DP=25;FAO=15,8;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=7,1;FSAR=8,7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0264565,0.163269;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=68.7337,11.3115;QD=33.682;RBI=0.0786867,0.221266;REFB=0.0293999,-0.049968;REVB=0.0741057,0.149338;RO=3;SAF=4,0;SAR=8,7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0.353846;SSSB=-0.127365,-0.791268;STB=0.503932,0.635964;STBP=0.881,0.227;TYPE=snp,del;VARB=-0.00893539,0.142577;OID=.,.;OPOS=100574821,100574817;OREF=C,C;OALT=G,-;OMAPALT=TCCCCG,TCCCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.6,0.32:12,7:25:15,8:25:2:7,1:8,7:1:1:45:3:4,0:8,7:2:1
chr4	100575398	.	C	T	475.26	PASS	AF=0.485714;AO=50;DP=106;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.00415564;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.058;QD=18.105;RBI=0.00662712;REFB=-0.0176921;REVB=0.00516231;RO=52;SAF=26;SAR=24;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170158;STB=0.503935;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.018461;OID=.;OPOS=100575398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:105:52:54:50:51:0.485714:24:26:28:24:24:27:29:25
chr4	100575483	.	G	T	277.17	PASS	AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.04754;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0463;QD=16.0676;RBI=0.0505171;REFB=-0.0100732;REVB=-0.0170859;RO=38;SAF=16;SAR=15;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157682;STB=0.508881;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0129308;OID=.;OPOS=100575483;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:38:38:31:31:0.449275:15:16:19:19:15:16:19:19
chr4	100575711	.	C	T	520.1	PASS	AF=0.538462;AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.000773953;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.552;QD=22.8613;RBI=0.00250566;REFB=-0.0324785;REVB=-0.00238314;RO=42;SAF=28;SAR=21;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0404813;STB=0.522284;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0322014;OID=.;OPOS=100575711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:42:42:49:49:0.538462:21:28:22:20:21:28:22:20
chr4	100805207	.	C	A	481.33	PASS	AF=0.438017;AO=53;DP=121;FAO=53;FDP=121;FR=.;FRO=68;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=-0.0224215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.664;QD=15.9117;RBI=0.0385458;REFB=-0.0123516;REVB=-0.0313538;RO=65;SAF=35;SAR=18;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647387;STB=0.552549;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0185281;OID=.;OPOS=100805207;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:65:68:53:53:0.438017:18:35:39:26:18:35:39:29
chr4	101401161	.	TAAC	T	499.78	PASS	AF=0.474359;AO=74;DP=157;FAO=74;FDP=156;FR=.;FRO=82;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=-0.00844413;FXX=0.00636902;HRUN=2;LEN=3;MLLD=245.068;QD=12.8149;RBI=0.00880187;REFB=-0.00806992;REVB=-0.00248385;RO=77;SAF=32;SAR=42;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104688;STB=0.567549;STBP=0.12;TYPE=del;VARB=0.00869433;OID=.;OPOS=101401162;OREF=AAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.474359:74:157:74:156:82:32:42:46:36:99:77:32:42:42:35
chr4	102751076	.	G	A	484.1	PASS	AF=0.477064;AO=52;DP=109;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=-0.000836767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6218;QD=17.765;RBI=0.032514;REFB=-0.0178338;REVB=-0.0325032;RO=57;SAF=29;SAR=23;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203398;STB=0.51129;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.013741;OID=.;OPOS=102751076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:57:57:52:52:0.477064:23:29:33:24:23:29:33:24
chr4	102751276	.	C	T	1634.8	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106723;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.566;QD=59.9926;RBI=0.0269633;REFB=0;REVB=0.0247613;RO=0;SAF=57;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.18161e-05;OID=.;OPOS=102751276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:109:0:0:106:109:1:49:57:0:0:51:58:0:0
chr4	102839287	.	G	A	552.15	PASS	AF=0.573034;AO=50;DP=88;FAO=51;FDP=89;FR=.;FRO=38;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0647121;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5274;QD=24.8158;RBI=0.074269;REFB=-0.0177981;REVB=-0.036445;RO=38;SAF=30;SAR=20;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703022;STB=0.534696;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0129597;OID=.;OPOS=102839287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:38:38:50:51:0.573034:20:30:26:12:20:31:26:12
chr4	102965043	.	T	C	1098.73	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.875;QD=60.2042;RBI=0.0264907;REFB=0;REVB=-0.0173812;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.91577e-06;OID=.;OPOS=102965043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:37:36:0:0:37:36:0:0
chr4	103514658	.	T	C	990.5	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00239906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.048;QD=59.1344;RBI=0.0465706;REFB=0;REVB=0.0465088;RO=0;SAF=53;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126724;OID=.;OPOS=103514658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:14:53:0:0:14:53:0:0
chr4	103555992	.	A	G	1748.21	PASS	AF=0.991525;AO=116;DP=118;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00630985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2474;QD=59.2612;RBI=0.0247859;REFB=0.0107493;REVB=-0.0239692;RO=1;SAF=70;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00673663;STB=0.503496;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.000187765;OID=.;OPOS=103555992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:118:118:1:1:116:117:0.991525:46:70:1:0:46:71:1:0
chr4	103557077	.	G	A	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0356619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.845;QD=62.9824;RBI=0.0411676;REFB=0;REVB=0.0205669;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.9397e-05;OID=.;OPOS=103557077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0
chr4	103611845	.	C	T	250.38	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0200106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3427;QD=20.0304;RBI=0.0270212;REFB=0.00128074;REVB=-0.0181582;RO=26;SAF=18;SAR=6;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188516;STB=0.607047;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=-0.00207887;OID=.;OPOS=103611845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:6:18:15:11:6:18:15:11
chr4	103808862	.	T	C	34.57	PASS	AF=0.193548;AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0150796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.754;QD=4.46121;RBI=0.0414706;REFB=-0.0079345;REVB=-0.0386318;RO=25;SAF=5;SAR=1;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368667;STB=0.758529;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0307676;OID=.;OPOS=103808862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:31:31:25:25:6:6:0.193548:1:5:14:11:1:5:14:11
chr4	103866480	.	G	A	149.52	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.0146056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.96;QD=11.9619;RBI=0.0166506;REFB=-0.0269637;REVB=-0.00799485;RO=32;SAF=9;SAR=8;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216319;STB=0.63295;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.019533;OID=.;OPOS=103866480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:32:33:17:17:0.34:8:9:23:9:8:9:24:9
chr4	103911069	.	C	A	172.99	PASS	AF=0.777778;AO=13;DP=17;FAO=14;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0226219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.337;QD=38.4422;RBI=0.0299098;REFB=-0.0812281;REVB=-0.0195665;RO=1;SAF=7;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603742;STB=0.562412;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00472796;OID=.;OPOS=103911069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:17:18:1:2:13:14:0.777778:6:7:1:0:7:7:2:0
chr4	104007666	.	TTGA	T,TTAA	227.1	PASS	AF=0.512195,0.0731707;AO=19,3;DP=42;FAO=21,3;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=9,1;FSAR=12,2;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0100247,-0.0250631;FXX=0.0238039;HRUN=2,1;LEN=3,1;MLLD=212.575,120.853;QD=22.1558;RBI=0.0263162,0.0281749;REFB=-0.0247224,-0.0193592;REVB=0.024332,0.012871;RO=19;SAF=7,1;SAR=12,2;SRF=12;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.232385,-0.31624;STB=0.57136,0.708343;STBP=0.358,0.516;TYPE=del,snp;VARB=0.014807,0.075246;OID=.,.;OPOS=104007667,104007668;OREF=TGA,G;OALT=-,A;OMAPALT=T,TTAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.512195,0.0731707:19,3:42:21,3:41:17:9,1:12,2:10:7:99:19:7,1:12,2:12:7
chr4	104065609	.	T	C	303.56	PASS	AF=0.471429;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.0296321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3485;QD=17.3465;RBI=0.0297402;REFB=-0.019011;REVB=-0.00253345;RO=36;SAF=19;SAR=14;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339488;STB=0.524985;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0254864;OID=.;OPOS=104065609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:36:37:33:33:0.471429:14:19:22:14:14:19:23:14
chr4	106159644	.	T	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374704;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.801;QD=55.0987;RBI=0.0374724;REFB=0;REVB=-0.000388904;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49834e-05;OID=.;OPOS=106159644;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr4	106161408	.	CT	CC,C	149.69	PASS	AF=0.0833333,0.625;AO=2,13;DP=24;FAO=2,15;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=2,14;FSAR=0,1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.188489,-0.276323;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=21.1703,18.8374;QD=24.9478;RBI=0.202286,0.299357;REFB=-0.0432791,-0.0700196;REVB=0.0734271,0.115153;RO=8;SAF=2,13;SAR=0,0;SRF=2;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.684179,0.841405;STB=0.995565,0.839405;STBP=0.09,0.003;TYPE=snp,del;VARB=0.0535003,0.00716504;OID=.,.;OPOS=106161409,106161409;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0833333,0.625:2,13:24:2,15:24:7:2,14:0,1:2:5:33:8:2,13:0,0:2:6
chr4	106317429	.	C	G	216.33	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.00416603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.264;QD=22.188;RBI=0.0200541;REFB=-0.0070052;REVB=0.0196166;RO=18;SAF=14;SAR=7;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525558;STB=0.529384;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0154612;OID=.;OPOS=106317429;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:7:14:13:5:7:14:13:5
chr4	106474096	.	T	C	625.04	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.212;QD=60.9791;RBI=0.0161313;REFB=0;REVB=0.00330684;RO=0;SAF=9;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54184e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.21039e-05;OID=.;OPOS=106474096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:31:9:0:0:31:10:0:0
chr4	106580341	.	C	T	281.94	PASS	AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.0020216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.634;QD=14.6464;RBI=0.0371958;REFB=0.00988925;REVB=-0.0371409;RO=41;SAF=23;SAR=9;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985887;STB=0.551261;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=-0.0156168;OID=.;OPOS=106580341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:41:45:32:32:0.415584:9:23:26:15:9:23:29:16
chr4	106861730	.	A	G	1449.51	PASS	AF=0.990196;AO=95;DP=100;FAO=101;FDP=102;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=25;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0693635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.908;QD=56.8433;RBI=0.0694696;REFB=-0.0143154;REVB=-0.00383718;RO=1;SAF=19;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00619959;STB=0.503267;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.000243489;OID=.;OPOS=106861730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:102:1:1:95:101:0.990196:76:19:0:1:76:25:0:1
chr4	107168431	.	G	C	266.51	PASS	AF=0.447761;AO=30;DP=67;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0667889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7888;QD=15.9113;RBI=0.0687428;REFB=-0.0319317;REVB=0.016273;RO=36;SAF=9;SAR=21;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258985;STB=0.654099;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0409076;OID=.;OPOS=107168431;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:36:37:30:30:0.447761:21:9:20:16:21:9:21:16
chr4	107249244	.	C	G	712.43	PASS	AF=1;AO=47;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242423;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.183;QD=56.9944;RBI=0.024385;REFB=0;REVB=-0.00263413;RO=0;SAF=15;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00243812;OID=.;OPOS=107249244;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:47:50:1:32:15:0:0:35:15:0:0
chr4	107288449	.	G	A	1524.9	PASS	AF=0.981132;AO=104;DP=106;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0239889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.863;QD=57.5433;RBI=0.0240963;REFB=0.00672086;REVB=0.00227307;RO=2;SAF=57;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197617;STB=0.510415;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.000104803;OID=.;OPOS=107288449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:106:106:2:2:104:104:0.981132:47:57:0:2:47:57:0:2
chr4	107845794	.	C	T	624.64	PASS	AF=0.512195;AO=63;DP=123;FAO=63;FDP=123;FR=.;FRO=60;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=-0.0414718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.3138;QD=20.3134;RBI=0.05099;REFB=-0.00422735;REVB=-0.0296659;RO=60;SAF=37;SAR=26;SRF=42;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10534;STB=0.557831;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00456686;OID=.;OPOS=107845794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:60:60:63:63:0.512195:26:37:42:18:26:37:42:18
chr4	108356274	.	G	A	173.0	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00458647;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4141;QD=18.7025;RBI=0.013873;REFB=-0.0199794;REVB=0.0130929;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237684;STB=0.513498;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.029271;OID=.;OPOS=108356274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:9:9:9:10:9:9:9:10
chr4	108641300	.	T	C	950.28	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315092;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.628;QD=58.4788;RBI=0.0497218;REFB=0;REVB=-0.0384634;RO=1;SAF=39;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119581;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.71501e-05;OID=.;OPOS=108641300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:1:0:64:65:1:25:39:1:0:25:40:0:0
chr4	108641317	.	G	A	725.61	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.8217;QD=56.9107;RBI=0.107684;REFB=0;REVB=0.010856;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139692;OID=.;OPOS=108641317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:22:27:0:0:23:28:0:0
chr4	108931039	.	T	C	921.22	PASS	AF=1;AO=54;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.169249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6354;QD=58.4899;RBI=0.16929;REFB=0;REVB=0.00369939;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173415;OID=.;OPOS=108931039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:54:63:1:23:31:0:0:24:39:0:0
chr4	109478108	.	C	G	285.16	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0257804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3741;QD=23.7632;RBI=0.0906627;REFB=-0.00461411;REVB=-0.0869201;RO=22;SAF=19;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135242;STB=0.575696;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00124563;OID=.;OPOS=109478108;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:7:19:13:9:7:19:13:9
chr4	109541499	.	C	T	580.46	PASS	AF=0.536364;AO=53;DP=106;FAO=59;FDP=110;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=14;FSRR=37;FWDB=0.0619714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9136;QD=21.1077;RBI=0.0794583;REFB=-0.0119856;REVB=0.0497309;RO=53;SAF=24;SAR=29;SRF=16;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14019;STB=0.600957;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0134002;OID=.;OPOS=109541499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:110:53:51:53:59:0.536364:29:24:16:37:30:29:14:37
chr4	109541603	.	T	A	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.0284401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.658;QD=14.6528;RBI=0.0284496;REFB=-0.0094367;REVB=-0.000735658;RO=8;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.499358;STB=0.785151;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00700552;OID=.;OPOS=109541603;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:3:5:0:8:3:5:0:8
chr4	109735133	.	T	C	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0537367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.151;QD=57.6775;RBI=0.0686638;REFB=0;REVB=0.0427444;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000552139;OID=.;OPOS=109735133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:21:10:0:0:21:10:0:0
chr4	109769899	.	C	T	740.36	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00386632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9485;QD=56.9511;RBI=0.0497233;REFB=0;REVB=0.0495727;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284457;OID=.;OPOS=109769899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0
chr4	109895718	.	GAA	GA,G	224.81	PASS	AF=1,0;AO=27,5;DP=39;FAO=39,0;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146312,0.0077101;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=8.88387,9.21637;QD=23.0576;RBI=0.0828345,0.0449772;REFB=-0.0391117,-0.0334467;REVB=-0.0815321,-0.0443115;RO=5;SAF=14,1;SAR=13,4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0235725,-0.363118;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0111733,0.0231486;OID=.,.;OPOS=109895719,109895719;OREF=A,AA;OALT=-,-;OMAPALT=GA,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:27,5:39:39,0:39:0:19,0:20,0:0:0:3:5:14,1:13,4:3:2
chr4	110442602	.	A	G	221.81	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0306729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.1142;QD=18.4843;RBI=0.0343443;REFB=-0.0226713;REVB=0.0154501;RO=26;SAF=8;SAR=14;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181358;STB=0.510279;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0391581;OID=.;OPOS=110442602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:14:8:9:17:14:8:9:17
chr4	110581363	.	T	A	95.93	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0241287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.2324;QD=11.9909;RBI=0.0530951;REFB=0.0158239;REVB=-0.0472958;RO=20;SAF=3;SAR=9;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378983;STB=0.725419;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=-0.0267907;OID=.;OPOS=110581363;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:32:32:20:20:12:12:0.375:9:3:12:8:9:3:12:8
chr4	110603784	.	T	C	93.3	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0944408;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.6809;QD=9.102;RBI=0.09563;REFB=0.00034248;REVB=0.0150341;RO=30;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102706;STB=0.579273;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.000596484;OID=.;OPOS=110603784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:42:41:30:29:12:12:0.292683:7:5:10:20:7:5:9:20
chr4	110605744	.	A	T	493.93	PASS	AF=0.489796;AO=48;DP=99;FAO=48;FDP=98;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.00599632;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.738;QD=20.1603;RBI=0.0192716;REFB=-0.0156707;REVB=-0.018315;RO=50;SAF=24;SAR=24;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736108;STB=0.540799;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0217142;OID=.;OPOS=110605744;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:98:50:50:48:48:0.489796:24:24:29:21:24:24:29:21
chr4	110638810	.	C	T	459.93	PASS	AF=0.40625;AO=51;DP=127;FAO=52;FDP=128;FR=.;FRO=76;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=44;FSRR=32;FWDB=0.0166811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.045;QD=14.3728;RBI=0.019579;REFB=-0.0166106;REVB=-0.0102508;RO=76;SAF=35;SAR=16;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124649;STB=0.574438;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0272361;OID=.;OPOS=110638810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:128:76:76:51:52:0.40625:16:35:44:32:16:36:44:32
chr4	110661937	.	G	A	499.56	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.218;QD=58.7719;RBI=0.0226138;REFB=0;REVB=-0.00469779;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.98906e-05;OID=.;OPOS=110661937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0
chr4	110678925	.	T	C	330.49	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.155;QD=52.8783;RBI=0.054782;REFB=0;REVB=0.0448616;RO=0;SAF=7;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00069209;OID=.;OPOS=110678925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:25:0:0:23:25:1:16:7:0:0:16:9:0:0
chr4	110681505	.	C	T	257.96	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0138255;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.064;QD=18.4255;RBI=0.0141417;REFB=-0.0108218;REVB=-0.00297402;RO=28;SAF=19;SAR=9;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10476;STB=0.55878;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0131196;OID=.;OPOS=110681505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:9:19:16:12:9:19:16:12
chr4	110737389	.	T	C	450.82	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0659109;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.86;QD=58.1702;RBI=0.0665291;REFB=0;REVB=-0.0090483;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209466;OID=.;OPOS=110737389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr4	110757224	.	G	A	549.34	PASS	AF=0.413333;AO=61;DP=151;FAO=62;FDP=150;FR=.;FRO=88;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.00249728;FXX=0.0384591;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.545;QD=14.649;RBI=0.0230234;REFB=-0.0123617;REVB=-0.0228876;RO=84;SAF=34;SAR=27;SRF=42;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595894;STB=0.544733;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.018696;OID=.;OPOS=110757224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:150:84:88:61:62:0.413333:27:34:42:42:27:35:43:45
chr4	110757287	.	G	A	467.36	PASS	AF=0.429752;AO=52;DP=121;FAO=52;FDP=121;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=37;FWDB=-0.00242321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.483;QD=15.45;RBI=0.0255393;REFB=-0.00392665;REVB=-0.0254241;RO=69;SAF=25;SAR=27;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173309;STB=0.509713;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.00550107;OID=.;OPOS=110757287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:69:69:52:52:0.429752:27:25:32:37:27:25:32:37
chr4	110773067	.	G	A	166.61	PASS	AF=0.761905;AO=16;DP=21;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0200904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.512;QD=31.7355;RBI=0.0268939;REFB=0.00575238;REVB=0.0178789;RO=5;SAF=1;SAR=15;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199246;STB=0.612077;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=-0.000702162;OID=.;OPOS=110773067;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:21:21:5:5:16:16:0.761905:15:1:1:4:15:1:1:4
chr4	110790911	.	A	T	452.31	PASS	AF=0.418033;AO=51;DP=122;FAO=51;FDP=122;FR=.;FRO=71;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=41;FSRR=30;FWDB=-0.011211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.328;QD=14.8297;RBI=0.0112435;REFB=-0.0174964;REVB=0.000855007;RO=71;SAF=34;SAR=17;SRF=41;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0996757;STB=0.55619;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0300844;OID=.;OPOS=110790911;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:71:71:51:51:0.418033:17:34:41:30:17:34:41:30
chr4	110791361	.	G	A	101.9	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00587388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7652;QD=8.86102;RBI=0.0809215;REFB=0.00146334;REVB=-0.080708;RO=33;SAF=8;SAR=5;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222674;STB=0.635555;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=-0.00484733;OID=.;OPOS=110791361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:5:8:14:19:5:8:14:19
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chr4	110901198	.	G	A	1641.9	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.826;QD=60.2531;RBI=0.023674;REFB=0;REVB=0.0131464;RO=0;SAF=50;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67725e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.55134e-05;OID=.;OPOS=110901198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:109:0:0:107:109:1:57:50:0:0:58:51:0:0
chr4	110914427	.	A	T	1177.89	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00989591;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4006;QD=61.189;RBI=0.0163192;REFB=0;REVB=0.0129764;RO=0;SAF=52;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000134621;OID=.;OPOS=110914427;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:25:52:0:0:25:52:0:0
chr4	110971030	.	G	T	1216.18	PASS	AF=1;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.002655;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0551;QD=61.5785;RBI=0.0242528;REFB=0;REVB=-0.024107;RO=0;SAF=52;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000154307;OID=.;OPOS=110971030;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:81:79:0:0:79:79:1:27:52:0:0:27:52:0:0
chr4	111398208	.	A	G	520.04	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00291677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.777;QD=59.4333;RBI=0.0376281;REFB=0;REVB=0.0375149;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000400593;OID=.;OPOS=111398208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr4	111409705	.	T	C	920.07	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.901;QD=58.4174;RBI=0.0324233;REFB=0;REVB=-0.0140977;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.66251e-05;OID=.;OPOS=111409705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0
chr4	111483133	.	C	A	300.52	PASS	AF=0.414634;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0559745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5685;QD=14.6596;RBI=0.063855;REFB=-0.00242441;REVB=-0.0307298;RO=47;SAF=18;SAR=16;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106195;STB=0.565676;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00571894;OID=.;OPOS=111483133;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:47:48:34:34:0.414634:16:18:20:27:16:18:20:28
chr4	111542124	.	G	A	618.83	PASS	AF=0.43125;AO=69;DP=159;FAO=69;FDP=160;FR=.;FRO=91;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=43;FSRR=48;FWDB=0.00367422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.966;QD=15.4707;RBI=0.0037346;REFB=-0.0131688;REVB=0.000668833;RO=90;SAF=37;SAR=32;SRF=42;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0705018;STB=0.536221;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0253743;OID=.;OPOS=111542124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:160:90:91:69:69:0.43125:32:37:42:48:32:37:43:48
chr4	111542234	.	C	T	837.81	PASS	AF=0.475138;AO=86;DP=181;FAO=86;FDP=181;FR=.;FRO=95;FSAF=56;FSAR=30;FSRF=57;FSRR=38;FWDB=0.0461408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.082;QD=18.5151;RBI=0.0478285;REFB=-0.0357476;REVB=-0.0125933;RO=95;SAF=56;SAR=30;SRF=57;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524729;STB=0.529029;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0416933;OID=.;OPOS=111542234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:181:95:95:86:86:0.475138:30:56:57:38:30:56:57:38
chr4	112252643	.	G	T	340.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0084;QD=54.5151;RBI=0.0399326;REFB=0;REVB=-0.0136806;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000565649;OID=.;OPOS=112252643;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0
chr4	113178894	.	ATTTGT	A	137.19	PASS	AF=0.337662;AO=21;DP=72;FAO=26;FDP=77;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=40;FSRR=11;FWDB=-0.0165022;FXX=0;HRUN=3;LEN=5;MLLD=250.379;QD=7.12653;RBI=0.0386462;REFB=-0.0184556;REVB=0.0349457;RO=43;SAF=12;SAR=9;SRF=36;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336556;STB=0.708034;STBP=0.025;TYPE=del;VARB=0.0389936;OID=.;OPOS=113178895;OREF=TTTGT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.337662:21:72:26:77:51:12:14:40:11:99:43:12:9:36:7
chr4	113198805	.	G	C	285.55	PASS	AF=0.526316;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=26;FWDB=-0.0224579;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0843;QD=20.0386;RBI=0.03169;REFB=-0.0173676;REVB=-0.0223584;RO=25;SAF=2;SAR=28;SRF=1;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967488;STB=0.562463;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0116476;OID=.;OPOS=113198805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:25:27:30:30:0.526316:28:2:1:24:28:2:1:26
chr4	113199075	.	A	G	293.02	PASS	AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0477441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.059;QD=14.8364;RBI=0.0477612;REFB=-0.0120174;REVB=-0.00127836;RO=46;SAF=19;SAR=14;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03488;STB=0.519735;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0167273;OID=.;OPOS=113199075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:14:19:28:18:14:19:28:18
chr4	113344925	.	C	T	92.58	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0108632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.508;QD=9.25821;RBI=0.0234846;REFB=-0.00991444;REVB=-0.0208211;RO=28;SAF=9;SAR=3;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377564;STB=0.730376;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0234183;OID=.;OPOS=113344925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:3:9:12:16:3:9:12:16
chr4	113347603	.	GCCCCT	GCC,GCCCT	31.59	PASS	AF=0.137931,0;AO=10,16;DP=85;FAO=12,0;FDP=87;FR=.;FRO=75;FSAF=11,0;FSAR=1,0;FSRF=40;FSRR=35;FWDB=-0.00645464,-0.174751;FXX=0.0113623;HRUN=4,4;LEN=3,1;MLLD=245.51,11.2448;QD=1.45259;RBI=0.0160103,0.263948;REFB=-0.000893452,-0.0537618;REVB=-0.0146515,-0.197816;RO=52;SAF=9,11;SAR=1,5;SRF=25;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.548837,0.259036;STB=0.885178,0.5;STBP=0.01,1;TYPE=del,del;VARB=0.0056706,0.000254446;OID=.,.;OPOS=113347606,113347604;OREF=CCT,C;OALT=-,-;OMAPALT=GCC,GCCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.137931,0:10,16:85:12,0:87:75:11,0:1,0:40:35:30:52:9,11:1,5:25:27
chr4	113347609	.	CTT	CTC,CT,CTTT	234.51	PASS	AF=0.141026,0.846154,0;AO=10,26,11;DP=78;FAO=11,66,0;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=10,30,0;FSAR=1,36,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00420008,0.0673894,-0.057145;FXX=0.0249969;HRUN=10,10,10;LEN=1,1,1;MLLD=214.003,3.87374,4.27958;QD=12.0261;RBI=0.0199453,0.911523,0.969962;REFB=0.0203466,0.225033,-0.23867;REVB=0.019498,0.909029,-0.968277;RO=25;SAF=9,19,2;SAR=1,7,9;SRF=6;SRR=19;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.699919,0.426224,-0.101167;STB=0.523767,0.508194,0.5;STBP=0.669,0.319,1;TYPE=snp,del,ins;VARB=-0.005518,0.0954626,-0.00628302;OID=.,.,.;OPOS=113347611,113347610,113347610;OREF=T,T,-;OALT=C,-,T;OMAPALT=CTC,CT,CTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.141026,0.846154,0:10,26,11:78:11,66,0:78:1:10,30,0:1,36,0:1:0:55:25:9,19,2:1,7,9:6:19
chr4	113352397	.	G	A	203.07	PASS	AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.00989888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.159;QD=12.3075;RBI=0.0273921;REFB=-0.00695436;REVB=0.0255409;RO=40;SAF=7;SAR=18;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577602;STB=0.527836;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0110022;OID=.;OPOS=113352397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:41:25:25:0.378788:18:7:13:27:18:7:13:28
chr4	113352899	.	G	A	494.33	PASS	AF=0.521277;AO=47;DP=87;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.021289;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.857;QD=21.0354;RBI=0.0338165;REFB=-0.0462025;REVB=-0.0262743;RO=40;SAF=25;SAR=22;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362251;STB=0.534674;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0422546;OID=.;OPOS=113352899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:94:40:45:47:49:0.521277:22:25:23:17:22:27:28:17
chr4	113353285	.	T	C	236.07	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00955702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.638;QD=19.2707;RBI=0.00956817;REFB=-0.000725894;REVB=-0.000461616;RO=24;SAF=20;SAR=3;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249185;STB=0.683571;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.000968618;OID=.;OPOS=113353285;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:26:23:23:0.469388:3:20:17:7:3:20:17:9
chr4	113359703	.	A	G	394.63	PASS	AF=0.565217;AO=38;DP=68;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.00037816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.291;QD=22.8771;RBI=0.0383527;REFB=-0.0248993;REVB=0.0383509;RO=30;SAF=24;SAR=14;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213526;STB=0.608445;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0137404;OID=.;OPOS=113359703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:30:30:38:39:0.565217:14:24:11:19:15:24:11:19
chr4	113362622	.	C	G	348.73	PASS	AF=0.408602;AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=-0.0487782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6823;QD=14.9991;RBI=0.0507647;REFB=-0.00157959;REVB=-0.014062;RO=55;SAF=26;SAR=12;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193634;STB=0.610048;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00248679;OID=.;OPOS=113362622;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:55:55:38:38:0.408602:12:26:28:27:12:26:28:27
chr4	113436044	.	T	G	86.04	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0013165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.086;QD=38.2403;RBI=0.0247177;REFB=0;REVB=-0.0246826;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00058584;OID=.;OPOS=113436044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:6:2:0:0:7:2:0:0
chr4	113479339	.	G	C	74.24	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0396284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7236;QD=10.6061;RBI=0.0588317;REFB=-0.00559291;REVB=-0.0434829;RO=18;SAF=7;SAR=3;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224862;STB=0.63608;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0131921;OID=.;OPOS=113479339;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:3:7:9:9:3:7:9:9
chr4	113539969	.	T	C	260.56	PASS	AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.012142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.609;QD=24.8149;RBI=0.0206934;REFB=-0.0226887;REVB=0.0167567;RO=18;SAF=7;SAR=17;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219793;STB=0.622738;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0152462;OID=.;OPOS=113539969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:17:7:10:8:17:7:10:8
chr4	113549989	.	G	A	199.48	PASS	AF=0.526316;AO=19;DP=37;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00663238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.246;QD=20.9982;RBI=0.0165911;REFB=0.000317145;REVB=-0.0152077;RO=18;SAF=12;SAR=7;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328183;STB=0.508712;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=-0.000316496;OID=.;OPOS=113549989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:18:18:19:20:0.526316:7:12:12:6:7:13:12:6
chr4	113565835	.	G	A	102.65	PASS	AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0365179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6345;QD=9.33138;RBI=0.0456974;REFB=-0.00753078;REVB=0.0274716;RO=30;SAF=6;SAR=7;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158696;STB=0.605379;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0145573;OID=.;OPOS=113565835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:30:31:13:13:0.295455:7:6:18:12:7:6:19:12
chr4	113611785	.	A	G	364.17	PASS	AF=0.528571;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0148419;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.7583;QD=20.8095;RBI=0.0186973;REFB=-0.0372755;REVB=-0.0113714;RO=33;SAF=24;SAR=13;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19564;STB=0.608498;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.04126;OID=.;OPOS=113611785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:33:33:37:37:0.528571:13:24:14:19:13:24:14:19
chr4	114081490	.	A	G	148.12	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0125481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.038;QD=17.9543;RBI=0.0127337;REFB=-0.00710731;REVB=-0.0021662;RO=17;SAF=12;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173577;STB=0.599867;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00706611;OID=.;OPOS=114081490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:4:12:10:7:4:12:10:7
chr4	114341210	.	T	C	271.36	PASS	AF=0.766667;AO=17;DP=31;FAO=23;FDP=30;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0434808;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.927;QD=36.1815;RBI=0.0442777;REFB=-0.0338708;REVB=-0.00836302;RO=6;SAF=9;SAR=8;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139023;STB=0.509083;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.01129;OID=.;OPOS=114341210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:31:30:6:7:17:23:0.766667:8:9:3:3:9:14:4:3
chr4	114341631	.	T	C	159.86	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.143757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.206;QD=26.6434;RBI=0.144392;REFB=-0.00839651;REVB=-0.0135319;RO=7;SAF=8;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039064;STB=0.541615;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.00554013;OID=.;OPOS=114341631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:7:8:16:16:0.666667:8:8:4:3:8:8:5:3
chr4	114822485	.	G	A	370.07	PASS	AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00262363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.384;QD=19.7369;RBI=0.0126697;REFB=-0.015403;REVB=-0.0123951;RO=37;SAF=20;SAR=18;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126791;STB=0.507039;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0100718;OID=.;OPOS=114822485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:37:37:38:38:0.506667:18:20:20:17:18:20:20:17
chr4	114823316	.	A	C	318.88	PASS	AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0356497;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.0559;QD=21.2588;RBI=0.072037;REFB=0.0307563;REVB=0.0625974;RO=26;SAF=24;SAR=9;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263585;STB=0.63991;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.0224308;OID=.;OPOS=114823316;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:27:33:33:0.55:9:24:11:15:9:24:12:15
chr4	115544713	.	CA	CG,TG	1315.42	PASS	AF=0.545455,0.454545;AO=46,40;DP=88;FAO=48,40;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=23,23;FSAR=25,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215778,0.00973164;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=71.4355,121.97;QD=59.7918;RBI=0.0244213,0.0331602;REFB=0,0;REVB=-0.0114367,0.0317;RO=0;SAF=22,23;SAR=24,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-6.4817e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00826069,-0.0051627;OID=.,.;OPOS=115544714,115544713;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:88:88:0:0:46,40:48,40:0.545455,0.454545:24,17:22,23:0:0:25,17:23,23:0:0
chr4	115589302	.	A	G	1011.74	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00854761;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7263;QD=59.514;RBI=0.026398;REFB=0;REVB=0.0249759;RO=0;SAF=38;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101417;OID=.;OPOS=115589302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:30:38:0:0:30:38:0:0
chr4	119237348	.	T	C	1190.33	PASS	AF=1;AO=76;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.076;QD=61.0426;RBI=0.0576845;REFB=0;REVB=0.0321069;RO=0;SAF=52;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.16397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137568;OID=.;OPOS=119237348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:76:78:1:24:52:0:0:24:54:0:0
chr4	119239539	.	G	A	177.35	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0107735;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.89;QD=13.3851;RBI=0.0134314;REFB=-0.00964681;REVB=0.00802095;RO=33;SAF=9;SAR=12;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279167;STB=0.524567;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0133048;OID=.;OPOS=119239539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:33:32:21:21:0.396226:12:9:15:18:12:9:15:17
chr4	119273712	.	C	G	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0263121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2194;QD=14.6525;RBI=0.0263121;REFB=-0.000793709;REVB=0;RO=5;SAF=6;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00135265;OID=.;OPOS=119273712;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:0:6:5:0:0:6:5:0
chr4	119736796	.	A	C	388.52	PASS	AF=0.427083;AO=41;DP=96;FAO=41;FDP=96;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=-0.0110049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6725;QD=16.1883;RBI=0.0137933;REFB=-0.0123623;REVB=0.00831543;RO=54;SAF=20;SAR=21;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124466;STB=0.574432;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0114855;OID=.;OPOS=119736796;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:54:55:41:41:0.427083:21:20:33:21:21:20:34:21
chr4	119947961	.	AAAG	A	1026.83	PASS	AF=1;AO=74;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121773;FXX=0.0229859;HRUN=3;LEN=3;MLLD=152.655;QD=48.3216;RBI=0.04408;REFB=0;REVB=-0.0423646;RO=0;SAF=43;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-2.34567e-05;OID=.;OPOS=119947962;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:74:86:85:85:0:50:35:0:0:18:0:43:31:0:0
chr4	119947985	.	G	C	1510.65	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6019;QD=63.6063;RBI=0.0556109;REFB=0;REVB=-0.0545277;RO=0;SAF=54;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000250744;OID=.;OPOS=119947985;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:41:54:0:0:41:54:0:0
chr4	119951647	.	A	G	429.38	PASS	AF=1;AO=25;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0771012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.9103;QD=57.25;RBI=0.177414;REFB=0;REVB=0.159785;RO=0;SAF=21;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0058044;OID=.;OPOS=119951647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:25:30:1:4:21:0:0:6:24:0:0
chr4	120057709	.	A	C	161.04	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0207044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3613;QD=18.9461;RBI=0.0210007;REFB=-0.042787;REVB=0.00351547;RO=17;SAF=11;SAR=6;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0554799;STB=0.531561;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0571485;OID=.;OPOS=120057709;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:6:11:10:7:6:11:10:7
chr4	120158685	.	T	G	649.36	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00950946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.603;QD=61.8441;RBI=0.0284795;REFB=0;REVB=0.026845;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22889e-05;OID=.;OPOS=120158685;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:42:0:0:39:42:1:21:18:0:0:22:20:0:0
chr4	120214030	.	T	G	236.03	PASS	AF=0.394366;AO=27;DP=70;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.0881332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.7588;QD=13.2974;RBI=0.0938494;REFB=-0.00178164;REVB=0.0322531;RO=43;SAF=15;SAR=12;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170247;STB=0.605503;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0051289;OID=.;OPOS=120214030;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:43:43:27:28:0.394366:12:15:17:26:12:16:17:26
chr4	120215314	.	A	G	1397.48	PASS	AF=1;AO=74;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00813668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.693;QD=61.4276;RBI=0.0563677;REFB=0;REVB=0.0557773;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112433;OID=.;OPOS=120215314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:91:0:0:74:91:1:35:39:0:0:47:44:0:0
chr4	120216418	.	T	A,TTA	293.84	PASS	AF=0,1;AO=2,20;DP=27;FAO=0,22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1;FSAR=0,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.188328,0.0132829;FXX=0.0434594;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=235.534,268.302;QD=53.4251;RBI=0.188685,0.0160787;REFB=0,0;REVB=-0.0116115,-0.00906029;RO=4;SAF=1,0;SAR=1,20;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.237547,-0.860074;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,1.48501e-05;OID=.,.;OPOS=120216418,120216419;OREF=T,-;OALT=A,TA;OMAPALT=A,TTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:27:22:4:0:2,20:0,22:0,1:1,20:1,0:3:1:0,21:0,1:0:0
chr4	120239831	.	A	G	507.58	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.087596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.694;QD=56.3979;RBI=0.0878664;REFB=-0.0705363;REVB=-0.00688872;RO=1;SAF=23;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199081;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00209941;OID=.;OPOS=120239831;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:36:36:1:0:35:36:1:12:23:1:0:12:24:0:0
chr4	120239878	.	G	A	594.52	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00474379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.691;QD=60.9761;RBI=0.00501773;REFB=0;REVB=-0.00163526;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26099e-05;OID=.;OPOS=120239878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr4	120240238	.	T	C	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.579;QD=56.9998;RBI=0.0759223;REFB=0;REVB=0.0599916;RO=0;SAF=15;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000650586;OID=.;OPOS=120240238;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:39:15:0:0:39:15:0:0
chr4	120241849	.	A	C,G	402.55	PASS	AF=0.0689655,0.931034;AO=2,27;DP=29;FAO=2,27;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=0,16;FSAR=2,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00491473,0.023937;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=88.3076,219.685;QD=55.5245;RBI=0.0086395,0.0239372;REFB=0,0;REVB=0.00710538,-7.9401e-05;RO=0;SAF=0,16;SAR=2,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.5146e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00999063,0.00049251;OID=.,.;OPOS=120241849,120241849;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:29:29:0:0:2,27:2,27:0.0689655,0.931034:2,11:0,16:0:0:2,11:0,16:0:0
chr4	120241902	.	T	C	567.78	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.545;QD=59.7662;RBI=0.027931;REFB=0;REVB=0.0108332;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171274;OID=.;OPOS=120241902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:17:20:0:0:18:20:0:0
chr4	120325630	.	G	A	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0271921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.72;QD=63.2867;RBI=0.0330671;REFB=0;REVB=-0.0188154;RO=0;SAF=4;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.5936e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.6281e-05;OID=.;OPOS=120325630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:42:4:0:0:42:4:0:0
chr4	120325653	.	TGCCCCTG	CTGCCCTG,TGCCCTG,TGCCCTGC	612.36	PASS	AF=0,0.981818,0;AO=5,44,3;DP=55;FAO=0,54,0;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=0,10,0;FSAR=0,44,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0831538,-0.027634,-0.0701496;FXX=0;HRUN=1,4,4;LEN=3,1,3;MLLD=10.7345,16.5324,6.2511;QD=44.5356;RBI=0.0856105,0.0822059,0.070191;REFB=-0.0655284,-0.0270518,0.0125905;REVB=-0.0203618,0.0774221,0.00240832;RO=3;SAF=0,10,0;SAR=5,34,3;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0.0396739,0;STB=0.5,0.505616,0.5;STBP=1,0.661,1;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0,0.00319715,0.0392795;OID=.,.,.;OPOS=120325653,120325655,120325658;OREF=TGC,C,CTG;OALT=CTG,-,TGC;OMAPALT=CTGCCCTG,TGCCCTG,TGCCCTGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:4:55:55:3:1:5,44,3:0,54,0:0,0.981818,0:5,34,3:0,10,0:0:3:0,44,0:0,10,0:0:1
chr4	120325732	.	C	A	1385.26	PASS	AF=0.957895;AO=91;DP=96;FAO=91;FDP=95;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=74;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00340415;FXX=0.0104156;HRUN=4;LEN=1;MLLD=308.006;QD=58.3268;RBI=0.0124072;REFB=-0.0567879;REVB=0.0119311;RO=4;SAF=17;SAR=74;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993354;STB=0.552619;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.000417108;OID=.;OPOS=120325732;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:96:95:4:4:91:91:0.957895:74:17:4:0:74:17:4:0
chr4	120325820	.	T	A	601.33	PASS	AF=0.484375;AO=61;DP=129;FAO=62;FDP=128;FR=.;FRO=66;FSAF=44;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=0.00822804;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.764;QD=18.7916;RBI=0.0244235;REFB=-0.0294253;REVB=-0.0229958;RO=63;SAF=43;SAR=18;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197168;STB=0.625778;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0223193;OID=.;OPOS=120325820;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:128:63:66:61:62:0.484375:18:43:32:31:18:44:32:34
chr4	120330155	.	C	T	594.51	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.658;QD=60.9748;RBI=0.104933;REFB=0;REVB=-0.0991444;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000741138;OID=.;OPOS=120330155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0
chr4	120330272	.	C	G	160.28	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.068927;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.9567;QD=45.7953;RBI=0.0734896;REFB=0;REVB=0.025491;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00372808;OID=.;OPOS=120330272;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr4	120330448	.	GC	AA	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225343;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=141.837;QD=45.8068;RBI=0.0407533;REFB=0;REVB=0.0339564;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000506669;OID=.;OPOS=120330448;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr4	120330539	.	G	A	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0981678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5693;QD=48.7334;RBI=0.128725;REFB=0;REVB=0.0832658;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00608223;OID=.;OPOS=120330539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr4	120423729	.	T	C	463.87	PASS	AF=0.970588;AO=32;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0216051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.255;QD=54.5729;RBI=0.0977813;REFB=-0.0432879;REVB=0.0953646;RO=1;SAF=19;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239419;STB=0.512188;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00107032;OID=.;OPOS=120423729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:32:33:0.970588:13:19:1:0:13:20:1:0
chr4	120474859	.	A	G	1178.33	PASS	AF=1;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518738;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.468;QD=61.2119;RBI=0.0518963;REFB=0;REVB=0.00152625;RO=0;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.28211e-06;OID=.;OPOS=120474859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:77:0:0:77:77:1:41:36:0:0:41:36:0:0
chr4	120528327	.	G	A	726.72	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0129556;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.834;QD=52.8523;RBI=0.0129738;REFB=-0.114577;REVB=-0.000685911;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.502442;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.000660012;OID=.;OPOS=120528327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:0:2:53:53:0.963636:23:30:0:0:23:30:1:1
chr4	120868354	.	C	T	429.31	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.642;QD=57.2411;RBI=0.0610563;REFB=0;REVB=0.0246831;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154564;OID=.;OPOS=120868354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:30:0:0:28:30:1:13:15:0:0:14:16:0:0
chr4	121957051	.	C	T	2441.7	PASS	AF=1;AO=159;DP=160;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132627;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.841;QD=61.4263;RBI=0.017672;REFB=0;REVB=-0.011679;RO=0;SAF=96;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.48925e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41245e-05;OID=.;OPOS=121957051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:160:159:0:0:159:159:1:63:96:0:0:63:96:0:0
chr4	121957734	.	T	C	1008.12	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.74;QD=59.301;RBI=0.0559446;REFB=0;REVB=0.0532366;RO=0;SAF=38;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106987;OID=.;OPOS=121957734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:30:38:0:0:30:38:0:0
chr4	121958091	.	T	G	602.33	PASS	AF=0.931818;AO=41;DP=44;FAO=41;FDP=44;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0511883;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.287;QD=54.7574;RBI=0.065428;REFB=-0.0409552;REVB=0.0407502;RO=3;SAF=22;SAR=19;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260326;STB=0.513898;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.000482989;OID=.;OPOS=121958091;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:44:44:3:3:41:41:0.931818:19:22:1:2:19:22:1:2
chr4	121958187	.	A	G	749.14	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.898;QD=56.5387;RBI=0.0157382;REFB=0;REVB=-0.0074361;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154752;OID=.;OPOS=121958187;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:26:26:0:0:26:27:0:0
chr4	121958697	.	G	A,C	774.42	PASS	AF=0.979592,0.0204082;AO=47,2;DP=49;FAO=48,1;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29,0;FSAR=19,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055641,0.02976;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=141.664,10.3493;QD=63.218;RBI=0.0578821,0.0438792;REFB=0,0;REVB=0.0159506,0.0322448;RO=0;SAF=28,1;SAR=19,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00337302,0.152426;OID=.,.;OPOS=121958697,121958697;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:49:49:0:0:47,2:48,1:0.979592,0.0204082:19,1:28,1:0:0:19,1:29,0:0:0
chr4	121966807	.	C	T	688.42	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=341.444;QD=62.5833;RBI=0.0394197;REFB=0;REVB=-0.00812244;RO=0;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167025;OID=.;OPOS=121966807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:44:0:0:42:44:1:28:14:0:0:28:16:0:0
chr4	122137662	.	T	A,G	738.11	PASS	AF=0.28,0.72;AO=11,36;DP=48;FAO=14,36;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=9,14;FSAR=5,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00560453,0.0497685;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=220.155,64.6595;QD=59.0485;RBI=0.0121974,0.0557767;REFB=0,0;REVB=-0.0108336,-0.025182;RO=0;SAF=8,14;SAR=3,22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.007332,0.0098453;OID=.,.;OPOS=122137662,122137662;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:88:48:50:0:0:11,36:14,36:0.28,0.72:3,22:8,14:0:0:5,22:9,14:0:0
chr4	122250734	.	A	G	278.5	PASS	AF=0.287879;AO=38;DP=132;FAO=38;FDP=132;FR=.;FRO=94;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=51;FSRR=43;FWDB=0.0914668;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=52.0351;QD=8.43943;RBI=0.0997353;REFB=-0.00955163;REVB=0.0397612;RO=94;SAF=22;SAR=16;SRF=51;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446621;STB=0.526345;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0235443;OID=.;OPOS=122250734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:94:94:38:38:0.287879:16:22:51:43:16:22:51:43
chr4	122254014	.	A	G	250.08	PASS	AF=0.432836;AO=28;DP=66;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0395554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7872;QD=14.9298;RBI=0.0568764;REFB=0.0112564;REVB=0.0408692;RO=37;SAF=16;SAR=12;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803497;STB=0.526748;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=-0.0134539;OID=.;OPOS=122254014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:37:38:28:29:0.432836:12:16:24:13:12:17:24:14
chr4	122254119	.	G	A	609.89	PASS	AF=0.62069;AO=55;DP=87;FAO=54;FDP=87;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.063039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9673;QD=28.0411;RBI=0.0769261;REFB=-0.0456907;REVB=-0.0440876;RO=31;SAF=25;SAR=30;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00196378;STB=0.503211;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0350361;OID=.;OPOS=122254119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:31:33:55:54:0.62069:30:25:14:17:29:25:15:18
chr4	122617718	.	G	C	174.43	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00990636;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=186.327;QD=19.3812;RBI=0.0522443;REFB=-0.031093;REVB=-0.0512965;RO=10;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234872;STB=0.527747;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0316818;OID=.;OPOS=122617718;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:10:18:15:18:0.5:8:7:8:2:9:9:10:8
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chr4	122683007	.	G	A	310.37	PASS	AF=0.365385;AO=38;DP=105;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=-0.012271;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.176;QD=11.9375;RBI=0.0310564;REFB=0.00684231;REVB=-0.0285293;RO=66;SAF=20;SAR=18;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079378;STB=0.545431;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=-0.00976629;OID=.;OPOS=122683007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:66:66:38:38:0.365385:18:20:30:36:18:20:30:36
chr4	122687238	.	A	G	401.63	PASS	AF=0.394958;AO=47;DP=117;FAO=47;FDP=119;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=-0.0135085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.618;QD=13.5;RBI=0.0205564;REFB=-0.0185297;REVB=-0.0154947;RO=69;SAF=25;SAR=22;SRF=33;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0565116;STB=0.527716;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0293744;OID=.;OPOS=122687238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:119:69:72:47:47:0.394958:22:25:33:36:22:25:35:37
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chr4	123192383	.	T	C	434.6	PASS	AF=0.458333;AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=36;FWDB=-0.0100762;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.544;QD=18.1082;RBI=0.037454;REFB=-0.000580904;REVB=0.0360731;RO=52;SAF=21;SAR=23;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166857;STB=0.592783;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.000440439;OID=.;OPOS=123192383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:52:52:44:44:0.458333:23:21:16:36:23:21:16:36
chr4	123268859	.	A	G	202.24	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=39;FAO=20;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.00839803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.063;QD=21.2889;RBI=0.03772;REFB=-0.0602678;REVB=0.0367733;RO=19;SAF=0;SAR=10;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.75049;STB=0.57887;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0474255;OID=.;OPOS=123268859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:19:18:10:20:0.526316:10:0:6:13:10:10:6:12
chr4	123377482	.	C	A	770.61	PASS	AF=0.982143;AO=54;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0131233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.821;QD=55.0433;RBI=0.0317599;REFB=-0.0824176;REVB=0.0289218;RO=1;SAF=35;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132766;STB=0.50704;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000710303;OID=.;OPOS=123377482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:1:1:54:55:0.982143:19:35:1:0:20:35:1:0
chr4	123536963	.	G	A	1458.11	PASS	AF=0.989247;AO=83;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.147;QD=62.7144;RBI=0.0526556;REFB=0;REVB=0.0200182;RO=0;SAF=40;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193708;OID=.;OPOS=123536963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:93:93:0:0:83:92:0.989247:43:40:0:0:46:46:0:0
chr4	123664445	.	C	T	130.41	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0387805;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.124;QD=12.7227;RBI=0.0435342;REFB=-0.0202936;REVB=-0.0197813;RO=26;SAF=7;SAR=8;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132467;STB=0.577458;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0477184;OID=.;OPOS=123664445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:26:26:15:15:0.365854:8:7:9:17:8:7:9:17
chr4	123665991	.	C	G	333.37	PASS	AF=0.433735;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.035177;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7851;QD=16.0661;RBI=0.0406438;REFB=-0.015303;REVB=-0.0203592;RO=47;SAF=17;SAR=19;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472235;STB=0.526585;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0283382;OID=.;OPOS=123665991;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:47:47:36:36:0.433735:19:17:20:27:19:17:20:27
chr4	123838758	.	A	G	2200.1	PASS	AF=1;AO=138;DP=138;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.762;QD=62.86;RBI=0.04612;REFB=0;REVB=0.0438784;RO=0;SAF=78;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70096e-05;OID=.;OPOS=123838758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:138:140:0:0:138:140:1:60:78:0:0:61:79:0:0
chr4	123843716	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.282;QD=40.7629;RBI=0.0307201;REFB=0;REVB=0.0307201;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000620264;OID=.;OPOS=123843716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:10:0:0:0:10:0:0:0
chr4	123949556	.	G	A	386.31	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.017973;FXX=0.0333222;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.219;QD=53.284;RBI=0.0185596;REFB=-0.0599951;REVB=-0.00462947;RO=0;SAF=2;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509427;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.000340971;OID=.;OPOS=123949556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:29:0:1:28:28:0.965517:26:2:0:0:26:2:0:1
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chr4	125592440	.	T	C	254.27	PASS	AF=0.314815;AO=34;DP=108;FAO=34;FDP=108;FR=.;FRO=74;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=0.0135727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.789;QD=9.41749;RBI=0.0239761;REFB=-0.0156565;REVB=0.0197645;RO=74;SAF=14;SAR=20;SRF=35;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729053;STB=0.54261;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0361721;OID=.;OPOS=125592440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:74:74:34:34:0.314815:20:14:35:39:20:14:35:39
chr4	126240485	.	C	T	454.41	PASS	AF=0.48913;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.00275075;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.6664;QD=19.7568;RBI=0.00415112;REFB=-0.0174056;REVB=0.00310888;RO=45;SAF=21;SAR=24;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403982;STB=0.5102;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0154827;OID=.;OPOS=126240485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:92:45:47:45:45:0.48913:24:21:19:26:24:21:21:26
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chr4	126241335	.	C	G	542.3	PASS	AF=0.525773;AO=51;DP=97;FAO=51;FDP=97;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.00884659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1109;QD=22.363;RBI=0.0504802;REFB=-0.0161861;REVB=-0.049699;RO=46;SAF=30;SAR=21;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583411;STB=0.532166;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0132353;OID=.;OPOS=126241335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:46:46:51:51:0.525773:21:30:24:22:21:30:24:22
chr4	126241871	.	C	T	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00273472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.587;QD=8.69803;RBI=0.0206416;REFB=-0.00302017;REVB=-0.0204596;RO=13;SAF=2;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478256;STB=0.76852;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00350832;OID=.;OPOS=126241871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:13:14:7:7:0.333333:5:2:10:3:5:2:10:4
chr4	126329789	.	T	C	1917.66	PASS	AF=0.992063;AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00388859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.425;QD=60.8782;RBI=0.0245667;REFB=-0.0414824;REVB=0.024257;RO=1;SAF=57;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0069365;STB=0.503649;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000146379;OID=.;OPOS=126329789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:126:126:1:1:125:125:0.992063:68:57:0:1:68:57:0:1
chr4	126336703	.	T	C	544.87	PASS	AF=0.513761;AO=56;DP=110;FAO=56;FDP=109;FR=.;FRO=53;FSAF=37;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.00926572;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.373;QD=19.9953;RBI=0.0127702;REFB=-0.00596211;REVB=0.0087878;RO=53;SAF=37;SAR=19;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140939;STB=0.577896;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00486951;OID=.;OPOS=126336703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:109:53:53:56:56:0.513761:19:37:27:26:19:37:27:26
chr4	126369872	.	G	C	1415.43	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0571363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.004;QD=62.9079;RBI=0.0579761;REFB=0;REVB=0.00983198;RO=0;SAF=48;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.9824e-05;OID=.;OPOS=126369872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:42:48:0:0:42:48:0:0
chr4	126372742	.	G	A	191.99	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=-0.0062171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.741;QD=11.8147;RBI=0.0344975;REFB=-0.00669548;REVB=-0.0339326;RO=41;SAF=18;SAR=6;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261488;STB=0.515139;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0122393;OID=.;OPOS=126372742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:6:18:30:11:6:18:30:11
chr4	126373789	.	G	A	739.1	PASS	AF=0.981481;AO=51;DP=52;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0333856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.274;QD=54.7484;RBI=0.0385666;REFB=0.146586;REVB=0.0193076;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.00122121;OID=.;OPOS=126373789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:54:0:1:51:53:0.981481:30:21:0:0:30:23:0:1
chr4	126412575	.	A	G	754.63	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7624;QD=56.9531;RBI=0.0636516;REFB=0;REVB=0.0459851;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000971581;OID=.;OPOS=126412575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:25:27:0:0:26:27:0:0
chr4	128689936	.	A	G	287.01	PASS	AF=0.492063;AO=30;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.0135402;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.114;QD=18.2227;RBI=0.0138846;REFB=-0.0157402;REVB=0.0030733;RO=32;SAF=19;SAR=11;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0872229;STB=0.558103;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0182053;OID=.;OPOS=128689936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:32:32:30:31:0.492063:11:19:23:9:12:19:23:9
chr4	128723042	.	T	C	337.74	PASS	AF=0.411111;AO=37;DP=90;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0765008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8304;QD=15.0108;RBI=0.0848924;REFB=-0.0196475;REVB=0.0368016;RO=53;SAF=16;SAR=21;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00162016;STB=0.500917;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.038546;OID=.;OPOS=128723042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:53:53:37:37:0.411111:21:16:23:30:21:16:23:30
chr4	128807219	.	T	A	286.51	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00213582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.095;QD=24.3839;RBI=0.0177349;REFB=-0.00417208;REVB=0.0176058;RO=21;SAF=21;SAR=5;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566682;STB=0.53162;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00282163;OID=.;OPOS=128807219;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:5:21:16:5:5:21:16:5
chr4	128814964	.	G	T	262.8	PASS	AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=-0.0205495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3512;QD=15.0173;RBI=0.0412009;REFB=-0.0103857;REVB=0.0357104;RO=40;SAF=11;SAR=19;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459655;STB=0.52597;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0151253;OID=.;OPOS=128814964;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:19:11:13:27:19:11:13:27
chr4	129012181	.	G	A	293.46	PASS	AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.00123245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.312;QD=14.8588;RBI=0.00376248;REFB=-0.0103839;REVB=0.0035549;RO=46;SAF=15;SAR=18;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046859;STB=0.526543;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0119199;OID=.;OPOS=129012181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:18:15:23:23:18:15:23:23
chr4	129012638	.	A	G	201.36	PASS	AF=0.27;AO=27;DP=100;FAO=27;FDP=100;FR=.;FRO=73;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=30;FWDB=0.0276079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7172;QD=8.05458;RBI=0.0297959;REFB=0.00175277;REVB=0.011207;RO=73;SAF=7;SAR=20;SRF=43;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401766;STB=0.740562;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.00457914;OID=.;OPOS=129012638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:73:73:27:27:0.27:20:7:43:30:20:7:43:30
chr4	129043204	.	C	G	237.13	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0710775;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.697;QD=19.7607;RBI=0.0724307;REFB=-0.0172011;REVB=0.0139356;RO=25;SAF=14;SAR=9;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120722;STB=0.568206;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0265203;OID=.;OPOS=129043204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:9:14:12:13:9:14:12:13
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chr4	129100643	.	G	A	294.43	PASS	AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=13;FWDB=0.00785751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.469;QD=15.0989;RBI=0.0183269;REFB=-0.0150037;REVB=-0.016557;RO=45;SAF=26;SAR=7;SRF=32;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108008;STB=0.561516;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0106978;OID=.;OPOS=129100643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:45:45:33:33:0.423077:7:26:32:13:7:26:32:13
chr4	129677239	.	T	C	982.45	PASS	AF=1;AO=47;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0959736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.744;QD=59.5427;RBI=0.100553;REFB=0;REVB=0.0300011;RO=1;SAF=16;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0284823;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422496;OID=.;OPOS=129677239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:1:0:47:66:1:31:16:1:0:31:35:0:0
chr4	129867280	.	T	A	868.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.462;QD=57.8836;RBI=0.0421534;REFB=0;REVB=0.0268802;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161082;OID=.;OPOS=129867280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:37:23:0:0:37:23:0:0
chr4	129924977	.	C	A	204.92	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0747115;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0391;QD=14.6371;RBI=0.102365;REFB=-0.0125768;REVB=-0.0699768;RO=31;SAF=17;SAR=7;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.37977;STB=0.722691;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0127043;OID=.;OPOS=129924977;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:31:32:24:24:0.428571:7:17:10:21:7:17:10:22
chr4	130030652	.	A	G	398.93	PASS	AF=0.633333;AO=38;DP=60;FAO=38;FDP=60;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0489697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.439;QD=26.5953;RBI=0.0527187;REFB=-0.0245119;REVB=0.0195251;RO=22;SAF=22;SAR=16;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174154;STB=0.595064;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00648022;OID=.;OPOS=130030652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:22:22:38:38:0.633333:16:22:7:15:16:22:7:15
chr4	133367588	.	T	C	422.05	PASS	AF=0.424779;AO=48;DP=113;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=36;FWDB=-0.00206604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.83;QD=14.9397;RBI=0.0504731;REFB=-0.00766097;REVB=0.0504308;RO=65;SAF=26;SAR=22;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0975794;STB=0.554797;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0152389;OID=.;OPOS=133367588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:65:65:48:48:0.424779:22:26:29:36:22:26:29:36
chr4	134071430	.	T	G	634.44	PASS	AF=0.420118;AO=71;DP=169;FAO=71;FDP=169;FR=.;FRO=98;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=58;FSRR=40;FWDB=-0.012616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.7065;QD=15.0162;RBI=0.0222535;REFB=0.00112617;REVB=0.0183318;RO=98;SAF=44;SAR=27;SRF=58;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303628;STB=0.517007;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=-0.00141868;OID=.;OPOS=134071430;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:169:98:98:71:71:0.420118:27:44:58:40:27:44:58:40
chr4	134072264	.	G	A	83.08	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0243856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8537;QD=9.49525;RBI=0.0244024;REFB=-0.00310943;REVB=-0.000906409;RO=24;SAF=9;SAR=2;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.538819;STB=0.825948;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00404317;OID=.;OPOS=134072264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:2:9:8:16:2:9:8:16
chr4	134076153	.	T	C	182.9	PASS	AF=0.315789;AO=22;DP=75;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=37;FWDB=-0.0383756;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.857;QD=9.62642;RBI=0.047632;REFB=0.00356767;REVB=-0.0282157;RO=52;SAF=12;SAR=10;SRF=15;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300912;STB=0.693946;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.00565835;OID=.;OPOS=134076153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:52:52:22:24:0.315789:10:12:15:37:10:14:15:37
chr4	134082967	.	T	C	2577.6	PASS	AF=0.506;AO=250;DP=506;FAO=253;FDP=500;FR=.;FRO=247;FSAF=106;FSAR=147;FSRF=114;FSRR=133;FWDB=-0.00587359;FXX=0.0328814;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.398;QD=20.6208;RBI=0.0679385;REFB=0.00550853;REVB=0.0676842;RO=224;SAF=103;SAR=147;SRF=109;SRR=115;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065907;STB=0.521443;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.00514729;OID=.;OPOS=134082967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:506:500:224:247:250:253:0.506:147:103:109:115:147:106:114:133
chr4	135121066	.	T	G	1026.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.756;QD=59.5018;RBI=0.0198957;REFB=0;REVB=-0.00930472;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.55609e-06;OID=.;OPOS=135121066;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:32:37:0:0:32:37:0:0
chr4	135121368	.	G	T	728.83	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0636157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.698;QD=57.1634;RBI=0.0771949;REFB=0;REVB=0.0437275;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.09879e-05;OID=.;OPOS=135121368;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0
chr4	135121601	.	C	T	340.74	PASS	AF=1;AO=20;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.953;QD=54.5177;RBI=0.0182667;REFB=0;REVB=0.0070109;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.24617e-05;OID=.;OPOS=135121601;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:20:25:1:9:11:0:0:9:16:0:0
chr4	138449683	.	A	G	726.84	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621629;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.377;QD=57.0071;RBI=0.0654697;REFB=0;REVB=0.0205441;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189616;OID=.;OPOS=138449683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:27:24:0:0:27:24:0:0
chr4	138453453	.	G	A	1362.44	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0189421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.751;QD=61.2334;RBI=0.0236985;REFB=-0.0164525;REVB=0.0142414;RO=1;SAF=50;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123069;STB=0.506492;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=7.12268e-05;OID=.;OPOS=138453453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:89:1:1:88:88:0.988764:38:50:0:1:38:50:0:1
chr4	139086246	.	A	G	557.54	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.96;QD=60.2745;RBI=0.135548;REFB=0;REVB=0.133588;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394424;OID=.;OPOS=139086246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:37:0:0:35:37:1:17:18:0:0:19:18:0:0
chr4	139100372	.	C	T	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.088;QD=63.8712;RBI=0.0283784;REFB=0;REVB=0.0112755;RO=0;SAF=33;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.66043e-05;OID=.;OPOS=139100372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:15:33:0:0:15:33:0:0
chr4	139135799	.	T	C	1911.47	PASS	AF=0.55625;AO=178;DP=327;FAO=178;FDP=320;FR=.;FRO=142;FSAF=78;FSAR=100;FSRF=60;FSRR=82;FWDB=0.032546;FXX=0.0303021;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.505;QD=23.8934;RBI=0.0337908;REFB=-0.0138326;REVB=0.00908721;RO=133;SAF=78;SAR=100;SRF=56;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137685;STB=0.507072;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.00918983;OID=.;OPOS=139135799;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:327:320:133:142:178:178:0.55625:100:78:56:77:100:78:60:82
chr4	140005294	.	A	G	1540.28	PASS	AF=0.989899;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0151172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4119;QD=62.2334;RBI=0.0628946;REFB=0.0931248;REVB=-0.0610508;RO=1;SAF=56;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114268;STB=0.506023;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=-0.00122034;OID=.;OPOS=140005294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:98:99:1:1:97:98:0.989899:41:56:0:1:41:57:0:1
chr4	140021554	.	G	A	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.006;QD=62.9823;RBI=0.0402504;REFB=0;REVB=0.0238051;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.142e-05;OID=.;OPOS=140021554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr4	140310520	.	T	C	1320.74	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.516;QD=62.1526;RBI=0.0280651;REFB=0;REVB=0.0114494;RO=0;SAF=46;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.06876e-05;OID=.;OPOS=140310520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:39:46:0:0:39:46:0:0
chr4	140417671	.	G	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.913;QD=63.8718;RBI=0.0351162;REFB=0;REVB=-0.0131757;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61006e-05;OID=.;OPOS=140417671;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0
chr4	140651584	.	TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC	TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC	53.95	PASS	AF=0,1;AO=2,2;DP=7;FAO=0,6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4;FSAR=0,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0833979,0.0846693;FXX=0.142653;HRUN=1,1;LEN=4,3;MLLD=236.53,255.761;QD=35.9682;RBI=0.142556,0.150091;REFB=0,0;REVB=0.115615,0.123929;RO=0;SAF=2,2;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.00129601;OID=.,.;OPOS=140651609,140651585;OREF=CTGC,CTG;OALT=-,-;OMAPALT=TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTG,TCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:2,2:7:0,6:6:0:0,4:0,2:0:0:3:0:2,2:0,0:0:0
chr4	140810334	.	T	C	352.18	PASS	AF=0.612245;AO=30;DP=49;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0167279;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.886;QD=28.7489;RBI=0.0177693;REFB=-0.0226282;REVB=0.00599352;RO=19;SAF=15;SAR=15;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927849;STB=0.550987;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0118137;OID=.;OPOS=140810334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:19:19:30:30:0.612245:15:15:12:7:15:15:12:7
chr4	140810637	.	C	T	76.82	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.00405314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3882;QD=12.8025;RBI=0.0758052;REFB=-0.0325149;REVB=-0.0756967;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361174;STB=0.707988;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0781656;OID=.;OPOS=140810637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:5:5:2:12:5:5:2:12
chr4	141264871	.	A	G	149.1	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0326133;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=196.989;QD=18.6371;RBI=0.0373814;REFB=-0.0116462;REVB=-0.0182688;RO=16;SAF=7;SAR=9;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269789;STB=0.652492;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.014484;OID=.;OPOS=141264871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:9:7:12:4:9:7:12:4
chr4	141295264	.	G	A	194.19	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0484877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.038;QD=24.2733;RBI=0.0506562;REFB=-0.0373855;REVB=-0.0146629;RO=13;SAF=9;SAR=10;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102746;STB=0.557317;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0175099;OID=.;OPOS=141295264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:10:9:8:5:10:9:8:5
chr4	141317068	.	G	A	258.33	PASS	AF=0.324324;AO=33;DP=108;FAO=36;FDP=111;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=45;FSRR=30;FWDB=-0.0533599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.005;QD=9.30924;RBI=0.0584825;REFB=-0.0316638;REVB=0.0239359;RO=74;SAF=11;SAR=22;SRF=44;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30593;STB=0.659329;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0680647;OID=.;OPOS=141317068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:111:74:75:33:36:0.324324:22:11:44:30:23:13:45:30
chr4	141364579	.	CTTAT	C	117.32	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0259227;FXX=0.0465008;HRUN=2;LEN=4;MLLD=251.271;QD=11.4459;RBI=0.0347735;REFB=-0.0279451;REVB=-0.0231777;RO=21;SAF=15;SAR=3;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172758;STB=0.646873;STBP=0.154;TYPE=del;VARB=0.0351834;OID=.;OPOS=141364580;OREF=TTAT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.439024:18:43:18:41:23:15:3:15:8:99:21:15:3:15:6
chr4	141499166	.	G	A	255.22	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00395941;FXX=0.0333278;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.096;QD=17.6016;RBI=0.0189245;REFB=-0.0286402;REVB=0.0185057;RO=30;SAF=8;SAR=20;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120893;STB=0.568131;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0239784;OID=.;OPOS=141499166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:58:30:30:28:28:0.482759:20:8:12:18:20:8:12:18
chr4	141543997	.	G	A	908.55	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.317;QD=57.6857;RBI=0.0472154;REFB=0;REVB=0.0429128;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215577;OID=.;OPOS=141543997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:33:29:0:0:34:29:0:0
chr4	141600320	.	A	G	575.64	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00879473;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.768;QD=60.5932;RBI=0.014912;REFB=0;REVB=0.0120424;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17593e-05;OID=.;OPOS=141600320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:20:17:0:0:20:18:0:0
chr4	141974816	.	A	C	203.29	PASS	AF=0.436364;AO=16;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0196998;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.257;QD=14.7845;RBI=0.093079;REFB=-0.00639682;REVB=0.0909704;RO=29;SAF=7;SAR=9;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874984;STB=0.618079;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0286987;OID=.;OPOS=141974816;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:31:16:24:0.436364:9:7:15:14:17:7:15:16
chr4	142654084	.	C	A	1175.44	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00994204;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.932;QD=61.062;RBI=0.017898;REFB=0;REVB=0.0148827;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.04762e-05;OID=.;OPOS=142654084;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:77:0:0:74:77:1:39:35:0:0:41:36:0:0
chr4	144116901	.	A	C	400.25	PASS	AF=0.476744;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=0.00604801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.579;QD=18.6164;RBI=0.00606199;REFB=-0.0173672;REVB=-0.000411494;RO=45;SAF=26;SAR=15;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104505;STB=0.505822;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0202225;OID=.;OPOS=144116901;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:45:45:41:41:0.476744:15:26:29:16:15:26:29:16
chr4	144135718	.	G	A	175.71	PASS	AF=0.333333;AO=23;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=36;FSRR=10;FWDB=0.00136581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2611;QD=10.1862;RBI=0.0661006;REFB=0.000464681;REVB=-0.0660865;RO=44;SAF=20;SAR=3;SRF=35;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155973;STB=0.607371;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=-0.00250882;OID=.;OPOS=144135718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:44:46:23:23:0.333333:3:20:35:9:3:20:36:10
chr4	144442611	.	T	C	289.36	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147351;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.211;QD=52.6104;RBI=0.0394793;REFB=0;REVB=-0.0366264;RO=0;SAF=18;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000150438;OID=.;OPOS=144442611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:4:18:0:0:4:18:0:0
chr4	144442735	.	C	T	393.19	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.492;QD=56.1704;RBI=0.0300819;REFB=0;REVB=0.00848914;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000360016;OID=.;OPOS=144442735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr4	144467104	.	T	C	1121.77	PASS	AF=1;AO=73;DP=75;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154664;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.44;QD=60.6362;RBI=0.0154869;REFB=0;REVB=-0.000796442;RO=0;SAF=46;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.94961e-05;OID=.;OPOS=144467104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:74:0:0:73:74:1:27:46:0:0:27:47:0:0
chr4	144618610	.	G	C	1490.96	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.276;QD=63.4449;RBI=0.023405;REFB=0;REVB=-0.017904;RO=0;SAF=56;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.33169e-06;OID=.;OPOS=144618610;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:38:56:0:0:38:56:0:0
chr4	144801662	.	C	G,T	1472.56	PASS	AF=0.343434,0.646465;AO=34,62;DP=98;FAO=34,64;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=19,36;FSAR=15,28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00875487,-0.0240076;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=121.859,32.5624;QD=59.4975;RBI=0.0733895,0.0259134;REFB=-0.055659,-0.0193445;REVB=-0.0728655,-0.00975379;RO=1;SAF=19,36;SAR=15,26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0301451,0.0178116;STB=0.51612,0.508769;STBP=0.307,0.313;TYPE=snp,snp;VARB=0.0357889,0.0336989;OID=.,.;OPOS=144801662,144801662;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:98:99:1:1:34,62:34,64:0.343434,0.646465:15,26:19,36:0:1:15,28:19,36:0:1
chr4	145041686	.	A	G	323.18	PASS	AF=0.925926;AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0624025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4005;QD=47.8779;RBI=0.0661787;REFB=-0.0663659;REVB=0.0220352;RO=2;SAF=3;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403562;STB=0.521722;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0153838;OID=.;OPOS=145041686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:27:27:2:2:25:25:0.925926:22:3:0:2:22:3:0:2
chr4	145041741	.	T	G	300.35	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0233959;FXX=0.039984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.206;QD=50.0575;RBI=0.0293051;REFB=-0.00308492;REVB=0.0176471;RO=1;SAF=3;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225969;STB=0.512185;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=-8.61098e-05;OID=.;OPOS=145041741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:20:3:0:1:20:3:0:1
chr4	145568001	.	G	A	259.61	PASS	AF=0.32381;AO=34;DP=105;FAO=34;FDP=105;FR=.;FRO=71;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=0.0466232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.942;QD=9.88983;RBI=0.0466233;REFB=-0.02131;REVB=-0.000121628;RO=71;SAF=17;SAR=17;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245431;STB=0.514277;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0447561;OID=.;OPOS=145568001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:71:71:34:34:0.32381:17:17:34:37:17:17:34:37
chr4	146054799	.	G	C	715.96	PASS	AF=0.547619;AO=69;DP=126;FAO=69;FDP=126;FR=.;FRO=57;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0121263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9859;QD=22.7289;RBI=0.0323345;REFB=-0.0228416;REVB=0.0299745;RO=57;SAF=41;SAR=28;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279296;STB=0.515291;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0294549;OID=.;OPOS=146054799;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:57:57:69:69:0.547619:28:41:32:25:28:41:32:25
chr4	146479235	.	AAAAAAAAAAA	CAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAC	194.09	PASS	AF=0.55,0;AO=3,2;DP=47;FAO=22,0;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=14,0;FSAR=8,0;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0511947,0.0480178;FXX=0.245237;HRUN=15,15;LEN=1,11;MLLD=121.356,147.183;QD=19.4087;RBI=0.055889,0.0505743;REFB=-0.118933,-0.0122636;REVB=-0.0224206,-0.0158762;RO=1;SAF=2,2;SAR=1,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.266641,0.697199;STB=0.702883,0.5;STBP=0.008,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0262208,0;OID=.,.;OPOS=146479235,146479235;OREF=A,AAAAAAAAAAA;OALT=C,CAAAAAAAAAC;OMAPALT=CAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:40:1:18:3,2:22,0:0.55,0:1,0:2,2:0:1:8,0:14,0:3:15
chr4	146828332	.	A	G	109.26	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0027103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.755;QD=14.0975;RBI=0.00283643;REFB=-0.00549416;REVB=0.000836434;RO=18;SAF=9;SAR=4;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355378;STB=0.520679;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00653651;OID=.;OPOS=146828332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:4:9:13:5:4:9:13:5
chr4	147176571	.	C	A	222.54	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.033297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0253;QD=18.9393;RBI=0.0731138;REFB=-0.0266813;REVB=-0.0650918;RO=24;SAF=9;SAR=13;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00721544;STB=0.505005;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0278328;OID=.;OPOS=147176571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:24:25:22:22:0.468085:13:9:10:14:13:9:10:15
chr4	147177468	.	T	G	233.7	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.003448;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=292.941;QD=24.5996;RBI=0.0231922;REFB=-0.0239045;REVB=0.0229344;RO=16;SAF=10;SAR=12;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345072;STB=0.519213;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0172914;OID=.;OPOS=147177468;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:12:10:8:8:12:10:8:8
chr4	147215092	.	T	C	631.95	PASS	AF=0.580952;AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=105;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.00302033;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0112;QD=24.0742;RBI=0.0200507;REFB=-0.0237197;REVB=-0.0198219;RO=44;SAF=32;SAR=29;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0537574;STB=0.529329;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.021359;OID=.;OPOS=147215092;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:105:44:44:61:61:0.580952:29:32:20:24:29:32:20:24
chr4	147788709	.	C	T	840.47	PASS	AF=0.422727;AO=91;DP=218;FAO=93;FDP=220;FR=.;FRO=127;FSAF=56;FSAR=37;FSRF=56;FSRR=71;FWDB=-0.00883031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.415;QD=15.2813;RBI=0.00913221;REFB=-0.00270608;REVB=0.00232873;RO=126;SAF=56;SAR=35;SRF=56;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178866;STB=0.593386;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00317319;OID=.;OPOS=147788709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:218:220:126:127:91:93:0.422727:35:56:56:70:37:56:56:71
chr4	147824864	.	G	A	223.42	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0392984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6337;QD=14.8948;RBI=0.0415108;REFB=-0.00993922;REVB=0.0133709;RO=34;SAF=7;SAR=19;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332224;STB=0.689365;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0162864;OID=.;OPOS=147824864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:19:7:20:14:19:7:20:14
chr4	148867764	.	C	A	132.91	PASS	AF=0.283582;AO=19;DP=63;FAO=19;FDP=67;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0102436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.396;QD=7.93515;RBI=0.112109;REFB=-0.0181813;REVB=-0.11164;RO=43;SAF=10;SAR=9;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647123;STB=0.511029;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0574372;OID=.;OPOS=148867764;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:67:43:48:19:19:0.283582:9:10:25:18:9:10:26:22
chr4	149000024	.	C	T	207.96	PASS	AF=0.288462;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0125734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.833;QD=15.9968;RBI=0.0198656;REFB=-0.0171803;REVB=0.0153802;RO=28;SAF=6;SAR=9;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11147;STB=0.612749;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0371748;OID=.;OPOS=149000024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:48:52:28:28:15:15:0.288462:9:6:14:14:10:5:14:14
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chr4	149356516	.	A	G	544.1	PASS	AF=0.513761;AO=56;DP=109;FAO=56;FDP=109;FR=.;FRO=53;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.0200195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.33;QD=19.9668;RBI=0.0289122;REFB=-0.0217786;REVB=-0.0208598;RO=52;SAF=33;SAR=23;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00620657;STB=0.507293;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.019442;OID=.;OPOS=149356516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:52:53:56:56:0.513761:23:33:31:21:23:33:32:21
chr4	149357475	.	C	T	108.57	PASS	AF=0.393939;AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00244987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.03;QD=13.1595;RBI=0.040353;REFB=0.00608654;REVB=0.0402785;RO=20;SAF=7;SAR=5;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.035838;STB=0.540999;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=-0.00633852;OID=.;OPOS=149357475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:20:20:12:13:0.393939:5:7:11:9:5:8:11:9
chr4	149358014	.	G	C	39.06	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00780282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.315;QD=12.0178;RBI=0.022166;REFB=-0.0104486;REVB=0.0207472;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523732;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0100827;OID=.;OPOS=149358014;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:7:6:6:0.461538:1:5:5:1:1:5:6:1
chr4	150769133	.	G	A	461.99	PASS	AF=0.517241;AO=45;DP=87;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00658198;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=257.123;QD=21.2409;RBI=0.00882604;REFB=-0.0126655;REVB=0.00588018;RO=40;SAF=29;SAR=16;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107103;STB=0.572845;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0133859;OID=.;OPOS=150769133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:40:42:45:45:0.517241:16:29:21:19:16:29:21:21
chr4	150855628	.	AT	A	40.66	PASS	AF=0.454545;AO=8;DP=31;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.113617;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.21704;QD=4.9285;RBI=0.173324;REFB=-0.0781284;REVB=0.130891;RO=16;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266321;STB=0.642672;STBP=0.171;TYPE=del;VARB=0.0918223;OID=.;OPOS=150855629;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.454545:8:31:15:33:18:9:6:6:12:39:16:5:3:6:10
chr4	151199080	.	G	A	455.07	PASS	AF=0.475248;AO=48;DP=101;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=0.00156678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.561;QD=18.0224;RBI=0.00234313;REFB=-0.00474004;REVB=-0.00174226;RO=53;SAF=30;SAR=18;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582936;STB=0.532454;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.00459669;OID=.;OPOS=151199080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:53:53:48:48:0.475248:18:30:30:23:18:30:30:23
chr4	151207127	.	C	T	111.98	PASS	AF=0.304348;AO=14;DP=46;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0105156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.387;QD=9.7378;RBI=0.011605;REFB=-0.0165791;REVB=0.00490889;RO=32;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108458;STB=0.565126;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0435889;OID=.;OPOS=151207127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:32:32:14:14:0.304348:7:7:13:19:7:7:13:19
chr4	151505322	.	T	A	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0562249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.658;QD=64.1535;RBI=0.0712755;REFB=0;REVB=-0.0438059;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000486904;OID=.;OPOS=151505322;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr4	151773593	.	G	C	144.65	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0587234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5588;QD=15.6379;RBI=0.0590883;REFB=0.00556087;REVB=-0.00655652;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00893246;STB=0.505148;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=-0.00599769;OID=.;OPOS=151773593;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:7:9:12:9:7:9:12:9
chr4	151829824	.	T	C	389.07	PASS	AF=0.481928;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.012879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.416;QD=18.7502;RBI=0.0283619;REFB=-0.00243438;REVB=0.0252692;RO=43;SAF=23;SAR=17;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159886;STB=0.508908;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.00277608;OID=.;OPOS=151829824;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:43:43:40:40:0.481928:17:23:24:19:17:23:24:19
chr4	152041502	.	C	G	171.14	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0105802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.924;QD=17.5532;RBI=0.010651;REFB=-0.0108749;REVB=-0.00122623;RO=20;SAF=3;SAR=15;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052925;STB=0.563304;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0150037;OID=.;OPOS=152041502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:21:18:18:0.461538:15:3:4:16:15:3:5:16
chr4	152070633	.	T	A	501.37	PASS	AF=0.457627;AO=54;DP=110;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=22;FWDB=-0.0151268;FXX=0.00840265;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.164;QD=16.9954;RBI=0.015135;REFB=-0.0215622;REVB=0.000498556;RO=56;SAF=34;SAR=20;SRF=37;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309347;STB=0.515598;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0260521;OID=.;OPOS=152070633;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:118:56:64:54:54:0.457627:20:34:37:19:20:34:42:22
chr4	152201053	.	G	A	442.74	PASS	AF=0.551282;AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0171795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.506;QD=22.7044;RBI=0.0320393;REFB=-0.0101587;REVB=0.0270441;RO=35;SAF=22;SAR=21;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119232;STB=0.5655;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00712821;OID=.;OPOS=152201053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:35:35:43:43:0.551282:21:22:23:12:21:22:23:12
chr4	152212486	.	C	T	363.82	PASS	AF=0.428571;AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=91;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=15;FWDB=-0.00221918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6526;QD=15.9922;RBI=0.025867;REFB=-0.0425876;REVB=-0.0257716;RO=51;SAF=21;SAR=18;SRF=36;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173089;STB=0.600987;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0478156;OID=.;OPOS=152212486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:51:52:39:39:0.428571:18:21:36:15:18:21:37:15
chr4	152212603	.	T	G	188.41	PASS	AF=0.403509;AO=22;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00334347;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4975;QD=13.2216;RBI=0.0451153;REFB=-0.0175203;REVB=0.0449912;RO=34;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310048;STB=0.530461;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0267872;OID=.;OPOS=152212603;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:34:34:22:23:0.403509:11:11:16:18:11:12:16:18
chr4	153690842	.	T	C	192.98	PASS	AF=0.324675;AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=77;FR=.;FRO=52;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=0.0232978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9397;QD=10.0249;RBI=0.0874526;REFB=-0.00762304;REVB=0.0842922;RO=51;SAF=16;SAR=9;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062931;STB=0.545018;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0145265;OID=.;OPOS=153690842;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:51:52:25:25:0.324675:9:16:30:21:9:16:30:22
chr4	153791946	.	A	G	570.76	PASS	AF=0.541284;AO=51;DP=101;FAO=59;FDP=109;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=34;FSRR=16;FWDB=0.0847192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1385;QD=20.9453;RBI=0.0896713;REFB=-0.0196988;REVB=-0.029387;RO=48;SAF=19;SAR=32;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256531;STB=0.608446;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0176254;OID=.;OPOS=153791946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:109:48:50:51:59:0.541284:32:19:32:16:33:26:34:16
chr4	153896358	.	C	T	3078.82	PASS	AF=0.958333;AO=207;DP=216;FAO=207;FDP=216;FR=.;FRO=9;FSAF=104;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0330383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.718;QD=57.0151;RBI=0.0337602;REFB=-0.167531;REVB=0.00694429;RO=8;SAF=104;SAR=103;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355655;STB=0.520928;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00171278;OID=.;OPOS=153896358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:216:216:8:9:207:207:0.958333:103:104:0:8:103:104:0:9
chr4	153897770	.	G	A	962.69	PASS	AF=0.957143;AO=67;DP=72;FAO=67;FDP=70;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0228543;FXX=0.0277739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.871;QD=55.0107;RBI=0.0534074;REFB=-0.19516;REVB=0.0482704;RO=2;SAF=36;SAR=31;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00205397;STB=0.508777;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000971974;OID=.;OPOS=153897770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:72:70:2:3:67:67:0.957143:31:36:1:1:31:36:1:2
chr4	153898178	.	A	G	57.1	PASS	AF=0.875;AO=8;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.026002;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4692;QD=28.55;RBI=0.0496136;REFB=-0.130517;REVB=-0.042254;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5554;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0201048;OID=.;OPOS=153898178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:0:1:8:7:0.875:5:3:0:0:4:3:0:1
chr4	154216710	.	G	A	43.41	PASS	AF=0.233333;AO=7;DP=30;FAO=7;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0154795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.69;QD=5.788;RBI=0.051614;REFB=-0.0210138;REVB=-0.0492381;RO=23;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.455619;STB=0.788743;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0323986;OID=.;OPOS=154216710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:30:30:23:23:7:7:0.233333:2:5:7:16:2:5:7:16
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chr4	154303033	.	A	G	529.68	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=106;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.0200104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=333.305;QD=18.9172;RBI=0.0240658;REFB=-0.00830722;REVB=-0.0133696;RO=56;SAF=19;SAR=31;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482645;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00796958;OID=.;OPOS=154303033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:112:56:56:50:56:0.5:31:19:24:32:32:24:24:32
chr4	154387597	.	G	C	82.39	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0558085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0697;QD=19.3863;RBI=0.0782582;REFB=-0.0278125;REVB=-0.0548613;RO=7;SAF=8;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214117;STB=0.624724;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00788197;OID=.;OPOS=154387597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:17:17:7:7:10:10:0.588235:2:8:4:3:2:8:4:3
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chr4	154479430	.	T	C	435.84	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00688413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9105;QD=54.48;RBI=0.00940082;REFB=-0.0232682;REVB=0.00640188;RO=1;SAF=13;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345339;STB=0.518507;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00329007;OID=.;OPOS=154479430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:18:13:1:0:18:13:1:0
chr4	154513627	.	A	G	298.69	PASS	AF=0.357143;AO=34;DP=97;FAO=35;FDP=98;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=0.00738814;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.513;QD=12.1913;RBI=0.00911625;REFB=-0.0151256;REVB=0.00534054;RO=59;SAF=24;SAR=10;SRF=30;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232371;STB=0.600691;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0225837;OID=.;OPOS=154513627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:59:63:34:35:0.357143:10:24:30:29:11:24:34:29
chr4	154513722	.	C	T	259.36	PASS	AF=0.356322;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.00445922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5999;QD=11.9247;RBI=0.0072848;REFB=-0.0106791;REVB=-0.00576052;RO=55;SAF=14;SAR=17;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163634;STB=0.587876;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0138543;OID=.;OPOS=154513722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:55:56:31:31:0.356322:17:14:33:22:17:14:33:23
chr4	154514965	.	T	C	204.19	PASS	AF=0.384615;AO=25;DP=65;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.00468011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.24;QD=12.5656;RBI=0.00693631;REFB=-0.0160102;REVB=-0.00511947;RO=40;SAF=10;SAR=15;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549565;STB=0.53162;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0436275;OID=.;OPOS=154514965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:40:40:25:25:0.384615:15:10:18:22:15:10:18:22
chr4	154624656	.	T	C	192.84	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00995202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.996;QD=14.8335;RBI=0.0119958;REFB=-0.00845996;REVB=-0.00669755;RO=30;SAF=17;SAR=5;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311506;STB=0.679823;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0105681;OID=.;OPOS=154624656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:5:17:15:15:5:17:15:15
chr4	154625409	.	T	C	350.15	PASS	AF=0.6;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00853567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2725;QD=28.0122;RBI=0.0248187;REFB=0.00973646;REVB=0.0233048;RO=20;SAF=20;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532809;STB=0.529392;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=-0.0105161;OID=.;OPOS=154625409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:20:20:30:30:0.6:10:20:12:8:10:20:12:8
chr4	154631543	.	A	T	815.64	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.768;QD=57.2381;RBI=0.0384485;REFB=0;REVB=0.00687615;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129886;OID=.;OPOS=154631543;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:23:34:0:0:23:34:0:0
chr4	154631563	.	T	C	360.88	PASS	AF=0.625;AO=33;DP=54;FAO=35;FDP=56;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00126031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.146;QD=25.777;RBI=0.0133426;REFB=-0.0187786;REVB=0.013283;RO=21;SAF=19;SAR=14;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373919;STB=0.518124;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0119643;OID=.;OPOS=154631563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:56:21:21:33:35:0.625:14:19:11:10:15:20:11:10
chr4	154702283	.	G	C	69.73	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.116816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5825;QD=16.4064;RBI=0.117917;REFB=-0.0424971;REVB=0.0160795;RO=6;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787225;STB=0.594396;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00823482;OID=.;OPOS=154702283;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:17:17:6:8:9:9:0.529412:4:5:4:2:4:5:6:2
chr4	154709856	.	A	C	612.47	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00337036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.045;QD=61.2467;RBI=0.0541253;REFB=0;REVB=0.0540203;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170678;OID=.;OPOS=154709856;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:16:23:0:0:17:23:0:0
chr4	155156207	.	G	A	728.73	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00375933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.309;QD=57.1552;RBI=0.0158927;REFB=0;REVB=0.0154416;RO=0;SAF=32;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9065e-05;OID=.;OPOS=155156207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:18:32:0:0:19:32:0:0
chr4	155241572	.	G	A	467.75	PASS	AF=0.447368;AO=50;DP=116;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=41;FWDB=0.0107565;FXX=0.0256388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.087;QD=16.4124;RBI=0.0185689;REFB=-0.00634234;REVB=-0.0151361;RO=65;SAF=23;SAR=27;SRF=22;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125161;STB=0.567824;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00752752;OID=.;OPOS=155241572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:114:65:63:50:51:0.447368:27:23:22:43:27:24:22:41
chr4	155243573	.	C	T	1641.93	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00654199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3944;QD=60.2542;RBI=0.030866;REFB=0;REVB=-0.0301648;RO=0;SAF=58;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000126767;OID=.;OPOS=155243573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:51:58:0:0:51:58:0:0
chr4	155243604	.	T	C	1530.58	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0442514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.336;QD=63.7741;RBI=0.0465465;REFB=0;REVB=0.0144357;RO=0;SAF=47;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294914;OID=.;OPOS=155243604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:48:47:0:0:48:48:0:0
chr4	155244401	.	TTTTGTTTGTTTG	TTTTGTTTG,TTTTGTTTGT	241.08	PASS	AF=0.758621,0.103448;AO=18,4;DP=30;FAO=22,3;FDP=29;FR=.;FRO=4;FSAF=19,2;FSAR=3,1;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0210151,0.0164786;FXX=0.0644953;HRUN=3,3;LEN=4,3;MLLD=229.073,227.14;QD=33.2532;RBI=0.041867,0.0313852;REFB=-0.00918302,-0.00660515;REVB=0.0362106,0.0267111;RO=0;SAF=15,4;SAR=3,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.32e-08,0;STB=0.601162,0.599313;STBP=0.073,0.678;TYPE=del,del;VARB=-0.00357212,0.0263587;OID=.,.;OPOS=155244402,155244411;OREF=TTTG,TTG;OALT=-,-;OMAPALT=TTTTGTTTG,TTTTGTTTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.758621,0.103448:18,4:30:22,3:29:4:19,2:3,1:2:2:15:0:15,4:3,0:0:0
chr4	155244475	.	G	T	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.047;QD=48.7332;RBI=0.0242282;REFB=0;REVB=-0.0016964;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000251551;OID=.;OPOS=155244475;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
chr4	155256177	.	A	G	347.73	PASS	AF=0.440476;AO=32;DP=86;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.012139;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.943;QD=16.5587;RBI=0.0124223;REFB=-0.0149254;REVB=-0.00263809;RO=40;SAF=25;SAR=7;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29616;STB=0.645269;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.024151;OID=.;OPOS=155256177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:84:40:47:32:37:0.440476:7:25:21:19:9:28:25:22
chr4	155256205	.	G	A	900.06	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.982;QD=58.0681;RBI=0.0653464;REFB=0;REVB=0.0553172;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204123;OID=.;OPOS=155256205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:62:0:0:56:62:1:24:32:0:0:27:35:0:0
chr4	155287535	.	T	C	121.07	PASS	AF=0.307692;AO=15;DP=51;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0460089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.662;QD=9.31272;RBI=0.0461367;REFB=-0.0126732;REVB=-0.00343088;RO=36;SAF=4;SAR=11;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289013;STB=0.635504;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0184273;OID=.;OPOS=155287535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:36:36:15:16:0.307692:11:4:18:18:11:5:18:18
chr4	155295076	.	A	G	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0352597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7719;QD=12.0514;RBI=0.0435323;REFB=-0.0308808;REVB=-0.0255306;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170594;STB=0.510181;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0428638;OID=.;OPOS=155295076;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:4:5:7:6:4:5:7:6
chr4	155407680	.	A	G	340.68	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140591;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.7886;QD=54.5083;RBI=0.0340814;REFB=0;REVB=-0.0310464;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000255082;OID=.;OPOS=155407680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0
chr4	155410650	.	T	C	414.42	PASS	AF=0.424779;AO=44;DP=109;FAO=48;FDP=113;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=28;FSRR=37;FWDB=-0.00948836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.724;QD=14.6696;RBI=0.0185652;REFB=-0.0259535;REVB=-0.0159574;RO=65;SAF=11;SAR=33;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220384;STB=0.589556;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0390994;OID=.;OPOS=155410650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:113:65:65:44:48:0.424779:33:11:28:37:34:14:28:37
chr4	155410667	.	G	A	346.87	PASS	AF=0.394231;AO=41;DP=104;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.0257599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1229;QD=13.341;RBI=0.0257603;REFB=-0.0147428;REVB=0.000156023;RO=63;SAF=14;SAR=27;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993744;STB=0.556533;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0241465;OID=.;OPOS=155410667;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:63:63:41:41:0.394231:27:14:27:36:27:14:27:36
chr4	155410731	.	G	C	185.68	PASS	AF=0.338028;AO=24;DP=70;FAO=24;FDP=71;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=0.00550821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.576;QD=10.4609;RBI=0.010866;REFB=-0.000827659;REVB=0.00936643;RO=46;SAF=10;SAR=14;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284154;STB=0.669571;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00147903;OID=.;OPOS=155410731;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:46:47:24:24:0.338028:14:10:31:15:14:10:32:15
chr4	155410822	.	G	A	623.27	PASS	AF=0.53913;AO=62;DP=115;FAO=62;FDP=115;FR=.;FRO=53;FSAF=41;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=12;FWDB=-0.00168844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.187;QD=21.6789;RBI=0.0274638;REFB=-0.0225511;REVB=0.0274118;RO=50;SAF=41;SAR=21;SRF=39;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112818;STB=0.559982;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0179787;OID=.;OPOS=155410822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:50:53:62:62:0.53913:21:41:39:11:21:41:41:12
chr4	155411065	.	T	C	1437.97	PASS	AF=0.989796;AO=97;DP=101;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0182877;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.322;QD=58.6928;RBI=0.0223556;REFB=-0.0783998;REVB=-0.0128582;RO=0;SAF=44;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.000144969;OID=.;OPOS=155411065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:98:0:1:97:97:0.989796:53:44:0:0:53:44:1:0
chr4	155411104	.	A	C	1556.44	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.431;QD=59.8632;RBI=0.0142831;REFB=0;REVB=0.00179734;RO=0;SAF=54;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.17728e-05;OID=.;OPOS=155411104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:50:54:0:0:50:54:0:0
chr4	155411939	.	A	C	638.54	PASS	AF=0.44586;AO=70;DP=157;FAO=70;FDP=157;FR=.;FRO=87;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=49;FSRR=38;FWDB=-0.00884612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.976;QD=16.2685;RBI=0.0401207;REFB=-0.00740846;REVB=-0.0391333;RO=87;SAF=41;SAR=29;SRF=49;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022956;STB=0.512783;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.00911443;OID=.;OPOS=155411939;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:157:87:87:70:70:0.44586:29:41:49:38:29:41:49:38
chr4	155412464	.	C	T	385.14	PASS	AF=0.52;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0563013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4478;QD=20.541;RBI=0.0620662;REFB=-0.0258058;REVB=0.0261223;RO=34;SAF=15;SAR=24;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173044;STB=0.58329;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0276416;OID=.;OPOS=155412464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:34:36:39:39:0.52:24:15:20:14:24:15:20:16
chr4	155507590	.	T	C	187.86	PASS	AF=0.425532;AO=19;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.029786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8314;QD=15.9879;RBI=0.0474473;REFB=-0.0642191;REVB=0.0369329;RO=27;SAF=11;SAR=8;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137074;STB=0.560449;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.104158;OID=.;OPOS=155507590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:19:20:0.425532:8:11:12:15:9:11:12:15
chr4	155719189	.	T	G	674.08	PASS	AF=0.570175;AO=65;DP=114;FAO=65;FDP=114;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-3.69659e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.186;QD=23.6518;RBI=0.0137141;REFB=-0.0101562;REVB=0.013714;RO=46;SAF=31;SAR=34;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340869;STB=0.50554;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.00681267;OID=.;OPOS=155719189;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:46:49:65:65:0.570175:34:31:24:22:34:31:24:25
chr4	155720274	.	T	C	495.69	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.794;QD=58.3159;RBI=0.0253383;REFB=0;REVB=0.0105592;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.10033e-05;OID=.;OPOS=155720274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:19:14:0:0:20:14:0:0
chr4	155720346	.	AGGC	AGC,AGGA	397.2	PASS	AF=0.23913,0.521739;AO=11,22;DP=46;FAO=11,24;FDP=46;FR=.;FRO=11;FSAF=11,10;FSAR=0,14;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.00144243,0.0449614;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=22.1342,207.59;QD=34.5395;RBI=0.0403031,0.0450951;REFB=0.022678,0.00373;REVB=-0.0402773,-0.00347009;RO=11;SAF=11,9;SAR=0,13;SRF=1;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0.398142,0;SSSB=0.851146,0.208769;STB=0.999007,0.609053;STBP=0,0.082;TYPE=del,snp;VARB=0.0751291,0.00289607;OID=.,.;OPOS=155720347,155720349;OREF=G,C;OALT=-,A;OMAPALT=AGC,AGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.23913,0.521739:11,22:46:11,24:46:11:11,10:0,14:1:10:87:11:11,9:0,13:1:10
chr4	156135676	.	C	T	1355.4	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0302559;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.0141;QD=62.3172;RBI=0.0530034;REFB=0;REVB=0.0435194;RO=0;SAF=49;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.26235e-05;OID=.;OPOS=156135676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:37:49:0:0:37:50:0:0
chr4	156136027	.	C	T	969.15	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0069923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.121;QD=58.7364;RBI=0.0660138;REFB=0;REVB=0.0656425;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317929;OID=.;OPOS=156136027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:30:35:0:0:31:35:0:0
chr4	156273768	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.361;QD=59.0186;RBI=0.0350252;REFB=0;REVB=0.0261621;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127658;OID=.;OPOS=156273768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:12:22:0:0:12:22:0:0
chr4	156274377	.	T	C	521.95	PASS	AF=0.902439;AO=35;DP=41;FAO=37;FDP=41;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0792109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6164;QD=50.9223;RBI=0.0821233;REFB=-0.0963589;REVB=0.0216765;RO=5;SAF=16;SAR=19;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333759;STB=0.531275;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0085828;OID=.;OPOS=156274377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:41:41:5:4:35:37:0.902439:19:16:3:2:21:16:3:1
chr4	156276289	.	C	T	415.99	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012587;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6846;QD=57.3785;RBI=0.0396881;REFB=0;REVB=-0.0376393;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110171;OID=.;OPOS=156276289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr4	156276317	.	A	G	263.02	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00893576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0165;QD=47.8209;RBI=0.0268994;REFB=-0.166153;REVB=0.0253719;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533301;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0110532;OID=.;OPOS=156276317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:0:1:21:21:0.954545:7:14:0:0:7:14:0:1
chr4	156379973	.	G	T	581.1	PASS	AF=0.558824;AO=57;DP=102;FAO=57;FDP=102;FR=.;FRO=45;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.00976494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0097;QD=22.7882;RBI=0.040607;REFB=-0.00709717;REVB=-0.0394154;RO=45;SAF=37;SAR=20;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15291;STB=0.583901;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00430183;OID=.;OPOS=156379973;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:45:45:57:57:0.558824:20:37:21:24:20:37:21:24
chr4	156380807	.	T	G	762.64	PASS	AF=0.596639;AO=71;DP=119;FAO=71;FDP=119;FR=.;FRO=48;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.00714007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.881;QD=25.6348;RBI=0.00828029;REFB=-0.0310493;REVB=-0.00419315;RO=47;SAF=38;SAR=33;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605755;STB=0.536575;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0185022;OID=.;OPOS=156380807;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:47:48:71:71:0.596639:33:38:29:18:33:38:30:18
chr4	156382707	.	T	A	387.48	PASS	AF=0.42268;AO=41;DP=97;FAO=41;FDP=97;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=-0.0144778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.422;QD=15.9786;RBI=0.0202665;REFB=-0.020023;REVB=-0.0141818;RO=55;SAF=17;SAR=24;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00371494;STB=0.502332;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0279467;OID=.;OPOS=156382707;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:55:56:41:41:0.42268:24:17:23:32:24:17:23:33
chr4	156382738	.	A	C	383.69	PASS	AF=0.513158;AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0201887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.194;QD=20.1942;RBI=0.0445255;REFB=-0.0112837;REVB=0.0396854;RO=37;SAF=10;SAR=29;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102721;STB=0.557196;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0138407;OID=.;OPOS=156382738;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:37:37:39:39:0.513158:29:10:13:24:29:10:13:24
chr4	156632391	.	A	G	860.02	PASS	AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0142191;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=304.451;QD=54.6042;RBI=0.0147968;REFB=-0.152754;REVB=0.004094;RO=2;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304298;STB=0.516124;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.000291211;OID=.;OPOS=156632391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:63:2:2:61:61:0.968254:30:31:0:2:30:31:0:2
chr4	156638428	.	A	G	740.08	PASS	AF=0.541985;AO=71;DP=131;FAO=71;FDP=131;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.00457005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.976;QD=22.5977;RBI=0.00628523;REFB=-0.00820853;REVB=0.00431496;RO=60;SAF=26;SAR=45;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130154;STB=0.571376;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00665344;OID=.;OPOS=156638428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:60:60:71:71:0.541985:45:26:31:29:45:26:31:29
chr4	156693910	.	T	G	226.88	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0681712;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.6695;QD=13.5453;RBI=0.0682104;REFB=-0.0176902;REVB=0.00231094;RO=40;SAF=16;SAR=11;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189526;STB=0.510824;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0272931;OID=.;OPOS=156693910;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:11:16:23:17:11:16:23:17
chr4	156787340	.	G	A	594.84	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342377;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.677;QD=61.0095;RBI=0.0504875;REFB=0;REVB=0.0371048;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00035004;OID=.;OPOS=156787340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:24:14:0:0:25:14:0:0
chr4	156847230	.	A	G	618.86	PASS	AF=1;AO=44;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271141;FXX=0.019604;HRUN=8;LEN=1;MLLD=25.5466;QD=49.5088;RBI=0.173385;REFB=0;REVB=0.171252;RO=5;SAF=33;SAR=11;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08485;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00845751;OID=.;OPOS=156847230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:51:50:5:0:44:50:1:11:33:2:3:15:35:0:0
chr4	156847236	.	AAGG	AAAG,AAG,AAGA,AG	529.88	PASS	AF=0,0,0,1;AO=6,24,3,9;DP=42;FAO=0,0,0,43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,0,30;FSAR=0,0,0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.107878,0.0495529,-0.0374716,-0.0578669;FXX=0.0444346;HRUN=2,2,2,8;LEN=1,1,1,2;MLLD=7.70146,14.1591,8.45669,18.5816;QD=49.2907;RBI=0.124201,0.0695335,0.0770815,0.10195;REFB=0,0,0,0;REVB=0.0615491,-0.0487792,-0.0673605,-0.0839364;RO=0;SAF=3,17,2,9;SAR=3,7,1,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,del,snp,del;VARB=0.019076,0.0167838,0,0.000215607;OID=.,.,.,.;OPOS=156847238,156847238,156847239,156847237;OREF=G,G,G,AG;OALT=A,-,A,-;OMAPALT=AAAG,AAG,AAGA,AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	4/4:0,0,0,1:6,24,3,9:42:0,0,0,43:43:0:0,0,0,30:0,0,0,13:0:0:3:0:3,17,2,9:3,7,1,0:0:0
chr4	157557726	.	A	G	998.18	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0310993;FXX=0.0142837;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7691;QD=57.8655;RBI=0.0483091;REFB=-0.158159;REVB=-0.0369676;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.50769;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00196613;OID=.;OPOS=157557726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:70:69:0:1:68:68:0.985507:32:36:0:0:32:36:0:1
chr4	157684248	.	T	C	275.95	PASS	AF=0.449275;AO=28;DP=66;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00247488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.041;QD=15.9968;RBI=0.00614078;REFB=-0.0237326;REVB=0.00561998;RO=37;SAF=22;SAR=6;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.411355;STB=0.688495;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0368821;OID=.;OPOS=157684248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:69:37:38:28:31:0.449275:6:22:15:22:8:23:16:22
chr4	158065038	.	T	C	1191.09	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0648171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.203;QD=61.0815;RBI=0.0651611;REFB=0;REVB=-0.00668698;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.29609e-05;OID=.;OPOS=158065038;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:34:43:0:0:34:44:0:0
chr4	158238830	.	T	C	3377.03	PASS	AF=1;AO=217;DP=220;FAO=217;FDP=217;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03254;FXX=0.0180987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.413;QD=62.2495;RBI=0.0364714;REFB=-0.00197218;REVB=0.0164715;RO=0;SAF=118;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.25314e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.07707e-05;OID=.;OPOS=158238830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:220:217:0:0:217:217:1:99:118:0:0:99:118:0:0
chr4	159076826	.	C	T	1609.36	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240354;FXX=0.0092584;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.227;QD=60.1628;RBI=0.0240664;REFB=0;REVB=-0.00122205;RO=0;SAF=61;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.73491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.30137e-05;OID=.;OPOS=159076826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:107:0:0:107:107:1:46:61:0:0:46:61:0:0
chr4	159092633	.	A	G	1357.65	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2671;QD=62.4205;RBI=0.0246568;REFB=0;REVB=0.0126771;RO=0;SAF=47;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113679;OID=.;OPOS=159092633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:40:47:0:0:40:47:0:0
chr4	159133982	.	CT	C	69.79	PASS	AF=0.382979;AO=14;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0725347;FXX=0.020829;HRUN=6;LEN=1;MLLD=12.7293;QD=5.93977;RBI=0.221607;REFB=-0.0431287;REVB=0.2094;RO=27;SAF=8;SAR=6;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299018;STB=0.563039;STBP=0.523;TYPE=del;VARB=0.0942646;OID=.;OPOS=159133983;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.382979:14:47:18:47:29:8:10:10:19:69:27:8:6:8:19
chr4	159156622	.	G	A	410.07	PASS	AF=0.387097;AO=47;DP=125;FAO=48;FDP=124;FR=.,HEALED;FRO=75;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=-0.00779329;FXX=0.0158718;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.451;QD=13.228;RBI=0.0445218;REFB=-0.0222613;REVB=-0.0438344;RO=58;SAF=27;SAR=20;SRF=41;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137437;STB=0.50978;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0330237;OID=.;OPOS=159156622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:124:58:75:47:48:0.387097:20:27:41:17:21:27:41:34
chr4	159601676	.	C	T	650.75	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00624874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.145;QD=61.9757;RBI=0.0225618;REFB=0;REVB=0.0216792;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147392;OID=.;OPOS=159601676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:14:28:0:0:14:28:0:0
chr4	159826773	.	T	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390802;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=350.677;QD=46.848;RBI=0.0404453;REFB=0;REVB=0.0104191;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122125;OID=.;OPOS=159826773;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0
chr4	159836329	.	T	C	33.1	PASS	AF=0.125;AO=6;DP=48;FAO=6;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=0.0697374;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=33.9102;QD=2.75856;RBI=0.0833529;REFB=-0.00687089;REVB=0.0456551;RO=33;SAF=2;SAR=4;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348114;STB=0.784019;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0429694;OID=.;OPOS=159836329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:48:48:33:42:6:6:0.125:4:2:21:12:4:2:29:13
chr4	159881479	.	T	C	198.67	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0773001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.493;QD=19.382;RBI=0.0997523;REFB=0.0270889;REVB=-0.0630493;RO=21;SAF=6;SAR=14;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296371;STB=0.668169;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.0276124;OID=.;OPOS=159881479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:14:6:13:8:14:6:13:8
chr4	159894250	.	C	T	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00305649;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=311.526;QD=58.6006;RBI=0.00937099;REFB=0;REVB=0.00885852;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.37439e-06;OID=.;OPOS=159894250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:28:36:0:0:28:36:0:0
chr4	159894277	.	T	C	266.38	PASS	AF=0.382716;AO=31;DP=81;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.00394139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.75;QD=13.1547;RBI=0.0385844;REFB=-0.0186352;REVB=0.0383826;RO=48;SAF=19;SAR=12;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0328484;STB=0.508356;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0384921;OID=.;OPOS=159894277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:48:50:31:31:0.382716:12:19:28:20:12:19:30:20
chr4	159894305	.	T	C	1351.46	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.977;QD=62.1363;RBI=0.0383506;REFB=0;REVB=0.0338332;RO=0;SAF=54;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11373e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.5363e-05;OID=.;OPOS=159894305;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:87:0:0:85:87:1:31:54:0:0:32:55:0:0
chr4	159894391	.	G	A	311.86	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0520195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2556;QD=16.6324;RBI=0.052806;REFB=0.000970152;REVB=-0.00908002;RO=40;SAF=20;SAR=14;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620268;STB=0.528829;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=-0.00242228;OID=.;OPOS=159894391;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:41:34:34:0.453333:14:20:21:19:14:20:22:19
chr4	160428588	.	G	A	651.43	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0431098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.001;QD=62.0405;RBI=0.0558551;REFB=0;REVB=0.0355154;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.2921e-05;OID=.;OPOS=160428588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:13:28:0:0:14:28:0:0
chr4	162307000	.	T	C	452.12	PASS	AF=0.418033;AO=51;DP=122;FAO=51;FDP=122;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=35;FWDB=-0.0119216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8625;QD=14.8234;RBI=0.0186625;REFB=0.017546;REVB=0.0143584;RO=70;SAF=30;SAR=21;SRF=36;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773093;STB=0.547926;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.0317705;OID=.;OPOS=162307000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:70:71:51:51:0.418033:21:30:36:34:21:30:36:35
chr4	164048199	.	G	C	1494.96	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00769953;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7433;QD=63.6154;RBI=0.00876172;REFB=0;REVB=-0.00418151;RO=0;SAF=60;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.12276e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.30846e-05;OID=.;OPOS=164048199;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:94:0:0:94:94:1:34:60:0:0:34:60:0:0
chr4	164085425	.	T	C	1998.91	PASS	AF=0.95;AO=133;DP=141;FAO=133;FDP=140;FR=.;FRO=7;FSAF=77;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.058112;FXX=0.0070917;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.193;QD=57.1116;RBI=0.079499;REFB=-0.161039;REVB=0.0542501;RO=7;SAF=77;SAR=56;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055794;STB=0.529407;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00180903;OID=.;OPOS=164085425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:141:140:7:7:133:133:0.95:56:77:0:7:56:77:0:7
chr4	164393117	.	T	A	727.19	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=50;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000868585;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.251;QD=59.3624;RBI=0.0536539;REFB=-0.0633747;REVB=-0.0536469;RO=2;SAF=33;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183761;STB=0.50978;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.00243424;OID=.;OPOS=164393117;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:49:2:2:47:47:0.959184:14:33:1:1:14:33:1:1
chr4	164533702	.	T	C	439.4	PASS	AF=0.483516;AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=0.0204363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.693;QD=19.3143;RBI=0.0487868;REFB=-0.0079116;REVB=0.0443002;RO=47;SAF=19;SAR=25;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0737092;STB=0.540998;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0113247;OID=.;OPOS=164533702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:47:47:44:44:0.483516:25:19:24:23:25:19:24:23
chr4	165878335	.	A	G	177.04	PASS	AF=0.37931;AO=21;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.03595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0502;QD=12.2094;RBI=0.0644667;REFB=-0.0282984;REVB=-0.0535122;RO=36;SAF=13;SAR=8;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13198;STB=0.587016;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0334276;OID=.;OPOS=165878335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:36:21:22:0.37931:8:13:18:18:8:14:18:18
chr4	166000195	.	A	G	631.36	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.534;QD=60.1291;RBI=0.0605879;REFB=0;REVB=0.0591401;RO=0;SAF=30;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00464e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000472863;OID=.;OPOS=166000195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:42:0:0:37:42:1:7:30:0:0:11:31:0:0
chr4	166000263	.	C	T	199.02	PASS	AF=0.357143;AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=70;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.0550742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.727;QD=11.3726;RBI=0.12144;REFB=0.0104549;REVB=-0.108234;RO=43;SAF=10;SAR=15;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728691;STB=0.558093;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=-0.022617;OID=.;OPOS=166000263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:70:43:45:25:25:0.357143:15:10:20:23:15:10:22:23
chr4	166403504	.	G	A	264.52	PASS	AF=0.326733;AO=33;DP=100;FAO=33;FDP=101;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=0.0194497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5672;QD=10.4762;RBI=0.0206663;REFB=-0.0108413;REVB=0.006986;RO=65;SAF=19;SAR=14;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255274;STB=0.521646;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0220151;OID=.;OPOS=166403504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:65:68:33:33:0.326733:14:19:36:29:14:19:37:31
chr4	166405584	.	C	T	710.26	PASS	AF=0.474684;AO=75;DP=159;FAO=75;FDP=158;FR=.;FRO=83;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=43;FSRR=40;FWDB=0.0100318;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.504;QD=17.9812;RBI=0.0157582;REFB=-0.00163182;REVB=0.0121525;RO=83;SAF=45;SAR=30;SRF=43;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795171;STB=0.54403;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00231732;OID=.;OPOS=166405584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:158:83:83:75:75:0.474684:30:45:43:40:30:45:43:40
chr4	167012381	.	G	A	910.16	PASS	AF=0.471795;AO=92;DP=195;FAO=92;FDP=195;FR=.;FRO=103;FSAF=57;FSAR=35;FSRF=53;FSRR=50;FWDB=9.63335e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8617;QD=18.6699;RBI=0.0597717;REFB=-0.0298412;REVB=-0.0597716;RO=103;SAF=57;SAR=35;SRF=53;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103392;STB=0.557204;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0296809;OID=.;OPOS=167012381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:195:195:103:103:92:92:0.471795:35:57:53:50:35:57:53:50
chr4	167012480	.	T	C	2006.65	PASS	AF=0.977612;AO=129;DP=133;FAO=131;FDP=134;FR=.;FRO=3;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0696902;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7059;QD=59.9001;RBI=0.0883;REFB=-0.163241;REVB=0.0542233;RO=3;SAF=70;SAR=59;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00909473;STB=0.504518;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.000870651;OID=.;OPOS=167012480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:133:134:3:3:129:131:0.977612:59:70:1:2:61:70:1:2
chr4	167654960	.	C	A,G	367.83	PASS	AF=0.0740741,0.925926;AO=2,25;DP=27;FAO=2,25;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=2,22;FSAR=0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00137423,0.00559879;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=109.6,131.682;QD=54.4938;RBI=0.0114435,0.124563;REFB=0,0;REVB=0.0113606,0.124437;RO=0;SAF=2,22;SAR=0,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.65945e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0176827,0.00148823;OID=.,.;OPOS=167654960,167654960;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:27:27:0:0:2,25:2,25:0.0740741,0.925926:0,3:2,22:0:0:0,3:2,22:0:0
chr4	168584259	.	T	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4162;QD=47.8223;RBI=0.0373819;REFB=0;REVB=0.034708;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000669932;OID=.;OPOS=168584259;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0
chr4	169083694	.	A	C	283.71	PASS	AF=0.472222;AO=30;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=9;FWDB=-0.0075822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.833;QD=15.7619;RBI=0.00883586;REFB=-0.026387;REVB=0.00453682;RO=35;SAF=27;SAR=3;SRF=27;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25583;STB=0.551149;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0172546;OID=.;OPOS=169083694;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:35:38:30:34:0.472222:3:27:27:8:6:28:29:9
chr4	169086441	.	A	G	84.28	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0290183;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.749;QD=10.2156;RBI=0.03108;REFB=-0.0212913;REVB=-0.0111312;RO=22;SAF=7;SAR=3;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0812577;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0478919;OID=.;OPOS=169086441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:33:33:22:22:10:11:0.333333:3:7:14:8:4:7:14:8
chr4	169099125	.	C	T	268.69	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0229861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.068;QD=22.391;RBI=0.0249153;REFB=-0.00944066;REVB=0.00961309;RO=23;SAF=13;SAR=12;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00149175;STB=0.500834;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0107942;OID=.;OPOS=169099125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:12:13:12:11:12:13:12:11
chr4	169141748	.	T	A	140.79	PASS	AF=0.13289;AO=39;DP=302;FAO=40;FDP=301;FR=.;FRO=261;FSAF=3;FSAR=37;FSRF=145;FSRR=116;FWDB=-0.0263436;FXX=0.0163393;HRUN=5;LEN=1;MLLD=113.235;QD=1.87092;RBI=0.03555;REFB=-0.0016326;REVB=-0.0238708;RO=237;SAF=7;SAR=32;SRF=129;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.469887;STB=0.922448;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0254516;OID=.;OPOS=169141748;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:302:301:237:261:39:40:0.13289:32:7:129:108:37:3:145:116
chr4	169194452	.	C	T	164.39	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0238946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7829;QD=13.6987;RBI=0.0239315;REFB=-0.0210235;REVB=-0.001328;RO=30;SAF=10;SAR=8;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240491;STB=0.514003;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0272291;OID=.;OPOS=169194452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:8:10:16:14:8:10:16:14
chr4	169282355	.	T	C	1138.8	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0052904;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.917;QD=60.7358;RBI=0.00583968;REFB=0;REVB=0.00247257;RO=0;SAF=49;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.1693e-05;OID=.;OPOS=169282355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:26:49:0:0:26:49:0:0
chr4	169299528	.	T	C	493.65	PASS	AF=0.473214;AO=53;DP=112;FAO=53;FDP=112;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.0130761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.53;QD=17.6303;RBI=0.0211197;REFB=-0.00633026;REVB=0.0165848;RO=59;SAF=27;SAR=26;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047374;STB=0.526306;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00462869;OID=.;OPOS=169299528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:59:59:53:53:0.473214:26:27:33:26:26:27:33:26
chr4	169315760	.	C	A	299.24	PASS	AF=0.390805;AO=34;DP=87;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0476843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.541;QD=13.758;RBI=0.0556897;REFB=-0.0147536;REVB=-0.0287671;RO=53;SAF=12;SAR=22;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112144;STB=0.564064;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0274413;OID=.;OPOS=169315760;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:53:53:34:34:0.390805:22:12:24:29:22:12:24:29
chr4	169317279	.	C	T	172.21	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.027009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1496;QD=26.4933;RBI=0.0420284;REFB=0.0350902;REVB=-0.0322009;RO=9;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264654;STB=0.645017;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=-0.0263152;OID=.;OPOS=169317279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:11:6:0:9:11:6:0:9
chr4	169327191	.	C	T	243.73	PASS	AF=0.459016;AO=26;DP=60;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.00520499;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.955;QD=15.9821;RBI=0.00552808;REFB=-0.0103822;REVB=0.0018622;RO=34;SAF=12;SAR=14;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384718;STB=0.511155;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0150201;OID=.;OPOS=169327191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:34:33:26:28:0.459016:14:12:17:17:15:13:16:17
chr4	169336662	.	T	C	465.11	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3665;QD=58.1387;RBI=0.0214261;REFB=0;REVB=-0.000518488;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281278;OID=.;OPOS=169336662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr4	169341435	.	A	G	1834.68	PASS	AF=0.991803;AO=119;DP=120;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00550333;FXX=0.0161277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.952;QD=60.1534;RBI=0.0291242;REFB=0.0215424;REVB=0.0285995;RO=1;SAF=66;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00714286;STB=0.503649;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=9.47093e-06;OID=.;OPOS=169341435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:120:122:1:1:119:121:0.991803:53:66:1:0:53:68:1:0
chr4	169362557	.	C	G	212.16	PASS	AF=0.567568;AO=20;DP=36;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.0392508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8884;QD=22.9363;RBI=0.0400402;REFB=-0.0126981;REVB=0.00791197;RO=16;SAF=5;SAR=15;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689287;STB=0.531107;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0139178;OID=.;OPOS=169362557;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:16:16:20:21:0.567568:15:5:3:13:16:5:3:13
chr4	169369820	.	T	A	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.87;QD=61.3354;RBI=0.0174716;REFB=0;REVB=0.0137584;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.99303e-05;OID=.;OPOS=169369820;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr4	169369853	.	A	T	670.15	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.923;QD=62.3399;RBI=0.0589054;REFB=0;REVB=0.0177566;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365502;OID=.;OPOS=169369853;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0
chr4	169369920	.	C	T	96.72	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0214838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.164;QD=15.4752;RBI=0.0813323;REFB=-0.00647578;REVB=-0.0784435;RO=13;SAF=8;SAR=2;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426955;STB=0.754173;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.000331229;OID=.;OPOS=169369920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:25:25:13:13:10:10:0.4:2:8:5:8:2:8:5:8
chr4	169393595	.	A	G	902.69	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0683128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5116;QD=58.2379;RBI=0.0867695;REFB=0;REVB=0.0535006;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101483;OID=.;OPOS=169393595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0
chr4	169621191	.	G	A	167.32	PASS	AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0534363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4413;QD=11.7416;RBI=0.0604951;REFB=-0.0108709;REVB=0.0283587;RO=36;SAF=7;SAR=14;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300585;STB=0.674253;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0139475;OID=.;OPOS=169621191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:36:36:21:21:0.368421:14:7:22:14:14:7:22:14
chr4	169630204	.	T	G	350.88	PASS	AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.00836838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.051;QD=20.6397;RBI=0.0160797;REFB=-0.000289808;REVB=-0.0137305;RO=32;SAF=21;SAR=15;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176167;STB=0.597507;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.000213386;OID=.;OPOS=169630204;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:15:21:12:20:15:21:12:20
chr4	169806527	.	A	G	439.78	PASS	AF=0.383459;AO=51;DP=133;FAO=51;FDP=133;FR=.;FRO=82;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=51;FSRR=31;FWDB=0.00285138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9129;QD=13.2263;RBI=0.00285712;REFB=-0.029774;REVB=0.00018102;RO=81;SAF=32;SAR=19;SRF=51;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00252456;STB=0.503618;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0576687;OID=.;OPOS=169806527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:81:82:51:51:0.383459:19:32:51:30:19:32:51:31
chr4	169846359	.	GCT	G	706.27	PASS	AF=1;AO=45;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596716;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=239.485;QD=55.3936;RBI=0.05971;REFB=0;REVB=0.00213974;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=8.46065e-05;OID=.;OPOS=169846360;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:45:51:51:51:0:26:25:0:0:4:0:23:22:0:0
chr4	169928842	.	G	T	3686.23	PASS	AF=1;AO=233;DP=233;FAO=233;FDP=233;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=123;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0731748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.787;QD=63.283;RBI=0.0731786;REFB=0;REVB=0.000749038;RO=0;SAF=110;SAR=123;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13347e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.3945e-05;OID=.;OPOS=169928842;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:233:233:0:0:233:233:1:123:110:0:0:123:110:0:0
chr4	170028300	.	G	A	271.5	PASS	AF=0.508772;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00825042;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.168;QD=19.0523;RBI=0.0306205;REFB=-0.0254268;REVB=-0.029488;RO=27;SAF=17;SAR=12;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185599;STB=0.594627;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0194027;OID=.;OPOS=170028300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:27:28:29:29:0.508772:12:17:10:17:12:17:11:17
chr4	170398454	.	T	C	174.86	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0449451;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6382;QD=18.9041;RBI=0.046413;REFB=0.0100298;REVB=0.0115803;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237684;STB=0.513498;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=-0.0164727;OID=.;OPOS=170398454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:19:19:18:18:0.486486:9:9:9:10:9:9:10:9
chr4	170581570	.	G	A	1062.19	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4622;QD=59.8417;RBI=0.0312085;REFB=0;REVB=-0.0045633;RO=0;SAF=47;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79556e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011931;OID=.;OPOS=170581570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:23:47:0:0:23:48:0:0
chr4	170623928	.	CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA	CAAAAAAAAAGAAAGAAGAAC,CAAAAAAAA,CAAAAAAA	528.15	PASS	AF=0.179487,0.820513,0;AO=3,21,7;DP=59;FAO=7,32,0;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=7,22,0;FSAR=0,10,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000196337,0.00226919,0.00213967;FXX=0.370908;HRUN=20,20,20;LEN=11,12,13;MLLD=176.033,28.9342,23.7721;QD=54.1693;RBI=0.004373,0.00692542,0.00639049;REFB=0,0,0;REVB=0.00436859,0.00654311,0.00602164;RO=0;SAF=3,12,7;SAR=0,9,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,del;VARB=0.02729,-0.00503101,-0.00363523;OID=.,.,.;OPOS=170623938,170623929,170623929;OREF=AAAAAAAAAAA,AAAAAAAAAAAA,AAAAAAAAAAAAA;OALT=GAAAGAAGAAC,-,-;OMAPALT=CAAAAAAAAAGAAAGAAGAAC,CAAAAAAAA,CAAAAAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.179487,0.820513,0:3,21,7:59:7,32,0:39:0:7,22,0:0,10,0:0:0:43:0:3,12,7:0,9,0:0:0
chr4	170623982	.	C	G	538.67	PASS	AF=0.432836;AO=58;DP=135;FAO=58;FDP=134;FR=.;FRO=76;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=47;FSRR=29;FWDB=0.00896364;FXX=0.00740686;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.32;QD=16.0798;RBI=0.0138131;REFB=-0.013716;REVB=-0.0105098;RO=76;SAF=21;SAR=37;SRF=47;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2589;STB=0.644748;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0167389;OID=.;OPOS=170623982;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:134:76:76:58:58:0.432836:37:21:47:29:37:21:47:29
chr4	170634390	.	C	T	553.8	PASS	AF=0.508929;AO=56;DP=111;FAO=57;FDP=112;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.0512827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.535;QD=19.7787;RBI=0.0513399;REFB=-0.0377786;REVB=0.00242203;RO=55;SAF=29;SAR=27;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105523;STB=0.561776;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0251638;OID=.;OPOS=170634390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:112:55:55:56:57:0.508929:27:29:22:33:27:30:22:33
chr4	170663235	.	C	T	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.416;QD=56.188;RBI=0.030848;REFB=0;REVB=0.0122815;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.33524e-05;OID=.;OPOS=170663235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:20:8:0:0:20:8:0:0
chr4	170678993	.	T	C	536.73	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0787022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.633;QD=59.6368;RBI=0.0889276;REFB=0;REVB=0.0414015;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166847;OID=.;OPOS=170678993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:36:0:0:33:36:1:17:16:0:0:17:19:0:0
chr4	170981425	.	G	C	227.93	PASS	AF=0.305263;AO=28;DP=94;FAO=29;FDP=95;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=0.00227554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.427;QD=9.59708;RBI=0.00227712;REFB=-0.00357888;REVB=8.47695e-05;RO=66;SAF=11;SAR=17;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0013476;STB=0.514276;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.027764;OID=.;OPOS=170981425;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:66:66:28:29:0.305263:17:11:26:40:17:12:26:40
chr4	170981431	.	T	G	194.58	PASS	AF=0.282609;AO=26;DP=92;FAO=26;FDP=92;FR=.;FRO=66;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=0.00314947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.727;QD=8.46017;RBI=0.0108263;REFB=-0.0182161;REVB=0.0103581;RO=64;SAF=11;SAR=15;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401271;STB=0.521535;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0423104;OID=.;OPOS=170981431;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:64:66:26:26:0.282609:15:11:25:39:15:11:26:40
chr4	170987636	.	A	G	203.34	PASS	AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.00844565;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=330.658;QD=14.2692;RBI=0.0103552;REFB=-0.00563103;REVB=-0.00599167;RO=33;SAF=8;SAR=16;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24987;STB=0.642736;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00743642;OID=.;OPOS=170987636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:16:8:19:14:16:8:19:14
chr4	172735897	.	C	G	485.64	PASS	AF=0.54023;AO=46;DP=86;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.000215728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9424;QD=22.3283;RBI=0.0875179;REFB=-0.0301027;REVB=-0.0875176;RO=40;SAF=26;SAR=20;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299974;STB=0.52186;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0293568;OID=.;OPOS=172735897;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:40:40:46:47:0.54023:20:26:24:16:21:26:24:16
chr4	174062875	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0438837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.445;QD=50.4135;RBI=0.0530506;REFB=0;REVB=0.0298092;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000420447;OID=.;OPOS=174062875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:16:3:0:0:16:3:0:0
chr4	174090004	.	G	A	351.18	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00707668;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.1;QD=23.412;RBI=0.00713453;REFB=-0.038887;REVB=0.000906733;RO=24;SAF=24;SAR=11;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509435;STB=0.540169;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0291768;OID=.;OPOS=174090004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:24:25:35:35:0.583333:11:24:15:9:11:24:15:10
chr4	175158212	.	G	T	224.47	PASS	AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=-0.0604986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3434;QD=13.0125;RBI=0.0703599;REFB=0.0045655;REVB=0.0359227;RO=42;SAF=17;SAR=10;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353732;STB=0.700891;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00901763;OID=.;OPOS=175158212;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:42:27:27:0.391304:10:17:12:30:10:17:12:30
chr4	175225452	.	G	A	406.88	PASS	AF=0.441176;AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.00839657;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.272;QD=15.9562;RBI=0.0205276;REFB=-0.0156929;REVB=-0.0187318;RO=57;SAF=25;SAR=20;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817834;STB=0.545831;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0171764;OID=.;OPOS=175225452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:57:57:45:45:0.441176:20:25:27:30:20:25:27:30
chr4	175229858	.	C	T	213.53	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.0210227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.887;QD=16.1153;RBI=0.038972;REFB=-0.0118194;REVB=0.0328156;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217907;STB=0.622545;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0156484;OID=.;OPOS=175229858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:12:12:21:8:12:12:21:8
chr4	175237408	.	T	C	1507.5	PASS	AF=0.990291;AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0391713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.251;QD=58.5436;RBI=0.043043;REFB=-0.137602;REVB=0.0178413;RO=1;SAF=42;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00797385;STB=0.504131;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00041767;OID=.;OPOS=175237408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:102:103:1:1:101:102:0.990291:59:42:0:1:60:42:0:1
chr4	175443156	.	C	T	221.98	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00975953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.372;QD=14.5563;RBI=0.0279055;REFB=-0.0148306;REVB=-0.0261432;RO=35;SAF=16;SAR=10;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104592;STB=0.559539;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0265433;OID=.;OPOS=175443156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:10:16:18:17:10:16:18:17
chr4	175598280	.	A	G	819.68	PASS	AF=0.485549;AO=84;DP=174;FAO=84;FDP=173;FR=.;FRO=89;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=-0.00486564;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.894;QD=18.952;RBI=0.0288307;REFB=0.00314003;REVB=0.0284172;RO=86;SAF=55;SAR=29;SRF=44;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138187;STB=0.563097;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=-0.00328997;OID=.;OPOS=175598280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:173:86:89:84:84:0.485549:29:55:44:42:29:55:48:41
chr4	175598334	.	T	C	2098.31	PASS	AF=0.992593;AO=133;DP=135;FAO=134;FDP=135;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00540354;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.62;QD=62.1722;RBI=0.00541484;REFB=-0.124036;REVB=-0.000349566;RO=1;SAF=70;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00674226;STB=0.503496;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000177089;OID=.;OPOS=175598334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:135:135:1:1:133:134:0.992593:63:70:1:0:63:71:1:0
chr4	175688138	.	A	G	918.56	PASS	AF=0.955882;AO=65;DP=68;FAO=65;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00220958;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.086;QD=54.0329;RBI=0.0204894;REFB=-0.00561427;REVB=0.0203699;RO=3;SAF=29;SAR=36;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463917;STB=0.524583;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=3.72252e-05;OID=.;OPOS=175688138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:68:68:3:3:65:65:0.955882:36:29:3:0:36:29:3:0
chr4	175688141	.	G	A	271.86	PASS	AF=0.485294;AO=32;DP=67;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.06053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.393;QD=15.9917;RBI=0.0708638;REFB=-0.0603147;REVB=0.0368483;RO=35;SAF=16;SAR=16;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666523;STB=0.544457;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0487666;OID=.;OPOS=175688141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:35:35:32:33:0.485294:16:16:15:20:16:17:15:20
chr4	176555585	.	A	C	1008.26	PASS	AF=0.55814;AO=96;DP=172;FAO=96;FDP=172;FR=.;FRO=76;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=0.0095325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7915;QD=23.448;RBI=0.0202986;REFB=-0.018687;REVB=-0.0179211;RO=76;SAF=45;SAR=51;SRF=38;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253904;STB=0.513835;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0171741;OID=.;OPOS=176555585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:172:76:76:96:96:0.55814:51:45:38:38:51:45:38:38
chr4	177073026	.	G	A	765.62	PASS	AF=1;AO=47;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119629;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.054;QD=56.7124;RBI=0.0424691;REFB=0;REVB=0.0407494;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7135e-05;OID=.;OPOS=177073026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:47:54:1:26:21:0:0:26:28:0:0
chr4	177087322	.	C	T	727.07	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0379122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3133;QD=63.2234;RBI=0.037958;REFB=0;REVB=-0.00186346;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000226215;OID=.;OPOS=177087322;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:25:21:0:0:25:21:0:0
chr4	177113779	.	T	C	1165.59	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172463;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.119;QD=60.5503;RBI=0.0177243;REFB=0;REVB=-0.00408839;RO=0;SAF=45;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.99906e-06;OID=.;OPOS=177113779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:75:77:1:30:45:0:0:32:45:0:0
chr4	177113956	.	A	G	310.61	PASS	AF=0.333333;AO=40;DP=120;FAO=40;FDP=120;FR=.;FRO=80;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=0.102738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.26;QD=10.3537;RBI=0.105348;REFB=-0.0146814;REVB=-0.0233041;RO=80;SAF=18;SAR=22;SRF=44;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114955;STB=0.566412;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0268775;OID=.;OPOS=177113956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:80:80:40:40:0.333333:22:18:44:36:22:18:44:36
chr4	177137988	.	C	T	1042.95	PASS	AF=0.96;AO=71;DP=75;FAO=72;FDP=75;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0515244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7732;QD=55.624;RBI=0.0794869;REFB=0.0209531;REVB=-0.060526;RO=4;SAF=41;SAR=30;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178549;STB=0.503432;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=-0.013325;OID=.;OPOS=177137988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:75:75:4:3:71:72:0.96:30:41:3:1:30:42:2:1
chr4	177605081	.	CTCA	C	938.62	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=70;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0113365;FXX=0.042851;HRUN=1;LEN=3;MLLD=285.387;QD=56.0372;RBI=0.0113839;REFB=-0.0406644;REVB=0.00103766;RO=0;SAF=42;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35381e-08;STB=0.520827;STBP=0.087;TYPE=del;VARB=0.00115111;OID=.;OPOS=177605082;OREF=TCA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.970149:65:70:65:67:2:42:23:0:2:6:0:42:23:0:0
chr4	178102691	.	C	G	661.65	PASS	AF=0.571429;AO=64;DP=112;FAO=64;FDP=112;FR=.;FRO=48;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0119798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4616;QD=23.6303;RBI=0.0140139;REFB=0.0324687;REVB=-0.00727146;RO=48;SAF=40;SAR=24;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166279;STB=0.59088;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.0237338;OID=.;OPOS=178102691;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:48:48:64:64:0.571429:24:40:20:28:24:40:20:28
chr4	178274565	.	A	G	428.95	PASS	AF=0.512195;AO=42;DP=76;FAO=42;FDP=82;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=0.00627044;FXX=0.0238067;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.4998;QD=20.9242;RBI=0.055238;REFB=0.0184571;REVB=0.0548809;RO=34;SAF=19;SAR=23;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157157;STB=0.607298;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.0115188;OID=.;OPOS=178274565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:82:34:40:42:42:0.512195:23:19:22:12:23:19:27:13
chr4	178274694	.	T	G	182.79	PASS	AF=0.32;AO=24;DP=75;FAO=24;FDP=75;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.00471613;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=301.417;QD=9.74856;RBI=0.00492125;REFB=-0.0128594;REVB=0.001406;RO=49;SAF=17;SAR=7;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172491;STB=0.604816;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0234553;OID=.;OPOS=178274694;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:49:51:24:24:0.32:7:17:28:21:7:17:29:22
chr4	178274750	.	C	T	125.75	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0239758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.957;QD=10.7023;RBI=0.0248264;REFB=-0.00234325;REVB=0.006443;RO=31;SAF=10;SAR=5;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212036;STB=0.637494;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.00723529;OID=.;OPOS=178274750;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:31:32:15:15:0.319149:5:10:15:16:5:10:15:17
chr4	178274835	.	A	C	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0229741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0013;QD=18.8847;RBI=0.0529943;REFB=-0.0447505;REVB=0.0477555;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199671;STB=0.615111;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.033518;OID=.;OPOS=178274835;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:4:4:1:4:4:4:1:4
chr4	178281753	.	G	GA	877.15	PASS	AF=1;AO=10;DP=82;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394132;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.643;QD=43.8576;RBI=0.113141;REFB=0;REVB=-0.106054;RO=72;SAF=0;SAR=10;SRF=27;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.621711;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000360926;OID=.;OPOS=178281754;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:82:80:80:0:27:53:0:0:15:72:0:10:27:45
chr4	178281754	.	G	A	967.96	PASS	AF=0.865854;AO=71;DP=82;FAO=71;FDP=82;FR=.;FRO=11;FSAF=27;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=-0.00467248;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.808;QD=47.2173;RBI=0.0186747;REFB=-0.159294;REVB=0.0180807;RO=11;SAF=27;SAR=44;SRF=0;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104678;STB=0.55554;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00654873;OID=.;OPOS=178281754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:82:82:11:11:71:71:0.865854:44:27:0:11:44:27:0:11
chr4	178359960	.	G	C	1026.78	PASS	AF=1;AO=62;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3172;QD=59.5237;RBI=0.0876307;REFB=0;REVB=0.080031;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129101;OID=.;OPOS=178359960;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:62:69:1:26:36:0:0:33:36:0:0
chr4	178881982	.	G	T	246.2	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0195793;FXX=0.0232504;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.765;QD=23.4481;RBI=0.0343514;REFB=-0.0164357;REVB=-0.0282254;RO=18;SAF=20;SAR=3;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321177;STB=0.675495;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0234823;OID=.;OPOS=178881982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:18:19:23:23:0.547619:3:20:11:7:3:20:12:7
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chr4	183652175	.	T	C	2970.63	PASS	AF=0.9801;AO=194;DP=198;FAO=197;FDP=201;FR=.;FRO=4;FSAF=111;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0105791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.212;QD=59.117;RBI=0.0357961;REFB=-0.173382;REVB=0.0341971;RO=3;SAF=109;SAR=85;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165079;STB=0.511362;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.000405168;OID=.;OPOS=183652175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:198:201:3:4:194:197:0.9801:85:109:0:3:86:111:0:4
chr4	183674697	.	C	T	478.39	PASS	AF=0.460177;AO=52;DP=112;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=-0.0172637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.231;QD=16.934;RBI=0.0204488;REFB=-0.0129367;REVB=-0.0109599;RO=59;SAF=27;SAR=25;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139454;STB=0.576386;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0158542;OID=.;OPOS=183674697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:113:59:61:52:52:0.460177:25:27:22:37:25:27:23:38
chr4	183715019	.	C	T	115.07	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.000993749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1096;QD=19.1788;RBI=0.00377365;REFB=-0.00678837;REVB=-0.00364045;RO=11;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131312;STB=0.575046;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00635579;OID=.;OPOS=183715019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:5:8:5:6:5:8:5:6
chr4	184190233	.	G	T	420.16	PASS	AF=0.452632;AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.0138033;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9615;QD=17.6908;RBI=0.0393694;REFB=-0.0176613;REVB=-0.0368703;RO=50;SAF=26;SAR=17;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.05655;STB=0.517269;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0236358;OID=.;OPOS=184190233;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:50:52:43:43:0.452632:17:26:33:17:17:26:33:19
chr4	184203886	.	G	C	323.76	PASS	AF=0.492754;AO=33;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0171788;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4577;QD=18.7688;RBI=0.0615025;REFB=-0.0208324;REVB=0.0590546;RO=33;SAF=14;SAR=19;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188713;STB=0.622825;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0223788;OID=.;OPOS=184203886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:33:35:33:34:0.492754:19:14:21:12:20:14:23:12
chr4	184237192	.	CA	AC,CAC	1636.77	PASS	AF=0,1;AO=6,109;DP=128;FAO=0,123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=0,70;FSAR=0,53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174594,-0.0679787;FXX=0.0238076;HRUN=4,1;LEN=2,1;MLLD=7.81298,20.1225;QD=53.2283;RBI=0.059084,0.140449;REFB=0,0;REVB=0.0564454,0.122902;RO=5;SAF=4,59;SAR=2,50;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.333798,-0.0385411;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,ins;VARB=0.0321121,-0.00098384;OID=.,.;OPOS=184237192,184237194;OREF=CA,-;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,CAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:9:128:123:5:0:6,109:0,123:0,1:2,50:4,59:5:0:0,53:0,70:0:0
chr4	184238670	.	C	G	314.31	PASS	AF=0.465753;AO=33;DP=71;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.00377698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6093;QD=17.2225;RBI=0.0331985;REFB=-0.0127892;REVB=-0.0329829;RO=37;SAF=8;SAR=25;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23806;STB=0.61976;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.022417;OID=.;OPOS=184238670;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:73:37:39:33:34:0.465753:25:8:17:20:25:9:18:21
chr4	184243528	.	G	A	385.52	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.489;QD=55.0737;RBI=0.0317225;REFB=0;REVB=0.023129;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138423;OID=.;OPOS=184243528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:15:12:0:0:16:12:0:0
chr4	184366145	.	C	T	887.04	PASS	AF=0.570423;AO=81;DP=142;FAO=81;FDP=142;FR=.;FRO=61;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=39;FSRR=22;FWDB=0.0753066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9883;QD=24.987;RBI=0.117743;REFB=-0.0251057;REVB=0.0905118;RO=59;SAF=52;SAR=29;SRF=38;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00176319;STB=0.501228;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0206716;OID=.;OPOS=184366145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:59:61:81:81:0.570423:29:52:38:21:29:52:39:22
chr4	184367558	.	TCTG	T	66.91	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0227303;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=326.378;QD=12.745;RBI=0.0254246;REFB=-0.0117695;REVB=-0.0113906;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166665;STB=0.583135;STBP=0.58;TYPE=del;VARB=0.0136976;OID=.;OPOS=184367559;OREF=CTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.428571:9:21:9:21:12:2:7:4:8:66:11:2:7:4:7
chr4	184368714	.	T	C	264.56	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00420615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.559;QD=20.7497;RBI=0.0443729;REFB=-0.0166862;REVB=0.0441731;RO=24;SAF=19;SAR=8;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766186;STB=0.542825;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0220057;OID=.;OPOS=184368714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:8:19:15:9:8:19:15:9
chr4	184426387	.	C	T	1045.11	PASS	AF=0.50237;AO=104;DP=210;FAO=106;FDP=211;FR=.;FRO=105;FSAF=56;FSAR=50;FSRF=55;FSRR=50;FWDB=-0.0112203;FXX=0.00471676;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.911;QD=19.8125;RBI=0.011774;REFB=-0.0515591;REVB=0.00356809;RO=105;SAF=56;SAR=48;SRF=55;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0134565;STB=0.502242;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0507798;OID=.;OPOS=184426387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:211:105:105:104:106:0.50237:48:56:55:50:50:56:55:50
chr4	184560790	.	G	A	223.72	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=0.0130336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.261;QD=12.784;RBI=0.0263781;REFB=-0.0122985;REVB=0.0229331;RO=42;SAF=9;SAR=18;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347021;STB=0.703558;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0218396;OID=.;OPOS=184560790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:42:43:27:27:0.385714:18:9:28:14:18:9:29:14
chr4	184570649	.	CTTTTTTG	CTTTTTG,CTTTTTGT	100.85	PASS	AF=0.525,0;AO=15,3;DP=40;FAO=21,0;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=15,0;FSAR=6,0;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0457899,-0.104339;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=10.6239,16.8787;QD=10.0845;RBI=0.253039,0.107239;REFB=-0.0142603,0.00634711;REVB=0.248861,0.0247727;RO=19;SAF=12,3;SAR=3,0;SRF=10;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.316837,0.590079;STB=0.5999,0.5;STBP=0.222,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0457304,0;OID=.,.;OPOS=184570650,184570655;OREF=T,TG;OALT=-,GT;OMAPALT=CTTTTTG,CTTTTTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.525,0:15,3:40:21,0:40:19:15,0:6,0:10:9:93:19:12,3:3,0:10:9
chr4	184596850	.	A	G,T	954.76	PASS	AF=0.954545,0.0454545;AO=63,3;DP=66;FAO=63,3;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=42,3;FSAR=21,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00715263,-0.0155534;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=58.5298,123.63;QD=57.8641;RBI=0.00715286,0.0292722;REFB=0,0;REVB=-5.68326e-05,-0.0247982;RO=0;SAF=42,3;SAR=21,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0203726,0.096081;OID=.,.;OPOS=184596850,184596850;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:66:66:0:0:63,3:63,3:0.954545,0.0454545:21,0:42,3:0:0:21,0:42,3:0:0
chr4	184600571	.	C	A	250.76	PASS	AF=0.365854;AO=30;DP=82;FAO=30;FDP=82;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.00287716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.834;QD=12.2321;RBI=0.0348664;REFB=-0.0131235;REVB=-0.0347475;RO=52;SAF=19;SAR=11;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129624;STB=0.574739;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.025892;OID=.;OPOS=184600571;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:52:52:30:30:0.365854:11:19:27:25:11:19:27:25
chr4	184600601	.	A	G	1434.42	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.064;QD=63.0514;RBI=0.0151268;REFB=0;REVB=0.000127327;RO=0;SAF=46;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.85563e-05;OID=.;OPOS=184600601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:44:46:0:0:45:46:0:0
chr4	184614874	.	C	T	421.76	PASS	AF=0.462366;AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.00553544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.221;QD=18.1403;RBI=0.0389792;REFB=0.0110197;REVB=-0.0385842;RO=49;SAF=21;SAR=22;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118103;STB=0.559853;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.00961656;OID=.;OPOS=184614874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:49:50:43:43:0.462366:22:21:30:19:22:21:30:20
chr4	184931818	.	G	A	209.71	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0067015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.036;QD=18.6414;RBI=0.00670193;REFB=-0.0159284;REVB=7.56889e-05;RO=23;SAF=14;SAR=7;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257585;STB=0.656566;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0158873;OID=.;OPOS=184931818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:24:21:21:0.466667:7:14:9:14:7:14:9:15
chr4	185012398	.	T	C	186.97	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=37;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0158429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5937;QD=19.6809;RBI=0.0210302;REFB=-0.00699862;REVB=-0.0138301;RO=18;SAF=15;SAR=3;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273763;STB=0.6846;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00670781;OID=.;OPOS=185012398;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:18:19:18:19:0.5:3:15:11:7:3:16:11:8
chr4	185200094	.	G	A	72.93	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00541228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=306.84;QD=20.8379;RBI=0.0244063;REFB=-0.0324774;REVB=0.0237986;RO=5;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157607;STB=0.589973;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0124019;OID=.;OPOS=185200094;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:4:5:4:1:4:5:4:1
chr4	185310218	.	C	T	201.93	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0454246;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=116.616;QD=21.2561;RBI=0.0513067;REFB=0.00841531;REVB=-0.0238534;RO=18;SAF=8;SAR=12;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00976358;STB=0.505489;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=-0.0198022;OID=.;OPOS=185310218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:12:8:7:11:12:8:7:11
chr4	185549217	.	C	T	97.89	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00759474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0287;QD=13.5023;RBI=0.0433531;REFB=-0.00828332;REVB=-0.0426827;RO=17;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147429;STB=0.586067;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0120152;OID=.;OPOS=185549217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:6:6:11:6:6:6:11:6
chr4	185587165	.	A	G	1026.4	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.336;QD=59.5017;RBI=0.0616306;REFB=0;REVB=-0.00284162;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.87174e-05;OID=.;OPOS=185587165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:30:39:0:0:30:39:0:0
chr4	185622046	.	C	T	785.87	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0469;QD=62.8694;RBI=0.0212991;REFB=0;REVB=0.0180407;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000838798;OID=.;OPOS=185622046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:48:50:1:24:24:0:0:25:25:0:0
chr4	185652147	.	G	A	711.48	PASS	AF=0.962963;AO=53;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00944804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.006;QD=52.7019;RBI=0.00983222;REFB=0.0201668;REVB=0.00272157;RO=1;SAF=14;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324593;STB=0.5357;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=-0.000145568;OID=.;OPOS=185652147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:54:1:2:53:52:0.962963:39:14:1:0:39:13:2:0
chr4	185678110	.	A	G	567.59	PASS	AF=0.451128;AO=60;DP=133;FAO=60;FDP=133;FR=.;FRO=73;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=0.0321873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.083;QD=17.0705;RBI=0.0325147;REFB=-0.00787842;REVB=0.00460244;RO=73;SAF=33;SAR=27;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427217;STB=0.523802;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.00933162;OID=.;OPOS=185678110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:73:73:60:60:0.451128:27:33:37:36:27:33:37:36
chr4	185678118	.	C	G	1847.97	PASS	AF=1;AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204573;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2152;QD=61.5989;RBI=0.0845009;REFB=0;REVB=0.0819872;RO=0;SAF=64;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103488;OID=.;OPOS=185678118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:120:0:0:120:120:1:56:64:0:0:56:64:0:0
chr4	185686032	.	C	T	632.07	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.45;QD=61.6649;RBI=0.149407;REFB=0;REVB=0.148849;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000934827;OID=.;OPOS=185686032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr4	185687863	.	A	G	382.2	PASS	AF=0.506494;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.012663;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.291;QD=19.8547;RBI=0.0762923;REFB=-6.75602e-07;REVB=-0.0752341;RO=38;SAF=17;SAR=22;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574318;STB=0.531884;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=-0.000147287;OID=.;OPOS=185687863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:38:38:39:39:0.506494:22:17:19:19:22:17:19:19
chr4	185940952	.	C	G	455.49	PASS	AF=0.475248;AO=48;DP=101;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=16;FWDB=0.0203639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.0832;QD=18.0394;RBI=0.0241931;REFB=-0.000666099;REVB=-0.0130621;RO=53;SAF=26;SAR=22;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151324;STB=0.583791;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.000471187;OID=.;OPOS=185940952;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:53:53:48:48:0.475248:22:26:37:16:22:26:37:16
chr4	185940991	.	GAAAAA	GAAAA,GAAAAG	503.63	PASS	AF=0.873016,0.126984;AO=33,9;DP=66;FAO=55,8;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31,8;FSAR=24,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.352746,0.0927198;FXX=0.0454477;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=10.6511,11.5861;QD=31.9766;RBI=0.524461,0.172433;REFB=-0.0226314,-0.0304727;REVB=0.388111,0.145382;RO=16;SAF=20,8;SAR=13,1;SRF=10;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0.329412,0;SSSB=-0.0118997,0.407633;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0466371,-0.101784;OID=.,.;OPOS=185940992,185940996;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=GAAAA,GAAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.873016,0.126984:33,9:66:55,8:63:0:31,8:24,0:0:0:36:16:20,8:13,1:10:6
chr4	186091487	.	G	A	223.09	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00247527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.548;QD=16.5251;RBI=0.00982545;REFB=-0.034133;REVB=-0.00950855;RO=29;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0632598;STB=0.535686;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.027116;OID=.;OPOS=186091487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:13:12:12:17:13:12:12:17
chr4	186097045	.	C	T	289.97	PASS	AF=0.457143;AO=31;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.00368756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.154;QD=16.5695;RBI=0.0165827;REFB=-0.00444528;REVB=-0.0161675;RO=34;SAF=20;SAR=11;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140779;STB=0.559962;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.00448571;OID=.;OPOS=186097045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:34:38:31:32:0.457143:11:20:17:17:11:21:21:17
chr4	186111639	.	T	C	326.0	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0103219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.194;QD=17.3869;RBI=0.0134343;REFB=-0.00544678;REVB=0.00859881;RO=40;SAF=18;SAR=17;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108642;STB=0.560756;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0120182;OID=.;OPOS=186111639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:40:35:35:0.466667:17:18:16:24:17:18:16:24
chr4	186112111	.	G	A	103.51	PASS	AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.00148639;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=286.747;QD=9.85817;RBI=0.0318901;REFB=-0.00766277;REVB=0.0318555;RO=29;SAF=6;SAR=7;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338958;STB=0.699733;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.026668;OID=.;OPOS=186112111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:29:29:13:13:0.309524:7:6:22:7:7:6:22:7
chr4	186320880	.	A	G	175.72	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0102875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.074;QD=11.9131;RBI=0.012769;REFB=-0.00502152;REVB=-0.00756405;RO=37;SAF=12;SAR=10;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639372;STB=0.537003;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=0.00772361;OID=.;OPOS=186320880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:10:12:18:19:10:12:18:19
chr4	186320906	.	C	G	155.86	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00472825;FXX=0.040808;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.522;QD=13.2644;RBI=0.00713637;REFB=-0.00866501;REVB=-0.00534522;RO=29;SAF=10;SAR=7;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186854;STB=0.598388;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.022843;OID=.;OPOS=186320906;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:29:30:17:17:0.361702:7:10:12:17:7:10:13:17
chr4	186339584	.	A	G	459.82	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.584;QD=57.477;RBI=0.0234597;REFB=0;REVB=0.0208719;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.29919e-05;OID=.;OPOS=186339584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:15:17:0:0:15:17:0:0
chr4	186347055	.	G	A	63.02	PASS	AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0105337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.342;QD=8.402;RBI=0.0129148;REFB=-0.00183486;REVB=-0.00747211;RO=21;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302029;STB=0.683085;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0027262;OID=.;OPOS=186347055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:4:5:6:15:4:5:6:15
chr4	186357523	.	C	G	660.12	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00965203;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.844;QD=62.8684;RBI=0.00980639;REFB=0;REVB=-0.00173308;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140535;OID=.;OPOS=186357523;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr4	186361876	.	A	G	545.23	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.036269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.587;QD=57.393;RBI=0.0365587;REFB=-0.0242982;REVB=0.00459342;RO=1;SAF=18;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253062;STB=0.513506;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=3.92185e-05;OID=.;OPOS=186361876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:19:18:1:0:19:18:1:0
chr4	186379371	.	G	A	1434.41	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0440851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.752;QD=63.0511;RBI=0.0446381;REFB=0;REVB=-0.00700415;RO=0;SAF=46;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000308778;OID=.;OPOS=186379371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:45:46:0:0:45:46:0:0
chr4	186379735	.	T	C	152.9	PASS	AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00577228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.702;QD=11.9925;RBI=0.0152891;REFB=-0.017797;REVB=0.0141576;RO=32;SAF=8;SAR=10;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609951;STB=0.545801;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0194083;OID=.;OPOS=186379735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:33:18:18:0.352941:10:8:16:16:10:8:17:16
chr4	186380709	.	A	AT	70.03	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0049511;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=137.527;QD=8.75405;RBI=0.0378795;REFB=-0.00324126;REVB=-0.0375545;RO=21;SAF=1;SAR=10;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.428005;STB=0.768609;STBP=0.072;TYPE=ins;VARB=0.0978699;OID=.;OPOS=186380710;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.34375:11:32:11:32:21:1:10:7:14:70:21:1:10:7:14
chr4	186381053	.	GA	AG,G,GT	140.37	PASS	AF=0,0.510638,0;AO=2,17,4;DP=47;FAO=0,24,0;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=0,20,0;FSAR=0,4,0;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.00473213,0.0191003,-0.0564162;FXX=0;HRUN=1,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=17.6874,12.3538,40.2771;QD=11.9466;RBI=0.0647574,0.0752223,0.0622877;REFB=-0.00690022,-0.0488994,-0.0305466;REVB=-0.0645842,0.072757,0.0264002;RO=21;SAF=0,14,4;SAR=2,3,0;SRF=5;SRR=16;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.413622,0.563639,0.744472;STB=0.5,0.801259,0.5;STBP=1,0.001,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,0.073027,-0.000345037;OID=.,.,.;OPOS=186381053,186381054,186381054;OREF=GA,A,A;OALT=AG,-,T;OMAPALT=AG,G,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:47:47:21:23:2,17,4:0,24,0:0,0.510638,0:2,3,0:0,14,4:5:16:0,4,0:0,20,0:6:17
chr4	186391868	.	T	C	291.02	PASS	AF=0.407407;AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0273802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.751;QD=14.3715;RBI=0.0317759;REFB=-0.0199537;REVB=-0.0161256;RO=48;SAF=17;SAR=16;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102598;STB=0.558174;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0421792;OID=.;OPOS=186391868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:48:48:33:33:0.407407:16:17:20:28:16:17:20:28
chr4	186391898	.	C	T	221.94	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0144162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.788;QD=14.5531;RBI=0.0144172;REFB=-0.02559;REVB=0.000166731;RO=35;SAF=12;SAR=14;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0923944;STB=0.55239;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0257425;OID=.;OPOS=186391898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:14:12:13:22:14:12:13:22
chr4	186393372	.	T	C	173.44	PASS	AF=0.392857;AO=21;DP=55;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00846961;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.5823;QD=12.3884;RBI=0.0271427;REFB=-0.0027606;REVB=0.0257874;RO=34;SAF=12;SAR=9;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138864;STB=0.56305;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=-0.000139347;OID=.;OPOS=186393372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:34:34:21:22:0.392857:9:12:15:19:10:12:15:19
chr4	186423637	.	G	A	315.66	PASS	AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0344839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9803;QD=22.5468;RBI=0.0346478;REFB=-0.0292929;REVB=0.0033659;RO=24;SAF=8;SAR=24;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28784;STB=0.659893;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0203602;OID=.;OPOS=186423637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:24:24:32:32:0.571429:24:8:14:10:24:8:14:10
chr4	186507298	.	AAT	A	259.14	PASS	AF=0.96;AO=22;DP=26;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0367047;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=2;MLLD=170.174;QD=41.4617;RBI=0.0553332;REFB=-0.0209586;REVB=0.0414068;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.538428;STBP=0.158;TYPE=del;VARB=0.00261015;OID=.;OPOS=186507299;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.96:22:26:24:25:1:18:6:0:1:4:0:16:6:0:0
chr4	186528433	.	T	C	639.18	PASS	AF=0.976744;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00948776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.593;QD=59.4588;RBI=0.0245246;REFB=-0.0298574;REVB=-0.0226151;RO=0;SAF=31;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.09277e-08;STB=0.507689;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.000718237;OID=.;OPOS=186528433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:43:0:1:41:42:0.976744:10:31:0:0:10:32:1:0
chr4	186544435	.	C	T	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00552984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.829;QD=13.4413;RBI=0.0196503;REFB=-0.000724847;REVB=-0.0188562;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154027;STB=0.509073;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.000162555;OID=.;OPOS=186544435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:4:6:8:5:4:6:8:5
chr4	187004216	.	TC	T,TT	431.07	PASS	AF=0.0645161,0.935484;AO=7,24;DP=32;FAO=2,29;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=0,20;FSAR=2,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00998743,0.00674939;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=38.1714,46.649;QD=55.6217;RBI=0.0386972,0.0469258;REFB=0,0;REVB=0.0373861,0.0464378;RO=0;SAF=3,16;SAR=4,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0348084,0.0116924;OID=.,.;OPOS=187004217,187004217;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0645161,0.935484:7,24:32:2,29:31:0:0,20:2,9:0:0:9:0:3,16:4,8:0:0
chr4	187074833	.	A	G	1510.93	PASS	AF=0.982143;AO=83;DP=112;FAO=110;FDP=112;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0125928;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.289;QD=53.9618;RBI=0.0502589;REFB=-0.149317;REVB=0.0486557;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.508332;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00389303;OID=.;OPOS=187074833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:112:112:0:2:83:110:0.982143:38:45:0:0:59:51:0:2
chr4	187077206	.	A	G	1621.55	PASS	AF=1;AO=106;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144924;FXX=0.0270246;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.523;QD=60.0573;RBI=0.0219029;REFB=0;REVB=-0.0164228;RO=0;SAF=54;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.39375e-05;OID=.;OPOS=187077206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:108:0:0:106:108:1:52:54:0:0:53:55:0:0
chr4	187078785	.	A	G	3110.68	PASS	AF=1;AO=200;DP=201;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=113;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.312;QD=61.5977;RBI=0.0599545;REFB=0;REVB=0.0465332;RO=0;SAF=111;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28467e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71069e-05;OID=.;OPOS=187078785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:201:202:0:0:200:202:1:89:111:0:0:89:113:0:0
chr4	187078819	.	C	G	2469.38	PASS	AF=1;AO=142;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=80;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.14114;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.5285;QD=60.9723;RBI=0.146615;REFB=0;REVB=0.039692;RO=0;SAF=64;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.22027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000666482;OID=.;OPOS=187078819;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:162:162:0:0:142:162:1:78:64:0:0:82:80:0:0
chr4	187120211	.	C	A	106.86	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.065821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.489;QD=12.2122;RBI=0.0665029;REFB=-0.0199462;REVB=-0.00949894;RO=22;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767043;STB=0.545384;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0156669;OID=.;OPOS=187120211;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:8:5:10:12:8:5:10:12
chr4	187122319	.	T	G	352.45	PASS	AF=0.480519;AO=36;DP=76;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.00387709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3085;QD=18.3093;RBI=0.00581984;REFB=-0.00255418;REVB=-0.00434035;RO=40;SAF=24;SAR=12;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175209;STB=0.50077;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.00193658;OID=.;OPOS=187122319;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:40:40:36:37:0.480519:12:24:26:14:13:24:26:14
chr4	187122355	.	T	C	530.55	PASS	AF=0.524272;AO=54;DP=102;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=0.0111298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.303;QD=20.604;RBI=0.0111827;REFB=-0.022703;REVB=-0.00108659;RO=48;SAF=34;SAR=20;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149205;STB=0.501543;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0204266;OID=.;OPOS=187122355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:48:49:54:54:0.524272:20:34:31:17:20:34:31:18
chr4	187133576	.	A	C	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.493;QD=57.5438;RBI=0.0506793;REFB=0;REVB=0.0383413;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013941;OID=.;OPOS=187133576;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:24:34:0:0:24:34:0:0
chr4	187158034	.	G	A	1025.88	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00540027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0388;QD=59.4714;RBI=0.0517655;REFB=0;REVB=-0.051483;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000288668;OID=.;OPOS=187158034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:33:35:0:0:33:36:0:0
chr4	187171427	.	C	A	486.02	PASS	AF=0.567901;AO=46;DP=81;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00941831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.132;QD=24.0011;RBI=0.0129768;REFB=-0.0233621;REVB=0.00892703;RO=35;SAF=19;SAR=27;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125455;STB=0.568852;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0175517;OID=.;OPOS=187171427;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:35:35:46:46:0.567901:27:19:20:15:27:19:20:15
chr4	187178473	.	G	A	1209.08	PASS	AF=0.524444;AO=118;DP=225;FAO=118;FDP=225;FR=.;FRO=107;FSAF=55;FSAR=63;FSRF=55;FSRR=52;FWDB=-0.0799411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.173;QD=21.4947;RBI=0.0803827;REFB=-0.0104558;REVB=-0.00841441;RO=107;SAF=55;SAR=63;SRF=55;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417322;STB=0.522818;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.00835224;OID=.;OPOS=187178473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:225:225:107:107:118:118:0.524444:63:55:55:52:63:55:55:52
chr4	187179210	.	T	C	781.29	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0754;QD=62.5035;RBI=0.0190287;REFB=0;REVB=-0.00097374;RO=0;SAF=12;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00711925;OID=.;OPOS=187179210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:50:0:0:48:50:1:36:12:0:0:36:14:0:0
chr4	187509861	.	G	C	213.45	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=0.0396119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.8638;QD=16.1096;RBI=0.0524746;REFB=-0.020605;REVB=-0.0344163;RO=29;SAF=13;SAR=11;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221286;STB=0.624707;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0297444;OID=.;OPOS=187509861;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:11:13:9:20:11:13:9:20
chr4	187510280	.	G	A	54.0	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0197246;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.849;QD=8.30758;RBI=0.0234804;REFB=-0.0154365;REVB=0.0127385;RO=18;SAF=5;SAR=3;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121057;STB=0.574292;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0335942;OID=.;OPOS=187510280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:18:18:8:8:0.307692:3:5:13:5:3:5:13:5
chr4	187516880	.	A	G	459.82	PASS	AF=0.666667;AO=42;DP=64;FAO=42;FDP=63;FR=.;FRO=21;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00586953;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.878;QD=29.1951;RBI=0.0333246;REFB=-0.0367378;REVB=0.0328036;RO=22;SAF=26;SAR=16;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106971;STB=0.549272;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.017754;OID=.;OPOS=187516880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:22:21:42:42:0.666667:16:26:10:12:16:26:10:11
chr4	187517758	.	G	A	310.77	PASS	AF=0.584906;AO=31;DP=53;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0112771;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.265;QD=23.4544;RBI=0.0299112;REFB=-0.00777844;REVB=0.0277039;RO=19;SAF=19;SAR=12;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052715;STB=0.551149;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.00346631;OID=.;OPOS=187517758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:19:22:31:31:0.584906:12:19:13:6:12:19:16:6
chr4	187519206	.	C	G	1474.24	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00877328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.056;QD=63.4083;RBI=0.0573835;REFB=0;REVB=0.0567088;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.81189e-05;OID=.;OPOS=187519206;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:93:0:0:89:93:1:45:44:0:0:48:45:0:0
chr4	187522528	.	C	T	317.01	PASS	AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.02993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.441;QD=17.8595;RBI=0.030088;REFB=-0.0279836;REVB=-0.00307859;RO=37;SAF=20;SAR=14;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197908;STB=0.511067;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0238138;OID=.;OPOS=187522528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:37:37:34:34:0.478873:14:20:21:16:14:20:21:16
chr4	187525020	.	A	C	87.46	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0449788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.933;QD=13.4552;RBI=0.0462955;REFB=0.000591754;REVB=0.0109625;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166702;STB=0.611322;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.000304203;OID=.;OPOS=187525020;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:14:15:11:11:0.423077:5:6:10:4:5:6:11:4
chr4	187531022	.	A	G	369.52	PASS	AF=0.448276;AO=39;DP=87;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=-0.00125831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.889;QD=16.9893;RBI=0.0458797;REFB=-0.00873095;REVB=0.0458624;RO=48;SAF=25;SAR=14;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738169;STB=0.541264;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0157091;OID=.;OPOS=187531022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:48:48:39:39:0.448276:14:25:34:14:14:25:34:14
chr4	187534363	.	G	A	508.93	PASS	AF=0.509434;AO=53;DP=105;FAO=54;FDP=106;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.022271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.466;QD=19.205;RBI=0.0224442;REFB=-0.00495307;REVB=0.00278319;RO=47;SAF=22;SAR=31;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00915813;STB=0.508194;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00485168;OID=.;OPOS=187534363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:47:52:53:54:0.509434:31:22:20:27:31:23:23:29
chr4	187538942	.	T	G	870.3	PASS	AF=0.533742;AO=86;DP=164;FAO=87;FDP=163;FR=.;FRO=76;FSAF=56;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=0.00637717;FXX=0.00609719;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2644;QD=21.357;RBI=0.0152064;REFB=-0.00314267;REVB=-0.0138046;RO=64;SAF=56;SAR=30;SRF=30;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149309;STB=0.570063;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00121635;OID=.;OPOS=187538942;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:163:64:76:86:87:0.533742:30:56:30:34:31:56:38:38
chr4	187542755	.	T	C	265.44	PASS	AF=0.3875;AO=31;DP=80;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.00942819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.461;QD=13.2719;RBI=0.0179827;REFB=-0.0263382;REVB=0.0153129;RO=49;SAF=16;SAR=15;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0718647;STB=0.541036;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0363402;OID=.;OPOS=187542755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:49:49:31:31:0.3875:15:16:22:27:15:16:22:27
chr4	187557893	.	T	C	897.85	PASS	AF=0.557692;AO=87;DP=156;FAO=87;FDP=156;FR=.;FRO=69;FSAF=54;FSAR=33;FSRF=23;FSRR=46;FWDB=0.00894601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6911;QD=23.0217;RBI=0.0350002;REFB=-0.0310529;REVB=0.0338376;RO=69;SAF=54;SAR=33;SRF=23;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232364;STB=0.626679;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0222004;OID=.;OPOS=187557893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:156:69:69:87:87:0.557692:33:54:23:46:33:54:23:46
chr4	187627792	.	T	C	542.45	PASS	AF=1;AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387905;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.209;QD=60.2724;RBI=0.0412627;REFB=0;REVB=-0.0140678;RO=0;SAF=7;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000565158;OID=.;OPOS=187627792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:35:36:1:28:7:0:0:28:8:0:0
chr4	187628398	.	C	G	1011.73	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00552444;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.44;QD=59.5136;RBI=0.031197;REFB=0;REVB=0.030704;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.76886e-05;OID=.;OPOS=187628398;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:38:30:0:0:38:30:0:0
chr4	187629140	.	G	C	817.62	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00626356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4342;QD=57.3771;RBI=0.0162102;REFB=0;REVB=0.0149512;RO=0;SAF=33;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103157;OID=.;OPOS=187629140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:24:33:0:0:24:33:0:0
chr4	187630590	.	G	A	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.847;QD=62.6703;RBI=0.0111762;REFB=0;REVB=0.00364505;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.49064e-05;OID=.;OPOS=187630590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr4	188924979	.	C	T	272.85	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.056;QD=51.9719;RBI=0.0134414;REFB=0;REVB=-4.1634e-05;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.05692e-05;OID=.;OPOS=188924979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:21:0:0:19:21:1:13:6:0:0:14:7:0:0
chr4	188925176	.	T	TGAC	789.29	PASS	AF=1;AO=54;DP=58;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127676;FXX=0.0517152;HRUN=0;LEN=3;MLLD=319.158;QD=57.4028;RBI=0.0153078;REFB=0;REVB=-0.00844498;RO=1;SAF=20;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229779;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000141284;OID=.;OPOS=188925177;OREF=-;OALT=GAC;OMAPALT=TGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:54:58:55:55:0:21:34:0:0:4:1:20:34:1:0
chr4	189012728	.	G	C	1534.6	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00251176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.888;QD=59.5962;RBI=0.00363775;REFB=0;REVB=0.0026314;RO=0;SAF=58;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.1169e-06;OID=.;OPOS=189012728;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:101:103:0:0:101:103:1:43:58:0:0:44:59:0:0
chr4	189012809	.	C	T	1048.12	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0201757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.6735;QD=58.2291;RBI=0.0267;REFB=-0.0977262;REVB=0.017488;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.506665;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-4.44245e-05;OID=.;OPOS=189012809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:0:1:71:71:0.986111:34:37:0:0:34:37:1:0
chr4	189022324	.	C	T	1406.78	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.843;QD=62.5236;RBI=0.0225829;REFB=0;REVB=0.0106513;RO=0;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51082e-05;OID=.;OPOS=189022324;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:90:0:0:88:90:1:42:46:0:0:43:47:0:0
chr4	189042746	.	T	C	242.15	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.0241657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.142;QD=16.9928;RBI=0.0245146;REFB=-0.0178195;REVB=0.0041213;RO=30;SAF=8;SAR=19;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759062;STB=0.542824;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0243477;OID=.;OPOS=189042746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:19:8:11:19:19:8:11:19
chr4	189060983	.	G	C	173.07	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0969707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5229;QD=18.7097;RBI=0.106394;REFB=-0.0174707;REVB=-0.0437774;RO=19;SAF=13;SAR=5;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197068;STB=0.612662;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0190543;OID=.;OPOS=189060983;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:5:13:10:9:5:13:10:9
chr4	190630778	.	GC	AT	1392.27	PASS	AF=0.598131;AO=125;DP=218;FAO=128;FDP=214;FR=.;FRO=86;FSAF=81;FSAR=47;FSRF=60;FSRR=26;FWDB=-0.00903911;FXX=0.02283;HRUN=1;LEN=2;MLLD=125.891;QD=26.0237;RBI=0.0117692;REFB=-0.0499717;REVB=-0.00753716;RO=77;SAF=80;SAR=45;SRF=57;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787963;STB=0.528465;STBP=0.331;TYPE=mnp;VARB=0.0272692;OID=.;OPOS=190630778;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:218:214:77:86:125:128:0.598131:45:80:57:20:47:81:60:26
chr4	190630786	.	A	G	1571.19	PASS	AF=0.577236;AO=142;DP=245;FAO=142;FDP=246;FR=.;FRO=104;FSAF=89;FSAR=53;FSRF=71;FSRR=33;FWDB=0.0142039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.85;QD=25.5478;RBI=0.022723;REFB=-0.0266854;REVB=-0.0177365;RO=103;SAF=89;SAR=53;SRF=71;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526696;STB=0.525595;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0221619;OID=.;OPOS=190630786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:245:246:103:104:142:142:0.577236:53:89:71:32:53:89:71:33
chr4	190630805	.	G	C	96.64	PASS	AF=0.104651;AO=27;DP=255;FAO=27;FDP=258;FR=.;FRO=231;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=147;FSRR=84;FWDB=-0.0318965;FXX=0.00386085;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4111;QD=1.49836;RBI=0.0587583;REFB=-0.00355132;REVB=0.0493472;RO=228;SAF=14;SAR=13;SRF=144;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141927;STB=0.606416;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0419178;OID=.;OPOS=190630805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:255:258:228:231:27:27:0.104651:13:14:144:84:13:14:147:84
chr4	190815066	.	CA	C,CG	54.61	PASS	AF=1,0;AO=4,2;DP=7;FAO=6,0;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2,0;FSAR=4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436818,0.112911;FXX=0.142653;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=78.8563,70.2826;QD=36.4097;RBI=0.0534237,0.129259;REFB=0,0;REVB=-0.0307569,-0.0629218;RO=0;SAF=1,0;SAR=3,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000655934,0;OID=.,.;OPOS=190815067,190815067;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:4,2:7:6,0:6:0:2,0:4,0:0:0:3:0:1,0:3,2:0:0
chr4	190874206	.	T	A	297.84	PASS	AF=0.289855;AO=38;DP=136;FAO=40;FDP=138;FR=.;FRO=98;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=54;FSRR=44;FWDB=0.00147473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.476;QD=8.63299;RBI=0.00863655;REFB=0.00425589;REVB=-0.00850971;RO=97;SAF=20;SAR=18;SRF=53;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245022;STB=0.51855;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=-0.00737769;OID=.;OPOS=190874206;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:138:97:98:38:40:0.289855:18:20:53:44:19:21:54:44
chr4	190874234	.	C	T	363.22	PASS	AF=0.30625;AO=49;DP=160;FAO=49;FDP=160;FR=.;FRO=111;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=61;FSRR=50;FWDB=-0.00646879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.89;QD=9.08044;RBI=0.00964499;REFB=-0.0129176;REVB=-0.00715406;RO=111;SAF=26;SAR=23;SRF=61;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226811;STB=0.513203;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0280533;OID=.;OPOS=190874234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:160:111:111:49:49:0.30625:23:26:61:50:23:26:61:50
chr4	190874255	.	A	T	35.95	PASS	AF=0.0760234;AO=12;DP=170;FAO=13;FDP=171;FR=.;FRO=158;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=89;FSRR=69;FWDB=-0.00890725;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.8;QD=0.840977;RBI=0.0136235;REFB=-0.00193455;REVB=-0.0103083;RO=157;SAF=5;SAR=7;SRF=89;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162445;STB=0.59308;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0281737;OID=.;OPOS=190874255;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:170:171:157:158:12:13:0.0760234:7:5:89:68:7:6:89:69
chr4	190874256	.	C	T	43.03	PASS	AF=0.0813953;AO=14;DP=172;FAO=14;FDP=172;FR=.;FRO=158;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=85;FSRR=73;FWDB=-0.0137217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.775;QD=1.00065;RBI=0.0325209;REFB=0.000218867;REVB=-0.0294843;RO=156;SAF=11;SAR=3;SRF=84;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295685;STB=0.743405;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.00355553;OID=.;OPOS=190874256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:172:172:156:158:14:14:0.0813953:3:11:84:72:3:11:85:73
chr4	190874290	.	T	A	77.65	PASS	AF=0.111732;AO=20;DP=179;FAO=20;FDP=179;FR=.;FRO=159;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=87;FSRR=72;FWDB=0.0168478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.69;QD=1.73513;RBI=0.032475;REFB=-0.000438287;REVB=0.0277629;RO=158;SAF=12;SAR=8;SRF=87;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0618338;STB=0.547897;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.00353687;OID=.;OPOS=190874290;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:179:179:158:159:20:20:0.111732:8:12:87:71:8:12:87:72
chr4	190876192	.	A	C	54.49	PASS	AF=0.112069;AO=13;DP=113;FAO=13;FDP=116;FR=.;FRO=103;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=63;FSRR=40;FWDB=-0.0238637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.609;QD=1.87908;RBI=0.0286311;REFB=-0.00262681;REVB=0.0158197;RO=100;SAF=9;SAR=4;SRF=60;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121004;STB=0.578821;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0332471;OID=.;OPOS=190876192;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:113:116:100:103:13:13:0.112069:4:9:60:40:4:9:63:40
chr4	190876195	.	C	T	243.32	PASS	AF=0.288136;AO=34;DP=118;FAO=34;FDP=118;FR=.;FRO=84;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=53;FSRR=31;FWDB=-0.018354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.96;QD=8.24803;RBI=0.038823;REFB=-0.00223043;REVB=-0.0342104;RO=84;SAF=21;SAR=13;SRF=53;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170639;STB=0.510068;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.00569266;OID=.;OPOS=190876195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:84:84:34:34:0.288136:13:21:53:31:13:21:53:31
chr4	190876196	.	G	A	67.25	PASS	AF=0.127119;AO=15;DP=118;FAO=15;FDP=118;FR=.;FRO=103;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=66;FSRR=37;FWDB=-0.00508556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.783;QD=2.27956;RBI=0.0271808;REFB=0.000732955;REVB=-0.0267008;RO=100;SAF=8;SAR=7;SRF=63;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123173;STB=0.595281;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=-0.00400432;OID=.;OPOS=190876196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:118:118:100:103:15:15:0.127119:7:8:63:37:7:8:66:37
chr4	190876204	.	G	A	494.38	PASS	AF=0.485981;AO=49;DP=115;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=-0.0226825;FXX=0.0932124;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9196;QD=18.4815;RBI=0.0518822;REFB=-0.0156524;REVB=0.0466611;RO=55;SAF=31;SAR=18;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330242;STB=0.508318;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0168079;OID=.;OPOS=190876204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:107:55:55:49:52:0.485981:18:31:33:22:20:32:33:22
chr4	190876242	.	G	A	1026.69	PASS	AF=0.656716;AO=88;DP=134;FAO=88;FDP=134;FR=.;FRO=46;FSAF=60;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.01057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9389;QD=30.6474;RBI=0.0599852;REFB=-0.0130052;REVB=-0.0590466;RO=45;SAF=60;SAR=28;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423504;STB=0.528324;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00725026;OID=.;OPOS=190876242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:45:46:88:88:0.656716:28:60:28:17:28:60:28:18
chr4	190876256	.	C	T	81.85	PASS	AF=0.131387;AO=18;DP=140;FAO=18;FDP=137;FR=.;FRO=119;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=77;FSRR=42;FWDB=-0.0787925;FXX=0.0283668;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.24;QD=2.38989;RBI=0.0793585;REFB=-0.00447489;REVB=-0.00946128;RO=119;SAF=14;SAR=4;SRF=77;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194662;STB=0.638721;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0454802;OID=.;OPOS=190876256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:140:137:119:119:18:18:0.131387:4:14:77:42:4:14:77:42
chr4	190876263	.	A	T	46.69	PASS	AF=0.0942029;AO=13;DP=138;FAO=13;FDP=138;FR=.;FRO=125;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=84;FSRR=41;FWDB=-0.0166392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.115;QD=1.35332;RBI=0.029958;REFB=-0.00213873;REVB=-0.0249123;RO=125;SAF=7;SAR=6;SRF=84;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165097;STB=0.623825;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0227632;OID=.;OPOS=190876263;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:138:138:125:125:13:13:0.0942029:6:7:84:41:6:7:84:41
chr4	190876278	.	G	A	67.1	PASS	AF=0.117647;AO=17;DP=136;FAO=16;FDP=136;FR=.;FRO=120;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=77;FSRR=43;FWDB=-0.0211416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.076;QD=1.97352;RBI=0.0238753;REFB=-0.00529197;REVB=-0.0110934;RO=118;SAF=13;SAR=4;SRF=75;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186469;STB=0.612893;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0359632;OID=.;OPOS=190876278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:136:136:118:120:17:16:0.117647:4:13:75:43:4:12:77:43
chr4	190876293	.	C	A	77.2	PASS	AF=0.132812;AO=17;DP=128;FAO=17;FDP=128;FR=.;FRO=111;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=69;FSRR=42;FWDB=-0.0503217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5125;QD=2.4124;RBI=0.0719061;REFB=0.00391709;REVB=-0.0513636;RO=110;SAF=13;SAR=4;SRF=68;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209394;STB=0.645603;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=-0.0328875;OID=.;OPOS=190876293;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:128:128:110:111:17:17:0.132812:4:13:68:42:4:13:69:42
chr4	190878563	.	C	A	30.82	PASS	AF=0.0888889;AO=8;DP=90;FAO=8;FDP=90;FR=.;FRO=82;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=-0.0223106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0275;QD=1.3697;RBI=0.0301911;REFB=-0.00390977;REVB=-0.0203406;RO=79;SAF=3;SAR=5;SRF=45;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218853;STB=0.665359;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0427967;OID=.;OPOS=190878563;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:90:90:79:82:8:8:0.0888889:5:3:45:34:5:3:46:36
chr4	190878597	.	C	T	161.27	PASS	AF=0.234234;AO=25;DP=110;FAO=26;FDP=111;FR=.;FRO=85;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=46;FWDB=-0.0383052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.751;QD=5.81163;RBI=0.0422767;REFB=-0.0151248;REVB=-0.0178896;RO=84;SAF=12;SAR=13;SRF=39;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197365;STB=0.50209;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.050251;OID=.;OPOS=190878597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:84:85:25:26:0.234234:13:12:39:45:14:12:39:46
chr4	190878654	.	C	G	69.02	PASS	AF=0.134615;AO=14;DP=103;FAO=14;FDP=104;FR=.;FRO=90;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=51;FWDB=-0.0798236;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9204;QD=2.65474;RBI=0.106605;REFB=-0.00981864;REVB=-0.0706594;RO=89;SAF=3;SAR=11;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.303819;STB=0.712634;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.080037;OID=.;OPOS=190878654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:103:104:89:90:14:14:0.134615:11:3:39:50:11:3:39:51
chr4	190906025	.	G	A	228.45	PASS	AF=0.282051;AO=32;DP=114;FAO=33;FDP=117;FR=.;FRO=84;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=59;FSRR=25;FWDB=-0.0383244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.418;QD=7.81031;RBI=0.0386392;REFB=-0.021448;REVB=0.00492241;RO=82;SAF=24;SAR=8;SRF=58;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0658825;STB=0.522059;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0502992;OID=.;OPOS=190906025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:117:82:84:32:33:0.282051:8:24:58:24:9:24:59:25
chr5	163259	.	GA	G,GC	207.57	PASS	AF=0.0588235,0.941176;AO=3,14;DP=17;FAO=1,16;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=1,8;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0927512,0.0938652;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=189.905,206.465;QD=48.8402;RBI=0.0980554,0.0983458;REFB=0,0;REVB=0.0318133,0.0293465;RO=0;SAF=3,6;SAR=0,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00149396,0.00211604;OID=.,.;OPOS=163260,163260;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0588235,0.941176:3,14:17:1,16:17:0:1,8:0,8:0:0:4:0:3,6:0,8:0:0
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chr5	367969	.	G	A	415.38	PASS	AF=0.419643;AO=47;DP=112;FAO=47;FDP=112;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=45;FSRR=20;FWDB=0.0152928;FXX=0.0175423;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.815;QD=14.835;RBI=0.0220714;REFB=-0.0123728;REVB=-0.0159147;RO=65;SAF=24;SAR=23;SRF=45;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189302;STB=0.605914;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0125407;OID=.;OPOS=367969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:65:65:47:47:0.419643:23:24:45:20:23:24:45:20
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chr5	453567	.	G	A	101.28	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.022092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8567;QD=16.8801;RBI=0.0466523;REFB=-0.0596455;REVB=0.04109;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369373;STB=0.708046;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.026421;OID=.;OPOS=453567;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:11:1:6:6:11:1
chr5	462465	.	C	A	658.8	PASS	AF=0.465278;AO=67;DP=144;FAO=67;FDP=144;FR=.;FRO=77;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=46;FSRR=31;FWDB=-0.0310847;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.344;QD=18.3001;RBI=0.039394;REFB=-0.0293366;REVB=0.0241997;RO=76;SAF=25;SAR=42;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222806;STB=0.620309;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0227362;OID=.;OPOS=462465;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:76:77:67:67:0.465278:42:25:46:30:42:25:46:31
chr5	472951	.	T	C	251.49	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.00107449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.809;QD=17.0498;RBI=0.107542;REFB=-0.00465113;REVB=-0.107537;RO=31;SAF=22;SAR=6;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.37984;STB=0.715281;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00331129;OID=.;OPOS=472951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:6:22:13:18:6:22:13:18
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chr5	482186	.	C	G	354.93	PASS	AF=0.513889;AO=36;DP=70;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.0506563;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.4988;QD=19.7186;RBI=0.0767388;REFB=-0.030917;REVB=0.0576436;RO=34;SAF=29;SAR=7;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12621;STB=0.569792;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0302541;OID=.;OPOS=482186;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:34:35:36:37:0.513889:7:29:24:10:7:30:25:10
chr5	601966	.	T	A	1884.54	PASS	AF=1;AO=122;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0366758;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7337;QD=61.7881;RBI=0.0371268;REFB=0;REVB=-0.00576909;RO=0;SAF=47;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98065e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000160186;OID=.;OPOS=601966;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:122:0:0:122:122:1:75:47:0:0:75:47:0:0
chr5	741736	.	G	T	120.19	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381354;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.831;QD=43.7065;RBI=0.0475;REFB=0;REVB=0.0283186;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000916365;OID=.;OPOS=741736;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:10:11:1:6:4:0:0:6:5:0:0
chr5	766910	.	C	T	2368.32	PASS	AF=0.993631;AO=155;DP=158;FAO=156;FDP=157;FR=.;FRO=1;FSAF=88;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00943845;FXX=0.00632871;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.606;QD=60.3393;RBI=0.00972236;REFB=-0.110547;REVB=-0.00233238;RO=1;SAF=88;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0053757;STB=0.502824;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-2.50391e-05;OID=.;OPOS=766910;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:158:157:1:1:155:156:0.993631:67:88:1:0:68:88:1:0
chr5	767033	.	A	C	1125.93	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.568;QD=60.0499;RBI=0.0483774;REFB=0;REVB=0.0364942;RO=0;SAF=48;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100139;OID=.;OPOS=767033;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:75:0:0:70:75:1:22:48:0:0:25:50:0:0
chr5	837556	.	T	G	65.34	PASS	AF=0.0945274;AO=18;DP=200;FAO=19;FDP=201;FR=.;FRO=182;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=91;FSRR=91;FWDB=0.0506336;FXX=0.00985173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1105;QD=1.30032;RBI=0.0506704;REFB=-0.00156113;REVB=-0.00193003;RO=182;SAF=9;SAR=9;SRF=91;SRR=91;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523809;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0150348;OID=.;OPOS=837556;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:200:201:182:182:18:19:0.0945274:9:9:91:91:10:9:91:91
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chr5	878525	.	T	A	185.07	PASS	AF=0.162281;AO=37;DP=228;FAO=37;FDP=228;FR=.;FRO=191;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=113;FSRR=78;FWDB=-0.0550175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.929;QD=3.24685;RBI=0.0557458;REFB=-0.00580419;REVB=-0.00898171;RO=191;SAF=12;SAR=25;SRF=113;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335879;STB=0.716467;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0350497;OID=.;OPOS=878525;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:228:228:191:191:37:37:0.162281:25:12:113:78:25:12:113:78
chr5	1009145	.	C	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.516;QD=40.7629;RBI=0.0466317;REFB=0;REVB=0.0466317;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000526426;OID=.;OPOS=1009145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:10:0:0:0:10:0:0:0
chr5	1036900	.	C	T	769.93	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0669721;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.446;QD=64.161;RBI=0.0689103;REFB=0;REVB=0.0162285;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155098;OID=.;OPOS=1036900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:24:24:0:0:24:24:0:0
chr5	1036962	.	C	A	514.05	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0696521;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7015;QD=57.1162;RBI=0.0980951;REFB=-0.163576;REVB=0.0690741;RO=1;SAF=17;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267214;STB=0.514278;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00436646;OID=.;OPOS=1036962;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:36:1:1:35:35:0.972222:18:17:1:0:18:17:1:0
chr5	1038526	.	A	G	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0435034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.791;QD=37.4874;RBI=0.0977614;REFB=0;REVB=0.0875485;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00319193;OID=.;OPOS=1038526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr5	1052360	.	C	T	1484.08	PASS	AF=0.990291;AO=96;DP=102;FAO=102;FDP=103;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=68;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0360221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9946;QD=57.6343;RBI=0.0452644;REFB=-0.0528587;REVB=0.0274093;RO=2;SAF=66;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00841277;STB=0.507245;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00282615;OID=.;OPOS=1052360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:102:103:2:1:96:102:0.990291:30:66:1:1:34:68:0:1
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chr5	1065399	.	C	T	689.38	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00975973;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=326.837;QD=62.6711;RBI=0.0241191;REFB=0;REVB=0.0220563;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.91904e-05;OID=.;OPOS=1065399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:19:24:0:0:19:25:0:0
chr5	1078000	.	GC	CG	32.25	PASS	AF=0.0680272;AO=9;DP=149;FAO=10;FDP=147;FR=.,HEALED;FRO=136;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=79;FSRR=57;FWDB=-0.0290619;FXX=0.0199987;HRUN=1;LEN=2;MLLD=28.1035;QD=0.877554;RBI=0.0980891;REFB=-0.0149079;REVB=-0.093685;RO=106;SAF=0;SAR=9;SRF=62;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.617788;STB=0.915267;STBP=0.013;TYPE=mnp;VARB=-0.0192732;OID=.;OPOS=1078000;OREF=GC;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:149:147:106:136:9:10:0.0680272:9:0:62:44:9:1:79:57
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chr5	1081767	.	C	T	454.6	PASS	AF=0.494505;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.00554037;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7312;QD=19.9825;RBI=0.00692758;REFB=-0.0535061;REVB=0.00415881;RO=46;SAF=26;SAR=19;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0704134;STB=0.53899;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0373379;OID=.;OPOS=1081767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:46:46:45:45:0.494505:19:26:30:16:19:26:30:16
chr5	1201806	.	G	A	144.39	PASS	AF=0.327586;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=0.0027173;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.862;QD=9.9581;RBI=0.047768;REFB=-0.00381464;REVB=-0.0476907;RO=37;SAF=17;SAR=2;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28856;STB=0.688946;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.00443599;OID=.;OPOS=1201806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:37:39:19:19:0.327586:2:17:28:9:2:17:29:10
chr5	1216775	.	A	G	1628.84	PASS	AF=0.990909;AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0132053;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4984;QD=59.2305;RBI=0.0287566;REFB=-0.0600936;REVB=0.0255453;RO=1;SAF=55;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00855298;STB=0.504504;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.000303166;OID=.;OPOS=1216775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:111:110:1:1:109:109:0.990909:54:55:1:0:54:55:1:0
chr5	1225613	.	G	A	715.5	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212379;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.817;QD=57.2397;RBI=0.0217865;REFB=0;REVB=0.00485825;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.40078e-05;OID=.;OPOS=1225613;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:18:31:0:0:18:32:0:0
chr5	1225626	.	T	A	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.965;QD=57.2376;RBI=0.0306814;REFB=0;REVB=-0.0230391;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000211918;OID=.;OPOS=1225626;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:21:35:0:0:21:35:0:0
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chr5	1225703	.	A	G	952.16	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0612988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.279;QD=58.5946;RBI=0.0613012;REFB=0;REVB=-0.000549044;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.23514e-05;OID=.;OPOS=1225703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:65:0:0:60:65:1:32:28:0:0:32:33:0:0
chr5	1466919	.	G	A	267.43	PASS	AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.0219347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.763;QD=13.7142;RBI=0.023504;REFB=-0.00459592;REVB=-0.00844437;RO=47;SAF=16;SAR=15;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731712;STB=0.541674;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.00613846;OID=.;OPOS=1466919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:47:47:31:31:0.397436:15:16:21:26:15:16:21:26
chr5	1494909	.	C	T	566.96	PASS	AF=0.666667;AO=50;DP=75;FAO=50;FDP=75;FR=.;FRO=25;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.028596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.195;QD=30.2377;RBI=0.0293977;REFB=-0.0412608;REVB=0.00681858;RO=25;SAF=27;SAR=23;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370033;STB=0.520056;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0232382;OID=.;OPOS=1494909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:25:25:50:50:0.666667:23:27:12:13:23:27:12:13
chr5	1814783	.	T	C	80.24	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0569343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8174;QD=16.8936;RBI=0.0588596;REFB=-0.0130521;REVB=-0.0149309;RO=9;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787205;STB=0.545367;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0354413;OID=.;OPOS=1814783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:7:3:2:7:7:3:2:7
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chr5	2184901	.	C	T	553.02	PASS	AF=0.508929;AO=57;DP=112;FAO=57;FDP=112;FR=.;FRO=55;FSAF=40;FSAR=17;FSRF=46;FSRR=9;FWDB=0.00325486;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.823;QD=19.7506;RBI=0.0175453;REFB=-0.0259702;REVB=-0.0172408;RO=54;SAF=40;SAR=17;SRF=45;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148991;STB=0.584306;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0214168;OID=.;OPOS=2184901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:54:55:57:57:0.508929:17:40:45:9:17:40:46:9
chr5	3600334	.	T	C	2126.68	PASS	AF=0.992701;AO=135;DP=136;FAO=136;FDP=137;FR=.;FRO=1;FSAF=92;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000950673;FXX=0.00724585;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.495;QD=62.0928;RBI=0.0529402;REFB=-0.00497146;REVB=-0.0529316;RO=0;SAF=91;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502702;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.000176702;OID=.;OPOS=3600334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:136:137:0:1:135:136:0.992701:44:91:0:0:44:92:1:0
chr5	3610658	.	T	C	1169.14	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00996382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8248;QD=60.7343;RBI=0.0274449;REFB=0;REVB=0.0255724;RO=0;SAF=42;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000481474;OID=.;OPOS=3610658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:34:42:0:0:35:42:0:0
chr5	5146335	.	C	G	184.56	PASS	AF=0.301205;AO=24;DP=76;FAO=25;FDP=83;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=41;FSRR=17;FWDB=-0.0639161;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.648;QD=8.89435;RBI=0.0642364;REFB=-0.0666282;REVB=-0.00640765;RO=52;SAF=19;SAR=5;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180216;STB=0.590525;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.107123;OID=.;OPOS=5146335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:83:52:58:24:25:0.301205:5:19:35:17:5:20:41:17
chr5	5146377	.	T	C	177.07	PASS	AF=0.359375;AO=20;DP=61;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.018969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.253;QD=11.0665;RBI=0.0216838;REFB=-0.011322;REVB=-0.0105056;RO=41;SAF=13;SAR=7;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010745;STB=0.527448;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0220717;OID=.;OPOS=5146377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:64:41:41:20:23:0.359375:7:13:27:14:7:16:27:14
chr5	5146395	.	A	G	448.11	PASS	AF=0.626866;AO=41;DP=66;FAO=42;FDP=67;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0119117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.939;QD=26.7529;RBI=0.0119322;REFB=-0.0326612;REVB=0.000698431;RO=25;SAF=24;SAR=17;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010472;STB=0.510912;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0159813;OID=.;OPOS=5146395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:25:25:41:42:0.626866:17:24:15:10:18:24:15:10
chr5	5200281	.	C	T	891.94	PASS	AF=1;AO=51;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00738724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.495;QD=57.5447;RBI=0.0108156;REFB=0;REVB=0.00789975;RO=0;SAF=33;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.68223e-05;OID=.;OPOS=5200281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:51:62:1:18:33:0:0:25:37:0:0
chr5	5447607	.	A	G	399.68	PASS	AF=0.526316;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=34;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=0.0103946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.987;QD=21.0356;RBI=0.0115855;REFB=-0.0125971;REVB=0.0051164;RO=35;SAF=34;SAR=6;SRF=28;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773809;STB=0.561288;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0144908;OID=.;OPOS=5447607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:35:36:40:40:0.526316:6:34:28:7:6:34:28:8
chr5	5457724	.	AT	A,TA	121.14	PASS	AF=0.931034,0;AO=13,4;DP=94;FAO=27,0;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=9,0;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0971975,0.0258919;FXX=0.23678;HRUN=7,1;LEN=1,2;MLLD=7.44384,66.5981;QD=16.7086;RBI=0.236621,0.0872195;REFB=-0.0448999,-0.0466013;REVB=0.215736,-0.0832877;RO=74;SAF=4,0;SAR=9,4;SRF=66;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.678475,-0.749145;STB=0.526297,0.5;STBP=0.401,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.0258444,0;OID=.,.;OPOS=5457725,5457724;OREF=T,AT;OALT=-,TA;OMAPALT=A,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:94:29:74:2:13,4:27,0:0.931034,0:9,4:4,0:66:8:18,0:9,0:0:2
chr5	5460569	.	C	T	713.45	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016099;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1848;QD=63.4174;RBI=0.0318993;REFB=0;REVB=-0.0275388;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215695;OID=.;OPOS=5460569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:28:17:0:0:28:17:0:0
chr5	5460619	.	G	C	766.44	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00283518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3275;QD=63.8697;RBI=0.0702643;REFB=0;REVB=0.0702071;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331129;OID=.;OPOS=5460619;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:30:18:0:0:30:18:0:0
chr5	5462148	.	G	A	279.79	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.799;QD=50.8713;RBI=0.0576273;REFB=0;REVB=0.0145253;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121114;OID=.;OPOS=5462148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:13:8:0:0:13:9:0:0
chr5	5462607	.	A	G	238.85	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0697424;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.616;QD=19.9043;RBI=0.0712104;REFB=-0.0155103;REVB=-0.0143847;RO=24;SAF=11;SAR=12;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132807;STB=0.583111;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0338858;OID=.;OPOS=5462607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:25:23:23:0.479167:12:11:8:16:12:11:8:17
chr5	5462620	.	G	A	146.32	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.00268908;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.288;QD=15.4024;RBI=0.0265206;REFB=-0.0110608;REVB=0.0263839;RO=19;SAF=8;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17504;STB=0.631426;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0139591;OID=.;OPOS=5462620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:19:22:16:16:0.421053:8:8:6:13:8:8:6:16
chr5	6600150	.	G	A	240.22	PASS	AF=0.3625;AO=29;DP=79;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.00395954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.605;QD=12.0109;RBI=0.00860709;REFB=-0.0207072;REVB=-0.00764225;RO=50;SAF=16;SAR=13;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767151;STB=0.536411;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0478817;OID=.;OPOS=6600150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:50:51:29:29:0.3625:13:16:31:19:13:16:31:20
chr5	6602544	.	T	C	1066.05	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0177452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5335;QD=58.4136;RBI=0.0314106;REFB=0.0814664;REVB=0.0259179;RO=1;SAF=43;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108729;STB=0.505746;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.00131709;OID=.;OPOS=6602544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:29:43:1:0:29:43:1:0
chr5	6645016	.	A	G	594.5	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.632;QD=60.9745;RBI=0.0327551;REFB=0;REVB=0.0106826;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000391784;OID=.;OPOS=6645016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr5	6651970	.	A	G	423.21	PASS	AF=0.447917;AO=43;DP=98;FAO=43;FDP=96;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.00428496;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.257;QD=17.6339;RBI=0.0042894;REFB=-0.015749;REVB=-0.000195017;RO=48;SAF=22;SAR=21;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503934;STB=0.532415;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0206668;OID=.;OPOS=6651970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:96:48:53:43:43:0.447917:21:22:22:26:21:22:24:29
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chr5	6656210	.	G	A	214.41	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0230415;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.2367;QD=19.4913;RBI=0.0508708;REFB=0.000455837;REVB=-0.0453534;RO=22;SAF=6;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251306;STB=0.633669;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00151965;OID=.;OPOS=6656210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:22:23:21:21:0.477273:15:6:12:10:15:6:12:11
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chr5	7868030	.	T	C	1572.5	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00520848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.864;QD=62.9;RBI=0.0142117;REFB=-0.00124348;REVB=0.0132228;RO=1;SAF=59;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00797265;STB=0.504201;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=8.51729e-06;OID=.;OPOS=7868030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:100:1:1:99:99:0.99:40:59:1:0:40:59:1:0
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chr5	7878424	.	T	A	149.06	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=-0.0704272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2571;QD=18.6327;RBI=0.092439;REFB=-0.00762832;REVB=0.0598746;RO=16;SAF=8;SAR=8;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334782;STB=0.687298;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00668958;OID=.;OPOS=7878424;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:8:8:14:2:8:8:14:2
chr5	7889216	.	G	A	231.31	PASS	AF=0.318681;AO=29;DP=91;FAO=29;FDP=91;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=-0.00593498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.011;QD=10.1672;RBI=0.0773646;REFB=-0.00822366;REVB=0.0771366;RO=62;SAF=14;SAR=15;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950386;STB=0.555518;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0153774;OID=.;OPOS=7889216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:62:62:29:29:0.318681:15:14:35:27:15:14:35:27
chr5	7889304	.	C	T	424.16	PASS	AF=0.428571;AO=48;DP=112;FAO=48;FDP=112;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.027344;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.562;QD=15.1485;RBI=0.027346;REFB=-0.00735288;REVB=0.000330171;RO=64;SAF=25;SAR=23;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212165;STB=0.511909;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0101442;OID=.;OPOS=7889304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:64:64:48:48:0.428571:23:25:32:32:23:25:32:32
chr5	7891506	.	C	G	221.97	PASS	AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00622088;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.749;QD=25.3678;RBI=0.00732512;REFB=0.00423891;REVB=0.00386756;RO=14;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119429;STB=0.566333;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=-0.00144923;OID=.;OPOS=7891506;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:11:10:9:5:11:10:9:5
chr5	9041924	.	T	C	368.91	PASS	AF=0.903226;AO=28;DP=31;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0178989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.733;QD=47.6007;RBI=0.0474574;REFB=-0.164662;REVB=0.0439526;RO=3;SAF=19;SAR=9;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690343;STB=0.537248;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00424255;OID=.;OPOS=9041924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:31:31:3:3:28:28:0.903226:9:19:1:2:9:19:1:2
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chr5	9053945	.	C	T	353.94	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1684;QD=54.452;RBI=0.0436703;REFB=0;REVB=0.0195758;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00493891;OID=.;OPOS=9053945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:26:0:0:23:26:1:10:13:0:0:12:14:0:0
chr5	9108333	.	C	T	278.78	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0206497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.353;QD=18.9003;RBI=0.0207256;REFB=0.0196123;REVB=-0.0017714;RO=29;SAF=22;SAR=8;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183671;STB=0.60306;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=-0.0190069;OID=.;OPOS=9108333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:8:22:16:13:8:22:16:13
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chr5	10250430	.	G	A	242.39	PASS	AF=0.326316;AO=24;DP=96;FAO=31;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=64;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=0.0164716;FXX=0.0104156;HRUN=6;LEN=1;MLLD=35.8446;QD=10.2059;RBI=0.144675;REFB=0.0079397;REVB=0.143734;RO=49;SAF=10;SAR=14;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198872;STB=0.616034;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=-0.01331;OID=.;OPOS=10250430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:95:49:64:24:31:0.326316:14:10:29:20:18:13:38:26
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chr5	10254817	.	A	G	334.1	PASS	AF=0.455696;AO=35;DP=78;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0435557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.402;QD=16.9163;RBI=0.0436804;REFB=-0.0343882;REVB=-0.00329871;RO=43;SAF=10;SAR=25;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194143;STB=0.614106;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0381269;OID=.;OPOS=10254817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:43:43:35:36:0.455696:25:10:20:23:26:10:20:23
chr5	10256161	.	T	C	494.41	PASS	AF=0.494845;AO=48;DP=98;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.0508348;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.408;QD=20.388;RBI=0.050879;REFB=-0.0259927;REVB=0.00211825;RO=49;SAF=20;SAR=28;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798272;STB=0.504423;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0246176;OID=.;OPOS=10256161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:49:49:48:48:0.494845:28:20:20:29:28:20:20:29
chr5	10261966	.	G	A	365.86	PASS	AF=0.487179;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0281376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.204;QD=18.762;RBI=0.0296113;REFB=0.00554109;REVB=-0.0092252;RO=39;SAF=15;SAR=23;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147196;STB=0.502819;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=-0.00627284;OID=.;OPOS=10261966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:39:40:38:38:0.487179:23:15:16:23:23:15:16:24
chr5	10505585	.	A	G	296.75	PASS	AF=0.428571;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0123682;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.997;QD=15.4158;RBI=0.0469723;REFB=0.00238643;REVB=0.0453148;RO=44;SAF=20;SAR=13;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154323;STB=0.587248;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=-0.00169412;OID=.;OPOS=10505585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:44:44:33:33:0.428571:13:20:20:24:13:20:20:24
chr5	10564846	.	C	T	1175.2	PASS	AF=1;AO=75;DP=77;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0264;QD=59.504;RBI=0.0751778;REFB=-0.0623384;REVB=0.0517846;RO=2;SAF=26;SAR=49;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00829112;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00164462;OID=.;OPOS=10564846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:77:79:2:0:75:79:1:49:26:1:1:51:28:0:0
chr5	10624887	.	T	C	897.15	PASS	AF=0.984375;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0100787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.228;QD=56.0721;RBI=0.0341792;REFB=-0.0392086;REVB=-0.0326594;RO=1;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178116;STB=0.509431;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00100219;OID=.;OPOS=10624887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:62:63:0.984375:26:36:0:1:26:37:0:1
chr5	10638180	.	T	C	1261.48	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00258848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.22;QD=61.5354;RBI=0.013357;REFB=0;REVB=0.0131038;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.11343e-06;OID=.;OPOS=10638180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:40:42:0:0:40:42:0:0
chr5	10649412	.	G	C	165.34	PASS	AF=0.217742;AO=28;DP=124;FAO=27;FDP=124;FR=.;FRO=97;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=60;FSRR=37;FWDB=-0.0312283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.488;QD=5.33362;RBI=0.0342314;REFB=-0.00340668;REVB=0.0140208;RO=95;SAF=20;SAR=8;SRF=59;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132335;STB=0.574925;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.017581;OID=.;OPOS=10649412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:95:97:28:27:0.217742:8:20:59:36:8:19:60:37
chr5	10649784	.	G	A	41.13	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0203315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.831;QD=16.4536;RBI=0.0477977;REFB=-0.0676321;REVB=0.0432579;RO=3;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146968;STB=0.681121;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0379187;OID=.;OPOS=10649784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:3:4:6:6:0.6:5:1:1:2:5:1:2:2
chr5	11117583	.	C	T	431.91	PASS	AF=0.5;AO=43;DP=87;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.0606233;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.1332;QD=19.6321;RBI=0.0859198;REFB=-0.00839952;REVB=0.0608854;RO=44;SAF=21;SAR=22;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17604;STB=0.57951;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0111402;OID=.;OPOS=11117583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:44:44:43:44:0.5:22:21:30:14:22:22:29:15
chr5	13701525	.	T	C	234.92	PASS	AF=0.46;AO=22;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0149415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.987;QD=18.7937;RBI=0.0204649;REFB=0.00572023;REVB=-0.0139844;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177218;STB=0.584702;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=-0.00507487;OID=.;OPOS=13701525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:22:23:0.46:13:9:16:11:13:10:16:11
chr5	13701536	.	T	C	186.48	PASS	AF=0.513514;AO=16;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0242533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.164;QD=20.1601;RBI=0.0399992;REFB=-0.0320288;REVB=0.0318074;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811631;STB=0.539893;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0298546;OID=.;OPOS=13701536;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:15:18:16:19:0.513514:10:6:7:8:13:6:7:11
chr5	13719022	.	T	G	445.67	PASS	AF=0.443478;AO=47;DP=112;FAO=51;FDP=115;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=29;FWDB=0.00645615;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.535;QD=15.5017;RBI=0.00646079;REFB=0.00254587;REVB=-0.00024466;RO=62;SAF=30;SAR=17;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112051;STB=0.535034;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0054176;OID=.;OPOS=13719022;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:115:62:64:47:51:0.443478:17:30:33:29:20:31:35:29
chr5	13719089	.	G	A	465.8	PASS	AF=0.47619;AO=46;DP=101;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.00929847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.201;QD=17.7447;RBI=0.0218359;REFB=-0.020137;REVB=0.0197572;RO=52;SAF=30;SAR=16;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575464;STB=0.554259;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0136981;OID=.;OPOS=13719089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:105:52:55:46:50:0.47619:16:30:31:21:17:33:31:24
chr5	13788886	.	C	A	367.32	PASS	AF=0.552239;AO=37;DP=67;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.00709097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2678;QD=21.9295;RBI=0.0171175;REFB=-0.0443685;REVB=-0.0155797;RO=30;SAF=25;SAR=12;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306179;STB=0.669008;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0169419;OID=.;OPOS=13788886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:30:30:37:37:0.552239:12:25:9:21:12:25:9:21
chr5	13811775	.	T	C	1506.95	PASS	AF=0.990291;AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0332707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6137;QD=58.5225;RBI=0.0337818;REFB=-0.129064;REVB=0.00585437;RO=0;SAF=57;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.17359e-08;STB=0.505493;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00137064;OID=.;OPOS=13811775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:102:103:0:1:101:102:0.990291:44:57:0:0:45:57:0:1
chr5	13829799	.	G	A	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.187;QD=58.7816;RBI=0.0228189;REFB=0;REVB=-0.00555444;RO=0;SAF=41;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.25588e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.23353e-05;OID=.;OPOS=13829799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:24:41:0:0:24:41:0:0
chr5	13845045	.	G	A	1331.68	PASS	AF=0.988764;AO=86;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0436497;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.81;QD=59.8506;RBI=0.0437607;REFB=-0.099225;REVB=-0.00311431;RO=0;SAF=29;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504347;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000317394;OID=.;OPOS=13845045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:89:89:0:1:86:88:0.988764:57:29:0:0:57:31:0:1
chr5	13864728	.	C	A	237.15	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0167349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.076;QD=19.7627;RBI=0.0223724;REFB=-0.00883915;REVB=-0.0148482;RO=25;SAF=6;SAR=17;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227845;STB=0.62951;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0115738;OID=.;OPOS=13864728;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:17:6:12:13:17:6:12:13
chr5	13865980	.	T	C	209.71	PASS	AF=0.366197;AO=24;DP=69;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00969955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.431;QD=11.8146;RBI=0.0451491;REFB=-0.0200357;REVB=0.0440949;RO=42;SAF=13;SAR=11;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197135;STB=0.503266;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0275049;OID=.;OPOS=13865980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:71:42:45:24:26:0.366197:11:13:22:20:12:14:24:21
chr5	13900345	.	A	G	1865.83	PASS	AF=1;AO=119;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174539;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.587;QD=61.6802;RBI=0.0409133;REFB=0;REVB=0.0370035;RO=0;SAF=60;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.00731e-05;OID=.;OPOS=13900345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:121:0:0:119:121:1:59:60:0:0:60:61:0:0
chr5	13902220	.	T	C	501.57	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.083081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.23;QD=59.008;RBI=0.0886768;REFB=0;REVB=0.0310019;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470416;OID=.;OPOS=13902220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr5	13913885	.	A	G	2257.7	PASS	AF=0.993056;AO=143;DP=144;FAO=143;FDP=144;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00193964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.557;QD=62.7138;RBI=0.00674211;REFB=0.192576;REVB=-0.00645707;RO=1;SAF=69;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00638285;STB=0.503355;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=-0.00050031;OID=.;OPOS=13913885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:144:144:1:1:143:143:0.993056:74:69:0:1:74:69:0:1
chr5	13931340	.	C	T	287.41	PASS	AF=0.492063;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0495075;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.4094;QD=18.2483;RBI=0.0499971;REFB=-0.0304308;REVB=-0.0069798;RO=33;SAF=10;SAR=21;SRF=10;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207878;STB=0.524418;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0302606;OID=.;OPOS=13931340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:33:32:31:31:0.492063:21:10:10:23:21:10:9:23
chr5	13944512	.	A	C	369.64	PASS	AF=0.560606;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=26;FSRR=3;FWDB=-0.0117465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1825;QD=22.4025;RBI=0.0158305;REFB=-0.00563685;REVB=-0.0106125;RO=29;SAF=30;SAR=7;SRF=26;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121603;STB=0.566441;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.00423659;OID=.;OPOS=13944512;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:29:29:37:37:0.560606:7:30:26:3:7:30:26:3
chr5	14184022	.	G	A	726.6	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00408125;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.159;QD=56.9882;RBI=0.0108558;REFB=0;REVB=-0.0100594;RO=0;SAF=32;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.29515e-05;OID=.;OPOS=14184022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:19:32:0:0:19:32:0:0
chr5	14184079	.	G	A	885.17	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.323;QD=58.0436;RBI=0.0254133;REFB=0;REVB=-0.00397456;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.74013e-05;OID=.;OPOS=14184079;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:25:36:0:0:25:36:0:0
chr5	14316642	.	G	A	199.12	PASS	AF=0.42;AO=20;DP=49;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0355713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6087;QD=15.9294;RBI=0.0433076;REFB=-0.0120713;REVB=0.0247029;RO=29;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142176;STB=0.59146;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0281271;OID=.;OPOS=14316642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:29:29:20:21:0.42:13:7:14:15:14:7:14:15
chr5	14420027	.	A	C	1358.06	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0751164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0188;QD=62.4393;RBI=0.080593;REFB=0;REVB=0.0292022;RO=0;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000310512;OID=.;OPOS=14420027;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:41:46:0:0:41:46:0:0
chr5	14709412	.	A	AT,ATT	235.23	PASS	AF=1,0;AO=16,3;DP=19;FAO=19,0;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.167435,-0.0950399;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=25.1309,6.17699;QD=49.5222;RBI=0.167486,0.0950987;REFB=0,0;REVB=-0.00413233,-0.00334277;RO=0;SAF=12,3;SAR=4,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.07465e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00967944,0;OID=.,.;OPOS=14709413,14709413;OREF=-,-;OALT=T,TT;OMAPALT=AT,ATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:16,3:19:19,0:19:0:15,0:4,0:0:0:4:0:12,3:4,0:0:0
chr5	16666180	.	A	G	246.57	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00343308;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7532;QD=46.9656;RBI=0.057079;REFB=-0.147578;REVB=-0.0569757;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516113;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00901508;OID=.;OPOS=16666180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:0:1:20:20:0.952381:5:15:0:0:5:15:1:0
chr5	16673975	.	C	G	589.74	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0678575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.648;QD=60.4861;RBI=0.0690446;REFB=0;REVB=0.0127481;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214659;OID=.;OPOS=16673975;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:21:17:0:0:22:17:0:0
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chr5	16769273	.	G	A	199.89	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00706954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0703;QD=13.5516;RBI=0.00707586;REFB=-0.0106279;REVB=-0.000299127;RO=33;SAF=7;SAR=17;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15022;STB=0.590758;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00790244;OID=.;OPOS=16769273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:33:35:24:24:0.40678:17:7:14:19:17:7:15:20
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chr5	31317494	.	C	T	192.82	PASS	AF=0.324675;AO=25;DP=77;FAO=25;FDP=77;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=-0.0685422;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4148;QD=10.0168;RBI=0.0699364;REFB=-0.0111472;REVB=0.0138949;RO=52;SAF=13;SAR=12;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200081;STB=0.616406;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0162338;OID=.;OPOS=31317494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:52:52:25:25:0.324675:12:13:18:34:12:13:18:34
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chr5	34823576	.	A	C	182.35	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0318368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.535;QD=17.3664;RBI=0.031842;REFB=-0.0123746;REVB=-0.00057533;RO=22;SAF=11;SAR=8;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28266;STB=0.668933;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.010078;OID=.;OPOS=34823576;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:23:19:19:0.452381:8:11:6:16:8:11:6:17
chr5	34862125	.	C	T	663.99	PASS	AF=0.546218;AO=65;DP=119;FAO=65;FDP=119;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=43;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0416126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.956;QD=22.3191;RBI=0.0455959;REFB=-0.0107758;REVB=0.0186381;RO=54;SAF=22;SAR=43;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172026;STB=0.59444;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0071118;OID=.;OPOS=34862125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:54:54:65:65:0.546218:43:22:29:25:43:22:29:25
chr5	34998877	.	C	A	955.18	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.718;QD=58.78;RBI=0.0427657;REFB=0;REVB=-0.0377454;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000243228;OID=.;OPOS=34998877;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:25:40:0:0:25:40:0:0
chr5	35010138	.	A	G	2545.88	PASS	AF=1;AO=149;DP=171;FAO=168;FDP=168;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=100;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0813708;FXX=0.0175428;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.074;QD=60.6161;RBI=0.0813735;REFB=0;REVB=0.000660279;RO=0;SAF=82;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.67496e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000537599;OID=.;OPOS=35010138;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:171:168:0:0:149:168:1:67:82:0:0:68:100:0:0
chr5	35033605	.	G	A	677.25	PASS	AF=0.98;AO=48;DP=51;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.002149;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.378;QD=54.18;RBI=0.0277808;REFB=-0.0101789;REVB=0.0276976;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.511107;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.000709048;OID=.;OPOS=35033605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:50:0:1:48:49:0.98:22:26:0:0:22:27:0:1
chr5	35641582	.	A	C	497.59	PASS	AF=0.45;AO=54;DP=120;FAO=54;FDP=120;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=-0.0142005;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.1;QD=16.5864;RBI=0.0269509;REFB=-0.0161111;REVB=0.0229062;RO=65;SAF=27;SAR=27;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226065;STB=0.50833;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0211073;OID=.;OPOS=35641582;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:65:66:54:54:0.45:27:27:31:34:27:27:32:34
chr5	35644621	.	T	C	367.68	PASS	AF=0.552239;AO=36;DP=67;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.00511065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5284;QD=21.951;RBI=0.0229428;REFB=-0.0232707;REVB=0.0223663;RO=30;SAF=28;SAR=8;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185676;STB=0.606632;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0108271;OID=.;OPOS=35644621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:30:30:36:37:0.552239:8:28:18:12:8:29:18:12
chr5	35646877	.	CAAAAAAT	CAAAAAAAT,CAAAAAAC,CAAAAAT	37.92	PASS	AF=0.117647,0.0784314,0;AO=8,4,6;DP=51;FAO=6,4,0;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=1,4,0;FSAR=5,0,0;FSRF=7;FSRR=34;FWDB=-0.151669,0.0707855,0.132171;FXX=0;HRUN=6,1,6;LEN=1,1,1;MLLD=11.1567,159.041,12.2697;QD=2.9742;RBI=0.180902,0.071833,0.163403;REFB=-0.0371166,-7.20052e-05,0.0339874;REVB=0.0986006,-0.0122226,-0.0960802;RO=32;SAF=3,4,0;SAR=5,0,6;SRF=5;SRR=27;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0.378906;SSSB=0.330594,0.767523,-0.57859;STB=0.506308,0.998778,0.5;STBP=0.998,0,1;TYPE=ins,snp,del;VARB=0.0711684,0.0515091,0;OID=.,.,.;OPOS=35646878,35646884,35646878;OREF=-,T,A;OALT=A,C,-;OMAPALT=CAAAAAAAT,CAAAAAAC,CAAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.117647,0.0784314,0:8,4,6:51:6,4,0:51:41:1,4,0:5,0,0:7:34:18:32:3,4,0:5,0,6:5:27
chr5	35654711	.	C	T	821.74	PASS	AF=0.536424;AO=81;DP=152;FAO=81;FDP=151;FR=.;FRO=70;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=-0.0311773;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.962;QD=21.768;RBI=0.0331646;REFB=0.00262008;REVB=-0.0113078;RO=70;SAF=33;SAR=48;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103937;STB=0.556923;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=-0.00184421;OID=.;OPOS=35654711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:151:70:70:81:81:0.536424:48:33:37:33:48:33:37:33
chr5	35692775	.	T	A	810.46	PASS	AF=0.546053;AO=73;DP=143;FAO=83;FDP=152;FR=.;FRO=69;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=36;FWDB=0.0182836;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.762;QD=21.3279;RBI=0.0190315;REFB=-0.0199491;REVB=0.00528286;RO=68;SAF=39;SAR=34;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558962;STB=0.523555;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0212359;OID=.;OPOS=35692775;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:152:68:69:73:83:0.546053:34:39:32:36:39:44:33:36
chr5	35695915	.	A	C	272.8	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0179174;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.307;QD=14.7461;RBI=0.0197648;REFB=-0.00871603;REVB=0.00834344;RO=43;SAF=20;SAR=11;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165414;STB=0.593997;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0241215;OID=.;OPOS=35695915;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:43:43:31:31:0.418919:11:20:21:22:11:20:21:22
chr5	35700598	.	T	C	128.04	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0147362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.727;QD=20.4858;RBI=0.0148648;REFB=-0.0243519;REVB=-0.00195157;RO=11;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204611;STB=0.511611;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0176984;OID=.;OPOS=35700598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:6:8:6:5:6:8:6:5
chr5	35702306	.	A	G	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00151158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.019;QD=15.1604;RBI=0.00454155;REFB=-0.000491369;REVB=0.00428262;RO=22;SAF=7;SAR=9;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290181;STB=0.516758;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.000663548;OID=.;OPOS=35702306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:9:7:9:13:9:7:9:13
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chr5	35876274	.	A	G	292.0	PASS	AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0256693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.109;QD=21.6298;RBI=0.0364783;REFB=-0.00473587;REVB=0.0259183;RO=24;SAF=23;SAR=7;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627341;STB=0.53486;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.00636182;OID=.;OPOS=35876274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:24:24:30:30:0.555556:7:23:17:7:7:23:17:7
chr5	35910529	.	C	T	201.35	PASS	AF=0.678571;AO=19;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0149434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.414;QD=28.7635;RBI=0.0201904;REFB=-0.027242;REVB=0.0135775;RO=8;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33025;STB=0.664038;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0202253;OID=.;OPOS=35910529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:8:9:19:19:0.678571:7:12:0:8:7:12:1:8
chr5	35962984	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=3;DP=5;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.491;QD=33.4285;RBI=0.0424149;REFB=0;REVB=0.0315972;RO=0;SAF=1;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.52466e-05;OID=.;OPOS=35962984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:5:6:0:0:3:6:1:2:1:0:0:5:1:0:0
chr5	35965970	.	A	C	109.94	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0294348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.999;QD=14.6582;RBI=0.0296724;REFB=-0.0129584;REVB=0.00374726;RO=17;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279278;STB=0.662901;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0136853;OID=.;OPOS=35965970;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:9:4:10:7:9:4:10:7
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chr5	36193232	.	T	C	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0102433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.069;QD=8.24622;RBI=0.0183081;REFB=-0.0309417;REVB=-0.0151744;RO=15;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342331;STB=0.713674;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0640228;OID=.;OPOS=36193232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:2:5:6:9:2:5:6:9
chr5	36257018	.	A	G	801.25	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256846;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.5145;QD=57.2322;RBI=0.0387774;REFB=0;REVB=0.0290514;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000535315;OID=.;OPOS=36257018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
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chr5	37309371	.	TAGA	T	146.18	PASS	AF=0.390244;AO=15;DP=42;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0156393;FXX=0.0888691;HRUN=1;LEN=3;MLLD=251.71;QD=14.2617;RBI=0.0183803;REFB=-0.0187063;REVB=-0.00965638;RO=21;SAF=6;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781561;STB=0.541349;STBP=0.683;TYPE=del;VARB=0.0258922;OID=.;OPOS=37309372;OREF=AGA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.390244:15:42:16:41:25:6:10:11:14:99:21:6:9:10:11
chr5	37364443	.	C	T	279.51	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00518265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.626;QD=50.8191;RBI=0.0592007;REFB=0;REVB=0.0589734;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000893537;OID=.;OPOS=37364443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:22:0:0:19:22:1:9:10:0:0:12:10:0:0
chr5	37688010	.	A	G	201.99	PASS	AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00297395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.471;QD=12.059;RBI=0.0135382;REFB=-0.0195257;REVB=-0.0132076;RO=41;SAF=11;SAR=14;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781063;STB=0.537785;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0194813;OID=.;OPOS=37688010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:41:42:25:25:0.373134:14:11:21:20:14:11:21:21
chr5	37688094	.	C	T	173.67	PASS	AF=0.319444;AO=23;DP=72;FAO=23;FDP=72;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0237489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.877;QD=9.64836;RBI=0.0246323;REFB=-0.0179043;REVB=0.00653774;RO=48;SAF=10;SAR=13;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12277;STB=0.565161;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0391766;OID=.;OPOS=37688094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:48:49:23:23:0.319444:13:10:26:22:13:10:26:23
chr5	37700502	.	C	T	625.98	PASS	AF=0.570093;AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.00769947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.261;QD=23.401;RBI=0.0204948;REFB=-0.0178473;REVB=-0.0189936;RO=46;SAF=32;SAR=29;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535216;STB=0.52924;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0102377;OID=.;OPOS=37700502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:46:46:61:61:0.570093:29:32:21:25:29:32:21:25
chr5	37700516	.	C	T	438.61	PASS	AF=0.409836;AO=49;DP=121;FAO=50;FDP=122;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=-0.0227463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.034;QD=14.3808;RBI=0.0332112;REFB=-0.0213636;REVB=-0.024199;RO=71;SAF=23;SAR=26;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983701;STB=0.552628;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0309876;OID=.;OPOS=37700516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:122:71:72:49:50:0.409836:26:23:40:31:26:24:41:31
chr5	38370537	.	T	C	549.69	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.595;QD=59.4254;RBI=0.0232607;REFB=0;REVB=0.00449601;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134071;OID=.;OPOS=38370537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:18:18:0:0:19:18:0:0
chr5	38464224	.	A	G	232.93	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00313243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.61;QD=16.9401;RBI=0.0400774;REFB=-0.00547138;REVB=0.0399548;RO=29;SAF=16;SAR=10;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397878;STB=0.522371;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0063452;OID=.;OPOS=38464224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:29:26:26:0.472727:10:16:19:10:10:16:19:10
chr5	38486065	.	C	T	190.48	PASS	AF=0.416667;AO=21;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.041372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.302;QD=15.8732;RBI=0.0427533;REFB=-0.0010159;REVB=-0.0107799;RO=26;SAF=5;SAR=16;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213582;STB=0.599893;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00108396;OID=.;OPOS=38486065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:28:21:20:0.416667:16:5:11:15:15:5:11:17
chr5	38821752	.	T	G	674.02	PASS	AF=0.528;AO=66;DP=127;FAO=66;FDP=125;FR=.;FRO=59;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=18;FWDB=0.0200572;FXX=0.0157468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3107;QD=21.5686;RBI=0.029335;REFB=-0.0216132;REVB=0.0214067;RO=59;SAF=41;SAR=25;SRF=41;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686685;STB=0.537623;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0252068;OID=.;OPOS=38821752;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:125:59:59:66:66:0.528:25:41:41:18:25:41:41:18
chr5	38822040	.	A	G	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.17093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.984;QD=39.2062;RBI=0.180374;REFB=0;REVB=-0.0575995;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.013511;OID=.;OPOS=38822040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr5	38823254	.	C	T	815.41	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.339;QD=57.2219;RBI=0.0517316;REFB=0;REVB=0.0430213;RO=0;SAF=42;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134701;OID=.;OPOS=38823254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:14:42:0:0:15:42:0:0
chr5	38823306	.	A	G	229.26	PASS	AF=0.481481;AO=25;DP=53;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0179346;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4463;QD=16.9825;RBI=0.0180465;REFB=-0.0537155;REVB=0.00200718;RO=28;SAF=21;SAR=4;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370377;STB=0.716282;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.093657;OID=.;OPOS=38823306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:28:28:25:26:0.481481:4:21:15:13:4:22:15:13
chr5	38940550	.	G	A	329.44	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0223391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1912;QD=18.3022;RBI=0.0358176;REFB=0.00336302;REVB=-0.0279976;RO=36;SAF=19;SAR=16;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137935;STB=0.515143;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=-0.00511006;OID=.;OPOS=38940550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:37:35:35:0.486111:16:19:19:17:16:19:19:18
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chr5	38941707	.	T	C	188.49	PASS	AF=0.415094;AO=21;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0774539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.5995;QD=14.2259;RBI=0.0775205;REFB=-0.00135395;REVB=-0.00321385;RO=32;SAF=8;SAR=13;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0947741;STB=0.52546;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0125144;OID=.;OPOS=38941707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:31:21:22:0.415094:13:8:15:17:13:9:14:17
chr5	38942090	.	T	A,C	757.51	PASS	AF=0.103448,0.896552;AO=6,51;DP=58;FAO=6,52;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=0,31;FSAR=6,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00269106,-0.00156277;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=140.617,165.614;QD=52.2419;RBI=0.0210514,0.039255;REFB=-0.0289515,-0.0823888;REVB=-0.0208787,0.0392239;RO=0;SAF=0,31;SAR=6,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.13361e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.121619,-0.000304579;OID=.,.;OPOS=38942090,38942090;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:26:58:58:0:0:6,51:6,52:0.103448,0.896552:6,20:0,31:0:0:6,21:0,31:0:0
chr5	38950776	.	G	A	1175.78	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247998;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.068;QD=61.0793;RBI=0.0298441;REFB=0;REVB=0.0166025;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.7828e-05;OID=.;OPOS=38950776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:39:37:0:0:39:38:0:0
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chr5	40853048	.	C	T	219.91	PASS	AF=0.44898;AO=21;DP=48;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=-0.0721247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5987;QD=17.9521;RBI=0.0752843;REFB=0.000729699;REVB=-0.0215813;RO=23;SAF=13;SAR=8;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267052;STB=0.588161;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=-0.00199356;OID=.;OPOS=40853048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:23:27:21:22:0.44898:8:13:20:3:8:14:21:6
chr5	40964852	.	A	C	2909.04	PASS	AF=1;AO=180;DP=181;FAO=185;FDP=185;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1282;QD=62.8981;RBI=0.0361226;REFB=0;REVB=0.0243059;RO=0;SAF=85;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.50985e-05;OID=.;OPOS=40964852;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:181:185:0:0:180:185:1:95:85:0:0:98:87:0:0
chr5	40972111	.	C	T	2363.34	PASS	AF=1;AO=153;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021589;FXX=0.0191071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.825;QD=61.3854;RBI=0.028623;REFB=0;REVB=-0.0187934;RO=0;SAF=90;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71982e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134224;OID=.;OPOS=40972111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:154:154:0:0:153:154:1:63:90:0:0:64:90:0:0
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chr5	41061715	.	CA	TG	228.81	PASS	AF=0.358974;AO=28;DP=78;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.00235192;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=227.619;QD=11.734;RBI=0.0202211;REFB=0.00764092;REVB=0.0200839;RO=49;SAF=16;SAR=12;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134852;STB=0.571378;STBP=0.371;TYPE=mnp;VARB=-0.0126515;OID=.;OPOS=41061715;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:49:50:28:28:0.358974:12:16:22:27:12:16:23:27
chr5	41158863	.	G	A	1268.07	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245804;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6424;QD=61.8569;RBI=0.0348944;REFB=0;REVB=-0.0247673;RO=0;SAF=37;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000269179;OID=.;OPOS=41158863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:82:0:0:82:82:1:45:37:0:0:45:37:0:0
chr5	41199959	.	G	T	298.55	PASS	AF=0.54;AO=27;DP=50;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.0235017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.112;QD=23.8843;RBI=0.0835717;REFB=-0.000692705;REVB=0.0801992;RO=22;SAF=17;SAR=10;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0869338;STB=0.555516;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.00133244;OID=.;OPOS=41199959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:22:23:27:27:0.54:10:17:16:6:10:17:17:6
chr5	41310957	.	C	G	135.94	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0169574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.292;QD=17.5411;RBI=0.0244232;REFB=-0.0150368;REVB=0.0175767;RO=16;SAF=4;SAR=11;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511692;STB=0.529372;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0213605;OID=.;OPOS=41310957;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:11:4:5:11:11:4:5:11
chr5	41312164	.	A	C	278.53	PASS	AF=0.442857;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.0169276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3331;QD=15.9159;RBI=0.0451937;REFB=-0.0399362;REVB=0.0419038;RO=38;SAF=23;SAR=8;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391312;STB=0.517148;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.022751;OID=.;OPOS=41312164;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:38:39:31:31:0.442857:8:23:27:11:8:23:28:11
chr5	41312206	.	TA	AT	160.63	PASS	AF=0.344828;AO=8;DP=57;FAO=20;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0359066;FXX=0;HRUN=12;LEN=2;MLLD=51.2934;QD=11.078;RBI=0.0364414;REFB=-0.0616099;REVB=0.00622027;RO=31;SAF=2;SAR=6;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362862;STB=0.54995;STBP=0.595;TYPE=mnp;VARB=0.00823628;OID=.;OPOS=41312206;OREF=TA;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:31:34:8:20:0.344828:6:2:17:14:11:9:18:16
chr5	42700044	.	A	G	538.74	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.53;QD=59.8599;RBI=0.0485923;REFB=0;REVB=0.0351234;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000381724;OID=.;OPOS=42700044;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:18:17:0:0:19:17:0:0
chr5	42719239	.	A	C	316.67	PASS	AF=0.571429;AO=26;DP=47;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.00351905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.326;QD=25.8503;RBI=0.0115958;REFB=-0.015305;REVB=0.0110489;RO=21;SAF=16;SAR=10;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129055;STB=0.557338;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0150181;OID=.;OPOS=42719239;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:21:21:26:28:0.571429:10:16:16:5:10:18:16:5
chr5	42720068	.	T	TA	408.53	PASS	AF=0.906977;AO=34;DP=43;FAO=39;FDP=43;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0162855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=340.807;QD=38.0029;RBI=0.0217558;REFB=-0.0472484;REVB=0.0144256;RO=9;SAF=21;SAR=13;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668784;STB=0.511076;STBP=0.674;TYPE=ins;VARB=0.00398856;OID=.;OPOS=42720069;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.906977:34:43:39:43:4:25:14:3:1:7:9:21:13:7:2
chr5	43120098	.	A	G	313.23	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0105667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.4977;QD=50.1169;RBI=0.0562725;REFB=-0.0409095;REVB=-0.0552715;RO=1;SAF=12;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370602;STB=0.519983;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000672694;OID=.;OPOS=43120098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:12:12:1:0:12:12:1:0
chr5	43174710	.	A	G	359.52	PASS	AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0405229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.281;QD=19.9735;RBI=0.0433798;REFB=0.00507602;REVB=0.0154822;RO=35;SAF=14;SAR=23;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04609;STB=0.525597;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=-0.00513116;OID=.;OPOS=43174710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:35:35:37:37:0.513889:23:14:15:20:23:14:15:20
chr5	43492978	.	G	A	312.15	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.249;QD=52.0251;RBI=0.0493045;REFB=0;REVB=0.0399274;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00063709;OID=.;OPOS=43492978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:12:11:0:0:12:12:0:0
chr5	43509348	.	T	A	1434.35	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0444384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0895;QD=63.0484;RBI=0.0444648;REFB=0;REVB=0.00153119;RO=0;SAF=49;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000273397;OID=.;OPOS=43509348;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:42:49:0:0:42:49:0:0
chr5	43527135	.	A	C	1178.99	PASS	AF=1;AO=77;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.229;QD=59.6958;RBI=0.0410258;REFB=-0.0799497;REVB=0.0394658;RO=1;SAF=48;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00975903;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00035494;OID=.;OPOS=43527135;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:79:79:1:0:77:79:1:29:48:1:0:30:49:0:0
chr5	43529902	.	G	A	131.29	PASS	AF=0.305085;AO=16;DP=59;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0209262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.548;QD=8.90113;RBI=0.0209273;REFB=-0.00753095;REVB=-0.000218843;RO=36;SAF=2;SAR=14;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.489887;STB=0.733597;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0145744;OID=.;OPOS=43529902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:36:41:16:18:0.305085:14:2:17:19:14:4:22:19
chr5	44066732	.	A	G	326.03	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0209333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8211;QD=17.388;RBI=0.0224822;REFB=-0.0035973;REVB=-0.00820034;RO=40;SAF=15;SAR=20;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115798;STB=0.564848;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00481967;OID=.;OPOS=44066732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:40:35:35:0.466667:20:15:22:18:20:15:22:18
chr5	44809162	.	G	C	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00291952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.778;QD=9.19983;RBI=0.0836967;REFB=0.00605009;REVB=0.0836458;RO=13;SAF=6;SAR=1;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343745;STB=0.71926;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=-0.00743107;OID=.;OPOS=44809162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:1:6:8:5:1:6:8:5
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chr5	50090163	.	G	A	190.01	PASS	AF=0.375;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.00988833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.496;QD=11.8754;RBI=0.0276576;REFB=-0.0166518;REVB=-0.0258295;RO=40;SAF=14;SAR=10;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910805;STB=0.552587;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0369848;OID=.;OPOS=50090163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:40:40:24:24:0.375:10:14:20:20:10:14:20:20
chr5	52087584	.	T	TCA	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416424;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=280.105;QD=52.6132;RBI=0.0419794;REFB=0;REVB=0.0053087;RO=0;SAF=2;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80459e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000138532;OID=.;OPOS=52087585;OREF=-;OALT=CA;OMAPALT=TCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:22:22:22:22:0:2:20:0:0:4:0:2:20:0:0
chr5	52096889	.	C	A	1419.33	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0244426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.423;QD=61.7098;RBI=0.0468947;REFB=0.011996;REVB=0.0400209;RO=1;SAF=39;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119989;STB=0.506328;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-0.000291347;OID=.;OPOS=52096889;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:1:1:91:91:0.98913:52:39:1:0:52:39:1:0
chr5	52157374	.	T	C	507.77	PASS	AF=0.533333;AO=48;DP=90;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=42;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0860559;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6352;QD=22.5677;RBI=0.0879913;REFB=0.00315987;REVB=0.0183536;RO=42;SAF=6;SAR=42;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367228;STB=0.706037;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00112171;OID=.;OPOS=52157374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:42:42:48:48:0.533333:42:6:17:25:42:6:17:25
chr5	52193287	.	C	T	45.06	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.146113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3198;QD=7.83696;RBI=0.153925;REFB=-0.00461468;REVB=-0.0484135;RO=16;SAF=1;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402921;STB=0.761037;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.00574975;OID=.;OPOS=52193287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:6:1:7:9:6:1:7:9
chr5	52248291	.	T	C	820.9	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154742;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.088;QD=57.6072;RBI=0.0431231;REFB=0;REVB=0.0402511;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102932;OID=.;OPOS=52248291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:25:31:0:0:25:32:0:0
chr5	52389455	.	A	G	226.0	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00480703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.167;QD=20.5452;RBI=0.00970407;REFB=-0.00655627;REVB=-0.00842979;RO=22;SAF=9;SAR=13;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200242;STB=0.612603;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00850568;OID=.;OPOS=52389455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:13:9:14:8:13:9:14:8
chr5	52403040	.	A	G	165.71	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0728083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.057;QD=14.4095;RBI=0.0728164;REFB=-0.0190047;REVB=0.00108595;RO=27;SAF=6;SAR=12;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339187;STB=0.685511;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0185364;OID=.;OPOS=52403040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:28:18:18:0.391304:12:6:18:9:12:6:18:10
chr5	52778870	.	CGGGGGC	CGGG,CGGGGC	136.37	PASS	AF=0.184211,0.447368;AO=5,11;DP=36;FAO=7,17;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=0,1;FSAR=7,16;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.00370295,-0.114338;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=3,1;MLLD=201.661,11.4434;QD=14.3551;RBI=0.0219608,0.138813;REFB=-0.024771,-0.091504;REVB=0.0216464,0.0787146;RO=15;SAF=0,0;SAR=5,11;SRF=4;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.652156,-0.768833;STB=0.997684,0.754313;STBP=0.063,0.057;TYPE=del,del;VARB=0.0486326,0.0179734;OID=.,.;OPOS=52778874,52778871;OREF=GGC,G;OALT=-,-;OMAPALT=CGGG,CGGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.184211,0.447368:5,11:36:7,17:38:14:0,1:7,16:4:10:68:15:0,0:5,11:4:11
chr5	52778877	.	GCC	GC,GCG	363.18	PASS	AF=0.810811,0.189189;AO=24,7;DP=36;FAO=30,7;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0;FSAR=25,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.40501,0.0203885;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=14.5262,217.757;QD=39.2632;RBI=0.424173,0.030308;REFB=-0.0394543,-0.0258859;REVB=0.126052,-0.0224251;RO=5;SAF=2,0;SAR=22,7;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.353587,-0.786958;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0324423,0.00644718;OID=.,.;OPOS=52778878,52778879;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GC,GCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.810811,0.189189:24,7:36:30,7:37:0:5,0:25,7:0:0:42:5:2,0:22,7:3:2
chr5	52856504	.	G	C	769.27	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9538;QD=56.9832;RBI=0.0680719;REFB=0;REVB=0.0662116;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000577747;OID=.;OPOS=52856504;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:23:31:0:0:23:31:0:0
chr5	52942083	.	A	C	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.409;QD=58.14;RBI=0.0416276;REFB=0;REVB=0.0116569;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151046;OID=.;OPOS=52942083;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0
chr5	52942197	.	A	G	1301.19	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0303449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.443;QD=60.5206;RBI=0.0548605;REFB=-0.117503;REVB=0.0457041;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.000219694;OID=.;OPOS=52942197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:85:86:0:1:85:85:0.988372:44:41:0:0:45:40:1:0
chr5	52979097	.	G	A	173.89	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.01477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.096;QD=11.5929;RBI=0.016459;REFB=-0.00484238;REVB=-0.00726264;RO=38;SAF=12;SAR=10;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210136;STB=0.512184;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00878686;OID=.;OPOS=52979097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:10:12:20:18:10:12:20:18
chr5	53344135	.	T	C	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.878;QD=53.9082;RBI=0.0402658;REFB=0;REVB=0.0262488;RO=0;SAF=4;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253668;OID=.;OPOS=53344135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:20:4:0:0:20:4:0:0
chr5	53751901	.	G	A	318.4	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0541208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.137;QD=18.1942;RBI=0.0564286;REFB=-0.0315186;REVB=0.0159728;RO=36;SAF=23;SAR=11;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146777;STB=0.582228;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.01966;OID=.;OPOS=53751901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:36:36:34:34:0.485714:11:23:19:17:11:23:19:17
chr5	53751988	.	T	C	422.88	PASS	AF=0.395161;AO=49;DP=124;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=50;FSRR=25;FWDB=-0.00433298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.368;QD=13.6411;RBI=0.00887796;REFB=-0.0196731;REVB=-0.00774877;RO=74;SAF=29;SAR=20;SRF=50;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944677;STB=0.547641;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0326516;OID=.;OPOS=53751988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:74:75:49:49:0.395161:20:29:50:24:20:29:50:25
chr5	53814394	.	T	C	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0355535;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.305;QD=30.7899;RBI=0.0720084;REFB=0.0065637;REVB=-0.0626191;RO=1;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174483;STB=0.599732;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=-0.00162805;OID=.;OPOS=53814394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:2:6:0:1:2:6:0:1
chr5	53840239	.	GAA	GA,G,TGA	37.26	PASS	AF=0.465116,0,0;AO=13,4,2;DP=39;FAO=20,0,0;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=12,0,0;FSAR=8,0,0;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.274096,-0.140795,-0.154647;FXX=0.0227221;HRUN=8,8,1;LEN=1,2,2;MLLD=6.86171,15.285,9.67815;QD=3.46559;RBI=0.280918,0.145071,0.162609;REFB=0.0220428,0.0093398,0.0166549;REVB=-0.0615352,-0.0349621,-0.0502598;RO=14;SAF=9,2,0;SAR=4,2,2;SRF=8;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.120083,-0.0800868,-0.576453;STB=0.504849,0.5,0.5;STBP=0.975,1,1;TYPE=del,del,mnp;VARB=-0.0232132,0,0;OID=.,.,.;OPOS=53840240,53840240,53840239;OREF=A,AA,GA;OALT=-,-,TG;OMAPALT=GA,G,TGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:39:43:14:23:13,4,2:20,0,0:0.465116,0,0:4,2,2:9,2,0:8:6:8,0,0:12,0,0:14:9
chr5	54252345	.	T	C	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.242;QD=58.5855;RBI=0.0711079;REFB=0;REVB=0.0404233;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000365059;OID=.;OPOS=54252345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr5	54253555	.	A	G	819.96	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0147197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.81;QD=55.5907;RBI=0.0525998;REFB=-0.0277658;REVB=-0.0504982;RO=0;SAF=43;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505745;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.00658351;OID=.;OPOS=54253555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:0:1:58:58:0.983051:15:43:0:0:15:43:1:0
chr5	54253581	.	A	G	789.08	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00476499;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.2273;QD=57.3878;RBI=0.012407;REFB=0;REVB=0.0114555;RO=0;SAF=40;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28425e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000561127;OID=.;OPOS=54253581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:15:40:0:0:15:40:0:0
chr5	54403957	.	T	C	357.97	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3913;QD=55.0718;RBI=0.0246949;REFB=0;REVB=0.0160296;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259022;OID=.;OPOS=54403957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr5	54404015	.	C	T	539.13	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.574;QD=59.9032;RBI=0.0290961;REFB=0;REVB=-0.000826381;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111513;OID=.;OPOS=54404015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:20:15:0:0:21:15:0:0
chr5	54404057	.	C	G	276.63	PASS	AF=0.508475;AO=26;DP=55;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00932284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.029;QD=18.7543;RBI=0.0211901;REFB=-0.0113994;REVB=0.0190291;RO=29;SAF=14;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780541;STB=0.559283;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00769639;OID=.;OPOS=54404057;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:59:29:29:26:30:0.508475:12:14:18:11:15:15:18:11
chr5	54410099	.	G	A	195.76	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00105617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.79;QD=12.6297;RBI=0.00119035;REFB=-0.0203216;REVB=-0.000549024;RO=35;SAF=14;SAR=10;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131069;STB=0.598849;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0297081;OID=.;OPOS=54410099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:62:35:38:24:24:0.387097:10:14:16:19:10:14:16:22
chr5	54410120	.	A	C	785.13	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00212122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.044;QD=57.1006;RBI=0.0373566;REFB=0;REVB=0.0372963;RO=0;SAF=22;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282941;OID=.;OPOS=54410120;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:33:22:0:0:33:22:0:0
chr5	54420799	.	A	C	112.3	PASS	AF=0.275862;AO=16;DP=58;FAO=16;FDP=58;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.021164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1201;QD=7.74512;RBI=0.0289929;REFB=0.0171405;REVB=0.0198159;RO=42;SAF=9;SAR=7;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108343;STB=0.506571;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.0408265;OID=.;OPOS=54420799;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:42:42:16:16:0.275862:7:9:24:18:7:9:24:18
chr5	54439466	.	G	A	136.15	PASS	AF=0.326923;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00657778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.894;QD=10.4734;RBI=0.0168534;REFB=-0.00939592;REVB=-0.0155168;RO=34;SAF=9;SAR=8;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165059;STB=0.605261;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0185314;OID=.;OPOS=54439466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:34:35:17:17:0.326923:8:9:13:21:8:9:13:22
chr5	54459961	.	A	G	346.79	PASS	AF=0.564516;AO=34;DP=61;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00535764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0524;QD=22.3733;RBI=0.0309047;REFB=-0.0110948;REVB=-0.0304367;RO=27;SAF=14;SAR=20;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14523;STB=0.584367;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0068993;OID=.;OPOS=54459961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:27:27:34:35:0.564516:20:14:16:11:21:14:16:11
chr5	54466544	.	A	G	282.28	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00371929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.294;QD=22.5827;RBI=0.128832;REFB=-0.0407293;REVB=0.128778;RO=24;SAF=21;SAR=5;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2898;STB=0.66389;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0301528;OID=.;OPOS=54466544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:5:21:13:11:5:21:13:11
chr5	54572163	.	T	C	258.61	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0273918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.622;QD=16.4196;RBI=0.0376532;REFB=-0.0354456;REVB=-0.0258352;RO=32;SAF=21;SAR=8;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230065;STB=0.617561;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0446204;OID=.;OPOS=54572163;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:63:32:34:29:29:0.460317:8:21:16:16:8:21:18:16
chr5	54645411	.	G	A	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00473687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.543;QD=11.6341;RBI=0.00606063;REFB=-0.00219046;REVB=0.00378065;RO=16;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334607;STB=0.6996;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0038966;OID=.;OPOS=54645411;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:16:16:10:10:0.384615:3:7:6:10:3:7:6:10
chr5	54674296	.	A	G	225.2	PASS	AF=0.440678;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0117066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.335;QD=15.2678;RBI=0.0147338;REFB=0.00424418;REVB=-0.00894641;RO=30;SAF=14;SAR=12;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591297;STB=0.555514;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=-0.00249074;OID=.;OPOS=54674296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:33:26:26:0.440678:12:14:18:12:12:14:21:12
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chr5	55058992	.	C	A	295.13	PASS	AF=0.414634;AO=32;DP=80;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0687339;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.8891;QD=14.3966;RBI=0.0694179;REFB=-0.013239;REVB=-0.00972104;RO=48;SAF=9;SAR=23;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161199;STB=0.580596;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0206014;OID=.;OPOS=55058992;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:82:48:48:32:34:0.414634:23:9:20:28:24:10:20:28
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chr5	55155402	.	C	T	312.76	PASS	AF=0.561404;AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0766147;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.8671;QD=21.9477;RBI=0.0837129;REFB=-0.0355615;REVB=0.0337349;RO=24;SAF=14;SAR=18;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489193;STB=0.518835;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0314034;OID=.;OPOS=55155402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:24:25:32:32:0.561404:18:14:12:12:18:14:12:13
chr5	55206444	.	G	A	579.13	PASS	AF=0.542056;AO=58;DP=107;FAO=58;FDP=107;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=-0.00147289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2131;QD=21.6496;RBI=0.00908174;REFB=-0.00988149;REVB=0.00896151;RO=49;SAF=27;SAR=31;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105093;STB=0.557642;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0103066;OID=.;OPOS=55206444;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:49:49:58:58:0.542056:31:27:29:20:31:27:29:20
chr5	55246001	.	A	G	288.56	PASS	AF=0.92;AO=22;DP=24;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0888132;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.3037;QD=46.1698;RBI=0.109495;REFB=-0.0334229;REVB=0.0640422;RO=2;SAF=11;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501741;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00300796;OID=.;OPOS=55246001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:25:2:2:22:23:0.92:11:11:1:1:12:11:1:1
chr5	56161787	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.429;QD=61.6836;RBI=0.0249839;REFB=0;REVB=0.021109;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.63016e-05;OID=.;OPOS=56161787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr5	56177743	.	G	A	219.71	PASS	AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.011198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.952;QD=12.0387;RBI=0.016795;REFB=-0.0179876;REVB=-0.012517;RO=46;SAF=15;SAR=12;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154877;STB=0.589059;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0302269;OID=.;OPOS=56177743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:46:46:27:27:0.369863:12:15:19:27:12:15:19:27
chr5	56177848	.	TCAA	T	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0167547;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=220.867;QD=18.7684;RBI=0.0270691;REFB=-0.0627505;REVB=0.0212607;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200664;STB=0.58791;STBP=0.578;TYPE=del;VARB=0.0342417;OID=.;OPOS=56177849;OREF=CAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:6:10:6:9:3:5:1:2:1:15:3:5:1:3:0
chr5	56178217	.	A	C	138.95	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0142775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.595;QD=19.8494;RBI=0.0151746;REFB=-0.0194608;REVB=0.00514021;RO=13;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132271;STB=0.574782;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0138316;OID=.;OPOS=56178217;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:7:8:9:4:7:8:9:4
chr5	56242774	.	T	C	220.94	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.0135046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.149;QD=18.0355;RBI=0.0144497;REFB=-0.0121328;REVB=0.00513998;RO=27;SAF=14;SAR=8;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032077;STB=0.518202;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0129047;OID=.;OPOS=56242774;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:8:14:18:9:8:14:18:9
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chr5	56526783	.	G	A	921.14	PASS	AF=0.984615;AO=63;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0136164;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.359;QD=56.6854;RBI=0.02291;REFB=-0.128615;REVB=0.0184246;RO=2;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336963;STB=0.508769;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0012048;OID=.;OPOS=56526783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:65:65:2:1:63:64:0.984615:27:36:0:2:28:36:0:1
chr5	57750267	.	A	C	1138.47	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0440482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1972;QD=59.1415;RBI=0.0485679;REFB=-0.133587;REVB=-0.0204597;RO=1;SAF=33;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108787;STB=0.505746;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00643025;OID=.;OPOS=57750267;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:43:33:0:1:43:33:0:1
chr5	57750350	.	C	G	885.95	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.886;QD=58.0949;RBI=0.0210912;REFB=0;REVB=0.0160394;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9174e-05;OID=.;OPOS=57750350;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:61:0:0:59:61:1:34:25:0:0:34:27:0:0
chr5	57754004	.	C	T	196.81	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0215941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.144;QD=18.3076;RBI=0.0218225;REFB=-0.0324337;REVB=0.0031489;RO=21;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107847;STB=0.534849;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.0118375;OID=.;OPOS=57754004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:21:23:20:20:0.465116:10:10:13:8:10:10:13:10
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chr5	57754808	.	G	A	671.87	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0511833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9519;QD=52.6954;RBI=0.0601057;REFB=-0.0013615;REVB=-0.0315113;RO=2;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427252;STB=0.522718;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=-0.000882242;OID=.;OPOS=57754808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:2:2:49:49:0.960784:21:28:0:2:21:28:0:2
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chr5	60220380	.	TCCCCCCCT	TCCCCCCT,TCCCCCCTC	31.11	PASS	AF=0.205882,0.117647;AO=8,2;DP=35;FAO=7,4;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=4,4;FSAR=3,0;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.0814229,-0.0356722;FXX=0.0285633;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=8.37189,27.9746;QD=3.66028;RBI=0.0944243,0.0469424;REFB=-0.147488,-0.0641784;REVB=-0.0478148,-0.0305136;RO=19;SAF=3,2;SAR=5,0;SRF=5;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.142215,0.636236;STB=0.756174,0.998335;STBP=0.175,0.001;TYPE=del,mnp;VARB=0.18007,-0.0804279;OID=.,.;OPOS=60220381,60220387;OREF=C,CT;OALT=-,TC;OMAPALT=TCCCCCCT,TCCCCCCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.205882,0.117647:8,2:35:7,4:34:23:4,4:3,0:5:18:13:19:3,2:5,0:5:14
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chr5	60982841	.	G	A	404.01	PASS	AF=0.43299;AO=42;DP=98;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.023113;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1565;QD=16.6602;RBI=0.061077;REFB=-0.0123204;REVB=-0.0565349;RO=55;SAF=24;SAR=18;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189621;STB=0.606364;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00896073;OID=.;OPOS=60982841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:55:55:42:42:0.43299:18:24:21:34:18:24:21:34
chr5	61772535	.	G	T	1186.61	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.776;QD=60.8519;RBI=0.0810417;REFB=0;REVB=0.0726262;RO=0;SAF=37;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141671;OID=.;OPOS=61772535;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:78:0:0:74:78:1:37:37:0:0:41:37:0:0
chr5	63665861	.	A	G	257.26	PASS	AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.0220469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.882;QD=13.7205;RBI=0.0460329;REFB=-0.0076782;REVB=0.04041;RO=45;SAF=15;SAR=15;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128937;STB=0.573286;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0142213;OID=.;OPOS=63665861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:45:45:30:30:0.4:15:15:28:17:15:15:28:17
chr5	63802599	.	CT	GC,TC	48.53	PASS	AF=0,0.122807;AO=5,11;DP=115;FAO=0,14;FDP=114;FR=.;FRO=100;FSAF=0,13;FSAR=0,1;FSRF=58;FSRR=42;FWDB=-0.0996943,-0.0611166;FXX=0.0086949;HRUN=3,3;LEN=2,2;MLLD=142.291,71.2943;QD=1.7027;RBI=0.106534,0.0613868;REFB=0.00163261,-0.00777488;REVB=-0.0375563,-0.00575295;RO=87;SAF=5,11;SAR=0,0;SRF=45;SRR=42;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.479553,0.646365;STB=0.5,0.886644;STBP=1,0.005;TYPE=mnp,mnp;VARB=0,0.187621;OID=.,.;OPOS=63802599,63802599;OREF=CT,CT;OALT=GC,TC;OMAPALT=GC,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:49:115:114:87:100:5,11:0,14:0,0.122807:0,0:5,11:45:42:0,1:0,13:58:42
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chr5	63991473	.	G	C	269.33	PASS	AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.0289181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9443;QD=14.1754;RBI=0.0377738;REFB=0.0183307;REVB=-0.0243024;RO=44;SAF=17;SAR=14;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686543;STB=0.544483;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.0456001;OID=.;OPOS=63991473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:45:31:31:0.407895:14:17:27:17:14:17:28:17
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chr5	64023924	.	C	A	269.25	PASS	AF=0.362637;AO=29;DP=89;FAO=33;FDP=91;FR=.;FRO=58;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.000509878;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.183;QD=11.8351;RBI=0.006304;REFB=-0.00601303;REVB=-0.00628334;RO=50;SAF=20;SAR=9;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0857368;STB=0.578353;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0103989;OID=.;OPOS=64023924;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:91:50:58:29:33:0.362637:9:20:31:19:10:23:34:24
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chr5	68546706	.	A	G	278.7	PASS	AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.037064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.598;QD=27.1899;RBI=0.0388016;REFB=-0.0239986;REVB=-0.0114817;RO=16;SAF=15;SAR=10;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201968;STB=0.611562;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0183276;OID=.;OPOS=68546706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:10:15:5:11:10:15:5:11
chr5	68551507	.	T	G	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.000158178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.37;QD=14.6537;RBI=0.0287562;REFB=-0.0139249;REVB=0.0287558;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23873;STB=0.642474;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0154958;OID=.;OPOS=68551507;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:2:6:4:4:2:6:4:4
chr5	68688608	.	T	C	216.17	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0287357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7672;QD=22.1715;RBI=0.0358438;REFB=0.0233814;REVB=0.0214251;RO=18;SAF=11;SAR=10;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292847;STB=0.66251;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=-0.0245131;OID=.;OPOS=68688608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:10:11:3:15:10:11:3:15
chr5	68715310	.	C	T	87.91	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00849067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8048;QD=14.065;RBI=0.0126786;REFB=-0.00259935;REVB=0.00941571;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777652;STB=0.565099;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.010788;OID=.;OPOS=68715310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:25:25:13:14:11:11:0.44:6:5:7:6:6:5:8:6
chr5	68720419	.	T	G	130.65	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0187361;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=264.218;QD=13.7531;RBI=0.0187396;REFB=-0.00924614;REVB=-0.000363342;RO=23;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791205;STB=0.546039;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0155144;OID=.;OPOS=68720419;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:7:8:14:9:7:8:14:9
chr5	68774966	.	A	G	326.41	PASS	AF=0.622222;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0127554;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.909;QD=29.0139;RBI=0.0169118;REFB=-0.0177607;REVB=0.0111045;RO=17;SAF=7;SAR=21;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136096;STB=0.575286;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00788577;OID=.;OPOS=68774966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:17:17:28:28:0.622222:21:7:7:10:21:7:7:10
chr5	70308251	.	C	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.98;QD=52.6132;RBI=0.0293267;REFB=0;REVB=-0.00351267;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.85867e-05;OID=.;OPOS=70308251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr5	70751818	.	T	G	493.95	PASS	AF=0.442623;AO=54;DP=122;FAO=54;FDP=122;FR=.;FRO=68;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=29;FSRR=39;FWDB=-0.0375457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1187;QD=16.1951;RBI=0.038265;REFB=-0.0137599;REVB=-0.00738472;RO=67;SAF=17;SAR=37;SRF=28;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112555;STB=0.568444;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0201045;OID=.;OPOS=70751818;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:67:68:54:54:0.442623:37:17:28:39:37:17:29:39
chr5	70800538	.	G	A	364.53	PASS	AF=0.481013;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0108337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.962;QD=18.4574;RBI=0.0151351;REFB=-0.00286155;REVB=-0.0105689;RO=41;SAF=22;SAR=16;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0855908;STB=0.547754;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.00277318;OID=.;OPOS=70800538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:41:41:38:38:0.481013:16:22:20:21:16:22:20:21
chr5	70806457	.	G	A	76.68	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0302955;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.753;QD=12.7793;RBI=0.0343505;REFB=-0.0158677;REVB=0.0161907;RO=13;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274414;STB=0.639072;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0235964;OID=.;OPOS=70806457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:13:14:10:10:0.416667:6:4:9:4:6:4:9:5
chr5	70806711	.	C	G	58.01	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0207524;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9256;QD=11.6013;RBI=0.0464521;REFB=-0.0151772;REVB=-0.0415588;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.434922;STB=0.755272;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0158926;OID=.;OPOS=70806711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:21:20:12:12:8:8:0.4:3:5:2:10:3:5:2:10
chr5	70806958	.	G	A	182.99	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00454295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.994;QD=17.4274;RBI=0.0394528;REFB=-0.00202585;REVB=-0.0391903;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556529;STB=0.531773;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.00259548;OID=.;OPOS=70806958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:8:11:12:11:8:11:12:11
chr5	70809169	.	A	G	182.1	PASS	AF=0.44186;AO=18;DP=42;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0195139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.744;QD=16.9399;RBI=0.0225418;REFB=-0.00642925;REVB=0.0112846;RO=24;SAF=14;SAR=4;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.314539;STB=0.689436;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00586089;OID=.;OPOS=70809169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:24:24:18:19:0.44186:4:14:12:12:4:15:12:12
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chr5	70840233	.	C	T	333.93	PASS	AF=0.393617;AO=37;DP=94;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=38;FWDB=-0.00445182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7137;QD=14.2097;RBI=0.0252356;REFB=-0.0141366;REVB=-0.0248398;RO=57;SAF=17;SAR=20;SRF=19;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137693;STB=0.57792;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00779691;OID=.;OPOS=70840233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:57:57:37:37:0.393617:20:17:19:38:20:17:19:38
chr5	70849021	.	G	T	268.53	PASS	AF=0.402597;AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0126291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.494;QD=13.9497;RBI=0.0207697;REFB=-0.0249568;REVB=-0.0164889;RO=46;SAF=17;SAR=14;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962664;STB=0.554776;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0275785;OID=.;OPOS=70849021;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:46:46:31:31:0.402597:14:17:21:25:14:17:21:25
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chr5	70945075	.	A	G	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0668568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.389;QD=59.8381;RBI=0.08969;REFB=0;REVB=0.0597869;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000563716;OID=.;OPOS=70945075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr5	71146741	.	T	G	152.4	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00362762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.355;QD=40.6387;RBI=0.00362762;REFB=-0.0908232;REVB=0;RO=1;SAF=14;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141232;OID=.;OPOS=71146741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:0:14:1:0:0:14:1:0
chr5	71146757	.	T	C	453.83	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000970932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.199;QD=55.0093;RBI=0.030148;REFB=0.0139596;REVB=-0.0301323;RO=1;SAF=27;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0169852;STB=0.509085;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=-0.00115535;OID=.;OPOS=71146757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:5:27:1:0:5:27:1:0
chr5	71146882	.	T	C	1988.07	PASS	AF=0.924138;AO=134;DP=146;FAO=134;FDP=145;FR=.;FRO=11;FSAF=81;FSAR=53;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.0209061;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.484;QD=54.8433;RBI=0.0209072;REFB=-0.0451613;REVB=0.000207467;RO=11;SAF=80;SAR=54;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471035;STB=0.524406;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00342645;OID=.;OPOS=71146882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:146:145:11:11:134:134:0.924138:54:80:10:1:53:81:10:1
chr5	71146889	.	A	G	1971.01	PASS	AF=0.923611;AO=133;DP=144;FAO=133;FDP=144;FR=.;FRO=11;FSAF=80;FSAR=53;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.0105667;FXX=0.0136977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.844;QD=54.7503;RBI=0.0212588;REFB=-0.0387066;REVB=0.0184467;RO=11;SAF=80;SAR=53;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046939;STB=0.524749;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00253921;OID=.;OPOS=71146889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:144:144:11:11:133:133:0.923611:53:80:10:1:53:80:10:1
chr5	71490962	.	A	G	291.09	PASS	AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0439224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9313;QD=46.5741;RBI=0.142114;REFB=-0.0480873;REVB=0.135156;RO=1;SAF=17;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264628;STB=0.527754;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0053372;OID=.;OPOS=71490962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:25:25:1:2:23:23:0.92:6:17:1:0:6:17:2:0
chr5	71756102	.	G	A	2254.0	PASS	AF=0.993056;AO=141;DP=141;FAO=143;FDP=144;FR=.;FRO=1;FSAF=85;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0307222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.672;QD=62.611;RBI=0.0757049;REFB=-0.0953219;REVB=0.0691909;RO=0;SAF=83;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.37582e-08;STB=0.502924;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0010365;OID=.;OPOS=71756102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:141:144:0:1:141:143:0.993056:58:83:0:0:58:85:1:0
chr5	71756670	.	C	T	55.8	PASS	AF=0.4;AO=4;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0363328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.456;QD=14.8805;RBI=0.0413141;REFB=-0.0177912;REVB=-0.0196668;RO=6;SAF=1;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388047;STB=0.583063;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0329467;OID=.;OPOS=71756670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:15:15:6:6:4:6:0.4:3:1:4:2:3:3:4:2
chr5	72144209	.	C	T	837.75	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000990457;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.949;QD=57.7761;RBI=0.0159274;REFB=0;REVB=0.0158965;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.37148e-05;OID=.;OPOS=72144209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:28:30:0:0:28:30:0:0
chr5	72174432	.	C	G	936.68	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2396;QD=58.5427;RBI=0.0470917;REFB=0;REVB=-0.0448224;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000363504;OID=.;OPOS=72174432;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:35:28:0:0:35:29:0:0
chr5	72184098	.	C	T	727.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4768;QD=63.2844;RBI=0.0509053;REFB=0;REVB=-0.0452682;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000235864;OID=.;OPOS=72184098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:16:30:0:0:16:30:0:0
chr5	72347222	.	C	CG	624.53	PASS	AF=1;AO=6;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123326;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=74.7899;QD=58.096;RBI=0.129206;REFB=0;REVB=-0.0385338;RO=36;SAF=4;SAR=2;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104246;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00049014;OID=.;OPOS=72347223;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:42:43:43:0:25:18:0:0:4:36:4:2:21:15
chr5	72347223	.	A	G	509.88	PASS	AF=0.860465;AO=37;DP=43;FAO=37;FDP=43;FR=.;FRO=6;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0377161;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.0379;QD=47.4308;RBI=0.0389024;REFB=-0.123738;REVB=-0.00953385;RO=6;SAF=21;SAR=16;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263314;STB=0.514131;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00526665;OID=.;OPOS=72347223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:43:43:6:6:37:37:0.860465:16:21:4:2:16:21:4:2
chr5	72351905	.	A	G	246.52	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0138581;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.743;QD=46.9563;RBI=0.0371526;REFB=-0.00998336;REVB=-0.0344712;RO=1;SAF=11;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0400637;STB=0.521717;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=2.81069e-05;OID=.;OPOS=72351905;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:9:11:1:0:9:11:1:0
chr5	72385914	.	A	G	521.32	PASS	AF=1;AO=32;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186471;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.8414;QD=59.5799;RBI=0.118969;REFB=0;REVB=0.117498;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000761777;OID=.;OPOS=72385914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:32:35:1:13:19:0:0:13:22:0:0
chr5	72419410	.	A	G	519.85	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.684;QD=59.4114;RBI=0.0118395;REFB=0;REVB=-0.00258467;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.41058e-05;OID=.;OPOS=72419410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:20:15:0:0:20:15:0:0
chr5	72419456	.	C	G	358.07	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00958668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8733;QD=55.0875;RBI=0.0574826;REFB=0;REVB=-0.0566776;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000929541;OID=.;OPOS=72419456;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:14:11:0:0:15:11:0:0
chr5	72419617	.	C	A	1020.77	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027104;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.638;QD=59.1753;RBI=0.0369436;REFB=0;REVB=0.0251038;RO=0;SAF=25;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010426;OID=.;OPOS=72419617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:66:69:0:0:65:69:1:40:25:0:0:43:26:0:0
chr5	72742882	.	T	C	191.06	PASS	AF=0.403509;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.00393897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.042;QD=13.4076;RBI=0.00408916;REFB=-0.0231074;REVB=0.00109803;RO=32;SAF=15;SAR=8;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337837;STB=0.675526;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0380831;OID=.;OPOS=72742882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:32:34:23:23:0.403509:8:15:10:22:8:15:12:22
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chr5	74442920	.	A	G	321.24	PASS	AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=-0.00207858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.048;QD=16.2652;RBI=0.00879416;REFB=-0.0066391;REVB=-0.00854498;RO=44;SAF=18;SAR=17;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126404;STB=0.570977;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00732456;OID=.;OPOS=74442920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:44:44:35:35:0.443038:17:18:17:27:17:18:17:27
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chr5	74970024	.	T	C	288.82	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.00770651;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.021;QD=16.2713;RBI=0.00807689;REFB=-0.00345582;REVB=-0.00241783;RO=39;SAF=22;SAR=10;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789023;STB=0.544526;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00336549;OID=.;OPOS=74970024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:10:22:24:15:10:22:24:15
chr5	75001582	.	A	G	248.23	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0439241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.74;QD=16.2776;RBI=0.0439601;REFB=-0.0159084;REVB=0.00177789;RO=33;SAF=16;SAR=12;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341333;STB=0.519217;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.016148;OID=.;OPOS=75001582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:33:28:28:0.459016:12:16:20:13:12:16:20:13
chr5	75003678	.	T	C	681.77	PASS	AF=0.4;AO=76;DP=190;FAO=76;FDP=190;FR=.;FRO=114;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=37;FSRR=77;FWDB=0.0142577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.916;QD=14.3531;RBI=0.015565;REFB=-0.0124618;REVB=0.00624414;RO=114;SAF=36;SAR=40;SRF=37;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161863;STB=0.590555;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0173785;OID=.;OPOS=75003678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:190:190:114:114:76:76:0.4:40:36:37:77:40:36:37:77
chr5	75427935	.	G	A	152.77	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.00869049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4781;QD=13.5791;RBI=0.0494299;REFB=0.00650632;REVB=0.0486599;RO=28;SAF=5;SAR=12;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.462341;STB=0.766297;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00833316;OID=.;OPOS=75427935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:12:5:21:7:12:5:21:7
chr5	75884734	.	G	A	194.29	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0151793;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0166;QD=16.1906;RBI=0.0245509;REFB=-0.0254005;REVB=-0.019296;RO=28;SAF=11;SAR=9;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509692;STB=0.529259;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0305086;OID=.;OPOS=75884734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:28:28:20:20:0.416667:9:11:14:14:9:11:14:14
chr5	75906851	.	T	C	1208.9	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.071;QD=61.2102;RBI=0.0472697;REFB=0;REVB=0.0328385;RO=0;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159652;OID=.;OPOS=75906851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:34:45:0:0:34:45:0:0
chr5	75923285	.	C	T	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.1787;QD=64.1526;RBI=0.0375887;REFB=0;REVB=-0.0338779;RO=0;SAF=41;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90022e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000147966;OID=.;OPOS=75923285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:8:41:0:0:8:41:0:0
chr5	75923294	.	T	G	785.98	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.612;QD=64.1614;RBI=0.038346;REFB=0;REVB=-0.0112359;RO=0;SAF=35;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64128e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6533e-05;OID=.;OPOS=75923294;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:49:0:0:45:49:1:10:35:0:0:10:39:0:0
chr5	75923307	.	A	G	772.68	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0103186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.325;QD=61.8143;RBI=0.0104749;REFB=-0.0102863;REVB=0.00180278;RO=1;SAF=40;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116232;STB=0.50617;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.000370123;OID=.;OPOS=75923307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:9:40:1:0:9:40:1:0
chr5	75932869	.	C	T	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.627;QD=58.7811;RBI=0.0439373;REFB=0;REVB=0.0224155;RO=0;SAF=43;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122816;OID=.;OPOS=75932869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:22:43:0:0:22:43:0:0
chr5	75932965	.	G	C	1026.32	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.376;QD=59.4969;RBI=0.0360076;REFB=0;REVB=0.0314103;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140125;OID=.;OPOS=75932965;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0
chr5	75960865	.	T	C	465.08	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3094;QD=58.1345;RBI=0.0606602;REFB=0;REVB=0.0387634;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000490117;OID=.;OPOS=75960865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr5	76003254	.	AAAAC	TAAAC,TAAAT	932.45	PASS	AF=0.535211,0.464789;AO=31,25;DP=70;FAO=38,33;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=25,16;FSAR=13,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106679,0.0063473;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,5;MLLD=20.9114,214.774;QD=52.5326;RBI=0.197639,0.00991432;REFB=0,0;REVB=0.166375,0.00761613;RO=1;SAF=21,12;SAR=10,13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0443701,0.0343588;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.018309,0.0022057;OID=.,.;OPOS=76003254,76003254;OREF=A,AAAAC;OALT=T,TAAAT;OMAPALT=TAAAC,TAAAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:70:71:1:0:31,25:38,33:0.535211,0.464789:10,13:21,12:0:1:13,17:25,16:0:0
chr5	76030796	.	T	C	371.58	PASS	AF=0.569231;AO=37;DP=64;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0121522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.615;QD=22.8663;RBI=0.0175403;REFB=-0.0176155;REVB=0.0126486;RO=27;SAF=14;SAR=23;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371162;STB=0.526396;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0125822;OID=.;OPOS=76030796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:27:28:37:37:0.569231:23:14:9:18:23:14:9:19
chr5	76128521	.	G	A	1005.91	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2779;QD=59.1709;RBI=0.0286716;REFB=0;REVB=-0.00579804;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001088;OID=.;OPOS=76128521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:31:36:0:0:32:36:0:0
chr5	76129053	.	T	C	745.71	PASS	AF=1;AO=45;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.138246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.7683;QD=56.2797;RBI=0.142404;REFB=0;REVB=-0.0341615;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139335;OID=.;OPOS=76129053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:45:53:1:22:23:0:0:23:30:0:0
chr5	76171252	.	A	C	206.44	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00125062;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.066;QD=16.5148;RBI=0.0185998;REFB=-0.0387742;REVB=-0.0185577;RO=23;SAF=15;SAR=6;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806656;STB=0.562852;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0491513;OID=.;OPOS=76171252;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:50:23:29:21:21:0.42:6:15:18:5:6:15:18:11
chr5	76621399	.	C	T	616.21	PASS	AF=0.597826;AO=55;DP=92;FAO=55;FDP=92;FR=.;FRO=37;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0592089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.7755;QD=26.7916;RBI=0.060351;REFB=-0.049439;REVB=-0.0116853;RO=37;SAF=30;SAR=25;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236909;STB=0.512918;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0323244;OID=.;OPOS=76621399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:37:37:55:55:0.597826:25:30:19:18:25:30:19:18
chr5	76704849	.	T	C	631.96	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.287;QD=61.6544;RBI=0.0408507;REFB=0;REVB=0.0360826;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.38922e-05;OID=.;OPOS=76704849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:39:41:1:22:17:0:0:23:18:0:0
chr5	76708987	.	A	G	507.87	PASS	AF=0.457627;AO=54;DP=123;FAO=54;FDP=118;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=0.011852;FXX=0.0406471;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.35;QD=17.216;RBI=0.0122289;REFB=-0.00836117;REVB=0.0030125;RO=55;SAF=21;SAR=33;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208684;STB=0.61107;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0115898;OID=.;OPOS=76708987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:118:55:64:54:54:0.457627:33:21:34:21:33:21:38:26
chr5	76722443	.	G	A	744.29	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9017;QD=63.3438;RBI=0.0553644;REFB=0;REVB=-0.0284436;RO=0;SAF=15;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240844;OID=.;OPOS=76722443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:32:15:0:0:32:15:0:0
chr5	76722891	.	T	C	289.28	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.065463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.6239;QD=52.5964;RBI=0.0658174;REFB=0;REVB=0.00682098;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00192684;OID=.;OPOS=76722891;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:13:8:0:0:13:9:0:0
chr5	76722895	.	A	G	76.7	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00762977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.654;QD=12.7826;RBI=0.0368469;REFB=-0.000953953;REVB=0.0360483;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20469;STB=0.639072;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00244083;OID=.;OPOS=76722895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:13:14:10:10:0.416667:4:6:5:8:4:6:5:9
chr5	76734084	.	C	T	1533.07	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115984;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.676;QD=63.8778;RBI=0.0282428;REFB=0;REVB=0.0257514;RO=0;SAF=52;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3298e-05;OID=.;OPOS=76734084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:95:96:1:43:52:0:0:43:53:0:0
chr5	76916335	.	G	GC	910.49	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.9282;QD=47.9203;RBI=0.0165111;REFB=0;REVB=0.0104528;RO=2;SAF=53;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017518;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000297096;OID=.;OPOS=76916336;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:74:76:76:76:0:55:21:0:0:16:2:53:21:2:0
chr5	76926578	.	T	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308485;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=283.566;QD=57.2026;RBI=0.0308975;REFB=0;REVB=-0.00173914;RO=0;SAF=24;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93566e-05;OID=.;OPOS=76926578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:6:24:0:0:6:24:0:0
chr5	77011066	.	T	C	278.76	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00833759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.243;QD=21.8637;RBI=0.0267692;REFB=-0.0105273;REVB=0.0254376;RO=23;SAF=13;SAR=15;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598752;STB=0.533216;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00769156;OID=.;OPOS=77011066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:15:13:9:14:15:13:9:14
chr5	77745853	.	C	A,CA	323.47	PASS	AF=0,1;AO=2,18;DP=27;FAO=0,27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0,19;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00764266,0.0736663;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=266.595,22.7564;QD=47.922;RBI=0.0159767,0.239178;REFB=0,0;REVB=0.0140302,0.22755;RO=7;SAF=2,17;SAR=0,1;SRF=0;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.804017,0.684905;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0191722;OID=.,.;OPOS=77745853,77745854;OREF=C,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:27:27:7:0:2,18:0,27:0,1:0,1:2,17:0:7:0,8:0,19:0:0
chr5	77781152	.	TTACAA	T	265.51	PASS	AF=0.419048;AO=42;DP=109;FAO=44;FDP=105;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=-0.00186009;FXX=0.0277752;HRUN=3;LEN=5;MLLD=217.664;QD=10.1146;RBI=0.0212559;REFB=-0.0242944;REVB=0.0211743;RO=61;SAF=22;SAR=20;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070004;STB=0.552357;STBP=0.393;TYPE=del;VARB=0.032852;OID=.;OPOS=77781153;OREF=TACAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.419048:42:109:44:105:61:22:22:36:25:99:61:22:20:36:25
chr5	77781390	.	G	A	137.38	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00747761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.33;QD=11.2146;RBI=0.0146303;REFB=-0.00514313;REVB=-0.012575;RO=33;SAF=7;SAR=9;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881603;STB=0.552364;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00701929;OID=.;OPOS=77781390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:33:33:16:16:0.326531:9:7:17:16:9:7:17:16
chr5	77781785	.	C	CT,T	722.5	PASS	AF=1,0;AO=46,2;DP=56;FAO=55,0;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27,0;FSAR=28,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00746127,-0.0312835;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=26.0677,6.27088;QD=52.5452;RBI=0.127571,0.0650746;REFB=0,0;REVB=0.127353,0.0570618;RO=7;SAF=25,0;SAR=21,2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.028511,-0.577625;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00274599,0;OID=.,.;OPOS=77781786,77781785;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:7:0:46,2:55,0:1,0:21,2:25,0:3:4:28,0:27,0:0:0
chr5	77782447	.	C	G	717.02	PASS	AF=0.42623;AO=78;DP=183;FAO=78;FDP=183;FR=.;FRO=105;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=62;FSRR=43;FWDB=-0.0278139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1302;QD=15.6725;RBI=0.0911468;REFB=-0.0214426;REVB=-0.0867994;RO=105;SAF=35;SAR=43;SRF=62;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144872;STB=0.580818;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0352875;OID=.;OPOS=77782447;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:183:105:105:78:78:0.42623:43:35:62:43:43:35:62:43
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chr5	77784438	.	T	A	377.25	PASS	AF=0.430108;AO=40;DP=93;FAO=40;FDP=93;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=0.00722913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.2108;QD=16.2256;RBI=0.0307302;REFB=-0.00441544;REVB=-0.0298677;RO=53;SAF=26;SAR=14;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129118;STB=0.572844;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0143194;OID=.;OPOS=77784438;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:53:53:40:40:0.430108:14:26:28:25:14:26:28:25
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chr5	78373431	.	C	T	983.03	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00536936;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.774;QD=59.5773;RBI=0.0159312;REFB=0;REVB=0.0149991;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125923;OID=.;OPOS=78373431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:30:36:0:0:30:36:0:0
chr5	78421959	.	G	A	590.75	PASS	AF=0.556701;AO=53;DP=96;FAO=54;FDP=97;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0170153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.761;QD=24.3608;RBI=0.0431311;REFB=-0.0220628;REVB=-0.039633;RO=43;SAF=29;SAR=24;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104745;STB=0.552362;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0241883;OID=.;OPOS=78421959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:43:43:53:54:0.556701:24:29:18:25:25:29:18:25
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chr5	78573790	.	A	T	487.34	PASS	AF=0.510638;AO=47;DP=93;FAO=48;FDP=94;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=-0.000590216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9619;QD=20.7379;RBI=0.0248654;REFB=-0.0224767;REVB=0.0248584;RO=46;SAF=27;SAR=20;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237883;STB=0.634092;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0117267;OID=.;OPOS=78573790;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:46:46:47:48:0.510638:20:27:14:32:20:28:14:32
chr5	78596044	.	T	C	597.22	PASS	AF=0.466165;AO=62;DP=132;FAO=62;FDP=133;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=29;FSRR=42;FWDB=0.00460708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.01;QD=17.9616;RBI=0.00752776;REFB=-0.00112838;REVB=0.00595332;RO=69;SAF=29;SAR=33;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593778;STB=0.531905;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.00140865;OID=.;OPOS=78596044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:133:69:71:62:62:0.466165:33:29:28:41:33:29:29:42
chr5	78617534	.	T	G	337.61	PASS	AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.00091949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=357.23;QD=20.1555;RBI=0.00439457;REFB=-0.0195689;REVB=-0.0042973;RO=32;SAF=19;SAR=16;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170599;STB=0.509461;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0174156;OID=.;OPOS=78617534;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:16:19:18:14:16:19:18:14
chr5	79025157	.	A	G	185.82	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.00397243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.951;QD=19.0582;RBI=0.00520519;REFB=-0.00492799;REVB=-0.0033636;RO=20;SAF=5;SAR=14;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193465;STB=0.610468;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00400862;OID=.;OPOS=79025157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:14:5:9:11:14:5:9:11
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chr5	79277817	.	A	C	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0766578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.287;QD=21.0138;RBI=0.0839621;REFB=0.0382719;REVB=0.0342522;RO=7;SAF=4;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145526;STB=0.583179;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=-0.00475408;OID=.;OPOS=79277817;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:7:4:4:3:7:4:4:3
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chr5	79439630	.	G	A	234.68	PASS	AF=0.489362;AO=22;DP=46;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.014257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.073;QD=19.9729;RBI=0.0206797;REFB=-0.00891693;REVB=0.0149796;RO=24;SAF=15;SAR=7;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159889;STB=0.517226;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0106968;OID=.;OPOS=79439630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:24:24:22:23:0.489362:7:15:16:8:7:16:16:8
chr5	79616083	.	G	C	904.44	PASS	AF=0.984375;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0266089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.145;QD=56.5272;RBI=0.0281217;REFB=-0.059727;REVB=-0.00909947;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.000115069;OID=.;OPOS=79616083;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:64:0:1:62:63:0.984375:33:29:0:0:34:29:0:1
chr5	79616274	.	TA	T	38.34	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.104953;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=17.0362;QD=7.66835;RBI=0.131199;REFB=-0.0184634;REVB=-0.0787275;RO=13;SAF=6;SAR=1;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260866;STB=0.66611;STBP=0.398;TYPE=del;VARB=0.0531935;OID=.;OPOS=79616275;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.35:7:20:7:20:13:6:1:9:4:38:13:6:1:9:4
chr5	79617357	.	T	C	340.73	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.403;QD=54.516;RBI=0.0157662;REFB=0;REVB=-0.00945752;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07983e-06;OID=.;OPOS=79617357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:10:14:0:0:11:14:0:0
chr5	79733079	.	T	C	145.16	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.138;QD=44.6641;RBI=0.0397197;REFB=0;REVB=0.0329295;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000557239;OID=.;OPOS=79733079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:12:13:1:8:4:0:0:8:5:0:0
chr5	79734297	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.632;QD=40.7629;RBI=0.044364;REFB=0;REVB=0.0414069;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125335;OID=.;OPOS=79734297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
chr5	79734409	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00759867;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.26;QD=51.1846;RBI=0.0367419;REFB=0;REVB=0.0359476;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181066;OID=.;OPOS=79734409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:6:14:0:0:6:14:0:0
chr5	79735858	.	A	G	1659.59	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.055;QD=60.3488;RBI=0.0445724;REFB=0;REVB=0.0274125;RO=0;SAF=62;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52354e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71165e-05;OID=.;OPOS=79735858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:48:62:0:0:48:62:0:0
chr5	79745469	.	A	G	1091.97	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0338528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.0298;QD=58.2382;RBI=0.0426057;REFB=-0.0986087;REVB=-0.0258696;RO=0;SAF=37;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139226;OID=.;OPOS=79745469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:75:75:0:0:74:75:1:37:37:0:0:37:38:0:0
chr5	79815658	.	T	C	1167.27	PASS	AF=0.975;AO=78;DP=81;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00510545;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.524;QD=58.3636;RBI=0.0418829;REFB=-0.14801;REVB=0.0415706;RO=0;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510414;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00217838;OID=.;OPOS=79815658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:81:80:0:2:78:78:0.975:47:31:0:0:47:31:0:2
chr5	79855372	.	A	G	670.16	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00846115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.691;QD=62.3403;RBI=0.0567736;REFB=0;REVB=-0.0561396;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118873;OID=.;OPOS=79855372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr5	79966029	.	G	A	754.43	PASS	AF=1;AO=36;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.936;QD=56.938;RBI=0.0717659;REFB=0;REVB=-0.0615594;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.52931e-05;OID=.;OPOS=79966029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:36:53:1:22:14:0:0:22:31:0:0
chr5	80149981	.	A	G	542.36	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0567964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.586;QD=58.6333;RBI=0.0589541;REFB=0;REVB=0.0158038;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166247;OID=.;OPOS=80149981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr5	80168937	.	G	A	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00288216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0218;QD=59.1419;RBI=0.0442425;REFB=0;REVB=-0.0441485;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000295773;OID=.;OPOS=80168937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:27:40:0:0:27:40:0:0
chr5	80409729	.	T	C	31.6	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0109815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.483;QD=14.0438;RBI=0.0112481;REFB=0.014984;REVB=-0.00243459;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251123;STB=0.651584;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=-0.0110367;OID=.;OPOS=80409729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:2:3:1:3:2:3:1:3
chr5	80502736	.	C	G	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=0.0251908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.814;QD=8.24627;RBI=0.0252673;REFB=-0.019692;REVB=0.00196559;RO=15;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236887;STB=0.642522;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0221282;OID=.;OPOS=80502736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:5:2:2:13:5:2:2:13
chr5	80736444	.	A	G	137.08	PASS	AF=0.425;AO=12;DP=38;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0188956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.714;QD=13.7083;RBI=0.0442771;REFB=-0.0351769;REVB=0.0400427;RO=23;SAF=9;SAR=3;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229895;STB=0.54994;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0474483;OID=.;OPOS=80736444;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:40:23:23:12:17:0.425:3:9:13:10:6:11:13:10
chr5	80756848	.	TAAAAAAA	TAAAAAA,TAAAAAAT	1859.08	PASS	AF=0.403509,0.536842;AO=68,52;DP=304;FAO=115,153;FDP=285;FR=.;FRO=17;FSAF=35,98;FSAR=80,55;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=-0.417639,-0.0536197;FXX=0.0686252;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.10195,148.409;QD=26.0924;RBI=0.437611,0.0554027;REFB=-0.168027,-0.0395272;REVB=0.130694,0.0139424;RO=40;SAF=20,28;SAR=48,24;SRF=4;SRR=36;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.173364,0.343325;STB=0.519744,0.548991;STBP=0.287,0;TYPE=del,snp;VARB=0.156923,0.0325568;OID=.,.;OPOS=80756849,80756855;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=TAAAAAA,TAAAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.403509,0.536842:68,52:304:115,153:285:17:35,98:80,55:3:14:99:40:20,28:48,24:4:36
chr5	81354389	.	T	C	136.59	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.00673344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.314;QD=10.9271;RBI=0.00971021;REFB=-0.0114718;REVB=-0.00699636;RO=34;SAF=12;SAR=4;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419502;STB=0.749687;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0253152;OID=.;OPOS=81354389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:4:12:13:21:4:12:13:21
chr5	81549216	.	C	T	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.512;QD=58.1418;RBI=0.0315769;REFB=0;REVB=0.00373501;RO=0;SAF=8;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.20173e-05;OID=.;OPOS=81549216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:24:8:0:0:24:8:0:0
chr5	81549240	.	C	A	246.51	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00791806;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.481;QD=46.9544;RBI=0.0117518;REFB=-0.0766358;REVB=0.00868389;RO=0;SAF=3;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514272;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.000844024;OID=.;OPOS=81549240;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:0:1:20:20:0.952381:17:3:0:0:17:3:0:1
chr5	81572184	.	G	C	923.03	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.193;QD=57.689;RBI=0.0495334;REFB=0;REVB=-0.00201714;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000631562;OID=.;OPOS=81572184;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:64:0:0:62:64:1:29:33:0:0:29:35:0:0
chr5	82500734	.	G	T	198.7	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0344697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.424;QD=19.3858;RBI=0.0366959;REFB=-0.00906651;REVB=0.0125869;RO=21;SAF=7;SAR=13;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304087;STB=0.517224;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0115032;OID=.;OPOS=82500734;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:13:7:8:13:13:7:8:13
chr5	82833145	.	G	A	559.64	PASS	AF=1;AO=29;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.136815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.649;QD=60.5017;RBI=0.13705;REFB=0;REVB=0.00802971;RO=0;SAF=5;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151474;OID=.;OPOS=82833145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:29:37:1:24:5:0:0:24:13:0:0
chr5	82833369	.	A	G	629.97	PASS	AF=0.895833;AO=44;DP=49;FAO=43;FDP=48;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.00303328;FXX=0.020404;HRUN=6;LEN=1;MLLD=270.181;QD=52.4972;RBI=0.0166301;REFB=-0.0810272;REVB=0.0163511;RO=4;SAF=26;SAR=18;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0544288;STB=0.540256;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.00120277;OID=.;OPOS=82833369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:49:48:4:5:44:43:0.895833:18:26:1:3:18:25:1:4
chr5	82834299	.	G	A	1227.46	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.484;QD=61.3729;RBI=0.0425571;REFB=0;REVB=0.0282942;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.77521e-05;OID=.;OPOS=82834299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:49:31:0:0:49:31:0:0
chr5	82834630	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.224;QD=52.613;RBI=0.0357321;REFB=0;REVB=-0.0237755;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.55531e-05;OID=.;OPOS=82834630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr5	82835545	.	A	G	801.33	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.864;QD=57.2376;RBI=0.0360151;REFB=0;REVB=0.0327324;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.52533e-05;OID=.;OPOS=82835545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:32:24:0:0:32:24:0:0
chr5	82835724	.	T	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.142;QD=50.4134;RBI=0.0204181;REFB=0;REVB=0.0177325;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60519e-05;OID=.;OPOS=82835724;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr5	82837631	.	G	T	557.04	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.625;QD=60.2205;RBI=0.0768426;REFB=0;REVB=0.0723002;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322702;OID=.;OPOS=82837631;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr5	82875800	.	C	T	1563.56	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0490035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.442;QD=63.8186;RBI=0.0499111;REFB=0;REVB=-0.00947471;RO=0;SAF=48;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.10658e-05;OID=.;OPOS=82875800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:97:98:1:49:48:0:0:49:49:0:0
chr5	82940273	.	C	G	470.71	PASS	AF=0.382979;AO=48;DP=141;FAO=54;FDP=141;FR=.,HEALED;FRO=87;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=54;FSRR=33;FWDB=-0.0870656;FXX=0.00704176;HRUN=6;LEN=1;MLLD=31.8908;QD=13.3536;RBI=0.099315;REFB=-0.0545977;REVB=-0.0477812;RO=58;SAF=24;SAR=24;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168876;STB=0.563402;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0462618;OID=.;OPOS=82940273;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:58:87:48:54:0.382979:24:24:30:28:26:28:54:33
chr5	82948542	.	T	C	238.88	PASS	AF=0.358025;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.00624436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.049;QD=11.7967;RBI=0.00751214;REFB=-0.010248;REVB=-0.00417615;RO=52;SAF=11;SAR=18;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115681;STB=0.566882;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.025472;OID=.;OPOS=82948542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:52:52:29:29:0.358025:18:11:25:27:18:11:25:27
chr5	82999358	.	T	G	133.75	PASS	AF=0.424242;AO=13;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0060223;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=167.964;QD=16.2116;RBI=0.00664361;REFB=-0.00195874;REVB=-0.00280525;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.548319;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=-0.00243515;OID=.;OPOS=82999358;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:13:17:13:14:0.424242:7:6:6:7:7:7:7:10
chr5	83360520	.	C	T	343.38	PASS	AF=0.493151;AO=36;DP=72;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.00383196;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.584;QD=18.8151;RBI=0.00702902;REFB=-0.0243289;REVB=-0.00589264;RO=36;SAF=24;SAR=12;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230471;STB=0.635437;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0195317;OID=.;OPOS=83360520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:36:37:36:36:0.493151:12:24:15:21:12:24:15:22
chr5	85582712	.	T	C	92.13	PASS	AF=0.214286;AO=15;DP=70;FAO=15;FDP=70;FR=.;FRO=55;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.0603976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.499;QD=5.26461;RBI=0.0981757;REFB=-0.00430325;REVB=0.0773989;RO=53;SAF=3;SAR=12;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369651;STB=0.738509;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0190107;OID=.;OPOS=85582712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:70:70:53:55:15:15:0.214286:12:3:25:28:12:3:26:29
chr5	85583507	.	T	G	46.75	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0214892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.225;QD=10.3883;RBI=0.0758288;REFB=-0.00766678;REVB=-0.0727201;RO=11;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116701;STB=0.571224;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.00717461;OID=.;OPOS=85583507;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:3:4:5:6:3:4:5:6
chr5	85583642	.	C	T	182.91	PASS	AF=0.44186;AO=18;DP=42;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00623486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.197;QD=17.015;RBI=0.00937281;REFB=-0.0198502;REVB=0.00699829;RO=24;SAF=6;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896612;STB=0.528467;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0308423;OID=.;OPOS=85583642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:24:24:18:19:0.44186:12:6:10:14:12:7:10:14
chr5	86513974	.	A	G	467.33	PASS	AF=0.459459;AO=51;DP=110;FAO=51;FDP=111;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=38;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.0695924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.212;QD=16.8408;RBI=0.0728358;REFB=-0.0224019;REVB=-0.0214929;RO=59;SAF=13;SAR=38;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255944;STB=0.648865;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0319767;OID=.;OPOS=86513974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:59:60:51:51:0.459459:38:13:29:30:38:13:30:30
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chr5	89769728	.	T	C	323.98	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0807661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2595;QD=53.9962;RBI=0.0978043;REFB=0;REVB=0.0551589;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00197748;OID=.;OPOS=89769728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:24:0:0:22:24:1:16:6:0:0:17:7:0:0
chr5	89810077	.	G	A	126.32	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0486832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1991;QD=21.0527;RBI=0.0945242;REFB=-0.000591458;REVB=-0.0810233;RO=10;SAF=7;SAR=7;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0736238;STB=0.541607;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=-0.00326153;OID=.;OPOS=89810077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:7:7:6:4:7:7:6:4
chr5	89816299	.	C	A	223.05	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=-0.100444;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.892;QD=16.5222;RBI=0.104895;REFB=0.0054499;REVB=-0.03023;RO=28;SAF=17;SAR=8;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0780248;STB=0.550226;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.00488834;OID=.;OPOS=89816299;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:28:29:25:25:0.462963:8:17:21:7:8:17:22:7
chr5	89816309	.	A	AT	73.63	PASS	AF=0.395833;AO=16;DP=52;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.000780317;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.9422;QD=6.13587;RBI=0.0455048;REFB=0.00528344;REVB=0.0454981;RO=33;SAF=11;SAR=5;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971719;STB=0.503813;STBP=0.978;TYPE=ins;VARB=-0.0307554;OID=.;OPOS=89816310;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.395833:16:52:19:48:29:13:6:20:9:73:33:11:5:25:8
chr5	89820984	.	T	C	123.24	PASS	AF=0.268657;AO=18;DP=67;FAO=18;FDP=67;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.00577955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.814;QD=7.35785;RBI=0.0143271;REFB=-0.00829759;REVB=-0.0131096;RO=49;SAF=6;SAR=12;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263393;STB=0.659821;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0273675;OID=.;OPOS=89820984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:49:49:18:18:0.268657:12:6:27:22:12:6:27:22
chr5	89943571	.	G	T	111.18	PASS	AF=0.541667;AO=11;DP=22;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00109318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7905;QD=18.5306;RBI=0.0138655;REFB=-0.0283854;REVB=-0.0138223;RO=10;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144334;STB=0.578384;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.024866;OID=.;OPOS=89943571;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:24:10:11:11:13:0.541667:9:2:3:7:10:3:4:7
chr5	89979589	.	G	A	380.3	PASS	AF=0.414141;AO=40;DP=99;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.0248912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8595;QD=15.3656;RBI=0.0374372;REFB=0.0100313;REVB=0.0279638;RO=58;SAF=19;SAR=21;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133912;STB=0.567535;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.00745695;OID=.;OPOS=89979589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:58:58:40:41:0.414141:21:19:35:23:21:20:35:23
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chr5	89988504	.	A	G	453.32	PASS	AF=0.45045;AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=37;FSAR=13;FSRF=47;FSRR=14;FWDB=0.0161109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7057;QD=16.3359;RBI=0.0265101;REFB=-0.00621785;REVB=0.0210529;RO=61;SAF=37;SAR=13;SRF=47;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399071;STB=0.522229;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.00608511;OID=.;OPOS=89988504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:61:61:50:50:0.45045:13:37:47:14:13:37:47:14
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chr5	90052289	.	G	A	193.61	PASS	AF=0.328947;AO=25;DP=76;FAO=25;FDP=76;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.0312561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2777;QD=10.19;RBI=0.0648076;REFB=-0.0125179;REVB=-0.0567722;RO=49;SAF=16;SAR=9;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00901772;STB=0.523093;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0321783;OID=.;OPOS=90052289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:49:51:25:25:0.328947:9:16:31:18:9:16:31:20
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chr5	90107108	.	A	G	1399.61	PASS	AF=0.98913;AO=82;DP=83;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0560041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.552;QD=60.8526;RBI=0.0843793;REFB=0.0544734;REVB=0.0631141;RO=0;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14462e-08;STB=0.506328;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-0.000285901;OID=.;OPOS=90107108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:83:92:0:1:82:91:0.98913:46:36:0:0:52:39:1:0
chr5	90119293	.	C	T	352.58	PASS	AF=0.426966;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.025298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0186;QD=15.8462;RBI=0.0275661;REFB=-0.00444969;REVB=0.0109499;RO=51;SAF=15;SAR=23;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00274541;STB=0.501547;STBP=0.992;TYPE=snp;VARB=0.0112961;OID=.;OPOS=90119293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:51:51:38:38:0.426966:23:15:20:31:23:15:20:31
chr5	90119324	.	G	A	972.87	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0384241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.075;QD=58.9616;RBI=0.0385035;REFB=0;REVB=-0.00247073;RO=0;SAF=23;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.20684e-05;OID=.;OPOS=90119324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:43:23:0:0:43:23:0:0
chr5	90151589	.	G	A	473.25	PASS	AF=0.40458;AO=53;DP=134;FAO=53;FDP=131;FR=.;FRO=78;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=45;FSRR=33;FWDB=-5.55336e-05;FXX=0.0223864;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.515;QD=14.4503;RBI=0.0157492;REFB=-0.0012656;REVB=-0.0157491;RO=72;SAF=35;SAR=18;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11462;STB=0.553468;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00348244;OID=.;OPOS=90151589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:131:72:78:53:53:0.40458:18:35:40:32:18:35:45:33
chr5	93731985	.	A	G	1531.8	PASS	AF=0.989796;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0209219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.025;QD=62.5224;RBI=0.0238665;REFB=-0.0923805;REVB=0.011484;RO=1;SAF=41;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00854504;STB=0.504424;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000277677;OID=.;OPOS=93731985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:97:98:1:1:96:97:0.989796:55:41:0:1:56:41:0:1
chr5	93798142	.	A	T	199.49	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00240779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.554;QD=15.646;RBI=0.00841808;REFB=-0.014904;REVB=-0.00806639;RO=29;SAF=14;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222769;STB=0.627124;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.023987;OID=.;OPOS=93798142;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:8:14:12:17:8:14:12:17
chr5	93987532	.	C	A	135.81	PASS	AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=-0.0154836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.78;QD=10.4465;RBI=0.0771892;REFB=-0.00302122;REVB=-0.0756203;RO=35;SAF=6;SAR=11;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307271;STB=0.681208;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00884186;OID=.;OPOS=93987532;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:11:6:22:13:11:6:22:13
chr5	94278129	.	T	C	53.26	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0012803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0204;QD=7.89029;RBI=0.0448253;REFB=-0.0120336;REVB=-0.044807;RO=18;SAF=6;SAR=2;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425351;STB=0.512164;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0396432;OID=.;OPOS=94278129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:18:19:8:8:0.296296:2:6:14:4:2:6:14:5
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chr5	94957676	.	A	T	119.88	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0878788;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9823;QD=14.9845;RBI=0.0961267;REFB=-0.0293918;REVB=-0.038957;RO=17;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837908;STB=0.531206;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0361544;OID=.;OPOS=94957676;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:17:18:14:14:0.4375:7:7:10:7:7:7:10:8
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chr5	95084131	.	G	A	1098.68	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0085742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.153;QD=60.2019;RBI=0.0154099;REFB=0;REVB=0.0128042;RO=0;SAF=26;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2476e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.45109e-05;OID=.;OPOS=95084131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:47:26:0:0:47:26:0:0
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chr5	95234377	.	C	T	84.58	PASS	AF=0.27907;AO=11;DP=42;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.00804085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0249;QD=7.86776;RBI=0.0552386;REFB=-0.0344206;REVB=0.0546502;RO=29;SAF=8;SAR=3;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14317;STB=0.542301;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0611648;OID=.;OPOS=95234377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:42:43:29:31:11:12:0.27907:3:8:18:11:4:8:19:12
chr5	95234392	.	A	C	136.7	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0104017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.601;QD=10.9357;RBI=0.0216712;REFB=-0.0105178;REVB=-0.0190117;RO=34;SAF=10;SAR=6;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00892191;STB=0.505312;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0294348;OID=.;OPOS=95234392;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:6:10:21:13:6:10:21:13
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chr5	95728440	.	A	G,T	1475.35	PASS	AF=0.957895,0.0421053;AO=91,4;DP=95;FAO=91,4;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=43,2;FSAR=48,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0502201,-0.0130258;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=50.0339,13.8809;QD=62.12;RBI=0.0685198,0.0238169;REFB=0,0;REVB=0.0466144,0.0199392;RO=0;SAF=43,2;SAR=48,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00227263,0.131065;OID=.,.;OPOS=95728440,95728440;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:95:95:0:0:91,4:91,4:0.957895,0.0421053:48,2:43,2:0:0:48,2:43,2:0:0
chr5	95759035	.	C	A	553.22	PASS	AF=0.508929;AO=57;DP=112;FAO=57;FDP=112;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=-0.00137057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.96;QD=19.7577;RBI=0.018477;REFB=0.0013758;REVB=0.018426;RO=55;SAF=25;SAR=32;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158919;STB=0.587582;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=-0.0010286;OID=.;OPOS=95759035;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:55:55:57:57:0.508929:32:25:34:21:32:25:34:21
chr5	95865526	.	G	A	300.45	PASS	AF=0.327731;AO=39;DP=119;FAO=39;FDP=119;FR=.;FRO=80;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=47;FWDB=0.0316828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8925;QD=10.0991;RBI=0.0685735;REFB=-0.0128713;REVB=0.0608155;RO=80;SAF=11;SAR=28;SRF=33;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169432;STB=0.598877;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.029709;OID=.;OPOS=95865526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:80:80:39:39:0.327731:28:11:33:47:28:11:33:47
chr5	96079387	.	C	T	775.38	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6274;QD=63.296;RBI=0.0254756;REFB=0;REVB=0.0133815;RO=0;SAF=14;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000361026;OID=.;OPOS=96079387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:48:49:1:34:14:0:0:35:14:0:0
chr5	96079402	.	C	T	755.8	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136332;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.715;QD=57.0413;RBI=0.0138288;REFB=0;REVB=0.00231747;RO=0;SAF=14;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50771e-05;OID=.;OPOS=96079402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:39:14:0:0:39:14:0:0
chr5	96231000	.	G	T	2930.45	PASS	AF=1;AO=186;DP=188;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00547373;FXX=0.0106377;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.355;QD=63.0205;RBI=0.0171051;REFB=-0.0847645;REVB=-0.0162057;RO=1;SAF=108;SAR=78;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00438863;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.95065e-05;OID=.;OPOS=96231000;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:188:186:1:0:186:186:1:78:108:1:0:78:108:0:0
chr5	96232142	.	T	A	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.754;QD=58.7811;RBI=0.122162;REFB=0;REVB=0.00283507;RO=0;SAF=12;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128409;OID=.;OPOS=96232142;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:53:12:0:0:53:12:0:0
chr5	96235896	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00844671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.094;QD=58.5872;RBI=0.0292119;REFB=0;REVB=0.027964;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.90368e-05;OID=.;OPOS=96235896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr5	96237326	.	G	A	1342.59	PASS	AF=0.988636;AO=86;DP=87;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0159562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8708;QD=61.0269;RBI=0.0447287;REFB=-0.0102771;REVB=0.0417859;RO=1;SAF=59;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172216;STB=0.509089;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.000542683;OID=.;OPOS=96237326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:88:1:1:86:87:0.988636:27:59:0:1:27:60:0:1
chr5	96245343	.	C	T	902.6	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.734;QD=58.2324;RBI=0.0313591;REFB=0;REVB=-0.0284879;RO=0;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.23559e-05;OID=.;OPOS=96245343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:25:37:0:0:25:37:0:0
chr5	96245439	.	C	T	820.76	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204775;FXX=0.0172384;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.595;QD=57.5971;RBI=0.0250503;REFB=0;REVB=0.0144288;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119051;OID=.;OPOS=96245439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:31:26:0:0:31:26:0:0
chr5	96249115	.	C	T	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00976673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.048;QD=59.1431;RBI=0.0420695;REFB=0;REVB=0.0409201;RO=0;SAF=41;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.59467e-05;OID=.;OPOS=96249115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:26:41:0:0:26:41:0:0
chr5	96350710	.	G	A	1189.69	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00549993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3316;QD=61.0097;RBI=0.00584406;REFB=0;REVB=-0.0019758;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.40272e-05;OID=.;OPOS=96350710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:77:78:1:42:35:0:0:43:35:0:0
chr5	96498783	.	G	A	632.23	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00635868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.627;QD=61.6813;RBI=0.0392904;REFB=0;REVB=0.0387725;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228087;OID=.;OPOS=96498783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:13:28:0:0:13:28:0:0
chr5	96503523	.	C	T	223.08	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131418;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.287;QD=49.5738;RBI=0.0657546;REFB=0;REVB=0.064428;RO=0;SAF=13;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000326658;OID=.;OPOS=96503523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:5:13:0:0:5:13:0:0
chr5	96512865	.	T	A	972.89	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=345.785;QD=58.9627;RBI=0.0536468;REFB=0;REVB=0.0516903;RO=0;SAF=29;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.96501e-05;OID=.;OPOS=96512865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:37:29:0:0:37:29:0:0
chr5	96512871	.	T	A	990.62	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.102;QD=59.1417;RBI=0.0268246;REFB=0;REVB=-0.00781735;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119632;OID=.;OPOS=96512871;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:38:29:0:0:38:29:0:0
chr5	96513471	.	G	C	647.18	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3667;QD=61.6365;RBI=0.0348678;REFB=0;REVB=-0.0187421;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000556845;OID=.;OPOS=96513471;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0
chr5	96518792	.	T	G	618.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.553;QD=61.834;RBI=0.170598;REFB=0;REVB=0.167666;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00212394;OID=.;OPOS=96518792;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:28:40:1:13:15:0:0:25:15:0:0
chr5	99382109	.	T	G	245.64	PASS	AF=0.295652;AO=34;DP=107;FAO=34;FDP=115;FR=.;FRO=81;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=40;FWDB=-0.0175572;FXX=0.00861995;HRUN=6;LEN=1;MLLD=37.7077;QD=8.54384;RBI=0.0296573;REFB=-0.0229513;REVB=0.0239019;RO=73;SAF=13;SAR=21;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131924;STB=0.588427;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0373816;OID=.;OPOS=99382109;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:115:73:81:34:34:0.295652:21:13:36:37:21:13:41:40
chr5	99388523	.	A	G	261.39	PASS	AF=0.360465;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=86;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.00692766;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.433;QD=12.1575;RBI=0.00975296;REFB=-0.00507018;REVB=-0.00686498;RO=55;SAF=14;SAR=17;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03765;STB=0.521659;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0136247;OID=.;OPOS=99388523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:55:55:31:31:0.360465:17:14:23:32:17:14:23:32
chr5	100068875	.	C	T	512.84	PASS	AF=0.430769;AO=56;DP=130;FAO=56;FDP=130;FR=.;FRO=74;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=-0.0507789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2656;QD=15.7797;RBI=0.060212;REFB=-0.0109865;REVB=-0.032357;RO=74;SAF=17;SAR=39;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172322;STB=0.596903;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0163959;OID=.;OPOS=100068875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:74:74:56:56:0.430769:39:17:34:40:39:17:34:40
chr5	100145388	.	A	C	446.99	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4251;QD=57.6759;RBI=0.0750002;REFB=0;REVB=0.0710076;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124403;OID=.;OPOS=100145388;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr5	100145662	.	A	AACAC	60.96	PASS	AF=0.380952;AO=7;DP=30;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=-0.0316491;FXX=0.159936;HRUN=2;LEN=4;MLLD=161.992;QD=11.6113;RBI=0.056981;REFB=-0.0467655;REVB=0.0473832;RO=19;SAF=6;SAR=1;SRF=17;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973266;STB=0.75962;STBP=0.442;TYPE=ins;VARB=0.0962857;OID=.;OPOS=100145663;OREF=-;OALT=ACAC;OMAPALT=AACAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.380952:7:30:8:21:13:6:2:13:0:60:19:6:1:17:2
chr5	100146447	.	G	T	968.49	PASS	AF=0.971429;AO=64;DP=69;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0381524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.051;QD=55.3423;RBI=0.0794449;REFB=-0.0258274;REVB=-0.0696842;RO=1;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140981;STB=0.50042;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0004544;OID=.;OPOS=100146447;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:70:1:2:64:68:0.971429:33:31:0:1:33:35:1:1
chr5	101466768	.	C	G	237.13	PASS	AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.0498522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.422;QD=13.7466;RBI=0.118686;REFB=-0.0246735;REVB=0.107709;RO=41;SAF=18;SAR=10;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462369;STB=0.526297;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0157696;OID=.;OPOS=101466768;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:41:41:28:28:0.405797:10:18:28:13:10:18:28:13
chr5	101575091	.	C	T	223.66	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0222068;FXX=0.031741;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.8569;QD=14.666;RBI=0.0557575;REFB=-0.00781589;REVB=-0.0511444;RO=37;SAF=13;SAR=13;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139115;STB=0.524571;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0110229;OID=.;OPOS=101575091;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:61:37:35:26:26:0.42623:13:13:18:19:13:13:16:19
chr5	101638381	.	G	A	952.08	PASS	AF=0.970588;AO=66;DP=69;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0343436;FXX=0.0144907;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.695;QD=56.0047;RBI=0.0343631;REFB=-0.17634;REVB=-0.00115742;RO=1;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136944;STB=0.514281;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.00185709;OID=.;OPOS=101638381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:69:68:1:2:66:66:0.970588:34:32:0:1:34:32:0:2
chr5	101816104	.	G	A	695.86	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.124862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9469;QD=60.5092;RBI=0.127944;REFB=-0.0959387;REVB=-0.0279145;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513507;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000984596;OID=.;OPOS=101816104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:0:1:45:45:0.978261:18:27:0:0:18:27:0:1
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chr5	102365186	.	G	A	296.6	PASS	AF=0.553571;AO=30;DP=55;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0100724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5762;QD=21.1854;RBI=0.0274359;REFB=-0.0165683;REVB=-0.0255201;RO=25;SAF=11;SAR=19;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129756;STB=0.560763;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0152452;OID=.;OPOS=102365186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:25:25:30:31:0.553571:19:11:13:12:19:12:13:12
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chr5	109035302	.	T	G,TAAAG	668.44	PASS	AF=0.0909091,0.909091;AO=4,38;DP=44;FAO=4,40;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=4,20;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607402,-0.0155763;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,4;MLLD=168.533,273.011;QD=60.7673;RBI=0.0672014,0.0307676;REFB=0,0;REVB=0.0287517,0.0265334;RO=0;SAF=4,19;SAR=0,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0589983,-0.000416735;OID=.,.;OPOS=109035302,109035303;OREF=T,-;OALT=G,AAAG;OMAPALT=G,TAAAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:44:44:0:0:4,38:4,40:0.0909091,0.909091:0,19:4,19:0:0:0,20:4,20:0:0
chr5	109035496	.	A	G	340.66	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.112;QD=54.5049;RBI=0.0325143;REFB=0;REVB=0.0204171;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.09568e-05;OID=.;OPOS=109035496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr5	109117171	.	A	G	2301.8	PASS	AF=0.993464;AO=152;DP=154;FAO=152;FDP=153;FR=.;FRO=1;FSAF=113;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0072165;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0072;QD=60.1779;RBI=0.0643214;REFB=-0.170028;REVB=0.0639153;RO=1;SAF=113;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120389;STB=0.506328;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00428122;OID=.;OPOS=109117171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:154:153:1:1:152:152:0.993464:39:113:0:1:39:113:0:1
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chr5	109181682	.	A	T	1320.49	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.737;QD=62.1405;RBI=0.0553721;REFB=0;REVB=0.0367573;RO=0;SAF=63;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35046e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.31307e-05;OID=.;OPOS=109181682;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:82:85:1:19:63:0:0:20:65:0:0
chr5	109190935	.	TCTC	T	1586.04	PASS	AF=1;AO=105;DP=108;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369317;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=3;MLLD=157.343;QD=59.8506;RBI=0.0375491;REFB=0;REVB=-0.00678078;RO=0;SAF=48;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=4.07377e-05;OID=.;OPOS=109190936;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:105:108:106:106:0:48:58:0:0:9:0:48:57:0:0
chr5	109849584	.	CAAAAAT	ACAAAAT,CAAAAA,CAAAA,CAAAAT	318.52	PASS	AF=0,0.272277,0,0.371287;AO=10,32,30,61;DP=202;FAO=0,55,0,75;FDP=202;FR=.;FRO=72;FSAF=0,55,0,29;FSAR=0,0,0,46;FSRF=48;FSRR=24;FWDB=-0.0455199,0.0323775,-0.0317104,-0.108546;FXX=0;HRUN=1,2,5,5;LEN=2,1,2,1;MLLD=37.8274,13.6003,13.3977,6.54359;QD=6.30737;RBI=0.113093,0.0487327,0.033894,0.109414;REFB=-0.0423545,-0.0567537,-0.102045,-0.150657;REVB=-0.103527,0.0364222,0.0119688,-0.0137528;RO=50;SAF=6,32,30,28;SAR=4,0,0,33;SRF=30;SRR=20;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0.823489,0.818181,-0.115514;STB=0.5,0.999705,0.5,0.635643;STBP=1,0,1,0.002;TYPE=mnp,del,del,del;VARB=0.0287975,0.0833776,0.151037,0.173845;OID=.,.,.,.;OPOS=109849584,109849590,109849589,109849585;OREF=CA,T,AT,A;OALT=AC,-,-,-;OMAPALT=ACAAAAT,CAAAAA,CAAAA,CAAAAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/4:99:202:202:50:72:10,32,30,61:0,55,0,75:0,0.272277,0,0.371287:4,0,0,33:6,32,30,28:30:20:0,0,0,46:0,55,0,29:48:24
chr5	109864483	.	T	C	116.14	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0106593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.995;QD=11.331;RBI=0.0108411;REFB=-0.00973582;REVB=0.00197722;RO=27;SAF=5;SAR=9;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158474;STB=0.50942;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0250225;OID=.;OPOS=109864483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:9:5:10:17:9:5:10:17
chr5	110020500	.	TC	CT,T	425.8	PASS	AF=0.084507,0.915493;AO=5,42;DP=73;FAO=6,65;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=0,37;FSAR=6,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169554,0.301835;FXX=0.0273935;HRUN=1,6;LEN=2,1;MLLD=174.844,8.34385;QD=23.9888;RBI=0.0863388,0.520039;REFB=0.0483756,-0.0220687;REVB=0.0846576,0.423481;RO=20;SAF=0,29;SAR=5,13;SRF=6;SRR=14;SSEN=0,0.466667;SSEP=0,0.904762;SSSB=-0.633036,0.243254;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=-0.0312352,0.0595077;OID=.,.;OPOS=110020500,110020501;OREF=TC,C;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:73:71:20:0:5,42:6,65:0.084507,0.915493:5,13:0,29:6:14:6,28:0,37:0:0
chr5	110784822	.	A	G	552.56	PASS	AF=0.408163;AO=60;DP=147;FAO=60;FDP=147;FR=.;FRO=87;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=49;FSRR=38;FWDB=0.0103143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6127;QD=15.0356;RBI=0.0360352;REFB=-0.00645309;REVB=0.0345276;RO=86;SAF=31;SAR=29;SRF=49;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0558609;STB=0.527623;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.00530681;OID=.;OPOS=110784822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:86:87:60:60:0.408163:29:31:49:37:29:31:49:38
chr5	111500816	.	C	CTAAAA	421.02	PASS	AF=0.373134;AO=48;DP=136;FAO=50;FDP=134;FR=.;FRO=84;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=-0.0106302;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=5;MLLD=271.551;QD=12.5677;RBI=0.0107274;REFB=-0.0117515;REVB=-0.00144078;RO=83;SAF=17;SAR=31;SRF=50;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274099;STB=0.639944;STBP=0.01;TYPE=ins;VARB=0.0213389;OID=.;OPOS=111500817;OREF=-;OALT=TAAAA;OMAPALT=CTAAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.373134:48:136:50:134:84:18:32:49:35:99:83:17:31:50:33
chr5	111504479	.	C	T	1505.9	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0365514;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.965;QD=59.6396;RBI=0.0370221;REFB=0;REVB=0.00588491;RO=0;SAF=57;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0001324;OID=.;OPOS=111504479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:100:101:1:43:57:0:0:44:57:0:0
chr5	111506069	.	G	A	1026.4	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0332814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.084;QD=59.5012;RBI=0.0334206;REFB=0;REVB=0.00304667;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.63805e-05;OID=.;OPOS=111506069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:31:38:0:0:31:38:0:0
chr5	111519740	.	T	C	2829.14	PASS	AF=0.953846;AO=186;DP=196;FAO=186;FDP=195;FR=.;FRO=9;FSAF=95;FSAR=91;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0423208;FXX=0.00510178;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.348;QD=58.0337;RBI=0.0722202;REFB=0.0117318;REVB=0.0585211;RO=5;SAF=95;SAR=91;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0055186;STB=0.513314;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.000175548;OID=.;OPOS=111519740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:196:195:5:9:186:186:0.953846:91:95:2:3:91:95:2:7
chr5	111530284	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9758;QD=53.2771;RBI=0.0318857;REFB=0;REVB=0.0189393;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109802;OID=.;OPOS=111530284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr5	111545670	.	C	G	1157.02	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00814062;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.01;QD=60.8957;RBI=0.0112035;REFB=0;REVB=0.00769734;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.44437e-05;OID=.;OPOS=111545670;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
chr5	111611076	.	A	G	315.52	PASS	AF=0.596154;AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0139553;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.197;QD=24.2706;RBI=0.0152945;REFB=-0.0246157;REVB=-0.00625859;RO=20;SAF=12;SAR=19;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466514;STB=0.537251;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0298644;OID=.;OPOS=111611076;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:20:21:31:31:0.596154:19:12:9:11:19:12:10:11
chr5	112162854	.	T	C	2102.67	PASS	AF=1;AO=133;DP=134;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00456937;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7991;QD=62.7662;RBI=0.0597006;REFB=0;REVB=0.0595254;RO=0;SAF=69;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115236;OID=.;OPOS=112162854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:134:0:0:133:134:1:64:69:0:0:65:69:0:0
chr5	112164561	.	G	A	1208.16	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00835737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3525;QD=61.1725;RBI=0.0554814;REFB=0;REVB=0.0548483;RO=0;SAF=35;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223281;OID=.;OPOS=112164561;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:44:35:0:0:44:35:0:0
chr5	112175770	.	G	A	754.63	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0179218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.715;QD=54.8819;RBI=0.0186423;REFB=0.0529634;REVB=0.00513258;RO=1;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149611;STB=0.507934;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.00135267;OID=.;OPOS=112175770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:31:23:0:1:31:23:0:1
chr5	112176325	.	G	A	671.87	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0281159;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.273;QD=52.696;RBI=0.0318155;REFB=-0.102905;REVB=0.0148904;RO=2;SAF=23;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391734;STB=0.520825;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00348277;OID=.;OPOS=112176325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:2:2:49:49:0.960784:26:23:2:0:26:23:2:0
chr5	112176559	.	T	G	698.31	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.072564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7897;QD=54.7693;RBI=0.0770948;REFB=-0.115617;REVB=0.0260399;RO=1;SAF=32;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014486;STB=0.507689;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00428543;OID=.;OPOS=112176559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:18:32:1:0:18:32:1:0
chr5	112176756	.	T	A	920.06	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.447;QD=58.4167;RBI=0.031045;REFB=0;REVB=0.0290958;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267259;OID=.;OPOS=112176756;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:31:32:0:0:31:32:0:0
chr5	112177171	.	G	A	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0192856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.822;QD=24.3282;RBI=0.0394133;REFB=-0.0760279;REVB=0.0343726;RO=2;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174483;STB=0.599732;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00197563;OID=.;OPOS=112177171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:3:4:2:0:3:4:2:0
chr5	112177434	.	C	CA	50.99	PASS	AF=0.521739;AO=8;DP=24;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.258832;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=11.1504;QD=8.86761;RBI=0.259159;REFB=-0.0529419;REVB=-0.0130157;RO=14;SAF=2;SAR=6;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0515286;STB=0.581247;STBP=0.555;TYPE=ins;VARB=0.0938774;OID=.;OPOS=112177435;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.521739:8:24:12:23:11:2:10:3:8:49:14:2:6:3:11
chr5	112200098	.	A	G	885.22	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0780175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8833;QD=58.0471;RBI=0.0854129;REFB=0;REVB=0.0347652;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105026;OID=.;OPOS=112200098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0
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chr5	112312528	.	T	C	329.15	PASS	AF=0.615385;AO=32;DP=52;FAO=32;FDP=52;FR=.;FRO=20;FSAF=30;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0369931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2294;QD=25.3191;RBI=0.0574555;REFB=-0.0251195;REVB=-0.0439618;RO=19;SAF=30;SAR=2;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464775;STB=0.75821;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0383261;OID=.;OPOS=112312528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:19:20:32:32:0.615385:2:30:12:7:2:30:13:7
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chr5	112358131	.	T	C	211.07	PASS	AF=0.44898;AO=21;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00284686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.216;QD=17.2302;RBI=0.013497;REFB=-0.010111;REVB=-0.0131933;RO=27;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650418;STB=0.519982;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0126253;OID=.;OPOS=112358131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:21:22:0.44898:8:13:15:12:9:13:15:12
chr5	112379289	.	G	A	261.65	PASS	AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.00932067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.457;QD=14.7407;RBI=0.0202903;REFB=-0.00654297;REVB=0.0180228;RO=41;SAF=17;SAR=13;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178239;STB=0.600864;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00863944;OID=.;OPOS=112379289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:41:41:30:30:0.422535:13:17:16:25:13:17:16:25
chr5	112384725	.	GGTCACTGGGCA	G	90.33	PASS	AF=0.314815;AO=16;DP=51;FAO=17;FDP=54;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.00257099;FXX=0.0357079;HRUN=2;LEN=11;MLLD=294.681;QD=6.69104;RBI=0.0690609;REFB=-0.0187519;REVB=-0.0690131;RO=27;SAF=12;SAR=4;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407926;STB=0.57768;STBP=0.473;TYPE=del;VARB=0.0396684;OID=.;OPOS=112384726;OREF=GTCACTGGGCA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.314815:16:51:17:54:37:13:4:25:12:90:27:12:4:21:6
chr5	112384802	.	G	A	983.68	PASS	AF=1;AO=66;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.124502;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5696;QD=58.7273;RBI=0.148981;REFB=0;REVB=0.0818199;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223594;OID=.;OPOS=112384802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:67:0:0:66:67:1:36:30:0:0:36:31:0:0
chr5	112399791	.	G	A	1470.54	PASS	AF=0.894309;AO=96;DP=111;FAO=110;FDP=123;FR=.;FRO=13;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0.0547126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9241;QD=47.8223;RBI=0.114659;REFB=-0.212434;REVB=0.100764;RO=15;SAF=55;SAR=41;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145756;STB=0.552836;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0237685;OID=.;OPOS=112399791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:111:123:15:13:96:110:0.894309:41:55:0:15:55:55:0:13
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chr5	112824069	.	T	C	31.44	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.111719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.216;QD=13.9723;RBI=0.128762;REFB=-0.0861922;REVB=0.0640198;RO=4;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118169;STB=0.571155;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.020906;OID=.;OPOS=112824069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:3:2:1:3:3:2:1:3
chr5	113589389	.	T	A	430.73	PASS	AF=0.5;AO=43;DP=85;FAO=43;FDP=86;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.010686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.779;QD=20.0339;RBI=0.0121729;REFB=-0.00806752;REVB=0.00583004;RO=40;SAF=24;SAR=19;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115826;STB=0.558113;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00729381;OID=.;OPOS=113589389;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:40:43:43:43:0.5:19:24:17:23:19:24:19:24
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chr5	113698631	.	T	TGCC	159.61	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.00704927;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=3;MLLD=137.309;QD=24.5556;RBI=0.0167023;REFB=-0.0618499;REVB=-0.0151418;RO=13;SAF=11;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0782386;STB=0.505611;STBP=0.972;TYPE=ins;VARB=0.0443911;OID=.;OPOS=113698632;OREF=-;OALT=GCC;OMAPALT=TGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.615385:16:29:16:26:10:11:5:7:3:69:13:11:5:10:3
chr5	113829121	.	A	G	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00971262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.059;QD=58.4195;RBI=0.0222316;REFB=0;REVB=0.0199977;RO=0;SAF=17;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71045e-05;OID=.;OPOS=113829121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:46:17:0:0:46:17:0:0
chr5	114460580	.	C	G	1551.85	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.262;QD=63.3407;RBI=0.0554747;REFB=0;REVB=0.0291084;RO=0;SAF=52;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360821;OID=.;OPOS=114460580;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:97:98:1:45:52:0:0:46:52:0:0
chr5	114462355	.	C	T	834.31	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.492;QD=57.5388;RBI=0.0240217;REFB=0;REVB=0.00895052;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11125e-05;OID=.;OPOS=114462355;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:22:35:0:0:23:35:0:0
chr5	114611185	.	A	C	303.9	PASS	AF=0.52459;AO=32;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.0139664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.087;QD=19.9277;RBI=0.0139698;REFB=-0.00507629;REVB=0.000307619;RO=28;SAF=13;SAR=19;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254889;STB=0.647855;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0126501;OID=.;OPOS=114611185;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:28:29:32:32:0.52459:19:13:20:8:19:13:21:8
chr5	115249078	.	C	T	61.61	PASS	AF=0.169231;AO=11;DP=65;FAO=11;FDP=65;FR=.;FRO=54;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=-0.00221558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.354;QD=3.79124;RBI=0.0183163;REFB=-0.00831043;REVB=-0.0181818;RO=53;SAF=7;SAR=4;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182074;STB=0.506013;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0227009;OID=.;OPOS=115249078;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:65:65:53:54:11:11:0.169231:4:7:33:20:4:7:34:20
chr5	115249271	.	G	A	519.6	PASS	AF=0.385093;AO=62;DP=161;FAO=62;FDP=161;FR=.;FRO=99;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=42;FSRR=57;FWDB=-0.0329936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1301;QD=12.9093;RBI=0.0372413;REFB=-0.0112834;REVB=-0.0172725;RO=98;SAF=24;SAR=38;SRF=42;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467414;STB=0.523802;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0338875;OID=.;OPOS=115249271;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:161:98:99:62:62:0.385093:38:24:42:56:38:24:42:57
chr5	115298232	.	G	C	1062.58	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.204;QD=59.8636;RBI=0.105548;REFB=0;REVB=-0.0151969;RO=0;SAF=31;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.82782e-05;OID=.;OPOS=115298232;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:71:0:0:69:71:1:38:31:0:0:38:33:0:0
chr5	115298378	.	C	T	638.54	PASS	AF=1;AO=27;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0812433;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.637;QD=62.2961;RBI=0.0845001;REFB=0;REVB=0.0232337;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000403302;OID=.;OPOS=115298378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:27:41:1:9:18:0:0:21:20:0:0
chr5	115298475	.	T	C	438.48	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2861;QD=56.5778;RBI=0.0308628;REFB=0;REVB=0.0122929;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00384831;OID=.;OPOS=115298475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:11:19:0:0:12:19:0:0
chr5	115298518	.	A	G	483.02	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5844;QD=58.5482;RBI=0.0728211;REFB=0;REVB=0.0623563;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109691;OID=.;OPOS=115298518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
chr5	115298977	.	C	T	2980.1	PASS	AF=0.980488;AO=191;DP=198;FAO=201;FDP=205;FR=.;FRO=4;FSAF=114;FSAR=87;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0918701;FXX=0.00966137;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.23;QD=58.1483;RBI=0.107329;REFB=-0.199436;REVB=0.0554925;RO=5;SAF=105;SAR=86;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122877;STB=0.503636;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0184435;OID=.;OPOS=115298977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:198:205:5:4:191:201:0.980488:86:105:4:1:87:114:3:1
chr5	115341611	.	G	T	2390.66	PASS	AF=1;AO=157;DP=158;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0096262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.955;QD=60.5231;RBI=0.0260965;REFB=-0.0662545;REVB=0.0242562;RO=0;SAF=74;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.87047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113618;OID=.;OPOS=115341611;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:158:158:0:0:157:158:1:83:74:0:0:84:74:0:0
chr5	115341638	.	G	C	2349.95	PASS	AF=1;AO=153;DP=155;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00608097;FXX=0.0128197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.587;QD=61.0377;RBI=0.00680838;REFB=0;REVB=0.00306201;RO=0;SAF=71;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6227e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.50975e-05;OID=.;OPOS=115341638;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:155:154:0:0:153:154:1:82:71:0:0:83:71:0:0
chr5	115362148	.	A	AG,G	1161.85	PASS	AF=0.0128205,0.987179;AO=11,66;DP=78;FAO=1,77;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=0,48;FSAR=1,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120847,0.0589567;FXX=0;HRUN=0,5;LEN=1,1;MLLD=74.0836,85.743;QD=59.5819;RBI=0.0121661,0.0589883;REFB=0,0;REVB=-0.00140573,0.00193062;RO=1;SAF=11,37;SAR=0,29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.826036,0.0160134;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.136826,0.000609672;OID=.,.;OPOS=115362149,115362148;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:78:78:1:0:11,66:1,77:0.0128205,0.987179:0,29:11,37:0:1:1,29:0,48:0:0
chr5	115394626	.	G	A	719.82	PASS	AF=0.622449;AO=57;DP=94;FAO=61;FDP=98;FR=.;FRO=37;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0200914;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.807;QD=29.3805;RBI=0.0309145;REFB=-0.0212472;REVB=0.0234956;RO=35;SAF=30;SAR=27;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923787;STB=0.53519;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0148324;OID=.;OPOS=115394626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:98:35:37:57:61:0.622449:27:30:23:12:27:34:24:13
chr5	115428334	.	G	T	503.91	PASS	AF=0.495327;AO=53;DP=107;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.0119841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.97;QD=18.8376;RBI=0.0200988;REFB=0.00956012;REVB=0.0161351;RO=54;SAF=29;SAR=24;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419935;STB=0.523222;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.00779239;OID=.;OPOS=115428334;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:54:54:53:53:0.495327:24:29:32:22:24:29:32:22
chr5	115469773	.	C	T	403.82	PASS	AF=0.547945;AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=73;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.00551932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.414;QD=22.127;RBI=0.0109182;REFB=-0.0098859;REVB=0.00942038;RO=32;SAF=19;SAR=21;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120617;STB=0.572561;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00877328;OID=.;OPOS=115469773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:32:33:40:40:0.547945:21:19:20:12:21:19:21:12
chr5	115811220	.	T	C	278.47	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.000195688;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.667;QD=25.3156;RBI=0.000981164;REFB=-0.0262936;REVB=-0.000961452;RO=18;SAF=13;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691082;STB=0.525527;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0119935;OID=.;OPOS=115811220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:18:19:25:25:0.568182:12:13:11:7:12:13:11:8
chr5	115813726	.	A	G	1482.79	PASS	AF=1;AO=93;DP=96;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0737995;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8291;QD=63.0973;RBI=0.0761901;REFB=0;REVB=0.0189362;RO=0;SAF=52;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233927;OID=.;OPOS=115813726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:94:0:0:93:94:1:41:52:0:0:42:52:0:0
chr5	118324112	.	CG	C,CC	207.81	PASS	AF=0.5,0.166667;AO=11,9;DP=30;FAO=15,5;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=13,3;FSAR=2,2;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0516297,0.0431552;FXX=0.0322477;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=197.166,199.383;QD=27.7075;RBI=0.0536732,0.0465971;REFB=-0.0582914,-0.0418966;REVB=-0.0146693,-0.017576;RO=10;SAF=11,5;SAR=0,4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.789066,-0.133598;STB=0.618866,0.571156;STBP=0.242,0.783;TYPE=del,snp;VARB=0.0277651,0.0103068;OID=.,.;OPOS=118324113,118324113;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5,0.166667:11,9:30:15,5:30:10:13,3:2,2:7:3:84:10:11,5:0,4:7:3
chr5	118451873	.	T	G	267.12	PASS	AF=0.631579;AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0157386;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.991;QD=28.1177;RBI=0.0159444;REFB=-0.0325007;REVB=0.00255309;RO=14;SAF=5;SAR=19;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293949;STB=0.663828;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0161179;OID=.;OPOS=118451873;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:14:14:24:24:0.631579:19:5:8:6:19:5:8:6
chr5	118474641	.	A	G	170.47	PASS	AF=0.62963;AO=17;DP=27;FAO=17;FDP=27;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.080197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6033;QD=25.2549;RBI=0.0803832;REFB=0.0189936;REVB=-0.00546822;RO=10;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151346;STB=0.584318;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=-0.00829562;OID=.;OPOS=118474641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:10:10:17:17:0.62963:9:8:7:3:9:8:7:3
chr5	118479532	.	AC	AA,CA	34.53	PASS	AF=0,0.115385;AO=4,2;DP=52;FAO=0,6;FDP=52;FR=.;FRO=46;FSAF=0,5;FSAR=0,1;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.000612203,0.0985106;FXX=0;HRUN=1,8;LEN=1,2;MLLD=172.069,40.6009;QD=2.65581;RBI=0.0131787,0.124437;REFB=-0.00278088,-0.0416436;REVB=-0.0131645,-0.0760279;RO=46;SAF=4,1;SAR=0,1;SRF=18;SRR=28;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.596856,0.0859306;STB=0.5,0.861988;STBP=1,0.097;TYPE=snp,mnp;VARB=0,0.0418953;OID=.,.;OPOS=118479533,118479532;OREF=C,AC;OALT=A,CA;OMAPALT=AA,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:34:52:52:46:46:4,2:0,6:0,0.115385:0,1:4,1:18:28:0,1:0,5:18:28
chr5	118484804	.	G	A	808.13	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.224;QD=56.7105;RBI=0.0495473;REFB=0;REVB=0.00191084;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120002;OID=.;OPOS=118484804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:57:0:0:56:57:1:32:24:0:0:33:24:0:0
chr5	118485238	.	G	C	444.94	PASS	AF=0.483871;AO=43;DP=91;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.00855325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.788;QD=19.137;RBI=0.0200791;REFB=-0.0150378;REVB=0.0181662;RO=45;SAF=25;SAR=18;SRF=17;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186096;STB=0.571397;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0138509;OID=.;OPOS=118485238;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:93:45:48:43:45:0.483871:18:25:17:28:20:25:20:28
chr5	118490402	.	G	A	247.3	PASS	AF=0.560976;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0554591;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8181;QD=24.1272;RBI=0.0750253;REFB=-0.000274946;REVB=-0.0505281;RO=18;SAF=9;SAR=14;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434061;STB=0.524208;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=-0.00249628;OID=.;OPOS=118490402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:18:18:23:23:0.560976:14:9:8:10:14:9:8:10
chr5	118513697	.	C	G	52.35	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00410551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5266;QD=6.54345;RBI=0.0421496;REFB=0.00756154;REVB=-0.0419492;RO=24;SAF=6;SAR=2;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118735;STB=0.57672;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=-0.0258856;OID=.;OPOS=118513697;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:2:6:16:8:2:6:16:8
chr5	118811533	.	G	A	254.72	PASS	AF=0.394737;AO=29;DP=75;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0145712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.696;QD=13.4061;RBI=0.019986;REFB=-0.0279903;REVB=-0.0136792;RO=45;SAF=13;SAR=16;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183435;STB=0.58531;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0295237;OID=.;OPOS=118811533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:45:46:29:30:0.394737:16:13:28:17:16:14:28:18
chr5	118827842	.	T	C	193.92	PASS	AF=0.375;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0145833;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.285;QD=12.12;RBI=0.014632;REFB=-0.0133532;REVB=-0.00119194;RO=38;SAF=8;SAR=16;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157377;STB=0.608603;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0263431;OID=.;OPOS=118827842;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:38:40:24:24:0.375:16:8:18:20:16:8:20:20
chr5	118845139	.	G	A	62.25	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00200169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1262;QD=35.5742;RBI=0.0236753;REFB=0;REVB=0.0235905;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174994;OID=.;OPOS=118845139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr5	118861713	.	A	G	224.59	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0229402;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.744;QD=19.1136;RBI=0.0384921;REFB=-0.0128208;REVB=0.0309094;RO=24;SAF=8;SAR=14;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112812;STB=0.50209;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0136955;OID=.;OPOS=118861713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:24:25:22:22:0.468085:14:8:9:15:14:8:9:16
chr5	118872184	.	C	T	393.88	PASS	AF=0.603175;AO=39;DP=63;FAO=38;FDP=63;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00608241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8158;QD=25.0081;RBI=0.0763733;REFB=-0.0102186;REVB=-0.0761307;RO=24;SAF=15;SAR=24;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830034;STB=0.534865;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0077607;OID=.;OPOS=118872184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:24:25:39:38:0.603175:24:15:12:12:23:15:12:13
chr5	118969960	.	C	T	274.22	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.00664697;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=204.675;QD=24.9294;RBI=0.0150353;REFB=-0.00445653;REVB=0.0134862;RO=18;SAF=12;SAR=13;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265795;STB=0.654563;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00307821;OID=.;OPOS=118969960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:18:19:25:25:0.568182:13:12:15:3:13:12:16:3
chr5	118970342	.	AGG	AGA,AG	1199.38	PASS	AF=0.0748299,0.92517;AO=17,57;DP=148;FAO=11,136;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=0,81;FSAR=11,55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0686011,0.75204;FXX=0.0067563;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=220.722,10.2035;QD=32.6363;RBI=0.0779596,0.760264;REFB=0.0246779,-0.00190637;REVB=-0.037035,0.111524;RO=71;SAF=0,22;SAR=17,35;SRF=57;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0.358629;SSSB=-0.833796,-0.397484;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.104789,0.00397139;OID=.,.;OPOS=118970344,118970343;OREF=G,G;OALT=A,-;OMAPALT=AGA,AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0748299,0.92517:17,57:148:11,136:147:0:0,81:11,55:0:0:29:71:0,22:17,35:57:14
chr5	120021819	.	G	A,C	699.84	PASS	AF=0.923077,0.0769231;AO=47,4;DP=51;FAO=48,4;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=35,4;FSAR=13,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00084024,-0.0248319;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=118.667,40.161;QD=53.834;RBI=0.0127203,0.0284725;REFB=0,0;REVB=-0.0126926,-0.0139306;RO=0;SAF=34,4;SAR=13,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000229149,0.166493;OID=.,.;OPOS=120021819,120021819;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:16:51:52:0:0:47,4:48,4:0.923077,0.0769231:13,0:34,4:0:0:13,0:35,4:0:0
chr5	121488635	.	AT	A	112.17	PASS	AF=0.548387;AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.037513;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=20.1749;QD=14.4735;RBI=0.0375243;REFB=-0.0511872;REVB=0.000922078;RO=14;SAF=4;SAR=12;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235435;STB=0.641076;STBP=0.129;TYPE=del;VARB=0.0470333;OID=.;OPOS=121488636;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.548387:16:31:17:31:14:4:13:7:7:81:14:4:12:7:7
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chr5	122165470	.	TACACACACACACAC	T	274.79	PASS	AF=0.615385;AO=20;DP=21;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0309034;FXX=0.0930016;HRUN=1;LEN=14;MLLD=304.23;QD=28.1836;RBI=0.0334159;REFB=-0.000688849;REVB=0.0127122;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.578452;STBP=0.319;TYPE=del;VARB=0.000370632;OID=.;OPOS=122165471;OREF=ACACACACACACAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.615385:20:21:24:39:15:17:7:13:2:99:0:13:7:0:0
chr5	122682334	.	C	T	169.75	PASS	AF=0.439024;AO=17;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0363176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.512;QD=16.5608;RBI=0.0432469;REFB=-0.0116005;REVB=0.0234802;RO=18;SAF=7;SAR=10;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130349;STB=0.614849;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0219345;OID=.;OPOS=122682334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:18:23:17:18:0.439024:10:7:10:8:10:8:15:8
chr5	122682348	.	A	G	160.98	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.013326;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.571;QD=17.4028;RBI=0.0319313;REFB=-0.0546311;REVB=0.0290177;RO=20;SAF=7;SAR=10;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311609;STB=0.676729;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0145107;OID=.;OPOS=122682348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:10:7:15:5:10:7:15:5
chr5	122758268	.	G	C	370.76	PASS	AF=0.470588;AO=37;DP=82;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0103209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.224;QD=17.4474;RBI=0.0116191;REFB=-0.0246412;REVB=0.00533701;RO=45;SAF=17;SAR=20;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288826;STB=0.505879;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0314887;OID=.;OPOS=122758268;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:85:45:45:37:40:0.470588:20:17:22:23:20:20:22:23
chr5	122950330	.	G	C	271.67	PASS	AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00452665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6637;QD=20.898;RBI=0.028393;REFB=-0.0238419;REVB=0.0280298;RO=24;SAF=15;SAR=13;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985106;STB=0.554756;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0214091;OID=.;OPOS=122950330;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:24:28:28:0.538462:13:15:10:14:13:15:10:14
chr5	122950911	.	G	A	1098.56	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.492;QD=60.1949;RBI=0.0359412;REFB=0;REVB=0.0216775;RO=0;SAF=55;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.54769e-05;OID=.;OPOS=122950911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:18:55:0:0:18:55:0:0
chr5	122990902	.	A	T	153.66	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.00151022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.637;QD=13.9687;RBI=0.00646852;REFB=-0.00796344;REVB=-0.00628975;RO=24;SAF=10;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132039;STB=0.609951;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0113022;OID=.;OPOS=122990902;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:27:17:17:0.386364:7:10:11:13:7:10:11:16
chr5	123984763	.	C	T	38.61	PASS	AF=0.428571;AO=5;DP=13;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.22472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.847;QD=11.0305;RBI=0.230519;REFB=-0.0114319;REVB=-0.0513796;RO=8;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255761;STB=0.526227;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0642951;OID=.;OPOS=123984763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:14:8:8:5:6:0.428571:2:3:5:3:2:4:5:3
chr5	125696118	.	G	C	164.13	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0218192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2351;QD=12.8725;RBI=0.0223459;REFB=-0.00649541;REVB=-0.00482301;RO=31;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067857;STB=0.549947;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.00665987;OID=.;OPOS=125696118;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:32:19:19:0.372549:11:8:15:16:11:8:16:16
chr5	125696140	.	G	A	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=328.801;QD=63.583;RBI=0.0326146;REFB=0;REVB=0.00251251;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.61741e-05;OID=.;OPOS=125696140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:26:21:0:0:26:21:0:0
chr5	125802027	.	G	A	300.64	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0153241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.794;QD=21.4745;RBI=0.0231294;REFB=-0.0198177;REVB=0.0173246;RO=25;SAF=17;SAR=14;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873465;STB=0.548356;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.016338;OID=.;OPOS=125802027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:25:31:31:0.553571:14:17:11:14:14:17:11:14
chr5	125828803	.	A	G	801.27	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.245;QD=57.2338;RBI=0.0201084;REFB=0;REVB=0.0135567;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.8436e-05;OID=.;OPOS=125828803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:30:25:0:0:31:25:0:0
chr5	126171999	.	T	C	1153.37	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0721318;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.5281;QD=60.7036;RBI=0.0733218;REFB=0;REVB=0.0131565;RO=0;SAF=21;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000717633;OID=.;OPOS=126171999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:55:21:0:0:55:21:0:0
chr5	126746277	.	C	T	772.48	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0064665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7766;QD=61.7985;RBI=0.0268196;REFB=-0.0271418;REVB=-0.0260283;RO=1;SAF=24;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192048;STB=0.5102;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00944552;OID=.;OPOS=126746277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:25:24:1:0:25:24:1:0
chr5	126792974	.	T	A	679.85	PASS	AF=0.614583;AO=59;DP=96;FAO=59;FDP=96;FR=.;FRO=37;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0119067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3946;QD=28.327;RBI=0.0293828;REFB=-0.032556;REVB=-0.0268623;RO=36;SAF=29;SAR=30;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00591014;STB=0.501942;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0148355;OID=.;OPOS=126792974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:36:37:59:59:0.614583:30:29:18:18:30:29:18:19
chr5	126887569	.	G	A	274.61	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0246686;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.2968;QD=19.9719;RBI=0.0250484;REFB=-0.0598366;REVB=0.0043458;RO=26;SAF=12;SAR=17;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202126;STB=0.612346;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0223335;OID=.;OPOS=126887569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:17:12:17:9:17:12:17:9
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chr5	127614472	.	A	G	509.21	PASS	AF=0.505155;AO=49;DP=97;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0239507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6284;QD=20.9982;RBI=0.02718;REFB=-0.0423306;REVB=-0.0128499;RO=48;SAF=22;SAR=27;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0458625;STB=0.52537;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0349819;OID=.;OPOS=127614472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:48:48:49:49:0.505155:27:22:24:24:27:22:24:24
chr5	127622491	.	T	C	222.79	PASS	AF=0.380282;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=71;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.019525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.883;QD=12.5516;RBI=0.0229804;REFB=0.000402209;REVB=-0.0121191;RO=44;SAF=8;SAR=19;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185627;STB=0.607223;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.00107206;OID=.;OPOS=127622491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:44:44:27:27:0.380282:19:8:20:24:19:8:20:24
chr5	127685135	.	C	T	728.98	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.329;QD=57.175;RBI=0.0231937;REFB=0;REVB=-0.00497482;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.74413e-05;OID=.;OPOS=127685135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:28:23:0:0:28:23:0:0
chr5	127685624	.	C	A	593.37	PASS	AF=0.521739;AO=60;DP=115;FAO=60;FDP=115;FR=.;FRO=55;FSAF=40;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.00152069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.913;QD=20.6388;RBI=0.00219486;REFB=-0.0102061;REVB=0.00158269;RO=55;SAF=40;SAR=20;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252277;STB=0.639006;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00714189;OID=.;OPOS=127685624;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:55:55:60:60:0.521739:20:40:21:34:20:40:21:34
chr5	128301885	.	T	G	281.6	PASS	AF=0.358696;AO=33;DP=92;FAO=33;FDP=92;FR=.;FRO=59;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=0.0659492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.546;QD=12.2433;RBI=0.0714134;REFB=0.00581695;REVB=0.0273966;RO=59;SAF=16;SAR=17;SRF=38;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177275;STB=0.601513;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.00803298;OID=.;OPOS=128301885;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:59:59:33:33:0.358696:17:16:38:21:17:16:38:21
chr5	128301971	.	T	C	266.69	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=55;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0385566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9988;QD=18.3921;RBI=0.0436748;REFB=-0.0295116;REVB=0.0205153;RO=28;SAF=7;SAR=20;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305572;STB=0.67364;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0467062;OID=.;OPOS=128301971;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:58:28:29:27:29:0.5:20:7:16:12:22:7:16:13
chr5	128430757	.	T	C	605.08	PASS	AF=0.521368;AO=61;DP=117;FAO=61;FDP=117;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0341335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.195;QD=20.6864;RBI=0.0354788;REFB=-0.0226772;REVB=-0.00967746;RO=56;SAF=29;SAR=32;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723295;STB=0.53975;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0328643;OID=.;OPOS=128430757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:56:56:61:61:0.521368:32:29:22:34:32:29:22:34
chr5	128797156	.	C	G	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0157567;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=142.445;QD=18.767;RBI=0.0161462;REFB=-0.0364716;REVB=-0.00352495;RO=3;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365022;STB=0.713603;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0183851;OID=.;OPOS=128797156;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:4:2:3:0:4:2:3:0
chr5	128797315	.	T	TCCCGGC	58.37	PASS	AF=0.150685;AO=10;DP=79;FAO=11;FDP=73;FR=.;FRO=62;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0341216;FXX=0.0874891;HRUN=3;LEN=6;MLLD=262.957;QD=3.1985;RBI=0.0433526;REFB=-0.0103424;REVB=-0.0267425;RO=62;SAF=3;SAR=7;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212668;STB=0.698857;STBP=0.152;TYPE=ins;VARB=0.050525;OID=.;OPOS=128797316;OREF=-;OALT=CCCGGC;OMAPALT=TCCCGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.150685:10:79:11:73:62:3:8:31:31:58:62:3:7:29:33
chr5	128863471	.	A	G	851.66	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00662046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.662;QD=57.7394;RBI=0.0205835;REFB=0;REVB=0.0194898;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91701e-05;OID=.;OPOS=128863471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:33:25:0:0:34:25:0:0
chr5	129072943	.	G	T	712.38	PASS	AF=0.981481;AO=49;DP=51;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0185413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.4475;QD=52.7685;RBI=0.0226339;REFB=-0.161456;REVB=-0.0129813;RO=1;SAF=21;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021881;STB=0.5102;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00725852;OID=.;OPOS=129072943;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:54:1:1:49:53:0.981481:28:21:1:0:29:24:1:0
chr5	129520679	.	G	A	192.9	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.000796403;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=312.413;QD=23.3816;RBI=0.0162186;REFB=-0.0239444;REVB=-0.016199;RO=14;SAF=10;SAR=9;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200656;STB=0.61154;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.014302;OID=.;OPOS=129520679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:19:19:0.575758:9:10:11:3:9:10:11:3
chr5	129521126	.	A	G	73.44	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0279405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.812;QD=9.47557;RBI=0.0281157;REFB=-0.00949489;REVB=0.00313452;RO=21;SAF=6;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221961;STB=0.513487;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0170922;OID=.;OPOS=129521126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:4:6:13:8:4:6:13:8
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chr5	130805475	.	C	T	218.05	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00187301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.897;QD=15.5751;RBI=0.041508;REFB=-0.0359115;REVB=-0.0414657;RO=31;SAF=13;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278056;STB=0.515747;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0244808;OID=.;OPOS=130805475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:31:31:25:25:0.446429:12:13:17:14:12:13:17:14
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chr5	131283376	.	C	T	453.67	PASS	AF=0.597222;AO=43;DP=72;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0392786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.457;QD=25.2041;RBI=0.0404277;REFB=-0.00191717;REVB=-0.00957018;RO=29;SAF=22;SAR=21;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295441;STB=0.516163;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.000764547;OID=.;OPOS=131283376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:29:29:43:43:0.597222:21:22:16:13:21:22:16:13
chr5	131322494	.	C	T	188.73	PASS	AF=0.352941;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=30;FWDB=0.0239315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.995;QD=11.1015;RBI=0.0404722;REFB=-0.0159961;REVB=-0.0326387;RO=44;SAF=15;SAR=9;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332105;STB=0.691339;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0419246;OID=.;OPOS=131322494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:44:44:24:24:0.352941:9:15:14:30:9:15:14:30
chr5	131324250	.	C	CTG	203.36	PASS	AF=0.390625;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0201305;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=2;MLLD=254.584;QD=12.71;RBI=0.0239291;REFB=-0.0176723;REVB=-0.0129369;RO=43;SAF=9;SAR=16;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312242;STB=0.693296;STBP=0.016;TYPE=ins;VARB=0.0228081;OID=.;OPOS=131324251;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.390625:25:69:25:64:39:8:17:25:14:99:43:9:16:28:15
chr5	131396478	.	C	T	336.73	PASS	AF=0.461538;AO=35;DP=77;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=0.00175904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.702;QD=17.2681;RBI=0.0259154;REFB=-0.00544766;REVB=0.0258557;RO=42;SAF=17;SAR=18;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19874;STB=0.602509;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.00861721;OID=.;OPOS=131396478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:42:42:35:36:0.461538:18:17:29:13:18:18:29:13
chr5	131411460	.	T	C	618.6	PASS	AF=0.457143;AO=64;DP=140;FAO=64;FDP=140;FR=.;FRO=76;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=39;FSRR=37;FWDB=0.00916825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.025;QD=17.6742;RBI=0.017771;REFB=-0.0337782;REVB=-0.0152233;RO=76;SAF=43;SAR=21;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164123;STB=0.591526;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0322419;OID=.;OPOS=131411460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:140:76:76:64:64:0.457143:21:43:39:37:21:43:39:37
chr5	131602166	.	T	C	176.19	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.00423275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5356;QD=14.0948;RBI=0.0519809;REFB=0.00312996;REVB=0.0518083;RO=29;SAF=12;SAR=7;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194552;STB=0.576395;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=-0.00259099;OID=.;OPOS=131602166;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:31:19:19:0.38:7:12:23:6:7:12:23:8
chr5	131663062	.	T	C	375.45	PASS	AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.0212526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2741;QD=18.3145;RBI=0.0239447;REFB=-0.00946995;REVB=-0.0110307;RO=43;SAF=18;SAR=21;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176942;STB=0.598464;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00980499;OID=.;OPOS=131663062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:43:43:39:39:0.47561:21:18:28:15:21:18:28:15
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chr5	131731304	.	A	T	246.47	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0245852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.601;QD=46.9463;RBI=0.0247134;REFB=-0.0829422;REVB=-0.00251392;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529382;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.000683562;OID=.;OPOS=131731304;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:0:1:20:20:0.952381:8:12:0:0:8:12:0:1
chr5	131755651	.	C	T	133.52	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00957973;FXX=0.174956;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.895;QD=16.1839;RBI=0.0185634;REFB=0.000151386;REVB=-0.0159006;RO=17;SAF=5;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00434626;STB=0.539114;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.00098136;OID=.;OPOS=131755651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:33:17:19:14:14:0.424242:9:5:6:11:9:5:8:11
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chr5	132099999	.	A	G	488.32	PASS	AF=0.456897;AO=52;DP=115;FAO=53;FDP=116;FR=.;FRO=63;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=-0.0233005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.573;QD=16.8386;RBI=0.0352816;REFB=-0.00469455;REVB=-0.0264929;RO=63;SAF=27;SAR=25;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987092;STB=0.549703;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00753362;OID=.;OPOS=132099999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:116:63:63:52:53:0.456897:25:27:39:24:25:28:39:24
chr5	132150948	.	T	G	1495.18	PASS	AF=0.980769;AO=102;DP=105;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0410427;FXX=0.0188661;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.011;QD=57.5067;RBI=0.0411515;REFB=-0.0566761;REVB=-0.00299081;RO=1;SAF=39;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120095;STB=0.502392;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.000646021;OID=.;OPOS=132150948;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:105:104:1:2:102:102:0.980769:63:39:1:0:63:39:1:1
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chr5	132232315	.	G	A	313.83	PASS	AF=0.416667;AO=34;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.00484119;FXX=0.0117633;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.558;QD=14.9443;RBI=0.0315279;REFB=-0.0179737;REVB=-0.031154;RO=48;SAF=23;SAR=11;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148962;STB=0.585315;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.032647;OID=.;OPOS=132232315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:48:49:34:35:0.416667:11:23:26:22:11:24:27:22
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chr5	132535046	.	G	A	414.66	PASS	AF=0.588235;AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=68;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0221893;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.031;QD=24.3915;RBI=0.0300831;REFB=-0.00530754;REVB=0.0203133;RO=27;SAF=22;SAR=18;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0595773;STB=0.538903;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00265835;OID=.;OPOS=132535046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:27:28:40:40:0.588235:18:22:17:10:18:22:18:10
chr5	133186603	.	A	C	190.98	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.924;QD=47.745;RBI=0.0614777;REFB=0;REVB=0.0584318;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000400046;OID=.;OPOS=133186603;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr5	133316518	.	G	A	352.42	PASS	AF=0.480519;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0230686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7207;QD=18.3076;RBI=0.0351061;REFB=-0.0330413;REVB=-0.0264628;RO=40;SAF=9;SAR=28;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271479;STB=0.652644;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0325512;OID=.;OPOS=133316518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:40:40:37:37:0.480519:28:9:20:20:28:9:20:20
chr5	133477802	.	C	T	335.51	PASS	AF=0.386139;AO=39;DP=101;FAO=39;FDP=101;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.0131953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.544;QD=13.2875;RBI=0.0138867;REFB=-0.0270976;REVB=-0.00432708;RO=61;SAF=26;SAR=13;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125172;STB=0.577424;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0219183;OID=.;OPOS=133477802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:61:62:39:39:0.386139:13:26:34:27:13:26:34:28
chr5	133481467	.	G	A	346.81	PASS	AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00354498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.217;QD=22.375;RBI=0.0170537;REFB=-0.0205378;REVB=-0.0166812;RO=27;SAF=15;SAR=20;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171038;STB=0.509429;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0156148;OID=.;OPOS=133481467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:20:15:11:16:20:15:11:16
chr5	133909475	.	G	A,C	1247.95	PASS	AF=0.952381,0.047619;AO=79,4;DP=84;FAO=80,4;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=35,4;FSAR=45,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559306,0.00147808;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=82.4703,144.091;QD=59.4262;RBI=0.132256,0.0347332;REFB=0,0;REVB=0.119848,-0.0347018;RO=1;SAF=35,4;SAR=44,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0106383,0.749895;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000269997,0.201739;OID=.,.;OPOS=133909475,133909475;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:84:84:1:0:79,4:80,4:0.952381,0.047619:44,0:35,4:0:1:45,0:35,4:0:0
chr5	134076812	.	G	A	142.88	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.00211154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.928;QD=10.7836;RBI=0.00812071;REFB=-0.0146509;REVB=-0.00784139;RO=34;SAF=12;SAR=6;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192046;STB=0.623236;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0233935;OID=.;OPOS=134076812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:34:35:18:18:0.339623:6:12:17:17:6:12:17:18
chr5	134223593	.	A	G	367.22	PASS	AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.00772779;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.3713;QD=19.0766;RBI=0.0436336;REFB=0.0229928;REVB=-0.0429438;RO=39;SAF=25;SAR=13;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162237;STB=0.590502;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=-0.0228116;OID=.;OPOS=134223593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:39:39:38:38:0.493506:13:25:19:20:13:25:19:20
chr5	134235613	.	A	C	235.66	PASS	AF=0.383562;AO=28;DP=71;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.010366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.238;QD=12.913;RBI=0.0311591;REFB=-0.0156971;REVB=0.0293843;RO=43;SAF=20;SAR=8;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277553;STB=0.648425;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0200129;OID=.;OPOS=134235613;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:73:43:45:28:28:0.383562:8:20:20:23:8:20:22:23
chr5	134343661	.	C	T	390.4	PASS	AF=0.487805;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00296885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.52;QD=19.0439;RBI=0.0085598;REFB=-0.0130157;REVB=-0.00802845;RO=40;SAF=25;SAR=15;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0473186;STB=0.516121;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0131062;OID=.;OPOS=134343661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:40:42:40:40:0.487805:15:25:23:17:15:25:25:17
chr5	134343799	.	A	G	380.44	PASS	AF=0.506329;AO=38;DP=77;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0352588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.905;QD=19.2629;RBI=0.0356166;REFB=-0.00878168;REVB=-0.00503599;RO=39;SAF=17;SAR=21;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105684;STB=0.507039;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.0103267;OID=.;OPOS=134343799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:79:39:39:38:40:0.506329:21:17:17:22:22:18:17:22
chr5	134781197	.	G	A	667.42	PASS	AF=0.37037;AO=80;DP=216;FAO=80;FDP=216;FR=.;FRO=136;FSAF=50;FSAR=30;FSRF=72;FSRR=64;FWDB=-0.0185514;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=324.717;QD=12.3596;RBI=0.0202329;REFB=-0.0120232;REVB=0.00807565;RO=136;SAF=50;SAR=30;SRF=72;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109594;STB=0.562185;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0215543;OID=.;OPOS=134781197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:216:136:136:80:80:0.37037:30:50:72:64:30:50:72:64
chr5	134782414	.	G	T	651.08	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250341;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.611;QD=62.0073;RBI=0.0266657;REFB=0;REVB=0.00918443;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.36884e-05;OID=.;OPOS=134782414;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr5	134782450	.	T	A	751.19	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058872;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.898;QD=63.9313;RBI=0.0807456;REFB=0;REVB=0.0552624;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115403;OID=.;OPOS=134782450;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr5	134782510	.	T	C,G	1131.88	PASS	AF=0.935897,0.0512821;AO=73,4;DP=78;FAO=73,4;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=45,0;FSAR=28,4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0175754,-0.00715413;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=122.448,15.2088;QD=58.045;RBI=0.0193554,0.0285924;REFB=0.0158108,0.0450826;REVB=-0.00810778,-0.0276829;RO=1;SAF=45,0;SAR=28,4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0165924,0;STB=0.50877,0.5;STBP=0.279,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00105095,0.0835375;OID=.,.;OPOS=134782510,134782510;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:78:78:1:1:73,4:73,4:0.935897,0.0512821:28,4:45,0:0:1:28,4:45,0:0:1
chr5	134782576	.	T	G	1421.91	PASS	AF=0.98;AO=97;DP=101;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0872223;FXX=0.0196059;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.0153;QD=56.8765;RBI=0.0908998;REFB=-0.152425;REVB=0.025594;RO=2;SAF=54;SAR=43;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00219972;STB=0.501243;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00874604;OID=.;OPOS=134782576;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:101:100:2:2:97:98:0.98:43:54:1:1:43:55:1:1
chr5	135178124	.	T	C	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2427;QD=62.6702;RBI=0.0206293;REFB=0;REVB=0.00294698;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000204314;OID=.;OPOS=135178124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:28:16:0:0:28:16:0:0
chr5	135188341	.	G	A	871.01	PASS	AF=0.43578;AO=95;DP=218;FAO=95;FDP=218;FR=.;FRO=123;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=68;FSRR=55;FWDB=0.00015881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.882;QD=15.9819;RBI=0.00332316;REFB=-0.0144665;REVB=0.00331936;RO=123;SAF=45;SAR=50;SRF=68;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801362;STB=0.544569;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0180298;OID=.;OPOS=135188341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:218:218:123:123:95:95:0.43578:50:45:68:55:50:45:68:55
chr5	135207187	.	G	A	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00217227;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.31;QD=15.293;RBI=0.0364454;REFB=-0.0163599;REVB=-0.0363806;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973785;STB=0.556839;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0245066;OID=.;OPOS=135207187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:4:5:6:3:4:5:6:3
chr5	135207382	.	C	T	817.62	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.437;QD=57.3765;RBI=0.0405878;REFB=0;REVB=0.0239642;RO=0;SAF=39;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102952;OID=.;OPOS=135207382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:18:39:0:0:18:39:0:0
chr5	135231229	.	A	G	316.19	PASS	AF=0.596154;AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0844747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1327;QD=24.3221;RBI=0.0950743;REFB=-0.0294119;REVB=0.0436251;RO=21;SAF=15;SAR=16;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641101;STB=0.535293;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0188794;OID=.;OPOS=135231229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:21:21:31:31:0.596154:16:15:12:9:16:15:12:9
chr5	135258105	.	G	A	1549.71	PASS	AF=0.981308;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00957577;FXX=0.0183469;HRUN=4;LEN=1;MLLD=172.077;QD=57.933;RBI=0.0354062;REFB=-0.137256;REVB=0.0340867;RO=1;SAF=61;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00771683;STB=0.501553;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.000435552;OID=.;OPOS=135258105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:107:107:1:2:105:105:0.981308:44:61:1:0:44:61:1:1
chr5	135276201	.	AGTTGT	AG,AGT	634.64	PASS	AF=0,1;AO=14,36;DP=53;FAO=0,52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=0,30;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363856,0.0354031;FXX=0.0188644;HRUN=2,2;LEN=4,3;MLLD=260.825,274.686;QD=48.8184;RBI=0.0375718,0.0548884;REFB=0,0;REVB=0.00936609,0.0419447;RO=0;SAF=4,27;SAR=10,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.63386e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.0128303,0.000294326;OID=.,.;OPOS=135276203,135276202;OREF=TTGT,GTT;OALT=-,-;OMAPALT=AG,AGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:14,36:53:0,52:52:0:0,30:0,22:0:0:11:0:4,27:10,9:0:0
chr5	135276314	.	C	T	1411.78	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=94;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0106353;FXX=0.0421008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.143;QD=62.0564;RBI=0.0138572;REFB=-0.0634455;REVB=0.00888329;RO=1;SAF=42;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00977254;STB=0.505153;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000143492;OID=.;OPOS=135276314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:91:1:1:90:90:0.989011:48:42:0:1:48:42:0:1
chr5	135276847	.	T	C	2258.25	PASS	AF=0.993464;AO=148;DP=151;FAO=152;FDP=153;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0400757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.616;QD=59.0393;RBI=0.0479845;REFB=-0.00975312;REVB=0.0263903;RO=0;SAF=64;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503649;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00132948;OID=.;OPOS=135276847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:151:153:0:1:148:152:0.993464:84:64:0:0:84:68:1:0
chr5	135282630	.	C	T	1331.26	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.839;QD=61.9191;RBI=0.0219842;REFB=0;REVB=0.00989893;RO=0;SAF=51;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.2938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.1479e-05;OID=.;OPOS=135282630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:86:0:0:82:86:1:31:51:0:0:32:54:0:0
chr5	135287029	.	T	C	902.7	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00586463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.881;QD=58.2384;RBI=0.0163265;REFB=0;REVB=0.0152368;RO=0;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.17981e-05;OID=.;OPOS=135287029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:25:37:0:0:25:37:0:0
chr5	135382989	.	G	C	428.78	PASS	AF=0.61194;AO=40;DP=66;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00162027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.634;QD=25.5989;RBI=0.0366553;REFB=-0.0255037;REVB=-0.0366194;RO=24;SAF=19;SAR=21;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742491;STB=0.534529;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0137774;OID=.;OPOS=135382989;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:24:26:40:41:0.61194:21:19:14:10:21:20:15:11
chr5	135513085	.	T	TC	1275.01	PASS	AF=1;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451184;FXX=0.0119033;HRUN=0;LEN=1;MLLD=95.0481;QD=61.4461;RBI=0.0451631;REFB=0;REVB=0.0020077;RO=1;SAF=51;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00919718;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000136541;OID=.;OPOS=135513086;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:83:85:83:83:0:52:31:0:0:7:1:51:32:1:0
chr5	136313330	.	A	AG	131.51	PASS	AF=0.382022;AO=28;DP=89;FAO=34;FDP=89;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=0.0964853;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.1901;QD=5.91041;RBI=0.0968276;REFB=-0.00473451;REVB=0.00813389;RO=55;SAF=17;SAR=11;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194081;STB=0.553245;STBP=0.435;TYPE=ins;VARB=0.00810237;OID=.;OPOS=136313331;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.382022:28:89:34:89:55:19:15:26:29:99:55:17:11:24:31
chr5	136953577	.	T	C	98.14	PASS	AF=0.6875;AO=10;DP=17;FAO=11;FDP=16;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0145843;FXX=0.111049;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.033;QD=24.5347;RBI=0.029214;REFB=-0.0298528;REVB=0.0253131;RO=4;SAF=8;SAR=2;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381322;STB=0.547855;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.00767068;OID=.;OPOS=136953577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:17:16:4:5:10:11:0.6875:2:8:3:1:3:8:3:2
chr5	136954719	.	T	C	251.73	PASS	AF=0.37037;AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=81;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.010666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.802;QD=12.4311;RBI=0.0133419;REFB=-0.018805;REVB=0.0080152;RO=49;SAF=22;SAR=8;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283442;STB=0.653945;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0187087;OID=.;OPOS=136954719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:49:51:30:30:0.37037:8:22:24:25:8:22:26:25
chr5	136955383	.	G	T	258.67	PASS	AF=0.329897;AO=22;DP=91;FAO=32;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=65;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=38;FWDB=0.0323661;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.699;QD=10.6668;RBI=0.0325362;REFB=-0.00589311;REVB=0.00332252;RO=41;SAF=14;SAR=8;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0880844;STB=0.577147;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0117354;OID=.;OPOS=136955383;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:97:41:65:22:32:0.329897:8:14:23:18:15:17:27:38
chr5	136969793	.	C	T	213.36	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0160367;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.453;QD=19.3965;RBI=0.0189653;REFB=-0.00990913;REVB=0.0101246;RO=23;SAF=7;SAR=14;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220059;STB=0.624878;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0100977;OID=.;OPOS=136969793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:14:7:13:10:14:7:13:10
chr5	137028029	.	T	C	1339.35	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00358584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.503;QD=62.2952;RBI=0.0217598;REFB=0;REVB=0.0214623;RO=0;SAF=55;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.02322e-05;OID=.;OPOS=137028029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:31:55:0:0:31:55:0:0
chr5	137206560	.	A	C	375.68	PASS	AF=0.878788;AO=28;DP=32;FAO=29;FDP=33;FR=.;FRO=4;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0192553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.3091;QD=45.5367;RBI=0.0430339;REFB=-0.0654317;REVB=0.0384857;RO=3;SAF=19;SAR=9;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0690343;STB=0.520534;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0237011;OID=.;OPOS=137206560;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:32:33:3:4:28:29:0.878788:9:19:1:2:10:19:2:2
chr5	137244517	.	G	A	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.594;QD=58.4197;RBI=0.0208977;REFB=0;REVB=-0.017124;RO=0;SAF=39;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.63541e-05;OID=.;OPOS=137244517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:24:39:0:0:24:39:0:0
chr5	137259179	.	T	C	2494.29	PASS	AF=1;AO=161;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183246;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5938;QD=61.5873;RBI=0.0198425;REFB=0;REVB=0.00761133;RO=0;SAF=79;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25821e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.54515e-05;OID=.;OPOS=137259179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:162:162:0:0:161:162:1:82:79:0:0:83:79:0:0
chr5	137347498	.	G	A	980.44	PASS	AF=0.945205;AO=69;DP=73;FAO=69;FDP=73;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0451637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.676;QD=53.7229;RBI=0.0454651;REFB=0.0349714;REVB=0.00522611;RO=4;SAF=32;SAR=37;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00376528;STB=0.501995;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=-0.0062314;OID=.;OPOS=137347498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:73:73:4:4:69:69:0.945205:37:32:2:2:37:32:2:2
chr5	137372207	.	A	T	639.91	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.314;QD=60.9433;RBI=0.0872612;REFB=0;REVB=0.0763312;RO=0;SAF=27;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127364;OID=.;OPOS=137372207;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:42:0:0:39:42:1:12:27:0:0:12:30:0:0
chr5	137426447	.	G	A	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0466666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.375;QD=13.4416;RBI=0.0483361;REFB=-0.00753255;REVB=-0.0125937;RO=13;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603878;STB=0.535642;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.00686437;OID=.;OPOS=137426447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:6:4:6:7:6:4:6:7
chr5	137476416	.	T	C	955.12	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3702;QD=58.7764;RBI=0.0344722;REFB=0;REVB=0.0163259;RO=0;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.55326e-05;OID=.;OPOS=137476416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:26:39:0:0:26:39:0:0
chr5	137665323	.	G	A,T	774.86	PASS	AF=0.947368,0.0350877;AO=54,2;DP=57;FAO=54,2;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=30,2;FSAR=24,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00214426,0.00480787;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=72.6454,177.564;QD=54.376;RBI=0.0462432,0.0130445;REFB=-0.152286,-0.0266047;REVB=0.0461934,0.0121261;RO=1;SAF=30,2;SAR=24,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0154512,0;STB=0.508194,0.5;STBP=0.516,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.013524,0.0251733;OID=.,.;OPOS=137665323,137665323;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:57:57:1:1:54,2:54,2:0.947368,0.0350877:24,0:30,2:1:0:24,0:30,2:1:0
chr5	137708434	.	C	T	1572.92	PASS	AF=1;AO=104;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.87;QD=59.9207;RBI=0.0209882;REFB=0;REVB=0.00801217;RO=0;SAF=54;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.1663e-05;OID=.;OPOS=137708434;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:104:105:1:50:54:0:0:51:54:0:0
chr5	137717265	.	G	A	1062.34	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.075;QD=59.8501;RBI=0.0503445;REFB=0;REVB=-0.00772783;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.49506e-05;OID=.;OPOS=137717265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:31:40:0:0:31:40:0:0
chr5	137721896	.	G	T	300.07	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00296569;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.232;QD=23.0825;RBI=0.0491661;REFB=-0.0523878;REVB=0.0490766;RO=18;SAF=17;SAR=13;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702784;STB=0.530243;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0177509;OID=.;OPOS=137721896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:18:22:30:30:0.576923:13:17:12:6:13:17:14:8
chr5	137754695	.	T	C	1175.44	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00146454;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9344;QD=61.0617;RBI=0.0247047;REFB=0;REVB=0.0246613;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.52345e-05;OID=.;OPOS=137754695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:42:35:0:0:42:35:0:0
chr5	137892170	.	G	A	248.19	PASS	AF=0.459016;AO=27;DP=60;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0102125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.204;QD=16.275;RBI=0.0107001;REFB=-0.0150446;REVB=0.00319338;RO=33;SAF=15;SAR=12;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982658;STB=0.563335;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0182271;OID=.;OPOS=137892170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:33:33:27:28:0.459016:12:15:15:18:12:16:15:18
chr5	137902339	.	T	C	111.03	PASS	AF=0.242857;AO=17;DP=70;FAO=17;FDP=70;FR=.;FRO=53;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.0140357;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.842;QD=6.34451;RBI=0.0214556;REFB=0.00419327;REVB=-0.0162278;RO=53;SAF=12;SAR=5;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251158;STB=0.655894;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.0136634;OID=.;OPOS=137902339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:53:53:17:17:0.242857:5:12:27:26:5:12:27:26
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chr5	138705188	.	C	CATT	1014.28	PASS	AF=0.911392;AO=68;DP=79;FAO=72;FDP=79;FR=.;FRO=7;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0110929;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=3;MLLD=304.081;QD=51.3562;RBI=0.0111408;REFB=0.0112804;REVB=-0.00103157;RO=7;SAF=43;SAR=25;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155583;STB=0.510823;STBP=0.596;TYPE=ins;VARB=-0.000687845;OID=.;OPOS=138705189;OREF=-;OALT=ATT;OMAPALT=CATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.911392:68:79:72:79:7:43:29:5:2:28:7:43:25:5:2
chr5	138713959	.	A	C	741.76	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353513;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.555;QD=57.0587;RBI=0.0614688;REFB=0;REVB=0.0502862;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000639828;OID=.;OPOS=138713959;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0
chr5	138720108	.	C	T	293.48	PASS	AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.0152257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5471;QD=14.8598;RBI=0.108368;REFB=0.0045075;REVB=0.107293;RO=46;SAF=12;SAR=21;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209088;STB=0.618532;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-0.00397418;OID=.;OPOS=138720108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:21:12:26:20:21:12:26:20
chr5	138720156	.	C	T	629.63	PASS	AF=0.575472;AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=106;FR=.;FRO=45;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.000123829;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.238;QD=23.7596;RBI=0.0796319;REFB=-0.0383944;REVB=0.0796318;RO=44;SAF=33;SAR=28;SRF=17;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118316;STB=0.568943;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0179579;OID=.;OPOS=138720156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:106:44:45:61:61:0.575472:28:33:17:27:28:33:17:28
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chr5	138728533	.	C	T	423.94	PASS	AF=0.716981;AO=38;DP=53;FAO=38;FDP=53;FR=.;FRO=15;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0508014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8409;QD=31.9952;RBI=0.0652858;REFB=-0.0562977;REVB=0.0410055;RO=14;SAF=22;SAR=16;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184823;STB=0.585731;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0170703;OID=.;OPOS=138728533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:14:15:38:38:0.716981:16:22:13:1:16:22:13:2
chr5	138732579	.	C	T	189.28	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00146102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.768;QD=13.0537;RBI=0.00516627;REFB=-0.0315259;REVB=0.00495538;RO=34;SAF=12;SAR=11;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387223;STB=0.512771;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0428637;OID=.;OPOS=138732579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:34:35:23:23:0.396552:11:12:19:15:11:12:19:16
chr5	138773090	.	A	G	68.09	PASS	AF=0.196078;AO=10;DP=52;FAO=10;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0185872;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.92;QD=5.34029;RBI=0.0279106;REFB=0.00593709;REVB=0.0208211;RO=41;SAF=4;SAR=6;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137959;STB=0.59037;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.0214001;OID=.;OPOS=138773090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:52:51:41:41:10:10:0.196078:6:4:21:20:6:4:21:20
chr5	138842178	.	C	T	553.11	PASS	AF=0.442177;AO=40;DP=148;FAO=65;FDP=147;FR=.,HEALED;FRO=82;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=61;FSRR=21;FWDB=0.0170001;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.547;QD=15.0507;RBI=0.0170007;REFB=-0.0265768;REVB=0.000133386;RO=80;SAF=31;SAR=9;SRF=59;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593445;STB=0.632294;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0181996;OID=.;OPOS=138842178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:147:80:82:40:65:0.442177:9:31:59:21:32:33:61:21
chr5	138857919	.	T	C	1877.87	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00778234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.663;QD=61.5696;RBI=0.030539;REFB=0;REVB=0.0295308;RO=0;SAF=57;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.85304e-05;OID=.;OPOS=138857919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:65:57:0:0:65:57:0:0
chr5	138861146	.	C	G	294.5	PASS	AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=12;FWDB=-0.0368671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.863;QD=15.1027;RBI=0.0396812;REFB=-0.0333812;REVB=0.0146771;RO=45;SAF=12;SAR=21;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36436;STB=0.704582;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0206141;OID=.;OPOS=138861146;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:45:45:33:33:0.423077:21:12:33:12:21:12:33:12
chr5	139661085	.	A	G	278.18	PASS	AF=0.54717;AO=28;DP=52;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.034652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2868;QD=20.9949;RBI=0.0348806;REFB=0.00176229;REVB=0.00398712;RO=24;SAF=21;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202771;STB=0.617697;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.00087322;OID=.;OPOS=139661085;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:24:24:28:29:0.54717:7:21:13:11:7:22:13:11
chr5	139740454	.	C	T	114.66	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00382675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.316;QD=19.11;RBI=0.00964378;REFB=-0.0075397;REVB=-0.00885203;RO=10;SAF=7;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180782;STB=0.579497;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0070988;OID=.;OPOS=139740454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:24:24:10:11:13:13:0.541667:6:7:3:7:6:7:4:7
chr5	139745154	.	T	C	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0589334;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.182;QD=57.1051;RBI=0.0589867;REFB=0;REVB=-0.00250563;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191168;OID=.;OPOS=139745154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0
chr5	139936760	.	G	T	490.56	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0133227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.51;QD=56.0639;RBI=0.0878867;REFB=-0.0746263;REVB=0.0868711;RO=0;SAF=24;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523795;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00167413;OID=.;OPOS=139936760;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:35:35:0:1:34:34:0.971429:10:24:0:0:10:24:0:1
chr5	139936980	.	A	G	675.12	PASS	AF=0.978261;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000622591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.88;QD=58.706;RBI=0.00500073;REFB=-0.0973691;REVB=-0.00496182;RO=1;SAF=17;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268199;STB=0.512815;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00119578;OID=.;OPOS=139936980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:46:1:1:43:45:0.978261:26:17:1:0:26:19:1:0
chr5	139940233	.	G	A	884.69	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127529;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=160.822;QD=58.0121;RBI=0.0242246;REFB=0;REVB=0.020596;RO=0;SAF=38;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.61761e-05;OID=.;OPOS=139940233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:23:38:0:0:23:38:0:0
chr5	139940302	.	G	A	292.76	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.0131889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.241;QD=17.2209;RBI=0.0132111;REFB=-0.00621155;REVB=-0.000764519;RO=36;SAF=23;SAR=9;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588758;STB=0.533091;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.00787105;OID=.;OPOS=139940302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:9:23:24:12:9:23:24:12
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chr5	140023238	.	C	G	368.46	PASS	AF=0.382609;AO=34;DP=117;FAO=44;FDP=115;FR=.;FRO=71;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=39;FWDB=0.0125221;FXX=0.0170926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.871;QD=12.8161;RBI=0.0126966;REFB=-0.00495543;REVB=-0.00209813;RO=55;SAF=19;SAR=15;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17052;STB=0.558333;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0095486;OID=.;OPOS=140023238;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:115:55:71:34:44:0.382609:15:19:22:33:20:24:32:39
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chr5	140048267	.	T	C	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.504;QD=58.2393;RBI=0.0176273;REFB=0;REVB=-0.00157456;RO=0;SAF=39;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.82082e-05;OID=.;OPOS=140048267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:23:39:0:0:23:39:0:0
chr5	140048544	.	C	T	361.83	PASS	AF=0.660377;AO=29;DP=47;FAO=35;FDP=53;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.000936096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.766;QD=27.3077;RBI=0.0568036;REFB=-0.0487416;REVB=0.0567959;RO=18;SAF=16;SAR=13;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00269498;STB=0.523693;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0246445;OID=.;OPOS=140048544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:53:18:18:29:35:0.660377:13:16:10:8:18:17:10:8
chr5	140052271	.	A	G	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0185437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.019;QD=12.3958;RBI=0.0355463;REFB=-0.00387983;REVB=-0.0303261;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00354462;OID=.;OPOS=140052271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:2:3:3:2:2:3:3:2
chr5	140098596	.	T	G	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0249338;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.575;QD=14.2624;RBI=0.0347666;REFB=-0.0238534;REVB=0.0242285;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861018;STB=0.549938;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0308508;OID=.;OPOS=140098596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:8:8:14:10:8:8:14:10
chr5	140111764	.	AT	A	301.75	PASS	AF=0.583333;AO=41;DP=72;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0139575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.8878;QD=16.7638;RBI=0.0728383;REFB=0.00376601;REVB=0.0714885;RO=30;SAF=18;SAR=23;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057001;STB=0.536273;STBP=0.491;TYPE=del;VARB=0.00610524;OID=.;OPOS=140111765;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.583333:41:72:42:72:30:19:23:11:19:99:30:18:23:11:19
chr5	140167463	.	C	T	357.86	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.069309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5502;QD=55.0552;RBI=0.072174;REFB=0;REVB=0.0201332;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000952235;OID=.;OPOS=140167463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:12:13:0:0:12:14:0:0
chr5	140168070	.	A	G	557.12	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0591055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1219;QD=60.2289;RBI=0.0741416;REFB=0;REVB=-0.0447607;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00132069;OID=.;OPOS=140168070;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:16:21:0:0:16:21:0:0
chr5	140168151	.	G	T	754.52	PASS	AF=0.979592;AO=46;DP=47;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0589789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.687;QD=61.5937;RBI=0.0738248;REFB=-0.0992448;REVB=0.0444025;RO=1;SAF=22;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02089;STB=0.511106;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.00291377;OID=.;OPOS=140168151;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:49:1:1:46:48:0.979592:24:22:1:0:26:22:1:0
chr5	140174622	.	G	A	1217.26	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.144623;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.491;QD=60.1116;RBI=0.151378;REFB=-0.0863303;REVB=0.0447143;RO=1;SAF=51;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00919411;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00394983;OID=.;OPOS=140174622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:81:81:1:0:80:81:1:29:51:1:0:29:52:0:0
chr5	140174865	.	G	C	994.23	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366088;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0956;QD=59.3568;RBI=0.0366577;REFB=0;REVB=-0.00189277;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102535;OID=.;OPOS=140174865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:33:33:0:0:33:34:0:0
chr5	140181734	.	A	G	854.55	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032406;FXX=0.0166639;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.546;QD=57.9355;RBI=0.0348869;REFB=0;REVB=-0.012921;RO=0;SAF=40;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.7823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144863;OID=.;OPOS=140181734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:19:40:0:0:19:40:0:0
chr5	140181892	.	T	C	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.172;QD=57.8849;RBI=0.0204826;REFB=0;REVB=0.003286;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.73707e-05;OID=.;OPOS=140181892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:25:35:0:0:25:35:0:0
chr5	140182101	.	G	T	740.31	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.582;QD=56.9469;RBI=0.0524488;REFB=0;REVB=0.032939;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371907;OID=.;OPOS=140182101;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
chr5	140183058	.	G	A	253.44	PASS	AF=1;AO=18;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0833882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.676;QD=50.688;RBI=0.0920825;REFB=0;REVB=0.0390589;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171962;OID=.;OPOS=140183058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:18:20:1:11:7:0:0:13:7:0:0
chr5	140186937	.	G	T	594.52	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.714;QD=60.9768;RBI=0.0798666;REFB=0;REVB=0.0666014;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000373256;OID=.;OPOS=140186937;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr5	140186979	.	GG	AA	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177111;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=81.1299;QD=39.2068;RBI=0.0313568;REFB=0;REVB=-0.0258761;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000132457;OID=.;OPOS=140186979;OREF=GG;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0
chr5	140186982	.	C	A	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.94;QD=37.4851;RBI=0.0428909;REFB=0;REVB=-0.0135382;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00025089;OID=.;OPOS=140186982;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr5	140186984	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4228;QD=37.4879;RBI=0.0350169;REFB=0;REVB=1.36789e-05;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000803824;OID=.;OPOS=140186984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr5	140187048	.	G	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.004;QD=37.4885;RBI=0.056681;REFB=0;REVB=0.0525421;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360236;OID=.;OPOS=140187048;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr5	140187102	.	A	G	306.27	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.202;QD=53.2635;RBI=0.0144405;REFB=0;REVB=-0.0101038;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9674e-06;OID=.;OPOS=140187102;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr5	140187322	.	C	T	905.95	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00994876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.346;QD=56.6218;RBI=0.0136468;REFB=-0.0287518;REVB=0.00934111;RO=1;SAF=39;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119558;STB=0.506327;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.000157902;OID=.;OPOS=140187322;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:24:39:1:0:24:39:1:0
chr5	140188383	.	T	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00205045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.146;QD=57.6806;RBI=0.00585341;REFB=0;REVB=-0.00548253;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.92017e-05;OID=.;OPOS=140188383;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0
chr5	140188401	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00987066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8221;QD=56.7063;RBI=0.0355929;REFB=0;REVB=0.0341968;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394279;OID=.;OPOS=140188401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr5	140188575	.	G	C	1542.2	PASS	AF=0.981308;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0436668;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8319;QD=57.6524;RBI=0.0436674;REFB=-0.184357;REVB=0.000227671;RO=2;SAF=56;SAR=49;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166453;STB=0.50877;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00374729;OID=.;OPOS=140188575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:107:107:2:2:105:105:0.981308:49:56:2:0:49:56:2:0
chr5	140201420	.	T	C	803.79	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156021;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.351;QD=57.4134;RBI=0.0345932;REFB=0;REVB=0.0308749;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.03414e-05;OID=.;OPOS=140201420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:34:22:0:0:34:22:0:0
chr5	140203432	.	C	T	191.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206958;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.737;QD=47.8204;RBI=0.0403208;REFB=0;REVB=0.0346042;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301347;OID=.;OPOS=140203432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0
chr5	140209467	.	T	G	453.79	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0347157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4898;QD=55.0043;RBI=0.0965805;REFB=-0.0171925;REVB=-0.0901256;RO=1;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321794;STB=0.517231;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.000788819;OID=.;OPOS=140209467;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:14:18:0:1:14:18:0:1
chr5	140214381	.	G	A	253.37	PASS	AF=0.913043;AO=20;DP=22;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00780426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8203;QD=44.0647;RBI=0.0113403;REFB=0.0126188;REVB=0.00822775;RO=2;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766752;STB=0.541627;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.0307672;OID=.;OPOS=140214381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:22:23:2:2:20:21:0.913043:11:9:0:2:11:10:0:2
chr5	140221139	.	G	A	375.49	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.406;QD=55.6283;RBI=0.022709;REFB=0;REVB=0.0177129;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242649;OID=.;OPOS=140221139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr5	140221195	.	G	C	50.71	PASS	AF=0.152542;AO=9;DP=58;FAO=9;FDP=59;FR=.;FRO=50;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0670118;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.8491;QD=3.43805;RBI=0.0925771;REFB=-0.0102872;REVB=0.0638744;RO=49;SAF=4;SAR=5;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129755;STB=0.580347;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0769852;OID=.;OPOS=140221195;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:58:59:49:50:9:9:0.152542:5:4:27:22:5:4:27:23
chr5	140222157	.	A	C	920.01	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0417;QD=58.4131;RBI=0.0448771;REFB=0;REVB=0.0376866;RO=0;SAF=46;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.48172e-05;OID=.;OPOS=140222157;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:17:46:0:0:17:46:0:0
chr5	140222641	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.965;QD=50.413;RBI=0.0972931;REFB=0;REVB=-0.087814;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000270219;OID=.;OPOS=140222641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr5	140228262	.	C	A	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.026188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.808;QD=21.2669;RBI=0.0266013;REFB=-0.00503652;REVB=0.00467114;RO=14;SAF=5;SAR=12;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158079;STB=0.588141;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00226395;OID=.;OPOS=140228262;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:12:5:2:12:12:5:2:12
chr5	140231237	.	T	C	814.26	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0008;QD=56.1562;RBI=0.089551;REFB=0;REVB=0.0835428;RO=1;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017147;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120307;OID=.;OPOS=140231237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:58:1:0:57:58:1:27:30:0:1:28:30:0:0
chr5	140236950	.	C	G	295.97	PASS	AF=0.423077;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=-0.0135069;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.424;QD=15.1781;RBI=0.0161524;REFB=-0.012952;REVB=-0.0088581;RO=46;SAF=12;SAR=21;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303973;STB=0.508767;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0149648;OID=.;OPOS=140236950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:46:45:33:33:0.423077:21:12:18:28:21:12:17:28
chr5	140237109	.	T	G	522.28	PASS	AF=0.425373;AO=57;DP=134;FAO=57;FDP=134;FR=.;FRO=77;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=45;FSRR=32;FWDB=-0.046755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4374;QD=15.5904;RBI=0.0653594;REFB=-0.0281342;REVB=-0.0456708;RO=77;SAF=36;SAR=21;SRF=45;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051092;STB=0.528668;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0365532;OID=.;OPOS=140237109;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:77:77:57:57:0.425373:21:36:45:32:21:36:45:32
chr5	140237387	.	T	G	288.09	PASS	AF=0.545455;AO=29;DP=54;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.00211564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6529;QD=20.9517;RBI=0.00287196;REFB=-0.0325186;REVB=0.00194223;RO=25;SAF=11;SAR=18;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053274;STB=0.523102;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0359658;OID=.;OPOS=140237387;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:25:25:29:30:0.545455:18:11:8:17:19:11:8:17
chr5	140237548	.	A	G	260.53	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00300261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.35;QD=18.9478;RBI=0.00662124;REFB=-0.021638;REVB=0.00590128;RO=26;SAF=15;SAR=13;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0969565;STB=0.544715;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0244205;OID=.;OPOS=140237548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:27:28:28:0.509091:13:15:11:15:13:15:12:15
chr5	140242451	.	GC	G	105.22	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.034957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.676;QD=8.09392;RBI=0.146663;REFB=-0.0113313;REVB=-0.142436;RO=31;SAF=14;SAR=6;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121954;STB=0.513875;STBP=0.894;TYPE=del;VARB=0.0096641;OID=.;OPOS=140242452;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.384615:20:52:20:52:32:14:6:23:9:99:31:14:6:22:9
chr5	140242479	.	T	A	251.88	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=0.00834203;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.237;QD=14.8164;RBI=0.0634531;REFB=-0.0186192;REVB=-0.0629024;RO=39;SAF=19;SAR=10;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722944;STB=0.540824;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.026234;OID=.;OPOS=140242479;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:39:39:29:29:0.426471:10:19:28:11:10:19:28:11
chr5	140250252	.	T	C	205.17	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0235979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.51;QD=15.7824;RBI=0.0717769;REFB=-0.0462715;REVB=0.0677869;RO=29;SAF=15;SAR=8;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204287;STB=0.616335;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0348102;OID=.;OPOS=140250252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:8:15:13:16:8:15:13:16
chr5	140255792	.	C	A	180.81	PASS	AF=0.566667;AO=13;DP=29;FAO=17;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.108869;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=27.1075;QD=24.1084;RBI=0.157344;REFB=-0.0971179;REVB=-0.113599;RO=4;SAF=5;SAR=8;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155903;STB=0.521714;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0248226;OID=.;OPOS=140255792;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:29:30:4:10:13:17:0.566667:8:5:3:1:11:6:3:7
chr5	140263290	.	T	G	198.9	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=-0.00827914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.111;QD=13.2602;RBI=0.0162184;REFB=-0.0260298;REVB=0.013946;RO=36;SAF=10;SAR=14;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366906;STB=0.707293;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0628243;OID=.;OPOS=140263290;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:36:24:24:0.4:14:10:28:8:14:10:28:8
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chr5	140307746	.	C	G	294.5	PASS	AF=0.619048;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0343614;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=197.121;QD=28.0475;RBI=0.0349374;REFB=-0.00169085;REVB=0.00631828;RO=16;SAF=13;SAR=13;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129661;STB=0.571375;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00142357;OID=.;OPOS=140307746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:16:16:26:26:0.619048:13:13:11:5:13:13:11:5
chr5	140307969	.	C	G	311.79	PASS	AF=0.5;AO=33;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0495174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3214;QD=18.3408;RBI=0.0674418;REFB=-0.0224058;REVB=-0.0457868;RO=34;SAF=22;SAR=11;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159761;STB=0.576807;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0186803;OID=.;OPOS=140307969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:34:34:33:34:0.5:11:22:17:17:12:22:17:17
chr5	140309016	.	C	T	434.36	PASS	AF=0.460784;AO=47;DP=102;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.0181396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1139;QD=17.0338;RBI=0.0184461;REFB=-0.00708474;REVB=-0.00334868;RO=55;SAF=24;SAR=23;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122179;STB=0.567992;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0140655;OID=.;OPOS=140309016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:55:55:47:47:0.460784:23:24:35:20:23:24:35:20
chr5	140309124	.	G	A	186.18	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0533958;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.9751;QD=18.6177;RBI=0.120659;REFB=-0.0468455;REVB=-0.108201;RO=18;SAF=8;SAR=10;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146151;STB=0.5251;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0317699;OID=.;OPOS=140309124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:40:18:20:18:20:0.5:10:8:11:7:11:9:10:10
chr5	140346468	.	T	A	416.57	PASS	AF=0.546667;AO=41;DP=76;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00511691;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.905;QD=22.217;RBI=0.0232615;REFB=-0.0269858;REVB=0.0226917;RO=34;SAF=27;SAR=14;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137579;STB=0.576011;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0268951;OID=.;OPOS=140346468;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:34:34:41:41:0.546667:14:27:17:17:14:27:17:17
chr5	140346712	.	T	C	739.46	PASS	AF=0.5;AO=76;DP=150;FAO=76;FDP=152;FR=.;FRO=76;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=37;FSRR=39;FWDB=0.00888786;FXX=0.0129862;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7334;QD=19.4595;RBI=0.0348056;REFB=-0.0234549;REVB=-0.0336516;RO=71;SAF=39;SAR=37;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194163;STB=0.513154;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0155994;OID=.;OPOS=140346712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:152:71:76:76:76:0.5:37:39:38:33:37:39:37:39
chr5	140347053	.	C	T	273.89	PASS	AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0590556;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.4917;QD=15.2163;RBI=0.071396;REFB=0.000797471;REVB=0.0401226;RO=41;SAF=23;SAR=8;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324893;STB=0.684793;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.000663383;OID=.;OPOS=140347053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:8:23:18:23:8:23:18:23
chr5	140475980	.	G	A	60.42	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.191558;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.31;QD=15.1052;RBI=0.192372;REFB=-0.0453575;REVB=0.0176759;RO=8;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309389;STB=0.681384;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0636017;OID=.;OPOS=140475980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:16:16:8:8:8:8:0.5:3:5:2:6:3:5:2:6
chr5	140476653	.	GC	AA	262.91	PASS	AF=0.373494;AO=31;DP=83;FAO=31;FDP=83;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.011303;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=273.256;QD=12.6705;RBI=0.0221777;REFB=-0.00410177;REVB=-0.0190813;RO=52;SAF=21;SAR=10;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261661;STB=0.650417;STBP=0.04;TYPE=mnp;VARB=0.00690213;OID=.;OPOS=140476653;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:52:52:31:31:0.373494:10:21:23:29:10:21:23:29
chr5	140480852	.	G	A	230.78	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0436897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9703;QD=23.0783;RBI=0.0496665;REFB=0.0514561;REVB=0.0236213;RO=17;SAF=11;SAR=11;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115028;STB=0.549955;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.0380211;OID=.;OPOS=140480852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:17:18:22:22:0.55:11:11:11:6:11:11:11:7
chr5	140481475	.	A	T	73.06	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00675532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.836;QD=9.13236;RBI=0.013176;REFB=-0.0136657;REVB=-0.0113124;RO=22;SAF=4;SAR=6;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163444;STB=0.5998;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0311258;OID=.;OPOS=140481475;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:6:4:12:10:6:4:12:10
chr5	140482483	.	G	A	651.04	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.674;QD=62.0034;RBI=0.05036;REFB=0;REVB=0.0469942;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242731;OID=.;OPOS=140482483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr5	140502177	.	G	A	257.98	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.00876467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.802;QD=18.4268;RBI=0.0140477;REFB=-0.0284199;REVB=-0.0109781;RO=28;SAF=13;SAR=15;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130023;STB=0.572489;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0311413;OID=.;OPOS=140502177;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:15:13:9:19:15:13:9:19
chr5	140502341	.	GCCC	GCTT	277.65	PASS	AF=0.537037;AO=28;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0164528;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=256.528;QD=20.5665;RBI=0.0164617;REFB=-0.031633;REVB=-0.000542355;RO=18;SAF=12;SAR=16;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288863;STB=0.565233;STBP=0.334;TYPE=mnp;VARB=0.0239275;OID=.;OPOS=140502343;OREF=CC;OALT=TT;OMAPALT=GCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.537037:28:54:29:54:25:12:17:7:18:99:18:12:16:7:11
chr5	140503237	.	A	G	76.14	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0123327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.248;QD=12.1823;RBI=0.0530376;REFB=0.00737994;REVB=-0.0515838;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169053;STB=0.599808;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=-0.00309139;OID=.;OPOS=140503237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:5:5:5:10:5:5:5:10
chr5	140517174	.	T	C	48.86	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00775071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.474;QD=13.9591;RBI=0.008496;REFB=-0.0326959;REVB=-0.00347974;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119504;STB=0.571224;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0266553;OID=.;OPOS=140517174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:4:3:4:3:4:3:4:3
chr5	140530529	.	G	A	334.66	PASS	AF=0.5;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=9;FWDB=-0.00319988;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.833;QD=19.1233;RBI=0.00832429;REFB=-0.00153578;REVB=-0.00768469;RO=32;SAF=18;SAR=17;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177862;STB=0.61507;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00223539;OID=.;OPOS=140530529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:32:35:35:35:0.5:17:18:23:9:17:18:26:9
chr5	140531175	.	T	C	660.13	PASS	AF=1;AO=31;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0912128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4215;QD=61.4075;RBI=0.0933264;REFB=0;REVB=-0.0197493;RO=0;SAF=7;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00222143;OID=.;OPOS=140531175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:31:43:1:24:7:0:0:29:14:0:0
chr5	140532420	.	C	G	167.26	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=-0.0245884;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.809;QD=14.2349;RBI=0.0327419;REFB=0.00422607;REVB=-0.0216205;RO=24;SAF=8;SAR=10;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248481;STB=0.63041;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.00824324;OID=.;OPOS=140532420;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:29:18:18:0.382979:10:8:5:19:10:8:7:22
chr5	140532871	.	T	A	248.42	PASS	AF=0.55814;AO=22;DP=41;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0895168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.2215;QD=23.1087;RBI=0.141862;REFB=-0.0749052;REVB=-0.110052;RO=19;SAF=15;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.093987;STB=0.565354;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0573654;OID=.;OPOS=140532871;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:43:19:19:22:24:0.55814:7:15:11:8:7:17:11:8
chr5	140553581	.	G	C	363.23	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.00580244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.686;QD=18.1615;RBI=0.00772316;REFB=-0.00308113;REVB=-0.00509695;RO=42;SAF=29;SAR=9;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324042;STB=0.68225;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00508932;OID=.;OPOS=140553581;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:9:29:19:23:9:29:19:23
chr5	140553856	.	G	A	36.41	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0388249;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.643;QD=6.93518;RBI=0.0592518;REFB=-0.00216572;REVB=-0.0447594;RO=13;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375164;STB=0.78843;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0120537;OID=.;OPOS=140553856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:21:13:15:6:6:0.285714:5:1:6:7:5:1:8:7
chr5	140554006	.	C	G	37.59	PASS	AF=0.375;AO=5;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0187248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.272;QD=9.39814;RBI=0.0195445;REFB=-0.017864;REVB=0.00560083;RO=10;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105052;STB=0.608323;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0305272;OID=.;OPOS=140554006;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:5:6:0.375:3:2:5:5:4:2:5:5
chr5	140554606	.	T	C	145.67	PASS	AF=0.30303;AO=21;DP=67;FAO=20;FDP=66;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.0441116;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.8965;QD=8.82867;RBI=0.0550868;REFB=-0.0108502;REVB=0.0329958;RO=44;SAF=11;SAR=10;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00124551;STB=0.534919;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.011497;OID=.;OPOS=140554606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:44:46:21:20:0.30303:10:11:23:21:9:11:23:23
chr5	140554808	.	T	A	409.65	PASS	AF=0.32;AO=50;DP=168;FAO=56;FDP=175;FR=.;FRO=119;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=63;FSRR=56;FWDB=-7.17098e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7273;QD=9.36333;RBI=0.0292261;REFB=-0.00606144;REVB=-0.0292261;RO=115;SAF=28;SAR=22;SRF=59;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05646;STB=0.541418;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0271285;OID=.;OPOS=140554808;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:175:115:119:50:56:0.32:22:28:59:56:23:33:63:56
chr5	140559596	.	T	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00316171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.213;QD=48.7373;RBI=0.0152708;REFB=0;REVB=0.0149399;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.87349e-05;OID=.;OPOS=140559596;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0
chr5	140559914	.	T	C	691.55	PASS	AF=0.606061;AO=60;DP=99;FAO=60;FDP=99;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=47;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.0218089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.771;QD=27.9414;RBI=0.0274537;REFB=-0.00584401;REVB=0.0166757;RO=39;SAF=13;SAR=47;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666333;STB=0.536364;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00292506;OID=.;OPOS=140559914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:39:39:60:60:0.606061:47:13:11:28:47:13:11:28
chr5	140563579	.	C	T	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0659211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=318.823;QD=15.2589;RBI=0.065975;REFB=-0.0114864;REVB=-0.00266625;RO=6;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293682;STB=0.666317;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0177821;OID=.;OPOS=140563579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:6:1:0:6:6:1:0:6
chr5	140564263	.	C	T	113.11	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0119442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.693;QD=17.401;RBI=0.0150028;REFB=-0.00899805;REVB=0.00907857;RO=12;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170674;STB=0.613866;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0139447;OID=.;OPOS=140564263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:12:13:13:13:0.5:6:7:4:8:6:7:4:9
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chr5	140568034	.	C	CA	602.8	PASS	AF=1;AO=48;DP=53;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034632;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.915;QD=48.2241;RBI=0.224719;REFB=0;REVB=-0.222035;RO=4;SAF=25;SAR=23;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331893;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00454758;OID=.;OPOS=140568035;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:48:53:50:50:0:26:24:0:0:11:4:25:23:3:1
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chr5	140573442	.	C	G	138.95	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00541064;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.322;QD=19.8494;RBI=0.005832;REFB=-0.0190616;REVB=-0.0021765;RO=13;SAF=10;SAR=5;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238067;STB=0.513496;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0155111;OID=.;OPOS=140573442;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:5:10:9:4:5:10:9:4
chr5	140575211	.	G	T	266.17	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0161841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.097;QD=21.2932;RBI=0.0190897;REFB=-0.0172441;REVB=-0.0101239;RO=25;SAF=12;SAR=13;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716692;STB=0.540161;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.019412;OID=.;OPOS=140575211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:13:12:10:15:13:12:10:15
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chr5	140581510	.	G	T	93.87	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=35;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0119148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.8;QD=10.4298;RBI=0.0425425;REFB=-0.00845719;REVB=0.0408399;RO=24;SAF=6;SAR=5;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141068;STB=0.558158;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0160177;OID=.;OPOS=140581510;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:35:36:24:24:11:12:0.333333:5:6:16:8:5:7:16:8
chr5	140594442	.	A	G	53.27	PASS	AF=0.10219;AO=14;DP=137;FAO=14;FDP=137;FR=.;FRO=123;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=54;FSRR=69;FWDB=-0.0167785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.013;QD=1.55546;RBI=0.0250702;REFB=-0.00334432;REVB=-0.0186279;RO=120;SAF=9;SAR=5;SRF=54;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228963;STB=0.678651;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0322661;OID=.;OPOS=140594442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:137:137:120:123:14:14:0.10219:5:9:54:66:5:9:54:69
chr5	140620056	.	A	G	360.2	PASS	AF=0.405941;AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=43;FSRR=17;FWDB=0.0657082;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.6946;QD=14.2655;RBI=0.0666105;REFB=0.0384711;REVB=-0.0109264;RO=60;SAF=24;SAR=17;SRF=43;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146904;STB=0.582571;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=-0.0558014;OID=.;OPOS=140620056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:60:60:41:41:0.405941:17:24:43:17:17:24:43:17
chr5	140626626	.	C	CA	73.25	PASS	AF=0.5;AO=3;DP=25;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.00718093;FXX=0.039984;HRUN=0;LEN=1;MLLD=143.669;QD=12.2084;RBI=0.0183199;REFB=-0.0330361;REVB=0.0168538;RO=22;SAF=0;SAR=3;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.536353;STB=0.588097;STBP=0.449;TYPE=ins;VARB=0.0642623;OID=.;OPOS=140626627;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:3:25:12:24:12:5:7:3:9:73:22:0:3:8:14
chr5	140626627	.	G	A	82.79	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0232072;FXX=0.119952;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.09;QD=15.0527;RBI=0.023649;REFB=-0.0272351;REVB=0.00455001;RO=12;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234457;STB=0.636111;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0457364;OID=.;OPOS=140626627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:25:22:12:12:10:10:0.454545:5:5:3:9:5:5:3:9
chr5	140682757	.	C	T	200.26	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=5;FWDB=0.00398383;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.087;QD=15.1137;RBI=0.00453399;REFB=-0.0166718;REVB=0.00216477;RO=29;SAF=13;SAR=10;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315939;STB=0.660749;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.010109;OID=.;OPOS=140682757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:30:23:23:0.433962:10:13:25:4:10:13:25:5
chr5	140683265	.	G	A	178.96	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0245617;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.132;QD=15.2306;RBI=0.0337937;REFB=-0.006955;REVB=-0.0232107;RO=28;SAF=9;SAR=10;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100654;STB=0.557975;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00825447;OID=.;OPOS=140683265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:10:9:16:12:10:9:16:12
chr5	140710705	.	G	A	501.58	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000483463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.373;QD=59.0091;RBI=0.000500964;REFB=0;REVB=-0.000131257;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.77388e-07;OID=.;OPOS=140710705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
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chr5	141243646	.	A	G	858.13	PASS	AF=0.447115;AO=93;DP=208;FAO=93;FDP=208;FR=.;FRO=115;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=60;FSRR=55;FWDB=-0.00118843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.569;QD=16.5024;RBI=0.00702485;REFB=-0.0198779;REVB=0.00692359;RO=115;SAF=51;SAR=42;SRF=60;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267038;STB=0.514827;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0199854;OID=.;OPOS=141243646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:208:208:115:115:93:93:0.447115:42:51:60:55:42:51:60:55
chr5	141309824	.	G	A	60.84	PASS	AF=0.219512;AO=9;DP=42;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0269229;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5179;QD=5.93571;RBI=0.0269383;REFB=-0.00920256;REVB=-0.000908438;RO=31;SAF=6;SAR=3;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286425;STB=0.509071;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0280469;OID=.;OPOS=141309824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:42:41:31:32:9:9:0.219512:3:6:20:11:3:6:21:11
chr5	141324955	.	C	CCTGCTGCTG	172.19	PASS	AF=0.226087;AO=24;DP=153;FAO=26;FDP=115;FR=.;FRO=89;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=72;FSRR=17;FWDB=-0.109294;FXX=0.243405;HRUN=2;LEN=9;MLLD=237.053;QD=5.98925;RBI=0.117929;REFB=-0.0303428;REVB=-0.0442959;RO=124;SAF=9;SAR=15;SRF=107;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.603389;STB=0.798854;STBP=0.003;TYPE=ins;VARB=0.0810891;OID=.;OPOS=141324956;OREF=-;OALT=CTGCTGCTG;OMAPALT=CCTGCTGCTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.226087:24:153:26:115:89:10:16:72:17:99:124:9:15:107:17
chr5	141325249	.	T	C	1666.95	PASS	AF=0.990991;AO=104;DP=111;FAO=110;FDP=111;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00184895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.013;QD=60.0701;RBI=0.0283817;REFB=0;REVB=0.0283214;RO=0;SAF=23;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.80348e-05;OID=.;OPOS=141325249;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:111:111:0:0:104:110:0.990991:81:23:0:0:82:28:0:0
chr5	141335241	.	A	G	233.7	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.017378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.255;QD=24.5996;RBI=0.0279976;REFB=-0.0160797;REVB=-0.0219515;RO=16;SAF=14;SAR=8;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288336;STB=0.660234;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0149485;OID=.;OPOS=141335241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:8:14:4:12:8:14:4:12
chr5	141335284	.	G	A	258.46	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0287369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8968;QD=18.7972;RBI=0.0373351;REFB=-0.0297487;REVB=0.0238348;RO=26;SAF=16;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00484298;STB=0.507931;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0476473;OID=.;OPOS=141335284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:27:28:28:0.509091:12:16:15:11:12:16:15:12
chr5	141335498	.	C	T	420.14	PASS	AF=0.457447;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0243572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.258;QD=17.8781;RBI=0.0267349;REFB=-0.0175724;REVB=0.011022;RO=51;SAF=23;SAR=20;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813146;STB=0.545433;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0183387;OID=.;OPOS=141335498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:51:51:43:43:0.457447:20:23:23:28:20:23:23:28
chr5	141336264	.	G	T	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.0216584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.608;QD=13.8496;RBI=0.0241616;REFB=-0.0149825;REVB=-0.0107097;RO=24;SAF=12;SAR=4;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596143;STB=0.508187;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0225411;OID=.;OPOS=141336264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:25:16:16:0.390244:4:12:19:5:4:12:19:6
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chr5	141337225	.	A	G	289.36	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.513;QD=52.6117;RBI=0.0146648;REFB=0;REVB=-0.00585807;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.57018e-05;OID=.;OPOS=141337225;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr5	141391532	.	G	A	1917.62	PASS	AF=1;AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122532;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1109;QD=61.8589;RBI=0.0140221;REFB=0;REVB=0.00681755;RO=0;SAF=74;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.08496e-05;OID=.;OPOS=141391532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:124:0:0:124:124:1:50:74:0:0:50:74:0:0
chr5	141531735	.	C	T	804.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.352;QD=64.3816;RBI=0.0291639;REFB=0;REVB=0.0239476;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71195e-05;OID=.;OPOS=141531735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:46:50:1:24:22:0:0:25:25:0:0
chr5	141973349	.	C	G	493.05	PASS	AF=0.485981;AO=51;DP=106;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.00871216;FXX=0.0272702;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.766;QD=18.4318;RBI=0.016451;REFB=-0.00427406;REVB=0.0139547;RO=53;SAF=24;SAR=27;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338763;STB=0.522488;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.00322824;OID=.;OPOS=141973349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:53:55:51:52:0.485981:27:24:23:30:28:24:23:32
chr5	141973501	.	T	C	290.15	PASS	AF=0.44;AO=32;DP=74;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0169381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.591;QD=15.4745;RBI=0.0176704;REFB=-0.0155645;REVB=0.00503421;RO=41;SAF=16;SAR=16;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607054;STB=0.518208;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0201831;OID=.;OPOS=141973501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:41:42:32:33:0.44:16:16:18:23:17:16:19:23
chr5	141974653	.	T	G	486.4	PASS	AF=0.495146;AO=51;DP=103;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=-0.00696552;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.267;QD=18.8894;RBI=0.0211222;REFB=0.00346663;REVB=-0.0199407;RO=52;SAF=31;SAR=20;SRF=36;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.082556;STB=0.545585;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=-0.00383879;OID=.;OPOS=141974653;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:52:52:51:51:0.495146:20:31:36:16:20:31:36:16
chr5	142254679	.	A	G	754.38	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00329116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.282;QD=56.9341;RBI=0.0167182;REFB=0;REVB=-0.016391;RO=0;SAF=16;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.33586e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.82483e-05;OID=.;OPOS=142254679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:37:16:0:0:37:16:0:0
chr5	142593652	.	C	T	1153.6	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00496016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.467;QD=60.7156;RBI=0.0102376;REFB=0;REVB=0.00895575;RO=0;SAF=46;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89405e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20371e-05;OID=.;OPOS=142593652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:29:46:0:0:29:47:0:0
chr5	143059433	.	T	C	169.1	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0437759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8747;QD=13.0073;RBI=0.055312;REFB=-0.0153942;REVB=-0.0338096;RO=31;SAF=12;SAR=8;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501522;STB=0.53655;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0262311;OID=.;OPOS=143059433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:32:20:20:0.384615:8:12:20:11:8:12:21:11
chr5	145246085	.	T	G	2969.13	PASS	AF=1;AO=177;DP=180;FAO=193;FDP=193;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.662;QD=61.5364;RBI=0.0614257;REFB=-0.026406;REVB=-0.00299494;RO=2;SAF=103;SAR=74;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01269;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.0293e-05;OID=.;OPOS=145246085;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:180:193:2:0:177:193:1:74:103:0:2:78:115:0:0
chr5	145393364	.	C	T	152.9	PASS	AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00838876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.238;QD=11.9923;RBI=0.0398638;REFB=0.0154455;REVB=0.0389712;RO=33;SAF=9;SAR=9;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167152;STB=0.509793;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.0115201;OID=.;OPOS=145393364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:9:9:17:16:9:9:17:16
chr5	145439647	.	T	C	989.0	PASS	AF=0.985714;AO=66;DP=69;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.014189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.674;QD=56.5141;RBI=0.0143506;REFB=-0.075723;REVB=-0.00214738;RO=1;SAF=23;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200972;STB=0.509431;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00011046;OID=.;OPOS=145439647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:69:70:1:1:66:69:0.985714:43:23:1:0:43:26:1:0
chr5	145477855	.	T	C	1496.89	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.638;QD=62.3705;RBI=0.0442544;REFB=0;REVB=0.0347941;RO=0;SAF=51;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222163;OID=.;OPOS=145477855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:96:0:0:89:96:1:38:51:0:0:42:54:0:0
chr5	145483844	.	A	T	612.08	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00861331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6256;QD=61.2076;RBI=0.00872121;REFB=0;REVB=0.00136764;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.70363e-05;OID=.;OPOS=145483844;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr5	145499996	.	C	T	1896.13	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9237;QD=61.6629;RBI=0.0860409;REFB=0;REVB=-0.0845489;RO=0;SAF=57;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000490437;OID=.;OPOS=145499996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:66:57:0:0:66:57:0:0
chr5	145508340	.	A	G	1413.94	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7023;QD=62.8419;RBI=0.0471959;REFB=0;REVB=0.0103102;RO=0;SAF=71;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.73879e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137205;OID=.;OPOS=145508340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:19:71:0:0:19:71:0:0
chr5	145508636	.	TA	CC	894.5	PASS	AF=1;AO=61;DP=64;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356775;FXX=0.0468677;HRUN=2;LEN=2;MLLD=134.23;QD=58.6558;RBI=0.0391266;REFB=0;REVB=0.0160626;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000124008;OID=.;OPOS=145508636;OREF=TA;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0
chr5	145519821	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.206;QD=50.4134;RBI=0.0587208;REFB=0;REVB=0.0265912;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231073;OID=.;OPOS=145519821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0
chr5	145523105	.	G	A	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.080126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7571;QD=59.0161;RBI=0.0808203;REFB=0;REVB=0.0105703;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00112092;OID=.;OPOS=145523105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr5	145539996	.	T	G	340.51	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0733418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6524;QD=54.482;RBI=0.0957138;REFB=0;REVB=0.0614989;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205614;OID=.;OPOS=145539996;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chr5	145543972	.	G	A	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000899639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.247;QD=57.3858;RBI=0.0631955;REFB=0;REVB=-0.0631891;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.33464e-05;OID=.;OPOS=145543972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
chr5	145890028	.	A	G	575.1	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.865;QD=60.5364;RBI=0.0547855;REFB=0;REVB=0.0240641;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214533;OID=.;OPOS=145890028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:23:14:0:0:24:14:0:0
chr5	145894896	.	G	C	754.37	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.658;QD=56.9332;RBI=0.034993;REFB=0;REVB=0.0303314;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250907;OID=.;OPOS=145894896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:21:31:0:0:21:32:0:0
chr5	145935658	.	G	A	2067.89	PASS	AF=0.992537;AO=132;DP=133;FAO=133;FDP=134;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00844103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.21;QD=61.7281;RBI=0.015049;REFB=-0.0634289;REVB=-0.0124588;RO=0;SAF=59;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.88567e-08;STB=0.503355;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=5.64924e-05;OID=.;OPOS=145935658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:133:134:0:1:132:133:0.992537:73:59:0:0:74:59:0:1
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chr5	146092398	.	A	G	157.85	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=2;FWDB=0.0343964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.505;QD=16.616;RBI=0.0380096;REFB=-0.00779705;REVB=0.0161744;RO=21;SAF=2;SAR=15;SRF=19;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.709104;STB=0.902145;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00206682;OID=.;OPOS=146092398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:15:2:19:2:15:2:19:2
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chr5	147593497	.	C	A	1013.76	PASS	AF=0.58642;AO=95;DP=162;FAO=95;FDP=162;FR=.;FRO=67;FSAF=59;FSAR=36;FSRF=41;FSRR=26;FWDB=-0.00677669;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.754;QD=25.0311;RBI=0.0121475;REFB=-0.00453331;REVB=-0.0100815;RO=67;SAF=59;SAR=36;SRF=41;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00735655;STB=0.503995;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.00269786;OID=.;OPOS=147593497;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:162:67:67:95:95:0.58642:36:59:41:26:36:59:41:26
chr5	147692959	.	A	G	147.51	PASS	AF=0.326923;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0511951;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=255.865;QD=11.3471;RBI=0.0567076;REFB=0.00859484;REVB=0.0243888;RO=18;SAF=4;SAR=13;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.445366;STB=0.771373;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.0231969;OID=.;OPOS=147692959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:18:34:17:17:0.326923:13:4:13:5:13:4:22:12
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chr5	147785886	.	A	G	226.43	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00719811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.001;QD=17.0887;RBI=0.11007;REFB=0.00265868;REVB=0.109834;RO=28;SAF=9;SAR=16;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232531;STB=0.631154;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.0038289;OID=.;OPOS=147785886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:16:9:17:11:16:9:17:11
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chr5	147856333	.	G	A	227.1	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0296021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.434;QD=21.1257;RBI=0.029746;REFB=-0.0110721;REVB=0.00292216;RO=21;SAF=13;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100802;STB=0.556693;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0152896;OID=.;OPOS=147856333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:9:13:10:11:9:13:10:11
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chr5	148206917	.	C	A	350.23	PASS	AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0102779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.845;QD=17.9603;RBI=0.0110572;REFB=0.000622742;REVB=0.00407773;RO=40;SAF=19;SAR=18;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0573964;STB=0.524987;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=-0.00071122;OID=.;OPOS=148206917;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:40:41:37:37:0.474359:18:19:23:17:18:19:23:18
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chr5	148384307	.	C	T	133.29	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0624057;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9349;QD=14.8102;RBI=0.100521;REFB=-0.0409015;REVB=0.0788032;RO=20;SAF=9;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100239;STB=0.572936;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0526002;OID=.;OPOS=148384307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:21:15:15:0.416667:6:9:10:10:6:9:10:11
chr5	148386525	.	T	C	408.78	PASS	AF=0.555556;AO=40;DP=73;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=6;FWDB=-0.0270053;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.089;QD=22.7099;RBI=0.0473635;REFB=-0.0189396;REVB=0.0389103;RO=31;SAF=28;SAR=12;SRF=25;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105737;STB=0.562471;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0130327;OID=.;OPOS=148386525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:31:32:40:40:0.555556:12:28:25:6:12:28:26:6
chr5	148407708	.	A	C	850.88	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2928;QD=57.6871;RBI=0.0183953;REFB=0;REVB=0.010117;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.78037e-05;OID=.;OPOS=148407708;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0
chr5	148407945	.	C	T	321.21	PASS	AF=0.53125;AO=33;DP=65;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00303561;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.259;QD=20.0757;RBI=0.0313459;REFB=-0.00795691;REVB=0.0311986;RO=30;SAF=18;SAR=15;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104641;STB=0.512075;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.00604199;OID=.;OPOS=148407945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:30:30:33:34:0.53125:15:18:16:14:15:19:16:14
chr5	148422274	.	C	T	460.82	PASS	AF=0.40625;AO=52;DP=128;FAO=52;FDP=128;FR=.;FRO=76;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=44;FSRR=32;FWDB=-0.0149786;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.9805;QD=14.4005;RBI=0.0232597;REFB=0.00298478;REVB=0.0177949;RO=76;SAF=31;SAR=21;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187329;STB=0.510561;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=-0.00401859;OID=.;OPOS=148422274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:76:76:52:52:0.40625:21:31:44:32:21:31:44:32
chr5	148437158	.	A	G	117.19	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00430912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.666;QD=12.0197;RBI=0.0100281;REFB=-0.015517;REVB=0.00905511;RO=25;SAF=13;SAR=1;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.597289;STB=0.866015;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0464037;OID=.;OPOS=148437158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:1:13:13:12:1:13:13:12
chr5	148578636	.	T	C	511.85	PASS	AF=0.490909;AO=53;DP=109;FAO=54;FDP=110;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.00381848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.183;QD=18.6127;RBI=0.00465701;REFB=-0.00358068;REVB=-0.00266589;RO=55;SAF=27;SAR=26;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499165;STB=0.527017;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.00347672;OID=.;OPOS=148578636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:55:56:53:54:0.490909:26:27:31:24:26:28:32:24
chr5	148610276	.	C	A	1037.31	PASS	AF=0.514851;AO=103;DP=201;FAO=104;FDP=202;FR=.;FRO=98;FSAF=60;FSAR=44;FSRF=46;FSRR=52;FWDB=0.0129094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.2;QD=20.5408;RBI=0.0134656;REFB=-0.0320254;REVB=-0.00383028;RO=95;SAF=60;SAR=43;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962624;STB=0.552561;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0307885;OID=.;OPOS=148610276;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:201:202:95:98:103:104:0.514851:43:60:45:50:44:60:46:52
chr5	148627252	.	G	A	221.98	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0310594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.163;QD=14.5558;RBI=0.0310762;REFB=-0.0170639;REVB=-0.00102187;RO=35;SAF=5;SAR=21;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238398;STB=0.637319;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0326875;OID=.;OPOS=148627252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:21:5:13:22:21:5:13:22
chr5	148699940	.	A	C	183.79	PASS	AF=0.423077;AO=21;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.00106573;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.823;QD=14.1378;RBI=0.0538834;REFB=-0.0131238;REVB=0.0538728;RO=29;SAF=8;SAR=13;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039234;STB=0.525524;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0158261;OID=.;OPOS=148699940;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:30:21:22:0.423077:13:8:10:19:13:9:11:19
chr5	148700031	.	A	T	140.92	PASS	AF=0.339286;AO=17;DP=55;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0215778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.394;QD=10.0657;RBI=0.0291867;REFB=-0.00763886;REVB=0.0196535;RO=37;SAF=7;SAR=10;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00756361;STB=0.525869;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00900353;OID=.;OPOS=148700031;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:37:37:17:19:0.339286:10:7:15:22:12:7:15:22
chr5	148720087	.	T	G	374.09	PASS	AF=0.46988;AO=38;DP=82;FAO=39;FDP=83;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.0670939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.045;QD=18.0282;RBI=0.0683072;REFB=-0.0208893;REVB=0.0128175;RO=44;SAF=14;SAR=24;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255437;STB=0.632286;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0304498;OID=.;OPOS=148720087;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:44:44:38:39:0.46988:24:14:28:16:24:15:28:16
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chr5	148996327	.	T	TA	76.54	PASS	AF=0.52381;AO=3;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0487113;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=128.112;QD=14.5794;RBI=0.0541819;REFB=-0.00179681;REVB=-0.0237251;RO=17;SAF=0;SAR=3;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.545438;STB=0.516099;STBP=0.953;TYPE=ins;VARB=0.00135744;OID=.;OPOS=148996328;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.52381:3:21:11:21:10:3:8:3:7:65:17:0:3:5:12
chr5	148996328	.	G	A	78.29	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0138828;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.2;QD=14.9123;RBI=0.0278954;REFB=-0.019836;REVB=-0.0241955;RO=11;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294979;STB=0.517207;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0170016;OID=.;OPOS=148996328;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:7:3:3:8:7:3:3:8
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chr5	149374932	.	T	C	991.19	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0355028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.795;QD=57.4605;RBI=0.0360144;REFB=-0.0633719;REVB=-0.00604869;RO=1;SAF=31;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150024;STB=0.507934;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000192723;OID=.;OPOS=149374932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:37:31:1:0:37:31:1:0
chr5	149406271	.	C	T	638.91	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036045;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.542;QD=62.3326;RBI=0.0582476;REFB=0;REVB=0.0457553;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276443;OID=.;OPOS=149406271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:22:18:0:0:23:18:0:0
chr5	149433400	.	G	C,GC	414.28	PASS	AF=0,1;AO=8,13;DP=35;FAO=0,30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,18;FSAR=0,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283712,0.0329151;FXX=0.142816;HRUN=8,0;LEN=1,1;MLLD=194.321,206.88;QD=55.2368;RBI=0.0295962,0.0363988;REFB=0,0;REVB=-0.00842646,-0.0155392;RO=13;SAF=8,9;SAR=0,4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.790232,0.27476;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.00147442;OID=.,.;OPOS=149433400,149433401;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:3:35:30:13:0:8,13:0,30:0,1:0,4:8,9:5:8:0,12:0,18:0:0
chr5	149433401	.	G	C	72.21	PASS	AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.0161349;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=85.3327;QD=8.25249;RBI=0.057119;REFB=0.0423514;REVB=0.0547928;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293146;STB=0.65686;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.00490884;OID=.;OPOS=149433401;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:35:24:25:10:10:0.285714:5:5:18:6:5:5:18:7
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chr5	149563715	.	T	C	805.13	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.102284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3419;QD=64.4106;RBI=0.110239;REFB=0;REVB=-0.0411166;RO=0;SAF=39;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00177411;OID=.;OPOS=149563715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:11:39:0:0:11:39:0:0
chr5	149583336	.	T	C	44.28	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0284551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.095;QD=6.81302;RBI=0.0323539;REFB=-0.00115441;REVB=-0.0153975;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520582;STB=0.533238;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.00334509;OID=.;OPOS=149583336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:3:4:10:9:3:4:10:9
chr5	149585025	.	A	C	1526.34	PASS	AF=1;AO=93;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00622516;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.296;QD=62.2994;RBI=0.011298;REFB=0;REVB=0.00942826;RO=0;SAF=49;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151344;OID=.;OPOS=149585025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:98:0:0:93:98:1:44:49:0:0:46:52:0:0
chr5	149602608	.	A	G	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0487949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.359;QD=62.0219;RBI=0.0515998;REFB=0;REVB=0.0167807;RO=0;SAF=11;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.24683e-05;OID=.;OPOS=149602608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:31:11:0:0:31:11:0:0
chr5	149644597	.	T	G	2307.67	PASS	AF=1;AO=151;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00946049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.565;QD=61.1304;RBI=0.0141482;REFB=0;REVB=0.01052;RO=0;SAF=83;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.07255e-06;OID=.;OPOS=149644597;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:151:151:0:0:151:151:1:68:83:0:0:68:83:0:0
chr5	149677851	.	A	G	897.17	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0098359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.328;QD=57.8817;RBI=0.0349243;REFB=0;REVB=0.0335106;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102823;OID=.;OPOS=149677851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:28:33:0:0:29:33:0:0
chr5	149824223	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00189201;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=361.744;QD=59.4356;RBI=0.00422415;REFB=0;REVB=0.00377674;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.27803e-06;OID=.;OPOS=149824223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0
chr5	149826526	.	C	T	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0066738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.027;QD=64.4154;RBI=0.00790034;REFB=0;REVB=0.00422797;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.40244e-06;OID=.;OPOS=149826526;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:25:25:0:0:25:25:0:0
chr5	149907533	.	T	G	128.09	PASS	AF=0.285714;AO=18;DP=63;FAO=18;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.0100148;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=314.429;QD=8.13255;RBI=0.0600214;REFB=-0.0134603;REVB=-0.05918;RO=31;SAF=12;SAR=6;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237241;STB=0.687295;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0216624;OID=.;OPOS=149907533;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:31:45:18:18:0.285714:6:12:14:17:6:12:18:27
chr5	149907602	.	A	G	106.27	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0240926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5098;QD=11.8074;RBI=0.0245541;REFB=-0.00806963;REVB=-0.00473811;RO=23;SAF=9;SAR=4;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442683;STB=0.758672;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0302662;OID=.;OPOS=149907602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:4:9:6:17:4:9:6:17
chr5	149919739	.	G	C	1351.66	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00287442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.211;QD=62.1452;RBI=0.0248549;REFB=0;REVB=0.0246881;RO=0;SAF=70;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.02038e-05;OID=.;OPOS=149919739;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:85:87:1:15:70:0:0:17:70:0:0
chr5	149923209	.	C	T	656.26	PASS	AF=0.585859;AO=58;DP=99;FAO=58;FDP=99;FR=.;FRO=41;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.0246469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5574;QD=26.5156;RBI=0.0251629;REFB=-0.0100254;REVB=0.00506942;RO=40;SAF=33;SAR=25;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624733;STB=0.527719;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00844199;OID=.;OPOS=149923209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:40:41:58:58:0.585859:25:33:26:14:25:33:26:15
chr5	149937495	.	TA	T,TT	387.14	PASS	AF=0.52,0.0133333;AO=34,5;DP=75;FAO=39,1;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=26,0;FSAR=13,1;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0189525,0.00869035;FXX=0.0131562;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=227.655,223.778;QD=20.6474;RBI=0.020615,0.0103435;REFB=-0.0211892,-0.0162415;REVB=0.00811065,0.00560951;RO=34;SAF=22,3;SAR=12,2;SRF=23;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0291947,-0.0960011;STB=0.510199,0.993408;STBP=0.853,0.236;TYPE=del,snp;VARB=0.0140645,0.0808414;OID=.,.;OPOS=149937496,149937496;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.52,0.0133333:34,5:75:39,1:75:35:26,0:13,1:24:11:99:34:22,3:12,2:23:11
chr5	149998128	.	G	A	651.17	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00623322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.926;QD=62.0161;RBI=0.0188658;REFB=0;REVB=-0.0178064;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.32818e-05;OID=.;OPOS=149998128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:16:26:0:0:16:26:0:0
chr5	150051779	.	G	C	390.16	PASS	AF=1;AO=24;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.366;QD=55.7368;RBI=0.0218653;REFB=0;REVB=-0.000850254;RO=1;SAF=5;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839257;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141601;OID=.;OPOS=150051779;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:1:0:24:28:1:19:5:1:0:19:9:0:0
chr5	150051958	.	T	C	1862.26	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.68;QD=61.0578;RBI=0.027757;REFB=0;REVB=0.0219838;RO=0;SAF=61;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.4687e-05;OID=.;OPOS=150051958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:122:0:0:116:122:1:55:61:0:0:61:61:0:0
chr5	150097883	.	G	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0165568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.774;QD=59.4353;RBI=0.0229897;REFB=0;REVB=0.01595;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.96412e-06;OID=.;OPOS=150097883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0
chr5	150158147	.	C	T	77.92	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00138217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.119;QD=14.1679;RBI=0.0209449;REFB=-0.0408212;REVB=-0.0208993;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655979;STB=0.538386;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0328917;OID=.;OPOS=150158147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:4:6:8:4:4:6:8:4
chr5	150158164	.	C	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.881;QD=53.277;RBI=0.0610733;REFB=0;REVB=0.0599776;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110939;OID=.;OPOS=150158164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr5	150158191	.	G	T	272.89	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0298554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.856;QD=45.4824;RBI=0.0298757;REFB=0.0175397;REVB=-0.00110139;RO=2;SAF=9;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921477;STB=0.549954;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.00836482;OID=.;OPOS=150158191;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:2:2:22:22:0.916667:13:9:2:0:13:9:2:0
chr5	150158199	.	C	T	246.29	PASS	AF=0.956522;AO=20;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.205625;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.562;QD=42.8335;RBI=0.213459;REFB=-0.21338;REVB=0.0572974;RO=3;SAF=8;SAR=12;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654458;STB=0.519982;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0337502;OID=.;OPOS=150158199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:23:23:3:1:20:22:0.956522:12:8:2:1:12:10:0:1
chr5	150158226	.	A	C	198.42	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0160437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.062;QD=44.0922;RBI=0.0297823;REFB=-0.00227344;REVB=0.0250915;RO=1;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482085;STB=0.526285;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.000456495;OID=.;OPOS=150158226;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:9:8:0:1:9:8:0:1
chr5	150227998	.	C	T	594.48	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8985;QD=60.9724;RBI=0.0735987;REFB=0;REVB=0.0685026;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142865;OID=.;OPOS=150227998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr5	150257616	.	A	G	701.22	PASS	AF=0.964912;AO=52;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0595964;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.2525;QD=49.2086;RBI=0.0635424;REFB=-0.200306;REVB=-0.0220434;RO=2;SAF=25;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361964;STB=0.500319;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0231026;OID=.;OPOS=150257616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:57:57:2:2:52:55:0.964912:27:25:2:0:27:28:1:1
chr5	150311773	.	T	C	1072.35	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0650388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.2905;QD=58.759;RBI=0.0708095;REFB=0;REVB=0.0279989;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000848498;OID=.;OPOS=150311773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:73:0:0:66:73:1:36:30:0:0:39:34:0:0
chr5	150323428	.	A	G	1358.62	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=283.236;QD=62.4654;RBI=0.0431647;REFB=0;REVB=0.0230569;RO=0;SAF=49;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.40454e-05;OID=.;OPOS=150323428;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:38:49:0:0:38:49:0:0
chr5	150407456	.	T	C	3677.11	PASS	AF=0.987395;AO=234;DP=240;FAO=235;FDP=238;FR=.;FRO=3;FSAF=122;FSAR=113;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00235759;FXX=0.00833299;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.47;QD=61.8002;RBI=0.0400895;REFB=-0.0555503;REVB=0.0400201;RO=3;SAF=121;SAR=113;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116672;STB=0.506072;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.000975573;OID=.;OPOS=150407456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:240:238:3:3:234:235:0.987395:113:121:3:0:113:122:3:0
chr5	150409477	.	T	C	902.69	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.778;QD=58.238;RBI=0.0383047;REFB=0;REVB=0.0338702;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.11649e-05;OID=.;OPOS=150409477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:32:29:0:0:32:30:0:0
chr5	150480520	.	C	T	553.6	PASS	AF=0.52;AO=52;DP=100;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.0636853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3825;QD=22.144;RBI=0.0671757;REFB=-0.00655854;REVB=-0.0213719;RO=47;SAF=24;SAR=28;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115239;STB=0.568121;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00637341;OID=.;OPOS=150480520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:47:48:52:52:0.52:28:24:28:19:28:24:29:19
chr5	150484787	.	C	T	624.0	PASS	AF=0.439189;AO=65;DP=148;FAO=65;FDP=148;FR=.;FRO=83;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=48;FSRR=35;FWDB=-0.0133669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4264;QD=16.8649;RBI=0.0133727;REFB=-0.00100787;REVB=0.000394491;RO=82;SAF=41;SAR=24;SRF=48;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480101;STB=0.531055;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.00154009;OID=.;OPOS=150484787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:148:82:83:65:65:0.439189:24:41:48:34:24:41:48:35
chr5	150489390	.	A	G	1190.59	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.63;QD=61.056;RBI=0.0304457;REFB=0;REVB=0.0146907;RO=0;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41393e-05;OID=.;OPOS=150489390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:78:0:0:75:78:1:37:38:0:0:37:41:0:0
chr5	150512740	.	G	A	320.96	PASS	AF=0.387097;AO=36;DP=93;FAO=36;FDP=93;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=41;FWDB=0.00360456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.502;QD=13.8047;RBI=0.015496;REFB=-0.0267241;REVB=-0.0150709;RO=57;SAF=18;SAR=18;SRF=16;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237927;STB=0.634339;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0409348;OID=.;OPOS=150512740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:57:57:36:36:0.387097:18:18:16:41:18:18:16:41
chr5	150518988	.	G	A	344.41	PASS	AF=0.586207;AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=58;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0575374;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.897;QD=23.7523;RBI=0.057547;REFB=0.00155025;REVB=0.00105255;RO=24;SAF=23;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174044;STB=0.596054;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.00162873;OID=.;OPOS=150518988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:24:24:34:34:0.586207:11:23:11:13:11:23:11:13
chr5	150562692	.	GCCCCT	GCCCC,GCCCCG,GCCCT	178.76	PASS	AF=0.359375,0.015625,0;AO=18,3,9;DP=65;FAO=23,1,0;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=14,0,0;FSAR=9,1,0;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.00104564,0.00180662,-0.124344;FXX=0.0153822;HRUN=1,1,4;LEN=1,1,1;MLLD=120.644,120.521,12.7736;QD=11.1727;RBI=0.00732247,0.00269121,0.22316;REFB=-0.0228566,-0.0215965,-0.134617;REVB=-0.00724743,-0.00199467,-0.185308;RO=29;SAF=13,0,6;SAR=5,3,3;SRF=19;SRR=10;SSEN=0,0,0.3;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0843599,-0.622762,0.0153032;STB=0.510908,0.992303,0.5;STBP=0.91,0.256,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.0480011,-0.0291803,0.0125374;OID=.,.,.;OPOS=150562697,150562697,150562693;OREF=T,T,C;OALT=-,G,-;OMAPALT=GCCCC,GCCCCG,GCCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.359375,0.015625,0:18,3,9:65:23,1,0:64:40:14,0,0:9,1,0:25:15:99:29:13,0,6:5,3,3:19:10
chr5	150578574	.	A	G	601.23	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0364939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.58;QD=58.6561;RBI=0.0397145;REFB=0.0299975;REVB=0.0156663;RO=1;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267872;STB=0.514279;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-9.74232e-05;OID=.;OPOS=150578574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:17:23:0:1:17:23:0:1
chr5	150639409	.	A	G	1361.68	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124754;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.494;QD=62.6062;RBI=0.0125561;REFB=0;REVB=0.00142184;RO=0;SAF=35;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.78543e-06;OID=.;OPOS=150639409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:52:35:0:0:52:35:0:0
chr5	150639439	.	A	G	1026.2	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7724;QD=59.4898;RBI=0.033291;REFB=0;REVB=-0.0277813;RO=0;SAF=24;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000232005;OID=.;OPOS=150639439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:45:24:0:0:45:24:0:0
chr5	150647012	.	A	G	405.67	PASS	AF=0.446809;AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=0.0250912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.922;QD=17.2627;RBI=0.0309642;REFB=-0.0222924;REVB=-0.0181443;RO=52;SAF=26;SAR=16;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368102;STB=0.520598;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0223224;OID=.;OPOS=150647012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:52:52:42:42:0.446809:16:26:34:18:16:26:34:18
chr5	150666933	.	C	A	729.39	PASS	AF=0.493421;AO=76;DP=153;FAO=75;FDP=152;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=51;FWDB=0.013182;FXX=0.00653552;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.666;QD=19.1945;RBI=0.0140764;REFB=-0.00258427;REVB=0.00493755;RO=76;SAF=35;SAR=41;SRF=26;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109435;STB=0.566205;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00440331;OID=.;OPOS=150666933;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:152:76:77:76:75:0.493421:41:35:26:50:40:35:26:51
chr5	150667016	.	T	C	711.03	PASS	AF=0.4375;AO=77;DP=176;FAO=77;FDP=176;FR=.;FRO=99;FSAF=25;FSAR=52;FSRF=47;FSRR=52;FWDB=-0.016836;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=258.01;QD=16.1599;RBI=0.0172707;REFB=-0.00635245;REVB=-0.00385034;RO=98;SAF=25;SAR=52;SRF=47;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165522;STB=0.59014;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00693955;OID=.;OPOS=150667016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:176:98:99:77:77:0.4375:52:25:47:51:52:25:47:52
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chr5	150696447	.	C	T	1212.15	PASS	AF=0.891089;AO=91;DP=98;FAO=90;FDP=101;FR=.;FRO=11;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0373088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4134;QD=48.0059;RBI=0.105535;REFB=-0.0360853;REVB=-0.0987206;RO=5;SAF=42;SAR=49;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137123;STB=0.53952;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0208163;OID=.;OPOS=150696447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:98:101:5:11:91:90:0.891089:49:42:3:2:49:41:9:2
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chr5	150696540	.	C	T	993.6	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250338;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.455;QD=59.3195;RBI=0.0432036;REFB=0;REVB=-0.0352116;RO=0;SAF=44;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.11549e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.24013e-05;OID=.;OPOS=150696540;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:67:0:0:67:67:1:23:44:0:0:23:44:0:0
chr5	150723806	.	G	A	909.25	PASS	AF=0.942029;AO=65;DP=69;FAO=65;FDP=69;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0282476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4459;QD=52.7103;RBI=0.051962;REFB=0.0279635;REVB=-0.0436133;RO=4;SAF=16;SAR=49;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712135;STB=0.537827;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.0139669;OID=.;OPOS=150723806;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:69:69:4:4:65:65:0.942029:49:16:3:1:49:16:3:1
chr5	150886725	.	G	A	682.52	PASS	AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0159355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.429;QD=52.5018;RBI=0.114995;REFB=0.0222245;REVB=-0.113885;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.50077;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=-0.00254824;OID=.;OPOS=150886725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:52:0:2:50:50:0.961538:24:26:0:0:24:26:1:1
chr5	150886882	.	G	A	2288.17	PASS	AF=1;AO=151;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.808;QD=60.215;RBI=0.0558866;REFB=-0.0982097;REVB=0.0512607;RO=0;SAF=72;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70733e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183644;OID=.;OPOS=150886882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:152:152:0:0:151:152:1:79:72:0:0:79:73:0:0
chr5	150891733	.	A	G	889.68	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.878;QD=57.399;RBI=0.0523353;REFB=0;REVB=-0.0341012;RO=0;SAF=34;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114381;OID=.;OPOS=150891733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:62:0:0:60:62:1:26:34:0:0:26:36:0:0
chr5	150901111	.	A	G	1453.45	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.373;QD=63.1935;RBI=0.0229883;REFB=0;REVB=0.0152019;RO=0;SAF=46;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59092e-05;OID=.;OPOS=150901111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:90:92:1:44:46:0:0:46:46:0:0
chr5	150901261	.	C	T	593.89	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6052;QD=60.9115;RBI=0.0619234;REFB=0;REVB=0.0455496;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00080775;OID=.;OPOS=150901261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr5	150901300	.	G	A	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00882695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.029;QD=59.0163;RBI=0.0408629;REFB=0;REVB=0.0398982;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122706;OID=.;OPOS=150901300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0
chr5	150901613	.	A	G	425.53	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00512058;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.9939;QD=54.9076;RBI=0.0283763;REFB=0;REVB=0.0279105;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000601115;OID=.;OPOS=150901613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:31:0:0:29:31:1:10:19:0:0:12:19:0:0
chr5	150923405	.	A	G	784.98	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0458447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9156;QD=57.0892;RBI=0.0547471;REFB=0;REVB=-0.029925;RO=0;SAF=20;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00085818;OID=.;OPOS=150923405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:35:20:0:0:35:20:0:0
chr5	150925144	.	A	G	95.64	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00974346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.936;QD=11.5926;RBI=0.0368895;REFB=-0.0034347;REVB=-0.0355795;RO=20;SAF=11;SAR=1;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.573752;STB=0.862021;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0180167;OID=.;OPOS=150925144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:20:21:12:12:0.363636:1:11:10:10:1:11:10:11
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chr5	150942969	.	G	A	343.21	PASS	AF=0.596491;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00417914;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.877;QD=24.0849;RBI=0.00515545;REFB=-0.0117239;REVB=0.00301885;RO=23;SAF=17;SAR=17;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478693;STB=0.5263;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00859049;OID=.;OPOS=150942969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:23:23:34:34:0.596491:17:17:13:10:17:17:13:10
chr5	150943085	.	G	A	469.17	PASS	AF=0.463636;AO=51;DP=110;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=0.00971374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.525;QD=17.0607;RBI=0.0170761;REFB=-0.00849674;REVB=0.0140441;RO=59;SAF=26;SAR=25;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805802;STB=0.54482;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.00666092;OID=.;OPOS=150943085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:59:59:51:51:0.463636:25:26:35:24:25:26:35:24
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chr5	153413390	.	C	T	996.0	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00293379;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.639;QD=59.4624;RBI=0.017828;REFB=0;REVB=-0.017585;RO=0;SAF=48;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.6764e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.65001e-06;OID=.;OPOS=153413390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:67:0:0:67:67:1:19:48:0:0:19:48:0:0
chr5	153429459	.	T	C	1560.84	PASS	AF=0.99;AO=96;DP=97;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0210139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2632;QD=62.4336;RBI=0.0467205;REFB=-0.116273;REVB=0.0417279;RO=1;SAF=45;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920842;STB=0.504586;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0017597;OID=.;OPOS=153429459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:97:100:1:1:96:99:0.99:51:45:0:1:54:45:0:1
chr5	153432733	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.776;QD=51.1837;RBI=0.0467262;REFB=0;REVB=0.0305162;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000479255;OID=.;OPOS=153432733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr5	153432970	.	C	T	1160.54	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0357372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6773;QD=60.2877;RBI=0.0373511;REFB=0;REVB=0.010861;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.92682e-05;OID=.;OPOS=153432970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:76:77:1:35:41:0:0:36:41:0:0
chr5	153729217	.	A	G	274.23	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0103248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.369;QD=24.9297;RBI=0.0119136;REFB=-0.00440214;REVB=0.00594398;RO=19;SAF=10;SAR=15;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587921;STB=0.532684;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.00309418;OID=.;OPOS=153729217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:15:10:9:10:15:10:9:10
chr5	153798056	.	C	T	216.68	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.00454588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.165;QD=13.3342;RBI=0.0185374;REFB=-0.010254;REVB=-0.0179714;RO=39;SAF=18;SAR=8;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200296;STB=0.615098;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0174206;OID=.;OPOS=153798056;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:8:18:20:19:8:18:20:19
chr5	153854714	.	A	T	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00237072;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.583;QD=12.7823;RBI=0.0234278;REFB=-0.0103864;REVB=-0.0233076;RO=14;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998889;STB=0.559202;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0161088;OID=.;OPOS=153854714;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:4:6:7:7:4:6:7:7
chr5	154268902	.	C	T	931.63	PASS	AF=0.984848;AO=63;DP=64;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0100694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5358;QD=56.4623;RBI=0.0414102;REFB=-0.0923686;REVB=0.0401673;RO=1;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136873;STB=0.507244;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00083538;OID=.;OPOS=154268902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:66:1:1:63:65:0.984848:34:29:0:1:34:31:0:1
chr5	154271948	.	G	A	1080.54	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.346;QD=60.03;RBI=0.0148136;REFB=0;REVB=0.00881667;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.32941e-05;OID=.;OPOS=154271948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:34:38:0:0:34:38:0:0
chr5	154291409	.	C	T	971.19	PASS	AF=1;AO=62;DP=65;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.648;QD=55.4966;RBI=0.189426;REFB=-0.0476394;REVB=0.186037;RO=3;SAF=39;SAR=23;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576847;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00247742;OID=.;OPOS=154291409;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:65:70:3:0:62:70:1:23:39:0:3:29:41:0:0
chr5	154300940	.	A	C	711.57	PASS	AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0262941;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.3072;QD=52.7086;RBI=0.0942213;REFB=-0.065236;REVB=0.090478;RO=1;SAF=35;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01327;STB=0.507244;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00316277;OID=.;OPOS=154300940;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:54:54:1:2:52:52:0.962963:17:35:1:0:17:35:1:1
chr5	154306972	.	T	C	1664.93	PASS	AF=0.991228;AO=112;DP=114;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0414213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3732;QD=58.4187;RBI=0.101885;REFB=-0.14971;REVB=0.093085;RO=1;SAF=52;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00904314;STB=0.504761;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00176587;OID=.;OPOS=154306972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:114:114:1:1:112:113:0.991228:60:52:1:0:61:52:1:0
chr5	154395158	.	G	T	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0995585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.144;QD=19.343;RBI=0.0995676;REFB=-0.0025567;REVB=-0.00134379;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197011;STB=0.610994;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.000872134;OID=.;OPOS=154395158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:9:9:13:5:9:9:13:5
chr5	154395458	.	G	A	181.52	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00262418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.905;QD=24.203;RBI=0.016713;REFB=-0.012841;REVB=0.0165057;RO=12;SAF=15;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377244;STB=0.714013;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00993481;OID=.;OPOS=154395458;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:3:15:5:7:3:15:5:7
chr5	154395682	.	G	A	472.72	PASS	AF=0.472222;AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.0218398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.555;QD=17.508;RBI=0.0261889;REFB=-0.0140575;REVB=-0.0144528;RO=57;SAF=35;SAR=16;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196643;STB=0.609711;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0285806;OID=.;OPOS=154395682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:57:57:51:51:0.472222:16:35:28:29:16:35:28:29
chr5	154396505	.	G	A	333.86	PASS	AF=0.514706;AO=34;DP=67;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0301802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4836;QD=19.6385;RBI=0.0406776;REFB=0.0123403;REVB=-0.0272732;RO=32;SAF=17;SAR=17;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514278;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=-0.012374;OID=.;OPOS=154396505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:32:33:34:35:0.514706:17:17:16:16:17:18:16:17
chr5	155511486	.	T	C	481.06	PASS	AF=0.494737;AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=37;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0224908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.089;QD=20.2553;RBI=0.0394751;REFB=-0.0330737;REVB=0.0324415;RO=47;SAF=10;SAR=37;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219526;STB=0.619102;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0213204;OID=.;OPOS=155511486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:47:48:47:47:0.494737:37:10:19:28:37:10:19:29
chr5	155771579	.	T	C	1510.66	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.316;QD=63.6068;RBI=0.0335027;REFB=0;REVB=0.0254653;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43953e-05;OID=.;OPOS=155771579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:44:51:0:0:44:51:0:0
chr5	156376703	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.053;QD=50.4135;RBI=0.0603307;REFB=0;REVB=0.0298599;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000926308;OID=.;OPOS=156376703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr5	156479424	.	A	C	2325.54	PASS	AF=1;AO=152;DP=153;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213225;FXX=0.0129862;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.868;QD=61.1985;RBI=0.0449996;REFB=0;REVB=0.0396273;RO=0;SAF=86;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104082;OID=.;OPOS=156479424;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:153:152:0:0:152:152:1:66:86:0:0:66:86:0:0
chr5	156479443	.	CTTG	C	582.74	PASS	AF=0.506024;AO=82;DP=163;FAO=84;FDP=166;FR=.;FRO=82;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=53;FSRR=29;FWDB=0.00282648;FXX=0.0119041;HRUN=2;LEN=3;MLLD=251.584;QD=14.0419;RBI=0.00360205;REFB=-0.024322;REVB=-0.00223288;RO=63;SAF=38;SAR=44;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148541;STB=0.589219;STBP=0.031;TYPE=del;VARB=0.0210417;OID=.;OPOS=156479444;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.506024:82:163:84:166:82:39:45:53:29:99:63:38:44:41:22
chr5	156479508	.	CAGAACAGTCGTTGTCGTTGGAATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTCATT	C	50.0	PASS	AO=72;DP=215;LEN=66;RO=143;SAF=40;SAR=70;SRF=64;SRR=41;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=156479509;OREF=AGAACAGTCGTTGTCGTTGGAATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTCATT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:215:143:72:70:40:64:41
chr5	156479509	.	A	G	2814.79	PASS	AF=1;AO=177;DP=178;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210136;FXX=0.0164826;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.756;QD=62.9003;RBI=0.0283442;REFB=0;REVB=0.0190216;RO=0;SAF=81;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43551e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.09135e-05;OID=.;OPOS=156479509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:178:179:0:0:177:179:1:96:81:0:0:96:83:0:0
chr5	156479557	.	GTTGGAACAGTCGTCA	G,GTTGGAACAGTCGTTGTCA	1445.25	PASS	AF=0.217822,0.782178;AO=21,67;DP=115;FAO=22,79;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=10,12;FSAR=12,67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253411,0.0346099;FXX=0.129299;HRUN=2,1;LEN=15,3;MLLD=90.8202,276.857;QD=57.2375;RBI=0.0568924,0.0397806;REFB=0,0;REVB=-0.0509369,0.0196125;RO=0;SAF=9,8;SAR=12,59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,ins;VARB=3.64239e-05,0.00626209;OID=.,.;OPOS=156479558,156479569;OREF=TTGGAACAGTCGTCA,-;OALT=-,GTT;OMAPALT=G,GTTGGAACAGTCGTTGTCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.217822,0.782178:21,67:115:22,79:101:0:10,12:12,67:0:0:99:0:9,8:12,59:0:0
chr5	156479596	.	A	ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCATTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGAA	50.0	PASS	AO=64;DP=215;LEN=69;RO=151;SAF=40;SAR=70;SRF=64;SRR=41;TYPE=ins;FR=.;OID=.;OPOS=156479596;OREF=-;OALT=ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCATTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGA;OMAPALT=ATGCTCATTGTTGTTGGAACAGTTGTCGTTGGAACAGTCGTTGTCATTGGAACAGTCGTTGTCGTTGGAA	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:215:151:64:70:40:64:41
chr5	156482459	.	G	T	1878.83	PASS	AF=0.991935;AO=123;DP=124;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0614967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9648;QD=60.6075;RBI=0.0796851;REFB=-0.0412718;REVB=-0.0506743;RO=1;SAF=68;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693583;STB=0.503649;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.000133717;OID=.;OPOS=156482459;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:124:124:1:1:123:123:0.991935:55:68:1:0:55:68:1:0
chr5	156531736	.	C	A	771.34	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0476509;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.641;QD=57.1363;RBI=0.0484354;REFB=0;REVB=0.00868225;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.45518e-05;OID=.;OPOS=156531736;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0
chr5	156721863	.	T	TC	1201.5	PASS	AF=1;AO=104;DP=134;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00588983;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.7577;QD=36.6871;RBI=0.0757969;REFB=0;REVB=0.0755677;RO=25;SAF=53;SAR=51;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0768108;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00111306;OID=.;OPOS=156721864;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:104:134:131:131:0:71:60:0:0:23:25:53:51:18:7
chr5	156747714	.	GC	CG,G	38.49	PASS	AF=0.0449438,0.179775;AO=10,30;DP=87;FAO=4,16;FDP=89;FR=.;FRO=69;FSAF=4,3;FSAR=0,13;FSRF=46;FSRR=23;FWDB=-0.0585944,-0.106333;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=75.8188,9.32424;QD=1.73009;RBI=0.0914732,0.213883;REFB=-0.0147412,-0.193939;REVB=-0.0702427,-0.185578;RO=40;SAF=10,5;SAR=0,25;SRF=33;SRR=7;SSEN=0,0.452381;SSEP=0,0;SSSB=0.654415,-0.632743;STB=0.996594,0.854638;STBP=0.081,0.003;TYPE=mnp,del;VARB=0.146436,0.150202;OID=.,.;OPOS=156747714,156747715;OREF=GC,C;OALT=CG,-;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:22:87:89:40:69:10,30:4,16:0.0449438,0.179775:0,25:10,5:33:7:0,13:4,3:46:23
chr5	156898690	.	A	G	1285.92	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.785;QD=61.9718;RBI=0.0492916;REFB=0;REVB=0.0461432;RO=0;SAF=56;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.17383e-05;OID=.;OPOS=156898690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:75:83:0:0:75:83:1:19:56:0:0:26:57:0:0
chr5	156904633	.	C	T	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0620489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.166;QD=62.3484;RBI=0.0622981;REFB=0;REVB=-0.00556758;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108264;OID=.;OPOS=156904633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:29:14:0:0:29:14:0:0
chr5	157102124	.	G	A,GA	104.49	PASS	AF=0,0.409091;AO=3,9;DP=43;FAO=0,18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=0,17;FSAR=0,1;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00738649,0.0639729;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=120.431,18.2581;QD=9.49947;RBI=0.0460035,0.0639814;REFB=-0.0284194,-0.081589;REVB=-0.0454066,-0.00104521;RO=30;SAF=3,9;SAR=0,0;SRF=16;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.532926,0.732592;STB=0.5,0.887507;STBP=1,0;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.140543;OID=.,.;OPOS=157102124,157102125;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:43:44:30:26:3,9:0,18:0,0.409091:0,0:3,9:16:14:0,1:0,17:13:13
chr5	157102159	.	G	A	198.67	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0139838;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.1578;QD=19.3824;RBI=0.0333001;REFB=0.00990865;REVB=-0.0302217;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196241;STB=0.5111;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=-0.0123749;OID=.;OPOS=157102159;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:9:11:12:9:9:11:12:9
chr5	157102185	.	A	G	157.79	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0339918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.899;QD=16.6091;RBI=0.0496524;REFB=-0.01689;REVB=0.0361928;RO=21;SAF=9;SAR=8;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00541022;STB=0.503102;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0120954;OID=.;OPOS=157102185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:8:9:11:10:8:9:11:10
chr5	157164962	.	T	C	187.39	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0167651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0896;QD=14.6975;RBI=0.0317102;REFB=-0.00673199;REVB=0.0269159;RO=30;SAF=14;SAR=7;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335899;STB=0.692129;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0122453;OID=.;OPOS=157164962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:7:14:10:20:7:14:10:20
chr5	157183735	.	AGGGGC	AGGGAC,AGGGCA	195.47	PASS	AF=0.423077,0;AO=17,2;DP=53;FAO=22,0;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=14,0;FSAR=8,0;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0359256,-0.161999;FXX=0.0188644;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=42.5058,20.0656;QD=15.0362;RBI=0.039779,0.233018;REFB=-0.00133514,-0.0659796;REVB=-0.0170797,-0.167493;RO=18;SAF=12,1;SAR=5,1;SRF=13;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0179243,-0.235288;STB=0.522367,0.5;STBP=0.827,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0455151,0;OID=.,.;OPOS=157183739,157183739;OREF=G,GC;OALT=A,CA;OMAPALT=AGGGAC,AGGGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.423077,0:17,2:53:22,0:52:30:14,0:8,0:18:12:99:18:12,1:5,1:13:5
chr5	157183770	.	C	T	119.69	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0322044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3009;QD=13.6785;RBI=0.0766288;REFB=-0.0113569;REVB=-0.0695331;RO=21;SAF=2;SAR=12;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430803;STB=0.757466;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0110674;OID=.;OPOS=157183770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:12:2:10:11:12:2:10:11
chr5	157213497	.	A	G	2115.35	PASS	AF=0.992754;AO=133;DP=135;FAO=137;FDP=138;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=65;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.125781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.794;QD=61.3144;RBI=0.127322;REFB=-0.167138;REVB=0.019746;RO=2;SAF=68;SAR=65;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137733;STB=0.503448;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.000983056;OID=.;OPOS=157213497;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:135:138:2:1:133:137:0.992754:65:68:2:0:65:72:1:0
chr5	158204425	.	A	G	1475.4	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232973;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.747;QD=63.4582;RBI=0.0258608;REFB=0;REVB=0.0112259;RO=0;SAF=45;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.34337e-05;OID=.;OPOS=158204425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:92:93:1:47:45:0:0:48:45:0:0
chr5	159505208	.	C	A	347.93	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.312;QD=53.5274;RBI=0.0299133;REFB=0;REVB=-0.0128086;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000478719;OID=.;OPOS=159505208;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:24:26:1:8:16:0:0:8:18:0:0
chr5	159659273	.	C	T	594.51	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.745;QD=60.975;RBI=0.0273097;REFB=0;REVB=0.00826476;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121701;OID=.;OPOS=159659273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr5	159679636	.	C	T	420.39	PASS	AF=0.457447;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.0273786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.647;QD=17.8891;RBI=0.0279701;REFB=-0.000583567;REVB=-0.00572189;RO=50;SAF=28;SAR=15;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032614;STB=0.525457;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.000721276;OID=.;OPOS=159679636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:50:51:43:43:0.457447:15:28:31:19:15:28:31:20
chr5	159679990	.	C	T	310.13	PASS	AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.011237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.118;QD=28.8489;RBI=0.0346206;REFB=-0.00483678;REVB=-0.0327462;RO=16;SAF=14;SAR=13;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967565;STB=0.553225;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.00373286;OID=.;OPOS=159679990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:13:14:6:10:13:14:6:10
chr5	159680046	.	T	C	143.0	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.00797811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4551;QD=10.7924;RBI=0.0308415;REFB=-0.0108709;REVB=0.0297917;RO=35;SAF=9;SAR=9;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160146;STB=0.509423;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0228778;OID=.;OPOS=159680046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:9:9:17:18:9:9:17:18
chr5	159686503	.	G	A	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0105546;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.66;QD=21.3533;RBI=0.017395;REFB=-0.0268611;REVB=0.013827;RO=9;SAF=10;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972524;STB=0.555466;STBP=0.571;TYPE=snp;VARB=0.0209156;OID=.;OPOS=159686503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:3:10:6:3:3:10:6:3
chr5	159696554	.	A	G	191.58	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.040608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1148;QD=15.639;RBI=0.0640906;REFB=-0.0106845;REVB=-0.0495842;RO=29;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177286;STB=0.510194;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0223396;OID=.;OPOS=159696554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:10:10:15:14:10:10:15:14
chr5	159718987	.	C	T	527.09	PASS	AF=0.470588;AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=119;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.0112366;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=177.983;QD=17.7174;RBI=0.0113951;REFB=-0.00016426;REVB=0.00189427;RO=59;SAF=22;SAR=34;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777775;STB=0.545326;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.000211788;OID=.;OPOS=159718987;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:119:59:63:56:56:0.470588:34:22:28:31:34:22:30:33
chr5	159775740	.	CG	AA,CA	376.91	PASS	AF=0,0.418367;AO=4,37;DP=98;FAO=0,41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=0,28;FSAR=0,13;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.0124985,-0.0262485;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=264.382,72.19;QD=15.3839;RBI=0.0172065,0.10187;REFB=0.00486609,-0.00301745;REVB=-0.0118258,-0.0984298;RO=48;SAF=4,24;SAR=0,13;SRF=32;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.477416,-0.0199681;STB=0.5,0.55565;STBP=1,0.369;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.000574446;OID=.,.;OPOS=159775740,159775741;OREF=CG,G;OALT=AA,A;OMAPALT=AA,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:98:98:48:57:4,37:0,41:0,0.418367:0,13:4,24:32:16:0,13:0,28:34:23
chr5	159776047	.	A	G	229.32	PASS	AF=0.464286;AO=24;DP=55;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0300159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.545;QD=16.3796;RBI=0.0302233;REFB=-0.0312824;REVB=-0.0035343;RO=28;SAF=9;SAR=15;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15568;STB=0.603612;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0339313;OID=.;OPOS=159776047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:28:30:24:26:0.464286:15:9:15:13:17:9:16:14
chr5	159776637	.	C	T	449.33	PASS	AF=0.581081;AO=43;DP=74;FAO=43;FDP=74;FR=.;FRO=31;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0553658;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=40.7454;QD=24.288;RBI=0.0987311;REFB=-0.0367827;REVB=-0.0817464;RO=30;SAF=27;SAR=16;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484309;STB=0.520948;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0249747;OID=.;OPOS=159776637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:30:31:43:43:0.581081:16:27:17:13:16:27:18:13
chr5	159901408	.	C	A	1190.06	PASS	AF=0.894737;AO=81;DP=91;FAO=85;FDP=95;FR=.;FRO=10;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0733147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.663;QD=50.1077;RBI=0.0736602;REFB=-0.0647439;REVB=0.00712545;RO=10;SAF=38;SAR=43;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271598;STB=0.511141;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0123263;OID=.;OPOS=159901408;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:91:95:10:10:81:85:0.894737:43:38:6:4:43:42:6:4
chr5	159912418	.	C	G	766.2	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00522426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8839;QD=63.8498;RBI=0.0239179;REFB=0;REVB=-0.0233404;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000246673;OID=.;OPOS=159912418;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:30:18:0:0:30:18:0:0
chr5	160097496	.	A	G	1175.34	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000172537;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0294;QD=61.0567;RBI=0.000972742;REFB=0;REVB=-0.000957318;RO=0;SAF=45;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.16165e-05;OID=.;OPOS=160097496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:32:45:0:0:32:45:0:0
chr5	160097632	.	G	A	754.42	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.488;QD=56.9374;RBI=0.038243;REFB=0;REVB=-0.0161462;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.74081e-05;OID=.;OPOS=160097632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:25:28:0:0:25:28:0:0
chr5	160716376	.	CTTTTTTTC	CTTTTTT,CTTTTTTC,CTTTTTTCC	325.79	PASS	AF=0,0.931818,0;AO=5,20,6;DP=47;FAO=0,41,0;FDP=44;FR=.;FRO=3;FSAF=0,25,0;FSAR=0,16,0;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0522054,0.0185666,0.0729386;FXX=0;HRUN=7,7,7;LEN=2,1,1;MLLD=9.71473,11.4972,5.53662;QD=29.6168;RBI=0.0627023,0.169752,0.155492;REFB=0.178594,-0.00284782,-0.179904;REVB=-0.0347301,-0.168733,-0.137324;RO=5;SAF=5,12,2;SAR=0,8,4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.706441,-0.0775293,-0.344857;STB=0.5,0.504082,0.5;STBP=1,0.931,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0,0.00673883,0;OID=.,.,.;OPOS=160716383,160716377,160716383;OREF=TC,T,T;OALT=-,-,C;OMAPALT=CTTTTTT,CTTTTTTC,CTTTTTTCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.931818,0:5,20,6:47:0,41,0:44:3:0,25,0:0,16,0:2:1:8:5:5,12,2:0,8,4:4:1
chr5	161119071	.	G	T	1641.93	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00228253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4378;QD=60.2543;RBI=0.00678017;REFB=0;REVB=-0.00638442;RO=0;SAF=61;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.08155e-05;OID=.;OPOS=161119071;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:48:61:0:0:48:61:0:0
chr5	161128761	.	C	G	851.24	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0471241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9355;QD=57.7114;RBI=0.0626778;REFB=0;REVB=-0.0413258;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000826496;OID=.;OPOS=161128761;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0
chr5	161281245	.	T	C	287.33	PASS	AF=0.349515;AO=36;DP=102;FAO=36;FDP=103;FR=.;FRO=67;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=38;FWDB=0.0218501;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.43;QD=11.1584;RBI=0.021997;REFB=-0.00916096;REVB=-0.00253819;RO=65;SAF=17;SAR=19;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293316;STB=0.525759;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0169831;OID=.;OPOS=161281245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:65:67:36:36:0.349515:19:17:29:36:19:17:29:38
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chr5	161528280	.	C	T	343.27	PASS	AF=0.45679;AO=31;DP=75;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.000169888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.289;QD=16.9514;RBI=0.00197081;REFB=-0.0211047;REVB=-0.00196347;RO=42;SAF=14;SAR=17;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981495;STB=0.510766;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0299106;OID=.;OPOS=161528280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:81:42:44:31:37:0.45679:17:14:15:27:22:15:17:27
chr5	161904930	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00708646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.026;QD=37.4885;RBI=0.0291952;REFB=0;REVB=-0.0283221;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000423023;OID=.;OPOS=161904930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr5	162210532	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.671;QD=59.4349;RBI=0.0358697;REFB=0;REVB=0.0338001;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.33413e-05;OID=.;OPOS=162210532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr5	162890953	.	G	A	1134.79	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.443;QD=60.5222;RBI=0.0247359;REFB=0;REVB=-0.00348877;RO=0;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.33844e-05;OID=.;OPOS=162890953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:40:35:0:0:40:35:0:0
chr5	162902516	.	T	C	134.21	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0100926;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.108;QD=15.3384;RBI=0.0206292;REFB=-0.0090661;REVB=-0.0179918;RO=20;SAF=6;SAR=9;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100239;STB=0.558061;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0142936;OID=.;OPOS=162902516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:20:20:15:15:0.428571:9:6:10:10:9:6:10:10
chr5	167489093	.	A	T	160.53	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0030767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.601;QD=18.3462;RBI=0.0077583;REFB=-0.00333481;REVB=0.00712216;RO=18;SAF=13;SAR=4;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364222;STB=0.70883;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00311759;OID=.;OPOS=167489093;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:4:13:7:11:4:13:7:11
chr5	167645888	.	T	C	1549.15	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00339628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8201;QD=63.8825;RBI=0.0310736;REFB=0;REVB=-0.0308874;RO=0;SAF=55;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104256;OID=.;OPOS=167645888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:42:55:0:0:42:55:0:0
chr5	167674370	.	C	T	321.65	PASS	AF=0.55;AO=30;DP=58;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.0128717;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.588;QD=21.4435;RBI=0.0925657;REFB=-0.0169719;REVB=0.0916664;RO=28;SAF=16;SAR=14;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12796;STB=0.581441;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0174276;OID=.;OPOS=167674370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:28:27:30:33:0.55:14:16:19:9:17:16:18:9
chr5	167850748	.	A	G	2618.44	PASS	AF=1;AO=164;DP=164;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.937;QD=61.975;RBI=0.0433162;REFB=0;REVB=0.0359025;RO=0;SAF=98;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.52816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21162e-05;OID=.;OPOS=167850748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:164:169:0:0:164:169:1:66:98:0:0:69:100:0:0
chr5	167868779	.	A	G	601.02	PASS	AF=0.540541;AO=60;DP=111;FAO=60;FDP=111;FR=.;FRO=51;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.0581308;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.79;QD=21.6583;RBI=0.058807;REFB=-0.0273516;REVB=-0.00889196;RO=47;SAF=38;SAR=22;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0042953;STB=0.516629;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0176417;OID=.;OPOS=167868779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:47:51:60:60:0.540541:22:38:30:17:22:38:34:17
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chr5	167895953	.	T	C	1914.78	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00435643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6742;QD=61.767;RBI=0.00717769;REFB=0;REVB=-0.00570445;RO=0;SAF=70;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.07983e-06;OID=.;OPOS=167895953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:54:70:0:0:54:70:0:0
chr5	167913510	.	G	A	514.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.65;QD=58.8185;RBI=0.0508391;REFB=0;REVB=0.0425879;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.49283e-05;OID=.;OPOS=167913510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:19:15:0:0:20:15:0:0
chr5	167943827	.	G	A	1302.17	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.586;QD=62.0082;RBI=0.0209799;REFB=0;REVB=0.0174816;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.01496e-05;OID=.;OPOS=167943827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:44:40:0:0:44:40:0:0
chr5	167957055	.	G	A	1116.97	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.24;QD=60.3765;RBI=0.0345937;REFB=0;REVB=0.00952198;RO=0;SAF=13;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27405e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.79338e-05;OID=.;OPOS=167957055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:61:13:0:0:61:13:0:0
chr5	167995996	.	T	C	227.39	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0152811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6384;QD=15.6819;RBI=0.0339306;REFB=0.00938774;REVB=0.0302948;RO=31;SAF=14;SAR=12;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215724;STB=0.52126;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=-0.0112335;OID=.;OPOS=167995996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:31:32:26:26:0.448276:12:14:16:15:12:14:16:16
chr5	168093522	.	G	A	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.652;QD=62.3508;RBI=0.0525105;REFB=0;REVB=0.0496314;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202958;OID=.;OPOS=168093522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:16:27:0:0:16:27:0:0
chr5	168098463	.	A	G	769.48	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.768;QD=56.9988;RBI=0.0198093;REFB=0;REVB=0.012157;RO=0;SAF=22;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.65766e-05;OID=.;OPOS=168098463;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:32:22:0:0:32:22:0:0
chr5	168114007	.	T	C	33.49	PASS	AF=0.109375;AO=7;DP=64;FAO=7;FDP=64;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=-0.0137463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.719;QD=2.09329;RBI=0.0259545;REFB=-0.00546727;REVB=0.0220153;RO=57;SAF=6;SAR=1;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.534383;STB=0.890586;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0313379;OID=.;OPOS=168114007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:64:64:57:57:7:7:0.109375:1:6:21:36:1:6:21:36
chr5	168176517	.	A	G	407.57	PASS	AF=0.619048;AO=39;DP=63;FAO=39;FDP=63;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0515895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9617;QD=25.8775;RBI=0.0874553;REFB=0.00135009;REVB=-0.0706184;RO=24;SAF=24;SAR=15;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169142;STB=0.592545;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.00284278;OID=.;OPOS=168176517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:24:24:39:39:0.619048:15:24:9:15:15:24:9:15
chr5	168180081	.	C	T	239.37	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.00779366;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.342;QD=20.8148;RBI=0.0101821;REFB=-0.0094452;REVB=0.00655234;RO=23;SAF=10;SAR=13;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191387;STB=0.607385;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0104363;OID=.;OPOS=168180081;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:13:10:15:8:13:10:15:8
chr5	168212951	.	A	G	336.16	PASS	AF=0.964286;AO=20;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=1;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.185991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.929;QD=48.0231;RBI=0.187688;REFB=-0.117739;REVB=0.0251767;RO=2;SAF=11;SAR=9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0766752;STB=0.514275;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.00497534;OID=.;OPOS=168212951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:28:28:2:1:20:27:0.964286:9:11:2:0:10:17:1:0
chr5	168690612	.	A	G	3150.19	PASS	AF=1;AO=197;DP=197;FAO=197;FDP=197;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.833;QD=63.9632;RBI=0.019021;REFB=0;REVB=0.00146132;RO=0;SAF=102;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36749e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.52478e-06;OID=.;OPOS=168690612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:197:197:0:0:197:197:1:95:102:0:0:95:102:0:0
chr5	169018217	.	CTA	ACT,CT	223.81	PASS	AF=0,0.966667;AO=2,19;DP=30;FAO=0,29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=0,8;FSAR=0,21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00126194,0.100244;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=3,1;MLLD=7.13419,11.7182;QD=29.8418;RBI=0.100476,0.297309;REFB=-0.015808,-0.0503236;REVB=0.100468,0.2799;RO=7;SAF=0,5;SAR=2,14;SRF=2;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0.357143;SSSB=-0.539624,-0.0140849;STB=0.5,0.529391;STBP=1,0.17;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.0513566;OID=.,.;OPOS=169018217,169018219;OREF=CTA,A;OALT=ACT,-;OMAPALT=ACT,CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:7:30:30:7:1:2,19:0,29:0,0.966667:2,14:0,5:2:5:0,21:0,8:1:0
chr5	169021610	.	C	T	604.6	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0098452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.563;QD=60.4598;RBI=0.095339;REFB=0;REVB=0.0948293;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000859028;OID=.;OPOS=169021610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:37:40:1:18:19:0:0:21:19:0:0
chr5	169028481	.	T	C	747.03	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.697;QD=63.5772;RBI=0.0715054;REFB=0;REVB=0.0678221;RO=0;SAF=33;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263476;OID=.;OPOS=169028481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:14:33:0:0:14:33:0:0
chr5	169031150	.	T	C	1283.25	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.128;QD=61.8435;RBI=0.0392975;REFB=0;REVB=0.0363574;RO=0;SAF=33;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15707e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123168;OID=.;OPOS=169031150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:50:33:0:0:50:33:0:0
chr5	169129422	.	A	G	1227.51	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00859477;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.931;QD=61.3756;RBI=0.0302681;REFB=0;REVB=0.0290222;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.59323e-05;OID=.;OPOS=169129422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:49:31:0:0:49:31:0:0
chr5	169310757	.	G	A	355.25	PASS	AF=0.431818;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=0.00286358;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.422;QD=16.1478;RBI=0.0173413;REFB=-0.013532;REVB=0.0171033;RO=50;SAF=27;SAR=11;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266862;STB=0.650932;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0146634;OID=.;OPOS=169310757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:50:50:38:38:0.431818:11:27:23:27:11:27:23:27
chr5	169435713	.	A	C	1737.34	PASS	AF=0.983051;AO=116;DP=118;FAO=116;FDP=118;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00623288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.472;QD=58.8928;RBI=0.00876962;REFB=-0.0894005;REVB=0.00616908;RO=2;SAF=60;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000555537;STB=0.500293;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.000877515;OID=.;OPOS=169435713;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:118:118:2:2:116:116:0.983051:56:60:1:1:56:60:1:1
chr5	169454941	.	C	G	276.19	PASS	AF=0.542373;AO=23;DP=59;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0835009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0155;QD=18.7249;RBI=0.0986551;REFB=-0.042886;REVB=0.0525398;RO=27;SAF=13;SAR=10;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184096;STB=0.517116;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0306225;OID=.;OPOS=169454941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:27:27:23:32:0.542373:10:13:10:17:19:13:10:17
chr5	169461547	.	C	T	285.09	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0101129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3224;QD=23.7575;RBI=0.0312968;REFB=-0.0229439;REVB=-0.0296179;RO=22;SAF=12;SAR=14;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317299;STB=0.517671;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0141063;OID=.;OPOS=169461547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:14:12:11:11:14:12:11:11
chr5	169504743	.	T	C	719.94	PASS	AF=0.542636;AO=68;DP=127;FAO=70;FDP=129;FR=.;FRO=59;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.0139775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.008;QD=22.3237;RBI=0.014039;REFB=-0.0152789;REVB=0.00131291;RO=57;SAF=34;SAR=34;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0803803;STB=0.536196;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0151448;OID=.;OPOS=169504743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:129:57:59:68:70:0.542636:34:34:34:23:34:36:35:24
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chr5	169661994	.	G	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.163;QD=49.599;RBI=0.0374575;REFB=0;REVB=-0.00530742;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144283;OID=.;OPOS=169661994;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr5	169685163	.	C	T	220.24	PASS	AF=0.433333;AO=25;DP=59;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.000344495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.689;QD=14.6829;RBI=0.000365139;REFB=-0.0173273;REVB=-0.000121036;RO=34;SAF=17;SAR=8;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103264;STB=0.549963;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0257121;OID=.;OPOS=169685163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:34:34:25:26:0.433333:8:17:26:8:8:18:26:8
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chr5	169805956	.	C	G	138.93	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00408244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.699;QD=19.8473;RBI=0.00827966;REFB=-0.0221575;REVB=0.00720323;RO=12;SAF=4;SAR=11;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643304;STB=0.523777;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0159773;OID=.;OPOS=169805956;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:28:12:13:15:15:0.535714:11:4:4:8:11:4:4:9
chr5	169910062	.	A	G	90.76	PASS	AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0312437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.115;QD=8.06752;RBI=0.0314766;REFB=-0.00451097;REVB=0.00382201;RO=33;SAF=7;SAR=5;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0816666;STB=0.550477;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0145701;OID=.;OPOS=169910062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:45:45:33:33:12:12:0.266667:5:7:17:16:5:7:17:16
chr5	169910084	.	G	T	676.45	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00767469;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.2179;QD=61.4954;RBI=0.00814761;REFB=0;REVB=-0.00273544;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00282769;OID=.;OPOS=169910084;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:20:23:0:0:21:23:0:0
chr5	170240990	.	TAAAAAC	ATAAAAC,TAAAAACA,TAAAACA,TAAAAC,TATAAAC	498.21	PASS	AF=0,0.322148,0.0134228,0.436242,0.0536913;AO=16,35,14,33,14;DP=152;FAO=0,48,2,65,8;FDP=149;FR=.;FRO=26;FSAF=0,47,2,6,0;FSAR=0,1,0,59,8;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0543782,-0.00211232,-0.0408699,-0.0816193,-0.0653169;FXX=0.0324654;HRUN=1,2,5,5,5;LEN=2,1,2,1,1;MLLD=19.454,12.0433,9.50375,10.086,166.091;QD=13.3748;RBI=0.275901,0.0547846,0.0745303,0.181732,0.0831234;REFB=0.0251942,-0.131153,-0.0918649,-0.0381314,0.012585;REVB=-0.270489,0.0547439,-0.0623251,-0.162373,-0.051412;RO=25;SAF=0,35,13,3,0;SAR=16,0,1,30,14;SRF=19;SRR=6;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.848838,0.84637,0.38705,-0.640456,-0.841948;STB=0.5,0.866565,0.992937,0.778769,0.998824;STBP=1,0.001,0.352,0,0.001;TYPE=mnp,ins,mnp,del,snp;VARB=0,0.127993,-0.0127492,0.0237473,0.0566962;OID=.,.,.,.,.;OPOS=170240990,170240997,170240995,170240991,170240992;OREF=TA,-,AC,A,A;OALT=AT,A,CA,-,T;OMAPALT=ATAAAAC,TAAAAACA,TAAAACA,TAAAAC,TATAAAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/4:99:152:149:25:26:16,35,14,33,14:0,48,2,65,8:0,0.322148,0.0134228,0.436242,0.0536913:16,0,1,30,14:0,35,13,3,0:19:6:0,1,0,59,8:0,47,2,6,0:18:8
chr5	170294132	.	G	A	801.9	PASS	AF=0.982759;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0138715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.25;QD=55.3033;RBI=0.0227124;REFB=0.0464234;REVB=0.0179843;RO=1;SAF=16;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285524;STB=0.515146;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.0010259;OID=.;OPOS=170294132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:56:57:0.982759:40:16:1:0:41:16:1:0
chr5	170336766	.	AG	GA,TA	52.77	PASS	AF=0.126214,0;AO=10,4;DP=105;FAO=13,0;FDP=103;FR=.;FRO=90;FSAF=12,0;FSAR=1,0;FSRF=38;FSRR=52;FWDB=0.0251922,-0.0875744;FXX=0.0190458;HRUN=4,4;LEN=2,2;MLLD=32.9439,88.8348;QD=2.04942;RBI=0.0331683,0.089102;REFB=-0.0452742,-0.00809766;REVB=-0.0215752,-0.0164284;RO=84;SAF=9,4;SAR=1,0;SRF=33;SRR=51;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.570876,0.497231;STB=0.926473,0.5;STBP=0.001,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.148289,0;OID=.,.;OPOS=170336766,170336766;OREF=AG,AG;OALT=GA,TA;OMAPALT=GA,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:105:103:84:90:10,4:13,0:0.126214,0:1,0:9,4:33:51:1,0:12,0:38:52
chr5	170338106	.	G	A	383.24	PASS	AF=0.567164;AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0633954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4999;QD=22.8801;RBI=0.0634307;REFB=0.00917379;REVB=0.00211353;RO=29;SAF=19;SAR=19;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406644;STB=0.522376;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.00502987;OID=.;OPOS=170338106;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:29:29:38:38:0.567164:19:19:16:13:19:19:16:13
chr5	170395512	.	A	T	1472.36	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0693678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.256;QD=63.3275;RBI=0.0895509;REFB=0;REVB=0.0566345;RO=0;SAF=42;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000324635;OID=.;OPOS=170395512;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:93:0:0:92:93:1:50:42:0:0:51:42:0:0
chr5	171201499	.	G	C	897.7	PASS	AF=0.955882;AO=63;DP=68;FAO=65;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0816877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1974;QD=52.8058;RBI=0.0820419;REFB=-0.0730626;REVB=0.00761563;RO=3;SAF=12;SAR=51;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269723;STB=0.513757;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0135286;OID=.;OPOS=171201499;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:68:68:3:3:63:65:0.955882:51:12:0:3:53:12:0:3
chr5	171472417	.	A	G	75.02	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0302625;FXX=0.0322477;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.3164;QD=10.0027;RBI=0.0573212;REFB=-0.00882752;REVB=-0.0486817;RO=18;SAF=5;SAR=5;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059334;STB=0.533267;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.00946013;OID=.;OPOS=171472417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:29:30:18:20:10:10:0.333333:5:5:10:8:5:5:11:9
chr5	171481606	.	A	G	670.24	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.288;QD=62.3479;RBI=0.0474089;REFB=0;REVB=0.0425647;RO=0;SAF=32;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61286e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296821;OID=.;OPOS=171481606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:11:32:0:0:11:32:0:0
chr5	171533782	.	T	C	1334.22	PASS	AF=1;AO=83;DP=85;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0725298;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4116;QD=59.2985;RBI=0.0870764;REFB=-0.051745;REVB=0.0481843;RO=2;SAF=33;SAR=50;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00475702;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00570964;OID=.;OPOS=171533782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:85:90:2:0:83:90:1:50:33:1:1:51:39:0:0
chr5	171760569	.	A	G	212.05	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.013962;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.499;QD=12.2928;RBI=0.0140102;REFB=-0.00424287;REVB=-0.00116126;RO=40;SAF=8;SAR=18;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080274;STB=0.545419;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0230235;OID=.;OPOS=171760569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:69:40:43:26:26:0.376812:18:8:15:25:18:8:16:27
chr5	171849471	.	G	A	64.87	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00368664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.031;QD=10.3792;RBI=0.0755083;REFB=-0.00602622;REVB=-0.0754183;RO=15;SAF=8;SAR=1;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480808;STB=0.789344;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00887806;OID=.;OPOS=171849471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:15:16:9:9:0.36:1:8:8:7:1:8:9:7
chr5	172196711	.	G	T	223.18	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.541;QD=49.596;RBI=0.0851718;REFB=0;REVB=0.0771981;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000710225;OID=.;OPOS=172196711;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0
chr5	172261462	.	G	A	54.42	PASS	AF=1;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403263;FXX=0.142653;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.326;QD=36.2797;RBI=0.0817964;REFB=0;REVB=0.0711648;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.002492;OID=.;OPOS=172261462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:7:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr5	172294193	.	C	T	374.38	PASS	AF=0.587302;AO=36;DP=62;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=-0.0189151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.131;QD=23.7702;RBI=0.0202135;REFB=-0.00180471;REVB=-0.0071276;RO=26;SAF=23;SAR=13;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0778901;STB=0.537997;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.00322036;OID=.;OPOS=172294193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:26:26:36:37:0.587302:13:23:19:7:13:24:19:7
chr5	172294194	.	G	T	219.2	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0174521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.58;QD=13.9175;RBI=0.0198884;REFB=-0.00383746;REVB=-0.00953798;RO=37;SAF=19;SAR=7;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101138;STB=0.557956;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0173688;OID=.;OPOS=172294194;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:7:19:24:13:7:19:24:13
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chr5	172342029	.	G	GT	73.74	PASS	AF=0.403509;AO=18;DP=60;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0916137;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.4715;QD=5.17463;RBI=0.118688;REFB=0.0277465;REVB=0.075457;RO=40;SAF=12;SAR=6;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0836404;STB=0.514007;STBP=0.867;TYPE=ins;VARB=-0.03741;OID=.;OPOS=172342030;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.403509:18:60:23:57:34:13:10:20:14:73:40:12:6:24:16
chr5	172342668	.	C	T	171.24	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0260332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8255;QD=12.4538;RBI=0.0286412;REFB=0.00654738;REVB=0.0119412;RO=32;SAF=9;SAR=12;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0753835;STB=0.56244;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=-0.0105852;OID=.;OPOS=172342668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:32:34:21:21:0.381818:12:9:16:16:12:9:18:16
chr5	172381973	.	A	AGGT	1265.54	PASS	AF=0.987952;AO=81;DP=87;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0275192;FXX=0.0459717;HRUN=1;LEN=3;MLLD=227.01;QD=60.99;RBI=0.0304233;REFB=-0.165151;REVB=0.0129721;RO=1;SAF=38;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122979;STB=0.506328;STBP=0.332;TYPE=ins;VARB=0.000988189;OID=.;OPOS=172381974;OREF=-;OALT=GGT;OMAPALT=AGGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.987952:81:87:82:83:1:39:43:1:0:3:1:38:43:1:0
chr5	172447762	.	G	A	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00179104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.625;QD=62.3494;RBI=0.00457671;REFB=0;REVB=-0.0042117;RO=0;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.81555e-05;OID=.;OPOS=172447762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:13:30:0:0:13:30:0:0
chr5	172631051	.	T	G	171.94	PASS	AF=0.653846;AO=16;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0716508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7139;QD=26.4517;RBI=0.100457;REFB=0.000415506;REVB=0.0704119;RO=9;SAF=4;SAR=12;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226843;STB=0.599877;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00492404;OID=.;OPOS=172631051;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:16:17:0.653846:12:4:5:4:12:5:5:4
chr5	172660518	.	A	T	33.55	PASS	AF=0.139535;AO=7;DP=44;FAO=6;FDP=43;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0247882;FXX=0.0227221;HRUN=14;LEN=1;MLLD=188.246;QD=3.12083;RBI=0.0267832;REFB=-0.0065161;REVB=-0.0101432;RO=31;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477937;STB=0.770651;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0273401;OID=.;OPOS=172660518;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:44:43:31:37:7:6:0.139535:2:5:9:22:2:4:12:25
chr5	172660523	.	T	A	189.18	PASS	AF=0.555556;AO=19;DP=34;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0555788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.208;QD=21.0194;RBI=0.0555811;REFB=-0.00927144;REVB=0.000502722;RO=14;SAF=7;SAR=12;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0688599;STB=0.5185;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.016887;OID=.;OPOS=172660523;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:36:14:16:19:20:0.555556:12:7:4:10:13:7:5:11
chr5	172662024	.	T	C	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00276932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.9586;QD=7.76167;RBI=0.0369313;REFB=-0.0181678;REVB=-0.0368273;RO=13;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30002;STB=0.689036;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.022581;OID=.;OPOS=172662024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:2:4:5:8:2:4:5:8
chr5	172750436	.	G	A	293.6	PASS	AF=0.525424;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00400087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3401;QD=19.9048;RBI=0.00783471;REFB=-0.0196524;REVB=0.00673615;RO=28;SAF=16;SAR=15;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137695;STB=0.507654;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0118528;OID=.;OPOS=172750436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:28:28:31:31:0.525424:15:16:14:14:15:16:14:14
chr5	173376506	.	A	G	355.42	PASS	AF=0.59322;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0216714;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0732;QD=24.0961;RBI=0.0271535;REFB=0.0029368;REVB=-0.0163604;RO=22;SAF=15;SAR=20;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1486;STB=0.575716;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.0035805;OID=.;OPOS=173376506;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:22:24:35:35:0.59322:20:15:5:17:20:15:6:18
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chr5	174156168	.	T	C	740.34	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.608;QD=63.0075;RBI=0.0472315;REFB=0;REVB=0.000209226;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210133;OID=.;OPOS=174156168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:23:23:0:0:23:24:0:0
chr5	174541854	.	A	G	521.61	PASS	AF=0.550562;AO=49;DP=89;FAO=49;FDP=89;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0090436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.381;QD=23.4431;RBI=0.00907716;REFB=-0.0290919;REVB=0.000779778;RO=40;SAF=23;SAR=26;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159347;STB=0.508752;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0225554;OID=.;OPOS=174541854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:40:40:49:49:0.550562:26:23:18:22:26:23:18:22
chr5	174868840	.	T	C	1076.2	PASS	AF=0.986486;AO=71;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0275522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.227;QD=58.1728;RBI=0.0330132;REFB=0.0188099;REVB=0.0181865;RO=1;SAF=36;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129547;STB=0.506847;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00111342;OID=.;OPOS=174868840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:71:73:0.986486:35:36:1:0:37:36:1:0
chr5	174870150	.	C	T	580.7	PASS	AF=1;AO=38;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00534428;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.685;QD=56.6535;RBI=0.0324613;REFB=0;REVB=0.0320184;RO=3;SAF=28;SAR=10;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121538;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00444513;OID=.;OPOS=174870150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:41:41:3:0:38:41:1:10:28:0:3:13:28:0:0
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chr5	175307256	.	T	C	32.39	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0574656;FXX=0.0832639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.7168;QD=11.779;RBI=0.085658;REFB=0.00269607;REVB=-0.0635216;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112423;STB=0.599562;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=-0.0144776;OID=.;OPOS=175307256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:12:11:7:6:5:5:0.454545:1:4:5:2:1:4:4:2
chr5	175307373	.	G	A	1431.46	PASS	AF=0.96875;AO=93;DP=96;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0278155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6838;QD=59.6443;RBI=0.0351943;REFB=-0.0604654;REVB=-0.0215624;RO=2;SAF=52;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225624;STB=0.507143;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0111699;OID=.;OPOS=175307373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:96:96:2:3:93:93:0.96875:41:52:0:2:41:52:1:2
chr5	175308022	.	A	G	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0123022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.984;QD=16.8229;RBI=0.054136;REFB=-0.0206083;REVB=-0.0527196;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237226;STB=0.640603;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0147109;OID=.;OPOS=175308022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:2:5:2:3:2:5:2:3
chr5	175811094	.	C	CGT	868.88	PASS	AF=0.890411;AO=61;DP=76;FAO=65;FDP=73;FR=.;FRO=8;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0514673;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=182.794;QD=47.6096;RBI=0.074421;REFB=-0.10697;REVB=0.053755;RO=12;SAF=32;SAR=29;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0958794;STB=0.523397;STBP=0.278;TYPE=ins;VARB=0.0115417;OID=.;OPOS=175811095;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=CGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.890411:61:76:65:73:8:35:30:6:2:34:12:32:29:10:2
chr5	175956271	.	A	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.181;QD=51.9167;RBI=0.0204639;REFB=0;REVB=0.0142642;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.13429e-06;OID=.;OPOS=175956271;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0
chr5	175998246	.	T	C	1044.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000988516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.226;QD=59.679;RBI=0.0379171;REFB=0;REVB=0.0379042;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.52772e-05;OID=.;OPOS=175998246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:39:31:0:0:39:31:0:0
chr5	176002144	.	A	C,G	757.93	PASS	AF=0.962963,0.037037;AO=52,2;DP=54;FAO=52,2;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=47,2;FSAR=5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128458,0.0065818;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=124.622,109.41;QD=56.1433;RBI=0.0223312,0.00856029;REFB=0,0;REVB=0.0182666,-0.00547343;RO=0;SAF=47,2;SAR=5,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000467924,0.0159641;OID=.,.;OPOS=176002144,176002144;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:54:54:0:0:52,2:52,2:0.962963,0.037037:5,0:47,2:0:0:5,0:47,2:0:0
chr5	176004476	.	T	C	227.25	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198342;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2831;QD=50.4996;RBI=0.0220748;REFB=0;REVB=0.00969027;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000282552;OID=.;OPOS=176004476;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr5	176017639	.	C	A,T	1206.73	PASS	AF=0.95122,0.0365854;AO=78,3;DP=82;FAO=78,3;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=20,1;FSAR=58,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0239786,-0.00727792;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=212.174,55.3595;QD=58.8647;RBI=0.0401886,0.0126746;REFB=-0.0261169,-0.094897;REVB=0.0322514,0.0103767;RO=1;SAF=20,1;SAR=58,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00809254,0.163246;STB=0.504272,0.59939;STBP=0.615,0.681;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000290503,0.168852;OID=.,.;OPOS=176017639,176017639;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:82:82:1:1:78,3:78,3:0.95122,0.0365854:58,2:20,1:0:1:58,2:20,1:0:1
chr5	176024880	.	C	T	912.97	PASS	AF=0.916667;AO=66;DP=72;FAO=66;FDP=72;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=55;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00344677;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.169;QD=50.7206;RBI=0.0188252;REFB=-0.132507;REVB=0.018507;RO=3;SAF=11;SAR=55;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112784;STB=0.588206;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000864182;OID=.;OPOS=176024880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:72:72:3:6:66:66:0.916667:55:11:3:0:55:11:5:1
chr5	176025938	.	T	C,G	556.67	PASS	AF=0.77551,0.0612245;AO=39,3;DP=48;FAO=38,3;FDP=49;FR=.;FRO=8;FSAF=29,2;FSAR=9,1;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00354159,0.000615573;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=123.335,173.273;QD=45.4421;RBI=0.0141314,0.0189139;REFB=-0.19339,-0.0744009;REVB=-0.0136804,0.0189038;RO=3;SAF=30,2;SAR=9,1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0781173,0.255936;STB=0.584967,0.704562;STBP=0.038,0.526;TYPE=snp,snp;VARB=0.00320908,0.0440062;OID=.,.;OPOS=176025938,176025938;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:48:49:3:8:39,3:38,3:0.77551,0.0612245:9,1:30,2:1:2:9,1:29,2:3:5
chr5	176047761	.	G	A	42.24	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0114568;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=106.303;QD=18.7721;RBI=0.0118601;REFB=-0.087278;REVB=-0.00306666;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772509;STB=0.614989;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.00928208;OID=.;OPOS=176047761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:2:3:6:6:0.666667:4:2:1:1:4:2:2:1
chr5	176053622	.	G	A	328.88	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604443;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0847;QD=54.8141;RBI=0.0893315;REFB=0;REVB=0.065777;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00403587;OID=.;OPOS=176053622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:18:6:0:0:18:6:0:0
chr5	176069831	.	G	A	1859.35	PASS	AF=0.991935;AO=120;DP=122;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0263424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.3983;QD=59.9792;RBI=0.0271186;REFB=-0.109073;REVB=-0.0064418;RO=1;SAF=55;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00725225;STB=0.503816;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00116934;OID=.;OPOS=176069831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:122:124:1:1:120:123:0.991935:65:55:0:1:65:58:0:1
chr5	176307625	.	A	C	39.53	PASS	AF=0.147059;AO=5;DP=34;FAO=5;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0412694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.094;QD=4.65089;RBI=0.0719476;REFB=-0.00351054;REVB=-0.0589346;RO=24;SAF=1;SAR=4;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.440804;STB=0.778067;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0527822;OID=.;OPOS=176307625;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:34:34:24:27:5:5:0.147059:4:1:14:10:4:1:14:13
chr5	176334195	.	C	T	169.9	PASS	AF=0.428571;AO=11;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=-0.0362392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5001;QD=16.1807;RBI=0.0515458;REFB=-0.024765;REVB=0.0366564;RO=18;SAF=9;SAR=2;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.553387;STB=0.692117;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0187622;OID=.;OPOS=176334195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:18:24:11:18:0.428571:2:9:5:13:8:10:5:19
chr5	176402401	.	G	A	196.65	PASS	AF=0.341772;AO=24;DP=76;FAO=27;FDP=79;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=15;FWDB=0.00657984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.67;QD=9.95706;RBI=0.0250219;REFB=-0.0117999;REVB=-0.0241413;RO=51;SAF=15;SAR=9;SRF=37;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12982;STB=0.559543;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.0275895;OID=.;OPOS=176402401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:79:51:52:24:27:0.341772:9:15:37:14:10:17:37:15
chr5	176492557	.	G	A	96.76	PASS	AF=0.48;AO=11;DP=24;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0229162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.055;QD=15.4816;RBI=0.0229337;REFB=-0.0100289;REVB=-0.000897046;RO=13;SAF=1;SAR=10;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370286;STB=0.612036;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.00923442;OID=.;OPOS=176492557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:24:25:13:13:11:12:0.48:10:1:4:9:10:2:4:9
chr5	176516631	.	G	A	643.51	PASS	AF=0.941176;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0249568;FXX=0.0192271;HRUN=5;LEN=1;MLLD=242.198;QD=50.4711;RBI=0.0639307;REFB=-0.141642;REVB=0.0588582;RO=3;SAF=37;SAR=11;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656681;STB=0.535024;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00119955;OID=.;OPOS=176516631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:51:51:3:3:48:48:0.941176:11:37:1:2:11:37:1:2
chr5	176517170	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.606;QD=52.613;RBI=0.121181;REFB=0;REVB=0.0296404;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010777;OID=.;OPOS=176517170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:16:6:0:0:16:6:0:0
chr5	176517292	.	A	G	757.93	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.5979;QD=61.872;RBI=0.0490694;REFB=0;REVB=-0.0309074;RO=0;SAF=12;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.37074e-05;OID=.;OPOS=176517292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:49:0:0:45:49:1:33:12:0:0:36:13:0:0
chr5	176517326	.	T	C	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.254;QD=63.583;RBI=0.0439435;REFB=0;REVB=0.0420103;RO=0;SAF=12;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04037e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113092;OID=.;OPOS=176517326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:35:12:0:0:35:12:0:0
chr5	176517461	.	T	G	272.8	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.034;QD=51.9627;RBI=0.0511772;REFB=0;REVB=0.048572;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196206;OID=.;OPOS=176517461;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:9:11:0:0:10:11:0:0
chr5	176517797	.	C	T	743.1	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.010324;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.101;QD=59.4477;RBI=0.0288521;REFB=0.0259316;REVB=0.0269418;RO=2;SAF=24;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375989;STB=0.519992;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=-8.56463e-05;OID=.;OPOS=176517797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:24:24:2:0:24:24:2:0
chr5	176518784	.	C	T	1018.13	PASS	AF=0.972222;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0169486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.816;QD=56.5627;RBI=0.0197732;REFB=-0.00560491;REVB=0.0101845;RO=2;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024233;STB=0.512817;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.000125327;OID=.;OPOS=176518784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:72:72:2:2:70:70:0.972222:38:32:0:2:38:32:0:2
chr5	176721198	.	T	C	545.98	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00359569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.925;QD=57.4711;RBI=0.0375344;REFB=-0.15986;REVB=-0.0373618;RO=1;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346573;STB=0.518508;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0012221;OID=.;OPOS=176721198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:38:38:1:1:37:37:0.973684:13:24:0:1:13:24:0:1
chr5	176728400	.	G	A	1162.74	PASS	AF=0.975;AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00401947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7856;QD=58.137;RBI=0.00828667;REFB=-0.0295241;REVB=0.00724657;RO=2;SAF=34;SAR=44;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00308162;STB=0.501628;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00863936;OID=.;OPOS=176728400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:80:80:2:2:78:78:0.975:44:34:1:1:44:34:1:1
chr5	176728458	.	G	T	1345.81	PASS	AF=0.988636;AO=85;DP=86;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0534158;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.976;QD=61.1732;RBI=0.0556733;REFB=-0.107647;REVB=0.0156931;RO=1;SAF=39;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011992;STB=0.506171;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00079971;OID=.;OPOS=176728458;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:86:88:1:1:85:87:0.988636:46:39:1:0:47:40:1:0
chr5	176733116	.	A	G	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.344;QD=58.4196;RBI=0.0158724;REFB=0;REVB=0.00294799;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.99851e-05;OID=.;OPOS=176733116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0
chr5	176733616	.	T	C	728.79	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.631;QD=63.3727;RBI=0.0855876;REFB=0;REVB=0.0611914;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244533;OID=.;OPOS=176733616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:46:0:0:41:46:1:22:19:0:0:27:19:0:0
chr5	176737720	.	A	G	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.727;QD=59.0187;RBI=0.0699516;REFB=0;REVB=0.0658864;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237246;OID=.;OPOS=176737720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr5	176815124	.	T	C	578.76	PASS	AF=0.448529;AO=61;DP=136;FAO=61;FDP=136;FR=.;FRO=75;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=-0.00481277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.514;QD=17.0224;RBI=0.0177706;REFB=-0.0152196;REVB=-0.0171065;RO=74;SAF=33;SAR=28;SRF=32;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106554;STB=0.562795;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0197175;OID=.;OPOS=176815124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:74:75:61:61:0.448529:28:33:32:42:28:33:32:43
chr5	176831826	.	C	G	2395.95	PASS	AF=0.993711;AO=155;DP=158;FAO=158;FDP=159;FR=.;FRO=1;FSAF=94;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00626505;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.11;QD=60.2756;RBI=0.0253286;REFB=-0.070496;REVB=0.0245415;RO=0;SAF=94;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67899e-08;STB=0.502645;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000396892;OID=.;OPOS=176831826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:158:159:0:1:155:158:0.993711:61:94:0:0:64:94:1:0
chr5	176836532	.	A	G	223.12	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0162565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.941;QD=16.5275;RBI=0.0287211;REFB=-0.0060217;REVB=-0.0236776;RO=29;SAF=10;SAR=15;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23952;STB=0.634931;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00553534;OID=.;OPOS=176836532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:15:10:19:10:15:10:19:10
chr5	176863519	.	G	C	2165.31	PASS	AF=1;AO=134;DP=135;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425352;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.899;QD=62.7625;RBI=0.044433;REFB=0;REVB=0.012847;RO=0;SAF=73;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.72667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67825e-05;OID=.;OPOS=176863519;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:135:138:0:0:134:138:1:61:73:0:0:62:76:0:0
chr5	176867943	.	A	G	1227.43	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00467498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9257;QD=61.3716;RBI=0.0113606;REFB=0;REVB=0.0103541;RO=0;SAF=53;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.99175e-05;OID=.;OPOS=176867943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:27:53:0:0:27:53:0:0
chr5	176883687	.	A	C	44.59	PASS	AF=0.241379;AO=4;DP=26;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0285697;FXX=0;HRUN=28;LEN=1;MLLD=136.656;QD=6.15033;RBI=0.036555;REFB=-0.00132191;REVB=-0.0228044;RO=20;SAF=4;SAR=0;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.786696;STB=0.846726;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00209803;OID=.;OPOS=176883687;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:29:20:22:4:7:0.241379:0:4:3:17:2:5:4:18
chr5	176885178	.	A	G	413.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0487405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4691;QD=55.0816;RBI=0.0494855;REFB=0;REVB=-0.00855433;RO=0;SAF=7;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000547449;OID=.;OPOS=176885178;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:29:30:1:22:7:0:0:22:8:0:0
chr5	176885499	.	T	C	1433.8	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.205;QD=63.024;RBI=0.0271347;REFB=0;REVB=0.0212645;RO=0;SAF=35;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.58269e-05;OID=.;OPOS=176885499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:91:0:0:89:91:1:54:35:0:0:55:36:0:0
chr5	176894756	.	C	T	526.81	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00119125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.909;QD=56.9526;RBI=0.0306131;REFB=-0.128438;REVB=0.0305899;RO=0;SAF=5;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507932;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.000507189;OID=.;OPOS=176894756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:0:1:36:36:0.972973:31:5:0:0:31:5:0:1
chr5	176916516	.	C	T	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.464;QD=61.6822;RBI=0.0583671;REFB=0;REVB=0.0436687;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000459935;OID=.;OPOS=176916516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:27:14:0:0:27:14:0:0
chr5	176917078	.	T	C	612.67	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.419;QD=61.2671;RBI=0.0219469;REFB=0;REVB=0.0194651;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.51903e-05;OID=.;OPOS=176917078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:20:19:0:0:20:20:0:0
chr5	176930135	.	G	A	882.5	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0078686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.796;QD=57.8688;RBI=0.0855161;REFB=0;REVB=0.0851533;RO=1;SAF=14;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101514;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297334;OID=.;OPOS=176930135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:1:0:60:61:1:46:14:0:1:47:14:0:0
chr5	176930171	.	AGAG	A	1162.37	PASS	AF=1;AO=72;DP=78;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196705;FXX=0.0379699;HRUN=1;LEN=3;MLLD=282.659;QD=61.1773;RBI=0.0745653;REFB=0;REVB=0.071924;RO=0;SAF=26;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.29177e-05;OID=.;OPOS=176930172;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:72:78:76:76:0:27:49:0:0:6:0:26:46:0:0
chr5	176936590	.	T	C	261.64	PASS	AF=0.422535;AO=30;DP=71;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0581296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.343;QD=14.7403;RBI=0.062713;REFB=-0.0121034;REVB=-0.0235346;RO=41;SAF=18;SAR=12;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212011;STB=0.620032;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0232541;OID=.;OPOS=176936590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:41:41:30:30:0.422535:12:18:16:25:12:18:16:25
chr5	176936650	.	T	C	804.45	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0631392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2632;QD=64.3559;RBI=0.0851777;REFB=0;REVB=0.0571723;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.37963e-06;OID=.;OPOS=176936650;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:29:20:0:0:30:20:0:0
chr5	176940384	.	G	A	218.73	PASS	AF=0.36;AO=27;DP=75;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.0103815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5875;QD=11.6653;RBI=0.0207807;REFB=-0.0480765;REVB=0.0180017;RO=48;SAF=15;SAR=12;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0077934;STB=0.504501;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0284612;OID=.;OPOS=176940384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:48:48:27:27:0.36:12:15:27:21:12:15:27:21
chr5	176951275	.	GA	G,GG	844.53	PASS	AF=0.0169492,0.983051;AO=18,43;DP=61;FAO=1,58;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=0,31;FSAR=1,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355288,0.0341197;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=184.028,196.829;QD=57.2559;RBI=0.0598054,0.0652924;REFB=0,0;REVB=0.0481081,0.0556682;RO=0;SAF=8,23;SAR=10,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0365201,0.00226112;OID=.,.;OPOS=176951276,176951276;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0169492,0.983051:18,43:61:1,58:59:0:0,31:1,27:0:0:5:0:8,23:10,20:0:0
chr5	177022652	.	A	G	188.54	PASS	AF=1;AO=12;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0703158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.5371;QD=47.134;RBI=0.216556;REFB=0;REVB=0.204822;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0143546;OID=.;OPOS=177022652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:12:16:1:3:9:0:0:5:11:0:0
chr5	177023098	.	A	T	545.26	PASS	AF=0.903846;AO=19;DP=42;FAO=47;FDP=52;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0385271;FXX=0;HRUN=11;LEN=1;MLLD=96.123;QD=41.9429;RBI=0.0739446;REFB=-0.120714;REVB=0.0631147;RO=5;SAF=0;SAR=19;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511348;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.00491387;OID=.;OPOS=177023098;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:42:52:5:5:19:47:0.903846:19:0:0:5:33:14:1:4
chr5	177035964	.	T	C	620.3	PASS	AF=0.525424;AO=62;DP=119;FAO=62;FDP=118;FR=.;FRO=56;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0460071;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.823;QD=21.0272;RBI=0.0480205;REFB=-0.00436388;REVB=-0.0137592;RO=54;SAF=35;SAR=27;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0551677;STB=0.530878;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00516273;OID=.;OPOS=177035964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:118:54:56:62:62:0.525424:27:35:27:27:27:35:28:28
chr5	177161891	.	A	G	50.13	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3254;QD=33.4223;RBI=0.0830936;REFB=0;REVB=-0.0820713;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00641553;OID=.;OPOS=177161891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr5	177180236	.	G	A	968.25	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00143216;FXX=0.0441112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.791;QD=59.5845;RBI=0.0345083;REFB=0;REVB=-0.0344786;RO=0;SAF=59;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.56535e-05;OID=.;OPOS=177180236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:6:59:0:0:6:59:0:0
chr5	177302645	.	GT	G	87.2	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2462;QD=38.7541;RBI=0.0652888;REFB=0;REVB=-0.0580929;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000914211;OID=.;OPOS=177302646;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:8:9:9:9:0:8:1:0:0:4:0:8:0:0:0
chr5	177422876	.	T	C	1840.84	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.396;QD=61.3612;RBI=0.0292769;REFB=0;REVB=-0.010752;RO=0;SAF=56;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.60462e-05;OID=.;OPOS=177422876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:64:56:0:0:64:56:0:0
chr5	177422908	.	A	G	1607.84	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.655;QD=60.1063;RBI=0.0296578;REFB=0;REVB=0.00909617;RO=0;SAF=48;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.52356e-05;OID=.;OPOS=177422908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:107:0:0:104:107:1:56:48:0:0:58:49:0:0
chr5	177547247	.	T	A,C	1039.18	PASS	AF=0.056338,0.943662;AO=4,67;DP=71;FAO=4,67;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=4,8;FSAR=0,59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00421302,-0.0107291;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=37.9047,242.263;QD=58.5456;RBI=0.0458572,0.014156;REFB=0,0;REVB=0.0456633,0.00923463;RO=0;SAF=4,8;SAR=0,59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0222742,0.000432579;OID=.,.;OPOS=177547247,177547247;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:71:71:0:0:4,67:4,67:0.056338,0.943662:0,59:4,8:0:0:0,59:4,8:0:0
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chr5	177551169	.	T	C	156.17	PASS	AF=0.615385;AO=15;DP=25;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00432334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.487;QD=24.0262;RBI=0.0116564;REFB=-0.0671378;REVB=-0.010825;RO=10;SAF=5;SAR=10;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269184;STB=0.531212;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0303714;OID=.;OPOS=177551169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:25:26:10:10:15:16:0.615385:10:5:3:7:10:6:3:7
chr5	177551176	.	T	C	153.61	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.12631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.151;QD=21.9445;RBI=0.126334;REFB=0.00572869;REVB=0.00244492;RO=11;SAF=6;SAR=10;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00880256;STB=0.519207;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.00397412;OID=.;OPOS=177551176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:11:12:16:16:0.571429:10:6:4:7:10:6:4:8
chr5	177612734	.	T	C	2047.47	PASS	AF=0.971014;AO=134;DP=138;FAO=134;FDP=138;FR=.;FRO=4;FSAF=82;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.013239;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.291;QD=59.3468;RBI=0.0183636;REFB=-0.126351;REVB=0.012726;RO=3;SAF=82;SAR=52;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02663;STB=0.510989;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.000324655;OID=.;OPOS=177612734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:138:138:3:4:134:134:0.971014:52:82:0:3:52:82:1:3
chr5	177612744	.	A	G	2107.78	PASS	AF=1;AO=134;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00993401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.494;QD=62.4528;RBI=0.0222251;REFB=0;REVB=0.0198814;RO=0;SAF=79;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.8181e-05;OID=.;OPOS=177612744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:135:135:0:0:134:135:1:55:79:0:0:55:80:0:0
chr5	177612983	.	G	A	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00656869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.779;QD=59.3227;RBI=0.0105015;REFB=0;REVB=0.00819353;RO=0;SAF=41;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.73551e-06;OID=.;OPOS=177612983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:27:41:0:0:27:41:0:0
chr5	177613123	.	T	C	565.18	PASS	AF=0.928571;AO=39;DP=42;FAO=39;FDP=42;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0420825;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.173;QD=53.8262;RBI=0.0451805;REFB=0.0783967;REVB=0.016442;RO=3;SAF=25;SAR=14;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00372627;STB=0.501991;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=-0.00458266;OID=.;OPOS=177613123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:42:42:3:3:39:39:0.928571:14:25:2:1:14:25:2:1
chr5	177613168	.	C	T	740.36	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0258286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1132;QD=56.9507;RBI=0.0599656;REFB=0;REVB=0.0541179;RO=0;SAF=37;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153399;OID=.;OPOS=177613168;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:15:37:0:0:15:37:0:0
chr5	177613296	.	C	T	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.306;QD=64.1537;RBI=0.0338672;REFB=0;REVB=-0.0128414;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102471;OID=.;OPOS=177613296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0
chr5	177614001	.	T	C	746.86	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.898;QD=63.5629;RBI=0.0401141;REFB=0;REVB=0.0372212;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108338;OID=.;OPOS=177614001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0
chr5	177614090	.	G	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.07;QD=54.5177;RBI=0.0136821;REFB=0;REVB=0.00857478;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92539e-05;OID=.;OPOS=177614090;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
chr5	177614094	.	C	G	267.89	PASS	AF=0.88;AO=22;DP=25;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.101216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.63;QD=42.8625;RBI=0.101247;REFB=-0.148812;REVB=0.00251525;RO=1;SAF=11;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401764;STB=0.559946;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00837261;OID=.;OPOS=177614094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:25:25:1:3:22:22:0.88:11:11:1:0:11:11:3:0
chr5	177614137	.	C	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00582098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.584;QD=51.1841;RBI=0.0291819;REFB=0;REVB=0.0285954;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111333;OID=.;OPOS=177614137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr5	177614183	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.804;QD=37.4885;RBI=0.0428677;REFB=0;REVB=0.0257296;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112734;OID=.;OPOS=177614183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr5	177669413	.	T	G	885.34	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00328698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.722;QD=58.0551;RBI=0.00478245;REFB=0;REVB=0.00347384;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.56105e-06;OID=.;OPOS=177669413;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:34:26:0:0:35:26:0:0
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chr5	177715581	.	T	C	359.36	PASS	AF=0.454545;AO=33;DP=82;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=0.00248211;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.386;QD=16.3344;RBI=0.0406477;REFB=-0.0309808;REVB=0.0405719;RO=48;SAF=18;SAR=15;SRF=35;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198835;STB=0.588743;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0571732;OID=.;OPOS=177715581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:88:48:48:33:40:0.454545:15:18:35:13:18:22:34:14
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chr5	178540975	.	G	A	602.26	PASS	AF=0.440559;AO=63;DP=143;FAO=63;FDP=143;FR=.;FRO=80;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=-0.00570841;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.93;QD=16.8465;RBI=0.00902862;REFB=-0.0191562;REVB=0.006995;RO=79;SAF=26;SAR=37;SRF=44;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144232;STB=0.57707;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0213591;OID=.;OPOS=178540975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:79:80:63:63:0.440559:37:26:44:35:37:26:44:36
chr5	178581859	.	G	A	233.42	PASS	AF=0.383562;AO=28;DP=73;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.00419737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.067;QD=12.7903;RBI=0.0226195;REFB=-0.0148056;REVB=0.0222267;RO=43;SAF=11;SAR=17;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00276303;STB=0.509777;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0243623;OID=.;OPOS=178581859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:43:45:28:28:0.383562:17:11:17:26:17:11:17:28
chr5	178634619	.	C	T	982.71	PASS	AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0337631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.134;QD=56.1551;RBI=0.0527789;REFB=-0.105414;REVB=0.0405668;RO=2;SAF=46;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201069;STB=0.510635;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.000985114;OID=.;OPOS=178634619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:70:70:2:2:68:68:0.971429:22:46:2:0:22:46:2:0
chr5	178634672	.	C	T	771.95	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025423;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.408;QD=57.1814;RBI=0.0271115;REFB=0;REVB=-0.00941844;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.48415e-05;OID=.;OPOS=178634672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:20:34:0:0:20:34:0:0
chr5	178634683	.	C	T	222.8	PASS	AF=0.468085;AO=22;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0881184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2319;QD=18.9618;RBI=0.107821;REFB=-0.0294715;REVB=0.0621328;RO=25;SAF=13;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0678115;STB=0.538426;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.037998;OID=.;OPOS=178634683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:25:22:22:0.468085:9:13:13:12:9:13:13:12
chr5	178949560	.	AG	GT	393.73	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182632;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=167.173;QD=56.2476;RBI=0.020365;REFB=0;REVB=-0.00901053;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000192822;OID=.;OPOS=178949560;OREF=AG;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:10:17:0:0:11:17:0:0
chr5	178949781	.	A	G	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000880419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.166;QD=50.4108;RBI=0.00272702;REFB=0;REVB=0.00258099;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.98239e-05;OID=.;OPOS=178949781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr5	178951598	.	G	A	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3372;QD=56.1893;RBI=0.078713;REFB=0;REVB=-0.0779486;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00179727;OID=.;OPOS=178951598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr5	178951831	.	G	A	50.02	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.131013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9432;QD=8.33718;RBI=0.131493;REFB=-0.0480417;REVB=-0.0112256;RO=11;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332362;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.064093;OID=.;OPOS=178951831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:24:24:11:16:8:8:0.333333:5:3:1:10:5:3:6:10
chr5	179020622	.	T	C	239.24	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0335774;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.3022;QD=20.8031;RBI=0.0408694;REFB=-0.00497719;REVB=0.0232996;RO=22;SAF=9;SAR=14;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0968126;STB=0.544708;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00542623;OID=.;OPOS=179020622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:22:23:23:23:0.5:14:9:11:11:14:9:11:12
chr5	179025789	.	G	A	70.78	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0260679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1001;QD=7.25923;RBI=0.0314291;REFB=0.010654;REVB=0.0175571;RO=29;SAF=8;SAR=2;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.432806;STB=0.773622;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=-0.0312919;OID=.;OPOS=179025789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:2:8:13:16:2:8:13:16
chr5	179069468	.	A	G	101.06	PASS	AF=0.270833;AO=13;DP=48;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0756034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.641;QD=8.42191;RBI=0.0975993;REFB=-0.020552;REVB=-0.0617232;RO=35;SAF=7;SAR=6;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129877;STB=0.579497;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0483795;OID=.;OPOS=179069468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:35:35:13:13:0.270833:6:7:15:20:6:7:15:20
chr5	179069912	.	C	T	159.42	PASS	AF=0.333333;AO=21;DP=63;FAO=21;FDP=63;FR=.;FRO=42;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=36;FSRR=6;FWDB=-0.0591825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.659;QD=10.1221;RBI=0.0620494;REFB=-0.023461;REVB=0.0186427;RO=42;SAF=11;SAR=10;SRF=36;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.400796;STB=0.727386;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0364094;OID=.;OPOS=179069912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:42:42:21:21:0.333333:10:11:36:6:10:11:36:6
chr5	179071866	.	A	G	435.87	PASS	AF=0.468085;AO=44;DP=93;FAO=44;FDP=94;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.0244784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1485;QD=18.5475;RBI=0.0330295;REFB=-0.0145671;REVB=-0.0221755;RO=49;SAF=18;SAR=26;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246319;STB=0.63137;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0124562;OID=.;OPOS=179071866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:49:50:44:44:0.468085:26:18:33:16:26:18:33:17
chr5	179078940	.	T	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.49;QD=62.3509;RBI=0.0489092;REFB=0;REVB=0.0356831;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153268;OID=.;OPOS=179078940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:27:16:0:0:27:16:0:0
chr5	179126090	.	C	T	141.53	PASS	AF=0.457143;AO=15;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0149304;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.174;QD=16.175;RBI=0.018003;REFB=-0.00478554;REVB=-0.0100593;RO=18;SAF=11;SAR=4;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383468;STB=0.716137;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00862298;OID=.;OPOS=179126090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:19:15:16:0.457143:4:11:6:12:4:12:7:12
chr5	179193598	.	C	T	146.95	PASS	AF=0.875;AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00300555;FXX=0.0587889;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.8881;QD=36.7384;RBI=0.0825721;REFB=-0.139983;REVB=0.0825173;RO=2;SAF=12;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144584;STB=0.580518;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00931768;OID=.;OPOS=179193598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:16:16:2:2:14:14:0.875:2:12:1:1:2:12:1:1
chr5	179201847	.	G	A	132.29	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0224561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.258;QD=15.1192;RBI=0.0332189;REFB=-0.0130866;REVB=-0.024479;RO=18;SAF=5;SAR=10;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577205;STB=0.571331;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.035056;OID=.;OPOS=179201847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:18:20:15:15:0.428571:10:5:7:11:10:5:9:11
chr5	179203933	.	A	G	215.56	PASS	AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.00771302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.365;QD=13.0645;RBI=0.00829631;REFB=-0.0210159;REVB=-0.00305582;RO=40;SAF=11;SAR=15;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21116;STB=0.620599;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0389811;OID=.;OPOS=179203933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:15:11:25:15:15:11:25:15
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chr5	179264731	.	T	C	786.85	PASS	AF=0.524476;AO=74;DP=143;FAO=75;FDP=143;FR=.;FRO=68;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=37;FSRR=31;FWDB=0.00480487;FXX=0.00694396;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.263;QD=22.0097;RBI=0.00950361;REFB=-0.0187679;REVB=-0.00819951;RO=67;SAF=39;SAR=35;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00893754;STB=0.505153;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0186775;OID=.;OPOS=179264731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:67:68:74:75:0.524476:35:39:36:31:35:40:37:31
chr5	179267949	.	T	C	1153.76	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.462;QD=60.7241;RBI=0.0709787;REFB=0;REVB=-0.0550289;RO=0;SAF=32;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.39573e-05;OID=.;OPOS=179267949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:43:32:0:0:43:33:0:0
chr5	179280379	.	T	C	227.95	PASS	AF=0.35443;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.00500102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.305;QD=11.5419;RBI=0.0181466;REFB=-0.00369253;REVB=0.0174439;RO=51;SAF=18;SAR=10;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647999;STB=0.537545;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.00711765;OID=.;OPOS=179280379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:51:51:28:28:0.35443:10:18:30:21:10:18:30:21
chr5	179285752	.	G	A	560.35	PASS	AF=0.543689;AO=56;DP=103;FAO=56;FDP=103;FR=.;FRO=47;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.0349345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.581;QD=21.761;RBI=0.102851;REFB=-0.0452005;REVB=0.0967363;RO=46;SAF=35;SAR=21;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00477194;STB=0.503875;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0347106;OID=.;OPOS=179285752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:46:47:56:56:0.543689:21:35:29:17:21:35:29:18
chr5	179529124	.	G	A	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0473837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.92;QD=59.0181;RBI=0.0486416;REFB=0;REVB=0.0109902;RO=0;SAF=9;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000223498;OID=.;OPOS=179529124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:25:9:0:0:25:9:0:0
chr5	179563435	.	T	C	885.37	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0473563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.565;QD=58.057;RBI=0.0506562;REFB=0;REVB=0.0179842;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000282299;OID=.;OPOS=179563435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:29:32:0:0:29:32:0:0
chr5	179729519	.	A	G	786.34	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0636452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5767;QD=55.182;RBI=0.0647402;REFB=0.0351497;REVB=0.011857;RO=1;SAF=27;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171432;STB=0.509088;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.00468961;OID=.;OPOS=179729519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:29:27:1:0:29:27:1:0
chr5	179734200	.	A	G	267.06	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00793478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9381;QD=20.1557;RBI=0.0221423;REFB=0.0128014;REVB=-0.0206718;RO=25;SAF=12;SAR=16;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779781;STB=0.543447;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=-0.0165736;OID=.;OPOS=179734200;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:16:12:13:12:16:12:13:12
chr5	179744009	.	T	G	173.67	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0183695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.261;QD=12.8645;RBI=0.0183719;REFB=-0.0107174;REVB=0.000299572;RO=32;SAF=9;SAR=12;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139972;STB=0.571361;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0234146;OID=.;OPOS=179744009;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:33:21:21:0.388889:12:9:18:14:12:9:18:15
chr5	179996111	.	C	T	941.0	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0188318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.422;QD=57.0303;RBI=0.018832;REFB=0.00198691;REVB=7.90592e-05;RO=1;SAF=41;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113841;STB=0.506022;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.000114593;OID=.;OPOS=179996111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:24:41:1:0:24:41:1:0
chr5	180035182	.	CAGT	C	35.95	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=0;FWDB=0.00263262;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=324.861;QD=6.25134;RBI=0.024472;REFB=-0.00165538;REVB=-0.0243299;RO=17;SAF=5;SAR=1;SRF=17;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.557998;STB=0.814358;STBP=0.855;TYPE=del;VARB=0.00552003;OID=.;OPOS=180035183;OREF=AGT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.26087:6:23:6:23:17:5:1:17:0:35:17:5:1:17:0
chr5	180046344	.	G	C	557.72	PASS	AF=0.457364;AO=58;DP=129;FAO=59;FDP=129;FR=.;FRO=70;FSAF=46;FSAR=13;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=-0.0343052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.706;QD=17.2937;RBI=0.0349616;REFB=-0.0391725;REVB=-0.00674306;RO=69;SAF=45;SAR=13;SRF=40;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233259;STB=0.638837;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0563832;OID=.;OPOS=180046344;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:69:70:58:59:0.457364:13:45:40:29:13:46:40:30
chr5	180046492	.	CAGAG	CA,CAG	631.04	PASS	AF=0,1;AO=4,35;DP=40;FAO=0,41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=0,28;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044295,0.0397985;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=292.343,311.025;QD=61.5651;RBI=0.0517992,0.047415;REFB=0,0;REVB=0.0268535,0.0257734;RO=0;SAF=3,25;SAR=1,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.86674e-08,-5.03206e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,7.28813e-05;OID=.,.;OPOS=180046494,180046493;OREF=GAG,AG;OALT=-,-;OMAPALT=CA,CAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:4,35:40:0,41:41:0:0,28:0,13:0:0:4:0:3,25:1,10:0:0
chr5	180046636	.	G	C	210.76	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0411193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.15;QD=14.0508;RBI=0.052499;REFB=0.000269229;REVB=-0.0326396;RO=34;SAF=7;SAR=18;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182393;STB=0.598105;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=-0.00212694;OID=.;OPOS=180046636;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:35:25:25:0.416667:18:7:15:19:18:7:15:20
chr5	180052946	.	G	A	55.73	PASS	AF=0.380952;AO=6;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=0.00320186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.697;QD=10.6144;RBI=0.0103872;REFB=-0.0158001;REVB=0.00988145;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.543832;STB=0.782185;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0119379;OID=.;OPOS=180052946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:10:13:6:8:0.380952:3:3:10:0:3:5:13:0
chr5	180057231	.	C	A	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00930626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.051;QD=11.0917;RBI=0.0580182;REFB=-0.00623518;REVB=0.057267;RO=6;SAF=4;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0477139;STB=0.529298;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0109045;OID=.;OPOS=180057231;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:1:4:5:1:1:4:5:1
chr5	180120192	.	G	T	241.37	PASS	AF=0.473684;AO=24;DP=55;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0073193;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.576;QD=16.9382;RBI=0.0113372;REFB=-0.0234155;REVB=0.00865793;RO=31;SAF=13;SAR=11;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0891288;STB=0.507807;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0222242;OID=.;OPOS=180120192;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:31:30:24:27:0.473684:11:13:14:17:14:13:14:16
chr5	180166461	.	C	G	179.61	PASS	AF=1;AO=13;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0167167;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2936;QD=47.8968;RBI=0.0878969;REFB=0;REVB=0.0862926;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0018;OID=.;OPOS=180166461;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:15:0:0:13:15:1:5:8:0:0:5:10:0:0
chr5	180219984	.	C	T	537.17	PASS	AF=0.549451;AO=50;DP=92;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0424763;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.8021;QD=23.612;RBI=0.0427244;REFB=-0.00540077;REVB=-0.00459761;RO=38;SAF=24;SAR=26;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571779;STB=0.514506;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.00685549;OID=.;OPOS=180219984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:38:41:50:50:0.549451:26:24:21:17:26:24:21:20
chr5	180276402	.	C	T	1047.84	PASS	AF=0.986111;AO=72;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0578855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.635;QD=58.2132;RBI=0.0819585;REFB=-0.0427787;REVB=0.0580212;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506847;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000854365;OID=.;OPOS=180276402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:0:1:72:71:0.986111:35:37:0:0:35:36:1:0
chr5	180277343	.	T	C	238.22	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00591712;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.016;QD=20.2743;RBI=0.00643134;REFB=-0.0236669;REVB=0.00251987;RO=24;SAF=8;SAR=15;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252528;STB=0.642333;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0195978;OID=.;OPOS=180277343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:15:8:15:9:15:8:15:9
chr5	180278393	.	C	G	428.0	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0632;QD=57.0671;RBI=0.11838;REFB=0;REVB=0.0110403;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000697764;OID=.;OPOS=180278393;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:29:30:1:18:11:0:0:18:12:0:0
chr5	180329359	.	T	C	234.02	PASS	AF=0.430769;AO=26;DP=63;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.0297078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6299;QD=14.4014;RBI=0.0479885;REFB=-0.023975;REVB=0.0376874;RO=37;SAF=18;SAR=8;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198977;STB=0.526297;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.025071;OID=.;OPOS=180329359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:65:37:37:26:28:0.430769:8:18:25:12:8:20:25:12
chr5	180335671	.	G	A	412.59	PASS	AF=0.445545;AO=44;DP=100;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=40;FWDB=0.0124126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.867;QD=16.3403;RBI=0.0130704;REFB=-0.00285705;REVB=-0.00409424;RO=55;SAF=24;SAR=20;SRF=16;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24947;STB=0.63536;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00364974;OID=.;OPOS=180335671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:55:56:44:45:0.445545:20:24:16:39:21:24:16:40
chr5	180336849	.	C	T	380.66	PASS	AF=0.5;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.010861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.716;QD=19.5209;RBI=0.0336629;REFB=-0.00270757;REVB=-0.0318626;RO=34;SAF=23;SAR=16;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519393;STB=0.564665;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00335315;OID=.;OPOS=180336849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:78:34:39:39:39:0.5:16:23:18:16:16:23:18:21
chr5	180338368	.	A	G	367.97	PASS	AF=0.5;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0527472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.515;QD=19.3667;RBI=0.0543838;REFB=-0.00689817;REVB=0.013241;RO=36;SAF=20;SAR=18;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0012855;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0067848;OID=.;OPOS=180338368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:36:38:38:38:0.5:18:20:19:17:18:20:20:18
chr5	180374534	.	G	A	452.25	PASS	AF=0.414634;AO=51;DP=123;FAO=51;FDP=123;FR=.;FRO=72;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=29;FWDB=-0.0184245;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5224;QD=14.7072;RBI=0.029991;REFB=-0.0139544;REVB=0.0236643;RO=72;SAF=30;SAR=21;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00966848;STB=0.505438;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0104012;OID=.;OPOS=180374534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:72:72:51:51:0.414634:21:30:43:29:21:30:43:29
chr5	180376972	.	C	G	90.68	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0804211;FXX=0.0999001;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.338;QD=40.3017;RBI=0.0804212;REFB=0;REVB=-0.000120666;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000447025;OID=.;OPOS=180376972;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:8:9:1:7:1:0:0:7:2:0:0
chr5	180376974	.	T	G	101.91	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0814326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.301;QD=40.7629;RBI=0.0995116;REFB=0;REVB=0.0571952;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00122322;OID=.;OPOS=180376974;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:10:0:0:9:10:1:7:2:0:0:8:2:0:0
chr5	180377018	.	C	A	223.97	PASS	AF=1;AO=15;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.945;QD=49.7703;RBI=0.0307155;REFB=0;REVB=0.0141979;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000368398;OID=.;OPOS=180377018;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:15:18:1:9:6:0:0:12:6:0:0
chr5	180432416	.	C	T	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0071716;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.242;QD=12.8608;RBI=0.0102866;REFB=-0.0207267;REVB=-0.00737446;RO=8;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490059;STB=0.529329;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.02036;OID=.;OPOS=180432416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:3:4:5:3:3:4:5:3
chr5	180472498	.	C	T	307.01	PASS	AF=0.923077;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0316141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.062;QD=47.2327;RBI=0.0548659;REFB=-0.205133;REVB=-0.0448421;RO=1;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487199;STB=0.510195;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.003954;OID=.;OPOS=180472498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:26:26:1:2:24:24:0.923077:9:15:0:1:9:15:1:1
chr5	180472513	.	A	G	538.9	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.526;QD=59.8772;RBI=0.0514809;REFB=0;REVB=-0.0132279;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.21848e-05;OID=.;OPOS=180472513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:12:23:0:0:12:24:0:0
chr5	180482899	.	C	T	483.57	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000684358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.319;QD=56.8904;RBI=0.0262737;REFB=0;REVB=0.0262648;RO=0;SAF=26;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011246;OID=.;OPOS=180482899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:34:0:0:31:34:1:5:26:0:0:7:27:0:0
chr5	180486247	.	G	T	769.48	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.245;QD=56.9986;RBI=0.0409178;REFB=0;REVB=0.0350665;RO=0;SAF=19;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162252;OID=.;OPOS=180486247;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:35:19:0:0:35:19:0:0
chr5	180582604	.	A	G	113.91	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0127088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0841;QD=18.2249;RBI=0.0508244;REFB=-0.0553657;REVB=-0.0492099;RO=11;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283465;STB=0.674456;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0508307;OID=.;OPOS=180582604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:11:12:13:13:0.52:7:6:9:2:7:6:10:2
chr5	180591141	.	A	G	48.85	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0786688;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.4489;QD=13.9569;RBI=0.108758;REFB=-0.000741135;REVB=0.0750969;RO=7;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197466;STB=0.620296;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000434531;OID=.;OPOS=180591141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:6:1:2:5:6:1:2:5
chr5	180596597	.	A	G	686.82	PASS	AF=0.30303;AO=91;DP=291;FAO=90;FDP=297;FR=.;FRO=207;FSAF=58;FSAR=32;FSRF=108;FSRR=99;FWDB=-0.0516892;FXX=0.0132886;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.6179;QD=9.25015;RBI=0.072352;REFB=0.00890379;REVB=0.0506264;RO=199;SAF=59;SAR=32;SRF=103;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160667;STB=0.588516;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=-0.0168101;OID=.;OPOS=180596597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:291:297:199:207:91:90:0.30303:32:59:103:96:32:58:108:99
chr5	180600638	.	T	C	962.12	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.139;QD=58.3105;RBI=0.10866;REFB=0;REVB=0.107582;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037197;OID=.;OPOS=180600638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:33:32:0:0:33:33:0:0
chr5	180600702	.	G	C	165.18	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=-0.0334835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.687;QD=12.4666;RBI=0.0334917;REFB=-0.0119926;REVB=0.000737953;RO=32;SAF=3;SAR=17;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175413;STB=0.623712;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.0168974;OID=.;OPOS=180600702;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:33:20:20:0.377358:17:3:8:24:17:3:9:24
chr5	180615933	.	T	C	284.12	PASS	AF=0.426667;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.0292627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.537;QD=15.1532;RBI=0.0301959;REFB=-0.00626784;REVB=-0.00744872;RO=43;SAF=14;SAR=18;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214001;STB=0.620616;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0114659;OID=.;OPOS=180615933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:43:43:32:32:0.426667:18:14:28:15:18:14:28:15
chr5	180618713	.	A	AC	774.54	PASS	AF=1;AO=74;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0938753;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.7668;QD=36.0253;RBI=0.102373;REFB=0;REVB=-0.0408374;RO=9;SAF=31;SAR=43;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742749;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00145117;OID=.;OPOS=180618714;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:74:87:86:86:0:39:47:0:0:16:9:31:43:7:2
chr5	180626927	.	A	G	616.3	PASS	AF=0.54955;AO=60;DP=112;FAO=61;FDP=111;FR=.;FRO=50;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.0151875;FXX=0.00892777;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.625;QD=22.2091;RBI=0.023086;REFB=-0.0057704;REVB=0.0173868;RO=48;SAF=32;SAR=28;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109765;STB=0.561494;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00532481;OID=.;OPOS=180626927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:111:48:50:60:61:0.54955:28:32:32:16:29:32:33:17
chr5	180645279	.	C	G	249.54	PASS	AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0156477;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=305.47;QD=14.2593;RBI=0.0196623;REFB=-0.0185321;REVB=-0.0119061;RO=40;SAF=18;SAR=11;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074918;STB=0.53646;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.022455;OID=.;OPOS=180645279;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:40:41:29:29:0.414286:11:18:22:18:11:18:23:18
chr5	180645350	.	G	T	271.68	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.0169719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.049;QD=14.6854;RBI=0.0357606;REFB=-0.00309681;REVB=-0.0314766;RO=43;SAF=20;SAR=11;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.044585;STB=0.525312;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.00561051;OID=.;OPOS=180645350;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:11:20:26:17:11:20:26:17
chr5	180648971	.	C	A	317.92	PASS	AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.0107667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.557;QD=15.5085;RBI=0.0163043;REFB=-0.0135483;REVB=-0.0122437;RO=46;SAF=20;SAR=15;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03857;STB=0.526866;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0156521;OID=.;OPOS=180648971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:46:47:35:35:0.426829:15:20:28:18:15:20:29:18
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chr6	656143	.	C	A	844.62	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00767888;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.84;QD=57.2626;RBI=0.0542461;REFB=0;REVB=-0.0536998;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00096022;OID=.;OPOS=656143;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:58:59:1:28:30:0:0:29:30:0:0
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chr6	1523145	.	C	CG,G	873.87	PASS	AF=0.272727,0.727273;AO=13,50;DP=66;FAO=18,48;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=0,34;FSAR=18,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0591263,-0.0552364;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=25.0705,41.9351;QD=52.9619;RBI=0.0602902,0.0572169;REFB=0,0;REVB=-0.0117891,-0.0149239;RO=3;SAF=0,34;SAR=13,16;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0804286;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0345247,0.00313138;OID=.,.;OPOS=1523146,1523145;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:81:66:66:3:0:13,50:18,48:0.272727,0.727273:13,16:0,34:0:3:18,14:0,34:0:0
chr6	2623820	.	G	A	180.06	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.000311025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9135;QD=23.2331;RBI=0.00132991;REFB=-0.0441619;REVB=0.00129302;RO=13;SAF=11;SAR=7;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00336458;STB=0.501885;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0467932;OID=.;OPOS=2623820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:7:11:8:5:7:11:8:5
chr6	2624262	.	T	G	86.81	PASS	AF=0.714286;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0097839;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.381;QD=24.8032;RBI=0.0348082;REFB=-0.00183616;REVB=0.0334048;RO=4;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113004;STB=0.564382;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00113036;OID=.;OPOS=2624262;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:14:14:4:4:10:10:0.714286:7:3:2:2:7:3:2:2
chr6	2664375	.	C	A	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.023993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.824;QD=14.0959;RBI=0.0283198;REFB=-0.00816401;REVB=-0.0150448;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0067129;STB=0.50393;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.00392785;OID=.;OPOS=2664375;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:4:7:9:5:4:7:9:5
chr6	2667031	.	A	G	465.11	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00923008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.788;QD=58.1392;RBI=0.0694242;REFB=0;REVB=0.0688079;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148896;OID=.;OPOS=2667031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0
chr6	2668071	.	G	C	65.31	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.00113819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.9;QD=10.885;RBI=0.00201577;REFB=0.00335445;REVB=0.00166368;RO=15;SAF=7;SAR=2;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.510522;STB=0.804666;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.00240853;OID=.;OPOS=2668071;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:2:7:4:11:2:7:4:11
chr6	2679676	.	G	A	388.52	PASS	AF=0.527027;AO=38;DP=73;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0156672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.918;QD=21.0011;RBI=0.0189985;REFB=-0.0285892;REVB=0.0107463;RO=32;SAF=12;SAR=26;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137751;STB=0.590428;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.025424;OID=.;OPOS=2679676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:32:35:38:39:0.527027:26:12:15:17:26:13:18:17
chr6	2685775	.	G	A	101.46	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0301553;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.0672;QD=15.6088;RBI=0.0516474;REFB=-0.0358976;REVB=0.0419298;RO=14;SAF=9;SAR=3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193547;STB=0.613434;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0449494;OID=.;OPOS=2685775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:26:14:14:12:12:0.461538:3:9:8:6:3:9:8:6
chr6	2766465	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.332;QD=46.8476;RBI=0.0758723;REFB=0;REVB=0.0681986;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162101;OID=.;OPOS=2766465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:3:12:0:0:3:12:0:0
chr6	2784571	.	G	A	728.98	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.472;QD=57.175;RBI=0.0319417;REFB=0;REVB=0.0087392;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145616;OID=.;OPOS=2784571;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0
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chr6	3015790	.	A	G	1607.13	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.669;QD=64.2853;RBI=0.0142739;REFB=0;REVB=0.00809554;RO=0;SAF=39;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39894e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.34659e-06;OID=.;OPOS=3015790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:61:39:0:0:61:39:0:0
chr6	3019927	.	G	C	341.76	PASS	AF=0.644444;AO=29;DP=45;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0147184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.498;QD=30.3788;RBI=0.0362802;REFB=0.00434688;REVB=-0.0331605;RO=16;SAF=15;SAR=14;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701157;STB=0.538435;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-0.00244246;OID=.;OPOS=3019927;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:16:16:29:29:0.644444:14:15:10:6:14:15:10:6
chr6	3077141	.	T	C	870.51	PASS	AF=0.530864;AO=86;DP=163;FAO=86;FDP=162;FR=.;FRO=76;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=30;FSRR=46;FWDB=0.0220404;FXX=0.0181807;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.342;QD=21.4941;RBI=0.0507332;REFB=-0.0214432;REVB=-0.0456955;RO=74;SAF=44;SAR=42;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101111;STB=0.554715;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0132404;OID=.;OPOS=3077141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:162:74:76:86:86:0.530864:42:44:29:45:42:44:30:46
chr6	3154871	.	A	C	383.66	PASS	AF=0.606557;AO=37;DP=62;FAO=37;FDP=61;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00986556;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3798;QD=25.1581;RBI=0.0100595;REFB=-0.0131902;REVB=0.00196598;RO=24;SAF=19;SAR=18;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129073;STB=0.570634;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00963372;OID=.;OPOS=3154871;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:24:24:37:37:0.606557:18:19:8:16:18:19:8:16
chr6	3154882	.	C	T	71.15	PASS	AF=0.2;AO=11;DP=55;FAO=11;FDP=55;FR=.;FRO=44;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0760785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5835;QD=5.1742;RBI=0.0774745;REFB=-0.00406576;REVB=-0.0146409;RO=42;SAF=1;SAR=10;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.566607;STB=0.877091;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0101831;OID=.;OPOS=3154882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:55:55:42:44:11:11:0.2:10:1:21:21:10:1:22:22
chr6	3225759	.	C	A	106.81	PASS	AF=0.253968;AO=16;DP=63;FAO=16;FDP=63;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.024932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.934;QD=6.78136;RBI=0.0291156;REFB=-0.00826706;REVB=-0.0150372;RO=47;SAF=9;SAR=7;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190375;STB=0.616297;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0376316;OID=.;OPOS=3225759;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:47:47:16:16:0.253968:7:9:19:28:7:9:19:28
chr6	3225770	.	C	T	39.59	PASS	AF=0.14;AO=7;DP=50;FAO=7;FDP=50;FR=.;FRO=43;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.124793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6558;QD=3.16696;RBI=0.127395;REFB=-0.00365446;REVB=-0.025614;RO=42;SAF=4;SAR=3;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254691;STB=0.666223;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0227123;OID=.;OPOS=3225770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:50:50:42:43:7:7:0.14:3:4:15:27:3:4:16:27
chr6	3255327	.	G	A	1190.44	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0869;QD=61.048;RBI=0.0520541;REFB=0;REVB=-0.0480254;RO=0;SAF=48;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000479054;OID=.;OPOS=3255327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:30:48:0:0:30:48:0:0
chr6	3255340	.	A	C	1358.84	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.512;QD=62.4752;RBI=0.0361125;REFB=0;REVB=-0.00534102;RO=0;SAF=55;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.10518e-05;OID=.;OPOS=3255340;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:31:55:0:0:31:56:0:0
chr6	3264487	.	T	C	1616.84	PASS	AF=1;AO=105;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.151056;FXX=0.0442439;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.436;QD=59.8828;RBI=0.154566;REFB=0;REVB=0.0327496;RO=0;SAF=54;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00188164;OID=.;OPOS=3264487;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:108:0:0:105:108:1:51:54:0:0:53:55:0:0
chr6	3264502	.	G	C	1357.89	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.081;QD=62.4318;RBI=0.0603719;REFB=0;REVB=0.0157274;RO=0;SAF=48;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.83512e-05;OID=.;OPOS=3264502;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:39:48:0:0:39:48:0:0
chr6	3264526	.	CT	TC	632.07	PASS	AF=0.924242;AO=62;DP=63;FAO=61;FDP=66;FR=.;FRO=5;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0797384;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=204.293;QD=38.3074;RBI=0.142771;REFB=-0.108225;REVB=0.118429;RO=1;SAF=37;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125907;STB=0.532457;STBP=0.08;TYPE=mnp;VARB=0.0052037;OID=.;OPOS=3264526;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:63:66:1:5:62:61:0.924242:25:37:1:0:25:36:5:0
chr6	3285286	.	A	G	1472.03	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7389;QD=63.313;RBI=0.0498983;REFB=0;REVB=0.00653332;RO=0;SAF=41;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342113;OID=.;OPOS=3285286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:52:41:0:0:52:41:0:0
chr6	3287118	.	T	C	689.21	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00329236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1082;QD=62.6551;RBI=0.00923983;REFB=0;REVB=0.00863336;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.37034e-05;OID=.;OPOS=3287118;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:16:28:0:0:16:28:0:0
chr6	3438738	.	G	A	165.73	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0180172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.683;QD=14.4114;RBI=0.0344007;REFB=0.00175502;REVB=0.0293051;RO=28;SAF=7;SAR=11;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262362;STB=0.651495;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.00271835;OID=.;OPOS=3438738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:11:7:18:10:11:7:18:10
chr6	3439595	.	G	GA	266.93	PASS	AF=1;AO=24;DP=32;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0788669;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=14.3912;QD=36.8185;RBI=0.261674;REFB=0;REVB=-0.249506;RO=6;SAF=12;SAR=12;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122583;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00689025;OID=.;OPOS=3439596;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:24:32:29:29:0:14:15:0:0:5:6:12:12:5:1
chr6	3727811	.	C	G	1414.96	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.797;QD=62.8872;RBI=0.0167166;REFB=0;REVB=0.0085959;RO=0;SAF=44;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.15616e-05;OID=.;OPOS=3727811;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:46:44:0:0:46:44:0:0
chr6	3851193	.	C	G	923.16	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00904944;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.507;QD=58.6131;RBI=0.00924077;REFB=0;REVB=-0.00187069;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17331e-05;OID=.;OPOS=3851193;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0
chr6	4069166	.	C	T	214.1	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0189961;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.512;QD=14.5155;RBI=0.0318954;REFB=-0.00772976;REVB=-0.0256216;RO=34;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202444;STB=0.511524;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0120904;OID=.;OPOS=4069166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:13:12:17:17:13:12:17:17
chr6	4069685	.	C	T	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.00720055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.214;QD=12.7816;RBI=0.01331;REFB=-0.0309142;REVB=-0.0111941;RO=14;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0168865;STB=0.50998;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0244203;OID=.;OPOS=4069685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:7:3:4:10:7:3:4:10
chr6	4074612	.	A	C	409.56	PASS	AF=0.387097;AO=48;DP=124;FAO=48;FDP=124;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=43;FSRR=33;FWDB=-0.00359636;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.434;QD=13.2117;RBI=0.00706537;REFB=-0.0127976;REVB=-0.00608159;RO=70;SAF=22;SAR=26;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738313;STB=0.565569;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0169208;OID=.;OPOS=4074612;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:70:76:48:48:0.387097:26:22:37:33:26:22:43:33
chr6	4074634	.	C	A	463.02	PASS	AF=0.471698;AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.0148211;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.768;QD=17.4724;RBI=0.0253165;REFB=-0.0295534;REVB=-0.0205246;RO=56;SAF=24;SAR=26;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490501;STB=0.527262;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0129205;OID=.;OPOS=4074634;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:106:56:56:50:50:0.471698:26:24:24:32:26:24:24:32
chr6	4079858	.	C	G	833.44	PASS	AF=0.528662;AO=82;DP=156;FAO=83;FDP=157;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=11;FSRR=63;FWDB=0.0373946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.942;QD=21.2341;RBI=0.0376195;REFB=-0.0340008;REVB=0.00410709;RO=71;SAF=33;SAR=49;SRF=10;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244954;STB=0.628915;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0314032;OID=.;OPOS=4079858;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:157:71:74:82:83:0.528662:49:33:10:61:50:33:11:63
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chr6	4116262	.	G	A	77.89	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.131103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.182;QD=14.162;RBI=0.132687;REFB=-0.0202919;REVB=-0.0204448;RO=12;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38819;STB=0.723744;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00840364;OID=.;OPOS=4116262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:6:4:10:2:6:4:10:2
chr6	4122249	.	C	A	165.31	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=5;FWDB=-0.0284943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.3279;QD=14.3747;RBI=0.0981785;REFB=0.0175912;REVB=-0.0939526;RO=27;SAF=16;SAR=2;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162474;STB=0.589362;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.0336646;OID=.;OPOS=4122249;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:27:28:18:18:0.391304:2:16:22:5:2:16:23:5
chr6	4428223	.	C	G	91.78	PASS	AF=0.833333;AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00487524;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=257.225;QD=30.5942;RBI=0.0297674;REFB=-0.0858964;REVB=0.0293654;RO=2;SAF=6;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305955;STB=0.517207;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00171502;OID=.;OPOS=4428223;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:12:12:2:2:10:10:0.833333:4:6:1:1:4:6:1:1
chr6	4716016	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.035;QD=45.8068;RBI=0.012349;REFB=0;REVB=-0.0019977;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119704;OID=.;OPOS=4716016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:4:10:0:0:4:10:0:0
chr6	4716037	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0576692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.521;QD=47.822;RBI=0.127955;REFB=0;REVB=0.114222;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00199561;OID=.;OPOS=4716037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr6	4735035	.	T	C	455.98	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0241482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1269;QD=55.2698;RBI=0.0372842;REFB=-0.122066;REVB=0.0284074;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511621;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.00574892;OID=.;OPOS=4735035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:33:33:0:1:32:32:0.969697:21:11:0:0:21:11:0:1
chr6	4735071	.	C	G	427.96	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312508;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.114;QD=57.0616;RBI=0.041872;REFB=0;REVB=0.0278686;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270425;OID=.;OPOS=4735071;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:18:11:0:0:18:12:0:0
chr6	5086211	.	G	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.353;QD=33.4285;RBI=0.0847836;REFB=0;REVB=0.0764868;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016094;OID=.;OPOS=5086211;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr6	5086558	.	C	A	365.84	PASS	AF=0.487179;AO=38;DP=78;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0283091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.886;QD=18.7608;RBI=0.0366369;REFB=-0.0223507;REVB=0.0232565;RO=40;SAF=22;SAR=16;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00372264;STB=0.502074;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0228125;OID=.;OPOS=5086558;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:40:40:38:38:0.487179:16:22:23:17:16:22:23:17
chr6	5139012	.	C	A	101.88	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0762889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.2011;QD=40.7527;RBI=0.103004;REFB=0;REVB=0.0692082;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000404687;OID=.;OPOS=5139012;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr6	5260936	.	A	C	578.04	PASS	AF=0.409938;AO=66;DP=162;FAO=66;FDP=161;FR=.;FRO=95;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=58;FSRR=37;FWDB=-0.0105196;FXX=0.0122692;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.061;QD=14.3612;RBI=0.0448968;REFB=-0.0187901;REVB=0.043647;RO=94;SAF=37;SAR=29;SRF=57;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490046;STB=0.530105;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0206716;OID=.;OPOS=5260936;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:161:94:95:66:66:0.409938:29:37:57:37:29:37:58:37
chr6	5431340	.	A	G	1399.49	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=93;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00188062;FXX=0.0215031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.356;QD=61.5162;RBI=0.0346322;REFB=-0.0993334;REVB=0.0345811;RO=0;SAF=47;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.16558e-08;STB=0.505746;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000567025;OID=.;OPOS=5431340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:91:0:1:90:90:0.989011:43:47:0:0:43:47:0:1
chr6	6003985	.	C	T	368.9	PASS	AF=0.506667;AO=37;DP=74;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.039154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3415;QD=19.6744;RBI=0.0391805;REFB=-0.0254282;REVB=-0.00144021;RO=36;SAF=24;SAR=13;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878069;STB=0.561764;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0303982;OID=.;OPOS=6003985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:36:37:37:38:0.506667:13:24:20:16:13:25:20:17
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chr6	6174866	.	G	A	566.38	PASS	AF=0.565217;AO=52;DP=91;FAO=52;FDP=92;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.00662049;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=323.765;QD=24.6254;RBI=0.0101896;REFB=-0.00625845;REVB=0.00774583;RO=39;SAF=25;SAR=27;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125102;STB=0.562476;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00524535;OID=.;OPOS=6174866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:39:40:52:52:0.565217:27:25:25:14:27:25:25:15
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chr6	7229346	.	T	C	197.77	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0276418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.692;QD=14.6499;RBI=0.0276438;REFB=-0.0308628;REVB=0.000336899;RO=30;SAF=12;SAR=11;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783139;STB=0.552629;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0288603;OID=.;OPOS=7229346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:31:23:23:0.425926:11:12:18:12:11:12:19:12
chr6	7230680	.	G	T	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0723181;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=106.805;QD=39.2063;RBI=0.0860929;REFB=0;REVB=0.0467127;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118608;OID=.;OPOS=7230680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
chr6	7246998	.	G	A	249.34	PASS	AF=0.402778;AO=24;DP=68;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0108838;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=115.268;QD=13.8521;RBI=0.0126703;REFB=-0.04204;REVB=-0.00648678;RO=24;SAF=14;SAR=10;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111914;STB=0.517162;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0623279;OID=.;OPOS=7246998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:72:24:43:24:29:0.402778:10:14:11:13:12:17:24:19
chr6	7247248	.	T	C	359.42	PASS	AF=1;AO=23;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.45;QD=55.2951;RBI=0.0453732;REFB=0;REVB=0.0421368;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000326852;OID=.;OPOS=7247248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:23:26:1:6:17:0:0:9:17:0:0
chr6	7248925	.	C	T	180.49	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.0100707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.437;QD=16.0431;RBI=0.0107507;REFB=-0.0279946;REVB=-0.00376277;RO=23;SAF=12;SAR=7;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115339;STB=0.589387;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0236884;OID=.;OPOS=7248925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:26:19:19:0.422222:7:12:17:6:7:12:20:6
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chr6	7572262	.	A	G	1231.75	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036395;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.678;QD=61.5873;RBI=0.038188;REFB=0;REVB=0.011564;RO=0;SAF=46;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.86137e-05;OID=.;OPOS=7572262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:77:80:0:0:76:80:1:30:46:0:0:31:49:0:0
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chr6	7580958	.	A	G	113.06	PASS	AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0164376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.65;QD=26.602;RBI=0.112436;REFB=-0.0169083;REVB=0.111228;RO=5;SAF=11;SAR=1;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.553229;STB=0.820218;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.010554;OID=.;OPOS=7580958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:17:17:5:5:12:12:0.705882:1:11:1:4:1:11:1:4
chr6	7585967	.	G	C	432.83	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244638;FXX=0.0322477;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.405;QD=57.7099;RBI=0.0313112;REFB=0;REVB=0.0195426;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.64887e-05;OID=.;OPOS=7585967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr6	7601720	.	C	T	408.91	PASS	AF=0.461538;AO=42;DP=91;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.0311069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5281;QD=17.9741;RBI=0.0448897;REFB=0.00888441;REVB=-0.0323642;RO=49;SAF=25;SAR=17;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198806;STB=0.610972;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=-0.0122396;OID=.;OPOS=7601720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:49:49:42:42:0.461538:17:25:19:30:17:25:19:30
chr6	7609918	.	ATTTTTTTA	AAATTTTTT,AATTTTTTA,ATTTTTT,ATTTTTTA,TTTTTTTAA	83.85	PASS	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mnp,snp,del,del,mnp;VARB=0,0,0.157615,0.208376,-0.00145473;OID=.,.,.,.,.;OPOS=7609919,7609919,7609925,7609919,7609918;OREF=TTTTTTTA,T,TA,T,ATTTTTTT;OALT=AATTTTTT,A,-,-,TTTTTTTA;OMAPALT=AAATTTTTT,AATTTTTTA,ATTTTTT,ATTTTTTA,TTTTTTTAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:39:50:47:18:27:2,2,10,5,3:0,0,13,4,3:0,0,0.276596,0.0851064,0.0638298:2,2,6,1,0:0,0,4,4,3:15:3:0,0,9,0,0:0,0,4,4,3:16:11
chr6	7727522	.	G	C,GAGC	144.14	PASS	AF=0.25,0.625;AO=7,9;DP=19;FAO=4,10;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=2,3;FSAR=2,7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0486575,0.00924109;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,3;MLLD=127.533,201.574;QD=36.0339;RBI=0.0891347,0.0940648;REFB=-0.0368781,-0.00819678;REVB=0.0746822,0.0936098;RO=3;SAF=5,3;SAR=2,6;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0295447,-0.154191;STB=0.66592,0.624739;STBP=0.375,0.114;TYPE=snp,ins;VARB=0.00944593,0.0243016;OID=.,.;OPOS=7727522,7727523;OREF=G,-;OALT=C,AGC;OMAPALT=C,GAGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:23:19:16:3:2:7,9:4,10:0.25,0.625:2,6:5,3:2:1:2,7:2,3:2:0
chr6	7862631	.	G	C	1523.24	PASS	AF=1;AO=83;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.148554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1372;QD=58.5862;RBI=0.151217;REFB=0;REVB=0.0282549;RO=0;SAF=24;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.003858;OID=.;OPOS=7862631;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:83:104:1:59:24:0:0:59:45:0:0
chr6	7986847	.	G	A	638.81	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.102614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.265;QD=59.4238;RBI=0.104954;REFB=-0.108416;REVB=0.0220353;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.516121;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00231321;OID=.;OPOS=7986847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:27:15:0:0:27:15:1:0
chr6	7988189	.	T	C	1024.18	PASS	AF=0.947368;AO=71;DP=75;FAO=72;FDP=76;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0394922;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.924;QD=53.904;RBI=0.0480356;REFB=0.0342336;REVB=0.0273458;RO=2;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225076;STB=0.504503;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=-0.00189355;OID=.;OPOS=7988189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:75:76:2:4:71:72:0.947368:41:30:0:2:42:30:2:2
chr6	8015129	.	T	C	871.17	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113903;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.098;QD=58.0779;RBI=0.11805;REFB=0;REVB=0.0310132;RO=0;SAF=25;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000344037;OID=.;OPOS=8015129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:35:25:0:0:35:25:0:0
chr6	8428137	.	A	AAAGT,AAGT,T	341.7	PASS	AF=0.08,0.92,0;AO=4,21,2;DP=29;FAO=2,23,0;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,15,0;FSAR=2,8,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163652,0.0232876,-0.00649951;FXX=0.0740466;HRUN=1,1,1;LEN=4,3,1;MLLD=153.477,167.44,44.5159;QD=54.6718;RBI=0.0335841,0.0458606,0.0303324;REFB=0,0,0;REVB=0.029327,0.039508,0.0296278;RO=1;SAF=0,15,2;SAR=4,6,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0.0708105,0.697199;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=ins,ins,snp;VARB=0.0540872,-0.00271239,0;OID=.,.,.;OPOS=8428138,8428138,8428137;OREF=-,-,A;OALT=AAGT,AGT,T;OMAPALT=AAAGT,AAGT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:29:25:1:0:4,21,2:2,23,0:0.08,0.92,0:4,6,0:0,15,2:0:1:2,8,0:0,15,0:0:0
chr6	8430049	.	G	A	1491.69	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.996;QD=63.4761;RBI=0.034995;REFB=0;REVB=0.0174165;RO=0;SAF=47;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.35016e-05;OID=.;OPOS=8430049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:93:94:1:46:47:0:0:47:47:0:0
chr6	9776058	.	G	A	166.56	PASS	AF=0.362069;AO=21;DP=58;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0257465;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9165;QD=11.4868;RBI=0.0353851;REFB=-0.0236519;REVB=-0.024274;RO=36;SAF=8;SAR=13;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219312;STB=0.635052;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0272267;OID=.;OPOS=9776058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:37:21:21:0.362069:13:8:21:15:13:8:22:15
chr6	9900599	.	T	TGAG	419.62	PASS	AF=0.408333;AO=48;DP=120;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=26;FWDB=0.0143788;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=262.429;QD=13.9875;RBI=0.0232534;REFB=-0.012548;REVB=0.0182748;RO=71;SAF=28;SAR=20;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0554979;STB=0.525931;STBP=0.656;TYPE=ins;VARB=0.0160722;OID=.;OPOS=9900600;OREF=-;OALT=GAG;OMAPALT=TGAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.408333:48:120:49:120:71:29:20:45:26:99:71:28:20:45:26
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chr6	10763312	.	G	A	471.92	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0151501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.617;QD=55.5196;RBI=0.0316302;REFB=-0.0232769;REVB=0.0277659;RO=1;SAF=14;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322;STB=0.517231;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000124605;OID=.;OPOS=10763312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:19:14:1:0:19:14:1:0
chr6	10764727	.	A	G	1627.14	PASS	AF=1;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.006667;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.127;QD=60.2644;RBI=0.00710563;REFB=0;REVB=0.00245788;RO=0;SAF=62;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67537e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.0442e-06;OID=.;OPOS=10764727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:108:0:0:108:108:1:46:62:0:0:46:62:0:0
chr6	10891781	.	C	T	756.45	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00299422;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.809;QD=57.0907;RBI=0.00813119;REFB=0;REVB=0.00755983;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.57031e-05;OID=.;OPOS=10891781;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0
chr6	10906256	.	A	G	155.83	PASS	AF=0.271605;AO=22;DP=81;FAO=22;FDP=81;FR=.;FRO=59;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0607421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0078;QD=7.69541;RBI=0.0646476;REFB=0.0136214;REVB=0.0221294;RO=57;SAF=7;SAR=15;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255368;STB=0.654277;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.0234538;OID=.;OPOS=10906256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:57:59:22:22:0.271605:15:7:30:27:15:7:31:28
chr6	10942964	.	A	G	138.42	PASS	AF=0.340426;AO=15;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=25;FWDB=0.019105;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.993;QD=11.7805;RBI=0.0202327;REFB=-0.0049936;REVB=-0.00666027;RO=31;SAF=8;SAR=7;SRF=6;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385165;STB=0.732582;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00771639;OID=.;OPOS=10942964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:31:31:15:16:0.340426:7:8:6:25:7:9:6:25
chr6	10955408	.	C	T	277.19	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=0.0301536;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.423;QD=18.4791;RBI=0.0307338;REFB=-0.022656;REVB=0.0059436;RO=31;SAF=14;SAR=16;SRF=25;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306031;STB=0.663656;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0301774;OID=.;OPOS=10955408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:31:30:30:30:0.5:16:14:25:6:16:14:24:6
chr6	10981053	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00444714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.753;QD=53.2772;RBI=0.00522036;REFB=0;REVB=0.00273406;RO=0;SAF=18;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.77419e-06;OID=.;OPOS=10981053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:5:18:0:0:5:18:0:0
chr6	11105763	.	C	T	545.22	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0195991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.646;QD=57.3913;RBI=0.0217659;REFB=0.00122915;REVB=0.00946744;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.512189;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.000128391;OID=.;OPOS=11105763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:0:1:37:37:0.973684:20:17:0:0:20:17:0:1
chr6	11185257	.	A	T	417.96	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0126043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0614;QD=53.9304;RBI=0.0391451;REFB=-0.0415877;REVB=-0.0370604;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.514276;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.000824037;OID=.;OPOS=11185257;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:0:1:30:30:0.967742:13:17:0:0:13:17:1:0
chr6	11185533	.	G	A	383.26	PASS	AF=0.419048;AO=44;DP=105;FAO=44;FDP=105;FR=.;FRO=61;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0204123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.927;QD=14.6004;RBI=0.022674;REFB=-0.0146482;REVB=0.00987145;RO=61;SAF=22;SAR=22;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110054;STB=0.561877;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0157605;OID=.;OPOS=11185533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:61:61:44:44:0.419048:22:22:37:24:22:22:37:24
chr6	11190626	.	A	G	1585.59	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00164991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.348;QD=59.8336;RBI=0.00691209;REFB=0;REVB=0.00671229;RO=0;SAF=57;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.18061e-05;OID=.;OPOS=11190626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:106:0:0:105:106:1:48:57:0:0:48:58:0:0
chr6	11192575	.	C	T	726.74	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0484406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7133;QD=63.1944;RBI=0.048539;REFB=0;REVB=-0.00308874;RO=0;SAF=30;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000440049;OID=.;OPOS=11192575;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:15:30:0:0:15:31:0:0
chr6	11576130	.	T	C	908.18	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.100101;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.8514;QD=55.0414;RBI=0.10285;REFB=-0.123793;REVB=0.0236234;RO=1;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136897;STB=0.50095;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00286653;OID=.;OPOS=11576130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:66:66:1:2:64:64:0.969697:34:30:0:1:34:30:1:1
chr6	11581374	.	T	C	357.94	PASS	AF=0.506849;AO=37;DP=73;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.0461999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6326;QD=19.6129;RBI=0.0662099;REFB=-0.0220958;REVB=0.047427;RO=36;SAF=28;SAR=9;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101747;STB=0.556786;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0334568;OID=.;OPOS=11581374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:36:36:37:37:0.506849:9:28:24:12:9:28:24:12
chr6	11644302	.	T	C	239.68	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8759;QD=50.4598;RBI=0.113762;REFB=0;REVB=-0.0289181;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0024975;OID=.;OPOS=11644302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:3:15:0:0:3:16:0:0
chr6	11644518	.	C	T	303.78	PASS	AF=0.464789;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0255912;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0273;QD=17.1142;RBI=0.0255912;REFB=-0.023256;REVB=-2.38714e-05;RO=38;SAF=14;SAR=19;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729947;STB=0.540959;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0310335;OID=.;OPOS=11644518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:38:38:33:33:0.464789:19:14:19:19:19:14:19:19
chr6	11714705	.	G	A	315.45	PASS	AF=0.406977;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=35;FWDB=-0.032858;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.412;QD=14.6719;RBI=0.0337134;REFB=-0.00382239;REVB=0.0075461;RO=51;SAF=19;SAR=16;SRF=16;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237119;STB=0.633675;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00886831;OID=.;OPOS=11714705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:51:51:35:35:0.406977:16:19:16:35:16:19:16:35
chr6	12122645	.	A	G	990.62	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.7;QD=59.1413;RBI=0.0205068;REFB=0;REVB=0.00946502;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.24384e-05;OID=.;OPOS=12122645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:27:40:0:0:27:40:0:0
chr6	12122773	.	T	C	613.1	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.961;QD=61.3096;RBI=0.0185538;REFB=0;REVB=0.00911263;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.48749e-05;OID=.;OPOS=12122773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:24:14:0:0:25:15:0:0
chr6	12294258	.	A	G	786.92	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00508641;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.696;QD=55.2225;RBI=0.0130611;REFB=0.0205433;REVB=-0.01203;RO=1;SAF=24;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192399;STB=0.5102;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-9.58138e-05;OID=.;OPOS=12294258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:32:24:1:0:32:24:1:0
chr6	13185109	.	TGC	TCC,TCG	83.18	PASS	AF=0,0.38;AO=4,8;DP=70;FAO=0,19;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=0,3;FSAR=0,16;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0366377,-0.000661561;FXX=0.166639;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=152.091,30.6109;QD=6.65452;RBI=0.0742643,0.0846249;REFB=-0.012492,-0.0318374;REVB=-0.0645977,-0.0846224;RO=43;SAF=1,3;SAR=3,5;SRF=29;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.427821,-0.353587;STB=0.5,0.806992;STBP=1,0.001;TYPE=snp,mnp;VARB=0,0.106011;OID=.,.;OPOS=13185110,13185110;OREF=G,GC;OALT=C,CG;OMAPALT=TCC,TCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.38:4,8:70:0,19:50:31:0,3:0,16:19:12:85:43:1,3:3,5:29:14
chr6	13206282	.	C	T	64.45	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0.0712101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.174;QD=9.91602;RBI=0.0874938;REFB=0.00772449;REVB=0.0508359;RO=17;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.523757;STB=0.792743;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=-0.00255467;OID=.;OPOS=13206282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:6:3:0:17:6:3:0:17
chr6	13288648	.	A	G	344.68	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172838;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.561;QD=55.1494;RBI=0.0176043;REFB=0;REVB=-0.0033442;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.69112e-05;OID=.;OPOS=13288648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr6	13288679	.	GCT	G	252.24	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102736;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=229.354;QD=50.4473;RBI=0.117965;REFB=0;REVB=0.0579746;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000840333;OID=.;OPOS=13288680;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:19:20:20:20:0:8:12:0:0:4:0:7:12:0:0
chr6	13295502	.	T	C	1227.43	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.406;QD=61.3713;RBI=0.0369669;REFB=0;REVB=0.0235921;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.94431e-05;OID=.;OPOS=13295502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:37:43:0:0:37:43:0:0
chr6	13295515	.	A	C	1236.78	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.553;QD=61.0757;RBI=0.0573822;REFB=0;REVB=0.0131696;RO=0;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.89224e-05;OID=.;OPOS=13295515;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:81:0:0:79:81:1:39:40:0:0:39:42:0:0
chr6	13295536	.	C	T	1190.46	PASS	AF=0.987654;AO=78;DP=80;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0612973;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.0302;QD=58.7883;RBI=0.0620857;REFB=-0.135542;REVB=0.00986289;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00410094;OID=.;OPOS=13295536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:81:0:1:78:80:0.987654:39:39:0:0:40:40:0:1
chr6	13361088	.	A	G	785.21	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.58;QD=57.1062;RBI=0.0224039;REFB=0;REVB=-0.0123284;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.68304e-06;OID=.;OPOS=13361088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:30:24:0:0:31:24:0:0
chr6	13470113	.	A	T	920.08	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000656701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8914;QD=58.4175;RBI=0.0394969;REFB=0;REVB=0.0394914;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239806;OID=.;OPOS=13470113;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:27:36:0:0:27:36:0:0
chr6	13487087	.	G	A	276.62	PASS	AF=0.526316;AO=28;DP=54;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0316161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.332;QD=19.4122;RBI=0.0377494;REFB=-0.0292598;REVB=0.0206262;RO=26;SAF=15;SAR=13;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129812;STB=0.559401;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0200993;OID=.;OPOS=13487087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:57:26:27:28:30:0.526316:13:15:10:16:14:16:11:16
chr6	13547958	.	C	T	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6304;QD=57.3853;RBI=0.0311322;REFB=0;REVB=-0.00710783;RO=0;SAF=42;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08575e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018238;OID=.;OPOS=13547958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:15:42:0:0:15:42:0:0
chr6	13548165	.	A	G	272.91	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0107848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.424;QD=45.4843;RBI=0.0129939;REFB=-0.0871679;REVB=0.00724777;RO=2;SAF=9;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921477;STB=0.549954;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00182066;OID=.;OPOS=13548165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:2:2:22:22:0.916667:13:9:2:0:13:9:2:0
chr6	13616712	.	A	T	84.31	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0159402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.923;QD=10.5389;RBI=0.0241808;REFB=-0.00625212;REVB=0.018183;RO=21;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229478;STB=0.636635;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0139208;OID=.;OPOS=13616712;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:5:6:7:14:5:6:7:14
chr6	13659079	.	T	G	69.79	PASS	AF=0.24;AO=10;DP=45;FAO=12;FDP=50;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.00494172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.5453;QD=5.58349;RBI=0.0704032;REFB=-0.0218618;REVB=-0.0702296;RO=31;SAF=7;SAR=3;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0138843;STB=0.538132;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0485855;OID=.;OPOS=13659079;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:45:50:31:38:10:12:0.24:3:7:22:9:5:7:24:14
chr6	13801615	.	T	C	57.66	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0410634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.1543;QD=13.567;RBI=0.0626778;REFB=-0.0299678;REVB=0.047353;RO=9;SAF=7;SAR=1;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348018;STB=0.695325;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0392171;OID=.;OPOS=13801615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:1:7:9:0:1:7:9:0
chr6	13978275	.	A	C	2352.14	PASS	AF=1;AO=150;DP=151;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00557236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6718;QD=61.0945;RBI=0.0755831;REFB=0;REVB=0.0753774;RO=0;SAF=95;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213508;OID=.;OPOS=13978275;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:151:154:0:0:150:154:1:55:95:0:0:59:95:0:0
chr6	13978618	.	C	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0715999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.149;QD=53.9112;RBI=0.0725079;REFB=0;REVB=0.011439;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264203;OID=.;OPOS=13978618;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0
chr6	13978802	.	TCTC	T,TCTT	574.83	PASS	AF=1,0;AO=34,2;DP=39;FAO=38,0;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23,0;FSAR=15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.066199,-0.0200966;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=245.067,3.96948;QD=60.5079;RBI=0.0699063,0.0566876;REFB=0,0;REVB=0.0224631,-0.0530057;RO=0;SAF=22,1;SAR=12,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.75716e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000189262,0;OID=.,.;OPOS=13978803,13978805;OREF=CTC,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:34,2:39:38,0:38:0:23,0:15,0:0:0:4:0:22,1:12,1:0:0
chr6	13978837	.	G	T	557.75	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.201;QD=60.2973;RBI=0.0416124;REFB=0;REVB=0.0093535;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199369;OID=.;OPOS=13978837;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:14:22:0:0:15:22:0:0
chr6	13978996	.	CTTTTTTT	CTTTTTT,CTTTTTTC	47.13	PASS	AF=0.375,0.0625;AO=12,2;DP=33;FAO=12,2;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=8,0;FSAR=4,2;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.193271,0.147911;FXX=0.0302939;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=8.04958,19.5594;QD=5.89096;RBI=0.246074,0.179357;REFB=-0.0760073,-0.0732174;REVB=0.152312,0.101446;RO=15;SAF=8,0;SAR=4,2;SRF=7;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.197057,-0.528044;STB=0.604472,0.994543;STBP=0.365,0.186;TYPE=del,snp;VARB=0.109221,-0.0593155;OID=.,.;OPOS=13978997,13979003;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CTTTTTT,CTTTTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375,0.0625:12,2:33:12,2:32:18:8,0:4,2:9:9:38:15:8,0:4,2:7:8
chr6	13979929	.	TTA	AAA,T,TAA	79.75	PASS	AF=0,0.9375,0;AO=2,4,2;DP=19;FAO=0,15,0;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=0,12,0;FSAR=0,3,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.209705,0.0298222,-0.415422;FXX=0.111049;HRUN=7,7,7;LEN=2,2,1;MLLD=15.3642,9.68707,5.95999;QD=19.9367;RBI=0.235407,0.137247,0.458458;REFB=-0.0162343,-0.155363,-0.0257103;REVB=0.106959,0.133968,0.193928;RO=9;SAF=2,2,2;SAR=0,2,0;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.502622,-0.300398,0.502622;STB=0.5,0.571326,0.5;STBP=1,0.165,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,-0.00992243,0.0506612;OID=.,.,.;OPOS=13979929,13979930,13979930;OREF=TT,TA,T;OALT=AA,-,A;OMAPALT=AAA,T,TAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:7:19:16:9:1:2,4,2:0,15,0:0,0.9375,0:0,2,0:2,2,2:7:2:0,3,0:0,12,0:0:1
chr6	14131804	.	G	A	780.74	PASS	AF=0.544118;AO=74;DP=136;FAO=74;FDP=136;FR=.;FRO=62;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=0.015259;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.258;QD=22.963;RBI=0.0342984;REFB=-0.0450982;REVB=0.0307171;RO=62;SAF=40;SAR=34;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610571;STB=0.533378;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0347842;OID=.;OPOS=14131804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:62:62:74:74:0.544118:34:40:38:24:34:40:38:24
chr6	14646772	.	A	G	739.03	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0322916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3204;QD=54.7432;RBI=0.0445159;REFB=0.0633062;REVB=0.0306419;RO=1;SAF=26;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177765;STB=0.50943;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=-0.000894599;OID=.;OPOS=14646772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:27:26:1:0:27:26:1:0
chr6	15513482	.	G	A	162.6	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0333979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4633;QD=19.7085;RBI=0.03376;REFB=-0.0265274;REVB=-0.00493084;RO=16;SAF=9;SAR=8;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784583;STB=0.544432;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0265054;OID=.;OPOS=15513482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:8:9:7:9:8:9:7:9
chr6	15586009	.	G	T	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.387;QD=59.142;RBI=0.0280694;REFB=0;REVB=0.000642772;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.81209e-05;OID=.;OPOS=15586009;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:31:36:0:0:31:36:0:0
chr6	16145325	.	A	G	857.39	PASS	AF=1;AO=59;DP=61;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00641422;FXX=0.0327815;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.165;QD=58.1282;RBI=0.0110147;REFB=0;REVB=0.00895439;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.09107e-06;OID=.;OPOS=16145325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:59:0:0:59:59:1:26:33:0:0:26:33:0:0
chr6	16205330	.	T	A,TA	32.36	PASS	AF=0,0.127273;AO=2,6;DP=57;FAO=0,7;FDP=55;FR=.;FRO=48;FSAF=0,3;FSAR=0,4;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=-0.0307974,0.0217116;FXX=0.0350816;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=214.201,69.0305;QD=2.35344;RBI=0.0325756,0.0343372;REFB=0.0027892,-0.000333986;REVB=-0.0106154,-0.0266017;RO=48;SAF=0,3;SAR=2,3;SRF=31;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.461535,-0.172163;STB=0.5,0.682939;STBP=1,0.365;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0379018;OID=.,.;OPOS=16205330,16205331;OREF=T,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:33:57:55:48:48:2,6:0,7:0,0.127273:2,3:0,3:31:17:0,4:0,3:31:17
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chr6	16306866	.	G	A	973.74	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401562;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.006;QD=59.0143;RBI=0.0416454;REFB=0;REVB=0.0110371;RO=0;SAF=28;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.6941e-05;OID=.;OPOS=16306866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:38:28:0:0:38:28:0:0
chr6	16327330	.	T	C	305.67	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4613;QD=53.16;RBI=0.0555417;REFB=0;REVB=0.0538485;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107749;OID=.;OPOS=16327330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr6	16327615	.	A	G	288.8	PASS	AF=0.555556;AO=29;DP=53;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.0271921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.481;QD=21.3929;RBI=0.0272265;REFB=-0.0575236;REVB=0.00136822;RO=24;SAF=19;SAR=10;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0488713;STB=0.521113;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.029096;OID=.;OPOS=16327615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:24:24:29:30:0.555556:10:19:17:7:10:20:17:7
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chr6	17629616	.	G	A	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.79;QD=62.022;RBI=0.0307983;REFB=0;REVB=0.0242873;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011098;OID=.;OPOS=17629616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:17:25:0:0:17:25:0:0
chr6	17633061	.	C	T	557.12	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0895191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.729;QD=60.2296;RBI=0.0900478;REFB=0;REVB=-0.00974359;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000575843;OID=.;OPOS=17633061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
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chr6	17737690	.	T	A	187.66	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00138151;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=36.3049;QD=15.0129;RBI=0.0324407;REFB=-0.0242538;REVB=0.0324112;RO=30;SAF=7;SAR=13;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291779;STB=0.667818;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0378994;OID=.;OPOS=17737690;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:30:20:20:0.4:13:7:19:11:13:7:19:11
chr6	17764530	.	C	T	293.76	PASS	AF=0.365591;AO=34;DP=93;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=-0.0311411;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.7133;QD=12.6349;RBI=0.107191;REFB=-0.0226035;REVB=-0.102568;RO=59;SAF=18;SAR=16;SRF=38;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128744;STB=0.573582;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0379219;OID=.;OPOS=17764530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:59:59:34:34:0.365591:16:18:38:21:16:18:38:21
chr6	17764755	.	T	C	356.68	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0454904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9219;QD=19.2801;RBI=0.0456089;REFB=-0.0112582;REVB=-0.00328545;RO=37;SAF=18;SAR=19;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242894;STB=0.513506;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.00940792;OID=.;OPOS=17764755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:19:18:19:18:19:18:19:18
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chr6	17794494	.	G	A	666.59	PASS	AF=0.465753;AO=67;DP=145;FAO=68;FDP=146;FR=.;FRO=78;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=52;FWDB=0.00518083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.929;QD=18.2627;RBI=0.0111827;REFB=-0.0282485;REVB=0.00991017;RO=78;SAF=35;SAR=32;SRF=26;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182439;STB=0.603804;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0187613;OID=.;OPOS=17794494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:146:78:78:67:68:0.465753:32:35:26:52:32:36:26:52
chr6	17834198	.	T	G	199.48	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0491328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.638;QD=15.6454;RBI=0.0841737;REFB=-0.0501376;REVB=0.068346;RO=29;SAF=11;SAR=11;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171759;STB=0.509795;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0407416;OID=.;OPOS=17834198;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:11:11:14:15:11:11:14:15
chr6	17834213	.	T	C	197.07	PASS	AF=0.433962;AO=20;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.142501;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=41.1102;QD=14.8735;RBI=0.143722;REFB=-0.0616807;REVB=-0.0186946;RO=20;SAF=10;SAR=10;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268169;STB=0.549875;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0755487;OID=.;OPOS=17834213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:20:30:20:23:0.433962:10:10:4:16:11:12:13:17
chr6	18122506	.	G	A	198.5	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0396486;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=268.001;QD=44.1121;RBI=0.0467673;REFB=-0.0750875;REVB=0.0248025;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521714;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.000673676;OID=.;OPOS=18122506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:0:1:17:17:0.944444:6:11:0:0:6:11:1:0
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chr6	19840802	.	AT	A	31.37	PASS	AF=0.241935;AO=19;DP=64;FAO=15;FDP=62;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.111607;FXX=0.0312451;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.01404;QD=2.02413;RBI=0.23819;REFB=-0.115546;REVB=0.210424;RO=35;SAF=9;SAR=10;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823623;STB=0.564187;STBP=0.579;TYPE=del;VARB=0.152073;OID=.;OPOS=19840803;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.241935:19:64:15:62:47:7:8:18:29:31:35:9:10:14:21
chr6	20282269	.	T	C	516.47	PASS	AF=0.974359;AO=33;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0207632;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.842;QD=52.9714;RBI=0.0547694;REFB=-0.0705123;REVB=0.0506811;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.517232;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00233713;OID=.;OPOS=20282269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:39:39:0:1:33:38:0.974359:14:19:0:0:14:24:0:1
chr6	20492995	.	T	C	789.26	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00949135;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.048;QD=55.3865;RBI=0.0114731;REFB=-0.111713;REVB=0.00644559;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.511107;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000409191;OID=.;OPOS=20492995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:57:57:0:1:56:56:0.982456:22:34:0:0:22:34:0:1
chr6	20599628	.	C	T	1245.09	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00280025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.611;QD=61.4857;RBI=0.0257767;REFB=0;REVB=0.0256242;RO=0;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.52387e-05;OID=.;OPOS=20599628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:38:43:0:0:38:43:0:0
chr6	21201493	.	G	A	518.62	PASS	AF=0.504673;AO=54;DP=107;FAO=54;FDP=107;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.016052;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.174;QD=19.3877;RBI=0.0170241;REFB=-0.00833361;REVB=-0.00567028;RO=53;SAF=25;SAR=29;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262039;STB=0.51447;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.00855667;OID=.;OPOS=21201493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:53:53:54:54:0.504673:29:25:23:30:29:25:23:30
chr6	22136879	.	G	T	309.04	PASS	AF=0.435897;AO=33;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.00407827;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.317;QD=15.8481;RBI=0.0411811;REFB=-0.0233388;REVB=-0.0409787;RO=43;SAF=17;SAR=16;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268372;STB=0.542144;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0266455;OID=.;OPOS=22136879;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:43:44:33:34:0.435897:16:17:21:22:16:18:20:24
chr6	24147409	.	C	A	922.02	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0863598;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.4327;QD=57.6263;RBI=0.118504;REFB=0;REVB=0.081149;RO=1;SAF=40;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116542;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143373;OID=.;OPOS=24147409;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:64:1:0:60:64:1:20:40:1:0:22:42:0:0
chr6	24174955	.	G	C	1587.77	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0317775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3619;QD=64.1521;RBI=0.0353907;REFB=0;REVB=-0.0155787;RO=0;SAF=63;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000232825;OID=.;OPOS=24174955;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:36:63:0:0:36:63:0:0
chr6	24291203	.	T	C	727.75	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7272;QD=63.2824;RBI=0.0714694;REFB=0;REVB=0.0439684;RO=0;SAF=33;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.94744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000765201;OID=.;OPOS=24291203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:13:33:0:0:13:33:0:0
chr6	24403455	.	C	T	1388.24	PASS	AF=1;AO=88;DP=91;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0657229;FXX=0.0219756;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.573;QD=62.3927;RBI=0.0678846;REFB=0;REVB=0.0169946;RO=1;SAF=58;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155322;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.00843e-05;OID=.;OPOS=24403455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:89:1:0:88:89:1:30:58:0:1:31:58:0:0
chr6	24411018	.	A	G	1226.84	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.059;QD=61.3419;RBI=0.05909;REFB=0;REVB=0.0235551;RO=0;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.13047e-05;OID=.;OPOS=24411018;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:76:80:0:0:76:80:1:41:35:0:0:43:37:0:0
chr6	24418786	.	T	C	1274.74	PASS	AF=0.976744;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0193732;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.737;QD=59.2902;RBI=0.022606;REFB=-0.0413332;REVB=0.0116495;RO=1;SAF=47;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00997231;STB=0.510414;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00171888;OID=.;OPOS=24418786;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:86:86:1:2:84:84:0.976744:37:47:1:0:37:47:2:0
chr6	24424231	.	G	T	293.4	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00765383;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.775;QD=53.346;RBI=0.0930768;REFB=0;REVB=-0.0927615;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000761185;OID=.;OPOS=24424231;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr6	24425606	.	T	TA	436.88	PASS	AF=1;AO=5;DP=48;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.173708;FXX=0.145803;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.7514;QD=42.6225;RBI=0.180821;REFB=0;REVB=-0.050217;RO=43;SAF=2;SAR=3;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00598511;OID=.;OPOS=24425607;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:48:41:41:0:22:19:0:0:8:43:2:3:22:21
chr6	24425609	.	T	A	706.94	PASS	AF=0.98;AO=40;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0107757;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=70.2753;QD=56.5549;RBI=0.13208;REFB=-0.0828642;REVB=0.13164;RO=2;SAF=23;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683707;STB=0.5102;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.00275144;OID=.;OPOS=24425609;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:2:1:40:49:0.98:17:23:1:1:25:24:1:0
chr6	24425671	.	A	G	723.6	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0166177;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.2159;QD=59.0694;RBI=0.0993499;REFB=-0.0401322;REVB=-0.0979503;RO=1;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019193;STB=0.500434;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-8.15541e-05;OID=.;OPOS=24425671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:49:1:2:47:47:0.959184:24:23:0:1:24:23:1:1
chr6	24425690	.	A	G	727.71	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.107;QD=63.279;RBI=0.0224075;REFB=0;REVB=0.0166998;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.92394e-05;OID=.;OPOS=24425690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0
chr6	24433483	.	T	C	1115.38	PASS	AF=0.962025;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0247248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.919;QD=56.4751;RBI=0.030348;REFB=-0.0906509;REVB=0.017598;RO=3;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410908;STB=0.521733;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.000883889;OID=.;OPOS=24433483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:79:79:3:3:76:76:0.962025:33:43:0:3:33:43:0:3
chr6	24437445	.	G	A	1401.94	PASS	AF=0.98913;AO=89;DP=91;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0181869;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.551;QD=60.954;RBI=0.0488442;REFB=-0.0709185;REVB=0.045332;RO=1;SAF=43;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108942;STB=0.505617;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.000537055;OID=.;OPOS=24437445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:92:1:1:89:91:0.98913:46:43:1:0:47:44:1:0
chr6	24447177	.	G	A	331.39	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0144881;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.085;QD=18.4107;RBI=0.0186891;REFB=-0.0127143;REVB=-0.0118058;RO=36;SAF=10;SAR=25;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261591;STB=0.653917;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0184234;OID=.;OPOS=24447177;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:37:35:35:0.486111:25:10:20:16:25:10:21:16
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chr6	24653273	.	G	C	189.83	PASS	AF=0.396552;AO=22;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0158205;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.961;QD=13.0916;RBI=0.0169764;REFB=-0.0163735;REVB=0.00615719;RO=35;SAF=14;SAR=8;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411983;STB=0.533951;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0221218;OID=.;OPOS=24653273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:35:22:23:0.396552:8:14:21:14:8:15:21:14
chr6	24653376	.	G	A	876.81	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0488964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.071;QD=57.496;RBI=0.0494784;REFB=0;REVB=0.00756648;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253235;OID=.;OPOS=24653376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:59:61:1:22:37:0:0:22:39:0:0
chr6	24780892	.	A	C	168.68	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0208807;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.671;QD=16.0648;RBI=0.0417264;REFB=-0.0215946;REVB=0.036126;RO=24;SAF=10;SAR=8;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137426;STB=0.57886;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0183024;OID=.;OPOS=24780892;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:8:10:10:14:8:10:10:14
chr6	24805826	.	GA	G	195.33	PASS	AF=0.403226;AO=23;DP=61;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=8;FWDB=0.00907435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.854;QD=12.6017;RBI=0.0109042;REFB=0.000161581;REVB=-0.00604625;RO=36;SAF=18;SAR=5;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.007482;STB=0.549211;STBP=0.606;TYPE=del;VARB=-0.000129343;OID=.;OPOS=24805827;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.403226:23:61:25:62:37:18:7:29:8:99:36:18:5:28:8
chr6	24818785	.	A	G	185.82	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00744065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.121;QD=19.0583;RBI=0.0173478;REFB=-0.0107002;REVB=-0.0156711;RO=20;SAF=9;SAR=10;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214966;STB=0.512182;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.00845497;OID=.;OPOS=24818785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:10:9:9:11:10:9:9:11
chr6	24825511	.	A	G	950.46	PASS	AF=1;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0022185;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6163;QD=58.4895;RBI=0.0133407;REFB=0;REVB=0.0131549;RO=0;SAF=25;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103531;OID=.;OPOS=24825511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:64:65:1:39:25:0:0:40:25:0:0
chr6	25084718	.	A	G	1589.54	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6743;QD=59.9827;RBI=0.0605952;REFB=0;REVB=0.0487335;RO=0;SAF=52;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000455306;OID=.;OPOS=25084718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:54:52:0:0:54:52:0:0
chr6	25106745	.	A	G	746.93	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.019;QD=63.5688;RBI=0.0644179;REFB=0;REVB=0.0431472;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151492;OID=.;OPOS=25106745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:22:24:0:0:22:25:0:0
chr6	25106783	.	G	A	305.52	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.142052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4609;QD=53.1345;RBI=0.143589;REFB=0;REVB=-0.0209544;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00428938;OID=.;OPOS=25106783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0
chr6	25115296	.	G	T	215.11	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00453272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.631;QD=21.5109;RBI=0.0105087;REFB=-0.00390618;REVB=-0.0094809;RO=19;SAF=12;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0831478;STB=0.546718;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0036993;OID=.;OPOS=25115296;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:9:12:9:10:9:12:9:10
chr6	25420344	.	C	G	1552.52	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0084149;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.754;QD=64.0213;RBI=0.0248356;REFB=0;REVB=-0.0233665;RO=0;SAF=58;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.9156e-05;OID=.;OPOS=25420344;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:39:58:0:0:39:58:0:0
chr6	25426768	.	G	A	200.46	PASS	AF=0.678571;AO=18;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00305089;FXX=0.0666445;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.184;QD=28.6375;RBI=0.00629439;REFB=0.00148671;REVB=-0.00550559;RO=9;SAF=12;SAR=6;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512182;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.000525567;OID=.;OPOS=25426768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:28:28:9:9:18:19:0.678571:6:12:6:3:7:12:6:3
chr6	25435758	.	A	G	274.8	PASS	AF=0.557692;AO=27;DP=50;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.00836291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8836;QD=21.1381;RBI=0.0711455;REFB=-0.0147336;REVB=0.0706523;RO=23;SAF=17;SAR=10;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100176;STB=0.571381;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0177357;OID=.;OPOS=25435758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:23:23:27:29:0.557692:10:17:17:6:12:17:17:6
chr6	25605091	.	G	A	689.29	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00288623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1149;QD=62.6626;RBI=0.0211497;REFB=0;REVB=-0.0209518;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000142063;OID=.;OPOS=25605091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:28:16:0:0:28:16:0:0
chr6	25726675	.	G	A	466.37	PASS	AF=0.489362;AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0133048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=312.85;QD=19.8456;RBI=0.014757;REFB=-0.0157913;REVB=0.00638369;RO=48;SAF=20;SAR=26;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0795481;STB=0.544167;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.020548;OID=.;OPOS=25726675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:48:48:46:46:0.489362:26:20:25:23:26:20:25:23
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chr6	26200425	.	C	T	530.06	PASS	AF=0.411348;AO=58;DP=141;FAO=58;FDP=141;FR=.;FRO=83;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=45;FWDB=-0.0029967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.931;QD=15.0373;RBI=0.014639;REFB=-0.00324019;REVB=-0.014329;RO=83;SAF=35;SAR=23;SRF=38;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153468;STB=0.586321;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00377059;OID=.;OPOS=26200425;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:83:83:58:58:0.411348:23:35:38:45:23:35:38:45
chr6	26200518	.	G	A	313.48	PASS	AF=0.338983;AO=40;DP=118;FAO=40;FDP=118;FR=.;FRO=78;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=47;FWDB=-0.0270192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.117;QD=10.6266;RBI=0.0389965;REFB=-0.0226654;REVB=-0.0281192;RO=78;SAF=15;SAR=25;SRF=31;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271657;STB=0.515687;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0515848;OID=.;OPOS=26200518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:78:78:40:40:0.338983:25:15:31:47:25:15:31:47
chr6	26200707	.	G	A	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0106907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.249;QD=18.6447;RBI=0.0110641;REFB=0.00405931;REVB=0.00285016;RO=13;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249743;STB=0.514265;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=-0.00269747;OID=.;OPOS=26200707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:5:9:8:5:5:9:8:5
chr6	26205052	.	G	A	483.77	PASS	AF=0.495413;AO=50;DP=108;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=0.0475497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.8135;QD=17.753;RBI=0.0929246;REFB=0.00469978;REVB=0.0798374;RO=58;SAF=30;SAR=20;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0034648;STB=0.541651;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=-0.00340377;OID=.;OPOS=26205052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:109:58:55:50:54:0.495413:20:30:35:23:24:30:35:20
chr6	26205293	.	G	A	57.93	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0134378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.475;QD=13.6311;RBI=0.0134395;REFB=0.031215;REVB=0.000209937;RO=9;SAF=2;SAR=6;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337293;STB=0.519951;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=-0.020589;OID=.;OPOS=26205293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:6:2:2:7:6:2:2:7
chr6	26205500	.	C	T	104.56	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0309337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2475;QD=19.9151;RBI=0.0316303;REFB=0.0172245;REVB=-0.00660168;RO=8;SAF=10;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967732;STB=0.540469;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=-0.00585862;OID=.;OPOS=26205500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:8:9:12:12:0.571429:2:10:6:2:2:10:7:2
chr6	26205604	.	C	T	259.15	PASS	AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.00983743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.09;QD=24.1067;RBI=0.0345077;REFB=-0.00748292;REVB=0.0330758;RO=19;SAF=18;SAR=6;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103677;STB=0.557332;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00655253;OID=.;OPOS=26205604;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:6:18:16:3:6:18:16:3
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chr6	26216584	.	C	T	328.86	PASS	AF=0.479452;AO=33;DP=71;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.00297992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.114;QD=18.0199;RBI=0.0322302;REFB=-0.0118947;REVB=0.0320921;RO=37;SAF=14;SAR=19;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209395;STB=0.619498;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0119462;OID=.;OPOS=26216584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:73:37:38:33:35:0.479452:19:14:24:13:21:14:24:14
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chr6	26299900	.	C	T	688.35	PASS	AF=0.4;AO=77;DP=204;FAO=82;FDP=205;FR=.;FRO=123;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=61;FSRR=62;FWDB=-0.010007;FXX=0.0144224;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5;QD=13.4312;RBI=0.103012;REFB=-0.0133468;REVB=-0.102525;RO=106;SAF=44;SAR=33;SRF=54;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648238;STB=0.539225;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0233492;OID=.;OPOS=26299900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:204:205:106:123:77:82:0.4:33:44:54:52:36:46:61:62
chr6	26305787	.	C	CGGCCACCTCGTCACAT	149.9	PASS	AF=0.283784;AO=21;DP=75;FAO=21;FDP=74;FR=.;FRO=53;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.00434918;FXX=0;HRUN=2;LEN=16;MLLD=374.038;QD=8.1025;RBI=0.0151242;REFB=-0.00384457;REVB=-0.0144854;RO=53;SAF=7;SAR=14;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377796;STB=0.71285;STBP=0.026;TYPE=ins;VARB=0.0102298;OID=.;OPOS=26305788;OREF=-;OALT=GGCCACCTCGTCACAT;OMAPALT=CGGCCACCTCGTCACAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.283784:21:75:21:74:53:7:14:34:19:99:53:7:14:35:18
chr6	26305796	.	C	T	230.95	PASS	AF=0.368421;AO=28;DP=74;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=0.0252795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7932;QD=12.1553;RBI=0.0985513;REFB=-0.023293;REVB=-0.0952539;RO=45;SAF=7;SAR=21;SRF=31;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.463424;STB=0.749821;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0486424;OID=.;OPOS=26305796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:45:48:28:28:0.368421:21:7:31:14:21:7:31:17
chr6	26305801	.	C	G	271.69	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=0.059412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.001;QD=14.6859;RBI=0.0604184;REFB=-0.0279017;REVB=0.0109819;RO=43;SAF=7;SAR=24;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.465664;STB=0.764429;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0197328;OID=.;OPOS=26305801;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:24:7:29:14:24:7:29:14
chr6	26313362	.	T	C	119.35	PASS	AF=0.388889;AO=13;DP=35;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00304389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.009;QD=13.2615;RBI=0.0425048;REFB=-0.0012625;REVB=0.0423957;RO=22;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124865;STB=0.543937;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.00191128;OID=.;OPOS=26313362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:22:22:13:14:0.388889:5:8:11:11:6:8:11:11
chr6	26327814	.	T	C	512.14	PASS	AF=0.427481;AO=56;DP=131;FAO=56;FDP=131;FR=.;FRO=75;FSAF=40;FSAR=16;FSRF=48;FSRR=27;FWDB=0.0153758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.11;QD=15.6379;RBI=0.015424;REFB=-0.00275487;REVB=0.00121771;RO=75;SAF=40;SAR=16;SRF=48;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886593;STB=0.549854;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.00420308;OID=.;OPOS=26327814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:75:75:56:56:0.427481:16:40:48:27:16:40:48:27
chr6	26328365	.	A	G	413.69	PASS	AF=0.445545;AO=45;DP=100;FAO=45;FDP=101;FR=.;FRO=56;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=41;FSRR=15;FWDB=-0.00198216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.984;QD=16.3839;RBI=0.0380106;REFB=-0.026614;REVB=-0.0379589;RO=55;SAF=32;SAR=13;SRF=41;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419923;STB=0.514357;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0337636;OID=.;OPOS=26328365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:55:56:45:45:0.445545:13:32:41:14:13:32:41:15
chr6	26466225	.	A	C	1524.73	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8756;QD=63.5305;RBI=0.0341218;REFB=0;REVB=-0.0239463;RO=0;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.87392e-06;OID=.;OPOS=26466225;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:44:51:0:0:45:51:0:0
chr6	26501897	.	T	C	1549.22	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.192;QD=63.8853;RBI=0.0169689;REFB=0;REVB=0.0132313;RO=0;SAF=53;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.64248e-05;OID=.;OPOS=26501897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:44:53:0:0:44:53:0:0
chr6	26505362	.	G	A	867.17	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.120074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2669;QD=57.8116;RBI=0.124158;REFB=0;REVB=-0.0315814;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011903;OID=.;OPOS=26505362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:58:60:1:36:22:0:0:36:24:0:0
chr6	26505403	.	C	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00731509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.787;QD=61.3358;RBI=0.019151;REFB=0;REVB=0.0176989;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.59294e-05;OID=.;OPOS=26505403;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:26:14:0:0:26:14:0:0
chr6	26509330	.	C	G	785.16	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7265;QD=57.1023;RBI=0.0488749;REFB=0;REVB=0.023699;RO=0;SAF=20;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000669588;OID=.;OPOS=26509330;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:35:20:0:0:35:20:0:0
chr6	26521435	.	C	G	1293.38	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00268571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.992;QD=61.5895;RBI=0.0315231;REFB=0;REVB=0.0314085;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22508e-05;OID=.;OPOS=26521435;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:84:0:0:82:84:1:42:40:0:0:43:41:0:0
chr6	26521520	.	T	C	1330.98	PASS	AF=0.977528;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0080664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.518;QD=59.8191;RBI=0.0201075;REFB=-0.182815;REVB=0.0184186;RO=2;SAF=33;SAR=54;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017225;STB=0.509089;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00195108;OID=.;OPOS=26521520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:89:89:2:2:87:87:0.977528:54:33:0:2:54:33:0:2
chr6	26538268	.	T	C	483.33	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.151;QD=58.5856;RBI=0.109746;REFB=0;REVB=0.108859;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291107;OID=.;OPOS=26538268;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:16:15:0:0:18:15:0:0
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chr6	26555484	.	A	G	815.07	PASS	AF=0.951613;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0475671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.2411;QD=52.5848;RBI=0.0679613;REFB=-0.0640836;REVB=0.0485397;RO=2;SAF=29;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000524089;STB=0.507656;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00555868;OID=.;OPOS=26555484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:62:62:2:3:59:59:0.951613:30:29:1:1:30:29:1:2
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chr6	26575798	.	CTT	CCT,C,CT	1316.29	PASS	AF=0,0,1;AO=4,13,81;DP=99;FAO=0,0,99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,48;FSAR=0,0,51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.132723,-0.0964543,-0.18959;FXX=0;HRUN=3,3,3;LEN=1,2,1;MLLD=5.73209,8.90825,20.2496;QD=53.1834;RBI=0.139438,0.117857,0.231699;REFB=0,0,0;REVB=-0.0427499,-0.0677257,-0.133192;RO=1;SAF=3,11,34;SAR=1,2,47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.272709,0.17901,0.00996906;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,del;VARB=-0.0323806,0,-0.002845;OID=.,.,.;OPOS=26575799,26575799,26575799;OREF=T,TT,T;OALT=C,-,-;OMAPALT=CCT,C,CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	3/3:0,0,1:4,13,81:99:0,0,99:99:0:0,0,48:0,0,51:0:0:6:1:3,11,34:1,2,47:0:1
chr6	26577326	.	C	A	2159.44	PASS	AF=1;AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.957;QD=63.0493;RBI=0.0610886;REFB=0;REVB=0.057826;RO=0;SAF=74;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.51641e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.86692e-05;OID=.;OPOS=26577326;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:137:137:0:0:137:137:1:63:74:0:0:63:74:0:0
chr6	26577370	.	C	T	2640.31	PASS	AF=1;AO=168;DP=168;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00655656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.322;QD=62.1249;RBI=0.0611348;REFB=0;REVB=0.0607822;RO=0;SAF=92;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02044e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.76172e-05;OID=.;OPOS=26577370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:168:170:0:0:168:170:1:76:92:0:0:76:94:0:0
chr6	26595168	.	T	C	2405.18	PASS	AF=1;AO=149;DP=149;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119449;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.88;QD=61.2786;RBI=0.119539;REFB=0;REVB=0.00464957;RO=0;SAF=88;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.92755e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000662642;OID=.;OPOS=26595168;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:149:157:0:0:149:157:1:61:88:0:0:61:96:0:0
chr6	26597333	.	A	G	1320.93	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00427571;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.741;QD=62.1614;RBI=0.0186634;REFB=0;REVB=0.0181671;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.32331e-05;OID=.;OPOS=26597333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:44:41:0:0:44:41:0:0
chr6	26598188	.	A	G	1484.19	PASS	AF=1;AO=79;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343819;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=74.688;QD=59.9671;RBI=0.117351;REFB=-0.0268765;REVB=0.112201;RO=0;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181953;OID=.;OPOS=26598188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:98:99:0:0:79:99:1:34:45:0:0:43:56:0:0
chr6	26745250	.	A	G	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4659;QD=37.4873;RBI=0.0745562;REFB=0;REVB=0.0649493;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0047325;OID=.;OPOS=26745250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr6	26745257	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.652;QD=37.4885;RBI=0.013807;REFB=0;REVB=-0.00921277;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.21474e-05;OID=.;OPOS=26745257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr6	26745260	.	A	G	62.27	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.525;QD=35.5802;RBI=0.0574887;REFB=0;REVB=0.053044;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125279;OID=.;OPOS=26745260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:1:5:0:0:2:5:0:0
chr6	26745262	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00497573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2509;QD=35.5759;RBI=0.0726446;REFB=0;REVB=0.072474;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00498349;OID=.;OPOS=26745262;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr6	26745286	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.681;QD=45.8068;RBI=0.0260663;REFB=0;REVB=0.00696329;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042903;OID=.;OPOS=26745286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr6	26758631	.	AT	GC	97.88	PASS	AF=1;AO=9;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0724309;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=170.907;QD=39.1502;RBI=0.074135;REFB=0;REVB=0.015804;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.00045994;OID=.;OPOS=26758631;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:9:10:1:5:4:0:0:5:5:0:0
chr6	26758634	.	ATGC	TCAA	79.23	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212072;FXX=0.110988;HRUN=2;LEN=4;MLLD=236.497;QD=39.6144;RBI=0.0589963;REFB=0;REVB=0.0550529;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000546908;OID=.;OPOS=26758634;OREF=ATGC;OALT=TCAA;OMAPALT=TCAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
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chr6	27181610	.	G	A	191.38	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.068016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.435;QD=47.8456;RBI=0.0810234;REFB=0;REVB=0.0440297;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015924;OID=.;OPOS=27181610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:16:0:0:14:16:1:7:7:0:0:8:8:0:0
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chr6	27277402	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.883;QD=59.4356;RBI=0.0254607;REFB=0;REVB=0.0121728;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.49718e-05;OID=.;OPOS=27277402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr6	27279852	.	T	C	704.72	PASS	AF=1;AO=43;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00336325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.235;QD=62.6414;RBI=0.0459952;REFB=0;REVB=0.0458721;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000959688;OID=.;OPOS=27279852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:43:45:1:15:28:0:0:17:28:0:0
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chr6	27573463	.	G	A	162.29	PASS	AF=0.377358;AO=18;DP=51;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.000557424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.338;QD=12.2486;RBI=0.0150877;REFB=-0.0277686;REVB=-0.0150774;RO=33;SAF=10;SAR=8;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111228;STB=0.559263;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0509296;OID=.;OPOS=27573463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:53:33:33:18:20:0.377358:8:10:15:18:9:11:15:18
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chr6	28359170	.	A	G	301.52	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.00751613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.137;QD=16.751;RBI=0.013452;REFB=-0.00702867;REVB=-0.0111564;RO=38;SAF=15;SAR=18;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143023;STB=0.586414;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00840161;OID=.;OPOS=28359170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:38:39:33:33:0.458333:18:15:23:15:18:15:24:15
chr6	28359186	.	C	T	289.16	PASS	AF=0.457143;AO=31;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.00302175;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1447;QD=16.5231;RBI=0.00770601;REFB=-0.0257351;REVB=-0.00708884;RO=39;SAF=15;SAR=16;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104359;STB=0.573667;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0239724;OID=.;OPOS=28359186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:39:38:31:32:0.457143:16:15:23:16:17:15:23:15
chr6	28483482	.	A	C	1145.14	PASS	AF=0.974684;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0195485;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=242.158;QD=57.9817;RBI=0.0212116;REFB=-0.0460947;REVB=0.00823357;RO=2;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248932;STB=0.513155;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.000165123;OID=.;OPOS=28483482;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:79:79:2:2:77:77:0.974684:37:40:0:2:37:40:0:2
chr6	28542424	.	G	A	582.09	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373155;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1436;QD=61.2724;RBI=0.0385562;REFB=0;REVB=0.00970233;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00110157;OID=.;OPOS=28542424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:17:19:0:0:19:19:0:0
chr6	28542520	.	C	T	1452.55	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.501;QD=63.1545;RBI=0.0315957;REFB=0;REVB=0.0192445;RO=0;SAF=51;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000387483;OID=.;OPOS=28542520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:88:92:0:0:88:92:1:37:51:0:0:37:55:0:0
chr6	28601934	.	A	T	738.13	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0268285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9171;QD=54.6766;RBI=0.0529973;REFB=-0.171213;REVB=0.045705;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00231424;OID=.;OPOS=28601934;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:54:54:0:1:52:53:0.981481:25:27:0:0:25:28:0:1
chr6	28616066	.	T	A	983.57	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.911;QD=58.7206;RBI=0.0658196;REFB=0;REVB=0.0633858;RO=0;SAF=37;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114892;OID=.;OPOS=28616066;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:29:37:0:0:30:37:0:0
chr6	28626098	.	G	A,T	758.38	PASS	AF=0.94,0.04;AO=46,2;DP=49;FAO=47,2;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=21,0;FSAR=26,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00473825,-0.0721119;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=99.1881,116.837;QD=60.6701;RBI=0.00597003,0.0722256;REFB=-0.0300022,-0.0901438;REVB=-0.00363184,-0.00405251;RO=1;SAF=20,0;SAR=26,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0177403,0;STB=0.50943,0.5;STBP=0.517,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00233323,0.00397454;OID=.,.;OPOS=28626098,28626098;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:49:50:1:1:46,2:47,2:0.94,0.04:26,2:20,0:0:1:26,2:21,0:0:1
chr6	28641689	.	A	G	465.11	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2734;QD=58.1383;RBI=0.0477656;REFB=0;REVB=-0.00566081;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000419623;OID=.;OPOS=28641689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:11:21:0:0:11:21:0:0
chr6	28663716	.	A	G	805.13	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.5395;QD=64.4101;RBI=0.0424936;REFB=0;REVB=-0.0323202;RO=0;SAF=36;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000331687;OID=.;OPOS=28663716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:14:36:0:0:14:36:0:0
chr6	28663754	.	T	C	919.88	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1988;QD=58.4053;RBI=0.0150084;REFB=0;REVB=0.000280843;RO=0;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.15063e-05;OID=.;OPOS=28663754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:27:36:0:0:27:36:0:0
chr6	28678357	.	T	C	575.75	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.482;QD=60.6054;RBI=0.0251985;REFB=0;REVB=0.0227133;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118953;OID=.;OPOS=28678357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:13:25:0:0:13:25:0:0
chr6	28687468	.	AGGCT	AAGCT,AGCT,AGCTA	524.99	PASS	AF=0.5,0.5,0;AO=20,13,2;DP=37;FAO=19,19,0;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=11,8,0;FSAR=8,11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0851251,-0.11049,-0.0644805;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=1,1,3;MLLD=21.8851,22.1336,4.31205;QD=55.2624;RBI=0.0858213,0.113634,0.101573;REFB=0,0,0;REVB=-0.0109093,0.0265455,-0.0784813;RO=0;SAF=12,6,0;SAR=8,7,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.0304872,0.00254664,0;OID=.,.,.;OPOS=28687469,28687469,28687470;OREF=G,G,GCT;OALT=A,-,CTA;OMAPALT=AAGCT,AGCT,AGCTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.5,0.5,0:20,13,2:37:19,19,0:38:0:11,8,0:8,11,0:0:0:59:0:12,6,0:8,7,2:0:0
chr6	28687542	.	T	C	508.14	PASS	AF=0.972222;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00593906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.743;QD=56.4598;RBI=0.0267322;REFB=-0.0121205;REVB=-0.0260641;RO=1;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252651;STB=0.512813;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=3.20292e-05;OID=.;OPOS=28687542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:36:1:1:34:35:0.972222:18:16:0:1:19:16:0:1
chr6	28703244	.	T	C	1212.84	PASS	AF=0.975904;AO=79;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0247171;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.004;QD=58.45;RBI=0.0440809;REFB=0.0312152;REVB=0.0364991;RO=2;SAF=52;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178592;STB=0.509089;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=-0.000412539;OID=.;OPOS=28703244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:83:83:2:2:79:81:0.975904:27:52:2:0:27:54:2:0
chr6	28703281	.	T	C	1080.52	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.658;QD=60.0287;RBI=0.0319811;REFB=0;REVB=0.00472165;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.18392e-05;OID=.;OPOS=28703281;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:70:72:1:30:40:0:0:30:42:0:0
chr6	28715604	.	G	C	1590.61	PASS	AF=0.990741;AO=104;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0585261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2071;QD=58.9114;RBI=0.0585261;REFB=-0.02308;REVB=-2.31446e-05;RO=1;SAF=43;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0077163;STB=0.503875;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.00022058;OID=.;OPOS=28715604;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:108:108:1:1:104:107:0.990741:61:43:0:1:64:43:0:1
chr6	28758580	.	TTTG	T	455.7	PASS	AF=0.88;AO=39;DP=45;FAO=44;FDP=50;FR=.;FRO=6;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0197798;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=3;MLLD=235.589;QD=36.4558;RBI=0.0343396;REFB=-0.0214327;REVB=0.0280708;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00214281;OID=.;OPOS=28758581;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.88:39:45:44:50:6:22:22:3:3:16:0:21:18:0:0
chr6	28770596	.	A	AC	498.37	PASS	AF=1;AO=42;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0988865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.6356;QD=44.2998;RBI=0.110254;REFB=0;REVB=-0.0487597;RO=3;SAF=14;SAR=28;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460241;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00149651;OID=.;OPOS=28770597;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:42:46:45:45:0:17:28:0:0:9:3:14:28:2:1
chr6	28775664	.	C	T	1339.77	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100066;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.114;QD=62.3147;RBI=0.0369395;REFB=0;REVB=0.0355583;RO=0;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.70357e-05;OID=.;OPOS=28775664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:41:45:0:0:41:45:0:0
chr6	28779933	.	G	A	962.19	PASS	AF=1;AO=64;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00645336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.013;QD=58.3145;RBI=0.0219862;REFB=0;REVB=0.0210178;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.4353e-05;OID=.;OPOS=28779933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:64:66:1:27:37:0:0:27:39:0:0
chr6	28785085	.	C	T	708.92	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.192;QD=63.0148;RBI=0.0528006;REFB=0;REVB=0.0240733;RO=0;SAF=32;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183605;OID=.;OPOS=28785085;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:12:32:0:0:13:32:0:0
chr6	28791134	.	G	A	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.866;QD=62.022;RBI=0.0404212;REFB=0;REVB=0.0385318;RO=0;SAF=12;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141661;OID=.;OPOS=28791134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:30:12:0:0:30:12:0:0
chr6	28791146	.	T	TC	326.93	PASS	AF=1;AO=5;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00802964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.125;QD=29.7213;RBI=0.0612339;REFB=0;REVB=-0.0607051;RO=39;SAF=1;SAR=4;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12426;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000255577;OID=.;OPOS=28791147;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:44:44:44:0:12:32:0:0:7:39:1:4:11:28
chr6	28791150	.	A	C	604.34	PASS	AF=0.893617;AO=42;DP=47;FAO=42;FDP=47;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.000161152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.599;QD=51.4334;RBI=0.0247512;REFB=0.0101601;REVB=0.0247506;RO=5;SAF=14;SAR=28;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767844;STB=0.540965;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.0244495;OID=.;OPOS=28791150;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:47:47:5:5:42:42:0.893617:28:14:0:5:28:14:0:5
chr6	28806218	.	G	A,GAA	145.27	PASS	AF=0.8,0.133333;AO=12,2;DP=15;FAO=12,2;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=6,2;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0108559,-0.0769139;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=113.823,14.917;QD=38.7389;RBI=0.0108991,0.0890164;REFB=-0.0474572,-0.160994;REVB=-0.000969701,0.0448125;RO=1;SAF=6,2;SAR=6,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.069361,0.697199;STB=0.538398,0.993266;STBP=0.538,0.227;TYPE=snp,ins;VARB=0.0184985,0.137153;OID=.,.;OPOS=28806218,28806219;OREF=G,-;OALT=A,AA;OMAPALT=A,GAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:15:15:1:1:12,2:12,2:0.8,0.133333:6,0:6,2:0:1:6,0:6,2:0:1
chr6	28849157	.	T	C	1845.3	PASS	AF=0.992;AO=121;DP=125;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0105017;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1281;QD=59.0495;RBI=0.0140225;REFB=-0.100521;REVB=-0.0092922;RO=0;SAF=65;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504201;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00354656;OID=.;OPOS=28849157;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:125:125:0:1:121:124:0.992:56:65:0:0:59:65:0:1
chr6	28911802	.	G	A	1008.34	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.4719;QD=59.3141;RBI=0.0653375;REFB=0;REVB=0.0454582;RO=1;SAF=46;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021968;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000841969;OID=.;OPOS=28911802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:1:0:67:68:1:21:46:0:1:22:46:0:0
chr6	28912076	.	C	T	1198.37	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00154865;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.8;QD=59.9186;RBI=0.0350659;REFB=-0.117926;REVB=0.0350317;RO=0;SAF=32;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45895e-08;STB=0.50769;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000250516;OID=.;OPOS=28912076;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:80:0:1:79:79:0.9875:47:32:0:0:47:32:1:0
chr6	28945522	.	C	T	1637.68	PASS	AF=0.973684;AO=111;DP=115;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0379441;FXX=0.0086949;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.315;QD=57.4624;RBI=0.0381161;REFB=-0.0273507;REVB=0.00361666;RO=2;SAF=61;SAR=50;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186089;STB=0.505739;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.000279436;OID=.;OPOS=28945522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:115:114:2:3:111:111:0.973684:50:61:0:2:50:61:1:2
chr6	28949971	.	C	T	190.04	PASS	AF=0.308642;AO=25;DP=81;FAO=25;FDP=81;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=39;FSRR=17;FWDB=-0.0182932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.585;QD=9.38451;RBI=0.0281777;REFB=-0.00977205;REVB=-0.0214323;RO=54;SAF=17;SAR=8;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00694902;STB=0.513163;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0366803;OID=.;OPOS=28949971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:54:56:25:25:0.308642:8:17:37:17:8:17:39:17
chr6	28963248	.	T	G	3210.64	PASS	AF=1;AO=199;DP=200;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00136398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.6429;QD=64.2128;RBI=0.0295861;REFB=0;REVB=0.0295546;RO=0;SAF=117;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.4117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75709e-05;OID=.;OPOS=28963248;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:200:200:0:0:199:200:1:82:117:0:0:83:117:0:0
chr6	29012067	.	C	T	1855.82	PASS	AF=0.954198;AO=126;DP=131;FAO=125;FDP=131;FR=.;FRO=6;FSAF=72;FSAR=53;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0557952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2884;QD=56.6662;RBI=0.101106;REFB=0.0211508;REVB=-0.084317;RO=5;SAF=73;SAR=53;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164444;STB=0.512107;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=-0.00898033;OID=.;OPOS=29012067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:131:131:5:6:126:125:0.954198:53:73:4:1:53:72:5:1
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chr6	29523952	.	A	G	825.3	PASS	AF=0.418182;AO=92;DP=220;FAO=92;FDP=220;FR=.;FRO=128;FSAF=62;FSAR=30;FSRF=55;FSRR=73;FWDB=0.00479443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8693;QD=15.0055;RBI=0.0417217;REFB=-0.0257175;REVB=0.0414453;RO=127;SAF=62;SAR=30;SRF=54;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263186;STB=0.645279;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0324857;OID=.;OPOS=29523952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:220:220:127:128:92:92:0.418182:30:62:54:73:30:62:55:73
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chr6	29718220	.	G	A	331.42	PASS	AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0591492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4317;QD=18.6713;RBI=0.0721371;REFB=-0.0131728;REVB=-0.0412933;RO=34;SAF=21;SAR=14;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037648;STB=0.508767;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0263455;OID=.;OPOS=29718220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:34:36:35:35:0.492958:14:21:19:15:14:21:21:15
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chr6	29795993	.	G	A	210.35	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.013465;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.378;QD=18.2913;RBI=0.0165191;REFB=-0.029433;REVB=-0.00956949;RO=24;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114699;STB=0.577093;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0269318;OID=.;OPOS=29795993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:24:25:21:21:0.456522:8:13:12:12:8:13:12:13
chr6	29796369	.	A	T	209.27	PASS	AF=0.351351;AO=26;DP=76;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.016878;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8975;QD=11.3121;RBI=0.048865;REFB=0.0074829;REVB=-0.0458576;RO=48;SAF=16;SAR=10;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013194;STB=0.507653;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=-0.0181857;OID=.;OPOS=29796369;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:74:48:48:26:26:0.351351:10:16:29:19:10:16:29:19
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chr6	29855849	.	A	C	133.22	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.00894717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.626;QD=15.6733;RBI=0.0279564;REFB=-0.018797;REVB=0.026486;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310618;STB=0.676712;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0183093;OID=.;OPOS=29855849;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:8:7:15:4:8:7:15:4
chr6	29855858	.	C	A	108.0	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=-0.0244253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.973;QD=13.0911;RBI=0.0251542;REFB=-0.00395418;REVB=0.00601133;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33022;STB=0.699733;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0145123;OID=.;OPOS=29855858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:20:13:13:0.393939:7:6:15:4:7:6:16:4
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chr6	29856546	.	G	T	219.85	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0102499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.532;QD=17.5877;RBI=0.0476852;REFB=-0.00528111;REVB=0.0465706;RO=27;SAF=17;SAR=5;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174197;STB=0.592932;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00614735;OID=.;OPOS=29856546;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:28:22:22:0.44:5:17:17:10:5:17:18:10
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chr6	29911239	.	TT	CA	220.44	PASS	AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.011801;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=127.408;QD=24.493;RBI=0.0334709;REFB=-0.0260613;REVB=-0.0313215;RO=15;SAF=10;SAR=11;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426929;STB=0.523787;STBP=0.759;TYPE=mnp;VARB=0.0153941;OID=.;OPOS=29911239;OREF=TT;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:11:10:8:7:11:10:8:7
chr6	29911256	.	T	G	516.03	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.617;QD=58.9751;RBI=0.0380282;REFB=0;REVB=0.00339627;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132263;OID=.;OPOS=29911256;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:18:16:0:0:18:17:0:0
chr6	29911260	.	AC	CG	85.43	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0291776;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=2;MLLD=221.315;QD=10.3555;RBI=0.0300534;REFB=-0.0151522;REVB=-0.00720208;RO=21;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177334;STB=0.621998;STBP=0.339;TYPE=mnp;VARB=0.0189099;OID=.;OPOS=29911260;OREF=AC;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:33:33:21:22:11:11:0.333333:7:4:11:10:7:4:12:10
chr6	29911296	.	G	A	63.35	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0202339;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.403;QD=8.73756;RBI=0.0320267;REFB=-0.00898131;REVB=-0.0248253;RO=20;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244737;STB=0.650823;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0202657;OID=.;OPOS=29911296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:3:6:9:11:3:6:9:11
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chr6	29911319	.	G	T	72.69	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0162811;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.105;QD=8.81105;RBI=0.0240405;REFB=-0.0228052;REVB=0.0176882;RO=23;SAF=7;SAR=3;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259722;STB=0.660047;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0597871;OID=.;OPOS=29911319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:3:7:11:12:3:7:11:12
chr6	29912368	.	C	T	55.05	PASS	AF=0.166667;AO=9;DP=54;FAO=9;FDP=54;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=32;FSRR=13;FWDB=0.00255907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.723;QD=4.07771;RBI=0.0786315;REFB=-0.00611859;REVB=-0.0785898;RO=45;SAF=8;SAR=1;SRF=32;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328029;STB=0.736196;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0247296;OID=.;OPOS=29912368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:54:54:45:45:9:9:0.166667:1:8:32:13:1:8:32:13
chr6	29912398	.	A	G	50.74	PASS	AF=0.152542;AO=9;DP=59;FAO=9;FDP=59;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=37;FSRR=13;FWDB=-0.0165902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.398;QD=3.44021;RBI=0.030858;REFB=-0.00246861;REVB=-0.0260189;RO=50;SAF=8;SAR=1;SRF=37;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289548;STB=0.712796;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0155305;OID=.;OPOS=29912398;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:59:59:50:50:9:9:0.152542:1:8:37:13:1:8:37:13
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chr6	30075843	.	T	C,TC	690.4	PASS	AF=0.977778,0.0222222;AO=33,12;DP=46;FAO=44,1;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=32,1;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459688,0.0141956;FXX=0.0217344;HRUN=7,0;LEN=1,1;MLLD=113.139,101.774;QD=61.3687;RBI=0.0477664,0.020008;REFB=0,0;REVB=-0.0129808,-0.0140998;RO=0;SAF=25,8;SAR=8,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00333268,0.0313098;OID=.,.;OPOS=30075843,30075844;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:46:45:0:0:33,12:44,1:0.977778,0.0222222:8,4:25,8:0:0:12,0:32,1:0:0
chr6	30075864	.	A	G	728.95	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2535;QD=57.1728;RBI=0.0604377;REFB=0;REVB=-0.0587876;RO=0;SAF=38;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000605041;OID=.;OPOS=30075864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:13:38:0:0:13:38:0:0
chr6	30075903	.	C	T	194.02	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.0177843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.46;QD=16.871;RBI=0.0178627;REFB=-0.0156165;REVB=0.00167198;RO=26;SAF=16;SAR=4;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147681;STB=0.585273;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0208533;OID=.;OPOS=30075903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:4:16:18:8:4:16:18:8
chr6	30114845	.	T	C	223.17	PASS	AF=0.433333;AO=24;DP=58;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0304804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.258;QD=14.8778;RBI=0.0308033;REFB=-0.02405;REVB=-0.00444846;RO=34;SAF=11;SAR=13;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126387;STB=0.527323;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0304875;OID=.;OPOS=30114845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:34:34:24:26:0.433333:13:11:16:18:15:11:16:18
chr6	30114955	.	C	T	196.23	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.00515178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.91;QD=13.7703;RBI=0.0109621;REFB=-0.00844913;REVB=-0.00967612;RO=33;SAF=10;SAR=12;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231259;STB=0.631291;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0148588;OID=.;OPOS=30114955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:33:22:22:0.385965:12:10:8:25:12:10:8:25
chr6	30115542	.	G	A	148.58	PASS	AF=0.345455;AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=-0.0778246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5298;QD=10.8054;RBI=0.0911283;REFB=0.0143612;REVB=-0.0474099;RO=36;SAF=17;SAR=2;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254776;STB=0.653652;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=-0.0312972;OID=.;OPOS=30115542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:36:36:19:19:0.345455:2:17:28:8:2:17:28:8
chr6	30121460	.	C	T	225.84	PASS	AF=0.283186;AO=32;DP=113;FAO=32;FDP=113;FR=.;FRO=81;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=45;FSRR=36;FWDB=-0.0257933;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.908;QD=7.99449;RBI=0.0262354;REFB=-0.00112932;REVB=0.00479623;RO=81;SAF=16;SAR=16;SRF=45;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067226;STB=0.539798;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00259464;OID=.;OPOS=30121460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:81:81:32:32:0.283186:16:16:45:36:16:16:45:36
chr6	30121821	.	A	G	605.03	PASS	AF=0.488189;AO=60;DP=125;FAO=62;FDP=127;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.0326486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.451;QD=19.0559;RBI=0.0346772;REFB=-0.0297474;REVB=0.0116864;RO=65;SAF=25;SAR=35;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129202;STB=0.560621;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0299362;OID=.;OPOS=30121821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:127:65:65:60:62:0.488189:35:25:36:29:35:27:36:29
chr6	30122154	.	T	C	1016.12	PASS	AF=0.946667;AO=71;DP=75;FAO=71;FDP=75;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=22;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00075602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.56;QD=54.193;RBI=0.0056486;REFB=-0.0211276;REVB=0.00559778;RO=4;SAF=49;SAR=22;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370513;STB=0.519602;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00165203;OID=.;OPOS=30122154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:75:75:4:4:71:71:0.946667:22:49:4:0:22:49:4:0
chr6	30131546	.	A	G	563.67	PASS	AF=0.577778;AO=51;DP=88;FAO=52;FDP=90;FR=.;FRO=38;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0020918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.156;QD=25.0518;RBI=0.0133589;REFB=-0.0228389;REVB=-0.0131941;RO=34;SAF=34;SAR=17;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0630782;STB=0.555534;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0227498;OID=.;OPOS=30131546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:90:34:38:51:52:0.577778:17:34:20:14:17:35:21:17
chr6	30139699	.	G	A	432.62	PASS	AF=0.444444;AO=48;DP=109;FAO=48;FDP=108;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0254855;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.902;QD=16.0229;RBI=0.0269834;REFB=-0.0229984;REVB=0.00886523;RO=60;SAF=17;SAR=31;SRF=33;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198362;STB=0.611152;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0232409;OID=.;OPOS=30139699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:108:60:60:48:48:0.444444:31:17:33:27:31:17:33:27
chr6	30140342	.	T	C	866.24	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.425;QD=57.7495;RBI=0.058737;REFB=0;REVB=0.0543301;RO=0;SAF=39;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118661;OID=.;OPOS=30140342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:21:39:0:0:21:39:0:0
chr6	30154199	.	T	C	149.63	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00900389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.953;QD=11.9706;RBI=0.0177902;REFB=-0.0148922;REVB=-0.0153434;RO=32;SAF=10;SAR=7;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292532;STB=0.528812;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0255023;OID=.;OPOS=30154199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:32:33:17:17:0.34:7:10:18:14:7:10:18:15
chr6	30227583	.	C	G	54.3	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0810423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1808;QD=8.68798;RBI=0.103328;REFB=-0.0134313;REVB=0.0641004;RO=17;SAF=6;SAR=2;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136257;STB=0.585139;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0240957;OID=.;OPOS=30227583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:2:6:11:6:2:6:11:6
chr6	30228230	.	A	C	224.26	PASS	AF=0.478261;AO=21;DP=45;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00461345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.352;QD=19.5005;RBI=0.00702574;REFB=-0.0321424;REVB=-0.00529879;RO=24;SAF=14;SAR=7;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0432487;STB=0.506377;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0353409;OID=.;OPOS=30228230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:24:24:21:22:0.478261:7:14:15:9:8:14:15:9
chr6	30228379	.	A	G	60.96	PASS	AF=0.243243;AO=9;DP=37;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=-0.012989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.871;QD=6.59054;RBI=0.104499;REFB=-0.00317814;REVB=-0.103688;RO=28;SAF=4;SAR=5;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.405318;STB=0.746687;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0122923;OID=.;OPOS=30228379;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:37:37:28:28:9:9:0.243243:5:4:22:6:5:4:22:6
chr6	30229013	.	A	G	64.66	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0253331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.369;QD=10.345;RBI=0.0311833;REFB=-0.0160824;REVB=-0.0181834;RO=16;SAF=5;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00743536;STB=0.504494;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0300214;OID=.;OPOS=30229013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:4:5:9:7:4:5:9:7
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chr6	30711805	.	C	G	596.58	PASS	AF=1;AO=36;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.039;QD=61.1872;RBI=0.0689961;REFB=0;REVB=0.0637123;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.76067e-05;OID=.;OPOS=30711805;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:36:39:1:21:15:0:0:24:15:0:0
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chr6	30782218	.	C	CTGTT	319.2	PASS	AF=0.443038;AO=33;DP=81;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.0299812;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=266.389;QD=16.162;RBI=0.0308952;REFB=-0.0113726;REVB=0.00745937;RO=46;SAF=17;SAR=16;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119369;STB=0.583527;STBP=0.194;TYPE=ins;VARB=0.0145123;OID=.;OPOS=30782219;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=CTGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.443038:33:81:35:79:44:17:18:28:16:99:46:17:16:29:17
chr6	30782235	.	G	A	885.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.023;QD=58.0497;RBI=0.0287358;REFB=0;REVB=0.0100504;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111271;OID=.;OPOS=30782235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:28:32:0:0:29:32:0:0
chr6	30782303	.	C	T	583.9	PASS	AF=1;AO=36;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105901;FXX=0.0731529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.346;QD=61.4627;RBI=0.0285294;REFB=0;REVB=0.0264911;RO=3;SAF=15;SAR=21;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848289;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.60435e-05;OID=.;OPOS=30782303;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:3:0:36:38:1:21:15:3:0:23:15:0:0
chr6	30782323	.	T	C	157.88	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0126023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.233;QD=16.6186;RBI=0.0139416;REFB=-0.0155762;REVB=0.00596232;RO=21;SAF=5;SAR=12;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190792;STB=0.610034;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.020811;OID=.;OPOS=30782323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:12:5:10:11:12:5:10:11
chr6	30782361	.	G	A	183.54	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0153694;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.159;QD=15.9596;RBI=0.0156633;REFB=-0.00998603;REVB=0.00302026;RO=26;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512182;STB=0.53913;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0125929;OID=.;OPOS=30782361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:26:27:19:19:0.413043:9:10:15:11:9:10:16:11
chr6	30782407	.	A	G	922.58	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352699;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.854;QD=58.5763;RBI=0.0520074;REFB=0;REVB=0.0382205;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.14868e-05;OID=.;OPOS=30782407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0
chr6	30857072	.	G	C	754.6	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00114655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3301;QD=54.8799;RBI=0.00117263;REFB=-0.092673;REVB=-0.00024592;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000930833;OID=.;OPOS=30857072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:0:1:54:54:0.981818:24:30:0:0:24:30:0:1
chr6	30858857	.	C	T	1932.17	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.27;QD=61.8295;RBI=0.0282877;REFB=0;REVB=0.0186412;RO=0;SAF=73;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.26923e-06;OID=.;OPOS=30858857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:52:73:0:0:52:73:0:0
chr6	30864829	.	T	C	1358.53	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00991279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.738;QD=62.4613;RBI=0.0488876;REFB=0;REVB=0.0478721;RO=0;SAF=47;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171776;OID=.;OPOS=30864829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:39:47:0:0:40:47:0:0
chr6	30865204	.	A	C	191.87	PASS	AF=0.320513;AO=26;DP=78;FAO=25;FDP=78;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=1;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0279572;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9624;QD=9.83922;RBI=0.0668476;REFB=0.00705352;REVB=0.0607206;RO=52;SAF=24;SAR=2;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.616203;STB=0.93032;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00829344;OID=.;OPOS=30865204;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:52:53:26:25:0.320513:2:24:26:26:1:24:26:27
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chr6	30877760	.	A	C	990.34	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101073;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.829;QD=59.1247;RBI=0.0179136;REFB=0;REVB=0.0178851;RO=0;SAF=46;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.3814e-07;OID=.;OPOS=30877760;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:20:46:0:0:21:46:0:0
chr6	30882203	.	T	C	101.89	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8122;QD=40.7581;RBI=0.0452252;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=10;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00239194;OID=.;OPOS=30882203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:0:10:0:0:0:10:0:0
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chr6	30888161	.	T	C,G	1073.21	PASS	AF=0.972603,0.0273973;AO=69,3;DP=72;FAO=71,2;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34,1;FSAR=37,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239703,0.00371664;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=78.1319,119.79;QD=58.8061;RBI=0.0245672,0.00422084;REFB=0,0;REVB=0.00538237,-0.00200052;RO=0;SAF=33,2;SAR=36,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.36169e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00680306,0.104668;OID=.,.;OPOS=30888161,30888161;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:72:73:0:0:69,3:71,2:0.972603,0.0273973:36,1:33,2:0:0:37,1:34,1:0:0
chr6	30888502	.	G	A	92.0	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.038106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.7402;QD=11.5002;RBI=0.0758266;REFB=-0.0284759;REVB=-0.0655562;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167492;STB=0.613216;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0520752;OID=.;OPOS=30888502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:32:32:19:20:12:12:0.375:5:7:8:11:5:7:8:12
chr6	30889389	.	T	C	706.61	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00528356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0914;QD=62.8096;RBI=0.0324065;REFB=0;REVB=0.0319729;RO=0;SAF=31;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417176;OID=.;OPOS=30889389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:14:31:0:0:14:31:0:0
chr6	30893127	.	G	A	730.79	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0893789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0765;QD=56.2145;RBI=0.0917858;REFB=0;REVB=0.0208815;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00262658;OID=.;OPOS=30893127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:31:20:0:0:31:21:0:0
chr6	30893728	.	C	T	1419.29	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0905799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6104;QD=61.7084;RBI=0.110424;REFB=-0.127487;REVB=0.0631566;RO=0;SAF=40;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00237559;OID=.;OPOS=30893728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:0:1:91:91:0.98913:51:40:0:0:51:40:0:1
chr6	30899571	.	C	T	359.24	PASS	AF=0.66;AO=33;DP=51;FAO=33;FDP=50;FR=.;FRO=17;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.020844;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.3003;QD=28.7392;RBI=0.0211011;REFB=-0.021206;REVB=0.00328346;RO=17;SAF=23;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0772254;STB=0.542276;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0163066;OID=.;OPOS=30899571;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:17:17:33:33:0.66:10:23:10:7:10:23:10:7
chr6	30900399	.	C	G	375.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0779;QD=55.6621;RBI=0.069997;REFB=0;REVB=0.0687001;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000804908;OID=.;OPOS=30900399;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:25:27:1:12:13:0:0:13:14:0:0
chr6	30900427	.	TAGA	GAGA,T	435.74	PASS	AF=0.258065,0.741935;AO=8,23;DP=32;FAO=8,23;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=6,7;FSAR=2,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024175,0.0503019;FXX=0.0605877;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=85.2939,135.229;QD=56.2241;RBI=0.026825,0.0856718;REFB=0,0;REVB=0.0116254,0.0693497;RO=0;SAF=6,7;SAR=2,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=5.58669e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=-0.00403994,-0.00824819;OID=.,.;OPOS=30900427,30900428;OREF=T,AGA;OALT=G,-;OMAPALT=GAGA,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:54:32:31:0:0:8,23:8,23:0.258065,0.741935:2,16:6,7:0:0:2,16:6,7:0:0
chr6	30900435	.	G	T	60.25	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0277286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4648;QD=6.02526;RBI=0.0406202;REFB=-0.0205772;REVB=0.0296838;RO=31;SAF=6;SAR=3;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32821;STB=0.709231;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0412164;OID=.;OPOS=30900435;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:31:31:9:9:0.225:3:6:12:19:3:6:12:19
chr6	30954245	.	T	C	31.0	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.012851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.83;QD=12.3995;RBI=0.0384629;REFB=-0.0004653;REVB=-0.0362526;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162496;STB=0.599599;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.00263205;OID=.;OPOS=30954245;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:3:2:3:2:3:2:3:2
chr6	30955182	.	C	T	31.6	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.058446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.9375;QD=14.0433;RBI=0.102985;REFB=-0.0521398;REVB=0.0847941;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268008;STB=0.665923;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.105849;OID=.;OPOS=30955182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:4:1:2:2:4:1:2:2
chr6	30955201	.	GC	AT	71.63	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.000685686;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=179.596;QD=19.1009;RBI=0.0481078;REFB=-0.0184957;REVB=-0.0481029;RO=5;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157607;STB=0.545355;STBP=0.695;TYPE=mnp;VARB=0.0234172;OID=.;OPOS=30955201;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:5:6:9:9:0.6:4:5:4:1:4:5:4:2
chr6	30955209	.	T	A	121.94	PASS	AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0301484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2278;QD=25.6711;RBI=0.0592874;REFB=-0.100538;REVB=-0.0510497;RO=6;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306968;STB=0.517215;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0185097;OID=.;OPOS=30955209;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:5:8:4:2:5:8:4:2
chr6	30955211	.	C	T	122.13	PASS	AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00292485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.282;QD=25.711;RBI=0.0511761;REFB=-0.0616199;REVB=0.0510924;RO=6;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306968;STB=0.517215;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0147488;OID=.;OPOS=30955211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:5:8:4:2:5:8:4:2
chr6	30955359	.	G	A	851.73	PASS	AF=0.563291;AO=74;DP=144;FAO=89;FDP=158;FR=.;FRO=69;FSAF=59;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=28;FWDB=0.0184548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2336;QD=21.5627;RBI=0.0716737;REFB=-0.0319063;REVB=0.0692571;RO=67;SAF=45;SAR=29;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0100497;STB=0.532848;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0373218;OID=.;OPOS=30955359;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:158:67:69:74:89:0.563291:29:45:40:27:30:59:41:28
chr6	30955929	.	C	A	634.67	PASS	AF=0.563636;AO=62;DP=110;FAO=62;FDP=110;FR=.;FRO=48;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=0.0160074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.631;QD=23.0787;RBI=0.0170759;REFB=-0.0126359;REVB=0.00594554;RO=48;SAF=39;SAR=23;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144261;STB=0.507884;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0115352;OID=.;OPOS=30955929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:48:48:62:62:0.563636:23:39:31:17:23:39:31:17
chr6	30993377	.	T	A	94.51	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=-0.0350822;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.6326;QD=10.8014;RBI=0.0399792;REFB=-0.0346864;REVB=-0.0191722;RO=23;SAF=10;SAR=2;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141212;STB=0.50846;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.043193;OID=.;OPOS=30993377;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:23:23:12:12:0.342857:2:10:19:4:2:10:19:4
chr6	30993499	.	C	T	73.06	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=4;FWDB=0.0348945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.4928;QD=9.13211;RBI=0.0415273;REFB=-0.0283397;REVB=0.0225142;RO=22;SAF=6;SAR=4;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280965;STB=0.666389;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0429989;OID=.;OPOS=30993499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:4:6:18:4:4:6:18:4
chr6	30993533	.	A	G	211.75	PASS	AF=0.488889;AO=17;DP=41;FAO=22;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=0.00621113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.692;QD=18.8225;RBI=0.0412781;REFB=-0.0427645;REVB=0.0408081;RO=14;SAF=11;SAR=6;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198416;STB=0.590496;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.042519;OID=.;OPOS=30993533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:45:14:23:17:22:0.488889:6:11:12:2:7:15:19:4
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chr6	30993866	.	A	T	65.27	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.037404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6325;QD=10.8782;RBI=0.0386214;REFB=0.00553667;REVB=0.00962035;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750523;STB=0.545351;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=-0.0125146;OID=.;OPOS=30993866;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:3:6:9:6:3:6:9:6
chr6	30993880	.	G	C	55.5	PASS	AF=0.32;AO=9;DP=26;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0428716;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.899;QD=8.8793;RBI=0.082838;REFB=-0.0230504;REVB=-0.0708813;RO=17;SAF=6;SAR=3;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0485249;STB=0.538362;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0548106;OID=.;OPOS=30993880;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:26:25:17:17:9:8:0.32:3:6:12:5:2:6:12:5
chr6	30993958	.	A	G	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00821767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5708;QD=56.1884;RBI=0.00901268;REFB=0;REVB=0.00370113;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.88265e-05;OID=.;OPOS=30993958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:7:21:0:0:7:21:0:0
chr6	30994052	.	A	T	410.69	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.708;QD=56.6472;RBI=0.057912;REFB=0;REVB=0.0473789;RO=0;SAF=23;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132039;OID=.;OPOS=30994052;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:29:0:0:26:29:1:3:23:0:0:5:24:0:0
chr6	30995178	.	C	T	252.62	PASS	AF=0.605263;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=22;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0793418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.557;QD=26.591;RBI=0.102484;REFB=-0.0604032;REVB=0.0648687;RO=14;SAF=22;SAR=1;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.477475;STB=0.768903;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0226945;OID=.;OPOS=30995178;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:14:15:23:23:0.605263:1:22:10:4:1:22:11:4
chr6	30995187	.	T	C	263.72	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0203039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.822;QD=26.3721;RBI=0.0297067;REFB=-0.0437373;REVB=-0.021685;RO=16;SAF=22;SAR=2;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282424;STB=0.659836;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0271345;OID=.;OPOS=30995187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:2:22:12:4:2:22:12:4
chr6	30995297	.	A	G	319.57	PASS	AF=0.581818;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0477925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2979;QD=23.2413;RBI=0.0519267;REFB=-0.0299021;REVB=0.0203042;RO=21;SAF=21;SAR=11;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471532;STB=0.539331;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0201043;OID=.;OPOS=30995297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:21:23:32:32:0.581818:11:21:15:6:11:21:17:6
chr6	30995532	.	T	C	151.96	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0468222;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1286;QD=19.6082;RBI=0.0876794;REFB=-0.0804005;REVB=-0.0741307;RO=14;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129841;STB=0.585672;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.040326;OID=.;OPOS=30995532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:15:16:16:0.516129:7:9:10:4:7:9:11:4
chr6	30996132	.	C	T	83.57	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0227199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0082;QD=20.8932;RBI=0.0332166;REFB=-0.0115903;REVB=0.0242311;RO=6;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109864;STB=0.562382;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.00462312;OID=.;OPOS=30996132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:3:7:5:1:3:7:5:1
chr6	30997078	.	T	C	196.14	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=-0.00861972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.525;QD=25.3081;RBI=0.0515948;REFB=-0.0103189;REVB=0.0508697;RO=10;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349628;STB=0.714088;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0117028;OID=.;OPOS=30997078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:30:31:10:12:19:19:0.612903:11:8:10:0:11:8:12:0
chr6	30997334	.	A	G	178.56	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=0.0326776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2638;QD=22.32;RBI=0.138578;REFB=-0.0549143;REVB=0.134671;RO=14;SAF=14;SAR=4;SRF=14;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304917;STB=0.666527;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.049212;OID=.;OPOS=30997334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:4:14:14:0:4:14:14:0
chr6	30997352	.	A	G	172.64	PASS	AF=0.545455;AO=17;DP=34;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=0.0421179;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.138;QD=20.9256;RBI=0.210084;REFB=-0.065759;REVB=0.205819;RO=15;SAF=13;SAR=4;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33397;STB=0.674275;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0554088;OID=.;OPOS=30997352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:15:15:17:18:0.545455:4:13:15:0:4:14:15:0
chr6	30997692	.	G	C	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.153;QD=53.9096;RBI=0.0573772;REFB=0;REVB=0.0433351;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290043;OID=.;OPOS=30997692;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0
chr6	30997816	.	G	T	133.84	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=48;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=5;FWDB=-0.000207057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.706;QD=10.4974;RBI=0.0986541;REFB=-0.021726;REVB=-0.0986538;RO=32;SAF=9;SAR=5;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285558;STB=0.63064;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0561789;OID=.;OPOS=30997816;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:51:32:34:14:17:0.333333:5:9:27:5:5:12:29:5
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chr6	31079889	.	C	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00675201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.541;QD=43.4862;RBI=0.0544451;REFB=0;REVB=-0.0540248;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000474654;OID=.;OPOS=31079889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0
chr6	31079994	.	C	T	121.52	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0123818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.185;QD=15.1895;RBI=0.0156285;REFB=-0.0339608;REVB=-0.00953621;RO=18;SAF=11;SAR=3;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212814;STB=0.624804;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0489083;OID=.;OPOS=31079994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:3:11:11:7:3:11:11:7
chr6	31080016	.	C	G	161.51	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00977947;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.929;QD=19.0006;RBI=0.0103794;REFB=-0.00848247;REVB=-0.0034775;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021362;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138142;OID=.;OPOS=31080016;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:16:17:0.5:6:10:11:6:6:11:11:6
chr6	31084684	.	G	A	70.58	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0269511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.851;QD=17.6438;RBI=0.0362549;REFB=-0.0108771;REVB=0.02425;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955156;STB=0.555432;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00676352;OID=.;OPOS=31084684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:4:5:3:4:4:5:3:4
chr6	31084792	.	C	T	191.81	PASS	AF=0.575758;AO=15;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00478809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.386;QD=23.2495;RBI=0.0313431;REFB=-0.0330945;REVB=0.0309752;RO=12;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156055;STB=0.588141;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0187017;OID=.;OPOS=31084792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:12:14:15:19:0.575758:8:7:8:4:12:7:8:6
chr6	31097453	.	T	G	394.06	PASS	AF=0.403509;AO=46;DP=114;FAO=46;FDP=114;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=-0.00156827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6945;QD=13.8266;RBI=0.00480602;REFB=-0.0256109;REVB=0.00454295;RO=66;SAF=28;SAR=18;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207781;STB=0.616971;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0565317;OID=.;OPOS=31097453;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:66:68:46:46:0.403509:18:28:27:39:18:28:28:40
chr6	31105891	.	A	G	88.45	PASS	AF=1;AO=7;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.979;QD=39.313;RBI=0.0332861;REFB=0;REVB=0.00168528;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422051;OID=.;OPOS=31105891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:7:9:1:5:2:0:0:5:4:0:0
chr6	31106177	.	T	C	133.83	PASS	AF=0.666667;AO=14;DP=21;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.06967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4808;QD=25.4914;RBI=0.0902809;REFB=-0.0559734;REVB=-0.0574172;RO=7;SAF=3;SAR=11;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603092;STB=0.53393;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0320349;OID=.;OPOS=31106177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:7:7:14:14:0.666667:11:3:2:5:11:3:2:5
chr6	31106268	.	A	G	260.08	PASS	AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0276687;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.394;QD=24.7698;RBI=0.0350039;REFB=0.0177401;REVB=0.0214409;RO=18;SAF=10;SAR=14;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021915;STB=0.512185;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=-0.0116279;OID=.;OPOS=31106268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:14:10:8:10:14:10:8:10
chr6	31106459	.	C	A	169.68	PASS	AF=0.349206;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0156748;FXX=0.0454477;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.2553;QD=10.7734;RBI=0.0218736;REFB=-0.0181173;REVB=0.0152564;RO=41;SAF=13;SAR=9;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00638582;STB=0.503722;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.0518562;OID=.;OPOS=31106459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:63:41:41:22:22:0.349206:9:13:24:17:9:13:24:17
chr6	31110391	.	G	C	336.83	PASS	AF=0.376147;AO=41;DP=109;FAO=41;FDP=109;FR=.;FRO=68;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=-0.0279727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.781;QD=12.3607;RBI=0.0279835;REFB=-0.000523164;REVB=-0.000777428;RO=66;SAF=25;SAR=16;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153192;STB=0.596531;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00104373;OID=.;OPOS=31110391;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:66:68:41:41:0.376147:16:25:31:35:16:25:31:37
chr6	31111180	.	T	C	341.99	PASS	AF=0.507246;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=0.016309;FXX=0.054787;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5907;QD=19.8255;RBI=0.0192408;REFB=-0.0292879;REVB=0.010209;RO=34;SAF=24;SAR=11;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390202;STB=0.521727;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.027622;OID=.;OPOS=31111180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:69:34:34:35:35:0.507246:11:24:22:12:11:24:22:12
chr6	31112484	.	C	T	184.83	PASS	AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.0240604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.741;QD=12.1201;RBI=0.0258063;REFB=-0.0339545;REVB=-0.00933073;RO=37;SAF=16;SAR=7;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044006;STB=0.511026;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.054671;OID=.;OPOS=31112484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:37:38:23:23:0.377049:7:16:27:10:7:16:27:11
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chr6	31237255	.	G	A	154.78	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.0232265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7237;QD=15.4776;RBI=0.0290898;REFB=-0.026157;REVB=-0.0175141;RO=23;SAF=5;SAR=12;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408023;STB=0.523439;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0463464;OID=.;OPOS=31237255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:12:5:6:17:12:5:6:17
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chr6	31237333	.	T	A	107.38	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0107345;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.456;QD=11.6089;RBI=0.0166846;REFB=0.00430884;REVB=-0.0127729;RO=24;SAF=4;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219898;STB=0.631369;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=-0.00816505;OID=.;OPOS=31237333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:24:24:13:13:0.351351:9:4:12:12:9:4:12:12
chr6	31238135	.	G	A	38.12	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00741041;FXX=0.049975;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.215;QD=8.02569;RBI=0.00755354;REFB=-0.0110555;REVB=0.00146345;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210359;STB=0.631171;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0268421;OID=.;OPOS=31238135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:20:19:13:13:6:6:0.315789:3:3:4:9:3:3:4:9
chr6	31238138	.	C	T	45.79	PASS	AF=0.35;AO=6;DP=19;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0117462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=337.223;QD=9.15817;RBI=0.0121285;REFB=-0.00882632;REVB=-0.00302121;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210359;STB=0.666222;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.027758;OID=.;OPOS=31238138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:19:20:13:13:6:7:0.35:3:3:4:9:3:4:4:9
chr6	31238155	.	G	A	56.21	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0717365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4612;QD=11.2428;RBI=0.0720613;REFB=-0.00359942;REVB=0.00683385;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284261;STB=0.670319;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0198279;OID=.;OPOS=31238155;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:3:5:4:8:3:5:4:8
chr6	31238490	.	T	C	143.25	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0048777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8673;QD=14.6918;RBI=0.00770288;REFB=-0.0190467;REVB=0.00596174;RO=23;SAF=10;SAR=6;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297626;STB=0.51722;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0112049;OID=.;OPOS=31238490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:6:10:15:8:6:10:15:8
chr6	31238492	.	C	A	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.00127603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.625;QD=14.262;RBI=0.0278874;REFB=-0.00841212;REVB=-0.0278582;RO=24;SAF=10;SAR=6;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465822;STB=0.526994;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0128804;OID=.;OPOS=31238492;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:6:10:16:8:6:10:16:8
chr6	31238851	.	T	C	44.31	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0228027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.906;QD=6.8174;RBI=0.0406547;REFB=-0.0272875;REVB=-0.0336578;RO=19;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170567;STB=0.60839;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0647275;OID=.;OPOS=31238851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:3:4:8:11:3:4:8:11
chr6	31238942	.	G	A	37.08	PASS	AF=0.230769;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.027389;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0767;QD=5.70478;RBI=0.0286432;REFB=-0.0142023;REVB=0.00838309;RO=19;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167553;STB=0.59427;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0491619;OID=.;OPOS=31238942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:28:26:19:20:6:6:0.230769:4:2:9:10:4:2:9:11
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chr6	31239417	.	C	T	211.75	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0255852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.763;QD=19.6973;RBI=0.0302563;REFB=-0.0273339;REVB=0.0161507;RO=22;SAF=10;SAR=11;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144454;STB=0.581422;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0270165;OID=.;OPOS=31239417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:11:10:14:8:11:10:14:8
chr6	31239501	.	G	T	70.57	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0959231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2494;QD=17.6437;RBI=0.0963937;REFB=-0.0407157;REVB=-0.00951344;RO=7;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123424;STB=0.571275;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0184369;OID=.;OPOS=31239501;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:5:4:2:5:5:4:2:5
chr6	31239518	.	C	T	62.82	PASS	AF=0.666667;AO=7;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0834626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.524;QD=20.9404;RBI=0.0881689;REFB=0.0275927;REVB=0.0284209;RO=4;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290716;STB=0.666295;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-0.001393;OID=.;OPOS=31239518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:12:12:4:4:7:8:0.666667:4:3:0:4:4:4:0:4
chr6	31239577	.	A	C	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0201636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8014;QD=16.199;RBI=0.0211632;REFB=-0.0482484;REVB=0.0064273;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165639;STB=0.599599;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0224007;OID=.;OPOS=31239577;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:1:2:2:3:1:2
chr6	31239776	.	A	C	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.00335585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.913;QD=8.25462;RBI=0.0265195;REFB=-0.00713462;REVB=-0.0263063;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177981;STB=0.610759;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0162737;OID=.;OPOS=31239776;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:3:3:8:4:3:3:8:4
chr6	31239802	.	C	G	73.58	PASS	AF=0.4;AO=9;DP=23;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0353417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2083;QD=11.7721;RBI=0.055909;REFB=-0.0105686;REVB=0.0433218;RO=14;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247851;STB=0.608469;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0378155;OID=.;OPOS=31239802;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:23:25:14:15:9:10:0.4:2:7:8:6:3:7:8:7
chr6	31239821	.	G	T	76.21	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0381839;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.8475;QD=11.2908;RBI=0.053968;REFB=-0.00863894;REVB=0.0381384;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518482;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.00473845;OID=.;OPOS=31239821;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:28:27:16:17:10:10:0.37037:5:5:8:8:5:5:9:8
chr6	31239827	.	C	T	98.42	PASS	AF=0.428571;AO=11;DP=27;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0183311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5843;QD=14.0594;RBI=0.0312019;REFB=-0.00899031;REVB=0.0252494;RO=16;SAF=7;SAR=4;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140607;STB=0.548112;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.00813231;OID=.;OPOS=31239827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:27:28:16:16:11:12:0.428571:4:7:8:8:5:7:8:8
chr6	31322470	.	C	G	391.83	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.948;QD=55.976;RBI=0.0404335;REFB=0;REVB=0.0297563;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.29594e-06;OID=.;OPOS=31322470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:9:18:0:0:10:18:0:0
chr6	31322888	.	A	G	508.91	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430245;FXX=0.0555401;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.744;QD=59.8712;RBI=0.0513616;REFB=0;REVB=0.0280518;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000393167;OID=.;OPOS=31322888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr6	31322911	.	C	T	726.3	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0567208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.124;QD=63.1569;RBI=0.0629943;REFB=0;REVB=0.0274049;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000427214;OID=.;OPOS=31322911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:25:21:0:0:25:21:0:0
chr6	31322980	.	C	T	785.7	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.679;QD=64.1386;RBI=0.0327335;REFB=0;REVB=0.0101171;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.79957e-05;OID=.;OPOS=31322980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr6	31322996	.	C	T	779.34	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1359;QD=63.6196;RBI=0.0202606;REFB=0;REVB=0.0150931;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000697835;OID=.;OPOS=31322996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:47:49:1:19:28:0:0:19:30:0:0
chr6	31323233	.	A	G	152.33	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0126258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.512;QD=21.0103;RBI=0.0140224;REFB=-0.0237012;REVB=-0.00610053;RO=13;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193001;STB=0.510903;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0121755;OID=.;OPOS=31323233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:9:7:6:7:9:7:6:7
chr6	31323296	.	A	G	319.62	PASS	AF=0.961538;AO=24;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0308264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.56;QD=49.1719;RBI=0.0320377;REFB=0.0345948;REVB=0.00872625;RO=1;SAF=13;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343222;STB=0.517228;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-4.27024e-05;OID=.;OPOS=31323296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:26:26:1:1:24:25:0.961538:11:13:1:0:11:14:1:0
chr6	31323337	.	T	C	109.25	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00917529;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.34;QD=21.8494;RBI=0.0127653;REFB=-0.0271031;REVB=0.00887512;RO=6;SAF=6;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984044;STB=0.549917;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0156002;OID=.;OPOS=31323337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:20:20:6:8:12:12:0.6:6:6:2:4:6:6:3:5
chr6	31323945	.	A	C	239.4	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0462757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.583;QD=50.4009;RBI=0.059303;REFB=0;REVB=-0.0370865;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000855698;OID=.;OPOS=31323945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr6	31323953	.	C	G	214.32	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0433909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.228;QD=45.1196;RBI=0.0516095;REFB=-0.0844703;REVB=0.0279423;RO=1;SAF=12;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367456;STB=0.519978;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00389222;OID=.;OPOS=31323953;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:6:12:1:0:6:12:1:0
chr6	31323958	.	T	G	223.17	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.579;QD=49.593;RBI=0.0453105;REFB=0;REVB=0.0417839;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000617269;OID=.;OPOS=31323958;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr6	31323960	.	G	C	219.47	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00337216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.51;QD=48.7723;RBI=0.06045;REFB=0;REVB=0.0603558;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000663576;OID=.;OPOS=31323960;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr6	31324003	.	TC	AG	154.87	PASS	AF=1;AO=13;DP=15;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00312242;FXX=0.133244;HRUN=1;LEN=2;MLLD=190.272;QD=47.6511;RBI=0.03573;REFB=0;REVB=0.0355933;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0013096;OID=.;OPOS=31324003;OREF=TC;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:15:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
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chr6	31324895	.	G	C	32.39	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0364969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3207;QD=16.1972;RBI=0.143843;REFB=0.0518442;REVB=-0.139136;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361596;STB=0.713517;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=-0.0392534;OID=.;OPOS=31324895;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:3:2:3:0:3:2:3:0
chr6	31371430	.	T	C	490.1	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.107492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.5672;QD=56.0111;RBI=0.120499;REFB=0.0775517;REVB=-0.0544562;RO=1;SAF=18;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252651;STB=0.513506;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.00643172;OID=.;OPOS=31371430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:16:18:1:0:16:18:1:0
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chr6	31378425	.	A	G	227.28	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.0114841;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.399;QD=18.1822;RBI=0.0115187;REFB=-0.0157316;REVB=-0.000891989;RO=26;SAF=9;SAR=15;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286288;STB=0.516116;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0154897;OID=.;OPOS=31378425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:26:26:24:24:0.48:15:9:9:17:15:9:9:17
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chr6	31379931	.	G	A	123.66	PASS	AF=0.272727;AO=18;DP=66;FAO=18;FDP=66;FR=.;FRO=48;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=-0.0337414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.515;QD=7.49423;RBI=0.0338368;REFB=-0.023474;REVB=-0.00253932;RO=48;SAF=4;SAR=14;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110375;STB=0.567488;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0439441;OID=.;OPOS=31379931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:48:48:18:18:0.272727:14:4:14:34:14:4:14:34
chr6	31380160	.	TG	T,TGCTGCTGCTGCT	316.88	PASS	AF=0.88,0.12;AO=22,3;DP=28;FAO=22,3;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10,1;FSAR=12,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0724705,-0.0267644;FXX=0.107105;HRUN=2,1;LEN=1,11;MLLD=23.834,215.741;QD=50.7001;RBI=0.0724891,0.0611088;REFB=0,0;REVB=-0.0016438,-0.0549359;RO=0;SAF=10,1;SAR=12,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,ins;VARB=0.00896702,0.0472021;OID=.,.;OPOS=31380161,31380162;OREF=G,-;OALT=-,CTGCTGCTGCT;OMAPALT=T,TGCTGCTGCTGCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.88,0.12:22,3:28:22,3:25:0:10,1:12,2:0:0:15:0:10,1:12,2:0:0
chr6	31380194	.	T	C	55.41	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.00446801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.226;QD=10.0752;RBI=0.0216394;REFB=-0.0115502;REVB=0.0211731;RO=14;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0479673;STB=0.529336;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0213599;OID=.;OPOS=31380194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:6:2:4:10:6:2:4:10
chr6	31380198	.	C	T	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0134373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.525;QD=8.69805;RBI=0.0182504;REFB=-0.00951089;REVB=-0.0123498;RO=14;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.01907;OID=.;OPOS=31380198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:5:2:4:10:5:2:4:10
chr6	31382882	.	C	A	380.83	PASS	AF=0.5;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0393044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.306;QD=19.5296;RBI=0.0432755;REFB=-0.0141462;REVB=0.018109;RO=38;SAF=22;SAR=17;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807432;STB=0.551425;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0162421;OID=.;OPOS=31382882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:38:39:39:39:0.5:17:22:18:20:17:22:18:21
chr6	31382911	.	A	G	1026.21	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0552122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8522;QD=59.4906;RBI=0.0553158;REFB=0;REVB=0.00338346;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000344192;OID=.;OPOS=31382911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:32:37:0:0:32:37:0:0
chr6	31466051	.	T	A	106.9	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.035879;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.418;QD=20.3628;RBI=0.0372049;REFB=-0.0177061;REVB=0.0098437;RO=8;SAF=3;SAR=9;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290321;STB=0.648383;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0110188;OID=.;OPOS=31466051;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:21:21:8:9:12:12:0.571429:9:3:5:3:9:3:5:4
chr6	31473546	.	A	G	1061.77	PASS	AF=0.936709;AO=74;DP=79;FAO=74;FDP=79;FR=.;FRO=5;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0345991;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.457;QD=53.7607;RBI=0.0369476;REFB=-0.152072;REVB=0.0129625;RO=4;SAF=38;SAR=36;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0472322;STB=0.530856;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00200498;OID=.;OPOS=31473546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:79:79:4:5:74:74:0.936709:36:38:4:0:36:38:5:0
chr6	31477681	.	A	G	1264.58	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0867475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1368;QD=61.6867;RBI=0.114371;REFB=0;REVB=-0.0745366;RO=0;SAF=50;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.44831e-05;OID=.;OPOS=31477681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:31:50:0:0:31:51:0:0
chr6	31496925	.	G	A	747.0	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.915;QD=63.5745;RBI=0.0370482;REFB=0;REVB=0.0246527;RO=0;SAF=11;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120722;OID=.;OPOS=31496925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:36:11:0:0:36:11:0:0
chr6	31497706	.	C	T	2419.34	PASS	AF=1;AO=158;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.190478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.379;QD=57.9482;RBI=0.191149;REFB=0;REVB=0.0159951;RO=9;SAF=77;SAR=81;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524292;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000763944;OID=.;OPOS=31497706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:167:167:9:0:158:167:1:81:77:9:0:81:86:0:0
chr6	31506624	.	T	C	1171.9	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.678;QD=60.878;RBI=0.0305603;REFB=0;REVB=0.023988;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115011;OID=.;OPOS=31506624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:40:37:0:0:40:37:0:0
chr6	31506648	.	G	T	1087.11	PASS	AF=1;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0977366;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.572;QD=60.395;RBI=0.098099;REFB=0;REVB=0.00842354;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00099037;OID=.;OPOS=31506648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:72:0:0:72:72:1:40:32:0:0:40:32:0:0
chr6	31506691	.	G	A	216.98	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.0852245;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.6651;QD=12.0543;RBI=0.113525;REFB=-0.0260595;REVB=-0.0749979;RO=40;SAF=16;SAR=11;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0353709;STB=0.509547;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0501863;OID=.;OPOS=31506691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:72:40:45:27:27:0.375:11:16:25:15:11:16:26:19
chr6	31509432	.	G	A	769.46	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00326579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.654;QD=56.9967;RBI=0.0128686;REFB=0;REVB=0.0124474;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.79767e-05;OID=.;OPOS=31509432;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:26:28:0:0:26:28:0:0
chr6	31510105	.	A	G	1474.93	PASS	AF=1;AO=92;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00193353;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7258;QD=63.438;RBI=0.00566883;REFB=0;REVB=0.00532889;RO=0;SAF=71;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50273e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.72758e-05;OID=.;OPOS=31510105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:93:0:0:92:93:1:21:71:0:0:22:71:0:0
chr6	31525912	.	C	T	958.07	PASS	AF=0.907895;AO=68;DP=77;FAO=69;FDP=76;FR=.;FRO=7;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.00877618;FXX=0.0129853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.48;QD=50.4246;RBI=0.0232711;REFB=-0.017067;REVB=-0.0215528;RO=7;SAF=29;SAR=39;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0764242;STB=0.539159;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.000840942;OID=.;OPOS=31525912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:77:76:7:7:68:69:0.907895:39:29:6:1:39:30:6:1
chr6	31528326	.	G	C	388.39	PASS	AF=0.637931;AO=36;DP=58;FAO=37;FDP=58;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0120934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1046;QD=26.7852;RBI=0.0286904;REFB=-0.0432916;REVB=0.0260171;RO=22;SAF=20;SAR=16;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702015;STB=0.550534;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0194217;OID=.;OPOS=31528326;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:22:21:36:37:0.637931:16:20:10:12:16:21:9:12
chr6	31540703	.	AG	AC,A	40.7	PASS	AF=0,0.529412;AO=2,7;DP=17;FAO=0,9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=0,5;FSAR=0,4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.0609621,0.213167;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=66.2592,12.7391;QD=9.57607;RBI=0.0775831,0.271961;REFB=0.00240249,-0.113459;REVB=-0.0479871,-0.168886;RO=7;SAF=2,2;SAR=0,5;SRF=1;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0.525773;SSSB=0.732272,0.161108;STB=0.5,0.695816;STBP=1,0.134;TYPE=snp,del;VARB=0,0.135406;OID=.,.;OPOS=31540704,31540704;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=AC,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.529412:2,7:17:0,9:17:8:0,5:0,4:1:7:39:7:2,2:0,5:1:6
chr6	31540784	.	C	A	47.06	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.104663;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.4898;QD=11.074;RBI=0.112592;REFB=-0.0198542;REVB=0.0415038;RO=10;SAF=1;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237604;STB=0.648156;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0430554;OID=.;OPOS=31540784;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:6:1:3:7:6:1:3:7
chr6	31555130	.	A	G	384.21	PASS	AF=0.43617;AO=40;DP=93;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.0285063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.872;QD=16.3492;RBI=0.0307215;REFB=-0.0317718;REVB=-0.0114543;RO=53;SAF=28;SAR=12;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129972;STB=0.57792;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0364505;OID=.;OPOS=31555130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:53:53:40:41:0.43617:12:28:31:22:12:29:31:22
chr6	31556709	.	A	G	331.71	PASS	AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0138014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.492;QD=17.0106;RBI=0.015777;REFB=0.00349573;REVB=-0.00764417;RO=41;SAF=19;SAR=17;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611795;STB=0.540518;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=-0.00246434;OID=.;OPOS=31556709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:41:42:36:36:0.461538:17:19:19:22:17:19:19:23
chr6	31583166	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.421;QD=59.8391;RBI=0.0500529;REFB=0;REVB=0.0437814;RO=0;SAF=34;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228943;OID=.;OPOS=31583166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:1:34:0:0:1:35:0:0
chr6	31583931	.	C	G,T	1347.02	PASS	AF=0.0229885,0.977011;AO=3,82;DP=85;FAO=2,85;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=1,50;FSAR=1,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00704206,0.0227117;FXX=0.0333296;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=131.215,196.27;QD=61.932;RBI=0.022806,0.0286249;REFB=0,0;REVB=0.0216915,0.0174231;RO=0;SAF=2,47;SAR=1,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.16565e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0572069,-0.00075321;OID=.,.;OPOS=31583931,31583931;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:85:87:0:0:3,82:2,85:0.0229885,0.977011:1,35:2,47:0:0:1,35:1,50:0:0
chr6	31594628	.	T	A	860.73	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00512914;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.627;QD=57.3819;RBI=0.00516458;REFB=0;REVB=0.000603946;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00313063;OID=.;OPOS=31594628;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:22:37:0:0:23:37:0:0
chr6	31595772	.	GCCTGCTGCCCCA	G,GCCTG	436.84	PASS	AF=0.931034,0.0689655;AO=27,4;DP=40;FAO=27,2;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=14,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345984,-0.0185007;FXX=0.274931;HRUN=2,1;LEN=12,8;MLLD=252.234,158.04;QD=60.2534;RBI=0.0440671,0.0295907;REFB=0,0;REVB=0.0272921,0.0230941;RO=0;SAF=13,0;SAR=14,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.39874e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0027771,0.00159707;OID=.,.;OPOS=31595773,31595777;OREF=CCTGCTGCCCCA,CTGCCCCA;OALT=-,-;OMAPALT=G,GCCTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.931034,0.0689655:27,4:40:27,2:29:0:13,0:14,2:0:0:12:0:13,0:14,4:0:0
chr6	31595882	.	C	A	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0630637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.438;QD=62.3509;RBI=0.0721953;REFB=0;REVB=0.0351446;RO=0;SAF=12;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41862e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236223;OID=.;OPOS=31595882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:31:12:0:0:31:12:0:0
chr6	31601344	.	T	C	414.52	PASS	AF=0.885714;AO=31;DP=35;FAO=31;FDP=35;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0354852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.8826;QD=47.3732;RBI=0.0415845;REFB=0.00766537;REVB=-0.0216811;RO=4;SAF=17;SAR=14;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0979146;STB=0.552598;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=-0.0367175;OID=.;OPOS=31601344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:35:35:4:4:31:31:0.885714:14:17:4:0:14:17:4:0
chr6	31602967	.	G	A	1513.42	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.8;QD=59.9374;RBI=0.0459155;REFB=0;REVB=0.0430532;RO=0;SAF=52;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10807e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.08823e-05;OID=.;OPOS=31602967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:49:52:0:0:49:52:0:0
chr6	31604044	.	T	G	552.09	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.065427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1497;QD=59.6858;RBI=0.0806528;REFB=0;REVB=-0.0471612;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144985;OID=.;OPOS=31604044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:27:9:0:0:27:10:0:0
chr6	31608570	.	TGGGGGGGA	TCGGGGGGA,TGGGGGGA,TGGGGGGAC	30.52	PASS	AF=0,0.267857,0;AO=2,19,2;DP=56;FAO=0,15,0;FDP=56;FR=.;FRO=41;FSAF=0,11,0;FSAR=0,4,0;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=-0.12581,-0.0882398,-0.115358;FXX=0;HRUN=7,7,7;LEN=1,1,2;MLLD=39.2912,8.07372,39.2819;QD=2.17986;RBI=0.126216,0.158636,0.132456;REFB=-0.0523705,-0.140514,-0.0401953;REVB=-0.0101122,0.13183,0.0650933;RO=28;SAF=2,13,2;SAR=0,6,0;SRF=20;SRR=8;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.388881,-0.0365594,0.388881;STB=0.5,0.523777,0.5;STBP=1,0.883,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0,0.171095,0;OID=.,.,.;OPOS=31608571,31608571,31608577;OREF=G,G,GA;OALT=C,-,AC;OMAPALT=TCGGGGGGA,TGGGGGGA,TGGGGGGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.267857,0:2,19,2:56:0,15,0:56:41:0,11,0:0,4,0:29:12:33:28:2,13,2:0,6,0:20:8
chr6	31612829	.	AGC	AG,GAG	166.56	PASS	AF=0.952381,0;AO=14,2;DP=21;FAO=20,0;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=12,0;FSAR=8,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.104226,-0.00897999;FXX=0;HRUN=5,1;LEN=1,3;MLLD=14.753,9.35295;QD=31.7258;RBI=0.282535,0.187434;REFB=0.0576911,0.0730446;REVB=0.262608,0.187219;RO=4;SAF=6,2;SAR=8,0;SRF=3;SRR=1;SSEN=0.5,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.128461,0.569412;STB=0.529382,0.5;STBP=0.321,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0314602,0.0294655;OID=.,.;OPOS=31612831,31612829;OREF=C,AGC;OALT=-,GAG;OMAPALT=AG,GAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:21:21:4:1:14,2:20,0:0.952381,0:8,0:6,2:3:1:8,0:12,0:0:1
chr6	31617054	.	AGGGGGGGA	ACGGGGGGA,AGGGGGA,AGGGGGGA,AGGGGGGAG,GAGGGGGGA	281.03	PASS	AF=0.0285714,0,0.742857,0.171429,0;AO=7,9,22,8,4;DP=71;FAO=2,0,52,12,0;FDP=70;FR=.;FRO=4;FSAF=0,0,9,12,0;FSAR=2,0,43,0,0;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0438076,-0.110281,-0.199302,-0.0867601,-0.050173;FXX=0.0277739;HRUN=7,7,7,7,1;LEN=1,2,1,2,2;MLLD=80.1489,10.3142,7.58828,133.75,133.494;QD=16.0589;RBI=0.24349,0.138298,0.254326,0.0920065,0.078101;REFB=0.021438,-0.0782541,-0.14013,-0.00572725,-0.00110999;REVB=-0.239517,-0.0834533,-0.157988,-0.0306249,-0.0598535;RO=11;SAF=0,2,6,8,0;SAR=7,7,16,0,4;SRF=2;SRR=9;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.715058,0.0566031,0.0719714,0.824474,-0.619207;STB=0.991616,0.5,0.509475,0.998639,0.5;STBP=0.42,1,0.801,0.001,1;TYPE=snp,del,del,mnp,mnp;VARB=-0.101636,0.00227391,0.0685354,0.072569,0;OID=.,.,.,.,.;OPOS=31617055,31617055,31617055,31617061,31617054;OREF=G,GG,G,GA,AG;OALT=C,-,-,AG,GA;OMAPALT=ACGGGGGGA,AGGGGGA,AGGGGGGA,AGGGGGGAG,GAGGGGGGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	3/4:35:71:70:11:4:7,9,22,8,4:2,0,52,12,0:0.0285714,0,0.742857,0.171429,0:7,7,16,0,4:0,2,6,8,0:2:9:2,0,43,0,0:0,0,9,12,0:1:3
chr6	31627449	.	C	G	2202.8	PASS	AF=1;AO=139;DP=142;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326173;FXX=0.0140835;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.317;QD=62.9371;RBI=0.0328713;REFB=0;REVB=-0.00407815;RO=0;SAF=85;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58833e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.99056e-05;OID=.;OPOS=31627449;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:140:0:0:139:140:1:54:85:0:0:54:86:0:0
chr6	31627523	.	C	T	2776.72	PASS	AF=0.98895;AO=179;DP=181;FAO=179;FDP=181;FR=.;FRO=2;FSAF=110;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00640363;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=77.6951;QD=61.3639;RBI=0.0198883;REFB=-0.0653448;REVB=0.0188291;RO=0;SAF=110;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507142;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.000303594;OID=.;OPOS=31627523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:181:181:0:2:179:179:0.98895:69:110:0:0:69:110:0:2
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chr6	31634758	.	G	A	1704.13	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00212239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.78;QD=60.323;RBI=0.0343982;REFB=0;REVB=0.0343327;RO=0;SAF=57;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.85244e-05;OID=.;OPOS=31634758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:56:57:0:0:56:57:0:0
chr6	31635710	.	T	C	619.86	PASS	AF=0.97619;AO=42;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0116433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.02;QD=59.0339;RBI=0.0145811;REFB=0.0682288;REVB=-0.00877738;RO=0;SAF=9;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27702e-08;STB=0.529397;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=-0.00133539;OID=.;OPOS=31635710;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:0:1:42:41:0.97619:33:9:0:0:33:8:1:0
chr6	31657413	.	T	C	1023.56	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00670203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.227;QD=59.3369;RBI=0.0365309;REFB=0;REVB=0.0359108;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.26638e-05;OID=.;OPOS=31657413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:66:69:0:0:66:69:1:35:31:0:0:36:33:0:0
chr6	31675765	.	G	A	1097.65	PASS	AF=0.938272;AO=74;DP=79;FAO=76;FDP=81;FR=.;FRO=5;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00227826;FXX=0.0121936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.5034;QD=54.205;RBI=0.0892358;REFB=-0.0604707;REVB=0.0892067;RO=5;SAF=43;SAR=31;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00232246;STB=0.50215;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.00319614;OID=.;OPOS=31675765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:79:81:5:5:74:76:0.938272:31:43:3:2:33:43:3:2
chr6	31687008	.	G	A	799.24	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.68;QD=56.0867;RBI=0.0662134;REFB=0;REVB=0.0617553;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000545154;OID=.;OPOS=31687008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:57:0:0:54:57:1:25:29:0:0:28:29:0:0
chr6	31708328	.	C	T	1704.53	PASS	AF=0.929134;AO=118;DP=127;FAO=118;FDP=127;FR=.;FRO=9;FSAF=41;FSAR=77;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0220602;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.685;QD=53.6861;RBI=0.0263219;REFB=-0.0934987;REVB=0.0143592;RO=5;SAF=41;SAR=77;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213191;STB=0.532943;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0010006;OID=.;OPOS=31708328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:127:127:5:9:118:118:0.929134:77:41:3:2:77:41:7:2
chr6	31728541	.	C	T	469.46	PASS	AF=0.555556;AO=44;DP=80;FAO=45;FDP=81;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0250794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.22;QD=23.1831;RBI=0.0250852;REFB=-0.0150874;REVB=-0.000536588;RO=36;SAF=15;SAR=29;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182306;STB=0.603401;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.013654;OID=.;OPOS=31728541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:36:36:44:45:0.555556:29:15:20:16:30:15:20:16
chr6	31729359	.	A	G	1438.05	PASS	AF=0.989362;AO=92;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.006144;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.418;QD=61.1935;RBI=0.0467899;REFB=-0.101038;REVB=-0.0463848;RO=0;SAF=52;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.0217e-08;STB=0.506023;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00196011;OID=.;OPOS=31729359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:0:1:92:93:0.989362:40:52:0:0:41:52:0:1
chr6	31731881	.	C	T	1162.15	PASS	AF=0.930233;AO=80;DP=86;FAO=80;FDP=86;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.000862807;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=159.191;QD=54.0537;RBI=0.00617653;REFB=-0.0832234;REVB=-0.00611597;RO=1;SAF=35;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133348;STB=0.507395;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.000293756;OID=.;OPOS=31731881;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:86:86:1:6:80:80:0.930233:45:35:1:0:45:35:2:4
chr6	31745284	.	C	T	805.18	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.209;QD=64.4143;RBI=0.0668016;REFB=0;REVB=0.0641323;RO=0;SAF=33;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211191;OID=.;OPOS=31745284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:16:33:0:0:16:34:0:0
chr6	31748820	.	G	A	923.46	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0028517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.957;QD=56.8281;RBI=0.0100211;REFB=-0.114219;REVB=-0.0096068;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508472;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000352166;OID=.;OPOS=31748820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:29:35:0:0:29:35:0:1
chr6	31750170	.	C	T	421.94	PASS	AF=0.625;AO=40;DP=64;FAO=40;FDP=64;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0705022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.939;QD=26.3714;RBI=0.120263;REFB=-0.0845404;REVB=0.09743;RO=24;SAF=16;SAR=24;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118815;STB=0.50649;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0506247;OID=.;OPOS=31750170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:24:24:40:40:0.625:24:16:10:14:24:16:10:14
chr6	31778272	.	G	A	689.3	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.122694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.637;QD=62.6633;RBI=0.124436;REFB=0;REVB=0.0207482;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000656415;OID=.;OPOS=31778272;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:21:22:0:0:21:23:0:0
chr6	31779472	.	G	A	365.56	PASS	AF=0.534247;AO=31;DP=66;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0224888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7118;QD=20.0305;RBI=0.0270461;REFB=-0.00957293;REVB=-0.0150248;RO=35;SAF=18;SAR=13;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469359;STB=0.501113;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.035481;OID=.;OPOS=31779472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:73:35:34:31:39:0.534247:13:18:22:13:15:24:21:13
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chr6	31797769	.	A	AAAGTT,T	910.75	PASS	AF=0.637097,0.0483871;AO=65,12;DP=131;FAO=79,6;FDP=124;FR=.;FRO=39;FSAF=45,6;FSAR=34,0;FSRF=37;FSRR=2;FWDB=-0.013492,-0.104036;FXX=0.0158718;HRUN=3,3;LEN=5,1;MLLD=219.378,41.7828;QD=29.3791;RBI=0.0162661,0.133264;REFB=-0.0373562,-0.0229545;REVB=0.0090858,-0.0832812;RO=50;SAF=34,11;SAR=31,1;SRF=46;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.325415,-0.0137654;STB=0.632456,0.996797;STBP=0,0.381;TYPE=ins,snp;VARB=0.0149771,0.0690725;OID=.,.;OPOS=31797770,31797769;OREF=-,A;OALT=AAGTT,T;OMAPALT=AAAGTT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:124:50:39:65,12:79,6:0.637097,0.0483871:31,1:34,11:46:4:34,0:45,6:37:2
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chr6	31975113	.	G	C	160.74	PASS	AF=0.318841;AO=21;DP=68;FAO=22;FDP=69;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=1;FSRF=36;FSRR=11;FWDB=-0.00101115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.992;QD=9.31834;RBI=0.0186644;REFB=-0.00743025;REVB=0.018637;RO=47;SAF=21;SAR=0;SRF=36;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.762767;STB=0.815129;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0123263;OID=.;OPOS=31975113;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:47:47:21:22:0.318841:0:21:36:11:1:21:36:11
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chr6	31977391	.	C	T	1246.02	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.976;QD=61.5317;RBI=0.0859522;REFB=0;REVB=0.0667789;RO=0;SAF=42;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194854;OID=.;OPOS=31977391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:39:42:0:0:39:42:0:0
chr6	31977528	.	C	G	90.68	PASS	AF=0.173913;AO=16;DP=92;FAO=16;FDP=92;FR=.;FRO=76;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=35;FSRR=41;FWDB=-0.0053011;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.15;QD=3.94253;RBI=0.00829469;REFB=-0.00572291;REVB=-0.00637967;RO=75;SAF=10;SAR=6;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214846;STB=0.634967;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0256033;OID=.;OPOS=31977528;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:92:92:75:76:16:16:0.173913:6:10:34:41:6:10:35:41
chr6	31977552	.	C	G	54.49	PASS	AF=0.139241;AO=11;DP=79;FAO=11;FDP=79;FR=.;FRO=68;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=37;FWDB=-0.0116522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.314;QD=2.75875;RBI=0.0202289;REFB=-0.00534587;REVB=-0.0165359;RO=68;SAF=8;SAR=3;SRF=31;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332392;STB=0.731846;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0256935;OID=.;OPOS=31977552;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:79:79:68:68:11:11:0.139241:3:8:31:37:3:8:31:37
chr6	31978746	.	G	A	871.36	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00255925;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.426;QD=56.2169;RBI=0.0174282;REFB=0;REVB=0.0172393;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00382823;OID=.;OPOS=31978746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:62:0:0:57:62:1:22:35:0:0:22:40:0:0
chr6	32006214	.	CCTGCTGCTGCTGCTGC	CCTGCTGCCTGCTGCTG,CCTGCTGCTGCTGC,CCTGCTGCTGCTG,CCTGCTGCTGCTGCTG	64.23	PASS	AF=0,0.347826,0.0434783,0;AO=2,5,3,5;DP=23;FAO=0,8,1,0;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=0,4,1,0;FSAR=0,4,0,0;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0748652,-0.0271601,-0.0309908,-0.192062;FXX=0;HRUN=1,1,1,4;LEN=9,3,4,1;MLLD=25.8558,180.246,175.179,11.1599;QD=11.1707;RBI=0.251077,0.0369126,0.0311093,0.359416;REFB=-0.102406,-0.0537993,-0.060473,-0.172607;REVB=-0.239656,0.0249973,0.00271274,-0.303796;RO=5;SAF=0,3,2,3;SAR=2,2,1,2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.705406,-0.179553,-0.152533,-0.179553;STB=0.5,0.590689,0.986952,0.5;STBP=1,0.533,0.516,1;TYPE=mnp,del,del,del;VARB=0,0.0746877,0.117989,0;OID=.,.,.,.;OPOS=32006222,32006215,32006227,32006230;OREF=TGCTGCTGC,CTG,CTGC,C;OALT=CTGCTGCTG,-,-,-;OMAPALT=CCTGCTGCCTGCTGCTG,CCTGCTGCTGCTGC,CCTGCTGCTGCTG,CCTGCTGCTGCTGCTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.347826,0.0434783,0:2,5,3,5:23:0,8,1,0:23:14:0,4,1,0:0,4,0,0:9:5:52:5:0,3,2,3:2,2,1,2:4:1
chr6	32006317	.	C	T	364.86	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0537068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5543;QD=52.1223;RBI=0.0661793;REFB=0.0969336;REVB=-0.0386688;RO=1;SAF=6;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713041;STB=0.538432;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=-0.00766783;OID=.;OPOS=32006317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:21:6:1:0:21:6:1:0
chr6	32006337	.	C	A	330.28	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.124355;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.2175;QD=50.8126;RBI=0.141224;REFB=-0.0255837;REVB=0.066934;RO=1;SAF=6;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711625;STB=0.53843;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00658949;OID=.;OPOS=32006337;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:19:6:1:0:19:6:1:0
chr6	32006858	.	C	A	713.63	PASS	AF=0.959184;AO=46;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.163372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5441;QD=58.2552;RBI=0.207073;REFB=-0.155097;REVB=0.127235;RO=3;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477505;STB=0.51666;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0107976;OID=.;OPOS=32006858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:49:3:2:46:47:0.959184:28:18:0:3:29:18:0:2
chr6	32006886	.	G	A	175.58	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0343534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0969;QD=13.7713;RBI=0.041041;REFB=-0.000391155;REVB=-0.0224546;RO=31;SAF=4;SAR=16;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.432261;STB=0.751867;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0010548;OID=.;OPOS=32006886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:16:4:18:13:16:4:18:13
chr6	32010272	.	T	A	775.16	PASS	AF=0.350554;AO=93;DP=264;FAO=95;FDP=271;FR=.;FRO=176;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=91;FSRR=85;FWDB=-0.0083329;FXX=0.00367634;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.216;QD=11.4415;RBI=0.0123686;REFB=-0.00768667;REVB=-0.00914031;RO=168;SAF=43;SAR=50;SRF=90;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829911;STB=0.528149;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.013598;OID=.;OPOS=32010272;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:264:271:168:176:93:95:0.350554:50:43:90:78:50:45:91:85
chr6	32012987	.	A	G	1239.68	PASS	AF=0.321357;AO=160;DP=510;FAO=161;FDP=501;FR=.;FRO=340;FSAF=87;FSAR=74;FSRF=163;FSRR=177;FWDB=-0.0302195;FXX=0.0195691;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.873;QD=9.89767;RBI=0.0356134;REFB=-0.0224587;REVB=-0.0188439;RO=349;SAF=86;SAR=74;SRF=173;SRR=176;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499124;STB=0.541359;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0437466;OID=.;OPOS=32012987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:510:501:349:340:160:161:0.321357:74:86:173:176:74:87:163:177
chr6	32024395	.	C	T	281.38	PASS	AF=0.492063;AO=30;DP=64;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.0123089;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5172;QD=17.8654;RBI=0.0317121;REFB=-0.0512641;REVB=0.0292258;RO=30;SAF=14;SAR=16;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152112;STB=0.555869;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0723582;OID=.;OPOS=32024395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:30:32:30:31:0.492063:16:14:9:21:17:14:11:21
chr6	32026107	.	C	T	70.58	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0555096;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.896;QD=17.6438;RBI=0.0557789;REFB=-0.0167593;REVB=0.00547423;RO=7;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657708;STB=0.538372;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0124283;OID=.;OPOS=32026107;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:7:2:2:5:7:2:2:5
chr6	32029226	.	A	G	233.46	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00201268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.683;QD=16.9793;RBI=0.0315288;REFB=-0.011801;REVB=-0.0314645;RO=28;SAF=12;SAR=14;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23091;STB=0.618697;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0104417;OID=.;OPOS=32029226;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:29:26:26:0.472727:14:12:20:8:14:12:20:9
chr6	32029431	.	G	A	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00989166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.924;QD=14.6525;RBI=0.0124199;REFB=-0.00021026;REVB=0.00751057;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207272;STB=0.624573;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.000482151;OID=.;OPOS=32029431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:4:2:3:2:4:2:3:2
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chr6	32050067	.	T	C	589.42	PASS	AF=0.56;AO=53;DP=97;FAO=56;FDP=100;FR=.;FRO=44;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=0.010974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.603;QD=23.5766;RBI=0.021336;REFB=-0.0315642;REVB=0.0182974;RO=41;SAF=32;SAR=21;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0880721;STB=0.549163;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0151697;OID=.;OPOS=32050067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:100:41:44:53:56:0.56:21:32:29:12:21:35:32:12
chr6	32063944	.	GCCCCCG	CGCCCCG,GCCCC,GCCCCG,GCCCCGG	120.73	PASS	AF=0,0.375,0.125,0;AO=2,14,10,2;DP=52;FAO=0,18,6,0;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=0,6,3,0;FSAR=0,12,3,0;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0573196,-0.0934126,-0.0631498,0.029638;FXX=0.020404;HRUN=1,5,5,5;LEN=2,2,1,1;MLLD=136.344,17.4695,10.002,14.5128;QD=10.0609;RBI=0.13315,0.0936671,0.0748486,0.0471393;REFB=-0.0144887,-0.111731,-0.157742,-0.0524488;REVB=-0.12018,0.00689942,0.0401798,0.0366566;RO=20;SAF=0,6,5,2;SAR=2,8,5,0;SRF=9;SRR=11;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.489708,-0.021973,0.0549448,0.531429;STB=0.5,0.622811,0.533223,0.5;STBP=1,0.196,0.909,1;TYPE=mnp,del,del,snp;VARB=0,0.142145,0.167249,0;OID=.,.,.,.;OPOS=32063944,32063949,32063945,32063949;OREF=GC,CG,C,C;OALT=CG,-,-,G;OMAPALT=CGCCCCG,GCCCC,GCCCCG,GCCCCGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:82:52:48:20:24:2,14,10,2:0,18,6,0:0,0.375,0.125,0:2,8,5,0:0,6,5,2:9:11:0,12,3,0:0,6,3,0:13:11
chr6	32088854	.	G	C	106.86	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0123429;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.459;QD=12.213;RBI=0.0249418;REFB=-0.0190125;REVB=-0.0216736;RO=21;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00405815;STB=0.516104;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0270104;OID=.;OPOS=32088854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:22:13:13:0.371429:8:5:8:13:8:5:9:13
chr6	32119898	.	T	C	4388.09	PASS	AF=0.966887;AO=291;DP=302;FAO=292;FDP=302;FR=.;FRO=10;FSAF=155;FSAR=137;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.00242674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.376;QD=58.1204;RBI=0.0124157;REFB=-0.0364664;REVB=0.0121763;RO=7;SAF=154;SAR=137;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211785;STB=0.515624;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00202368;OID=.;OPOS=32119898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:302:302:7:10:291:292:0.966887:137:154:7:0:137:155:10:0
chr6	32122386	.	C	G	1115.04	PASS	AF=1;AO=47;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.918;QD=60.2722;RBI=0.0695864;REFB=0;REVB=0.0662934;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00041139;OID=.;OPOS=32122386;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:47:74:1:26:21:0:0:49:25:0:0
chr6	32151443	.	C	T	434.34	PASS	AF=0.396825;AO=50;DP=126;FAO=50;FDP=126;FR=.;FRO=76;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=-0.00631063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.547;QD=13.7887;RBI=0.00730668;REFB=-0.0222976;REVB=-0.00368285;RO=72;SAF=22;SAR=28;SRF=40;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120795;STB=0.56778;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0375748;OID=.;OPOS=32151443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:72:76:50:50:0.396825:28:22:40:32:28:22:42:34
chr6	32151690	.	TGGGGGC	TGGGC,TGGGG,TGGGGC,TGGGGCC	883.88	PASS	AF=0,0.93617,0,0;AO=13,40,17,6;DP=99;FAO=0,88,0,0;FDP=94;FR=.;FRO=6;FSAF=0,56,0,0;FSAR=0,32,0,0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0924057,-0.0995249,0.178784,0.29005;FXX=0.0105252;HRUN=5,5,5,5;LEN=2,2,1,1;MLLD=9.01037,19.5704,11.5697,6.80408;QD=37.6118;RBI=0.384915,0.108204,0.745016,0.796828;REFB=-0.0599589,-0.136319,-0.106722,0.0121711;REVB=-0.373659,-0.0424616,-0.723246,-0.742163;RO=5;SAF=0,39,10,6;SAR=13,1,7,0;SRF=4;SRR=1;SSEN=0.305263,0.305263,0.305263,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.841937,0.265443,-0.0918578,0.731761;STB=0.5,0.525418,0.5,0.5;STBP=1,0.095,1,1;TYPE=del,del,del,snp;VARB=0,0.019003,0.0619968,0;OID=.,.,.,.;OPOS=32151691,32151695,32151691,32151695;OREF=GG,GC,G,G;OALT=-,-,-,C;OMAPALT=TGGGC,TGGGG,TGGGGC,TGGGGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.93617,0,0:13,40,17,6:99:0,88,0,0:94:6:0,56,0,0:0,32,0,0:6:0:22:5:0,39,10,6:13,1,7,0:4:1
chr6	32151994	.	A	T	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.036;QD=62.3503;RBI=0.0383212;REFB=0;REVB=-0.0276402;RO=0;SAF=31;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41862e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.56104e-06;OID=.;OPOS=32151994;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:12:31:0:0:12:31:0:0
chr6	32154998	.	C	T	387.65	PASS	AF=0.45977;AO=39;DP=95;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=0.000945185;FXX=0.0842017;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.0738;QD=17.823;RBI=0.0240103;REFB=-0.00208378;REVB=0.0239917;RO=44;SAF=20;SAR=19;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552522;STB=0.528721;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00423457;OID=.;OPOS=32154998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:87:44:47:39:40:0.45977:19:20:20:24:20:20:21:26
chr6	32159956	.	T	C	76.55	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.026585;FXX=0.117578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.42;QD=20.413;RBI=0.0401756;REFB=-0.0127031;REVB=-0.0301217;RO=5;SAF=8;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.441617;STB=0.799198;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0234011;OID=.;OPOS=32159956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:17:15:5:6:9:9:0.6:1:8:2:3:1:8:2:4
chr6	32172065	.	T	G	2044.84	PASS	AF=0.992481;AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=133;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00794867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.105;QD=61.499;RBI=0.0130655;REFB=-0.0416362;REVB=-0.0103695;RO=0;SAF=76;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.94421e-08;STB=0.503267;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=6.16911e-05;OID=.;OPOS=32172065;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:133:133:0:1:132:132:0.992481:56:76:0:0:56:76:1:0
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chr6	32188297	.	G	C	265.4	PASS	AF=0.274194;AO=17;DP=62;FAO=17;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0140326;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.607;QD=17.1226;RBI=0.0154958;REFB=-0.015079;REVB=0.0065731;RO=32;SAF=4;SAR=13;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.51335;STB=0.785722;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0321204;OID=.;OPOS=32188297;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:62:62:32:32:17:17:0.274194:13:4:23:9:13:4:22:10
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chr6	32191620	.	C	T	116.01	PASS	AF=0.290909;AO=16;DP=55;FAO=16;FDP=55;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.022169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2872;QD=8.43718;RBI=0.0221784;REFB=-0.0347659;REVB=0.000648569;RO=31;SAF=14;SAR=2;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.437271;STB=0.757576;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0313946;OID=.;OPOS=32191620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:39:16:16:0.290909:2:14:18:13:2:14:24:15
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chr6	32256418	.	T	C	124.89	PASS	AF=0.2375;AO=19;DP=80;FAO=19;FDP=80;FR=.;FRO=61;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=50;FWDB=-0.00286061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7886;QD=6.24429;RBI=0.0933774;REFB=0.0178803;REVB=0.0933336;RO=61;SAF=5;SAR=14;SRF=11;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145946;STB=0.588152;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=-0.0424589;OID=.;OPOS=32256418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:61:61:19:19:0.2375:14:5:11:50:14:5:11:50
chr6	32261507	.	T	C	403.07	PASS	AF=0.408696;AO=47;DP=115;FAO=47;FDP=115;FR=.;FRO=68;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=47;FWDB=0.0164237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.724;QD=14.0198;RBI=0.0213497;REFB=-0.0222293;REVB=0.0136408;RO=68;SAF=21;SAR=26;SRF=21;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149638;STB=0.583966;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.024634;OID=.;OPOS=32261507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:68:68:47:47:0.408696:26:21:21:47:26:21:21:47
chr6	32261952	.	G	A	35.75	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0239624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.145;QD=5.95831;RBI=0.0241355;REFB=-0.0289692;REVB=-0.00288564;RO=17;SAF=5;SAR=1;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443236;STB=0.780226;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.075543;OID=.;OPOS=32261952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:24:24:17:18:6:6:0.25:1:5:8:9:1:5:9:9
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chr6	32369586	.	GAA	G	51.82	PASS	AF=0.188235;AO=16;DP=84;FAO=16;FDP=85;FR=.;FRO=69;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=-0.0731726;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=30.8107;QD=2.43839;RBI=0.0739285;REFB=0.0104908;REVB=-0.0105449;RO=57;SAF=6;SAR=10;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0.330986;SSSB=-0.0817905;STB=0.608172;STBP=0.347;TYPE=del;VARB=-0.0433478;OID=.;OPOS=32369587;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.188235:16:84:16:85:69:6:10:35:34:51:57:6:10:25:32
chr6	32369594	.	A	G	92.25	PASS	AF=0.181818;AO=16;DP=88;FAO=16;FDP=88;FR=.;FRO=72;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=-0.0299273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.996;QD=4.19332;RBI=0.0308993;REFB=-0.0043436;REVB=-0.00768895;RO=71;SAF=6;SAR=10;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132898;STB=0.592369;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.025935;OID=.;OPOS=32369594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:88:88:71:72:16:16:0.181818:10:6:34:37:10:6:35:37
chr6	32369596	.	A	G	82.99	PASS	AF=0.168539;AO=15;DP=89;FAO=15;FDP=89;FR=.;FRO=74;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=0.0293549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.1294;QD=3.72984;RBI=0.0299174;REFB=-0.00255057;REVB=0.00577413;RO=74;SAF=6;SAR=9;SRF=35;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929189;STB=0.561561;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0142277;OID=.;OPOS=32369596;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:89:89:74:74:15:15:0.168539:9:6:35:39:9:6:35:39
chr6	32370791	.	G	A	324.53	PASS	AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00909605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.463;QD=19.6682;RBI=0.015496;REFB=-0.0107718;REVB=-0.0125454;RO=29;SAF=25;SAR=9;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114475;STB=0.581345;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0119089;OID=.;OPOS=32370791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:29:32:34:34:0.515152:9:25:18:11:9:25:19:13
chr6	32370794	.	C	T	303.95	PASS	AF=0.507937;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=0.0199171;FXX=0.0454477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2745;QD=19.2985;RBI=0.0203645;REFB=0.0250191;REVB=-0.00424558;RO=34;SAF=19;SAR=13;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139797;STB=0.560426;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=-0.0246569;OID=.;OPOS=32370794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:63:34:31:32:32:0.507937:13:19:25:9:13:19:22:9
chr6	32370816	.	G	A	1116.96	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.329;QD=60.3762;RBI=0.0278351;REFB=0;REVB=0.0278165;RO=0;SAF=49;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198784;OID=.;OPOS=32370816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:25:49:0:0:25:49:0:0
chr6	32370835	.	T	C	1080.53	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.6411;QD=60.0293;RBI=0.012202;REFB=0;REVB=-0.00178534;RO=0;SAF=44;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.45551e-05;OID=.;OPOS=32370835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:28:44:0:0:28:44:0:0
chr6	32370860	.	G	A	249.34	PASS	AF=0.408451;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00976401;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.692;QD=14.0471;RBI=0.00978141;REFB=-0.0158795;REVB=0.000583247;RO=42;SAF=20;SAR=9;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159626;STB=0.591276;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0320522;OID=.;OPOS=32370860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:42:42:29:29:0.408451:9:20:23:19:9:20:23:19
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chr6	32546726	.	A	G	142.34	PASS	AF=1;AO=12;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=34.5222;QD=40.6674;RBI=0.145735;REFB=0;REVB=0.140097;RO=0;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00623134;OID=.;OPOS=32546726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:12:14:1:1:11:0:0:1:13:0:0
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chr6	32549401	.	T	C	86.58	PASS	AF=0.215385;AO=14;DP=65;FAO=14;FDP=65;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0615644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9386;QD=5.32812;RBI=0.06252;REFB=-0.00961912;REVB=0.0108893;RO=51;SAF=9;SAR=5;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960748;STB=0.561112;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0319979;OID=.;OPOS=32549401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:65:65:51:51:14:14:0.215385:5:9:29:22:5:9:29:22
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chr6	32549501	.	A	C	178.82	PASS	AF=0.25;AO=25;DP=100;FAO=25;FDP=100;FR=.;FRO=75;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=39;FSRR=36;FWDB=-0.0226309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.531;QD=7.15293;RBI=0.026623;REFB=-0.0139342;REVB=-0.0140224;RO=74;SAF=20;SAR=5;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.374563;STB=0.735222;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0334829;OID=.;OPOS=32549501;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:74:75:25:25:0.25:5:20:39:35:5:20:39:36
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chr6	32549596	.	T	C	208.99	PASS	AF=0.258333;AO=31;DP=120;FAO=31;FDP=120;FR=.;FRO=89;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=53;FWDB=-0.0197008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7145;QD=6.96646;RBI=0.0273813;REFB=-0.00585507;REVB=0.0190162;RO=87;SAF=15;SAR=16;SRF=35;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101103;STB=0.55912;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0182169;OID=.;OPOS=32549596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:87:89:31:31:0.258333:16:15:35:52:16:15:36:53
chr6	32549611	.	T	A	172.7	PASS	AF=0.236842;AO=27;DP=113;FAO=27;FDP=114;FR=.;FRO=87;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=33;FSRR=54;FWDB=-0.0117162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.872;QD=6.05977;RBI=0.0184865;REFB=-0.00288999;REVB=-0.0142996;RO=86;SAF=15;SAR=12;SRF=33;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212285;STB=0.63209;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.023658;OID=.;OPOS=32549611;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:86:87:27:27:0.236842:12:15:33:53:12:15:33:54
chr6	32551911	.	CA	AC	604.46	PASS	AF=0.931818;AO=38;DP=44;FAO=41;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0211563;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=75.1175;QD=54.9513;RBI=0.0262674;REFB=-0.00390284;REVB=-0.0155688;RO=3;SAF=20;SAR=18;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652474;STB=0.530598;STBP=0.163;TYPE=mnp;VARB=0.000981227;OID=.;OPOS=32551911;OREF=CA;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:44:44:3:3:38:41:0.931818:18:20:3:0:18:23:3:0
chr6	32606701	.	A	G	3106.12	PASS	AF=1;AO=195;DP=196;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=129;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0648734;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.4288;QD=61.2043;RBI=0.0891381;REFB=0;REVB=0.0611314;RO=0;SAF=121;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.72594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000463323;OID=.;OPOS=32606701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:196:203:0:0:195:203:1:74:121:0:0:74:129:0:0
chr6	32609094	.	C	T	1208.95	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.853;QD=61.2129;RBI=0.0467052;REFB=0;REVB=0.0265281;RO=0;SAF=57;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.14853e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.12942e-05;OID=.;OPOS=32609094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:22:57:0:0:22:57:0:0
chr6	32609147	.	A	T	716.3	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358873;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.774;QD=57.3037;RBI=0.116428;REFB=0;REVB=0.110759;RO=0;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000982493;OID=.;OPOS=32609147;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:31:19:0:0:31:19:0:0
chr6	32609195	.	G	A	1080.7	PASS	AF=0.986486;AO=71;DP=73;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0260509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5203;QD=58.4164;RBI=0.0321283;REFB=-0.0317193;REVB=0.0188036;RO=2;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0304803;STB=0.507934;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000544411;OID=.;OPOS=32609195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:74:2:1:71:73:0.986486:30:41:0:2:31:42:0:1
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chr6	32609873	.	GT	CG	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00481819;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=224.236;QD=57.6807;RBI=0.00555955;REFB=0;REVB=-0.00277376;RO=0;SAF=24;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=1.01236e-05;OID=.;OPOS=32609873;OREF=GT;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:7:24:0:0:7:24:0:0
chr6	32610075	.	A	G	1171.35	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7894;QD=60.8492;RBI=0.0379811;REFB=0;REVB=0.0178325;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000374168;OID=.;OPOS=32610075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:40:37:0:0:40:37:0:0
chr6	32610151	.	T	A	492.9	PASS	AF=0.945946;AO=33;DP=36;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0287617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.5985;QD=53.2869;RBI=0.032217;REFB=-0.103846;REVB=0.0145156;RO=2;SAF=19;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0466723;STB=0.523796;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00532506;OID=.;OPOS=32610151;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:37:2:2:33:35:0.945946:14:19:2:0:15:20:2:0
chr6	32610461	.	A	G	1246.1	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.37;QD=61.536;RBI=0.0243796;REFB=0;REVB=-0.0119198;RO=0;SAF=55;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06944e-05;OID=.;OPOS=32610461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:26:55:0:0:26:55:0:0
chr6	32610535	.	A	C	916.99	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.23;QD=58.2215;RBI=0.0535709;REFB=0;REVB=0.0236885;RO=0;SAF=42;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155406;OID=.;OPOS=32610535;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:61:63:1:19:42:0:0:19:44:0:0
chr6	32610696	.	G	A	877.8	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=64;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.037583;FXX=0.0312451;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.231;QD=56.6325;RBI=0.039028;REFB=-0.0970576;REVB=-0.0105216;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000115617;OID=.;OPOS=32610696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:62:0:1:61:61:0.983871:35:26:0:0:35:26:0:1
chr6	32610749	.	G	A	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.298;QD=62.022;RBI=0.0180527;REFB=0;REVB=0.0123643;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.15446e-05;OID=.;OPOS=32610749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:26:16:0:0:26:16:0:0
chr6	32610976	.	A	C	1955.37	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00883382;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.52;QD=62.0754;RBI=0.0172273;REFB=0;REVB=0.0147899;RO=0;SAF=60;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47389e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.46007e-05;OID=.;OPOS=32610976;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:124:126:0:0:124:126:1:64:60:0:0:65:61:0:0
chr6	32628045	.	C	G	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.82;QD=62.9794;RBI=0.0435019;REFB=0;REVB=0.0403605;RO=0;SAF=14;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014462;OID=.;OPOS=32628045;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:31:14:0:0:31:14:0:0
chr6	32628047	.	T	G	695.57	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.108943;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.9644;QD=60.484;RBI=0.11356;REFB=-0.0136475;REVB=0.0320499;RO=1;SAF=14;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323812;STB=0.517234;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.000455554;OID=.;OPOS=32628047;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:31:14:1:0:31:14:1:0
chr6	32628065	.	C	G	481.54	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.012;QD=58.3688;RBI=0.0364667;REFB=0;REVB=0.0070276;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.0449e-05;OID=.;OPOS=32628065;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:22:11:0:0:22:11:0:0
chr6	32628602	.	G	GT	206.51	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0603696;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=202.579;QD=48.5898;RBI=0.063824;REFB=0;REVB=0.0207125;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000327371;OID=.;OPOS=32628603;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:17:17:17:17:0:9:8:0:0:4:0:9:8:0:0
chr6	32628609	.	C	T	182.8	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0205575;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.209;QD=43.0108;RBI=0.0302314;REFB=-0.12591;REVB=-0.0221659;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533291;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00395447;OID=.;OPOS=32628609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:0:1:16:16:0.941176:7:9:0:0:7:9:0:1
chr6	32628611	.	C	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7416;QD=48.7369;RBI=0.121801;REFB=0;REVB=-0.11542;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00145518;OID=.;OPOS=32628611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr6	32628660	.	T	C	235.13	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00902167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3059;QD=49.5006;RBI=0.0749193;REFB=0;REVB=0.0743742;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0025263;OID=.;OPOS=32628660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:11:7:0:0:12:7:0:0
chr6	32629161	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.094725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.7917;QD=33.4284;RBI=0.104236;REFB=0;REVB=0.0435012;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00296085;OID=.;OPOS=32629161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr6	32629193	.	C	T	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0317878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.63;QD=30.79;RBI=0.0425397;REFB=-0.0143232;REVB=0.0282694;RO=1;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125393;STB=0.571246;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00456548;OID=.;OPOS=32629193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:3:5:0:1:3:5:0:1
chr6	32629210	.	C	T	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.043953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.98;QD=30.7904;RBI=0.0486828;REFB=-0.0194703;REVB=0.0209321;RO=1;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125393;STB=0.571246;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00208264;OID=.;OPOS=32629210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:3:5:0:1:3:5:0:1
chr6	32629802	.	A	G	507.03	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114195;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.566;QD=59.6501;RBI=0.0199058;REFB=0;REVB=0.0163044;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00233314;OID=.;OPOS=32629802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr6	32629809	.	C	T	553.38	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9963;QD=59.8246;RBI=0.0147137;REFB=0;REVB=0.00914927;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202733;OID=.;OPOS=32629809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:21:16:0:0:21:16:0:0
chr6	32629847	.	A	G	836.14	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0265746;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.4984;QD=55.7428;RBI=0.0550966;REFB=-0.00980265;REVB=-0.0482642;RO=1;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017801;STB=0.509431;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-0.000513961;OID=.;OPOS=32629847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:26:33:0:1:26:33:0:1
chr6	32629859	.	A	G	1038.15	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.883;QD=59.3229;RBI=0.0148395;REFB=0;REVB=-0.00240479;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.06832e-05;OID=.;OPOS=32629859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:30:39:0:0:31:39:0:0
chr6	32629889	.	G	A	1320.94	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00924577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.358;QD=62.1618;RBI=0.0453582;REFB=0;REVB=0.0444059;RO=0;SAF=46;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105508;OID=.;OPOS=32629889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:39:46:0:0:39:46:0:0
chr6	32629904	.	A	G	1420.63	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.529;QD=62.4452;RBI=0.0420794;REFB=0;REVB=0.00875329;RO=0;SAF=48;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90986e-05;OID=.;OPOS=32629904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:88:91:0:0:88:91:1:40:48:0:0:42:49:0:0
chr6	32632642	.	C	T	1662.26	PASS	AF=0.991071;AO=110;DP=111;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0331578;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.759;QD=59.3663;RBI=0.0449304;REFB=-0.103962;REVB=0.0303199;RO=0;SAF=61;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504064;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.000145133;OID=.;OPOS=32632642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:111:112:0:1:110:111:0.991071:49:61:0:0:50:61:1:0
chr6	32632650	.	C	T	1576.75	PASS	AF=0.981651;AO=107;DP=109;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00280591;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.506;QD=57.8623;RBI=0.0238844;REFB=-0.061584;REVB=0.023719;RO=2;SAF=58;SAR=49;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00147464;STB=0.500777;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.000180772;OID=.;OPOS=32632650;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:109:109:2:2:107:107:0.981651:49:58:1:1:49:58:1:1
chr6	32632659	.	CT	TG	1378.74	PASS	AF=0.989691;AO=92;DP=98;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0548065;FXX=0.0396;HRUN=1;LEN=2;MLLD=227.018;QD=56.8552;RBI=0.0552448;REFB=-0.0774469;REVB=0.00694495;RO=0;SAF=45;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9386e-08;STB=0.505049;STBP=0.518;TYPE=mnp;VARB=0.000605812;OID=.;OPOS=32632659;OREF=CT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:98:97:0:1:92:96:0.989691:47:45:0:0:47:49:1:0
chr6	32632687	.	A	G	1006.26	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.816;QD=58.3341;RBI=0.053181;REFB=0;REVB=0.0135566;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000500434;OID=.;OPOS=32632687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:63:69:0:0:63:69:1:33:30:0:0:33:36:0:0
chr6	32632714	.	G	C	563.79	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0119195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.554;QD=57.8246;RBI=0.0119428;REFB=0.0387605;REVB=0.000746331;RO=1;SAF=12;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374416;STB=0.519989;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=-0.00139455;OID=.;OPOS=32632714;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:26:12:1:0:26:12:1:0
chr6	32632717	.	G	A	565.08	PASS	AF=0.928571;AO=39;DP=42;FAO=39;FDP=42;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00495795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.928;QD=53.8168;RBI=0.0138797;REFB=-0.00606502;REVB=0.012964;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.548362;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.000459865;OID=.;OPOS=32632717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:42:42:0:3:39:39:0.928571:25:14:0:0:25:14:3:0
chr6	32632745	.	G	A	382.68	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0234981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.195;QD=52.7838;RBI=0.0353741;REFB=-0.173909;REVB=0.0264417;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516118;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0036641;OID=.;OPOS=32632745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:0:1:28:28:0.965517:15:13:0:0:15:13:0:1
chr6	32632749	.	A	C	358.26	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0130288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.759;QD=55.1163;RBI=0.0268899;REFB=0;REVB=-0.0235227;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000437317;OID=.;OPOS=32632749;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:14:11:0:0:15:11:0:0
chr6	32632781	.	AG	TA	106.12	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441657;FXX=0.0908265;HRUN=2;LEN=2;MLLD=96.9148;QD=42.4485;RBI=0.0512844;REFB=0;REVB=-0.0260669;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000518497;OID=.;OPOS=32632781;OREF=AG;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr6	32632801	.	G	A	105.66	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191384;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.653;QD=42.2636;RBI=0.0236875;REFB=0;REVB=-0.0139577;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00192012;OID=.;OPOS=32632801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr6	32632820	.	C	G	115.99	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.151165;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0575;QD=42.1772;RBI=0.165657;REFB=0;REVB=0.0677596;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0114629;OID=.;OPOS=32632820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0
chr6	32632833	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0655276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.498;QD=40.7629;RBI=0.0677382;REFB=0;REVB=-0.0171639;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000488946;OID=.;OPOS=32632833;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr6	32636217	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.003;QD=48.7373;RBI=0.0176189;REFB=0;REVB=-0.0112115;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203806;OID=.;OPOS=32636217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr6	32636221	.	T	G	206.98	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4248;QD=48.7005;RBI=0.0616077;REFB=0;REVB=0.0607332;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223554;OID=.;OPOS=32636221;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr6	32636262	.	C	A	187.82	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000588149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.585;QD=46.955;RBI=0.00308307;REFB=0;REVB=0.00302645;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59485e-05;OID=.;OPOS=32636262;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:8:7:0:0:8:8:0:0
chr6	32636385	.	A	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00911313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.65;QD=35.5755;RBI=0.00949835;REFB=0;REVB=0.0026776;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000242608;OID=.;OPOS=32636385;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr6	32636432	.	AA	AG,GG	114.11	PASS	AF=0.818182,0.181818;AO=9,2;DP=11;FAO=9,2;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=1,0;FSAR=8,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398028,0.0185801;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=193.374,31.0436;QD=41.4947;RBI=0.0399121,0.0204647;REFB=0,0;REVB=0.00295125,0.00857799;RO=0;SAF=1,0;SAR=8,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0244057,-0.0099572;OID=.,.;OPOS=32636433,32636432;OREF=A,AA;OALT=G,GG;OMAPALT=AG,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:11:11:0:0:9,2:9,2:0.818182,0.181818:8,2:1,0:0:0:8,2:1,0:0:0
chr6	32709309	.	A	G	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.982;QD=57.1774;RBI=0.0446636;REFB=0;REVB=0.0406972;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153901;OID=.;OPOS=32709309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:28:23:0:0:28:23:0:0
chr6	32713030	.	T	C	1195.29	PASS	AF=0.486166;AO=123;DP=253;FAO=123;FDP=253;FR=.;FRO=130;FSAF=64;FSAR=59;FSRF=69;FSRR=61;FWDB=0.0326848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.947;QD=18.8979;RBI=0.0329839;REFB=-0.0159683;REVB=-0.00443186;RO=130;SAF=64;SAR=59;SRF=69;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00977672;STB=0.505377;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0177947;OID=.;OPOS=32713030;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:253:253:130:130:123:123:0.486166:59:64:69:61:59:64:69:61
chr6	32713044	.	C	T	1252.18	PASS	AF=0.51046;AO=120;DP=238;FAO=122;FDP=239;FR=.;FRO=117;FSAF=66;FSAR=56;FSRF=64;FSRR=53;FWDB=0.000880755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.844;QD=20.9569;RBI=0.00715281;REFB=-0.0229158;REVB=-0.00709838;RO=117;SAF=65;SAR=55;SRF=64;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00484563;STB=0.50297;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0190587;OID=.;OPOS=32713044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:238:239:117:117:120:122:0.51046:55:65:64:53:56:66:64:53
chr6	32724258	.	C	T	110.86	PASS	AF=0.239437;AO=17;DP=72;FAO=17;FDP=71;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0160478;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.539;QD=6.24588;RBI=0.0560468;REFB=-0.00406153;REVB=-0.0537002;RO=54;SAF=12;SAR=5;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303022;STB=0.687802;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0155868;OID=.;OPOS=32724258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:54:54:17:17:0.239437:5:12:25:29:5:12:25:29
chr6	32725062	.	T	A	257.83	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00353853;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.404;QD=21.0476;RBI=0.0388809;REFB=-0.0335225;REVB=0.0387196;RO=23;SAF=13;SAR=13;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182825;STB=0.510196;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0340756;OID=.;OPOS=32725062;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:23:23:26:26:0.530612:13:13:12:11:13:13:12:11
chr6	32725619	.	TG	CA,CG	1161.03	PASS	AF=0.360465,0.593023;AO=31,51;DP=86;FAO=31,51;FDP=86;FR=.;FRO=4;FSAF=16,21;FSAR=15,30;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0249758,0.00572361;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=102.105,94.5302;QD=54.0015;RBI=0.0265206,0.0113372;REFB=-0.0596222,-0.0607269;REVB=-0.00891913,-0.00978632;RO=4;SAF=16,21;SAR=15,30;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0498038,-0.0472512;STB=0.526785,0.525154;STBP=0.374,0.208;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00192059,0.010423;OID=.,.;OPOS=32725619,32725619;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:86:86:4:4:31,51:31,51:0.360465,0.593023:15,30:16,21:3:1:15,30:16,21:3:1
chr6	32725625	.	T	C	298.33	PASS	AF=0.386364;AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=4.38255e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.04;QD=13.5604;RBI=0.0185854;REFB=-0.00900886;REVB=-0.0185854;RO=54;SAF=18;SAR=16;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11094;STB=0.563212;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0143477;OID=.;OPOS=32725625;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:54:54:34:34:0.386364:16:18:23:31:16:18:23:31
chr6	32726803	.	C	T	521.66	PASS	AF=0.451613;AO=56;DP=125;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=41;FWDB=0.0154256;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.954;QD=16.8278;RBI=0.0206399;REFB=-0.000734593;REVB=0.0137134;RO=68;SAF=32;SAR=24;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170474;STB=0.594932;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00106631;OID=.;OPOS=32726803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:124:68:68:56:56:0.451613:24:32:27:41:24:32:27:41
chr6	32726838	.	C	T	1752.8	PASS	AF=1;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0435626;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.31;QD=60.9668;RBI=0.0561297;REFB=0;REVB=0.0353955;RO=0;SAF=55;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.60935e-06;OID=.;OPOS=32726838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:115:0:0:115:115:1:60:55:0:0:60:55:0:0
chr6	32729459	.	C	T	1121.17	PASS	AF=0.987013;AO=75;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0283551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.299;QD=58.2424;RBI=0.0456974;REFB=-0.0679415;REVB=0.0358363;RO=2;SAF=56;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158762;STB=0.504424;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.00078817;OID=.;OPOS=32729459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:2:1:75:76:0.987013:19:56:1:1:20:56:1:0
chr6	32729642	.	G	C	1805.69	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00724997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.764;QD=61.21;RBI=0.0423849;REFB=0;REVB=0.0417603;RO=0;SAF=63;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.20366e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.54992e-05;OID=.;OPOS=32729642;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:118:0:0:115:118:1:52:63:0:0:55:63:0:0
chr6	32782897	.	C	T	581.76	PASS	AF=0.56383;AO=49;DP=91;FAO=53;FDP=94;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.0246304;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.404;QD=24.7557;RBI=0.0606529;REFB=-0.0338342;REVB=0.0554267;RO=42;SAF=25;SAR=24;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051434;STB=0.530674;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.02326;OID=.;OPOS=32782897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:94:42:41:49:53:0.56383:24:25:24:18:27:26:23:18
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chr6	32796653	.	C	A	365.92	PASS	AF=0.348837;AO=45;DP=129;FAO=45;FDP=129;FR=.;FRO=84;FSAF=36;FSAR=9;FSRF=56;FSRR=28;FWDB=-0.000104191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.511;QD=11.3462;RBI=0.0114744;REFB=-0.0210419;REVB=-0.011474;RO=80;SAF=36;SAR=9;SRF=56;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154402;STB=0.61661;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0324716;OID=.;OPOS=32796653;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:80:84:45:45:0.348837:9:36:56:24:9:36:56:28
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chr6	32948462	.	G	A	142.38	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0471795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0532;QD=14.2381;RBI=0.0505444;REFB=-0.025578;REVB=-0.0181338;RO=23;SAF=11;SAR=5;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179752;STB=0.619051;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0495881;OID=.;OPOS=32948462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:24:16:16:0.4:5:11:12:11:5:11:12:12
chr6	32948607	.	C	T	192.7	PASS	AF=1;AO=6;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222216;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=211.957;QD=45.3415;RBI=0.024344;REFB=0;REVB=0.00994137;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00033123;OID=.;OPOS=32948607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:17:17:0:0:6:17:1:3:3:0:0:7:10:0:0
chr6	32948804	.	C	T	1098.68	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3233;QD=60.2017;RBI=0.0218281;REFB=0;REVB=-0.00830945;RO=0;SAF=28;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11247e-05;OID=.;OPOS=32948804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:44:28:0:0:44:29:0:0
chr6	32974934	.	G	A	259.03	PASS	AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0170088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.192;QD=24.0962;RBI=0.0182054;REFB=-0.0564252;REVB=0.0064914;RO=17;SAF=19;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246462;STB=0.622054;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.00704983;OID=.;OPOS=32974934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:17:19:24:24:0.55814:5:19:9:8:5:19:11:8
chr6	32975014	.	T	C	728.86	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.1749;QD=57.1655;RBI=0.0151664;REFB=0;REVB=-0.00177334;RO=0;SAF=35;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5765e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.78398e-05;OID=.;OPOS=32975014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:16:35:0:0:16:35:0:0
chr6	32975257	.	C	T	1661.29	PASS	AF=0.991071;AO=111;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=72;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0569523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3856;QD=59.3319;RBI=0.0586585;REFB=0.0201797;REVB=0.014045;RO=1;SAF=39;SAR=72;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120167;STB=0.506328;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.000129497;OID=.;OPOS=32975257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:112:112:1:1:111:111:0.991071:72:39:1:0:72:39:1:0
chr6	32975808	.	G	A	421.81	PASS	AF=0.395161;AO=49;DP=124;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=51;FSRR=24;FWDB=-0.00564479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.549;QD=13.6068;RBI=0.0838487;REFB=-0.0269588;REVB=0.0836585;RO=74;SAF=32;SAR=17;SRF=51;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0431377;STB=0.518171;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0383597;OID=.;OPOS=32975808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:74:75:49:49:0.395161:17:32:51:23:17:32:51:24
chr6	32975869	.	G	A	215.66	PASS	AF=0.295918;AO=28;DP=90;FAO=29;FDP=98;FR=.;FRO=69;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=34;FWDB=-0.0269664;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7855;QD=8.80224;RBI=0.029145;REFB=-0.0366784;REVB=0.0110565;RO=53;SAF=10;SAR=18;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912282;STB=0.591365;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0937183;OID=.;OPOS=32975869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:98:53:69:28:29:0.295918:18:10:23:30:18:11:35:34
chr6	33036435	.	T	G	356.48	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00965207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6355;QD=54.8427;RBI=0.240536;REFB=0;REVB=0.240342;RO=0;SAF=23;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.66402e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00257026;OID=.;OPOS=33036435;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:1:23:0:0:2:24:0:0
chr6	33036505	.	GA	AC,CA	729.06	PASS	AF=0.037037,0.944444;AO=2,43;DP=53;FAO=2,51;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=2,32;FSAR=0,19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00257234,0.0104565;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=89.1645,126.962;QD=54.0042;RBI=0.00261586,0.0426923;REFB=-0.0925261,-0.085254;REVB=-0.000475147,0.0413919;RO=1;SAF=2,25;SAR=0,18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0184156;STB=0.5,0.507689;STBP=1,0.539;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0559267,0.00112194;OID=.,.;OPOS=33036505,33036505;OREF=GA,G;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:53:54:1:1:2,43:2,51:0.037037,0.944444:0,18:2,25:1:0:0,19:2,32:1:0
chr6	33036853	.	A	C	1199.42	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=81;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0403103;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2947;QD=59.9711;RBI=0.0419945;REFB=0.00187085;REVB=0.0117738;RO=1;SAF=49;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0095643;STB=0.505049;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000185285;OID=.;OPOS=33036853;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:80:1:1:79:79:0.9875:30:49:1:0:30:49:1:0
chr6	33036951	.	A	G	1176.97	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.479;QD=59.5936;RBI=0.0527135;REFB=0;REVB=0.0400522;RO=0;SAF=47;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000958196;OID=.;OPOS=33036951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:77:79:1:30:47:0:0:30:49:0:0
chr6	33036959	.	G	A	1282.35	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466514;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.454;QD=61.7999;RBI=0.047068;REFB=0;REVB=0.00624808;RO=0;SAF=52;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.34826e-05;OID=.;OPOS=33036959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:82:83:1:30:52:0:0:30:53:0:0
chr6	33036971	.	C	T	1241.55	PASS	AF=1;AO=80;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0766585;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.281;QD=60.5632;RBI=0.0808017;REFB=-0.0482012;REVB=-0.0255418;RO=1;SAF=51;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00919411;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396257;OID=.;OPOS=33036971;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:82:82:1:0:80:82:1:29:51:1:0:29:53:0:0
chr6	33036977	.	G	A	485.4	PASS	AF=0.554217;AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=0.0322082;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.439;QD=23.3927;RBI=0.0560805;REFB=-0.0217295;REVB=0.0459092;RO=36;SAF=28;SAR=18;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0977501;STB=0.558037;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0139789;OID=.;OPOS=33036977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:36:37:46:46:0.554217:18:28:26:10:18:28:27:10
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chr6	33036999	.	T	C	949.34	PASS	AF=0.875;AO=69;DP=79;FAO=70;FDP=80;FR=.;FRO=10;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.0217301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.041;QD=47.4668;RBI=0.0546398;REFB=-0.0558052;REVB=0.0501329;RO=10;SAF=43;SAR=26;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0981334;STB=0.551006;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0503909;OID=.;OPOS=33036999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:79:80:10:10:69:70:0.875:26:43:10:0:26:44:10:0
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chr6	33256397	.	G	A	291.52	PASS	AF=0.714286;AO=25;DP=35;FAO=25;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0100674;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.834;QD=33.3166;RBI=0.0109544;REFB=-0.0159134;REVB=-0.0043181;RO=10;SAF=14;SAR=11;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021243;STB=0.511619;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00639393;OID=.;OPOS=33256397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:35:10:10:25:25:0.714286:11:14:6:4:11:14:6:4
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chr6	33333446	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.099;QD=42.1826;RBI=0.03707;REFB=0;REVB=0.0254591;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000495464;OID=.;OPOS=33333446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr6	33333916	.	G	T	483.19	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00684613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.765;QD=58.5682;RBI=0.0346;REFB=0;REVB=0.0339159;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.10732e-05;OID=.;OPOS=33333916;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:12:20:0:0:13:20:0:0
chr6	33382288	.	G	A	1289.24	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0749771;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.361;QD=60.6699;RBI=0.0798913;REFB=0;REVB=0.0275873;RO=0;SAF=21;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170156;OID=.;OPOS=33382288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:85:0:0:80:85:1:59:21:0:0:62:23:0:0
chr6	33408542	.	G	A	785.03	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00270694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.898;QD=57.0933;RBI=0.0220799;REFB=0;REVB=0.0219133;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.80982e-05;OID=.;OPOS=33408542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0
chr6	33420410	.	GCCCCCCCC	GCCCCCCCG,GCCCCCCC	75.51	PASS	AF=0,1;AO=2,2;DP=17;FAO=0,17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=0,11;FSAR=0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0297622,0.0453657;FXX=0.0555247;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=32.858,6.58644;QD=17.768;RBI=0.309582,0.242829;REFB=0.0464724,0.1545;REVB=-0.308148,-0.238554;RO=1;SAF=0,1;SAR=2,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.697199,-0.25849;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0,-0.0222467;OID=.,.;OPOS=33420418,33420411;OREF=C,C;OALT=G,-;OMAPALT=GCCCCCCCG,GCCCCCCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,1:2,2:17:0,17:17:0:0,11:0,6:0:0:4:1:0,1:2,1:1:0
chr6	33422976	.	T	G	809.43	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0273;QD=56.8024;RBI=0.113282;REFB=0;REVB=0.109064;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146487;OID=.;OPOS=33422976;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:57:0:0:56:57:1:25:31:0:0:25:32:0:0
chr6	33541507	.	A	G	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0747774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.392;QD=63.2868;RBI=0.0767293;REFB=0;REVB=0.0171969;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112246;OID=.;OPOS=33541507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0
chr6	33560896	.	A	G	55.82	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.000958499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.759;QD=10.6321;RBI=0.0497928;REFB=-0.00713856;REVB=-0.0497836;RO=13;SAF=6;SAR=2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743475;STB=0.545336;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0231675;OID=.;OPOS=33560896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:2:6:9:4:2:6:9:4
chr6	33636907	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.103;QD=59.4354;RBI=0.0523741;REFB=0;REVB=0.0320648;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396591;OID=.;OPOS=33636907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:25:10:0:0:25:10:0:0
chr6	33638180	.	C	T	1100.19	PASS	AF=0.974026;AO=74;DP=77;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0572341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.791;QD=57.1528;RBI=0.0678613;REFB=-0.135084;REVB=0.0364611;RO=3;SAF=38;SAR=36;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0358907;STB=0.512497;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.000913605;OID=.;OPOS=33638180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:77:3:2:74:75:0.974026:36:38:3:0:36:39:2:0
chr6	33638300	.	G	A	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.107914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.753;QD=12.6373;RBI=0.109467;REFB=-0.0108757;REVB=0.0183714;RO=21;SAF=2;SAR=11;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490583;STB=0.793315;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0103314;OID=.;OPOS=33638300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:11:2:12:9:11:2:12:9
chr6	33641379	.	T	C	1098.43	PASS	AF=1;AO=62;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.068;QD=60.1878;RBI=0.0343239;REFB=0;REVB=0.00651949;RO=0;SAF=42;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.11913e-05;OID=.;OPOS=33641379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:62:73:1:20:42:0:0:30:43:0:0
chr6	33648228	.	C	T	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204178;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=333.395;QD=59.6795;RBI=0.0408457;REFB=0;REVB=0.0353763;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.08466e-05;OID=.;OPOS=33648228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:33:37:0:0:33:37:0:0
chr6	33653448	.	C	T	1098.29	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.288;QD=60.1802;RBI=0.0337121;REFB=0;REVB=0.028047;RO=0;SAF=45;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.82047e-05;OID=.;OPOS=33653448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:27:45:0:0:28:45:0:0
chr6	33659472	.	C	G	989.1	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4732;QD=59.0507;RBI=0.0155152;REFB=0;REVB=0.00158178;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.9607e-05;OID=.;OPOS=33659472;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:67:0:0:65:67:1:36:29:0:0:37:30:0:0
chr6	33690796	.	CA	TG	655.99	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00421598;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=2;MLLD=197.781;QD=62.4747;RBI=0.0211798;REFB=0;REVB=0.0207559;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000118841;OID=.;OPOS=33690796;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr6	33739118	.	C	CA	147.89	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00817672;FXX=0.0681663;HRUN=1;LEN=1;MLLD=30.4472;QD=14.4281;RBI=0.0374734;REFB=0.0271251;REVB=0.0365704;RO=22;SAF=8;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166943;STB=0.516114;STBP=0.856;TYPE=ins;VARB=-0.0237154;OID=.;OPOS=33739119;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.512195:21:44:21:41:20:8:13:7:13:99:22:8:13:8:14
chr6	33739960	.	A	G	817.66	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0461;QD=57.3796;RBI=0.0612155;REFB=0;REVB=0.0316683;RO=0;SAF=41;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000819106;OID=.;OPOS=33739960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:16:41:0:0:16:41:0:0
chr6	33740025	.	C	T	95.91	PASS	AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.8655;QD=22.5673;RBI=0.0967349;REFB=-0.0691543;REVB=0.0967349;RO=6;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0448923;OID=.;OPOS=33740025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:11:0:0:6:11:0:0:6
chr6	33768897	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.187;QD=52.6132;RBI=0.0258016;REFB=0;REVB=0.017583;RO=0;SAF=5;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194856;OID=.;OPOS=33768897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:17:5:0:0:17:5:0:0
chr6	34008006	.	A	G	127.73	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00972814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.1237;QD=11.8814;RBI=0.0299435;REFB=-0.000211961;REVB=0.0283191;RO=28;SAF=3;SAR=12;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.435423;STB=0.759632;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.00174714;OID=.;OPOS=34008006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:12:3:16:12:12:3:16:12
chr6	34069822	.	G	A	165.14	PASS	AF=0.27381;AO=23;DP=84;FAO=23;FDP=84;FR=.;FRO=61;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0171747;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.471;QD=7.86375;RBI=0.0172545;REFB=-0.00623378;REVB=0.00165664;RO=57;SAF=12;SAR=11;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573422;STB=0.52172;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0194652;OID=.;OPOS=34069822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:57:61:23:23:0.27381:11:12:27:30:11:12:30:31
chr6	34078463	.	G	A	99.09	PASS	AF=0.733333;AO=10;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0753363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3441;QD=26.4237;RBI=0.0818905;REFB=-0.0355262;REVB=0.0321012;RO=4;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162992;STB=0.583201;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0150314;OID=.;OPOS=34078463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:15:15:4:4:10:11:0.733333:9:1:0:4:10:1:0:4
chr6	34212743	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3702;QD=56.1911;RBI=0.00624351;REFB=0;REVB=0.00624351;RO=0;SAF=0;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.04756e-05;OID=.;OPOS=34212743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:23:28:1:23:0:0:0:28:0:0:0
chr6	34213295	.	G	GC	469.57	PASS	AF=1;AO=5;DP=48;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.144539;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=98.0643;QD=41.7397;RBI=0.146374;REFB=0;REVB=0.0231087;RO=43;SAF=5;SAR=0;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.573219;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000596933;OID=.;OPOS=34213296;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:48:45:45:0:27:18:0:0:9:43:5:0:25:18
chr6	34213296	.	T	C	707.49	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00434364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.887;QD=62.888;RBI=0.0195287;REFB=0;REVB=0.0190395;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.85827e-05;OID=.;OPOS=34213296;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0
chr6	34213868	.	A	G	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00929057;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.166;QD=49.5987;RBI=0.0108323;REFB=0;REVB=0.00556994;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.4247e-05;OID=.;OPOS=34213868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr6	34214322	.	C	G	716.0	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00799061;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=136.389;QD=60.9358;RBI=0.0106949;REFB=-0.170219;REVB=0.00710851;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.508768;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000760684;OID=.;OPOS=34214322;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:47:47:0:1:46:46:0.978723:18:28:0:0:18:28:1:0
chr6	34502687	.	T	C	1973.12	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.349;QD=62.1456;RBI=0.0445571;REFB=0;REVB=0.0427467;RO=0;SAF=57;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21959e-05;OID=.;OPOS=34502687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:116:127:0:0:116:127:1:59:57:0:0:68:59:0:0
chr6	34557374	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.706;QD=55.6558;RBI=0.0342134;REFB=0;REVB=-0.00183236;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011732;OID=.;OPOS=34557374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr6	34803947	.	C	T	207.57	PASS	AF=0.418182;AO=22;DP=56;FAO=23;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00167414;FXX=0.017854;HRUN=5;LEN=1;MLLD=236.368;QD=15.0959;RBI=0.0132664;REFB=-0.021857;REVB=0.0131604;RO=24;SAF=18;SAR=4;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322761;STB=0.691459;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0200128;OID=.;OPOS=34803947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:24:30:22:23:0.418182:4:18:13:11:4:19:17:13
chr6	34824107	.	A	C	405.57	PASS	AF=0.5;AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=29;FWDB=0.0348204;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.054;QD=19.7838;RBI=0.0360174;REFB=-0.0259365;REVB=-0.00920821;RO=41;SAF=23;SAR=18;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238248;STB=0.631732;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0307402;OID=.;OPOS=34824107;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:41:41:41:41:0.5:18:23:12:29:18:23:12:29
chr6	34824636	.	A	G	246.83	PASS	AF=0.510638;AO=23;DP=46;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.00327982;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.416;QD=21.0065;RBI=0.0330114;REFB=-0.022433;REVB=0.032848;RO=23;SAF=7;SAR=16;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347679;STB=0.699296;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0143218;OID=.;OPOS=34824636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:23:23:23:24:0.510638:16:7:16:7:17:7:16:7
chr6	34831866	.	G	A	612.98	PASS	AF=0.441379;AO=64;DP=144;FAO=64;FDP=145;FR=.;FRO=81;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=54;FWDB=0.0159356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.246;QD=16.9099;RBI=0.022451;REFB=-0.00423852;REVB=-0.0158147;RO=80;SAF=30;SAR=34;SRF=27;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132937;STB=0.576648;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00733131;OID=.;OPOS=34831866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:145:80:81:64:64:0.441379:34:30:27:53:34:30:27:54
chr6	34977663	.	C	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.065976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2382;QD=40.7624;RBI=0.072805;REFB=0;REVB=0.0307853;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00333508;OID=.;OPOS=34977663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr6	35005993	.	A	G	267.31	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=23;FSRR=6;FWDB=0.0143397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.119;QD=18.4349;RBI=0.0146249;REFB=-0.0237545;REVB=0.00287413;RO=29;SAF=16;SAR=13;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225847;STB=0.625075;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.013691;OID=.;OPOS=35005993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:13:16:23:6:13:16:23:6
chr6	35027927	.	T	C	2260.95	PASS	AF=0.993056;AO=142;DP=144;FAO=143;FDP=144;FR=.;FRO=1;FSAF=85;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00566544;FXX=0.00689608;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.945;QD=62.8043;RBI=0.0388922;REFB=0.0722689;REVB=-0.0384774;RO=1;SAF=84;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00812768;STB=0.504273;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.000192288;OID=.;OPOS=35027927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:144:144:1:1:142:143:0.993056:58:84:0:1:58:85:0:1
chr6	35050506	.	G	A	1011.8	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.897;QD=57.8174;RBI=0.0622244;REFB=0;REVB=0.0182006;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00290166;OID=.;OPOS=35050506;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:64:70:0:0:63:70:1:26:37:0:0:27:43:0:0
chr6	35203203	.	T	G	452.35	PASS	AF=0.904762;AO=29;DP=42;FAO=38;FDP=42;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0157515;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=174.173;QD=43.0807;RBI=0.0315553;REFB=-0.0889095;REVB=0.0273428;RO=0;SAF=23;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529397;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00269608;OID=.;OPOS=35203203;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:42:42:0:4:29:38:0.904762:6:23:0:0:6:32:4:0
chr6	35216740	.	G	A	118.31	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=-0.0170391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4022;QD=12.7905;RBI=0.0179488;REFB=0.00844567;REVB=-0.00564166;RO=22;SAF=6;SAR=8;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337442;STB=0.699773;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=-0.0142269;OID=.;OPOS=35216740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:23:14:14:0.378378:8:6:3:19:8:6:3:20
chr6	35260503	.	C	T	782.76	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.206;QD=63.8989;RBI=0.0538278;REFB=0;REVB=0.0210218;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173734;OID=.;OPOS=35260503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:46:49:1:23:23:0:0:25:24:0:0
chr6	35260530	.	C	T	641.61	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0979794;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6503;QD=61.106;RBI=0.115491;REFB=0;REVB=0.0611408;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202626;OID=.;OPOS=35260530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:16:25:0:0:17:25:0:0
chr6	35263555	.	A	G	760.32	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0280419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8903;QD=62.0673;RBI=0.0746857;REFB=-0.0539012;REVB=0.0692214;RO=1;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149366;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161725;OID=.;OPOS=35263555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:49:49:1:0:48:49:1:31:17:0:1:32:17:0:0
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chr6	35395795	.	G	C	233.21	PASS	AF=0.308411;AO=28;DP=104;FAO=33;FDP=107;FR=.;FRO=74;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=53;FWDB=-0.00132893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5854;QD=8.71802;RBI=0.0166063;REFB=-0.0138652;REVB=-0.0165531;RO=74;SAF=12;SAR=16;SRF=21;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187588;STB=0.640288;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0192113;OID=.;OPOS=35395795;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:107:74:74:28:33:0.308411:16:12:21:53:17:16:21:53
chr6	35423662	.	A	C	114.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0141428;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.957;QD=16.9231;RBI=0.0144342;REFB=-0.0101363;REVB=0.00288554;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034656;STB=0.519969;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.00907882;OID=.;OPOS=35423662;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:27:14:14:13:13:0.481481:7:6:7:7:7:6:7:7
chr6	35477025	.	C	G	650.87	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0073877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.749;QD=61.9877;RBI=0.0149872;REFB=0;REVB=0.0130398;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.26487e-05;OID=.;OPOS=35477025;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
chr6	35479574	.	G	C	160.36	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0785422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.773;QD=45.8159;RBI=0.0823038;REFB=0;REVB=0.0245976;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000494169;OID=.;OPOS=35479574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:9:4:0:0:10:4:0:0
chr6	35705892	.	T	C	218.21	PASS	AF=0.947368;AO=16;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00528786;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5637;QD=45.9381;RBI=0.0407351;REFB=-0.0116852;REVB=-0.0403904;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526287;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000122226;OID=.;OPOS=35705892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:0:1:16:18:0.947368:9:7:0:0:9:9:0:1
chr6	35745655	.	C	T	579.09	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0917376;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.205;QD=60.9573;RBI=0.0923042;REFB=0;REVB=0.0102112;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461302;OID=.;OPOS=35745655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr6	35803192	.	C	A	209.93	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0182205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3311;QD=15.5504;RBI=0.0249019;REFB=-0.0206769;REVB=0.0169741;RO=30;SAF=13;SAR=11;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19378;STB=0.609092;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0315849;OID=.;OPOS=35803192;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:11:13:22:8:11:13:22:8
chr6	35888067	.	G	C	252.15	PASS	AF=0.758621;AO=22;DP=29;FAO=22;FDP=29;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0242741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.241;QD=34.7792;RBI=0.0243338;REFB=-0.108134;REVB=0.00170409;RO=7;SAF=14;SAR=8;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375629;STB=0.520529;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0123204;OID=.;OPOS=35888067;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:7:7:22:22:0.758621:8:14:5:2:8:14:5:2
chr6	36027142	.	A	G	266.34	PASS	AF=0.531915;AO=24;DP=46;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0353088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.122;QD=22.6673;RBI=0.051731;REFB=-0.0211755;REVB=0.0378072;RO=22;SAF=14;SAR=10;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297294;STB=0.669293;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.011795;OID=.;OPOS=36027142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:22:22:24:25:0.531915:10:14:5:17:10:15:5:17
chr6	36098410	.	A	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.997;QD=35.5759;RBI=0.0309571;REFB=0;REVB=0.0309571;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000349602;OID=.;OPOS=36098410;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0
chr6	36168297	.	A	T	191.53	PASS	AF=0.403509;AO=21;DP=55;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0566557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8877;QD=13.441;RBI=0.153651;REFB=-0.0155733;REVB=0.142824;RO=34;SAF=10;SAR=11;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375939;STB=0.503873;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0273611;OID=.;OPOS=36168297;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:34:34:21:23:0.403509:11:10:15:19:13:10:15:19
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chr6	36931162	.	A	G	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.246;QD=50.4094;RBI=0.0584465;REFB=0;REVB=0.0429793;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00056465;OID=.;OPOS=36931162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr6	36931364	.	C	G	259.09	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-1.2641e-05;FXX=0.0555453;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.149;QD=20.3207;RBI=0.0176182;REFB=-0.0348557;REVB=-0.0176182;RO=24;SAF=14;SAR=13;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0156365;STB=0.508714;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0252687;OID=.;OPOS=36931364;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:51:24:24:27:27:0.529412:13:14:12:12:13:14:12:12
chr6	36936697	.	T	C	457.2	PASS	AF=0.47619;AO=49;DP=103;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=0.0102623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4406;QD=17.4171;RBI=0.0228818;REFB=-0.00523955;REVB=-0.0204515;RO=53;SAF=29;SAR=20;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0066984;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0103984;OID=.;OPOS=36936697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:105:53:55:49:50:0.47619:20:29:31:22:20:30:33:22
chr6	36937798	.	G	A	86.3	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00532419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.303;QD=12.3284;RBI=0.011858;REFB=0.00461436;REVB=-0.0105955;RO=17;SAF=8;SAR=3;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2224;STB=0.632838;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.00767929;OID=.;OPOS=36937798;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:3:8:9:8:3:8:9:8
chr6	36943513	.	G	C	154.13	PASS	AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0588633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.581;QD=15.0372;RBI=0.0592253;REFB=-0.00609733;REVB=0.0065386;RO=23;SAF=11;SAR=6;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214446;STB=0.612768;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.016786;OID=.;OPOS=36943513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:24:17:17:0.414634:6:11:10:13:6:11:11:13
chr6	36945393	.	G	A	51.36	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.197011;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=31.0535;QD=10.2716;RBI=0.200338;REFB=-0.0702885;REVB=-0.0363573;RO=11;SAF=6;SAR=2;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.110317;OID=.;OPOS=36945393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:20:20:11:12:8:8:0.4:2:6:9:2:2:6:9:3
chr6	36945938	.	C	T	79.4	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0589685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4451;QD=15.8793;RBI=0.0600825;REFB=-0.00711951;REVB=-0.0115163;RO=8;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172877;STB=0.646773;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0114657;OID=.;OPOS=36945938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:8:10:10:10:0.5:6:4:5:3:6:4:7:3
chr6	36976637	.	G	C	1390.42	PASS	AF=0.968421;AO=91;DP=95;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0210869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.018;QD=58.5439;RBI=0.0508847;REFB=-0.170876;REVB=0.0463098;RO=0;SAF=46;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515461;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00130854;OID=.;OPOS=36976637;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:95:95:0:3:91:92:0.968421:45:46:0:0:45:47:3:0
chr6	36978834	.	A	G	277.57	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101873;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.086;QD=52.8712;RBI=0.0456872;REFB=0;REVB=0.0445369;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00048749;OID=.;OPOS=36978834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:12:9:0:0
chr6	36988364	.	C	T	284.65	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=6;FWDB=0.00065095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.819;QD=17.7909;RBI=0.00767745;REFB=-0.0100018;REVB=0.0076498;RO=33;SAF=20;SAR=11;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186374;STB=0.603207;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0117487;OID=.;OPOS=36988364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:11:20:27:6:11:20:27:6
chr6	36989349	.	AG	A	44.47	PASS	AF=0.261905;AO=5;DP=42;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0517577;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.8468;QD=4.23545;RBI=0.107398;REFB=-0.0359016;REVB=-0.094103;RO=29;SAF=1;SAR=4;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347276;STB=0.846701;STBP=0.018;TYPE=del;VARB=0.0866152;OID=.;OPOS=36989350;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.261905:5:42:11:42:31:1:10:14:17:44:29:1:4:14:15
chr6	36995222	.	G	A	396.03	PASS	AF=0.540541;AO=39;DP=74;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.00236029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.928;QD=21.407;RBI=0.0161492;REFB=-0.00793264;REVB=-0.0159758;RO=34;SAF=27;SAR=12;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315221;STB=0.662946;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00494277;OID=.;OPOS=36995222;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:34:34:39:40:0.540541:12:27:11:23:13:27:11:23
chr6	37138220	.	C	G	75.2	PASS	AF=1;AO=6;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.084;QD=37.599;RBI=0.280582;REFB=0;REVB=0.260231;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0053678;OID=.;OPOS=37138220;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:6:8:1:0:6:0:0:1:7:0:0
chr6	37180237	.	G	A	885.34	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00189533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.613;QD=58.0548;RBI=0.0137208;REFB=0;REVB=0.0135892;RO=0;SAF=31;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116274;OID=.;OPOS=37180237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:30:31:0:0:30:31:0:0
chr6	37180355	.	G	A	988.28	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.259;QD=59.0019;RBI=0.0401964;REFB=0;REVB=6.52361e-05;RO=0;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.80672e-05;OID=.;OPOS=37180355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:40:26:0:0:41:26:0:0
chr6	37180523	.	A	G	1366.72	PASS	AF=0.95098;AO=97;DP=102;FAO=97;FDP=102;FR=.;FRO=5;FSAF=63;FSAR=34;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00830994;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=37.5866;QD=53.597;RBI=0.00872357;REFB=-0.168106;REVB=0.00265435;RO=0;SAF=63;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-9.76468e-08;STB=0.50814;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00875707;OID=.;OPOS=37180523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:102:102:0:5:97:97:0.95098:34:63:0:0:34:63:4:1
chr6	37250112	.	A	G	262.98	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.117063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.218;QD=47.8142;RBI=0.121834;REFB=-0.0315087;REVB=0.0337592;RO=1;SAF=2;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18245;STB=0.59989;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.000776252;OID=.;OPOS=37250112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:19:2:1:0:19:2:1:0
chr6	37252210	.	C	T	767.36	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.107;QD=63.9464;RBI=0.0406827;REFB=0;REVB=0.0355771;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114543;OID=.;OPOS=37252210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:26:21:0:0:26:22:0:0
chr6	37288036	.	A	G	828.99	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0432476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.772;QD=57.172;RBI=0.0482162;REFB=0;REVB=0.0213179;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.67972e-05;OID=.;OPOS=37288036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:27:30:0:0:28:30:0:0
chr6	37349033	.	G	A	1026.39	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00390302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.073;QD=59.5008;RBI=0.0147532;REFB=0;REVB=-0.0142275;RO=0;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.38093e-05;OID=.;OPOS=37349033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:36:33:0:0:36:33:0:0
chr6	37450914	.	T	C	342.74	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00772318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.832;QD=21.4213;RBI=0.0101873;REFB=0.0153213;REVB=0.00664334;RO=29;SAF=24;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149721;STB=0.583041;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=-0.00901185;OID=.;OPOS=37450914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:11:24:15:14:11:24:15:14
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chr6	37800789	.	A	C	182.33	PASS	AF=0.365079;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.010296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.244;QD=11.5762;RBI=0.0108167;REFB=-0.00545448;REVB=-0.00331537;RO=40;SAF=18;SAR=5;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270537;STB=0.65875;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00758377;OID=.;OPOS=37800789;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:40:40:23:23:0.365079:5:18:23:17:5:18:23:17
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chr6	38121211	.	A	G	201.54	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=21;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.00625128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.067;QD=13.8993;RBI=0.0104412;REFB=-0.00873641;REVB=-0.00836304;RO=33;SAF=3;SAR=21;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366295;STB=0.709249;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00920819;OID=.;OPOS=38121211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:34:24:24:0.413793:21:3:12:21:21:3:12:22
chr6	38670837	.	G	A	493.14	PASS	AF=0.494845;AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=0.037555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2175;QD=20.3356;RBI=0.0628381;REFB=-0.0183002;REVB=0.050381;RO=48;SAF=15;SAR=33;SRF=16;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216682;STB=0.508193;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0189571;OID=.;OPOS=38670837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:48:49:48:48:0.494845:33:15:16:32:33:15:16:33
chr6	38747770	.	G	A	989.8	PASS	AF=0.958333;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0150522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.899;QD=54.989;RBI=0.0183221;REFB=-0.057707;REVB=0.0104467;RO=3;SAF=42;SAR=27;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00479308;STB=0.502537;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.00264595;OID=.;OPOS=38747770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:72:72:3:3:69:69:0.958333:27:42:2:1:27:42:2:1
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chr6	38750888	.	A	G	405.67	PASS	AF=0.446809;AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=36;FWDB=-0.0102117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.94;QD=17.2623;RBI=0.0113104;REFB=-0.00443749;REVB=0.00486289;RO=52;SAF=23;SAR=19;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234137;STB=0.630549;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00529859;OID=.;OPOS=38750888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:52:52:42:42:0.446809:19:23:16:36:19:23:16:36
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chr6	38841101	.	G	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0291156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.578;QD=56.1915;RBI=0.0293347;REFB=0;REVB=0.00357868;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.60263e-05;OID=.;OPOS=38841101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
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chr6	39851818	.	G	A	977.86	PASS	AF=1;AO=46;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0603634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=366.876;QD=59.2645;RBI=0.0604757;REFB=0;REVB=0.00368367;RO=0;SAF=10;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.72143e-05;OID=.;OPOS=39851818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:46:66:1:36:10:0:0:38:28:0:0
chr6	39864730	.	C	T	271.14	PASS	AF=0.666667;AO=24;DP=36;FAO=24;FDP=36;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0482723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.767;QD=30.1269;RBI=0.0529763;REFB=-0.0232528;REVB=0.0218236;RO=12;SAF=6;SAR=18;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180555;STB=0.599911;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00509872;OID=.;OPOS=39864730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:12:12:24:24:0.666667:18:6:6:6:18:6:6:6
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chr6	41196605	.	T	C	1054.33	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0570218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.155;QD=58.5738;RBI=0.05742;REFB=0;REVB=-0.00675067;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58478e-05;OID=.;OPOS=41196605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:65:72:0:0:64:72:1:26:38:0:0:26:46:0:0
chr6	41196727	.	C	T	458.65	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00991554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1004;QD=55.594;RBI=0.0238747;REFB=-0.0409516;REVB=0.0217182;RO=1;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266731;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00504677;OID=.;OPOS=41196727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:33:33:1:0:32:33:1:17:15:0:1:18:15:0:0
chr6	41197785	.	T	C	1018.06	PASS	AF=0.972222;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0303477;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.91;QD=56.559;RBI=0.0677209;REFB=-0.0230601;REVB=0.0605404;RO=2;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286275;STB=0.514702;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.000377484;OID=.;OPOS=41197785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:71:72:2:2:69:70:0.972222:32:37:0:2:33:37:0:2
chr6	41197857	.	C	T	937.51	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000109728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.251;QD=58.5944;RBI=0.0350036;REFB=0;REVB=0.0350034;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.45757e-05;OID=.;OPOS=41197857;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:26:38:0:0:26:38:0:0
chr6	41250466	.	T	A	610.44	PASS	AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0200242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.472;QD=56.7852;RBI=0.0252664;REFB=-0.0574938;REVB=0.0154085;RO=2;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407606;STB=0.521729;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00270701;OID=.;OPOS=41250466;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:43:43:2:2:41:41:0.953488:22:19:0:2:22:19:0:2
chr6	41270223	.	C	T	920.05	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0466388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.87;QD=58.4159;RBI=0.079127;REFB=0;REVB=-0.0639211;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000942253;OID=.;OPOS=41270223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0
chr6	41303592	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.518;QD=50.413;RBI=0.0287078;REFB=0;REVB=-0.00900184;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000567714;OID=.;OPOS=41303592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr6	41303995	.	A	G	196.41	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00123332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.603;QD=14.2846;RBI=0.00192181;REFB=-0.0225004;REVB=-0.00147386;RO=30;SAF=14;SAR=9;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174859;STB=0.582328;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0249519;OID=.;OPOS=41303995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:30:32:23:23:0.418182:9:14:13:17:9:14:15:17
chr6	41309552	.	T	C	265.35	PASS	AF=0.531915;AO=23;DP=45;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00545861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.858;QD=22.5828;RBI=0.0254955;REFB=-0.0202683;REVB=-0.0249043;RO=22;SAF=11;SAR=12;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176566;STB=0.57627;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0192187;OID=.;OPOS=41309552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:22:22:23:25:0.531915:12:11:15:7:12:13:15:7
chr6	41318424	.	T	A	171.02	PASS	AF=0.404255;AO=18;DP=46;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00800782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.136;QD=14.5545;RBI=0.0121517;REFB=-0.00466023;REVB=-0.00913997;RO=28;SAF=13;SAR=5;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383032;STB=0.728264;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0126202;OID=.;OPOS=41318424;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:28:28:18:19:0.404255:5:13:10:18:5:14:10:18
chr6	41318438	.	A	G	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.637;QD=57.1769;RBI=0.0355036;REFB=0;REVB=0.00847546;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89461e-05;OID=.;OPOS=41318438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:28:23:0:0:28:23:0:0
chr6	41533579	.	C	A	247.71	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.0382695;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.189;QD=18.0153;RBI=0.0387111;REFB=-0.0146088;REVB=0.00583085;RO=27;SAF=11;SAR=16;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345038;STB=0.526741;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0184199;OID=.;OPOS=41533579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:27:28:27:27:0.490909:16:11:10:17:16:11:10:18
chr6	41621617	.	GA	G,GG	235.92	PASS	AF=0.0526316,0.947368;AO=2,17;DP=19;FAO=1,18;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=1,18;FSAR=0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152782,0.00345053;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=70.224,88.0079;QD=49.6681;RBI=0.0152782,0.00345053;REFB=0,0;REVB=0,0;RO=0;SAF=2,17;SAR=0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0544357,-0.0139406;OID=.,.;OPOS=41621618,41621618;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0526316,0.947368:2,17:19:1,18:19:0:1,18:0,0:0:0:5:0:2,17:0,0:0:0
chr6	41621625	.	G	A	219.27	PASS	AF=0.863636;AO=19;DP=22;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0314387;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=214.38;QD=39.8679;RBI=0.0314387;REFB=0.00553634;REVB=0;RO=0;SAF=19;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000415204;OID=.;OPOS=41621625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:22:22:0:3:19:19:0.863636:0:19:0:0:0:19:3:0
chr6	41658566	.	C	T	351.74	PASS	AF=0.513889;AO=36;DP=71;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00732205;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.5706;QD=19.541;RBI=0.0351597;REFB=-0.0286008;REVB=0.0343889;RO=35;SAF=22;SAR=14;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.088222;STB=0.553972;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0280914;OID=.;OPOS=41658566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:35:35:36:37:0.513889:14:22:18:17:14:23:18:17
chr6	41658889	.	C	T	305.81	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.025;QD=53.1841;RBI=0.0610195;REFB=0;REVB=0.0519421;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000416704;OID=.;OPOS=41658889;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr6	41708938	.	C	G	267.62	PASS	AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0142724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.525;QD=13.7239;RBI=0.0319828;REFB=-0.0161112;REVB=-0.0286216;RO=44;SAF=21;SAR=10;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729434;STB=0.567523;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0232321;OID=.;OPOS=41708938;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:44:47:31:31:0.397436:10:21:27:17:10:21:27:20
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chr6	41754573	.	C	CCTT,T	181.01	PASS	AF=0.928571,0.0714286;AO=10,2;DP=21;FAO=13,1;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9,1;FSAR=4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0597933,0.0809105;FXX=0.333175;HRUN=2,2;LEN=3,1;MLLD=157.289,46.5182;QD=51.7174;RBI=0.0699162,0.0918242;REFB=0,0;REVB=0.0362358,0.0434187;RO=7;SAF=6,2;SAR=4,0;SRF=4;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0211612,0.577625;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00877668,-0.0376054;OID=.,.;OPOS=41754574,41754573;OREF=-,C;OALT=CTT,T;OMAPALT=CCTT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:21:14:7:0:10,2:13,1:0.928571,0.0714286:4,0:6,2:4:3:4,0:9,1:0:0
chr6	41754576	.	C	T	45.07	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0917589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.427;QD=7.83912;RBI=0.0950259;REFB=-0.0254262;REVB=0.0247027;RO=16;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613202;STB=0.538354;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0280041;OID=.;OPOS=41754576;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:3:4:10:6:3:4:10:6
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chr6	42532102	.	C	T	108.59	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0123017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.679;QD=13.5733;RBI=0.0194767;REFB=-0.0126327;REVB=-0.0151;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732572;STB=0.524235;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0190496;OID=.;OPOS=42532102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:19:13:13:0.40625:6:7:11:7:6:7:11:8
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chr6	42992825	.	C	G	312.9	PASS	AF=0.459459;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.00524642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.128;QD=16.9134;RBI=0.00605079;REFB=-0.00478216;REVB=0.00301448;RO=40;SAF=21;SAR=13;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209587;STB=0.617578;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00450326;OID=.;OPOS=42992825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:40:40:34:34:0.459459:13:21:16:24:13:21:16:24
chr6	42995210	.	A	AG	81.34	PASS	AF=0.666667;AO=2;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0522857;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=105.576;QD=21.6908;RBI=0.175794;REFB=-0.0255892;REVB=-0.167839;RO=13;SAF=2;SAR=0;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.448443;STB=0.618849;STBP=0.377;TYPE=ins;VARB=0.0133127;OID=.;OPOS=42995211;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:2:15:10:15:5:8:2:5:0:23:13:2:0:11:2
chr6	42995211	.	A	G	48.26	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0195241;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=114.725;QD=12.8698;RBI=0.0463575;REFB=0.0418816;REVB=-0.0420455;RO=8;SAF=6;SAR=1;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0334227;STB=0.519944;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=-0.0280651;OID=.;OPOS=42995211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:1:6:7:1:1:6:7:1
chr6	43004132	.	C	T	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.121996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.338;QD=26.0262;RBI=0.122767;REFB=-0.000812798;REVB=-0.0137416;RO=1;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0789211;STB=0.54531;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=-0.00632038;OID=.;OPOS=43004132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:5:1:0:1:5:1:0:1
chr6	43008298	.	C	T	98.04	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=23;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0259084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.228;QD=16.3399;RBI=0.0390258;REFB=0.0123025;REVB=-0.0291851;RO=12;SAF=7;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296512;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00942171;OID=.;OPOS=43008298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:23:24:12:12:11:12:0.5:4:7:8:4:4:8:8:4
chr6	43014298	.	TT	CC	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00171156;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=117.324;QD=45.8068;RBI=0.0324943;REFB=0;REVB=0.0324491;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00027114;OID=.;OPOS=43014298;OREF=TT;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:12:2:0:0:12:2:0:0
chr6	43020188	.	G	A	316.31	PASS	AF=0.675;AO=27;DP=40;FAO=27;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00207112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.751;QD=31.6311;RBI=0.0229511;REFB=-0.00371308;REVB=0.0228575;RO=13;SAF=8;SAR=19;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111222;STB=0.561134;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00152315;OID=.;OPOS=43020188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:13:13:27:27:0.675:19:8:6:7:19:8:6:7
chr6	43034850	.	C	T	121.88	PASS	AF=0.684211;AO=13;DP=19;FAO=13;FDP=19;FR=.;FRO=6;FSAF=0;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7682;QD=25.6589;RBI=0.0280975;REFB=-0.0300031;REVB=0.0280975;RO=6;SAF=0;SAR=13;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0357466;OID=.;OPOS=43034850;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:6:6:13:13:0.684211:13:0:0:6:13:0:0:6
chr6	43148987	.	G	C	507.11	PASS	AF=0.447154;AO=55;DP=123;FAO=55;FDP=123;FR=.;FRO=68;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=0.0136957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.652;QD=16.4913;RBI=0.0143158;REFB=-0.0265357;REVB=-0.0041674;RO=68;SAF=23;SAR=32;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00653871;STB=0.503648;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.034328;OID=.;OPOS=43148987;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:68:68:55:55:0.447154:32:23:28:40:32:23:28:40
chr6	43152573	.	A	G	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0410901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.595;QD=16.8838;RBI=0.0466086;REFB=-0.00816898;REVB=-0.0219992;RO=17;SAF=2;SAR=13;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.420017;STB=0.746736;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00772564;OID=.;OPOS=43152573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:13:2:8:9:13:2:8:9
chr6	43154091	.	C	G	545.24	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0158859;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=313.717;QD=57.3936;RBI=0.0384558;REFB=-0.0682702;REVB=0.0350212;RO=1;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228411;STB=0.512189;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000404509;OID=.;OPOS=43154091;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:20:17:0:1:20:17:0:1
chr6	43184132	.	A	C	104.95	PASS	AF=0.382353;AO=10;DP=31;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0070096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.618;QD=12.3466;RBI=0.0184556;REFB=-0.0395704;REVB=0.0170726;RO=21;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861957;STB=0.509077;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0778432;OID=.;OPOS=43184132;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:34:21:21:10:13:0.382353:6:4:10:11:7:6:10:11
chr6	43270097	.	T	C	987.23	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256505;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0528;QD=58.9393;RBI=0.055433;REFB=0;REVB=0.0491414;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269359;OID=.;OPOS=43270097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:65:67:1:29:36:0:0:30:37:0:0
chr6	43273604	.	A	G	1084.21	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0249677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.415;QD=58.6058;RBI=0.0465057;REFB=-0.0884109;REVB=0.0392351;RO=0;SAF=45;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1195e-08;STB=0.505493;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000946735;OID=.;OPOS=43273604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:0:1:73:73:0.986486:28:45:0:0:28:45:1:0
chr6	43306346	.	A	G	1456.87	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212314;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.045;QD=63.3424;RBI=0.0254244;REFB=0;REVB=0.0139868;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40383e-05;OID=.;OPOS=43306346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:92:0:0:92:92:1:45:47:0:0:45:47:0:0
chr6	43306998	.	C	T	48.71	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0207067;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=158.234;QD=12.1784;RBI=0.0228447;REFB=-0.020928;REVB=-0.00964946;RO=7;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.66611;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.00919986;OID=.;OPOS=43306998;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:14:16:7:9:7:7:0.4375:6:1:1:6:6:1:3:6
chr6	43406501	.	C	T	115.19	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.000829626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.103;QD=10.7151;RBI=0.0233931;REFB=-0.00826915;REVB=-0.0233784;RO=29;SAF=6;SAR=8;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251706;STB=0.649148;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0171706;OID=.;OPOS=43406501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:8:6:19:10:8:6:19:10
chr6	43488766	.	G	A	39.25	PASS	AF=0.0833333;AO=12;DP=142;FAO=12;FDP=144;FR=.;FRO=132;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=72;FSRR=60;FWDB=0.00396848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.583;QD=1.09032;RBI=0.0217043;REFB=-0.000580182;REVB=-0.0213384;RO=130;SAF=9;SAR=3;SRF=72;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235753;STB=0.699651;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00686972;OID=.;OPOS=43488766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:142:144:130:132:12:12:0.0833333:3:9:72:58:3:9:72:60
chr6	43533405	.	G	A	97.88	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0206059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.75;QD=13.5014;RBI=0.0337691;REFB=-0.00710301;REVB=-0.0267534;RO=17;SAF=8;SAR=4;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310145;STB=0.681519;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0220732;OID=.;OPOS=43533405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:4:8:6:11:4:8:6:11
chr6	43581585	.	C	T	36.15	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0422417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.971;QD=6.57347;RBI=0.042399;REFB=0.00184959;REVB=-0.00364829;RO=16;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257618;STB=0.666111;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=-0.00844695;OID=.;OPOS=43581585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:4:2:9:7:4:2:9:7
chr6	43596716	.	CGGGGGGC	CGGGGG,CGGGGGC	106.81	PASS	AF=0,1;AO=2,9;DP=18;FAO=0,18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179772,0.257793;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=160.761,9.63173;QD=23.7364;RBI=0.0181345,0.279839;REFB=0.0210549,-0.0573091;REVB=0.00238317,0.108871;RO=4;SAF=1,6;SAR=1,3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0.648649,0.648649;SSSB=0,0.0966199;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.0353393;OID=.,.;OPOS=43596722,43596717;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=CGGGGG,CGGGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,1:2,9:18:0,18:18:0:0,10:0,8:0:0:4:4:1,6:1,3:2:2
chr6	43638636	.	G	A	385.38	PASS	AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.0143744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.734;QD=17.9245;RBI=0.0143764;REFB=-0.0105232;REVB=0.000236841;RO=46;SAF=25;SAR=15;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203891;STB=0.613978;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0136475;OID=.;OPOS=43638636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:15:25:19:27:15:25:19:27
chr6	43640099	.	A	G	648.94	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00654431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.094;QD=60.3663;RBI=0.0174954;REFB=0;REVB=-0.0162253;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248193;OID=.;OPOS=43640099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:17:24:0:0:19:24:0:0
chr6	43753794	.	CT	TC	82.8	PASS	AF=0.24;AO=12;DP=50;FAO=12;FDP=50;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=29;FWDB=0.0183767;FXX=0.019604;HRUN=4;LEN=2;MLLD=131.201;QD=6.62428;RBI=0.019074;REFB=-0.00251773;REVB=-0.00511002;RO=37;SAF=11;SAR=1;SRF=8;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.741609;STB=0.94225;STBP=0.005;TYPE=mnp;VARB=0.0774597;OID=.;OPOS=43753794;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:50:50:37:38:12:12:0.24:1:11:8:29:1:11:9:29
chr6	43968814	.	A	G	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.881;QD=54.5172;RBI=0.019907;REFB=0;REVB=0.0165687;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36384e-05;OID=.;OPOS=43968814;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr6	44081718	.	G	A	1239.79	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00179487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5543;QD=61.2242;RBI=0.146953;REFB=0;REVB=0.146942;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000522813;OID=.;OPOS=44081718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:77:81:0:0:77:81:1:37:40:0:0:41:40:0:0
chr6	44108028	.	G	T	384.35	PASS	AF=0.541667;AO=36;DP=69;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0148185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.582;QD=21.3527;RBI=0.0216099;REFB=-0.0405171;REVB=-0.0157289;RO=33;SAF=15;SAR=21;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111783;STB=0.538442;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0323726;OID=.;OPOS=44108028;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:72:33:33:36:39:0.541667:21:15:18:15:21:18:18:15
chr6	44108150	.	T	C	51.44	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0404436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6499;QD=7.34828;RBI=0.0426173;REFB=-0.00761208;REVB=0.0134371;RO=18;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.567925;STB=0.857549;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0553865;OID=.;OPOS=44108150;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:26:28:18:20:8:8:0.285714:1:7:7:11:1:7:8:12
chr6	44108848	.	C	T	231.0	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0280985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0916;QD=16.5;RBI=0.0304082;REFB=-0.0106492;REVB=0.0116246;RO=27;SAF=14;SAR=12;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181643;STB=0.538432;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0165309;OID=.;OPOS=44108848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:27:30:26:26:0.464286:12:14:14:13:12:14:14:16
chr6	44118379	.	GGC	G,GG	41.12	PASS	AF=0.177778,0.155556;AO=9,8;DP=43;FAO=8,7;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=1,4;FSAR=7,3;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00325325,-0.0994716;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=19.7408,10.5495;QD=3.65475;RBI=0.242519,0.188194;REFB=-0.0764208,-0.154307;REVB=-0.242497,-0.159757;RO=23;SAF=1,5;SAR=8,3;SRF=13;SRR=10;SSEN=0.445161,0.463768;SSEP=0,0.536585;SSSB=-0.568915,0.0723403;STB=0.849061,0.53116;STBP=0.047,0.959;TYPE=del,del;VARB=0.107526,0.153881;OID=.,.;OPOS=44118380,44118381;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.177778,0.155556:9,8:43:8,7:45:30:1,4:7,3:16:14:19:23:1,5:8,3:13:10
chr6	44145063	.	T	C	1263.39	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.943;QD=61.6288;RBI=0.0396581;REFB=0;REVB=0.00482354;RO=0;SAF=43;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259856;OID=.;OPOS=44145063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:39:43:0:0:39:43:0:0
chr6	44147337	.	C	T	357.46	PASS	AF=0.410526;AO=39;DP=95;FAO=39;FDP=95;FR=.;FRO=56;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.0120115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2498;QD=15.0507;RBI=0.0128499;REFB=-0.0362286;REVB=0.00456544;RO=55;SAF=30;SAR=9;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339351;STB=0.698815;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0483102;OID=.;OPOS=44147337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:55:56:39:39:0.410526:9:30:26:29:9:30:26:30
chr6	44218120	.	A	G	152.38	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0286064;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=85.4159;QD=40.6333;RBI=0.046411;REFB=0.115958;REVB=0.0365466;RO=1;SAF=1;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337274;STB=0.518492;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=-0.00333622;OID=.;OPOS=44218120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:13:1:0:1:13:1:0:1
chr6	44223010	.	G	T	227.2	PASS	AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0113799;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.106;QD=28.3996;RBI=0.0220984;REFB=-0.0362163;REVB=-0.018943;RO=11;SAF=16;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166249;STB=0.592498;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0144694;OID=.;OPOS=44223010;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:5:16:6:5:5:16:6:5
chr6	44247951	.	T	G	1194.29	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0232267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.026;QD=59.7143;RBI=0.0359504;REFB=-0.0874593;REVB=-0.02744;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.506328;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00112329;OID=.;OPOS=44247951;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:0:1:79:79:0.9875:40:39:0:0:40:39:1:0
chr6	44253749	.	A	G	375.66	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3184;QD=55.6526;RBI=0.0123002;REFB=0;REVB=0.00348256;RO=0;SAF=20;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331538;OID=.;OPOS=44253749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:7:20:0:0:7:20:0:0
chr6	44253765	.	A	G	480.17	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9056;QD=58.2018;RBI=0.0413866;REFB=0;REVB=0.0319131;RO=0;SAF=23;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123332;OID=.;OPOS=44253765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:8:23:0:0:9:24:0:0
chr6	44268135	.	C	T	1026.35	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.416;QD=59.4987;RBI=0.0585679;REFB=0;REVB=-0.00849503;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190431;OID=.;OPOS=44268135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:38:30:0:0:38:31:0:0
chr6	44268371	.	T	C	1079.37	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00459135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2159;QD=59.9648;RBI=0.0723349;REFB=0;REVB=0.072189;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213817;OID=.;OPOS=44268371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:30:42:0:0:30:42:0:0
chr6	44275011	.	T	C	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.824;QD=58.061;RBI=0.0282064;REFB=0;REVB=-0.0150565;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.29833e-05;OID=.;OPOS=44275011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:34:27:0:0:34:27:0:0
chr6	44320548	.	T	A	1396.2	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220127;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8311;QD=62.7506;RBI=0.0386121;REFB=0;REVB=-0.0317229;RO=0;SAF=62;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.27477e-05;OID=.;OPOS=44320548;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:27:62:0:0:27:62:0:0
chr6	44371714	.	C	T	160.31	PASS	AF=0.33871;AO=21;DP=62;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=33;FWDB=0.00357466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.969;QD=10.3426;RBI=0.0351202;REFB=-0.0184022;REVB=-0.0349378;RO=41;SAF=9;SAR=12;SRF=8;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287817;STB=0.664891;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0343912;OID=.;OPOS=44371714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:41:41:21:21:0.33871:12:9:8:33:12:9:8:33
chr6	44403438	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0389197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.703;QD=45.8068;RBI=0.0391971;REFB=0;REVB=0.00465507;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000228488;OID=.;OPOS=44403438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr6	44413463	.	T	A	633.1	PASS	AF=0.492308;AO=64;DP=131;FAO=64;FDP=130;FR=.;FRO=66;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=36;FWDB=0.00115357;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.234;QD=19.48;RBI=0.00207512;REFB=-0.00837154;REVB=0.00172493;RO=59;SAF=38;SAR=26;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134441;STB=0.571268;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00567296;OID=.;OPOS=44413463;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:130:59:66:64:64:0.492308:26:38:26:33:26:38:30:36
chr6	46047458	.	C	T	308.32	PASS	AF=0.613636;AO=27;DP=44;FAO=27;FDP=44;FR=.;FRO=17;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0010438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.191;QD=28.0295;RBI=0.0278599;REFB=-0.0158855;REVB=-0.0278403;RO=17;SAF=22;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308996;STB=0.672345;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00892227;OID=.;OPOS=46047458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:17:17:27:27:0.613636:5:22:8:9:5:22:8:9
chr6	46107752	.	C	G	890.01	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3998;QD=57.4198;RBI=0.0889301;REFB=0;REVB=0.0706144;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000871757;OID=.;OPOS=46107752;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:62:0:0:57:62:1:26:31:0:0:29:33:0:0
chr6	46128688	.	G	C	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00492435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.402;QD=64.1538;RBI=0.0278861;REFB=0;REVB=0.0274479;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.2697e-05;OID=.;OPOS=46128688;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0
chr6	46128745	.	C	T	555.47	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2941;QD=60.0504;RBI=0.13533;REFB=0;REVB=-0.131484;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00163123;OID=.;OPOS=46128745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:20:17:0:0:20:17:0:0
chr6	46129345	.	G	A	803.4	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0313434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.885;QD=55.4069;RBI=0.0349485;REFB=-0.0652315;REVB=0.0154592;RO=1;SAF=23;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200621;STB=0.510635;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00258747;OID=.;OPOS=46129345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:34:23:1:0:34:23:1:0
chr6	46135489	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00765793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.057;QD=55.656;RBI=0.0423099;REFB=0;REVB=0.0416111;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192593;OID=.;OPOS=46135489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:19:8:0:0:19:8:0:0
chr6	46135984	.	G	T	736.69	PASS	AF=0.963636;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0195425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0176;QD=53.5772;RBI=0.0267272;REFB=0.0031548;REVB=-0.0182327;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.508471;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00100169;OID=.;OPOS=46135984;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:55:0:1:52:53:0.963636:29:23:0:0:29:24:0:1
chr6	46563817	.	A	T	157.03	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00240749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.925;QD=16.1053;RBI=0.00571745;REFB=-0.0106743;REVB=-0.00518587;RO=22;SAF=10;SAR=7;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174965;STB=0.600483;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0135109;OID=.;OPOS=46563817;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:7:10:9:13:7:10:9:13
chr6	46623698	.	T	C	1305.4	PASS	AF=1;AO=74;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00434299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.069;QD=62.1621;RBI=0.0831053;REFB=0;REVB=0.0829918;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120969;OID=.;OPOS=46623698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:74:84:1:42:32:0:0:51:33:0:0
chr6	46657057	.	A	G	978.61	PASS	AF=0.985294;AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0129369;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.891;QD=57.5652;RBI=0.025838;REFB=-0.0639088;REVB=0.0223661;RO=0;SAF=44;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00079643;OID=.;OPOS=46657057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:68:0:1:65:67:0.985294:21:44:0:0:22:45:1:0
chr6	46657259	.	C	T	244.13	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0162898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7704;QD=23.2502;RBI=0.0166078;REFB=-0.0232866;REVB=0.00323453;RO=19;SAF=12;SAR=11;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00371334;STB=0.502073;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0283294;OID=.;OPOS=46657259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:11:12:10:9:11:12:10:9
chr6	46658892	.	A	T	242.14	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0302898;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.078;QD=18.6259;RBI=0.0303715;REFB=-0.0108907;REVB=0.00222575;RO=24;SAF=15;SAR=11;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801908;STB=0.539847;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0115181;OID=.;OPOS=46658892;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:24:26:26:26:0.5:11:15:16:8:11:15:17:9
chr6	46658905	.	C	G	771.43	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190339;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.4;QD=57.1431;RBI=0.0558138;REFB=0;REVB=-0.0524681;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000131453;OID=.;OPOS=46658905;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:22:32:0:0:22:32:0:0
chr6	46672943	.	A	G	2049.6	PASS	AF=1;AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00859229;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.14;QD=62.5832;RBI=0.0622392;REFB=0;REVB=0.0616433;RO=0;SAF=76;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.14372e-05;OID=.;OPOS=46672943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:132:131:0:0:131:131:1:55:76:0:0:55:76:0:0
chr6	46677098	.	C	A	720.74	PASS	AF=0.546875;AO=70;DP=127;FAO=70;FDP=128;FR=.;FRO=58;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.0137986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.5923;QD=22.5232;RBI=0.140509;REFB=0.0182324;REVB=-0.13983;RO=57;SAF=45;SAR=25;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0859238;STB=0.551872;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.0170275;OID=.;OPOS=46677098;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:128:57:58:70:70:0.546875:25:45:31:26:25:45:31:27
chr6	46679303	.	A	G	648.08	PASS	AF=0.485294;AO=64;DP=134;FAO=66;FDP=136;FR=.;FRO=70;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=0.0164176;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5067;QD=19.0611;RBI=0.0215766;REFB=0.00775287;REVB=-0.0140004;RO=67;SAF=38;SAR=26;SRF=41;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175101;STB=0.50444;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=-0.0190246;OID=.;OPOS=46679303;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:136:67:70:64:66:0.485294:26:38:41:26:26:40:43:27
chr6	46684222	.	C	T	133.19	PASS	AF=0.240964;AO=20;DP=83;FAO=20;FDP=83;FR=.;FRO=63;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=42;FWDB=-0.0404611;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2484;QD=6.41885;RBI=0.176746;REFB=-0.0174724;REVB=-0.172052;RO=63;SAF=11;SAR=9;SRF=21;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265263;STB=0.660628;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0632538;OID=.;OPOS=46684222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:63:63:20:20:0.240964:9:11:21:42:9:11:21:42
chr6	46766321	.	TTA	T,TAA	243.27	PASS	AF=0.886364,0;AO=13,8;DP=59;FAO=39,0;FDP=44;FR=.;FRO=5;FSAF=34,0;FSAR=5,0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00432451,0.00837566;FXX=0.119976;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=12.179,5.40923;QD=22.1151;RBI=0.295464,0.437863;REFB=0.0542427,0.00178735;REVB=-0.295433,0.437783;RO=23;SAF=13,8;SAR=0,0;SRF=19;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.751102,0.677127;STB=0.53423,0.5;STBP=0.459,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.043324,0;OID=.,.;OPOS=46766322,46766322;OREF=TA,T;OALT=-,A;OMAPALT=T,TAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.886364,0:13,8:59:39,0:44:5:34,0:5,0:5:0:18:23:13,8:0,0:19:4
chr6	46824448	.	A	G	414.57	PASS	AF=0.885714;AO=31;DP=35;FAO=31;FDP=35;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0440178;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.8993;QD=47.379;RBI=0.0619367;REFB=-0.0586027;REVB=0.0435728;RO=3;SAF=26;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137064;STB=0.565172;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00880063;OID=.;OPOS=46824448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:35:35:3:4:31:31:0.885714:5:26:1:2:5:26:2:2
chr6	46826508	.	G	A	701.46	PASS	AF=0.958333;AO=45;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0304099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.974;QD=58.4553;RBI=0.0322053;REFB=-0.131265;REVB=-0.0106028;RO=1;SAF=34;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136255;STB=0.513883;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00140635;OID=.;OPOS=46826508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:48:48:1:2:45:46:0.958333:11:34:1:0:11:35:2:0
chr6	46826715	.	T	A	1358.59	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.992;QD=62.4641;RBI=0.0335003;REFB=0;REVB=0.00782141;RO=0;SAF=52;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.32535e-05;OID=.;OPOS=46826715;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:35:52:0:0:35:52:0:0
chr6	46826844	.	T	C	1343.88	PASS	AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0350431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.699;QD=61.0857;RBI=0.0406847;REFB=-0.0954318;REVB=0.0206694;RO=1;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114167;STB=0.506023;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.000246023;OID=.;OPOS=46826844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:88:88:1:1:87:87:0.988636:41:46:0:1:41:46:0:1
chr6	46826910	.	G	A	1376.09	PASS	AF=0.967742;AO=90;DP=93;FAO=90;FDP=93;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.000758557;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.487;QD=59.1866;RBI=0.0172136;REFB=-0.0130464;REVB=0.0171969;RO=2;SAF=57;SAR=33;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278557;STB=0.510358;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000251121;OID=.;OPOS=46826910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:93:93:2:3:90:90:0.967742:33:57:0:2:33:57:1:2
chr6	46827073	.	A	G	2018.3	PASS	AF=0.992366;AO=130;DP=133;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0197919;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.677;QD=61.6275;RBI=0.0267251;REFB=-0.131918;REVB=0.0179586;RO=1;SAF=70;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0067414;STB=0.503546;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=8.2e-05;OID=.;OPOS=46827073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:133:131:1:1:130:130:0.992366:60:70:1:0:60:70:1:0
chr6	46827126	.	C	T	1438.04	PASS	AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0169347;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.149;QD=61.8512;RBI=0.0182609;REFB=-0.159129;REVB=0.00683186;RO=1;SAF=52;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903006;STB=0.504761;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000474428;OID=.;OPOS=46827126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:40:52:1:0:40:52:1:0
chr6	46832813	.	G	A	1453.14	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00697068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.54;QD=63.1799;RBI=0.0375847;REFB=0;REVB=0.0369326;RO=0;SAF=37;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.47356e-05;OID=.;OPOS=46832813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:54:37:0:0:55:37:0:0
chr6	46834685	.	G	A	1952.16	PASS	AF=1;AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00823548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.784;QD=61.9733;RBI=0.0220199;REFB=0;REVB=0.0204219;RO=0;SAF=75;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68071e-05;OID=.;OPOS=46834685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:126:126:0:0:126:126:1:51:75:0:0:51:75:0:0
chr6	46856100	.	G	A,T	799.39	PASS	AF=0.95,0.0333333;AO=55,3;DP=60;FAO=57,2;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=42,2;FSAR=15,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00115728,-0.0148115;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=165.981,201.455;QD=53.2929;RBI=0.0174347,0.0155681;REFB=0.0221199,0.0145382;REVB=0.0173963,-0.00479437;RO=1;SAF=40,3;SAR=15,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0116415,0;STB=0.50588,0.5;STBP=0.613,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000727841,0.173229;OID=.,.;OPOS=46856100,46856100;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:60:60:1:1:55,3:57,2:0.95,0.0333333:15,0:40,3:1:0:15,0:42,2:1:0
chr6	47563692	.	C	T	1233.73	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2291;QD=60.9249;RBI=0.0393522;REFB=0;REVB=0.0317211;RO=0;SAF=44;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47622e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.79692e-05;OID=.;OPOS=47563692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:78:81:0:0:78:81:1:34:44:0:0:34:47:0:0
chr6	47577025	.	TGA	TAG	48.76	PASS	AF=0.194444;AO=6;DP=36;FAO=7;FDP=36;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=28;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0137109;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=187.688;QD=5.41821;RBI=0.0788998;REFB=-0.00418782;REVB=-0.0776994;RO=18;SAF=0;SAR=6;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.79477;STB=0.875917;STBP=0.033;TYPE=mnp;VARB=0.112865;OID=.;OPOS=47577026;OREF=GA;OALT=AG;OMAPALT=TAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.194444:6:36:7:36:28:1:6:18:10:36:18:0:6:14:4
chr6	47594302	.	T	C	1264.75	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.017;QD=61.6953;RBI=0.022087;REFB=0;REVB=0.0138914;RO=0;SAF=48;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.28089e-05;OID=.;OPOS=47594302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:34:48:0:0:34:48:0:0
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chr6	47624299	.	A	G	52.37	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0463829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5793;QD=6.54623;RBI=0.0617791;REFB=0.00737333;REVB=-0.0408079;RO=24;SAF=6;SAR=2;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118735;STB=0.57672;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=-0.0204205;OID=.;OPOS=47624299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:2:6:16:8:2:6:16:8
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chr6	47682604	.	A	C	1491.0	PASS	AF=0.990196;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0578968;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.501;QD=58.4704;RBI=0.0596679;REFB=-0.124411;REVB=0.0144298;RO=1;SAF=59;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00797385;STB=0.504201;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.000245353;OID=.;OPOS=47682604;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:102:102:1:1:101:101:0.990196:42:59:1:0:42:59:1:0
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chr6	47791205	.	G	A	341.21	PASS	AF=0.39604;AO=39;DP=100;FAO=40;FDP=101;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=-0.0257637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.924;QD=13.5134;RBI=0.0274275;REFB=-0.0102857;REVB=-0.00940737;RO=59;SAF=15;SAR=24;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220393;STB=0.604691;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0123868;OID=.;OPOS=47791205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:59:61:39:40:0.39604:24:15:35:24:24:16:35:26
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chr6	49460152	.	A	G	428.98	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7458;QD=57.1975;RBI=0.047937;REFB=0;REVB=0.0412034;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124339;OID=.;OPOS=49460152;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr6	49485266	.	C	A	1206.46	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.573;QD=61.0866;RBI=0.017648;REFB=0;REVB=0.00716171;RO=0;SAF=29;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.28885e-06;OID=.;OPOS=49485266;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:79:0:0:76:79:1:47:29:0:0:50:29:0:0
chr6	49518914	.	C	G	1682.67	PASS	AF=1;AO=108;DP=111;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0732426;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2529;QD=57.5273;RBI=0.0734191;REFB=-0.0558486;REVB=0.00508783;RO=0;SAF=44;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72235e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00585009;OID=.;OPOS=49518914;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:111:117:0:0:108:117:1:64:44:0:0:69:48:0:0
chr6	49660577	.	C	G	245.97	PASS	AF=0.340909;AO=30;DP=88;FAO=30;FDP=88;FR=.;FRO=58;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=-0.0433794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.725;QD=11.1803;RBI=0.0443085;REFB=-0.0162265;REVB=0.00902623;RO=58;SAF=9;SAR=21;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293046;STB=0.670444;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0240072;OID=.;OPOS=49660577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:58:58:30:30:0.340909:21:9:32:26:21:9:32:26
chr6	49696473	.	G	T	801.26	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00759697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.8137;QD=57.233;RBI=0.0841006;REFB=0;REVB=-0.0837568;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000415855;OID=.;OPOS=49696473;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0
chr6	49701523	.	A	G	804.67	PASS	AF=1;AO=45;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000166785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.156;QD=57.4763;RBI=0.0929538;REFB=0;REVB=0.0929536;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257929;OID=.;OPOS=49701523;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:45:56:1:28:17:0:0:39:17:0:0
chr6	51524403	.	G	A	206.24	PASS	AF=0.45283;AO=22;DP=52;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00127149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.719;QD=15.5651;RBI=0.00815544;REFB=-0.00375279;REVB=0.00805572;RO=29;SAF=16;SAR=6;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459778;STB=0.542132;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.002762;OID=.;OPOS=51524403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:29:29:22:24:0.45283:6:16:20:9:6:18:20:9
chr6	51586771	.	G	A	673.96	PASS	AF=1;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00732358;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.049;QD=62.6938;RBI=0.0355997;REFB=0;REVB=0.0348382;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013374;OID=.;OPOS=51586771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:42:43:1:16:26:0:0:17:26:0:0
chr6	51613177	.	C	T	482.31	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185632;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.2803;QD=58.4624;RBI=0.0258607;REFB=0;REVB=0.0180051;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.88578e-06;OID=.;OPOS=51613177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr6	51720838	.	T	C	754.64	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0133942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.695;QD=54.8826;RBI=0.0205053;REFB=-0.00270667;REVB=0.0155262;RO=1;SAF=28;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165343;STB=0.508769;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=4.54677e-05;OID=.;OPOS=51720838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:26:28:1:0:26:28:1:0
chr6	51875250	.	A	C	743.7	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0457005;FXX=0.0357079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.662;QD=55.0886;RBI=0.0457007;REFB=-0.110236;REVB=0.000124831;RO=1;SAF=15;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122398;STB=0.506491;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.00549567;OID=.;OPOS=51875250;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:54:1:1:53:53:0.981481:38:15:0:1:38:15:0:1
chr6	51890823	.	G	A	3110.21	PASS	AF=1;AO=190;DP=193;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.918;QD=61.285;RBI=0.0548896;REFB=0;REVB=0.0495844;RO=0;SAF=96;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.68785e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.56768e-05;OID=.;OPOS=51890823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:193:203:0:0:190:203:1:94:96:0:0:103:100:0:0
chr6	51914956	.	G	A	837.18	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0033953;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.316;QD=57.7367;RBI=0.0212214;REFB=0;REVB=0.020948;RO=0;SAF=38;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.36742e-05;OID=.;OPOS=51914956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:20:38:0:0:20:38:0:0
chr6	51915054	.	T	C	38.71	PASS	AF=0.176471;AO=9;DP=51;FAO=9;FDP=51;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.0278468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7407;QD=3.03638;RBI=0.0414502;REFB=-0.0189804;REVB=-0.030703;RO=42;SAF=6;SAR=3;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.228136;OID=.;OPOS=51915054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:51:51:42:42:9:9:0.176471:3:6:28:14:3:6:28:14
chr6	51924774	.	A	G	888.19	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00505635;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9796;QD=58.2416;RBI=0.00605317;REFB=0;REVB=0.00332779;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.90232e-05;OID=.;OPOS=51924774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0
chr6	52360283	.	T	A	749.71	PASS	AF=1;AO=49;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.533;QD=54.5246;RBI=0.0271565;REFB=0;REVB=0.0224967;RO=0;SAF=38;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000793418;OID=.;OPOS=52360283;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:49:55:1:11:38:0:0:15:40:0:0
chr6	52362844	.	T	A	338.45	PASS	AF=0.833333;AO=28;DP=36;FAO=30;FDP=36;FR=.;FRO=6;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0535928;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=29.1613;QD=37.6052;RBI=0.0892132;REFB=-0.0672747;REVB=0.0713218;RO=5;SAF=15;SAR=13;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381036;STB=0.566622;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0114521;OID=.;OPOS=52362844;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:36:36:5:6:28:30:0.833333:13:15:2:3:13:17:1:5
chr6	52374319	.	T	TAC	1398.12	PASS	AF=0.968085;AO=91;DP=96;FAO=91;FDP=94;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0121821;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=2;MLLD=176.223;QD=59.4943;RBI=0.0347977;REFB=-0.0837745;REVB=0.0325956;RO=4;SAF=59;SAR=32;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00891148;STB=0.500641;STBP=0.949;TYPE=ins;VARB=0.00567786;OID=.;OPOS=52374320;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=TAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.968085:91:96:91:94:3:59:32:2:1:6:4:59:32:3:1
chr6	52617731	.	C	G	471.54	PASS	AF=0.485437;AO=50;DP=103;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.0128944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.604;QD=18.3122;RBI=0.0175877;REFB=-0.00437729;REVB=-0.0119608;RO=53;SAF=24;SAR=26;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622225;STB=0.534509;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00517146;OID=.;OPOS=52617731;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:53:53:50:50:0.485437:26:24:29:24:26:24:29:24
chr6	52617738	.	G	A	522.86	PASS	AF=0.505051;AO=50;DP=99;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.00560912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.372;QD=21.1256;RBI=0.0295155;REFB=-0.00942594;REVB=-0.0289776;RO=49;SAF=29;SAR=21;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815917;STB=0.545139;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.00837892;OID=.;OPOS=52617738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:49:49:50:50:0.505051:21:29:24:25:21:29:24:25
chr6	52658962	.	T	C	354.57	PASS	AF=0.396226;AO=40;DP=104;FAO=42;FDP=106;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=0.0772443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5726;QD=13.3802;RBI=0.0776929;REFB=-0.00698935;REVB=0.00833665;RO=64;SAF=12;SAR=28;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162909;STB=0.567534;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0141934;OID=.;OPOS=52658962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:106:64:64:40:42:0.396226:28:12:28:36:28:14:28:36
chr6	52701143	.	C	T	136.56	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00451968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.384;QD=18.2079;RBI=0.019055;REFB=-0.00167436;REVB=-0.0185112;RO=15;SAF=9;SAR=6;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11811;STB=0.567477;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0016051;OID=.;OPOS=52701143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:6:9:7:8:6:9:7:8
chr6	52843131	.	G	T	1055.1	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011759;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9499;QD=59.4421;RBI=0.118962;REFB=0;REVB=0.118379;RO=0;SAF=44;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000687081;OID=.;OPOS=52843131;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:71:0:0:66:71:1:22:44:0:0:24:47:0:0
chr6	52844045	.	G	A	746.92	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.455;QD=63.568;RBI=0.106365;REFB=0;REVB=0.100422;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341285;OID=.;OPOS=52844045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:20:27:0:0:20:27:0:0
chr6	52963071	.	A	G	490.09	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0155243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.695;QD=56.0107;RBI=0.0229872;REFB=-0.0959336;REVB=0.0169531;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521726;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.000582439;OID=.;OPOS=52963071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:0:1:34:34:0.971429:11:23:0:0:11:23:0:1
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chr6	53370107	.	T	C	276.51	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308718;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.1613;QD=52.6677;RBI=0.0654992;REFB=0;REVB=0.0577674;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000721772;OID=.;OPOS=53370107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0
chr6	53514843	.	T	C	159.79	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0189147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3132;QD=26.6313;RBI=0.0628608;REFB=-0.0363768;REVB=0.0599476;RO=8;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168034;STB=0.592916;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0101267;OID=.;OPOS=53514843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:6:10:7:1:6:10:7:1
chr6	53516876	.	T	G	1225.26	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00810201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.792;QD=61.263;RBI=0.0237401;REFB=0;REVB=-0.0223148;RO=0;SAF=38;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.43909e-05;OID=.;OPOS=53516876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:41:38:0:0:41:39:0:0
chr6	53519062	.	A	G	485.24	PASS	AF=0.449153;AO=53;DP=118;FAO=53;FDP=118;FR=.;FRO=65;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=0.00180201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5723;QD=16.4487;RBI=0.015204;REFB=0.0133614;REVB=0.0150968;RO=65;SAF=35;SAR=18;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157958;STB=0.588399;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.0160938;OID=.;OPOS=53519062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:65:65:53:53:0.449153:18:35:33:32:18:35:33:32
chr6	53519605	.	C	T	685.64	PASS	AF=0.463087;AO=70;DP=150;FAO=69;FDP=149;FR=.;FRO=80;FSAF=25;FSAR=44;FSRF=44;FSRR=36;FWDB=0.000846584;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.429;QD=18.4065;RBI=0.0659854;REFB=-0.0215543;REVB=-0.0659799;RO=74;SAF=25;SAR=45;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187281;STB=0.602829;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0342224;OID=.;OPOS=53519605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:149:74:80:70:69:0.463087:45:25:41:33:44:25:44:36
chr6	53519857	.	G	A	564.4	PASS	AF=0.53271;AO=57;DP=108;FAO=57;FDP=107;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.060722;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2791;QD=21.0992;RBI=0.106552;REFB=0.00331487;REVB=-0.0875563;RO=50;SAF=24;SAR=33;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.08493;STB=0.546703;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-0.00436859;OID=.;OPOS=53519857;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:50:50:57:57:0.53271:33:24:26:24:33:24:26:24
chr6	53989526	.	G	A	382.62	PASS	AF=0.567164;AO=37;DP=66;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0323111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9119;QD=22.843;RBI=0.0334747;REFB=-0.0169145;REVB=0.00874922;RO=29;SAF=22;SAR=15;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198016;STB=0.612314;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0572991;OID=.;OPOS=53989526;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:29:29:37:38:0.567164:15:22:10:19:15:23:10:19
chr6	54002741	.	A	G	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0287798;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.097;QD=11.8307;RBI=0.0345239;REFB=-0.0230745;REVB=0.0190688;RO=17;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431914;STB=0.74031;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0312576;OID=.;OPOS=54002741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:17:18:11:11:0.37931:3:8:5:12:3:8:6:12
chr6	54002962	.	AC	A	34.28	PASS	AF=0.261905;AO=12;DP=42;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0634294;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.6218;QD=3.26491;RBI=0.0674742;REFB=-0.0578162;REVB=0.0230104;RO=26;SAF=9;SAR=3;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0.5;SSSB=0.447329;STB=0.831349;STBP=0.02;TYPE=del;VARB=0.076421;OID=.;OPOS=54002963;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.261905:12:42:11:42:31:9:2:11:20:34:26:9:3:9:17
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chr6	56327849	.	C	T	437.95	PASS	AF=0.4375;AO=49;DP=112;FAO=49;FDP=112;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.00486254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.416;QD=15.6411;RBI=0.0127124;REFB=-0.0155581;REVB=-0.0117457;RO=63;SAF=27;SAR=22;SRF=33;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275144;STB=0.515412;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0192937;OID=.;OPOS=56327849;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:63:63:49:49:0.4375:22:27:33:30:22:27:33:30
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chr6	56417545	.	T	C	218.98	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.00617007;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.972;QD=23.6736;RBI=0.00631439;REFB=-0.0365221;REVB=0.0013423;RO=16;SAF=9;SAR=12;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933049;STB=0.551952;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0248676;OID=.;OPOS=56417545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:12:9:5:11:12:9:5:11
chr6	56420538	.	C	T	457.05	PASS	AF=0.511364;AO=45;DP=88;FAO=45;FDP=88;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0118778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.844;QD=20.7751;RBI=0.0309481;REFB=-0.00704151;REVB=-0.028578;RO=42;SAF=10;SAR=35;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265593;STB=0.655514;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00522793;OID=.;OPOS=56420538;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:42:43:45:45:0.511364:35:10:20:22:35:10:21:22
chr6	56426931	.	C	T	255.34	PASS	AF=0.491228;AO=27;DP=56;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0436967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7351;QD=17.9187;RBI=0.04636;REFB=-0.060204;REVB=-0.0154871;RO=29;SAF=14;SAR=13;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127993;STB=0.579023;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0626883;OID=.;OPOS=56426931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:29:29:27:28:0.491228:13:14:11:18:13:15:11:18
chr6	56463410	.	T	C	483.28	PASS	AF=0.505376;AO=47;DP=93;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0865313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6506;QD=20.7861;RBI=0.086806;REFB=-0.00133395;REVB=-0.00690068;RO=46;SAF=15;SAR=32;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191587;STB=0.606367;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0030069;OID=.;OPOS=56463410;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:46:46:47:47:0.505376:32:15:24:22:32:15:24:22
chr6	56470690	.	G	A	522.6	PASS	AF=0.505051;AO=50;DP=99;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0208352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.457;QD=21.1152;RBI=0.052842;REFB=-0.00798823;REVB=-0.048561;RO=47;SAF=17;SAR=33;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.08105;STB=0.536688;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0117713;OID=.;OPOS=56470690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:47:49:50:50:0.505051:33:17:20:27:33:17:20:29
chr6	56471402	.	G	A	376.24	PASS	AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0156356;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.6475;QD=21.1964;RBI=0.047541;REFB=0.00123565;REVB=-0.0448963;RO=33;SAF=15;SAR=23;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178074;STB=0.598461;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.00166538;OID=.;OPOS=56471402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:23:15:20:13:23:15:20:13
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chr6	57467093	.	A	G	245.88	PASS	AF=0.213904;AO=40;DP=186;FAO=40;FDP=187;FR=.;FRO=147;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=75;FSRR=72;FWDB=0.0139829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.132;QD=5.25948;RBI=0.0205145;REFB=-0.00174304;REVB=0.0150108;RO=145;SAF=26;SAR=14;SRF=74;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181699;STB=0.612545;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00754034;OID=.;OPOS=57467093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:187:145:147:40:40:0.213904:14:26:74:71:14:26:75:72
chr6	57467100	.	G	C	1064.35	PASS	AF=0.534392;AO=101;DP=189;FAO=101;FDP=189;FR=.;FRO=88;FSAF=53;FSAR=48;FSRF=49;FSRR=39;FWDB=-0.00229013;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.929;QD=22.5258;RBI=0.00615198;REFB=-0.0220037;REVB=-0.00570983;RO=86;SAF=53;SAR=48;SRF=47;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183886;STB=0.514986;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0155601;OID=.;OPOS=57467100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:189:86:88:101:101:0.534392:48:53:47:39:48:53:49:39
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chr6	57467175	.	A	G	293.32	PASS	AF=0.267081;AO=43;DP=161;FAO=43;FDP=161;FR=.;FRO=118;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=66;FSRR=52;FWDB=-0.0177679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.742;QD=7.28754;RBI=0.0231251;REFB=-0.00876228;REVB=-0.0148011;RO=118;SAF=19;SAR=24;SRF=66;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144071;STB=0.585495;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0183593;OID=.;OPOS=57467175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:161:118:118:43:43:0.267081:24:19:66:52:24:19:66:52
chr6	57512476	.	G	A	1363.16	PASS	AF=0.491039;AO=137;DP=279;FAO=137;FDP=279;FR=.;FRO=142;FSAF=67;FSAR=70;FSRF=76;FSRR=66;FWDB=-0.00179597;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.636;QD=19.5435;RBI=0.00185655;REFB=0.000865712;REVB=-0.000470399;RO=142;SAF=67;SAR=70;SRF=76;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0427528;STB=0.523477;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=-0.000896063;OID=.;OPOS=57512476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:279:279:142:142:137:137:0.491039:70:67:76:66:70:67:76:66
chr6	57512510	.	T	G	2589.81	PASS	AF=0.696774;AO=216;DP=309;FAO=216;FDP=310;FR=.;FRO=94;FSAF=113;FSAR=103;FSRF=49;FSRR=45;FWDB=-0.00639718;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.012;QD=33.4169;RBI=0.0233688;REFB=-0.0479306;REVB=0.0224761;RO=93;SAF=113;SAR=103;SRF=48;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0039607;STB=0.500569;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0173554;OID=.;OPOS=57512510;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:309:310:93:94:216:216:0.696774:103:113:48:45:103:113:49:45
chr6	57512529	.	C	A	469.74	PASS	AF=0.234177;AO=74;DP=317;FAO=74;FDP=316;FR=.;FRO=242;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=130;FSRR=112;FWDB=-0.0142751;FXX=0.00315447;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.469;QD=5.94609;RBI=0.0248405;REFB=-0.00677349;REVB=-0.0203291;RO=240;SAF=34;SAR=40;SRF=128;SRR=112;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936112;STB=0.559329;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0166226;OID=.;OPOS=57512529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:317:316:240:242:74:74:0.234177:40:34:128:112:40:34:130:112
chr6	57512565	.	T	C	1118.53	PASS	AF=0.473029;AO=107;DP=235;FAO=114;FDP=241;FR=.;FRO=127;FSAF=54;FSAR=60;FSRF=72;FSRR=55;FWDB=0.0284191;FXX=0.00413206;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.064;QD=18.5648;RBI=0.0287604;REFB=-0.00972273;REVB=-0.00441738;RO=127;SAF=47;SAR=60;SRF=72;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124955;STB=0.549011;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00990063;OID=.;OPOS=57512565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:235:241:127:127:107:114:0.473029:60:47:72:55:60:54:72:55
chr6	57512678	.	G	A	210.81	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.021961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.7508;QD=14.0539;RBI=0.0221062;REFB=-0.00410401;REVB=-0.00252976;RO=35;SAF=10;SAR=15;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175258;STB=0.59992;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00782055;OID=.;OPOS=57512678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:15:10:20:15:15:10:20:15
chr6	58141869	.	C	T	120.66	PASS	AF=0.243243;AO=18;DP=77;FAO=18;FDP=74;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=0.00420095;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.61;QD=6.52207;RBI=0.0135167;REFB=-0.0108215;REVB=-0.0128474;RO=55;SAF=15;SAR=3;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.408671;STB=0.752373;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.020654;OID=.;OPOS=58141869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:74:55:56:18:18:0.243243:3:15:30:25:3:15:31:25
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chr6	58141878	.	A	G	134.03	PASS	AF=0.243902;AO=20;DP=81;FAO=20;FDP=82;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=37;FSRR=25;FWDB=0.00133875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.904;QD=6.53794;RBI=0.00541193;REFB=-0.00341789;REVB=0.00524373;RO=60;SAF=17;SAR=3;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403135;STB=0.745797;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.014541;OID=.;OPOS=58141878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:60:62:20:20:0.243902:3:17:35:25:3:17:37:25
chr6	58141886	.	G	C	1107.96	PASS	AF=0.927711;AO=77;DP=83;FAO=77;FDP=83;FR=.;FRO=6;FSAF=52;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0162569;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=295.766;QD=53.3959;RBI=0.0197431;REFB=-0.0738929;REVB=0.0112029;RO=6;SAF=52;SAR=25;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269909;STB=0.514302;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.000815029;OID=.;OPOS=58141886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:83:83:6:6:77:77:0.927711:25:52:3:3:25:52:3:3
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chr6	61944740	.	C	A	66.86	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0727227;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.0599;QD=12.7344;RBI=0.110464;REFB=0.0288415;REVB=-0.0831488;RO=12;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271144;STB=0.516093;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=-0.0465082;OID=.;OPOS=61944740;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:4:5:7:5:4:5:7:5
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chr6	62283016	.	T	G	137.96	PASS	AF=0.306452;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.00786837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.562;QD=8.90048;RBI=0.0120081;REFB=-0.00742324;REVB=0.00907108;RO=42;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19551;STB=0.605953;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0216543;OID=.;OPOS=62283016;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:42:43:19:19:0.306452:9:10:15:27:9:10:16:27
chr6	62284247	.	T	G	606.73	PASS	AF=0.477273;AO=61;DP=128;FAO=63;FDP=132;FR=.;FRO=69;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=0.0319917;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.1389;QD=18.3859;RBI=0.035849;REFB=-0.00798757;REVB=0.0161767;RO=67;SAF=38;SAR=23;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405733;STB=0.529402;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00848938;OID=.;OPOS=62284247;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:132:67:69:61:63:0.477273:23:38:39:28:24:39:39:30
chr6	62284356	.	CA	C	385.87	PASS	AF=0.537736;AO=53;DP=105;FAO=57;FDP=106;FR=.;FRO=49;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=0.0269086;FXX=0.0185168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.8364;QD=14.5612;RBI=0.0329286;REFB=-0.00782721;REVB=0.0189795;RO=48;SAF=34;SAR=19;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0153996;STB=0.500533;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0140617;OID=.;OPOS=62284357;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.537736:53:105:57:106:49:36:21:31:18:99:48:34:19:30:18
chr6	62284487	.	C	T	294.08	PASS	AF=0.356436;AO=36;DP=102;FAO=36;FDP=101;FR=.;FRO=65;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=49;FSRR=16;FWDB=-0.0226058;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.221;QD=11.6466;RBI=0.0412465;REFB=-0.0113906;REVB=-0.0345;RO=65;SAF=22;SAR=14;SRF=49;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177482;STB=0.600916;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0190246;OID=.;OPOS=62284487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:65:65:36:36:0.356436:14:22:49:16:14:22:49:16
chr6	62284512	.	T	C	1491.64	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.609;QD=63.4741;RBI=0.0314429;REFB=0;REVB=0.0297356;RO=0;SAF=67;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.56607e-05;OID=.;OPOS=62284512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:27:67:0:0:27:67:0:0
chr6	62390916	.	T	C	380.86	PASS	AF=0.391304;AO=45;DP=116;FAO=45;FDP=115;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=39;FWDB=-0.0148757;FXX=0.00861995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.573;QD=13.2471;RBI=0.0188645;REFB=-0.0205809;REVB=-0.011601;RO=70;SAF=26;SAR=19;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14464;STB=0.581978;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.031634;OID=.;OPOS=62390916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:115:70:70:45:45:0.391304:19:26:31:39:19:26:31:39
chr6	62442604	.	A	G	379.5	PASS	AF=0.550725;AO=38;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.0188257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4957;QD=21.9998;RBI=0.0194101;REFB=0.00926211;REVB=-0.004727;RO=30;SAF=26;SAR=12;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0147168;STB=0.513362;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=-0.00787363;OID=.;OPOS=62442604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:30:31:38:38:0.550725:12:26:21:9:12:26:22:9
chr6	63921853	.	A	G	412.87	PASS	AF=0.532468;AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.0183855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.052;QD=21.4479;RBI=0.019914;REFB=-0.0138966;REVB=0.00765125;RO=36;SAF=20;SAR=21;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367576;STB=0.520295;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.010934;OID=.;OPOS=63921853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:36:36:41:41:0.532468:21:20:16:20:21:20:16:20
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chr6	63921924	.	A	G	161.48	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0437796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.64;QD=18.9972;RBI=0.0452413;REFB=-0.0119662;REVB=0.0114069;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677773;STB=0.55937;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0200081;OID=.;OPOS=63921924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:17:13:17:0.5:7:6:5:8:7:10:8:9
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chr6	63922916	.	T	C	133.42	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0106763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.692;QD=15.696;RBI=0.0117548;REFB=0.00362133;REVB=0.0049186;RO=17;SAF=1;SAR=14;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3711;STB=0.706713;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=-0.00649251;OID=.;OPOS=63922916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:17:19:15:15:0.441176:14:1:4:13:14:1:4:15
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chr6	66005970	.	G	A	265.26	PASS	AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0261724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.395;QD=15.6036;RBI=0.0358491;REFB=-0.00939397;REVB=-0.0244982;RO=35;SAF=18;SAR=12;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561898;STB=0.556848;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.012687;OID=.;OPOS=66005970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:38:30:30:0.441176:12:18:19:16:12:18:19:19
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chr6	66112409	.	A	G	327.85	PASS	AF=0.418605;AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.00923583;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.189;QD=15.2486;RBI=0.0274784;REFB=-0.0150392;REVB=0.0258798;RO=49;SAF=23;SAR=13;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115133;STB=0.571868;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.02604;OID=.;OPOS=66112409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:49:50:36:36:0.418605:13:23:26:23:13:23:26:24
chr6	68599166	.	A	G	1525.72	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00684047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.103;QD=59.8321;RBI=0.0175473;REFB=0;REVB=0.0161591;RO=0;SAF=44;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.13143e-05;OID=.;OPOS=68599166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:58:44:0:0:58:44:0:0
chr6	68599169	.	A	T	1514.61	PASS	AF=1;AO=89;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=44;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.736;QD=59.9847;RBI=0.0593518;REFB=0;REVB=0.0478009;RO=0;SAF=42;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000684615;OID=.;OPOS=68599169;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:89:101:1:47:42:0:0:57:44:0:0
chr6	69348852	.	TGA	T,TG	30.35	PASS	AF=0,0.27907;AO=7,13;DP=43;FAO=0,12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=0,11;FSAR=0,1;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0595658,-0.148605;FXX=0;HRUN=1,6;LEN=2,1;MLLD=103.14,10.0193;QD=2.82316;RBI=0.0614805,0.153316;REFB=-0.00469027,-0.159526;REVB=-0.0152238,-0.037716;RO=20;SAF=7,9;SAR=0,4;SRF=6;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0.396491;SSSB=0.784093,0.39327;STB=0.5,0.896273;STBP=1,0.006;TYPE=del,del;VARB=0,0.137802;OID=.,.;OPOS=69348853,69348854;OREF=GA,A;OALT=-,-;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.27907:7,13:43:0,12:43:31:0,11:0,1:13:18:29:20:7,9:0,4:6:14
chr6	69666684	.	A	G	1227.32	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00347133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.815;QD=61.366;RBI=0.0127972;REFB=0;REVB=-0.0123174;RO=0;SAF=32;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.54467e-05;OID=.;OPOS=69666684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:48:32:0:0:48:32:0:0
chr6	70071173	.	G	A	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.377;QD=60.6093;RBI=0.0203219;REFB=0;REVB=0.00944613;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147254;OID=.;OPOS=70071173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0
chr6	70071214	.	A	G	92.86	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0246848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.155;QD=9.28605;RBI=0.0963535;REFB=0.0324219;REVB=0.0931378;RO=27;SAF=5;SAR=7;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108949;STB=0.508533;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=-0.03926;OID=.;OPOS=70071214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:27:28:12:12:0.3:7:5:11:16:7:5:12:16
chr6	70407465	.	A	T	1195.99	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385872;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.338;QD=60.5564;RBI=0.0503965;REFB=0;REVB=0.0324167;RO=0;SAF=45;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223987;OID=.;OPOS=70407465;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:78:79:1:33:45:0:0:34:45:0:0
chr6	70778378	.	GC	CT	405.7	PASS	AF=1;AO=26;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0773926;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=2;MLLD=70.397;QD=55.9593;RBI=0.0784501;REFB=0;REVB=0.0128371;RO=0;SAF=4;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00685529;OID=.;OPOS=70778378;OREF=GC;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:26:29:1:22:4:0:0:23:6:0:0
chr6	70812123	.	A	G	315.04	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0420212;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.672;QD=50.4067;RBI=0.0435035;REFB=-0.130948;REVB=0.0112595;RO=1;SAF=10;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440956;STB=0.52379;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00158188;OID=.;OPOS=70812123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:25:25:1:1:24:24:0.96:14:10:1:0:14:10:1:0
chr6	70917558	.	TA	AT,TAT	531.76	PASS	AF=0,1;AO=2,24;DP=47;FAO=0,39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=0,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236055,0.0244978;FXX=0.0249938;HRUN=3,0;LEN=2,1;MLLD=161.134,170.134;QD=54.5395;RBI=0.0269625,0.0249159;REFB=0,0;REVB=0.0130291,0.00454548;RO=18;SAF=2,12;SAR=0,12;SRF=13;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.444428,-0.171837;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,ins;VARB=0,0.000302936;OID=.,.;OPOS=70917558,70917560;OREF=TA,-;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,TAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:47:39:18:0:2,24:0,39:0,1:0,12:2,12:13:5:0,18:0,21:0:0
chr6	70917560	.	GT	TG	72.64	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00297386;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=2;MLLD=66.6996;QD=7.45065;RBI=0.00495563;REFB=-0.124519;REVB=0.00396414;RO=29;SAF=5;SAR=5;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613067;STB=0.538385;STBP=0.778;TYPE=mnp;VARB=0.0109456;OID=.;OPOS=70917560;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:40:39:29:29:10:10:0.25641:5:5:16:13:5:5:16:13
chr6	71238105	.	A	G	902.44	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0791491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.281;QD=58.2218;RBI=0.0987667;REFB=0;REVB=0.0590787;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000327515;OID=.;OPOS=71238105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:62:0:0:58:62:1:26:32:0:0:27:35:0:0
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chr6	71569090	.	T	C	817.72	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.354;QD=57.3841;RBI=0.0108092;REFB=0;REVB=0.00134213;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.06046e-05;OID=.;OPOS=71569090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:36:21:0:0:36:21:0:0
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chr6	72889471	.	T	TG	1078.41	PASS	AF=1;AO=15;DP=101;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.210106;FXX=0.0219756;HRUN=0;LEN=1;MLLD=116.624;QD=48.4678;RBI=0.211615;REFB=0;REVB=0.0252293;RO=72;SAF=1;SAR=14;SRF=37;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.615345;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000679173;OID=.;OPOS=72889472;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:15:101:89:89:0:38:51:0:0:6:72:1:14:37:35
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chr6	72892257	.	A	G	191.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.248;QD=47.8189;RBI=0.0350936;REFB=0;REVB=-0.0136264;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000866207;OID=.;OPOS=72892257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
chr6	74019376	.	T	C	253.1	PASS	AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=5;FWDB=-0.0115203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.063;QD=15.1104;RBI=0.029197;REFB=-0.00730885;REVB=-0.0268281;RO=38;SAF=21;SAR=8;SRF=33;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202373;STB=0.612699;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0114132;OID=.;OPOS=74019376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:8:21:33:5:8:21:33:5
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chr6	74161503	.	A	G	173.52	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.055;QD=46.2731;RBI=0.0906956;REFB=0;REVB=0.0748458;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371247;OID=.;OPOS=74161503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:8:6:0:0:9:6:0:0
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chr6	74190448	.	T	C	458.67	PASS	AF=0.564103;AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.0147137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8635;QD=23.5215;RBI=0.0155484;REFB=-0.00230259;REVB=0.00502611;RO=33;SAF=22;SAR=22;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154169;STB=0.589704;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00239341;OID=.;OPOS=74190448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:33:34:44:44:0.564103:22:22:23:10:22:22:24:10
chr6	74197548	.	C	T	77.28	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.00312591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.4964;QD=13.4403;RBI=0.0301114;REFB=-0.0251373;REVB=0.0299487;RO=13;SAF=8;SAR=2;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443574;STB=0.526261;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0353231;OID=.;OPOS=74197548;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:2:8:10:3:2:8:10:3
chr6	74521947	.	C	T	712.09	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011541;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.338;QD=63.2972;RBI=0.0246897;REFB=0;REVB=-0.0218262;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118709;OID=.;OPOS=74521947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr6	74533192	.	T	G	428.6	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0649209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.47;QD=57.1472;RBI=0.065073;REFB=0;REVB=-0.00444618;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000377951;OID=.;OPOS=74533192;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr6	75797302	.	C	T	530.19	PASS	AF=0.583333;AO=49;DP=84;FAO=49;FDP=84;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00303565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.169;QD=25.2473;RBI=0.0275522;REFB=-0.0175181;REVB=0.0273845;RO=35;SAF=26;SAR=23;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124672;STB=0.50682;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0156401;OID=.;OPOS=75797302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:35:35:49:49:0.583333:23:26:18:17:23:26:18:17
chr6	75841722	.	A	T	1647.55	PASS	AF=1;AO=109;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.999;QD=59.9108;RBI=0.0164283;REFB=0;REVB=-0.00279205;RO=0;SAF=71;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.60383e-06;OID=.;OPOS=75841722;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:109:110:1:38:71:0:0:38:72:0:0
chr6	75848181	.	A	G	436.2	PASS	AF=0.433628;AO=49;DP=113;FAO=49;FDP=113;FR=.;FRO=64;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.00182395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.698;QD=15.4407;RBI=0.0117409;REFB=-0.00797999;REVB=-0.0115983;RO=64;SAF=21;SAR=28;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135129;STB=0.575727;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.00979933;OID=.;OPOS=75848181;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:64:64:49:49:0.433628:28:21:36:28:28:21:36:28
chr6	76138146	.	C	CAG	531.24	PASS	AF=0.549451;AO=49;DP=92;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00925161;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=2;MLLD=289.687;QD=23.3513;RBI=0.0182632;REFB=-0.0246399;REVB=0.0157465;RO=41;SAF=20;SAR=29;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263023;STB=0.508768;STBP=0.856;TYPE=ins;VARB=0.0198274;OID=.;OPOS=76138147;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.549451:49:92:50:91:41:21:29:18:23:99:41:20:29:18:23
chr6	76369054	.	A	G	1541.56	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267216;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.388;QD=59.8662;RBI=0.0473615;REFB=0;REVB=0.0391033;RO=0;SAF=49;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.95759e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117475;OID=.;OPOS=76369054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:54:49:0:0:54:49:0:0
chr6	76425594	.	A	C	734.02	PASS	AF=0.979167;AO=46;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0238451;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.992;QD=61.1682;RBI=0.037139;REFB=0.0500245;REVB=0.0284731;RO=1;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218604;STB=0.511106;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.000112516;OID=.;OPOS=76425594;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:1:1:46:47:0.979167:21:25:0:1:22:25:0:1
chr6	76570815	.	ATG	A	110.14	PASS	AF=0.448276;AO=9;DP=30;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.022331;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=2;MLLD=252.259;QD=15.1923;RBI=0.0252196;REFB=0.00144194;REVB=0.0117198;RO=15;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633357;STB=0.559344;STBP=0.634;TYPE=del;VARB=-0.00364504;OID=.;OPOS=76570816;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.448276:9:30:13:29:16:3:10:5:11:99:15:2:7:4:11
chr6	76604573	.	T	G	274.19	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00887038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.876;QD=24.9263;RBI=0.0132725;REFB=0.00428176;REVB=-0.00987294;RO=19;SAF=15;SAR=10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998414;STB=0.555511;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=-0.00644343;OID=.;OPOS=76604573;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:10:15:9:10:10:15:9:10
chr6	76625079	.	T	C	531.6	PASS	AF=0.537634;AO=50;DP=93;FAO=50;FDP=93;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0200774;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=323.537;QD=22.8644;RBI=0.0218374;REFB=-0.00482059;REVB=-0.00858899;RO=42;SAF=22;SAR=28;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501859;STB=0.52256;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00398384;OID=.;OPOS=76625079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:42:43:50:50:0.537634:28:22:21:21:28:22:21:22
chr6	76626756	.	T	C	357.35	PASS	AF=0.422222;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.0215078;FXX=0.0217368;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.8714;QD=15.8822;RBI=0.0323598;REFB=-0.0256749;REVB=0.0241779;RO=51;SAF=23;SAR=15;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118761;STB=0.561946;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0337864;OID=.;OPOS=76626756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:51:52:38:38:0.422222:15:23:25:26:15:23:26:26
chr6	76627598	.	TGGTT	TGG,TGGT,TG,TGT,TGTT	363.58	PASS	AF=0,0,0,1,0;AO=5,5,4,6,5;DP=38;FAO=0,0,0,38,0;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,0,18,0;FSAR=0,0,0,20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.291855,-0.56182,-0.0862096,0.0997504,0.7232;FXX=0.0256345;HRUN=11,11,2,2,2;LEN=2,1,3,2,1;MLLD=6.21936,3.00034,14.1477,15.8299,14.2277;QD=38.2718;RBI=0.2939,0.5675,0.130535,0.217374,0.765851;REFB=0,0,0,0,0;REVB=0.034611,0.0800869,0.0980163,0.193135,0.252011;RO=3;SAF=4,4,1,0,0;SAR=1,1,3,6,5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=0.116878,0.116878,-0.305979,-0.778585,-0.762666;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=del,del,del,del,del;VARB=0,0,-0.0552304,0.00659231,0.017988;OID=.,.,.,.,.;OPOS=76627601,76627601,76627600,76627600,76627599;OREF=TT,T,GTT,GT,G;OALT=-,-,-,-,-;OMAPALT=TGG,TGGT,TG,TGT,TGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	4/4:0,0,0,1,0:5,5,4,6,5:38:0,0,0,38,0:38:0:0,0,0,18,0:0,0,0,20,0:0:0:6:3:4,4,1,0,0:1,1,3,6,5:2:1
chr6	76631823	.	C	T	137.74	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00578455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.609;QD=11.9777;RBI=0.00589073;REFB=-0.00391266;REVB=-0.00111337;RO=30;SAF=7;SAR=9;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14212;STB=0.58368;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00701021;OID=.;OPOS=76631823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:9:7:17:13:9:7:17:13
chr6	76660551	.	G	C	205.81	PASS	AF=0.396825;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=30;FWDB=-0.0128838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5009;QD=13.0676;RBI=0.0425331;REFB=-0.0517984;REVB=-0.0405348;RO=38;SAF=15;SAR=10;SRF=8;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.394836;STB=0.722735;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0487519;OID=.;OPOS=76660551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:38:38:25:25:0.396825:10:15:8:30:10:15:8:30
chr6	78172260	.	C	G	766.4	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9587;QD=63.8669;RBI=0.0755933;REFB=0;REVB=-0.0645918;RO=0;SAF=47;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000279167;OID=.;OPOS=78172260;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:1:47:0:0:1:47:0:0
chr6	78172992	.	G	A	1449.8	PASS	AF=0.961905;AO=101;DP=105;FAO=101;FDP=105;FR=.;FRO=4;FSAF=61;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0429633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.208;QD=55.2306;RBI=0.0549887;REFB=-0.0205759;REVB=0.0343207;RO=2;SAF=61;SAR=40;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231267;STB=0.523805;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.000670565;OID=.;OPOS=78172992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:105:105:2:4:101:101:0.961905:40:61:0:2:40:61:0:4
chr6	79595167	.	A	ACTTAT	453.5	PASS	AF=0.76087;AO=33;DP=48;FAO=35;FDP=46;FR=.;FRO=11;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0249771;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=5;MLLD=268.339;QD=39.4351;RBI=0.0250669;REFB=-0.0555777;REVB=-0.00212023;RO=12;SAF=20;SAR=13;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951647;STB=0.528286;STBP=0.571;TYPE=ins;VARB=0.0133126;OID=.;OPOS=79595168;OREF=-;OALT=CTTAT;OMAPALT=ACTTAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.76087:33:48:35:46:11:20:15:5:6:80:12:20:13:5:7
chr6	79612800	.	G	A	1126.03	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.247;QD=60.0551;RBI=0.020282;REFB=0;REVB=0.000159651;RO=0;SAF=31;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.25832e-05;OID=.;OPOS=79612800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:75:0:0:72:75:1:41:31:0:0:41:34:0:0
chr6	79657391	.	G	A	1339.76	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00859658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.917;QD=62.3142;RBI=0.016665;REFB=0;REVB=-0.0142766;RO=0;SAF=54;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.17557e-05;OID=.;OPOS=79657391;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:32:54:0:0:32:54:0:0
chr6	79679577	.	A	G	817.7	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.054;QD=57.3822;RBI=0.0265381;REFB=0;REVB=0.0136501;RO=0;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01489e-05;OID=.;OPOS=79679577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:32:24:0:0:33:24:0:0
chr6	79708000	.	A	C	833.97	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5468;QD=57.5149;RBI=0.0225608;REFB=0;REVB=-0.0173987;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.77162e-05;OID=.;OPOS=79708000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:23:35:0:0:23:35:0:0
chr6	79918309	.	G	A	766.54	PASS	AF=1;AO=45;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0617244;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=32.5205;QD=54.7526;RBI=0.0723779;REFB=0;REVB=0.0377976;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00368172;OID=.;OPOS=79918309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:45:56:1:25:20:0:0:32:24:0:0
chr6	79944246	.	T	C	980.39	PASS	AF=0.945205;AO=67;DP=73;FAO=69;FDP=73;FR=.;FRO=4;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00784199;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=281.07;QD=53.7199;RBI=0.0153683;REFB=0.00381779;REVB=0.013217;RO=4;SAF=41;SAR=26;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124855;STB=0.507159;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-3.90311e-06;OID=.;OPOS=79944246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:73:73:4:4:67:69:0.945205:26:41:2:2:26:43:2:2
chr6	80196498	.	T	C	815.1	PASS	AF=0.923077;AO=60;DP=65;FAO=60;FDP=65;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0548829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4022;QD=50.1598;RBI=0.0709974;REFB=-0.139985;REVB=0.0450389;RO=1;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125858;STB=0.501355;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0144506;OID=.;OPOS=80196498;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:65:65:1:5:60:60:0.923077:37:23:0:1:37:23:2:3
chr6	80228541	.	A	G	2764.71	PASS	AF=0.973545;AO=181;DP=189;FAO=184;FDP=189;FR=.;FRO=5;FSAF=97;FSAR=87;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0548811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.807;QD=58.5125;RBI=0.0651466;REFB=-0.132013;REVB=0.0351021;RO=4;SAF=94;SAR=87;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00950882;STB=0.507244;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.000999671;OID=.;OPOS=80228541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:189:189:4:5:181:184:0.973545:87:94:3:1:87:97:4:1
chr6	80411572	.	C	A	664.38	PASS	AF=0.977778;AO=42;DP=43;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0351763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8771;QD=59.0558;RBI=0.0353447;REFB=-0.0311238;REVB=-0.00344589;RO=1;SAF=26;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177147;STB=0.50943;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0133421;OID=.;OPOS=80411572;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:45:1:1:42:44:0.977778:16:26:1:0:18:26:1:0
chr6	80580038	.	T	G	1377.49	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0680999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.198;QD=62.6132;RBI=0.0789787;REFB=0;REVB=0.0400006;RO=0;SAF=50;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284552;OID=.;OPOS=80580038;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:88:0:0:87:88:1:37:50:0:0:38:50:0:0
chr6	80715838	.	T	G	1487.8	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00287658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.722;QD=63.3104;RBI=0.0375394;REFB=0;REVB=0.037429;RO=0;SAF=52;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.85051e-05;OID=.;OPOS=80715838;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:41:52:0:0:42:52:0:0
chr6	80837253	.	GA	AT,TA	84.22	PASS	AF=0,0.375;AO=3,7;DP=30;FAO=0,12;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=0,8;FSAR=0,4;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0198223,0.0194426;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=42.3054,42.8433;QD=10.5278;RBI=0.0542716,0.0245147;REFB=-0.0293613,0.0055209;REVB=-0.050522,0.0149317;RO=13;SAF=1,6;SAR=2,1;SRF=9;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.378161,0.260866;STB=0.5,0.577644;STBP=1,0.548;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0975669,0.00909892;OID=.,.;OPOS=80837253,80837253;OREF=GA,G;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:75:30:32:13:20:3,7:0,12:0,0.375:2,1:1,6:9:4:0,4:0,8:11:9
chr6	82457147	.	C	G	194.05	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0235405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.472;QD=16.8738;RBI=0.0254506;REFB=-0.0108418;REVB=-0.00967363;RO=26;SAF=7;SAR=13;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046774;STB=0.526673;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0151228;OID=.;OPOS=82457147;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:13:7:8:18:13:7:8:18
chr6	82458639	.	G	T	377.74	PASS	AF=0.542857;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.041389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7963;QD=21.5849;RBI=0.0642797;REFB=-0.0681021;REVB=-0.0491816;RO=27;SAF=21;SAR=17;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0593247;STB=0.563142;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0508697;OID=.;OPOS=82458639;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:70:27:32:38:38:0.542857:17:21:17:10:17:21:22:10
chr6	82461520	.	A	G	76.19	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0588113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.6896;QD=12.1909;RBI=0.0595177;REFB=0.0018589;REVB=0.00914272;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141152;STB=0.559882;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=-0.00717349;OID=.;OPOS=82461520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:25:14:15:10:10:0.4:5:5:5:9:5:5:6:9
chr6	83078381	.	C	T	198.33	PASS	AF=0.396825;AO=24;DP=62;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0908382;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.6141;QD=12.5923;RBI=0.0911935;REFB=-0.0386165;REVB=0.00804241;RO=28;SAF=13;SAR=11;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397674;STB=0.527896;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0493351;OID=.;OPOS=83078381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:28:38:24:25:0.396825:11:13:14:14:13:12:20:18
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chr6	83667045	.	C	T	249.27	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.0336574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8956;QD=18.4644;RBI=0.0336876;REFB=-0.0349032;REVB=0.00142427;RO=27;SAF=15;SAR=12;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136717;STB=0.576217;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0143604;OID=.;OPOS=83667045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:12:15:19:8:12:15:19:8
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chr6	84862685	.	C	A	318.37	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0207455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.78;QD=18.1924;RBI=0.0208686;REFB=0.000680672;REVB=-0.00226359;RO=36;SAF=19;SAR=15;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799732;STB=0.544662;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-0.000524816;OID=.;OPOS=84862685;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:36:36:34:34:0.485714:15:19:17:19:15:19:17:19
chr6	86199233	.	A	G	350.06	PASS	AF=0.398058;AO=40;DP=103;FAO=41;FDP=103;FR=.;FRO=62;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.00719289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.818;QD=13.5944;RBI=0.0766801;REFB=-0.022013;REVB=0.076342;RO=62;SAF=21;SAR=19;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425127;STB=0.516937;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0255437;OID=.;OPOS=86199233;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:62:62:40:41:0.398058:19:21:35:27:19:22:35:27
chr6	86205323	.	T	G	106.76	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.000801147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.116;QD=12.2008;RBI=0.0498618;REFB=-0.000264579;REVB=0.0498554;RO=22;SAF=9;SAR=4;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168049;STB=0.59984;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.00026631;OID=.;OPOS=86205323;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:4:9:12:10:4:9:12:10
chr6	86303091	.	G	A	224.14	PASS	AF=0.428571;AO=25;DP=61;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0547432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7516;QD=14.231;RBI=0.0562224;REFB=-0.00245426;REVB=0.0128115;RO=36;SAF=10;SAR=15;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104857;STB=0.553659;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00671345;OID=.;OPOS=86303091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:63:36:36:25:27:0.428571:15:10:18:18:16:11:18:18
chr6	87796233	.	G	A	62.69	PASS	AF=0.666667;AO=8;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.042015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.833;QD=20.8979;RBI=0.0506854;REFB=-0.0110334;REVB=0.0283505;RO=4;SAF=2;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171168;STB=0.599732;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.00965554;OID=.;OPOS=87796233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:12:12:4:4:8:8:0.666667:6:2:2:2:6:2:2:2
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chr6	90039670	.	G	C	976.28	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00903365;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.087;QD=59.1684;RBI=0.0233928;REFB=0;REVB=0.0215781;RO=0;SAF=24;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1333e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.77465e-05;OID=.;OPOS=90039670;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:42:24:0:0:42:24:0:0
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chr6	90340276	.	G	A	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00500845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.84;QD=62.0216;RBI=0.0140666;REFB=0;REVB=0.0131448;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.89838e-05;OID=.;OPOS=90340276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
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chr6	90371202	.	G	A	1759.44	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00844759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9841;QD=60.6703;RBI=0.0260818;REFB=0;REVB=-0.0246759;RO=0;SAF=73;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.51916e-05;OID=.;OPOS=90371202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:116:0:0:115:116:1:42:73:0:0:43:73:0:0
chr6	90390443	.	C	A	289.24	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0960978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.255;QD=52.5897;RBI=0.0962014;REFB=0;REVB=-0.00446273;RO=0;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000824604;OID=.;OPOS=90390443;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:16:5:0:0:16:6:0:0
chr6	90402482	.	G	A	972.88	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.048;QD=58.9627;RBI=0.0332415;REFB=0;REVB=0.0253926;RO=0;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.60683e-05;OID=.;OPOS=90402482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:26:39:0:0:27:39:0:0
chr6	90402840	.	C	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.125;QD=49.5992;RBI=0.0399534;REFB=0;REVB=0.0314268;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000695118;OID=.;OPOS=90402840;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
chr6	90418262	.	C	T	2197.75	PASS	AF=1;AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00622657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.387;QD=63.2447;RBI=0.0221198;REFB=0;REVB=0.0212253;RO=0;SAF=67;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.16883e-05;OID=.;OPOS=90418262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:139:139:0:0:139:139:1:72:67:0:0:72:67:0:0
chr6	90448092	.	C	T	1061.94	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00473023;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.415;QD=59.8275;RBI=0.0243993;REFB=0;REVB=0.0239364;RO=0;SAF=37;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000749966;OID=.;OPOS=90448092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:70:71:1:33:37:0:0:34:37:0:0
chr6	90455084	.	A	G	519.97	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0887747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.147;QD=59.4253;RBI=0.0899365;REFB=0;REVB=0.014409;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000742574;OID=.;OPOS=90455084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr6	90459454	.	G	A	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.72;QD=57.3855;RBI=0.0353482;REFB=0;REVB=-0.00487473;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.43737e-05;OID=.;OPOS=90459454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:28:29:0:0:28:29:0:0
chr6	90461123	.	G	A	374.25	PASS	AF=0.731707;AO=30;DP=41;FAO=30;FDP=41;FR=.;FRO=11;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00614711;FXX=0.0465008;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.05;QD=36.512;RBI=0.0663791;REFB=-0.0273462;REVB=-0.0660939;RO=11;SAF=20;SAR=10;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0655189;STB=0.53569;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0136551;OID=.;OPOS=90461123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:41:41:11:11:30:30:0.731707:10:20:6:5:10:20:6:5
chr6	90482397	.	T	C	338.93	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0129477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.901;QD=17.8384;RBI=0.0140962;REFB=-0.0280722;REVB=-0.00557324;RO=40;SAF=19;SAR=17;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924759;STB=0.551594;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0333871;OID=.;OPOS=90482397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:17:19:25:15:17:19:25:15
chr6	90497589	.	A	C	187.44	PASS	AF=0.692308;AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0233855;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=45.2701;QD=28.8375;RBI=0.0827035;REFB=0.00433304;REVB=0.0793283;RO=7;SAF=14;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358934;STB=0.719365;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00158483;OID=.;OPOS=90497589;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:7:8:18:18:0.692308:4:14:1:6:4:14:1:7
chr6	90565242	.	A	G	85.21	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0220769;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=72.178;QD=12.1725;RBI=0.0315543;REFB=-0.00962994;REVB=-0.0225452;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210453;STB=0.632838;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0180541;OID=.;OPOS=90565242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:27:28:15:17:11:11:0.392857:3:8:8:7:3:8:9:8
chr6	90584090	.	C	CT,T	31.79	PASS	AF=0.170732,0;AO=13,3;DP=82;FAO=14,0;FDP=82;FR=.;FRO=68;FSAF=7,0;FSAR=7,0;FSRF=42;FSRR=26;FWDB=-0.00519294,-0.0287763;FXX=0.0120467;HRUN=5,1;LEN=1,1;MLLD=11.2638,94.912;QD=1.55087;RBI=0.0315199,0.0399185;REFB=-0.0825316,-0.00596211;REVB=-0.0310892,-0.0276661;RO=63;SAF=5,2;SAR=8,1;SRF=40;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.30531,0.0290973;STB=0.597427,0.5;STBP=0.433,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0607855,0;OID=.,.;OPOS=90584091,90584090;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:82:82:63:68:13,3:14,0:0.170732,0:8,1:5,2:40:23:7,0:7,0:42:26
chr6	90638390	.	G	A	272.67	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.011427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6597;QD=24.237;RBI=0.0163381;REFB=-0.031974;REVB=-0.0116772;RO=20;SAF=14;SAR=11;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0737293;STB=0.540951;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0287306;OID=.;OPOS=90638390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:20:20:25:25:0.555556:11:14:13:7:11:14:13:7
chr6	90638553	.	T	G	263.04	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0274005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.0937;QD=17.8334;RBI=0.0371873;REFB=-0.0307854;REVB=-0.0251417;RO=30;SAF=21;SAR=8;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097682;STB=0.554898;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0329601;OID=.;OPOS=90638553;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:8:21:19:11:8:21:19:11
chr6	90641674	.	ATAT	A	53.94	PASS	AF=1;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0825845;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=3;MLLD=92.2457;QD=35.9628;RBI=0.182193;REFB=0;REVB=0.162401;RO=3;SAF=4;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194334;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00533941;OID=.;OPOS=90641675;OREF=TAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:9:6:6:0:4:2:0:0:3:3:4:2:1:2
chr6	90660319	.	T	C	118.82	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0305283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.521;QD=22.6315;RBI=0.0316635;REFB=0.000577421;REVB=0.00840222;RO=8;SAF=3;SAR=10;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218735;STB=0.624791;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.000234563;OID=.;OPOS=90660319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:10:3:4:4:10:3:4:4
chr6	91225737	.	C	T	535.24	PASS	AF=0.459677;AO=57;DP=122;FAO=57;FDP=124;FR=.;FRO=67;FSAF=46;FSAR=11;FSRF=36;FSRR=31;FWDB=-0.00873773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.319;QD=17.2659;RBI=0.00927283;REFB=-0.0428813;REVB=-0.00310445;RO=65;SAF=46;SAR=11;SRF=35;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318579;STB=0.681651;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0324533;OID=.;OPOS=91225737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:124:65:67:57:57:0.459677:11:46:35:30:11:46:36:31
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chr6	96034883	.	G	A	147.3	PASS	AF=0.144737;AO=33;DP=228;FAO=33;FDP=228;FR=.;FRO=195;FSAF=30;FSAR=3;FSRF=128;FSRR=67;FWDB=-0.0415597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1249;QD=2.58428;RBI=0.0692929;REFB=-0.0109474;REVB=-0.0554464;RO=195;SAF=30;SAR=3;SRF=128;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444383;STB=0.815613;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0873126;OID=.;OPOS=96034883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:228:228:195:195:33:33:0.144737:3:30:128:67:3:30:128:67
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chr6	96652370	.	G	GC	444.26	PASS	AF=1;AO=4;DP=36;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646983;FXX=0.0605877;HRUN=0;LEN=1;MLLD=203.461;QD=57.3238;RBI=0.0648279;REFB=0;REVB=0.00409836;RO=29;SAF=3;SAR=1;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334478;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000681388;OID=.;OPOS=96652371;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:36:31:31:0:17:14:0:0:4:29:3:1:13:16
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chr6	96653208	.	C	G	919.08	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00528388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7761;QD=58.3544;RBI=0.0140121;REFB=0;REVB=-0.0129777;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000149203;OID=.;OPOS=96653208;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0
chr6	96661315	.	T	C	130.44	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.4373;QD=43.4791;RBI=0.0391375;REFB=0;REVB=0.029328;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011387;OID=.;OPOS=96661315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
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chr6	99284244	.	G	A	453.36	PASS	AF=0.421488;AO=51;DP=121;FAO=51;FDP=121;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=-0.00619155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.771;QD=14.9869;RBI=0.00620657;REFB=-0.00599679;REVB=-0.000431576;RO=70;SAF=18;SAR=33;SRF=39;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213549;STB=0.62013;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00689737;OID=.;OPOS=99284244;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:70:70:51:51:0.421488:33:18:39:31:33:18:39:31
chr6	99724713	.	G	A	273.41	PASS	AF=0.413333;AO=30;DP=76;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0246537;FXX=0.0259707;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.136;QD=14.5817;RBI=0.0250993;REFB=-0.0155249;REVB=0.00470837;RO=44;SAF=17;SAR=13;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224629;STB=0.501735;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0258542;OID=.;OPOS=99724713;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:44:44:30:31:0.413333:13:17:24:20:14:17:24:20
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chr6	99817416	.	ATTT	ATTTC,ATT	238.18	PASS	AF=0.479167,0;AO=21,5;DP=48;FAO=23,0;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=13,0;FSAR=10,0;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.00193913,-0.00388917;FXX=0;HRUN=0,5;LEN=1,1;MLLD=298.946,12.7284;QD=19.8481;RBI=0.0107814,0.0179316;REFB=-0.0104276,-0.0391519;REVB=0.0106056,0.0175048;RO=19;SAF=13,1;SAR=8,4;SRF=7;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.211786,-0.235877;STB=0.625563,0.5;STBP=0.103,1;TYPE=ins,del;VARB=0.0109421,0;OID=.,.;OPOS=99817420,99817417;OREF=-,T;OALT=C,-;OMAPALT=ATTTC,ATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.479167,0:21,5:48:23,0:48:25:13,0:10,0:8:17:99:19:13,1:8,4:7:12
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chr6	99842056	.	C	A	293.13	PASS	AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0221868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.26;QD=22.9909;RBI=0.0230962;REFB=-0.0500622;REVB=-0.00641726;RO=20;SAF=19;SAR=10;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12136;STB=0.550689;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.0361776;OID=.;OPOS=99842056;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:20:22:29:29:0.568627:10:19:10:10:10:19:12:10
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chr6	102503317	.	G	A	151.56	PASS	AF=0.333333;AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.00794507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.753;QD=10.1039;RBI=0.00794616;REFB=-0.030322;REVB=-0.000131796;RO=40;SAF=10;SAR=10;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0567044;STB=0.5333;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.057459;OID=.;OPOS=102503317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:40:40:20:20:0.333333:10:10:22:18:10:10:22:18
chr6	105300250	.	A	G	128.04	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.00111389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.167;QD=20.4858;RBI=0.00291751;REFB=-0.00410951;REVB=0.0026965;RO=11;SAF=6;SAR=8;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126338;STB=0.57133;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00488456;OID=.;OPOS=105300250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:8:6:3:8:8:6:3:8
chr6	105530994	.	GTA	G,GTG	251.32	PASS	AF=0.329268,0.0487805;AO=25,4;DP=87;FAO=27,4;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=17,3;FSAR=10,1;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.00981102,0.0625817;FXX=0.03529;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=265.531,51.9465;QD=12.2597;RBI=0.00995879,0.0690446;REFB=-0.00360949,-0.0239219;REVB=0.00170919,-0.0291666;RO=54;SAF=16,3;SAR=9,1;SRF=30;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.102606,0.204084;STB=0.541801,0.682202;STBP=0.617,0.532;TYPE=del,snp;VARB=0.00751127,0.0285279;OID=.,.;OPOS=105530995,105530996;OREF=TA,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.329268,0.0487805:25,4:87:27,4:82:51:17,3:10,1:29:22:99:54:16,3:9,1:30:24
chr6	106352349	.	T	C	371.51	PASS	AF=0.654545;AO=35;DP=54;FAO=36;FDP=55;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00481041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.387;QD=27.0188;RBI=0.0494043;REFB=-0.0106897;REVB=0.0491695;RO=19;SAF=17;SAR=18;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00775394;STB=0.509086;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00691207;OID=.;OPOS=106352349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:19:19:35:36:0.654545:18:17:9:10:18:18:9:10
chr6	106555025	.	G	A	209.55	PASS	AF=0.457143;AO=15;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0121296;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.5913;QD=23.9483;RBI=0.0133056;REFB=-0.0090179;REVB=0.00546909;RO=5;SAF=9;SAR=6;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179999;STB=0.544131;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0272319;OID=.;OPOS=106555025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:35:35:5:11:15:16:0.457143:6:9:1:4:7:9:5:6
chr6	106959424	.	A	G	247.08	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117833;FXX=0.0908678;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.6675;QD=49.4168;RBI=0.117975;REFB=0;REVB=-0.0057725;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00970008;OID=.;OPOS=106959424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:18:20:0:0:18:20:1:13:5:0:0:15:5:0:0
chr6	106959999	.	C	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163799;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=195.539;QD=44.6898;RBI=0.0438148;REFB=0;REVB=0.0406379;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231936;OID=.;OPOS=106959999;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0
chr6	106960039	.	G	A	252.4	PASS	AF=1;AO=14;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000589446;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.2495;QD=50.4802;RBI=0.0900568;REFB=0;REVB=0.0900549;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00397877;OID=.;OPOS=106960039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:14:20:1:5:9:0:0:8:12:0:0
chr6	106960447	.	G	A	116.08	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.089421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3825;QD=42.2098;RBI=0.102825;REFB=0;REVB=0.0507623;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00301593;OID=.;OPOS=106960447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:11:0:0:10:11:1:8:2:0:0:8:3:0:0
chr6	106987370	.	A	C	1171.97	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.752;QD=60.8815;RBI=0.0311196;REFB=0;REVB=0.0208778;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120916;OID=.;OPOS=106987370;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:33:44:0:0:33:44:0:0
chr6	106992464	.	A	G	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00954039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.809;QD=58.2396;RBI=0.0161126;REFB=0;REVB=0.0129845;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.40863e-06;OID=.;OPOS=106992464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0
chr6	107016731	.	T	C	305.1	PASS	AF=0.419753;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.0102431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.062;QD=15.0667;RBI=0.0121037;REFB=-0.00868951;REVB=0.00644821;RO=47;SAF=9;SAR=25;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274324;STB=0.656227;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00948955;OID=.;OPOS=107016731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:47:47:34:34:0.419753:25:9:24:23:25:9:24:23
chr6	107076783	.	A	T	293.18	PASS	AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0113839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7269;QD=22.9945;RBI=0.0154632;REFB=-0.0280734;REVB=0.0104651;RO=21;SAF=20;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138104;STB=0.589038;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0197261;OID=.;OPOS=107076783;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:22:29:29:0.568627:9:20:11:10:9:20:11:11
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chr6	107389510	.	A	T	71.65	PASS	AF=0.228571;AO=7;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0197327;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=17.9541;QD=8.18885;RBI=0.168181;REFB=-0.0152804;REVB=0.16702;RO=12;SAF=1;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.500083;STB=0.836027;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=-0.00432746;OID=.;OPOS=107389510;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:35:35:12:18:7:8:0.228571:6:1:7:5:7:1:10:8
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chr6	107565060	.	T	C	1138.85	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424945;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.675;QD=60.7389;RBI=0.0437948;REFB=0;REVB=-0.0105924;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.24233e-05;OID=.;OPOS=107565060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:34:41:0:0:34:41:0:0
chr6	107980406	.	A	T	1269.99	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8662;QD=61.2042;RBI=0.0753452;REFB=0;REVB=0.074278;RO=0;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302047;OID=.;OPOS=107980406;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:83:0:0:81:83:1:38:43:0:0:39:44:0:0
chr6	108026146	.	C	T	270.81	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0026343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.739;QD=16.9258;RBI=0.0120483;REFB=-0.0238029;REVB=0.0117568;RO=33;SAF=21;SAR=9;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15872;STB=0.599246;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0221354;OID=.;OPOS=108026146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:33:34:30:30:0.46875:9:21:18:15:9:21:18:16
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chr6	108026455	.	A	G	1320.52	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.485;QD=62.1423;RBI=0.0354289;REFB=0;REVB=0.0337433;RO=0;SAF=26;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.87071e-05;OID=.;OPOS=108026455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:85:0:0:81:85:1:55:26:0:0:58:27:0:0
chr6	108029091	.	G	A	306.58	PASS	AF=0.6;AO=27;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0038199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.175;QD=27.2517;RBI=0.00997839;REFB=0.00317818;REVB=-0.00921828;RO=18;SAF=18;SAR=9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128911;STB=0.571374;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.00238371;OID=.;OPOS=108029091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:18:18:27:27:0.6:9:18:9:9:9:18:9:9
chr6	108029109	.	T	C	716.56	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282511;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.906;QD=62.3093;RBI=0.0290492;REFB=0;REVB=-0.00676223;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202361;OID=.;OPOS=108029109;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:44:46:1:19:25:0:0:19:27:0:0
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chr6	108277287	.	C	A	2111.0	PASS	AF=0.985507;AO=135;DP=138;FAO=136;FDP=138;FR=.;FRO=2;FSAF=80;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0304623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.496;QD=61.1884;RBI=0.0342268;REFB=0.0220973;REVB=-0.0156051;RO=2;SAF=79;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00243339;STB=0.501319;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=-0.000521419;OID=.;OPOS=108277287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:138:138:2:2:135:136:0.985507:56:79:1:1:56:80:1:1
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chr6	109616762	.	A	G	523.11	PASS	AF=0.425373;AO=57;DP=134;FAO=57;FDP=134;FR=.;FRO=77;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=47;FSRR=30;FWDB=0.00829214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.334;QD=15.6153;RBI=0.0123064;REFB=-0.0223036;REVB=0.00909332;RO=77;SAF=29;SAR=28;SRF=47;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104587;STB=0.55851;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0226838;OID=.;OPOS=109616762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:77:77:57:57:0.425373:28:29:47:30:28:29:47:30
chr6	109621494	.	T	C	257.13	PASS	AF=0.22093;AO=18;DP=87;FAO=19;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=53;FSAF=2;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.0102965;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.45;QD=11.9593;RBI=0.0628551;REFB=-0.0272875;REVB=-0.062006;RO=50;SAF=1;SAR=17;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.656679;STB=0.858163;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0371689;OID=.;OPOS=109621494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:50:53:18:19:0.22093:17:1:25:25:17:2:28:25
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chr6	109674055	.	C	T	213.93	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0106543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.116;QD=20.871;RBI=0.0172554;REFB=-0.00867978;REVB=-0.0135733;RO=20;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106966;STB=0.560128;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00892921;OID=.;OPOS=109674055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:10:11:8:12:10:11:8:12
chr6	109689431	.	A	G	820.41	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103709;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.09;QD=57.5727;RBI=0.0438831;REFB=0;REVB=0.04264;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.25211e-05;OID=.;OPOS=109689431;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:22:35:0:0:22:35:0:0
chr6	109761437	.	A	G	58.8	PASS	AF=0.1875;AO=8;DP=48;FAO=9;FDP=48;FR=.;FRO=39;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=33;FWDB=-0.0135889;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.6301;QD=4.90014;RBI=0.0718397;REFB=-0.00898574;REVB=0.0705428;RO=40;SAF=0;SAR=8;SRF=7;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.61126;STB=0.577129;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0330749;OID=.;OPOS=109761437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:48:48:40:39:8:9:0.1875:8:0:7:33:8:1:6:33
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chr6	109954252	.	C	T	352.15	PASS	AF=0.507042;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.00367522;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2231;QD=19.8392;RBI=0.0179124;REFB=-0.00843138;REVB=-0.0175314;RO=33;SAF=18;SAR=18;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915308;STB=0.549269;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0083064;OID=.;OPOS=109954252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:71:33:35:36:36:0.507042:18:18:13:20:18:18:14:21
chr6	110064928	.	A	T	244.29	PASS	AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0153996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.77;QD=13.0287;RBI=0.0155246;REFB=-0.0168191;REVB=-0.00196581;RO=46;SAF=17;SAR=12;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701055;STB=0.540159;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0302279;OID=.;OPOS=110064928;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:12:17:24:22:12:17:24:22
chr6	110074412	.	C	T	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0228391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.538;QD=21.8421;RBI=0.0399944;REFB=0.000366731;REVB=0.0328318;RO=2;SAF=2;SAR=4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284202;STB=0.666109;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00101165;OID=.;OPOS=110074412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:4:2:2:0:4:2:2:0
chr6	110106234	.	A	G	459.23	PASS	AF=0.46729;AO=48;DP=105;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=40;FWDB=0.00129761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.883;QD=17.1674;RBI=0.0165502;REFB=-0.0238939;REVB=-0.0164993;RO=57;SAF=28;SAR=20;SRF=17;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272039;STB=0.646744;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.024887;OID=.;OPOS=110106234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:107:57:57:48:50:0.46729:20:28:17:40:21:29:17:40
chr6	110107517	.	T	C	251.68	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0753355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1467;QD=17.0633;RBI=0.0825912;REFB=-0.0254324;REVB=0.0338508;RO=31;SAF=14;SAR=14;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754288;STB=0.542343;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0312666;OID=.;OPOS=110107517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:14:14:13:18:14:14:13:18
chr6	110146303	.	G	A	633.53	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0638719;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.163;QD=60.3362;RBI=0.0740287;REFB=0;REVB=0.0374249;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220994;OID=.;OPOS=110146303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:40:42:1:24:16:0:0:24:18:0:0
chr6	110301661	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.364;QD=58.587;RBI=0.0345718;REFB=0;REVB=0.0263673;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283698;OID=.;OPOS=110301661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:10:23:0:0:10:23:0:0
chr6	110301757	.	C	CT,T	65.7	PASS	AF=0.271186,0;AO=8,3;DP=59;FAO=16,0;FDP=59;FR=.;FRO=43;FSAF=4,0;FSAR=12,0;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0759965,-0.0290377;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=13.2211,45.1481;QD=4.45396;RBI=0.142199,0.139003;REFB=-0.0754601,-0.0130384;REVB=-0.120187,-0.135937;RO=45;SAF=3,0;SAR=5,3;SRF=23;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.165548,-0.491624;STB=0.702437,0.5;STBP=0.057,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0241432,0;OID=.,.;OPOS=110301758,110301757;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:59:59:45:43:8,3:16,0:0.271186,0:5,3:3,0:23:22:12,0:4,0:22:21
chr6	110421361	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00809766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.998;QD=59.0184;RBI=0.0440654;REFB=0;REVB=-0.0433149;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000293363;OID=.;OPOS=110421361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:14:19:0:0:15:19:0:0
chr6	110746526	.	T	C	1219.97	PASS	AF=1;AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0343022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5479;QD=60.9987;RBI=0.0344188;REFB=0;REVB=-0.00282965;RO=0;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000175975;OID=.;OPOS=110746526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:79:80:1:34:45:0:0:35:45:0:0
chr6	110746545	.	T	G	362.02	PASS	AF=0.40625;AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.000766032;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0402;QD=15.084;RBI=0.0114545;REFB=-0.00235269;REVB=-0.0114288;RO=57;SAF=25;SAR=14;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879436;STB=0.549889;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.00521359;OID=.;OPOS=110746545;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:57:57:39:39:0.40625:14:25:32:25:14:25:32:25
chr6	110777962	.	A	G	350.92	PASS	AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.00176396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2127;QD=20.9503;RBI=0.0238956;REFB=-0.00674046;REVB=-0.0238304;RO=30;SAF=19;SAR=17;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00458338;STB=0.50957;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.00592199;OID=.;OPOS=110777962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:30:31:36:36:0.537313:17:19:16:14:17:19:17:14
chr6	110778128	.	T	C	303.72	PASS	AF=0.471429;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00381952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.619;QD=17.3554;RBI=0.0173799;REFB=-0.0187662;REVB=-0.016955;RO=37;SAF=17;SAR=16;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239919;STB=0.513435;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0200281;OID=.;OPOS=110778128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:37:37:33:33:0.471429:16:17:20:17:16:17:20:17
chr6	110797702	.	GCCG	GCGC	337.64	PASS	AF=1;AO=3;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.140483;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=2;MLLD=18.6232;QD=42.2055;RBI=0.202132;REFB=0;REVB=-0.145334;RO=4;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149914;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00765047;OID=.;OPOS=110797704;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GCGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:3:33:32:32:0:15:17:0:0:3:4:1:2:2:2
chr6	110797707	.	GGGG	CACC,CCCA	446.82	PASS	AF=0.65625,0.34375;AO=19,11;DP=32;FAO=21,11;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=7,8;FSAR=14,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356005,0.0358528;FXX=0.0302939;HRUN=4,4;LEN=4,4;MLLD=142.812,125.273;QD=55.8526;RBI=0.045235,0.0389317;REFB=0,0;REVB=0.0279071,0.015174;RO=0;SAF=6,8;SAR=13,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.851e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.015018,-0.00874649;OID=.,.;OPOS=110797707,110797707;OREF=GGGG,GGGG;OALT=CACC,CCCA;OMAPALT=CACC,CCCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:85:32:32:0:0:19,11:21,11:0.65625,0.34375:13,3:6,8:0:0:14,3:7,8:0:0
chr6	110797713	.	C	T	219.03	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.00581409;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.309;QD=23.6789;RBI=0.021748;REFB=-0.0262339;REVB=0.0209564;RO=13;SAF=7;SAR=14;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346987;STB=0.701568;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0105272;OID=.;OPOS=110797713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:13:16:21:21:0.567568:14:7:11:2:14:7:13:3
chr6	110942500	.	G	A	66.69	PASS	AF=0.727273;AO=6;DP=12;FAO=8;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0142905;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.955;QD=24.2512;RBI=0.245489;REFB=-0.0485406;REVB=0.245072;RO=3;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236104;STB=0.636047;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.011013;OID=.;OPOS=110942500;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:12:11:3:3:6:8:0.727273:2:4:3:0:4:4:3:0
chr6	110964409	.	G	A	74.69	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0141764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.164;QD=10.6698;RBI=0.0195807;REFB=-0.0046529;REVB=-0.0135068;RO=17;SAF=3;SAR=7;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46173;STB=0.782397;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0267495;OID=.;OPOS=110964409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:17:18:10:10:0.357143:7:3:13:4:7:3:14:4
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chr6	111283592	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0439506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.989;QD=56.7063;RBI=0.0950199;REFB=0;REVB=-0.0842445;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00161608;OID=.;OPOS=111283592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0
chr6	111587266	.	T	C	443.38	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.00036842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.734;QD=20.1538;RBI=0.0349068;REFB=-0.027528;REVB=0.0349048;RO=43;SAF=24;SAR=20;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961851;STB=0.546198;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.0305469;OID=.;OPOS=111587266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:43:44:44:44:0.5:20:24:28:15:20:24:28:16
chr6	111589293	.	A	C	119.35	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.11272;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.9977;QD=13.6396;RBI=0.14862;REFB=0.00790382;REVB=0.0968605;RO=21;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.050373;STB=0.52937;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=-0.00189894;OID=.;OPOS=111589293;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:8:6:8:13:8:6:8:13
chr6	111620758	.	G	A	329.32	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0045078;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.798;QD=54.8861;RBI=0.0215548;REFB=0;REVB=0.0210782;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243881;OID=.;OPOS=111620758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr6	111695073	.	C	T	46.46	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0325986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.16;QD=7.74404;RBI=0.0346744;REFB=-0.0217876;REVB=-0.011817;RO=17;SAF=3;SAR=4;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305792;STB=0.689165;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0434931;OID=.;OPOS=111695073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:24:24:17:17:7:7:0.291667:4:3:12:5:4:3:12:5
chr6	111695268	.	C	T	381.79	PASS	AF=0.449438;AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=13;FWDB=0.00716368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.052;QD=17.1591;RBI=0.0163484;REFB=-0.0191143;REVB=-0.0146953;RO=49;SAF=28;SAR=12;SRF=36;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413984;STB=0.523149;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.025047;OID=.;OPOS=111695268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:49:49:40:40:0.449438:12:28:36:13:12:28:36:13
chr6	111695887	.	G	A	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0495335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.027;QD=21.0138;RBI=0.0532574;REFB=-0.00657532;REVB=-0.019565;RO=7;SAF=9;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331304;STB=0.691912;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00881832;OID=.;OPOS=111695887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:2:9:3:4:2:9:3:4
chr6	111696257	.	G	A	341.69	PASS	AF=0.430233;AO=37;DP=86;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=32;FWDB=-0.0387149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1838;QD=15.8927;RBI=0.0404188;REFB=0.00775702;REVB=-0.0116117;RO=49;SAF=11;SAR=26;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582825;STB=0.532925;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=-0.0114521;OID=.;OPOS=111696257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:49:49:37:37:0.430233:26:11:17:32:26:11:17:32
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chr6	112493872	.	A	G	666.77	PASS	AF=0.519685;AO=66;DP=127;FAO=66;FDP=127;FR=.;FRO=61;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=39;FSRR=22;FWDB=-0.00540776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.667;QD=21.0007;RBI=0.0124881;REFB=0.00025487;REVB=-0.0112565;RO=60;SAF=30;SAR=36;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153995;STB=0.588042;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.00024711;OID=.;OPOS=112493872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:60:61:66:66:0.519685:36:30:38:22:36:30:39:22
chr6	112508769	.	TG	GT	303.39	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110762;FXX=0.17854;HRUN=1;LEN=2;MLLD=216.466;QD=26.3819;RBI=0.141098;REFB=0;REVB=0.0874094;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000892903;OID=.;OPOS=112508769;OREF=TG;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:56:46:0:0:55:46:1:30:25:0:0:20:26:0:0
chr6	112521387	.	A	C	336.57	PASS	AF=0.411111;AO=36;DP=89;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=0.0664016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.775;QD=14.9586;RBI=0.067302;REFB=-0.00624238;REVB=0.0109717;RO=52;SAF=16;SAR=20;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980159;STB=0.551531;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0091828;OID=.;OPOS=112521387;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:52:53:36:37:0.411111:20:16:28:24:20:17:29:24
chr6	116262976	.	G	A	539.0	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2025;QD=58.2704;RBI=0.0304591;REFB=0;REVB=-0.0279969;RO=0;SAF=15;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.70916e-05;OID=.;OPOS=116262976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:35:37:1:20:15:0:0:21:16:0:0
chr6	116263181	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.598;QD=51.1841;RBI=0.0525834;REFB=0;REVB=0.0504028;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285359;OID=.;OPOS=116263181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr6	116325142	.	C	T	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.061;QD=58.4197;RBI=0.0152158;REFB=0;REVB=-0.00837748;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.08294e-06;OID=.;OPOS=116325142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:35:28:0:0:35:28:0:0
chr6	116571255	.	G	A	696.71	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0404812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.7643;QD=52.5816;RBI=0.0757525;REFB=-0.0399046;REVB=-0.064029;RO=2;SAF=25;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000696368;STB=0.50037;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.000339558;OID=.;OPOS=116571255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:53:2:2:51:51:0.962264:26:25:1:1:26:25:1:1
chr6	116574455	.	G	A	538.38	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7796;QD=59.8197;RBI=0.0481303;REFB=0;REVB=-0.0339559;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.35876e-06;OID=.;OPOS=116574455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr6	116575083	.	C	A	1350.34	PASS	AF=0.977778;AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=56;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0974034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.794;QD=60.0151;RBI=0.098239;REFB=-0.104962;REVB=0.0127858;RO=2;SAF=32;SAR=56;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286932;STB=0.515148;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.000741272;OID=.;OPOS=116575083;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:90:90:2:2:88:88:0.977778:56:32:2:0:56:32:2:0
chr6	116599665	.	T	C	123.61	PASS	AF=0.357143;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0275805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4272;QD=11.7726;RBI=0.0644276;REFB=-0.0246985;REVB=-0.0582257;RO=27;SAF=13;SAR=2;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.468289;STB=0.782694;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0350465;OID=.;OPOS=116599665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:27:27:15:15:0.357143:2:13:14:13:2:13:14:13
chr6	116600465	.	T	TCAC	202.18	PASS	AF=0.857143;AO=17;DP=24;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0012616;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=3;MLLD=264.135;QD=38.5107;RBI=0.00750095;REFB=-0.0287041;REVB=0.00739409;RO=5;SAF=9;SAR=8;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0532951;STB=0.523783;STBP=0.717;TYPE=ins;VARB=0.00689425;OID=.;OPOS=116600466;OREF=-;OALT=CAC;OMAPALT=TCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.857143:17:24:18:21:3:9:9:1:2:17:5:9:8:2:3
chr6	116600774	.	C	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0803122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.067;QD=33.4285;RBI=0.0880456;REFB=0;REVB=0.036083;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00148714;OID=.;OPOS=116600774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:3:3:0:0:3:3:0:0
chr6	116600810	.	G	A	157.13	PASS	AF=0.882353;AO=15;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.122197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4084;QD=36.9715;RBI=0.122206;REFB=-0.123132;REVB=0.00150771;RO=2;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150929;STB=0.583219;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0702068;OID=.;OPOS=116600810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:17:17:2:2:15:15:0.882353:5:10:0:2:5:10:0:2
chr6	116757557	.	T	C	114.58	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3991;QD=41.6641;RBI=0.0532277;REFB=0;REVB=-0.0494143;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00131535;OID=.;OPOS=116757557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0
chr6	116875427	.	G	A	1296.47	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.963;QD=61.0104;RBI=0.0401758;REFB=0;REVB=0.0166607;RO=0;SAF=31;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127642;OID=.;OPOS=116875427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:85:85:0:0:84:85:1:53:31:0:0:53:32:0:0
chr6	117113653	.	T	C	145.55	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00185063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.637;QD=16.1724;RBI=0.00546445;REFB=-0.00384986;REVB=0.00514153;RO=20;SAF=7;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369908;STB=0.52125;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.00386879;OID=.;OPOS=117113653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:9:7:8:12:9:7:8:12
chr6	117114025	.	G	A	151.95	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0320975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.592;QD=20.959;RBI=0.041959;REFB=-0.0542186;REVB=-0.0270242;RO=12;SAF=10;SAR=6;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338333;STB=0.672061;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0443228;OID=.;OPOS=117114025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:29:12:13:16:16:0.551724:6:10:2:10:6:10:3:10
chr6	117114223	.	T	A	306.95	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.00926289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7418;QD=15.5416;RBI=0.0224873;REFB=0.00124714;REVB=-0.0204909;RO=45;SAF=15;SAR=19;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025976;STB=0.514664;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=-0.00227822;OID=.;OPOS=117114223;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:19:15:21:24:19:15:21:24
chr6	117114403	.	G	A	261.7	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.00886618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5176;QD=17.1604;RBI=0.0141959;REFB=-0.0183782;REVB=-0.0110866;RO=32;SAF=11;SAR=18;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00428057;STB=0.502402;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0361147;OID=.;OPOS=117114403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:18:11:12:20:18:11:12:20
chr6	117121894	.	G	A	868.25	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00106914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.809;QD=57.8836;RBI=0.0559838;REFB=0;REVB=-0.0559736;RO=0;SAF=39;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000113405;OID=.;OPOS=117121894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:21:39:0:0:21:39:0:0
chr6	117130704	.	G	A	315.4	PASS	AF=0.421687;AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0274983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7276;QD=15.2001;RBI=0.0279624;REFB=-0.0137759;REVB=0.00507351;RO=48;SAF=20;SAR=15;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0565271;STB=0.531897;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0258707;OID=.;OPOS=117130704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:48:48:35:35:0.421687:15:20:30:18:15:20:30:18
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chr6	117869491	.	G	A	64.19	PASS	AF=0.3;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0317825;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.084;QD=8.55817;RBI=0.0324967;REFB=-0.0107819;REVB=-0.00677549;RO=21;SAF=2;SAR=7;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407405;STB=0.753263;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0251239;OID=.;OPOS=117869491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:31:30:21:21:9:9:0.3:7:2:12:9:7:2:12:9
chr6	117996896	.	G	T	64.07	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0142602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.037;QD=9.49176;RBI=0.0146944;REFB=-0.043793;REVB=0.00354562;RO=18;SAF=8;SAR=1;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372062;STB=0.736195;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0650418;OID=.;OPOS=117996896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:1:8:12:6:1:8:12:6
chr6	119149149	.	C	G	1089.05	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.871;QD=59.6742;RBI=0.0312211;REFB=0;REVB=-0.00170349;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144601;OID=.;OPOS=119149149;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:73:0:0:70:73:1:36:34:0:0:37:36:0:0
chr6	119500916	.	T	C	370.04	PASS	AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00546402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.229;QD=19.7356;RBI=0.0319037;REFB=-0.0204916;REVB=-0.0314324;RO=37;SAF=22;SAR=16;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391702;STB=0.521728;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.032407;OID=.;OPOS=119500916;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:37:37:38:38:0.506667:16:22:23:14:16:22:23:14
chr6	119510941	.	C	A	1318.6	PASS	AF=0.949495;AO=93;DP=100;FAO=94;FDP=99;FR=.;FRO=5;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.021087;FXX=0.0198;HRUN=6;LEN=1;MLLD=94.9082;QD=53.2767;RBI=0.0243023;REFB=-0.0432632;REVB=-0.0120806;RO=1;SAF=51;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00920605;STB=0.52336;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.000550355;OID=.;OPOS=119510941;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:100:99:1:5:93:94:0.949495:42:51:1:0:43:51:5:0
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chr6	120583501	.	T	G	54.87	PASS	AF=0.243243;AO=8;DP=36;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00221436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.72;QD=5.93163;RBI=0.0150001;REFB=-0.0111803;REVB=0.0148357;RO=28;SAF=5;SAR=3;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27214;STB=0.621041;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0393903;OID=.;OPOS=120583501;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:36:37:28:28:8:9:0.243243:3:5:11:17:4:5:11:17
chr6	120583509	.	A	G	61.25	PASS	AF=0.272727;AO=8;DP=32;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.010786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.899;QD=7.42463;RBI=0.0297692;REFB=-0.00634293;REVB=0.0277465;RO=23;SAF=5;SAR=3;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172077;STB=0.570314;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0223763;OID=.;OPOS=120583509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:32:33:23:24:8:9:0.272727:3:5:11:12:4:5:11:13
chr6	120583521	.	A	T	43.61	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0419739;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.981;QD=6.0151;RBI=0.0690177;REFB=-0.00816606;REVB=-0.0547872;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837426;STB=0.554299;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0553252;OID=.;OPOS=120583521;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:3:4:11:11:3:4:11:11
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chr6	121629167	.	G	A	1994.99	PASS	AF=1;AO=126;DP=131;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0574066;FXX=0.0303007;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7567;QD=62.3433;RBI=0.0716781;REFB=0;REVB=-0.0429213;RO=0;SAF=73;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000759937;OID=.;OPOS=121629167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:128:0:0:126:128:1:53:73:0:0:55:73:0:0
chr6	121632008	.	T	A	1080.53	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00540039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6523;QD=60.0297;RBI=0.0352914;REFB=0;REVB=0.0348758;RO=0;SAF=28;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228119;OID=.;OPOS=121632008;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:44:28:0:0:44:28:0:0
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chr6	123702499	.	G	A	1074.08	PASS	AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00349492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.536;QD=57.284;RBI=0.016424;REFB=-0.0865859;REVB=0.0160478;RO=2;SAF=43;SAR=30;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214917;STB=0.511361;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00301014;OID=.;OPOS=123702499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:75:75:2:2:73:73:0.973333:30:43:2:0:30:43:2:0
chr6	123758492	.	C	T	632.17	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.809;QD=61.6754;RBI=0.0187751;REFB=0;REVB=0.0131524;RO=0;SAF=28;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.39802e-05;OID=.;OPOS=123758492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:12:28:0:0:12:29:0:0
chr6	123833457	.	G	C	1536.57	PASS	AF=1;AO=96;DP=98;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00526651;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.191;QD=64.0236;RBI=0.0163796;REFB=0;REVB=0.0155098;RO=0;SAF=58;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35824e-06;OID=.;OPOS=123833457;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:96:0:0:96:96:1:38:58:0:0:38:58:0:0
chr6	123869607	.	G	C	121.57	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0238267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6407;QD=15.196;RBI=0.104063;REFB=-0.0175832;REVB=-0.101299;RO=18;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224506;STB=0.630871;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0177373;OID=.;OPOS=123869607;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:4:10:9:9:4:10:9:9
chr6	123892209	.	C	CG,G	33.55	PASS	AF=0.207547,0;AO=8,3;DP=56;FAO=11,0;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=8,0;FSAR=3,0;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.00354772,-0.00814775;FXX=0.0535619;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=60.1331,53.4788;QD=2.53174;RBI=0.106291,0.0445412;REFB=-0.00641914,-0.0175976;REVB=-0.106232,-0.0437896;RO=41;SAF=6,3;SAR=2,0;SRF=19;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.350665,0.517805;STB=0.719321,0.5;STBP=0.134,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.152898,0;OID=.,.;OPOS=123892210,123892209;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:56:53:41:42:8,3:11,0:0.207547,0:2,0:6,3:19:22:3,0:8,0:19:23
chr6	125284071	.	GC	G	33.55	PASS	AF=0.27907;AO=9;DP=44;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0306309;FXX=0.0227221;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.168;QD=3.12048;RBI=0.0357744;REFB=-0.0380276;REVB=-0.0184813;RO=26;SAF=7;SAR=2;SRF=14;SRR=12;SSEN=0.590909;SSEP=0;SSSB=0.311238;STB=0.662049;STBP=0.222;TYPE=del;VARB=-0.031014;OID=.;OPOS=125284072;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.27907:9:44:12:43:31:9:3:17:14:33:26:7:2:14:12
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chr6	127476516	.	G	A	447.01	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.120072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1552;QD=57.6792;RBI=0.12013;REFB=0;REVB=-0.00374975;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00223965;OID=.;OPOS=127476516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr6	127609691	.	C	T	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.461;QD=39.2066;RBI=0.0360362;REFB=0;REVB=-0.00759283;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248298;OID=.;OPOS=127609691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr6	127768472	.	G	A	708.32	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9395;QD=62.9615;RBI=0.0206278;REFB=0;REVB=-0.00727101;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.63882e-05;OID=.;OPOS=127768472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:21:24:0:0
chr6	127797179	.	G	A	795.28	PASS	AF=0.982759;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0266413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.768;QD=54.8467;RBI=0.0269375;REFB=-0.155071;REVB=0.0039836;RO=1;SAF=31;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149682;STB=0.50769;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0069554;OID=.;OPOS=127797179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:58:1:1:56:57:0.982759:25:31:1:0:25:32:1:0
chr6	127797374	.	G	A	1418.79	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00618408;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.92;QD=63.0572;RBI=0.00768276;REFB=0;REVB=0.00455872;RO=0;SAF=49;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.36161e-06;OID=.;OPOS=127797374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:90:0:0:90:90:1:41:49:0:0:41:49:0:0
chr6	128312033	.	A	G	236.47	PASS	AF=0.4;AO=28;DP=70;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.00215785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.6125;QD=13.5124;RBI=0.00611872;REFB=-0.0331994;REVB=0.00572559;RO=42;SAF=13;SAR=15;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112189;STB=0.563979;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0488604;OID=.;OPOS=128312033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:42:42:28:28:0.4:15:13:24:18:15:13:24:18
chr6	128388799	.	G	T	300.54	PASS	AF=0.388889;AO=35;DP=90;FAO=35;FDP=90;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=-0.0091046;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=49.1335;QD=13.3575;RBI=0.0221376;REFB=-0.0246713;REVB=-0.0201786;RO=49;SAF=10;SAR=25;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0977144;STB=0.530285;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0408048;OID=.;OPOS=128388799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:49:55:35:35:0.388889:25:10:18:31:25:10:18:37
chr6	128403745	.	A	G	1398.91	PASS	AF=0.919643;AO=101;DP=110;FAO=103;FDP=112;FR=.;FRO=9;FSAF=51;FSAR=52;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0142043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.9549;QD=49.961;RBI=0.0506011;REFB=-0.0996691;REVB=-0.0485665;RO=9;SAF=49;SAR=52;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624118;STB=0.531618;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0187955;OID=.;OPOS=128403745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:110:112:9:9:101:103:0.919643:52:49:8:1:52:51:8:1
chr6	129381026	.	C	A	1044.04	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00840805;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.312;QD=59.6595;RBI=0.0261373;REFB=0;REVB=0.024748;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.15581e-05;OID=.;OPOS=129381026;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:38:32:0:0:38:32:0:0
chr6	129511373	.	T	C	517.47	PASS	AF=0.394737;AO=60;DP=152;FAO=60;FDP=152;FR=.;FRO=92;FSAF=42;FSAR=18;FSRF=49;FSRR=43;FWDB=2.97978e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.632;QD=13.6177;RBI=0.000331271;REFB=-0.0165255;REVB=0.000329928;RO=92;SAF=42;SAR=18;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193943;STB=0.609962;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.020467;OID=.;OPOS=129511373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:152:92:92:60:60:0.394737:18:42:49:43:18:42:49:43
chr6	129612808	.	A	G	739.08	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00314197;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=280.164;QD=54.7463;RBI=0.0385457;REFB=-0.0712525;REVB=0.0384174;RO=1;SAF=23;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200431;STB=0.510634;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000312932;OID=.;OPOS=129612808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:30:23:1:0:30:23:1:0
chr6	129722389	.	A	G	277.34	PASS	AF=0.595238;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00464895;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.211;QD=26.4135;RBI=0.0150048;REFB=-0.00861837;REVB=0.0142665;RO=17;SAF=14;SAR=11;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150531;STB=0.583267;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00556012;OID=.;OPOS=129722389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:17:17:25:25:0.595238:11:14:6:11:11:14:6:11
chr6	129722425	.	G	A	219.99	PASS	AF=0.478261;AO=21;DP=43;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.100311;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.0905;QD=19.1298;RBI=0.11757;REFB=-0.0535892;REVB=-0.0613223;RO=22;SAF=14;SAR=7;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276113;STB=0.65611;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0540697;OID=.;OPOS=129722425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:46:22:24:21:22:0.478261:7:14:8:14:8:14:8:16
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chr6	130031215	.	T	C	1250.79	PASS	AF=0.987952;AO=80;DP=82;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00486472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1636;QD=60.279;RBI=0.0878261;REFB=-0.0217485;REVB=0.0876913;RO=0;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30416e-08;STB=0.505493;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00140509;OID=.;OPOS=130031215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:82:83:0:1:80:82:0.987952:35:45:0:0:37:45:1:0
chr6	130374102	.	C	A	713.92	PASS	AF=0.978723;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.011876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.3593;QD=60.759;RBI=0.155715;REFB=0.0220554;REVB=-0.155261;RO=1;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240908;STB=0.512815;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.00257524;OID=.;OPOS=130374102;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:47:1:1:45:46:0.978723:19:26:0:1:19:27:0:1
chr6	130381246	.	T	C	1306.44	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00226114;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.89;QD=62.2113;RBI=0.0126587;REFB=0;REVB=0.0124551;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207769;OID=.;OPOS=130381246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:37:46:0:0:37:47:0:0
chr6	130537005	.	G	A	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.565;QD=56.9382;RBI=0.0331737;REFB=0;REVB=-0.0132844;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.96958e-05;OID=.;OPOS=130537005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0
chr6	130763224	.	T	A	178.94	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=0.00997781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.125;QD=15.2292;RBI=0.0150648;REFB=-0.00464033;REVB=0.0112867;RO=28;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226;STB=0.629823;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0067154;OID=.;OPOS=130763224;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:8:11:10:18:8:11:10:18
chr6	131148737	.	G	A	1966.5	PASS	AF=0.992308;AO=123;DP=127;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0306123;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.397;QD=60.5076;RBI=0.0349377;REFB=-0.0893625;REVB=0.0168383;RO=1;SAF=58;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00812089;STB=0.504201;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000679486;OID=.;OPOS=131148737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:127:130:1:1:123:129:0.992308:65:58:1:0:70:59:1:0
chr6	131156102	.	G	T	1026.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117859;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=340.177;QD=59.5018;RBI=0.0133217;REFB=0;REVB=0.00620963;RO=0;SAF=45;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23301e-05;OID=.;OPOS=131156102;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:24:45:0:0:24:45:0:0
chr6	131160876	.	G	T	747.03	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00380703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.857;QD=56.3797;RBI=0.0656829;REFB=0;REVB=0.0655724;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.63518e-05;OID=.;OPOS=131160876;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:53:0:0:50:53:1:17:33:0:0:19:34:0:0
chr6	131161504	.	T	C	97.31	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0115965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.454;QD=12.9748;RBI=0.0116592;REFB=-0.00670866;REVB=-0.00120747;RO=18;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215384;STB=0.624812;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0146709;OID=.;OPOS=131161504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:5:7:14:4:5:7:14:4
chr6	131184770	.	T	G	236.48	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0101044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.891;QD=19.3047;RBI=0.011069;REFB=-0.010142;REVB=0.00451931;RO=25;SAF=19;SAR=4;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197365;STB=0.631585;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0161519;OID=.;OPOS=131184770;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:26:23:23:0.469388:4:19:17:8:4:19:17:9
chr6	131520655	.	G	A	262.28	PASS	AF=0.46875;AO=29;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0150298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.695;QD=16.3925;RBI=0.0171976;REFB=-0.00343524;REVB=-0.00835831;RO=33;SAF=19;SAR=10;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080634;STB=0.545424;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00317266;OID=.;OPOS=131520655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:34:29:30:0.46875:10:19:19:14:10:20:20:14
chr6	132141692	.	A	T	346.35	PASS	AF=0.555556;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0425496;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.075;QD=21.9903;RBI=0.0523886;REFB=-0.0428445;REVB=0.030563;RO=28;SAF=23;SAR=12;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104241;STB=0.557677;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0272431;OID=.;OPOS=132141692;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:28:28:35:35:0.555556:12:23:15:13:12:23:15:13
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chr6	132271952	.	G	C	400.21	PASS	AF=0.966667;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0453807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.007;QD=53.3611;RBI=0.104344;REFB=-0.129765;REVB=0.0939593;RO=1;SAF=18;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251595;STB=0.512812;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.00221226;OID=.;OPOS=132271952;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:30:1:1:28:29:0.966667:10:18:1:0:10:19:1:0
chr6	132271959	.	T	G	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0716653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6699;QD=54.516;RBI=0.0791894;REFB=0;REVB=-0.0336904;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00202641;OID=.;OPOS=132271959;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0
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chr6	132859609	.	T	A	2263.36	PASS	AF=0.993377;AO=144;DP=144;FAO=150;FDP=151;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0494085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.327;QD=59.9566;RBI=0.0682742;REFB=-0.0619957;REVB=0.0471187;RO=0;SAF=63;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.25873e-08;STB=0.50303;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000138211;OID=.;OPOS=132859609;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:144:151:0:1:144:150:0.993377:81:63:0:0:82:68:0:1
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chr6	133045902	.	A	G	389.42	PASS	AF=0.396552;AO=46;DP=115;FAO=46;FDP=116;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=0.0446704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5114;QD=13.4282;RBI=0.0504221;REFB=-0.0129961;REVB=0.0233869;RO=69;SAF=25;SAR=21;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0844932;STB=0.551998;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0234928;OID=.;OPOS=133045902;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:116:69:70:46:46:0.396552:21:25:32:37:21:25:32:38
chr6	133052616	.	C	T	250.44	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0285578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.099;QD=20.035;RBI=0.068557;REFB=0.00446599;REVB=-0.0623258;RO=26;SAF=15;SAR=9;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466067;STB=0.526294;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=-0.00853814;OID=.;OPOS=133052616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:9:15:15:11:9:15:15:11
chr6	133070995	.	G	T	1533.98	PASS	AF=0.989796;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0243795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.519;QD=62.6115;RBI=0.0268755;REFB=0.12863;REVB=0.0113109;RO=1;SAF=57;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00824859;STB=0.504347;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.000541955;OID=.;OPOS=133070995;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:98:98:1:1:97:97:0.989796:40:57:1:0:40:57:1:0
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chr6	133074645	.	A	G	162.19	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=0.0202611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.324;QD=12.014;RBI=0.020383;REFB=-0.00193042;REVB=0.00222667;RO=34;SAF=3;SAR=17;SRF=8;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155493;STB=0.59167;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00264306;OID=.;OPOS=133074645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:17:3:8:26:17:3:8:26
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chr6	134493397	.	G	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.544;QD=57.6801;RBI=0.0224115;REFB=0;REVB=0.010533;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.45288e-05;OID=.;OPOS=134493397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:21:10:0:0:21:10:0:0
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chr6	135375762	.	G	A	189.24	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00689001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.534;QD=13.0512;RBI=0.00726064;REFB=-0.00309827;REVB=0.00229014;RO=35;SAF=16;SAR=7;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112064;STB=0.564648;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0048613;OID=.;OPOS=135375762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:7:16:21:14:7:16:21:14
chr6	135424155	.	GCCCCCCCT	GCCCCCCT,GCCCCCCTC	40.01	PASS	AF=0.341463,0;AO=15,3;DP=40;FAO=14,0;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=8,0;FSAR=6,0;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=-0.0356048,-0.0250995;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=8.60195,21.0864;QD=3.90305;RBI=0.0370771,0.148335;REFB=-0.129435,-0.0744037;REVB=-0.0103447,-0.146196;RO=21;SAF=11,0;SAR=4,3;SRF=17;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.104278,-0.734474;STB=0.671435,0.5;STBP=0.164,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.171004,0;OID=.,.;OPOS=135424156,135424162;OREF=C,CT;OALT=-,TC;OMAPALT=GCCCCCCT,GCCCCCCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.341463,0:15,3:40:14,0:41:27:8,0:6,0:22:5:41:21:11,0:4,3:17:4
chr6	135539459	.	T	G	40.46	PASS	AF=0.0762712;AO=8;DP=115;FAO=9;FDP=118;FR=.,HEALED;FRO=102;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=44;FSRR=58;FWDB=0.124501;FXX=0.0166653;HRUN=6;LEN=1;MLLD=20.5762;QD=1.37154;RBI=0.188149;REFB=-0.0439108;REVB=0.141066;RO=75;SAF=7;SAR=1;SRF=29;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.530997;STB=0.899919;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.122516;OID=.;OPOS=135539459;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:115:118:75:102:8:9:0.0762712:1:7:29:46:1:8:44:58
chr6	135539911	.	ATTTTTTTT	ATTTTTTT,ATTTTTTTC	306.79	PASS	AF=0.484848,0.242424;AO=39,18;DP=107;FAO=48,24;FDP=99;FR=.;FRO=27;FSAF=15,21;FSAR=33,3;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0336137,0.101019;FXX=0.0999909;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.42938,23.3362;QD=12.3954;RBI=0.254372,0.118351;REFB=-0.181441,-0.120566;REVB=-0.252141,-0.06166;RO=25;SAF=11,16;SAR=28,2;SRF=15;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.245909,0.431123;STB=0.594554,0.744436;STBP=0.029,0.006;TYPE=del,snp;VARB=0.20194,-0.0353091;OID=.,.;OPOS=135539912,135539919;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=ATTTTTTT,ATTTTTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.484848,0.242424:39,18:107:48,24:99:27:15,21:33,3:15:12:99:25:11,16:28,2:15:10
chr6	135754208	.	A	G	229.14	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0182128;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.317;QD=16.0802;RBI=0.0364916;REFB=-0.0172695;REVB=0.0316217;RO=30;SAF=16;SAR=10;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522167;STB=0.536205;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0274746;OID=.;OPOS=135754208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:57:30:31:26:26:0.45614:10:16:20:10:10:16:21:10
chr6	136582401	.	A	T	35.03	PASS	AF=0.214286;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0235775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.66;QD=5.00452;RBI=0.0239214;REFB=-0.00236118;REVB=-0.00404159;RO=21;SAF=4;SAR=2;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171939;STB=0.633691;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0438979;OID=.;OPOS=136582401;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:28:28:21:22:6:6:0.214286:2:4:11:10:2:4:11:11
chr6	136582417	.	G	A	74.69	PASS	AF=0.20339;AO=12;DP=59;FAO=12;FDP=59;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.0209039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.42;QD=5.06388;RBI=0.0412537;REFB=-0.00823033;REVB=-0.0355654;RO=46;SAF=8;SAR=4;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104905;STB=0.560871;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0330074;OID=.;OPOS=136582417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:59:59:46:47:12:12:0.20339:4:8:27:19:4:8:28:19
chr6	136582497	.	G	T	270.29	PASS	AF=0.25641;AO=38;DP=153;FAO=40;FDP=156;FR=.;FRO=116;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=67;FSRR=49;FWDB=0.000500674;FXX=0.0126574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.054;QD=6.93051;RBI=0.021917;REFB=-0.00698385;REVB=-0.0219113;RO=106;SAF=25;SAR=13;SRF=57;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154346;STB=0.557114;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0255094;OID=.;OPOS=136582497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:156:106:116:38:40:0.25641:13:25:57:49:14:26:67:49
chr6	136597004	.	A	G	109.44	PASS	AF=0.185185;AO=19;DP=108;FAO=20;FDP=108;FR=.;FRO=88;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=47;FSRR=41;FWDB=-0.00533591;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.332;QD=4.05343;RBI=0.0425879;REFB=-0.00440752;REVB=0.0422523;RO=89;SAF=11;SAR=8;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0650882;STB=0.513047;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.015753;OID=.;OPOS=136597004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:89:88:19:20:0.185185:8:11:47:42:9:11:47:41
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chr6	137026266	.	T	G	690.34	PASS	AF=0.348739;AO=83;DP=242;FAO=83;FDP=238;FR=.;FRO=155;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=85;FSRR=70;FWDB=0.058595;FXX=0.0165282;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.945;QD=11.6023;RBI=0.0589566;REFB=-0.00196592;REVB=-0.00651925;RO=148;SAF=41;SAR=42;SRF=84;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829768;STB=0.535402;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.00274668;OID=.;OPOS=137026266;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:242:238:148:155:83:83:0.348739:42:41:84:64:42:41:85:70
chr6	137151125	.	GTT	CTG,G,GT	135.46	PASS	AF=0.075,0.1,0.75;AO=3,8,15;DP=41;FAO=3,4,30;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=3,3,21;FSAR=0,1,9;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00492372,0.0573799,0.0953568;FXX=0.0243843;HRUN=1,12,12;LEN=3,2,1;MLLD=203.823,8.1011,5.06713;QD=13.5463;RBI=0.0396475,0.108965,0.164405;REFB=0.00237465,0.0128719,0.00407291;REVB=-0.0393405,0.0926327,0.133926;RO=10;SAF=3,7,10;SAR=0,1,5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.597037,0.270467,-0.0269184;STB=0.5,0.666019,0.533312;STBP=1,0.715,0.296;TYPE=mnp,del,del;VARB=0.00803485,0.0779446,0.0468728;OID=.,.,.;OPOS=137151125,137151126,137151126;OREF=GTT,TT,T;OALT=CTG,-,-;OMAPALT=CTG,G,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/3:18:41:40:10:3:3,8,15:3,4,30:0.075,0.1,0.75:0,1,5:3,7,10:7:3:0,1,9:3,3,21:3:0
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chr6	137325847	.	C	T	762.36	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0487936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4515;QD=62.2335;RBI=0.0566946;REFB=0;REVB=0.0288697;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00258265;OID=.;OPOS=137325847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:49:0:0:45:49:1:22:23:0:0:22:27:0:0
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chr6	138753337	.	C	T	484.52	PASS	AF=1;AO=29;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.147;QD=58.7299;RBI=0.0472254;REFB=0;REVB=0.0384543;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165533;OID=.;OPOS=138753337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:29:33:1:17:12:0:0:19:14:0:0
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chr6	138754323	.	A	G	817.72	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.415;QD=57.3836;RBI=0.0318453;REFB=0;REVB=-0.00983921;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70963e-05;OID=.;OPOS=138754323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:23:34:0:0:23:34:0:0
chr6	138754715	.	C	T	261.18	PASS	AF=0.364706;AO=31;DP=85;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.00551529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8215;QD=12.2907;RBI=0.011485;REFB=-0.00733738;REVB=0.010074;RO=54;SAF=16;SAR=15;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849219;STB=0.548749;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0111939;OID=.;OPOS=138754715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:54:54:31:31:0.364706:15:16:32:22:15:16:32:22
chr6	139013188	.	C	T	483.2	PASS	AF=0.554217;AO=44;DP=81;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.00715433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.977;QD=23.2867;RBI=0.0225586;REFB=-0.0157521;REVB=0.0213941;RO=37;SAF=26;SAR=18;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0979976;STB=0.554187;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0146222;OID=.;OPOS=139013188;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:83:37:37:44:46:0.554217:18:26:26:11:19:27:26:11
chr6	139013673	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1804;QD=33.4285;RBI=0.0521516;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00474347;OID=.;OPOS=139013673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr6	139017780	.	G	A	585.08	PASS	AF=0.5;AO=60;DP=120;FAO=60;FDP=120;FR=.;FRO=60;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.000213578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.318;QD=19.5027;RBI=0.00406619;REFB=0.00672528;REVB=0.00406057;RO=59;SAF=38;SAR=22;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542437;STB=0.535199;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=-0.00552833;OID=.;OPOS=139017780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:59:60:60:60:0.5:22:38:34:25:22:38:34:26
chr6	139017815	.	A	G	513.49	PASS	AF=0.482456;AO=55;DP=114;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=0.014288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.375;QD=18.0171;RBI=0.0645254;REFB=-0.0337639;REVB=-0.0629236;RO=59;SAF=33;SAR=22;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229425;STB=0.512723;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0365779;OID=.;OPOS=139017815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:59:59:55:55:0.482456:22:33:34:25:22:33:34:25
chr6	139094638	.	A	G	133.87	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=38;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.0191145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.7318;QD=13.3873;RBI=0.0856021;REFB=-0.0171962;REVB=0.0834407;RO=24;SAF=10;SAR=4;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481776;STB=0.583236;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.0464161;OID=.;OPOS=139094638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:40:24:24:14:16:0.4:4:10:18:6:6:10:18:6
chr6	139097232	.	C	T	318.84	PASS	AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0175372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.149;QD=26.5704;RBI=0.0189635;REFB=-0.0172626;REVB=-0.00721529;RO=20;SAF=17;SAR=11;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034139;STB=0.518855;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0171547;OID=.;OPOS=139097232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:20:20:28:28:0.583333:11:17:13:7:11:17:13:7
chr6	139197609	.	G	A	85.27	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.00525545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6853;QD=11.3692;RBI=0.0495141;REFB=-0.00516703;REVB=-0.0492344;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642199;STB=0.538391;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.00574032;OID=.;OPOS=139197609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:7:4:8:11:7:4:8:11
chr6	139694690	.	TG	GT,T	88.49	PASS	AF=0,0.542857;AO=4,17;DP=35;FAO=0,19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=0,2;FSAR=0,17;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0855842,-0.0121994;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=19.4132,11.0782;QD=10.113;RBI=0.219326,0.128342;REFB=-0.0648372,-0.110882;REVB=-0.201938,-0.127761;RO=12;SAF=0,2;SAR=4,15;SRF=9;SRR=3;SSEN=0,0.333333;SSEP=0,0;SSSB=-0.756743,-0.561797;STB=0.5,0.815601;STBP=1,0.002;TYPE=mnp,del;VARB=0.110038,0.0684989;OID=.,.;OPOS=139694690,139694691;OREF=TG,G;OALT=GT,-;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:83:35:35:12:16:4,17:0,19:0,0.542857:4,15:0,2:9:3:0,17:0,2:10:6
chr6	141004961	.	CT	TG	38.57	PASS	AF=0.0863309;AO=15;DP=139;FAO=12;FDP=139;FR=.;FRO=127;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=63;FSRR=64;FWDB=0.00604866;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=38.9675;QD=1.10983;RBI=0.0147587;REFB=-0.0133604;REVB=-0.0134623;RO=123;SAF=13;SAR=2;SRF=59;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.479137;STB=0.818311;STBP=0.026;TYPE=mnp;VARB=0.11408;OID=.;OPOS=141004961;OREF=CT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:139:139:123:127:15:12:0.0863309:2:13:59:64:2:10:63:64
chr6	141004964	.	G	GT,T	1643.25	PASS	AF=0.88,0.12;AO=83,28;DP=141;FAO=110,15;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=49,13;FSAR=61,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110094,-0.0746452;FXX=0.0601459;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=23.0777,12.7227;QD=52.5841;RBI=0.110094,0.0746921;REFB=0,0;REVB=2.42606e-06,-0.00264609;RO=13;SAF=23,26;SAR=60,2;SRF=9;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.124004,0.339655;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00106905,0.0149492;OID=.,.;OPOS=141004965,141004964;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:39:141:125:13:0:83,28:110,15:0.88,0.12:60,2:23,26:9:4:61,2:49,13:0:0
chr6	142691549	.	A	C	117.75	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0236716;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=251.1;QD=12.3946;RBI=0.0249667;REFB=-0.00801233;REVB=0.00793669;RO=24;SAF=5;SAR=9;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0676393;STB=0.539942;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.013803;OID=.;OPOS=142691549;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:9:5:10:14:9:5:10:14
chr6	142703137	.	C	T	132.66	PASS	AF=0.310345;AO=18;DP=58;FAO=18;FDP=58;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.00801679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.278;QD=9.14901;RBI=0.0282251;REFB=-0.0149767;REVB=-0.0270626;RO=40;SAF=7;SAR=11;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013481;STB=0.508023;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0450643;OID=.;OPOS=142703137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:40:40:18:18:0.310345:11:7:16:24:11:7:16:24
chr6	142718801	.	G	A	994.19	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00697704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.59;QD=57.6343;RBI=0.0300343;REFB=0.0197842;REVB=0.0292127;RO=1;SAF=47;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00995181;STB=0.505262;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.00108457;OID=.;OPOS=142718801;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:21:47:1:0:21:47:1:0
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chr6	142758631	.	A	G	1116.5	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1669;QD=60.3515;RBI=0.0410005;REFB=0;REVB=-0.0319386;RO=0;SAF=34;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.37936e-05;OID=.;OPOS=142758631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:40:34:0:0:40:34:0:0
chr6	143074700	.	T	C	1006.42	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1731;QD=59.2013;RBI=0.0707063;REFB=0;REVB=0.0699197;RO=0;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357944;OID=.;OPOS=143074700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:31:37:0:0:31:37:0:0
chr6	143090734	.	T	C	323.87	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0511784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1007;QD=17.2729;RBI=0.0514502;REFB=0.0131137;REVB=0.00528172;RO=39;SAF=16;SAR=19;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020202;STB=0.517311;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=-0.0147836;OID=.;OPOS=143090734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:39:40:35:35:0.466667:19:16:17:22:19:16:17:23
chr6	143091263	.	A	G	1007.55	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00427076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.415;QD=59.2674;RBI=0.0351009;REFB=0;REVB=0.0348401;RO=0;SAF=41;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.70549e-05;OID=.;OPOS=143091263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:26:41:0:0:27:41:0:0
chr6	143091769	.	G	A	204.98	PASS	AF=0.442308;AO=22;DP=51;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00704362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1412;QD=15.7678;RBI=0.00980248;REFB=-0.0421715;REVB=-0.00681733;RO=28;SAF=11;SAR=11;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140847;STB=0.597924;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0510697;OID=.;OPOS=143091769;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:28:29:22:23:0.442308:11:11:18:10:12:11:19:10
chr6	143382110	.	T	C	1045.75	PASS	AF=0.595092;AO=95;DP=159;FAO=97;FDP=163;FR=.;FRO=66;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.07055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6031;QD=25.6626;RBI=0.0734126;REFB=-0.0259483;REVB=-0.0203006;RO=64;SAF=57;SAR=38;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0876207;STB=0.536135;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0183295;OID=.;OPOS=143382110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:163:64:66:95:97:0.595092:38:57:31:33:40:57:33:33
chr6	143745915	.	A	G	894.15	PASS	AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0532221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1407;QD=55.0243;RBI=0.0976112;REFB=-0.00909574;REVB=0.0818251;RO=1;SAF=18;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255073;STB=0.526307;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00128912;OID=.;OPOS=143745915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:65:65:1:2:63:63:0.969231:45:18:1:0:45:18:2:0
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chr6	143816859	.	C	T	1011.55	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00466186;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.099;QD=59.5032;RBI=0.0128256;REFB=0;REVB=0.0119484;RO=0;SAF=50;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.90375e-05;OID=.;OPOS=143816859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:18:50:0:0:18:50:0:0
chr6	144081768	.	C	A	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0644122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.9982;QD=18.8865;RBI=0.0843827;REFB=-0.0228035;REVB=-0.0545116;RO=5;SAF=5;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276405;STB=0.659985;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0441533;OID=.;OPOS=144081768;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:3:5:1:4:3:5:1:4
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chr6	145503887	.	G	A	496.56	PASS	AF=0.410448;AO=55;DP=132;FAO=55;FDP=134;FR=.;FRO=79;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=46;FSRR=33;FWDB=0.000887174;FXX=0.00740686;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.651;QD=14.8227;RBI=0.00242553;REFB=-0.0218976;REVB=-0.00225746;RO=77;SAF=29;SAR=26;SRF=45;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597649;STB=0.53263;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0384008;OID=.;OPOS=145503887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:134:77:79:55:55:0.410448:26:29:45:32:26:29:46:33
chr6	145822992	.	A	G	227.88	PASS	AF=0.35443;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.0724221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3121;QD=11.5384;RBI=0.0726041;REFB=-0.0113307;REVB=-0.0051386;RO=51;SAF=21;SAR=7;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252485;STB=0.647369;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0307482;OID=.;OPOS=145822992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:51:51:28:28:0.35443:7:21:28:23:7:21:28:23
chr6	145823642	.	G	A	234.99	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0132973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.561;QD=15.4089;RBI=0.0136253;REFB=-0.00250717;REVB=-0.00297136;RO=34;SAF=15;SAR=12;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259652;STB=0.514695;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00459706;OID=.;OPOS=145823642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:12:15:18:16:12:15:18:16
chr6	146112348	.	T	C	272.49	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0349125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.747;QD=51.9026;RBI=0.0390058;REFB=0;REVB=0.0173945;RO=0;SAF=1;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78928e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000206704;OID=.;OPOS=146112348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:20:1:0:0:20:1:0:0
chr6	146185504	.	G	A,GA	37.64	PASS	AF=0,0.269231;AO=3,3;DP=26;FAO=0,7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=0,3;FSAR=0,4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00486887,-0.019585;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=118.04,50.575;QD=5.7913;RBI=0.0251125,0.0302868;REFB=-0.0184679,-0.00628189;REVB=-0.0246359,0.0231023;RO=18;SAF=3,0;SAR=0,3;SRF=7;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.647452,-0.567432;STB=0.5,0.505602;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0470869,0.09184;OID=.,.;OPOS=146185504,146185505;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:35:26:26:18:19:3,3:0,7:0,0.269231:0,3:3,0:7:11:0,4:0,3:8:11
chr6	146234644	.	G	A	575.78	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.046879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.631;QD=60.6081;RBI=0.0516255;REFB=0;REVB=-0.021623;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000936839;OID=.;OPOS=146234644;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0
chr6	146755140	.	G	A	249.12	PASS	AF=0.52;AO=22;DP=47;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.00626694;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7888;QD=19.9296;RBI=0.0265376;REFB=-0.0413044;REVB=0.025787;RO=23;SAF=10;SAR=12;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254714;STB=0.636264;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0241949;OID=.;OPOS=146755140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:50:23:24:22:26:0.52:12:10:17:6:14:12:18:6
chr6	146755324	.	T	C	154.8	PASS	AF=0.404762;AO=15;DP=40;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0095115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.244;QD=14.743;RBI=0.0115571;REFB=-0.0172718;REVB=0.0065649;RO=25;SAF=4;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287878;STB=0.642682;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0366171;OID=.;OPOS=146755324;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:42:25:25:15:17:0.404762:11:4:13:12:12:5:13:12
chr6	146755515	.	T	G	182.12	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0268586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.948;QD=16.9418;RBI=0.0281877;REFB=-0.0185087;REVB=0.00855347;RO=22;SAF=6;SAR=13;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225554;STB=0.653102;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0171663;OID=.;OPOS=146755515;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:24:19:19:0.44186:13:6:12:10:13:6:14:10
chr6	146755560	.	T	G	145.46	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0871853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.686;QD=16.1617;RBI=0.0934759;REFB=-0.0136959;REVB=-0.0337115;RO=19;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16392;STB=0.583225;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0527568;OID=.;OPOS=146755560;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:20:16:16:0.444444:11:5:9:10:11:5:9:11
chr6	146755842	.	C	A	469.8	PASS	AF=0.40458;AO=53;DP=131;FAO=53;FDP=131;FR=.;FRO=78;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=0.0152191;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=164.795;QD=14.3451;RBI=0.0199312;REFB=-0.0106204;REVB=0.0128698;RO=75;SAF=19;SAR=34;SRF=40;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185882;STB=0.61651;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0119928;OID=.;OPOS=146755842;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:75:78:53:53:0.40458:34:19:40:35:34:19:43:35
chr6	146993445	.	T	C	1008.44	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.433;QD=59.3201;RBI=0.017823;REFB=0;REVB=-0.00543493;RO=0;SAF=28;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.79011e-05;OID=.;OPOS=146993445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:40:28:0:0:40:28:0:0
chr6	147106841	.	A	G	588.75	PASS	AF=0.893617;AO=41;DP=47;FAO=42;FDP=47;FR=.;FRO=5;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0670179;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.7565;QD=50.1061;RBI=0.0673567;REFB=-0.159054;REVB=0.00674691;RO=3;SAF=26;SAR=15;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00447983;STB=0.518386;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0213696;OID=.;OPOS=147106841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:47:47:3:5:41:42:0.893617:15:26:2:1:15:27:4:1
chr6	147136212	.	A	T	1420.94	PASS	AF=0.970297;AO=98;DP=101;FAO=98;FDP=101;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.04498;FXX=0.00980296;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.559;QD=56.2747;RBI=0.0461779;REFB=-0.0412848;REVB=0.0104497;RO=2;SAF=49;SAR=49;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504949;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.000858465;OID=.;OPOS=147136212;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:101:101:2:3:98:98:0.970297:49:49:1:1:49:49:1:2
chr6	147136244	.	A	G	1456.58	PASS	AF=0.989362;AO=92;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0742315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.0851;QD=61.9822;RBI=0.0805233;REFB=-0.0108928;REVB=0.0312039;RO=1;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101945;STB=0.505262;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.000795206;OID=.;OPOS=147136244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:1:1:92:93:0.989362:46:46:0:1:47:46:0:1
chr6	147635385	.	C	G	193.77	PASS	AF=0.328947;AO=25;DP=76;FAO=25;FDP=76;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.00672468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.674;QD=10.1985;RBI=0.0107956;REFB=-0.000854765;REVB=0.00844538;RO=51;SAF=13;SAR=12;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101442;STB=0.559239;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.00119695;OID=.;OPOS=147635385;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:51:51:25:25:0.328947:12:13:22:29:12:13:22:29
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chr6	147680359	.	A	G	446.05	PASS	AF=0.511628;AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.000923907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1506;QD=20.7466;RBI=0.00909823;REFB=-0.0374953;REVB=0.0090512;RO=42;SAF=27;SAR=17;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273887;STB=0.515145;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0227616;OID=.;OPOS=147680359;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:42:42:44:44:0.511628:17:27:27:15:17:27:27:15
chr6	147830073	.	C	T	1012.34	PASS	AF=0.424242;AO=112;DP=264;FAO=112;FDP=264;FR=.;FRO=152;FSAF=50;FSAR=62;FSRF=88;FSRR=64;FWDB=0.00732188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.1;QD=15.3384;RBI=0.014565;REFB=-0.0208091;REVB=0.0125908;RO=152;SAF=50;SAR=62;SRF=88;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136357;STB=0.575915;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0235519;OID=.;OPOS=147830073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:264:264:152:152:112:112:0.424242:62:50:88:64:62:50:88:64
chr6	147886107	.	C	G	809.4	PASS	AF=0.576923;AO=75;DP=131;FAO=75;FDP=130;FR=.;FRO=55;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.0487238;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6631;QD=24.9045;RBI=0.0487698;REFB=-0.0711231;REVB=0.0021168;RO=55;SAF=47;SAR=28;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368101;STB=0.520064;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0470039;OID=.;OPOS=147886107;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:130:55:55:75:75:0.576923:28:47:32:23:28:47:32:23
chr6	148664232	.	G	A	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00613142;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=251.73;QD=11.0198;RBI=0.0224346;REFB=-0.0263594;REVB=-0.0215805;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912889;STB=0.555379;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0327603;OID=.;OPOS=148664232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:2:4:6:2:2:4:6:2
chr6	148664236	.	G	T	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0141044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.564;QD=11.0195;RBI=0.0150806;REFB=-0.00198881;REVB=-0.00533744;RO=8;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912889;STB=0.555379;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0140841;OID=.;OPOS=148664236;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:2:4:6:2:2:4:6:2
chr6	148664242	.	T	C	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0011697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.311;QD=9.76014;RBI=0.043091;REFB=-0.00703823;REVB=-0.0430751;RO=11;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.383694;STB=0.676997;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0225611;OID=.;OPOS=148664242;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:11:12:7:7:0.368421:3:4:10:1:3:4:10:2
chr6	148865257	.	A	G	114.02	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00519713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.721;QD=18.2428;RBI=0.0202583;REFB=-0.0348889;REVB=0.0195803;RO=12;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101714;STB=0.558193;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0274463;OID=.;OPOS=148865257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:7:6:7:5:7:6:7:5
chr6	149068636	.	GCCCCT	GCCCTG	72.14	PASS	AF=0.2125;AO=11;DP=82;FAO=17;FDP=80;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=58;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.0562615;FXX=0.0476134;HRUN=4;LEN=2;MLLD=144.724;QD=3.60706;RBI=0.0621822;REFB=-0.00736605;REVB=-0.0264816;RO=45;SAF=0;SAR=11;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.766767;STB=0.932794;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.264126;OID=.;OPOS=149068640;OREF=CT;OALT=TG;OMAPALT=GCCCTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.2125:11:82:17:80:58:1:16:34:24:55:45:0:11:28:17
chr6	149397743	.	AT	A	226.53	PASS	AF=0.881579;AO=38;DP=75;FAO=67;FDP=76;FR=.;FRO=9;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.119404;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.5491;QD=11.9228;RBI=0.263514;REFB=0.00579405;REVB=0.234909;RO=19;SAF=20;SAR=18;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648902;STB=0.508597;STBP=0.696;TYPE=del;VARB=0.0697863;OID=.;OPOS=149397744;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.881579:38:75:67:76:9:40:27:6:3:9:19:20:18:12:7
chr6	149721690	.	G	A	211.7	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.025389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.577;QD=19.6929;RBI=0.0293422;REFB=-0.0299829;REVB=-0.0147094;RO=22;SAF=11;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611111;STB=0.534489;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0241909;OID=.;OPOS=149721690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:10:11:13:9:10:11:13:9
chr6	149721965	.	T	C	86.73	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.00979545;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5062;QD=12.8489;RBI=0.0673685;REFB=-0.016266;REVB=0.0666526;RO=16;SAF=2;SAR=9;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104637;STB=0.562378;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0266572;OID=.;OPOS=149721965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:9:2:4:12:9:2:4:12
chr6	149722040	.	A	G	207.11	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.185;QD=48.7319;RBI=0.0317577;REFB=0;REVB=-0.00618195;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257428;OID=.;OPOS=149722040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr6	149899981	.	T	C	176.78	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.00958083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.177;QD=13.3419;RBI=0.0234849;REFB=-0.00635563;REVB=-0.0214417;RO=31;SAF=10;SAR=11;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207878;STB=0.607744;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.012472;OID=.;OPOS=149899981;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:32:21:21:0.396226:11:10:21:10:11:10:21:11
chr6	149953981	.	C	T	1102.5	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0139435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.825;QD=58.8002;RBI=0.0332299;REFB=0.000646578;REVB=0.030163;RO=1;SAF=39;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119765;STB=0.506327;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=1.95418e-06;OID=.;OPOS=149953981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:35:39:1:0:35:39:1:0
chr6	149983216	.	G	A	538.59	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000190982;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3053;QD=59.8429;RBI=0.0543252;REFB=0;REVB=0.0543249;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217039;OID=.;OPOS=149983216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:10:25:0:0:10:26:0:0
chr6	150004779	.	A	G	1346.42	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.659;QD=61.2008;RBI=0.0197707;REFB=0;REVB=0.00560094;RO=0;SAF=46;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00281056;OID=.;OPOS=150004779;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:88:0:0:84:88:1:38:46:0:0:42:46:0:0
chr6	150067675	.	A	G	726.08	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.664;QD=56.9478;RBI=0.0478239;REFB=0;REVB=0.0295474;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264497;OID=.;OPOS=150067675;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:25:25:0:0:26:25:0:0
chr6	150093678	.	C	T	365.07	PASS	AF=0.964286;AO=28;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00210277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.445;QD=52.1523;RBI=0.00397342;REFB=-0.0119073;REVB=0.00337142;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516117;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00093397;OID=.;OPOS=150093678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:28:27:0.964286:12:16:0:0:12:15:1:0
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chr6	150114745	.	G	A	670.19	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5656;QD=62.3437;RBI=0.0179108;REFB=0;REVB=0.0147446;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000188767;OID=.;OPOS=150114745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0
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chr6	150210685	.	C	T	1116.95	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000235213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.498;QD=60.3756;RBI=0.0180273;REFB=0;REVB=-0.0180257;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.86568e-05;OID=.;OPOS=150210685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:39:35:0:0:39:35:0:0
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chr6	150212003	.	C	T	345.17	PASS	AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.00959254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5811;QD=20.0101;RBI=0.0378183;REFB=-0.0272526;REVB=0.0365815;RO=30;SAF=19;SAR=17;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115617;STB=0.581863;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0339763;OID=.;OPOS=150212003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:30:33:36:36:0.521739:17:19:20:10:17:19:23:10
chr6	150239330	.	C	T	148.14	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.069207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1695;QD=17.9558;RBI=0.0743757;REFB=0.0132008;REVB=0.0272423;RO=16;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562335;STB=0.544692;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.0148583;OID=.;OPOS=150239330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:16:17:16:16:0.484848:9:7:6:10:9:7:6:11
chr6	150240829	.	G	C	499.76	PASS	AF=0.426357;AO=55;DP=129;FAO=55;FDP=129;FR=.;FRO=74;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=0.00303127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3102;QD=15.4964;RBI=0.0372768;REFB=-0.0157263;REVB=-0.0371533;RO=74;SAF=32;SAR=23;SRF=34;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125614;STB=0.570433;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0208624;OID=.;OPOS=150240829;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:74:74:55:55:0.426357:23:32:34:40:23:32:34:40
chr6	150267527	.	A	C	923.26	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00774224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3433;QD=56.816;RBI=0.0903426;REFB=-0.0601062;REVB=0.0900102;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00803346;OID=.;OPOS=150267527;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:23:41:0:0:23:41:0:1
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chr6	150346531	.	CT	C,CC	257.33	PASS	AF=0.386364,0.181818;AO=12,13;DP=44;FAO=17,8;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=16,4;FSAR=1,4;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00977047,0.00393185;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=204.723,210.367;QD=23.3936;RBI=0.0501201,0.0408198;REFB=-0.0475485,-0.0411637;REVB=-0.0491586,-0.04063;RO=19;SAF=12,8;SAR=0,5;SRF=13;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.772598,-0.0754579;STB=0.793855,0.629327;STBP=0.039,0.44;TYPE=del,snp;VARB=0.04041,0.0503373;OID=.,.;OPOS=150346532,150346532;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.386364,0.181818:12,13:44:17,8:44:19:16,4:1,4:13:6:99:19:12,8:0,5:13:6
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chr6	150665277	.	A	AG	43.81	PASS	AF=0.322581;AO=4;DP=36;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0119082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.969;QD=5.65324;RBI=0.0155346;REFB=-0.0029172;REVB=-0.00997587;RO=32;SAF=4;SAR=0;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.636081;STB=0.615156;STBP=0.405;TYPE=ins;VARB=-0.0113012;OID=.;OPOS=150665278;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.322581:4:36:10:31:21:6:4:9:12:43:32:4:0:13:19
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chr6	150716533	.	T	A	189.07	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00203384;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=254.576;QD=21.0076;RBI=0.0126605;REFB=-0.00723928;REVB=0.0124961;RO=17;SAF=12;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893329;STB=0.550405;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00505023;OID=.;OPOS=150716533;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:7:12:9:8:7:12:9:8
chr6	150716696	.	TG	CA,CG	385.53	PASS	AF=0.321429,0.678571;AO=9,19;DP=28;FAO=9,19;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7,12;FSAR=2,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000642958,0.00707774;FXX=0.0344709;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=190.211,192.211;QD=55.0756;RBI=0.00445941,0.0070943;REFB=0,0;REVB=-0.00441282,0.000484501;RO=0;SAF=7,12;SAR=2,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0154868,-0.00486426;OID=.,.;OPOS=150716696,150716696;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:65:28:28:0:0:9,19:9,19:0.321429,0.678571:2,7:7,12:0:0:2,7:7,12:0:0
chr6	150717640	.	T	C	524.04	PASS	AF=0.510204;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.0348861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.506;QD=21.3895;RBI=0.0393591;REFB=0.00234725;REVB=-0.0182236;RO=48;SAF=32;SAR=18;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183375;STB=0.601462;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.0026398;OID=.;OPOS=150717640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:48:48:50:50:0.510204:18:32:21:27:18:32:21:27
chr6	150722187	.	TG	CA,CG	2009.39	PASS	AF=0.455224,0.544776;AO=61,73;DP=134;FAO=61,73;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=29,41;FSAR=32,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415982,0.0404296;FXX=0.00740686;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=166.702,138.439;QD=59.9816;RBI=0.0459592,0.0563175;REFB=0,0;REVB=0.0195408,0.039206;RO=0;SAF=29,41;SAR=32,32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0163425,0.00509812;OID=.,.;OPOS=150722187,150722187;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:134:134:0:0:61,73:61,73:0.455224,0.544776:32,32:29,41:0:0:32,32:29,41:0:0
chr6	151055031	.	C	T	624.38	PASS	AF=0.53913;AO=62;DP=115;FAO=62;FDP=115;FR=.;FRO=53;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=0.015989;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.437;QD=21.7175;RBI=0.0299652;REFB=-0.0235063;REVB=0.025343;RO=53;SAF=35;SAR=27;SRF=36;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0995984;STB=0.55451;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0154598;OID=.;OPOS=151055031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:53:53:62:62:0.53913:27:35:36:17:27:35:36:17
chr6	151121915	.	G	A	1246.11	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.356;QD=61.5363;RBI=0.0194156;REFB=0;REVB=0.0155632;RO=0;SAF=54;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.07755e-05;OID=.;OPOS=151121915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:27:54:0:0:27:54:0:0
chr6	151152257	.	A	G	1463.61	PASS	AF=0.971154;AO=101;DP=104;FAO=101;FDP=104;FR=.;FRO=3;FSAF=63;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0208345;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.259;QD=56.2926;RBI=0.0224459;REFB=-0.16203;REVB=0.00835107;RO=1;SAF=63;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123204;STB=0.501319;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.000220603;OID=.;OPOS=151152257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:104:104:1:3:101:101:0.971154:38:63:0:1:38:63:2:1
chr6	151152656	.	T	C	1340.47	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.249;QD=62.3475;RBI=0.0280396;REFB=0;REVB=0.0194567;RO=0;SAF=32;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.6793e-05;OID=.;OPOS=151152656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:86:0:0:82:86:1:50:32:0:0:52:34:0:0
chr6	151198895	.	T	C	329.52	PASS	AF=0.377358;AO=40;DP=106;FAO=40;FDP=106;FR=.;FRO=66;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.0759519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.59;QD=12.4348;RBI=0.0785595;REFB=-0.00651562;REVB=-0.0200726;RO=65;SAF=20;SAR=20;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417963;STB=0.518858;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0103478;OID=.;OPOS=151198895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:65:66:40:40:0.377358:20:20:30:35:20:20:31:35
chr6	151336739	.	C	G	800.17	PASS	AF=0.527778;AO=76;DP=144;FAO=76;FDP=144;FR=.;FRO=68;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=0.0481294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.477;QD=22.2271;RBI=0.0914149;REFB=0.00460017;REVB=-0.0777191;RO=68;SAF=47;SAR=29;SRF=36;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794245;STB=0.543599;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.00516933;OID=.;OPOS=151336739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:68:68:76:76:0.527778:29:47:36:32:29:47:36:32
chr6	151669875	.	A	G	739.87	PASS	AF=0.932203;AO=55;DP=59;FAO=55;FDP=59;FR=.;FRO=4;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.000616289;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.587;QD=50.1607;RBI=0.0140557;REFB=0.00289649;REVB=-0.0140422;RO=4;SAF=35;SAR=20;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508871;STB=0.527017;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-8.23701e-05;OID=.;OPOS=151669875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:59:59:4:4:55:55:0.932203:20:35:4:0:20:35:4:0
chr6	151670172	.	A	C	385.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0679188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6393;QD=55.0956;RBI=0.068224;REFB=0;REVB=-0.00644554;RO=1;SAF=13;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344248;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00142948;OID=.;OPOS=151670172;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:1:0:27:28:1:14:13:1:0:14:14:0:0
chr6	151670897	.	T	C	1529.78	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.098;QD=63.7408;RBI=0.0558201;REFB=0;REVB=0.0468125;RO=0;SAF=42;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.98327e-05;OID=.;OPOS=151670897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:54:42:0:0:54:42:0:0
chr6	151672122	.	CAAAAAAG	AAAAAAAG,CAAAAAG,CAAAAAGA	31.52	PASS	AF=0,0.20339,0.0169492;AO=2,16,3;DP=55;FAO=0,12,1;FDP=59;FR=.;FRO=46;FSAF=0,5,1;FSAR=0,7,0;FSRF=35;FSRR=11;FWDB=-0.022898,0.0734147,-0.0245199;FXX=0;HRUN=3,6,6;LEN=1,1,2;MLLD=27.0691,7.74037,58.8208;QD=2.13691;RBI=0.0688474,0.213992,0.0327214;REFB=0.0813752,-0.127583,-0.0131234;REVB=-0.064928,-0.201004,-0.0216671;RO=32;SAF=2,11,3;SAR=0,5,0;SRF=27;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.334739,-0.230445,0.424073;STB=0.5,0.756412,0.985106;STBP=1,0.081,0.54;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.0457004,0.141554,0.114961;OID=.,.,.;OPOS=151672122,151672123,151672128;OREF=C,A,AG;OALT=A,-,GA;OMAPALT=AAAAAAAG,CAAAAAG,CAAAAAGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:31:55:59:32:46:2,16,3:0,12,1:0,0.20339,0.0169492:0,5,0:2,11,3:27:5:0,7,0:0,5,1:35:11
chr6	151674114	.	ATT	ATTGAG,GAG	490.98	PASS	AF=0.891892,0.0540541;AO=28,2;DP=39;FAO=33,2;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=26,2;FSAR=7,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00347603,0.0158038;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=3,3;MLLD=201.662,194.12;QD=53.0787;RBI=0.0715499,0.0899638;REFB=0.074462,0.0185813;REVB=0.0714654,0.0885649;RO=4;SAF=22,2;SAR=6,0;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0922617,0.623114;STB=0.518507,0.5;STBP=0.589,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.00015249,0.0112675;OID=.,.;OPOS=151674117,151674114;OREF=-,ATT;OALT=GAG,GAG;OMAPALT=ATTGAG,GAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:39:37:4:2:28,2:33,2:0.891892,0.0540541:6,0:22,2:2:2:7,0:26,2:2:0
chr6	151674326	.	A	C	600.46	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0214447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5271;QD=58.5811;RBI=0.060983;REFB=-0.0103147;REVB=0.0570881;RO=1;SAF=29;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159019;STB=0.50847;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0039968;OID=.;OPOS=151674326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:11:29:1:0:11:29:1:0
chr6	151686905	.	C	T	1573.31	PASS	AF=0.990654;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00234023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4445;QD=58.8154;RBI=0.0172365;REFB=0.0477957;REVB=0.0170769;RO=1;SAF=47;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00999073;STB=0.505262;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=7.41492e-05;OID=.;OPOS=151686905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:107:107:1:1:106:106:0.990654:59:47:1:0:59:47:1:0
chr6	151694771	.	ATTTTTTA	AATTTTTA,ATTTTT,ATTTTTA,ATTTTTAA	47.85	PASS	AF=0,0.037037,0.407407,0;AO=2,5,8,2;DP=33;FAO=0,1,11,0;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=0,0,8,0;FSAR=0,1,3,0;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0103429,0.00700445,0.0581808,0.0589306;FXX=0.0689417;HRUN=6,6,6,6;LEN=1,2,1,1;MLLD=17.0776,15.0783,8.88391,10.0785;QD=7.08941;RBI=0.155927,0.137525,0.150914,0.0589763;REFB=-0.0436054,-0.00435097,-0.100371,-0.100042;REVB=-0.155584,-0.137347,-0.139248,0.00232211;RO=11;SAF=2,4,4,2;SAR=0,1,4,0;SRF=5;SRR=6;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0.368421,0.368421,0;SSSB=0.585255,0.39117,0.043798,0.585255;STB=0.5,0.988956,0.661345,0.5;STBP=1,0.479,0.181,1;TYPE=snp,del,del,snp;VARB=0,-0.269883,0.127831,0;OID=.,.,.,.;OPOS=151694772,151694777,151694772,151694777;OREF=T,TA,T,T;OALT=A,-,-,A;OMAPALT=AATTTTTA,ATTTTT,ATTTTTA,ATTTTTAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0.037037,0.407407,0:2,5,8,2:33:0,1,11,0:27:15:0,0,8,0:0,1,3,0:7:8:31:11:2,4,4,2:0,1,4,0:5:6
chr6	151789912	.	C	T	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0451374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.952;QD=23.2168;RBI=0.0460104;REFB=-0.0063256;REVB=0.00892055;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951258;STB=0.555346;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00507461;OID=.;OPOS=151789912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:4:1:0:1:4:1:0:1
chr6	151859314	.	A	G	626.58	PASS	AF=0.976744;AO=41;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0221374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.914;QD=58.2865;RBI=0.0365225;REFB=-0.0520374;REVB=0.0290487;RO=2;SAF=22;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00320586;STB=0.511106;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000479296;OID=.;OPOS=151859314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:2:1:41:42:0.976744:19:22:1:1:20:22:1:0
chr6	151894505	.	T	C	1026.35	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6676;QD=59.4983;RBI=0.0708754;REFB=0;REVB=-0.0678344;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000782753;OID=.;OPOS=151894505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:32:37:0:0:32:37:0:0
chr6	151914265	.	T	C	525.6	PASS	AF=0.515464;AO=49;DP=97;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.00305703;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.858;QD=21.6743;RBI=0.0304137;REFB=-0.0273899;REVB=0.0302596;RO=47;SAF=24;SAR=25;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0561116;STB=0.525763;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0271871;OID=.;OPOS=151914265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:47:47:49:50:0.515464:25:24:26:21:25:25:26:21
chr6	151936677	.	G	A	232.09	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0564649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.867;QD=14.7357;RBI=0.0786545;REFB=0.0129021;REVB=-0.0547563;RO=36;SAF=12;SAR=15;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284165;STB=0.516117;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=-0.0311719;OID=.;OPOS=151936677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:15:12:15:21:15:12:15:21
chr6	151939181	.	G	A	740.42	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.5;QD=56.9557;RBI=0.0469379;REFB=0;REVB=-0.0311476;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.81687e-06;OID=.;OPOS=151939181;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:21:30:0:0:21:31:0:0
chr6	152129077	.	T	C	838.9	PASS	AF=0.512048;AO=84;DP=166;FAO=85;FDP=166;FR=.;FRO=81;FSAF=59;FSAR=26;FSRF=51;FSRR=30;FWDB=-0.00281519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.598;QD=20.2144;RBI=0.00668363;REFB=-0.0197563;REVB=-0.00606182;RO=77;SAF=59;SAR=25;SRF=48;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0792871;STB=0.536007;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.015981;OID=.;OPOS=152129077;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:166:77:81:84:85:0.512048:25:59:48:29:26:59:51:30
chr6	152201875	.	T	C	1115.68	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215919;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.075;QD=59.5032;RBI=0.024057;REFB=0;REVB=-0.0106078;RO=0;SAF=28;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205384;OID=.;OPOS=152201875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:75:0:0:72:75:1:44:28:0:0:44:31:0:0
chr6	152265522	.	G	C	2220.92	PASS	AF=1;AO=116;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=93;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.385;QD=62.5613;RBI=0.0343506;REFB=0;REVB=0.0251374;RO=0;SAF=76;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00186107;OID=.;OPOS=152265522;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:116:142:1:40:76:0:0:49:93:0:0
chr6	152420095	.	G	A	178.72	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0127522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.404;QD=22.3405;RBI=0.0241276;REFB=-0.00442012;REVB=-0.0204823;RO=14;SAF=16;SAR=2;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332505;STB=0.691099;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00697835;OID=.;OPOS=152420095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:2:16:9:5:2:16:9:5
chr6	152422335	.	C	T	1396.42	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.027;QD=62.7603;RBI=0.0276301;REFB=0;REVB=0.0257455;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97007e-05;OID=.;OPOS=152422335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:45:44:0:0:45:44:0:0
chr6	152443756	.	C	T	130.0	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0393872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.407;QD=13.3335;RBI=0.0441735;REFB=-0.0444855;REVB=-0.0199987;RO=23;SAF=7;SAR=8;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101896;STB=0.571334;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0527623;OID=.;OPOS=152443756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:24:15:15:0.384615:8:7:13:10:8:7:14:10
chr6	152446487	.	C	T	361.99	PASS	AF=0.469136;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.050075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3201;QD=17.8762;RBI=0.0669637;REFB=-0.0174568;REVB=-0.0444593;RO=42;SAF=16;SAR=22;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03003;STB=0.511282;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0194693;OID=.;OPOS=152446487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:42:43:38:38:0.469136:22:16:19:23:22:16:19:24
chr6	152464839	.	A	G	286.75	PASS	AF=0.426667;AO=32;DP=75;FAO=32;FDP=75;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.0064927;FXX=0.0131562;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.749;QD=15.2934;RBI=0.00833996;REFB=-0.00592655;REVB=0.00523447;RO=41;SAF=23;SAR=9;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0712384;STB=0.545964;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00654232;OID=.;OPOS=152464839;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:43:32:32:0.426667:9:23:27:14:9:23:28:15
chr6	152489294	.	T	C	882.77	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.238;QD=57.8868;RBI=0.0494024;REFB=0;REVB=0.0458345;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240703;OID=.;OPOS=152489294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:31:29:0:0:31:30:0:0
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chr6	152540278	.	A	C	1395.12	PASS	AF=0.968085;AO=91;DP=94;FAO=91;FDP=94;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.000538464;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=262.745;QD=59.3666;RBI=0.00404812;REFB=-0.0326809;REVB=-0.00401215;RO=3;SAF=51;SAR=40;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270659;STB=0.514283;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-3.98421e-05;OID=.;OPOS=152540278;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:94:94:3:3:91:91:0.968085:40:51:3:0:40:51:3:0
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chr6	152665261	.	C	A	425.41	PASS	AF=0.477778;AO=43;DP=90;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=-0.0112465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.738;QD=18.9069;RBI=0.0195604;REFB=-0.0022655;REVB=-0.0160039;RO=46;SAF=30;SAR=13;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0258333;STB=0.510323;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.00341127;OID=.;OPOS=152665261;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:46:47:43:43:0.477778:13:30:31:15:13:30:32:15
chr6	152675854	.	A	G	978.5	PASS	AF=0.549708;AO=94;DP=171;FAO=94;FDP=171;FR=.;FRO=77;FSAF=46;FSAR=48;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=-0.0385854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.948;QD=22.8889;RBI=0.0390042;REFB=-0.0198667;REVB=0.00570024;RO=77;SAF=46;SAR=48;SRF=37;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00730104;STB=0.503983;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0148041;OID=.;OPOS=152675854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:171:171:77:77:94:94:0.549708:48:46:37:40:48:46:37:40
chr6	152683413	.	G	T	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.2;QD=58.4192;RBI=0.0254348;REFB=0;REVB=0.0205702;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.24188e-05;OID=.;OPOS=152683413;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0
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chr6	154414446	.	A	T	721.47	PASS	AF=0.458333;AO=76;DP=168;FAO=77;FDP=168;FR=.;FRO=91;FSAF=48;FSAR=29;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=0.0195759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.312;QD=17.178;RBI=0.0718547;REFB=-0.0312291;REVB=-0.0691367;RO=90;SAF=47;SAR=29;SRF=49;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0749508;STB=0.547809;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0253921;OID=.;OPOS=154414446;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:90:91:76:77:0.458333:29:47:49:41:29:48:49:42
chr6	154414563	.	A	G	205.36	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0103641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.796;QD=14.6688;RBI=0.014974;REFB=-0.012258;REVB=-0.0108077;RO=31;SAF=14;SAR=10;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675675;STB=0.530278;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0165255;OID=.;OPOS=154414563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:31:32:24:24:0.428571:10:14:16:15:10:14:17:15
chr6	154414573	.	C	T	209.57	PASS	AF=0.446809;AO=22;DP=48;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00641521;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4453;QD=17.8353;RBI=0.00716526;REFB=-0.0204119;REVB=0.00319156;RO=26;SAF=14;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1344;STB=0.567502;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0360426;OID=.;OPOS=154414573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:26:26:22:21:0.446809:8:14:13:13:8:13:13:13
chr6	154428666	.	C	T	237.68	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.000734901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7587;QD=18.6419;RBI=0.0202035;REFB=-0.0125242;REVB=-0.0201901;RO=25;SAF=11;SAR=14;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245859;STB=0.626445;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00864413;OID=.;OPOS=154428666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:26:25:25:0.490196:14:11:18:7:14:11:18:8
chr6	154431565	.	G	A	178.95	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0209588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.867;QD=15.2296;RBI=0.0217667;REFB=-0.014207;REVB=-0.00587503;RO=28;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00973477;STB=0.505612;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0177407;OID=.;OPOS=154431565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:9:10:15:13:9:10:15:13
chr6	154771277	.	A	G	1434.23	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00589683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6234;QD=63.0429;RBI=0.0160281;REFB=0;REVB=0.014904;RO=0;SAF=53;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134783;OID=.;OPOS=154771277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:38:53:0:0:38:53:0:0
chr6	155451352	.	G	A	85.37	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.088;QD=37.9412;RBI=0.0635026;REFB=0;REVB=0.0123478;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00227112;OID=.;OPOS=155451352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:8:9:1:5:3:0:0:5:4:0:0
chr6	155485554	.	G	A	957.98	PASS	AF=1;AO=63;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.961;QD=58.0597;RBI=0.090728;REFB=0;REVB=-0.0898922;RO=0;SAF=43;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357748;OID=.;OPOS=155485554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:63:66:1:20:43:0:0:22:44:0:0
chr6	155561760	.	T	C	1135.21	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00390459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.419;QD=60.5447;RBI=0.0417455;REFB=0;REVB=0.0415625;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.041e-05;OID=.;OPOS=155561760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:38:37:0:0:38:37:0:0
chr6	155577823	.	C	T	594.51	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00738959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.509;QD=60.9754;RBI=0.0195511;REFB=0;REVB=0.0181008;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013548;OID=.;OPOS=155577823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:13:26:0:0:13:26:0:0
chr6	155578592	.	A	AT	552.6	PASS	AF=1;AO=10;DP=74;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.173538;FXX=0.0277739;HRUN=6;LEN=1;MLLD=11.4513;QD=31.577;RBI=0.195103;REFB=0;REVB=-0.0891612;RO=63;SAF=7;SAR=3;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167089;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00864022;OID=.;OPOS=155578593;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:74:70:70:0:41:29:0:0:11:63:7:3:36:27
chr6	155578599	.	A	T	1027.03	PASS	AF=0.986301;AO=66;DP=68;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000199931;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.6904;QD=56.2758;RBI=0.00274888;REFB=0.0140892;REVB=-0.0027416;RO=1;SAF=40;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011667;STB=0.506171;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.000122898;OID=.;OPOS=155578599;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:73:1:1:66:72:0.986301:26:40:1:0:32:40:1:0
chr6	155578756	.	A	T	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00996456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.361;QD=55.0965;RBI=0.0186158;REFB=0;REVB=-0.0157244;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.76502e-05;OID=.;OPOS=155578756;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0
chr6	155596901	.	T	C	1170.93	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00702103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.179;QD=60.0478;RBI=0.0153245;REFB=0;REVB=0.0136215;RO=0;SAF=54;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108881;OID=.;OPOS=155596901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:76:78:1:22:54:0:0:24:54:0:0
chr6	155597147	.	C	T	1791.6	PASS	AF=0.991597;AO=118;DP=120;FAO=118;FDP=119;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00380682;FXX=0.00833264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.02;QD=60.2217;RBI=0.0161142;REFB=-0.0255572;REVB=0.0156581;RO=0;SAF=50;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.08833e-08;STB=0.50495;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.000385319;OID=.;OPOS=155597147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:120:119:0:1:118:118:0.991597:68:50:0:0:68:50:1:0
chr6	155606325	.	C	T	1025.58	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.037083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.725;QD=59.4539;RBI=0.0402877;REFB=0;REVB=0.0157465;RO=0;SAF=45;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.33788e-05;OID=.;OPOS=155606325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:24:45:0:0:24:45:0:0
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chr6	157801040	.	T	A,G	662.9	PASS	AF=0.954545,0.0454545;AO=41,2;DP=45;FAO=42,2;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=7,0;FSAR=35,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079759,0.0327573;FXX=0.0222173;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=182.772,34.8784;QD=60.2636;RBI=0.0797598,0.0384968;REFB=0,0;REVB=0.00037184,-0.0202229;RO=0;SAF=6,0;SAR=35,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.02085e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000593418,0.0592607;OID=.,.;OPOS=157801040,157801040;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:45:44:0:0:41,2:42,2:0.954545,0.0454545:35,2:6,0:0:0:35,2:7,0:0:0
chr6	157801186	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374725;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.237;QD=50.4134;RBI=0.0500588;REFB=0;REVB=0.0331918;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255853;OID=.;OPOS=157801186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0
chr6	157801516	.	A	G	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.181;QD=58.0611;RBI=0.018433;REFB=0;REVB=0.0150497;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.98533e-05;OID=.;OPOS=157801516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0
chr6	158497717	.	T	C	162.18	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0334954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1393;QD=12.013;RBI=0.0612569;REFB=-0.00111055;REVB=-0.0512881;RO=34;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637573;STB=0.537;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=-9.4637e-06;OID=.;OPOS=158497717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:10:10:15:19:10:10:15:19
chr6	158499302	.	G	T	530.46	PASS	AF=0.524272;AO=51;DP=101;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=26;FWDB=0.00388109;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.21;QD=20.6003;RBI=0.0380238;REFB=-0.0118193;REVB=0.0378252;RO=50;SAF=28;SAR=23;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0797664;STB=0.550144;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0105072;OID=.;OPOS=158499302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:103:50:49:51:54:0.524272:23:28:23:27:23:31:23:26
chr6	158505088	.	A	G	416.79	PASS	AF=0.597015;AO=40;DP=68;FAO=40;FDP=67;FR=.;FRO=27;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.00164841;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.297;QD=24.883;RBI=0.00947358;REFB=-0.019647;REVB=-0.00932906;RO=27;SAF=23;SAR=17;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150141;STB=0.567655;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0115375;OID=.;OPOS=158505088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:27:27:40:40:0.597015:17:23:10:17:17:23:11:16
chr6	158507981	.	G	A	254.42	PASS	AF=0.529412;AO=26;DP=52;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0264311;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.959;QD=19.9542;RBI=0.0688854;REFB=-0.0426587;REVB=0.0636129;RO=23;SAF=16;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813267;STB=0.563205;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.0414562;OID=.;OPOS=158507981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:23:24:26:27:0.529412:10:16:12:11:10:17:12:12
chr6	158509750	.	A	G	173.37	PASS	AF=0.348485;AO=20;DP=63;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.102328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.1047;QD=10.507;RBI=0.105128;REFB=-0.0179228;REVB=-0.0240993;RO=42;SAF=9;SAR=11;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302286;STB=0.53681;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0429656;OID=.;OPOS=158509750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:66:42:43:20:23:0.348485:11:9:20:22:11:12:20:23
chr6	158517308	.	A	G	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0113792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2368;QD=15.3788;RBI=0.0152313;REFB=0.0458831;REVB=0.0101245;RO=14;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0533302;OID=.;OPOS=158517308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:6:6:7:7:6:6:7:7
chr6	158571501	.	G	A	768.27	PASS	AF=1;AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00564245;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2208;QD=56.9091;RBI=0.0254069;REFB=0;REVB=-0.0247724;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3951e-06;OID=.;OPOS=158571501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:53:54:1:22:31:0:0:22:32:0:0
chr6	158735087	.	C	T	708.46	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0477;QD=62.9741;RBI=0.0863038;REFB=0;REVB=-0.0856662;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000960206;OID=.;OPOS=158735087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr6	158735090	.	T	C	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00254566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.752;QD=62.9825;RBI=0.00619435;REFB=0;REVB=-0.00564709;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.0171e-05;OID=.;OPOS=158735090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chr6	158923434	.	G	C	1152.21	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0490927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2917;QD=60.6424;RBI=0.0493386;REFB=0;REVB=0.00492024;RO=0;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144922;OID=.;OPOS=158923434;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:31:45:0:0:31:45:0:0
chr6	158924088	.	T	C	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000718864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.443;QD=57.6806;RBI=0.0485294;REFB=0;REVB=0.048524;RO=0;SAF=26;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.05016e-05;OID=.;OPOS=158924088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:5:26:0:0:5:26:0:0
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chr6	159054833	.	TGT	TG,TT,TTT	178.9	PASS	AF=0.0232558,0.44186,0;AO=5,12,3;DP=38;FAO=1,19,0;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=0,15,0;FSAR=1,4,0;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0920325,0.00738027,0.00600809;FXX=0;HRUN=8,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=7.2258,234.801,234;QD=16.6422;RBI=0.32902,0.00769469,0.0203509;REFB=-0.00418611,-0.0172646,-0.0160493;REVB=-0.315886,0.00217714,0.0194438;RO=18;SAF=1,9,3;SAR=4,3,0;SRF=9;SRR=9;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.367462,0.279999,0.604808;STB=0.98857,0.718061,0.5;STBP=0.468,0.017,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.00538605,0.0103246,0;OID=.,.,.;OPOS=159054835,159054834,159054834;OREF=T,G,G;OALT=-,-,T;OMAPALT=TG,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0232558,0.44186,0:5,12,3:38:1,19,0:43:23:0,15,0:1,4,0:10:13:99:18:1,9,3:4,3,0:9:9
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chr6	160169258	.	G	T	303.96	PASS	AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.00575222;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.32;QD=19.6104;RBI=0.00815763;REFB=-0.0273334;REVB=-0.00578437;RO=30;SAF=24;SAR=8;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125079;STB=0.569954;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0289833;OID=.;OPOS=160169258;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:8:24:19:11:8:24:19:11
chr6	160182617	.	C	T	244.21	PASS	AF=0.376623;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0234761;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.987;QD=12.6864;RBI=0.0338311;REFB=-0.0216617;REVB=0.0243602;RO=48;SAF=14;SAR=15;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0187236;STB=0.510745;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0200266;OID=.;OPOS=160182617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:48:48:29:29:0.376623:15:14:24:24:15:14:24:24
chr6	160198359	.	C	T	283.1	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.000763886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9543;QD=17.4217;RBI=0.0102391;REFB=-0.00515137;REVB=0.0102106;RO=34;SAF=15;SAR=16;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972221;STB=0.554421;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0104871;OID=.;OPOS=160198359;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:16:15:20:14:16:15:20:14
chr6	160201295	.	C	A	131.53	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0041951;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.563;QD=14.2199;RBI=0.0247746;REFB=-0.0408482;REVB=-0.0244168;RO=21;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136602;STB=0.589629;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0388668;OID=.;OPOS=160201295;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:22:15:15:0.405405:8:7:7:14:8:7:7:15
chr6	160206716	.	T	C	269.09	PASS	AF=0.648649;AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.016026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3469;QD=29.0907;RBI=0.0196755;REFB=-0.00889924;REVB=0.0114146;RO=13;SAF=11;SAR=13;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511609;STB=0.528193;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.00534052;OID=.;OPOS=160206716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:13:13:24:24:0.648649:13:11:7:6:13:11:7:6
chr6	160211636	.	G	A	574.58	PASS	AF=0.344498;AO=71;DP=208;FAO=72;FDP=209;FR=.;FRO=137;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=63;FSRR=74;FWDB=0.00481469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.532;QD=10.9967;RBI=0.0179953;REFB=-0.00990177;REVB=0.0173393;RO=136;SAF=36;SAR=35;SRF=62;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058742;STB=0.526308;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=0.0224435;OID=.;OPOS=160211636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:208:209:136:137:71:72:0.344498:35:36:62:74:36:36:63:74
chr6	160211645	.	GGTT	G	322.23	PASS	AF=0.340314;AO=45;DP=180;FAO=65;FDP=191;FR=.;FRO=126;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=55;FSRR=71;FWDB=0.000376381;FXX=0.00520806;HRUN=5;LEN=3;MLLD=274.262;QD=6.74827;RBI=0.00574431;REFB=-0.00528357;REVB=0.00573197;RO=122;SAF=26;SAR=19;SRF=52;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185092;STB=0.53685;STBP=0.476;TYPE=del;VARB=0.00940715;OID=.;OPOS=160211646;OREF=GTT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.340314:45:180:65:191:126:32:33:55:71:99:122:26:19:52:70
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chr6	160234625	.	G	C	578.84	PASS	AF=0.458647;AO=61;DP=133;FAO=61;FDP=133;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=-0.0226063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5137;QD=17.4086;RBI=0.0783548;REFB=-0.011562;REVB=0.0750228;RO=72;SAF=29;SAR=32;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0913317;STB=0.550758;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0155403;OID=.;OPOS=160234625;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:72:72:61:61:0.458647:32:29:41:31:32:29:41:31
chr6	160328620	.	C	T	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.631;QD=59.8394;RBI=0.0128951;REFB=0;REVB=-0.00524207;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.82401e-05;OID=.;OPOS=160328620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr6	160448324	.	C	G	123.13	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.00302808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6108;QD=16.4169;RBI=0.0113307;REFB=-0.0579604;REVB=-0.0109186;RO=16;SAF=3;SAR=11;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190475;STB=0.610938;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0412844;OID=.;OPOS=160448324;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:11:3:6:10:11:3:6:10
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chr6	160468278	.	A	G	1033.69	PASS	AF=0.986301;AO=67;DP=70;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0101592;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8579;QD=56.6405;RBI=0.156101;REFB=-0.0930623;REVB=0.15577;RO=1;SAF=46;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101641;STB=0.505375;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00157103;OID=.;OPOS=160468278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:70:73:1:1:67:72:0.986301:21:46:1:0:26:46:1:0
chr6	160485487	.	CGGGGGGGGAC	CGGGGGGGAC,CGGGGGGGACG	37.41	PASS	AF=0.222222,0.010101;AO=25,5;DP=96;FAO=22,1;FDP=99;FR=.;FRO=76;FSAF=11,1;FSAR=11,0;FSRF=50;FSRR=26;FWDB=0.0568906,-0.0187081;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,3;MLLD=6.58082,70.1839;QD=1.51169;RBI=0.179455,0.081504;REFB=-0.0918609,-0.0105754;REVB=-0.170198,-0.0793278;RO=50;SAF=14,2;SAR=11,3;SRF=33;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.118264,-0.283842;STB=0.622344,0.987082;STBP=0.206,0.51;TYPE=del,mnp;VARB=0.0334306,-0.299676;OID=.,.;OPOS=160485488,160485495;OREF=G,GAC;OALT=-,ACG;OMAPALT=CGGGGGGGAC,CGGGGGGGACG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.222222,0.010101:25,5:96:22,1:99:76:11,1:11,0:50:26:36:50:14,2:11,3:33:17
chr6	160493834	.	G	A	504.94	PASS	AF=0.369697;AO=61;DP=163;FAO=61;FDP=165;FR=.;FRO=104;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=51;FWDB=-0.0129926;FXX=0.00602373;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.122;QD=12.2409;RBI=0.0148107;REFB=-0.00534206;REVB=-0.00710967;RO=102;SAF=32;SAR=29;SRF=52;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01633;STB=0.50945;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00947268;OID=.;OPOS=160493834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:165:102:104:61:61:0.369697:29:32:52:50:29:32:53:51
chr6	160494409	.	A	G	1453.63	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.118;QD=63.2013;RBI=0.0524851;REFB=0;REVB=0.0451821;RO=0;SAF=34;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.5219e-05;OID=.;OPOS=160494409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:57:34:0:0:57:35:0:0
chr6	160505199	.	C	G	670.07	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.120128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.293;QD=62.3319;RBI=0.120438;REFB=0;REVB=0.00863262;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260841;OID=.;OPOS=160505199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0
chr6	160517481	.	C	T	508.2	PASS	AF=0.387755;AO=56;DP=146;FAO=57;FDP=147;FR=.;FRO=90;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=39;FSRR=51;FWDB=-0.0108982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8938;QD=13.8286;RBI=0.0112;REFB=-0.0169613;REVB=-0.00258246;RO=90;SAF=21;SAR=35;SRF=39;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663239;STB=0.530161;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0248212;OID=.;OPOS=160517481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:147:90:90:56:57:0.387755:35:21:39:51:35:22:39:51
chr6	160526904	.	TCAAA	T	116.0	PASS	AF=0.341463;AO=13;DP=43;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.00548559;FXX=0.0465008;HRUN=1;LEN=4;MLLD=239.096;QD=11.317;RBI=0.0175225;REFB=-0.0104127;REVB=0.0166417;RO=26;SAF=5;SAR=8;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293411;STB=0.629957;STBP=0.271;TYPE=del;VARB=0.0179785;OID=.;OPOS=160526905;OREF=CAAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.341463:13:43:14:41:27:6:8:17:10:99:26:5:8:17:9
chr6	160551204	.	G	C	1717.54	PASS	AF=0.982759;AO=104;DP=111;FAO=114;FDP=116;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=54;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0522985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.229;QD=59.2256;RBI=0.0584909;REFB=-0.0880835;REVB=0.0261925;RO=1;SAF=49;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00958601;STB=0.504586;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00131349;OID=.;OPOS=160551204;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:111:116:1:1:104:114:0.982759:55:49:1:0:60:54:1:0
chr6	160557643	.	C	T	387.27	PASS	AF=0.584615;AO=38;DP=65;FAO=38;FDP=65;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0174409;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.399;QD=23.8318;RBI=0.0178163;REFB=-0.0197243;REVB=0.00363793;RO=27;SAF=22;SAR=16;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129973;STB=0.571391;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.011874;OID=.;OPOS=160557643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:27:27:38:38:0.584615:16:22:11:16:16:22:11:16
chr6	160560845	.	A	G	1340.14	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0658074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.638;QD=62.332;RBI=0.0661619;REFB=0;REVB=0.00683978;RO=0;SAF=46;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.69046e-05;OID=.;OPOS=160560845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:86:0:0:80:86:1:34:46:0:0:35:51:0:0
chr6	160560897	.	CTGGTAAGT	C	471.06	PASS	AF=0.765957;AO=34;DP=37;FAO=36;FDP=47;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.00939885;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=8;MLLD=267.838;QD=40.0901;RBI=0.00985995;REFB=-0.0307281;REVB=-0.00297997;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.593588;STBP=0.024;TYPE=del;VARB=0.0074358;OID=.;OPOS=160560898;OREF=TGGTAAGT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.765957:34:37:36:47:11:15:21:9:2:80:0:13:21:0:0
chr6	160645832	.	C	T	735.21	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050355;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.309;QD=55.4874;RBI=0.050465;REFB=0;REVB=0.00333048;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00072481;OID=.;OPOS=160645832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:29:23:0:0:29:24:0:0
chr6	160670282	.	A	C	3797.71	PASS	AF=0.97992;AO=242;DP=248;FAO=244;FDP=249;FR=.;FRO=5;FSAF=139;FSAR=105;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.017607;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.956;QD=61.0074;RBI=0.0546097;REFB=-0.144425;REVB=0.0516935;RO=4;SAF=138;SAR=104;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101066;STB=0.507554;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0013298;OID=.;OPOS=160670282;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:248:249:4:5:242:244:0.97992:104:138:1:3:105:139:1:4
chr6	160679400	.	C	A	177.46	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.000251971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.231;QD=21.5108;RBI=0.00262221;REFB=-0.0148813;REVB=0.00261008;RO=15;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168412;STB=0.593999;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00822269;OID=.;OPOS=160679400;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:7:11:12:3:7:11:12:3
chr6	160858188	.	G	A	637.93	PASS	AF=0.481481;AO=65;DP=134;FAO=65;FDP=135;FR=.;FRO=70;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=44;FSRR=26;FWDB=-0.040705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.556;QD=18.9015;RBI=0.0434156;REFB=-0.00726677;REVB=-0.0151003;RO=69;SAF=36;SAR=29;SRF=44;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.079842;STB=0.539523;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00611242;OID=.;OPOS=160858188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:135:69:70:65:65:0.481481:29:36:44:25:29:36:44:26
chr6	160872151	.	C	T	304.06	PASS	AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=0.0016629;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.665;QD=17.1302;RBI=0.00167603;REFB=-0.0134244;REVB=-0.000209368;RO=38;SAF=10;SAR=23;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460455;STB=0.525758;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0160125;OID=.;OPOS=160872151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:38:38:33:33:0.464789:23:10:10:28:23:10:10:28
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chr6	161173946	.	T	G	2652.25	PASS	AF=0.994318;AO=169;DP=172;FAO=175;FDP=176;FR=.;FRO=1;FSAF=91;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0163288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.375;QD=60.2785;RBI=0.0170054;REFB=0.0192558;REVB=0.0047492;RO=2;SAF=85;SAR=84;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110656;STB=0.502732;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=3.72589e-05;OID=.;OPOS=161173946;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:172:176:2:1:169:175:0.994318:84:85:2:0:84:91:1:0
chr6	161469774	.	G	A	747.5	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8835;QD=56.4148;RBI=0.0144496;REFB=0;REVB=-0.00869677;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.1179e-06;OID=.;OPOS=161469774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:25:27:0:0:25:28:0:0
chr6	161519331	.	C	T	112.9	PASS	AF=0.75;AO=12;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0267426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.308;QD=28.226;RBI=0.0279101;REFB=-0.0477751;REVB=0.0079878;RO=4;SAF=9;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136204;STB=0.576787;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0229098;OID=.;OPOS=161519331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:16:16:4:4:12:12:0.75:3:9:2:2:3:9:2:2
chr6	161538250	.	G	A	645.04	PASS	AF=0.461538;AO=66;DP=143;FAO=66;FDP=143;FR=.;FRO=77;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=-0.0211591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.822;QD=18.0431;RBI=0.0372519;REFB=-0.0305656;REVB=0.0306593;RO=77;SAF=29;SAR=37;SRF=41;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.090442;STB=0.550229;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0346057;OID=.;OPOS=161538250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:77:77:66:66:0.461538:37:29:41:36:37:29:41:36
chr6	161565180	.	G	A	326.54	PASS	AF=0.413793;AO=36;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=15;FWDB=-0.0106878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5026;QD=15.0133;RBI=0.0152169;REFB=0.0178745;REVB=-0.0108317;RO=51;SAF=22;SAR=14;SRF=36;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106473;STB=0.559968;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=-0.0259954;OID=.;OPOS=161565180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:51:51:36:36:0.413793:14:22:36:15:14:22:36:15
chr6	161582535	.	T	C	86.13	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.00520639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.344;QD=12.3036;RBI=0.038125;REFB=-0.0197125;REVB=-0.0377678;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264132;STB=0.636116;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0247184;OID=.;OPOS=161582535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:14:17:11:11:0.392857:4:7:5:9:4:7:7:10
chr6	162622197	.	C	T	253.59	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0169502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.586;QD=17.4889;RBI=0.020936;REFB=-0.0226319;REVB=0.0122886;RO=30;SAF=17;SAR=11;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131225;STB=0.573697;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.022303;OID=.;OPOS=162622197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:11:17:14:16:11:17:14:16
chr6	163587146	.	C	G	1780.03	PASS	AF=1;AO=110;DP=112;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016637;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2548;QD=60.8557;RBI=0.0550188;REFB=0;REVB=0.0524431;RO=0;SAF=84;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.57056e-05;OID=.;OPOS=163587146;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:112:117:0:0:110:117:1:26:84:0:0:28:89:0:0
chr6	163587266	.	C	A	507.22	PASS	AF=0.529412;AO=51;DP=101;FAO=54;FDP=102;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.013335;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.973;QD=19.891;RBI=0.0286533;REFB=-0.0232639;REVB=0.0253612;RO=44;SAF=33;SAR=18;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204417;STB=0.602701;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0136647;OID=.;OPOS=163587266;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:44:48:51:54:0.529412:18:33:18:26:18:36:22:26
chr6	163612783	.	C	A	681.57	PASS	AF=1;AO=43;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.279044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.8486;QD=60.5836;RBI=0.2818;REFB=0;REVB=0.0393105;RO=2;SAF=8;SAR=35;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103831;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00414682;OID=.;OPOS=163612783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:2:0:43:45:1:35:8:2:0:35:10:0:0
chr6	163736204	.	T	C	594.4	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.872;QD=60.9639;RBI=0.0356324;REFB=0;REVB=0.00834024;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102372;OID=.;OPOS=163736204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0
chr6	165832227	.	C	T	375.69	PASS	AF=0.587302;AO=37;DP=63;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0500279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6775;QD=23.853;RBI=0.0505116;REFB=-0.0114478;REVB=-0.00697361;RO=26;SAF=8;SAR=29;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289448;STB=0.66036;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00760279;OID=.;OPOS=165832227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:26:26:37:37:0.587302:29:8:14:12:29:8:14:12
chr6	166307718	.	T	C	1338.79	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.377;QD=62.2692;RBI=0.0206546;REFB=0;REVB=0.0136125;RO=0;SAF=50;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07088e-05;OID=.;OPOS=166307718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:36:50:0:0:36:50:0:0
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chr6	166309167	.	G	A	557.11	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.986;QD=60.228;RBI=0.0596788;REFB=0;REVB=-0.0467425;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.08001e-05;OID=.;OPOS=166309167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0
chr6	166309245	.	A	T	118.89	PASS	AF=0.857143;AO=11;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0189906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.093;QD=33.968;RBI=0.0413743;REFB=-0.0141412;REVB=-0.0367585;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526271;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.00174815;OID=.;OPOS=166309245;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:14:14:0:2:11:12:0.857143:4:7:0:0:4:8:1:1
chr6	166309249	.	G	T	156.14	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0543618;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.8951;QD=44.611;RBI=0.0559012;REFB=0;REVB=-0.0130283;RO=1;SAF=8;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533084;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000593706;OID=.;OPOS=166309249;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:1:0:13:14:1:5:8:1:0:5:9:0:0
chr6	166309288	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6496;QD=59.4351;RBI=0.0233811;REFB=0;REVB=0.0194617;RO=0;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.36888e-05;OID=.;OPOS=166309288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:26:9:0:0:26:9:0:0
chr6	166571157	.	G	A	328.93	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0218026;FXX=0.061212;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.314;QD=28.6029;RBI=0.0415907;REFB=-0.00239123;REVB=-0.035418;RO=17;SAF=12;SAR=16;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957971;STB=0.561248;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00155242;OID=.;OPOS=166571157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:46:17:18:28:28:0.608696:16:12:5:12:16:12:5:13
chr6	166571164	.	T	G	354.05	PASS	AF=0.625;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0218012;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=172.257;QD=29.5045;RBI=0.0220757;REFB=-0.00211225;REVB=-0.00347064;RO=18;SAF=12;SAR=18;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0887819;STB=0.548641;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.00149664;OID=.;OPOS=166571164;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:18:18:30:30:0.625:18:12:5:13:18:12:5:13
chr6	166572005	.	T	C	117.47	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.019675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.757;QD=12.3657;RBI=0.0236034;REFB=-0.0170126;REVB=-0.013039;RO=23;SAF=8;SAR=6;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277372;STB=0.646858;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0263511;OID=.;OPOS=166572005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:23:24:14:14:0.368421:6:8:7:16:6:8:8:16
chr6	166721211	.	G	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429984;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=200.315;QD=33.4285;RBI=0.0432639;REFB=0;REVB=0.00478483;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000447799;OID=.;OPOS=166721211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr6	166721224	.	C	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00324105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.43;QD=33.4285;RBI=0.0252311;REFB=0;REVB=0.0250221;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235339;OID=.;OPOS=166721224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr6	166739646	.	T	C	55.42	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0247281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.779;QD=10.0768;RBI=0.0373434;REFB=-0.0109709;REVB=-0.027983;RO=13;SAF=7;SAR=1;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.500064;STB=0.799127;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0131324;OID=.;OPOS=166739646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:13:14:8:8:0.363636:1:7:6:7:1:7:7:7
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chr6	166755979	.	A	C	108.14	PASS	AF=0.291667;AO=13;DP=47;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0386943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5217;QD=9.01144;RBI=0.048893;REFB=-0.0115679;REVB=-0.0298877;RO=34;SAF=6;SAR=7;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114477;STB=0.591586;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.041673;OID=.;OPOS=166755979;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:34:34:13:14:0.291667:7:6:19:15:8:6:19:15
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chr6	166826255	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.156;QD=46.848;RBI=0.0280007;REFB=0;REVB=-0.0151449;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.03824e-05;OID=.;OPOS=166826255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr6	166826304	.	T	C	341.02	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00820196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.977;QD=54.5633;RBI=0.0093725;REFB=0;REVB=-0.00453561;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.78401e-05;OID=.;OPOS=166826304;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:11:13:0:0:12:13:0:0
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chr6	167571048	.	T	C	1080.54	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00785704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6574;QD=60.0301;RBI=0.0301641;REFB=0;REVB=0.0291228;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151879;OID=.;OPOS=167571048;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:30:42:0:0:30:42:0:0
chr6	167571430	.	A	T	724.24	PASS	AF=0.481013;AO=76;DP=159;FAO=76;FDP=158;FR=.;FRO=82;FSAF=54;FSAR=22;FSRF=49;FSRR=33;FWDB=-0.00845067;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.621;QD=18.3352;RBI=0.0105084;REFB=-0.0166323;REVB=0.00624596;RO=83;SAF=54;SAR=22;SRF=49;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129051;STB=0.567209;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0195473;OID=.;OPOS=167571430;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:158:83:82:76:76:0.481013:22:54:49:34:22:54:49:33
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chr6	167754661	.	A	G	1268.34	PASS	AF=1;AO=71;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=51;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.303;QD=61.125;RBI=0.02354;REFB=0;REVB=0.0151331;RO=0;SAF=43;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00276229;OID=.;OPOS=167754661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:71:83:1:28:43:0:0:32:51:0:0
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chr6	167789493	.	T	C	231.0	PASS	AF=0.45;AO=26;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.000391436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2994;QD=15.4;RBI=0.0327014;REFB=-0.0316969;REVB=0.0326991;RO=33;SAF=10;SAR=16;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273747;STB=0.660078;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.044816;OID=.;OPOS=167789493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:26:27:0.45:16:10:22:11:17:10:22:11
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chr6	167796319	.	T	C	251.84	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0229559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.106;QD=14.814;RBI=0.040402;REFB=-0.00409251;REVB=-0.0332468;RO=39;SAF=17;SAR=12;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202127;STB=0.61438;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0187818;OID=.;OPOS=167796319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:39:39:29:29:0.426471:12:17:15:24:12:17:15:24
chr6	168070084	.	G	A	275.66	PASS	AF=0.705882;AO=24;DP=34;FAO=24;FDP=34;FR=.;FRO=10;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.00161899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.927;QD=32.43;RBI=0.0352848;REFB=-0.0138998;REVB=0.0352476;RO=10;SAF=16;SAR=8;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967546;STB=0.553146;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.000907263;OID=.;OPOS=168070084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:10:10:24:24:0.705882:8:16:5:5:8:16:5:5
chr6	168070293	.	GCCCA	ACCAC,ACCCA	198.99	PASS	AF=0,0.408163;AO=2,18;DP=50;FAO=0,20;FDP=49;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=28;FSAF=0,11;FSAR=0,9;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0483653,-0.0337525;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=153.313,153.781;QD=16.2439;RBI=0.0594649,0.0339374;REFB=-0.0257113,-0.0280477;REVB=-0.0345959,-0.00353789;RO=23;SAF=0,11;SAR=2,7;SRF=12;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.502119,0.0896712;STB=0.5,0.512646;STBP=1,0.889;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0562656;OID=.,.;OPOS=168070293,168070293;OREF=GCCCA,G;OALT=ACCAC,A;OMAPALT=ACCAC,ACCCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:50:49:23:28:2,18:0,20:0,0.408163:2,7:0,11:12:11:0,9:0,11:16:12
chr6	168323664	.	A	G	805.07	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0386564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5039;QD=64.4053;RBI=0.0389265;REFB=0;REVB=-0.00457713;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000522784;OID=.;OPOS=168323664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0
chr6	168343838	.	T	C	1529.27	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2935;QD=63.7195;RBI=0.069264;REFB=0;REVB=0.0304402;RO=0;SAF=51;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317652;OID=.;OPOS=168343838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:45:51:0:0:45:51:0:0
chr6	168349011	.	C	T	651.62	PASS	AF=0.978261;AO=43;DP=45;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0973294;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=33.3325;QD=56.6628;RBI=0.124433;REFB=-0.181417;REVB=0.0775277;RO=2;SAF=21;SAR=22;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000970065;STB=0.511106;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0101184;OID=.;OPOS=168349011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:45:46:2:1:43:45:0.978261:22:21:1:1:22:23:0:1
chr6	168376866	.	T	C	62.25	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0582101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.652;QD=35.5727;RBI=0.0757955;REFB=0;REVB=0.0485443;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00288673;OID=.;OPOS=168376866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr6	168376869	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165909;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=198.468;QD=35.5759;RBI=0.0408615;REFB=0;REVB=0.0373418;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000581934;OID=.;OPOS=168376869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr6	168442765	.	G	A	251.04	PASS	AF=0.365854;AO=30;DP=82;FAO=30;FDP=82;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0139712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.879;QD=12.2457;RBI=0.0635962;REFB=-0.032618;REVB=0.0620426;RO=47;SAF=11;SAR=19;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157186;STB=0.574739;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0819929;OID=.;OPOS=168442765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:47:52:30:30:0.365854:19:11:24:23:19:11:25:27
chr6	168457801	.	A	G	647.95	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000922311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.792;QD=61.7098;RBI=0.0246911;REFB=0;REVB=0.0246739;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.02833e-05;OID=.;OPOS=168457801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:42:0:0:39:42:1:20:19:0:0:21:21:0:0
chr6	168457966	.	G	A	747.4	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.714;QD=56.4072;RBI=0.0387032;REFB=0;REVB=0.0163166;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000523987;OID=.;OPOS=168457966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:32:20:0:0:32:21:0:0
chr6	168459790	.	G	T	1651.06	PASS	AF=0.974576;AO=108;DP=112;FAO=115;FDP=118;FR=.;FRO=3;FSAF=68;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0168391;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=59.3216;QD=55.968;RBI=0.116527;REFB=-0.0743064;REVB=0.115304;RO=4;SAF=65;SAR=43;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00718502;STB=0.501983;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0205236;OID=.;OPOS=168459790;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:112:118:4:3:108:115:0.974576:43:65:2:2:47:68:2:1
chr6	168459792	.	G	A	1593.7	PASS	AF=0.940678;AO=111;DP=118;FAO=111;FDP=118;FR=.;FRO=7;FSAF=65;FSAR=46;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00783701;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=254.531;QD=54.0238;RBI=0.013262;REFB=0.0137264;REVB=0.0106987;RO=7;SAF=65;SAR=46;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149437;STB=0.507885;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=-0.000130688;OID=.;OPOS=168459792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:118:118:7:7:111:111:0.940678:46:65:5:2:46:65:5:2
chr6	168459845	.	G	C	2287.94	PASS	AF=1;AO=151;DP=153;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0807017;FXX=0.00653552;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.566;QD=60.2089;RBI=0.0974206;REFB=-0.115191;REVB=0.0545711;RO=1;SAF=86;SAR=65;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00726167;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337249;OID=.;OPOS=168459845;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:153:152:1:0:151:152:1:65:86:0:1:66:86:0:0
chr6	168479604	.	G	A	1221.93	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.184;QD=61.0963;RBI=0.0618661;REFB=0;REVB=0.051613;RO=0;SAF=47;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34733e-05;OID=.;OPOS=168479604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:32:47:0:0:32:48:0:0
chr6	168482110	.	C	T	1531.48	PASS	AF=1;AO=72;DP=103;FAO=104;FDP=104;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=59;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0804213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.243;QD=58.9031;RBI=0.108618;REFB=0;REVB=0.073009;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130808;OID=.;OPOS=168482110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:104:0:0:72:104:1:29:43:0:0:45:59:0:0
chr6	168482111	.	G	T	128.65	PASS	AF=0.201923;AO=17;DP=100;FAO=21;FDP=104;FR=.;FRO=83;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=52;FSRR=31;FWDB=-0.015802;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.1649;QD=4.94813;RBI=0.0515733;REFB=-0.0515155;REVB=0.0490928;RO=83;SAF=5;SAR=12;SRF=52;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403751;STB=0.723726;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0294933;OID=.;OPOS=168482111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:104:83:83:17:21:0.201923:12:5:52:31:14:7:52:31
chr6	168694594	.	C	T	697.66	PASS	AF=0.5;AO=69;DP=138;FAO=69;FDP=138;FR=.;FRO=69;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.0469727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7538;QD=20.2221;RBI=0.0499925;REFB=0.0154324;REVB=-0.0171119;RO=66;SAF=36;SAR=33;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346574;STB=0.529106;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.013826;OID=.;OPOS=168694594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:66:69:69:69:0.5:33:36:37:29:33:36:40:29
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chr6	169064933	.	T	C	229.9	PASS	AF=0.536585;AO=21;DP=40;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0155324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.69;QD=22.4292;RBI=0.0155856;REFB=-0.0144451;REVB=-0.0012873;RO=19;SAF=11;SAR=10;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0866726;STB=0.55747;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0111971;OID=.;OPOS=169064933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:19:19:21:22:0.536585:10:11:8:11:10:12:8:11
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chr6	170068180	.	A	G	2179.23	PASS	AF=0.992908;AO=137;DP=138;FAO=140;FDP=141;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=78;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0374023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2033;QD=61.8222;RBI=0.0720554;REFB=-0.0779646;REVB=-0.0615877;RO=1;SAF=62;SAR=75;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00760616;STB=0.503999;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00393067;OID=.;OPOS=170068180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:138:141:1:1:137:140:0.992908:75:62:1:0:78:62:1:0
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chr6	170102267	.	A	G	357.78	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0555276;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.3568;QD=55.0425;RBI=0.0557642;REFB=0;REVB=0.00513094;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116013;OID=.;OPOS=170102267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chr6	170103508	.	G	GT	87.34	PASS	AF=0.363636;AO=14;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.00968843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.9992;QD=7.93991;RBI=0.0250076;REFB=-0.0151388;REVB=-0.0230546;RO=30;SAF=8;SAR=6;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156193;STB=0.522699;STBP=0.821;TYPE=ins;VARB=0.0219863;OID=.;OPOS=170103509;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.363636:14:44:16:44:28:8:8:13:15:87:30:8:6:13:17
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chr6	170176146	.	G	A	313.49	PASS	AF=0.402299;AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0152927;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.113;QD=14.4135;RBI=0.0280656;REFB=-0.0343103;REVB=-0.0235332;RO=52;SAF=19;SAR=16;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00465686;STB=0.502644;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.056993;OID=.;OPOS=170176146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:52:52:35:35:0.402299:16:19:28:24:16:19:28:24
chr6	170176467	.	A	G	473.29	PASS	AF=0.516854;AO=46;DP=89;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=36;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=11;FWDB=0.0123388;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.046;QD=21.2715;RBI=0.0137121;REFB=-0.0309474;REVB=0.00598129;RO=40;SAF=36;SAR=10;SRF=30;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0393482;STB=0.526451;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0241147;OID=.;OPOS=170176467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:40:43:46:46:0.516854:10:36:30:10:10:36:32:11
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chr6	170878793	.	T	C	687.25	PASS	AF=0.507463;AO=68;DP=134;FAO=68;FDP=134;FR=.;FRO=66;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=0.0150347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.566;QD=20.5148;RBI=0.0324961;REFB=-0.0164045;REVB=0.0288089;RO=66;SAF=38;SAR=30;SRF=31;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799631;STB=0.54404;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0160231;OID=.;OPOS=170878793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:66:66:68:68:0.507463:30:38:31:35:30:38:31:35
chr6	170887693	.	G	C	102.51	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00770239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.268;QD=17.8274;RBI=0.0253669;REFB=0.0189495;REVB=-0.0241693;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181486;STB=0.604144;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.00899682;OID=.;OPOS=170887693;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:5:7:4:7:5:7:4:7
chr7	299850	.	G	T	1739.92	PASS	AF=0.975;AO=112;DP=116;FAO=117;FDP=120;FR=.;FRO=3;FSAF=62;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0258696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.018;QD=57.9974;RBI=0.0542614;REFB=-0.0916912;REVB=0.0476977;RO=3;SAF=59;SAR=53;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261135;STB=0.513272;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.000309635;OID=.;OPOS=299850;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:116:120:3:3:112:117:0.975:53:59:0:3:55:62:0:3
chr7	299881	.	A	G	1720.67	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9365;QD=60.3742;RBI=0.0511496;REFB=0;REVB=-0.0487878;RO=0;SAF=64;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00033462;OID=.;OPOS=299881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:114:0:0:112:114:1:48:64:0:0:49:65:0:0
chr7	470239	.	A	G	1263.88	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00413871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.669;QD=61.6529;RBI=0.0168959;REFB=0;REVB=-0.0163812;RO=0;SAF=14;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.83601e-05;OID=.;OPOS=470239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:81:82:1:67:14:0:0:67:15:0:0
chr7	470281	.	A	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.215;QD=62.9829;RBI=0.0182401;REFB=0;REVB=0.0151215;RO=0;SAF=6;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.44635e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.077e-05;OID=.;OPOS=470281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:39:6:0:0:39:6:0:0
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chr7	624222	.	A	G	365.76	PASS	AF=0.247934;AO=57;DP=230;FAO=60;FDP=242;FR=.;FRO=182;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=86;FSRR=96;FWDB=0.0152161;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=35.5902;QD=6.04559;RBI=0.0637065;REFB=-0.0421059;REVB=-0.0618627;RO=173;SAF=35;SAR=22;SRF=86;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148391;STB=0.621701;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.186277;OID=.;OPOS=624222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:230:242:173:182:57:60:0.247934:22:35:86:87:22:38:86:96
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chr7	926827	.	T	C	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0179759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.399;QD=59.143;RBI=0.0188787;REFB=0;REVB=0.00576844;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.04059e-05;OID=.;OPOS=926827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0
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chr7	940258	.	G	GGGCAAAGGCA	118.05	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=51;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0164808;FXX=0.0217344;HRUN=4;LEN=10;MLLD=275.987;QD=10.4935;RBI=0.0329599;REFB=-0.00960575;REVB=-0.0285436;RO=35;SAF=7;SAR=4;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15022;STB=0.625241;STBP=0.215;TYPE=ins;VARB=0.0232261;OID=.;OPOS=940259;OREF=-;OALT=GGCAAAGGCA;OMAPALT=GGGCAAAGGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:11:51:15:45:30:11:4:17:13:99:35:7:4:18:17
chr7	995003	.	G	C	169.69	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0226177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.889;QD=16.5553;RBI=0.0482755;REFB=-0.0228226;REVB=0.0426493;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12534;STB=0.555495;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0227041;OID=.;OPOS=995003;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:22:23:18:18:0.439024:10:8:7:15:10:8:8:15
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chr7	1023013	.	C	T	712.54	PASS	AF=1;AO=33;DP=48;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221579;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.6126;QD=54.8104;RBI=0.0362729;REFB=0;REVB=0.0287185;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460799;OID=.;OPOS=1023013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:52:0:0:33:52:1:21:12:0:0:39:13:0:0
chr7	1097409	.	C	G	59.19	PASS	AF=0.136364;AO=9;DP=66;FAO=9;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=50;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0580633;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=32.0811;QD=3.58728;RBI=0.0580678;REFB=-0.0388233;REVB=0.000721568;RO=41;SAF=3;SAR=6;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193048;STB=0.595021;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.085544;OID=.;OPOS=1097409;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:66:66:41:50:9:9:0.136364:6:3:20:21:6:3:22:28
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chr7	1132691	.	C	T	77.08	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00563273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.5322;QD=13.4044;RBI=0.00576996;REFB=-0.0248722;REVB=-0.00125094;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168206;STB=0.599791;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0830529;OID=.;OPOS=1132691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:3:7:7:6:3:7:7:6
chr7	1133171	.	G	T	309.33	PASS	AF=0.542373;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.00735635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.544;QD=20.9718;RBI=0.0461914;REFB=-0.0340506;REVB=0.0456018;RO=23;SAF=19;SAR=13;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816104;STB=0.553159;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0298361;OID=.;OPOS=1133171;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:23:27:32:32:0.542373:13:19:16:7:13:19:19:8
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chr7	1480286	.	G	A	36.15	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0357922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.714;QD=6.57359;RBI=0.0392424;REFB=0.00214882;REVB=-0.0160899;RO=16;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703916;STB=0.545304;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=-0.0038393;OID=.;OPOS=1480286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:3:3:9:7:3:3:9:7
chr7	1481919	.	C	A,G	1019.2	PASS	AF=0.906667,0.0533333;AO=67,5;DP=75;FAO=68,4;FDP=75;FR=.;FRO=3;FSAF=40,0;FSAR=28,4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0236205,-0.066971;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=241.213,16.2375;QD=54.3573;RBI=0.0348881,0.0717101;REFB=-0.124642,-0.115239;REVB=0.0256758,0.0256363;RO=1;SAF=39,1;SAR=28,4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0119641,-0.277405;STB=0.51107,0.995652;STBP=0.409,0.213;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000471029,0.174593;OID=.,.;OPOS=1481919,1481919;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:75:75:1:3:67,5:68,4:0.906667,0.0533333:28,4:39,1:1:0:28,4:40,0:1:2
chr7	1482101	.	C	G	139.88	PASS	AF=0.340426;AO=15;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.0151186;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.135;QD=11.9044;RBI=0.0229063;REFB=-0.0114694;REVB=0.0172084;RO=31;SAF=4;SAR=11;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477683;STB=0.787541;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0233359;OID=.;OPOS=1482101;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:31:31:15:16:0.340426:11:4:22:9:12:4:22:9
chr7	1484572	.	A	G	158.81	PASS	AF=1;AO=2;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.199495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5783;QD=45.3736;RBI=0.207375;REFB=0;REVB=0.0566195;RO=0;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0017723;OID=.;OPOS=1484572;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:2:14:1:1:1:0:0:8:6:0:0
chr7	1484573	.	C	G	53.12	PASS	AF=0.571429;AO=7;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.121586;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.162;QD=15.1766;RBI=0.122891;REFB=-0.0852618;REVB=0.0178607;RO=7;SAF=0;SAR=7;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.817436;STB=0.839066;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00270808;OID=.;OPOS=1484573;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:14:14:7:6:7:8:0.571429:7:0:6:1:7:1:5:1
chr7	1484587	.	C	T	47.11	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0270588;FXX=0.110988;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.544;QD=23.553;RBI=0.0280207;REFB=-0.0445198;REVB=0.0072787;RO=2;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0119475;OID=.;OPOS=1484587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:9:8:2:2:6:6:0.75:3:3:1:1:3:3:1:1
chr7	1486451	.	G	A	735.0	PASS	AF=0.645833;AO=51;DP=97;FAO=62;FDP=96;FR=.;FRO=34;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00637695;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2747;QD=30.625;RBI=0.0478899;REFB=-0.0372415;REVB=0.0474634;RO=32;SAF=27;SAR=24;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429482;STB=0.543905;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0182966;OID=.;OPOS=1486451;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:32:34:51:62:0.645833:24:27:15:17:27:35:15:19
chr7	1574016	.	C	T	364.24	PASS	AF=0.648148;AO=33;DP=58;FAO=35;FDP=54;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0193528;FXX=0.0689536;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.9166;QD=26.9804;RBI=0.0300736;REFB=-0.0329681;REVB=-0.0230193;RO=17;SAF=13;SAR=20;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661362;STB=0.540961;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0282683;OID=.;OPOS=1574016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:54:17:19:33:35:0.648148:20:13:5:12:20:15:6:13
chr7	1588391	.	A	G	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0136125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3866;QD=13.486;RBI=0.0344464;REFB=0.00748425;REVB=0.0316426;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171427;STB=0.599799;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=-0.00330475;OID=.;OPOS=1588391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:3:6:9:2:3:6:9:2
chr7	1588549	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.001;QD=46.8477;RBI=0.0316573;REFB=0;REVB=-0.0283922;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000173101;OID=.;OPOS=1588549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0
chr7	1588768	.	G	A	159.27	PASS	AF=0.666667;AO=15;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0284567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.924;QD=26.5448;RBI=0.134515;REFB=-0.0665154;REVB=0.131471;RO=9;SAF=9;SAR=6;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177944;STB=0.562422;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0201344;OID=.;OPOS=1588768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:9:8:15:16:0.666667:6:9:3:6:7:9:3:5
chr7	1595068	.	G	A	107.39	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0171101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.889;QD=12.6339;RBI=0.06086;REFB=-0.00587272;REVB=-0.0584054;RO=21;SAF=8;SAR=5;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00405815;STB=0.502389;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0131133;OID=.;OPOS=1595068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:5:8:13:8:5:8:13:8
chr7	1878377	.	A	G	120.99	PASS	AF=0.288136;AO=17;DP=59;FAO=17;FDP=59;FR=.;FRO=42;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.0303179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.845;QD=8.20282;RBI=0.0327595;REFB=-0.0122107;REVB=-0.0124101;RO=41;SAF=9;SAR=8;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155203;STB=0.581725;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0243032;OID=.;OPOS=1878377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:41:42:17:17:0.288136:8:9:27:14:8:9:27:15
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chr7	2748803	.	C	T	170.84	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0329929;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.369;QD=16.6675;RBI=0.0520785;REFB=-0.0258335;REVB=0.0402944;RO=23;SAF=8;SAR=10;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333225;STB=0.519104;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0244748;OID=.;OPOS=2748803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:23:23:18:18:0.439024:10:8:11:12:10:8:11:12
chr7	2946461	.	T	C	191.92	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0505071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.444;QD=19.1916;RBI=0.0505859;REFB=-0.0210136;REVB=-0.00282308;RO=20;SAF=11;SAR=8;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116964;STB=0.575681;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0218671;OID=.;OPOS=2946461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:20:20:19:20:0.5:8:11:9:11:8:12:9:11
chr7	2957005	.	T	C	654.76	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211888;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.631;QD=62.3583;RBI=0.0217378;REFB=0;REVB=0.00485451;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.872e-05;OID=.;OPOS=2957005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
chr7	2959172	.	G	A	427.31	PASS	AF=0.436364;AO=48;DP=110;FAO=48;FDP=110;FR=.;FRO=62;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=44;FSRR=18;FWDB=-0.00707729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6798;QD=15.5386;RBI=0.00730516;REFB=0.0231733;REVB=-0.00181035;RO=62;SAF=33;SAR=15;SRF=44;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026268;STB=0.5147;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=-0.030156;OID=.;OPOS=2959172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:62:62:48:48:0.436364:15:33:44:18:15:33:44:18
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chr7	3197788	.	G	C	325.92	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.00763825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.751;QD=17.3823;RBI=0.00960645;REFB=-0.00677047;REVB=-0.00582591;RO=36;SAF=26;SAR=9;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171042;STB=0.576131;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00416104;OID=.;OPOS=3197788;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:36:40:35:35:0.466667:9:26:21:15:9:26:25:15
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chr7	5105133	.	C	T	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.00634954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.107;QD=21.0138;RBI=0.00808988;REFB=-0.0326716;REVB=-0.00501294;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175522;STB=0.599822;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0253948;OID=.;OPOS=5105133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:5:6:2:5:5:6:2:5
chr7	5112035	.	C	T	114.04	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.0235674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1028;QD=18.2457;RBI=0.111663;REFB=-0.00606583;REVB=0.109148;RO=12;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365471;STB=0.708774;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00800389;OID=.;OPOS=5112035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:9:4:9:3:9:4:9:3
chr7	5161512	.	G	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00444626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.058;QD=59.0187;RBI=0.0462449;REFB=0;REVB=0.0460307;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127194;OID=.;OPOS=5161512;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr7	5254227	.	C	G	1836.56	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.063764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1231;QD=61.2188;RBI=0.077191;REFB=0;REVB=0.043504;RO=0;SAF=75;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.63924e-05;OID=.;OPOS=5254227;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:120:0:0:119:120:1:44:75:0:0:44:76:0:0
chr7	5271656	.	GCTTCC	G	169.02	PASS	AF=0.372881;AO=19;DP=52;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0124289;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=5;MLLD=200.614;QD=11.4588;RBI=0.0126322;REFB=-0.017514;REVB=-0.00225676;RO=25;SAF=9;SAR=10;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853572;STB=0.64693;STBP=0.093;TYPE=del;VARB=0.040224;OID=.;OPOS=5271657;OREF=CTTCC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.372881:19:52:22:59:37:9:13:24:13:99:25:9:10:14:11
chr7	5327564	.	G	A	82.68	PASS	AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0907996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.856;QD=9.18716;RBI=0.0912636;REFB=-0.00499536;REVB=0.00919115;RO=25;SAF=5;SAR=6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119597;STB=0.572733;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0168903;OID=.;OPOS=5327564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:36:36:25:25:11:11:0.305556:6:5:14:11:6:5:14:11
chr7	5338714	.	T	C	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0315501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.047;QD=12.7823;RBI=0.0476969;REFB=-0.0339909;REVB=-0.0357713;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361174;STB=0.707988;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0267299;OID=.;OPOS=5338714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:5:5:2:12:5:5:2:12
chr7	5346735	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0389576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.883;QD=37.4877;RBI=0.0587595;REFB=0;REVB=0.0439884;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135584;OID=.;OPOS=5346735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0
chr7	5353003	.	CGGGGGGA	CGGGGGA,CGGGGGAG	97.55	PASS	AF=0.647059,0.352941;AO=5,4;DP=17;FAO=11,6;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4,6;FSAR=7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.432761,-0.0601647;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=8.02257,67.1892;QD=22.952;RBI=0.447798,0.0625653;REFB=-0.125922,-0.0861067;REVB=0.115071,-0.0171646;RO=3;SAF=0,4;SAR=5,0;SRF=1;SRR=2;SSEN=0.8375,0;SSEP=0.481481,0;SSSB=-0.73361,0.74182;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0927335,0.0151098;OID=.,.;OPOS=5353004,5353009;OREF=G,GA;OALT=-,AG;OMAPALT=CGGGGGA,CGGGGGAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.647059,0.352941:5,4:17:11,6:17:0:4,6:7,0:0:0:23:3:0,4:5,0:1:2
chr7	5427517	.	G	A	90.26	PASS	AF=0.27907;AO=12;DP=43;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0113821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5589;QD=8.39668;RBI=0.0539554;REFB=-0.0062537;REVB=0.0527412;RO=31;SAF=4;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182844;STB=0.61271;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0297617;OID=.;OPOS=5427517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:43:43:31:31:12:12:0.27907:8:4:15:16:8:4:15:16
chr7	5427652	.	G	A	368.01	PASS	AF=0.62;AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0602343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.418;QD=29.4411;RBI=0.0617844;REFB=-0.0229799;REVB=0.013753;RO=19;SAF=17;SAR=14;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12403;STB=0.56808;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0224567;OID=.;OPOS=5427652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:19:19:31:31:0.62:14:17:7:12:14:17:7:12
chr7	5427720	.	A	G	464.73	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00721025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4143;QD=58.091;RBI=0.0292353;REFB=0;REVB=-0.0283323;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111344;OID=.;OPOS=5427720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr7	5434135	.	A	G	753.95	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0355067;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.3208;QD=56.9021;RBI=0.0586492;REFB=0;REVB=0.0466798;RO=1;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229599;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.26204e-05;OID=.;OPOS=5434135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:1:0:51:53:1:20:31:0:1:22:31:0:0
chr7	5459984	.	T	C	1532.0	PASS	AF=0.508306;AO=152;DP=300;FAO=153;FDP=301;FR=.;FRO=148;FSAF=75;FSAR=78;FSRF=83;FSRR=65;FWDB=-0.033825;FXX=0.00331115;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8918;QD=20.3588;RBI=0.0338252;REFB=-0.033625;REVB=0.000127075;RO=143;SAF=74;SAR=78;SRF=79;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581138;STB=0.534682;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0327518;OID=.;OPOS=5459984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:300:301:143:148:152:153:0.508306:78:74:79:64:78:75:83:65
chr7	5460452	.	G	C	376.64	PASS	AF=0.365079;AO=46;DP=125;FAO=46;FDP=126;FR=.;FRO=80;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=52;FWDB=0.00547554;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8107;QD=11.9568;RBI=0.0153824;REFB=0.0046184;REVB=-0.0143749;RO=79;SAF=19;SAR=27;SRF=29;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053131;STB=0.555532;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=-0.011632;OID=.;OPOS=5460452;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:126:79:80:46:46:0.365079:27:19:29:50:26:20:28:52
chr7	5467696	.	CA	C,CC	231.96	PASS	AF=0.485294,0.0147059;AO=32,4;DP=72;FAO=33,1;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=18,0;FSAR=15,1;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0168174,-0.00651077;FXX=0.0144907;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=38.2168,41.1771;QD=13.6444;RBI=0.0170558,0.0139125;REFB=-0.0344432,-0.0319572;REVB=0.00284187,0.012295;RO=33;SAF=18,2;SAR=14,2;SRF=22;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0977216,-0.19023;STB=0.567827,0.993222;STBP=0.32,0.232;TYPE=del,snp;VARB=0.104681,0.107298;OID=.,.;OPOS=5467697,5467697;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.485294,0.0147059:32,4:72:33,1:68:34:18,0:15,1:23:11:99:33:18,2:14,2:22:11
chr7	5467858	.	A	G	36.29	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.00790187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.0103;QD=7.25723;RBI=0.117938;REFB=-0.0487089;REVB=-0.117673;RO=14;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159998;STB=0.599699;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.1088;OID=.;OPOS=5467858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:4:2:3:11:4:2:3:11
chr7	5487458	.	T	C	567.59	PASS	AF=1;AO=33;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304363;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.458;QD=59.7466;RBI=0.0572235;REFB=0;REVB=0.0484578;RO=0;SAF=28;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47732e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000626072;OID=.;OPOS=5487458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:33:38:1:5:28:0:0:7:31:0:0
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chr7	5521553	.	G	A	660.38	PASS	AF=0.566372;AO=64;DP=113;FAO=64;FDP=113;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.00352224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.592;QD=23.3764;RBI=0.00854766;REFB=-0.0157125;REVB=-0.00778821;RO=49;SAF=26;SAR=38;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147944;STB=0.580853;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0172724;OID=.;OPOS=5521553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:49:49:64:64:0.566372:38:26:29:20:38:26:29:20
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chr7	5959485	.	G	A	116.67	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.00652732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3022;QD=11.6671;RBI=0.0803031;REFB=-0.0067677;REVB=-0.0800374;RO=26;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.396398;STB=0.733939;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0110311;OID=.;OPOS=5959485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:4:10:9:17:4:10:9:17
chr7	5965334	.	C	T	81.23	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0063444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.843;QD=18.0506;RBI=0.055946;REFB=-0.0376321;REVB=0.0555851;RO=8;SAF=4;SAR=6;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124286;STB=0.571292;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0401181;OID=.;OPOS=5965334;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:6:4:2:6:6:4:2:6
chr7	5983012	.	A	G	110.71	PASS	AF=0.705882;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0169616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.834;QD=26.0488;RBI=0.0297443;REFB=-0.018877;REVB=0.0244342;RO=5;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096601;STB=0.554364;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0188414;OID=.;OPOS=5983012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:17:17:5:5:12:12:0.705882:7:5:3:2:7:5:3:2
chr7	5983070	.	T	C	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0556897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5691;QD=6.81335;RBI=0.0566636;REFB=-0.00579359;REVB=-0.0104604;RO=19;SAF=2;SAR=5;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335034;STB=0.713674;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0189553;OID=.;OPOS=5983070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:5:2:11:8:5:2:11:8
chr7	6026775	.	T	C	726.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102773;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.38;QD=63.1975;RBI=0.0182527;REFB=0;REVB=0.0150844;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.25716e-05;OID=.;OPOS=6026775;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:26:20:0:0:26:20:0:0
chr7	6026942	.	G	T	305.31	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=65;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0105816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5575;QD=18.5037;RBI=0.0349146;REFB=-0.0434568;REVB=0.0332724;RO=33;SAF=17;SAR=15;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151575;STB=0.575435;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.035596;OID=.;OPOS=6026942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:33:33:32:33:0.5:15:17:12:21:16:17:12:21
chr7	6036980	.	G	C	255.49	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0529059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5965;QD=51.0988;RBI=0.0888536;REFB=0;REVB=-0.0713857;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00379717;OID=.;OPOS=6036980;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr7	6043386	.	G	A	233.69	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00148165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.751;QD=24.5991;RBI=0.0202043;REFB=-0.0118164;REVB=-0.0201499;RO=16;SAF=11;SAR=11;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472435;STB=0.526292;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.00784941;OID=.;OPOS=6043386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:11:11:7:9:11:11:7:9
chr7	6043954	.	CAAAAAAAATCTG	AACAAAAAAAATC,CAAAAAAAATC,CAAAAAAATCTG	159.83	PASS	AF=0.0434783,0.347826,0;AO=2,9,7;DP=48;FAO=2,16,0;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=0,6,0;FSAR=2,10,0;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.00876854,-0.00542664,0.0188095;FXX=0.041658;HRUN=1,1,8;LEN=13,2,1;MLLD=239.646,243.493,5.89299;QD=13.8981;RBI=0.00885493,0.00582136,0.0593973;REFB=-0.0200335,-0.0201832,-0.0904938;REVB=-0.00123386,-0.00210709,-0.0563404;RO=19;SAF=0,3,2;SAR=2,6,5;SRF=8;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.485011,-0.103902,-0.169726;STB=0.994059,0.535669,0.5;STBP=0.192,0.753,1;TYPE=mnp,del,del;VARB=0.0721564,0.0254231,0.00976477;OID=.,.,.;OPOS=6043954,6043965,6043955;OREF=CAAAAAAAATCTG,TG,A;OALT=AACAAAAAAAATC,-,-;OMAPALT=AACAAAAAAAATC,CAAAAAAAATC,CAAAAAAATCTG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:48:46:19:28:2,9,7:2,16,0:0.0434783,0.347826,0:2,6,5:0,3,2:8:11:2,10,0:0,6,0:12:16
chr7	6056530	.	G	A	221.17	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.00570542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.405;QD=18.0546;RBI=0.145181;REFB=-0.00439282;REVB=-0.145069;RO=26;SAF=11;SAR=11;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221846;STB=0.632541;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.00435375;OID=.;OPOS=6056530;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:27:22:22:0.44898:11:11:7:19:11:11:7:20
chr7	6066450	.	T	C	657.73	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00173346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1696;QD=59.7938;RBI=0.00983784;REFB=-0.130794;REVB=0.00968391;RO=1;SAF=22;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208679;STB=0.511106;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00841264;OID=.;OPOS=6066450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:21:22:1:0:21:22:1:0
chr7	6066461	.	T	C	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.284;QD=62.021;RBI=0.0325935;REFB=0;REVB=0.00992278;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.62031e-05;OID=.;OPOS=6066461;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr7	6087389	.	C	A	290.25	PASS	AF=1;AO=18;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.178;QD=52.7733;RBI=0.0731399;REFB=0;REVB=0.0712607;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000597317;OID=.;OPOS=6087389;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:18:22:1:9:9:0:0:13:9:0:0
chr7	6087400	.	C	A	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.463;QD=53.9083;RBI=0.0251393;REFB=0;REVB=-0.0200529;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.75973e-05;OID=.;OPOS=6087400;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr7	6087566	.	C	T	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00126743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.807;QD=26.0262;RBI=0.0428648;REFB=0.0495586;REVB=-0.042846;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123249;STB=0.571194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.00836321;OID=.;OPOS=6087566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:3:3:1:0:3:3:1:0
chr7	6088420	.	A	G	207.09	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116045;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0408;QD=48.7274;RBI=0.207135;REFB=0;REVB=0.206809;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00669508;OID=.;OPOS=6088420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr7	6189487	.	C	A	283.55	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00129376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.358;QD=23.1471;RBI=0.00675995;REFB=-0.0322099;REVB=-0.00663499;RO=23;SAF=9;SAR=17;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117456;STB=0.565672;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0312304;OID=.;OPOS=6189487;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:23:26:26:0.530612:17:9:11:12:17:9:11:12
chr7	6193521	.	G	C	50.3	PASS	AF=0.583333;AO=6;DP=11;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00024169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.194;QD=16.7666;RBI=0.0204896;REFB=-0.0215673;REVB=0.0204881;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207272;STB=0.640603;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.014813;OID=.;OPOS=6193521;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:12:5:5:6:7:0.583333:4:2:3:2:5:2:3:2
chr7	6194274	.	T	C	243.92	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0038347;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.756;QD=15.0105;RBI=0.0336603;REFB=-0.0197557;REVB=-0.0334411;RO=37;SAF=18;SAR=10;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107652;STB=0.561156;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0244519;OID=.;OPOS=6194274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:37:37:28:28:0.430769:10:18:20:17:10:18:20:17
chr7	6204999	.	A	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0216007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.937;QD=55.0982;RBI=0.0400838;REFB=0;REVB=0.0337656;RO=0;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.71314e-05;OID=.;OPOS=6204999;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:19:7:0:0:19:7:0:0
chr7	6252291	.	G	A	153.43	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0471281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.714;QD=13.948;RBI=0.0600217;REFB=-0.0221309;REVB=-0.0371691;RO=27;SAF=12;SAR=5;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920473;STB=0.553781;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0415045;OID=.;OPOS=6252291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:27:27:17:17:0.386364:5:12:17:10:5:12:17:10
chr7	6370194	.	C	T	741.96	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296063;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6712;QD=57.0741;RBI=0.0408832;REFB=0;REVB=0.0281941;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000934497;OID=.;OPOS=6370194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0
chr7	6370305	.	C	G,T	264.23	PASS	AF=0.826087,0.130435;AO=17,4;DP=22;FAO=19,3;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=11,3;FSAR=8,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0083462,-0.0080108;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=85.8204,91.2752;QD=45.9531;RBI=0.0513085,0.0260933;REFB=-0.063092,-0.142385;REVB=-0.0506251,-0.0248332;RO=1;SAF=9,4;SAR=8,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0482085,0;STB=0.521716,0.5;STBP=0.513,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0125666,0.0416943;OID=.,.;OPOS=6370305,6370305;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:22:23:1:1:17,4:19,3:0.826087,0.130435:8,0:9,4:1:0:8,0:11,3:1:0
chr7	6370406	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00992644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.372;QD=45.8066;RBI=0.0286525;REFB=0;REVB=0.0268781;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145717;OID=.;OPOS=6370406;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:12:14:1:2:10:0:0:2:12:0:0
chr7	6456302	.	C	T	1453.06	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0843;QD=62.497;RBI=0.0726527;REFB=0;REVB=0.0711398;RO=0;SAF=60;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00226163;OID=.;OPOS=6456302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:93:0:0:91:93:1:31:60:0:0:33:60:0:0
chr7	6461534	.	C	T	257.47	PASS	AF=0.394737;AO=30;DP=77;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0296504;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1712;QD=13.5511;RBI=0.030096;REFB=-0.000435716;REVB=0.00515959;RO=43;SAF=13;SAR=17;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129056;STB=0.592274;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=-1.97307e-06;OID=.;OPOS=6461534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:43:46:30:30:0.394737:17:13:24:19:17:13:27:19
chr7	6502367	.	T	C	50.46	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0295645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0308;QD=16.8191;RBI=0.0685373;REFB=0.00341205;REVB=0.0618329;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121017;STB=0.571224;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00192334;OID=.;OPOS=6502367;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:3:4:2:3:3:4:2:3
chr7	6505901	.	T	C	257.33	PASS	AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.00425108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.791;QD=13.7241;RBI=0.0212035;REFB=-0.00539723;REVB=0.0207729;RO=45;SAF=8;SAR=22;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360751;STB=0.706281;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0147153;OID=.;OPOS=6505901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:45:45:30:30:0.4:22:8:27:18:22:8:27:18
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chr7	6656897	.	A	G	737.12	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0458399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8757;QD=56.7012;RBI=0.0502792;REFB=0;REVB=-0.0206568;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000579399;OID=.;OPOS=6656897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:24:27:0:0:25:27:0:0
chr7	6660790	.	G	A	165.14	PASS	AF=0.377358;AO=19;DP=52;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0186674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.948;QD=12.4634;RBI=0.0285432;REFB=-0.0227355;REVB=-0.0215927;RO=32;SAF=8;SAR=11;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184798;STB=0.596167;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0449877;OID=.;OPOS=6660790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:32:33:19:20:0.377358:11:8:19:13:11:9:20:13
chr7	6713936	.	C	T	239.32	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0156341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.464;QD=20.8107;RBI=0.0297181;REFB=-0.0170928;REVB=0.0252734;RO=23;SAF=14;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155866;STB=0.587709;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00621472;OID=.;OPOS=6713936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:9:14:10:13:9:14:10:13
chr7	6713940	.	CAG	C	200.49	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0145045;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=2;MLLD=238.414;QD=19.5596;RBI=0.0288839;REFB=-0.0407445;REVB=-0.024978;RO=19;SAF=12;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155274;STB=0.588147;STBP=0.336;TYPE=del;VARB=0.0205958;OID=.;OPOS=6713941;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.487805:20:43:20:41:21:12:8:9:12:99:19:12:8:8:11
chr7	6713985	.	A	G	495.21	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.267;QD=58.2597;RBI=0.0562201;REFB=0;REVB=0.0248842;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002094;OID=.;OPOS=6713985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr7	6714028	.	G	A	92.22	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.00296512;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.89;QD=18.4438;RBI=0.00925589;REFB=-0.0128255;REVB=-0.0087681;RO=9;SAF=6;SAR=5;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249998;STB=0.642612;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00934023;OID=.;OPOS=6714028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:5:6:2:7:5:6:2:7
chr7	6859453	.	C	G	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0675471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6917;QD=12.8606;RBI=0.0795735;REFB=0.00353886;REVB=0.0420635;RO=8;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397415;STB=0.523743;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.00415954;OID=.;OPOS=6859453;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:5:2:2:6:5:2:2:6
chr7	7283569	.	G	A	151.54	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0269101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8926;QD=12.8971;RBI=0.0714296;REFB=0.00384615;REVB=-0.0661667;RO=30;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248868;STB=0.644286;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.010459;OID=.;OPOS=7283569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:30:17:17:0.361702:8:9:9:21:8:9:9:21
chr7	7283688	.	T	A	144.77	PASS	AF=0.307692;AO=20;DP=65;FAO=20;FDP=65;FR=.;FRO=45;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=0.0136749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.291;QD=8.9091;RBI=0.0165178;REFB=-0.0150325;REVB=-0.00926475;RO=45;SAF=11;SAR=9;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249915;STB=0.64692;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0321701;OID=.;OPOS=7283688;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:45:45:20:20:0.307692:9:11:15:30:9:11:15:30
chr7	7571094	.	G	C	1475.35	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00949185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.701;QD=62.781;RBI=0.0368172;REFB=0;REVB=0.0355727;RO=0;SAF=56;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.483e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.79871e-05;OID=.;OPOS=7571094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:94:0:0:90:94:1:34:56:0:0:35:59:0:0
chr7	7646651	.	G	T	1026.4	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.823;QD=59.5012;RBI=0.0300303;REFB=0;REVB=-0.0262576;RO=0;SAF=32;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172925;OID=.;OPOS=7646651;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:37:32:0:0:37:32:0:0
chr7	8125964	.	C	T	1200.77	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00567887;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.981;QD=58.5741;RBI=0.0245015;REFB=-0.0460144;REVB=0.0238343;RO=1;SAF=34;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137211;STB=0.514282;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.000322212;OID=.;OPOS=8125964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:1:2:80:80:0.97561:46:34:1:0:46:34:2:0
chr7	8132252	.	T	C	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0091737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.722;QD=58.4194;RBI=0.0108792;REFB=0;REVB=0.0058481;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2446e-05;OID=.;OPOS=8132252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0
chr7	8196529	.	A	T	905.89	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00645506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.533;QD=56.6178;RBI=0.0175467;REFB=-0.103985;REVB=-0.0163162;RO=1;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160049;STB=0.508472;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000288537;OID=.;OPOS=8196529;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:29:34:0:1:29:34:0:1
chr7	8196566	.	AAAAAAAAAAAAAAAAAAAG	A,AA,AAAAAGAAAGAAAGAAAGAA,AAAGAAAAAGAAAAGAAAAG	382.8	PASS	AF=0.689655,0,0.241379,0.0689655;AO=10,5,2,2;DP=26;FAO=20,0,7,2;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0,5,2;FSAR=6,0,2,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0256652,-0.0265992,-0.0280352,-0.0272509;FXX=0.340832;HRUN=25,25,25,25;LEN=19,18,15,12;MLLD=172.84,171.854,94.9577,96.7951;QD=52.7994;RBI=0.0256652,0.0265998,0.0282864,0.0276095;REFB=0,0,0,0;REVB=3.92309e-05,0.000171951,-0.00376202,-0.00443539;RO=0;SAF=6,4,0,2;SAR=4,1,2,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,mnp,mnp;VARB=0.00812708,0.00209622,-0.00651113,0.0225962;OID=.,.,.,.;OPOS=8196567,8196568,8196571,8196569;OREF=AAAAAAAAAAAAAAAAAAG,AAAAAAAAAAAAAAAAAG,AAAAAAAAAAAAAAG,AAAAAAAAAAAA;OALT=-,-,GAAAGAAAGAAAGAA,GAAAAAGAAAAG;OMAPALT=A,AA,AAAAAGAAAGAAAGAAAGAA,AAAGAAAAAGAAAAGAAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.689655,0,0.241379,0.0689655:10,5,2,2:26:20,0,7,2:29:0:14,0,5,2:6,0,2,0:0:0:48:0:6,4,0,2:4,1,2,0:0:0
chr7	8196594	.	AAAG	A	54.68	PASS	AF=0.245283;AO=10;DP=60;FAO=13;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0099167;FXX=0.145138;HRUN=3;LEN=3;MLLD=208.886;QD=4.1269;RBI=0.0107518;REFB=-0.00817039;REVB=-0.00415462;RO=44;SAF=6;SAR=4;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175684;STB=0.596061;STBP=0.5;TYPE=del;VARB=0.0211048;OID=.;OPOS=8196595;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.245283:10:60:13:53:40:9:4:23:17:54:44:6:4:27:17
chr7	8792148	.	T	C	911.22	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0669504;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9485;QD=55.2257;RBI=0.0678535;REFB=-0.0777936;REVB=-0.0110332;RO=1;SAF=30;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154834;STB=0.50095;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00374328;OID=.;OPOS=8792148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:66:66:1:2:64:64:0.969697:34:30:1:0:34:30:1:1
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chr7	11486891	.	A	G	476.12	PASS	AF=0.505376;AO=47;DP=93;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=35;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.000717982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0927;QD=20.4782;RBI=0.0578372;REFB=-0.0527102;REVB=0.0578327;RO=46;SAF=35;SAR=12;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124491;STB=0.569234;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0436159;OID=.;OPOS=11486891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:46:46:47:47:0.505376:12:35:29:17:12:35:29:17
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chr7	11676551	.	G	T	305.69	PASS	AF=0.391304;AO=34;DP=92;FAO=36;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=40;FSRR=16;FWDB=0.0034149;FXX=0.0315756;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.956;QD=13.2908;RBI=0.0135732;REFB=-0.0239468;REVB=0.0131366;RO=54;SAF=21;SAR=13;SRF=38;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101085;STB=0.551117;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0355145;OID=.;OPOS=11676551;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:54:56:34:36:0.391304:13:21:38:16:13:23:40:16
chr7	12269417	.	C	G	775.44	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=58;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0166129;FXX=0.0344768;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.52;QD=55.3883;RBI=0.027001;REFB=-0.0131825;REVB=0.0212853;RO=1;SAF=28;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165384;STB=0.508769;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000120583;OID=.;OPOS=12269417;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:56:1:1:55:55:0.982143:27:28:1:0:27:28:1:0
chr7	12271997	.	G	A	550.95	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0810213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.0294;QD=59.5624;RBI=0.0810775;REFB=0;REVB=0.00302037;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012717;OID=.;OPOS=12271997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:37:0:0:35:37:1:16:19:0:0:18:19:0:0
chr7	12370794	.	T	C	1375.39	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0944;QD=62.5175;RBI=0.12436;REFB=0;REVB=0.11782;RO=0;SAF=42;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000681687;OID=.;OPOS=12370794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:46:42:0:0:46:42:0:0
chr7	12376811	.	A	C	1050.44	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00122235;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=315.98;QD=58.3578;RBI=0.00491129;REFB=-0.127098;REVB=-0.00475674;RO=1;SAF=26;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178383;STB=0.509431;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.000367039;OID=.;OPOS=12376811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:72:1:1:71:71:0.986111:45:26:1:0:45:26:1:0
chr7	12391319	.	G	T	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.971;QD=64.4149;RBI=0.0401232;REFB=0;REVB=-0.0388338;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.95222e-05;OID=.;OPOS=12391319;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:19:31:0:0:19:31:0:0
chr7	12393966	.	A	G	766.02	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333191;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6259;QD=63.8354;RBI=0.103672;REFB=0;REVB=0.0981718;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158359;OID=.;OPOS=12393966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:17:31:0:0:17:31:0:0
chr7	12393974	.	A	C	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.959;QD=64.1523;RBI=0.0135175;REFB=0;REVB=-0.00252896;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.04002e-05;OID=.;OPOS=12393974;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:18:31:0:0:18:31:0:0
chr7	12394053	.	G	T	820.19	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0343683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.594;QD=55.6061;RBI=0.0412489;REFB=-0.165654;REVB=-0.0228099;RO=1;SAF=36;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209573;STB=0.511107;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.000760465;OID=.;OPOS=12394053;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:59:1:1:58:58:0.983051:22:36:0:1:22:36:0:1
chr7	12395813	.	T	C	769.45	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.898;QD=56.9959;RBI=0.0263081;REFB=0;REVB=-0.00445865;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178075;OID=.;OPOS=12395813;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:19:35:0:0:19:35:0:0
chr7	12409882	.	G	A	195.8	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00832962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.742;QD=17.8003;RBI=0.0085615;REFB=-0.00730644;REVB=0.00197908;RO=24;SAF=5;SAR=15;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145161;STB=0.583245;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0116059;OID=.;OPOS=12409882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:15:5:9:15:15:5:9:15
chr7	12410112	.	G	A	82.1	PASS	AF=0.297297;AO=10;DP=36;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.00933401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.259;QD=8.87615;RBI=0.0111475;REFB=-0.00465249;REVB=-0.00609458;RO=25;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228014;STB=0.672771;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0084682;OID=.;OPOS=12410112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:36:37:25:26:10:11:0.297297:4:6:10:15:4:7:10:16
chr7	12417407	.	C	T	199.49	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0152008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.218;QD=15.6459;RBI=0.036411;REFB=-0.0234847;REVB=-0.0330862;RO=27;SAF=13;SAR=9;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773359;STB=0.538284;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0292816;OID=.;OPOS=12417407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:27:29:22:22:0.431373:9:13:18:9:9:13:19:10
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chr7	12730503	.	T	G	242.46	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.014824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.155;QD=14.9204;RBI=0.0148244;REFB=-0.00857095;REVB=-0.000115821;RO=37;SAF=10;SAR=18;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0670373;STB=0.537871;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00932933;OID=.;OPOS=12730503;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:18:10:11:26:18:10:11:26
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chr7	14217673	.	G	A	59.81	PASS	AF=0.214286;AO=9;DP=42;FAO=9;FDP=42;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0467829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.434;QD=5.69649;RBI=0.0518916;REFB=-0.00943502;REVB=-0.0224522;RO=33;SAF=4;SAR=5;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193885;STB=0.624732;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.0368635;OID=.;OPOS=14217673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:42:42:33:33:9:9:0.214286:5:4:20:13:5:4:20:13
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chr7	15651770	.	C	T	300.6	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0506192;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3979;QD=50.0992;RBI=0.0507873;REFB=-0.0478481;REVB=0.00412948;RO=1;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543643;STB=0.529386;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00469883;OID=.;OPOS=15651770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:25:24:1:1:23:23:0.958333:8:15:0:1:8:15:0:1
chr7	16129172	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.35;QD=50.4125;RBI=0.134;REFB=0;REVB=0.0467759;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139256;OID=.;OPOS=16129172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:16:3:0:0:16:3:0:0
chr7	16823095	.	G	A	108.68	PASS	AF=0.368421;AO=13;DP=37;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0105534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.682;QD=11.4403;RBI=0.0110929;REFB=-0.0142265;REVB=-0.0034174;RO=24;SAF=11;SAR=2;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.50979;STB=0.813067;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0297783;OID=.;OPOS=16823095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:24:24:13:14:0.368421:2:11:10:14:2:12:10:14
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chr7	16872913	.	G	A	409.52	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=83;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0241303;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4686;QD=19.9766;RBI=0.0601591;REFB=-0.0204497;REVB=-0.0551076;RO=40;SAF=27;SAR=13;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0983606;STB=0.539632;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0185589;OID=.;OPOS=16872913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:40:41:40:41:0.5:13:27:23:17:14:27:24:17
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chr7	19155074	.	T	C	125.68	PASS	AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0109985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.888;QD=9.66797;RBI=0.0119039;REFB=-0.0126329;REVB=-0.0045535;RO=36;SAF=4;SAR=12;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338179;STB=0.703815;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0450611;OID=.;OPOS=19155074;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:36:36:16:16:0.307692:12:4:19:17:12:4:19:17
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chr7	20180717	.	C	G	288.82	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.00379893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.965;QD=16.2715;RBI=0.0052094;REFB=-0.0170621;REVB=-0.00356455;RO=39;SAF=17;SAR=15;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830211;STB=0.546638;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0218969;OID=.;OPOS=20180717;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:15:17:24:15:15:17:24:15
chr7	20198440	.	G	A	1567.07	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.033612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6286;QD=63.9619;RBI=0.0496002;REFB=0;REVB=0.0364748;RO=0;SAF=50;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.8234e-06;OID=.;OPOS=20198440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:47:50:0:0:48:50:0:0
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chr7	20768013	.	G	A	420.56	PASS	AF=0.457447;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=0.00393951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.8599;QD=17.8961;RBI=0.00457734;REFB=-0.00812215;REVB=0.00233073;RO=51;SAF=31;SAR=12;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127141;STB=0.571394;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00810025;OID=.;OPOS=20768013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:51:51:43:43:0.457447:12:31:31:20:12:31:31:20
chr7	20778646	.	G	A	1431.63	PASS	AF=1;AO=81;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.947;QD=62.9287;RBI=0.0251157;REFB=0;REVB=-0.00231947;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.23712e-05;OID=.;OPOS=20778646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:81:91:1:43:38:0:0:46:45:0:0
chr7	20822196	.	A	AC	595.1	PASS	AF=1;AO=51;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.7021;QD=42.5072;RBI=0.220092;REFB=0;REVB=0.187698;RO=7;SAF=28;SAR=23;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00721183;OID=.;OPOS=20822197;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:51:58:56:56:0:32:24:0:0:10:7:28:23:6:1
chr7	20822304	.	C	CA	392.38	PASS	AF=1;AO=32;DP=38;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.069756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.1955;QD=44.8431;RBI=0.0762767;REFB=0;REVB=0.0308584;RO=6;SAF=23;SAR=9;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0761813;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00354832;OID=.;OPOS=20822305;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:32:38:35:35:0:23:12:0:0:7:6:23:9:3:3
chr7	20824614	.	C	T	261.57	PASS	AF=0.47541;AO=24;DP=60;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00341655;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.634;QD=17.152;RBI=0.0137546;REFB=-0.0207152;REVB=0.0133235;RO=29;SAF=18;SAR=6;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150984;STB=0.514888;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0229034;OID=.;OPOS=20824614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:29:32:24:29:0.47541:6:18:18:11:11:18:19:13
chr7	20826452	.	TTTTTA	GTTTTA,TTTTAT,TTTTTAT	358.46	PASS	AF=0.452381,0.0952381,0.285714;AO=19,6,7;DP=51;FAO=19,4,12;FDP=42;FR=.;FRO=7;FSAF=14,4,12;FSAR=5,0,0;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00875565,0.0862225,0.166467;FXX=0.176436;HRUN=6,6,1;LEN=1,2,1;MLLD=172.869,18.1287,16.0514;QD=34.139;RBI=0.0227524,0.0875995,0.267223;REFB=-0.0285443,-0.0500123,-0.0779162;REVB=0.0210002,-0.0154714,-0.209038;RO=5;SAF=14,6,6;SAR=5,0,1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.151063,0.773282,0.413035;STB=0.597048,0.996819,0.99868;STBP=0.14,0.037,0.003;TYPE=snp,mnp,ins;VARB=0.012039,0.0940079,0.212641;OID=.,.,.;OPOS=20826452,20826456,20826458;OREF=T,TA,-;OALT=G,AT,T;OMAPALT=GTTTTA,TTTTAT,TTTTTAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/3:78:51:42:5:7:19,6,7:19,4,12:0.452381,0.0952381,0.285714:5,0,1:14,6,6:2:3:5,0,0:14,4,12:3:4
chr7	21599233	.	C	T	871.66	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0034112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.512;QD=57.1582;RBI=0.00381215;REFB=0;REVB=0.00170184;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00409325;OID=.;OPOS=21599233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:61:0:0:59:61:1:25:34:0:0:25:36:0:0
chr7	21603886	.	A	G	172.12	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0321093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.207;QD=18.1176;RBI=0.0322478;REFB=-0.0442918;REVB=-0.00298569;RO=20;SAF=8;SAR=10;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974848;STB=0.555494;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0420917;OID=.;OPOS=21603886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:10:8:11:9:10:8:11:9
chr7	21628237	.	C	T	1809.18	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192543;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.126;QD=61.3282;RBI=0.0204168;REFB=0;REVB=0.00679098;RO=0;SAF=60;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017248;OID=.;OPOS=21628237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:118:0:0:117:118:1:57:60:0:0:57:61:0:0
chr7	21630982	.	A	G	1556.43	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5246;QD=63.5276;RBI=0.0164559;REFB=0;REVB=0.00781179;RO=0;SAF=58;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294493;OID=.;OPOS=21630982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:98:0:0:96:98:1:38:58:0:0:39:59:0:0
chr7	21640405	.	A	G	1534.89	PASS	AF=0.989796;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0416081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1364;QD=62.6485;RBI=0.0982448;REFB=-0.115802;REVB=0.0889989;RO=0;SAF=55;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505881;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00121796;OID=.;OPOS=21640405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:98:98:0:1:97:97:0.989796:42:55:0:0:42:55:0:1
chr7	21641218	.	G	A	804.89	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2676;QD=64.3909;RBI=0.0166416;REFB=0;REVB=0.0123474;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.37604e-05;OID=.;OPOS=21641218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0
chr7	21659645	.	T	C	1264.29	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00281027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0932;QD=61.6727;RBI=0.0206196;REFB=0;REVB=0.0204272;RO=0;SAF=39;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001191;OID=.;OPOS=21659645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:43:39:0:0:43:39:0:0
chr7	21775443	.	G	A	90.43	PASS	AF=0.26087;AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.00762183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.454;QD=7.86374;RBI=0.0322732;REFB=-0.0285521;REVB=-0.0313603;RO=33;SAF=6;SAR=6;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199952;STB=0.608523;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0967991;OID=.;OPOS=21775443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:46:46:33:34:12:12:0.26087:6:6:22:11:6:6:22:12
chr7	21856151	.	G	A	1556.45	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00342174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.359;QD=59.8635;RBI=0.0803067;REFB=0;REVB=-0.0802338;RO=0;SAF=55;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.55795e-05;OID=.;OPOS=21856151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:49:55:0:0:49:55:0:0
chr7	21901566	.	T	C	710.68	PASS	AF=0.622642;AO=66;DP=107;FAO=66;FDP=106;FR=.;FRO=40;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=10;FWDB=0.0349861;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3602;QD=26.818;RBI=0.0384884;REFB=-0.020693;REVB=0.0160415;RO=38;SAF=33;SAR=33;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160046;STB=0.594312;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0140671;OID=.;OPOS=21901566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:106:38:40:66:66:0.622642:33:33:28:10:33:33:30:10
chr7	21901593	.	G	A	227.26	PASS	AF=0.345679;AO=28;DP=82;FAO=28;FDP=81;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=-0.00731031;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.693;QD=11.2229;RBI=0.0164602;REFB=-0.00472881;REVB=-0.0147478;RO=52;SAF=19;SAR=9;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783423;STB=0.540696;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00944248;OID=.;OPOS=21901593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:52:53:28:28:0.345679:9:19:32:20:9:19:33:20
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chr7	21939032	.	C	A	242.4	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.0065193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5383;QD=14.9167;RBI=0.0317914;REFB=-0.0106556;REVB=0.0311158;RO=37;SAF=15;SAR=13;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171832;STB=0.596799;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0145096;OID=.;OPOS=21939032;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:13:15:26:11:13:15:26:11
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chr7	23751736	.	A	G	267.79	PASS	AF=0.344086;AO=32;DP=93;FAO=32;FDP=93;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=-0.0127317;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.624;QD=11.5177;RBI=0.0298396;REFB=-0.0214788;REVB=-0.0269872;RO=61;SAF=18;SAR=14;SRF=32;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0433526;STB=0.525086;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0388616;OID=.;OPOS=23751736;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:61:61:32:32:0.344086:14:18:32:29:14:18:32:29
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chr7	24325009	.	G	A	282.79	PASS	AF=0.469697;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0249463;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.922;QD=17.1387;RBI=0.032038;REFB=-0.00356407;REVB=0.0201026;RO=35;SAF=8;SAR=23;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187434;STB=0.605884;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0041897;OID=.;OPOS=24325009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:35:35:31:31:0.469697:23:8:15:20:23:8:15:20
chr7	24703298	.	G	A	1080.56	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.023;QD=60.031;RBI=0.0498794;REFB=0;REVB=0.0446438;RO=0;SAF=31;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.58287e-05;OID=.;OPOS=24703298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:41:31:0:0:41:31:0:0
chr7	24758753	.	C	T	300.99	PASS	AF=0.4;AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0115101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.117;QD=14.1641;RBI=0.0280516;REFB=-0.0199622;REVB=-0.0255815;RO=50;SAF=13;SAR=21;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146493;STB=0.577935;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0284142;OID=.;OPOS=24758753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:50:51:34:34:0.4:21:13:26:24:21:13:26:25
chr7	24758795	.	T	C	980.7	PASS	AF=0.971429;AO=67;DP=69;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0731407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5141;QD=56.0401;RBI=0.1017;REFB=0.063624;REVB=0.070664;RO=2;SAF=27;SAR=40;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00551277;STB=0.503067;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-0.0210995;OID=.;OPOS=24758795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:69:70:2:2:67:68:0.971429:40:27:1:1:41:27:1:1
chr7	24758818	.	G	T	214.11	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.0074457;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.904;QD=14.7663;RBI=0.0343501;REFB=-0.0237851;REVB=-0.0335335;RO=32;SAF=8;SAR=17;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187926;STB=0.599917;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0313182;OID=.;OPOS=24758818;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:33:25:25:0.431034:17:8:16:16:17:8:16:17
chr7	24874016	.	C	A	126.64	PASS	AF=0.340909;AO=14;DP=43;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0108822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.795;QD=11.5125;RBI=0.0136426;REFB=-0.00604012;REVB=-0.00822787;RO=29;SAF=6;SAR=8;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176414;STB=0.57821;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.011991;OID=.;OPOS=24874016;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:29:29:14:15:0.340909:8:6:17:12:8:7:17:12
chr7	25181912	.	T	C	1317.01	PASS	AF=1;AO=83;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306193;FXX=0.0333296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.748;QD=60.552;RBI=0.0398082;REFB=0;REVB=0.0254391;RO=0;SAF=47;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000954849;OID=.;OPOS=25181912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:83:87:1:36:47:0:0:37:50:0:0
chr7	25194665	.	G	C	643.8	PASS	AF=0.492424;AO=65;DP=133;FAO=65;FDP=132;FR=.;FRO=67;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=49;FSRR=18;FWDB=0.00204949;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.611;QD=19.5091;RBI=0.0143974;REFB=0.00601816;REVB=0.0142508;RO=66;SAF=40;SAR=25;SRF=49;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127;STB=0.563986;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.00616466;OID=.;OPOS=25194665;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:132:66:67:65:65:0.492424:25:40:49:17:25:40:49:18
chr7	25194753	.	C	T	886.01	PASS	AF=0.444444;AO=95;DP=217;FAO=96;FDP=216;FR=.;FRO=120;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=75;FSRR=45;FWDB=0.0153301;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.453;QD=16.4077;RBI=0.0184844;REFB=-0.0395237;REVB=0.0103276;RO=119;SAF=44;SAR=51;SRF=74;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157942;STB=0.586189;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0366093;OID=.;OPOS=25194753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:217:216:119:120:95:96:0.444444:51:44:74:45:51:45:75:45
chr7	25267934	.	T	C	482.5	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.213;QD=58.4847;RBI=0.12932;REFB=0;REVB=0.102351;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00309307;OID=.;OPOS=25267934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr7	25267963	.	G	C	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00692327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6999;QD=60.6096;RBI=0.0361106;REFB=0;REVB=0.0354407;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000448789;OID=.;OPOS=25267963;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:24:14:0:0:24:14:0:0
chr7	25304395	.	A	G	901.39	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00117367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.263;QD=58.1542;RBI=0.0347892;REFB=0;REVB=0.0347694;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149606;OID=.;OPOS=25304395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:32:30:0:0:32:30:0:0
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chr7	26685934	.	T	C	512.1	PASS	AF=0.404255;AO=56;DP=140;FAO=57;FDP=141;FR=.;FRO=84;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=51;FSRR=33;FWDB=0.00350663;FXX=0.013985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3077;QD=14.5277;RBI=0.0735366;REFB=-0.0219336;REVB=0.073453;RO=79;SAF=33;SAR=23;SRF=50;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474259;STB=0.517315;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0353327;OID=.;OPOS=26685934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:141:79:84:56:57:0.404255:23:33:50:29:24:33:51:33
chr7	26778406	.	A	G	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.338;QD=56.1905;RBI=0.0833286;REFB=0;REVB=0.0735079;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000331583;OID=.;OPOS=26778406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:9:19:0:0:9:19:0:0
chr7	27135314	.	C	T	260.14	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341512;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.935;QD=52.0276;RBI=0.0342317;REFB=0;REVB=-0.00234625;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104992;OID=.;OPOS=27135314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:5:15:0:0:5:15:0:0
chr7	27169093	.	T	G	1431.41	PASS	AF=1;AO=90;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.696;QD=62.2352;RBI=0.0176914;REFB=0;REVB=0.011345;RO=0;SAF=58;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208159;OID=.;OPOS=27169093;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:90:92:1:32:58:0:0:32:60:0:0
chr7	27196069	.	A	C	2205.04	PASS	AF=0.949045;AO=146;DP=157;FAO=149;FDP=157;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=52;FSAR=97;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0685585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9727;QD=56.1795;RBI=0.0789044;REFB=-0.225122;REVB=0.0390594;RO=4;SAF=49;SAR=97;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00487378;STB=0.505339;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00365437;OID=.;OPOS=27196069;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:157:157:4:5:146:149:0.949045:97:49:1:3:97:52:1:4
chr7	27196113	.	C	T	2204.61	PASS	AF=0.928571;AO=152;DP=165;FAO=156;FDP=168;FR=.;FRO=12;FSAF=63;FSAR=93;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.054127;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=50.5768;QD=52.4906;RBI=0.0558865;REFB=-0.0669678;REVB=0.0139131;RO=13;SAF=61;SAR=91;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266684;STB=0.51771;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00494927;OID=.;OPOS=27196113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:165:168:13:12:152:156:0.928571:91:61:3:10:93:63:2:10
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chr7	28997141	.	G	C	325.69	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00203746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8152;QD=24.5801;RBI=0.00635826;REFB=-0.0510016;REVB=-0.00602297;RO=20;SAF=18;SAR=14;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791126;STB=0.53442;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.038439;OID=.;OPOS=28997141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:20:21:32:32:0.603774:14:18:9:11:14:18:10:11
chr7	28997497	.	GCCA	GCA,GCAG	896.18	PASS	AF=1,0;AO=59,3;DP=65;FAO=65,0;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0;FSAR=43,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00404118,-0.091119;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=23.2437,8.44721;QD=55.1492;RBI=0.100537,0.119278;REFB=0,0;REVB=-0.100455,-0.0769708;RO=0;SAF=18,3;SAR=41,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.49224e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.00165666,0;OID=.,.;OPOS=28997498,28997499;OREF=C,CA;OALT=-,AG;OMAPALT=GCA,GCAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:59,3:65:65,0:65:0:22,0:43,0:0:0:5:0:18,3:41,0:0:0
chr7	29070209	.	G	A	144.18	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00804747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.187;QD=24.0296;RBI=0.0150264;REFB=-0.0214038;REVB=-0.0126898;RO=9;SAF=5;SAR=10;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228246;STB=0.628396;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0125372;OID=.;OPOS=29070209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:10:5:6:3:10:5:6:3
chr7	29186576	.	A	G	1396.38	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.377;QD=62.7586;RBI=0.0338988;REFB=0;REVB=0.0238892;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.72846e-05;OID=.;OPOS=29186576;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:43:46:0:0:43:46:0:0
chr7	29523563	.	G	A	1301.19	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0078916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.762;QD=61.9614;RBI=0.0238609;REFB=0;REVB=0.0225181;RO=0;SAF=45;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.54696e-05;OID=.;OPOS=29523563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:39:45:0:0:39:45:0:0
chr7	29605973	.	TCC	TC,TCG	505.07	PASS	AF=0.111111,0.888889;AO=5,29;DP=37;FAO=4,32;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=2,17;FSAR=2,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286652,-0.0395456;FXX=0.0270197;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=18.1976,31.6815;QD=56.1189;RBI=0.0303413,0.0961485;REFB=0,0;REVB=0.0099449,0.0876395;RO=0;SAF=2,15;SAR=3,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.92057e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0540339,-0.00728545;OID=.,.;OPOS=29605974,29605975;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=TC,TCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.111111,0.888889:5,29:37:4,32:36:0:2,17:2,15:0:0:12:0:2,15:3,14:0:0
chr7	29606288	.	C	T	141.34	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0177319;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=334.256;QD=21.7444;RBI=0.0181504;REFB=-0.0151333;REVB=0.00387515;RO=11;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241875;STB=0.636185;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00999078;OID=.;OPOS=29606288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:9:6:8:3:9:6:8:3
chr7	29771597	.	A	C	414.79	PASS	AF=0.443299;AO=43;DP=96;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0181339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1892;QD=17.1049;RBI=0.0544284;REFB=-0.018953;REVB=0.0513187;RO=53;SAF=26;SAR=17;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958187;STB=0.535524;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0233148;OID=.;OPOS=29771597;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:53:54:43:43:0.443299:17:26:27:26:18:25:28:26
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chr7	31682453	.	C	T	1245.95	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6406;QD=61.5284;RBI=0.0399582;REFB=0;REVB=0.0247139;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253574;OID=.;OPOS=31682453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:47:34:0:0:47:34:0:0
chr7	31683410	.	G	A	1415.37	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.158;QD=62.9052;RBI=0.0196124;REFB=0;REVB=0.00509296;RO=0;SAF=53;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.82094e-05;OID=.;OPOS=31683410;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:37:53:0:0:37:53:0:0
chr7	31848706	.	A	G	360.33	PASS	AF=0.41;AO=40;DP=100;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.0106068;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6821;QD=14.4131;RBI=0.0409496;REFB=-0.00924999;REVB=0.039552;RO=57;SAF=21;SAR=19;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351251;STB=0.516626;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=0.00870354;OID=.;OPOS=31848706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:57:59:40:41:0.41:19:21:28:29:19:22:30:29
chr7	31855569	.	G	A	72.33	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0228742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.518;QD=8.50941;RBI=0.0459996;REFB=-0.00481029;REVB=0.039909;RO=24;SAF=2;SAR=8;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.486618;STB=0.7994;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0297301;OID=.;OPOS=31855569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:8:2:15:9:8:2:15:9
chr7	31855578	.	G	A	560.18	PASS	AF=1;AO=31;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.079119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.088;QD=58.9661;RBI=0.0854309;REFB=0;REVB=0.0322275;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146138;OID=.;OPOS=31855578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:31:38:1:14:17:0:0:19:19:0:0
chr7	32209425	.	A	G	1709.85	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00733112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.365;QD=60.5257;RBI=0.0201114;REFB=0;REVB=0.0187276;RO=0;SAF=57;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.06306e-05;OID=.;OPOS=32209425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:56:57:0:0:56:57:0:0
chr7	32209459	.	C	T	1915.34	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00562582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.718;QD=61.7851;RBI=0.0480745;REFB=0;REVB=0.0477442;RO=0;SAF=64;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.56303e-05;OID=.;OPOS=32209459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:124:0:0:123:124:1:59:64:0:0:60:64:0:0
chr7	32338337	.	G	A	477.11	PASS	AF=0.474747;AO=47;DP=100;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=0.0647831;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5588;QD=19.277;RBI=0.075427;REFB=-0.0309731;REVB=0.0386313;RO=52;SAF=23;SAR=24;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117629;STB=0.565303;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0344745;OID=.;OPOS=32338337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:99:52:52:47:47:0.474747:24:23:19:33:24:23:19:33
chr7	32529936	.	G	C	137.82	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.122571;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.1178;QD=19.0097;RBI=0.123277;REFB=-0.0825094;REVB=-0.0131779;RO=13;SAF=6;SAR=9;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802345;STB=0.52171;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0240361;OID=.;OPOS=32529936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:29:13:14:15:15:0.517241:9:6:4:9:9:6:5:9
chr7	32530105	.	G	C	223.64	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=-0.0358932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.002;QD=12.7794;RBI=0.0707244;REFB=-0.0413656;REVB=-0.0609395;RO=38;SAF=12;SAR=15;SRF=30;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347838;STB=0.665521;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0677304;OID=.;OPOS=32530105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:70:38:43:27:27:0.385714:15:12:30:8:15:12:31:12
chr7	32530198	.	AA	TC	120.99	PASS	AF=0.288136;AO=17;DP=59;FAO=17;FDP=59;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0339716;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=112.297;QD=8.20278;RBI=0.0353443;REFB=-0.0114424;REVB=0.00975456;RO=41;SAF=4;SAR=13;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347875;STB=0.718878;STBP=0.034;TYPE=mnp;VARB=0.0249907;OID=.;OPOS=32530198;OREF=AA;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:41:42:17:17:0.288136:13:4:21:20:13:4:22:20
chr7	32598630	.	T	A	136.05	PASS	AF=0.296875;AO=19;DP=64;FAO=19;FDP=64;FR=.;FRO=45;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=-0.0172762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.126;QD=8.50315;RBI=0.0263916;REFB=0.000383777;REVB=0.0199512;RO=45;SAF=6;SAR=13;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135392;STB=0.581307;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.00113688;OID=.;OPOS=32598630;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:45:45:19:19:0.296875:13:6:19:26:13:6:19:26
chr7	32598656	.	C	T	149.36	PASS	AF=0.327869;AO=20;DP=61;FAO=20;FDP=61;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.0230809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.0469;QD=9.79394;RBI=0.0231384;REFB=-0.0132455;REVB=-0.00163025;RO=41;SAF=7;SAR=13;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197096;STB=0.511616;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.0340883;OID=.;OPOS=32598656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:41:41:20:20:0.327869:13:7:15:26:13:7:15:26
chr7	32613020	.	A	G	385.14	PASS	AF=0.52;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.0303466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6035;QD=20.5408;RBI=0.0376875;REFB=-0.0256772;REVB=-0.0223479;RO=36;SAF=20;SAR=19;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158703;STB=0.587585;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0323407;OID=.;OPOS=32613020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:36:36:39:39:0.52:19:20:25:11:19:20:25:11
chr7	32623477	.	C	G	404.05	PASS	AF=0.442105;AO=42;DP=95;FAO=42;FDP=95;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.0734507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0956;QD=17.0125;RBI=0.0734864;REFB=-0.0209409;REVB=0.00229243;RO=53;SAF=21;SAR=21;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00938083;STB=0.505261;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0177725;OID=.;OPOS=32623477;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:53:53:42:42:0.442105:21:21:27:26:21:21:27:26
chr7	32623796	.	C	T	747.57	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.859;QD=63.6232;RBI=0.0271174;REFB=0;REVB=0.00470906;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44481e-05;OID=.;OPOS=32623796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
chr7	32908135	.	C	G	173.03	PASS	AF=0.360656;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0278897;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.68;QD=11.346;RBI=0.0289935;REFB=-0.0121075;REVB=-0.00792413;RO=39;SAF=12;SAR=10;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207359;STB=0.512037;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.030505;OID=.;OPOS=32908135;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:39:39:22:22:0.360656:10:12:22:17:10:12:22:17
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chr7	33003171	.	G	A	187.39	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.013251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.101;QD=14.6973;RBI=0.0425524;REFB=-0.00349415;REVB=0.0404366;RO=30;SAF=15;SAR=6;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236019;STB=0.636227;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00376688;OID=.;OPOS=33003171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:6:15:15:15:6:15:15:15
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chr7	33054117	.	T	TAAG,TAAGA	242.59	PASS	AF=0,0.952381;AO=5,14;DP=29;FAO=0,20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=0,10;FSAR=0,10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000187152,-0.002529;FXX=0.0454339;HRUN=3,3;LEN=3,4;MLLD=127.152,230.972;QD=46.2083;RBI=0.0856095,0.0937418;REFB=-0.0081284,-0.00722386;REVB=-0.0856093,-0.0937076;RO=6;SAF=2,12;SAR=3,2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.231237,0.176469;STB=0.5,0.523786;STBP=1,0.535;TYPE=ins,ins;VARB=0,-0.000903142;OID=.,.;OPOS=33054118,33054118;OREF=-,-;OALT=AAG,AAGA;OMAPALT=TAAG,TAAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.952381:5,14:29:0,20:21:1:0,10:0,10:1:0:6:6:2,12:3,2:4:2
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chr7	33060946	.	A	G	131.27	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.0614115;FXX=0.0434688;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1131;QD=11.9335;RBI=0.0937071;REFB=-2.93894e-05;REVB=0.0707788;RO=27;SAF=11;SAR=4;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103855;STB=0.535532;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00944584;OID=.;OPOS=33060946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:44:27:29:15:15:0.340909:4:11:20:7:4:11:20:9
chr7	33385852	.	C	T	242.98	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.000848509;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.811;QD=14.9524;RBI=0.11485;REFB=-0.0148624;REVB=-0.114846;RO=35;SAF=15;SAR=13;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638848;STB=0.533827;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0300515;OID=.;OPOS=33385852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:37:28:28:0.430769:13:15:21:14:13:15:22:15
chr7	33388713	.	G	A	377.6	PASS	AF=0.418367;AO=34;DP=94;FAO=41;FDP=98;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=-0.00102447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.944;QD=15.4122;RBI=0.00135701;REFB=-0.0103797;REVB=-0.0008899;RO=56;SAF=16;SAR=18;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320286;STB=0.545157;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.013452;OID=.;OPOS=33388713;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:98:56:57:34:41:0.418367:18:16:28:28:24:17:28:29
chr7	33391089	.	G	A	126.92	PASS	AF=0.309091;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.00866952;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8219;QD=9.23043;RBI=0.0228076;REFB=-0.00962122;REVB=-0.0210956;RO=38;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183823;STB=0.608575;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.022836;OID=.;OPOS=33391089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:38:38:17:17:0.309091:9:8:12:26:9:8:12:26
chr7	33979637	.	A	G	123.27	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0159943;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.648;QD=19.7227;RBI=0.0188178;REFB=-0.0100813;REVB=0.00991427;RO=12;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413789;STB=0.768576;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0070069;OID=.;OPOS=33979637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:25:25:12:11:8:8:0.32:2:6:4:8:2:6:3:8
chr7	34009946	.	C	T	464.89	PASS	AF=0.389706;AO=52;DP=135;FAO=53;FDP=136;FR=.;FRO=83;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=55;FWDB=-0.0824571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.107;QD=13.6731;RBI=0.0912332;REFB=-0.0180055;REVB=-0.0390426;RO=82;SAF=28;SAR=24;SRF=28;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211148;STB=0.626082;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0340232;OID=.;OPOS=34009946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:136:82:83:52:53:0.389706:24:28:28:54:24:29:28:55
chr7	34192762	.	G	C	1246.07	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.175;QD=61.5344;RBI=0.0454117;REFB=0;REVB=0.0421938;RO=0;SAF=55;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136254;OID=.;OPOS=34192762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:25:55:0:0:25:56:0:0
chr7	34818113	.	A	T	353.76	PASS	AF=0.537313;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.0179977;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1257;QD=21.12;RBI=0.0220511;REFB=0.0201501;REVB=0.0127411;RO=31;SAF=23;SAR=13;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0655722;STB=0.522715;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=-0.0180006;OID=.;OPOS=34818113;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:31:31:36:36:0.537313:13:23:22:9:12:24:22:9
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chr7	36320821	.	G	A	1381.97	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324321;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.183;QD=62.817;RBI=0.0351902;REFB=0;REVB=0.0136569;RO=0;SAF=48;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000440594;OID=.;OPOS=36320821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:88:0:0:86:88:1:38:48:0:0:38:50:0:0
chr7	36338749	.	T	C	1525.72	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.018;QD=59.8322;RBI=0.0305733;REFB=0;REVB=0.0249646;RO=0;SAF=60;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.4777e-06;OID=.;OPOS=36338749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:42:60:0:0:42:60:0:0
chr7	36406318	.	A	G	356.54	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=5;FWDB=0.0177932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.706;QD=19.2727;RBI=0.0264925;REFB=-0.00356313;REVB=0.0196279;RO=37;SAF=21;SAR=16;SRF=32;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287745;STB=0.657801;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00419706;OID=.;OPOS=36406318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:16:21:32:5:16:21:32:5
chr7	36438709	.	C	G	126.36	PASS	AF=0.441176;AO=14;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0866081;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.491;QD=14.8656;RBI=0.0872906;REFB=-0.0149458;REVB=0.0108939;RO=20;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00786832;STB=0.549935;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0198729;OID=.;OPOS=36438709;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:19:14:15:0.441176:5:9:13:7:6:9:13:6
chr7	36445856	.	G	A	1132.61	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.717;QD=60.4061;RBI=0.0290906;REFB=0;REVB=-0.00136618;RO=0;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64525e-05;OID=.;OPOS=36445856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:75:0:0:71:75:1:33:38:0:0:33:42:0:0
chr7	36446121	.	A	G	520.4	PASS	AF=0.451613;AO=56;DP=124;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=17;FSAR=39;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.0355783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.524;QD=16.787;RBI=0.0371957;REFB=-0.0147139;REVB=0.0108491;RO=68;SAF=17;SAR=39;SRF=35;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220785;STB=0.62357;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0097734;OID=.;OPOS=36446121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:68:68:56:56:0.451613:39:17:35:33:39:17:35:33
chr7	36447349	.	A	ACTT	802.12	PASS	AF=0.895522;AO=56;DP=68;FAO=60;FDP=67;FR=.;FRO=7;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00386856;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=3;MLLD=246.391;QD=47.8879;RBI=0.0392881;REFB=-0.0724765;REVB=0.0390972;RO=7;SAF=36;SAR=20;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163075;STB=0.510837;STBP=0.632;TYPE=ins;VARB=0.00939602;OID=.;OPOS=36447350;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=ACTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.895522:56:68:60:67:7:37:23:5:2:32:7:36:20:5:2
chr7	36455477	.	T	C	320.1	PASS	AF=0.4375;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0195613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.026;QD=16.0052;RBI=0.019844;REFB=-0.00820993;REVB=-0.00333729;RO=45;SAF=20;SAR=15;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829434;STB=0.546736;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.00706826;OID=.;OPOS=36455477;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:45:45:35:35:0.4375:15:20:22:23:15:20:22:23
chr7	36459067	.	A	G	274.95	PASS	AF=0.462687;AO=30;DP=66;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0163235;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.281;QD=16.4152;RBI=0.0190558;REFB=-0.0300489;REVB=0.00983179;RO=36;SAF=19;SAR=11;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106278;STB=0.547139;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0337413;OID=.;OPOS=36459067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:36:36:30:31:0.462687:11:19:19:17:12:19:19:17
chr7	36492212	.	C	T	600.02	PASS	AF=0.469697;AO=62;DP=133;FAO=62;FDP=132;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=45;FWDB=-0.019241;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.855;QD=18.1825;RBI=0.0193311;REFB=-0.00792857;REVB=0.00186437;RO=67;SAF=28;SAR=34;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103928;STB=0.551055;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00816491;OID=.;OPOS=36492212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:132:67:70:62:62:0.469697:34:28:23:44:34:28:25:45
chr7	36552790	.	G	GT	942.97	PASS	AF=1;AO=79;DP=91;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.6913;QD=42.8624;RBI=0.0332249;REFB=0;REVB=-0.00231628;RO=5;SAF=41;SAR=38;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00912749;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000563467;OID=.;OPOS=36552791;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:79:91:88:88:0:49:39:0:0:18:5:41:38:3:2
chr7	36656001	.	C	T	137.8	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0188135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0912;QD=19.0074;RBI=0.027086;REFB=-0.0397064;REVB=-0.0194861;RO=14;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204528;STB=0.616284;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0292002;OID=.;OPOS=36656001;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:9:6:9:5:9:6:9:5
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chr7	36729757	.	T	C	868.16	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.831;QD=57.877;RBI=0.0227779;REFB=0;REVB=0.012804;RO=0;SAF=43;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001471;OID=.;OPOS=36729757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:17:43:0:0:17:43:0:0
chr7	36763672	.	C	T	192.43	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00126145;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.493;QD=21.9923;RBI=0.0221225;REFB=-0.0177476;REVB=-0.0220865;RO=15;SAF=11;SAR=8;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127839;STB=0.551671;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0137564;OID=.;OPOS=36763672;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:16:19:19:0.542857:8:11:11:4:8:11:11:5
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chr7	37209284	.	G	A	146.01	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0302432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.305;QD=13.5827;RBI=0.0308473;REFB=-0.0035614;REVB=-0.00607503;RO=26;SAF=11;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118371;STB=0.568883;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00540416;OID=.;OPOS=37209284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:6:11:14:12:6:11:14:12
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chr7	38389410	.	G	C	445.79	PASS	AF=0.470588;AO=48;DP=104;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.0302526;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1346;QD=17.4821;RBI=0.0356157;REFB=-0.0225947;REVB=0.0187951;RO=53;SAF=18;SAR=30;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398586;STB=0.528339;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0182228;OID=.;OPOS=38389410;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:102:53:54:48:48:0.470588:30:18:22:31:30:18:23:31
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chr7	38398077	.	T	A	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00445819;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.72;QD=17.1565;RBI=0.0378308;REFB=-0.00896672;REVB=-0.0375672;RO=20;SAF=11;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477634;STB=0.527365;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0102576;OID=.;OPOS=38398077;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:6:11:12:8:6:11:12:8
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chr7	38402496	.	A	G	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.493;QD=57.1062;RBI=0.0332415;REFB=0;REVB=0.0166069;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.34424e-05;OID=.;OPOS=38402496;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:22:33:0:0:22:33:0:0
chr7	38431430	.	A	G	255.48	PASS	AF=0.326316;AO=31;DP=95;FAO=31;FDP=95;FR=.;FRO=64;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=-0.0135487;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.692;QD=10.7569;RBI=0.0135498;REFB=-0.0129246;REVB=0.000173194;RO=61;SAF=11;SAR=20;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142702;STB=0.569349;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0256899;OID=.;OPOS=38431430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:61:64:31:31:0.326316:20:11:29:32:20:11:29:35
chr7	38433726	.	T	G	45.32	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=-0.0191888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.625;QD=8.23988;RBI=0.0337038;REFB=-0.035072;REVB=-0.027708;RO=15;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021674;STB=0.513475;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0814828;OID=.;OPOS=38433726;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:6:1:2:13:6:1:2:13
chr7	38467842	.	A	G	51.64	PASS	AF=0.216216;AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0436711;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2485;QD=5.58323;RBI=0.043701;REFB=-0.0118542;REVB=0.00161656;RO=29;SAF=3;SAR=5;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391828;STB=0.525485;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0350703;OID=.;OPOS=38467842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:38:37:29:29:8:8:0.216216:5:3:10:19:5:3:10:19
chr7	38467923	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.064;QD=55.0976;RBI=0.0486605;REFB=0;REVB=0.047399;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000373064;OID=.;OPOS=38467923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:18:8:0:0:18:8:0:0
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chr7	38780883	.	C	T	1751.72	PASS	AF=0.991453;AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000863792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=327.265;QD=59.8879;RBI=0.00141111;REFB=0.018418;REVB=0.00111584;RO=1;SAF=72;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00655085;STB=0.503448;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.0001776;OID=.;OPOS=38780883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:117:117:1:1:116:116:0.991453:44:72:1:0:44:72:1:0
chr7	38780924	.	T	C	2325.12	PASS	AF=1;AO=152;DP=155;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241821;FXX=0.0192295;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.129;QD=60.7875;RBI=0.0429886;REFB=0;REVB=0.0355422;RO=0;SAF=86;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109695;OID=.;OPOS=38780924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:155:153:0:0:152:153:1:66:86:0:0:67:86:0:0
chr7	39379541	.	GCCCCCCG	GCCCCCCGC,GCCCCCG	43.82	PASS	AF=0.444444,0;AO=5,2;DP=18;FAO=8,0;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=5,0;FSAR=3,0;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0984033,-0.0254498;FXX=0;HRUN=1,6;LEN=1,1;MLLD=18.9956,13.556;QD=9.73885;RBI=0.106859,0.0844888;REFB=-0.10209,-0.152385;REVB=-0.0416599,-0.0805646;RO=8;SAF=3,2;SAR=2,0;SRF=3;SRR=5;SSEN=0,0.666667;SSEP=0,0.769231;SSSB=0.216847,0.634114;STB=0.571247,0.5;STBP=0.584,1;TYPE=ins,del;VARB=0.10793,0;OID=.,.;OPOS=39379549,39379542;OREF=-,C;OALT=C,-;OMAPALT=GCCCCCCGC,GCCCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.444444,0:5,2:18:8,0:18:10:5,0:3,0:5:5:44:8:3,2:2,0:3:5
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chr7	39472708	.	A	G	301.72	PASS	AF=0.432099;AO=33;DP=79;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00676809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.409;QD=14.8999;RBI=0.00753683;REFB=-0.0111564;REVB=0.00331615;RO=43;SAF=25;SAR=8;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342009;STB=0.698702;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.013959;OID=.;OPOS=39472708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:43:46:33:35:0.432099:8:25:19:24:8:27:21:25
chr7	39472846	.	G	A	205.83	PASS	AF=0.456522;AO=22;DP=45;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0392428;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.0208;QD=17.8985;RBI=0.0993255;REFB=-0.0302316;REVB=-0.0912445;RO=23;SAF=14;SAR=8;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268159;STB=0.562439;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0290952;OID=.;OPOS=39472846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:23:25:22:21:0.456522:8:14:14:9:7:14:14:11
chr7	40314243	.	A	G	397.17	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0364534;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1221;QD=56.7386;RBI=0.0403107;REFB=0;REVB=0.0172076;RO=0;SAF=23;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39272e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000220542;OID=.;OPOS=40314243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:5:23:0:0:5:23:0:0
chr7	40899967	.	G	C	136.33	PASS	AF=0.219512;AO=9;DP=43;FAO=9;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.0244884;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.764;QD=13.3;RBI=0.0246554;REFB=-0.0242702;REVB=-0.00286519;RO=26;SAF=4;SAR=5;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38028;STB=0.749559;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0300294;OID=.;OPOS=40899967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:43:41:26:25:9:9:0.219512:5:4:20:6:5:4:20:5
chr7	42950640	.	C	T	920.08	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.036989;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.6128;QD=58.418;RBI=0.0434749;REFB=0;REVB=-0.0228447;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0003551;OID=.;OPOS=42950640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:23:40:0:0:23:40:0:0
chr7	42970733	.	C	T	724.66	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4786;QD=63.0139;RBI=0.0307478;REFB=0;REVB=0.0276579;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145982;OID=.;OPOS=42970733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:24:21:0:0:24:22:0:0
chr7	42976789	.	A	G	1804.07	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.544;QD=61.1548;RBI=0.0500532;REFB=0;REVB=0.045124;RO=0;SAF=59;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.19297e-05;OID=.;OPOS=42976789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:118:0:0:117:118:1:58:59:0:0:58:60:0:0
chr7	42977091	.	G	A	538.36	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300821;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=89.9104;QD=59.8175;RBI=0.0339942;REFB=0;REVB=-0.0158327;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00052511;OID=.;OPOS=42977091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:19:17:0:0:19:17:0:0
chr7	43506059	.	A	G	170.54	PASS	AF=0.349206;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.016984;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4272;QD=10.8279;RBI=0.0545131;REFB=-0.0125198;REVB=-0.0517998;RO=41;SAF=12;SAR=10;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145181;STB=0.584451;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0385186;OID=.;OPOS=43506059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:41:41:22:22:0.349206:10:12:17:24:10:12:17:24
chr7	43506158	.	T	C	173.69	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0287483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.71;QD=12.8661;RBI=0.0384884;REFB=0.0104699;REVB=0.0255908;RO=33;SAF=11;SAR=10;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00917798;STB=0.505295;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=-0.0199057;OID=.;OPOS=43506158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:10:11:17:16:10:11:17:16
chr7	43664280	.	A	G	478.98	PASS	AF=0.397059;AO=54;DP=136;FAO=54;FDP=136;FR=.;FRO=82;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=0.0149831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.419;QD=14.0876;RBI=0.0150936;REFB=-0.00939768;REVB=0.0018227;RO=81;SAF=25;SAR=29;SRF=37;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00660287;STB=0.507125;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0141065;OID=.;OPOS=43664280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:81:82:54:54:0.397059:29:25:37:44:29:25:37:45
chr7	43664625	.	G	T	186.63	PASS	AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0379463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.615;QD=27.6494;RBI=0.0400555;REFB=-0.0111535;REVB=-0.0128266;RO=9;SAF=13;SAR=5;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187339;STB=0.604528;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0120132;OID=.;OPOS=43664625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:27:9:9:18:18:0.666667:5:13:4:5:5:13:4:5
chr7	43664785	.	C	T	223.74	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0171858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.292;QD=19.4552;RBI=0.048861;REFB=-0.0379969;REVB=-0.0457389;RO=24;SAF=13;SAR=9;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327725;STB=0.518502;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0365745;OID=.;OPOS=43664785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:9:13:15:9:9:13:15:9
chr7	43810764	.	G	A	394.51	PASS	AF=0.506329;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0434703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.709;QD=19.9753;RBI=0.0436458;REFB=-0.0259059;REVB=0.00391075;RO=39;SAF=26;SAR=14;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815231;STB=0.545308;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0258701;OID=.;OPOS=43810764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:39:39:40:40:0.506329:14:26:22:17:14:26:22:17
chr7	43906513	.	A	G	143.91	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0724987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.892;QD=15.148;RBI=0.0743091;REFB=-0.0469395;REVB=0.0163028;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131328;STB=0.562422;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0282125;OID=.;OPOS=43906513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:22:16:16:0.421053:7:9:9:12:7:9:10:12
chr7	43916128	.	C	CCT	1316.58	PASS	AF=1;AO=78;DP=103;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177584;FXX=0.115777;HRUN=3;LEN=2;MLLD=276.348;QD=62.6941;RBI=0.0179234;REFB=0;REVB=-0.00242639;RO=20;SAF=40;SAR=38;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525758;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-8.94261e-05;OID=.;OPOS=43916129;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:78:103:84:84:0:43:41:0:0:7:20:40:38:13:7
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chr7	43916138	.	C	G	1337.92	PASS	AF=0.967033;AO=88;DP=91;FAO=88;FDP=91;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0569734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.222;QD=58.8096;RBI=0.0577941;REFB=-0.146436;REVB=0.00970563;RO=3;SAF=46;SAR=42;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00900814;STB=0.504756;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00266161;OID=.;OPOS=43916138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:91:91:3:3:88:88:0.967033:42:46:2:1:42:46:2:1
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chr7	43917013	.	G	A	540.83	PASS	AF=0.478992;AO=57;DP=119;FAO=57;FDP=119;FR=.;FRO=62;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=27;FWDB=0.0478807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.766;QD=18.1792;RBI=0.0494139;REFB=-0.0149293;REVB=-0.0122135;RO=62;SAF=22;SAR=35;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169231;STB=0.593894;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0166336;OID=.;OPOS=43917013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:62:62:57:57:0.478992:35:22:35:27:35:22:35:27
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chr7	43982482	.	A	C	503.95	PASS	AF=0.469565;AO=54;DP=115;FAO=54;FDP=115;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=-0.033399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.821;QD=17.5288;RBI=0.034357;REFB=-0.0266917;REVB=-0.00805652;RO=61;SAF=29;SAR=25;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831163;STB=0.546119;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0261251;OID=.;OPOS=43982482;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:61:61:54:54:0.469565:25:29:38:23:25:29:38:23
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chr7	44047066	.	T	C	231.75	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=-0.0205416;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.99;QD=20.1517;RBI=0.0433033;REFB=-0.0132733;REVB=-0.0381211;RO=23;SAF=6;SAR=16;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120722;STB=0.559537;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0155759;OID=.;OPOS=44047066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:22:23:0.5:16:6:4:19:17:6:4:19
chr7	44148553	.	A	G	1377.5	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.347;QD=62.6136;RBI=0.0472513;REFB=0;REVB=0.00671389;RO=0;SAF=30;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123243;OID=.;OPOS=44148553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:58:30:0:0:58:30:0:0
chr7	44180079	.	A	AG	426.94	PASS	AF=1;AO=34;DP=46;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00603802;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=22.0256;QD=41.6528;RBI=0.0458276;REFB=0;REVB=-0.0454281;RO=11;SAF=12;SAR=22;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00527312;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000500857;OID=.;OPOS=44180080;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:34:46:41:41:0:12:29:0:0:8:11:12:22:4:7
chr7	44180652	.	G	T	267.95	PASS	AF=0.54;AO=25;DP=51;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.00710198;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.749;QD=21.4362;RBI=0.0125592;REFB=-0.0362182;REVB=-0.0103583;RO=14;SAF=14;SAR=11;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552005;STB=0.571603;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0275113;OID=.;OPOS=44180652;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:14:23:25:27:0.54:11:14:9:5:11:16:17:6
chr7	44251833	.	GT	G	33.74	PASS	AF=0.25641;AO=16;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.257897;FXX=0.0249938;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.56557;QD=3.46056;RBI=0.260333;REFB=-0.116036;REVB=0.0355311;RO=21;SAF=6;SAR=10;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267453;STB=0.521696;STBP=0.907;TYPE=del;VARB=0.138385;OID=.;OPOS=44251834;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.25641:16:39:10:39:29:3:7:8:21:33:21:6:10:3:18
chr7	44258994	.	GTTTTTC	GTTTTC,GTTTTCT	50.47	PASS	AF=0.253333,0;AO=8,9;DP=71;FAO=19,0;FDP=75;FR=.;FRO=56;FSAF=17,0;FSAR=2,0;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.0512092,-0.224228;FXX=0.0259707;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=11.3797,22.1648;QD=2.69199;RBI=0.0951784,0.252232;REFB=-0.0635732,-0.0161155;REVB=0.0802281,0.115511;RO=44;SAF=7,9;SAR=1,0;SRF=19;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.537529,0.726407;STB=0.834675,0.5;STBP=0.002,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.117353,0;OID=.,.;OPOS=44258995,44258999;OREF=T,TC;OALT=-,CT;OMAPALT=GTTTTC,GTTTTCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.253333,0:8,9:71:19,0:75:56:17,0:2,0:30:26:51:44:7,9:1,0:19:25
chr7	44259706	.	G	A	703.72	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.635;QD=61.1933;RBI=0.0410483;REFB=0;REVB=0.0170483;RO=1;SAF=21;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218529;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000535509;OID=.;OPOS=44259706;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:46:46:1:0:45:46:1:24:21:1:0:24:22:0:0
chr7	44259871	.	C	T	559.24	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113219;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.881;QD=60.4584;RBI=0.0152598;REFB=0;REVB=-0.0102311;RO=0;SAF=26;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.85852e-05;OID=.;OPOS=44259871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:11:26:0:0:11:26:0:0
chr7	44442296	.	A	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.756;QD=62.3504;RBI=0.0265883;REFB=0;REVB=0.00460711;RO=0;SAF=13;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119969;OID=.;OPOS=44442296;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:30:13:0:0:30:13:0:0
chr7	44574064	.	G	A	303.49	PASS	AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0214281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.041;QD=22.072;RBI=0.0225936;REFB=-0.0262179;REVB=-0.00716273;RO=23;SAF=12;SAR=19;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106339;STB=0.568817;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0153525;OID=.;OPOS=44574064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:23:24:31:31:0.563636:19:12:12:11:19:12:13:11
chr7	44579180	.	G	C	1263.75	PASS	AF=0.988235;AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00437387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3145;QD=59.4707;RBI=0.0972775;REFB=-0.157799;REVB=0.0971791;RO=2;SAF=54;SAR=29;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017218;STB=0.504503;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00226499;OID=.;OPOS=44579180;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:85:85:2:1:83:84:0.988235:29:54:2:0:29:55:1:0
chr7	44612229	.	G	A	1362.57	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0164179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.861;QD=61.239;RBI=0.0214104;REFB=-0.0470626;REVB=0.0137426;RO=1;SAF=48;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116996;STB=0.506171;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0005196;OID=.;OPOS=44612229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:89:1:1:88:88:0.988764:40:48:0:1:40:48:0:1
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chr7	44836314	.	A	G	1817.91	PASS	AF=0.991736;AO=119;DP=120;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0219646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.578;QD=60.0962;RBI=0.0325228;REFB=-0.113118;REVB=0.0239852;RO=1;SAF=41;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605125;STB=0.503144;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00103571;OID=.;OPOS=44836314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:120:121:1:1:119:120:0.991736:78:41:0:1:79:41:0:1
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chr7	45004063	.	T	C	1356.76	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00786668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.473;QD=62.3797;RBI=0.0316854;REFB=0;REVB=0.0306933;RO=0;SAF=48;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.98946e-05;OID=.;OPOS=45004063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:87:0:0:84:87:1:36:48:0:0:39:48:0:0
chr7	45005795	.	G	A	412.85	PASS	AF=0.588235;AO=40;DP=68;FAO=40;FDP=68;FR=.;FRO=28;FSAF=30;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0373653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8303;QD=24.2855;RBI=0.0377854;REFB=-0.0112934;REVB=0.00561856;RO=28;SAF=30;SAR=10;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00900223;OID=.;OPOS=45005795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:28:28:40:40:0.588235:10:30:21:7:10:30:21:7
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chr7	45009723	.	G	A	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.021516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.711;QD=14.1699;RBI=0.0217833;REFB=-0.0273945;REVB=-0.00340205;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160312;STB=0.509415;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0317648;OID=.;OPOS=45009723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:4:6:7:5:4:6:7:5
chr7	45015107	.	G	A	356.47	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.0416781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0321;QD=19.2689;RBI=0.0425405;REFB=-0.0143366;REVB=-0.00852259;RO=37;SAF=17;SAR=20;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245114;STB=0.513626;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0143542;OID=.;OPOS=45015107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:20:17:16:21:20:17:16:21
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chr7	45113170	.	G	A	158.84	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.01234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.447;QD=17.1721;RBI=0.0137777;REFB=-0.00588401;REVB=0.00612781;RO=20;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144153;STB=0.582682;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.00686944;OID=.;OPOS=45113170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:11:6:10:10:11:6:10:10
chr7	45122464	.	A	C	54.84	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0354249;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.48;QD=8.12444;RBI=0.0358281;REFB=-0.00583968;REVB=-0.00535982;RO=18;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0618928;STB=0.518472;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0239849;OID=.;OPOS=45122464;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:28:27:18:19:8:8:0.296296:4:4:10:8:4:4:10:9
chr7	45122723	.	G	A	219.66	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0146978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9355;QD=18.3052;RBI=0.0226454;REFB=-0.0317391;REVB=0.0172275;RO=24;SAF=13;SAR=9;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160733;STB=0.610802;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0407755;OID=.;OPOS=45122723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:26:22:22:0.458333:9:13:10:14:9:13:10:16
chr7	45123090	.	G	A	129.28	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0164549;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=200.784;QD=21.5459;RBI=0.0298254;REFB=0.00234969;REVB=0.0248754;RO=10;SAF=12;SAR=2;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.490824;STB=0.782147;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.00318288;OID=.;OPOS=45123090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:2:12:3:7:2:12:3:7
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chr7	45765234	.	G	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7887;QD=51.916;RBI=0.0367831;REFB=0;REVB=0.0341684;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357587;OID=.;OPOS=45765234;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr7	45932669	.	A	G	282.27	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0458782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.781;QD=22.5818;RBI=0.048667;REFB=-0.0219086;REVB=0.0162379;RO=24;SAF=11;SAR=15;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0668278;STB=0.537354;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0262178;OID=.;OPOS=45932669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:15:11:12:12:15:11:12:12
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chr7	47323456	.	A	G	121.96	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.00532128;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.874;QD=12.8376;RBI=0.0157221;REFB=-0.0189789;REVB=-0.0147943;RO=23;SAF=8;SAR=6;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277372;STB=0.671305;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0206215;OID=.;OPOS=47323456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:24:14:14:0.368421:6:8:7:16:6:8:7:17
chr7	47408029	.	A	G	1557.99	PASS	AF=1;AO=96;DP=99;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257164;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6983;QD=63.5913;RBI=0.0267907;REFB=0;REVB=-0.00751087;RO=0;SAF=36;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259194;OID=.;OPOS=47408029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:98:0:0:96:98:1:60:36:0:0:60:38:0:0
chr7	47408443	.	C	G	104.63	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0337933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.273;QD=19.9291;RBI=0.132788;REFB=-0.070572;REVB=-0.128416;RO=9;SAF=10;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189337;STB=0.609552;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0259721;OID=.;OPOS=47408443;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:2:10:6:3:2:10:6:3
chr7	47408974	.	T	A	805.05	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0675251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.319;QD=64.4036;RBI=0.0675284;REFB=0;REVB=-0.000669349;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133168;OID=.;OPOS=47408974;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:27:23:0:0:27:23:0:0
chr7	47872845	.	A	G	889.43	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236448;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1395;QD=58.3235;RBI=0.0559856;REFB=0;REVB=0.0507475;RO=0;SAF=13;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139333;OID=.;OPOS=47872845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:47:13:0:0:48:13:0:0
chr7	47913579	.	T	C	1194.88	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0117966;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.54;QD=59.7441;RBI=0.0182868;REFB=-0.0939064;REVB=0.0139731;RO=1;SAF=41;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114068;STB=0.506023;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000178792;OID=.;OPOS=47913579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:80:80:1:1:79:79:0.9875:38:41:1:0:38:41:1:0
chr7	47925331	.	C	G	304.54	PASS	AF=0.542373;AO=28;DP=54;FAO=32;FDP=59;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0332486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.68;QD=20.6468;RBI=0.0333802;REFB=-0.03897;REVB=0.00296031;RO=24;SAF=18;SAR=10;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160373;STB=0.531625;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0287015;OID=.;OPOS=47925331;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:59:24:27:28:32:0.542373:10:18:15:9:11:21:16:11
chr7	47968927	.	C	A	118.76	PASS	AF=0.378378;AO=13;DP=36;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00494992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.488;QD=12.8392;RBI=0.00722297;REFB=-0.000486399;REVB=0.00526018;RO=23;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0648377;STB=0.513494;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.00108447;OID=.;OPOS=47968927;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:23:23:13:14:0.378378:7:6:12:11:7:7:12:11
chr7	47971575	.	A	G	312.86	PASS	AF=0.402299;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.00958862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.912;QD=14.3843;RBI=0.0342039;REFB=-0.0244887;REVB=-0.0328324;RO=52;SAF=19;SAR=16;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568711;STB=0.532251;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.0327807;OID=.;OPOS=47971575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:52:52:35:35:0.402299:16:19:31:21:16:19:31:21
chr7	47971626	.	G	A	380.6	PASS	AF=0.5;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0119349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.976;QD=19.5181;RBI=0.0169685;REFB=-0.00733571;REVB=-0.0120618;RO=39;SAF=17;SAR=22;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00998573;OID=.;OPOS=47971626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:39:39:39:39:0.5:22:17:17:22:22:17:17:22
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chr7	48011063	.	A	C	214.09	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0282439;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.485;QD=16.158;RBI=0.0364729;REFB=-0.0264758;REVB=0.0230771;RO=28;SAF=14;SAR=10;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952016;STB=0.54095;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0292825;OID=.;OPOS=48011063;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:28:29:24:24:0.45283:10:14:19:9:10:14:19:10
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chr7	48285485	.	C	T	1200.49	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0010967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.804;QD=58.5604;RBI=0.0248679;REFB=-0.104339;REVB=-0.0248437;RO=2;SAF=54;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172124;STB=0.509089;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.000429798;OID=.;OPOS=48285485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:2:2:80:80:0.97561:26:54:2:0:26:54:2:0
chr7	48312674	.	G	A	786.38	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2405;QD=62.9107;RBI=0.0387532;REFB=0;REVB=-0.0266548;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00340934;OID=.;OPOS=48312674;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:50:0:0:47:50:1:27:20:0:0:27:23:0:0
chr7	48315796	.	C	A	768.37	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.329;QD=54.8833;RBI=0.0468364;REFB=0;REVB=0.0175216;RO=0;SAF=32;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159625;OID=.;OPOS=48315796;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:56:0:0:51:56:1:19:32:0:0:20:36:0:0
chr7	48318811	.	C	T	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0131595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.909;QD=60.6098;RBI=0.0446036;REFB=0;REVB=-0.0426181;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000164185;OID=.;OPOS=48318811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr7	48335451	.	A	G	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00340458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.186;QD=14.7986;RBI=0.0302003;REFB=0.0204167;REVB=0.0300078;RO=13;SAF=8;SAR=3;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264456;STB=0.65544;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=-0.0133001;OID=.;OPOS=48335451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:3:8:6:7:3:8:6:7
chr7	48336844	.	C	T	1398.95	PASS	AF=1;AO=87;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0686085;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2839;QD=62.8744;RBI=0.0708327;REFB=0;REVB=0.0176111;RO=0;SAF=50;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000146859;OID=.;OPOS=48336844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:89:0:0:87:89:1:37:50:0:0:38:51:0:0
chr7	48349647	.	C	T	472.67	PASS	AF=0.358025;AO=58;DP=164;FAO=58;FDP=162;FR=.;FRO=104;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=62;FSRR=42;FWDB=-0.0228804;FXX=0.0181807;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4397;QD=11.6708;RBI=0.0604442;REFB=-0.0204675;REVB=-0.0559462;RO=101;SAF=24;SAR=34;SRF=61;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210091;STB=0.615799;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0315974;OID=.;OPOS=48349647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:162:101:104:58:58:0.358025:34:24:61:40:34:24:62:42
chr7	48443570	.	G	A	205.01	PASS	AF=0.384615;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=1;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.00585528;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2384;QD=12.616;RBI=0.0393448;REFB=0.00507568;REVB=-0.0389067;RO=41;SAF=1;SAR=24;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.736336;STB=0.933124;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.011188;OID=.;OPOS=48443570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:41:40:25:25:0.384615:24:1:24:17:24:1:23:17
chr7	48450157	.	T	C	468.54	PASS	AF=0.480769;AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.00845155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.829;QD=18.0207;RBI=0.0148851;REFB=-0.0155866;REVB=-0.0122531;RO=54;SAF=35;SAR=15;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283622;STB=0.657935;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0175529;OID=.;OPOS=48450157;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:54:54:50:50:0.480769:15:35:22:32:15:35:22:32
chr7	48506566	.	A	G	1661.35	PASS	AF=0.983051;AO=110;DP=112;FAO=116;FDP=118;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00628621;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.957;QD=56.3168;RBI=0.00771988;REFB=-0.0430755;REVB=0.00448107;RO=2;SAF=47;SAR=63;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148309;STB=0.507811;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.000428789;OID=.;OPOS=48506566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:112:118:2:2:110:116:0.983051:63:47:0:2:63:53:0:2
chr7	48506642	.	A	G	1301.28	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.918;QD=61.9658;RBI=0.0185304;REFB=0;REVB=-0.0150258;RO=0;SAF=39;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.20197e-06;OID=.;OPOS=48506642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:84:0:0:82:84:1:43:39:0:0:43:41:0:0
chr7	48545976	.	A	G	1064.59	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00307906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.467;QD=58.3339;RBI=0.0497981;REFB=0.0412298;REVB=0.0497028;RO=1;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116777;STB=0.506171;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.000662621;OID=.;OPOS=48545976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:40:32:0:1:40:32:0:1
chr7	48964322	.	G	T	1699.76	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.34;QD=59.1221;RBI=0.061897;REFB=0;REVB=0.0109324;RO=1;SAF=50;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00939812;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362441;OID=.;OPOS=48964322;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:115:1:0:107:115:1:57:50:1:0:59:56:0:0
chr7	48965000	.	G	A	517.87	PASS	AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0447223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.833;QD=54.5124;RBI=0.0459;REFB=-0.0144671;REVB=0.010331;RO=2;SAF=23;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147385;STB=0.507882;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.000960011;OID=.;OPOS=48965000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:38:2:2:36:36:0.947368:13:23:1:1:13:23:1:1
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chr7	50611735	.	T	C	1658.75	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00737643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8027;QD=60.318;RBI=0.00887345;REFB=0;REVB=0.00493218;RO=0;SAF=49;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.10494e-05;OID=.;OPOS=50611735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:61:49:0:0:61:49:0:0
chr7	50660438	.	T	C	1463.85	PASS	AF=0.971154;AO=101;DP=105;FAO=101;FDP=104;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0123272;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.275;QD=56.3019;RBI=0.0261512;REFB=-0.000842634;REVB=0.0230635;RO=3;SAF=58;SAR=43;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0319487;STB=0.516851;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-2.67672e-05;OID=.;OPOS=50660438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:105:104:3:3:101:101:0.971154:43:58:0:3:43:58:0:3
chr7	50673029	.	T	C	770.53	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0075285;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.367;QD=64.2108;RBI=0.0194453;REFB=0;REVB=0.0179288;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.88487e-05;OID=.;OPOS=50673029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0
chr7	51093013	.	A	T	313.35	PASS	AF=0.96;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0460407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.503;QD=50.1363;RBI=0.0578559;REFB=-0.0614032;REVB=0.0350366;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52379;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00416384;OID=.;OPOS=51093013;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:25:0:1:23:24:0.96:10:13:0:0:10:14:0:1
chr7	51096036	.	G	C	519.88	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00080422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3673;QD=59.4152;RBI=0.0443474;REFB=0;REVB=0.0443401;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000814316;OID=.;OPOS=51096036;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:11:24:0:0:11:24:0:0
chr7	51096974	.	C	T	475.73	PASS	AF=0.420635;AO=53;DP=126;FAO=53;FDP=126;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=-0.00198711;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.498;QD=15.1024;RBI=0.00917479;REFB=-0.0138391;REVB=-0.00895701;RO=72;SAF=26;SAR=27;SRF=36;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00968266;STB=0.50943;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0202139;OID=.;OPOS=51096974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:72:73:53:53:0.420635:27:26:36:36:27:26:37:36
chr7	51097063	.	T	G	1246.09	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.74;QD=61.5353;RBI=0.0460455;REFB=0;REVB=0.0181926;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.92051e-05;OID=.;OPOS=51097063;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:47:34:0:0:47:34:0:0
chr7	51098567	.	GTCTTCT	GTC,GTCT,GTCTTCA	2157.38	PASS	AF=0,0.964029,0.0359712;AO=14,117,7;DP=140;FAO=0,134,5;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=0,62,0;FSAR=0,72,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00619981,0.0180895,0.011344;FXX=0.00714235;HRUN=2,2,2;LEN=4,3,1;MLLD=173.711,199.205,102.482;QD=62.0828;RBI=0.0135314,0.0223008,0.0492809;REFB=0,0,0;REVB=-0.0120275,0.0130421,-0.0479575;RO=0;SAF=11,48,1;SAR=3,69,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0440894,-0.000199966,0.0459613;OID=.,.,.;OPOS=51098570,51098568,51098573;OREF=TTCT,TCT,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=GTC,GTCT,GTCTTCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.964029,0.0359712:14,117,7:140:0,134,5:139:0:0,62,0:0,72,5:0:0:8:0:11,48,1:3,69,6:0:0
chr7	51287470	.	A	G	1026.38	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00701834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5592;QD=59.5003;RBI=0.0102222;REFB=0;REVB=-0.00743209;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.74319e-06;OID=.;OPOS=51287470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:30:39:0:0:30:39:0:0
chr7	53103371	.	G	T	414.19	PASS	AF=0.482759;AO=40;DP=85;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=0.0455243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.2434;QD=19.0434;RBI=0.0835107;REFB=-0.0222642;REVB=0.0700112;RO=42;SAF=19;SAR=21;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197324;STB=0.609468;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0253827;OID=.;OPOS=53103371;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:87:42:45:40:42:0.482759:21:19:29:13:23:19:30:15
chr7	53103382	.	G	T	493.72	PASS	AF=0.494845;AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=0.00233248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.735;QD=20.3594;RBI=0.0374886;REFB=-0.029676;REVB=0.037416;RO=49;SAF=22;SAR=26;SRF=32;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176159;STB=0.597407;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0384379;OID=.;OPOS=53103382;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:49:49:48:48:0.494845:26:22:32:17:26:22:32:17
chr7	53103673	.	C	A	606.94	PASS	AF=0.893617;AO=42;DP=47;FAO=42;FDP=47;FR=.;FRO=5;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0125426;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.002;QD=51.6547;RBI=0.0411183;REFB=0.069573;REVB=0.0391586;RO=5;SAF=24;SAR=18;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0346113;STB=0.51851;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.000786242;OID=.;OPOS=53103673;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:47:47:5:5:42:42:0.893617:18:24:2:3:18:24:2:3
chr7	53104078	.	G	A	253.9	PASS	AF=0.482759;AO=27;DP=57;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=28;FWDB=-0.0370999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9494;QD=17.5101;RBI=0.0379135;REFB=-0.0267798;REVB=0.00781198;RO=30;SAF=2;SAR=25;SRF=2;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0259481;STB=0.509427;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0204116;OID=.;OPOS=53104078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:30:30:27:28:0.482759:25:2:2:28:26:2:2:28
chr7	53433863	.	G	A	786.66	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0703957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.872;QD=64.2168;RBI=0.0777887;REFB=0;REVB=0.0330986;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.85075e-05;OID=.;OPOS=53433863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:19:28:0:0:19:30:0:0
chr7	53557935	.	A	C	450.97	PASS	AF=0.5;AO=43;DP=91;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0629148;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.278;QD=19.6075;RBI=0.0630198;REFB=-0.0133298;REVB=-0.00363789;RO=43;SAF=23;SAR=20;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628688;STB=0.532874;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0141891;OID=.;OPOS=53557935;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:43:46:43:46:0.5:20:23:20:23:20:26:23:23
chr7	53557963	.	A	G	621.35	PASS	AF=0.529915;AO=61;DP=115;FAO=62;FDP=117;FR=.;FRO=55;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.0287382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.998;QD=21.2429;RBI=0.0296081;REFB=-0.000909623;REVB=0.00712412;RO=54;SAF=34;SAR=27;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030625;STB=0.508286;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.000777297;OID=.;OPOS=53557963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:117:54:55:61:62:0.529915:27:34:32:22:27:35:32:23
chr7	53558015	.	G	T	496.53	PASS	AF=0.45;AO=54;DP=119;FAO=54;FDP=120;FR=.;FRO=66;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=35;FWDB=-0.0142544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.124;QD=16.5508;RBI=0.0273523;REFB=-0.0228439;REVB=0.0233444;RO=65;SAF=35;SAR=19;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172957;STB=0.601107;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0201885;OID=.;OPOS=53558015;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:120:65:66:54:54:0.45:19:35:31:34:19:35:31:35
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chr7	57188718	.	T	C	528.54	PASS	AF=0.474576;AO=56;DP=118;FAO=56;FDP=118;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=-0.00160056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7893;QD=17.9167;RBI=0.0114325;REFB=-0.0372124;REVB=-0.0113199;RO=62;SAF=32;SAR=24;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00891864;STB=0.504949;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.034129;OID=.;OPOS=57188718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:62:62:56:56:0.474576:24:32:36:26:24:32:36:26
chr7	57238635	.	G	A	868.18	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4071;QD=57.8789;RBI=0.0226586;REFB=0;REVB=0.00320856;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107253;OID=.;OPOS=57238635;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:29:31:0:0:29:31:0:0
chr7	57242225	.	T	C	583.52	PASS	AF=0.705882;AO=43;DP=69;FAO=48;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00114486;FXX=0.0144907;HRUN=8;LEN=1;MLLD=225.242;QD=34.325;RBI=0.036747;REFB=-0.00117734;REVB=0.0367291;RO=8;SAF=23;SAR=20;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468311;STB=0.51666;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=-0.00118088;OID=.;OPOS=57242225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:69:68:8:12:43:48:0.705882:20:23:3:5:24:24:7:5
chr7	57257162	.	A	C	1115.28	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515852;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.962;QD=60.2855;RBI=0.0544816;REFB=0;REVB=0.0175275;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.21968e-05;OID=.;OPOS=57257162;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:30:42:0:0:30:44:0:0
chr7	57257226	.	G	A	47.72	PASS	AF=0.110092;AO=11;DP=110;FAO=12;FDP=109;FR=.;FRO=97;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=51;FSRR=46;FWDB=-0.0189586;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.288;QD=1.75129;RBI=0.0646966;REFB=-0.0157071;REVB=-0.0618565;RO=97;SAF=5;SAR=6;SRF=52;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961297;STB=0.596491;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0702532;OID=.;OPOS=57257226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:110:109:97:97:11:12:0.110092:6:5:52:45:7:5:51:46
chr7	57528996	.	GT	G,GC	100.11	PASS	AF=0.3,0.7;AO=2,8;DP=10;FAO=3,7;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0,7;FSAR=3,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156754,-0.0145329;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=277.396,291.434;QD=40.0422;RBI=0.0164054,0.0176088;REFB=0,0;REVB=0.00483935,-0.00994304;RO=0;SAF=0,7;SAR=2,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.78849e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00038046,-5.59798e-05;OID=.,.;OPOS=57528997,57528997;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.3,0.7:2,8:10:3,7:10:0:0,7:3,0:0:0:15:0:0,7:2,1:0:0
chr7	57529392	.	A	C	375.48	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00398614;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5456;QD=55.6265;RBI=0.0192551;REFB=0;REVB=-0.018838;RO=1;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371368;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000496106;OID=.;OPOS=57529392;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:1:0:26:27:1:12:14:0:1:13:14:0:0
chr7	63225803	.	T	A	132.63	PASS	AF=0.320755;AO=16;DP=52;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.013213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.376;QD=10.0095;RBI=0.0587372;REFB=-0.022469;REVB=-0.0572318;RO=36;SAF=5;SAR=11;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632864;STB=0.506046;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0644824;OID=.;OPOS=63225803;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:36:36:16:17:0.320755:11:5:13:23:11:6:13:23
chr7	63225842	.	A	T	106.8	PASS	AF=0.253968;AO=16;DP=63;FAO=16;FDP=63;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=35;FWDB=0.0105786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9892;QD=6.78121;RBI=0.0423761;REFB=-0.0123918;REVB=-0.0410344;RO=46;SAF=5;SAR=11;SRF=12;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0757938;STB=0.551497;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0369331;OID=.;OPOS=63225842;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:46:47:16:16:0.253968:11:5:12:34:11:5:12:35
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chr7	63537849	.	G	A	296.72	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.000799742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.235;QD=15.617;RBI=0.0107093;REFB=-0.00601024;REVB=-0.0106793;RO=43;SAF=16;SAR=17;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733688;STB=0.541376;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00685384;OID=.;OPOS=63537849;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:43:43:33:33:0.434211:17:16:24:19:17:16:24:19
chr7	63565953	.	A	C	191.65	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00792033;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.051;QD=15.6447;RBI=0.0115622;REFB=-0.0143472;REVB=0.00842338;RO=27;SAF=12;SAR=8;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0833138;STB=0.570177;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.021198;OID=.;OPOS=63565953;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:29:20:20:0.408163:8:12:14:13:8:12:14:15
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chr7	63808867	.	C	A	39.47	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0132621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.156;QD=13.1573;RBI=0.0300395;REFB=0.0280369;REVB=-0.0269534;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138347;STB=0.583063;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=-0.0796267;OID=.;OPOS=63808867;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:3:3:2:4:3:3:2:4
chr7	63981563	.	A	G	149.1	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00345488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6647;QD=18.6369;RBI=0.00930878;REFB=-0.0169169;REVB=-0.00864391;RO=16;SAF=13;SAR=3;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.429897;STB=0.747449;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0121013;OID=.;OPOS=63981563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:3:13:6:10:3:13:6:10
chr7	64152353	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.734;QD=42.1826;RBI=0.0696789;REFB=0;REVB=0.0431159;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000758704;OID=.;OPOS=64152353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr7	64168205	.	C	A	499.28	PASS	AF=0.516129;AO=48;DP=93;FAO=48;FDP=93;FR=.;FRO=45;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0275714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.232;QD=21.4744;RBI=0.0449954;REFB=-0.0251288;REVB=-0.0355585;RO=45;SAF=25;SAR=23;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0697394;STB=0.53848;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0275319;OID=.;OPOS=64168205;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:45:45:48:48:0.516129:23:25:27:18:23:25:27:18
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chr7	64254901	.	T	C	214.81	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00557485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.3039;QD=47.7353;RBI=0.0417494;REFB=0;REVB=0.0413755;RO=0;SAF=15;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000764636;OID=.;OPOS=64254901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:17:18:1:2:15:0:0:2:16:0:0
chr7	64291333	.	T	A	1270.41	PASS	AF=0.955056;AO=83;DP=88;FAO=85;FDP=89;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0248645;FXX=0.0111099;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.635;QD=57.0973;RBI=0.0270975;REFB=-0.0485994;REVB=-0.0107717;RO=3;SAF=39;SAR=44;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130269;STB=0.500794;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.000386176;OID=.;OPOS=64291333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:88:89:3:4:83:85:0.955056:44:39:2:1:44:41:2:2
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chr7	64389089	.	A	C	250.43	PASS	AF=0.605263;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0309626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7934;QD=26.3612;RBI=0.0737594;REFB=-0.0248347;REVB=0.066946;RO=15;SAF=8;SAR=15;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114146;STB=0.506324;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.016652;OID=.;OPOS=64389089;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:15:15:23:23:0.605263:15:8:5:10:15:8:5:10
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chr7	64451699	.	T	C	1659.33	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.9614;QD=60.3393;RBI=0.0232383;REFB=0;REVB=0.0147914;RO=0;SAF=76;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.8689e-05;OID=.;OPOS=64451699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:34:76:0:0:34:76:0:0
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chr7	64452738	.	G	A	207.85	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0130374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.175;QD=17.6894;RBI=0.0160644;REFB=-0.0091126;REVB=-0.00938566;RO=26;SAF=14;SAR=7;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139197;STB=0.507929;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0177773;OID=.;OPOS=64452738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:7:14:17:9:7:14:17:9
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chr7	64453136	.	G	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.703;QD=53.9104;RBI=0.0265119;REFB=0;REVB=0.0183985;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105963;OID=.;OPOS=64453136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr7	64453615	.	T	C	769.46	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.53;QD=56.9973;RBI=0.0502434;REFB=0;REVB=0.00896507;RO=0;SAF=43;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360234;OID=.;OPOS=64453615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:11:43:0:0:11:43:0:0
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chr7	64864894	.	C	T	102.51	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.00756496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.466;QD=17.8269;RBI=0.0586952;REFB=-0.0114352;REVB=-0.0582057;RO=11;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321591;STB=0.518487;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0265818;OID=.;OPOS=64864894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:5:7:6:5:5:7:6:5
chr7	64864912	.	A	C	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0258579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.612;QD=12.7298;RBI=0.0380012;REFB=0.00714203;REVB=-0.027847;RO=12;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13278;STB=0.578773;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=-0.00367295;OID=.;OPOS=64864912;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:4:5:5:7:4:5:5:7
chr7	64865118	.	A	G	190.7	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=0.0181037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.39;QD=15.2557;RBI=0.0200241;REFB=-0.00515362;REVB=-0.00855699;RO=30;SAF=11;SAR=9;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161656;STB=0.592505;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0068999;OID=.;OPOS=64865118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:30:20:20:0.4:9:11:21:9:9:11:21:9
chr7	64865280	.	G	A	620.18	PASS	AF=0.53913;AO=62;DP=115;FAO=62;FDP=115;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=-0.0456979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.485;QD=21.5713;RBI=0.0462959;REFB=0.00057111;REVB=-0.00741657;RO=53;SAF=32;SAR=30;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579759;STB=0.531785;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=-0.000464758;OID=.;OPOS=64865280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:53:53:62:62:0.53913:30:32:31:22:30:32:31:22
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chr7	65842543	.	C	CAT	817.37	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=63;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00744511;FXX=0.0793525;HRUN=0;LEN=2;MLLD=232.826;QD=56.3707;RBI=0.0461761;REFB=0.00411392;REVB=0.045572;RO=6;SAF=33;SAR=24;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161465;STB=0.510201;STBP=0.322;TYPE=ins;VARB=-1.42037e-05;OID=.;OPOS=65842544;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.982759:57:63:57:58:1:33:24:0:1:4:6:33:24:4:2
chr7	65842545	.	T	C	767.62	PASS	AF=0.919355;AO=57;DP=63;FAO=57;FDP=62;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00463351;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5684;QD=49.5236;RBI=0.00682878;REFB=-0.046421;REVB=-0.00501626;RO=4;SAF=33;SAR=24;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538088;STB=0.518382;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0127735;OID=.;OPOS=65842545;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:63:62:4:5:57:57:0.919355:24:33:4:0:24:33:4:1
chr7	65860213	.	T	TAGAG	454.63	PASS	AF=0.969697;AO=30;DP=34;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00723686;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=4;MLLD=315.195;QD=55.1061;RBI=0.00815334;REFB=-0.038204;REVB=0.00375564;RO=1;SAF=10;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0443379;STB=0.521725;STBP=0.274;TYPE=ins;VARB=2.22014e-05;OID=.;OPOS=65860214;OREF=-;OALT=AGAG;OMAPALT=TAGAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.969697:30:34:32:33:1:11:21:1:0:5:1:10:20:1:0
chr7	65860264	.	CCATAT	C	303.36	PASS	AF=1;AO=24;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00620496;FXX=0;HRUN=2;LEN=5;MLLD=229.446;QD=44.9419;RBI=0.0301166;REFB=0;REVB=0.0294705;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000512624;OID=.;OPOS=65860265;OREF=CATAT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:24:26:27:27:0:6:21:0:0:6:0:6:18:0:0
chr7	66015630	.	C	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0679909;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.692;QD=51.9167;RBI=0.0760484;REFB=0;REVB=0.0340675;RO=0;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.45803e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000466669;OID=.;OPOS=66015630;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:4:17:0:0:4:17:0:0
chr7	66104003	.	C	T	229.38	PASS	AF=0.465517;AO=24;DP=56;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.00170285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.356;QD=15.819;RBI=0.00529495;REFB=-0.0217545;REVB=0.00501366;RO=30;SAF=15;SAR=9;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125562;STB=0.558818;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0229674;OID=.;OPOS=66104003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:30:31:24:27:0.465517:9:15:15:15:11:16:15:16
chr7	66105163	.	C	G	279.6	PASS	AF=0.457143;AO=30;DP=69;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=28;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=-0.0301492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.469;QD=15.9773;RBI=0.0302608;REFB=-0.0029692;REVB=0.00259701;RO=39;SAF=4;SAR=26;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24909;STB=0.656135;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0102058;OID=.;OPOS=66105163;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:39:38:30:32:0.457143:26:4:11:28:28:4:11:27
chr7	66147057	.	T	C	295.22	PASS	AF=0.52459;AO=31;DP=60;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0404803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.711;QD=19.3588;RBI=0.0405325;REFB=-0.0327231;REVB=0.00205724;RO=29;SAF=12;SAR=19;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231116;STB=0.63257;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0147437;OID=.;OPOS=66147057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:29:29:31:32:0.52459:19:12:19:10:20:12:19:10
chr7	66147149	.	A	G	31.58	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00367611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.679;QD=14.0376;RBI=0.0434161;REFB=-0.0261813;REVB=0.0432602;RO=1;SAF=4;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0951258;STB=0.666163;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0182836;OID=.;OPOS=66147149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:1:4:5:5:0.555556:1:4:1:0:1:4:4:0
chr7	66147746	.	C	G	205.97	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0499611;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.6339;QD=16.8137;RBI=0.0601301;REFB=0.00664821;REVB=-0.0334593;RO=26;SAF=10;SAR=11;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134722;STB=0.574398;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=-0.0057622;OID=.;OPOS=66147746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:28:21:21:0.428571:11:10:16:10:11:10:17:11
chr7	66762680	.	CA	C	48.34	PASS	AF=0.395833;AO=18;DP=48;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0685953;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.21263;QD=4.0285;RBI=0.0826689;REFB=-0.0560753;REVB=0.0461393;RO=26;SAF=10;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571009;STB=0.526288;STBP=0.804;TYPE=del;VARB=0.0713267;OID=.;OPOS=66762681;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.395833:18:48:19:48:29:9:10:15:14:48:26:10:8:13:13
chr7	66774604	.	G	C	677.6	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.111;QD=61.6;RBI=0.0280171;REFB=0;REVB=0.00936573;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297476;OID=.;OPOS=66774604;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:15:28:0:0:15:29:0:0
chr7	66785634	.	T	A	152.08	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0307519;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3396;QD=13.5181;RBI=0.0898476;REFB=-0.00402359;REVB=-0.084421;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248103;STB=0.640865;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00556816;OID=.;OPOS=66785634;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:28:17:17:0.377778:10:7:17:9:10:7:18:10
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chr7	68796377	.	G	A	487.5	PASS	AF=0.35503;AO=60;DP=169;FAO=60;FDP=169;FR=.;FRO=109;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=60;FWDB=-0.00918922;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=247.145;QD=11.5385;RBI=0.0351528;REFB=-0.023471;REVB=-0.0339305;RO=106;SAF=32;SAR=28;SRF=47;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100554;STB=0.553877;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0404116;OID=.;OPOS=68796377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:169:106:109:60:60:0.35503:28:32:47:59:28:32:49:60
chr7	70250396	.	C	A	656.66	PASS	AF=0.447853;AO=72;DP=162;FAO=73;FDP=163;FR=.;FRO=90;FSAF=37;FSAR=36;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=-0.0130433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.813;QD=16.1144;RBI=0.0357261;REFB=0.000420128;REVB=-0.03326;RO=90;SAF=36;SAR=36;SRF=46;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110862;STB=0.502353;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=-0.000499678;OID=.;OPOS=70250396;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:163:90:90:72:73:0.447853:36:36:46:44:36:37:46:44
chr7	70597522	.	C	A	2868.21	PASS	AF=1;AO=181;DP=183;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0713229;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5803;QD=63.0375;RBI=0.101788;REFB=0;REVB=0.0726213;RO=0;SAF=97;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239084;OID=.;OPOS=70597522;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:183:182:0:0:181:182:1:84:97:0:0:84:98:0:0
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chr7	71150706	.	A	T	563.19	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.837;QD=59.283;RBI=0.0493246;REFB=0;REVB=-0.0106669;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229685;OID=.;OPOS=71150706;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:21:16:0:0:21:17:0:0
chr7	71252189	.	A	AG	307.84	PASS	AF=1;AO=29;DP=36;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.15784;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.7413;QD=37.3134;RBI=0.231091;REFB=-0.0722013;REVB=-0.168789;RO=6;SAF=14;SAR=15;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00546895;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0128861;OID=.;OPOS=71252190;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:29:36:33:33:0:16:17:0:0:3:6:14:15:3:3
chr7	72312214	.	A	G	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0492264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1572;QD=10.0339;RBI=0.077491;REFB=-0.031183;REVB=0.0598466;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274957;STB=0.517172;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0525857;OID=.;OPOS=72312214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:4:3:2:3:4:3
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chr7	72413494	.	G	A	42.24	PASS	AF=0.181818;AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=33;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=25;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.000708592;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.884;QD=5.11962;RBI=0.0183189;REFB=0.00276053;REVB=-0.0183052;RO=18;SAF=3;SAR=3;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516075;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0242185;OID=.;OPOS=72413494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:34:33:18:25:6:6:0.181818:3:3:9:9:3:3:13:12
chr7	72413874	.	T	C	49.68	PASS	AF=0.177778;AO=8;DP=45;FAO=8;FDP=45;FR=.;FRO=37;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=-0.00175649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.857;QD=4.41637;RBI=0.018854;REFB=-0.00316427;REVB=-0.018772;RO=37;SAF=3;SAR=5;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145195;STB=0.596052;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0100383;OID=.;OPOS=72413874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:45:45:37:37:8:8:0.177778:5:3:10:27:5:3:10:27
chr7	72418963	.	T	C	49.05	PASS	AF=0.163265;AO=8;DP=49;FAO=8;FDP=49;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0258153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4682;QD=4.00432;RBI=0.0392823;REFB=0.00190705;REVB=-0.0296086;RO=41;SAF=4;SAR=4;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104252;STB=0.571254;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=-0.0138097;OID=.;OPOS=72418963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:49:49:41:41:8:8:0.163265:4:4:24:17:4:4:24:17
chr7	72418992	.	C	T	432.36	PASS	AF=0.714286;AO=39;DP=55;FAO=40;FDP=56;FR=.;FRO=16;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.01607;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.2869;QD=30.8831;RBI=0.0646148;REFB=-0.020949;REVB=0.0625845;RO=16;SAF=22;SAR=17;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333825;STB=0.514672;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.00967536;OID=.;OPOS=72418992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:16:16:39:40:0.714286:17:22:10:6:17:23:10:6
chr7	72419059	.	CTTTTTG	CTTTTG,CTTTTGT	34.09	PASS	AF=0.243243,0.0810811;AO=12,4;DP=38;FAO=9,3;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=2,3;FSAR=7,0;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0654063,-0.0238616;FXX=0.0263089;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=9.88844,60.0709;QD=3.68548;RBI=0.0715908,0.0466876;REFB=-0.114414,-0.0290345;REVB=-0.0291078,-0.0401293;RO=19;SAF=2,4;SAR=10,0;SRF=14;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.580599,0.585194;STB=0.815301,0.995269;STBP=0.047,0.159;TYPE=del,mnp;VARB=0.146532,0.020611;OID=.,.;OPOS=72419060,72419064;OREF=T,TG;OALT=-,GT;OMAPALT=CTTTTG,CTTTTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.243243,0.0810811:12,4:38:9,3:37:25:2,3:7,0:17:8:20:19:2,4:10,0:14:5
chr7	72436471	.	C	G	115.1	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0184208;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.918;QD=10.7068;RBI=0.0379782;REFB=-0.0246793;REVB=-0.0332117;RO=29;SAF=5;SAR=9;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220646;STB=0.631917;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0671669;OID=.;OPOS=72436471;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:9:5:16:13:9:5:16:13
chr7	72738749	.	A	G	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0803165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.395;QD=48.7344;RBI=0.0805926;REFB=0;REVB=0.00666545;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000933503;OID=.;OPOS=72738749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr7	72738762	.	CA	TG	134.72	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207786;FXX=0.076864;HRUN=2;LEN=2;MLLD=168.513;QD=44.9081;RBI=0.0226929;REFB=0;REVB=0.00912222;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=4.02823e-05;OID=.;OPOS=72738762;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr7	72884776	.	C	T	218.69	PASS	AF=0.482759;AO=26;DP=56;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.0937895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.2341;QD=15.082;RBI=0.119856;REFB=0.0176393;REVB=0.0746258;RO=30;SAF=6;SAR=20;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00341996;STB=0.534138;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=-0.00807107;OID=.;OPOS=72884776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:30:30:26:28:0.482759:20:6:7:23:20:8:7:23
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chr7	73020301	.	T	C	2053.31	PASS	AF=1;AO=127;DP=127;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00278756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.768;QD=62.2216;RBI=0.00457815;REFB=0;REVB=0.00363166;RO=0;SAF=55;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90143e-05;OID=.;OPOS=73020301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:132:0:0:127:132:1:72:55:0:0:72:60:0:0
chr7	73097238	.	G	A	111.41	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0672017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.533;QD=15.9162;RBI=0.0675248;REFB=-0.00235245;REVB=-0.00659737;RO=15;SAF=9;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274687;STB=0.515899;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.00342957;OID=.;OPOS=73097238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:4:9:10:5:4:9:10:5
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chr7	75441111	.	G	T	108.86	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.000337001;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.556;QD=24.1899;RBI=0.00379849;REFB=-0.044819;REVB=0.00378351;RO=6;SAF=5;SAR=7;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510973;STB=0.528799;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0170327;OID=.;OPOS=75441111;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:7:5:2:4:7:5:2:4
chr7	75442730	.	T	G	1007.54	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0030531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2372;QD=59.267;RBI=0.00793135;REFB=0;REVB=-0.00732017;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.58405e-05;OID=.;OPOS=75442730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:38:30:0:0:38:30:0:0
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chr7	75597545	.	C	T	121.56	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00772603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4048;QD=15.1953;RBI=0.0489557;REFB=-0.0244399;REVB=0.0483422;RO=16;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057851;STB=0.562412;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0333679;OID=.;OPOS=75597545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:18:14:14:0.4375:7:7:9:7:7:7:11:7
chr7	75609677	.	A	G	318.92	PASS	AF=0.692308;AO=26;DP=39;FAO=27;FDP=39;FR=.;FRO=12;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.018409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.868;QD=32.71;RBI=0.0234946;REFB=-0.0163323;REVB=-0.0145981;RO=12;SAF=18;SAR=8;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172108;STB=0.597409;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.00857048;OID=.;OPOS=75609677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:12:12:26:27:0.692308:8:18:5:7:8:19:5:7
chr7	75614953	.	T	C	1316.05	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0331973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.9615;QD=61.9318;RBI=0.108861;REFB=0;REVB=0.103676;RO=0;SAF=38;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00041222;OID=.;OPOS=75614953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:85:0:0:80:85:1:42:38:0:0:47:38:0:0
chr7	75615006	.	C	T	269.27	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.018471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.999;QD=16.5706;RBI=0.0233727;REFB=-0.0254627;REVB=-0.0143215;RO=35;SAF=10;SAR=20;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207403;STB=0.616941;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0213348;OID=.;OPOS=75615006;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:20:10:19:16:20:10:19:16
chr7	75621827	.	A	G	626.76	PASS	AF=0.977273;AO=40;DP=41;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00773328;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.578;QD=56.9784;RBI=0.011058;REFB=0.0907136;REVB=-0.00790417;RO=1;SAF=17;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199568;STB=0.50943;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-1.98133e-06;OID=.;OPOS=75621827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:44:1:1:40:43:0.977273:23:17:0:1:26:17:0:1
chr7	75629778	.	T	C	1040.06	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.068;QD=59.432;RBI=0.0704993;REFB=0;REVB=0.0637413;RO=0;SAF=55;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.17502e-05;OID=.;OPOS=75629778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:63:70:0:0:63:70:1:8:55:0:0:12:58:0:0
chr7	75630274	.	T	C	211.9	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=0.0334873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6184;QD=16.6194;RBI=0.0335368;REFB=-0.00236169;REVB=-0.00182186;RO=28;SAF=18;SAR=5;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347007;STB=0.698841;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00343343;OID=.;OPOS=75630274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:5:18:13:15:5:18:13:15
chr7	75643089	.	G	A	155.51	PASS	AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0125913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.478;QD=15.172;RBI=0.0126323;REFB=-0.0186373;REVB=0.001018;RO=24;SAF=13;SAR=4;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218317;STB=0.627424;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0249463;OID=.;OPOS=75643089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:24:17:17:0.414634:4:13:14:10:4:13:14:10
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chr7	75716804	.	G	A	82.94	PASS	AF=0.150943;AO=16;DP=106;FAO=16;FDP=106;FR=.;FRO=90;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=49;FSRR=41;FWDB=0.0100907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=316.194;QD=3.12997;RBI=0.0208981;REFB=-0.00376197;REVB=-0.0183005;RO=90;SAF=10;SAR=6;SRF=49;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103701;STB=0.570299;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0254365;OID=.;OPOS=75716804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:106:106:90:90:16:16:0.150943:6:10:49:41:6:10:49:41
chr7	75914934	.	G	GC	1032.68	PASS	AF=1;AO=95;DP=130;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0574258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=11.7864;QD=33.0458;RBI=0.297276;REFB=0;REVB=0.291677;RO=29;SAF=53;SAR=42;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279821;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00297979;OID=.;OPOS=75914935;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:95:130:125:125:0:71:54:0:0:21:29:53:42:18:11
chr7	76029695	.	C	T	1209.88	PASS	AF=0.97619;AO=80;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.159462;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8862;QD=57.6134;RBI=0.161744;REFB=-0.221476;REVB=0.0270717;RO=3;SAF=56;SAR=24;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246886;STB=0.508473;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.00354392;OID=.;OPOS=76029695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:3:2:80:82:0.97619:24:56:3:0:24:58:2:0
chr7	76069811	.	T	C	672.66	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596457;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=347.091;QD=62.5729;RBI=0.0628753;REFB=0;REVB=0.0198918;RO=0;SAF=7;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.9155e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.77513e-05;OID=.;OPOS=76069811;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:44:43:1:37:7:0:0:36:7:0:0
chr7	76111835	.	G	A	1608.31	PASS	AF=0.990826;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0307664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.98;QD=59.0204;RBI=0.0324877;REFB=-0.107196;REVB=0.0104346;RO=0;SAF=67;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81585e-08;STB=0.503703;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000295617;OID=.;OPOS=76111835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:109:0:1:108:108:0.990826:41:67:0:0:41:67:1:0
chr7	76112060	.	C	T	635.11	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.136;QD=61.9619;RBI=0.0572735;REFB=0;REVB=0.0293788;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166727;OID=.;OPOS=76112060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:41:0:0:37:41:1:14:23:0:0:14:27:0:0
chr7	76131645	.	A	G	889.11	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.454;QD=57.3617;RBI=0.0476993;REFB=0;REVB=-0.0463873;RO=1;SAF=31;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014984;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104968;OID=.;OPOS=76131645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:1:0:61:62:1:30:31:1:0:30:32:0:0
chr7	76131695	.	A	G	1071.68	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7419;QD=59.5376;RBI=0.0187527;REFB=0;REVB=-0.00919971;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.62033e-05;OID=.;OPOS=76131695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:34:37:0:0:35:37:0:0
chr7	76144455	.	A	C	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0732225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.538;QD=59.8363;RBI=0.0831477;REFB=0;REVB=0.0393954;RO=0;SAF=5;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292742;OID=.;OPOS=76144455;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:31:5:0:0:31:5:0:0
chr7	76144560	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.070324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.156;QD=47.8223;RBI=0.0717623;REFB=0;REVB=0.0142955;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000182933;OID=.;OPOS=76144560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:15:16:1:13:2:0:0:14:2:0:0
chr7	76240785	.	CA	C	688.5	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00143325;FXX=0.0565931;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5582;QD=55.0799;RBI=0.0072141;REFB=0;REVB=0.00707029;RO=0;SAF=42;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81061e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000139215;OID=.;OPOS=76240786;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:50:51:50:50:0:42:8:0:0:4:0:42:8:0:0
chr7	76240888	.	A	G	1023.2	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.178;QD=59.3158;RBI=0.0252556;REFB=0;REVB=0.0121313;RO=0;SAF=55;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122043;OID=.;OPOS=76240888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:69:0:0:67:69:1:12:55:0:0:14:55:0:0
chr7	76885769	.	A	G	71.89	PASS	AF=0.277778;AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.052324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.8761;QD=7.98743;RBI=0.0545573;REFB=-0.0140908;REVB=0.0154497;RO=23;SAF=2;SAR=8;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215424;STB=0.692905;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0489625;OID=.;OPOS=76885769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:36:36:23:26:10:10:0.277778:8:2:8:15:8:2:11:15
chr7	76891485	.	A	G	483.29	PASS	AF=0.505376;AO=47;DP=93;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=0.0164207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.1;QD=20.7867;RBI=0.0216206;REFB=0.000384386;REVB=-0.0140646;RO=46;SAF=32;SAR=15;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247323;STB=0.637209;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.000383604;OID=.;OPOS=76891485;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:46:46:47:47:0.505376:15:32:19:27:15:32:19:27
chr7	77033937	.	A	G	176.16	PASS	AF=0.333333;AO=22;DP=65;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.00319354;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=295.276;QD=10.2124;RBI=0.0217658;REFB=-0.00758978;REVB=-0.0215302;RO=30;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101053;STB=0.514489;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0152538;OID=.;OPOS=77033937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:69:30:46:22:23:0.333333:11:11:12:18:11:12:23:23
chr7	77035392	.	T	C	453.78	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0416744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.454;QD=55.0032;RBI=0.0439091;REFB=-0.075999;REVB=0.0138294;RO=1;SAF=16;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282865;STB=0.515142;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00131798;OID=.;OPOS=77035392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:16:16:1:0:16:16:1:0
chr7	77053084	.	T	C	157.56	PASS	AF=0.64;AO=15;DP=24;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00590474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.509;QD=25.2099;RBI=0.0404275;REFB=0.0123956;REVB=0.0399939;RO=9;SAF=4;SAR=11;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139671;STB=0.585252;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-0.00269949;OID=.;OPOS=77053084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:24:25:9:9:15:16:0.64:11:4:4:5:12:4:4:5
chr7	77247821	.	G	A	937.57	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00519934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8553;QD=58.5983;RBI=0.0338304;REFB=0;REVB=-0.0334285;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017104;OID=.;OPOS=77247821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:26:38:0:0:26:38:0:0
chr7	77256713	.	A	G	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.482;QD=59.0161;RBI=0.0656159;REFB=0;REVB=0.0190578;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362665;OID=.;OPOS=77256713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr7	77552127	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.122;QD=59.0184;RBI=0.0340691;REFB=0;REVB=0.0137865;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125977;OID=.;OPOS=77552127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr7	77648575	.	G	A	95.56	PASS	AF=0.25;AO=13;DP=52;FAO=13;FDP=52;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.00465512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.398;QD=7.35068;RBI=0.00499646;REFB=0.00242428;REVB=0.00181507;RO=39;SAF=5;SAR=8;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639966;STB=0.539815;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=-0.00592857;OID=.;OPOS=77648575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:52:52:39:39:13:13:0.25:8:5:17:22:8:5:17:22
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chr7	80378319	.	G	C	286.88	PASS	AF=0.346535;AO=35;DP=101;FAO=35;FDP=101;FR=.;FRO=66;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=-0.00968195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.129;QD=11.3618;RBI=0.00995329;REFB=-0.00832486;REVB=-0.00230822;RO=66;SAF=13;SAR=22;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449835;STB=0.525986;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0144917;OID=.;OPOS=80378319;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:66:66:35:35:0.346535:22:13:27:39:22:13:27:39
chr7	80962963	.	A	T	2971.37	PASS	AF=0.989529;AO=188;DP=191;FAO=189;FDP=191;FR=.;FRO=2;FSAF=100;FSAR=89;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00137636;FXX=0.00520806;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.383;QD=62.2277;RBI=0.00313229;REFB=-0.184772;REVB=-0.0028137;RO=0;SAF=99;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.80058e-08;STB=0.50495;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=3.46235e-05;OID=.;OPOS=80962963;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:191:191:0:2:188:189:0.989529:89:99:0:0:89:100:2:0
chr7	81380475	.	TTA	T,TAA	68.14	PASS	AF=0.25,0;AO=11,14;DP=90;FAO=14,0;FDP=56;FR=.;FRO=42;FSAF=8,0;FSAR=6,0;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=-0.0379377,-0.00632944;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=25.9296,23.4023;QD=4.8669;RBI=0.105391,0.0456719;REFB=-0.0464565,-0.00634897;REVB=-0.0983263,-0.0452312;RO=60;SAF=5,14;SAR=6,0;SRF=29;SRR=31;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0357197,0.742841;STB=0.639808,0.5;STBP=0.235,1;TYPE=del,snp;VARB=0.163268,0;OID=.,.;OPOS=81380476,81380476;OREF=TA,T;OALT=-,A;OMAPALT=T,TAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.25,0:11,14:90:14,0:56:42:8,0:6,0:16:26:68:60:5,14:6,0:29:31
chr7	82435033	.	C	T	392.0	PASS	AF=0.44086;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.00919129;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=183.175;QD=16.8603;RBI=0.00922998;REFB=-0.0221708;REVB=0.000844216;RO=52;SAF=28;SAR=13;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135442;STB=0.576291;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.027692;OID=.;OPOS=82435033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:52:52:41:41:0.44086:13:28:29:23:13:28:29:23
chr7	82453708	.	A	C	470.43	PASS	AF=0.494624;AO=45;DP=93;FAO=46;FDP=93;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0236986;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.073;QD=20.2336;RBI=0.0241142;REFB=-0.0175344;REVB=-0.00445766;RO=47;SAF=21;SAR=24;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209314;STB=0.516667;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0192853;OID=.;OPOS=82453708;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:47:47:45:46:0.494624:24:21:23:24:25:21:23:24
chr7	82455895	.	A	G	350.72	PASS	AF=0.521739;AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.000106524;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=360.885;QD=20.3314;RBI=0.00626964;REFB=0.00495928;REVB=-0.00626874;RO=34;SAF=16;SAR=20;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17582;STB=0.605038;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.00512614;OID=.;OPOS=82455895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:34:33:36:36:0.521739:20:16:22:12:20:16:22:11
chr7	82544987	.	A	G	1007.92	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5401;QD=59.2892;RBI=0.131285;REFB=0;REVB=0.00431319;RO=0;SAF=24;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000693219;OID=.;OPOS=82544987;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:44:24:0:0:44:24:0:0
chr7	82581488	.	T	TCA,TTCA	668.19	PASS	AF=0,0.956522;AO=7,37;DP=49;FAO=0,44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=0,32;FSAR=0,12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00119875,0.00452839;FXX=0.041658;HRUN=1,5;LEN=2,3;MLLD=267.774,280.701;QD=58.1037;RBI=0.00667765,0.008792;REFB=-0.0170872,-0.0191123;REVB=0.00656917,0.00753611;RO=4;SAF=5,26;SAR=2,11;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0275654,-0.0103539;STB=0.5,0.51231;STBP=1,0.51;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.00152142;OID=.,.;OPOS=82581489,82581489;OREF=-,-;OALT=CA,TCA;OMAPALT=TCA,TTCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.956522:7,37:49:0,44:46:2:0,32:0,12:1:1:10:4:5,26:2,11:3:1
chr7	82582846	.	C	T	131.29	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00508261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.76;QD=14.1936;RBI=0.0305252;REFB=-0.00900553;REVB=0.0300991;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126392;STB=0.57338;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00763975;OID=.;OPOS=82582846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:8:7:13:9:8:7:13:9
chr7	82764424	.	GC	G,GG	559.93	PASS	AF=0.0526316,0.947368;AO=5,35;DP=40;FAO=2,36;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=0,9;FSAR=2,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0321338,-0.0334479;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=119.392,134.083;QD=58.9403;RBI=0.0326439,0.0366476;REFB=0,0;REVB=0.00574803,0.0149761;RO=0;SAF=0,9;SAR=5,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0583522,0.00214206;OID=.,.;OPOS=82764425,82764425;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0526316,0.947368:5,35:40:2,36:38:0:0,9:2,27:0:0:8:0:0,9:5,26:0:0
chr7	82784832	.	C	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9503;QD=43.4862;RBI=0.0342281;REFB=0;REVB=-0.0266736;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000213068;OID=.;OPOS=82784832;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr7	83023587	.	TAC	T	770.44	PASS	AF=1;AO=46;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437381;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=2;MLLD=184.526;QD=56.0322;RBI=0.135538;REFB=0;REVB=0.128287;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000248552;OID=.;OPOS=83023588;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:46:53:55:55:0:20:35:0:0:4:0:19:27:0:0
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chr7	83034754	.	T	A	1721.56	PASS	AF=0.991379;AO=105;DP=106;FAO=115;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00900382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.314;QD=59.3641;RBI=0.0213209;REFB=-0.00762171;REVB=0.0193265;RO=1;SAF=46;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0079761;STB=0.503936;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-9.72485e-06;OID=.;OPOS=83034754;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:106:116:1:1:105:115:0.991379:59:46:0:1:63:52:0:1
chr7	83037751	.	C	A	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0279011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3192;QD=63.8719;RBI=0.0323685;REFB=0;REVB=0.0164088;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104526;OID=.;OPOS=83037751;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:30:18:0:0:30:18:0:0
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chr7	86415987	.	C	T	104.6	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0422961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.1513;QD=19.9243;RBI=0.0517452;REFB=-0.0159966;REVB=-0.0298096;RO=9;SAF=9;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791542;STB=0.545376;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0145386;OID=.;OPOS=86415987;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:3:9:6:3:3:9:6:3
chr7	86800351	.	A	G	1212.77	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0297633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.006;QD=59.8899;RBI=0.0460255;REFB=-0.0504899;REVB=0.0351069;RO=1;SAF=49;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150268;STB=0.507935;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=5.90835e-05;OID=.;OPOS=86800351;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:31:49:0:1:31:49:0:1
chr7	87082292	.	G	A	403.6	PASS	AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0126136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9915;QD=16.6433;RBI=0.0276163;REFB=0.00175711;REVB=0.0245674;RO=53;SAF=22;SAR=20;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126478;STB=0.56986;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=-0.00176667;OID=.;OPOS=87082292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:53:55:42:42:0.43299:20:22:21:32:20:22:22:33
chr7	87138645	.	A	G	405.81	PASS	AF=0.425926;AO=46;DP=107;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0180386;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1001;QD=15.0298;RBI=0.0184916;REFB=-0.0265778;REVB=-0.00406796;RO=61;SAF=32;SAR=14;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219661;STB=0.620101;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.033299;OID=.;OPOS=87138645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:61:62:46:46:0.425926:14:32:30:31:14:32:31:31
chr7	87160618	.	A	C	249.09	PASS	AF=0.357143;AO=30;DP=82;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=-0.0340834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.826;QD=11.8615;RBI=0.0367048;REFB=-0.0173784;REVB=-0.0136222;RO=52;SAF=16;SAR=14;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0700007;STB=0.550529;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0338221;OID=.;OPOS=87160618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:84:52:54:30:30:0.357143:14:16:31:21:14:16:33:21
chr7	87179601	.	A	G	366.18	PASS	AF=0.625;AO=35;DP=56;FAO=35;FDP=56;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=31;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.00346924;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.737;QD=26.1558;RBI=0.0132492;REFB=-0.00692524;REVB=0.0127869;RO=20;SAF=4;SAR=31;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23897;STB=0.627445;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0066843;OID=.;OPOS=87179601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:20:21:35:35:0.625:31:4:6:14:31:4:6:15
chr7	87229501	.	T	C	1185.23	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00766447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1706;QD=60.7808;RBI=0.0256415;REFB=0;REVB=-0.0244692;RO=0;SAF=31;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000205042;OID=.;OPOS=87229501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:47:31:0:0:47:31:0:0
chr7	87840263	.	T	C	86.46	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0522384;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1766;QD=23.0563;RBI=0.0778316;REFB=-0.0354233;REVB=-0.0576967;RO=5;SAF=5;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176021;STB=0.599808;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0214697;OID=.;OPOS=87840263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:16:15:5:5:10:10:0.666667:5:5:1:4:5:5:1:4
chr7	87913361	.	C	T	787.41	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00397215;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3332;QD=57.2658;RBI=0.00459334;REFB=0;REVB=0.00230668;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.65012e-05;OID=.;OPOS=87913361;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:34:21:0:0:34:21:0:0
chr7	88423881	.	T	C	215.59	PASS	AF=0.366197;AO=26;DP=75;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=-0.00486032;FXX=0.0657808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.382;QD=12.146;RBI=0.00838855;REFB=0.00313991;REVB=-0.00683704;RO=36;SAF=15;SAR=11;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244534;STB=0.663738;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=-0.0026726;OID=.;OPOS=88423881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:71:36:45:26:26:0.366197:11:15:12:24:11:15:14:31
chr7	88956699	.	A	G	4488.92	PASS	AF=1;AO=280;DP=280;FAO=283;FDP=283;FR=.;FRO=0;FSAF=144;FSAR=139;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.62;QD=63.4477;RBI=0.0605016;REFB=0;REVB=0.0542308;RO=0;SAF=144;SAR=136;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.3367e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.04773e-05;OID=.;OPOS=88956699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:24:280:283:0:0:280:283:1:136:144:0:0:139:144:0:0
chr7	88963039	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0409114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0198;QD=51.1836;RBI=0.0410955;REFB=0;REVB=0.00388497;RO=0;SAF=16;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000630677;OID=.;OPOS=88963039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:4:16:0:0:4:16:0:0
chr7	88964000	.	C	T	462.79	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.139;QD=57.8488;RBI=0.0405002;REFB=0;REVB=-0.00184658;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.23808e-05;OID=.;OPOS=88964000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:32:0:0:29:32:1:19:10:0:0:19:13:0:0
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chr7	88964196	.	T	A	1255.16	PASS	AF=0.914894;AO=86;DP=94;FAO=86;FDP=94;FR=.;FRO=8;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0108465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.117;QD=53.4112;RBI=0.0174173;REFB=0.00707876;REVB=0.0136277;RO=7;SAF=39;SAR=47;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777918;STB=0.535936;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.000251112;OID=.;OPOS=88964196;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:94:94:7:8:86:86:0.914894:47:39:7:0:47:39:7:1
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chr7	89866845	.	G	T	521.66	PASS	AF=0.386667;AO=58;DP=150;FAO=58;FDP=150;FR=.;FRO=92;FSAF=42;FSAR=16;FSRF=56;FSRR=36;FWDB=-0.0232536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.16;QD=13.911;RBI=0.0727601;REFB=-0.0279811;REVB=-0.0689442;RO=90;SAF=42;SAR=16;SRF=54;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153232;STB=0.58206;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0419755;OID=.;OPOS=89866845;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:90:92:58:58:0.386667:16:42:54:36:16:42:56:36
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chr7	89912301	.	G	A	734.3	PASS	AF=1;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117144;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.152;QD=63.8519;RBI=0.0123769;REFB=0;REVB=-0.00399501;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.32479e-05;OID=.;OPOS=89912301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:46:0:0:46:46:1:15:31:0:0:15:31:0:0
chr7	89933362	.	G	A	394.21	PASS	AF=0.450549;AO=41;DP=89;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=-0.067563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.8903;QD=17.328;RBI=0.0918091;REFB=-0.00602998;REVB=-0.0621622;RO=48;SAF=21;SAR=20;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109389;STB=0.570472;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0124959;OID=.;OPOS=89933362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:91:48:50:41:41:0.450549:20:21:30:18:20:21:32:18
chr7	89937168	.	G	A	323.8	PASS	AF=0.523077;AO=31;DP=63;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0486639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.8835;QD=19.9264;RBI=0.0684525;REFB=0.00490057;REVB=-0.0481411;RO=31;SAF=19;SAR=12;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174461;STB=0.566357;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.00630307;OID=.;OPOS=89937168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:65:31:31:31:34:0.523077:12:19:13:18:15:19:13:18
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chr7	91630620	.	G	T	97.75	PASS	AF=0.482759;AO=10;DP=26;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0286061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.748;QD=13.483;RBI=0.0373386;REFB=-0.00658848;REVB=0.0239972;RO=13;SAF=0;SAR=10;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.819321;STB=0.69971;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0255626;OID=.;OPOS=91630620;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:26:29:13:15:10:14:0.482759:10:0:9:4:10:4:10:5
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chr7	91641928	.	A	G	568.38	PASS	AF=0.82;AO=41;DP=50;FAO=41;FDP=50;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00977391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.322;QD=45.4704;RBI=0.0227088;REFB=-0.0142882;REVB=0.0204978;RO=9;SAF=11;SAR=30;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115116;STB=0.562029;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00389002;OID=.;OPOS=91641928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:50:50:9:9:41:41:0.82:30:11:5:4:30:11:5:4
chr7	91652178	.	A	AAAC	142.81	PASS	AF=0.6;AO=14;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00491754;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=274.19;QD=22.8494;RBI=0.00586201;REFB=-0.00153337;REVB=0.00319076;RO=11;SAF=12;SAR=2;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344775;STB=0.716191;STBP=0.035;TYPE=ins;VARB=0.00156131;OID=.;OPOS=91652179;OREF=-;OALT=AAC;OMAPALT=AAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6:14:25:15:25:10:13:2:5:5:76:11:12:2:6:5
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chr7	91779242	.	G	A	278.95	PASS	AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0617185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.274;QD=13.9473;RBI=0.0617427;REFB=-0.0040958;REVB=-0.00172806;RO=48;SAF=12;SAR=20;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15634;STB=0.589116;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.00529942;OID=.;OPOS=91779242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:48:48:32:32:0.4:20:12:25:23:20:12:25:23
chr7	91779971	.	T	G	305.09	PASS	AF=0.416667;AO=22;DP=85;FAO=35;FDP=84;FR=.,HEALED,HEALED,HEALED;FRO=49;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=0.0566229;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3987;QD=14.5281;RBI=0.0571152;REFB=-0.0187896;REVB=-0.00748325;RO=23;SAF=6;SAR=16;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136369;STB=0.522665;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0264972;OID=.;OPOS=91779971;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:23:49:22:35:0.416667:16:6:6:17:22:13:20:29
chr7	92027906	.	C	A	248.32	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0127639;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.944;QD=19.4762;RBI=0.0135632;REFB=-0.0011761;REVB=-0.00458742;RO=24;SAF=5;SAR=21;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252491;STB=0.657399;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00122273;OID=.;OPOS=92027906;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:24:25:26:26:0.509804:21:5:10:14:21:5:11:14
chr7	92028039	.	C	A	74.47	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.016588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.8;QD=22.915;RBI=0.0257321;REFB=-0.0054631;REVB=0.0196718;RO=4;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162954;STB=0.593016;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.00105978;OID=.;OPOS=92028039;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:4:5:1:3:4:5:1:3
chr7	92029302	.	G	A	358.2	PASS	AF=0.397959;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=-0.00132588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1608;QD=14.6203;RBI=0.0421675;REFB=0.00253756;REVB=-0.0421466;RO=59;SAF=25;SAR=14;SRF=38;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00351061;STB=0.501991;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=-0.00836368;OID=.;OPOS=92029302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:59:59:39:39:0.397959:14:25:38:21:14:25:38:21
chr7	92131289	.	G	T	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.883;QD=57.8848;RBI=0.0314541;REFB=0;REVB=0.0106571;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.96778e-05;OID=.;OPOS=92131289;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:29:31:0:0:29:31:0:0
chr7	92166194	.	G	A	295.63	PASS	AF=0.566038;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.039671;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5848;QD=22.3117;RBI=0.0590129;REFB=-0.0066049;REVB=0.043689;RO=21;SAF=12;SAR=18;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583965;STB=0.53486;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.00639029;OID=.;OPOS=92166194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:53:21:23:30:30:0.566038:18:12:10:11:18:12:11:12
chr7	92236829	.	A	G	199.74	PASS	AF=0.342105;AO=26;DP=76;FAO=26;FDP=76;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0288142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2318;QD=10.5124;RBI=0.0288147;REFB=-0.00680678;REVB=0.000175471;RO=50;SAF=13;SAR=13;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0678889;STB=0.539443;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.010884;OID=.;OPOS=92236829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:50:50:26:26:0.342105:13:13:28:22:13:13:28:22
chr7	92243347	.	A	G	179.7	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00159455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.575;QD=15.6261;RBI=0.00514248;REFB=-0.014204;REVB=-0.00488902;RO=27;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0623899;STB=0.535925;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0206195;OID=.;OPOS=92243347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:8:11:14:13:8:11:14:13
chr7	92600509	.	T	C	457.27	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.471;QD=57.1591;RBI=0.0323358;REFB=0;REVB=0.0219314;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000389517;OID=.;OPOS=92600509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:21:10:0:0:22:10:0:0
chr7	93054827	.	C	CTCTT	223.0	PASS	AF=0.375;AO=24;DP=77;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=0.00326009;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=272.412;QD=12.389;RBI=0.0636476;REFB=-0.0146827;REVB=-0.0635641;RO=47;SAF=24;SAR=0;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.793428;STB=0.727066;STBP=0.013;TYPE=ins;VARB=0.0208949;OID=.;OPOS=93054828;OREF=-;OALT=TCTT;OMAPALT=CTCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375:24:77:27:72:45:24:3:30:15:99:47:24:0:31:16
chr7	93055344	.	T	G	186.16	PASS	AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0190305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.354;QD=12.4108;RBI=0.0204246;REFB=0.00671143;REVB=-0.00741649;RO=37;SAF=8;SAR=15;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237079;STB=0.636776;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.0097744;OID=.;OPOS=93055344;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:37:37:23:23:0.383333:15:8:21:16:15:8:21:16
chr7	93055650	.	G	A	417.81	PASS	AF=0.554054;AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.000691054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0444;QD=22.584;RBI=0.00625794;REFB=0.00926473;REVB=0.00621967;RO=33;SAF=19;SAR=22;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664153;STB=0.536568;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.0074768;OID=.;OPOS=93055650;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:33:33:41:41:0.554054:22:19:18:15:22:19:18:15
chr7	93055753	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000205359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.181;QD=61.3362;RBI=0.0158581;REFB=0;REVB=0.0158567;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59198e-05;OID=.;OPOS=93055753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr7	93515993	.	T	G	369.83	PASS	AF=0.805556;AO=25;DP=37;FAO=29;FDP=36;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0021278;FXX=0.0270197;HRUN=6;LEN=1;MLLD=183.647;QD=41.0918;RBI=0.00384988;REFB=-0.0234932;REVB=-0.00320843;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.597303;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00266928;OID=.;OPOS=93515993;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:37:36:0:7:25:29:0.805556:17:8:0:0:21:8:5:2
chr7	93623458	.	A	G	275.62	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0021903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=332.725;QD=18.0734;RBI=0.00776157;REFB=-0.0196216;REVB=0.00744611;RO=31;SAF=23;SAR=7;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2649;STB=0.649443;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0191501;OID=.;OPOS=93623458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:31:31:30:30:0.491803:7:23:16:15:7:23:16:15
chr7	94027699	.	T	C	1054.34	PASS	AF=0.360465;AO=123;DP=341;FAO=124;FDP=344;FR=.;FRO=220;FSAF=74;FSAR=50;FSRF=118;FSRR=102;FWDB=0.00241482;FXX=0.00864528;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.662;QD=12.2598;RBI=0.0179328;REFB=-0.0215049;REVB=-0.0177694;RO=216;SAF=72;SAR=51;SRF=115;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606391;STB=0.539518;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0409613;OID=.;OPOS=94027699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:341:344:216:220:123:124:0.360465:51:72:115:101:50:74:118:102
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chr7	94174854	.	T	C	601.52	PASS	AF=0.443662;AO=63;DP=142;FAO=63;FDP=142;FR=.;FRO=79;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=31;FSRR=48;FWDB=0.00210992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2316;QD=16.9442;RBI=0.118162;REFB=-0.0055365;REVB=0.118143;RO=79;SAF=30;SAR=33;SRF=31;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.08426;STB=0.546913;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.00679444;OID=.;OPOS=94174854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:79:79:63:63:0.443662:33:30:31:48:33:30:31:48
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chr7	98258736	.	G	A	427.27	PASS	AF=0.455446;AO=46;DP=101;FAO=46;FDP=101;FR=.;FRO=55;FSAF=33;FSAR=13;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.0108438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0966;QD=16.9215;RBI=0.0384396;REFB=-0.0159735;REVB=0.0368784;RO=52;SAF=33;SAR=13;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717925;STB=0.551928;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0187696;OID=.;OPOS=98258736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:52:55:46:46:0.455446:13:33:34:18:13:33:35:20
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chr7	99711040	.	G	A	221.03	PASS	AF=0.740741;AO=20;DP=27;FAO=20;FDP=27;FR=.;FRO=7;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.01886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0959;QD=32.7454;RBI=0.0964981;REFB=0.0150087;REVB=0.0946371;RO=7;SAF=13;SAR=7;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401159;STB=0.522066;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=-0.0029057;OID=.;OPOS=99711040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:27:27:7:7:20:20:0.740741:7:13:4:3:7:13:4:3
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chr7	99757612	.	G	A	44.53	PASS	AF=0.28;AO=7;DP=25;FAO=7;FDP=25;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00411269;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.569;QD=7.12511;RBI=0.0374688;REFB=-0.027129;REVB=0.0372424;RO=18;SAF=4;SAR=3;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182661;STB=0.511595;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0439727;OID=.;OPOS=99757612;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:25:18:18:7:7:0.28:3:4:10:8:3:4:10:8
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chr7	99757954	.	C	T	84.33	PASS	AF=0.392857;AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0175699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.46;QD=12.0475;RBI=0.0212789;REFB=0.00477866;REVB=0.0120038;RO=18;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545372;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=-0.0038139;OID=.;OPOS=99757954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:28:28:18:17:10:11:0.392857:5:5:9:9:6:5:9:8
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chr7	99796146	.	A	C	1298.6	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00369816;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.464;QD=61.8382;RBI=0.0220011;REFB=0;REVB=-0.0216881;RO=0;SAF=35;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.46682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.17726e-05;OID=.;OPOS=99796146;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:84:0:0:81:84:1:46:35:0:0:47:37:0:0
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chr7	100173282	.	G	A	74.58	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=-0.017404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.8263;QD=10.654;RBI=0.0457313;REFB=-0.00676236;REVB=-0.0422901;RO=18;SAF=7;SAR=3;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188504;STB=0.610917;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0160246;OID=.;OPOS=100173282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:3:7:15:3:3:7:15:3
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chr7	100276038	.	C	T	281.35	PASS	AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0468647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.824;QD=21.2338;RBI=0.0490185;REFB=-0.0237662;REVB=0.0143706;RO=23;SAF=12;SAR=17;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155462;STB=0.57697;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0122647;OID=.;OPOS=100276038;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:23:24:29:29:0.54717:17:12:14:9:17:12:14:10
chr7	100278657	.	A	G	692.13	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00586237;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.59;QD=62.9205;RBI=0.0163878;REFB=0;REVB=0.0153033;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.07849e-05;OID=.;OPOS=100278657;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr7	100281768	.	T	C	146.89	PASS	AF=1;AO=11;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.68;QD=41.9688;RBI=0.121239;REFB=0;REVB=0.119601;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.57015e-05;OID=.;OPOS=100281768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:11:14:1:4:7:0:0:6:8:0:0
chr7	100285476	.	C	T	209.31	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.057623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.84;QD=13.725;RBI=0.0576429;REFB=-0.00557913;REVB=-0.00151526;RO=35;SAF=9;SAR=16;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436889;STB=0.518295;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.00532481;OID=.;OPOS=100285476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:35:36:25:25:0.409836:16:9:14:21:16:9:14:22
chr7	100348384	.	T	C	149.64	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=0.0421255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.515;QD=11.9716;RBI=0.0421701;REFB=0.00770442;REVB=-0.00193812;RO=33;SAF=12;SAR=5;SRF=25;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724871;STB=0.542474;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=-0.0120515;OID=.;OPOS=100348384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:5:12:25:8:5:12:25:8
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chr7	100371358	.	G	A	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.228;QD=63.2856;RBI=0.0736609;REFB=0;REVB=0.0710119;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000345637;OID=.;OPOS=100371358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr7	100371474	.	G	A	537.9	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.052;QD=59.767;RBI=0.0713713;REFB=0;REVB=0.0232278;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000496048;OID=.;OPOS=100371474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0
chr7	100371476	.	T	TG	438.26	PASS	AF=1;AO=32;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486987;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=258.945;QD=48.6955;RBI=0.0582857;REFB=0;REVB=0.0320259;RO=1;SAF=21;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217181;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000208347;OID=.;OPOS=100371477;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:32:36:36:36:0:24:12:0:0:8:1:21:11:1:0
chr7	100373077	.	C	G	494.94	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.856;QD=58.2282;RBI=0.0107283;REFB=0;REVB=-0.00119389;RO=0;SAF=5;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.47732e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000996891;OID=.;OPOS=100373077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:28:5:0:0:28:6:0:0
chr7	100373367	.	G	C	785.76	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.704;QD=64.1439;RBI=0.0198046;REFB=0;REVB=-0.00360967;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.9889e-05;OID=.;OPOS=100373367;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0
chr7	100386900	.	T	C	999.79	PASS	AF=1;AO=58;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.027822;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7699;QD=58.8113;RBI=0.0290094;REFB=0;REVB=-0.00821482;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000243279;OID=.;OPOS=100386900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:58:68:1:28:30:0:0:30:38:0:0
chr7	100386901	.	G	C	59.34	PASS	AF=0.15942;AO=11;DP=69;FAO=11;FDP=69;FR=.;FRO=58;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.017917;FXX=0.0142837;HRUN=4;LEN=1;MLLD=74.9725;QD=3.43996;RBI=0.042248;REFB=-0.063388;REVB=0.0382606;RO=58;SAF=8;SAR=3;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269842;STB=0.684734;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0185443;OID=.;OPOS=100386901;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:69:69:58:58:11:11:0.15942:3:8:30:28:3:8:30:28
chr7	100391644	.	T	C	1859.74	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00297698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.816;QD=61.479;RBI=0.0208842;REFB=0;REVB=0.020671;RO=0;SAF=77;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.26728e-05;OID=.;OPOS=100391644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:121:0:0:120:121:1:43:77:0:0:43:78:0:0
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chr7	100416139	.	T	C	785.83	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.831;QD=64.1494;RBI=0.0232444;REFB=0;REVB=0.0093631;RO=0;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.90723e-05;OID=.;OPOS=100416139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:33:16:0:0:33:16:0:0
chr7	100416250	.	A	G	1227.34	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00145147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.716;QD=61.3668;RBI=0.0111987;REFB=0;REVB=-0.0111042;RO=0;SAF=41;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.18676e-05;OID=.;OPOS=100416250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:39:41:0:0:39:41:0:0
chr7	100424586	.	CG	C,CC	857.44	PASS	AF=0.333333,0.666667;AO=10,47;DP=57;FAO=20,40;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=6,11;FSAR=14,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046066,0.0407268;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=209.192,209.761;QD=57.1629;RBI=0.0460668,0.0407309;REFB=0,0;REVB=-0.000273284,-0.00058232;RO=0;SAF=1,14;SAR=9,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.8593e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.017805,0.0157838;OID=.,.;OPOS=100424587,100424587;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.333333,0.666667:10,47:57:20,40:60:0:6,11:14,29:0:0:35:0:1,14:9,33:0:0
chr7	100458795	.	T	C	2236.5	PASS	AF=1;AO=140;DP=140;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.832;QD=63.4469;RBI=0.0410145;REFB=0;REVB=0.0263887;RO=0;SAF=74;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.67742e-05;OID=.;OPOS=100458795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:141:0:0:140:141:1:66:74:0:0:66:75:0:0
chr7	100460331	.	G	A	1083.85	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201698;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.384;QD=60.2139;RBI=0.0201937;REFB=0;REVB=-0.000983125;RO=0;SAF=19;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15237e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.18465e-05;OID=.;OPOS=100460331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:53:19:0:0:53:19:0:0
chr7	100468284	.	A	G	1671.07	PASS	AF=1;AO=108;DP=112;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203289;FXX=0.0350846;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9373;QD=60.7662;RBI=0.0515041;REFB=0;REVB=-0.0473224;RO=0;SAF=27;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000569935;OID=.;OPOS=100468284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:110:0:0:108:110:1:81:27:0:0:82:28:0:0
chr7	100482026	.	T	C	223.08	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0249369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.665;QD=49.5743;RBI=0.0419887;REFB=0;REVB=0.0337817;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213296;OID=.;OPOS=100482026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr7	100486656	.	T	G	715.01	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00743718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.933;QD=60.8518;RBI=0.0139082;REFB=-0.0569909;REVB=0.0117527;RO=1;SAF=8;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551787;STB=0.529399;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.000524728;OID=.;OPOS=100486656;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:38:8:1:0:38:8:1:0
chr7	100494222	.	G	GC	1663.41	PASS	AF=1;AO=134;DP=139;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154993;FXX=0.0215812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=26.3705;QD=48.9237;RBI=0.0613048;REFB=0;REVB=0.0593132;RO=3;SAF=72;SAR=62;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224411;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000382769;OID=.;OPOS=100494223;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:134:139:136:136:0:73:63:0:0:30:3:72:62:0:3
chr7	100549505	.	T	C	31.15	PASS	AF=0.113208;AO=6;DP=53;FAO=6;FDP=53;FR=.;FRO=47;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0440006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.647;QD=2.35117;RBI=0.0564845;REFB=-0.00510528;REVB=-0.0354182;RO=47;SAF=4;SAR=2;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111797;STB=0.58637;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0454955;OID=.;OPOS=100549505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:53:53:47:47:6:6:0.113208:2:4:27:20:2:4:27:20
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chr7	100550184	.	C	A	44.77	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00138099;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7436;QD=6.39524;RBI=0.00966151;REFB=0.00394849;REVB=0.0095623;RO=21;SAF=1;SAR=6;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402521;STB=0.768344;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.00965285;OID=.;OPOS=100550184;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:29:28:21:21:7:7:0.25:6:1:9:12:6:1:9:12
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chr7	100677523	.	A	C	92.64	PASS	AF=0.183908;AO=16;DP=84;FAO=16;FDP=87;FR=.;FRO=71;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=45;FSRR=26;FWDB=-0.0231383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.512;QD=4.25915;RBI=0.0630176;REFB=-0.00057854;REVB=-0.058616;RO=68;SAF=14;SAR=2;SRF=42;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413744;STB=0.768228;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00509833;OID=.;OPOS=100677523;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:84:87:68:71:16:16:0.183908:2:14:42:26:2:14:45:26
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chr7	100677625	.	G	A	87.72	PASS	AF=0.16;AO=16;DP=100;FAO=16;FDP=100;FR=.;FRO=84;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=66;FSRR=18;FWDB=-0.0704208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1651;QD=3.50893;RBI=0.0704209;REFB=-0.00490709;REVB=-9.16215e-05;RO=83;SAF=10;SAR=6;SRF=65;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237786;STB=0.65501;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0280274;OID=.;OPOS=100677625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:100:100:83:84:16:16:0.16:6:10:65:18:6:10:66:18
chr7	100677630	.	C	T	490.87	PASS	AF=0.5;AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=43;FSRR=8;FWDB=4.02216e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8216;QD=19.2496;RBI=0.00857478;REFB=0.0112535;REVB=-0.00857469;RO=51;SAF=37;SAR=14;SRF=43;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144202;STB=0.579082;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=-0.0114969;OID=.;OPOS=100677630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:51:51:51:51:0.5:14:37:43:8:14:37:43:8
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chr7	100678029	.	G	C	30.32	PASS	AF=0.0860215;AO=8;DP=85;FAO=8;FDP=93;FR=.;FRO=85;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=36;FSRR=49;FWDB=-0.099213;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.23;QD=1.30416;RBI=0.121116;REFB=-0.0041204;REVB=-0.069468;RO=77;SAF=4;SAR=4;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112695;STB=0.569721;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0265116;OID=.;OPOS=100678029;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:85:93:77:85:8:8:0.0860215:4:4:31:46:4:4:36:49
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chr7	100678086	.	T	C	817.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4363;QD=57.3845;RBI=0.0437923;REFB=0;REVB=-0.0421358;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000494311;OID=.;OPOS=100678086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0
chr7	100678173	.	C	T	293.26	PASS	AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.014416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.858;QD=23.0009;RBI=0.0247585;REFB=-0.0240399;REVB=0.0201286;RO=22;SAF=16;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145775;STB=0.58059;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0231738;OID=.;OPOS=100678173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:22:22:29:29:0.568627:13:16:8:14:13:16:8:14
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chr7	100678464	.	C	T	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0337009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.647;QD=14.1695;RBI=0.0748682;REFB=-0.0262478;REVB=-0.0668542;RO=12;SAF=8;SAR=2;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252837;STB=0.650827;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0190435;OID=.;OPOS=100678464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:2:8:7:5:2:8:7:5
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chr7	100678820	.	T	C	64.87	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.0147256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.3575;QD=10.8118;RBI=0.0454253;REFB=-0.0228455;REVB=-0.0429722;RO=15;SAF=2;SAR=7;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.558375;STB=0.829854;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0347901;OID=.;OPOS=100678820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:24:24:15:15:9:9:0.375:7:2:12:3:7:2:12:3
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chr7	100681359	.	C	G	37.76	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0388481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4172;QD=9.43913;RBI=0.0669587;REFB=0.0198427;REVB=0.054537;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726992;STB=0.545299;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=-0.0240229;OID=.;OPOS=100681359;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:4:2:4:6:4:2:4:6
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chr7	100682275	.	A	G	71.62	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0177753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.13;QD=19.0998;RBI=0.0227245;REFB=-0.0176099;REVB=0.0141578;RO=6;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152681;STB=0.588041;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0119171;OID=.;OPOS=100682275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:5:4:4:2:5:4:4:2
chr7	100683050	.	T	G	205.91	PASS	AF=0.730769;AO=19;DP=26;FAO=19;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0423165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.88;QD=31.6788;RBI=0.0435968;REFB=-0.0298677;REVB=0.0104878;RO=7;SAF=16;SAR=3;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139636;STB=0.507684;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.014056;OID=.;OPOS=100683050;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:7:7:19:19:0.730769:3:16:6:1:3:16:6:1
chr7	100683864	.	C	T	93.96	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0376989;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.401;QD=18.7913;RBI=0.0389325;REFB=-0.0322549;REVB=-0.00972272;RO=9;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15431;STB=0.589302;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0304581;OID=.;OPOS=100683864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:21:20:9:9:11:11:0.55:3:8:5:4:3:8:5:4
chr7	100692680	.	T	G	410.57	PASS	AF=0.390244;AO=48;DP=123;FAO=48;FDP=123;FR=.;FRO=75;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=30;FWDB=-0.0183123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.442;QD=13.3518;RBI=0.0184731;REFB=-0.00669789;REVB=-0.00243222;RO=75;SAF=28;SAR=20;SRF=45;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0185177;STB=0.510485;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0115016;OID=.;OPOS=100692680;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:75:75:48:48:0.390244:20:28:45:30:20:28:45:30
chr7	100694976	.	C	CG,G	31.44	PASS	AF=0.233333,0;AO=6,2;DP=31;FAO=7,0;FDP=30;FR=.;FRO=23;FSAF=2,0;FSAR=5,0;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00877491,-0.0904619;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=25.8293,50.0372;QD=4.19172;RBI=0.0330883,0.129554;REFB=-0.0267778,-0.00536397;REVB=-0.0319036,-0.0927413;RO=22;SAF=3,0;SAR=3,2;SRF=14;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.161628,-0.563482;STB=0.765061,0.5;STBP=0.133,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.15732,0;OID=.,.;OPOS=100694977,100694976;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:31:30:22:23:6,2:7,0:0.233333,0:3,2:3,0:14:8:5,0:2,0:15:8
chr7	100701610	.	T	A	56.29	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0316823;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.48;QD=11.2576;RBI=0.0421377;REFB=-0.0325541;REVB=-0.0277817;RO=12;SAF=6;SAR=2;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102563;STB=0.562336;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.034871;OID=.;OPOS=100701610;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:2:6:8:4:2:6:8:4
chr7	100731505	.	C	G	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0193696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6636;QD=16.3863;RBI=0.0454009;REFB=-0.0194661;REVB=-0.0410617;RO=8;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163174;STB=0.594396;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0147459;OID=.;OPOS=100731505;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:5:4:2:6:5:4:2:6
chr7	100731829	.	T	C	498.49	PASS	AF=0.481818;AO=51;DP=107;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.0185106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.6;QD=18.1267;RBI=0.0284112;REFB=-0.0330666;REVB=0.0215535;RO=56;SAF=33;SAR=18;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110413;STB=0.542514;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0395219;OID=.;OPOS=100731829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:110:56:57:51:53:0.481818:18:33:30:26:20:33:31:26
chr7	100733100	.	G	A	56.54	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.134124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2563;QD=11.9025;RBI=0.135792;REFB=-0.0219615;REVB=0.0212163;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313604;STB=0.683812;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0477747;OID=.;OPOS=100733100;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:4:4:2:9:4:4:2:9
chr7	100781729	.	T	C	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.058;QD=16.199;RBI=0.00550252;REFB=-0.0212395;REVB=0.00550252;RO=3;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0121501;OID=.;OPOS=100781729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:5:0:0:3:5:0:0:3
chr7	100804240	.	T	C,TACCTCC	171.82	PASS	AF=0,0.96;AO=3,20;DP=25;FAO=0,24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=0,15;FSAR=0,9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0231339,0.0153272;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,6;MLLD=206.468,95.4351;QD=27.4911;RBI=0.0261678,0.0199146;REFB=-0.0177812,-0.0696736;REVB=-0.0122303,-0.0127148;RO=2;SAF=2,12;SAR=1,8;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.272699,-0.0708106;STB=0.5,0.516116;STBP=1,0.507;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.00250635;OID=.,.;OPOS=100804240,100804241;OREF=T,-;OALT=C,ACCTCC;OMAPALT=C,TACCTCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:10:25:25:2:1:3,20:0,24:0,0.96:1,8:2,12:2:0:0,9:0,15:1:0
chr7	101006376	.	C	T	651.19	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0877829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.335;QD=62.0177;RBI=0.0945425;REFB=0;REVB=0.0351063;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000443277;OID=.;OPOS=101006376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr7	101006382	.	C	T	652.99	PASS	AF=1;AO=36;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.17976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.099;QD=62.189;RBI=0.249338;REFB=0;REVB=0.172789;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00525721;OID=.;OPOS=101006382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:36:42:1:19:17:0:0:21:21:0:0
chr7	101187311	.	G	C	500.45	PASS	AF=0.423077;AO=55;DP=131;FAO=55;FDP=130;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=48;FSRR=27;FWDB=-0.00375242;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.859;QD=15.3984;RBI=0.00664795;REFB=-0.0103261;REVB=-0.00548768;RO=75;SAF=29;SAR=26;SRF=48;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117389;STB=0.565673;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0225596;OID=.;OPOS=101187311;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:130:75:75:55:55:0.423077:26:29:48:27:26:29:48:27
chr7	101200669	.	A	AG	808.91	PASS	AF=1;AO=94;DP=115;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00890628;FXX=0.0265463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=9.36798;QD=29.4148;RBI=0.154075;REFB=0;REVB=-0.153817;RO=15;SAF=63;SAR=31;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00103973;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000574967;OID=.;OPOS=101200670;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:94:115:110:110:0:72:38:0:0:18:15:63:31:10:5
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chr7	101286843	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.894;QD=42.1811;RBI=0.114147;REFB=0;REVB=-0.0115707;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160197;OID=.;OPOS=101286843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
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chr7	102063527	.	G	C	239.4	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6691;QD=50.4004;RBI=0.0283836;REFB=0;REVB=0.0170444;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.14147e-05;OID=.;OPOS=102063527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
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chr7	102066539	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.029;QD=37.4885;RBI=0.0322924;REFB=0;REVB=-0.0275722;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0002375;OID=.;OPOS=102066539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr7	102087202	.	T	C	532.2	PASS	AF=0.590361;AO=49;DP=83;FAO=49;FDP=83;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0418282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.2726;QD=25.6483;RBI=0.0423417;REFB=0.0019344;REVB=-0.00657393;RO=33;SAF=23;SAR=26;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786936;STB=0.53593;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=-0.00144006;OID=.;OPOS=102087202;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:33:34:49:49:0.590361:26:23:12:21:26:23:13:21
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chr7	102574715	.	A	G	175.28	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=0.0100038;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.6573;QD=13.2283;RBI=0.0986059;REFB=0.00982336;REVB=-0.0980972;RO=27;SAF=13;SAR=8;SRF=24;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312561;STB=0.587224;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=-0.0185597;OID=.;OPOS=102574715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:53:27:32:21:21:0.396226:8:13:24:3:8:13:24:8
chr7	102574999	.	TGAAGAAGAA	TGAAGAA,TGAAGAAGAG	281.54	PASS	AF=0.509091,0.0363636;AO=28,2;DP=55;FAO=28,2;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=22,2;FSAR=6,0;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.0155951,0.0161909;FXX=0;HRUN=1,4;LEN=3,1;MLLD=304.692,132.306;QD=20.4758;RBI=0.0410937,0.0396082;REFB=-0.0152994,-0.00565248;REVB=0.0380195,-0.0361479;RO=24;SAF=22,2;SAR=6,0;SRF=17;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0893988,0.411833;STB=0.543694,0.992677;STBP=0.603,0.327;TYPE=del,snp;VARB=0.0112405,0.00621424;OID=.,.;OPOS=102575000,102575008;OREF=GAA,A;OALT=-,G;OMAPALT=TGAAGAA,TGAAGAAGAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.509091,0.0363636:28,2:55:28,2:55:25:22,2:6,0:18:7:99:24:22,2:6,0:17:7
chr7	102665620	.	C	G	440.84	PASS	AF=0.463918;AO=44;DP=96;FAO=45;FDP=97;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.00122388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.099;QD=18.1791;RBI=0.00463573;REFB=-0.00732455;REVB=-0.00447126;RO=52;SAF=26;SAR=18;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139769;STB=0.512815;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.00724777;OID=.;OPOS=102665620;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:52:52:44:45:0.463918:18:26:30:22:18:27:30:22
chr7	102668001	.	A	C	1028.29	PASS	AF=0.985915;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000432541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.843;QD=57.9319;RBI=0.0224206;REFB=-0.126999;REVB=0.0224164;RO=1;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154963;STB=0.508194;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000311988;OID=.;OPOS=102668001;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:70:71:1:1:69:70:0.985915:30:39:0:1:30:40:0:1
chr7	102669176	.	G	A	226.33	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00579825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.469;QD=17.0814;RBI=0.00599443;REFB=-0.0283498;REVB=0.00152101;RO=28;SAF=20;SAR=5;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302649;STB=0.672743;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0249872;OID=.;OPOS=102669176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:5:20:15:13:5:20:15:13
chr7	102696108	.	A	G	120.12	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.00548723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.825;QD=14.1312;RBI=0.00903034;REFB=-0.00649998;REVB=0.00717198;RO=20;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27918;STB=0.663474;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00898285;OID=.;OPOS=102696108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:4:10:9:11:4:10:9:11
chr7	102740683	.	G	A	563.78	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00886471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.105;QD=57.8237;RBI=0.0594484;REFB=0.0536919;REVB=-0.0587838;RO=1;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267628;STB=0.514278;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.000183316;OID=.;OPOS=102740683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:17:21:0:1:17:21:0:1
chr7	102742144	.	C	T	740.41	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0013607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.819;QD=56.9545;RBI=0.0240147;REFB=0;REVB=0.0239761;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101855;OID=.;OPOS=102742144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0
chr7	102743893	.	C	T	690.0	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2993;QD=62.7268;RBI=0.0678555;REFB=0;REVB=0.00716332;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000423644;OID=.;OPOS=102743893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:18:25:0:0:19:25:0:0
chr7	102948040	.	T	C	322.23	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00251433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.995;QD=28.0198;RBI=0.0169604;REFB=-0.0210352;REVB=-0.016773;RO=18;SAF=18;SAR=10;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018512;STB=0.510197;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0202362;OID=.;OPOS=102948040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:10:18:12:6:10:18:12:6
chr7	102950891	.	G	A	416.11	PASS	AF=0.546667;AO=41;DP=75;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.00424678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.204;QD=22.1924;RBI=0.0256778;REFB=-0.00186895;REVB=0.0253242;RO=34;SAF=31;SAR=10;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335188;STB=0.685842;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00261085;OID=.;OPOS=102950891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:34:34:41:41:0.546667:10:31:13:21:10:31:13:21
chr7	103007949	.	A	C	1044.85	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00374792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.475;QD=59.7058;RBI=0.0154292;REFB=0;REVB=0.0149671;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12488e-05;OID=.;OPOS=103007949;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:31:38:0:0:32:38:0:0
chr7	103073964	.	T	C	189.87	PASS	AF=0.358209;AO=23;DP=66;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0132301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.675;QD=11.3353;RBI=0.0294523;REFB=-0.00596444;REVB=0.0263135;RO=41;SAF=8;SAR=15;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160009;STB=0.589397;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0152276;OID=.;OPOS=103073964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:41:43:23:24:0.358209:15:8:20:21:16:8:20:23
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chr7	103073993	.	T	C	154.88	PASS	AF=0.33871;AO=20;DP=63;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0395883;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.735;QD=9.99241;RBI=0.0429685;REFB=-0.0229837;REVB=-0.0167052;RO=42;SAF=4;SAR=16;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3123;STB=0.63754;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0346175;OID=.;OPOS=103073993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:42:41:20:21:0.33871:16:4:18:24:16:5:17:24
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chr7	103124788	.	C	T	122.93	PASS	AF=0.264706;AO=18;DP=69;FAO=18;FDP=68;FR=.;FRO=50;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0116417;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.017;QD=7.23127;RBI=0.0192657;REFB=-0.0148479;REVB=-0.0153505;RO=51;SAF=6;SAR=12;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218543;STB=0.639842;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.02135;OID=.;OPOS=103124788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:51:50:18:18:0.264706:12:6:26:25:12:6:26:24
chr7	103155705	.	A	G	920.11	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.341;QD=58.4197;RBI=0.0720776;REFB=0;REVB=-0.0695661;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.21614e-05;OID=.;OPOS=103155705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:28:34:0:0:28:35:0:0
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chr7	103389954	.	A	G	664.59	PASS	AF=0.84375;AO=50;DP=62;FAO=54;FDP=64;FR=.;FRO=10;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.158451;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.2896;QD=41.5371;RBI=0.158942;REFB=-0.188828;REVB=-0.012494;RO=6;SAF=17;SAR=33;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106216;STB=0.5147;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0186031;OID=.;OPOS=103389954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:62:64:6:10:50:54:0.84375:33:17:5:1:33:21:3:7
chr7	104263425	.	T	C	88.2	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0494762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.29;QD=39.2018;RBI=0.0545818;REFB=0;REVB=0.0230496;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000369361;OID=.;OPOS=104263425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr7	104536783	.	C	T	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=0.0072439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.035;QD=18.2512;RBI=0.021187;REFB=-0.0328558;REVB=0.0199102;RO=15;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781246;STB=0.544322;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0352553;OID=.;OPOS=104536783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:11:4:3:12:11:4:3:12
chr7	104717517	.	C	T	242.36	PASS	AF=0.666667;AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.00401745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2405;QD=29.3774;RBI=0.0113678;REFB=-0.0187543;REVB=0.0106342;RO=11;SAF=16;SAR=6;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00565861;OID=.;OPOS=104717517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:11:11:22:22:0.666667:6:16:8:3:6:16:8:3
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chr7	104785779	.	T	G	115.07	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.00152292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.158;QD=19.1776;RBI=0.0175614;REFB=-0.026537;REVB=0.0174952;RO=11;SAF=3;SAR=10;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354326;STB=0.703889;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0252404;OID=.;OPOS=104785779;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:10:3:7:4:10:3:7:4
chr7	105245754	.	A	G	549.66	PASS	AF=0.554348;AO=51;DP=91;FAO=51;FDP=92;FR=.;FRO=41;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.0262003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.44;QD=23.8982;RBI=0.0278193;REFB=0.00766143;REVB=-0.00935168;RO=40;SAF=34;SAR=17;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00753565;STB=0.508193;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.00411616;OID=.;OPOS=105245754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:40:41:51:51:0.554348:17:34:27:13:17:34:28:13
chr7	105245877	.	G	A	303.32	PASS	AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0231816;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.493;QD=25.8143;RBI=0.0341983;REFB=-0.0325104;REVB=-0.0251424;RO=20;SAF=24;SAR=3;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215562;STB=0.621255;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0261633;OID=.;OPOS=105245877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:20:20:27:27:0.574468:3:24:15:5:3:24:15:5
chr7	105615406	.	G	A	258.69	PASS	AF=0.352273;AO=31;DP=88;FAO=31;FDP=88;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=39;FSRR=18;FWDB=-0.0253365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.901;QD=11.7587;RBI=0.0429265;REFB=-0.0304924;REVB=-0.0346518;RO=57;SAF=22;SAR=9;SRF=39;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0340127;STB=0.519672;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.042176;OID=.;OPOS=105615406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:57:57:31:31:0.352273:9:22:39:18:9:22:39:18
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chr7	105668105	.	TAAAAAAAAAAAAAG	TAAAAAAAAAAG,TAAATAAAAAAAAAG,TTAAAAAAAAAAAAG,TTAAAAAAAAAAGAT	239.53	PASS	AF=0.541667,0.458333,0,0;AO=4,7,2,2;DP=28;FAO=13,11,0,0;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0,0,0;FSAR=8,11,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.134546,0.0147293,0.0698925,0.0704583;FXX=0.172354;HRUN=13,13,13,13;LEN=3,1,1,14;MLLD=17.0835,112.402,11.3808,49.905;QD=39.9215;RBI=0.135538,0.0190497,0.0816291,0.0704589;REFB=0,0,0,0;REVB=-0.0163662,-0.0120805,-0.0421704,-0.00028746;RO=0;SAF=1,0,2,2;SAR=3,7,0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-4.86674e-08,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,snp,snp,mnp;VARB=-0.013626,0.0346444,0,-0.00840079;OID=.,.,.,.;OPOS=105668106,105668109,105668106,105668106;OREF=AAA,A,A,AAAAAAAAAAAAAG;OALT=-,T,T,TAAAAAAAAAAGAT;OMAPALT=TAAAAAAAAAAG,TAAATAAAAAAAAAG,TTAAAAAAAAAAAAG,TTAAAAAAAAAAGAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.541667,0.458333,0,0:4,7,2,2:28:13,11,0,0:24:0:5,0,0,0:8,11,0,0:0:0:80:0:1,0,2,2:3,7,0,0:0:0
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chr7	106508987	.	T	C,G	2786.11	PASS	AF=0.956284,0.0382514;AO=174,8;DP=183;FAO=175,7;FDP=183;FR=.;FRO=1;FSAF=116,7;FSAR=59,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00703137,-0.00541459;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=82.164,96.2029;QD=60.8987;RBI=0.00990647,0.0282995;REFB=-0.0301052,-0.139271;REVB=0.00697839,-0.0277767;RO=1;SAF=115,8;SAR=59,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00412147,0;STB=0.502146,0.5;STBP=0.53,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000702877,0.112942;OID=.,.;OPOS=106508987,106508987;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:183:183:1:1:174,8:175,7:0.956284,0.0382514:59,0:115,8:1:0:59,0:116,7:1:0
chr7	106509331	.	C	A	380.23	PASS	AF=0.606557;AO=37;DP=61;FAO=37;FDP=61;FR=.;FRO=24;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.00067394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.367;QD=24.9332;RBI=0.0631417;REFB=0.0121248;REVB=0.0631381;RO=24;SAF=25;SAR=12;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224255;STB=0.6232;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.00769767;OID=.;OPOS=106509331;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:24:24:37:37:0.606557:12:25:9:15:12:25:9:15
chr7	106524689	.	C	T	502.26	PASS	AF=0.527473;AO=48;DP=91;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.0357068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.528;QD=22.0772;RBI=0.0575271;REFB=-0.0345298;REVB=-0.0451043;RO=43;SAF=26;SAR=22;SRF=14;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183707;STB=0.601047;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0252144;OID=.;OPOS=106524689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:43:43:48:48:0.527473:22:26:14:29:22:26:14:29
chr7	106685448	.	G	T	902.69	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0881242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.805;QD=58.2383;RBI=0.120536;REFB=0;REVB=0.0822383;RO=0;SAF=42;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000655881;OID=.;OPOS=106685448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:20:42:0:0:20:42:0:0
chr7	107002806	.	A	G	356.81	PASS	AF=0.4;AO=42;DP=105;FAO=42;FDP=105;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=0.0159287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.2152;QD=13.5928;RBI=0.025545;REFB=-0.0134346;REVB=0.0199706;RO=63;SAF=26;SAR=16;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05264;STB=0.529843;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0412232;OID=.;OPOS=107002806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:63:63:42:42:0.4:16:26:36:27:16:26:36:27
chr7	107188719	.	G	T	323.52	PASS	AF=0.460526;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0368898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5368;QD=17.0276;RBI=0.0910225;REFB=-0.0205169;REVB=-0.083212;RO=40;SAF=14;SAR=21;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246418;STB=0.508192;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0252404;OID=.;OPOS=107188719;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:40:41:35:35:0.460526:21:14:17:23:21:14:17:24
chr7	107208250	.	T	C	171.5	PASS	AF=0.333333;AO=20;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.00242669;FXX=0.0416609;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.941;QD=9.94183;RBI=0.00882109;REFB=-0.00954974;REVB=-0.00848074;RO=49;SAF=5;SAR=15;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.388539;STB=0.645442;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0190194;OID=.;OPOS=107208250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:49:46:20:23:0.333333:15:5:28:21:15:8:26:20
chr7	107414419	.	A	G	894.97	PASS	AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0117684;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.249;QD=55.0752;RBI=0.0275311;REFB=-0.178289;REVB=0.0248891;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519225;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.000821315;OID=.;OPOS=107414419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:65:65:0:2:63:63:0.969231:25:38:0:0:25:38:0:2
chr7	107559911	.	G	A	868.22	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6502;QD=57.8811;RBI=0.0267604;REFB=0;REVB=0.0190936;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.02231e-06;OID=.;OPOS=107559911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr7	107569517	.	A	G	293.49	PASS	AF=0.333333;AO=38;DP=114;FAO=38;FDP=114;FR=.;FRO=76;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=50;FSRR=26;FWDB=0.00542241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.75;QD=10.2978;RBI=0.0345433;REFB=-0.00612271;REVB=-0.034115;RO=76;SAF=29;SAR=9;SRF=50;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150732;STB=0.588015;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.012495;OID=.;OPOS=107569517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:76:76:38:38:0.333333:9:29:50:26:9:29:50:26
chr7	107593989	.	T	C	88.25	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.852;QD=39.2203;RBI=0.0265857;REFB=0;REVB=0.0186757;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00034518;OID=.;OPOS=107593989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:8:9:1:2:6:0:0:3:6:0:0
chr7	107603431	.	A	C	590.38	PASS	AF=0.41358;AO=67;DP=164;FAO=67;FDP=162;FR=.;FRO=95;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=58;FSRR=37;FWDB=-0.021987;FXX=0.0121944;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.932;QD=14.5773;RBI=0.0224093;REFB=-0.0152984;REVB=0.00432961;RO=94;SAF=31;SAR=36;SRF=57;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148843;STB=0.586037;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0161072;OID=.;OPOS=107603431;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:162:94:95:67:67:0.41358:36:31:57:37:36:31:58:37
chr7	107788905	.	CTG	C	217.91	PASS	AF=0.552632;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=-0.0310929;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=2;MLLD=180.998;QD=22.9382;RBI=0.0311973;REFB=-0.0198935;REVB=-0.00254956;RO=17;SAF=7;SAR=14;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915441;STB=0.550974;STBP=0.517;TYPE=del;VARB=0.0150041;OID=.;OPOS=107788906;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.552632:21:39:21:38:17:7:14:4:13:99:17:7:14:4:13
chr7	107818851	.	T	C	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00947163;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.477;QD=63.583;RBI=0.0384846;REFB=0;REVB=0.0373008;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.63655e-05;OID=.;OPOS=107818851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:31:16:0:0:31:16:0:0
chr7	107824678	.	A	G	1231.3	PASS	AF=1;AO=67;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=53;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0858035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.188;QD=61.5652;RBI=0.0880593;REFB=0;REVB=0.0198039;RO=0;SAF=42;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.93036e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000684003;OID=.;OPOS=107824678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:67:80:1:25:42:0:0:27:53:0:0
chr7	107824889	.	C	G	454.09	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0858807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.454;QD=56.7613;RBI=0.0986435;REFB=0;REVB=0.0485288;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00149598;OID=.;OPOS=107824889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:30:32:1:14:16:0:0:14:18:0:0
chr7	107834613	.	G	C	751.65	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0555188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.696;QD=56.7281;RBI=0.0604442;REFB=0;REVB=0.0238989;RO=0;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0001309;OID=.;OPOS=107834613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:22:31:0:0:22:31:0:0
chr7	107834734	.	C	T	1104.65	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.42;QD=59.7106;RBI=0.0410578;REFB=0;REVB=0.0375258;RO=0;SAF=39;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110614;OID=.;OPOS=107834734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:72:74:1:33:39:0:0:33:41:0:0
chr7	107838464	.	G	T	937.49	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0121665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.85;QD=58.5931;RBI=0.0921967;REFB=0;REVB=-0.0913904;RO=0;SAF=26;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000438463;OID=.;OPOS=107838464;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:38:26:0:0:38:26:0:0
chr7	107849908	.	G	A	1413.43	PASS	AF=1;AO=69;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00136338;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.93;QD=62.1288;RBI=0.0115423;REFB=0;REVB=-0.0114615;RO=0;SAF=44;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148067;OID=.;OPOS=107849908;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:91:0:0:69:91:1:25:44:0:0:40:51:0:0
chr7	107849909	.	T	A	81.16	PASS	AF=0.159574;AO=13;DP=92;FAO=15;FDP=94;FR=.;FRO=79;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=48;FSRR=31;FWDB=-0.0139948;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=94.3441;QD=3.4536;RBI=0.0234489;REFB=-0.00136637;REVB=0.0188148;RO=79;SAF=3;SAR=10;SRF=48;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.450036;STB=0.825501;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00202672;OID=.;OPOS=107849909;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:92:94:79:79:13:15:0.159574:10:3:48:31:12:3:48:31
chr7	107872816	.	G	A	908.72	PASS	AF=1;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187132;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.792;QD=58.6268;RBI=0.0523119;REFB=0;REVB=0.0488503;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107626;OID=.;OPOS=107872816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:62:0:0:62:62:1:36:26:0:0:36:26:0:0
chr7	107875170	.	T	C	711.49	PASS	AF=0.962963;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0117226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.744;QD=52.703;RBI=0.0124074;REFB=-0.0105834;REVB=0.00406486;RO=1;SAF=18;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254383;STB=0.506267;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.000145326;OID=.;OPOS=107875170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:54:1:2:51:52:0.962963:33:18:1:0:34:18:1:1
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chr7	111367623	.	T	C	137.37	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0142698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.458;QD=11.2142;RBI=0.0150322;REFB=-0.00134324;REVB=-0.0047266;RO=33;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0540173;STB=0.532093;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.00278551;OID=.;OPOS=111367623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:33:33:16:16:0.326531:7:9:17:16:7:9:17:16
chr7	111487098	.	C	T	214.34	PASS	AF=0.38806;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0173379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2394;QD=12.7966;RBI=0.0212422;REFB=0.00658776;REVB=-0.012273;RO=40;SAF=18;SAR=8;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214901;STB=0.631856;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=-0.0152173;OID=.;OPOS=111487098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:40:41:26:26:0.38806:8:18:20:20:8:18:20:21
chr7	111970342	.	A	G	374.08	PASS	AF=0.933333;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.067451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2077;QD=49.8779;RBI=0.0785;REFB=-0.148887;REVB=0.0401573;RO=2;SAF=11;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0772824;STB=0.538434;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0151696;OID=.;OPOS=111970342;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:30:2:2:27:28:0.933333:16:11:2:0:16:12:2:0
chr7	112101907	.	ATTTT	ATATA,ATATT,ATTAT,AT	481.97	PASS	AF=0.0779221,0.363636,0.103896,0.298701;AO=4,7,6,16;DP=74;FAO=6,28,8,23;FDP=77;FR=.;FRO=12;FSAF=2,11,1,16;FSAR=4,17,7,7;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0140105,-0.00566139,-0.00679386,-0.0168859;FXX=0.0374953;HRUN=11,11,11,11;LEN=3,1,1,3;MLLD=110.585,113.879,108.048,8.81933;QD=25.0373;RBI=0.173436,0.140958,0.179193,0.299378;REFB=-0.0564492,-0.0601909,-0.0687227,-0.2612;REVB=-0.172869,-0.140845,-0.179064,-0.298901;RO=5;SAF=1,6,0,7;SAR=3,1,6,9;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.590845,-0.258845,-0.819749,-0.238547;STB=0.837919,0.65374,0.912181,0.596139;STBP=0.125,0.006,0.018,0.223;TYPE=mnp,snp,snp,del;VARB=0.00346287,0.0404333,-0.0167407,0.260912;OID=.,.,.,.;OPOS=112101909,112101909,112101910,112101908;OREF=TTT,T,T,TTT;OALT=ATA,A,A,-;OMAPALT=ATATA,ATATT,ATTAT,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/4:0.0779221,0.363636,0.103896,0.298701:4,7,6,16:74:6,28,8,23:77:12:2,11,1,16:4,17,7,7:11:1:99:5:1,6,0,7:3,1,6,9:5:0
chr7	112102355	.	T	G	620.27	PASS	AF=0.496063;AO=63;DP=127;FAO=63;FDP=127;FR=.;FRO=64;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=0.0382415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.1212;QD=19.5359;RBI=0.049641;REFB=-0.0190722;REVB=0.0316515;RO=64;SAF=38;SAR=25;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152315;STB=0.584146;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0111947;OID=.;OPOS=112102355;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:64:64:63:63:0.496063:25:38:28:36:25:38:28:36
chr7	112112279	.	G	A	312.83	PASS	AF=0.561404;AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00299824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=323.983;QD=21.9527;RBI=0.00642031;REFB=0.00216475;REVB=0.00567723;RO=25;SAF=16;SAR=16;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175113;STB=0.596433;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.00206941;OID=.;OPOS=112112279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:25:25:32:32:0.561404:16:16:18:7:16:16:18:7
chr7	112405982	.	TAAAAAAAT	TAAAAAAT,TAAAAAATA	107.26	PASS	AF=0.45679,0.0246914;AO=35,3;DP=81;FAO=37,2;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=26,0;FSAR=11,2;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=0.0429616,0.000739113;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=6.76729,181.302;QD=5.29677;RBI=0.101404,0.00374628;REFB=-0.105123,-0.00965062;REVB=0.0918536,-0.00367265;RO=32;SAF=24,0;SAR=11,3;SRF=21;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0290294,-0.612085;STB=0.507726,0.996609;STBP=0.911,0.056;TYPE=del,mnp;VARB=0.133882,-0.0268707;OID=.,.;OPOS=112405983,112405989;OREF=A,AT;OALT=-,TA;OMAPALT=TAAAAAAT,TAAAAAATA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.45679,0.0246914:35,3:81:37,2:81:42:26,0:11,2:29:13:99:32:24,0:11,3:21:11
chr7	112406507	.	C	T	128.28	PASS	AF=0.357143;AO=15;DP=42;FAO=15;FDP=42;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0162716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.426;QD=12.2168;RBI=0.0177623;REFB=-0.00967652;REVB=0.00712276;RO=27;SAF=6;SAR=9;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169479;STB=0.599867;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0161487;OID=.;OPOS=112406507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:27:27:15:15:0.357143:9:6:15:12:9:6:15:12
chr7	112459652	.	T	A	179.07	PASS	AF=0.404255;AO=18;DP=46;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0294319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.22;QD=15.2397;RBI=0.0299145;REFB=-0.00919563;REVB=0.00535187;RO=28;SAF=7;SAR=11;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227155;STB=0.641277;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0111005;OID=.;OPOS=112459652;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:28:28:18:19:0.404255:11:7:17:11:12:7:17:11
chr7	112459770	.	T	C	184.24	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.000840769;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.893;QD=24.5659;RBI=0.0146781;REFB=-0.024377;REVB=0.014654;RO=11;SAF=11;SAR=7;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286132;STB=0.672479;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00699573;OID=.;OPOS=112459770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:31:30:11:12:18:18:0.6:7:11:2:9:7:11:2:10
chr7	112461608	.	A	G	270.04	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0203609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.45;QD=22.9819;RBI=0.036373;REFB=-0.0222027;REVB=0.0301401;RO=22;SAF=20;SAR=5;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18551;STB=0.60456;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0138948;OID=.;OPOS=112461608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:5:20:14:8:5:20:14:8
chr7	112724417	.	A	G	463.4	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451211;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.9976;QD=57.9251;RBI=0.0652558;REFB=0;REVB=0.0471424;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120658;OID=.;OPOS=112724417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:17:14:0:0:18:14:0:0
chr7	112724525	.	A	G	372.78	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.387;QD=53.2547;RBI=0.0211256;REFB=-0.0445579;REVB=0.0105768;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445666;OID=.;OPOS=112724525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:28:28:0:0:27:28:1:15:12:0:0:16:12:0:0
chr7	113518434	.	C	A	172.21	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0871751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0698;QD=26.4931;RBI=0.090407;REFB=-0.036927;REVB=-0.0239565;RO=9;SAF=5;SAR=12;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106481;STB=0.559513;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0118905;OID=.;OPOS=113518434;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:9:9:17:17:0.653846:12:5:4:5:12:5:4:5
chr7	113518498	.	C	A	308.0	PASS	AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0359792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.742;QD=24.1566;RBI=0.0523384;REFB=-0.0199514;REVB=-0.0380106;RO=21;SAF=11;SAR=19;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489478;STB=0.527028;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0173791;OID=.;OPOS=113518498;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:19:11:9:12:19:11:9:12
chr7	113518502	.	A	T	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00339016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.661;QD=64.4153;RBI=0.0285635;REFB=0;REVB=0.0283616;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.69447e-05;OID=.;OPOS=113518502;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr7	113519719	.	A	T	968.36	PASS	AF=0.985294;AO=64;DP=65;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00594345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.803;QD=56.9621;RBI=0.0243502;REFB=-0.0855396;REVB=0.0236137;RO=1;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154834;STB=0.507934;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00129513;OID=.;OPOS=113519719;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:68:1:1:64:67:0.985294:30:34:0:1:31:36:0:1
chr7	113519796	.	C	T	754.27	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00367543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1705;QD=56.9262;RBI=0.0243592;REFB=0;REVB=-0.0240803;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000155743;OID=.;OPOS=113519796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:23:30:0:0:23:30:0:0
chr7	114296590	.	A	C	196.46	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0507648;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.927;QD=16.72;RBI=0.0562936;REFB=0.01096;REVB=0.0243291;RO=27;SAF=7;SAR=13;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137497;STB=0.578984;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.0070209;OID=.;OPOS=114296590;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:47:27:27:20:20:0.425532:13:7:13:14:13:7:13:14
chr7	114619598	.	C	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106486;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=325.412;QD=44.6898;RBI=0.0106486;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=13;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75006e-05;OID=.;OPOS=114619598;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:0:13:0:0:0:13:0:0
chr7	115578124	.	G	T	899.69	PASS	AF=0.984375;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0109155;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.151;QD=56.2303;RBI=0.0135667;REFB=-0.103863;REVB=-0.0080565;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00171369;OID=.;OPOS=115578124;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:0:1:62:63:0.984375:29:33:0:0:30:33:0:1
chr7	115892650	.	T	G	415.36	PASS	AF=0.488372;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.00101307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.458;QD=19.319;RBI=0.0059326;REFB=-0.0157884;REVB=-0.00584547;RO=44;SAF=24;SAR=18;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10785;STB=0.559971;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0208359;OID=.;OPOS=115892650;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:44:44:42:42:0.488372:18:24:20:24:18:24:20:24
chr7	115897392	.	G	C	343.23	PASS	AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.00447488;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.578;QD=18.8072;RBI=0.0131549;REFB=-0.0197789;REVB=-0.0123704;RO=36;SAF=20;SAR=16;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025352;STB=0.506169;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0214947;OID=.;OPOS=115897392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:36:37:36:36:0.493151:16:20:21:15:16:20:21:16
chr7	116146127	.	C	T	482.94	PASS	AF=0.490385;AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=104;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=37;FWDB=-0.0439552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.946;QD=18.5748;RBI=0.0537612;REFB=-0.00993523;REVB=-0.030955;RO=52;SAF=21;SAR=30;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100127;STB=0.558976;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00970808;OID=.;OPOS=116146127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:52:53:51:51:0.490385:30:21:16:36:30:21:16:37
chr7	116165360	.	A	C,G	633.54	PASS	AF=0.928571,0.0714286;AO=39,3;DP=42;FAO=39,3;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=32,3;FSAR=7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204802,-0.0119995;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=110.979,160.29;QD=60.3375;RBI=0.0980979,0.0183344;REFB=0,0;REVB=0.0959362,0.0138623;RO=0;SAF=33,2;SAR=6,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00815568,0.0486443;OID=.,.;OPOS=116165360,116165360;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:42:42:0:0:39,3:39,3:0.928571,0.0714286:6,1:33,2:0:0:7,0:32,3:0:0
chr7	116165462	.	CTT	CCT,CTC	616.24	PASS	AF=0.837209,0.162791;AO=26,8;DP=43;FAO=36,7;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25,5;FSAR=11,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0896356,-0.0170813;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=32.5385,44.3606;QD=57.325;RBI=0.153625,0.193012;REFB=0,0;REVB=0.124765,-0.192254;RO=0;SAF=21,5;SAR=5,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.46938e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00843282,0.11473;OID=.,.;OPOS=116165463,116165464;OREF=T,T;OALT=C,C;OMAPALT=CCT,CTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.837209,0.162791:26,8:43:36,7:43:0:25,5:11,2:0:0:31:0:21,5:5,3:0:0
chr7	116364823	.	CA	C	230.25	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00380074;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.858;QD=16.4462;RBI=0.0168154;REFB=-0.0196115;REVB=-0.0163802;RO=31;SAF=14;SAR=12;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525914;STB=0.520645;STBP=0.746;TYPE=del;VARB=0.019336;OID=.;OPOS=116364824;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.464286:26:57:26:56:30:14:12:15:15:99:31:14:12:15:16
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chr7	116437606	.	G	A	2033.64	PASS	AF=1;AO=127;DP=129;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142875;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.161;QD=62.0958;RBI=0.0160735;REFB=0;REVB=-0.00736365;RO=1;SAF=67;SAR=60;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00703987;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.62115e-05;OID=.;OPOS=116437606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:131:1:0:127:131:1:60:67:1:0:62:69:0:0
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chr7	120740103	.	G	T	2006.92	PASS	AF=1;AO=128;DP=130;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00593157;FXX=0.0303007;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.467;QD=62.7164;RBI=0.00630821;REFB=0;REVB=0.0021471;RO=0;SAF=92;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17504e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.7227e-05;OID=.;OPOS=120740103;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:128:0:0:128:128:1:36:92:0:0:36:92:0:0
chr7	120764477	.	G	C	392.91	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.4418;QD=56.1298;RBI=0.0632163;REFB=0;REVB=0.0445065;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00196302;OID=.;OPOS=120764477;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:8:20:0:0:8:20:0:0
chr7	120765954	.	T	C	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00220007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.021;QD=58.4197;RBI=0.0142009;REFB=0;REVB=0.0140294;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.47621e-05;OID=.;OPOS=120765954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0
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chr7	123152035	.	T	C	219.14	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.000485432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.059;QD=13.9133;RBI=0.0459841;REFB=-0.0182303;REVB=-0.0459816;RO=36;SAF=15;SAR=11;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0791394;STB=0.537672;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0408795;OID=.;OPOS=123152035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:36:37:26:26:0.412698:11:15:18:18:11:15:19:18
chr7	123197020	.	GGT	GG,G	48.42	PASS	AF=0.607143,0;AO=8,3;DP=29;FAO=17,0;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=8,0;FSAR=9,0;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.283117,0.079481;FXX=0.0344709;HRUN=7,3;LEN=1,2;MLLD=8.04144,13.9055;QD=6.9168;RBI=0.290239,0.189679;REFB=-0.100305,-0.0138371;REVB=0.0639017,-0.172223;RO=14;SAF=3,0;SAR=5,3;SRF=9;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.274631,-0.677194;STB=0.564778,0.5;STBP=0.449,1;TYPE=del,del;VARB=0.12459,0;OID=.,.;OPOS=123197022,123197021;OREF=T,GT;OALT=-,-;OMAPALT=GG,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.607143,0:8,3:29:17,0:28:11:8,0:9,0:7:4:41:14:3,0:5,3:9:5
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chr7	123264804	.	C	T	482.59	PASS	AF=0.554217;AO=46;DP=83;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.0102183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7066;QD=23.2575;RBI=0.0153001;REFB=0.00398363;REVB=-0.0113876;RO=37;SAF=24;SAR=22;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941314;STB=0.551702;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=-0.00372834;OID=.;OPOS=123264804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:37:37:46:46:0.554217:22:24:15:22:22:24:15:22
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chr7	124116470	.	A	G	58.62	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0403907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1508;QD=14.6539;RBI=0.0566688;REFB=-0.0112472;REVB=0.0397485;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323874;STB=0.687096;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0102554;OID=.;OPOS=124116470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:4:4:1:7:4:4:1:7
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chr7	124387374	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.4966;QD=33.4285;RBI=0.0634967;REFB=0;REVB=-0.0601633;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00370111;OID=.;OPOS=124387374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr7	124486980	.	T	C	1448.95	PASS	AF=1;AO=62;DP=95;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394658;FXX=0.0421008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.821;QD=63.6902;RBI=0.129121;REFB=0;REVB=0.122941;RO=0;SAF=42;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000599257;OID=.;OPOS=124486980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:91:0:0:62:91:1:20:42:0:0:28:63:0:0
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chr7	124540872	.	C	T	321.13	PASS	AF=0.52381;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00929525;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.233;QD=20.3889;RBI=0.0382231;REFB=-0.0274349;REVB=0.0370756;RO=27;SAF=24;SAR=9;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160823;STB=0.588572;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0215787;OID=.;OPOS=124540872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:27:30:33:33:0.52381:9:24:15:12:9:24:17:13
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chr7	126542667	.	A	T	423.93	PASS	AF=0.525;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0403828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.8;QD=21.1966;RBI=0.0405785;REFB=-0.0110717;REVB=0.00398096;RO=34;SAF=24;SAR=18;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385864;STB=0.516476;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0116365;OID=.;OPOS=126542667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:80:34:38:42:42:0.525:18:24:21:13:18:24:23:15
chr7	127222157	.	G	A	210.15	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0299165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6628;QD=15.5663;RBI=0.0539154;REFB=0.00833083;REVB=0.0448539;RO=30;SAF=12;SAR=12;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163745;STB=0.592518;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=-0.00758585;OID=.;OPOS=127222157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:12:12:20:10:12:12:20:10
chr7	127224286	.	A	G	249.46	PASS	AF=0.466667;AO=26;DP=58;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00565578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.503;QD=16.6303;RBI=0.00565808;REFB=-0.008509;REVB=-0.000161116;RO=32;SAF=17;SAR=9;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243621;STB=0.648672;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0145265;OID=.;OPOS=127224286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:32:32:26:28:0.466667:9:17:13:19:9:19:13:19
chr7	127224414	.	AGGC	AG,AGC,AGTC	89.07	PASS	AF=0,0.404762,0.0714286;AO=5,12,3;DP=41;FAO=0,17,3;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=0,5,0;FSAR=0,12,3;FSRF=21;FSRR=1;FWDB=-0.0580991,-0.146181,-0.0337121;FXX=0.0232504;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=82.3667,13.2954,113.831;QD=8.48239;RBI=0.161508,0.174761,0.0622025;REFB=-0.0125733,-0.189574,-0.0107656;REVB=-0.150696,-0.0957731,-0.0522748;RO=18;SAF=1,8,0;SAR=4,4,3;SRF=17;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0.308901,0.308901,0;SSSB=-0.734837,-0.380088,-0.821145;STB=0.5,0.827285,0.998929;STBP=1,0.004,0.001;TYPE=del,del,snp;VARB=0,0.15941,0.0445689;OID=.,.,.;OPOS=127224416,127224415,127224416;OREF=GC,G,G;OALT=-,-,T;OMAPALT=AG,AGC,AGTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.404762,0.0714286:5,12,3:41:0,17,3:42:22:0,5,0:0,12,3:21:1:53:18:1,8,0:4,4,3:17:1
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chr7	127721507	.	T	C	222.02	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0136464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.462;QD=14.5589;RBI=0.0250123;REFB=-0.0272742;REVB=0.0209617;RO=35;SAF=20;SAR=6;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143919;STB=0.582456;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0323203;OID=.;OPOS=127721507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:6:20:23:12:6:20:23:12
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chr7	128098071	.	G	A	367.81	PASS	AF=0.552239;AO=37;DP=67;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=-0.0140664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.892;QD=21.959;RBI=0.0442014;REFB=0.00449751;REVB=0.0419034;RO=30;SAF=16;SAR=21;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11156;STB=0.561371;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.00355299;OID=.;OPOS=128098071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:30:30:37:37:0.552239:21:16:9:21:21:16:9:21
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chr7	128133984	.	G	A	656.08	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393956;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.922;QD=62.4839;RBI=0.039543;REFB=0;REVB=0.00341138;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176367;OID=.;OPOS=128133984;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr7	128140982	.	T	C	315.66	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00165436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.543;QD=17.5365;RBI=0.00220786;REFB=-0.0126239;REVB=0.0014621;RO=38;SAF=15;SAR=19;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557845;STB=0.531232;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0131593;OID=.;OPOS=128140982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:19:15:19:19:19:15:19:19
chr7	128141865	.	T	C	1320.64	PASS	AF=0.988506;AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00276788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.525;QD=60.7192;RBI=0.0195088;REFB=-0.124137;REVB=-0.0193115;RO=1;SAF=54;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00869298;STB=0.504586;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-4.19214e-05;OID=.;OPOS=128141865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:86:87:1:1:85:86:0.988506:31:54:1:0:32:54:1:0
chr7	128312450	.	C	T	188.71	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00338023;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.431;QD=19.8643;RBI=0.00941315;REFB=-0.00982099;REVB=0.0087853;RO=19;SAF=6;SAR=13;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240949;STB=0.636739;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0203549;OID=.;OPOS=128312450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:19:19:19:19:0.5:13:6:11:8:13:6:11:8
chr7	128358891	.	C	A	386.63	PASS	AF=0.405405;AO=45;DP=111;FAO=45;FDP=111;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=39;FSRR=27;FWDB=0.00404788;FXX=0.00892777;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.887;QD=13.9326;RBI=0.00406729;REFB=-0.000890664;REVB=0.000396951;RO=65;SAF=30;SAR=15;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076053;STB=0.548997;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.000807661;OID=.;OPOS=128358891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:65:66:45:45:0.405405:15:30:39:26:15:30:39:27
chr7	128363287	.	G	A	288.86	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0070177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.108;QD=21.0082;RBI=0.0225974;REFB=-0.0227464;REVB=-0.0214801;RO=24;SAF=9;SAR=21;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313394;STB=0.510722;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0186495;OID=.;OPOS=128363287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:25:30:30:0.545455:21:9:8:16:21:9:8:17
chr7	128371206	.	G	A	232.0	PASS	AF=0.322222;AO=29;DP=90;FAO=29;FDP=90;FR=.;FRO=61;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=39;FWDB=-0.0164633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.013;QD=10.3113;RBI=0.0336915;REFB=-0.0162755;REVB=-0.0293952;RO=58;SAF=11;SAR=18;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02111;STB=0.513504;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0313017;OID=.;OPOS=128371206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:58:61:29:29:0.322222:18:11:21:37:18:11:22:39
chr7	128451353	.	C	CAGAGAGCCTGGGA	327.12	PASS	AF=1;AO=20;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271842;FXX=0;HRUN=2;LEN=13;MLLD=375.755;QD=52.3391;RBI=0.0383496;REFB=0;REVB=0.0270501;RO=1;SAF=8;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541413;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000594988;OID=.;OPOS=128451354;OREF=-;OALT=AGAGAGCCTGGGA;OMAPALT=CAGAGAGCCTGGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:20:26:25:25:0:11:14:0:0:4:1:8:12:1:0
chr7	128455767	.	C	G	399.58	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.205;QD=55.1143;RBI=0.0292648;REFB=0;REVB=0.00466863;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.18544e-05;OID=.;OPOS=128455767;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:20:8:0:0:21:8:0:0
chr7	128455916	.	G	A	424.83	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0589655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2279;QD=54.8171;RBI=0.107389;REFB=-0.0692119;REVB=0.0897522;RO=1;SAF=21;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489889;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00633766;OID=.;OPOS=128455916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:31:31:1:0:30:31:1:9:21:0:1:10:21:0:0
chr7	128478103	.	C	T	820.68	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229159;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.393;QD=57.5913;RBI=0.0233217;REFB=0;REVB=0.00433153;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000213651;OID=.;OPOS=128478103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:27:29:0:0:27:30:0:0
chr7	128480123	.	C	A	499.56	PASS	AF=0.945946;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0198087;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.7289;QD=54.006;RBI=0.094865;REFB=-0.158826;REVB=0.0927738;RO=1;SAF=19;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239852;STB=0.502331;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0119404;OID=.;OPOS=128480123;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:37:1:2:35:35:0.945946:16:19:1:0:16:19:1:1
chr7	128484816	.	A	G	2352.33	PASS	AF=1;AO=152;DP=153;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.387;QD=60.7053;RBI=0.0254272;REFB=0;REVB=0.011034;RO=0;SAF=89;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49468e-05;OID=.;OPOS=128484816;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:153:155:0:0:152:155:1:63:89:0:0:66:89:0:0
chr7	128486363	.	C	T	1061.26	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.536;QD=58.9588;RBI=0.0397609;REFB=0;REVB=0.030842;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000596438;OID=.;OPOS=128486363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:72:0:0:69:72:1:35:34:0:0:36:36:0:0
chr7	128486446	.	C	T	1557.9	PASS	AF=1;AO=98;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.446;QD=62.9456;RBI=0.0300103;REFB=-0.0769323;REVB=0.0180716;RO=1;SAF=42;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839512;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.98693e-05;OID=.;OPOS=128486446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:99:99:1:0:98:99:1:56:42:0:1:57:42:0:0
chr7	128487866	.	T	C	348.75	PASS	AF=0.964286;AO=26;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00613654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3327;QD=49.8217;RBI=0.0327153;REFB=0.0884962;REVB=0.0321347;RO=1;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617811;STB=0.533308;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.0014578;OID=.;OPOS=128487866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:28:28:1:1:26:27:0.964286:7:19:0:1:7:20:0:1
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chr7	128491603	.	T	C	1030.33	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210847;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.073;QD=59.729;RBI=0.0250902;REFB=0;REVB=-0.0135997;RO=0;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.0688e-05;OID=.;OPOS=128491603;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:28:41:0:0:28:41:0:0
chr7	128495338	.	C	T	1110.07	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0175272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.892;QD=60.0037;RBI=0.0648453;REFB=0;REVB=0.0624317;RO=0;SAF=55;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.24299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284409;OID=.;OPOS=128495338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:18:55:0:0:19:55:0:0
chr7	128532980	.	T	C	82.03	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0435614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.598;QD=32.813;RBI=0.0683106;REFB=0.0206433;REVB=0.0526189;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984833;STB=0.555432;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.0136244;OID=.;OPOS=128532980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:5:4:1:0:5:4:1:0
chr7	128544133	.	G	T	1012.38	PASS	AF=0.972973;AO=70;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0841889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.199;QD=54.7233;RBI=0.0996498;REFB=-0.167325;REVB=0.0533133;RO=3;SAF=43;SAR=27;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228754;STB=0.511361;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00965549;OID=.;OPOS=128544133;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:74:74:3:2:70:72:0.972973:27:43:1:2:29:43:2:0
chr7	128550680	.	GCCCCC	GCCCC,GCCCCG	297.06	PASS	AF=1,0;AO=22,3;DP=27;FAO=25,0;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10,0;FSAR=15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484318,-0.100429;FXX=0.0740466;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=17.6157,5.1809;QD=47.5296;RBI=0.0519374,0.103685;REFB=0,0;REVB=-0.0187577,-0.0257811;RO=0;SAF=7,3;SAR=15,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.323529,0;SSEP=0,0;SSSB=5.79751e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00188465,0;OID=.,.;OPOS=128550681,128550685;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GCCCC,GCCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:22,3:27:25,0:25:0:10,0:15,0:0:0:3:0:7,3:15,0:0:0
chr7	128607384	.	G	A	708.07	PASS	AF=0.482993;AO=70;DP=147;FAO=71;FDP=147;FR=.;FRO=76;FSAF=48;FSAR=23;FSRF=45;FSRR=31;FWDB=-0.0432099;FXX=0.0134219;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.93;QD=19.2672;RBI=0.0552094;REFB=0.00723585;REVB=-0.0343654;RO=76;SAF=47;SAR=23;SRF=45;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817641;STB=0.547862;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=-0.00714485;OID=.;OPOS=128607384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:76:76:70:71:0.482993:23:47:45:31:23:48:45:31
chr7	128630227	.	C	T	920.09	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0433021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.33;QD=58.4186;RBI=0.0433038;REFB=0;REVB=0.000377845;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156243;OID=.;OPOS=128630227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:36:27:0:0:36:27:0:0
chr7	128641226	.	G	C	224.57	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0271425;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0265;QD=14.9711;RBI=0.0319799;REFB=-0.0167275;REVB=-0.0169115;RO=34;SAF=10;SAR=16;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231002;STB=0.630943;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0295549;OID=.;OPOS=128641226;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:34:34:26:26:0.433333:16:10:21:13:16:10:21:13
chr7	128767250	.	G	A	371.73	PASS	AF=0.381356;AO=44;DP=117;FAO=45;FDP=118;FR=.;FRO=73;FSAF=16;FSAR=29;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=-0.00934472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.265;QD=12.601;RBI=0.0345135;REFB=-0.0117493;REVB=0.0332244;RO=73;SAF=16;SAR=28;SRF=33;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101094;STB=0.562744;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0140229;OID=.;OPOS=128767250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:118:73:73:44:45:0.381356:28:16:33:40:29:16:33:40
chr7	128767410	.	A	G	280.95	PASS	AF=0.517241;AO=29;DP=57;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0237216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0527;QD=19.3757;RBI=0.0313794;REFB=-0.0283587;REVB=0.0205415;RO=27;SAF=16;SAR=13;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135407;STB=0.555783;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0220505;OID=.;OPOS=128767410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:27:28:29:30:0.517241:13:16:19:8:13:17:19:9
chr7	128767490	.	T	C	141.59	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0226883;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.8039;QD=16.6579;RBI=0.0246939;REFB=0.0017797;REVB=-0.00974835;RO=15;SAF=5;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638684;STB=0.577671;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.000468798;OID=.;OPOS=128767490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:17:15:15:0.441176:10:5:6:9:10:5:8:9
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chr7	128804780	.	C	G	1243.04	PASS	AF=0.987952;AO=81;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.176594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.581;QD=59.9053;RBI=0.176901;REFB=-0.125546;REVB=0.0104113;RO=1;SAF=28;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016609;STB=0.504672;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00156239;OID=.;OPOS=128804780;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:1:1:81:82:0.987952:53:28:1:0:53:29:0:1
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chr7	129297332	.	T	G	882.85	PASS	AF=0.969697;AO=59;DP=63;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.01683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8742;QD=53.5059;RBI=0.0172765;REFB=0.0558457;REVB=0.00390259;RO=2;SAF=38;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024187;STB=0.511901;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.000126492;OID=.;OPOS=129297332;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:66:2:2:59:64:0.969697:21:38:2:0:23:41:2:0
chr7	129395075	.	G	A	241.17	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0353547;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.036;QD=20.9716;RBI=0.0365904;REFB=-0.0093958;REVB=-0.00942887;RO=22;SAF=14;SAR=9;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24974;STB=0.649224;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00876268;OID=.;OPOS=129395075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:22:23:23:23:0.5:9:14:7:15:9:14:7:16
chr7	129504866	.	C	G	149.64	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0426388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.7637;QD=11.9712;RBI=0.0473073;REFB=-0.0196637;REVB=-0.0204919;RO=33;SAF=7;SAR=10;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926827;STB=0.554393;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0230129;OID=.;OPOS=129504866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:33:33:17:17:0.34:10:7:11:22:10:7:11:22
chr7	129664312	.	T	C	724.12	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0269755;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.027;QD=54.6503;RBI=0.0274093;REFB=-0.0128862;REVB=0.00485698;RO=1;SAF=30;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154433;STB=0.508194;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000772715;OID=.;OPOS=129664312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:22:30:1:0:22:30:1:0
chr7	129813738	.	T	C	785.19	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5544;QD=64.0972;RBI=0.159036;REFB=0;REVB=0.158311;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145001;OID=.;OPOS=129813738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0
chr7	129916515	.	T	C	834.37	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.712;QD=57.5426;RBI=0.0860165;REFB=0;REVB=0.0842925;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000238647;OID=.;OPOS=129916515;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:36:21:0:0:37:21:0:0
chr7	129938598	.	G	T	291.76	PASS	AF=0.619048;AO=25;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0106107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.031;QD=27.7867;RBI=0.0132737;REFB=-0.00960977;REVB=-0.00797516;RO=15;SAF=18;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192341;STB=0.580581;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.00741061;OID=.;OPOS=129938598;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:15:16:25:26:0.619048:7:18:7:8:8:18:8:8
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chr7	129962360	.	A	G	888.55	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0249099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.224;QD=56.4157;RBI=0.0254147;REFB=-0.0810111;REVB=0.00503999;RO=1;SAF=38;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012264;STB=0.506491;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000398481;OID=.;OPOS=129962360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:24:38:1:0:24:38:1:0
chr7	129962682	.	A	G	817.75	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.011;QD=57.3858;RBI=0.0529558;REFB=0;REVB=0.0464044;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.50525e-05;OID=.;OPOS=129962682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:25:31:0:0:26:31:0:0
chr7	130002317	.	T	C	246.52	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0822708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.116;QD=46.9562;RBI=0.0955271;REFB=-0.0598481;REVB=0.0485482;RO=1;SAF=10;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438656;STB=0.523786;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00649804;OID=.;OPOS=130002317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:10:10:1:0:10:10:1:0
chr7	130021488	.	G	C	999.22	PASS	AF=0.507389;AO=100;DP=203;FAO=103;FDP=203;FR=.;FRO=100;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=54;FSRR=46;FWDB=0.0137051;FXX=0.00490172;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.7326;QD=19.6891;RBI=0.0183846;REFB=0.0126504;REVB=0.0122541;RO=102;SAF=39;SAR=61;SRF=54;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130127;STB=0.581121;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.011096;OID=.;OPOS=130021488;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:203:203:102:100:100:103:0.507389:61:39:54:48:64:39:54:46
chr7	130080812	.	T	G	1467.73	PASS	AF=0.969388;AO=94;DP=99;FAO=95;FDP=98;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00572519;FXX=0.0101;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.249;QD=59.9075;RBI=0.0115493;REFB=-0.013188;REVB=-0.0100304;RO=2;SAF=53;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00256164;STB=0.503067;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.00029305;OID=.;OPOS=130080812;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:99:98:2:3:94:95:0.969388:41:53:1:1:41:54:2:1
chr7	130368464	.	G	A	644.69	PASS	AF=0.538462;AO=62;DP=118;FAO=63;FDP=117;FR=.;FRO=54;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.00225012;FXX=0.0168053;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.553;QD=22.0407;RBI=0.00445329;REFB=-0.0132141;REVB=-0.00384301;RO=50;SAF=35;SAR=27;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463351;STB=0.534873;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0117321;OID=.;OPOS=130368464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:117:50:54:62:63:0.538462:27:35:31:19:28:35:34:20
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chr7	131241085	.	G	A	50.08	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0775187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.389;QD=33.3876;RBI=0.0909833;REFB=0;REVB=0.0476321;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00250631;OID=.;OPOS=131241085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr7	131812922	.	T	C	885.29	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1543;QD=58.0515;RBI=0.0398856;REFB=0;REVB=0.00711441;RO=0;SAF=44;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.89926e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000343549;OID=.;OPOS=131812922;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:17:44:0:0:17:44:0:0
chr7	131814185	.	A	G	1487.1	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.376;QD=63.2808;RBI=0.112008;REFB=0;REVB=0.111288;RO=0;SAF=53;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.15175e-05;OID=.;OPOS=131814185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:94:0:0:90:94:1:37:53:0:0:40:54:0:0
chr7	131814529	.	G	A	288.91	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.0017476;FXX=0.020829;HRUN=5;LEN=1;MLLD=231.192;QD=24.5879;RBI=0.0040644;REFB=-0.0132594;REVB=-0.0036695;RO=19;SAF=21;SAR=5;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435495;STB=0.501318;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0117673;OID=.;OPOS=131814529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:19:21:26:26:0.553191:5:21:16:3:5:21:17:4
chr7	131815310	.	A	G	1058.32	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00693086;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2612;QD=58.7953;RBI=0.00706837;REFB=0;REVB=-0.00138747;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000886145;OID=.;OPOS=131815310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:72:0:0:68:72:1:38:30:0:0:40:32:0:0
chr7	131817850	.	T	C	571.01	PASS	AF=0.590909;AO=52;DP=88;FAO=52;FDP=88;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.00251812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5241;QD=25.955;RBI=0.0358493;REFB=-0.0403678;REVB=0.0357607;RO=36;SAF=24;SAR=28;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00804294;STB=0.504392;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0255407;OID=.;OPOS=131817850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:36:36:52:52:0.590909:28:24:17:19:28:24:17:19
chr7	131859678	.	G	T	370.09	PASS	AF=0.632653;AO=31;DP=49;FAO=31;FDP=49;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0393061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.2046;QD=30.2113;RBI=0.0399929;REFB=-0.00454039;REVB=-0.00737996;RO=18;SAF=10;SAR=21;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166327;STB=0.591488;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00164097;OID=.;OPOS=131859678;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:18:18:31:31:0.632653:21:10:10:8:21:10:10:8
chr7	131864591	.	T	C	1115.85	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0226358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.106;QD=60.3161;RBI=0.0386225;REFB=0;REVB=0.031294;RO=0;SAF=51;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.50646e-05;OID=.;OPOS=131864591;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:23:51:0:0:23:51:0:0
chr7	131870108	.	A	G	557.42	PASS	AF=0.453846;AO=59;DP=131;FAO=59;FDP=130;FR=.;FRO=71;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=30;FWDB=0.0469759;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.925;QD=17.1515;RBI=0.0472684;REFB=-0.00204417;REVB=0.0052499;RO=71;SAF=38;SAR=21;SRF=41;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695103;STB=0.538769;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00352278;OID=.;OPOS=131870108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:130:71:71:59:59:0.453846:21:38:41:30:21:38:41:30
chr7	131912277	.	G	C	560.23	PASS	AF=0.5;AO=58;DP=116;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.0190302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.939;QD=19.3181;RBI=0.0274383;REFB=-0.0402804;REVB=0.0197665;RO=58;SAF=35;SAR=23;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799367;STB=0.544192;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0447695;OID=.;OPOS=131912277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:58:58:58:58:0.5:23:35:30:28:23:35:30:28
chr7	132192295	.	G	A	106.88	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0105572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.7;QD=12.2153;RBI=0.0118459;REFB=-0.0101243;REVB=0.00537312;RO=22;SAF=7;SAR=6;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156584;STB=0.591793;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0100972;OID=.;OPOS=132192295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:6:7:15:7:6:7:15:7
chr7	132192949	.	T	C	718.84	PASS	AF=0.586207;AO=68;DP=116;FAO=68;FDP=116;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.024153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.723;QD=24.7874;RBI=0.0241569;REFB=-0.0163211;REVB=0.00043403;RO=46;SAF=36;SAR=32;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861475;STB=0.537983;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0135965;OID=.;OPOS=132192949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:46:48:68:68:0.586207:32:36:19:27:32:36:21:27
chr7	132707171	.	C	T	289.37	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.859;QD=52.6119;RBI=0.0963091;REFB=0;REVB=-0.0948027;RO=0;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.45803e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00141033;OID=.;OPOS=132707171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:4:17:0:0:4:18:0:0
chr7	132767617	.	C	A	123.13	PASS	AF=0.923077;AO=13;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00690239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7079;QD=37.8863;RBI=0.151888;REFB=-0.003762;REVB=-0.151731;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.533278;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.00350361;OID=.;OPOS=132767617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:0:1:13:12:0.923077:5:8:0:0:5:7:1:0
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chr7	133989543	.	A	G	252.77	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0724781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3442;QD=21.0644;RBI=0.0729975;REFB=0.0275805;REVB=0.00869284;RO=24;SAF=15;SAR=9;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.081145;STB=0.545418;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=-0.0202443;OID=.;OPOS=133989543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:9:15:17:7:9:15:17:7
chr7	134212741	.	A	G	743.09	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0326711;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.489;QD=59.447;RBI=0.033819;REFB=0.0082845;REVB=0.00873643;RO=1;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177516;STB=0.501677;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-0.000411324;OID=.;OPOS=134212741;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:1:2:48:48:0.96:26:22:0:1:26:22:1:1
chr7	134215403	.	T	C	706.57	PASS	AF=0.963636;AO=52;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00802188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.7442;QD=51.387;RBI=0.0182849;REFB=-0.0162944;REVB=0.0164313;RO=3;SAF=22;SAR=30;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00944468;STB=0.503175;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00136117;OID=.;OPOS=134215403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:3:2:52:53:0.963636:30:22:1:2:31:22:1:1
chr7	134221826	.	A	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.307;QD=53.9112;RBI=0.0639959;REFB=0;REVB=0.0577099;RO=0;SAF=2;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.48349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122871;OID=.;OPOS=134221826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:22:2:0:0:22:2:0:0
chr7	134225788	.	C	T	223.99	PASS	AF=1;AO=14;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.841;QD=49.7755;RBI=0.0628583;REFB=0;REVB=0.0109619;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000684244;OID=.;OPOS=134225788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:14:18:1:8:6:0:0:8:10:0:0
chr7	134225827	.	A	G	357.48	PASS	AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0344057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.5749;QD=49.3071;RBI=0.0516442;REFB=-0.0701886;REVB=0.0385145;RO=2;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0580428;STB=0.531227;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00691159;OID=.;OPOS=134225827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:15:12:0:2:15:12:0:2
chr7	134254179	.	C	G	269.33	PASS	AF=0.343434;AO=34;DP=103;FAO=34;FDP=99;FR=.;FRO=65;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=24;FWDB=0.0292994;FXX=0.0571374;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2585;QD=10.882;RBI=0.0978272;REFB=0.00329947;REVB=0.0933365;RO=60;SAF=19;SAR=15;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467185;STB=0.548418;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00474435;OID=.;OPOS=134254179;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:99:60:65:34:34:0.343434:15:19:36:24:15:19:41:24
chr7	134261097	.	C	G	353.31	PASS	AF=0.480519;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=0.0200415;FXX=0.0128189;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.909;QD=18.3538;RBI=0.0206671;REFB=-0.0197847;REVB=-0.00504659;RO=40;SAF=19;SAR=18;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0822794;STB=0.545876;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0198948;OID=.;OPOS=134261097;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:40:40:37:37:0.480519:18:19:17:23:18:19:17:23
chr7	134264286	.	C	T	100.67	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.108845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2403;QD=16.107;RBI=0.156618;REFB=-0.0341156;REVB=-0.112614;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103751;STB=0.559901;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.02912;OID=.;OPOS=134264286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:6:6:8:5:6:6:8:5
chr7	134576441	.	T	C	588.05	PASS	AF=0.891304;AO=44;DP=45;FAO=41;FDP=46;FR=.;FRO=5;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00246159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3323;QD=51.1346;RBI=0.0356352;REFB=-0.10636;REVB=0.0355501;RO=1;SAF=30;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323695;STB=0.563075;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00302265;OID=.;OPOS=134576441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:45:46:1:5:44:41:0.891304:14:30:0:1:12:29:1:4
chr7	134618710	.	A	G	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00159333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.508;QD=30.7898;RBI=0.0119706;REFB=0.0411741;REVB=0.0118641;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.533253;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=-0.000334214;OID=.;OPOS=134618710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:0:1:8:8:0.888889:7:1:0:0:7:1:0:1
chr7	134678253	.	T	A	357.26	PASS	AF=0.447059;AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0125661;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=261.301;QD=16.8123;RBI=0.0146335;REFB=-0.0177605;REVB=0.00749885;RO=47;SAF=19;SAR=19;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524021;STB=0.529396;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0164875;OID=.;OPOS=134678253;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:47:47:38:38:0.447059:19:19:26:21:19:19:26:21
chr7	134701856	.	G	C	1996.66	PASS	AF=0.984848;AO=130;DP=132;FAO=130;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00320415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.727;QD=60.5049;RBI=0.00473271;REFB=0.0373377;REVB=-0.0034831;RO=1;SAF=71;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00798707;STB=0.500705;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=-0.000235506;OID=.;OPOS=134701856;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:132:132:1:2:130:130:0.984848:59:71:0:1:59:71:1:1
chr7	134719551	.	C	G	1838.09	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.658;QD=60.7633;RBI=0.028991;REFB=0;REVB=-0.0113334;RO=0;SAF=61;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.93668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357717;OID=.;OPOS=134719551;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:121:0:0:119:121:1:58:61:0:0:59:62:0:0
chr7	134849280	.	T	A	1085.13	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00177133;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.549;QD=58.6556;RBI=0.059502;REFB=-0.132302;REVB=0.0594756;RO=1;SAF=46;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171952;STB=0.509088;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00047574;OID=.;OPOS=134849280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:27:46:0:1:27:46:0:1
chr7	134850465	.	C	T	1044.91	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.185;QD=59.709;RBI=0.101732;REFB=0;REVB=0.100184;RO=0;SAF=45;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269055;OID=.;OPOS=134850465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:24:45:0:0:24:46:0:0
chr7	134850469	.	A	G	1044.35	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.027;QD=59.6774;RBI=0.0206726;REFB=0;REVB=0.0206478;RO=0;SAF=46;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.69565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.96633e-05;OID=.;OPOS=134850469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:24:46:0:0:24:46:0:0
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chr7	135048804	.	C	T	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00365429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.023;QD=64.1538;RBI=0.0144218;REFB=0;REVB=0.0139511;RO=0;SAF=13;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.99464e-05;OID=.;OPOS=135048804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:36:13:0:0:36:13:0:0
chr7	135095270	.	A	G	1594.2	PASS	AF=0.981818;AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0467442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.694;QD=57.971;RBI=0.0564469;REFB=-0.141308;REVB=0.0316423;RO=2;SAF=60;SAR=48;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155578;STB=0.508195;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.000901432;OID=.;OPOS=135095270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:110:110:2:2:108:108:0.981818:48:60:2:0:48:60:2:0
chr7	135279315	.	A	C	146.88	PASS	AF=0.358491;AO=16;DP=52;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.0139139;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.156;QD=11.0852;RBI=0.0145547;REFB=-0.0264564;REVB=0.00427114;RO=34;SAF=4;SAR=12;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496347;STB=0.80738;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0403924;OID=.;OPOS=135279315;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:34:34:16:19:0.358491:12:4:24:10:15:4:24:10
chr7	135300783	.	C	G	230.46	PASS	AF=0.293578;AO=32;DP=109;FAO=32;FDP=109;FR=.;FRO=77;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=-0.00923259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.154;QD=8.45725;RBI=0.0138868;REFB=-0.0156895;REVB=-0.0103731;RO=77;SAF=21;SAR=11;SRF=39;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184488;STB=0.609166;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0268919;OID=.;OPOS=135300783;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:77:77:32:32:0.293578:11:21:39:38:11:21:39:38
chr7	135304273	.	G	C	1847.11	PASS	AF=1;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369338;FXX=0.0163921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.836;QD=61.5705;RBI=0.0404453;REFB=0;REVB=0.0164838;RO=0;SAF=57;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.52749e-06;OID=.;OPOS=135304273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:120:0:0:120:120:1:63:57:0:0:63:57:0:0
chr7	135387656	.	G	A	536.2	PASS	AF=0.948718;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0108762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3067;QD=54.9949;RBI=0.0431087;REFB=-0.0158054;REVB=-0.0417141;RO=1;SAF=23;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019929;STB=0.520822;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00333029;OID=.;OPOS=135387656;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:39:39:1:2:37:37:0.948718:14:23:1:0:14:23:2:0
chr7	135392876	.	T	C	2530.37	PASS	AF=1;AO=158;DP=158;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.593;QD=61.7164;RBI=0.0308112;REFB=0;REVB=0.017014;RO=0;SAF=80;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.38159e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.55395e-05;OID=.;OPOS=135392876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:158:164:0:0:158:164:1:78:80:0:0:79:85:0:0
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chr7	138347869	.	C	T	74.24	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0131664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.563;QD=10.2404;RBI=0.0157059;REFB=-0.00700393;REVB=-0.00856287;RO=18;SAF=5;SAR=5;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.059334;STB=0.551622;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0107355;OID=.;OPOS=138347869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:18:19:10:10:0.344828:5:5:10:8:5:5:11:8
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chr7	138417791	.	A	G	300.4	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=56;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0119401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0209;QD=21.4568;RBI=0.0174982;REFB=-0.0294638;REVB=0.0127914;RO=24;SAF=10;SAR=21;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245901;STB=0.645294;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00565627;OID=.;OPOS=138417791;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:24:25:31:31:0.553571:21:10:15:9:21:10:16:9
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chr7	138602916	.	G	C	119.54	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00241323;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.013;QD=13.6612;RBI=0.0207372;REFB=-0.00172702;REVB=0.0205963;RO=21;SAF=6;SAR=8;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240764;STB=0.639808;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00356423;OID=.;OPOS=138602916;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:8:6:14:7:8:6:14:7
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chr7	138761034	.	G	C	569.22	PASS	AF=0.542857;AO=57;DP=105;FAO=57;FDP=105;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=0.000695673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.701;QD=21.6844;RBI=0.0397129;REFB=0.00692091;REVB=-0.0397068;RO=48;SAF=36;SAR=21;SRF=31;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128043;STB=0.507025;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-0.00650802;OID=.;OPOS=138761034;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:48:48:57:57:0.542857:21:36:31:17:21:36:31:17
chr7	138764060	.	G	A	452.83	PASS	AF=0.478723;AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=94;FR=.;FRO=49;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.0235027;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.885;QD=19.2695;RBI=0.0241821;REFB=-0.00748259;REVB=-0.00569212;RO=49;SAF=21;SAR=24;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154677;STB=0.585878;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00590955;OID=.;OPOS=138764060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:49:49:45:45:0.478723:24:21:31:18:24:21:31:18
chr7	138764145	.	T	C	191.66	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.00786769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.219;QD=15.6453;RBI=0.0158286;REFB=-0.00961741;REVB=0.0137348;RO=28;SAF=6;SAR=14;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.43875;STB=0.756519;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00918167;OID=.;OPOS=138764145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:29:20:20:0.408163:14:6:21:7:14:6:22:7
chr7	138764233	.	C	T	179.16	PASS	AF=0.487179;AO=18;DP=38;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.000616473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=347.208;QD=18.3752;RBI=0.00546234;REFB=-0.00289059;REVB=0.00542744;RO=20;SAF=11;SAR=7;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194659;STB=0.620574;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00422039;OID=.;OPOS=138764233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:20:20:18:19:0.487179:7:11:16:4:8:11:16:4
chr7	138831707	.	C	T	98.55	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.00786097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=341.676;QD=14.0792;RBI=0.0312138;REFB=-9.13987e-05;REVB=0.0302077;RO=16;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173361;STB=0.59985;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.000224874;OID=.;OPOS=138831707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:4:8:13:3:4:8:13:3
chr7	139026152	.	T	G	286.66	PASS	AF=0.383721;AO=33;DP=86;FAO=33;FDP=86;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=-0.0539174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5869;QD=13.3329;RBI=0.0687888;REFB=0.0132813;REVB=-0.0427178;RO=51;SAF=15;SAR=18;SRF=19;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890731;STB=0.560309;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=-0.0241912;OID=.;OPOS=139026152;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:51:53:33:33:0.383721:18:15:19:32:18:15:19:34
chr7	139077240	.	C	A	195.86	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0290025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6569;QD=25.2721;RBI=0.0322787;REFB=0.0276671;REVB=0.0141694;RO=12;SAF=15;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187271;STB=0.60526;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.0187327;OID=.;OPOS=139077240;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:4:15:7:5:4:15:7:5
chr7	139097282	.	AT	AC,A	369.89	PASS	AF=0.405063,0.493671;AO=19,13;DP=82;FAO=32,39;FDP=79;FR=.;FRO=8;FSAF=18,24;FSAR=14,15;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.00381785,0.0294473;FXX=0.0365809;HRUN=12,12;LEN=1,1;MLLD=146.081,4.09639;QD=18.7284;RBI=0.0768454,0.116453;REFB=-0.00982055,-0.37779;REVB=-0.0767505,-0.112668;RO=15;SAF=9,10;SAR=10,3;SRF=12;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.255202,-0.0412888;STB=0.590855,0.571394;STBP=0.04,0.038;TYPE=snp,del;VARB=-0.000392694,0.0392805;OID=.,.;OPOS=139097283,139097283;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=AC,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.405063,0.493671:19,13:82:32,39:79:8:18,24:14,15:8:0:99:15:9,10:10,3:12:3
chr7	139107660	.	A	G	178.73	PASS	AF=0.315068;AO=23;DP=77;FAO=23;FDP=73;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=-0.00100053;FXX=0.0640943;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.07;QD=9.79356;RBI=0.011154;REFB=-0.00617146;REVB=0.0111091;RO=47;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164852;STB=0.567145;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0173574;OID=.;OPOS=139107660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:73:47:50:23:23:0.315068:13:10:14:33:13:10:17:33
chr7	139138870	.	GT	G,GG	76.7	PASS	AF=0.1,0.1;AO=8,5;DP=70;FAO=7,7;FDP=70;FR=.;FRO=56;FSAF=5,5;FSAR=2,2;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=-0.000147167,-2.70874e-05;FXX=0.0140825;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=185.851,189.937;QD=4.38306;RBI=0.0222454,0.0200766;REFB=-0.0151353,-0.0132112;REVB=-0.0222449,-0.0200766;RO=55;SAF=6,4;SAR=2,1;SRF=21;SRR=34;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.42281,0.429197;STB=0.779869,0.779869;STBP=0.159,0.159;TYPE=del,snp;VARB=0.0538868,0.0583163;OID=.,.;OPOS=139138871,139138871;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.1,0.1:8,5:70:7,7:70:56:5,5:2,2:21:35:25:55:6,4:2,1:21:34
chr7	139138950	.	C	G	92.85	PASS	AF=0.361111;AO=12;DP=32;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=-0.0942528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.2656;QD=10.3162;RBI=0.124742;REFB=-0.0675895;REVB=-0.0817133;RO=20;SAF=3;SAR=9;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0738629;STB=0.536029;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.08186;OID=.;OPOS=139138950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:32:36:20:23:12:13:0.361111:9:3:4:16:9:4:6:17
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chr7	139252780	.	T	C	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5697;QD=62.3492;RBI=0.0470895;REFB=0;REVB=0.0423211;RO=0;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000513298;OID=.;OPOS=139252780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:13:30:0:0:13:30:0:0
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chr7	139653196	.	A	C	660.44	PASS	AF=0.894737;AO=51;DP=57;FAO=51;FDP=57;FR=.;FRO=6;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0162589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4702;QD=46.3467;RBI=0.0207952;REFB=0.00109372;REVB=0.0129649;RO=6;SAF=26;SAR=25;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0970742;STB=0.551704;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.000319705;OID=.;OPOS=139653196;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:57:57:6:6:51:51:0.894737:25:26:6:0:25:26:6:0
chr7	139719829	.	C	T	241.69	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0436208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.001;QD=21.9719;RBI=0.0542059;REFB=-0.000708512;REVB=-0.0321792;RO=20;SAF=14;SAR=9;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0814471;STB=0.529387;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=-5.69122e-05;OID=.;OPOS=139719829;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:21:23:23:0.522727:9:14:14:6:9:14:14:7
chr7	139724358	.	G	A	1641.02	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5294;QD=60.2209;RBI=0.0313366;REFB=0;REVB=-0.0167175;RO=0;SAF=71;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.30564e-05;OID=.;OPOS=139724358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:38:71:0:0:38:71:0:0
chr7	139724555	.	C	T	1617.16	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7905;QD=59.8948;RBI=0.0437904;REFB=0;REVB=0.0270232;RO=0;SAF=70;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000492036;OID=.;OPOS=139724555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:107:108:1:37:70:0:0:38:70:0:0
chr7	139727135	.	G	A	708.79	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000424197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.919;QD=63.0039;RBI=0.0325199;REFB=0;REVB=0.0325172;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.08222e-05;OID=.;OPOS=139727135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:20:23:0:0:21:24:0:0
chr7	139784641	.	A	G	923.19	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0180506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.163;QD=56.8116;RBI=0.0374162;REFB=-0.122654;REVB=0.0327742;RO=1;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149923;STB=0.507934;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.000423108;OID=.;OPOS=139784641;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:31:33:0:1:31:33:0:1
chr7	139818985	.	C	CT	48.69	PASS	AF=0.291667;AO=14;DP=49;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.0255798;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.6463;QD=4.0576;RBI=0.0298217;REFB=-0.0507069;REVB=0.01533;RO=35;SAF=1;SAR=13;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.551459;STB=0.854621;STBP=0.01;TYPE=ins;VARB=0.104664;OID=.;OPOS=139818986;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.291667:14:49:14:48:34:1:13:14:20:48:35:1:13:14:21
chr7	140051790	.	T	C	186.17	PASS	AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=0.00716058;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.457;QD=12.4113;RBI=0.0203894;REFB=-0.00447168;REVB=0.0190907;RO=36;SAF=9;SAR=14;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0279928;STB=0.509083;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.00676589;OID=.;OPOS=140051790;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:36:37:23:23:0.383333:14:9:15:21:14:9:15:22
chr7	140080087	.	C	G	217.28	PASS	AF=0.346154;AO=27;DP=79;FAO=27;FDP=78;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.0430434;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3923;QD=11.1425;RBI=0.0718146;REFB=0.00126301;REVB=0.0574858;RO=51;SAF=15;SAR=12;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014938;STB=0.508664;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=-0.000191387;OID=.;OPOS=140080087;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:51:51:27:27:0.346154:12:15:29:22:12:15:29:22
chr7	140158851	.	C	G	148.43	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=0.00551658;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.994;QD=17.4629;RBI=0.0296207;REFB=-0.0253803;REVB=-0.0291024;RO=17;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20463;STB=0.624862;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0302248;OID=.;OPOS=140158851;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:18:16:16:0.470588:6:10:14:3:6:10:15:3
chr7	140258000	.	T	C	696.67	PASS	AF=1;AO=43;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00160474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.845;QD=61.9258;RBI=0.0105398;REFB=0;REVB=0.0104169;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168268;OID=.;OPOS=140258000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:43:45:1:22:21:0:0:22:23:0:0
chr7	140301731	.	G	T	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106398;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.623;QD=55.6561;RBI=0.0106502;REFB=0;REVB=0.000470175;RO=0;SAF=24;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.76606e-05;OID=.;OPOS=140301731;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:3:24:0:0:3:24:0:0
chr7	140774467	.	C	G	130.44	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0782272;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.1649;QD=43.4795;RBI=0.0952301;REFB=0;REVB=0.0543073;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00128822;OID=.;OPOS=140774467;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr7	141176928	.	G	A	455.89	PASS	AF=0.494505;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=-0.00799801;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.958;QD=20.0392;RBI=0.0227498;REFB=-0.0254338;REVB=0.0212975;RO=46;SAF=21;SAR=24;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0895739;STB=0.549608;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0224991;OID=.;OPOS=141176928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:46:46:45:45:0.494505:24:21:17:29:24:21:17:29
chr7	141364712	.	G	A	540.45	PASS	AF=0.5;AO=55;DP=112;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=32;FWDB=0.00827267;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8037;QD=19.3016;RBI=0.0567185;REFB=-0.0208522;REVB=0.0561119;RO=56;SAF=24;SAR=31;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00723063;STB=0.509047;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0166113;OID=.;OPOS=141364712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:56:56:55:56:0.5:31:24:24:32:31:25:24:32
chr7	141464765	.	C	T	1008.37	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.268;QD=59.316;RBI=0.0148268;REFB=0;REVB=-0.00106542;RO=0;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.99649e-05;OID=.;OPOS=141464765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:31:37:0:0:31:37:0:0
chr7	141478308	.	T	C	573.71	PASS	AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0740024;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.0203;QD=55.9715;RBI=0.0761643;REFB=-0.147326;REVB=0.0180178;RO=1;SAF=23;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199479;STB=0.520823;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00931162;OID=.;OPOS=141478308;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:41:41:1:2:39:39:0.95122:16:23:1:0:16:23:2:0
chr7	141478574	.	G	C	737.3	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2753;QD=56.7157;RBI=0.0495801;REFB=0;REVB=0.0458693;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000742404;OID=.;OPOS=141478574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0
chr7	141478800	.	G	A	935.84	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00574496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.197;QD=58.4897;RBI=0.0061043;REFB=0;REVB=-0.00206345;RO=0;SAF=40;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.25912e-06;OID=.;OPOS=141478800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:24:40:0:0:24:40:0:0
chr7	141490238	.	G	T	1316.11	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.327;QD=61.9348;RBI=0.0746997;REFB=0;REVB=0.0729655;RO=0;SAF=51;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09613e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.21091e-05;OID=.;OPOS=141490238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:33:51:0:0:33:52:0:0
chr7	141501943	.	G	C	667.48	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0556085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.1751;QD=60.6799;RBI=0.0580649;REFB=0;REVB=-0.01671;RO=1;SAF=25;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183934;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000682562;OID=.;OPOS=141501943;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:44:1:0:40:44:1:15:25:1:0:15:29:0:0
chr7	141537735	.	T	G	1649.48	PASS	AF=1;AO=107;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00861232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2463;QD=59.4407;RBI=0.0173496;REFB=0;REVB=-0.0150611;RO=0;SAF=48;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.41052e-06;OID=.;OPOS=141537735;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:111:0:0:107:111:1:59:48:0:0:59:52:0:0
chr7	141537942	.	T	TCAA	378.64	PASS	AF=0.75;AO=27;DP=55;FAO=30;FDP=40;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0171603;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=3;MLLD=317.248;QD=37.8641;RBI=0.0341258;REFB=-0.0501268;REVB=0.0294973;RO=27;SAF=5;SAR=22;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360991;STB=0.596831;STBP=0.05;TYPE=ins;VARB=0.0168505;OID=.;OPOS=141537943;OREF=-;OALT=CAA;OMAPALT=TCAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.75:27:55:30:40:10:8:22:6:4:72:27:5:22:14:13
chr7	141537945	.	T	A	66.16	PASS	AF=0.192308;AO=10;DP=52;FAO=10;FDP=52;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.000585951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.074;QD=5.0895;RBI=0.0377538;REFB=-0.00906818;REVB=-0.0377493;RO=42;SAF=4;SAR=6;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879304;STB=0.557266;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0513834;OID=.;OPOS=141537945;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:52:52:42:42:10:10:0.192308:6:4:14:28:6:4:14:28
chr7	141538741	.	T	C	195.74	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0227584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.578;QD=17.7946;RBI=0.0302927;REFB=-0.00576761;REVB=0.0199927;RO=24;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205404;STB=0.616479;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0148474;OID=.;OPOS=141538741;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:24:20:20:0.454545:9:11:8:16:9:11:8:16
chr7	141672604	.	T	C	312.81	PASS	AF=0.576923;AO=26;DP=51;FAO=30;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=3;FSRR=14;FWDB=0.00940704;FXX=0.0545355;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0265;QD=24.0621;RBI=0.0460627;REFB=-0.127205;REVB=0.045092;RO=15;SAF=0;SAR=26;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.833832;STB=0.532141;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0974489;OID=.;OPOS=141672604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:15:17:26:30:0.576923:26:0:1:14:26:4:3:14
chr7	141672705	.	G	A	327.69	PASS	AF=0.651163;AO=28;DP=43;FAO=28;FDP=43;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.016252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.792;QD=30.483;RBI=0.0203676;REFB=-0.0239984;REVB=0.0122765;RO=15;SAF=9;SAR=19;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101294;STB=0.555718;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.010606;OID=.;OPOS=141672705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:15:15:28:28:0.651163:19:9:7:8:19:9:7:8
chr7	141673345	.	C	G	148.57	PASS	AF=0.484848;AO=14;DP=31;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0489708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9543;QD=18.0079;RBI=0.0493054;REFB=-0.0259769;REVB=0.00573499;RO=17;SAF=7;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837908;STB=0.513497;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0302291;OID=.;OPOS=141673345;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:33:17:17:14:16:0.484848:7:7:10:7:7:9:10:7
chr7	141747658	.	A	G	538.32	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.2492;QD=59.8133;RBI=0.0821535;REFB=0;REVB=0.0582484;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116399;OID=.;OPOS=141747658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:14:22:0:0:14:22:0:0
chr7	141796131	.	G	A	734.56	PASS	AF=1;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167694;FXX=0.041658;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.895;QD=63.875;RBI=0.0167765;REFB=0;REVB=0.000488265;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119331;OID=.;OPOS=141796131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr7	141838362	.	C	G	240.49	PASS	AF=0.3625;AO=28;DP=80;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=15;FWDB=-0.00839429;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.353;QD=12.0244;RBI=0.0090781;REFB=-0.0148631;REVB=-0.00345654;RO=50;SAF=7;SAR=21;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483586;STB=0.762205;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0381481;OID=.;OPOS=141838362;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:50:51:28:29:0.3625:21:7:35:15:21:8:36:15
chr7	141857846	.	A	G	1989.65	PASS	AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.827;QD=62.1764;RBI=0.0458808;REFB=0;REVB=0.0271631;RO=0;SAF=67;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14595e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.75795e-05;OID=.;OPOS=141857846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:61:67:0:0:61:67:0:0
chr7	141896059	.	A	G	1376.59	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.403;QD=62.5725;RBI=0.0299828;REFB=0;REVB=-0.00900979;RO=0;SAF=43;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3564e-05;OID=.;OPOS=141896059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:45:43:0:0:45:43:0:0
chr7	141898522	.	T	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00855991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.192;QD=48.7371;RBI=0.0249912;REFB=0;REVB=0.0234795;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.79858e-05;OID=.;OPOS=141898522;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr7	141918233	.	A	C	173.08	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0137096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.887;QD=18.7115;RBI=0.0284477;REFB=-0.00238441;REVB=-0.0249263;RO=18;SAF=11;SAR=7;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100257;STB=0.571785;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.00379726;OID=.;OPOS=141918233;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:18:19:18:18:0.486486:7:11:9:9:7:11:9:10
chr7	141957504	.	A	G	225.35	PASS	AF=0.636364;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=33;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00319502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.151;QD=27.3146;RBI=0.0182917;REFB=-0.0425991;REVB=0.0180105;RO=12;SAF=7;SAR=14;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117325;STB=0.565153;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0266665;OID=.;OPOS=141957504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:12:12:21:21:0.636364:14:7:6:6:14:7:6:6
chr7	142001030	.	A	G	1498.84	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495539;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.361;QD=59.9538;RBI=0.0658911;REFB=0;REVB=0.0434286;RO=0;SAF=61;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5137e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.55205e-05;OID=.;OPOS=142001030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:99:100:1:38:61:0:0:38:62:0:0
chr7	142013384	.	G	A,C	1178.45	PASS	AF=0.075,0.925;AO=6,74;DP=80;FAO=6,74;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=6,48;FSAR=0,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00390598,0.0201704;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=88.7293,123.08;QD=58.9225;RBI=0.0292116,0.0327832;REFB=0,0;REVB=0.0289493,0.0258437;RO=0;SAF=6,48;SAR=0,26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.16077e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.242323,-0.00127748;OID=.,.;OPOS=142013384,142013384;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:18:80:80:0:0:6,74:6,74:0.075,0.925:0,26:6,48:0:0:0,26:6,48:0:0
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chr7	142045678	.	ACT	GTC	224.63	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=75;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00773298;FXX=0.0399947;HRUN=2;LEN=3;MLLD=243.012;QD=12.4796;RBI=0.0202616;REFB=-0.0128944;REVB=-0.0187279;RO=44;SAF=13;SAR=14;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0045458;STB=0.504631;STBP=0.96;TYPE=mnp;VARB=0.0247268;OID=.;OPOS=142045678;OREF=ACT;OALT=GTC;OMAPALT=GTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:72:44:45:27:27:0.375:14:13:21:23:14:13:22:23
chr7	142045683	.	A	G	233.44	PASS	AF=0.378378;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0204631;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.909;QD=12.6185;RBI=0.0206161;REFB=0.00868943;REVB=0.00250689;RO=46;SAF=14;SAR=14;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235257;STB=0.513504;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-0.0186024;OID=.;OPOS=142045683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:46:46:28:28:0.378378:14:14:22:24:14:14:22:24
chr7	142045690	.	A	G	257.77	PASS	AF=0.4;AO=31;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.00450201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.075;QD=13.7476;RBI=0.0145426;REFB=0.00121992;REVB=-0.0138282;RO=44;SAF=16;SAR=15;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401189;STB=0.539938;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=-0.00140048;OID=.;OPOS=142045690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:44:45:31:30:0.4:15:16:21:23:14:16:21:24
chr7	142045692	.	AC	GT	272.85	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00951256;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=2;MLLD=294.18;QD=14.7484;RBI=0.0195594;REFB=-0.00577235;REVB=-0.0170904;RO=43;SAF=16;SAR=15;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522198;STB=0.529598;STBP=0.67;TYPE=mnp;VARB=0.00655189;OID=.;OPOS=142045692;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:43:43:31:31:0.418919:15:16:20:23:15:16:20:23
chr7	142045802	.	T	C	152.67	PASS	AF=0.3;AO=21;DP=70;FAO=21;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=-0.119864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3544;QD=8.72422;RBI=0.120396;REFB=-0.00273222;REVB=-0.011309;RO=49;SAF=7;SAR=14;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323161;STB=0.69141;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00290805;OID=.;OPOS=142045802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:49:49:21:21:0.3:14:7:30:19:14:7:30:19
chr7	142045848	.	T	C	766.16	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.374;QD=63.8466;RBI=0.0380288;REFB=0;REVB=0.031413;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118787;OID=.;OPOS=142045848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:29:18:0:0:29:19:0:0
chr7	142045899	.	A	G	42.3	PASS	AF=0.194444;AO=7;DP=36;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0161325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1175;QD=4.70044;RBI=0.0259834;REFB=0.015455;REVB=0.0203687;RO=29;SAF=1;SAR=6;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237441;STB=0.666111;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=-0.0498717;OID=.;OPOS=142045899;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:36:36:29:29:7:7:0.194444:6:1:8:21:6:1:8:21
chr7	142045912	.	A	G	42.83	PASS	AF=0.212121;AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=20;FWDB=0.00893054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.555;QD=5.19184;RBI=0.0116128;REFB=0.00552573;REVB=-0.00742305;RO=26;SAF=1;SAR=6;SRF=6;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171699;STB=0.617265;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=-0.0122227;OID=.;OPOS=142045912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:33:33:26:26:7:7:0.212121:6:1:6:20:6:1:6:20
chr7	142045924	.	A	G	251.3	PASS	AF=0.84;AO=21;DP=26;FAO=21;FDP=25;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0580593;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3703;QD=40.2087;RBI=0.0593564;REFB=0.0171689;REVB=0.0123411;RO=4;SAF=4;SAR=17;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277385;STB=0.515137;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=-0.00315291;OID=.;OPOS=142045924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:26:25:4:4:21:21:0.84:17:4:1:3:17:4:1:3
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chr7	142124424	.	T	G	1557.64	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00383634;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9195;QD=59.3385;RBI=0.0235064;REFB=0;REVB=0.0231912;RO=0;SAF=55;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.60623e-05;OID=.;OPOS=142124424;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:105:0:0:102:105:1:47:55:0:0:48:57:0:0
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chr7	142139773	.	C	T	127.49	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00512389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.965;QD=11.8593;RBI=0.0121687;REFB=-0.0115434;REVB=-0.0110373;RO=28;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149984;STB=0.588666;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0166603;OID=.;OPOS=142139773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:6:9:13:15:6:9:13:15
chr7	142139783	.	C	A,G	567.29	PASS	AF=0.9,0.075;AO=36,3;DP=40;FAO=36,3;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=19,1;FSAR=17,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0125353,-0.0317988;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=301.43,18.305;QD=56.7293;RBI=0.0174845,0.0323286;REFB=0.0101187,0.00799899;REVB=0.0121892,0.0058291;RO=1;SAF=19,1;SAR=17,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0267359,0.163246;STB=0.514278,0.59939;STBP=0.325,0.681;TYPE=snp,snp;VARB=0.00241533,0.0711284;OID=.,.;OPOS=142139783,142139783;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:40:40:1:1:36,3:36,3:0.9,0.075:17,2:19,1:0:1:17,2:19,1:0:1
chr7	142143804	.	A	C	1622.74	PASS	AF=0.965217;AO=111;DP=115;FAO=111;FDP=115;FR=.;FRO=4;FSAF=69;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0133414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.999;QD=56.4431;RBI=0.0140757;REFB=0.0527571;REVB=0.00448697;RO=4;SAF=69;SAR=42;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430883;STB=0.522723;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.00368803;OID=.;OPOS=142143804;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:115:115:4:4:111:111:0.965217:42:69:0:4:42:69:0:4
chr7	142143879	.	A	T	46.97	PASS	AF=0.0948905;AO=13;DP=137;FAO=13;FDP=137;FR=.;FRO=124;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=65;FSRR=59;FWDB=0.00673534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6434;QD=1.37129;RBI=0.0107106;REFB=-0.00849199;REVB=0.00832775;RO=123;SAF=7;SAR=6;SRF=64;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213882;STB=0.512945;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0397415;OID=.;OPOS=142143879;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:137:137:123:124:13:13:0.0948905:6:7:64:59:6:7:65:59
chr7	142143906	.	GT	CC	166.01	PASS	AF=0.195804;AO=28;DP=143;FAO=28;FDP=143;FR=.;FRO=115;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=66;FSRR=49;FWDB=0.003814;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=320.904;QD=4.6437;RBI=0.00593625;REFB=0.00213974;REVB=0.00454889;RO=113;SAF=17;SAR=11;SRF=65;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420691;STB=0.527657;STBP=0.73;TYPE=mnp;VARB=-0.00768322;OID=.;OPOS=142143906;OREF=GT;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:113:115:28:28:0.195804:11:17:65:48:11:17:66:49
chr7	142143941	.	T	C	203.18	PASS	AF=0.238462;AO=30;DP=130;FAO=31;FDP=130;FR=.;FRO=99;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=54;FSRR=45;FWDB=-0.0281216;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.693;QD=6.2516;RBI=0.0306714;REFB=0.000816964;REVB=-0.0122436;RO=98;SAF=17;SAR=13;SRF=53;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032804;STB=0.527255;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=-0.00581207;OID=.;OPOS=142143941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:98:99:30:31:0.238462:13:17:53:45:13:18:54:45
chr7	142144022	.	T	C	137.71	PASS	AF=0.25;AO=20;DP=82;FAO=20;FDP=80;FR=.;FRO=60;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.0272157;FXX=0.0476134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.456;QD=6.88525;RBI=0.032107;REFB=-0.00397197;REVB=-0.0170343;RO=60;SAF=9;SAR=11;SRF=38;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223048;STB=0.598913;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.010329;OID=.;OPOS=142144022;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:80:60:60:20:20:0.25:11:9:38:22:11:9:35:25
chr7	142144059	.	A	C	51.87	PASS	AF=0.151515;AO=5;DP=63;FAO=10;FDP=66;FR=.;FRO=56;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.00797959;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.033;QD=3.14355;RBI=0.0271231;REFB=-0.01217;REVB=-0.0259227;RO=57;SAF=1;SAR=4;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407375;STB=0.57561;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0622899;OID=.;OPOS=142144059;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:63:66:57:56:5:10:0.151515:4:1:34:23:5:5:33:23
chr7	142149160	.	T	G	782.38	PASS	AF=0.548148;AO=73;DP=134;FAO=74;FDP=135;FR=.;FRO=61;FSAF=32;FSAR=42;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=0.0169857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.969;QD=23.1815;RBI=0.0173492;REFB=-0.0012012;REVB=0.00353275;RO=61;SAF=31;SAR=42;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137661;STB=0.571181;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.000841125;OID=.;OPOS=142149160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:135:61:61:73:74:0.548148:42:31:36:25:42:32:36:25
chr7	142149349	.	A	C	802.74	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.446;QD=57.3383;RBI=0.0478492;REFB=0;REVB=0.0333118;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.1035e-05;OID=.;OPOS=142149349;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:56:0:0:52:56:1:28:24:0:0:28:28:0:0
chr7	142162001	.	A	C	2582.6	PASS	AF=0.994083;AO=167;DP=168;FAO=168;FDP=169;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00676505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.581;QD=61.1266;RBI=0.0327565;REFB=-0.10564;REVB=0.0320503;RO=0;SAF=79;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502825;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00020627;OID=.;OPOS=142162001;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:168:169:0:1:167:168:0.994083:88:79:0:0:88:80:0:1
chr7	142162050	.	A	G	1089.39	PASS	AF=0.530612;AO=103;DP=195;FAO=104;FDP=196;FR=.;FRO=92;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=41;FSRR=51;FWDB=0.0205692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.067;QD=22.2323;RBI=0.0205812;REFB=-0.00447504;REVB=-0.000703847;RO=91;SAF=47;SAR=56;SRF=41;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00498308;STB=0.507508;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0058856;OID=.;OPOS=142162050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:195:196:91:92:103:104:0.530612:56:47:41:50:56:48:41:51
chr7	142162148	.	C	T	570.52	PASS	AF=0.39759;AO=66;DP=167;FAO=66;FDP=166;FR=.;FRO=100;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=61;FSRR=39;FWDB=-0.00419388;FXX=0.00598767;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.557;QD=13.7475;RBI=0.0346309;REFB=-0.00900457;REVB=-0.034376;RO=100;SAF=34;SAR=32;SRF=61;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10206;STB=0.557372;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0163213;OID=.;OPOS=142162148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:166:100:100:66:66:0.39759:32:34:61:39:32:34:61:39
chr7	142162306	.	A	G	182.73	PASS	AF=0.396552;AO=21;DP=56;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=6;FWDB=-0.00763753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.393;QD=12.602;RBI=0.00804078;REFB=-0.00517957;REVB=0.00251441;RO=35;SAF=13;SAR=8;SRF=29;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261787;STB=0.648131;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00628979;OID=.;OPOS=142162306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:35:35:21:23:0.396552:8:13:29:6:9:14:29:6
chr7	142168429	.	A	G	753.4	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0813444;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.186;QD=62.7833;RBI=0.0829637;REFB=0;REVB=0.0163112;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00321827;OID=.;OPOS=142168429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:48:0:0:45:48:1:24:21:0:0:24:24:0:0
chr7	142168452	.	C	A	720.72	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249085;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9146;QD=54.3943;RBI=0.0407331;REFB=0;REVB=0.0322297;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00512179;OID=.;OPOS=142168452;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:53:0:0:49:53:1:22:27:0:0:25:28:0:0
chr7	142168662	.	CG	TC	718.58	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00820695;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=203.677;QD=56.3592;RBI=0.0426172;REFB=0;REVB=0.0418195;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000226304;OID=.;OPOS=142168662;OREF=CG;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:25:25:0:0:25:26:0:0
chr7	142168819	.	G	A	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=5.01664e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.168;QD=13.8493;RBI=0.0131781;REFB=-0.0257818;REVB=-0.013178;RO=24;SAF=15;SAR=1;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.513854;STB=0.82818;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0339051;OID=.;OPOS=142168819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:25:16:16:0.390244:1:15:16:8:1:15:16:9
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chr7	142176378	.	A	G	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00868546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.878;QD=57.5444;RBI=0.0499066;REFB=0;REVB=0.0491451;RO=0;SAF=36;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.13964e-05;OID=.;OPOS=142176378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:22:36:0:0:22:36:0:0
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chr7	142180770	.	T	C	226.03	PASS	AF=0.204301;AO=38;DP=186;FAO=38;FDP=186;FR=.;FRO=148;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=78;FSRR=70;FWDB=0.00321082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=346.65;QD=4.86079;RBI=0.00418794;REFB=-0.00247179;REVB=-0.00268876;RO=147;SAF=17;SAR=21;SRF=77;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976151;STB=0.563208;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.011746;OID=.;OPOS=142180770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:186:147:148:38:38:0.204301:21:17:77:70:21:17:78:70
chr7	142206617	.	G	A	323.74	PASS	AF=0.72973;AO=27;DP=37;FAO=27;FDP=37;FR=.;FRO=10;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0169293;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.579;QD=34.9991;RBI=0.0245637;REFB=-0.0141223;REVB=-0.0177982;RO=10;SAF=16;SAR=11;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470055;STB=0.525648;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.00522824;OID=.;OPOS=142206617;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:37:37:10:10:27:27:0.72973:11:16:5:5:11:16:5:5
chr7	142231701	.	G	T	338.29	PASS	AF=0.5;AO=35;DP=72;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=10;FWDB=-0.0217917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5572;QD=18.2859;RBI=0.0391862;REFB=-0.0432014;REVB=-0.0325681;RO=36;SAF=28;SAR=7;SRF=27;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0675259;STB=0.561021;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0392643;OID=.;OPOS=142231701;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:74:36:37:35:37:0.5:7:28:27:9:7:30:27:10
chr7	142242511	.	A	G	36.01	PASS	AF=0.0820896;AO=11;DP=134;FAO=11;FDP=134;FR=.;FRO=123;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=59;FSRR=64;FWDB=-0.0858862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.525;QD=1.07484;RBI=0.0891198;REFB=-0.00151924;REVB=-0.0237888;RO=123;SAF=4;SAR=7;SRF=59;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13237;STB=0.608077;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0108783;OID=.;OPOS=142242511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:134:134:123:123:11:11:0.0820896:7:4:59:64:7:4:59:64
chr7	142242552	.	G	T	43.58	PASS	AF=0.0990991;AO=11;DP=111;FAO=11;FDP=111;FR=.;FRO=100;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=42;FSRR=58;FWDB=-0.0503309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.762;QD=1.5703;RBI=0.0504106;REFB=-0.0024535;REVB=-0.00283432;RO=100;SAF=4;SAR=7;SRF=42;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690711;STB=0.553166;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0229484;OID=.;OPOS=142242552;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:111:111:100:100:11:11:0.0990991:7:4:42:58:7:4:42:58
chr7	142247134	.	T	C	184.82	PASS	AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0122602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.861;QD=12.1191;RBI=0.0309738;REFB=-0.00218202;REVB=0.0284441;RO=38;SAF=13;SAR=10;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423775;STB=0.524474;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.00363818;OID=.;OPOS=142247134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:10:13:20:18:10:13:20:18
chr7	142247288	.	T	C	70.5	PASS	AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0185246;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=319.254;QD=7.04963;RBI=0.0297342;REFB=-0.00848349;REVB=-0.0232586;RO=30;SAF=2;SAR=8;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31976;STB=0.705428;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0313176;OID=.;OPOS=142247288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:40:40:30:30:10:10:0.25:8:2:13:17:8:2:13:17
chr7	142247347	.	AT	CC	57.23	PASS	AF=0.225;AO=8;DP=39;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0392187;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=94.7233;QD=5.72279;RBI=0.0493677;REFB=-0.02609;REVB=-0.0299844;RO=28;SAF=1;SAR=7;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.525481;STB=0.854473;STBP=0.035;TYPE=mnp;VARB=0.0638295;OID=.;OPOS=142247347;OREF=AT;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:39:40:28:31:8:9:0.225:7:1:15:13:8:1:16:15
chr7	142250938	.	T	G	1294.81	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0725339;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.43;QD=61.6574;RBI=0.0755592;REFB=0;REVB=0.0211664;RO=0;SAF=34;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000573559;OID=.;OPOS=142250938;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:82:84:1:48:34:0:0:48:36:0:0
chr7	142250988	.	G	A	717.52	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1267;QD=56.276;RBI=0.0602671;REFB=0;REVB=0.033337;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00282581;OID=.;OPOS=142250988;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:30:20:0:0:30:21:0:0
chr7	142251132	.	G	T	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.447;QD=54.5177;RBI=0.0377513;REFB=0;REVB=0.0192325;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000173407;OID=.;OPOS=142251132;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:17:8:0:0:17:8:0:0
chr7	142326607	.	C	T	1686.46	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.976;QD=60.2306;RBI=0.0249221;REFB=0;REVB=0.0225272;RO=0;SAF=59;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7266e-05;OID=.;OPOS=142326607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:112:0:0:111:112:1:52:59:0:0:52:60:0:0
chr7	142326909	.	C	G	769.4	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0554439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7628;QD=56.9928;RBI=0.105083;REFB=0;REVB=0.0892663;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229934;OID=.;OPOS=142326909;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:22:32:0:0:22:32:0:0
chr7	142334648	.	A	T	1029.66	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000445904;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.508;QD=59.6905;RBI=0.0435013;REFB=0;REVB=-0.043499;RO=0;SAF=43;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.08274e-05;OID=.;OPOS=142334648;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:26:43:0:0:26:43:0:0
chr7	142378831	.	C	G	762.74	PASS	AF=1;AO=46;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120583;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.419;QD=63.5613;RBI=0.0877529;REFB=0;REVB=0.0869204;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022073;OID=.;OPOS=142378831;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:46:48:1:22:24:0:0:24:24:0:0
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chr7	142423547	.	C	T	474.44	PASS	AF=0.479592;AO=47;DP=89;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.00682616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.455;QD=19.3648;RBI=0.0265115;REFB=-0.0067557;REVB=-0.0256177;RO=42;SAF=30;SAR=17;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0817657;STB=0.612159;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00503042;OID=.;OPOS=142423547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:98:42:51:47:47:0.479592:17:30:23:19:16:31:23:28
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chr7	142460335	.	A	G	358.11	PASS	AF=0.29697;AO=48;DP=164;FAO=49;FDP=165;FR=.;FRO=116;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=66;FSRR=50;FWDB=0.00403284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.472;QD=8.68138;RBI=0.0209004;REFB=0.0013152;REVB=-0.0205076;RO=116;SAF=27;SAR=21;SRF=66;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00793635;STB=0.501766;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=-0.00885176;OID=.;OPOS=142460335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:165:116:116:48:49:0.29697:21:27:66:50:21:28:66:50
chr7	142460369	.	G	A	273.04	PASS	AF=0.248521;AO=41;DP=169;FAO=42;FDP=169;FR=.;FRO=127;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=73;FSRR=54;FWDB=1.24734e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.125;QD=6.46258;RBI=0.00900668;REFB=-0.000705271;REVB=-0.00900668;RO=128;SAF=22;SAR=19;SRF=74;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527219;STB=0.520687;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.00212086;OID=.;OPOS=142460369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:169:128:127:41:42:0.248521:19:22:74:54:19:23:73:54
chr7	142460394	.	T	C	193.27	PASS	AF=0.208054;AO=31;DP=149;FAO=31;FDP=149;FR=.;FRO=118;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=69;FSRR=49;FWDB=0.05089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.0856;QD=5.18845;RBI=0.0570403;REFB=0.00151948;REVB=-0.0257643;RO=117;SAF=15;SAR=16;SRF=69;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13464;STB=0.57951;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=-0.00685637;OID=.;OPOS=142460394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:117:118:31:31:0.208054:16:15:69:48:16:15:69:49
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chr7	142460865	.	T	C	152.79	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=0.00668044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5252;QD=13.5814;RBI=0.0357427;REFB=0.0156621;REVB=-0.0351129;RO=28;SAF=5;SAR=12;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.400778;STB=0.732559;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.0225578;OID=.;OPOS=142460865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:12:5:19:9:12:5:19:9
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chr7	142478897	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.909;QD=56.1916;RBI=0.0277688;REFB=0;REVB=0.0173255;RO=0;SAF=2;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.96139e-05;OID=.;OPOS=142478897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:26:2:0:0:26:2:0:0
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chr7	142479940	.	C	T	693.48	PASS	AF=0.489362;AO=69;DP=141;FAO=69;FDP=141;FR=.;FRO=72;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=51;FSRR=21;FWDB=0.00457028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.315;QD=19.6733;RBI=0.00919178;REFB=-0.0115729;REVB=0.00797505;RO=71;SAF=35;SAR=34;SRF=51;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195452;STB=0.602982;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0172951;OID=.;OPOS=142479940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:71:72:69:69:0.489362:34:35:51:20:34:35:51:21
chr7	142479954	.	C	T	772.76	PASS	AF=0.516556;AO=78;DP=154;FAO=78;FDP=151;FR=.;FRO=73;FSAF=56;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=39;FWDB=-0.0070765;FXX=0.0194793;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.357;QD=20.4704;RBI=0.00740832;REFB=-0.00923392;REVB=-0.00219234;RO=73;SAF=56;SAR=22;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241163;STB=0.633026;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00917447;OID=.;OPOS=142479954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:151:73:73:78:78:0.516556:22:56:34:39:22:56:34:39
chr7	142480002	.	C	A	885.84	PASS	AF=0.51462;AO=85;DP=164;FAO=88;FDP=171;FR=.;FRO=83;FSAF=56;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=41;FWDB=0.0076847;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.127;QD=20.7213;RBI=0.00789215;REFB=-0.0277983;REVB=0.00179765;RO=79;SAF=55;SAR=30;SRF=40;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129341;STB=0.565876;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0242949;OID=.;OPOS=142480002;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:171:79:83:85:88:0.51462:30:55:40:39:32:56:42:41
chr7	142480012	.	C	T	800.71	PASS	AF=0.474286;AO=82;DP=175;FAO=83;FDP=175;FR=.;FRO=92;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=58;FSRR=34;FWDB=0.0224813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.761;QD=18.302;RBI=0.0225638;REFB=-0.0264252;REVB=-0.00192776;RO=91;SAF=40;SAR=42;SRF=57;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131655;STB=0.571608;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00925439;OID=.;OPOS=142480012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:175:91:92:82:83:0.474286:42:40:57:34:42:41:58:34
chr7	142480034	.	C	A	745.91	PASS	AF=0.475904;AO=74;DP=163;FAO=79;FDP=166;FR=.;FRO=87;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=55;FSRR=32;FWDB=0.0137629;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.838;QD=17.9737;RBI=0.0142463;REFB=-0.0191357;REVB=0.00367943;RO=88;SAF=38;SAR=36;SRF=56;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120963;STB=0.559666;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0214023;OID=.;OPOS=142480034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:166:88:87:74:79:0.475904:36:38:56:32:38:41:55:32
chr7	142480067	.	C	T	545.58	PASS	AF=0.487179;AO=57;DP=118;FAO=57;FDP=117;FR=.;FRO=60;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.0164022;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.394;QD=18.6522;RBI=0.0188943;REFB=-0.00326079;REVB=-0.0093788;RO=60;SAF=37;SAR=20;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128611;STB=0.571358;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00175468;OID=.;OPOS=142480067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:117:60:60:57:57:0.487179:20:37:31:29:20:37:31:29
chr7	142481234	.	T	C	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.817;QD=57.8849;RBI=0.0463026;REFB=0;REVB=0.0445329;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.37844e-05;OID=.;OPOS=142481234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0
chr7	142481376	.	T	A	54.62	PASS	AF=1;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170502;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.452;QD=36.4137;RBI=0.0687461;REFB=0;REVB=0.0665982;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.88231e-06;OID=.;OPOS=142481376;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr7	142481807	.	C	T	651.17	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.774;QD=62.0161;RBI=0.0280942;REFB=0;REVB=-0.0185199;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.50366e-06;OID=.;OPOS=142481807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr7	142481867	.	C	G	744.27	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00264339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6572;QD=63.3419;RBI=0.0181046;REFB=0;REVB=-0.0179106;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015122;OID=.;OPOS=142481867;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
chr7	142494045	.	GAAA	TGTG	89.31	PASS	AF=1;AO=8;DP=11;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186736;FXX=0.181653;HRUN=1;LEN=4;MLLD=265.675;QD=39.6929;RBI=0.0186736;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00130888;OID=.;OPOS=142494045;OREF=GAAA;OALT=TGTG;OMAPALT=TGTG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:11:9:0:0:8:9:1:0:8:0:0:0:9:0:0
chr7	142498732	.	GAAAAAC	GAACAAG	95.74	PASS	AF=0.292683;AO=11;DP=42;FAO=12;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0391168;FXX=0;HRUN=5;LEN=4;MLLD=197.176;QD=9.34093;RBI=0.0596594;REFB=0.00185925;REVB=0.0450459;RO=22;SAF=8;SAR=3;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220022;STB=0.561298;STBP=0.637;TYPE=mnp;VARB=-0.0119711;OID=.;OPOS=142498735;OREF=AAAC;OALT=CAAG;OMAPALT=GAACAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.292683:11:42:12:41:29:8:4:17:12:93:22:8:3:12:10
chr7	142498833	.	A	T	333.21	PASS	AF=0.366071;AO=41;DP=113;FAO=41;FDP=112;FR=.;FRO=71;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=38;FSRR=33;FWDB=0.0211054;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.898;QD=11.9004;RBI=0.0554287;REFB=0.0154253;REVB=0.0512534;RO=67;SAF=27;SAR=14;SRF=36;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138901;STB=0.582336;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=-0.0388989;OID=.;OPOS=142498833;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:112:67:71:41:41:0.366071:14:27:36:31:14:27:38:33
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chr7	142498897	.	A	G	325.44	PASS	AF=0.353448;AO=39;DP=114;FAO=41;FDP=116;FR=.;FRO=75;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=41;FSRR=34;FWDB=0.00795149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.698;QD=11.222;RBI=0.00927505;REFB=-0.0205667;REVB=-0.00477498;RO=74;SAF=21;SAR=18;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00237711;STB=0.506556;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0368188;OID=.;OPOS=142498897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:116:74:75:39:41:0.353448:18:21:40:34:19:22:41:34
chr7	142499071	.	T	C	469.03	PASS	AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0461234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.363;QD=20.3928;RBI=0.0477401;REFB=-0.0081033;REVB=-0.0123184;RO=46;SAF=25;SAR=21;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136634;STB=0.575625;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0169784;OID=.;OPOS=142499071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:46:46:46:46:0.5:21:25:18:28:21:25:18:28
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chr7	143042761	.	CTG	CGT,GCG,GTG	126.61	PASS	AF=0.237288,0.152542,0;AO=11,3,4;DP=59;FAO=14,9,0;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=4,3,0;FSAR=10,6,0;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=-0.0156431,-0.034569,-0.0310327;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,2,1;MLLD=55.1332,129.436,128.751;QD=8.58391;RBI=0.154913,0.0437575,0.0441171;REFB=-0.0368102,-0.0162013,-0.0144247;REVB=0.154122,0.0268272,0.0313575;RO=33;SAF=3,0,4;SAR=8,3,0;SRF=27;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.590456,-0.712323,0.491502;STB=0.815955,0.815255,0.5;STBP=0.023,0.054,1;TYPE=mnp,mnp,snp;VARB=0.102776,0.17434,0;OID=.,.,.;OPOS=143042762,143042761,143042761;OREF=TG,CT,C;OALT=GT,GC,G;OMAPALT=CGT,GCG,GTG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:59:59:33:36:11,3,4:14,9,0:0.237288,0.152542,0:8,3,0:3,0,4:27:6:10,6,0:4,3,0:28:8
chr7	143042837	.	C	T	976.92	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0234415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.095;QD=57.4659;RBI=0.04235;REFB=-0.167174;REVB=0.0352707;RO=0;SAF=35;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.62221e-08;STB=0.50704;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000544816;OID=.;OPOS=143042837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:0:1:67:67:0.985294:32:35:0:0:32:35:1:0
chr7	143053260	.	A	G	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.282;QD=61.6831;RBI=0.049252;REFB=0;REVB=0.0350988;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170718;OID=.;OPOS=143053260;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0
chr7	143053723	.	C	T	83.55	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0201196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.237;QD=20.8887;RBI=0.0210009;REFB=-0.0293772;REVB=0.00601976;RO=6;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.066985;STB=0.538384;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.0142923;OID=.;OPOS=143053723;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:4:6:3:3:4:6:3:3
chr7	143086968	.	C	T	607.94	PASS	AF=0.496;AO=62;DP=125;FAO=62;FDP=125;FR=.;FRO=63;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=0.00377616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.604;QD=19.454;RBI=0.011999;REFB=-0.0224919;REVB=0.0113894;RO=63;SAF=38;SAR=24;SRF=35;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543351;STB=0.530033;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0231226;OID=.;OPOS=143086968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:63:63:62:62:0.496:24:38:35:28:24:38:35:28
chr7	143088823	.	T	C,G	525.98	PASS	AF=0.944444,0.0555556;AO=34,2;DP=36;FAO=34,2;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17,1;FSAR=17,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175064,-0.00554606;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=137.555,130.848;QD=58.4425;RBI=0.0381871,0.0347817;REFB=0,0;REVB=0.0339379,0.0343367;RO=0;SAF=17,1;SAR=17,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000262311,0.0522522;OID=.,.;OPOS=143088823,143088823;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:36:36:0:0:34,2:34,2:0.944444,0.0555556:17,1:17,1:0:0:17,1:17,1:0:0
chr7	143088867	.	T	C	289.34	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.992;QD=52.608;RBI=0.0179914;REFB=0;REVB=0.0041404;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108053;OID=.;OPOS=143088867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:13:8:0:0:14:8:0:0
chr7	143093538	.	G	A	1519.23	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00920413;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2902;QD=59.5778;RBI=0.0309977;REFB=0;REVB=-0.0295997;RO=0;SAF=53;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000712572;OID=.;OPOS=143093538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:102:0:0:101:102:1:48:53:0:0:49:53:0:0
chr7	143097100	.	A	G	619.89	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0221399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.064;QD=59.0371;RBI=0.0441808;REFB=-0.102484;REVB=0.0382331;RO=1;SAF=11;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407439;STB=0.521728;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.00201714;OID=.;OPOS=143097100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:30:11:1:0:30:11:1:0
chr7	143141475	.	T	C	375.44	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0425;QD=55.6207;RBI=0.0247208;REFB=0;REVB=-0.0183166;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000557182;OID=.;OPOS=143141475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0
chr7	143270172	.	A	G	628.59	PASS	AF=0.570093;AO=61;DP=104;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=44;FSRF=13;FSRR=33;FWDB=0.032001;FXX=0.0272702;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.6036;QD=23.4988;RBI=0.0710592;REFB=0.00831881;REVB=-0.0634456;RO=43;SAF=17;SAR=44;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220288;STB=0.502091;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=-0.000279323;OID=.;OPOS=143270172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:107:43:46:61:61:0.570093:44:17:13:30:44:17:13:33
chr7	143451771	.	G	A	47.81	PASS	AF=0.153846;AO=8;DP=52;FAO=8;FDP=52;FR=.;FRO=44;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0229112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.478;QD=3.67731;RBI=0.0273586;REFB=-0.00847372;REVB=-0.0149523;RO=44;SAF=3;SAR=5;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713594;STB=0.549873;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0395723;OID=.;OPOS=143451771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:52:52:44:44:8:8:0.153846:5:3:19:25:5:3:19:25
chr7	143632618	.	C	T	297.96	PASS	AF=0.54386;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.036416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.728;QD=20.9093;RBI=0.0405816;REFB=-0.018435;REVB=0.0179094;RO=26;SAF=18;SAR=13;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191412;STB=0.605993;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0149342;OID=.;OPOS=143632618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:26:26:31:31:0.54386:13:18:9:17:13:18:9:17
chr7	143633297	.	A	G	118.32	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0268633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.924;QD=12.7913;RBI=0.0372246;REFB=0.00286454;REVB=-0.0257689;RO=23;SAF=10;SAR=4;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.5289;STB=0.803825;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.0075994;OID=.;OPOS=143633297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:4:10:4:19:4:10:4:19
chr7	143657801	.	A	G	809.81	PASS	AF=0.550725;AO=73;DP=136;FAO=76;FDP=138;FR=.;FRO=62;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0211411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.396;QD=23.4727;RBI=0.0254088;REFB=-0.0186449;REVB=-0.0140947;RO=62;SAF=40;SAR=33;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0539173;STB=0.531026;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.012169;OID=.;OPOS=143657801;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:138:62:62:73:76:0.550725:33:40:30:32:34:42:30:32
chr7	143701516	.	C	T	96.2	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.013869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.845;QD=12.0244;RBI=0.0286534;REFB=-0.0264224;REVB=-0.0250733;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035838;STB=0.521241;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0318041;OID=.;OPOS=143701516;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:7:5:9:11:7:5:9:11
chr7	143701884	.	C	T	434.79	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0512926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8164;QD=54.3491;RBI=0.0515548;REFB=-0.0615771;REVB=-0.0051929;RO=1;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252169;STB=0.513505;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0165578;OID=.;OPOS=143701884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:18:13:0:1:18:13:0:1
chr7	143748364	.	T	C	1624.4	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0083761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.76;QD=60.1629;RBI=0.0294059;REFB=0;REVB=0.0281877;RO=0;SAF=47;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.16714e-05;OID=.;OPOS=143748364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:61:47:0:0:61:47:0:0
chr7	143771408	.	G	C	745.84	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.133;QD=56.2895;RBI=0.0482966;REFB=0;REVB=0.0383523;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156518;OID=.;OPOS=143771408;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:27:25:0:0:28:25:0:0
chr7	143771536	.	G	A	1493.65	PASS	AF=1;AO=90;DP=92;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0081907;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.922;QD=63.5596;RBI=0.0191714;REFB=0;REVB=0.0173336;RO=0;SAF=53;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196208;OID=.;OPOS=143771536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:94:0:0:90:94:1:37:53:0:0:39:55:0:0
chr7	143771557	.	T	C	644.69	PASS	AF=0.598039;AO=61;DP=102;FAO=61;FDP=102;FR=.;FRO=41;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=-0.00347811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.473;QD=25.2817;RBI=0.00681192;REFB=-0.0203864;REVB=-0.00585704;RO=41;SAF=30;SAR=31;SRF=29;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158996;STB=0.586378;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.010189;OID=.;OPOS=143771557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:41:41:61:61:0.598039:31:30:29:12:31:30:29:12
chr7	143771937	.	G	C	1114.62	PASS	AF=0.986842;AO=70;DP=71;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.040596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.057;QD=58.6643;RBI=0.0427187;REFB=-0.0688707;REVB=0.0132984;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505881;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000790485;OID=.;OPOS=143771937;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:71:76:0:1:70:75:0.986842:32:38:0:0:33:42:1:0
chr7	143792747	.	G	A	1156.91	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259722;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.822;QD=60.8898;RBI=0.0261795;REFB=0;REVB=-0.0032877;RO=0;SAF=56;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63985e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102945;OID=.;OPOS=143792747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:20:56:0:0:20:56:0:0
chr7	143792893	.	G	A	1591.3	PASS	AF=0.990826;AO=94;DP=110;FAO=108;FDP=109;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=66;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.104576;FXX=0.00909008;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.2585;QD=58.3964;RBI=0.188604;REFB=-0.125848;REVB=0.156956;RO=2;SAF=60;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155419;STB=0.503759;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00297746;OID=.;OPOS=143792893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:110:109:2:1:94:108:0.990826:34:60:2:0:42:66:1:0
chr7	143807515	.	T	G	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00125203;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.851;QD=54.5172;RBI=0.0127653;REFB=0;REVB=0.0127037;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.20625e-05;OID=.;OPOS=143807515;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0
chr7	143807518	.	T	C	341.13	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.733;QD=54.5806;RBI=0.0311979;REFB=0;REVB=0.00614908;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107082;OID=.;OPOS=143807518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:10:14:0:0:10:15:0:0
chr7	143826603	.	G	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00595697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.51;QD=57.2025;RBI=0.0226971;REFB=0;REVB=0.0219014;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119705;OID=.;OPOS=143826603;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr7	143826697	.	C	A,G	378.78	PASS	AF=0.40625,0.53125;AO=11,17;DP=32;FAO=13,17;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=13,6;FSAR=0,11;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.139058,0.00410128;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=58.1236,33.3537;QD=47.3472;RBI=0.141738,0.00894091;REFB=-0.178649,0.0338202;REVB=-0.0274295,-0.00794477;RO=4;SAF=11,6;SAR=0,11;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.22684;STB=0.5,0.571342;STBP=1,0.135;TYPE=snp,snp;VARB=0.0651304,0.0402152;OID=.,.;OPOS=143826697,143826697;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:32:32:4:2:11,17:13,17:0.40625,0.53125:0,11:11,6:4:0:0,11:13,6:2:0
chr7	143826729	.	ACTT	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305162;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=299.5;QD=47.8224;RBI=0.0440367;REFB=0;REVB=0.0317488;RO=0;SAF=5;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000231053;OID=.;OPOS=143826730;OREF=CTT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:16:16:16:16:0:5:11:0:0:4:0:5:11:0:0
chr7	143882673	.	C	T	40.2	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0181668;FXX=0.0666222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.517;QD=11.4864;RBI=0.10157;REFB=-0.021554;REVB=0.0999324;RO=9;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228861;STB=0.576643;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0369403;OID=.;OPOS=143882673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:15:14:9:8:6:6:0.428571:1:5:6:3:1:5:6:2
chr7	143884103	.	G	A	1078.32	PASS	AF=0.986486;AO=70;DP=71;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0657771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.637;QD=58.2878;RBI=0.0730058;REFB=-0.0133606;REVB=0.0316735;RO=0;SAF=33;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.000296797;OID=.;OPOS=143884103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:71:74:0:1:70:73:0.986486:37:33:0:0:40:33:0:1
chr7	144095600	.	A	G	49.58	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0176104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3012;QD=15.2569;RBI=0.042506;REFB=-0.0285274;REVB=-0.0386863;RO=6;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23478;STB=0.642384;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0551395;OID=.;OPOS=144095600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:1:6:4:2:1:6:4:2
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chr7	148113623	.	ATAGTT	A	402.83	PASS	AF=1;AO=27;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467992;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=5;MLLD=283.832;QD=55.5633;RBI=0.0469873;REFB=0;REVB=0.00419997;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0001998;OID=.;OPOS=148113624;OREF=TAGTT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:27:29:29:29:0:12:17:0:0:4:0:10:17:0:0
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chr7	148143136	.	A	G	3101.4	PASS	AF=0.994898;AO=194;DP=197;FAO=195;FDP=196;FR=.;FRO=1;FSAF=101;FSAR=94;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0535429;FXX=0.00507588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7681;QD=63.2938;RBI=0.0789973;REFB=-0.0616143;REVB=-0.0580838;RO=1;SAF=100;SAR=94;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00473862;STB=0.502463;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=3.73034e-05;OID=.;OPOS=148143136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:197:196:1:1:194:195:0.994898:94:100:1:0:94:101:1:0
chr7	148457582	.	GAAAAA	GAAAA,GAAAAG	30.52	PASS	AF=0.135135,0.0540541;AO=8,2;DP=37;FAO=5,2;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=2,2;FSAR=3,0;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0229865,0.000431328;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=13.5994,34.0757;QD=3.29991;RBI=0.124286,0.0650846;REFB=-0.0481179,-0.0309054;REVB=0.122141,0.0650832;RO=26;SAF=5,2;SAR=3,0;SRF=12;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.193611,0.493968;STB=0.613186,0.994427;STBP=0.667,0.179;TYPE=del,snp;VARB=0.103446,0.040077;OID=.,.;OPOS=148457583,148457587;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=GAAAA,GAAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.135135,0.0540541:8,2:37:5,2:37:30:2,2:3,0:16:14:21:26:5,2:3,0:12:14
chr7	148481488	.	G	A	818.05	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.327;QD=57.4069;RBI=0.0423351;REFB=0;REVB=0.0382423;RO=0;SAF=45;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.71233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11777e-05;OID=.;OPOS=148481488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:10:45:0:0:11:46:0:0
chr7	148506396	.	A	C	300.64	PASS	AF=0.553571;AO=30;DP=55;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0102555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.617;QD=21.4743;RBI=0.0392289;REFB=-0.0215633;REVB=0.0378647;RO=25;SAF=20;SAR=10;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243285;STB=0.518843;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0143708;OID=.;OPOS=148506396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:25:25:30:31:0.553571:10:20:16:9:10:21:16:9
chr7	148525904	.	C	G	179.7	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0360442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2749;QD=15.6257;RBI=0.0363448;REFB=-0.00853157;REVB=-0.0046646;RO=27;SAF=12;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810188;STB=0.546713;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0137845;OID=.;OPOS=148525904;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:7:12:15:12:7:12:15:12
chr7	148638578	.	A	G	522.78	PASS	AF=0.505051;AO=50;DP=99;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=8.66435e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.98;QD=21.1223;RBI=0.0109716;REFB=0.00249903;REVB=0.0109713;RO=49;SAF=28;SAR=22;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104719;STB=0.55775;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=-0.00174225;OID=.;OPOS=148638578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:49:49:50:50:0.505051:22:28:33:16:22:28:33:16
chr7	148700541	.	G	GA,GC	222.86	PASS	AF=0.413793,0.586207;AO=3,3;DP=30;FAO=12,17;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=4,12;FSAR=8,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.042149,0.0228252;FXX=0;HRUN=4,0;LEN=1,1;MLLD=5.60044,173.245;QD=30.7393;RBI=0.582463,0.0253164;REFB=0.0130626,-0.0480175;REVB=0.580936,-0.0109514;RO=23;SAF=1,0;SAR=2,3;SRF=14;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.288733,-0.624482;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.276041,0.0322202;OID=.,.;OPOS=148700542,148700542;OREF=-,-;OALT=A,C;OMAPALT=GA,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.413793,0.586207:3,3:30:12,17:29:0:4,12:8,5:0:0:75:23:1,0:2,3:14:9
chr7	148700542	.	A	C	97.35	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.000249541;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.536;QD=12.9797;RBI=0.0207605;REFB=-0.0225542;REVB=-0.020759;RO=17;SAF=10;SAR=2;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.549026;STB=0.813408;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0146832;OID=.;OPOS=148700542;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:17:18:12:12:0.4:2:10:5:12:2:10:6:12
chr7	148712092	.	G	A	123.12	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0180961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.886;QD=16.4156;RBI=0.0346221;REFB=-0.00982255;REVB=0.0295164;RO=16;SAF=13;SAR=1;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.440556;STB=0.764207;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0208617;OID=.;OPOS=148712092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:1:13:11:5:1:13:11:5
chr7	148801091	.	G	A	306.32	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00304432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=288.145;QD=53.2722;RBI=0.00560154;REFB=0;REVB=0.00470206;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.46205e-06;OID=.;OPOS=148801091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0
chr7	148801658	.	C	T	575.77	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.536;QD=60.6078;RBI=0.0313467;REFB=0;REVB=0.0275836;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111213;OID=.;OPOS=148801658;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:12:26:0:0:12:26:0:0
chr7	148822810	.	C	T	1859.06	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0745175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.089;QD=61.4566;RBI=0.0754239;REFB=0;REVB=0.0116581;RO=0;SAF=64;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109668;OID=.;OPOS=148822810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:121:0:0:120:121:1:56:64:0:0:56:65:0:0
chr7	148848358	.	G	A	263.73	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0229845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.34;QD=47.9506;RBI=0.0508096;REFB=-0.122308;REVB=0.0453136;RO=1;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542216;STB=0.529383;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00209544;OID=.;OPOS=148848358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:22:22:1:1:21:21:0.954545:8:13:0:1:8:13:0:1
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chr7	149028274	.	C	T	779.37	PASS	AF=0.982456;AO=50;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0221929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9037;QD=54.6929;RBI=0.023285;REFB=0.124511;REVB=-0.00704769;RO=1;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140538;STB=0.50704;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.000626973;OID=.;OPOS=149028274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:50:56:0.982456:33:17:0:1:35:21:0:1
chr7	149112306	.	A	G	272.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.134;QD=51.9136;RBI=0.0504368;REFB=0;REVB=0.0469146;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348638;OID=.;OPOS=149112306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0
chr7	149152770	.	A	G	35.85	PASS	AF=0.285714;AO=4;DP=19;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0764194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7457;QD=6.82854;RBI=0.0878243;REFB=-0.0277355;REVB=0.0432802;RO=15;SAF=1;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190249;STB=0.571195;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0470498;OID=.;OPOS=149152770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:19:21:15:15:4:6:0.285714:3:1:6:9:3:3:6:9
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chr7	149318409	.	T	C	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0489457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.48;QD=9.19956;RBI=0.0490802;REFB=-0.0234325;REVB=0.00363117;RO=13;SAF=2;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34615;STB=0.713673;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0201902;OID=.;OPOS=149318409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:5:2:8:5:5:2:8:5
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chr7	149416771	.	C	T	382.18	PASS	AF=0.481481;AO=38;DP=82;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0173576;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.542;QD=18.8728;RBI=0.0239873;REFB=-0.0348192;REVB=-0.0165562;RO=38;SAF=17;SAR=21;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711685;STB=0.557992;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0382706;OID=.;OPOS=149416771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:38:42:38:39:0.481481:21:17:20:18:22:17:23:19
chr7	149418856	.	C	T	341.23	PASS	AF=0.392157;AO=38;DP=102;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0268836;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.175;QD=13.3815;RBI=0.0347991;REFB=-0.0165866;REVB=0.0220963;RO=61;SAF=12;SAR=26;SRF=31;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217732;STB=0.62964;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.029533;OID=.;OPOS=149418856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:61:62:38:40:0.392157:26:12:31:30:28:12:31:31
chr7	149419635	.	T	G	97.91	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0.0243982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.53;QD=13.5051;RBI=0.053739;REFB=-0.0110301;REVB=-0.0478811;RO=17;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464306;STB=0.757305;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0243122;OID=.;OPOS=149419635;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:8:4:0:17:8:4:0:17
chr7	149421773	.	A	G	797.45	PASS	AF=0.419811;AO=89;DP=213;FAO=89;FDP=212;FR=.;FRO=123;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=69;FSRR=54;FWDB=0.00296064;FXX=0.00934536;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.224;QD=15.0461;RBI=0.0135647;REFB=-0.00985455;REVB=-0.0132376;RO=119;SAF=51;SAR=38;SRF=65;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279685;STB=0.507132;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0137213;OID=.;OPOS=149421773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:213:212:119:123:89:89:0.419811:38:51:65:54:38:51:69:54
chr7	149426305	.	G	GC	945.22	PASS	AF=0.989011;AO=82;DP=92;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0207456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.4849;QD=41.5482;RBI=0.104008;REFB=0.0153753;REVB=0.101918;RO=7;SAF=37;SAR=45;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.003397;STB=0.505049;STBP=0.517;TYPE=ins;VARB=0.00253866;OID=.;OPOS=149426306;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.989011:82:92:90:91:1:41:49:0:1:11:7:37:45:3:4
chr7	149427409	.	T	G	1564.21	PASS	AF=1;AO=104;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6784;QD=59.0267;RBI=0.101376;REFB=0;REVB=-0.099872;RO=1;SAF=40;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00735759;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000212455;OID=.;OPOS=149427409;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:105:106:1:0:104:106:1:64:40:0:1:66:40:0:0
chr7	149474827	.	G	A	394.8	PASS	AF=0.438776;AO=43;DP=101;FAO=43;FDP=98;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.011185;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.505;QD=16.1143;RBI=0.0115556;REFB=-0.0163224;REVB=0.00290308;RO=53;SAF=20;SAR=23;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992254;STB=0.555109;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0173719;OID=.;OPOS=149474827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:98:53:55:43:43:0.438776:23:20:30:23:23:20:31:24
chr7	149500809	.	AGGGGG	AGGGG,AGGGGC,CAGGGG	583.41	PASS	AF=1,0,0;AO=43,10,5;DP=80;FAO=81,0,0;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=57,0,0;FSAR=24,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118378,0.0130409,-0.0201311;FXX=0;HRUN=5,5,1;LEN=1,1,2;MLLD=10.5806,9.66835,8.89318;QD=28.8103;RBI=0.0899834,0.208523,0.0641578;REFB=-0.0421631,-0.00221436,-0.0193219;REVB=0.0892013,-0.208115,0.0609177;RO=6;SAF=41,0,4;SAR=2,10,1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0.384615,0,0;SSSB=0.133601,-0.831907,-0.0477139;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.0136528,0,0;OID=.,.,.;OPOS=149500810,149500814,149500809;OREF=G,G,AG;OALT=-,C,CA;OMAPALT=AGGGG,AGGGGC,CAGGGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:80:81:6:0:43,10,5:81,0,0:1,0,0:2,10,1:41,0,4:5:1:24,0,0:57,0,0:0:0
chr7	149503843	.	T	G	1357.63	PASS	AF=0.988764;AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0186617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9274;QD=61.0171;RBI=0.0367439;REFB=0.0117468;REVB=-0.0316521;RO=1;SAF=53;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00885716;STB=0.504586;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.000932054;OID=.;OPOS=149503843;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:88:89:1:1:87:88:0.988764:34:53:1:0:34:54:1:0
chr7	149503915	.	GGGATAGATA	GGATA,GGGATA,GGGATAGAGT	1228.58	PASS	AF=0,0.939759,0.060241;AO=10,56,4;DP=86;FAO=0,78,5;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=0,48,2;FSAR=0,30,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403132,0.03044,-0.0116365;FXX=0.0348797;HRUN=3,1,1;LEN=5,4,2;MLLD=197.59,212.903,66.8384;QD=59.2089;RBI=0.0668093,0.0593082,0.0466949;REFB=0,0,0;REVB=0.053276,0.0509006,-0.0452218;RO=0;SAF=0,38,1;SAR=10,18,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.76069e-08,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,mnp;VARB=0,0.00498205,0.0461145;OID=.,.,.;OPOS=149503916,149503917,149503923;OREF=GGATA,GATA,TA;OALT=-,-,GT;OMAPALT=GGATA,GGGATA,GGGATAGAGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.939759,0.060241:10,56,4:86:0,78,5:83:0:0,48,2:0,30,3:0:0:14:0:0,38,1:10,18,3:0:0
chr7	149506211	.	G	GC	3063.05	PASS	AF=1;AO=267;DP=282;FAO=274;FDP=274;FR=.;FRO=0;FSAF=170;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131416;FXX=0.0179205;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.7269;QD=44.716;RBI=0.132625;REFB=-0.00923684;REVB=0.0178626;RO=13;SAF=165;SAR=102;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142071;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00131546;OID=.;OPOS=149506212;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:267:282:274:274:0:170:104:0:0:51:13:165:102:10:3
chr7	149511985	.	A	G	619.94	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.062607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.968;QD=59.0419;RBI=0.0661762;REFB=-0.107148;REVB=0.0214393;RO=1;SAF=22;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208513;STB=0.511106;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000957066;OID=.;OPOS=149511985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:19:22:1:0:19:22:1:0
chr7	149512832	.	C	G	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0298479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3198;QD=14.6535;RBI=0.0579857;REFB=0.0546107;REVB=-0.0497136;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105859;STB=0.562346;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=-0.0597947;OID=.;OPOS=149512832;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:4:4:3:5:4:4:3:5
chr7	149513152	.	C	T	130.4	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0944046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.752;QD=43.4679;RBI=0.0951501;REFB=0;REVB=-0.0118879;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116654;OID=.;OPOS=149513152;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr7	149513560	.	T	C	942.97	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168099;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.784;QD=58.9356;RBI=0.0545424;REFB=0;REVB=0.0518873;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216515;OID=.;OPOS=149513560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0
chr7	149515103	.	C	T	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00243107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.108;QD=58.9623;RBI=0.0399639;REFB=0;REVB=0.0398899;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.16162e-05;OID=.;OPOS=149515103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:36:30:0:0:36:30:0:0
chr7	149515188	.	TAA	TA,TAC	240.72	PASS	AF=1,0;AO=17,2;DP=21;FAO=21,0;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11,0;FSAR=10,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0433917,-0.0428553;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=18.2089,6.05491;QD=45.8512;RBI=0.0726469,0.0888234;REFB=0,0;REVB=-0.0582644,-0.0778011;RO=0;SAF=10,0;SAR=7,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00533744,0;OID=.,.;OPOS=149515189,149515190;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=TA,TAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:17,2:21:21,0:21:0:11,0:10,0:0:0:4:0:10,0:7,2:0:0
chr7	149515754	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.174;QD=62.6705;RBI=0.0470116;REFB=0;REVB=-0.0194256;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.94452e-05;OID=.;OPOS=149515754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr7	149515775	.	C	G	605.99	PASS	AF=0.893617;AO=39;DP=50;FAO=42;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0252549;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.053;QD=51.5739;RBI=0.0858785;REFB=-0.150432;REVB=0.0820811;RO=5;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103789;STB=0.553166;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00481469;OID=.;OPOS=149515775;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:50:47:5:5:39:42:0.893617:20:19:0:5:21:21:0:5
chr7	149515796	.	C	T	788.58	PASS	AF=0.893939;AO=59;DP=66;FAO=59;FDP=66;FR=.;FRO=7;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0153154;FXX=0.0149231;HRUN=4;LEN=1;MLLD=146.065;QD=47.7928;RBI=0.0170465;REFB=-0.0950417;REVB=0.00748486;RO=4;SAF=30;SAR=29;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289011;STB=0.521843;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00399957;OID=.;OPOS=149515796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:66:66:4:7:59:59:0.893939:29:30:3:1:29:30:5:2
chr7	149516485	.	GA	G,GG	1002.34	PASS	AF=0.0147059,0.985294;AO=8,61;DP=69;FAO=1,67;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=0,19;FSAR=1,48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0630044,0.0698426;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=164.768,181.189;QD=58.9611;RBI=0.10787,0.0949856;REFB=0,0;REVB=0.0875574,0.064376;RO=0;SAF=6,13;SAR=2,48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=5.58669e-08,-4.13514e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00404496,0.000857181;OID=.,.;OPOS=149516486,149516486;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0147059,0.985294:8,61:69:1,67:68:0:0,19:1,48:0:0:3:0:6,13:2,48:0:0
chr7	149516881	.	G	T	1344.5	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437948;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.673;QD=62.5347;RBI=0.0641526;REFB=0;REVB=0.0468783;RO=0;SAF=48;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119745;OID=.;OPOS=149516881;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:38:48:0:0:38:48:0:0
chr7	149518148	.	A	G	544.45	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2642;QD=58.8598;RBI=0.0354229;REFB=0;REVB=0.00656447;RO=0;SAF=6;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50008e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00305883;OID=.;OPOS=149518148;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:30:6:0:0:30:7:0:0
chr7	149518532	.	TC	T	1250.96	PASS	AF=1;AO=102;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0382299;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.1122;QD=43.5118;RBI=0.104637;REFB=-0.0465083;REVB=0.0974028;RO=4;SAF=43;SAR=59;SRF=0;SRR=4;SSEN=0.227976;SSEP=0;SSSB=0.0310817;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00411824;OID=.;OPOS=149518533;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:102:114:115:115:0:46:69:0:0:16:4:43:59:0:4
chr7	149518961	.	T	C	3775.47	PASS	AF=0.99177;AO=232;DP=235;FAO=241;FDP=243;FR=.;FRO=2;FSAF=130;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00916123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3856;QD=62.1477;RBI=0.0648368;REFB=-0.0482605;REVB=0.0641863;RO=2;SAF=129;SAR=103;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00916251;STB=0.504464;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0016032;OID=.;OPOS=149518961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:235:243:2:2:232:241:0.99177:103:129:0:2:111:130:0:2
chr7	149519184	.	C	T	801.57	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.554;QD=57.2552;RBI=0.101846;REFB=0;REVB=0.0880133;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442426;OID=.;OPOS=149519184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:28:27:0:0:28:28:0:0
chr7	149521183	.	G	A	940.13	PASS	AF=0.971014;AO=65;DP=68;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0170769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.272;QD=54.5;RBI=0.0495137;REFB=-0.124248;REVB=0.0464757;RO=0;SAF=30;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513509;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00192971;OID=.;OPOS=149521183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:68:69:0:2:65:67:0.971014:35:30:0:0:36:31:0:2
chr7	149521544	.	CGC	CTGC,TCG,TGC	954.57	PASS	AF=0,0.0416667,0.944444;AO=10,6,52;DP=73;FAO=0,3,68;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=0,3,46;FSAR=0,0,22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.027227,0.0824642,0.162849;FXX=0;HRUN=0,1,1;LEN=1,3,1;MLLD=83.6102,47.1837,79.0103;QD=53.0317;RBI=0.0283186,0.0844643,0.16608;REFB=-0.00774278,-0.0848986,-0.0812085;REVB=-0.00778678,0.0182722,0.0325978;RO=3;SAF=8,6,32;SAR=2,0,20;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.141327,0,-0.0421349;STB=0.5,0.5,0.505375;STBP=1,1,0.617;TYPE=ins,mnp,snp;VARB=0,0.0796661,0.0147729;OID=.,.,.;OPOS=149521545,149521544,149521544;OREF=-,CGC,C;OALT=T,TCG,T;OMAPALT=CTGC,TCG,TGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:7:73:72:3:1:10,6,52:0,3,68:0,0.0416667,0.944444:2,0,20:8,6,32:3:0:0,0,22:0,3,46:1:0
chr7	149522162	.	G	T	4317.87	PASS	AF=1;AO=270;DP=273;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=197;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353513;FXX=0.0107523;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.127;QD=62.5779;RBI=0.0764475;REFB=-0.0178801;REVB=0.0677828;RO=1;SAF=194;SAR=76;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00245157;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000164011;OID=.;OPOS=149522162;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:19:273:276:1:0:270:276:1:76:194:1:0:79:197:0:0
chr7	149522366	.	T	G	1044.34	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.894;QD=59.6766;RBI=0.014186;REFB=0;REVB=0.00396604;RO=0;SAF=45;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.7553e-05;OID=.;OPOS=149522366;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:25:45:0:0:25:45:0:0
chr7	149523277	.	A	G	2238.41	PASS	AF=0.986301;AO=131;DP=133;FAO=144;FDP=146;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=73;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0529641;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.669;QD=61.3264;RBI=0.056893;REFB=-0.143213;REVB=0.0207754;RO=2;SAF=58;SAR=73;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161044;STB=0.506943;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00117471;OID=.;OPOS=149523277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:133:146:2:2:131:144:0.986301:73:58:2:0:73:71:2:0
chr7	149528262	.	C	T	1098.88	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0589101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5356;QD=59.3988;RBI=0.0866853;REFB=0;REVB=0.063592;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000590402;OID=.;OPOS=149528262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:74:0:0:67:74:1:37:30:0:0:39:35:0:0
chr7	149530894	.	G	A	745.66	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00987077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.044;QD=62.138;RBI=0.0165227;REFB=0;REVB=0.0132501;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212597;OID=.;OPOS=149530894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:25:22:0:0:26:22:0:0
chr7	149556518	.	C	T	902.68	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.796;QD=58.2373;RBI=0.0321728;REFB=0;REVB=0.0274943;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118759;OID=.;OPOS=149556518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:27:35:0:0:27:35:0:0
chr7	149558409	.	G	C	64.46	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.004101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.086;QD=9.91641;RBI=0.0189703;REFB=-0.0218688;REVB=0.0185217;RO=17;SAF=6;SAR=3;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126056;STB=0.575601;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0345145;OID=.;OPOS=149558409;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:3:6:13:4:3:6:13:4
chr7	149559273	.	C	T	307.17	PASS	AF=0.551724;AO=29;DP=56;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00650227;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.687;QD=21.1838;RBI=0.00690754;REFB=-0.0100887;REVB=0.00233122;RO=27;SAF=17;SAR=12;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0271562;STB=0.540515;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0106629;OID=.;OPOS=149559273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:27:26:29:32:0.551724:12:17:15:12:12:20:14:12
chr7	149559465	.	C	T	561.94	PASS	AF=0.593023;AO=51;DP=87;FAO=51;FDP=86;FR=.;FRO=35;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0143126;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3173;QD=26.1369;RBI=0.0441916;REFB=-0.0152141;REVB=0.0418096;RO=35;SAF=28;SAR=23;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0821671;STB=0.544804;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0106367;OID=.;OPOS=149559465;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:35:35:51:51:0.593023:23:28:23:12:23:28:23:12
chr7	149562627	.	CCG	C	406.76	PASS	AF=1;AO=21;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361903;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=160.009;QD=47.8538;RBI=0.0373818;REFB=0;REVB=0.00936257;RO=0;SAF=20;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.402516;SSEP=0;SSSB=-3.78928e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000215281;OID=.;OPOS=149562628;OREF=CG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:21:32:34:34:0:32:2:0:0:7:0:20:1:0:0
chr7	149571095	.	G	A	307.72	PASS	AF=0.702703;AO=26;DP=37;FAO=26;FDP=37;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0212708;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.118;QD=33.2669;RBI=0.0281285;REFB=-0.0701495;REVB=0.0184055;RO=11;SAF=15;SAR=11;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332647;STB=0.518187;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0172215;OID=.;OPOS=149571095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:37:37:11:11:26:26:0.702703:11:15:7:4:11:15:7:4
chr7	149576818	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0646874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.536;QD=51.1842;RBI=0.0652414;REFB=0;REVB=0.00848406;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000424707;OID=.;OPOS=149576818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr7	150028958	.	A	G	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.765;QD=63.5828;RBI=0.0385792;REFB=0;REVB=0.0228152;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.58721e-05;OID=.;OPOS=150028958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr7	150034184	.	T	C	357.47	PASS	AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0640923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.396;QD=49.3067;RBI=0.0642585;REFB=-0.0465316;REVB=-0.00461784;RO=2;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713683;STB=0.538433;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00233759;OID=.;OPOS=150034184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:12:15:0:2:12:15:0:2
chr7	150034378	.	A	G	601.8	PASS	AF=0.903846;AO=46;DP=53;FAO=47;FDP=52;FR=.;FRO=5;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0129993;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.5398;QD=46.2919;RBI=0.0293181;REFB=-0.0926575;REVB=0.0262787;RO=5;SAF=25;SAR=21;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631782;STB=0.534086;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00763609;OID=.;OPOS=150034378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:53:52:5:5:46:47:0.903846:21:25:1:4:21:26:1:4
chr7	150035183	.	C	T	397.02	PASS	AF=0.794872;AO=31;DP=39;FAO=31;FDP=39;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=27;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.00678329;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=255.139;QD=40.7204;RBI=0.0136589;REFB=-0.163742;REVB=0.0118555;RO=5;SAF=4;SAR=27;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351826;STB=0.725986;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00196208;OID=.;OPOS=150035183;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:39:39:5:8:31:31:0.794872:27:4:5:0:27:4:7:1
chr7	150035459	.	T	G	223.28	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0866541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4406;QD=49.618;RBI=0.0942693;REFB=0;REVB=0.0371184;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00172324;OID=.;OPOS=150035459;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:7:10:0:0:8:10:0:0
chr7	150035500	.	C	G	175.66	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0075232;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.766;QD=46.8433;RBI=0.0192269;REFB=0;REVB=0.0176939;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000388433;OID=.;OPOS=150035500;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0
chr7	150035526	.	T	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.003279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.065;QD=46.8481;RBI=0.0213761;REFB=0;REVB=-0.0211231;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.20278e-05;OID=.;OPOS=150035526;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0
chr7	150037660	.	A	G	534.23	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.069028;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.471;QD=59.359;RBI=0.0971882;REFB=0;REVB=0.0684156;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159505;OID=.;OPOS=150037660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:16:19:0:0:16:20:0:0
chr7	150068371	.	T	C	842.0	PASS	AF=1;AO=56;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.922;QD=57.0846;RBI=0.0243438;REFB=0;REVB=0.0184939;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.12772e-05;OID=.;OPOS=150068371;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:56:59:1:25:31:0:0:28:31:0:0
chr7	150068605	.	G	A	1865.6	PASS	AF=1;AO=121;DP=124;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.185202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.91;QD=59.2255;RBI=0.18883;REFB=-0.17768;REVB=0.0368348;RO=2;SAF=48;SAR=73;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193784;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00214756;OID=.;OPOS=150068605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:124:126:2:0:121:126:1:73:48:2:0:73:53:0:0
chr7	150068620	.	C	T	1494.55	PASS	AF=0.931034;AO=103;DP=111;FAO=108;FDP=116;FR=.;FRO=8;FSAF=44;FSAR=64;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.103988;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=51.9261;QD=51.5361;RBI=0.110954;REFB=-0.0547478;REVB=0.0386924;RO=8;SAF=41;SAR=62;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495258;STB=0.524242;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.012511;OID=.;OPOS=150068620;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:111:116:8:8:103:108:0.931034:62:41:6:2:64:44:6:2
chr7	150068933	.	T	C	382.98	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.973;QD=54.7107;RBI=0.0595524;REFB=0;REVB=0.0362241;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165314;OID=.;OPOS=150068933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:17:10:0:0:18:10:0:0
chr7	150070630	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.0232;QD=45.8068;RBI=0.0426905;REFB=0;REVB=0.0260831;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132805;OID=.;OPOS=150070630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:11:3:0:0:11:3:0:0
chr7	150070663	.	T	C	175.67	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.4;QD=46.8462;RBI=0.0312299;REFB=0;REVB=-0.0279863;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000109364;OID=.;OPOS=150070663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:12:3:0:0:12:3:0:0
chr7	150070814	.	G	A	1590.71	PASS	AF=0.990741;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=108;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00362711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8724;QD=58.915;RBI=0.0443273;REFB=0.0684123;REVB=-0.0441786;RO=1;SAF=59;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00978547;STB=0.505154;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.00166688;OID=.;OPOS=150070814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:108:108:1:1:107:107:0.990741:48:59:0:1:48:59:0:1
chr7	150093701	.	A	C	1828.46	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00403642;FXX=0.0399968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.041;QD=60.9487;RBI=0.014159;REFB=0;REVB=0.0135714;RO=0;SAF=70;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000725954;OID=.;OPOS=150093701;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:120:0:0:115:120:1:45:70:0:0:46:74:0:0
chr7	150217089	.	G	A	236.84	PASS	AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.00972162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.743;QD=26.3155;RBI=0.0299924;REFB=-0.0239563;REVB=0.0283731;RO=13;SAF=14;SAR=8;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22193;STB=0.63624;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0127625;OID=.;OPOS=150217089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:13:14:22:22:0.611111:8:14:4:9:8:14:4:10
chr7	150217248	.	A	G	262.81	PASS	AF=0.428571;AO=30;DP=70;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=0.00595384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.661;QD=15.0178;RBI=0.00990682;REFB=-0.0121589;REVB=0.00791813;RO=40;SAF=15;SAR=15;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177369;STB=0.599936;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.014202;OID=.;OPOS=150217248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:40:40:30:30:0.428571:15:15:27:13:15:15:27:13
chr7	150218002	.	C	T	248.19	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.00380105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.741;QD=16.2745;RBI=0.0212478;REFB=-0.0439064;REVB=-0.020905;RO=32;SAF=16;SAR=12;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241666;STB=0.642105;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0297713;OID=.;OPOS=150218002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:32:33:28:28:0.459016:12:16:10:22:12:16:10:23
chr7	150324825	.	C	T	108.56	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0418506;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=128.747;QD=13.5698;RBI=0.041882;REFB=-0.0138987;REVB=-0.00162182;RO=19;SAF=4;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180198;STB=0.606048;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0179857;OID=.;OPOS=150324825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:9:4:9:10:9:4:9:10
chr7	150326191	.	A	G	314.97	PASS	AF=0.52381;AO=33;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.;FRO=30;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.000375989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.205;QD=19.998;RBI=0.0118174;REFB=-0.0179873;REVB=-0.0118114;RO=29;SAF=23;SAR=10;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734722;STB=0.534862;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.0182578;OID=.;OPOS=150326191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:29:30:33:33:0.52381:10:23:18:11:10:23:19:11
chr7	150327024	.	C	T	447.85	PASS	AF=0.475248;AO=47;DP=100;FAO=48;FDP=101;FR=.;FRO=53;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=40;FSRR=13;FWDB=-0.0446549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.169;QD=17.7366;RBI=0.0535632;REFB=-0.0625908;REVB=-0.0295797;RO=49;SAF=30;SAR=17;SRF=37;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121255;STB=0.564785;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0500679;OID=.;OPOS=150327024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:49:53:47:48:0.475248:17:30:37:12:17:31:40:13
chr7	150389593	.	T	C	274.5	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0217275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.641;QD=19.9633;RBI=0.0218124;REFB=-0.0265132;REVB=0.00192307;RO=26;SAF=13;SAR=16;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0550256;STB=0.530591;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.038926;OID=.;OPOS=150389593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:16:13:10:16:16:13:10:16
chr7	150389677	.	G	C	154.79	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0206701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.016;QD=14.7418;RBI=0.0208443;REFB=-0.0162005;REVB=-0.00268899;RO=25;SAF=3;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410676;STB=0.741405;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0249005;OID=.;OPOS=150389677;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:14:3:13:12:14:3:13:12
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chr7	150447027	.	T	G	754.65	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0704461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.792;QD=56.9545;RBI=0.0726201;REFB=0;REVB=0.017636;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000377298;OID=.;OPOS=150447027;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:21:31:0:0:21:32:0:0
chr7	150488616	.	A	G	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00600714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.135;QD=58.5856;RBI=0.0107776;REFB=0;REVB=0.00894829;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.4052e-05;OID=.;OPOS=150488616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:15:18:0:0:15:18:0:0
chr7	150490376	.	C	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6922;QD=52.6132;RBI=0.0210029;REFB=0;REVB=0.0110576;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000185396;OID=.;OPOS=150490376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr7	150491084	.	T	G	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0227852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.54;QD=55.6542;RBI=0.0357129;REFB=0;REVB=-0.0275;RO=0;SAF=26;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000522098;OID=.;OPOS=150491084;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:1:26:0:0:1:26:0:0
chr7	150491137	.	ACCCCCA	ACCCCA,ACCCCAC	38.23	PASS	AF=0.32,0.04;AO=9,2;DP=25;FAO=8,1;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=6,1;FSAR=2,0;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0292045,-0.0811614;FXX=0.0384468;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=10.3584,58.078;QD=6.11602;RBI=0.183685,0.105747;REFB=-0.148686,-0.0150811;REVB=-0.181348,-0.067789;RO=13;SAF=7,2;SAR=2,0;SRF=10;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0121026,0.468324;STB=0.5,0.985076;STBP=1,0.52;TYPE=del,mnp;VARB=0.170858,0.152615;OID=.,.;OPOS=150491138,150491142;OREF=C,CA;OALT=-,AC;OMAPALT=ACCCCA,ACCCCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.32,0.04:9,2:25:8,1:25:16:6,1:2,0:12:4:31:13:7,2:2,0:10:3
chr7	150500729	.	A	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.439;QD=62.9829;RBI=0.0386716;REFB=0;REVB=0.0279281;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180654;OID=.;OPOS=150500729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr7	150501516	.	A	G	1788.43	PASS	AF=1;AO=91;DP=120;FAO=118;FDP=118;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00123037;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.132;QD=60.6248;RBI=0.0262712;REFB=0;REVB=0.0262424;RO=0;SAF=40;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150814;OID=.;OPOS=150501516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:118:0:0:91:118:1:51:40:0:0:69:49:0:0
chr7	150501517	.	C	G	48.93	PASS	AF=0.141667;AO=25;DP=118;FAO=17;FDP=120;FR=.;FRO=103;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=60;FWDB=0.0270469;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=26.3592;QD=1.6311;RBI=0.0279672;REFB=-0.0618824;REVB=-0.0071156;RO=93;SAF=8;SAR=17;SRF=42;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174858;STB=0.505045;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.241688;OID=.;OPOS=150501517;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:118:120:93:103:25:17:0.141667:17:8:42:51:10:7:43:60
chr7	150554887	.	G	A	871.09	PASS	AF=0.985294;AO=55;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0149577;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=107.391;QD=51.2404;RBI=0.160226;REFB=-0.109786;REVB=0.159527;RO=0;SAF=45;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.71233e-08;STB=0.505375;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00349369;OID=.;OPOS=150554887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:68:0:1:55:67:0.985294:10:45:0:0:21:46:1:0
chr7	150555915	.	A	G	2150.45	PASS	AF=0.985714;AO=137;DP=141;FAO=138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=90;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00284734;FXX=0.0140835;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.029;QD=61.4414;RBI=0.00965385;REFB=-0.0766387;REVB=-0.0092244;RO=2;SAF=89;SAR=48;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193925;STB=0.510203;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=7.63889e-05;OID=.;OPOS=150555915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:141:140:2:2:137:138:0.985714:48:89:0:2:48:90:0:2
chr7	150556002	.	T	C	1499.01	PASS	AF=1;AO=98;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159791;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.879;QD=59.9603;RBI=0.0174497;REFB=0;REVB=0.00701141;RO=0;SAF=56;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59993e-05;OID=.;OPOS=150556002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:100:0:0:98:100:1:42:56:0:0:43:57:0:0
chr7	150556055	.	CG	GC	946.74	PASS	AF=1;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190075;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=2;MLLD=192.954;QD=58.2609;RBI=0.0233975;REFB=0;REVB=-0.013644;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=7.5214e-05;OID=.;OPOS=150556055;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:64:65:1:27:37:0:0:27:38:0:0
chr7	150557622	.	G	A	1368.38	PASS	AF=0.978022;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0129048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.52;QD=60.1488;RBI=0.0290134;REFB=-0.153993;REVB=0.0259854;RO=2;SAF=42;SAR=47;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220304;STB=0.511625;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00091906;OID=.;OPOS=150557622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:91:91:2:2:89:89:0.978022:47:42:2:0:47:42:2:0
chr7	150557665	.	C	G	819.55	PASS	AF=0.9375;AO=56;DP=60;FAO=60;FDP=64;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0775813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.87;QD=51.2218;RBI=0.0809923;REFB=-0.0640292;REVB=0.0232573;RO=2;SAF=19;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115972;STB=0.507681;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.00219538;OID=.;OPOS=150557665;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:60:64:2:4:56:60:0.9375:37:19:1:1:37:23:2:2
chr7	150648198	.	A	G	783.08	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9444;QD=55.9343;RBI=0.0621885;REFB=0;REVB=0.0574654;RO=0;SAF=34;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104766;OID=.;OPOS=150648198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:56:0:0:52:56:1:18:34:0:0:21:35:0:0
chr7	150648789	.	T	C	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0030777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.454;QD=59.1431;RBI=0.0171326;REFB=0;REVB=-0.0168539;RO=0;SAF=33;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.61397e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.59134e-05;OID=.;OPOS=150648789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:34:33:0:0:34:33:0:0
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chr7	150773807	.	A	T	281.09	PASS	AF=0.54717;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00397587;FXX=0.036357;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.485;QD=21.2141;RBI=0.00865812;REFB=-0.0244584;REVB=-0.00769126;RO=21;SAF=19;SAR=10;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0686098;STB=0.535187;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0207396;OID=.;OPOS=150773807;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:53:21:24:29:29:0.54717:10:19:12:9:10:19:14:10
chr7	150774308	.	G	A	317.16	PASS	AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0618441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.1198;QD=25.891;RBI=0.0633838;REFB=-0.0237297;REVB=0.0138859;RO=20;SAF=19;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106037;STB=0.572055;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0228828;OID=.;OPOS=150774308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:20:21:28:28:0.571429:9:19:11:9:9:19:11:10
chr7	150774868	.	C	CG	48.24	PASS	AF=0.380952;AO=10;DP=22;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0119959;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=48.0537;QD=9.18899;RBI=0.0231885;REFB=-0.0121431;REVB=-0.0198446;RO=12;SAF=8;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327406;STB=0.648251;STBP=0.33;TYPE=ins;VARB=0.105889;OID=.;OPOS=150774869;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.380952:10:22:8:21:13:6:2:7:6:48:12:8:2:6:6
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chr7	150883726	.	C	T	130.61	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0267599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.887;QD=22.7155;RBI=0.0685418;REFB=-0.0344081;REVB=0.0631022;RO=9;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199914;STB=0.611368;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0316551;OID=.;OPOS=150883726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:5:9:8:1:5:9:8:1
chr7	150884266	.	C	CAG,G	84.78	PASS	AF=0.526316,0;AO=9,2;DP=22;FAO=10,0;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=6,0;FSAR=4,0;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0480507,0.130554;FXX=0.049975;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=56.8301,67.152;QD=17.8476;RBI=0.0921572,0.147756;REFB=-0.1025,-0.0575471;REVB=-0.078639,-0.0691899;RO=10;SAF=6,0;SAR=3,2;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.033981,-0.655147;STB=0.521695,0.5;STBP=0.919,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.149858,0;OID=.,.;OPOS=150884267,150884266;OREF=-,C;OALT=AG,G;OMAPALT=CAG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:19:10:9:9,2:10,0:0.526316,0:3,2:6,0:7:3:4,0:6,0:5:4
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chr7	151097323	.	A	G	1133.67	PASS	AF=0.483051;AO=114;DP=238;FAO=114;FDP=236;FR=.;FRO=122;FSAF=66;FSAR=48;FSRF=66;FSRR=56;FWDB=-0.0166329;FXX=0.00840301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.378;QD=19.2148;RBI=0.034257;REFB=-0.0148269;REVB=-0.0299481;RO=118;SAF=66;SAR=48;SRF=62;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503064;STB=0.519996;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0168099;OID=.;OPOS=151097323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:238:236:118:122:114:114:0.483051:48:66:62:56:48:66:66:56
chr7	151106066	.	C	T	412.73	PASS	AF=0.434343;AO=41;DP=97;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.00585585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.801;QD=16.6757;RBI=0.00588521;REFB=-0.0168656;REVB=0.000587166;RO=56;SAF=16;SAR=25;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150551;STB=0.594214;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0231525;OID=.;OPOS=151106066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:99:56:56:41:43:0.434343:25:16:30:26:27:16:30:26
chr7	151168534	.	G	A	775.03	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00937995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.294;QD=56.3659;RBI=0.0121589;REFB=0;REVB=0.00773666;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.55042e-05;OID=.;OPOS=151168534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:55:0:0:52:55:1:22:30:0:0:24:31:0:0
chr7	151504019	.	T	C	84.04	PASS	AF=0.357143;AO=7;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.008544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.334;QD=12.0054;RBI=0.0198597;REFB=-0.0144449;REVB=0.0179278;RO=17;SAF=5;SAR=2;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156386;STB=0.666296;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0271643;OID=.;OPOS=151504019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:28:28:17:17:7:10:0.357143:2:5:10:7:2:8:10:7
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chr7	151597368	.	G	A	255.49	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.00203992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8677;QD=22.7102;RBI=0.0486132;REFB=-0.0893595;REVB=-0.0485704;RO=21;SAF=9;SAR=15;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00529031;STB=0.502956;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0895492;OID=.;OPOS=151597368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:15:9:8:13:15:9:8:13
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chr7	151970797	.	A	T	127.52	PASS	AF=0.097561;AO=40;DP=411;FAO=40;FDP=410;FR=.;FRO=370;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=190;FSRR=180;FWDB=0.000762911;FXX=0.00243303;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.097;QD=1.24408;RBI=0.00919162;REFB=-0.00100507;REVB=-0.0091599;RO=370;SAF=28;SAR=12;SRF=190;SRR=180;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230671;STB=0.672584;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00942136;OID=.;OPOS=151970797;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:411:410:370:370:40:40:0.097561:12:28:190:180:12:28:190:180
chr7	151970856	.	T	A	2783.17	PASS	AF=0.619403;AO=248;DP=401;FAO=249;FDP=402;FR=.;FRO=153;FSAF=127;FSAR=122;FSRF=71;FSRR=82;FWDB=-0.0380295;FXX=0.00248133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5956;QD=27.6932;RBI=0.038145;REFB=-0.0240453;REVB=0.00296662;RO=152;SAF=126;SAR=122;SRF=71;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289074;STB=0.517496;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.00956118;OID=.;OPOS=151970856;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:401:402:152:153:248:249:0.619403:122:126:71:81:122:127:71:82
chr7	151970859	.	C	T	31.67	PASS	AF=0.0519802;AO=21;DP=404;FAO=21;FDP=404;FR=.;FRO=383;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=193;FSRR=190;FWDB=-0.0209074;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.972;QD=0.313515;RBI=0.0243148;REFB=-0.000637995;REVB=-0.0124133;RO=372;SAF=6;SAR=15;SRF=189;SRR=183;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223132;STB=0.707986;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00925008;OID=.;OPOS=151970859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:404:404:372:383:21:21:0.0519802:15:6:189:183:15:6:193:190
chr7	151970877	.	G	A	31.88	PASS	AF=0.0544413;AO=19;DP=349;FAO=19;FDP=349;FR=.;FRO=330;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=159;FSRR=171;FWDB=-0.0462766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5585;QD=0.365346;RBI=0.060674;REFB=0.00218666;REVB=-0.0392404;RO=330;SAF=10;SAR=9;SRF=159;SRR=171;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447849;STB=0.541961;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=-0.045278;OID=.;OPOS=151970877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:349:349:330:330:19:19:0.0544413:9:10:159:171:9:10:159:171
chr7	151970931	.	G	A	155.58	PASS	AF=0.203008;AO=25;DP=133;FAO=27;FDP=133;FR=.;FRO=106;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=48;FSRR=58;FWDB=-0.0771455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4204;QD=4.679;RBI=0.0822933;REFB=0.00306227;REVB=-0.028649;RO=108;SAF=8;SAR=17;SRF=48;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166926;STB=0.63323;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.00770402;OID=.;OPOS=151970931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:108:106:25:27:0.203008:17:8:48:60:19:8:48:58
chr7	152099906	.	T	A	1209.6	PASS	AF=0.686275;AO=104;DP=152;FAO=105;FDP=153;FR=.;FRO=48;FSAF=51;FSAR=54;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0468571;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.425;QD=31.6237;RBI=0.0468826;REFB=-0.0269873;REVB=-0.00154396;RO=48;SAF=50;SAR=54;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000943617;STB=0.502056;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.00977753;OID=.;OPOS=152099906;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:153:48:48:104:105:0.686275:54:50:23:25:54:51:23:25
chr7	152099917	.	G	A	1171.65	PASS	AF=0.684211;AO=99;DP=147;FAO=104;FDP=152;FR=.;FRO=48;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.000408197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.66;QD=30.8329;RBI=0.0076265;REFB=-0.017407;REVB=-0.00761557;RO=46;SAF=46;SAR=53;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209396;STB=0.500507;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.010296;OID=.;OPOS=152099917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:152:46:48:99:104:0.684211:53:46:23:23:54:50:23:25
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chr7	152290144	.	A	G	96.2	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0135249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.652;QD=12.0244;RBI=0.0457769;REFB=-0.0109002;REVB=-0.0437333;RO=20;SAF=9;SAR=3;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0146504;OID=.;OPOS=152290144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:3:9:15:5:3:9:15:5
chr7	154429560	.	C	T	1453.49	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.346;QD=63.1954;RBI=0.0230002;REFB=0;REVB=-0.00503032;RO=0;SAF=41;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59636e-05;OID=.;OPOS=154429560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:51:41:0:0:51:41:0:0
chr7	154461112	.	A	G	1841.0	PASS	AF=0.991803;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=74;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0376205;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.6525;QD=60.3608;RBI=0.06849;REFB=0.00325057;REVB=0.0572326;RO=1;SAF=74;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00999959;STB=0.505262;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.000155397;OID=.;OPOS=154461112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:122:122:1:1:121:121:0.991803:47:74:0:1:47:74:0:1
chr7	154667628	.	A	G	972.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.5612;QD=58.9195;RBI=0.0262652;REFB=0;REVB=0.019652;RO=0;SAF=22;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86818e-05;OID=.;OPOS=154667628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:43:22:0:0:44:22:0:0
chr7	154667643	.	G	A	307.39	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=30;FWDB=0.00552355;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.027;QD=15.3694;RBI=0.0178941;REFB=-0.0190785;REVB=-0.0170202;RO=46;SAF=19;SAR=15;SRF=16;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212218;STB=0.619497;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0353898;OID=.;OPOS=154667643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:46:46:34:34:0.425:15:19:16:30:15:19:16:30
chr7	154672662	.	C	T	263.97	PASS	AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0184632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.541;QD=15.3024;RBI=0.0291219;REFB=-0.0319373;REVB=-0.022521;RO=39;SAF=6;SAR=24;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.426755;STB=0.743415;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0393197;OID=.;OPOS=154672662;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:24:6:23:16:24:6:23:16
chr7	154679447	.	G	A	1116.96	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.087101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7496;QD=60.3764;RBI=0.0871856;REFB=0;REVB=-0.00383942;RO=0;SAF=47;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.09191e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000426151;OID=.;OPOS=154679447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:27:47:0:0:27:47:0:0
chr7	154681050	.	C	T	206.96	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0394255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.548;QD=17.247;RBI=0.0394747;REFB=0.00852502;REVB=-0.00197177;RO=27;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0891061;STB=0.550849;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.0120874;OID=.;OPOS=154681050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:12:9:14:13:12:9:14:13
chr7	154681216	.	G	A	61.27	PASS	AF=0.25;AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00900381;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=303.536;QD=6.80728;RBI=0.0146627;REFB=-0.0134237;REVB=-0.0115726;RO=27;SAF=8;SAR=1;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.419944;STB=0.778008;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0331754;OID=.;OPOS=154681216;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:36:36:27:27:9:9:0.25:1:8:17:10:1:8:17:10
chr7	154760369	.	A	G	95.19	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.103575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.38;QD=34.6154;RBI=0.107272;REFB=-0.091205;REVB=-0.0279228;RO=1;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687795;STB=0.538386;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00655341;OID=.;OPOS=154760369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:6:4:0:1:6:4:0:1
chr7	154862621	.	T	A	364.46	PASS	AF=0.590164;AO=36;DP=61;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0389375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.176;QD=23.8988;RBI=0.0396616;REFB=0.0146218;REVB=-0.00754382;RO=25;SAF=14;SAR=22;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548393;STB=0.530081;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=-0.0164103;OID=.;OPOS=154862621;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:25:25:36:36:0.590164:22:14:8:17:22:14:8:17
chr7	154973603	.	G	A	256.28	PASS	AF=0.75;AO=20;DP=28;FAO=21;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0105525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.479;QD=36.6117;RBI=0.131052;REFB=0.0141614;REVB=0.130626;RO=5;SAF=15;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700211;STB=0.52629;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.00191356;OID=.;OPOS=154973603;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:28:28:5:5:20:21:0.75:5:15:3:2:6:15:3:2
chr7	154989054	.	C	T	341.67	PASS	AF=0.392157;AO=40;DP=101;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=37;FWDB=-0.0231658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7861;QD=13.3988;RBI=0.038531;REFB=0.00494394;REVB=-0.0307893;RO=60;SAF=17;SAR=23;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455136;STB=0.513588;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.00883352;OID=.;OPOS=154989054;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:60:62:40:40:0.392157:23:17:23:37:23:17:25:37
chr7	154989982	.	G	A	243.9	PASS	AF=0.547619;AO=22;DP=40;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00875931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2082;QD=23.2282;RBI=0.0742237;REFB=-0.0208549;REVB=-0.0737051;RO=18;SAF=4;SAR=18;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2797;STB=0.642721;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0317197;OID=.;OPOS=154989982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:42:18:19:22:23:0.547619:18:4:8:10:18:5:9:10
chr7	154990003	.	C	T	196.72	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.0590415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3536;QD=18.2999;RBI=0.0617466;REFB=0.00572462;REVB=-0.018076;RO=23;SAF=8;SAR=12;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188409;STB=0.605963;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.0100017;OID=.;OPOS=154990003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:12:8:5:18:12:8:5:18
chr7	155150472	.	G	A	712.31	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203723;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.697;QD=63.3161;RBI=0.0440593;REFB=0;REVB=0.0390666;RO=0;SAF=31;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97211e-05;OID=.;OPOS=155150472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:14:31:0:0:14:31:0:0
chr7	155150560	.	A	G	740.86	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00391163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4654;QD=59.2689;RBI=0.0281389;REFB=-0.00639375;REVB=-0.0278656;RO=1;SAF=34;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136387;STB=0.51428;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.00189929;OID=.;OPOS=155150560;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:50:1:2:48:48:0.96:14:34:1:0:14:34:2:0
chr7	155150602	.	T	C	587.7	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.535;QD=60.2765;RBI=0.0340145;REFB=0;REVB=0.0274716;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.28426e-05;OID=.;OPOS=155150602;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:39:0:0:36:39:1:10:26:0:0:12:27:0:0
chr7	155150765	.	C	T	575.76	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.477;QD=60.6061;RBI=0.0464926;REFB=0;REVB=0.0429987;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013999;OID=.;OPOS=155150765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0
chr7	155151018	.	G	A	513.87	PASS	AF=0.947368;AO=34;DP=37;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.138824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6792;QD=54.0918;RBI=0.182529;REFB=-0.0714678;REVB=0.11851;RO=2;SAF=17;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0386324;OID=.;OPOS=155151018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:38:2:2:34:36:0.947368:17:17:1:1:18:18:1:1
chr7	155151095	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.12;QD=52.613;RBI=0.0530356;REFB=0;REVB=-0.0371377;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04803e-06;OID=.;OPOS=155151095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr7	155151194	.	G	A	1357.15	PASS	AF=1;AO=88;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7023;QD=60.3177;RBI=0.103968;REFB=-0.120714;REVB=0.0853007;RO=0;SAF=37;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00223456;OID=.;OPOS=155151194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:90:0:0:88:90:1:51:37:0:0:53:37:0:0
chr7	155151307	.	A	G	996.35	PASS	AF=1;AO=65;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.922;QD=58.6089;RBI=0.0311937;REFB=0;REVB=0.0122163;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163485;OID=.;OPOS=155151307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:65:68:1:37:28:0:0:37:31:0:0
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chr7	157959636	.	G	A	520.41	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00995404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.588;QD=59.4748;RBI=0.0821368;REFB=0;REVB=0.0815315;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000478698;OID=.;OPOS=157959636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:20:14:0:0:21:14:0:0
chr7	157959879	.	C	T	415.01	PASS	AF=0.608696;AO=39;DP=67;FAO=42;FDP=69;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00688353;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8933;QD=24.0586;RBI=0.0183903;REFB=-0.0298479;REVB=0.0170534;RO=25;SAF=25;SAR=14;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000794614;STB=0.501073;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0185443;OID=.;OPOS=157959879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:69:25:27:39:42:0.608696:14:25:16:9:17:25:16:11
chr7	157959895	.	C	T	445.39	PASS	AF=0.66129;AO=41;DP=62;FAO=41;FDP=62;FR=.;FRO=21;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0406055;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7221;QD=28.7348;RBI=0.0428398;REFB=0.0207295;REVB=0.0136546;RO=20;SAF=22;SAR=19;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385868;STB=0.51188;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=-0.0101396;OID=.;OPOS=157959895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:20:21:41:41:0.66129:19:22:12:8:19:22:12:9
chr7	157959911	.	A	G	908.94	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00404594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.136;QD=57.7107;RBI=0.0536243;REFB=0;REVB=0.0534714;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149767;OID=.;OPOS=157959911;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:63:0:0:60:63:1:28:32:0:0:30:33:0:0
chr7	158263331	.	T	C	284.96	PASS	AF=0.857143;AO=23;DP=27;FAO=24;FDP=28;FR=.;FRO=4;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0339979;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.6337;QD=40.7084;RBI=0.0424593;REFB=-0.0820965;REVB=0.0254349;RO=4;SAF=10;SAR=13;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0180349;STB=0.512185;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0126534;OID=.;OPOS=158263331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:27:28:4:4:23:24:0.857143:13:10:2:2:14:10:2:2
chr7	158263336	.	G	C	391.05	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00630277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.393;QD=55.8645;RBI=0.0231507;REFB=0;REVB=0.0222762;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.15612e-05;OID=.;OPOS=158263336;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:15:12:0:0:16:12:0:0
chr7	158263344	.	T	A	446.39	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0831421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.497;QD=57.5981;RBI=0.083872;REFB=0;REVB=0.0110413;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210595;OID=.;OPOS=158263344;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr7	158325503	.	C	T	314.14	PASS	AF=0.658537;AO=27;DP=41;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0237233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.15;QD=30.648;RBI=0.0284811;REFB=-0.00814705;REVB=0.01576;RO=14;SAF=15;SAR=12;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123073;STB=0.567518;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00642669;OID=.;OPOS=158325503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:14:14:27:27:0.658537:12:15:5:9:12:15:5:9
chr7	158384305	.	CTGTG	C	152.58	PASS	AF=0.369565;AO=15;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00443913;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=4;MLLD=300.961;QD=13.2681;RBI=0.0249368;REFB=-0.0083013;REVB=0.0245385;RO=29;SAF=5;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245901;STB=0.668231;STBP=0.099;TYPE=del;VARB=0.0175167;OID=.;OPOS=158384306;OREF=TGTG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.369565:15:46:17:46:29:5:12:16:13:99:29:5:10:16:13
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chr7	158672476	.	C	G	416.55	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.987;QD=55.5396;RBI=0.0458526;REFB=0;REVB=0.031851;RO=0;SAF=5;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128832;OID=.;OPOS=158672476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:24:5:0:0:25:5:0:0
chr7	158672619	.	A	G	125.77	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0133149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.002;QD=18.6328;RBI=0.0650503;REFB=-0.0184163;REVB=-0.063673;RO=12;SAF=4;SAR=10;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318003;STB=0.66642;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0218636;OID=.;OPOS=158672619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:12:13:14:14:0.518519:10:4:8:4:10:4:8:5
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chr8	1953642	.	CAGAG	CAG,CAGA	825.29	PASS	AF=0.779661,0.220339;AO=41,13;DP=57;FAO=46,13;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=37,11;FSAR=9,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238708,0.0217412;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=285.235,276.283;QD=55.9516;RBI=0.043173,0.0460445;REFB=0,0;REVB=0.0359735,0.0405884;RO=0;SAF=34,11;SAR=7,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=5.33091e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.000655688,0.00043645;OID=.,.;OPOS=1953643,1953646;OREF=AG,G;OALT=-,-;OMAPALT=CAG,CAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.779661,0.220339:41,13:57:46,13:59:0:37,11:9,2:0:0:52:0:34,11:7,2:0:0
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chr8	1954237	.	G	C	1156.9	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00991293;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.29;QD=60.8896;RBI=0.0316438;REFB=0;REVB=0.030051;RO=0;SAF=37;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.95552e-05;OID=.;OPOS=1954237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:74:76:1:37:37:0:0:37:39:0:0
chr8	1954587	.	G	A	337.38	PASS	AF=1;AO=19;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.018;QD=53.9807;RBI=0.0470279;REFB=0;REVB=0.0432541;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.46329e-05;OID=.;OPOS=1954587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:19:25:1:7:12:0:0:9:16:0:0
chr8	2021421	.	G	T	407.74	PASS	AF=0.412281;AO=47;DP=114;FAO=47;FDP=114;FR=.;FRO=67;FSAF=36;FSAR=11;FSRF=51;FSRR=16;FWDB=0.00436299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.928;QD=14.3067;RBI=0.0531693;REFB=-0.0280564;REVB=-0.05299;RO=67;SAF=36;SAR=11;SRF=51;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00689313;STB=0.503886;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0532258;OID=.;OPOS=2021421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:67:67:47:47:0.412281:11:36:51:16:11:36:51:16
chr8	2027633	.	C	G	243.79	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0773426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0295;QD=15.2371;RBI=0.0787272;REFB=-0.0221405;REVB=-0.0147001;RO=36;SAF=10;SAR=18;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062951;STB=0.535688;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0296897;OID=.;OPOS=2027633;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:36:28:28:0.4375:18:10:15:21:18:10:15:21
chr8	2040337	.	T	C	2068.25	PASS	AF=1;AO=132;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0955846;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7356;QD=62.6744;RBI=0.0977168;REFB=0;REVB=-0.0203014;RO=0;SAF=65;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.83182e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00069118;OID=.;OPOS=2040337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:132:0:0:132:132:1:67:65:0:0:67:65:0:0
chr8	2048811	.	A	C	1192.66	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144737;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.581;QD=61.1623;RBI=0.0873784;REFB=0;REVB=0.0861713;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.65871e-05;OID=.;OPOS=2048811;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:77:78:1:42:35:0:0:43:35:0:0
chr8	2056569	.	C	T	1003.53	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0375966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2297;QD=59.0314;RBI=0.0383405;REFB=0;REVB=-0.00751596;RO=0;SAF=22;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000204255;OID=.;OPOS=2056569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:45:22:0:0:46:22:0:0
chr8	2148550	.	G	A	937.61	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.385;QD=58.6004;RBI=0.0315807;REFB=0;REVB=0.0296359;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.55464e-05;OID=.;OPOS=2148550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:31:32:0:0:32:32:0:0
chr8	2148587	.	TATGTGTGTACATATGTAC	T	110.79	PASS	AF=0.291667;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0235697;FXX=0.0769083;HRUN=1;LEN=18;MLLD=358.583;QD=9.23279;RBI=0.0275908;REFB=-0.0174851;REVB=-0.0143429;RO=33;SAF=6;SAR=8;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100788;STB=0.571327;STBP=0.579;TYPE=del;VARB=0.0338969;OID=.;OPOS=2148588;OREF=ATGTGTGTACATATGTAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.291667:14:52:14:48:34:6:8:18:16:99:33:6:8:17:16
chr8	2148771	.	C	T	637.18	PASS	AF=1;AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238963;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.752;QD=62.1642;RBI=0.0270291;REFB=0;REVB=-0.012631;RO=0;SAF=16;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171207;OID=.;OPOS=2148771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:40:41:1:24:16:0:0:24:17:0:0
chr8	2792964	.	ATT	AAT,A,AT	208.77	PASS	AF=0,0,0.72973;AO=3,8,35;DP=76;FAO=0,0,54;FDP=74;FR=.;FRO=20;FSAF=0,0,29;FSAR=0,0,25;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0277802,0.076093,0.146982;FXX=0.0263123;HRUN=7,7,7;LEN=1,2,1;MLLD=19.4186,11.3848,7.43782;QD=11.2849;RBI=0.0747993,0.103533,0.202075;REFB=-0.0370526,0.00837056,0.0172363;REVB=-0.0694493,-0.0702059,-0.138674;RO=24;SAF=0,2,20;SAR=3,6,15;SRF=17;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.669239,-0.504218,-0.105396;STB=0.5,0.5,0.517148;STBP=1,1,0.669;TYPE=snp,del,del;VARB=0,0.00885264,0.0450143;OID=.,.,.;OPOS=2792965,2792965,2792965;OREF=T,TT,T;OALT=A,-,-;OMAPALT=AAT,A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0,0.72973:3,8,35:76:0,0,54:74:20:0,0,29:0,0,25:12:8:45:24:0,2,20:3,6,15:17:7
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chr8	2820745	.	G	C	306.85	PASS	AF=0.368421;AO=35;DP=96;FAO=35;FDP=95;FR=.;FRO=60;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.00272838;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=309.092;QD=12.9199;RBI=0.00353586;REFB=-0.0101089;REVB=-0.00224906;RO=60;SAF=20;SAR=15;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00535026;STB=0.503066;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0212813;OID=.;OPOS=2820745;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:95:60:60:35:35:0.368421:15:20:34:26:15:20:34:26
chr8	2832139	.	C	G	1525.71	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0825778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.663;QD=59.2509;RBI=0.0835122;REFB=0;REVB=0.0124574;RO=0;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140665;OID=.;OPOS=2832139;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:103:0:0:100:103:1:54:46:0:0:55:48:0:0
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chr8	7218752	.	G	C	44.64	PASS	AF=0.130435;AO=9;DP=70;FAO=9;FDP=69;FR=.;FRO=60;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=41;FWDB=-0.0336754;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.185;QD=2.58761;RBI=0.0739962;REFB=-0.00119807;REVB=-0.0658893;RO=57;SAF=4;SAR=5;SRF=16;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215352;STB=0.615148;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0313331;OID=.;OPOS=7218752;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:70:69:57:60:9:9:0.130435:5:4:16:41:5:4:19:41
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chr8	9564437	.	A	G	387.82	PASS	AF=0.47619;AO=40;DP=84;FAO=40;FDP=84;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0052829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.293;QD=18.4675;RBI=0.0240533;REFB=-0.00772062;REVB=-0.0234659;RO=41;SAF=22;SAR=18;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0788967;STB=0.526303;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.00891164;OID=.;OPOS=9564437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:41:44:40:40:0.47619:18:22:19:22:18:22:22:22
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chr8	11188743	.	C	T	792.34	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=59;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00779322;FXX=0.0338926;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.8981;QD=55.6028;RBI=0.0166668;REFB=-0.119436;REVB=0.0147325;RO=1;SAF=40;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116443;STB=0.506171;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.000708527;OID=.;OPOS=11188743;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:57:1:1:56:56:0.982456:16:40:1:0:16:40:1:0
chr8	11188752	.	G	A	632.03	PASS	AF=0.890909;AO=49;DP=55;FAO=49;FDP=55;FR=.;FRO=6;FSAF=39;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0652754;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.4429;QD=45.9658;RBI=0.111252;REFB=-0.1292;REVB=0.09009;RO=6;SAF=39;SAR=10;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0876556;STB=0.546905;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.00580317;OID=.;OPOS=11188752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:55:55:6:6:49:49:0.890909:10:39:3:3:10:39:3:3
chr8	11189316	.	G	C	195.63	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559305;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.486;QD=48.9083;RBI=0.161048;REFB=0;REVB=0.151024;RO=0;SAF=14;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00249749;OID=.;OPOS=11189316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:16:0:0:16:16:1:2:14:0:0:2:14:0:0
chr8	11189488	.	T	C	1547.13	PASS	AF=0.99;AO=98;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.025477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.039;QD=61.8852;RBI=0.0255289;REFB=-0.0149924;REVB=-0.00162705;RO=2;SAF=50;SAR=48;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193504;STB=0.505049;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-3.95504e-05;OID=.;OPOS=11189488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:100:2:1:98:99:0.99:48:50:0:2:49:50:0:1
chr8	11189535	.	T	C	784.33	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642188;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.9793;QD=62.7464;RBI=0.107475;REFB=0;REVB=0.086179;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00380018;OID=.;OPOS=11189535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:50:0:0:46:50:1:27:19:0:0:28:22:0:0
chr8	11204165	.	C	T	817.72	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.338;QD=57.3841;RBI=0.0521459;REFB=0;REVB=-0.0454629;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000395531;OID=.;OPOS=11204165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:22:35:0:0:22:35:0:0
chr8	11204184	.	G	A	685.86	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.422;QD=62.351;RBI=0.016559;REFB=0;REVB=0.00691395;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.31897e-05;OID=.;OPOS=11204184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:20:23:0:0:21:23:0:0
chr8	11280851	.	C	T	416.12	PASS	AF=0.546667;AO=41;DP=75;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.018168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.094;QD=22.1928;RBI=0.0182095;REFB=-0.00921044;REVB=-0.00122787;RO=34;SAF=20;SAR=21;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141689;STB=0.507809;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.00759324;OID=.;OPOS=11280851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:34:34:41:41:0.546667:21:20:16:18:21:20:16:18
chr8	11281963	.	G	A	484.88	PASS	AF=0.485981;AO=50;DP=105;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=0.0215542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8059;QD=18.1265;RBI=0.0658241;REFB=-0.0426549;REVB=0.0621951;RO=55;SAF=22;SAR=28;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166785;STB=0.599534;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0469522;OID=.;OPOS=11281963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:107:55:55:50:52:0.485981:28:22:34:21:30:22:34:21
chr8	11301753	.	A	C	4457.44	PASS	AF=0.992982;AO=282;DP=286;FAO=283;FDP=285;FR=.;FRO=2;FSAF=142;FSAR=141;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0204103;FXX=0.0069684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4079;QD=62.5606;RBI=0.0204673;REFB=-0.10256;REVB=0.00152729;RO=2;SAF=142;SAR=140;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00676293;STB=0.503521;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.000393782;OID=.;OPOS=11301753;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:286:285:2:2:282:283:0.992982:140:142:0:2:141:142:0:2
chr8	11414237	.	T	C	1120.3	PASS	AF=0.974359;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.068542;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.494;QD=57.4515;RBI=0.0719259;REFB=0.0469179;REVB=-0.0218019;RO=1;SAF=47;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0099631;STB=0.510414;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.00544102;OID=.;OPOS=11414237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:78:1:2:76:76:0.974359:29:47:1:0:29:47:2:0
chr8	11418385	.	G	A	754.16	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226995;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.939;QD=56.9173;RBI=0.0344898;REFB=0;REVB=0.0259669;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.1665e-05;OID=.;OPOS=11418385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr8	11418773	.	C	T	1568.29	PASS	AF=0.973214;AO=107;DP=111;FAO=109;FDP=112;FR=.;FRO=3;FSAF=56;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0521937;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=53.9166;QD=56.0102;RBI=0.0563621;REFB=-0.123654;REVB=0.0212722;RO=4;SAF=54;SAR=53;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000319338;STB=0.504834;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.00266856;OID=.;OPOS=11418773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:111:112:4:3:107:109:0.973214:53:54:2:2:53:56:1:2
chr8	11421793	.	C	T	1373.29	PASS	AF=0.978022;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00519428;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.916;QD=60.3646;RBI=0.192375;REFB=-0.153708;REVB=0.192305;RO=2;SAF=68;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430103;STB=0.522722;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.000261317;OID=.;OPOS=11421793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:91:91:2:2:89:89:0.978022:21:68:0:2:21:68:0:2
chr8	11619261	.	T	A	1165.08	PASS	AF=0.975;AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0678135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9539;QD=58.2541;RBI=0.141389;REFB=-0.153688;REVB=0.124066;RO=1;SAF=49;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160409;STB=0.503424;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.00596273;OID=.;OPOS=11619261;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:80:80:1:2:78:78:0.975:29:49:0:1:29:49:1:1
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chr8	11620769	.	T	C	2315.39	PASS	AF=1;AO=144;DP=146;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00983754;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.999;QD=63.8727;RBI=0.01488;REFB=0;REVB=0.011164;RO=0;SAF=80;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.83153e-05;OID=.;OPOS=11620769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:146:145:0:0:144:145:1:64:80:0:0:64:81:0:0
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chr8	11637276	.	G	A	763.68	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=59;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0243126;FXX=0.0338926;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.337;QD=53.5914;RBI=0.0544017;REFB=-0.0900665;REVB=0.0486666;RO=2;SAF=31;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00427299;STB=0.502267;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.00768982;OID=.;OPOS=11637276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:59:57:2:2:55:55:0.964912:24:31:1:1:24:31:1:1
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chr8	11689119	.	G	C	834.22	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0478141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4795;QD=57.5324;RBI=0.0486408;REFB=0;REVB=-0.0089295;RO=0;SAF=38;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299402;OID=.;OPOS=11689119;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:20:38:0:0:20:38:0:0
chr8	11701842	.	A	C	859.26	PASS	AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0243494;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.6322;QD=54.556;RBI=0.024409;REFB=-0.124205;REVB=-0.00170488;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502954;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00401288;OID=.;OPOS=11701842;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:63:0:2:61:61:0.968254:25:36:0:0:25:36:1:1
chr8	11702542	.	T	C	902.61	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.72;QD=58.2329;RBI=0.0214066;REFB=0;REVB=0.0150969;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1502e-05;OID=.;OPOS=11702542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:27:35:0:0:27:35:0:0
chr8	11793447	.	T	C	1540.42	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0916445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0567;QD=59.822;RBI=0.0934079;REFB=0;REVB=0.018064;RO=0;SAF=29;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000512615;OID=.;OPOS=11793447;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:102:103:1:73:29:0:0:73:30:0:0
chr8	11832079	.	A	G	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00379628;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.934;QD=59.0187;RBI=0.00435862;REFB=0;REVB=0.00214144;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.0179e-05;OID=.;OPOS=11832079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr8	11872239	.	C	A	323.44	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.1789;QD=53.9075;RBI=0.112645;REFB=0;REVB=0.0272364;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012626;OID=.;OPOS=11872239;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr8	11995062	.	G	A	211.25	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119535;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2352;QD=49.7046;RBI=0.0132834;REFB=0;REVB=0.00579329;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000199407;OID=.;OPOS=11995062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr8	11995274	.	G	A	267.13	PASS	AF=0.954545;AO=20;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0432327;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.032;QD=48.5684;RBI=0.0436574;REFB=-0.161607;REVB=0.00607502;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545409;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=-6.62799e-05;OID=.;OPOS=11995274;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:22:22:0:1:20:21:0.954545:15:5:0:0:16:5:1:0
chr8	11996086	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9177;QD=33.4268;RBI=0.0126592;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000958219;OID=.;OPOS=11996086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr8	11996150	.	C	G	50.13	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.4201;QD=33.4216;RBI=0.0403313;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00367751;OID=.;OPOS=11996150;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr8	12042821	.	TC	CT	66.5	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0272683;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=310.736;QD=26.6016;RBI=0.0294573;REFB=-0.0378458;REVB=0.0111433;RO=2;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12621;STB=0.571264;STBP=0.613;TYPE=mnp;VARB=0.00922727;OID=.;OPOS=12042821;OREF=TC;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:6:2:0:2:6:2:0:2
chr8	12042880	.	T	C	66.5	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0167796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.993;QD=26.6016;RBI=0.0168415;REFB=-0.00157543;REVB=-0.00144304;RO=2;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12621;STB=0.571264;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00123776;OID=.;OPOS=12042880;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:6:2:0:2:6:2:0:2
chr8	12516729	.	T	G	789.17	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121478;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8639;QD=64.4223;RBI=0.0133314;REFB=0;REVB=0.00549149;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.85467e-05;OID=.;OPOS=12516729;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:32:17:0:0:32:17:0:0
chr8	12516857	.	T	C	1210.91	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0670357;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.643;QD=61.3119;RBI=0.0693895;REFB=0;REVB=0.0179198;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000159261;OID=.;OPOS=12516857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:38:41:0:0:38:41:0:0
chr8	12580049	.	G	A	217.36	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.492;QD=48.3026;RBI=0.0281892;REFB=0;REVB=-0.0105813;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00060432;OID=.;OPOS=12580049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:8:9:0:0:9:9:0:0
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chr8	12809691	.	A	G	1876.09	PASS	AF=0.51532;AO=185;DP=362;FAO=185;FDP=359;FR=.;FRO=174;FSAF=94;FSAR=91;FSRF=94;FSRR=80;FWDB=0.0746886;FXX=0.00828706;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.232;QD=20.9035;RBI=0.0747399;REFB=-0.0270645;REVB=-0.00276905;RO=170;SAF=94;SAR=91;SRF=90;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0187025;STB=0.515579;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0238733;OID=.;OPOS=12809691;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:362:359:170:174:185:185:0.51532:91:94:90:80:91:94:94:80
chr8	12809700	.	G	A	5150.08	PASS	AF=0.962644;AO=335;DP=349;FAO=335;FDP=348;FR=.;FRO=13;FSAF=172;FSAR=163;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0120141;FXX=0.00286525;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.904;QD=59.1963;RBI=0.0468547;REFB=-0.0100248;REVB=0.0452882;RO=9;SAF=172;SAR=163;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013199;STB=0.500936;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.000440928;OID=.;OPOS=12809700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:349:348:9:13:335:335:0.962644:163:172:7:2:163:172:7:6
chr8	12878637	.	A	G	840.03	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348297;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3936;QD=57.9327;RBI=0.0360417;REFB=0;REVB=0.00926793;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156807;OID=.;OPOS=12878637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:28:29:0:0:29:29:0:0
chr8	12878677	.	T	C	984.99	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.897;QD=58.8053;RBI=0.073401;REFB=0;REVB=0.0674563;RO=0;SAF=24;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140237;OID=.;OPOS=12878677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:67:0:0:64:67:1:40:24:0:0:42:25:0:0
chr8	12878807	.	T	G	1529.82	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00604608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.684;QD=63.7424;RBI=0.00733633;REFB=0;REVB=0.00415531;RO=0;SAF=32;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.18502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43702e-06;OID=.;OPOS=12878807;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:63:32:0:0:63:33:0:0
chr8	12879062	.	T	C	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0316781;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.735;QD=54.8231;RBI=0.0361866;REFB=0.0537383;REVB=0.0174918;RO=1;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218873;STB=0.511623;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.000133921;OID=.;OPOS=12879062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:21:29:0:1:21:29:0:1
chr8	12879099	.	G	A	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00575551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.831;QD=57.5439;RBI=0.0184694;REFB=0;REVB=-0.0175497;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.79141e-06;OID=.;OPOS=12879099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:23:35:0:0:23:35:0:0
chr8	12879334	.	T	C	696.1	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0588697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3471;QD=60.5301;RBI=0.109457;REFB=-0.128342;REVB=0.0922775;RO=0;SAF=15;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516122;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0050794;OID=.;OPOS=12879334;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:46:46:0:1:45:45:0.978261:30:15:0:0:30:15:1:0
chr8	12879539	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=351.481;QD=33.4285;RBI=0.01644;REFB=0;REVB=0.00268578;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.96621e-05;OID=.;OPOS=12879539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr8	12887172	.	A	G	363.05	PASS	AF=0.423913;AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=-0.0368699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3767;QD=15.7846;RBI=0.057836;REFB=-0.0122143;REVB=0.0445602;RO=51;SAF=22;SAR=17;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152636;STB=0.585322;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0177215;OID=.;OPOS=12887172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:51:53:39:39:0.423913:17:22:21:30:17:22:22:31
chr8	12888908	.	T	G	278.8	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00941299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.852;QD=21.867;RBI=0.0279977;REFB=-0.0154372;REVB=-0.026368;RO=22;SAF=11;SAR=17;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134465;STB=0.500734;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0122711;OID=.;OPOS=12888908;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:22:23:28:28:0.54902:17:11:9:13:17:11:9:14
chr8	12941709	.	C	A	147.67	PASS	AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0114197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.066;QD=26.8493;RBI=0.0208442;REFB=-0.0314261;REVB=-0.0174376;RO=7;SAF=6;SAR=9;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016877;STB=0.509421;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0190832;OID=.;OPOS=12941709;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:9:6:3:4:9:6:3:4
chr8	12943065	.	T	C	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.00562313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.675;QD=16.8984;RBI=0.00773913;REFB=-0.00874078;REVB=0.00531738;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373874;STB=0.521695;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.00880571;OID=.;OPOS=12943065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:6:4:4:5:6:4:4:5
chr8	12957475	.	C	T	245.3	PASS	AF=0.391892;AO=29;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0157087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.101;QD=13.2592;RBI=0.01655;REFB=-0.00458752;REVB=-0.00520951;RO=45;SAF=18;SAR=11;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719581;STB=0.541193;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00625381;OID=.;OPOS=12957475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:45:45:29:29:0.391892:11:18:25:20:11:18:25:20
chr8	12958025	.	C	A	197.18	PASS	AF=0.633333;AO=19;DP=30;FAO=19;FDP=30;FR=.;FRO=11;FSAF=19;FSAR=0;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.0465853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1732;QD=26.2906;RBI=0.0465853;REFB=-0.0193592;REVB=0;RO=11;SAF=19;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0114761;OID=.;OPOS=12958025;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:11:11:19:19:0.633333:0:19:11:0:0:19:11:0
chr8	12990422	.	A	G	30.02	PASS	AF=0.714286;AO=4;DP=6;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0161552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.139;QD=17.1523;RBI=0.0174681;REFB=-0.0189363;REVB=0.00664418;RO=2;SAF=3;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161039;STB=0.614874;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0185356;OID=.;OPOS=12990422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:6:7:2:2:4:5:0.714286:1:3:1:1:1:4:1:1
chr8	13072177	.	C	T	1206.48	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00604197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.59;QD=60.324;RBI=0.0278104;REFB=0;REVB=0.0271461;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.15251e-05;OID=.;OPOS=13072177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:80:0:0:75:80:1:36:39:0:0:38:42:0:0
chr8	13356802	.	G	A	407.15	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0672492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3086;QD=56.1584;RBI=0.0766354;REFB=0;REVB=0.0367496;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109076;OID=.;OPOS=13356802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:29:0:0:27:29:1:15:12:0:0:15:14:0:0
chr8	13356818	.	TT	CG	328.64	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00809167;FXX=0.039984;HRUN=4;LEN=2;MLLD=281.14;QD=54.7735;RBI=0.014298;REFB=0;REVB=0.011788;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00208088;OID=.;OPOS=13356818;OREF=TT;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr8	13357340	.	G	C	1377.44	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.971;QD=62.6109;RBI=0.0241095;REFB=0;REVB=-0.00964912;RO=0;SAF=40;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.43431e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.11872e-06;OID=.;OPOS=13357340;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:48:40:0:0:48:40:0:0
chr8	13424583	.	C	T	862.63	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.217;QD=57.5086;RBI=0.0356682;REFB=0;REVB=0.0326473;RO=0;SAF=39;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.28868e-05;OID=.;OPOS=13424583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:60:0:0:57:60:1:18:39:0:0:18:42:0:0
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chr8	13425353	.	T	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00574605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.159;QD=59.8391;RBI=0.0117837;REFB=0;REVB=-0.0102878;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.23046e-05;OID=.;OPOS=13425353;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr8	15095085	.	C	G	499.09	PASS	AF=0.521739;AO=48;DP=93;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.00310588;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.9494;QD=21.6994;RBI=0.0911011;REFB=-0.0513779;REVB=0.0910482;RO=43;SAF=25;SAR=23;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00789751;STB=0.509969;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0495222;OID=.;OPOS=15095085;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:43:44:48:48:0.521739:23:25:22:21:23:25:22:22
chr8	15978063	.	C	T	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0044886;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.57;QD=56.9383;RBI=0.0278497;REFB=0;REVB=0.0274856;RO=0;SAF=35;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51639e-05;OID=.;OPOS=15978063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:18:35:0:0:18:35:0:0
chr8	16012648	.	G	C	1659.01	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0531638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.42;QD=60.3277;RBI=0.0536684;REFB=0;REVB=-0.00734195;RO=0;SAF=68;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.85447e-05;OID=.;OPOS=16012648;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:110:0:0:109:110:1:41:68:0:0:41:69:0:0
chr8	16043667	.	C	T	217.08	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0151691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4193;QD=15.5058;RBI=0.190251;REFB=-0.00202057;REVB=-0.189645;RO=24;SAF=16;SAR=9;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141537;STB=0.589029;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00179893;OID=.;OPOS=16043667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:56:24:31:25:25:0.446429:9:16:15:9:9:16:15:16
chr8	16043686	.	G	C	206.41	PASS	AF=0.396825;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.0140907;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3519;QD=13.1051;RBI=0.0447224;REFB=-0.0319839;REVB=0.0424446;RO=38;SAF=16;SAR=9;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2051;STB=0.617665;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0633629;OID=.;OPOS=16043686;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:38:38:25:25:0.396825:9:16:17:21:9:16:17:21
chr8	16927250	.	A	C	376.32	PASS	AF=0.421053;AO=40;DP=95;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.109981;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.778;QD=15.8448;RBI=0.110036;REFB=-0.00923294;REVB=0.00349767;RO=55;SAF=20;SAR=20;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840553;STB=0.547345;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0219472;OID=.;OPOS=16927250;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:55:55:40:40:0.421053:20:20:23:32:20:20:23:32
chr8	16939284	.	G	A	80.94	PASS	AF=0.268293;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.00941044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1775;QD=7.89628;RBI=0.028038;REFB=-0.00212179;REVB=-0.0264116;RO=29;SAF=6;SAR=5;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132619;STB=0.590752;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0036878;OID=.;OPOS=16939284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:40:41:29:30:11:11:0.268293:5:6:19:10:5:6:20:10
chr8	16939299	.	CG	CAG,GT	58.37	PASS	AF=0.210526,0.0263158;AO=7,2;DP=39;FAO=8,1;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=5,0;FSAR=3,1;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00129232,-0.0378448;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,2;MLLD=141.585,116.587;QD=6.14379;RBI=0.0140038,0.0384484;REFB=-0.00353787,-0.00473312;REVB=0.013944,0.00678624;RO=29;SAF=5,1;SAR=2,1;SRF=19;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0817605,-0.144971;STB=0.525485,0.992757;STBP=0.859,0.226;TYPE=ins,mnp;VARB=0.00502212,0.0438588;OID=.,.;OPOS=16939300,16939299;OREF=-,CG;OALT=A,GT;OMAPALT=CAG,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:39:38:29:29:7,2:8,1:0.210526,0.0263158:2,1:5,1:19:10:3,1:5,0:19:10
chr8	17079358	.	A	G	436.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232298;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.507;QD=54.5415;RBI=0.0665396;REFB=0;REVB=0.062353;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0025629;OID=.;OPOS=17079358;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:32:0:0:28:32:1:14:14:0:0:16:16:0:0
chr8	17092164	.	G	T	1839.7	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8873;QD=61.3232;RBI=0.0170857;REFB=0;REVB=-0.00995904;RO=0;SAF=72;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000120374;OID=.;OPOS=17092164;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:48:72:0:0:48:72:0:0
chr8	17125768	.	T	C	708.36	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.514;QD=62.9649;RBI=0.0626445;REFB=0;REVB=-0.046098;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.86543e-05;OID=.;OPOS=17125768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0
chr8	17142065	.	C	T	690.12	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.803;QD=62.7382;RBI=0.0140166;REFB=0;REVB=0.00836487;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40566e-05;OID=.;OPOS=17142065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:19:24:0:0:20:24:0:0
chr8	17157259	.	G	A	1135.9	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.707;QD=60.5812;RBI=0.013781;REFB=0;REVB=-0.000477656;RO=0;SAF=44;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.46308e-05;OID=.;OPOS=17157259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:29:44:0:0:31:44:0:0
chr8	17166765	.	A	G	58.62	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0458945;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=168.688;QD=14.6539;RBI=0.0458947;REFB=-0.00995395;REVB=-0.000139012;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128818;STB=0.576719;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0109261;OID=.;OPOS=17166765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:2:6:5:3:2:6:5:3
chr8	17206588	.	G	A	222.7	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=-0.00783956;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.76;QD=12.3721;RBI=0.0198852;REFB=-0.0151016;REVB=-0.0182747;RO=46;SAF=14;SAR=13;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020255;STB=0.518505;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0221385;OID=.;OPOS=17206588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:46:45:27:27:0.375:13:14:23:23:13:14:22:23
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chr8	17270759	.	C	T	257.99	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.0128801;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.937;QD=18.4277;RBI=0.0300964;REFB=-0.0637271;REVB=-0.027201;RO=28;SAF=11;SAR=17;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175609;STB=0.597429;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0547095;OID=.;OPOS=17270759;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:28:28:28:28:0.5:17:11:6:22:17:11:6:22
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chr8	17270787	.	A	G	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.509;QD=57.544;RBI=0.0235747;REFB=0;REVB=0.00513158;RO=0;SAF=15;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.78794e-05;OID=.;OPOS=17270787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:43:15:0:0:43:15:0:0
chr8	17412140	.	G	C	1327.48	PASS	AF=1;AO=85;DP=87;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206912;FXX=0.0229859;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.612;QD=62.4696;RBI=0.034147;REFB=0;REVB=-0.0271641;RO=0;SAF=33;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.96816e-05;OID=.;OPOS=17412140;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:85:0:0:85:85:1:52:33:0:0:52:33:0:0
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chr8	17424920	.	T	C	326.96	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258859;FXX=0.039984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.117;QD=54.4932;RBI=0.0297346;REFB=0;REVB=0.014631;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.24521e-05;OID=.;OPOS=17424920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0
chr8	17425296	.	C	T	434.83	PASS	AF=0.458333;AO=44;DP=97;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=15;FWDB=-0.00791798;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.063;QD=18.1178;RBI=0.0286266;REFB=-0.0218035;REVB=-0.0275097;RO=51;SAF=28;SAR=16;SRF=37;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956679;STB=0.545054;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0296016;OID=.;OPOS=17425296;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:96:51:52:44:44:0.458333:16:28:37:14:16:28:37:15
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chr8	17503125	.	C	T	466.64	PASS	AF=0.5;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=0.00265438;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=42.0677;QD=20.2888;RBI=0.00713449;REFB=0.0076149;REVB=-0.00662232;RO=46;SAF=23;SAR=23;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392289;STB=0.52173;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=-0.0042899;OID=.;OPOS=17503125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:46:46:46:46:0.5:23:23:21:25:23:23:21:25
chr8	17503205	.	G	A	377.49	PASS	AF=0.444444;AO=34;DP=86;FAO=40;FDP=90;FR=.;FRO=50;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=36;FWDB=0.00121564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.271;QD=16.7771;RBI=0.0179335;REFB=-0.00237723;REVB=-0.0178923;RO=47;SAF=13;SAR=21;SRF=13;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119053;STB=0.571395;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00261825;OID=.;OPOS=17503205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:90:47:50:34:40:0.444444:21:13:13:34:24:16:14:36
chr8	17503270	.	G	C	205.31	PASS	AF=0.438596;AO=23;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=30;FWDB=-0.0109625;FXX=0.0499917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3416;QD=14.4076;RBI=0.011774;REFB=-0.054305;REVB=0.00429544;RO=29;SAF=4;SAR=19;SRF=2;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211118;STB=0.618105;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0440622;OID=.;OPOS=17503270;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:32:23:25:0.438596:19:4:2:27:21:4:2:30
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chr8	22262418	.	A	G	1171.4	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00489406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.367;QD=60.8517;RBI=0.00497854;REFB=0;REVB=-0.000913236;RO=0;SAF=28;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.26722e-06;OID=.;OPOS=22262418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:49:28:0:0:49:28:0:0
chr8	22279010	.	G	GGGA	834.42	PASS	AF=1;AO=53;DP=63;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492816;FXX=0.0491723;HRUN=3;LEN=3;MLLD=121.189;QD=57.5463;RBI=0.053876;REFB=0;REVB=0.0217704;RO=8;SAF=32;SAR=21;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579564;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000164797;OID=.;OPOS=22279011;OREF=-;OALT=GGA;OMAPALT=GGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:53:63:58:58:0:34:24:0:0:5:8:32:21:3:5
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chr8	23059324	.	C	G	757.46	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0131601;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1032;QD=61.8338;RBI=0.0353754;REFB=-0.0686278;REVB=0.0328364;RO=0;SAF=16;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515145;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00230372;OID=.;OPOS=23059324;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:49:0:1:48:48:0.979592:32:16:0:0:32:16:1:0
chr8	23060256	.	T	C	1212.18	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0333697;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6755;QD=61.3763;RBI=0.0401747;REFB=0;REVB=0.0223712;RO=0;SAF=28;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.04719e-05;OID=.;OPOS=23060256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:51:28:0:0:51:28:0:0
chr8	23118304	.	C	T	102.26	PASS	AF=0.288889;AO=13;DP=45;FAO=13;FDP=45;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0123922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.887;QD=9.09;RBI=0.0280281;REFB=-0.00228575;REVB=0.0251397;RO=32;SAF=6;SAR=7;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117446;STB=0.57132;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0034866;OID=.;OPOS=23118304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:32:32:13:13:0.288889:7:6:18:14:7:6:18:14
chr8	23118400	.	T	C	223.51	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0395354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.7289;QD=14.9009;RBI=0.0520601;REFB=-0.0153092;REVB=0.0338704;RO=34;SAF=17;SAR=9;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270916;STB=0.653728;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0186903;OID=.;OPOS=23118400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:9:17:13:21:9:17:13:21
chr8	23147564	.	G	A	948.01	PASS	AF=1;AO=63;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.130094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.8264;QD=54.172;RBI=0.218291;REFB=-0.0423904;REVB=0.175289;RO=5;SAF=36;SAR=27;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520827;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00995733;OID=.;OPOS=23147564;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:68:70:5:0:63:70:1:27:36:1:4:31:39:0:0
chr8	23148930	.	A	G	1921.22	PASS	AF=0.992126;AO=122;DP=124;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0337637;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.764;QD=60.5109;RBI=0.0370216;REFB=-0.0642303;REVB=0.0151859;RO=0;SAF=58;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503999;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00052262;OID=.;OPOS=23148930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:124:127:0:1:122:126:0.992126:64:58:0:0:64:62:1:0
chr8	23148940	.	G	A	2235.78	PASS	AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.141;QD=63.4265;RBI=0.0302038;REFB=0;REVB=0.0202071;RO=0;SAF=74;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.38966e-05;OID=.;OPOS=23148940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:67:74:0:0:67:74:0:0
chr8	23150878	.	T	G	1960.35	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.769;QD=61.7435;RBI=0.0251174;REFB=0;REVB=0.0072112;RO=0;SAF=67;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.5772e-05;OID=.;OPOS=23150878;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:122:127:0:0:122:127:1:55:67:0:0:56:71:0:0
chr8	23152334	.	A	G	1302.11	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.848;QD=62.0054;RBI=0.0288719;REFB=0;REVB=0.0238495;RO=0;SAF=34;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06517e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.95436e-05;OID=.;OPOS=23152334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:50:34:0:0:50:34:0:0
chr8	23153022	.	T	C	2087.02	PASS	AF=1;AO=133;DP=134;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232319;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.177;QD=62.7675;RBI=0.0236491;REFB=0;REVB=0.00442279;RO=0;SAF=70;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.77216e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.09922e-05;OID=.;OPOS=23153022;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:134:133:0:0:133:133:1:63:70:0:0:63:70:0:0
chr8	23154982	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00797396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.596;QD=51.9167;RBI=0.0341786;REFB=0;REVB=0.0332354;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.57462e-05;OID=.;OPOS=23154982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:5:15:0:0:5:16:0:0
chr8	23154989	.	T	G	358.12	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00791603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.125;QD=55.0954;RBI=0.0630035;REFB=0;REVB=0.0625042;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392768;OID=.;OPOS=23154989;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr8	23155130	.	A	C	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0333166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.3182;QD=11.0197;RBI=0.0387354;REFB=-0.0145446;REVB=0.0197595;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236249;STB=0.642419;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0186245;OID=.;OPOS=23155130;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:3:3:6:2:3:3:6:2
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chr8	23225745	.	C	T	86.3	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0033484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.453;QD=12.329;RBI=0.00557267;REFB=-0.00994951;REVB=-0.00445454;RO=17;SAF=10;SAR=1;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.529751;STB=0.824958;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0152661;OID=.;OPOS=23225745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:1:10:9:8:1:10:9:8
chr8	23294562	.	G	T	103.13	PASS	AF=0.138462;AO=18;DP=131;FAO=18;FDP=130;FR=.,HEALED;FRO=107;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=65;FSRR=42;FWDB=0.0328677;FXX=0.0225547;HRUN=5;LEN=1;MLLD=29.3356;QD=3.17314;RBI=0.0461628;REFB=-0.0469843;REVB=-0.0324148;RO=89;SAF=1;SAR=17;SRF=59;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.712195;STB=0.949568;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.152367;OID=.;OPOS=23294562;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:131:130:89:107:18:18:0.138462:17:1:59:30:17:1:65:42
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chr8	23432314	.	T	C	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.026911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.261;QD=21.2668;RBI=0.0269118;REFB=-0.0242409;REVB=0.000213538;RO=14;SAF=2;SAR=15;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248151;STB=0.642659;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.0165504;OID=.;OPOS=23432314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:15:2:4:10:15:2:4:10
chr8	23432326	.	T	A	495.66	PASS	AF=0.921053;AO=35;DP=39;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0509218;FXX=0.0256345;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.962;QD=52.1744;RBI=0.0536241;REFB=-0.0370269;REVB=-0.0168082;RO=3;SAF=8;SAR=27;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215871;STB=0.511572;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00178649;OID=.;OPOS=23432326;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:39:38:3:3:35:35:0.921053:27:8:1:2:27:8:1:2
chr8	23432776	.	A	C	1530.04	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=292.657;QD=63.7518;RBI=0.0362749;REFB=0;REVB=0.02893;RO=0;SAF=54;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7945e-06;OID=.;OPOS=23432776;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:42:54:0:0:42:54:0:0
chr8	24171051	.	C	T	1138.93	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00715222;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.349;QD=59.9435;RBI=0.0173543;REFB=0;REVB=-0.0158119;RO=0;SAF=37;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.46003e-06;OID=.;OPOS=24171051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:38:37:0:0:38:38:0:0
chr8	24208847	.	G	A	346.29	PASS	AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=0.00406575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.794;QD=16.8922;RBI=0.0526932;REFB=-0.0145238;REVB=-0.0525361;RO=45;SAF=29;SAR=8;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151265;STB=0.585552;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0165314;OID=.;OPOS=24208847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:45:45:37:37:0.45122:8:29:30:15:8:29:30:15
chr8	24211278	.	C	T	230.29	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0356632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.795;QD=46.0578;RBI=0.0375706;REFB=-0.0385223;REVB=-0.011819;RO=1;SAF=10;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0437955;STB=0.523785;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000545316;OID=.;OPOS=24211278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:9:10:1:0:9:10:1:0
chr8	24211331	.	G	A	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.231;QD=48.7372;RBI=0.0150765;REFB=0;REVB=0.00953542;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.45031e-05;OID=.;OPOS=24211331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
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chr8	25182969	.	C	T	899.95	PASS	AF=0.915493;AO=65;DP=73;FAO=65;FDP=71;FR=.;FRO=6;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00129829;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.486;QD=50.7013;RBI=0.0025883;REFB=-0.052699;REVB=-0.00223914;RO=6;SAF=31;SAR=34;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00367955;STB=0.501953;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.00207336;OID=.;OPOS=25182969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:73:71:6:6:65:65:0.915493:34:31:3:3:34:31:3:3
chr8	25183041	.	C	T	190.26	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.021579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0387;QD=21.7438;RBI=0.0719529;REFB=0.00248517;REVB=0.0686409;RO=16;SAF=8;SAR=11;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0922199;STB=0.551671;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=-0.000671074;OID=.;OPOS=25183041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:11:8:5:11:11:8:5:11
chr8	25203022	.	A	G	1302.65	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.873;QD=62.031;RBI=0.0601922;REFB=0;REVB=0.0421322;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193448;OID=.;OPOS=25203022;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:42:41:0:0:43:41:0:0
chr8	25222165	.	A	G	869.1	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.57;QD=57.9397;RBI=0.0360893;REFB=0;REVB=0.00325118;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17423e-05;OID=.;OPOS=25222165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:34:24:0:0:34:26:0:0
chr8	25230168	.	C	T	1357.48	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00593128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5339;QD=62.4129;RBI=0.0214868;REFB=0;REVB=0.0206519;RO=0;SAF=46;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.389e-05;OID=.;OPOS=25230168;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:41:46:0:0:41:46:0:0
chr8	25234858	.	A	G	1480.32	PASS	AF=0.962617;AO=103;DP=107;FAO=103;FDP=107;FR=.;FRO=4;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0750266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1563;QD=55.339;RBI=0.0763264;REFB=-0.0910848;REVB=0.0140259;RO=4;SAF=39;SAR=64;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277543;STB=0.514644;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.010587;OID=.;OPOS=25234858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:107:107:4:4:103:103:0.962617:64:39:3:1:64:39:3:1
chr8	25258442	.	C	T	289.71	PASS	AF=0.508197;AO=30;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0209559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.825;QD=18.9973;RBI=0.0213195;REFB=-0.000497213;REVB=0.00392058;RO=30;SAF=9;SAR=21;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222707;STB=0.629203;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.000470329;OID=.;OPOS=25258442;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:30:31:0.508197:21:9:16:14:22:9:16:14
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chr8	37702472	.	G	A	297.21	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0891578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.9128;QD=49.5355;RBI=0.139242;REFB=-0.111795;REVB=0.106955;RO=1;SAF=3;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225969;STB=0.512185;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0113564;OID=.;OPOS=37702472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:24:24:1:1:23:23:0.958333:20:3:0:1:20:3:0:1
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chr8	37728019	.	T	G	868.24	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.081938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1537;QD=57.8829;RBI=0.0979395;REFB=0;REVB=0.0536499;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000236226;OID=.;OPOS=37728019;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:32:28:0:0:32:28:0:0
chr8	37730366	.	G	A	183.07	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.00947946;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=66.731;QD=13.3139;RBI=0.0115762;REFB=0.00585123;REVB=0.00664443;RO=33;SAF=14;SAR=8;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251889;STB=0.644606;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.014541;OID=.;OPOS=37730366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:33:33:22:22:0.4:8:14:13:20:8:14:13:20
chr8	37730368	.	G	A	767.46	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180183;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.2893;QD=56.8487;RBI=0.0260029;REFB=0;REVB=0.0187482;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.73815e-06;OID=.;OPOS=37730368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:27:27:0:0:27:27:0:0
chr8	37823798	.	A	G	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0154284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.619;QD=16.9316;RBI=0.0235212;REFB=-0.00779474;REVB=-0.0177542;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722214;STB=0.541598;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00894631;OID=.;OPOS=37823798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:6:6:7:5:6:6:7:5
chr8	37979919	.	G	A,C	682.82	PASS	AF=0.0444444,0.955556;AO=2,42;DP=44;FAO=2,43;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=2,29;FSAR=0,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00254101,0.00753857;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=224.817,269.065;QD=60.6951;RBI=0.0161572,0.0132396;REFB=0,0;REVB=-0.0159561,0.0108838;RO=0;SAF=2,28;SAR=0,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0300988,-0.00165392;OID=.,.;OPOS=37979919,37979919;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:44:45:0:0:2,42:2,43:0.0444444,0.955556:0,14:2,28:0:0:0,14:2,29:0:0
chr8	37985897	.	A	G	644.9	PASS	AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00978418;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3107;QD=57.324;RBI=0.047748;REFB=-0.0403359;REVB=-0.0467348;RO=2;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040792;STB=0.521729;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=-8.81389e-05;OID=.;OPOS=37985897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:45:45:2:2:43:43:0.955556:22:21:0:2:22:21:0:2
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chr8	38835666	.	T	C	62.09	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0360945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.247;QD=7.52626;RBI=0.0420712;REFB=-0.00535377;REVB=0.021614;RO=24;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0182247;OID=.;OPOS=38835666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:6:3:8:16:6:3:8:16
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chr8	38964647	.	G	A	360.97	PASS	AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.00892486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.002;QD=20.3365;RBI=0.0101292;REFB=-0.0117166;REVB=-0.00479039;RO=34;SAF=18;SAR=19;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0903526;STB=0.550011;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0118106;OID=.;OPOS=38964647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:34:34:37:37:0.521127:19:18:13:21:19:18:13:21
chr8	38965271	.	C	T	954.1	PASS	AF=0.459091;AO=101;DP=220;FAO=101;FDP=220;FR=.;FRO=119;FSAF=58;FSAR=43;FSRF=63;FSRR=56;FWDB=0.0055887;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.576;QD=17.3473;RBI=0.0132715;REFB=-0.0212434;REVB=0.0120374;RO=115;SAF=58;SAR=43;SRF=59;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596782;STB=0.524618;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0284517;OID=.;OPOS=38965271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:220:220:115:119:101:101:0.459091:43:58:59:56:43:58:63:56
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chr8	39311600	.	C	T	1640.67	PASS	AF=0.991071;AO=110;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0351579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.498;QD=58.5953;RBI=0.0819216;REFB=0.00178011;REVB=-0.0739937;RO=2;SAF=77;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121707;STB=0.503184;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.000156147;OID=.;OPOS=39311600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:112:112:2:1:110:111:0.991071:33:77:2:0:33:78:1:0
chr8	39312886	.	G	A	1727.1	PASS	AF=1;AO=97;DP=114;FAO=114;FDP=114;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=81;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.677;QD=60.6001;RBI=0.0417921;REFB=0;REVB=0.0137586;RO=0;SAF=70;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.53332e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00235695;OID=.;OPOS=39312886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:114:114:0:0:97:114:1:27:70:0:0:33:81:0:0
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chr8	39873478	.	T	C	92.53	PASS	AF=1;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0367232;FXX=0.0999001;HRUN=4;LEN=1;MLLD=66.2931;QD=41.1244;RBI=0.0368676;REFB=0;REVB=0.00326013;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00190444;OID=.;OPOS=39873478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
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chr8	46951813	.	G	T	344.97	PASS	AF=0.9;AO=25;DP=28;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0238772;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=32.766;QD=45.9962;RBI=0.025851;REFB=-0.0715934;REVB=0.00990722;RO=3;SAF=10;SAR=15;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12047;STB=0.555514;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00699793;OID=.;OPOS=46951813;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:28:30:3:3:25:27:0.9:15:10:3:0:15:12:3:0
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chr8	48102786	.	C	T	957.57	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104821;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.601;QD=58.9276;RBI=0.035402;REFB=0;REVB=-0.0338146;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112048;OID=.;OPOS=48102786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:34:31:0:0:34:31:0:0
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chr8	56821795	.	T	G	1419.84	PASS	AF=1;AO=78;DP=86;FAO=91;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.943;QD=62.4106;RBI=0.0396803;REFB=0;REVB=0.00926485;RO=0;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76157e-05;OID=.;OPOS=56821795;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:86:91:0:0:78:91:1:38:40:0:0:46:45:0:0
chr8	56821809	.	C	T	1510.83	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.787;QD=63.6139;RBI=0.022473;REFB=0;REVB=-0.00296388;RO=0;SAF=50;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.6929e-05;OID=.;OPOS=56821809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:45:50:0:0:45:50:0:0
chr8	56821945	.	G	A	696.12	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0676672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1951;QD=60.5325;RBI=0.0973601;REFB=-0.161651;REVB=0.070001;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514279;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00303122;OID=.;OPOS=56821945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:0:1:45:45:0.978261:17:28:0:0:17:28:0:1
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chr8	64098729	.	A	AG	1339.77	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0075774;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=248.597;QD=62.3147;RBI=0.0317748;REFB=0;REVB=0.030858;RO=0;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=5.82486e-05;OID=.;OPOS=64098730;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:86:86:86:86:0:44:42:0:0:7:0:44:42:0:0
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chr8	72942210	.	G	T	613.35	PASS	AF=1;AO=35;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.664;QD=61.335;RBI=0.0411331;REFB=0;REVB=0.0202544;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00030584;OID=.;OPOS=72942210;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:35:40:1:10:25:0:0:15:25:0:0
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chr8	74005131	.	A	G	2369.88	PASS	AF=1;AO=147;DP=147;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.4579;QD=64.0507;RBI=0.055407;REFB=0;REVB=-0.026744;RO=0;SAF=60;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.20375e-05;OID=.;OPOS=74005131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:147:148:0:0:147:148:1:87:60:0:0:87:61:0:0
chr8	74005179	.	T	G	1339.76	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.694;QD=62.3145;RBI=0.0221091;REFB=0;REVB=0.00844242;RO=0;SAF=28;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.34112e-05;OID=.;OPOS=74005179;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:57:28:0:0:58:28:0:0
chr8	74169337	.	T	C	1217.13	PASS	AF=0.987654;AO=81;DP=82;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0492629;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5473;QD=60.105;RBI=0.0523657;REFB=-0.00401089;REVB=0.0177577;RO=1;SAF=34;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137227;STB=0.507245;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00112863;OID=.;OPOS=74169337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:81:1:1:81:80:0.987654:47:34:1:0:46:34:1:0
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chr8	75262798	.	G	C	768.54	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7156;QD=55.8938;RBI=0.0781548;REFB=0;REVB=0.0700826;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0066483;OID=.;OPOS=75262798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:55:0:0:51:55:1:22:29:0:0:22:33:0:0
chr8	75274141	.	T	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=7.93531e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.375;QD=58.5878;RBI=0.00809969;REFB=0;REVB=0.0080993;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.08776e-05;OID=.;OPOS=75274141;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
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chr8	89340162	.	G	C	323.94	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0170764;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.335;QD=19.9347;RBI=0.0171484;REFB=-0.0327352;REVB=-0.00157042;RO=31;SAF=15;SAR=19;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647068;STB=0.535921;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0317751;OID=.;OPOS=89340162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:19:15:16:15:19:15:16:15
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chr8	90995019	.	C	T	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.166;QD=64.1538;RBI=0.0163712;REFB=0;REVB=0.00360989;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.56323e-05;OID=.;OPOS=90995019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:19:30:0:0:19:30:0:0
chr8	91031074	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0408656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8941;QD=50.4133;RBI=0.0831832;REFB=0;REVB=-0.0724531;RO=0;SAF=15;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00237134;OID=.;OPOS=91031074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:4:15:0:0:4:15:0:0
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chr8	107710044	.	T	A	1424.83	PASS	AF=0.978723;AO=91;DP=93;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0201766;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9242;QD=60.6312;RBI=0.0229872;REFB=-0.0885166;REVB=-0.0110143;RO=1;SAF=52;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00902916;STB=0.509432;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.00446081;OID=.;OPOS=107710044;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:93:94:1:2:91:92:0.978723:39:52:1:0:40:52:2:0
chr8	107754450	.	GTTTTTG	GTTTG,GTTTGTT	704.09	PASS	AF=0.844828,0.155172;AO=11,3;DP=59;FAO=49,9;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21,9;FSAR=28,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123083,-0.0503716;FXX=0.0333278;HRUN=5,5;LEN=2,3;MLLD=19.8822,142.867;QD=48.558;RBI=1.00748,0.172519;REFB=0,0;REVB=0.999934,0.165001;RO=26;SAF=11,3;SAR=0,0;SRF=0;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0.355556,0;SSSB=0.882229,0.873703;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0224673,0.0545102;OID=.,.;OPOS=107754451,107754454;OREF=TT,TTG;OALT=-,GTT;OMAPALT=GTTTG,GTTTGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.844828,0.155172:11,3:59:49,9:58:0:21,9:28,0:0:0:46:26:11,3:0,0:0:26
chr8	107764454	.	GT	G	431.21	PASS	AF=1;AO=2;DP=5;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462236;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.374;QD=52.2673;RBI=0.119632;REFB=0;REVB=0.110341;RO=2;SAF=2;SAR=0;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.639851;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00166505;OID=.;OPOS=107764455;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:5:33:33:0:13:20:0:0:4:2:2:0:1:1
chr8	107782065	.	A	G	688.89	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00186224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.811;QD=62.626;RBI=0.00217204;REFB=0;REVB=0.00111796;RO=0;SAF=13;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41056e-05;OID=.;OPOS=107782065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:31:13:0:0:31:13:0:0
chr8	107782122	.	AG	A	45.23	PASS	AF=0.384615;AO=9;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0247702;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=15.5308;QD=6.95773;RBI=0.0461531;REFB=-0.069755;REVB=-0.0389429;RO=14;SAF=1;SAR=8;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0.345756;SSSB=-0.206442;STB=0.512171;STBP=0.991;TYPE=del;VARB=0.100942;OID=.;OPOS=107782123;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.384615:9:26:10:26:16:2:8:3:13:45:14:1:8:3:11
chr8	107782395	.	G	A	481.8	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0713409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0002;QD=58.3999;RBI=0.0932033;REFB=0;REVB=0.0599777;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00201901;OID=.;OPOS=107782395;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr8	108970367	.	A	G	1453.49	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00160779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.334;QD=63.1953;RBI=0.00682634;REFB=0;REVB=-0.0066343;RO=0;SAF=59;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.22208e-06;OID=.;OPOS=108970367;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:33:59:0:0:33:59:0:0
chr8	110254895	.	C	A	1713.13	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00991739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.054;QD=60.6416;RBI=0.0196278;REFB=0;REVB=0.016938;RO=0;SAF=57;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49258e-05;OID=.;OPOS=110254895;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:56:57:0:0:56:57:0:0
chr8	110301998	.	T	C	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.822;QD=56.7053;RBI=0.0514534;REFB=0;REVB=0.00274978;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000353455;OID=.;OPOS=110301998;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr8	110302047	.	T	A,G	643.38	PASS	AF=0.0444444,0.933333;AO=2,41;DP=45;FAO=2,42;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=1,20;FSAR=1,22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00783632,0.0100688;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=16.403,131.407;QD=57.1896;RBI=0.0231489,0.0239559;REFB=0.0388197,0.0790637;REVB=0.0217822,0.0217371;RO=2;SAF=1,20;SAR=1,21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.390188,0.0426083;STB=0.665164,0.511106;STBP=0.662,0.509;TYPE=snp,snp;VARB=0.129011,-0.000481715;OID=.,.;OPOS=110302047,110302047;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:45:45:2:1:2,41:2,42:0.0444444,0.933333:1,21:1,20:0:2:1,22:1,20:0:1
chr8	110412519	.	G	A	1099.49	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313832;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.5589;QD=59.4317;RBI=0.0353721;REFB=0;REVB=0.0163182;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.63635e-05;OID=.;OPOS=110412519;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:38:34:0:0:40:34:0:0
chr8	110413762	.	T	C	1269.33	PASS	AF=1;AO=72;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=49;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010516;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.916;QD=57.0485;RBI=0.0552441;REFB=0;REVB=0.054234;RO=7;SAF=46;SAR=26;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376193;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123449;OID=.;OPOS=110413762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:90:89:7:0:72:89:1:26:46:3:4:40:49:0:0
chr8	110416813	.	C	T	1072.26	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000809064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.691;QD=59.5699;RBI=0.0401243;REFB=0;REVB=-0.0401162;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123368;OID=.;OPOS=110416813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:29:42:0:0:29:43:0:0
chr8	110420384	.	T	C	1222.18	PASS	AF=0.975904;AO=81;DP=84;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00166055;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.952;QD=58.9002;RBI=0.0672133;REFB=-0.0246885;REVB=0.0671928;RO=2;SAF=46;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00315386;STB=0.501666;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000797348;OID=.;OPOS=110420384;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:84:83:2:2:81:81:0.975904:35:46:1:1:35:46:1:1
chr8	110420429	.	A	G	1134.05	PASS	AF=0.9625;AO=77;DP=80;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0937623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0456;QD=56.7024;RBI=0.0961732;REFB=-0.0552947;REVB=0.021399;RO=3;SAF=43;SAR=34;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00778821;STB=0.504118;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00861445;OID=.;OPOS=110420429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:80:80:3:3:77:77:0.9625:34:43:2:1:34:43:2:1
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chr8	111946844	.	G	C	817.07	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.7377;QD=57.338;RBI=0.0215177;REFB=0;REVB=0.0116957;RO=0;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.32194e-05;OID=.;OPOS=111946844;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:21:36:0:0:21:36:0:0
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chr8	113655752	.	T	C	369.2	PASS	AF=0.36;AO=45;DP=124;FAO=45;FDP=125;FR=.;FRO=80;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=51;FSRR=29;FWDB=0.00814844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.406;QD=11.8145;RBI=0.0174769;REFB=-0.00838363;REVB=-0.015461;RO=79;SAF=32;SAR=13;SRF=51;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0848794;STB=0.554659;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0095437;OID=.;OPOS=113655752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:125:79:80:45:45:0.36:13:32:51:28:13:32:51:29
chr8	114186003	.	T	C	1583.47	PASS	AF=1;AO=104;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111997;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.195;QD=59.7534;RBI=0.0456141;REFB=0;REVB=0.0442178;RO=0;SAF=59;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.61221e-05;OID=.;OPOS=114186003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:106:0:0:104:106:1:45:59:0:0:46:60:0:0
chr8	116423424	.	T	C	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266461;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.773;QD=62.022;RBI=0.02859;REFB=0;REVB=0.010362;RO=0;SAF=30;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90388e-05;OID=.;OPOS=116423424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:12:30:0:0:12:30:0:0
chr8	116423490	.	A	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.445;QD=61.3364;RBI=0.100624;REFB=0;REVB=0.0992506;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300758;OID=.;OPOS=116423490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr8	116424270	.	A	AC,C	406.41	PASS	AF=1,0;AO=12,14;DP=29;FAO=29,0;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0;FSAR=13,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0649699,-0.100434;FXX=0;HRUN=0,9;LEN=1,1;MLLD=179.726,175.606;QD=56.0566;RBI=0.065091,0.100546;REFB=0,0;REVB=0.0039687,0.00474227;RO=1;SAF=5,10;SAR=7,4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0818676,-0.0433252;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000787129,0.0109595;OID=.,.;OPOS=116424271,116424270;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:1:0:12,14:29,0:1,0:7,4:5,10:1:0:13,0:16,0:0:0
chr8	117035009	.	C	T	576.31	PASS	AF=0.553398;AO=57;DP=103;FAO=57;FDP=103;FR=.;FRO=46;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=27;FWDB=-0.00255939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.799;QD=22.3809;RBI=0.00965029;REFB=-0.0234133;REVB=-0.00930471;RO=46;SAF=23;SAR=34;SRF=19;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00805333;STB=0.504414;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.0202576;OID=.;OPOS=117035009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:46:46:57:57:0.553398:34:23:19:27:34:23:19:27
chr8	117791733	.	T	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.761;QD=62.3509;RBI=0.0357369;REFB=0;REVB=0.0104596;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157864;OID=.;OPOS=117791733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr8	117858389	.	G	A	1412.42	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9429;QD=62.7741;RBI=0.0142449;REFB=0;REVB=-0.00441708;RO=0;SAF=44;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36634e-05;OID=.;OPOS=117858389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:46:44:0:0:46:44:0:0
chr8	118030465	.	C	G	124.87	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0835539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.535;QD=17.839;RBI=0.0881339;REFB=-0.0160403;REVB=0.0280414;RO=14;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12462;STB=0.571326;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0152062;OID=.;OPOS=118030465;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:6:8:6:8:6:8:6:8
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chr8	118819578	.	C	T	232.58	PASS	AF=0.45;AO=24;DP=57;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.018234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.175;QD=15.5055;RBI=0.0206551;REFB=-0.0187934;REVB=0.0097034;RO=32;SAF=9;SAR=15;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219411;STB=0.588171;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0185805;OID=.;OPOS=118819578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:60:32:33:24:27:0.45:15:9:19:13:15:12:20:13
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chr8	124448804	.	T	A	151.27	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0380505;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.5354;QD=12.8742;RBI=0.0529876;REFB=-0.0167941;REVB=-0.0368761;RO=27;SAF=9;SAR=8;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0672357;STB=0.545402;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0495863;OID=.;OPOS=124448804;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:47:27:30:17:17:0.361702:8:9:16:11:8:9:18:12
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chr8	124453543	.	T	A	204.12	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0706934;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=44.9722;QD=15.7018;RBI=0.0735209;REFB=0.0333583;REVB=-0.0201934;RO=26;SAF=10;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0616294;STB=0.507633;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=-0.00768366;OID=.;OPOS=124453543;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:29:23:23:0.442308:13:10:13:13:13:10:13:16
chr8	124525483	.	C	T	419.92	PASS	AF=0.35461;AO=49;DP=141;FAO=50;FDP=141;FR=.;FRO=91;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=55;FSRR=36;FWDB=-0.0150404;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0545;QD=11.9127;RBI=0.0221446;REFB=-0.0129919;REVB=0.0162533;RO=91;SAF=28;SAR=21;SRF=55;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384391;STB=0.529264;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0294895;OID=.;OPOS=124525483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:91:91:49:50:0.35461:21:28:55:36:22:28:55:36
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chr8	124664792	.	C	T	1441.39	PASS	AF=1;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224824;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.979;QD=63.3579;RBI=0.0226086;REFB=0;REVB=0.00238568;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.54753e-05;OID=.;OPOS=124664792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:91:0:0:91:91:1:44:47:0:0:44:47:0:0
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chr8	124749608	.	A	AT	277.51	PASS	AF=1;AO=6;DP=49;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.192883;FXX=0.104145;HRUN=1;LEN=1;MLLD=7.76794;QD=25.8149;RBI=0.272194;REFB=0;REVB=-0.192056;RO=43;SAF=3;SAR=3;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680824;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.0144148;OID=.;OPOS=124749609;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:49:43:43:0:23:20:0:0:7:43:3:3:24:19
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chr8	124824826	.	G	A	1135.25	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.037;QD=60.5467;RBI=0.0227613;REFB=0;REVB=-0.00945039;RO=0;SAF=59;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.4023e-05;OID=.;OPOS=124824826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:16:59:0:0:16:59:0:0
chr8	124826804	.	G	T	2252.7	PASS	AF=1;AO=141;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1455;QD=63.4563;RBI=0.075875;REFB=0;REVB=0.0525889;RO=0;SAF=76;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.52843e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371885;OID=.;OPOS=124826804;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:141:142:1:65:76:0:0:66:76:0:0
chr8	124987478	.	T	C	1529.18	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.109;QD=63.7157;RBI=0.0279457;REFB=0;REVB=0.0246344;RO=0;SAF=59;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112739;OID=.;OPOS=124987478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:37:59:0:0:37:59:0:0
chr8	124989830	.	C	T	396.82	PASS	AF=0.565217;AO=39;DP=70;FAO=39;FDP=69;FR=.;FRO=30;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0204126;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.488;QD=23.0041;RBI=0.0284569;REFB=0.00604467;REVB=0.0198273;RO=30;SAF=23;SAR=16;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150207;STB=0.58267;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.00520567;OID=.;OPOS=124989830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:30:30:39:39:0.565217:16:23:12:18:16:23:12:18
chr8	125035698	.	C	A	90.28	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=6.99833e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.4629;QD=16.4151;RBI=0.072125;REFB=-0.00685346;REVB=0.0721249;RO=11;SAF=3;SAR=8;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00780993;OID=.;OPOS=125035698;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:8:3:3:8:8:3:3:8
chr8	125035788	.	G	C	273.15	PASS	AF=0.958333;AO=9;DP=23;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0515996;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.614;QD=45.5251;RBI=0.0881571;REFB=-0.0418914;REVB=0.0714784;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517226;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00381928;OID=.;OPOS=125035788;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:24:0:1:9:23:0.958333:1:8:0:0:14:9:0:1
chr8	125061895	.	G	A	2329.42	PASS	AF=0.993243;AO=141;DP=142;FAO=147;FDP=148;FR=.;FRO=1;FSAF=82;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0341701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.428;QD=62.9573;RBI=0.0342861;REFB=0.1363;REVB=-0.00281865;RO=1;SAF=77;SAR=64;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00737156;STB=0.503816;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.000304428;OID=.;OPOS=125061895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:142:148:1:1:141:147:0.993243:64:77:0:1:65:82:0:1
chr8	125072426	.	T	C	711.06	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.527;QD=63.2054;RBI=0.0860691;REFB=0;REVB=0.0762093;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146401;OID=.;OPOS=125072426;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:15:28:0:0:16:29:0:0
chr8	125076589	.	T	G	1390.04	PASS	AF=0.960396;AO=96;DP=100;FAO=97;FDP=101;FR=.;FRO=4;FSAF=56;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0864433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.847;QD=55.0513;RBI=0.102193;REFB=-0.0908164;REVB=0.0545075;RO=1;SAF=55;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00854504;STB=0.50702;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00250011;OID=.;OPOS=125076589;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:100:101:1:4:96:97:0.960396:41:55:1:0:41:56:3:1
chr8	125107201	.	G	A	936.75	PASS	AF=0.956522;AO=66;DP=69;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00392623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=287.96;QD=54.3046;RBI=0.0112096;REFB=-0.107855;REVB=0.0104996;RO=3;SAF=33;SAR=33;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410323;STB=0.521733;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00217025;OID=.;OPOS=125107201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:69:69:3:3:66:66:0.956522:33:33:3:0:33:33:3:0
chr8	125107207	.	C	T	869.05	PASS	AF=0.941176;AO=63;DP=69;FAO=64;FDP=68;FR=.;FRO=4;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0380514;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4152;QD=51.1204;RBI=0.0394499;REFB=-0.201168;REVB=-0.0104106;RO=5;SAF=31;SAR=32;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702987;STB=0.529403;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.00639733;OID=.;OPOS=125107207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:69:68:5:4:63:64:0.941176:32:31:5:0:32:32:4:0
chr8	125384092	.	TA	AC,CA,TAC	50.05	PASS	AF=0.0258621,0.0517241,0.0775862;AO=6,6,20;DP=116;FAO=3,6,9;FDP=116;FR=.;FRO=98;FSAF=3,6,5;FSAR=0,0,4;FSRF=37;FSRR=61;FWDB=-0.114225,-0.0226996,-0.145737;FXX=0.0169477;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=28.724,160.822,13.5177;QD=1.72573;RBI=0.180315,0.0300267,0.25765;REFB=-0.0147788,-0.000750978,-0.0466766;REVB=-0.139521,-0.0196553,-0.212471;RO=75;SAF=5,6,5;SAR=1,0,15;SRF=30;SRR=45;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.439688,0.600527,-0.213927;STB=0.997371,0.998624,0.6589;STBP=0.032,0.002,0.379;TYPE=mnp,snp,ins;VARB=0.0366984,0.093291,0.156249;OID=.,.,.;OPOS=125384092,125384092,125384094;OREF=TA,T,-;OALT=AC,C,C;OMAPALT=AC,CA,TAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:17:116:116:75:98:6,6,20:3,6,9:0.0258621,0.0517241,0.0775862:1,0,15:5,6,5:30:45:0,0,4:3,6,5:37:61
chr8	125463250	.	T	C	1306.07	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.016411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.764;QD=60.7475;RBI=0.0186713;REFB=-0.075502;REVB=0.00890478;RO=1;SAF=38;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997334;STB=0.505262;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00159649;OID=.;OPOS=125463250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:1:1:85:85:0.988372:47:38:0:1:47:38:0:1
chr8	125463544	.	T	C	553.65	PASS	AF=0.52;AO=52;DP=99;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.0175411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.792;QD=22.1461;RBI=0.0317136;REFB=-0.0285068;REVB=0.0264209;RO=47;SAF=27;SAR=25;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047775;STB=0.530876;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0234716;OID=.;OPOS=125463544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:47:48:52:52:0.52:25:27:27:20:25:27:28:20
chr8	125465042	.	C	T	252.55	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.00326173;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6548;QD=17.122;RBI=0.0726368;REFB=-0.00184037;REVB=-0.0725636;RO=32;SAF=9;SAR=19;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00973651;STB=0.518974;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.00118597;OID=.;OPOS=125465042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:32:31:28:28:0.474576:19:9:10:22:19:9:9:22
chr8	125498547	.	C	T	660.09	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128607;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.35;QD=61.4038;RBI=0.0241281;REFB=0;REVB=0.0204149;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386937;OID=.;OPOS=125498547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:22:19:0:0:22:21:0:0
chr8	125562029	.	C	T	249.92	PASS	AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0223481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.151;QD=16.6612;RBI=0.0233331;REFB=-0.0118865;REVB=-0.00670804;RO=32;SAF=17;SAR=11;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161743;STB=0.591062;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0104022;OID=.;OPOS=125562029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:11:17:14:18:11:17:14:18
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chr8	129022785	.	T	C	747.05	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.276;QD=63.5791;RBI=0.0176512;REFB=0;REVB=0.00818617;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.39804e-05;OID=.;OPOS=129022785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr8	129022816	.	G	A	195.49	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.00136403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.957;QD=14.2175;RBI=0.00276687;REFB=-0.0228087;REVB=0.00240728;RO=30;SAF=12;SAR=11;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14591;STB=0.597363;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0154093;OID=.;OPOS=129022816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:30:32:23:23:0.418182:11:12:20:10:11:12:22:10
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chr8	129162433	.	G	A	124.67	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00561302;FXX=0.0832986;HRUN=7;LEN=1;MLLD=190.494;QD=22.6678;RBI=0.0495908;REFB=-0.0394447;REVB=0.0492721;RO=9;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449419;STB=0.525508;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0175059;OID=.;OPOS=129162433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:22:22:9:9:13:13:0.590909:5:8:5:4:5:8:5:4
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chr8	133101818	.	G	A	220.56	PASS	AF=0.419355;AO=25;DP=61;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00242156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.97;QD=14.2298;RBI=0.00534261;REFB=-0.00656552;REVB=-0.00476231;RO=35;SAF=8;SAR=17;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207824;STB=0.59295;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00979128;OID=.;OPOS=133101818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:35:36:25:26:0.419355:17:8:18:17:17:9:18:18
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chr8	133113531	.	A	T	101.16	PASS	AF=0.270833;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=48;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0257334;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=119.268;QD=8.43016;RBI=0.0508298;REFB=0.00227298;REVB=-0.0438344;RO=33;SAF=11;SAR=2;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.521801;STB=0.834454;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.0425609;OID=.;OPOS=133113531;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:48:33:35:13:13:0.270833:2:11:14:19:2:11:14:21
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chr8	133900252	.	T	G	227.62	PASS	AF=0.341463;AO=28;DP=83;FAO=28;FDP=82;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.00111555;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.424;QD=11.1036;RBI=0.0199191;REFB=-0.0205905;REVB=0.0198878;RO=54;SAF=15;SAR=13;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614707;STB=0.535689;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0349179;OID=.;OPOS=133900252;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:54:54:28:28:0.341463:13:15:26:28:13:15:26:28
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chr8	141568622	.	G	A	1729.35	PASS	AF=1;AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000187096;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4002;QD=60.679;RBI=0.000237713;REFB=0;REVB=-0.000146637;RO=0;SAF=53;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.24572e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291895;OID=.;OPOS=141568622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:115:114:0:0:114:114:1:61:53:0:0:61:53:0:0
chr8	141774282	.	A	C	221.66	PASS	AF=0.6;AO=20;DP=34;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0592436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1532;QD=25.3326;RBI=0.112689;REFB=0.0137794;REVB=0.0958592;RO=14;SAF=11;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19318;STB=0.594507;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=-0.00423366;OID=.;OPOS=141774282;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:14:14:20:21:0.6:9:11:4:10:10:11:4:10
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chr8	142218119	.	G	A	344.9	PASS	AF=0.725;AO=28;DP=40;FAO=29;FDP=40;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0230259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8286;QD=34.4895;RBI=0.0617755;REFB=-0.0167409;REVB=0.0573238;RO=12;SAF=14;SAR=14;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457483;STB=0.54214;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00686651;OID=.;OPOS=142218119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:40:40:12:11:28:29:0.725:14:14:5:7:14:15:4:7
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chr8	143961005	.	T	C	272.62	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00720311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.21;QD=51.9274;RBI=0.0415281;REFB=0;REVB=0.0408986;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.59203e-05;OID=.;OPOS=143961005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:5:15:0:0:5:16:0:0
chr8	143961102	.	C	T	546.8	PASS	AF=0.926829;AO=37;DP=41;FAO=38;FDP=41;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.000278829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.03;QD=53.3467;RBI=0.000440031;REFB=-0.0278107;REVB=0.000340414;RO=3;SAF=13;SAR=24;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0476896;STB=0.523148;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00112446;OID=.;OPOS=143961102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:41:41:3:3:37:38:0.926829:24:13:2:1:24:14:2:1
chr8	143994041	.	C	T	1642.13	PASS	AF=0.982456;AO=110;DP=114;FAO=112;FDP=114;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00048663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.65;QD=57.6186;RBI=0.0372177;REFB=-0.0582729;REVB=-0.0372145;RO=1;SAF=63;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00999333;STB=0.501446;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.000387399;OID=.;OPOS=143994041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:114:114:1:2:110:112:0.982456:47:63:0:1:47:65:1:1
chr8	143994702	.	G	T	634.65	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357813;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.633;QD=61.9175;RBI=0.0845089;REFB=0;REVB=0.0765602;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000500849;OID=.;OPOS=143994702;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0
chr8	144099678	.	G	A	1540.33	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0640832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.223;QD=59.8185;RBI=0.14209;REFB=0;REVB=0.126818;RO=0;SAF=61;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300453;OID=.;OPOS=144099678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:42:61:0:0:42:61:0:0
chr8	144102747	.	C	T	1080.34	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0454774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.085;QD=60.0189;RBI=0.104417;REFB=0;REVB=0.0939928;RO=0;SAF=44;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133045;OID=.;OPOS=144102747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:28:44:0:0:28:44:0:0
chr8	144124609	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00765937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.844;QD=49.5989;RBI=0.0257914;REFB=0;REVB=-0.0246278;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000301219;OID=.;OPOS=144124609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr8	144295154	.	C	T	131.81	PASS	AF=0.441176;AO=14;DP=33;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.00947836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.906;QD=15.5065;RBI=0.0499682;REFB=-0.017856;REVB=0.049061;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403388;STB=0.763328;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0397608;OID=.;OPOS=144295154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:16:19:14:15:0.441176:9:5:13:3:10:5:16:3
chr8	144295782	.	G	T	394.09	PASS	AF=0.373016;AO=47;DP=126;FAO=47;FDP=126;FR=.;FRO=79;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=42;FWDB=0.0749189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5745;QD=12.5107;RBI=0.106895;REFB=0.0026049;REVB=0.0762471;RO=79;SAF=27;SAR=20;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117051;STB=0.566661;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.00249067;OID=.;OPOS=144295782;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:79:79:47:47:0.373016:20:27:37:42:20:27:37:42
chr8	144332012	.	T	C	766.32	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0532877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9992;QD=63.8599;RBI=0.0571983;REFB=0;REVB=-0.0207863;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00064005;OID=.;OPOS=144332012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr8	144332082	.	T	C	766.42	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0660196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.524;QD=63.8679;RBI=0.0660379;REFB=0;REVB=-0.00155196;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289103;OID=.;OPOS=144332082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
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chr8	144351632	.	A	G	1058.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.238;QD=58.8016;RBI=0.050674;REFB=0;REVB=0.0492715;RO=0;SAF=17;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000430826;OID=.;OPOS=144351632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:72:0:0:53:72:1:36:17:0:0:54:18:0:0
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chr8	144688736	.	C	G	418.39	PASS	AF=0.65;AO=39;DP=60;FAO=39;FDP=60;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00776891;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.983;QD=27.8928;RBI=0.00786406;REFB=-0.0263053;REVB=-0.00121961;RO=21;SAF=21;SAR=18;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00945318;STB=0.505152;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0183026;OID=.;OPOS=144688736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:21:21:39:39:0.65:18:21:11:10:18:21:11:10
chr8	144689146	.	C	T	889.12	PASS	AF=0.458937;AO=95;DP=201;FAO=95;FDP=207;FR=.;FRO=112;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=70;FSRR=42;FWDB=-0.00728674;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.459;QD=17.181;RBI=0.0514678;REFB=-0.0216033;REVB=0.0509493;RO=106;SAF=48;SAR=47;SRF=65;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103327;STB=0.564867;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0286577;OID=.;OPOS=144689146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:201:207:106:112:95:95:0.458937:47:48:65:41:47:48:70:42
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chr8	144822037	.	G	T	734.31	PASS	AF=0.503401;AO=73;DP=138;FAO=74;FDP=147;FR=.;FRO=73;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=44;FSRR=29;FWDB=0.00992269;FXX=0.0264883;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.219;QD=19.9811;RBI=0.0124704;REFB=-0.0307123;REVB=0.00755316;RO=65;SAF=42;SAR=31;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00536459;STB=0.511083;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0276034;OID=.;OPOS=144822037;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:147:65:73:73:74:0.503401:31:42:37:28:31:43:44:29
chr8	144885580	.	A	G	2942.51	PASS	AF=1;AO=177;DP=178;FAO=196;FDP=196;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=115;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.128321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.7796;QD=60.0511;RBI=0.128585;REFB=0;REVB=0.00824275;RO=1;SAF=79;SAR=98;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00483303;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00697532;OID=.;OPOS=144885580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:178:196:1:0:177:196:1:98:79:0:1:115:81:0:0
chr8	144889172	.	A	G	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.197;QD=58.4196;RBI=0.0630321;REFB=0;REVB=0.0154837;RO=0;SAF=25;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121296;OID=.;OPOS=144889172;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:38:25:0:0:38:25:0:0
chr8	144890873	.	A	T	583.22	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.192665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.231;QD=59.8174;RBI=0.196446;REFB=0;REVB=0.0383564;RO=0;SAF=0;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000629677;OID=.;OPOS=144890873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:37:0:0:0:38:1:0:0
chr8	144894496	.	G	A	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.314;QD=57.5441;RBI=0.024456;REFB=0;REVB=0.0197009;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.84002e-05;OID=.;OPOS=144894496;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr8	144895553	.	G	A	635.46	PASS	AF=0.916667;AO=44;DP=48;FAO=44;FDP=48;FR=.;FRO=4;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0260047;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3814;QD=52.9549;RBI=0.0657441;REFB=-0.11557;REVB=-0.0603825;RO=4;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0936111;STB=0.549977;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0354283;OID=.;OPOS=144895553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:48:48:4:4:44:44:0.916667:18:26:0:4:18:26:0:4
chr8	144904690	.	A	G	362.64	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138528;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6694;QD=55.7906;RBI=0.0217602;REFB=0;REVB=0.0167812;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000510474;OID=.;OPOS=144904690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0
chr8	144940222	.	A	C	1054.96	PASS	AF=0.512077;AO=106;DP=206;FAO=106;FDP=207;FR=.;FRO=101;FSAF=17;FSAR=89;FSRF=42;FSRR=59;FWDB=0.0018535;FXX=0.00480746;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.466;QD=20.3858;RBI=0.0259656;REFB=-0.033004;REVB=-0.0258994;RO=99;SAF=17;SAR=89;SRF=41;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313138;STB=0.676027;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0249422;OID=.;OPOS=144940222;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:206:207:99:101:106:106:0.512077:89:17:41:58:89:17:42:59
chr8	144940230	.	G	C	1287.98	PASS	AF=0.541485;AO=123;DP=229;FAO=124;FDP=229;FR=.;FRO=105;FSAF=25;FSAR=99;FSRF=43;FSRR=62;FWDB=-0.014294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.168;QD=22.4975;RBI=0.038393;REFB=-0.038619;REVB=0.0356329;RO=106;SAF=25;SAR=98;SRF=43;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224354;STB=0.625803;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0352656;OID=.;OPOS=144940230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:229:229:106:105:123:124:0.541485:98:25:43:63:99:25:43:62
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chr8	144995494	.	C	T	792.17	PASS	AF=0.592;AO=73;DP=126;FAO=74;FDP=125;FR=.;FRO=51;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.116053;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.284;QD=25.3496;RBI=0.117155;REFB=-0.03407;REVB=-0.0160268;RO=52;SAF=33;SAR=40;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220875;STB=0.504566;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0324541;OID=.;OPOS=144995494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:125:52:51:73:74:0.592:40:33:25:27:40:34:24:27
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chr8	144996029	.	A	G	68.47	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00543114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7609;QD=15.2144;RBI=0.0186538;REFB=0.0121619;REVB=0.0178457;RO=9;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195767;STB=0.615121;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=-0.00661038;OID=.;OPOS=144996029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:3:6:4:5:3:6:4:5
chr8	144996408	.	T	G	536.19	PASS	AF=0.504505;AO=53;DP=108;FAO=56;FDP=111;FR=.;FRO=55;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=-0.0110457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.901;QD=19.322;RBI=0.0117175;REFB=-0.0667429;REVB=0.00391055;RO=51;SAF=30;SAR=23;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560167;STB=0.533792;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0547534;OID=.;OPOS=144996408;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:111:51:55:53:56:0.504505:23:30:32:19:23:33:36:19
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chr8	144997927	.	G	A	127.86	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00552802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.074;QD=20.4569;RBI=0.0854387;REFB=-0.0256766;REVB=0.0852597;RO=11;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204611;STB=0.511611;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0489889;OID=.;OPOS=144997927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:6:8:6:5:6:8:6:5
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chr8	145160646	.	T	C	635.93	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210016;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.212;QD=62.0418;RBI=0.02426;REFB=0;REVB=0.012144;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.08827e-05;OID=.;OPOS=145160646;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chr8	145161823	.	G	A	134.7	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141322;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=174.56;QD=41.4451;RBI=0.100844;REFB=0;REVB=0.0998489;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000864787;OID=.;OPOS=145161823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:5:7:0:0:6:7:0:0
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chr8	145164847	.	A	G	425.42	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0281211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4426;QD=56.7231;RBI=0.126739;REFB=0;REVB=-0.123579;RO=0;SAF=22;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00292057;OID=.;OPOS=145164847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:7:22:0:0:7:23:0:0
chr8	145166134	.	C	G	330.04	PASS	AF=0.486111;AO=34;DP=71;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=27;FWDB=0.0281697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.545;QD=18.3356;RBI=0.0363441;REFB=-0.00373798;REVB=0.0229645;RO=37;SAF=16;SAR=18;SRF=10;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190776;STB=0.611451;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.00463294;OID=.;OPOS=145166134;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:37:37:34:35:0.486111:18:16:10:27:18:17:10:27
chr8	145168611	.	A	G	647.71	PASS	AF=0.8;AO=51;DP=68;FAO=52;FDP=65;FR=.;FRO=13;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0.0200167;FXX=0.0579626;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.053;QD=39.8588;RBI=0.0291659;REFB=-0.0732153;REVB=0.0212127;RO=0;SAF=36;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.746e-08;STB=0.644387;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00188159;OID=.;OPOS=145168611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:68:65:0:13:51:52:0.8:15:36:0:0:16:36:0:13
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chr8	145223288	.	C	T	463.74	PASS	AF=1;AO=29;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4581;QD=57.9678;RBI=0.123682;REFB=0;REVB=0.0510732;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118322;OID=.;OPOS=145223288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:29:32:1:17:12:0:0:17:15:0:0
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chr8	145603114	.	A	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00524382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.204;QD=58.5878;RBI=0.0204169;REFB=0;REVB=0.019732;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.06651e-05;OID=.;OPOS=145603114;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
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chr8	145690308	.	C	T	1359.75	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108555;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.453;QD=62.5172;RBI=0.0454142;REFB=0;REVB=0.0440977;RO=0;SAF=50;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144555;OID=.;OPOS=145690308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:85:87:1:35:50:0:0:36:51:0:0
chr8	145690348	.	G	A	974.34	PASS	AF=1;AO=59;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0589412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5128;QD=59.0506;RBI=0.118088;REFB=0;REVB=0.102327;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161648;OID=.;OPOS=145690348;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:59:66:1:22:37:0:0:25:41:0:0
chr8	145690396	.	A	C	867.79	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0810053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0253;QD=57.8529;RBI=0.093141;REFB=0;REVB=0.0459716;RO=0;SAF=42;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41114e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000978189;OID=.;OPOS=145690396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:18:42:0:0:18:42:0:0
chr8	145692385	.	C	T	318.74	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.1645;QD=50.9979;RBI=0.0611553;REFB=-0.0997051;REVB=0.0423072;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00327025;OID=.;OPOS=145692385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:24:25:0:0:24:25:1:14:10:0:0:14:11:0:0
chr8	145693720	.	A	G	3206.94	PASS	AF=1;AO=207;DP=208;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162399;FXX=0.00480746;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.207;QD=61.9699;RBI=0.0416158;REFB=0;REVB=0.0383163;RO=0;SAF=110;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.96854e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.59051e-05;OID=.;OPOS=145693720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:208:207:0:0:207:207:1:97:110:0:0:97:110:0:0
chr8	145693776	.	C	T	828.96	PASS	AF=0.462366;AO=83;DP=180;FAO=86;FDP=186;FR=.;FRO=100;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=57;FSRR=43;FWDB=0.0548934;FXX=0.00534731;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.2326;QD=17.8272;RBI=0.0552845;REFB=-0.0497081;REVB=-0.00656441;RO=96;SAF=30;SAR=53;SRF=56;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21698;STB=0.600883;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0467148;OID=.;OPOS=145693776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:186:96:100:83:86:0.462366:53:30:56:40:53:33:57:43
chr8	145723417	.	CTT	CT,CTG	1204.27	PASS	AF=0.0609756,0.939024;AO=9,60;DP=81;FAO=5,77;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=4,35;FSAR=1,42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0589266,-0.0908468;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=29.1931,35.5545;QD=58.7446;RBI=0.0956871,0.0913981;REFB=0,0;REVB=-0.0753901,0.0100233;RO=0;SAF=4,32;SAR=5,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0687729,0.00772945;OID=.,.;OPOS=145723418,145723419;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=CT,CTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0609756,0.939024:9,60:81:5,77:82:0:4,35:1,42:0:0:12:0:4,32:5,28:0:0
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chr8	145729727	.	C	A	2112.67	PASS	AF=1;AO=128;DP=130;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.364;QD=61.6837;RBI=0.081594;REFB=0;REVB=0.0801846;RO=0;SAF=65;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1359e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.871e-05;OID=.;OPOS=145729727;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:137:0:0:128:137:1:63:65:0:0:72:65:0:0
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chr8	145739024	.	C	T	291.41	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0647567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.829;QD=19.4273;RBI=0.0648312;REFB=-0.014232;REVB=0.00310662;RO=28;SAF=9;SAR=22;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426702;STB=0.529393;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0172013;OID=.;OPOS=145739024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:28:29:31:31:0.516667:22:9:7:21:22:9:7:22
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chr8	145741765	.	G	A	727.15	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205574;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.021;QD=57.0312;RBI=0.0846947;REFB=0;REVB=0.0821619;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106944;OID=.;OPOS=145741765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:23:28:0:0:23:28:0:0
chr8	145742514	.	A	G	4345.94	PASS	AF=1;AO=275;DP=278;FAO=278;FDP=278;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112497;FXX=0.0035841;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7787;QD=62.5315;RBI=0.0175224;REFB=-0.0385025;REVB=0.0134343;RO=1;SAF=158;SAR=117;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00405794;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232064;OID=.;OPOS=145742514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:278:278:1:0:275:278:1:117:158:0:1:119:159:0:0
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chr8	145745182	.	T	C	2304.39	PASS	AF=1;AO=139;DP=140;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1101;QD=63.134;RBI=0.017903;REFB=0;REVB=0.0141698;RO=0;SAF=60;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99523e-05;OID=.;OPOS=145745182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:146:0:0:139:146:1:79:60:0:0:84:62:0:0
chr8	145747920	.	T	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0439634;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.831;QD=47.822;RBI=0.0445097;REFB=0;REVB=-0.00695228;RO=0;SAF=14;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141793;OID=.;OPOS=145747920;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:2:14:0:0:2:14:0:0
chr8	145772564	.	C	T	973.82	PASS	AF=0.492611;AO=100;DP=204;FAO=100;FDP=203;FR=.;FRO=103;FSAF=52;FSAR=48;FSRF=60;FSRR=43;FWDB=-0.0181368;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3039;QD=19.1885;RBI=0.0239709;REFB=-0.0126473;REVB=0.0156735;RO=103;SAF=52;SAR=48;SRF=60;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0579304;STB=0.53185;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0120892;OID=.;OPOS=145772564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:204:203:103:103:100:100:0.492611:48:52:60:43:48:52:60:43
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chr9	118173	.	C	G	648.34	PASS	AF=0.924528;AO=48;DP=52;FAO=49;FDP=53;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.017748;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=252.008;QD=48.9314;RBI=0.0520843;REFB=-0.110003;REVB=0.0489672;RO=1;SAF=29;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159482;STB=0.52643;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.000562796;OID=.;OPOS=118173;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:52:53:1:4:48:49:0.924528:19:29:1:0:20:29:1:3
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chr9	215057	.	T	C	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00965098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.234;QD=37.4869;RBI=0.0456917;REFB=0;REVB=0.0446609;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000504643;OID=.;OPOS=215057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr9	215269	.	A	C	1080.43	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000705502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.906;QD=60.0241;RBI=0.0619816;REFB=0;REVB=0.0619776;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011622;OID=.;OPOS=215269;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:40:32:0:0:40:32:0:0
chr9	215534	.	C	T	888.44	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00457493;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.62;QD=58.2582;RBI=0.00704372;REFB=0;REVB=0.00535575;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92546e-05;OID=.;OPOS=215534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0
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chr9	4664749	.	C	T	253.9	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0654593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1997;QD=21.6085;RBI=0.0720476;REFB=-0.00849865;REVB=-0.0300988;RO=21;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994847;STB=0.531888;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.00831228;OID=.;OPOS=4664749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:21:23:24:24:0.510638:12:12:13:8:12:12:13:10
chr9	4664836	.	A	T	173.74	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0121907;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.04;QD=12.8698;RBI=0.0133975;REFB=-0.0124191;REVB=-0.00555683;RO=32;SAF=12;SAR=9;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239783;STB=0.5027;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0193785;OID=.;OPOS=4664836;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:33:21:21:0.388889:9:12:19:13:9:12:19:14
chr9	4664852	.	A	G	258.61	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0302024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.951;QD=16.4195;RBI=0.0512466;REFB=-0.0202211;REVB=0.0414009;RO=33;SAF=18;SAR=11;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445573;STB=0.534833;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00830861;OID=.;OPOS=4664852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:33:34:29:29:0.460317:11:18:19:14:11:18:19:15
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chr9	4706214	.	C	T	511.85	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.846;QD=58.4968;RBI=0.0333572;REFB=0;REVB=-0.0299882;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.16374e-05;OID=.;OPOS=4706214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:13:21:0:0:14:21:0:0
chr9	4711357	.	CA	C	181.95	PASS	AF=0.462687;AO=29;DP=69;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=-0.00252994;FXX=0.0289813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.3525;QD=10.8628;RBI=0.00425813;REFB=-0.0163729;REVB=-0.00342507;RO=35;SAF=18;SAR=11;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240108;STB=0.616482;STBP=0.095;TYPE=del;VARB=0.0254081;OID=.;OPOS=4711358;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.462687:29:69:31:67:36:18:13:13:23:99:35:18:11:13:22
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chr9	5231712	.	T	A	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0295374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3262;QD=12.8607;RBI=0.0566463;REFB=-0.000808155;REVB=-0.0483357;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529329;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=-0.00529316;OID=.;OPOS=5231712;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:8:7:7:0.466667:4:3:3:4:4:3:3:5
chr9	5557672	.	T	C	1659.33	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9511;QD=60.3393;RBI=0.0278671;REFB=0;REVB=-0.0231477;RO=0;SAF=70;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.74501e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.18169e-05;OID=.;OPOS=5557672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:40:70:0:0:40:70:0:0
chr9	5732483	.	T	C	1510.81	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260642;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.283;QD=59.8339;RBI=0.132234;REFB=0;REVB=0.12964;RO=0;SAF=58;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203332;OID=.;OPOS=5732483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:101:0:0:101:101:1:43:58:0:0:43:58:0:0
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chr9	7103816	.	C	T	1491.58	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.325;QD=63.4716;RBI=0.0161314;REFB=0;REVB=0.0125668;RO=0;SAF=56;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32527e-05;OID=.;OPOS=7103816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:38:56:0:0:38:56:0:0
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chr9	7798435	.	C	T	717.86	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00590746;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.066;QD=57.4291;RBI=0.00775009;REFB=0;REVB=0.00501656;RO=0;SAF=32;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.45707e-05;OID=.;OPOS=7798435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:18:32:0:0:17:33:0:0
chr9	7798518	.	G	C	1283.27	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5763;QD=61.8445;RBI=0.0939354;REFB=0;REVB=0.0774776;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000609456;OID=.;OPOS=7798518;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:37:46:0:0:37:46:0:0
chr9	7799606	.	C	A	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.665;QD=57.2026;RBI=0.0442526;REFB=0;REVB=0.0157838;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.34819e-05;OID=.;OPOS=7799606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:20:10:0:0:20:10:0:0
chr9	7799653	.	G	T	375.0	PASS	AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0368231;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=151.833;QD=49.9996;RBI=0.0433323;REFB=-0.133904;REVB=0.0228418;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502391;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.00122665;OID=.;OPOS=7799653;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:30:30:0:2:28:28:0.933333:15:13:0:0:15:13:1:1
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chr9	8465598	.	A	G	1246.24	PASS	AF=0.627119;AO=110;DP=176;FAO=111;FDP=177;FR=.;FRO=66;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=0.0413124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.453;QD=28.1637;RBI=0.041387;REFB=-0.00435521;REVB=0.00248376;RO=66;SAF=54;SAR=56;SRF=42;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100902;STB=0.552472;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00253848;OID=.;OPOS=8465598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:177:66:66:110:111:0.627119:56:54:42:24:56:55:42:24
chr9	8486482	.	T	C	346.6	PASS	AF=0.394231;AO=41;DP=104;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=43;FSRR=20;FWDB=0.0116046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.944;QD=13.3309;RBI=0.011833;REFB=-0.00497602;REVB=-0.00231357;RO=62;SAF=29;SAR=12;SRF=42;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375796;STB=0.517848;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.00976459;OID=.;OPOS=8486482;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:62:63:41:41:0.394231:12:29:42:20:12:29:43:20
chr9	8518143	.	T	C	638.1	PASS	AF=0.427711;AO=71;DP=166;FAO=71;FDP=166;FR=.;FRO=95;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=61;FSRR=34;FWDB=0.0474612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.888;QD=15.3758;RBI=0.0477078;REFB=-0.0264775;REVB=-0.00484466;RO=92;SAF=30;SAR=41;SRF=59;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21871;STB=0.623775;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0241742;OID=.;OPOS=8518143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:166:92:95:71:71:0.427711:41:30:59:33:41:30:61:34
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chr9	12821998	.	T	A	113.0	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0229481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.826;QD=18.8335;RBI=0.0335273;REFB=-0.0212874;REVB=0.0244432;RO=11;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00564475;STB=0.503221;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0179753;OID=.;OPOS=12821998;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:11:11:13:13:0.541667:6:7:6:5:6:7:6:5
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chr9	13112116	.	A	G	2372.29	PASS	AF=0.9875;AO=156;DP=159;FAO=158;FDP=160;FR=.;FRO=2;FSAF=98;FSAR=60;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0260803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.875;QD=59.3073;RBI=0.037002;REFB=-0.110419;REVB=-0.0262481;RO=2;SAF=97;SAR=59;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00970758;STB=0.50505;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00127099;OID=.;OPOS=13112116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:159:160:2:2:156:158:0.9875:59:97:2:0:60:98:2:0
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chr9	14086768	.	TG	GT,TGT,TT	31.16	PASS	AF=0.030303,0.181818,0.030303;AO=2,5,3;DP=41;FAO=1,6,1;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=0,1,0;FSAR=1,5,1;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.15535,-0.267871,-0.0313674;FXX=0.174956;HRUN=2,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=25.228,14.7515,192.523;QD=3.77756;RBI=0.160995,0.269656,0.0322721;REFB=-0.0220134,-0.0237363,-0.000918611;REVB=-0.0422598,0.0309753,0.0075879;RO=29;SAF=0,3,1;SAR=2,2,2;SRF=21;SRR=8;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.586032,-0.162317,-0.401163;STB=0.994655,0.899876,0.994655;STBP=0.155,0.127,0.155;TYPE=mnp,ins,snp;VARB=0.0504677,0.022328,0.0621971;OID=.,.,.;OPOS=14086768,14086770,14086769;OREF=TG,-,G;OALT=GT,T,T;OMAPALT=GT,TGT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:24:41:33:29:25:2,5,3:1,6,1:0.030303,0.181818,0.030303:2,2,2:0,3,1:21:8:1,5,1:0,1,0:19:6
chr9	14087769	.	C	T	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.694;QD=58.1402;RBI=0.0471205;REFB=0;REVB=0.0420786;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382883;OID=.;OPOS=14087769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:11:21:0:0:11:21:0:0
chr9	14618856	.	C	T	242.96	PASS	AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.015281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9584;QD=22.6009;RBI=0.0450436;REFB=-0.0139693;REVB=-0.0423723;RO=20;SAF=12;SAR=11;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142272;STB=0.579409;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00896049;OID=.;OPOS=14618856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:11:12:7:13:11:12:7:13
chr9	14737506	.	T	G	901.49	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0599934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3204;QD=58.1606;RBI=0.0847798;REFB=0;REVB=-0.0599032;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116706;OID=.;OPOS=14737506;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:31:31:0:0:31:31:0:0
chr9	14775853	.	A	G	1196.45	PASS	AF=1;AO=77;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0371749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8118;QD=60.5795;RBI=0.0377098;REFB=0;REVB=-0.00632906;RO=0;SAF=27;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.12936e-05;OID=.;OPOS=14775853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:77:79:1:50:27:0:0:50:29:0:0
chr9	14801769	.	C	T	260.07	PASS	AF=0.326733;AO=33;DP=101;FAO=33;FDP=101;FR=.;FRO=68;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=0.0634374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.4504;QD=10.2998;RBI=0.12646;REFB=0.00178421;REVB=-0.109397;RO=67;SAF=20;SAR=13;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132391;STB=0.572428;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=-0.00894278;OID=.;OPOS=14801769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:67:68:33:33:0.326733:13:20:33:34:13:20:34:34
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chr9	15188106	.	T	C	1286.67	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180294;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.35;QD=62.0082;RBI=0.0273825;REFB=0;REVB=0.0206093;RO=0;SAF=58;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.59981e-05;OID=.;OPOS=15188106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:25:58:0:0:25:58:0:0
chr9	15591372	.	T	A	196.26	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0100688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.748;QD=17.0659;RBI=0.0237107;REFB=-0.0131817;REVB=-0.0214667;RO=25;SAF=12;SAR=8;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230941;STB=0.62057;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0134578;OID=.;OPOS=15591372;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:25:26:20:20:0.434783:8:12:9:16:8:12:10:16
chr9	15744683	.	G	A	287.6	PASS	AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0122993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.714;QD=15.9779;RBI=0.0358804;REFB=-0.007102;REVB=-0.0337065;RO=40;SAF=13;SAR=19;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691267;STB=0.538983;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0189456;OID=.;OPOS=15744683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:40:40:32:32:0.444444:19:13:19:21:19:13:19:21
chr9	15784631	.	A	G	270.04	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00385621;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.268;QD=22.9824;RBI=0.0177893;REFB=-0.014394;REVB=0.0173663;RO=22;SAF=14;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885669;STB=0.549448;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.011878;OID=.;OPOS=15784631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:11:14:10:12:11:14:10:12
chr9	15922137	.	A	G	1026.38	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.841;QD=59.5001;RBI=0.0608552;REFB=0;REVB=0.0539874;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.33946e-05;OID=.;OPOS=15922137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:35:34:0:0:35:34:0:0
chr9	16410956	.	G	C	137.42	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0297235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.501;QD=21.9875;RBI=0.0316729;REFB=-0.0777876;REVB=0.0109402;RO=10;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013628;STB=0.5078;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0453063;OID=.;OPOS=16410956;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:25:25:10:10:12:12:0.48:5:7:6:4:5:7:6:4
chr9	16411463	.	G	T	205.38	PASS	AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0619324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9605;QD=12.8359;RBI=0.0673642;REFB=-0.069427;REVB=-0.0265012;RO=39;SAF=16;SAR=9;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112384;STB=0.564653;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0429928;OID=.;OPOS=16411463;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:39:39:25:25:0.390625:9:16:21:18:9:16:21:18
chr9	16417431	.	G	A	1524.76	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.272;QD=59.7944;RBI=0.0176409;REFB=0;REVB=-0.0132111;RO=0;SAF=46;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.60912e-05;OID=.;OPOS=16417431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:56:46:0:0:56:46:0:0
chr9	16418078	.	TTA	T,TAA,TTT,TTTAA	64.02	PASS	AF=0.116279,0,0,0.186047;AO=7,4,4,5;DP=50;FAO=5,0,0,8;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=3,0,0,4;FSAR=2,0,0,4;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.077557,-0.129609,0.129662,0.0909049;FXX=0.0444346;HRUN=8,8,6,8;LEN=2,1,1,2;MLLD=20.5531,14.8663,13.0989,19.3891;QD=5.95528;RBI=0.112082,0.176594,0.167657,0.108103;REFB=-0.0346836,0.00260366,-0.00296251,0.0299012;REVB=-0.0809153,0.119945,-0.106286,0.0585022;RO=25;SAF=2,4,0,3;SAR=5,0,4,2;SRF=16;SRR=9;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.404629,0.580471,-0.680375,-0.0495746;STB=0.613186,0.5,0.5,0.52625;STBP=0.642,1,1,0.914;TYPE=del,snp,snp,ins;VARB=0.157212,0,0,0.061251;OID=.,.,.,.;OPOS=16418079,16418079,16418080,16418080;OREF=TA,T,A,-;OALT=-,A,T,TA;OMAPALT=T,TAA,TTT,TTTAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/4:0.116279,0,0,0.186047:7,4,4,5:50:5,0,0,8:43:30:3,0,0,4:2,0,0,4:14:16:42:25:2,4,0,3:5,0,4,2:16:9
chr9	16418440	.	TGGCCCCTCAA	T	67.34	PASS	AF=0.285714;AO=14;DP=51;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0188902;FXX=0.039208;HRUN=2;LEN=10;MLLD=302.098;QD=5.49738;RBI=0.0546697;REFB=-0.00843264;REVB=-0.0513024;RO=33;SAF=12;SAR=2;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.349742;STB=0.743778;STBP=0.064;TYPE=del;VARB=0.02017;OID=.;OPOS=16418441;OREF=GGCCCCTCAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.285714:14:51:14:49:35:12:2:21:14:67:33:12:2:21:12
chr9	16685539	.	T	C	350.58	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00359067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5074;QD=53.9352;RBI=0.0275727;REFB=0;REVB=0.0273379;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00248601;OID=.;OPOS=16685539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:10:14:0:0:11:15:0:0
chr9	17001122	.	C	A	1476.11	PASS	AF=0.989474;AO=92;DP=93;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0296402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3847;QD=62.1522;RBI=0.029648;REFB=0.00473417;REVB=0.000676581;RO=1;SAF=57;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013351;STB=0.507041;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=4.1213e-05;OID=.;OPOS=17001122;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:95:1:1:92:94:0.989474:35:57:0:1:35:59:0:1
chr9	17001200	.	C	A	2178.12	PASS	AF=1;AO=137;DP=137;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032599;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.847;QD=63.134;RBI=0.0350839;REFB=0;REVB=0.0129686;RO=0;SAF=81;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64187e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.40017e-05;OID=.;OPOS=17001200;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:137:138:0:0:137:138:1:56:81:0:0:57:81:0:0
chr9	17001216	.	A	C	2030.07	PASS	AF=0.992424;AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=132;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0421986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.705;QD=61.5171;RBI=0.0488927;REFB=-0.101508;REVB=0.0246937;RO=0;SAF=80;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15683e-08;STB=0.504854;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00021488;OID=.;OPOS=17001216;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:132:132:0:1:131:131:0.992424:51:80:0:0:51:80:0:1
chr9	17053994	.	G	A	295.74	PASS	AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0379159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.263;QD=22.3198;RBI=0.0416405;REFB=-0.0308378;REVB=-0.0172138;RO=23;SAF=15;SAR=15;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0511513;STB=0.528283;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0341699;OID=.;OPOS=17053994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:23:23:30:30:0.566038:15:15:13:10:15:15:13:10
chr9	17054142	.	A	G	280.39	PASS	AF=0.534483;AO=28;DP=56;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0026812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0458;QD=19.3372;RBI=0.0364775;REFB=-0.00767862;REVB=0.0363789;RO=27;SAF=14;SAR=14;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813953;STB=0.550467;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.010695;OID=.;OPOS=17054142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:27:27:28:31:0.534483:14:14:11:16:15:16:11:16
chr9	17273731	.	A	G	74.25	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00582775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.767;QD=10.2408;RBI=0.00763963;REFB=0.00463113;REVB=0.00493977;RO=19;SAF=8;SAR=2;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288731;STB=0.677571;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.00633515;OID=.;OPOS=17273731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:2:8:11:8:2:8:11:8
chr9	17273754	.	A	C	157.17	PASS	AF=0.425;AO=15;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00260268;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.327;QD=15.7165;RBI=0.0331513;REFB=-0.0157901;REVB=0.033049;RO=22;SAF=10;SAR=5;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175409;STB=0.503222;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0161548;OID=.;OPOS=17273754;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:23:15:17:0.425:5:10:15:7:6:11:15:8
chr9	17342383	.	C	T	867.19	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.297;QD=57.8124;RBI=0.0180131;REFB=0;REVB=-0.00319877;RO=0;SAF=45;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.13682e-05;OID=.;OPOS=17342383;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:15:45:0:0:15:45:0:0
chr9	17394536	.	C	T	142.36	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.476;QD=43.8038;RBI=0.0161387;REFB=0;REVB=-0.00803241;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000584791;OID=.;OPOS=17394536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:4:8:0:0:4:9:0:0
chr9	17394996	.	T	C	1447.59	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00118529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.592;QD=62.9389;RBI=0.0414559;REFB=0;REVB=0.0414389;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.75125e-05;OID=.;OPOS=17394996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:44:47:0:0:45:47:0:0
chr9	17409366	.	G	A	1135.24	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00708167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.587;QD=60.5464;RBI=0.0124896;REFB=0;REVB=0.0102878;RO=0;SAF=32;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.80897e-06;OID=.;OPOS=17409366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:43:32:0:0:43:32:0:0
chr9	18504916	.	T	A	752.97	PASS	AF=1;AO=41;DP=47;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370649;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.051;QD=56.8281;RBI=0.0430862;REFB=0;REVB=0.0219684;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000790422;OID=.;OPOS=18504916;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:53:0:0:41:53:1:19:22:0:0:25:28:0:0
chr9	18504917	.	G	A	37.44	PASS	AF=0.125;AO=6;DP=55;FAO=7;FDP=56;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0345122;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.0777;QD=2.67409;RBI=0.0349357;REFB=0.000119664;REVB=-0.00542311;RO=49;SAF=6;SAR=0;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.641023;STB=0.856124;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=-0.000501462;OID=.;OPOS=18504917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:55:56:49:49:6:7:0.125:0:6:22:27:1:6:22:27
chr9	18651156	.	C	T	766.75	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00154253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.626;QD=63.8959;RBI=0.0492561;REFB=0;REVB=0.0492319;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000303409;OID=.;OPOS=18651156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:46:48:1:16:30:0:0:18:30:0:0
chr9	18651282	.	A	G	817.69	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.622;QD=57.3816;RBI=0.0339759;REFB=0;REVB=0.0163792;RO=0;SAF=37;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146867;OID=.;OPOS=18651282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:20:37:0:0:20:37:0:0
chr9	18775810	.	C	A	1281.49	PASS	AF=0.955556;AO=86;DP=91;FAO=86;FDP=90;FR=.;FRO=4;FSAF=52;FSAR=34;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0520062;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.826;QD=56.9552;RBI=0.0557591;REFB=-0.10011;REVB=0.0201107;RO=2;SAF=52;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178726;STB=0.518514;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00276031;OID=.;OPOS=18775810;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:91:90:2:4:86:86:0.955556:34:52:2:0:34:52:4:0
chr9	18776840	.	A	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.56;QD=60.61;RBI=0.0190272;REFB=0;REVB=0.011875;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.41634e-05;OID=.;OPOS=18776840;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0
chr9	18777196	.	A	C	246.84	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.0284565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.748;QD=17.9522;RBI=0.0340022;REFB=-0.0134471;REVB=-0.0186112;RO=28;SAF=18;SAR=9;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252599;STB=0.641868;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0183888;OID=.;OPOS=18777196;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:9:18:11:17:9:18:11:17
chr9	18777368	.	T	C	1039.07	PASS	AF=0.986111;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0460005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0064;QD=57.7258;RBI=0.0467687;REFB=-0.0920004;REVB=-0.00844188;RO=0;SAF=45;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509431;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00584814;OID=.;OPOS=18777368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:0:1:70:71:0.986111:25:45:0:0:26:45:0:1
chr9	18777422	.	G	A	473.63	PASS	AF=0.472222;AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=-0.00522211;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.573;QD=17.5418;RBI=0.0166579;REFB=-0.00532917;REVB=0.0158181;RO=56;SAF=29;SAR=22;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0721665;STB=0.534167;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00419119;OID=.;OPOS=18777422;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:108:56:57:51:51:0.472222:22:29:36:20:22:29:36:21
chr9	18950787	.	G	A	315.1	PASS	AF=0.288591;AO=42;DP=151;FAO=43;FDP=149;FR=.,HEALED;FRO=106;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=54;FSRR=52;FWDB=-0.0683724;FXX=0.0197355;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0519;QD=8.45918;RBI=0.0684865;REFB=-0.00266783;REVB=0.00395044;RO=74;SAF=19;SAR=23;SRF=27;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0997835;STB=0.531528;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.00459402;OID=.;OPOS=18950787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:149:74:106:42:43:0.288591:23:19:27:47:23:20:54:52
chr9	18950895	.	T	C	502.73	PASS	AF=0.388158;AO=59;DP=153;FAO=59;FDP=152;FR=.;FRO=93;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=50;FWDB=0.00924602;FXX=0.00653552;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.892;QD=13.2298;RBI=0.00945826;REFB=-0.0176468;REVB=-0.00199239;RO=88;SAF=37;SAR=22;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196928;STB=0.602135;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0324273;OID=.;OPOS=18950895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:152:88:93:59:59:0.388158:22:37:39:49:22:37:43:50
chr9	19056147	.	T	TA	297.81	PASS	AF=0.52381;AO=42;DP=90;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.00121244;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.7153;QD=14.1816;RBI=0.112941;REFB=-0.0605124;REVB=-0.112934;RO=48;SAF=20;SAR=22;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227657;STB=0.511899;STBP=0.818;TYPE=ins;VARB=0.0487902;OID=.;OPOS=19056148;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.52381:42:90:44:84:40:22:22:19:21:99:48:20:22:24:24
chr9	19063108	.	T	C	226.97	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00169011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.62;QD=15.6534;RBI=0.00583424;REFB=-0.0115007;REVB=-0.00558407;RO=31;SAF=13;SAR=13;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776654;STB=0.551685;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0173266;OID=.;OPOS=19063108;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:32:26:26:0.448276:13:13:18:13:13:13:19:13
chr9	19076673	.	G	C	107.32	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00459348;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=302.43;QD=22.5934;RBI=0.00650671;REFB=-0.00777341;REVB=0.00460839;RO=7;SAF=9;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238292;STB=0.63612;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00438287;OID=.;OPOS=19076673;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:19:19:7:7:12:12:0.631579:3:9:3:4:3:9:3:4
chr9	19087154	.	T	C	202.0	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0989897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.318;QD=21.2631;RBI=0.100391;REFB=-0.00984416;REVB=-0.0167168;RO=18;SAF=10;SAR=10;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0936166;STB=0.552579;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0119743;OID=.;OPOS=19087154;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:10:10:7:11:10:10:7:11
chr9	19126281	.	C	T	304.79	PASS	AF=0.485294;AO=25;DP=69;FAO=33;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=0.0167506;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.203;QD=17.9285;RBI=0.0171349;REFB=-0.0204499;REVB=0.00360884;RO=26;SAF=10;SAR=15;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194598;STB=0.641056;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0207732;OID=.;OPOS=19126281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:26:34:25:33:0.485294:15:10:16:10:20:13:23:11
chr9	19434980	.	C	T	912.76	PASS	AF=0.520231;AO=90;DP=174;FAO=90;FDP=173;FR=.;FRO=83;FSAF=54;FSAR=36;FSRF=46;FSRR=37;FWDB=-0.0269073;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.079;QD=21.1043;RBI=0.0307135;REFB=-0.015213;REVB=0.0148095;RO=82;SAF=54;SAR=36;SRF=45;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459199;STB=0.522668;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0177738;OID=.;OPOS=19434980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:173:82:83:90:90:0.520231:36:54:45:37:36:54:46:37
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chr9	19492914	.	GGTGGTCTACCA	G,GGTGGTTTACCA	151.89	PASS	AF=0.3,0;AO=19,3;DP=72;FAO=21,0;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=10,0;FSAR=11,0;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=-0.0102544,0.0137201;FXX=0.0410903;HRUN=2,1;LEN=11,1;MLLD=289.376,153.936;QD=8.67967;RBI=0.0289053,0.0483115;REFB=-0.00900505,-0.00500769;REVB=-0.0270252,-0.0463224;RO=42;SAF=10,2;SAR=9,1;SRF=28;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.166061,0;STB=0.62253,0.5;STBP=0.188,1;TYPE=del,snp;VARB=0.020194,0;OID=.,.;OPOS=19492915,19492920;OREF=GTGGTCTACCA,C;OALT=-,T;OMAPALT=G,GGTGGTTTACCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.3,0:19,3:72:21,0:70:49:10,0:11,0:32:17:99:42:10,2:9,1:28:14
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chr9	19786217	.	G	A	593.88	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0629432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2412;QD=60.9104;RBI=0.122818;REFB=0;REVB=-0.105463;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00245439;OID=.;OPOS=19786217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr9	20418323	.	T	C	238.22	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=-0.0021493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.915;QD=20.2743;RBI=0.00228055;REFB=-0.0238231;REVB=0.000762523;RO=24;SAF=9;SAR=14;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139813;STB=0.578249;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0247448;OID=.;OPOS=20418323;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:14:9:6:18:14:9:6:18
chr9	20866974	.	C	G	1138.52	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126703;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5799;QD=60.7208;RBI=0.0134256;REFB=0;REVB=-0.00443985;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.24091e-05;OID=.;OPOS=20866974;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:44:31:0:0:44:31:0:0
chr9	20953049	.	A	G	254.68	PASS	AF=0.394737;AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.057046;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.736;QD=13.4042;RBI=0.0588397;REFB=-0.0137317;REVB=-0.0144176;RO=46;SAF=18;SAR=12;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130283;STB=0.574418;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0317044;OID=.;OPOS=20953049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:46:46:30:30:0.394737:12:18:22:24:12:18:22:24
chr9	20988426	.	A	G	765.47	PASS	AF=0.949153;AO=56;DP=59;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00273903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.365;QD=51.8961;RBI=0.006491;REFB=-0.20443;REVB=-0.0058848;RO=3;SAF=21;SAR=35;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295398;STB=0.515689;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.000323338;OID=.;OPOS=20988426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:59:59:3:3:56:56:0.949153:35:21:2:1:35:21:2:1
chr9	21029330	.	T	C	74.71	PASS	AF=0.263158;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0144385;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.293;QD=7.86457;RBI=0.0212737;REFB=-0.00800888;REVB=0.0156237;RO=24;SAF=3;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282276;STB=0.721217;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0369823;OID=.;OPOS=21029330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:39:38:24:28:10:10:0.263158:7:3:13:11:7:3:17:11
chr9	21077716	.	G	A	322.53	PASS	AF=0.607843;AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=51;FR=.;FRO=20;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0102188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.357;QD=25.2968;RBI=0.0119582;REFB=-0.0480746;REVB=-0.00621079;RO=20;SAF=19;SAR=12;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466514;STB=0.525675;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0323685;OID=.;OPOS=21077716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:20:20:31:31:0.607843:12:19:11:9:12:19:11:9
chr9	21141810	.	G	A	392.38	PASS	AF=0.487805;AO=40;DP=83;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0108379;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.73;QD=19.1404;RBI=0.0157924;REFB=-0.0115992;REVB=0.0114864;RO=42;SAF=24;SAR=16;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071781;STB=0.53998;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0100557;OID=.;OPOS=21141810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:42:42:40:40:0.487805:16:24:22:20:16:24:22:20
chr9	21166077	.	T	C	310.16	PASS	AF=0.627907;AO=27;DP=43;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0249628;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=310.952;QD=28.8522;RBI=0.0249661;REFB=-0.00397691;REVB=-0.000404179;RO=16;SAF=10;SAR=17;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215395;STB=0.618629;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.00140394;OID=.;OPOS=21166077;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:16:16:27:27:0.627907:17:10:11:5:17:10:11:5
chr9	21187121	.	T	A	229.58	PASS	AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.00836593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.277;QD=22.3977;RBI=0.00841659;REFB=-0.013516;REVB=0.000922082;RO=19;SAF=14;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138884;STB=0.577909;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00663798;OID=.;OPOS=21187121;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:8:14:9:10:8:14:9:10
chr9	21187311	.	C	T	1451.82	PASS	AF=0.969072;AO=94;DP=97;FAO=94;FDP=97;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=57;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0135249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.864;QD=59.8687;RBI=0.0305334;REFB=-0.063421;REVB=0.0273745;RO=3;SAF=37;SAR=57;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166938;STB=0.50881;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.000585076;OID=.;OPOS=21187311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:97:97:3:3:94:94:0.969072:57:37:2:1:57:37:2:1
chr9	21201703	.	T	C	465.61	PASS	AF=0.47619;AO=50;DP=105;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.00235467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.19;QD=17.7375;RBI=0.0117009;REFB=-0.017669;REVB=0.0114615;RO=55;SAF=33;SAR=17;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199858;STB=0.611306;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0115115;OID=.;OPOS=21201703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:55:55:50:50:0.47619:17:33:25:30:17:33:25:30
chr9	21206763	.	G	T	281.99	PASS	AF=0.357895;AO=33;DP=94;FAO=34;FDP=95;FR=.;FRO=61;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=41;FWDB=0.00847548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4709;QD=11.8732;RBI=0.00853224;REFB=-0.0285637;REVB=-0.000982531;RO=61;SAF=12;SAR=21;SRF=20;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441558;STB=0.517798;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0331092;OID=.;OPOS=21206763;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:61:61:33:34:0.357895:21:12:20:41:22:12:20:41
chr9	21207000	.	C	G	566.62	PASS	AF=0.974359;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0101863;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.236;QD=58.1152;RBI=0.0235768;REFB=-0.151714;REVB=0.0212627;RO=1;SAF=28;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0492024;STB=0.523797;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.000823328;OID=.;OPOS=21207000;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:38:39:1:1:37:38:0.974359:9:28:0:1:10:28:0:1
chr9	21207005	.	C	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.436;QD=59.4356;RBI=0.0835362;REFB=0;REVB=0.0798361;RO=0;SAF=26;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201341;OID=.;OPOS=21207005;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:9:26:0:0:9:26:0:0
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chr9	21207037	.	A	T	575.78	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0659158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.019;QD=60.6085;RBI=0.0756399;REFB=0;REVB=0.0371012;RO=0;SAF=27;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000368582;OID=.;OPOS=21207037;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:10:27:0:0:10:28:0:0
chr9	21227622	.	A	C,T	575.03	PASS	AF=0.875,0.1;AO=34,4;DP=39;FAO=35,4;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=11,4;FSAR=24,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0229924,0.000592079;FXX=0.0697512;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=85.9651,184.833;QD=57.5025;RBI=0.0506995,0.0249604;REFB=-0.110237,-0.011292;REVB=0.0451861,0.0249534;RO=1;SAF=11,4;SAR=23,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0198968,0.749895;STB=0.510198,0.995941;STBP=0.61,0.099;TYPE=snp,snp;VARB=0.0160326,0.0567915;OID=.,.;OPOS=21227622,21227622;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:39:40:1:1:34,4:35,4:0.875,0.1:23,0:11,4:0:1:24,0:11,4:0:1
chr9	21227651	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0502616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.023;QD=53.2772;RBI=0.0608777;REFB=0;REVB=0.0343493;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120702;OID=.;OPOS=21227651;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0
chr9	21227942	.	G	T	1399.34	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187683;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4646;QD=62.8915;RBI=0.0211891;REFB=0;REVB=0.00983519;RO=0;SAF=48;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.99698e-05;OID=.;OPOS=21227942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:89:0:0:89:89:1:41:48:0:0:41:48:0:0
chr9	21228040	.	C	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.321;QD=60.2307;RBI=0.03169;REFB=0;REVB=0.0243627;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.64671e-05;OID=.;OPOS=21228040;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0
chr9	21228182	.	GC	TG	1389.35	PASS	AF=1;AO=82;DP=90;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349107;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=2;MLLD=223.331;QD=58.4991;RBI=0.106193;REFB=0;REVB=0.100291;RO=0;SAF=39;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000325509;OID=.;OPOS=21228182;OREF=GC;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:95:0:0:82:95:1:43:39:0:0:47:48:0:0
chr9	21304803	.	G	A	264.5	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0165156;FXX=0.0163908;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.094;QD=17.6333;RBI=0.0165156;REFB=-0.0285291;REVB=-1.64106e-06;RO=31;SAF=18;SAR=11;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241134;STB=0.513504;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0321492;OID=.;OPOS=21304803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:31:31:29:29:0.483333:11:18:20:11:11:18:20:11
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chr9	21481556	.	T	G	123.09	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0223831;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.13;QD=16.4125;RBI=0.0252642;REFB=-0.0343816;REVB=0.0117166;RO=16;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236183;STB=0.635327;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0315322;OID=.;OPOS=21481556;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:8:6:11:5:8:6:11:5
chr9	21482089	.	G	A	170.88	PASS	AF=0.423077;AO=18;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.0115395;FXX=0.0714158;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.36;QD=13.1447;RBI=0.0311565;REFB=0.00759816;REVB=0.0289408;RO=24;SAF=11;SAR=7;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590993;STB=0.519067;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=-0.00981177;OID=.;OPOS=21482089;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:30:18:22:0.423077:7:11:16:8:8:14:20:10
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chr9	21968199	.	C	G	1116.18	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329974;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1864;QD=60.334;RBI=0.036157;REFB=0;REVB=-0.0147819;RO=0;SAF=52;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53902e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00037183;OID=.;OPOS=21968199;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:22:52:0:0:22:52:0:0
chr9	22029445	.	G	A	753.47	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00405792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.351;QD=56.8654;RBI=0.0180455;REFB=0;REVB=-0.0175834;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.24563e-05;OID=.;OPOS=22029445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr9	22447655	.	T	A	291.85	PASS	AF=0.540984;AO=30;DP=63;FAO=33;FDP=61;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0231574;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.672;QD=19.1378;RBI=0.0263056;REFB=-0.0389713;REVB=0.0124787;RO=27;SAF=12;SAR=18;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164446;STB=0.597501;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0245204;OID=.;OPOS=22447655;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:61:27:28:30:33:0.540984:18:12:16:11:21:12:16:12
chr9	24545513	.	G	A	1190.1	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313644;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=130.971;QD=61.0308;RBI=0.0484963;REFB=0;REVB=0.0369887;RO=0;SAF=55;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11101e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.12056e-05;OID=.;OPOS=24545513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:23:55:0:0:23:55:0:0
chr9	24905556	.	A	G	1607.11	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174966;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.76;QD=64.2843;RBI=0.018038;REFB=0;REVB=0.00438619;RO=0;SAF=47;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.34349e-05;OID=.;OPOS=24905556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:52:47:0:0:52:48:0:0
chr9	24905678	.	C	A	191.63	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=0.00188836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.806;QD=15.643;RBI=0.010162;REFB=-0.00544875;REVB=-0.00998496;RO=29;SAF=10;SAR=10;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30621;STB=0.673317;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.00805239;OID=.;OPOS=24905678;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:10:10:6:23:10:10:6:23
chr9	25678640	.	T	A	732.76	PASS	AF=1;AO=51;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.261632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.645;QD=55.3028;RBI=0.264104;REFB=0;REVB=0.0360542;RO=1;SAF=31;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149495;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000867039;OID=.;OPOS=25678640;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:1:0:51:53:1:20:31:1:0:20:33:0:0
chr9	26116150	.	G	T	255.99	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.668;QD=51.1973;RBI=0.0393593;REFB=0;REVB=0.0220394;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171365;OID=.;OPOS=26116150;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:11:8:0:0:12:8:0:0
chr9	26892654	.	G	A	675.75	PASS	AF=0.977778;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0258444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.836;QD=60.0665;RBI=0.0807261;REFB=0.04854;REVB=0.0764772;RO=1;SAF=31;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149113;STB=0.507689;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=-4.40959e-05;OID=.;OPOS=26892654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:45:1:1:43:44:0.977778:12:31:1:0:12:32:1:0
chr9	26895808	.	A	G	769.49	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.019;QD=56.9992;RBI=0.0112197;REFB=0;REVB=-0.00373735;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.04756e-05;OID=.;OPOS=26895808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:22:32:0:0:22:32:0:0
chr9	26978170	.	A	G	1357.5	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.317;QD=61.7046;RBI=0.0296114;REFB=0;REVB=0.0273705;RO=0;SAF=52;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.87052e-05;OID=.;OPOS=26978170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:88:0:0:83:88:1:31:52:0:0:36:52:0:0
chr9	26978259	.	A	G	739.17	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0112181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.481;QD=54.7532;RBI=0.0166373;REFB=-0.0500222;REVB=0.0122863;RO=0;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19417e-08;STB=0.51428;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.000127813;OID=.;OPOS=26978259;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:0:1:53:53:0.981481:17:36:0:0:17:36:0:1
chr9	27183463	.	A	C	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00196857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.782;QD=60.9776;RBI=0.0118296;REFB=0;REVB=0.0116646;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.92148e-05;OID=.;OPOS=27183463;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr9	27220066	.	G	A	286.37	PASS	AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0302355;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1888;QD=15.6913;RBI=0.0392837;REFB=-0.00232806;REVB=-0.0250804;RO=41;SAF=14;SAR=18;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0987453;STB=0.555711;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.00298982;OID=.;OPOS=27220066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:18:14:22:19:18:14:22:19
chr9	27296705	.	A	G	288.86	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0347536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.19;QD=21.0077;RBI=0.0385673;REFB=-0.0048566;REVB=0.0167219;RO=24;SAF=5;SAR=25;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.465404;STB=0.769032;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00350713;OID=.;OPOS=27296705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:25:30:30:0.545455:25:5:16:8:25:5:17:8
chr9	27328886	.	C	A	740.92	PASS	AF=0.521429;AO=61;DP=129;FAO=73;FDP=140;FR=.;FRO=67;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=0.0245536;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.652;QD=21.1692;RBI=0.0246023;REFB=-0.0140209;REVB=-0.00154765;RO=65;SAF=33;SAR=28;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102468;STB=0.575029;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0126652;OID=.;OPOS=27328886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:140:65:67:61:73:0.521429:28:33:28:37:29:44:30:37
chr9	27328964	.	C	T	3004.6	PASS	AF=1;AO=186;DP=187;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00458408;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.68;QD=63.5894;RBI=0.0128225;REFB=0;REVB=0.0119751;RO=0;SAF=84;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.0248e-05;OID=.;OPOS=27328964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:187:189:0:0:186:189:1:102:84:0:0:104:85:0:0
chr9	27378301	.	A	G	58.6	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00746162;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.942;QD=11.1621;RBI=0.033261;REFB=-0.00644744;REVB=0.0324133;RO=13;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442988;STB=0.776954;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0105578;OID=.;OPOS=27378301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:21:21:13:13:8:8:0.380952:1:7:7:6:1:7:7:6
chr9	27524731	.	A	G	947.75	PASS	AF=1;AO=54;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00380904;FXX=0.0302984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7379;QD=59.234;RBI=0.113972;REFB=0;REVB=0.113908;RO=1;SAF=24;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192307;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000907182;OID=.;OPOS=27524731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:1:0:54:64:1:30:24:1:0:40:24:0:0
chr9	32069857	.	T	G	538.45	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1607;QD=59.8275;RBI=0.0228867;REFB=0;REVB=-0.00296764;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328458;OID=.;OPOS=32069857;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0
chr9	32425910	.	A	G	749.12	PASS	AF=0.484472;AO=78;DP=163;FAO=78;FDP=161;FR=.;FRO=83;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=53;FSRR=30;FWDB=0.0119906;FXX=0.0122692;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.8819;QD=18.6117;RBI=0.012664;REFB=-0.0116129;REVB=0.00407466;RO=82;SAF=46;SAR=32;SRF=52;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430145;STB=0.526239;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0163641;OID=.;OPOS=32425910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:161:82:83:78:78:0.484472:32:46:52:30:32:46:53:30
chr9	32436014	.	A	G	386.86	PASS	AF=0.575758;AO=36;DP=67;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=30;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0326701;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.993;QD=23.4462;RBI=0.0327708;REFB=-0.00938953;REVB=0.00256677;RO=26;SAF=28;SAR=8;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225325;STB=0.619766;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00491165;OID=.;OPOS=32436014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:26:28:36:38:0.575758:8:28:14:12:8:30:16:12
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chr9	32498291	.	A	G	750.54	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00540761;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.583;QD=63.876;RBI=0.0429928;REFB=0;REVB=0.0426514;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.69651e-05;OID=.;OPOS=32498291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:16:30:0:0:16:31:0:0
chr9	32526146	.	G	A	82.18	PASS	AF=0.297297;AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0111871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.942;QD=8.88421;RBI=0.105733;REFB=-0.00661549;REVB=0.105139;RO=26;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0080845;STB=0.504942;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0173526;OID=.;OPOS=32526146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:37:37:26:26:11:11:0.297297:5:6:14:12:5:6:14:12
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chr9	32785399	.	C	T	2434.41	PASS	AF=1;AO=157;DP=160;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00332268;FXX=0.0124216;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.927;QD=61.243;RBI=0.0471696;REFB=0;REVB=-0.0470524;RO=0;SAF=88;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47484e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136014;OID=.;OPOS=32785399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:160:159:0:0:157:159:1:69:88:0:0:71:88:0:0
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chr9	33062128	.	G	A	63.01	PASS	AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.019236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.874;QD=8.40175;RBI=0.029164;REFB=0.00102696;REVB=-0.0219206;RO=21;SAF=5;SAR=4;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182291;STB=0.511253;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=-0.00296137;OID=.;OPOS=33062128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:4:5:12:9:4:5:12:9
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chr9	33352826	.	C	A,CAAA	929.51	PASS	AF=0.046875,0.953125;AO=3,59;DP=77;FAO=3,61;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=0,24;FSAR=3,37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.048972,-0.0273597;FXX=0.085702;HRUN=1,0;LEN=1,3;MLLD=27.8506,173.728;QD=58.0944;RBI=0.0639599,0.0274062;REFB=0,0;REVB=-0.0411414,0.00159592;RO=12;SAF=1,23;SAR=2,36;SRF=8;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.350702,-0.0900373;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.150021,0.00135458;OID=.,.;OPOS=33352826,33352827;OREF=C,-;OALT=A,AAA;OMAPALT=A,CAAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:77:64:12:0:3,59:3,61:0.046875,0.953125:2,36:1,23:8:4:3,37:0,24:0:0
chr9	33385241	.	C	A	500.54	PASS	AF=0.945946;AO=34;DP=36;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.118872;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5168;QD=54.1126;RBI=0.119195;REFB=-0.133704;REVB=0.00876393;RO=2;SAF=16;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00306052;STB=0.500772;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.00844402;OID=.;OPOS=33385241;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:36:37:2:2:34:35:0.945946:18:16:1:1:18:17:1:1
chr9	33395196	.	A	G	272.54	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.791;QD=51.9122;RBI=0.0193004;REFB=0;REVB=0.0131325;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.25366e-06;OID=.;OPOS=33395196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:7:14:0:0:7:14:0:0
chr9	33442952	.	G	A	178.91	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.00234545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2737;QD=12.5548;RBI=0.0272992;REFB=-3.01437e-05;REVB=0.0271982;RO=35;SAF=12;SAR=10;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24348;STB=0.639378;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.000246909;OID=.;OPOS=33442952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:10:12:11:24:10:12:11:24
chr9	33461567	.	A	G	30.94	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00502988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.755;QD=12.3743;RBI=0.0585511;REFB=-0.0175202;REVB=0.0583347;RO=5;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20967;STB=0.630995;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0317892;OID=.;OPOS=33461567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:1:4:3:2:1:4:3:2
chr9	33461574	.	C	T	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00978778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.368;QD=18.886;RBI=0.00979312;REFB=0.00841005;REVB=0.000323193;RO=5;SAF=7;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2967;STB=0.676889;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=-0.00743028;OID=.;OPOS=33461574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:1:7:3:2:1:7:3:2
chr9	33466219	.	A	C	104.85	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0456719;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.834;QD=10.7536;RBI=0.0533205;REFB=-0.0170204;REVB=-0.0275163;RO=26;SAF=7;SAR=6;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0429136;STB=0.525652;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0387801;OID=.;OPOS=33466219;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:6:7:13:13:6:7:13:13
chr9	33524684	.	G	A	749.14	PASS	AF=1;AO=43;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.552;QD=56.5385;RBI=0.0532799;REFB=0;REVB=0.0491368;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000432611;OID=.;OPOS=33524684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:43:53:1:19:24:0:0:24:29:0:0
chr9	33566234	.	C	T	172.07	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0122958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.868;QD=18.1125;RBI=0.026851;REFB=-0.011485;REVB=-0.0238703;RO=20;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418177;STB=0.523783;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0126252;OID=.;OPOS=33566234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:10:8:8:12:10:8:8:12
chr9	33568789	.	T	G	322.38	PASS	AF=0.603774;AO=31;DP=57;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.019503;FXX=0.0701631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.438;QD=24.3308;RBI=0.0241504;REFB=-0.020112;REVB=0.0142434;RO=20;SAF=15;SAR=16;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0599977;STB=0.528284;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0108401;OID=.;OPOS=33568789;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:53:20:21:31:32:0.603774:16:15:8:12:16:16:9:12
chr9	33572347	.	T	C	206.29	PASS	AF=0.416667;AO=24;DP=59;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.0604117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.38;QD=13.7527;RBI=0.0604665;REFB=-0.00915999;REVB=-0.00257453;RO=35;SAF=14;SAR=10;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101927;STB=0.567513;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0168343;OID=.;OPOS=33572347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:35:35:24:25:0.416667:10:14:17:18:10:15:17:18
chr9	33618358	.	A	G	1335.98	PASS	AF=0.977528;AO=87;DP=90;FAO=87;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0382302;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.228;QD=60.044;RBI=0.0382678;REFB=-0.0414907;REVB=0.00169649;RO=1;SAF=44;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106475;STB=0.500129;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.000347034;OID=.;OPOS=33618358;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:90:89:1:2:87:87:0.977528:43:44:1:0:43:44:1:1
chr9	33618460	.	A	T	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.272;QD=59.4324;RBI=0.0499415;REFB=0;REVB=0.0232808;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270317;OID=.;OPOS=33618460;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:25:10:0:0:25:10:0:0
chr9	33618497	.	G	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0677208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.261;QD=55.6558;RBI=0.0679447;REFB=0;REVB=-0.00551163;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000805647;OID=.;OPOS=33618497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0
chr9	33624694	.	G	A	472.27	PASS	AF=0.444444;AO=52;DP=117;FAO=52;FDP=117;FR=.;FRO=65;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=41;FWDB=-0.0371793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.065;QD=16.1458;RBI=0.0895363;REFB=-0.00878257;REVB=-0.0814521;RO=64;SAF=23;SAR=29;SRF=24;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680786;STB=0.541525;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0261204;OID=.;OPOS=33624694;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:64:65:52:52:0.444444:29:23:24:40:29:23:24:41
chr9	33625185	.	C	T	1395.74	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=337.642;QD=62.7299;RBI=0.0399416;REFB=0;REVB=0.0157247;RO=0;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.8033e-05;OID=.;OPOS=33625185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:89:0:0:86:89:1:53:33:0:0:53:36:0:0
chr9	33662181	.	TCTGTAGCCCCAA	T	41.49	PASS	AF=0.162791;AO=7;DP=43;FAO=7;FDP=43;FR=.;FRO=36;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0149587;FXX=0;HRUN=1;LEN=12;MLLD=316.841;QD=3.85934;RBI=0.0157843;REFB=0.00494909;REVB=0.00503808;RO=31;SAF=2;SAR=5;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211004;STB=0.704108;STBP=0.28;TYPE=del;VARB=-0.0267731;OID=.;OPOS=33662182;OREF=CTGTAGCCCCAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.162791:7:43:7:43:36:2:5:19:17:41:31:2:5:14:17
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chr9	33675629	.	A	C	341.65	PASS	AF=0.303448;AO=43;DP=144;FAO=44;FDP=145;FR=.;FRO=101;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=42;FSRR=59;FWDB=0.00897869;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=324.296;QD=9.42477;RBI=0.0129128;REFB=0.000312361;REVB=-0.00928028;RO=100;SAF=23;SAR=20;SRF=42;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136737;STB=0.589512;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.000708735;OID=.;OPOS=33675629;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:145:100:101:43:44:0.303448:20:23:42:58:20:24:42:59
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chr9	33798075	.	T	C	48.72	PASS	AF=0.16;AO=8;DP=50;FAO=8;FDP=50;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=-0.0230985;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.927;QD=3.8978;RBI=0.0257376;REFB=-0.00223041;REVB=0.0113527;RO=42;SAF=7;SAR=1;SRF=30;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28866;STB=0.710304;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00975485;OID=.;OPOS=33798075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:50:50:42:42:8:8:0.16:1:7:30:12:1:7:30:12
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chr9	34311195	.	G	C	254.35	PASS	AF=0.384615;AO=28;DP=78;FAO=30;FDP=78;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.00241015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.121;QD=13.0434;RBI=0.00301467;REFB=-0.00598336;REVB=-0.00181091;RO=47;SAF=13;SAR=15;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426128;STB=0.510464;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0107876;OID=.;OPOS=34311195;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:47:48:28:30:0.384615:15:13:20:27:17:13:20:28
chr9	34370020	.	T	A	224.02	PASS	AF=0.904762;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.205427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9193;QD=42.6706;RBI=0.232347;REFB=-0.0402369;REVB=0.108559;RO=2;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101867;STB=0.555497;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0119581;OID=.;OPOS=34370020;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:21:21:2:2:19:19:0.904762:8:11:0:2:8:11:0:2
chr9	34372783	.	G	C	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.192;QD=64.1533;RBI=0.0618375;REFB=0;REVB=0.0549966;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131185;OID=.;OPOS=34372783;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0
chr9	34372873	.	C	G	789.23	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00998666;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.242;QD=64.4265;RBI=0.0169608;REFB=0;REVB=0.013709;RO=0;SAF=33;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.68508e-05;OID=.;OPOS=34372873;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:16:33:0:0:16:33:0:0
chr9	34372931	.	T	A	576.01	PASS	AF=0.552083;AO=53;DP=96;FAO=53;FDP=96;FR=.;FRO=43;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.00135876;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.189;QD=24.0004;RBI=0.0576182;REFB=-0.0283228;REVB=0.0576022;RO=42;SAF=30;SAR=23;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0537416;STB=0.524633;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0218053;OID=.;OPOS=34372931;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:42:43:53:53:0.552083:23:30:21:21:23:30:22:21
chr9	34379692	.	C	T	575.16	PASS	AF=0.604651;AO=52;DP=86;FAO=52;FDP=86;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0112289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.868;QD=26.7516;RBI=0.0298084;REFB=-0.0299946;REVB=-0.0276126;RO=34;SAF=26;SAR=26;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639894;STB=0.53487;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0398658;OID=.;OPOS=34379692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:34:34:52:52:0.604651:26:26:20:14:26:26:20:14
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chr9	34500821	.	G	A	237.68	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0147152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.115;QD=18.6418;RBI=0.0263157;REFB=-0.0339064;REVB=0.0218169;RO=26;SAF=3;SAR=22;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.470087;STB=0.769981;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0307633;OID=.;OPOS=34500821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:22:3:13:13:22:3:13:13
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chr9	34834880	.	A	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.173;QD=44.6898;RBI=0.0652661;REFB=0;REVB=0.0435522;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00057929;OID=.;OPOS=34834880;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0
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chr9	35546735	.	A	G	747.03	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.722;QD=63.5771;RBI=0.0318997;REFB=0;REVB=0.0193531;RO=0;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.15569e-05;OID=.;OPOS=35546735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:17:30:0:0:17:30:0:0
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chr9	35562549	.	G	A	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0166765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.098;QD=6.81375;RBI=0.018551;REFB=-0.0184521;REVB=0.008126;RO=18;SAF=5;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131357;STB=0.609427;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0556204;OID=.;OPOS=35562549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:18:19:7:7:0.269231:2:5:11:7:2:5:11:8
chr9	35606884	.	G	A	516.99	PASS	AF=0.515464;AO=49;DP=98;FAO=50;FDP=97;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0240643;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.746;QD=21.3191;RBI=0.0251404;REFB=-0.00374712;REVB=0.00727646;RO=47;SAF=27;SAR=22;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110929;STB=0.565048;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0033655;OID=.;OPOS=35606884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:47:47:49:50:0.515464:22:27:20:27:22:28:20:27
chr9	35660990	.	A	G	728.92	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.113;QD=57.17;RBI=0.0204763;REFB=0;REVB=0.0175591;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010757;OID=.;OPOS=35660990;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0
chr9	35663228	.	G	C	578.39	PASS	AF=0.95122;AO=37;DP=39;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0083213;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.897;QD=56.4286;RBI=0.0584253;REFB=-0.163973;REVB=0.0578297;RO=2;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049227;STB=0.523797;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.00386728;OID=.;OPOS=35663228;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:39:41:2:2:37:39:0.95122:18:19:0:2:20:19:0:2
chr9	35674053	.	G	A	750.69	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200237;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.458;QD=63.8882;RBI=0.0304414;REFB=0;REVB=0.0229288;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125294;OID=.;OPOS=35674053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0
chr9	35704150	.	C	T	92.21	PASS	AF=0.769231;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.159719;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.155;QD=28.3719;RBI=0.161341;REFB=-0.0158068;REVB=-0.0228245;RO=4;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303873;STB=0.588075;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.00861376;OID=.;OPOS=35704150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:14:13:4:3:10:10:0.769231:7:3:1:3:7:3:0:3
chr9	35753170	.	C	A	284.33	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0137373;FXX=0.0151492;HRUN=5;LEN=1;MLLD=255.493;QD=17.4971;RBI=0.017275;REFB=-0.00722051;REVB=0.0104744;RO=31;SAF=17;SAR=14;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0587492;STB=0.521113;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00763701;OID=.;OPOS=35753170;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:31:34:31:31:0.476923:14:17:19:12:14:17:20:14
chr9	35841783	.	G	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0650091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.997;QD=54.5161;RBI=0.0792471;REFB=0;REVB=0.0453202;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000715967;OID=.;OPOS=35841783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:18:7:0:0:18:7:0:0
chr9	35957355	.	G	A	237.15	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0529025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.548;QD=19.7625;RBI=0.0545153;REFB=-0.0252459;REVB=-0.0131623;RO=25;SAF=12;SAR=11;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110123;STB=0.561991;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0162542;OID=.;OPOS=35957355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:11:12:16:9:11:12:16:9
chr9	35957669	.	T	C	233.69	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.033757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.039;QD=24.599;RBI=0.0339463;REFB=-0.0251118;REVB=0.00357984;RO=16;SAF=17;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197167;STB=0.610669;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.023231;OID=.;OPOS=35957669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:5:17:9:7:5:17:9:7
chr9	35958047	.	T	C	268.7	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=56;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00658503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.937;QD=17.9133;RBI=0.0165013;REFB=-0.032673;REVB=-0.0151305;RO=30;SAF=16;SAR=10;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112134;STB=0.588175;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0351912;OID=.;OPOS=35958047;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:60:30:30:26:30:0.5:10:16:15:15:10:20:15:15
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chr9	36265475	.	A	G	102.38	PASS	AF=0.264151;AO=14;DP=53;FAO=14;FDP=53;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0160168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.973;QD=7.72695;RBI=0.0180425;REFB=-0.0154184;REVB=-0.00830626;RO=39;SAF=5;SAR=9;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0663243;STB=0.540484;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0404564;OID=.;OPOS=36265475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:39:39:14:14:0.264151:9:5:12:27:9:5:12:27
chr9	36674842	.	C	T	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.46;QD=62.3497;RBI=0.0949122;REFB=0;REVB=-0.0885288;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000942961;OID=.;OPOS=36674842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
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chr9	39118205	.	G	T	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.012;QD=53.9104;RBI=0.0393428;REFB=0;REVB=-0.0318843;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.59174e-05;OID=.;OPOS=39118205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr9	39118207	.	A	G	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.913;QD=53.9093;RBI=0.0126175;REFB=0;REVB=-0.0069068;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.62219e-05;OID=.;OPOS=39118207;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
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chr9	68415318	.	G	A	40.7	PASS	AF=0.0869565;AO=12;DP=135;FAO=12;FDP=138;FR=.;FRO=126;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=64;FSRR=62;FWDB=-0.0307137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.098;QD=1.17974;RBI=0.0367519;REFB=-0.00629869;REVB=-0.0201834;RO=123;SAF=8;SAR=4;SRF=61;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197955;STB=0.646811;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0610472;OID=.;OPOS=68415318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:135:138:123:126:12:12:0.0869565:4:8:61:62:4:8:64:62
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chr9	68415352	.	A	G	52.94	PASS	AF=0.114286;AO=12;DP=105;FAO=12;FDP=105;FR=.;FRO=93;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=51;FSRR=42;FWDB=-0.00710493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.056;QD=2.0169;RBI=0.00771146;REFB=-0.00169184;REVB=0.00299778;RO=91;SAF=7;SAR=5;SRF=50;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0417272;STB=0.53145;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0354638;OID=.;OPOS=68415352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:105:105:91:93:12:12:0.114286:5:7:50:41:5:7:51:42
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chr9	68415386	.	G	A	53.58	PASS	AF=0.140625;AO=9;DP=66;FAO=9;FDP=64;FR=.;FRO=55;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=-0.0983991;FXX=0.0447694;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.3623;QD=3.34898;RBI=0.113169;REFB=-0.0198929;REVB=-0.0558996;RO=56;SAF=1;SAR=8;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.55486;STB=0.888026;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0638098;OID=.;OPOS=68415386;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:66:64:56:55:9:9:0.140625:8:1:32:24:8:1:31:24
chr9	68415387	.	GA	AT,GT	475.34	PASS	AF=0.177419,0.532258;AO=11,32;DP=62;FAO=11,33;FDP=62;FR=.;FRO=18;FSAF=6,17;FSAR=5,16;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.157106,-0.0844605;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=51.2889,107.034;QD=30.6672;RBI=0.159137,0.0885667;REFB=0.0152743,-0.0454093;REVB=-0.0253455,0.0266549;RO=17;SAF=6,16;SAR=5,16;SRF=9;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0165255,-0.0186467;STB=0.52825,0.505347;STBP=0.811,0.958;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00512918,0.0365854;OID=.,.;OPOS=68415387,68415388;OREF=GA,A;OALT=AT,T;OMAPALT=AT,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:62:62:17:18:11,32:11,33:0.177419,0.532258:5,16:6,16:9:8:5,16:6,17:9:9
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chr9	77684690	.	A	C	829.35	PASS	AF=0.967213;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0690264;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8564;QD=54.3837;RBI=0.155015;REFB=-0.167639;REVB=0.138798;RO=1;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149779;STB=0.500835;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00478567;OID=.;OPOS=77684690;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:62:61:1:2:59:59:0.967213:31:28:0:1:31:28:1:1
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chr9	78790167	.	G	C	57.08	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0942302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.093;QD=28.5377;RBI=0.0946639;REFB=-0.0425924;REVB=-0.00905112;RO=1;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796435;STB=0.54533;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0118095;OID=.;OPOS=78790167;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:5:2:0:1:5:2:0:1
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chr9	79318921	.	A	G,T	789.34	PASS	AF=0.964286,0.0357143;AO=54,2;DP=56;FAO=54,2;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=24,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371192,-0.0299206;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=101.08,48.7166;QD=56.3813;RBI=0.0536228,0.0341575;REFB=0,0;REVB=0.0386985,-0.0164771;RO=0;SAF=30,0;SAR=24,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00178226,0.0661369;OID=.,.;OPOS=79318921,79318921;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:56:56:0:0:54,2:54,2:0.964286,0.0357143:24,2:30,0:0:0:24,2:30,0:0:0
chr9	79318998	.	A	G	380.43	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426678;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1319;QD=56.3599;RBI=0.06559;REFB=0;REVB=0.0498148;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181593;OID=.;OPOS=79318998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr9	79320640	.	C	T	1219.66	PASS	AF=1;AO=69;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00752684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1005;QD=60.9828;RBI=0.0242569;REFB=0;REVB=0.0230596;RO=0;SAF=44;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.61314e-05;OID=.;OPOS=79320640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:69:80:1:25:44:0:0:34:46:0:0
chr9	79320641	.	G	T	53.73	PASS	AF=0.135802;AO=11;DP=81;FAO=11;FDP=81;FR=.;FRO=70;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=44;FSRR=26;FWDB=-0.0192856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.7855;QD=2.65323;RBI=0.0398951;REFB=-0.0238388;REVB=0.034924;RO=70;SAF=2;SAR=9;SRF=44;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.519248;STB=0.854789;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0144855;OID=.;OPOS=79320641;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:81:81:70:70:11:11:0.135802:9:2:44:26:9:2:44:26
chr9	79321276	.	T	C	868.21	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00694842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.494;QD=57.8809;RBI=0.0353295;REFB=0;REVB=0.0346394;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300744;OID=.;OPOS=79321276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr9	79321871	.	C	T	817.71	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351175;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.311;QD=57.3833;RBI=0.0472119;REFB=0;REVB=0.0315552;RO=0;SAF=41;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.40491e-05;OID=.;OPOS=79321871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:16:41:0:0:16:41:0:0
chr9	79322068	.	G	T	739.96	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0975835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.847;QD=56.9202;RBI=0.102506;REFB=0;REVB=-0.0313824;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00121056;OID=.;OPOS=79322068;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0
chr9	79322674	.	A	G	1061.82	PASS	AF=0.986486;AO=71;DP=73;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0998994;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7526;QD=57.3956;RBI=0.099903;REFB=-0.0673892;REVB=0.000856606;RO=0;SAF=26;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00231368;OID=.;OPOS=79322674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:74:0:1:71:73:0.986486:45:26:0:0:45:28:0:1
chr9	79322720	.	A	G	632.17	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00158542;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=145.901;QD=61.6746;RBI=0.00187302;REFB=0;REVB=-0.000997307;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.24287e-06;OID=.;OPOS=79322720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0
chr9	79324135	.	A	ATGACTGTTGCAG	178.77	PASS	AF=0.410714;AO=19;DP=59;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=-0.0175531;FXX=0.0666556;HRUN=1;LEN=12;MLLD=239.075;QD=12.7692;RBI=0.0181856;REFB=-0.0198218;REVB=0.00475447;RO=37;SAF=4;SAR=15;SRF=29;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.594659;STB=0.778207;STBP=0.004;TYPE=ins;VARB=0.0189632;OID=.;OPOS=79324136;OREF=-;OALT=TGACTGTTGCAG;OMAPALT=ATGACTGTTGCAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.410714:19:59:23:56:33:6:17:25:8:99:37:4:15:29:8
chr9	79324179	.	G	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.676;QD=55.6561;RBI=0.0465741;REFB=0;REVB=0.0441322;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.6045e-05;OID=.;OPOS=79324179;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0
chr9	79324741	.	T	C	1009.95	PASS	AF=0.972973;AO=70;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0459206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.453;QD=54.5917;RBI=0.094401;REFB=0.0167857;REVB=0.0824794;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512192;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=-0.00483853;OID=.;OPOS=79324741;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:74:74:0:2:70:72:0.972973:32:38:0:0:32:40:2:0
chr9	79325558	.	G	C	767.5	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00976272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7939;QD=56.852;RBI=0.054471;REFB=0;REVB=-0.053589;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000568765;OID=.;OPOS=79325558;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:20:33:0:0:21:33:0:0
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chr9	90501448	.	C	A	1719.97	PASS	AF=1;AO=95;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=75;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0439893;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.54;QD=60.3497;RBI=0.0512439;REFB=0;REVB=0.0262845;RO=0;SAF=59;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000816452;OID=.;OPOS=90501448;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:115:114:0:0:95:114:1:36:59:0:0:39:75:0:0
chr9	90502458	.	T	A	785.07	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0359352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0578;QD=57.0963;RBI=0.0460367;REFB=0;REVB=-0.0287757;RO=0;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00071995;OID=.;OPOS=90502458;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:20:35:0:0:20:35:0:0
chr9	90503734	.	C	T	70.57	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0166507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.158;QD=17.6432;RBI=0.0858574;REFB=0.0110829;REVB=-0.0842274;RO=7;SAF=8;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474609;STB=0.783546;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.0225957;OID=.;OPOS=90503734;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:1:8:3:4:1:8:3:4
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chr9	90744786	.	T	A	199.75	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0534105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.255;QD=19.9748;RBI=0.0603005;REFB=-0.039234;REVB=-0.0279905;RO=20;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219277;STB=0.62364;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0190684;OID=.;OPOS=90744786;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:8:12:7:13:8:12:7:13
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chr9	90746326	.	C	T	272.9	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0100723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.243;QD=45.4833;RBI=0.0142468;REFB=-0.00377547;REVB=-0.0100758;RO=2;SAF=10;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0070384;STB=0.503813;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.000368778;OID=.;OPOS=90746326;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:2:2:22:22:0.916667:12:10:1:1:12:10:1:1
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chr9	94456702	.	ATTT	AATT,ATT,ATTA	637.77	PASS	AF=0.0444444,0,0.955556;AO=2,7,29;DP=45;FAO=2,0,43;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,17;FSAR=2,0,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175137,0.0727911,0.163864;FXX=0;HRUN=3,3,3;LEN=1,1,1;MLLD=6.82001,20.3551,26.0958;QD=56.6909;RBI=0.036349,0.122521,0.163887;REFB=0,0,0;REVB=-0.0318516,0.0985532,0.00275732;RO=0;SAF=0,5,10;SAR=2,2,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.27427e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=-0.062049,-0.0711549,0.00375219;OID=.,.,.;OPOS=94456703,94456703,94456705;OREF=T,T,T;OALT=A,-,A;OMAPALT=AATT,ATT,ATTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.0444444,0,0.955556:2,7,29:45:2,0,43:45:0:0,0,17:2,0,26:0:0:9:0:0,5,10:2,2,19:0:0
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chr9	94486688	.	G	A	356.73	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00486168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.446;QD=54.8809;RBI=0.0148794;REFB=0;REVB=0.0140627;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6602e-05;OID=.;OPOS=94486688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr9	94495608	.	T	C	336.27	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0968044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.412;QD=53.8023;RBI=0.11162;REFB=0;REVB=0.0555683;RO=1;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040273;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00597297;OID=.;OPOS=94495608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:1:0:24:25:1:11:13:0:1:12:13:0:0
chr9	94518328	.	C	T	355.44	PASS	AF=0.513889;AO=36;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.00184305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9068;QD=19.7465;RBI=0.0175794;REFB=-0.0221077;REVB=-0.0174825;RO=33;SAF=19;SAR=17;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680485;STB=0.528202;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0353148;OID=.;OPOS=94518328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:33:35:36:37:0.513889:17:19:20:13:18:19:20:15
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chr9	95219597	.	G	A	744.56	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.004;QD=56.1929;RBI=0.0550625;REFB=0;REVB=-0.0427802;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.14873e-05;OID=.;OPOS=95219597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:29:23:0:0:29:24:0:0
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chr9	95380726	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6094;QD=53.2766;RBI=0.0219355;REFB=0;REVB=-0.00550162;RO=0;SAF=18;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00039723;OID=.;OPOS=95380726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:5:18:0:0:5:18:0:0
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chr9	95738781	.	C	A	364.3	PASS	AF=0.398148;AO=43;DP=108;FAO=43;FDP=108;FR=.;FRO=65;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=0.0286953;FXX=0.00917347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.926;QD=13.4927;RBI=0.0346054;REFB=-0.0140527;REVB=-0.0193421;RO=65;SAF=20;SAR=23;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126454;STB=0.571518;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.016941;OID=.;OPOS=95738781;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:65:65:43:43:0.398148:23:20:38:27:23:20:38:27
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chr9	95780465	.	A	G	1716.06	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000671861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.001;QD=60.2128;RBI=0.0401547;REFB=0;REVB=0.0401491;RO=0;SAF=57;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60583e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.44509e-05;OID=.;OPOS=95780465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:114:0:0:108:114:1:51:57:0:0:54:60:0:0
chr9	95782667	.	C	T	408.41	PASS	AF=0.443299;AO=42;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=40;FSRR=14;FWDB=-0.00295005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.989;QD=16.8418;RBI=0.00321016;REFB=-0.00714886;REVB=0.00126582;RO=54;SAF=27;SAR=15;SRF=40;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111141;STB=0.569576;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0128092;OID=.;OPOS=95782667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:54:54:42:43:0.443299:15:27:40:14:16:27:40:14
chr9	95795226	.	CAG	AGC,CGG	138.04	PASS	AF=0,0.340426;AO=2,16;DP=47;FAO=0,16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=0,7;FSAR=0,9;FSRF=5;FSRR=26;FWDB=-0.0125115,-0.0200709;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=3,1;MLLD=41.4569,130.507;QD=11.7478;RBI=0.0360496,0.0246881;REFB=-0.0140953,-0.00127468;REVB=0.0338088,-0.0143758;RO=29;SAF=2,7;SAR=0,9;SRF=3;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.738988,0.408782;STB=0.5,0.693854;STBP=1,0.087;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.00310778;OID=.,.;OPOS=95795226,95795227;OREF=CAG,A;OALT=AGC,G;OMAPALT=AGC,CGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:47:47:29:31:2,16:0,16:0,0.340426:0,9:2,7:3:26:0,9:0,7:5:26
chr9	95797999	.	C	T	195.66	PASS	AF=0.387097;AO=23;DP=61;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00820755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.508;QD=12.6229;RBI=0.0328613;REFB=-0.0273805;REVB=-0.0318198;RO=37;SAF=17;SAR=6;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342599;STB=0.698102;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0136423;OID=.;OPOS=95797999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:37:38:23:24:0.387097:6:17:16:21:6:18:17:21
chr9	95887320	.	G	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.1133;QD=61.3357;RBI=0.0376114;REFB=0;REVB=0.0263171;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449039;OID=.;OPOS=95887320;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr9	96015256	.	C	T	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.124387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.638;QD=60.6091;RBI=0.124738;REFB=0;REVB=0.00934806;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000401146;OID=.;OPOS=96015256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr9	96021312	.	G	A	801.3	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.097;QD=57.2359;RBI=0.106632;REFB=0;REVB=0.0140811;RO=0;SAF=3;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000271331;OID=.;OPOS=96021312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:53:3:0:0:53:3:0:0
chr9	96021418	.	ACCCCCCT	ACCCCC,ACCCCCT,ACCCCCTC,ACCCCTCT	345.82	PASS	AF=0,0.333333,0,0.619048;AO=5,5,2,18;DP=41;FAO=0,14,0,26;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=0,12,0,16;FSAR=0,2,0,10;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0562935,-0.12867,-0.159932,-0.0180584;FXX=0;HRUN=6,6,6,6;LEN=2,1,2,1;MLLD=87.2914,8.75864,36.2486,154.405;QD=32.9354;RBI=0.0565727,0.32698,0.161221,0.0521566;REFB=0.0121021,-0.20001,-0.137047,-0.0665939;REVB=-0.00561365,0.300599,0.0203471,0.0489306;RO=3;SAF=4,4,2,10;SAR=1,1,0,8;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.576923,0.576923,0,0;SSEP=0.550218,0.550218,0,0;SSSB=-0.23409,-0.23409,0,-0.11941;STB=0.5,0.538409,0.5,0.52939;STBP=1,0.656,1,0.314;TYPE=del,del,mnp,snp;VARB=0,0.235773,0,0.0331303;OID=.,.,.,.;OPOS=96021424,96021419,96021424,96021423;OREF=CT,C,CT,C;OALT=-,-,TC,T;OMAPALT=ACCCCC,ACCCCCT,ACCCCCTC,ACCCCTCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/4:0,0.333333,0,0.619048:5,5,2,18:41:0,14,0,26:42:2:0,12,0,16:0,2,0,10:2:0:66:3:4,4,2,10:1,1,0,8:3:0
chr9	96051521	.	A	G	323.38	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00234386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.761;QD=53.8968;RBI=0.00312283;REFB=0;REVB=0.00206358;RO=0;SAF=4;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.43224e-05;OID=.;OPOS=96051521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:20:4:0:0:20:4:0:0
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chr9	100617375	.	T	C	2061.77	PASS	AF=1;AO=130;DP=130;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00289767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.533;QD=62.478;RBI=0.0419073;REFB=0;REVB=0.041807;RO=0;SAF=90;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.84633e-05;OID=.;OPOS=100617375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:132:0:0:130:132:1:40:90:0:0:41:91:0:0
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chr9	100684757	.	A	G	304.07	PASS	AF=0.414634;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.0144792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.466;QD=14.8328;RBI=0.0418194;REFB=-0.0194532;REVB=-0.0392329;RO=48;SAF=22;SAR=12;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476545;STB=0.527032;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0242713;OID=.;OPOS=100684757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:48:48:34:34:0.414634:12:22:29:19:12:22:29:19
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chr9	101796880	.	A	G	30.09	PASS	AF=0.117647;AO=8;DP=46;FAO=6;FDP=51;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=39;FWDB=-0.000351974;FXX=0.0892698;HRUN=28;LEN=1;MLLD=169.444;QD=2.36014;RBI=0.0134433;REFB=-0.00112701;REVB=-0.0134387;RO=36;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.438005;STB=0.89062;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00399279;OID=.;OPOS=101796880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:46:51:36:45:8:6:0.117647:4:4:6:30:2:4:6:39
chr9	101822220	.	C	T	127.73	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.016625;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.294;QD=11.882;RBI=0.0175206;REFB=0.00146629;REVB=0.00552973;RO=27;SAF=11;SAR=4;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215885;STB=0.64241;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=-0.00206795;OID=.;OPOS=101822220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:27:28:15:15:0.348837:4:11:15:12:4:11:15:13
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chr9	102068058	.	A	G	171.17	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00193597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.789;QD=17.5555;RBI=0.0121969;REFB=-0.0199191;REVB=-0.0120422;RO=21;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129221;STB=0.57383;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0257471;OID=.;OPOS=102068058;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:7:11:10:11:7:11:10:11
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chr9	102713580	.	G	A	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.897;QD=57.5451;RBI=0.0157837;REFB=0;REVB=0.000671151;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.67271e-05;OID=.;OPOS=102713580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:30:28:0:0:30:28:0:0
chr9	102732237	.	T	C	389.35	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.614;QD=55.6217;RBI=0.0591691;REFB=0;REVB=0.00369711;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224995;OID=.;OPOS=102732237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:13:14:0:0:14:14:0:0
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chr9	104133628	.	C	T	538.8	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00679001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.97;QD=59.8668;RBI=0.0810318;REFB=0;REVB=0.0807468;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283998;OID=.;OPOS=104133628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:17:18:0:0:18:18:0:0
chr9	104324545	.	G	A	210.24	PASS	AF=0.366197;AO=26;DP=71;FAO=26;FDP=71;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=30;FWDB=-0.00193268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.363;QD=11.8446;RBI=0.00450835;REFB=-0.00852692;REVB=-0.00407308;RO=45;SAF=13;SAR=13;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.184;STB=0.605556;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0194257;OID=.;OPOS=104324545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:45:45:26:26:0.366197:13:13:15:30:13:13:15:30
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chr9	107266844	.	A	G	332.98	PASS	AF=0.397849;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.00942015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.005;QD=14.3217;RBI=0.0184084;REFB=-0.00778757;REVB=-0.0158155;RO=54;SAF=16;SAR=21;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046819;STB=0.513362;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0159699;OID=.;OPOS=107266844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:54:56:37:37:0.397849:21:16:21:33:21:16:23:33
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chr9	107267304	.	C	T	582.7	PASS	AF=0.537037;AO=58;DP=111;FAO=58;FDP=108;FR=.;FRO=50;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=-0.0260676;FXX=0.0357111;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3492;QD=21.5814;RBI=0.0377613;REFB=-0.0324629;REVB=-0.0273203;RO=49;SAF=28;SAR=30;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0624913;STB=0.529138;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0253094;OID=.;OPOS=107267304;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:108:49:50:58:58:0.537037:30:28:20:29:30:28:21:29
chr9	107331504	.	C	A	955.1	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200936;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.638;QD=58.7755;RBI=0.0394672;REFB=0;REVB=-0.0339692;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.51247e-05;OID=.;OPOS=107331504;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:34:31:0:0:34:31:0:0
chr9	107360922	.	A	G	2088.65	PASS	AF=1;AO=134;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00469316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2047;QD=61.8858;RBI=0.00474314;REFB=-0.0916423;REVB=-0.00068676;RO=0;SAF=71;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000551489;OID=.;OPOS=107360922;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:135:135:0:0:134:135:1:63:71:0:0:64:71:0:0
chr9	107361312	.	T	C	825.27	PASS	AF=1;AO=36;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.135;QD=55.9503;RBI=0.0373563;REFB=0;REVB=0.00669112;RO=0;SAF=7;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386924;OID=.;OPOS=107361312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:36:59:1:29:7:0:0:32:27:0:0
chr9	107361439	.	G	C	629.2	PASS	AF=0.954545;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00963887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.002;QD=57.2002;RBI=0.0245426;REFB=-0.0853231;REVB=0.0225706;RO=2;SAF=26;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034749;STB=0.51851;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00347745;OID=.;OPOS=107361439;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:44:2:2:42:42:0.954545:16:26:2:0:16:26:2:0
chr9	107361449	.	T	A,C	549.72	PASS	AF=0.972973,0.027027;AO=2,35;DP=37;FAO=36,1;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=12,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300818,0.0343643;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=289.11,232.214;QD=59.4292;RBI=0.0313224,0.0374569;REFB=0,0;REVB=0.00872779,0.0149036;RO=0;SAF=2,22;SAR=0,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.39865e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000386526,0.0459525;OID=.,.;OPOS=107361449,107361449;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:37:37:0:0:2,35:36,1:0.972973,0.027027:0,13:2,22:0:0:12,1:24,0:0:0
chr9	107361451	.	GC	AG	498.1	PASS	AF=1;AO=35;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0939101;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=226.187;QD=53.8487;RBI=0.16826;REFB=0;REVB=0.139615;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00146096;OID=.;OPOS=107361451;OREF=GC;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:35:37:1:12:23:0:0:13:24:0:0
chr9	107361460	.	G	A	499.65	PASS	AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0024967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2986;QD=54.0166;RBI=0.0483358;REFB=-0.15662;REVB=0.0482713;RO=2;SAF=22;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406472;STB=0.521727;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00970476;OID=.;OPOS=107361460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:37:2:2:35:35:0.945946:13:22:2:0:13:22:2:0
chr9	107361490	.	A	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0601406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.695;QD=50.412;RBI=0.076268;REFB=0;REVB=0.0469033;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139905;OID=.;OPOS=107361490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr9	107361642	.	G	A	1358.25	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00121499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.26;QD=61.7387;RBI=0.0346089;REFB=0;REVB=0.0345875;RO=0;SAF=26;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.77523e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.31211e-05;OID=.;OPOS=107361642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:88:0:0:79:88:1:53:26:0:0:61:27:0:0
chr9	107367132	.	G	A	1044.37	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.572;QD=59.6786;RBI=0.0198969;REFB=0;REVB=-0.00666296;RO=0;SAF=46;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.69565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00015087;OID=.;OPOS=107367132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:24:46:0:0:24:46:0:0
chr9	107379895	.	G	T	635.62	PASS	AF=0.914894;AO=43;DP=48;FAO=43;FDP=47;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0182358;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.227;QD=54.0952;RBI=0.0436721;REFB=0.09196;REVB=0.0396825;RO=2;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493531;STB=0.549977;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.00418735;OID=.;OPOS=107379895;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:48:47:2:4:43:43:0.914894:18:25:0:2:18:25:0:4
chr9	107380396	.	T	G	259.98	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149823;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.721;QD=51.9968;RBI=0.046282;REFB=0;REVB=0.0437899;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185289;OID=.;OPOS=107380396;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr9	107456763	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=21;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253037;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=289.077;QD=55.0987;RBI=0.0421332;REFB=0;REVB=0.0336887;RO=0;SAF=16;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21015e-05;OID=.;OPOS=107456763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:21:26:1:5:16:0:0:5:21:0:0
chr9	107457275	.	A	C	1320.95	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.448;QD=62.1623;RBI=0.0189889;REFB=0;REVB=0.0102411;RO=0;SAF=43;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.35162e-05;OID=.;OPOS=107457275;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:42:43:0:0:42:43:0:0
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chr9	107533175	.	C	G	502.9	PASS	AF=0.394366;AO=56;DP=143;FAO=56;FDP=142;FR=.;FRO=86;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=46;FSRR=40;FWDB=-0.00667651;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.102;QD=14.1661;RBI=0.0230444;REFB=-0.0288755;REVB=-0.0220561;RO=85;SAF=27;SAR=29;SRF=46;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0629801;STB=0.531898;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.034544;OID=.;OPOS=107533175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:142:85:86:56:56:0.394366:29:27:46:39:29:27:46:40
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chr9	108152199	.	G	A	1190.42	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203466;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=306.038;QD=61.0471;RBI=0.0217708;REFB=0;REVB=0.00774491;RO=0;SAF=42;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50397e-05;OID=.;OPOS=108152199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:36:42:0:0:36:42:0:0
chr9	108398331	.	T	G	1086.23	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199181;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4436;QD=60.3463;RBI=0.0238622;REFB=0;REVB=0.0131404;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000599151;OID=.;OPOS=108398331;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:38:34:0:0:38:34:0:0
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chr9	111653574	.	C	G	547.39	PASS	AF=0.427536;AO=59;DP=138;FAO=59;FDP=138;FR=.;FRO=79;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=51;FSRR=28;FWDB=0.012174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3602;QD=15.8664;RBI=0.0382204;REFB=-0.0124955;REVB=-0.0362297;RO=79;SAF=28;SAR=31;SRF=51;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174024;STB=0.597139;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.018232;OID=.;OPOS=111653574;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:79:79:59:59:0.427536:31:28:51:28:31:28:51:28
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chr9	111881927	.	T	C	305.66	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.809;QD=53.1579;RBI=0.0740286;REFB=0;REVB=0.0717052;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000570941;OID=.;OPOS=111881927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0
chr9	111945049	.	T	G	448.12	PASS	AF=0.505747;AO=43;DP=87;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0426381;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6227;QD=20.6033;RBI=0.0427657;REFB=-0.00203037;REVB=0.00330163;RO=44;SAF=19;SAR=24;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325417;STB=0.505261;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.00327911;OID=.;OPOS=111945049;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:44:43:43:44:0.505747:24:19:21:23:24:20:20:23
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chr9	112629858	.	A	G	234.99	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0137499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.311;QD=15.4094;RBI=0.0193641;REFB=-0.0156922;REVB=0.0136349;RO=33;SAF=13;SAR=14;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145752;STB=0.588676;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0161298;OID=.;OPOS=112629858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:34:27:27:0.442623:14:13:11:22:14:13:11:23
chr9	112705399	.	C	CG	34.9	PASS	AF=0.15873;AO=9;DP=64;FAO=10;FDP=63;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=-0.0180083;FXX=0.0156226;HRUN=0;LEN=1;MLLD=28.051;QD=2.21618;RBI=0.0181377;REFB=-0.0262607;REVB=-0.00216235;RO=55;SAF=9;SAR=0;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.632865;STB=0.781907;STBP=0.105;TYPE=ins;VARB=0.17981;OID=.;OPOS=112705400;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.15873:9:64:10:63:53:9:1:36:17:34:55:9:0:36:19
chr9	112710511	.	CA	C,CC	93.55	PASS	AF=0.333333,0.0769231;AO=15,2;DP=40;FAO=13,3;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=2,2;FSAR=11,1;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.167722,0.113542;FXX=0.0249938;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=15.5229,26.4274;QD=9.59469;RBI=0.209621,0.118934;REFB=-0.0125041,-0.024551;REVB=-0.125739,0.0354032;RO=19;SAF=2,1;SAR=13,1;SRF=7;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.33866,0.131617;STB=0.678693,0.760375;STBP=0.177,0.445;TYPE=del,snp;VARB=-0.0175037,0.0815072;OID=.,.;OPOS=112710512,112710512;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333,0.0769231:15,2:40:13,3:39:23:2,2:11,1:8:15:74:19:2,1:13,1:7:12
chr9	112713075	.	C	CA	95.9	PASS	AF=0.415094;AO=20;DP=52;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.18604;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.5814;QD=7.23801;RBI=0.197211;REFB=0.00283233;REVB=-0.065433;RO=28;SAF=16;SAR=4;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286012;STB=0.660386;STBP=0.087;TYPE=ins;VARB=-0.0702612;OID=.;OPOS=112713076;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.415094:20:52:22:53:31:18:4:19:12:95:28:16:4:16:12
chr9	112852637	.	A	G	285.12	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.000545009;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4311;QD=17.8198;RBI=0.00722512;REFB=-0.0242511;REVB=-0.00720453;RO=33;SAF=18;SAR=13;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0890631;STB=0.549866;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0305439;OID=.;OPOS=112852637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:13:18:16:17:13:18:16:17
chr9	112852717	.	C	T	300.31	PASS	AF=0.55102;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0147963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3108;QD=24.5147;RBI=0.0148938;REFB=-0.0103089;REVB=-0.00170102;RO=21;SAF=14;SAR=13;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707988;STB=0.52868;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00782218;OID=.;OPOS=112852717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:21:22:27:27:0.55102:13:14:9:12:13:14:10:12
chr9	112899361	.	A	C	805.02	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00455125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.7;QD=64.4015;RBI=0.065451;REFB=0;REVB=0.0652926;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237539;OID=.;OPOS=112899361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:24:26:0:0:24:26:0:0
chr9	112900341	.	G	GGAAGCT	181.67	PASS	AF=0.5625;AO=15;DP=33;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00351812;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=6;MLLD=273.053;QD=22.7083;RBI=0.0420714;REFB=-0.0553058;REVB=0.041924;RO=14;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282995;STB=0.524448;STBP=0.824;TYPE=ins;VARB=0.0199249;OID=.;OPOS=112900342;OREF=-;OALT=GAAGCT;OMAPALT=GGAAGCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5625:15:33:18:32:14:8:10:7:7:99:14:7:8:7:7
chr9	112900785	.	A	G	239.44	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0686881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4101;QD=50.4078;RBI=0.0780426;REFB=0;REVB=-0.0370486;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000934377;OID=.;OPOS=112900785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr9	112931462	.	GA	G,GG	70.97	PASS	AF=0.266667,0.166667;AO=6,5;DP=30;FAO=8,5;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=5,5;FSAR=3,0;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0647107,0.0196705;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=13.5586,34.2763;QD=9.46301;RBI=0.276074,0.20018;REFB=-0.0547308,-0.0204289;REVB=0.268383,0.199211;RO=17;SAF=4,5;SAR=2,0;SRF=5;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.404914,0.757217;STB=0.713796,0.998183;STBP=0.191,0.003;TYPE=del,snp;VARB=0.103956,0.0175768;OID=.,.;OPOS=112931463,112931463;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.266667,0.166667:6,5:30:8,5:30:17:5,5:3,0:5:12:35:17:4,5:2,0:5:12
chr9	112931646	.	G	A	878.39	PASS	AF=0.96875;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0344803;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.258;QD=54.899;RBI=0.0344805;REFB=-0.0813325;REVB=-0.000114671;RO=2;SAF=47;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204983;STB=0.510866;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.00329248;OID=.;OPOS=112931646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:64:64:2:2:62:62:0.96875:15:47:1:1:15:47:1:1
chr9	112932329	.	G	A	1059.17	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.117;QD=59.6715;RBI=0.0355232;REFB=0;REVB=0.0190984;RO=0;SAF=29;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012715;OID=.;OPOS=112932329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:64:71:0:0:64:71:1:35:29:0:0:39:32:0:0
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chr9	112960858	.	T	C	1117.38	PASS	AF=0.962025;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0436181;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.3784;QD=56.5761;RBI=0.0473729;REFB=-0.0704276;REVB=0.0184839;RO=3;SAF=38;SAR=38;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119657;STB=0.506327;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.00232059;OID=.;OPOS=112960858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:79:79:3:3:76:76:0.962025:38:38:1:2:38:38:1:2
chr9	112960869	.	A	G	1153.6	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00393246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.253;QD=60.716;RBI=0.0270493;REFB=0;REVB=-0.0267619;RO=0;SAF=36;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.93447e-05;OID=.;OPOS=112960869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:40:36:0:0:40:36:0:0
chr9	112963504	.	A	G	1127.29	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00329804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.179;QD=60.122;RBI=0.00869012;REFB=0;REVB=0.00803996;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.71938e-05;OID=.;OPOS=112963504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:36:38:0:0:36:39:0:0
chr9	112963702	.	G	A	83.02	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00800511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.802;QD=9.48832;RBI=0.0132056;REFB=-0.000237151;REVB=0.0105027;RO=24;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246225;STB=0.649215;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0012858;OID=.;OPOS=112963702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:4:7:10:14:4:7:10:14
chr9	113006420	.	A	G	1409.18	PASS	AF=1;AO=57;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=77;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286024;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3735;QD=60.6098;RBI=0.110404;REFB=0;REVB=0.106635;RO=1;SAF=50;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00934182;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000552391;OID=.;OPOS=113006420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:94:93:1:0:57:93:1:7:50:1:0:16:77:0:0
chr9	113006421	.	T	G	320.8	PASS	AF=0.378947;AO=33;DP=91;FAO=36;FDP=95;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=9;FSRF=51;FSRR=8;FWDB=-0.0129137;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=133.031;QD=13.5073;RBI=0.0413698;REFB=-0.0436352;REVB=0.0393027;RO=58;SAF=27;SAR=6;SRF=50;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877562;STB=0.604601;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.00324129;OID=.;OPOS=113006421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:95:58:59:33:36:0.378947:6:27:50:8:9:27:51:8
chr9	113132221	.	G	A	1008.38	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0032559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1125;QD=59.3164;RBI=0.0390141;REFB=0;REVB=-0.038878;RO=0;SAF=30;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000261947;OID=.;OPOS=113132221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:38:30:0:0:38:30:0:0
chr9	113192655	.	T	G	1383.02	PASS	AF=1;AO=88;DP=90;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00834258;FXX=0.0222198;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.936;QD=62.8643;RBI=0.0204116;REFB=0;REVB=0.0186289;RO=0;SAF=57;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.90485e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132724;OID=.;OPOS=113192655;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:88:0:0:88:88:1:31:57:0:0:31:57:0:0
chr9	113220820	.	C	T	853.82	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0213396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4971;QD=55.9883;RBI=0.0297453;REFB=-0.120796;REVB=0.0207221;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.508472;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00149798;OID=.;OPOS=113220820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:0:1:60:60:0.983607:29:31:0:0:29:31:0:1
chr9	113233720	.	G	A	1476.01	PASS	AF=0.980583;AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0110695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.278;QD=57.3209;RBI=0.0235259;REFB=-0.0180708;REVB=0.020759;RO=2;SAF=66;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00622699;STB=0.503283;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.000247004;OID=.;OPOS=113233720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:103:103:2:2:101:101:0.980583:35:66:1:1:35:66:1:1
chr9	113245903	.	G	A	576.63	PASS	AF=0.47619;AO=60;DP=125;FAO=60;FDP=126;FR=.;FRO=66;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.000873457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.887;QD=18.3056;RBI=0.0403133;REFB=-0.0191057;REVB=-0.0403039;RO=65;SAF=35;SAR=25;SRF=33;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0719884;STB=0.544221;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0207323;OID=.;OPOS=113245903;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:126:65:66:60:60:0.47619:25:35:33:32:25:35:33:33
chr9	113275227	.	C	T	461.87	PASS	AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.00620165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.9085;QD=21.4821;RBI=0.0273213;REFB=0.000347383;REVB=-0.0266081;RO=41;SAF=18;SAR=27;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119437;STB=0.566008;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=-0.000790541;OID=.;OPOS=113275227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:27:18:22:19:27:18:22:19
chr9	113457726	.	G	A	569.46	PASS	AF=0.554455;AO=56;DP=99;FAO=56;FDP=101;FR=.;FRO=45;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0862111;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3195;QD=22.5529;RBI=0.142127;REFB=-0.0401474;REVB=-0.112995;RO=43;SAF=30;SAR=26;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056052;STB=0.530775;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.030422;OID=.;OPOS=113457726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:101:43:45:56:56:0.554455:26:30:20:23:26:30:21:24
chr9	113636353	.	T	A,G	443.43	PASS	AF=0.0606061,0.909091;AO=2,30;DP=33;FAO=2,30;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=0,23;FSAR=2,7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0354662,0.0251563;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=97.8632,145.891;QD=53.749;RBI=0.0357441,0.0253464;REFB=0.0164288,0.0368336;REVB=-0.00444823,-0.0030984;RO=1;SAF=0,23;SAR=2,7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0619954;STB=0.5,0.53331;STBP=1,0.15;TYPE=snp,snp;VARB=0.0184929,0.000425968;OID=.,.;OPOS=113636353,113636353;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:33:33:1:1:2,30:2,30:0.0606061,0.909091:2,7:0,23:0:1:2,7:0,23:0:1
chr9	113636379	.	C	T	321.08	PASS	AF=0.710526;AO=26;DP=38;FAO=27;FDP=38;FR=.;FRO=11;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0519009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.285;QD=33.7974;RBI=0.0638468;REFB=-0.0357631;REVB=0.0371848;RO=11;SAF=16;SAR=10;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653529;STB=0.540954;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0104375;OID=.;OPOS=113636379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:38:38:11:11:26:27:0.710526:10:16:8:3:11:16:8:3
chr9	113636393	.	TTA	AAA,T,TT,TTT	136.1	PASS	AF=0,0.947368,0,0;AO=10,8,5,3;DP=35;FAO=0,18,0,0;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=0,4,0,0;FSAR=0,14,0,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.101257,0.0174847,-0.159811,-0.180163;FXX=0.424114;HRUN=7,7,7,7;LEN=2,2,1,1;MLLD=19.5816,16.0785,8.99653,8.16608;QD=28.6517;RBI=0.117576,0.205588,0.173953,0.219134;REFB=-0.109388,-0.0764013,0.0615814,0.160142;REVB=0.0597603,0.204843,0.0687029,-0.124744;RO=7;SAF=10,2,0,0;SAR=0,6,5,3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.811433,-0.168179,-0.725162,-0.649962;STB=0.5,0.517223,0.5,0.5;STBP=1,0.64,1,1;TYPE=mnp,del,del,snp;VARB=0,-0.00575797,-0.0636617,0;OID=.,.,.,.;OPOS=113636393,113636394,113636395,113636395;OREF=TT,TA,A,A;OALT=AA,-,-,T;OMAPALT=AAA,T,TT,TTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:8:35:19:7:1:10,8,5,3:0,18,0,0:0,0.947368,0,0:0,6,5,3:10,2,0,0:3:4:0,14,0,0:0,4,0,0:0:1
chr9	113636486	.	G	C	44.52	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=30;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0839445;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4974;QD=6.14132;RBI=0.085369;REFB=-0.00781004;REVB=-0.0155301;RO=20;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13233;STB=0.556809;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.026218;OID=.;OPOS=113636486;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:30:29:20:22:7:7:0.241379:5:2:4:16:5:2:5:17
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chr9	114184477	.	C	T	184.73	PASS	AF=0.434783;AO=19;DP=45;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.00573392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8909;QD=16.0636;RBI=0.0160788;REFB=-0.0105421;REVB=0.0150216;RO=26;SAF=13;SAR=6;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232505;STB=0.642054;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0223643;OID=.;OPOS=114184477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:26:26:19:20:0.434783:6:13:12:14:6:14:12:14
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chr9	114366094	.	G	C	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0201238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.621;QD=64.4151;RBI=0.0412891;REFB=0;REVB=-0.0360531;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00022842;OID=.;OPOS=114366094;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0
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chr9	114456644	.	TA	T	78.95	PASS	AF=0.619048;AO=11;DP=23;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0305264;FXX=0.0869187;HRUN=6;LEN=1;MLLD=13.4226;QD=15.0378;RBI=0.11576;REFB=-0.0837225;REVB=0.111662;RO=8;SAF=4;SAR=7;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00898424;STB=0.529366;STBP=0.767;TYPE=del;VARB=0.0617386;OID=.;OPOS=114456645;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.619048:11:23:13:21:8:4:9:3:5:42:8:4:7:3:5
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chr9	114982463	.	T	C	506.05	PASS	AF=1;AO=29;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.808;QD=57.8338;RBI=0.0263665;REFB=0;REVB=0.00377617;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000808673;OID=.;OPOS=114982463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:35:0:0:29:35:1:13:16:0:0:19:16:0:0
chr9	114982549	.	C	T	648.28	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.216;QD=61.7406;RBI=0.0285291;REFB=0;REVB=0.025986;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.70926e-05;OID=.;OPOS=114982549;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:42:0:0:40:42:1:26:14:0:0:28:14:0:0
chr9	115034899	.	A	T	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228133;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=321.207;QD=57.6807;RBI=0.0316953;REFB=0;REVB=0.0220034;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.97685e-06;OID=.;OPOS=115034899;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr9	115095743	.	T	C	520.04	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00673787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.671;QD=59.4334;RBI=0.0342314;REFB=0;REVB=0.0335617;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.10934e-05;OID=.;OPOS=115095743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr9	115567184	.	T	C	775.06	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.100672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.946;QD=53.4522;RBI=0.121667;REFB=-0.136231;REVB=0.0683228;RO=2;SAF=31;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294499;STB=0.515619;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0106829;OID=.;OPOS=115567184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:2:2:56:56:0.965517:25:31:2:0:25:31:2:0
chr9	115580008	.	G	C	955.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.637;QD=58.7798;RBI=0.0196799;REFB=0;REVB=-0.0169081;RO=0;SAF=44;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.88279e-05;OID=.;OPOS=115580008;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:21:44:0:0:21:44:0:0
chr9	115600848	.	T	C	1441.86	PASS	AF=1;AO=91;DP=93;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00573595;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.708;QD=63.3784;RBI=0.0240404;REFB=0;REVB=0.0233461;RO=0;SAF=53;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108953;OID=.;OPOS=115600848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:91:0:0:91:91:1:38:53:0:0:38:53:0:0
chr9	115617061	.	T	C	1002.22	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4704;QD=58.9541;RBI=0.0327834;REFB=0;REVB=0.0127625;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138861;OID=.;OPOS=115617061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:68:0:0:65:68:1:30:35:0:0:32:36:0:0
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chr9	115925104	.	C	T	2269.35	PASS	AF=0.980645;AO=152;DP=155;FAO=152;FDP=155;FR=.;FRO=3;FSAF=78;FSAR=74;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00307808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.79;QD=58.5639;RBI=0.0471099;REFB=-0.0405024;REVB=-0.0470092;RO=2;SAF=78;SAR=74;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120394;STB=0.502973;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.000696388;OID=.;OPOS=115925104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:155:155:2:3:152:152:0.980645:74:78:2:0:74:78:2:1
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chr9	116122968	.	G	A	330.18	PASS	AF=0.539683;AO=34;DP=64;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0110992;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3053;QD=20.9639;RBI=0.0700126;REFB=-0.0172715;REVB=0.0691272;RO=29;SAF=22;SAR=12;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198142;STB=0.609877;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0332268;OID=.;OPOS=116122968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:29:29:34:34:0.539683:12:22:12:17:12:22:12:17
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chr9	116136198	.	C	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252989;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=301.268;QD=50.4135;RBI=0.0559449;REFB=0;REVB=0.0498979;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153649;OID=.;OPOS=116136198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr9	116152891	.	A	G	52.86	PASS	AF=0.266667;AO=7;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.00919552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.296;QD=7.04801;RBI=0.0148418;REFB=-0.00738361;REVB=-0.0116499;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398441;STB=0.768678;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0343497;OID=.;OPOS=116152891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:22:22:7:8:0.266667:3:4:5:17:3:5:5:17
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chr9	116356373	.	G	C	955.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0720345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.551;QD=58.7795;RBI=0.0720412;REFB=0;REVB=-0.000983839;RO=0;SAF=19;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.91737e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261197;OID=.;OPOS=116356373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:46:19:0:0:46:19:0:0
chr9	116356516	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00381424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.106;QD=42.1826;RBI=0.0141396;REFB=0;REVB=0.0136154;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000370796;OID=.;OPOS=116356516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr9	116356529	.	C	G	102.31	PASS	AF=1;AO=7;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00903629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=347.866;QD=40.9222;RBI=0.083832;REFB=0;REVB=0.0833436;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283786;OID=.;OPOS=116356529;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:7:10:1:4:3:0:0:6:4:0:0
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chr9	116980089	.	T	C	86.53	PASS	AF=0.34375;AO=10;DP=31;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00782414;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.554;QD=10.8157;RBI=0.00806364;REFB=-0.012995;REVB=0.00195069;RO=21;SAF=2;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348953;STB=0.645683;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0235655;OID=.;OPOS=116980089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:31:32:21:21:10:11:0.34375:8:2:10:11:8:3:10:11
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chr9	117085635	.	TTTT	CTTT,TTTC	671.62	PASS	AF=0.942308,0.0384615;AO=37,2;DP=52;FAO=49,2;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=12,2;FSAR=37,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0704273,-0.0633211;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=35.5097,236.831;QD=51.663;RBI=0.0778255,0.0684881;REFB=-0.13203,0.0336477;REVB=0.033118,-0.0260972;RO=1;SAF=4,2;SAR=33,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0139855,0.697199;STB=0.506664,0.993266;STBP=0.639,0.227;TYPE=snp,snp;VARB=0.00590962,0.035637;OID=.,.;OPOS=117085635,117085638;OREF=T,T;OALT=C,C;OMAPALT=CTTT,TTTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:52:52:1:1:37,2:49,2:0.942308,0.0384615:33,0:4,2:0:1:37,0:12,2:0:1
chr9	117103973	.	A	G	259.03	PASS	AF=0.518519;AO=27;DP=53;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0126641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6337;QD=19.1871;RBI=0.0129906;REFB=-0.0289333;REVB=0.00289436;RO=26;SAF=12;SAR=15;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490108;STB=0.517229;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0284001;OID=.;OPOS=117103973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:26:26:27:28:0.518519:15:12:13:13:15:13:13:13
chr9	117110046	.	C	T	116.68	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.00943244;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.586;QD=11.6675;RBI=0.0597439;REFB=-0.0216087;REVB=-0.0589946;RO=26;SAF=10;SAR=4;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775238;STB=0.54615;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.032253;OID=.;OPOS=117110046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:4:10:17:9:4:10:17:9
chr9	117122202	.	C	T	990.52	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00969596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.782;QD=59.1357;RBI=0.0413353;REFB=0;REVB=0.040182;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011024;OID=.;OPOS=117122202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:32:34:0:0:33:34:0:0
chr9	117124731	.	G	A	520.0	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5796;QD=59.4283;RBI=0.0927456;REFB=0;REVB=0.0860327;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173824;OID=.;OPOS=117124731;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:24:11:0:0:24:11:0:0
chr9	117138278	.	C	T	91.77	PASS	AF=0.833333;AO=10;DP=12;FAO=10;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.942;QD=30.5909;RBI=0.0286034;REFB=2.05534e-06;REVB=0.0286034;RO=1;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000531196;OID=.;OPOS=117138278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:12:12:1:2:10:10:0.833333:10:0:0:1:10:0:0:2
chr9	117166246	.	A	G	417.77	PASS	AF=0.554054;AO=40;DP=73;FAO=41;FDP=74;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00277352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.034;QD=22.5821;RBI=0.0491991;REFB=-0.00746954;REVB=-0.0491208;RO=33;SAF=23;SAR=17;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049743;STB=0.520629;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.00512369;OID=.;OPOS=117166246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:33:33:40:41:0.554054:17:23:17:16:18:23:17:16
chr9	117166338	.	G	C	508.32	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0290986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.123;QD=56.4801;RBI=0.0791144;REFB=0.0247883;REVB=0.0735687;RO=1;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032238;STB=0.517231;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000111704;OID=.;OPOS=117166338;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:14:21:0:1:14:21:0:1
chr9	117169033	.	A	G	448.49	PASS	AF=0.46875;AO=45;DP=96;FAO=45;FDP=96;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0451784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5765;QD=18.687;RBI=0.0544919;REFB=-0.0140941;REVB=-0.0304676;RO=51;SAF=23;SAR=22;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174567;STB=0.509727;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0139452;OID=.;OPOS=117169033;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:51:51:45:45:0.46875:22:23:27:24:22:23:27:24
chr9	117186677	.	A	G	1201.42	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.035622;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.654;QD=60.0711;RBI=0.049445;REFB=-0.129956;REVB=0.034291;RO=1;SAF=35;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106383;STB=0.505617;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00092188;OID=.;OPOS=117186677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:80:80:1:1:79:79:0.9875:44:35:0:1:44:35:0:1
chr9	117188566	.	C	T	1703.01	PASS	AF=0.991667;AO=111;DP=117;FAO=119;FDP=120;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00074478;FXX=0.0243883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.129;QD=56.767;RBI=0.0304695;REFB=-0.126662;REVB=0.0304604;RO=0;SAF=72;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73502e-08;STB=0.503267;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000533276;OID=.;OPOS=117188566;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:117:120:0:1:111:119:0.991667:39:72:0:0:43:76:1:0
chr9	117377843	.	G	C	451.23	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00726068;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.541;QD=58.2231;RBI=0.0310404;REFB=0;REVB=0.0301793;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171353;OID=.;OPOS=117377843;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:12:18:0:0:12:19:0:0
chr9	117428960	.	T	C	155.81	PASS	AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0386668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6524;QD=10.934;RBI=0.0398951;REFB=-0.0180984;REVB=-0.00982347;RO=36;SAF=11;SAR=9;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372801;STB=0.511534;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0283164;OID=.;OPOS=117428960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:36:37:20:20:0.350877:9:11:21:15:9:11:21:16
chr9	117430611	.	A	T	420.86	PASS	AF=0.452632;AO=43;DP=96;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0155647;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.074;QD=17.7203;RBI=0.0240778;REFB=-0.018071;REVB=-0.0183706;RO=51;SAF=32;SAR=11;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236404;STB=0.629149;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0146615;OID=.;OPOS=117430611;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:95:51:52:43:43:0.452632:11:32:27:24:11:32:28:24
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chr9	117668142	.	C	T	419.57	PASS	AF=0.439252;AO=47;DP=108;FAO=47;FDP=107;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.00105231;FXX=0.0092584;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.11;QD=15.685;RBI=0.0172797;REFB=-0.0121929;REVB=0.0172476;RO=59;SAF=28;SAR=19;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121674;STB=0.573002;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0151841;OID=.;OPOS=117668142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:59:60:47:47:0.439252:19:28:28:31:19:28:28:32
chr9	117791664	.	C	T	322.89	PASS	AF=0.395604;AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.000732396;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.514;QD=14.193;RBI=0.00640881;REFB=-0.00522569;REVB=-0.00636682;RO=55;SAF=14;SAR=22;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129789;STB=0.573871;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00852045;OID=.;OPOS=117791664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:55:55:36:36:0.395604:22:14:28:27:22:14:28:27
chr9	117792583	.	C	G	1359.19	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.267;QD=62.4916;RBI=0.0467018;REFB=0;REVB=-0.00365762;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247121;OID=.;OPOS=117792583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:43:43:0:0:43:44:0:0
chr9	117797597	.	T	C	178.46	PASS	AF=0.403846;AO=20;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0180287;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.119;QD=13.7279;RBI=0.0193708;REFB=-0.0181948;REVB=0.00708497;RO=32;SAF=10;SAR=10;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332173;STB=0.523787;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0245039;OID=.;OPOS=117797597;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:32:31:20:21:0.403846:10:10:17:15:11:10:16:15
chr9	117808785	.	T	A	689.06	PASS	AF=0.474026;AO=72;DP=153;FAO=73;FDP=154;FR=.;FRO=81;FSAF=56;FSAR=17;FSRF=68;FSRR=13;FWDB=0.00190269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.333;QD=17.8976;RBI=0.0161851;REFB=-0.00858998;REVB=0.0160729;RO=80;SAF=56;SAR=16;SRF=67;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0869872;STB=0.55648;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00939652;OID=.;OPOS=117808785;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:154:80:81:72:73:0.474026:16:56:67:13:17:56:68:13
chr9	117835931	.	G	A	348.94	PASS	AF=0.404255;AO=38;DP=95;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0140755;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.606;QD=14.8487;RBI=0.0196899;REFB=-0.017468;REVB=0.0137686;RO=56;SAF=19;SAR=19;SRF=22;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112814;STB=0.563797;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0275582;OID=.;OPOS=117835931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:56:56:38:38:0.404255:19:19:22:34:19:19:22:34
chr9	117846570	.	C	T	1511.47	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.553;QD=63.6408;RBI=0.0166966;REFB=0;REVB=0.0058131;RO=0;SAF=52;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73189e-05;OID=.;OPOS=117846570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:95:0:0:94:95:1:42:52:0:0:43:52:0:0
chr9	117848197	.	C	T	141.21	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.023044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.081;QD=21.7251;RBI=0.0470134;REFB=0.00299265;REVB=-0.0409785;RO=11;SAF=9;SAR=6;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176946;STB=0.599867;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=-0.0031916;OID=.;OPOS=117848197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:6:9:4:7:6:9:4:7
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chr9	119463189	.	T	C	238.2	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0514601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.917;QD=20.2724;RBI=0.051901;REFB=-0.0183428;REVB=0.00675093;RO=24;SAF=15;SAR=8;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252528;STB=0.642333;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0318053;OID=.;OPOS=119463189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:8:15:9:15:8:15:9:15
chr9	119495697	.	T	C	1502.47	PASS	AF=1;AO=100;DP=103;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0033101;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=363.264;QD=59.5039;RBI=0.00863003;REFB=0;REVB=0.00796999;RO=0;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.97531e-05;OID=.;OPOS=119495697;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:103:101:0:0:100:101:1:54:46:0:0:54:47:0:0
chr9	119738452	.	C	T	316.68	PASS	AF=0.432099;AO=34;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=-0.00149669;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4251;QD=15.6386;RBI=0.00268111;REFB=0.00372316;REVB=-0.00222447;RO=45;SAF=17;SAR=17;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112084;STB=0.508111;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=-0.00742604;OID=.;OPOS=119738452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:45:46:34:35:0.432099:17:17:23:22:18:17:23:23
chr9	119770480	.	C	T	511.69	PASS	AF=0.336898;AO=63;DP=188;FAO=63;FDP=187;FR=.;FRO=124;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=69;FSRR=55;FWDB=-0.0155805;FXX=0.00531887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.37;QD=10.9452;RBI=0.0172126;REFB=0.0005174;REVB=-0.00731585;RO=119;SAF=37;SAR=26;SRF=65;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479214;STB=0.520939;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=-0.0010659;OID=.;OPOS=119770480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:187:119:124:63:63:0.336898:26:37:65:54:26:37:69:55
chr9	120039299	.	T	C	1832.11	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00223492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.197;QD=61.0702;RBI=0.022466;REFB=0;REVB=0.0223546;RO=0;SAF=59;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4761e-05;OID=.;OPOS=120039299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:120:0:0:114:120:1:55:59:0:0:59:61:0:0
chr9	120039324	.	GCTGAT	G	559.63	PASS	AF=0.513274;AO=55;DP=114;FAO=58;FDP=113;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.00772729;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=5;MLLD=280.693;QD=19.8098;RBI=0.012165;REFB=-0.00784602;REVB=0.00939557;RO=53;SAF=25;SAR=30;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148607;STB=0.599059;STBP=0.044;TYPE=del;VARB=0.00850038;OID=.;OPOS=120039325;OREF=CTGAT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.513274:55:114:58:113:55:25:33:35:20:99:53:25:30:33:20
chr9	120039469	.	C	T	581.14	PASS	AF=0.558824;AO=57;DP=102;FAO=57;FDP=102;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=14;FSRR=31;FWDB=0.0152553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.085;QD=22.7897;RBI=0.0177891;REFB=-0.013885;REVB=-0.00915022;RO=44;SAF=21;SAR=36;SRF=14;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435514;STB=0.52755;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0116312;OID=.;OPOS=120039469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:44:45:57:57:0.558824:36:21:14:30:36:21:14:31
chr9	120053776	.	T	C	1512.2	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138602;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.889;QD=59.8893;RBI=0.0267406;REFB=0;REVB=0.0228682;RO=0;SAF=64;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.04789e-05;OID=.;OPOS=120053776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:101:0:0:101:101:1:37:64:0:0:37:64:0:0
chr9	120470358	.	G	A	884.35	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.807;QD=57.9903;RBI=0.0281428;REFB=0;REVB=-0.0154393;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.27899e-05;OID=.;OPOS=120470358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:25:36:0:0:25:36:0:0
chr9	122001000	.	G	A	1347.48	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.425;QD=61.9531;RBI=0.0220111;REFB=0;REVB=0.0109551;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.03364e-06;OID=.;OPOS=122001000;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:85:87:1:49:36:0:0:49:38:0:0
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chr9	123929770	.	C	T	117.7	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00500745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.816;QD=12.3893;RBI=0.0336595;REFB=-0.00412132;REVB=0.0332849;RO=24;SAF=8;SAR=6;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164728;STB=0.596878;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.00854684;OID=.;OPOS=123929770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:6:8:10:14:6:8:10:14
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chr9	124547496	.	G	A	343.54	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202345;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1778;QD=52.8525;RBI=0.0221172;REFB=0;REVB=0.00892954;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00601721;OID=.;OPOS=124547496;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:26:26:0:0:25:26:1:13:12:0:0:13:13:0:0
chr9	124794020	.	G	T	180.52	PASS	AF=0.307692;AO=24;DP=78;FAO=24;FDP=78;FR=.;FRO=54;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.000855579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.111;QD=9.25746;RBI=0.00482054;REFB=0.0022428;REVB=-0.004744;RO=53;SAF=11;SAR=13;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596984;STB=0.528884;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=-0.00514566;OID=.;OPOS=124794020;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:53:54:24:24:0.307692:13:11:27:26:13:11:27:27
chr9	124855211	.	C	T	52.92	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0266527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.338;QD=21.1692;RBI=0.0992729;REFB=-0.00443024;REVB=0.0956281;RO=3;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.367917;STB=0.713672;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00409211;OID=.;OPOS=124855211;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:5:2:3:0:5:2:3:0
chr9	125133479	.	T	C	708.13	PASS	AF=0.980769;AO=50;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.035305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225;QD=54.4716;RBI=0.0355699;REFB=-0.0396325;REVB=0.00433324;RO=1;SAF=15;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303442;STB=0.515146;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.000515307;OID=.;OPOS=125133479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:50:51:0.980769:35:15:1:0:35:16:1:0
chr9	125152522	.	G	A	661.13	PASS	AF=0.546218;AO=65;DP=119;FAO=65;FDP=119;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.00160357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5166;QD=22.2227;RBI=0.0750059;REFB=0.00172647;REVB=0.0749887;RO=54;SAF=29;SAR=36;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136087;STB=0.574495;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.00125122;OID=.;OPOS=125152522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:54:54:65:65:0.546218:36:29:33:21:36:29:33:21
chr9	125239253	.	T	C	64.33	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0101182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.668;QD=23.3935;RBI=0.0371156;REFB=-0.0307467;REVB=-0.0357098;RO=3;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509198;STB=0.529336;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0195875;OID=.;OPOS=125239253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:2:6:2:1:2:6:2:1
chr9	125289521	.	G	A	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0161394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.496;QD=9.19905;RBI=0.0242361;REFB=-0.000158075;REVB=0.0180807;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476186;STB=0.529329;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.000433618;OID=.;OPOS=125289521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:4:3:5:8:4:3:5:8
chr9	125315542	.	C	T	342.03	PASS	AF=0.576271;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0021946;FXX=0.0483793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.982;QD=23.1882;RBI=0.00253733;REFB=-0.023697;REVB=0.00127349;RO=28;SAF=19;SAR=15;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104495;STB=0.535148;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0155849;OID=.;OPOS=125315542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:59:28:25:34:34:0.576271:15:19:16:12:15:19:16:9
chr9	125315557	.	T	C	957.16	PASS	AF=0.970588;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0240442;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6501;QD=56.3037;RBI=0.0513977;REFB=-0.154249;REVB=0.0454268;RO=1;SAF=32;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145365;STB=0.500446;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.00419026;OID=.;OPOS=125315557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:68:68:1:2:66:66:0.970588:34:32:1:0:34:32:1:1
chr9	125315778	.	G	C	1193.98	PASS	AF=0.987654;AO=79;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00484485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4243;QD=58.9622;RBI=0.052409;REFB=-0.116099;REVB=0.0521845;RO=2;SAF=29;SAR=50;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185588;STB=0.504853;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00168989;OID=.;OPOS=125315778;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:2:1:79:80:0.987654:50:29:0:2:51:29:0:1
chr9	125316033	.	T	C	502.19	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0529751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.743;QD=59.0813;RBI=0.0634816;REFB=0;REVB=0.0349792;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000263893;OID=.;OPOS=125316033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:20:13:0:0:21:13:0:0
chr9	125316042	.	T	C	465.66	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.477;QD=58.2073;RBI=0.0581673;REFB=0;REVB=-0.0076764;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181344;OID=.;OPOS=125316042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:21:10:0:0:21:11:0:0
chr9	125316179	.	T	G	724.55	PASS	AF=1;AO=51;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0800454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6391;QD=53.6701;RBI=0.0872144;REFB=-0.0857394;REVB=0.0346277;RO=2;SAF=20;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447795;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0069715;OID=.;OPOS=125316179;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:53:54:2:0:51:54:1:31:20:2:0:31:23:0:0
chr9	125316350	.	C	T	1713.92	PASS	AF=1;AO=113;DP=114;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00793499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6688;QD=59.6146;RBI=0.0310856;REFB=-0.070644;REVB=-0.0300558;RO=1;SAF=57;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00825764;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106716;OID=.;OPOS=125316350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:114:115:1:0:113:115:1:56:57:1:0:56:59:0:0
chr9	125316455	.	C	T	163.73	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.102138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.004;QD=13.3659;RBI=0.105858;REFB=-0.00696179;REVB=-0.0278172;RO=31;SAF=11;SAR=7;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13954;STB=0.581518;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0140601;OID=.;OPOS=125316455;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:7:11:15:16:7:11:15:16
chr9	125330125	.	C	G	344.6	PASS	AF=1;AO=22;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123038;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1731;QD=55.1359;RBI=0.0124028;REFB=0;REVB=0.00156371;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000243236;OID=.;OPOS=125330125;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:25:0:0:22:25:1:12:10:0:0:15:10:0:0
chr9	125330184	.	A	C	72.93	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0120597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.793;QD=20.8377;RBI=0.0193244;REFB=-0.00125995;REVB=0.0150995;RO=5;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289354;STB=0.666296;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.000578463;OID=.;OPOS=125330184;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:6:3:4:1:6:3:4:1
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chr9	125391369	.	A	G	55.83	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00540697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2689;QD=10.6336;RBI=0.00558962;REFB=-0.00034501;REVB=0.00141723;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104179;STB=0.506313;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.000708816;OID=.;OPOS=125391369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:5:3:5:8:5:3:5:8
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chr9	125423906	.	A	G	30.42	PASS	AF=0.109091;AO=6;DP=55;FAO=6;FDP=55;FR=.;FRO=49;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=0.0548121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9724;QD=2.21223;RBI=0.103259;REFB=0.00175901;REVB=0.0875103;RO=49;SAF=2;SAR=4;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378787;STB=0.776993;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=-0.000293497;OID=.;OPOS=125423906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:55:55:49:49:6:6:0.109091:4:2:33:16:4:2:33:16
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chr9	125512193	.	C	A	681.1	PASS	AF=0.981818;AO=47;DP=52;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.262013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=40.2998;QD=49.5348;RBI=0.271264;REFB=-0.132541;REVB=0.070237;RO=2;SAF=13;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211804;STB=0.50704;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0136202;OID=.;OPOS=125512193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:52:55:2:1:47:54:0.981818:34:13:1:1:35:19:0:1
chr9	125512575	.	G	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00947574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.445;QD=53.277;RBI=0.0095017;REFB=0;REVB=-0.000701937;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.57944e-05;OID=.;OPOS=125512575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr9	125512770	.	T	C	728.96	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00743556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1035;QD=57.1733;RBI=0.0646609;REFB=0;REVB=0.064232;RO=0;SAF=2;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000529824;OID=.;OPOS=125512770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:49:2:0:0:49:2:0:0
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chr9	125512795	.	G	C	1102.43	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0498484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.618;QD=58.7961;RBI=0.0547219;REFB=0.139359;REVB=-0.0225749;RO=1;SAF=8;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00711579;STB=0.503758;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=-0.00108221;OID=.;OPOS=125512795;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:1:1:74:74:0.986667:66:8:0:1:66:8:0:1
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chr9	125582173	.	C	T	743.63	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00208843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3451;QD=63.2877;RBI=0.0224248;REFB=0;REVB=0.0223273;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152822;OID=.;OPOS=125582173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:26:20:0:0:26:21:0:0
chr9	125611808	.	TAAAAAAAAT	TAAAAAAAT,TAAAAAAATA,TAAAAAATAT,TAAAAAT,TAATTAAAAT	363.0	PASS	AF=0.178571,0.0178571,0.0535714,0.714286,0.0357143;AO=4,2,2,4,2;DP=27;FAO=10,1,3,40,2;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=8,1,2,29,0;FSAR=2,0,1,11,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.428776,0.0142475,0.0322418,0.140607,0.0163789;FXX=0;HRUN=8,8,8,8,8;LEN=1,2,1,3,2;MLLD=5.25295,10.116,79.0452,10.426,110.46;QD=25.9286;RBI=0.429722,0.0161578,0.0375682,0.140954,0.0351109;REFB=0,0,0,0,0;REVB=0.0284947,-0.00762113,-0.0192829,0.00988171,-0.0310565;RO=2;SAF=4,2,2,1,0;SAR=0,0,0,3,2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=0,0,0,-0.407562,-0.727176;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=del,mnp,snp,del,mnp;VARB=-0.363893,-0.643688,0.0522757,0.128927,0.0899485;OID=.,.,.,.,.;OPOS=125611809,125611816,125611815,125611809,125611811;OREF=A,AT,A,AAA,AA;OALT=-,TA,T,-,TT;OMAPALT=TAAAAAAAT,TAAAAAAATA,TAAAAAATAT,TAAAAAT,TAATTAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/4:0.178571,0.0178571,0.0535714,0.714286,0.0357143:4,2,2,4,2:27:10,1,3,40,2:56:0:8,1,2,29,0:2,0,1,11,2:0:0:22:2:4,2,2,1,0:0,0,0,3,2:2:0
chr9	125637471	.	A	T	667.72	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00940368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.873;QD=60.7021;RBI=0.0395878;REFB=0;REVB=0.0384547;RO=1;SAF=22;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208679;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.89673e-05;OID=.;OPOS=125637471;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:44:44:1:0:43:44:1:21:22:1:0:21:23:0:0
chr9	125637648	.	T	C	305.85	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2721;QD=53.1914;RBI=0.0765877;REFB=0;REVB=0.0729196;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.002455;OID=.;OPOS=125637648;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:10:12:0:0:11:12:0:0
chr9	125652757	.	G	A	293.52	PASS	AF=0.417722;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0123523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.591;QD=14.8619;RBI=0.0152689;REFB=-0.0162755;REVB=-0.00897549;RO=42;SAF=15;SAR=18;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092336;STB=0.539147;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0209168;OID=.;OPOS=125652757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:42:46:33:33:0.417722:18:15:23:19:18:15:24:22
chr9	125866070	.	G	C	697.5	PASS	AF=0.619048;AO=65;DP=105;FAO=65;FDP=105;FR=.;FRO=40;FSAF=44;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0146521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.213;QD=26.5714;RBI=0.0162084;REFB=-0.0186554;REVB=0.00693024;RO=40;SAF=44;SAR=21;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116122;STB=0.56318;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0161678;OID=.;OPOS=125866070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:40:40:65:65:0.619048:21:44:21:19:21:44:21:19
chr9	125920376	.	G	A	98.33	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0421537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.6346;QD=14.0474;RBI=0.073107;REFB=0.00444766;REVB=-0.0597303;RO=15;SAF=9;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294635;STB=0.691969;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.0115434;OID=.;OPOS=125920376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:15:16:12:12:0.428571:3:9:7:8:3:9:7:9
chr9	126028395	.	C	G	837.12	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0257971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.05;QD=55.8081;RBI=0.0336705;REFB=-0.133031;REVB=0.0216382;RO=0;SAF=40;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.7823e-08;STB=0.506171;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.000813149;OID=.;OPOS=126028395;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:60:0:1:59:59:0.983333:19:40:0:0:19:40:1:0
chr9	126125318	.	C	A	1567.88	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0928;QD=63.9953;RBI=0.096917;REFB=0;REVB=0.0946544;RO=0;SAF=44;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00043532;OID=.;OPOS=126125318;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:98:0:0:97:98:1:53:44:0:0:54:44:0:0
chr9	126132919	.	G	A	103.49	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0144892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.468;QD=18.8165;RBI=0.0764467;REFB=-0.0039246;REVB=0.075061;RO=10;SAF=2;SAR=10;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163889;STB=0.595062;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0217181;OID=.;OPOS=126132919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:10:2:3:7:10:2:3:7
chr9	126133497	.	C	T	171.21	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.0245759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.224;QD=17.5599;RBI=0.0466381;REFB=-0.0132586;REVB=-0.0396376;RO=21;SAF=14;SAR=4;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213159;STB=0.512181;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0191085;OID=.;OPOS=126133497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:4:14:16:5:4:14:16:5
chr9	126133547	.	T	C	364.3	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.499;QD=53.9697;RBI=0.142212;REFB=0;REVB=0.0587475;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00159113;OID=.;OPOS=126133547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:14:12:0:0:15:12:0:0
chr9	126136139	.	C	T	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0116217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9829;QD=16.2008;RBI=0.0116217;REFB=-0.106642;REVB=0;RO=3;SAF=5;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0383929;OID=.;OPOS=126136139;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:0:5:3:0:0:5:3:0
chr9	126136247	.	A	G	214.9	PASS	AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=-0.0352972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.625;QD=13.0241;RBI=0.115248;REFB=-0.00289096;REVB=-0.109709;RO=40;SAF=15;SAR=11;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137337;STB=0.578182;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00417546;OID=.;OPOS=126136247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:11:15:28:12:11:15:28:12
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chr9	127231774	.	C	G	228.52	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00144519;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.062;QD=16.0368;RBI=0.00423493;REFB=-0.0111645;REVB=0.00398071;RO=31;SAF=16;SAR=10;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668104;STB=0.537786;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0132542;OID=.;OPOS=127231774;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:10:16:17:14:10:16:17:14
chr9	127298215	.	A	AC,C	47.71	PASS	AF=0.112676,0.084507;AO=8,7;DP=72;FAO=8,6;FDP=71;FR=.;FRO=57;FSAF=4,3;FSAR=4,3;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-4.68139e-05,-0.00910952;FXX=0.0273935;HRUN=0,3;LEN=1,1;MLLD=63.8905,77.0391;QD=2.68793;RBI=0.00139314,0.0232109;REFB=-0.00560422,-0.00250153;REVB=-0.00139236,-0.0213486;RO=54;SAF=5,4;SAR=3,3;SRF=30;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.08562,0.0188911;STB=0.553713,0.555373;STBP=0.768,0.806;TYPE=ins,snp;VARB=0.148496,0.0286692;OID=.,.;OPOS=127298216,127298215;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:72:71:54:57:8,7:8,6:0.112676,0.084507:3,3:5,4:30:24:4,3:4,3:32:25
chr9	127369679	.	C	T	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0749539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.754;QD=59.8367;RBI=0.0749558;REFB=0;REVB=0.00053304;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199055;OID=.;OPOS=127369679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr9	127563364	.	G	A	670.24	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.042;QD=62.3477;RBI=0.0506824;REFB=0;REVB=0.0456525;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295702;OID=.;OPOS=127563364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0
chr9	127566378	.	A	C,G	789.25	PASS	AF=0.0357143,0.964286;AO=2,54;DP=56;FAO=2,54;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=2,39;FSAR=0,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00903284,-0.0177688;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=103.333,147.62;QD=56.375;RBI=0.0131587,0.0677866;REFB=0,0;REVB=0.00956864,-0.0654163;RO=0;SAF=2,39;SAR=0,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0877915,-0.00536924;OID=.,.;OPOS=127566378,127566378;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:56:56:0:0:2,54:2,54:0.0357143,0.964286:0,15:2,39:0:0:0,15:2,39:0:0
chr9	127616537	.	A	G	538.13	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0377518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4487;QD=59.7921;RBI=0.0418654;REFB=0;REVB=-0.0180974;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000930516;OID=.;OPOS=127616537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr9	127618776	.	A	G	501.37	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00839485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.087;QD=58.9845;RBI=0.00845107;REFB=0;REVB=0.000973155;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102472;OID=.;OPOS=127618776;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:11:23:0:0:11:23:0:0
chr9	127618839	.	C	G	683.66	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5263;QD=62.1511;RBI=0.0163485;REFB=0;REVB=-0.00115253;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214258;OID=.;OPOS=127618839;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:21:22:0:0:22:22:0:0
chr9	127643456	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.691;QD=52.6128;RBI=0.017894;REFB=0;REVB=-0.0141923;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.16314e-05;OID=.;OPOS=127643456;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0
chr9	127661645	.	G	A	1469.2	PASS	AF=1;AO=97;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0660847;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8414;QD=59.9674;RBI=0.0701828;REFB=0;REVB=0.0236311;RO=0;SAF=55;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158678;OID=.;OPOS=127661645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:98:0:0:97:98:1:42:55:0:0:43:55:0:0
chr9	127674200	.	A	C	868.23	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.317;QD=57.8821;RBI=0.0450473;REFB=0;REVB=0.00951065;RO=0;SAF=23;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132121;OID=.;OPOS=127674200;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:37:23:0:0:37:23:0:0
chr9	127818276	.	C	T	300.48	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0645421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.91;QD=23.1139;RBI=0.0653537;REFB=-0.0190814;REVB=0.0102682;RO=19;SAF=13;SAR=17;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00882078;STB=0.509109;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.010726;OID=.;OPOS=127818276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:19:22:30:30:0.576923:17:13:8:11:17:13:10:12
chr9	127962916	.	G	A	221.79	PASS	AF=0.6;AO=21;DP=33;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0520822;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.526;QD=25.347;RBI=0.0522062;REFB=-0.0323295;REVB=0.0035961;RO=11;SAF=16;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166249;STB=0.561342;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0247439;OID=.;OPOS=127962916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:35:11:14:21:21:0.6:5:16:6:5:5:16:9:5
chr9	127996046	.	A	G	268.63	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.00274093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.932;QD=22.3855;RBI=0.0130986;REFB=-0.0133634;REVB=0.0128087;RO=23;SAF=14;SAR=11;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120183;STB=0.566958;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0197396;OID=.;OPOS=127996046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:11:14:16:7:11:14:16:7
chr9	128074807	.	T	C	785.16	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0094929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7724;QD=57.1022;RBI=0.0481175;REFB=0;REVB=0.0471718;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000542941;OID=.;OPOS=128074807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:22:33:0:0:22:33:0:0
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chr9	129102840	.	G	A	706.63	PASS	AF=0.980769;AO=49;DP=51;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0347031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.01;QD=54.3558;RBI=0.0410631;REFB=-0.116329;REVB=0.0219516;RO=1;SAF=20;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229468;STB=0.511107;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000813985;OID=.;OPOS=129102840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:52:1:1:49:51:0.980769:29:20:1:0:29:22:1:0
chr9	129143435	.	A	G	725.08	PASS	AF=1;AO=42;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.094;QD=56.8691;RBI=0.0311182;REFB=0;REVB=0.026063;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190247;OID=.;OPOS=129143435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:42:51:1:24:18:0:0:30:21:0:0
chr9	129143436	.	T	G	38.69	PASS	AF=0.137255;AO=7;DP=51;FAO=7;FDP=51;FR=.;FRO=44;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0864368;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.6829;QD=3.03437;RBI=0.0864459;REFB=-0.021746;REVB=0.00125205;RO=44;SAF=1;SAR=6;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412037;STB=0.80672;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.092619;OID=.;OPOS=129143436;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:51:51:44:44:7:7:0.137255:6:1:20:24:6:1:20:24
chr9	129265715	.	C	G	1494.91	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144457;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6616;QD=63.613;RBI=0.110907;REFB=0;REVB=0.109963;RO=0;SAF=63;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000604015;OID=.;OPOS=129265715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:94:0:0:94:94:1:31:63:0:0:31:63:0:0
chr9	129453229	.	A	G	489.44	PASS	AF=0.485981;AO=52;DP=107;FAO=52;FDP=107;FR=.;FRO=55;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.00263343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.82;QD=18.2969;RBI=0.0105439;REFB=-0.0522489;REVB=-0.0102097;RO=55;SAF=30;SAR=22;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046734;STB=0.525921;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.056294;OID=.;OPOS=129453229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:55:55:52:52:0.485981:22:30:29:26:22:30:29:26
chr9	129595667	.	C	T	227.47	PASS	AF=0.385714;AO=26;DP=71;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.0487429;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5746;QD=12.9982;RBI=0.0498081;REFB=0.00367264;REVB=-0.0102461;RO=38;SAF=12;SAR=14;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126729;STB=0.582031;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.00521421;OID=.;OPOS=129595667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:38:43:26:27:0.385714:14:12:13:25:14:13:15:28
chr9	129595895	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.44;QD=58.5875;RBI=0.0485638;REFB=0;REVB=0.0100097;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185707;OID=.;OPOS=129595895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr9	129597065	.	C	T	68.7	PASS	AF=0.357143;AO=9;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=-0.0308585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.461;QD=9.81494;RBI=0.0322543;REFB=-0.0330206;REVB=0.00938574;RO=18;SAF=4;SAR=5;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.484008;STB=0.789038;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0457839;OID=.;OPOS=129597065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:28:28:18:18:9:10:0.357143:5:4:16:2:6:4:16:2
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chr9	129646734	.	TTTGTTGTTGTTG	TTTGTTGTTG,TTTGTTGTTGT	492.83	PASS	AF=0.626168,0.046729;AO=27,9;DP=89;FAO=67,5;FDP=107;FR=.;FRO=35;FSAF=30,1;FSAR=37,4;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.00315027,-0.0037529;FXX=0.0613981;HRUN=2,2;LEN=3,2;MLLD=173.512,173.506;QD=18.4234;RBI=0.0161133,0.0173004;REFB=-0.0254906,-0.0233783;REVB=0.0158024,0.0168885;RO=0;SAF=5,1;SAR=22,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.526621,0.682117;STBP=0.464,0.468;TYPE=del,del;VARB=0.0131551,0.0138022;OID=.,.;OPOS=129646735,129646745;OREF=TTG,TG;OALT=-,-;OMAPALT=TTTGTTGTTG,TTTGTTGTTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.626168,0.046729:27,9:89:67,5:107:35:30,1:37,4:13:22:99:0:5,1:22,8:0:0
chr9	129646775	.	A	G	1234.44	PASS	AF=0.987805;AO=17;DP=91;FAO=81;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257694;FXX=0.108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.594;QD=60.2165;RBI=0.0440224;REFB=0;REVB=0.0356919;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00228773;OID=.;OPOS=129646775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:91:82:0:0:17:81:0.987805:10:7:0:0:53:28:0:0
chr9	129752239	.	C	T	726.56	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.075;QD=56.9849;RBI=0.0558813;REFB=0;REVB=0.0365223;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00030805;OID=.;OPOS=129752239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0
chr9	129831659	.	T	A	918.04	PASS	AF=0.893333;AO=68;DP=76;FAO=67;FDP=75;FR=.;FRO=8;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.00352475;FXX=0.0131562;HRUN=9;LEN=1;MLLD=245.543;QD=48.9624;RBI=0.022952;REFB=-0.0583529;REVB=0.0226798;RO=8;SAF=35;SAR=33;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218859;STB=0.512541;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000228141;OID=.;OPOS=129831659;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:76:75:8:8:68:67:0.893333:33:35:5:3:33:34:5:3
chr9	130242166	.	A	G	1377.5	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0755299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.802;QD=62.6135;RBI=0.0815867;REFB=0;REVB=0.0308485;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000163921;OID=.;OPOS=130242166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:44:44:0:0:44:44:0:0
chr9	130245217	.	AT	A	114.15	PASS	AF=0.677966;AO=29;DP=59;FAO=40;FDP=59;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.159414;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=7.29091;QD=7.73916;RBI=0.197495;REFB=-0.115777;REVB=-0.116582;RO=22;SAF=11;SAR=18;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20112;STB=0.558591;STBP=0.184;TYPE=del;VARB=0.123305;OID=.;OPOS=130245218;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.677966:29:59:40:59:19:16:24:11:8:47:22:11:18:14:8
chr9	130259618	.	A	C	632.22	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6431;QD=61.6799;RBI=0.045763;REFB=0;REVB=-0.0338201;RO=0;SAF=7;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33091e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.22802e-05;OID=.;OPOS=130259618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:34:7:0:0:34:7:0:0
chr9	130494957	.	T	C	1624.13	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.173;QD=60.1531;RBI=0.0644012;REFB=0;REVB=0.0363013;RO=0;SAF=45;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.69741e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.58923e-05;OID=.;OPOS=130494957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:63:45:0:0:63:45:0:0
chr9	130536717	.	G	A	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00409226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.585;QD=58.5878;RBI=0.0335903;REFB=0;REVB=0.0333401;RO=0;SAF=2;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.37487e-05;OID=.;OPOS=130536717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:31:2:0:0:31:2:0:0
chr9	130630639	.	A	G	1283.44	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.956;QD=61.8525;RBI=0.0692306;REFB=0;REVB=0.0683484;RO=0;SAF=46;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58535e-05;OID=.;OPOS=130630639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:83:0:0:80:83:1:34:46:0:0:36:47:0:0
chr9	130647583	.	T	C	1553.05	PASS	AF=0.989899;AO=97;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0177393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6743;QD=62.7494;RBI=0.0972761;REFB=-0.0391981;REVB=-0.095645;RO=1;SAF=49;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00958098;STB=0.504949;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=7.71628e-05;OID=.;OPOS=130647583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:99:99:1:1:97:98:0.989899:48:49:1:0:48:50:1:0
chr9	130648680	.	G	A	523.75	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00187385;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.648;QD=59.8571;RBI=0.0232003;REFB=0;REVB=-0.0231245;RO=0;SAF=29;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61498e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000135831;OID=.;OPOS=130648680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:6:29:0:0:6:29:0:0
chr9	130670310	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00878456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.815;QD=48.7373;RBI=0.0430557;REFB=0;REVB=0.0421501;RO=0;SAF=15;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106383;OID=.;OPOS=130670310;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:2:15:0:0:2:15:0:0
chr9	130690412	.	G	C	501.2	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0141206;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.811;QD=58.9644;RBI=0.0312584;REFB=0;REVB=0.0278872;RO=0;SAF=7;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.75695e-05;OID=.;OPOS=130690412;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:27:7:0:0:27:7:0:0
chr9	130698029	.	G	C	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.67;QD=58.9626;RBI=0.0401725;REFB=0;REVB=-0.0373122;RO=0;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.25986e-05;OID=.;OPOS=130698029;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:40:26:0:0:40:26:0:0
chr9	130698043	.	A	G	990.05	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.672;QD=59.1074;RBI=0.0743572;REFB=0;REVB=0.056447;RO=0;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000212936;OID=.;OPOS=130698043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:41:26:0:0:41:26:0:0
chr9	130703789	.	G	A	884.58	PASS	AF=0.984127;AO=59;DP=60;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00445869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7346;QD=56.1636;RBI=0.072506;REFB=-0.0602017;REVB=0.0723688;RO=0;SAF=23;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506491;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00111127;OID=.;OPOS=130703789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:60:63:0:1:59:62:0.984127:36:23:0:0:38:24:0:1
chr9	130703852	.	A	AAAC	266.19	PASS	AF=0.88;AO=15;DP=30;FAO=22;FDP=25;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0458974;FXX=0.0384468;HRUN=4;LEN=3;MLLD=238.365;QD=42.5904;RBI=0.049215;REFB=-0.0446192;REVB=0.0177637;RO=13;SAF=4;SAR=11;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244954;STB=0.503933;STBP=0.959;TYPE=ins;VARB=0.00504532;OID=.;OPOS=130703853;OREF=-;OALT=AAC;OMAPALT=AAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.88:15:30:22:25:3:8:14:1:2:14:13:4:11:7:6
chr9	130705220	.	C	T	210.19	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0323544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3472;QD=19.5521;RBI=0.056875;REFB=-0.0260571;REVB=0.0467756;RO=22;SAF=15;SAR=6;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289366;STB=0.664173;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0462003;OID=.;OPOS=130705220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:6:15:9:13:6:15:9:13
chr9	130707081	.	A	G	828.11	PASS	AF=1;AO=59;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017885;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.042;QD=54.3024;RBI=0.0178947;REFB=-0.143094;REVB=-0.000589868;RO=2;SAF=35;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261996;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00296298;OID=.;OPOS=130707081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:61:61:2:0:59:61:1:24:35:2:0:24:37:0:0
chr9	130829039	.	A	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00885947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.143;QD=53.9109;RBI=0.0193915;REFB=0;REVB=-0.0172494;RO=0;SAF=18;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.54468e-05;OID=.;OPOS=130829039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:6:18:0:0:6:18:0:0
chr9	130860866	.	T	C	1377.51	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00215086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.285;QD=62.6141;RBI=0.0359593;REFB=0;REVB=0.0358949;RO=0;SAF=38;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49151e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77767e-05;OID=.;OPOS=130860866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:50:38:0:0:50:38:0:0
chr9	130864676	.	T	C	556.99	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.3331;QD=60.2152;RBI=0.0519569;REFB=0;REVB=0.0480872;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244197;OID=.;OPOS=130864676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:13:24:0:0:13:24:0:0
chr9	130869499	.	A	T	944.19	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124378;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2389;QD=59.0119;RBI=0.0276409;REFB=0;REVB=0.0246844;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184885;OID=.;OPOS=130869499;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:63:64:1:34:29:0:0:35:29:0:0
chr9	130883511	.	C	T	2584.69	PASS	AF=1;AO=167;DP=167;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.954;QD=61.9088;RBI=0.0249035;REFB=0;REVB=0.020254;RO=0;SAF=90;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.3312e-05;OID=.;OPOS=130883511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:167:167:0:0:167:167:1:77:90:0:0:77:90:0:0
chr9	130942789	.	C	T	329.55	PASS	AF=0.428571;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=-0.0137679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.046;QD=15.6927;RBI=0.0137789;REFB=-0.0100918;REVB=0.00054859;RO=46;SAF=20;SAR=16;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339606;STB=0.531897;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0156995;OID=.;OPOS=130942789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:46:48:36:36:0.428571:16:20:24:22:16:20:24:24
chr9	130965795	.	C	A	277.0	PASS	AF=0.390244;AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0240227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.718;QD=13.5123;RBI=0.0266919;REFB=-0.0189179;REVB=0.0116349;RO=50;SAF=21;SAR=11;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130751;STB=0.574831;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0360433;OID=.;OPOS=130965795;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:50:50:32:32:0.390244:11:21:27:23:11:21:27:23
chr9	130984755	.	C	T	786.49	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0382412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.462;QD=55.1924;RBI=0.042928;REFB=0.0218399;REVB=0.0195045;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.508194;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.000150645;OID=.;OPOS=130984755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:0:1:56:56:0.982456:26:30:0:0:26:30:1:0
chr9	131085373	.	G	C	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.838;QD=64.4154;RBI=0.0273762;REFB=0;REVB=0.0170187;RO=0;SAF=18;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.18772e-06;OID=.;OPOS=131085373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:32:18:0:0:32:18:0:0
chr9	131235321	.	A	G	379.76	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147997;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.617;QD=56.261;RBI=0.0148688;REFB=0;REVB=0.00143184;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000241956;OID=.;OPOS=131235321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr9	131346218	.	A	C	1306.1	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0263383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.355;QD=60.749;RBI=0.0282913;REFB=-0.100917;REVB=0.0103293;RO=1;SAF=54;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00869298;STB=0.504586;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000439964;OID=.;OPOS=131346218;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:1:1:85:85:0.988372:31:54:1:0:31:54:1:0
chr9	131353800	.	G	A	178.41	PASS	AF=0.296296;AO=24;DP=81;FAO=24;FDP=81;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=41;FSRR=16;FWDB=0.0280168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.632;QD=8.81043;RBI=0.0321566;REFB=-0.0025699;REVB=0.0157831;RO=56;SAF=17;SAR=7;SRF=40;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00855007;STB=0.509403;STBP=0.939;TYPE=snp;VARB=0.00697179;OID=.;OPOS=131353800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:56:57:24:24:0.296296:7:17:40:16:7:17:41:16
chr9	131371956	.	A	AT,T	36.73	PASS	AF=0.3,0;AO=10,2;DP=46;FAO=12,0;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=3,0;FSAR=9,0;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0891546,0.0440884;FXX=0;HRUN=7,2;LEN=1,1;MLLD=7.63792,31.1036;QD=3.67276;RBI=0.124569,0.0503485;REFB=-0.0596912,-0.0401141;REVB=0.0869996,0.0243144;RO=29;SAF=4,0;SAR=6,2;SRF=10;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0695676,-0.40267;STB=0.642602,0.5;STBP=0.252,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0720377,0;OID=.,.;OPOS=131371957,131371956;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:46:40:29:28:10,2:12,0:0.3,0:6,2:4,0:10:19:9,0:3,0:12:16
chr9	131375701	.	A	G	1087.84	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188142;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4461;QD=59.6079;RBI=0.0240549;REFB=0;REVB=0.0149888;RO=0;SAF=53;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.15237e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000794073;OID=.;OPOS=131375701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:19:53:0:0:20:53:0:0
chr9	131390472	.	C	A	289.48	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00978374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.501;QD=52.6325;RBI=0.0393163;REFB=0;REVB=0.0380795;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118048;OID=.;OPOS=131390472;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:13:8:0:0:14:8:0:0
chr9	131397395	.	C	T	2403.83	PASS	AF=1;AO=156;DP=156;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=101;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6426;QD=61.2441;RBI=0.0604226;REFB=0;REVB=0.036963;RO=0;SAF=100;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139184;OID=.;OPOS=131397395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:156:157:0:0:156:157:1:56:100:0:0:56:101:0:0
chr9	131465167	.	A	G	441.48	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.8569;QD=56.9656;RBI=0.0630555;REFB=0;REVB=-0.0619692;RO=1;SAF=18;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251989;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00121051;OID=.;OPOS=131465167;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:1:0:30:31:1:12:18:1:0:12:19:0:0
chr9	131479023	.	T	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.178;QD=56.9383;RBI=0.0281148;REFB=0;REVB=0.016184;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.04848e-05;OID=.;OPOS=131479023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0
chr9	131483741	.	G	A	253.73	PASS	AF=0.638889;AO=23;DP=36;FAO=23;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0351926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.557;QD=28.1924;RBI=0.037572;REFB=-0.0462356;REVB=-0.013158;RO=13;SAF=8;SAR=15;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292134;STB=0.516115;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0195747;OID=.;OPOS=131483741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:13:13:23:23:0.638889:15:8:4:9:15:8:4:9
chr9	131483749	.	T	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00912402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.892;QD=58.1421;RBI=0.0118976;REFB=0;REVB=-0.0076358;RO=0;SAF=9;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.89258e-06;OID=.;OPOS=131483749;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:23:9:0:0:23:9:0:0
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chr9	131570274	.	C	T	224.92	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0127588;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.8;QD=19.9929;RBI=0.0156482;REFB=-0.027766;REVB=0.00905978;RO=23;SAF=7;SAR=15;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194578;STB=0.610175;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0267025;OID=.;OPOS=131570274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:15:7:12:11:15:7:12:11
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chr9	131585069	.	A	G	393.06	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.934;QD=56.1519;RBI=0.0466571;REFB=0;REVB=-0.0455659;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167237;OID=.;OPOS=131585069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:8:20:0:0:8:20:0:0
chr9	131588652	.	T	C	130.44	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6197;QD=43.4795;RBI=0.0643529;REFB=0;REVB=-0.0571149;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000811906;OID=.;OPOS=131588652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0
chr9	131670457	.	T	C	199.48	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0272269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.69;QD=15.6454;RBI=0.0413637;REFB=0.00339026;REVB=0.0311392;RO=29;SAF=16;SAR=6;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439568;STB=0.749779;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00240612;OID=.;OPOS=131670457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:6:16:8:21:6:16:8:21
chr9	131670919	.	T	C	393.25	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.711;QD=56.179;RBI=0.0406073;REFB=0;REVB=0.0366699;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000669024;OID=.;OPOS=131670919;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:13:14:0:0:13:15:0:0
chr9	131765796	.	G	T	238.87	PASS	AF=0.358025;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0236151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9675;QD=11.7962;RBI=0.0284845;REFB=0.000759583;REVB=0.0159279;RO=52;SAF=13;SAR=16;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148755;STB=0.508585;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=-0.00164865;OID=.;OPOS=131765796;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:52:52:29:29:0.358025:16:13:24:28:16:13:24:28
chr9	131767668	.	A	C	332.08	PASS	AF=0.618182;AO=30;DP=54;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.023898;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.2408;QD=24.1511;RBI=0.109899;REFB=-0.107458;REVB=-0.107269;RO=15;SAF=17;SAR=13;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181302;STB=0.573726;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0493666;OID=.;OPOS=131767668;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:15:21:30:34:0.618182:13:17:4:11:13:21:9:12
chr9	131804785	.	T	C	506.89	PASS	AF=0.545455;AO=48;DP=88;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0192399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7326;QD=23.0404;RBI=0.0194084;REFB=-0.0316234;REVB=0.00255195;RO=40;SAF=25;SAR=23;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0996288;STB=0.554746;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0428757;OID=.;OPOS=131804785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:40:40:48:48:0.545455:23:25:16:24:23:25:16:24
chr9	131846957	.	T	C	1005.15	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.956;QD=59.1267;RBI=0.0514701;REFB=0;REVB=0.029628;RO=0;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100749;OID=.;OPOS=131846957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:31:37:0:0:31:37:0:0
chr9	131860900	.	A	AT	903.16	PASS	AF=0.985294;AO=8;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0690032;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=140.497;QD=53.1269;RBI=0.0693009;REFB=0.0199425;REVB=0.00641654;RO=58;SAF=0;SAR=8;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.658428;STB=0.506847;STBP=0.495;TYPE=ins;VARB=3.26987e-05;OID=.;OPOS=131860901;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.985294:8:67:67:68:1:31:36:0:1:3:58:0:8:30:28
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chr9	132377900	.	C	T	86.73	PASS	AF=0.228571;AO=7;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0254507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.2427;QD=9.91162;RBI=0.0339556;REFB=-0.00911452;REVB=-0.0224776;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789762;STB=0.612635;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.118137;OID=.;OPOS=132377900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:35:35:22:23:7:8:0.228571:3:4:14:8:4:4:15:8
chr9	132400480	.	G	A	35.95	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0274307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.578;QD=6.25133;RBI=0.0394142;REFB=-0.0130096;REVB=0.0283025;RO=17;SAF=5;SAR=1;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122428;STB=0.581099;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0302616;OID=.;OPOS=132400480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:1:5:13:4:1:5:13:4
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chr9	132591509	.	A	G	146.62	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0190923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.8463;QD=17.2495;RBI=0.0429148;REFB=-0.027782;REVB=-0.0384339;RO=18;SAF=12;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964265;STB=0.555483;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0292978;OID=.;OPOS=132591509;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:4:12:12:6:4:12:12:6
chr9	132597021	.	C	T	1218.21	PASS	AF=0.415385;AO=134;DP=325;FAO=135;FDP=325;FR=.;FRO=190;FSAF=67;FSAR=68;FSRF=69;FSRR=121;FWDB=-0.074671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4773;QD=14.9934;RBI=0.0991514;REFB=-0.0351157;REVB=-0.0652321;RO=189;SAF=66;SAR=68;SRF=68;SRR=121;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139983;STB=0.577918;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0463772;OID=.;OPOS=132597021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:325:325:189:190:134:135:0.415385:68:66:68:121:68:67:69:121
chr9	132618578	.	T	C	654.56	PASS	AF=1;AO=37;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.411;QD=62.3393;RBI=0.0770873;REFB=0;REVB=0.0198506;RO=0;SAF=9;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256036;OID=.;OPOS=132618578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:37:42:1:28:9:0:0:28:14:0:0
chr9	132620364	.	T	C	682.47	PASS	AF=1;AO=35;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.195529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.266;QD=62.0431;RBI=0.19573;REFB=0;REVB=0.00887524;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0017092;OID=.;OPOS=132620364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:35:44:1:21:14:0:0:21:23:0:0
chr9	132623293	.	C	T	306.64	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.127644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1619;QD=53.3287;RBI=0.143883;REFB=0;REVB=0.0664035;RO=0;SAF=2;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0021167;OID=.;OPOS=132623293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:21:23:1:19:2:0:0:20:3:0:0
chr9	132623868	.	T	C	1224.93	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00485942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.308;QD=61.2466;RBI=0.0149416;REFB=0;REVB=0.0141293;RO=0;SAF=36;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.45509e-05;OID=.;OPOS=132623868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:44:36:0:0:44:36:0:0
chr9	132630664	.	TGAC	T	53.03	PASS	AF=1;AO=5;DP=7;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438819;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=3;MLLD=241.275;QD=35.3536;RBI=0.062967;REFB=0;REVB=0.0451577;RO=0;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000794052;OID=.;OPOS=132630665;OREF=GAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:7:6:6:0:5:1:0:0:3:0:4:1:0:0
chr9	132631680	.	T	C	389.19	PASS	AF=0.966667;AO=28;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0145098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.896;QD=51.8925;RBI=0.0258833;REFB=-0.012882;REVB=0.0214338;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.523793;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0011218;OID=.;OPOS=132631680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:0:1:28:29:0.966667:19:9:0:0:19:10:1:0
chr9	132636030	.	CA	C,CG	431.9	PASS	AF=0.225806,0.774194;AO=7,24;DP=31;FAO=7,24;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=7,10;FSAR=0,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263855,0.00809568;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=74.5704,94.4558;QD=55.7292;RBI=0.0422938,0.0212514;REFB=0,0;REVB=-0.0330541,-0.019649;RO=0;SAF=7,10;SAR=0,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0233661,0.00854218;OID=.,.;OPOS=132636031,132636031;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.225806,0.774194:7,24:31:7,24:31:0:7,10:0,14:0:0:26:0:7,10:0,14:0:0
chr9	132636033	.	TG	CG,GC	432.1	PASS	AF=0.774194,0.225806;AO=24,7;DP=31;FAO=24,7;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10,7;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286701,-0.0496432;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=121.814,95.45;QD=55.7551;RBI=0.0472718,0.0566979;REFB=0,0;REVB=0.0375852,0.0273898;RO=0;SAF=10,7;SAR=14,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00233893,0.0873888;OID=.,.;OPOS=132636033,132636033;OREF=T,TG;OALT=C,GC;OMAPALT=CG,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:36:31:31:0:0:24,7:24,7:0.774194,0.225806:14,0:10,7:0:0:14,0:10,7:0:0
chr9	132637712	.	G	A	274.23	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0276661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.71;QD=24.9299;RBI=0.0320323;REFB=-0.0571046;REVB=-0.0161448;RO=19;SAF=14;SAR=11;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188021;STB=0.604235;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0205145;OID=.;OPOS=132637712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:11:14:6:13:11:14:6:13
chr9	132649662	.	A	G,T	928.46	PASS	AF=0.969231,0.0307692;AO=60,4;DP=64;FAO=63,2;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=32,2;FSAR=31,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184954,-0.028503;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=189.53,146.24;QD=57.1357;RBI=0.0893995,0.0809648;REFB=0,0;REVB=0.0874654,0.0757817;RO=0;SAF=29,4;SAR=31,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.73709e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00355377,0.040337;OID=.,.;OPOS=132649662,132649662;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:64:65:0:0:60,4:63,2:0.969231,0.0307692:31,0:29,4:0:0:31,0:32,2:0:0
chr9	132662786	.	C	T	130.72	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.0907945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3725;QD=13.76;RBI=0.0909357;REFB=-0.00564681;REVB=0.00506561;RO=22;SAF=6;SAR=9;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.368281;STB=0.71974;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00748526;OID=.;OPOS=132662786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:23:15:15:0.394737:9:6:17:5:9:6:18:5
chr9	132671359	.	T	TG	255.7	PASS	AF=1;AO=27;DP=50;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.15392;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.98306;QD=23.7864;RBI=0.16027;REFB=-0.0304208;REVB=0.0446668;RO=19;SAF=10;SAR=17;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806243;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.012638;OID=.;OPOS=132671360;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:27:50:43:43:0:14:29:0:0:4:19:10:17:9:10
chr9	132686186	.	A	G	1471.39	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00134975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.298;QD=63.2855;RBI=0.00769044;REFB=0;REVB=0.00757107;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.00309e-05;OID=.;OPOS=132686186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:92:93:1:49:43:0:0:50:43:0:0
chr9	132872686	.	A	G	708.49	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0449;QD=62.9773;RBI=0.0289529;REFB=0;REVB=0.00565893;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000311452;OID=.;OPOS=132872686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr9	132883161	.	C	CCTT	1698.59	PASS	AF=0.936;AO=111;DP=130;FAO=117;FDP=125;FR=.;FRO=8;FSAF=57;FSAR=60;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.00139633;FXX=0.0234357;HRUN=3;LEN=3;MLLD=223.337;QD=54.355;RBI=0.0702734;REFB=-0.162175;REVB=0.0702595;RO=13;SAF=54;SAR=57;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103038;STB=0.524801;STBP=0.054;TYPE=ins;VARB=0.00672959;OID=.;OPOS=132883162;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.936:111:130:117:125:8:57:60:7:1:22:13:54:57:7:6
chr9	132904650	.	C	T	527.62	PASS	AF=0.509091;AO=53;DP=100;FAO=56;FDP=110;FR=.;FRO=54;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=-0.025593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.487;QD=19.1863;RBI=0.0264873;REFB=-0.0105649;REVB=0.0068246;RO=47;SAF=29;SAR=24;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0313588;STB=0.5102;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0134011;OID=.;OPOS=132904650;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:110:47:54:53:56:0.509091:24:29:24:23:25:31:31:23
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chr9	133284310	.	G	A	333.17	PASS	AF=0.666667;AO=28;DP=42;FAO=28;FDP=42;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0912275;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.332;QD=31.7303;RBI=0.0926047;REFB=-0.0475878;REVB=0.0159117;RO=14;SAF=6;SAR=22;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220258;STB=0.621644;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.010697;OID=.;OPOS=133284310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:14:14:28:28:0.666667:22:6:7:7:22:6:7:7
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chr9	133884820	.	T	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0207267;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5839;QD=52.6131;RBI=0.0208928;REFB=0;REVB=0.0026296;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000448313;OID=.;OPOS=133884820;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
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chr9	133948049	.	A	G	1596.91	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.778;QD=59.1447;RBI=0.073153;REFB=0;REVB=0.0521599;RO=0;SAF=46;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182133;OID=.;OPOS=133948049;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:98:108:0:0:98:108:1:52:46:0:0:57:51:0:0
chr9	133951230	.	C	T	335.39	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0352552;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.7486;QD=16.9816;RBI=0.0444458;REFB=-0.0129988;REVB=0.0270648;RO=43;SAF=23;SAR=13;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172504;STB=0.596917;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00947917;OID=.;OPOS=133951230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:43:43:36:36:0.455696:13:23:20:23:13:23:20:23
chr9	133986980	.	T	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205438;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.898;QD=53.9112;RBI=0.0315337;REFB=0;REVB=0.0239233;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140989;OID=.;OPOS=133986980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr9	133987060	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000997099;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.401;QD=51.1846;RBI=0.0387858;REFB=0;REVB=0.038773;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122605;OID=.;OPOS=133987060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr9	134020092	.	C	T	180.98	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00572261;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.774;QD=22.6225;RBI=0.0373362;REFB=-0.043966;REVB=0.036895;RO=13;SAF=11;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170469;STB=0.580895;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0085862;OID=.;OPOS=134020092;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:14:18:18:0.5625:7:11:5:8:7:11:6:8
chr9	134021630	.	A	G	428.65	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.169853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4343;QD=57.1529;RBI=0.175463;REFB=0;REVB=0.044012;RO=0;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00248427;OID=.;OPOS=134021630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:24:6:0:0:24:6:0:0
chr9	134133539	.	G	T	736.53	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.235;QD=62.6831;RBI=0.0604762;REFB=0;REVB=-0.0070857;RO=0;SAF=13;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217725;OID=.;OPOS=134133539;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:43:47:1:30:13:0:0:31:16:0:0
chr9	134136515	.	A	G	1510.5	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.586;QD=59.8216;RBI=0.0523442;REFB=0;REVB=-0.0359117;RO=0;SAF=58;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81716e-06;OID=.;OPOS=134136515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:42:58:0:0:42:59:0:0
chr9	134136677	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.492;QD=55.0979;RBI=0.0282866;REFB=0;REVB=0.0126472;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158731;OID=.;OPOS=134136677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr9	134183379	.	C	T	541.61	PASS	AF=0.421429;AO=59;DP=141;FAO=59;FDP=140;FR=.;FRO=81;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=48;FSRR=33;FWDB=-0.0213613;FXX=0.0070917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0204;QD=15.4745;RBI=0.0288726;REFB=-0.0212403;REVB=0.0194247;RO=81;SAF=32;SAR=27;SRF=48;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524899;STB=0.529402;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0515925;OID=.;OPOS=134183379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:140:81:81:59:59:0.421429:27:32:48:33:27:32:48:33
chr9	134183503	.	T	C	442.83	PASS	AF=0.449541;AO=49;DP=109;FAO=49;FDP=109;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=18;FWDB=-0.0485613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.734;QD=16.2507;RBI=0.0543755;REFB=-0.0759692;REVB=0.0244642;RO=60;SAF=26;SAR=23;SRF=42;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170254;STB=0.59464;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0526043;OID=.;OPOS=134183503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:60:60:49:49:0.449541:23:26:42:18:23:26:42:18
chr9	134346315	.	T	C	411.05	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2534;QD=56.6964;RBI=0.0805163;REFB=0;REVB=-0.070136;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000580939;OID=.;OPOS=134346315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0
chr9	134350323	.	C	G	214.27	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0490796;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.131;QD=45.1089;RBI=0.0521058;REFB=-0.0660587;REVB=0.0174988;RO=1;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437188;STB=0.523783;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00130992;OID=.;OPOS=134350323;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:10:8:0:1:10:8:0:1
chr9	134350458	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109482;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=152.557;QD=60.6103;RBI=0.0497031;REFB=0;REVB=0.0484823;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147974;OID=.;OPOS=134350458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr9	134350647	.	T	C	451.25	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00634356;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.83;QD=58.2255;RBI=0.0171661;REFB=0;REVB=0.015951;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177812;OID=.;OPOS=134350647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr9	134351065	.	G	T	437.56	PASS	AF=0.914286;AO=32;DP=35;FAO=32;FDP=35;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.106675;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.8525;QD=50.0071;RBI=0.135755;REFB=-0.122808;REVB=0.0839629;RO=1;SAF=27;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845286;STB=0.527669;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0115555;OID=.;OPOS=134351065;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:35:35:1:3:32:32:0.914286:5:27:0:1:5:27:2:1
chr9	134351343	.	C	T	42.47	PASS	AF=0.21875;AO=7;DP=32;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0733556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.1423;QD=5.30887;RBI=0.0828614;REFB=-0.00928595;REVB=-0.0385352;RO=23;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045161;STB=0.509065;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0381613;OID=.;OPOS=134351343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:32:32:23:25:7:7:0.21875:4:3:9:14:4:3:11:14
chr9	134351660	.	G	A	97.31	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.00244285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.689;QD=12.9747;RBI=0.0163937;REFB=-0.0134285;REVB=-0.0162107;RO=18;SAF=9;SAR=3;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279999;STB=0.66637;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0163912;OID=.;OPOS=134351660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:3:9:9:9:3:9:9:9
chr9	134373770	.	G	C	267.66	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0529185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.601;QD=50.9831;RBI=0.0810425;REFB=0;REVB=-0.06138;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00312294;OID=.;OPOS=134373770;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0
chr9	134385436	.	A	G	972.75	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.061;QD=58.9545;RBI=0.011787;REFB=0;REVB=-0.00166933;RO=0;SAF=27;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.96172e-05;OID=.;OPOS=134385436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:39:27:0:0:39:27:0:0
chr9	134386744	.	T	C	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.099;QD=56.9569;RBI=0.0236484;REFB=0;REVB=0.00871391;RO=0;SAF=14;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.76537e-05;OID=.;OPOS=134386744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:38:14:0:0:38:14:0:0
chr9	134387488	.	T	C	557.11	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00822634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.604;QD=60.2282;RBI=0.023896;REFB=0;REVB=0.0224354;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37486e-05;OID=.;OPOS=134387488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:18:19:0:0:18:19:0:0
chr9	134401335	.	C	T	428.85	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.142;QD=57.1801;RBI=0.0345694;REFB=0;REVB=0.00947737;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260529;OID=.;OPOS=134401335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
chr9	134406071	.	C	G	255.88	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.117632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.362;QD=51.175;RBI=0.11814;REFB=0;REVB=0.0109376;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000869139;OID=.;OPOS=134406071;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr9	134453976	.	G	A	199.46	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0074267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.028;QD=15.6439;RBI=0.0671455;REFB=-0.017238;REVB=0.0667335;RO=29;SAF=14;SAR=8;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122984;STB=0.570305;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0151351;OID=.;OPOS=134453976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:8:14:15:14:8:14:15:14
chr9	134600816	.	G	A	43.68	PASS	AF=0.75;AO=5;DP=7;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0723377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.958;QD=21.8388;RBI=0.0737116;REFB=0.0492792;REVB=0.0141651;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190062;STB=0.545299;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=-0.00328182;OID=.;OPOS=134600816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:8:2:2:5:6:0.75:4:1:1:1:4:2:1:1
chr9	134658234	.	G	A	248.78	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00708962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.584;QD=19.5118;RBI=0.0128091;REFB=-0.0139358;REVB=0.0106682;RO=25;SAF=13;SAR=13;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525473;STB=0.529389;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0123603;OID=.;OPOS=134658234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:13:13:14:11:13:13:14:11
chr9	135102254	.	C	T	806.31	PASS	AF=0.461538;AO=84;DP=182;FAO=84;FDP=182;FR=.;FRO=98;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=65;FSRR=33;FWDB=-0.0212623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.968;QD=17.721;RBI=0.0280431;REFB=-0.0133556;REVB=-0.0182847;RO=97;SAF=38;SAR=46;SRF=65;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208583;STB=0.612119;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0144921;OID=.;OPOS=135102254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:182:182:97:98:84:84:0.461538:46:38:65:32:46:38:65:33
chr9	135105964	.	A	G	1135.45	PASS	AF=1;AO=72;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.052389;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9555;QD=58.9844;RBI=0.0547719;REFB=0;REVB=-0.0159797;RO=0;SAF=20;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00385785;OID=.;OPOS=135105964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:72:77:1:52:20:0:0:52:25:0:0
chr9	135114365	.	G	A	298.81	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=64;FAO=32;FDP=64;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.0119856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.071;QD=18.6756;RBI=0.0120148;REFB=-0.0115386;REVB=-0.000837156;RO=32;SAF=21;SAR=11;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0636119;STB=0.535377;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0115849;OID=.;OPOS=135114365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:32:32:32:32:0.5:11:21:23:9:11:21:23:9
chr9	135139826	.	T	C	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.00942123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.776;QD=11.9536;RBI=0.0587264;REFB=-0.00290119;REVB=-0.0579658;RO=11;SAF=6;SAR=2;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132829;STB=0.580431;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.00641885;OID=.;OPOS=135139826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:2:6:7:4:2:6:7:4
chr9	135139901	.	T	C	53.69	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.00577381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5282;QD=7.95399;RBI=0.0231251;REFB=-0.00792096;REVB=0.0223927;RO=19;SAF=6;SAR=2;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469121;STB=0.788797;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0191732;OID=.;OPOS=135139901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:2:6:6:13:2:6:6:13
chr9	135172412	.	A	G	311.93	PASS	AF=0.397727;AO=35;DP=88;FAO=35;FDP=88;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=0.00861775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.504;QD=14.1785;RBI=0.00935696;REFB=-0.00943644;REVB=-0.00364515;RO=53;SAF=18;SAR=17;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156306;STB=0.588455;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.00833141;OID=.;OPOS=135172412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:53:53:35:35:0.397727:17:18:35:18:17:18:35:18
chr9	135173685	.	T	C	250.13	PASS	AF=0.491228;AO=27;DP=55;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0115814;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=109.163;QD=17.5528;RBI=0.0644913;REFB=-0.00263815;REVB=-0.0634428;RO=28;SAF=16;SAR=11;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197941;STB=0.507687;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.00277961;OID=.;OPOS=135173685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:28:29:27:28:0.491228:11:16:16:12:12:16:17:12
chr9	135202829	.	T	C	187.94	PASS	AF=0.47619;AO=19;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00967063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.363;QD=17.899;RBI=0.0286065;REFB=0.00997183;REVB=0.0269223;RO=23;SAF=10;SAR=9;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03751;STB=0.547572;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=-0.0071531;OID=.;OPOS=135202829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:22:19:20:0.47619:9:10:13:10:10:10:13:9
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chr9	135203409	.	A	C	266.15	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0101273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.65;QD=21.2919;RBI=0.013831;REFB=-0.042817;REVB=0.00941985;RO=25;SAF=9;SAR=16;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111642;STB=0.562763;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0461786;OID=.;OPOS=135203409;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:25:25:25:0.5:16:9:12:13:16:9:12:13
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chr9	135296997	.	TGAGAATCCTGGGTTCTCATGCTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCTGTG	T	50.0	PASS	AO=52;DP=59;LEN=76;RO=7;SAF=35;SAR=20;SRF=3;SRR=1;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=135296998;OREF=GAGAATCCTGGGTTCTCATGCTCTGGTTTCTCTTCAAATCGTATAAATCTTTCGCCTTTTACTAAAGATTTCTGTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	1/1:99:59:7:52:20:35:3:1
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chr9	135448320	.	C	A	826.08	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=62;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000673798;FXX=0.0483793;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.96;QD=56.0056;RBI=0.0133615;REFB=0.0221886;REVB=-0.0133445;RO=1;SAF=34;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136737;STB=0.507244;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-4.02045e-05;OID=.;OPOS=135448320;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:62:59:1:1:58:58:0.983051:24:34:1:0:24:34:1:0
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chr9	135554566	.	G	A	810.67	PASS	AF=0.966667;AO=58;DP=61;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0152309;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1177;QD=54.0444;RBI=0.0233657;REFB=-0.0354213;REVB=-0.0177194;RO=1;SAF=29;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159891;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0203233;OID=.;OPOS=135554566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:61:60:1:2:58:58:0.966667:29:29:1:0:29:29:1:1
chr9	135763816	.	C	T	393.6	PASS	AF=0.526316;AO=38;DP=74;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0108574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.236;QD=20.7157;RBI=0.0113001;REFB=-0.0261054;REVB=0.00313221;RO=34;SAF=14;SAR=24;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01425;STB=0.519327;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0253739;OID=.;OPOS=135763816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:34:36:38:40:0.526316:24:14:12:22:24:16:13:23
chr9	135771332	.	GA	G,GG	108.96	PASS	AF=0.571429,0.047619;AO=9,2;DP=19;FAO=12,1;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=9,1;FSAR=3,0;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0123912,0.0171317;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=24.3233,23.1144;QD=20.7551;RBI=0.0125188,0.0186926;REFB=0.00184825,-0.0510401;REVB=-0.0017831,-0.00747787;RO=7;SAF=6,2;SAR=3,0;SRF=5;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.041038,0.539624;STB=0.5,0.984745;STBP=0.973,0.541;TYPE=del,snp;VARB=-0.00397369,-0.0487559;OID=.,.;OPOS=135771333,135771333;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.571429,0.047619:9,2:19:12,1:21:8:9,1:3,0:6:2:51:7:6,2:3,0:5:2
chr9	135771980	.	GAAA	GAA,GAAG	218.08	PASS	AF=1,0;AO=14,2;DP=21;FAO=20,0;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0;FSAR=4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.237713,0.085846;FXX=0.0475964;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=17.436,7.9335;QD=43.6156;RBI=0.238678,0.101072;REFB=0,0;REVB=0.0214432,0.0533482;RO=3;SAF=10,2;SAR=4,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.118465,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0166373,0;OID=.,.;OPOS=135771981,135771983;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=GAA,GAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:14,2:21:20,0:20:0:16,0:4,0:0:0:3:3:10,2:4,0:3:0
chr9	135782221	.	T	C	125.22	PASS	AF=0.3125;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.00308841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0671;QD=10.4349;RBI=0.0523171;REFB=-0.00944453;REVB=0.0522259;RO=33;SAF=3;SAR=12;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.570668;STB=0.836798;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0222641;OID=.;OPOS=135782221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:33:33:15:15:0.3125:12:3:24:9:12:3:24:9
chr9	135786904	.	A	G	363.26	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.00405421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.91;QD=18.1631;RBI=0.0120516;REFB=-0.0150829;REVB=0.0113492;RO=42;SAF=13;SAR=25;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220379;STB=0.623249;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0178969;OID=.;OPOS=135786904;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:25:13:24:18:25:13:24:18
chr9	135821099	.	C	T	261.95	PASS	AF=0.47541;AO=28;DP=60;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0474895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.479;QD=17.1771;RBI=0.0475106;REFB=-0.0229642;REVB=0.00141774;RO=32;SAF=18;SAR=10;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140351;STB=0.565071;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.027073;OID=.;OPOS=135821099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:32:32:28:29:0.47541:10:18:16:16:11:18:16:16
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chr9	135930735	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.522;QD=37.4885;RBI=0.114451;REFB=0;REVB=0.0415605;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00289574;OID=.;OPOS=135930735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
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chr9	135961809	.	T	C	131.31	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.00568163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.047;QD=14.1955;RBI=0.0131466;REFB=-0.00241354;REVB=-0.0118555;RO=22;SAF=7;SAR=8;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305018;STB=0.673874;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00453736;OID=.;OPOS=135961809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:8:7:4:18:8:7:4:18
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chr9	135973678	.	C	T	67.97	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00943167;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.9926;QD=12.358;RBI=0.0309925;REFB=-0.0222531;REVB=0.0295225;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865477;STB=0.533258;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.048259;OID=.;OPOS=135973678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:23:22:12:13:9:9:0.409091:6:3:5:7:6:3:5:8
chr9	135974079	.	G	C	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.366;QD=61.3358;RBI=0.0644354;REFB=0;REVB=0.0462848;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000413129;OID=.;OPOS=135974079;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:25:15:0:0:25:15:0:0
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chr9	136308542	.	C	G,T	1477.25	PASS	AF=0.0631579,0.936842;AO=6,88;DP=94;FAO=6,89;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=6,42;FSAR=0,47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00309704,0.0638251;FXX=0.0206164;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=166.595,69.3041;QD=62.2001;RBI=0.00409572,0.0638592;REFB=0,0;REVB=-0.00268017,0.00208551;RO=0;SAF=6,42;SAR=0,46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.178903,0.000465818;OID=.,.;OPOS=136308542,136308542;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:94:95:0:0:6,88:6,89:0.0631579,0.936842:0,46:6,42:0:0:0,47:6,42:0:0
chr9	136328657	.	T	C	1029.84	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.112468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.198;QD=58.0192;RBI=0.116519;REFB=-0.0836424;REVB=0.030459;RO=1;SAF=32;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145457;STB=0.50769;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00024444;OID=.;OPOS=136328657;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:38:32:1:0:38:32:1:0
chr9	136340200	.	T	G	1181.0	PASS	AF=0.963855;AO=72;DP=75;FAO=80;FDP=83;FR=.;FRO=3;FSAF=55;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0300268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.789;QD=56.9157;RBI=0.0913012;REFB=-0.0450825;REVB=0.0862224;RO=3;SAF=54;SAR=18;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410271;STB=0.514728;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.000983026;OID=.;OPOS=136340200;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:75:83:3:3:72:80:0.963855:18:54:1:2:25:55:1:2
chr9	136379890	.	A	G	719.16	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203666;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.486;QD=62.5353;RBI=0.0241556;REFB=0;REVB=-0.0129883;RO=0;SAF=13;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167439;OID=.;OPOS=136379890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:32:13:0:0:33:13:0:0
chr9	136412170	.	C	T	315.17	PASS	AF=0.465753;AO=35;DP=74;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.00162712;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.681;QD=17.2695;RBI=0.0037374;REFB=-0.0269673;REVB=-0.00336461;RO=39;SAF=20;SAR=15;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198184;STB=0.620949;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0304174;OID=.;OPOS=136412170;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:39:39:35:34:0.465753:15:20:14:25:14:20:14:25
chr9	136412236	.	A	T	358.41	PASS	AF=0.452381;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.0327256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.988;QD=17.067;RBI=0.0328272;REFB=-0.00278367;REVB=0.00258057;RO=46;SAF=24;SAR=14;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234592;STB=0.63151;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00376387;OID=.;OPOS=136412236;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:46:46:38:38:0.452381:14:24:18:28:14:24:18:28
chr9	136412255	.	A	C	344.02	PASS	AF=0.440476;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0257497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.725;QD=16.3818;RBI=0.0276915;REFB=0.00195695;REVB=-0.0101869;RO=47;SAF=25;SAR=12;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274116;STB=0.654365;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.00169779;OID=.;OPOS=136412255;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:47:47:37:37:0.440476:12:25:19:28:12:25:19:28
chr9	136419629	.	G	A	1771.51	PASS	AF=0.898551;AO=122;DP=138;FAO=124;FDP=138;FR=.;FRO=14;FSAF=59;FSAR=65;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0494705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.927;QD=51.3482;RBI=0.0565675;REFB=-0.163091;REVB=0.0274327;RO=11;SAF=59;SAR=63;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0617177;STB=0.512079;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.00352198;OID=.;OPOS=136419629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:138:138:11:14:122:124:0.898551:63:59:1:10:65:59:5:9
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chr9	136508640	.	G	A	732.99	PASS	AF=0.618182;AO=68;DP=110;FAO=68;FDP=110;FR=.;FRO=42;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.000567501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.078;QD=26.6543;RBI=0.011574;REFB=-0.0350146;REVB=-0.0115601;RO=42;SAF=32;SAR=36;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104157;STB=0.556487;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0347589;OID=.;OPOS=136508640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:42:42:68:68:0.618182:36:32:26:16:36:32:26:16
chr9	136518097	.	A	G	1629.36	PASS	AF=0.99115;AO=105;DP=105;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0303434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.669;QD=57.6763;RBI=0.0303442;REFB=-0.00804691;REVB=0.000215941;RO=0;SAF=58;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00123755;OID=.;OPOS=136518097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:113:0:1:105:112:0.99115:47:58:0:0:51:61:0:1
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chr9	136628770	.	T	C	1504.16	PASS	AF=1;AO=83;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0294229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.49;QD=59.5707;RBI=0.0533877;REFB=0;REVB=0.0445482;RO=0;SAF=36;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69144e-05;OID=.;OPOS=136628770;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:83:101:1:47:36:0:0:55:46:0:0
chr9	136628771	.	G	C	103.23	PASS	AF=0.174757;AO=16;DP=101;FAO=18;FDP=103;FR=.;FRO=85;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=49;FWDB=0.000853695;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=75.7957;QD=4.00909;RBI=0.0747153;REFB=-0.0814522;REVB=0.0747105;RO=85;SAF=8;SAR=8;SRF=36;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966256;STB=0.607559;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0192916;OID=.;OPOS=136628771;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:103:85:85:16:18:0.174757:8:8:36:49:8:10:36:49
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chr9	136898627	.	A	G	558.14	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061822;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.526;QD=60.3394;RBI=0.064353;REFB=0;REVB=0.0178702;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302138;OID=.;OPOS=136898627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr9	136907005	.	G	A	1147.0	PASS	AF=1;AO=67;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0481628;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=75.4727;QD=57.3501;RBI=0.0853722;REFB=0;REVB=0.0704894;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0101647;OID=.;OPOS=136907005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:80:80:0:0:67:80:1:37:30:0:0:38:42:0:0
chr9	136913355	.	T	C	1232.95	PASS	AF=1;AO=79;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329867;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.421;QD=61.6474;RBI=0.0348164;REFB=0;REVB=0.0111379;RO=0;SAF=27;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283769;OID=.;OPOS=136913355;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:80:0:0:79:80:1:52:27:0:0:52:28:0:0
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chr9	137690318	.	A	T	833.86	PASS	AF=1;AO=55;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119109;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8845;QD=55.5903;RBI=0.125551;REFB=0;REVB=0.0397018;RO=0;SAF=13;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70796e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00613837;OID=.;OPOS=137690318;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:0:0:55:60:1:42:13:0:0:45:15:0:0
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chr9	137711997	.	G	C	359.15	PASS	AF=0.457831;AO=38;DP=82;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.0323117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.5743;QD=17.3086;RBI=0.0545734;REFB=-0.0139665;REVB=-0.0439796;RO=44;SAF=23;SAR=15;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0368489;STB=0.527854;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0152162;OID=.;OPOS=137711997;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:44:45:38:38:0.457831:15:23:25:19:15:23:25:20
chr9	137775139	.	A	G	707.77	PASS	AF=0.946429;AO=52;DP=56;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0661871;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.1372;QD=50.5547;RBI=0.0770241;REFB=-0.114329;REVB=-0.0393953;RO=4;SAF=23;SAR=29;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0416339;STB=0.511529;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00581524;OID=.;OPOS=137775139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:56:56:4:3:52:53:0.946429:29:23:3:1:29:24:2:1
chr9	137775155	.	T	C	785.84	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.322;QD=64.1499;RBI=0.0498867;REFB=0;REVB=-0.0450653;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000215853;OID=.;OPOS=137775155;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0
chr9	137777132	.	G	A	263.12	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=23;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.0281373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9464;QD=26.3119;RBI=0.0305182;REFB=-0.0503885;REVB=0.0118173;RO=14;SAF=23;SAR=1;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.40275;STB=0.718503;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0387148;OID=.;OPOS=137777132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:40:14:16:24:24:0.6:1:23:11:3:1:23:13:3
chr9	137801014	.	G	A	119.54	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=35;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00112449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.153;QD=13.6618;RBI=0.0470116;REFB=-0.0274588;REVB=0.0469982;RO=21;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024428;STB=0.514265;STBP=0.948;TYPE=snp;VARB=0.0328275;OID=.;OPOS=137801014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:21:14:14:0.4:7:7:11:10:7:7:11:10
chr9	137801314	.	A	G	355.0	PASS	AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=-0.0322231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.788;QD=18.9332;RBI=0.0327542;REFB=-0.00770102;REVB=-0.00587491;RO=37;SAF=25;SAR=12;SRF=12;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315762;STB=0.681394;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0134821;OID=.;OPOS=137801314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:37:38:37:37:0.493333:12:25:12:25:12:25:12:26
chr9	137801800	.	T	C	553.84	PASS	AF=0.52;AO=52;DP=100;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.0454159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9722;QD=22.1534;RBI=0.0458707;REFB=0.00961686;REVB=0.00644282;RO=48;SAF=29;SAR=23;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412371;STB=0.522719;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.00928141;OID=.;OPOS=137801800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:48:48:52:52:0.52:23:29:29:19:23:29:29:19
chr9	137804360	.	A	G	37.78	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.0111427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2065;QD=9.44392;RBI=0.0247916;REFB=0.0122172;REVB=0.0221464;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0726992;STB=0.545299;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=-0.0192894;OID=.;OPOS=137804360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:4:2:4:6:4:2:4:6
chr9	137968919	.	G	GAA	1355.53	PASS	AF=1;AO=78;DP=94;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174825;FXX=0.0652103;HRUN=0;LEN=2;MLLD=277.458;QD=63.0477;RBI=0.0474756;REFB=0;REVB=0.0441395;RO=6;SAF=31;SAR=47;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032734;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=3.56417e-05;OID=.;OPOS=137968920;OREF=-;OALT=AA;OMAPALT=GAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:78:94:86:86:0:36:50:0:0:7:6:31:47:1:5
chr9	137978552	.	A	G	1119.64	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164981;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.599;QD=60.5209;RBI=0.0168977;REFB=0;REVB=-0.00365333;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000125263;OID=.;OPOS=137978552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:35:38:0:0:35:39:0:0
chr9	137982127	.	T	C	1569.9	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.12;QD=64.0773;RBI=0.0390367;REFB=0;REVB=0.0373388;RO=0;SAF=55;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44114e-05;OID=.;OPOS=137982127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:98:0:0:95:98:1:40:55:0:0:42:56:0:0
chr9	138236031	.	A	G	718.04	PASS	AF=0.428571;AO=57;DP=135;FAO=57;FDP=133;FR=.,HEALED;FRO=55;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=-0.016961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.161;QD=21.5953;RBI=0.0292227;REFB=-0.0192669;REVB=-0.0237969;RO=51;SAF=30;SAR=27;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164865;STB=0.579412;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0256462;OID=.;OPOS=138236031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:133:51:55:57:57:0.428571:27:30:17:34:27:30:20:35
chr9	138236212	.	T	G	572.32	PASS	AF=0.424658;AO=56;DP=140;FAO=62;FDP=146;FR=.;FRO=84;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=40;FSRR=44;FWDB=-0.0115102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.599;QD=15.68;RBI=0.0185327;REFB=-0.00397449;REVB=0.014525;RO=82;SAF=19;SAR=37;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15111;STB=0.5835;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00544761;OID=.;OPOS=138236212;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:146:82:84:56:62:0.424658:37:19:39:43:41:21:40:44
chr9	138376649	.	T	C	1153.56	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00648821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4144;QD=60.7137;RBI=0.0460161;REFB=0;REVB=0.0455564;RO=0;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247155;OID=.;OPOS=138376649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:33:43:0:0:33:43:0:0
chr9	138377657	.	T	C	1559.09	PASS	AF=1;AO=103;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00734331;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.791;QD=59.9651;RBI=0.0547149;REFB=0;REVB=0.0542199;RO=0;SAF=62;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194497;OID=.;OPOS=138377657;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:103:104:1:41:62:0:0:42:62:0:0
chr9	138377853	.	A	G	1038.96	PASS	AF=1;AO=59;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.575;QD=59.3692;RBI=0.055914;REFB=0;REVB=0.0515041;RO=0;SAF=42;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000463876;OID=.;OPOS=138377853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:59:70:1:17:42:0:0:28:42:0:0
chr9	138377915	.	G	A	358.07	PASS	AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00124813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7641;QD=22.3793;RBI=0.0215747;REFB=-0.0267021;REVB=0.0215385;RO=28;SAF=22;SAR=14;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0033082;STB=0.501824;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0203948;OID=.;OPOS=138377915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:28:28:36:36:0.5625:14:22:17:11:14:22:17:11
chr9	138378856	.	A	G	1227.5	PASS	AF=1;AO=78;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.227;QD=61.3748;RBI=0.0662791;REFB=0;REVB=-0.0523644;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.90442e-05;OID=.;OPOS=138378856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:78:80:1:39:39:0:0:39:41:0:0
chr9	138379002	.	T	G	555.41	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.45;QD=58.4636;RBI=0.112624;REFB=0;REVB=0.10873;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000535626;OID=.;OPOS=138379002;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:12:24:0:0:12:26:0:0
chr9	138379059	.	G	T	284.56	PASS	AF=0.508197;AO=28;DP=58;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.0118017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.1444;QD=18.6599;RBI=0.104351;REFB=-0.0503038;REVB=0.103681;RO=30;SAF=18;SAR=10;SRF=23;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130224;STB=0.567786;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0509007;OID=.;OPOS=138379059;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:61:30:30:28:31:0.508197:10:18:23:7:11:20:23:7
chr9	138391299	.	T	A	150.8	PASS	AF=0.365385;AO=17;DP=50;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0324842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9004;QD=11.5998;RBI=0.0328948;REFB=-0.0114314;REVB=0.00518116;RO=33;SAF=14;SAR=3;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310584;STB=0.597048;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0308184;OID=.;OPOS=138391299;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:33:33:17:19:0.365385:3:14:20:13:5:14:20:13
chr9	138394124	.	C	T	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0263292;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=192.183;QD=10.9409;RBI=0.0268397;REFB=-0.00371781;REVB=0.00521028;RO=17;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522142;STB=0.509537;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.00647751;OID=.;OPOS=138394124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:17:20:11:11:0.354839:4:7:10:7:4:7:13:7
chr9	138395122	.	G	A	381.06	PASS	AF=0.421569;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=102;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0171232;FXX=0.0377323;HRUN=4;LEN=1;MLLD=121.711;QD=14.9437;RBI=0.0294156;REFB=-0.0175514;REVB=-0.023918;RO=56;SAF=23;SAR=20;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189414;STB=0.514227;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0229204;OID=.;OPOS=138395122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:102:56:59:43:43:0.421569:20:23:31:25:20:23:33:26
chr9	138440525	.	C	G	1241.73	PASS	AF=0.895833;AO=86;DP=96;FAO=86;FDP=96;FR=.;FRO=10;FSAF=49;FSAR=37;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0363441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.126;QD=51.7389;RBI=0.0760937;REFB=-0.0727278;REVB=0.0668532;RO=6;SAF=49;SAR=37;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545608;STB=0.524621;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0078784;OID=.;OPOS=138440525;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:96:96:6:10:86:86:0.895833:37:49:6:0:37:49:8:2
chr9	138440527	.	T	C	1354.55	PASS	AF=0.947368;AO=89;DP=94;FAO=90;FDP=95;FR=.;FRO=5;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0136611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.116;QD=57.0339;RBI=0.0188096;REFB=-0.0371843;REVB=0.0129297;RO=4;SAF=50;SAR=39;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0364132;STB=0.523359;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.000674543;OID=.;OPOS=138440527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:94:95:4:5:89:90:0.947368:39:50:4:0:39:51:5:0
chr9	138440641	.	T	C	752.06	PASS	AF=1;AO=44;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.61;QD=56.7594;RBI=0.0602331;REFB=0;REVB=0.0148195;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031975;OID=.;OPOS=138440641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:44:53:1:18:26:0:0:21:32:0:0
chr9	138518010	.	A	G	1540.16	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00691218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.284;QD=59.8122;RBI=0.00691262;REFB=0;REVB=-7.80304e-05;RO=0;SAF=68;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.52853e-06;OID=.;OPOS=138518010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:103:0:0:102:103:1:34:68:0:0:34:69:0:0
chr9	138523332	.	C	A	1408.97	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=4.68083e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.34;QD=62.6211;RBI=0.028296;REFB=0;REVB=0.0282959;RO=0;SAF=35;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.32331e-05;OID=.;OPOS=138523332;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:90:0:0:85:90:1:50:35:0:0:53:37:0:0
chr9	138586198	.	G	A	614.65	PASS	AF=0.956522;AO=37;DP=45;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0126861;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=232.42;QD=53.448;RBI=0.0360699;REFB=-0.0175742;REVB=0.0337654;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.50099;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.000835335;OID=.;OPOS=138586198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:45:46:0:2:37:44:0.956522:17:20:0:0:21:23:1:1
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chr9	138905136	.	C	T	554.57	PASS	AF=0.405063;AO=64;DP=158;FAO=64;FDP=158;FR=.;FRO=94;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=43;FSRR=51;FWDB=0.00602797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8076;QD=14.0398;RBI=0.00605814;REFB=-0.0270212;REVB=-0.000603837;RO=92;SAF=34;SAR=30;SRF=41;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0896813;STB=0.543825;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0551822;OID=.;OPOS=138905136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:92:94:64:64:0.405063:30:34:41:51:30:34:43:51
chr9	139142710	.	G	A	206.77	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00858796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.541;QD=48.6507;RBI=0.0202668;REFB=0;REVB=0.0183573;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24748e-05;OID=.;OPOS=139142710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr9	139142808	.	T	C	589.86	PASS	AF=1;AO=34;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4935;QD=60.4984;RBI=0.106013;REFB=0;REVB=0.102273;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00407834;OID=.;OPOS=139142808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:34:39:1:21:13:0:0:24:15:0:0
chr9	139235526	.	C	A	278.86	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00794909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.001;QD=21.8713;RBI=0.0167963;REFB=-0.0177582;REVB=-0.0147962;RO=23;SAF=14;SAR=14;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0176448;STB=0.509797;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0319156;OID=.;OPOS=139235526;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:14:14:12:11:14:14:12:11
chr9	139235606	.	G	C	137.88	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0121037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.366;QD=19.0177;RBI=0.0158703;REFB=-0.05343;REVB=0.0102647;RO=14;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208276;STB=0.618885;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0423853;OID=.;OPOS=139235606;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:5:10:6:8:5:10:6:8
chr9	139252495	.	G	A,C	3236.45	PASS	AF=0.930876,0.0599078;AO=203,12;DP=217;FAO=202,13;FDP=217;FR=.;FRO=2;FSAF=107,13;FSAR=95,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0259877,0.0102332;FXX=0.00458695;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=105.704,105.201;QD=59.658;RBI=0.0762098,0.0194899;REFB=-0.140564,-0.0404222;REVB=0.071642,-0.0165872;RO=1;SAF=109,11;SAR=94,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00435001,-0.0393232;STB=0.504629,0.5;STBP=0.223,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00084363,0.090537;OID=.,.;OPOS=139252495,139252495;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:27:217:217:1:2:203,12:202,13:0.930876,0.0599078:94,1:109,11:1:0:95,0:107,13:2:0
chr9	139256468	.	C	G	723.13	PASS	AF=0.435754;AO=78;DP=180;FAO=78;FDP=179;FR=.;FRO=101;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=62;FSRR=39;FWDB=-0.00249135;FXX=0.00555525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.175;QD=16.1594;RBI=0.00350397;REFB=-0.0203454;REVB=0.00246394;RO=101;SAF=45;SAR=33;SRF=62;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038585;STB=0.521483;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.025663;OID=.;OPOS=139256468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:179:101:101:78:78:0.435754:33:45:62:39:33:45:62:39
chr9	139256541	.	C	T	936.18	PASS	AF=0.445055;AO=64;DP=189;FAO=81;FDP=182;FR=.,HEALED;FRO=63;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=49;FSRR=14;FWDB=0.00330281;FXX=0.010869;HRUN=4;LEN=1;MLLD=214.645;QD=20.5753;RBI=0.00420664;REFB=-0.0285047;REVB=0.00260523;RO=50;SAF=35;SAR=29;SRF=41;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227737;STB=0.638079;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0317625;OID=.;OPOS=139256541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:182:50:63:64:81:0.445055:29:35:41:9:44:37:49:14
chr9	139273402	.	C	T	676.62	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00487984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.699;QD=61.5111;RBI=0.0717745;REFB=0;REVB=0.0716084;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110897;OID=.;OPOS=139273402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:17:26:0:0:17:27:0:0
chr9	139343718	.	TCTG	TTG,TTGT,TTTG	763.48	PASS	AF=0.0363636,0,0.963636;AO=14,4,37;DP=57;FAO=2,0,53;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,19;FSAR=2,0,34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101177,0.0932222,0.0899863;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,3,1;MLLD=180.599,131.906,188.724;QD=55.5259;RBI=0.101178,0.0939411,0.0899873;REFB=0,0,0;REVB=0.000503079,-0.0115999,0.000422506;RO=0;SAF=8,4,5;SAR=6,0,32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=-0.00989797,-0.060808,0.0117953;OID=.,.,.;OPOS=139343719,139343719,139343719;OREF=C,CTG,C;OALT=-,TGT,T;OMAPALT=TTG,TTGT,TTTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.0363636,0,0.963636:14,4,37:57:2,0,53:55:0:0,0,19:2,0,34:0:0:6:0:8,4,5:6,0,32:0:0
chr9	139389432	.	C	T	1055.77	PASS	AF=0.925;AO=74;DP=80;FAO=74;FDP=80;FR=.;FRO=6;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0551345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.201;QD=52.7885;RBI=0.0602384;REFB=-0.0541233;REVB=0.0242663;RO=5;SAF=40;SAR=34;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0071559;STB=0.509534;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.000546298;OID=.;OPOS=139389432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:80:80:5:6:74:74:0.925:34:40:3:2:34:40:4:2
chr9	139391636	.	G	A	3353.86	PASS	AF=0.986486;AO=218;DP=224;FAO=219;FDP=222;FR=.;FRO=3;FSAF=109;FSAR=110;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00799602;FXX=0.00892817;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.181;QD=60.4299;RBI=0.0315174;REFB=-0.188458;REVB=0.0304862;RO=0;SAF=108;SAR=110;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506726;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.000270179;OID=.;OPOS=139391636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:224:222:0:3:218:219:0.986486:110:108:0:0:110:109:0:3
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chr9	139407932	.	A	G	912.24	PASS	AF=1;AO=61;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00850154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1545;QD=56.1376;RBI=0.0253705;REFB=0;REVB=-0.0239037;RO=1;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125883;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00245421;OID=.;OPOS=139407932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:1:0:61:65:1:37:24:0:1:39:26:0:0
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chr9	139616742	.	A	G	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.544;QD=62.9827;RBI=0.0422135;REFB=0;REVB=0.00265392;RO=0;SAF=18;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105022;OID=.;OPOS=139616742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:27:18:0:0:27:18:0:0
chr9	139634495	.	G	A	267.36	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00552437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.463;QD=18.4388;RBI=0.00648339;REFB=-0.0160809;REVB=-0.00339348;RO=29;SAF=15;SAR=14;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0146474;OID=.;OPOS=139634495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:14:15:15:14:14:15:15:14
chr9	139635430	.	C	T	263.72	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0415103;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.765;QD=26.372;RBI=0.0441958;REFB=-0.0163498;REVB=0.015171;RO=16;SAF=8;SAR=16;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333696;STB=0.518503;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0108266;OID=.;OPOS=139635430;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:16:8:6:10:16:8:6:10
chr9	139648918	.	T	G	281.22	PASS	AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=-0.00307809;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.565;QD=27.4361;RBI=0.0115111;REFB=-0.0118847;REVB=0.011092;RO=16;SAF=22;SAR=3;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105423;STB=0.557747;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.00828024;OID=.;OPOS=139648918;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:3:22:15:1:3:22:15:1
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chr9	139649612	.	C	A	430.92	PASS	AF=0.44898;AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.008368;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.614;QD=17.5887;RBI=0.0274452;REFB=-0.0236169;REVB=-0.0261384;RO=54;SAF=23;SAR=21;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950781;STB=0.553167;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0291684;OID=.;OPOS=139649612;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:54:54:44:44:0.44898:21:23:23:31:21:23:23:31
chr9	139650060	.	C	A	225.66	PASS	AF=0.345679;AO=28;DP=81;FAO=28;FDP=81;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.0136189;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.7052;QD=11.1434;RBI=0.0379962;REFB=-0.0152274;REVB=0.0354716;RO=52;SAF=18;SAR=10;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226415;STB=0.63707;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0130547;OID=.;OPOS=139650060;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:52:53:28:28:0.345679:10:18:23:29:10:18:23:30
chr9	139652329	.	G	C	474.28	PASS	AF=0.424;AO=53;DP=125;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=48;FSRR=24;FWDB=0.020384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.999;QD=15.1771;RBI=0.0248999;REFB=-0.018829;REVB=0.0143002;RO=69;SAF=35;SAR=18;SRF=46;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00710043;STB=0.504047;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0197147;OID=.;OPOS=139652329;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:69:72:53:53:0.424:18:35:46:23:18:35:48:24
chr9	139652338	.	C	G	577.35	PASS	AF=0.491667;AO=59;DP=124;FAO=59;FDP=120;FR=.;FRO=61;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=22;FWDB=-0.00553229;FXX=0.0322555;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.5499;QD=19.245;RBI=0.0320738;REFB=0.00319143;REVB=-0.0315931;RO=59;SAF=39;SAR=20;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337894;STB=0.512191;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.00445653;OID=.;OPOS=139652338;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:120:59:61:59:59:0.491667:20:39:37:22:20:39:39:22
chr9	139656670	.	T	C,G	1759.4	PASS	AF=0.928571,0.031746;AO=113,7;DP=126;FAO=117,4;FDP=126;FR=.;FRO=5;FSAF=83,2;FSAR=34,2;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0188354,-0.0621076;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=109.533,21.2798;QD=55.8541;RBI=0.0549494,0.062127;REFB=-0.0107256,-0.0343722;REVB=0.0516203,-0.0015522;RO=5;SAF=79,5;SAR=34,2;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0282099,0.237226;STB=0.515179,0.555281;STBP=0.137,0.813;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000992328,0.185966;OID=.,.;OPOS=139656670,139656670;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:126:126:5:5:113,7:117,4:0.928571,0.031746:34,2:79,5:2:3:34,2:83,2:2:3
chr9	139656706	.	A	C	2140.9	PASS	AF=0.992806;AO=134;DP=136;FAO=138;FDP=139;FR=.;FRO=1;FSAF=91;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00630771;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.183;QD=61.6087;RBI=0.00668078;REFB=-0.0667126;REVB=-0.00220128;RO=1;SAF=88;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00537157;STB=0.502732;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.000101288;OID=.;OPOS=139656706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:136:139:1:1:134:138:0.992806:46:88:1:0:47:91:1:0
chr9	139657834	.	G	C	985.22	PASS	AF=0.945205;AO=67;DP=72;FAO=69;FDP=73;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00258583;FXX=0.0266631;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.131;QD=53.9845;RBI=0.0321289;REFB=-0.0225153;REVB=0.0320247;RO=4;SAF=51;SAR=16;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00163458;STB=0.500773;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.00185826;OID=.;OPOS=139657834;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:72:73:4:4:67:69:0.945205:16:51:3:1:18:51:3:1
chr9	139690840	.	G	A	1075.8	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.558;QD=59.7665;RBI=0.0555939;REFB=0;REVB=0.0378901;RO=0;SAF=39;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.71123e-05;OID=.;OPOS=139690840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:31:39:0:0:33:39:0:0
chr9	139693596	.	T	C	2051.15	PASS	AF=0.532432;AO=196;DP=373;FAO=197;FDP=370;FR=.;FRO=173;FSAF=93;FSAR=104;FSRF=98;FSRR=75;FWDB=-0.0118176;FXX=0.0106949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.684;QD=22.1746;RBI=0.013272;REFB=-0.0127511;REVB=-0.00604088;RO=167;SAF=93;SAR=103;SRF=92;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645389;STB=0.544051;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0152122;OID=.;OPOS=139693596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:373:370:167:173:196:197:0.532432:103:93:92:75:104:93:98:75
chr9	139694521	.	T	G	822.77	PASS	AF=0.5;AO=83;DP=167;FAO=84;FDP=168;FR=.;FRO=84;FSAF=45;FSAR=39;FSRF=39;FSRR=45;FWDB=-0.00615902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8141;QD=19.5897;RBI=0.0154299;REFB=-0.0260094;REVB=-0.0141474;RO=82;SAF=45;SAR=38;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0711804;STB=0.535706;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0159794;OID=.;OPOS=139694521;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:168:82:84:83:84:0.5:38:45:38:44:39:45:39:45
chr9	139694569	.	A	C	578.05	PASS	AF=0.513043;AO=59;DP=114;FAO=59;FDP=115;FR=.;FRO=56;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.0466459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4139;QD=20.106;RBI=0.0547031;REFB=-0.0185583;REVB=-0.0285762;RO=55;SAF=34;SAR=25;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435981;STB=0.520089;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.020929;OID=.;OPOS=139694569;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:115:55:56:59:59:0.513043:25:34:29:26:25:34:30:26
chr9	139700605	.	T	C	738.24	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1607;QD=62.829;RBI=0.0251045;REFB=0;REVB=0.0147226;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000475252;OID=.;OPOS=139700605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:16:30:0:0:16:31:0:0
chr9	139701108	.	A	C	575.47	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.132735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6836;QD=60.5755;RBI=0.132908;REFB=0;REVB=-0.00677949;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00201506;OID=.;OPOS=139701108;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr9	139726239	.	A	G	910.42	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0691124;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.4608;QD=57.8044;RBI=0.0912921;REFB=0;REVB=-0.0596467;RO=1;SAF=24;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192485;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00102337;OID=.;OPOS=139726239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:63:1:0:58:63:1:34:24:1:0:37:26:0:0
chr9	139732331	.	G	C	2302.07	PASS	AF=0.986486;AO=145;DP=147;FAO=146;FDP=148;FR=.;FRO=2;FSAF=96;FSAR=50;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0345966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8634;QD=62.2182;RBI=0.0444167;REFB=-0.148391;REVB=0.0278552;RO=2;SAF=95;SAR=50;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00990612;STB=0.505154;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00110222;OID=.;OPOS=139732331;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:147:148:2:2:145:146:0.986486:50:95:2:0:50:96:2:0
chr9	139733700	.	G	A	136.36	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0123322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.845;QD=18.1807;RBI=0.0123985;REFB=-0.0100062;REVB=-0.00128055;RO=15;SAF=12;SAR=2;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33275;STB=0.702381;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0315485;OID=.;OPOS=139733700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:14:15:0.5:2:12:9:6:2:13:9:6
chr9	139739643	.	T	C	613.31	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.479;QD=61.3309;RBI=0.0737085;REFB=0;REVB=0.0559969;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001208;OID=.;OPOS=139739643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:18:21:0:0:19:21:0:0
chr9	139749067	.	C	T	1149.58	PASS	AF=0.974684;AO=77;DP=80;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.071649;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.347;QD=58.2068;RBI=0.078978;REFB=-0.153469;REVB=0.0332257;RO=0;SAF=28;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509997;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00173801;OID=.;OPOS=139749067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:80:79:0:2:77:77:0.974684:49:28:0:0:49:28:0:2
chr9	139751381	.	CA	AC,CAC,CG	73.25	PASS	AF=0.0181818,0.181818,0.0545455;AO=2,10,3;DP=56;FAO=1,10,3;FDP=55;FR=.;FRO=41;FSAF=1,8,0;FSAR=0,2,3;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0310196,-0.061479,-0.0727677;FXX=0;HRUN=4,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=31.4558,20.0941,73.3764;QD=5.32725;RBI=0.0754964,0.0789366,0.0778945;REFB=-0.0138772,-0.0460188,-0.00345033;REVB=-0.0688294,-0.0495108,-0.0277923;RO=41;SAF=2,8,0;SAR=0,2,3;SRF=17;SRR=24;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.451669,0.468241,-0.466663;STB=0.99156,0.805597,0.995936;STBP=0.257,0.052,0.12;TYPE=mnp,ins,snp;VARB=0.143837,0.144762,0.0105862;OID=.,.,.;OPOS=139751381,139751383,139751382;OREF=CA,-,A;OALT=AC,C,G;OMAPALT=AC,CAC,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:48:56:55:41:41:2,10,3:1,10,3:0.0181818,0.181818,0.0545455:0,2,3:2,8,0:17:24:0,2,3:1,8,0:17:24
chr9	139752899	.	T	G	414.38	PASS	AF=1;AO=15;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0684255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6185;QD=55.2509;RBI=0.0762598;REFB=0;REVB=0.0336676;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0138622;OID=.;OPOS=139752899;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:15:30:1:12:3:0:0:16:14:0:0
chr9	139818368	.	C	T	188.88	PASS	AF=0.352941;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00895915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.857;QD=11.1105;RBI=0.0120256;REFB=-0.0124944;REVB=0.00802169;RO=43;SAF=11;SAR=13;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444854;STB=0.532231;STBP=0.709;TYPE=snp;VARB=0.0245143;OID=.;OPOS=139818368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:43:44:24:24:0.352941:13:11:18:25:13:11:18:26
chr9	139839783	.	CT	C,CC	327.03	PASS	AF=0.397959,0.0102041;AO=31,4;DP=93;FAO=39,1;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=20,0;FSAR=19,1;FSRF=39;FSRR=19;FWDB=-0.00272548,-0.0039189;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=101.523,104.252;QD=13.3482;RBI=0.0116731,0.0103601;REFB=-0.0129974,-0.0120891;REVB=0.0113505,0.00959032;RO=56;SAF=15,2;SAR=16,2;SRF=39;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.237427,-0.207892;STB=0.595912,0.993303;STBP=0.147,0.261;TYPE=del,snp;VARB=0.0114317,0.0356754;OID=.,.;OPOS=139839784,139839784;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.397959,0.0102041:31,4:93:39,1:98:58:20,0:19,1:39:19:99:56:15,2:16,2:39:17
chr9	139839904	.	T	G	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00273777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.328;QD=60.9778;RBI=0.0091231;REFB=0;REVB=-0.00870261;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.19744e-05;OID=.;OPOS=139839904;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr9	139840543	.	A	G	357.98	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0756304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3353;QD=55.0733;RBI=0.0761625;REFB=0;REVB=0.0089874;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00126595;OID=.;OPOS=139840543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0
chr9	139848688	.	C	T	2445.49	PASS	AF=0.993827;AO=158;DP=159;FAO=161;FDP=162;FR=.;FRO=1;FSAF=99;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0101794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.093;QD=60.3825;RBI=0.0110328;REFB=-0.107727;REVB=0.00425469;RO=1;SAF=98;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00786335;STB=0.503999;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000162225;OID=.;OPOS=139848688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:159:162:1:1:158:161:0.993827:60:98:0:1:62:99:0:1
chr9	139872048	.	A	G	2664.51	PASS	AF=0.983051;AO=174;DP=177;FAO=174;FDP=177;FR=.;FRO=3;FSAF=87;FSAR=87;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.024765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.045;QD=60.2148;RBI=0.0307174;REFB=-0.125553;REVB=-0.0181729;RO=2;SAF=87;SAR=87;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502825;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.000984038;OID=.;OPOS=139872048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:177:177:2:3:174:174:0.983051:87:87:1:1:87:87:2:1
chr9	139878317	.	C	T	650.71	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.147465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.233;QD=61.9721;RBI=0.148246;REFB=0;REVB=0.0151996;RO=0;SAF=11;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127211;OID=.;OPOS=139878317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:31:11:0:0:31:11:0:0
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chr9	139902214	.	A	G	1712.12	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.69;QD=60.6061;RBI=0.0404286;REFB=0;REVB=-0.0367609;RO=0;SAF=58;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000161656;OID=.;OPOS=139902214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:55:58:0:0:55:58:0:0
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chr9	139913239	.	T	G	2150.53	PASS	AF=0.992857;AO=129;DP=129;FAO=139;FDP=140;FR=.;FRO=1;FSAF=86;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0293971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.881;QD=61.4436;RBI=0.0592371;REFB=-0.185992;REVB=0.051428;RO=0;SAF=82;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504672;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.000871535;OID=.;OPOS=139913239;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:129:140:0:1:129:139:0.992857:47:82:0:0:53:86:0:1
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chr9	139935631	.	GGCCCCCG	GCCCCG,GGCCCC,GGCCCCG,GGCCCCGC,GGCCCCGG	298.42	PASS	AF=0,0,0.930233,0,0;AO=5,6,15,3,4;DP=43;FAO=0,0,40,0,0;FDP=43;FR=.;FRO=3;FSAF=0,0,19,0,0;FSAR=0,0,21,0,0;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0461736,-0.0184455,0.144454,-0.0029691,0.0130618;FXX=0;HRUN=2,5,5,5,5;LEN=2,2,1,2,1;MLLD=10.9764,154.539,11.0068,9.09203,10.7775;QD=27.7596;RBI=0.0464324,0.0570443,0.227272,0.279073,0.0535026;REFB=0.136648,-0.0308226,-0.00624288,-0.142731,0.019535;REVB=-0.00489524,0.0539798,0.175457,0.279057,0.0518837;RO=6;SAF=0,0,7,3,4;SAR=5,6,8,0,0;SRF=2;SRR=4;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.716421,-0.740222,0.0691076,0.711122,0.742829;STB=0.5,0.5,0.533317,0.5,0.5;STBP=1,1,0.111,1,1;TYPE=del,del,del,mnp,snp;VARB=0,0,0.0911506,0.0279465,0.102386;OID=.,.,.,.,.;OPOS=139935632,139935637,139935633,139935637,139935637;OREF=GC,CG,C,CG,C;OALT=-,-,-,GC,G;OMAPALT=GCCCCG,GGCCCC,GGCCCCG,GGCCCCGC,GGCCCCGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0,0.930233,0,0:5,6,15,3,4:43:0,0,40,0,0:43:3:0,0,19,0,0:0,0,21,0,0:0:3:12:6:0,0,7,3,4:5,6,8,0,0:2:4
chr9	139937795	.	T	C	766.41	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000878765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.592;QD=63.8674;RBI=0.038743;REFB=0;REVB=0.038733;RO=0;SAF=12;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152858;OID=.;OPOS=139937795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:36:12:0:0:36:12:0:0
chr9	139937799	.	G	A	805.13	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00534062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9022;QD=64.4102;RBI=0.00615664;REFB=0;REVB=-0.003063;RO=0;SAF=12;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39911e-05;OID=.;OPOS=139937799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:38:12:0:0:38:12:0:0
chr9	139943429	.	G	A	138.29	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0439238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.582;QD=39.5107;RBI=0.103719;REFB=-0.187293;REVB=0.0939592;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523774;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.00572014;OID=.;OPOS=139943429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:14:14:0:1:13:13:0.928571:3:10:0:0:3:10:1:0
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chr9	139996641	.	C	A	95.86	PASS	AF=0.647059;AO=10;DP=18;FAO=11;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0930675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.308;QD=22.5549;RBI=0.0934289;REFB=-0.118163;REVB=0.00820946;RO=6;SAF=8;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444069;STB=0.749558;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0174348;OID=.;OPOS=139996641;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:18:17:6:6:10:11:0.647059:2:8:1:5:3:8:0:6
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chr9	140002220	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0070853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.631;QD=37.4884;RBI=0.135789;REFB=0;REVB=0.135604;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127828;OID=.;OPOS=140002220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0
chr9	140002989	.	T	C	1607.1	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5091;QD=64.2841;RBI=0.0256904;REFB=0;REVB=0.012785;RO=0;SAF=57;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.01379e-05;OID=.;OPOS=140002989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:43:57:0:0:43:57:0:0
chr9	140003427	.	A	G	795.13	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.118;QD=56.7952;RBI=0.030867;REFB=0;REVB=-0.00970252;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.08802e-05;OID=.;OPOS=140003427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:33:23:0:0:33:23:0:0
chr9	140006202	.	G	A	530.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0717425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6224;QD=57.3033;RBI=0.0856819;REFB=-0.0944922;REVB=0.0468444;RO=1;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373832;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165384;OID=.;OPOS=140006202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:37:37:1:0:35:37:1:12:23:0:1:13:24:0:0
chr9	140006425	.	C	G	526.57	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0178801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.3273;QD=56.926;RBI=0.0270818;REFB=-0.0744846;REVB=-0.0203403;RO=1;SAF=13;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346393;STB=0.518508;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.00101168;OID=.;OPOS=140006425;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:23:13:1:0:23:13:1:0
chr9	140061897	.	A	C	106.31	PASS	AF=0.220779;AO=17;DP=79;FAO=17;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=60;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=44;FSRR=16;FWDB=0.0544709;FXX=0.0253133;HRUN=5;LEN=1;MLLD=27.9063;QD=5.52279;RBI=0.130517;REFB=-0.0630431;REVB=0.118607;RO=42;SAF=3;SAR=14;SRF=33;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.648502;STB=0.879307;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.14291;OID=.;OPOS=140061897;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:77:42:60:17:17:0.220779:14:3:33:9:14:3:44:16
chr9	140120396	.	C	T	283.56	PASS	AF=0.96;AO=18;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0683164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.551;QD=45.3695;RBI=0.0688255;REFB=-0.148633;REVB=-0.00835614;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516116;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00377419;OID=.;OPOS=140120396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:0:1:18:24:0.96:7:11:0:0:9:15:1:0
chr9	140123132	.	C	G	100.67	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00337422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.732;QD=16.1072;RBI=0.0347388;REFB=-0.0451364;REVB=0.0345746;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144848;STB=0.559901;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0097642;OID=.;OPOS=140123132;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:13:12:12:0.48:6:6:4:8:6:6:5:8
chr9	140123345	.	C	T	745.0	PASS	AF=0.554688;AO=71;DP=128;FAO=71;FDP=128;FR=.;FRO=57;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.00224824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.016;QD=23.2813;RBI=0.0139674;REFB=-0.0251698;REVB=0.0137853;RO=55;SAF=36;SAR=35;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161795;STB=0.516401;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0196415;OID=.;OPOS=140123345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:55:57:71:71:0.554688:35:36:29:26:35:36:31:26
chr9	140128085	.	T	C	425.6	PASS	AF=0.552632;AO=40;DP=75;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.055462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7854;QD=22.3997;RBI=0.0556552;REFB=-1.04297e-05;REVB=-0.00463354;RO=33;SAF=23;SAR=17;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.049743;STB=0.530191;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=-0.000589851;OID=.;OPOS=140128085;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:33:34:40:42:0.552632:17:23:17:16:17:25:18:16
chr9	140130606	.	A	T	1066.06	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.025082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9647;QD=58.4143;RBI=0.0301137;REFB=-0.0556841;REVB=-0.0166652;RO=1;SAF=27;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171927;STB=0.509088;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000380581;OID=.;OPOS=140130606;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:45:27:1:0:45:27:1:0
chr9	140139757	.	G	A	641.55	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.698;QD=61.1001;RBI=0.123249;REFB=0;REVB=0.122214;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000416849;OID=.;OPOS=140139757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:16:25:0:0:17:25:0:0
chr9	140147152	.	C	G	267.31	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0336587;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6928;QD=21.8208;RBI=0.0864384;REFB=-0.0353029;REVB=0.0796159;RO=22;SAF=15;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0079192;STB=0.508468;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.0301522;OID=.;OPOS=140147152;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:22:24:25:25:0.510204:10:15:13:9:10:15:14:10
chr9	140147273	.	C	T	362.83	PASS	AF=0.4;AO=39;DP=105;FAO=44;FDP=110;FR=.;FRO=66;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=25;FWDB=-0.024721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.356;QD=13.194;RBI=0.0276022;REFB=-0.0189953;REVB=0.0122781;RO=66;SAF=16;SAR=23;SRF=41;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229108;STB=0.625556;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0454067;OID=.;OPOS=140147273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:110:66:66:39:44:0.4:23:16:41:25:26:18:41:25
chr9	140167022	.	G	A	222.43	PASS	AF=0.36;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=75;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=-0.0263109;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.769;QD=11.8628;RBI=0.0266885;REFB=-0.00244026;REVB=0.0044732;RO=47;SAF=13;SAR=14;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109338;STB=0.568539;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.00365359;OID=.;OPOS=140167022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:47:48:27:27:0.36:14:13:18:29:14:13:18:30
chr9	140176294	.	G	T	53.13	PASS	AF=0.275862;AO=8;DP=29;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00531782;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=280.725;QD=7.3277;RBI=0.00698157;REFB=-0.000452387;REVB=-0.00452362;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273308;STB=0.517198;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=0.00143051;OID=.;OPOS=140176294;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:21:21:8:8:0.275862:4:4:11:10:4:4:11:10
chr9	140177040	.	A	T	817.55	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0489;QD=57.3721;RBI=0.0319846;REFB=0;REVB=0.0107709;RO=0;SAF=28;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000206227;OID=.;OPOS=140177040;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:29:28:0:0:29:28:0:0
chr9	140243844	.	C	T	770.16	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0711951;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.964;QD=64.1803;RBI=0.0712686;REFB=0;REVB=-0.00323599;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000476129;OID=.;OPOS=140243844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0
chr9	140247085	.	T	TC	31.36	PASS	AF=0.129032;AO=8;DP=65;FAO=8;FDP=62;FR=.;FRO=54;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=39;FSRR=15;FWDB=-0.0568526;FXX=0.0605969;HRUN=0;LEN=1;MLLD=102.813;QD=2.02299;RBI=0.0568571;REFB=-0.000959548;REVB=-0.00070941;RO=56;SAF=1;SAR=7;SRF=39;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.6163;STB=0.92635;STBP=0.045;TYPE=ins;VARB=0.0336519;OID=.;OPOS=140247086;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.129032:8:65:8:62:54:1:7:39:15:31:56:1:7:39:17
chr9	140247143	.	T	G	1156.26	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4386;QD=60.0652;RBI=0.0414076;REFB=0;REVB=-0.0266476;RO=0;SAF=50;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000975338;OID=.;OPOS=140247143;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:77:0:0:74:77:1:24:50:0:0:25:52:0:0
chr9	140250817	.	C	CT	445.56	PASS	AF=1;AO=7;DP=67;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000997021;FXX=0.13844;HRUN=0;LEN=1;MLLD=111.53;QD=31.8255;RBI=0.0106605;REFB=0;REVB=0.0106138;RO=60;SAF=6;SAR=1;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330491;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00234758;OID=.;OPOS=140250818;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:7:67:56:56:0:41:15:0:0:4:60:6:1:37:23
chr9	140250818	.	C	G,T	925.53	PASS	AF=0.0769231,0.923077;AO=6,59;DP=65;FAO=5,60;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=5,36;FSAR=0,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521828,-0.0293716;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=12.2957,143.778;QD=56.9557;RBI=0.0524957,0.0537967;REFB=0,0;REVB=-0.00572317,0.045071;RO=0;SAF=5,36;SAR=1,23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.18042e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0989735,-7.36781e-05;OID=.,.;OPOS=140250818,140250818;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:65:65:0:0:6,59:5,60:0.0769231,0.923077:1,23:5,36:0:0:0,24:5,36:0:0
chr9	140262426	.	C	T	347.93	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0469105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.765;QD=51.5454;RBI=0.0523306;REFB=-0.196673;REVB=0.0231927;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517228;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00394117;OID=.;OPOS=140262426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:0:1:26:26:0.962963:12:14:0:0:12:14:1:0
chr9	140330976	.	T	C	1283.42	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.192;QD=61.8514;RBI=0.0758327;REFB=0;REVB=-0.073262;RO=0;SAF=61;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.85855e-05;OID=.;OPOS=140330976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:22:61:0:0:22:61:0:0
chr9	140332478	.	A	G	1096.75	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00302512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.54;QD=59.2839;RBI=0.0135488;REFB=0;REVB=0.0132067;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.70786e-05;OID=.;OPOS=140332478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:32:40:0:0:34:40:0:0
chr9	140356422	.	G	C	460.16	PASS	AF=0.464646;AO=46;DP=99;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.0179657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.017;QD=18.5924;RBI=0.0308632;REFB=-0.0454069;REVB=0.0250953;RO=52;SAF=24;SAR=22;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108471;STB=0.564574;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0346525;OID=.;OPOS=140356422;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:52:53:46:46:0.464646:22:24:33:19:22:24:34:19
chr9	140357972	.	A	G	740.67	PASS	AF=0.981818;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0244896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7427;QD=53.8669;RBI=0.029064;REFB=0.0358833;REVB=0.0156517;RO=1;SAF=20;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229721;STB=0.512191;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.000245488;OID=.;OPOS=140357972;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:55:1:1:53:54:0.981818:33:20:1:0:34:20:1:0
chr9	140374861	.	A	G	1328.55	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00921331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.077;QD=61.7932;RBI=0.0108752;REFB=0;REVB=0.00577803;RO=0;SAF=58;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173648;OID=.;OPOS=140374861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:27:58:0:0:27:59:0:0
chr9	140435087	.	G	A	251.17	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0479177;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.6671;QD=20.0938;RBI=0.0485128;REFB=5.08483e-05;REVB=0.00757535;RO=23;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.056906;STB=0.519983;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.00122673;OID=.;OPOS=140435087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:23:26:24:24:0.48:12:12:10:13:12:12:12:14
chr9	140611140	.	G	A	205.24	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0226443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1197;QD=23.4562;RBI=0.0276319;REFB=-0.012414;REVB=0.0158353;RO=14;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0754591;STB=0.558081;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0165535;OID=.;OPOS=140611140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:15:20:20:0.571429:8:12:7:7:8:12:7:8
chr9	140777306	.	C	G	250.08	PASS	AF=0.365854;AO=30;DP=83;FAO=30;FDP=82;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0562062;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3772;QD=12.1988;RBI=0.0562772;REFB=-0.0235324;REVB=-0.00282652;RO=47;SAF=22;SAR=8;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169427;STB=0.625599;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0345812;OID=.;OPOS=140777306;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:47:52:30:30:0.365854:8:22:28:19:8:22:29:23
chr9	141008876	.	C	T	332.53	PASS	AF=0.58;AO=28;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0814727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8881;QD=26.6023;RBI=0.0816666;REFB=-0.0123018;REVB=0.0056238;RO=21;SAF=19;SAR=9;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238315;STB=0.635741;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.010651;OID=.;OPOS=141008876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:21:21:28:29:0.58:9:19:8:13:9:20:8:13
chr9	141016262	.	T	G	460.54	PASS	AF=0.409449;AO=52;DP=127;FAO=52;FDP=127;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=46;FSRR=29;FWDB=0.0126562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.34;QD=14.5051;RBI=0.0130876;REFB=-0.000797359;REVB=-0.00333284;RO=74;SAF=29;SAR=23;SRF=45;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537459;STB=0.533547;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.00132362;OID=.;OPOS=141016262;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:74:75:52:52:0.409449:23:29:45:29:23:29:46:29
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chr9	141071475	.	C	G	263.64	PASS	AF=0.251656;AO=38;DP=151;FAO=38;FDP=151;FR=.;FRO=113;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=78;FWDB=0.0167027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3986;QD=6.98385;RBI=0.0168376;REFB=0.0151956;REVB=-0.00212732;RO=113;SAF=17;SAR=21;SRF=35;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179162;STB=0.606434;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=-0.0473241;OID=.;OPOS=141071475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:113:113:38:38:0.251656:21:17:35:78:21:17:35:78
chr9	141071552	.	C	T	99.43	PASS	AF=0.228571;AO=16;DP=70;FAO=16;FDP=70;FR=.;FRO=54;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=42;FWDB=0.024466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.072;QD=5.68165;RBI=0.0266514;REFB=-0.0087562;REVB=0.0105693;RO=54;SAF=3;SAR=13;SRF=12;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066081;STB=0.541612;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0179919;OID=.;OPOS=141071552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:54:54:16:16:0.228571:13:3:12:42:13:3:12:42
chr10	294953	.	A	G	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2231;QD=48.733;RBI=0.110787;REFB=0;REVB=-0.0972352;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00156125;OID=.;OPOS=294953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
chr10	429977	.	G	A	120.08	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0202155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.052;QD=14.1269;RBI=0.0237316;REFB=-0.0118347;REVB=-0.0124306;RO=19;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453628;STB=0.504581;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0169264;OID=.;OPOS=429977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:20:14:14:0.411765:5:9:13:6:5:9:13:7
chr10	445061	.	C	T	613.33	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00881375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3025;QD=61.3329;RBI=0.0699937;REFB=0;REVB=0.0694366;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000620675;OID=.;OPOS=445061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr10	459940	.	G	A	121.41	PASS	AF=0.375;AO=14;DP=39;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0355562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.498;QD=12.1414;RBI=0.0382925;REFB=-0.0243772;REVB=0.0142152;RO=25;SAF=5;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179997;STB=0.575656;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0373314;OID=.;OPOS=459940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:25:25:14:15:0.375:9:5:13:12:9:6:13:12
chr10	696237	.	G	A	545.26	PASS	AF=0.588235;AO=50;DP=85;FAO=50;FDP=85;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=9;FWDB=-0.00649051;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.519;QD=25.6592;RBI=0.00663813;REFB=-0.0567329;REVB=-0.00139213;RO=35;SAF=29;SAR=21;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129169;STB=0.570343;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0344616;OID=.;OPOS=696237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:35:35:50:50:0.588235:21:29:26:9:21:29:26:9
chr10	696868	.	AC	A	496.57	PASS	AF=0.621849;AO=73;DP=120;FAO=74;FDP=119;FR=.;FRO=45;FSAF=46;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0305475;FXX=0.00833264;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.1172;QD=16.6915;RBI=0.057361;REFB=0.0420199;REVB=0.0485503;RO=43;SAF=46;SAR=27;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00163614;STB=0.509212;STBP=0.821;TYPE=del;VARB=-0.0179247;OID=.;OPOS=696869;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.621849:73:120:74:119:45:46:28:29:16:99:43:46:27:27:16
chr10	1018585	.	T	G	1530.01	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.687;QD=63.7506;RBI=0.0261524;REFB=0;REVB=-0.00684106;RO=0;SAF=66;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.61565e-05;OID=.;OPOS=1018585;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:30:66:0:0:30:66:0:0
chr10	1046712	.	G	A	1804.93	PASS	AF=0.968;AO=121;DP=125;FAO=121;FDP=125;FR=.;FRO=4;FSAF=72;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00962698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.138;QD=57.7576;RBI=0.0859305;REFB=-0.0574073;REVB=0.0853895;RO=4;SAF=72;SAR=49;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00598162;STB=0.503151;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.00201177;OID=.;OPOS=1046712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:125:125:4:4:121:121:0.968:49:72:2:2:49:72:2:2
chr10	1081882	.	T	C	437.51	PASS	AF=0.406504;AO=50;DP=123;FAO=50;FDP=123;FR=.;FRO=73;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=0.0270946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.797;QD=14.2279;RBI=0.0271651;REFB=-0.00324667;REVB=-0.00195505;RO=73;SAF=34;SAR=16;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192183;STB=0.60877;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0071639;OID=.;OPOS=1081882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:73:73:50:50:0.406504:16:34:37:36:16:34:37:36
chr10	1089616	.	T	C	801.05	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.408;QD=57.2177;RBI=0.0176549;REFB=0;REVB=-0.00994811;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.49588e-05;OID=.;OPOS=1089616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:34:22:0:0:34:22:0:0
chr10	1142208	.	T	C	1089.06	PASS	AF=1;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.066149;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.231;QD=59.6744;RBI=0.0691662;REFB=0;REVB=0.0202056;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269111;OID=.;OPOS=1142208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:72:73:1:30:42:0:0:31:42:0:0
chr10	1175894	.	A	G	253.97	PASS	AF=0.392405;AO=30;DP=77;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=-0.0457413;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7383;QD=12.859;RBI=0.0467825;REFB=-0.00580339;REVB=-0.00981514;RO=47;SAF=14;SAR=16;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113886;STB=0.547391;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.019447;OID=.;OPOS=1175894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:79:47:48:30:31:0.392405:16:14:17:30:17:14:18:30
chr10	1175939	.	C	T	487.07	PASS	AF=0.625;AO=45;DP=72;FAO=45;FDP=72;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=0.0364454;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.276;QD=27.0593;RBI=0.0400101;REFB=-0.015606;REVB=0.016509;RO=27;SAF=15;SAR=30;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120174;STB=0.56519;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.00989624;OID=.;OPOS=1175939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:27:27:45:45:0.625:30:15:5:22:30:15:5:22
chr10	1230968	.	C	T	3053.95	PASS	AF=1;AO=199;DP=203;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=119;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.16541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.171;QD=60.1764;RBI=0.166959;REFB=-0.0434586;REVB=0.0226965;RO=3;SAF=81;SAR=118;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173093;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000477418;OID=.;OPOS=1230968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:203:203:3:0:199:203:1:118:81:3:0:119:84:0:0
chr10	3143643	.	A	C	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.924;QD=62.9825;RBI=0.0732654;REFB=0;REVB=0.0703246;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313505;OID=.;OPOS=3143643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr10	3150898	.	C	T	430.69	PASS	AF=0.61194;AO=41;DP=67;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0107804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.775;QD=25.7128;RBI=0.0221309;REFB=-0.00242532;REVB=-0.0193278;RO=26;SAF=24;SAR=17;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220367;STB=0.512042;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.00132796;OID=.;OPOS=3150898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:26:26:41:41:0.61194:17:24:16:10:17:24:16:10
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chr10	3172121	.	C	T	187.41	PASS	AF=0.383333;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.00363181;FXX=0.0322529;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.471;QD=12.4939;RBI=0.0040049;REFB=-0.0109352;REVB=-0.00168795;RO=37;SAF=15;SAR=8;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316279;STB=0.681664;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0305246;OID=.;OPOS=3172121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:60:37:37:23:23:0.383333:8:15:13:24:8:15:13:24
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chr10	3180227	.	T	C	1788.76	PASS	AF=1;AO=117;DP=118;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139304;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9212;QD=61.1542;RBI=0.0240414;REFB=0;REVB=0.0195941;RO=0;SAF=75;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000256592;OID=.;OPOS=3180227;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:117:0:0:117:117:1:42:75:0:0:42:75:0:0
chr10	3180316	.	T	C	438.72	PASS	AF=0.5375;AO=42;DP=79;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.036955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.721;QD=21.9361;RBI=0.0512715;REFB=-0.0333207;REVB=0.0355401;RO=37;SAF=23;SAR=19;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605264;STB=0.502629;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0260282;OID=.;OPOS=3180316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:37:37:42:43:0.5375:19:23:20:17:20:23:20:17
chr10	3181003	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00314949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.813;QD=55.6555;RBI=0.051537;REFB=0;REVB=0.0514407;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00040242;OID=.;OPOS=3181003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr10	3181107	.	G	A	609.78	PASS	AF=0.578431;AO=59;DP=101;FAO=59;FDP=102;FR=.;FRO=43;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0414084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4387;QD=23.9131;RBI=0.042448;REFB=0.0243922;REVB=0.00933729;RO=42;SAF=35;SAR=24;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144332;STB=0.574129;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=-0.0178774;OID=.;OPOS=3181107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:42:43:59:59:0.578431:24:35:17:25:24:35:18:25
chr10	3189380	.	C	T	902.71	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.97;QD=58.2393;RBI=0.0124807;REFB=0;REVB=-0.00664524;RO=0;SAF=40;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.22966e-05;OID=.;OPOS=3189380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:21:40:0:0:21:41:0:0
chr10	3190265	.	A	G	205.49	PASS	AF=0.346667;AO=26;DP=74;FAO=26;FDP=75;FR=.;FRO=49;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.134143;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.2251;QD=10.9597;RBI=0.17036;REFB=0.00176782;REVB=0.105015;RO=47;SAF=10;SAR=16;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0473587;STB=0.529891;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.00251908;OID=.;OPOS=3190265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:47:49:26:26:0.346667:16:10:20:27:16:10:21:28
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chr10	3200292	.	G	A	173.71	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0128667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.141;QD=12.8671;RBI=0.0136353;REFB=-0.00630565;REVB=-0.00451324;RO=32;SAF=14;SAR=7;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274301;STB=0.666508;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00850582;OID=.;OPOS=3200292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:33:21:21:0.388889:7:14:13:19:7:14:13:20
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chr10	3214369	.	A	G	598.15	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0047571;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.583;QD=61.3484;RBI=0.035981;REFB=0;REVB=0.0356652;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128164;OID=.;OPOS=3214369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:24:15:0:0:24:15:0:0
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chr10	5019959	.	G	A	446.89	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000405258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.751;QD=57.6636;RBI=0.0343041;REFB=0;REVB=0.0343017;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014032;OID=.;OPOS=5019959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:13:17:0:0:14:17:0:0
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chr10	5197881	.	A	G	213.13	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.016921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4888;QD=21.3133;RBI=0.0518668;REFB=-0.0455626;REVB=0.049029;RO=18;SAF=15;SAR=6;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194927;STB=0.57937;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0376686;OID=.;OPOS=5197881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:19:21:21:0.525:6:15:16:2:6:15:16:3
chr10	5199934	.	G	C	119.94	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.00314608;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6583;QD=11.9935;RBI=0.0790565;REFB=-0.0225184;REVB=0.0789939;RO=26;SAF=9;SAR=5;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161059;STB=0.564429;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.103379;OID=.;OPOS=5199934;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:40:26:26:14:14:0.35:5:9:20:6:5:9:19:7
chr10	5202060	.	C	T	61.64	PASS	AF=0.219512;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.00263118;FXX=0.0238039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.5284;QD=6.01361;RBI=0.0174535;REFB=0.00353223;REVB=-0.017254;RO=30;SAF=8;SAR=1;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.475431;STB=0.804945;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.0313342;OID=.;OPOS=5202060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:40:41:30:32:9:9:0.219512:1:8:17:13:1:8:19:13
chr10	5202104	.	C	T	708.35	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0381585;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2008;QD=62.964;RBI=0.0425752;REFB=0;REVB=-0.0188833;RO=0;SAF=31;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000783698;OID=.;OPOS=5202104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:14:31:0:0:14:31:0:0
chr10	5203748	.	A	G	169.14	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=0.0552944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2208;QD=12.0812;RBI=0.0560461;REFB=-0.00843992;REVB=0.00914847;RO=34;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231922;STB=0.620583;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0228168;OID=.;OPOS=5203748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:35:21:21:0.375:11:10:9:25:11:10:10:25
chr10	5242164	.	A	G	714.45	PASS	AF=0.414894;AO=78;DP=190;FAO=78;FDP=188;FR=.;FRO=110;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=52;FSRR=58;FWDB=-0.00679619;FXX=0.0105258;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.644;QD=15.2009;RBI=0.00684018;REFB=-0.0115899;REVB=-0.000774499;RO=112;SAF=43;SAR=35;SRF=52;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0914756;STB=0.546001;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0186451;OID=.;OPOS=5242164;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:190:188:112:110:78:78:0.414894:35:43:52:60:35:43:52:58
chr10	5246584	.	C	A	335.82	PASS	AF=0.402174;AO=36;DP=91;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.0750125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.363;QD=14.6006;RBI=0.0754018;REFB=-0.00199854;REVB=-0.00765203;RO=55;SAF=13;SAR=23;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142399;STB=0.586749;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00241464;OID=.;OPOS=5246584;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:55:55:36:37:0.402174:23:13:27:28:24:13:27:28
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chr10	5260682	.	C	G	393.14	PASS	AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=0.00302324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.923;QD=16.2118;RBI=0.0130484;REFB=-0.0235623;REVB=-0.0126933;RO=53;SAF=23;SAR=19;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149691;STB=0.583091;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0298958;OID=.;OPOS=5260682;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:53:55:42:42:0.43299:19:23:21:32:19:23:22:33
chr10	5415954	.	A	G	169.2	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00926615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.181;QD=13.0154;RBI=0.0178889;REFB=-0.0269489;REVB=-0.015302;RO=31;SAF=11;SAR=9;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0327042;STB=0.527317;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0349916;OID=.;OPOS=5415954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:32:20:20:0.384615:9:11:18:13:9:11:19:13
chr10	5435823	.	T	C	156.95	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00318245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.368;QD=16.0974;RBI=0.0533115;REFB=-0.000965675;REVB=-0.0532164;RO=22;SAF=12;SAR=5;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126847;STB=0.573289;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=-0.00073168;OID=.;OPOS=5435823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:5:12:13:9:5:12:13:9
chr10	5435918	.	G	A	439.11	PASS	AF=0.488889;AO=44;DP=89;FAO=44;FDP=90;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.00759052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4944;QD=19.5159;RBI=0.0168166;REFB=-0.0136087;REVB=0.015006;RO=45;SAF=17;SAR=27;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155931;STB=0.592305;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0202533;OID=.;OPOS=5435918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:45:46:44:44:0.488889:27:17:25:20:27:17:26:20
chr10	5436259	.	CA	C,CG	1461.33	PASS	AF=0.0736842,0.926316;AO=15,81;DP=96;FAO=7,88;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=7,36;FSAR=0,52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327439,0.0590336;FXX=0.0104156;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=183.659,202.381;QD=61.5298;RBI=0.0335217,0.0591609;REFB=0,0;REVB=0.00717934,0.00388002;RO=0;SAF=15,29;SAR=0,52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.45212e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0406551,0.00270815;OID=.,.;OPOS=5436260,5436260;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0736842,0.926316:15,81:96:7,88:95:0:7,36:0,52:0:0:20:0:15,29:0,52:0:0
chr10	5437365	.	A	G	1116.96	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00960322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.363;QD=60.3761;RBI=0.0325371;REFB=0;REVB=-0.0310877;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.63551e-05;OID=.;OPOS=5437365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:39:35:0:0:39:35:0:0
chr10	5446794	.	C	T	920.09	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0549924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8334;QD=58.4186;RBI=0.0561365;REFB=0;REVB=0.0112759;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000251237;OID=.;OPOS=5446794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:35:28:0:0:35:28:0:0
chr10	5471200	.	C	T	296.54	PASS	AF=0.317073;AO=39;DP=123;FAO=39;FDP=123;FR=.;FRO=84;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=46;FSRR=38;FWDB=-0.00780502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2713;QD=9.64354;RBI=0.0368939;REFB=-0.00576975;REVB=0.0360589;RO=83;SAF=19;SAR=20;SRF=46;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783598;STB=0.541195;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0133805;OID=.;OPOS=5471200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:83:84:39:39:0.317073:20:19:46:37:20:19:46:38
chr10	5495218	.	T	C	763.15	PASS	AF=0.98;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0041007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.585;QD=61.0518;RBI=0.0182191;REFB=-0.0725366;REVB=0.0177516;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.511107;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00012961;OID=.;OPOS=5495218;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:49:50:0:1:48:49:0.98:22:26:0:0:22:27:0:1
chr10	5498223	.	T	C	491.66	PASS	AF=0.777778;AO=41;DP=53;FAO=42;FDP=54;FR=.;FRO=12;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.00079393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6818;QD=36.419;RBI=0.0141759;REFB=-0.0177643;REVB=0.0141537;RO=12;SAF=22;SAR=19;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126807;STB=0.564835;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00538449;OID=.;OPOS=5498223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:53:54:12:12:41:42:0.777778:19:22:10:2:19:23:10:2
chr10	5498693	.	A	G	294.05	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=34;FWDB=0.0272692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3056;QD=15.4763;RBI=0.0273217;REFB=-0.006492;REVB=0.00169264;RO=42;SAF=12;SAR=21;SRF=8;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19939;STB=0.5994;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0133068;OID=.;OPOS=5498693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:42:43:33:33:0.434211:21:12:8:34:21:12:9:34
chr10	5498752	.	C	T	337.91	PASS	AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=0.00698781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8814;QD=17.5538;RBI=0.0191023;REFB=-0.0258566;REVB=-0.0177783;RO=41;SAF=13;SAR=23;SRF=11;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990377;STB=0.555168;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0360461;OID=.;OPOS=5498752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:41:41:36:36:0.467532:23:13:11:30:23:13:11:30
chr10	5499703	.	ATA	AT,ATT,TAT,TTT	1302.58	PASS	AF=0.988636,0.0113636,0,0;AO=57,40,6,5;DP=139;FAO=87,1,0,0;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=26,1,0,0;FSAR=61,0,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00867866,0.00348668,1.83152e-05,-0.0238949;FXX=0.10203;HRUN=1,1,1,1;LEN=1,1,3,3;MLLD=92.9857,89.9928,79.4272,72.6621;QD=59.2082;RBI=0.174626,0.0915916,0.0763681,0.0252196;REFB=0,0,0,0;REVB=0.17441,0.0915253,0.0763681,0.00806624;RO=16;SAF=17,28,5,5;SAR=40,12,1,0;SRF=5;SRR=11;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.00693781,0.219333,0.560302,0.753745;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,snp,mnp,mnp;VARB=0.00220827,-0.0205216,0.0211354,0;OID=.,.,.,.;OPOS=5499705,5499705,5499703,5499703;OREF=A,A,ATA,ATA;OALT=-,T,TAT,TTT;OMAPALT=AT,ATT,TAT,TTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:139:88:16:0:57,40,6,5:87,1,0,0:0.988636,0.0113636,0,0:40,12,1,0:17,28,5,5:5:11:61,0,0,0:26,1,0,0:0:0
chr10	5499787	.	T	C	931.85	PASS	AF=0.440529;AO=100;DP=227;FAO=100;FDP=227;FR=.;FRO=127;FSAF=41;FSAR=59;FSRF=55;FSRR=72;FWDB=0.0305517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.035;QD=16.4202;RBI=0.0617492;REFB=0.00939785;REVB=0.0536615;RO=126;SAF=41;SAR=59;SRF=55;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273343;STB=0.513273;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=-0.00802219;OID=.;OPOS=5499787;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:227:227:126:127:100:100:0.440529:59:41:55:71:59:41:55:72
chr10	5567366	.	G	A	2621.61	PASS	AF=1;AO=169;DP=169;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.003632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1353;QD=62.0499;RBI=0.0164695;REFB=0;REVB=0.0160641;RO=0;SAF=104;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.12435e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.7546e-05;OID=.;OPOS=5567366;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:169:169:0:0:169:169:1:65:104:0:0:65:104:0:0
chr10	5567695	.	G	A	1801.85	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.285;QD=61.0796;RBI=0.0593764;REFB=0;REVB=0.0200775;RO=0;SAF=84;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100468;OID=.;OPOS=5567695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:118:0:0:117:118:1:33:84:0:0:34:84:0:0
chr10	5567967	.	G	T	1459.16	PASS	AF=0.989474;AO=93;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0376288;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.429;QD=61.4384;RBI=0.0451403;REFB=-0.0411168;REVB=0.0249343;RO=2;SAF=36;SAR=57;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256071;STB=0.506665;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=7.68142e-05;OID=.;OPOS=5567967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:95:95:2:1:93:94:0.989474:57:36:2:0:57:37:1:0
chr10	5673528	.	G	A	237.42	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00483713;FXX=0.0263089;HRUN=4;LEN=1;MLLD=191.29;QD=25.667;RBI=0.0108431;REFB=-0.00239688;REVB=0.00970436;RO=15;SAF=9;SAR=13;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00686416;STB=0.503813;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.00158047;OID=.;OPOS=5673528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:15:15:22:22:0.594595:13:9:6:9:13:9:6:9
chr10	5781628	.	T	G	334.2	PASS	AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0649151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6604;QD=22.2802;RBI=0.0738813;REFB=0.028057;REVB=-0.035277;RO=26;SAF=13;SAR=21;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184296;STB=0.601718;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.0563466;OID=.;OPOS=5781628;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:21:13:16:10:21:13:16:10
chr10	5781967	.	A	C	257.74	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0497343;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8408;QD=23.431;RBI=0.068546;REFB=0.0643461;REVB=0.0471705;RO=19;SAF=13;SAR=11;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218775;STB=0.608526;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.0522043;OID=.;OPOS=5781967;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:20:24:24:0.545455:11:13:5:14:11:13:6:14
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chr10	5788608	.	G	C	83.11	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0137826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.86;QD=9.49823;RBI=0.0342604;REFB=-0.0110926;REVB=-0.0313658;RO=23;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178993;STB=0.622811;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0168782;OID=.;OPOS=5788608;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:35:23:24:11:11:0.314286:7:4:12:11:7:4:13:11
chr10	5788833	.	C	G	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.0150584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.819;QD=15.1603;RBI=0.0384244;REFB=0.00129131;REVB=-0.0353508;RO=22;SAF=6;SAR=10;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222893;STB=0.626726;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=-0.00376674;OID=.;OPOS=5788833;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:10:6:4:18:10:6:4:18
chr10	5790420	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.061;QD=46.848;RBI=0.045168;REFB=0;REVB=0.0411882;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00057276;OID=.;OPOS=5790420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0
chr10	5804531	.	G	A	289.47	PASS	AF=0.39759;AO=33;DP=83;FAO=33;FDP=83;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.000107808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.396;QD=13.9501;RBI=0.00717532;REFB=-0.0185297;REVB=0.00717451;RO=50;SAF=12;SAR=21;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847959;STB=0.548357;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0236738;OID=.;OPOS=5804531;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:50:50:33:33:0.39759:21:12:22:28:21:12:22:28
chr10	5804949	.	G	A	132.11	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00422884;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.829;QD=13.9062;RBI=0.0292598;REFB=-0.00589143;REVB=-0.0289526;RO=23;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101896;STB=0.559362;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.00688938;OID=.;OPOS=5804949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:7:8:10:13:7:8:10:13
chr10	5895755	.	GC	TA	205.47	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00736867;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=2;MLLD=190.592;QD=22.2134;RBI=0.0172275;REFB=-0.0169485;REVB=-0.015572;RO=17;SAF=12;SAR=8;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201123;STB=0.612791;STBP=0.148;TYPE=mnp;VARB=0.023775;OID=.;OPOS=5895755;OREF=GC;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:17:17:20:20:0.540541:8:12:6:11:8:12:6:11
chr10	5920121	.	T	C	427.63	PASS	AF=1;AO=26;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.795;QD=53.4533;RBI=0.0628868;REFB=0;REVB=0.0617553;RO=0;SAF=22;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0030123;OID=.;OPOS=5920121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:26:32:1:4:22:0:0:9:23:0:0
chr10	5925971	.	C	A	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00872091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.7165;QD=55.0963;RBI=0.0346365;REFB=0;REVB=-0.0335206;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000424649;OID=.;OPOS=5925971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:8:18:0:0:8:18:0:0
chr10	5929962	.	G	C	353.92	PASS	AF=0.431818;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=-0.0368889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.163;QD=16.0873;RBI=0.0411407;REFB=0.00715045;REVB=0.0182146;RO=50;SAF=8;SAR=30;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45488;STB=0.757434;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00776239;OID=.;OPOS=5929962;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:50:50:38:38:0.431818:30:8:32:18:30:8:32:18
chr10	5979117	.	T	C	351.06	PASS	AF=0.388889;AO=41;DP=107;FAO=42;FDP=108;FR=.;FRO=66;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=43;FSRR=23;FWDB=-0.0722582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.596;QD=13.0024;RBI=0.0726274;REFB=-0.0282573;REVB=-0.00731352;RO=60;SAF=16;SAR=25;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235501;STB=0.6476;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0311072;OID=.;OPOS=5979117;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:60:66:41:42:0.388889:25:16:37:23:25:17:43:23
chr10	6001696	.	C	T	400.22	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00786598;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=341.633;QD=53.3624;RBI=0.021298;REFB=0.117806;REVB=0.0197922;RO=1;SAF=18;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251798;STB=0.513504;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=4.17311e-05;OID=.;OPOS=6001696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:11:18:1:0:11:18:1:0
chr10	6002368	.	T	G	1400.0	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0310384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9456;QD=61.5384;RBI=0.0452077;REFB=0.0257946;REVB=0.0328688;RO=1;SAF=56;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00838952;STB=0.504424;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=3.92232e-05;OID=.;OPOS=6002368;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:34:56:1:0:34:56:1:0
chr10	6008172	.	C	T	287.94	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0183663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=286.707;QD=18.5769;RBI=0.0309275;REFB=-0.0224856;REVB=0.0248835;RO=31;SAF=12;SAR=19;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11796;STB=0.565914;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0205366;OID=.;OPOS=6008172;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:19:12:16:15:19:12:16:15
chr10	6191733	.	G	A	315.96	PASS	AF=0.675;AO=27;DP=40;FAO=27;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0304754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5661;QD=31.5955;RBI=0.0306174;REFB=-0.0202225;REVB=-0.00294541;RO=13;SAF=8;SAR=19;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205095;STB=0.612816;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0235636;OID=.;OPOS=6191733;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:13:13:27:27:0.675:19:8:8:5:19:8:8:5
chr10	6191735	.	T	C	598.89	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021857;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.909;QD=61.4245;RBI=0.0349732;REFB=0;REVB=0.0273019;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027649;OID=.;OPOS=6191735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:24:15:0:0:24:15:0:0
chr10	6287695	.	G	A	515.87	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0689586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.192;QD=58.956;RBI=0.0711891;REFB=0;REVB=0.0176804;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181651;OID=.;OPOS=6287695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:35:0:0:32:35:1:19:13:0:0:19:16:0:0
chr10	6392848	.	G	A	144.77	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0275901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.11;QD=15.6509;RBI=0.0291718;REFB=-0.00100941;REVB=0.00947501;RO=21;SAF=3;SAR=13;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.459074;STB=0.767169;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0011075;OID=.;OPOS=6392848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:13:3:13:8:13:3:13:8
chr10	6393009	.	A	G	106.02	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0272264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5966;QD=11.78;RBI=0.0273099;REFB=-0.0093296;REVB=-0.00213467;RO=22;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00748266;STB=0.517215;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0164672;OID=.;OPOS=6393009;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:22:23:13:13:0.361111:7:6:10:12:7:6:10:13
chr10	6393260	.	C	G	35.98	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0645793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.459;QD=6.25669;RBI=0.0651254;REFB=-0.00946901;REVB=-0.0084167;RO=17;SAF=4;SAR=2;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954119;STB=0.562286;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0335739;OID=.;OPOS=6393260;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:2:4:10:7:2:4:10:7
chr10	6393706	.	ACAGG	A	95.64	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.00306744;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=4;MLLD=190.843;QD=20.1349;RBI=0.0195658;REFB=-0.0600451;REVB=0.0193239;RO=8;SAF=5;SAR=6;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335209;STB=0.519196;STBP=0.94;TYPE=del;VARB=0.040015;OID=.;OPOS=6393707;OREF=CAGG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.578947:11:20:11:19:8:5:6:4:4:56:8:5:6:4:4
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chr10	7528721	.	A	C	675.04	PASS	AF=0.403226;AO=75;DP=188;FAO=75;FDP=186;FR=.;FRO=111;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=52;FSRR=59;FWDB=-0.0541071;FXX=0.0106377;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.199;QD=14.5171;RBI=0.0595878;REFB=-0.0363393;REVB=0.0249626;RO=110;SAF=36;SAR=39;SRF=52;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00771657;STB=0.506895;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0568624;OID=.;OPOS=7528721;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:186:110:111:75:75:0.403226:39:36:52:58:39:36:52:59
chr10	7528738	.	G	A	707.11	PASS	AF=0.430168;AO=77;DP=179;FAO=77;FDP=179;FR=.;FRO=102;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=47;FSRR=55;FWDB=-0.0388257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0789;QD=15.8012;RBI=0.0442062;REFB=-0.0238281;REVB=-0.0211364;RO=102;SAF=34;SAR=43;SRF=47;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198444;STB=0.511076;STBP=0.805;TYPE=snp;VARB=0.0402283;OID=.;OPOS=7528738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:179:102:102:77:77:0.430168:43:34:47:55:43:34:47:55
chr10	7605067	.	C	T	278.91	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.00217482;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.36;QD=16.4066;RBI=0.0224909;REFB=-0.0169807;REVB=0.0223855;RO=36;SAF=17;SAR=14;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00692295;STB=0.504303;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0191478;OID=.;OPOS=7605067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:37:31:31:0.455882:14:17:20:16:14:17:20:17
chr10	7605076	.	GTC	CGT,GT	1033.65	PASS	AF=0,1;AO=3,69;DP=74;FAO=0,73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=0,39;FSAR=0,34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0477365,0.0171704;FXX=0.0135117;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=135.355,25.3899;QD=56.6384;RBI=0.0493813,0.0690671;REFB=0,0;REVB=-0.012639,-0.0668987;RO=0;SAF=3,36;SAR=0,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0.213368;SSEP=0,0;SSSB=0,4.36169e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0,-0.000795822;OID=.,.;OPOS=7605076,7605078;OREF=GTC,C;OALT=CGT,-;OMAPALT=CGT,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:6:74:73:0:0:3,69:0,73:0,1:0,33:3,36:0:0:0,34:0,39:0:0
chr10	7605101	.	A	G	1287.71	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.9394;QD=61.3196;RBI=0.0455548;REFB=0;REVB=-0.024822;RO=0;SAF=41;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114381;OID=.;OPOS=7605101;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:84:0:0:81:84:1:40:41:0:0:41:43:0:0
chr10	7618501	.	A	G	1540.58	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.988;QD=59.8282;RBI=0.0191182;REFB=0;REVB=-0.00639264;RO=0;SAF=65;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.48149e-05;OID=.;OPOS=7618501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:38:65:0:0:38:65:0:0
chr10	7618685	.	GT	G,GG	911.5	PASS	AF=0.015873,0.984127;AO=13,50;DP=63;FAO=1,62;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=1,39;FSAR=0,23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364751,0.0443199;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=164.685,178.305;QD=57.873;RBI=0.0565365,0.0552762;REFB=0,0;REVB=0.0431965,0.0330335;RO=0;SAF=11,29;SAR=2,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.20481e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00039074,0.00318832;OID=.,.;OPOS=7618686,7618686;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.015873,0.984127:13,50:63:1,62:63:0:1,39:0,23:0:0:4:0:11,29:2,21:0:0
chr10	7679393	.	C	T	147.51	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.013837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8669;QD=17.8795;RBI=0.0771052;REFB=-0.000706635;REVB=-0.0758535;RO=17;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236638;STB=0.513497;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=-0.00115525;OID=.;OPOS=7679393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:7:9:10:7:7:9:10:7
chr10	7763661	.	A	G	1458.34	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0162714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.236;QD=62.0569;RBI=0.020213;REFB=-0.128522;REVB=0.011992;RO=1;SAF=59;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013739;STB=0.507245;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.000310727;OID=.;OPOS=7763661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:94:94:1:1:93:93:0.989362:34:59:0:1:34:59:0:1
chr10	7780646	.	C	G	604.53	PASS	AF=0.521368;AO=61;DP=117;FAO=61;FDP=117;FR=.;FRO=56;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.0348276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.4046;QD=20.6675;RBI=0.040135;REFB=-0.0131686;REVB=0.0199464;RO=56;SAF=34;SAR=27;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0190449;STB=0.510478;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0143811;OID=.;OPOS=7780646;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:56:56:61:61:0.521368:27:34:30:26:27:34:30:26
chr10	7797903	.	C	CAACT,T	494.52	PASS	AF=0.945946,0;AO=32,3;DP=41;FAO=35,0;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=24,0;FSAR=11,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00745576,-0.0599059;FXX=0.0975372;HRUN=2,1;LEN=4,1;MLLD=213.027,62.5432;QD=53.4621;RBI=0.010613,0.0677332;REFB=-0.020633,0.0265337;REVB=-0.00755297,-0.0316082;RO=3;SAF=21,0;SAR=11,3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00184338,-0.712642;STB=0.511539,0.5;STBP=0.567,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.000849036,0;OID=.,.;OPOS=7797904,7797903;OREF=-,C;OALT=AACT,T;OMAPALT=CAACT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:41:37:3:2:32,3:35,0:0.945946,0:11,3:21,0:2:1:11,0:24,0:1:1
chr10	7808086	.	T	C	638.4	PASS	AF=0.976744;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0366643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.109;QD=59.3856;RBI=0.0406232;REFB=-0.00657072;REVB=0.017492;RO=1;SAF=24;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191513;STB=0.509799;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00432732;OID=.;OPOS=7808086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:43:1:1:41:42:0.976744:17:24:1:0:17:25:1:0
chr10	8006798	.	A	G	213.91	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0126586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.591;QD=20.8692;RBI=0.0130381;REFB=-0.0235585;REVB=0.0031229;RO=18;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420569;STB=0.516114;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0190676;OID=.;OPOS=8006798;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:18:20:21:21:0.512195:8:13:12:6:8:13:13:7
chr10	8007559	.	GT	CC,GC	393.77	PASS	AF=0.37931,0.62069;AO=10,18;DP=29;FAO=11,18;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=2,2;FSAR=9,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744656,0.115531;FXX=0.0333222;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=86.2231,94.4762;QD=54.3124;RBI=0.096187,0.132045;REFB=0,0;REVB=0.0608835,0.0639418;RO=0;SAF=2,2;SAR=8,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00729506,0.00496467;OID=.,.;OPOS=8007559,8007560;OREF=GT,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:79:29:29:0:0:10,18:11,18:0.37931,0.62069:8,16:2,2:0:0:9,16:2,2:0:0
chr10	8116079	.	C	T	1171.12	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.272;QD=60.8375;RBI=0.010342;REFB=0;REVB=-0.00241141;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.1454e-05;OID=.;OPOS=8116079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:33:44:0:0:33:44:0:0
chr10	11299735	.	A	T	259.54	PASS	AF=0.46875;AO=27;DP=61;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00534387;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.188;QD=16.2209;RBI=0.0117431;REFB=-0.0213512;REVB=0.0104567;RO=34;SAF=15;SAR=12;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837794;STB=0.551221;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.025484;OID=.;OPOS=11299735;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:64:34:34:27:30:0.46875:12:15:16:18:13:17:16:18
chr10	11356160	.	C	T	362.13	PASS	AF=0.390909;AO=43;DP=109;FAO=43;FDP=110;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=38;FSRR=29;FWDB=0.00503739;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2603;QD=13.1682;RBI=0.0163569;REFB=0.0171813;REVB=0.0155619;RO=63;SAF=16;SAR=27;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178496;STB=0.619316;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.0166468;OID=.;OPOS=11356160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:63:67:43:43:0.390909:27:16:34:29:27:16:38:29
chr10	11373418	.	A	ATC	890.61	PASS	AF=0.666667;AO=74;DP=124;FAO=80;FDP=120;FR=.;FRO=40;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00655431;FXX=0.0399968;HRUN=1;LEN=2;MLLD=243.687;QD=29.6868;RBI=0.0162546;REFB=-0.00201709;REVB=-0.0148746;RO=40;SAF=38;SAR=36;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250015;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000617841;OID=.;OPOS=11373419;OREF=-;OALT=TC;OMAPALT=ATC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:74:124:80:120:40:38:42:19:21:99:40:38:36:19:21
chr10	11373420	.	G	C	152.52	PASS	AF=0.210084;AO=25;DP=125;FAO=25;FDP=119;FR=.;FRO=94;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=42;FSRR=52;FWDB=0.0132741;FXX=0.0479962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0407;QD=5.12668;RBI=0.0450497;REFB=-0.0107935;REVB=-0.0430497;RO=86;SAF=14;SAR=11;SRF=41;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104426;STB=0.588715;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.000846706;OID=.;OPOS=11373420;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:119:86:94:25:25:0.210084:11:14:41:45:11:14:42:52
chr10	11502653	.	TAAA	TAA,T,TATA	236.54	PASS	AF=0.263158,0.175439,0.192982;AO=10,10,7;DP=59;FAO=15,10,11;FDP=57;FR=.;FRO=21;FSAF=5,9,5;FSAR=10,1,6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0472668,0.0161272,-0.0233445;FXX=0.136343;HRUN=5,5,5;LEN=1,3,1;MLLD=10.1663,26.8354,113.125;QD=16.5994;RBI=0.061472,0.0212056,0.0263657;REFB=-0.159025,-0.0559973,-0.0322922;REVB=0.0393022,0.0137692,0.012255;RO=20;SAF=2,9,3;SAR=8,1,4;SRF=13;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.494115,0.419661,-0.251837;STB=0.666444,0.785697,0.606553;STBP=0.108,0.06,0.46;TYPE=del,del,snp;VARB=0.119564,0.0675706,0.103376;OID=.,.,.;OPOS=11502654,11502654,11502655;OREF=A,AAA,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=TAA,T,TATA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.263158,0.175439,0.192982:10,10,7:59:15,10,11:57:21:5,9,5:10,1,6:13:8:48:20:2,9,3:8,1,4:13:7
chr10	11504313	.	C	T	766.36	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0017062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2519;QD=63.8637;RBI=0.055958;REFB=0;REVB=-0.0559319;RO=0;SAF=33;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000641911;OID=.;OPOS=11504313;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:15:33:0:0:15:33:0:0
chr10	11504752	.	T	C	463.35	PASS	AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0283723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7429;QD=21.8046;RBI=0.104006;REFB=0.0110899;REVB=0.100062;RO=40;SAF=30;SAR=15;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233322;STB=0.628974;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.0072916;OID=.;OPOS=11504752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:40:40:45:45:0.529412:15:30:16:24:15:30:16:24
chr10	11505051	.	GC	G	253.26	PASS	AF=0.961538;AO=22;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0308517;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.1042;QD=38.9624;RBI=0.255181;REFB=0.00072161;REVB=0.25331;RO=4;SAF=4;SAR=18;SRF=2;SRR=2;SSEN=0.356912;SSEP=0;SSSB=-0.135896;STB=0.545416;STBP=0.107;TYPE=del;VARB=0.0189721;OID=.;OPOS=11505052;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.961538:22:26:25:26:1:5:20:1:0:3:4:4:18:2:2
chr10	11505175	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=377.118;QD=33.4285;RBI=0.0496042;REFB=0;REVB=0.0452621;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270804;OID=.;OPOS=11505175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr10	11789382	.	G	A	775.87	PASS	AF=1;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00165116;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2396;QD=63.336;RBI=0.0133569;REFB=0;REVB=0.0132544;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105087;OID=.;OPOS=11789382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:48:49:1:17:31:0:0:18:31:0:0
chr10	11789405	.	G	A	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207956;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6003;QD=56.9383;RBI=0.0267419;REFB=0;REVB=0.0168128;RO=0;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00019971;OID=.;OPOS=11789405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:17:36:0:0:17:36:0:0
chr10	11797436	.	T	C	902.75	PASS	AF=0.955224;AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0262665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8151;QD=53.8954;RBI=0.0364291;REFB=-0.126005;REVB=-0.0252418;RO=3;SAF=36;SAR=28;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377443;STB=0.519994;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0046259;OID=.;OPOS=11797436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:67:67:3:3:64:64:0.955224:28:36:3:0:28:36:3:0
chr10	11797467	.	G	A	1044.36	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.366;QD=59.6776;RBI=0.109395;REFB=0;REVB=0.108332;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248087;OID=.;OPOS=11797467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0
chr10	11912431	.	C	T	703.36	PASS	AF=0.486842;AO=73;DP=152;FAO=74;FDP=152;FR=.;FRO=78;FSAF=50;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=53;FWDB=0.00577132;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=92.7585;QD=18.5094;RBI=0.0265357;REFB=-0.0198469;REVB=0.0259005;RO=75;SAF=50;SAR=23;SRF=24;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335222;STB=0.681367;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0138131;OID=.;OPOS=11912431;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:152:75:78:73:74:0.486842:23:50:24:51:24:50:25:53
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chr10	12111090	.	T	C	1825.48	PASS	AF=0.98374;AO=120;DP=122;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0186541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8173;QD=59.3653;RBI=0.0372021;REFB=-0.0850788;REVB=0.0321873;RO=2;SAF=65;SAR=55;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00130627;STB=0.500745;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.00595345;OID=.;OPOS=12111090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:122:123:2:2:120:121:0.98374:55:65:1:1:55:66:1:1
chr10	12131081	.	T	G	222.39	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.00842618;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.46;QD=14.5827;RBI=0.00903073;REFB=-0.024241;REVB=0.00324861;RO=35;SAF=13;SAR=13;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217767;STB=0.622862;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.015508;OID=.;OPOS=12131081;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:35:35:26:26:0.42623:13:13:25:10:13:13:25:10
chr10	12143105	.	C	G	500.84	PASS	AF=0.504854;AO=52;DP=103;FAO=52;FDP=103;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=20;FWDB=-0.00964697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.837;QD=19.4499;RBI=0.0156644;REFB=0.00275842;REVB=-0.0123414;RO=51;SAF=31;SAR=21;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108995;STB=0.506022;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=-0.00313761;OID=.;OPOS=12143105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:51:51:52:52:0.504854:21:31:31:20:21:31:31:20
chr10	12148259	.	A	C	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.276;QD=57.8849;RBI=0.0195021;REFB=0;REVB=0.0053967;RO=0;SAF=40;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.77766e-05;OID=.;OPOS=12148259;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:20:40:0:0:20:40:0:0
chr10	12148286	.	T	C	902.68	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00112389;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.51;QD=58.2374;RBI=0.0270917;REFB=0;REVB=0.0270683;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.82486e-05;OID=.;OPOS=12148286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:24:38:0:0:24:38:0:0
chr10	12149939	.	C	T	207.08	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00916822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.976;QD=48.7257;RBI=0.013018;REFB=0;REVB=0.00924184;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.19981e-05;OID=.;OPOS=12149939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr10	12191933	.	C	T	280.92	PASS	AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0061413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.757;QD=14.406;RBI=0.0201024;REFB=-0.00649684;REVB=-0.0191413;RO=43;SAF=15;SAR=17;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199285;STB=0.505624;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.00952066;OID=.;OPOS=12191933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:43:46:32:32:0.410256:17:15:21:22:17:15:22:24
chr10	12209752	.	T	C	293.9	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0980926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.879;QD=17.5462;RBI=0.0985705;REFB=-0.0122276;REVB=0.00969525;RO=35;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202708;STB=0.613191;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0141159;OID=.;OPOS=12209752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:14:18:12:23:14:18:12:23
chr10	12212186	.	T	A	150.58	PASS	AF=0.414634;AO=16;DP=40;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0316534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.354;QD=14.691;RBI=0.0322377;REFB=-0.0142897;REVB=0.00611001;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430056;STB=0.507196;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0216112;OID=.;OPOS=12212186;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:24:24:16:17:0.414634:8:8:13:11:8:9:13:11
chr10	12238325	.	TGGGA	T	104.33	PASS	AF=0.454545;AO=9;DP=45;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.00908424;FXX=0.0434688;HRUN=3;LEN=4;MLLD=175.04;QD=9.48435;RBI=0.0114697;REFB=-0.0167729;REVB=-0.00700223;RO=19;SAF=7;SAR=2;SRF=16;SRR=3;SSEN=0.377643;SSEP=0;SSSB=-0.11244;STB=0.704162;STBP=0.023;TYPE=del;VARB=0.0311402;OID=.;OPOS=12238326;OREF=GGGA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.454545:9:45:20:44:24:8:12:19:5:99:19:7:2:16:3
chr10	12292344	.	A	G	195.18	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0196528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.21;QD=14.1949;RBI=0.0220165;REFB=0.00373278;REVB=0.00992432;RO=32;SAF=14;SAR=9;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112676;STB=0.564459;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=-0.0057283;OID=.;OPOS=12292344;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:9:14:16:16:9:14:16:16
chr10	12292454	.	A	G	311.81	PASS	AF=0.52381;AO=31;DP=63;FAO=33;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0347599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7552;QD=19.7974;RBI=0.0356728;REFB=-0.0221021;REVB=0.0080187;RO=21;SAF=14;SAR=17;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124735;STB=0.521726;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0231329;OID=.;OPOS=12292454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:21:30:31:33:0.52381:17:14:6:15:18:15:15:15
chr10	12867598	.	C	G	247.09	PASS	AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0808501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1696;QD=24.7085;RBI=0.0845837;REFB=0.0129081;REVB=0.0248529;RO=17;SAF=8;SAR=15;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527522;STB=0.529386;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=-0.00941637;OID=.;OPOS=12867598;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:17:17:23:23:0.575:15:8:7:10:15:8:7:10
chr10	12940455	.	A	G	673.59	PASS	AF=1;AO=34;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267606;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1392;QD=61.2356;RBI=0.03521;REFB=0;REVB=-0.0228826;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000241486;OID=.;OPOS=12940455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:34:44:1:15:19:0:0:15:29:0:0
chr10	13158262	.	C	T	466.09	PASS	AF=1;AO=28;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.382;QD=58.2611;RBI=0.0460443;REFB=0;REVB=0.0448992;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000792714;OID=.;OPOS=13158262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:28:32:1:13:15:0:0:16:16:0:0
chr10	13166076	.	A	G	381.36	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.725;QD=54.4798;RBI=0.0301042;REFB=0;REVB=-0.00324596;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000453147;OID=.;OPOS=13166076;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:9:18:0:0:9:19:0:0
chr10	13206233	.	A	T	851.01	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.379;QD=57.6957;RBI=0.031737;REFB=0;REVB=0.0279949;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01272e-05;OID=.;OPOS=13206233;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0
chr10	13230950	.	C	T	125.71	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.000468478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.333;QD=10.6984;RBI=0.000946172;REFB=0.00111519;REVB=-0.000822052;RO=32;SAF=4;SAR=11;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216285;STB=0.630388;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=-0.00220833;OID=.;OPOS=13230950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:32:32:15:15:0.319149:11:4:14:18:11:4:14:18
chr10	13275553	.	T	G	206.68	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.813;QD=48.6299;RBI=0.0481506;REFB=0;REVB=0.0400504;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245652;OID=.;OPOS=13275553;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:16:17:1:5:11:0:0:5:12:0:0
chr10	13337588	.	G	A	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.6;QD=60.6102;RBI=0.0260116;REFB=0;REVB=-0.00207898;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.809e-05;OID=.;OPOS=13337588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr10	13375906	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.423;QD=62.671;RBI=0.022879;REFB=0;REVB=-0.00793661;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.28044e-05;OID=.;OPOS=13375906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr10	13481427	.	T	A	801.31	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.012;QD=57.2367;RBI=0.0483582;REFB=0;REVB=0.0406779;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332481;OID=.;OPOS=13481427;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
chr10	13494594	.	T	C	2068.52	PASS	AF=1;AO=131;DP=133;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114163;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.327;QD=62.6823;RBI=0.0445081;REFB=0;REVB=0.0430191;RO=0;SAF=72;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95289e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.76892e-07;OID=.;OPOS=13494594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:132:0:0:131:132:1:59:72:0:0:60:72:0:0
chr10	13633835	.	A	G	1510.51	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0734756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9324;QD=63.6004;RBI=0.0806322;REFB=0;REVB=-0.0332096;RO=0;SAF=61;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000238699;OID=.;OPOS=13633835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:34:61:0:0:34:61:0:0
chr10	13685766	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00108464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.456;QD=51.9167;RBI=0.0155725;REFB=0;REVB=0.0155347;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20854e-05;OID=.;OPOS=13685766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0
chr10	13687890	.	G	A	94.22	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.10881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.511;QD=10.4688;RBI=0.109464;REFB=-0.00624743;REVB=-0.0119475;RO=24;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0150258;OID=.;OPOS=13687890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:6:6:12:12:6:6:12:12
chr10	13769842	.	A	G	1621.39	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281733;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.472;QD=59.5006;RBI=0.0432501;REFB=0;REVB=0.0328152;RO=0;SAF=48;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112799;OID=.;OPOS=13769842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:109:0:0:105:109:1:57:48:0:0:59:50:0:0
chr10	14425204	.	T	A	339.33	PASS	AF=0.576271;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.00454502;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9102;QD=23.0055;RBI=0.0253755;REFB=-0.00839444;REVB=0.0249652;RO=25;SAF=21;SAR=13;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0853687;STB=0.546899;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.00986305;OID=.;OPOS=14425204;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:25:25:34:34:0.576271:13:21:18:7:13:21:18:7
chr10	14425221	.	G	C	199.87	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0238041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6484;QD=13.5502;RBI=0.023967;REFB=-0.0151491;REVB=-0.00278981;RO=35;SAF=15;SAR=9;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686306;STB=0.539139;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.029696;OID=.;OPOS=14425221;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:9:15:24:11:9:15:24:11
chr10	14705494	.	G	C	113.39	PASS	AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.0154324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7388;QD=9.65026;RBI=0.0211405;REFB=0.0106827;REVB=0.0144486;RO=33;SAF=6;SAR=8;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306075;STB=0.682115;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=-0.0247374;OID=.;OPOS=14705494;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:33:33:14:14:0.297872:8:6:23:10:8:6:23:10
chr10	15008493	.	A	C	859.43	PASS	AF=0.939394;AO=62;DP=66;FAO=62;FDP=66;FR=.;FRO=4;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0185794;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.23;QD=52.0867;RBI=0.0449887;REFB=-0.194389;REVB=0.040973;RO=4;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697555;STB=0.537025;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00110717;OID=.;OPOS=15008493;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:66:66:4:4:62:62:0.939394:25:37:0:4:25:37:0:4
chr10	15057374	.	G	A	504.01	PASS	AF=0.495327;AO=53;DP=107;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=-0.0260943;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.487;QD=18.8415;RBI=0.0287291;REFB=-0.00302747;REVB=-0.0120187;RO=53;SAF=20;SAR=33;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105605;STB=0.554398;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.00313165;OID=.;OPOS=15057374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:53:54:53:53:0.495327:33:20:26:27:33:20:26:28
chr10	15058964	.	C	T	315.68	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=6;FWDB=0.0161707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.033;QD=17.5376;RBI=0.0467495;REFB=-0.0347902;REVB=0.0438637;RO=38;SAF=21;SAR=13;SRF=32;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241246;STB=0.633204;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0349865;OID=.;OPOS=15058964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:13:21:32:6:13:21:32:6
chr10	15106441	.	A	G	1492.06	PASS	AF=0.980769;AO=102;DP=104;FAO=102;FDP=104;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00179056;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.324;QD=57.3868;RBI=0.0191026;REFB=-0.0661448;REVB=0.0190185;RO=2;SAF=61;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00371651;STB=0.501959;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.000106416;OID=.;OPOS=15106441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:104:104:2:2:102:102:0.980769:41:61:1:1:41:61:1:1
chr10	15255292	.	G	A	627.63	PASS	AF=0.453333;AO=65;DP=148;FAO=68;FDP=150;FR=.;FRO=82;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=46;FWDB=0.0360368;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5101;QD=16.7367;RBI=0.0744432;REFB=-0.0299157;REVB=0.0651394;RO=82;SAF=36;SAR=29;SRF=37;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102586;STB=0.565368;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0360786;OID=.;OPOS=15255292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:150:82:82:65:68:0.453333:29:36:37:45:30:38:36:46
chr10	15573050	.	A	G	1831.39	PASS	AF=0.991736;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=89;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0472763;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.369;QD=60.542;RBI=0.0654266;REFB=-0.145404;REVB=0.0452283;RO=0;SAF=89;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502793;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.000835362;OID=.;OPOS=15573050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:122:121:0:1:120:120:0.991736:31:89:0:0:31:89:1:0
chr10	15713667	.	C	G	305.47	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.079;QD=53.1245;RBI=0.0245262;REFB=0;REVB=0.00124239;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.36987e-05;OID=.;OPOS=15713667;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0
chr10	16547058	.	A	G	1625.8	PASS	AF=0.990909;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=110;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0193868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.819;QD=59.12;RBI=0.0230569;REFB=0.0103433;REVB=0.0124809;RO=1;SAF=56;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0088725;STB=0.504672;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=2.44425e-05;OID=.;OPOS=16547058;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:110:110:1:1:109:109:0.990909:53:56:0:1:53:56:0:1
chr10	16556204	.	C	CAT	227.29	PASS	AF=0.511628;AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00712864;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=176.558;QD=21.1432;RBI=0.0116026;REFB=-0.0417903;REVB=0.00915444;RO=25;SAF=7;SAR=14;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222482;STB=0.580711;STBP=0.291;TYPE=ins;VARB=0.042505;OID=.;OPOS=16556205;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.511628:21:46:22:43:21:8:14:11:10:99:25:7:14:14:11
chr10	16562600	.	G	A	768.98	PASS	AF=0.606838;AO=69;DP=116;FAO=71;FDP=117;FR=.;FRO=46;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.0464741;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.215;QD=26.2898;RBI=0.0467415;REFB=-0.0221606;REVB=0.00499265;RO=46;SAF=34;SAR=35;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101224;STB=0.553964;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0149329;OID=.;OPOS=16562600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:117:46:46:69:71:0.606838:35:34:29:17:36:35:29:17
chr10	16796919	.	C	A	281.82	PASS	AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=13;FWDB=-0.0243923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.222;QD=14.6397;RBI=0.0385568;REFB=-0.0078948;REVB=0.0298604;RO=45;SAF=10;SAR=22;SRF=32;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399037;STB=0.72514;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.020681;OID=.;OPOS=16796919;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:45:45:32:32:0.415584:22:10:32:13:22:10:32:13
chr10	16882518	.	T	C	456.17	PASS	AF=0.5;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00489331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.729;QD=20.2742;RBI=0.0217903;REFB=-0.0165265;REVB=0.0212338;RO=45;SAF=19;SAR=26;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060926;STB=0.533786;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.018766;OID=.;OPOS=16882518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:45:45:45:45:0.5:26:19:22:23:26:19:22:23
chr10	16943371	.	G	A,C	786.49	PASS	AF=0.0535714,0.946429;AO=3,52;DP=55;FAO=3,53;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=3,22;FSAR=0,31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129333,-0.000418277;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=180.893,219.462;QD=56.1779;RBI=0.0396637,0.0393213;REFB=0,0;REVB=0.0374958,0.0393191;RO=0;SAF=3,22;SAR=0,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0988041,-0.00266115;OID=.,.;OPOS=16943371,16943371;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:55:56:0:0:3,52:3,53:0.0535714,0.946429:0,30:3,22:0:0:0,31:3,22:0:0
chr10	16967401	.	C	T	754.42	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00171549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.926;QD=56.9377;RBI=0.0171014;REFB=0;REVB=-0.0170152;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.07717e-05;OID=.;OPOS=16967401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:25:27:0:0:25:28:0:0
chr10	17024503	.	G	A	1098.72	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.92;QD=60.2036;RBI=0.0237129;REFB=0;REVB=-0.00894369;RO=0;SAF=33;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.92223e-05;OID=.;OPOS=17024503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:40:33:0:0:40:33:0:0
chr10	17024615	.	A	T	591.16	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0462465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.658;QD=57.6744;RBI=0.0478073;REFB=-0.112499;REVB=0.0121162;RO=2;SAF=16;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550491;STB=0.514279;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000805116;OID=.;OPOS=17024615;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:2:1:39:40:0.97561:23:16:2:0:23:17:1:0
chr10	17113563	.	C	T	557.91	PASS	AF=0.518182;AO=57;DP=110;FAO=57;FDP=110;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0309983;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4971;QD=20.2877;RBI=0.0328505;REFB=-0.0221724;REVB=-0.0108747;RO=52;SAF=22;SAR=35;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0847056;STB=0.551887;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0209503;OID=.;OPOS=17113563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:52:53:57:57:0.518182:35:22:25:27:35:22:26:27
chr10	17146590	.	A	G	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.00158207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.243;QD=12.73;RBI=0.002448;REFB=-0.000947721;REVB=-0.00186809;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940419;STB=0.555438;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.00337718;OID=.;OPOS=17146590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:6:3:3:9:6:3:3:9
chr10	17147521	.	G	T	504.9	PASS	AF=0.495327;AO=53;DP=108;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0386948;FXX=0.0092584;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8079;QD=18.8747;RBI=0.0685968;REFB=0.00734756;REVB=-0.0566412;RO=54;SAF=25;SAR=28;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00799391;STB=0.504423;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=-0.0131477;OID=.;OPOS=17147521;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:54:54:53:53:0.495327:28:25:25:29:28:25:25:29
chr10	17152994	.	G	A	261.6	PASS	AF=0.422535;AO=29;DP=70;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.0261203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.89;QD=14.738;RBI=0.0271168;REFB=-0.0150405;REVB=-0.0072836;RO=40;SAF=19;SAR=10;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225961;STB=0.51579;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0173253;OID=.;OPOS=17152994;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:40:41:29:30:0.422535:10:19:27:13:11:19:27:14
chr10	17156151	.	A	G	1047.68	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111774;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.432;QD=59.8676;RBI=0.0121928;REFB=0;REVB=0.00487133;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.12895e-05;OID=.;OPOS=17156151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:30:40:0:0:30:40:0:0
chr10	17204247	.	A	T	211.84	PASS	AF=0.95;AO=18;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000637494;FXX=0.0475964;HRUN=15;LEN=1;MLLD=50.006;QD=42.3679;RBI=0.0701201;REFB=0.0405638;REVB=0.0701172;RO=2;SAF=4;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070175;STB=0.545405;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00161725;OID=.;OPOS=17204247;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:20:20:2:1:18:19:0.95:14:4:1:1:14:5:1:0
chr10	17210822	.	A	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357659;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.8;QD=39.2068;RBI=0.0729178;REFB=0;REVB=0.0635438;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000951526;OID=.;OPOS=17210822;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0
chr10	17243638	.	G	C	221.35	PASS	AF=0.538462;AO=16;DP=42;FAO=21;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.031515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.346;QD=22.7029;RBI=0.0321998;REFB=-0.0251332;REVB=-0.00660544;RO=19;SAF=8;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17504;STB=0.582203;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0302089;OID=.;OPOS=17243638;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:39:19:17:16:21:0.538462:8:8:6:13:11:10:5:12
chr10	17256354	.	ATT	ATA,AT	788.79	PASS	AF=0.235849,0.764151;AO=27,32;DP=105;FAO=25,81;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=0,46;FSAR=25,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0464926,0.885306;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=239.687,10.2097;QD=29.7657;RBI=0.0465131,0.88646;REFB=-0.0253935,0.00253676;REVB=0.00138129,0.0452211;RO=40;SAF=0,8;SAR=27,24;SRF=36;SRR=4;SSEN=0,0.448276;SSEP=0,0;SSSB=-0.883428,-0.586086;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0309251,-0.00670314;OID=.,.;OPOS=17256356,17256355;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=ATA,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.235849,0.764151:27,32:105:25,81:106:0:0,46:25,35:0:0:99:40:0,8:27,24:36:4
chr10	17432607	.	A	G	162.15	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0157054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.417;QD=12.0109;RBI=0.0255837;REFB=-0.00679864;REVB=0.0201957;RO=33;SAF=12;SAR=8;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760974;STB=0.551131;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0113812;OID=.;OPOS=17432607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:33:34:20:20:0.37037:8:12:22:11:8:12:23:11
chr10	17891586	.	G	A	723.67	PASS	AF=0.630631;AO=60;DP=102;FAO=70;FDP=111;FR=.;FRO=41;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0233662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.062;QD=26.0782;RBI=0.0333975;REFB=-0.0361269;REVB=0.0238624;RO=40;SAF=28;SAR=32;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0308149;STB=0.506748;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0204061;OID=.;OPOS=17891586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:111:40:41:60:70:0.630631:32:28:17:23:38:32:18:23
chr10	17891705	.	A	G	50.3	PASS	AF=0.0952381;AO=13;DP=146;FAO=14;FDP=147;FR=.;FRO=133;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=68;FSRR=65;FWDB=0.0170134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.13;QD=1.36862;RBI=0.0350469;REFB=-0.00126571;REVB=0.0306403;RO=130;SAF=3;SAR=10;SRF=65;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318885;STB=0.705586;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0195624;OID=.;OPOS=17891705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:146:147:130:133:13:14:0.0952381:10:3:65:65:10:4:68:65
chr10	17891731	.	T	C	45.13	PASS	AF=0.0902778;AO=13;DP=144;FAO=13;FDP=144;FR=.;FRO=131;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=68;FSRR=63;FWDB=-0.0207679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0038;QD=1.25356;RBI=0.021079;REFB=-0.00355646;REVB=0.00360795;RO=127;SAF=8;SAR=5;SRF=65;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121913;STB=0.588607;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0545079;OID=.;OPOS=17891731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:144:144:127:131:13:13:0.0902778:5:8:65:62:5:8:68:63
chr10	18138639	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0832107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8459;QD=33.428;RBI=0.0988818;REFB=0;REVB=0.0534191;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00286033;OID=.;OPOS=18138639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
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chr10	18254606	.	C	A	194.05	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.00756432;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.334;QD=16.8737;RBI=0.0250138;REFB=-0.00277868;REVB=-0.0238426;RO=26;SAF=9;SAR=11;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105214;STB=0.559942;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00319411;OID=.;OPOS=18254606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:11:9:9:17:11:9:9:17
chr10	18266989	.	G	A	618.61	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00754951;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.633;QD=61.8606;RBI=0.00768492;REFB=0;REVB=-0.00143629;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200663;OID=.;OPOS=18266989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr10	18828371	.	C	T	321.24	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=0.00725379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.148;QD=18.8966;RBI=0.0358295;REFB=-0.00583497;REVB=-0.0350876;RO=34;SAF=21;SAR=13;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145911;STB=0.580754;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00499609;OID=.;OPOS=18828371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:13:21:26:8:13:21:26:8
chr10	18829981	.	A	ATGTT	1534.26	PASS	AF=0.882812;AO=106;DP=130;FAO=113;FDP=128;FR=.;FRO=15;FSAF=68;FSAR=45;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0281551;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=4;MLLD=216.223;QD=47.9455;RBI=0.0293305;REFB=-0.02089;REVB=0.00822011;RO=18;SAF=63;SAR=43;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206143;STB=0.500216;STBP=0.982;TYPE=ins;VARB=0.00210177;OID=.;OPOS=18829982;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=ATGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.882812:106:130:113:128:15:68:45:9:6:66:18:63:43:12:6
chr10	18965160	.	G	A	211.22	PASS	AF=0.436364;AO=23;DP=56;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0131967;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.075;QD=15.3612;RBI=0.0151434;REFB=-0.019223;REVB=-0.0074276;RO=31;SAF=12;SAR=11;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0380893;STB=0.509083;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0218658;OID=.;OPOS=18965160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:31:31:23:24:0.436364:11:12:15:16:12:12:15:16
chr10	18965960	.	G	T	788.29	PASS	AF=0.496933;AO=81;DP=163;FAO=81;FDP=163;FR=.;FRO=82;FSAF=54;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=43;FWDB=-0.0387516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4069;QD=19.3446;RBI=0.0401412;REFB=-0.014747;REVB=-0.0104706;RO=82;SAF=54;SAR=27;SRF=39;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18264;STB=0.600833;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0170301;OID=.;OPOS=18965960;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:163:82:82:81:81:0.496933:27:54:39:43:27:54:39:43
chr10	18966490	.	C	T	116.67	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0211044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.523;QD=11.6673;RBI=0.0244814;REFB=-0.0217523;REVB=-0.0124074;RO=26;SAF=7;SAR=7;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126888;STB=0.574895;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0211331;OID=.;OPOS=18966490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:7:7:16:10:7:7:16:10
chr10	19492832	.	A	C	741.26	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.992;QD=57.0202;RBI=0.111588;REFB=0;REVB=0.0184954;RO=0;SAF=12;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229089;OID=.;OPOS=19492832;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:52:0:0:50:52:1:38:12:0:0:38:14:0:0
chr10	19498278	.	G	A	1356.81	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.058;QD=61.6733;RBI=0.0246497;REFB=0;REVB=0.0200032;RO=0;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197011;OID=.;OPOS=19498278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:88:0:0:86:88:1:41:45:0:0:41:47:0:0
chr10	19620407	.	A	C	784.23	PASS	AF=0.465909;AO=82;DP=176;FAO=82;FDP=176;FR=.;FRO=94;FSAF=35;FSAR=47;FSRF=52;FSRR=42;FWDB=0.0143174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1183;QD=17.8235;RBI=0.0595421;REFB=0.00308933;REVB=0.0577952;RO=94;SAF=35;SAR=47;SRF=52;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122057;STB=0.567585;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=-0.00413779;OID=.;OPOS=19620407;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:176:94:94:82:82:0.465909:47:35:52:42:47:35:52:42
chr10	19620439	.	A	G	799.08	PASS	AF=0.479769;AO=82;DP=172;FAO=83;FDP=173;FR=.;FRO=90;FSAF=34;FSAR=49;FSRF=54;FSRR=36;FWDB=0.00964246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.016;QD=18.4759;RBI=0.0319292;REFB=-0.00713558;REVB=0.0304384;RO=88;SAF=34;SAR=48;SRF=53;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1753;STB=0.598699;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00987458;OID=.;OPOS=19620439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:173:88:90:82:83:0.479769:48:34:53:35:49:34:54:36
chr10	19636869	.	G	T	233.45	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.098136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7131;QD=16.9785;RBI=0.100213;REFB=-0.00953005;REVB=-0.0202986;RO=29;SAF=15;SAR=11;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00891358;STB=0.505018;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0167188;OID=.;OPOS=19636869;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:29:26:26:0.472727:11:15:17:12:11:15:17:12
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chr10	19678286	.	C	T	1495.68	PASS	AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0469192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.674;QD=62.32;RBI=0.0477937;REFB=-0.0760762;REVB=-0.00910104;RO=1;SAF=37;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00810635;STB=0.504273;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000310187;OID=.;OPOS=19678286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:96:96:1:1:95:95:0.989583:58:37:0:1:58:37:0:1
chr10	19678449	.	A	G	350.85	PASS	AF=0.417582;AO=38;DP=91;FAO=38;FDP=91;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=-0.0106117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.414;QD=15.4218;RBI=0.0123331;REFB=-0.0043144;REVB=-0.00628459;RO=53;SAF=19;SAR=19;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291735;STB=0.516475;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.00611077;OID=.;OPOS=19678449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:53:53:38:38:0.417582:19:19:25:28:19:19:25:28
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chr10	19778056	.	G	A	290.74	PASS	AF=0.312;AO=39;DP=124;FAO=39;FDP=125;FR=.;FRO=86;FSAF=6;FSAR=33;FSRF=24;FSRR=62;FWDB=0.0793628;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.4269;QD=9.30358;RBI=0.0828907;REFB=-0.00103032;REVB=0.0239254;RO=85;SAF=6;SAR=33;SRF=24;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230593;STB=0.634537;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00309023;OID=.;OPOS=19778056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:125:85:86:39:39:0.312:33:6:24:61:33:6:24:62
chr10	19778072	.	A	G	1697.33	PASS	AF=0.991228;AO=112;DP=114;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=88;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00629456;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=308.546;QD=59.5554;RBI=0.0132167;REFB=-0.0273215;REVB=0.0116215;RO=1;SAF=24;SAR=88;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193677;STB=0.509802;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=2.34537e-05;OID=.;OPOS=19778072;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:114:114:1:1:112:113:0.991228:88:24:1:0:88:25:1:0
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chr10	19884264	.	G	A	252.84	PASS	AF=0.346939;AO=23;DP=95;FAO=34;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=64;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=-0.0326805;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.248;QD=10.3202;RBI=0.0338898;REFB=-0.0139259;REVB=-0.0089725;RO=47;SAF=8;SAR=15;SRF=17;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173779;STB=0.501204;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0343502;OID=.;OPOS=19884264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:98:47:64:23:34:0.346939:15:8:17:30:16:18:34:30
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chr10	19896830	.	C	A	734.25	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-4.58602e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.936;QD=61.1877;RBI=0.00554888;REFB=-0.131315;REVB=-0.0055487;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511106;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000800373;OID=.;OPOS=19896830;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:0:1:47:47:0.979167:22:25:0:0:22:25:0:1
chr10	20036605	.	A	AGT	43.09	PASS	AF=0.189189;AO=7;DP=46;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0115183;FXX=0.0512689;HRUN=0;LEN=2;MLLD=91.4399;QD=4.65846;RBI=0.0117689;REFB=-0.0280926;REVB=-0.00241562;RO=38;SAF=5;SAR=2;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175318;STB=0.679471;STBP=0.318;TYPE=ins;VARB=0.04111;OID=.;OPOS=20036606;OREF=-;OALT=GT;OMAPALT=AGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.189189:7:46:7:37:30:5:2:15:15:43:38:5:2:22:16
chr10	20357183	.	A	G	267.53	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=23;FWDB=0.0266569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.599;QD=21.8389;RBI=0.0266601;REFB=-0.00706596;REVB=-0.000413504;RO=22;SAF=8;SAR=17;SRF=1;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302199;STB=0.676423;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0110601;OID=.;OPOS=20357183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:22:24:25:25:0.510204:17:8:1:21:17:8:1:23
chr10	20534333	.	A	G	368.8	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00829138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6754;QD=19.4108;RBI=0.0273618;REFB=-0.00659822;REVB=0.0260753;RO=37;SAF=16;SAR=21;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733714;STB=0.539951;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.00862226;OID=.;OPOS=20534333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:37:38:37:38:0.5:21:16:19:18:22:16:19:19
chr10	21071191	.	G	C	618.81	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0026235;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.186;QD=61.8812;RBI=0.00909068;REFB=0;REVB=0.00870389;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000565266;OID=.;OPOS=21071191;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:13:26:0:0:14:26:0:0
chr10	21074344	.	A	G	1227.01	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3696;QD=61.3506;RBI=0.125884;REFB=0;REVB=0.122703;RO=0;SAF=43;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000829149;OID=.;OPOS=21074344;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:36:43:0:0:36:44:0:0
chr10	21074455	.	T	C	1859.33	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.361;QD=61.4655;RBI=0.0176254;REFB=0;REVB=0.0130284;RO=0;SAF=63;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07607e-05;OID=.;OPOS=21074455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:58:63:0:0:58:63:0:0
chr10	21414892	.	C	G	186.2	PASS	AF=0.383333;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.00847783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.943;QD=12.4135;RBI=0.0174984;REFB=-0.00568597;REVB=-0.0153075;RO=37;SAF=11;SAR=12;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0953083;STB=0.554866;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.011691;OID=.;OPOS=21414892;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:37:37:23:23:0.383333:12:11:21:16:12:11:21:16
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chr10	21806993	.	CGTTTTTTTA	CGTTTTTT,CGTTTTTTA,CGTTTTTTAA,TCGTTTTTTA	116.53	PASS	AF=0.586207,0,0,0;AO=4,7,5,2;DP=37;FAO=17,0,0,0;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=9,0,0,0;FSAR=8,0,0,0;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.214098,-0.0248543,-0.247291,-0.0385277;FXX=0;HRUN=7,7,7,1;LEN=2,1,1,3;MLLD=17.7048,10.0061,9.20419,23.5952;QD=16.0726;RBI=0.267319,0.0985638,0.253607,0.0454734;REFB=0.0621601,0.215968,0.17583,0.0246383;REVB=0.160067,0.0953787,-0.0562423,-0.0241546;RO=11;SAF=0,7,5,0;SAR=4,0,0,2;SRF=6;SRR=5;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.701405,0.755432,0.712192,-0.585255;STB=0.62796,0.5,0.5,0.5;STBP=0.133,1,1,1;TYPE=del,del,snp,mnp;VARB=-0.00309326,0.0174249,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=21807001,21806995,21807001,21806993;OREF=TA,T,T,CGT;OALT=-,-,A,TCG;OMAPALT=CGTTTTTT,CGTTTTTTA,CGTTTTTTAA,TCGTTTTTTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:37:29:11:12:4,7,5,2:17,0,0,0:0.586207,0,0,0:4,0,0,2:0,7,5,0:6:5:8,0,0,0:9,0,0,0:10:2
chr10	21827796	.	G	A	381.59	PASS	AF=0.558824;AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=68;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00363431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.816;QD=22.4463;RBI=0.0201142;REFB=-0.00221875;REVB=0.0197831;RO=28;SAF=11;SAR=27;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061489;STB=0.539978;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0020448;OID=.;OPOS=21827796;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:28:30:38:38:0.558824:27:11:10:18:27:11:11:19
chr10	21950592	.	A	G	146.37	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0100401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2413;QD=16.7274;RBI=0.0258501;REFB=-0.00568862;REVB=-0.0238207;RO=19;SAF=9;SAR=7;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181939;STB=0.604112;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00359075;OID=.;OPOS=21950592;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:7:9:7:12:7:9:7:12
chr10	22498749	.	A	T	2254.97	PASS	AF=1;AO=142;DP=142;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2735;QD=63.5203;RBI=0.0326267;REFB=0;REVB=0.00562512;RO=0;SAF=93;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103824;OID=.;OPOS=22498749;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:142:0:0:142:142:1:49:93:0:0:49:93:0:0
chr10	22825596	.	C	T	167.21	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0189097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.6245;QD=41.8019;RBI=0.0273256;REFB=-0.101226;REVB=0.0197259;RO=1;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0699995;STB=0.53841;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.00640645;OID=.;OPOS=22825596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:6:9:0:1:6:9:0:1
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chr10	23297252	.	G	A	1265.0	PASS	AF=0.428135;AO=137;DP=322;FAO=140;FDP=327;FR=.;FRO=187;FSAF=58;FSAR=82;FSRF=86;FSRR=101;FWDB=-0.00187531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.298;QD=15.4741;RBI=0.0319753;REFB=-0.0067505;REVB=0.0319202;RO=169;SAF=57;SAR=80;SRF=82;SRR=87;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699924;STB=0.526622;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.00867501;OID=.;OPOS=23297252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:322:327:169:187:137:140:0.428135:80:57:82:87:82:58:86:101
chr10	23482634	.	GT	G,GC	97.7	PASS	AF=1,0;AO=7,3;DP=10;FAO=10,0;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0;FSAR=2,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0669574,0.0649224;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=117.372,110.803;QD=39.0781;RBI=0.0679067,0.0722006;REFB=0,0;REVB=-0.0113149,-0.0315915;RO=0;SAF=7,1;SAR=0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00159825,0.0541888;OID=.,.;OPOS=23482635,23482635;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:7,3:10:10,0:10:0:8,0:2,0:0:0:4:0:7,1:0,2:0:0
chr10	23482777	.	A	G	78.64	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.110228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9214;QD=14.9786;RBI=0.167697;REFB=-0.0434397;REVB=0.12638;RO=11;SAF=8;SAR=2;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940418;STB=0.555438;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0481922;OID=.;OPOS=23482777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:2:8:8:3:2:8:8:3
chr10	23482991	.	AGAT	A	692.19	PASS	AF=0.54918;AO=56;DP=129;FAO=67;FDP=122;FR=.;FRO=55;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=42;FSRR=13;FWDB=0.000565392;FXX=0.0757518;HRUN=1;LEN=3;MLLD=268.953;QD=22.6948;RBI=0.0137282;REFB=-0.0254405;REVB=0.0137166;RO=46;SAF=33;SAR=23;SRF=35;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150699;STB=0.615881;STBP=0.007;TYPE=del;VARB=0.0228651;OID=.;OPOS=23482992;OREF=GAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.54918:56:129:67:122:55:34:33:42:13:99:46:33:23:35:11
chr10	23556110	.	A	G	149.22	PASS	AF=0.28;AO=21;DP=76;FAO=21;FDP=75;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=-0.0119371;FXX=0.0131562;HRUN=6;LEN=1;MLLD=117.991;QD=7.95845;RBI=0.0124015;REFB=-0.0225411;REVB=-0.00336193;RO=50;SAF=6;SAR=15;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244095;STB=0.637722;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0594923;OID=.;OPOS=23556110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:50:54:21:21:0.28:15:6:24:26:15:6:25:29
chr10	23633566	.	C	A	526.29	PASS	AF=0.372781;AO=63;DP=169;FAO=63;FDP=169;FR=.;FRO=106;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=51;FSRR=55;FWDB=-0.0360035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.664;QD=12.4566;RBI=0.0360616;REFB=-0.021937;REVB=-0.00204604;RO=106;SAF=33;SAR=30;SRF=51;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471606;STB=0.526752;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0363713;OID=.;OPOS=23633566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:169:106:106:63:63:0.372781:30:33:51:55:30:33:51:55
chr10	24721946	.	A	C	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=-0.0370649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2859;QD=14.0964;RBI=0.081217;REFB=-0.0177157;REVB=0.0722662;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.447146;STB=0.756357;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00966293;OID=.;OPOS=24721946;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:4:7:2:12:4:7:2:12
chr10	24762465	.	A	G	279.01	PASS	AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0506753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.613;QD=27.2202;RBI=0.0506935;REFB=-0.00825446;REVB=-0.00136166;RO=16;SAF=10;SAR=15;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243844;STB=0.63451;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00422755;OID=.;OPOS=24762465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:15:10:12:4:15:10:12:4
chr10	24832885	.	C	T	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.644;QD=57.6807;RBI=0.04548;REFB=0;REVB=0.041799;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273512;OID=.;OPOS=24832885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr10	24833137	.	C	T	781.42	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0765408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.795;QD=63.789;RBI=0.0784324;REFB=0;REVB=0.0171215;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000580173;OID=.;OPOS=24833137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:23:25:0:0:24:25:0:0
chr10	24873369	.	C	G	159.24	PASS	AF=0.289474;AO=22;DP=76;FAO=22;FDP=76;FR=.;FRO=54;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.00268296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.538;QD=8.38096;RBI=0.0133919;REFB=-0.0167208;REVB=0.0131204;RO=54;SAF=7;SAR=15;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264902;STB=0.65839;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0385365;OID=.;OPOS=24873369;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:54:54:22:22:0.289474:15:7:29:25:15:7:29:25
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chr10	25313818	.	C	T	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0207245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.4568;QD=16.8982;RBI=0.049489;REFB=0.0170043;REVB=-0.0449406;RO=9;SAF=7;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.382806;STB=0.721216;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.0238692;OID=.;OPOS=25313818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:3:7:2:7:3:7:2:7
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chr10	25861632	.	C	T	480.75	PASS	AF=0.377483;AO=57;DP=151;FAO=57;FDP=151;FR=.;FRO=94;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=73;FSRR=21;FWDB=-0.00744518;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1413;QD=12.7351;RBI=0.00760818;REFB=-0.0076426;REVB=-0.00156645;RO=94;SAF=32;SAR=25;SRF=73;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251289;STB=0.640669;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0118067;OID=.;OPOS=25861632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:94:94:57:57:0.377483:25:32:73:21:25:32:73:21
chr10	25888180	.	A	G	82.31	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0234004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.072;QD=19.3672;RBI=0.0243922;REFB=-0.0206305;REVB=-0.00688505;RO=7;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207621;STB=0.620002;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0592023;OID=.;OPOS=25888180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:3:7:3:4:3:7:3:4
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chr10	26355992	.	A	G	547.13	PASS	AF=0.926829;AO=36;DP=41;FAO=38;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0387021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.9383;QD=53.3786;RBI=0.0403713;REFB=-0.0512694;REVB=0.0114889;RO=2;SAF=8;SAR=28;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385681;STB=0.506575;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00180386;OID=.;OPOS=26355992;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:41:41:2:3:36:38:0.926829:28:8:1:1:28:10:1:2
chr10	26357748	.	G	A	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.42;QD=62.9827;RBI=0.0324936;REFB=0;REVB=0.0117568;RO=0;SAF=10;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64128e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269781;OID=.;OPOS=26357748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:35:10:0:0:35:10:0:0
chr10	26463130	.	C	A	417.79	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0347967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8213;QD=53.9078;RBI=0.0352362;REFB=-0.101419;REVB=0.00554786;RO=1;SAF=16;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282472;STB=0.515141;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00138546;OID=.;OPOS=26463130;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:14:16:1:0:14:16:1:0
chr10	26482157	.	A	G	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.00589781;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=180.45;QD=12.8689;RBI=0.0169375;REFB=-0.0110436;REVB=0.0158775;RO=16;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21426;STB=0.624791;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0242189;OID=.;OPOS=26482157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:5:6:12:4:5:6:12:4
chr10	26991067	.	CG	C	115.67	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=36.6475;QD=42.0623;RBI=0.0191324;REFB=0;REVB=0.00388314;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00140753;OID=.;OPOS=26991068;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:11:11:11:11:0:3:8:0:0:4:0:3:8:0:0
chr10	26993597	.	AT	A	68.99	PASS	AF=0.357143;AO=18;DP=54;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00585752;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.3365;QD=4.92765;RBI=0.109144;REFB=-0.0230383;REVB=0.108987;RO=32;SAF=8;SAR=10;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949207;STB=0.582651;STBP=0.357;TYPE=del;VARB=0.0684809;OID=.;OPOS=26993598;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.357143:18:54:20:56:36:8:12:19:17:68:32:8:10:17:15
chr10	27303605	.	A	T	348.56	PASS	AF=0.404255;AO=38;DP=94;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=-0.0889414;FXX=0.0105252;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9962;QD=14.8326;RBI=0.0897573;REFB=-0.0250175;REVB=-0.0120743;RO=56;SAF=24;SAR=14;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104635;STB=0.559409;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0350228;OID=.;OPOS=27303605;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:56:56:38:38:0.404255:14:24:30:26:14:24:30:26
chr10	27317778	.	T	C	123.79	PASS	AF=0.298246;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=57;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.00515124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.887;QD=8.68704;RBI=0.0202153;REFB=-0.00511134;REVB=0.019548;RO=40;SAF=6;SAR=11;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.08908;STB=0.553546;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.011721;OID=.;OPOS=27317778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:40:40:17:17:0.298246:11:6:17:23:11:6:17:23
chr10	27317840	.	C	T	151.55	PASS	AF=0.333333;AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0663343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3639;QD=10.1035;RBI=0.0706286;REFB=-0.000727342;REVB=-0.024252;RO=40;SAF=8;SAR=12;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581395;STB=0.534212;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=-0.00104002;OID=.;OPOS=27317840;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:40:40:20:20:0.333333:12:8:18:22:12:8:18:22
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chr10	27381349	.	T	C	127.2	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0184755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.677;QD=11.5634;RBI=0.0448904;REFB=-0.0302511;REVB=0.0409121;RO=29;SAF=14;SAR=1;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.519099;STB=0.822958;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0322732;OID=.;OPOS=27381349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:1:14:19:10:1:14:19:10
chr10	27389197	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.489;QD=54.5176;RBI=0.0276992;REFB=0;REVB=0.0100849;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136325;OID=.;OPOS=27389197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0
chr10	27400861	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4901;QD=59.8391;RBI=0.0334075;REFB=0;REVB=0.0228207;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.89699e-05;OID=.;OPOS=27400861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0
chr10	27434483	.	G	A	727.21	PASS	AF=0.538462;AO=70;DP=131;FAO=70;FDP=130;FR=.;FRO=60;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=-0.0264952;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.001;QD=22.3758;RBI=0.0265425;REFB=-0.0154315;REVB=-0.00158499;RO=60;SAF=35;SAR=35;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140366;STB=0.50769;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0112524;OID=.;OPOS=27434483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:130:60:60:70:70:0.538462:35:35:31:29:35:35:31:29
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chr10	28909299	.	GTT	GT,GTA,TGT	1051.75	PASS	AF=0.986486,0,0.0135135;AO=68,3,3;DP=74;FAO=73,0,1;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=37,0,1;FSAR=36,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00922017,-0.115569,-0.0236986;FXX=0;HRUN=2,2,1;LEN=1,1,2;MLLD=25.5861,6.40252,8.35352;QD=56.8513;RBI=0.0129183,0.11567,0.032598;REFB=0,0,0;REVB=-0.00904832,0.00483452,-0.0223831;RO=0;SAF=34,3,1;SAR=34,0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,mnp;VARB=0.00306014,0,0.0636751;OID=.,.,.;OPOS=28909300,28909301,28909299;OREF=T,T,GT;OALT=-,A,TG;OMAPALT=GT,GTA,TGT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/3:3:74:74:0:0:68,3,3:73,0,1:0.986486,0,0.0135135:34,0,2:34,3,1:0:0:36,0,0:37,0,1:0:0
chr10	28970487	.	C	T	151.2	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0169491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.159;QD=20.16;RBI=0.0319546;REFB=-0.0183421;REVB=-0.0270891;RO=13;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140495;STB=0.562422;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0157784;OID=.;OPOS=28970487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:14:16:16:0.533333:7:9:5:8:7:9:6:8
chr10	29136228	.	C	G	87.9	PASS	AF=0.24;AO=12;DP=50;FAO=12;FDP=50;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0137541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3527;QD=7.03217;RBI=0.0307681;REFB=-0.00932894;REVB=-0.0275227;RO=38;SAF=4;SAR=8;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322695;STB=0.700974;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.072407;OID=.;OPOS=29136228;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:50:50:38:38:12:12:0.24:8:4:23:15:8:4:23:15
chr10	29163413	.	G	A	97.31	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0349699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.704;QD=12.9748;RBI=0.03705;REFB=0.000497396;REVB=-0.0122395;RO=18;SAF=3;SAR=9;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105263;STB=0.562391;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=-0.000931048;OID=.;OPOS=29163413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:9:3:6:12:9:3:6:12
chr10	29578084	.	A	G	727.78	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.052526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2679;QD=63.2848;RBI=0.0726953;REFB=0;REVB=-0.0502556;RO=0;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00111275;OID=.;OPOS=29578084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:17:29:0:0:17:29:0:0
chr10	29599972	.	G	A	1514.08	PASS	AF=0.989691;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0135113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.383;QD=62.4364;RBI=0.0307109;REFB=-0.0287142;REVB=-0.027579;RO=1;SAF=50;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00938984;STB=0.504853;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=4.52518e-05;OID=.;OPOS=29599972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:96:97:1:1:95:96:0.989691:45:50:1:0:45:51:1:0
chr10	29606197	.	C	G	829.25	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=63;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0260601;FXX=0.063482;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.354;QD=56.2202;RBI=0.026765;REFB=-0.071521;REVB=0.00610226;RO=1;SAF=31;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149748;STB=0.507934;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00194388;OID=.;OPOS=29606197;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:63:59:1:1:58:58:0.983051:27:31:1:0:27:31:1:0
chr10	29606270	.	A	T	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.759;QD=57.0006;RBI=0.0172283;REFB=0;REVB=-0.00422068;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13853e-05;OID=.;OPOS=29606270;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0
chr10	29783908	.	A	G	126.65	PASS	AF=0.181102;AO=23;DP=126;FAO=23;FDP=127;FR=.;FRO=104;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=49;FSRR=55;FWDB=0.01368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.584;QD=3.98894;RBI=0.0170882;REFB=-0.00771745;REVB=-0.0102403;RO=103;SAF=16;SAR=7;SRF=48;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29373;STB=0.685394;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.041402;OID=.;OPOS=29783908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:127:103:104:23:23:0.181102:7:16:48:55:7:16:49:55
chr10	29784072	.	G	C	821.22	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00598051;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.141;QD=55.6762;RBI=0.0673128;REFB=-0.123049;REVB=0.0670466;RO=1;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165496;STB=0.508769;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.000676971;OID=.;OPOS=29784072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:59:1:1:58:58:0.983051:28:30:0:1:28:30:0:1
chr10	29784114	.	T	C	889.08	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509594;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.83;QD=58.3004;RBI=0.0516096;REFB=0;REVB=0.00816641;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000238581;OID=.;OPOS=29784114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0
chr10	29822032	.	C	T	289.26	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0813034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2031;QD=52.5928;RBI=0.111672;REFB=0;REVB=-0.0765528;RO=0;SAF=17;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.88361e-05;OID=.;OPOS=29822032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:5:17:0:0:5:17:0:0
chr10	30000844	.	T	G	498.68	PASS	AF=0.486486;AO=49;DP=106;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=-0.0227918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.486;QD=17.9705;RBI=0.0871389;REFB=-0.00710841;REVB=0.0841054;RO=57;SAF=20;SAR=29;SRF=37;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229714;STB=0.632261;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0128114;OID=.;OPOS=30000844;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:111:57:57:49:54:0.486486:29:20:37:20:33:21:37:20
chr10	30728101	.	T	C	491.68	PASS	AF=0.490566;AO=52;DP=106;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=0.0198208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.557;QD=18.554;RBI=0.0447896;REFB=-0.021032;REVB=0.0401652;RO=52;SAF=18;SAR=34;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179793;STB=0.600712;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0245507;OID=.;OPOS=30728101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:52:54:52:52:0.490566:34:18:28:24:34:18:29:25
chr10	30728250	.	A	G	772.76	PASS	AF=0.585366;AO=72;DP=124;FAO=72;FDP=123;FR=.;FRO=51;FSAF=30;FSAR=42;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0172018;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.03;QD=25.1303;RBI=0.017754;REFB=-0.0287048;REVB=0.00439359;RO=51;SAF=30;SAR=42;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0418953;STB=0.522815;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0172331;OID=.;OPOS=30728250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:123:51:51:72:72:0.585366:42:30:24:27:42:30:24:27
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chr10	32045045	.	A	C	84.34	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00479614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.468;QD=10.5421;RBI=0.00485007;REFB=0.00140582;REVB=0.000721289;RO=21;SAF=4;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126689;STB=0.576329;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.00243508;OID=.;OPOS=32045045;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:7:4:10:11:7:4:10:11
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chr10	32635834	.	G	A	486.47	PASS	AF=0.767442;AO=31;DP=41;FAO=33;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0107648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.028;QD=45.2534;RBI=0.0347736;REFB=-0.0829934;REVB=-0.0330654;RO=3;SAF=19;SAR=12;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0681581;STB=0.562464;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0368825;OID=.;OPOS=32635834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:41:43:3:6:31:33:0.767442:12:19:3:0:12:21:6:0
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chr10	33018351	.	G	A,C	1531.45	PASS	AF=0.0384615,0.961538;AO=4,98;DP=102;FAO=4,100;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=4,44;FSAR=0,56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213791,0.000966456;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=197.804,240.391;QD=58.9021;RBI=0.0215263,0.00243844;REFB=0,0;REVB=-0.00251357,0.00223874;RO=0;SAF=4,42;SAR=0,56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0772923,-0.00080701;OID=.,.;OPOS=33018351,33018351;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:102:104:0:0:4,98:4,100:0.0384615,0.961538:0,56:4,42:0:0:0,56:4,44:0:0
chr10	33123824	.	G	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.379;QD=56.9383;RBI=0.0474534;REFB=0;REVB=0.0291767;RO=0;SAF=17;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126885;OID=.;OPOS=33123824;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:36:17:0:0:36:17:0:0
chr10	33143396	.	G	A	688.54	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9866;QD=62.5947;RBI=0.0321853;REFB=0;REVB=-0.0300418;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000343023;OID=.;OPOS=33143396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
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chr10	33468456	.	C	T	228.94	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0121943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0095;QD=16.0659;RBI=0.0227631;REFB=-0.0151229;REVB=0.0192212;RO=31;SAF=12;SAR=14;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215724;STB=0.512186;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0141382;OID=.;OPOS=33468456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:31:31:26:26:0.45614:14:12:15:16:14:12:15:16
chr10	33469181	.	A	G	194.73	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.00238083;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.136;QD=16.5724;RBI=0.0190039;REFB=-0.031429;REVB=0.0188542;RO=27;SAF=11;SAR=9;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159422;STB=0.590723;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0472056;OID=.;OPOS=33469181;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:27:27:20:20:0.425532:9:11:19:8:9:11:19:8
chr10	33552695	.	CA	CG,TG	938.11	PASS	AF=0.485294,0.5;AO=33,34;DP=68;FAO=33,34;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=17,11;FSAR=16,23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0315633,-0.0135719;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=99.3182,301.889;QD=55.1829;RBI=0.0342866,0.0135719;REFB=-0.0569598,-0.0516096;REVB=0.0133914,-1.63984e-05;RO=1;SAF=17,11;SAR=16,23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0283046,0.0198968;STB=0.515142,0.510632;STBP=0.531,0.618;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00889338,0.00455778;OID=.,.;OPOS=33552696,33552695;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:68:68:1:1:33,34:33,34:0.485294,0.5:16,23:17,11:0:1:16,23:17,11:0:1
chr10	33577361	.	G	A	415.97	PASS	AF=0.446602;AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=0.00312228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2772;QD=16.1542;RBI=0.0249064;REFB=-0.00385971;REVB=-0.02471;RO=57;SAF=22;SAR=24;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109621;STB=0.561198;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00470612;OID=.;OPOS=33577361;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:57:57:46:46:0.446602:24:22:21:36:24:22:21:36
chr10	34606123	.	C	CT,T	44.43	PASS	AF=0.163636,0.0545455;AO=16,3;DP=57;FAO=9,3;FDP=55;FR=.;FRO=43;FSAF=8,2;FSAR=1,1;FSRF=35;FSRR=8;FWDB=-0.0422428,-0.0485078;FXX=0;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=74.692,85.2176;QD=3.2314;RBI=0.0618527,0.0649138;REFB=-0.00204697,-0.000759373;REVB=-0.0451808,-0.043137;RO=38;SAF=14,2;SAR=2,1;SRF=31;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.135946,-0.204347;STB=0.625761,0.67182;STBP=0.535,0.803;TYPE=ins,snp;VARB=0.181534,0.0701787;OID=.,.;OPOS=34606124,34606123;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:57:55:38:43:16,3:9,3:0.163636,0.0545455:2,1:14,2:31:7:1,1:8,2:35:8
chr10	34688287	.	G	A	776.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6175;QD=63.3846;RBI=0.0311745;REFB=0;REVB=0.00202714;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0025235;OID=.;OPOS=34688287;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:48:49:1:20:28:0:0:21:28:0:0
chr10	35215790	.	C	G	90.96	PASS	AF=1;AO=8;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0672757;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7355;QD=40.4272;RBI=0.0842256;REFB=0;REVB=0.0506747;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00877519;OID=.;OPOS=35215790;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:9:0:0:8:9:1:5:3:0:0:6:3:0:0
chr10	35302705	.	C	T	308.01	PASS	AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0209025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.824;QD=24.1577;RBI=0.0313642;REFB=-0.0296553;REVB=-0.0233838;RO=21;SAF=24;SAR=6;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333054;STB=0.685577;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0115842;OID=.;OPOS=35302705;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:6:24:9:12:6:24:9:12
chr10	35321414	.	C	T	287.96	PASS	AF=0.565217;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00730237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.525;QD=25.0397;RBI=0.0241291;REFB=-0.0136869;REVB=-0.0229976;RO=19;SAF=17;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103221;STB=0.570616;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00812126;OID=.;OPOS=35321414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:19:20:26:26:0.565217:9:17:10:9:9:17:10:10
chr10	35338699	.	G	A	315.4	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00358577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.376;QD=17.5222;RBI=0.00561626;REFB=-0.00288242;REVB=-0.00432257;RO=38;SAF=21;SAR=13;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139572;STB=0.507808;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.00513547;OID=.;OPOS=35338699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:38:38:34:34:0.472222:13:21:24:14:13:21:24:14
chr10	35362977	.	A	G	138.43	PASS	AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0484474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9587;QD=11.7809;RBI=0.0728892;REFB=-0.00653648;REVB=-0.0544581;RO=31;SAF=13;SAR=3;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245096;STB=0.64748;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0134098;OID=.;OPOS=35362977;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:31:31:16:16:0.340426:3:13:20:11:3:13:20:11
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chr10	35929131	.	G	A	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.699;QD=16.4545;RBI=0.00879058;REFB=0.00244941;REVB=-0.00879058;RO=4;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00151023;OID=.;OPOS=35929131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:6:0:0:4:6:0:0:4
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chr10	37447358	.	T	G	219.07	PASS	AF=0.307692;AO=28;DP=91;FAO=28;FDP=91;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=0.0069516;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.401;QD=9.62963;RBI=0.0146626;REFB=-0.00515127;REVB=0.0129099;RO=63;SAF=19;SAR=9;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328307;STB=0.692649;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0125169;OID=.;OPOS=37447358;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:63:63:28:28:0.307692:9:19:25:38:9:19:25:38
chr10	37488689	.	G	C	199.06	PASS	AF=0.271845;AO=28;DP=103;FAO=28;FDP=103;FR=.;FRO=75;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=37;FSRR=38;FWDB=-0.0381139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.922;QD=7.73048;RBI=0.041328;REFB=-0.0133804;REVB=-0.0159792;RO=75;SAF=13;SAR=15;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354301;STB=0.52118;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0301084;OID=.;OPOS=37488689;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:75:75:28:28:0.271845:15:13:37:38:15:13:37:38
chr10	37505141	.	G	A	166.43	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0155569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.817;QD=14.7937;RBI=0.0199486;REFB=-0.0308261;REVB=-0.0124871;RO=26;SAF=10;SAR=8;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176619;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0271215;OID=.;OPOS=37505141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:27:18:18:0.4:8:10:14:12:8:10:15:12
chr10	37505192	.	C	T	311.56	PASS	AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.00752295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.176;QD=19.1729;RBI=0.0187264;REFB=-0.0291571;REVB=0.0171488;RO=32;SAF=17;SAR=16;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013399;STB=0.507458;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0222225;OID=.;OPOS=37505192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:32:32:33:33:0.507692:16:17:16:16:16:17:16:16
chr10	37508450	.	A	C	227.12	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0181964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.207;QD=21.1275;RBI=0.0236484;REFB=-0.0133188;REVB=0.0151043;RO=21;SAF=9;SAR=13;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0174248;STB=0.509795;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.0146825;OID=.;OPOS=37508450;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:13:9:9:12:13:9:9:12
chr10	37890955	.	G	A	170.33	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00864984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.866;QD=17.0325;RBI=0.0207441;REFB=-0.0151575;REVB=0.0188547;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182845;STB=0.604282;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.023969;OID=.;OPOS=37890955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:10:8:14:8:10:8:14:8
chr10	37891465	.	G	T	170.27	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.132472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7655;QD=17.027;RBI=0.150183;REFB=0.0283199;REVB=0.0707532;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131387;STB=0.574919;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=-0.0349664;OID=.;OPOS=37891465;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:9:9:14:8:9:9:14:8
chr10	37891576	.	G	A	504.09	PASS	AF=0.638889;AO=46;DP=72;FAO=46;FDP=72;FR=.;FRO=26;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00950101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1177;QD=28.0051;RBI=0.0177589;REFB=0.00612372;REVB=0.0150036;RO=26;SAF=28;SAR=18;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219999;STB=0.511975;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=-0.00340374;OID=.;OPOS=37891576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:26:26:46:46:0.638889:18:28:15:11:18:28:15:11
chr10	38344700	.	C	G	143.15	PASS	AF=0.3125;AO=19;DP=63;FAO=20;FDP=64;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.0113723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.362;QD=8.94687;RBI=0.0275516;REFB=-0.00284905;REVB=-0.0250951;RO=43;SAF=16;SAR=3;SRF=15;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.574684;STB=0.84965;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0105915;OID=.;OPOS=38344700;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:43:44:19:20:0.3125:3:16:15:28:3:17:15:29
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chr10	38740546	.	G	T	175.71	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=29;FWDB=-0.0555513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.734;QD=11.9125;RBI=0.0585395;REFB=-0.0268748;REVB=-0.0184642;RO=36;SAF=1;SAR=21;SRF=8;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.482297;STB=0.790423;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0560732;OID=.;OPOS=38740546;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:36:37:22:22:0.372881:21:1:8:28:21:1:8:29
chr10	38740590	.	A	G	49.64	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.0944259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9838;QD=8.2735;RBI=0.0964678;REFB=-0.0180661;REVB=0.0197431;RO=17;SAF=1;SAR=6;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070928;STB=0.624739;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0427282;OID=.;OPOS=38740590;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:24:24:17:16:7:8:0.333333:6:1:3:14:6:2:2:14
chr10	42965636	.	C	T	263.49	PASS	AF=0.518519;AO=27;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.00149061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.5815;QD=19.5179;RBI=0.00654651;REFB=0.0104919;REVB=-0.00637455;RO=26;SAF=5;SAR=22;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308873;STB=0.678675;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.00807573;OID=.;OPOS=42965636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:27:28:0.518519:22:5:12:14:23:5:12:14
chr10	43089965	.	G	A	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.168;QD=63.8713;RBI=0.0322618;REFB=0;REVB=0.0192429;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017149;OID=.;OPOS=43089965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0
chr10	43281089	.	T	C	1044.23	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0483931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2538;QD=59.6705;RBI=0.0528207;REFB=0;REVB=0.0211691;RO=0;SAF=42;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101003;OID=.;OPOS=43281089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:28:42:0:0:28:42:0:0
chr10	43289407	.	G	A	355.46	PASS	AF=0.463415;AO=37;DP=83;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0271247;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.008;QD=17.3394;RBI=0.0302376;REFB=-0.00223691;REVB=-0.0133628;RO=46;SAF=17;SAR=20;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104053;STB=0.538441;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.00285919;OID=.;OPOS=43289407;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:46:44:37:38:0.463415:20:17:26:20:20:18:24:20
chr10	43312807	.	C	T	584.12	PASS	AF=0.491803;AO=46;DP=122;FAO=60;FDP=122;FR=.,HEALED;FRO=62;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=27;FSRR=35;FWDB=-0.0468139;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=163.126;QD=19.1516;RBI=0.046874;REFB=-0.0381791;REVB=0.0023717;RO=47;SAF=16;SAR=30;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758699;STB=0.536896;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0343809;OID=.;OPOS=43312807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:47:62:46:60:0.491803:30:16:20:27:38:22:27:35
chr10	43595968	.	A	G	1774.29	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.718;QD=60.6596;RBI=0.0622537;REFB=0;REVB=0.0454029;RO=0;SAF=61;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18616e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272962;OID=.;OPOS=43595968;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:117:0:0:115:117:1:54:61:0:0:54:63:0:0
chr10	43606687	.	A	G	1363.81	PASS	AF=0.469055;AO=140;DP=304;FAO=144;FDP=307;FR=.;FRO=163;FSAF=61;FSAR=83;FSRF=96;FSRR=67;FWDB=-0.00792359;FXX=0.0222923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.478;QD=17.7695;RBI=0.00961898;REFB=-0.00867861;REVB=-0.00545358;RO=153;SAF=57;SAR=83;SRF=86;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147582;STB=0.587473;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0103537;OID=.;OPOS=43606687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:304:307:153:163:140:144:0.469055:83:57:86:67:83:61:96:67
chr10	43606856	.	G	A	443.02	PASS	AF=0.494382;AO=30;DP=89;FAO=44;FDP=89;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0356431;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.907;QD=19.9111;RBI=0.0357661;REFB=-0.0374294;REVB=-0.00296359;RO=32;SAF=13;SAR=17;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20319;STB=0.50588;STBP=0.923;TYPE=snp;VARB=0.0246475;OID=.;OPOS=43606856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:32:45:30:44:0.494382:17:13:21:11:21:23:23:22
chr10	43613843	.	G	T	470.33	PASS	AF=0.410853;AO=50;DP=126;FAO=53;FDP=129;FR=.;FRO=76;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=36;FSRR=40;FWDB=0.0337332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.048;QD=14.5838;RBI=0.0368894;REFB=-0.035377;REVB=0.0149297;RO=76;SAF=18;SAR=32;SRF=36;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126031;STB=0.570791;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0546278;OID=.;OPOS=43613843;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:129:76:76:50:53:0.410853:32:18:36:40:34:19:36:40
chr10	43690189	.	G	A	1102.72	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0255407;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=246.17;QD=58.812;RBI=0.0284634;REFB=-0.134126;REVB=0.0125632;RO=0;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507934;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000352943;OID=.;OPOS=43690189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:0:1:74:74:0.986667:43:31:0:0:43:31:1:0
chr10	43691691	.	C	T	268.42	PASS	AF=0.648649;AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0246881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3481;QD=29.0186;RBI=0.0305596;REFB=-0.00436143;REVB=-0.0180109;RO=13;SAF=11;SAR=13;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998667;STB=0.55501;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00418793;OID=.;OPOS=43691691;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:13:13:24:24:0.648649:13:11:8:5:13:11:8:5
chr10	43837352	.	A	G	139.76	PASS	AF=0.875;AO=13;DP=15;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0115412;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.07;QD=34.9407;RBI=0.0182399;REFB=-0.0776313;REVB=0.0141242;RO=2;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1501;STB=0.571326;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00345336;OID=.;OPOS=43837352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:15:16:2:2:13:14:0.875:5:8:0:2:6:8:0:2
chr10	43978087	.	A	G	853.75	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0764826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.697;QD=55.9838;RBI=0.0765112;REFB=-0.0800268;REVB=-0.00208916;RO=1;SAF=19;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113736;STB=0.506022;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.00983036;OID=.;OPOS=43978087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:41:19:0:1:41:19:0:1
chr10	44052902	.	CA	C,CC,CT	1171.5	PASS	AF=0,0.9625,0.0375;AO=30,47,3;DP=81;FAO=0,77,3;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=0,43,0;FSAR=0,34,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119795,0.100866,0.127696;FXX=0.0123442;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=187.309,209.362,173.814;QD=58.5749;RBI=0.12196,0.105859,0.127708;REFB=0,0,0;REVB=0.0228809,0.0321262,0.00170922;RO=0;SAF=30,13,0;SAR=0,34,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.018239,-4.57897e-05,0.0861138;OID=.,.,.;OPOS=44052903,44052903,44052903;OREF=A,A,A;OALT=-,C,T;OMAPALT=C,CC,CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.9625,0.0375:30,47,3:81:0,77,3:80:0:0,43,0:0,34,3:0:0:5:0:30,13,0:0,34,3:0:0
chr10	44053013	.	G	C	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.552;QD=63.2857;RBI=0.025113;REFB=0;REVB=-0.0182086;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000152492;OID=.;OPOS=44053013;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:25:21:0:0:25:21:0:0
chr10	44053585	.	C	T	689.18	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00569773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.262;QD=62.6531;RBI=0.0137582;REFB=0;REVB=-0.012523;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.80461e-05;OID=.;OPOS=44053585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr10	44285777	.	T	C	1015.2	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0334308;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.75;QD=59.7174;RBI=0.0360347;REFB=0;REVB=0.0134494;RO=0;SAF=22;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.20416e-05;OID=.;OPOS=44285777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:45:22:0:0:45:23:0:0
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chr10	44793299	.	C	T	273.92	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0338682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.705;QD=17.6723;RBI=0.0349261;REFB=-0.023231;REVB=0.00853126;RO=31;SAF=14;SAR=16;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0156743;STB=0.501079;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0156956;OID=.;OPOS=44793299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:31:32:30:30:0.483871:16:14:15:16:16:14:15:17
chr10	45430462	.	C	T	278.85	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=17;FWDB=0.0123019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.28;QD=21.8705;RBI=0.0171624;REFB=-0.0246116;REVB=-0.0119671;RO=23;SAF=19;SAR=9;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33691;STB=0.686933;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0160356;OID=.;OPOS=45430462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:9:19:6:17:9:19:6:17
chr10	45467099	.	C	T	518.58	PASS	AF=0.532609;AO=48;DP=93;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0227139;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.54;QD=22.5471;RBI=0.040147;REFB=-0.0307898;REVB=-0.0331038;RO=43;SAF=32;SAR=16;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161194;STB=0.592029;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0249345;OID=.;OPOS=45467099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:43:43:48:49:0.532609:16:32:21:22:16:33:21:22
chr10	45477921	.	A	AG,G	60.84	PASS	AF=0.322581,0;AO=5,2;DP=32;FAO=10,0;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=9,0;FSAR=1,0;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0227049,0.00990974;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=15.6131,30.2726;QD=7.85072;RBI=0.0500433,0.027952;REFB=-0.0819905,-0.0463123;REVB=-0.0445962,0.0261363;RO=25;SAF=5,2;SAR=0,0;SRF=10;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.699994,0.529207;STB=0.893232,0.5;STBP=0.008,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.158983,0;OID=.,.;OPOS=45477922,45477921;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:32:31:25:21:5,2:10,0:0.322581,0:0,0:5,2:10:15:1,0:9,0:7:14
chr10	45478092	.	A	G	62.69	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.0440568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1389;QD=8.08931;RBI=0.0440678;REFB=0.0101842;REVB=-0.000981825;RO=22;SAF=4;SAR=5;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319852;STB=0.694061;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=-0.0142522;OID=.;OPOS=45478092;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:5:4:16:6:5:4:16:6
chr10	45479434	.	G	A	529.48	PASS	AF=0.525773;AO=50;DP=96;FAO=51;FDP=97;FR=.;FRO=46;FSAF=42;FSAR=9;FSRF=36;FSRR=10;FWDB=-0.00943324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.746;QD=21.8343;RBI=0.0275921;REFB=-0.039139;REVB=0.0259295;RO=43;SAF=42;SAR=8;SRF=34;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0725045;STB=0.531987;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0453629;OID=.;OPOS=45479434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:43:46:50:51:0.525773:8:42:34:9:9:42:36:10
chr10	45496120	.	A	T	320.44	PASS	AF=0.376147;AO=41;DP=109;FAO=41;FDP=109;FR=.;FRO=68;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0307141;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.7785;QD=11.7592;RBI=0.0469854;REFB=-0.0164375;REVB=0.0355566;RO=62;SAF=21;SAR=20;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471679;STB=0.544214;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.016167;OID=.;OPOS=45496120;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:62:68:41:41:0.376147:20:21:29:33:20:21:30:38
chr10	45500221	.	A	G	366.04	PASS	AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0129927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.061;QD=21.5315;RBI=0.0177169;REFB=-0.0269802;REVB=0.012045;RO=30;SAF=21;SAR=16;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109082;STB=0.567531;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0244161;OID=.;OPOS=45500221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:30:31:37:37:0.544118:16:21:13:17:16:21:13:18
chr10	45878050	.	G	A	226.93	PASS	AF=0.4375;AO=26;DP=63;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0122333;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.7044;QD=14.183;RBI=0.0208698;REFB=-0.0143865;REVB=-0.0169084;RO=34;SAF=16;SAR=10;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883721;STB=0.551849;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.0176626;OID=.;OPOS=45878050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:34:36:26:28:0.4375:10:16:18:16:10:18:20:16
chr10	45953767	.	A	G	699.73	PASS	AF=0.567797;AO=67;DP=119;FAO=67;FDP=118;FR=.;FRO=51;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=0.00440252;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.996;QD=23.7197;RBI=0.0109605;REFB=-0.0173573;REVB=0.0100374;RO=50;SAF=38;SAR=29;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0913569;STB=0.544304;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0149917;OID=.;OPOS=45953767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:118:50:51:67:67:0.567797:29:38:34:16:29:38:34:17
chr10	46342667	.	CGCTCCTGCCATCCTGTCCCCA	C	50.0	PASS	AO=41;DP=182;LEN=21;RO=141;SAF=8;SAR=20;SRF=52;SRR=102;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=46342668;OREF=GCTCCTGCCATCCTGTCCCCA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:182:141:41:20:8:52:102
chr10	46934832	.	A	G	88.94	PASS	AF=0.714286;AO=10;DP=14;FAO=10;FDP=14;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0125025;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=89.4952;QD=25.4124;RBI=0.123068;REFB=-0.150757;REVB=0.122431;RO=3;SAF=9;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209237;STB=0.599769;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0221874;OID=.;OPOS=46934832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:14:14:3:4:10:10:0.714286:1:9:2:1:1:9:3:1
chr10	46965727	.	G	A	181.26	PASS	AF=0.311688;AO=24;DP=77;FAO=24;FDP=77;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.00825751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.883;QD=9.41602;RBI=0.0593855;REFB=-0.0214;REVB=-0.0588086;RO=52;SAF=16;SAR=8;SRF=33;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411364;STB=0.519215;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0428485;OID=.;OPOS=46965727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:52:53:24:24:0.311688:8:16:33:19:8:16:34:19
chr10	46967483	.	T	C	217.89	PASS	AF=0.215569;AO=36;DP=162;FAO=36;FDP=167;FR=.;FRO=131;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=65;FSRR=66;FWDB=-0.0173259;FXX=0.00595203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.88;QD=5.21894;RBI=0.0229137;REFB=-0.0131245;REVB=-0.014995;RO=124;SAF=22;SAR=14;SRF=62;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141975;STB=0.59095;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.054167;OID=.;OPOS=46967483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:167:124:131:36:36:0.215569:14:22:62:62:14:22:65:66
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chr10	46970792	.	G	C	100.75	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0138057;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.888;QD=16.1194;RBI=0.0322387;REFB=-0.0382126;REVB=0.029133;RO=12;SAF=7;SAR=5;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236162;STB=0.647268;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0370942;OID=.;OPOS=46970792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:13:12:12:0.48:5:7:10:2:5:7:11:2
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chr10	46999030	.	C	T	541.8	PASS	AF=0.525773;AO=51;DP=97;FAO=51;FDP=97;FR=.;FRO=46;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.00269932;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=191.269;QD=22.3424;RBI=0.0177859;REFB=-0.062943;REVB=0.0175798;RO=44;SAF=26;SAR=25;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684352;STB=0.546983;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0582558;OID=.;OPOS=46999030;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:44:46:51:51:0.525773:25:26:26:18:25:26:28:18
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chr10	46999178	.	A	C	385.94	PASS	AF=0.603175;AO=29;DP=63;FAO=38;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0110803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.35;QD=24.5041;RBI=0.0110924;REFB=-0.017203;REVB=0.000518671;RO=25;SAF=24;SAR=5;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299717;STB=0.599737;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0145776;OID=.;OPOS=46999178;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:25:25:29:38:0.603175:5:24:14:11:9:29:14:11
chr10	46999189	.	CA	CG,TG	825.87	PASS	AF=0.627119,0.372881;AO=36,23;DP=60;FAO=37,22;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29,11;FSAR=8,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185465,0.0217496;FXX=0.0327815;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=79.0747,151.61;QD=55.9911;RBI=0.0210768,0.0218267;REFB=0,0;REVB=0.010013,0.00183349;RO=0;SAF=28,12;SAR=8,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00509831,0.0193113;OID=.,.;OPOS=46999190,46999189;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:60:59:0:0:36,23:37,22:0.627119,0.372881:8,11:28,12:0:0:8,11:29,11:0:0
chr10	46999198	.	G	T	184.21	PASS	AF=0.370968;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=31;FSRR=8;FWDB=-0.029786;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.857;QD=11.8845;RBI=0.0299371;REFB=-0.0245053;REVB=0.00300455;RO=37;SAF=12;SAR=11;SRF=29;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289367;STB=0.674619;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.046066;OID=.;OPOS=46999198;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:37:39:23:23:0.370968:11:12:29:8:11:12:31:8
chr10	46999465	.	A	G	34.72	PASS	AF=0.2;AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0145469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.866;QD=4.62989;RBI=0.0412528;REFB=0.0139034;REVB=0.0386029;RO=24;SAF=3;SAR=3;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987067;STB=0.566449;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=-0.0201848;OID=.;OPOS=46999465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:24:24:6:6:0.2:3:3:10:14:3:3:10:14
chr10	46999484	.	G	T	268.0	PASS	AF=0.766667;AO=23;DP=30;FAO=23;FDP=30;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0124942;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=309.709;QD=35.7329;RBI=0.0146399;REFB=-0.0162942;REVB=-0.00763032;RO=7;SAF=10;SAR=13;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0588234;STB=0.532136;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.00640945;OID=.;OPOS=46999484;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:30:30:7:7:23:23:0.766667:13:10:4:3:13:10:4:3
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chr10	46999604	.	A	G	643.1	PASS	AF=0.934783;AO=36;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00396365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.773;QD=55.922;RBI=0.118563;REFB=-0.0288235;REVB=0.118497;RO=3;SAF=29;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460087;STB=0.523799;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00366235;OID=.;OPOS=46999604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:46:46:3:3:36:43:0.934783:7:29:3:0:13:30:3:0
chr10	46999732	.	G	A	1218.49	PASS	AF=0.549296;AO=116;DP=214;FAO=117;FDP=213;FR=.;FRO=96;FSAF=71;FSAR=46;FSRF=60;FSRR=36;FWDB=0.0063584;FXX=0.00467268;HRUN=6;LEN=1;MLLD=182.759;QD=22.8825;RBI=0.0254224;REFB=-0.0210205;REVB=0.0246144;RO=91;SAF=71;SAR=45;SRF=60;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0406521;STB=0.508608;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0149424;OID=.;OPOS=46999732;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:214:213:91:96:116:117:0.549296:45:71:60:31:46:71:60:36
chr10	46999747	.	T	C	595.08	PASS	AF=0.349057;AO=73;DP=207;FAO=74;FDP=212;FR=.;FRO=138;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=72;FSRR=66;FWDB=-0.0142686;FXX=0.00469462;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.485;QD=11.2278;RBI=0.0536742;REFB=-0.0319852;REVB=-0.0517429;RO=134;SAF=43;SAR=30;SRF=69;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853293;STB=0.548273;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0441223;OID=.;OPOS=46999747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:207:212:134:138:73:74:0.349057:30:43:69:65:30:44:72:66
chr10	46999922	.	G	T	263.62	PASS	AF=0.685714;AO=21;DP=32;FAO=24;FDP=35;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0244738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.003;QD=30.1278;RBI=0.0454653;REFB=-0.0432675;REVB=0.0383162;RO=11;SAF=10;SAR=11;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430355;STB=0.514274;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0173622;OID=.;OPOS=46999922;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:32:35:11:11:21:24:0.685714:11:10:6:5:12:12:6:5
chr10	47000004	.	T	C	767.23	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3985;QD=56.8317;RBI=0.0834988;REFB=0;REVB=-0.0806213;RO=0;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000452544;OID=.;OPOS=47000004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:19:34:0:0:20:34:0:0
chr10	47000071	.	G	A	408.15	PASS	AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.00656962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.416;QD=20.4076;RBI=0.0334239;REFB=-0.00188161;REVB=-0.0327719;RO=37;SAF=22;SAR=19;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0034115;STB=0.500919;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00361046;OID=.;OPOS=47000071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:37:39:41:41:0.5125:19:22:20:17:19:22:21:18
chr10	47000079	.	T	C	361.53	PASS	AF=0.469136;AO=37;DP=79;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.00244354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.64;QD=17.8535;RBI=0.00776035;REFB=-0.0239381;REVB=-0.0073656;RO=42;SAF=19;SAR=18;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00979489;STB=0.504561;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0260537;OID=.;OPOS=47000079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:42:43:37:38:0.469136:18:19:22:20:18:20:23:20
chr10	47000146	.	C	T	356.17	PASS	AF=0.545455;AO=27;DP=57;FAO=30;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=0.0227489;FXX=0.0350816;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.11;QD=25.9032;RBI=0.0285706;REFB=-0.0757842;REVB=-0.0172848;RO=12;SAF=14;SAR=13;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243816;STB=0.646646;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0519566;OID=.;OPOS=47000146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:55:12:18:27:30:0.545455:13:14:1:11:13:17:3:15
chr10	47000188	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.133;QD=51.1841;RBI=0.0845727;REFB=0;REVB=-0.0813349;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000340407;OID=.;OPOS=47000188;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:9:10:0:0:9:11:0:0
chr10	47000239	.	C	T	60.57	PASS	AF=0.25;AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.00764813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.42;QD=6.73016;RBI=0.0128486;REFB=-0.0152697;REVB=-0.0103244;RO=27;SAF=3;SAR=6;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341106;STB=0.713832;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0416504;OID=.;OPOS=47000239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:36:36:27:27:9:9:0.25:6:3:17:10:6:3:17:10
chr10	47000321	.	G	A	229.88	PASS	AF=0.272727;AO=33;DP=120;FAO=33;FDP=121;FR=.;FRO=88;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=-0.0126589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.558;QD=7.59923;RBI=0.0374791;REFB=-0.00522337;REVB=0.0352766;RO=87;SAF=17;SAR=16;SRF=50;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729522;STB=0.54698;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0171586;OID=.;OPOS=47000321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:87:88:33:33:0.272727:16:17:50:37:16:17:51:37
chr10	47000366	.	C	G	350.43	PASS	AF=0.291667;AO=49;DP=168;FAO=49;FDP=168;FR=.;FRO=119;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=70;FSRR=49;FWDB=-0.00279831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6735;QD=8.34346;RBI=0.0151245;REFB=-0.00501847;REVB=0.0148633;RO=118;SAF=28;SAR=21;SRF=69;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164503;STB=0.51219;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.00927935;OID=.;OPOS=47000366;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:118:119:49:49:0.291667:21:28:69:49:21:28:70:49
chr10	47000374	.	T	C	339.55	PASS	AF=0.287425;AO=47;DP=166;FAO=48;FDP=167;FR=.;FRO=119;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=70;FSRR=49;FWDB=-0.0245084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.004;QD=8.13287;RBI=0.0245479;REFB=-0.00549968;REVB=-0.00139154;RO=116;SAF=27;SAR=20;SRF=68;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014585;STB=0.518709;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0100176;OID=.;OPOS=47000374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:167:116:119:47:48:0.287425:20:27:68:48:21:27:70:49
chr10	47000381	.	T	C	2663.81	PASS	AF=1;AO=171;DP=172;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124063;FXX=0.00581362;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.202;QD=62.3113;RBI=0.0219374;REFB=0;REVB=0.0180923;RO=0;SAF=103;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.40292e-06;OID=.;OPOS=47000381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:172:171:0:0:171:171:1:68:103:0:0:68:103:0:0
chr10	47000426	.	T	C	3086.49	PASS	AF=1;AO=187;DP=187;FAO=204;FDP=204;FR=.;FRO=0;FSAF=118;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9109;QD=60.5194;RBI=0.0500468;REFB=0;REVB=0.0353469;RO=0;SAF=109;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.97473e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.67583e-05;OID=.;OPOS=47000426;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:187:204:0:0:187:204:1:78:109:0:0:86:118:0:0
chr10	47000487	.	G	A	444.04	PASS	AF=0.302083;AO=58;DP=190;FAO=58;FDP=192;FR=.;FRO=134;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=81;FSRR=53;FWDB=0.00666204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.958;QD=9.25079;RBI=0.00705435;REFB=-0.00709824;REVB=-0.00231972;RO=132;SAF=27;SAR=31;SRF=81;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175994;STB=0.596121;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0178012;OID=.;OPOS=47000487;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:190:192:132:134:58:58:0.302083:31:27:81:51:31:27:81:53
chr10	47000547	.	G	T	227.56	PASS	AF=0.269231;AO=29;DP=124;FAO=35;FDP=130;FR=.;FRO=95;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=55;FSRR=40;FWDB=0.00473531;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.081;QD=7.00182;RBI=0.00480322;REFB=-0.00133953;REVB=-0.000804808;RO=95;SAF=11;SAR=18;SRF=55;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24727;STB=0.629107;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.00493617;OID=.;OPOS=47000547;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:130:95:95:29:35:0.269231:18:11:55:40:21:14:55:40
chr10	47000728	.	T	C	820.08	PASS	AF=0.566176;AO=67;DP=125;FAO=77;FDP=136;FR=.;FRO=59;FSAF=52;FSAR=25;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=0.0206758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.969;QD=24.1201;RBI=0.0272534;REFB=-0.0302107;REVB=0.0177555;RO=57;SAF=46;SAR=21;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233248;STB=0.621481;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0254146;OID=.;OPOS=47000728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:136:57:59:67:77:0.566176:21:46:24:33:25:52:24:35
chr10	47000863	.	A	G	1702.73	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.777;QD=59.7448;RBI=0.041788;REFB=0;REVB=0.0156488;RO=0;SAF=63;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123066;OID=.;OPOS=47000863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:114:0:0:106:114:1:43:63:0:0:44:70:0:0
chr10	47000873	.	T	A,G	1730.72	PASS	AF=0.336134,0.663866;AO=40,71;DP=111;FAO=40,79;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=23,50;FSAR=17,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000916671,0.00745368;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=47.07,193.94;QD=58.1756;RBI=0.00297564,0.0195132;REFB=0,0;REVB=-0.00283093,0.0180336;RO=0;SAF=23,46;SAR=17,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-6.4817e-08,-4.50978e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00376983,0.0140076;OID=.,.;OPOS=47000873,47000873;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:111:119:0:0:40,71:40,79:0.336134,0.663866:17,25:23,46:0:0:17,29:23,50:0:0
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chr10	47001032	.	G	A	157.77	PASS	AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0122862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.394;QD=12.1361;RBI=0.0157313;REFB=-0.034605;REVB=-0.00982453;RO=32;SAF=8;SAR=11;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152096;STB=0.578864;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0313421;OID=.;OPOS=47001032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:32:33:19:19:0.365385:11:8:18:14:11:8:18:15
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chr10	47001543	.	C	T	524.45	PASS	AF=0.347826;AO=63;DP=183;FAO=64;FDP=184;FR=.;FRO=120;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=59;FSRR=61;FWDB=-0.0241169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.44;QD=11.4011;RBI=0.0285373;REFB=-0.00857606;REVB=-0.0152561;RO=118;SAF=32;SAR=31;SRF=57;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283682;STB=0.505433;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0260805;OID=.;OPOS=47001543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:184:118:120:63:64:0.347826:31:32:57:61:32:32:59:61
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chr10	47003115	.	C	T	272.39	PASS	AF=0.273381;AO=23;DP=138;FAO=38;FDP=139;FR=.;FRO=101;FSAF=9;FSAR=29;FSRF=57;FSRR=44;FWDB=-0.101336;FXX=0.0211253;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.942;QD=7.83858;RBI=0.102675;REFB=-0.0123802;REVB=-0.0165308;RO=80;SAF=7;SAR=16;SRF=46;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336328;STB=0.744326;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0324154;OID=.;OPOS=47003115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:139:80:101:23:38:0.273381:16:7:46:34:29:9:57:44
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chr10	47003215	.	T	C	190.76	PASS	AF=0.3125;AO=25;DP=80;FAO=25;FDP=80;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.00797613;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.696;QD=9.53778;RBI=0.0144903;REFB=-0.00824024;REVB=0.0120975;RO=55;SAF=9;SAR=16;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237736;STB=0.639888;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0187077;OID=.;OPOS=47003215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:55:55:25:25:0.3125:16:9:31:24:16:9:31:24
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chr10	47005267	.	C	T	205.16	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00115321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.024;QD=15.7819;RBI=0.0856664;REFB=0.000164806;REVB=-0.0856586;RO=28;SAF=17;SAR=6;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222298;STB=0.619851;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.000334053;OID=.;OPOS=47005267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:28:29:23:23:0.442308:6:17:15:13:6:17:16:13
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chr10	47086978	.	G	A	819.78	PASS	AF=0.307042;AO=109;DP=355;FAO=109;FDP=355;FR=.;FRO=246;FSAF=65;FSAR=44;FSRF=137;FSRR=109;FWDB=-0.0182209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.386;QD=9.23698;RBI=0.0185887;REFB=-0.0107231;REVB=0.00367937;RO=246;SAF=65;SAR=44;SRF=137;SRR=109;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485178;STB=0.528057;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.022313;OID=.;OPOS=47086978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:355:355:246:246:109:109:0.307042:44:65:137:109:44:65:137:109
chr10	47087474	.	C	T	2990.24	PASS	AF=0.984536;AO=191;DP=194;FAO=191;FDP=194;FR=.;FRO=3;FSAF=113;FSAR=78;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00205962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6431;QD=61.6545;RBI=0.00307902;REFB=0.0330031;REVB=0.00228874;RO=3;SAF=113;SAR=78;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124727;STB=0.50655;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.002297;OID=.;OPOS=47087474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:194:194:3:3:191:191:0.984536:78:113:3:0:78:113:3:0
chr10	47087501	.	C	T	494.66	PASS	AF=0.331551;AO=62;DP=187;FAO=62;FDP=187;FR=.;FRO=125;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=77;FSRR=48;FWDB=0.0615472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0079;QD=10.581;RBI=0.0626873;REFB=-0.00979911;REVB=0.0119011;RO=124;SAF=34;SAR=28;SRF=76;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763361;STB=0.546015;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=0.0192208;OID=.;OPOS=47087501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:187:187:124:125:62:62:0.331551:28:34:76:48:28:34:77:48
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chr10	47087680	.	C	T	2224.4	PASS	AF=0.979592;AO=141;DP=147;FAO=144;FDP=147;FR=.;FRO=3;FSAF=87;FSAR=57;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0390809;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2331;QD=60.528;RBI=0.046016;REFB=-0.148108;REVB=0.0242932;RO=3;SAF=84;SAR=57;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00291716;STB=0.501334;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0033802;OID=.;OPOS=47087680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:147:147:3:3:141:144:0.979592:57:84:2:1:57:87:2:1
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chr10	47747159	.	G	C	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0558461;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.823;QD=23.2183;RBI=0.059395;REFB=-0.0275873;REVB=0.0202232;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121807;STB=0.571154;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.011939;OID=.;OPOS=47747159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:3:2:0:1:3:2:0:1
chr10	47756065	.	C	T	64.89	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.00669926;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.0946;QD=10.3831;RBI=0.0129678;REFB=0.0137342;REVB=0.0111033;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285022;STB=0.66637;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.00946581;OID=.;OPOS=47756065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:6:3:2:14:6:3:2:14
chr10	48370595	.	G	A	1464.71	PASS	AF=0.989899;AO=82;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=48;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.117228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.2325;QD=59.1802;RBI=0.161727;REFB=-0.0986644;REVB=0.111414;RO=7;SAF=41;SAR=41;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318255;STB=0.504949;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.00620537;OID=.;OPOS=48370595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:99:99:7:1:82:98:0.989899:41:41:2:5:50:48:0:1
chr10	48371276	.	GC	CG,GT	247.3	PASS	AF=0,0.641026;AO=3,18;DP=39;FAO=0,25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=0,11;FSAR=0,14;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.00159582,0.16305;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=90.7569,59.6447;QD=25.3636;RBI=0.00271195,0.164903;REFB=-0.00395369,-0.0219667;REVB=0.00219272,0.0246484;RO=13;SAF=3,4;SAR=0,14;SRF=6;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.64472,-0.220761;STB=0.5,0.530374;STBP=1,0.628;TYPE=mnp,snp;VARB=0,-0.0017793;OID=.,.;OPOS=48371276,48371277;OREF=GC,C;OALT=CG,T;OMAPALT=CG,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:95:39:39:13:14:3,18:0,25:0,0.641026:0,14:3,4:6:7:0,14:0,11:5:9
chr10	48373123	.	G	A	82.43	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00446263;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9871;QD=17.3546;RBI=0.00925848;REFB=-0.018853;REVB=-0.00811199;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662608;STB=0.518481;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0260645;OID=.;OPOS=48373123;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:20:19:8:9:10:10:0.526316:3:7:5:3:3:7:6:3
chr10	48373576	.	T	C	68.81	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0429799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7705;QD=15.2921;RBI=0.043762;REFB=-0.0172647;REVB=0.00823631;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144653;STB=0.609518;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.031526;OID=.;OPOS=48373576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:8:9:9:9:0.5:4:5:3:5:4:5:3:6
chr10	48373663	.	C	T	162.77	PASS	AF=0.485714;AO=12;DP=36;FAO=17;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00164812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.108;QD=18.6017;RBI=0.0808458;REFB=-0.0895957;REVB=0.080829;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0401846;STB=0.565136;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0701213;OID=.;OPOS=48373663;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:19:18:12:17:0.485714:8:4:7:12:13:4:6:12
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chr10	49659553	.	GCCCCA	GCCCAT	241.99	PASS	AF=1;AO=2;DP=50;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.235687;FXX=0.446713;HRUN=4;LEN=2;MLLD=40.8856;QD=37.2296;RBI=0.235803;REFB=0;REVB=0.00741587;RO=31;SAF=2;SAR=0;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474592;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0129427;OID=.;OPOS=49659557;OREF=CA;OALT=AT;OMAPALT=GCCCAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:2:50:26:26:0:9:17:0:0:5:31:2:0:14:17
chr10	49659559	.	C	T	672.19	PASS	AF=0.960784;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0496692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.832;QD=52.7204;RBI=0.0766762;REFB=-0.100382;REVB=0.0584142;RO=2;SAF=27;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335788;STB=0.517234;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.000561554;OID=.;OPOS=49659559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:50:51:2:2:48:49:0.960784:21:27:2:0:21:28:2:0
chr10	49659637	.	T	C	375.18	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00991839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.952;QD=55.5824;RBI=0.0154493;REFB=0;REVB=-0.0118451;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101667;OID=.;OPOS=49659637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
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chr10	49667795	.	T	C	1135.24	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00934848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.081;QD=60.5461;RBI=0.0145588;REFB=0;REVB=0.0111609;RO=0;SAF=26;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.61111e-05;OID=.;OPOS=49667795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:49:26:0:0:49:26:0:0
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chr10	49998824	.	C	T	424.71	PASS	AF=0.453608;AO=43;DP=96;FAO=44;FDP=97;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.0133564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8019;QD=17.5138;RBI=0.0161921;REFB=-0.0193807;REVB=0.00915379;RO=51;SAF=28;SAR=15;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854133;STB=0.565187;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0277844;OID=.;OPOS=49998824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:51:53:43:44:0.453608:15:28:29:22:15:29:29:24
chr10	50004372	.	C	T	561.22	PASS	AF=0.5;AO=58;DP=116;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=-0.0604292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0977;QD=19.3525;RBI=0.0764789;REFB=-0.0157717;REVB=-0.0468757;RO=58;SAF=32;SAR=26;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0797072;STB=0.543951;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0174462;OID=.;OPOS=50004372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:58:58:58:58:0.5:26:32:37:21:26:32:37:21
chr10	50013402	.	T	C	958.7	PASS	AF=0.985075;AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0489503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.716;QD=57.2359;RBI=0.0508943;REFB=0.0525931;REVB=0.013932;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-0.00094621;OID=.;OPOS=50013402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:67:0:1:64:66:0.985075:32:32:0:0:32:34:1:0
chr10	50025396	.	G	A	832.58	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.986;QD=57.4196;RBI=0.0547244;REFB=0;REVB=0.0226407;RO=0;SAF=20;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119152;OID=.;OPOS=50025396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:56:58:1:36:20:0:0:37:21:0:0
chr10	50038800	.	A	G	873.02	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0350322;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.616;QD=56.3237;RBI=0.0360246;REFB=-0.143976;REVB=0.00839726;RO=1;SAF=35;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132969;STB=0.50704;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000492505;OID=.;OPOS=50038800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:26:35:1:0:26:35:1:0
chr10	50083111	.	T	C	1093.55	PASS	AF=0.849462;AO=79;DP=93;FAO=79;FDP=93;FR=.;FRO=14;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0616455;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.133;QD=47.0346;RBI=0.0617167;REFB=-0.0739601;REVB=0.0029623;RO=13;SAF=29;SAR=50;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00500551;STB=0.509904;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0124586;OID=.;OPOS=50083111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:93:93:13:14:79:79:0.849462:50:29:5:8:50:29:6:8
chr10	50083113	.	T	C	39.86	PASS	AF=0.105263;AO=10;DP=95;FAO=10;FDP=95;FR=.;FRO=85;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=52;FWDB=0.024519;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=32.3402;QD=1.67848;RBI=0.0269363;REFB=-0.0238236;REVB=0.0111527;RO=85;SAF=2;SAR=8;SRF=33;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255281;STB=0.699558;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.191394;OID=.;OPOS=50083113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:95:95:85:85:10:10:0.105263:8:2:33:52:8:2:33:52
chr10	50109902	.	G	A	517.07	PASS	AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0279412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3233;QD=54.4279;RBI=0.0336335;REFB=-0.158831;REVB=0.0187217;RO=2;SAF=17;SAR=19;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0519265;STB=0.527762;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00576837;OID=.;OPOS=50109902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:38:2:2:36:36:0.947368:19:17:2:0:19:17:2:0
chr10	50121784	.	T	C	2316.17	PASS	AF=1;AO=145;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00226004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9931;QD=63.0251;RBI=0.0614677;REFB=0;REVB=0.0614262;RO=0;SAF=78;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226584;OID=.;OPOS=50121784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:147:0:0:145:147:1:67:78:0:0:68:79:0:0
chr10	50122181	.	C	A	567.16	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000126559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7564;QD=59.7008;RBI=0.00538312;REFB=0;REVB=-0.00538164;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143821;OID=.;OPOS=50122181;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:16:21:0:0:16:22:0:0
chr10	50227785	.	T	C	1549.21	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.579;QD=63.8851;RBI=0.0612404;REFB=0;REVB=0.0205399;RO=0;SAF=43;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108965;OID=.;OPOS=50227785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:54:43:0:0:54:43:0:0
chr10	50374819	.	T	C	168.28	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00196056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9337;QD=12.2388;RBI=0.0168279;REFB=-0.0226512;REVB=-0.0167133;RO=33;SAF=10;SAR=10;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813988;STB=0.518378;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0565222;OID=.;OPOS=50374819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:33:33:20:22:0.4:10:10:14:19:12:10:14:19
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chr10	50531606	.	C	A	99.47	PASS	AF=0.461538;AO=9;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0550586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.122;QD=15.3025;RBI=0.0551422;REFB=-0.0362615;REVB=0.00303622;RO=14;SAF=2;SAR=7;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868934;STB=0.524957;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0453178;OID=.;OPOS=50531606;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:26:26:14:14:9:12:0.461538:7:2:4:10:9:3:4:10
chr10	50531972	.	A	C	230.83	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0116323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7208;QD=23.0829;RBI=0.0141112;REFB=-0.018015;REVB=-0.00798853;RO=18;SAF=7;SAR=15;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139605;STB=0.507805;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0129082;OID=.;OPOS=50531972;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:15:7:6:12:15:7:6:12
chr10	50532683	.	T	C	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.126811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7966;QD=50.4095;RBI=0.162904;REFB=0;REVB=-0.102257;RO=0;SAF=3;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00697851;OID=.;OPOS=50532683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:16:3:0:0:16:3:0:0
chr10	50532746	.	T	C	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00194117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.472;QD=12.7388;RBI=0.0326411;REFB=-0.00874071;REVB=-0.0325833;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0123391;OID=.;OPOS=50532746;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:4:4:5:5:4:4:5:5
chr10	50533617	.	T	C	115.96	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1862;QD=42.168;RBI=0.126656;REFB=0;REVB=0.0626312;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00399773;OID=.;OPOS=50533617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0
chr10	50534599	.	G	C	188.33	PASS	AF=0.588235;AO=7;DP=35;FAO=20;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0757051;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.0809;QD=22.1569;RBI=0.0822;REFB=-0.0431287;REVB=0.0320245;RO=13;SAF=7;SAR=0;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.823522;STB=0.915152;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0772465;OID=.;OPOS=50534599;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:34:13:13:7:20:0.588235:0:7:2:11:1:19:2:11
chr10	50534862	.	T	C	460.21	PASS	AF=0.517241;AO=43;DP=85;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0141899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.565;QD=21.1593;RBI=0.0247689;REFB=-0.0134719;REVB=0.0203013;RO=42;SAF=14;SAR=29;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0777574;STB=0.550693;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0163312;OID=.;OPOS=50534862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:87:42:42:43:45:0.517241:29:14:17:25:31:14:17:25
chr10	50535186	.	C	T	544.59	PASS	AF=0.636364;AO=49;DP=77;FAO=49;FDP=77;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.0616008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.768;QD=28.2901;RBI=0.0626344;REFB=-0.049104;REVB=0.0113319;RO=27;SAF=17;SAR=32;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0930253;STB=0.554997;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0296046;OID=.;OPOS=50535186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:27:28:49:49:0.636364:32:17:6:21:32:17:6:22
chr10	50678231	.	ATTTTTTG	ATTTTT,ATTTTTAG,ATTTTTG	125.35	PASS	AF=0,0,0.724138;AO=4,2,11;DP=29;FAO=0,0,21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=0,0,14;FSAR=0,0,7;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0303865,-0.0349837,0.135584;FXX=0;HRUN=6,6,6;LEN=2,1,1;MLLD=45.2484,205.801,13.1363;QD=17.2893;RBI=0.0402209,0.0488612,0.138542;REFB=-0.00725141,0.00862638,-0.108225;REVB=-0.0263512,-0.034111,-0.0284765;RO=10;SAF=4,0,8;SAR=0,2,3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0.491525,0,0.491525;SSSB=0.650438,-0.655147,0.0278546;STB=0.5,0.5,0.512808;STBP=1,1,0.864;TYPE=del,snp,del;VARB=0,0,0.093021;OID=.,.,.;OPOS=50678237,50678237,50678232;OREF=TG,T,T;OALT=-,A,-;OMAPALT=ATTTTT,ATTTTTAG,ATTTTTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0,0.724138:4,2,11:29:0,0,21:29:8:0,0,14:0,0,7:5:3:39:10:4,0,8:0,2,3:7:3
chr10	50683438	.	T	C	674.69	PASS	AF=0.359649;AO=81;DP=230;FAO=82;FDP=228;FR=.;FRO=146;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=78;FSRR=68;FWDB=-0.0382827;FXX=0.00869527;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4486;QD=11.8366;RBI=0.0431354;REFB=-0.0112219;REVB=-0.0198771;RO=141;SAF=44;SAR=37;SRF=75;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127221;STB=0.501505;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.017098;OID=.;OPOS=50683438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:230:228:141:146:81:82:0.359649:37:44:75:66:38:44:78:68
chr10	50723684	.	G	A	991.03	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00450783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.564;QD=58.2961;RBI=0.0133409;REFB=0;REVB=0.0125563;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213258;OID=.;OPOS=50723684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:68:0:0:66:68:1:35:31:0:0:36:32:0:0
chr10	50724016	.	C	T	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.063;QD=63.872;RBI=0.0203844;REFB=0;REVB=0.00949953;RO=0;SAF=16;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35664e-05;OID=.;OPOS=50724016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:32:16:0:0:32:16:0:0
chr10	50732280	.	C	T	242.4	PASS	AF=0.666667;AO=22;DP=33;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0055871;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.097;QD=29.3818;RBI=0.0471213;REFB=-0.0318184;REVB=0.0467889;RO=11;SAF=6;SAR=16;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128847;STB=0.57136;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.022614;OID=.;OPOS=50732280;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:11:11:22:22:0.666667:16:6:5:6:16:6:5:6
chr10	50740600	.	C	T	286.11	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0244587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.149;QD=20.4364;RBI=0.0247711;REFB=-0.0139055;REVB=-0.00392137;RO=25;SAF=20;SAR=10;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19334;STB=0.617204;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0114793;OID=.;OPOS=50740600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:26:30:30:0.535714:10:20:11:14:10:20:11:15
chr10	50740876	.	G	C	260.05	PASS	AF=0.69697;AO=23;DP=33;FAO=23;FDP=33;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0577995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7184;QD=31.5207;RBI=0.0605538;REFB=-0.0149043;REVB=0.018055;RO=9;SAF=12;SAR=11;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132657;STB=0.55433;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.00961023;OID=.;OPOS=50740876;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:9:10:23:23:0.69697:11:12:7:2:11:12:7:3
chr10	50819182	.	T	C	365.12	PASS	AF=0.528571;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.0172745;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.029;QD=20.8637;RBI=0.0284673;REFB=-0.0387015;REVB=0.022627;RO=33;SAF=18;SAR=19;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178912;STB=0.598719;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0482045;OID=.;OPOS=50819182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:33:33:37:37:0.528571:19:18:23:10:19:18:23:10
chr10	50820345	.	C	A	1086.35	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0580717;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.962;QD=60.3526;RBI=0.0653151;REFB=0;REVB=0.0298954;RO=0;SAF=48;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134969;OID=.;OPOS=50820345;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:24:48:0:0:24:48:0:0
chr10	50820424	.	G	T	237.47	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0324661;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.179;QD=18.6249;RBI=0.0905554;REFB=-0.0106173;REVB=0.0845354;RO=25;SAF=5;SAR=20;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231707;STB=0.62489;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0113805;OID=.;OPOS=50820424;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:26:25:25:0.490196:20:5:10:15:20:5:10:16
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chr10	50856652	.	G	A	728.7	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.029;QD=57.1525;RBI=0.0563793;REFB=0;REVB=0.0542027;RO=0;SAF=35;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5765e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.79805e-05;OID=.;OPOS=50856652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:16:35:0:0:16:35:0:0
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chr10	50901938	.	C	T	337.24	PASS	AF=0.378378;AO=40;DP=109;FAO=42;FDP=111;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.026374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.526;QD=12.1528;RBI=0.0318919;REFB=-0.0117085;REVB=0.0179306;RO=68;SAF=17;SAR=23;SRF=39;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162867;STB=0.608143;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0320505;OID=.;OPOS=50901938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:111:68:69:40:42:0.378378:23:17:39:29:25:17:40:29
chr10	50916484	.	A	G	171.21	PASS	AF=0.306667;AO=20;DP=72;FAO=23;FDP=75;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=34;FWDB=-0.00317201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.066;QD=9.13126;RBI=0.034674;REFB=-0.0167632;REVB=0.0345286;RO=52;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128623;STB=0.62059;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0345677;OID=.;OPOS=50916484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:75:52:52:20:23:0.306667:11:9:18:34:11:12:18:34
chr10	50916542	.	C	T	252.2	PASS	AF=0.316327;AO=31;DP=99;FAO=31;FDP=98;FR=.;FRO=67;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=41;FWDB=-0.00871165;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9951;QD=10.294;RBI=0.00989139;REFB=-0.0178434;REVB=-0.00468474;RO=66;SAF=16;SAR=15;SRF=25;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159829;STB=0.587101;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0360787;OID=.;OPOS=50916542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:98:66:67:31:31:0.316327:15:16:25:41:15:16:26:41
chr10	50944524	.	G	GGC	33.92	PASS	AF=0.0884956;AO=13;DP=120;FAO=10;FDP=113;FR=.;FRO=103;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=50;FSRR=53;FWDB=-0.142859;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=2;MLLD=28.8316;QD=1.20085;RBI=0.143273;REFB=-0.0302625;REVB=0.010894;RO=102;SAF=3;SAR=10;SRF=46;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284113;STB=0.880181;STBP=0.018;TYPE=ins;VARB=0.268111;OID=.;OPOS=50944525;OREF=-;OALT=GC;OMAPALT=GGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.0884956:13:120:10:113:103:1:9:50:53:33:102:3:10:46:56
chr10	50960209	.	G	A	211.31	PASS	AF=0.477273;AO=20;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.00803698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.149;QD=19.2097;RBI=0.0333305;REFB=-0.0140738;REVB=0.032347;RO=23;SAF=9;SAR=11;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144846;STB=0.503308;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0143221;OID=.;OPOS=50960209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:23:23:20:21:0.477273:11:9:10:13:12:9:10:13
chr10	51465552	.	A	T	411.36	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00400016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.162;QD=56.7388;RBI=0.0138124;REFB=0;REVB=0.0132205;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71759e-05;OID=.;OPOS=51465552;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:11:17:0:0:12:17:0:0
chr10	51486073	.	CGCTCCTGCCATCCTGTCCTCA	C	50.0	PASS	AO=33;DP=148;LEN=21;RO=115;SAF=16;SAR=17;SRF=37;SRR=78;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=51486074;OREF=GCTCCTGCCATCCTGTCCTCA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:148:115:33:17:16:37:78
chr10	51549545	.	G	T	1077.4	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-8.15054e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.198;QD=59.0357;RBI=0.00138731;REFB=0;REVB=0.00138491;RO=0;SAF=46;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182075;OID=.;OPOS=51549545;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:73:0:0:68:73:1:22:46:0:0:23:50:0:0
chr10	51568378	.	T	G	312.88	PASS	AF=0.402299;AO=35;DP=87;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=-0.0180556;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.135;QD=14.3854;RBI=0.0180684;REFB=-0.017401;REVB=-0.000679202;RO=52;SAF=15;SAR=20;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0555264;STB=0.531543;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0266518;OID=.;OPOS=51568378;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:52:52:35:35:0.402299:20:15:25:27:20:15:25:27
chr10	51748684	.	G	A	917.52	PASS	AF=1;AO=32;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023271;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.13;QD=58.255;RBI=0.0265389;REFB=0;REVB=0.0127584;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132955;OID=.;OPOS=51748684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:32:63:1:15:17:0:0:26:37:0:0
chr10	51769562	.	G	A	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=14;FWDB=0.107503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.191;QD=8.24585;RBI=0.113134;REFB=-0.0236742;REVB=0.0352464;RO=15;SAF=1;SAR=6;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208262;STB=0.624713;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0263446;OID=.;OPOS=51769562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:6:1:1:14:6:1:1:14
chr10	51827763	.	A	G	165.06	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0166015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.74;QD=14.0472;RBI=0.0227144;REFB=-0.00794218;REVB=0.0155026;RO=29;SAF=13;SAR=5;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420123;STB=0.524468;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0169966;OID=.;OPOS=51827763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:5:13:20:9:5:13:20:9
chr10	51827934	.	G	A	177.81	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0112452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.781;QD=12.2626;RBI=0.0149692;REFB=-0.0211859;REVB=0.00988043;RO=36;SAF=11;SAR=11;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298274;STB=0.517226;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0513323;OID=.;OPOS=51827934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:11:11:17:19:11:11:17:19
chr10	52002980	.	T	G	234.41	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00843208;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.469;QD=17.0477;RBI=0.0148325;REFB=-0.0132908;REVB=-0.0122026;RO=31;SAF=18;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212589;STB=0.59992;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0170275;OID=.;OPOS=52002980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:55:31:29:26:26:0.472727:8:18:15:16:8:18:15:14
chr10	52005153	.	A	G	382.58	PASS	AF=0.41;AO=40;DP=98;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=39;FSRR=20;FWDB=-0.0385781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.043;QD=15.3031;RBI=0.0524496;REFB=-0.0259508;REVB=-0.0355344;RO=57;SAF=29;SAR=11;SRF=38;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0729427;STB=0.550596;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0585713;OID=.;OPOS=52005153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:100:57:59:40:41:0.41:11:29:38:19:11:30:39:20
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chr10	53458121	.	C	G	43.74	PASS	AF=0.160714;AO=9;DP=56;FAO=9;FDP=56;FR=.;FRO=47;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=11;FWDB=-0.0601185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.4475;QD=3.12445;RBI=0.0935017;REFB=-0.00750887;REVB=-0.0716124;RO=43;SAF=1;SAR=8;SRF=35;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.727166;STB=0.938982;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0637997;OID=.;OPOS=53458121;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:56:56:43:47:9:9:0.160714:8:1:35:8:8:1:36:11
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chr10	55949151	.	G	A	162.96	PASS	AF=0.36;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0117938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9468;QD=13.0365;RBI=0.102164;REFB=-0.016003;REVB=-0.101481;RO=32;SAF=12;SAR=6;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189107;STB=0.610984;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0187877;OID=.;OPOS=55949151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:32:32:18:18:0.36:6:12:16:16:6:12:16:16
chr10	55955444	.	T	G	440.99	PASS	AF=0.544304;AO=41;DP=77;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=0.00219666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.778;QD=22.3286;RBI=0.111699;REFB=-0.0175362;REVB=0.111677;RO=35;SAF=22;SAR=19;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176324;STB=0.609188;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0154757;OID=.;OPOS=55955444;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:79:35:36:41:43:0.544304:19:22:26:9:21:22:27:9
chr10	55955485	.	A	G	494.2	PASS	AF=0.495238;AO=52;DP=105;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=0.029174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.663;QD=18.8266;RBI=0.100566;REFB=-0.0189558;REVB=0.0962415;RO=53;SAF=30;SAR=22;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113584;STB=0.56289;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0216586;OID=.;OPOS=55955485;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:53:53:52:52:0.495238:22:30:24:29:22:30:24:29
chr10	55955610	.	C	T	442.74	PASS	AF=0.551282;AO=43;DP=78;FAO=43;FDP=78;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00351922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.196;QD=22.7046;RBI=0.00367889;REFB=-0.02412;REVB=0.00107206;RO=35;SAF=23;SAR=20;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633538;STB=0.534867;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.013283;OID=.;OPOS=55955610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:35:35:43:43:0.551282:20:23:16:19:20:23:16:19
chr10	56288120	.	T	C	169.52	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0123344;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=168.603;QD=16.5383;RBI=0.0200331;REFB=-0.00783329;REVB=-0.0157857;RO=23;SAF=11;SAR=7;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213918;STB=0.622506;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00573371;OID=.;OPOS=56288120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:7:11:9:14:7:11:9:14
chr10	56335031	.	A	G	638.49	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00727561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.468;QD=59.3943;RBI=0.034576;REFB=-0.0542929;REVB=-0.0338019;RO=1;SAF=33;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0493147;STB=0.526303;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.000568722;OID=.;OPOS=56335031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:9:33:0:1:9:33:0:1
chr10	56335067	.	A	G	684.78	PASS	AF=0.84375;AO=54;DP=64;FAO=54;FDP=64;FR=.;FRO=10;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.000557001;FXX=0;HRUN=11;LEN=1;MLLD=227.488;QD=42.799;RBI=0.00444244;REFB=-0.0588567;REVB=0.00440739;RO=4;SAF=35;SAR=19;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508756;STB=0.562478;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.000794275;OID=.;OPOS=56335067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:64:64:4:10:54:54:0.84375:19:35:4:0:19:35:10:0
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chr10	57359697	.	C	T	1020.82	PASS	AF=0.985915;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-7.00508e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.283;QD=57.5111;RBI=0.0443799;REFB=-0.0669511;REVB=-0.0443798;RO=1;SAF=49;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230456;STB=0.511625;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.000985788;OID=.;OPOS=57359697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:71:1:1:69:70:0.985915:20:49:0:1:21:49:0:1
chr10	57359819	.	T	C	936.09	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7805;QD=58.5057;RBI=0.0235643;REFB=0;REVB=0.00495054;RO=0;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.83063e-05;OID=.;OPOS=57359819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:64:0:0:62:64:1:24:38:0:0:24:40:0:0
chr10	58118630	.	T	C	1136.78	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0550071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2176;QD=59.8306;RBI=0.0633139;REFB=0;REVB=0.0313506;RO=0;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000275325;OID=.;OPOS=58118630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:76:0:0:74:76:1:43:31:0:0:44:32:0:0
chr10	58120988	.	C	A	297.04	PASS	AF=0.342342;AO=38;DP=111;FAO=38;FDP=111;FR=.;FRO=73;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=47;FWDB=0.090615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.755;QD=10.7041;RBI=0.0916872;REFB=-0.0202469;REVB=-0.0139812;RO=73;SAF=19;SAR=19;SRF=26;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164705;STB=0.594547;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0385793;OID=.;OPOS=58120988;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:73:73:38:38:0.342342:19:19:26:47:19:19:26:47
chr10	59956041	.	C	T	428.78	PASS	AF=0.538462;AO=42;DP=79;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0279424;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2036;QD=21.9887;RBI=0.0322451;REFB=-0.00492732;REVB=-0.0160924;RO=36;SAF=19;SAR=23;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862941;STB=0.547596;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00613162;OID=.;OPOS=59956041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:36:36:42:42:0.538462:23:19:20:16:23:19:20:16
chr10	60573753	.	G	T	1757.11	PASS	AF=0.991525;AO=107;DP=109;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0200102;FXX=0.00840265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.843;QD=59.5631;RBI=0.0884589;REFB=-0.102368;REVB=0.0861659;RO=0;SAF=54;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66183e-08;STB=0.504424;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.000371034;OID=.;OPOS=60573753;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:109:118:0:1:107:117:0.991525:53:54:0:0:61:56:1:0
chr10	60577393	.	T	C	1373.89	PASS	AF=0.948454;AO=90;DP=95;FAO=92;FDP=97;FR=.;FRO=5;FSAF=58;FSAR=34;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0376337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4746;QD=56.6554;RBI=0.0772581;REFB=-0.0152543;REVB=0.0674724;RO=5;SAF=57;SAR=33;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00356991;STB=0.501682;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.00792098;OID=.;OPOS=60577393;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:95:97:5:5:90:92:0.948454:33:57:3:2:34:58:3:2
chr10	60588553	.	T	C	1529.83	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00692757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.879;QD=63.7427;RBI=0.00897066;REFB=0;REVB=-0.00569926;RO=0;SAF=60;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.28852e-07;OID=.;OPOS=60588553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:36:60:0:0:36:60:0:0
chr10	61005244	.	G	C	1153.6	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5619;QD=60.7156;RBI=0.0497311;REFB=0;REVB=0.0460257;RO=0;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00038821;OID=.;OPOS=61005244;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:29:47:0:0:29:47:0:0
chr10	61122268	.	T	TTA	414.96	PASS	AF=1;AO=29;DP=33;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0752736;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=2;MLLD=193.587;QD=57.2355;RBI=0.0762744;REFB=0;REVB=0.0123153;RO=4;SAF=20;SAR=9;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159516;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000346251;OID=.;OPOS=61122269;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:29:33:29:29:0:20:9:0:0:4:4:20:9:3:1
chr10	61414011	.	G	T	1813.9	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.96;QD=59.9637;RBI=0.0441818;REFB=0;REVB=0.0425109;RO=0;SAF=62;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138161;OID=.;OPOS=61414011;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:112:121:0:0:112:121:1:50:62:0:0:56:65:0:0
chr10	61549657	.	AT	A	483.93	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0886452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.8588;QD=46.0883;RBI=0.0960752;REFB=0;REVB=0.0370468;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00351787;OID=.;OPOS=61549658;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:41:42:42:42:0:24:18:0:0:9:0:23:18:0:0
chr10	61551428	.	T	C	698.95	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0132935;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.662;QD=54.8199;RBI=0.0977533;REFB=-0.0370708;REVB=-0.0968452;RO=1;SAF=23;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200269;STB=0.510634;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=-4.58186e-05;OID=.;OPOS=61551428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:27:23:1:0:27:23:1:0
chr10	61552692	.	G	T	705.03	PASS	AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00628935;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=279.792;QD=58.7525;RBI=0.00629598;REFB=-0.124148;REVB=-0.000288934;RO=1;SAF=28;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164967;STB=0.517234;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000594825;OID=.;OPOS=61552692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:48:48:1:2:46:46:0.958333:18:28:1:0:18:28:2:0
chr10	61552774	.	C	T	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7897;QD=55.0967;RBI=0.0645739;REFB=0;REVB=0.0617052;RO=0;SAF=21;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000727215;OID=.;OPOS=61552774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:5:21:0:0:5:21:0:0
chr10	61665886	.	C	A	2081.59	PASS	AF=0.992593;AO=129;DP=131;FAO=134;FDP=135;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0440482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.308;QD=61.6766;RBI=0.0593514;REFB=-0.103978;REVB=0.0397787;RO=1;SAF=63;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00748387;STB=0.503875;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.000262914;OID=.;OPOS=61665886;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:131:135:1:1:129:134:0.992593:66:63:1:0:70:64:1:0
chr10	61719232	.	A	AT	990.56	PASS	AF=1;AO=93;DP=107;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0684098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.0779;QD=38.0984;RBI=0.152977;REFB=0;REVB=-0.136828;RO=10;SAF=59;SAR=34;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0130133;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00220471;OID=.;OPOS=61719233;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:93:107:104:104:0:66:38:0:0:21:10:59:34:7:3
chr10	61841573	.	CTTTTC	CTTT,CTTTC,CTTTCC	540.3	PASS	AF=0,1,0;AO=7,33,3;DP=46;FAO=0,42,0;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10,0;FSAR=0,32,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0754226,0.0669204,0.150059;FXX=0.0454442;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=6.71616,17.8621,5.66605;QD=51.4573;RBI=0.181557,0.163805,0.150254;REFB=0,0,0;REVB=-0.165149,-0.149512,0.00765302;RO=1;SAF=4,5,2;SAR=3,28,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.422397,0.422397,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0971198,-0.0845854,-0.163246;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0,-0.000543643,0;OID=.,.,.;OPOS=61841577,61841574,61841577;OREF=TC,T,T;OALT=-,-,C;OMAPALT=CTTT,CTTTC,CTTTCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1,0:7,33,3:46:0,42,0:42:0:0,10,0:0,32,0:0:0:3:1:4,5,2:3,28,1:1:0
chr10	62060128	.	A	G	442.11	PASS	AF=0.494382;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0111564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.184;QD=19.8701;RBI=0.0117222;REFB=-0.0166621;REVB=0.00359783;RO=44;SAF=21;SAR=23;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818151;STB=0.539503;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0167221;OID=.;OPOS=62060128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:44:45:44:44:0.494382:23:21:25:19:23:21:25:20
chr10	63172694	.	A	G	432.73	PASS	AF=0.448598;AO=46;DP=107;FAO=48;FDP=107;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=0.0201534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.1218;QD=16.1769;RBI=0.0431279;REFB=0.0147587;REVB=0.0381295;RO=59;SAF=29;SAR=17;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216399;STB=0.503464;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=-0.00828482;OID=.;OPOS=63172694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:59:59:46:48:0.448598:17:29:36:23:19:29:36:23
chr10	63422751	.	CTGG	CTGGGGCCGACCCCGGCA,CTGGGGGCCGACCCCGGCA,GGCA	875.06	PASS	AF=0.123894,0.663717,0.0530973;AO=24,30,6;DP=119;FAO=14,75,6;FDP=113;FR=.;FRO=18;FSAF=14,52,6;FSAR=0,23,0;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0325209,0.0210745,-0.0422338;FXX=0.0737644;HRUN=5,5,3;LEN=14,15,4;MLLD=138.531,142.111,220.314;QD=30.9755;RBI=0.036451,0.024818,0.047404;REFB=-0.0228239,-0.016474,-0.019458;REVB=-0.0164642,-0.0131072,-0.0215278;RO=25;SAF=21,11,6;SAR=3,19,0;SRF=14;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.411331,-0.162011,0.679843;STB=0.999017,0.554249,0.998058;STBP=0.001,0.039,0.007;TYPE=ins,ins,mnp;VARB=0.0591604,0.00932027,0.0693131;OID=.,.,.;OPOS=63422755,63422755,63422751;OREF=-,-,CTGG;OALT=GGCCGACCCCGGCA,GGGCCGACCCCGGCA,GGCA;OMAPALT=CTGGGGCCGACCCCGGCA,CTGGGGGCCGACCCCGGCA,GGCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:93:119:113:25:18:24,30,6:14,75,6:0.123894,0.663717,0.0530973:3,19,0:21,11,6:14:11:0,23,0:14,52,6:8:10
chr10	63520698	.	T	C	1069.92	PASS	AF=0.948718;AO=74;DP=78;FAO=74;FDP=78;FR=.;FRO=4;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0237581;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.394;QD=54.8677;RBI=0.0340364;REFB=-0.0228532;REVB=0.0243726;RO=2;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262641;STB=0.501389;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00022375;OID=.;OPOS=63520698;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:78:78:2:4:74:74:0.948718:35:39:0:2:35:39:2:2
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chr10	63995983	.	C	T	1587.81	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.237;QD=64.1539;RBI=0.0460244;REFB=0;REVB=-0.0436679;RO=0;SAF=45;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.6123e-05;OID=.;OPOS=63995983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:54:45:0:0:54:45:0:0
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chr10	64567938	.	C	T	170.87	PASS	AF=0.38;AO=14;DP=45;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0190783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.75;QD=13.6699;RBI=0.0321077;REFB=-0.009659;REVB=0.0258248;RO=31;SAF=6;SAR=8;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878931;STB=0.542626;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.01299;OID=.;OPOS=64567938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:50:31:31:14:19:0.38:8:6:11:20:11:8:11:20
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chr10	64573771	.	C	T	566.78	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114377;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.295;QD=61.2739;RBI=0.0125651;REFB=0;REVB=0.00520191;RO=0;SAF=34;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000345322;OID=.;OPOS=64573771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:2:34:0:0:2:35:0:0
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chr10	68040325	.	C	T	95.55	PASS	AF=0.352941;AO=11;DP=33;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.00108638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.192;QD=11.2412;RBI=0.0240098;REFB=-0.00975116;REVB=0.0239852;RO=20;SAF=8;SAR=3;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105447;STB=0.519198;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0223781;OID=.;OPOS=68040325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:34:20:22:11:12:0.352941:3:8:16:4:3:9:16:6
chr10	68526088	.	A	G	287.2	PASS	AF=0.421053;AO=31;DP=78;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.00754859;FXX=0.0379699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8256;QD=15.1157;RBI=0.0223698;REFB=-0.0365333;REVB=0.0210577;RO=44;SAF=22;SAR=9;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0613546;STB=0.518856;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0298557;OID=.;OPOS=68526088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:76:44:44:31:32:0.421053:9:22:29:15:10:22:29:15
chr10	68685929	.	G	C	601.05	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0310007;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.26;QD=58.6387;RBI=0.0536663;REFB=-0.00952923;REVB=0.0438067;RO=0;SAF=31;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.54184e-08;STB=0.526302;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.000187528;OID=.;OPOS=68685929;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:0:1:40:40:0.97561:9:31:0:0:9:31:0:1
chr10	69571336	.	G	A	332.69	PASS	AF=0.557377;AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0136496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9691;QD=21.8156;RBI=0.0289894;REFB=-0.023934;REVB=-0.0255749;RO=27;SAF=17;SAR=17;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445111;STB=0.524576;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.033517;OID=.;OPOS=69571336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:27:27:34:34:0.557377:17:17:15:12:17:17:15:12
chr10	69666598	.	T	C	288.37	PASS	AF=0.432432;AO=32;DP=74;FAO=32;FDP=74;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0331757;FXX=0.0263123;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.7088;QD=15.5876;RBI=0.0371912;REFB=-0.0133535;REVB=0.0168094;RO=41;SAF=13;SAR=19;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00862897;STB=0.513058;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0197616;OID=.;OPOS=69666598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:41:42:32:32:0.432432:19:13:17:24:19:13:18:24
chr10	69773841	.	G	A	1172.66	PASS	AF=0.941176;AO=80;DP=86;FAO=80;FDP=85;FR=.;FRO=5;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0791301;FXX=0.0116266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=53.2969;QD=55.184;RBI=0.0794771;REFB=-0.0692241;REVB=0.00741882;RO=5;SAF=41;SAR=39;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0320075;STB=0.516932;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.00308529;OID=.;OPOS=69773841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:86:85:5:5:80:80:0.941176:39:41:4:1:39:41:4:1
chr10	69785435	.	T	TA,TAA	67.19	PASS	AF=0.678571,0;AO=12,4;DP=32;FAO=19,0;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=6,0;FSAR=13,0;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0189332,0.00412019;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,2;MLLD=6.72365,9.98324;QD=9.59823;RBI=0.0460817,0.0248439;REFB=-0.0609266,-0.0387753;REVB=0.0420125,0.0244999;RO=15;SAF=4,2;SAR=8,2;SRF=3;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.153102,0.360561;STB=0.506487,0.5;STBP=0.965,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.0302205,0.0345348;OID=.,.;OPOS=69785436,69785436;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=TA,TAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.678571,0:12,4:32:19,0:28:9:6,0:13,0:3:6:17:15:4,2:8,2:3:12
chr10	69934258	.	C	G	84.34	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=17;FWDB=-0.00320359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.358;QD=10.5422;RBI=0.00995599;REFB=-0.0176259;REVB=-0.00942649;RO=20;SAF=1;SAR=10;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254328;STB=0.649023;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0220456;OID=.;OPOS=69934258;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:20:21:11:11:0.34375:10:1:4:16:10:1:4:17
chr10	69948844	.	T	C	1859.14	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00836086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.426;QD=61.4593;RBI=0.0252638;REFB=0;REVB=-0.0238403;RO=0;SAF=57;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.20916e-05;OID=.;OPOS=69948844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:121:121:1:64:57:0:0:64:57:0:0
chr10	69991853	.	A	G	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0324814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.55;QD=14.6525;RBI=0.0324814;REFB=-0.0158577;REVB=0;RO=5;SAF=6;SAR=0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00838238;OID=.;OPOS=69991853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:0:6:5:0:0:6:5:0
chr10	70044031	.	T	C	114.03	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0886116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.8944;QD=18.2455;RBI=0.107314;REFB=-0.0577293;REVB=-0.0605328;RO=12;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234295;STB=0.633942;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0474717;OID=.;OPOS=70044031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:8:5:8:4:8:5:8:4
chr10	70051810	.	A	G	690.02	PASS	AF=0.690476;AO=49;DP=75;FAO=58;FDP=84;FR=.;FRO=26;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00157577;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=253.487;QD=32.8582;RBI=0.00295856;REFB=0.0123132;REVB=-0.002504;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.530467;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=-0.00327183;OID=.;OPOS=70051810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:84:0:26:49:58:0.690476:23:26:0:0:28:30:16:10
chr10	70051928	.	A	G	1476.03	PASS	AF=1;AO=64;DP=94;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047417;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.022;QD=63.4852;RBI=0.0602071;REFB=0;REVB=0.0371015;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.10019e-05;OID=.;OPOS=70051928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:93:0:0:64:93:1:31:33:0:0:59:34:0:0
chr10	70102936	.	T	A	1196.58	PASS	AF=0.987654;AO=77;DP=80;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.135833;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5794;QD=59.0905;RBI=0.140599;REFB=-0.00204858;REVB=0.0362962;RO=1;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111359;STB=0.505746;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000914831;OID=.;OPOS=70102936;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:81:1:1:77:80:0.987654:42:35:0:1:43:37:0:1
chr10	70103272	.	G	C	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0058062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7352;QD=61.6829;RBI=0.031785;REFB=0;REVB=0.0312502;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241849;OID=.;OPOS=70103272;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:16:25:0:0:16:25:0:0
chr10	70105560	.	G	A	769.42	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0690502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.677;QD=56.994;RBI=0.0714648;REFB=0;REVB=-0.0184201;RO=0;SAF=7;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000409545;OID=.;OPOS=70105560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:47:7:0:0:47:7:0:0
chr10	70221267	.	T	C	252.77	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.0135125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.5402;QD=21.0642;RBI=0.0389311;REFB=-0.00337174;REVB=0.0365108;RO=24;SAF=8;SAR=16;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393819;STB=0.719827;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0100108;OID=.;OPOS=70221267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:16:8:19:5:16:8:19:5
chr10	70225504	.	G	T	324.62	PASS	AF=0.4;AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=17;FWDB=-0.0257103;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3396;QD=14.4275;RBI=0.0305722;REFB=0.014288;REVB=-0.0165421;RO=54;SAF=15;SAR=21;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278072;STB=0.656957;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.0232396;OID=.;OPOS=70225504;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:90:54:54:36:36:0.4:21:15:37:17:21:15:37:17
chr10	70230336	.	A	C	263.51	PASS	AF=0.510638;AO=14;DP=45;FAO=24;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0180432;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.176;QD=22.4266;RBI=0.109216;REFB=-0.00455965;REVB=0.107715;RO=22;SAF=3;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.415655;STB=0.678413;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0186647;OID=.;OPOS=70230336;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:22:22:14:24:0.510638:11:3:13:9:18:6:13:9
chr10	70405010	.	A	G	196.55	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.00530986;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.756;QD=17.4712;RBI=0.0155068;REFB=-0.0122851;REVB=0.0145693;RO=25;SAF=15;SAR=5;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0379765;STB=0.521717;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0121243;OID=.;OPOS=70405010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:5:15:18:7:5:15:18:7
chr10	70405855	.	A	G	234.71	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0999699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2217;QD=49.4133;RBI=0.142132;REFB=0;REVB=0.101032;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00568474;OID=.;OPOS=70405855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr10	70446380	.	G	C	190.27	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00687309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.888;QD=21.7452;RBI=0.00809221;REFB=-0.00799253;REVB=0.00427135;RO=14;SAF=10;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199634;STB=0.516599;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.00644345;OID=.;OPOS=70446380;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:16:19:19:0.542857:9:10:7:7:9:10:9:7
chr10	70495544	.	T	C	73.69	PASS	AF=0.2;AO=12;DP=61;FAO=12;FDP=60;FR=.;FRO=48;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=0.0297017;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9425;QD=4.91284;RBI=0.0309822;REFB=-0.00519334;REVB=-0.00881503;RO=47;SAF=3;SAR=9;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239839;STB=0.650674;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0317944;OID=.;OPOS=70495544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:61:60:47:48:12:12:0.2:9:3:20:27:9:3:20:28
chr10	70502288	.	G	A	346.88	PASS	AF=0.4625;AO=36;DP=81;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.0291294;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.583;QD=17.3437;RBI=0.0408825;REFB=-0.0348827;REVB=0.0286855;RO=38;SAF=16;SAR=20;SRF=27;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241661;STB=0.615939;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0423033;OID=.;OPOS=70502288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:38:43:36:37:0.4625:20:16:27:11:21:16:28:15
chr10	70641860	.	T	C	453.89	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0234751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.2046;QD=55.017;RBI=0.0268336;REFB=-0.112326;REVB=0.0129986;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517231;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00190061;OID=.;OPOS=70641860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:18:14:0:0:18:14:1:0
chr10	70673289	.	C	T	395.78	PASS	AF=0.471264;AO=40;DP=86;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0282875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.459;QD=18.1966;RBI=0.0283695;REFB=-0.00283173;REVB=-0.00215538;RO=46;SAF=21;SAR=19;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654619;STB=0.542276;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0032987;OID=.;OPOS=70673289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:46:46:40:41:0.471264:19:21:21:25:19:22:21:25
chr10	70696713	.	C	T	834.3	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00104632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.202;QD=57.538;RBI=0.0213957;REFB=0;REVB=0.0213701;RO=0;SAF=36;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.37157e-05;OID=.;OPOS=70696713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:22:36:0:0:22:36:0:0
chr10	70700944	.	A	G	358.11	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357107;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.8616;QD=55.0937;RBI=0.0357228;REFB=0;REVB=0.00093146;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000805114;OID=.;OPOS=70700944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:18:8:0:0:18:8:0:0
chr10	70748703	.	GCCCGG	GCCCG,GCCG,GCCGGC,GCCGG	885.09	PASS	AF=0.87,0,0.07,0;AO=32,24,7,13;DP=100;FAO=87,0,7,0;FDP=100;FR=.;FRO=6;FSAF=34,0,6,0;FSAR=53,0,1,0;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.681115,0.132411,-0.029546,-0.418698;FXX=0;HRUN=3,3,3,3;LEN=1,2,3,1;MLLD=13.5201,12.1437,182.487,15.0861;QD=35.4037;RBI=0.683851,0.198623,0.0969946,0.549427;REFB=0.110057,0.255999,0.113205,0.35762;REVB=0.0611153,-0.148048,-0.092385,-0.355755;RO=21;SAF=0,6,6,13;SAR=32,18,1,0;SRF=15;SRR=6;SSEN=0.257812,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.874308,-0.399582,0.248482,0.772076;STB=0.52678,0.5,0.873989,0.5;STBP=0.067,1,0.019,1;TYPE=del,del,mnp,del;VARB=0.0368321,0.0231239,0.0866589,0;OID=.,.,.,.;OPOS=70748707,70748706,70748706,70748704;OREF=G,CG,CGG,C;OALT=-,-,GGC,-;OMAPALT=GCCCG,GCCG,GCCGGC,GCCGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.87,0,0.07,0:32,24,7,13:100:87,0,7,0:100:6:34,0,6,0:53,0,1,0:0:6:24:21:0,6,6,13:32,18,1,0:15:6
chr10	70748784	.	G	A	195.15	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.000129395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.353;QD=14.1929;RBI=0.0166546;REFB=-0.0176346;REVB=0.0166541;RO=32;SAF=15;SAR=8;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301204;STB=0.517226;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0165607;OID=.;OPOS=70748784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:8:15:20:12:8:15:20:12
chr10	70856852	.	G	A	1065.94	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0286962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.593;QD=58.4076;RBI=0.0677696;REFB=0.0429251;REVB=0.0613942;RO=1;SAF=47;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00995774;STB=0.505262;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-1.74754e-05;OID=.;OPOS=70856852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:25:47:1:0:25:47:1:0
chr10	70992664	.	C	T	385.97	PASS	AF=0.534247;AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0163529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.754;QD=21.1493;RBI=0.0203998;REFB=-0.0182765;REVB=-0.0121956;RO=34;SAF=20;SAR=19;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637283;STB=0.535193;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.020042;OID=.;OPOS=70992664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:34:34:39:39:0.534247:19:20:20:14:19:20:20:14
chr10	71018660	.	T	C	1080.56	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0183219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.327;QD=60.0309;RBI=0.0215583;REFB=0;REVB=0.0113608;RO=0;SAF=24;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.17393e-06;OID=.;OPOS=71018660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:48:24:0:0:48:24:0:0
chr10	71026510	.	C	A	1154.98	PASS	AF=0.963855;AO=77;DP=82;FAO=80;FDP=83;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0548929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2067;QD=55.6615;RBI=0.0796918;REFB=-0.10494;REVB=0.0577716;RO=4;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461003;STB=0.517643;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00258022;OID=.;OPOS=71026510;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:82:83:4:3:77:80:0.963855:39:38:0:4:41:39:0:3
chr10	71055459	.	T	C	304.91	PASS	AF=1;AO=8;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.134664;FXX=0;HRUN=11;LEN=1;MLLD=57.4767;QD=53.0283;RBI=0.134666;REFB=0;REVB=-0.000753878;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000970931;OID=.;OPOS=71055459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:8:23:1:0:8:0:0:4:19:0:0
chr10	71060610	.	A	G	234.16	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0245409;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.641;QD=46.832;RBI=0.040222;REFB=-0.0857346;REVB=0.0318677;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.526288;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00233162;OID=.;OPOS=71060610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:20:0:1:19:19:0.95:9:10:0:0:9:10:0:1
chr10	71060621	.	C	T	92.22	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0118407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.818;QD=18.4438;RBI=0.0208288;REFB=-0.0142241;REVB=-0.0171359;RO=9;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393937;STB=0.723766;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0169026;OID=.;OPOS=71060621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:4:7:1:8:4:7:1:8
chr10	71060634	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00839505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.898;QD=50.4131;RBI=0.0183693;REFB=0;REVB=0.0163388;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82395e-05;OID=.;OPOS=71060634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:12:7:0:0:12:7:0:0
chr10	71098295	.	T	A	474.12	PASS	AF=0.522727;AO=46;DP=88;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=-0.00392736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1432;QD=21.5507;RBI=0.0137794;REFB=-0.0203308;REVB=0.0132078;RO=41;SAF=22;SAR=24;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00816329;STB=0.510381;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0138272;OID=.;OPOS=71098295;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:41:42:46:46:0.522727:24:22:20:21:24:22:21:21
chr10	71103597	.	C	G	382.51	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0341047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.269;QD=52.7606;RBI=0.0347636;REFB=0.0201206;REVB=0.00673617;RO=1;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251595;STB=0.513504;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=-4.58999e-05;OID=.;OPOS=71103597;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:18:10:0:1:18:10:0:1
chr10	71142420	.	G	A	1045.26	PASS	AF=1;AO=47;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.22475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.2873;QD=59.729;RBI=0.234738;REFB=0;REVB=0.0677425;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00282502;OID=.;OPOS=71142420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:47:70:1:31:16:0:0:34:36:0:0
chr10	71168685	.	A	T	701.54	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00938959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.307;QD=62.359;RBI=0.0389948;REFB=0;REVB=0.0378475;RO=0;SAF=30;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010858;OID=.;OPOS=71168685;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:14:30:0:0:14:31:0:0
chr10	71176012	.	A	G	290.19	PASS	AF=0.568627;AO=28;DP=50;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0392551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.584;QD=22.7602;RBI=0.039267;REFB=-0.0448745;REVB=-0.000967715;RO=21;SAF=16;SAR=12;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182812;STB=0.58059;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.031724;OID=.;OPOS=71176012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:21:22:28:29:0.568627:12:16:7:14:13:16:8:14
chr10	71332204	.	A	G	203.07	PASS	AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.000414372;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.456;QD=12.3075;RBI=0.000553469;REFB=-0.0123577;REVB=-0.000366911;RO=41;SAF=17;SAR=8;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335617;STB=0.692893;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0150873;OID=.;OPOS=71332204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:41:41:25:25:0.378788:8:17:15:26:8:17:15:26
chr10	71390392	.	C	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0045515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.044;QD=57.1772;RBI=0.0158375;REFB=0;REVB=-0.0151693;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.07377e-05;OID=.;OPOS=71390392;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:17:34:0:0:17:34:0:0
chr10	71392557	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00387514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.513;QD=55.0977;RBI=0.00476294;REFB=0;REVB=-0.00276927;RO=0;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.76527e-06;OID=.;OPOS=71392557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:7:19:0:0:7:19:0:0
chr10	71392692	.	T	C	1542.9	PASS	AF=0.989899;AO=97;DP=99;FAO=98;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0453882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.758;QD=62.3395;RBI=0.0589332;REFB=-0.04408;REVB=0.0375902;RO=1;SAF=58;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00810761;STB=0.504201;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.000608687;OID=.;OPOS=71392692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:99:99:1:1:97:98:0.989899:39:58:1:0:39:59:1:0
chr10	71562437	.	G	A	216.05	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.00918368;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.449;QD=16.619;RBI=0.0288786;REFB=-0.0333208;REVB=-0.0273795;RO=25;SAF=18;SAR=6;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0121752;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.035424;OID=.;OPOS=71562437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:25:28:24:24:0.461538:6:18:19:6:6:18:21:7
chr10	71582192	.	C	G	55.62	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0190765;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.234;QD=8.89906;RBI=0.0191302;REFB=-0.0190404;REVB=-0.00143128;RO=17;SAF=5;SAR=3;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.098437;STB=0.560295;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0291926;OID=.;OPOS=71582192;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:26:25:17:17:8:8:0.32:3:5:12:5:3:5:12:5
chr10	71620403	.	G	A	62.09	PASS	AF=0.272727;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=33;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.0332674;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.87;QD=7.52632;RBI=0.0339799;REFB=-0.00272217;REVB=-0.00692227;RO=24;SAF=4;SAR=5;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35202;STB=0.713877;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0063172;OID=.;OPOS=71620403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:33:33:24:24:9:9:0.272727:5:4:18:6:5:4:18:6
chr10	71620482	.	G	A	73.06	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=-0.00170876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.034;QD=9.13234;RBI=0.00208809;REFB=-0.0063898;REVB=-0.0012001;RO=22;SAF=3;SAR=7;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496303;STB=0.794951;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0272232;OID=.;OPOS=71620482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:32:32:22:22:10:10:0.3125:7:3:17:5:7:3:17:5
chr10	71637832	.	A	G	246.84	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0164964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.384;QD=17.9523;RBI=0.0206483;REFB=-0.0141571;REVB=-0.0124187;RO=28;SAF=11;SAR=16;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823827;STB=0.546066;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0126094;OID=.;OPOS=71637832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:16:11:9:19:16:11:9:19
chr10	71657272	.	A	G	582.43	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0348228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.647;QD=58.243;RBI=0.035936;REFB=-0.0448655;REVB=-0.00887527;RO=1;SAF=24;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191347;STB=0.510199;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000228909;OID=.;OPOS=71657272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:15:24:1:0:15:24:1:0
chr10	71658512	.	G	A	803.81	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151578;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.857;QD=57.4149;RBI=0.0200083;REFB=0;REVB=-0.0130604;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.7228e-05;OID=.;OPOS=71658512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:30:26:0:0:30:26:0:0
chr10	71678058	.	C	G	301.92	PASS	AF=0.404762;AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=84;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=39;FSRR=11;FWDB=-0.0144502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.349;QD=14.377;RBI=0.0561993;REFB=0.00116251;REVB=-0.0543098;RO=50;SAF=26;SAR=8;SRF=39;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226075;STB=0.512813;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=-0.00245649;OID=.;OPOS=71678058;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:50:50:34:34:0.404762:8:26:39:11:8:26:39:11
chr10	71876382	.	C	T	741.52	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419011;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.873;QD=57.0403;RBI=0.0469377;REFB=0;REVB=0.0211529;RO=0;SAF=47;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206735;OID=.;OPOS=71876382;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:5:47:0:0:5:47:0:0
chr10	71905178	.	TGGGGGT	TGGGGT,TGGGGTG	35.05	PASS	AF=0.241379,0;AO=15,6;DP=89;FAO=21,0;FDP=87;FR=.;FRO=66;FSAF=20,0;FSAR=1,0;FSRF=49;FSRR=17;FWDB=0.00630294,-0.122851;FXX=0.0224694;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=10.126,18.0921;QD=1.6115;RBI=0.219862,0.122913;REFB=-0.0137125,-0.0124844;REVB=0.219771,-0.00390967;RO=48;SAF=14,6;SAR=1,0;SRF=34;SRR=14;SSEN=0.348958,0;SSEP=0,0;SSSB=0.47394,0.554482;STB=0.838709,0.5;STBP=0.018,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.091979,0;OID=.,.;OPOS=71905179,71905183;OREF=G,GT;OALT=-,TG;OMAPALT=TGGGGT,TGGGGTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.241379,0:15,6:89:21,0:87:66:20,0:1,0:49:17:36:48:14,6:1,0:34:14
chr10	72014779	.	G	A	215.56	PASS	AF=0.666667;AO=17;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0103666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.186;QD=28.7414;RBI=0.0501263;REFB=-0.0687591;REVB=0.0490426;RO=7;SAF=7;SAR=10;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0091037;STB=0.5185;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0221719;OID=.;OPOS=72014779;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:30:30:7:10:17:20:0.666667:10:7:3:4:13:7:3:7
chr10	72014863	.	G	A	52.91	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.107242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.162;QD=21.1655;RBI=0.108532;REFB=-0.0164556;REVB=-0.0166844;RO=3;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21311;STB=0.624624;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0266665;OID=.;OPOS=72014863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:2:5:1:2:2:5:1:2
chr10	72015573	.	T	G	104.85	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.012975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.964;QD=10.7536;RBI=0.0154458;REFB=-0.0167541;REVB=-0.00837989;RO=26;SAF=11;SAR=2;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.538541;STB=0.824475;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0268347;OID=.;OPOS=72015573;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:2:11:10:16:2:11:10:16
chr10	72043389	.	T	G	348.9	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.117;QD=53.6766;RBI=0.0337392;REFB=0;REVB=-0.0102756;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258222;OID=.;OPOS=72043389;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:18:7:0:0:18:8:0:0
chr10	72179746	.	C	T	246.5	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0278892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.074;QD=46.9516;RBI=0.0360484;REFB=-0.0234093;REVB=0.0228404;RO=1;SAF=5;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0834715;STB=0.545407;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00417105;OID=.;OPOS=72179746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:15:5:1:0:15:5:1:0
chr10	72181460	.	G	T	770.33	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0775474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.3072;QD=62.8837;RBI=0.0888368;REFB=0;REVB=-0.0433403;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00145317;OID=.;OPOS=72181460;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:23:24:0:0:24:25:0:0
chr10	72195438	.	GTG	CGC,GCG	509.43	PASS	AF=0.0571429,0.942857;AO=2,17;DP=34;FAO=2,33;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=2,20;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000604942,0.016447;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=3,1;MLLD=28.8399,67.9248;QD=58.2204;RBI=0.04672,0.0473944;REFB=0,0;REVB=0.0467161,0.0444491;RO=0;SAF=2,5;SAR=0,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0902391,-0.00139892;OID=.,.;OPOS=72195438,72195439;OREF=GTG,T;OALT=CGC,C;OMAPALT=CGC,GCG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:34:35:0:0:2,17:2,33:0.0571429,0.942857:0,12:2,5:0:0:0,13:2,20:0:0
chr10	72289701	.	G	A	83.77	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00286159;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.972;QD=10.1536;RBI=0.0850294;REFB=-0.0128407;REVB=-0.0849813;RO=22;SAF=8;SAR=3;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0608311;STB=0.536844;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0243506;OID=.;OPOS=72289701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:3:8:15:7:3:8:15:7
chr10	72307101	.	C	T	419.49	PASS	AF=0.561644;AO=41;DP=73;FAO=41;FDP=73;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0367261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.554;QD=22.9859;RBI=0.0470088;REFB=-0.0188786;REVB=-0.0293431;RO=31;SAF=25;SAR=16;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19965;STB=0.603167;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0353774;OID=.;OPOS=72307101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:31:32:41:41:0.561644:16:25:11:20:16:25:12:20
chr10	72307172	.	G	C	180.85	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0194274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.632;QD=13.9117;RBI=0.0260707;REFB=-0.00625589;REVB=0.0173856;RO=31;SAF=5;SAR=16;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375343;STB=0.717132;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.011423;OID=.;OPOS=72307172;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:16:5:18:13:16:5:18:13
chr10	72324141	.	CAA	CA,CAG	2063.6	PASS	AF=0.152174,0.847826;AO=19,116;DP=139;FAO=21,117;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=13,55;FSAR=8,62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00950234,0.0103035;FXX=0.00719373;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=28.8204,51.6833;QD=59.8145;RBI=0.0134348,0.0307604;REFB=0,0;REVB=0.00949735,-0.0289835;RO=0;SAF=11,55;SAR=8,61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.41338e-08,3.12874e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0334259,-0.00887481;OID=.,.;OPOS=72324142,72324143;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=CA,CAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.152174,0.847826:19,116:139:21,117:138:0:13,55:8,62:0:0:88:0:11,55:8,61:0:0
chr10	72324145	.	A	G	67.54	PASS	AF=0.15;AO=25;DP=140;FAO=21;FDP=140;FR=.;FRO=119;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=59;FSRR=60;FWDB=-0.115264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.6529;QD=1.9297;RBI=0.138409;REFB=-0.039659;REVB=-0.0766243;RO=114;SAF=13;SAR=12;SRF=54;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059056;STB=0.557322;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.186378;OID=.;OPOS=72324145;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:140:140:114:119:25:21:0.15:12:13:54:60:12:9:59:60
chr10	72358577	.	G	A	314.36	PASS	AF=0.416667;AO=34;DP=84;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.0341258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2614;QD=14.9697;RBI=0.0399959;REFB=-0.00645082;REVB=0.020859;RO=49;SAF=14;SAR=20;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145172;STB=0.588466;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00799342;OID=.;OPOS=72358577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:49:49:34:35:0.416667:20:14:27:22:21:14:27:22
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chr10	72500863	.	C	G	1320.93	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.232;QD=62.1615;RBI=0.0229435;REFB=0;REVB=0.0176242;RO=0;SAF=32;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.31521e-06;OID=.;OPOS=72500863;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:53:32:0:0:53:32:0:0
chr10	72503344	.	G	A	1539.58	PASS	AF=0.869231;AO=110;DP=126;FAO=113;FDP=130;FR=.;FRO=17;FSAF=81;FSAR=32;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0146699;FXX=0.0151504;HRUN=5;LEN=1;MLLD=189.766;QD=47.3716;RBI=0.068264;REFB=-0.170541;REVB=0.0666691;RO=8;SAF=81;SAR=29;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182355;STB=0.507764;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.00291459;OID=.;OPOS=72503344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:126:130:8:17:110:113:0.869231:29:81:5:3:32:81:13:4
chr10	72517830	.	G	A	77.58	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0211043;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.154;QD=11.0828;RBI=0.0299419;REFB=0.0183781;REVB=0.0212398;RO=18;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0487512;STB=0.529352;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=-0.0134106;OID=.;OPOS=72517830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:28:28:18:18:10:10:0.357143:4:6:10:8:4:6:10:8
chr10	72517837	.	C	T	195.9	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00813315;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.815;QD=25.2771;RBI=0.00816718;REFB=-0.019055;REVB=0.000744738;RO=12;SAF=11;SAR=8;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0031244;STB=0.50174;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00945364;OID=.;OPOS=72517837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:8:11:7:5:8:11:7:5
chr10	72518009	.	A	G	125.13	PASS	AF=0.3125;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0420077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5804;QD=10.4274;RBI=0.0422123;REFB=-0.00274133;REVB=0.00415023;RO=32;SAF=10;SAR=5;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521333;STB=0.545393;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00823706;OID=.;OPOS=72518009;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:32:33:15:15:0.3125:5:10:20:12:5:10:20:13
chr10	72520660	.	T	C	410.57	PASS	AF=0.639344;AO=39;DP=61;FAO=39;FDP=61;FR=.;FRO=22;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0267575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9425;QD=26.9223;RBI=0.0481947;REFB=-0.0431997;REVB=-0.0400844;RO=21;SAF=25;SAR=14;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201051;STB=0.618012;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0342003;OID=.;OPOS=72520660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:21:22:39:39:0.639344:14:25:7:14:14:25:7:15
chr10	72532037	.	C	T	288.84	PASS	AF=0.450704;AO=31;DP=70;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0408633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.152;QD=16.2726;RBI=0.0429615;REFB=-0.0130662;REVB=-0.0132621;RO=39;SAF=10;SAR=21;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197136;STB=0.616747;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0146381;OID=.;OPOS=72532037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:39:39:31:32:0.450704:21:10:20:19:22:10:20:19
chr10	72535007	.	C	T	726.82	PASS	AF=1;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0554387;FXX=0.0377287;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.338;QD=57.0053;RBI=0.0566411;REFB=0;REVB=0.011609;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216271;OID=.;OPOS=72535007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0
chr10	72619205	.	C	T	2005.53	PASS	AF=1;AO=125;DP=126;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466436;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.769;QD=62.1869;RBI=0.0609615;REFB=0;REVB=0.0392514;RO=0;SAF=55;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.59774e-05;OID=.;OPOS=72619205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:126:129:0:0:125:129:1:70:55:0:0:72:57:0:0
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chr10	73111408	.	C	T	750.76	PASS	AF=0.568;AO=70;DP=124;FAO=71;FDP=125;FR=.;FRO=54;FSAF=46;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.0581321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8279;QD=24.0244;RBI=0.067665;REFB=-0.00719074;REVB=0.0346297;RO=54;SAF=45;SAR=25;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430201;STB=0.525771;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00634367;OID=.;OPOS=73111408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:125:54:54:70:71:0.568:25:45:32:22:25:46:32:22
chr10	73111423	.	G	T	477.5	PASS	AF=0.420635;AO=53;DP=127;FAO=53;FDP=126;FR=.;FRO=73;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=46;FSRR=27;FWDB=0.00762857;FXX=0.0156238;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.5594;QD=15.1586;RBI=0.00773161;REFB=-0.00209371;REVB=-0.0012581;RO=72;SAF=28;SAR=25;SRF=46;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114978;STB=0.559567;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00304622;OID=.;OPOS=73111423;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:126:72:73:53:53:0.420635:25:28:46:26:25:28:46:27
chr10	73111433	.	G	C	483.67	PASS	AF=0.409091;AO=54;DP=133;FAO=54;FDP=132;FR=.;FRO=78;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=47;FSRR=31;FWDB=-0.0722137;FXX=0.00751823;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9454;QD=14.6566;RBI=0.0730227;REFB=0.013439;REVB=0.01084;RO=78;SAF=27;SAR=27;SRF=47;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107806;STB=0.560584;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=-0.0201793;OID=.;OPOS=73111433;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:132:78:78:54:54:0.409091:27:27:47:31:27:27:47:31
chr10	73115941	.	TG	CA	1197.56	PASS	AF=1;AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315392;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=2;MLLD=200.46;QD=61.4133;RBI=0.0337142;REFB=0;REVB=0.0119133;RO=0;SAF=36;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-7.5949e-05;OID=.;OPOS=73115941;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:80:78:0:0:78:78:1:42:36:0:0:42:36:0:0
chr10	73121913	.	A	G	706.14	PASS	AF=1;AO=48;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13203;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.903;QD=56.4911;RBI=0.132122;REFB=0;REVB=0.00493701;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000456334;OID=.;OPOS=73121913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:48:50:1:18:30:0:0:18:32:0:0
chr10	73121945	.	T	C	192.86	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.040785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.529;QD=14.835;RBI=0.0412686;REFB=-0.012343;REVB=0.00629908;RO=29;SAF=16;SAR=6;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402926;STB=0.529386;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0207655;OID=.;OPOS=73121945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:29:30:22:22:0.423077:6:16:22:7:6:16:23:7
chr10	73270906	.	T	C	1083.11	PASS	AF=0.986667;AO=71;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=50;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0148696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.903;QD=57.7657;RBI=0.0340926;REFB=0.0548546;REVB=0.030679;RO=1;SAF=49;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00955431;STB=0.504949;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=-4.12416e-05;OID=.;OPOS=73270906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:75:75:1:1:71:74:0.986667:22:49:1:0:24:50:1:0
chr10	73270982	.	G	A	357.42	PASS	AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0429516;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.68;QD=49.2986;RBI=0.0473627;REFB=-0.155701;REVB=-0.0199596;RO=2;SAF=13;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662949;STB=0.535688;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00507082;OID=.;OPOS=73270982;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:29:2:2:27:27:0.931034:14:13:2:0:14:13:2:0
chr10	73434906	.	G	A	140.7	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0132958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.21;QD=13.088;RBI=0.0138126;REFB=-0.00699415;REVB=-0.00374311;RO=27;SAF=6;SAR=10;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117265;STB=0.568775;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0166622;OID=.;OPOS=73434906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:27:27:16:16:0.372093:10:6:13:14:10:6:13:14
chr10	73455201	.	T	C	164.3	PASS	AF=0.36;AO=20;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0791242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.528;QD=13.1439;RBI=0.0801903;REFB=-0.00685969;REVB=-0.0130322;RO=30;SAF=8;SAR=12;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139706;STB=0.648481;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00243279;OID=.;OPOS=73455201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:32:20:18:0.36:12:8:16:14:12:6:18:14
chr10	73455273	.	T	C	203.35	PASS	AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0152588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.483;QD=14.2702;RBI=0.0157099;REFB=0.00212305;REVB=0.00373766;RO=33;SAF=11;SAR=13;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882762;STB=0.550323;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=-0.00244056;OID=.;OPOS=73455273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:13:11:18:15:13:11:18:15
chr10	73472868	.	C	G	133.84	PASS	AF=0.235294;AO=9;DP=53;FAO=12;FDP=51;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=34;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.00791306;FXX=0.0555453;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.43;QD=10.4971;RBI=0.0551531;REFB=-0.0060493;REVB=0.0545825;RO=27;SAF=4;SAR=5;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130762;STB=0.62665;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0215552;OID=.;OPOS=73472868;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:53:51:27:34:9:12:0.235294:5:4:15:12:8:4:17:17
chr10	73472882	.	C	T	183.98	PASS	AF=0.370968;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.00417887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.156;QD=11.8694;RBI=0.00433255;REFB=-0.0239136;REVB=0.0011437;RO=38;SAF=9;SAR=14;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174501;STB=0.593139;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0211763;OID=.;OPOS=73472882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:38:39:23:23:0.370968:14:9:21:17:14:9:21:18
chr10	73492078	.	C	CG	357.18	PASS	AF=1;AO=4;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00737185;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=23.4395;QD=47.6244;RBI=0.0277937;REFB=0;REVB=0.0267983;RO=27;SAF=2;SAR=2;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148602;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00117663;OID=.;OPOS=73492079;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:31:30:30:0:12:18:0:0:4:27:2:2:10:17
chr10	73492079	.	A	G	350.81	PASS	AF=0.9;AO=27;DP=30;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0263292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5353;QD=46.7745;RBI=0.0267281;REFB=-0.00133521;REVB=0.00460035;RO=3;SAF=10;SAR=17;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578511;STB=0.531227;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000845334;OID=.;OPOS=73492079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:30:30:3:3:27:27:0.9:17:10:2:1:17:10:2:1
chr10	73501556	.	G	A	851.15	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0579433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.8025;QD=57.705;RBI=0.0595148;REFB=0;REVB=0.0135862;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346044;OID=.;OPOS=73501556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0
chr10	73520632	.	A	C	747.09	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00952863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2574;QD=63.5818;RBI=0.0584443;REFB=0;REVB=0.0576623;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316094;OID=.;OPOS=73520632;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:20:26:0:0:20:27:0:0
chr10	73521578	.	G	A	384.41	PASS	AF=0.41;AO=41;DP=100;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.00254826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.211;QD=15.3764;RBI=0.00371922;REFB=-0.025814;REVB=-0.00270905;RO=59;SAF=25;SAR=16;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142801;STB=0.580781;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.032;OID=.;OPOS=73521578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:59:59:41:41:0.41:16:25:28:31:16:25:28:31
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chr10	73537614	.	G	A	279.03	PASS	AF=0.530612;AO=25;DP=48;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.0312689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4911;QD=22.7778;RBI=0.0364841;REFB=-0.0249032;REVB=-0.0187975;RO=23;SAF=14;SAR=11;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288276;STB=0.664003;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0210992;OID=.;OPOS=73537614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:23:23:25:26:0.530612:11:14:5:18:11:15:5:18
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chr10	73819046	.	T	C	149.18	PASS	AF=0.5625;AO=12;DP=30;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.031453;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=93.1789;QD=18.647;RBI=0.0540006;REFB=-0.0156897;REVB=0.0438951;RO=2;SAF=12;SAR=0;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.825249;STB=0.583232;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=0.0239464;OID=.;OPOS=73819046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:32:2:14:12:18:0.5625:0:12:1:1:3:15:10:4
chr10	73822343	.	T	C	323.08	PASS	AF=0.607843;AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=51;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=-0.0210333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.437;QD=25.3397;RBI=0.0212064;REFB=-0.0219396;REVB=0.00270358;RO=20;SAF=18;SAR=13;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127182;STB=0.569678;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0167319;OID=.;OPOS=73822343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:20:20:31:31:0.607843:13:18:15:5:13:18:15:5
chr10	74093652	.	C	T	171.2	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0312857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.161;QD=17.5595;RBI=0.0328934;REFB=-0.00394622;REVB=0.0101577;RO=21;SAF=5;SAR=13;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250433;STB=0.643795;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00379716;OID=.;OPOS=74093652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:13:5:11:10:13:5:11:10
chr10	74237247	.	C	CT,T	479.09	PASS	AF=0.509615,0;AO=50,4;DP=105;FAO=53,0;FDP=104;FR=.;FRO=51;FSAF=29,0;FSAR=24,0;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.0228185,-0.00422775;FXX=0.0095229;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=25.3392,180.47;QD=18.4266;RBI=0.239594,0.0746154;REFB=0.014326,-0.0124152;REVB=-0.238505,-0.0744955;RO=49;SAF=29,0;SAR=21,4;SRF=28;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00785963,-0.569268;STB=0.500915,0.5;STBP=0.997,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0214894,0;OID=.,.;OPOS=74237248,74237247;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:49:51:50,4:53,0:0.509615,0:21,4:29,0:28:21:24,0:29,0:28:23
chr10	74937720	.	C	T	438.12	PASS	AF=0.52439;AO=43;DP=83;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.000881429;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3068;QD=21.3716;RBI=0.0601842;REFB=-0.00462824;REVB=-0.0601777;RO=38;SAF=22;SAR=21;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00988129;STB=0.511622;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00287302;OID=.;OPOS=74937720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:82:38:39:43:43:0.52439:21:22:19:19:21:22:19:20
chr10	75451768	.	A	G	112.34	PASS	AF=0.275862;AO=16;DP=58;FAO=16;FDP=58;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=30;FWDB=-0.0114941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.59;QD=7.74728;RBI=0.0118394;REFB=-0.0135823;REVB=-0.00283885;RO=42;SAF=1;SAR=15;SRF=12;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.484892;STB=0.811975;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0259118;OID=.;OPOS=75451768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:42:42:16:16:0.275862:15:1:12:30:15:1:12:30
chr10	75523729	.	GCCCCCA	GCCCCA,GCCCCAG,GCCCCGA	90.18	PASS	AF=0.389831,0,0;AO=18,3,3;DP=59;FAO=23,0,0;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=9,0,0;FSAR=14,0,0;FSRF=10;FSRR=26;FWDB=-0.147679,-0.15603,-0.0880274;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=1,2,1;MLLD=12.0287,27.4979,44.8138;QD=6.11416;RBI=0.156117,0.159927,0.0900981;REFB=-0.0944179,-0.0342496,-0.00266956;REVB=0.0506282,-0.0350885,-0.0192049;RO=31;SAF=6,3,0;SAR=12,0,3;SRF=7;SRR=24;SSEN=0.344828,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.13961,0.686405,-0.447719;STB=0.575018,0.5,0.5;STBP=0.376,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.132439,0,0;OID=.,.,.;OPOS=75523730,75523734,75523734;OREF=C,CA,C;OALT=-,AG,G;OMAPALT=GCCCCA,GCCCCAG,GCCCCGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.389831,0,0:18,3,3:59:23,0,0:59:36:9,0,0:14,0,0:10:26:91:31:6,3,0:12,0,3:7:24
chr10	75526198	.	C	T	560.83	PASS	AF=0.431655;AO=60;DP=139;FAO=60;FDP=139;FR=.;FRO=79;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=51;FSRR=28;FWDB=-0.013436;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.758;QD=16.139;RBI=0.0349648;REFB=-0.00520132;REVB=0.0322802;RO=79;SAF=34;SAR=26;SRF=51;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827956;STB=0.546203;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.00660783;OID=.;OPOS=75526198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:79:79:60:60:0.431655:26:34:51:28:26:34:51:28
chr10	75533448	.	A	G	176.68	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.00714306;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1937;QD=13.3342;RBI=0.0899531;REFB=-0.00951555;REVB=-0.089669;RO=32;SAF=13;SAR=8;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114905;STB=0.565756;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00889809;OID=.;OPOS=75533448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:8:13:23:9:8:13:23:9
chr10	75556128	.	G	GA	38.47	PASS	AF=0.631579;AO=7;DP=20;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.125096;FXX=0.136302;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.39609;QD=8.09899;RBI=0.193689;REFB=-0.0441584;REVB=0.147872;RO=11;SAF=6;SAR=1;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119123;STB=0.563984;STBP=0.785;TYPE=ins;VARB=0.0769894;OID=.;OPOS=75556129;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.631579:7:20:12:19:7:11:1:6:1:30:11:6:1:10:1
chr10	75673101	.	T	C	136.88	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0381625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9982;QD=18.2505;RBI=0.038306;REFB=0.00239438;REVB=0.00331182;RO=15;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125748;STB=0.571338;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-0.00289836;OID=.;OPOS=75673101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:15:15:0.5:6:9:11:4:6:9:11:4
chr10	75673879	.	C	T	309.42	PASS	AF=0.72973;AO=24;DP=36;FAO=27;FDP=37;FR=.;FRO=10;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.108422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9048;QD=33.4513;RBI=0.117042;REFB=-0.0096136;REVB=-0.0440861;RO=11;SAF=15;SAR=9;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20281;STB=0.629532;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.012001;OID=.;OPOS=75673879;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:36:37:11:10:24:27:0.72973:9:15:3:8:9:18:2:8
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chr10	78636112	.	T	C	154.65	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0296387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.225;QD=14.7287;RBI=0.042004;REFB=-0.0122472;REVB=0.0297637;RO=25;SAF=9;SAR=8;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11529;STB=0.566496;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.0158936;OID=.;OPOS=78636112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:8:9:16:9:8:9:16:9
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chr10	79550544	.	C	T	45.06	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.00509753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6136;QD=7.83607;RBI=0.0443905;REFB=-0.0104405;REVB=-0.0440969;RO=16;SAF=6;SAR=1;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.587714;STB=0.866454;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0184068;OID=.;OPOS=79550544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:1:6:5:11:1:6:5:11
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chr10	79628875	.	A	G	131.31	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.0199141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.389;QD=14.1952;RBI=0.0202197;REFB=-0.019263;REVB=0.00350238;RO=22;SAF=12;SAR=3;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106364;STB=0.562411;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0321674;OID=.;OPOS=79628875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:3:12:16:6:3:12:16:6
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chr10	79762028	.	G	A	374.71	PASS	AF=0.45977;AO=39;DP=86;FAO=40;FDP=87;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.00687013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.558;QD=17.2282;RBI=0.00687322;REFB=-0.0160066;REVB=-0.000206003;RO=47;SAF=17;SAR=22;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0107982;STB=0.512003;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0243447;OID=.;OPOS=79762028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:47:47:39:40:0.45977:22:17:21:26:23:17:21:26
chr10	79793688	.	C	T	204.93	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0336609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1545;QD=22.7704;RBI=0.0375289;REFB=-0.0445968;REVB=0.0165942;RO=14;SAF=6;SAR=14;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126225;STB=0.527001;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0312184;OID=.;OPOS=79793688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:36:14:16:20:20:0.555556:14:6:4:10:14:6:4:12
chr10	80310465	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000235546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.051;QD=42.181;RBI=0.0560674;REFB=0;REVB=0.0560669;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00073955;OID=.;OPOS=80310465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0
chr10	80310636	.	G	A	2315.02	PASS	AF=1;AO=149;DP=150;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.245;QD=60.9217;RBI=0.0207742;REFB=0;REVB=-0.00781095;RO=0;SAF=101;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.76567e-06;OID=.;OPOS=80310636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:152:0:0:149:152:1:48:101:0:0:49:103:0:0
chr10	81053475	.	G	A	383.84	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0129869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.449;QD=52.9429;RBI=0.0207261;REFB=-0.185109;REVB=0.0161528;RO=1;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0372036;STB=0.519986;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00300746;OID=.;OPOS=81053475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:29:29:1:1:28:28:0.965517:12:16:0:1:12:16:0:1
chr10	81145701	.	G	C	375.54	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.07837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0275;QD=55.6351;RBI=0.183528;REFB=0;REVB=0.165954;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00485155;OID=.;OPOS=81145701;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:6:21:0:0:6:21:0:0
chr10	81270253	.	A	G	93.32	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0521211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.407;QD=19.646;RBI=0.0521332;REFB=-0.00629263;REVB=0.00112392;RO=8;SAF=7;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280231;STB=0.66009;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00755335;OID=.;OPOS=81270253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:4:7:2:6:4:7:2:6
chr10	81270319	.	T	A	89.52	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0345655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.378;QD=15.5689;RBI=0.035907;REFB=-0.0135731;REVB=-0.00972294;RO=10;SAF=7;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197016;STB=0.65597;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0145146;OID=.;OPOS=81270319;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:10:12:11:11:0.478261:4:7:4:6:4:7:4:8
chr10	81272881	.	A	G	57.3	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0419642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9114;QD=12.7339;RBI=0.0801197;REFB=-0.0246344;REVB=-0.0682508;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283851;STB=0.666296;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.028196;OID=.;OPOS=81272881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:4:4:2:8:4:4:2:8
chr10	81273507	.	GAAAAAAAAAAAA	GAAAAAAAAAAA,GAAAAAAAAAAAG	59.42	PASS	AF=0.3,0.7;AO=3,2;DP=12;FAO=3,7;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0,6;FSAR=3,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0637192,0.0102397;FXX=0.166528;HRUN=15,15;LEN=1,1;MLLD=1.40335,141.833;QD=23.7668;RBI=0.31053,0.0276945;REFB=-0.322688,-0.0339338;REVB=-0.303923,-0.025732;RO=0;SAF=0,1;SAR=3,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.111569,0.00619242;OID=.,.;OPOS=81273508,81273519;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=GAAAAAAAAAAA,GAAAAAAAAAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.3,0.7:3,2:12:3,7:10:0:0,6:3,1:0:0:11:0:0,1:3,1:0:0
chr10	81319423	.	C	T	972.86	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00241638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.277;QD=58.961;RBI=0.0252312;REFB=0;REVB=0.0251152;RO=0;SAF=29;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.70932e-05;OID=.;OPOS=81319423;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:37:29:0:0:37:29:0:0
chr10	81319483	.	A	G	765.25	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.772;QD=63.7708;RBI=0.0339685;REFB=0;REVB=0.0315395;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114999;OID=.;OPOS=81319483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:46:48:1:25:21:0:0:25:23:0:0
chr10	81373674	.	T	C	444.75	PASS	AF=0.494382;AO=44;DP=91;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=33;FWDB=-0.00313762;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6103;QD=19.9888;RBI=0.0354623;REFB=0.00967341;REVB=0.0353232;RO=44;SAF=24;SAR=20;SRF=12;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243023;STB=0.638495;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.0131294;OID=.;OPOS=81373674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:89:44:45:44:44:0.494382:20:24:12:32:20:24:12:33
chr10	81701722	.	T	C	305.98	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0915008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2313;QD=15.2992;RBI=0.0916137;REFB=-0.0178002;REVB=-0.00454602;RO=41;SAF=21;SAR=13;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0573982;STB=0.505432;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0103466;OID=.;OPOS=81701722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:41:46:34:34:0.425:13:21:23:18:13:21:28:18
chr10	81706324	.	A	G	271.38	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0213287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4802;QD=23.5986;RBI=0.0506022;REFB=0.0177313;REVB=-0.0458875;RO=21;SAF=16;SAR=9;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177069;STB=0.59885;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=-0.0211088;OID=.;OPOS=81706324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:9:16:9:12:9:16:9:12
chr10	81841692	.	G	T	736.24	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.19;QD=62.6584;RBI=0.0566992;REFB=0;REVB=0.0311188;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125146;OID=.;OPOS=81841692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:25:21:0:0:26:21:0:0
chr10	81915136	.	T	C	884.17	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9123;QD=57.978;RBI=0.0247544;REFB=0;REVB=0.0192716;RO=0;SAF=42;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.66483e-05;OID=.;OPOS=81915136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:19:42:0:0:19:42:0:0
chr10	81917708	.	A	G	686.6	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.889;QD=62.4182;RBI=0.0482199;REFB=0;REVB=-0.0237481;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.16387e-05;OID=.;OPOS=81917708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:19:24:0:0:19:25:0:0
chr10	81926702	.	G	A	2872.61	PASS	AF=1;AO=181;DP=181;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=120;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00252842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.795;QD=62.7892;RBI=0.0242332;REFB=0;REVB=0.0241009;RO=0;SAF=120;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.29633e-05;OID=.;OPOS=81926702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:181:183:0:0:181:183:1:61:120:0:0:63:120:0:0
chr10	82012599	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.078796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.688;QD=35.5759;RBI=0.0794412;REFB=0;REVB=0.0101042;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000949004;OID=.;OPOS=82012599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr10	82012748	.	G	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0475714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3212;QD=35.5759;RBI=0.076585;REFB=0;REVB=-0.0600185;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0079354;OID=.;OPOS=82012748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr10	82012954	.	A	G	429.96	PASS	AF=1;AO=27;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0767447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.301;QD=57.3286;RBI=0.0783055;REFB=0;REVB=-0.0155563;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386535;OID=.;OPOS=82012954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:27:30:1:16:11:0:0:16:14:0:0
chr10	82012967	.	G	T	468.96	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0685631;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.445;QD=58.6202;RBI=0.0707867;REFB=0;REVB=0.017603;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442228;OID=.;OPOS=82012967;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr10	82013119	.	G	A	912.97	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0283068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.206;QD=55.3314;RBI=0.0347401;REFB=-0.137974;REVB=0.0201394;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.520827;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.000921431;OID=.;OPOS=82013119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:66:66:0:2:64:64:0.969697:23:41:0:0:23:41:0:2
chr10	82034842	.	A	G	1269.43	PASS	AF=0.988095;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0492543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6598;QD=60.4489;RBI=0.0628592;REFB=-0.104856;REVB=0.039055;RO=0;SAF=46;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14462e-08;STB=0.506665;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00141053;OID=.;OPOS=82034842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:84:0:1:82:83:0.988095:36:46:0:0:37:46:0:1
chr10	82034854	.	T	C,G	1214.96	PASS	AF=0.963415,0.0243902;AO=75,3;DP=80;FAO=79,2;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=42,2;FSAR=37,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0336732,0.0282494;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=136.246,90.3238;QD=59.2661;RBI=0.0592425,0.0291133;REFB=-0.0624747,-0.0244534;REVB=0.0487422,0.0070397;RO=0;SAF=40,2;SAR=35,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.71047e-08,0;STB=0.506665,0.993266;STBP=0.301,0.227;TYPE=snp,snp;VARB=0.000175802,0.0443585;OID=.,.;OPOS=82034854,82034854;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:80:82:0:1:75,3:79,2:0.963415,0.0243902:35,1:40,2:0:0:37,0:42,2:0:1
chr10	82040052	.	A	G	785.52	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00787316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7686;QD=64.124;RBI=0.0264668;REFB=0;REVB=0.0252686;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000262683;OID=.;OPOS=82040052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0
chr10	82095968	.	T	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=332.122;QD=51.9167;RBI=0.026794;REFB=0;REVB=0.0179588;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.83355e-05;OID=.;OPOS=82095968;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr10	82192713	.	T	A	572.82	PASS	AF=1;AO=34;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0838527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.918;QD=60.2965;RBI=0.086245;REFB=0;REVB=0.0201722;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000628447;OID=.;OPOS=82192713;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:34:38:1:22:12:0:0:22:16:0:0
chr10	82363340	.	C	A	798.88	PASS	AF=0.493976;AO=82;DP=166;FAO=82;FDP=166;FR=.;FRO=84;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=59;FSRR=25;FWDB=0.00774639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.848;QD=19.2502;RBI=0.00891363;REFB=-0.0276169;REVB=-0.00440979;RO=83;SAF=40;SAR=42;SRF=59;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203574;STB=0.608047;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0234885;OID=.;OPOS=82363340;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:166:83:84:82:82:0.493976:42:40:59:24:42:40:59:25
chr10	82363404	.	A	G	681.49	PASS	AF=0.492754;AO=68;DP=138;FAO=68;FDP=138;FR=.;FRO=70;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=49;FSRR=21;FWDB=-0.0467082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0613;QD=19.7534;RBI=0.0470839;REFB=-0.0260339;REVB=-0.00593651;RO=67;SAF=38;SAR=30;SRF=46;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118795;STB=0.573858;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0274831;OID=.;OPOS=82363404;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:67:70:68:68:0.492754:30:38:46:21:30:38:49:21
chr10	82369195	.	C	T	243.88	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00170717;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.1681;QD=15.4844;RBI=0.0104762;REFB=-0.0102256;REVB=-0.0103361;RO=35;SAF=12;SAR=16;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285108;STB=0.516117;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0444537;OID=.;OPOS=82369195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:16:12:16:19:16:12:16:19
chr10	84745256	.	C	T	739.02	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0517953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5728;QD=54.7419;RBI=0.0965313;REFB=0.0151575;REVB=0.0814588;RO=1;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177765;STB=0.50943;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00112789;OID=.;OPOS=84745256;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:26:27:0:1:26:27:0:1
chr10	85960395	.	A	G	546.5	PASS	AF=1;AO=30;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.164;QD=59.0811;RBI=0.0475298;REFB=0;REVB=0.0119475;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000589083;OID=.;OPOS=85960395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:30:37:1:19:11:0:0:25:12:0:0
chr10	85972043	.	A	G	671.34	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.039483;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9753;QD=52.6541;RBI=0.0396667;REFB=-0.00549226;REVB=0.00381378;RO=2;SAF=43;SAR=6;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213906;STB=0.511359;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.00197328;OID=.;OPOS=85972043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:2:2:49:49:0.960784:6:43:2:0:6:43:2:0
chr10	85974236	.	T	C	1639.81	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.512;QD=60.1764;RBI=0.0374873;REFB=0;REVB=0.0173364;RO=0;SAF=48;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71714e-05;OID=.;OPOS=85974236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:109:0:0:107:109:1:59:48:0:0:59:50:0:0
chr10	85978939	.	G	A	733.01	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00600712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6553;QD=56.3852;RBI=0.0373285;REFB=0;REVB=-0.036842;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.34254e-05;OID=.;OPOS=85978939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:50:52:1:25:25:0:0:25:27:0:0
chr10	85978991	.	C	T	318.55	PASS	AF=0.581818;AO=28;DP=51;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0710558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.374;QD=23.1674;RBI=0.0710591;REFB=-0.0577471;REVB=-0.000692877;RO=23;SAF=12;SAR=16;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0310483;STB=0.545426;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0409366;OID=.;OPOS=85978991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:55:23:23:28:32:0.581818:16:12:9:14:16:16:9:14
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chr10	85981842	.	A	G	75.13	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.00142622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.098;QD=11.1301;RBI=0.0112959;REFB=-0.00990345;REVB=0.0112055;RO=17;SAF=4;SAR=6;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522173;STB=0.531188;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0163045;OID=.;OPOS=85981842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:6:4:6:11:6:4:6:11
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chr10	85984444	.	T	G	636.26	PASS	AF=0.602151;AO=56;DP=89;FAO=56;FDP=93;FR=.;FRO=37;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0116375;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.6148;QD=27.3661;RBI=0.0302828;REFB=-0.0505284;REVB=-0.0279574;RO=33;SAF=36;SAR=20;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154389;STB=0.575972;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0291764;OID=.;OPOS=85984444;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:93:33:37:56:56:0.602151:20:36:14:19:20:36:17:20
chr10	85984723	.	G	A	292.01	PASS	AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00470957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.641;QD=21.6306;RBI=0.010315;REFB=0.00224577;REVB=0.00917708;RO=23;SAF=4;SAR=26;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.451453;STB=0.748956;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00108985;OID=.;OPOS=85984723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:23:24:30:30:0.555556:26:4:13:10:26:4:13:11
chr10	85992390	.	G	T	159.17	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0501672;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.2325;QD=18.1903;RBI=0.0710436;REFB=-0.00165265;REVB=-0.0503035;RO=16;SAF=12;SAR=5;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0465313;STB=0.523781;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.00147807;OID=.;OPOS=85992390;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:18:17:17:0.485714:5:12:12:4:5:12:12:6
chr10	85992478	.	T	C	740.1	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.459;QD=62.987;RBI=0.0540428;REFB=0;REVB=0.0494364;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.75907e-05;OID=.;OPOS=85992478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:19:25:0:0:20:27:0:0
chr10	85992511	.	T	C	710.05	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00851105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4353;QD=54.6189;RBI=0.00875179;REFB=0.00643695;REVB=0.00203857;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.507933;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=-0.000251811;OID=.;OPOS=85992511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:0:1:51:51:0.980769:20:31:0:0:20:31:1:0
chr10	85993836	.	A	G	339.32	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.632;QD=54.2904;RBI=0.0218584;REFB=0;REVB=-0.00509937;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.47874e-05;OID=.;OPOS=85993836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:16:8:0:0:16:9:0:0
chr10	85993910	.	G	A	766.74	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7165;QD=63.8949;RBI=0.0927608;REFB=0;REVB=0.0920392;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000554041;OID=.;OPOS=85993910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:48:0:0:44:48:1:27:17:0:0:31:17:0:0
chr10	85997250	.	G	A	378.26	PASS	AF=0.933333;AO=28;DP=31;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0388855;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.737;QD=50.435;RBI=0.0470984;REFB=-0.0182523;REVB=0.0265741;RO=2;SAF=26;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167163;STB=0.590834;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.000960212;OID=.;OPOS=85997250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:30:2:2:28:28:0.933333:2:26:1:1:2:26:1:1
chr10	86004873	.	T	C	529.95	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0669795;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.643;QD=60.5661;RBI=0.0890263;REFB=0;REVB=-0.0586466;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000215738;OID=.;OPOS=86004873;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:35:0:0:36:35:1:20:16:0:0:20:15:0:0
chr10	86012713	.	C	T	820.42	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000557247;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.263;QD=57.5731;RBI=0.0189287;REFB=0;REVB=0.0189205;RO=0;SAF=23;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.58157e-05;OID=.;OPOS=86012713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:34:23:0:0:34:23:0:0
chr10	86017740	.	C	T	314.76	PASS	AF=0.411765;AO=34;DP=84;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=-0.00774114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8493;QD=14.8124;RBI=0.0690184;REFB=0.00717392;REVB=0.0685829;RO=50;SAF=22;SAR=12;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149282;STB=0.519989;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=-0.0098668;OID=.;OPOS=86017740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:50:50:34:35:0.411765:12:22:33:17:13:22:33:17
chr10	86274871	.	C	T	2602.26	PASS	AF=1;AO=165;DP=165;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.416;QD=61.9585;RBI=0.0178028;REFB=0;REVB=0.00957649;RO=0;SAF=71;SAR=94;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.46607e-06;OID=.;OPOS=86274871;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:165:168:0:0:165:168:1:94:71:0:0:95:73:0:0
chr10	87359676	.	T	A	529.13	PASS	AF=0.79661;AO=42;DP=59;FAO=47;FDP=59;FR=.;FRO=12;FSAF=0;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=12;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.1049;QD=35.8729;RBI=0.100442;REFB=-0.146046;REVB=0.100442;RO=12;SAF=0;SAR=42;SRF=0;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0538555;OID=.;OPOS=87359676;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:59:59:12:12:42:47:0.79661:42:0:0:12:47:0:0:12
chr10	87359826	.	A	G	130.49	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.324;QD=43.4968;RBI=0.0526664;REFB=0;REVB=0.0081283;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00254759;OID=.;OPOS=87359826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr10	87361961	.	G	A	67.86	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.00898873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.069;QD=15.0806;RBI=0.028619;REFB=-0.0239321;REVB=0.0271707;RO=9;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0973785;STB=0.615147;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0330133;OID=.;OPOS=87361961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:20:18:9:9:9:9:0.5:4:5:6:3:4:5:7:2
chr10	87898729	.	G	A	476.29	PASS	AF=0.51087;AO=46;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=28;FWDB=0.0281858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.479;QD=20.7083;RBI=0.0303441;REFB=-0.0202076;REVB=0.0112395;RO=44;SAF=20;SAR=26;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0646399;STB=0.534387;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0231094;OID=.;OPOS=87898729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:44:45:46:47:0.51087:26:20:16:28:26:21:17:28
chr10	88126072	.	G	A	104.56	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0137482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6994;QD=19.9165;RBI=0.0232054;REFB=0.021566;REVB=0.0186943;RO=9;SAF=9;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257835;STB=0.648383;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=-0.013104;OID=.;OPOS=88126072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:3:9:4:5:3:9:4:5
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chr10	88505700	.	T	G	176.66	PASS	AF=0.413043;AO=18;DP=45;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0108789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.143;QD=15.3615;RBI=0.0162072;REFB=-0.0185281;REVB=0.0120135;RO=26;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504582;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0319742;OID=.;OPOS=88505700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:26:27:18:19:0.413043:9:9:13:13:9:10:14:13
chr10	88683890	.	T	A	108.31	PASS	AF=0.371429;AO=10;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=-0.0523054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.7721;QD=12.3777;RBI=0.0707422;REFB=-0.022432;REVB=-0.0476298;RO=16;SAF=7;SAR=3;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14995;STB=0.591712;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0315861;OID=.;OPOS=88683890;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:22:10:13:0.371429:3:7:13:3:3:10:19:3
chr10	88702350	.	G	C	306.95	PASS	AF=1;AO=20;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.173998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4944;QD=53.3832;RBI=0.186481;REFB=0;REVB=0.0670828;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00621966;OID=.;OPOS=88702350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:20:23:1:11:9:0:0:14:9:0:0
chr10	88717140	.	T	A	1659.56	PASS	AF=1;AO=107;DP=109;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.033;QD=60.3477;RBI=0.0582745;REFB=0;REVB=0.0551976;RO=0;SAF=71;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10022e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136863;OID=.;OPOS=88717140;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:110:0:0:107:110:1:36:71:0:0:38:72:0:0
chr10	88717154	.	C	T	395.03	PASS	AF=0.376;AO=47;DP=125;FAO=47;FDP=125;FR=.;FRO=78;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=40;FSRR=38;FWDB=0.00208973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.797;QD=12.6411;RBI=0.00785895;REFB=-0.0223623;REVB=0.00757602;RO=62;SAF=32;SAR=15;SRF=39;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588346;STB=0.610902;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.037618;OID=.;OPOS=88717154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:62:78:47:47:0.376:15:32:39:23:15:32:40:38
chr10	88719789	.	C	G	255.67	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0181632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4425;QD=17.9418;RBI=0.0396759;REFB=0.0182193;REVB=-0.0352742;RO=29;SAF=15;SAR=13;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110319;STB=0.561754;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=-0.019788;OID=.;OPOS=88719789;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:13:15:12:17:13:15:12:17
chr10	88722398	.	A	T	247.12	PASS	AF=0.560976;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00237154;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.841;QD=24.1093;RBI=0.00510534;REFB=-0.0162144;REVB=-0.0045211;RO=18;SAF=8;SAR=15;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169419;STB=0.594629;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0223709;OID=.;OPOS=88722398;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:18:18:23:23:0.560976:15:8:10:8:15:8:10:8
chr10	88730106	.	C	T	184.04	PASS	AF=0.666667;AO=17;DP=26;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0353675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6717;QD=27.2656;RBI=0.0631838;REFB=-0.0326666;REVB=0.0523578;RO=9;SAF=9;SAR=8;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0527584;STB=0.518498;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0195167;OID=.;OPOS=88730106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:27:9:9:17:18:0.666667:8:9:4:5:9:9:4:5
chr10	88730177	.	A	G	105.22	PASS	AF=0.368421;AO=10;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.00882621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.124;QD=22.1519;RBI=0.0178121;REFB=0.0450245;REVB=-0.0154716;RO=7;SAF=3;SAR=7;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390506;STB=0.705362;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0616271;OID=.;OPOS=88730177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:19:19:7:7:10:7:0.368421:7:3:6:1:4:3:6:1
chr10	88730312	.	T	C	236.6	PASS	AF=0.724138;AO=21;DP=30;FAO=21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0186513;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8647;QD=32.6339;RBI=0.0424177;REFB=-0.010347;REVB=-0.0380971;RO=8;SAF=12;SAR=9;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275661;STB=0.515137;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.00168385;OID=.;OPOS=88730312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:30:29:8:8:21:21:0.724138:9:12:5:3:9:12:5:3
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chr10	88782084	.	A	G	238.56	PASS	AF=0.628571;AO=22;DP=35;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.148852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7945;QD=27.2634;RBI=0.151589;REFB=-0.0596292;REVB=0.0286733;RO=13;SAF=16;SAR=6;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361687;STB=0.519982;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0275801;OID=.;OPOS=88782084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:13:13:22:22:0.628571:6:16:10:3:6:16:10:3
chr10	88782111	.	C	T	75.62	PASS	AF=0.384615;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0410464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.504;QD=11.6341;RBI=0.0411035;REFB=-0.00866768;REVB=-0.00216448;RO=14;SAF=7;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0168865;STB=0.537663;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0181535;OID=.;OPOS=88782111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:14:16:10:10:0.384615:3:7:10:4:3:7:12:4
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chr10	88988115	.	G	A	106.02	PASS	AF=0.304348;AO=12;DP=45;FAO=14;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=0.0348236;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.286;QD=9.21882;RBI=0.0375242;REFB=-0.0259743;REVB=-0.0139779;RO=27;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337339;STB=0.638517;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0720674;OID=.;OPOS=88988115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:27:32:12:14:0.304348:8:4:3:24:9:5:6:26
chr10	88992641	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354597;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.846;QD=44.6898;RBI=0.0513093;REFB=0;REVB=0.0370843;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000428544;OID=.;OPOS=88992641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0
chr10	89267957	.	C	T	1241.22	PASS	AF=0.97619;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0215801;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.357;QD=59.1056;RBI=0.0229502;REFB=0.0468433;REVB=-0.00781112;RO=2;SAF=54;SAR=28;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00792266;STB=0.504184;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=-0.000144567;OID=.;OPOS=89267957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:84:84:2:2:82:82:0.97619:28:54:1:1:28:54:1:1
chr10	89420789	.	A	G	334.52	PASS	AF=0.486486;AO=35;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.0298091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.704;QD=18.0823;RBI=0.0305765;REFB=-0.0272537;REVB=-0.00680755;RO=38;SAF=9;SAR=26;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385035;STB=0.526301;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0275398;OID=.;OPOS=89420789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:38:38:35:36:0.486486:26:9:11:27:27:9:11:27
chr10	89463480	.	G	A	245.65	PASS	AF=0.386667;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=10;FWDB=-0.0376911;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.704;QD=13.1011;RBI=0.0464479;REFB=-0.0173134;REVB=0.0271438;RO=46;SAF=16;SAR=13;SRF=36;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261358;STB=0.647419;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0134521;OID=.;OPOS=89463480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:46:46:29:29:0.386667:13:16:36:10:13:16:36:10
chr10	89624218	.	C	G	398.02	PASS	AF=0.365854;AO=29;DP=85;FAO=30;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.026249;FXX=0.03529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8453;QD=19.4155;RBI=0.0270481;REFB=-0.0266415;REVB=-0.00652576;RO=38;SAF=15;SAR=14;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00910152;STB=0.502911;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0572086;OID=.;OPOS=89624218;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:82:38:39:29:30:0.365854:14:15:20:18:14:16:21:18
chr10	89720907	.	T	G	2267.87	PASS	AF=0.97973;AO=144;DP=148;FAO=145;FDP=148;FR=.;FRO=3;FSAF=72;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0442783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6699;QD=61.2937;RBI=0.0466302;REFB=-0.111207;REVB=0.0146219;RO=4;SAF=72;SAR=72;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012841;STB=0.503308;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.00847063;OID=.;OPOS=89720907;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:148:148:4:3:144:145:0.97973:72:72:1:3:73:72:1:2
chr10	89725861	.	C	T	48.03	PASS	AF=0.111111;AO=11;DP=99;FAO=11;FDP=99;FR=.;FRO=88;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=-0.0215902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.704;QD=1.94063;RBI=0.148823;REFB=0.000148946;REVB=-0.147248;RO=88;SAF=3;SAR=8;SRF=46;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30066;STB=0.72284;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=-0.00858548;OID=.;OPOS=89725861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:99:99:88:88:11:11:0.111111:8:3:46:42:8:3:46:42
chr10	90345429	.	G	A	1084.07	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0559712;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3755;QD=60.226;RBI=0.0568869;REFB=0;REVB=0.0101654;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00133238;OID=.;OPOS=90345429;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:34:38:0:0:34:38:0:0
chr10	90356598	.	A	G	1572.65	PASS	AF=0.990654;AO=105;DP=109;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=82;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0139077;FXX=0.0183469;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3735;QD=58.7907;RBI=0.0210151;REFB=-0.0338145;REVB=-0.0157547;RO=1;SAF=24;SAR=81;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0193588;STB=0.510202;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.000464407;OID=.;OPOS=90356598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:107:1:1:105:106:0.990654:81:24:1:0:82:24:1:0
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chr10	90429652	.	A	G	291.37	PASS	AF=0.463768;AO=32;DP=69;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0141674;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.613;QD=16.8908;RBI=0.0150313;REFB=-0.0152399;REVB=0.00502256;RO=36;SAF=19;SAR=13;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0898931;STB=0.558274;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0223597;OID=.;OPOS=90429652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:36:37:32:32:0.463768:13:19:18:18:13:19:18:19
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chr10	90490921	.	G	A	366.62	PASS	AF=0.544118;AO=36;DP=67;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.00561814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.058;QD=21.5658;RBI=0.0119276;REFB=-0.0209847;REVB=0.0105216;RO=31;SAF=22;SAR=14;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301905;STB=0.511464;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0157514;OID=.;OPOS=90490921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:31:31:36:37:0.544118:14:22:20:11:14:23:20:11
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chr10	90771829	.	T	C	519.67	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0563775;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0598;QD=59.3912;RBI=0.0567305;REFB=0;REVB=-0.00631876;RO=0;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000850822;OID=.;OPOS=90771829;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:26:9:0:0:26:9:0:0
chr10	90966437	.	C	T	288.82	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0386501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7232;QD=16.2715;RBI=0.0403284;REFB=-0.0066169;REVB=-0.0115131;RO=38;SAF=16;SAR=16;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025408;STB=0.507038;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.00539408;OID=.;OPOS=90966437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:38:39:32:32:0.450704:16:16:20:18:16:16:20:19
chr10	90966546	.	C	T	379.44	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0649301;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4212;QD=56.2139;RBI=0.0693516;REFB=0;REVB=0.0243665;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125906;OID=.;OPOS=90966546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:8:19:0:0:8:19:0:0
chr10	90966996	.	C	G	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0284;QD=61.6837;RBI=0.0273844;REFB=0;REVB=-0.0190903;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.579e-06;OID=.;OPOS=90966996;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr10	91007360	.	T	G	165.05	PASS	AF=0.381818;AO=19;DP=53;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0171036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.15;QD=12.0036;RBI=0.0218673;REFB=-0.00551747;REVB=-0.0136251;RO=33;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370945;STB=0.557088;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0147306;OID=.;OPOS=91007360;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:33:34:19:21:0.381818:11:8:15:18:13:8:16:18
chr10	91066460	.	T	A,G	694.65	PASS	AF=0.955556,0.0444444;AO=43,2;DP=45;FAO=43,2;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=19,2;FSAR=24,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00291777,0.0136571;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=206.41,93.5789;QD=61.7465;RBI=0.0119226,0.0234197;REFB=0,0;REVB=0.0115601,-0.0190253;RO=0;SAF=19,2;SAR=24,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000662355,0.069292;OID=.,.;OPOS=91066460,91066460;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:45:45:0:0:43,2:43,2:0.955556,0.0444444:24,0:19,2:0:0:24,0:19,2:0:0
chr10	91066769	.	C	A	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.812;QD=57.3849;RBI=0.0215778;REFB=0;REVB=-0.0151788;RO=0;SAF=35;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.09007e-05;OID=.;OPOS=91066769;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:22:35:0:0:22:35:0:0
chr10	91067595	.	C	G	1597.1	PASS	AF=0.99;AO=82;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=67;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.314;QD=63.8841;RBI=0.0446485;REFB=0;REVB=0.0365342;RO=0;SAF=55;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000571361;OID=.;OPOS=91067595;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:100:0:0:82:99:0.99:27:55:0:0:32:67:0:0
chr10	91099630	.	T	C	179.03	PASS	AF=0.5625;AO=17;DP=31;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0172146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.656;QD=22.3786;RBI=0.043664;REFB=-0.0293594;REVB=-0.0401273;RO=14;SAF=6;SAR=11;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123214;STB=0.549944;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0175742;OID=.;OPOS=91099630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:14:14:17:18:0.5625:11:6:7:7:11:7:7:7
chr10	91099943	.	C	G	769.76	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.608;QD=57.0195;RBI=0.0625507;REFB=0;REVB=0.0558827;RO=0;SAF=45;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.07122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170936;OID=.;OPOS=91099943;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:7:45:0:0:7:47:0:0
chr10	91100068	.	C	A	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0369027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.859;QD=15.293;RBI=0.0380341;REFB=0.0232091;REVB=-0.00920772;RO=9;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112036;STB=0.565081;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.0193294;OID=.;OPOS=91100068;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:3:6:7:2:3:6:7:2
chr10	91143529	.	T	A	972.86	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.104;QD=58.9612;RBI=0.0227351;REFB=0;REVB=0.0169122;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.63136e-06;OID=.;OPOS=91143529;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:33:33:0:0:33:33:0:0
chr10	91162497	.	A	G	362.84	PASS	AF=0.875;AO=28;DP=32;FAO=28;FDP=32;FR=.;FRO=4;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0053789;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=275.305;QD=45.3545;RBI=0.00579855;REFB=-0.092978;REVB=0.0021658;RO=3;SAF=14;SAR=14;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299205;STB=0.531228;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.00112497;OID=.;OPOS=91162497;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:32:32:3:4:28:28:0.875:14:14:1:2:14:14:1:3
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chr10	91178000	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.609;QD=56.7063;RBI=0.0339597;REFB=0;REVB=-0.0155679;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.8803e-05;OID=.;OPOS=91178000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
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chr10	91352966	.	G	A	1301.78	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0688727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3356;QD=61.9895;RBI=0.0713759;REFB=0;REVB=0.0187367;RO=0;SAF=39;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000296628;OID=.;OPOS=91352966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:45:39:0:0:45:39:0:0
chr10	91404448	.	C	G	70.58	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0463138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.989;QD=17.6438;RBI=0.0548896;REFB=-0.0376634;REVB=0.0294602;RO=7;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186168;STB=0.608447;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0239612;OID=.;OPOS=91404448;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:6:3:4:3:6:3:4:3
chr10	91470834	.	A	C	145.24	PASS	AF=0.404762;AO=16;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.105148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2329;QD=13.8324;RBI=0.105155;REFB=-0.0298003;REVB=-0.00124595;RO=26;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0948443;STB=0.578852;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0753895;OID=.;OPOS=91470834;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:25:16:17:0.404762:6:10:14:12:6:11:13:12
chr10	91484780	.	G	A	349.02	PASS	AF=0.463415;AO=35;DP=80;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.00660346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.617;QD=17.0251;RBI=0.00661043;REFB=-0.0128794;REVB=0.000303413;RO=44;SAF=17;SAR=18;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366153;STB=0.512189;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0161573;OID=.;OPOS=91484780;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:82:44:44:35:38:0.463415:18:17:23:21:19:19:23:21
chr10	91497631	.	T	A	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0440982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.763;QD=12.7823;RBI=0.0441587;REFB=-0.00353242;REVB=-0.0023098;RO=14;SAF=1;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330288;STB=0.702621;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0030663;OID=.;OPOS=91497631;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:9:1:4:10:9:1:4:10
chr10	91497902	.	C	CTAAAAG	250.51	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=85;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=34;FWDB=0.0013861;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=6;MLLD=269.145;QD=12.5256;RBI=0.00957102;REFB=-0.0124638;REVB=-0.00947012;RO=52;SAF=18;SAR=9;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391796;STB=0.709543;STBP=0.007;TYPE=ins;VARB=0.0304793;OID=.;OPOS=91497903;OREF=-;OALT=TAAAAG;OMAPALT=CTAAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375:27:85:30:80:50:20:10:16:34:99:52:18:9:16:36
chr10	91498127	.	T	C	83.08	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00140664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.08;QD=9.49515;RBI=0.0122655;REFB=0.0097438;REVB=0.0121845;RO=24;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980574;STB=0.559478;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=-0.0540802;OID=.;OPOS=91498127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:5:6:11:13:5:6:11:13
chr10	91498254	.	A	G	112.22	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0210874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.754;QD=16.6258;RBI=0.0283469;REFB=-0.0165164;REVB=0.0189439;RO=14;SAF=3;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144167;STB=0.583803;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0251182;OID=.;OPOS=91498254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:10:3:5:9:10:3:5:9
chr10	91498318	.	A	G	85.04	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.00236355;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.135;QD=22.6785;RBI=0.0432749;REFB=-0.0094627;REVB=0.0432103;RO=5;SAF=2;SAR=8;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00553802;OID=.;OPOS=91498318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:8:2:1:4:8:2:1:4
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chr10	92456074	.	C	T	324.82	PASS	AF=0.378641;AO=39;DP=103;FAO=39;FDP=103;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=35;FWDB=-0.013159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.193;QD=12.6145;RBI=0.0353856;REFB=-0.00854552;REVB=-0.0328479;RO=63;SAF=24;SAR=15;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169451;STB=0.601451;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0127089;OID=.;OPOS=92456074;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:63:64:39:39:0.378641:15:24:29:34:15:24:29:35
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chr10	92503619	.	T	C	200.8	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.018688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.993;QD=15.1544;RBI=0.0523757;REFB=-0.00848416;REVB=0.0489282;RO=30;SAF=10;SAR=13;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13075;STB=0.574404;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0183721;OID=.;OPOS=92503619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:13:10:17:13:13:10:17:13
chr10	92912593	.	C	T	39.4	PASS	AF=0.0722892;AO=9;DP=82;FAO=6;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=71;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=43;FSRR=28;FWDB=-0.0197966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.3038;QD=1.89873;RBI=0.193228;REFB=-0.00876861;REVB=-0.192211;RO=60;SAF=4;SAR=5;SRF=39;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248471;STB=0.56054;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0888868;OID=.;OPOS=92912593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:82:83:60:71:9:6:0.0722892:5:4:39:21:2:4:43:28
chr10	93608142	.	G	A	386.98	PASS	AF=0.686275;AO=35;DP=51;FAO=35;FDP=51;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0115197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.772;QD=30.3515;RBI=0.0217231;REFB=0.0217169;REVB=0.0184171;RO=16;SAF=17;SAR=18;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151956;STB=0.582543;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.0104029;OID=.;OPOS=93608142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:16:16:35:35:0.686275:18:17:12:4:18:17:12:4
chr10	93667635	.	C	T	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538825;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.345;QD=62.3509;RBI=0.0576286;REFB=0;REVB=0.0204383;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161902;OID=.;OPOS=93667635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr10	93841227	.	A	G	1314.96	PASS	AF=1;AO=80;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132293;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.62;QD=61.8805;RBI=0.13729;REFB=0;REVB=0.0367033;RO=0;SAF=23;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.96953e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258899;OID=.;OPOS=93841227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:85:0:0:80:85:1:57:23:0:0:58:27:0:0
chr10	93999850	.	A	G	74.23	PASS	AF=0.37037;AO=7;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.00344979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.539;QD=10.9964;RBI=0.0631002;REFB=-0.0101422;REVB=0.0630058;RO=17;SAF=5;SAR=2;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114368;STB=0.504416;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.0267187;OID=.;OPOS=93999850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:27:17:17:7:10:0.37037:2:5:12:5:3:7:12:5
chr10	94264625	.	C	T	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0477326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.067;QD=14.6579;RBI=0.0478232;REFB=-0.0212502;REVB=-0.00294276;RO=17;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279278;STB=0.662901;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.020514;OID=.;OPOS=94264625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:9:4:10:7:9:4:10:7
chr10	94594565	.	G	A	123.1	PASS	AF=0.307692;AO=16;DP=53;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0333003;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.182;QD=9.46895;RBI=0.0415215;REFB=0.00720734;REVB=-0.0248019;RO=35;SAF=12;SAR=4;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232396;STB=0.65197;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.0220453;OID=.;OPOS=94594565;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:35:36:16:16:0.307692:4:12:20:15:4:12:20:16
chr10	94695617	.	C	T	670.07	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.033;QD=62.3318;RBI=0.0330692;REFB=0;REVB=0.0269455;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2539e-05;OID=.;OPOS=94695617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:26:17:0:0:26:17:0:0
chr10	94822686	.	C	T	516.84	PASS	AF=0.519231;AO=54;DP=105;FAO=54;FDP=104;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0132291;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.0976;QD=19.8784;RBI=0.02203;REFB=-0.00351014;REVB=0.0176156;RO=49;SAF=27;SAR=27;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264386;STB=0.528836;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00312787;OID=.;OPOS=94822686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:49:50:54:54:0.519231:27:27:26:23:27:27:28:22
chr10	95072906	.	T	C	1254.45	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00645684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.392;QD=61.1928;RBI=0.00857256;REFB=0;REVB=0.00563897;RO=0;SAF=52;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45212e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143345;OID=.;OPOS=95072906;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:29:52:0:0:29:53:0:0
chr10	95168634	.	A	G	306.56	PASS	AF=0.37234;AO=35;DP=94;FAO=35;FDP=94;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.0272481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5989;QD=13.0451;RBI=0.0293555;REFB=-0.00323255;REVB=-0.010922;RO=58;SAF=26;SAR=9;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253094;STB=0.652111;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.00698692;OID=.;OPOS=95168634;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:58:59:35:35:0.37234:9:26:31:27:9:26:31:28
chr10	95237963	.	A	G	1432.65	PASS	AF=0.96875;AO=93;DP=96;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00297097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5878;QD=59.6936;RBI=0.0407002;REFB=-0.0033228;REVB=0.0405916;RO=2;SAF=29;SAR=64;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014585;STB=0.511448;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.000996042;OID=.;OPOS=95237963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:96:96:2:3:93:93:0.96875:64:29:0:2:64:29:0:3
chr10	95259979	.	C	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0080543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6653;QD=50.4134;RBI=0.0105837;REFB=0;REVB=0.00686609;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00047916;OID=.;OPOS=95259979;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr10	95262981	.	A	G	740.37	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5673;QD=56.9512;RBI=0.109918;REFB=0;REVB=0.108506;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112626;OID=.;OPOS=95262981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0
chr10	95279506	.	A	T	200.79	PASS	AF=0.362319;AO=25;DP=70;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.000386154;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.516;QD=11.6398;RBI=0.00361788;REFB=-0.00700461;REVB=-0.00359721;RO=44;SAF=14;SAR=11;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162176;STB=0.509382;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.0120981;OID=.;OPOS=95279506;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:44:44:25:25:0.362319:11:14:24:20:11:14:24:20
chr10	95279653	.	A	G	734.37	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0456003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5651;QD=61.1976;RBI=0.068409;REFB=-0.139858;REVB=0.0509941;RO=1;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159432;STB=0.508471;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00317113;OID=.;OPOS=95279653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:29:18:0:1:29:18:0:1
chr10	95326676	.	C	T	113.92	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0323974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.056;QD=18.2267;RBI=0.032408;REFB=-0.0749884;REVB=-0.000827634;RO=12;SAF=9;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304683;STB=0.674727;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0260075;OID=.;OPOS=95326676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:4:9:4:8:4:9:4:8
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chr10	95518520	.	C	CT,T	37.95	PASS	AF=0.140625,0;AO=11,3;DP=65;FAO=9,0;FDP=64;FR=.;FRO=55;FSAF=4,0;FSAR=5,0;FSRF=49;FSRR=6;FWDB=-0.182868,-0.0963309;FXX=0.0153822;HRUN=3,2;LEN=1,1;MLLD=13.5762,30.8574;QD=2.37163;RBI=0.185225,0.117242;REFB=-0.0444666,-0.022569;REVB=-0.0294523,-0.0668283;RO=51;SAF=9,0;SAR=2,3;SRF=45;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.156208,-0.734446;STB=0.857183,0.5;STBP=0.187,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0975252,0;OID=.,.;OPOS=95518521,95518520;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:65:64:51:55:11,3:9,0:0.140625,0:2,3:9,0:45:6:5,0:4,0:49:6
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chr10	96295165	.	A	G	656.71	PASS	AF=0.561404;AO=64;DP=114;FAO=64;FDP=114;FR=.;FRO=50;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=16;FWDB=0.016324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8385;QD=23.0426;RBI=0.0166865;REFB=-0.0243618;REVB=0.00345934;RO=50;SAF=39;SAR=25;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0604471;STB=0.532992;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0206552;OID=.;OPOS=96295165;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:50:50:64:64:0.561404:25:39:34:16:25:39:34:16
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chr10	97106165	.	T	C	1301.33	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164928;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.4648;QD=61.2391;RBI=0.020767;REFB=0;REVB=0.0126197;RO=0;SAF=50;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06517e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239498;OID=.;OPOS=97106165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:34:50:0:0:34:51:0:0
chr10	97116219	.	C	T	281.25	PASS	AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00644922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2048;QD=21.2267;RBI=0.0692093;REFB=-0.0109963;REVB=0.0689081;RO=24;SAF=9;SAR=20;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216776;STB=0.51204;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.00858448;OID=.;OPOS=97116219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:20:9:8:16:20:9:8:16
chr10	97127462	.	C	A	306.75	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.626;QD=53.3482;RBI=0.0451717;REFB=0;REVB=0.00692604;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266237;OID=.;OPOS=97127462;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:13:9:0:0:13:10:0:0
chr10	97141523	.	G	A	807.41	PASS	AF=1;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0567112;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5861;QD=57.6721;RBI=0.0571697;REFB=0;REVB=-0.00722618;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000263055;OID=.;OPOS=97141523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
chr10	97174164	.	A	G	500.5	PASS	AF=0.494949;AO=46;DP=96;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=37;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=-0.00611935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.914;QD=20.222;RBI=0.021369;REFB=-0.0510585;REVB=0.020474;RO=50;SAF=36;SAR=10;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173246;STB=0.572724;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0560666;OID=.;OPOS=97174164;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:99:50:50:46:49:0.494949:10:36:32:18:12:37:32:18
chr10	97192324	.	A	G	2338.7	PASS	AF=0.986667;AO=148;DP=150;FAO=148;FDP=150;FR=.;FRO=2;FSAF=78;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00266256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.579;QD=62.3653;RBI=0.00931574;REFB=-0.0176855;REVB=0.00892714;RO=2;SAF=78;SAR=70;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00068739;STB=0.500361;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.000233116;OID=.;OPOS=97192324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:150:150:2:2:148:148:0.986667:70:78:1:1:70:78:1:1
chr10	97380926	.	G	A	208.65	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0139683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7746;QD=18.1435;RBI=0.0345423;REFB=-0.0121377;REVB=0.0315921;RO=24;SAF=12;SAR=9;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220951;STB=0.634023;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0100845;OID=.;OPOS=97380926;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:25:21:21:0.456522:9:12:8:16:9:12:8:17
chr10	97447373	.	A	T	2375.9	PASS	AF=0.993711;AO=157;DP=159;FAO=158;FDP=159;FR=.;FRO=1;FSAF=110;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0283239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.229;QD=59.7709;RBI=0.0512242;REFB=-0.155963;REVB=0.042681;RO=0;SAF=110;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505154;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00057473;OID=.;OPOS=97447373;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:159:159:0:1:157:158:0.993711:47:110:0:0:48:110:0:1
chr10	97698370	.	C	T	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.692;QD=57.0008;RBI=0.0313009;REFB=0;REVB=0.0247922;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.14002e-05;OID=.;OPOS=97698370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr10	97817650	.	G	T	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00190986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.378;QD=58.6005;RBI=0.0834211;REFB=0;REVB=0.0833992;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013821;OID=.;OPOS=97817650;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:23:41:0:0:23:41:0:0
chr10	97872580	.	C	T	297.05	PASS	AF=0.757576;AO=25;DP=33;FAO=25;FDP=33;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0128172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.615;QD=36.0061;RBI=0.0129128;REFB=-0.0426196;REVB=-0.00156807;RO=8;SAF=5;SAR=20;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0540699;STB=0.529389;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0127503;OID=.;OPOS=97872580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:33:33:8:8:25:25:0.757576:20:5:1:7:20:5:1:7
chr10	97920062	.	G	A	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.686;QD=57.7123;RBI=0.0113817;REFB=0;REVB=0.0007971;RO=0;SAF=38;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22967e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.22542e-06;OID=.;OPOS=97920062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:21:38:0:0:21:38:0:0
chr10	97920099	.	T	TC	699.99	PASS	AF=1;AO=58;DP=62;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.7394;QD=47.4571;RBI=0.17838;REFB=0;REVB=0.170558;RO=3;SAF=33;SAR=25;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409724;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00443813;OID=.;OPOS=97920100;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:58:62:59:59:0:34:25:0:0:12:3:33:25:3:0
chr10	98078127	.	C	T	1172.31	PASS	AF=0.9875;AO=76;DP=79;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00757019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.862;QD=58.6157;RBI=0.0175059;REFB=-0.125128;REVB=0.0157844;RO=3;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333705;STB=0.505617;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000742186;OID=.;OPOS=98078127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:80:3:1:76:79:0.9875:41:35:0:3:44:35:0:1
chr10	98078239	.	A	G	1115.46	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0759;QD=60.2949;RBI=0.0720367;REFB=0;REVB=0.0691882;RO=0;SAF=25;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00073165;OID=.;OPOS=98078239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:49:25:0:0:49:25:0:0
chr10	98287261	.	G	C	90.12	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=22;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=8;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0226588;FXX=0.0434594;HRUN=6;LEN=1;MLLD=144.421;QD=16.3846;RBI=0.0359216;REFB=-0.0303713;REVB=-0.0278737;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26538;STB=0.624687;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0356296;OID=.;OPOS=98287261;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:24:22:7:8:8:8:0.363636:5:3:5:2:5:3:5:3
chr10	98287792	.	G	T	187.81	PASS	AF=0.666667;AO=18;DP=27;FAO=18;FDP=27;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0167377;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.924;QD=27.824;RBI=0.121013;REFB=-0.0237473;REVB=-0.11985;RO=9;SAF=9;SAR=9;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333351;STB=0.518498;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0129355;OID=.;OPOS=98287792;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:27:27:9:9:18:18:0.666667:9:9:5:4:9:9:5:4
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chr10	98354373	.	T	C	120.03	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00861336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.422;QD=14.1214;RBI=0.0337134;REFB=0.0094263;REVB=-0.0325945;RO=20;SAF=5;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462575;STB=0.526988;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.0149955;OID=.;OPOS=98354373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:9:5:8:12:9:5:8:12
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chr10	98808866	.	C	G	792.06	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.846;QD=56.5759;RBI=0.0338055;REFB=0;REVB=-0.0184835;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119464;OID=.;OPOS=98808866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:29:25:0:0:29:27:0:0
chr10	98819317	.	A	G	801.3	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0685129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.56;QD=57.236;RBI=0.0685201;REFB=0;REVB=0.000989889;RO=0;SAF=14;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.47831e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61443e-05;OID=.;OPOS=98819317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:41:14:0:0:41:15:0:0
chr10	98901433	.	C	T	2035.81	PASS	AF=0.890909;AO=146;DP=164;FAO=147;FDP=165;FR=.;FRO=18;FSAF=95;FSAR=52;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0019035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.8483;QD=49.3529;RBI=0.00539751;REFB=-0.0183658;REVB=-0.00505072;RO=18;SAF=94;SAR=52;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178552;STB=0.509109;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0012207;OID=.;OPOS=98901433;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:164:165:18:18:146:147:0.890909:52:94:13:5:52:95:13:5
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chr10	98901468	.	T	C	83.45	PASS	AF=0.112821;AO=21;DP=195;FAO=22;FDP=195;FR=.;FRO=173;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=101;FSRR=72;FWDB=-0.0479453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.768;QD=1.71183;RBI=0.0482016;REFB=-0.00586654;REVB=-0.00496428;RO=173;SAF=12;SAR=9;SRF=101;SRR=72;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155261;STB=0.534501;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.043185;OID=.;OPOS=98901468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:195:195:173:173:21:22:0.112821:9:12:101:72:10:12:101:72
chr10	98901472	.	C	T	264.38	PASS	AF=0.216495;AO=42;DP=196;FAO=42;FDP=194;FR=.;FRO=152;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=98;FSRR=54;FWDB=-0.0794591;FXX=0.0152277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.579;QD=5.45113;RBI=0.105035;REFB=-0.0263529;REVB=-0.0686925;RO=149;SAF=13;SAR=29;SRF=96;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409486;STB=0.748843;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0757409;OID=.;OPOS=98901472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:196:194:149:152:42:42:0.216495:29:13:96:53:29:13:98:54
chr10	98901482	.	T	C	56.71	PASS	AF=0.0932642;AO=18;DP=192;FAO=18;FDP=193;FR=.;FRO=175;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=96;FSRR=79;FWDB=-0.0197994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2839;QD=1.17538;RBI=0.0418092;REFB=-0.00236641;REVB=0.0368238;RO=174;SAF=10;SAR=8;SRF=95;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114576;STB=0.506396;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0151379;OID=.;OPOS=98901482;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:192:193:174:175:18:18:0.0932642:8:10:95:79:8:10:96:79
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chr10	98901498	.	C	T	65.64	PASS	AF=0.104046;AO=18;DP=172;FAO=18;FDP=173;FR=.;FRO=155;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=74;FSRR=81;FWDB=-0.102136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.344;QD=1.51762;RBI=0.127518;REFB=-0.00709345;REVB=-0.0763492;RO=151;SAF=12;SAR=6;SRF=73;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222701;STB=0.669043;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.133852;OID=.;OPOS=98901498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:172:173:151:155:18:18:0.104046:6:12:73:78:6:12:74:81
chr10	98901503	.	C	T	48.9	PASS	AF=0.0877193;AO=15;DP=171;FAO=15;FDP=171;FR=.;FRO=156;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=74;FSRR=82;FWDB=-0.0821377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0886;QD=1.14388;RBI=0.106916;REFB=-0.00501613;REVB=-0.0684426;RO=156;SAF=11;SAR=4;SRF=74;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299931;STB=0.735301;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0455632;OID=.;OPOS=98901503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:171:171:156:156:15:15:0.0877193:4:11:74:82:4:11:74:82
chr10	98901514	.	G	A	116.64	PASS	AF=0.151316;AO=23;DP=152;FAO=23;FDP=152;FR=.;FRO=129;FSAF=1;FSAR=22;FSRF=67;FSRR=62;FWDB=-0.0718489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.105;QD=3.06943;RBI=0.0720915;REFB=-0.00598654;REVB=0.0059101;RO=128;SAF=1;SAR=22;SRF=66;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.652426;STB=0.946411;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0258236;OID=.;OPOS=98901514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:152:128:129:23:23:0.151316:22:1:66:62:22:1:67:62
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chr10	99080871	.	G	T	82.29	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=17;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0480099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8144;QD=19.3633;RBI=0.070079;REFB=0.00343748;REVB=0.0510501;RO=7;SAF=4;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0871479;STB=0.549903;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0032636;OID=.;OPOS=99080871;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:7:7:10:10:0.588235:6:4:2:5:6:4:2:5
chr10	99081531	.	G	GA	98.74	PASS	AF=0.555556;AO=12;DP=28;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0122572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.2008;QD=14.6277;RBI=0.0507031;REFB=-0.0483962;REVB=0.0491992;RO=14;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270556;STB=0.58812;STBP=0.344;TYPE=ins;VARB=0.0470024;OID=.;OPOS=99081532;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.555556:12:28:15:27:12:8:7:4:8:70:14:7:5:4:10
chr10	99092540	.	G	A	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0307011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7022;QD=12.7286;RBI=0.0448582;REFB=-0.0326316;REVB=-0.0327063;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453824;STB=0.764191;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0437025;OID=.;OPOS=99092540;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:6:3:10:2:6:3:10:2
chr10	99125949	.	C	T	428.93	PASS	AF=0.440367;AO=48;DP=109;FAO=48;FDP=109;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=-0.00422113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.911;QD=15.7406;RBI=0.00702019;REFB=-0.029123;REVB=-0.00560938;RO=61;SAF=25;SAR=23;SRF=35;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0531527;STB=0.529738;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0407305;OID=.;OPOS=99125949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:61:61:48:48:0.440367:23:25:35:26:23:25:35:26
chr10	99129230	.	T	C	173.73	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0164381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.54;QD=12.8686;RBI=0.050404;REFB=-0.00987337;REVB=-0.0476483;RO=33;SAF=16;SAR=5;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230708;STB=0.634517;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0115171;OID=.;OPOS=99129230;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:5:16:19:14:5:16:19:14
chr10	99160965	.	A	G	704.76	PASS	AF=1;AO=37;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4105;QD=62.6451;RBI=0.166659;REFB=0;REVB=-0.101731;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000241178;OID=.;OPOS=99160965;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:37:45:1:18:19:0:0:19:26:0:0
chr10	99205686	.	A	G	256.0	PASS	AF=0.491228;AO=27;DP=56;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0197;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.217;QD=17.9647;RBI=0.025617;REFB=-0.0133043;REVB=0.016375;RO=29;SAF=7;SAR=20;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292952;STB=0.645053;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00755467;OID=.;OPOS=99205686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:29:29:27:28:0.491228:20:7:16:13:20:8:16:13
chr10	99220707	.	C	T	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026474;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.4029;QD=56.1882;RBI=0.031483;REFB=0;REVB=0.0170384;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000946397;OID=.;OPOS=99220707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:9:19:0:0:9:19:0:0
chr10	99225846	.	C	T	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0299183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.989;QD=18.8859;RBI=0.0422112;REFB=0.00291363;REVB=-0.0297771;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199671;STB=0.615111;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.00886465;OID=.;OPOS=99225846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:4:4:1:4:4:4:1:4
chr10	99240758	.	G	C	2046.61	PASS	AF=1;AO=130;DP=130;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.941;QD=62.492;RBI=0.0318458;REFB=0;REVB=0.0264219;RO=0;SAF=79;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.86222e-05;OID=.;OPOS=99240758;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:131:0:0:130:131:1:51:79:0:0:51:80:0:0
chr10	99337572	.	G	A	1283.26	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0864;QD=61.8437;RBI=0.0760671;REFB=0;REVB=0.0739254;RO=0;SAF=52;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00036635;OID=.;OPOS=99337572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:82:83:1:30:52:0:0:30:53:0:0
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chr10	99504630	.	G	T	163.93	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0065264;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8421;QD=19.8704;RBI=0.0378467;REFB=-0.0036672;REVB=0.0372797;RO=17;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109612;STB=0.550504;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00420302;OID=.;OPOS=99504630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:17:16:17:17:0.515152:10:7:5:12:10:7:5:11
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chr10	99991408	.	A	G	1566.29	PASS	AF=1;AO=95;DP=98;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559427;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.512;QD=63.2846;RBI=0.0587161;REFB=0;REVB=0.0178323;RO=1;SAF=51;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106552;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165697;OID=.;OPOS=99991408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:99:1:0:95:99:1:44:51:0:1:48:51:0:0
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chr10	101445591	.	A	C	593.74	PASS	AF=0.5625;AO=52;DP=94;FAO=54;FDP=96;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00862444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.672;QD=24.7391;RBI=0.0127338;REFB=-0.00595253;REVB=-0.00936843;RO=42;SAF=23;SAR=29;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0666544;STB=0.526652;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00481422;OID=.;OPOS=101445591;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:96:42:42:52:54:0.5625:29:23:22:20:29:25:22:20
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chr10	101473218	.	A	G	88.06	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0344133;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.7982;QD=14.0903;RBI=0.0496922;REFB=-0.013349;REVB=-0.0358474;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134192;STB=0.578801;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0163252;OID=.;OPOS=101473218;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:4:7:7:7:4:7:7:7
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chr10	101544447	.	A	T	1712.74	PASS	AF=1;AO=109;DP=110;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.033;QD=60.6279;RBI=0.0384178;REFB=0;REVB=0.00349179;RO=0;SAF=61;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.38896e-05;OID=.;OPOS=101544447;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:113:0:0:109:113:1:48:61:0:0:48:65:0:0
chr10	101604207	.	C	T	141.6	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.0294724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8552;QD=13.172;RBI=0.029485;REFB=0.0137321;REVB=0.00086018;RO=25;SAF=15;SAR=1;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.418078;STB=0.773732;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=-0.0350756;OID=.;OPOS=101604207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:27:16:16:0.372093:1:15:19:6:1:15:20:7
chr10	101639616	.	C	T	358.1	PASS	AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0166289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.699;QD=22.3815;RBI=0.0192563;REFB=-0.0178354;REVB=0.00971005;RO=28;SAF=18;SAR=18;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11348;STB=0.562466;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0111686;OID=.;OPOS=101639616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:28:28:36:36:0.5625:18:18:18:10:18:18:18:10
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chr10	102265847	.	A	C	192.98	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0140393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.437;QD=16.4242;RBI=0.0145716;REFB=-0.00408316;REVB=-0.00390238;RO=27;SAF=13;SAR=7;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278663;STB=0.659461;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00697174;OID=.;OPOS=102265847;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:7:13:10:17:7:13:10:17
chr10	102267277	.	T	TA	68.55	PASS	AF=0.40625;AO=12;DP=33;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0165782;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.5456;QD=8.56872;RBI=0.0248214;REFB=0.0179913;REVB=0.0184734;RO=19;SAF=9;SAR=3;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147809;STB=0.505609;STBP=0.975;TYPE=ins;VARB=-0.0325876;OID=.;OPOS=102267278;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.40625:12:33:13:32:19:9:4:13:6:68:19:9:3:12:7
chr10	102269085	.	C	A	246.69	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0159935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.144;QD=15.9154;RBI=0.0233685;REFB=-0.00989644;REVB=-0.0170381;RO=33;SAF=22;SAR=6;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277338;STB=0.668376;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0174154;OID=.;OPOS=102269085;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:34:28:28:0.451613:6:22:18:15:6:22:18:16
chr10	102269206	.	A	G	251.04	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0121066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.18;QD=19.6894;RBI=0.0125171;REFB=-0.00273124;REVB=-0.00317945;RO=25;SAF=6;SAR=20;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22127;STB=0.624896;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00224372;OID=.;OPOS=102269206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:20:6:11:14:20:6:11:14
chr10	102506070	.	G	C	3941.9	PASS	AF=0.98062;AO=180;DP=259;FAO=253;FDP=258;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=147;FSAR=106;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.258316;FXX=0.00386085;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.174;QD=61.1147;RBI=0.262174;REFB=0;REVB=-0.0448146;RO=0;SAF=75;SAR=105;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135254;OID=.;OPOS=102506070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:259:258:0:0:180:253:0.98062:105:75:0:0:106:147:0:0
chr10	102734778	.	C	G	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00685336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.543;QD=58.2393;RBI=0.0495254;REFB=0;REVB=-0.0490489;RO=0;SAF=42;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.61451e-05;OID=.;OPOS=102734778;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:20:42:0:0:20:42:0:0
chr10	102745062	.	G	T	1659.88	PASS	AF=0.950413;AO=114;DP=121;FAO=115;FDP=121;FR=.;FRO=6;FSAF=59;FSAR=56;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0173744;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.734;QD=54.8719;RBI=0.024164;REFB=-0.109418;REVB=-0.0167937;RO=3;SAF=59;SAR=55;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00897247;STB=0.500647;STBP=0.927;TYPE=snp;VARB=0.00110353;OID=.;OPOS=102745062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:121:121:3:6:114:115:0.950413:55:59:1:2:56:59:3:3
chr10	102746503	.	C	T	262.98	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0186211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.538;QD=47.8151;RBI=0.029083;REFB=-0.105592;REVB=0.02234;RO=0;SAF=16;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78933e-08;STB=0.515137;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.00114835;OID=.;OPOS=102746503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:0:1:21:21:0.954545:5:16:0:0:5:16:1:0
chr10	102750623	.	T	C	755.92	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.063075;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.196;QD=57.0505;RBI=0.0666527;REFB=0;REVB=0.0215434;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235019;OID=.;OPOS=102750623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:27:26:0:0:27:26:0:0
chr10	102750783	.	C	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0710532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.993;QD=52.6131;RBI=0.0731399;REFB=0;REVB=0.0173462;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227463;OID=.;OPOS=102750783;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr10	102766574	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0578092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.661;QD=62.6705;RBI=0.061026;REFB=0;REVB=-0.0195516;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000509388;OID=.;OPOS=102766574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0
chr10	102767574	.	A	T	66.92	PASS	AF=0.218182;AO=14;DP=52;FAO=12;FDP=55;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=33;FWDB=0.0676289;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=42.0192;QD=4.86661;RBI=0.0745817;REFB=-0.0025085;REVB=-0.0314445;RO=30;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269795;STB=0.655515;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0548343;OID=.;OPOS=102767574;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:52:55:30:43:14:12:0.218182:7:7:8:22:7:5:10:33
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chr10	102770327	.	A	G	689.29	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000266385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.592;QD=62.6624;RBI=0.0670412;REFB=0;REVB=-0.0670407;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000245572;OID=.;OPOS=102770327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:17:27:0:0:17:27:0:0
chr10	102796499	.	G	C,GC	31.27	PASS	AF=0,0.127451;AO=6,14;DP=103;FAO=0,13;FDP=102;FR=.;FRO=89;FSAF=0,3;FSAR=0,10;FSRF=31;FSRR=58;FWDB=-0.00323272,-0.0258445;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=40.4275,21.474;QD=1.22625;RBI=0.0938635,0.137549;REFB=-0.020612,-0.0437215;REVB=-0.0938078,-0.135099;RO=83;SAF=0,3;SAR=6,11;SRF=32;SRR=51;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.491028,-0.247337;STB=0.5,0.624792;STBP=1,0.408;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.159132;OID=.,.;OPOS=102796499,102796500;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:31:103:102:83:89:6,14:0,13:0,0.127451:6,11:0,3:32:51:0,10:0,3:31:58
chr10	102925957	.	A	G	181.43	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0335793;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.984;QD=22.679;RBI=0.0335801;REFB=-0.0211274;REVB=0.000233247;RO=14;SAF=14;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312556;STB=0.677205;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0163058;OID=.;OPOS=102925957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:4:14:6:8:4:14:6:8
chr10	103124606	.	A	G	4799.95	PASS	AF=0.865337;AO=347;DP=401;FAO=347;FDP=401;FR=.;FRO=54;FSAF=106;FSAR=241;FSRF=23;FSRR=31;FWDB=0.00591119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.867;QD=47.8798;RBI=0.00660307;REFB=0.0052886;REVB=-0.0029425;RO=54;SAF=106;SAR=241;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356811;STB=0.518832;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.000163233;OID=.;OPOS=103124606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:401:401:54:54:347:347:0.865337:241:106:23:31:241:106:23:31
chr10	103124647	.	A	G	5020.77	PASS	AF=0.859857;AO=361;DP=421;FAO=362;FDP=421;FR=.;FRO=59;FSAF=113;FSAR=249;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=-0.000645924;FXX=0.00236961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.872;QD=47.7033;RBI=0.00449683;REFB=-0.0175892;REVB=0.00445019;RO=59;SAF=112;SAR=249;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039893;STB=0.520645;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00269824;OID=.;OPOS=103124647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:421:421:59:59:361:362:0.859857:249:112:26:33:249:113:26:33
chr10	103124689	.	A	G	48.04	PASS	AF=0.0638889;AO=20;DP=360;FAO=23;FDP=360;FR=.,HEALED;FRO=337;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=120;FSRR=217;FWDB=-0.0574682;FXX=0.00552471;HRUN=5;LEN=1;MLLD=46.7111;QD=0.533792;RBI=0.0609908;REFB=0.00197322;REVB=0.0204275;RO=285;SAF=4;SAR=16;SRF=89;SRR=196;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151137;STB=0.603965;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=-0.0384169;OID=.;OPOS=103124689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:360:360:285:337:20:23:0.0638889:16:4:89:196:17:6:120:217
chr10	103124696	.	T	C	4103.64	PASS	AF=0.855524;AO=286;DP=339;FAO=302;FDP=353;FR=.;FRO=51;FSAF=103;FSAR=199;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0504034;FXX=0.00282478;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.065;QD=46.5002;RBI=0.0509892;REFB=-0.0137057;REVB=0.0077066;RO=50;SAF=100;SAR=186;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155162;STB=0.508169;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.000936269;OID=.;OPOS=103124696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:339:353:50:51:286:302:0.855524:186:100:20:30:199:103:20:31
chr10	103124715	.	A	G	3413.91	PASS	AF=0.840532;AO=231;DP=279;FAO=253;FDP=301;FR=.;FRO=48;FSAF=97;FSAR=156;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.0644869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.613;QD=45.3676;RBI=0.0708529;REFB=-0.0403601;REVB=0.0293527;RO=48;SAF=75;SAR=156;SRF=19;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0261066;STB=0.502095;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.00511949;OID=.;OPOS=103124715;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:279:301:48:48:231:253:0.840532:156:75:19:29:156:97:19:29
chr10	103124726	.	A	G	2365.48	PASS	AF=0.827907;AO=177;DP=214;FAO=178;FDP=215;FR=.;FRO=37;FSAF=82;FSAR=96;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0564276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.612;QD=44.0089;RBI=0.0694085;REFB=-0.0345775;REVB=0.0404161;RO=36;SAF=81;SAR=96;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136014;STB=0.504466;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0034879;OID=.;OPOS=103124726;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:214:215:36:37:177:178:0.827907:96:81:18:18:96:82:18:19
chr10	103124736	.	C	T	1902.6	PASS	AF=0.80663;AO=140;DP=176;FAO=146;FDP=181;FR=.;FRO=35;FSAF=74;FSAR=72;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00471528;FXX=0.0054942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.114;QD=42.0464;RBI=0.0248534;REFB=-0.0328602;REVB=0.024402;RO=35;SAF=72;SAR=68;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41193e-08;STB=0.501438;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0118901;OID=.;OPOS=103124736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:181:35:35:140:146:0.80663:68:72:18:17:72:74:18:17
chr10	103124746	.	G	A	1415.16	PASS	AF=0.767606;AO=107;DP=140;FAO=109;FDP=142;FR=.;FRO=33;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0277782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.387;QD=39.8636;RBI=0.0327042;REFB=-0.00454759;REVB=0.0172607;RO=33;SAF=50;SAR=57;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00778608;STB=0.501812;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.00134464;OID=.;OPOS=103124746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:142:33:33:107:109:0.767606:57:50:16:17:57:52:16:17
chr10	103827737	.	T	G	187.05	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.00327762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.64;QD=14.6709;RBI=0.0298536;REFB=-0.0178991;REVB=0.0296731;RO=30;SAF=8;SAR=13;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205561;STB=0.5118;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0293833;OID=.;OPOS=103827737;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:13:8:12:18:13:8:12:18
chr10	103904763	.	TC	T	224.64	PASS	AF=1;AO=28;DP=42;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309261;FXX=0.0217344;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.55951;QD=19.968;RBI=0.149629;REFB=-0.0242054;REVB=0.146398;RO=8;SAF=24;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167027;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0108228;OID=.;OPOS=103904764;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:28:42:45:45:0:33:12:0:0:4:8:24:4:5:3
chr10	103908217	.	T	C	260.81	PASS	AF=0.416667;AO=31;DP=72;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0143512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9796;QD=14.4892;RBI=0.0182849;REFB=-0.00935242;REVB=-0.0113306;RO=41;SAF=12;SAR=19;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542424;STB=0.51723;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=0.0261329;OID=.;OPOS=103908217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:42:31:30:0.416667:19:12:18:23:18:12:18:24
chr10	103991381	.	G	A	1358.58	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8029;QD=62.4636;RBI=0.0897782;REFB=0;REVB=0.0814072;RO=0;SAF=53;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000744958;OID=.;OPOS=103991381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:34:53:0:0:34:53:0:0
chr10	104136469	.	T	C	1008.46	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.656;QD=59.3209;RBI=0.0370018;REFB=0;REVB=0.0289353;RO=0;SAF=47;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113277;OID=.;OPOS=104136469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:20:47:0:0:21:47:0:0
chr10	104160434	.	A	G	530.32	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000152256;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.49;QD=57.3319;RBI=0.0172838;REFB=-0.0284048;REVB=-0.0172831;RO=1;SAF=22;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208029;STB=0.511105;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000723812;OID=.;OPOS=104160434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:37:1:1:36:36:0.972973:14:22:1:0:14:22:1:0
chr10	104174895	.	G	A	286.58	PASS	AF=0.438356;AO=31;DP=72;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=31;FWDB=0.128018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.928;QD=15.7028;RBI=0.128262;REFB=-0.0299416;REVB=0.00790785;RO=41;SAF=11;SAR=20;SRF=10;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127909;STB=0.581701;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0524371;OID=.;OPOS=104174895;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:41:41:31:32:0.438356:20:11:10:31:20:12:10:31
chr10	104214048	.	A	T	785.72	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.05242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.412;QD=64.1407;RBI=0.057659;REFB=0;REVB=0.0240148;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000393551;OID=.;OPOS=104214048;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:27:21:0:0:27:22:0:0
chr10	104230437	.	C	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.087;QD=37.4883;RBI=0.0796757;REFB=0;REVB=0.0701677;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107582;OID=.;OPOS=104230437;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr10	104230745	.	T	A	330.85	PASS	AF=0.615385;AO=32;DP=52;FAO=32;FDP=52;FR=.;FRO=20;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0238814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.439;QD=25.4497;RBI=0.0240728;REFB=-0.0574714;REVB=-0.00302971;RO=20;SAF=25;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242468;STB=0.634237;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0478715;OID=.;OPOS=104230745;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:20:20:32:32:0.615385:7:25:10:10:7:25:10:10
chr10	104236457	.	C	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00718983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9284;QD=61.3362;RBI=0.0108567;REFB=0;REVB=-0.0081348;RO=0;SAF=9;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54184e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000216037;OID=.;OPOS=104236457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:31:9:0:0:31:9:0:0
chr10	104386934	.	T	C	919.86	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2825;QD=58.4036;RBI=0.0421985;REFB=0;REVB=-0.00738167;RO=0;SAF=35;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000335217;OID=.;OPOS=104386934;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:28:35:0:0:28:35:0:0
chr10	104389932	.	T	G	1693.06	PASS	AF=1;AO=99;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=63;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.057652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.8;QD=60.4663;RBI=0.0667838;REFB=0;REVB=0.0337094;RO=0;SAF=51;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149816;OID=.;OPOS=104389932;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:112:0:0:99:112:1:48:51:0:0:49:63:0:0
chr10	104435746	.	C	T	968.94	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.012;QD=58.7237;RBI=0.0364447;REFB=0;REVB=0.0206213;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011238;OID=.;OPOS=104435746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:66:0:0:64:66:1:34:30:0:0:35:31:0:0
chr10	104436641	.	C	T	766.95	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0367392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.334;QD=63.9128;RBI=0.0381766;REFB=0;REVB=0.0103772;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.28496e-05;OID=.;OPOS=104436641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:27:20:0:0:27:21:0:0
chr10	104572963	.	T	C	72.18	PASS	AF=0.6;AO=7;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00114917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.754;QD=19.2479;RBI=0.146329;REFB=0.0156148;REVB=0.146325;RO=6;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.329175;STB=0.687155;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.00839997;OID=.;OPOS=104572963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:15:15:6:6:7:9:0.6:2:5:6:0:4:5:6:0
chr10	104573017	.	G	T	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0050602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.311;QD=9.76003;RBI=0.0439872;REFB=-0.00982046;REVB=0.0436952;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240999;STB=0.646658;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0529402;OID=.;OPOS=104573017;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:4:3:8:4:4:3:8:4
chr10	104574329	.	A	T	138.52	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=49;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0481321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.814;QD=10.864;RBI=0.0504499;REFB=-0.0288111;REVB=-0.0151158;RO=34;SAF=5;SAR=10;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132023;STB=0.520071;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0168067;OID=.;OPOS=104574329;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:34:34:15:17:0.333333:10:5:15:19:10:7:15:19
chr10	104574562	.	T	G	163.8	PASS	AF=0.515152;AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=-0.066879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.307;QD=19.8539;RBI=0.0669363;REFB=-0.0244396;REVB=0.00276836;RO=15;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389287;STB=0.710344;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0308892;OID=.;OPOS=104574562;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:33:15:16:16:17:0.515152:10:6:0:15:11:6:0:16
chr10	104575870	.	A	G	235.22	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.0104363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.04;QD=25.4294;RBI=0.0111354;REFB=-0.0343074;REVB=-0.00388342;RO=15;SAF=16;SAR=6;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13815;STB=0.576096;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0264963;OID=.;OPOS=104575870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:6:16:13:2:6:16:13:2
chr10	104596924	.	C	A	443.74	PASS	AF=0.466019;AO=48;DP=103;FAO=48;FDP=103;FR=.;FRO=55;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0102266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.012;QD=17.2325;RBI=0.0215711;REFB=-0.0218904;REVB=-0.0189929;RO=55;SAF=18;SAR=30;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025357;STB=0.514133;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0243153;OID=.;OPOS=104596924;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:55:55:48:48:0.466019:30:18:22:33:30:18:22:33
chr10	104596981	.	G	A	485.02	PASS	AF=0.415385;AO=54;DP=127;FAO=54;FDP=130;FR=.;FRO=76;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=-0.00715022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4613;QD=14.9238;RBI=0.0072902;REFB=-0.0128366;REVB=-0.00142175;RO=70;SAF=24;SAR=30;SRF=37;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849847;STB=0.555535;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0149005;OID=.;OPOS=104596981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:130:70:76:54:54:0.415385:30:24:37:33:30:24:41:35
chr10	104628234	.	T	C	914.38	PASS	AF=0.538012;AO=82;DP=161;FAO=92;FDP=171;FR=.;FRO=79;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=49;FSRR=30;FWDB=0.00831493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.917;QD=21.3891;RBI=0.0113537;REFB=-0.0180473;REVB=0.007731;RO=79;SAF=48;SAR=34;SRF=49;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322978;STB=0.531013;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0208741;OID=.;OPOS=104628234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:171:79:79:82:92:0.538012:34:48:49:30:41:51:49:30
chr10	104661484	.	T	C	237.17	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.00483135;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=305.94;QD=19.7637;RBI=0.00493701;REFB=-0.0138785;REVB=0.00101591;RO=23;SAF=13;SAR=10;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153781;STB=0.585512;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0125699;OID=.;OPOS=104661484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:25:23:23:0.479167:10:13:9:14:10:13:10:15
chr10	104814162	.	T	C	1713.11	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4321;QD=60.6412;RBI=0.0597873;REFB=0;REVB=0.056945;RO=0;SAF=65;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.8673e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282615;OID=.;OPOS=104814162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:113:0:0:112:113:1:47:65:0:0:47:66:0:0
chr10	104835919	.	C	T	1497.13	PASS	AF=0.989583;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0394529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.577;QD=62.3805;RBI=0.069121;REFB=-0.0734012;REVB=0.0567555;RO=1;SAF=50;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104212;STB=0.505493;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000511619;OID=.;OPOS=104835919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:96:96:1:1:95:95:0.989583:45:50:0:1:45:50:0:1
chr10	104849468	.	G	A	739.33	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0126449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.815;QD=54.7654;RBI=0.0573885;REFB=-0.0712131;REVB=0.0559781;RO=0;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97342e-08;STB=0.507244;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.000481782;OID=.;OPOS=104849468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:0:1:53:53:0.981481:19:34:0:0:19:34:1:0
chr10	104851301	.	G	A,T	1082.55	PASS	AF=0.04,0.946667;AO=4,69;DP=74;FAO=3,71;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=2,34;FSAR=1,37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00442221,0.00862955;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=244.818,79.3724;QD=57.7362;RBI=0.00889083,0.0119495;REFB=-0.00149716,-0.0112517;REVB=-0.00771303,0.00826561;RO=0;SAF=1,34;SAR=3,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,0;STB=0.665547,0.506665;STBP=0.558,0.509;TYPE=snp,snp;VARB=0.0111639,0.000478651;OID=.,.;OPOS=104851301,104851301;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:74:75:0:1:4,69:3,71:0.04,0.946667:3,35:1,34:0:0:1,37:2,34:0:1
chr10	105049105	.	C	G	1021.77	PASS	AF=0.972222;AO=70;DP=72;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0287767;FXX=0.0136968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.174;QD=56.7651;RBI=0.0297666;REFB=-0.0354448;REVB=-0.00761226;RO=2;SAF=37;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248698;STB=0.513154;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.000972505;OID=.;OPOS=105049105;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:72:72:2:2:70:70:0.972222:33:37:2:0:33:37:2:0
chr10	105049789	.	G	A	162.19	PASS	AF=0.459459;AO=12;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0100742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.1702;QD=17.5342;RBI=0.0301985;REFB=-0.00594378;REVB=-0.0284686;RO=16;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201473;STB=0.646285;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00731065;OID=.;OPOS=105049789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:20:12:17:0.459459:5:7:6:10:5:12:9:11
chr10	105154089	.	A	G	1680.45	PASS	AF=0.99115;AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0235123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7976;QD=59.4849;RBI=0.0240384;REFB=-0.111161;REVB=0.00500137;RO=1;SAF=55;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00825711;STB=0.504347;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00112892;OID=.;OPOS=105154089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:113:113:1:1:112:112:0.99115:57:55:0:1:57:55:0:1
chr10	105194086	.	C	T	312.16	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0593337;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.3413;QD=49.9455;RBI=0.0595346;REFB=-0.0778702;REVB=-0.00488698;RO=1;SAF=14;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319609;STB=0.517227;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00550135;OID=.;OPOS=105194086;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:10:14:1:0:10:14:1:0
chr10	105205302	.	A	C	778.09	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.7984;QD=56.5882;RBI=0.182038;REFB=0;REVB=0.149409;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00282444;OID=.;OPOS=105205302;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:55:0:0:51:55:1:17:34:0:0:18:37:0:0
chr10	105215016	.	A	G	817.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00814143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.828;QD=56.3668;RBI=0.0174582;REFB=0;REVB=0.0154436;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000314454;OID=.;OPOS=105215016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:56:58:1:25:31:0:0:25:33:0:0
chr10	105217976	.	C	T	452.15	PASS	AF=0.536585;AO=44;DP=82;FAO=44;FDP=82;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0395251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.195;QD=22.0561;RBI=0.0871687;REFB=-0.0184449;REVB=0.0776927;RO=38;SAF=25;SAR=19;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132843;STB=0.507325;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0165985;OID=.;OPOS=105217976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:38:38:44:44:0.536585:19:25:21:17:19:25:21:17
chr10	105218252	.	A	G	1989.57	PASS	AF=1;AO=128;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.605;QD=62.1741;RBI=0.0304852;REFB=0;REVB=0.00856132;RO=0;SAF=77;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.76402e-05;OID=.;OPOS=105218252;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:128:0:0:128:128:1:51:77:0:0:51:77:0:0
chr10	105218359	.	T	C	802.13	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014114;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.006;QD=57.295;RBI=0.0274956;REFB=0;REVB=0.0235967;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151577;OID=.;OPOS=105218359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:23:32:0:0:24:32:0:0
chr10	105233110	.	C	T	1052.31	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.568;QD=58.4614;RBI=0.191554;REFB=-0.118459;REVB=0.189545;RO=1;SAF=51;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255332;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00595685;OID=.;OPOS=105233110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:70:72:1:0:69:72:1:18:51:0:1:21:51:0:0
chr10	105361816	.	T	G	160.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.825;QD=45.783;RBI=0.035127;REFB=0;REVB=0.0248688;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320837;OID=.;OPOS=105361816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:13:14:1:8:5:0:0:9:5:0:0
chr10	105362209	.	T	C	330.86	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0514062;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.979;QD=50.9017;RBI=0.0748168;REFB=-0.0154102;REVB=-0.0543594;RO=1;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370998;STB=0.519984;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.000393669;OID=.;OPOS=105362209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:12:13:0:1:12:13:0:1
chr10	105372696	.	G	A	387.92	PASS	AF=0.52;AO=39;DP=77;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.0271605;FXX=0.0259707;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4095;QD=20.689;RBI=0.0272433;REFB=-0.0207578;REVB=-0.0021222;RO=34;SAF=11;SAR=28;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.36298;STB=0.712408;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0229577;OID=.;OPOS=105372696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:75:34:36:39:39:0.52:28:11:24:10:28:11:26:10
chr10	105657316	.	G	C	679.87	PASS	AF=0.9375;AO=45;DP=48;FAO=45;FDP=48;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0149094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.036;QD=56.6554;RBI=0.03386;REFB=-0.274641;REVB=0.0304008;RO=3;SAF=30;SAR=15;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085146;STB=0.545434;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00363778;OID=.;OPOS=105657316;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:48:48:3:3:45:45:0.9375:15:30:0:3:15:30:0:3
chr10	105659826	.	T	C	1161.6	PASS	AF=0.987179;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0785135;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.523;QD=59.5694;RBI=0.0837631;REFB=-0.0560686;REVB=0.0291872;RO=1;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126197;STB=0.506665;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.000288222;OID=.;OPOS=105659826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:78:1:1:77:77:0.987179:37:40:0:1:37:40:0:1
chr10	105796819	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0272;QD=52.6119;RBI=0.0446949;REFB=0;REVB=-0.041476;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000670605;OID=.;OPOS=105796819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr10	105798872	.	T	C	1502.97	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262017;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.276;QD=63.2831;RBI=0.0487495;REFB=0;REVB=0.0411095;RO=0;SAF=46;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.21959e-05;OID=.;OPOS=105798872;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:95:0:0:95:95:1:49:46:0:0:49:46:0:0
chr10	105799216	.	G	T	1122.12	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302337;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.9102;QD=57.5446;RBI=0.0715073;REFB=0;REVB=-0.0648014;RO=2;SAF=54;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171998;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228002;OID=.;OPOS=105799216;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:76:78:2:0:74:78:1:20:54:2:0:20:58:0:0
chr10	105801253	.	G	A	710.61	PASS	AF=1;AO=27;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0528696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.1322;QD=61.7918;RBI=0.22913;REFB=0;REVB=0.222947;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00389162;OID=.;OPOS=105801253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:27:46:1:17:10:0:0:18:28:0:0
chr10	105805497	.	C	T	1000.17	PASS	AF=0.971831;AO=68;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0176093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4034;QD=56.3477;RBI=0.0378217;REFB=-0.137668;REVB=-0.0334723;RO=2;SAF=47;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196884;STB=0.510414;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00149872;OID=.;OPOS=105805497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:71:71:2:2:68:69:0.971831:21:47:2:0:22:47:2:0
chr10	105810400	.	T	C	1529.83	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.256;QD=63.7428;RBI=0.0286781;REFB=0;REVB=0.0237057;RO=0;SAF=38;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.19884e-05;OID=.;OPOS=105810400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:58:38:0:0:58:38:0:0
chr10	105816916	.	C	T	2353.53	PASS	AF=1;AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00870899;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.4784;QD=64.0417;RBI=0.0281844;REFB=0;REVB=0.0268051;RO=0;SAF=80;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.13466e-05;OID=.;OPOS=105816916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:147:0:0:147:147:1:67:80:0:0:67:80:0:0
chr10	105819956	.	G	A	2277.03	PASS	AF=0.993103;AO=144;DP=145;FAO=144;FDP=145;FR=.;FRO=1;FSAF=91;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00508448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.831;QD=62.8145;RBI=0.0246572;REFB=-0.0130548;REVB=-0.0241273;RO=1;SAF=91;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00888751;STB=0.504672;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-4.00371e-05;OID=.;OPOS=105819956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:145:145:1:1:144:144:0.993103:53:91:0:1:53:91:0:1
chr10	105824333	.	G	A	1098.68	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0233595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2184;QD=60.2018;RBI=0.0251318;REFB=0;REVB=0.00927039;RO=0;SAF=31;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.26028e-05;OID=.;OPOS=105824333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:42:31:0:0:42:31:0:0
chr10	106159126	.	G	T	108.77	PASS	AF=0.341463;AO=13;DP=39;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=0.00866374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7607;QD=10.6116;RBI=0.0101518;REFB=-0.0441637;REVB=-0.00529135;RO=22;SAF=12;SAR=1;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27181;STB=0.68992;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0725992;OID=.;OPOS=106159126;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:41:22:27:13:14:0.341463:1:12:18:4:1:13:22:5
chr10	108338917	.	T	C	491.8	PASS	AF=0.490566;AO=52;DP=106;FAO=52;FDP=106;FR=.;FRO=54;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00667639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.275;QD=18.5585;RBI=0.0186189;REFB=-0.00831865;REVB=0.0173807;RO=54;SAF=29;SAR=23;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872612;STB=0.548345;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0101638;OID=.;OPOS=108338917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:54:54:52:52:0.490566:23:29:25:29:23:29:25:29
chr10	108380213	.	G	A	530.93	PASS	AF=0.411348;AO=58;DP=142;FAO=58;FDP=141;FR=.;FRO=83;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=48;FSRR=35;FWDB=-0.0164558;FXX=0.00704176;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.769;QD=15.0619;RBI=0.0213715;REFB=0.00545473;REVB=0.0136362;RO=83;SAF=32;SAR=26;SRF=48;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282429;STB=0.515868;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=-0.00422197;OID=.;OPOS=108380213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:141:83:83:58:58:0.411348:26:32:48:35:26:32:48:35
chr10	111640016	.	A	AT	30.67	PASS	AF=0.275;AO=13;DP=44;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.141779;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.68777;QD=3.06726;RBI=0.146306;REFB=-0.115809;REVB=0.0361107;RO=28;SAF=10;SAR=3;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366798;STB=0.681098;STBP=0.205;TYPE=ins;VARB=0.172732;OID=.;OPOS=111640017;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.275:13:44:11:40:29:4:7:18:11:30:28:10:3:13:15
chr10	111893124	.	AG	CT	136.0	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0490003;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=2;MLLD=122.526;QD=16.485;RBI=0.0532545;REFB=-0.0104274;REVB=0.020857;RO=18;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109898;STB=0.506321;STBP=0.969;TYPE=mnp;VARB=0.0137375;OID=.;OPOS=111893124;OREF=AG;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:18:18:15:15:0.454545:6:9:11:7:6:9:11:7
chr10	112044841	.	TTAAAAC	T,TT	69.93	PASS	AF=0,0.37037;AO=4,4;DP=16;FAO=0,10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=0,5;FSAR=0,5;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0205813,0.0250913;FXX=0.0357015;HRUN=3,4;LEN=6,5;MLLD=166.961,169.133;QD=10.3598;RBI=0.0231859,0.0261627;REFB=-0.0280929,-0.0277913;REVB=0.0106769,0.00741042;RO=0;SAF=4,0;SAR=0,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0.31058;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.592414;STBP=1,0.484;TYPE=del,del;VARB=0.0544021,0.0396917;OID=.,.;OPOS=112044842,112044843;OREF=TAAAAC,AAAAC;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.37037:4,4:16:0,10:27:17:0,5:0,5:11:6:67:0:4,0:0,4:0:0
chr10	112266771	.	C	T	971.74	PASS	AF=0.957746;AO=68;DP=71;FAO=68;FDP=71;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=55;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0263463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.6756;QD=54.7458;RBI=0.0704272;REFB=-0.0991633;REVB=0.0653136;RO=2;SAF=13;SAR=55;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673199;STB=0.551708;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0103024;OID=.;OPOS=112266771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:71:71:2:3:68:68:0.957746:55:13:2:0:55:13:3:0
chr10	112266822	.	GC	AT	708.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224796;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=149.769;QD=62.9829;RBI=0.0239023;REFB=0;REVB=-0.00812334;RO=0;SAF=4;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=6.7106e-05;OID=.;OPOS=112266822;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:41:4:0:0:41:4:0:0
chr10	112271241	.	GGTTGTTGTTGTTGTTC	GGTTGTTGTTGTTC,GGTTGTTGTTGTTCTTG	317.12	PASS	AF=0.584906,0.0377358;AO=24,2;DP=53;FAO=31,2;FDP=53;FR=.;FRO=20;FSAF=12,2;FSAR=19,0;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00534172,0.00310569;FXX=0.0185151;HRUN=1,1;LEN=3,4;MLLD=177.42,104.563;QD=23.9333;RBI=0.0245403,0.0164431;REFB=-0.0314094,-0.0286453;REVB=0.0239519,-0.0161472;RO=15;SAF=8,2;SAR=16,0;SRF=6;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0510647,0.583083;STB=0.505316,0.995483;STBP=0.945,0.092;TYPE=del,mnp;VARB=0.0279156,0.0152867;OID=.,.;OPOS=112271242,112271254;OREF=GTT,GTTC;OALT=-,CTTG;OMAPALT=GGTTGTTGTTGTTC,GGTTGTTGTTGTTCTTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.584906,0.0377358:24,2:53:31,2:53:20:12,2:19,0:8:12:99:15:8,2:16,0:6:9
chr10	112361870	.	A	G	1240.04	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3329;QD=61.2363;RBI=0.114435;REFB=0;REVB=0.0549575;RO=0;SAF=42;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000646905;OID=.;OPOS=112361870;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:38:42:0:0:38:43:0:0
chr10	112402492	.	G	T	1154.32	PASS	AF=0.987179;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.024576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.892;QD=59.1957;RBI=0.026122;REFB=-0.157151;REVB=-0.00885326;RO=1;SAF=39;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012618;STB=0.506492;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.00102463;OID=.;OPOS=112402492;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:78:1:1:76:77:0.987179:37:39:0:1:38:39:0:1
chr10	112572458	.	G	C	771.24	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00750338;FXX=0.020404;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.9471;QD=64.2698;RBI=0.0707207;REFB=0;REVB=0.0703216;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000761217;OID=.;OPOS=112572458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:48:0:0:46:48:1:21:25:0:0:22:26:0:0
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chr10	112641053	.	A	G	683.11	PASS	AF=0.883333;AO=51;DP=59;FAO=53;FDP=60;FR=.;FRO=7;FSAF=47;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0326138;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.491;QD=45.5404;RBI=0.144574;REFB=-0.153372;REVB=0.140847;RO=5;SAF=46;SAR=5;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462757;STB=0.580213;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.00434466;OID=.;OPOS=112641053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:59:60:5:7:51:53:0.883333:5:46:4:1:6:47:4:3
chr10	112658060	.	G	A	272.22	PASS	AF=0.484375;AO=29;DP=62;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.00402138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8673;QD=17.0139;RBI=0.0221857;REFB=-0.0244337;REVB=-0.0218182;RO=33;SAF=17;SAR=12;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236051;STB=0.609493;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0228836;OID=.;OPOS=112658060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:33:33:29:31:0.484375:12:17:11:22:14:17:11:22
chr10	112838892	.	C	A	110.59	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00993641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.926;QD=15.254;RBI=0.0113461;REFB=-0.0267719;REVB=-0.00547743;RO=16;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112115;STB=0.565116;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0479937;OID=.;OPOS=112838892;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:5:8:8:8:5:8:8:8
chr10	112839579	.	A	G	235.19	PASS	AF=0.3625;AO=18;DP=80;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=33;FWDB=-0.0323041;FXX=0.0123442;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.159;QD=11.7596;RBI=0.0352352;REFB=-0.00981849;REVB=-0.0140701;RO=32;SAF=3;SAR=15;SRF=3;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16508;STB=0.58817;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0167296;OID=.;OPOS=112839579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:32:51:18:29:0.3625:15:3:3:29:22:7:18:33
chr10	112840171	.	A	G	790.66	PASS	AF=0.535714;AO=74;DP=140;FAO=75;FDP=140;FR=.;FRO=65;FSAF=51;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=0.00264456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.134;QD=22.5904;RBI=0.00749617;REFB=-0.00679161;REVB=-0.00701419;RO=64;SAF=50;SAR=24;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131996;STB=0.571587;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00644039;OID=.;OPOS=112840171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:140:64:65:74:75:0.535714:24:50:34:30:24:51:35:30
chr10	113912997	.	A	C	146.27	PASS	AF=0.470588;AO=12;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0375987;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.601;QD=17.2084;RBI=0.0377143;REFB=0.0150113;REVB=-0.00295041;RO=18;SAF=3;SAR=9;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424241;STB=0.773445;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.0119345;OID=.;OPOS=113912997;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:12:16:0.470588:9:3:12:6:13:3:12:6
chr10	113913193	.	T	C	300.5	PASS	AF=0.507937;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0137836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6065;QD=19.0795;RBI=0.0350132;REFB=0.0531725;REVB=0.0321859;RO=30;SAF=10;SAR=22;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14588;STB=0.591339;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.0491462;OID=.;OPOS=113913193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:30:31:32:32:0.507937:22:10:14:16:22:10:15:16
chr10	113913222	.	T	C	931.96	PASS	AF=0.984848;AO=62;DP=63;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0235186;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.623;QD=56.4823;RBI=0.0243979;REFB=0.00399168;REVB=0.00649091;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.000695471;OID=.;OPOS=113913222;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:66:0:1:62:65:0.984848:34:28:0:0:37:28:1:0
chr10	113914366	.	C	A	52.92	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0880199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2016;QD=21.1675;RBI=0.0880199;REFB=-0.039773;REVB=0;RO=3;SAF=7;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0119199;OID=.;OPOS=113914366;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:0:7:3:0:0:7:3:0
chr10	113917085	.	T	A	1396.16	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.651;QD=62.7487;RBI=0.0164283;REFB=0;REVB=-0.00309094;RO=0;SAF=47;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.01512e-05;OID=.;OPOS=113917085;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:42:47:0:0:42:47:0:0
chr10	113920465	.	G	A	794.03	PASS	AF=0.435233;AO=84;DP=193;FAO=84;FDP=193;FR=.;FRO=109;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=68;FSRR=41;FWDB=0.0217095;FXX=0.00515437;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.699;QD=16.4566;RBI=0.0675597;REFB=-0.0167764;REVB=0.0639766;RO=107;SAF=44;SAR=40;SRF=66;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0944592;STB=0.556924;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0170302;OID=.;OPOS=113920465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:193:193:107:109:84:84:0.435233:40:44:66:41:40:44:68:41
chr10	113935379	.	T	C	320.25	PASS	AF=0.595745;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0415626;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.3992;QD=27.2553;RBI=0.0472436;REFB=0.0363961;REVB=0.0224611;RO=19;SAF=17;SAR=11;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215091;STB=0.511877;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=-0.0222752;OID=.;OPOS=113935379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:19:19:28:28:0.595745:11:17:11:8:11:17:11:8
chr10	113940329	.	T	C	938.08	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.796;QD=58.6302;RBI=0.0641654;REFB=0;REVB=0.0489861;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281481;OID=.;OPOS=113940329;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:29:34:0:0:30:34:0:0
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chr10	114059330	.	TCTCTGTTTTC	T	134.31	PASS	AF=0.482759;AO=15;DP=33;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00382029;FXX=0.17138;HRUN=1;LEN=10;MLLD=344.91;QD=18.5251;RBI=0.00386424;REFB=-0.0140779;REVB=-0.000581121;RO=10;SAF=8;SAR=7;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237195;STB=0.554377;STBP=0.63;TYPE=del;VARB=0.0133592;OID=.;OPOS=114059331;OREF=CTCTGTTTTC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.482759:15:33:14:29:15:8:6:7:8:99:10:8:7:5:5
chr10	114186624	.	G	A	1513.05	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.405;QD=59.9227;RBI=0.0241568;REFB=0;REVB=-0.00133068;RO=0;SAF=56;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15371e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.21577e-05;OID=.;OPOS=114186624;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:45:56:0:0:45:56:0:0
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chr10	114925369	.	C	A	117.93	PASS	AF=0.451613;AO=13;DP=30;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0445082;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.0519;QD=15.217;RBI=0.058228;REFB=-0.0394272;REVB=-0.0375436;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292758;STB=0.678337;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0497035;OID=.;OPOS=114925369;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:17:17:13:14:0.451613:6:7:4:13:6:8:4:13
chr10	114925998	.	A	T	37.52	PASS	AF=0.0529412;AO=16;DP=170;FAO=9;FDP=170;FR=.,HEALED;FRO=153;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=53;FSRR=100;FWDB=0.0355706;FXX=0.01734;HRUN=6;LEN=1;MLLD=19.0409;QD=0.882937;RBI=0.124311;REFB=-0.0416653;REVB=-0.119113;RO=94;SAF=1;SAR=15;SRF=47;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.600071;STB=0.799202;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=-0.0252283;OID=.;OPOS=114925998;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:170:170:94:153:16:9:0.0529412:15:1:47:47:8:1:53:100
chr10	115332413	.	C	T	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0518913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.921;QD=19.3428;RBI=0.0533504;REFB=-0.00603579;REVB=-0.0123918;RO=18;SAF=15;SAR=3;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217118;STB=0.624844;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00793419;OID=.;OPOS=115332413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:3:15:12:6:3:15:12:6
chr10	115334124	.	C	T	166.43	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=0.0228544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0625;QD=14.7936;RBI=0.0328219;REFB=-0.0235289;REVB=0.0235574;RO=27;SAF=10;SAR=8;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287339;STB=0.663056;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0395691;OID=.;OPOS=115334124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:8:10:22:5:8:10:22:5
chr10	115370254	.	A	G	849.27	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4527;QD=57.5775;RBI=0.027337;REFB=0;REVB=0.00230835;RO=0;SAF=21;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131522;OID=.;OPOS=115370254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:57:59:1:36:21:0:0:37:22:0:0
chr10	115370274	.	T	C	777.9	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=59;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0186285;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4147;QD=53.6485;RBI=0.0189376;REFB=-0.0137334;REVB=-0.00340771;RO=2;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269297;STB=0.514281;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00401604;OID=.;OPOS=115370274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:59:58:2:2:56:56:0.965517:34:22:0:2:34:22:0:2
chr10	115375528	.	C	A	556.3	PASS	AF=0.483333;AO=57;DP=124;FAO=58;FDP=120;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=0.000765977;FXX=0.0399968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.456;QD=18.5432;RBI=0.0131978;REFB=-0.0331784;REVB=0.0131756;RO=57;SAF=30;SAR=27;SRF=37;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112388;STB=0.558039;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0436793;OID=.;OPOS=115375528;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:120:57:62:57:58:0.483333:27:30:37:20:28:30:39:23
chr10	115393929	.	G	A	1316.31	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.282;QD=61.9442;RBI=0.030723;REFB=0;REVB=0.0188167;RO=0;SAF=49;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.09971e-05;OID=.;OPOS=115393929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:35:49:0:0:36:49:0:0
chr10	115405615	.	T	C	996.96	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2055;QD=58.6448;RBI=0.0513032;REFB=0;REVB=0.00473599;RO=0;SAF=39;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296467;OID=.;OPOS=115405615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:67:68:1:28:39:0:0:29:39:0:0
chr10	115405664	.	C	T	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.495;QD=59.142;RBI=0.0118169;REFB=0;REVB=-0.00371633;RO=0;SAF=42;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.93036e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.72704e-05;OID=.;OPOS=115405664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:25:42:0:0:25:42:0:0
chr10	115410234	.	T	C	315.97	PASS	AF=0.363636;AO=36;DP=99;FAO=36;FDP=99;FR=.;FRO=63;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.000744512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.83;QD=12.7666;RBI=0.0530902;REFB=-0.00690824;REVB=0.053085;RO=63;SAF=21;SAR=15;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11937;STB=0.56849;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0112631;OID=.;OPOS=115410234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:63:63:36:36:0.363636:15:21:30:33:15:21:30:33
chr10	115411614	.	A	G	861.36	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0780268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3712;QD=56.4829;RBI=0.0792761;REFB=0;REVB=0.0140185;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00324709;OID=.;OPOS=115411614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:61:0:0:58:61:1:31:27:0:0:32:29:0:0
chr10	115417289	.	G	A	1552.33	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196237;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.236;QD=64.0134;RBI=0.0196427;REFB=0;REVB=0.0008627;RO=0;SAF=62;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.81934e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.24189e-05;OID=.;OPOS=115417289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:35:62:0:0:35:62:0:0
chr10	115439530	.	G	C	670.07	PASS	AF=0.960784;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0175573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8788;QD=52.5547;RBI=0.0177967;REFB=-0.000551955;REVB=0.00290956;RO=2;SAF=33;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162924;STB=0.507689;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=8.75166e-05;OID=.;OPOS=115439530;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:51:2:2:48:49:0.960784:15:33:1:1:16:33:1:1
chr10	115439569	.	C	T	1128.71	PASS	AF=0.950617;AO=76;DP=80;FAO=77;FDP=81;FR=.;FRO=4;FSAF=55;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0266917;FXX=0.0121936;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.483;QD=55.7388;RBI=0.0508767;REFB=-0.136799;REVB=0.0433128;RO=3;SAF=55;SAR=21;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344369;STB=0.512817;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.00118254;OID=.;OPOS=115439569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:80:81:3:4:76:77:0.950617:21:55:1:2:22:55:2:2
chr10	115489152	.	C	G	365.07	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0409109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.147;QD=52.1522;RBI=0.041105;REFB=-0.0344174;REVB=-0.00399;RO=1;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238509;STB=0.512811;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.000387113;OID=.;OPOS=115489152;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:19:8:0:1:19:8:0:1
chr10	115489167	.	G	A	375.61	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000923698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.881;QD=55.6455;RBI=0.0161408;REFB=0;REVB=0.0161144;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.08347e-05;OID=.;OPOS=115489167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:25:27:1:18:7:0:0:20:7:0:0
chr10	115525175	.	T	C	169.49	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.00074774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.022;QD=16.5359;RBI=0.00114863;REFB=-0.0172073;REVB=-0.000871917;RO=23;SAF=14;SAR=4;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329958;STB=0.691127;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0220266;OID=.;OPOS=115525175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:4:14:11:12:4:14:11:12
chr10	115535599	.	T	C	251.08	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.020687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.931;QD=19.6924;RBI=0.0208558;REFB=-0.0244703;REVB=-0.0026487;RO=25;SAF=12;SAR=14;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162916;STB=0.590703;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0250033;OID=.;OPOS=115535599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:14:12:7:18:14:12:7:18
chr10	115540411	.	T	C	163.84	PASS	AF=0.314286;AO=22;DP=70;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0125141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.368;QD=9.36204;RBI=0.0169695;REFB=-0.00504618;REVB=-0.0114614;RO=48;SAF=14;SAR=8;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13805;STB=0.581694;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0104042;OID=.;OPOS=115540411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:48:48:22:22:0.314286:8:14:25:23:8:14:25:23
chr10	115609830	.	TTA	T,TTT	152.39	PASS	AF=0.352273,0;AO=17,6;DP=94;FAO=31,0;FDP=88;FR=.;FRO=57;FSAF=21,0;FSAR=10,0;FSRF=42;FSRR=15;FWDB=0.0711033,-0.0333867;FXX=0;HRUN=6,7;LEN=2,1;MLLD=19.3713,14.6974;QD=6.92702;RBI=0.125499,0.241907;REFB=-0.0265848,0.0351763;REVB=0.103413,-0.239592;RO=56;SAF=13,5;SAR=4,1;SRF=45;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0704344,0.0555289;STB=0.545426,0.5;STBP=0.573,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0547536,0;OID=.,.;OPOS=115609831,115609832;OREF=TA,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.352273,0:17,6:94:31,0:88:57:21,0:10,0:42:15:99:56:13,5:4,1:45:11
chr10	115609915	.	C	G,T	1012.67	PASS	AF=0.930556,0.0555556;AO=66,4;DP=72;FAO=67,4;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=28,1;FSAR=39,3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0387917,-0.107486;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=141.727,9.43574;QD=56.2596;RBI=0.03936,0.121279;REFB=0.0864302,0.0160733;REVB=-0.00666458,-0.0561728;RO=1;SAF=27,1;SAR=39,3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0119621,0.119989;STB=0.506327,0.571096;STBP=0.495,0.672;TYPE=snp,snp;VARB=0.000559098,0.136152;OID=.,.;OPOS=115609915,115609915;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:72:72:1:1:66,4:67,4:0.930556,0.0555556:39,3:27,1:0:1:39,3:28,1:0:1
chr10	115668149	.	A	G	522.9	PASS	AF=0.607595;AO=48;DP=79;FAO=48;FDP=79;FR=.;FRO=31;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00126805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4677;QD=26.4757;RBI=0.00697792;REFB=0.00460918;REVB=0.00686173;RO=29;SAF=23;SAR=25;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694109;STB=0.536286;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=-0.00234206;OID=.;OPOS=115668149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:29:31:48:48:0.607595:25:23:11:18:25:23:12:19
chr10	115675025	.	G	A	393.32	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.015;QD=56.1888;RBI=0.0447529;REFB=0;REVB=-0.0407662;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000153577;OID=.;OPOS=115675025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr10	115805056	.	G	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00399021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=345.448;QD=35.5759;RBI=0.0309516;REFB=0;REVB=0.0306934;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257568;OID=.;OPOS=115805056;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0
chr10	115805637	.	TTC	T,TT	71.8	PASS	AF=0.482759,0;AO=7,7;DP=29;FAO=14,0;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=13,0;FSAR=1,0;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.233997,0.038413;FXX=0;HRUN=7,5;LEN=2,1;MLLD=18.3829,11.4089;QD=9.90366;RBI=0.244801,0.180948;REFB=-0.092283,-0.11462;REVB=0.0719216,0.176823;RO=14;SAF=7,7;SAR=0,0;SRF=11;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.704188,0.704188;STB=0.599833,0.5;STBP=0.569,1;TYPE=del,del;VARB=0.119065,0;OID=.,.;OPOS=115805638,115805639;OREF=TC,C;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.482759,0:7,7:29:14,0:29:15:13,0:1,0:13:2:69:14:7,7:0,0:11:3
chr10	116032519	.	A	G	290.77	PASS	AF=0.463768;AO=31;DP=68;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=-0.0456126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8362;QD=16.8561;RBI=0.0802652;REFB=0.00538794;REVB=-0.0660454;RO=36;SAF=20;SAR=11;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052442;STB=0.528073;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=-0.00948285;OID=.;OPOS=116032519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:36:37:31:32:0.463768:11:20:25:11:11:21:26:11
chr10	116032548	.	G	T	353.34	PASS	AF=0.426966;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=16;FWDB=0.0203257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.7672;QD=15.8803;RBI=0.0351215;REFB=-0.0224397;REVB=-0.0286425;RO=49;SAF=20;SAR=18;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149616;STB=0.592768;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0366526;OID=.;OPOS=116032548;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:49:51:38:38:0.426966:18:20:33:16:18:20:35:16
chr10	116060387	.	T	C	330.44	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0178776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.571;QD=50.8367;RBI=0.0185357;REFB=-0.0226188;REVB=-0.00489553;RO=1;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281249;STB=0.515139;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00170556;OID=.;OPOS=116060387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:16:9:0:1:16:9:0:1
chr10	116064540	.	TG	GT,TGG	38.28	PASS	AF=0.0434783,0.15942;AO=3,12;DP=70;FAO=3,11;FDP=69;FR=.;FRO=55;FSAF=3,9;FSAR=0,2;FSRF=16;FSRR=39;FWDB=-0.0206733,-0.0713946;FXX=0.0142837;HRUN=1,4;LEN=2,1;MLLD=132.671,14.4167;QD=2.21884;RBI=0.0701626,0.128106;REFB=0.0109105,-0.042062;REVB=-0.0670478,0.106367;RO=48;SAF=3,10;SAR=0,2;SRF=14;SRR=34;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.590844,0.612187;STB=0.997823,0.880104;STBP=0.004,0.014;TYPE=mnp,ins;VARB=0.0641945,0.126348;OID=.,.;OPOS=116064540,116064541;OREF=TG,-;OALT=GT,G;OMAPALT=GT,TGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:26:70:69:48:55:3,12:3,11:0.0434783,0.15942:0,2:3,10:14:34:0,2:3,9:16:39
chr10	116073696	.	C	T	1587.74	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00108095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7631;QD=64.1512;RBI=0.00110704;REFB=0;REVB=0.000238924;RO=0;SAF=51;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.21808e-06;OID=.;OPOS=116073696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:48:51:0:0:48:51:0:0
chr10	116085784	.	C	CCCG	882.35	PASS	AF=1;AO=55;DP=68;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126257;FXX=0.031741;HRUN=3;LEN=3;MLLD=178.877;QD=57.8591;RBI=0.0220202;REFB=0;REVB=-0.0180411;RO=7;SAF=25;SAR=30;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551834;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000785233;OID=.;OPOS=116085785;OREF=-;OALT=CCG;OMAPALT=CCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:55:68:61:61:0:27:34:0:0:5:7:25:30:5:2
chr10	116183647	.	G	A	325.87	PASS	AF=0.382353;AO=39;DP=106;FAO=39;FDP=102;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.00870168;FXX=0.0467246;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.384;QD=12.779;RBI=0.0179523;REFB=-0.00212555;REVB=0.0157025;RO=53;SAF=22;SAR=17;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946231;STB=0.554407;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.00367871;OID=.;OPOS=116183647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:102:53:63:39:39:0.382353:17:22:25:28:17:22:30:33
chr10	116183816	.	C	T	72.93	PASS	AF=0.642857;AO=9;DP=14;FAO=9;FDP=14;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0291166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.237;QD=20.8383;RBI=0.0301266;REFB=-0.00454183;REVB=-0.00773527;RO=5;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157607;STB=0.589973;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00197533;OID=.;OPOS=116183816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:14:14:5:5:9:9:0.642857:5:4:1:4:5:4:1:4
chr10	116193082	.	T	C	248.58	PASS	AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0211737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.008;QD=25.4956;RBI=0.0315148;REFB=-0.0617207;REVB=0.0233422;RO=16;SAF=18;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153247;STB=0.585719;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0431592;OID=.;OPOS=116193082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:5:18:10:6:5:18:10:6
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chr10	116307504	.	A	G	332.91	PASS	AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0181329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.091;QD=19.0235;RBI=0.0182761;REFB=-0.0183505;REVB=-0.00228339;RO=33;SAF=21;SAR=14;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219379;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0177488;OID=.;OPOS=116307504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:33:35:35:35:0.5:14:21:19:14:14:21:21:14
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chr10	116931101	.	C	CTT,T	537.43	PASS	AF=0.756757,0.243243;AO=23,13;DP=40;FAO=28,9;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10,2;FSAR=18,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034986,-0.00814532;FXX=0.0263089;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=41.4873,251.104;QD=58.1005;RBI=0.0385558,0.0232196;REFB=0,0;REVB=-0.0162029,-0.0217441;RO=3;SAF=6,6;SAR=17,7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0749874,0.159262;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00992791,0.0497209;OID=.,.;OPOS=116931102,116931101;OREF=-,C;OALT=TT,T;OMAPALT=CTT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:61:40:37:3:0:23,13:28,9:0.756757,0.243243:17,7:6,6:0:3:18,7:10,2:0:0
chr10	117075175	.	G	A	1327.05	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.792;QD=61.7231;RBI=0.0269579;REFB=0;REVB=0.0131958;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000543877;OID=.;OPOS=117075175;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:85:86:1:44:41:0:0:44:42:0:0
chr10	117226713	.	T	C	224.76	PASS	AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.0198945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.394;QD=13.0293;RBI=0.0530904;REFB=-0.0286489;REVB=0.049222;RO=40;SAF=16;SAR=11;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456055;STB=0.542638;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0357707;OID=.;OPOS=117226713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:40:42:27:27:0.391304:11:16:22:18:11:16:22:20
chr10	117228794	.	A	G	690.58	PASS	AF=0.385714;AO=81;DP=211;FAO=81;FDP=210;FR=.;FRO=129;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=67;FSRR=62;FWDB=-0.00657368;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.6;QD=13.1538;RBI=0.0100138;REFB=-0.00127562;REVB=-0.00755394;RO=128;SAF=42;SAR=39;SRF=67;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00535299;STB=0.50053;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0023363;OID=.;OPOS=117228794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:211:210:128:129:81:81:0.385714:39:42:67:61:39:42:67:62
chr10	117823739	.	A	G	681.33	PASS	AF=0.944444;AO=50;DP=53;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0143842;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.8903;QD=50.4688;RBI=0.0759593;REFB=0.0586565;REVB=-0.0745849;RO=3;SAF=34;SAR=16;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00162855;STB=0.501263;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.00125164;OID=.;OPOS=117823739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:53:54:3:3:50:51:0.944444:16:34:2:1:16:35:2:1
chr10	117884950	.	G	A	1527.92	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00853224;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.199;QD=59.9182;RBI=0.0346794;REFB=0;REVB=0.0336134;RO=0;SAF=51;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10484e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.657e-06;OID=.;OPOS=117884950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:101:102:1:50:51:0:0:51:51:0:0
chr10	118231360	.	G	A	850.9	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0136;QD=57.6879;RBI=0.0337954;REFB=0;REVB=0.0274515;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276352;OID=.;OPOS=118231360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:29:30:0:0:29:30:0:0
chr10	118231362	.	TA	T,TG	795.01	PASS	AF=0.175439,0.824561;AO=13,39;DP=57;FAO=10,47;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=10,20;FSAR=0,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111734,-0.0141573;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=194.251,207.897;QD=55.79;RBI=0.0131623,0.017141;REFB=0,0;REVB=0.00695718,0.00966358;RO=0;SAF=12,14;SAR=1,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.00075e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0136799,0.00680847;OID=.,.;OPOS=118231363,118231363;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.175439,0.824561:13,39:57:10,47:57:0:10,20:0,27:0:0:33:0:12,14:1,25:0:0
chr10	118236610	.	T	A	323.43	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.361;QD=53.9041;RBI=0.0270905;REFB=0;REVB=0.0181769;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.05905e-05;OID=.;OPOS=118236610;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr10	118363642	.	T	C	2606.5	PASS	AF=1;AO=168;DP=169;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287874;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.136;QD=62.0596;RBI=0.0489068;REFB=0;REVB=0.0395369;RO=0;SAF=92;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02044e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.39347e-05;OID=.;OPOS=118363642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:169:168:0:0:168:168:1:76:92:0:0:76:92:0:0
chr10	118364967	.	G	C	1496.55	PASS	AF=1;AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00879884;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.676;QD=59.862;RBI=0.00888076;REFB=0;REVB=0.00120345;RO=0;SAF=58;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.93627e-05;OID=.;OPOS=118364967;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:100:0:0:99:100:1:41:58:0:0:42:58:0:0
chr10	118380511	.	A	G	190.8	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.417;QD=47.7006;RBI=0.034258;REFB=0;REVB=0.0321357;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108096;OID=.;OPOS=118380511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:8:7:0:0:8:8:0:0
chr10	118383461	.	AGA	AGAG,GAG	1339.82	PASS	AF=1,0;AO=84,6;DP=104;FAO=100,0;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=67,0;FSAR=33,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.196661,0.059988;FXX=0.00990001;HRUN=1,4;LEN=1,3;MLLD=21.1941,8.23158;QD=53.5928;RBI=0.206875,0.0604846;REFB=0,0;REVB=0.0641986,0.00773455;RO=11;SAF=54,6;SAR=30,0;SRF=8;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0201919,0.705658;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.00340222,0;OID=.,.;OPOS=118383464,118383461;OREF=-,AGA;OALT=G,GAG;OMAPALT=AGAG,GAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:104:100:11:0:84,6:100,0:1,0:30,0:54,6:8:3:33,0:67,0:0:0
chr10	118387282	.	AG	A,GG	276.92	PASS	AF=0.25,0.53125;AO=8,17;DP=32;FAO=8,17;FDP=32;FR=.;FRO=7;FSAF=0,10;FSAR=8,7;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.108624,0.0136469;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=21.1961,166.242;QD=34.6145;RBI=0.117509,0.0531673;REFB=0.0269929,-0.0739551;REVB=0.0448245,-0.0513861;RO=7;SAF=0,10;SAR=8,7;SRF=7;SRR=0;SSEN=0.367647,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.840898,-0.236216;STB=0.998665,0.629493;STBP=0,0.085;TYPE=del,snp;VARB=-0.0818407,0.0080553;OID=.,.;OPOS=118387283,118387282;OREF=G,A;OALT=-,G;OMAPALT=A,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:59:32:32:7:7:8,17:8,17:0.25,0.53125:8,7:0,10:7:0:8,7:0,10:7:0
chr10	118397884	.	A	G	164.46	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0232036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6549;QD=13.7046;RBI=0.0353551;REFB=-0.0274898;REVB=-0.0266754;RO=29;SAF=12;SAR=6;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270009;STB=0.666481;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0380469;OID=.;OPOS=118397884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:29:30:18:18:0.375:6:12:12:17:6:12:12:18
chr10	118397894	.	A	G	163.92	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0111981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.195;QD=12.8561;RBI=0.0131664;REFB=-0.0258203;REVB=0.00692513;RO=32;SAF=12;SAR=7;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273115;STB=0.658373;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0452677;OID=.;OPOS=118397894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:7:12:12:20:7:12:12:20
chr10	118397971	.	A	G	165.23	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.0013458;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=119.724;QD=12.4702;RBI=0.0158738;REFB=-0.0174284;REVB=-0.0158166;RO=31;SAF=16;SAR=4;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.507342;STB=0.805668;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0239158;OID=.;OPOS=118397971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:53:31:33:20:20:0.377358:4:16:10:21:4:16:10:23
chr10	118404620	.	A	G	50.84	PASS	AF=0.205128;AO=8;DP=39;FAO=8;FDP=39;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0490885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.27;QD=5.21424;RBI=0.0496537;REFB=-0.00270366;REVB=0.00747001;RO=31;SAF=3;SAR=5;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133221;STB=0.588012;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00874125;OID=.;OPOS=118404620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:39:39:31:31:8:8:0.205128:5:3:15:16:5:3:15:16
chr10	118616110	.	C	T	306.89	PASS	AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.00131606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.742;QD=18.0526;RBI=0.0253682;REFB=-0.0375224;REVB=0.025334;RO=35;SAF=12;SAR=21;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632461;STB=0.535389;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0385075;OID=.;OPOS=118616110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:21:12:15:20:21:12:15:20
chr10	118635605	.	C	G	219.67	PASS	AF=0.478261;AO=21;DP=45;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.017105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.54;QD=19.1013;RBI=0.0451237;REFB=-0.0120391;REVB=0.0417561;RO=24;SAF=12;SAR=9;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284033;STB=0.526292;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0394137;OID=.;OPOS=118635605;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:24:24:21:22:0.478261:9:12:13:11:9:13:13:11
chr10	118890573	.	T	C	138.65	PASS	AF=0.306452;AO=19;DP=62;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.00653535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3368;QD=8.94507;RBI=0.00707353;REFB=-0.0375483;REVB=-0.00270628;RO=40;SAF=7;SAR=12;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288877;STB=0.660936;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0445496;OID=.;OPOS=118890573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:40:43:19:19:0.306452:12:7:25:15:12:7:26:17
chr10	119013632	.	C	T	108.3	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00635896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0303;QD=13.5371;RBI=0.0325247;REFB=-0.0483235;REVB=-0.031897;RO=19;SAF=9;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231534;STB=0.636147;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0677206;OID=.;OPOS=119013632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:4:9:9:10:4:9:9:10
chr10	119026566	.	T	C	480.43	PASS	AF=0.494737;AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=32;FWDB=-0.0255323;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.657;QD=20.2288;RBI=0.0339462;REFB=-0.0122184;REVB=0.0223707;RO=47;SAF=18;SAR=29;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411082;STB=0.52686;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.010643;OID=.;OPOS=119026566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:47:48:47:47:0.494737:29:18:16:31:29:18:16:32
chr10	119133968	.	G	C	720.44	PASS	AF=0.490066;AO=74;DP=151;FAO=74;FDP=151;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=43;FSRR=34;FWDB=0.000258774;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=327.102;QD=19.0845;RBI=0.0139097;REFB=-0.00640688;REVB=-0.0139073;RO=77;SAF=34;SAR=40;SRF=43;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0913267;STB=0.55038;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00593453;OID=.;OPOS=119133968;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:77:77:74:74:0.490066:40:34:43:34:40:34:43:34
chr10	119134058	.	T	C	525.57	PASS	AF=0.470588;AO=55;DP=118;FAO=56;FDP=119;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=23;FWDB=-0.0547698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3762;QD=17.6661;RBI=0.078671;REFB=0.00363146;REVB=-0.0564747;RO=63;SAF=31;SAR=24;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703624;STB=0.534641;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-0.00683297;OID=.;OPOS=119134058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:119:63:63:55:56:0.470588:24:31:40:23:24:32:40:23
chr10	119768551	.	C	T	224.38	PASS	AF=0.302083;AO=28;DP=95;FAO=29;FDP=96;FR=.;FRO=67;FSAF=24;FSAR=5;FSRF=47;FSRR=20;FWDB=-0.0073531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.087;QD=9.34921;RBI=0.0194174;REFB=-0.0151041;REVB=-0.0179713;RO=66;SAF=23;SAR=5;SRF=47;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186397;STB=0.628173;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0292097;OID=.;OPOS=119768551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:66:67:28:29:0.302083:5:23:47:19:5:24:47:20
chr10	120069611	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.265;QD=44.6898;RBI=0.0129613;REFB=0;REVB=9.98438e-05;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.83336e-05;OID=.;OPOS=120069611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr10	120070427	.	G	T	252.99	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0795629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.059;QD=50.5988;RBI=0.0795725;REFB=0;REVB=-0.0012318;RO=0;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000712343;OID=.;OPOS=120070427;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:20:0:0:18:20:1:15:3:0:0:15:5:0:0
chr10	120353910	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.213;QD=56.1912;RBI=0.0366131;REFB=0;REVB=0.0167134;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199803;OID=.;OPOS=120353910;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr10	120354223	.	G	C	195.4	PASS	AF=0.512821;AO=18;DP=37;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.000801827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.284;QD=20.0409;RBI=0.0533721;REFB=-0.0214757;REVB=0.0533661;RO=19;SAF=12;SAR=6;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193773;STB=0.629099;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0168703;OID=.;OPOS=120354223;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:39:19:19:18:20:0.512821:6:12:16:3:8:12:16:3
chr10	120791060	.	A	C	317.89	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0998743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.592;QD=52.9814;RBI=0.104875;REFB=0;REVB=0.0319997;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000758506;OID=.;OPOS=120791060;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:22:24:1:14:8:0:0:14:10:0:0
chr10	120791778	.	TAAATACC	T	397.43	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00929548;FXX=0;HRUN=3;LEN=7;MLLD=324.359;QD=48.1728;RBI=0.0125001;REFB=0;REVB=-0.00835739;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-2.17827e-05;OID=.;OPOS=120791779;OREF=AAATACC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:29:29:33:33:0:14:19:0:0:7:0:14:15:0:0
chr10	120792297	.	G	A,GCTA	908.43	PASS	AF=0.0285714,0.914286;AO=3,61;DP=71;FAO=2,64;FDP=70;FR=.;FRO=4;FSAF=1,22;FSAR=1,42;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0128867,0.00423195;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=104.74,299.89;QD=51.9103;RBI=0.0149185,0.00655563;REFB=0.0272543,0.00648193;REVB=-0.00751622,0.00500668;RO=5;SAF=1,21;SAR=2,40;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0671606,-0.00877636;STB=0.5,0.510118;STBP=1,0.553;TYPE=snp,ins;VARB=0.0179755,0.000262186;OID=.,.;OPOS=120792297,120792298;OREF=G,-;OALT=A,CTA;OMAPALT=A,GCTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:14:71:70:5:4:3,61:2,64:0.0285714,0.914286:2,40:1,21:2:3:1,42:1,22:2:2
chr10	120792684	.	A	G	289.73	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00948756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.528;QD=52.6781;RBI=0.0799405;REFB=0;REVB=0.0793755;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376329;OID=.;OPOS=120792684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:12:9:0:0:13:9:0:0
chr10	120792703	.	C	A	411.1	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.895;QD=56.7031;RBI=0.0275425;REFB=0;REVB=0.0130502;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.13782e-05;OID=.;OPOS=120792703;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:16:12:0:0:17:12:0:0
chr10	120820528	.	A	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192263;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.7991;QD=46.8477;RBI=0.0555573;REFB=0;REVB=0.0521245;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00069043;OID=.;OPOS=120820528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:8:7:0:0:8:7:0:0
chr10	120828969	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.71;QD=55.6555;RBI=0.0876104;REFB=0;REVB=0.0805338;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000643275;OID=.;OPOS=120828969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr10	120896027	.	G	A	1154.82	PASS	AF=1;AO=73;DP=75;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00838435;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9103;QD=59.2214;RBI=0.0332391;REFB=0;REVB=-0.0321642;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00164786;OID=.;OPOS=120896027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:78:0:0:73:78:1:34:39:0:0:36:42:0:0
chr10	120909785	.	C	T	1418.79	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00977263;FXX=0.0109878;HRUN=2;LEN=1;MLLD=293.668;QD=63.0575;RBI=0.0104348;REFB=0;REVB=0.00365789;RO=0;SAF=60;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.05167e-05;OID=.;OPOS=120909785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:90:0:0:88:90:1:28:60:0:0:30:60:0:0
chr10	120917445	.	G	A	748.99	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00259547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9733;QD=55.4809;RBI=0.0346839;REFB=0;REVB=0.0345866;RO=1;SAF=29;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159704;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116579;OID=.;OPOS=120917445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:1:0:53:54:1:24:29:1:0:24:30:0:0
chr10	120919246	.	T	C	507.93	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0202699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.535;QD=56.4362;RBI=0.0205803;REFB=0.0291327;REVB=-0.00356101;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510198;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=-0.00177504;OID=.;OPOS=120919246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:0:1:35:35:0.972222:11:24:0:0:11:24:1:0
chr10	120920588	.	T	C	750.54	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0509694;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2541;QD=63.8757;RBI=0.0509745;REFB=0;REVB=0.000722342;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567768;OID=.;OPOS=120920588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:29:18:0:0:29:18:0:0
chr10	120933324	.	G	A	101.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1766;QD=40.7616;RBI=0.0449971;REFB=0;REVB=-0.0449971;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00145839;OID=.;OPOS=120933324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:10:0:0:0:10:0:0:0
chr10	121196335	.	G	A	293.24	PASS	AF=0.361702;AO=34;DP=94;FAO=34;FDP=94;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0160498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.427;QD=12.4782;RBI=0.018068;REFB=-0.0049162;REVB=-0.008298;RO=59;SAF=25;SAR=9;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339447;STB=0.691582;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0102035;OID=.;OPOS=121196335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:59:60:34:34:0.361702:9:25:26:33:9:25:27:33
chr10	121432157	.	G	A	454.66	PASS	AF=0.474227;AO=45;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.0135669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.152;QD=18.7487;RBI=0.014213;REFB=-0.00846863;REVB=-0.00423678;RO=50;SAF=30;SAR=15;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127866;STB=0.570981;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00866808;OID=.;OPOS=121432157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:50:51:45:46:0.474227:15:30:27:23:15:31:28:23
chr10	121436068	.	T	G	127.8	PASS	AF=0.290323;AO=18;DP=62;FAO=18;FDP=62;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.00599878;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.694;QD=8.24505;RBI=0.0324672;REFB=-0.00919521;REVB=-0.0319082;RO=44;SAF=11;SAR=7;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185004;STB=0.610988;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0163652;OID=.;OPOS=121436068;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:44:44:18:18:0.290323:7:11:20:24:7:11:20:24
chr10	121436286	.	C	T	65.73	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.075403;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9787;QD=10.1128;RBI=0.0796568;REFB=0.00945668;REVB=-0.0256826;RO=18;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120817;STB=0.555432;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=-0.0143745;OID=.;OPOS=121436286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:27:26:18:17:9:9:0.346154:4:5:8:10:4:5:8:9
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chr10	121579040	.	T	C	213.53	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0125275;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.736;QD=16.1155;RBI=0.0212557;REFB=-0.00109573;REVB=-0.0171717;RO=28;SAF=11;SAR=13;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631938;STB=0.524622;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00138606;OID=.;OPOS=121579040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:29:24:24:0.45283:13:11:11:17:13:11:12:17
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chr10	121618382	.	T	A	97.29	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0257886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3303;QD=12.972;RBI=0.0476467;REFB=-0.0389955;REVB=-0.0400644;RO=18;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225979;STB=0.634375;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0595928;OID=.;OPOS=121618382;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:9:3:8:10:9:3:8:10
chr10	121671651	.	T	C	367.36	PASS	AF=0.297619;AO=48;DP=167;FAO=50;FDP=168;FR=.;FRO=118;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=56;FSRR=62;FWDB=-0.00149882;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.492;QD=8.74677;RBI=0.0443275;REFB=-0.0147438;REVB=0.0443022;RO=117;SAF=22;SAR=26;SRF=56;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246425;STB=0.524486;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0376303;OID=.;OPOS=121671651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:168:117:118:48:50:0.297619:26:22:56:61:28:22:56:62
chr10	121679013	.	A	G	1433.35	PASS	AF=0.98;AO=97;DP=100;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0249651;FXX=0.0196059;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.32;QD=57.334;RBI=0.0290911;REFB=-0.0771451;REVB=0.0149344;RO=2;SAF=36;SAR=61;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00527961;STB=0.502601;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.000139517;OID=.;OPOS=121679013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:100:100:2:2:97:98:0.98:61:36:1:1:61:37:1:1
chr10	121685559	.	G	A	171.73	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0105332;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.357;QD=12.4891;RBI=0.0743954;REFB=-0.00430881;REVB=-0.0736459;RO=34;SAF=13;SAR=8;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985706;STB=0.557088;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00698573;OID=.;OPOS=121685559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:34:34:21:21:0.381818:8:13:18:16:8:13:18:16
chr10	121693246	.	A	G	149.86	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00397345;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.491;QD=18.7323;RBI=0.0258926;REFB=-0.0295893;REVB=-0.0255859;RO=15;SAF=11;SAR=5;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0833065;STB=0.568876;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0299808;OID=.;OPOS=121693246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:16:16:16:0.5:5:11:9:6:5:11:9:7
chr10	122216862	.	C	T	935.3	PASS	AF=0.578231;AO=82;DP=144;FAO=85;FDP=147;FR=.;FRO=62;FSAF=50;FSAR=35;FSRF=47;FSRR=15;FWDB=0.0317772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.877;QD=25.4504;RBI=0.047253;REFB=-0.0421877;REVB=-0.0349722;RO=60;SAF=47;SAR=35;SRF=45;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144015;STB=0.575895;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0244338;OID=.;OPOS=122216862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:147:60:62:82:85:0.578231:35:47:45:15:35:50:47:15
chr10	122263113	.	G	T	339.92	PASS	AF=0.630435;AO=29;DP=46;FAO=29;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0227189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.859;QD=29.5585;RBI=0.0382261;REFB=0.00960443;REVB=-0.0307422;RO=17;SAF=8;SAR=21;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0626841;STB=0.534521;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=-0.00855261;OID=.;OPOS=122263113;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:17:17:29:29:0.630435:21:8:6:11:21:8:6:11
chr10	122358342	.	G	C	1113.44	PASS	AF=0.974684;AO=76;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0489358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.541;QD=56.3768;RBI=0.0969274;REFB=-0.0603567;REVB=0.0836672;RO=2;SAF=47;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00607549;STB=0.510414;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000903459;OID=.;OPOS=122358342;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:79:79:2:2:76:77:0.974684:29:47:1:1:30:47:2:0
chr10	122358463	.	G	A	1578.3	PASS	AF=0.981651;AO=107;DP=109;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=62;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0327049;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.981;QD=57.9191;RBI=0.039189;REFB=-0.200548;REVB=0.0215909;RO=1;SAF=62;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00759448;STB=0.501494;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00072513;OID=.;OPOS=122358463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:109:109:1:2:107:107:0.981651:45:62:1:0:45:62:1:1
chr10	122358657	.	A	T	124.04	PASS	AF=1;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618993;FXX=0.153728;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.2467;QD=45.1064;RBI=0.0748859;REFB=0;REVB=0.0421472;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00511712;OID=.;OPOS=122358657;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:13:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0
chr10	122359344	.	C	T	1510.83	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00549972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.106;QD=63.6138;RBI=0.0153585;REFB=0;REVB=0.01434;RO=0;SAF=48;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16501e-05;OID=.;OPOS=122359344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:47:48:0:0:47:48:0:0
chr10	123239112	.	G	A	840.9	PASS	AF=0.557143;AO=77;DP=140;FAO=78;FDP=140;FR=.;FRO=62;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=-0.00387404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.685;QD=24.0257;RBI=0.0152276;REFB=-0.011668;REVB=0.0147266;RO=61;SAF=37;SAR=40;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101814;STB=0.555541;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0131159;OID=.;OPOS=123239112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:140:61:62:77:78:0.557143:40:37:37:24:40:38:38:24
chr10	123298158	.	T	C	4019.15	PASS	AF=1;AO=257;DP=257;FAO=258;FDP=258;FR=.;FRO=0;FSAF=159;FSAR=99;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.607;QD=62.3125;RBI=0.0221546;REFB=0;REVB=0.0168484;RO=0;SAF=158;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.10552e-05;OID=.;OPOS=123298158;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:22:257:258:0:0:257:258:1:99:158:0:0:99:159:0:0
chr10	123549691	.	T	G	77.04	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.000351161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.818;QD=13.3976;RBI=0.0291827;REFB=-0.0134141;REVB=0.0291806;RO=12;SAF=5;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234457;STB=0.651897;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0302867;OID=.;OPOS=123549691;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:12:13:10:10:0.434783:5:5:9:3:5:5:10:3
chr10	123596254	.	T	C	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5902;QD=51.1822;RBI=0.0749079;REFB=0;REVB=0.058503;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00296982;OID=.;OPOS=123596254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr10	123673339	.	T	C	462.61	PASS	AF=0.918919;AO=32;DP=36;FAO=34;FDP=37;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.04099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2431;QD=50.0115;RBI=0.0758522;REFB=-0.0630961;REVB=0.063823;RO=3;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716813;STB=0.536564;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00441535;OID=.;OPOS=123673339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:36:37:3:3:32:34:0.918919:18:14:0:3:19:15:0:3
chr10	123719928	.	C	T	190.7	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00484358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.365;QD=15.2558;RBI=0.00614533;REFB=-0.00300922;REVB=0.00378218;RO=30;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12709;STB=0.573454;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00285931;OID=.;OPOS=123719928;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:30:20:20:0.4:13:7:14:16:13:7:14:16
chr10	123810060	.	G	A	187.11	PASS	AF=0.487179;AO=18;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.0470618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3698;QD=19.1909;RBI=0.0474856;REFB=-0.0209118;REVB=0.00633013;RO=17;SAF=12;SAR=6;SRF=14;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162284;STB=0.605962;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0221993;OID=.;OPOS=123810060;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:17:20:18:19:0.487179:6:12:14:3:6:13:17:3
chr10	123842825	.	C	G	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0171497;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=190.521;QD=12.73;RBI=0.0228459;REFB=-0.0172042;REVB=0.0150938;RO=11;SAF=1;SAR=8;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.510886;STB=0.799199;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0130232;OID=.;OPOS=123842825;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:11:12:9:9:0.428571:8:1:6:5:8:1:6:6
chr10	123843185	.	T	C	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.723;QD=12.8607;RBI=0.0418703;REFB=-0.0401567;REVB=-0.0418703;RO=7;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0561043;OID=.;OPOS=123843185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:8:7:7:0.466667:7:0:0:7:7:0:0:8
chr10	123845322	.	T	C	805.14	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00302162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4775;QD=64.4115;RBI=0.0260857;REFB=0;REVB=0.0259101;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105836;OID=.;OPOS=123845322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0
chr10	123846490	.	C	T	871.65	PASS	AF=0.449761;AO=94;DP=211;FAO=94;FDP=209;FR=.;FRO=115;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=45;FSRR=70;FWDB=0.0113766;FXX=0.00947822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.97;QD=16.6823;RBI=0.0124105;REFB=-0.0226821;REVB=-0.00495924;RO=115;SAF=40;SAR=54;SRF=45;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349359;STB=0.519368;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0322441;OID=.;OPOS=123846490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:211:209:115:115:94:94:0.449761:54:40:45:70:54:40:45:70
chr10	123848113	.	G	A	261.38	PASS	AF=0.454545;AO=28;DP=63;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00718699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.491;QD=15.8412;RBI=0.0189839;REFB=-0.00507429;REVB=0.0175709;RO=31;SAF=16;SAR=12;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052286;STB=0.518206;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.00629593;OID=.;OPOS=123848113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:66:31:36:28:30:0.454545:12:16:16:15:14:16:18:18
chr10	123976391	.	C	A	1345.41	PASS	AF=0.9375;AO=90;DP=96;FAO=90;FDP=96;FR=.;FRO=6;FSAF=55;FSAR=35;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0227231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.528;QD=56.0588;RBI=0.0242041;REFB=-0.106043;REVB=-0.00833674;RO=6;SAF=55;SAR=35;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489491;STB=0.525856;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00235258;OID=.;OPOS=123976391;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:96:96:6:6:90:90:0.9375:35:55:6:0:35:55:6:0
chr10	123996976	.	G	A	785.41	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7986;QD=57.1208;RBI=0.0450148;REFB=0;REVB=0.032617;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272265;OID=.;OPOS=123996976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:30:24:0:0:30:25:0:0
chr10	124001539	.	G	C	716.55	PASS	AF=0.963636;AO=51;DP=54;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0528573;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=41.2395;QD=52.113;RBI=0.0970273;REFB=-0.120301;REVB=0.0813659;RO=3;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447913;STB=0.515146;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00526361;OID=.;OPOS=124001539;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:54:55:3:2:51:53:0.963636:30:21:0:3:32:21:0:2
chr10	124013604	.	C	A	1592.25	PASS	AF=1;AO=106;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115184;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.727;QD=60.085;RBI=0.013786;REFB=0;REVB=0.00757502;RO=0;SAF=56;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.6063e-05;OID=.;OPOS=124013604;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:106:0:0:106:106:1:50:56:0:0:50:56:0:0
chr10	124089036	.	G	A	1012.91	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0470959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=298.509;QD=57.8804;RBI=0.053104;REFB=-0.147194;REVB=0.0245359;RO=1;SAF=43;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108681;STB=0.505745;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000333732;OID=.;OPOS=124089036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:26:43:1:0:26:43:1:0
chr10	124089075	.	G	A	447.65	PASS	AF=0.573333;AO=43;DP=75;FAO=43;FDP=75;FR=.;FRO=32;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00238341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8251;QD=23.8744;RBI=0.017558;REFB=-0.0218868;REVB=-0.0173954;RO=32;SAF=29;SAR=14;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216954;STB=0.61936;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.014999;OID=.;OPOS=124089075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:32:32:43:43:0.573333:14:29:13:19:14:29:13:19
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chr10	124096061	.	A	C	171.98	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0111495;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.595;QD=17.198;RBI=0.0141791;REFB=-0.00366008;REVB=-0.0087599;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345678;STB=0.519752;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00446462;OID=.;OPOS=124096061;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:22:22:18:18:0.45:8:10:13:9:8:10:13:9
chr10	124183732	.	T	C	3200.7	PASS	AF=1;AO=207;DP=207;FAO=207;FDP=207;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8715;QD=61.8492;RBI=0.0322805;REFB=0;REVB=-0.0302012;RO=0;SAF=103;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95298e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.40909e-05;OID=.;OPOS=124183732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:207:207:0:0:207:207:1:104:103:0:0:104:103:0:0
chr10	124189197	.	A	G	731.44	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.076471;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1934;QD=63.6031;RBI=0.110113;REFB=0;REVB=0.0792272;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129215;OID=.;OPOS=124189197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:15:31:0:0:15:31:0:0
chr10	124214448	.	G	T	470.07	PASS	AF=0.511111;AO=45;DP=89;FAO=46;FDP=90;FR=.;FRO=44;FSAF=36;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=6;FWDB=0.00422582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.667;QD=20.8921;RBI=0.0120057;REFB=-0.0224396;REVB=-0.0112374;RO=43;SAF=36;SAR=9;SRF=37;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0888587;STB=0.562285;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0191222;OID=.;OPOS=124214448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:43:44:45:46:0.511111:9:36:37:6:10:36:38:6
chr10	124271528	.	C	T	143.02	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0131053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7897;QD=10.7938;RBI=0.0201784;REFB=-0.015298;REVB=0.0153434;RO=35;SAF=13;SAR=5;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0494976;STB=0.529229;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0362062;OID=.;OPOS=124271528;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:5:13:24:11:5:13:24:11
chr10	124329672	.	TC	CT	589.92	PASS	AF=1;AO=50;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.14018;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=156.211;QD=45.3784;RBI=0.148603;REFB=-0.0795598;REVB=0.0493201;RO=1;SAF=28;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165169;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.002317;OID=.;OPOS=124329672;OREF=TC;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:52:52:1:0:50:52:1:22:28:1:0:23:29:0:0
chr10	124329710	.	C	A	712.75	PASS	AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0244997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.039;QD=52.7965;RBI=0.0255729;REFB=-0.0577364;REVB=0.00733068;RO=1;SAF=23;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200378;STB=0.502164;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.000795667;OID=.;OPOS=124329710;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:54:54:1:2:52:52:0.962963:29:23:1:0:29:23:1:1
chr10	124329746	.	A	T	734.22	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0043428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.713;QD=61.1848;RBI=0.0285011;REFB=0.0114901;REVB=0.0281683;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508768;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-4.85285e-06;OID=.;OPOS=124329746;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:0:1:47:47:0.979167:28:19:0:0:28:19:0:1
chr10	124330427	.	C	T	1183.2	PASS	AF=0.987805;AO=78;DP=80;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0791794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.951;QD=57.7171;RBI=0.0891972;REFB=-0.129089;REVB=-0.0410702;RO=2;SAF=42;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0220049;STB=0.505493;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00582351;OID=.;OPOS=124330427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:82:2:1:78:81:0.987805:36:42:2:0:36:45:1:0
chr10	124331867	.	C	T	1936.21	PASS	AF=0.992126;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00886348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.004;QD=60.9831;RBI=0.012007;REFB=-0.0769458;REVB=-0.00809981;RO=1;SAF=77;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0095981;STB=0.50505;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.000165365;OID=.;OPOS=124331867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:127:127:1:1:126:126:0.992126:49:77:0:1:49:77:0:1
chr10	124339332	.	T	C	1589.8	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00921419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.343;QD=59.9923;RBI=0.0101224;REFB=0;REVB=-0.00419063;RO=0;SAF=55;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.43331e-05;OID=.;OPOS=124339332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:51:55:0:0:51:55:0:0
chr10	124339378	.	A	G	246.06	PASS	AF=0.313725;AO=32;DP=102;FAO=32;FDP=102;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=-0.000489757;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.344;QD=9.64937;RBI=0.0501649;REFB=-0.0053304;REVB=0.0501625;RO=70;SAF=18;SAR=14;SRF=43;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.062393;STB=0.53641;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0115011;OID=.;OPOS=124339378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:70:70:32:32:0.313725:14:18:43:27:14:18:43:27
chr10	124402677	.	A	G	473.38	PASS	AF=0.516854;AO=45;DP=87;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.00810565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3779;QD=21.2756;RBI=0.0408711;REFB=-0.0406472;REVB=-0.0400593;RO=42;SAF=27;SAR=18;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471067;STB=0.525344;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0330719;OID=.;OPOS=124402677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:89:42:43:45:46:0.516854:18:27:23:19:18:28:24:19
chr10	124585833	.	T	C	1326.15	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00251903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.182;QD=60.2793;RBI=0.0535619;REFB=0;REVB=0.0535026;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018135;OID=.;OPOS=124585833;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:88:0:0:79:88:1:35:44:0:0:37:51:0:0
chr10	124610027	.	G	A	1628.69	PASS	AF=0.982143;AO=110;DP=112;FAO=110;FDP=112;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00408054;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.844;QD=58.1674;RBI=0.0463713;REFB=0.08444;REVB=-0.0461914;RO=2;SAF=60;SAR=50;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0186077;STB=0.509802;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.00891777;OID=.;OPOS=124610027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:112:112:2:2:110:110:0.982143:50:60:0:2:50:60:0:2
chr10	124648150	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3539;QD=42.1823;RBI=0.109849;REFB=0;REVB=0.105428;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00668671;OID=.;OPOS=124648150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr10	124742792	.	G	A	185.98	PASS	AF=0.324324;AO=24;DP=73;FAO=24;FDP=74;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=10;FWDB=-0.0329422;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.322;QD=10.0529;RBI=0.0334462;REFB=-0.00718814;REVB=-0.00578435;RO=45;SAF=15;SAR=9;SRF=35;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195605;STB=0.634518;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0301576;OID=.;OPOS=124742792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:45:50:24:24:0.324324:9:15:35:10:9:15:40:10
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chr10	124816515	.	C	G	638.8	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0369831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9362;QD=59.4235;RBI=0.0370559;REFB=0.00829379;REVB=0.00232263;RO=1;SAF=27;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170712;STB=0.509087;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.000739374;OID=.;OPOS=124816515;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:15:27:1:0:15:27:1:0
chr10	125426412	.	A	G	219.68	PASS	AF=0.346154;AO=27;DP=79;FAO=27;FDP=78;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=14;FWDB=-0.0555569;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.39;QD=11.2654;RBI=0.0561001;REFB=-0.0261333;REVB=-0.00778778;RO=51;SAF=17;SAR=10;SRF=37;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120806;STB=0.569571;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0354542;OID=.;OPOS=125426412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:51:51:27:27:0.346154:10:17:37:14:10:17:37:14
chr10	125426565	.	G	C	1540.59	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0090438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.875;QD=59.8287;RBI=0.0130244;REFB=0;REVB=-0.0093726;RO=0;SAF=55;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.60496e-07;OID=.;OPOS=125426565;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:48:55:0:0:48:55:0:0
chr10	125449015	.	G	A	817.4	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.147;QD=57.3612;RBI=0.0270851;REFB=0;REVB=0.00520859;RO=0;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.56237e-05;OID=.;OPOS=125449015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:21:36:0:0:21:36:0:0
chr10	125450857	.	C	G	1097.29	PASS	AF=1;AO=62;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0877015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.877;QD=60.1252;RBI=0.105119;REFB=0;REVB=0.0579529;RO=0;SAF=24;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000343164;OID=.;OPOS=125450857;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:62:73:1:38:24:0:0:40:33:0:0
chr10	125506302	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.971;QD=63.8719;RBI=0.0177298;REFB=0;REVB=0.00454245;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.94748e-05;OID=.;OPOS=125506302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:21:27:0:0:21:27:0:0
chr10	125521533	.	G	A	165.18	PASS	AF=0.38;AO=18;DP=51;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.00967237;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.004;QD=13.2145;RBI=0.0133853;REFB=-0.00737663;REVB=0.0092527;RO=31;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305167;STB=0.654876;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0112125;OID=.;OPOS=125521533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:31:31:18:19:0.38:7:11:10:21:8:11:10:21
chr10	125521590	.	G	A	257.98	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=56;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0185594;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.331;QD=18.4269;RBI=0.0225524;REFB=0.00521643;REVB=0.0128126;RO=26;SAF=16;SAR=12;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389841;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00490678;OID=.;OPOS=125521590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:26:28:28:28:0.5:12:16:16:10:12:16:16:12
chr10	125528048	.	G	A	2774.41	PASS	AF=0.98895;AO=178;DP=184;FAO=179;FDP=181;FR=.;FRO=2;FSAF=95;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0124319;FXX=0.0163035;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.567;QD=61.3128;RBI=0.0292757;REFB=-0.0390081;REVB=0.026505;RO=0;SAF=94;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35328e-08;STB=0.500341;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.000138395;OID=.;OPOS=125528048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:184:181:0:2:178:179:0.98895:84:94:0:0:84:95:1:1
chr10	126089434	.	G	A	108.0	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00713317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.772;QD=13.0913;RBI=0.00864911;REFB=-0.0049713;REVB=0.00489132;RO=19;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414547;STB=0.537678;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0244138;OID=.;OPOS=126089434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:20:13:13:0.393939:6:7:11:8:6:7:12:8
chr10	126172863	.	A	G	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0619415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.4;QD=57.1057;RBI=0.0641684;REFB=0;REVB=-0.0167582;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181156;OID=.;OPOS=126172863;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:34:21:0:0:34:21:0:0
chr10	126517989	.	G	A	937.56	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0206676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7819;QD=58.5977;RBI=0.0357304;REFB=0;REVB=0.0291464;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75005e-05;OID=.;OPOS=126517989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:27:37:0:0:27:37:0:0
chr10	126674093	.	T	C	81.61	PASS	AF=0.282051;AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00810644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8899;QD=8.37017;RBI=0.0711266;REFB=-0.00125235;REVB=0.0706632;RO=27;SAF=6;SAR=5;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116427;STB=0.583184;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0041101;OID=.;OPOS=126674093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:39:39:27:28:11:11:0.282051:5:6:12:15:5:6:12:16
chr10	126674227	.	C	CT,T	1345.86	PASS	AF=0.984,0.016;AO=109,5;DP=126;FAO=123,2;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=59,2;FSAR=64,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00403548,-0.0282435;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=14.6857,159.998;QD=43.0674;RBI=0.158659,0.054485;REFB=0,0;REVB=-0.158608,-0.0465932;RO=8;SAF=56,4;SAR=53,1;SRF=2;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0341414,0.5176;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=6.76153e-05,0.0387171;OID=.,.;OPOS=126674228,126674227;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:126:125:8:0:109,5:123,2:0.984,0.016:53,1:56,4:2:6:64,0:59,2:0:0
chr10	126674876	.	A	G	293.65	PASS	AF=0.783784;AO=20;DP=27;FAO=29;FDP=37;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0277519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7892;QD=31.7456;RBI=0.288239;REFB=-0.101978;REVB=0.286899;RO=7;SAF=3;SAR=17;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366526;STB=0.629859;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.10181;OID=.;OPOS=126674876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:27:37:7:8:20:29:0.783784:17:3:5:2:22:7:6:2
chr10	126675759	.	A	AAGAT	495.96	PASS	AF=0.453782;AO=53;DP=120;FAO=54;FDP=119;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.020077;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=291.682;QD=16.6708;RBI=0.0222867;REFB=-0.0264867;REVB=-0.00967528;RO=66;SAF=24;SAR=29;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0769613;STB=0.541198;STBP=0.45;TYPE=ins;VARB=0.0319748;OID=.;OPOS=126675760;OREF=-;OALT=AGAT;OMAPALT=AAGAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.453782:53:120:54:119:65:25:29:35:30:99:66:24:29:35:31
chr10	126677239	.	GAAGAA	G	100.62	PASS	AF=0.538462;AO=13;DP=25;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0238806;FXX=0;HRUN=2;LEN=5;MLLD=213.77;QD=15.4796;RBI=0.0265586;REFB=-0.00344086;REVB=0.0116222;RO=8;SAF=8;SAR=5;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243638;STB=0.644963;STBP=0.142;TYPE=del;VARB=0.00243932;OID=.;OPOS=126677240;OREF=AAGAA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.538462:13:25:14:26:12:8:6:3:9:76:8:8:5:2:6
chr10	126714714	.	G	C	114.06	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0454178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.74;QD=18.2489;RBI=0.057117;REFB=0.00717604;REVB=0.0346348;RO=12;SAF=2;SAR=11;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.438003;STB=0.755275;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.00228884;OID=.;OPOS=126714714;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:11:2:7:5:11:2:7:5
chr10	126714966	.	A	G	114.56	PASS	AF=0.545455;AO=11;DP=21;FAO=12;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0229281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.691;QD=20.8295;RBI=0.0483802;REFB=-0.00107447;REVB=-0.0426022;RO=6;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287382;STB=0.620483;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.00493076;OID=.;OPOS=126714966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:21:22:6:8:11:12:0.545455:4:7:1:5:4:8:3:5
chr10	126715154	.	A	G	235.37	PASS	AF=0.394366;AO=28;DP=71;FAO=28;FDP=71;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0584517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.975;QD=13.2602;RBI=0.0788022;REFB=-0.0353751;REVB=-0.0528506;RO=41;SAF=19;SAR=9;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106074;STB=0.578832;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0546018;OID=.;OPOS=126715154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:41:43:28:28:0.394366:9:19:24:17:9:19:24:19
chr10	126715242	.	GGC	G,GG	61.42	PASS	AF=0,0.615385;AO=4,9;DP=26;FAO=0,16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=0,6;FSAR=0,10;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.103412,0.233334;FXX=0;HRUN=3,7;LEN=2,1;MLLD=16.8551,8.93556;QD=9.44965;RBI=0.234015,0.238074;REFB=-0.010625,-0.119506;REVB=-0.209926,-0.0472677;RO=11;SAF=0,5;SAR=4,4;SRF=7;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.725474,-0.0769224;STB=0.5,0.588123;STBP=1,0.263;TYPE=del,del;VARB=0,0.117396;OID=.,.;OPOS=126715243,126715244;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.615385:4,9:26:0,16:26:10:0,6:0,10:6:4:36:11:0,5:4,4:7:4
chr10	126715375	.	C	T	180.16	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.0125199;FXX=0.0588062;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.946;QD=22.5198;RBI=0.0147426;REFB=0.026738;REVB=-0.0077843;RO=12;SAF=11;SAR=3;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32036;STB=0.644997;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.00420251;OID=.;OPOS=126715375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:34:32:12:9:14:14:0.4375:3:11:12:0:3:11:9:0
chr10	126715629	.	C	T	393.25	PASS	AF=0.424528;AO=45;DP=106;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=27;FWDB=0.0316754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0026;QD=14.8395;RBI=0.0398244;REFB=-0.00617151;REVB=0.0241382;RO=61;SAF=24;SAR=21;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247583;STB=0.513918;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.00825783;OID=.;OPOS=126715629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:61:61:45:45:0.424528:21:24:34:27:21:24:34:27
chr10	126721441	.	C	A	198.54	PASS	AF=0.678571;AO=14;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.00409854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.081;QD=28.3631;RBI=0.018144;REFB=-0.0260151;REVB=0.017675;RO=9;SAF=4;SAR=10;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161555;STB=0.550848;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0150557;OID=.;OPOS=126721441;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:28:28:9:9:14:19:0.678571:10:4:1:8:15:4:1:8
chr10	126727602	.	T	A	58.05	PASS	AF=0.133333;AO=12;DP=90;FAO=12;FDP=90;FR=.;FRO=78;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=24;FSRR=54;FWDB=-0.0119936;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.711;QD=2.58022;RBI=0.0224489;REFB=0.00238635;REVB=0.0189764;RO=78;SAF=3;SAR=9;SRF=24;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874836;STB=0.562391;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=-0.0128781;OID=.;OPOS=126727602;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:90:90:78:78:12:12:0.133333:9:3:24:54:9:3:24:54
chr10	126727604	.	T	C	58.38	PASS	AF=0.134831;AO=12;DP=89;FAO=12;FDP=89;FR=.;FRO=77;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=54;FWDB=-0.00203118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0722;QD=2.62399;RBI=0.00633701;REFB=0.00204402;REVB=0.00600266;RO=76;SAF=3;SAR=9;SRF=22;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0614159;STB=0.553099;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=-0.0153218;OID=.;OPOS=126727604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:89:89:76:77:12:12:0.134831:9:3:22:54:9:3:23:54
chr10	126727630	.	T	G	72.46	PASS	AF=0.175676;AO=13;DP=74;FAO=13;FDP=74;FR=.;FRO=61;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=48;FWDB=0.000822232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.479;QD=3.91664;RBI=0.0134497;REFB=-0.00343941;REVB=0.0134246;RO=60;SAF=3;SAR=10;SRF=12;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05683;STB=0.520927;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0202804;OID=.;OPOS=126727630;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:74:74:60:61:13:13:0.175676:10:3:12:48:10:3:13:48
chr10	127445408	.	G	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7641;QD=33.4285;RBI=0.0279489;REFB=0;REVB=-0.0208017;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00354691;OID=.;OPOS=127445408;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr10	127462525	.	A	G	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8686;QD=55.6549;RBI=0.0223522;REFB=0;REVB=-0.0136856;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.86226e-05;OID=.;OPOS=127462525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0
chr10	127579186	.	C	A	85.22	PASS	AF=0.127517;AO=19;DP=149;FAO=19;FDP=149;FR=.;FRO=130;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=75;FSRR=55;FWDB=-0.045475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.173;QD=2.28786;RBI=0.0516147;REFB=-0.00655562;REVB=-0.0244153;RO=128;SAF=11;SAR=8;SRF=74;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00105282;STB=0.501808;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0506628;OID=.;OPOS=127579186;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:149:149:128:130:19:19:0.127517:8:11:74:54:8:11:75:55
chr10	127579210	.	T	C	204.49	PASS	AF=0.204678;AO=35;DP=171;FAO=35;FDP=171;FR=.;FRO=136;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=65;FSRR=71;FWDB=0.0268053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4624;QD=4.78348;RBI=0.0356986;REFB=-0.00498136;REVB=0.0235769;RO=136;SAF=27;SAR=8;SRF=65;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388137;STB=0.74332;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0189255;OID=.;OPOS=127579210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:171:171:136:136:35:35:0.204678:8:27:65:71:8:27:65:71
chr10	127579238	.	G	T	480.05	PASS	AF=0.338983;AO=60;DP=177;FAO=60;FDP=177;FR=.;FRO=117;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=62;FSRR=55;FWDB=-0.00780401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.536;QD=10.8485;RBI=0.0243111;REFB=-0.00512369;REVB=-0.0230245;RO=117;SAF=27;SAR=33;SRF=62;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0920065;STB=0.552777;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0113418;OID=.;OPOS=127579238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:177:117:117:60:60:0.338983:33:27:62:55:33:27:62:55
chr10	127585173	.	T	C	94.54	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.000684581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.492;QD=21.0083;RBI=0.0147599;REFB=-0.0481217;REVB=0.0147441;RO=7;SAF=5;SAR=6;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178658;STB=0.510186;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0222084;OID=.;OPOS=127585173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:6:5:3:4:6:5:3:4
chr10	127585179	.	G	C	152.36	PASS	AF=0.75;AO=15;DP=20;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0470597;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=260.857;QD=30.4719;RBI=0.0470598;REFB=-0.0634358;REVB=-7.54456e-05;RO=5;SAF=7;SAR=8;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0599997;STB=0.533289;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0124387;OID=.;OPOS=127585179;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:20:20:5:5:15:15:0.75:8:7:3:2:8:7:3:2
chr10	127585240	.	G	A	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0593417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1979;QD=14.6525;RBI=0.0708885;REFB=0.0462137;REVB=0.038778;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120202;STB=0.571205;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=-0.0289232;OID=.;OPOS=127585240;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:2:4:4:1:2:4:4:1
chr10	127585263	.	C	T	30.97	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0368488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2191;QD=12.3872;RBI=0.0651207;REFB=-0.0090207;REVB=0.0536924;RO=4;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341697;STB=0.726606;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0370731;OID=.;OPOS=127585263;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:4:5:5:5:0.5:2:3:4:0:2:3:5:0
chr10	127724778	.	A	G	448.5	PASS	AF=1;AO=25;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.039;QD=57.871;RBI=0.0999711;REFB=0;REVB=0.0989539;RO=0;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000604134;OID=.;OPOS=127724778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:25:31:1:6:19:0:0:9:22:0:0
chr10	127730728	.	C	T	579.92	PASS	AF=0.558824;AO=56;DP=101;FAO=57;FDP=102;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.00505452;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.412;QD=22.7418;RBI=0.0238308;REFB=-0.0218125;REVB=-0.0232886;RO=45;SAF=27;SAR=29;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14955;STB=0.577187;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.020099;OID=.;OPOS=127730728;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:45:45:56:57:0.558824:29:27:30:15:29:28:30:15
chr10	127834139	.	T	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.544;QD=55.0987;RBI=0.045933;REFB=0;REVB=0.0445607;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120452;OID=.;OPOS=127834139;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr10	128019025	.	C	G	347.95	PASS	AF=0.408602;AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.00668101;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.3101;QD=14.9657;RBI=0.0094865;REFB=-0.0217637;REVB=0.00673482;RO=55;SAF=11;SAR=27;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110508;STB=0.562832;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0119616;OID=.;OPOS=128019025;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:55:55:38:38:0.408602:27:11:21:34:27:11:21:34
chr10	128114325	.	G	A	900.11	PASS	AF=1;AO=59;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.596;QD=58.0718;RBI=0.0311872;REFB=0;REVB=-0.0268669;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.43224e-05;OID=.;OPOS=128114325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:59:62:1:27:32:0:0:28:34:0:0
chr10	128150015	.	G	C	268.23	PASS	AF=0.641026;AO=24;DP=39;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0320746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8577;QD=27.5111;RBI=0.0330963;REFB=-0.0636747;REVB=-0.00816;RO=15;SAF=16;SAR=8;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510647;STB=0.501113;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0768949;OID=.;OPOS=128150015;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:15:14:24:25:0.641026:8:16:9:6:9:16:9:5
chr10	128202435	.	T	C	1074.53	PASS	AF=0.904762;AO=76;DP=84;FAO=76;FDP=84;FR=.;FRO=8;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00190376;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=91.5669;QD=51.1683;RBI=0.0553481;REFB=-0.149411;REVB=0.0553153;RO=1;SAF=46;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101772;STB=0.534874;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00887372;OID=.;OPOS=128202435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:84:84:1:8:76:76:0.904762:30:46:1:0:30:46:2:6
chr10	128926013	.	A	G	2156.45	PASS	AF=1;AO=136;DP=136;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00886905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.204;QD=62.9621;RBI=0.0150753;REFB=0;REVB=0.0121904;RO=0;SAF=84;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.81982e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.96321e-06;OID=.;OPOS=128926013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:136:137:0:0:136:137:1:52:84:0:0:53:84:0:0
chr10	128974621	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0369592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.324;QD=43.4861;RBI=0.0461958;REFB=0;REVB=0.0277141;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000182798;OID=.;OPOS=128974621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr10	129216658	.	T	C	413.58	PASS	AF=0.482759;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0146157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.357;QD=19.0152;RBI=0.0186042;REFB=-0.0502428;REVB=-0.0115109;RO=44;SAF=20;SAR=22;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019981;STB=0.504937;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0355442;OID=.;OPOS=129216658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:44:45:42:42:0.482759:22:20:20:24:22:20:21:24
chr10	129242515	.	G	A	228.34	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00383688;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.342;QD=21.7465;RBI=0.00922503;REFB=-0.0369808;REVB=-0.00838925;RO=20;SAF=10;SAR=12;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0469145;STB=0.526292;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0306147;OID=.;OPOS=129242515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:12:10:8:12:12:10:8:12
chr10	129249662	.	G	A	1116.89	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.876;QD=60.3726;RBI=0.0618331;REFB=0;REVB=0.0563389;RO=0;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185603;OID=.;OPOS=129249662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:34:40:0:0:34:40:0:0
chr10	129249676	.	C	T	336.47	PASS	AF=0.461538;AO=34;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.0244526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.892;QD=17.2549;RBI=0.043943;REFB=-0.0215586;REVB=0.0365111;RO=42;SAF=18;SAR=16;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652261;STB=0.536565;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0203905;OID=.;OPOS=129249676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:42:42:34:36:0.461538:16:18:25:17:17:19:25:17
chr10	129249693	.	G	A	329.96	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0120076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.116;QD=18.331;RBI=0.0243358;REFB=-0.0218002;REVB=0.0211672;RO=35;SAF=18;SAR=17;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514504;STB=0.541378;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.026467;OID=.;OPOS=129249693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:35:37:35:35:0.486111:17:18:20:15:17:18:22:15
chr10	129249701	.	C	G	1056.56	PASS	AF=0.960526;AO=69;DP=72;FAO=73;FDP=76;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0631399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7528;QD=55.6086;RBI=0.0867943;REFB=-0.0425697;REVB=0.0595534;RO=3;SAF=43;SAR=26;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241198;STB=0.510383;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0123616;OID=.;OPOS=129249701;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:72:76:3:3:69:73:0.960526:26:43:1:2:30:43:1:2
chr10	129249925	.	T	C	294.55	PASS	AF=0.342342;AO=36;DP=110;FAO=38;FDP=111;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=0.0112905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.699;QD=10.6144;RBI=0.0120594;REFB=-0.0381742;REVB=-0.00423728;RO=73;SAF=28;SAR=8;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332623;STB=0.678983;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0175981;OID=.;OPOS=129249925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:73:73:36:38:0.342342:8:28:38:35:9:29:38:35
chr10	129534478	.	A	AGCGCGGC	229.31	PASS	AF=0.833333;AO=19;DP=24;FAO=20;FDP=24;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0126206;FXX=0;HRUN=1;LEN=7;MLLD=303.932;QD=38.2178;RBI=0.0129606;REFB=-0.0525684;REVB=-0.00294913;RO=4;SAF=7;SAR=12;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125282;STB=0.570104;STBP=0.17;TYPE=ins;VARB=0.0079199;OID=.;OPOS=129534479;OREF=-;OALT=GCGCGGC;OMAPALT=AGCGCGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.833333:19:24:20:24:4:7:13:3:1:20:4:7:12:3:1
chr10	129534679	.	T	C	2291.24	PASS	AF=1;AO=140;DP=140;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.66;QD=63.6455;RBI=0.0621752;REFB=0;REVB=0.0603535;RO=0;SAF=102;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.43417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94824e-05;OID=.;OPOS=129534679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:144:0:0:140:144:1:38:102:0:0:41:103:0:0
chr10	129534739	.	C	G	2464.5	PASS	AF=0.97076;AO=163;DP=171;FAO=166;FDP=171;FR=.;FRO=5;FSAF=110;FSAR=56;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00233491;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.597;QD=57.649;RBI=0.051436;REFB=-0.0557632;REVB=-0.051383;RO=6;SAF=107;SAR=56;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0259329;STB=0.502046;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00126778;OID=.;OPOS=129534739;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:171:171:6:5:163:166:0.97076:56:107:6:0:56:110:3:2
chr10	129534864	.	A	C	1302.14	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.061;QD=62.0065;RBI=0.0497871;REFB=0;REVB=0.0177488;RO=0;SAF=41;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.48904e-05;OID=.;OPOS=129534864;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:43:41:0:0:43:41:0:0
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chr10	129839193	.	C	T	311.82	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.00887367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.715;QD=16.6302;RBI=0.022482;REFB=-0.0230171;REVB=0.0206566;RO=41;SAF=17;SAR=17;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0355935;STB=0.519988;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0187926;OID=.;OPOS=129839193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:41:34:34:0.453333:17:17:19:22:17:17:19:22
chr10	129845902	.	G	A	419.03	PASS	AF=0.577465;AO=41;DP=71;FAO=41;FDP=71;FR=.;FRO=30;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00694992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.981;QD=23.6075;RBI=0.0491245;REFB=-0.0234813;REVB=0.0486304;RO=28;SAF=23;SAR=18;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455352;STB=0.540036;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0177781;OID=.;OPOS=129845902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:28:30:41:41:0.577465:18:23:14:14:18:23:14:16
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chr10	129859992	.	T	C	363.95	PASS	AF=0.423913;AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=0.0165105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.156;QD=15.8237;RBI=0.0165175;REFB=-0.00525991;REVB=-0.000480101;RO=52;SAF=19;SAR=20;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168919;STB=0.599285;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.00669166;OID=.;OPOS=129859992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:52:53:39:39:0.423913:20:19:34:18:20:19:35:18
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chr10	129871635	.	AGGGG	AGGGC,GAGGG	35.28	PASS	AF=0.175,0;AO=4,2;DP=40;FAO=7,0;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=3,0;FSAR=4,0;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.162503,-0.0155937;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=25.428,126.577;QD=3.52821;RBI=0.170998,0.016282;REFB=-0.0405781,-0.00531836;REVB=0.0532276,0.00468425;RO=24;SAF=1,0;SAR=3,2;SRF=14;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.369782,-0.525765;STB=0.546629,0.5;STBP=0.81,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.208567,0.0835543;OID=.,.;OPOS=129871639,129871635;OREF=G,AG;OALT=C,GA;OMAPALT=AGGGC,GAGGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:40:40:24:33:4,2:7,0:0.175,0:3,2:1,0:14:10:4,0:3,0:16:17
chr10	129871690	.	A	G	360.78	PASS	AF=0.625;AO=35;DP=56;FAO=35;FDP=56;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0289227;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3152;QD=25.7702;RBI=0.0587869;REFB=-0.00930173;REVB=-0.0511798;RO=20;SAF=14;SAR=21;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166711;STB=0.582686;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00313105;OID=.;OPOS=129871690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:20:21:35:35:0.625:21:14:13:7:21:14:13:8
chr10	129882401	.	C	T	238.8	PASS	AF=0.411765;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=2;FSRF=38;FSRR=2;FWDB=0.00982364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4435;QD=14.0471;RBI=0.0123439;REFB=0.0111597;REVB=-0.00747446;RO=39;SAF=26;SAR=2;SRF=37;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849543;STB=0.55169;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=-0.0189845;OID=.;OPOS=129882401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:39:40:28:28:0.411765:2:26:37:2:2:26:38:2
chr10	129883370	.	A	G	752.11	PASS	AF=0.449438;AO=80;DP=178;FAO=80;FDP=178;FR=.;FRO=98;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=56;FSRR=42;FWDB=0.0426894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1637;QD=16.9014;RBI=0.0426952;REFB=-0.0169309;REVB=-0.000704613;RO=97;SAF=41;SAR=39;SRF=56;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641567;STB=0.532509;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0190772;OID=.;OPOS=129883370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:178:97:98:80:80:0.449438:39:41:56:41:39:41:56:42
chr10	129883933	.	C	T	320.14	PASS	AF=0.4375;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.00649644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.798;QD=16.0068;RBI=0.0113669;REFB=0.000218082;REVB=-0.00932757;RO=45;SAF=14;SAR=21;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19878;STB=0.611877;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.000264375;OID=.;OPOS=129883933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:45:45:35:35:0.4375:21:14:27:18:21:14:27:18
chr10	129903592	.	G	A	368.45	PASS	AF=0.40566;AO=43;DP=107;FAO=43;FDP=106;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.00709894;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.749;QD=13.9038;RBI=0.0138725;REFB=-0.0179375;REVB=0.0119185;RO=63;SAF=26;SAR=17;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152794;STB=0.586426;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0188458;OID=.;OPOS=129903592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:106:63:63:43:43:0.40566:17:26:29:34:17:26:29:34
chr10	129903802	.	A	G	342.26	PASS	AF=0.430233;AO=36;DP=87;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.00245494;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.836;QD=15.9189;RBI=0.00290138;REFB=-0.0165706;REVB=-0.00154639;RO=41;SAF=15;SAR=21;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0686515;STB=0.502241;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0145753;OID=.;OPOS=129903802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:41:49:36:37:0.430233:21:15:20:21:21:16:21:28
chr10	129904560	.	C	T	151.99	PASS	AF=0.533333;AO=15;DP=29;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00131152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.955;QD=20.265;RBI=0.0500935;REFB=-0.0172353;REVB=0.0500763;RO=14;SAF=6;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0863963;STB=0.560268;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0227761;OID=.;OPOS=129904560;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:14:14:15:16:0.533333:9:6:7:7:10:6:7:7
chr10	129906903	.	C	T	443.33	PASS	AF=0.423729;AO=50;DP=118;FAO=50;FDP=118;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=43;FSRR=25;FWDB=-0.00884391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.635;QD=15.0282;RBI=0.0172408;REFB=0.000829769;REVB=0.0147997;RO=68;SAF=22;SAR=28;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195416;STB=0.609468;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.0015012;OID=.;OPOS=129906903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:68:68:50:50:0.423729:28:22:43:25:28:22:43:25
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chr10	132303374	.	G	C	817.11	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0386887;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.096;QD=57.3411;RBI=0.0421473;REFB=0;REVB=0.0167207;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000279716;OID=.;OPOS=132303374;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:57:0:0:56:57:1:25:31:0:0:25:32:0:0
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chr10	133918420	.	G	A	465.55	PASS	AF=0.288889;AO=62;DP=222;FAO=65;FDP=225;FR=.;FRO=160;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=85;FSRR=75;FWDB=-0.00249947;FXX=0.00442458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.997;QD=8.27649;RBI=0.0132782;REFB=-0.0118731;REVB=0.0130408;RO=160;SAF=27;SAR=35;SRF=85;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11727;STB=0.560408;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0320585;OID=.;OPOS=133918420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:222:225:160:160:62:65:0.288889:35:27:85:75:36:29:85:75
chr10	133948634	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00257774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.17;QD=59.0183;RBI=0.0230889;REFB=0;REVB=0.0229446;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.34329e-05;OID=.;OPOS=133948634;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr10	133950642	.	T	C	379.47	PASS	AF=0.4875;AO=37;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.0268336;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.813;QD=18.9737;RBI=0.0273295;REFB=-0.0187318;REVB=-0.00518265;RO=38;SAF=17;SAR=20;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596448;STB=0.524259;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0232321;OID=.;OPOS=133950642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:38:41:37:39:0.4875:20:17:15:23:21:18:17:24
chr10	133954011	.	C	T	490.89	PASS	AF=0.421875;AO=54;DP=128;FAO=54;FDP=128;FR=.;FRO=74;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=-0.0117443;FXX=0.0153834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.855;QD=15.3402;RBI=0.0117712;REFB=-0.0146841;REVB=-0.000795395;RO=74;SAF=29;SAR=25;SRF=42;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317094;STB=0.517788;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0236632;OID=.;OPOS=133954011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:74:74:54:54:0.421875:25:29:42:32:25:29:42:32
chr10	133955427	.	A	G	446.79	PASS	AF=0.457944;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=0.00915187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.191;QD=16.7024;RBI=0.0154755;REFB=-0.0144071;REVB=0.0124793;RO=56;SAF=21;SAR=28;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102978;STB=0.548367;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0169093;OID=.;OPOS=133955427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:56:58:49:49:0.457944:28:21:30:26:28:21:30:28
chr10	133961494	.	C	T	217.38	PASS	AF=0.346154;AO=27;DP=79;FAO=27;FDP=78;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0171439;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.368;QD=11.1475;RBI=0.0177669;REFB=-0.0128161;REVB=0.00466362;RO=51;SAF=9;SAR=18;SRF=20;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722177;STB=0.542024;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0203904;OID=.;OPOS=133961494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:51:51:27:27:0.346154:18:9:20:31:18:9:20:31
chr10	133963466	.	A	G	2019.42	PASS	AF=1;AO=126;DP=130;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00262928;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0139;QD=61.6615;RBI=0.0227357;REFB=0;REVB=0.0225831;RO=0;SAF=74;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140035;OID=.;OPOS=133963466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:131:0:0:126:131:1:52:74:0:0:55:76:0:0
chr10	133981682	.	G	A	698.15	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0483626;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=65.7066;QD=54.7572;RBI=0.0507469;REFB=-0.131011;REVB=0.0153723;RO=1;SAF=33;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140538;STB=0.50746;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.00236331;OID=.;OPOS=133981682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:51:51:1:1:50:50:0.980392:17:33:1:0:17:33:1:0
chr10	134013990	.	G	A	173.19	PASS	AF=0.842105;AO=16;DP=19;FAO=16;FDP=19;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0699233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.639;QD=36.4604;RBI=0.0708291;REFB=-0.0412758;REVB=0.0112909;RO=3;SAF=6;SAR=10;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181457;STB=0.599873;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.00225655;OID=.;OPOS=134013990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:19:19:3:3:16:16:0.842105:10:6:3:0:10:6:3:0
chr10	134017295	.	A	G	720.38	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9904;QD=56.5004;RBI=0.0505896;REFB=0;REVB=0.0465614;RO=0;SAF=37;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000846739;OID=.;OPOS=134017295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:51:0:0:48:51:1:11:37:0:0:12:39:0:0
chr10	134017388	.	C	G	488.0	PASS	AF=0.481481;AO=52;DP=108;FAO=52;FDP=108;FR=.;FRO=56;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.0143013;FXX=0.00917347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.449;QD=18.0741;RBI=0.0145939;REFB=-0.0359816;REVB=-0.00290802;RO=54;SAF=28;SAR=24;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863219;STB=0.547635;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0317552;OID=.;OPOS=134017388;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:54:56:52:52:0.481481:24:28:24:30:24:28:25:31
chr10	134018834	.	C	T	1148.0	PASS	AF=0.604651;AO=104;DP=173;FAO=104;FDP=172;FR=.;FRO=68;FSAF=47;FSAR=57;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=0.0127781;FXX=0.00578001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.17;QD=26.6977;RBI=0.013114;REFB=-0.0253489;REVB=-0.0029488;RO=68;SAF=47;SAR=57;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781267;STB=0.542302;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.016158;OID=.;OPOS=134018834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:172:68:68:104:104:0.604651:57:47:38:30:57:47:38:30
chr10	134036193	.	A	G	575.67	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6011;QD=60.5972;RBI=0.0846638;REFB=0;REVB=-0.0752026;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000473498;OID=.;OPOS=134036193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:25:13:0:0:25:13:0:0
chr10	134062574	.	G	A	2693.52	PASS	AF=0.977778;AO=172;DP=180;FAO=176;FDP=180;FR=.;FRO=4;FSAF=81;FSAR=95;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0377132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.446;QD=59.8559;RBI=0.0491282;REFB=-0.00982597;REVB=0.0314848;RO=3;SAF=81;SAR=91;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00640434;STB=0.506473;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=6.72597e-05;OID=.;OPOS=134062574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:180:180:3:4:172:176:0.977778:91:81:2:1:95:81:3:1
chr10	134143985	.	GC	TT	35.88	PASS	AF=0.118644;AO=7;DP=59;FAO=7;FDP=59;FR=.;FRO=52;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=32;FWDB=-0.0312041;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=234.78;QD=2.43244;RBI=0.0314654;REFB=-0.00366549;REVB=-0.00404681;RO=50;SAF=2;SAR=5;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992106;STB=0.597533;STBP=0.669;TYPE=mnp;VARB=0.0248476;OID=.;OPOS=134143985;OREF=GC;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:59:59:50:52:7:7:0.118644:5:2:18:32:5:2:20:32
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chr10	134145136	.	A	G	191.62	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0367287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.671;QD=15.6423;RBI=0.0795257;REFB=-0.0118858;REVB=-0.0705361;RO=28;SAF=7;SAR=13;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157788;STB=0.602001;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0206216;OID=.;OPOS=134145136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:29:20:20:0.408163:13:7:14:14:13:7:15:14
chr10	134145138	.	C	G	192.63	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0338987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4359;QD=16.0523;RBI=0.0421136;REFB=-0.0309943;REVB=-0.0249886;RO=28;SAF=7;SAR=13;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192957;STB=0.610998;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0277756;OID=.;OPOS=134145138;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:13:7:15:13:13:7:15:13
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chr10	134145293	.	G	T	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0182099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4222;QD=19.1341;RBI=0.0186771;REFB=0.0382489;REVB=-0.00415119;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212944;STB=0.62455;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=-0.0147074;OID=.;OPOS=134145293;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:3:2:0:2:3:2:0:2
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chr10	134218296	.	C	G	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9908;QD=14.6501;RBI=0.000666778;REFB=0.0114979;REVB=-0.000666778;RO=4;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0100507;OID=.;OPOS=134218296;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:4:5:6:6:0.545455:6:0:0:4:6:0:0:5
chr10	134459388	.	A	G	955.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2185;QD=58.7797;RBI=0.0562084;REFB=0;REVB=-0.0393675;RO=0;SAF=43;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.42492e-06;OID=.;OPOS=134459388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:22:43:0:0:22:43:0:0
chr10	134596131	.	TTA	T,TT,TTT	45.74	PASS	AF=0.183333,0,0;AO=8,16,5;DP=76;FAO=11,0,0;FDP=60;FR=.;FRO=49;FSAF=8,0,0;FSAR=3,0,0;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=-0.0130953,-0.0391525,-0.0225669;FXX=0.0322529;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=19.1192,10.0191,16.3093;QD=3.04961;RBI=0.120755,0.213282,0.111071;REFB=-0.0377964,-0.0502945,-0.0115036;REVB=-0.120043,-0.209657,-0.108754;RO=40;SAF=7,6,1;SAR=1,10,4;SRF=28;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.306915,-0.370513,-0.524758;STB=0.606691,0.5,0.5;STBP=0.473,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.118964,0.0289109,0;OID=.,.,.;OPOS=134596132,134596133,134596133;OREF=TA,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.183333,0,0:8,16,5:76:11,0,0:60:49:8,0,0:3,0,0:30:19:44:40:7,6,1:1,10,4:28:12
chr10	134598628	.	A	G	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000469178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.52;QD=63.2866;RBI=0.00345409;REFB=0;REVB=0.00342208;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20597e-05;OID=.;OPOS=134598628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:29:17:0:0:29:17:0:0
chr10	134622408	.	T	C	222.08	PASS	AF=0.42623;AO=25;DP=60;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0274919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8381;QD=14.5629;RBI=0.0657104;REFB=-0.019451;REVB=0.0596829;RO=35;SAF=13;SAR=12;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350515;STB=0.50819;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0340642;OID=.;OPOS=134622408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:35:35:25:26:0.42623:12:13:17:18:13:13:17:18
chr10	134623959	.	T	C	190.98	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0360139;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.539;QD=13.1711;RBI=0.0406767;REFB=-0.00746278;REVB=-0.01891;RO=35;SAF=12;SAR=11;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00783727;STB=0.504501;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0136642;OID=.;OPOS=134623959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:11:12:18:17:11:12:18:17
chr10	134624225	.	G	A	278.84	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0165662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.364;QD=21.8699;RBI=0.0426544;REFB=-0.0176379;REVB=0.039306;RO=23;SAF=13;SAR=15;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186491;STB=0.603257;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0296538;OID=.;OPOS=134624225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:15:13:16:7:15:13:16:7
chr10	134624504	.	C	T	879.66	PASS	AF=0.55102;AO=81;DP=148;FAO=81;FDP=147;FR=.;FRO=66;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=0.0339051;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.725;QD=23.9362;RBI=0.0355677;REFB=-0.0128088;REVB=-0.0107475;RO=66;SAF=38;SAR=43;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254179;STB=0.513883;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0128234;OID=.;OPOS=134624504;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:147:66:66:81:81:0.55102:43:38:33:33:43:38:33:33
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chr10	134736076	.	T	G	189.72	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00633502;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.982;QD=13.084;RBI=0.0326792;REFB=-0.0012108;REVB=-0.0320593;RO=33;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174917;STB=0.598727;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.000935022;OID=.;OPOS=134736076;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:33:35:23:23:0.396552:10:13:13:20:10:13:14:21
chr10	134738232	.	A	G	689.22	PASS	AF=0.390863;AO=77;DP=197;FAO=77;FDP=197;FR=.;FRO=120;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=67;FSRR=53;FWDB=0.00521686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.063;QD=13.9944;RBI=0.0127169;REFB=-0.016509;REVB=-0.0115976;RO=119;SAF=41;SAR=36;SRF=67;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331776;STB=0.515851;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0355096;OID=.;OPOS=134738232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:197:197:119:120:77:77:0.390863:36:41:67:52:36:41:67:53
chr10	134748331	.	C	T	185.24	PASS	AF=0.333333;AO=24;DP=72;FAO=24;FDP=72;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0130563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.134;QD=10.2909;RBI=0.0142345;REFB=-0.00250418;REVB=-0.00567059;RO=45;SAF=16;SAR=8;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205438;STB=0.601854;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00433392;OID=.;OPOS=134748331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:45:48:24:24:0.333333:8:16:22:23:8:16:25:23
chr10	134756013	.	T	C	111.01	PASS	AF=0.705882;AO=11;DP=16;FAO=12;FDP=17;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0212063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.119;QD=26.1189;RBI=0.0944051;REFB=-0.0305205;REVB=0.0919924;RO=5;SAF=4;SAR=7;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.341223;STB=0.691994;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0150925;OID=.;OPOS=134756013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:16:17:5:5:11:12:0.705882:7:4:5:0:8:4:5:0
chr10	134777790	.	G	A	1054.24	PASS	AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00836843;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=311.361;QD=56.9859;RBI=0.0246864;REFB=-0.172891;REVB=0.0232247;RO=0;SAF=17;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54913e-08;STB=0.508926;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000429864;OID=.;OPOS=134777790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:74:74:0:2:72:72:0.972973:55:17:0:0:55:17:0:2
chr10	134884516	.	G	A	689.34	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00753208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.847;QD=62.6669;RBI=0.0512783;REFB=0;REVB=0.0507221;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266598;OID=.;OPOS=134884516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:15:29:0:0:15:29:0:0
chr10	134884546	.	A	G	1166.21	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0844226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5562;QD=59.8058;RBI=0.0945695;REFB=0;REVB=0.042617;RO=0;SAF=37;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461795;OID=.;OPOS=134884546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:40:37:0:0:40:38:0:0
chr10	134884595	.	G	A	1882.62	PASS	AF=0.968992;AO=125;DP=129;FAO=125;FDP=129;FR=.;FRO=4;FSAF=55;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0252221;FXX=0.00769172;HRUN=4;LEN=1;MLLD=136.019;QD=58.3759;RBI=0.0490632;REFB=-0.165879;REVB=0.0420838;RO=3;SAF=55;SAR=70;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199249;STB=0.505985;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.000787177;OID=.;OPOS=134884595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:129:129:3:4:125:125:0.968992:70:55:0:3:70:55:1:3
chr10	134884610	.	C	G	2054.28	PASS	AF=0.964286;AO=135;DP=140;FAO=135;FDP=140;FR=.;FRO=5;FSAF=59;FSAR=76;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0259818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0985;QD=58.6937;RBI=0.0260078;REFB=0.0317245;REVB=-0.00116294;RO=4;SAF=59;SAR=76;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173421;STB=0.513126;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.0075115;OID=.;OPOS=134884610;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:140:140:4:5:135:135:0.964286:76:59:3:1:76:59:4:1
chr10	134886618	.	G	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.676;QD=55.6561;RBI=0.0244465;REFB=0;REVB=0.0207707;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57978e-05;OID=.;OPOS=134886618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr10	134902396	.	C	G	177.46	PASS	AF=0.888889;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0394882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7559;QD=39.4349;RBI=0.0412553;REFB=0.00763271;REVB=-0.0119449;RO=2;SAF=6;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129916;STB=0.571338;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=-0.0142656;OID=.;OPOS=134902396;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:18:18:2:2:16:16:0.888889:10:6:2:0:10:6:2:0
chr10	134902398	.	C	T	202.32	PASS	AF=1;AO=17;DP=19;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503453;FXX=0.157812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4403;QD=50.5788;RBI=0.0618421;REFB=0;REVB=0.0359137;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00112424;OID=.;OPOS=134902398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:19:16:0:0:17:16:1:10:7:0:0:10:6:0:0
chr10	134942166	.	A	G	714.0	PASS	AF=0.401961;AO=83;DP=204;FAO=82;FDP=204;FR=.;FRO=122;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=45;FSRR=77;FWDB=-0.0187233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.394;QD=13.9999;RBI=0.0808716;REFB=-0.0186801;REVB=-0.0786743;RO=120;SAF=43;SAR=40;SRF=44;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159292;STB=0.585398;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0295246;OID=.;OPOS=134942166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:204:204:120:122:83:82:0.401961:40:43:44:76:40:42:45:77
chr10	134942832	.	G	A	390.77	PASS	AF=0.666667;AO=32;DP=48;FAO=32;FDP=48;FR=.;FRO=16;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.0259273;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.609;QD=32.5641;RBI=0.0299202;REFB=-0.0213633;REVB=0.0149331;RO=16;SAF=26;SAR=6;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00669198;OID=.;OPOS=134942832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:16:16:32:32:0.666667:6:26:13:3:6:26:13:3
chr10	134999602	.	G	C	851.3	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.765;QD=57.715;RBI=0.043685;REFB=0;REVB=0.0417622;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010616;OID=.;OPOS=134999602;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:25:33:0:0:25:34:0:0
chr10	135000055	.	C	T	58.62	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.682;QD=14.6539;RBI=0.0216296;REFB=-0.0163859;REVB=0.0216296;RO=8;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00913958;OID=.;OPOS=135000055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:8:0:0:8:8:0:0:8
chr10	135051543	.	T	C	92.92	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=35;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00200382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.158;QD=10.3248;RBI=0.00447082;REFB=-0.020063;REVB=-0.00399661;RO=23;SAF=2;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340093;STB=0.713877;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0374529;OID=.;OPOS=135051543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:35:36:23:24:11:12:0.333333:9:2:10:13:10:2:10:14
chr10	135051562	.	A	G	501.93	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3944;QD=59.0509;RBI=0.0306508;REFB=0;REVB=0.0274235;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.68069e-05;OID=.;OPOS=135051562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:21:12:0:0:22:12:0:0
chr10	135061112	.	C	T	432.21	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116952;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6965;QD=57.6277;RBI=0.0383225;REFB=0;REVB=0.0364943;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181185;OID=.;OPOS=135061112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0
chr10	135076596	.	T	C	429.83	PASS	AF=0.96875;AO=30;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0151992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.234;QD=53.7281;RBI=0.0387476;REFB=-0.13887;REVB=0.0356421;RO=0;SAF=26;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9955e-08;STB=0.555517;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00243666;OID=.;OPOS=135076596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:0:1:30:31:0.96875:4:26:0:0:4:27:0:1
chr10	135076712	.	AG	A	263.35	PASS	AF=1;AO=21;DP=30;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.258721;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9208;QD=31.9216;RBI=0.273208;REFB=-0.00781478;REVB=0.0877844;RO=7;SAF=9;SAR=12;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.299652;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0199742;OID=.;OPOS=135076713;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:21:30:33:33:0:13:20:0:0:4:7:9:12:3:4
chr10	135082346	.	A	G	1010.58	PASS	AF=0.985714;AO=68;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00536752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0915;QD=57.7476;RBI=0.0163567;REFB=-0.0967961;REVB=-0.015451;RO=2;SAF=38;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00321836;STB=0.506492;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0141031;OID=.;OPOS=135082346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:2:1:68:69:0.985714:30:38:1:1:31:38:1:0
chr10	135084232	.	C	CAGA	1899.06	PASS	AF=0.927536;AO=122;DP=142;FAO=128;FDP=138;FR=.;FRO=10;FSAF=37;FSAR=91;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0041583;FXX=0.0416638;HRUN=1;LEN=3;MLLD=234.922;QD=55.0452;RBI=0.0298153;REFB=-0.0509681;REVB=0.0295239;RO=15;SAF=37;SAR=85;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0856969;STB=0.535145;STBP=0.005;TYPE=ins;VARB=0.00474653;OID=.;OPOS=135084233;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=CAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.927536:122:142:128:138:10:37:91:7:3:28:15:37:85:10:5
chr10	135084322	.	A	G	2320.27	PASS	AF=1;AO=149;DP=152;FAO=152;FDP=152;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=111;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0466952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1913;QD=61.0597;RBI=0.0591752;REFB=0;REVB=-0.0363491;RO=0;SAF=38;SAR=111;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000251787;OID=.;OPOS=135084322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:152:152:0:0:149:152:1:111:38:0:0:111:41:0:0
chr10	135085321	.	C	T	628.94	PASS	AF=0.954545;AO=41;DP=43;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0326382;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.226;QD=57.1767;RBI=0.0397828;REFB=0.0110169;REVB=-0.0227469;RO=2;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407606;STB=0.521729;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=-0.00034524;OID=.;OPOS=135085321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:43:44:2:2:41:42:0.954545:22:19:0:2:22:20:0:2
chr10	135085426	.	A	G	1264.75	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0451309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.024;QD=61.6951;RBI=0.0472374;REFB=0;REVB=0.013949;RO=0;SAF=32;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.15896e-05;OID=.;OPOS=135085426;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:50:32:0:0:50:32:0:0
chr10	135085754	.	G	A	1648.04	PASS	AF=0.973684;AO=110;DP=118;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=72;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0216696;FXX=0.0338954;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.15;QD=57.8261;RBI=0.0280695;REFB=-0.176836;REVB=0.0178417;RO=0;SAF=39;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509052;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.000269998;OID=.;OPOS=135085754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:118:114:0:3:110:111:0.973684:71:39:0:0:72:39:2:1
chr10	135087521	.	G	A	462.25	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.979;QD=57.7815;RBI=0.0325104;REFB=0;REVB=0.024581;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.50285e-05;OID=.;OPOS=135087521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:31:32:1:9:22:0:0:9:23:0:0
chr10	135089035	.	A	G	1677.31	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4708;QD=60.4435;RBI=0.0645769;REFB=0;REVB=0.0109844;RO=0;SAF=47;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213701;OID=.;OPOS=135089035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:111:0:0:108:111:1:61:47:0:0:61:50:0:0
chr10	135097434	.	A	G	802.06	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363867;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.602;QD=64.165;RBI=0.0376849;REFB=0;REVB=0.0098061;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182799;OID=.;OPOS=135097434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:50:0:0:47:50:1:24:23:0:0:25:25:0:0
chr10	135098672	.	G	A	575.66	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.719;QD=60.5962;RBI=0.0395445;REFB=0;REVB=0.0381014;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277369;OID=.;OPOS=135098672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:12:26:0:0:12:26:0:0
chr10	135098830	.	T	C	490.22	PASS	AF=0.971429;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0148488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.922;QD=56.0249;RBI=0.0161517;REFB=-0.0536882;REVB=-0.00635518;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.513506;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00166714;OID=.;OPOS=135098830;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:35:0:1:33:34:0.971429:16:17:0:0:16:18:1:0
chr10	135098845	.	C	T	470.82	PASS	AF=1;AO=30;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0061542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.45;QD=57.0686;RBI=0.0645408;REFB=0;REVB=0.0642467;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00081998;OID=.;OPOS=135098845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:30:33:1:10:20:0:0:12:21:0:0
chr10	135160950	.	C	T	191.13	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0021421;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.7034;QD=47.783;RBI=0.130524;REFB=0;REVB=0.130507;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00255321;OID=.;OPOS=135160950;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:13:3:0:0:13:3:0:0
chr10	135165790	.	A	G	688.7	PASS	AF=1;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295714;FXX=0.058812;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.012;QD=57.392;RBI=0.0551598;REFB=0;REVB=-0.0465632;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000270173;OID=.;OPOS=135165790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:48:0:0:48:48:1:16:32:0:0:16:32:0:0
chr10	135180430	.	A	G	1785.76	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.717;QD=61.0515;RBI=0.034152;REFB=0;REVB=-0.0296489;RO=0;SAF=44;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26857e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.51713e-05;OID=.;OPOS=135180430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:73:44:0:0:73:44:0:0
chr10	135184126	.	G	A	1936.52	PASS	AF=1;AO=125;DP=126;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148496;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.362;QD=61.9688;RBI=0.03934;REFB=0;REVB=0.0364297;RO=0;SAF=57;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.94512e-05;OID=.;OPOS=135184126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:126:125:0:0:125:125:1:68:57:0:0:68:57:0:0
chr10	135186806	.	A	G	340.71	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1037;QD=54.5141;RBI=0.0255068;REFB=0;REVB=0.0230408;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226943;OID=.;OPOS=135186806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:19:6:0:0:19:6:0:0
chr10	135204950	.	C	G	1084.41	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.04482;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.852;QD=58.6167;RBI=0.0474724;REFB=-0.176301;REVB=-0.015646;RO=0;SAF=30;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000991901;OID=.;OPOS=135204950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:0:1:73:73:0.986486:43:30:0:0:43:30:0:1
chr10	135205009	.	C	G	1349.96	PASS	AF=1;AO=87;DP=89;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512125;FXX=0.0112347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.315;QD=61.3617;RBI=0.0514747;REFB=-0.128955;REVB=-0.00518942;RO=0;SAF=47;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302188;OID=.;OPOS=135205009;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:89:88:0:0:87:88:1:40:47:0:0:40:48:0:0
chr10	135233541	.	A	G	1475.79	PASS	AF=0.990196;AO=97;DP=101;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0109531;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.662;QD=57.8743;RBI=0.0299808;REFB=-0.0582871;REVB=0.0279083;RO=0;SAF=62;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.81934e-08;STB=0.506492;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.000599901;OID=.;OPOS=135233541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:101:102:0:1:97:101:0.990196:35:62:0:0:38:63:0:1
chr10	135269982	.	C	T	86.85	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=0.0216806;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.181;QD=12.8672;RBI=0.037981;REFB=-0.0289607;REVB=0.031185;RO=16;SAF=10;SAR=1;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221813;STB=0.634628;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.050491;OID=.;OPOS=135269982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:1:10:13:3:1:10:13:3
chr10	135270837	.	TCCCC	TCCC,TCCCG	235.15	PASS	AF=0.464789,0;AO=30,3;DP=72;FAO=33,0;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=20,0;FSAR=13,0;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0602022,-0.111103;FXX=0.013887;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=17.5379,22.3693;QD=13.2479;RBI=0.0613631,0.113071;REFB=0.001608,-0.0112803;REVB=0.0118795,-0.0210043;RO=35;SAF=19,2;SAR=11,1;SRF=18;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.118057,0.154333;STB=0.529549,0.5;STBP=0.656,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0039804,0;OID=.,.;OPOS=135270838,135270841;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=TCCC,TCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.464789,0:30,3:72:33,0:71:38:20,0:13,0:21:17:99:35:19,2:11,1:18:17
chr10	135271789	.	C	T	1680.07	PASS	AF=0.99115;AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00313554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.66;QD=59.4713;RBI=0.0156855;REFB=-0.12352;REVB=0.0153689;RO=1;SAF=68;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693169;STB=0.503649;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000252086;OID=.;OPOS=135271789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:113:113:1:1:112:112:0.99115:44:68:1:0:44:68:1:0
chr10	135278193	.	A	G	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0350151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7992;QD=59.4324;RBI=0.0511488;REFB=0;REVB=-0.0372846;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000780661;OID=.;OPOS=135278193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr10	135278244	.	CTGGGGTGTGGGGT	CTGGGGT,CTGGGGTGTGGGGA	335.3	PASS	AF=0.769231,0.230769;AO=16,4;DP=27;FAO=20,6;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12,5;FSAR=8,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00557978,0.0391382;FXX=0.103413;HRUN=1,1;LEN=7,1;MLLD=159.609,71.7072;QD=51.5848;RBI=0.156349,0.0400132;REFB=0,0;REVB=0.156249,0.00832222;RO=1;SAF=11,4;SAR=5,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0397692,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0161993,0.0216545;OID=.,.;OPOS=135278245,135278257;OREF=TGGGGTG,T;OALT=-,A;OMAPALT=CTGGGGT,CTGGGGTGTGGGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.769231,0.230769:16,4:27:20,6:26:0:12,5:8,1:0:0:35:1:11,4:5,0:1:0
chr10	135279810	.	T	G	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.91;QD=58.5853;RBI=0.0446286;REFB=0;REVB=0.0370328;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131149;OID=.;OPOS=135279810;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr10	135280765	.	C	T	1264.58	PASS	AF=0.988095;AO=82;DP=85;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.014018;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.81;QD=60.2181;RBI=0.0349458;REFB=0.0335712;REVB=0.032011;RO=1;SAF=42;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111424;STB=0.505881;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000180577;OID=.;OPOS=135280765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:84:1:1:82:83:0.988095:40:42:1:0:41:42:1:0
chr10	135347397	.	T	C	979.79	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107174;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8357;QD=58.4949;RBI=0.0127541;REFB=0;REVB=-0.00691408;RO=0;SAF=48;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.6764e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.56638e-05;OID=.;OPOS=135347397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:19:48:0:0:19:48:0:0
chr10	135351362	.	T	C	268.17	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.0187254;FXX=0.0483793;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.094;QD=18.1813;RBI=0.0189076;REFB=0.00176395;REVB=-0.00261835;RO=28;SAF=11;SAR=18;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549663;STB=0.506845;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=-0.0021212;OID=.;OPOS=135351362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:59:28:30:29:29:0.491525:18:11:9:19:18:11:11:19
chr10	135368163	.	A	G	134.27	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0168102;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.14;QD=17.9022;RBI=0.0206097;REFB=-0.0120489;REVB=-0.0119238;RO=15;SAF=3;SAR=11;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21079;STB=0.578836;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0076345;OID=.;OPOS=135368163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:15:14:15:0.5:11:3:6:9:11:4:6:9
chr10	135368590	.	T	C	249.73	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.0194798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.609;QD=18.4985;RBI=0.0205308;REFB=-0.00786115;REVB=0.00648466;RO=27;SAF=14;SAR=13;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197839;STB=0.610276;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0085723;OID=.;OPOS=135368590;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:13:14:8:19:13:14:8:19
chr10	135369532	.	T	C	533.46	PASS	AF=0.555556;AO=50;DP=89;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0378833;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.6447;QD=23.7094;RBI=0.0384177;REFB=-0.00768499;REVB=-0.00638505;RO=39;SAF=22;SAR=28;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0876078;STB=0.540967;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.00526704;OID=.;OPOS=135369532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:39:40:50:50:0.555556:28:22:13:26:28:22:14:26
chr10	135370343	.	G	A	220.66	PASS	AF=0.397059;AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0416183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1405;QD=12.9802;RBI=0.0439096;REFB=-0.0202393;REVB=0.0139987;RO=41;SAF=19;SAR=8;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111948;STB=0.564307;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0379811;OID=.;OPOS=135370343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:41:41:27:27:0.397059:8:19:25:16:8:19:25:16
chr10	135370633	.	C	T	93.11	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=-0.0812852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1942;QD=19.6023;RBI=0.08729;REFB=-0.0539219;REVB=-0.031816;RO=8;SAF=2;SAR=9;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0744319;STB=0.5423;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0310658;OID=.;OPOS=135370633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:9:2:1:7:9:2:1:7
chr10	135370639	.	C	A	93.31	PASS	AF=0.578947;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=19;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0296845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8258;QD=19.6452;RBI=0.0297366;REFB=0.0250846;REVB=-0.00175982;RO=8;SAF=2;SAR=9;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0744319;STB=0.5423;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=-0.0120691;OID=.;OPOS=135370639;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:8:8:11:11:0.578947:9:2:1:7:9:2:1:7
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chr10	135373591	.	C	T	224.31	PASS	AF=0.677419;AO=21;DP=31;FAO=21;FDP=31;FR=.;FRO=10;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0273141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.246;QD=28.9427;RBI=0.028145;REFB=-0.0190873;REVB=-0.00678826;RO=10;SAF=17;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303171;STB=0.66911;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0104792;OID=.;OPOS=135373591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:10:10:21:21:0.677419:4:17:4:6:4:17:4:6
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chr10	135381425	.	G	A	113.11	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0139476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.642;QD=17.4007;RBI=0.0173375;REFB=-0.00285674;REVB=-0.0102982;RO=13;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136804;STB=0.578197;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.00519783;OID=.;OPOS=135381425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:6:7:9:4:6:7:9:4
chr10	135381443	.	C	T	112.9	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0228362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.065;QD=17.3685;RBI=0.028062;REFB=-0.0269012;REVB=0.016309;RO=13;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136804;STB=0.578197;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0676492;OID=.;OPOS=135381443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:6:7:9:4:6:7:9:4
chr10	135381623	.	T	C	300.13	PASS	AF=0.55102;AO=26;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0192179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.348;QD=24.5004;RBI=0.0284291;REFB=-0.030353;REVB=-0.0209496;RO=22;SAF=11;SAR=15;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138035;STB=0.565562;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0236835;OID=.;OPOS=135381623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:22:22:26:27:0.55102:15:11:13:9:15:12:13:9
chr10	135381766	.	C	T	156.51	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0428532;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.797;QD=24.0786;RBI=0.0476118;REFB=-0.0289135;REVB=-0.0207482;RO=10;SAF=4;SAR=12;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470477;STB=0.526284;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0118634;OID=.;OPOS=135381766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:26:26:10:10:16:16:0.615385:12:4:2:8:12:4:2:8
chr10	135381927	.	T	G	81.61	PASS	AF=0.282051;AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=5;FWDB=-0.0015687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.841;QD=8.37057;RBI=0.014342;REFB=-0.00194667;REVB=-0.014256;RO=28;SAF=6;SAR=5;SRF=23;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.349639;STB=0.707016;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00766932;OID=.;OPOS=135381927;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:39:39:28:28:11:11:0.282051:5:6:23:5:5:6:23:5
chr10	135438929	.	T	G	123.28	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0760913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.904;QD=37.931;RBI=0.0766738;REFB=0.0702179;REVB=0.00943324;RO=1;SAF=3;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128042;STB=0.571302;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=-0.000377651;OID=.;OPOS=135438929;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:9:3:1:0:9:3:1:0
chr10	135438951	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296518;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=338.811;QD=46.8481;RBI=0.0483045;REFB=0;REVB=0.0381326;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325255;OID=.;OPOS=135438951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:12:3:0:0:12:3:0:0
chr10	135438955	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219743;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.405;QD=46.848;RBI=0.0346879;REFB=0;REVB=0.0268398;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255832;OID=.;OPOS=135438955;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:12:3:0:0:12:3:0:0
chr10	135438967	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0932342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.759;QD=47.8224;RBI=0.0938573;REFB=0;REVB=-0.0107971;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00125588;OID=.;OPOS=135438967;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:13:3:0:0:13:3:0:0
chr10	135438977	.	G	A	195.59	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0042511;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.432;QD=48.8978;RBI=0.0323567;REFB=0;REVB=0.0320763;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000310422;OID=.;OPOS=135438977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0
chr10	135440203	.	A	T	147.57	PASS	AF=0.875;AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0252822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.44;QD=36.8923;RBI=0.0282615;REFB=0.0137579;REVB=0.0126301;RO=2;SAF=6;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164511;STB=0.509078;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=-0.00262309;OID=.;OPOS=135440203;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:16:16:2:2:14:14:0.875:8:6:1:1:8:6:1:1
chr11	193722	.	A	G	234.53	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.0127289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6366;QD=18.7622;RBI=0.0199941;REFB=-0.0158247;REVB=-0.0154187;RO=24;SAF=19;SAR=4;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253339;STB=0.625194;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0106026;OID=.;OPOS=193722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:27:23:23:0.46:4:19:15:9:4:19:18:9
chr11	193863	.	T	C	1863.11	PASS	AF=1;AO=121;DP=122;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113509;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.539;QD=61.5904;RBI=0.0139826;REFB=0;REVB=0.00816514;RO=0;SAF=84;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156545;OID=.;OPOS=193863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:121:0:0:121:121:1:37:84:0:0:37:84:0:0
chr11	193865	.	T	G	552.25	PASS	AF=0.47541;AO=58;DP=122;FAO=58;FDP=122;FR=.;FRO=64;FSAF=44;FSAR=14;FSRF=41;FSRR=23;FWDB=0.0219121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.685;QD=18.1067;RBI=0.0247931;REFB=-0.00850186;REVB=-0.0116;RO=64;SAF=44;SAR=14;SRF=41;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139229;STB=0.577686;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0111153;OID=.;OPOS=193865;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:64:64:58:58:0.47541:14:44:41:23:14:44:41:23
chr11	194441	.	C	T	65.36	PASS	AF=0.166667;AO=12;DP=72;FAO=12;FDP=72;FR=.;FRO=60;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=-0.00280402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.627;QD=3.63096;RBI=0.0132608;REFB=-0.00412934;REVB=0.012961;RO=59;SAF=7;SAR=5;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126955;STB=0.51433;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.022979;OID=.;OPOS=194441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:72:72:59:60:12:12:0.166667:5:7:35:24:5:7:36:24
chr11	197337	.	G	A,C	776.27	PASS	AF=0.915254,0.0508475;AO=54,3;DP=59;FAO=54,3;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=28,1;FSAR=26,2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00077678,0.00921923;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=219.982,31.109;QD=52.6284;RBI=0.0138235,0.0553397;REFB=-0.0607399,-0.155868;REVB=0.0138017,0.0545664;RO=2;SAF=28,1;SAR=26,2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0348761,0.272699;STB=0.518512,0.665762;STBP=0.245,0.686;TYPE=snp,snp;VARB=0.00182335,-0.0103997;OID=.,.;OPOS=197337,197337;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:59:59:2:2:54,3:54,3:0.915254,0.0508475:26,2:28,1:0:2:26,2:28,1:0:2
chr11	198469	.	G	A	281.63	PASS	AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.0133074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.83;QD=17.0684;RBI=0.0163813;REFB=-0.0112348;REVB=0.00955306;RO=35;SAF=15;SAR=16;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136439;STB=0.576388;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00926345;OID=.;OPOS=198469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:35:35:31:31:0.469697:16:15:22:13:16:15:22:13
chr11	223796	.	A	G	120.18	PASS	AF=0.411765;AO=13;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0286025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.683;QD=14.1389;RBI=0.0286816;REFB=0.0057693;REVB=0.00212815;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064306;STB=0.558741;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-0.00762866;OID=.;OPOS=223796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:13:14:0.411765:6:7:12:8:7:7:12:8
chr11	236091	.	G	A	659.48	PASS	AF=0.5;AO=65;DP=131;FAO=66;FDP=132;FR=.;FRO=66;FSAF=51;FSAR=15;FSRF=41;FSRR=25;FWDB=0.0162615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.155;QD=19.9842;RBI=0.0195354;REFB=-0.0223942;REVB=0.0108256;RO=65;SAF=50;SAR=15;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174618;STB=0.59646;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0182051;OID=.;OPOS=236091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:132:65:66:65:66:0.5:15:50:40:25:15:51:41:25
chr11	237087	.	A	G	1498.98	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287977;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.003;QD=59.9593;RBI=0.0395095;REFB=0;REVB=-0.0270498;RO=0;SAF=60;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.47126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.39421e-05;OID=.;OPOS=237087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:99:100:1:39:60:0:0:40:60:0:0
chr11	244106	.	A	G,T	501.61	PASS	AF=0.971429,0.0285714;AO=33,2;DP=35;FAO=34,1;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=21,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000855709,0.0114239;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=42.9016,12.8504;QD=57.3271;RBI=0.00306607,0.0400852;REFB=0,0;REVB=0.00294424,-0.0384229;RO=0;SAF=13,0;SAR=20,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.82173e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000531097,0.0422675;OID=.,.;OPOS=244106,244106;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:35:35:0:0:33,2:34,1:0.971429,0.0285714:20,2:13,0:0:0:21,1:13,0:0:0
chr11	244108	.	A	G	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00627455;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=320.309;QD=59.0187;RBI=0.03004;REFB=0;REVB=0.0293774;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.48175e-05;OID=.;OPOS=244108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr11	244115	.	G	A	508.35	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0556159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.086;QD=56.4829;RBI=0.0570364;REFB=-0.161971;REVB=0.0126497;RO=1;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217573;STB=0.511621;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00646934;OID=.;OPOS=244115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:21:14:0:1:21:14:0:1
chr11	244129	.	C	T	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0280978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0524;QD=59.0152;RBI=0.0632105;REFB=0;REVB=-0.0566223;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000902482;OID=.;OPOS=244129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr11	244141	.	G	A	482.75	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.705;QD=58.5151;RBI=0.015984;REFB=0;REVB=0.00890555;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.13607e-05;OID=.;OPOS=244141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0
chr11	244167	.	C	T	347.69	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.103537;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.782;QD=51.5089;RBI=0.106611;REFB=-0.146656;REVB=0.0254167;RO=1;SAF=8;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545422;STB=0.529389;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0018256;OID=.;OPOS=244167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:18:8:1:0:18:8:1:0
chr11	244171	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186696;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=314.816;QD=55.0986;RBI=0.0248698;REFB=0;REVB=0.0164303;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27746e-05;OID=.;OPOS=244171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr11	244197	.	T	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.062;QD=49.599;RBI=0.0239622;REFB=0;REVB=0.0127944;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259599;OID=.;OPOS=244197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
chr11	244414	.	C	T	526.67	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00693814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.1181;QD=56.937;RBI=0.0637511;REFB=-0.0672925;REVB=-0.0633725;RO=1;SAF=24;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191068;STB=0.510198;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0112105;OID=.;OPOS=244414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:12:24:1:0:12:24:1:0
chr11	244490	.	ATACCTTTTAGTACCTTTTAGA	ATACCTTTTAG,ATACCTTTTAGA,ATTACCTTTTAGA	326.7	PASS	AF=0,1,0;AO=3,13,7;DP=25;FAO=0,24,0;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=0,11,0;FSAR=0,13,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0519394,0.0541036,0.0456733;FXX=0.039984;HRUN=1,1,1;LEN=11,10,9;MLLD=171.48,326.064,306.077;QD=54.4503;RBI=0.0549145,0.073385,0.0579415;REFB=0,0,0;REVB=0.0178296,0.0495798,0.0356533;RO=0;SAF=0,10,0;SAR=3,3,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0,0.000681154,-0.00254093;OID=.,.,.;OPOS=244501,244491,244492;OREF=TACCTTTTAGA,TACCTTTTAG,ACCTTTTAG;OALT=-,-,-;OMAPALT=ATACCTTTTAG,ATACCTTTTAGA,ATTACCTTTTAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1,0:3,13,7:25:0,24,0:24:0:0,11,0:0,13,0:0:0:4:0:0,10,0:3,3,7:0:0
chr11	280816	.	AT	TC	445.68	PASS	AF=0.449541;AO=49;DP=111;FAO=49;FDP=109;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=-0.0181828;FXX=0.0267833;HRUN=1;LEN=2;MLLD=120.553;QD=16.3553;RBI=0.0531742;REFB=-0.0144469;REVB=-0.0499688;RO=56;SAF=31;SAR=18;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00786271;STB=0.509415;STBP=0.868;TYPE=mnp;VARB=0.016596;OID=.;OPOS=280816;OREF=AT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:109:56:60:49:49:0.449541:18:31:35:21:18:31:37:23
chr11	299411	.	C	G	154.16	PASS	AF=0.305085;AO=18;DP=63;FAO=18;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0490739;FXX=0.0781128;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.526;QD=10.4512;RBI=0.055714;REFB=-0.0301967;REVB=-0.0263781;RO=18;SAF=10;SAR=8;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0979282;STB=0.552788;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0392126;OID=.;OPOS=299411;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:59:18:38:18:18:0.305085:8:10:8:10:8:10:24:14
chr11	308290	.	T	C	698.59	PASS	AF=0.980392;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0487107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9477;QD=54.7915;RBI=0.0519529;REFB=-0.0482328;REVB=-0.0180656;RO=1;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184525;STB=0.5098;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000416358;OID=.;OPOS=308290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:51:1:1:49:50:0.980392:25:24:0:1:25:25:0:1
chr11	308314	.	T	C	556.99	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.069;QD=60.2151;RBI=0.0138293;REFB=0;REVB=-0.00347885;RO=0;SAF=8;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.86936e-05;OID=.;OPOS=308314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:29:8:0:0:29:8:0:0
chr11	308362	.	T	TC	263.83	PASS	AF=1;AO=4;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.2219;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=189.079;QD=43.972;RBI=0.222057;REFB=0;REVB=-0.00833411;RO=18;SAF=0;SAR=4;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.567691;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.0010276;OID=.;OPOS=308363;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:24:24:24:0:5:19:0:0:4:18:0:4:3:15
chr11	308363	.	G	C	272.23	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0200761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.028;QD=45.3719;RBI=0.0208281;REFB=0.184002;REVB=-0.00554627;RO=2;SAF=3;SAR=19;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227928;STB=0.624869;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00297154;OID=.;OPOS=308363;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:2:2:22:22:0.916667:19:3:2:0:19:3:2:0
chr11	308426	.	G	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.237;QD=45.8068;RBI=0.0529862;REFB=0;REVB=-0.0493031;RO=0;SAF=2;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000721213;OID=.;OPOS=308426;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:12:2:0:0:12:2:0:0
chr11	309127	.	A	G	792.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.58;QD=63.4314;RBI=0.0649749;REFB=0;REVB=0.0441152;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000308691;OID=.;OPOS=309127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:23:26:0:0:24:26:0:0
chr11	314207	.	C	G	872.93	PASS	AF=0.96875;AO=53;DP=58;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0282142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4364;QD=54.5581;RBI=0.116155;REFB=0.026487;REVB=0.112676;RO=3;SAF=33;SAR=20;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409266;STB=0.514281;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=-0.0149846;OID=.;OPOS=314207;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:58:64:3:2:53:62:0.96875:20:33:3:0:28:34:2:0
chr11	320772	.	A	G	223.79	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0128504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.416;QD=19.4597;RBI=0.0362412;REFB=-0.0160987;REVB=-0.0338865;RO=23;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177949;STB=0.608601;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0207539;OID=.;OPOS=320772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:24:22:22:0.478261:11:11:16:7:11:11:17:7
chr11	372157	.	C	T	220.83	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.0892372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8678;QD=18.0272;RBI=0.0903672;REFB=-0.0294689;REVB=-0.0142463;RO=27;SAF=16;SAR=6;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0710126;STB=0.540502;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0456328;OID=.;OPOS=372157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:6:16:18:9:6:16:18:9
chr11	372700	.	G	C	152.15	PASS	AF=0.75;AO=15;DP=20;FAO=15;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00974742;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=314.125;QD=30.429;RBI=0.0108104;REFB=-0.0195434;REVB=0.00467471;RO=5;SAF=3;SAR=12;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234373;STB=0.631385;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.00416341;OID=.;OPOS=372700;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:20:20:5:5:15:15:0.75:12:3:3:2:12:3:3:2
chr11	379598	.	A	G	68.81	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.066241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.553;QD=15.2912;RBI=0.0667614;REFB=0.00576719;REVB=-0.00831917;RO=8;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0371297;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0135215;OID=.;OPOS=379598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:8:9:9:9:0.5:6:3:3:5:6:3:3:6
chr11	396915	.	C	T	109.73	PASS	AF=0.705882;AO=10;DP=17;FAO=12;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0691577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.068;QD=25.8176;RBI=0.0693805;REFB=-0.0463204;REVB=0.00555597;RO=3;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157689;STB=0.519967;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0476666;OID=.;OPOS=396915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:17:17:3:5:10:12:0.705882:7:3:0:3:9:3:1:4
chr11	400109	.	A	G	686.12	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00522302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.433;QD=62.3748;RBI=0.00981693;REFB=0;REVB=0.00831217;RO=0;SAF=5;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90575e-05;OID=.;OPOS=400109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:38:5:0:0:39:5:0:0
chr11	403764	.	C	T	220.76	PASS	AF=0.369863;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=0.0067305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.319;QD=12.0963;RBI=0.0306125;REFB=-0.0151551;REVB=-0.0298634;RO=45;SAF=16;SAR=11;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276072;STB=0.663261;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0318164;OID=.;OPOS=403764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:45:46:27:27:0.369863:11:16:15:30:11:16:15:31
chr11	404468	.	G	A	395.62	PASS	AF=0.428571;AO=45;DP=101;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.0178219;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.5183;QD=15.0711;RBI=0.0376791;REFB=-0.0258565;REVB=0.0331978;RO=56;SAF=31;SAR=14;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24953;STB=0.65085;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0289824;OID=.;OPOS=404468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:105:56:60:45:45:0.428571:14:31:25:31:14:31:26:34
chr11	406042	.	AG	A,AA	1491.25	PASS	AF=0.0520833,0.947917;AO=16,79;DP=95;FAO=5,91;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=5,48;FSAR=0,43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248357,0.0270391;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=164.266,174.144;QD=62.1353;RBI=0.0288606,0.0292565;REFB=0,0;REVB=-0.0147011,-0.0111729;RO=0;SAF=11,41;SAR=5,38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=5.36667e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0292188,0.00185797;OID=.,.;OPOS=406043,406043;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0520833,0.947917:16,79:95:5,91:96:0:5,48:0,43:0:0:10:0:11,41:5,38:0:0
chr11	428385	.	A	G	340.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00149723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.924;QD=54.5159;RBI=0.0500141;REFB=0;REVB=0.0499917;RO=0;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00110763;OID=.;OPOS=428385;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:6:19:0:0:6:19:0:0
chr11	428489	.	T	C	255.89	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.889;QD=51.1783;RBI=0.0456642;REFB=0;REVB=0.0305329;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000489049;OID=.;OPOS=428489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr11	429659	.	C	T	437.31	PASS	AF=0.484536;AO=45;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=40;FSRR=10;FWDB=0.00719289;FXX=0.0490148;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.993;QD=18.0334;RBI=0.025829;REFB=-0.0129363;REVB=0.0248072;RO=46;SAF=26;SAR=19;SRF=36;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199297;STB=0.632248;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0113249;OID=.;OPOS=429659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:46:50:45:47:0.484536:19:26:36:10:21:26:40:10
chr11	431834	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.09657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.288;QD=50.413;RBI=0.0986064;REFB=0;REVB=0.0199362;RO=0;SAF=4;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000871702;OID=.;OPOS=431834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:15:4:0:0:15:4:0:0
chr11	433387	.	A	G	902.67	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00508202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.967;QD=58.2368;RBI=0.0166854;REFB=0;REVB=0.0158926;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.58664e-05;OID=.;OPOS=433387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:28:33:0:0:29:33:0:0
chr11	490036	.	G	A	304.37	PASS	AF=0.362745;AO=37;DP=102;FAO=37;FDP=102;FR=.;FRO=65;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=27;FWDB=0.0229739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.078;QD=11.9359;RBI=0.0258273;REFB=-0.0265707;REVB=-0.0118005;RO=65;SAF=16;SAR=21;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167974;STB=0.596163;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0321271;OID=.;OPOS=490036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:65:65:37:37:0.362745:21:16:38:27:21:16:38:27
chr11	502722	.	C	T	95.98	PASS	AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00638473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.873;QD=22.5845;RBI=0.00769608;REFB=0.0305769;REVB=0.00429707;RO=6;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184829;STB=0.604217;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.0211362;OID=.;OPOS=502722;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:5:6:5:1:5:6:5:1
chr11	549959	.	C	T	822.3	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0436025;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0068;QD=57.7051;RBI=0.0501887;REFB=0;REVB=0.0248541;RO=0;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000468831;OID=.;OPOS=549959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:57:0:0:57:57:1:19:38:0:0:19:38:0:0
chr11	551753	.	G	A	2853.0	PASS	AF=0.946602;AO=191;DP=207;FAO=195;FDP=206;FR=.;FRO=11;FSAF=105;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.0171652;FXX=0.00961492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.06;QD=55.398;RBI=0.0738025;REFB=-0.131776;REVB=0.0717786;RO=7;SAF=105;SAR=86;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371897;STB=0.528793;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000509284;OID=.;OPOS=551753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:207:206:7:11:191:195:0.946602:86:105:0:7:90:105:0:11
chr11	554166	.	C	G	1255.0	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2658;QD=61.2197;RBI=0.0524197;REFB=0;REVB=-0.0168621;RO=0;SAF=44;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.21456e-05;OID=.;OPOS=554166;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:82:0:0:80:82:1:36:44:0:0:37:45:0:0
chr11	554214	.	G	C	885.41	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0484236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9303;QD=58.0593;RBI=0.0485528;REFB=0;REVB=0.00353949;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003503;OID=.;OPOS=554214;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:34:27:0:0:34:27:0:0
chr11	556521	.	C	G	871.25	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0240315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.0005;QD=56.2098;RBI=0.0268638;REFB=-0.116252;REVB=-0.0120064;RO=1;SAF=35;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132969;STB=0.50704;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00126705;OID=.;OPOS=556521;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:26:35:1:0:26:35:1:0
chr11	556857	.	G	C	1060.44	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.495;QD=59.743;RBI=0.073201;REFB=0;REVB=0.0552592;RO=0;SAF=22;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293671;OID=.;OPOS=556857;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:71:0:0:68:71:1:46:22:0:0:48:23:0:0
chr11	557989	.	C	T	699.98	PASS	AF=0.539683;AO=68;DP=126;FAO=68;FDP=126;FR=.;FRO=58;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.0718602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.444;QD=22.2215;RBI=0.0916708;REFB=-0.0153301;REVB=0.0569179;RO=58;SAF=39;SAR=29;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407788;STB=0.522328;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0122589;OID=.;OPOS=557989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:58:58:68:68:0.539683:29:39:36:22:29:39:36:22
chr11	558884	.	C	T	281.3	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.190671;FXX=0.0869187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.062;QD=53.5811;RBI=0.192486;REFB=0;REVB=0.026369;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00249495;OID=.;OPOS=558884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr11	559016	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.954;QD=45.8057;RBI=0.0963461;REFB=0;REVB=-0.0801759;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000284463;OID=.;OPOS=559016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr11	562168	.	A	G	377.09	PASS	AF=0.416667;AO=40;DP=98;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=19;FWDB=-0.0251758;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.494;QD=15.7122;RBI=0.045939;REFB=-0.00544344;REVB=-0.0384261;RO=54;SAF=17;SAR=23;SRF=35;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224581;STB=0.634904;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00869665;OID=.;OPOS=562168;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:96:54:56:40:40:0.416667:23:17:35:19:23:17:37:19
chr11	562219	.	C	G	428.85	PASS	AF=0.621212;AO=40;DP=66;FAO=41;FDP=66;FR=.;FRO=25;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.031679;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.7803;QD=25.9909;RBI=0.0340811;REFB=0.0175385;REVB=0.0125684;RO=26;SAF=27;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135629;STB=0.556232;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-0.0110177;OID=.;OPOS=562219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:26:25:40:41:0.621212:13:27:13:13:14:27:13:12
chr11	562421	.	G	A	592.45	PASS	AF=0.588889;AO=53;DP=84;FAO=53;FDP=90;FR=.;FRO=37;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.00828328;FXX=0.0109878;HRUN=4;LEN=1;MLLD=136.058;QD=26.3311;RBI=0.0287967;REFB=-0.0214151;REVB=-0.0275797;RO=31;SAF=30;SAR=23;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101079;STB=0.511982;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0102229;OID=.;OPOS=562421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:90:31:37:53:53:0.588889:23:30:18:13:23:30:22:15
chr11	563257	.	G	A	293.61	PASS	AF=0.525424;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=25;FWDB=0.00726286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.279;QD=19.9054;RBI=0.0088912;REFB=-0.00573299;REVB=-0.00512878;RO=27;SAF=6;SAR=25;SRF=2;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182676;STB=0.571387;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.00463048;OID=.;OPOS=563257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:27:28:31:31:0.525424:25:6:2:25:25:6:3:25
chr11	563649	.	C	T	259.83	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=24;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.0817119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.379;QD=16.7633;RBI=0.0905099;REFB=-0.00390165;REVB=0.0389256;RO=33;SAF=5;SAR=24;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220009;STB=0.62531;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00683114;OID=.;OPOS=563649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:24:5:11:22:24:5:11:22
chr11	610277	.	T	C	286.13	PASS	AF=0.492063;AO=31;DP=63;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.00139616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2548;QD=18.1672;RBI=0.00889061;REFB=-0.00698333;REVB=-0.0087803;RO=32;SAF=19;SAR=12;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160925;STB=0.590003;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0085331;OID=.;OPOS=610277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:32:32:31:31:0.492063:12:19:14:18:12:19:14:18
chr11	611693	.	G	A	329.87	PASS	AF=0.428571;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.00932182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.611;QD=15.7079;RBI=0.0127424;REFB=-0.0216311;REVB=0.00868753;RO=48;SAF=24;SAR=12;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176647;STB=0.599943;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0249107;OID=.;OPOS=611693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:48:48:36:36:0.428571:12:24:24:24:12:24:24:24
chr11	614864	.	C	T	268.03	PASS	AF=0.454545;AO=29;DP=67;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0521546;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.266;QD=16.2441;RBI=0.0531121;REFB=-0.0277241;REVB=0.0100396;RO=34;SAF=23;SAR=6;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275764;STB=0.651051;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0260357;OID=.;OPOS=614864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:34:36:29:30:0.454545:6:23:19:15:6:24:21:15
chr11	616970	.	A	T	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.968;QD=54.5177;RBI=0.0365154;REFB=0;REVB=0.0289818;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43264e-05;OID=.;OPOS=616970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:19:6:0:0:19:6:0:0
chr11	617537	.	C	T	572.58	PASS	AF=0.432624;AO=61;DP=141;FAO=61;FDP=141;FR=.;FRO=80;FSAF=39;FSAR=22;FSRF=56;FSRR=24;FWDB=0.0375424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.8424;QD=16.2433;RBI=0.043626;REFB=-0.0224412;REVB=-0.0222215;RO=80;SAF=39;SAR=22;SRF=56;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0683311;STB=0.538093;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0218649;OID=.;OPOS=617537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:80:80:61:61:0.432624:22:39:56:24:22:39:56:24
chr11	617967	.	C	G	1422.05	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.341;QD=61.8282;RBI=0.0560576;REFB=-0.126402;REVB=-0.00295412;RO=1;SAF=47;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0099782;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052074;OID=.;OPOS=617967;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:91:92:1:0:90:92:1:43:47:1:0:44:48:0:0
chr11	618852	.	GCCCCCA	GCCCCAC	43.25	PASS	AF=0.238095;AO=4;DP=20;FAO=5;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.165711;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=29.6946;QD=8.23811;RBI=0.204258;REFB=-0.0449451;REVB=-0.119421;RO=11;SAF=1;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241825;STB=0.716993;STBP=0.345;TYPE=mnp;VARB=0.0724735;OID=.;OPOS=618857;OREF=CA;OALT=AC;OMAPALT=GCCCCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.238095:4:20:5:21:13:1:4:6:7:29:11:1:3:5:6
chr11	618998	.	G	A	158.46	PASS	AF=0.5625;AO=14;DP=30;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0544135;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=92.5253;QD=19.807;RBI=0.054487;REFB=-0.0554943;REVB=0.00282766;RO=9;SAF=2;SAR=12;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468103;STB=0.596892;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0284268;OID=.;OPOS=618998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:32:9:14:14:18:0.5625:12:2:1:8:16:2:3:11
chr11	704583	.	A	G	66.78	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.06123;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.4;QD=12.7204;RBI=0.0671708;REFB=-0.00331549;REVB=0.0276188;RO=10;SAF=2;SAR=7;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.43731;STB=0.793179;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.023345;OID=.;OPOS=704583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:19:21:10:12:9:9:0.428571:7:2:7:3:7:2:9:3
chr11	704604	.	GA	G	58.14	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0134411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.7;QD=14.5354;RBI=0.0154791;REFB=-0.000527706;REVB=-0.00767711;RO=7;SAF=2;SAR=6;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468349;STB=0.793435;STBP=0.051;TYPE=del;VARB=0.00256291;OID=.;OPOS=704605;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:8:16:8:16:8:2:6:7:1:54:7:2:6:6:1
chr11	709401	.	A	G	253.89	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0115619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.512;QD=21.6076;RBI=0.0744553;REFB=-0.0302649;REVB=-0.0735521;RO=23;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203563;STB=0.613941;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0262581;OID=.;OPOS=709401;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:14:10:15:8:14:10:15:8
chr11	720197	.	C	T	165.76	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0459843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2963;QD=14.4136;RBI=0.0476066;REFB=0.00140154;REVB=0.0123222;RO=27;SAF=7;SAR=11;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246517;STB=0.651495;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.000381624;OID=.;OPOS=720197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:28:18:18:0.391304:11:7:17:10:11:7:18:10
chr11	721877	.	G	C	294.5	PASS	AF=0.619048;AO=26;DP=42;FAO=26;FDP=42;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00439896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.053;QD=28.0478;RBI=0.0269677;REFB=-0.0272285;REVB=0.0266065;RO=16;SAF=12;SAR=14;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266401;STB=0.514695;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0158818;OID=.;OPOS=721877;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:16:16:26:26:0.619048:14:12:8:8:14:12:8:8
chr11	793582	.	C	CG	41.8	PASS	AF=0.146067;AO=16;DP=89;FAO=13;FDP=89;FR=.;FRO=76;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=33;FSRR=43;FWDB=-0.0439111;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=104.949;QD=1.87844;RBI=0.0497661;REFB=-0.0054817;REVB=-0.0234196;RO=68;SAF=12;SAR=4;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431777;STB=0.651724;STBP=0.279;TYPE=ins;VARB=0.15717;OID=.;OPOS=793583;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.146067:16:89:13:89:76:8:5:33:43:41:68:12:4:27:41
chr11	793588	.	G	A	384.24	PASS	AF=0.465116;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.000256066;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=82.0514;QD=17.8714;RBI=0.0187453;REFB=-0.0290234;REVB=-0.0187435;RO=45;SAF=14;SAR=26;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158533;STB=0.595132;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0726238;OID=.;OPOS=793588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:45:46:40:40:0.465116:26:14:23:22:26:14:24:22
chr11	801644	.	A	T	56.53	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00830931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5557;QD=11.3063;RBI=0.00954678;REFB=-0.0537249;REVB=-0.00470067;RO=10;SAF=2;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.418021;STB=0.709978;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0322509;OID=.;OPOS=801644;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:10:12:8:8:0.4:6:2:7:3:6:2:7:5
chr11	823809	.	C	G	383.99	PASS	AF=0.513158;AO=40;DP=77;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.000379265;FXX=0.0129853;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9206;QD=20.2098;RBI=0.0395846;REFB=-0.0184866;REVB=-0.0395828;RO=36;SAF=27;SAR=13;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111193;STB=0.552353;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0113981;OID=.;OPOS=823809;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:36:37:40:39:0.513158:13:27:20:16:13:26:21:16
chr11	825089	.	TC	T	31.7	PASS	AF=0.6;AO=8;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.103173;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=8.70642;QD=8.4534;RBI=0.257838;REFB=-0.0521547;REVB=0.236296;RO=4;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533262;STBP=0.817;TYPE=del;VARB=0.11493;OID=.;OPOS=825090;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6:8:15:9:15:6:2:7:1:5:25:4:2:6:1:3
chr11	828916	.	G	A	805.75	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293402;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.025;QD=57.5534;RBI=0.0315211;REFB=0;REVB=0.0115209;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00043209;OID=.;OPOS=828916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:20:36:0:0:20:36:0:0
chr11	829539	.	A	G	2252.6	PASS	AF=0.986842;AO=150;DP=152;FAO=150;FDP=152;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0229559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.178;QD=59.279;RBI=0.0252197;REFB=0.0716481;REVB=0.010443;RO=2;SAF=68;SAR=82;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114588;STB=0.506023;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=-0.000185727;OID=.;OPOS=829539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:152:152:2:2:150:150:0.986842:82:68:0:2:82:68:0:2
chr11	830487	.	C	T	190.95	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0611319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7802;QD=47.7384;RBI=0.0709944;REFB=0;REVB=0.0360984;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00183508;OID=.;OPOS=830487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr11	830670	.	G	T	511.57	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0747485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.56;QD=58.4647;RBI=0.0974465;REFB=0;REVB=0.0625179;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000433026;OID=.;OPOS=830670;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:35:0:0:31:35:1:16:15:0:0:18:17:0:0
chr11	831122	.	C	T	722.93	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.843;QD=62.8636;RBI=0.049827;REFB=0;REVB=0.0467195;RO=0;SAF=31;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100217;OID=.;OPOS=831122;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:14:31:0:0:14:32:0:0
chr11	837582	.	G	A	1473.72	PASS	AF=0.990099;AO=99;DP=102;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00929209;FXX=0.00980296;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.7695;QD=58.3653;RBI=0.0932278;REFB=-0.174252;REVB=0.0927636;RO=0;SAF=67;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-9.76003e-08;STB=0.503703;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0030129;OID=.;OPOS=837582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:102:101:0:1:99:100:0.990099:32:67:0:0:33:67:1:0
chr11	840477	.	A	G	575.74	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0527886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.679;QD=60.6044;RBI=0.0647973;REFB=0;REVB=0.0375773;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.84833e-05;OID=.;OPOS=840477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:19:18:0:0:19:19:0:0
chr11	862652	.	T	C	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8251;QD=57.385;RBI=0.0613642;REFB=0;REVB=-0.056711;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000819735;OID=.;OPOS=862652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:23:34:0:0:23:34:0:0
chr11	870446	.	G	A	385.05	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.459;QD=55.0077;RBI=0.0418644;REFB=0;REVB=0.0301306;RO=1;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371713;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172709;OID=.;OPOS=870446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:1:0:27:28:1:12:15:0:1:13:15:0:0
chr11	900929	.	C	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0518442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.599;QD=51.1846;RBI=0.0668535;REFB=0;REVB=0.0422087;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000615681;OID=.;OPOS=900929;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr11	903070	.	G	C	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00264984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.624;QD=57.6797;RBI=0.0219789;REFB=0;REVB=0.0218186;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.66784e-05;OID=.;OPOS=903070;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr11	993907	.	C	G	128.83	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0211545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1817;QD=12.569;RBI=0.0583572;REFB=-0.0344431;REVB=-0.054388;RO=26;SAF=11;SAR=4;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.379469;STB=0.723383;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0837914;OID=.;OPOS=993907;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:4:11:10:16:4:11:10:16
chr11	1016594	.	A	G	64.77	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0350838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3187;QD=10.363;RBI=0.11337;REFB=0.00381242;REVB=-0.107805;RO=15;SAF=2;SAR=7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407492;STB=0.732786;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=-0.0335987;OID=.;OPOS=1016594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:15:16:9:9:0.36:7:2:9:6:7:2:9:7
chr11	1016604	.	ACT	GGC	136.89	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.035934;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=3;MLLD=104.058;QD=17.1114;RBI=0.0390106;REFB=-0.0282565;REVB=-0.0151848;RO=16;SAF=6;SAR=9;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201563;STB=0.62946;STBP=0.18;TYPE=mnp;VARB=0.0248275;OID=.;OPOS=1016604;OREF=ACT;OALT=GGC;OMAPALT=GGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:32:16:17:15:15:0.46875:9:6:10:6:9:6:11:6
chr11	1016614	.	G	T	288.64	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0171182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5628;QD=20.9923;RBI=0.0177555;REFB=-0.00769313;REVB=0.00471423;RO=25;SAF=10;SAR=20;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945984;STB=0.552596;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00776365;OID=.;OPOS=1016614;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:25:25:30:30:0.545455:20:10:11:14:20:10:11:14
chr11	1016618	.	G	C	327.87	PASS	AF=0.578947;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0058763;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=208.801;QD=23.0081;RBI=0.0156717;REFB=-0.0299769;REVB=0.0145283;RO=23;SAF=10;SAR=23;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110371;STB=0.554183;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0187934;OID=.;OPOS=1016618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:23:24:33:33:0.578947:23:10:10:13:23:10:10:14
chr11	1016665	.	C	T	77.13	PASS	AF=0.164706;AO=14;DP=86;FAO=14;FDP=85;FR=.;FRO=71;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=44;FWDB=-0.0361734;FXX=0.034087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.234;QD=3.62949;RBI=0.0733718;REFB=-0.00709454;REVB=-0.063835;RO=70;SAF=4;SAR=10;SRF=26;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120955;STB=0.58922;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0474135;OID=.;OPOS=1016665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:86:85:70:71:14:14:0.164706:10:4:26:44:10:4:27:44
chr11	1016704	.	C	A	62.08	PASS	AF=0.131313;AO=13;DP=96;FAO=13;FDP=99;FR=.;FRO=86;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=35;FSRR=51;FWDB=-0.00970954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5141;QD=2.50816;RBI=0.0751894;REFB=-0.00724374;REVB=-0.0745599;RO=83;SAF=4;SAR=9;SRF=35;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150246;STB=0.593759;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0506915;OID=.;OPOS=1016704;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:96:99:83:86:13:13:0.131313:9:4:35:48:9:4:35:51
chr11	1016713	.	T	C	74.73	PASS	AF=0.152174;AO=14;DP=92;FAO=14;FDP=92;FR=.;FRO=78;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=33;FSRR=45;FWDB=0.023352;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0319;QD=3.24911;RBI=0.0246366;REFB=-0.0292829;REVB=0.00785169;RO=77;SAF=5;SAR=9;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932253;STB=0.558738;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.073329;OID=.;OPOS=1016713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:92:92:77:78:14:14:0.152174:9:5:33:44:9:5:33:45
chr11	1016722	.	T	G	43.04	PASS	AF=0.108696;AO=10;DP=92;FAO=10;FDP=92;FR=.;FRO=82;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=45;FWDB=-0.0164118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.314;QD=1.8711;RBI=0.0241576;REFB=-0.00973978;REVB=-0.0177269;RO=80;SAF=5;SAR=5;SRF=36;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0598083;STB=0.543392;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0630476;OID=.;OPOS=1016722;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:92:92:80:82:10:10:0.108696:5:5:36:44:5:5:37:45
chr11	1016724	.	A	G	102.12	PASS	AF=0.193182;AO=17;DP=89;FAO=17;FDP=88;FR=.;FRO=71;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=33;FSRR=38;FWDB=-0.0356192;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.819;QD=4.64189;RBI=0.03564;REFB=-0.0222147;REVB=0.00121716;RO=67;SAF=8;SAR=9;SRF=31;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00995197;STB=0.504692;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0548225;OID=.;OPOS=1016724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:67:71:17:17:0.193182:9:8:31:36:9:8:33:38
chr11	1016776	.	C	T	307.18	PASS	AF=0.44;AO=32;DP=105;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=-0.0128454;FXX=0.285687;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.598;QD=16.3828;RBI=0.0192755;REFB=-0.0368595;REVB=-0.0143715;RO=42;SAF=18;SAR=14;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133641;STB=0.567049;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0406693;OID=.;OPOS=1016776;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:75:42:42:32:33:0.44:14:18:29:13:14:19:29:13
chr11	1016795	.	C	G	45.05	PASS	AF=0.102804;AO=11;DP=107;FAO=11;FDP=107;FR=.;FRO=96;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=67;FSRR=29;FWDB=-0.0430125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.085;QD=1.68405;RBI=0.139047;REFB=-0.0077337;REVB=-0.132227;RO=92;SAF=6;SAR=5;SRF=64;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191333;STB=0.641246;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.100332;OID=.;OPOS=1016795;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:107:107:92:96:11:11:0.102804:5:6:64:28:5:6:67:29
chr11	1016819	.	G	T	32.81	PASS	AF=0.0743243;AO=11;DP=148;FAO=11;FDP=148;FR=.;FRO=137;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=77;FSRR=60;FWDB=-0.0275549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.799;QD=0.886857;RBI=0.066192;REFB=-0.00802689;REVB=-0.060184;RO=137;SAF=7;SAR=4;SRF=77;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840816;STB=0.571296;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0840656;OID=.;OPOS=1016819;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:148:148:137:137:11:11:0.0743243:4:7:77:60:4:7:77:60
chr11	1016825	.	G	A	97.98	PASS	AF=0.133333;AO=22;DP=165;FAO=22;FDP=165;FR=.;FRO=143;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=78;FSRR=65;FWDB=-0.0180342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2744;QD=2.3753;RBI=0.0307517;REFB=-0.00492944;REVB=-0.0249085;RO=143;SAF=7;SAR=15;SRF=78;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283667;STB=0.694648;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0721686;OID=.;OPOS=1016825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:165:165:143:143:22:22:0.133333:15:7:78:65:15:7:78:65
chr11	1016834	.	G	A	221.85	PASS	AF=0.214689;AO=38;DP=177;FAO=38;FDP=177;FR=.;FRO=139;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=64;FSRR=75;FWDB=0.0273805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1624;QD=5.01349;RBI=0.0465473;REFB=-0.0168373;REVB=0.0376425;RO=129;SAF=26;SAR=12;SRF=62;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261938;STB=0.676747;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.114317;OID=.;OPOS=1016834;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:177:129:139:38:38:0.214689:12:26:62:67:12:26:64:75
chr11	1016869	.	AGG	CAG,CAT,TGG	437.09	PASS	AF=0,0,0.382812;AO=8,9,48;DP=145;FAO=0,0,49;FDP=128;FR=.;FRO=79;FSAF=0,0,38;FSAR=0,0,11;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=-0.00508824,0.00323413,0.00674475;FXX=0.117233;HRUN=2,2,2;LEN=2,3,1;MLLD=121.522,127.501,108.873;QD=13.6589;RBI=0.0186505,0.0124796,0.00839682;REFB=-0.0253494,-0.0236536,-0.0291414;REVB=-0.017943,-0.0120533,0.00500149;RO=72;SAF=2,4,37;SAR=6,5,11;SRF=40;SRR=32;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.348284,-0.131269,0.267248;STB=0.5,0.5,0.688822;STBP=1,1,0.008;TYPE=mnp,mnp,snp;VARB=0.0555531,0.0942179,0.0391975;OID=.,.,.;OPOS=1016869,1016869,1016869;OREF=AG,AGG,A;OALT=CA,CAT,T;OMAPALT=CAG,CAT,TGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:99:145:128:72:79:8,9,48:0,0,49:0,0,0.382812:6,5,11:2,4,37:40:32:0,0,11:0,0,38:40:39
chr11	1016887	.	G	A	35.29	PASS	AF=0.0854701;AO=10;DP=117;FAO=10;FDP=117;FR=.;FRO=107;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=75;FSRR=32;FWDB=-0.0290832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.624;QD=1.20641;RBI=0.0297651;REFB=-0.00334826;REVB=-0.00633466;RO=106;SAF=3;SAR=7;SRF=75;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.444885;STB=0.823022;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0331891;OID=.;OPOS=1016887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:117:117:106:107:10:10:0.0854701:7:3:75:31:7:3:75:32
chr11	1016889	.	GG	AA,GA	239.24	PASS	AF=0.0841121,0.233645;AO=7,25;DP=100;FAO=9,25;FDP=107;FR=.;FRO=73;FSAF=6,14;FSAR=3,11;FSRF=54;FSRR=19;FWDB=-0.0111817,-0.0200359;FXX=0.0183469;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=164.346,195.288;QD=8.94348;RBI=0.0296112,0.0369636;REFB=-0.0159979,-0.021234;REVB=-0.0274189,-0.0310624;RO=65;SAF=4,14;SAR=3,11;SRF=50;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.26153,-0.272168;STB=0.576764,0.640311;STBP=0.685,0.139;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0508919,0.044134;OID=.,.;OPOS=1016889,1016890;OREF=GG,G;OALT=AA,A;OMAPALT=AA,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:100:107:65:73:7,25:9,25:0.0841121,0.233645:3,11:4,14:50:15:3,11:6,14:54:19
chr11	1016894	.	G	A	172.23	PASS	AF=0.25;AO=25;DP=100;FAO=25;FDP=100;FR=.;FRO=75;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=50;FSRR=25;FWDB=-0.0268157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.716;QD=6.88927;RBI=0.0328849;REFB=-0.0119757;REVB=-0.0190351;RO=75;SAF=22;SAR=3;SRF=50;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.381679;STB=0.740152;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.133298;OID=.;OPOS=1016894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:75:75:25:25:0.25:3:22:50:25:3:22:50:25
chr11	1016906	.	G	T	32.48	PASS	AF=0.0952381;AO=8;DP=83;FAO=8;FDP=84;FR=.;FRO=76;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=61;FSRR=15;FWDB=-0.052546;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=157.873;QD=1.54674;RBI=0.0572597;REFB=-0.00980557;REVB=-0.0227506;RO=75;SAF=3;SAR=5;SRF=60;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496012;STB=0.841557;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0795941;OID=.;OPOS=1016906;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:83:84:75:76:8:8:0.0952381:5:3:60:15:5:3:61:15
chr11	1016914	.	G	T	159.94	PASS	AF=0.297297;AO=22;DP=74;FAO=22;FDP=74;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=45;FSRR=7;FWDB=-0.0294948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.0384;QD=8.64522;RBI=0.0559465;REFB=0.00560017;REVB=0.0475401;RO=52;SAF=17;SAR=5;SRF=45;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1773;STB=0.603032;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=-0.0125083;OID=.;OPOS=1016914;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:52:52:22:22:0.297297:5:17:45:7:5:17:45:7
chr11	1016928	.	C	G	657.57	PASS	AF=0.760563;AO=54;DP=71;FAO=54;FDP=71;FR=.;FRO=17;FSAF=47;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0357874;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.16;QD=37.0464;RBI=0.0390801;REFB=-0.042882;REVB=0.0157008;RO=15;SAF=47;SAR=7;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111458;STB=0.577246;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.011483;OID=.;OPOS=1016928;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:15:17:54:54:0.760563:7:47:11:4:7:47:12:5
chr11	1016933	.	C	T	114.8	PASS	AF=0.261538;AO=17;DP=65;FAO=17;FDP=65;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=38;FSRR=10;FWDB=-0.0118489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.381;QD=7.06457;RBI=0.0126497;REFB=-0.0143449;REVB=-0.00442929;RO=47;SAF=14;SAR=3;SRF=37;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0704014;STB=0.538414;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0562142;OID=.;OPOS=1016933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:47:48:17:17:0.261538:3:14:37:10:3:14:38:10
chr11	1016960	.	G	T	58.73	PASS	AF=0.191489;AO=9;DP=47;FAO=9;FDP=47;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0542013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2661;QD=4.99835;RBI=0.0577503;REFB=0.00235003;REVB=0.0199328;RO=38;SAF=6;SAR=3;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119576;STB=0.507919;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=-0.0119523;OID=.;OPOS=1016960;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:47:47:38:38:9:9:0.191489:3:6:25:13:3:6:25:13
chr11	1016991	.	T	G	41.73	PASS	AF=0.12;AO=9;DP=75;FAO=9;FDP=75;FR=.;FRO=66;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=20;FSRR=46;FWDB=-0.0310602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.6541;QD=2.22536;RBI=0.0989318;REFB=-0.0095205;REVB=-0.0939296;RO=66;SAF=8;SAR=1;SRF=20;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.630488;STB=0.929945;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0677141;OID=.;OPOS=1016991;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:75:75:66:66:9:9:0.12:1:8:20:46:1:8:20:46
chr11	1017023	.	G	A	83.88	PASS	AF=0.152381;AO=16;DP=105;FAO=16;FDP=105;FR=.;FRO=89;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=64;FWDB=-0.00388973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.787;QD=3.19536;RBI=0.0447524;REFB=-0.0166443;REVB=-0.0445831;RO=89;SAF=7;SAR=9;SRF=25;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212885;STB=0.639394;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0797213;OID=.;OPOS=1017023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:105:105:89:89:16:16:0.152381:9:7:25:64:9:7:25:64
chr11	1017029	.	T	G	476.98	PASS	AF=0.476636;AO=51;DP=110;FAO=51;FDP=107;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=36;FSRF=14;FSRR=42;FWDB=-0.0550561;FXX=0.0272702;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7534;QD=17.831;RBI=0.067666;REFB=-0.0661829;REVB=-0.0393385;RO=59;SAF=15;SAR=36;SRF=14;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0682017;STB=0.528444;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0534334;OID=.;OPOS=1017029;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:107:59:56:51:51:0.476636:36:15:14:45:36:15:14:42
chr11	1017036	.	G	A	141.93	PASS	AF=0.222222;AO=23;DP=110;FAO=24;FDP=108;FR=.,HEALED;FRO=84;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=65;FWDB=0.044055;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.246;QD=5.25671;RBI=0.0455129;REFB=-0.0331136;REVB=-0.0114273;RO=59;SAF=7;SAR=16;SRF=19;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247658;STB=0.56491;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.071507;OID=.;OPOS=1017036;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:108:59:84:23:24:0.222222:16:7:19:40:17:7:19:65
chr11	1017041	.	GT	TG	127.26	PASS	AF=0.19469;AO=22;DP=115;FAO=22;FDP=113;FR=.;FRO=91;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=70;FWDB=-0.0266019;FXX=0.0173898;HRUN=2;LEN=2;MLLD=120.005;QD=4.50485;RBI=0.0548161;REFB=-0.00434428;REVB=-0.0479285;RO=90;SAF=8;SAR=14;SRF=21;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194897;STB=0.623278;STBP=0.278;TYPE=mnp;VARB=0.0359312;OID=.;OPOS=1017041;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:113:90:91:22:22:0.19469:14:8:21:69:14:8:21:70
chr11	1017045	.	G	T	157.64	PASS	AF=0.214876;AO=26;DP=120;FAO=26;FDP=121;FR=.;FRO=95;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=70;FWDB=-0.0135818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.098;QD=5.21106;RBI=0.059216;REFB=-0.0112871;REVB=-0.0576374;RO=92;SAF=7;SAR=19;SRF=24;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01351;STB=0.506088;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0463245;OID=.;OPOS=1017045;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:92:95:26:26:0.214876:19:7:24:68:19:7:25:70
chr11	1017069	.	G	A	106.91	PASS	AF=0.156716;AO=21;DP=134;FAO=21;FDP=134;FR=.;FRO=113;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=79;FWDB=0.00789669;FXX=0.0147048;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7022;QD=3.19118;RBI=0.0130951;REFB=-0.0109784;REVB=-0.0104463;RO=110;SAF=9;SAR=12;SRF=32;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188906;STB=0.613384;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0430266;OID=.;OPOS=1017069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:110:113:21:21:0.156716:12:9:32:78:12:9:34:79
chr11	1017084	.	G	A	187.45	PASS	AF=0.202614;AO=33;DP=146;FAO=31;FDP=153;FR=.;FRO=122;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=84;FWDB=0.00165932;FXX=0.00649309;HRUN=4;LEN=1;MLLD=116.149;QD=4.90075;RBI=0.042428;REFB=-0.00315086;REVB=-0.0423956;RO=112;SAF=11;SAR=22;SRF=38;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00841426;STB=0.538582;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0185927;OID=.;OPOS=1017084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:153:112:122:33:31:0.202614:22:11:38:74:20:11:38:84
chr11	1017110	.	C	T	312.26	PASS	AF=0.310127;AO=42;DP=147;FAO=49;FDP=158;FR=.;FRO=109;FSAF=16;FSAR=33;FSRF=32;FSRR=77;FWDB=-0.00525378;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.69;QD=7.90538;RBI=0.00590534;REFB=-0.033499;REVB=0.00269645;RO=100;SAF=16;SAR=26;SRF=32;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0796506;STB=0.526305;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0947123;OID=.;OPOS=1017110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:158:100:109:42:49:0.310127:26:16:32:68:33:16:32:77
chr11	1017112	.	GT	AC,CC,GC	527.89	PASS	AF=0.0422535,0.267606,0.140845;AO=6,38,31;DP=158;FAO=6,38,20;FDP=142;FR=.;FRO=78;FSAF=2,16,11;FSAR=4,22,9;FSRF=21;FSRR=57;FWDB=0.0218721,0.00911868,0.0353865;FXX=0.101259;HRUN=2,2,1;LEN=2,2,1;MLLD=120.075,109.447,86.5323;QD=14.8701;RBI=0.0226429,0.0229784,0.037728;REFB=-0.0248776,-0.0263282,-0.0340086;REVB=0.00585756,0.0210916,0.0130844;RO=74;SAF=2,16,11;SAR=4,22,20;SRF=20;SRR=54;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0809766,0.184632,0.115611;STB=0.569875,0.608225,0.715793;STBP=0.782,0.156,0.05;TYPE=mnp,mnp,snp;VARB=0.0288892,0.0403784,0.0219425;OID=.,.,.;OPOS=1017112,1017112,1017113;OREF=GT,GT,T;OALT=AC,CC,C;OMAPALT=AC,CC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:158:142:74:78:6,38,31:6,38,20:0.0422535,0.267606,0.140845:4,22,20:2,16,11:20:54:4,22,9:2,16,11:21:57
chr11	1017135	.	G	A	48.34	PASS	AF=0.0824742;AO=16;DP=194;FAO=16;FDP=194;FR=.;FRO=178;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=49;FSRR=129;FWDB=0.0133089;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.392;QD=0.996623;RBI=0.0278486;REFB=-0.00218125;REVB=-0.0244626;RO=176;SAF=9;SAR=7;SRF=49;SRR=127;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335454;STB=0.75067;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0467071;OID=.;OPOS=1017135;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:194:194:176:178:16:16:0.0824742:7:9:49:127:7:9:49:129
chr11	1017154	.	T	G	135.56	PASS	AF=0.151351;AO=27;DP=186;FAO=28;FDP=185;FR=.;FRO=157;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=40;FSRR=117;FWDB=-0.0345928;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.171;QD=2.93103;RBI=0.0473292;REFB=-0.0043129;REVB=-0.0323015;RO=156;SAF=14;SAR=13;SRF=40;SRR=116;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344615;STB=0.707985;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0476756;OID=.;OPOS=1017154;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:185:156:157:27:28:0.151351:13:14:40:116:14:14:40:117
chr11	1017158	.	G	T	113.32	PASS	AF=0.140449;AO=24;DP=174;FAO=25;FDP=178;FR=.;FRO=153;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=114;FWDB=-0.0243875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7713;QD=2.54642;RBI=0.0405761;REFB=-0.00901843;REVB=0.0324294;RO=150;SAF=11;SAR=13;SRF=39;SRR=111;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270873;STB=0.696714;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0627169;OID=.;OPOS=1017158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:178:150:153:24:25:0.140449:13:11:39:111:13:12:39:114
chr11	1017161	.	C	T	40.86	PASS	AF=0.0777778;AO=13;DP=179;FAO=14;FDP=180;FR=.;FRO=166;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=44;FSRR=122;FWDB=-0.0366747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.595;QD=0.908002;RBI=0.0576984;REFB=-0.00150225;REVB=-0.044543;RO=160;SAF=7;SAR=6;SRF=42;SRR=118;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323962;STB=0.716416;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0290115;OID=.;OPOS=1017161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:179:180:160:166:13:14:0.0777778:6:7:42:118:7:7:44:122
chr11	1017173	.	G	A	576.83	PASS	AF=0.391813;AO=67;DP=170;FAO=67;FDP=171;FR=.;FRO=104;FSAF=22;FSAR=45;FSRF=27;FSRR=77;FWDB=-0.00335522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.393;QD=13.493;RBI=0.00681537;REFB=-0.027843;REVB=-0.00593226;RO=102;SAF=22;SAR=45;SRF=26;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0928564;STB=0.548974;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0438074;OID=.;OPOS=1017173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:171:102:104:67:67:0.391813:45:22:26:76:45:22:27:77
chr11	1017183	.	G	T	171.22	PASS	AF=0.190184;AO=29;DP=160;FAO=31;FDP=163;FR=.;FRO=132;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=95;FWDB=0.0323419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2266;QD=4.20173;RBI=0.0347523;REFB=-0.00305186;REVB=-0.0127171;RO=130;SAF=8;SAR=21;SRF=36;SRR=94;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0016978;STB=0.509921;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0162041;OID=.;OPOS=1017183;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:163:130:132:29:31:0.190184:21:8:36:94:22:9:37:95
chr11	1017186	.	A	G	36.76	PASS	AF=0.0784314;AO=12;DP=151;FAO=12;FDP=153;FR=.;FRO=141;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=38;FSRR=103;FWDB=-0.0419814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3151;QD=0.961;RBI=0.0784412;REFB=-0.0110465;REVB=-0.0662614;RO=136;SAF=4;SAR=8;SRF=38;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724968;STB=0.569123;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0944442;OID=.;OPOS=1017186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:151:153:136:141:12:12:0.0784314:8:4:38:98:8:4:38:103
chr11	1017220	.	T	C	834.21	PASS	AF=0.701923;AO=72;DP=104;FAO=73;FDP=104;FR=.;FRO=31;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0585622;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.521;QD=32.0851;RBI=0.0594412;REFB=-0.0874036;REVB=0.0101847;RO=31;SAF=28;SAR=44;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00105463;STB=0.501113;STBP=0.982;TYPE=snp;VARB=0.0719025;OID=.;OPOS=1017220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:31:31:72:73:0.701923:44:28:12:19:45:28:12:19
chr11	1017231	.	A	G	610.94	PASS	AF=0.627907;AO=50;DP=98;FAO=54;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0220215;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.059;QD=28.4159;RBI=0.0223286;REFB=-0.0422766;REVB=0.00369072;RO=32;SAF=25;SAR=25;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111947;STB=0.533321;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0450879;OID=.;OPOS=1017231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:86:32:31:50:54:0.627907:25:25:11:21:30:24:11:20
chr11	1017239	.	CG	TA	565.71	PASS	AF=0.617284;AO=49;DP=90;FAO=50;FDP=81;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.00261836;FXX=0.0999889;HRUN=2;LEN=2;MLLD=194.586;QD=27.9364;RBI=0.00420535;REFB=-0.0293545;REVB=0.00329077;RO=30;SAF=21;SAR=28;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0443796;STB=0.520636;STBP=0.641;TYPE=mnp;VARB=0.0157772;OID=.;OPOS=1017239;OREF=CG;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:81:30:31:49:50:0.617284:28:21:11:19:28:22:12:19
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chr11	1017325	.	A	C	97.79	PASS	AF=0.241935;AO=15;DP=62;FAO=15;FDP=62;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.0284126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3038;QD=6.30919;RBI=0.0616175;REFB=-0.019639;REVB=0.0546757;RO=46;SAF=7;SAR=8;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119652;STB=0.58109;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0686959;OID=.;OPOS=1017325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:62:62:46:47:15:15:0.241935:8:7:26:20:8:7:27:20
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chr11	1017443	.	C	G	79.32	PASS	AF=0.168675;AO=14;DP=88;FAO=14;FDP=83;FR=.;FRO=69;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=-0.0271619;FXX=0.0568117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.719;QD=3.82285;RBI=0.063903;REFB=-0.00357912;REVB=-0.057843;RO=67;SAF=11;SAR=3;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439679;STB=0.797223;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0320527;OID=.;OPOS=1017443;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:88:83:67:69:14:14:0.168675:3:11:29:38:3:11:29:40
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chr11	1017767	.	G	C	144.3	PASS	AF=0.173333;AO=26;DP=150;FAO=26;FDP=150;FR=.;FRO=124;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=40;FSRR=84;FWDB=-0.00322317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.786;QD=3.84803;RBI=0.0140464;REFB=-0.0154215;REVB=-0.0136716;RO=123;SAF=13;SAR=13;SRF=40;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22767;STB=0.646564;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0796207;OID=.;OPOS=1017767;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:123:124:26:26:0.173333:13:13:40:83:13:13:40:84
chr11	1017773	.	G	A	100.59	PASS	AF=0.157534;AO=20;DP=147;FAO=23;FDP=146;FR=.,HEALED;FRO=123;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=47;FSRR=76;FWDB=0.0265976;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1667;QD=2.75584;RBI=0.0693243;REFB=-0.0138065;REVB=0.0640189;RO=101;SAF=7;SAR=13;SRF=31;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619581;STB=0.572879;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0673674;OID=.;OPOS=1017773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:146:101:123:20:23:0.157534:13:7:31:70:16:7:47:76
chr11	1017783	.	A	G	614.16	PASS	AF=0.423313;AO=67;DP=162;FAO=69;FDP=163;FR=.;FRO=94;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=36;FSRR=58;FWDB=-0.0348931;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.813;QD=15.0715;RBI=0.0508403;REFB=-0.0164529;REVB=-0.0369758;RO=93;SAF=32;SAR=35;SRF=35;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106031;STB=0.555301;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0177618;OID=.;OPOS=1017783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:163:93:94:67:69:0.423313:35:32:35:58:36:33:36:58
chr11	1017789	.	A	C	123.07	PASS	AF=0.155172;AO=25;DP=170;FAO=27;FDP=174;FR=.;FRO=147;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=73;FSRR=74;FWDB=-0.022343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9735;QD=2.82923;RBI=0.0325238;REFB=-0.00581722;REVB=-0.0236344;RO=140;SAF=5;SAR=20;SRF=70;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399161;STB=0.7812;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0511396;OID=.;OPOS=1017789;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:174:140:147:25:27:0.155172:20:5:70:70:22:5:73:74
chr11	1017793	.	T	G	42.16	PASS	AF=0.08;AO=14;DP=175;FAO=14;FDP=175;FR=.;FRO=161;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=77;FSRR=84;FWDB=0.0350218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7247;QD=0.963547;RBI=0.0396955;REFB=0.00228145;REVB=0.018687;RO=161;SAF=2;SAR=12;SRF=77;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397821;STB=0.831076;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.0240081;OID=.;OPOS=1017793;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:175:175:161:161:14:14:0.08:12:2:77:84:12:2:77:84
chr11	1017833	.	C	T	44.04	PASS	AF=0.0872483;AO=13;DP=148;FAO=13;FDP=149;FR=.;FRO=136;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=55;FSRR=81;FWDB=-0.0144761;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.653;QD=1.18238;RBI=0.0576648;REFB=-0.00835632;REVB=-0.0558182;RO=133;SAF=5;SAR=8;SRF=55;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0347998;STB=0.51889;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0643966;OID=.;OPOS=1017833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:148:149:133:136:13:13:0.0872483:8:5:55:78:8:5:55:81
chr11	1017844	.	TC	CG,TG	374.48	PASS	AF=0.0510949,0.29927;AO=7,26;DP=140;FAO=7,41;FDP=137;FR=.;FRO=89;FSAF=2,9;FSAR=5,32;FSRF=48;FSRR=41;FWDB=-0.0305973,-0.0856524;FXX=0.021427;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=136.776,142.7;QD=10.9338;RBI=0.0326076,0.0875118;REFB=-0.0228916,-0.0386687;REVB=-0.0112721,-0.0179439;RO=75;SAF=2,6;SAR=5,20;SRF=40;SRR=35;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.273191,-0.387986;STB=0.730348,0.735066;STBP=0.267,0.003;TYPE=mnp,snp;VARB=0.053443,0.0469898;OID=.,.;OPOS=1017844,1017845;OREF=TC,C;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:140:137:75:89:7,26:7,41:0.0510949,0.29927:5,20:2,6:40:35:5,32:2,9:48:41
chr11	1017858	.	A	G	295.85	PASS	AF=0.277027;AO=41;DP=148;FAO=41;FDP=148;FR=.;FRO=107;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=55;FSRR=52;FWDB=-0.0460074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1468;QD=7.99603;RBI=0.053896;REFB=-0.0331728;REVB=-0.0280731;RO=105;SAF=10;SAR=31;SRF=53;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338576;STB=0.708153;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0615766;OID=.;OPOS=1017858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:148:105:107:41:41:0.277027:31:10:53:52:31:10:55:52
chr11	1017883	.	C	A	55.31	PASS	AF=0.0980392;AO=15;DP=148;FAO=15;FDP=153;FR=.;FRO=138;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=62;FSRR=76;FWDB=-0.0401568;FXX=0.0129024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.4446;QD=1.44602;RBI=0.0461486;REFB=-0.00488087;REVB=-0.0227404;RO=131;SAF=4;SAR=11;SRF=62;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256145;STB=0.675732;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0482568;OID=.;OPOS=1017883;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:148:153:131:138:15:15:0.0980392:11:4:62:69:11:4:62:76
chr11	1017891	.	GCA	GCG,TGA	81.6	PASS	AF=0.0588235,0.0514706;AO=8,7;DP=141;FAO=8,7;FDP=136;FR=.,HEALED;FRO=115;FSAF=1,4;FSAR=7,3;FSRF=57;FSRR=58;FWDB=-0.0114878,-0.0146286;FXX=0.0354585;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=112.877,98.2411;QD=2.39988;RBI=0.0760561,0.0753806;REFB=-0.00637661,-0.0115832;REVB=-0.0751835,-0.0739475;RO=108;SAF=1,4;SAR=7,3;SRF=56;SRR=52;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.419283,0.0535695;STB=0.861055,0.571225;STBP=0.048,0.754;TYPE=snp,mnp;VARB=0.123566,0.0532668;OID=.,.;OPOS=1017893,1017891;OREF=A,GC;OALT=G,TG;OMAPALT=GCG,TGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:141:136:108:115:8,7:8,7:0.0588235,0.0514706:7,3:1,4:56:52:7,3:1,4:57:58
chr11	1017921	.	C	T	31.49	PASS	AF=0.0793651;AO=9;DP=127;FAO=10;FDP=126;FR=.;FRO=116;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=52;FSRR=64;FWDB=-0.0434066;FXX=0.0526276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.4702;QD=0.99968;RBI=0.0434806;REFB=-0.0126637;REVB=-0.00253554;RO=107;SAF=2;SAR=7;SRF=45;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236587;STB=0.749465;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0806562;OID=.;OPOS=1017921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:127:126:107:116:9:10:0.0793651:7:2:45:62:8:2:52:64
chr11	1017935	.	A	G	87.41	PASS	AF=0.156522;AO=18;DP=116;FAO=18;FDP=115;FR=.;FRO=97;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=47;FSRR=50;FWDB=-0.0658339;FXX=0.00861995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.5321;QD=3.04027;RBI=0.0749945;REFB=-0.0155397;REVB=-0.0359176;RO=95;SAF=5;SAR=13;SRF=45;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258346;STB=0.68193;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0507524;OID=.;OPOS=1017935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:116:115:95:97:18:18:0.156522:13:5:45:50:13:5:47:50
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chr11	1018295	.	T	C	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0262839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.207;QD=14.657;RBI=0.0300553;REFB=-0.024878;REVB=-0.0145767;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660375;STB=0.538402;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.019629;OID=.;OPOS=1018295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:6:7:8:9:6:7:8:9
chr11	1018385	.	T	A	33.57	PASS	AF=0.157895;AO=5;DP=37;FAO=6;FDP=38;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=27;FWDB=0.00137344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.322;QD=3.5335;RBI=0.0525173;REFB=-0.0129177;REVB=-0.0524994;RO=32;SAF=3;SAR=2;SRF=5;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.529967;STB=0.864922;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0622581;OID=.;OPOS=1018385;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:37:38:32:32:5:6:0.157895:2:3:5:27:2:4:5:27
chr11	1018456	.	G	A	50.43	PASS	AF=0.195122;AO=8;DP=41;FAO=8;FDP=41;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=28;FWDB=0.0486964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.594;QD=4.91977;RBI=0.0671466;REFB=-0.00205195;REVB=-0.0462312;RO=33;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340662;STB=0.711837;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0244216;OID=.;OPOS=1018456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:41:41:33:33:8:8:0.195122:5:3:5:28:5:3:5:28
chr11	1018483	.	C	G	30.26	PASS	AF=0.193548;AO=8;DP=30;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=22;FWDB=-0.0515394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=38.4032;QD=3.90507;RBI=0.194922;REFB=-0.029792;REVB=-0.187984;RO=21;SAF=4;SAR=4;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433964;STB=0.871992;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0780353;OID=.;OPOS=1018483;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:30:31:21:25:8:6:0.193548:4:4:3:18:2:4:3:22
chr11	1019375	.	C	T	366.94	PASS	AF=0.411765;AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=45;FWDB=-0.00752037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.258;QD=14.3898;RBI=0.00753806;REFB=-0.0457746;REVB=-0.000516099;RO=59;SAF=15;SAR=27;SRF=14;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142351;STB=0.571397;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0499779;OID=.;OPOS=1019375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:59:60:42:42:0.411765:27:15:14:45:27:15:15:45
chr11	1026392	.	GC	CG,GCG	37.4	PASS	AF=0.00531915,0.0957447;AO=14,43;DP=189;FAO=1,18;FDP=188;FR=.;FRO=169;FSAF=1,15;FSAR=0,3;FSRF=109;FSRR=60;FWDB=-0.189514,-0.167396;FXX=0;HRUN=3,0;LEN=2,1;MLLD=24.2271,13.4533;QD=0.795802;RBI=0.251427,0.26885;REFB=0.00710029,-0.000955398;REVB=-0.165228,-0.210378;RO=121;SAF=9,30;SAR=5,13;SRF=78;SRR=43;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00231291,0.0747136;STB=0.987389,0.717264;STBP=0.502,0.081;TYPE=mnp,ins;VARB=0.0531641,0.0166053;OID=.,.;OPOS=1026392,1026394;OREF=GC,-;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,GCG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:36:189:188:121:169:14,43:1,18:0.00531915,0.0957447:5,13:9,30:78:43:0,3:1,15:109:60
chr11	1075747	.	T	C	407.7	PASS	AF=0.433962;AO=46;DP=106;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=17;FWDB=-0.0141731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.668;QD=15.3849;RBI=0.0152808;REFB=-0.0239899;REVB=0.00571167;RO=59;SAF=25;SAR=21;SRF=43;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191936;STB=0.600463;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0223859;OID=.;OPOS=1075747;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:59:60:46:46:0.433962:21:25:43:16:21:25:43:17
chr11	1080576	.	G	A	769.98	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111345;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.803;QD=64.1651;RBI=0.0111562;REFB=0;REVB=0.000696849;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.89206e-05;OID=.;OPOS=1080576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0
chr11	1081074	.	T	C,G	805.52	PASS	AF=0.964912,0.0350877;AO=54,3;DP=57;FAO=55,2;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33,0;FSAR=22,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186223,-0.00468398;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=132.484,167.339;QD=56.5279;RBI=0.0205899,0.0395622;REFB=0,0;REVB=0.00878368,-0.0392839;RO=0;SAF=33,0;SAR=21,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.70667e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00065226,0.0780481;OID=.,.;OPOS=1081074,1081074;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:57:57:0:0:54,3:55,2:0.964912,0.0350877:21,3:33,0:0:0:22,2:33,0:0:0
chr11	1081112	.	G	C	799.61	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5921;QD=57.1147;RBI=0.0328278;REFB=0;REVB=0.0144553;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000216259;OID=.;OPOS=1081112;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:22:33:0:0:23:33:0:0
chr11	1081151	.	T	C,G	554.76	PASS	AF=0.897436,0.0769231;AO=35,3;DP=39;FAO=35,3;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=16,1;FSAR=19,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.124801,-0.0327287;FXX=0.0249938;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=60.8646,175.325;QD=56.8983;RBI=0.126505,0.0345427;REFB=0.022485,-0.0580425;REVB=0.0206894,-0.0110467;RO=0;SAF=17,0;SAR=18,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.11116e-08,0;STB=0.512813,0.59939;STBP=0.517,0.681;TYPE=snp,snp;VARB=0.00710559,0.110661;OID=.,.;OPOS=1081151,1081151;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:39:39:0:1:35,3:35,3:0.897436,0.0769231:18,3:17,0:0:0:19,2:16,1:0:1
chr11	1081757	.	G	C	885.41	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0702348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.946;QD=58.0596;RBI=0.0706008;REFB=0;REVB=0.00717972;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000187874;OID=.;OPOS=1081757;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0
chr11	1083293	.	T	C	1047.61	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.05255;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7773;QD=59.8633;RBI=0.052606;REFB=0;REVB=0.00242629;RO=0;SAF=39;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000174788;OID=.;OPOS=1083293;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:31:39:0:0:31:39:0:0
chr11	1084821	.	T	C,G	2207.4	PASS	AF=0.922535,0.0774648;AO=129,12;DP=141;FAO=131,11;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=74,0;FSAR=57,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232958,0.0151784;FXX=0.0206882;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=206.294,184.427;QD=62.1802;RBI=0.0307013,0.018559;REFB=0,0;REVB=0.0199968,-0.0106794;RO=0;SAF=74,0;SAR=55,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000930438,0.0650462;OID=.,.;OPOS=1084821,1084821;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:25:141:142:0:0:129,12:131,11:0.922535,0.0774648:55,12:74,0:0:0:57,11:74,0:0:0
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chr11	1093710	.	C	G	160.31	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244569;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.659;QD=45.8024;RBI=0.0912292;REFB=0;REVB=0.0878899;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00158417;OID=.;OPOS=1093710;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0
chr11	1094690	.	C	T	378.14	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403043;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.244;QD=56.0211;RBI=0.040874;REFB=0;REVB=-0.0068006;RO=0;SAF=7;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.37635e-05;OID=.;OPOS=1094690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:20:7:0:0:20:7:0:0
chr11	1094752	.	CAA	CAC,CCA	324.92	PASS	AF=0.461538,0.538462;AO=10,12;DP=26;FAO=12,14;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1,4;FSAR=11,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00060342,0.0720019;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=16.0766,20.619;QD=49.9882;RBI=0.0256162,0.0721743;REFB=0,0;REVB=0.0256091,0.00498422;RO=0;SAF=0,2;SAR=10,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.137429,0.00470876;OID=.,.;OPOS=1094754,1094753;OREF=A,A;OALT=C,C;OMAPALT=CAC,CCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.461538,0.538462:10,12:26:12,14:26:0:1,4:11,10:0:0:84:0:0,2:10,10:0:0
chr11	1096494	.	T	C	2253.82	PASS	AF=0.986928;AO=143;DP=144;FAO=151;FDP=153;FR=.;FRO=2;FSAF=90;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0394248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5736;QD=58.9234;RBI=0.0397228;REFB=-0.0797749;REVB=0.00485659;RO=0;SAF=84;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.25139e-08;STB=0.505494;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00115933;OID=.;OPOS=1096494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:144:153:0:2:143:151:0.986928:59:84:0:0:61:90:2:0
chr11	1101649	.	T	C	689.28	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195908;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.5892;QD=62.6618;RBI=0.0885356;REFB=0;REVB=0.0863409;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147477;OID=.;OPOS=1101649;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:15:29:0:0:15:29:0:0
chr11	1151695	.	C	T	417.43	PASS	AF=0.396694;AO=48;DP=121;FAO=48;FDP=121;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=47;FSRR=26;FWDB=0.0154414;FXX=0.0241916;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.342;QD=13.7993;RBI=0.0243936;REFB=-0.019182;REVB=0.0188841;RO=73;SAF=31;SAR=17;SRF=47;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00232632;STB=0.501316;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0293978;OID=.;OPOS=1151695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:73:73:48:48:0.396694:17:31:47:26:17:31:47:26
chr11	1158073	.	T	C	2827.63	PASS	AF=1;AO=180;DP=180;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.755;QD=62.8363;RBI=0.014305;REFB=0;REVB=0.00152503;RO=0;SAF=114;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89843e-06;OID=.;OPOS=1158073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:180:180:0:0:180:180:1:66:114:0:0:66:114:0:0
chr11	1161315	.	T	C,G	563.86	PASS	AF=0.947368,0.0526316;AO=36,2;DP=38;FAO=36,2;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0;FSAR=19,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224875,-0.00443179;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=86.9708,160.087;QD=59.3533;RBI=0.0250397,0.0197256;REFB=0,0;REVB=0.0110135,-0.0192213;RO=0;SAF=17,0;SAR=19,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000253409,0.159953;OID=.,.;OPOS=1161315,1161315;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:38:38:0:0:36,2:36,2:0.947368,0.0526316:19,2:17,0:0:0:19,2:17,0:0:0
chr11	1212877	.	A	G	190.99	PASS	AF=0.276596;AO=26;DP=94;FAO=26;FDP=94;FR=.;FRO=68;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=-0.0415966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.961;QD=8.12708;RBI=0.0429936;REFB=-0.0140174;REVB=-0.0108707;RO=68;SAF=11;SAR=15;SRF=38;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163433;STB=0.597487;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0555541;OID=.;OPOS=1212877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:68:68:26:26:0.276596:15:11:38:30:15:11:38:30
chr11	1212921	.	C	T	67.96	PASS	AF=0.2;AO=10;DP=51;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00556196;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.462;QD=5.43688;RBI=0.0156898;REFB=-0.00518512;REVB=-0.0146709;RO=39;SAF=2;SAR=8;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298315;STB=0.691882;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0174232;OID=.;OPOS=1212921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:51:50:39:40:10:10:0.2:8:2:16:23:8:2:16:24
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chr11	1213174	.	A	G	43.67	PASS	AF=0.173913;AO=7;DP=45;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=34;FWDB=1.61754e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.851;QD=3.79696;RBI=0.0285644;REFB=-0.0185551;REVB=-0.0285644;RO=35;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399031;STB=0.769315;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0642679;OID=.;OPOS=1213174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:45:46:35:38:7:8:0.173913:5:2:3:32:5:3:4:34
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chr11	1213204	.	C	G	129.31	PASS	AF=0.295082;AO=18;DP=62;FAO=18;FDP=61;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=34;FWDB=0.00941704;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.773;QD=8.47912;RBI=0.0127663;REFB=-0.0118101;REVB=-0.00861967;RO=40;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357247;STB=0.704729;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0311876;OID=.;OPOS=1213204;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:40:43:18:18:0.295082:9:9:8:32:9:9:9:34
chr11	1220760	.	T	C	368.52	PASS	AF=0.42;AO=33;DP=93;FAO=42;FDP=100;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=39;FSRR=19;FWDB=-0.000752371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.3265;QD=14.7406;RBI=0.00210009;REFB=-0.044902;REVB=-0.00196069;RO=60;SAF=23;SAR=10;SRF=43;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264575;STB=0.503758;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0835482;OID=.;OPOS=1220760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:100:60:58:33:42:0.42:10:23:43:17:14:28:39:19
chr11	1220796	.	T	C	457.16	PASS	AF=0.432203;AO=51;DP=118;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=45;FSRR=22;FWDB=-0.0190539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.79;QD=15.4968;RBI=0.019428;REFB=-0.0195071;REVB=-0.00379442;RO=66;SAF=33;SAR=18;SRF=45;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388722;STB=0.515413;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0216151;OID=.;OPOS=1220796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:66:67:51:51:0.432203:18:33:45:21:18:33:45:22
chr11	1246941	.	A	G	229.02	PASS	AF=0.464286;AO=24;DP=54;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.00697103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.665;QD=16.3583;RBI=0.0152651;REFB=-0.0139509;REVB=0.0135804;RO=30;SAF=9;SAR=15;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250762;STB=0.611329;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0157545;OID=.;OPOS=1246941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:56:30:30:24:26:0.464286:15:9:19:11:15:11:19:11
chr11	1247458	.	C	T	677.76	PASS	AF=0.462025;AO=73;DP=158;FAO=73;FDP=158;FR=.;FRO=85;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=29;FSRR=56;FWDB=0.0256179;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.0854;QD=17.1586;RBI=0.0513433;REFB=-0.036988;REVB=0.0444956;RO=83;SAF=32;SAR=41;SRF=29;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879496;STB=0.553777;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0399142;OID=.;OPOS=1247458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:83:85:73:73:0.462025:41:32:29:54:41:32:29:56
chr11	1250488	.	C	T	1525.67	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0528024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.88;QD=59.8303;RBI=0.0590906;REFB=0;REVB=0.0265256;RO=0;SAF=47;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141844;OID=.;OPOS=1250488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:55:47:0:0:55:47:0:0
chr11	1252708	.	G	C	741.76	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138702;FXX=0.0188644;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.458;QD=57.0583;RBI=0.035884;REFB=0;REVB=0.033095;RO=0;SAF=36;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189099;OID=.;OPOS=1252708;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:16:36:0:0:16:36:0:0
chr11	1253942	.	T	C	1013.77	PASS	AF=0.985714;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0381819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.096;QD=57.9296;RBI=0.0532538;REFB=-0.0953856;REVB=0.037123;RO=1;SAF=30;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154939;STB=0.508194;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.00120863;OID=.;OPOS=1253942;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:69:70:1:1:68:69:0.985714:38:30:1:0:39:30:1:0
chr11	1253969	.	A	G	37.41	PASS	AF=0.125;AO=7;DP=56;FAO=7;FDP=56;FR=.;FRO=49;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=27;FWDB=-0.0187569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.468;QD=2.67209;RBI=0.0187678;REFB=-0.00222483;REVB=-0.000641149;RO=49;SAF=3;SAR=4;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245088;STB=0.518083;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0138659;OID=.;OPOS=1253969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:56:56:49:49:7:7:0.125:4:3:22:27:4:3:22:27
chr11	1253976	.	A	G	32.7	PASS	AF=0.130435;AO=6;DP=46;FAO=6;FDP=46;FR=.;FRO=40;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0646536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.323;QD=2.84376;RBI=0.0693288;REFB=-0.0060085;REVB=-0.025028;RO=38;SAF=2;SAR=4;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109034;STB=0.584326;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0385462;OID=.;OPOS=1253976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:46:46:38:40:6:6:0.130435:4:2:16:22:4:2:17:23
chr11	1255773	.	C	T	2144.98	PASS	AF=0.992754;AO=137;DP=138;FAO=137;FDP=138;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0744811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.82;QD=62.1734;RBI=0.0745046;REFB=-0.121214;REVB=-0.00187164;RO=1;SAF=60;SAR=77;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00613445;STB=0.503225;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000839301;OID=.;OPOS=1255773;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:138:138:1:1:137:137:0.992754:77:60:0:1:77:60:0:1
chr11	1258283	.	G	A	61.83	PASS	AF=0.114504;AO=15;DP=130;FAO=15;FDP=131;FR=.;FRO=116;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=62;FSRR=54;FWDB=-0.0185627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.773;QD=1.88788;RBI=0.0231112;REFB=-0.00457646;REVB=-0.0137678;RO=115;SAF=9;SAR=6;SRF=61;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860534;STB=0.558927;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0321467;OID=.;OPOS=1258283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:130:131:115:116:15:15:0.114504:6:9:61:54:6:9:62:54
chr11	1258286	.	C	T	61.51	PASS	AF=0.113636;AO=15;DP=132;FAO=15;FDP=132;FR=.;FRO=117;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=62;FSRR=55;FWDB=0.017397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.661;QD=1.86387;RBI=0.0273275;REFB=-0.00607597;REVB=-0.0210746;RO=116;SAF=9;SAR=6;SRF=62;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810645;STB=0.562992;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0418121;OID=.;OPOS=1258286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:132:132:116:117:15:15:0.113636:6:9:62:54:6:9:62:55
chr11	1258295	.	A	G	61.48	PASS	AF=0.113636;AO=15;DP=132;FAO=15;FDP=132;FR=.;FRO=117;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=62;FSRR=55;FWDB=-0.0244699;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.538;QD=1.86295;RBI=0.0254161;REFB=-0.00613549;REVB=0.00687027;RO=115;SAF=9;SAR=6;SRF=61;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0860534;STB=0.562992;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0507299;OID=.;OPOS=1258295;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:132:132:115:117:15:15:0.113636:6:9:61:54:6:9:62:55
chr11	1263552	.	C	CG,G	72.68	PASS	AF=0.259259,0;AO=22,4;DP=81;FAO=21,0;FDP=81;FR=.;FRO=60;FSAF=12,0;FSAR=9,0;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=-0.01096,-0.0302679;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=28.3028,32.1842;QD=3.58891;RBI=0.0432691,0.0885099;REFB=-0.0443003,-0.0525403;REVB=-0.041858,-0.0831737;RO=52;SAF=16,2;SAR=6,2;SRF=27;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.263203,-0.0194584;STB=0.503594,0.5;STBP=0.985,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.177741,0;OID=.,.;OPOS=1263553,1263552;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:81:81:52:60:22,4:21,0:0.259259,0:6,2:16,2:27:25:9,0:12,0:34:26
chr11	1264823	.	T	C	62.01	PASS	AF=1;AO=5;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.105796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.398;QD=35.4368;RBI=0.115955;REFB=0;REVB=0.0474632;RO=0;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000988075;OID=.;OPOS=1264823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:5:7:1:4:1:0:0:4:3:0:0
chr11	1267562	.	C	T	130.41	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.56;QD=43.4705;RBI=0.033111;REFB=0;REVB=0.033111;RO=0;SAF=0;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.8913e-05;OID=.;OPOS=1267562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:12:0:0:0:12:0:0:0
chr11	1268513	.	G	C	182.82	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0752023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.4;QD=43.016;RBI=0.0755047;REFB=0.0663485;REVB=-0.00675031;RO=0;SAF=1;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.666403;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.00372243;OID=.;OPOS=1268513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:17:0:1:16:16:0.941176:15:1:0:0:15:1:1:0
chr11	1268607	.	CA	C,CG	262.71	PASS	AF=1,0;AO=2,17;DP=20;FAO=20,0;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=2,0;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00077561,-0.0257548;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=239.111,217.058;QD=52.5412;RBI=0.0219539,0.064926;REFB=0,0;REVB=-0.0219402,-0.0595993;RO=0;SAF=1,1;SAR=1,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000269054,0;OID=.,.;OPOS=1268608,1268608;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:2,17:20:20,0:20:0:2,0:18,0:0:0:4:0:1,1:1,16:0:0
chr11	1269627	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.1523;QD=35.5759;RBI=0.0542984;REFB=0;REVB=0.0532047;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00306127;OID=.;OPOS=1269627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr11	1269834	.	C	CA	73.88	PASS	AF=1;AO=2;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323315;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=157.16;QD=32.834;RBI=0.033204;REFB=0;REVB=-0.00756189;RO=8;SAF=2;SAR=0;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.55315;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000177981;OID=.;OPOS=1269835;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:10:9:9:0:6:3:0:0:4:8:2:0:5:3
chr11	1269835	.	G	A,C	86.54	PASS	AF=0.777778,0.222222;AO=7,2;DP=9;FAO=7,2;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4,2;FSAR=3,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00362572,0.0557153;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=167.703,59.8728;QD=38.4634;RBI=0.00478552,0.0557169;REFB=0,0;REVB=-0.00312336,0.000411336;RO=0;SAF=4,2;SAR=3,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00143091,0.0610194;OID=.,.;OPOS=1269835,1269835;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:9:9:0:0:7,2:7,2:0.777778,0.222222:3,0:4,2:0:0:3,0:4,2:0:0
chr11	1271428	.	C	CT	60.46	PASS	AF=1;AO=2;DP=9;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0503904;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=135.803;QD=34.5482;RBI=0.0742771;REFB=0;REVB=-0.0545701;RO=6;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.562437;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000866294;OID=.;OPOS=1271429;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:9:7:7:0:4:3:0:0:4:6:2:0:4:2
chr11	1272226	.	A	C	88.42	PASS	AF=1;AO=7;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.143438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.256;QD=39.2982;RBI=0.146427;REFB=0;REVB=0.029434;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0018926;OID=.;OPOS=1272226;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:7:9:1:7:0:0:0:8:1:0:0
chr11	1272858	.	C	T	243.94	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0146974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.382;QD=48.7872;RBI=0.0269523;REFB=0;REVB=0.0225924;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.94649e-05;OID=.;OPOS=1272858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:7:13:0:0:7:13:0:0
chr11	1501670	.	G	C	750.38	PASS	AF=0.981818;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0140662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8248;QD=54.5729;RBI=0.0245021;REFB=-0.0285297;REVB=-0.0200623;RO=1;SAF=36;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01291;STB=0.506847;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.00124228;OID=.;OPOS=1501670;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:55:1:1:53:54:0.981818:17:36:1:0:18:36:1:0
chr11	1502097	.	A	G	874.73	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.425;QD=57.3596;RBI=0.0206575;REFB=0;REVB=-0.0133328;RO=0;SAF=19;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.98516e-05;OID=.;OPOS=1502097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:61:0:0:58:61:1:39:19:0:0:42:19:0:0
chr11	1507731	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00928581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.608;QD=47.8224;RBI=0.0252202;REFB=0;REVB=0.0234485;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.81843e-05;OID=.;OPOS=1507731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr11	1628965	.	G	A	111.42	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0423964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.528;QD=15.9168;RBI=0.0427566;REFB=-0.0422488;REVB=-0.00553773;RO=14;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985294;STB=0.538402;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0426546;OID=.;OPOS=1628965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:15:13:13:0.464286:6:7:6:8:6:7:7:8
chr11	1628992	.	G	A	46.76	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00881506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.266;QD=10.3903;RBI=0.0136477;REFB=-0.0211711;REVB=-0.0104189;RO=11;SAF=1;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396358;STB=0.749166;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0561466;OID=.;OPOS=1628992;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:6:1:5:6:6:1:5:6
chr11	1642883	.	G	GC	34.83	PASS	AF=0.666667;AO=2;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.02569;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=147.573;QD=15.4796;RBI=0.0343864;REFB=-0.0488476;REVB=-0.0228571;RO=7;SAF=2;SAR=0;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.621371;STB=0.555372;STBP=0.703;TYPE=ins;VARB=0.0631867;OID=.;OPOS=1642884;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:2:9:6:9:3:3:3:2:1:16:7:2:0:3:4
chr11	1651830	.	G	T	150.12	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00492956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.29;QD=19.3697;RBI=0.0418718;REFB=-0.0296222;REVB=0.0415806;RO=15;SAF=4;SAR=12;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21392;STB=0.622477;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0457794;OID=.;OPOS=1651830;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:12:4:7:8:12:4:7:8
chr11	1651917	.	C	T	73.69	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0105894;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.545;QD=10.1641;RBI=0.0690767;REFB=-0.0220302;REVB=-0.0682602;RO=19;SAF=4;SAR=6;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2471;STB=0.64836;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0352298;OID=.;OPOS=1651917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:29:29:19:19:10:10:0.344828:6:4:12:7:6:4:12:7
chr11	1855854	.	G	C	676.58	PASS	AF=0.459119;AO=73;DP=159;FAO=73;FDP=159;FR=.;FRO=86;FSAF=21;FSAR=52;FSRF=25;FSRR=61;FWDB=-0.013477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.996;QD=17.0209;RBI=0.0559166;REFB=-0.0358913;REVB=0.0542682;RO=83;SAF=21;SAR=52;SRF=25;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157239;STB=0.501993;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0403925;OID=.;OPOS=1855854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:83:86:73:73:0.459119:52:21:25:58:52:21:25:61
chr11	1857173	.	T	C	317.62	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0873865;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.162;QD=52.9367;RBI=0.0874173;REFB=0;REVB=-0.00231947;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168068;OID=.;OPOS=1857173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr11	1858262	.	C	T	64.87	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0348945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.924;QD=10.3794;RBI=0.0373935;REFB=-0.0121031;REVB=0.0134404;RO=16;SAF=2;SAR=7;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381346;STB=0.732786;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00467005;OID=.;OPOS=1858262;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:7:2:9:7:7:2:9:7
chr11	1861760	.	T	C	1190.44	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0018404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.941;QD=61.048;RBI=0.0686632;REFB=0;REVB=0.0686385;RO=0;SAF=49;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6597e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237393;OID=.;OPOS=1861760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:29:49:0:0:29:49:0:0
chr11	1887806	.	T	A	166.21	PASS	AF=0.439024;AO=17;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0118154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.48;QD=16.2158;RBI=0.0269251;REFB=-0.0227247;REVB=0.0241941;RO=23;SAF=9;SAR=8;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353885;STB=0.682751;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0165839;OID=.;OPOS=1887806;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:17:18:0.439024:8:9:4:19:9:9:4:19
chr11	1890990	.	G	A	60.29	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0640039;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.729;QD=17.2263;RBI=0.0648556;REFB=-0.0572992;REVB=0.0104764;RO=6;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946669;STB=0.555414;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00933612;OID=.;OPOS=1890990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:3:5:3:3:3:5:3:3
chr11	1910707	.	T	C	84.4	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0453986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9902;QD=37.5121;RBI=0.0866029;REFB=0;REVB=0.0737498;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000865624;OID=.;OPOS=1910707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:2:6:0:0:3:6:0:0
chr11	1911115	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0350698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.092;QD=33.4283;RBI=0.0397889;REFB=0;REVB=-0.0187954;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00211296;OID=.;OPOS=1911115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr11	1974029	.	G	A	264.69	PASS	AF=0.571429;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.00882871;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.652;QD=25.2086;RBI=0.0114353;REFB=-0.0323951;REVB=0.00726775;RO=20;SAF=14;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149289;STB=0.55995;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0243357;OID=.;OPOS=1974029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:42:20:18:24:24:0.571429:10:14:8:12:10:14:8:10
chr11	1993975	.	C	A	902.7	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0675967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.499;QD=58.239;RBI=0.0716627;REFB=0;REVB=0.0237956;RO=0;SAF=17;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000303577;OID=.;OPOS=1993975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:45:17:0:0:45:17:0:0
chr11	2016619	.	A	G	166.54	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0168747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.381;QD=22.205;RBI=0.0660764;REFB=-0.0508809;REVB=-0.0638853;RO=13;SAF=13;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20958;STB=0.618896;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0188128;OID=.;OPOS=2016619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:4:13:7:6:4:13:7:6
chr11	2016659	.	T	C	76.4	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00950603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.229;QD=25.4671;RBI=0.0418043;REFB=-0.00822796;REVB=-0.0407092;RO=3;SAF=8;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198601;STB=0.615086;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=0.00148191;OID=.;OPOS=2016659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:12:3:3:9:9:0.75:1:8:2:1:1:8:2:1
chr11	2016662	.	T	C	78.88	PASS	AF=0.818182;AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00324317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.91;QD=28.6826;RBI=0.0186034;REFB=-0.0270106;REVB=0.0183186;RO=2;SAF=8;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0990128;STB=0.555441;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00676795;OID=.;OPOS=2016662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:11:11:2:2:9:9:0.818182:1:8:2:0:1:8:2:0
chr11	2016908	.	G	A	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.515;QD=39.2067;RBI=0.0332999;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000581265;OID=.;OPOS=2016908;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:0:9:0:0:0:9:0:0
chr11	2017017	.	A	C	191.63	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0142851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0884;QD=15.6429;RBI=0.0155569;REFB=-0.00159329;REVB=0.00616059;RO=29;SAF=11;SAR=9;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111039;STB=0.563612;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.00246301;OID=.;OPOS=2017017;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:9:11:19:10:9:11:19:10
chr11	2017110	.	C	G	232.53	PASS	AF=0.378378;AO=28;DP=74;FAO=28;FDP=74;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0241854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0063;QD=12.569;RBI=0.0538263;REFB=-0.019266;REVB=-0.0480867;RO=46;SAF=14;SAR=14;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235257;STB=0.513504;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0251087;OID=.;OPOS=2017110;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:46:46:28:28:0.378378:14:14:24:22:14:14:24:22
chr11	2017439	.	C	G	395.93	PASS	AF=0.506173;AO=33;DP=74;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0244935;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.006;QD=19.552;RBI=0.0281605;REFB=-0.0478127;REVB=-0.0138953;RO=40;SAF=12;SAR=21;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137168;STB=0.582446;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0342766;OID=.;OPOS=2017439;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:81:40:40:33:41:0.506173:21:12:20:20:27:14:20:20
chr11	2018336	.	A	T	345.29	PASS	AF=0.445783;AO=36;DP=82;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=11;FWDB=0.003823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.185;QD=16.6403;RBI=0.00987974;REFB=-0.0329242;REVB=-0.00911009;RO=44;SAF=26;SAR=10;SRF=34;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0638298;STB=0.522313;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.034749;OID=.;OPOS=2018336;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:44:46:36:37:0.445783:10:26:34:10:10:27:35:11
chr11	2018449	.	A	G	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.00668088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=317.305;QD=11.0198;RBI=0.00753804;REFB=-0.00414526;REVB=0.00349111;RO=6;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202122;STB=0.576643;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00676754;OID=.;OPOS=2018449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:8:6:6:0.428571:5:1:2:4:5:1:2:6
chr11	2018853	.	G	A	641.8	PASS	AF=0.44898;AO=66;DP=148;FAO=66;FDP=147;FR=.;FRO=81;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=42;FWDB=-0.0165827;FXX=0.0067563;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.848;QD=17.464;RBI=0.0326975;REFB=-0.0327989;REVB=0.0281805;RO=79;SAF=36;SAR=30;SRF=37;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755782;STB=0.535305;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0405795;OID=.;OPOS=2018853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:147:79:81:66:66:0.44898:30:36:37:42:30:36:39:42
chr11	2154282	.	C	CG	71.53	PASS	AF=0.177419;AO=43;DP=187;FAO=33;FDP=186;FR=.;FRO=153;FSAF=32;FSAR=1;FSRF=122;FSRR=31;FWDB=-0.0257708;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=98.5062;QD=1.53828;RBI=0.0947684;REFB=-0.00457816;REVB=-0.0911972;RO=142;SAF=42;SAR=1;SRF=111;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.599876;STB=0.868938;STBP=0.005;TYPE=ins;VARB=0.246391;OID=.;OPOS=2154283;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.177419:43:187:33:186:153:32:1:122:31:71:142:42:1:111:31
chr11	2167543	.	T	G	52.92	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0205883;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.984;QD=10.0808;RBI=0.0411305;REFB=-0.0181215;REVB=-0.0356068;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392276;STB=0.52375;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0313207;OID=.;OPOS=2167543;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:21:21:13:13:8:8:0.380952:4:4:7:6:4:4:7:6
chr11	2167618	.	A	G	263.57	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.00761629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.521;QD=26.3566;RBI=0.0361601;REFB=-0.0230161;REVB=-0.0353489;RO=15;SAF=10;SAR=14;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354928;STB=0.50854;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0130733;OID=.;OPOS=2167618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:15:16:24:24:0.6:14:10:7:8:14:10:7:9
chr11	2168375	.	G	C	127.85	PASS	AF=0.441176;AO=14;DP=33;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=18;FWDB=-0.0478706;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=103.176;QD=15.0412;RBI=0.0500116;REFB=0.00201149;REVB=0.0144766;RO=19;SAF=3;SAR=11;SRF=1;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292411;STB=0.678184;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=-0.0274037;OID=.;OPOS=2168375;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:19:19:14:15:0.441176:11:3:1:18:11:4:1:18
chr11	2169014	.	A	G	56.06	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0900417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.8352;QD=11.211;RBI=0.0975233;REFB=-0.0055233;REVB=-0.0374605;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359997;STB=0.713795;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0137835;OID=.;OPOS=2169014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:3:5:3:9:3:5:3:9
chr11	2181060	.	T	G	340.27	PASS	AF=0.896552;AO=24;DP=28;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0294366;FXX=0.0644953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.049;QD=46.9337;RBI=0.0297082;REFB=-0.0400715;REVB=0.00400789;RO=4;SAF=24;SAR=0;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.872334;STB=0.742314;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0054093;OID=.;OPOS=2181060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:28:29:4:3:24:26:0.896552:0:24:0:4:1:25:1:2
chr11	2190951	.	C	T	487.01	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431009;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.796;QD=59.0314;RBI=0.0463805;REFB=0;REVB=0.0171308;RO=0;SAF=10;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333203;OID=.;OPOS=2190951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:23:10:0:0:23:10:0:0
chr11	2337218	.	G	A	224.22	PASS	AF=0.904762;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0792958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.872;QD=42.7077;RBI=0.0804515;REFB=-0.148842;REVB=0.0135876;RO=2;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917561;STB=0.549948;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.00480659;OID=.;OPOS=2337218;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:21:21:2:2:19:19:0.904762:9:10:0:2:9:10:0:2
chr11	2424683	.	CA	C,CC	765.97	PASS	AF=0.0185185,0.981481;AO=22,32;DP=54;FAO=1,53;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=1,34;FSAR=0,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422438,0.0385614;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=224.166,234.955;QD=56.7389;RBI=0.11442,0.121762;REFB=0,0;REVB=0.106337,0.115494;RO=0;SAF=6,29;SAR=16,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.17051e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0216793,0.00144933;OID=.,.;OPOS=2424684,2424684;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0185185,0.981481:22,32:54:1,53:54:0:1,34:0,19:0:0:5:0:6,29:16,3:0:0
chr11	2427290	.	GA	CG,G,GC	1117.74	PASS	AF=0.0125,0.075,0.9125;AO=3,12,55;DP=80;FAO=1,6,73;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=1,2,24;FSAR=0,4,49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314113,0.00849071,0.0112133;FXX=0.0123442;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=41.0857,32.967,38.9217;QD=55.8871;RBI=0.0789155,0.084257,0.134791;REFB=0,0,0;REVB=-0.0723946,-0.0838281,-0.134324;RO=1;SAF=2,9,14;SAR=1,3,41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.163246,-0.0475628,-0.0324755;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0.197724,0.0140922,0.0165573;OID=.,.,.;OPOS=2427290,2427291,2427291;OREF=GA,A,A;OALT=CG,-,C;OMAPALT=CG,G,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:9:80:80:1:0:3,12,55:1,6,73:0.0125,0.075,0.9125:1,3,41:2,9,14:1:0:0,4,49:1,2,24:0:0
chr11	2432964	.	T	C	111.42	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00560287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.893;QD=15.9165;RBI=0.0108458;REFB=-0.0167003;REVB=-0.00928646;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664503;STB=0.538402;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.008086;OID=.;OPOS=2432964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:6:7:7:8:6:7:7:8
chr11	2435946	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.406;QD=39.2068;RBI=0.01993;REFB=0;REVB=0.00829982;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246833;OID=.;OPOS=2435946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr11	2435956	.	C	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.344;QD=40.7629;RBI=0.0758465;REFB=0;REVB=0.0579736;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100975;OID=.;OPOS=2435956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr11	2439542	.	A	G	874.99	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00200937;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.043;QD=58.3329;RBI=0.00233402;REFB=0;REVB=-0.00118746;RO=0;SAF=36;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111587;OID=.;OPOS=2439542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:58:60:1:22:36:0:0:22:38:0:0
chr11	2439767	.	T	C	499.62	PASS	AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.023272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.681;QD=54.0127;RBI=0.0243173;REFB=-0.0840904;REVB=-0.00705297;RO=2;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0424896;STB=0.522714;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00572503;OID=.;OPOS=2439767;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:37:2:2:35:35:0.945946:21:14:0:2:21:14:0:2
chr11	2797237	.	G	A	349.71	PASS	AF=0.358333;AO=43;DP=121;FAO=43;FDP=120;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=0.0100272;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.791;QD=11.6569;RBI=0.019569;REFB=-0.016486;REVB=-0.0168048;RO=77;SAF=24;SAR=19;SRF=33;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144436;STB=0.582621;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.022923;OID=.;OPOS=2797237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:120:77:77:43:43:0.358333:19:24:33:44:19:24:33:44
chr11	2870108	.	A	G	841.57	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00958759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.767;QD=57.0554;RBI=0.025234;REFB=0;REVB=0.0233417;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.55573e-05;OID=.;OPOS=2870108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:58:59:1:27:31:0:0:27:32:0:0
chr11	2920666	.	C	T	207.06	PASS	AF=0.290323;AO=27;DP=93;FAO=27;FDP=93;FR=.;FRO=66;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=0.0215569;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0208;QD=8.90575;RBI=0.0358543;REFB=-0.0232264;REVB=0.0286501;RO=64;SAF=19;SAR=8;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218322;STB=0.631612;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0435558;OID=.;OPOS=2920666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:64:66:27:27:0.290323:8:19:34:30:8:19:35:31
chr11	2924610	.	G	A	239.98	PASS	AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0194543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.186;QD=14.3269;RBI=0.019471;REFB=-0.0206066;REVB=0.000806303;RO=38;SAF=18;SAR=10;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276142;STB=0.649575;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0326058;OID=.;OPOS=2924610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:39:28:28:0.41791:10:18:14:24:10:18:15:24
chr11	2929552	.	A	G	201.52	PASS	AF=0.436364;AO=22;DP=53;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0493468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.188;QD=14.656;RBI=0.0522635;REFB=-0.0153115;REVB=0.0172154;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0773359;STB=0.522187;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0165765;OID=.;OPOS=2929552;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:27:31:22:24:0.436364:13:9:9:18:13:11:13:18
chr11	2999507	.	G	T	129.42	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0362271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.162;QD=12.9421;RBI=0.0365952;REFB=-0.0159035;REVB=-0.00517715;RO=25;SAF=4;SAR=11;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207063;STB=0.622468;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0217541;OID=.;OPOS=2999507;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:11:4:11:14:11:4:11:14
chr11	3000395	.	C	T	176.9	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0307435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.737;QD=18.1438;RBI=0.0310458;REFB=-0.0263782;REVB=-0.00432184;RO=20;SAF=6;SAR=13;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221313;STB=0.625925;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0260197;OID=.;OPOS=3000395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:13:6:11:9:13:6:11:9
chr11	3026622	.	A	G	38.14	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.022815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9661;QD=10.1698;RBI=0.0493914;REFB=0.0150759;REVB=0.0438062;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0176408;OID=.;OPOS=3026622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:2:4:6:3:2:4:6:3
chr11	3028140	.	G	A	157.03	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.00560003;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.757;QD=16.1056;RBI=0.00755008;REFB=-0.0250399;REVB=0.00506393;RO=22;SAF=10;SAR=7;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196259;STB=0.61153;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.016849;OID=.;OPOS=3028140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:7:10:17:5:7:10:17:5
chr11	3061780	.	C	T	295.5	PASS	AF=0.428571;AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.000594392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2395;QD=15.3507;RBI=0.0340347;REFB=-0.00356606;REVB=0.0340295;RO=41;SAF=12;SAR=21;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173682;STB=0.605704;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0104478;OID=.;OPOS=3061780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:41:44:33:33:0.428571:21:12:22:19:21:12:24:20
chr11	3078536	.	C	G	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0317983;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=221.027;QD=15.2931;RBI=0.0591823;REFB=-0.0382176;REVB=0.049914;RO=9;SAF=6;SAR=3;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237585;STB=0.636106;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0338462;OID=.;OPOS=3078536;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:3:6:8:1:3:6:8:1
chr11	3109403	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00868625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=355.246;QD=48.7373;RBI=0.00987514;REFB=0;REVB=0.00469759;RO=0;SAF=16;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.7923e-06;OID=.;OPOS=3109403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:1:16:0:0:1:16:0:0
chr11	3109408	.	C	T	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.899;QD=47.8223;RBI=0.0940489;REFB=0;REVB=0.0934713;RO=0;SAF=15;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000687801;OID=.;OPOS=3109408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:1:15:0:0:1:15:0:0
chr11	3150391	.	C	T	57.97	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0490876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6235;QD=10.0823;RBI=0.0544714;REFB=-0.00781013;REVB=-0.0236124;RO=11;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205271;STB=0.594327;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0618068;OID=.;OPOS=3150391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:23:23:11:14:7:7:0.304348:4:3:7:4:4:3:8:6
chr11	3243346	.	C	T	112.44	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0512811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7353;QD=17.2979;RBI=0.0515291;REFB=-0.0131177;REVB=0.00504932;RO=13;SAF=11;SAR=2;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469729;STB=0.774171;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0160764;OID=.;OPOS=3243346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:2:11:5:8:2:11:5:8
chr11	3243427	.	T	C	55.74	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.00257605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.46;QD=10.6178;RBI=0.013545;REFB=-0.00245287;REVB=-0.0132978;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104179;STB=0.506313;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.00501607;OID=.;OPOS=3243427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:13:13:8:8:0.380952:5:3:5:8:5:3:5:8
chr11	3243638	.	A	G	245.21	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=25;FWDB=0.0207336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.136;QD=15.5687;RBI=0.0209572;REFB=-0.0128638;REVB=-0.00305271;RO=35;SAF=9;SAR=19;SRF=10;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409683;STB=0.523101;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0142937;OID=.;OPOS=3243638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:19:9:10:25:19:9:10:25
chr11	3243665	.	C	T	249.88	PASS	AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=4;FSRR=28;FWDB=0.0627396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4634;QD=16.6586;RBI=0.0715863;REFB=-0.00959696;REVB=0.0344725;RO=32;SAF=8;SAR=20;SRF=4;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208163;STB=0.615314;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0083664;OID=.;OPOS=3243665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:20:8:4:28:20:8:4:28
chr11	3243673	.	G	C	234.58	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=29;FWDB=-0.0414048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5797;QD=15.382;RBI=0.0705271;REFB=-0.00463604;REVB=0.0570938;RO=34;SAF=7;SAR=20;SRF=5;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157993;STB=0.588278;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00814062;OID=.;OPOS=3243673;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:20:7:5:29:20:7:5:29
chr11	3244005	.	TC	T	658.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.16938;FXX=0.0447694;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.314;QD=41.1409;RBI=0.172583;REFB=0;REVB=-0.0331005;RO=0;SAF=19;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.7823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00281287;OID=.;OPOS=3244006;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:59:62:64:64:0:21:43:0:0:12:0:19:40:0:0
chr11	3249984	.	C	T	343.64	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=-0.0043126;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.306;QD=21.4773;RBI=0.00869338;REFB=-0.0161545;REVB=0.00754826;RO=29;SAF=23;SAR=12;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957071;STB=0.552684;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0176874;OID=.;OPOS=3249984;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:29:29:35:35:0.546875:12:23:22:7:12:23:22:7
chr11	3361087	.	T	C	726.83	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0970326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.996;QD=63.2027;RBI=0.0973926;REFB=0;REVB=0.00836665;RO=0;SAF=16;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31553e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295892;OID=.;OPOS=3361087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:30:16:0:0:30:16:0:0
chr11	3436492	.	A	G	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0773792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.378;QD=49.5971;RBI=0.102166;REFB=0;REVB=0.0667112;RO=0;SAF=12;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138048;OID=.;OPOS=3436492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:6:12:0:0:6:12:0:0
chr11	3659993	.	G	T	337.38	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0296859;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.675;QD=19.8461;RBI=0.0358057;REFB=-0.0248128;REVB=0.0200198;RO=33;SAF=22;SAR=13;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206343;STB=0.614667;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0229816;OID=.;OPOS=3659993;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:33:33:35:35:0.514706:13:22:13:20:13:22:13:20
chr11	3660295	.	C	T	57.95	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0262032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0238;QD=13.6342;RBI=0.0274521;REFB=0.013695;REVB=-0.00818607;RO=9;SAF=3;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256503;STB=0.6518;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=-0.00605993;OID=.;OPOS=3660295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:5:3:6:3:5:3:6:3
chr11	3661140	.	T	C	670.41	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.788;QD=62.3636;RBI=0.0319895;REFB=0;REVB=0.0192238;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.41711e-05;OID=.;OPOS=3661140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:43:0:0:40:43:1:22:18:0:0:24:19:0:0
chr11	3661585	.	A	ATGG,G	296.17	PASS	AF=0.958333,0;AO=19,4;DP=24;FAO=23,0;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=11,0;FSAR=12,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0094164,-0.00928633;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=164.668,181.926;QD=49.3617;RBI=0.010622,0.00936799;REFB=0.0367027,-0.0703631;REVB=-0.00491502,-0.00123423;RO=1;SAF=8,3;SAR=11,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0540538,-0.119989;STB=0.52172,0.5;STBP=0.524,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000414219,0;OID=.,.;OPOS=3661586,3661585;OREF=-,A;OALT=TGG,G;OMAPALT=ATGG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:19,4:23,0:0.958333,0:11,1:8,3:1:0:12,0:11,0:1:0
chr11	3681519	.	T	C	212.59	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00756562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.9;QD=20.2471;RBI=0.033182;REFB=-0.0203906;REVB=-0.032308;RO=21;SAF=10;SAR=11;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0139516;OID=.;OPOS=3681519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:21:21:21:0.5:11:10:10:11:11:10:10:11
chr11	3838910	.	G	C	130.46	PASS	AF=1;AO=11;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.335;QD=43.486;RBI=0.151205;REFB=0;REVB=0.0796146;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00303719;OID=.;OPOS=3838910;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:11:12:1:7:4:0:0:8:4:0:0
chr11	3838953	.	T	C	116.78	PASS	AF=1;AO=6;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00192936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.842;QD=42.4654;RBI=0.0817732;REFB=0;REVB=0.0817504;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129062;OID=.;OPOS=3838953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:6:11:1:3:3:0:0:7:4:0:0
chr11	4103524	.	A	G	178.72	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0082268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.5711;QD=12.5415;RBI=0.0363686;REFB=-0.0164948;REVB=0.0354259;RO=35;SAF=13;SAR=9;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142731;STB=0.582325;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0258157;OID=.;OPOS=4103524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:9:13:16:19:9:13:16:19
chr11	4141132	.	C	A	214.09	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0175061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.453;QD=14.7649;RBI=0.0251363;REFB=-0.0112356;REVB=0.018038;RO=31;SAF=18;SAR=7;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121167;STB=0.556051;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0117248;OID=.;OPOS=4141132;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:31:33:25:25:0.431034:7:18:19:12:7:18:21:12
chr11	4159457	.	A	G	249.67	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0097662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9821;QD=18.4942;RBI=0.0486148;REFB=0.00141333;REVB=0.0476237;RO=27;SAF=7;SAR=20;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191449;STB=0.607915;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.00111495;OID=.;OPOS=4159457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:20:7:12:15:20:7:12:15
chr11	4159466	.	G	A	267.52	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0378446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.487;QD=21.8387;RBI=0.0380477;REFB=-0.0265615;REVB=-0.0039259;RO=24;SAF=7;SAR=18;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560467;STB=0.53147;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0252001;OID=.;OPOS=4159466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:18:7:8:16:18:7:8:16
chr11	4388905	.	C	T	118.82	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.019244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.343;QD=22.6314;RBI=0.0403703;REFB=0.00964886;REVB=0.0354885;RO=8;SAF=10;SAR=3;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375934;STB=0.713935;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=-0.00464857;OID=.;OPOS=4388905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:3:10:2:6:3:10:2:6
chr11	4389404	.	AG	A	154.95	PASS	AF=0.441176;AO=28;DP=67;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=-0.0871593;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.4582;QD=9.11447;RBI=0.0890728;REFB=-0.0037316;REVB=0.0183636;RO=37;SAF=8;SAR=20;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0773731;STB=0.568027;STBP=0.377;TYPE=del;VARB=0.000729112;OID=.;OPOS=4389405;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.441176:28:67:30:68:38:8:22:14:24:99:37:8:20:13:24
chr11	4510285	.	A	G	368.59	PASS	AF=0.383333;AO=36;DP=114;FAO=46;FDP=120;FR=.,HEALED;FRO=74;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=43;FSRR=31;FWDB=0.0561731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.896;QD=12.2863;RBI=0.061721;REFB=-0.0166559;REVB=0.0255747;RO=55;SAF=13;SAR=23;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142399;STB=0.616556;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.020875;OID=.;OPOS=4510285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:120:55:74:36:46:0.383333:23:13:27:28:28:18:43:31
chr11	4510587	.	C	T	73.83	PASS	AF=0.30303;AO=9;DP=34;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0422831;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.241;QD=8.94932;RBI=0.042492;REFB=-0.0357433;REVB=0.0042086;RO=18;SAF=5;SAR=4;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0608169;STB=0.57561;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0695513;OID=.;OPOS=4510587;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:34:33:18:23:9:10:0.30303:4:5:9:9:5:5:14:9
chr11	4566711	.	C	T	431.16	PASS	AF=0.387597;AO=50;DP=129;FAO=50;FDP=129;FR=.;FRO=79;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=44;FSRR=35;FWDB=-0.000809282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.744;QD=13.3694;RBI=0.0183212;REFB=-0.0139647;REVB=-0.0183033;RO=78;SAF=22;SAR=28;SRF=43;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119546;STB=0.5714;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0226081;OID=.;OPOS=4566711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:78:79:50:50:0.387597:28:22:43:35:28:22:44:35
chr11	4567335	.	C	G	54.36	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0438247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.7604;QD=10.3544;RBI=0.0653423;REFB=-0.0024622;REVB=0.0484665;RO=12;SAF=7;SAR=1;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.523804;STB=0.810699;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0052171;OID=.;OPOS=4567335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:20:21:12:13:8:8:0.380952:1:7:5:7:1:7:6:7
chr11	4592708	.	C	CAG	397.6	PASS	AF=0.347826;AO=46;DP=139;FAO=48;FDP=138;FR=.;FRO=90;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=49;FSRR=41;FWDB=-0.00258834;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=2;MLLD=299.18;QD=11.5247;RBI=0.0398484;REFB=0.00351216;REVB=-0.0397643;RO=90;SAF=29;SAR=17;SRF=49;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102489;STB=0.569318;STBP=0.231;TYPE=ins;VARB=-0.00626469;OID=.;OPOS=4592709;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.347826:46:139:48:138:90:31:17:49:41:99:90:29:17:49:41
chr11	4608262	.	A	C	33.07	PASS	AF=0.0710059;AO=11;DP=168;FAO=12;FDP=169;FR=.;FRO=157;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=93;FSRR=64;FWDB=-0.0328202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.605;QD=0.782688;RBI=0.0332963;REFB=0.000724956;REVB=0.00561072;RO=157;SAF=10;SAR=1;SRF=93;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383375;STB=0.761639;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=-0.0292804;OID=.;OPOS=4608262;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:168:169:157:157:11:12:0.0710059:1:10:93:64:2:10:93:64
chr11	4608542	.	C	T	261.79	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0128965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.534;QD=17.1663;RBI=0.0161628;REFB=-0.0210079;REVB=0.00974247;RO=31;SAF=17;SAR=12;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0356394;STB=0.529391;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0137754;OID=.;OPOS=4608542;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:31:32:29:29:0.47541:12:17:17:14:12:17:17:15
chr11	4615234	.	A	G	265.41	PASS	AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.0178145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.859;QD=27.2214;RBI=0.0477107;REFB=-0.0332719;REVB=0.04426;RO=15;SAF=15;SAR=9;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135316;STB=0.57441;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.01944;OID=.;OPOS=4615234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:15:15:24:24:0.615385:9:15:12:3:9:15:12:3
chr11	4615390	.	C	T	1098.73	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0199957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3111;QD=60.2044;RBI=0.0417944;REFB=0;REVB=0.0367008;RO=0;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107004;OID=.;OPOS=4615390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:31:42:0:0:31:42:0:0
chr11	4615508	.	C	G	151.91	PASS	AF=0.22549;AO=23;DP=102;FAO=23;FDP=102;FR=.;FRO=79;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=41;FWDB=-0.0156651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2336;QD=5.95741;RBI=0.0250879;REFB=0.000765706;REVB=-0.0195962;RO=79;SAF=12;SAR=11;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509727;STB=0.531489;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.0035985;OID=.;OPOS=4615508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:79:79:23:23:0.22549:11:12:38:41:11:12:38:41
chr11	4703165	.	C	A	800.82	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.542;QD=57.2015;RBI=0.0252565;REFB=0;REVB=0.00774432;RO=0;SAF=53;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000120734;OID=.;OPOS=4703165;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:3:53:0:0:3:53:0:0
chr11	4730985	.	C	T	259.27	PASS	AF=0.447761;AO=29;DP=66;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.0134711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.208;QD=15.4787;RBI=0.0254921;REFB=-0.0234857;REVB=-0.021642;RO=37;SAF=19;SAR=10;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00713545;STB=0.511104;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0608668;OID=.;OPOS=4730985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:37:37:29:30:0.447761:10:19:24:13:10:20:24:13
chr11	4731180	.	G	A	582.67	PASS	AF=0.495868;AO=60;DP=120;FAO=60;FDP=121;FR=.;FRO=61;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=-0.0237246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7982;QD=19.262;RBI=0.0383533;REFB=-0.0575859;REVB=-0.030135;RO=59;SAF=39;SAR=21;SRF=21;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264801;STB=0.638588;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0443146;OID=.;OPOS=4731180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:59:61:60:60:0.495868:21:39:21:38:21:39:23:38
chr11	4731468	.	G	A	398.8	PASS	AF=0.590909;AO=38;DP=65;FAO=39;FDP=66;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0206688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3098;QD=24.1699;RBI=0.0383492;REFB=-0.01946;REVB=-0.0323027;RO=27;SAF=20;SAR=18;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.089713;STB=0.553461;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0116249;OID=.;OPOS=4731468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:27:27:38:39:0.590909:18:20:11:16:18:21:11:16
chr11	4731583	.	C	T	681.96	PASS	AF=0.621053;AO=59;DP=95;FAO=59;FDP=95;FR=.;FRO=36;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.0415325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.968;QD=28.7142;RBI=0.0431366;REFB=-0.0208328;REVB=0.0116542;RO=36;SAF=32;SAR=27;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881224;STB=0.54781;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.0125822;OID=.;OPOS=4731583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:36:36:59:59:0.621053:27:32:24:12:27:32:24:12
chr11	4731633	.	G	T	215.45	PASS	AF=0.346154;AO=25;DP=77;FAO=27;FDP=78;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.0141165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.684;QD=11.0487;RBI=0.0171102;REFB=-0.014645;REVB=-0.00966866;RO=48;SAF=15;SAR=10;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137403;STB=0.567543;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0246619;OID=.;OPOS=4731633;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:48:51:25:27:0.346154:10:15:23:25:11:16:25:26
chr11	4791111	.	T	C	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00933659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.333;QD=10.1733;RBI=0.0236457;REFB=-0.0120644;REVB=0.0217244;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219799;STB=0.635901;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0113601;OID=.;OPOS=4791111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:5:4:4:2:5:4
chr11	4945196	.	T	G	557.09	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0830387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3598;QD=60.226;RBI=0.0854656;REFB=0;REVB=-0.0202224;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00170852;OID=.;OPOS=4945196;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr11	4964753	.	A	G	1396.39	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00937067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.467;QD=62.759;RBI=0.0131389;REFB=0;REVB=-0.00920986;RO=0;SAF=37;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.80618e-05;OID=.;OPOS=4964753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:52:37:0:0:52:37:0:0
chr11	4965301	.	G	T	764.89	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0811;QD=56.6588;RBI=0.0266387;REFB=0;REVB=0.012237;RO=1;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229661;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000415686;OID=.;OPOS=4965301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:1:0:52:54:1:20:32:0:1:21:33:0:0
chr11	4967468	.	G	A	937.58	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00220468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.927;QD=57.6974;RBI=0.0327748;REFB=0;REVB=0.0327006;RO=1;SAF=46;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025512;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.40488e-05;OID=.;OPOS=4967468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:1:0:64:65:1:18:46:0:1:19:46:0:0
chr11	4968198	.	C	A	279.56	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0982347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9475;QD=48.619;RBI=0.175577;REFB=0.0495546;REVB=-0.145524;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529385;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.0150735;OID=.;OPOS=4968198;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:23:0:1:22:22:0.956522:8:14:0:0:8:14:0:1
chr11	4976811	.	C	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0264086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6368;QD=35.5755;RBI=0.153447;REFB=0;REVB=-0.151157;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0147882;OID=.;OPOS=4976811;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr11	5020416	.	A	G	631.56	PASS	AF=0.567568;AO=57;DP=109;FAO=63;FDP=111;FR=.;FRO=48;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=14;FWDB=0.0511289;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.899;QD=22.759;RBI=0.0524744;REFB=-0.00667072;REVB=0.011807;RO=48;SAF=30;SAR=27;SRF=33;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136007;STB=0.561478;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.00502803;OID=.;OPOS=5020416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:111:48:48:57:63:0.567568:27:30:33:15:27:36:34:14
chr11	5067984	.	A	G	590.23	PASS	AF=0.442857;AO=62;DP=138;FAO=62;FDP=140;FR=.;FRO=78;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.00349466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.428;QD=16.8636;RBI=0.0199998;REFB=-0.021114;REVB=-0.0196921;RO=75;SAF=34;SAR=28;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933984;STB=0.555435;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0275271;OID=.;OPOS=5067984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:140:75:78:62:62:0.442857:28:34:34:41:28:34:35:43
chr11	5068137	.	G	A	189.67	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0221176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.589;QD=21.6768;RBI=0.0279818;REFB=-0.0187987;REVB=0.0171404;RO=16;SAF=7;SAR=12;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161077;STB=0.590672;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0102724;OID=.;OPOS=5068137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:12:7:9:7:12:7:9:7
chr11	5068177	.	A	T	55.72	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0273641;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.236;QD=8.91537;RBI=0.0319489;REFB=-0.0100225;REVB=-0.0164906;RO=17;SAF=2;SAR=6;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377676;STB=0.734096;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0128806;OID=.;OPOS=5068177;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:26:25:17:17:8:8:0.32:6:2:10:7:6:2:10:7
chr11	5068297	.	G	A	201.06	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0498994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.1675;QD=13.8659;RBI=0.057305;REFB=-0.0040989;REVB=-0.0281764;RO=34;SAF=14;SAR=10;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562209;STB=0.532137;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0040562;OID=.;OPOS=5068297;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:10:14:18:16:10:14:18:16
chr11	5068431	.	G	A	138.4	PASS	AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.00615739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.488;QD=11.7791;RBI=0.0262149;REFB=-0.00690272;REVB=-0.0254815;RO=30;SAF=5;SAR=11;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0673176;STB=0.554825;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0114509;OID=.;OPOS=5068431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:31:16:16:0.340426:11:5:11:19:11:5:12:19
chr11	5068661	.	AC	GT	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00948087;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=267.798;QD=12.3961;RBI=0.0130142;REFB=-0.0431638;REVB=0.00891532;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162496;STB=0.599599;STBP=0.681;TYPE=mnp;VARB=0.0349942;OID=.;OPOS=5068661;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:3:2:3:2:3:2:3:2
chr11	5079946	.	C	T	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00723373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.787;QD=57.5439;RBI=0.014149;REFB=0;REVB=0.0121601;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49603e-05;OID=.;OPOS=5079946;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:33:25:0:0:33:25:0:0
chr11	5080068	.	G	A	72.64	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.0980658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.2753;QD=8.80473;RBI=0.105082;REFB=-0.0442921;REVB=-0.0377528;RO=22;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103333;STB=0.572385;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0858699;OID=.;OPOS=5080068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:22:23:10:10:0.30303:7:3:5:17:7:3:5:18
chr11	5080337	.	T	C	55.96	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0275459;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.041;QD=8.9533;RBI=0.0351406;REFB=-0.0165761;REVB=-0.0218194;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.379089;STB=0.734096;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.0208142;OID=.;OPOS=5080337;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:26:25:15:17:8:8:0.32:6:2:9:6:6:2:10:7
chr11	5141902	.	T	C	53.84	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.0159048;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.612;QD=7.97657;RBI=0.0312645;REFB=-0.00723897;REVB=0.0269167;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272686;STB=0.666296;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0276372;OID=.;OPOS=5141902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:4:4:14:5:4:4:14:5
chr11	5141980	.	A	G	194.88	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0271267;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.972;QD=16.9463;RBI=0.0334277;REFB=-0.00866018;REVB=-0.0195333;RO=26;SAF=3;SAR=17;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.489806;STB=0.784295;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0264675;OID=.;OPOS=5141980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:26:26:20:20:0.434783:17:3:15:11:17:3:15:11
chr11	5142270	.	T	G	285.5	PASS	AF=0.541667;AO=25;DP=47;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0220939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.615;QD=23.7919;RBI=0.0252738;REFB=-0.0037301;REVB=0.012273;RO=21;SAF=15;SAR=10;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0999619;STB=0.555514;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.00396227;OID=.;OPOS=5142270;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:21:22:25:26:0.541667:10:15:15:6:10:16:16:6
chr11	5142549	.	T	C	386.54	PASS	AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00350952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.008;QD=18.19;RBI=0.0133085;REFB=-0.010249;REVB=-0.0128374;RO=45;SAF=24;SAR=16;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106995;STB=0.559778;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0126868;OID=.;OPOS=5142549;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:16:24:22:23:16:24:22:23
chr11	5172786	.	A	G	881.11	PASS	AF=1;AO=39;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.105;QD=57.7779;RBI=0.0684769;REFB=0;REVB=0.0649149;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134278;OID=.;OPOS=5172786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:39:61:1:15:24:0:0:35:26:0:0
chr11	5221645	.	C	A	159.86	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0177049;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=277.902;QD=26.6428;RBI=0.0203436;REFB=-0.0158995;REVB=-0.0100199;RO=7;SAF=10;SAR=6;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309522;STB=0.543423;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00697277;OID=.;OPOS=5221645;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:7:8:16:16:0.666667:6:10:4:3:6:10:4:4
chr11	5221825	.	G	A	41.47	PASS	AF=0.666667;AO=5;DP=8;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0134544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.181;QD=18.4306;RBI=0.0223091;REFB=-0.0193027;REVB=-0.0177954;RO=3;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436878;STB=0.555372;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.015102;OID=.;OPOS=5221825;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:9:3:3:5:6:0.666667:3:2:1:2:3:3:1:2
chr11	5248243	.	A	G	182.32	PASS	AF=0.365079;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.020842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.601;QD=11.5757;RBI=0.0254553;REFB=-0.00173446;REVB=-0.0146144;RO=40;SAF=8;SAR=15;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171973;STB=0.599911;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00257769;OID=.;OPOS=5248243;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:40:40:23:23:0.365079:15:8:20:20:15:8:20:20
chr11	5269583	.	GTGA	AGAG,GAGG	841.36	PASS	AF=0.95,0.05;AO=54,4;DP=62;FAO=57,3;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=34,3;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296101,0.0310927;FXX=0.0322529;HRUN=1,1;LEN=4,3;MLLD=288.267,246.621;QD=56.0905;RBI=0.0417843,0.0438753;REFB=0,0;REVB=0.0294816,0.0309562;RO=0;SAF=33,3;SAR=21,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.70667e-08,4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.000847225,0.00870054;OID=.,.;OPOS=5269583,5269584;OREF=GTGA,TGA;OALT=AGAG,AGG;OMAPALT=AGAG,GAGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:62:60:0:0:54,4:57,3:0.95,0.05:21,1:33,3:0:0:23,0:34,3:0:0
chr11	5322520	.	G	A	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0207753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.619;QD=11.5972;RBI=0.0253192;REFB=-0.00838202;REVB=-0.0144724;RO=21;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058873;STB=0.534827;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0104497;OID=.;OPOS=5322520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:8:4:6:15:8:4:6:15
chr11	5322737	.	A	G	227.22	PASS	AF=0.65625;AO=21;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.000646204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.208;QD=28.4028;RBI=0.00266719;REFB=-0.04899;REVB=-0.00258772;RO=11;SAF=13;SAR=8;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215178;STB=0.618934;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0101845;OID=.;OPOS=5322737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:11:11:21:21:0.65625:8:13:3:8:8:13:3:8
chr11	5322776	.	G	A	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0459141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.876;QD=21.3523;RBI=0.0486361;REFB=-0.0264854;REVB=0.0160427;RO=8;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109699;STB=0.583207;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0692125;OID=.;OPOS=5322776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:8:9:13:13:0.590909:7:6:5:3:7:6:6:3
chr11	5323071	.	C	T	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.967;QD=58.6003;RBI=0.0175656;REFB=0;REVB=0.00196617;RO=0;SAF=23;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.00964e-05;OID=.;OPOS=5323071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:41:23:0:0:41:23:0:0
chr11	5443442	.	G	C	672.7	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.924;QD=61.1546;RBI=0.124128;REFB=0;REVB=0.123113;RO=1;SAF=33;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446492;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000627253;OID=.;OPOS=5443442;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:1:0:43:44:1:10:33:0:1:11:33:0:0
chr11	5443700	.	C	T	707.67	PASS	AF=0.980769;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00460192;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.997;QD=54.4362;RBI=0.00541544;REFB=-0.106249;REVB=0.0028547;RO=1;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154349;STB=0.508194;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000562798;OID=.;OPOS=5443700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:52:1:1:50:51:0.980769:30:20:0:1:30:21:0:1
chr11	5443739	.	T	C	644.88	PASS	AF=0.866667;AO=51;DP=60;FAO=52;FDP=60;FR=.;FRO=8;FSAF=18;FSAR=34;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0287234;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=234.948;QD=42.992;RBI=0.0561723;REFB=-0.141279;REVB=0.0482731;RO=6;SAF=18;SAR=33;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00424307;STB=0.54004;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00276269;OID=.;OPOS=5443739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:60:60:6:8:51:52:0.866667:33:18:2:4:34:18:5:3
chr11	5443867	.	C	T	575.71	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.302;QD=60.6008;RBI=0.0135303;REFB=0;REVB=0.00510247;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.44292e-05;OID=.;OPOS=5443867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr11	5443887	.	T	C	400.64	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0113563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.784;QD=53.4191;RBI=0.0369738;REFB=-0.173917;REVB=0.0351866;RO=1;SAF=12;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037234;STB=0.519986;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00244244;OID=.;OPOS=5443887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:17:12:1:0:17:12:1:0
chr11	5443893	.	G	A	355.9	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5874;QD=54.753;RBI=0.0411401;REFB=0;REVB=-0.0128799;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0120543;OID=.;OPOS=5443893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:13:12:0:0:13:13:0:0
chr11	5443963	.	G	A	75.0	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.3976;QD=37.5022;RBI=0.0472741;REFB=0;REVB=0.00548552;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00396986;OID=.;OPOS=5443963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:6:1:0:0:7:1:0:0
chr11	5443969	.	A	C	74.96	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6821;QD=37.4789;RBI=0.0479691;REFB=0;REVB=-0.0444119;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00456327;OID=.;OPOS=5443969;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr11	5444061	.	G	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00186902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.724;QD=61.3361;RBI=0.0114581;REFB=0;REVB=0.0113046;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95463e-05;OID=.;OPOS=5444061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0
chr11	5444136	.	C	T	1513.38	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6576;QD=59.9358;RBI=0.0169876;REFB=0;REVB=-0.00245588;RO=0;SAF=62;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102268;OID=.;OPOS=5444136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:100:101:1:38:62:0:0:38:63:0:0
chr11	5444353	.	T	C	539.33	PASS	AF=0.904762;AO=39;DP=42;FAO=38;FDP=42;FR=.;FRO=4;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0663277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.4986;QD=51.3648;RBI=0.0839425;REFB=-0.00495515;REVB=0.0514488;RO=2;SAF=16;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00845566;STB=0.534865;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00103226;OID=.;OPOS=5444353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:42:42:2:4:39:38:0.904762:23:16:1:1:23:15:3:1
chr11	5462085	.	G	A	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=7.3475e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.766;QD=57.2023;RBI=0.0133795;REFB=0;REVB=0.0133793;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.84595e-05;OID=.;OPOS=5462085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:20:10:0:0:20:10:0:0
chr11	5462105	.	T	C	358.52	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.067;QD=55.1562;RBI=0.0348674;REFB=0;REVB=0.028079;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232266;OID=.;OPOS=5462105;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:16:9:0:0:17:9:0:0
chr11	5462255	.	C	G	1019.89	PASS	AF=0.986111;AO=66;DP=67;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00610246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.32;QD=56.6605;RBI=0.0468738;REFB=-0.0171529;REVB=0.0464749;RO=1;SAF=47;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242139;STB=0.510201;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00176009;OID=.;OPOS=5462255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:72:1:1:66:71:0.986111:19:47:0:1:24:47:0:1
chr11	5462374	.	C	T	1510.74	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00776308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9946;QD=63.6102;RBI=0.0512976;REFB=0;REVB=0.0507068;RO=0;SAF=63;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.18502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000310696;OID=.;OPOS=5462374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:32:63:0:0:32:63:0:0
chr11	5462702	.	G	A	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.512;QD=48.7348;RBI=0.037506;REFB=0;REVB=0.0224809;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00043217;OID=.;OPOS=5462702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0
chr11	5475118	.	A	C,G	859.68	PASS	AF=0.046875,0.921875;AO=3,59;DP=64;FAO=3,59;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=2,35;FSAR=1,24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0413633,0.000402135;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=17.9095,110.013;QD=53.7302;RBI=0.0433773,0.0242874;REFB=0.0163637,-0.0522657;REVB=-0.0130637,0.0242841;RO=1;SAF=2,35;SAR=1,24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.163246,-0.0132917;STB=0.570936,0.503162;STBP=0.906,0.87;TYPE=snp,snp;VARB=0.166151,0.00242163;OID=.,.;OPOS=5475118,5475118;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:64:64:1:2:3,59:3,59:0.046875,0.921875:1,24:2,35:1:0:1,24:2,35:1:1
chr11	5510284	.	A	G	1279.54	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0657904;FXX=0.0348797;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.377;QD=61.6644;RBI=0.0708607;REFB=0;REVB=0.0263222;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355663;OID=.;OPOS=5510284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:82:83:1:38:44:0:0:38:45:0:0
chr11	5510341	.	C	T	1900.21	PASS	AF=1;AO=123;DP=124;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271227;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.599;QD=61.7954;RBI=0.0329928;REFB=0;REVB=0.0187852;RO=0;SAF=67;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.60146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.96521e-05;OID=.;OPOS=5510341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:123:0:0:123:123:1:56:67:0:0:56:67:0:0
chr11	5510423	.	ATCT	A	1162.43	PASS	AF=0.97619;AO=72;DP=90;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0547369;FXX=0.176453;HRUN=1;LEN=3;MLLD=194.228;QD=55.3536;RBI=0.0547724;REFB=0.00440151;REVB=0.00197057;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512817;STBP=0.157;TYPE=del;VARB=3.56356e-05;OID=.;OPOS=5510424;OREF=TCT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.97619:72:90:82:84:2:38:44:2:0:5:0:33:39:0:0
chr11	5510497	.	T	C	834.31	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8605;QD=57.5386;RBI=0.0498264;REFB=0;REVB=0.0363217;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000481903;OID=.;OPOS=5510497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr11	5510626	.	T	C	909.03	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.025;QD=57.7161;RBI=0.072313;REFB=0;REVB=0.048976;RO=0;SAF=41;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247373;OID=.;OPOS=5510626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:21:41:0:0:21:42:0:0
chr11	5510928	.	G	A	353.08	PASS	AF=0.964286;AO=25;DP=27;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0163672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6044;QD=50.4403;RBI=0.0166793;REFB=-0.110652;REVB=-0.00321179;RO=1;SAF=10;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044143;STB=0.521723;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00355451;OID=.;OPOS=5510928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:27:28:1:1:25:27:0.964286:15:10:1:0:16:11:1:0
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chr11	5536848	.	G	A	690.32	PASS	AF=0.578947;AO=66;DP=114;FAO=66;FDP=114;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=38;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0480648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.057;QD=24.2218;RBI=0.0480965;REFB=0.00105989;REVB=-0.00174649;RO=48;SAF=28;SAR=38;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268085;STB=0.514622;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=-0.000546537;OID=.;OPOS=5536848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:48:48:66:66:0.578947:38:28:22:26:38:28:22:26
chr11	5536852	.	A	G	391.83	PASS	AF=0.396552;AO=46;DP=115;FAO=46;FDP=116;FR=.;FRO=70;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=-0.00227431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.154;QD=13.5112;RBI=0.0072485;REFB=-0.00697258;REVB=0.00688246;RO=68;SAF=21;SAR=25;SRF=27;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637158;STB=0.525786;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0148477;OID=.;OPOS=5536852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:116:68:70:46:46:0.396552:25:21:27:41:25:21:29:41
chr11	5537045	.	T	G	166.49	PASS	AF=0.328358;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=67;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=0.0145065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.659;QD=9.93971;RBI=0.0154376;REFB=-0.0109701;REVB=0.00528046;RO=41;SAF=9;SAR=13;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139318;STB=0.586033;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.0107665;OID=.;OPOS=5537045;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:41:45:22:22:0.328358:13:9:12:29:13:9:13:32
chr11	5537161	.	A	G	215.5	PASS	AF=0.393939;AO=25;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.0100295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.12;QD=13.0607;RBI=0.0519875;REFB=-0.00170417;REVB=-0.0510109;RO=40;SAF=17;SAR=8;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941401;STB=0.56245;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.00248223;OID=.;OPOS=5537161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:40:25:26:0.393939:8:17:24:16:8:18:24:16
chr11	5537780	.	C	A	74.83	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0135655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6453;QD=11.0852;RBI=0.0558214;REFB=-0.00204125;REVB=-0.054148;RO=17;SAF=8;SAR=2;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330446;STB=0.701309;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00337969;OID=.;OPOS=5537780;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:27:27:17:17:10:10:0.37037:2:8:9:8:2:8:9:8
chr11	5565906	.	A	G	327.47	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.017353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.96;QD=18.1927;RBI=0.0559044;REFB=-0.018971;REVB=0.053143;RO=36;SAF=21;SAR=14;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926618;STB=0.545428;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0215234;OID=.;OPOS=5565906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:37:35:35:0.486111:14:21:18:18:14:21:19:18
chr11	5566030	.	A	G	272.76	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00341207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.543;QD=51.9534;RBI=0.0401747;REFB=0;REVB=0.0400295;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214274;OID=.;OPOS=5566030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:9:11:0:0:10:11:0:0
chr11	5566365	.	T	C	1283.37	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.965;QD=61.849;RBI=0.0793553;REFB=0;REVB=0.0780136;RO=0;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162535;OID=.;OPOS=5566365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:41:42:0:0:41:42:0:0
chr11	5602275	.	A	G	632.2	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3304;QD=61.6781;RBI=0.0338155;REFB=0;REVB=0.0317732;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00061962;OID=.;OPOS=5602275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0
chr11	5602438	.	T	A	669.86	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00698149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6671;QD=62.3124;RBI=0.080578;REFB=0;REVB=0.080275;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000496571;OID=.;OPOS=5602438;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chr11	5602605	.	G	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.953;QD=61.3358;RBI=0.0281547;REFB=0;REVB=-0.00444324;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.48919e-05;OID=.;OPOS=5602605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr11	5602615	.	A	G	556.97	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0976348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.7806;QD=60.2124;RBI=0.0981435;REFB=0;REVB=-0.00997944;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129858;OID=.;OPOS=5602615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:22:15:0:0:22:15:0:0
chr11	5602679	.	T	C	727.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0567233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.639;QD=63.2846;RBI=0.056798;REFB=0;REVB=0.00291132;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000457384;OID=.;OPOS=5602679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0
chr11	5602790	.	A	G	1914.91	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00922139;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188;QD=61.7713;RBI=0.00981193;REFB=0;REVB=0.00335259;RO=0;SAF=59;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65337e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131257;OID=.;OPOS=5602790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:124:0:0:122:124:1:63:59:0:0:63:61:0:0
chr11	5602927	.	CG	C,CC	1761.65	PASS	AF=0.0634921,0.896825;AO=14,107;DP=123;FAO=8,113;FDP=126;FR=.;FRO=5;FSAF=7,50;FSAR=1,63;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0124034,0.0239044;FXX=0.023254;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=199.688,217.184;QD=55.9254;RBI=0.0337625,0.0370384;REFB=0.0126495,0.0160695;REVB=0.0314017,0.0282918;RO=0;SAF=13,44;SAR=1,63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.78072e-08;STB=0.631318,0.523805;STBP=0.705,0.023;TYPE=del,snp;VARB=-0.00566822,2.15603e-05;OID=.,.;OPOS=5602928,5602928;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0634921,0.896825:14,107:123:8,113:126:5:7,50:1,63:5:0:9:0:13,44:1,63:0:0
chr11	5602968	.	G	A	1713.24	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.248;QD=60.6458;RBI=0.0255253;REFB=0;REVB=0.0202192;RO=0;SAF=57;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.70729e-05;OID=.;OPOS=5602968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:56:57:0:0:56:57:0:0
chr11	5625847	.	A	G	629.95	PASS	AF=0.901961;AO=46;DP=51;FAO=46;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0233317;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=213.363;QD=49.4076;RBI=0.0293906;REFB=-0.0341829;REVB=-0.0178728;RO=1;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229252;STB=0.514382;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.00014143;OID=.;OPOS=5625847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:51:51:1:3:46:46:0.901961:20:26:0:1:20:26:1:2
chr11	5629607	.	G	A	2621.92	PASS	AF=1;AO=165;DP=165;FAO=169;FDP=169;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00819074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.718;QD=62.0572;RBI=0.0218013;REFB=0;REVB=0.0202042;RO=0;SAF=92;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.69451e-06;OID=.;OPOS=5629607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:165:169:0:0:165:169:1:73:92:0:0:73:96:0:0
chr11	5632212	.	G	A	3679.77	PASS	AF=0.96875;AO=245;DP=254;FAO=248;FDP=256;FR=.;FRO=8;FSAF=116;FSAR=132;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0122891;FXX=0.015384;HRUN=5;LEN=1;MLLD=181.11;QD=57.4963;RBI=0.027461;REFB=-0.0257969;REVB=0.0245578;RO=8;SAF=115;SAR=130;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00570695;STB=0.501012;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.000148848;OID=.;OPOS=5632212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:254:256:8:8:245:248:0.96875:130:115:3:5:132:116:4:4
chr11	5664831	.	C	A	491.96	PASS	AF=0.522222;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=26;FWDB=0.00934581;FXX=0.0322546;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.225;QD=21.8648;RBI=0.0108739;REFB=-0.0244338;REVB=0.00555851;RO=42;SAF=27;SAR=20;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16481;STB=0.585261;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0217988;OID=.;OPOS=5664831;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:90:42:43:47:47:0.522222:20:27:16:26:20:27:17:26
chr11	5688940	.	C	T	191.54	PASS	AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0478598;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.694;QD=22.5343;RBI=0.0590054;REFB=-0.0296624;REVB=-0.0345119;RO=15;SAF=6;SAR=13;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740321;STB=0.541622;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.00793618;OID=.;OPOS=5688940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:13:6:6:9:13:6:6:9
chr11	5691214	.	A	C	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.00289439;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=308.603;QD=7.76204;RBI=0.0159736;REFB=-0.0134248;REVB=0.0157091;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177981;STB=0.631171;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0278817;OID=.;OPOS=5691214;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:12:13:6:6:0.315789:3:3:8:4:3:3:9:4
chr11	5700340	.	T	C	134.91	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0317092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.697;QD=16.8637;RBI=0.0318109;REFB=-0.0240929;REVB=-0.00254163;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16617;STB=0.594477;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.0319148;OID=.;OPOS=5700340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:6:9:13:4:6:9:13:4
chr11	5701281	.	G	A	223.56	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.00735975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.913;QD=14.904;RBI=0.0077439;REFB=-0.0121489;REVB=-0.00240876;RO=34;SAF=11;SAR=15;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419753;STB=0.523791;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0148667;OID=.;OPOS=5701281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:15:11:13:21:15:11:13:21
chr11	5717762	.	T	C	223.18	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.00173644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0815;QD=16.5319;RBI=0.023414;REFB=-0.0300993;REVB=-0.0233495;RO=27;SAF=8;SAR=17;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108785;STB=0.550226;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00373487;OID=.;OPOS=5717762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:29:25:25:0.462963:17:8:6:21:17:8:7:22
chr11	5718517	.	G	A	605.63	PASS	AF=0.405882;AO=69;DP=170;FAO=69;FDP=170;FR=.;FRO=101;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=67;FSRR=34;FWDB=-0.0621561;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1324;QD=14.2502;RBI=0.0918604;REFB=-0.00435148;REVB=-0.0676384;RO=99;SAF=33;SAR=36;SRF=65;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186569;STB=0.609107;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00494559;OID=.;OPOS=5718517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:170:99:101:69:69:0.405882:36:33:65:34:36:33:67:34
chr11	5719667	.	T	C	138.34	PASS	AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00794187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.003;QD=11.7738;RBI=0.0395313;REFB=-0.00865984;REVB=0.0387253;RO=30;SAF=9;SAR=7;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325676;STB=0.530792;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0209492;OID=.;OPOS=5719667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:31:16:16:0.340426:7:9:16:14:7:9:16:15
chr11	5719750	.	G	C	420.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028939;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=99.2357;QD=54.2087;RBI=0.0585812;REFB=-0.114155;REVB=0.0509342;RO=1;SAF=15;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300429;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00259844;OID=.;OPOS=5719750;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:30:31:1:0:29:31:1:14:15:1:0:14:17:0:0
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chr11	5758118	.	A	C	199.89	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0258553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.922;QD=13.5517;RBI=0.0283727;REFB=-0.0175032;REVB=-0.011684;RO=35;SAF=9;SAR=15;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147165;STB=0.584344;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0208592;OID=.;OPOS=5758118;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:15:9:18:17:15:9:18:17
chr11	5776287	.	C	T	2488.13	PASS	AF=1;AO=161;DP=162;FAO=163;FDP=163;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00925141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.353;QD=61.0585;RBI=0.0211491;REFB=0;REVB=0.0190183;RO=0;SAF=107;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65294e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21825e-05;OID=.;OPOS=5776287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:162:163:0:0:161:163:1:54:107:0:0:54:109:0:0
chr11	5776470	.	T	C,G	490.41	PASS	AF=0.0588235,0.941176;AO=2,32;DP=34;FAO=2,32;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=0,23;FSAR=2,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197698,0.0584219;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=213.253,63.7766;QD=57.6948;RBI=0.0361312,0.0770399;REFB=0,0;REVB=-0.0302426,0.0502198;RO=0;SAF=0,23;SAR=2,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.02243e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.149918,0.00390819;OID=.,.;OPOS=5776470,5776470;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:34:34:0:0:2,32:2,32:0.0588235,0.941176:2,9:0,23:0:0:2,9:0,23:0:0
chr11	5776595	.	T	G	188.01	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.000142475;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.8699;QD=17.0916;RBI=0.0239545;REFB=-0.0414189;REVB=-0.0239541;RO=20;SAF=16;SAR=4;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229999;STB=0.650995;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0736;OID=.;OPOS=5776595;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:24:20:20:0.454545:4:16:12:8:4:16:14:10
chr11	5776623	.	A	T	740.42	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.322;QD=56.9554;RBI=0.0464046;REFB=0;REVB=0.0411701;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134226;OID=.;OPOS=5776623;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:22:29:0:0:23:29:0:0
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chr11	5809230	.	G	A	511.58	PASS	AF=0.411765;AO=56;DP=140;FAO=56;FDP=136;FR=.;FRO=80;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.0144726;FXX=0.0285694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.892;QD=15.0465;RBI=0.0296905;REFB=-0.0193959;REVB=-0.0259243;RO=83;SAF=34;SAR=22;SRF=44;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0836763;STB=0.556907;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0234417;OID=.;OPOS=5809230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:136:83:80:56:56:0.411765:22:34:44:39:22:34:41:39
chr11	5809308	.	A	T	1465.66	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=101;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0181594;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3352;QD=58.6264;RBI=0.0242624;REFB=0.0112178;REVB=0.0160904;RO=0;SAF=56;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504424;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000127865;OID=.;OPOS=5809308;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:100:0:1:99:99:0.99:43:56:0:0:43:56:1:0
chr11	5809548	.	G	A	923.42	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00319935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.443;QD=56.8257;RBI=0.0338852;REFB=0.0173259;REVB=0.0337338;RO=1;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125954;STB=0.506665;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-2.80926e-05;OID=.;OPOS=5809548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:37:27:0:1:37:27:0:1
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chr11	5809990	.	G	A	197.69	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.029251;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.5788;QD=18.828;RBI=0.0589879;REFB=-0.00648231;REVB=0.0512246;RO=22;SAF=14;SAR=6;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315835;STB=0.679429;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00997426;OID=.;OPOS=5809990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:6:14:8:14:6:14:8:14
chr11	5841856	.	C	T	252.69	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0722062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.104;QD=21.0578;RBI=0.0757624;REFB=0.00780586;REVB=0.0229392;RO=23;SAF=9;SAR=15;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131254;STB=0.585034;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=-0.00868277;OID=.;OPOS=5841856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:24:24:24:0.5:15:9:12:11:15:9:13:11
chr11	5842310	.	T	G	153.43	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.0200038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.976;QD=13.9481;RBI=0.0286964;REFB=-0.00634122;REVB=-0.020575;RO=26;SAF=8;SAR=9;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269823;STB=0.641006;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00774612;OID=.;OPOS=5842310;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:27:17:17:0.386364:9:8:19:7:9:8:19:8
chr11	5842356	.	A	G	128.29	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.00191933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.075;QD=12.5156;RBI=0.0279283;REFB=-0.00708185;REVB=0.0278623;RO=26;SAF=7;SAR=8;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.325108;STB=0.687677;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0186683;OID=.;OPOS=5842356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:8:7:20:6:8:7:20:6
chr11	5862532	.	A	C	117.75	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00862459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.533;QD=12.3949;RBI=0.0283613;REFB=-0.0156852;REVB=0.0270181;RO=24;SAF=6;SAR=8;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208022;STB=0.622052;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0108803;OID=.;OPOS=5862532;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:8:6:15:9:8:6:15:9
chr11	5862653	.	T	C	300.49	PASS	AF=0.507937;AO=32;DP=63;FAO=32;FDP=63;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0153941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.795;QD=19.0785;RBI=0.0154605;REFB=-0.0210601;REVB=-0.00143166;RO=31;SAF=13;SAR=19;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181983;STB=0.601322;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0176082;OID=.;OPOS=5862653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:31:31:32:32:0.507937:19:13:19:12:19:13:19:12
chr11	5862731	.	A	G	269.51	PASS	AF=0.508772;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0128598;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.152;QD=18.9132;RBI=0.0432551;REFB=0.00699226;REVB=-0.0412993;RO=28;SAF=13;SAR=16;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139099;STB=0.577564;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=-0.00973063;OID=.;OPOS=5862731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:28:28:29:29:0.508772:16:13:17:11:16:13:17:11
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chr11	5906048	.	G	A	354.29	PASS	AF=0.636364;AO=34;DP=54;FAO=35;FDP=55;FR=.;FRO=20;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.0293904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0762;QD=25.7668;RBI=0.0334781;REFB=-0.0701111;REVB=0.0160309;RO=20;SAF=24;SAR=10;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365628;STB=0.52766;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0250422;OID=.;OPOS=5906048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:20:20:34:35:0.636364:10:24:15:5:11:24:15:5
chr11	5906073	.	G	T	274.23	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.00462565;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=149.822;QD=24.9303;RBI=0.0146858;REFB=-0.0303134;REVB=-0.0139382;RO=18;SAF=21;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203034;STB=0.606841;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0118029;OID=.;OPOS=5906073;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:18:19:25:25:0.568182:4:21:12:6:4:21:13:6
chr11	5906192	.	A	C	169.59	PASS	AF=0.8;AO=16;DP=20;FAO=16;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00590831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.433;QD=33.9181;RBI=0.0219734;REFB=-0.0155947;REVB=-0.0211641;RO=4;SAF=6;SAR=10;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13913;STB=0.576825;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00659591;OID=.;OPOS=5906192;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:20:20:4:4:16:16:0.8:10:6:3:1:10:6:3:1
chr11	5906205	.	G	A	236.53	PASS	AF=0.75;AO=21;DP=28;FAO=21;FDP=28;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.0332704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0347;QD=33.7904;RBI=0.0498629;REFB=-0.0085898;REVB=-0.0371402;RO=7;SAF=6;SAR=15;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276226;STB=0.652022;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0080375;OID=.;OPOS=5906205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:7:7:21:21:0.75:15:6:6:1:15:6:6:1
chr11	5968728	.	T	C	390.1	PASS	AF=0.461538;AO=42;DP=91;FAO=42;FDP=91;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.0408268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3111;QD=17.1473;RBI=0.0528121;REFB=-0.0145018;REVB=0.0335006;RO=49;SAF=25;SAR=17;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377435;STB=0.521063;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0164202;OID=.;OPOS=5968728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:49:49:42:42:0.461538:17:25:31:18:17:25:31:18
chr11	5969185	.	A	G	305.08	PASS	AF=0.419753;AO=34;DP=81;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=11;FWDB=0.0205606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.191;QD=15.0659;RBI=0.0396359;REFB=0.0035093;REVB=0.0338861;RO=47;SAF=26;SAR=8;SRF=36;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00178476;STB=0.50101;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00480827;OID=.;OPOS=5969185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:47:47:34:34:0.419753:8:26:36:11:8:26:36:11
chr11	5989293	.	G	A	146.82	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.032498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7914;QD=11.294;RBI=0.0349565;REFB=-0.0210804;REVB=-0.0128777;RO=34;SAF=10;SAR=8;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190949;STB=0.611693;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0634908;OID=.;OPOS=5989293;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:8:10:13:21:8:10:13:21
chr11	5989415	.	C	A,T	738.32	PASS	AF=0.574074,0.425926;AO=28,22;DP=50;FAO=31,23;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24,13;FSAR=7,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0434298,-0.00527507;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=31.2218,216.663;QD=54.6904;RBI=0.0678063,0.0100763;REFB=0,0;REVB=0.0520725,0.00858518;RO=0;SAF=24,13;SAR=4,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.2029e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0284418,0.0291549;OID=.,.;OPOS=5989415,5989415;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:50:54:0:0:28,22:31,23:0.574074,0.425926:4,9:24,13:0:0:7,10:24,13:0:0
chr11	6007272	.	A	G	785.86	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.681;QD=64.1517;RBI=0.036882;REFB=0;REVB=0.0270931;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.89849e-06;OID=.;OPOS=6007272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0
chr11	6007613	.	T	G	946.92	PASS	AF=0.970588;AO=65;DP=68;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0197111;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.329;QD=55.701;RBI=0.0357083;REFB=-0.00982914;REVB=-0.0297751;RO=2;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269769;STB=0.513885;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=5.25331e-05;OID=.;OPOS=6007613;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:68:68:2:2:65:66:0.970588:34:31:0:2:35:31:0:2
chr11	6007680	.	A	G	1194.41	PASS	AF=1;AO=75;DP=77;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378465;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.422;QD=59.7205;RBI=0.0585864;REFB=0;REVB=0.0447214;RO=0;SAF=29;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89405e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00245639;OID=.;OPOS=6007680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:80:0:0:75:80:1:46:29:0:0:50:30:0:0
chr11	6007743	.	A	G	724.05	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0361846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4656;QD=54.6451;RBI=0.0446675;REFB=-0.132979;REVB=-0.0261888;RO=1;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154433;STB=0.508194;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00505027;OID=.;OPOS=6007743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:30:22:0:1:30:22:0:1
chr11	6007899	.	C	T	54.67	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0238358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4503;QD=9.1122;RBI=0.0310446;REFB=-0.0232131;REVB=-0.0198902;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185755;STB=0.642474;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0422103;OID=.;OPOS=6007899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:23:24:15:16:8:8:0.333333:6:2:6:9:6:2:7:9
chr11	6129837	.	C	T	774.66	PASS	AF=0.98;AO=48;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0296933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4575;QD=61.973;RBI=0.0479367;REFB=-0.0110215;REVB=0.0376329;RO=1;SAF=29;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159482;STB=0.508193;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00336695;OID=.;OPOS=6129837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:50:50:1:1:48:49:0.98:19:29:1:0:19:30:1:0
chr11	6173364	.	T	A	529.23	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030583;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.3511;QD=58.8032;RBI=0.0321131;REFB=0;REVB=0.00979451;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00351428;OID=.;OPOS=6173364;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr11	6221169	.	A	G	1175.33	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341049;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.384;QD=61.0563;RBI=0.0341691;REFB=0;REVB=-0.00209374;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49429e-05;OID=.;OPOS=6221169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:35:42:0:0:35:42:0:0
chr11	6221214	.	T	A	1514.55	PASS	AF=0.989796;AO=95;DP=97;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0178716;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.168;QD=61.8184;RBI=0.0412937;REFB=-0.0856448;REVB=0.0372261;RO=1;SAF=58;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126427;STB=0.506665;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.000564684;OID=.;OPOS=6221214;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:98:1:1:95:97:0.989796:37:58:0:1:37:60:0:1
chr11	6231731	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.666;QD=56.7059;RBI=0.0439448;REFB=0;REVB=0.013023;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000286374;OID=.;OPOS=6231731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:13:15:0:0:13:16:0:0
chr11	6232189	.	G	C	34.05	PASS	AF=0.118644;AO=9;DP=59;FAO=7;FDP=59;FR=.;FRO=52;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=38;FSRR=14;FWDB=-0.00183079;FXX=0.0166639;HRUN=5;LEN=1;MLLD=36.2327;QD=2.30853;RBI=0.0469931;REFB=-0.0130439;REVB=-0.0469574;RO=48;SAF=9;SAR=0;SRF=35;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.632176;STB=0.67107;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.146284;OID=.;OPOS=6232189;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:59:59:48:52:9:7:0.118644:0:9:35:13:1:6:38:14
chr11	6243804	.	A	G	868.2	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.346;QD=57.8798;RBI=0.0257925;REFB=0;REVB=-0.0038021;RO=0;SAF=51;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.47789e-05;OID=.;OPOS=6243804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:9:51:0:0:9:51:0:0
chr11	6340525	.	A	T	103.91	PASS	AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=-0.0775622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.651;QD=10.1374;RBI=0.0775858;REFB=-0.0022102;REVB=-0.00191403;RO=28;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251516;STB=0.648445;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.00771604;OID=.;OPOS=6340525;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:7:6:7:21:7:6:7:21
chr11	6340706	.	A	G	305.5	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=69;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0142397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.231;QD=17.7099;RBI=0.0160671;REFB=-0.0165754;REVB=0.00744187;RO=36;SAF=13;SAR=20;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126565;STB=0.570875;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0267134;OID=.;OPOS=6340706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:36:36:33:33:0.478261:20:13:19:17:20:13:19:17
chr11	6341684	.	C	G	101.87	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402748;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.9607;QD=40.7483;RBI=0.17098;REFB=0;REVB=0.166169;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0142149;OID=.;OPOS=6341684;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr11	6411935	.	T	C	422.83	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0387133;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.503;QD=54.5589;RBI=0.0500836;REFB=-0.198036;REVB=0.031775;RO=1;SAF=14;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321345;STB=0.51723;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00374514;OID=.;OPOS=6411935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:31:1:1:30:30:0.967742:16:14:1:0:16:14:1:0
chr11	6549779	.	A	C	972.87	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00894162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.315;QD=58.9616;RBI=0.020538;REFB=0;REVB=0.0184894;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62246e-05;OID=.;OPOS=6549779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:29:36:0:0:30:36:0:0
chr11	6549995	.	A	G	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0572716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.573;QD=56.1906;RBI=0.0595311;REFB=0;REVB=0.0162454;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00033068;OID=.;OPOS=6549995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0
chr11	6550004	.	A	G	339.7	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.114;QD=54.3526;RBI=0.0315178;REFB=0;REVB=0.026742;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109026;OID=.;OPOS=6550004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0
chr11	6550309	.	G	A	705.01	PASS	AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0262718;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.82;QD=58.7504;RBI=0.028351;REFB=-0.167923;REVB=0.0106569;RO=2;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031325;STB=0.516659;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.000808693;OID=.;OPOS=6550309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:48:48:2:2:46:46:0.958333:29:17:0:2:29:17:0:2
chr11	6555365	.	A	G	273.36	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.213239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1522;QD=52.0677;RBI=0.222264;REFB=0;REVB=0.0626934;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0040546;OID=.;OPOS=6555365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:21:0:0:19:21:1:12:7:0:0:12:9:0:0
chr11	6567894	.	GC	CA,GCTGCCCTACTGCA	319.74	PASS	AF=0.075,0.675;AO=3,24;DP=40;FAO=3,27;FDP=40;FR=.;FRO=10;FSAF=3,21;FSAR=0,6;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0137327,-0.0483977;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=2,12;MLLD=145.12,190.207;QD=31.9735;RBI=0.0174446,0.0548063;REFB=-0.00108956,-0.0325148;REVB=-0.0107575,-0.0257176;RO=13;SAF=3,18;SAR=0,6;SRF=12;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.5212,-0.16166;STB=0.993778,0.550424;STBP=0.424,0.441;TYPE=mnp,ins;VARB=-0.0014235,0.00678256;OID=.,.;OPOS=6567894,6567896;OREF=GC,-;OALT=CA,TGCCCTACTGCA;OMAPALT=CA,GCTGCCCTACTGCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:75:40:40:13:10:3,24:3,27:0.075,0.675:0,6:3,18:12:1:0,6:3,21:9:1
chr11	6579106	.	C	A	69.46	PASS	AF=0.529412;AO=8;DP=16;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0932208;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.7476;QD=16.3436;RBI=0.0935163;REFB=-0.0985029;REVB=0.00742851;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323874;STB=0.657229;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0320388;OID=.;OPOS=6579106;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:16:17:8:8:8:9:0.529412:4:4:7:1:4:5:7:1
chr11	6585007	.	G	A	252.56	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0189138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4634;QD=21.0467;RBI=0.0236009;REFB=-0.0187237;REVB=-0.0141163;RO=22;SAF=10;SAR=14;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110704;STB=0.583264;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0316993;OID=.;OPOS=6585007;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:24:24:24:0.5:14:10:12:10:14:10:14:10
chr11	6588228	.	G	A	348.95	PASS	AF=0.385321;AO=42;DP=109;FAO=42;FDP=109;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=-0.00918793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.69;QD=12.8054;RBI=0.0148484;REFB=-0.0115892;REVB=-0.0116644;RO=67;SAF=28;SAR=14;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21085;STB=0.620194;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0113576;OID=.;OPOS=6588228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:67:67:42:42:0.385321:14:28:32:35:14:28:32:35
chr11	6622714	.	G	A	904.84	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210216;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7429;QD=58.3767;RBI=0.0818164;REFB=0;REVB=0.0790697;RO=0;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000526649;OID=.;OPOS=6622714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:25:37:0:0:25:37:0:0
chr11	6623372	.	C	G	104.33	PASS	AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.00209659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0229;QD=10.1782;RBI=0.00231382;REFB=-0.00341501;REVB=-0.000978821;RO=28;SAF=9;SAR=4;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.371796;STB=0.722296;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0074688;OID=.;OPOS=6623372;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:4:9:10:18:4:9:10:18
chr11	6630028	.	TCCCCCA	CTCCCCA,TCCCCA,TCCCCAT	892.85	PASS	AF=0,1,0;AO=7,67,3;DP=85;FAO=0,83,0;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=0,44,0;FSAR=0,39,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0617161,0.0704922,0.00796373;FXX=0.0235266;HRUN=1,5,5;LEN=2,1,2;MLLD=11.0542,14.5634,7.50657;QD=43.029;RBI=0.0985208,0.0705094,0.0302825;REFB=-0.0244343,-0.0344034,-0.0314497;REVB=-0.076795,0.00155513,0.0292166;RO=7;SAF=4,34,2;SAR=3,33,1;SRF=5;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0.650794,0;SSSB=-0.125462,-0.0368702,-0.056032;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0.133625,0.000739882,0;OID=.,.,.;OPOS=6630028,6630029,6630033;OREF=TC,C,CA;OALT=CT,-,AT;OMAPALT=CTCCCCA,TCCCCA,TCCCCAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:3:85:83:7:0:7,67,3:0,83,0:0,1,0:3,33,1:4,34,2:5:2:0,39,0:0,44,0:0:0
chr11	6634149	.	C	T	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00349974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.698;QD=58.4192;RBI=0.00903681;REFB=0;REVB=0.00833161;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33828e-05;OID=.;OPOS=6634149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:35:28:0:0:35:28:0:0
chr11	6634189	.	G	A	306.92	PASS	AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00190077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.072;QD=18.0544;RBI=0.00225252;REFB=-0.00848576;REVB=-0.00120868;RO=35;SAF=14;SAR=19;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229445;STB=0.512813;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0105028;OID=.;OPOS=6634189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:19:14:14:21:19:14:14:21
chr11	6636106	.	T	A	154.54	PASS	AF=0.33871;AO=20;DP=61;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0545165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4091;QD=9.97035;RBI=0.0586855;REFB=-0.00858229;REVB=-0.0217241;RO=41;SAF=7;SAR=13;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29267;STB=0.680681;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0163379;OID=.;OPOS=6636106;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:41:41:20:21:0.33871:13:7:25:16:14:7:25:16
chr11	6638506	.	A	T	312.05	PASS	AF=0.425;AO=33;DP=83;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=10;FWDB=0.00795893;FXX=0.0588166;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.297;QD=15.6023;RBI=0.00850257;REFB=-0.0166103;REVB=0.00299149;RO=35;SAF=18;SAR=15;SRF=28;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244601;STB=0.64857;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0227753;OID=.;OPOS=6638506;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:80:35:46:33:34:0.425:15:18:28:7:16:18:36:10
chr11	6648424	.	G	A	76.13	PASS	AF=0.4;AO=7;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0396221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.452;QD=12.1813;RBI=0.0410398;REFB=-0.0313857;REVB=0.0106936;RO=15;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420002;STB=0.580483;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0429465;OID=.;OPOS=6648424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:7:10:0.4:3:4:8:7:6:4:8:7
chr11	6652618	.	C	T	249.31	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.000353951;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=198.079;QD=16.3485;RBI=0.0203233;REFB=0.00651464;REVB=0.0203202;RO=32;SAF=10;SAR=18;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197975;STB=0.619866;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=-0.0046184;OID=.;OPOS=6652618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:32:33:28:28:0.459016:18:10:18:14:18:10:19:14
chr11	6655433	.	G	A	356.26	PASS	AF=0.39;AO=39;DP=100;FAO=39;FDP=100;FR=.;FRO=61;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.00663423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.858;QD=14.2503;RBI=0.0125643;REFB=-0.014014;REVB=0.01067;RO=61;SAF=26;SAR=13;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194756;STB=0.611053;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0230983;OID=.;OPOS=6655433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:61:61:39:39:0.39:13:26:30:31:13:26:30:31
chr11	6735869	.	A	G	201.94	PASS	AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.000170859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.532;QD=12.0563;RBI=0.0307573;REFB=-0.0222886;REVB=-0.0307569;RO=42;SAF=16;SAR=9;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517899;STB=0.529912;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0284415;OID=.;OPOS=6735869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:42:42:25:25:0.373134:9:16:25:17:9:16:25:17
chr11	6736745	.	G	A	171.96	PASS	AF=0.545455;AO=17;DP=32;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.00479238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.764;QD=20.8431;RBI=0.0468427;REFB=-0.00322466;REVB=-0.0465969;RO=13;SAF=13;SAR=4;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.376063;STB=0.720327;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00274509;OID=.;OPOS=6736745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:13:15:17:18:0.545455:4:13:4:9:4:14:5:10
chr11	6737138	.	T	C	119.4	PASS	AF=0.296296;AO=16;DP=54;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.00813811;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.988;QD=8.84448;RBI=0.0143517;REFB=-0.014977;REVB=-0.0118212;RO=38;SAF=8;SAR=8;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0373771;OID=.;OPOS=6737138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:38:38:16:16:0.296296:8:8:19:19:8:8:19:19
chr11	6737258	.	C	T	80.07	PASS	AF=0.261905;AO=11;DP=42;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0243649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4669;QD=7.62596;RBI=0.0499615;REFB=0.00075368;REVB=-0.0436177;RO=31;SAF=8;SAR=3;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229609;STB=0.644273;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.00395394;OID=.;OPOS=6737258;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:42:42:31:31:11:11:0.261905:3:8:17:14:3:8:17:14
chr11	6737893	.	C	T	85.32	PASS	AF=0.307692;AO=5;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.012492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.629;QD=13.1266;RBI=0.0387383;REFB=-0.0158798;REVB=0.0366688;RO=15;SAF=2;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1089e-08;STB=0.615076;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0485272;OID=.;OPOS=6737893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:26:26:15:15:5:8:0.307692:3:2:6:9:6:2:6:9
chr11	6737927	.	G	A	128.84	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00171186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.834;QD=12.5694;RBI=0.0844206;REFB=-0.00845243;REVB=-0.0844033;RO=26;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109202;STB=0.56427;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0137693;OID=.;OPOS=6737927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:9:6:13:13:9:6:13:13
chr11	6738291	.	CT	AC,TT	152.9	PASS	AF=0,0.404762;AO=2,15;DP=43;FAO=0,17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=0,6;FSAR=0,11;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=-0.00368757,-0.0241361;FXX=0.0454442;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=33.1914,87.2782;QD=14.5621;RBI=0.0147047,0.0480729;REFB=0.000434262,-0.005484;REVB=-0.0142348,-0.0415746;RO=24;SAF=0,6;SAR=2,9;SRF=6;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.399466,0.172758;STB=0.5,0.576838;STBP=1,0.476;TYPE=mnp,snp;VARB=0.130505,0.0188784;OID=.,.;OPOS=6738291,6738291;OREF=CT,C;OALT=AC,T;OMAPALT=AC,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:43:42:24:25:2,15:0,17:0,0.404762:2,9:0,6:6:18:0,11:0,6:6:19
chr11	6738728	.	T	C	131.31	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00718704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2562;QD=14.1962;RBI=0.00729858;REFB=-0.00982614;REVB=0.00127108;RO=21;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136602;STB=0.589629;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0184052;OID=.;OPOS=6738728;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:21:22:15:15:0.405405:7:8:14:7:7:8:15:7
chr11	6738952	.	G	T	234.42	PASS	AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0397349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.278;QD=13.0234;RBI=0.039877;REFB=-0.0131396;REVB=0.00336405;RO=44;SAF=9;SAR=19;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.311732;STB=0.678444;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0146693;OID=.;OPOS=6738952;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:44:44:28:28:0.388889:19:9:27:17:19:9:27:17
chr11	6739551	.	T	C	45.07	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.0299726;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.609;QD=7.83805;RBI=0.0416422;REFB=0.00352866;REVB=0.0289088;RO=15;SAF=2;SAR=5;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.519455;STB=0.823432;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=-0.00507316;OID=.;OPOS=6739551;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:15:16:7:7:0.304348:5:2:12:3:5:2:13:3
chr11	6739809	.	C	T	162.55	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0226605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4315;QD=19.7024;RBI=0.0342297;REFB=0.0195246;REVB=-0.025655;RO=16;SAF=15;SAR=2;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290911;STB=0.668552;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.0148232;OID=.;OPOS=6739809;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:2:15:11:5:2:15:11:5
chr11	6739814	.	C	T	158.96	PASS	AF=0.586207;AO=16;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0243912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.631;QD=21.9251;RBI=0.026005;REFB=-0.00363384;REVB=0.00901836;RO=13;SAF=14;SAR=2;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328746;STB=0.704406;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00294239;OID=.;OPOS=6739814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:29:29:13:12:16:17:0.586207:2:14:8:5:2:15:7:5
chr11	6739841	.	G	A	181.57	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0672165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4328;QD=24.2095;RBI=0.0707632;REFB=-0.0781536;REVB=0.0221217;RO=12;SAF=12;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0652509;STB=0.536544;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0427942;OID=.;OPOS=6739841;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:30:30:12:12:18:18:0.6:6:12:7:5:6:12:7:5
chr11	6740136	.	G	A	208.38	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.014919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2909;QD=25.2583;RBI=0.097489;REFB=0.0360452;REVB=-0.0963407;RO=12;SAF=10;SAR=10;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283856;STB=0.636237;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.0255007;OID=.;OPOS=6740136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:12:13:20:20:0.606061:10:10:11:1:10:10:11:2
chr11	6740206	.	C	T	120.86	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.00958252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.804;QD=14.6498;RBI=0.0401774;REFB=-0.0151467;REVB=-0.0390179;RO=19;SAF=10;SAR=4;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963034;STB=0.555481;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0189092;OID=.;OPOS=6740206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:4:10:15:4:4:10:15:4
chr11	6740285	.	G	A	127.54	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00979521;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.781;QD=11.8639;RBI=0.00984686;REFB=0.00300116;REVB=-0.00100727;RO=28;SAF=10;SAR=5;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112207;STB=0.566575;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=-0.00933334;OID=.;OPOS=6740285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:5:10:16:12:5:10:16:12
chr11	6740462	.	G	C	72.01	PASS	AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0276018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.052;QD=8.23023;RBI=0.0367112;REFB=-0.0101724;REVB=-0.0242044;RO=25;SAF=4;SAR=6;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139175;STB=0.586034;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0162863;OID=.;OPOS=6740462;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:35:25:25:10:10:0.285714:6:4:13:12:6:4:13:12
chr11	6741108	.	G	C	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00550721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1317;QD=17.2298;RBI=0.045075;REFB=0.0254234;REVB=-0.0447373;RO=5;SAF=1;SAR=7;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.528386;STB=0.839066;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.0221451;OID=.;OPOS=6741108;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:5:6:8:8:0.571429:7:1:4:1:7:1:5:1
chr11	6789294	.	G	C	585.33	PASS	AF=0.564356;AO=55;DP=100;FAO=57;FDP=101;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.013762;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.622;QD=23.1815;RBI=0.0195363;REFB=-0.0111765;REVB=0.0138664;RO=45;SAF=27;SAR=28;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016568;STB=0.513715;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00770267;OID=.;OPOS=6789294;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:45:44:55:57:0.564356:28:27:23:22:29:28:23:21
chr11	6790106	.	T	C	1699.97	PASS	AF=1;AO=112;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414394;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2229;QD=60.7131;RBI=0.0414931;REFB=0;REVB=-0.00210992;RO=0;SAF=49;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000469221;OID=.;OPOS=6790106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:112:0:0:112:112:1:63:49:0:0:63:49:0:0
chr11	6806496	.	T	C	507.12	PASS	AF=0.477876;AO=54;DP=113;FAO=54;FDP=113;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=-0.00665051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.215;QD=17.9513;RBI=0.00738614;REFB=-0.00809961;REVB=-0.00321336;RO=59;SAF=23;SAR=31;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094163;STB=0.552274;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.00944441;OID=.;OPOS=6806496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:59:59:54:54:0.477876:31:23:31:28:31:23:31:28
chr11	6806827	.	G	T	340.99	PASS	AF=0.538462;AO=35;DP=65;FAO=35;FDP=65;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0513855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.26;QD=20.9837;RBI=0.0525827;REFB=0.0226102;REVB=0.0111569;RO=30;SAF=15;SAR=20;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115343;STB=0.56384;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.0213119;OID=.;OPOS=6806827;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:30:30:35:35:0.538462:20:15:17:13:20:15:17:13
chr11	6807163	.	C	G,T	1206.61	PASS	AF=0.45122,0.54878;AO=35,45;DP=80;FAO=37,45;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=19,21;FSAR=18,24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133225,0.00393498;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=176.98,89.5354;QD=58.8589;RBI=0.017274,0.00820787;REFB=0,0;REVB=0.0109955,-0.00720313;RO=0;SAF=18,21;SAR=17,24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.11116e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0111187,0.00340593;OID=.,.;OPOS=6807163,6807163;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:80:82:0:0:35,45:37,45:0.45122,0.54878:17,24:18,21:0:0:18,24:19,21:0:0
chr11	6807243	.	G	A	406.97	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00612661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.904;QD=56.1338;RBI=0.0121053;REFB=0;REVB=0.0104404;RO=0;SAF=8;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.95795e-05;OID=.;OPOS=6807243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:29:0:0:26:29:1:18:8:0:0:20:9:0:0
chr11	6816778	.	A	G	602.98	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.505;QD=60.2984;RBI=0.0168546;REFB=0;REVB=-0.00506805;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203992;OID=.;OPOS=6816778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:15:24:0:0:15:25:0:0
chr11	6891113	.	A	G	663.2	PASS	AF=0.461039;AO=71;DP=160;FAO=71;FDP=154;FR=.;FRO=83;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=55;FWDB=0.0620463;FXX=0.0374977;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.085;QD=17.2259;RBI=0.0739627;REFB=-0.0483222;REVB=0.0402584;RO=73;SAF=33;SAR=38;SRF=19;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192687;STB=0.569686;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0542189;OID=.;OPOS=6891113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:154:73:83:71:71:0.461039:38:33:19:54:38:33:28:55
chr11	6891385	.	G	A	215.5	PASS	AF=0.393939;AO=26;DP=66;FAO=26;FDP=66;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.00790752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.396;QD=13.0607;RBI=0.014556;REFB=-0.00522302;REVB=0.0122208;RO=40;SAF=19;SAR=7;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717769;STB=0.541278;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.00670636;OID=.;OPOS=6891385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:40:40:26:26:0.393939:7:19:27:13:7:19:27:13
chr11	6891528	.	C	G	114.71	PASS	AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.019929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7959;QD=10.4286;RBI=0.0377424;REFB=0.00170066;REVB=0.0320518;RO=30;SAF=5;SAR=9;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30773;STB=0.683291;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=-0.00221962;OID=.;OPOS=6891528;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:9:5:19:11:9:5:19:11
chr11	6891605	.	A	G	112.3	PASS	AF=0.275862;AO=16;DP=58;FAO=16;FDP=58;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0139638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5958;QD=7.74453;RBI=0.0178414;REFB=-0.0237748;REVB=-0.0111053;RO=42;SAF=13;SAR=3;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340259;STB=0.710643;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0612673;OID=.;OPOS=6891605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:42:42:16:16:0.275862:3:13:24:18:3:13:24:18
chr11	6891758	.	A	C	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.00135616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.585;QD=14.0965;RBI=0.0412243;REFB=-0.0122403;REVB=0.041202;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240656;STB=0.63887;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0138146;OID=.;OPOS=6891758;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:5:6:11:3:5:6:11:3
chr11	6913244	.	A	G	326.52	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062285;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.688;QD=54.4193;RBI=0.062524;REFB=0;REVB=-0.00546238;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407804;OID=.;OPOS=6913244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr11	6942476	.	C	A	53.4	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0992551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7351;QD=7.62863;RBI=0.0992551;REFB=0.00271101;REVB=-3.92114e-05;RO=20;SAF=2;SAR=6;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718033;STB=0.545336;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.000354353;OID=.;OPOS=6942476;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:6:2:6:14:6:2:6:14
chr11	6942628	.	A	C	325.37	PASS	AF=0.460526;AO=34;DP=75;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00636919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.096;QD=17.1246;RBI=0.00650388;REFB=0.00104236;REVB=0.00131674;RO=41;SAF=13;SAR=21;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10539;STB=0.564943;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=-0.00114976;OID=.;OPOS=6942628;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:41:41:34:35:0.460526:21:13:20:21:22:13:20:21
chr11	6942726	.	G	C	313.8	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=65;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0681993;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=67.0493;QD=18.4588;RBI=0.0705575;REFB=0.00109011;REVB=0.0180891;RO=33;SAF=15;SAR=17;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146692;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449627;OID=.;OPOS=6942726;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:68:33:34:32:34:0.5:17:15:16:17:18:16:16:18
chr11	6942952	.	T	C	290.1	PASS	AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0271125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.949;QD=16.5768;RBI=0.0289833;REFB=-0.0166398;REVB=-0.0102442;RO=38;SAF=16;SAR=16;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152932;STB=0.585662;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0227859;OID=.;OPOS=6942952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:38:38:32:32:0.457143:16:16:25:13:16:16:25:13
chr11	6943254	.	C	T	63.77	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.044665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3299;QD=9.44731;RBI=0.0517163;REFB=-0.0177772;REVB=-0.0260695;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124271;STB=0.537107;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0521274;OID=.;OPOS=6943254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:27:16:18:9:9:0.333333:5:4:9:7:5:4:9:9
chr11	6977175	.	G	C	542.25	PASS	AF=1;AO=32;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315145;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7061;QD=60.2497;RBI=0.0768583;REFB=0;REVB=-0.0701002;RO=0;SAF=30;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000645217;OID=.;OPOS=6977175;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:32:36:1:2:30:0:0:6:30:0:0
chr11	7022038	.	A	G	752.19	PASS	AF=0.572581;AO=71;DP=122;FAO=71;FDP=124;FR=.;FRO=53;FSAF=48;FSAR=23;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=0.0236235;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.8507;QD=24.2642;RBI=0.0265867;REFB=-0.00801199;REVB=-0.0121976;RO=51;SAF=48;SAR=23;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106469;STB=0.551709;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0057275;OID=.;OPOS=7022038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:124:51:53:71:71:0.572581:23:48:28:23:23:48:30:23
chr11	7022160	.	A	G	1291.93	PASS	AF=0.988372;AO=79;DP=80;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0166847;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.384;QD=60.0898;RBI=0.0538539;REFB=-0.0596496;REVB=0.0512041;RO=0;SAF=44;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.37809e-08;STB=0.506023;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=-1.18862e-05;OID=.;OPOS=7022160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:86:0:1:79:85:0.988372:35:44:0:0:41:44:0:1
chr11	7022531	.	A	T	1012.11	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.010006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.176;QD=57.8348;RBI=0.0540954;REFB=-0.0710153;REVB=0.053162;RO=1;SAF=45;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103906;STB=0.505493;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000273252;OID=.;OPOS=7022531;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:24:45:1:0:24:45:1:0
chr11	7022717	.	T	C	631.99	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.602;QD=61.6571;RBI=0.0159912;REFB=0;REVB=0.0119315;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.04664e-05;OID=.;OPOS=7022717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:18:22:0:0:19:22:0:0
chr11	7059960	.	A	C	1011.77	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0305774;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.159;QD=59.5156;RBI=0.0405309;REFB=0;REVB=0.0266041;RO=0;SAF=41;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.93446e-05;OID=.;OPOS=7059960;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:27:41:0:0:27:41:0:0
chr11	7063755	.	C	T	1716.55	PASS	AF=1;AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024286;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.445;QD=60.7627;RBI=0.0252183;REFB=0;REVB=0.0067935;RO=0;SAF=63;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.65945e-05;OID=.;OPOS=7063755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:114:113:0:0:113:113:1:50:63:0:0:50:63:0:0
chr11	7071031	.	G	A	1175.41	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.0061;QD=58.7705;RBI=0.118897;REFB=-0.103654;REVB=-0.0394241;RO=1;SAF=36;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129601;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00529392;OID=.;OPOS=7071031;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:75:80:1:0:74:80:1:38:36:1:0:38:42:0:0
chr11	7079038	.	G	A	1751.65	PASS	AF=1;AO=114;DP=114;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0714045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.906;QD=60.4018;RBI=0.0714049;REFB=0;REVB=0.000238113;RO=0;SAF=47;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3323e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.80108e-05;OID=.;OPOS=7079038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:114:116:0:0:114:116:1:67:47:0:0:67:49:0:0
chr11	7273437	.	C	T	200.93	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0265308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.606;QD=20.6084;RBI=0.0266189;REFB=-0.0470431;REVB=-0.00216433;RO=19;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111128;STB=0.562597;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0169077;OID=.;OPOS=7273437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:11:9:11:8:11:9:11:8
chr11	7324475	.	T	C	852.24	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0791926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.874;QD=57.7792;RBI=0.081122;REFB=0;REVB=0.0175873;RO=0;SAF=23;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131421;OID=.;OPOS=7324475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:59:0:0:56:59:1:33:23:0:0:33:26:0:0
chr11	7509566	.	A	T	131.95	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0193065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.458;QD=14.6608;RBI=0.0215222;REFB=-0.0129911;REVB=0.00951121;RO=20;SAF=3;SAR=12;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46506;STB=0.781222;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0185006;OID=.;OPOS=7509566;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:21:15:15:0.416667:12:3:13:7:12:3:14:7
chr11	7619518	.	T	C	1543.86	PASS	AF=1;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00255409;FXX=0.0190458;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.646;QD=59.9555;RBI=0.0448047;REFB=0;REVB=0.0447318;RO=0;SAF=66;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.41364e-05;OID=.;OPOS=7619518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:103:0:0:103:103:1:37:66:0:0:37:66:0:0
chr11	7619549	.	G	A	351.24	PASS	AF=0.468354;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0766223;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.293;QD=17.7843;RBI=0.0768247;REFB=-0.0152691;REVB=-0.00557318;RO=42;SAF=22;SAR=15;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242392;STB=0.513545;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0211852;OID=.;OPOS=7619549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:42:42:37:37:0.468354:15:22:26:16:15:22:26:16
chr11	7662732	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.565;QD=59.4353;RBI=0.0485953;REFB=0;REVB=0.0362795;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000569451;OID=.;OPOS=7662732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
chr11	7670440	.	A	G	1556.35	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.049;QD=59.8597;RBI=0.0253036;REFB=0;REVB=0.0161368;RO=0;SAF=46;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.55331e-05;OID=.;OPOS=7670440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:58:46:0:0:58:46:0:0
chr11	7673015	.	G	A	1765.69	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.263;QD=60.8859;RBI=0.0337796;REFB=0;REVB=0.0276024;RO=0;SAF=50;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.13809e-05;OID=.;OPOS=7673015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:108:116:0:0:108:116:1:58:50:0:0:63:53:0:0
chr11	7686602	.	G	GTGTT	362.02	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00799865;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=4;MLLD=320.07;QD=55.6957;RBI=0.00899651;REFB=0;REVB=-0.00411812;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=1.01698e-05;OID=.;OPOS=7686603;OREF=-;OALT=TGTT;OMAPALT=GTGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:26:27:26:26:0:10:16:0:0:4:0:10:16:0:0
chr11	7686674	.	T	C	940.77	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295592;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.9703;QD=58.7978;RBI=0.0366981;REFB=0;REVB=-0.0217486;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.99537e-07;OID=.;OPOS=7686674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:33:31:0:0:33:31:0:0
chr11	7687146	.	G	A	666.83	PASS	AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0440918;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.834;QD=57.9853;RBI=0.0443254;REFB=-0.133448;REVB=0.00454449;RO=1;SAF=17;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268299;STB=0.527765;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00320526;OID=.;OPOS=7687146;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:46:46:1:2:44:44:0.956522:27:17:1:0:27:17:2:0
chr11	7687715	.	T	C	1343.62	PASS	AF=0.988636;AO=86;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00868704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.316;QD=61.0738;RBI=0.0207168;REFB=-0.0113481;REVB=0.0188075;RO=0;SAF=41;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505493;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000242428;OID=.;OPOS=7687715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:88:88:0:1:86:87:0.988636:45:41:0:0:45:42:0:1
chr11	7710877	.	C	T	326.78	PASS	AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00327907;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.126;QD=19.8048;RBI=0.00965738;REFB=-0.0101125;REVB=-0.00908365;RO=32;SAF=18;SAR=16;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00160893;STB=0.500894;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0145776;OID=.;OPOS=7710877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:16:18:17:15:16:18:17:15
chr11	7711207	.	T	C	298.04	PASS	AF=0.54386;AO=30;DP=56;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.023776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.702;QD=20.9152;RBI=0.0237796;REFB=-0.00808129;REVB=0.000410628;RO=25;SAF=12;SAR=18;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517149;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0104357;OID=.;OPOS=7711207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:25:26:30:31:0.54386:18:12:10:15:19:12:11:15
chr11	7712471	.	C	T	325.78	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00707165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.292;QD=24.5871;RBI=0.0107919;REFB=-0.0138702;REVB=0.00815206;RO=21;SAF=17;SAR=15;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397002;STB=0.521828;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0110016;OID=.;OPOS=7712471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:15:17:10:11:15:17:10:11
chr11	7712523	.	G	A	202.14	PASS	AF=0.373134;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.00787845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.351;QD=12.0677;RBI=0.00944645;REFB=-0.0127838;REVB=-0.00521204;RO=42;SAF=15;SAR=10;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584081;STB=0.533715;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0196702;OID=.;OPOS=7712523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:42:42:25:25:0.373134:10:15:23:19:10:15:23:19
chr11	7712561	.	T	A	214.26	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0160193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8621;QD=12.421;RBI=0.0162035;REFB=-0.0119267;REVB=0.00243612;RO=42;SAF=15;SAR=11;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032044;STB=0.526593;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0208936;OID=.;OPOS=7712561;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:42:43:26:26:0.376812:11:15:23:19:11:15:23:20
chr11	7716855	.	T	A	2199.97	PASS	AF=0.992908;AO=140;DP=141;FAO=140;FDP=141;FR=.;FRO=1;FSAF=100;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0405553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1635;QD=62.4106;RBI=0.0613064;REFB=-0.0384976;REVB=-0.0459755;RO=1;SAF=100;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00473145;STB=0.502487;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00157801;OID=.;OPOS=7716855;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:141:141:1:1:140:140:0.992908:40:100:1:0:40:100:1:0
chr11	7717214	.	AAA	GCC	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00178523;FXX=0;HRUN=25;LEN=3;MLLD=301.871;QD=33.4285;RBI=0.00178523;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-8.79611e-06;OID=.;OPOS=7717214;OREF=AAA;OALT=GCC;OMAPALT=GCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr11	7717219	.	A	T	182.11	PASS	AF=0.944444;AO=16;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00226854;FXX=0;HRUN=25;LEN=1;MLLD=232.936;QD=40.4687;RBI=0.0456433;REFB=-0.148016;REVB=0.0455869;RO=2;SAF=14;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298627;STB=0.571337;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0029807;OID=.;OPOS=7717219;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:2:1:16:17:0.944444:2:14:0:2:3:14:0:1
chr11	7721870	.	G	A	2463.4	PASS	AF=0.988372;AO=164;DP=172;FAO=170;FDP=172;FR=.;FRO=2;FSAF=106;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0669705;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.7596;QD=57.2885;RBI=0.0981631;REFB=-0.18924;REVB=0.0717701;RO=8;SAF=104;SAR=60;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244985;STB=0.501528;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.00705053;OID=.;OPOS=7721870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:172:172:8:2:164:170:0.988372:60:104:3:5:64:106:1:1
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chr11	7727886	.	C	T	377.52	PASS	AF=0.542857;AO=38;DP=70;FAO=38;FDP=70;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00382619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.322;QD=21.5727;RBI=0.0097652;REFB=-0.000411175;REVB=-0.00898439;RO=32;SAF=17;SAR=21;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438026;STB=0.524193;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.00051468;OID=.;OPOS=7727886;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:32:32:38:38:0.542857:21:17:16:16:21:17:16:16
chr11	7749695	.	C	T	280.51	PASS	AF=0.343137;AO=35;DP=101;FAO=35;FDP=102;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.0233689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.191;QD=11.0002;RBI=0.024974;REFB=-0.0135217;REVB=-0.00880881;RO=65;SAF=20;SAR=15;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106819;STB=0.552083;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0406582;OID=.;OPOS=7749695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:65:67:35:35:0.343137:15:20:31:34:15:20:33:34
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chr11	7949350	.	A	G	1952.46	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.767;QD=61.9827;RBI=0.0180867;REFB=0;REVB=0.00953625;RO=0;SAF=66;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.09999e-05;OID=.;OPOS=7949350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:125:126:0:0:125:126:1:59:66:0:0:59:67:0:0
chr11	7949791	.	A	C	132.94	PASS	AF=0.56;AO=13;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.00843832;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=36.9185;QD=21.2701;RBI=0.00922868;REFB=-0.0501035;REVB=0.00373674;RO=7;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166666;STB=0.574225;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00831919;OID=.;OPOS=7949791;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:25:25:7:10:13:14:0.56:5:8:6:1:5:9:8:2
chr11	7949860	.	G	A	154.59	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.00219642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.689;QD=14.7226;RBI=0.041417;REFB=-0.00870903;REVB=-0.0413587;RO=25;SAF=10;SAR=7;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191353;STB=0.609491;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0163371;OID=.;OPOS=7949860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:7:10:19:6:7:10:19:6
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chr11	7961130	.	C	T	164.83	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0260302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.463;QD=21.2681;RBI=0.0260853;REFB=-0.0127782;REVB=0.0016946;RO=14;SAF=10;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717644;STB=0.540492;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0101817;OID=.;OPOS=7961130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:7:10:7:7:7:10:7:7
chr11	8014479	.	C	T	52.85	PASS	AF=0.266667;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00338816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.616;QD=7.04712;RBI=0.00521483;REFB=-0.00655845;REVB=0.0039642;RO=22;SAF=7;SAR=1;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.460837;STB=0.801207;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0162296;OID=.;OPOS=8014479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:22:22:8:8:0.266667:1:7:12:10:1:7:12:10
chr11	8123499	.	G	A	373.05	PASS	AF=0.520548;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=31;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.00109065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.817;QD=20.4412;RBI=0.00547306;REFB=-0.01399;REVB=-0.00536329;RO=35;SAF=31;SAR=7;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164001;STB=0.591676;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0113732;OID=.;OPOS=8123499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:35:35:38:38:0.520548:7:31:24:11:7:31:24:11
chr11	8127495	.	T	C	571.73	PASS	AF=0.548077;AO=57;DP=104;FAO=57;FDP=104;FR=.;FRO=47;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=0.0192829;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.2982;QD=21.9896;RBI=0.0607978;REFB=0.0164924;REVB=-0.0576588;RO=47;SAF=34;SAR=23;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158904;STB=0.587169;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.0152043;OID=.;OPOS=8127495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:47:47:57:57:0.548077:23:34:19:28:23:34:19:28
chr11	8159892	.	G	T	493.74	PASS	AF=0.494845;AO=48;DP=97;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=36;FSRR=13;FWDB=0.00531235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.207;QD=20.3605;RBI=0.0383689;REFB=-0.0152348;REVB=-0.0379994;RO=49;SAF=33;SAR=15;SRF=36;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051224;STB=0.528319;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0175348;OID=.;OPOS=8159892;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:49:49:48:48:0.494845:15:33:36:13:15:33:36:13
chr11	8174966	.	G	A	264.28	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0129208;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.271;QD=17.3299;RBI=0.028145;REFB=-0.0106403;REVB=-0.0250038;RO=29;SAF=14;SAR=15;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0308283;STB=0.509044;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0188438;OID=.;OPOS=8174966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:32:29:29:0.47541:15:14:15:14:15:14:16:16
chr11	8251921	.	G	C	458.49	PASS	AF=0.435897;AO=51;DP=117;FAO=51;FDP=117;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=-0.0259378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.331;QD=15.6748;RBI=0.0263988;REFB=-0.0340184;REVB=-0.00491162;RO=66;SAF=27;SAR=24;SRF=36;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0162328;STB=0.509087;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0475803;OID=.;OPOS=8251921;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:66:66:51:51:0.435897:24:27:36:30:24:27:36:30
chr11	8435077	.	CA	TC	247.41	PASS	AF=0.314815;AO=33;DP=108;FAO=34;FDP=108;FR=.;FRO=74;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=46;FSRR=28;FWDB=0.00665003;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=158.608;QD=9.16344;RBI=0.00919362;REFB=-0.00657384;REVB=-0.00634821;RO=73;SAF=12;SAR=21;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292545;STB=0.680067;STBP=0.014;TYPE=mnp;VARB=0.0177935;OID=.;OPOS=8435077;OREF=CA;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:73:74:33:34:0.314815:21:12:45:28:22:12:46:28
chr11	8486310	.	C	A	216.34	PASS	AF=0.337349;AO=26;DP=83;FAO=28;FDP=83;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0188458;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.636;QD=10.4262;RBI=0.0210131;REFB=-0.0407078;REVB=0.00929441;RO=55;SAF=15;SAR=11;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.058221;STB=0.529595;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0684719;OID=.;OPOS=8486310;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:55:55:26:28:0.337349:11:15:29:26:12:16:29:26
chr11	8646670	.	T	G	241.11	PASS	AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0213628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3005;QD=14.6124;RBI=0.0344551;REFB=0.00209292;REVB=-0.027033;RO=38;SAF=7;SAR=21;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375557;STB=0.714127;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00402761;OID=.;OPOS=8646670;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:21:7:23:15:21:7:23:15
chr11	8646763	.	G	C	86.28	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0251248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.57;QD=12.3251;RBI=0.0270995;REFB=-0.0144807;REVB=0.010155;RO=17;SAF=8;SAR=3;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383176;STB=0.726859;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0444746;OID=.;OPOS=8646763;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:3:8:6:11:3:8:6:11
chr11	8669609	.	CAAAAC	CAAAC,CAAACA	59.02	PASS	AF=0.222222,0.0555556;AO=20,3;DP=54;FAO=12,3;FDP=54;FR=.;FRO=39;FSAF=8,3;FSAR=4,0;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=-0.255857,-0.0907662;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=12.5534,137.199;QD=4.37218;RBI=0.284662,0.0911466;REFB=-0.0921172,0.00103381;REVB=0.12478,-0.00831894;RO=27;SAF=16,3;SAR=4,0;SRF=7;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.535905,0.677413;STB=0.65763,0.996684;STBP=0.232,0.072;TYPE=del,mnp;VARB=0.0244764,0.093316;OID=.,.;OPOS=8669610,8669613;OREF=A,AC;OALT=-,CA;OMAPALT=CAAAC,CAAACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.222222,0.0555556:20,3:54:12,3:54:39:8,3:4,0:18:21:41:27:16,3:4,0:7:20
chr11	8671369	.	C	T	326.44	PASS	AF=0.460526;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=76;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0125852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6884;QD=17.1812;RBI=0.0335853;REFB=-0.0308667;REVB=-0.0311382;RO=39;SAF=19;SAR=16;SRF=14;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171977;STB=0.607375;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0306311;OID=.;OPOS=8671369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:39:41:35:35:0.460526:16:19:14:25:16:19:14:27
chr11	8693405	.	G	A,T	1482.34	PASS	AF=0.553398,0.446602;AO=58,45;DP=103;FAO=57,46;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=31,27;FSAR=26,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195863,-0.009892;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=125.718,122.435;QD=57.5668;RBI=0.0411401,0.0159947;REFB=0,0;REVB=-0.0361785,0.012569;RO=0;SAF=31,27;SAR=27,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.07727e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0115998,0.0193493;OID=.,.;OPOS=8693405,8693405;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:103:103:0:0:58,45:57,46:0.553398,0.446602:27,18:31,27:0:0:26,19:31,27:0:0
chr11	8705472	.	AC	A	72.11	PASS	AF=0.730769;AO=16;DP=26;FAO=19;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.141778;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.26732;QD=11.0944;RBI=0.226538;REFB=-0.0513833;REVB=0.176688;RO=7;SAF=9;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736045;STB=0.526288;STBP=0.699;TYPE=del;VARB=0.052366;OID=.;OPOS=8705473;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.730769:16:26:19:26:7:10:9:3:4:25:7:9:7:3:4
chr11	8717003	.	C	T	81.27	PASS	AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=-0.0277818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.078;QD=8.12712;RBI=0.0425962;REFB=-0.014725;REVB=-0.0322894;RO=29;SAF=6;SAR=5;SRF=22;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265805;STB=0.660123;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0341862;OID=.;OPOS=8717003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:40:40:29:29:11:11:0.275:5:6:22:7:5:6:22:7
chr11	8751640	.	G	C	191.21	PASS	AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0500085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5364;QD=22.4958;RBI=0.0565813;REFB=-0.0406906;REVB=0.0264687;RO=15;SAF=13;SAR=6;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281315;STB=0.658058;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0345587;OID=.;OPOS=8751640;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:6:13:5:10:6:13:5:10
chr11	8751889	.	C	G	162.34	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00469558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.492;QD=19.6771;RBI=0.0710039;REFB=-0.0245574;REVB=0.0708484;RO=16;SAF=8;SAR=9;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825894;STB=0.546708;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0120515;OID=.;OPOS=8751889;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:9:8:6:10:9:8:6:10
chr11	8788168	.	A	T	176.78	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0166724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.39;QD=13.3417;RBI=0.0168834;REFB=-0.0101119;REVB=0.00266129;RO=32;SAF=14;SAR=7;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829241;STB=0.547898;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0179526;OID=.;OPOS=8788168;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:7:14:19:13:7:14:19:13
chr11	8788225	.	A	C	76.9	PASS	AF=0.255814;AO=8;DP=39;FAO=11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0124241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.464;QD=7.15381;RBI=0.0176523;REFB=-0.0140219;REVB=0.0125398;RO=29;SAF=4;SAR=4;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103706;STB=0.580636;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0347987;OID=.;OPOS=8788225;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:39:43:29:32:8:11:0.255814:4:4:12:17:7:4:15:17
chr11	8797709	.	A	G	137.3	PASS	AF=0.7;AO=13;DP=18;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.121304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8051;QD=27.46;RBI=0.154474;REFB=-0.107084;REVB=0.095643;RO=4;SAF=10;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144739;STB=0.57366;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0511189;OID=.;OPOS=8797709;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:18:20:4:6:13:14:0.7:3:10:2:2:4:10:3:3
chr11	8797711	.	A	G	106.49	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0929163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7362;QD=21.2988;RBI=0.181282;REFB=-0.109093;REVB=0.155659;RO=8;SAF=8;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324761;STB=0.518487;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.105287;OID=.;OPOS=8797711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:20:20:8:8:12:12:0.6:4:8:5:3:4:8:5:3
chr11	8866808	.	C	G	94.1	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00170903;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7575;QD=9.65155;RBI=0.0102267;REFB=-0.00841597;REVB=-0.0100828;RO=27;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13415;STB=0.581678;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0188551;OID=.;OPOS=8866808;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:40:39:27:27:12:12:0.307692:8:4:12:15:8:4:12:15
chr11	8942999	.	G	A	1877.21	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9583;QD=61.548;RBI=0.0175106;REFB=0;REVB=-0.00459736;RO=0;SAF=61;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.74056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.99712e-05;OID=.;OPOS=8942999;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:122:0:0:121:122:1:60:61:0:0:60:62:0:0
chr11	8947021	.	A	G	290.55	PASS	AF=1;AO=18;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.171986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7566;QD=52.8266;RBI=0.185418;REFB=0;REVB=-0.069288;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00269094;OID=.;OPOS=8947021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:18:22:1:11:7:0:0:11:11:0:0
chr11	8947283	.	G	C	714.31	PASS	AF=0.96;AO=47;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0519939;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.5914;QD=57.1449;RBI=0.110375;REFB=-0.20419;REVB=0.0973621;RO=2;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447272;STB=0.522718;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0142055;OID=.;OPOS=8947283;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:50:50:2:2:47:48:0.96:20:27:0:2:21:27:0:2
chr11	8947586	.	C	G	187.86	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0425888;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=111.439;QD=21.4694;RBI=0.0470004;REFB=-0.0329302;REVB=0.0198806;RO=13;SAF=8;SAR=11;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249112;STB=0.64691;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0217885;OID=.;OPOS=8947586;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:35:13:16:19:19:0.542857:11:8:10:3:11:8:12:4
chr11	8948680	.	A	T	959.48	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00619014;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.79;QD=59.0447;RBI=0.00857634;REFB=0;REVB=-0.00593597;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.47168e-05;OID=.;OPOS=8948680;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:38:27:0:0:38:27:0:0
chr11	8959511	.	T	G	541.6	PASS	AF=0.847826;AO=39;DP=46;FAO=39;FDP=46;FR=.;FRO=7;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0029167;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.715;QD=47.096;RBI=0.00293349;REFB=0.0205791;REVB=0.000313429;RO=0;SAF=28;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.598689;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.000899286;OID=.;OPOS=8959511;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:46:46:0:7:39:39:0.847826:11:28:0:0:11:28:1:6
chr11	8959545	.	C	A	714.9	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0111463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.356;QD=60.8426;RBI=0.0224983;REFB=-0.000967728;REVB=-0.019543;RO=1;SAF=28;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164967;STB=0.508768;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-7.92046e-06;OID=.;OPOS=8959545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:46:46:0.978723:18:28:1:0:18:28:1:0
chr11	8968878	.	GAGGACAT	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00968623;FXX=0;HRUN=1;LEN=7;MLLD=287.19;QD=35.5759;RBI=0.0302989;REFB=0;REVB=0.0287089;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000230732;OID=.;OPOS=8968879;OREF=AGGACAT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:7:7:7:7:0:5:2:0:0:4:0:5:2:0:0
chr11	8969309	.	T	C	169.41	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=5;FWDB=0.0138339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3654;QD=16.5282;RBI=0.0420873;REFB=-0.00391886;REVB=0.0397488;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310326;STB=0.684026;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0079549;OID=.;OPOS=8969309;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:23:18:18:0.439024:10:8:17:5:10:8:18:5
chr11	8977830	.	A	G	141.0	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.688;QD=13.4286;RBI=0.0135514;REFB=-0.00497638;REVB=0.0133683;RO=25;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401239;STB=0.50908;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.00996805;OID=.;OPOS=8977830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:25:26:16:16:0.380952:9:7:10:15:9:7:11:15
chr11	9005036	.	T	A	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.194;QD=64.1539;RBI=0.0308788;REFB=0;REVB=-0.0113595;RO=0;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45288e-05;OID=.;OPOS=9005036;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:28:21:0:0:28:21:0:0
chr11	9052423	.	A	C	834.33	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.097212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.785;QD=57.5401;RBI=0.102691;REFB=0;REVB=0.0330949;RO=0;SAF=38;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342391;OID=.;OPOS=9052423;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:20:38:0:0:20:38:0:0
chr11	9225486	.	C	G	666.25	PASS	AF=0.662791;AO=57;DP=86;FAO=57;FDP=86;FR=.;FRO=29;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00985984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.345;QD=30.9883;RBI=0.0248384;REFB=-0.0399404;REVB=-0.0227976;RO=29;SAF=39;SAR=18;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917819;STB=0.549777;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.022445;OID=.;OPOS=9225486;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:29:29:57:57:0.662791:18:39:16:13:18:39:16:13
chr11	9228785	.	G	A	101.9	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0691477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6489;QD=8.86102;RBI=0.0695587;REFB=-0.00274537;REVB=-0.00755056;RO=33;SAF=5;SAR=8;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0115194;STB=0.507031;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.00419976;OID=.;OPOS=9228785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:8:5:13:20:8:5:13:20
chr11	9305051	.	T	C	360.4	PASS	AF=0.463415;AO=37;DP=81;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.0354602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4797;QD=17.5807;RBI=0.0440371;REFB=-0.0206814;REVB=0.0261121;RO=44;SAF=21;SAR=16;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687184;STB=0.531898;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0151781;OID=.;OPOS=9305051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:44:44:37:38:0.463415:16:21:28:16:16:22:28:16
chr11	9316937	.	G	A	1050.31	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00116776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.386;QD=59.1724;RBI=0.00718427;REFB=0;REVB=0.00708872;RO=0;SAF=25;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.93036e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101833;OID=.;OPOS=9316937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:71:0:0:67:71:1:42:25:0:0:42:29:0:0
chr11	9406349	.	T	C	1799.25	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.913;QD=60.9915;RBI=0.0465771;REFB=0;REVB=0.0192738;RO=0;SAF=48;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.21597e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.60822e-05;OID=.;OPOS=9406349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:118:0:0:116:118:1:68:48:0:0:69:49:0:0
chr11	9450377	.	T	G	586.88	PASS	AF=0.582418;AO=53;DP=91;FAO=53;FDP=91;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0289648;FXX=0.0108684;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.193;QD=25.7967;RBI=0.0290347;REFB=-0.0134695;REVB=0.00201383;RO=37;SAF=28;SAR=25;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518126;STB=0.522813;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00909397;OID=.;OPOS=9450377;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:37:38:53:53:0.582418:25:28:17:20:25:28:18:20
chr11	9537904	.	G	C	651.04	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273281;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.873;QD=62.0039;RBI=0.0436116;REFB=0;REVB=0.0339874;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.35006e-05;OID=.;OPOS=9537904;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
chr11	9769483	.	C	T	351.09	PASS	AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0149563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.242;QD=18.0046;RBI=0.0320874;REFB=-0.0108849;REVB=-0.0283886;RO=40;SAF=25;SAR=12;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173205;STB=0.604337;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00876593;OID=.;OPOS=9769483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:40:41:37:37:0.474359:12:25:20:20:12:25:20:21
chr11	10529822	.	A	G	134.19	PASS	AF=0.555556;AO=13;DP=25;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.039084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.993;QD=19.8804;RBI=0.0402742;REFB=-0.0419997;REVB=-0.00971837;RO=12;SAF=9;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101817;STB=0.540485;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.05749;OID=.;OPOS=10529822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:27:12:12:13:15:0.555556:4:9:7:5:5:10:7:5
chr11	10533952	.	T	C	217.81	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0261915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.376;QD=16.7548;RBI=0.0549023;REFB=-0.0139843;REVB=0.0482521;RO=27;SAF=8;SAR=16;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214701;STB=0.631467;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0230091;OID=.;OPOS=10533952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:27:28:24:24:0.461538:16:8:15:12:16:8:16:12
chr11	10597081	.	G	A	342.44	PASS	AF=0.408602;AO=35;DP=91;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=-0.00357366;FXX=0.0412329;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.533;QD=14.7288;RBI=0.00778712;REFB=-0.0203305;REVB=-0.00691868;RO=45;SAF=17;SAR=18;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636132;STB=0.52094;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0282803;OID=.;OPOS=10597081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:93:45:55:35:38:0.408602:18:17:19:26:18:20:27:28
chr11	10647702	.	G	A	751.06	PASS	AF=0.41791;AO=81;DP=198;FAO=84;FDP=201;FR=.;FRO=117;FSAF=44;FSAR=40;FSRF=73;FSRR=44;FWDB=-0.0207071;FXX=0.00495025;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.754;QD=14.9465;RBI=0.0208889;REFB=-0.0183975;REVB=0.00274973;RO=115;SAF=42;SAR=39;SRF=71;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104374;STB=0.558726;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0226939;OID=.;OPOS=10647702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:198:201:115:117:81:84:0.41791:39:42:71:44:40:44:73:44
chr11	10650329	.	C	T	81.34	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0259253;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0157;QD=16.2676;RBI=0.0333431;REFB=-0.00935716;REVB=-0.0209676;RO=10;SAF=9;SAR=1;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413788;STB=0.749374;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00600482;OID=.;OPOS=10650329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:20:10:10:10:10:0.5:1:9:6:4:1:9:6:4
chr11	10655609	.	C	T	1361.95	PASS	AF=0.988764;AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0516857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9722;QD=61.2114;RBI=0.0538337;REFB=-0.0418506;REVB=-0.0150551;RO=1;SAF=34;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00885716;STB=0.504586;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00045199;OID=.;OPOS=10655609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:88:89:1:1:87:88:0.988764:53:34:0:1:54:34:0:1
chr11	10673738	.	A	AC	734.22	PASS	AF=1;AO=34;DP=278;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0878046;FXX=0.462077;HRUN=0;LEN=1;MLLD=138.44;QD=19.7105;RBI=0.0902772;REFB=0;REVB=0.020984;RO=244;SAF=33;SAR=1;SRF=79;SRR=165;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.726116;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000581362;OID=.;OPOS=10673739;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:34:278:149:149:0:5:144:0:0:8:244:33:1:79:165
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chr11	10715124	.	T	C	878.37	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.961;QD=57.5978;RBI=0.0481879;REFB=0;REVB=0.037486;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.59724e-05;OID=.;OPOS=10715124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:29:32:0:0:29:32:0:0
chr11	10786142	.	C	T	1525.69	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.391;QD=59.8312;RBI=0.023679;REFB=0;REVB=0.0206115;RO=0;SAF=47;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154337;OID=.;OPOS=10786142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:55:47:0:0:55:47:0:0
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chr11	11373508	.	T	C	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.466;QD=63.2863;RBI=0.0207406;REFB=0;REVB=-0.00949163;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112043;OID=.;OPOS=11373508;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr11	11373587	.	A	G	1490.28	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=342.124;QD=62.7485;RBI=0.0353397;REFB=0;REVB=0.0137732;RO=0;SAF=45;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.39218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.77605e-05;OID=.;OPOS=11373587;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:95:0:0:88:95:1:43:45:0:0:47:48:0:0
chr11	11373635	.	C	T	1643.55	PASS	AF=0.990991;AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.061121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9683;QD=59.227;RBI=0.0628676;REFB=-0.0859678;REVB=-0.0147161;RO=1;SAF=51;SAR=59;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00797874;STB=0.504201;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000815905;OID=.;OPOS=11373635;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:111:111:1:1:110:110:0.990991:59:51:0:1:59:51:0:1
chr11	11373808	.	T	G	1914.89	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.078;QD=61.7706;RBI=0.0334451;REFB=0;REVB=-0.0269095;RO=0;SAF=66;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.36702e-06;OID=.;OPOS=11373808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:58:66:0:0:58:66:0:0
chr11	11373925	.	A	C	1606.15	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253939;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.0415;QD=64.2462;RBI=0.0326266;REFB=0;REVB=-0.0204852;RO=0;SAF=53;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00025418;OID=.;OPOS=11373925;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:47:53:0:0:47:53:0:0
chr11	11373960	.	C	T	1641.86	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.268;QD=60.2516;RBI=0.0310547;REFB=0;REVB=-0.00873538;RO=0;SAF=53;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.27763e-05;OID=.;OPOS=11373960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:56:53:0:0:56:53:0:0
chr11	11374016	.	T	A	1556.5	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.715;QD=59.8655;RBI=0.0331871;REFB=0;REVB=-0.014376;RO=0;SAF=51;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.13766e-05;OID=.;OPOS=11374016;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:53:51:0:0:53:51:0:0
chr11	11374269	.	A	G	2189.59	PASS	AF=0.965986;AO=142;DP=148;FAO=142;FDP=147;FR=.;FRO=5;FSAF=82;FSAR=60;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0567027;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.224;QD=59.5808;RBI=0.0662424;REFB=-0.0992408;REVB=0.034247;RO=4;SAF=82;SAR=60;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00921802;STB=0.507773;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.000682083;OID=.;OPOS=11374269;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:148:147:4:5:142:142:0.965986:60:82:3:1:60:82:4:1
chr11	11374283	.	T	G	2119.47	PASS	AF=0.954248;AO=146;DP=154;FAO=146;FDP=153;FR=.;FRO=7;FSAF=85;FSAR=61;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.020965;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.937;QD=55.4109;RBI=0.0210896;REFB=0.0038006;REVB=0.00228877;RO=6;SAF=85;SAR=61;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00632662;STB=0.507205;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=-0.000228684;OID=.;OPOS=11374283;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:154:153:6:7:146:146:0.954248:61:85:3:3:61:85:3:4
chr11	11913585	.	G	T	894.31	PASS	AF=0.969231;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0127786;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=312.992;QD=55.0346;RBI=0.015384;REFB=0.00225724;REVB=-0.00856581;RO=2;SAF=30;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304411;STB=0.516124;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=3.27689e-06;OID=.;OPOS=11913585;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:65:65:2:2:63:63:0.969231:33:30:2:0:33:30:2:0
chr11	11976628	.	G	A	1774.89	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5318;QD=60.6801;RBI=0.0705365;REFB=0;REVB=-0.0567229;RO=0;SAF=55;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07878e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.12851e-05;OID=.;OPOS=11976628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:62:55:0:0:62:55:0:0
chr11	11977573	.	T	C	315.08	PASS	AF=0.596154;AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.0122306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4234;QD=24.2367;RBI=0.0268308;REFB=-0.0329404;REVB=0.023881;RO=21;SAF=14;SAR=17;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224876;STB=0.623395;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0148952;OID=.;OPOS=11977573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:21:21:31:31:0.596154:17:14:16:5:17:14:16:5
chr11	11978815	.	T	TGA	327.8	PASS	AF=0.373832;AO=40;DP=107;FAO=40;FDP=107;FR=.;FRO=67;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=38;FWDB=-0.0156197;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=2;MLLD=267.414;QD=12.2541;RBI=0.016287;REFB=-0.0188652;REVB=-0.00461433;RO=67;SAF=23;SAR=17;SRF=29;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155355;STB=0.588602;STBP=0.159;TYPE=ins;VARB=0.0320632;OID=.;OPOS=11978816;OREF=-;OALT=GA;OMAPALT=TGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.373832:40:107:40:107:67:23:17:29:38:99:67:23:17:29:38
chr11	11986061	.	T	C	1093.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.823;QD=59.9112;RBI=0.0421271;REFB=0;REVB=-0.0084538;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.50075e-05;OID=.;OPOS=11986061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:73:0:0:70:73:1:32:38:0:0:32:41:0:0
chr11	12225945	.	GT	G,GG	1461.65	PASS	AF=0.106383,0.893617;AO=17,74;DP=91;FAO=10,84;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=0,47;FSAR=10,37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417873,0.0425921;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=285.346,301.089;QD=62.1977;RBI=0.0594589,0.0620647;REFB=0,0;REVB=0.0422988,0.0451436;RO=0;SAF=8,39;SAR=9,35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.126e-08,3.80413e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0274629,0.000910231;OID=.,.;OPOS=12225946,12225946;OREF=T,T;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.106383,0.893617:17,74:91:10,84:94:0:0,47:10,37:0:0:12:0:8,39:9,35:0:0
chr11	12229655	.	T	G	2603.12	PASS	AF=1;AO=168;DP=168;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.071;QD=61.9791;RBI=0.0404444;REFB=0;REVB=0.0031328;RO=0;SAF=76;SAR=92;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02044e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.8308e-05;OID=.;OPOS=12229655;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:168:168:0:0:168:168:1:92:76:0:0:92:76:0:0
chr11	12246233	.	G	C	412.77	PASS	AF=0.532468;AO=41;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0274989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5856;QD=21.4428;RBI=0.0286938;REFB=0.025816;REVB=-0.00819407;RO=36;SAF=18;SAR=23;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754355;STB=0.541673;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=-0.0143566;OID=.;OPOS=12246233;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:36:36:41:41:0.532468:23:18:19:17:23:18:19:17
chr11	12285090	.	C	T	201.54	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.0162953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.041;QD=13.8996;RBI=0.0197513;REFB=-0.0242549;REVB=-0.0111613;RO=34;SAF=11;SAR=13;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251423;STB=0.642543;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0363018;OID=.;OPOS=12285090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:13:11:24:10:13:11:24:10
chr11	12315186	.	G	A,C	1152.56	PASS	AF=0.923077,0.0769231;AO=70,6;DP=77;FAO=72,6;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=27,6;FSAR=45,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0476764,0.0524573;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=132.786,123.075;QD=59.1058;RBI=0.0510917,0.0525509;REFB=0,0;REVB=-0.0183664,-0.00313418;RO=0;SAF=26,6;SAR=44,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000320642,0.178723;OID=.,.;OPOS=12315186,12315186;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:77:78:0:0:70,6:72,6:0.923077,0.0769231:44,0:26,6:0:0:45,0:27,6:0:0
chr11	12315407	.	G	C	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0309591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.431;QD=53.9089;RBI=0.051209;REFB=0;REVB=0.0407908;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217152;OID=.;OPOS=12315407;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0
chr11	12315716	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000726478;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.349;QD=45.8068;RBI=0.0263492;REFB=0;REVB=0.0263392;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113242;OID=.;OPOS=12315716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr11	12315891	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.636;QD=43.4861;RBI=0.0617023;REFB=0;REVB=-0.00982137;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000182388;OID=.;OPOS=12315891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr11	12315915	.	A	G	175.6	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00656315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.656;QD=46.8273;RBI=0.0410728;REFB=0;REVB=-0.040545;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00018435;OID=.;OPOS=12315915;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:9:5:0:0:9:6:0:0
chr11	12550368	.	TATA	T	624.13	PASS	AF=0.508065;AO=59;DP=124;FAO=63;FDP=124;FR=.;FRO=61;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.0294784;FXX=0.0236202;HRUN=1;LEN=3;MLLD=256.372;QD=20.1334;RBI=0.0299057;REFB=-0.0224541;REVB=0.00503725;RO=59;SAF=32;SAR=27;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767135;STB=0.53967;STBP=0.417;TYPE=del;VARB=0.0215895;OID=.;OPOS=12550369;OREF=ATA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.508065:59:124:63:124:61:34:29:28:33:99:59:32:27:27:32
chr11	12903443	.	C	T	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.632;QD=60.9783;RBI=0.0208477;REFB=0;REVB=0.0124304;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.19759e-05;OID=.;OPOS=12903443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0
chr11	13031708	.	A	G	691.38	PASS	AF=0.482993;AO=71;DP=147;FAO=71;FDP=147;FR=.;FRO=76;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=49;FSRR=27;FWDB=-0.00979026;FXX=0.0264883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.197;QD=18.813;RBI=0.00979128;REFB=-0.016891;REVB=0.000140951;RO=75;SAF=34;SAR=37;SRF=48;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149327;STB=0.585263;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0211798;OID=.;OPOS=13031708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:75:76:71:71:0.482993:37:34:48:27:37:34:49:27
chr11	13398129	.	T	A	1079.96	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.294;QD=59.9976;RBI=0.0756984;REFB=0;REVB=0.0740415;RO=0;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.43263e-05;OID=.;OPOS=13398129;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:66:72:0:0:66:72:1:26:40:0:0:32:40:0:0
chr11	13441126	.	A	G	483.58	PASS	AF=0.430894;AO=52;DP=123;FAO=53;FDP=123;FR=.;FRO=70;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=50;FSRR=20;FWDB=-0.0136466;FXX=0.0238076;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.813;QD=15.7261;RBI=0.0222128;REFB=-0.00925408;REVB=-0.0175265;RO=65;SAF=30;SAR=22;SRF=45;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120364;STB=0.577793;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0181758;OID=.;OPOS=13441126;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:65:70:52:53:0.430894:22:30:45:20:22:31:50:20
chr11	13443250	.	C	T	202.52	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0109886;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.7889;QD=13.9671;RBI=0.0333115;REFB=0.00308271;REVB=-0.0314469;RO=34;SAF=9;SAR=15;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707983;STB=0.540506;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=-0.00268146;OID=.;OPOS=13443250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:34:34:24:24:0.413793:15:9:15:19:15:9:15:19
chr11	13929046	.	T	A	347.89	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0199292;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.212;QD=51.5399;RBI=0.0327474;REFB=-0.161983;REVB=-0.025985;RO=1;SAF=13;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0343929;STB=0.518504;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000823039;OID=.;OPOS=13929046;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:13:13:1:0:13:13:1:0
chr11	14101493	.	G	GC	651.67	PASS	AF=1;AO=60;DP=71;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=15.3474;QD=38.3337;RBI=0.113965;REFB=0;REVB=0.109501;RO=9;SAF=36;SAR=24;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0458074;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00356365;OID=.;OPOS=14101494;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:60:71:68:68:0:42:26:0:0:12:9:36:24:7:2
chr11	14632570	.	A	C	123.79	PASS	AF=0.298246;AO=17;DP=57;FAO=17;FDP=57;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=-0.017537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.242;QD=8.68713;RBI=0.0325753;REFB=-0.00979264;REVB=0.0274518;RO=39;SAF=6;SAR=11;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.40646;STB=0.730222;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0239129;OID=.;OPOS=14632570;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:39:40:17:17:0.298246:11:6:28:11:11:6:28:12
chr11	14810762	.	A	G	381.55	PASS	AF=0.454545;AO=39;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0154534;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.656;QD=17.3432;RBI=0.0155492;REFB=-8.50233e-05;REVB=0.00172311;RO=47;SAF=8;SAR=31;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328067;STB=0.695544;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.000296318;OID=.;OPOS=14810762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:47:48:39:40:0.454545:31:8:23:24:32:8:24:24
chr11	14913575	.	G	A	1006.77	PASS	AF=0.505155;AO=98;DP=194;FAO=98;FDP=194;FR=.;FRO=96;FSAF=54;FSAR=44;FSRF=47;FSRR=49;FWDB=0.0134361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.399;QD=20.7582;RBI=0.0285539;REFB=-0.0171157;REVB=0.0251952;RO=96;SAF=54;SAR=44;SRF=47;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0555812;STB=0.530524;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0147894;OID=.;OPOS=14913575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:194:194:96:96:98:98:0.505155:44:54:47:49:44:54:47:49
chr11	14991539	.	T	C	2368.26	PASS	AF=1;AO=155;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257873;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.114;QD=61.1164;RBI=0.0427576;REFB=0;REVB=-0.0341061;RO=0;SAF=93;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000221651;OID=.;OPOS=14991539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:155:155:0:0:155:155:1:62:93:0:0:62:93:0:0
chr11	15199956	.	GT	G,GC	783.99	PASS	AF=0.04,0.96;AO=5,44;DP=49;FAO=2,48;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=1,30;FSAR=1,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0527582,0.0681905;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=25.586,48.5178;QD=62.719;RBI=0.0528757,0.076628;REFB=0,0;REVB=-0.00352368,0.0349557;RO=0;SAF=4,26;SAR=1,18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.102758,0.00834996;OID=.,.;OPOS=15199957,15199957;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.04,0.96:5,44:49:2,48:50:0:1,30:1,18:0:0:7:0:4,26:1,18:0:0
chr11	15992264	.	T	C	356.14	PASS	AF=0.44186;AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.0192724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.417;QD=16.5645;RBI=0.0600067;REFB=-0.0125731;REVB=0.0568276;RO=47;SAF=17;SAR=21;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833533;STB=0.541083;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0170328;OID=.;OPOS=15992264;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:47:48:38:38:0.44186:21:17:25:22:21:17:25:23
chr11	16133413	.	A	G	364.44	PASS	AF=0.521127;AO=36;DP=72;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0135596;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.85;QD=20.5316;RBI=0.0278975;REFB=-0.0461184;REVB=0.0243805;RO=35;SAF=17;SAR=19;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16318;STB=0.589077;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0361552;OID=.;OPOS=16133413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:35:34:36:37:0.521127:19:17:23:12:20:17:22:12
chr11	16863907	.	C	T	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0150145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.83;QD=19.0003;RBI=0.0380155;REFB=-0.0281911;REVB=0.0349249;RO=17;SAF=7;SAR=10;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0236432;OID=.;OPOS=16863907;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:10:7:7:10:10:7:7:10
chr11	17035718	.	A	G	129.21	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.131507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.008;QD=43.0696;RBI=0.147606;REFB=0;REVB=0.0670333;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00310704;OID=.;OPOS=17035718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:10:12:1:7:3:0:0:8:4:0:0
chr11	17172133	.	T	C	385.18	PASS	AF=0.52;AO=39;DP=75;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0731469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.004;QD=20.5429;RBI=0.0731852;REFB=-0.0214331;REVB=0.00236863;RO=36;SAF=29;SAR=10;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350334;STB=0.694884;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0353264;OID=.;OPOS=17172133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:36:36:39:39:0.52:10:29:13:23:10:29:13:23
chr11	17191019	.	A	G	195.49	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0362778;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7761;QD=16.9989;RBI=0.041609;REFB=-0.00348792;REVB=0.0203771;RO=26;SAF=12;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137865;STB=0.578868;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.00611218;OID=.;OPOS=17191019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:26:26:20:20:0.434783:8:12:12:14:8:12:12:14
chr11	17333663	.	G	A	306.3	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8466;QD=53.2689;RBI=0.0649961;REFB=0;REVB=0.0578663;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139943;OID=.;OPOS=17333663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr11	17339127	.	T	C	871.4	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00016236;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=236.032;QD=56.2191;RBI=0.0313293;REFB=-0.0974397;REVB=0.0313289;RO=0;SAF=48;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13514e-08;STB=0.518512;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.000315924;OID=.;OPOS=17339127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:0:1:61:61:0.983871:13:48:0:0:13:48:0:1
chr11	17352476	.	TTACA	T,TT	419.23	PASS	AF=0,1;AO=5,20;DP=27;FAO=0,30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0534641,0.0612372;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=4,3;MLLD=239.403,262.375;QD=55.8979;RBI=0.0584013,0.0653736;REFB=0,0;REVB=0.023501,0.0228847;RO=0;SAF=2,5;SAR=3,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0797323,-0.000115645;OID=.,.;OPOS=17352477,17352478;OREF=TACA,ACA;OALT=-,-;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:5,20:27:0,30:30:0:0,10:0,20:0:0:4:0:2,5:3,15:0:0
chr11	17408404	.	C	T	771.51	PASS	AF=0.867647;AO=57;DP=66;FAO=59;FDP=68;FR=.;FRO=9;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0166472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.169;QD=45.383;RBI=0.0244874;REFB=-0.0115045;REVB=0.0179584;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.532581;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.00112204;OID=.;OPOS=17408404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:66:68:0:9:57:59:0.867647:23:34:0:0:25:34:3:6
chr11	17408630	.	C	G,T	1061.07	PASS	AF=0.0277778,0.972222;AO=3,69;DP=72;FAO=2,70;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=0,40;FSAR=2,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00364188,0.00410426;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=75.3061,155.715;QD=58.9483;RBI=0.0676444,0.0305017;REFB=0,0;REVB=-0.0675462,-0.0302244;RO=0;SAF=0,40;SAR=3,29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.149961,9.54675e-05;OID=.,.;OPOS=17408630,17408630;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:72:72:0:0:3,69:2,70:0.0277778,0.972222:3,29:0,40:0:0:2,30:0,40:0:0
chr11	17409069	.	G	A	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335159;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.669;QD=60.6103;RBI=0.0336658;REFB=0;REVB=0.00317292;RO=0;SAF=28;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.24006e-05;OID=.;OPOS=17409069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:10:28:0:0:10:28:0:0
chr11	17409572	.	T	C,G	1064.06	PASS	AF=0.972222,0.0277778;AO=69,3;DP=72;FAO=70,2;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=47,2;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249785,-0.0655535;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=266.567,18.5234;QD=59.1143;RBI=0.0434566,0.0733537;REFB=0,0;REVB=0.0355606,-0.0329166;RO=0;SAF=46,3;SAR=23,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-5.48827e-05,0.204558;OID=.,.;OPOS=17409572,17409572;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:72:72:0:0:69,3:70,2:0.972222,0.0277778:23,0:46,3:0:0:23,0:47,2:0:0
chr11	17418477	.	C	A	1044.38	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0811;QD=59.6791;RBI=0.0336694;REFB=0;REVB=0.0275587;RO=0;SAF=42;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000362789;OID=.;OPOS=17418477;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:27:42:0:0:27:43:0:0
chr11	17522638	.	G	A	167.39	PASS	AF=0.368421;AO=20;DP=56;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00548171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.277;QD=11.747;RBI=0.00722189;REFB=0.00421426;REVB=-0.00470176;RO=36;SAF=8;SAR=12;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111592;STB=0.545411;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=-0.00817838;OID=.;OPOS=17522638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:36:36:20:21:0.368421:12:8:18:18:12:9:18:18
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chr11	17593709	.	T	C	595.53	PASS	AF=0.432258;AO=65;DP=154;FAO=67;FDP=155;FR=.;FRO=88;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=40;FSRR=48;FWDB=0.00111802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.995;QD=15.3684;RBI=0.0142703;REFB=-0.0280521;REVB=-0.0142265;RO=86;SAF=31;SAR=34;SRF=41;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000182641;STB=0.521582;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0361707;OID=.;OPOS=17593709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:155:86:88:65:67:0.432258:34:31:41:45:34:33:40:48
chr11	17596313	.	G	A	665.12	PASS	AF=0.515625;AO=66;DP=128;FAO=66;FDP=128;FR=.;FRO=62;FSAF=47;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=-0.00478769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.355;QD=20.7849;RBI=0.0296376;REFB=-0.0152935;REVB=0.0292483;RO=61;SAF=47;SAR=19;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746157;STB=0.538256;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0124089;OID=.;OPOS=17596313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:61:62:66:66:0.515625:19:47:39:22:19:47:40:22
chr11	17598187	.	G	A	131.86	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.00591525;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.256;QD=21.9771;RBI=0.0287232;REFB=-0.0293048;REVB=0.0281075;RO=10;SAF=2;SAR=12;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0796851;STB=0.545385;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0117261;OID=.;OPOS=17598187;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:25:24:10:10:14:14:0.583333:12:2:2:8:12:2:2:8
chr11	17600033	.	G	A	960.85	PASS	AF=0.492228;AO=91;DP=192;FAO=95;FDP=193;FR=.;FRO=98;FSAF=58;FSAR=37;FSRF=49;FSRR=49;FWDB=0.0479793;FXX=0.0102559;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.639;QD=19.914;RBI=0.0548323;REFB=-0.0247205;REVB=0.0265438;RO=96;SAF=56;SAR=35;SRF=47;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119831;STB=0.557493;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0323122;OID=.;OPOS=17600033;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:192:193:96:98:91:95:0.492228:35:56:47:49:37:58:49:49
chr11	17627613	.	G	C	881.71	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.171;QD=56.8846;RBI=0.0542781;REFB=0;REVB=0.0495148;RO=0;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170293;OID=.;OPOS=17627613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:62:0:0:56:62:1:24:32:0:0:30:32:0:0
chr11	17631751	.	C	T	176.19	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.031608;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=51.0806;QD=13.2974;RBI=0.0956767;REFB=8.75418e-05;REVB=0.0903048;RO=27;SAF=9;SAR=12;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125114;STB=0.598837;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0018638;OID=.;OPOS=17631751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:32:21:21:0.396226:12:9:15:12:12:9:19:13
chr11	17632651	.	C	T	407.71	PASS	AF=0.433962;AO=46;DP=106;FAO=46;FDP=106;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.0307697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7999;QD=15.3854;RBI=0.0321049;REFB=-0.00720809;REVB=-0.0091626;RO=60;SAF=31;SAR=15;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279586;STB=0.657038;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0113429;OID=.;OPOS=17632651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:60:60:46:46:0.433962:15:31:24:36:15:31:24:36
chr11	17656686	.	C	T	336.5	PASS	AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.0276204;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8288;QD=17.2562;RBI=0.0413019;REFB=0.00196325;REVB=0.0307077;RO=41;SAF=15;SAR=21;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160148;STB=0.595692;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.00137442;OID=.;OPOS=17656686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:41:42:36:36:0.461538:21:15:24:17:21:15:25:17
chr11	17663444	.	C	T	476.27	PASS	AF=0.528736;AO=46;DP=87;FAO=46;FDP=87;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00292516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.146;QD=21.8976;RBI=0.0119666;REFB=-0.0175673;REVB=0.0116036;RO=41;SAF=26;SAR=20;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457478;STB=0.525241;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0241537;OID=.;OPOS=17663444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:41:41:46:46:0.528736:20:26:21:20:20:26:21:20
chr11	17663742	.	G	C	453.62	PASS	AF=0.45045;AO=50;DP=111;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=38;FSAR=12;FSRF=46;FSRR=15;FWDB=0.0506085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.278;QD=16.3467;RBI=0.0617167;REFB=-0.0483276;REVB=-0.0353232;RO=59;SAF=38;SAR=12;SRF=44;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187141;STB=0.504423;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0515376;OID=.;OPOS=17663742;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:59:61:50:50:0.45045:12:38:44:15:12:38:46:15
chr11	17948311	.	T	C	200.94	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.00555921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.7;QD=15.1655;RBI=0.00649363;REFB=-0.014926;REVB=0.00335595;RO=30;SAF=14;SAR=9;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904492;STB=0.50515;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0165053;OID=.;OPOS=17948311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:9:14:18:12:9:14:18:12
chr11	17981047	.	C	T	145.25	PASS	AF=0.346939;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.0046051;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.207;QD=11.857;RBI=0.0382776;REFB=-0.0159137;REVB=-0.0379996;RO=32;SAF=12;SAR=5;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304284;STB=0.679587;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0269914;OID=.;OPOS=17981047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:49:32:32:17:17:0.346939:5:12:14:18:5:12:14:18
chr11	18041193	.	AAGT	A	132.3	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.000766097;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=136.096;QD=11.025;RBI=0.0150368;REFB=-0.00339183;REVB=-0.0150173;RO=26;SAF=12;SAR=9;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.083006;STB=0.533711;STBP=0.714;TYPE=del;VARB=0.00520365;OID=.;OPOS=18041194;OREF=AGT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4375:21:48:21:48:27:12:9:17:10:99:26:12:9:17:9
chr11	18159169	.	A	G	1607.13	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.952;QD=64.2852;RBI=0.0192648;REFB=0;REVB=-0.00584446;RO=0;SAF=57;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.67908e-05;OID=.;OPOS=18159169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:43:57:0:0:43:57:0:0
chr11	18159254	.	A	G	1341.32	PASS	AF=0.977778;AO=87;DP=92;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0252938;FXX=0.0217368;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.3547;QD=59.6144;RBI=0.0340648;REFB=-0.0709267;REVB=-0.0228174;RO=2;SAF=42;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000734801;STB=0.500506;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00293384;OID=.;OPOS=18159254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:92:90:2:2:87:88:0.977778:45:42:1:1:46:42:1:1
chr11	18194944	.	T	A	760.9	PASS	AF=0.982456;AO=55;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00461431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.261;QD=53.3962;RBI=0.0327378;REFB=-0.19585;REVB=0.032411;RO=2;SAF=26;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00180786;STB=0.509431;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00184968;OID=.;OPOS=18194944;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:57:57:2:1:55:56:0.982456:29:26:1:1:30:26:1:0
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chr11	18210480	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.997;QD=37.4885;RBI=0.0919955;REFB=0;REVB=0.0896619;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00093086;OID=.;OPOS=18210480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
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chr11	18290859	.	C	T	95.33	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00529925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.5014;QD=34.6656;RBI=0.0552591;REFB=-0.0618493;REVB=-0.0550045;RO=1;SAF=7;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596689;STB=0.533268;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.00617766;OID=.;OPOS=18290859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:3:7:1:0:3:7:1:0
chr11	18291321	.	T	C	1936.31	PASS	AF=0.992126;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0114609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.135;QD=60.9861;RBI=0.0300361;REFB=0.0507118;REVB=0.0277636;RO=1;SAF=71;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00664586;STB=0.503496;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.000141067;OID=.;OPOS=18291321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:127:127:1:1:126:126:0.992126:55:71:1:0:55:71:1:0
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chr11	18422487	.	C	A,T	1284.58	PASS	AF=0.964286,0.0357143;AO=81,4;DP=85;FAO=81,3;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=42,2;FSAR=39,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-8.34386e-06,0.00238213;FXX=0.0117633;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=90.847,169.945;QD=61.1705;RBI=0.020298,0.0235277;REFB=0,0;REVB=-0.0202979,-0.0234068;RO=0;SAF=42,2;SAR=39,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00651469,0.0282174;OID=.,.;OPOS=18422487,18422487;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:85:84:0:0:81,4:81,3:0.964286,0.0357143:39,2:42,2:0:0:39,1:42,2:0:0
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chr11	18487305	.	C	G	658.48	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0041589;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.024;QD=52.6783;RBI=0.0160816;REFB=0.0109062;REVB=0.0155345;RO=2;SAF=28;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324231;STB=0.517234;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=-0.000100969;OID=.;OPOS=18487305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:50:2:2:48:48:0.96:20:28:2:0:20:28:2:0
chr11	18596966	.	GA	AG	82.84	PASS	AF=1;AO=2;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0166976;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=2;MLLD=11.8372;QD=27.614;RBI=0.229237;REFB=0;REVB=0.228628;RO=1;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25849;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.016811;OID=.;OPOS=18596966;OREF=GA;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:12:12:1:0:2:12:1:1:1:0:1:8:4:0:0
chr11	18628076	.	A	AAT	32.24	PASS	AF=0.2;AO=5;DP=35;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00460109;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=20.6045;QD=3.68503;RBI=0.0908902;REFB=-0.0147823;REVB=-0.0907737;RO=25;SAF=3;SAR=2;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230261;STB=0.612587;STBP=0.603;TYPE=ins;VARB=0.0525737;OID=.;OPOS=18628077;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=AAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.2:5:35:7:35:28:4:3:12:16:32:25:3:2:10:15
chr11	18633971	.	G	A	1472.5	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0068264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.823;QD=63.3332;RBI=0.00758897;REFB=0;REVB=-0.00331553;RO=0;SAF=46;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11958e-05;OID=.;OPOS=18633971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:47:46:0:0:47:46:0:0
chr11	18735396	.	G	T	786.63	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0801107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.822;QD=64.2147;RBI=0.0845377;REFB=0;REVB=0.0269979;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012376;OID=.;OPOS=18735396;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:47:49:1:29:18:0:0:30:19:0:0
chr11	18735465	.	G	A	634.3	PASS	AF=0.602151;AO=56;DP=93;FAO=56;FDP=93;FR=.;FRO=37;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0356475;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6696;QD=27.2815;RBI=0.0356598;REFB=-0.00979832;REVB=0.000937173;RO=36;SAF=29;SAR=27;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132246;STB=0.565993;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00728769;OID=.;OPOS=18735465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:36:37:56:56:0.602151:27:29:12:24:27:29:13:24
chr11	18735947	.	T	C	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0722615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6499;QD=59.8374;RBI=0.0722798;REFB=0;REVB=-0.00162622;RO=0;SAF=13;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000759747;OID=.;OPOS=18735947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:23:13:0:0:23:13:0:0
chr11	18737095	.	C	T	1415.57	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.773;QD=62.9141;RBI=0.0473148;REFB=0;REVB=0.0319239;RO=0;SAF=49;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124033;OID=.;OPOS=18737095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:40:49:0:0:41:49:0:0
chr11	18738281	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.067;QD=57.202;RBI=0.0269045;REFB=0;REVB=0.00192383;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231917;OID=.;OPOS=18738281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr11	18751041	.	C	T	398.94	PASS	AF=0.633333;AO=38;DP=60;FAO=38;FDP=60;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00430231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.722;QD=26.5957;RBI=0.0406095;REFB=-0.0279641;REVB=0.040381;RO=22;SAF=18;SAR=20;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108851;STB=0.559409;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0200201;OID=.;OPOS=18751041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:22:22:38:38:0.633333:20:18:14:8:20:18:14:8
chr11	18764026	.	G	C	343.78	PASS	AF=0.818182;AO=23;DP=35;FAO=27;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=25;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0406551;FXX=0.0294031;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.579;QD=41.6708;RBI=0.112198;REFB=0.0140707;REVB=0.104573;RO=8;SAF=21;SAR=2;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0534891;STB=0.553535;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=-0.000651918;OID=.;OPOS=18764026;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:35:33:8:6:23:27:0.818182:2:21:7:1:2:25:6:0
chr11	18955744	.	C	T	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.482;QD=53.2757;RBI=0.0447762;REFB=0;REVB=-0.0318875;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.90628e-06;OID=.;OPOS=18955744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr11	18956196	.	C	T	324.45	PASS	AF=0.378641;AO=39;DP=103;FAO=39;FDP=103;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=-0.00919409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3251;QD=12.6002;RBI=0.0281612;REFB=-0.00885229;REVB=0.0266181;RO=64;SAF=27;SAR=12;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11887;STB=0.56807;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.0229899;OID=.;OPOS=18956196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:64:64:39:39:0.378641:12:27:38:26:12:27:38:26
chr11	19077755	.	A	C	104.39	PASS	AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0143797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.709;QD=10.4385;RBI=0.0474612;REFB=-0.024878;REVB=-0.0452304;RO=27;SAF=9;SAR=4;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123277;STB=0.574349;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0478987;OID=.;OPOS=19077755;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:27:27:13:13:0.325:4:9:16:11:4:9:16:11
chr11	19077765	.	T	C	140.71	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0165144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.508;QD=13.0888;RBI=0.0397297;REFB=-0.0157526;REVB=-0.0361348;RO=25;SAF=11;SAR=5;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562203;STB=0.565831;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0136843;OID=.;OPOS=19077765;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:43:25:27:16:16:0.372093:5:11:16:9:5:11:16:11
chr11	19077904	.	T	G	72.02	PASS	AF=0.285714;AO=10;DP=35;FAO=10;FDP=35;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.0152826;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.07;QD=8.23124;RBI=0.0260225;REFB=-0.0155682;REVB=-0.0210621;RO=24;SAF=9;SAR=1;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.449303;STB=0.781907;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0574428;OID=.;OPOS=19077904;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:35:35:24:25:10:10:0.285714:1:9:15:9:1:9:16:9
chr11	19167850	.	A	G	1491.35	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.1788;QD=63.4617;RBI=0.034364;REFB=0;REVB=0.0230209;RO=0;SAF=42;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.65293e-05;OID=.;OPOS=19167850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:52:42:0:0:52:42:0:0
chr11	19245854	.	T	C	1514.76	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00877534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.753;QD=62.4645;RBI=0.0436625;REFB=0.0107509;REVB=0.0427715;RO=1;SAF=42;SAR=54;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111571;STB=0.505881;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=4.03965e-05;OID=.;OPOS=19245854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:54:42:1:0:54:42:1:0
chr11	19251289	.	C	G	334.74	PASS	AF=0.507042;AO=34;DP=69;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00663065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.289;QD=18.8585;RBI=0.0147906;REFB=-0.025677;REVB=0.013221;RO=33;SAF=13;SAR=21;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038807;STB=0.520525;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0277608;OID=.;OPOS=19251289;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:71:33:35:34:36:0.507042:21:13:14:19:23:13:14:21
chr11	19612775	.	C	T	975.43	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137949;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.9494;QD=59.1168;RBI=0.0202716;REFB=0;REVB=0.0148538;RO=0;SAF=25;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04816e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185382;OID=.;OPOS=19612775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:41:25:0:0:41:25:0:0
chr11	19799522	.	GCCCCG	GCCC,GCCCC,GCCCG	667.96	PASS	AF=0,0.473684,0;AO=16,54,22;DP=158;FAO=0,72,0;FDP=152;FR=.;FRO=80;FSAF=0,35,0;FSAR=0,37,0;FSRF=49;FSRR=31;FWDB=-0.0433266,0.0264664,-0.377942;FXX=0.0256394;HRUN=4,1,4;LEN=2,1,1;MLLD=99.0896,102.74,13.4809;QD=17.5778;RBI=0.0447832,0.0269463,0.401733;REFB=-0.021446,-0.0171094,-0.0682478;REVB=-0.011329,-0.00506244,-0.136194;RO=60;SAF=11,22,21;SAR=5,32,1;SRF=29;SRR=31;SSEN=0.4,0,0.4;SSEP=0.492063,0,0.492063;SSSB=0.258747,-0.0733027,0.691874;STB=0.5,0.566308,0.5;STBP=1,0.147,1;TYPE=del,del,del;VARB=-0.00403579,0.0286642,0;OID=.,.,.;OPOS=19799526,19799527,19799523;OREF=CG,G,C;OALT=-,-,-;OMAPALT=GCCC,GCCCC,GCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.473684,0:16,54,22:158:0,72,0:152:80:0,35,0:0,37,0:49:31:99:60:11,22,21:5,32,1:29:31
chr11	19854088	.	G	A	1127.19	PASS	AF=0.987179;AO=76;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.039914;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.851;QD=57.8046;RBI=0.0411914;REFB=-0.181396;REVB=-0.0101788;RO=2;SAF=31;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295493;STB=0.50769;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00436924;OID=.;OPOS=19854088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:2:1:76:77:0.987179:45:31:2:0:45:32:1:0
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chr11	20112417	.	A	C	315.23	PASS	AF=0.56;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=50;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00120264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.376;QD=25.218;RBI=0.0147345;REFB=-0.0150721;REVB=0.0146853;RO=22;SAF=17;SAR=11;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0244454;STB=0.513545;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0134941;OID=.;OPOS=20112417;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:22:22:28:28:0.56:11:17:14:8:11:17:14:8
chr11	20112492	.	G	A	157.86	PASS	AF=0.365385;AO=19;DP=52;FAO=19;FDP=52;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0141354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.528;QD=12.1432;RBI=0.0146575;REFB=-0.00261963;REVB=0.00387715;RO=33;SAF=9;SAR=10;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110778;STB=0.564449;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0051505;OID=.;OPOS=20112492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:33:33:19:19:0.365385:10:9:19:14:10:9:19:14
chr11	20117232	.	T	C	1524.26	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.381;QD=59.7747;RBI=0.0462134;REFB=0;REVB=0.0433537;RO=0;SAF=66;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.66358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7314e-05;OID=.;OPOS=20117232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:102:0:0:100:102:1:34:66:0:0:34:68:0:0
chr11	20124914	.	A	C	1234.63	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0015994;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.222;QD=60.2258;RBI=0.0198204;REFB=-0.100511;REVB=-0.0197558;RO=0;SAF=48;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28649e-08;STB=0.505153;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=-0.000102162;OID=.;OPOS=20124914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:82:0:1:81:81:0.987805:33:48:0:0:33:48:1:0
chr11	20139937	.	C	T	370.53	PASS	AF=0.903226;AO=28;DP=31;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0147099;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=266.213;QD=47.8108;RBI=0.0241391;REFB=-0.172343;REVB=0.0191394;RO=1;SAF=17;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265944;STB=0.540512;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.000966147;OID=.;OPOS=20139937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:31:31:1:3:28:28:0.903226:11:17:1:0:11:17:3:0
chr11	20140020	.	C	A	235.45	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0105645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2402;QD=17.4405;RBI=0.0457461;REFB=0.0294473;REVB=0.0445095;RO=28;SAF=19;SAR=7;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235452;STB=0.633225;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.0294358;OID=.;OPOS=20140020;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:7:19:14:14:7:19:14:14
chr11	20140361	.	A	G	31.91	PASS	AF=0.0930233;AO=8;DP=86;FAO=8;FDP=86;FR=.;FRO=78;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=49;FSRR=29;FWDB=0.0340524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.382;QD=1.4842;RBI=0.0549259;REFB=-0.00602674;REVB=-0.0430963;RO=77;SAF=7;SAR=1;SRF=49;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335957;STB=0.788625;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0457669;OID=.;OPOS=20140361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:86:86:77:78:8:8:0.0930233:1:7:49:28:1:7:49:29
chr11	20140387	.	A	G	1482.61	PASS	AF=0.989583;AO=93;DP=95;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0224601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5552;QD=61.7753;RBI=0.024498;REFB=-0.0765041;REVB=0.00978236;RO=1;SAF=58;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133522;STB=0.506848;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00083284;OID=.;OPOS=20140387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:95:96:1:1:93:95:0.989583:35:58:0:1:36:59:0:1
chr11	20140471	.	A	G	1278.55	PASS	AF=0.988372;AO=84;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0944431;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.9331;QD=59.4674;RBI=0.0955705;REFB=-0.0224345;REVB=0.0146359;RO=2;SAF=51;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182123;STB=0.504761;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00193486;OID=.;OPOS=20140471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:86:86:2:1:84:85:0.988372:33:51:2:0:33:52:1:0
chr11	20142377	.	GTCAC	G	735.87	PASS	AF=1;AO=50;DP=59;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00751658;FXX=0.13557;HRUN=1;LEN=4;MLLD=318.55;QD=57.7149;RBI=0.00828918;REFB=0;REVB=0.00349451;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=8.38273e-06;OID=.;OPOS=20142378;OREF=TCAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:50:59:51:51:0:30:21:0:0:4:0:29:21:0:0
chr11	20142448	.	T	C	987.34	PASS	AF=0.958333;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0174259;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5639;QD=54.8523;RBI=0.0182212;REFB=-0.129035;REVB=0.00532452;RO=1;SAF=28;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165827;STB=0.525416;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00565255;OID=.;OPOS=20142448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:72:72:1:3:69:69:0.958333:41:28:1:0:41:28:3:0
chr11	20178717	.	G	T	284.66	PASS	AF=0.657895;AO=25;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.025171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7899;QD=29.9646;RBI=0.0580213;REFB=0.0298924;REVB=0.0522771;RO=13;SAF=10;SAR=15;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0606681;STB=0.533307;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=-0.0109274;OID=.;OPOS=20178717;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:13:13:25:25:0.657895:15:10:4:9:15:10:4:9
chr11	20529886	.	G	A	1510.72	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0046942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.444;QD=63.6094;RBI=0.0198634;REFB=0;REVB=-0.0193008;RO=0;SAF=56;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.99073e-05;OID=.;OPOS=20529886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:39:56:0:0:39:56:0:0
chr11	20623023	.	C	T	583.01	PASS	AF=0.975;AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0537586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.648;QD=58.3005;RBI=0.0720854;REFB=-0.00508429;REVB=0.0480242;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511622;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000250278;OID=.;OPOS=20623023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:40:0:1:36:39:0.975:17:19:0:0:18:21:1:0
chr11	20623042	.	T	C	734.41	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0260019;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.334;QD=61.2012;RBI=0.0261718;REFB=-0.0915838;REVB=0.00297706;RO=1;SAF=28;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016502;STB=0.508768;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000235168;OID=.;OPOS=20623042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:1:1:47:47:0.979167:19:28:1:0:19:28:1:0
chr11	20623156	.	C	G	851.33	PASS	AF=1;AO=48;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452964;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0144;QD=57.7176;RBI=0.201481;REFB=0;REVB=0.196323;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00241978;OID=.;OPOS=20623156;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:48:59:1:22:26:0:0:32:27:0:0
chr11	20629164	.	G	A	272.02	PASS	AF=0.47619;AO=30;DP=63;FAO=30;FDP=63;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0416863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.511;QD=17.2711;RBI=0.0511727;REFB=-0.00540209;REVB=-0.02968;RO=32;SAF=11;SAR=19;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126936;STB=0.580098;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00807341;OID=.;OPOS=20629164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:32:33:30:30:0.47619:19:11:16:16:19:11:17:16
chr11	20639400	.	A	G,T	1302.35	PASS	AF=0.897727,0.0909091;AO=78,8;DP=88;FAO=79,8;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=35,8;FSAR=44,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0101326,-0.0644435;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=57.5053,97.5457;QD=59.1978;RBI=0.0124088,0.0691511;REFB=-0.103368,-0.130897;REVB=-0.00716298,-0.0250781;RO=0;SAF=35,8;SAR=43,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=6.91087e-08,0;STB=0.505617,0.997736;STBP=0.514,0.046;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00145966,0.213819;OID=.,.;OPOS=20639400,20639400;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:31:88:88:0:1:78,8:79,8:0.897727,0.0909091:43,0:35,8:0:0:44,0:35,8:0:1
chr11	20673867	.	G	A	2792.97	PASS	AF=1;AO=175;DP=178;FAO=178;FDP=178;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433004;FXX=0.0165737;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.856;QD=62.7634;RBI=0.0433006;REFB=0;REVB=9.82712e-05;RO=0;SAF=106;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.77801e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124565;OID=.;OPOS=20673867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:178:178:0:0:175:178:1:69:106:0:0:70:108:0:0
chr11	20805286	.	G	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00256763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.182;QD=47.8222;RBI=0.0480634;REFB=0;REVB=-0.0479948;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000375761;OID=.;OPOS=20805286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr11	21305927	.	T	C	1936.11	PASS	AF=0.992188;AO=126;DP=128;FAO=127;FDP=128;FR=.;FRO=1;FSAF=65;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0282345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.089;QD=60.5035;RBI=0.0358468;REFB=-0.124254;REVB=0.0220863;RO=0;SAF=64;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.29882e-08;STB=0.503816;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00052948;OID=.;OPOS=21305927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:128:128:0:1:126:127:0.992188:62:64:0:0:62:65:1:0
chr11	21581805	.	C	T	1154.91	PASS	AF=0.952381;AO=70;DP=73;FAO=80;FDP=84;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.105655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.6492;QD=54.9958;RBI=0.112237;REFB=-0.0144512;REVB=0.0378726;RO=2;SAF=41;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00463189;STB=0.51803;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.000377991;OID=.;OPOS=21581805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:73:84:2:4:70:80:0.952381:29:41:1:1:31:49:1:3
chr11	22242729	.	T	C	609.23	PASS	AF=0.56701;AO=54;DP=96;FAO=55;FDP=97;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.070981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.948;QD=25.1228;RBI=0.0723454;REFB=-0.0226371;REVB=0.013984;RO=42;SAF=26;SAR=28;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999608;STB=0.550454;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0186926;OID=.;OPOS=22242729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:42:42:54:55:0.56701:28:26:15:27:29:26:15:27
chr11	22696451	.	A	G	853.65	PASS	AF=1;AO=50;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000243723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.731;QD=57.8748;RBI=0.178897;REFB=0;REVB=0.178897;RO=0;SAF=39;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000440801;OID=.;OPOS=22696451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:50:59:1:11:39:0:0:20:39:0:0
chr11	22709973	.	C	A	1713.2	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.6695;QD=60.6441;RBI=0.0472872;REFB=0;REVB=-0.0356242;RO=0;SAF=62;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31804e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000218521;OID=.;OPOS=22709973;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:51:62:0:0:51:62:0:0
chr11	22834189	.	C	T	341.81	PASS	AF=0.486486;AO=36;DP=74;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0519245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9891;QD=18.4764;RBI=0.0937667;REFB=-0.00539794;REVB=-0.0780771;RO=37;SAF=15;SAR=21;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397141;STB=0.5298;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.00345196;OID=.;OPOS=22834189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:37:38:36:36:0.486486:21:15:17:20:21:15:18:20
chr11	22881002	.	C	T	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.236;QD=58.0606;RBI=0.0165237;REFB=0;REVB=0.00924174;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.75121e-05;OID=.;OPOS=22881002;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:27:34:0:0:27:34:0:0
chr11	24784862	.	A	T	2331.1	PASS	AF=1;AO=150;DP=150;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.236;QD=60.9437;RBI=0.0595608;REFB=0;REVB=0.035135;RO=0;SAF=71;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.75918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.09006e-05;OID=.;OPOS=24784862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:153:0:0:150:153:1:79:71:0:0:80:73:0:0
chr11	25098938	.	G	C	2372.3	PASS	AF=1;AO=136;DP=141;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0969652;FXX=0.0133324;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5713;QD=64.1162;RBI=0.100837;REFB=0;REVB=-0.0276746;RO=0;SAF=38;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65333e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.78017e-05;OID=.;OPOS=25098938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:141:148:0:0:136:148:1:98:38:0:0:98:50:0:0
chr11	26481611	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.252;QD=52.6132;RBI=0.0151005;REFB=0;REVB=-0.00259125;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89366e-05;OID=.;OPOS=26481611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr11	26568966	.	A	G	2667.55	PASS	AF=0.99422;AO=172;DP=175;FAO=172;FDP=173;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=104;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00487424;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.546;QD=61.6773;RBI=0.00622577;REFB=-0.00468629;REVB=0.00387324;RO=0;SAF=68;SAR=104;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502392;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=-0.00017626;OID=.;OPOS=26568966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:175:173:0:1:172:172:0.99422:104:68:0:0:104:68:0:1
chr11	26621117	.	A	C	711.05	PASS	AF=0.4375;AO=77;DP=176;FAO=77;FDP=176;FR=.;FRO=99;FSAF=26;FSAR=51;FSRF=53;FSRR=46;FWDB=-0.00415275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.558;QD=16.1602;RBI=0.00505614;REFB=-0.0188084;REVB=-0.0028843;RO=99;SAF=26;SAR=51;SRF=53;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205906;STB=0.61499;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0249096;OID=.;OPOS=26621117;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:176:99:99:77:77:0.4375:51:26:53:46:51:26:53:46
chr11	26677947	.	C	T	413.74	PASS	AF=0.43;AO=42;DP=99;FAO=43;FDP=100;FR=.;FRO=57;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=-0.0105879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9582;QD=16.5494;RBI=0.0508465;REFB=-0.00831877;REVB=-0.0497319;RO=57;SAF=25;SAR=17;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142938;STB=0.585326;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00655925;OID=.;OPOS=26677947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:57:57:42:43:0.43:17:25:26:31:17:26:26:31
chr11	26692733	.	T	C	1264.55	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016163;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.052;QD=61.6853;RBI=0.021463;REFB=0;REVB=-0.0141216;RO=0;SAF=37;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00019663;OID=.;OPOS=26692733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:45:37:0:0:45:37:0:0
chr11	26692742	.	G	A	1283.42	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.052;QD=61.8516;RBI=0.0245396;REFB=0;REVB=-0.0217993;RO=0;SAF=37;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.68156e-05;OID=.;OPOS=26692742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:46:37:0:0:46:37:0:0
chr11	26702664	.	C	T	1283.39	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0451007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3948;QD=61.8503;RBI=0.0504894;REFB=0;REVB=-0.0226959;RO=0;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000441369;OID=.;OPOS=26702664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:41:42:0:0:41:42:0:0
chr11	27017607	.	C	G	142.6	PASS	AF=0.289855;AO=20;DP=69;FAO=20;FDP=69;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=2;FSRF=29;FSRR=20;FWDB=0.00577989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.512;QD=8.26657;RBI=0.0078354;REFB=-0.0166935;REVB=0.00529022;RO=49;SAF=18;SAR=2;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.496601;STB=0.807786;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0328445;OID=.;OPOS=27017607;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:49:49:20:20:0.289855:2:18:29:20:2:18:29:20
chr11	27018019	.	G	A	246.85	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0175118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.992;QD=17.953;RBI=0.0775014;REFB=-0.0104718;REVB=-0.0754971;RO=26;SAF=18;SAR=9;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125827;STB=0.506844;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.00694287;OID=.;OPOS=27018019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:26:28:27:27:0.490909:9:18:17:9:9:18:19:9
chr11	27018202	.	T	C	251.88	PASS	AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0173095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2377;QD=27.2306;RBI=0.0756801;REFB=-0.00696898;REVB=0.073674;RO=14;SAF=12;SAR=11;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034087;STB=0.518852;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00656013;OID=.;OPOS=27018202;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:14:14:23:23:0.621622:11:12:8:6:11:12:8:6
chr11	27018626	.	G	A	553.58	PASS	AF=0.553191;AO=51;DP=94;FAO=52;FDP=94;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.00215801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.148;QD=23.5565;RBI=0.00810848;REFB=-0.00651377;REVB=0.00781604;RO=42;SAF=14;SAR=37;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815637;STB=0.547695;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.00548135;OID=.;OPOS=27018626;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:42:42:51:52:0.553191:37:14:15:27:38:14:15:27
chr11	27077118	.	C	T	1541.93	PASS	AF=0.981308;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00836589;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.805;QD=57.6421;RBI=0.0196752;REFB=-0.0426681;REVB=0.017808;RO=2;SAF=47;SAR=58;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00187793;STB=0.50099;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.00121641;OID=.;OPOS=27077118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:107:107:2:2:105:105:0.981308:58:47:1:1:58:47:1:1
chr11	27388073	.	ATTTTTTTAG	ATTTTTTAG,ATTTTTTAGT,ATTTTTTTAGT	65.96	PASS	AF=0.126984,0.0793651,0.111111;AO=15,6,8;DP=65;FAO=8,5,7;FDP=63;FR=.;FRO=43;FSAF=1,5,7;FSAR=7,0,0;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.170546,-0.114137,-0.0443042;FXX=0.0307645;HRUN=7,7,1;LEN=1,3,1;MLLD=7.98229,19.2713,16.934;QD=4.18775;RBI=0.189884,0.114197,0.0887363;REFB=-0.0892958,-0.0498377,-0.0112692;REVB=0.0834866,-0.00371702,-0.0768848;RO=28;SAF=7,6,8;SAR=8,0,0;SRF=16;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.114947,0.665535,0.712324;STB=0.869708,0.997592,0.998232;STBP=0.034,0.025,0.008;TYPE=del,mnp,ins;VARB=0.0558235,0.0632448,0.0284712;OID=.,.,.;OPOS=27388074,27388080,27388083;OREF=T,TAG,-;OALT=-,AGT,T;OMAPALT=ATTTTTTAG,ATTTTTTAGT,ATTTTTTTAGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.126984,0.0793651,0.111111:15,6,8:65:8,5,7:63:43:1,5,7:7,0,0:24:19:23:28:7,6,8:8,0,0:16:12
chr11	27390089	.	T	C	918.68	PASS	AF=0.984848;AO=63;DP=64;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.024213;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.927;QD=55.6777;RBI=0.0303995;REFB=-0.063641;REVB=-0.0183809;RO=1;SAF=36;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171678;STB=0.508472;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.000403252;OID=.;OPOS=27390089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:66:1:1:63:65:0.984848:27:36:0:1:29:36:0:1
chr11	27517670	.	T	C	33.46	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0251202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.582;QD=19.122;RBI=0.0251203;REFB=-0.00310032;REVB=7.34871e-05;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212944;STB=0.62455;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.00564613;OID=.;OPOS=27517670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:3:2:0:2:3:2:0:2
chr11	27679662	.	T	C	1470.95	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.463;QD=63.2669;RBI=0.0734177;REFB=0;REVB=0.0637819;RO=0;SAF=43;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138507;OID=.;OPOS=27679662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:88:93:0:0:87:93:1:44:43:0:0:49:44:0:0
chr11	27679916	.	C	T	293.69	PASS	AF=0.365591;AO=34;DP=93;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=29;FWDB=0.0148616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.439;QD=12.632;RBI=0.0187235;REFB=-0.00589737;REVB=-0.0113887;RO=58;SAF=14;SAR=20;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116775;STB=0.561905;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.00989577;OID=.;OPOS=27679916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:58:59:34:34:0.365591:20:14:30:28:20:14:30:29
chr11	28057957	.	T	C	240.74	PASS	AF=0.358025;AO=29;DP=81;FAO=29;FDP=81;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=0.0033642;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3117;QD=11.8882;RBI=0.054671;REFB=0.00399223;REVB=0.0545674;RO=51;SAF=17;SAR=12;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199421;STB=0.518732;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=-0.00960501;OID=.;OPOS=28057957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:51:52:29:29:0.358025:12:17:29:22:12:17:29:23
chr11	28098605	.	T	C	170.62	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00469723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.467;QD=17.0622;RBI=0.0311823;REFB=-0.0196686;REVB=-0.0308265;RO=22;SAF=11;SAR=7;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276419;STB=0.657439;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0143533;OID=.;OPOS=28098605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:7:11:7:15:7:11:7:15
chr11	28110151	.	T	C	243.16	PASS	AF=0.408451;AO=26;DP=68;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.0368308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1605;QD=13.6991;RBI=0.0382595;REFB=-0.00526891;REVB=-0.0103577;RO=39;SAF=15;SAR=11;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0947037;STB=0.586896;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0113602;OID=.;OPOS=28110151;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:71:39:42:26:29:0.408451:11:15:19:20:11:18:20:22
chr11	28119403	.	T	C	94.25	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.0137933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.772;QD=10.4723;RBI=0.0206355;REFB=-0.0100734;REVB=0.0153483;RO=24;SAF=9;SAR=3;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45341e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0177737;OID=.;OPOS=28119403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:3:9:18:6:3:9:18:6
chr11	28134974	.	C	A	56.05	PASS	AF=0.16129;AO=10;DP=62;FAO=10;FDP=62;FR=.;FRO=52;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=-0.0175781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.676;QD=3.61593;RBI=0.0177655;REFB=-0.00111875;REVB=0.00257378;RO=52;SAF=6;SAR=4;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972928;STB=0.565392;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=0.00465828;OID=.;OPOS=28134974;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:62:62:52:52:10:10:0.16129:4:6:35:17:4:6:35:17
chr11	30255185	.	C	T	1135.25	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00573711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.751;QD=60.5465;RBI=0.020652;REFB=0;REVB=0.0198392;RO=0;SAF=41;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92368e-05;OID=.;OPOS=30255185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:34:41:0:0:34:41:0:0
chr11	30432220	.	A	T	737.36	PASS	AF=0.467066;AO=78;DP=167;FAO=78;FDP=167;FR=.;FRO=89;FSAF=33;FSAR=45;FSRF=41;FSRR=48;FWDB=-0.0821024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9774;QD=17.6613;RBI=0.108684;REFB=-0.0140759;REVB=0.0712143;RO=85;SAF=33;SAR=45;SRF=40;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455323;STB=0.520389;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0172174;OID=.;OPOS=30432220;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:167:85:89:78:78:0.467066:45:33:40:45:45:33:41:48
chr11	30965855	.	A	T	196.81	PASS	AF=0.342466;AO=25;DP=74;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.00593468;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.705;QD=10.7839;RBI=0.0501663;REFB=-1.15673e-05;REVB=-0.049814;RO=48;SAF=10;SAR=15;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435992;STB=0.525403;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.000251996;OID=.;OPOS=30965855;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:48:48:25:25:0.342466:15:10:21:27:15:10:21:27
chr11	30974115	.	C	A	362.51	PASS	AF=0.521127;AO=36;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0288915;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5715;QD=20.4231;RBI=0.0552101;REFB=-0.0164238;REVB=-0.0470472;RO=35;SAF=22;SAR=14;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626029;STB=0.545861;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0139525;OID=.;OPOS=30974115;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:35:34:36:37:0.521127:14:22:19:16:14:23:18:16
chr11	31458730	.	T	G	446.87	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.217;QD=57.6602;RBI=0.0417381;REFB=0;REVB=0.0238454;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000630653;OID=.;OPOS=31458730;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr11	31838128	.	G	A	197.79	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0242637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.636;QD=14.6512;RBI=0.0325763;REFB=-0.0188473;REVB=0.0217368;RO=30;SAF=12;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216143;STB=0.52172;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0243841;OID=.;OPOS=31838128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:31:23:23:0.425926:11:12:15:15:11:12:15:16
chr11	32124579	.	C	T	135.88	PASS	AF=0.321429;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0322651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.74;QD=9.70536;RBI=0.0323728;REFB=-0.000166458;REVB=0.0026385;RO=38;SAF=6;SAR=12;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225561;STB=0.633994;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=5.04737e-05;OID=.;OPOS=32124579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:38:38:18:18:0.321429:12:6:20:18:12:6:20:18
chr11	32124978	.	T	C	337.13	PASS	AF=0.566667;AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0047432;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2164;QD=22.4753;RBI=0.0116617;REFB=-0.0233;REVB=0.0106535;RO=26;SAF=15;SAR=19;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016175;STB=0.508923;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0178608;OID=.;OPOS=32124978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:26:26:34:34:0.566667:19:15:12:14:19:15:12:14
chr11	32125961	.	C	T	191.55	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00966048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.955;QD=15.6367;RBI=0.0395151;REFB=-0.0114599;REVB=-0.0383161;RO=29;SAF=7;SAR=13;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210881;STB=0.621498;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0215854;OID=.;OPOS=32125961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:13:7:16:13:13:7:16:13
chr11	32722320	.	A	T	882.68	PASS	AF=0.809091;AO=71;DP=99;FAO=89;FDP=110;FR=.;FRO=21;FSAF=51;FSAR=38;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.053922;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=35.2771;QD=32.0974;RBI=0.0860842;REFB=-0.153451;REVB=0.0671037;RO=26;SAF=45;SAR=26;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303122;STB=0.518359;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0163883;OID=.;OPOS=32722320;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:99:110:26:21:71:89:0.809091:26:45:15:11:38:51:14:7
chr11	32954344	.	G	A	954.21	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0166223;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.103;QD=58.7205;RBI=0.0186203;REFB=0;REVB=0.00839123;RO=0;SAF=25;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.64173e-05;OID=.;OPOS=32954344;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:40:25:0:0:40:25:0:0
chr11	32956244	.	A	G	160.31	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.091;QD=45.8035;RBI=0.0609713;REFB=0;REVB=0.0575288;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165263;OID=.;OPOS=32956244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0
chr11	32956620	.	A	G	635.17	PASS	AF=0.914894;AO=43;DP=47;FAO=43;FDP=47;FR=.;FRO=4;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0259065;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.212;QD=54.0567;RBI=0.0261249;REFB=-0.0182996;REVB=-0.00337111;RO=2;SAF=21;SAR=22;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426412;STB=0.522245;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.00122883;OID=.;OPOS=32956620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:47:47:2:4:43:43:0.914894:22:21:2:0:22:21:3:1
chr11	33054958	.	A	G	267.36	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0231539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9904;QD=18.4384;RBI=0.0231933;REFB=-0.0029719;REVB=0.00135043;RO=29;SAF=18;SAR=11;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126275;STB=0.570682;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00692201;OID=.;OPOS=33054958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:11:18:14:15:11:18:14:15
chr11	33076191	.	T	C	740.42	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.265;QD=56.9554;RBI=0.0386904;REFB=0;REVB=0.0328725;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328228;OID=.;OPOS=33076191;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:19:33:0:0:19:33:0:0
chr11	33106616	.	C	T	364.03	PASS	AF=0.398148;AO=43;DP=108;FAO=43;FDP=108;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.0134101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.66;QD=13.4826;RBI=0.0196563;REFB=-0.00459328;REVB=-0.0143715;RO=65;SAF=24;SAR=19;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00462045;STB=0.502617;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.00630924;OID=.;OPOS=33106616;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:65:65:43:43:0.398148:19:24:36:29:19:24:36:29
chr11	33129997	.	C	T	187.34	PASS	AF=0.294118;AO=25;DP=85;FAO=25;FDP=85;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=-0.0137606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.708;QD=8.81584;RBI=0.0449373;REFB=-0.0060903;REVB=-0.0427786;RO=59;SAF=12;SAR=13;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133966;STB=0.584204;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.024341;OID=.;OPOS=33129997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:59:60:25:25:0.294118:13:12:35:24:13:12:36:24
chr11	33564123	.	T	C	417.96	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0605972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.107;QD=53.9306;RBI=0.0771117;REFB=-0.0355449;REVB=0.0476884;RO=1;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321345;STB=0.51723;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00206572;OID=.;OPOS=33564123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:14:16:0:1:14:16:0:1
chr11	33565593	.	C	T	834.23	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00227457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.262;QD=57.533;RBI=0.0221086;REFB=0;REVB=0.0219913;RO=0;SAF=35;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.54585e-05;OID=.;OPOS=33565593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:23:35:0:0:23:35:0:0
chr11	33581306	.	G	A	769.39	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00325469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3724;QD=56.9919;RBI=0.0266651;REFB=0;REVB=-0.0264657;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000163153;OID=.;OPOS=33581306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:30:24:0:0:30:24:0:0
chr11	33604885	.	C	T	233.45	PASS	AF=0.435484;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0103474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.805;QD=15.061;RBI=0.0127711;REFB=-0.0204756;REVB=0.00748549;RO=35;SAF=15;SAR=12;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0979716;STB=0.555514;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.031472;OID=.;OPOS=33604885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:35:27:27:0.435484:12:15:16:19:12:15:16:19
chr11	33604960	.	C	T	270.75	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=0.0455448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.184;QD=16.9221;RBI=0.0503515;REFB=-0.0189294;REVB=0.0214698;RO=34;SAF=15;SAR=15;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111426;STB=0.562459;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0215678;OID=.;OPOS=33604960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:15:15:13:21:15:15:13:21
chr11	33631423	.	G	A	254.37	PASS	AF=0.519231;AO=23;DP=47;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.00733284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.734;QD=19.5667;RBI=0.0352069;REFB=-0.0189954;REVB=0.0344348;RO=24;SAF=14;SAR=9;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13796;STB=0.500713;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0179089;OID=.;OPOS=33631423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:52:24:25:23:27:0.519231:9:14:11:13:14:13:12:13
chr11	33640104	.	A	C	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.872;QD=62.021;RBI=0.018366;REFB=0;REVB=0.0106245;RO=0;SAF=29;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.36943e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.88929e-05;OID=.;OPOS=33640104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:13:29:0:0:13:29:0:0
chr11	33667333	.	A	G	169.77	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0287037;FXX=0.0377287;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.798;QD=13.3152;RBI=0.0292603;REFB=-0.0177683;REVB=0.0056798;RO=30;SAF=12;SAR=8;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173384;STB=0.59046;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0326826;OID=.;OPOS=33667333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:51:30:31:20:20:0.392157:8:12:13:17:8:12:14:17
chr11	33680371	.	C	T	186.01	PASS	AF=0.287356;AO=25;DP=87;FAO=25;FDP=87;FR=.;FRO=62;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=43;FSRR=19;FWDB=0.0442374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.411;QD=8.55232;RBI=0.0459028;REFB=-0.0111122;REVB=-0.0122526;RO=62;SAF=12;SAR=13;SRF=43;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256241;STB=0.650481;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0190486;OID=.;OPOS=33680371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:62:62:25:25:0.287356:13:12:43:19:13:12:43:19
chr11	33775982	.	A	G	245.51	PASS	AF=0.709677;AO=22;DP=31;FAO=22;FDP=31;FR=.;FRO=9;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0243773;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=38.4049;QD=31.6788;RBI=0.117063;REFB=0.00261991;REVB=0.114497;RO=8;SAF=18;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141078;STB=0.567501;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.000728617;OID=.;OPOS=33775982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:31:31:8:9:22:22:0.709677:4:18:5:3:4:18:6:3
chr11	33881016	.	T	C	615.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0933315;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.774;QD=60.0542;RBI=0.100256;REFB=0;REVB=0.0366136;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146204;OID=.;OPOS=33881016;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:36:41:1:24:12:0:0:24:17:0:0
chr11	34122369	.	G	T	2034.5	PASS	AF=0.985075;AO=132;DP=134;FAO=132;FDP=134;FR=.;FRO=2;FSAF=79;FSAR=53;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00414509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.547;QD=60.7314;RBI=0.00579879;REFB=0.0496799;REVB=0.00405515;RO=2;SAF=79;SAR=53;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118801;STB=0.506249;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.00071548;OID=.;OPOS=34122369;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:134:134:2:2:132:132:0.985075:53:79:2:0:53:79:2:0
chr11	34152939	.	T	C	855.91	PASS	AF=1;AO=59;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.005691;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.218;QD=55.2198;RBI=0.0887602;REFB=-0.0685725;REVB=0.0885776;RO=0;SAF=32;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135431;OID=.;OPOS=34152939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:62:62:0:0:59:62:1:27:32:0:0:29:33:0:0
chr11	34154641	.	C	T	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162224;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.6363;QD=57.2018;RBI=0.0314137;REFB=0;REVB=-0.0269008;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100389;OID=.;OPOS=34154641;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0
chr11	34482908	.	C	T	588.42	PASS	AF=0.595506;AO=53;DP=89;FAO=53;FDP=89;FR=.;FRO=36;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0640736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.724;QD=26.446;RBI=0.0641258;REFB=-0.0161873;REVB=-0.00258696;RO=35;SAF=33;SAR=20;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103181;STB=0.551431;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0121752;OID=.;OPOS=34482908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:35:36:53:53:0.595506:20:33:17:18:20:33:18:18
chr11	34501596	.	A	G	223.63	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.000899305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.237;QD=19.4465;RBI=0.014872;REFB=-0.0330544;REVB=-0.0148448;RO=23;SAF=13;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141866;STB=0.590826;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0356372;OID=.;OPOS=34501596;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:24:22:22:0.478261:9:13:10:13:9:13:10:14
chr11	34643955	.	G	A	426.6	PASS	AF=0.404959;AO=48;DP=120;FAO=49;FDP=121;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=0.0624214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.377;QD=14.1024;RBI=0.066687;REFB=-0.0107767;REVB=-0.0234676;RO=64;SAF=28;SAR=20;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0054457;STB=0.54715;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0177897;OID=.;OPOS=34643955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:64:72:48:49:0.404959:20:28:37:27:20:29:37:35
chr11	34668143	.	C	T	825.72	PASS	AF=0.609756;AO=68;DP=120;FAO=75;FDP=123;FR=.;FRO=48;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0309173;FXX=0.0238076;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.874;QD=26.8526;RBI=0.0339843;REFB=-0.0341806;REVB=0.0141087;RO=52;SAF=40;SAR=28;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00924714;STB=0.523484;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0210503;OID=.;OPOS=34668143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:123:52:48:68:75:0.609756:28:40:30:22:30:45:26:22
chr11	34680634	.	G	A	750.12	PASS	AF=0.948276;AO=55;DP=58;FAO=55;FDP=58;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0141203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.943;QD=51.7325;RBI=0.0141392;REFB=-0.171667;REVB=0.000732058;RO=3;SAF=35;SAR=20;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315679;STB=0.516772;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00231083;OID=.;OPOS=34680634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:58:58:3:3:55:55:0.948276:20:35:1:2:20:35:1:2
chr11	34680853	.	G	T	304.16	PASS	AF=0.414634;AO=34;DP=82;FAO=34;FDP=82;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=0.0137629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.943;QD=14.8373;RBI=0.0143584;REFB=-0.0287675;REVB=0.00409222;RO=47;SAF=13;SAR=21;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0685676;STB=0.546035;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0249123;OID=.;OPOS=34680853;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:47:48:34:34:0.414634:21:13:21:26:21:13:22:26
chr11	34909926	.	T	G	600.9	PASS	AF=0.572917;AO=53;DP=94;FAO=55;FDP=96;FR=.;FRO=41;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00514911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=366.332;QD=25.0376;RBI=0.00992539;REFB=-0.00839186;REVB=0.00848528;RO=41;SAF=25;SAR=28;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322721;STB=0.516869;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00636567;OID=.;OPOS=34909926;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:96:41:41:53:55:0.572917:28:25:21:20:29:26:21:20
chr11	34910397	.	C	T	263.81	PASS	AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0334131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.104;QD=12.8687;RBI=0.0347352;REFB=-0.0154839;REVB=-0.00949198;RO=48;SAF=23;SAR=8;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301687;STB=0.659317;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0255306;OID=.;OPOS=34910397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:48:51:31:31:0.378049:8:23:23:25:8:23:26:25
chr11	34918375	.	A	G	176.65	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.00594003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.97;QD=14.1318;RBI=0.0109629;REFB=-0.00205256;REVB=0.00921419;RO=30;SAF=12;SAR=7;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00199253;STB=0.509081;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.00334517;OID=.;OPOS=34918375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:31:19:19:0.38:7:12:19:11:7:12:20:11
chr11	34937813	.	G	A	239.48	PASS	AF=0.3625;AO=29;DP=79;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=37;FWDB=0.00176749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.163;QD=11.974;RBI=0.0188247;REFB=-0.0251509;REVB=-0.0187415;RO=48;SAF=15;SAR=14;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290843;STB=0.653191;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0220425;OID=.;OPOS=34937813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:48:51:29:29:0.3625:14:15:12:36:14:15:14:37
chr11	34937931	.	G	A	43.83	PASS	AF=0.25;AO=7;DP=28;FAO=7;FDP=28;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=19;FWDB=0.0120661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.435;QD=6.26137;RBI=0.0174726;REFB=-0.00888676;REVB=-0.0126373;RO=21;SAF=1;SAR=6;SRF=2;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129686;STB=0.581191;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0604825;OID=.;OPOS=34937931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:28:28:21:21:7:7:0.25:6:1:2:19:6:1:2:19
chr11	34938265	.	C	T	522.74	PASS	AF=0.505051;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=33;FSRR=16;FWDB=-0.00407069;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=193.166;QD=21.1209;RBI=0.00548592;REFB=-0.0281803;REVB=-0.00367762;RO=47;SAF=34;SAR=16;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00085831;STB=0.503702;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0269356;OID=.;OPOS=34938265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:47:49:50:50:0.505051:16:34:32:15:16:34:33:16
chr11	34963416	.	T	C	553.18	PASS	AF=0.450382;AO=55;DP=128;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=0.00161376;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165;QD=16.8908;RBI=0.0106184;REFB=-0.0165215;REVB=0.010495;RO=62;SAF=25;SAR=30;SRF=21;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112943;STB=0.541199;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0227429;OID=.;OPOS=34963416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:131:62:72:55:59:0.450382:30:25:21:41:30:29:30:42
chr11	34991727	.	T	C	179.69	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0642215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.4658;QD=15.6251;RBI=0.0645012;REFB=-0.000753222;REVB=0.00599997;RO=27;SAF=9;SAR=10;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158338;STB=0.590816;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00243809;OID=.;OPOS=34991727;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:10:9:17:10:10:9:17:10
chr11	34999745	.	C	G	165.05	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.0426066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3186;QD=14.0468;RBI=0.0434471;REFB=-0.00996393;REVB=-0.00850497;RO=29;SAF=4;SAR=14;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.436404;STB=0.754609;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0275603;OID=.;OPOS=34999745;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:29:18:18:0.382979:14:4:18:11:14:4:18:11
chr11	35017205	.	G	T	287.16	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.0311086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4651;QD=17.9474;RBI=0.0428573;REFB=-0.0209157;REVB=-0.0294789;RO=33;SAF=15;SAR=16;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223896;STB=0.624549;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0134491;OID=.;OPOS=35017205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:16:15:24:9:16:15:24:9
chr11	35017363	.	C	A	38.0	PASS	AF=0.4;AO=4;DP=13;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0154095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.936;QD=10.1332;RBI=0.0245453;REFB=-0.0259586;REVB=-0.0191054;RO=9;SAF=2;SAR=2;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300398;STB=0.666172;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0506659;OID=.;OPOS=35017363;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:13:15:9:9:4:6:0.4:2:2:2:7:3:3:2:7
chr11	35226155	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301984;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.427;QD=62.6711;RBI=0.0340408;REFB=0;REVB=0.0157109;RO=0;SAF=32;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.72728e-05;OID=.;OPOS=35226155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:12:32:0:0:12:32:0:0
chr11	35229673	.	T	C	1139.45	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00488968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.895;QD=59.192;RBI=0.023199;REFB=-0.119523;REVB=0.0226779;RO=0;SAF=46;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508195;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000486778;OID=.;OPOS=35229673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:30:46:0:0:30:46:0:1
chr11	35274829	.	A	G	2051.54	PASS	AF=1;AO=132;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0720441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3185;QD=60.3395;RBI=0.171095;REFB=-0.182602;REVB=0.155188;RO=3;SAF=56;SAR=76;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183895;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0047654;OID=.;OPOS=35274829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:135:136:3:0:132:136:1:76:56:0:3:80:56:0:0
chr11	36250770	.	AG	AGC,GC	49.01	PASS	AF=0.275,0;AO=10,2;DP=40;FAO=11,0;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=1,0;FSAR=10,0;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.192605,-0.0782107;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=17.1947,40.2308;QD=4.90067;RBI=0.213815,0.0993923;REFB=-0.0547165,-0.0133701;REVB=0.0928447,-0.0613344;RO=28;SAF=2,0;SAR=8,2;SRF=16;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.44891,-0.499993;STB=0.890323,0.5;STBP=0.008,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.115944,0;OID=.,.;OPOS=36250772,36250770;OREF=-,AG;OALT=C,GC;OMAPALT=AGC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:40:40:28:29:10,2:11,0:0.275,0:8,2:2,0:16:12:10,0:1,0:17:12
chr11	36293048	.	G	A	766.46	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.687;QD=63.872;RBI=0.0194586;REFB=0;REVB=0.00469893;RO=1;SAF=37;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125447;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.52137e-05;OID=.;OPOS=36293048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:1:0:47:48:1:10:37:1:0:10:38:0:0
chr11	36422792	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.652;QD=43.4862;RBI=0.0156577;REFB=0;REVB=0.00973968;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.73223e-05;OID=.;OPOS=36422792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr11	36472800	.	A	G	449.33	PASS	AF=0.462264;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=40;FSRR=17;FWDB=-0.0329977;FXX=0.00934492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5912;QD=16.9559;RBI=0.0467894;REFB=-0.0155054;REVB=-0.0331723;RO=56;SAF=28;SAR=21;SRF=40;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143502;STB=0.573005;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.013879;OID=.;OPOS=36472800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:106:56:57:49:49:0.462264:21:28:40:16:21:28:40:17
chr11	36484208	.	T	C	763.71	PASS	AF=0.982143;AO=53;DP=55;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0303376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.477;QD=54.5504;RBI=0.0489135;REFB=-0.0123005;REVB=0.0383688;RO=1;SAF=29;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159704;STB=0.508194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000311397;OID=.;OPOS=36484208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:56:1:1:53:55:0.982143:24:29:1:0:25:30:1:0
chr11	36595600	.	A	G	57.78	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0965749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8441;QD=13.5953;RBI=0.0993908;REFB=-0.0364847;REVB=-0.0234908;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162764;STB=0.596769;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0263244;OID=.;OPOS=36595600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:3:5:4:5:3:5:4:5
chr11	36597313	.	A	G	127.19	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0377046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0239;QD=11.5627;RBI=0.0590167;REFB=-0.00561929;REVB=0.0454019;RO=29;SAF=7;SAR=8;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0205681;STB=0.512179;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0196902;OID=.;OPOS=36597313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:8:7:13:16:8:7:13:16
chr11	36601170	.	G	A	231.91	PASS	AF=0.315217;AO=29;DP=92;FAO=29;FDP=92;FR=.;FRO=63;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=-0.0484831;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0357;QD=10.0831;RBI=0.0512474;REFB=-0.00646277;REVB=-0.0166036;RO=56;SAF=20;SAR=9;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244315;STB=0.660917;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0130647;OID=.;OPOS=36601170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:56:63:29:29:0.315217:9:20:27:29:9:20:29:34
chr11	40137543	.	T	C	561.62	PASS	AF=0.468254;AO=59;DP=126;FAO=59;FDP=126;FR=.;FRO=67;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=0.0124998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.167;QD=17.8291;RBI=0.0182934;REFB=-0.0192249;REVB=0.0133568;RO=67;SAF=32;SAR=27;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00952287;STB=0.505287;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.0187921;OID=.;OPOS=40137543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:67:67:59:59:0.468254:27:32:37:30:27:32:37:30
chr11	41144553	.	C	T	581.27	PASS	AF=0.352041;AO=70;DP=196;FAO=69;FDP=196;FR=.;FRO=127;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=74;FSRR=53;FWDB=-0.062995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4955;QD=11.8627;RBI=0.0709458;REFB=-0.00930041;REVB=-0.0326336;RO=126;SAF=43;SAR=27;SRF=73;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411041;STB=0.517555;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0195957;OID=.;OPOS=41144553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:196:196:126:127:70:69:0.352041:27:43:73:53:27:42:74:53
chr11	43349348	.	T	C	302.65	PASS	AF=0.5625;AO=26;DP=47;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0626664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8361;QD=25.2211;RBI=0.0626779;REFB=-0.0309621;REVB=0.00119727;RO=21;SAF=14;SAR=12;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881223;STB=0.555514;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.014573;OID=.;OPOS=43349348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:21:21:26:27:0.5625:12:14:9:12:12:15:9:12
chr11	43876698	.	C	T	391.35	PASS	AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=6;FWDB=-0.0120809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8941;QD=22.0479;RBI=0.0194327;REFB=-0.0121067;REVB=-0.0152211;RO=32;SAF=28;SAR=11;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100486;STB=0.555113;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.011057;OID=.;OPOS=43876698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:32:32:39:39:0.549296:11:28:26:6:11:28:26:6
chr11	43905517	.	G	T	530.03	PASS	AF=0.478632;AO=56;DP=117;FAO=56;FDP=117;FR=.;FRO=61;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=40;FWDB=-0.00563808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.665;QD=18.1207;RBI=0.0446784;REFB=-0.00831698;REVB=-0.0443213;RO=61;SAF=30;SAR=26;SRF=21;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178746;STB=0.598877;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00601785;OID=.;OPOS=43905517;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:61:61:56:56:0.478632:26:30:21:40:26:30:21:40
chr11	43911365	.	T	C	670.2	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000265782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.81;QD=62.3445;RBI=0.0120996;REFB=0;REVB=0.0120967;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.95932e-05;OID=.;OPOS=43911365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0
chr11	43940644	.	G	T	447.61	PASS	AF=0.517647;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0142573;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.998;QD=21.064;RBI=0.0152851;REFB=-0.0264968;REVB=0.00551037;RO=41;SAF=14;SAR=30;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15899;STB=0.588194;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0209143;OID=.;OPOS=43940644;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:41:41:44:44:0.517647:30:14:20:21:30:14:20:21
chr11	43946967	.	A	G	1396.31	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00930425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.914;QD=62.7555;RBI=0.0315965;REFB=0;REVB=-0.0301956;RO=0;SAF=48;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000266094;OID=.;OPOS=43946967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:41:48:0:0:41:48:0:0
chr11	43947990	.	T	C	339.85	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011841;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.404;QD=54.3752;RBI=0.0357919;REFB=0;REVB=-0.0337765;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000367915;OID=.;OPOS=43947990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr11	43963905	.	G	C	37.69	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.147785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8652;QD=9.42225;RBI=0.158433;REFB=-0.00813909;REVB=0.0571004;RO=10;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267756;STB=0.666111;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0132052;OID=.;OPOS=43963905;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:4:2:6:4:4:2:6:4
chr11	44080210	.	T	C	1246.26	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.873;QD=61.5435;RBI=0.060069;REFB=0;REVB=0.0423323;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141204;OID=.;OPOS=44080210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:49:31:0:0:50:31:0:0
chr11	44092880	.	C	T	169.19	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.00593585;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=322.492;QD=13.0148;RBI=0.00757301;REFB=-0.0114014;REVB=-0.00470277;RO=32;SAF=9;SAR=11;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217008;STB=0.62488;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0202792;OID=.;OPOS=44092880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:32:32:20:20:0.384615:11:9:21:11:11:9:21:11
chr11	44096238	.	G	A	450.8	PASS	AF=0.969697;AO=30;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0506094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.277;QD=54.6422;RBI=0.053138;REFB=0.0301437;REVB=-0.0161967;RO=1;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0251989;STB=0.513505;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=-0.00145716;OID=.;OPOS=44096238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:30:32:0.969697:18:12:0:1:18:14:0:1
chr11	44104981	.	C	T	560.45	PASS	AF=0.690141;AO=48;DP=72;FAO=49;FDP=71;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=38;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0282705;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.105;QD=31.5748;RBI=0.0349506;REFB=-0.0606452;REVB=0.0205505;RO=21;SAF=11;SAR=37;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144504;STB=0.575289;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0261546;OID=.;OPOS=44104981;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:21:22:48:49:0.690141:37:11:9:12:38:11:9:13
chr11	44297054	.	T	C	2307.98	PASS	AF=1;AO=149;DP=150;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00450471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.415;QD=61.1385;RBI=0.0294496;REFB=0;REVB=0.0291031;RO=0;SAF=77;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80287e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.10185e-05;OID=.;OPOS=44297054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:151:0:0:149:151:1:72:77:0:0:73:78:0:0
chr11	44331309	.	G	A	130.76	PASS	AF=1;AO=10;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0773363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4449;QD=43.585;RBI=0.129282;REFB=0;REVB=0.103599;RO=0;SAF=9;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00680906;OID=.;OPOS=44331309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:10:12:1:1:9:0:0:2:10:0:0
chr11	44331509	.	C	G	791.98	PASS	AF=0.966102;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0327241;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.946;QD=53.6937;RBI=0.034687;REFB=0.0232777;REVB=0.0115029;RO=1;SAF=11;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0409364;STB=0.538447;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.000964801;OID=.;OPOS=44331509;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:59:1:2:56:57:0.966102:45:11:1:0:45:12:2:0
chr11	44636833	.	G	A	733.92	PASS	AF=0.484472;AO=72;DP=155;FAO=78;FDP=161;FR=.;FRO=83;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=46;FSRR=37;FWDB=0.0074549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.611;QD=18.234;RBI=0.00840787;REFB=-0.0149969;REVB=-0.00388803;RO=83;SAF=39;SAR=33;SRF=46;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122177;STB=0.501529;STBP=0.972;TYPE=snp;VARB=0.0151717;OID=.;OPOS=44636833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:161:83:83:72:78:0.484472:33:39:46:37:35:43:46:37
chr11	44636839	.	C	T	798.83	PASS	AF=0.5125;AO=79;DP=161;FAO=82;FDP=160;FR=.;FRO=78;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=0.0256646;FXX=0.00621079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.87;QD=19.9708;RBI=0.0256842;REFB=-0.0221769;REVB=0.00100289;RO=76;SAF=46;SAR=33;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015071;STB=0.50479;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.00948812;OID=.;OPOS=44636839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:160:76:78:79:82:0.5125:33:46:43:33:36:46:43:35
chr11	44640268	.	A	G	115.2	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0328649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.966;QD=10.7159;RBI=0.0776401;REFB=-0.0165447;REVB=-0.0703412;RO=29;SAF=13;SAR=1;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.504585;STB=0.816549;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0236658;OID=.;OPOS=44640268;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:1:13:19:10:1:13:19:10
chr11	44640640	.	C	G	848.78	PASS	AF=0.472826;AO=86;DP=182;FAO=87;FDP=184;FR=.;FRO=97;FSAF=56;FSAR=31;FSRF=51;FSRR=46;FWDB=0.00769038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.515;QD=18.4518;RBI=0.0117266;REFB=-0.0065492;REVB=-0.00885269;RO=96;SAF=56;SAR=30;SRF=51;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12056;STB=0.565196;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00646392;OID=.;OPOS=44640640;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:182:184:96:97:86:87:0.472826:30:56:51:45:31:56:51:46
chr11	44924950	.	GC	G,GG	2193.59	PASS	AF=0.958042,0.041958;AO=133,9;DP=143;FAO=137,6;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=75,3;FSAR=62,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411525,0.0269126;FXX=0.00694396;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=114.383,99.49;QD=61.3591;RBI=0.0422289,0.0274374;REFB=0,0;REVB=0.00947339,0.00534082;RO=0;SAF=72,6;SAR=61,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.79172e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000438539,-0.0514663;OID=.,.;OPOS=44924951,44924951;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.958042,0.041958:133,9:143:137,6:143:0:75,3:62,3:0:0:11:0:72,6:61,3:0:0
chr11	44940828	.	G	A	668.88	PASS	AF=1;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256557;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.636;QD=62.221;RBI=0.0260369;REFB=0;REVB=0.00443947;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170282;OID=.;OPOS=44940828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:42:43:1:15:27:0:0:16:27:0:0
chr11	45670395	.	C	T	363.23	PASS	AF=0.62;AO=30;DP=49;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0221757;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.543;QD=29.0581;RBI=0.0272798;REFB=-0.0182465;REVB=-0.0158879;RO=19;SAF=17;SAR=13;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124698;STB=0.57327;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0104246;OID=.;OPOS=45670395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:19:19:30:31:0.62:13:17:14:5:14:17:14:5
chr11	45671329	.	TGGG	TGG,TGGC	76.24	PASS	AF=0.324324,0.0810811;AO=12,3;DP=37;FAO=12,3;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=4,2;FSAR=8,1;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00258934,0.0276522;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=15.3045,25.7764;QD=8.24223;RBI=0.0554217,0.0303615;REFB=-0.153898,-0.0745594;REVB=-0.0553612,-0.0125372;RO=21;SAF=4,2;SAR=8,1;SRF=10;SRR=11;SSEN=0.501577,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.160135,0.205794;STB=0.612053,0.64765;STBP=0.37,0.673;TYPE=del,snp;VARB=0.162954,0.174829;OID=.,.;OPOS=45671330,45671332;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=TGG,TGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.324324,0.0810811:12,3:37:12,3:37:22:4,2:8,1:11:11:61:21:4,2:8,1:10:11
chr11	45672261	.	A	G	127.93	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=0.022937;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.621;QD=11.3714;RBI=0.064571;REFB=-0.0226523;REVB=-0.0603598;RO=30;SAF=6;SAR=9;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207466;STB=0.621214;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0285978;OID=.;OPOS=45672261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:9:6:7:23:9:6:7:23
chr11	45793218	.	G	C	1416.67	PASS	AF=0.952381;AO=99;DP=104;FAO=100;FDP=105;FR=.;FRO=5;FSAF=62;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0118034;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.1064;QD=53.9684;RBI=0.0963475;REFB=-0.184302;REVB=0.0956218;RO=5;SAF=62;SAR=37;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409854;STB=0.521004;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00830077;OID=.;OPOS=45793218;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:104:105:5:5:99:100:0.952381:37:62:1:4:38:62:1:4
chr11	45935384	.	A	G	265.26	PASS	AF=0.441176;AO=30;DP=68;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0308624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.072;QD=15.6035;RBI=0.0884085;REFB=-0.00479901;REVB=-0.0828467;RO=37;SAF=15;SAR=15;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0927095;STB=0.544088;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00458575;OID=.;OPOS=45935384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:37:38:30:30:0.441176:15:15:15:22:15:15:16:22
chr11	45937267	.	C	T	109.05	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0264463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.648;QD=36.3492;RBI=0.0546934;REFB=-0.0881255;REVB=0.0478744;RO=1;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0815441;STB=0.545372;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.00404972;OID=.;OPOS=45937267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:5:6:0:1:5:6:0:1
chr11	45949534	.	C	T	124.55	PASS	AF=0.421053;AO=13;DP=36;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0241098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3165;QD=13.1109;RBI=0.0301373;REFB=-0.0294366;REVB=0.0180824;RO=21;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652316;STB=0.509987;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0598607;OID=.;OPOS=45949534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:38:21:22:13:16:0.421053:7:6:11:10:7:9:12:10
chr11	45975130	.	C	T	1449.01	PASS	AF=0.99;AO=97;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0105508;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.029;QD=57.9606;RBI=0.0450926;REFB=-0.122205;REVB=0.0438409;RO=1;SAF=29;SAR=68;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0069245;STB=0.503545;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.000215574;OID=.;OPOS=45975130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:100:100:1:1:97:99:0.99:68:29:0:1:70:29:0:1
chr11	46342081	.	TGGGGT	TGGGT,TGGGTG	704.23	PASS	AF=1,0;AO=46,4;DP=63;FAO=59,0;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=29,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.149524,-0.132089;FXX=0.063482;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=16.4834,5.91343;QD=47.7444;RBI=0.170106,0.134237;REFB=0,0;REVB=0.0811088,-0.0239216;RO=2;SAF=24,2;SAR=22,2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0408345,0.277405;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.00114365,0;OID=.,.;OPOS=46342082,46342085;OREF=G,GT;OALT=-,TG;OMAPALT=TGGGT,TGGGTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:46,4:63:59,0:59:0:30,0:29,0:0:0:4:2:24,2:22,2:0:2
chr11	46401517	.	A	G	186.23	PASS	AF=0.211268;AO=30;DP=142;FAO=30;FDP=142;FR=.;FRO=112;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=46;FSRR=66;FWDB=-0.0253826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.354;QD=5.24597;RBI=0.0259391;REFB=-0.00760911;REVB=0.00534461;RO=112;SAF=17;SAR=13;SRF=46;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196133;STB=0.621106;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0267309;OID=.;OPOS=46401517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:112:112:30:30:0.211268:13:17:46:66:13:17:46:66
chr11	46702920	.	T	C	1413.9	PASS	AF=0.968421;AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=95;FR=.;FRO=3;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00600048;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=230.655;QD=59.5328;RBI=0.00840181;REFB=0.038899;REVB=0.00588086;RO=2;SAF=39;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175518;STB=0.50293;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=-0.000176176;OID=.;OPOS=46702920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:95:95:2:3:92:92:0.968421:53:39:0:2:53:39:1:2
chr11	46724716	.	CAGTGGTGACAGAA	CA,CAGTGGAGTCTGCT	399.19	PASS	AF=0.9,0.0666667;AO=26,2;DP=33;FAO=27,2;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=12,0;FSAR=15,2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0317942,0.0318017;FXX=0.117612;HRUN=1,1;LEN=12,8;MLLD=393.513,237.954;QD=53.2252;RBI=0.0355602,0.0319298;REFB=-0.0124665,-0.012472;REVB=0.0159266,0.0028569;RO=1;SAF=12,0;SAR=14,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0371368,-0.697199;STB=0.519985,0.993266;STBP=0.324,0.232;TYPE=del,mnp;VARB=0.000775289,0.0139204;OID=.,.;OPOS=46724717,46724722;OREF=AGTGGTGACAGA,TGACAGAA;OALT=-,AGTCTGCT;OMAPALT=CA,CAGTGGAGTCTGCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.9,0.0666667:26,2:33:27,2:30:1:12,0:15,2:1:0:16:1:12,0:14,2:1:0
chr11	46745003	.	C	T	877.0	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403693;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.246;QD=56.5808;RBI=0.0624118;REFB=0;REVB=0.0475978;RO=0;SAF=41;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.92381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.003725;OID=.;OPOS=46745003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:62:0:0:57:62:1:16:41:0:0:20:42:0:0
chr11	46801502	.	T	C	447.44	PASS	AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0345735;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.05;QD=52.6403;RBI=0.0519887;REFB=-0.167057;REVB=0.0388266;RO=2;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0466437;STB=0.524985;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00274098;OID=.;OPOS=46801502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:34:34:2:2:32:32:0.941176:19:13:0:2:19:13:0:2
chr11	46879990	.	T	C	632.15	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.65;QD=61.673;RBI=0.0151408;REFB=0;REVB=-0.00756226;RO=0;SAF=31;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.06448e-05;OID=.;OPOS=46879990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:10:31:0:0:10:31:0:0
chr11	46890197	.	G	A	349.12	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.447;QD=53.7107;RBI=0.240608;REFB=0;REVB=0.240143;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000906095;OID=.;OPOS=46890197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:26:0:0:23:26:1:11:12:0:0:14:12:0:0
chr11	46897446	.	G	A	2626.65	PASS	AF=0.994152;AO=170;DP=172;FAO=170;FDP=171;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0277937;FXX=0.00581362;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.393;QD=61.442;RBI=0.0312203;REFB=0.0430588;REVB=0.0142203;RO=1;SAF=79;SAR=91;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00520174;STB=0.502732;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=2.46899e-05;OID=.;OPOS=46897446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:172:171:1:1:170:170:0.994152:91:79:0:1:91:79:0:1
chr11	46914583	.	T	C	556.89	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0855384;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2724;QD=60.2046;RBI=0.0862141;REFB=0;REVB=-0.0107725;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00147842;OID=.;OPOS=46914583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:12:25:0:0:12:25:0:0
chr11	46914598	.	A	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.5698;QD=60.2302;RBI=0.0209107;REFB=0;REVB=-0.0132894;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11367e-05;OID=.;OPOS=46914598;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:12:25:0:0:12:25:0:0
chr11	46969616	.	T	C	1135.26	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.484;QD=60.5472;RBI=0.0365473;REFB=0;REVB=0.0299027;RO=0;SAF=43;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.77983e-05;OID=.;OPOS=46969616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:32:43:0:0:32:43:0:0
chr11	47188314	.	T	C	787.97	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0885558;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.853;QD=57.3066;RBI=0.0885558;REFB=0;REVB=-5.25782e-05;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243646;OID=.;OPOS=47188314;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:24:31:0:0:24:31:0:0
chr11	47194286	.	T	C	339.25	PASS	AF=0.530303;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0263118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.154;QD=20.5608;RBI=0.0272575;REFB=-0.0307478;REVB=0.00711765;RO=31;SAF=14;SAR=21;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695247;STB=0.53844;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0220424;OID=.;OPOS=47194286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:31:31:35:35:0.530303:21:14:10:21:21:14:10:21
chr11	47196982	.	C	T	538.41	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.841;QD=59.8233;RBI=0.0353006;REFB=0;REVB=0.0172554;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.76089e-05;OID=.;OPOS=47196982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr11	47238522	.	T	C	606.3	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0794004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.944;QD=60.6302;RBI=0.0807017;REFB=0;REVB=0.0144343;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000496638;OID=.;OPOS=47238522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:20:19:0:0:20:20:0:0
chr11	47266808	.	T	G	747.29	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.09;QD=63.599;RBI=0.0612809;REFB=0;REVB=0.0563943;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000214;OID=.;OPOS=47266808;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:47:0:0:45:47:1:19:26:0:0:20:27:0:0
chr11	47269159	.	T	C	1383.38	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0492802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.349;QD=62.1744;RBI=0.0561171;REFB=0;REVB=0.0268438;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.59739e-05;OID=.;OPOS=47269159;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:45:44:0:0:45:44:0:0
chr11	47270255	.	C	T	1039.11	PASS	AF=1;AO=46;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0649405;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.9968;QD=59.3777;RBI=0.104167;REFB=0;REVB=-0.0814465;RO=0;SAF=21;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.70691e-05;OID=.;OPOS=47270255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:46:70:1:25:21:0:0:29:41:0:0
chr11	47282024	.	C	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00265674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6343;QD=57.1769;RBI=0.0166885;REFB=0;REVB=0.0164757;RO=0;SAF=44;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150245;OID=.;OPOS=47282024;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:7:44:0:0:7:44:0:0
chr11	47306585	.	G	A	632.21	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0016492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.911;QD=61.6787;RBI=0.0467568;REFB=0;REVB=-0.0467277;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000246418;OID=.;OPOS=47306585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr11	47331116	.	T	C	1116.59	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00325887;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.739;QD=60.3564;RBI=0.00327449;REFB=0;REVB=-0.000319503;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.47084e-06;OID=.;OPOS=47331116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:39:35:0:0:39:35:0:0
chr11	47346145	.	G	A	1171.2	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.418;QD=60.8415;RBI=0.0338945;REFB=0;REVB=0.0193058;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.57558e-05;OID=.;OPOS=47346145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:42:35:0:0:42:35:0:0
chr11	47354787	.	C	T	192.0	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.0168538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.722;QD=11.8156;RBI=0.017157;REFB=-0.00561924;REVB=-0.00321123;RO=41;SAF=10;SAR=14;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577603;STB=0.533306;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.00950453;OID=.;OPOS=47354787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:14:10:15:26:14:10:15:26
chr11	47364762	.	A	C,G	674.54	PASS	AF=0.0454545,0.954545;AO=2,42;DP=44;FAO=2,42;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=1,22;FSAR=1,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0079436,0.00770085;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=43.8815,135.881;QD=61.3217;RBI=0.00940844,0.0245105;REFB=0,0;REVB=0.00504163,0.0232693;RO=0;SAF=1,22;SAR=1,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0788014,-0.000582018;OID=.,.;OPOS=47364762,47364762;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:44:44:0:0:2,42:2,42:0.0454545,0.954545:1,20:1,22:0:0:1,20:1,22:0:0
chr11	47380340	.	G	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0061665;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=50.5466;QD=33.4276;RBI=0.143202;REFB=0;REVB=0.143069;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0132879;OID=.;OPOS=47380340;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr11	47431728	.	A	G	316.3	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00839346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.6721;QD=52.7173;RBI=0.00862082;REFB=0;REVB=0.00196682;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140268;OID=.;OPOS=47431728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:22:24:1:8:14:0:0:8:16:0:0
chr11	47434986	.	G	A	397.57	PASS	AF=0.465909;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=88;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.0151644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.208;QD=18.0714;RBI=0.0668244;REFB=-0.0285539;REVB=0.065081;RO=46;SAF=13;SAR=28;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300306;STB=0.662828;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0560292;OID=.;OPOS=47434986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:46:47:41:41:0.465909:28:13:29:17:28:13:29:18
chr11	47460306	.	A	G	164.27	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0013254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1088;QD=13.6893;RBI=0.0734996;REFB=-0.0590107;REVB=-0.0734876;RO=28;SAF=7;SAR=11;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0432554;STB=0.549944;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0383231;OID=.;OPOS=47460306;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:30:18:18:0.375:11:7:12:16:11:7:14:16
chr11	47469439	.	A	G	672.31	PASS	AF=0.464516;AO=72;DP=155;FAO=72;FDP=155;FR=.;FRO=83;FSAF=23;FSAR=49;FSRF=53;FSRR=30;FWDB=-0.0270155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.527;QD=17.3498;RBI=0.0270405;REFB=-0.0202625;REVB=-0.00116186;RO=82;SAF=23;SAR=49;SRF=52;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304916;STB=0.672033;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0126606;OID=.;OPOS=47469439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:155:82:83:72:72:0.464516:49:23:52:30:49:23:53:30
chr11	47579119	.	A	T	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.373;QD=59.8394;RBI=0.0307377;REFB=0;REVB=0.0165341;RO=0;SAF=10;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.75517e-05;OID=.;OPOS=47579119;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:26:10:0:0:26:10:0:0
chr11	47593945	.	A	C	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.031;QD=58.2391;RBI=0.105316;REFB=0;REVB=0.104792;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132819;OID=.;OPOS=47593945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:31:31:0:0:31:31:0:0
chr11	47609867	.	G	A	1463.65	PASS	AF=0.971154;AO=101;DP=105;FAO=101;FDP=104;FR=.;FRO=3;FSAF=67;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00899829;FXX=0.0095229;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.2308;QD=56.2942;RBI=0.0397962;REFB=-0.0145693;REVB=0.0387656;RO=2;SAF=67;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139508;STB=0.500107;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.000544305;OID=.;OPOS=47609867;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:105:104:2:3:101:101:0.971154:34:67:2:0:34:67:2:1
chr11	47681370	.	T	G	230.77	PASS	AF=0.833333;AO=15;DP=24;FAO=20;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0222139;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.858;QD=38.4615;RBI=0.0246658;REFB=-0.023361;REVB=0.0107212;RO=5;SAF=14;SAR=1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.483866;STB=0.538422;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.00596868;OID=.;OPOS=47681370;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:24:24:5:4:15:20:0.833333:1:14:2:3:6:14:2:2
chr11	47701528	.	C	A	230.79	PASS	AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0202471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.196;QD=17.7534;RBI=0.0206748;REFB=-0.00495033;REVB=0.00418336;RO=27;SAF=15;SAR=10;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14441;STB=0.58133;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00649337;OID=.;OPOS=47701528;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:10:15:12:15:10:15:12:15
chr11	47748509	.	T	C	1237.18	PASS	AF=0.97619;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0184817;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.32;QD=58.9132;RBI=0.032607;REFB=-0.0885304;REVB=0.0268634;RO=1;SAF=43;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108864;STB=0.511361;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00249377;OID=.;OPOS=47748509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:84:84:1:2:82:82:0.97619:39:43:1:0:39:43:2:0
chr11	47826090	.	A	C	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00929644;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.056;QD=12.8689;RBI=0.036787;REFB=-0.014849;REVB=0.035593;RO=16;SAF=3;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304135;STB=0.680509;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0215428;OID=.;OPOS=47826090;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:8:3:9:7:8:3:9:7
chr11	47834592	.	G	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.165;QD=58.1421;RBI=0.0317877;REFB=0;REVB=0.0161564;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250616;OID=.;OPOS=47834592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:12:20:0:0:12:20:0:0
chr11	47857253	.	T	C	105.83	PASS	AF=0.27451;AO=12;DP=50;FAO=14;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=29;FWDB=-0.053083;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9439;QD=8.30039;RBI=0.0585876;REFB=-0.0137162;REVB=0.0247932;RO=30;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254384;STB=0.565131;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0392188;OID=.;OPOS=47857253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:30:37:12:14:0.27451:9:3:8:22:10:4:8:29
chr11	47869855	.	C	T	815.93	PASS	AF=0.496241;AO=66;DP=144;FAO=66;FDP=133;FR=.,HEALED;FRO=47;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=8;FSRR=39;FWDB=0.0583703;FXX=0.0220572;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.603;QD=24.5392;RBI=0.0587667;REFB=-0.0544286;REVB=0.00681431;RO=43;SAF=26;SAR=40;SRF=8;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164811;STB=0.606712;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0439226;OID=.;OPOS=47869855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:133:43:47:66:66:0.496241:40:26:8:35:39:27:8:39
chr11	48118347	.	T	TA	207.21	PASS	AF=0.657895;AO=24;DP=38;FAO=25;FDP=38;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.139753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=21.6158;QD=21.8112;RBI=0.161313;REFB=0.0337889;REVB=-0.0805663;RO=13;SAF=14;SAR=10;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0724971;STB=0.533307;STBP=0.605;TYPE=ins;VARB=-0.0290344;OID=.;OPOS=48118348;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.657895:24:38:25:38:13:15:10:9:4:64:13:14:10:9:4
chr11	48145166	.	G	A	338.73	PASS	AF=0.41573;AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.00239785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.232;QD=15.2237;RBI=0.0436543;REFB=-0.0315371;REVB=-0.0435884;RO=50;SAF=20;SAR=17;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122289;STB=0.568283;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0267185;OID=.;OPOS=48145166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:50:52:37:37:0.41573:17:20:21:29:17:20:22:30
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chr11	48146622	.	G	A	371.83	PASS	AF=0.396396;AO=44;DP=111;FAO=44;FDP=111;FR=.;FRO=67;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=40;FSRR=27;FWDB=0.0218391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.474;QD=13.3995;RBI=0.0240062;REFB=-0.00200783;REVB=-0.00996759;RO=67;SAF=29;SAR=15;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715147;STB=0.540594;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00354675;OID=.;OPOS=48146622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:67:67:44:44:0.396396:15:29:40:27:15:29:40:27
chr11	48190383	.	A	T	1254.6	PASS	AF=0.988095;AO=74;DP=76;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0131898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.036;QD=59.7429;RBI=0.0294329;REFB=-0.0564979;REVB=0.0263121;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.506665;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000960961;OID=.;OPOS=48190383;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:84:0:1:74:83:0.988095:39:35:0:0:46:37:1:0
chr11	48190527	.	T	C	834.35	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.583;QD=57.5413;RBI=0.0423159;REFB=0;REVB=0.0349191;RO=0;SAF=22;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000555433;OID=.;OPOS=48190527;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:36:22:0:0:36:22:0:0
chr11	48238421	.	T	G	1573.11	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0637895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.407;QD=62.9243;RBI=0.0721179;REFB=-0.132326;REVB=0.0336434;RO=0;SAF=44;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000660551;OID=.;OPOS=48238421;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:100:100:0:1:99:99:0.99:55:44:0:0:55:44:1:0
chr11	48238549	.	G	A	364.49	PASS	AF=0.340909;AO=44;DP=133;FAO=45;FDP=132;FR=.;FRO=87;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=51;FWDB=-0.0524491;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1312;QD=11.0452;RBI=0.0525446;REFB=-0.0216434;REVB=0.0031652;RO=87;SAF=20;SAR=24;SRF=36;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0475887;STB=0.520539;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0293843;OID=.;OPOS=48238549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:132:87:87:44:45:0.340909:24:20:36:51:25:20:36:51
chr11	48238880	.	C	T	113.38	PASS	AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.00547703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.155;QD=9.64915;RBI=0.0421443;REFB=-0.00505811;REVB=-0.0417869;RO=33;SAF=11;SAR=3;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.284765;STB=0.674816;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0189796;OID=.;OPOS=48238880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:33:33:14:14:0.297872:3:11:19:14:3:11:19:14
chr11	48239182	.	C	A	83.9	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.00490538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.215;QD=10.1696;RBI=0.0644003;REFB=-0.0272079;REVB=-0.0642132;RO=21;SAF=6;SAR=5;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191843;STB=0.624792;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0442175;OID=.;OPOS=48239182;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:32:33:21:22:11:11:0.333333:5:6:15:6:5:6:16:6
chr11	48266736	.	C	G	363.24	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.0270408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.288;QD=18.1622;RBI=0.0279659;REFB=-0.0184385;REVB=0.00713382;RO=42;SAF=25;SAR=13;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638298;STB=0.535695;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0298188;OID=.;OPOS=48266736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:13:25:25:17:13:25:25:17
chr11	48267589	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00277703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9549;QD=40.7622;RBI=0.0424644;REFB=0;REVB=0.0423735;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00243541;OID=.;OPOS=48267589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr11	48285842	.	A	G	1455.67	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.057;QD=62.6095;RBI=0.04895;REFB=0;REVB=0.0397445;RO=0;SAF=59;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.27253e-05;OID=.;OPOS=48285842;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:93:0:0:89:93:1:30:59:0:0:31:62:0:0
chr11	48285856	.	C	T	189.94	PASS	AF=0.371429;AO=23;DP=68;FAO=26;FDP=70;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=14;FWDB=0.0215999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7752;QD=10.854;RBI=0.0218284;REFB=-0.0136428;REVB=-0.0031501;RO=37;SAF=17;SAR=6;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834696;STB=0.507686;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0692691;OID=.;OPOS=48285856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:70:37:44:23:26:0.371429:6:17:25:12:8:18:30:14
chr11	48285906	.	C	T	130.98	PASS	AF=0.313725;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00139228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.002;QD=10.2732;RBI=0.00628962;REFB=-0.0075792;REVB=0.00613359;RO=34;SAF=10;SAR=6;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784672;STB=0.558302;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0155995;OID=.;OPOS=48285906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:34:35:16:16:0.313725:6:10:19:15:6:10:19:16
chr11	48286231	.	T	A	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.000399274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.256;QD=16.8984;RBI=0.00607122;REFB=0.00349167;REVB=0.00605808;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128055;STB=0.574318;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=-0.00267856;OID=.;OPOS=48286231;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:6:4:5:4:6:4:5:4
chr11	48328644	.	C	T	302.17	PASS	AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0207091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.215;QD=19.4951;RBI=0.0212179;REFB=-0.0282802;REVB=0.00461875;RO=30;SAF=21;SAR=11;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0836144;STB=0.546608;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0209493;OID=.;OPOS=48328644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:11:21:17:13:11:21:17:13
chr11	48346588	.	A	C	57.51	PASS	AF=0.114754;AO=14;DP=122;FAO=14;FDP=122;FR=.;FRO=108;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=59;FSRR=49;FWDB=-0.00723378;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.08;QD=1.88542;RBI=0.0255578;REFB=-0.0101047;REVB=-0.0245128;RO=108;SAF=6;SAR=8;SRF=59;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142596;STB=0.603103;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0629024;OID=.;OPOS=48346588;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:122:122:108:108:14:14:0.114754:8:6:59:49:8:6:59:49
chr11	48346604	.	T	G	182.51	PASS	AF=0.211679;AO=24;DP=141;FAO=29;FDP=137;FR=.,HEALED;FRO=108;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=64;FSRR=44;FWDB=-0.00992673;FXX=0.0283668;HRUN=5;LEN=1;MLLD=228.904;QD=5.32888;RBI=0.0264559;REFB=-0.0106654;REVB=-0.0245229;RO=72;SAF=18;SAR=6;SRF=51;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654044;STB=0.552765;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0485179;OID=.;OPOS=48346604;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:137:72:108:24:29:0.211679:6:18:51:21:10:19:64:44
chr11	48346615	.	G	A	233.73	PASS	AF=0.23125;AO=35;DP=160;FAO=37;FDP=160;FR=.;FRO=123;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=64;FSRR=59;FWDB=0.0113827;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.5144;QD=5.8433;RBI=0.0521025;REFB=0.00284307;REVB=-0.0508439;RO=101;SAF=24;SAR=11;SRF=57;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160708;STB=0.601615;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.0113784;OID=.;OPOS=48346615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:160:101:123:35:37:0.23125:11:24:57:44:13:24:64:59
chr11	48346660	.	TTTGCTGATC	T	175.08	PASS	AF=0.263473;AO=39;DP=173;FAO=44;FDP=167;FR=.;FRO=123;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=62;FSRR=61;FWDB=-0.0205188;FXX=0.0290681;HRUN=5;LEN=9;MLLD=307.554;QD=4.1936;RBI=0.0323784;REFB=-0.00706882;REVB=-0.0250467;RO=113;SAF=20;SAR=19;SRF=57;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104224;STB=0.547474;STBP=0.461;TYPE=del;VARB=0.0248104;OID=.;OPOS=48346661;OREF=TTGCTGATC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.263473:39:173:44:167:123:25:19:62:61:99:113:20:19:57:56
chr11	48346681	.	G	A	386.07	PASS	AF=0.274611;AO=53;DP=194;FAO=53;FDP=193;FR=.;FRO=140;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=71;FSRR=69;FWDB=0.0186337;FXX=0.0153053;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.464;QD=8.00153;RBI=0.0355575;REFB=-0.00350651;REVB=-0.030284;RO=140;SAF=31;SAR=22;SRF=71;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0963663;STB=0.556938;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00415937;OID=.;OPOS=48346681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:194:193:140:140:53:53:0.274611:22:31:71:69:22:31:71:69
chr11	48346729	.	G	C	241.23	PASS	AF=0.233129;AO=38;DP=163;FAO=38;FDP=163;FR=.;FRO=125;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=66;FSRR=59;FWDB=-0.00736277;FXX=0.00609719;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.069;QD=5.91983;RBI=0.0130236;REFB=-0.00711626;REVB=-0.0107426;RO=122;SAF=10;SAR=28;SRF=65;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347738;STB=0.709693;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.029031;OID=.;OPOS=48346729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:163:122:125:38:38:0.233129:28:10:65:57:28:10:66:59
chr11	48346791	.	C	T	165.19	PASS	AF=0.234234;AO=23;DP=111;FAO=26;FDP=111;FR=.;FRO=85;FSAF=5;FSAR=21;FSRF=48;FSRR=37;FWDB=-0.00655726;FXX=0.0263135;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.531;QD=5.95289;RBI=0.00656148;REFB=-0.00829683;REVB=-0.000235187;RO=85;SAF=2;SAR=21;SRF=51;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.654753;STB=0.793069;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0245235;OID=.;OPOS=48346791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:85:85:23:26:0.234234:21:2:51:34:21:5:48:37
chr11	48346822	.	A	C	83.97	PASS	AF=0.172414;AO=15;DP=88;FAO=15;FDP=87;FR=.;FRO=72;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=0.000262496;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.313;QD=3.86076;RBI=0.0251623;REFB=-0.00112354;REVB=0.0251609;RO=72;SAF=5;SAR=10;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292581;STB=0.691479;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0139924;OID=.;OPOS=48346822;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:88:87:72:72:15:15:0.172414:10:5:41:31:10:5:41:31
chr11	48346843	.	C	T	82.52	PASS	AF=0.1875;AO=14;DP=79;FAO=15;FDP=80;FR=.;FRO=65;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=-0.0262568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.298;QD=4.12579;RBI=0.0309291;REFB=-0.0106947;REVB=-0.0163459;RO=63;SAF=4;SAR=10;SRF=40;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.419361;STB=0.719723;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0386095;OID=.;OPOS=48346843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:79:80:63:65:14:15:0.1875:10:4:40:23:10:5:40:25
chr11	48346916	.	G	C	228.32	PASS	AF=0.298077;AO=31;DP=103;FAO=31;FDP=104;FR=.;FRO=73;FSAF=9;FSAR=22;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.0433651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9445;QD=8.78168;RBI=0.0512578;REFB=0.001613;REVB=-0.0273282;RO=72;SAF=9;SAR=22;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306117;STB=0.685193;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.00621465;OID=.;OPOS=48346916;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:72:73:31:31:0.298077:22:9:39:33:22:9:40:33
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chr11	48347014	.	G	A	653.86	PASS	AF=0.449664;AO=67;DP=149;FAO=67;FDP=149;FR=.;FRO=82;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=0.0921638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.732;QD=17.5532;RBI=0.0937367;REFB=-0.00130004;REVB=0.0170998;RO=82;SAF=30;SAR=37;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759083;STB=0.542248;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0104106;OID=.;OPOS=48347014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:82:82:67:67:0.449664:37:30:43:39:37:30:43:39
chr11	48347023	.	C	T	698.0	PASS	AF=0.479452;AO=65;DP=141;FAO=70;FDP=146;FR=.;FRO=76;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=40;FSRR=36;FWDB=0.0116225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.682;QD=19.1232;RBI=0.0116622;REFB=-0.0179181;REVB=0.000962425;RO=76;SAF=26;SAR=39;SRF=40;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124024;STB=0.551166;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0182312;OID=.;OPOS=48347023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:146:76:76:65:70:0.479452:39:26:40:36:40:30:40:36
chr11	48347067	.	C	T	604.87	PASS	AF=0.453237;AO=63;DP=139;FAO=63;FDP=139;FR=.;FRO=76;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=44;FSRR=32;FWDB=-0.00994255;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.288;QD=17.4064;RBI=0.0225002;REFB=-0.0318737;REVB=-0.0201843;RO=76;SAF=32;SAR=31;SRF=44;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699089;STB=0.538872;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0332443;OID=.;OPOS=48347067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:76:76:63:63:0.453237:31:32:44:32:31:32:44:32
chr11	48347100	.	C	T	461.19	PASS	AF=0.443478;AO=51;DP=115;FAO=51;FDP=115;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=-0.0265313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.716;QD=16.0413;RBI=0.0337087;REFB=-0.0126296;REVB=0.0207934;RO=64;SAF=25;SAR=26;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.071906;STB=0.540175;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0124355;OID=.;OPOS=48347100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:64:64:51:51:0.443478:26:25:36:28:26:25:36:28
chr11	48347124	.	A	G	360.41	PASS	AF=0.405941;AO=42;DP=99;FAO=41;FDP=101;FR=.;FRO=60;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=-0.0682587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2285;QD=14.2738;RBI=0.108993;REFB=-0.00520193;REVB=-0.0849717;RO=57;SAF=27;SAR=15;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106175;STB=0.568533;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00579226;OID=.;OPOS=48347124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:101:57:60:42:41:0.405941:15:27:31:26:14:27:33:27
chr11	48347130	.	C	G	362.98	PASS	AF=0.41;AO=41;DP=101;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0179672;FXX=0.00990001;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7763;QD=14.5194;RBI=0.0180071;REFB=0.000443667;REVB=0.00119788;RO=60;SAF=28;SAR=13;SRF=34;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132611;STB=0.57927;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=-0.000895069;OID=.;OPOS=48347130;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:60:59:41:41:0.41:13:28:34:26:13:28:33:26
chr11	48347140	.	T	C	878.51	PASS	AF=0.75;AO=69;DP=92;FAO=69;FDP=92;FR=.;FRO=23;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0277496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.831;QD=38.1962;RBI=0.0283267;REFB=-0.0494104;REVB=-0.00568916;RO=22;SAF=42;SAR=27;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034931;STB=0.523039;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0207254;OID=.;OPOS=48347140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:22:23:69:69:0.75:27:42:15:7:27:42:16:7
chr11	48347142	.	C	T	334.88	PASS	AF=0.397849;AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=0.0200038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.869;QD=14.4036;RBI=0.0200452;REFB=-0.00898122;REVB=0.00128752;RO=56;SAF=25;SAR=12;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079985;STB=0.545546;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00847864;OID=.;OPOS=48347142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:56:56:37:37:0.397849:12:25:34:22:12:25:34:22
chr11	48347144	.	T	C	319.33	PASS	AF=0.378947;AO=36;DP=94;FAO=36;FDP=95;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=37;FSRR=22;FWDB=-0.0141886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.724;QD=13.4452;RBI=0.0146519;REFB=-0.0219053;REVB=-0.00365529;RO=56;SAF=24;SAR=12;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695242;STB=0.527116;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0171744;OID=.;OPOS=48347144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:56:59:36:36:0.378947:12:24:34:22:12:24:37:22
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chr11	48347306	.	G	T	127.95	PASS	AF=0.184;AO=23;DP=126;FAO=23;FDP=125;FR=.;FRO=102;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=58;FSRR=44;FWDB=-0.0089275;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.876;QD=4.09438;RBI=0.0106321;REFB=-0.00631624;REVB=-0.00577415;RO=102;SAF=13;SAR=10;SRF=59;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171683;STB=0.50283;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.028524;OID=.;OPOS=48347306;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:125:102:102:23:23:0.184:10:13:59:43:10:13:58:44
chr11	48347342	.	G	A	85.04	PASS	AF=0.150442;AO=17;DP=113;FAO=17;FDP=113;FR=.;FRO=96;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=55;FSRR=41;FWDB=-0.0753832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.911;QD=3.01025;RBI=0.0790078;REFB=-0.0073451;REVB=-0.0236561;RO=94;SAF=8;SAR=9;SRF=55;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14407;STB=0.58625;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0389479;OID=.;OPOS=48347342;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:113:113:94:96:17:17:0.150442:9:8:55:39:9:8:55:41
chr11	48347346	.	A	T	71.99	PASS	AF=0.136364;AO=15;DP=110;FAO=15;FDP=110;FR=.;FRO=95;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=53;FSRR=42;FWDB=-0.0325447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.471;QD=2.61777;RBI=0.0579499;REFB=-0.00910807;REVB=-0.0479483;RO=92;SAF=8;SAR=7;SRF=53;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539939;STB=0.521339;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0982478;OID=.;OPOS=48347346;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:110:110:92:95:15:15:0.136364:7:8:53:39:7:8:53:42
chr11	48347358	.	C	T	52.87	PASS	AF=0.115385;AO=12;DP=102;FAO=12;FDP=104;FR=.;FRO=92;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=51;FSRR=41;FWDB=-0.0544274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1957;QD=2.03332;RBI=0.0606117;REFB=0.00127399;REVB=0.0266728;RO=90;SAF=5;SAR=7;SRF=49;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154206;STB=0.620057;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=-0.00106306;OID=.;OPOS=48347358;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:102:104:90:92:12:12:0.115385:7:5:49:41:7:5:51:41
chr11	48347363	.	C	T	48.11	PASS	AF=0.111111;AO=11;DP=99;FAO=11;FDP=99;FR=.;FRO=88;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=-0.0216838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.029;QD=1.94391;RBI=0.0238315;REFB=-0.00452257;REVB=-0.00988698;RO=88;SAF=4;SAR=7;SRF=46;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190383;STB=0.64077;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0270647;OID=.;OPOS=48347363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:99:99:88:88:11:11:0.111111:7:4:46:42:7:4:46:42
chr11	48347392	.	T	C	52.84	PASS	AF=0.151515;AO=10;DP=66;FAO=10;FDP=66;FR=.;FRO=56;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0154098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.675;QD=3.2022;RBI=0.0273156;REFB=-0.0117864;REVB=0.0225539;RO=55;SAF=5;SAR=5;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111826;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0570823;OID=.;OPOS=48347392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:66:66:55:56:10:10:0.151515:5:5:27:28:5:5:28:28
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chr11	48347492	.	G	A	118.85	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00810959;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6903;QD=13.2057;RBI=0.0682924;REFB=-0.040628;REVB=-0.0678092;RO=22;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208041;STB=0.512178;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=0.0603205;OID=.;OPOS=48347492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:8:6:9:13:8:6:9:13
chr11	48347498	.	A	T	120.86	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00171196;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=332.42;QD=14.6498;RBI=0.0189081;REFB=-0.0146538;REVB=-0.0188304;RO=19;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00761006;STB=0.504418;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0207767;OID=.;OPOS=48347498;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:8:6:8:11:8:6:8:11
chr11	48366958	.	T	G	256.47	PASS	AF=0.340659;AO=31;DP=91;FAO=31;FDP=91;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=-0.00575164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.325;QD=11.2733;RBI=0.0116952;REFB=-0.0147236;REVB=0.0101831;RO=53;SAF=17;SAR=14;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125175;STB=0.531985;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0130614;OID=.;OPOS=48366958;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:53:60:31:31:0.340659:14:17:23:30:14:17:30:30
chr11	48366971	.	GG	CA	234.91	PASS	AF=0.337209;AO=29;DP=86;FAO=29;FDP=86;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.00430372;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=313.804;QD=10.9262;RBI=0.00833473;REFB=-0.00593329;REVB=-0.00713762;RO=57;SAF=18;SAR=11;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188524;STB=0.609601;STBP=0.153;TYPE=mnp;VARB=0.0124912;OID=.;OPOS=48366971;OREF=GG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:57:57:29:29:0.337209:11:18:26:31:11:18:26:31
chr11	48367050	.	T	TAG	151.89	PASS	AF=0.338983;AO=19;DP=61;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0154958;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=2;MLLD=236.526;QD=10.2973;RBI=0.0255236;REFB=-0.0272125;REVB=-0.0202814;RO=40;SAF=12;SAR=7;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383523;STB=0.507035;STBP=0.955;TYPE=ins;VARB=0.061089;OID=.;OPOS=48367051;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=TAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.338983:19:61:20:59:39:12:8:23:16:99:40:12:7:24:16
chr11	48367073	.	A	C	267.54	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00934128;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=234.675;QD=21.8399;RBI=0.00996692;REFB=-0.0209197;REVB=0.00347562;RO=23;SAF=12;SAR=13;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109959;STB=0.570676;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0206009;OID=.;OPOS=48367073;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:23:24:25:25:0.510204:13:12:14:9:13:12:15:9
chr11	48367097	.	A	G	116.15	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0274781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.296;QD=11.332;RBI=0.0276026;REFB=-0.0520888;REVB=0.00261862;RO=27;SAF=8;SAR=6;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178774;STB=0.510623;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0653532;OID=.;OPOS=48367097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:6:8:15:12:6:8:15:12
chr11	48367133	.	C	A	62.67	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0225142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.891;QD=8.08601;RBI=0.0747713;REFB=-0.0258469;REVB=-0.0713012;RO=22;SAF=3;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195702;STB=0.621944;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0495331;OID=.;OPOS=48367133;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:6:3:11:11:6:3:11:11
chr11	48367136	.	C	T	47.77	PASS	AF=0.266667;AO=7;DP=29;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0109743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.674;QD=6.36967;RBI=0.0372318;REFB=-0.0329759;REVB=-0.0355777;RO=21;SAF=2;SAR=5;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233142;STB=0.695912;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0532249;OID=.;OPOS=48367136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:29:30:21:22:7:8:0.266667:5:2:10:11:6:2:11:11
chr11	48367155	.	T	A	35.38	PASS	AF=0.230769;AO=7;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.132613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.111;QD=5.44325;RBI=0.132701;REFB=-0.0174423;REVB=-0.00483274;RO=14;SAF=1;SAR=6;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237013;STB=0.756616;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0453663;OID=.;OPOS=48367155;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:14:20:7:6:0.230769:6:1:4:10:5:1:9:11
chr11	48367159	.	C	T	35.19	PASS	AF=0.222222;AO=5;DP=26;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0231655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.391;QD=5.21388;RBI=0.0242607;REFB=-0.00866136;REVB=0.0072068;RO=21;SAF=1;SAR=4;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346042;STB=0.773641;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.018638;OID=.;OPOS=48367159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:27:21:21:5:6:0.222222:4:1:10:11:5:1:10:11
chr11	48367163	.	A	G	36.05	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0876047;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.7917;QD=5.34013;RBI=0.0886129;REFB=-0.0105568;REVB=-0.0133293;RO=21;SAF=1;SAR=5;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401666;STB=0.773641;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0229367;OID=.;OPOS=48367163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:27:27:21:21:6:6:0.222222:5:1:10:11:5:1:10:11
chr11	48367170	.	G	A	35.15	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0151804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1012;QD=5.2072;RBI=0.138471;REFB=-0.0129133;REVB=-0.137637;RO=19;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224955;STB=0.682326;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0253058;OID=.;OPOS=48367170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:27:19:21:6:6:0.222222:2:4:9:10:2:4:9:12
chr11	48367195	.	C	T	43.21	PASS	AF=0.225806;AO=7;DP=31;FAO=7;FDP=31;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00549732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.009;QD=5.57544;RBI=0.0694539;REFB=0.00270786;REVB=-0.069236;RO=23;SAF=6;SAR=1;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.515148;STB=0.830676;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.0401059;OID=.;OPOS=48367195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:31:31:23:24:7:7:0.225806:1:6:10:13:1:6:11:13
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chr11	48367252	.	G	A	163.4	PASS	AF=0.375;AO=17;DP=47;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0342392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6793;QD=13.6162;RBI=0.0567912;REFB=-0.0151849;REVB=0.0453091;RO=30;SAF=14;SAR=3;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.408285;STB=0.749687;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0193287;OID=.;OPOS=48367252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:30:30:17:18:0.375:3:14:15:15:3:15:15:15
chr11	48367311	.	T	C	230.55	PASS	AF=0.368421;AO=28;DP=76;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=29;FWDB=0.00140333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.5628;QD=12.1344;RBI=0.00318857;REFB=-0.00721665;REVB=-0.00286315;RO=46;SAF=20;SAR=8;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373015;STB=0.703275;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0188733;OID=.;OPOS=48367311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:46:48:28:28:0.368421:8:20:17:29:8:20:19:29
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chr11	48367387	.	C	T	89.84	PASS	AF=0.202703;AO=15;DP=74;FAO=15;FDP=74;FR=.;FRO=59;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=0.0486982;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.6087;QD=4.85596;RBI=0.0489998;REFB=-0.0095064;REVB=-0.00542762;RO=59;SAF=5;SAR=10;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161413;STB=0.603631;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0418602;OID=.;OPOS=48367387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:74:74:59:59:15:15:0.202703:10:5:27:32:10:5:27:32
chr11	48367419	.	G	A	92.13	PASS	AF=0.214286;AO=15;DP=70;FAO=15;FDP=70;FR=.;FRO=55;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=33;FWDB=-0.0239911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.273;QD=5.26437;RBI=0.0261332;REFB=-0.00500086;REVB=-0.0103621;RO=54;SAF=7;SAR=8;SRF=21;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981066;STB=0.552917;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0179842;OID=.;OPOS=48367419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:70:70:54:55:15:15:0.214286:8:7:21:33:8:7:22:33
chr11	48367424	.	C	G	93.09	PASS	AF=0.217391;AO=15;DP=70;FAO=15;FDP=69;FR=.;FRO=54;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=33;FWDB=-0.0433634;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.673;QD=5.39668;RBI=0.0433948;REFB=0.000767649;REVB=-0.00164956;RO=55;SAF=7;SAR=8;SRF=22;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840392;STB=0.561564;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=-0.00937095;OID=.;OPOS=48367424;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:70:69:55:54:15:15:0.217391:8:7:22:33:8:7:21:33
chr11	48367455	.	G	A	90.68	PASS	AF=0.240741;AO=13;DP=54;FAO=13;FDP=54;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0243307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=312.474;QD=6.71704;RBI=0.0247953;REFB=-0.00198304;REVB=-0.00477729;RO=41;SAF=8;SAR=5;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240786;STB=0.649635;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.00746064;OID=.;OPOS=48367455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:54:54:41:41:13:13:0.240741:5:8:17:24:5:8:17:24
chr11	48367469	.	TG	CA	90.01	PASS	AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.038744;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=180.972;QD=7.50079;RBI=0.0388689;REFB=-0.0259885;REVB=-0.00311376;RO=34;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202385;STB=0.623087;STBP=0.374;TYPE=mnp;VARB=0.0502948;OID=.;OPOS=48367469;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:48:48:34:36:12:12:0.25:5:7:14:20:5:7:15:21
chr11	48367474	.	A	G	92.46	PASS	AF=0.27907;AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0323567;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.918;QD=8.60135;RBI=0.0351513;REFB=0.00391097;REVB=-0.0137351;RO=31;SAF=7;SAR=5;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117074;STB=0.571864;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=-0.00531822;OID=.;OPOS=48367474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:44:43:31:31:12:12:0.27907:5:7:15:16:5:7:15:16
chr11	48367499	.	A	G	52.86	PASS	AF=0.266667;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.00689224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.017;QD=7.04735;RBI=0.0349854;REFB=-0.0131977;REVB=-0.0342997;RO=22;SAF=7;SAR=1;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.496771;STB=0.822617;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0645808;OID=.;OPOS=48367499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:22:22:8:8:0.266667:1:7:11:11:1:7:11:11
chr11	48367511	.	T	G	53.79	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0211793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.661;QD=8.60567;RBI=0.0373778;REFB=-0.00149704;REVB=-0.0307983;RO=17;SAF=7;SAR=1;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.509815;STB=0.822616;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0160091;OID=.;OPOS=48367511;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:25:25:17:17:8:8:0.32:1:7:8:9:1:7:8:9
chr11	48373748	.	C	G	94.09	PASS	AF=0.258621;AO=13;DP=56;FAO=15;FDP=58;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=-5.77344e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1015;QD=6.48904;RBI=0.0157187;REFB=-0.00280218;REVB=-0.0157186;RO=41;SAF=6;SAR=7;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.328693;STB=0.725227;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0126371;OID=.;OPOS=48373748;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:56:58:41:43:13:15:0.258621:7:6:30:11:9:6:31:12
chr11	48373770	.	T	A	88.21	PASS	AF=0.222222;AO=14;DP=63;FAO=14;FDP=63;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=13;FWDB=-0.00682424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=318.942;QD=5.60078;RBI=0.012229;REFB=-0.00232114;REVB=0.0101478;RO=49;SAF=6;SAR=8;SRF=36;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.371896;STB=0.726997;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0174369;OID=.;OPOS=48373770;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:63:63:49:49:14:14:0.222222:8:6:36:13:8:6:36:13
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chr11	48373805	.	G	A	79.88	PASS	AF=0.184211;AO=14;DP=76;FAO=14;FDP=76;FR=.;FRO=62;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=51;FSRR=11;FWDB=-0.0646414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6358;QD=4.20436;RBI=0.0710513;REFB=-0.0109512;REVB=-0.029492;RO=62;SAF=9;SAR=5;SRF=51;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282781;STB=0.675476;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0326705;OID=.;OPOS=48373805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:76:76:62:62:14:14:0.184211:5:9:51:11:5:9:51:11
chr11	48373815	.	A	G	94.81	PASS	AF=0.195122;AO=16;DP=82;FAO=16;FDP=82;FR=.;FRO=66;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=54;FSRR=12;FWDB=0.0615383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3747;QD=4.62509;RBI=0.0763678;REFB=0.00908243;REVB=0.0452226;RO=66;SAF=11;SAR=5;SRF=54;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217581;STB=0.634624;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=-0.0345559;OID=.;OPOS=48373815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:82:82:66:66:16:16:0.195122:5:11:54:12:5:11:54:12
chr11	48373817	.	C	T	104.2	PASS	AF=0.207317;AO=16;DP=81;FAO=17;FDP=82;FR=.;FRO=65;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=53;FSRR=12;FWDB=-0.0077792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.805;QD=5.08282;RBI=0.0223687;REFB=-0.00725695;REVB=-0.0209724;RO=61;SAF=11;SAR=5;SRF=50;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218572;STB=0.61425;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0319694;OID=.;OPOS=48373817;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:61:65:16:17:0.207317:5:11:50:11:5:12:53:12
chr11	48373827	.	G	A	92.12	PASS	AF=0.214286;AO=15;DP=70;FAO=15;FDP=70;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=46;FSRR=9;FWDB=-0.017728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.571;QD=5.26404;RBI=0.0452174;REFB=-0.00870782;REVB=-0.0415973;RO=55;SAF=12;SAR=3;SRF=46;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755112;STB=0.547111;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0280507;OID=.;OPOS=48373827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:70:70:55:55:15:15:0.214286:3:12:46:9:3:12:46:9
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chr11	48373900	.	A	G	408.38	PASS	AF=0.384;AO=48;DP=125;FAO=48;FDP=125;FR=.;FRO=77;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.00562792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6151;QD=13.0683;RBI=0.00998597;REFB=0.00374531;REVB=-0.00824901;RO=76;SAF=22;SAR=26;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0875778;STB=0.553537;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.00506254;OID=.;OPOS=48373900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:76:77:48:48:0.384:26:22:41:35:26:22:42:35
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chr11	48373986	.	A	G	449.68	PASS	AF=0.473684;AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=34;FWDB=0.0684965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.465;QD=18.934;RBI=0.0690669;REFB=-0.00722282;REVB=0.00885813;RO=50;SAF=21;SAR=24;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141163;STB=0.578314;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00718325;OID=.;OPOS=48373986;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:50:50:45:45:0.473684:24:21:16:34:24:21:16:34
chr11	48374000	.	C	CT	81.32	PASS	AF=0.379747;AO=30;DP=84;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=33;FWDB=-0.141807;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.2219;QD=4.11748;RBI=0.237907;REFB=-0.0353029;REVB=0.191025;RO=46;SAF=16;SAR=14;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24108;STB=0.626586;STBP=0.087;TYPE=ins;VARB=-0.0213313;OID=.;OPOS=48374001;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.379747:30:84:30:79:49:16:14:16:33:81:46:16:14:14:32
chr11	48387098	.	A	C	89.33	PASS	AF=0.26087;AO=11;DP=45;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=-0.00399822;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.975;QD=7.76805;RBI=0.0144977;REFB=-0.0151275;REVB=0.0139355;RO=34;SAF=9;SAR=2;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144721;STB=0.514262;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.027832;OID=.;OPOS=48387098;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:45:46:34:34:11:12:0.26087:2:9:25:9:3:9:25:9
chr11	48387107	.	T	C	66.73	PASS	AF=0.208333;AO=10;DP=47;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=-0.0124501;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=156.135;QD=5.5611;RBI=0.0332608;REFB=-0.00731974;REVB=-0.0308428;RO=37;SAF=7;SAR=3;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00392707;STB=0.50998;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0598192;OID=.;OPOS=48387107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:47:48:37:38:10:10:0.208333:3:7:26:11:3:7:27:11
chr11	48387115	.	G	A	41.42	PASS	AF=0.152174;AO=7;DP=47;FAO=7;FDP=46;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.0211222;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.571;QD=3.60168;RBI=0.0446441;REFB=-0.00926592;REVB=-0.0393313;RO=39;SAF=6;SAR=1;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328971;STB=0.742988;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0501314;OID=.;OPOS=48387115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:47:46:39:39:7:7:0.152174:1:6:25:14:1:6:25:14
chr11	48387118	.	G	A	49.2	PASS	AF=0.166667;AO=8;DP=48;FAO=8;FDP=48;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0511596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.797;QD=4.09991;RBI=0.0550046;REFB=-0.00579543;REVB=-0.020204;RO=40;SAF=7;SAR=1;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361039;STB=0.760091;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0729719;OID=.;OPOS=48387118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:48:48:40:40:8:8:0.166667:1:7:26:14:1:7:26:14
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chr11	48387301	.	G	A	93.42	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00877828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.642;QD=9.83318;RBI=0.0231319;REFB=-0.0185629;REVB=0.0214016;RO=21;SAF=9;SAR=3;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357831;STB=0.685387;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0486203;OID=.;OPOS=48387301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:38:21:26:12:12:0.315789:3:9:9:12:3:9:13:13
chr11	48387335	.	C	A	115.52	PASS	AF=0.288462;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0247826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.22;QD=8.88631;RBI=0.0268669;REFB=0.000848646;REVB=0.0103756;RO=36;SAF=10;SAR=5;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707046;STB=0.535163;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=-0.00229084;OID=.;OPOS=48387335;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:36:37:15:15:0.288462:5:10:22:14:5:10:23:14
chr11	48387370	.	A	G	162.43	PASS	AF=0.338462;AO=20;DP=63;FAO=22;FDP=65;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=0.00472808;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.766;QD=9.99542;RBI=0.0050681;REFB=-0.00529252;REVB=-0.00182507;RO=43;SAF=14;SAR=6;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344766;STB=0.527583;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0192818;OID=.;OPOS=48387370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:65:43:43:20:22:0.338462:6:14:29:14:8:14:29:14
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chr11	48387490	.	G	A	330.32	PASS	AF=0.377551;AO=37;DP=98;FAO=37;FDP=98;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0163016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6029;QD=13.4825;RBI=0.0163152;REFB=-0.0114067;REVB=-0.000666712;RO=60;SAF=19;SAR=18;SRF=36;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0942729;STB=0.558109;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.025081;OID=.;OPOS=48387490;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:60:61:37:37:0.377551:18:19:36:24:18:19:37:24
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chr11	48387526	.	G	T	263.8	PASS	AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0011294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.457;QD=12.8683;RBI=0.0136407;REFB=-0.0270874;REVB=0.0135938;RO=51;SAF=14;SAR=17;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10549;STB=0.560401;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0269584;OID=.;OPOS=48387526;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:51:51:31:31:0.378049:17:14:28:23:17:14:28:23
chr11	48387535	.	T	C	230.57	PASS	AF=0.368421;AO=28;DP=76;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0127982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9995;QD=12.1354;RBI=0.0443008;REFB=-0.00279368;REVB=0.0424119;RO=48;SAF=14;SAR=14;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.068575;STB=0.539446;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.00284465;OID=.;OPOS=48387535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:48:48:28:28:0.368421:14:14:27:21:14:14:27:21
chr11	48387540	.	G	T	219.84	PASS	AF=0.364865;AO=26;DP=73;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.0308941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.756;QD=11.883;RBI=0.0342917;REFB=-0.0184486;REVB=0.014882;RO=47;SAF=13;SAR=13;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591533;STB=0.522072;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0159706;OID=.;OPOS=48387540;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:47:47:26:27:0.364865:13:13:26:21:13:14:26:21
chr11	48387580	.	G	T	115.09	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0705639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2559;QD=10.7061;RBI=0.0835553;REFB=-0.0116347;REVB=0.0447461;RO=28;SAF=6;SAR=8;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197621;STB=0.605115;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0180137;OID=.;OPOS=48387580;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:28:29:14:14:0.325581:8:6:17:11:8:6:17:12
chr11	48387582	.	C	T	92.6	PASS	AF=0.3;AO=12;DP=40;FAO=12;FDP=40;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.039856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.6176;QD=9.2595;RBI=0.0444258;REFB=-0.0475051;REVB=0.0196253;RO=28;SAF=6;SAR=6;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410896;STB=0.524958;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0555654;OID=.;OPOS=48387582;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:40:28:28:12:12:0.3:6:6:15:13:6:6:15:13
chr11	48387584	.	A	T	104.38	PASS	AF=0.325;AO=12;DP=39;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0472064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.678;QD=10.438;RBI=0.0553412;REFB=-0.0368525;REVB=0.0288826;RO=26;SAF=6;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04353;STB=0.563122;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0502706;OID=.;OPOS=48387584;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:26:27:12:13:0.325:6:6:14:12:7:6:15:12
chr11	48387591	.	A	G	51.67	PASS	AF=0.228571;AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0171155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.124;QD=5.90519;RBI=0.0783343;REFB=-0.0209077;REVB=-0.0764416;RO=27;SAF=6;SAR=2;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253124;STB=0.666223;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.041468;OID=.;OPOS=48387591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:35:35:27:27:8:8:0.228571:2:6:15:12:2:6:15:12
chr11	48997107	.	G	A	453.53	PASS	AF=0.597222;AO=43;DP=72;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0461867;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9343;QD=25.1958;RBI=0.0678998;REFB=-0.0466252;REVB=-0.0497712;RO=29;SAF=25;SAR=18;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298728;STB=0.516337;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0312356;OID=.;OPOS=48997107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:29:29:43:43:0.597222:18:25:18:11:18:25:18:11
chr11	48997334	.	T	G	251.57	PASS	AF=0.489796;AO=23;DP=48;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0220185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.746;QD=20.5367;RBI=0.024936;REFB=-0.0198936;REVB=-0.0117044;RO=25;SAF=15;SAR=8;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164627;STB=0.575852;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0121936;OID=.;OPOS=48997334;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:25:25:23:24:0.489796:8:15:12:13:9:15:12:13
chr11	48998688	.	A	G	93.39	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0341624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.407;QD=9.8303;RBI=0.0364898;REFB=-0.0102817;REVB=0.0128232;RO=26;SAF=4;SAR=8;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275558;STB=0.666389;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0214901;OID=.;OPOS=48998688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:8:4:15:11:8:4:15:11
chr11	49000423	.	C	G	406.88	PASS	AF=0.441176;AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.0372454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.189;QD=15.9559;RBI=0.0382988;REFB=-0.00606414;REVB=0.0089207;RO=56;SAF=20;SAR=25;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00198838;STB=0.50331;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.00731103;OID=.;OPOS=49000423;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:56:57:45:45:0.441176:25:20:25:31:25:20:25:32
chr11	49000522	.	C	T	341.96	PASS	AF=0.417582;AO=35;DP=89;FAO=38;FDP=91;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0023504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.4133;QD=15.0311;RBI=0.00388656;REFB=-0.00471961;REVB=-0.00309532;RO=51;SAF=16;SAR=19;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272166;STB=0.507688;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.00899546;OID=.;OPOS=49000522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:91:51:53:35:38:0.417582:19:16:22:29:22:16:23:30
chr11	49000553	.	CTTTTG	CTTTAC,CTTTAT,CTTTTA	292.15	PASS	AF=0,0,0.531915;AO=2,2,19;DP=50;FAO=0,0,25;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=0,0,6;FSAR=0,0,19;FSRF=3;FSRR=16;FWDB=-0.0520739,-0.208752,0.0278105;FXX=0.040808;HRUN=4,4,1;LEN=2,2,1;MLLD=138.965,79.4453,146.021;QD=24.8637;RBI=0.0543724,0.210874,0.0299673;REFB=-0.0273244,-0.0132169,-0.0317733;REVB=-0.0156419,-0.0298384,-0.0111632;RO=17;SAF=1,2,1;SAR=1,0,18;SRF=5;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.216821,0.626525,-0.480794;STB=0.5,0.5,0.551143;STBP=1,1,0.545;TYPE=mnp,mnp,snp;VARB=0,0,0.0210704;OID=.,.,.;OPOS=49000557,49000557,49000558;OREF=TG,TG,G;OALT=AC,AT,A;OMAPALT=CTTTAC,CTTTAT,CTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0,0.531915:2,2,19:50:0,0,25:47:19:0,0,6:0,0,19:3:16:99:17:1,2,1:1,0,18:5:12
chr11	49059362	.	C	A	472.19	PASS	AF=0.410853;AO=53;DP=129;FAO=53;FDP=129;FR=.;FRO=76;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=0.00136205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7838;QD=14.6416;RBI=0.0244626;REFB=-0.015255;REVB=-0.0244247;RO=76;SAF=21;SAR=32;SRF=42;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164382;STB=0.592557;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0330285;OID=.;OPOS=49059362;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:76:76:53:53:0.410853:32:21:42:34:32:21:42:34
chr11	49075605	.	G	A	235.43	PASS	AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=-0.00804095;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.382;QD=13.0792;RBI=0.00812101;REFB=-0.00479461;REVB=-0.00113755;RO=43;SAF=18;SAR=10;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368878;STB=0.510862;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.00422552;OID=.;OPOS=49075605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:43:44:28:28:0.388889:10:18:29:14:10:18:29:15
chr11	49076898	.	T	G	322.83	PASS	AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=27;FWDB=-0.00828065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.1904;QD=19.2731;RBI=0.0263886;REFB=-0.0232954;REVB=0.0250557;RO=33;SAF=16;SAR=18;SRF=6;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263462;STB=0.645084;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0219982;OID=.;OPOS=49076898;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:33:33:34:34:0.507463:18:16:6:27:18:16:6:27
chr11	49079350	.	A	G	353.78	PASS	AF=0.486842;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0266112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.704;QD=18.6197;RBI=0.0266989;REFB=0.00859353;REVB=-0.00216309;RO=39;SAF=16;SAR=21;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167354;STB=0.59317;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.00804009;OID=.;OPOS=49079350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:39:39:37:37:0.486842:21:16:24:15:21:16:24:15
chr11	49080565	.	A	C	304.38	PASS	AF=0.471429;AO=29;DP=72;FAO=33;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.006048;FXX=0.0277739;HRUN=4;LEN=1;MLLD=113.223;QD=17.3929;RBI=0.0853875;REFB=-0.0128021;REVB=-0.0851731;RO=28;SAF=16;SAR=13;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147655;STB=0.524985;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0204937;OID=.;OPOS=49080565;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:70:28:37:29:33:0.471429:13:16:20:8:14:19:23:14
chr11	49172981	.	GAC	CAG,G	247.75	PASS	AF=0.0277778,0.611111;AO=5,13;DP=35;FAO=1,22;FDP=36;FR=.;FRO=13;FSAF=1,13;FSAR=0,9;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0822145,-0.00376293;FXX=0.0270197;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=78.1158,132.523;QD=27.5277;RBI=0.106508,0.0872179;REFB=-0.0980435,-0.102209;REVB=-0.0677112,-0.0871367;RO=13;SAF=1,8;SAR=4,5;SRF=3;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0502989,0.325318;STB=0.994317,0.631596;STBP=0.133,0.043;TYPE=mnp,del;VARB=0.115604,0.0593884;OID=.,.;OPOS=49172981,49172982;OREF=GAC,AC;OALT=CAG,-;OMAPALT=CAG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:35:36:13:13:5,13:1,22:0.0277778,0.611111:4,5:1,8:3:10:0,9:1,13:3:10
chr11	49196490	.	T	C	64.46	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0410433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.193;QD=9.91657;RBI=0.0425493;REFB=-0.00817116;REVB=0.0112202;RO=17;SAF=2;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407997;STB=0.749423;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00908787;OID=.;OPOS=49196490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:7:2:10:7:7:2:10:7
chr11	49207315	.	A	G	170.61	PASS	AF=0.349206;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-8.72885e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.113;QD=10.8322;RBI=0.00803179;REFB=-0.0147591;REVB=-0.00803131;RO=40;SAF=16;SAR=6;SRF=27;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.069969;STB=0.535178;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0252578;OID=.;OPOS=49207315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:40:41:22:22:0.349206:6:16:27:13:6:16:28:13
chr11	49221885	.	T	A	522.14	PASS	AF=0.364162;AO=63;DP=173;FAO=63;FDP=173;FR=.;FRO=110;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=51;FSRR=59;FWDB=0.0142308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.514;QD=12.0725;RBI=0.0193239;REFB=-0.0159055;REVB=-0.0130727;RO=110;SAF=35;SAR=28;SRF=51;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102677;STB=0.55839;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0259284;OID=.;OPOS=49221885;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:173:110:110:63:63:0.364162:28:35:51:59:28:35:51:59
chr11	49227620	.	A	G	436.37	PASS	AF=0.52439;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0591841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7951;QD=21.2865;RBI=0.0665665;REFB=-0.0228641;REVB=0.0304686;RO=39;SAF=26;SAR=17;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586995;STB=0.53246;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0300146;OID=.;OPOS=49227620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:39:39:43:43:0.52439:17:26:21:18:17:26:21:18
chr11	49598178	.	G	A	662.09	PASS	AF=0.507692;AO=66;DP=130;FAO=66;FDP=130;FR=.;FRO=64;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=27;FSRR=37;FWDB=0.0543092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5926;QD=20.372;RBI=0.0543096;REFB=-0.0181101;REVB=0.000203081;RO=64;SAF=36;SAR=30;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110158;STB=0.560651;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0249492;OID=.;OPOS=49598178;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:64:64:66:66:0.507692:30:36:27:37:30:36:27:37
chr11	49598207	.	T	C	556.62	PASS	AF=0.487395;AO=58;DP=118;FAO=58;FDP=119;FR=.;FRO=61;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=38;FWDB=0.0131661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6432;QD=18.7098;RBI=0.0459991;REFB=-0.0164655;REVB=-0.0440746;RO=60;SAF=29;SAR=29;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107369;STB=0.571569;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0148777;OID=.;OPOS=49598207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:119:60:61:58:58:0.487395:29:29:23:37:28:30:23:38
chr11	49598209	.	T	C	1792.63	PASS	AF=1;AO=117;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.836;QD=60.2564;RBI=0.045136;REFB=0;REVB=-0.000523356;RO=2;SAF=52;SAR=65;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00179484;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300863;OID=.;OPOS=49598209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:119:119:2:0:117:119:1:65:52:1:1:66:53:0:0
chr11	49830142	.	G	T	2034.13	PASS	AF=1;AO=128;DP=128;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.419;QD=62.1109;RBI=0.0336242;REFB=0;REVB=0.0243136;RO=0;SAF=64;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64861e-05;OID=.;OPOS=49830142;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:131:0:0:128:131:1:64:64:0:0:65:66:0:0
chr11	49973979	.	C	T	285.81	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.0150363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7569;QD=20.4152;RBI=0.0465579;REFB=-0.0238154;REVB=-0.044063;RO=26;SAF=16;SAR=14;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202189;STB=0.611581;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0243872;OID=.;OPOS=49973979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:14:16:20:6:14:16:20:6
chr11	49974371	.	G	A	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.744;QD=60.6102;RBI=0.0340067;REFB=0;REVB=-0.0315197;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.05093e-05;OID=.;OPOS=49974371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0
chr11	49974931	.	G	A	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.689;QD=57.201;RBI=0.080754;REFB=0;REVB=0.0784519;RO=0;SAF=21;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360182;OID=.;OPOS=49974931;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:9:21:0:0:9:21:0:0
chr11	50003191	.	C	A	738.56	PASS	AF=0.521429;AO=69;DP=136;FAO=73;FDP=140;FR=.;FRO=67;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.0116557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3946;QD=21.1018;RBI=0.0138134;REFB=-0.0124175;REVB=0.00741326;RO=66;SAF=39;SAR=30;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985719;STB=0.541338;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0166594;OID=.;OPOS=50003191;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:140:66:67:69:73:0.521429:30:39:30:36:34:39:30:37
chr11	51411510	.	C	T	544.38	PASS	AF=0.410596;AO=36;DP=153;FAO=62;FDP=151;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=87;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=47;FSRR=40;FWDB=0.0172609;FXX=0.0194793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.262;QD=14.4206;RBI=0.0179968;REFB=-0.0102267;REVB=-0.00509381;RO=61;SAF=16;SAR=20;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342765;STB=0.580493;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0182536;OID=.;OPOS=51411510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:151:61:87:36:62:0.410596:20:16:29:32:37:25:47:40
chr11	51412379	.	T	C	175.59	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0292341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.992;QD=13.7715;RBI=0.0396464;REFB=-0.0321878;REVB=-0.0267806;RO=31;SAF=8;SAR=12;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898566;STB=0.551947;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0587213;OID=.;OPOS=51412379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:12:8:15:16:12:8:15:16
chr11	51515460	.	C	T	414.84	PASS	AF=0.462366;AO=39;DP=89;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=31;FWDB=-0.0169609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.1937;QD=17.8426;RBI=0.0338035;REFB=-0.0335826;REVB=0.0292404;RO=50;SAF=19;SAR=20;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875042;STB=0.546261;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0363576;OID=.;OPOS=51515460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:93:50:50:39:43:0.462366:20:19:20:30:23:20:19:31
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chr11	51515912	.	C	T	500.11	PASS	AF=0.573171;AO=47;DP=82;FAO=47;FDP=82;FR=.;FRO=35;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=9;FWDB=-0.0102227;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.7976;QD=24.3956;RBI=0.0241887;REFB=-0.0479673;REVB=-0.0219224;RO=34;SAF=28;SAR=19;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138914;STB=0.566824;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.0261168;OID=.;OPOS=51515912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:34:35:47:47:0.573171:19:28:26:8:19:28:26:9
chr11	51516000	.	C	T	182.28	PASS	AF=0.370968;AO=21;DP=59;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0174186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.718;QD=11.7599;RBI=0.0200506;REFB=-0.0277356;REVB=0.00993072;RO=38;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687899;STB=0.559271;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0510326;OID=.;OPOS=51516000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:62:38:39:21:23:0.370968:12:9:14:24:12:11:15:24
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chr11	55111238	.	C	A	565.17	PASS	AF=0.62963;AO=50;DP=83;FAO=51;FDP=81;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0338476;FXX=0.0240935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.07;QD=27.9096;RBI=0.038147;REFB=-0.021611;REVB=-0.0175935;RO=30;SAF=26;SAR=24;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322465;STB=0.521078;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0109134;OID=.;OPOS=55111238;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:81:30:30:50:51:0.62963:24:26:17:13:25:26:17:13
chr11	55111584	.	A	T	474.56	PASS	AF=0.628571;AO=44;DP=70;FAO=44;FDP=70;FR=.;FRO=26;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.000904486;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.863;QD=27.1176;RBI=0.0187466;REFB=-0.0182914;REVB=-0.0187248;RO=26;SAF=31;SAR=13;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0994704;STB=0.554371;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0125458;OID=.;OPOS=55111584;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:26:26:44:44:0.628571:13:31:15:11:13:31:15:11
chr11	55135435	.	C	T	339.15	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.00868896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.444;QD=17.8502;RBI=0.0135298;REFB=-0.00031324;REVB=-0.0103711;RO=40;SAF=19;SAR=17;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06855;STB=0.538271;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000410922;OID=.;OPOS=55135435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:40:40:36:36:0.473684:17:19:24:16:17:19:24:16
chr11	55259387	.	C	T	644.59	PASS	AF=0.59375;AO=57;DP=96;FAO=57;FDP=96;FR=.;FRO=39;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0413922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4465;QD=26.8578;RBI=0.051654;REFB=-0.0144004;REVB=-0.0309001;RO=37;SAF=33;SAR=24;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480799;STB=0.516773;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0083151;OID=.;OPOS=55259387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:37:39:57:57:0.59375:24:33:19:18:24:33:21:18
chr11	55322211	.	A	G	587.97	PASS	AF=0.557692;AO=58;DP=104;FAO=58;FDP=104;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.00664557;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=268.721;QD=22.6143;RBI=0.0175538;REFB=-0.00407223;REVB=0.0162472;RO=46;SAF=30;SAR=28;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490026;STB=0.52683;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.00307256;OID=.;OPOS=55322211;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:46:46:58:58:0.557692:28:30:21:25:28:30:21:25
chr11	55322298	.	C	T	671.74	PASS	AF=0.565217;AO=65;DP=115;FAO=65;FDP=115;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=-0.0397254;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8146;QD=23.3649;RBI=0.0420521;REFB=-0.0499412;REVB=-0.0137939;RO=50;SAF=30;SAR=35;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0782909;STB=0.542768;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0327763;OID=.;OPOS=55322298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:50:50:65:65:0.565217:35:30:28:22:35:30:28:22
chr11	55322638	.	C	T	382.97	PASS	AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0193021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4178;QD=17.4078;RBI=0.0497822;REFB=-0.00554765;REVB=-0.0458878;RO=47;SAF=24;SAR=16;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0255173;STB=0.521116;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.00648607;OID=.;OPOS=55322638;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:47:48:40:40:0.454545:16:24:27:20:16:24:27:21
chr11	55339652	.	C	T	259.51	PASS	AF=0.356322;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=17;FWDB=-0.00960492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6528;QD=11.9314;RBI=0.0483875;REFB=0.00391471;REVB=-0.0474246;RO=55;SAF=18;SAR=13;SRF=38;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129445;STB=0.578406;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.00360081;OID=.;OPOS=55339652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:55:56:31:31:0.356322:13:18:38:17:13:18:39:17
chr11	55339798	.	C	T	189.34	PASS	AF=0.304878;AO=25;DP=82;FAO=25;FDP=82;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=2;FSRF=40;FSRR=17;FWDB=0.00255661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4257;QD=9.23611;RBI=0.0377077;REFB=-0.0122137;REVB=-0.0376209;RO=57;SAF=23;SAR=2;SRF=40;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.447209;STB=0.775912;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0262722;OID=.;OPOS=55339798;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:57:57:25:25:0.304878:2:23:40:17:2:23:40:17
chr11	55339829	.	A	G	1110.82	PASS	AF=0.95;AO=76;DP=82;FAO=76;FDP=80;FR=.;FRO=4;FSAF=52;FSAR=24;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0153017;FXX=0.0243873;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.558;QD=55.5409;RBI=0.0240994;REFB=-0.00773093;REVB=0.0186182;RO=4;SAF=52;SAR=24;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350194;STB=0.518514;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.000120657;OID=.;OPOS=55339829;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:82:80:4:4:76:76:0.95:24:52:4:0:24:52:4:0
chr11	55340379	.	T	C	608.75	PASS	AF=0.530435;AO=59;DP=113;FAO=61;FDP=115;FR=.;FRO=54;FSAF=43;FSAR=18;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.0252944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9514;QD=21.174;RBI=0.048113;REFB=-0.00659629;REVB=0.0409274;RO=54;SAF=41;SAR=18;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999543;STB=0.56024;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00577136;OID=.;OPOS=55340379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:115:54:54:59:61:0.530435:18:41:32:22:18:43:32:22
chr11	55406022	.	C	G	541.62	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0572432;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.571;QD=60.1801;RBI=0.0723236;REFB=0;REVB=0.0442033;RO=0;SAF=30;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50008e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289762;OID=.;OPOS=55406022;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:6:30:0:0:6:30:0:0
chr11	55418693	.	T	C	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232459;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.931;QD=63.583;RBI=0.0397123;REFB=0;REVB=0.0321977;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.06263e-05;OID=.;OPOS=55418693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0
chr11	55433040	.	T	C	146.43	PASS	AF=0.485714;AO=15;DP=33;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00279742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.476;QD=16.7343;RBI=0.00549977;REFB=-0.00315189;REVB=-0.00473518;RO=18;SAF=13;SAR=2;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.489537;STB=0.796046;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0150421;OID=.;OPOS=55433040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:35:18:18:15:17:0.485714:2:13:8:10:2:15:8:10
chr11	55541098	.	G	A	697.35	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3067;QD=61.9863;RBI=0.0418002;REFB=0;REVB=-0.035875;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0032859;OID=.;OPOS=55541098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:19:25:0:0:19:26:0:0
chr11	55541807	.	T	C	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0139142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8692;QD=12.6372;RBI=0.0866278;REFB=0.00733452;REVB=0.0855031;RO=21;SAF=6;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164083;STB=0.596268;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.0118416;OID=.;OPOS=55541807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:7:6:13:8:7:6:13:8
chr11	55563336	.	A	T	78.64	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00187689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.162;QD=14.9787;RBI=0.0366185;REFB=-0.0242605;REVB=-0.0365704;RO=11;SAF=3;SAR=7;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151801;STB=0.589287;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0293441;OID=.;OPOS=55563336;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:7:3:5:6:7:3:5:6
chr11	55563563	.	C	A	550.15	PASS	AF=0.539216;AO=55;DP=102;FAO=55;FDP=102;FR=.;FRO=47;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.095316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5302;QD=21.5744;RBI=0.097943;REFB=-0.0118014;REVB=-0.022532;RO=47;SAF=28;SAR=27;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165431;STB=0.509088;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0140947;OID=.;OPOS=55563563;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:47:47:55:55:0.539216:27:28:23:24:27:28:23:24
chr11	55563776	.	T	G	746.81	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0517182;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.795;QD=53.3432;RBI=0.0616965;REFB=-0.119073;REVB=0.0336405;RO=0;SAF=28;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52846e-08;STB=0.500662;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000567265;OID=.;OPOS=55563776;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:57:56:0:2:54:54:0.964286:26:28:0:0:26:28:1:1
chr11	55587117	.	T	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0972865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.513;QD=43.4861;RBI=0.107879;REFB=0;REVB=-0.0466178;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00152091;OID=.;OPOS=55587117;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr11	55587511	.	A	G	1830.24	PASS	AF=0.976;AO=121;DP=126;FAO=122;FDP=125;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0114123;FXX=0.0157468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.248;QD=58.5677;RBI=0.0175005;REFB=-0.12427;REVB=0.0132675;RO=3;SAF=42;SAR=79;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000698161;STB=0.500503;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.00103507;OID=.;OPOS=55587511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:126:125:3:3:121:122:0.976:79:42:1:2:79:43:1:2
chr11	55587914	.	A	G	198.49	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0198933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.948;QD=19.3652;RBI=0.0582121;REFB=-0.0459052;REVB=0.0547074;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15199;STB=0.585871;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.025373;OID=.;OPOS=55587914;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:9:11:8:13:9:11:8:13
chr11	55606302	.	G	T	1472.58	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.32;QD=63.3367;RBI=0.0269162;REFB=0;REVB=0.0149343;RO=0;SAF=46;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.85534e-05;OID=.;OPOS=55606302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:47:46:0:0:47:46:0:0
chr11	55606818	.	C	T	302.63	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.4376;QD=52.6305;RBI=0.0257845;REFB=0;REVB=-0.0149869;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115811;OID=.;OPOS=55606818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:6:16:0:0:6:17:0:0
chr11	55652963	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.819;QD=47.8223;RBI=0.0329274;REFB=0;REVB=-0.0026245;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000351903;OID=.;OPOS=55652963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr11	55652971	.	C	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=316.937;QD=47.8223;RBI=0.0419789;REFB=0;REVB=0.0116775;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221546;OID=.;OPOS=55652971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr11	55653164	.	G	A	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0431475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.345;QD=55.0976;RBI=0.0531915;REFB=0;REVB=0.0311068;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.84038e-05;OID=.;OPOS=55653164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr11	55656483	.	T	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.218;QD=53.2771;RBI=0.0582458;REFB=0;REVB=0.0502913;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141182;OID=.;OPOS=55656483;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0
chr11	55681494	.	G	A	340.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.695;QD=54.5154;RBI=0.0258596;REFB=0;REVB=0.0224956;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.53783e-05;OID=.;OPOS=55681494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr11	55681999	.	G	A	64.41	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0200836;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.756;QD=9.909;RBI=0.0308941;REFB=-0.0101292;REVB=-0.0234754;RO=17;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153571;STB=0.593016;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0205554;OID=.;OPOS=55681999;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:5:4:10:7:5:4:10:7
chr11	55746891	.	G	A	2658.94	PASS	AF=1;AO=171;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.297;QD=62.1975;RBI=0.0199729;REFB=0;REVB=-0.0094631;RO=0;SAF=71;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.78155e-06;OID=.;OPOS=55746891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:171:171:0:0:171:171:1:100:71:0:0:100:71:0:0
chr11	55761221	.	C	T	739.64	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3207;QD=56.8953;RBI=0.0363548;REFB=0;REVB=0.0263396;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000593806;OID=.;OPOS=55761221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:20:31:0:0:20:32:0:0
chr11	55761738	.	T	G	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0311892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.658;QD=58.7816;RBI=0.034363;REFB=0;REVB=-0.0144241;RO=0;SAF=25;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.68666e-05;OID=.;OPOS=55761738;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:40:25:0:0:40:25:0:0
chr11	55798152	.	G	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.87;QD=54.5173;RBI=0.0157761;REFB=0;REVB=-0.00412249;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.01611e-05;OID=.;OPOS=55798152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0
chr11	55872876	.	C	T	1866.95	PASS	AF=0.99187;AO=122;DP=124;FAO=122;FDP=123;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0642619;FXX=0.00806387;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.831;QD=60.7139;RBI=0.0652933;REFB=0.0117769;REVB=0.0115597;RO=0;SAF=40;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50303;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=3.19575e-05;OID=.;OPOS=55872876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:124:123:0:1:122:122:0.99187:82:40:0:0:82:40:0:1
chr11	55873024	.	A	G	1896.41	PASS	AF=1;AO=122;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.538;QD=61.6719;RBI=0.0110838;REFB=0;REVB=0.00170376;RO=0;SAF=80;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.55622e-06;OID=.;OPOS=55873024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:122:123:1:42:80:0:0:42:81:0:0
chr11	55873368	.	G	A	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6215;QD=63.2857;RBI=0.0173798;REFB=0;REVB=-0.0125308;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017918;OID=.;OPOS=55873368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr11	55890257	.	C	T	1586.53	PASS	AF=0.918033;AO=112;DP=122;FAO=112;FDP=122;FR=.;FRO=10;FSAF=61;FSAR=51;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.005093;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.1929;QD=52.0174;RBI=0.00865968;REFB=0.0293822;REVB=0.00700367;RO=10;SAF=61;SAR=51;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00866381;STB=0.504577;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=-0.0019615;OID=.;OPOS=55890257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:122:122:10:10:112:112:0.918033:51:61:6:4:51:61:6:4
chr11	56000403	.	C	G	1062.42	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.859;QD=59.8548;RBI=0.0166814;REFB=0;REVB=0.00331599;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.75108e-05;OID=.;OPOS=56000403;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:31:40:0:0:31:40:0:0
chr11	56000600	.	G	T	315.38	PASS	AF=0.658537;AO=22;DP=42;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00893834;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.888;QD=30.7688;RBI=0.0133442;REFB=-0.0075782;REVB=0.00990832;RO=12;SAF=15;SAR=7;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231702;STB=0.646349;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00811279;OID=.;OPOS=56000600;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:12:14:22:27:0.658537:7:15:4:8:7:20:5:9
chr11	56020049	.	T	C	169.94	PASS	AF=0.302632;AO=23;DP=76;FAO=23;FDP=76;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.00713895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.485;QD=8.94419;RBI=0.0123755;REFB=-0.00460829;REVB=-0.0101088;RO=51;SAF=17;SAR=6;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.328297;STB=0.707305;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0092113;OID=.;OPOS=56020049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:51:53:23:23:0.302632:6:17:24:27:6:17:24:29
chr11	56043604	.	A	G	1514.2	PASS	AF=1;AO=88;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.455;QD=63.7558;RBI=0.0409776;REFB=0;REVB=-0.00271962;RO=0;SAF=34;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.68294e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.17008e-05;OID=.;OPOS=56043604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:95:0:0:88:95:1:54:34:0:0:55:40:0:0
chr11	56043702	.	G	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.772;QD=63.8713;RBI=0.0116055;REFB=0;REVB=-0.0017749;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2652e-05;OID=.;OPOS=56043702;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:29:19:0:0:29:19:0:0
chr11	56058197	.	G	A	1133.34	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00427297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.746;QD=60.4449;RBI=0.0571203;REFB=0;REVB=0.0569602;RO=0;SAF=43;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.11861e-05;OID=.;OPOS=56058197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:31:43:0:0:31:44:0:0
chr11	56086147	.	T	G	501.26	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0686727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.425;QD=58.972;RBI=0.0691144;REFB=0;REVB=-0.00780103;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000421387;OID=.;OPOS=56086147;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr11	56113516	.	T	C	707.36	PASS	AF=0.958333;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00376421;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.713;QD=58.9469;RBI=0.0900567;REFB=-0.155033;REVB=0.089978;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519991;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00218602;OID=.;OPOS=56113516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:49:48:0:2:46:46:0.958333:24:22:0:0:24:22:0:2
chr11	56113575	.	A	G	1252.31	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00226407;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.629;QD=61.8427;RBI=0.0443971;REFB=0;REVB=0.0443394;RO=0;SAF=51;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40248e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.06165e-05;OID=.;OPOS=56113575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:30:51:0:0:30:51:0:0
chr11	56113593	.	C	A	1489.91	PASS	AF=0.969697;AO=96;DP=99;FAO=96;FDP=99;FR=.;FRO=3;FSAF=63;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.010702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.097;QD=60.1985;RBI=0.014497;REFB=0.0479767;REVB=0.00977901;RO=1;SAF=63;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141523;STB=0.50035;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.000299845;OID=.;OPOS=56113593;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:99:99:1:3:96:96:0.969697:33:63:0:1:33:63:2:1
chr11	56127746	.	A	G	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00308122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.696;QD=64.1539;RBI=0.0087973;REFB=0;REVB=0.00824006;RO=0;SAF=31;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4489e-05;OID=.;OPOS=56127746;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:18:31:0:0:18:31:0:0
chr11	56128524	.	C	T	1035.18	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.883;QD=59.1529;RBI=0.0230239;REFB=0;REVB=0.00593386;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000294376;OID=.;OPOS=56128524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:70:0:0:67:70:1:27:40:0:0:27:43:0:0
chr11	56143156	.	C	T	1539.51	PASS	AF=0.990476;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.036217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.632;QD=58.6479;RBI=0.0554144;REFB=-0.098892;REVB=0.0419415;RO=1;SAF=58;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811183;STB=0.504273;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.000298177;OID=.;OPOS=56143156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:105:1:1:104:104:0.990476:46:58:1:0:46:58:1:0
chr11	56143158	.	A	G	1563.27	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.906;QD=59.553;RBI=0.0749633;REFB=0;REVB=0.0371402;RO=0;SAF=56;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000302321;OID=.;OPOS=56143158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:105:0:0:102:105:1:46:56:0:0:46:59:0:0
chr11	56143592	.	C	T	1004.57	PASS	AF=0.77551;AO=76;DP=98;FAO=76;FDP=98;FR=.;FRO=22;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0273183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.925;QD=41.0028;RBI=0.0287061;REFB=-0.0454255;REVB=0.00881756;RO=21;SAF=40;SAR=36;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572315;STB=0.524831;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0145668;OID=.;OPOS=56143592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:21:22:76:76:0.77551:36:40:14:7:36:40:14:8
chr11	56143690	.	C	A	297.78	PASS	AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=0.0258739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7793;QD=15.8818;RBI=0.0449264;REFB=-0.0206299;REVB=-0.0367277;RO=42;SAF=18;SAR=15;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198331;STB=0.61091;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0396695;OID=.;OPOS=56143690;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:42:42:33:33:0.44:15:18:31:11:15:18:31:11
chr11	56143696	.	C	T	214.12	PASS	AF=0.4;AO=27;DP=69;FAO=28;FDP=70;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=0.0148041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.271;QD=12.2356;RBI=0.0744164;REFB=-0.0424321;REVB=0.072929;RO=38;SAF=13;SAR=14;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262053;STB=0.657042;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.135522;OID=.;OPOS=56143696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:38:42:27:28:0.4:14:13:28:10:14:14:32:10
chr11	56143716	.	TG	CA	113.21	PASS	AF=0.253731;AO=17;DP=67;FAO=17;FDP=67;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=34;FSRR=16;FWDB=0.00723251;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=194.454;QD=6.75891;RBI=0.00882481;REFB=-0.0118752;REVB=-0.00505649;RO=50;SAF=5;SAR=12;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44717;STB=0.769448;STBP=0.018;TYPE=mnp;VARB=0.0535074;OID=.;OPOS=56143716;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:50:50:17:17:0.253731:12:5:34:16:12:5:34:16
chr11	56143723	.	T	C	104.27	PASS	AF=0.242424;AO=16;DP=66;FAO=16;FDP=66;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=-0.00684233;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.375;QD=6.31953;RBI=0.00909764;REFB=-0.00156083;REVB=-0.00599579;RO=50;SAF=5;SAR=11;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408427;STB=0.748816;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00589069;OID=.;OPOS=56143723;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:50:50:16:16:0.242424:11:5:33:17:11:5:33:17
chr11	56143725	.	C	G	103.5	PASS	AF=0.238806;AO=16;DP=67;FAO=16;FDP=67;FR=.;FRO=51;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.00228437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.977;QD=6.17929;RBI=0.0205432;REFB=-0.00218698;REVB=-0.0204158;RO=51;SAF=5;SAR=11;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416126;STB=0.753663;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0229722;OID=.;OPOS=56143725;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:51:51:16:16:0.238806:11:5:34:17:11:5:34:17
chr11	56143729	.	CC	TG	78.65	PASS	AF=0.203125;AO=13;DP=64;FAO=13;FDP=64;FR=.;FRO=51;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.0271754;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=235.87;QD=4.91592;RBI=0.0377565;REFB=-0.00334292;REVB=-0.0262117;RO=50;SAF=5;SAR=8;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354924;STB=0.71366;STBP=0.111;TYPE=mnp;VARB=0.0175495;OID=.;OPOS=56143729;OREF=CC;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:64:64:50:51:13:13:0.203125:8:5:34:16:8:5:34:17
chr11	56184888	.	G	A	1996.28	PASS	AF=1;AO=126;DP=128;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.847;QD=61.9001;RBI=0.0124083;REFB=0;REVB=0.00572763;RO=0;SAF=59;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31893e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.95148e-06;OID=.;OPOS=56184888;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:129:0:0:126:129:1:67:59:0:0:69:60:0:0
chr11	56185345	.	A	G	340.68	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.856;QD=54.5093;RBI=0.018141;REFB=0;REVB=0.00525281;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000106924;OID=.;OPOS=56185345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr11	56294338	.	G	A	923.41	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0182853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.097;QD=56.8253;RBI=0.0606505;REFB=0.00123066;REVB=0.0578285;RO=1;SAF=38;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122684;STB=0.506491;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.000172848;OID=.;OPOS=56294338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:26:38:1:0:26:38:1:0
chr11	56309889	.	G	A	117.29	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.016721;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.698;QD=12.6801;RBI=0.0171134;REFB=-0.00990547;REVB=-0.0036437;RO=23;SAF=5;SAR=9;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347296;STB=0.702329;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0148505;OID=.;OPOS=56309889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:9:5:16:7:9:5:16:7
chr11	56310222	.	C	T	375.62	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5529;QD=55.6474;RBI=0.0783604;REFB=0;REVB=0.071311;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151913;OID=.;OPOS=56310222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:6:21:0:0:6:21:0:0
chr11	56344993	.	C	A	852.68	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00367106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.682;QD=57.8086;RBI=0.0427525;REFB=0;REVB=0.0425946;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.55219e-05;OID=.;OPOS=56344993;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:54:59:0:0:54:59:1:27:27:0:0:31:28:0:0
chr11	56380134	.	C	G	1202.22	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00410025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.917;QD=60.872;RBI=0.0538516;REFB=0;REVB=0.0536953;RO=0;SAF=44;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.90914e-05;OID=.;OPOS=56380134;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:79:0:0:74:79:1:30:44:0:0:35:44:0:0
chr11	56431216	.	C	T	1339.76	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269103;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.831;QD=62.3144;RBI=0.0420889;REFB=0;REVB=0.0323622;RO=0;SAF=39;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.09033e-06;OID=.;OPOS=56431216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:47:39:0:0:47:39:0:0
chr11	56467881	.	T	C	329.21	PASS	AF=0.328125;AO=42;DP=128;FAO=42;FDP=128;FR=.;FRO=86;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=51;FWDB=0.00221594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0049;QD=10.2879;RBI=0.0370365;REFB=0.00765149;REVB=0.0369701;RO=86;SAF=25;SAR=17;SRF=35;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216363;STB=0.624941;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=-0.0108808;OID=.;OPOS=56467881;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:86:86:42:42:0.328125:17:25:35:51:17:25:35:51
chr11	56467926	.	A	G	552.2	PASS	AF=0.384615;AO=65;DP=167;FAO=65;FDP=169;FR=.;FRO=104;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=61;FWDB=-0.0226471;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7221;QD=13.0698;RBI=0.0350682;REFB=-0.0114858;REVB=-0.0267749;RO=102;SAF=34;SAR=31;SRF=43;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109523;STB=0.56716;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0171624;OID=.;OPOS=56467926;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:169:102:104:65:65:0.384615:31:34:43:59:31:34:43:61
chr11	56467945	.	G	T	647.23	PASS	AF=0.396739;AO=73;DP=186;FAO=73;FDP=184;FR=.;FRO=111;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=67;FWDB=-0.00318379;FXX=0.0107521;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.719;QD=14.0702;RBI=0.0210588;REFB=-0.0125159;REVB=-0.0208167;RO=111;SAF=41;SAR=32;SRF=42;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194533;STB=0.598734;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0213162;OID=.;OPOS=56467945;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:184:111:111:73:73:0.396739:32:41:42:69:32:41:44:67
chr11	56468020	.	TG	CA	412.81	PASS	AF=0.297872;AO=53;DP=186;FAO=56;FDP=188;FR=.;FRO=132;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=57;FSRR=75;FWDB=-0.0374054;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=168.729;QD=8.78326;RBI=0.0403999;REFB=-0.0215287;REVB=-0.0152639;RO=130;SAF=30;SAR=23;SRF=55;SRR=75;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171999;STB=0.60969;STBP=0.059;TYPE=mnp;VARB=0.0379784;OID=.;OPOS=56468020;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:188:130:132:53:56:0.297872:23:30:55:75:23:33:57:75
chr11	56468044	.	T	G	1990.48	PASS	AF=0.930556;AO=134;DP=144;FAO=134;FDP=144;FR=.;FRO=10;FSAF=51;FSAR=83;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0061852;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=254.964;QD=55.2911;RBI=0.0125458;REFB=-0.0592198;REVB=-0.0109151;RO=6;SAF=51;SAR=83;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245216;STB=0.501428;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.000207819;OID=.;OPOS=56468044;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:144:144:6:10:134:134:0.930556:83:51:4:2:83:51:4:6
chr11	56468047	.	AC	GT	1952.27	PASS	AF=1;AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293879;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=236.004;QD=61.9768;RBI=0.029797;REFB=0;REVB=0.00492113;RO=0;SAF=54;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=2.1732e-05;OID=.;OPOS=56468047;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:126:126:0:0:126:126:1:72:54:0:0:72:54:0:0
chr11	56468111	.	C	T	274.91	PASS	AF=0.303279;AO=37;DP=119;FAO=37;FDP=122;FR=.;FRO=85;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=47;FWDB=-0.0186615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.603;QD=9.01344;RBI=0.0242019;REFB=-0.0117752;REVB=-0.0154103;RO=82;SAF=19;SAR=18;SRF=38;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590607;STB=0.546194;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0266097;OID=.;OPOS=56468111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:122:82:85:37:37:0.303279:18:19:38:44:18:19:38:47
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chr11	56468200	.	C	T	402.42	PASS	AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.0075418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0862;QD=16.5946;RBI=0.0179605;REFB=-0.00159208;REVB=0.0163003;RO=55;SAF=23;SAR=19;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914169;STB=0.551252;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.00208846;OID=.;OPOS=56468200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:55:55:42:42:0.43299:19:23:35:20:19:23:35:20
chr11	56468202	.	G	A	402.22	PASS	AF=0.43299;AO=42;DP=97;FAO=42;FDP=97;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=0.0274345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.332;QD=16.5863;RBI=0.0372916;REFB=-0.0430683;REVB=0.0252589;RO=55;SAF=23;SAR=19;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914169;STB=0.551252;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0545552;OID=.;OPOS=56468202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:55:55:42:42:0.43299:19:23:35:20:19:23:35:20
chr11	56468212	.	G	A	476.73	PASS	AF=0.479592;AO=47;DP=98;FAO=47;FDP=98;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.0133495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.234;QD=19.4584;RBI=0.0462191;REFB=-0.0204793;REVB=0.0442492;RO=51;SAF=25;SAR=22;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905083;STB=0.55022;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0114981;OID=.;OPOS=56468212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:51:51:47:47:0.479592:22:25:32:19:22:25:32:19
chr11	56468259	.	C	T	578.94	PASS	AF=0.542056;AO=58;DP=107;FAO=58;FDP=107;FR=.;FRO=49;FSAF=37;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=21;FWDB=-0.00179132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.367;QD=21.6426;RBI=0.00698157;REFB=-0.0430638;REVB=-0.00674786;RO=42;SAF=37;SAR=21;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110781;STB=0.532363;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0219407;OID=.;OPOS=56468259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:42:49:58:58:0.542056:21:37:21:21:21:37:28:21
chr11	56468368	.	C	T	251.7	PASS	AF=0.258993;AO=36;DP=139;FAO=36;FDP=139;FR=.;FRO=103;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=54;FSRR=49;FWDB=-0.0056243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.11;QD=7.24329;RBI=0.0671014;REFB=-0.0101977;REVB=-0.0668653;RO=101;SAF=16;SAR=20;SRF=52;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868854;STB=0.559073;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.0306277;OID=.;OPOS=56468368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:101:103:36:36:0.258993:20:16:52:49:20:16:54:49
chr11	56468403	.	G	A	185.33	PASS	AF=0.232;AO=29;DP=126;FAO=29;FDP=125;FR=.;FRO=96;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=45;FSRR=51;FWDB=-0.0268818;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7336;QD=5.93046;RBI=0.0281041;REFB=-0.00607999;REVB=-0.00819803;RO=96;SAF=14;SAR=15;SRF=45;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176172;STB=0.510772;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.0202897;OID=.;OPOS=56468403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:125:96:96:29:29:0.232:15:14:45:51:15:14:45:51
chr11	56468416	.	G	A	126.31	PASS	AF=0.19469;AO=22;DP=113;FAO=22;FDP=113;FR=.;FRO=91;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=46;FSRR=45;FWDB=0.0559927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.99;QD=4.4713;RBI=0.0650517;REFB=-0.00823389;REVB=0.0331141;RO=91;SAF=10;SAR=12;SRF=46;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0646333;STB=0.541025;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0426006;OID=.;OPOS=56468416;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:91:91:22:22:0.19469:12:10:46:45:12:10:46:45
chr11	56468440	.	G	T	129.05	PASS	AF=0.217391;AO=20;DP=92;FAO=20;FDP=92;FR=.;FRO=72;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=32;FSRR=40;FWDB=-0.0481118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.6657;QD=5.61064;RBI=0.0539346;REFB=-0.0113887;REVB=-0.0243762;RO=72;SAF=12;SAR=8;SRF=32;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193569;STB=0.62057;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0405037;OID=.;OPOS=56468440;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:72:72:20:20:0.217391:8:12:32:40:8:12:32:40
chr11	56468448	.	AA	GT	122.81	PASS	AF=0.215909;AO=19;DP=89;FAO=19;FDP=88;FR=.;FRO=69;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=40;FWDB=-0.00380754;FXX=0.0112347;HRUN=4;LEN=2;MLLD=114.805;QD=5.58233;RBI=0.00479579;REFB=0.00174827;REVB=-0.00291587;RO=68;SAF=11;SAR=8;SRF=29;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188897;STB=0.622515;STBP=0.245;TYPE=mnp;VARB=-0.00566808;OID=.;OPOS=56468448;OREF=AA;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:68:69:19:19:0.215909:8:11:29:39:8:11:29:40
chr11	56468452	.	A	C	131.88	PASS	AF=0.232558;AO=20;DP=86;FAO=20;FDP=86;FR=.;FRO=66;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=0.00924818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6435;QD=6.134;RBI=0.00933437;REFB=-0.0063103;REVB=0.00126559;RO=66;SAF=12;SAR=8;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198047;STB=0.621999;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0319862;OID=.;OPOS=56468452;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:66:66:20:20:0.232558:8:12:29:37:8:12:29:37
chr11	56468493	.	A	G	199.34	PASS	AF=0.329114;AO=25;DP=78;FAO=26;FDP=79;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0215326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9977;QD=10.0933;RBI=0.0215653;REFB=-0.00298252;REVB=0.00118792;RO=53;SAF=15;SAR=10;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191361;STB=0.621266;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00793725;OID=.;OPOS=56468493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:53:53:25:26:0.329114:10:15:23:30:10:16:23:30
chr11	56468554	.	A	C	286.79	PASS	AF=0.346535;AO=34;DP=100;FAO=35;FDP=101;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=44;FSRR=22;FWDB=-0.0222511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7404;QD=11.3579;RBI=0.0314829;REFB=-0.00546597;REVB=-0.0222724;RO=66;SAF=24;SAR=10;SRF=44;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523453;STB=0.536891;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.010378;OID=.;OPOS=56468554;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:66:66:34:35:0.346535:10:24:44:22:10:25:44:22
chr11	56468560	.	TA	CG	291.09	PASS	AF=0.346939;AO=34;DP=99;FAO=34;FDP=98;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=44;FSRR=20;FWDB=0.0172625;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=2;MLLD=159.31;QD=11.8814;RBI=0.0181239;REFB=-0.0203173;REVB=-0.00552091;RO=64;SAF=25;SAR=9;SRF=44;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666221;STB=0.53861;STBP=0.618;TYPE=mnp;VARB=0.0256559;OID=.;OPOS=56468560;OREF=TA;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:98:64:64:34:34:0.346939:9:25:44:20:9:25:44:20
chr11	56468637	.	C	T	412.53	PASS	AF=0.362963;AO=49;DP=135;FAO=49;FDP=135;FR=.;FRO=86;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=57;FSRR=29;FWDB=-0.0179693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.735;QD=12.2232;RBI=0.0186036;REFB=-0.0274096;REVB=0.00481648;RO=86;SAF=31;SAR=18;SRF=57;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366314;STB=0.520873;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0433044;OID=.;OPOS=56468637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:86:86:49:49:0.362963:18:31:57:29:18:31:57:29
chr11	56468646	.	C	T	366.02	PASS	AF=0.348837;AO=45;DP=129;FAO=45;FDP=129;FR=.;FRO=84;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=56;FSRR=28;FWDB=-0.0150786;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.927;QD=11.3495;RBI=0.0150804;REFB=-0.00867449;REVB=-0.000229338;RO=84;SAF=28;SAR=17;SRF=56;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545561;STB=0.531236;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0142346;OID=.;OPOS=56468646;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:84:84:45:45:0.348837:17:28:56:28:17:28:56:28
chr11	56468694	.	C	T	220.29	PASS	AF=0.291262;AO=30;DP=103;FAO=30;FDP=103;FR=.;FRO=73;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=46;FSRR=27;FWDB=-0.0439738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6909;QD=8.55498;RBI=0.052153;REFB=-0.021342;REVB=-0.02804;RO=73;SAF=17;SAR=13;SRF=46;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786275;STB=0.546334;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0351701;OID=.;OPOS=56468694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:73:73:30:30:0.291262:13:17:46:27:13:17:46:27
chr11	56468699	.	T	A	179.26	PASS	AF=0.271739;AO=24;DP=91;FAO=25;FDP=92;FR=.;FRO=67;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=41;FSRR=26;FWDB=-0.0187897;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7022;QD=7.79399;RBI=0.0213721;REFB=-0.0119232;REVB=-0.0101841;RO=67;SAF=13;SAR=11;SRF=41;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874466;STB=0.538705;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0191307;OID=.;OPOS=56468699;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:67:67:24:25:0.271739:11:13:41:26:11:14:41:26
chr11	56468704	.	T	C	182.62	PASS	AF=0.271739;AO=25;DP=92;FAO=25;FDP=92;FR=.;FRO=67;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=41;FSRR=26;FWDB=0.00631546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1131;QD=7.93981;RBI=0.0260958;REFB=-0.018648;REVB=0.0253201;RO=67;SAF=14;SAR=11;SRF=41;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647392;STB=0.538705;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0552146;OID=.;OPOS=56468704;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:67:67:25:25:0.271739:11:14:41:26:11:14:41:26
chr11	56468720	.	T	C	127.76	PASS	AF=0.25;AO=19;DP=77;FAO=19;FDP=76;FR=.;FRO=57;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0398064;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.054;QD=6.72438;RBI=0.0404162;REFB=-0.0167292;REVB=-0.00699435;RO=58;SAF=9;SAR=10;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116736;STB=0.565449;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.0457765;OID=.;OPOS=56468720;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:58:57:19:19:0.25:10:9:33:25:10:9:32:25
chr11	56508525	.	A	G	785.55	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443762;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.317;QD=64.1263;RBI=0.0687611;REFB=0;REVB=0.0525247;RO=0;SAF=19;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325639;OID=.;OPOS=56508525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:30:19:0:0:30:19:0:0
chr11	56510672	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=342.579;QD=42.1826;RBI=0.0326954;REFB=0;REVB=-0.00324474;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118454;OID=.;OPOS=56510672;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0
chr11	56756399	.	G	T	754.63	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0111456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.807;QD=54.8819;RBI=0.0117657;REFB=-0.0389009;REVB=-0.00376937;RO=1;SAF=37;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269107;STB=0.51428;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.000248597;OID=.;OPOS=56756399;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:17:37:0:1:17:37:0:1
chr11	56756664	.	G	A,T	1110.7	PASS	AF=0.922078,0.0649351;AO=66,10;DP=77;FAO=71,5;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=40,5;FSAR=31,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00601772,-0.0299156;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=74.7681,184.535;QD=57.6989;RBI=0.0135766,0.030111;REFB=-0.133329,-0.110962;REVB=-0.0121701,-0.00342437;RO=0;SAF=35,10;SAR=31,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.769e-08,0;STB=0.507934,0.996613;STBP=0.295,0.062;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00823257,0.063708;OID=.,.;OPOS=56756664,56756664;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:16:77:77:0:1:66,10:71,5:0.922078,0.0649351:31,0:35,10:0:0:31,0:40,5:0:1
chr11	56956516	.	G	A	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.743;QD=57.5448;RBI=0.0296368;REFB=0;REVB=-0.010311;RO=0;SAF=32;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000243453;OID=.;OPOS=56956516;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:26:32:0:0:26:32:0:0
chr11	57004344	.	G	T	813.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.537;QD=65.0687;RBI=0.0552129;REFB=0;REVB=0.0516504;RO=0;SAF=13;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000233853;OID=.;OPOS=57004344;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:40:50:1:27:13:0:0:36:14:0:0
chr11	57081197	.	G	C	597.53	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0539837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.798;QD=58.2957;RBI=0.113175;REFB=-0.0834322;REVB=0.0994709;RO=1;SAF=30;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153811;STB=0.508193;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00217372;OID=.;OPOS=57081197;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:41:41:1:1:40:40:0.97561:10:30:1:0:10:30:1:0
chr11	57137371	.	G	A	1161.15	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0283404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.82;QD=59.5464;RBI=0.0737988;REFB=-0.097136;REVB=0.0681401;RO=1;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111359;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000651807;OID=.;OPOS=57137371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:78:78:1:0:77:78:1:42:35:0:1:43:35:0:0
chr11	57137424	.	C	T	1267.43	PASS	AF=0.988235;AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=50;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.151809;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8537;QD=59.6438;RBI=0.152514;REFB=-0.125596;REVB=0.0146418;RO=2;SAF=33;SAR=50;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278364;STB=0.507245;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0029495;OID=.;OPOS=57137424;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:85:2:1:83:84:0.988235:50:33:2:0:50:34:1:0
chr11	57147016	.	A	G	1513.4	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00179074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.117;QD=59.9368;RBI=0.0110555;REFB=0;REVB=0.0109095;RO=0;SAF=68;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-9.32919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.63238e-05;OID=.;OPOS=57147016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:33:68:0:0:33:68:0:0
chr11	57148175	.	A	G	1483.77	PASS	AF=1;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396246;FXX=0.0312467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.587;QD=63.8179;RBI=0.0407258;REFB=0;REVB=0.00940642;RO=0;SAF=49;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000489408;OID=.;OPOS=57148175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:93:0:0:93:93:1:44:49:0:0:44:49:0:0
chr11	57155001	.	G	A	2642.23	PASS	AF=0.994186;AO=171;DP=172;FAO=171;FDP=172;FR=.;FRO=1;FSAF=90;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0191072;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.79;QD=61.4472;RBI=0.0194066;REFB=-0.0141327;REVB=0.00339581;RO=0;SAF=90;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503067;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=5.08829e-05;OID=.;OPOS=57155001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:172:172:0:1:171:171:0.994186:81:90:0:0:81:90:0:1
chr11	57155288	.	T	C	3598.02	PASS	AF=1;AO=228;DP=230;FAO=228;FDP=228;FR=.;FRO=0;FSAF=126;FSAR=102;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191748;FXX=0.00869527;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.876;QD=63.1231;RBI=0.0410006;REFB=0;REVB=0.0362406;RO=0;SAF=126;SAR=102;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.38044e-06;OID=.;OPOS=57155288;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:19:230:228:0:0:228:228:1:102:126:0:0:102:126:0:0
chr11	57157405	.	A	G	207.1	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00540724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.213;QD=48.7287;RBI=0.0124519;REFB=0;REVB=0.0112166;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143106;OID=.;OPOS=57157405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr11	57235132	.	GC	G,GG	49.05	PASS	AF=0.243243,0.108108;AO=11,4;DP=37;FAO=9,4;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=8,4;FSAR=1,0;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0176166,0.0692311;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=9.62503,25.4337;QD=5.30264;RBI=0.188294,0.136605;REFB=-0.107749,-0.0645852;REVB=0.187468,0.117762;RO=18;SAF=9,4;SAR=2,0;SRF=13;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.14699,0.594763;STB=0.718504,0.996266;STBP=0.223,0.124;TYPE=del,snp;VARB=0.127431,0.0343695;OID=.,.;OPOS=57235133,57235133;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.243243,0.108108:11,4:37:9,4:37:24:8,4:1,0:17:7:27:18:9,4:2,0:13:5
chr11	57313469	.	C	G	2161.36	PASS	AF=0.909091;AO=154;DP=176;FAO=160;FDP=176;FR=.;FRO=16;FSAF=81;FSAR=79;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0120772;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.2169;QD=49.1218;RBI=0.0598111;REFB=-0.098037;REVB=0.058579;RO=20;SAF=80;SAR=74;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0585792;STB=0.517606;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0409715;OID=.;OPOS=57313469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:176:176:20:16:154:160:0.909091:74:80:5:15:79:81:5:11
chr11	57353983	.	T	G	417.96	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00597522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.044;QD=53.93;RBI=0.00644877;REFB=-0.0918722;REVB=-0.00242558;RO=1;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345091;STB=0.518506;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000286503;OID=.;OPOS=57353983;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:13:17:0:1:13:17:0:1
chr11	57463500	.	T	C	740.37	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.627;QD=56.9518;RBI=0.0133274;REFB=0;REVB=-0.00605955;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203468;OID=.;OPOS=57463500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:32:20:0:0:32:20:0:0
chr11	57468129	.	T	C	1190.38	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0897432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.586;QD=61.0449;RBI=0.102105;REFB=0;REVB=0.0487;RO=0;SAF=35;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00049353;OID=.;OPOS=57468129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:43:35:0:0:43:35:0:0
chr11	57509429	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00843238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.46;QD=35.5759;RBI=0.0572252;REFB=0;REVB=0.0566005;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000438157;OID=.;OPOS=57509429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr11	57509690	.	G	A	524.25	PASS	AF=0.514286;AO=54;DP=105;FAO=54;FDP=105;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=-0.0173762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.392;QD=19.9715;RBI=0.0186817;REFB=-0.0353734;REVB=0.00686106;RO=51;SAF=17;SAR=37;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297314;STB=0.664211;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0209593;OID=.;OPOS=57509690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:51:51:54:54:0.514286:37:17:33:18:37:17:33:18
chr11	57571232	.	C	T	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00721613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.529;QD=63.8711;RBI=0.0132109;REFB=0;REVB=-0.0110659;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.7754e-05;OID=.;OPOS=57571232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:31:17:0:0:31:17:0:0
chr11	57798723	.	A	G	251.77	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.00154882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.869;QD=14.81;RBI=0.0185935;REFB=-0.0137777;REVB=0.0185288;RO=36;SAF=11;SAR=18;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664937;STB=0.533875;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0231184;OID=.;OPOS=57798723;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:39:29:29:0.426471:18:11:16:20:18:11:17:22
chr11	57798942	.	A	G	238.91	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=0;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=25;FWDB=0;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.144;QD=19.9089;RBI=0.0058723;REFB=0.00180784;REVB=-0.0058723;RO=25;SAF=0;SAR=23;SRF=0;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00124348;OID=.;OPOS=57798942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:25:25:23:23:0.479167:23:0:0:25:23:0:0:25
chr11	57947264	.	C	G	710.28	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0155594;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.67;QD=54.6365;RBI=0.0215354;REFB=0.00617392;REVB=0.0148889;RO=1;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177671;STB=0.50943;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-9.28328e-05;OID=.;OPOS=57947264;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:26:25:0:1:26:25:0:1
chr11	57948141	.	AT	AA,A	89.15	PASS	AF=0,0.428571;AO=4,42;DP=101;FAO=0,42;FDP=98;FR=.;FRO=56;FSAF=0,13;FSAR=0,29;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.0472554,0.0389109;FXX=0.0392118;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=20.7067,6.91982;QD=3.63892;RBI=0.061583,0.048416;REFB=-0.0379538,-0.116926;REVB=-0.0394891,-0.0288106;RO=44;SAF=4,12;SAR=0,30;SRF=23;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.544188,-0.235754;STB=0.5,0.616005;STBP=1,0.055;TYPE=snp,del;VARB=0.0491414,0.104028;OID=.,.;OPOS=57948142,57948142;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.428571:4,42:101:0,42:98:56:0,13:0,29:28:28:88:44:4,12:0,30:23:21
chr11	57948952	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.227;QD=51.1842;RBI=0.0757557;REFB=0;REVB=0.043249;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000551699;OID=.;OPOS=57948952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr11	57958775	.	C	T	541.58	PASS	AF=0.574713;AO=50;DP=87;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00463733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.972;QD=24.9002;RBI=0.00848512;REFB=-0.0122511;REVB=-0.0071058;RO=37;SAF=29;SAR=21;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312644;STB=0.517121;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.00775343;OID=.;OPOS=57958775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:37:37:50:50:0.574713:21:29:20:17:21:29:20:17
chr11	57958972	.	C	A	206.05	PASS	AF=0.456522;AO=20;DP=45;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0158729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4155;QD=17.9175;RBI=0.0508011;REFB=0.0142462;REVB=-0.0482577;RO=25;SAF=6;SAR=14;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263634;STB=0.626742;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.0252913;OID=.;OPOS=57958972;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:25:25:20:21:0.456522:14:6:14:11:14:7:14:11
chr11	57970980	.	AC	GT	478.97	PASS	AF=0.575;AO=42;DP=79;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.00960372;FXX=0.0476134;HRUN=1;LEN=2;MLLD=171.395;QD=23.9485;RBI=0.02658;REFB=-0.0334437;REVB=0.0247844;RO=33;SAF=16;SAR=26;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273131;STB=0.641947;STBP=0.005;TYPE=mnp;VARB=0.0396764;OID=.;OPOS=57970980;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:33:34:42:46:0.575:26:16:24:9:29:17:24:10
chr11	57971171	.	C	T	67.15	PASS	AF=0.196078;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=30;FWDB=0.0662653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8125;QD=5.26668;RBI=0.070435;REFB=-0.0417502;REVB=-0.0238747;RO=40;SAF=3;SAR=7;SRF=11;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373279;STB=0.53104;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0621761;OID=.;OPOS=57971171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:50:51:40:41:10:10:0.196078:7:3:11:29:7:3:11:30
chr11	57971195	.	G	A	372.19	PASS	AF=0.632653;AO=31;DP=50;FAO=31;FDP=49;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.0101946;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.106;QD=30.3825;RBI=0.0252843;REFB=-0.0140695;REVB=-0.0231379;RO=19;SAF=13;SAR=18;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746329;STB=0.532766;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00440813;OID=.;OPOS=57971195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:19:18:31:31:0.632653:18:13:6:13:18:13:6:12
chr11	57971201	.	G	A	740.35	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.258;QD=56.9502;RBI=0.0185703;REFB=0;REVB=-0.0116451;RO=0;SAF=21;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.05471e-05;OID=.;OPOS=57971201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:31:21:0:0:31:21:0:0
chr11	57971478	.	A	G	447.5	PASS	AF=0.517647;AO=43;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00435685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.394;QD=21.0589;RBI=0.0199522;REFB=-0.00840691;REVB=0.0194707;RO=40;SAF=19;SAR=24;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0943155;STB=0.551259;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0121501;OID=.;OPOS=57971478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:40:41:43:44:0.517647:24:19:22:18:24:20:23:18
chr11	57982229	.	A	G	882.16	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.348;QD=57.8468;RBI=0.0222703;REFB=0;REVB=0.0122978;RO=0;SAF=43;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.2692e-05;OID=.;OPOS=57982229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:17:43:0:0:17:44:0:0
chr11	57982584	.	T	C	876.81	PASS	AF=0.96875;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0265864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0186;QD=54.8005;RBI=0.026837;REFB=-0.104251;REVB=-0.00365855;RO=2;SAF=21;SAR=41;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428554;STB=0.52272;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00616381;OID=.;OPOS=57982584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:64:64:2:2:62:62:0.96875:41:21:2:0:41:21:2:0
chr11	57982620	.	A	G	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.608;QD=58.9622;RBI=0.0117479;REFB=0;REVB=0.00190965;RO=0;SAF=27;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51167e-05;OID=.;OPOS=57982620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:39:27:0:0:39:27:0:0
chr11	57982726	.	G	T	471.65	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407887;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.334;QD=58.9566;RBI=0.0407976;REFB=0;REVB=0.000850417;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000516502;OID=.;OPOS=57982726;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr11	57982763	.	A	G	306.72	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0760173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0215;QD=53.3419;RBI=0.0847262;REFB=0;REVB=0.0374153;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00178979;OID=.;OPOS=57982763;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:8:14:0:0:8:15:0:0
chr11	57982832	.	T	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00838459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.939;QD=51.1839;RBI=0.00840172;REFB=0;REVB=0.000536272;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194578;OID=.;OPOS=57982832;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:5:15:0:0:5:15:0:0
chr11	57982896	.	G	T	851.06	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00898476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.735;QD=57.6992;RBI=0.029089;REFB=0;REVB=-0.0276667;RO=0;SAF=47;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.70516e-05;OID=.;OPOS=57982896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:11:47:0:0:11:48:0:0
chr11	57983194	.	A	G	256.77	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.000407919;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.177;QD=23.343;RBI=0.00651591;REFB=-0.0139923;REVB=-0.00650313;RO=20;SAF=8;SAR=16;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151734;STB=0.508467;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0124201;OID=.;OPOS=57983194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:20:20:24:24:0.545455:16:8:7:13:16:8:7:13
chr11	57996312	.	C	G	1231.3	PASS	AF=1;AO=75;DP=77;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.205;QD=60.8048;RBI=0.0281058;REFB=0;REVB=0.00446601;RO=0;SAF=31;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289191;OID=.;OPOS=57996312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:77:81:0:0:75:81:1:44:31:0:0:46:35:0:0
chr11	58034543	.	C	T	1231.1	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00033665;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.438;QD=61.5549;RBI=0.00564105;REFB=0;REVB=0.00563099;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.88087e-05;OID=.;OPOS=58034543;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:80:0:0:80:80:1:43:37:0:0:43:37:0:0
chr11	58123152	.	T	C	1465.03	PASS	AF=0.979167;AO=94;DP=97;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.012658;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.555;QD=61.0428;RBI=0.0469474;REFB=-0.0172355;REVB=0.0452088;RO=2;SAF=48;SAR=46;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000420359;STB=0.500222;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.000732785;OID=.;OPOS=58123152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:97:96:2:2:94:94:0.979167:46:48:1:1:46:48:1:1
chr11	58125620	.	T	C	881.43	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.185;QD=56.8663;RBI=0.0153339;REFB=0;REVB=0.00235758;RO=0;SAF=40;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000579452;OID=.;OPOS=58125620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:62:0:0:60:62:1:20:40:0:0:20:42:0:0
chr11	58126305	.	A	T	614.52	PASS	AF=0.888889;AO=48;DP=54;FAO=48;FDP=54;FR=.;FRO=6;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00807953;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=300.88;QD=45.5198;RBI=0.00908446;REFB=-0.0179492;REVB=-0.00415313;RO=0;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.537022;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.00185411;OID=.;OPOS=58126305;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:54:54:0:6:48:48:0.888889:24:24:0:0:24:24:5:1
chr11	58207204	.	A	G	1112.24	PASS	AF=0.974026;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=77;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0364111;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.561;QD=57.7787;RBI=0.0563525;REFB=-0.188417;REVB=0.0430097;RO=1;SAF=50;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00937034;STB=0.504853;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.000819278;OID=.;OPOS=58207204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:78:77:1:2:75:75:0.974026:25:50:1:0:25:50:1:1
chr11	58318619	.	C	G	1187.75	PASS	AF=0.987654;AO=79;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00911287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.512;QD=58.6543;RBI=0.0401511;REFB=-0.102853;REVB=0.0391033;RO=1;SAF=45;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137195;STB=0.505493;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00040087;OID=.;OPOS=58318619;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:1:1:79:80:0.987654:34:45:0:1:35:45:1:0
chr11	58478084	.	T	C	1806.44	PASS	AF=0.991667;AO=118;DP=119;FAO=119;FDP=120;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0104019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.4219;QD=60.2146;RBI=0.0398552;REFB=0.0752157;REVB=0.0384739;RO=1;SAF=61;SAR=57;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00772287;STB=0.503999;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.000414127;OID=.;OPOS=58478084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:119:120:1:1:118:119:0.991667:57:61:1:0:57:62:1:0
chr11	58894067	.	A	G	123.83	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.00548716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.0657;QD=17.0798;RBI=0.0634075;REFB=-0.015734;REVB=0.0631697;RO=15;SAF=10;SAR=4;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0212445;STB=0.512178;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0188555;OID=.;OPOS=58894067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:4:10:11:4:4:10:11:4
chr11	58894253	.	T	C	445.97	PASS	AF=0.459184;AO=45;DP=98;FAO=45;FDP=98;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.0266591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.196;QD=18.2027;RBI=0.0357019;REFB=-0.0142027;REVB=0.0237471;RO=50;SAF=21;SAR=24;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504285;STB=0.52315;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0126997;OID=.;OPOS=58894253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:50:53:45:45:0.459184:24:21:26:24:24:21:27:26
chr11	58919813	.	A	G	148.09	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0209934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.9;QD=17.9501;RBI=0.0976503;REFB=-0.0152018;REVB=0.095367;RO=16;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51722;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0195859;OID=.;OPOS=58919813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:17:16:16:0.484848:9:7:7:9:9:7:8:9
chr11	58940278	.	G	T	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0168948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.021;QD=11.9196;RBI=0.0219435;REFB=-0.042989;REVB=0.014003;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318742;STB=0.689164;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0409637;OID=.;OPOS=58940278;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:3:4:2:7:3:4:2:7
chr11	58949881	.	G	A	334.21	PASS	AF=0.384615;AO=40;DP=103;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.00450059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.625;QD=12.8542;RBI=0.00945608;REFB=-0.00745848;REVB=-0.00831638;RO=62;SAF=26;SAR=14;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199281;STB=0.604897;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0220952;OID=.;OPOS=58949881;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:62:64:40:40:0.384615:14:26:29:33:14:26:31:33
chr11	58973982	.	GTA	G	681.3	PASS	AF=0.730769;AO=46;DP=85;FAO=57;FDP=78;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=42;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00239111;FXX=0.133319;HRUN=1;LEN=2;MLLD=171.748;QD=34.9386;RBI=0.037331;REFB=-0.0817156;REVB=0.0372543;RO=23;SAF=9;SAR=37;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231251;STB=0.610551;STBP=0.004;TYPE=del;VARB=0.019513;OID=.;OPOS=58973983;OREF=TA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.730769:46:85:57:78:21:15:42:13:8:99:23:9:37:11:12
chr11	58978940	.	C	T	247.33	PASS	AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=0.0404988;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.9388;QD=13.7405;RBI=0.0406754;REFB=-0.00782998;REVB=-0.0037856;RO=43;SAF=13;SAR=16;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906924;STB=0.551688;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0158497;OID=.;OPOS=58978940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:16:13:23:20:16:13:23:20
chr11	58982071	.	C	T	322.18	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.010896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.453;QD=28.0158;RBI=0.0142099;REFB=-0.0189302;REVB=-0.00912134;RO=18;SAF=19;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536084;STB=0.529595;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0135117;OID=.;OPOS=58982071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:9:19:11:7:9:19:11:7
chr11	59058590	.	C	G	443.98	PASS	AF=0.358621;AO=52;DP=145;FAO=52;FDP=145;FR=.;FRO=93;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=56;FSRR=37;FWDB=0.00199196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.2;QD=12.2478;RBI=0.00984538;REFB=-0.000949174;REVB=0.00964176;RO=92;SAF=30;SAR=22;SRF=56;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366973;STB=0.516651;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00180217;OID=.;OPOS=59058590;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:92:93:52:52:0.358621:22:30:56:36:22:30:56:37
chr11	59132798	.	G	C	834.22	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5429;QD=57.5322;RBI=0.0573969;REFB=0;REVB=0.0426049;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000455866;OID=.;OPOS=59132798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:23:34:0:0:24:34:0:0
chr11	59132882	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.433;QD=61.3363;RBI=0.052446;REFB=0;REVB=0.0432895;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149421;OID=.;OPOS=59132882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:25:15:0:0:25:15:0:0
chr11	59211188	.	G	A	754.19	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0598981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9631;QD=56.9202;RBI=0.069169;REFB=0;REVB=0.0345914;RO=0;SAF=18;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000706615;OID=.;OPOS=59211188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:34:18:0:0:35:18:0:0
chr11	59211265	.	T	C	397.16	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0532564;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.975;QD=56.7365;RBI=0.060782;REFB=0;REVB=0.0292951;RO=0;SAF=7;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000375321;OID=.;OPOS=59211265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:21:7:0:0:21:7:0:0
chr11	59224720	.	A	G	1491.73	PASS	AF=0.990291;AO=99;DP=101;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0826148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.419;QD=57.9312;RBI=0.0864545;REFB=-0.0826735;REVB=-0.0254789;RO=1;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104245;STB=0.505375;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000538985;OID=.;OPOS=59224720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:101:103:1:1:99:102:0.990291:45:54:0:1:46:56:0:1
chr11	59271637	.	T	C	406.44	PASS	AF=0.408696;AO=47;DP=115;FAO=47;FDP=115;FR=.;FRO=68;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=-0.00284659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.472;QD=14.1369;RBI=0.0508944;REFB=-0.0129193;REVB=0.0508148;RO=68;SAF=14;SAR=33;SRF=39;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297412;STB=0.668249;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0298651;OID=.;OPOS=59271637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:68:68:47:47:0.408696:33:14:39:29:33:14:39:29
chr11	59318118	.	C	T	620.2	PASS	AF=0.56;AO=56;DP=100;FAO=56;FDP=100;FR=.;FRO=44;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.0183217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.894;QD=24.8081;RBI=0.0241468;REFB=0.00734231;REVB=0.0157285;RO=44;SAF=35;SAR=21;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122148;STB=0.566986;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.00517655;OID=.;OPOS=59318118;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:44:44:56:56:0.56:21:35:21:23:21:35:21:23
chr11	59323951	.	G	A	2445.55	PASS	AF=0.993789;AO=160;DP=161;FAO=160;FDP=161;FR=.;FRO=1;FSAF=100;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0133717;FXX=0.0122692;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.54;QD=60.7589;RBI=0.0137895;REFB=0.0256462;REVB=0.00336903;RO=1;SAF=100;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00786377;STB=0.504132;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=5.37275e-05;OID=.;OPOS=59323951;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:161:161:1:1:160:160:0.993789:60:100:0:1:60:100:0:1
chr11	59480951	.	T	C	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00929079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.777;QD=63.872;RBI=0.0104792;REFB=0;REVB=-0.00484723;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11601e-06;OID=.;OPOS=59480951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr11	59603364	.	G	A	442.52	PASS	AF=0.483516;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=91;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0104567;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.9307;QD=19.4514;RBI=0.0108699;REFB=-0.0139089;REVB=0.00296851;RO=47;SAF=23;SAR=21;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283945;STB=0.515782;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=0.0122697;OID=.;OPOS=59603364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:47:47:44:44:0.483516:21:23:26:21:21:23:26:21
chr11	59814173	.	G	A	1139.64	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00720434;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8554;QD=60.7809;RBI=0.0200282;REFB=0;REVB=-0.0186876;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118854;OID=.;OPOS=59814173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:35:40:0:0:35:40:0:0
chr11	59946302	.	C	T	241.0	PASS	AF=1;AO=15;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=332.013;QD=50.7365;RBI=0.0335189;REFB=0;REVB=-0.00087227;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00080763;OID=.;OPOS=59946302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:19:0:0:15:19:1:15:0:0:0:14:5:0:0
chr11	59947252	.	C	T	1173.32	PASS	AF=0.9875;AO=78;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0229212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0806;QD=58.666;RBI=0.0281729;REFB=-0.134229;REVB=0.0163808;RO=2;SAF=40;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242587;STB=0.506328;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00161905;OID=.;OPOS=59947252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:2:1:78:79:0.9875:38:40:0:2:39:40:0:1
chr11	60050125	.	A	G	284.54	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.00812293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.68;QD=17.7835;RBI=0.048847;REFB=-0.0226197;REVB=-0.0481669;RO=33;SAF=14;SAR=17;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170326;STB=0.594761;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.01323;OID=.;OPOS=60050125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:17:14:9:24:17:14:9:24
chr11	60073597	.	C	T	2348.65	PASS	AF=0.975309;AO=158;DP=163;FAO=158;FDP=162;FR=.;FRO=4;FSAF=85;FSAR=73;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0325276;FXX=0.00613459;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6154;QD=57.9915;RBI=0.0329723;REFB=-0.0201678;REVB=0.00539723;RO=4;SAF=85;SAR=73;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100212;STB=0.505269;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00341771;OID=.;OPOS=60073597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:163:162:4:4:158:158:0.975309:73:85:3:1:73:85:3:1
chr11	60102384	.	A	G	598.75	PASS	AF=0.495935;AO=61;DP=124;FAO=61;FDP=123;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=0.0440628;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.105;QD=19.4717;RBI=0.0444686;REFB=-0.000243106;REVB=0.00599367;RO=60;SAF=32;SAR=29;SRF=39;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11391;STB=0.553032;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.000187612;OID=.;OPOS=60102384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:123:60:62:61:61:0.495935:29:32:39:21:29:32:39:23
chr11	60102396	.	A	G	659.67	PASS	AF=0.475177;AO=66;DP=140;FAO=67;FDP=141;FR=.;FRO=74;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=47;FSRR=27;FWDB=0.0198285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.048;QD=18.714;RBI=0.0780305;REFB=-0.0211586;REVB=0.0754692;RO=73;SAF=34;SAR=32;SRF=46;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109692;STB=0.567135;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0310846;OID=.;OPOS=60102396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:141:73:74:66:67:0.475177:32:34:46:27:33:34:47:27
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chr11	60152584	.	G	A	421.89	PASS	AF=0.388889;AO=49;DP=127;FAO=49;FDP=126;FR=.;FRO=77;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=53;FSRR=24;FWDB=0.0188958;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8009;QD=13.3933;RBI=0.0467724;REFB=-0.00180917;REVB=-0.0427856;RO=77;SAF=28;SAR=21;SRF=53;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132056;STB=0.574439;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.00360353;OID=.;OPOS=60152584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:126:77:77:49:49:0.388889:21:28:53:24:21:28:53:24
chr11	60157107	.	T	G	236.22	PASS	AF=0.481481;AO=20;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0151517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.997;QD=17.4976;RBI=0.0158144;REFB=-0.0227198;REVB=-0.00453003;RO=22;SAF=7;SAR=13;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586231;STB=0.614793;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0283265;OID=.;OPOS=60157107;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:28:20:26:0.481481:13:7:9:13:19:7:13:15
chr11	60157166	.	C	T	285.1	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=-0.0222532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=340.014;QD=23.7582;RBI=0.0243744;REFB=-0.0205902;REVB=-0.00994538;RO=22;SAF=6;SAR=20;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00406092;STB=0.502261;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0163338;OID=.;OPOS=60157166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:20:6:5:17:20:6:5:17
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chr11	60172087	.	C	T	90.03	PASS	AF=0.324324;AO=11;DP=35;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0165752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.575;QD=9.73344;RBI=0.0247932;REFB=-0.00759409;REVB=-0.0184381;RO=24;SAF=9;SAR=2;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403988;STB=0.752215;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0103729;OID=.;OPOS=60172087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:35:37:24:25:11:12:0.324324:2:9:12:12:2:10:13:12
chr11	60173360	.	A	G	252.15	PASS	AF=0.758621;AO=17;DP=29;FAO=22;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.02278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.614;QD=34.78;RBI=0.0233053;REFB=-0.0252132;REVB=-0.00492039;RO=7;SAF=12;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00533511;STB=0.503933;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0126834;OID=.;OPOS=60173360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:7:7:17:22:0.758621:5:12:5:2:6:16:5:2
chr11	60182970	.	A	T	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.028863;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=310.622;QD=6.8134;RBI=0.0289086;REFB=-0.00853342;REVB=0.00162376;RO=19;SAF=2;SAR=5;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335034;STB=0.713674;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0217244;OID=.;OPOS=60182970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:5:2:11:8:5:2:11:8
chr11	60184191	.	G	A	147.67	PASS	AF=0.681818;AO=15;DP=22;FAO=15;FDP=22;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.00482104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.18;QD=26.8498;RBI=0.0570846;REFB=-0.0697168;REVB=0.0568807;RO=7;SAF=10;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595398;STB=0.533288;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0264929;OID=.;OPOS=60184191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:7:7:15:15:0.681818:5:10:4:3:5:10:4:3
chr11	60198328	.	C	T	196.94	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0305667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2259;QD=12.9138;RBI=0.0336759;REFB=0.004018;REVB=0.0141329;RO=35;SAF=14;SAR=10;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0427501;STB=0.509796;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=-0.00207972;OID=.;OPOS=60198328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:37:24:24:0.393443:10:14:19:16:10:14:21:16
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chr11	60285575	.	A	G	2339.89	PASS	AF=1;AO=143;DP=144;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00198196;FXX=0.0266649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.231;QD=64.1065;RBI=0.00199478;REFB=0;REVB=0.000225717;RO=0;SAF=97;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.72207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217934;OID=.;OPOS=60285575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:144:146:0:0:143:146:1:46:97:0:0:48:98:0:0
chr11	60291413	.	C	T	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0530363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.514;QD=57.1054;RBI=0.05598;REFB=0;REVB=-0.0179141;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000381524;OID=.;OPOS=60291413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:31:24:0:0:31:24:0:0
chr11	60504436	.	T	C	153.31	PASS	AF=0.533333;AO=17;DP=31;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0276603;FXX=0.0322477;HRUN=16;LEN=1;MLLD=187.964;QD=20.4418;RBI=0.0621496;REFB=-0.0138693;REVB=-0.055655;RO=13;SAF=14;SAR=3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291666;STB=0.71762;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00821269;OID=.;OPOS=60504436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:13:14:17:16:0.533333:3:14:7:6:2:14:8:6
chr11	60531264	.	A	G	381.98	PASS	AF=0.506494;AO=38;DP=76;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0170531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.885;QD=19.8431;RBI=0.0306172;REFB=-0.023523;REVB=-0.0254284;RO=38;SAF=27;SAR=11;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283432;STB=0.504671;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0232854;OID=.;OPOS=60531264;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:38:38:38:39:0.506494:11:27:26:12:12:27:26:12
chr11	60559805	.	A	G	309.49	PASS	AF=0.53125;AO=33;DP=64;FAO=34;FDP=64;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.0423707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.079;QD=19.343;RBI=0.043824;REFB=-0.0231567;REVB=-0.0111925;RO=30;SAF=17;SAR=16;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101903;STB=0.533314;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0112902;OID=.;OPOS=60559805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:30:30:33:34:0.53125:16:17:19:11:16:18:18:12
chr11	60610065	.	G	A	289.11	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.00328318;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=296.141;QD=16.2878;RBI=0.0067226;REFB=0.00551433;REVB=-0.00586635;RO=39;SAF=8;SAR=24;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.373225;STB=0.710974;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.00847336;OID=.;OPOS=60610065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:39:39:32:32:0.450704:24:8:24:15:24:8:24:15
chr11	60620585	.	A	G	731.33	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00338274;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.666;QD=63.5941;RBI=0.0529336;REFB=0;REVB=-0.0528254;RO=0;SAF=32;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167062;OID=.;OPOS=60620585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:14:32:0:0:14:32:0:0
chr11	60620590	.	C	G	728.82	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6815;QD=57.1627;RBI=0.0452762;REFB=0;REVB=-0.0409163;RO=0;SAF=37;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000246289;OID=.;OPOS=60620590;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:14:37:0:0:14:37:0:0
chr11	60635091	.	T	C	239.3	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00114022;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6515;QD=50.3798;RBI=0.115255;REFB=0;REVB=-0.115249;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00345264;OID=.;OPOS=60635091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr11	60638461	.	C	T	426.59	PASS	AF=0.448598;AO=47;DP=104;FAO=48;FDP=107;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.00907957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.542;QD=15.9471;RBI=0.00908045;REFB=-0.00727374;REVB=-0.000126525;RO=54;SAF=22;SAR=25;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587267;STB=0.521289;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.00972277;OID=.;OPOS=60638461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:107:54:59:47:48:0.448598:25:22:22:32:25:23:26:33
chr11	60638470	.	A	G	1525.24	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.735;QD=59.8134;RBI=0.0260385;REFB=0;REVB=-0.0106425;RO=0;SAF=43;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57376e-05;OID=.;OPOS=60638470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:102:0:0:101:102:1:58:43:0:0:58:44:0:0
chr11	60666341	.	G	A	194.77	PASS	AF=0.454545;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.00244238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.029;QD=17.7059;RBI=0.00286465;REFB=-0.0350133;REVB=0.00149701;RO=23;SAF=9;SAR=11;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268425;STB=0.659852;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0304269;OID=.;OPOS=60666341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:23:24:20:20:0.454545:11:9:17:6:11:9:18:6
chr11	60673868	.	T	C	103.51	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0496023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.852;QD=18.8206;RBI=0.0589436;REFB=-0.00476961;REVB=-0.0318426;RO=10;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301131;STB=0.517213;STBP=0.917;TYPE=snp;VARB=0.00822232;OID=.;OPOS=60673868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:8:4:3:7:8:4:3:7
chr11	60689445	.	T	C	1209.3	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.155728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.601;QD=59.7187;RBI=0.155743;REFB=0;REVB=-0.00218459;RO=0;SAF=6;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53612e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000926213;OID=.;OPOS=60689445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:68:81:0:0:67:81:1:61:6:0:0:61:20:0:0
chr11	60695301	.	C	A	2030.19	PASS	AF=0.992424;AO=131;DP=132;FAO=131;FDP=132;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=92;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0438039;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.687;QD=61.5208;RBI=0.0543163;REFB=-0.119527;REVB=0.0321165;RO=1;SAF=39;SAR=92;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00513862;STB=0.502702;STBP=0.584;TYPE=snp;VARB=0.000156084;OID=.;OPOS=60695301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:132:132:1:1:131:131:0.992424:92:39:0:1:92:39:0:1
chr11	60698054	.	G	A	74.69	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0138905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.709;QD=10.6703;RBI=0.0150428;REFB=-0.0338394;REVB=-0.00577404;RO=17;SAF=1;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.414426;STB=0.749375;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0585384;OID=.;OPOS=60698054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:27:28:17:18:10:10:0.357143:9:1:6:11:9:1:6:12
chr11	60699230	.	G	A	256.57	PASS	AF=0.394737;AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.00773793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.8111;QD=13.5034;RBI=0.00794742;REFB=-0.0232643;REVB=-0.00181274;RO=45;SAF=18;SAR=12;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164053;STB=0.599933;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0270213;OID=.;OPOS=60699230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:46:30:30:0.394737:12:18:20:25:12:18:20:26
chr11	60701136	.	C	G	417.99	PASS	AF=0.5;AO=41;DP=83;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.00390539;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=221.89;QD=19.9041;RBI=0.00623789;REFB=-0.0298185;REVB=0.00486406;RO=41;SAF=27;SAR=14;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0479369;STB=0.525535;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0264619;OID=.;OPOS=60701136;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:41:42:41:42:0.5:14:27:25:16:15:27:25:17
chr11	60703777	.	G	A	255.43	PASS	AF=0.446154;AO=28;DP=64;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0227419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8725;QD=15.7185;RBI=0.0725633;REFB=-0.0268246;REVB=0.0689074;RO=36;SAF=24;SAR=4;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425222;STB=0.748728;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0193659;OID=.;OPOS=60703777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:36:36:28:29:0.446154:4:24:19:17:4:25:19:17
chr11	60704213	.	C	T	478.23	PASS	AF=0.460177;AO=52;DP=113;FAO=52;FDP=113;FR=.;FRO=61;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=33;FSRR=28;FWDB=0.0341748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.596;QD=16.9284;RBI=0.0343838;REFB=-0.0118375;REVB=0.00378518;RO=59;SAF=32;SAR=20;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557063;STB=0.541592;STBP=0.428;TYPE=snp;VARB=0.0130214;OID=.;OPOS=60704213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:59:61:52:52:0.460177:20:32:33:26:20:32:33:28
chr11	60705454	.	A	G	793.23	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495238;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9377;QD=57.6897;RBI=0.0581848;REFB=0;REVB=-0.0305429;RO=0;SAF=38;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97918e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000856613;OID=.;OPOS=60705454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:17:38:0:0:17:38:0:0
chr11	60892606	.	A	G	793.04	PASS	AF=1;AO=53;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0667756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2905;QD=56.6461;RBI=0.0754723;REFB=0;REVB=0.0351723;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000903483;OID=.;OPOS=60892606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:53:56:1:25:28:0:0:25:31:0:0
chr11	60893235	.	C	T	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.859;QD=60.6099;RBI=0.0543479;REFB=0;REVB=0.0144564;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108083;OID=.;OPOS=60893235;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:16:22:0:0:16:22:0:0
chr11	60899767	.	A	G	676.73	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0651019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8217;QD=60.154;RBI=0.0656366;REFB=0.009392;REVB=-0.00836158;RO=1;SAF=38;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122067;STB=0.506491;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=-0.00102403;OID=.;OPOS=60899767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:6:38:1:0:6:38:1:0
chr11	61106892	.	G	C	877.02	PASS	AF=0.96875;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0539068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5752;QD=54.8138;RBI=0.0539488;REFB=-0.137117;REVB=-0.00212863;RO=1;SAF=34;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136821;STB=0.514281;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00450834;OID=.;OPOS=61106892;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:64:1:2:61:62:0.96875:27:34:1:0:28:34:2:0
chr11	61108974	.	G	A	439.43	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0817441;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0052;QD=54.9287;RBI=0.106606;REFB=-0.0764913;REVB=0.068431;RO=1;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0321576;STB=0.51723;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00507457;OID=.;OPOS=61108974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:32:1:1:31:31:0.96875:14:17:0:1:14:17:0:1
chr11	61112802	.	C	T	1218.53	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1519;QD=60.9264;RBI=0.0253875;REFB=0;REVB=0.0199669;RO=0;SAF=45;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274425;OID=.;OPOS=61112802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:78:80:0:0:77:80:1:32:45:0:0:35:45:0:0
chr11	61165280	.	G	A	1767.44	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0169112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.965;QD=60.9462;RBI=0.0471327;REFB=0;REVB=-0.0439943;RO=0;SAF=84;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90511e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167245;OID=.;OPOS=61165280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:32:84:0:0:32:84:0:0
chr11	61165731	.	C	CA	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00333835;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=293.726;QD=44.6898;RBI=0.0230357;REFB=0;REVB=0.0227925;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000121739;OID=.;OPOS=61165732;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:13:13:13:13:0:6:7:0:0:4:0:6:7:0:0
chr11	61165741	.	G	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.242;QD=44.6898;RBI=0.0148777;REFB=0;REVB=0.00949768;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114464;OID=.;OPOS=61165741;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr11	61166306	.	G	A	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00519416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7976;QD=47.8219;RBI=0.0155299;REFB=0;REVB=-0.0146355;RO=0;SAF=4;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000187646;OID=.;OPOS=61166306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:12:4:0:0:12:4:0:0
chr11	61179285	.	G	A	1568.43	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00913739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.119;QD=64.0176;RBI=0.0427433;REFB=0;REVB=0.0417553;RO=0;SAF=72;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.03398e-05;OID=.;OPOS=61179285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:26:72:0:0:26:72:0:0
chr11	61204361	.	A	C	1556.87	PASS	AF=0.990654;AO=103;DP=106;FAO=106;FDP=107;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0217743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2876;QD=58.2009;RBI=0.061678;REFB=0.0829112;REVB=0.0577066;RO=1;SAF=57;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102034;STB=0.50505;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=-0.000812017;OID=.;OPOS=61204361;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:106:107:1:1:103:106:0.990654:46:57:0:1:49:57:0:1
chr11	61249383	.	C	A	1054.87	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114768;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2034;QD=59.4292;RBI=0.0410178;REFB=0;REVB=0.0393795;RO=0;SAF=43;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.07168e-05;OID=.;OPOS=61249383;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:70:71:1:27:43:0:0:27:44:0:0
chr11	61277031	.	C	T	60.8	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0746551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.207;QD=34.7444;RBI=0.0784617;REFB=0;REVB=0.0241422;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00244802;OID=.;OPOS=61277031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:1:5:0:0:1:6:0:0
chr11	61277698	.	A	G	777.32	PASS	AF=1;AO=52;DP=54;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300088;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.477;QD=53.6081;RBI=0.0333083;REFB=-0.034485;REVB=-0.014454;RO=0;SAF=39;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115858;OID=.;OPOS=61277698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:58:0:0:52:58:1:13:39:0:0:13:45:0:0
chr11	61277775	.	A	G	1172.98	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269258;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.457;QD=60.9338;RBI=0.0271128;REFB=0;REVB=-0.00317897;RO=0;SAF=53;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.10845e-05;OID=.;OPOS=61277775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:76:77:1:23:53:0:0:24:53:0:0
chr11	61277885	.	G	A	1092.11	PASS	AF=0.962025;AO=75;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=58;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0113518;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=231.471;QD=55.2968;RBI=0.0129616;REFB=0.0304698;REVB=0.00625611;RO=3;SAF=57;SAR=18;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00925066;STB=0.50504;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=-5.78902e-05;OID=.;OPOS=61277885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:79:79:3:3:75:76:0.962025:18:57:2:1:18:58:2:1
chr11	61278246	.	T	C,G	760.89	PASS	AF=0.938776,0.0612245;AO=45,3;DP=48;FAO=46,3;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31,2;FSAR=15,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00854453,-0.00404618;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=75.9461,84.1059;QD=62.1134;RBI=0.0209115,0.00547457;REFB=0,0;REVB=-0.0190862,0.00368773;RO=0;SAF=31,2;SAR=14,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.017248,0.0356704;OID=.,.;OPOS=61278246,61278246;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:48:49:0:0:45,3:46,3:0.938776,0.0612245:14,1:31,2:0:0:15,1:31,2:0:0
chr11	61487690	.	G	A	1472.47	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.0848;QD=63.3318;RBI=0.0543215;REFB=0;REVB=-0.00493214;RO=0;SAF=46;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211244;OID=.;OPOS=61487690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:47:46:0:0:47:46:0:0
chr11	61505168	.	G	A	851.12	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.592;QD=57.7029;RBI=0.0227211;REFB=0;REVB=0.0165134;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58319e-05;OID=.;OPOS=61505168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:28:31:0:0:28:31:0:0
chr11	61534872	.	A	C	1083.36	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6272;QD=59.3624;RBI=0.0300166;REFB=0;REVB=0.011093;RO=0;SAF=52;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172024;OID=.;OPOS=61534872;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:73:0:0:67:73:1:15:52:0:0:15:58:0:0
chr11	61551356	.	T	C	674.72	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00630659;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.72;QD=62.7649;RBI=0.0443334;REFB=0;REVB=0.0438825;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121737;OID=.;OPOS=61551356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr11	61564299	.	G	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0656227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2854;QD=42.1815;RBI=0.0675077;REFB=0;REVB=-0.0158415;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00235856;OID=.;OPOS=61564299;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0
chr11	61582708	.	T	C	347.63	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0391322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2951;QD=51.5013;RBI=0.153952;REFB=-0.000957281;REVB=-0.148896;RO=1;SAF=16;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281527;STB=0.51514;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.00425157;OID=.;OPOS=61582708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:10:16:1:0:10:16:1:0
chr11	61593816	.	C	T	761.09	PASS	AF=0.964912;AO=54;DP=56;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0602916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.849;QD=53.4099;RBI=0.0763016;REFB=-0.196479;REVB=0.0467639;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515619;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.00334066;OID=.;OPOS=61593816;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:56:57:0:2:54:55:0.964912:24:30:0:0:24:31:2:0
chr11	61633174	.	C	T	366.01	PASS	AF=0.433333;AO=39;DP=91;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0129451;FXX=0.0109878;HRUN=5;LEN=1;MLLD=116.834;QD=16.2671;RBI=0.0131278;REFB=-0.00827373;REVB=0.00218276;RO=50;SAF=12;SAR=27;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22385;STB=0.621753;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0113001;OID=.;OPOS=61633174;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:90:50:51:39:39:0.433333:27:12:26:24:27:12:26:25
chr11	61658800	.	C	T	61.22	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0288211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.915;QD=18.8358;RBI=0.0357377;REFB=-0.00277686;REVB=0.0211312;RO=5;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175135;STB=0.510178;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0063184;OID=.;OPOS=61658800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:5:3:2:3:5:3:2:3
chr11	61669946	.	G	A	313.85	PASS	AF=0.406977;AO=35;DP=86;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.0179158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.759;QD=14.5976;RBI=0.0284995;REFB=-0.00498641;REVB=0.0221641;RO=51;SAF=15;SAR=20;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165943;STB=0.594006;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00568612;OID=.;OPOS=61669946;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:51:51:35:35:0.406977:20:15:30:21:20:15:30:21
chr11	61672235	.	T	C	88.98	PASS	AF=0.24;AO=12;DP=50;FAO=12;FDP=50;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0264756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5729;QD=7.1182;RBI=0.0484484;REFB=0.00971749;REVB=-0.0405744;RO=38;SAF=6;SAR=6;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318612;STB=0.519967;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-0.0357783;OID=.;OPOS=61672235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:50:50:38:38:12:12:0.24:6:6:20:18:6:6:20:18
chr11	61672265	.	T	C	124.77	PASS	AF=0.306122;AO=15;DP=49;FAO=15;FDP=49;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0240265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=339.93;QD=10.1856;RBI=0.0240341;REFB=0.00123255;REVB=-0.000601318;RO=34;SAF=5;SAR=10;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261922;STB=0.657323;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=-0.00304584;OID=.;OPOS=61672265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:34:34:15:15:0.306122:10:5:19:15:10:5:19:15
chr11	61719330	.	TC	T	78.9	PASS	AF=0.414634;AO=17;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.125464;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.7026;QD=7.6978;RBI=0.128296;REFB=-0.0953662;REVB=0.0268074;RO=23;SAF=15;SAR=2;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.540267;STB=0.827145;STBP=0.003;TYPE=del;VARB=0.108222;OID=.;OPOS=61719331;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.414634:17:41:17:41:24:15:2:10:14:78:23:15:2:10:13
chr11	61719360	.	A	AG	37.53	PASS	AF=0.243902;AO=11;DP=40;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0503245;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=22.5066;QD=3.6615;RBI=0.0601722;REFB=-0.038343;REVB=0.0329868;RO=28;SAF=10;SAR=1;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.592158;STB=0.718621;STBP=0.172;TYPE=ins;VARB=0.136632;OID=.;OPOS=61719361;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.243902:11:40:10:41:31:8:2:17:14:37:28:10:1:13:15
chr11	61719387	.	T	C	409.9	PASS	AF=0.9375;AO=32;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0171358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.15;QD=51.238;RBI=0.0389758;REFB=-0.167584;REVB=0.0350068;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533311;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0120666;OID=.;OPOS=61719387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:32:32:0:2:32:30:0.9375:16:16:0:0:16:14:2:0
chr11	61722645	.	C	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.286;QD=54.5173;RBI=0.0379504;REFB=0;REVB=0.0335867;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00052056;OID=.;OPOS=61722645;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0
chr11	61730234	.	T	C	349.88	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0173348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.861;QD=51.8347;RBI=0.0689787;REFB=-0.185162;REVB=0.066765;RO=1;SAF=11;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403563;STB=0.521722;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.003289;OID=.;OPOS=61730234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:27:27:1:1:26:26:0.962963:15:11:1:0:15:11:1:0
chr11	61730555	.	G	A	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.000795596;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.81;QD=15.6995;RBI=0.011979;REFB=-0.00531158;REVB=0.0119525;RO=18;SAF=13;SAR=2;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.526574;STB=0.80049;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00218717;OID=.;OPOS=61730555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:19:15:15:0.441176:2:13:7:11:2:13:8:11
chr11	61906374	.	T	C	156.43	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0143066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.322;QD=24.0666;RBI=0.0270374;REFB=0.00842299;REVB=-0.0229422;RO=10;SAF=4;SAR=12;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444459;STB=0.524968;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=-0.0162457;OID=.;OPOS=61906374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:12:4:3:7:12:4:3:7
chr11	62105611	.	C	T	511.25	PASS	AF=0.454545;AO=50;DP=122;FAO=55;FDP=121;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=51;FWDB=0.0027783;FXX=0.00819605;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.967;QD=16.9007;RBI=0.0497857;REFB=-0.0346311;REVB=-0.0497081;RO=45;SAF=22;SAR=28;SRF=15;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943497;STB=0.619413;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0333623;OID=.;OPOS=62105611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:121:45:66:50:55:0.454545:28:22:15:30:31:24:15:51
chr11	62156674	.	C	T	260.3	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0428138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.44;QD=18.9311;RBI=0.0459401;REFB=-0.00872238;REVB=-0.0166573;RO=27;SAF=20;SAR=8;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0869659;STB=0.548744;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0102507;OID=.;OPOS=62156674;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:27:28:28:0.509091:8:20:17:10:8:20:17:10
chr11	62236219	.	T	C	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0335608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.559;QD=21.353;RBI=0.0446474;REFB=0.00795949;REVB=-0.029446;RO=9;SAF=7;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124041;STB=0.507031;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=-0.0184656;OID=.;OPOS=62236219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:6:7:5:4:6:7:5:4
chr11	62286070	.	G	A	210.29	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00581597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.974;QD=15.5769;RBI=0.0175093;REFB=-0.000823198;REVB=-0.0165151;RO=30;SAF=16;SAR=8;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202595;STB=0.615286;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.000423769;OID=.;OPOS=62286070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:8:16:14:16:8:16:14:16
chr11	62291300	.	T	C	154.1	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.00246754;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.269;QD=14.3345;RBI=0.0026671;REFB=-0.00509896;REVB=0.00101227;RO=26;SAF=4;SAR=13;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.470819;STB=0.772656;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0122408;OID=.;OPOS=62291300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:13:4:18:8:13:4:18:8
chr11	62292882	.	G	T	1168.24	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220476;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.1056;QD=59.1513;RBI=0.0537764;REFB=-0.0689012;REVB=-0.049049;RO=1;SAF=32;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145596;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00263114;OID=.;OPOS=62292882;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:78:79:1:0:77:79:1:45:32:1:0:45:34:0:0
chr11	62293822	.	C	T	325.97	PASS	AF=0.377551;AO=36;DP=98;FAO=37;FDP=98;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=51;FSRR=10;FWDB=-0.0149355;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.397;QD=13.3049;RBI=0.019702;REFB=-0.0231869;REVB=-0.0128491;RO=58;SAF=25;SAR=11;SRF=48;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186101;STB=0.623745;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0247731;OID=.;OPOS=62293822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:58:61:36:37:0.377551:11:25:48:10:12:25:51:10
chr11	62294991	.	A	G	375.9	PASS	AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.00434502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.019;QD=18.3364;RBI=0.0214485;REFB=-0.0152906;REVB=-0.0210038;RO=42;SAF=31;SAR=8;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304835;STB=0.679414;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0211167;OID=.;OPOS=62294991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:42:43:39:39:0.47561:8:31:22:20:8:31:22:21
chr11	62383714	.	TGAA	ATCA,T,TCAA	201.93	PASS	AF=0,0.925926,0.0740741;AO=2,11,7;DP=31;FAO=0,25,2;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0,9,1;FSAR=0,16,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.727964,-0.219239,0.00642284;FXX=0.0999667;HRUN=1,1,1;LEN=3,3,1;MLLD=7.86508,12.8606,7.56617;QD=29.9149;RBI=0.764102,0.226343,0.359615;REFB=0,0,0;REVB=-0.232208,-0.0562615,-0.359557;RO=0;SAF=0,6,4;SAR=2,5,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,-0.256003,0.207326;OID=.,.,.;OPOS=62383714,62383715,62383715;OREF=TGA,GAA,G;OALT=ATC,-,C;OMAPALT=ATCA,T,TCAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:14:31:27:0:0:2,11,7:0,25,2:0,0.925926,0.0740741:2,5,3:0,6,4:0:0:0,16,1:0,9,1:0:0
chr11	62383718	.	A	C	52.24	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=27;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.0144997;FXX=0.0624805;HRUN=15;LEN=1;MLLD=110.173;QD=6.96559;RBI=0.0220981;REFB=-0.00297515;REVB=-0.0166759;RO=21;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135199;STB=0.650867;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0278517;OID=.;OPOS=62383718;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:27:30:21:21:6:9:0.3:4:2:5:16:5:4:5:16
chr11	62430659	.	T	A,C	948.03	PASS	AF=0.909091,0.0909091;AO=59,6;DP=65;FAO=60,6;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=25,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397802,0.0307541;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=182.776,147.404;QD=57.4565;RBI=0.0442129,0.0373437;REFB=0,0;REVB=-0.0192953,-0.0211834;RO=0;SAF=34,0;SAR=25,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.03209e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000287184,0.11585;OID=.,.;OPOS=62430659,62430659;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:23:65:66:0:0:59,6:60,6:0.909091,0.0909091:25,6:34,0:0:0:25,6:35,0:0:0
chr11	62437335	.	A	G	326.43	PASS	AF=0.548387;AO=28;DP=56;FAO=34;FDP=62;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0198371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4434;QD=21.0602;RBI=0.142431;REFB=-0.00525092;REVB=0.141043;RO=28;SAF=10;SAR=18;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195075;STB=0.634064;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00787662;OID=.;OPOS=62437335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:62:28:28:28:34:0.548387:18:10:16:12:24:10:16:12
chr11	62439569	.	G	A	1549.25	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.614;QD=63.8866;RBI=0.0732311;REFB=0;REVB=0.0501768;RO=0;SAF=50;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171323;OID=.;OPOS=62439569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:47:50:0:0:47:50:0:0
chr11	62554232	.	T	C	106.32	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0285902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.323;QD=11.8133;RBI=0.0324813;REFB=-0.00611449;REVB=0.0154154;RO=23;SAF=6;SAR=7;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204005;STB=0.620076;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0131361;OID=.;OPOS=62554232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:7:6:15:8:7:6:15:8
chr11	62563353	.	G	A,GA	424.62	PASS	AF=0.966667,0.0333333;AO=27,3;DP=30;FAO=29,1;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=22,1;FSAR=7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148944,0.0158983;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=276.22,240.783;QD=56.6164;RBI=0.0172939,0.024223;REFB=0,0;REVB=0.00878847,0.0182756;RO=0;SAF=20,3;SAR=7,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.41836e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.00256408,-0.0832275;OID=.,.;OPOS=62563353,62563354;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:30:30:0:0:27,3:29,1:0.966667,0.0333333:7,0:20,3:0:0:7,0:22,1:0:0
chr11	62564731	.	G	A	244.31	PASS	AF=0.414286;AO=28;DP=69;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0195043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3769;QD=13.9603;RBI=0.057947;REFB=0.0114883;REVB=-0.0545659;RO=41;SAF=17;SAR=11;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497405;STB=0.515141;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=-0.0169569;OID=.;OPOS=62564731;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:41:41:28:29:0.414286:11:17:23:18:12:17:23:18
chr11	62609112	.	A	G	1089.16	PASS	AF=0.622642;AO=99;DP=159;FAO=99;FDP=159;FR=.;FRO=60;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=0.0179261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7185;QD=27.4002;RBI=0.0263525;REFB=0.0256336;REVB=-0.0193161;RO=59;SAF=44;SAR=55;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145209;STB=0.504248;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=-0.0140725;OID=.;OPOS=62609112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:59:60:99:99:0.622642:55:44:25:34:55:44:26:34
chr11	62609171	.	TATT	CTGC	1911.98	PASS	AF=0.733333;AO=147;DP=217;FAO=154;FDP=210;FR=.;FRO=56;FSAF=69;FSAR=85;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.00821556;FXX=0.0540516;HRUN=1;LEN=4;MLLD=227.247;QD=36.4187;RBI=0.0455949;REFB=-0.0484097;REVB=0.0448487;RO=54;SAF=66;SAR=81;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117395;STB=0.510085;STBP=0.644;TYPE=mnp;VARB=0.0143492;OID=.;OPOS=62609171;OREF=TATT;OALT=CTGC;OMAPALT=CTGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:217:210:54:56:147:154:0.733333:81:66:23:31:85:69:23:33
chr11	62621359	.	A	T	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.00296164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.808;QD=20.4562;RBI=0.00868975;REFB=-0.00285567;REVB=-0.00816948;RO=15;SAF=9;SAR=8;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161694;STB=0.591136;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00292735;OID=.;OPOS=62621359;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:8:9:5:10:8:9:5:10
chr11	62782278	.	C	T	481.67	PASS	AF=0.485714;AO=51;DP=105;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=0.0107951;FXX=0.0186898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.163;QD=18.3494;RBI=0.012461;REFB=-0.020685;REVB=0.00622442;RO=53;SAF=27;SAR=24;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338763;STB=0.513508;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0169446;OID=.;OPOS=62782278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:53:54:51:51:0.485714:24:27:30:23:24:27:30:24
chr11	62847453	.	T	C	284.27	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0109622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7113;QD=20.3049;RBI=0.0383973;REFB=-0.0199111;REVB=0.0367992;RO=25;SAF=11;SAR=19;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162011;STB=0.582052;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0298501;OID=.;OPOS=62847453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:26:30:30:0.535714:19:11:14:11:19:11:14:12
chr11	62848487	.	A	C	205.76	PASS	AF=0.342105;AO=26;DP=76;FAO=26;FDP=76;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.00326102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.655;QD=10.8292;RBI=0.00338401;REFB=-0.0106556;REVB=-0.000904001;RO=50;SAF=8;SAR=18;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249064;STB=0.645454;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0203512;OID=.;OPOS=62848487;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:50:50:26:26:0.342105:18:8:26:24:18:8:26:24
chr11	62863518	.	A	G	280.22	PASS	AF=0.551724;AO=24;DP=54;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.00729074;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=37.1008;QD=19.3255;RBI=0.067313;REFB=-0.0241734;REVB=0.066917;RO=23;SAF=10;SAR=14;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166963;STB=0.58239;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.00795664;OID=.;OPOS=62863518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:58:23:26:24:32:0.551724:14:10:14:9:17:15:17:9
chr11	62886319	.	G	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8976;QD=51.9157;RBI=0.0460283;REFB=0;REVB=0.0422596;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000525777;OID=.;OPOS=62886319;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr11	62902172	.	A	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.958;QD=62.3509;RBI=0.0379769;REFB=0;REVB=0.0350164;RO=0;SAF=31;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41862e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160029;OID=.;OPOS=62902172;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:12:31:0:0:12:31:0:0
chr11	62910849	.	T	C	1573.01	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.642;QD=59.9241;RBI=0.0324851;REFB=0;REVB=0.0268132;RO=0;SAF=77;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.85902e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.46615e-05;OID=.;OPOS=62910849;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:28:77:0:0:28:77:0:0
chr11	62911079	.	G	C	990.65	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.381;QD=59.143;RBI=0.0250667;REFB=0;REVB=0.00870521;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115321;OID=.;OPOS=62911079;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:38:29:0:0:38:29:0:0
chr11	62931484	.	T	C	1216.49	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0157174;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.069;QD=60.0736;RBI=0.0498095;REFB=-0.0795277;REVB=0.0472647;RO=0;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506328;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.000308461;OID=.;OPOS=62931484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:81:0:1:80:80:0.987654:41:39:0:0:41:39:1:0
chr11	62951221	.	C	G	740.65	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036502;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6341;QD=56.9732;RBI=0.0395577;REFB=0;REVB=0.015245;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205508;OID=.;OPOS=62951221;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0
chr11	62984868	.	T	C	726.57	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0690228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0827;QD=52.8415;RBI=0.107589;REFB=-0.0109227;REVB=0.0825302;RO=2;SAF=26;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000646073;STB=0.500343;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0046341;OID=.;OPOS=62984868;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:2:2:53:53:0.963636:27:26:1:1:27:26:1:1
chr11	62985544	.	C	T	255.89	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00405686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3241;QD=51.1782;RBI=0.0262415;REFB=0;REVB=-0.0259261;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000608872;OID=.;OPOS=62985544;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr11	63072226	.	C	A	768.46	PASS	AF=0.490683;AO=79;DP=162;FAO=79;FDP=161;FR=.;FRO=82;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=49;FSRR=33;FWDB=0.0285753;FXX=0.0122692;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.6561;QD=19.0922;RBI=0.0433226;REFB=0.00630488;REVB=-0.0325623;RO=80;SAF=40;SAR=39;SRF=47;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742742;STB=0.546516;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=-0.0077207;OID=.;OPOS=63072226;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:161:80:82:79:79:0.490683:39:40:47:33:39:40:49:33
chr11	63129876	.	T	G	740.34	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.978;QD=56.9489;RBI=0.0356208;REFB=0;REVB=-0.000619305;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.87322e-05;OID=.;OPOS=63129876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:24:27:0:0:24:28:0:0
chr11	63258416	.	T	C	799.27	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.868;QD=56.0892;RBI=0.0314238;REFB=0;REVB=0.0283505;RO=0;SAF=37;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185334;OID=.;OPOS=63258416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:57:0:0:54:57:1:17:37:0:0:18:39:0:0
chr11	63313644	.	T	C	1506.02	PASS	AF=0.989796;AO=96;DP=98;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00335962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.68;QD=61.4702;RBI=0.0419274;REFB=0.0049144;REVB=0.0417926;RO=1;SAF=60;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129899;STB=0.504131;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000500671;OID=.;OPOS=63313644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:98:98:1:1:96:97:0.989796:36:60:0:1:37:60:1:0
chr11	63413962	.	AAAAT	A	1100.42	PASS	AF=0.98913;AO=79;DP=88;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0483596;FXX=0.0107515;HRUN=4;LEN=4;MLLD=274.086;QD=47.8443;RBI=0.0496221;REFB=-0.0690132;REVB=0.0111225;RO=0;SAF=35;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.37809e-08;STB=0.506171;STBP=0.303;TYPE=del;VARB=0.000528232;OID=.;OPOS=63413963;OREF=AAAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.98913:79:88:91:92:1:40:51:1:0:13:0:35:44:0:0
chr11	63472391	.	AT	A	85.65	PASS	AF=0.469388;AO=19;DP=45;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0148599;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=10.3066;QD=6.99208;RBI=0.151187;REFB=-0.021476;REVB=0.150455;RO=20;SAF=15;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308996;STB=0.563853;STBP=0.445;TYPE=del;VARB=0.041893;OID=.;OPOS=63472392;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.469388:19:45:23:49:26:15:8:14:12:85:20:15:4:10:10
chr11	63487386	.	T	C	996.39	PASS	AF=0.985714;AO=66;DP=67;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00764547;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.574;QD=56.9364;RBI=0.0126184;REFB=0.0597123;REVB=0.0100385;RO=1;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141028;STB=0.507461;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=3.93757e-05;OID=.;OPOS=63487386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:70:1:1:66:69:0.985714:33:33:0:1:33:36:0:1
chr11	63585804	.	C	A	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0383929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.517;QD=16.8983;RBI=0.0385291;REFB=-0.00453249;REVB=0.00323738;RO=8;SAF=3;SAR=7;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662608;STB=0.576311;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00272883;OID=.;OPOS=63585804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:8:9:10:10:0.526316:7:3:3:5:7:3:4:5
chr11	63661820	.	C	T	689.89	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.867;QD=62.7169;RBI=0.0531921;REFB=0;REVB=0.0244851;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.74519e-05;OID=.;OPOS=63661820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:26:17:0:0:27:17:0:0
chr11	63670244	.	C	A	38.62	PASS	AF=0.32;AO=6;DP=22;FAO=8;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.182304;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=22.2555;QD=6.17887;RBI=0.184083;REFB=-0.0526603;REVB=-0.0255322;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329965;STB=0.642474;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.114504;OID=.;OPOS=63670244;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:22:25:12:16:6:8:0.32:1:5:7:5:2:6:9:7
chr11	63673603	.	CTG	C	54.48	PASS	AF=1;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112477;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=2;MLLD=267.148;QD=36.3171;RBI=0.145924;REFB=0;REVB=0.0929668;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00341387;OID=.;OPOS=63673604;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:7:6:6:0:5:1:0:0:3:0:5:1:0:0
chr11	63681513	.	T	C	715.13	PASS	AF=0.946429;AO=53;DP=56;FAO=53;FDP=56;FR=.;FRO=3;FSAF=52;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0290784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1478;QD=51.0807;RBI=0.0950077;REFB=0.0159163;REVB=0.0904484;RO=3;SAF=52;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264147;STB=0.514013;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=-0.00767997;OID=.;OPOS=63681513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:56:56:3:3:53:53:0.946429:1:52:3:0:1:52:3:0
chr11	63723647	.	A	G	394.11	PASS	AF=0.450549;AO=41;DP=91;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.0262831;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.843;QD=17.3237;RBI=0.031221;REFB=-0.0199158;REVB=-0.0168507;RO=49;SAF=17;SAR=24;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152502;STB=0.590646;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0217001;OID=.;OPOS=63723647;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:49:50:41:41:0.450549:24:17:28:21:24:17:29:21
chr11	63883985	.	T	C	287.59	PASS	AF=0.444444;AO=32;DP=72;FAO=32;FDP=72;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.0482133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.203;QD=15.9773;RBI=0.0483185;REFB=0.00501494;REVB=-0.00318695;RO=35;SAF=18;SAR=14;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119102;STB=0.564477;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=-0.00842362;OID=.;OPOS=63883985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:35:40:32:32:0.444444:14:18:24:11:14:18:27:13
chr11	63884027	.	C	T	193.22	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0147262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.343;QD=16.444;RBI=0.0334093;REFB=-0.0197373;REVB=0.0299887;RO=27;SAF=12;SAR=8;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00771642;STB=0.50442;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0261103;OID=.;OPOS=63884027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:8:12:16:11:8:12:16:11
chr11	63884453	.	C	T	744.16	PASS	AF=0.478528;AO=77;DP=162;FAO=78;FDP=163;FR=.;FRO=85;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=48;FWDB=0.0621079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8413;QD=18.2617;RBI=0.0621238;REFB=-0.0226257;REVB=-0.00140639;RO=85;SAF=50;SAR=27;SRF=37;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207309;STB=0.616805;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0229198;OID=.;OPOS=63884453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:163:85:85:77:78:0.478528:27:50:37:48:27:51:37:48
chr11	63884474	.	C	T	669.51	PASS	AF=0.468966;AO=66;DP=143;FAO=68;FDP=145;FR=.;FRO=77;FSAF=48;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=0.056999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.0107;QD=18.4692;RBI=0.0573414;REFB=-0.040316;REVB=-0.00625716;RO=73;SAF=48;SAR=18;SRF=28;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339103;STB=0.660968;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0447502;OID=.;OPOS=63884474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:145:73:77:66:68:0.468966:18:48:28:45:20:48:32:45
chr11	63885632	.	A	G	738.96	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0875779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2222;QD=54.7378;RBI=0.0876806;REFB=-0.108256;REVB=0.00424168;RO=1;SAF=31;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209328;STB=0.511107;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.010928;OID=.;OPOS=63885632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:22:31:0:1:22:31:0:1
chr11	63885704	.	C	T	145.19	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0495622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0878;QD=16.1318;RBI=0.04958;REFB=-0.0190902;REVB=-0.00132747;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123809;STB=0.571338;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.0326991;OID=.;OPOS=63885704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:6:10:10:10:6:10:10:10
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chr11	63988045	.	G	A	263.11	PASS	AF=0.416667;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0140658;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.983;QD=14.617;RBI=0.0148978;REFB=-0.0258383;REVB=0.00490911;RO=37;SAF=20;SAR=10;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196791;STB=0.559959;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0356065;OID=.;OPOS=63988045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:72:37:42:30:30:0.416667:10:20:24:13:10:20:24:18
chr11	63994312	.	T	TC	52.42	PASS	AF=0.175439;AO=16;DP=60;FAO=10;FDP=57;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0737207;FXX=0.0172384;HRUN=0;LEN=1;MLLD=55.7021;QD=3.67869;RBI=0.0790949;REFB=-0.015598;REVB=-0.0286576;RO=42;SAF=13;SAR=3;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36484;STB=0.714974;STBP=0.17;TYPE=ins;VARB=0.164075;OID=.;OPOS=63994313;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.175439:16:60:10:57:47:8:2:27:20:52:42:13:3:23:19
chr11	63994692	.	T	C	1749.75	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0584311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.627;QD=60.8609;RBI=0.0591091;REFB=0;REVB=0.00892742;RO=0;SAF=32;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43392e-05;OID=.;OPOS=63994692;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:113:115:0:0:113:115:1:81:32:0:0:83:32:0:0
chr11	63994696	.	T	C	1468.45	PASS	AF=0.938053;AO=104;DP=112;FAO=106;FDP=113;FR=.;FRO=7;FSAF=25;FSAR=81;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.0421744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2811;QD=51.9806;RBI=0.0458123;REFB=-0.0180399;REVB=0.0178909;RO=8;SAF=24;SAR=80;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13474;STB=0.561391;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0194465;OID=.;OPOS=63994696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:112:113:8:7:104:106:0.938053:80:24:8:0:81:25:7:0
chr11	63997329	.	A	G	1693.69	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.252;QD=60.4888;RBI=0.0152407;REFB=0;REVB=-0.00692168;RO=0;SAF=48;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.46823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96054e-06;OID=.;OPOS=63997329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:112:0:0:111:112:1:63:48:0:0:63:49:0:0
chr11	63997338	.	T	C	1667.69	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.753;QD=60.0968;RBI=0.0674905;REFB=0;REVB=0.0555485;RO=0;SAF=46;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.73491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.02525e-05;OID=.;OPOS=63997338;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:111:0:0:107:111:1:61:46:0:0:64:47:0:0
chr11	64004692	.	C	T	129.47	PASS	AF=0.8125;AO=13;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0413902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7191;QD=32.368;RBI=0.0876459;REFB=0.00770838;REVB=-0.0772571;RO=3;SAF=5;SAR=8;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.097715;STB=0.55437;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=-0.00749328;OID=.;OPOS=64004692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:16:16:3:3:13:13:0.8125:8:5:2:1:8:5:2:1
chr11	64011441	.	T	C	718.04	PASS	AF=0.981132;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0794626;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.892;QD=54.192;RBI=0.0812221;REFB=-0.0740283;REVB=0.0168147;RO=1;SAF=21;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218935;STB=0.511623;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.000842668;OID=.;OPOS=64011441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:51:52:0.981132:30:21:1:0:31:21:1:0
chr11	64012225	.	G	C	326.16	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00521977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.365;QD=52.1862;RBI=0.0790904;REFB=0;REVB=0.078918;RO=1;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0544279;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000834703;OID=.;OPOS=64012225;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:1:0:24:25:1:8:16:0:1:9:16:0:0
chr11	64014017	.	C	G	39.05	PASS	AF=0.0943396;AO=10;DP=106;FAO=10;FDP=106;FR=.;FRO=96;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=51;FSRR=45;FWDB=-0.0391428;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.093;QD=1.47374;RBI=0.039911;REFB=-0.010109;REVB=-0.00779281;RO=95;SAF=6;SAR=4;SRF=51;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0743435;STB=0.563091;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.0794096;OID=.;OPOS=64014017;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:106:106:95:96:10:10:0.0943396:4:6:51:44:4:6:51:45
chr11	64022459	.	A	G	1768.4	PASS	AF=0.991525;AO=80;DP=110;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0201234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.141;QD=59.9456;RBI=0.0564017;REFB=-0.192041;REVB=0.0526897;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505154;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00100113;OID=.;OPOS=64022459;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:110:118:0:1:80:117:0.991525:37:43:0:0:48:69:0:1
chr11	64023971	.	G	A	553.88	PASS	AF=0.541667;AO=51;DP=96;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=27;FWDB=0.0582488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.84;QD=23.0782;RBI=0.0596661;REFB=-0.0245731;REVB=0.0129277;RO=45;SAF=28;SAR=23;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126388;STB=0.57812;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0186029;OID=.;OPOS=64023971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:45:44:51:52:0.541667:23:28:18:27:23:29:17:27
chr11	64026144	.	G	A	248.19	PASS	AF=0.575;AO=22;DP=41;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0345919;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1937;QD=24.8187;RBI=0.0493387;REFB=-0.0255982;REVB=0.035181;RO=16;SAF=3;SAR=19;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185314;STB=0.543964;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.008869;OID=.;OPOS=64026144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:16:17:22:23:0.575:19:3:2:14:19:4:2:15
chr11	64026685	.	C	T	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0118287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.057;QD=11.8306;RBI=0.0185494;REFB=-0.0168318;REVB=0.0142886;RO=17;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522142;STB=0.552534;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.024834;OID=.;OPOS=64026685;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:17:18:11:11:0.37931:4:7:10:7:4:7:10:8
chr11	64034911	.	G	A	46.28	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00233877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.81;QD=11.5704;RBI=0.00870223;REFB=-0.0141128;REVB=0.00838206;RO=9;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163877;STB=0.5997;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0179588;OID=.;OPOS=64034911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:16:16:9:9:7:7:0.4375:2:5:5:4:2:5:5:4
chr11	64037437	.	A	T	115.63	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0693584;FXX=0.0937207;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.6711;QD=15.9487;RBI=0.0703256;REFB=-0.0188857;REVB=-0.0116233;RO=16;SAF=6;SAR=7;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213164;STB=0.622855;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0366638;OID=.;OPOS=64037437;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:29:16:16:13:13:0.448276:7:6:11:5:7:6:11:5
chr11	64083252	.	T	C	34.67	PASS	AF=0.103896;AO=8;DP=77;FAO=8;FDP=77;FR=.;FRO=69;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.0700625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.496;QD=1.80103;RBI=0.0702588;REFB=-0.00184343;REVB=-0.00524848;RO=66;SAF=2;SAR=6;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.358196;STB=0.781939;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0256361;OID=.;OPOS=64083252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:77:77:66:69:8:8:0.103896:6:2:37:29:6:2:40:29
chr11	64083269	.	G	A	47.27	PASS	AF=0.138462;AO=9;DP=66;FAO=9;FDP=65;FR=.;FRO=56;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.0444997;FXX=0.0151492;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6684;QD=2.90896;RBI=0.0446321;REFB=-0.00807557;REVB=0.00343592;RO=52;SAF=3;SAR=6;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313288;STB=0.69957;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0753731;OID=.;OPOS=64083269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:66:65:52:56:9:9:0.138462:6:3:31:21:6:3:32:24
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chr11	64083293	.	G	T	75.93	PASS	AF=0.22449;AO=11;DP=49;FAO=11;FDP=49;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0043173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.9942;QD=6.19862;RBI=0.0111413;REFB=-0.0132925;REVB=0.0102708;RO=38;SAF=4;SAR=7;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168233;STB=0.607349;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.05236;OID=.;OPOS=64083293;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:49:49:38:38:11:11:0.22449:7:4:19:19:7:4:19:19
chr11	64083295	.	CGGG	C	40.32	PASS	AF=0.212766;AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=47;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0419951;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=3;MLLD=185.054;QD=3.4314;RBI=0.0424207;REFB=-0.0294481;REVB=-0.00599398;RO=35;SAF=4;SAR=6;SRF=21;SRR=14;SSEN=0.426471;SSEP=0;SSSB=-0.23882;STB=0.629996;STBP=0.395;TYPE=del;VARB=0.0720174;OID=.;OPOS=64083296;OREF=GGG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.212766:10:48:10:47:37:4:6:21:16:40:35:4:6:21:14
chr11	64083300	.	G	A	68.44	PASS	AF=0.208333;AO=10;DP=48;FAO=10;FDP=48;FR=.;FRO=38;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0317365;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.782;QD=5.70343;RBI=0.0458382;REFB=-0.0258051;REVB=-0.0330746;RO=38;SAF=4;SAR=6;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185096;STB=0.619598;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0706032;OID=.;OPOS=64083300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:48:48:38:38:10:10:0.208333:6:4:21:17:6:4:21:17
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chr11	64083320	.	T	C	91.49	PASS	AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.012953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.508;QD=8.7134;RBI=0.0132853;REFB=-0.0249452;REVB=-0.00295298;RO=30;SAF=4;SAR=8;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199858;STB=0.622741;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0369289;OID=.;OPOS=64083320;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:42:42:30:30:12:12:0.285714:8:4:15:15:8:4:15:15
chr11	64083328	.	C	T	70.76	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0218033;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.055;QD=7.25718;RBI=0.0325031;REFB=-0.0020609;REVB=0.0241053;RO=29;SAF=3;SAR=7;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300493;STB=0.688737;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0113811;OID=.;OPOS=64083328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:7:3:16:13:7:3:16:13
chr11	64083331	.	C	T	70.45	PASS	AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00112542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.765;QD=7.04514;RBI=0.0229118;REFB=-0.00478117;REVB=-0.0228841;RO=30;SAF=3;SAR=7;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31724;STB=0.6996;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0446768;OID=.;OPOS=64083331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:40:40:30:30:10:10:0.25:7:3:17:13:7:3:17:13
chr11	64084113	.	A	G	876.53	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.287;QD=57.4776;RBI=0.0182322;REFB=0;REVB=0.00612473;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70576e-05;OID=.;OPOS=64084113;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:32:28:0:0:32:29:0:0
chr11	64085785	.	A	G	885.31	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8548;QD=58.0528;RBI=0.0558219;REFB=0;REVB=0.0303625;RO=0;SAF=39;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417584;OID=.;OPOS=64085785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:21:39:0:0:21:40:0:0
chr11	64111928	.	T	C	264.71	PASS	AF=0.568182;AO=22;DP=40;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0132416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.001;QD=24.0644;RBI=0.0192455;REFB=-0.00735372;REVB=0.013966;RO=16;SAF=7;SAR=15;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148256;STB=0.618082;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0103507;OID=.;OPOS=64111928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:44:16:19:22:25:0.568182:15:7:8:8:18:7:10:9
chr11	64116843	.	A	C	727.05	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7611;QD=63.2219;RBI=0.104877;REFB=0;REVB=-0.027317;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000945421;OID=.;OPOS=64116843;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:28:17:0:0:28:18:0:0
chr11	64124757	.	AG	GA	30.23	PASS	AF=0.134615;AO=7;DP=51;FAO=7;FDP=52;FR=.;FRO=45;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=39;FSRR=6;FWDB=-0.00734835;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=107.911;QD=2.32542;RBI=0.0756853;REFB=-0.00406417;REVB=0.0753277;RO=37;SAF=4;SAR=3;SRF=33;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.482868;STB=0.847916;STBP=0.256;TYPE=mnp;VARB=0.196994;OID=.;OPOS=64124757;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:51:52:37:45:7:7:0.134615:3:4:33:4:4:3:39:6
chr11	64137007	.	A	G	349.89	PASS	AF=0.413043;AO=38;DP=92;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=0.00187057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.229;QD=15.2124;RBI=0.00737131;REFB=-0.0193643;REVB=-0.00713002;RO=53;SAF=18;SAR=20;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100364;STB=0.561169;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0313482;OID=.;OPOS=64137007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:53:54:38:38:0.413043:20:18:20:33:20:18:20:34
chr11	64367325	.	A	G	2184.62	PASS	AF=0.993333;AO=119;DP=151;FAO=149;FDP=150;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=60;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410943;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3499;QD=58.2565;RBI=0.0460848;REFB=0;REVB=0.0208583;RO=0;SAF=46;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00569893;OID=.;OPOS=64367325;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:151:150:0:0:119:149:0.993333:73:46:0:0:89:60:0:0
chr11	64367862	.	T	C	372.15	PASS	AF=0.550725;AO=31;DP=69;FAO=38;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=32;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0512714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.2018;QD=21.574;RBI=0.0518626;REFB=-0.0670798;REVB=0.00780871;RO=29;SAF=27;SAR=4;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.400278;STB=0.669501;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0573297;OID=.;OPOS=64367862;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:29:31:31:38:0.550725:4:27:16:13:6:32:18:13
chr11	64415767	.	G	A	305.62	PASS	AF=0.658537;AO=26;DP=41;FAO=27;FDP=41;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0519517;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2351;QD=29.8169;RBI=0.0519655;REFB=-0.0543129;REVB=-0.00119576;RO=13;SAF=14;SAR=12;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471745;STB=0.530364;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0489127;OID=.;OPOS=64415767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:13:14:26:27:0.658537:12:14:8:5:12:15:9:5
chr11	64453268	.	G	A	565.57	PASS	AF=0.475806;AO=59;DP=123;FAO=59;FDP=124;FR=.;FRO=65;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.0140116;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.203;QD=18.2442;RBI=0.0140444;REFB=-0.046698;REVB=0.000959069;RO=59;SAF=24;SAR=35;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158389;STB=0.529402;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0499962;OID=.;OPOS=64453268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:124:59:65:59:59:0.475806:35:24:25:34:35:24:30:35
chr11	64496357	.	G	T	568.1	PASS	AF=0.517857;AO=57;DP=111;FAO=58;FDP=112;FR=.;FRO=54;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=23;FWDB=0.00866915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.987;QD=20.2894;RBI=0.0405113;REFB=-0.0152495;REVB=0.0395729;RO=53;SAF=35;SAR=22;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266753;STB=0.523586;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.0210498;OID=.;OPOS=64496357;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:112:53:54:57:58:0.517857:22:35:31:22:22:36:31:23
chr11	64507680	.	A	C	323.17	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.049652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.8731;QD=53.8615;RBI=0.0638011;REFB=0;REVB=0.0400658;RO=0;SAF=21;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.86584e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203132;OID=.;OPOS=64507680;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:3:21:0:0:3:21:0:0
chr11	64511050	.	G	C	344.99	PASS	AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.030611;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.204;QD=22.6225;RBI=0.0344521;REFB=-0.0770695;REVB=0.0158087;RO=26;SAF=12;SAR=23;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158268;STB=0.587375;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.020853;OID=.;OPOS=64511050;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:23:12:14:12:23:12:14:12
chr11	64519062	.	T	C	35.12	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.0209068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.4584;QD=5.20366;RBI=0.0349546;REFB=-0.0301736;REVB=0.0280131;RO=21;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257094;STB=0.666173;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0946229;OID=.;OPOS=64519062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:3:3:6:15:3:3:6:15
chr11	64543927	.	G	GT	237.36	PASS	AF=0.522388;AO=33;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0967632;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.4114;QD=14.171;RBI=0.101684;REFB=0.0128118;REVB=0.0312489;RO=33;SAF=14;SAR=19;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822204;STB=0.564066;STBP=0.297;TYPE=ins;VARB=-0.0154684;OID=.;OPOS=64543928;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.522388:33:67:35:67:32:15:20:18:14:99:33:14:19:17:16
chr11	64559898	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.953;QD=47.8223;RBI=0.0354995;REFB=0;REVB=0.0338605;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312258;OID=.;OPOS=64559898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:4:12:0:0:4:12:0:0
chr11	64572018	.	T	C	188.04	PASS	AF=0.369231;AO=22;DP=63;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0162054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5248;QD=11.5714;RBI=0.0308119;REFB=-0.0183605;REVB=0.026206;RO=40;SAF=8;SAR=14;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716134;STB=0.514424;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0345727;OID=.;OPOS=64572018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:65:40:41:22:24:0.369231:14:8:17:23:14:10:18:23
chr11	64572557	.	A	G	735.76	PASS	AF=1;AO=49;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.339;QD=56.5967;RBI=0.0497539;REFB=0;REVB=0.0390196;RO=0;SAF=33;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000634782;OID=.;OPOS=64572557;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:49:52:1:16:33:0:0:16:36:0:0
chr11	64597201	.	G	A	116.0	PASS	AF=0.75;AO=12;DP=17;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0264811;FXX=0.0587889;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.134;QD=29.001;RBI=0.0711656;REFB=-0.022704;REVB=0.0660553;RO=4;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0776539;STB=0.543407;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.0057569;OID=.;OPOS=64597201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:17:16:4:4:12:12:0.75:5:7:3:1:5:7:3:1
chr11	64597205	.	G	T	175.49	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0838988;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9411;QD=46.7962;RBI=0.127834;REFB=0;REVB=0.0964497;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00648068;OID=.;OPOS=64597205;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:14:15:1:5:9:0:0:5:10:0:0
chr11	64601933	.	T	C	411.07	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00592719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.088;QD=56.6991;RBI=0.00723741;REFB=0;REVB=-0.00415313;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.17809e-05;OID=.;OPOS=64601933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr11	64621856	.	A	G	357.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.531;QD=54.9958;RBI=0.0435614;REFB=0;REVB=0.0404461;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196376;OID=.;OPOS=64621856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:13:11:0:0:15:11:0:0
chr11	64622869	.	G	C	310.98	PASS	AF=0.416667;AO=34;DP=83;FAO=35;FDP=84;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0376294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.414;QD=14.8087;RBI=0.0419056;REFB=-0.00836293;REVB=-0.0184419;RO=49;SAF=12;SAR=22;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168608;STB=0.582936;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0100416;OID=.;OPOS=64622869;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:49:49:34:35:0.416667:22:12:25:24:22:13:25:24
chr11	64645871	.	A	G	197.7	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0205708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.617;QD=18.8286;RBI=0.0205714;REFB=-0.0173001;REVB=0.000157519;RO=22;SAF=6;SAR=14;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315835;STB=0.679429;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0178247;OID=.;OPOS=64645871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:14:6:14:8:14:6:14:8
chr11	64656757	.	G	A	133.84	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.039955;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.5144;QD=16.7293;RBI=0.0440362;REFB=-0.0258514;REVB=0.0185145;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0458804;STB=0.526281;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0476418;OID=.;OPOS=64656757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:6:9:11:6:6:9:11:6
chr11	64677293	.	G	C	253.57	PASS	AF=0.913043;AO=19;DP=22;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0171405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.881;QD=44.0993;RBI=0.0286214;REFB=-0.00319059;REVB=0.0229213;RO=2;SAF=6;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366475;STB=0.522366;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.000689764;OID=.;OPOS=64677293;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:22:23:2:2:19:21:0.913043:13:6:1:1:15:6:1:1
chr11	64680819	.	G	A	294.61	PASS	AF=0.525424;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0101757;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.785;QD=19.9736;RBI=0.0652442;REFB=-0.018464;REVB=0.0644458;RO=27;SAF=10;SAR=21;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34668;STB=0.699122;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0300236;OID=.;OPOS=64680819;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:27:28:31:31:0.525424:21:10:20:7:21:10:21:7
chr11	64695360	.	G	A	169.1	PASS	AF=0.291139;AO=23;DP=79;FAO=23;FDP=79;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=-0.0101474;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.06;QD=8.56201;RBI=0.0111857;REFB=-0.00797539;REVB=-0.00470637;RO=55;SAF=14;SAR=9;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118492;STB=0.501154;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0252472;OID=.;OPOS=64695360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:55:56:23:23:0.291139:9:14:34:21:9:14:34:22
chr11	64820695	.	T	G	542.27	PASS	AF=0.377907;AO=64;DP=169;FAO=65;FDP=172;FR=.;FRO=107;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=57;FSRR=50;FWDB=-0.0018904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.642;QD=12.6109;RBI=0.0434071;REFB=-0.0223345;REVB=-0.0433659;RO=105;SAF=30;SAR=34;SRF=57;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.081166;STB=0.544222;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.0342069;OID=.;OPOS=64820695;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:172:105:107:64:65:0.377907:34:30:57:48:35:30:57:50
chr11	64851453	.	CTTA	CT,CTA	82.36	PASS	AF=0,0.5;AO=3,9;DP=24;FAO=0,12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=0,7;FSAR=0,5;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0719638,-0.0831338;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=96.9045,24.6973;QD=13.7258;RBI=0.0724273,0.117809;REFB=0.0252601,0.0135009;REVB=-0.00818067,-0.0834732;RO=11;SAF=2,5;SAR=1,4;SRF=9;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.213228,-0.259998;STB=0.5,0.634129;STBP=1,0.265;TYPE=del,del;VARB=0,-0.0297244;OID=.,.;OPOS=64851455,64851454;OREF=TA,T;OALT=-,-;OMAPALT=CT,CTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.5:3,9:24:0,12:24:12:0,7:0,5:10:2:78:11:2,5:1,4:9:2
chr11	64852421	.	T	C	198.98	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=27;FWDB=-0.0459404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.7446;QD=13.4899;RBI=0.0491151;REFB=-0.0133762;REVB=-0.0173718;RO=35;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321032;STB=0.681244;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0154714;OID=.;OPOS=64852421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:11:13:8:27:11:13:8:27
chr11	64856500	.	A	G	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.369;QD=39.2066;RBI=0.0372606;REFB=0;REVB=0.0354575;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000710955;OID=.;OPOS=64856500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
chr11	64878660	.	CT	CC,C	959.02	PASS	AF=0.940299,0.0597015;AO=57,8;DP=67;FAO=63,4;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=21,2;FSAR=42,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132396,0.117508;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=34.4441,22.4575;QD=57.2552;RBI=0.133229,0.122036;REFB=0,0;REVB=0.014879,0.0329339;RO=0;SAF=16,6;SAR=41,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.92381e-08,5.58669e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.00874447,-0.0221689;OID=.,.;OPOS=64878661,64878661;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.940299,0.0597015:57,8:67:63,4:67:0:21,2:42,2:0:0:10:0:16,6:41,2:0:0
chr11	64880090	.	G	C	74.92	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00875119;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.3795;QD=37.4607;RBI=0.00968935;REFB=0;REVB=0.00415935;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000287547;OID=.;OPOS=64880090;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr11	64884052	.	G	A	641.3	PASS	AF=0.581633;AO=57;DP=99;FAO=57;FDP=98;FR=.;FRO=41;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=0.0118707;FXX=0.0101;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.565;QD=26.1756;RBI=0.0140342;REFB=-0.0315413;REVB=-0.00748632;RO=35;SAF=28;SAR=29;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0639515;STB=0.552547;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0199766;OID=.;OPOS=64884052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:98:35:41:57:57:0.581633:29:28:14:21:29:28:15:26
chr11	64895202	.	A	G	416.69	PASS	AF=0.406504;AO=50;DP=121;FAO=50;FDP=123;FR=.;FRO=73;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=50;FSRR=23;FWDB=-0.0303166;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.319;QD=13.5509;RBI=0.0334037;REFB=-0.0130573;REVB=-0.0140253;RO=63;SAF=26;SAR=24;SRF=42;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147876;STB=0.59878;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0320735;OID=.;OPOS=64895202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:123:63:73:50:50:0.406504:24:26:42:21:24:26:50:23
chr11	64948277	.	A	C	282.4	PASS	AF=0.362637;AO=33;DP=91;FAO=33;FDP=91;FR=.;FRO=58;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=48;FSRR=10;FWDB=-0.0252162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8667;QD=12.4132;RBI=0.0253236;REFB=0.0170812;REVB=-0.00232994;RO=58;SAF=18;SAR=15;SRF=48;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33346;STB=0.687406;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.0156136;OID=.;OPOS=64948277;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:58:58:33:33:0.362637:15:18:48:10:15:18:48:10
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chr11	64981472	.	G	A	267.59	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0726577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.724;QD=21.8441;RBI=0.0726644;REFB=-0.0221998;REVB=-0.000982526;RO=24;SAF=13;SAR=12;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189832;STB=0.51063;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0272604;OID=.;OPOS=64981472;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:12:13:13:11:12:13:13:11
chr11	64981522	.	C	A	201.06	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=42;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0165694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.388;QD=19.1482;RBI=0.0389714;REFB=-0.000123896;REVB=0.0352736;RO=22;SAF=10;SAR=10;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839961;STB=0.523895;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.000236298;OID=.;OPOS=64981522;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:21:20:21:0.5:10:10:9:13:11:10:9:12
chr11	64981587	.	G	A	210.06	PASS	AF=0.440678;AO=21;DP=57;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00920727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.639;QD=14.2416;RBI=0.00944813;REFB=-0.0199279;REVB=0.00211975;RO=32;SAF=8;SAR=13;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222055;STB=0.58025;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0415384;OID=.;OPOS=64981587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:59:32:33:21:26:0.440678:13:8:19:13:14:12:20:13
chr11	64981837	.	C	T	229.42	PASS	AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=0.00257473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.529;QD=14.1182;RBI=0.028106;REFB=-0.0306085;REVB=0.0279878;RO=38;SAF=15;SAR=12;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136675;STB=0.57741;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0345451;OID=.;OPOS=64981837;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:12:15:26:12:12:15:26:12
chr11	64990041	.	G	C	255.16	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0685312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.836;QD=22.188;RBI=0.0685474;REFB=-0.0330851;REVB=-0.00149423;RO=22;SAF=10;SAR=14;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130086;STB=0.572461;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0477437;OID=.;OPOS=64990041;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:22:22:24:24:0.521739:14:10:6:16:14:10:6:16
chr11	65000719	.	C	T	50.07	PASS	AF=0.186047;AO=8;DP=42;FAO=8;FDP=43;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0110366;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=176.769;QD=4.65738;RBI=0.011158;REFB=0.000339694;REVB=-0.00164155;RO=34;SAF=2;SAR=6;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14704;STB=0.616127;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.00341872;OID=.;OPOS=65000719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:42:43:34:35:8:8:0.186047:6:2:12:22:6:2:13:22
chr11	65004301	.	G	T	590.01	PASS	AF=0.508333;AO=57;DP=116;FAO=61;FDP=120;FR=.;FRO=59;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=25;FWDB=0.040713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9112;QD=19.6671;RBI=0.0550804;REFB=-0.0418977;REVB=0.0370986;RO=59;SAF=34;SAR=23;SRF=34;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192171;STB=0.515491;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0483559;OID=.;OPOS=65004301;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:120:59:59:57:61:0.508333:23:34:34:25:24:37:34:25
chr11	65064690	.	G	A	264.69	PASS	AF=0.517857;AO=28;DP=54;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.00232985;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.197;QD=18.9063;RBI=0.0349637;REFB=-0.0238735;REVB=-0.034886;RO=25;SAF=11;SAR=17;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175974;STB=0.568726;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0257654;OID=.;OPOS=65064690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:56:25:27:28:29:0.517857:17:11:15:10:17:12:15:12
chr11	65089791	.	T	TC	509.92	PASS	AF=1;AO=4;DP=38;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04013;FXX=0.0270197;HRUN=0;LEN=1;MLLD=32.8346;QD=56.6573;RBI=0.0969977;REFB=0;REVB=0.088307;RO=33;SAF=3;SAR=1;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108859;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00433045;OID=.;OPOS=65089792;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:38:36:36:0:24:12:0:0:4:33:3:1:22:11
chr11	65089792	.	G	C	445.42	PASS	AF=0.891892;AO=32;DP=36;FAO=33;FDP=37;FR=.;FRO=4;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00191192;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.0194;QD=48.1539;RBI=0.0151652;REFB=-0.104795;REVB=0.0150442;RO=4;SAF=21;SAR=11;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216306;STB=0.513361;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0118264;OID=.;OPOS=65089792;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:36:37:4:4:32:33:0.891892:11:21:3:1:12:21:3:1
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chr11	65124992	.	A	T	261.03	PASS	AF=0.369048;AO=31;DP=84;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=0.00787997;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=319.014;QD=12.43;RBI=0.026347;REFB=-0.00329691;REVB=-0.025141;RO=53;SAF=18;SAR=13;SRF=36;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114046;STB=0.565177;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00744932;OID=.;OPOS=65124992;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:53:53:31:31:0.369048:13:18:36:17:13:18:36:17
chr11	65144075	.	T	C	613.36	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.733;QD=61.3362;RBI=0.0458631;REFB=0;REVB=0.00713447;RO=0;SAF=10;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194402;OID=.;OPOS=65144075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:29:10:0:0:30:10:0:0
chr11	65168281	.	C	T	823.12	PASS	AF=0.562963;AO=75;DP=137;FAO=76;FDP=135;FR=.;FRO=59;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.0114308;FXX=0.0217376;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.931;QD=24.3886;RBI=0.0223481;REFB=-0.0312502;REVB=0.0192035;RO=59;SAF=44;SAR=31;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0503987;STB=0.529826;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0181348;OID=.;OPOS=65168281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:135:59:59:75:76:0.562963:31:44:31:28:31:45:31:28
chr11	65180883	.	A	G	1504.65	PASS	AF=1;AO=94;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115546;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.351;QD=63.3535;RBI=0.0253088;REFB=0;REVB=0.0225173;RO=0;SAF=30;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.06775e-05;OID=.;OPOS=65180883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:95:0:0:94:95:1:64:30:0:0:65:30:0:0
chr11	65211940	.	C	A	424.09	PASS	AF=0.518072;AO=40;DP=82;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=9;FWDB=0.0821133;FXX=0.0235266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.0695;QD=20.438;RBI=0.130203;REFB=-0.0352986;REVB=0.101045;RO=41;SAF=24;SAR=16;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179262;STB=0.589019;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0363382;OID=.;OPOS=65211940;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:41:40:40:43:0.518072:16:24:32:9:17:26:31:9
chr11	65211979	.	G	A	400.16	PASS	AF=0.435644;AO=44;DP=101;FAO=44;FDP=101;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.082424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8101;QD=15.8477;RBI=0.122397;REFB=-0.0273343;REVB=0.090484;RO=57;SAF=30;SAR=14;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201788;STB=0.613648;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0377995;OID=.;OPOS=65211979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:57:57:44:44:0.435644:14:30:28:29:14:30:28:29
chr11	65222952	.	T	C	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.921;QD=60.6097;RBI=0.0422703;REFB=0;REVB=0.0379266;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159112;OID=.;OPOS=65222952;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0
chr11	65307852	.	G	A	165.92	PASS	AF=0.280488;AO=23;DP=82;FAO=23;FDP=82;FR=.;FRO=59;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=41;FSRR=18;FWDB=0.0345256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6943;QD=8.09384;RBI=0.0491827;REFB=-0.0126111;REVB=-0.0350273;RO=58;SAF=7;SAR=16;SRF=41;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.457171;STB=0.763211;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0223241;OID=.;OPOS=65307852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:58:59:23:23:0.280488:16:7:41:17:16:7:41:18
chr11	65347636	.	G	C	815.67	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00459064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6317;QD=57.2401;RBI=0.0905605;REFB=0;REVB=0.0904441;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00095829;OID=.;OPOS=65347636;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
chr11	65349849	.	A	T	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.873;QD=37.4885;RBI=0.0190788;REFB=0;REVB=-0.000705189;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00130642;OID=.;OPOS=65349849;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr11	65359257	.	C	G	306.27	PASS	AF=0.923077;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00157676;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=253.497;QD=47.1178;RBI=0.0217155;REFB=-0.0146753;REVB=0.0216582;RO=2;SAF=1;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284913;STB=0.656975;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.000856379;OID=.;OPOS=65359257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:26:26:2:2:24:24:0.923077:23:1:1:1:23:1:1:1
chr11	65380916	.	G	A	728.48	PASS	AF=0.569106;AO=70;DP=123;FAO=70;FDP=123;FR=.;FRO=53;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.00670887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2459;QD=23.6903;RBI=0.00891526;REFB=-0.0678514;REVB=0.00587137;RO=48;SAF=40;SAR=30;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00909921;STB=0.505937;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0441144;OID=.;OPOS=65380916;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:48:53:70:70:0.569106:30:40:28:20:30:40:31:22
chr11	65383896	.	G	C	1480.36	PASS	AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0341628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1083;QD=58.6281;RBI=0.0456756;REFB=-0.0983173;REVB=-0.0303176;RO=0;SAF=54;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21299e-08;STB=0.505375;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.000422108;OID=.;OPOS=65383896;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:101:0:1:100:100:0.990099:46:54:0:0:46:54:0:1
chr11	65384727	.	C	T	431.02	PASS	AF=0.44898;AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=31;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=0.00464481;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.003;QD=17.5925;RBI=0.00516802;REFB=-0.0104248;REVB=0.00226586;RO=53;SAF=13;SAR=31;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.35784;STB=0.695888;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00927689;OID=.;OPOS=65384727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:53:54:44:44:0.44898:31:13:35:18:31:13:35:19
chr11	65385606	.	A	G	1549.21	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00435714;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.388;QD=59.5849;RBI=0.0043917;REFB=0;REVB=0.000549892;RO=0;SAF=41;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.25502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.47804e-05;OID=.;OPOS=65385606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:104:0:0:101:104:1:60:41:0:0:60:44:0:0
chr11	65387012	.	C	T	242.11	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.00628214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.09;QD=16.9902;RBI=0.0220182;REFB=-0.0357824;REVB=0.0211029;RO=29;SAF=18;SAR=9;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240726;STB=0.519985;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0403777;OID=.;OPOS=65387012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:30:27:27:0.473684:9:18:20:9:9:18:21:9
chr11	65387378	.	T	A	385.65	PASS	AF=0.493671;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=11;FWDB=-0.0619449;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5662;QD=19.5265;RBI=0.06859;REFB=-0.0139849;REVB=0.0294519;RO=40;SAF=21;SAR=18;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174202;STB=0.596375;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0107438;OID=.;OPOS=65387378;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:79:40:40:39:39:0.493671:18:21:29:11:18:21:29:11
chr11	65408708	.	G	T	86.79	PASS	AF=0.423077;AO=10;DP=25;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00603788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.19;QD=13.3516;RBI=0.030961;REFB=-0.0270134;REVB=0.0303665;RO=15;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13532;STB=0.599815;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0211551;OID=.;OPOS=65408708;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:25:26:15:15:10:11:0.423077:4:6:7:8:4:7:7:8
chr11	65408937	.	C	T	435.39	PASS	AF=0.714286;AO=39;DP=55;FAO=40;FDP=56;FR=.;FRO=16;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0568933;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.9694;QD=31.0992;RBI=0.0573016;REFB=-0.0148579;REVB=-0.0068284;RO=16;SAF=28;SAR=11;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134643;STB=0.575117;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.00904395;OID=.;OPOS=65408937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:16:16:39:40:0.714286:11:28:8:8:11:29:8:8
chr11	65423082	.	G	A	1454.99	PASS	AF=0.989362;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.014333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2395;QD=61.9143;RBI=0.0259254;REFB=0.0203721;REVB=-0.021603;RO=0;SAF=71;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50273e-08;STB=0.503496;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=-0.00153655;OID=.;OPOS=65423082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:94:0:1:92:93:0.989362:21:71:0:0:22:71:1:0
chr11	65563501	.	TTA	T,TT,TTT	231.19	PASS	AF=0.222222,0.177778,0.111111;AO=5,7,10;DP=49;FAO=10,8,5;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=1,6,3;FSAR=9,2,2;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.000320929,0.000235826,-6.91187e-05;FXX=0.081616;HRUN=4,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=251.179,258.219,257.413;QD=20.5497;RBI=0.034117,0.0334591,0.0318408;REFB=-0.0188058,-0.0173317,-0.0166149;REVB=0.0341155,0.0334582,0.0318407;RO=26;SAF=2,5,5;SAR=3,2,5;SRF=14;SRR=12;SSEN=0.482828,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.160848,0.220979,-0.0447464;STB=0.802826,0.749375,0.651587;STBP=0.042,0.119,0.513;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00130615,0.0177958,0.0236974;OID=.,.,.;OPOS=65563502,65563503,65563503;OREF=TA,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.222222,0.177778,0.111111:5,7,10:49:10,8,5:45:22:1,6,3:9,2,2:9:13:36:26:2,5,5:3,2,5:14:12
chr11	65617113	.	AGGGGGT	AGGGGT,AGGGGTC,AGGGT,CAGGGGT	449.06	PASS	AF=1,0,0,0;AO=25,4,4,3;DP=37;FAO=40,0,0,0;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20,0,0,0;FSAR=20,0,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128871,-0.113625,0.0691212,0.0181217;FXX=0;HRUN=5,5,5,1;LEN=1,2,2,2;MLLD=15.3057,80.5271,8.32852,6.17256;QD=44.9061;RBI=0.243451,0.114196,0.129406,0.1241;REFB=-0.0282046,-0.0348743,-0.0403603,0.0207693;REVB=-0.206545,-0.0114009,-0.109399,-0.12277;RO=1;SAF=13,4,0,2;SAR=12,0,4,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.0343588,0,-0.749895,-0.163246;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,mnp,del,mnp;VARB=-0.0016446,0,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=65617114,65617118,65617114,65617113;OREF=G,GT,GG,AG;OALT=-,TC,-,CA;OMAPALT=AGGGGT,AGGGGTC,AGGGT,CAGGGGT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:37:40:1:0:25,4,4,3:40,0,0,0:1,0,0,0:12,0,4,1:13,4,0,2:1:0:20,0,0,0:20,0,0,0:0:0
chr11	65636053	.	T	C	357.99	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00833615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.062;QD=55.0751;RBI=0.0365701;REFB=0;REVB=0.0356073;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002065;OID=.;OPOS=65636053;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0
chr11	65649774	.	A	G	728.96	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00715762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1637;QD=57.1734;RBI=0.014772;REFB=0;REVB=-0.0129222;RO=0;SAF=34;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.16925e-05;OID=.;OPOS=65649774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:17:34:0:0:17:34:0:0
chr11	65649984	.	T	C	191.62	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.000793496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.065;QD=15.6426;RBI=0.046465;REFB=-0.00568395;REVB=0.0464582;RO=28;SAF=13;SAR=7;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261118;STB=0.640516;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00668145;OID=.;OPOS=65649984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:29:20:20:0.408163:7:13:11:17:7:13:12:17
chr11	65655393	.	G	C	208.25	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0147214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.631;QD=14.1183;RBI=0.0168963;REFB=-0.00173529;REVB=0.00829254;RO=33;SAF=4;SAR=21;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477432;STB=0.782359;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00194325;OID=.;OPOS=65655393;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:33:34:25:25:0.423729:21:4:19:14:21:4:20:14
chr11	65664346	.	T	C	300.59	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0167544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.817;QD=23.1224;RBI=0.018128;REFB=-0.0105631;REVB=-0.00692219;RO=22;SAF=19;SAR=11;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00249917;STB=0.50138;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.00863854;OID=.;OPOS=65664346;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:22:22:30:30:0.576923:11:19:14:8:11:19:14:8
chr11	65684929	.	C	T	700.88	PASS	AF=0.945455;AO=52;DP=55;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0389119;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=326.962;QD=50.9728;RBI=0.0390648;REFB=-0.0844494;REVB=0.00345228;RO=1;SAF=25;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018468;STB=0.510143;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.000270261;OID=.;OPOS=65684929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:55:55:1:3:52:52:0.945455:27:25:1:0:27:25:2:1
chr11	65685225	.	T	C	613.34	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00212749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.743;QD=61.3341;RBI=0.0347111;REFB=0;REVB=-0.0346458;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.89309e-05;OID=.;OPOS=65685225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0
chr11	65713207	.	T	C	800.15	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.882;QD=57.1536;RBI=0.0331965;REFB=0;REVB=-0.0234396;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000134775;OID=.;OPOS=65713207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:21:35:0:0:21:35:0:0
chr11	65727301	.	A	G	210.71	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.00389986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.707;QD=19.1551;RBI=0.0578082;REFB=-0.00599466;REVB=-0.0576765;RO=23;SAF=16;SAR=5;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284167;STB=0.516113;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0120752;OID=.;OPOS=65727301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:5:16:17:6:5:16:17:6
chr11	65732651	.	G	A	339.54	PASS	AF=0.530303;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.0390189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.946;QD=20.578;RBI=0.0421093;REFB=-0.0541096;REVB=0.0158341;RO=31;SAF=19;SAR=16;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882078;STB=0.548785;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0377529;OID=.;OPOS=65732651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:31:31:35:35:0.530303:16:19:20:11:16:19:20:11
chr11	65733393	.	C	T	481.73	PASS	AF=0.468468;AO=51;DP=110;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=0.00690214;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.541;QD=17.3596;RBI=0.00696121;REFB=-0.0199461;REVB=-0.00090499;RO=58;SAF=22;SAR=29;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496702;STB=0.526342;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0186452;OID=.;OPOS=65733393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:58:59:51:52:0.468468:29:22:28:30:29:23:29:30
chr11	65735174	.	G	C	178.62	PASS	AF=0.73913;AO=17;DP=23;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00539331;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=186.764;QD=31.0644;RBI=0.00717297;REFB=-0.0245336;REVB=-0.00472903;RO=6;SAF=3;SAR=14;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218446;STB=0.622061;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0110786;OID=.;OPOS=65735174;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:6:6:17:17:0.73913:14:3:3:3:14:3:3:3
chr11	65765866	.	C	G	212.6	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0532284;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.2113;QD=19.3269;RBI=0.0634854;REFB=-0.0378789;REVB=-0.0345998;RO=22;SAF=14;SAR=7;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0633716;STB=0.543819;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0448697;OID=.;OPOS=65765866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:22:23:21:21:0.477273:7:14:16:6:7:14:17:6
chr11	65788072	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00775215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.132;QD=46.848;RBI=0.060723;REFB=0;REVB=0.0602261;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000537183;OID=.;OPOS=65788072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr11	65790527	.	G	T	336.54	PASS	AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.023413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.8339;QD=28.6418;RBI=0.0235742;REFB=-0.046856;REVB=-0.00275205;RO=18;SAF=21;SAR=8;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29003;STB=0.660261;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0300141;OID=.;OPOS=65790527;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:8:21:6:12:8:21:6:12
chr11	65793454	.	C	T	174.09	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0018998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.691;QD=19.3436;RBI=0.00255357;REFB=-0.00187866;REVB=0.00170631;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0591057;STB=0.528271;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.00151408;OID=.;OPOS=65793454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:18:18:18:0.5:8:10:10:6:8:10:11:7
chr11	65809875	.	C	A	879.36	PASS	AF=0.914286;AO=64;DP=70;FAO=64;FDP=70;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00386366;FXX=0.0140825;HRUN=4;LEN=1;MLLD=77.2824;QD=50.249;RBI=0.0128573;REFB=-0.158002;REVB=-0.012263;RO=4;SAF=35;SAR=29;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227808;STB=0.524879;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.00365841;OID=.;OPOS=65809875;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:70:70:4:6:64:64:0.914286:29:35:3:1:29:35:5:1
chr11	65810209	.	C	T	291.61	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116217;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.253;QD=53.0208;RBI=0.11629;REFB=0;REVB=0.00410903;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000458373;OID=.;OPOS=65810209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:21:22:1:12:9:0:0:12:10:0:0
chr11	65810749	.	T	C	465.13	PASS	AF=1;AO=28;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.881;QD=58.1411;RBI=0.0647935;REFB=0;REVB=0.0616186;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000232144;OID=.;OPOS=65810749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:28:32:1:13:15:0:0:17:15:0:0
chr11	65819899	.	T	TGCC	411.62	PASS	AF=0.482759;AO=38;DP=100;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=33;FSAR=9;FSRF=39;FSRR=6;FWDB=-0.0608409;FXX=0.0439512;HRUN=1;LEN=3;MLLD=106.294;QD=18.9249;RBI=0.063213;REFB=-0.0471386;REVB=-0.0171541;RO=55;SAF=33;SAR=5;SRF=46;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0685895;STB=0.5669;STBP=0.374;TYPE=ins;VARB=0.0557736;OID=.;OPOS=65819900;OREF=-;OALT=GCC;OMAPALT=TGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.482759:38:100:42:87:45:33:9:39:6:99:55:33:5:46:9
chr11	65820673	.	A	G	640.24	PASS	AF=0.455172;AO=66;DP=144;FAO=66;FDP=145;FR=.;FRO=79;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=0.0235491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.162;QD=17.6617;RBI=0.0237358;REFB=-0.0202166;REVB=0.0029716;RO=77;SAF=42;SAR=24;SRF=38;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142865;STB=0.564403;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0320125;OID=.;OPOS=65820673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:145:77:79:66:66:0.455172:24:42:38:39:25:41:40:39
chr11	65868310	.	T	A	481.97	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=4.45281e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3151;QD=58.4208;RBI=0.0975526;REFB=0;REVB=-0.0975526;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00169606;OID=.;OPOS=65868310;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr11	65985000	.	A	C	566.88	PASS	AF=0.884615;AO=45;DP=52;FAO=46;FDP=52;FR=.;FRO=6;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0125331;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1571;QD=43.6059;RBI=0.0151486;REFB=-0.201842;REVB=-0.00850892;RO=6;SAF=27;SAR=18;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603032;STB=0.510305;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.0118063;OID=.;OPOS=65985000;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:52:52:6:6:45:46:0.884615:18:27:2:4:19:27:3:3
chr11	66010633	.	T	C	653.15	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.824;QD=60.758;RBI=0.0208831;REFB=0;REVB=-0.00404039;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280036;OID=.;OPOS=66010633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:41:43:1:21:20:0:0:22:21:0:0
chr11	66035286	.	CA	C	583.81	PASS	AF=1;AO=38;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0059756;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5812;QD=59.878;RBI=0.0837765;REFB=0;REVB=-0.0835631;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000599453;OID=.;OPOS=66035287;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:38:40:39:39:0:19:20:0:0:4:0:19:19:0:0
chr11	66083129	.	T	C	48.87	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.000826323;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.816;QD=11.4987;RBI=0.0311367;REFB=-0.0203649;REVB=-0.0311257;RO=10;SAF=1;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.558176;STB=0.841088;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0551644;OID=.;OPOS=66083129;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:18:17:10:10:7:7:0.411765:6:1:7:3:6:1:7:3
chr11	66083170	.	TGAG	T	41.65	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0181855;FXX=0.124948;HRUN=1;LEN=3;MLLD=268.728;QD=7.93407;RBI=0.0230082;REFB=-0.00674679;REVB=0.0140948;RO=14;SAF=5;SAR=1;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41176;STB=0.753765;STBP=0.192;TYPE=del;VARB=0.00853439;OID=.;OPOS=66083171;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.285714:6:21:6:21:15:5:1:8:7:41:14:5:1:7:7
chr11	66083782	.	G	A	182.8	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0224875;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.805;QD=13.2945;RBI=0.0343979;REFB=-0.0188343;REVB=0.0260294;RO=31;SAF=10;SAR=12;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289983;STB=0.66006;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.030534;OID=.;OPOS=66083782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:31:33:22:22:0.4:12:10:23:8:12:10:24:9
chr11	66099987	.	C	G,T	637.79	PASS	AF=0.047619,0.952381;AO=2,40;DP=42;FAO=2,40;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12;FSAR=2,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139491,0.0213496;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=19.0366,108.024;QD=60.742;RBI=0.0148806,0.0320441;REFB=0,0;REVB=-0.0051823,0.023896;RO=0;SAF=0,12;SAR=2,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0372612,0.000871535;OID=.,.;OPOS=66099987,66099987;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:42:42:0:0:2,40:2,40:0.047619,0.952381:2,28:0,12:0:0:2,28:0,12:0:0
chr11	66100152	.	T	C	1087.6	PASS	AF=1;AO=71;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00661579;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3127;QD=59.5945;RBI=0.126316;REFB=0;REVB=0.126143;RO=1;SAF=39;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145478;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102891;OID=.;OPOS=66100152;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:1:0:71:73:1:32:39:0:1:34:39:0:0
chr11	66105194	.	G	A	353.19	PASS	AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0150157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.483;QD=23.9447;RBI=0.0722011;REFB=-0.0242336;REVB=0.0706224;RO=24;SAF=25;SAR=10;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267512;STB=0.64758;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00902067;OID=.;OPOS=66105194;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:10:25:9:15:10:25:9:15
chr11	66106171	.	G	T	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00832392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6862;QD=12.8608;RBI=0.0174838;REFB=0.0314532;REVB=0.0153752;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.488979;STB=0.799039;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=-0.0203715;OID=.;OPOS=66106171;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:6:1:5:3:6:1:5:3
chr11	66107674	.	A	G	465.06	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0216724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.151;QD=58.1329;RBI=0.0250374;REFB=0;REVB=-0.0125372;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000165958;OID=.;OPOS=66107674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:11:21:0:0:11:21:0:0
chr11	66108268	.	C	T	805.21	PASS	AF=0.435644;AO=87;DP=202;FAO=88;FDP=202;FR=.;FRO=114;FSAF=35;FSAR=53;FSRF=53;FSRR=61;FWDB=0.0076512;FXX=0.0146334;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.076;QD=15.9448;RBI=0.0154452;REFB=-0.0246792;REVB=-0.0134169;RO=104;SAF=34;SAR=53;SRF=49;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811135;STB=0.538933;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0248658;OID=.;OPOS=66108268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:202:202:104:114:87:88:0.435644:53:34:49:55:53:35:53:61
chr11	66131149	.	C	T	289.29	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.062;QD=52.5973;RBI=0.014527;REFB=0;REVB=-0.00580852;RO=0;SAF=6;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119193;OID=.;OPOS=66131149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:16:6:0:0:16:6:0:0
chr11	66161072	.	C	T	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00408135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.836;QD=58.1403;RBI=0.0315889;REFB=0;REVB=-0.0313241;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000151193;OID=.;OPOS=66161072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr11	66206169	.	C	T	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=-0.00353884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.698;QD=15.293;RBI=0.0118347;REFB=-0.00502085;REVB=-0.0112932;RO=9;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34898;STB=0.695347;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.00535322;OID=.;OPOS=66206169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:7:2:0:9:7:2:0:9
chr11	66244025	.	C	CG	54.63	PASS	AF=0.22449;AO=11;DP=52;FAO=11;FDP=49;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0469111;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=106.715;QD=4.45966;RBI=0.0696962;REFB=0.000409464;REVB=-0.0515452;RO=41;SAF=10;SAR=1;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.606181;STB=0.881582;STBP=0.011;TYPE=ins;VARB=-0.0428842;OID=.;OPOS=66244026;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.22449:11:52:11:49:38:10:1:18:20:54:41:10:1:18:23
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chr11	66327673	.	G	A	444.75	PASS	AF=0.505747;AO=43;DP=86;FAO=44;FDP=87;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0178309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4504;QD=20.4484;RBI=0.0467547;REFB=-0.0123791;REVB=0.043221;RO=43;SAF=20;SAR=23;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210222;STB=0.505492;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.00798454;OID=.;OPOS=66327673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:43:43:43:44:0.505747:23:20:21:22:23:21:21:22
chr11	66328095	.	T	C	185.46	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0198281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.828;QD=13.738;RBI=0.0435345;REFB=-0.00538266;REVB=-0.0387569;RO=32;SAF=16;SAR=6;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110191;STB=0.506323;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00724339;OID=.;OPOS=66328095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:6:16:23:9:6:16:23:9
chr11	66328719	.	T	C	548.64	PASS	AF=0.548387;AO=47;DP=90;FAO=51;FDP=93;FR=.;FRO=42;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.0201921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.208;QD=23.5975;RBI=0.0484809;REFB=-0.0248735;REVB=0.0440758;RO=41;SAF=28;SAR=19;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01233;STB=0.505317;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.0234803;OID=.;OPOS=66328719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:93:41:42:47:51:0.548387:19:28:25:16:20:31:26:16
chr11	66329732	.	A	G	223.11	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=0.039557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.611;QD=16.5267;RBI=0.040087;REFB=-0.0269459;REVB=-0.00649714;RO=29;SAF=11;SAR=14;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590725;STB=0.533307;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0447233;OID=.;OPOS=66329732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:14:11:11:18:14:11:11:18
chr11	66330599	.	GCCCC	GCCC,GCCCG	47.27	PASS	AF=0.186047,0.116279;AO=5,5;DP=42;FAO=8,5;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=4,5;FSAR=4,0;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.114716,-0.118535;FXX=0.0652032;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=10.0536,20.6813;QD=4.39712;RBI=0.11662,0.148848;REFB=-0.12541,-0.0667187;REVB=0.0209836,0.0900285;RO=27;SAF=1,5;SAR=4,0;SRF=16;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.5,0;SSSB=-0.446707,0.630075;STB=0.578755,0.99738;STBP=0.66,0.035;TYPE=del,snp;VARB=0.132226,0.0321482;OID=.,.;OPOS=66330600,66330603;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=GCCC,GCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.186047,0.116279:5,5:42:8,5:43:30:4,5:4,0:18:12:19:27:1,5:4,0:16:11
chr11	66331458	.	A	G	189.27	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0325866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4142;QD=13.0533;RBI=0.0402672;REFB=0.0195257;REVB=-0.0236551;RO=35;SAF=13;SAR=10;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131954;STB=0.575365;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=-0.0553623;OID=.;OPOS=66331458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:10:13:24:11:10:13:24:11
chr11	66333598	.	C	T	156.35	PASS	AF=0.328125;AO=20;DP=63;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=36;FSRR=7;FWDB=0.0363489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1196;QD=9.7717;RBI=0.052932;REFB=0.00486205;REVB=-0.0384779;RO=43;SAF=5;SAR=15;SRF=36;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.608432;STB=0.850575;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00971275;OID=.;OPOS=66333598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:43:43:20:21:0.328125:15:5:36:7:16:5:36:7
chr11	66335548	.	A	G	179.4	PASS	AF=0.34375;AO=18;DP=59;FAO=22;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0272526;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.811;QD=11.2124;RBI=0.0272686;REFB=-0.029936;REVB=0.000933024;RO=28;SAF=12;SAR=6;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145256;STB=0.598472;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.057751;OID=.;OPOS=66335548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:64:28:41:18:22:0.34375:6:12:15:13:9:13:18:23
chr11	66358126	.	C	T	237.95	PASS	AF=0.353659;AO=29;DP=82;FAO=29;FDP=82;FR=.;FRO=53;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.0453339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.028;QD=11.6075;RBI=0.0467013;REFB=-0.0273692;REVB=-0.0112181;RO=53;SAF=17;SAR=12;SRF=28;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0657701;STB=0.53804;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.047501;OID=.;OPOS=66358126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:53:53:29:29:0.353659:12:17:28:25:12:17:28:25
chr11	66472274	.	T	C	219.95	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.855;QD=48.8771;RBI=0.03161;REFB=0;REVB=0.0297617;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.6155e-05;OID=.;OPOS=66472274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:18:0:0:17:18:1:9:8:0:0:10:8:0:0
chr11	66610645	.	G	C	246.53	PASS	AF=0.408451;AO=28;DP=70;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.00489868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.952;QD=13.8889;RBI=0.0301722;REFB=-0.02917;REVB=-0.0297718;RO=41;SAF=17;SAR=11;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00285564;STB=0.50103;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.0417046;OID=.;OPOS=66610645;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:41:42:28:29:0.408451:11:17:25:16:11:18:26:16
chr11	66626234	.	T	C	531.88	PASS	AF=0.406667;AO=60;DP=154;FAO=61;FDP=150;FR=.;FRO=89;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=49;FSRR=40;FWDB=-0.00894411;FXX=0.0384591;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.605;QD=14.1834;RBI=0.0120078;REFB=-0.0285528;REVB=0.00801181;RO=84;SAF=28;SAR=32;SRF=48;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108544;STB=0.544488;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0385406;OID=.;OPOS=66626234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:150:84:89:60:61:0.406667:32:28:48:36:32:29:49:40
chr11	66834252	.	C	T	373.72	PASS	AF=0.520548;AO=38;DP=72;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.00767533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.964;QD=20.4778;RBI=0.00796671;REFB=-0.0014785;REVB=0.00213491;RO=34;SAF=15;SAR=23;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237849;STB=0.637456;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.000926341;OID=.;OPOS=66834252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:34:35:38:38:0.520548:23:15:23:11:23:15:24:11
chr11	66837965	.	T	C	599.29	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390121;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.404;QD=61.4661;RBI=0.0586322;REFB=0;REVB=0.0437697;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.32792e-05;OID=.;OPOS=66837965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr11	66995603	.	T	C	257.47	PASS	AF=0.453125;AO=29;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00309726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.798;QD=16.0919;RBI=0.0148435;REFB=-0.0047832;REVB=0.0145167;RO=35;SAF=17;SAR=12;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147217;STB=0.5083;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.00574587;OID=.;OPOS=66995603;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:35:35:29:29:0.453125:12:17:20:15:12:17:20:15
chr11	67021929	.	GC	AA	159.87	PASS	AF=0.363636;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0163899;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=2;MLLD=174.968;QD=11.6272;RBI=0.0234818;REFB=-0.010191;REVB=-0.0168157;RO=33;SAF=10;SAR=10;SRF=11;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179928;STB=0.581739;STBP=0.367;TYPE=mnp;VARB=0.0163632;OID=.;OPOS=67021929;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:33:35:20:20:0.363636:10:10:11:22:10:10:13:22
chr11	67068859	.	T	C	670.23	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.365;QD=62.347;RBI=0.0483813;REFB=0;REVB=0.0366569;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.2746e-05;OID=.;OPOS=67068859;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr11	67071584	.	C	G	1434.32	PASS	AF=0.96875;AO=93;DP=96;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=49;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0507274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1889;QD=59.7631;RBI=0.0530016;REFB=-0.123974;REVB=-0.015359;RO=3;SAF=44;SAR=49;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312283;STB=0.51648;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00307818;OID=.;OPOS=67071584;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:96:96:3:3:93:93:0.96875:49:44:3:0:49:44:3:0
chr11	67075131	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0559659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.677;QD=60.6101;RBI=0.0610238;REFB=0;REVB=0.0243253;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176859;OID=.;OPOS=67075131;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr11	67130122	.	A	G	785.89	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.794;QD=64.1539;RBI=0.020759;REFB=0;REVB=0.0152191;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.65455e-05;OID=.;OPOS=67130122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0
chr11	67160961	.	A	G	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9155;QD=61.6824;RBI=0.0563307;REFB=0;REVB=-0.047758;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156826;OID=.;OPOS=67160961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0
chr11	67166310	.	G	A	375.61	PASS	AF=0.421053;AO=40;DP=95;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=0.00369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.201;QD=15.8152;RBI=0.00375096;REFB=-0.00974554;REVB=0.000673496;RO=55;SAF=23;SAR=17;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0496584;STB=0.528016;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0275246;OID=.;OPOS=67166310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:55:55:40:40:0.421053:17:23:29:26:17:23:29:26
chr11	67171736	.	C	T	945.11	PASS	AF=0.918919;AO=69;DP=74;FAO=68;FDP=74;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0158644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1057;QD=51.0868;RBI=0.0311634;REFB=-0.0158687;REVB=-0.0268231;RO=5;SAF=36;SAR=33;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00999683;STB=0.512337;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0183867;OID=.;OPOS=67171736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:74:74:5:6:69:68:0.918919:33:36:3:2:33:35:4:2
chr11	67176898	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.597;QD=58.586;RBI=0.0486015;REFB=0;REVB=0.0337481;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138112;OID=.;OPOS=67176898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:10:23:0:0:10:23:0:0
chr11	67177278	.	G	A	709.88	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00162329;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.783;QD=56.7904;RBI=0.0361835;REFB=0;REVB=0.036147;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105353;OID=.;OPOS=67177278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:24:26:0:0:24:26:0:0
chr11	67191449	.	T	C	1246.1	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.167;QD=61.536;RBI=0.0493368;REFB=0;REVB=0.0201748;RO=0;SAF=66;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150282;OID=.;OPOS=67191449;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:14:66:0:0:14:67:0:0
chr11	67191859	.	G	A	196.13	PASS	AF=0.612903;AO=18;DP=30;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.00612439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.568;QD=25.3074;RBI=0.0111011;REFB=-0.033812;REVB=0.0092588;RO=11;SAF=1;SAR=17;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283205;STB=0.658326;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0201412;OID=.;OPOS=67191859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:30:31:11:12:18:19:0.612903:17:1:2:9:18:1:2:10
chr11	67192555	.	G	A	1070.59	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.133;QD=59.4774;RBI=0.0224207;REFB=0;REVB=0.0144017;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1222e-05;OID=.;OPOS=67192555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:27:44:0:0:28:44:0:0
chr11	67200819	.	C	T	149.94	PASS	AF=0.472222;AO=15;DP=34;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0240339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.301;QD=16.6598;RBI=0.0273427;REFB=-0.0193547;REVB=0.0130382;RO=19;SAF=9;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072901;STB=0.533294;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0310923;OID=.;OPOS=67200819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:36:19:19:15:17:0.472222:6:9:10:9:7:10:10:9
chr11	67202156	.	C	T	82.71	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00853099;FXX=0.0475964;HRUN=5;LEN=1;MLLD=146.692;QD=16.5416;RBI=0.00972497;REFB=-0.0115812;REVB=0.00466875;RO=8;SAF=2;SAR=8;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.097017;STB=0.571275;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0105456;OID=.;OPOS=67202156;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:19:20:8:10:10:10:0.5:8:2:1:7:8:2:3:7
chr11	67257556	.	C	T	311.43	PASS	AF=0.596154;AO=30;DP=51;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0466299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.993;QD=23.9559;RBI=0.0468463;REFB=-0.0407238;REVB=0.00449701;RO=20;SAF=19;SAR=11;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24191;STB=0.62727;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0164789;OID=.;OPOS=67257556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:20:21:30:31:0.596154:11:19:6:14:11:20:7:14
chr11	67257823	.	C	A	577.99	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0602111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3659;QD=57.7994;RBI=0.0739976;REFB=-0.11814;REVB=-0.0430148;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.513507;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00370182;OID=.;OPOS=67257823;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:0:1:39:39:0.975:18:21:0:0:18:21:0:1
chr11	67258391	.	A	G	718.84	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00603003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.002;QD=55.295;RBI=0.0280168;REFB=0;REVB=0.0273602;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134125;OID=.;OPOS=67258391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:52:0:0:48:52:1:23:25:0:0:25:27:0:0
chr11	67263767	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0042854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.787;QD=51.1846;RBI=0.0328022;REFB=0;REVB=0.032521;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131499;OID=.;OPOS=67263767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:5:15:0:0:5:15:0:0
chr11	67288594	.	C	T	176.8	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0128207;FXX=0.0166639;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.75;QD=11.9865;RBI=0.0167636;REFB=-0.0182125;REVB=0.0108004;RO=34;SAF=8;SAR=14;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147695;STB=0.579544;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0350031;OID=.;OPOS=67288594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:34:37:22:22:0.372881:14:8:17:17:14:8:18:19
chr11	67351585	.	C	G	265.92	PASS	AF=0.508475;AO=28;DP=57;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=7;FWDB=0.015603;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1806;QD=18.0287;RBI=0.0604817;REFB=-0.0260175;REVB=0.0584344;RO=26;SAF=22;SAR=6;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208065;STB=0.516118;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0528791;OID=.;OPOS=67351585;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:59:26:29:28:30:0.508475:6:22:20:6:8:22:22:7
chr11	67412771	.	G	C	37.44	PASS	AF=0.352941;AO=5;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0489357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=253.413;QD=8.81005;RBI=0.0516169;REFB=0.00637228;REVB=0.0164196;RO=9;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20092;STB=0.545308;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=-0.0143933;OID=.;OPOS=67412771;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:9:11:5:6:0.352941:3:2:2:7:4:2:3:8
chr11	67430762	.	T	C	826.86	PASS	AF=1;AO=56;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0098449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.438;QD=57.0245;RBI=0.0366955;REFB=0;REVB=0.0353502;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180799;OID=.;OPOS=67430762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:56:58:1:30:26:0:0:30:28:0:0
chr11	67432804	.	T	C	639.63	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.25;QD=60.917;RBI=0.0361978;REFB=0;REVB=0.0147244;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.3676e-06;OID=.;OPOS=67432804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:23:18:0:0:23:19:0:0
chr11	67432854	.	T	C	884.08	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.496;QD=57.9721;RBI=0.0341877;REFB=0;REVB=0.0294535;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148249;OID=.;OPOS=67432854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0
chr11	67433869	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.68;QD=35.5757;RBI=0.0553033;REFB=0;REVB=0.0492102;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124578;OID=.;OPOS=67433869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr11	67434416	.	C	A	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=353.362;QD=58.5878;RBI=0.0505978;REFB=0;REVB=0.0492382;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.0788e-05;OID=.;OPOS=67434416;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr11	67564197	.	T	C	487.64	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00610224;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.542;QD=59.1072;RBI=0.0152878;REFB=0;REVB=0.0140171;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163193;OID=.;OPOS=67564197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:17:14:0:0:18:15:0:0
chr11	67564238	.	C	T	224.37	PASS	AF=0.904762;AO=19;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0135402;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.41;QD=42.7372;RBI=0.0351373;REFB=-0.0680184;REVB=0.0324236;RO=1;SAF=7;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0612242;STB=0.562433;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.00355195;OID=.;OPOS=67564238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:21:21:1:2:19:19:0.904762:12:7:1:0:12:7:2:0
chr11	67564241	.	C	T	223.18	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.195062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.144;QD=49.5965;RBI=0.195542;REFB=0;REVB=0.0136873;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00178173;OID=.;OPOS=67564241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr11	67572698	.	G	T	219.35	PASS	AF=0.863636;AO=13;DP=22;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0342693;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=168.675;QD=39.8824;RBI=0.0423963;REFB=-0.0241537;REVB=0.0249612;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505149;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.000735743;OID=.;OPOS=67572698;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:22:22:0:3:13:19:0.863636:2:11:0:0:7:12:2:1
chr11	67663113	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.704;QD=43.4862;RBI=0.0513541;REFB=0;REVB=-0.0474426;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000240683;OID=.;OPOS=67663113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:3:9:0:0:3:9:0:0
chr11	67663116	.	T	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.2;QD=43.486;RBI=0.0157954;REFB=0;REVB=-0.010641;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000216606;OID=.;OPOS=67663116;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:3:9:0:0:3:9:0:0
chr11	67765163	.	A	AG,G	1025.42	PASS	AF=1,0;AO=64,3;DP=72;FAO=73,0;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=55,0;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0914443,0.0204213;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=26.5924,11.1459;QD=56.1874;RBI=0.207823,0.0423927;REFB=-0.0198104,-0.0155048;REVB=0.186624,0.0371499;RO=5;SAF=52,2;SAR=12,1;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0868111,0.247694;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00657116,0;OID=.,.;OPOS=67765164,67765163;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:72:73:5:0:64,3:73,0:1,0:12,1:52,2:2:3:18,0:55,0:0:0
chr11	67786064	.	A	AC,C	953.03	PASS	AF=1,0;AO=62,4;DP=69;FAO=67,0;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=52,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0102418,-0.167778;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=26.4752,4.47751;QD=56.8972;RBI=0.0103835,0.204017;REFB=0,0;REVB=0.00170958,-0.116075;RO=3;SAF=15,0;SAR=47,4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0291879,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00011142,0.0353209;OID=.,.;OPOS=67786065,67786064;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:67:3:0:62,4:67,0:1,0:47,4:15,0:0:3:52,0:15,0:0:0
chr11	67789293	.	G	GC	910.3	PASS	AF=1;AO=77;DP=83;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.066837;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.8344;QD=46.0912;RBI=0.091379;REFB=0;REVB=0.0623132;RO=4;SAF=33;SAR=44;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411009;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=8.98438e-06;OID=.;OPOS=67789294;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:77:83:79:79:0:35:44:0:0:17:4:33:44:0:4
chr11	67795378	.	G	GC	219.41	PASS	AF=1;AO=22;DP=27;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000583162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.1803;QD=35.1051;RBI=0.0696858;REFB=0;REVB=0.0696833;RO=4;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131556;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00478361;OID=.;OPOS=67795379;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:22:27:25:25:0:11:14:0:0:5:4:10:12:0:4
chr11	67803215	.	G	A	545.64	PASS	AF=0.41844;AO=59;DP=142;FAO=59;FDP=141;FR=.;FRO=82;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=33;FSRR=49;FWDB=-0.00411589;FXX=0.00704176;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.083;QD=15.4791;RBI=0.0111247;REFB=-0.0290829;REVB=0.0103353;RO=82;SAF=28;SAR=31;SRF=33;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753598;STB=0.542227;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0349147;OID=.;OPOS=67803215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:141:82:82:59:59:0.41844:31:28:33:49:31:28:33:49
chr11	67810468	.	CCGGGGGG	CCGGGGG,CCGGGGGC,CGGGGG	546.28	PASS	AF=0.372093,0.232558,0;AO=29,10,16;DP=132;FAO=48,30,0;FDP=129;FR=.;FRO=51;FSAF=18,24,0;FSAR=30,6,0;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.214311,-0.0160001,-0.0993051;FXX=0.0227256;HRUN=6,6,5;LEN=1,1,2;MLLD=11.0499,19.9109,13.9442;QD=16.9389;RBI=0.240551,0.0361549,0.148302;REFB=-0.122526,-0.0691306,-0.0232633;REVB=-0.109249,-0.0324218,-0.110145;RO=36;SAF=4,5,12;SAR=25,5,4;SRF=15;SRR=21;SSEN=0,0,0;SSEP=0.54717,0,0;SSSB=-0.382857,0.101609,0.39176;STB=0.561332,0.723001,0.5;STBP=0.26,0.002,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.0743132,0.0350317,0.0382712;OID=.,.,.;OPOS=67810470,67810475,67810469;OREF=G,G,CG;OALT=-,C,-;OMAPALT=CCGGGGG,CCGGGGGC,CGGGGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.372093,0.232558,0:29,10,16:132:48,30,0:129:51:18,24,0:30,6,0:25:26:99:36:4,5,12:25,5,4:15:21
chr11	67814979	.	G	C	1295.31	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9269;QD=60.9559;RBI=0.0463672;REFB=0;REVB=-0.00113609;RO=0;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350986;OID=.;OPOS=67814979;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:83:85:1:42:41:0:0:44:41:0:0
chr11	67957518	.	A	T	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.473;QD=57.5062;RBI=0.0360862;REFB=0;REVB=0.0139375;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295713;OID=.;OPOS=67957518;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:35:28:0:0:35:29:0:0
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chr11	68171013	.	T	C	1719.64	PASS	AF=0.95935;AO=117;DP=124;FAO=118;FDP=123;FR=.;FRO=5;FSAF=57;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00319512;FXX=0.00806387;HRUN=5;LEN=1;MLLD=141.236;QD=55.9232;RBI=0.00581404;REFB=-0.00595186;REVB=0.00485738;RO=3;SAF=56;SAR=61;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0069104;STB=0.50338;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.00010091;OID=.;OPOS=68171013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:124:123:3:5:117:118:0.95935:61:56:1:2:61:57:2:3
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chr11	68678962	.	T	C	340.63	PASS	AF=0.555556;AO=28;DP=62;FAO=35;FDP=63;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0027278;FXX=0.0307645;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.811;QD=21.6273;RBI=0.0115428;REFB=-0.0190299;REVB=0.0112159;RO=20;SAF=14;SAR=14;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753722;STB=0.532092;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.015736;OID=.;OPOS=68678962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:20:28:28:35:0.555556:14:14:8:12:15:20:14:14
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chr11	68748003	.	T	C	605.82	PASS	AF=0.654321;AO=53;DP=81;FAO=53;FDP=81;FR=.;FRO=28;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0359971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.002;QD=29.917;RBI=0.0360837;REFB=-0.021538;REVB=-0.00249904;RO=28;SAF=34;SAR=19;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950392;STB=0.551603;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0155274;OID=.;OPOS=68748003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:28:28:53:53:0.654321:19:34:14:14:19:34:14:14
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chr11	70016247	.	T	TG	147.84	PASS	AF=0.351351;AO=31;DP=115;FAO=39;FDP=111;FR=.;FRO=72;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=40;FSRR=32;FWDB=0.0631006;FXX=0.00892777;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.9291;QD=5.32771;RBI=0.109207;REFB=0.00246051;REVB=0.0891318;RO=78;SAF=19;SAR=12;SRF=43;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.076592;STB=0.511167;STBP=0.861;TYPE=ins;VARB=-0.00463561;OID=.;OPOS=70016248;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.351351:31:115:39:111:72:21:18:40:32:99:78:19:12:43:35
chr11	70118489	.	G	A	124.15	PASS	AF=0.3;AO=15;DP=50;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.00307787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.293;QD=9.93224;RBI=0.0378139;REFB=-0.0124624;REVB=-0.0376885;RO=35;SAF=9;SAR=6;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197962;STB=0.61889;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0185179;OID=.;OPOS=70118489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:35:35:15:15:0.3:6:9:15:20:6:9:15:20
chr11	70229171	.	G	A	174.33	PASS	AF=0.366667;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=60;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=28;FWDB=-0.00251633;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.275;QD=11.6223;RBI=0.0241463;REFB=-0.0132006;REVB=0.0240148;RO=38;SAF=14;SAR=8;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39115;STB=0.723952;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0133813;OID=.;OPOS=70229171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:38:38:22:22:0.366667:8:14:10:28:8:14:10:28
chr11	71146577	.	G	A	211.88	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0965895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0693;QD=16.6178;RBI=0.103983;REFB=-0.0139836;REVB=0.0385101;RO=28;SAF=6;SAR=17;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378935;STB=0.715597;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0245296;OID=.;OPOS=71146577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:17:6:18:10:17:6:18:10
chr11	71146691	.	A	G	513.96	PASS	AF=0.495413;AO=54;DP=109;FAO=54;FDP=109;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=19;FSRR=36;FWDB=-0.0636405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.423;QD=18.8608;RBI=0.0636567;REFB=-0.00428863;REVB=-0.00143205;RO=55;SAF=24;SAR=30;SRF=19;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092618;STB=0.55113;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.00442479;OID=.;OPOS=71146691;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:55:55:54:54:0.495413:30:24:19:36:30:24:19:36
chr11	71146952	.	G	A	261.8	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00168582;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=289.621;QD=17.167;RBI=0.00550759;REFB=-0.0116302;REVB=-0.00524324;RO=31;SAF=21;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241706;STB=0.645651;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0100159;OID=.;OPOS=71146952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:31:32:29:29:0.47541:8:21:15:16:8:21:15:17
chr11	71152461	.	A	G	1098.23	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00568919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9062;QD=60.177;RBI=0.0143491;REFB=0;REVB=0.0131731;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111054;OID=.;OPOS=71152461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:39:33:0:0:39:34:0:0
chr11	71155153	.	A	G	1453.46	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000302746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.67;QD=63.1938;RBI=0.00688464;REFB=0;REVB=0.00687798;RO=0;SAF=39;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.3426e-06;OID=.;OPOS=71155153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:53:39:0:0:53:39:0:0
chr11	71155171	.	C	T	1208.86	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.085;QD=61.2079;RBI=0.0654799;REFB=0;REVB=0.0273697;RO=0;SAF=34;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40017e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000229736;OID=.;OPOS=71155171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:45:34:0:0:45:34:0:0
chr11	71169547	.	G	C	1713.04	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6731;QD=60.6388;RBI=0.0401655;REFB=0;REVB=-0.0349231;RO=0;SAF=43;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000185811;OID=.;OPOS=71169547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:70:43:0:0:70:43:0:0
chr11	71183474	.	C	T	682.43	PASS	AF=0.961538;AO=52;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.025884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3017;QD=52.4948;RBI=0.0513778;REFB=-0.0105617;REVB=0.0443813;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.515619;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00129259;OID=.;OPOS=71183474;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:52:0:2:52:50:0.961538:19:33:0:0:19:31:2:0
chr11	71183477	.	C	T	730.31	PASS	AF=1;AO=50;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1299;QD=56.1774;RBI=0.0307569;REFB=0;REVB=-0.0160996;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00390045;OID=.;OPOS=71183477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:50:52:1:19:31:0:0:19:33:0:0
chr11	71184678	.	A	C	2557.57	PASS	AF=1;AO=166;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.96;QD=61.6282;RBI=0.0710286;REFB=0;REVB=0.0414374;RO=0;SAF=69;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.34011e-05;OID=.;OPOS=71184678;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:166:166:0:0:166:166:1:97:69:0:0:97:69:0:0
chr11	71185479	.	T	C	1056.34	PASS	AF=1;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00326746;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.967;QD=59.5122;RBI=0.0330793;REFB=0;REVB=0.0329175;RO=0;SAF=47;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79556e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337959;OID=.;OPOS=71185479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:70:71:1:23:47:0:0:24:47:0:0
chr11	71185518	.	T	C	1472.47	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.281;QD=63.3321;RBI=0.0261278;REFB=0;REVB=0.0180898;RO=0;SAF=57;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.7791e-05;OID=.;OPOS=71185518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:36:57:0:0:36:57:0:0
chr11	71189436	.	T	C	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00506003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=336.757;QD=57.0008;RBI=0.0144458;REFB=0;REVB=0.0135306;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.73634e-06;OID=.;OPOS=71189436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0
chr11	71249386	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00539686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8275;QD=50.413;RBI=0.00606337;REFB=0;REVB=-0.00276375;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000164949;OID=.;OPOS=71249386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr11	71260243	.	T	C	560.85	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149328;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.997;QD=60.6323;RBI=0.0157681;REFB=0;REVB=0.00506388;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.14032e-05;OID=.;OPOS=71260243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:23:14:0:0:23:14:0:0
chr11	71260296	.	G	A	739.87	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044412;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4322;QD=56.9129;RBI=0.0478944;REFB=0;REVB=-0.017929;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027536;OID=.;OPOS=71260296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
chr11	71276632	.	T	C	375.65	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0237444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.691;QD=55.6514;RBI=0.0502004;REFB=0;REVB=0.0442299;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228235;OID=.;OPOS=71276632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr11	71276681	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.5;QD=39.2068;RBI=0.055919;REFB=0;REVB=0.0161051;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000303869;OID=.;OPOS=71276681;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr11	71277531	.	T	C	957.14	PASS	AF=0.51087;AO=94;DP=183;FAO=94;FDP=184;FR=.;FRO=90;FSAF=74;FSAR=20;FSRF=64;FSRR=26;FWDB=0.0423475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1291;QD=20.8073;RBI=0.0423494;REFB=-0.0326147;REVB=0.000396575;RO=89;SAF=74;SAR=20;SRF=64;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0849468;STB=0.552227;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0247303;OID=.;OPOS=71277531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:184:89:90:94:94:0.51087:20:74:64:25:20:74:64:26
chr11	71277598	.	A	C	2292.46	PASS	AF=1;AO=143;DP=143;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.779;QD=63.6795;RBI=0.0323191;REFB=0;REVB=0.0281541;RO=0;SAF=86;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.29822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.10857e-05;OID=.;OPOS=71277598;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:143:144:0:0:143:144:1:57:86:0:0:57:87:0:0
chr11	71277647	.	CCGCT	C	710.62	PASS	AF=1;AO=50;DP=65;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457936;FXX=0.104462;HRUN=2;LEN=4;MLLD=293.73;QD=47.3749;RBI=0.0463523;REFB=0;REVB=0.00717477;RO=0;SAF=12;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=8.32394e-05;OID=.;OPOS=71277648;OREF=CGCT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:50:65:60:60:0:20:40:0:0:12:0:12:38:0:0
chr11	71279936	.	A	C	163.58	PASS	AF=0.314286;AO=20;DP=70;FAO=22;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=31;FWDB=-0.0102892;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0486;QD=9.34724;RBI=0.0780448;REFB=-0.01794;REVB=-0.0773636;RO=41;SAF=5;SAR=15;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158038;STB=0.527833;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.034494;OID=.;OPOS=71279936;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:41:48:20:22:0.314286:15:5:15:26:15:7:17:31
chr11	71318195	.	G	A	191.92	PASS	AF=1;AO=13;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.19537;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.2387;QD=47.9797;RBI=0.195427;REFB=0;REVB=0.00471293;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00433643;OID=.;OPOS=71318195;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:13:16:1:4:9:0:0:4:12:0:0
chr11	71498591	.	C	G	44.04	PASS	AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.0171063;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.8334;QD=6.52482;RBI=0.0463562;REFB=0.0156473;REVB=-0.0430845;RO=20;SAF=5;SAR=2;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052215;STB=0.533241;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=-0.0454475;OID=.;OPOS=71498591;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:27:27:20:20:7:7:0.259259:2:5:15:5:2:5:15:5
chr11	71498601	.	G	T	44.05	PASS	AF=0.259259;AO=7;DP=27;FAO=7;FDP=27;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.0554041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.653;QD=6.52578;RBI=0.0775062;REFB=-0.0168562;REVB=0.0541997;RO=19;SAF=5;SAR=2;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03226;STB=0.533241;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0234815;OID=.;OPOS=71498601;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:27:27:19:20:7:7:0.259259:2:5:14:5:2:5:15:5
chr11	71498648	.	A	G	35.54	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0446862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.163;QD=5.68602;RBI=0.0528315;REFB=-0.0403063;REVB=-0.0281836;RO=19;SAF=5;SAR=1;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829805;STB=0.555358;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.111886;OID=.;OPOS=71498648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:1:5:15:4:1:5:15:4
chr11	71498671	.	G	C	34.8	PASS	AF=0.157895;AO=4;DP=19;FAO=3;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=2;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.00707199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.567;QD=7.32631;RBI=0.00791887;REFB=-0.0248111;REVB=-0.00356305;RO=12;SAF=3;SAR=1;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5994;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0881708;OID=.;OPOS=71498671;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:19:19:12:13:4:3:0.157895:1:3:9:3:1:2:10:3
chr11	71544269	.	C	T	333.8	PASS	AF=0.479452;AO=34;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.115126;FXX=0.0266631;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9713;QD=18.2905;RBI=0.116666;REFB=-0.0184622;REVB=-0.0188973;RO=39;SAF=19;SAR=15;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0196198;STB=0.523796;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0389457;OID=.;OPOS=71544269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:39:38:34:35:0.479452:15:19:21:18:15:20:20:18
chr11	71548465	.	A	G	304.62	PASS	AF=0.358491;AO=38;DP=106;FAO=38;FDP=106;FR=.;FRO=68;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=44;FSRR=24;FWDB=0.117143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6729;QD=11.4949;RBI=0.117687;REFB=-0.0166135;REVB=-0.0112963;RO=67;SAF=24;SAR=14;SRF=44;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303654;STB=0.510724;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.0245014;OID=.;OPOS=71548465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:67:68:38:38:0.358491:14:24:44:23:14:24:44:24
chr11	71548492	.	C	T	248.91	PASS	AF=0.314815;AO=33;DP=107;FAO=34;FDP=108;FR=.;FRO=74;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=49;FSRR=25;FWDB=-0.0199586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1745;QD=9.21895;RBI=0.024114;REFB=-0.00338429;REVB=-0.0135329;RO=73;SAF=20;SAR=13;SRF=48;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064633;STB=0.532768;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0229582;OID=.;OPOS=71548492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:73:74:33:34:0.314815:13:20:48:25:13:21:49:25
chr11	71548520	.	A	T	225.54	PASS	AF=0.29;AO=29;DP=100;FAO=29;FDP=100;FR=.;FRO=71;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=45;FSRR=26;FWDB=-0.00536169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.88;QD=9.02156;RBI=0.00961876;REFB=-0.00109289;REVB=-0.00798579;RO=71;SAF=17;SAR=12;SRF=45;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596677;STB=0.535228;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0023182;OID=.;OPOS=71548520;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:71:71:29:29:0.29:12:17:45:26:12:17:45:26
chr11	71548544	.	A	G	106.22	PASS	AF=0.217949;AO=17;DP=78;FAO=17;FDP=78;FR=.;FRO=61;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=39;FSRR=22;FWDB=-0.0221327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.169;QD=5.44729;RBI=0.0464411;REFB=0.000351033;REVB=-0.040828;RO=61;SAF=12;SAR=5;SRF=39;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0941725;STB=0.559513;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=-0.0127023;OID=.;OPOS=71548544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:61:61:17:17:0.217949:5:12:39:22:5:12:39:22
chr11	71707489	.	T	C	212.93	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.00363637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.714;QD=16.0699;RBI=0.00859447;REFB=-0.0126254;REVB=0.00778728;RO=26;SAF=5;SAR=19;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209734;STB=0.66136;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0138298;OID=.;OPOS=71707489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:29:24:24:0.45283:19:5:10:16:19:5:13:16
chr11	71708013	.	G	A	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.00151112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.943;QD=18.645;RBI=0.0098936;REFB=-0.00409732;REVB=0.00977752;RO=13;SAF=3;SAR=11;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10776;STB=0.56195;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00309646;OID=.;OPOS=71708013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:11:3:4:9:11:3:4:9
chr11	71714526	.	G	C	343.43	PASS	AF=0.435294;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=13;FWDB=0.000496895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.578;QD=16.1615;RBI=0.0399845;REFB=-0.0312656;REVB=0.0399814;RO=47;SAF=22;SAR=15;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137529;STB=0.581196;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0136299;OID=.;OPOS=71714526;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:47:48:37:37:0.435294:15:22:34:13:15:22:35:13
chr11	71816044	.	G	C	485.27	PASS	AF=0.5;AO=47;DP=95;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=12;FSRR=36;FWDB=-0.0453477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9116;QD=20.2198;RBI=0.101077;REFB=-0.0364605;REVB=-0.0903339;RO=48;SAF=17;SAR=30;SRF=12;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114614;STB=0.568938;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0330569;OID=.;OPOS=71816044;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:48:48:47:48:0.5:30:17:12:36:30:18:12:36
chr11	71820350	.	C	T	257.34	PASS	AF=0.4;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=4;FSRF=35;FSRR=10;FWDB=0.00439597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.578;QD=13.7247;RBI=0.00441037;REFB=-0.0107855;REVB=0.000356128;RO=44;SAF=26;SAR=4;SRF=34;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177478;STB=0.59861;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0169348;OID=.;OPOS=71820350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:44:45:30:30:0.4:4:26:34:10:4:26:35:10
chr11	71821236	.	A	G	332.69	PASS	AF=0.611111;AO=29;DP=50;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00775322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.66;QD=24.644;RBI=0.00963904;REFB=-0.0893745;REVB=0.00572702;RO=21;SAF=16;SAR=13;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0893216;STB=0.524926;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0422317;OID=.;OPOS=71821236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:54:21:21:29:33:0.611111:13:16:14:7:13:20:14:7
chr11	72281818	.	A	G	326.49	PASS	AF=0.413793;AO=35;DP=87;FAO=36;FDP=87;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0202671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.7;QD=15.0111;RBI=0.0221087;REFB=-0.010226;REVB=-0.00883393;RO=51;SAF=22;SAR=13;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207207;STB=0.605575;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0126121;OID=.;OPOS=72281818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:51:51:35:36:0.413793:13:22:22:29:14:22:22:29
chr11	72281884	.	C	T	356.67	PASS	AF=0.419355;AO=35;DP=92;FAO=39;FDP=93;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0225998;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.512;QD=15.3405;RBI=0.0286535;REFB=-0.00510905;REVB=-0.0176145;RO=53;SAF=22;SAR=13;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168828;STB=0.563442;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.0153948;OID=.;OPOS=72281884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:53:54:35:39:0.419355:13:22:25:28:16:23:26:28
chr11	72281941	.	A	G	290.07	PASS	AF=0.452055;AO=32;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0869832;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.635;QD=15.8942;RBI=0.0873093;REFB=-0.00660055;REVB=0.0075391;RO=39;SAF=14;SAR=18;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.048878;STB=0.524985;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.00951201;OID=.;OPOS=72281941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:39:40:32:33:0.452055:18:14:19:20:18:15:20:20
chr11	72287350	.	A	G	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00851519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.45;QD=49.5983;RBI=0.0149353;REFB=0;REVB=0.01227;RO=0;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101109;OID=.;OPOS=72287350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:16:2:0:0:16:2:0:0
chr11	72288599	.	G	A	385.35	PASS	AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.00791216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.376;QD=17.9231;RBI=0.00977602;REFB=-0.016402;REVB=0.0057418;RO=46;SAF=13;SAR=27;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156331;STB=0.587641;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0200792;OID=.;OPOS=72288599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:27:13:22:24:27:13:22:24
chr11	72290629	.	G	A	48.24	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0134967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.445;QD=12.8641;RBI=0.0317006;REFB=-0.0119922;REVB=0.0286839;RO=8;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09181;STB=0.555391;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.011615;OID=.;OPOS=72290629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:5:2:3:5:5:2:3:5
chr11	72291927	.	T	C	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00287436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.848;QD=57.2025;RBI=0.0344934;REFB=0;REVB=0.0343734;RO=0;SAF=9;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.65001e-05;OID=.;OPOS=72291927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:21:9:0:0:21:9:0:0
chr11	72293602	.	A	G	987.89	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.87;QD=58.9782;RBI=0.0763207;REFB=0;REVB=0.0483707;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000595236;OID=.;OPOS=72293602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:34:32:0:0:34:33:0:0
chr11	72295502	.	T	C	976.36	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014389;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.093;QD=59.1732;RBI=0.0189544;REFB=0;REVB=-0.012338;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.11475e-05;OID=.;OPOS=72295502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:66:66:1:35:31:0:0:35:31:0:0
chr11	72295906	.	A	G	364.7	PASS	AF=1;AO=24;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0601866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.463;QD=54.0297;RBI=0.0807649;REFB=0;REVB=0.0538566;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00245431;OID=.;OPOS=72295906;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:24:27:1:8:16:0:0:8:19:0:0
chr11	72301049	.	AGGGGGT	AGGGGTG	131.38	PASS	AF=0.326531;AO=8;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=26;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.110682;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=20.7812;QD=10.7251;RBI=0.129261;REFB=-0.0970021;REVB=0.0667665;RO=23;SAF=8;SAR=0;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.813288;STB=0.826194;STBP=0.005;TYPE=mnp;VARB=0.146776;OID=.;OPOS=72301054;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=AGGGGTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.326531:8:49:16:49:26:13:3:7:19:87:23:8:0:5:18
chr11	72368986	.	T	G	152.32	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0118832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3593;QD=21.0099;RBI=0.0279596;REFB=-0.00417615;REVB=-0.0253087;RO=12;SAF=5;SAR=11;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154264;STB=0.608154;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00855818;OID=.;OPOS=72368986;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:12:13:16:16:0.551724:11:5:6:6:11:5:7:6
chr11	72396990	.	G	A	79.22	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.00942871;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.632;QD=15.8448;RBI=0.0162884;REFB=-0.0340873;REVB=-0.013282;RO=10;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253163;STB=0.646773;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0421296;OID=.;OPOS=72396990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:6:4:7:3:6:4:7:3
chr11	72408055	.	G	C	125.51	PASS	AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.00700294;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.043;QD=9.6545;RBI=0.0164367;REFB=-0.027145;REVB=-0.0148703;RO=36;SAF=8;SAR=8;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0965556;STB=0.557621;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0650858;OID=.;OPOS=72408055;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:36:36:16:16:0.307692:8:8:21:15:8:8:21:15
chr11	72408657	.	C	T	526.7	PASS	AF=0.569767;AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.0191212;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.475;QD=24.4977;RBI=0.0225665;REFB=-0.0271829;REVB=-0.0119843;RO=37;SAF=25;SAR=24;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152078;STB=0.583102;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0175965;OID=.;OPOS=72408657;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:37:37:49:49:0.569767:24:25:26:11:24:25:26:11
chr11	72532569	.	G	T	708.78	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00756284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.575;QD=54.5215;RBI=0.0196595;REFB=-0.0429381;REVB=0.0181466;RO=1;SAF=29;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015962;STB=0.508471;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00300696;OID=.;OPOS=72532569;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:22:29:1:0:22:29:1:0
chr11	72532621	.	T	G	729.22	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.571;QD=57.1938;RBI=0.0452675;REFB=0;REVB=0.0170296;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.94212e-05;OID=.;OPOS=72532621;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:25:24:0:0:26:25:0:0
chr11	72532708	.	C	T	323.22	PASS	AF=0.925926;AO=25;DP=27;FAO=25;FDP=27;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.03028;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=194.353;QD=47.8843;RBI=0.0319061;REFB=-0.0921284;REVB=0.010056;RO=2;SAF=11;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00834051;STB=0.504501;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.00113879;OID=.;OPOS=72532708;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:27:27:2:2:25:25:0.925926:14:11:1:1:14:11:1:1
chr11	72945341	.	C	T	2084.42	PASS	AF=0.971429;AO=136;DP=140;FAO=136;FDP=140;FR=.;FRO=4;FSAF=67;FSAR=69;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00389731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0967;QD=59.5547;RBI=0.0200659;REFB=-0.0156327;REVB=-0.0196837;RO=4;SAF=67;SAR=69;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131761;STB=0.506935;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00172178;OID=.;OPOS=72945341;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:140:140:4:4:136:136:0.971429:69:67:1:3:69:67:1:3
chr11	72946020	.	C	T	465.13	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0826899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.606;QD=58.1406;RBI=0.0917437;REFB=0;REVB=0.0397404;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385281;OID=.;OPOS=72946020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:9:22:0:0:9:23:0:0
chr11	72946204	.	C	T	97.59	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00441412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.981;QD=13.4607;RBI=0.0233075;REFB=-0.00617071;REVB=0.0228857;RO=17;SAF=8;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218026;STB=0.512799;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.00516432;OID=.;OPOS=72946204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:4:8:11:6:4:8:11:6
chr11	72947242	.	G	A	534.63	PASS	AF=0.478632;AO=56;DP=119;FAO=56;FDP=117;FR=.;FRO=61;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=0.0175496;FXX=0.0249979;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.429;QD=18.2779;RBI=0.019554;REFB=0.00265629;REVB=0.00862377;RO=58;SAF=18;SAR=38;SRF=25;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11011;STB=0.577632;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=-0.00274076;OID=.;OPOS=72947242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:117:58:61:56:56:0.478632:38:18:25:33:38:18:28:33
chr11	73022117	.	C	T	414.63	PASS	AF=0.431193;AO=47;DP=109;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=-0.0155193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.697;QD=15.2159;RBI=0.0229821;REFB=0.00141809;REVB=-0.0169508;RO=60;SAF=26;SAR=21;SRF=22;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18505;STB=0.602507;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.0104406;OID=.;OPOS=73022117;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:60:62:47:47:0.431193:21:26:22:38:21:26:23:39
chr11	73387057	.	TTAAGTA	T	126.59	PASS	AF=0.461538;AO=14;DP=37;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0133104;FXX=0;HRUN=3;LEN=6;MLLD=243.361;QD=12.9832;RBI=0.0141225;REFB=-0.00385237;REVB=0.00471992;RO=19;SAF=2;SAR=12;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.568353;STB=0.699785;STBP=0.041;TYPE=del;VARB=0.00375161;OID=.;OPOS=73387058;OREF=TAAGTA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.461538:14:37:18:39:21:6:12:15:6:99:19:2:12:13:6
chr11	73387605	.	C	T	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.04063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.625;QD=12.3961;RBI=0.0481237;REFB=-0.0136557;REVB=-0.0257894;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0144991;OID=.;OPOS=73387605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:3:2:2:3:3:2:2:3
chr11	73390772	.	GAA	GA,G,GAG	167.68	PASS	AF=0.0212766,0.297872,0.106383;AO=5,10,5;DP=45;FAO=1,14,5;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=0,10,3;FSAR=1,4,2;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0433217,0.0224643,-0.0198761;FXX=0.020829;HRUN=3,3,3;LEN=1,2,1;MLLD=16.8117,37.9214,238.612;QD=14.2708;RBI=0.165771,0.0862286,0.0861592;REFB=-0.0337639,-0.0174498,0.00976254;REVB=-0.16001,-0.083251,-0.0838353;RO=23;SAF=1,10,3;SAR=4,0,2;SRF=11;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.347454,0.774829,0.141867;STB=0.988802,0.683184,0.629121;STBP=0.496,0.123,0.648;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0791149,-0.00707841,0.0366613;OID=.,.,.;OPOS=73390773,73390773,73390774;OREF=A,AA,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=GA,G,GAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0212766,0.297872,0.106383:5,10,5:45:1,14,5:47:27:0,10,3:1,4,2:12:15:99:23:1,10,3:4,0,2:11:12
chr11	73441772	.	A	C	327.39	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171388;FXX=0.039984;HRUN=6;LEN=1;MLLD=259.572;QD=54.5655;RBI=0.0337638;REFB=0;REVB=0.0290904;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.27671e-05;OID=.;OPOS=73441772;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:25:24:1:12:13:0:0:12:12:0:0
chr11	73543621	.	T	C	217.63	PASS	AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0.0183262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.005;QD=22.908;RBI=0.0192056;REFB=-0.0239417;REVB=-0.00574518;RO=17;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361912;STB=0.697529;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00922516;OID=.;OPOS=73543621;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:17:17:21:21:0.552632:13:8:0:17:13:8:0:17
chr11	73611349	.	G	C	670.32	PASS	AF=0.623656;AO=58;DP=93;FAO=58;FDP=93;FR=.;FRO=35;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.00936985;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.556;QD=28.8311;RBI=0.0261243;REFB=0.00225336;REVB=0.0243862;RO=35;SAF=30;SAR=28;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057533;STB=0.531239;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=-0.00158223;OID=.;OPOS=73611349;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:35:35:58:58:0.623656:28:30:21:14:28:30:21:14
chr11	73670645	.	T	C	643.44	PASS	AF=0.52459;AO=64;DP=122;FAO=64;FDP=122;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.024041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.638;QD=21.0964;RBI=0.0291208;REFB=-0.00914815;REVB=-0.0164333;RO=57;SAF=28;SAR=36;SRF=35;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150701;STB=0.578547;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00692838;OID=.;OPOS=73670645;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:57:58:64:64:0.52459:36:28:35:22:36:28:35:23
chr11	73689104	.	G	A	282.65	PASS	AF=0.641026;AO=25;DP=39;FAO=25;FDP=39;FR=.;FRO=14;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0939646;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5462;QD=28.9899;RBI=0.0963127;REFB=-0.00961021;REVB=0.0211375;RO=14;SAF=19;SAR=6;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0397903;STB=0.52196;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.0104826;OID=.;OPOS=73689104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:14:14:25:25:0.641026:6:19:10:4:6:19:10:4
chr11	73715542	.	G	A	708.54	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.481;QD=62.9809;RBI=0.0500514;REFB=0;REVB=0.0422159;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181592;OID=.;OPOS=73715542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0
chr11	73717254	.	A	G	288.88	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.000623361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.965;QD=16.2747;RBI=0.0190687;REFB=-0.0350297;REVB=-0.0190585;RO=39;SAF=20;SAR=12;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2338;STB=0.631497;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0422743;OID=.;OPOS=73717254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:12:20:15:24:12:20:15:24
chr11	73785326	.	T	C	1713.23	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.099;QD=60.6452;RBI=0.0354694;REFB=0;REVB=0.0329682;RO=0;SAF=59;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29304e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.9438e-05;OID=.;OPOS=73785326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:54:59:0:0:54:59:0:0
chr11	73796917	.	C	T	438.82	PASS	AF=0.52381;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0618605;FXX=0.0117633;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.362;QD=20.8962;RBI=0.0630842;REFB=-0.019425;REVB=0.0123648;RO=40;SAF=21;SAR=23;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452627;STB=0.524989;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0216895;OID=.;OPOS=73796917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:40:40:44:44:0.52381:23:21:17:23:23:21:17:23
chr11	73806443	.	C	T	187.87	PASS	AF=0.418182;AO=22;DP=54;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.000971342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.309;QD=13.6632;RBI=0.025675;REFB=-0.0326083;REVB=-0.0256566;RO=30;SAF=9;SAR=13;SRF=7;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192673;STB=0.593004;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0143225;OID=.;OPOS=73806443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:30:32:22:23:0.418182:13:9:7:23:13:10:9:23
chr11	73825503	.	T	C	607.2	PASS	AF=0.426667;AO=64;DP=149;FAO=64;FDP=150;FR=.;FRO=86;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=47;FSRR=39;FWDB=0.0028136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.538;QD=16.1921;RBI=0.00281419;REFB=-0.00534788;REVB=-5.77159e-05;RO=85;SAF=28;SAR=36;SRF=46;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105829;STB=0.56248;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00482075;OID=.;OPOS=73825503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:150:85:86:64:64:0.426667:36:28:46:39:36:28:47:39
chr11	74043708	.	G	A	793.81	PASS	AF=1;AO=44;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0615754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.09;QD=56.7004;RBI=0.064845;REFB=0;REVB=0.0203309;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000576764;OID=.;OPOS=74043708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:44:56:1:21:23:0:0:28:28:0:0
chr11	74046975	.	C	T	1301.62	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-8.67731e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.905;QD=61.9821;RBI=0.0180849;REFB=0;REVB=-0.0180846;RO=0;SAF=40;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.83957e-05;OID=.;OPOS=74046975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:44:40:0:0:44:40:0:0
chr11	74049569	.	A	G	1415.38	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00183275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2377;QD=62.9058;RBI=0.00464879;REFB=0;REVB=-0.00427227;RO=0;SAF=53;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.23106e-06;OID=.;OPOS=74049569;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:37:53:0:0:37:53:0:0
chr11	74053547	.	C	T	1042.94	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=74;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00934388;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.585;QD=57.1475;RBI=0.0100962;REFB=-0.203192;REVB=0.00382429;RO=2;SAF=36;SAR=35;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255447;STB=0.51351;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00105402;OID=.;OPOS=74053547;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:74:73:2:2:71:71:0.972603:35:36:2:0:35:36:2:0
chr11	74167409	.	T	C	155.61	PASS	AF=0.333333;AO=19;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=11;FWDB=0.032865;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.6081;QD=10.3738;RBI=0.0362702;REFB=-0.0196411;REVB=0.0153435;RO=37;SAF=11;SAR=8;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114471;STB=0.620579;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00808191;OID=.;OPOS=74167409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:37:40:19:20:0.333333:8:11:25:12:9:11:29:11
chr11	74203308	.	T	A	410.53	PASS	AF=0.609375;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=64;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.0251688;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4006;QD=25.6582;RBI=0.0272629;REFB=-0.022078;REVB=-0.0104783;RO=24;SAF=20;SAR=19;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166593;STB=0.597051;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0146487;OID=.;OPOS=74203308;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:64:24:25:39:39:0.609375:19:20:18:6:19:20:19:6
chr11	74204269	.	T	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00801502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.23;QD=59.4352;RBI=0.0277962;REFB=0;REVB=0.0266156;RO=0;SAF=12;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120287;OID=.;OPOS=74204269;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:23:12:0:0:23:12:0:0
chr11	74208029	.	C	T	568.41	PASS	AF=0.483607;AO=59;DP=123;FAO=59;FDP=122;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=20;FSRR=43;FWDB=-0.0165285;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.756;QD=18.6365;RBI=0.0206686;REFB=-0.0162647;REVB=-0.0124096;RO=63;SAF=19;SAR=40;SRF=19;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220367;STB=0.502709;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0141914;OID=.;OPOS=74208029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:122:63:63:59:59:0.483607:40:19:19:44:40:19:20:43
chr11	74208214	.	G	A	116.61	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0193658;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.066;QD=11.6609;RBI=0.0194063;REFB=0.00548437;REVB=-0.00125314;RO=26;SAF=7;SAR=7;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0421631;STB=0.524964;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=-0.00809421;OID=.;OPOS=74208214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:7:7:12:14:7:7:12:14
chr11	74208592	.	G	T	63.01	PASS	AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0465542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2549;QD=8.40184;RBI=0.0692312;REFB=-0.0083224;REVB=0.0512414;RO=21;SAF=2;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31818;STB=0.69952;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0277096;OID=.;OPOS=74208592;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:7:2:10:11:7:2:10:11
chr11	74278090	.	C	T	665.73	PASS	AF=0.431953;AO=73;DP=169;FAO=73;FDP=169;FR=.;FRO=96;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=59;FSRR=37;FWDB=-0.00539816;FXX=0.0116952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.705;QD=15.7569;RBI=0.0186368;REFB=-0.0211848;REVB=-0.0178379;RO=95;SAF=45;SAR=28;SRF=59;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00495211;STB=0.501113;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0241558;OID=.;OPOS=74278090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:169:169:95:96:73:73:0.431953:28:45:59:36:28:45:59:37
chr11	74396330	.	C	T	412.91	PASS	AF=0.629032;AO=38;DP=61;FAO=39;FDP=62;FR=.;FRO=23;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00848111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.366;QD=26.6396;RBI=0.0189983;REFB=-0.0217038;REVB=0.0170002;RO=22;SAF=24;SAR=14;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092209;STB=0.563225;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.00891848;OID=.;OPOS=74396330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:22:23:38:39:0.629032:14:24:11:11:14:25:11:12
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chr11	74413872	.	A	G	530.89	PASS	AF=0.509259;AO=54;DP=108;FAO=55;FDP=108;FR=.;FRO=53;FSAF=41;FSAR=14;FSRF=38;FSRR=15;FWDB=0.0551521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3333;QD=19.6624;RBI=0.106966;REFB=0.0146435;REVB=-0.0916515;RO=54;SAF=40;SAR=14;SRF=39;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215246;STB=0.518076;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=-0.0147127;OID=.;OPOS=74413872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:54:53:54:55:0.509259:14:40:39:15:14:41:38:15
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chr11	74563071	.	G	A	350.69	PASS	AF=0.395833;AO=38;DP=99;FAO=38;FDP=96;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=39;FSRR=19;FWDB=0.00498195;FXX=0.039996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.704;QD=14.612;RBI=0.0117007;REFB=0.000130994;REVB=-0.0105871;RO=59;SAF=16;SAR=22;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217821;STB=0.648371;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.000305064;OID=.;OPOS=74563071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:96:59:58:38:38:0.395833:22:16:37:22:22:16:39:19
chr11	74563077	.	G	A	370.49	PASS	AF=0.4;AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=0.0153473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.645;QD=14.8196;RBI=0.0191533;REFB=-0.00282898;REVB=-0.0114591;RO=60;SAF=18;SAR=22;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175041;STB=0.598961;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0121087;OID=.;OPOS=74563077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:60:60:40:40:0.4:22:18:37:23:22:18:37:23
chr11	74676101	.	T	TA	34.54	PASS	AF=0.304348;AO=6;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0432851;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=17.2237;QD=6.00676;RBI=0.224045;REFB=0.0311824;REVB=0.219824;RO=14;SAF=5;SAR=1;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275858;STB=0.616089;STBP=0.455;TYPE=ins;VARB=-0.023023;OID=.;OPOS=74676102;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.304348:6:23:7:23:16:5:2:9:7:34:14:5:1:9:5
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chr11	74862391	.	A	G	271.95	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204914;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.246;QD=51.8001;RBI=0.0824087;REFB=0;REVB=0.0798204;RO=0;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.45803e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000486069;OID=.;OPOS=74862391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:4:17:0:0:4:17:0:0
chr11	74904362	.	T	C	1767.54	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00341185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.297;QD=60.9495;RBI=0.0201792;REFB=0;REVB=0.0198886;RO=0;SAF=71;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.57291e-05;OID=.;OPOS=74904362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:116:0:0:115:116:1:44:71:0:0:44:72:0:0
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chr11	74977088	.	GCC	GC,G,GGC	354.3	PASS	AF=0.605263,0.289474,0.0789474;AO=15,11,3;DP=33;FAO=23,11,3;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=7,6,0;FSAR=16,5,3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0499916,0.027707,-0.00343274;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=1,2,1;MLLD=12.5604,13.8173,7.55698;QD=37.2947;RBI=0.0651487,0.0356533,0.121458;REFB=0.0524643,0.0482596,0.0530666;REVB=-0.0417754,-0.0224383,0.12141;RO=2;SAF=4,7,1;SAR=11,4,2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0.30137,0.30137,0;SSSB=-0.0615517,0.0399473,-0.111102;STB=0.533304,0.538392,0.994936;STBP=0.28,0.542,0.121;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0645446,0.0765568,0.0225824;OID=.,.,.;OPOS=74977089,74977089,74977089;OREF=C,CC,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=GC,G,GGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.605263,0.289474,0.0789474:15,11,3:33:23,11,3:38:1:7,6,0:16,5,3:1:0:42:2:4,7,1:11,4,2:1:1
chr11	74995350	.	C	T	657.76	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0279238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8095;QD=59.7965;RBI=0.0279399;REFB=0.0335211;REVB=-0.000947212;RO=1;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240734;STB=0.512815;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.000718316;OID=.;OPOS=74995350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:19:24:0:1:19:24:0:1
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chr11	75152242	.	G	GT	94.66	PASS	AF=1;AO=2;DP=17;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.289807;FXX=0.470312;HRUN=0;LEN=1;MLLD=128.789;QD=42.0721;RBI=0.291994;REFB=0;REVB=0.0356681;RO=15;SAF=2;SAR=0;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.554201;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00695214;OID=.;OPOS=75152243;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:2:17:9:9:0:9:0:0:0:3:15:2:0:7:8
chr11	75152243	.	C	G,T	203.09	PASS	AF=0.117647,0.882353;AO=2,15;DP=17;FAO=2,15;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2,7;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250667,-0.0163647;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=107.189,113.239;QD=47.7863;RBI=0.0460122,0.0341261;REFB=0,0;REVB=-0.0385848,0.0299465;RO=0;SAF=2,7;SAR=0,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.151396,0.00146787;OID=.,.;OPOS=75152243,75152243;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:17:17:0:0:2,15:2,15:0.117647,0.882353:0,8:2,7:0:0:0,8:2,7:0:0
chr11	75160575	.	G	A	931.64	PASS	AF=0.458333;AO=99;DP=216;FAO=99;FDP=216;FR=.;FRO=117;FSAF=44;FSAR=55;FSRF=62;FSRR=55;FWDB=-0.017922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.342;QD=17.2526;RBI=0.0364902;REFB=-0.0127684;REVB=0.0317858;RO=117;SAF=44;SAR=55;SRF=62;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0837671;STB=0.546382;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0137951;OID=.;OPOS=75160575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:216:117:117:99:99:0.458333:55:44:62:55:55:44:62:55
chr11	75277628	.	A	G	1132.2	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00777557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.463;QD=59.5897;RBI=0.0553405;REFB=0;REVB=0.0547916;RO=0;SAF=18;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.06239e-05;OID=.;OPOS=75277628;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:76:0:0:70:76:1:52:18:0:0:57:19:0:0
chr11	75277992	.	C	T	291.0	PASS	AF=0.590909;AO=26;DP=44;FAO=26;FDP=44;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0307042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.754;QD=26.4548;RBI=0.0313905;REFB=-0.0126106;REVB=-0.00652803;RO=18;SAF=13;SAR=13;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00535495;OID=.;OPOS=75277992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:18:18:26:26:0.590909:13:13:9:9:13:13:9:9
chr11	75852448	.	C	T	1008.48	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0075193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.648;QD=59.3223;RBI=0.0147656;REFB=0;REVB=0.0127076;RO=0;SAF=41;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.88967e-05;OID=.;OPOS=75852448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:27:41:0:0:27:41:0:0
chr11	76207633	.	G	A	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00651108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.061;QD=63.8718;RBI=0.0142872;REFB=0;REVB=0.0127173;RO=0;SAF=20;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.70308e-05;OID=.;OPOS=76207633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:28:20:0:0:28:20:0:0
chr11	76262357	.	TTA	T,TAA,TT	98.64	PASS	AF=0.448276,0,0;AO=11,3,4;DP=38;FAO=13,0,0;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7,0,0;FSAR=6,0,0;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0140017,-0.026441,0.0393682;FXX=0.0333222;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=21.7544,13.7402,11.4978;QD=13.606;RBI=0.126084,0.17898,0.282261;REFB=-0.0627531,0.00317559,-0.0648865;REVB=-0.125304,0.177017,-0.279502;RO=19;SAF=7,3,0;SAR=4,0,4;SRF=15;SRR=4;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.189188,0.509709,-0.760437;STB=0.58366,0.5,0.5;STBP=0.458,1,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.0643391,0,0;OID=.,.,.;OPOS=76262358,76262358,76262359;OREF=TA,T,A;OALT=-,A,-;OMAPALT=T,TAA,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.448276,0,0:11,3,4:38:13,0,0:29:16:7,0,0:6,0,0:11:5:97:19:7,3,0:4,0,4:15:4
chr11	76368553	.	A	G	696.66	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0179808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2147;QD=52.5782;RBI=0.0332803;REFB=-0.00342987;REVB=0.0280048;RO=1;SAF=20;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229599;STB=0.504259;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.000856746;OID=.;OPOS=76368553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:53:1:2:51:51:0.962264:31:20:1:0:31:20:1:1
chr11	76368639	.	A	C	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.094;QD=59.8559;RBI=0.0106078;REFB=0;REVB=-0.000268381;RO=0;SAF=38;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26e-05;OID=.;OPOS=76368639;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:33:38:0:0:33:38:0:0
chr11	76370792	.	A	G	893.7	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.971;QD=57.6579;RBI=0.0248142;REFB=0;REVB=0.00837279;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121069;OID=.;OPOS=76370792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:36:25:0:0:36:26:0:0
chr11	76372052	.	A	G	582.37	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00683593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3755;QD=58.2372;RBI=0.0225329;REFB=0.0505901;REVB=-0.0214709;RO=0;SAF=31;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529396;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=-0.00840299;OID=.;OPOS=76372052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:0:1:39:39:0.975:8:31:0:0:8:31:0:1
chr11	76372418	.	T	C	191.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0581461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7715;QD=47.8209;RBI=0.0967841;REFB=0;REVB=0.0773705;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00487454;OID=.;OPOS=76372418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr11	76400254	.	T	C	487.75	PASS	AF=0.456897;AO=53;DP=116;FAO=53;FDP=116;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=-0.00081623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2684;QD=16.8189;RBI=0.00745088;REFB=-0.0166037;REVB=-0.00740604;RO=63;SAF=27;SAR=26;SRF=30;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323813;STB=0.518042;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.022538;OID=.;OPOS=76400254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:63:63:53:53:0.456897:26:27:30:33:26:27:30:33
chr11	76405613	.	C	T	409.8	PASS	AF=0.518987;AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.0135842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.306;QD=20.7492;RBI=0.014063;REFB=0.00247247;REVB=0.00363833;RO=37;SAF=18;SAR=23;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223341;STB=0.628355;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.00230679;OID=.;OPOS=76405613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:37:38:41:41:0.518987:23:18:26:11:23:18:27:11
chr11	76415209	.	G	A	210.44	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=63;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.105097;FXX=0.031741;HRUN=5;LEN=1;MLLD=45.3842;QD=13.7993;RBI=0.112055;REFB=0.0137729;REVB=0.0388709;RO=37;SAF=11;SAR=14;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205197;STB=0.51919;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.00604148;OID=.;OPOS=76415209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:61:37:36:25:25:0.409836:14:11:17:20:14:11:17:19
chr11	76418737	.	A	G	426.63	PASS	AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.085465;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4774;QD=51.7126;RBI=0.0866281;REFB=-0.0279309;REVB=0.0141477;RO=2;SAF=20;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017791;STB=0.509548;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.000497198;OID=.;OPOS=76418737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:33:2:2:31:31:0.939394:11:20:1:1:11:20:1:1
chr11	76427674	.	G	C	114.05	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0129549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.974;QD=18.2486;RBI=0.0324321;REFB=-0.00925133;REVB=0.0297323;RO=12;SAF=4;SAR=9;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173529;STB=0.59984;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0116263;OID=.;OPOS=76427674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:9:4:6:6:9:4:6:6
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chr11	76430585	.	C	T	95.33	PASS	AF=0.363636;AO=11;DP=31;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0390873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.0345;QD=11.5546;RBI=0.157735;REFB=-0.022273;REVB=0.152816;RO=19;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642199;STB=0.523521;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.048148;OID=.;OPOS=76430585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:31:33:19:21:11:12:0.363636:4:7:11:8:5:7:13:8
chr11	76430597	.	A	G	118.93	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.021686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.87;QD=13.2139;RBI=0.0379205;REFB=0.00450955;REVB=-0.0311076;RO=21;SAF=8;SAR=6;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512178;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=-0.010744;OID=.;OPOS=76430597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:22:14:14:0.388889:6:8:12:9:6:8:13:9
chr11	76507282	.	C	T	45.66	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0960712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.595;QD=8.69805;RBI=0.0965267;REFB=-0.0152199;REVB=-0.00936564;RO=14;SAF=2;SAR=5;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168697;STB=0.605742;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0195817;OID=.;OPOS=76507282;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:5:2:6:8:5:2:6:8
chr11	76507403	.	G	A	717.37	PASS	AF=0.385321;AO=82;DP=216;FAO=84;FDP=218;FR=.;FRO=134;FSAF=52;FSAR=32;FSRF=67;FSRR=67;FWDB=-0.00357109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.712;QD=13.1627;RBI=0.0197233;REFB=-0.0031227;REVB=-0.0193973;RO=134;SAF=50;SAR=32;SRF=67;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122625;STB=0.574792;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00551356;OID=.;OPOS=76507403;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:218:134:134:82:84:0.385321:32:50:67:67:32:52:67:67
chr11	76507582	.	G	A	602.22	PASS	AF=0.512605;AO=61;DP=118;FAO=61;FDP=119;FR=.;FRO=58;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=0.0205666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.239;QD=20.2427;RBI=0.0582293;REFB=-0.0311529;REVB=0.0544763;RO=57;SAF=38;SAR=23;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245283;STB=0.510064;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0277568;OID=.;OPOS=76507582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:119:57:58:61:61:0.512605:23:38:34:23:23:38:35:23
chr11	76507692	.	T	A,C	2653.73	PASS	AF=0.927374,0.0614525;AO=162,9;DP=176;FAO=166,11;FDP=179;FR=.;FRO=2;FSAF=58,11;FSAR=108,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0321416,-0.00407173;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=44.8555,79.5549;QD=59.3013;RBI=0.0454473,0.0108675;REFB=-0.0858197,-0.0686804;REVB=0.0321306,-0.0100759;RO=5;SAF=55,9;SAR=107,0;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0289267,0.779824;STB=0.501969,0.998287;STBP=0.771,0.066;TYPE=snp,snp;VARB=0.0101367,0.0673055;OID=.,.;OPOS=76507692,76507692;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:22:176:179:5:2:162,9:166,11:0.927374,0.0614525:107,0:55,9:4:1:108,0:58,11:1:1
chr11	76508314	.	A	G	182.06	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00758259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.023;QD=16.9353;RBI=0.0476052;REFB=-0.0409216;REVB=-0.0469974;RO=24;SAF=15;SAR=4;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.397655;STB=0.72947;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0283426;OID=.;OPOS=76508314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:4:15:10:14:4:15:10:14
chr11	76508569	.	GG	CC	1345.54	PASS	AF=0.542735;AO=127;DP=227;FAO=127;FDP=234;FR=.;FRO=107;FSAF=89;FSAR=38;FSRF=63;FSRR=44;FWDB=-0.0516874;FXX=0.0126577;HRUN=3;LEN=2;MLLD=98.3875;QD=23.0006;RBI=0.0645757;REFB=-0.00321162;REVB=-0.0387096;RO=98;SAF=89;SAR=38;SRF=57;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108157;STB=0.558198;STBP=0.056;TYPE=mnp;VARB=0.00281411;OID=.;OPOS=76508569;OREF=GG;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:227:234:98:107:127:127:0.542735:38:89:57:41:38:89:63:44
chr11	76637651	.	G	A	266.78	PASS	AF=0.315789;AO=34;DP=113;FAO=36;FDP=114;FR=.;FRO=78;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=59;FSRR=19;FWDB=-0.0187836;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7273;QD=9.3608;RBI=0.0188156;REFB=-0.0102637;REVB=0.00109675;RO=78;SAF=19;SAR=15;SRF=59;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250047;STB=0.659623;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.035718;OID=.;OPOS=76637651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:78:78:34:36:0.315789:15:19:59:19:17:19:59:19
chr11	76637680	.	G	A	219.24	PASS	AF=0.287037;AO=27;DP=104;FAO=31;FDP=108;FR=.;FRO=77;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=56;FSRR=21;FWDB=0.0546354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3043;QD=8.12002;RBI=0.0546452;REFB=0.00679877;REVB=0.00103546;RO=77;SAF=11;SAR=16;SRF=56;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381507;STB=0.690948;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=-0.00952018;OID=.;OPOS=76637680;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:108:77:77:27:31:0.287037:16:11:56:21:17:14:56:21
chr11	76687399	.	A	C	1039.26	PASS	AF=0.972603;AO=71;DP=74;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0146323;FXX=0.0135117;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.158;QD=56.9457;RBI=0.022833;REFB=0.00956509;REVB=0.0175283;RO=2;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270022;STB=0.514282;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-4.67486e-06;OID=.;OPOS=76687399;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:74:73:2:2:71:71:0.972603:34:37:0:2:34:37:0:2
chr11	76701606	.	G	A	769.13	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00254521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.794;QD=56.9728;RBI=0.0264919;REFB=0;REVB=-0.0263693;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.6269e-05;OID=.;OPOS=76701606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr11	76709795	.	G	A	212.4	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0213543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.1;QD=14.3998;RBI=0.0234659;REFB=-0.0158844;REVB=-0.00972841;RO=34;SAF=10;SAR=15;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246471;STB=0.639891;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0171397;OID=.;OPOS=76709795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:15:10:22:12:15:10:22:12
chr11	76732308	.	G	A	817.72	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00759622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.028;QD=57.3842;RBI=0.00805567;REFB=0;REVB=-0.00268166;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.87182e-05;OID=.;OPOS=76732308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:35:22:0:0:35:22:0:0
chr11	76732949	.	T	C	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0713248;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=88.0947;QD=54.516;RBI=0.0818301;REFB=0;REVB=0.0401117;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147812;OID=.;OPOS=76732949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0
chr11	76733024	.	A	G	230.29	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0289789;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.926;QD=46.0582;RBI=0.0331593;REFB=-0.0925729;REVB=0.016117;RO=1;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0540538;STB=0.529381;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00104278;OID=.;OPOS=76733024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:8:11:0:1:8:11:0:1
chr11	76751166	.	G	A	208.77	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00992241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7295;QD=25.3055;RBI=0.0818326;REFB=0.00782395;REVB=0.0812288;RO=13;SAF=9;SAR=11;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170103;STB=0.594502;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=-0.00279769;OID=.;OPOS=76751166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:11:9:9:4:11:9:9:4
chr11	76751541	.	CT	C,GC	588.1	PASS	AF=1,0;AO=37,2;DP=40;FAO=40,0;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=31,0;FSAR=9,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109841,-0.0109205;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,2;MLLD=29.0119,40.7586;QD=58.8103;RBI=0.160443,0.247063;REFB=0,0;REVB=-0.160066,-0.246821;RO=0;SAF=30,0;SAR=7,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.00464e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.00465744,0;OID=.,.;OPOS=76751542,76751541;OREF=T,CT;OALT=-,GC;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:37,2:40,0:1,0:7,2:30,0:0:0:9,0:31,0:0:0
chr11	76751584	.	CT	C,CC,CG	1057.41	PASS	AF=0.931507,0.0273973,0.0410959;AO=65,3,5;DP=73;FAO=68,2,3;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=48,2,3;FSAR=20,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00164465,-0.00143838,-0.000290148;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=293.959,271.421,272.989;QD=57.9401;RBI=0.042314,0.0508904,0.0948656;REFB=0,0,0;REVB=-0.042282,-0.05087,-0.0948652;RO=0;SAF=47,3,3;SAR=18,0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=3.05661e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=-0.00310459,5.09345e-05,0.0476065;OID=.,.,.;OPOS=76751585,76751585,76751585;OREF=T,T,T;OALT=-,C,G;OMAPALT=C,CC,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.931507,0.0273973,0.0410959:65,3,5:73:68,2,3:73:0:48,2,3:20,0,0:0:0:10:0:47,3,3:18,0,2:0:0
chr11	76751603	.	CT	C	1287.67	PASS	AF=1;AO=105;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0938183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.4315;QD=47.2541;RBI=0.12679;REFB=0;REVB=-0.0852868;RO=0;SAF=72;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00186208;OID=.;OPOS=76751604;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:105:109:109:109:0:74:35:0:0:23:0:72:33:0:0
chr11	76796077	.	G	A	354.42	PASS	AF=0.486842;AO=36;DP=75;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=-0.0148551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.999;QD=18.6538;RBI=0.019786;REFB=-0.0145775;REVB=-0.0130695;RO=39;SAF=13;SAR=23;SRF=29;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346268;STB=0.681505;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.011838;OID=.;OPOS=76796077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:39:39:36:37:0.486842:23:13:29:10:23:14:29:10
chr11	76799004	.	T	C	865.74	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00332302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.706;QD=57.7159;RBI=0.0378564;REFB=0;REVB=0.0377102;RO=0;SAF=37;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.06382e-05;OID=.;OPOS=76799004;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:22:37:0:0:23:37:0:0
chr11	76827360	.	A	G	561.22	PASS	AF=0.541667;AO=52;DP=96;FAO=52;FDP=96;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=35;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.013621;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.188;QD=23.384;RBI=0.113319;REFB=-0.0513871;REVB=-0.112497;RO=44;SAF=17;SAR=35;SRF=27;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245632;STB=0.63526;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0711905;OID=.;OPOS=76827360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:44:44:52:52:0.541667:35:17:27:17:35:17:27:17
chr11	76836864	.	G	A	1196.57	PASS	AF=0.564356;AO=113;DP=200;FAO=114;FDP=202;FR=.;FRO=88;FSAF=64;FSAR=50;FSRF=47;FSRR=41;FWDB=0.0101844;FXX=0.0146334;HRUN=4;LEN=1;MLLD=164.145;QD=23.6945;RBI=0.0131472;REFB=-0.0176531;REVB=-0.00831427;RO=85;SAF=63;SAR=50;SRF=45;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224363;STB=0.512043;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0143321;OID=.;OPOS=76836864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:200:202:85:88:113:114:0.564356:50:63:45:40:50:64:47:41
chr11	76853783	.	T	C	235.38	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0302701;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.693;QD=15.4348;RBI=0.0326143;REFB=-0.0356845;REVB=-0.0121414;RO=27;SAF=11;SAR=16;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100449;STB=0.58459;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0506936;OID=.;OPOS=76853783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:27:34:27:27:0.442623:16:11:14:13:16:11:19:15
chr11	76917220	.	A	G	196.95	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0161953;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.1703;QD=19.2146;RBI=0.0293371;REFB=-0.0103792;REVB=-0.0244618;RO=21;SAF=14;SAR=6;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835471;STB=0.547437;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00952506;OID=.;OPOS=76917220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:6:14:13:8:6:14:13:8
chr11	76928149	.	A	G	2396.69	PASS	AF=0.97561;AO=160;DP=164;FAO=160;FDP=164;FR=.;FRO=4;FSAF=57;FSAR=103;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00475027;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.803;QD=58.4559;RBI=0.0162018;REFB=0.0178225;REVB=0.0154898;RO=3;SAF=57;SAR=103;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013655;STB=0.502829;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.000407962;OID=.;OPOS=76928149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:164:164:3:4:160:160:0.97561:103:57:0:3:103:57:1:3
chr11	76954788	.	T	TA	162.59	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.036103;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.7913;QD=13.5492;RBI=0.0602923;REFB=-0.0515418;REVB=-0.048288;RO=28;SAF=13;SAR=10;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0415392;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0507277;OID=.;OPOS=76954789;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:23:53:24:48:24:13:11:13:11:99:28:13:10:17:11
chr11	76954812	.	T	C	184.79	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0280896;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5197;QD=17.5992;RBI=0.0291292;REFB=-0.00795336;REVB=-0.0077125;RO=23;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0876044;STB=0.549948;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0133008;OID=.;OPOS=76954812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:23:23:19:19:0.452381:10:9:13:10:10:9:13:10
chr11	76954833	.	G	A	198.55	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.027498;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.913;QD=18.47;RBI=0.0276219;REFB=-0.0152403;REVB=-0.0026131;RO=21;SAF=10;SAR=10;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215333;STB=0.511616;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.017078;OID=.;OPOS=76954833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:21:23:20:20:0.465116:10:10:10:11:10:10:12:11
chr11	77033699	.	A	G	318.77	PASS	AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0136282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.686;QD=26.5641;RBI=0.0209685;REFB=-0.018811;REVB=-0.0159358;RO=20;SAF=18;SAR=10;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0058703;STB=0.503244;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0181508;OID=.;OPOS=77033699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:20:20:28:28:0.583333:10:18:13:7:10:18:13:7
chr11	77301341	.	G	A	435.89	PASS	AF=0.630769;AO=41;DP=65;FAO=41;FDP=65;FR=.;FRO=24;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0391597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1799;QD=26.8241;RBI=0.0511857;REFB=0.000172155;REVB=0.032962;RO=24;SAF=25;SAR=16;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160317;STB=0.587523;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=-0.000184045;OID=.;OPOS=77301341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:24:24:41:41:0.630769:16:25:9:15:16:25:9:15
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chr11	77378505	.	A	G	222.66	PASS	AF=0.6;AO=20;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0561889;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.3585;QD=25.4467;RBI=0.056471;REFB=-0.0389311;REVB=0.00563801;RO=14;SAF=12;SAR=8;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218355;STB=0.519981;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0291117;OID=.;OPOS=77378505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:14:20:21:0.6:8:12:8:6:8:13:8:6
chr11	77402734	.	C	A	269.3	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.00364346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.28;QD=16.5726;RBI=0.0218146;REFB=-0.0265979;REVB=-0.0215082;RO=35;SAF=13;SAR=17;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0609604;STB=0.534224;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0322543;OID=.;OPOS=77402734;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:17:13:13:22:17:13:13:22
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chr11	77597794	.	G	C	77.7	PASS	AF=0.454545;AO=9;DP=21;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.0091536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.317;QD=14.1274;RBI=0.0180722;REFB=-0.0135281;REVB=0.0155825;RO=11;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342062;STB=0.681502;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0332676;OID=.;OPOS=77597794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:21:22:11:12:9:10:0.454545:5:4:9:2:5:5:10:2
chr11	77629132	.	A	AT	491.41	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0898121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=28.4669;QD=45.7123;RBI=0.102484;REFB=0;REVB=-0.0493639;RO=1;SAF=20;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229007;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00357489;OID=.;OPOS=77629133;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:43:44:43:43:0:20:23:0:0:9:1:20:23:1:0
chr11	77734209	.	T	C	116.51	PASS	AF=0.269841;AO=16;DP=63;FAO=17;FDP=63;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=31;FSRR=15;FWDB=-0.00956547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.849;QD=7.39744;RBI=0.0264325;REFB=-0.00223911;REVB=-0.024641;RO=45;SAF=5;SAR=11;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410184;STB=0.76162;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0427939;OID=.;OPOS=77734209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:45:46:16:17:0.269841:11:5:30:15:12:5:31:15
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chr11	77909014	.	G	A	346.35	PASS	AF=0.546875;AO=34;DP=65;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0278712;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.79;QD=21.6471;RBI=0.0575535;REFB=-0.0350927;REVB=0.0503547;RO=29;SAF=21;SAR=13;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0333304;STB=0.526301;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0274362;OID=.;OPOS=77909014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:29:29:34:35:0.546875:13:21:19:10:14:21:19:10
chr11	77920563	.	G	T	331.29	PASS	AF=0.632653;AO=31;DP=51;FAO=31;FDP=49;FR=.;FRO=18;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0105286;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.747;QD=27.0443;RBI=0.0323814;REFB=-0.0256808;REVB=0.0306219;RO=17;SAF=20;SAR=11;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435059;STB=0.508665;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0120526;OID=.;OPOS=77920563;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:49:17:18:31:31:0.632653:11:20:12:5:11:20:12:6
chr11	77920863	.	C	A	83.2	PASS	AF=0.314286;AO=6;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.124397;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=46.4826;QD=9.50905;RBI=0.128161;REFB=-0.000352304;REVB=-0.03083;RO=15;SAF=3;SAR=3;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347481;STB=0.516099;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0070815;OID=.;OPOS=77920863;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:15:24:6:11:0.314286:3:3:12:3:3:8:17:7
chr11	77920930	.	A	G	45.1	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=32;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0467545;FXX=0.0937207;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.471;QD=6.22049;RBI=0.0574468;REFB=-0.0156057;REVB=-0.033379;RO=24;SAF=6;SAR=1;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257744;STB=0.694995;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0686103;OID=.;OPOS=77920930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:32:29:24:22:7:7:0.241379:1:6:17:7:1:6:15:7
chr11	77921527	.	G	C	756.03	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.72;QD=56.0021;RBI=0.0426585;REFB=0;REVB=0.040619;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89597e-05;OID=.;OPOS=77921527;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:54:0:0:50:54:1:24:26:0:0:26:28:0:0
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chr11	77930345	.	T	C	320.83	PASS	AF=0.55;AO=33;DP=60;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0245825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.294;QD=21.3887;RBI=0.0253846;REFB=-0.0279917;REVB=0.00633096;RO=27;SAF=9;SAR=24;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279977;STB=0.655638;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0199151;OID=.;OPOS=77930345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:27:27:33:33:0.55:24:9:16:11:24:9:16:11
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chr11	77937800	.	G	A	274.41	PASS	AF=0.329114;AO=18;DP=78;FAO=26;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=46;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=0.0567821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.255;QD=13.8942;RBI=0.0584389;REFB=-0.00865288;REVB=-0.0138167;RO=45;SAF=5;SAR=13;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478453;STB=0.61103;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0271975;OID=.;OPOS=77937800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:45:46:18:26:0.329114:13:5:14:31:13:13:15:31
chr11	78277277	.	A	G	213.54	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0203548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.667;QD=16.116;RBI=0.0275393;REFB=-0.00836177;REVB=-0.0185498;RO=29;SAF=10;SAR=14;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13074;STB=0.574071;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0099671;OID=.;OPOS=78277277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:14:10:16:13:14:10:16:13
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chr11	82443672	.	C	G	108.02	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0452976;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.4604;QD=13.0938;RBI=0.0453083;REFB=-0.0043916;REVB=-0.000985862;RO=18;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732572;STB=0.507031;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0152655;OID=.;OPOS=82443672;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:20:13:13:0.393939:7:6:7:11:7:6:9:11
chr11	82443817	.	G	A	69.13	PASS	AF=0.222222;AO=10;DP=45;FAO=10;FDP=45;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0828335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3948;QD=6.14516;RBI=0.0828356;REFB=0.00508142;REVB=0.000591285;RO=35;SAF=5;SAR=5;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173091;STB=0.511089;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=-0.0181183;OID=.;OPOS=82443817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:45:45:35:35:10:10:0.222222:5:5:18:17:5:5:18:17
chr11	82535963	.	C	T	154.1	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.018072;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.202;QD=14.3353;RBI=0.0347209;REFB=-0.0176962;REVB=-0.029647;RO=26;SAF=12;SAR=5;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830903;STB=0.547891;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0163699;OID=.;OPOS=82535963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:5:12:20:6:5:12:20:6
chr11	82896177	.	T	TA	32.69	PASS	AF=0.188406;AO=11;DP=70;FAO=13;FDP=69;FR=.;FRO=56;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0126797;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=169.029;QD=1.89526;RBI=0.022963;REFB=-0.000788471;REVB=-0.0191449;RO=58;SAF=9;SAR=2;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398611;STB=0.80831;STBP=0.028;TYPE=ins;VARB=0.0723473;OID=.;OPOS=82896178;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.188406:11:70:13:69:56:11:2:28:28:32:58:9:2:30:28
chr11	82973004	.	C	T	141.36	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0310448;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.094;QD=13.4628;RBI=0.037204;REFB=-0.0134449;REVB=0.0205025;RO=24;SAF=7;SAR=9;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149715;STB=0.60869;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.019515;OID=.;OPOS=82973004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:26:16:16:0.380952:9:7:14:10:9:7:16:10
chr11	82996986	.	A	C	395.26	PASS	AF=0.506329;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.0140441;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.478;QD=20.0132;RBI=0.0173089;REFB=-0.0371221;REVB=0.0101174;RO=39;SAF=18;SAR=22;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235487;STB=0.630075;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0354902;OID=.;OPOS=82996986;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:39:39:40:40:0.506329:22:18:28:11:22:18:28:11
chr11	85195025	.	A	C	2396.86	PASS	AF=0.942529;AO=163;DP=174;FAO=164;FDP=174;FR=.;FRO=10;FSAF=61;FSAR=103;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0258703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.955;QD=55.1003;RBI=0.047379;REFB=0.0469621;REVB=-0.0396925;RO=10;SAF=61;SAR=102;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0146766;STB=0.507843;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=-0.00358175;OID=.;OPOS=85195025;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:174:174:10:10:163:164:0.942529:102:61:5:5:103:61:5:5
chr11	85195075	.	T	C	2894.51	PASS	AF=0.930233;AO=200;DP=215;FAO=200;FDP=215;FR=.;FRO=15;FSAF=77;FSAR=123;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0024702;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.246;QD=53.8513;RBI=0.00504765;REFB=-0.00730734;REVB=0.00440192;RO=15;SAF=77;SAR=123;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00209764;STB=0.501104;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.000540606;OID=.;OPOS=85195075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:215:215:15:15:200:200:0.930233:123:77:6:9:123:77:6:9
chr11	85195154	.	A	T	2214.98	PASS	AF=0.933333;AO=151;DP=163;FAO=154;FDP=165;FR=.;FRO=11;FSAF=77;FSAR=77;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0448576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.525;QD=53.6965;RBI=0.0964151;REFB=-0.121846;REVB=0.0853444;RO=10;SAF=76;SAR=75;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0121771;STB=0.50303;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.00746592;OID=.;OPOS=85195154;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:163:165:10:11:151:154:0.933333:75:76:4:6:77:77:5:6
chr11	85195185	.	T	C	1387.96	PASS	AF=0.978261;AO=89;DP=92;FAO=90;FDP=92;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00616889;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.254;QD=60.3462;RBI=0.00618373;REFB=-0.0349055;REVB=0.000428186;RO=2;SAF=51;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024287;STB=0.512818;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.000250096;OID=.;OPOS=85195185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:92:92:2:2:89:90:0.978261:38:51:0:2:38:52:0:2
chr11	85195190	.	CA	GG	1032.01	PASS	AF=0.972603;AO=66;DP=68;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0227011;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=261.424;QD=56.5484;RBI=0.0360055;REFB=-0.0176912;REVB=0.0279474;RO=2;SAF=42;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377507;STB=0.517236;STBP=0.128;TYPE=mnp;VARB=0.000780007;OID=.;OPOS=85195190;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:68:73:2:2:66:71:0.972603:24:42:0:2:28:43:0:2
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chr11	85393897	.	T	C	163.65	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0399172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.422;QD=20.4558;RBI=0.0557518;REFB=-0.0529802;REVB=0.0389214;RO=15;SAF=8;SAR=9;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161694;STB=0.591136;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0156792;OID=.;OPOS=85393897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:9:8:10:5:9:8:10:5
chr11	85397190	.	A	G	723.88	PASS	AF=0.496644;AO=74;DP=148;FAO=74;FDP=149;FR=.;FRO=75;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=47;FSRR=28;FWDB=0.0302669;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4018;QD=19.433;RBI=0.0371662;REFB=-0.0245547;REVB=-0.0215696;RO=71;SAF=41;SAR=33;SRF=47;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0985492;STB=0.53727;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0221147;OID=.;OPOS=85397190;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:149:71:75:74:74:0.496644:33:41:47:24:33:41:47:28
chr11	85435730	.	C	T	920.06	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.919;QD=58.4168;RBI=0.0738192;REFB=0;REVB=-0.0689256;RO=0;SAF=19;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.08994e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117327;OID=.;OPOS=85435730;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:44:19:0:0:44:19:0:0
chr11	85436352	.	G	A	1165.9	PASS	AF=1;AO=74;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00296409;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.093;QD=59.7896;RBI=0.0032933;REFB=0;REVB=-0.00143526;RO=0;SAF=30;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300154;OID=.;OPOS=85436352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:74:78:1:44:30:0:0:44:34:0:0
chr11	85436394	.	T	C	1054.99	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0043255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.266;QD=59.4363;RBI=0.0205473;REFB=0;REVB=0.0200868;RO=0;SAF=32;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.91026e-05;OID=.;OPOS=85436394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:71:0:0:69:71:1:37:32:0:0:38:33:0:0
chr11	85436500	.	T	C	390.39	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00748132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.476;QD=55.7705;RBI=0.0576878;REFB=0;REVB=0.0572006;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280922;OID=.;OPOS=85436500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:12:15:0:0:13:15:0:0
chr11	85436699	.	A	G	1452.48	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00903135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.957;QD=63.1514;RBI=0.084373;REFB=0;REVB=0.0838882;RO=0;SAF=52;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.0217e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114299;OID=.;OPOS=85436699;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:40:52:0:0:40:52:0:0
chr11	85436868	.	G	C	838.55	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0651096;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.795;QD=55.9031;RBI=0.0692163;REFB=0;REVB=0.0234867;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00534743;OID=.;OPOS=85436868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:60:0:0:55:60:1:30:25:0:0:31:29:0:0
chr11	85437896	.	A	G	681.12	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00338061;FXX=0.0652032;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7584;QD=63.3601;RBI=0.0844281;REFB=0;REVB=0.0843603;RO=0;SAF=26;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00226562;OID=.;OPOS=85437896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:17:26:0:0:17:26:0:0
chr11	85447611	.	T	C	961.94	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0479896;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.086;QD=57.4293;RBI=0.0580417;REFB=-0.127941;REVB=0.0326471;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.507244;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00197871;OID=.;OPOS=85447611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:67:0:1:66:66:0.985075:32:34:0:0:32:34:1:0
chr11	85456703	.	T	C	1841.58	PASS	AF=1;AO=119;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387785;FXX=0.0163921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0154;QD=61.3861;RBI=0.0388253;REFB=0;REVB=0.00190566;RO=1;SAF=75;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00629163;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000836238;OID=.;OPOS=85456703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:120:1:0:119:120:1:44:75:1:0:44:76:0:0
chr11	85565409	.	G	A	252.18	PASS	AF=0.426471;AO=29;DP=68;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0079642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.589;QD=14.8338;RBI=0.0337981;REFB=-0.0218343;REVB=0.0328464;RO=38;SAF=8;SAR=21;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244283;STB=0.633422;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0348328;OID=.;OPOS=85565409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:38:39:29:29:0.426471:21:8:19:19:21:8:19:20
chr11	85692181	.	A	C	1171.89	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6556;QD=60.8775;RBI=0.0439366;REFB=0;REVB=-0.0310564;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.63617e-08;OID=.;OPOS=85692181;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:33:44:0:0:33:44:0:0
chr11	85718641	.	T	C	1779.76	PASS	AF=0.97541;AO=118;DP=122;FAO=119;FDP=122;FR=.;FRO=3;FSAF=51;FSAR=68;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0647913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.525;QD=58.3528;RBI=0.0739379;REFB=0.0269824;REVB=0.0356215;RO=3;SAF=50;SAR=68;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276418;STB=0.514283;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=-9.56734e-05;OID=.;OPOS=85718641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:122:122:3:3:118:119:0.97541:68:50:3:0:68:51:3:0
chr11	85725937	.	C	T	1369.95	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.029;QD=61.5708;RBI=0.0442529;REFB=0;REVB=0.0375348;RO=0;SAF=60;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376885;OID=.;OPOS=85725937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:89:0:0:84:89:1:24:60:0:0:24:65:0:0
chr11	85968623	.	C	T	252.84	PASS	AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0316609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3879;QD=23.5203;RBI=0.0418654;REFB=-0.0636299;REVB=0.0273915;RO=19;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122424;STB=0.506817;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0301026;OID=.;OPOS=85968623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:11:13:10:9:11:13:10:9
chr11	86098680	.	T	C	1540.26	PASS	AF=0.98;AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=100;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0557253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8808;QD=61.6103;RBI=0.0772296;REFB=-0.0389028;REVB=0.0534705;RO=2;SAF=55;SAR=43;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00235663;STB=0.501243;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00356008;OID=.;OPOS=86098680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:100:100:2:2:98:98:0.98:43:55:1:1:43:55:1:1
chr11	86267633	.	C	T	362.0	PASS	AF=0.469136;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.00572693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.904;QD=17.8764;RBI=0.0479866;REFB=-0.0163761;REVB=0.0476436;RO=43;SAF=27;SAR=11;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0661872;STB=0.537088;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0167159;OID=.;OPOS=86267633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:43:43:38:38:0.469136:11:27:28:15:11:27:28:15
chr11	86267714	.	C	A	307.45	PASS	AF=0.376344;AO=35;DP=93;FAO=35;FDP=93;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=-0.00974878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.901;QD=13.2236;RBI=0.0353501;REFB=-0.00716039;REVB=-0.0339792;RO=58;SAF=20;SAR=15;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00274022;STB=0.501566;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.00916945;OID=.;OPOS=86267714;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:58:58:35:35:0.376344:15:20:33:25:15:20:33:25
chr11	86520445	.	C	T	213.94	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00187899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.908;QD=20.8717;RBI=0.0204907;REFB=-0.0326124;REVB=-0.0204044;RO=20;SAF=15;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20371;STB=0.615269;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0349075;OID=.;OPOS=86520445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:6:15:10:10:6:15:10:10
chr11	86520632	.	G	A	216.37	PASS	AF=0.346154;AO=27;DP=78;FAO=27;FDP=78;FR=.;FRO=51;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.0238545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.404;QD=11.0958;RBI=0.0241923;REFB=-0.0202697;REVB=-0.00402867;RO=51;SAF=7;SAR=20;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37866;STB=0.720378;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0265553;OID=.;OPOS=86520632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:51:51:27:27:0.346154:20:7:30:21:20:7:30:21
chr11	86520752	.	G	A	80.01	PASS	AF=0.25;AO=11;DP=44;FAO=11;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0413119;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.794;QD=7.27408;RBI=0.0417856;REFB=-0.0090756;REVB=-0.006274;RO=33;SAF=6;SAR=5;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367502;STB=0.522971;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.025435;OID=.;OPOS=86520752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:44:44:33:33:11:11:0.25:5:6:19:14:5:6:19:14
chr11	86521682	.	ATTTTTTTA	ATTTTT,ATTTTTT,ATTTTTTA	99.92	PASS	AF=0.6,0,0.05;AO=4,3,4;DP=23;FAO=12,0,1;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=4,0,0;FSAR=8,0,1;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0542344,-0.0641944,-0.106348;FXX=0.0475964;HRUN=7,7,7;LEN=3,2,1;MLLD=26.2572,17.5107,9.23511;QD=19.9831;RBI=0.181675,0.206219,0.42652;REFB=0.0314704,0.0651115,0.0122204;REVB=0.173391,0.195973,0.413049;RO=6;SAF=1,0,3;SAR=3,3,1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.254893,-0.672276,0.254893;STB=0.642615,0.5,0.992551;STBP=0.127,1,0.268;TYPE=del,del,del;VARB=-0.0568148,0.0201942,0.0519192;OID=.,.,.;OPOS=86521688,86521689,86521683;OREF=TTA,TA,T;OALT=-,-,-;OMAPALT=ATTTTT,ATTTTTT,ATTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.6,0,0.05:4,3,4:23:12,0,1:20:7:4,0,0:8,0,1:5:2:35:6:1,0,3:3,3,1:3:3
chr11	86660886	.	G	A	2351.93	PASS	AF=1;AO=154;DP=154;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0052961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.635;QD=61.0891;RBI=0.0186307;REFB=0;REVB=-0.0178621;RO=0;SAF=83;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.38236e-05;OID=.;OPOS=86660886;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:154:154:0:0:154:154:1:71:83:0:0:71:83:0:0
chr11	87908448	.	A	G	497.81	PASS	AF=0.481818;AO=58;DP=110;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=-0.0170719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4983;QD=18.1021;RBI=0.0481361;REFB=-0.000969949;REVB=-0.045007;RO=52;SAF=29;SAR=29;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0661341;STB=0.582933;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.00141801;OID=.;OPOS=87908448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:52:57:58:53:0.481818:29:29:30:22:29:24:35:22
chr11	88045583	.	A	G	905.34	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230547;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1614;QD=58.4092;RBI=0.0422265;REFB=0;REVB=0.0353774;RO=0;SAF=21;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101633;OID=.;OPOS=88045583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:41:21:0:0:41:21:0:0
chr11	88059623	.	TA	T	48.04	PASS	AF=0.375;AO=7;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0372053;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=16.6099;QD=8.00637;RBI=0.0996232;REFB=-0.00294941;REVB=0.0924151;RO=13;SAF=6;SAR=1;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.527602;STB=0.870411;STBP=0.009;TYPE=del;VARB=0.0133466;OID=.;OPOS=88059624;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375:7:24:9:24:15:8:1:5:10:48:13:6:1:5:8
chr11	88645129	.	T	A	244.16	PASS	AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.00752838;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=262.271;QD=13.0219;RBI=0.0126451;REFB=-0.00904275;REVB=-0.0101598;RO=46;SAF=11;SAR=18;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17735;STB=0.601601;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0128734;OID=.;OPOS=88645129;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:18:11:25:21:18:11:25:21
chr11	88645211	.	G	A	301.32	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=-0.0662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.775;QD=16.7401;RBI=0.0755408;REFB=-0.0218259;REVB=-0.0363863;RO=37;SAF=18;SAR=15;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281407;STB=0.653379;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0351473;OID=.;OPOS=88645211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:37:39:33:33:0.458333:15:18:9:28:15:18:10:29
chr11	89060002	.	G	A	106.82	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.013711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2724;QD=12.2079;RBI=0.0151301;REFB=-0.0231854;REVB=-0.00639758;RO=22;SAF=8;SAR=5;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218069;STB=0.628624;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0360393;OID=.;OPOS=89060002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:22:22:13:13:0.371429:5:8:9:13:5:8:9:13
chr11	89133449	.	C	T	1194.07	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00772183;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.629;QD=61.2344;RBI=0.017709;REFB=0;REVB=0.0159368;RO=0;SAF=48;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.9604e-05;OID=.;OPOS=89133449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:78:0:0:78:78:1:30:48:0:0:30:48:0:0
chr11	89224101	.	G	T	258.69	PASS	AF=0.352273;AO=31;DP=88;FAO=31;FDP=88;FR=.;FRO=57;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=0.000102858;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.749;QD=11.7587;RBI=0.0181178;REFB=-0.00846776;REVB=-0.0181175;RO=56;SAF=12;SAR=19;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205232;STB=0.623553;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0142853;OID=.;OPOS=89224101;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:56:57:31:31:0.352273:19:12:32:24:19:12:33:24
chr11	89224131	.	T	TCTC	115.04	PASS	AF=0.265625;AO=16;DP=75;FAO=17;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0537519;FXX=0.085702;HRUN=1;LEN=3;MLLD=208.912;QD=7.18992;RBI=0.0537521;REFB=-0.0247746;REVB=0.000162132;RO=57;SAF=5;SAR=11;SRF=32;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.307789;STB=0.646886;STBP=0.165;TYPE=ins;VARB=0.0676666;OID=.;OPOS=89224132;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.265625:16:75:17:64:47:6:11:26:21:99:57:5:11:32:25
chr11	89531764	.	T	C	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00580342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.519;QD=11.0924;RBI=0.0205562;REFB=-0.0060608;REVB=0.0197199;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369772;STB=0.723349;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0116392;OID=.;OPOS=89531764;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:3:2:5:1:3:2:5:1
chr11	89774540	.	C	A	191.91	PASS	AF=0.175879;AO=35;DP=199;FAO=35;FDP=199;FR=.;FRO=164;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=102;FSRR=62;FWDB=-0.0176519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6868;QD=3.85738;RBI=0.0295462;REFB=0.00887364;REVB=-0.0236937;RO=163;SAF=22;SAR=13;SRF=102;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00385529;STB=0.505821;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=-0.0417831;OID=.;OPOS=89774540;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:199:163:164:35:35:0.175879:13:22:102:61:13:22:102:62
chr11	89935586	.	G	T	1492.2	PASS	AF=0.990196;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0130696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.049;QD=58.5176;RBI=0.0622922;REFB=0.113455;REVB=-0.0609057;RO=1;SAF=54;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00998727;STB=0.505262;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.00109114;OID=.;OPOS=89935586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:102:102:1:1:101:101:0.990196:47:54:0:1:47:54:0:1
chr11	89939448	.	G	A	379.15	PASS	AF=0.965517;AO=26;DP=27;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0152389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2452;QD=52.2961;RBI=0.0195363;REFB=0.00913382;REVB=0.0122246;RO=1;SAF=15;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029965;STB=0.516118;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=-0.00927539;OID=.;OPOS=89939448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:29:1:1:26:28:0.965517:11:15:1:0:13:15:1:0
chr11	91545212	.	C	G	632.16	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00219435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.9711;QD=61.6742;RBI=0.0961515;REFB=0;REVB=0.0961264;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00141431;OID=.;OPOS=91545212;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:41:0:0:39:41:1:23:16:0:0:25:16:0:0
chr11	92087959	.	G	A	366.14	PASS	AF=0.433333;AO=39;DP=89;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=12;FSAR=27;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=-0.00568451;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.817;QD=16.2728;RBI=0.0124792;REFB=-0.00834336;REVB=-0.0111093;RO=50;SAF=12;SAR=27;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315737;STB=0.682664;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0163746;OID=.;OPOS=92087959;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:50:51:39:39:0.433333:27:12:31:19:27:12:32:19
chr11	92088177	.	C	T	202.37	PASS	AF=0.416667;AO=24;DP=59;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.00646868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.22;QD=13.4913;RBI=0.0220256;REFB=-0.0177079;REVB=-0.0210543;RO=35;SAF=15;SAR=9;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287263;STB=0.646945;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0189718;OID=.;OPOS=92088177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:35:35:24:25:0.416667:9:15:12:23:10:15:12:23
chr11	92507319	.	C	T	253.6	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0392811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.409;QD=17.4897;RBI=0.0392957;REFB=-0.0403153;REVB=0.00107135;RO=30;SAF=11;SAR=17;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0386922;STB=0.521723;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0410486;OID=.;OPOS=92507319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:17:11:13:17:17:11:13:17
chr11	92531356	.	A	G	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=349.454;QD=56.9569;RBI=0.0152676;REFB=0;REVB=0.00978808;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04693e-05;OID=.;OPOS=92531356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0
chr11	92532677	.	T	C	305.23	PASS	AF=0.923077;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0586506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.6266;QD=46.9591;RBI=0.073255;REFB=-0.180195;REVB=0.0438907;RO=2;SAF=12;SAR=12;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711626;STB=0.53843;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0169757;OID=.;OPOS=92532677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:26:26:2:2:24:24:0.923077:12:12:2:0:12:12:2:0
chr11	92534442	.	A	G	598.2	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018815;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.405;QD=61.3539;RBI=0.0255889;REFB=0;REVB=0.0173432;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03025e-05;OID=.;OPOS=92534442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr11	92590448	.	A	G	1618.57	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.509;QD=59.947;RBI=0.0444957;REFB=0;REVB=0.0400568;RO=0;SAF=66;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.87293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107708;OID=.;OPOS=92590448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:108:0:0:107:108:1:41:66:0:0:42:66:0:0
chr11	92625944	.	G	T	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.026375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.824;QD=54.8231;RBI=0.0305523;REFB=-0.0207107;REVB=0.0154208;RO=1;SAF=15;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303442;STB=0.516122;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.000427458;OID=.;OPOS=92625944;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:35:15:1:0:35:15:1:0
chr11	92627848	.	A	G	1442.19	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338447;FXX=0.0215031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.964;QD=63.393;RBI=0.0340163;REFB=0;REVB=0.00341259;RO=0;SAF=45;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169696;OID=.;OPOS=92627848;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:91:0:0:91:91:1:46:45:0:0:46:45:0:0
chr11	92629305	.	C	T	1227.48	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0138581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8537;QD=61.3742;RBI=0.0299249;REFB=0;REVB=-0.0265227;RO=0;SAF=26;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000299284;OID=.;OPOS=92629305;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:54:26:0:0:54:26:0:0
chr11	92629599	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3978;QD=33.4285;RBI=0.146328;REFB=0;REVB=-0.142652;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00958717;OID=.;OPOS=92629599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr11	92718127	.	G	C	151.49	PASS	AF=0.386364;AO=16;DP=43;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.00195382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.972;QD=13.7715;RBI=0.008863;REFB=-0.00430116;REVB=-0.00864496;RO=27;SAF=9;SAR=7;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319352;STB=0.693879;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00456696;OID=.;OPOS=92718127;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:27:27:16:17:0.386364:7:9:7:20:7:10:7:20
chr11	93141580	.	C	A	223.17	PASS	AF=0.462963;AO=23;DP=52;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0105208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.426;QD=16.5314;RBI=0.0125693;REFB=-0.0122604;REVB=-0.0068776;RO=27;SAF=12;SAR=11;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00307392;STB=0.504501;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0147045;OID=.;OPOS=93141580;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:54:27:29:23:25:0.462963:11:12:14:13:11:14:16:13
chr11	93211736	.	T	C	310.27	PASS	AF=0.365385;AO=38;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=37;FSRR=29;FWDB=0.00684078;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.2554;QD=11.9333;RBI=0.0142242;REFB=-0.0155193;REVB=0.0124713;RO=65;SAF=29;SAR=9;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.265061;STB=0.649679;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0153216;OID=.;OPOS=93211736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:65:66:38:38:0.365385:9:29:36:29:9:29:37:29
chr11	93211764	.	A	G	1677.03	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6633;QD=60.4335;RBI=0.098123;REFB=0;REVB=0.0850211;RO=0;SAF=67;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000733135;OID=.;OPOS=93211764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:44:67:0:0:44:67:0:0
chr11	93212254	.	C	T	1213.06	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0250807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.667;QD=59.9043;RBI=0.026643;REFB=-0.156247;REVB=0.00898935;RO=1;SAF=45;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104059;STB=0.505493;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00086103;OID=.;OPOS=93212254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:1:1:80:80:0.987654:35:45:1:0:35:45:1:0
chr11	93402096	.	C	A	198.36	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.136875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.7416;QD=44.0809;RBI=0.138534;REFB=0.0520732;REVB=-0.021374;RO=1;SAF=6;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0703222;STB=0.538415;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=-0.00537836;OID=.;OPOS=93402096;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:11:6:1:0:11:6:1:0
chr11	93408831	.	G	A	679.73	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285053;FXX=0.0444346;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.595;QD=63.2307;RBI=0.0358489;REFB=0;REVB=-0.0217392;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.19043e-05;OID=.;OPOS=93408831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0
chr11	93425159	.	C	A	2159.15	PASS	AF=1;AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7817;QD=63.0408;RBI=0.0273965;REFB=0;REVB=0.0192961;RO=0;SAF=76;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.61267e-05;OID=.;OPOS=93425159;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:137:137:0:0:137:137:1:61:76:0:0:61:76:0:0
chr11	93462607	.	A	T	1524.5	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2902;QD=63.5208;RBI=0.0169459;REFB=0;REVB=-0.0117151;RO=0;SAF=44;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000117128;OID=.;OPOS=93462607;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:95:96:1:51:44:0:0:51:45:0:0
chr11	93463726	.	T	TAG	458.3	PASS	AF=0.564103;AO=42;DP=79;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00341263;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=161.994;QD=23.5024;RBI=0.0515899;REFB=0.0040226;REVB=0.0514769;RO=35;SAF=26;SAR=16;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00834455;STB=0.508768;STBP=0.864;TYPE=ins;VARB=-0.00333685;OID=.;OPOS=93463727;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=TAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.564103:42:79:44:78:34:28:16:21:13:99:35:26:16:22:13
chr11	93464175	.	A	C	125.89	PASS	AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0231609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.158;QD=10.947;RBI=0.0289047;REFB=-0.013728;REVB=0.0172931;RO=30;SAF=7;SAR=8;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11177;STB=0.55484;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0262832;OID=.;OPOS=93464175;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:30:31:15:15:0.326087:8:7:17:13:8:7:17:14
chr11	93474570	.	T	TGCGTGA	1261.61	PASS	AF=0.934066;AO=79;DP=99;FAO=85;FDP=91;FR=.;FRO=6;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.00781811;FXX=0.0421008;HRUN=1;LEN=6;MLLD=259.842;QD=55.4554;RBI=0.0200962;REFB=-0.0626587;REVB=0.0185131;RO=10;SAF=37;SAR=42;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912053;STB=0.534083;STBP=0.018;TYPE=ins;VARB=0.00340939;OID=.;OPOS=93474571;OREF=-;OALT=GCGTGA;OMAPALT=TGCGTGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.934066:79:99:85:91:6:41:44:6:0:19:10:37:42:9:1
chr11	93517874	.	C	G	915.63	PASS	AF=1;AO=50;DP=57;FAO=63;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.152071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.974;QD=58.1353;RBI=0.155473;REFB=0;REVB=0.0323474;RO=0;SAF=9;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162198;OID=.;OPOS=93517874;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:63:0:0:50:63:1:41:9:0:0:46:17:0:0
chr11	93517886	.	G	C	665.51	PASS	AF=0.961538;AO=49;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0737819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7939;QD=51.1933;RBI=0.0806613;REFB=-0.0486791;REVB=0.0325957;RO=3;SAF=10;SAR=39;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122045;STB=0.541649;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.00654873;OID=.;OPOS=93517886;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:52:52:3:2:49:50:0.961538:39:10:3:0:39:11:2:0
chr11	93797619	.	A	G	771.33	PASS	AF=0.95;AO=55;DP=58;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0955251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5103;QD=51.4219;RBI=0.134158;REFB=-0.0328048;REVB=0.0941976;RO=3;SAF=21;SAR=34;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291486;STB=0.515882;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00370984;OID=.;OPOS=93797619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:58:60:3:3:55:57:0.95:34:21:2:1:36:21:2:1
chr11	93845511	.	A	G	710.98	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0452939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.832;QD=54.6911;RBI=0.0827919;REFB=-0.133194;REVB=0.0693035;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509087;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.000701162;OID=.;OPOS=93845511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:0:1:51:51:0.980769:24:27:0:0:24:27:1:0
chr11	93862493	.	A	C	761.15	PASS	AF=0.5625;AO=72;DP=128;FAO=72;FDP=128;FR=.;FRO=56;FSAF=48;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=25;FWDB=-0.0626386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2084;QD=23.7859;RBI=0.0672066;REFB=-0.00115895;REVB=-0.0243545;RO=56;SAF=48;SAR=24;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980814;STB=0.553657;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.000502439;OID=.;OPOS=93862493;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:56:56:72:72:0.5625:24:48:31:25:24:48:31:25
chr11	93913036	.	A	G	616.33	PASS	AF=0.54955;AO=61;DP=111;FAO=61;FDP=111;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=36;FSRF=15;FSRR=35;FWDB=-0.0171068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.517;QD=22.21;RBI=0.0226347;REFB=-0.0219622;REVB=0.0148218;RO=49;SAF=25;SAR=36;SRF=14;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106865;STB=0.552083;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0144273;OID=.;OPOS=93913036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:49:50:61:61:0.54955:36:25:14:35:36:25:15:35
chr11	94231257	.	C	G	726.61	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0287152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.216;QD=59.3153;RBI=0.0641805;REFB=-0.132238;REVB=0.0573984;RO=2;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0361449;STB=0.519223;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.000929731;OID=.;OPOS=94231257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:49:49:2:2:47:47:0.959184:25:22:0:2:25:22:0:2
chr11	94231847	.	G	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0289702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.839;QD=60.2304;RBI=0.0359953;REFB=0;REVB=-0.0213632;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000278463;OID=.;OPOS=94231847;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0
chr11	94245740	.	A	G	695.88	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0439699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.717;QD=60.5111;RBI=0.0477359;REFB=-0.115959;REVB=0.0185838;RO=1;SAF=21;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218529;STB=0.511623;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00108455;OID=.;OPOS=94245740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:24:21:1:0:24:21:1:0
chr11	94261255	.	C	G	1979.82	PASS	AF=1;AO=127;DP=129;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261382;FXX=0.0155027;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.796;QD=62.3566;RBI=0.0351461;REFB=0;REVB=0.0234956;RO=0;SAF=68;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.98927e-05;OID=.;OPOS=94261255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:127:0:0:127:127:1:59:68:0:0:59:68:0:0
chr11	94279112	.	C	T	263.28	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.00397594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.229;QD=17.2639;RBI=0.00888552;REFB=-0.010636;REVB=-0.00794635;RO=31;SAF=16;SAR=13;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17991;STB=0.607749;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.017312;OID=.;OPOS=94279112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:31:32:29:29:0.47541:13:16:11:20:13:16:11:21
chr11	94282014	.	G	A	601.15	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00860365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.986;QD=58.6486;RBI=0.0158905;REFB=-0.00492797;REVB=0.0133598;RO=1;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302369;STB=0.516121;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=1.54969e-05;OID=.;OPOS=94282014;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:15:25:0:1:15:25:0:1
chr11	94320237	.	T	C	657.65	PASS	AF=0.925926;AO=50;DP=54;FAO=50;FDP=54;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0411854;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.583;QD=48.7149;RBI=0.0466662;REFB=-0.10029;REVB=0.021943;RO=0;SAF=34;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50598;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.00079874;OID=.;OPOS=94320237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:54:54:0:4:50:50:0.925926:16:34:0:0:16:34:3:1
chr11	94322352	.	AG	TA	502.09	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357332;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=243.219;QD=59.0696;RBI=0.035844;REFB=0;REVB=0.00281674;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=8.72491e-05;OID=.;OPOS=94322352;OREF=AG;OALT=TA;OMAPALT=TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:10:23:0:0:10:24:0:0
chr11	94326765	.	G	C	727.6	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.012823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2699;QD=63.2693;RBI=0.0160962;REFB=0;REVB=-0.00972913;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000299566;OID=.;OPOS=94326765;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0
chr11	94337220	.	C	T	780.73	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.599;QD=55.7662;RBI=0.0248699;REFB=0;REVB=0.0146325;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392707;OID=.;OPOS=94337220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:28:26:0:0:29:27:0:0
chr11	94533373	.	C	T	754.71	PASS	AF=0.40566;AO=86;DP=213;FAO=86;FDP=212;FR=.;FRO=126;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=77;FSRR=49;FWDB=-0.00369782;FXX=0.00934536;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.659;QD=14.2397;RBI=0.00996564;REFB=-0.00543823;REVB=0.00925419;RO=121;SAF=35;SAR=51;SRF=75;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220191;STB=0.620033;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00648344;OID=.;OPOS=94533373;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:213:212:121:126:86:86:0.40566:51:35:75:46:51:35:77:49
chr11	94602414	.	C	T	391.07	PASS	AF=0.9375;AO=29;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0496792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.742;QD=48.8838;RBI=0.0567461;REFB=-0.163616;REVB=0.0274245;RO=2;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071485;STB=0.504234;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.00138393;OID=.;OPOS=94602414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:32:32:2:2:29:30:0.9375:12:17:0:2:13:17:1:1
chr11	94608992	.	ATTTTTA	AATTTTT,ATTTTA,ATTTT,ATTTTT	107.05	PASS	AF=0,0,0.145833,0.354167;AO=2,6,11,11;DP=48;FAO=0,0,7,17;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=0,0,2,2;FSAR=0,0,5,15;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0703106,-0.578232,-0.358724,-0.0948551;FXX=0;HRUN=5,5,5,5;LEN=6,1,2,1;MLLD=20.3894,10.9732,16.174,9.88785;QD=8.92068;RBI=0.133708,0.582406,0.361522,0.0968826;REFB=-0.0680448,0.0298665,-0.062795,-0.152131;REVB=-0.113728,-0.0696064,-0.044899,-0.0197167;RO=13;SAF=0,5,4,0;SAR=2,1,7,11;SRF=2;SRR=11;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.448443,0.651854,0.229475,-0.763418;STB=0.5,0.5,0.578712,0.732999;STBP=1,1,0.66,0.034;TYPE=mnp,del,del,del;VARB=0.0550026,0,0.108247,0.167889;OID=.,.,.,.;OPOS=94608993,94608993,94608997,94608998;OREF=TTTTTA,T,TA,A;OALT=ATTTTT,-,-,-;OMAPALT=AATTTTT,ATTTTA,ATTTT,ATTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/4:0,0,0.145833,0.354167:2,6,11,11:48:0,0,7,17:48:24:0,0,2,2:0,0,5,15:9:15:52:13:0,5,4,0:2,1,7,11:2:11
chr11	94699507	.	A	AT	826.17	PASS	AF=1;AO=69;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.032957;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=18.2111;QD=42.9179;RBI=0.141381;REFB=0;REVB=0.137486;RO=4;SAF=39;SAR=30;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194945;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00485069;OID=.;OPOS=94699508;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:69:78:77:77:0:43:34:0:0:15:4:39:30:3:1
chr11	94731759	.	G	A	747.51	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.513;QD=63.6181;RBI=0.0357186;REFB=0;REVB=-0.0305411;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000203882;OID=.;OPOS=94731759;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:18:28:0:0:18:29:0:0
chr11	94758838	.	C	T	348.91	PASS	AF=0.57377;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=61;FR=.;FRO=26;FSAF=27;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.00675786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.729;QD=22.8793;RBI=0.0166349;REFB=-0.00151285;REVB=0.0152003;RO=26;SAF=27;SAR=8;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219889;STB=0.622044;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.00134902;OID=.;OPOS=94758838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:26:26:35:35:0.57377:8:27:14:12:8:27:14:12
chr11	94759059	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.922;QD=35.5759;RBI=0.0465003;REFB=0;REVB=0.0448656;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00030578;OID=.;OPOS=94759059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:1:6:0:0:1:6:0:0
chr11	94759726	.	C	T	88.22	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.083082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.5042;QD=14.115;RBI=0.115651;REFB=-0.0238558;REVB=-0.0804517;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435331;STB=0.525501;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.0197584;OID=.;OPOS=94759726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:5:6:7:7:5:6:7:7
chr11	94800902	.	G	GC	829.74	PASS	AF=1;AO=76;DP=89;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.139373;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.1122;QD=38.5925;RBI=0.140232;REFB=0;REVB=-0.0155024;RO=4;SAF=55;SAR=21;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00311312;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00304894;OID=.;OPOS=94800903;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:76:89:86:86:0:64:22:0:0:16:4:55:21:3:1
chr11	94802776	.	G	C	143.32	PASS	AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.0038229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.444;QD=9.88431;RBI=0.00383932;REFB=-0.00703376;REVB=-0.000354749;RO=39;SAF=10;SAR=9;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132724;STB=0.577902;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.0164042;OID=.;OPOS=94802776;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:39:39:19:19:0.327586:9:10:25:14:9:10:25:14
chr11	94861862	.	A	G	105.32	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.00666976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.681;QD=11.0866;RBI=0.0179454;REFB=-0.00449836;REVB=0.0166598;RO=25;SAF=5;SAR=8;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0632438;STB=0.537756;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.00751904;OID=.;OPOS=94861862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:8:5:11:14:8:5:11:14
chr11	96116444	.	T	C	52.36	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0105845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.993;QD=6.54486;RBI=0.0168995;REFB=0.00339656;REVB=0.0131744;RO=24;SAF=5;SAR=3;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511092;STB=0.532704;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=-0.0100011;OID=.;OPOS=96116444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:3:5:14:10:3:5:14:10
chr11	97716872	.	A	G	183.07	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0466127;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.133;QD=43.0752;RBI=0.065076;REFB=-0.0706502;REVB=0.0454108;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538413;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.000927295;OID=.;OPOS=97716872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:17:17:0:1:16:16:0.941176:10:6:0:0:10:6:1:0
chr11	98991112	.	C	T	1135.25	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.193;QD=60.5468;RBI=0.0220069;REFB=0;REVB=-0.00154601;RO=0;SAF=27;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17327e-05;OID=.;OPOS=98991112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:48:27:0:0:48:27:0:0
chr11	99690286	.	T	G	125.68	PASS	AF=0.319149;AO=11;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0118704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.35;QD=10.6963;RBI=0.0123823;REFB=-0.0101193;REVB=-0.00352342;RO=28;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342859;STB=0.729444;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0442946;OID=.;OPOS=99690286;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:32:11:15:0.319149:5:6:7:21:5:10:10:22
chr11	99690376	.	C	T	87.15	PASS	AF=0.232143;AO=13;DP=56;FAO=13;FDP=56;FR=.;FRO=43;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=31;FWDB=-0.0353862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1162;QD=6.22519;RBI=0.0699696;REFB=-0.0129839;REVB=-0.0603619;RO=43;SAF=6;SAR=7;SRF=12;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234086;STB=0.643869;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0337798;OID=.;OPOS=99690376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:56:56:43:43:13:13:0.232143:7:6:12:31:7:6:12:31
chr11	99690428	.	T	G	65.41	PASS	AF=0.183333;AO=10;DP=60;FAO=11;FDP=60;FR=.;FRO=49;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=34;FWDB=0.00810646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9646;QD=4.36043;RBI=0.0686436;REFB=-0.00233771;REVB=-0.0681632;RO=49;SAF=6;SAR=4;SRF=15;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354475;STB=0.689959;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0228533;OID=.;OPOS=99690428;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:60:60:49:49:10:11:0.183333:4:6:15:34:5:6:15:34
chr11	100226883	.	T	A	415.7	PASS	AF=0.446602;AO=46;DP=104;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.00337044;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.956;QD=16.1438;RBI=0.0059248;REFB=-0.0484127;REVB=0.00487272;RO=55;SAF=27;SAR=19;SRF=31;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0233218;STB=0.524374;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0525503;OID=.;OPOS=100226883;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:103:55:57:46:46:0.446602:19:27:31:24:19:27:31:26
chr11	100814570	.	A	G,T	1336.71	PASS	AF=0.954545,0.0454545;AO=83,4;DP=87;FAO=84,4;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=37,3;FSAR=47,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036451,0.0241954;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=245.283,198.62;QD=60.7596;RBI=0.0391848,0.0265524;REFB=0,0;REVB=0.0143796,0.0109366;RO=0;SAF=37,3;SAR=46,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-6.12122e-08,4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000929128,0.0471577;OID=.,.;OPOS=100814570,100814570;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:87:88:0:0:83,4:84,4:0.954545,0.0454545:46,1:37,3:0:0:47,1:37,3:0:0
chr11	100846936	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.584;QD=56.7065;RBI=0.0410018;REFB=0;REVB=-0.0106302;RO=0;SAF=10;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90396e-05;OID=.;OPOS=100846936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:19:10:0:0:19:10:0:0
chr11	100847050	.	A	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00868128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.707;QD=46.848;RBI=0.0108346;REFB=0;REVB=-0.00648252;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26932e-05;OID=.;OPOS=100847050;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:12:3:0:0:12:3:0:0
chr11	100847069	.	G	A	127.55	PASS	AF=1;AO=10;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356755;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.876;QD=42.5169;RBI=0.0423209;REFB=0;REVB=-0.0227665;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00195872;OID=.;OPOS=100847069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:10:12:1:8:2:0:0:10:2:0:0
chr11	100863096	.	A	G	704.98	PASS	AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0140388;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=250.3;QD=58.7482;RBI=0.0300154;REFB=-0.0802395;REVB=0.0265299;RO=2;SAF=34;SAR=12;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239531;STB=0.512755;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00110108;OID=.;OPOS=100863096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:48:48:2:2:46:46:0.958333:12:34:1:1:12:34:1:1
chr11	100863152	.	TC	T,TT	286.89	PASS	AF=0.5,0.115385;AO=25,6;DP=52;FAO=26,6;FDP=52;FR=.;FRO=20;FSAF=23,0;FSAR=3,6;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=-0.00303974,-0.0143674;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=19.6671,22.3038;QD=22.0681;RBI=0.0662171,0.102358;REFB=0.00766664,0.0268591;REVB=0.0661473,0.101345;RO=20;SAF=23,0;SAR=2,6;SRF=16;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.244364,-0.799646;STB=0.579069,0.998718;STBP=0.4,0;TYPE=del,snp;VARB=0.0152991,-0.00743152;OID=.,.;OPOS=100863153,100863153;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5,0.115385:25,6:52:26,6:52:20:23,0:3,6:16:4:99:20:23,0:2,6:16:4
chr11	100863354	.	C	A	1026.1	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00175683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5102;QD=59.4843;RBI=0.00181239;REFB=0;REVB=0.000445311;RO=0;SAF=46;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.19961e-05;OID=.;OPOS=100863354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:23:46:0:0:23:46:0:0
chr11	100863464	.	ATTTTTTATTTTTTG	ATTTTTTATTTTTG,ATTTTTTATTTTTGT,ATTTTTTTATTTTTTG	36.65	PASS	AF=0.3,0.05,0;AO=8,3,6;DP=43;FAO=12,2,0;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=10,2,0;FSAR=2,0,0;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=0.173211,-0.0642562,-0.231002;FXX=0.0476077;HRUN=6,6,6;LEN=1,2,1;MLLD=8.53681,80.3138,9.59086;QD=3.66467;RBI=0.173244,0.0675077,0.287966;REFB=-0.180334,-0.0127606,-0.0743152;REVB=-0.00336496,-0.0206987,-0.171938;RO=19;SAF=5,3,5;SAR=3,0,1;SRF=16;SRR=3;SSEN=0.38,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.295481,0.496188,-0.0185824;STB=0.53025,0.991881,0.5;STBP=0.872,0.404,1;TYPE=del,mnp,ins;VARB=0.163758,0.138676,0.0384028;OID=.,.,.;OPOS=100863472,100863477,100863465;OREF=T,TG,-;OALT=-,GT,T;OMAPALT=ATTTTTTATTTTTG,ATTTTTTATTTTTGT,ATTTTTTTATTTTTTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.3,0.05,0:8,3,6:43:12,2,0:40:26:10,2,0:2,0,0:21:5:30:19:5,3,5:3,0,1:16:3
chr11	100864367	.	G	A	2393.1	PASS	AF=1;AO=149;DP=150;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202591;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.771;QD=64.2444;RBI=0.0265043;REFB=0;REVB=0.0170894;RO=0;SAF=79;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.4756e-05;OID=.;OPOS=100864367;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:149:0:0:149:149:1:70:79:0:0:70:79:0:0
chr11	100907716	.	G	T	35.45	PASS	AF=0.107143;AO=11;DP=85;FAO=9;FDP=84;FR=.;FRO=75;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=-0.0419257;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.2;QD=1.68823;RBI=0.0432501;REFB=-0.00258529;REVB=-0.0106211;RO=71;SAF=10;SAR=1;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.513589;STB=0.843855;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.210995;OID=.;OPOS=100907716;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:85:84:71:75:11:9:0.107143:1:10:38:33:1:8:42:33
chr11	100909991	.	T	C	225.18	PASS	AF=0.440678;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0160137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.414;QD=15.2662;RBI=0.0209567;REFB=0.00199017;REVB=0.0135184;RO=33;SAF=14;SAR=12;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675696;STB=0.538229;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=-0.0014855;OID=.;OPOS=100909991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:33:33:26:26:0.440678:12:14:20:13:12:14:20:13
chr11	100921665	.	C	A	809.62	PASS	AF=0.435;AO=74;DP=187;FAO=87;FDP=200;FR=.;FRO=113;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=53;FSRR=60;FWDB=-0.000816866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.25;QD=16.1924;RBI=0.0154798;REFB=-0.0253388;REVB=0.0154582;RO=111;SAF=37;SAR=37;SRF=52;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.033648;STB=0.501268;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0342583;OID=.;OPOS=100921665;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:187:200:111:113:74:87:0.435:37:37:52:59:46:41:53:60
chr11	101771248	.	G	A	436.39	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00413479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.696;QD=54.5489;RBI=0.00816713;REFB=-0.210285;REVB=0.00704312;RO=1;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227606;STB=0.512187;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00120533;OID=.;OPOS=101771248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:20:11:0:1:20:11:0:1
chr11	101826949	.	T	C	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0303113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.464;QD=11.9536;RBI=0.0304623;REFB=-0.010037;REVB=0.00302954;RO=11;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117224;STB=0.507025;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0152862;OID=.;OPOS=101826949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:3:5:7:4:3:5:7:4
chr11	101832478	.	G	T	115.91	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0950293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1756;QD=42.1496;RBI=0.15019;REFB=0;REVB=-0.116303;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0119888;OID=.;OPOS=101832478;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr11	101833644	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00878554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.091;QD=60.6102;RBI=0.0246925;REFB=0;REVB=0.0230767;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42217e-05;OID=.;OPOS=101833644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0
chr11	101857758	.	G	A	446.89	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8683;QD=57.6636;RBI=0.026746;REFB=0;REVB=0.0212417;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50345e-05;OID=.;OPOS=101857758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr11	102201848	.	G	A	420.86	PASS	AF=0.512195;AO=42;DP=82;FAO=42;FDP=82;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.00576451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.04;QD=20.5296;RBI=0.00884987;REFB=-0.00814776;REVB=-0.00671495;RO=40;SAF=22;SAR=20;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108731;STB=0.560157;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.00691936;OID=.;OPOS=102201848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:40:40:42:42:0.512195:20:22:16:24:20:22:16:24
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chr11	102477377	.	G	T	224.13	PASS	AF=0.421875;AO=27;DP=64;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0139562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4943;QD=14.0081;RBI=0.0718988;REFB=-0.016832;REVB=0.0705312;RO=37;SAF=16;SAR=11;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598686;STB=0.533956;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.0365631;OID=.;OPOS=102477377;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:37:37:27:27:0.421875:11:16:24:13:11:16:24:13
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chr11	102562700	.	C	T	489.55	PASS	AF=0.46087;AO=53;DP=115;FAO=53;FDP=115;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=36;FWDB=-0.0688293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.295;QD=17.0276;RBI=0.069903;REFB=-0.00940211;REVB=-0.0122046;RO=62;SAF=13;SAR=40;SRF=26;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200042;STB=0.612199;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00711173;OID=.;OPOS=102562700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:62:62:53:53:0.46087:40:13:26:36:40:13:26:36
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chr11	102567207	.	T	A	751.06	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0205096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.715;QD=62.5882;RBI=0.07469;REFB=0;REVB=0.0718188;RO=1;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229327;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019734;OID=.;OPOS=102567207;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:1:0:47:48:1:20:27:0:1:21:27:0:0
chr11	102573569	.	C	A	349.89	PASS	AF=0.468354;AO=37;DP=79;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=31;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=-0.000226257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.235;QD=17.7157;RBI=0.0116213;REFB=-0.00203988;REVB=-0.0116191;RO=42;SAF=31;SAR=6;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212835;STB=0.62058;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00291211;OID=.;OPOS=102573569;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:42:42:37:37:0.468354:6:31:29:13:6:31:29:13
chr11	102576358	.	T	C	260.36	PASS	AF=0.360465;AO=31;DP=86;FAO=31;FDP=86;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=5;FSRF=37;FSRR=18;FWDB=-0.0123467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.881;QD=12.1096;RBI=0.0557093;REFB=-0.0153658;REVB=0.0543239;RO=55;SAF=26;SAR=5;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263992;STB=0.654869;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0183007;OID=.;OPOS=102576358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:55:55:31:31:0.360465:5:26:37:18:5:26:37:18
chr11	102576375	.	G	A	1256.04	PASS	AF=0.976471;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0256772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0299;QD=59.1078;RBI=0.128238;REFB=-0.0453277;REVB=-0.125641;RO=2;SAF=60;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012317;STB=0.506506;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=2.58731e-05;OID=.;OPOS=102576375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:85:85:2:2:83:83:0.976471:23:60:1:1:23:60:1:1
chr11	102593248	.	T	C	784.07	PASS	AF=0.531915;AO=60;DP=137;FAO=75;FDP=141;FR=.;FRO=66;FSAF=32;FSAR=43;FSRF=36;FSRR=30;FWDB=0.0221042;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=47.5629;QD=22.2431;RBI=0.0221342;REFB=0.0193408;REVB=-0.00115279;RO=50;SAF=24;SAR=36;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117646;STB=0.555879;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-0.0103518;OID=.;OPOS=102593248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:141:50:66:60:75:0.531915:36:24:27:23:43:32:36:30
chr11	102595492	.	G	A	213.46	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.025836;FXX=0.139972;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.985;QD=19.857;RBI=0.0267669;REFB=-0.00670073;REVB=-0.00699764;RO=20;SAF=11;SAR=9;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0444401;STB=0.561424;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0209049;OID=.;OPOS=102595492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:43:20:23:20:20:0.465116:9:11:10:10:9:11:10:13
chr11	102650246	.	G	A	232.04	PASS	AF=0.322222;AO=29;DP=90;FAO=29;FDP=90;FR=.;FRO=61;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=29;FWDB=0.000705989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=336.058;QD=10.3127;RBI=0.00655426;REFB=-0.0060674;REVB=-0.00651612;RO=60;SAF=15;SAR=14;SRF=31;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000664508;STB=0.504985;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0131183;OID=.;OPOS=102650246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:60:61:29:29:0.322222:14:15:31:29:14:15:32:29
chr11	102666316	.	T	C	119.42	PASS	AF=0.296296;AO=16;DP=54;FAO=16;FDP=54;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0320921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.86;QD=8.84554;RBI=0.0335008;REFB=0.00999418;REVB=0.00961261;RO=38;SAF=8;SAR=8;SRF=14;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154784;STB=0.592481;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=-0.0249995;OID=.;OPOS=102666316;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:38:38:16:16:0.296296:8:8:14:24:8:8:14:24
chr11	102709425	.	A	G	298.85	PASS	AF=0.365591;AO=33;DP=92;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0240111;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.007;QD=12.8535;RBI=0.0272838;REFB=-0.020509;REVB=-0.0129565;RO=59;SAF=23;SAR=10;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257749;STB=0.654161;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0502631;OID=.;OPOS=102709425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:59:59:33:34:0.365591:10:23:28:31:10:24:28:31
chr11	102713465	.	A	G	452.02	PASS	AF=0.483871;AO=45;DP=93;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=0.00286069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.385;QD=19.4415;RBI=0.00486556;REFB=-0.0155725;REVB=-0.00393575;RO=46;SAF=28;SAR=17;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338236;STB=0.509859;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0174128;OID=.;OPOS=102713465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:46:48:45:45:0.483871:17:28:27:19:17:28:29:19
chr11	102713620	.	T	C	151.28	PASS	AF=0.346939;AO=17;DP=50;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.000295851;FXX=0.019996;HRUN=6;LEN=1;MLLD=52.8606;QD=12.349;RBI=0.0427028;REFB=0.0139154;REVB=0.0427018;RO=31;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143006;STB=0.590693;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=-0.00920216;OID=.;OPOS=102713620;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:31:32:17:17:0.346939:10:7:9:22:10:7:9:23
chr11	102736642	.	T	C	385.05	PASS	AF=0.41;AO=41;DP=99;FAO=41;FDP=100;FR=.;FRO=59;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=27;FWDB=0.0734145;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.6855;QD=15.4019;RBI=0.0785649;REFB=-0.0175232;REVB=0.0279777;RO=58;SAF=18;SAR=23;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116781;STB=0.560946;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0126671;OID=.;OPOS=102736642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:58:59:41:41:0.41:23:18:32:26:23:18:32:27
chr11	102738793	.	G	GT,GTT	354.2	PASS	AF=0,1;AO=29,4;DP=40;FAO=0,34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10988,0.0586551;FXX=0.0285633;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=11.0496,16.8989;QD=41.67;RBI=0.183662,0.0966127;REFB=0,0;REVB=-0.147168,-0.0767697;RO=5;SAF=11,2;SAR=18,2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.171274,-0.467015;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.00490796;OID=.,.;OPOS=102738794,102738794;OREF=-,-;OALT=T,TT;OMAPALT=GT,GTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:29,4:40:0,34:34:0:0,14:0,20:0:0:7:5:11,2:18,2:5:0
chr11	102738795	.	G	T	489.8	PASS	AF=0.971429;AO=33;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0269132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.768;QD=55.9774;RBI=0.0616144;REFB=-0.0433465;REVB=-0.0554257;RO=2;SAF=12;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716814;STB=0.518508;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00111581;OID=.;OPOS=102738795;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:2:1:33:34:0.971429:21:12:2:0:21:13:1:0
chr11	103029516	.	A	G	775.29	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0692271;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.906;QD=53.4682;RBI=0.0811295;REFB=0.00821248;REVB=0.0423036;RO=1;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184862;STB=0.501867;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=6.0709e-05;OID=.;OPOS=103029516;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:1:2:56:56:0.965517:25:31:0:1:25:31:1:1
chr11	103047007	.	C	A	1396.4	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0749481;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1646;QD=62.7594;RBI=0.110264;REFB=0;REVB=-0.0808755;RO=0;SAF=37;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000835149;OID=.;OPOS=103047007;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:52:37:0:0:52:37:0:0
chr11	103057048	.	A	G	1283.38	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00598087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.552;QD=61.8498;RBI=0.028569;REFB=0;REVB=-0.027936;RO=0;SAF=51;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.4598e-05;OID=.;OPOS=103057048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:32:51:0:0:32:51:0:0
chr11	103058126	.	C	T	1171.9	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.287;QD=60.8781;RBI=0.029299;REFB=0;REVB=0.0266216;RO=0;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.72757e-05;OID=.;OPOS=103058126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:33:43:0:0:34:43:0:0
chr11	103082590	.	G	A	2714.8	PASS	AF=1;AO=172;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.003866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.07;QD=62.4092;RBI=0.00612505;REFB=0;REVB=-0.00475081;RO=0;SAF=83;SAR=89;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.89335e-06;OID=.;OPOS=103082590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:173:174:0:0:172:174:1:89:83:0:0:91:83:0:0
chr11	103158278	.	C	T	615.61	PASS	AF=0.591398;AO=55;DP=93;FAO=55;FDP=93;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.0553169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.091;QD=26.4776;RBI=0.0584948;REFB=-0.0313585;REVB=-0.0190181;RO=38;SAF=23;SAR=32;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12095;STB=0.566014;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0136553;OID=.;OPOS=103158278;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:38:38:55:55:0.591398:32:23:22:16:32:23:22:16
chr11	103229027	.	T	C	122.32	PASS	AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.00886748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8267;QD=8.43568;RBI=0.010166;REFB=-0.000464919;REVB=-0.00497137;RO=41;SAF=10;SAR=7;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174621;STB=0.604716;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0035966;OID=.;OPOS=103229027;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:41:41:17:17:0.293103:7:10:18:23:7:10:18:23
chr11	103274940	.	A	T	261.47	PASS	AF=0.344086;AO=31;DP=94;FAO=32;FDP=93;FR=.;FRO=61;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=44;FSRR=17;FWDB=-0.0212018;FXX=0.0210504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.499;QD=11.2462;RBI=0.021816;REFB=-0.0333734;REVB=0.00514024;RO=63;SAF=19;SAR=12;SRF=44;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10731;STB=0.58958;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0660629;OID=.;OPOS=103274940;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:63:61:31:32:0.344086:12:19:44:19:13:19:44:17
chr11	103275034	.	G	T	316.32	PASS	AF=0.418605;AO=32;DP=84;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.057664;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.8325;QD=14.7127;RBI=0.0726161;REFB=-0.0113443;REVB=-0.0441356;RO=52;SAF=14;SAR=18;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886438;STB=0.560513;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0151053;OID=.;OPOS=103275034;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:86:52:50:32:36:0.418605:18:14:27:25:21:15:26:24
chr11	103277984	.	G	T	127.58	PASS	AF=0.290323;AO=18;DP=62;FAO=18;FDP=62;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.111748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0108;QD=8.23078;RBI=0.111769;REFB=-0.00933075;REVB=-0.00219011;RO=44;SAF=10;SAR=8;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119023;STB=0.57135;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.029866;OID=.;OPOS=103277984;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:44:44:18:18:0.290323:8:10:20:24:8:10:20:24
chr11	103278048	.	G	C	194.89	PASS	AF=0.342466;AO=21;DP=69;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=-0.00872985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.005;QD=10.6787;RBI=0.00942348;REFB=-0.0192784;REVB=-0.00354848;RO=47;SAF=8;SAR=13;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106499;STB=0.534518;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0317713;OID=.;OPOS=103278048;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:73:47:48:21:25:0.342466:13:8:14:33:16:9:15:33
chr11	103278083	.	C	G	179.61	PASS	AF=0.288136;AO=16;DP=59;FAO=17;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=28;FWDB=-0.0155846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.133;QD=12.1767;RBI=0.0179023;REFB=-0.00289659;REVB=-0.00880994;RO=34;SAF=4;SAR=12;SRF=6;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121535;STB=0.512486;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0343619;OID=.;OPOS=103278083;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:36:16:17:0.288136:12:4:6:28:13:4:8:28
chr11	103278129	.	C	CTCTA	229.0	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=20;FWDB=0.0351031;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=4;MLLD=350.55;QD=21.3022;RBI=0.0351184;REFB=-0.00793311;REVB=0.00103586;RO=21;SAF=5;SAR=17;SRF=1;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263183;STB=0.644495;STBP=0.171;TYPE=ins;VARB=0.00767638;OID=.;OPOS=103278130;OREF=-;OALT=TCTA;OMAPALT=CTCTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.511628:22:44:22:43:21:5:17:1:20:99:21:5:17:1:20
chr11	103279098	.	C	T	598.92	PASS	AF=0.535714;AO=60;DP=112;FAO=60;FDP=112;FR=.;FRO=52;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=-0.0723975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8652;QD=21.39;RBI=0.0908939;REFB=-0.0147166;REVB=-0.0549573;RO=51;SAF=29;SAR=31;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0876843;STB=0.552239;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0127361;OID=.;OPOS=103279098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:51:52:60:60:0.535714:31:29:30:21:31:29:31:21
chr11	103778154	.	C	T	1677.4	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.023;QD=60.4467;RBI=0.0174834;REFB=0;REVB=0.0122835;RO=0;SAF=68;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.8017e-06;OID=.;OPOS=103778154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:111:0:0:110:111:1:42:68:0:0:43:68:0:0
chr11	103780455	.	A	G	1568.19	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0993661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2441;QD=64.0076;RBI=0.121909;REFB=0;REVB=0.0706273;RO=0;SAF=52;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000905311;OID=.;OPOS=103780455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:98:0:0:96:98:1:44:52:0:0:44:54:0:0
chr11	103908735	.	G	A	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.015419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.37;QD=16.6272;RBI=0.0208733;REFB=-0.0128182;REVB=-0.0140694;RO=14;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0985294;STB=0.556731;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0197576;OID=.;OPOS=103908735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:6:7:6:8:6:7:6:8
chr11	103908968	.	C	T	204.52	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.00144569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.907;QD=22.7239;RBI=0.00950175;REFB=-0.0135647;REVB=-0.00939112;RO=16;SAF=6;SAR=14;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173225;STB=0.597459;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00876172;OID=.;OPOS=103908968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:14:6:8:8:14:6:8:8
chr11	103909897	.	A	G	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0489033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.081;QD=13.2053;RBI=0.0507771;REFB=-0.00258987;REVB=-0.0136667;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45721;STB=0.780223;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00710354;OID=.;OPOS=103909897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:1:5:2:4:1:5:2:4
chr11	104758035	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2006;QD=55.0981;RBI=0.0317749;REFB=0;REVB=-0.0274094;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000547007;OID=.;OPOS=104758035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr11	104761100	.	T	C	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.141;QD=53.9091;RBI=0.0920644;REFB=0;REVB=0.0894471;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000497859;OID=.;OPOS=104761100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0
chr11	104761206	.	C	T	785.19	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148729;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3248;QD=57.1049;RBI=0.0496417;REFB=0;REVB=-0.0473614;RO=0;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000583154;OID=.;OPOS=104761206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:30:25:0:0:30:25:0:0
chr11	104763117	.	G	A	1155.77	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00532933;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.154;QD=60.8298;RBI=0.0126085;REFB=0;REVB=0.0114268;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.03095e-05;OID=.;OPOS=104763117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:39:37:0:0:39:37:0:0
chr11	104763716	.	A	G	742.85	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0357966;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=257.073;QD=53.0609;RBI=0.0358571;REFB=-0.166755;REVB=-0.00208187;RO=0;SAF=15;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.000649776;OID=.;OPOS=104763716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:56:0:2:54:54:0.964286:39:15:0:0:39:15:1:1
chr11	104767998	.	C	CA	271.86	PASS	AF=1;AO=6;DP=50;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0503731;FXX=0.119976;HRUN=1;LEN=1;MLLD=8.34699;QD=24.7146;RBI=0.0773059;REFB=0;REVB=0.0586408;RO=44;SAF=4;SAR=2;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366997;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00362754;OID=.;OPOS=104767999;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:50:44:44:0:15:29:0:0:7:44:4:2:15:29
chr11	104768000	.	G	A,T	766.93	PASS	AF=0.88,0.12;AO=42,6;DP=48;FAO=44,6;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=15,4;FSAR=29,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235722,-0.0242552;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=57.1041,27.7437;QD=61.3543;RBI=0.0543531,0.036542;REFB=0,0;REVB=0.0489756,-0.0273314;RO=0;SAF=15,4;SAR=27,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.13648e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0123103,0.052966;OID=.,.;OPOS=104768000,104768000;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:29:48:50:0:0:42,6:44,6:0.88,0.12:27,2:15,4:0:0:29,2:15,4:0:0
chr11	104768098	.	T	C	699.48	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0304675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.911;QD=54.8613;RBI=0.123899;REFB=-0.129083;REVB=0.120094;RO=1;SAF=19;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149453;STB=0.507933;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00255122;OID=.;OPOS=104768098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:51:1:1:50:50:0.980392:31:19:0:1:31:19:0:1
chr11	104819327	.	T	C	1102.99	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=75;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00945005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.526;QD=58.826;RBI=0.0127131;REFB=-0.0686527;REVB=0.00850408;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.506848;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=-0.000124287;OID=.;OPOS=104819327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:75:0:1:74:74:0.986667:36:38:0:0:36:38:0:1
chr11	104839222	.	A	G	631.99	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109867;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.783;QD=61.658;RBI=0.0170809;REFB=0;REVB=-0.0130787;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.27117e-06;OID=.;OPOS=104839222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr11	104869708	.	G	C	757.45	PASS	AF=0.979592;AO=47;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0216469;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.206;QD=61.8322;RBI=0.0268238;REFB=-0.0940863;REVB=0.0158408;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512815;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.000948825;OID=.;OPOS=104869708;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:0:1:47:48:0.979592:28:19:0:0:29:19:1:0
chr11	105223502	.	T	C	1061.29	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8848;QD=59.7909;RBI=0.0515678;REFB=0;REVB=-0.0461592;RO=1;SAF=41;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113932;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000589989;OID=.;OPOS=105223502;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:1:0:70:71:1:29:41:1:0:29:42:0:0
chr11	105878844	.	C	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0322798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.516;QD=59.4355;RBI=0.0339605;REFB=0;REVB=0.0105512;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000170394;OID=.;OPOS=105878844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr11	105969258	.	T	A	204.99	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.00776289;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=171.676;QD=15.7682;RBI=0.0127189;REFB=-0.0130243;REVB=-0.0100751;RO=26;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885263;STB=0.555508;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00972399;OID=.;OPOS=105969258;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:29:23:23:0.442308:12:11:10:16:12:11:11:18
chr11	107197640	.	T	C	479.98	PASS	AF=0.485714;AO=50;DP=104;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.0241539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.149;QD=18.2848;RBI=0.033544;REFB=-0.00858507;REVB=0.0232763;RO=53;SAF=27;SAR=23;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957189;STB=0.542189;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.00711693;OID=.;OPOS=107197640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:53:54:50:51:0.485714:23:27:34:19:23:28:34:20
chr11	107286943	.	C	T	212.7	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.000539846;FXX=0.0294031;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.512;QD=25.7819;RBI=0.148598;REFB=-0.00255601;REVB=-0.148597;RO=13;SAF=16;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177849;STB=0.599891;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00122648;OID=.;OPOS=107286943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:13:13:20:20:0.606061:4:16:8:5:4:16:8:5
chr11	107299623	.	A	C	572.16	PASS	AF=0.465116;AO=60;DP=129;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=0.0123121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7086;QD=17.7412;RBI=0.0182372;REFB=-0.0154497;REVB=0.0134539;RO=67;SAF=30;SAR=30;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781034;STB=0.534872;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0136118;OID=.;OPOS=107299623;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:67:69:60:60:0.465116:30:30:39:28:30:30:39:30
chr11	107328544	.	G	A	162.93	PASS	AF=0.36;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0590816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.581;QD=13.0347;RBI=0.0611442;REFB=-0.00686754;REVB=-0.0157471;RO=31;SAF=10;SAR=8;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0078536;STB=0.515678;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00847358;OID=.;OPOS=107328544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:32:18:18:0.36:8:10:17:14:8:10:17:15
chr11	107420530	.	A	G	495.44	PASS	AF=0.605263;AO=46;DP=76;FAO=46;FDP=76;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0186608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.4;QD=26.076;RBI=0.0259489;REFB=-0.0202947;REVB=0.0180311;RO=30;SAF=26;SAR=20;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716734;STB=0.539153;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0176573;OID=.;OPOS=107420530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:30:30:46:46:0.605263:20:26:14:16:20:26:14:16
chr11	107462522	.	G	C	135.95	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0203076;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.541;QD=17.542;RBI=0.0203624;REFB=-0.0357285;REVB=0.00149246;RO=15;SAF=12;SAR=3;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0852268;STB=0.538408;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0363306;OID=.;OPOS=107462522;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:16:15:15:0.483871:3:12:11:4:3:12:12:4
chr11	107463159	.	A	G	622.07	PASS	AF=0.504;AO=63;DP=125;FAO=63;FDP=125;FR=.;FRO=62;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=33;FWDB=0.00539992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.487;QD=19.9063;RBI=0.0150718;REFB=-0.0180391;REVB=0.0140713;RO=62;SAF=38;SAR=25;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123514;STB=0.568166;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0184037;OID=.;OPOS=107463159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:62:62:63:63:0.504:25:38:29:33:25:38:29:33
chr11	107535758	.	G	A	50.31	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00445829;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.624;QD=13.4166;RBI=0.0436652;REFB=-0.00192833;REVB=0.043437;RO=8;SAF=5;SAR=2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.308464;STB=0.685728;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00143867;OID=.;OPOS=107535758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:16:15:8:8:7:7:0.466667:2:5:3:5:2:5:3:5
chr11	107578721	.	C	G	122.13	PASS	AF=0.301887;AO=16;DP=53;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.0756674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.915;QD=9.21742;RBI=0.0756675;REFB=-0.0130636;REVB=-0.000144827;RO=37;SAF=8;SAR=8;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.238946;STB=0.641347;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0294909;OID=.;OPOS=107578721;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:37:37:16:16:0.301887:8:8:26:11:8:8:26:11
chr11	107799426	.	C	A	261.76	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0280828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.095;QD=17.1649;RBI=0.032034;REFB=-0.0314381;REVB=0.0154121;RO=29;SAF=8;SAR=21;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0740409;STB=0.523529;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0290265;OID=.;OPOS=107799426;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:32:29:29:0.47541:21:8:10:19:21:8:10:22
chr11	108043988	.	C	T	586.41	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.789;QD=60.1448;RBI=0.0919142;REFB=0;REVB=0.0910866;RO=0;SAF=27;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.67388e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000387052;OID=.;OPOS=108043988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:10:27:0:0:12:27:0:0
chr11	108055962	.	A	C	753.88	PASS	AF=0.51049;AO=73;DP=143;FAO=73;FDP=143;FR=.;FRO=70;FSAF=51;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=34;FWDB=-0.00605377;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=307.749;QD=21.0876;RBI=0.00651308;REFB=-0.0191148;REVB=0.00240252;RO=70;SAF=51;SAR=22;SRF=36;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178798;STB=0.598714;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0178517;OID=.;OPOS=108055962;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:70:70:73:73:0.51049:22:51:36:34:22:51:36:34
chr11	108093208	.	A	T	727.67	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.107;QD=63.2759;RBI=0.0565693;REFB=0;REVB=0.0299533;RO=0;SAF=31;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184119;OID=.;OPOS=108093208;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:14:31:0:0:14:32:0:0
chr11	108183167	.	A	G	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0796107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.799;QD=59.0186;RBI=0.0855507;REFB=0;REVB=0.0313217;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301817;OID=.;OPOS=108183167;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr11	108345515	.	G	GA	541.69	PASS	AF=1;AO=43;DP=49;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015548;FXX=0.061212;HRUN=0;LEN=1;MLLD=151.544;QD=47.1031;RBI=0.0390337;REFB=0;REVB=0.0358035;RO=1;SAF=19;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240734;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000247387;OID=.;OPOS=108345516;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:43:49:46:46:0:20:26:0:0:10:1:19:24:1:0
chr11	108380335	.	T	C	699.04	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0205024;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.682;QD=54.8265;RBI=0.0206783;REFB=-0.150582;REVB=-0.00269142;RO=1;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165169;STB=0.508768;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000943283;OID=.;OPOS=108380335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:28:22:0:1:28:22:0:1
chr11	108381247	.	C	T	444.75	PASS	AF=0.453704;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=17;FWDB=-0.0177764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.588;QD=16.4724;RBI=0.0178221;REFB=-0.0134543;REVB=0.00127562;RO=59;SAF=25;SAR=24;SRF=42;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199379;STB=0.610667;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0145243;OID=.;OPOS=108381247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:59:59:49:49:0.453704:24:25:42:17:24:25:42:17
chr11	108384207	.	C	T	158.71	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00410253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.03;QD=17.1577;RBI=0.0264428;REFB=0.00333882;REVB=-0.0261226;RO=20;SAF=5;SAR=12;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297664;STB=0.670846;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=-0.00501271;OID=.;OPOS=108384207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:12:5:12:8:12:5:12:8
chr11	108409784	.	T	A	301.03	PASS	AF=0.445946;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.0230869;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.319;QD=16.2719;RBI=0.0277672;REFB=-0.0193183;REVB=-0.0154277;RO=40;SAF=14;SAR=19;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501436;STB=0.535633;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0255094;OID=.;OPOS=108409784;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:40:41:33:33:0.445946:19:14:19:21:19:14:20:21
chr11	110451885	.	A	G	180.48	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.00351653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.699;QD=16.0422;RBI=0.0149469;REFB=-0.000649932;REVB=-0.0145274;RO=25;SAF=9;SAR=10;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282809;STB=0.668043;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.000813194;OID=.;OPOS=110451885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:26:19:19:0.422222:10:9:19:6:10:9:20:6
chr11	110910870	.	C	G	252.53	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00792321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.706;QD=21.0444;RBI=0.0221525;REFB=-0.018943;REVB=-0.0206871;RO=24;SAF=18;SAR=6;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215287;STB=0.621842;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0135392;OID=.;OPOS=110910870;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:6:18:13:11:6:18:13:11
chr11	110910932	.	C	G	209.71	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0329324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.428;QD=18.6413;RBI=0.036914;REFB=-0.0159921;REVB=-0.0166765;RO=24;SAF=15;SAR=6;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139664;STB=0.579631;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0187475;OID=.;OPOS=110910932;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:24:24:21:21:0.466667:6:15:14:10:6:15:14:10
chr11	111164651	.	T	C	258.44	PASS	AF=0.4;AO=30;DP=76;FAO=30;FDP=75;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=-0.00292987;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.999;QD=13.7836;RBI=0.00604528;REFB=-0.0143602;REVB=-0.00528785;RO=45;SAF=18;SAR=12;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242063;STB=0.513803;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0207766;OID=.;OPOS=111164651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:45:45:30:30:0.4:12:18:26:19:12:18:26:19
chr11	111167557	.	A	C	95.6	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0273318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.176;QD=11.5873;RBI=0.0300438;REFB=0.00837408;REVB=0.0124741;RO=21;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055847;STB=0.533277;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=-0.0192015;OID=.;OPOS=111167557;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:4:8:13:8:4:8:13:8
chr11	111167776	.	C	G	192.44	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=44;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.000366559;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=230.755;QD=16.0365;RBI=0.0146011;REFB=-0.0137934;REVB=-0.0145965;RO=23;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267609;STB=0.529259;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0205783;OID=.;OPOS=111167776;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:48:23:28:20:20:0.416667:11:9:11:12:11:9:14:14
chr11	111167792	.	T	G	116.97	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0100335;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.714;QD=11.1397;RBI=0.0499394;REFB=-0.0361105;REVB=-0.0489211;RO=27;SAF=6;SAR=8;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998837;STB=0.571326;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0695021;OID=.;OPOS=111167792;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:27:28:14:14:0.333333:8:6:14:13:8:6:15:13
chr11	111168767	.	C	T	328.74	PASS	AF=0.37;AO=37;DP=100;FAO=37;FDP=100;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=-0.0120983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.382;QD=13.1495;RBI=0.0691148;REFB=-0.00211794;REVB=-0.0680477;RO=63;SAF=18;SAR=19;SRF=35;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759472;STB=0.54342;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00414938;OID=.;OPOS=111168767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:63:63:37:37:0.37:19:18:35:28:19:18:35:28
chr11	111327213	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0172773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.859;QD=45.8055;RBI=0.0226085;REFB=0;REVB=0.0145822;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.19118e-05;OID=.;OPOS=111327213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr11	111368047	.	G	T	740.93	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0171227;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.545;QD=54.8839;RBI=0.0193089;REFB=0.00250785;REVB=-0.00892435;RO=1;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171308;STB=0.509087;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=-0.00019931;OID=.;OPOS=111368047;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:54:1:1:53:53:0.981481:27:26:0:1:27:26:0:1
chr11	111420364	.	A	G	1540.59	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.267;QD=59.8287;RBI=0.04593;REFB=0;REVB=0.0339185;RO=0;SAF=39;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.0664e-05;OID=.;OPOS=111420364;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:64:39:0:0:64:39:0:0
chr11	111431656	.	GAATAAT	GAAT,GAATA	1092.46	PASS	AF=0.912088,0.0879121;AO=76,10;DP=91;FAO=83,8;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=66,7;FSAR=17,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0406416,0.0300789;FXX=0.0108684;HRUN=2,2;LEN=3,2;MLLD=262.338,250.78;QD=48.0203;RBI=0.0418429,0.0313865;REFB=0,0;REVB=0.00995424,0.00896523;RO=0;SAF=61,8;SAR=15,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.000651077,0.00557996;OID=.,.;OPOS=111431657,111431661;OREF=AAT,AT;OALT=-,-;OMAPALT=GAAT,GAATA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.912088,0.0879121:76,10:91:83,8:91:0:66,7:17,1:0:0:7:0:61,8:15,2:0:0
chr11	111553893	.	T	C	296.39	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00846667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=151.123;QD=49.3982;RBI=0.0504805;REFB=-0.150108;REVB=0.0497655;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516115;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00192674;OID=.;OPOS=111553893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:0:1:23:23:0.958333:8:15:0:0:8:15:1:0
chr11	111692182	.	G	A	108.0	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0333352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1949;QD=13.0903;RBI=0.0422877;REFB=-0.0213791;REVB=0.0260194;RO=20;SAF=11;SAR=2;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.50697;STB=0.801576;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0336025;OID=.;OPOS=111692182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:2:11:8:12:2:11:8:12
chr11	111724133	.	C	T	110.57	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0106081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5392;QD=15.2506;RBI=0.042175;REFB=-0.00853228;REVB=-0.0408191;RO=15;SAF=6;SAR=7;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188592;STB=0.622855;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0110823;OID=.;OPOS=111724133;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:16:13:13:0.448276:7:6:10:5:7:6:11:5
chr11	111747297	.	A	G	343.14	PASS	AF=0.486486;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0256655;FXX=0.0133316;HRUN=4;LEN=1;MLLD=69.6552;QD=18.5481;RBI=0.0286544;REFB=0.0369207;REVB=0.0127419;RO=37;SAF=16;SAR=20;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0630875;STB=0.542145;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=-0.0154752;OID=.;OPOS=111747297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:37:38:36:36:0.486486:20:16:19:18:20:16:20:18
chr11	111749349	.	A	T	844.3	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.039;QD=57.2407;RBI=0.0292032;REFB=0;REVB=-0.000353896;RO=0;SAF=43;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.26304e-05;OID=.;OPOS=111749349;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:15:43:0:0:15:44:0:0
chr11	111754574	.	A	C	132.48	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.000610886;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2807;QD=15.1403;RBI=0.0183134;REFB=-0.000646864;REVB=-0.0183032;RO=20;SAF=9;SAR=6;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161375;STB=0.592478;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00100621;OID=.;OPOS=111754574;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:6:9:15:5:6:9:15:5
chr11	111781047	.	A	C	231.98	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00381157;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.76;QD=16.5702;RBI=0.00386347;REFB=-0.0118487;REVB=0.000631169;RO=31;SAF=19;SAR=7;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166422;STB=0.601183;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00375387;OID=.;OPOS=111781047;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:56:31:30:26:26:0.464286:7:19:18:13:7:19:17:13
chr11	111848531	.	C	T	179.01	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.0101128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0289;QD=12.5621;RBI=0.0285469;REFB=-0.0151094;REVB=0.0266957;RO=35;SAF=14;SAR=8;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00892891;STB=0.50515;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0125861;OID=.;OPOS=111848531;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:8:14:22:13:8:14:22:13
chr11	111853106	.	G	GC	478.83	PASS	AF=1;AO=44;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.138699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.0635;QD=39.088;RBI=0.138935;REFB=0;REVB=0.00809785;RO=4;SAF=23;SAR=21;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.074976;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0039647;OID=.;OPOS=111853107;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:44:48:49:49:0:27:22:0:0:10:4:23:21:4:0
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chr11	111908162	.	T	C	258.47	PASS	AF=0.441176;AO=28;DP=67;FAO=30;FDP=68;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00401549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8008;QD=15.204;RBI=0.0115789;REFB=-0.0204886;REVB=-0.0108603;RO=38;SAF=10;SAR=18;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12318;STB=0.562203;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0334026;OID=.;OPOS=111908162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:38:38:28:30:0.441176:18:10:18:20:19:11:18:20
chr11	111916647	.	G	A	263.5	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0484078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0169;QD=19.5187;RBI=0.0549282;REFB=-0.0230402;REVB=0.0259576;RO=25;SAF=8;SAR=20;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147903;STB=0.595167;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0199893;OID=.;OPOS=111916647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:25:26:28:28:0.518519:20:8:11:14:20:8:12:14
chr11	111953315	.	CA	AC,C	31.19	PASS	AF=0.0833333,0.138889;AO=5,13;DP=40;FAO=3,5;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=0,1;FSAR=3,4;FSRF=5;FSRR=23;FWDB=0.0420316,0.144437;FXX=0.099975;HRUN=1,6;LEN=2,1;MLLD=21.2173,8.08736;QD=3.46564;RBI=0.0878426,0.154263;REFB=-0.0915718,-0.150718;REVB=-0.0771341,-0.0541769;RO=18;SAF=0,1;SAR=5,12;SRF=3;SRR=15;SSEN=0,0.416667;SSEP=0,0;SSSB=-0.613462,-0.232665;STB=0.994445,0.529299;STBP=0.317,0.924;TYPE=mnp,del;VARB=0.0282948,0.190728;OID=.,.;OPOS=111953315,111953316;OREF=CA,A;OALT=AC,-;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:15:40:36:18:28:5,13:3,5:0.0833333,0.138889:5,12:0,1:3:15:3,4:0,1:5:23
chr11	111953919	.	GATTAT	GATTA,GAT,GATT	448.97	PASS	AF=0.597403,0.272727,0.12987;AO=22,9,8;DP=76;FAO=46,21,10;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=23,7,4;FSAR=23,14,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13628,-0.0135181,-0.0154508;FXX=0.0128189;HRUN=9,2,1;LEN=1,3,2;MLLD=4.74764,186.071,187.73;QD=23.323;RBI=0.24048,0.0306321,0.0221359;REFB=0.0151373,-0.0112131,-0.0130722;REVB=0.198137,0.027488,0.0158516;RO=13;SAF=11,2,4;SAR=11,7,4;SRF=2;SRR=11;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.233578,0.1059,0.364734;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.0908302,-0.00187688,-0.00561286;OID=.,.,.;OPOS=111953924,111953920,111953922;OREF=T,ATT,TA;OALT=-,-,-;OMAPALT=GATTA,GAT,GATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.597403,0.272727,0.12987:22,9,8:76:46,21,10:77:0:23,7,4:23,14,6:0:0:77:13:11,2,4:11,7,4:2:11
chr11	111956989	.	C	A	1349.01	PASS	AF=1;AO=85;DP=86;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.618;QD=61.3186;RBI=0.0665586;REFB=0;REVB=0.064898;RO=0;SAF=59;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109282;OID=.;OPOS=111956989;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:86:88:0:0:85:88:1:26:59:0:0:28:60:0:0
chr11	112065434	.	T	C	934.32	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.904;QD=58.3947;RBI=0.0213342;REFB=0;REVB=0.0120487;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.77773e-06;OID=.;OPOS=112065434;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:34:30:0:0:34:30:0:0
chr11	112088499	.	A	C	1510.76	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7462;QD=63.611;RBI=0.14724;REFB=0;REVB=0.144136;RO=0;SAF=66;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107859;OID=.;OPOS=112088499;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:29:66:0:0:29:66:0:0
chr11	112123095	.	A	G	275.12	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.017115;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.2631;QD=20.0084;RBI=0.121416;REFB=-0.02645;REVB=-0.120204;RO=24;SAF=10;SAR=19;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199938;STB=0.595233;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0197446;OID=.;OPOS=112123095;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:24:26:29:29:0.527273:19:10:14:10:19:10:14:12
chr11	112223299	.	G	A	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.146;QD=56.7065;RBI=0.0155171;REFB=0;REVB=0.0103394;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.62967e-05;OID=.;OPOS=112223299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr11	112832353	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314585;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.556;QD=50.4135;RBI=0.0330103;REFB=0;REVB=0.0100021;RO=0;SAF=18;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199002;OID=.;OPOS=112832353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:1:18:0:0:1:18:0:0
chr11	112832358	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00448548;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.062;QD=50.4134;RBI=0.044826;REFB=0;REVB=0.044601;RO=0;SAF=18;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184661;OID=.;OPOS=112832358;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:1:18:0:0:1:18:0:0
chr11	113103996	.	T	G	1931.46	PASS	AF=0.935714;AO=131;DP=140;FAO=131;FDP=140;FR=.;FRO=9;FSAF=68;FSAR=63;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.0104148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.37;QD=55.1845;RBI=0.0363629;REFB=-0.0763968;REVB=0.0348395;RO=8;SAF=68;SAR=63;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293818;STB=0.519081;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0297741;OID=.;OPOS=113103996;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:140:140:8:9:131:131:0.935714:63:68:2:6:63:68:2:7
chr11	113111501	.	T	C	167.84	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=21;FWDB=-0.021244;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.1149;QD=14.9191;RBI=0.0213172;REFB=0.0304102;REVB=-0.00176495;RO=28;SAF=1;SAR=17;SRF=6;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416113;STB=0.757573;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.0477967;OID=.;OPOS=113111501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:28:27:18:18:0.4:17:1:6:22:17:1:6:21
chr11	113113515	.	G	A	153.61	PASS	AF=0.258824;AO=22;DP=84;FAO=22;FDP=85;FR=.;FRO=63;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=48;FSRR=15;FWDB=-0.0261154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.33;QD=7.22872;RBI=0.0448038;REFB=-0.0111271;REVB=-0.0364056;RO=61;SAF=13;SAR=9;SRF=46;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219148;STB=0.63752;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0424257;OID=.;OPOS=113113515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:61:63:22:22:0.258824:9:13:46:15:9:13:48:15
chr11	113200709	.	G	A	1889.02	PASS	AF=0.984127;AO=124;DP=127;FAO=124;FDP=126;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=78;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0159272;FXX=0.0078734;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.62;QD=59.969;RBI=0.0165109;REFB=-0.0385027;REVB=0.00435111;RO=1;SAF=46;SAR=78;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010216;STB=0.510637;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=7.46068e-05;OID=.;OPOS=113200709;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:127:126:1:2:124:124:0.984127:78:46:1:0:78:46:2:0
chr11	113212553	.	T	C	851.02	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.409;QD=57.6959;RBI=0.0359528;REFB=0;REVB=-0.0238909;RO=0;SAF=35;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.69033e-06;OID=.;OPOS=113212553;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:24:35:0:0:24:35:0:0
chr11	113264272	.	T	C	2064.55	PASS	AF=1;AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.754;QD=62.562;RBI=0.074182;REFB=0;REVB=0.0732983;RO=0;SAF=58;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.72444e-05;OID=.;OPOS=113264272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:132:132:0:0:132:132:1:74:58:0:0:74:58:0:0
chr11	113264470	.	A	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.056;QD=56.1912;RBI=0.0265519;REFB=0;REVB=0.0209627;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.00791e-05;OID=.;OPOS=113264470;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr11	113270369	.	G	A	394.25	PASS	AF=0.424528;AO=45;DP=106;FAO=45;FDP=106;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=0.000589333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.109;QD=14.8772;RBI=0.025018;REFB=-0.0135932;REVB=-0.025011;RO=61;SAF=25;SAR=20;SRF=36;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360309;STB=0.520247;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0212307;OID=.;OPOS=113270369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:61:61:45:45:0.424528:20:25:36:25:20:25:36:25
chr11	113270374	.	C	T	1605.17	PASS	AF=1;AO=105;DP=108;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5812;QD=58.3698;RBI=0.168047;REFB=-0.0779852;REVB=0.166699;RO=2;SAF=62;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215576;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100579;OID=.;OPOS=113270374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:108:110:2:0:105:110:1:43:62:0:2:47:63:0:0
chr11	113561025	.	G	A	571.98	PASS	AF=0.371585;AO=68;DP=183;FAO=68;FDP=183;FR=.;FRO=115;FSAF=44;FSAR=24;FSRF=68;FSRR=47;FWDB=-0.0108558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7791;QD=12.5022;RBI=0.0345665;REFB=-0.00849552;REVB=-0.0328177;RO=115;SAF=44;SAR=24;SRF=68;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0660003;STB=0.537497;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0191627;OID=.;OPOS=113561025;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:183:115:115:68:68:0.371585:24:44:68:47:24:44:68:47
chr11	113561054	.	A	G	538.38	PASS	AF=0.361111;AO=64;DP=180;FAO=65;FDP=180;FR=.;FRO=115;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=67;FSRR=48;FWDB=0.00542752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.474;QD=11.9639;RBI=0.00542915;REFB=-0.0192609;REVB=-0.000133326;RO=114;SAF=38;SAR=26;SRF=66;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.01718;STB=0.501319;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0267397;OID=.;OPOS=113561054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:180:114:115:64:65:0.361111:26:38:66:48:27:38:67:48
chr11	113561057	.	A	G	489.7	PASS	AF=0.338889;AO=60;DP=179;FAO=61;FDP=180;FR=.;FRO=119;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=70;FSRR=49;FWDB=-0.0122674;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.9689;QD=10.8823;RBI=0.0129987;REFB=-0.0345606;REVB=0.00429855;RO=118;SAF=34;SAR=26;SRF=69;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0213288;STB=0.509801;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0328179;OID=.;OPOS=113561057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:180:118:119:60:61:0.338889:26:34:69:49:26:35:70:49
chr11	113570405	.	T	C	110.32	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0.0403773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.346;QD=14.7094;RBI=0.0477399;REFB=-0.0318865;REVB=0.0254711;RO=15;SAF=2;SAR=11;SRF=0;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367599;STB=0.717738;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0267315;OID=.;OPOS=113570405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:15:17:13:13:0.433333:11:2:0:15:11:2:0:17
chr11	113576932	.	A	G	269.06	PASS	AF=0.520833;AO=24;DP=47;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.0185306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.52;QD=22.4212;RBI=0.0188363;REFB=-0.0638516;REVB=-0.00337966;RO=23;SAF=12;SAR=12;SRF=4;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287593;STB=0.663802;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0245708;OID=.;OPOS=113576932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:23:23:24:25:0.520833:12:12:4:19:12:13:4:19
chr11	113670052	.	T	A	695.77	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.012693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.645;QD=52.5107;RBI=0.0213004;REFB=-0.0183452;REVB=0.0171054;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.50037;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.000603941;OID=.;OPOS=113670052;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:53:0:2:51:51:0.962264:26:25:0:0:26:25:1:1
chr11	113679119	.	C	T	694.31	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014344;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7396;QD=63.1195;RBI=0.0144527;REFB=0;REVB=-0.00176935;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0032042;OID=.;OPOS=113679119;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:18:26:0:0:18:26:0:0
chr11	113803104	.	G	A	309.37	PASS	AF=0.441558;AO=34;DP=77;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.0106106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3852;QD=16.071;RBI=0.0284043;REFB=-0.0174661;REVB=-0.0263481;RO=43;SAF=21;SAR=13;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135836;STB=0.507651;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0215374;OID=.;OPOS=113803104;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:43:43:34:34:0.441558:13:21:26:17:13:21:26:17
chr11	113848273	.	A	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.4208;QD=46.8477;RBI=0.0706568;REFB=0;REVB=-0.0696868;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00151807;OID=.;OPOS=113848273;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chr11	114393652	.	C	T	1253.3	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00785368;FXX=0.0119033;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.206;QD=60.3998;RBI=0.0255746;REFB=-0.0600944;REVB=0.0243388;RO=1;SAF=43;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119881;STB=0.506328;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=3.129e-05;OID=.;OPOS=114393652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:83:1:1:82:82:0.987952:39:43:0:1:39:43:0:1
chr11	114401577	.	T	C	1152.38	PASS	AF=0.94186;AO=79;DP=86;FAO=81;FDP=86;FR=.;FRO=5;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0256227;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.36;QD=53.599;RBI=0.0290227;REFB=-0.0545375;REVB=0.0136307;RO=2;SAF=33;SAR=46;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00394874;STB=0.513166;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00314844;OID=.;OPOS=114401577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:86:86:2:5:79:81:0.94186:46:33:1:1:47:34:1:4
chr11	114441943	.	G	A	688.1	PASS	AF=0.92;AO=46;DP=50;FAO=46;FDP=50;FR=.;FRO=4;FSAF=15;FSAR=31;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0131021;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.793;QD=55.0477;RBI=0.0201537;REFB=-0.0534715;REVB=-0.0153135;RO=4;SAF=15;SAR=31;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110092;STB=0.558797;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00134302;OID=.;OPOS=114441943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:50:50:4:4:46:46:0.92:31:15:4:0:31:15:4:0
chr11	114442103	.	A	G,T	306.9	PASS	AF=0.913043,0.0869565;AO=21,2;DP=23;FAO=21,2;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12,1;FSAR=9,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140118,0.00972422;FXX=0.0416493;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=119.569,177.038;QD=53.3733;RBI=0.0176132,0.0112828;REFB=0,0;REVB=0.0106722,-0.00572197;RO=0;SAF=12,1;SAR=9,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00451852,0.0211792;OID=.,.;OPOS=114442103,114442103;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:23:23:0:0:21,2:21,2:0.913043,0.0869565:9,1:12,1:0:0:9,1:12,1:0:0
chr11	114569054	.	A	G	1189.26	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0837616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.644;QD=60.9877;RBI=0.0841369;REFB=0;REVB=0.00793885;RO=0;SAF=39;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202664;OID=.;OPOS=114569054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:78:0:0:74:78:1:35:39:0:0:36:42:0:0
chr11	114576626	.	A	T	333.82	PASS	AF=0.535714;AO=29;DP=58;FAO=30;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0100867;FXX=0.0175408;HRUN=6;LEN=1;MLLD=39.6036;QD=23.8446;RBI=0.0392767;REFB=0.00418893;REVB=-0.0379595;RO=23;SAF=24;SAR=5;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247163;STB=0.648036;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00786329;OID=.;OPOS=114576626;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:56:23:22:29:30:0.535714:5:24:14:9:5:25:13:9
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chr11	116633825	.	C	T	291.65	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0212831;FXX=0.040808;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.721;QD=24.8209;RBI=0.0297603;REFB=-0.0137489;REVB=0.0208017;RO=19;SAF=16;SAR=10;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150091;STB=0.584652;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.00894984;OID=.;OPOS=116633825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:47:19:21:26:26:0.553191:10:16:8:11:10:16:9:12
chr11	116661826	.	T	C	538.6	PASS	AF=0.574713;AO=46;DP=83;FAO=50;FDP=87;FR=.;FRO=37;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.00704901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.264;QD=24.7632;RBI=0.00828812;REFB=-0.0240816;REVB=-0.0043594;RO=35;SAF=31;SAR=15;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367187;STB=0.51219;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.012383;OID=.;OPOS=116661826;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:87:35:37:46:50:0.574713:15:31:25:10:15:35:25:12
chr11	116662579	.	C	T	178.94	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00508852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.673;QD=15.2292;RBI=0.0316893;REFB=-0.0115164;REVB=-0.0312781;RO=28;SAF=13;SAR=6;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126815;STB=0.573449;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.012856;OID=.;OPOS=116662579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:6:13:16:12:6:13:16:12
chr11	116701535	.	T	C	195.8	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=44;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0164378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.569;QD=17.8004;RBI=0.0174327;REFB=-0.0481672;REVB=-0.0058052;RO=22;SAF=2;SAR=13;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430811;STB=0.631438;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0469147;OID=.;OPOS=116701535;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:24:15:20:0.454545:13:2:10:12:15:5:11:13
chr11	116728842	.	G	A	470.4	PASS	AF=0.505495;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.00924295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.237;QD=20.6767;RBI=0.0146087;REFB=-0.0120611;REVB=0.0113129;RO=45;SAF=27;SAR=19;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287423;STB=0.515917;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0141035;OID=.;OPOS=116728842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:45:45:46:46:0.505495:19:27:25:20:19:27:25:20
chr11	116729013	.	T	C	164.13	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00373698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.88;QD=12.8732;RBI=0.0565288;REFB=-0.0266068;REVB=-0.0564052;RO=31;SAF=13;SAR=6;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155737;STB=0.602537;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0377782;OID=.;OPOS=116729013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:32:19:19:0.372549:6:13:17:14:6:13:17:15
chr11	116729196	.	T	C	169.16	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0395726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.863;QD=12.0827;RBI=0.0404414;REFB=-0.0260051;REVB=-0.00833764;RO=35;SAF=7;SAR=14;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453046;STB=0.52629;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0423334;OID=.;OPOS=116729196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:14:7:13:22:14:7:13:22
chr11	117042377	.	G	A	1358.2	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.787;QD=62.4459;RBI=0.0353848;REFB=0;REVB=0.0224545;RO=0;SAF=49;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.19832e-05;OID=.;OPOS=117042377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:38:49:0:0:38:49:0:0
chr11	117052757	.	G	T	228.92	PASS	AF=0.769231;AO=20;DP=27;FAO=20;FDP=26;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.00277558;FXX=0.0370233;HRUN=5;LEN=1;MLLD=196.547;QD=35.219;RBI=0.0164941;REFB=-0.02362;REVB=0.0162589;RO=6;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196363;STB=0.607043;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0177069;OID=.;OPOS=117052757;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:26:6:6:20:20:0.769231:11:9:0:6:11:9:0:6
chr11	117077034	.	A	G	207.63	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.0522604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.846;QD=15.1007;RBI=0.0546603;REFB=0.0028423;REVB=-0.0160185;RO=30;SAF=16;SAR=8;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293534;STB=0.674554;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=-0.0069882;OID=.;OPOS=117077034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:30:31:24:24:0.436364:8:16:11:19:8:16:11:20
chr11	117099025	.	A	G	312.17	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.043253;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4633;QD=16.6493;RBI=0.0497962;REFB=-0.0204617;REVB=0.0246747;RO=39;SAF=22;SAR=12;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0480427;STB=0.521726;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0279141;OID=.;OPOS=117099025;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:39:41:34:34:0.453333:12:22:27:12:12:22:28:13
chr11	117156552	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00049813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.563;QD=56.1912;RBI=0.0250062;REFB=0;REVB=-0.0250012;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000221976;OID=.;OPOS=117156552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr11	117160347	.	A	G	774.78	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.894;QD=56.3478;RBI=0.0312236;REFB=0;REVB=0.00296058;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304283;OID=.;OPOS=117160347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:55:0:0:53:55:1:28:25:0:0:28:27:0:0
chr11	117163824	.	C	G	1264.53	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.249;QD=61.6845;RBI=0.0349503;REFB=0;REVB=0.0308183;RO=0;SAF=46;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14462e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000275652;OID=.;OPOS=117163824;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:36:46:0:0:36:46:0:0
chr11	117252489	.	T	C	938.35	PASS	AF=0.45;AO=73;DP=201;FAO=90;FDP=200;FR=.,HEALED;FRO=101;FSAF=69;FSAR=21;FSRF=63;FSRR=38;FWDB=0.00807917;FXX=0.0196069;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.643;QD=18.7671;RBI=0.0229647;REFB=-0.0220246;REVB=-0.0214967;RO=98;SAF=57;SAR=16;SRF=63;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181371;STB=0.594892;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0275632;OID=.;OPOS=117252489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:201:200:98:101:73:90:0.45:16:57:63:35:21:69:63:38
chr11	117267884	.	A	G	723.36	PASS	AF=0.565574;AO=69;DP=122;FAO=69;FDP=122;FR=.;FRO=53;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=31;FWDB=0.0167065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.076;QD=23.7166;RBI=0.0199316;REFB=-0.00912512;REVB=-0.0108702;RO=53;SAF=42;SAR=27;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15557;STB=0.58499;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00758451;OID=.;OPOS=117267884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:53:53:69:69:0.565574:27:42:22:31:27:42:22:31
chr11	117282800	.	G	T	198.98	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.0532123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9326;QD=15.6066;RBI=0.0602446;REFB=-0.025456;REVB=0.0282465;RO=27;SAF=14;SAR=8;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451108;STB=0.50957;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0401609;OID=.;OPOS=117282800;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:51:27:29:22:22:0.431373:8:14:16:11:8:14:18:11
chr11	117304196	.	C	T	47.46	PASS	AF=0.4375;AO=4;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.114061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.7553;QD=11.8641;RBI=0.118928;REFB=-0.0163441;REVB=-0.0336731;RO=8;SAF=2;SAR=2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127513;STB=0.631215;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0515761;OID=.;OPOS=117304196;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:8:9:4:7:0.4375:2:2:3:5:3:4:3:6
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chr11	117351270	.	T	TG	81.6	PASS	AF=0.575758;AO=13;DP=38;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.0389618;FXX=0.0294031;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.99461;QD=9.89082;RBI=0.0794624;REFB=-0.107003;REVB=0.069255;RO=24;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602297;STB=0.551672;STBP=0.537;TYPE=ins;VARB=0.109101;OID=.;OPOS=117351271;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.575758:13:38:19:33:14:6:13:3:11:51:24:5:8:8:16
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chr11	117403235	.	G	T	915.16	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.103;QD=58.1052;RBI=0.0444445;REFB=0;REVB=-0.000622313;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04325e-05;OID=.;OPOS=117403235;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:63:0:0:58:63:1:34:24:0:0:37:26:0:0
chr11	117693255	.	T	C	1153.33	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00198136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.55;QD=60.7014;RBI=0.0169185;REFB=0;REVB=0.0168021;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99229e-05;OID=.;OPOS=117693255;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:76:0:0:74:76:1:38:36:0:0:39:37:0:0
chr11	117693371	.	G	T	75.14	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0115152;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.811;QD=11.1312;RBI=0.0421482;REFB=-0.0391568;REVB=-0.0405447;RO=16;SAF=7;SAR=3;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277675;STB=0.683837;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.040927;OID=.;OPOS=117693371;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:16:17:10:10:0.37037:3:7:7:9:3:7:7:10
chr11	117698762	.	G	A	289.65	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0122094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.842;QD=18.9935;RBI=0.034621;REFB=0.0177923;REVB=0.0323966;RO=30;SAF=17;SAR=14;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188039;STB=0.604537;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=-0.0180286;OID=.;OPOS=117698762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:14:17:10:20:14:17:10:20
chr11	117774146	.	C	G	475.04	PASS	AF=0.576923;AO=45;DP=78;FAO=45;FDP=78;FR=.;FRO=33;FSAF=34;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=0.00263516;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=333.641;QD=24.3608;RBI=0.00804525;REFB=-0.00535109;REVB=-0.00760145;RO=33;SAF=34;SAR=11;SRF=24;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029016;STB=0.515926;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.00400787;OID=.;OPOS=117774146;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:33:33:45:45:0.576923:11:34:24:9:11:34:24:9
chr11	117774291	.	A	C	676.67	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0282787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7185;QD=60.1481;RBI=0.0676353;REFB=-0.0732391;REVB=-0.0614398;RO=1;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028453;STB=0.515145;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00372365;OID=.;OPOS=117774291;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:16:28:0:1:16:28:0:1
chr11	117781435	.	A	G	688.09	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.334;QD=62.5537;RBI=0.0613761;REFB=0;REVB=0.0291516;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127943;OID=.;OPOS=117781435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:44:0:0:41:44:1:22:19:0:0:23:21:0:0
chr11	117789242	.	C	G	530.3	PASS	AF=0.524272;AO=54;DP=103;FAO=54;FDP=103;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=12;FWDB=-0.0536696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0724;QD=20.594;RBI=0.0734287;REFB=0.015543;REVB=-0.0501134;RO=48;SAF=27;SAR=27;SRF=36;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21482;STB=0.621317;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.0150716;OID=.;OPOS=117789242;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:48:49:54:54:0.524272:27:27:36:12:27:27:37:12
chr11	117864047	.	A	G	216.92	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0066232;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=97.23;QD=16.6861;RBI=0.00851391;REFB=-0.0872992;REVB=0.00534974;RO=23;SAF=11;SAR=13;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207296;STB=0.541632;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0647551;OID=.;OPOS=117864047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:52:23:28:24:24:0.461538:13:11:10:13:13:11:15:13
chr11	117864113	.	G	A	237.13	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0134814;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.057;QD=19.7605;RBI=0.0288482;REFB=-0.0116357;REVB=-0.0255043;RO=25;SAF=14;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839702;STB=0.547444;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0170064;OID=.;OPOS=117864113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:9:14:13:12:9:14:13:12
chr11	117864846	.	A	G	124.06	PASS	AF=0.272727;AO=18;DP=66;FAO=18;FDP=66;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.000259834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9147;QD=7.51904;RBI=0.0425761;REFB=-0.0023259;REVB=-0.0425753;RO=46;SAF=12;SAR=6;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204213;STB=0.639018;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00356911;OID=.;OPOS=117864846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:46:48:18:18:0.272727:6:12:23:23:6:12:23:25
chr11	117869670	.	A	G	340.62	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.814;QD=54.4997;RBI=0.0371473;REFB=0;REVB=0.0305859;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162896;OID=.;OPOS=117869670;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0
chr11	117896135	.	C	T	842.11	PASS	AF=0.369004;AO=100;DP=270;FAO=100;FDP=271;FR=.;FRO=171;FSAF=59;FSAR=41;FSRF=85;FSRR=86;FWDB=0.000843816;FXX=0.00732574;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.637;QD=12.4296;RBI=0.00210851;REFB=-0.0073696;REVB=0.0019323;RO=169;SAF=59;SAR=41;SRF=84;SRR=85;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10442;STB=0.559292;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.013286;OID=.;OPOS=117896135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:270:271:169:171:100:100:0.369004:41:59:84:85:41:59:85:86
chr11	117965530	.	A	G	97.62	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0340679;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.7246;QD=12.2021;RBI=0.0570625;REFB=0.00970364;REVB=0.0457767;RO=19;SAF=6;SAR=6;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819582;STB=0.562397;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=-0.00864097;OID=.;OPOS=117965530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:33:32:19:20:12:12:0.375:6:6:8:11:6:6:8:12
chr11	117965595	.	C	T	86.81	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.019426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.151;QD=12.8605;RBI=0.0209926;REFB=0.0038158;REVB=-0.00795741;RO=16;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317216;STB=0.68595;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=-0.0154371;OID=.;OPOS=117965595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:4:7:5:11:4:7:5:11
chr11	117982495	.	T	G	934.3	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00978398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.772;QD=58.3939;RBI=0.0249978;REFB=0;REVB=0.0230036;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.51636e-05;OID=.;OPOS=117982495;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:30:33:0:0:30:34:0:0
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chr11	118068752	.	T	C	465.91	PASS	AF=0.489362;AO=46;DP=94;FAO=46;FDP=94;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=-0.0197151;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=158.192;QD=19.8258;RBI=0.0198371;REFB=-0.0116734;REVB=0.00219653;RO=39;SAF=14;SAR=32;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208705;STB=0.575505;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00546965;OID=.;OPOS=118068752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:39:48:46:46:0.489362:32:14:21:18:32:14:21:27
chr11	118074337	.	A	G	162.53	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=-0.00927658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2563;QD=19.7009;RBI=0.058856;REFB=-0.00395008;REVB=0.0581203;RO=16;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366468;STB=0.703101;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0049782;OID=.;OPOS=118074337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:8:9:15:1:8:9:15:1
chr11	118083664	.	A	G	455.34	PASS	AF=0.5;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.00936455;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.5703;QD=20.2374;RBI=0.0159092;REFB=-0.0295364;REVB=0.012861;RO=44;SAF=22;SAR=23;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909612;STB=0.544359;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0274492;OID=.;OPOS=118083664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:44:45:45:45:0.5:23:22:26:18:23:22:26:19
chr11	118107805	.	A	G	301.95	PASS	AF=0.458333;AO=32;DP=71;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.0108733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.577;QD=16.7751;RBI=0.0225048;REFB=-0.0255646;REVB=0.0197038;RO=39;SAF=20;SAR=12;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0998774;STB=0.56518;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0271375;OID=.;OPOS=118107805;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:39:39:32:33:0.458333:12:20:28:11:13:20:28:11
chr11	118110977	.	T	C	447.75	PASS	AF=0.408;AO=49;DP=123;FAO=51;FDP=125;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=53;FSRR=21;FWDB=0.0212815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.3239;QD=14.328;RBI=0.0383549;REFB=-0.00314973;REVB=-0.0319091;RO=74;SAF=28;SAR=21;SRF=53;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162472;STB=0.58039;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00546104;OID=.;OPOS=118110977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:125:74:74:49:51:0.408:21:28:53:21:21:30:53:21
chr11	118178007	.	C	T	44.79	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.15819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.772;QD=7.46455;RBI=0.15861;REFB=-0.00150537;REVB=-0.0115291;RO=16;SAF=5;SAR=2;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310646;STB=0.678486;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00155612;OID=.;OPOS=118178007;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:16:17:7:7:0.291667:2:5:7:9:2:5:8:9
chr11	118179197	.	A	G	428.9	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0572601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.027;QD=57.1865;RBI=0.0637058;REFB=0;REVB=0.0279232;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00044841;OID=.;OPOS=118179197;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr11	118182829	.	T	A	145.73	PASS	AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.0153044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.137;QD=25.3447;RBI=0.0531931;REFB=0.00726918;REVB=0.0509439;RO=8;SAF=6;SAR=9;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.288641;STB=0.660811;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.003395;OID=.;OPOS=118182829;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:23:23:8:8:15:15:0.652174:9:6:7:1:9:6:7:1
chr11	118185140	.	T	C	72.94	PASS	AF=0.3125;AO=10;DP=32;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00112499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.933;QD=9.11759;RBI=0.0064129;REFB=-0.00849179;REVB=-0.00631345;RO=21;SAF=2;SAR=8;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348953;STB=0.731889;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.027041;OID=.;OPOS=118185140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:32:32:21:22:10:10:0.3125:8:2:10:11:8:2:11:11
chr11	118221350	.	G	T	1338.93	PASS	AF=1;AO=6;DP=84;FAO=87;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=53;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0571803;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.319;QD=61.56;RBI=0.123818;REFB=0;REVB=0.109824;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00261718;OID=.;OPOS=118221350;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:87:0:0:6:87:1:2:4:0:0:34:53:0:0
chr11	118359176	.	CTTTTTTAC	CTTTTTAC,CTTTTTACT	100.09	PASS	AF=0.402597,0.0519481;AO=28,5;DP=75;FAO=31,4;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=26,4;FSAR=5,0;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.0762899,-0.0755618;FXX=0.0253133;HRUN=6,6;LEN=1,3;MLLD=7.99293,84.5095;QD=5.19967;RBI=0.125237,0.0759578;REFB=-0.190722,-0.0179533;REVB=0.0993189,0.00774599;RO=34;SAF=24,5;SAR=4,0;SRF=12;SRR=22;SSEN=0.456311,0;SSEP=0,0;SSSB=0.547112,0.691191;STB=0.783718,0.997725;STBP=0.001,0.012;TYPE=del,mnp;VARB=0.168269,0.153615;OID=.,.;OPOS=118359177,118359182;OREF=T,TAC;OALT=-,ACT;OMAPALT=CTTTTTAC,CTTTTTACT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.402597,0.0519481:28,5:75:31,4:77:42:26,4:5,0:17:25:84:34:24,5:4,0:12:22
chr11	118393396	.	A	G	334.25	PASS	AF=0.45;AO=36;DP=80;FAO=36;FDP=80;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00110616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.357;QD=16.7127;RBI=0.00430675;REFB=0.00261629;REVB=-0.00416228;RO=44;SAF=13;SAR=23;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0500402;STB=0.528132;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.0027605;OID=.;OPOS=118393396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:44:44:36:36:0.45:23:13:18:26:23:13:18:26
chr11	118404804	.	G	A	169.45	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0313225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6373;QD=16.5319;RBI=0.0419633;REFB=0.00876922;REVB=-0.0279252;RO=23;SAF=14;SAR=4;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329958;STB=0.691127;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.0180446;OID=.;OPOS=118404804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:4:14:11:12:4:14:11:12
chr11	118405068	.	A	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00318664;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.666;QD=46.8477;RBI=0.00341142;REFB=0;REVB=0.00121782;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.16915e-05;OID=.;OPOS=118405068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:11:4:0:0:11:4:0:0
chr11	118405305	.	G	A	187.71	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0997172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0233;QD=20.2929;RBI=0.099946;REFB=-0.0324466;REVB=0.00675929;RO=18;SAF=14;SAR=5;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467227;STB=0.526289;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0448688;OID=.;OPOS=118405305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:5:14:14:4:5:14:14:4
chr11	118405835	.	G	A	43.61	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0655562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.655;QD=6.01549;RBI=0.0656337;REFB=-0.00170792;REVB=-0.00318801;RO=22;SAF=1;SAR=6;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339937;STB=0.728959;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0078563;OID=.;OPOS=118405835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:6:1:8:14:6:1:8:14
chr11	118406328	.	CAGTGTGGA	C	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.023158;FXX=0;HRUN=1;LEN=8;MLLD=309.408;QD=15.3789;RBI=0.0434755;REFB=-0.0166253;REVB=0.0367944;RO=14;SAF=4;SAR=8;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.095208;STB=0.555461;STBP=0.62;TYPE=del;VARB=0.0190909;OID=.;OPOS=118406329;OREF=AGTGTGGA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.461538:12:26:12:26:14:4:8:6:8:99:14:4:8:6:8
chr11	118430519	.	C	T	175.08	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0490704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8921;QD=20.0094;RBI=0.0659197;REFB=8.46116e-05;REVB=-0.0440171;RO=16;SAF=7;SAR=11;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196754;STB=0.624468;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.00327785;OID=.;OPOS=118430519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:17:18:18:0.514286:11:7:10:6:11:7:11:6
chr11	118471423	.	T	C	1158.43	PASS	AF=0.734375;AO=94;DP=128;FAO=94;FDP=128;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=69;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0255554;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9677;QD=36.2009;RBI=0.0354004;REFB=0.00624602;REVB=0.0244971;RO=34;SAF=25;SAR=69;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536994;STB=0.528784;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.00262453;OID=.;OPOS=118471423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:34:34:94:94:0.734375:69:25:12:22:69:25:12:22
chr11	118472354	.	C	A	255.83	PASS	AF=0.317757;AO=34;DP=107;FAO=34;FDP=107;FR=.;FRO=73;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=0.0248375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0451;QD=9.56375;RBI=0.0382331;REFB=-0.0275122;REVB=0.0290667;RO=73;SAF=17;SAR=17;SRF=45;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136642;STB=0.579394;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0584273;OID=.;OPOS=118472354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:73:73:34:34:0.317757:17:17:45:28:17:17:45:28
chr11	118505676	.	GTA	GA,GAG,GGA	1610.98	PASS	AF=0.938053,0.0265487,0.0353982;AO=100,5,7;DP=112;FAO=106,3,4;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=56,2,4;FSAR=50,1,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257966,0.0186007,0.0245126;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,2,1;MLLD=89.9801,72.9707,72.7318;QD=57.0257;RBI=0.0946027,0.0790351,0.0899669;REFB=0,0,0;REVB=-0.0910176,-0.0768151,-0.0865632;RO=0;SAF=52,4,5;SAR=48,1,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-4.19274e-08,0,3.27427e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,snp;VARB=-0.000796565,-0.0307377,0.0213409;OID=.,.,.;OPOS=118505677,118505677,118505677;OREF=T,TA,T;OALT=-,AG,G;OMAPALT=GA,GAG,GGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.938053,0.0265487,0.0353982:100,5,7:112:106,3,4:113:0:56,2,4:50,1,0:0:0:8:0:52,4,5:48,1,2:0:0
chr11	118509668	.	A	G	937.54	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0360774;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.682;QD=58.5964;RBI=0.0367114;REFB=0;REVB=-0.00679332;RO=0;SAF=47;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000221306;OID=.;OPOS=118509668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:17:47:0:0:17:47:0:0
chr11	118509676	.	G	A	200.88	PASS	AF=0.367647;AO=25;DP=68;FAO=25;FDP=68;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0212038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.365;QD=11.8165;RBI=0.0239589;REFB=-0.0204843;REVB=-0.0111548;RO=42;SAF=21;SAR=4;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297493;STB=0.670431;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0315734;OID=.;OPOS=118509676;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:42:43:25:25:0.367647:4:21:27:15:4:21:28:15
chr11	118512363	.	G	A	396.18	PASS	AF=0.597015;AO=38;DP=67;FAO=40;FDP=67;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0129082;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=83.6904;QD=23.6523;RBI=0.0210592;REFB=-0.0498935;REVB=-0.0166394;RO=18;SAF=17;SAR=21;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00174733;STB=0.552941;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0318247;OID=.;OPOS=118512363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:18:27:38:40:0.597015:21:17:8:10:23:17:15:12
chr11	118516453	.	C	T	323.39	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=10;FWDB=0.0633065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.722;QD=17.2472;RBI=0.0633165;REFB=-0.0213686;REVB=0.00112503;RO=40;SAF=14;SAR=21;SRF=30;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324213;STB=0.680316;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0113886;OID=.;OPOS=118516453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:40:35:35:0.466667:21:14:30:10:21:14:30:10
chr11	118518751	.	G	A	294.21	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0176185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.388;QD=17.5648;RBI=0.0205003;REFB=-0.0333987;REVB=0.0104809;RO=35;SAF=19;SAR=13;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154431;STB=0.586475;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0408242;OID=.;OPOS=118518751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:13:19:15:20:13:19:15:20
chr11	118529017	.	T	G	137.48	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00159895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.035;QD=39.2803;RBI=0.00881422;REFB=0.0426922;REVB=0.00866798;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571311;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=-0.0066558;OID=.;OPOS=118529017;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:14:0:1:13:13:0.928571:3:10:0:0:3:10:0:1
chr11	118529044	.	C	CG	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162999;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=260.845;QD=46.848;RBI=0.0213641;REFB=0;REVB=0.0138108;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000101844;OID=.;OPOS=118529045;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:15:15:15:15:0:10:5:0:0:4:0:10:5:0:0
chr11	118529069	.	G	C	239.43	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0456166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7643;QD=50.4061;RBI=0.0878836;REFB=0;REVB=0.0751176;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000938357;OID=.;OPOS=118529069;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr11	118529078	.	GC	CC,CT	46.15	PASS	AF=0.368421,0;AO=7,12;DP=19;FAO=7,0;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=5,0;FSAR=2,0;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.089524,-0.00462005;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=47.7401,131.77;QD=9.71637;RBI=0.166725,0.0208076;REFB=-0.0204702,0.0152792;REVB=0.140651,0.0202882;RO=0;SAF=5,6;SAR=2,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.27427e-08,0;STB=0.644727,0.5;STBP=0.414,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0371444,0;OID=.,.;OPOS=118529078,118529078;OREF=G,GC;OALT=C,CT;OMAPALT=CC,CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:0:12:7,12:7,0:0.368421,0:2,6:5,6:0:0:2,0:5,0:6:6
chr11	118529703	.	G	A	94.24	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.0295685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.805;QD=10.4711;RBI=0.038095;REFB=0.00505868;REVB=-0.0240194;RO=24;SAF=5;SAR=7;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0974616;STB=0.558158;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=-0.0150317;OID=.;OPOS=118529703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:24:24:12:12:0.333333:7:5:8:16:7:5:8:16
chr11	118532376	.	A	G	76.14	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=2;FWDB=0.00681252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.968;QD=12.1819;RBI=0.158733;REFB=-0.0288926;REVB=-0.158587;RO=15;SAF=9;SAR=1;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0846473;STB=0.55091;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0378365;OID=.;OPOS=118532376;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:1:9:13:2:1:9:13:2
chr11	118620858	.	AAAAAT	AA,A	169.77	PASS	AF=0.76,0;AO=13,6;DP=25;FAO=19,0;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=9,0;FSAR=10,0;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0151728,0.0133584;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=4,5;MLLD=383.052,368.59;QD=27.1626;RBI=0.0200885,0.0174754;REFB=-0.00937446,-0.00941624;REVB=0.0131655,0.011267;RO=3;SAF=7,2;SAR=6,4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0436406,-0.194334;STB=0.54617,0.5;STBP=0.433,1;TYPE=del,del;VARB=0.0030615,0;OID=.,.;OPOS=118620860,118620859;OREF=AAAT,AAAAT;OALT=-,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.76,0:13,6:25:19,0:25:6:9,0:10,0:4:2:30:3:7,2:6,4:2:1
chr11	118621777	.	G	A	35.21	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.0838181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.073;QD=5.21627;RBI=0.0838282;REFB=-2.28276e-05;REVB=0.00130406;RO=21;SAF=1;SAR=5;SRF=3;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529649;STB=0.534773;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=-0.000301492;OID=.;OPOS=118621777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:5:1:3:18:5:1:3:18
chr11	118621825	.	G	GT,T	898.54	PASS	AF=1,0;AO=58,5;DP=65;FAO=66,0;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=40,0;FSAR=26,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0242171,-0.0153315;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=22.3803,77.624;QD=54.4572;RBI=0.142106,0.0318836;REFB=0,0;REVB=0.140027,-0.0279555;RO=2;SAF=36,3;SAR=22,2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00803624,0.0491618;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00224551,0;OID=.,.;OPOS=118621826,118621825;OREF=-,G;OALT=T,T;OMAPALT=GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:2:0:58,5:66,0:1,0:22,2:36,3:1:1:26,0:40,0:0:0
chr11	118622744	.	G	A	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00425194;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5603;QD=59.017;RBI=0.0146698;REFB=0;REVB=-0.0140401;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000311349;OID=.;OPOS=118622744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr11	118744701	.	A	AAAAG,AAAG	116.45	PASS	AF=1,0;AO=8,3;DP=11;FAO=11,0;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=4,3;MLLD=163.608,145.44;QD=42.3464;RBI=0.0948625,0.0725197;REFB=0,0;REVB=0.0948625,0.0725197;RO=0;SAF=0,0;SAR=8,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.00128492,0;OID=.,.;OPOS=118744702,118744702;OREF=-,-;OALT=AAAG,AAG;OMAPALT=AAAAG,AAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:8,3:11:11,0:11:0:0,0:11,0:0:0:4:0:0,0:8,3:0:0
chr11	118757191	.	G	A	109.05	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00381016;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=218.751;QD=36.3484;RBI=0.019562;REFB=-0.0421066;REVB=0.0191873;RO=1;SAF=10;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292301;STB=0.666293;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.000496475;OID=.;OPOS=118757191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:1:10:0:1:1:10:0:1
chr11	118757201	.	C	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00498783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.161;QD=40.7624;RBI=0.0548341;REFB=0;REVB=0.0546068;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328271;OID=.;OPOS=118757201;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr11	118757219	.	C	G	48.85	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2475;QD=13.9572;RBI=0.0876326;REFB=-0.0139967;REVB=-0.0870252;RO=7;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358511;STB=0.713673;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0107921;OID=.;OPOS=118757219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:2:5:2:5:2:5:2:5
chr11	118898435	.	AC	A	557.79	PASS	AF=0.928571;AO=51;DP=57;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.002569;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.9044;QD=39.8423;RBI=0.0918424;REFB=-0.0963522;REVB=0.0918065;RO=5;SAF=24;SAR=27;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456466;STB=0.53447;STBP=0.074;TYPE=del;VARB=0.0135898;OID=.;OPOS=118898436;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.928571:51:57:52:56:4:25:27:0:4:6:5:24:27:1:4
chr11	118919206	.	T	C	740.25	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.089;QD=56.9424;RBI=0.0151037;REFB=0;REVB=-0.00640629;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68967e-05;OID=.;OPOS=118919206;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0
chr11	118925341	.	G	A	161.43	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0217739;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.08;QD=17.9371;RBI=0.0225914;REFB=0.00206286;REVB=-0.00602259;RO=18;SAF=12;SAR=5;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978135;STB=0.545399;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=-0.00243699;OID=.;OPOS=118925341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:18:19:17:17:0.472222:5:12:11:7:5:12:12:7
chr11	118940957	.	C	G	126.19	PASS	AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0157592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.7;QD=10.9728;RBI=0.0167421;REFB=-0.0112653;REVB=0.00565183;RO=31;SAF=6;SAR=9;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226489;STB=0.513495;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0221402;OID=.;OPOS=118940957;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:9:6:13:18:9:6:13:18
chr11	118947634	.	C	T	316.27	PASS	AF=0.675;AO=27;DP=40;FAO=27;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0310998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2451;QD=31.6265;RBI=0.0371911;REFB=-0.0526359;REVB=-0.0203955;RO=13;SAF=15;SAR=12;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101321;STB=0.555514;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0150012;OID=.;OPOS=118947634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:13:13:27:27:0.675:12:15:5:8:12:15:5:8
chr11	118949331	.	C	T	153.97	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=-0.0126259;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0976;QD=13.3887;RBI=0.019874;REFB=0.00044545;REVB=-0.015348;RO=29;SAF=8;SAR=9;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272414;STB=0.657261;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.0007239;OID=.;OPOS=118949331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:29:29:17:17:0.369565:9:8:21:8:9:8:21:8
chr11	118952173	.	A	G	63.98	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0192096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9716;QD=9.47819;RBI=0.019439;REFB=-0.00527055;REVB=0.00297761;RO=18;SAF=6;SAR=3;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705676;STB=0.542765;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0159186;OID=.;OPOS=118952173;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:27:27:18:18:9:9:0.333333:3:6:13:5:3:6:13:5
chr11	118967758	.	T	C,G	742.58	PASS	AF=0.962264,0.0377358;AO=51,2;DP=53;FAO=51,2;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=36,1;FSAR=15,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114434,0.0022661;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=194.07,117.653;QD=56.0438;RBI=0.0129144,0.0144096;REFB=0,0;REVB=0.00598582,0.0142303;RO=0;SAF=36,1;SAR=15,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.746e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00159114,-0.0376977;OID=.,.;OPOS=118967758,118967758;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:53:53:0:0:51,2:51,2:0.962264,0.0377358:15,1:36,1:0:0:15,1:36,1:0:0
chr11	118969141	.	TGA	ATG,TG	33.77	PASS	AF=0.0190476,0.190476;AO=4,31;DP=106;FAO=2,20;FDP=105;FR=.;FRO=83;FSAF=2,11;FSAR=0,9;FSRF=49;FSRR=34;FWDB=-0.0174334,-0.0656412;FXX=0.00943307;HRUN=1,8;LEN=3,1;MLLD=143.904,6.57583;QD=1.28647;RBI=0.0180119,0.18748;REFB=-0.0126814,-0.16142;REVB=0.00452835,0.175613;RO=61;SAF=4,21;SAR=0,10;SRF=31;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.49704,0.201799;STB=0.994065,0.533037;STBP=0.21,0.763;TYPE=mnp,del;VARB=0.0824113,0.153344;OID=.,.;OPOS=118969141,118969143;OREF=TGA,A;OALT=ATG,-;OMAPALT=ATG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:31:106:105:61:83:4,31:2,20:0.0190476,0.190476:0,10:4,21:31:30:0,9:2,11:49:34
chr11	118984422	.	C	T	210.19	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0115211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.607;QD=15.5694;RBI=0.0349688;REFB=-0.0341253;REVB=0.0330164;RO=29;SAF=9;SAR=15;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680509;STB=0.524979;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0378383;OID=.;OPOS=118984422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:30:24:24:0.444444:15:9:9:20:15:9:10:20
chr11	119005088	.	C	T	517.45	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00212087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.186;QD=59.1369;RBI=0.0526864;REFB=0;REVB=0.0526437;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00230237;OID=.;OPOS=119005088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:35:0:0:33:35:1:22:11:0:0:24:11:0:0
chr11	119005132	.	C	T	203.14	PASS	AF=0.863636;AO=17;DP=20;FAO=19;FDP=22;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.15528;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=147.642;QD=36.935;RBI=0.155644;REFB=-0.0775817;REVB=-0.0106474;RO=3;SAF=3;SAR=14;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196077;STB=0.610556;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0327088;OID=.;OPOS=119005132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:20:22:3:3:17:19:0.863636:14:3:2:1:16:3:2:1
chr11	119031841	.	G	GC	172.67	PASS	AF=1;AO=14;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117237;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.5223;QD=36.3507;RBI=0.155026;REFB=0;REVB=-0.101431;RO=5;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141904;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00342456;OID=.;OPOS=119031842;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:14:20:19:19:0:10:9:0:0:3:5:7:7:4:1
chr11	119043656	.	C	T	1409.82	PASS	AF=0.94898;AO=93;DP=98;FAO=93;FDP=98;FR=.;FRO=5;FSAF=60;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0120842;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.202;QD=57.5436;RBI=0.0131882;REFB=-0.124967;REVB=0.005282;RO=5;SAF=60;SAR=33;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0462513;STB=0.524445;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.000811763;OID=.;OPOS=119043656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:98:98:5:5:93:93:0.94898:33:60:1:4:33:60:1:4
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chr11	119059404	.	G	A	623.62	PASS	AF=0.918367;AO=34;DP=49;FAO=45;FDP=49;FR=.;FRO=4;FSAF=40;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0526453;FXX=0.019996;HRUN=4;LEN=1;MLLD=104.006;QD=50.9075;RBI=0.0529325;REFB=-0.125683;REVB=-0.00550661;RO=0;SAF=29;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523799;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.00695241;OID=.;OPOS=119059404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:49:0:4:34:45:0.918367:5:29:0:0:5:40:4:0
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chr11	119063908	.	C	T	172.14	PASS	AF=0.653846;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=0.00490063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.245;QD=26.4828;RBI=0.0109021;REFB=-0.0176198;REVB=-0.00973856;RO=8;SAF=11;SAR=6;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230969;STB=0.646886;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00794551;OID=.;OPOS=119063908;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:8:9:17:17:0.653846:6:11:2:6:6:11:2:7
chr11	119065709	.	G	C	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0670905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.4057;QD=58.5844;RBI=0.0692456;REFB=0;REVB=0.0171414;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106675;OID=.;OPOS=119065709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr11	119177651	.	GAAAAAAA	GAAAAAA,GAAAAA,GAAAAAAC	330.95	PASS	AF=0.0930233,0.44186,0.465116;AO=7,7,13;DP=45;FAO=4,19,20;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=1,8,16;FSAR=3,11,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237687,-0.00308375,-0.0138249;FXX=0.0444346;HRUN=13,13,13;LEN=1,2,1;MLLD=2.70445,5.73665,256.083;QD=30.7863;RBI=0.0645992,0.0379841,0.0139173;REFB=0.226276,0.157938,0.0314857;REVB=0.0600675,0.0378587,-0.0016006;RO=2;SAF=4,3,10;SAR=3,4,3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.216951,0.174483,0.223563;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.15236,0.162833,0.00346453;OID=.,.,.;OPOS=119177652,119177652,119177658;OREF=A,AA,A;OALT=-,-,C;OMAPALT=GAAAAAA,GAAAAA,GAAAAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0.0930233,0.44186,0.465116:7,7,13:45:4,19,20:43:0:1,8,16:3,11,4:0:0:81:2:4,3,10:3,4,3:0:2
chr11	119206779	.	G	C	313.16	PASS	AF=0.608696;AO=26;DP=43;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0216501;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=115.347;QD=27.2313;RBI=0.0850262;REFB=-0.030144;REVB=0.0822236;RO=17;SAF=9;SAR=17;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0906;STB=0.519842;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0157936;OID=.;OPOS=119206779;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:46:17:18:26:28:0.608696:17:9:4:13:19:9:5:13
chr11	119207227	.	A	G	205.08	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.0239327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.0525;QD=16.4063;RBI=0.0425378;REFB=-0.0156537;REVB=-0.0351666;RO=28;SAF=19;SAR=2;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.431607;STB=0.769147;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0225162;OID=.;OPOS=119207227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:29:21:21:0.42:2:19:18:10:2:19:18:11
chr11	119216231	.	A	G	250.21	PASS	AF=0.605263;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0157322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.923;QD=26.3378;RBI=0.0369043;REFB=-0.010512;REVB=-0.033383;RO=14;SAF=17;SAR=6;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137039;STB=0.566606;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0118722;OID=.;OPOS=119216231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:14:15:23:23:0.605263:6:17:8:6:6:17:9:6
chr11	119229964	.	G	A	559.79	PASS	AF=0.457364;AO=59;DP=129;FAO=59;FDP=129;FR=.;FRO=70;FSAF=37;FSAR=22;FSRF=44;FSRR=26;FWDB=-0.015639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.035;QD=17.3579;RBI=0.0180531;REFB=-0.0193386;REVB=-0.00901865;RO=70;SAF=37;SAR=22;SRF=44;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00151489;STB=0.500843;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.0243524;OID=.;OPOS=119229964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:70:70:59:59:0.457364:22:37:44:26:22:37:44:26
chr11	119243612	.	T	C	269.32	PASS	AF=0.407895;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=76;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0138857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.9201;QD=14.1746;RBI=0.0752344;REFB=-0.0285756;REVB=-0.0739419;RO=45;SAF=10;SAR=21;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332388;STB=0.688693;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.033555;OID=.;OPOS=119243612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:45:45:31:31:0.407895:21:10:29:16:21:10:29:16
chr11	119244095	.	C	T	143.96	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00827826;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.774;QD=14.3964;RBI=0.0128582;REFB=-0.00632132;REVB=-0.00983889;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0851303;STB=0.562422;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.011335;OID=.;OPOS=119244095;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:24:16:16:0.4:7:9:10:11:7:9:11:13
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chr11	119252199	.	T	G	3166.25	PASS	AF=1;AO=202;DP=204;FAO=205;FDP=205;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252834;FXX=0.00485413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.58;QD=61.7804;RBI=0.0631317;REFB=0;REVB=0.0578477;RO=0;SAF=116;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.42268e-05;OID=.;OPOS=119252199;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:204:205:0:0:202:205:1:86:116:0:0:86:119:0:0
chr11	119290034	.	G	C	392.79	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0112545;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=292.218;QD=50.6825;RBI=0.0223871;REFB=-0.147966;REVB=-0.0193525;RO=1;SAF=27;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016949;STB=0.517845;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.000384004;OID=.;OPOS=119290034;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:31:31:1:2:29:29:0.935484:2:27:1:0:2:27:2:0
chr11	119510644	.	A	C	3834.94	PASS	AF=0.992032;AO=250;DP=251;FAO=249;FDP=251;FR=.;FRO=2;FSAF=144;FSAR=105;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0101187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3148;QD=61.1145;RBI=0.0337462;REFB=0.0067374;REVB=0.0321935;RO=1;SAF=145;SAR=105;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00327621;STB=0.503448;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.000186629;OID=.;OPOS=119510644;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:251:251:1:2:250:249:0.992032:105:145:1:0:105:144:2:0
chr11	119879425	.	T	C	708.45	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0193638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.278;QD=62.9735;RBI=0.0391658;REFB=0;REVB=0.0340442;RO=0;SAF=14;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.53702e-05;OID=.;OPOS=119879425;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:31:14:0:0:31:14:0:0
chr11	119993897	.	CCTCT	CCT,CCTC	605.04	PASS	AF=1,0;AO=31,6;DP=41;FAO=39,0;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0899184,0.0468181;FXX=0.0487686;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=261.429,242.205;QD=62.0556;RBI=0.0899291,0.0468567;REFB=0,0;REVB=0.00138701,-0.00190123;RO=0;SAF=9,6;SAR=22,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.15349e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.000153535,0;OID=.,.;OPOS=119993898,119993901;OREF=CT,T;OALT=-,-;OMAPALT=CCT,CCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:31,6:41:39,0:39:0:16,0:23,0:0:0:4:0:9,6:22,0:0:0
chr11	119999191	.	A	G	1135.21	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410129;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.106;QD=60.5443;RBI=0.0436305;REFB=0;REVB=0.0148847;RO=0;SAF=57;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016173;OID=.;OPOS=119999191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:17:57:0:0:17:58:0:0
chr11	120042082	.	G	A	63.35	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0116644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.395;QD=8.73779;RBI=0.0488086;REFB=-0.00304698;REVB=-0.0473943;RO=19;SAF=6;SAR=3;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103902;STB=0.585171;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0084424;OID=.;OPOS=120042082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:29:19:20:9:9:0.310345:3:6:11:8:3:6:11:9
chr11	120042087	.	T	C	63.39	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0896344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5031;QD=8.7435;RBI=0.098255;REFB=0.00826382;REVB=0.0402459;RO=18;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187906;STB=0.585171;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=-0.0100436;OID=.;OPOS=120042087;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:18:20:9:9:0.310345:3:6:9:9:3:6:11:9
chr11	120099658	.	A	G	409.17	PASS	AF=0.415929;AO=45;DP=111;FAO=47;FDP=113;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=41;FWDB=0.00213311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.775;QD=14.4839;RBI=0.0767396;REFB=-0.0120515;REVB=-0.0767099;RO=66;SAF=22;SAR=23;SRF=25;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116514;STB=0.576761;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0136533;OID=.;OPOS=120099658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:113:66:66:45:47:0.415929:23:22:25:41:23:24:25:41
chr11	120099679	.	G	A	469.05	PASS	AF=0.422764;AO=52;DP=125;FAO=52;FDP=123;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=43;FWDB=0.00882622;FXX=0.0159987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.647;QD=15.2537;RBI=0.00907238;REFB=-0.0217406;REVB=0.00209904;RO=71;SAF=30;SAR=22;SRF=28;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186257;STB=0.604424;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.02783;OID=.;OPOS=120099679;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:123:71:71:52:52:0.422764:22:30:28:43:22:30:28:43
chr11	120099791	.	C	T	549.57	PASS	AF=0.402685;AO=59;DP=148;FAO=60;FDP=149;FR=.;FRO=89;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=53;FSRR=36;FWDB=0.033098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.69;QD=14.7536;RBI=0.0388248;REFB=-0.0128907;REVB=0.020295;RO=89;SAF=34;SAR=25;SRF=53;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210856;STB=0.507495;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0209851;OID=.;OPOS=120099791;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:149:89:89:59:60:0.402685:25:34:53:36:25:35:53:36
chr11	120100597	.	G	A	176.81	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=-0.0148997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.549;QD=13.3444;RBI=0.0149723;REFB=0.00379156;REVB=0.00147327;RO=32;SAF=10;SAR=11;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319678;STB=0.681263;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.00177886;OID=.;OPOS=120100597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:11:10:25:7:11:10:25:7
chr11	120175749	.	A	G	1011.98	PASS	AF=1;AO=61;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00710915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5576;QD=57.8275;RBI=0.00778237;REFB=0;REVB=0.00316628;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000222408;OID=.;OPOS=120175749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:61:70:1:32:29:0:0:39:31:0:0
chr11	120198093	.	G	A	202.01	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.036535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.622;QD=21.2646;RBI=0.0698673;REFB=-0.0188327;REVB=-0.0595536;RO=18;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523046;STB=0.529383;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0271644;OID=.;OPOS=120198093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:9:11:11:7:9:11:11:7
chr11	120292570	.	T	A	935.83	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.136;QD=58.489;RBI=0.0300305;REFB=0;REVB=0.0165402;RO=0;SAF=35;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.94593e-05;OID=.;OPOS=120292570;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:64:0:0:59:64:1:24:35:0:0:25:39:0:0
chr11	120312499	.	A	G	220.78	PASS	AF=0.470588;AO=23;DP=50;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0265027;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.41;QD=17.316;RBI=0.0347753;REFB=-0.0270492;REVB=0.0225151;RO=27;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0735483;STB=0.551344;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0333379;OID=.;OPOS=120312499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:27:27:23:24:0.470588:11:12:12:15:11:13:12:15
chr11	120355230	.	A	G	449.29	PASS	AF=0.473684;AO=45;DP=95;FAO=45;FDP=95;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=0.0340776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4157;QD=18.9174;RBI=0.034912;REFB=-0.0243756;REVB=0.00758704;RO=50;SAF=27;SAR=18;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114976;STB=0.564074;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0317215;OID=.;OPOS=120355230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:50:50:45:45:0.473684:18:27:24:26:18:27:24:26
chr11	120745874	.	C	T	302.8	PASS	AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00406365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.192;QD=17.0589;RBI=0.0186976;REFB=-0.00675156;REVB=-0.0182507;RO=37;SAF=17;SAR=16;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0524917;STB=0.53621;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.00749774;OID=.;OPOS=120745874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:37:38:33:33:0.464789:16:17:17:20:16:17:17:21
chr11	120776000	.	AG	A,AA	809.87	PASS	AF=0.982759,0;AO=18,31;DP=60;FAO=57,0;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=28,0;FSAR=29,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0192376,-0.0388877;FXX=0.0645057;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=237.501,230.17;QD=55.8533;RBI=0.0531559,0.0517588;REFB=0.00884355,0.00924367;REVB=0.0495527,0.0341573;RO=0;SAF=3,24;SAR=15,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.32e-08,-3.71661e-08;STB=0.508472,0.5;STBP=0.515,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000828502,0.0776892;OID=.,.;OPOS=120776001,120776001;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.982759,0:18,31:60:57,0:58:1:28,0:29,0:0:1:4:0:3,24:15,7:0:0
chr11	120827609	.	A	G	599.27	PASS	AF=0.901961;AO=45;DP=50;FAO=46;FDP=51;FR=.;FRO=5;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0366527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.0758;QD=47.0019;RBI=0.0616254;REFB=-0.211524;REVB=-0.0495406;RO=5;SAF=25;SAR=20;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00843416;STB=0.505587;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0249285;OID=.;OPOS=120827609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:50:51:5:5:45:46:0.901961:20:25:3:2:21:25:3:2
chr11	120996292	.	A	G	494.42	PASS	AF=0.495238;AO=52;DP=105;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=24;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=13;FWDB=-0.00657842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.141;QD=18.8349;RBI=0.00933629;REFB=-0.0234747;REVB=0.006625;RO=53;SAF=24;SAR=28;SRF=40;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264471;STB=0.645481;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.02421;OID=.;OPOS=120996292;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:53:53:52:52:0.495238:28:24:40:13:28:24:40:13
chr11	120998942	.	C	T	512.4	PASS	AF=0.515789;AO=49;DP=95;FAO=49;FDP=95;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.0236649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.154;QD=21.5748;RBI=0.0251424;REFB=-0.00624512;REVB=-0.00849183;RO=46;SAF=28;SAR=21;SRF=20;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119956;STB=0.566238;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00733916;OID=.;OPOS=120998942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:46:46:49:49:0.515789:21:28:20:26:21:28:20:26
chr11	121000784	.	T	C	210.73	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0283419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.9974;QD=19.1571;RBI=0.0834507;REFB=-0.0208521;REVB=-0.0784905;RO=22;SAF=10;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103559;STB=0.546392;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0254797;OID=.;OPOS=121000784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:22:23:21:21:0.477273:11:10:13:9:11:10:13:10
chr11	121032978	.	G	A	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.325;QD=57.6807;RBI=0.0182391;REFB=0;REVB=0.00184388;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20701e-05;OID=.;OPOS=121032978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:15:16:0:0:15:16:0:0
chr11	121367626	.	T	C	371.21	PASS	AF=0.438202;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.0207939;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.608;QD=16.6835;RBI=0.0515165;REFB=-0.0115992;REVB=-0.0471334;RO=50;SAF=25;SAR=14;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022644;STB=0.512734;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0224807;OID=.;OPOS=121367626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:50:50:39:39:0.438202:14:25:31:19:14:25:31:19
chr11	121403229	.	T	C	1472.44	PASS	AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.032815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.115;QD=58.3144;RBI=0.0341458;REFB=-0.0777395;REVB=-0.0094399;RO=1;SAF=58;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00810947;STB=0.504273;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.000413322;OID=.;OPOS=121403229;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:101:101:1:1:100:100:0.990099:42:58:1:0:42:58:1:0
chr11	121437819	.	C	G	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0410339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.985;QD=57.0007;RBI=0.0414184;REFB=0;REVB=0.00563098;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.07108e-05;OID=.;OPOS=121437819;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:27:27:0:0:27:27:0:0
chr11	121448090	.	T	G	224.92	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0277533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.832;QD=19.9928;RBI=0.0307722;REFB=0.00238075;REVB=-0.0132922;RO=23;SAF=15;SAR=7;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615051;STB=0.534576;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=-0.0047227;OID=.;OPOS=121448090;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:7:15:17:6:7:15:17:6
chr11	121461593	.	G	C	226.57	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0695961;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.037;QD=18.1257;RBI=0.0976698;REFB=0.00475454;REVB=0.0685256;RO=26;SAF=15;SAR=9;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221646;STB=0.605971;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.00556964;OID=.;OPOS=121461593;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:26:26:24:24:0.48:9:15:10:16:9:15:11:15
chr11	121475922	.	T	A	228.34	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.013951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.388;QD=21.7465;RBI=0.0211041;REFB=-0.00603973;REVB=-0.0158352;RO=20;SAF=13;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161935;STB=0.590826;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0049996;OID=.;OPOS=121475922;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:9:13:8:12:9:13:8:12
chr11	121491782	.	G	A	1264.54	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151061;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1019;QD=61.6848;RBI=0.0154339;REFB=0;REVB=0.00316383;RO=0;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.34795e-05;OID=.;OPOS=121491782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:81:82:1:38:43:0:0:39:43:0:0
chr11	122022927	.	C	T	294.21	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=-0.00852362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.307;QD=17.5646;RBI=0.0175302;REFB=-0.0306662;REVB=0.0153185;RO=35;SAF=20;SAR=12;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0914262;STB=0.55099;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0212396;OID=.;OPOS=122022927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:12:20:25:10:12:20:25:10
chr11	122322268	.	A	C	490.45	PASS	AF=0.534091;AO=47;DP=88;FAO=47;FDP=88;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=0.0444009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.123;QD=22.2933;RBI=0.051703;REFB=-0.00937982;REVB=-0.0264908;RO=41;SAF=21;SAR=26;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348995;STB=0.519232;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0083583;OID=.;OPOS=122322268;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:41:41:47:47:0.534091:26:21:20:21:26:21:20:21
chr11	122430682	.	C	A	346.09	PASS	AF=0.5;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=72;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=0.00172352;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.936;QD=19.227;RBI=0.0111751;REFB=-0.0135407;REVB=0.0110414;RO=37;SAF=25;SAR=11;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690067;STB=0.551013;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0107712;OID=.;OPOS=122430682;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:37:36:36:36:0.5:11:25:28:9:11:25:28:8
chr11	122665437	.	A	G	201.55	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=6;FWDB=-0.0320947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.947;QD=13.8997;RBI=0.0384785;REFB=-0.010578;REVB=0.0212256;RO=34;SAF=7;SAR=17;SRF=28;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.509733;STB=0.786826;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0174478;OID=.;OPOS=122665437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:34:24:24:0.413793:17:7:28:6:17:7:28:6
chr11	122681254	.	T	C	45.74	PASS	AF=0.35;AO=6;DP=19;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0466303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.846;QD=9.14828;RBI=0.0501702;REFB=-0.0173293;REVB=0.018511;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125021;STB=0.619384;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0227594;OID=.;OPOS=122681254;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:19:20:13:13:6:7:0.35:3:3:8:5:4:3:8:5
chr11	122684355	.	G	C	117.03	PASS	AF=0.590909;AO=11;DP=20;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0378355;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.5727;QD=21.2787;RBI=0.16568;REFB=-0.0144036;REVB=0.161302;RO=9;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15431;STB=0.525508;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0221502;OID=.;OPOS=122684355;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:20:22:9:9:11:13:0.590909:3:8:5:4:5:8:5:4
chr11	122738261	.	A	G	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345358;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.558;QD=60.6103;RBI=0.0383799;REFB=0;REVB=0.016742;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.92196e-05;OID=.;OPOS=122738261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
chr11	122742427	.	A	AG	175.01	PASS	AF=1;AO=2;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250672;FXX=0.062461;HRUN=0;LEN=1;MLLD=100.126;QD=46.6689;RBI=0.0332243;REFB=0;REVB=0.0218058;RO=13;SAF=1;SAR=1;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390695;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000587706;OID=.;OPOS=122742428;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:16:15:15:0:8:7:0:0:4:13:1:1:6:7
chr11	122742428	.	T	G	144.02	PASS	AF=0.875;AO=13;DP=15;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00766303;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=118.44;QD=36.006;RBI=0.032589;REFB=-0.111596;REVB=0.0316752;RO=2;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00929408;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00500745;OID=.;OPOS=122742428;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:15:16:2:2:13:14:0.875:7:6:1:1:7:7:1:1
chr11	122929624	.	A	G	413.71	PASS	AF=0.427273;AO=47;DP=110;FAO=47;FDP=110;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=0.0151484;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=260.723;QD=15.044;RBI=0.0161693;REFB=-0.0047286;REVB=0.00565454;RO=63;SAF=26;SAR=21;SRF=35;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0024383;STB=0.501369;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.00646189;OID=.;OPOS=122929624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:63:63:47:47:0.427273:21:26:35:28:21:26:35:28
chr11	123598941	.	T	C	521.94	PASS	AF=0.422222;AO=57;DP=135;FAO=57;FDP=135;FR=.;FRO=78;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.000736543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.366;QD=15.4649;RBI=0.00487313;REFB=-0.0116383;REVB=-0.00481714;RO=78;SAF=35;SAR=22;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158783;STB=0.589132;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.0125491;OID=.;OPOS=123598941;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:78:78:57:57:0.422222:22:35:36:42:22:35:36:42
chr11	123600475	.	A	G	282.68	PASS	AF=0.327434;AO=37;DP=113;FAO=37;FDP=113;FR=.;FRO=76;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=0.00912381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2774;QD=10.0065;RBI=0.0269687;REFB=-0.00739874;REVB=0.0253784;RO=76;SAF=14;SAR=23;SRF=41;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187739;STB=0.608992;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0150491;OID=.;OPOS=123600475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:76:76:37:37:0.327434:23:14:41:35:23:14:41:35
chr11	123676413	.	G	A	169.13	PASS	AF=0.375;AO=21;DP=56;FAO=21;FDP=56;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0258966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8249;QD=12.0807;RBI=0.0310074;REFB=-0.0404184;REVB=-0.0170535;RO=35;SAF=11;SAR=10;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206123;STB=0.511934;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0510593;OID=.;OPOS=123676413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:35:35:21:21:0.375:10:11:19:16:10:11:19:16
chr11	123753937	.	A	G	1498.9	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00198867;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.363;QD=59.9562;RBI=0.0276751;REFB=0;REVB=0.0276035;RO=0;SAF=53;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7534e-05;OID=.;OPOS=123753937;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:99:100:1:46:53:0:0:47:53:0:0
chr11	123754844	.	T	C	905.94	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0394253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.527;QD=56.621;RBI=0.0616385;REFB=-0.0548049;REVB=0.0473809;RO=1;SAF=36;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129378;STB=0.506847;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00050314;OID=.;OPOS=123754844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:27:36:1:0:27:36:1:0
chr11	123777433	.	A	AT	34.61	PASS	AF=0.344828;AO=11;DP=30;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.100284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=11.9955;QD=4.77422;RBI=0.136028;REFB=-0.0540481;REVB=0.0919064;RO=17;SAF=10;SAR=1;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.633766;STB=0.863181;STBP=0.013;TYPE=ins;VARB=0.0471957;OID=.;OPOS=123777434;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.344828:11:30:10:29:19:9:1:8:11:34:17:10:1:6:11
chr11	123777497	.	G	A	453.97	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.059218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.089;QD=55.0263;RBI=0.0629128;REFB=-0.0875907;REVB=-0.0212424;RO=1;SAF=17;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266731;STB=0.514277;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00135109;OID=.;OPOS=123777497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:15:17:1:0:15:17:1:0
chr11	123777536	.	G	A	742.99	PASS	AF=0.981818;AO=52;DP=53;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0834965;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.3856;QD=54.0356;RBI=0.0850491;REFB=-0.0193094;REVB=0.0161768;RO=1;SAF=31;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0149535;STB=0.50746;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0018336;OID=.;OPOS=123777536;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:55:1:1:52:54:0.981818:21:31:1:0:21:33:1:0
chr11	123777986	.	T	C	707.45	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.927;QD=62.8843;RBI=0.0610527;REFB=0;REVB=0.0281355;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016118;OID=.;OPOS=123777986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:26:18:0:0:27:18:0:0
chr11	123778030	.	AG	A,AA	458.24	PASS	AF=0.03125,0.96875;AO=5,27;DP=32;FAO=1,31;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=0,9;FSAR=1,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00989092,0.00989111;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=283.525,295.247;QD=57.2794;RBI=0.0447516,0.0390975;REFB=0,0;REVB=0.0436449,0.0378256;RO=0;SAF=2,7;SAR=3,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.41836e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0106871,0.00294716;OID=.,.;OPOS=123778031,123778031;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.03125,0.96875:5,27:32:1,31:32:0:0,9:1,22:0:0:5:0:2,7:3,20:0:0
chr11	123778173	.	T	G	128.95	PASS	AF=1;AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.181902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=37.7684;QD=42.9815;RBI=0.186055;REFB=0;REVB=-0.0390895;RO=0;SAF=2;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0082353;OID=.;OPOS=123778173;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:12:0:0:12:12:1:10:2:0:0:10:2:0:0
chr11	123811013	.	G	A	167.32	PASS	AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.00149227;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.651;QD=11.742;RBI=0.0063562;REFB=-0.0234061;REVB=-0.00617854;RO=36;SAF=12;SAR=9;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1738;STB=0.599911;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0411263;OID=.;OPOS=123811013;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:36:36:21:21:0.368421:9:12:26:10:9:12:26:10
chr11	123811342	.	C	CT	109.31	PASS	AF=1;AO=2;DP=19;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.124614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=7.65873;QD=25.7198;RBI=0.124639;REFB=0;REVB=0.00252798;RO=17;SAF=0;SAR=2;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.540081;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00104117;OID=.;OPOS=123811343;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:19:17:17:0:7:10:0:0:3:17:0:2:9:8
chr11	123811344	.	C	T	193.23	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0943157;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.8937;QD=48.3075;RBI=0.0949244;REFB=0;REVB=0.0107333;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000953892;OID=.;OPOS=123811344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr11	123813795	.	T	C	368.85	PASS	AF=0.648148;AO=34;DP=52;FAO=35;FDP=54;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00958879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.178;QD=27.3225;RBI=0.010257;REFB=-0.0488543;REVB=0.00364151;RO=18;SAF=9;SAR=25;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209842;STB=0.610563;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0320106;OID=.;OPOS=123813795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:54:18:19:34:35:0.648148:25:9:10:8:26:9:10:9
chr11	123814261	.	G	A	321.26	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0258149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.951;QD=18.8973;RBI=0.0522641;REFB=-0.00351176;REVB=0.0454437;RO=33;SAF=25;SAR=9;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192655;STB=0.617515;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00249731;OID=.;OPOS=123814261;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:33:34:34:34:0.5:9:25:18:15:9:25:18:16
chr11	123814356	.	G	A	257.49	PASS	AF=0.405405;AO=30;DP=74;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.0121388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8213;QD=13.9181;RBI=0.0176238;REFB=-0.0121844;REVB=0.0127768;RO=42;SAF=14;SAR=16;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107284;STB=0.546731;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.0146154;OID=.;OPOS=123814356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:42:44:30:30:0.405405:16:14:24:18:16:14:24:20
chr11	123814478	.	A	G	198.7	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0324554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.515;QD=19.3849;RBI=0.0343327;REFB=-0.0242936;REVB=0.0111974;RO=21;SAF=11;SAR=9;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196241;STB=0.5111;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0357971;OID=.;OPOS=123814478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:9:11:12:9:9:11:12:9
chr11	123847473	.	A	G	222.21	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.0405099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.328;QD=14.5708;RBI=0.0405104;REFB=-0.0206664;REVB=-0.000195041;RO=34;SAF=9;SAR=17;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323936;STB=0.675644;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0117427;OID=.;OPOS=123847473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:35:26:26:0.42623:17:9:23:11:17:9:23:12
chr11	123848121	.	T	C	104.6	PASS	AF=0.571429;AO=12;DP=21;FAO=12;FDP=21;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0414285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6768;QD=19.9235;RBI=0.0453597;REFB=0.0230418;REVB=0.0184712;RO=9;SAF=10;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189337;STB=0.609552;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=-0.0388362;OID=.;OPOS=123848121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:9:9:12:12:0.571429:2:10:6:3:2:10:6:3
chr11	123848212	.	C	T	204.52	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00421026;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.606;QD=22.7239;RBI=0.0555339;REFB=-0.0282076;REVB=-0.0553741;RO=16;SAF=11;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398524;STB=0.522324;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0176098;OID=.;OPOS=123848212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:9:11:8:8:9:11:8:8
chr11	123886307	.	CA	CG,TG	1701.3	PASS	AF=0.422414,0.577586;AO=48,67;DP=117;FAO=49,67;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=17,29;FSAR=32,38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458964,0.0267114;FXX=0.0169477;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=67.8559,82.2869;QD=58.6655;RBI=0.0665668,0.0654391;REFB=0,0;REVB=0.0482147,0.0597392;RO=0;SAF=17,29;SAR=31,38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00871863,-0.00167235;OID=.,.;OPOS=123886308,123886307;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:117:116:0:0:48,67:49,67:0.422414,0.577586:31,38:17,29:0:0:32,38:17,29:0:0
chr11	123886466	.	C	T	104.62	PASS	AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0640835;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.632;QD=9.7319;RBI=0.0649749;REFB=0.00875095;REVB=-0.0107258;RO=30;SAF=5;SAR=8;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186056;STB=0.511261;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=-0.0200211;OID=.;OPOS=123886466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:8:5:12:18:8:5:12:18
chr11	123886681	.	A	G	998.35	PASS	AF=0.945946;AO=70;DP=74;FAO=70;FDP=74;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0227746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.7366;QD=53.9646;RBI=0.0313006;REFB=-0.0173845;REVB=0.0214719;RO=3;SAF=29;SAR=41;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00648169;STB=0.509175;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.000549957;OID=.;OPOS=123886681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:74:74:3:4:70:70:0.945946:41:29:1:2:41:29:1:3
chr11	123886717	.	G	A	65.89	PASS	AF=0.169014;AO=12;DP=71;FAO=12;FDP=71;FR=.;FRO=59;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=37;FWDB=-0.0490712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.653;QD=3.71191;RBI=0.0495372;REFB=-0.00499447;REVB=-0.00677878;RO=59;SAF=4;SAR=8;SRF=22;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537508;STB=0.536021;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0264931;OID=.;OPOS=123886717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:71:71:59:59:12:12:0.169014:8:4:22:37:8:4:22:37
chr11	123886822	.	C	T	324.29	PASS	AF=0.366972;AO=40;DP=108;FAO=40;FDP=109;FR=.;FRO=69;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=30;FWDB=-0.00873681;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.131;QD=11.9005;RBI=0.0193881;REFB=-0.0151876;REVB=-0.017308;RO=66;SAF=27;SAR=13;SRF=37;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134128;STB=0.574998;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0278587;OID=.;OPOS=123886822;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:109:66:69:40:40:0.366972:13:27:37:29:13:27:39:30
chr11	123886865	.	T	A	1970.77	PASS	AF=1;AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0378676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4726;QD=62.0714;RBI=0.058591;REFB=0;REVB=0.0447097;RO=0;SAF=87;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02135e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000372472;OID=.;OPOS=123886865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:127:0:0:127:127:1:40:87:0:0:40:87:0:0
chr11	123886984	.	A	G	1491.69	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00624593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.718;QD=63.4761;RBI=0.0495323;REFB=0;REVB=-0.049137;RO=0;SAF=58;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.15564e-05;OID=.;OPOS=123886984;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:36:58:0:0:36:58:0:0
chr11	123887164	.	A	C	556.63	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.586;QD=60.1758;RBI=0.0387042;REFB=0;REVB=0.0168497;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269533;OID=.;OPOS=123887164;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr11	123887184	.	T	G	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.591;QD=58.1414;RBI=0.0416785;REFB=0;REVB=0.00965563;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150305;OID=.;OPOS=123887184;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr11	123893745	.	C	T	575.1	PASS	AF=0.472441;AO=60;DP=127;FAO=60;FDP=127;FR=.;FRO=67;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=38;FWDB=-0.0216276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.43;QD=18.1134;RBI=0.0234229;REFB=-0.0152449;REVB=0.00899323;RO=66;SAF=36;SAR=24;SRF=29;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152601;STB=0.588578;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0194807;OID=.;OPOS=123893745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:66:67:60:60:0.472441:24:36:29:37:24:36:29:38
chr11	123893904	.	C	T	176.83	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0390951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.156;QD=21.4336;RBI=0.0417192;REFB=-0.0253862;REVB=-0.0145625;RO=15;SAF=4;SAR=14;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02641;STB=0.514835;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.00839262;OID=.;OPOS=123893904;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:14:4:3:12:14:4:3:12
chr11	123894119	.	A	G	105.86	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0518832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.206;QD=21.1726;RBI=0.0538998;REFB=-0.00675575;REVB=0.0146055;RO=8;SAF=4;SAR=8;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0677961;STB=0.538399;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.00504422;OID=.;OPOS=123894119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:8:4:2:6:8:4:2:6
chr11	123894136	.	A	G	306.67	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.135;QD=53.3331;RBI=0.0373211;REFB=0;REVB=-0.00178999;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217693;OID=.;OPOS=123894136;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:15:7:0:0:15:8:0:0
chr11	123894234	.	A	G	429.74	PASS	AF=0.494253;AO=41;DP=85;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0127551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.649;QD=19.7581;RBI=0.0128273;REFB=-0.0101061;REVB=-0.00135911;RO=44;SAF=23;SAR=18;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570567;STB=0.517677;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.010743;OID=.;OPOS=123894234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:87:44:44:41:43:0.494253:18:23:22:22:20:23:22:22
chr11	123894246	.	A	G	428.51	PASS	AF=0.477778;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=90;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=-0.0151668;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4142;QD=19.0448;RBI=0.0156556;REFB=-0.0208888;REVB=-0.00388154;RO=47;SAF=22;SAR=21;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040808;STB=0.522717;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=0.021631;OID=.;OPOS=123894246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:90:47:47:43:43:0.477778:21:22:22:25:21:22:22:25
chr11	123894317	.	G	T	464.35	PASS	AF=0.46789;AO=48;DP=106;FAO=51;FDP=109;FR=.;FRO=58;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=0.0198754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.758;QD=17.0404;RBI=0.0281595;REFB=-0.00543325;REVB=0.019948;RO=58;SAF=26;SAR=22;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577807;STB=0.524828;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00699437;OID=.;OPOS=123894317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:109:58:58:48:51:0.46789:22:26:28:30:24:27:28:30
chr11	123894329	.	C	G	458.78	PASS	AF=0.462963;AO=50;DP=108;FAO=50;FDP=108;FR=.;FRO=58;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0146897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.059;QD=16.992;RBI=0.0157737;REFB=-0.00886298;REVB=-0.00574655;RO=57;SAF=26;SAR=24;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275384;STB=0.510744;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.00870377;OID=.;OPOS=123894329;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:57:58:50:50:0.462963:24:26:28:29:24:26:29:29
chr11	123894402	.	A	G	193.41	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.013292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.759;QD=12.6829;RBI=0.094183;REFB=-0.021177;REVB=0.0932404;RO=37;SAF=12;SAR=12;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428173;STB=0.52457;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0454413;OID=.;OPOS=123894402;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:12:12:20:17:12:12:20:17
chr11	123894556	.	A	G	50.01	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0201196;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.93;QD=12.5031;RBI=0.0287219;REFB=0.00353357;REVB=-0.0204975;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118071;STB=0.571224;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=-0.00184045;OID=.;OPOS=123894556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:16:16:9:9:7:7:0.4375:3:4:4:5:3:4:4:5
chr11	123900694	.	A	G	361.04	PASS	AF=0.521127;AO=37;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.00727948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.239;QD=20.3401;RBI=0.00840674;REFB=-0.0220315;REVB=-0.00420505;RO=33;SAF=13;SAR=24;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.093197;STB=0.560353;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0195976;OID=.;OPOS=123900694;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:33:34:37:37:0.521127:24:13:15:18:24:13:16:18
chr11	123900916	.	C	T	177.76	PASS	AF=0.292683;AO=24;DP=82;FAO=24;FDP=82;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=-0.0210318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7545;QD=8.67114;RBI=0.0315023;REFB=-0.0143255;REVB=-0.0234534;RO=57;SAF=13;SAR=11;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162846;STB=0.601527;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0352036;OID=.;OPOS=123900916;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:57:58:24:24:0.292683:11:13:23:34:11:13:23:35
chr11	123909099	.	G	T	433.85	PASS	AF=0.494253;AO=43;DP=89;FAO=43;FDP=87;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0116401;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.723;QD=19.9473;RBI=0.0118886;REFB=-0.0210656;REVB=-0.00241808;RO=43;SAF=23;SAR=20;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0419761;STB=0.529146;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0153345;OID=.;OPOS=123909099;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:87:43:44:43:43:0.494253:20:23:21:22:20:23:21:23
chr11	123909627	.	T	C	289.36	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.143;QD=52.6113;RBI=0.0276871;REFB=0;REVB=0.00693637;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189615;OID=.;OPOS=123909627;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr11	123909637	.	G	T	88.14	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00275962;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=212.014;QD=14.1023;RBI=0.0337157;REFB=-0.0062311;REVB=-0.0336025;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200253;STB=0.617431;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00725853;OID=.;OPOS=123909637;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:4:7:6:8:4:7:6:8
chr11	123909695	.	G	C	632.21	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137478;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.888;QD=61.679;RBI=0.0784325;REFB=0;REVB=0.0772183;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207747;OID=.;OPOS=123909695;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0
chr11	124006972	.	G	T	214.67	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.0392801;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.238;QD=14.8047;RBI=0.0408229;REFB=-0.0123065;REVB=0.0111166;RO=31;SAF=7;SAR=18;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124132;STB=0.536394;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0183521;OID=.;OPOS=124006972;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:31:33:25:25:0.431034:18:7:9:22:18:7:11:22
chr11	124006993	.	G	A	205.31	PASS	AF=0.442308;AO=22;DP=51;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0484454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1823;QD=15.7927;RBI=0.0496811;REFB=-0.0168908;REVB=0.0110116;RO=29;SAF=6;SAR=16;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402926;STB=0.514273;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0310618;OID=.;OPOS=124006993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:29:29:22:23:0.442308:16:6:7:22:17:6:7:22
chr11	124015994	.	C	T	1172.0	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.79;QD=60.8833;RBI=0.0448146;REFB=0;REVB=-0.0215194;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.15524e-05;OID=.;OPOS=124015994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:36:41:0:0:36:41:0:0
chr11	124056377	.	T	C	1508.48	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00569962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4627;QD=63.515;RBI=0.0169216;REFB=0;REVB=-0.0159328;RO=0;SAF=49;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.22749e-05;OID=.;OPOS=124056377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:46:49:0:0:46:49:0:0
chr11	124056566	.	G	A	273.34	PASS	AF=0.52;AO=23;DP=47;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0152554;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.9518;QD=21.8673;RBI=0.0753638;REFB=-0.0422683;REVB=0.0738036;RO=24;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560942;STB=0.521722;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0362007;OID=.;OPOS=124056566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:50:24:24:23:26:0.52:12:11:10:14:14:12:10:14
chr11	124056581	.	A	G	185.62	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0137201;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.786;QD=18.1091;RBI=0.015545;REFB=-0.00409499;REVB=-0.00730791;RO=22;SAF=7;SAR=12;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00484832;STB=0.50276;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.00368091;OID=.;OPOS=124056581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:22:22:19:19:0.463415:12:7:8:14:12:7:8:14
chr11	124056731	.	AT	A,AC,AG	956.75	PASS	AF=1,0,0;AO=11,6,50;DP=71;FAO=70,0,0;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36,0,0;FSAR=34,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0421054,-0.059633,-0.0622946;FXX=0.0140825;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=47.7003,35.1679,41.7581;QD=54.6716;RBI=0.0893189,0.0610297,0.387442;REFB=0,0,0;REVB=0.0787718,0.0129821,-0.382401;RO=1;SAF=9,6,18;SAR=2,0,32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.177567,0.782178,0.014486;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0022858,0,0.00193832;OID=.,.,.;OPOS=124056732,124056732,124056732;OREF=T,T,T;OALT=-,C,G;OMAPALT=A,AC,AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0,0:11,6,50:71:70,0,0:70:0:36,0,0:34,0,0:0:0:5:1:9,6,18:2,0,32:0:1
chr11	124056787	.	G	A	861.18	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2992;QD=57.4121;RBI=0.0558803;REFB=0;REVB=-0.0429129;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000347066;OID=.;OPOS=124056787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:34:25:0:0:35:25:0:0
chr11	124095494	.	C	T	917.59	PASS	AF=0.637795;AO=81;DP=127;FAO=81;FDP=127;FR=.;FRO=46;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=-0.0164639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.905;QD=28.9003;RBI=0.0165002;REFB=-0.0165515;REVB=-0.00109486;RO=46;SAF=48;SAR=33;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011198;STB=0.506052;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0107122;OID=.;OPOS=124095494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:46:46:81:81:0.637795:33:48:28:18:33:48:28:18
chr11	124121199	.	G	C	719.36	PASS	AF=0.490066;AO=74;DP=151;FAO=74;FDP=151;FR=.;FRO=77;FSAF=46;FSAR=28;FSRF=47;FSRR=30;FWDB=-0.00828959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.945;QD=19.0559;RBI=0.0284486;REFB=-0.0103297;REVB=0.0272141;RO=77;SAF=46;SAR=28;SRF=47;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0109952;STB=0.506068;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0117059;OID=.;OPOS=124121199;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:77:77:74:74:0.490066:28:46:47:30:28:46:47:30
chr11	124134743	.	G	A	167.17	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0747627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.8576;QD=17.1459;RBI=0.161067;REFB=-0.0288871;REVB=-0.142664;RO=21;SAF=13;SAR=5;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291993;STB=0.667479;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0292678;OID=.;OPOS=124134743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:5:13:9:12:5:13:9:12
chr11	124135009	.	G	A	264.73	PASS	AF=0.450704;AO=29;DP=68;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.0326696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.747;QD=14.9145;RBI=0.032685;REFB=0.00120897;REVB=-0.00100196;RO=38;SAF=10;SAR=19;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187341;STB=0.559285;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.00451344;OID=.;OPOS=124135009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:71:38:39:29:32:0.450704:19:10:20:18:19:13:20:19
chr11	124135438	.	G	A	223.7	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.00476289;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.2785;QD=12.7826;RBI=0.044678;REFB=-0.0062026;REVB=-0.0444234;RO=42;SAF=15;SAR=12;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0844311;STB=0.541371;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0132298;OID=.;OPOS=124135438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:42:43:27:27:0.385714:12:15:20:22:12:15:21:22
chr11	124135481	.	C	T	226.91	PASS	AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0078268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3802;QD=13.752;RBI=0.0164065;REFB=-0.0183494;REVB=0.0144192;RO=39;SAF=14;SAR=13;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207083;STB=0.511802;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0385748;OID=.;OPOS=124135481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:39:39:27:27:0.409091:13:14:21:18:13:14:21:18
chr11	124179835	.	C	T	378.51	PASS	AF=0.434783;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=17;FWDB=-0.000387765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0951;QD=16.4569;RBI=0.0169688;REFB=-0.00788223;REVB=-0.0169644;RO=52;SAF=21;SAR=19;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15107;STB=0.584575;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.00618403;OID=.;OPOS=124179835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:52:52:40:40:0.434783:19:21:35:17:19:21:35:17
chr11	124180082	.	A	G	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0274647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.781;QD=13.8496;RBI=0.0344347;REFB=-0.00798922;REVB=-0.0207711;RO=25;SAF=3;SAR=13;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323763;STB=0.691746;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.013083;OID=.;OPOS=124180082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:13:3:11:14:13:3:11:14
chr11	124180282	.	A	C	418.5	PASS	AF=0.597015;AO=40;DP=69;FAO=40;FDP=67;FR=.;FRO=27;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0147152;FXX=0.0289813;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.618;QD=24.9853;RBI=0.0273914;REFB=-0.0169431;REVB=-0.0231031;RO=27;SAF=27;SAR=13;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671391;STB=0.520526;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.0106734;OID=.;OPOS=124180282;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:67:27:27:40:40:0.597015:13:27:16:11:13:27:17:10
chr11	124189306	.	G	A	346.26	PASS	AF=0.493671;AO=28;DP=79;FAO=39;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0118316;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=32.4045;QD=17.5324;RBI=0.0257767;REFB=-0.0503603;REVB=0.0229009;RO=28;SAF=12;SAR=16;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127608;STB=0.555526;STBP=0.371;TYPE=snp;VARB=0.0558261;OID=.;OPOS=124189306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:28:39:28:39:0.493671:16:12:16:12:26:13:17:22
chr11	124189729	.	C	T	54.75	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0183708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.149;QD=24.3329;RBI=0.0257946;REFB=-0.0723166;REVB=0.0181073;RO=2;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0278747;STB=0.516083;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.00531011;OID=.;OPOS=124189729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:3:4:1:1:3:4:1:1
chr11	124190137	.	A	G	188.53	PASS	AF=0.513514;AO=18;DP=36;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0121974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.286;QD=20.3813;RBI=0.023174;REFB=-0.0400601;REVB=0.0197043;RO=18;SAF=6;SAR=12;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202772;STB=0.622621;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0346717;OID=.;OPOS=124190137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:18:18:18:19:0.513514:12:6:10:8:13:6:10:8
chr11	124266912	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0769162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.194;QD=58.5867;RBI=0.0809209;REFB=0;REVB=0.0251413;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000675742;OID=.;OPOS=124266912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
chr11	124267177	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0039033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.786;QD=33.4285;RBI=0.0211367;REFB=0;REVB=0.0207732;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243347;OID=.;OPOS=124267177;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr11	124267189	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.53;QD=33.4285;RBI=0.0311153;REFB=0;REVB=0.0080511;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111836;OID=.;OPOS=124267189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr11	124293857	.	A	C	210.71	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.00450005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.565;QD=19.155;RBI=0.00512889;REFB=-0.00196304;REVB=0.00246071;RO=23;SAF=14;SAR=7;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587138;STB=0.533301;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.00142695;OID=.;OPOS=124293857;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:7:14:14:9:7:14:14:9
chr11	124294703	.	T	C	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.876;QD=53.2772;RBI=0.0397106;REFB=0;REVB=0.0345007;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151225;OID=.;OPOS=124294703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr11	124310622	.	A	G	64.87	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0110241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.728;QD=10.3792;RBI=0.0136746;REFB=-0.0114213;REVB=0.00809105;RO=16;SAF=3;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117295;STB=0.571265;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0179414;OID=.;OPOS=124310622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:6:3:7:9:6:3:7:9
chr11	124440362	.	C	G	205.21	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.013486;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.588;QD=22.8008;RBI=0.0206082;REFB=-0.0245757;REVB=-0.0155829;RO=16;SAF=15;SAR=5;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0634919;STB=0.535677;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.0176291;OID=.;OPOS=124440362;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:5:15:11:5:5:15:11:5
chr11	124440617	.	C	T	1184.18	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.274;QD=60.727;RBI=0.0153862;REFB=0;REVB=0.0112926;RO=0;SAF=33;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.80511e-06;OID=.;OPOS=124440617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:78:0:0:76:78:1:43:33:0:0:44:34:0:0
chr11	124610011	.	C	CG	41.64	PASS	AF=0.454545;AO=13;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=1;FWDB=-0.168665;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=7.07279;QD=5.04711;RBI=0.209811;REFB=-0.0789692;REVB=0.124791;RO=16;SAF=13;SAR=0;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.76255;STB=0.525391;STBP=0.819;TYPE=ins;VARB=0.0280449;OID=.;OPOS=124610012;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.454545:13:33:15:33:18:14:1:17:1:40:16:13:0:15:1
chr11	124742365	.	G	A	316.05	PASS	AF=0.421687;AO=35;DP=83;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.00686059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4244;QD=15.2315;RBI=0.065144;REFB=-0.0111035;REVB=0.0647817;RO=47;SAF=17;SAR=18;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395801;STB=0.527934;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0123061;OID=.;OPOS=124742365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:47:48:35:35:0.421687:18:17:21:26:18:17:21:27
chr11	124747837	.	G	A	294.89	PASS	AF=0.369565;AO=34;DP=91;FAO=34;FDP=92;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=37;FSRR=21;FWDB=-0.0025439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=104.002;QD=12.8212;RBI=0.0039697;REFB=-0.0010458;REVB=-0.00304748;RO=57;SAF=17;SAR=17;SRF=37;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163812;STB=0.586907;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00128702;OID=.;OPOS=124747837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:57:58:34:34:0.369565:17:17:37:20:17:17:37:21
chr11	124766128	.	A	G	2068.43	PASS	AF=1;AO=127;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=53;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.753;QD=62.6798;RBI=0.0306654;REFB=0;REVB=-0.0158792;RO=0;SAF=53;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254083;OID=.;OPOS=124766128;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:132:132:0:0:127:132:1:74:53:0:0:79:53:0:0
chr11	124767067	.	T	C	74.47	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0358396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.752;QD=22.9127;RBI=0.041934;REFB=-0.0151978;REVB=-0.0217711;RO=4;SAF=7;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187655;STB=0.608433;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0229446;OID=.;OPOS=124767067;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:2:7:2:2:2:7:2:2
chr11	124767125	.	G	A	60.45	PASS	AF=0.533333;AO=7;DP=14;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0356476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5224;QD=16.1201;RBI=0.101176;REFB=-0.0284982;REVB=0.0946876;RO=7;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334793;STB=0.599733;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.029642;OID=.;OPOS=124767125;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:14:15:7:7:7:8:0.533333:1:6:4:3:2:6:4:3
chr11	124789755	.	T	C	1098.47	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=77;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00963461;FXX=0.0512755;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2176;QD=59.3768;RBI=0.0117499;REFB=-0.0380884;REVB=0.00672572;RO=1;SAF=29;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160305;STB=0.508472;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00175658;OID=.;OPOS=124789755;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:74:1:1:73:73:0.986486:44:29:1:0:44:29:1:0
chr11	124793682	.	T	C	919.78	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000782237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.158;QD=58.399;RBI=0.0149898;REFB=0;REVB=0.0149693;RO=0;SAF=40;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.40009e-05;OID=.;OPOS=124793682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:23:40:0:0:23:40:0:0
chr11	124951311	.	T	C	264.88	PASS	AF=0.509091;AO=14;DP=56;FAO=28;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.0123192;FXX=0.0350816;HRUN=9;LEN=1;MLLD=248.534;QD=19.2641;RBI=0.0147176;REFB=-0.00789625;REVB=0.00805258;RO=13;SAF=11;SAR=3;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0203139;STB=0.562071;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.00891405;OID=.;OPOS=124951311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:13:27:14:28:0.509091:3:11:10:3:5:23:20:7
chr11	124955032	.	T	C	132.71	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0230517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.541;QD=15.1663;RBI=0.0304949;REFB=-0.0160623;REVB=0.019964;RO=20;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507199;STB=0.529372;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=0.0194112;OID=.;OPOS=124955032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:6:9:11:9:6:9:11:9
chr11	124972208	.	A	G	743.08	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0107549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.98;QD=59.446;RBI=0.0430137;REFB=-0.0406082;REVB=0.0416474;RO=2;SAF=33;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0586721;STB=0.531237;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.000287461;OID=.;OPOS=124972208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:15:33:0:2:15:33:0:2
chr11	124972518	.	A	G	853.15	PASS	AF=0.96875;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00296922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8129;QD=53.322;RBI=0.0248175;REFB=-0.0794847;REVB=0.0246392;RO=2;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325244;STB=0.516661;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0401209;OID=.;OPOS=124972518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:64:2:2:61:62:0.96875:28:33:0:2:29:33:0:2
chr11	124972522	.	T	C	912.65	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00840135;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.107;QD=57.9459;RBI=0.0514638;REFB=0;REVB=0.0507734;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.69927e-05;OID=.;OPOS=124972522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:61:63:1:29:32:0:0:30:33:0:0
chr11	125128968	.	C	T	349.27	PASS	AF=0.618182;AO=34;DP=55;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0131447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.288;QD=25.4017;RBI=0.0152864;REFB=-0.0282671;REVB=0.00780327;RO=21;SAF=16;SAR=18;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00391209;STB=0.502145;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0182041;OID=.;OPOS=125128968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:21:21:34:34:0.618182:18:16:10:11:18:16:10:11
chr11	125301587	.	T	C	1116.8	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.928;QD=60.3678;RBI=0.0616148;REFB=0;REVB=-0.0600112;RO=0;SAF=41;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.54285e-05;OID=.;OPOS=125301587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:33:41:0:0:33:41:0:0
chr11	125443429	.	T	C	156.66	PASS	AF=0.363636;AO=17;DP=52;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.00145701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.243;QD=11.3934;RBI=0.0292272;REFB=0.00169153;REVB=0.0291908;RO=30;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17055;STB=0.588701;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=-0.00193048;OID=.;OPOS=125443429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:55:30:35:17:20:0.363636:10:7:8:22:11:9:11:24
chr11	125443473	.	A	C	150.12	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.0416556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.239;QD=13.9648;RBI=0.0533242;REFB=-0.00806463;REVB=0.0332908;RO=25;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556242;STB=0.541499;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0186528;OID=.;OPOS=125443473;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:26:17:17:0.395349:10:7:9:16:10:7:9:17
chr11	125452300	.	A	AC	462.89	PASS	AF=1;AO=41;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.0391;QD=37.7871;RBI=0.0422467;REFB=0;REVB=-0.0280735;RO=6;SAF=15;SAR=26;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0754811;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000769638;OID=.;OPOS=125452301;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:41:50:49:49:0:19:30:0:0:9:6:15:26:4:2
chr11	125452313	.	A	G	284.15	PASS	AF=0.530612;AO=25;DP=48;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0258052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.902;QD=23.1961;RBI=0.0280296;REFB=-0.035074;REVB=-0.010943;RO=23;SAF=10;SAR=15;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0872469;STB=0.558058;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.043196;OID=.;OPOS=125452313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:23:23:25:26:0.530612:15:10:7:16:15:11:7:16
chr11	125479363	.	G	A	243.59	PASS	AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.00377566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.878;QD=12.9913;RBI=0.0106665;REFB=-0.014229;REVB=-0.00997587;RO=46;SAF=19;SAR=10;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194603;STB=0.611664;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0191621;OID=.;OPOS=125479363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:10:19:22:24:10:19:22:24
chr11	125479496	.	C	T	272.0	PASS	AF=0.430556;AO=30;DP=71;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.0231315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.872;QD=15.111;RBI=0.0692922;REFB=-0.0249629;REVB=-0.0653172;RO=41;SAF=20;SAR=10;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165255;STB=0.599933;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0282616;OID=.;OPOS=125479496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:41:41:30:31:0.430556:10:20:21:20:10:21:21:20
chr11	125525195	.	A	G	2224.81	PASS	AF=0.980392;AO=149;DP=150;FAO=150;FDP=153;FR=.;FRO=3;FSAF=82;FSAR=68;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00399802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.147;QD=58.165;RBI=0.012703;REFB=0.00910749;REVB=-0.0120574;RO=0;SAF=82;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.67496e-08;STB=0.508981;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.000137937;OID=.;OPOS=125525195;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:150:153:0:3:149:150:0.980392:67:82:0:0:68:82:3:0
chr11	125617610	.	A	G	353.56	PASS	AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0109558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.642;QD=23.9702;RBI=0.0335699;REFB=-0.0296851;REVB=-0.0317318;RO=24;SAF=23;SAR=12;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123227;STB=0.567861;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0200252;OID=.;OPOS=125617610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:12:23:12:12:12:23:12:12
chr11	125648503	.	G	A	547.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00742676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.737;QD=59.1929;RBI=0.00744333;REFB=0;REVB=0.000496269;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.84162e-05;OID=.;OPOS=125648503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:36:37:1:13:23:0:0:13:24:0:0
chr11	125707761	.	A	C	708.17	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.1;QD=62.9487;RBI=0.0667421;REFB=0;REVB=0.0588656;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258955;OID=.;OPOS=125707761;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:22:23:0:0
chr11	125708198	.	C	A,T	619.01	PASS	AF=0.0487805,0.95122;AO=2,37;DP=39;FAO=2,39;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=0,24;FSAR=2,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.009184,-0.0410472;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=78.5573,116.914;QD=60.3916;RBI=0.0102318,0.0423625;REFB=0,0;REVB=0.00451043,0.0104743;RO=0;SAF=0,22;SAR=2,15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.82408e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.124782,-0.00150093;OID=.,.;OPOS=125708198,125708198;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:39:41:0:0:2,37:2,39:0.0487805,0.95122:2,15:0,22:0:0:2,15:0,24:0:0
chr11	125763746	.	C	G	1859.62	PASS	AF=1;AO=119;DP=123;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117565;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.651;QD=60.9712;RBI=0.141686;REFB=0;REVB=0.079078;RO=0;SAF=59;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120942;OID=.;OPOS=125763746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:122:0:0:119:122:1:60:59:0:0:61:61:0:0
chr11	125766044	.	C	A	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.89;QD=56.9567;RBI=0.0518854;REFB=0;REVB=-0.0386806;RO=0;SAF=36;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.41529e-06;OID=.;OPOS=125766044;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:16:36:0:0:16:36:0:0
chr11	125766173	.	A	C	436.01	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0311811;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.132;QD=54.5011;RBI=0.0473447;REFB=-0.0633578;REVB=0.0356267;RO=1;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0282674;STB=0.515142;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.000873614;OID=.;OPOS=125766173;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:16:15:0:1:16:15:0:1
chr11	125769354	.	T	C	338.07	PASS	AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00867088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.064;QD=28.7722;RBI=0.0103547;REFB=-0.00686669;REVB=-0.00566001;RO=18;SAF=23;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332476;STB=0.684623;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00604578;OID=.;OPOS=125769354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:6:23:7:11:6:23:7:11
chr11	125770425	.	A	C	152.32	PASS	AF=0.304348;AO=21;DP=71;FAO=21;FDP=69;FR=.;FRO=48;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.000571557;FXX=0.028165;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.86;QD=8.83;RBI=0.0178666;REFB=-0.0136827;REVB=-0.0178575;RO=48;SAF=13;SAR=8;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117635;STB=0.569947;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0366002;OID=.;OPOS=125770425;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:69:48:48:21:21:0.304348:8:13:25:23:8:13:25:23
chr11	125788678	.	T	C	2797.35	PASS	AF=1;AO=179;DP=179;FAO=179;FDP=179;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.393;QD=62.5106;RBI=0.0316416;REFB=0;REVB=0.0299778;RO=0;SAF=83;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11687e-05;OID=.;OPOS=125788678;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:179:179:0:0:179:179:1:96:83:0:0:96:83:0:0
chr11	125810714	.	T	C	86.82	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0167058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.907;QD=12.8615;RBI=0.0313459;REFB=-0.00708766;REVB=0.0265232;RO=16;SAF=3;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246768;STB=0.646777;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0137131;OID=.;OPOS=125810714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:8:3:8:8:8:3:8:8
chr11	125810721	.	G	A	89.54	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0238485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4901;QD=15.5715;RBI=0.0245198;REFB=0.0143203;REVB=-0.00569845;RO=12;SAF=3;SAR=8;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224136;STB=0.631326;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=-0.0145555;OID=.;OPOS=125810721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:12:12:11:11:0.478261:8:3:6:6:8:3:6:6
chr11	125812875	.	G	A	227.93	PASS	AF=0.35443;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0407388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8262;QD=11.5407;RBI=0.0440276;REFB=0.00301065;REVB=0.0166967;RO=51;SAF=11;SAR=17;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153483;STB=0.588815;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.00708984;OID=.;OPOS=125812875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:51:51:28:28:0.35443:17:11:27:24:17:11:27:24
chr11	125813527	.	G	A	264.09	PASS	AF=0.528302;AO=25;DP=50;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0109362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.742;QD=19.9315;RBI=0.0147573;REFB=-0.0211787;REVB=0.00990855;RO=25;SAF=14;SAR=11;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141918;STB=0.598035;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0191264;OID=.;OPOS=125813527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:53:25:25:25:28:0.528302:11:14:10:15:11:17:10:15
chr11	125825708	.	A	G	182.97	PASS	AF=0.452381;AO=18;DP=41;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00699152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.935;QD=17.4258;RBI=0.0162176;REFB=-0.00661002;REVB=-0.0146331;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131387;STB=0.569549;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.00980383;OID=.;OPOS=125825708;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:22:23:18:19:0.452381:9:9:8:14:10:9:8:15
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chr11	125830970	.	A	T	1343.55	PASS	AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00924245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.247;QD=61.0707;RBI=0.00929239;REFB=-0.00336999;REVB=-0.000962146;RO=0;SAF=38;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-3.91543e-06;OID=.;OPOS=125830970;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:88:88:0:1:87:87:0.988636:49:38:0:0:49:38:0:1
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chr11	125871735	.	C	T	503.46	PASS	AF=0.510417;AO=47;DP=95;FAO=49;FDP=96;FR=.;FRO=47;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=0.0056039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.405;QD=20.9775;RBI=0.00575583;REFB=-0.0124657;REVB=-0.00131371;RO=47;SAF=21;SAR=26;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118495;STB=0.565059;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0070759;OID=.;OPOS=125871735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:47:47:47:49:0.510417:26:21:15:32:27:22:15:32
chr11	125891269	.	C	T	240.91	PASS	AF=0.306931;AO=31;DP=101;FAO=31;FDP=101;FR=.;FRO=70;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=-4.94769e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.189;QD=9.54093;RBI=0.01526;REFB=-0.000366245;REVB=-0.0152599;RO=70;SAF=18;SAR=13;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111431;STB=0.50654;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.000717962;OID=.;OPOS=125891269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:70:70:31:31:0.306931:13:18:40:30:13:18:40:30
chr11	126045822	.	T	C	116.09	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.11198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.2267;QD=11.3255;RBI=0.114607;REFB=0.00193337;REVB=-0.0243984;RO=27;SAF=10;SAR=4;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307102;STB=0.683184;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-2.31947e-05;OID=.;OPOS=126045822;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:4:10:12:15:4:10:12:15
chr11	126045830	.	C	G	269.07	PASS	AF=0.648649;AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=37;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.00916171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.315;QD=29.0891;RBI=0.0161475;REFB=0.00861504;REVB=-0.0132968;RO=13;SAF=11;SAR=13;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196415;STB=0.60793;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=-0.00483295;OID=.;OPOS=126045830;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:13:13:24:24:0.648649:13:11:10:3:13:11:10:3
chr11	126045882	.	C	T	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.00614297;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=299.234;QD=15.2589;RBI=0.0247512;REFB=-0.00589156;REVB=0.0239768;RO=6;SAF=6;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23478;STB=0.642384;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.00581525;OID=.;OPOS=126045882;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:1:6:4:2:1:6:4:2
chr11	126081403	.	T	C	367.81	PASS	AF=0.520548;AO=37;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.014011;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.764;QD=20.1541;RBI=0.0349234;REFB=-0.0194055;REVB=-0.0319897;RO=32;SAF=22;SAR=15;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106866;STB=0.558468;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.0108459;OID=.;OPOS=126081403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:32:35:37:38:0.520548:15:22:15:17:15:23:17:18
chr11	126081500	.	AG	AC,A	66.69	PASS	AF=0.0196078,0.313725;AO=2,19;DP=53;FAO=1,16;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=1,8;FSAR=0,8;FSRF=8;FSRR=26;FWDB=-0.0212652,-0.02065;FXX=0.0377287;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=224.431,11.6124;QD=5.23056;RBI=0.047534,0.0693645;REFB=-0.0014,-0.150834;REVB=-0.042512,-0.0662194;RO=26;SAF=2,4;SAR=0,15;SRF=7;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.602933,-0.0832843;STB=0.994897,0.679804;STBP=0.117,0.107;TYPE=snp,del;VARB=0.00814196,0.179934;OID=.,.;OPOS=126081501,126081501;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=AC,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0196078,0.313725:2,19:53:1,16:51:34:1,8:0,8:8:26:63:26:2,4:0,15:7:19
chr11	126133641	.	G	A	89.55	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=20;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.0210681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.659;QD=16.282;RBI=0.0637822;REFB=-0.04857;REVB=0.0602022;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133598;STB=0.593059;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0338657;OID=.;OPOS=126133641;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:20:22:10:11:9:11:0.5:4:5:7:3:5:6:8:3
chr11	126139100	.	T	C	1026.33	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0377863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.937;QD=59.4975;RBI=0.0620009;REFB=0;REVB=0.049156;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195169;OID=.;OPOS=126139100;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0
chr11	126139313	.	T	A	656.07	PASS	AF=0.942308;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=52;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0626243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.4525;QD=50.467;RBI=0.0626336;REFB=-0.183466;REVB=-0.0010805;RO=2;SAF=29;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0313537;STB=0.52458;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0132374;OID=.;OPOS=126139313;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:51:52:2:3:49:49:0.942308:20:29:2:0:20:29:3:0
chr11	126162607	.	G	A	356.01	PASS	AF=0.638298;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=47;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0476474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5162;QD=30.2989;RBI=0.0496006;REFB=-0.0181918;REVB=0.0137819;RO=17;SAF=17;SAR=13;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178291;STB=0.597685;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0125719;OID=.;OPOS=126162607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:17:17:30:30:0.638298:13:17:5:12:13:17:5:12
chr11	126162843	.	C	T	131.99	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0143561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.195;QD=14.6657;RBI=0.024753;REFB=0.00084577;REVB=-0.0201646;RO=20;SAF=10;SAR=5;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26529;STB=0.641318;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.00154264;OID=.;OPOS=126162843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:21:15:15:0.416667:5:10:8:12:5:10:9:12
chr11	126162862	.	C	T	215.6	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.00656019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2324;QD=22.1132;RBI=0.029789;REFB=-0.0315201;REVB=0.0290577;RO=18;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149696;STB=0.583862;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0287005;OID=.;OPOS=126162862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:12:9:11:7:12:9:11:7
chr11	126163612	.	T	G	433.08	PASS	AF=0.567568;AO=42;DP=74;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.0319107;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7571;QD=23.4095;RBI=0.0328998;REFB=0.0192212;REVB=-0.00800646;RO=31;SAF=28;SAR=14;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989474;STB=0.563076;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.0149329;OID=.;OPOS=126163612;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:31:32:42:42:0.567568:14:28:17:14:14:28:17:15
chr11	126176578	.	G	A	1383.63	PASS	AF=1;AO=88;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.294;QD=62.1857;RBI=0.0373726;REFB=0;REVB=0.0263329;RO=0;SAF=49;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156645;OID=.;OPOS=126176578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:88:89:1:39:49:0:0:40:49:0:0
chr11	126201403	.	T	C	118.75	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.100989;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8294;QD=12.1794;RBI=0.10337;REFB=0.00350582;REVB=-0.022059;RO=24;SAF=9;SAR=5;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200212;STB=0.606587;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=-0.0196128;OID=.;OPOS=126201403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:24:25:14:14:0.358974:5:9:11:13:5:9:12:13
chr11	126294817	.	G	A	202.3	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=19;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00065999;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.37;QD=44.955;RBI=0.0369726;REFB=0.0277652;REVB=0.0369667;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.529377;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=-0.000234627;OID=.;OPOS=126294817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:18:0:1:17:17:0.944444:8:9:0:0:8:9:0:1
chr11	126310299	.	T	C	123.11	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0562671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.3243;QD=16.4152;RBI=0.0571691;REFB=-0.0178549;REVB=-0.0101155;RO=16;SAF=6;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123893;STB=0.571326;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0148566;OID=.;OPOS=126310299;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:8:6:9:7:8:6:9:7
chr11	126870418	.	C	T	954.09	PASS	AF=1;AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139291;FXX=0.0588149;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.26;QD=59.6308;RBI=0.0221975;REFB=0;REVB=0.0172832;RO=0;SAF=41;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000741124;OID=.;OPOS=126870418;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:64:0:0:64:64:1:23:41:0:0:23:41:0:0
chr11	128333503	.	T	C	128.83	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0587906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4205;QD=12.5688;RBI=0.0797578;REFB=0.0175481;REVB=0.0538978;RO=26;SAF=10;SAR=5;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30187;STB=0.677185;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=-0.0256816;OID=.;OPOS=128333503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:5:10:10:16:5:10:10:16
chr11	128675292	.	T	A	358.23	PASS	AF=0.397959;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=40;FSRR=19;FWDB=-0.0227085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.656;QD=14.6215;RBI=0.0260047;REFB=-0.00398898;REVB=-0.0126716;RO=59;SAF=30;SAR=9;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124953;STB=0.57139;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0128241;OID=.;OPOS=128675292;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:59:59:39:39:0.397959:9:30:40:19:9:30:40:19
chr11	128781339	.	T	C	1525.38	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.019;QD=59.8189;RBI=0.0313154;REFB=0;REVB=0.0194033;RO=0;SAF=55;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.26931e-05;OID=.;OPOS=128781339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:47:55:0:0:47:55:0:0
chr11	128781978	.	T	G	410.94	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0790709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6221;QD=56.6811;RBI=0.0809687;REFB=0;REVB=-0.0174279;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103104;OID=.;OPOS=128781978;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:10:19:0:0:10:19:0:0
chr11	128782002	.	T	C	747.08	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.096;QD=63.5815;RBI=0.0244954;REFB=0;REVB=0.00819325;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.9847e-05;OID=.;OPOS=128782002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr11	128782012	.	C	G	736.95	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324129;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.756;QD=62.7195;RBI=0.0461174;REFB=0;REVB=-0.0328058;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.54294e-06;OID=.;OPOS=128782012;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr11	128787554	.	C	T	145.22	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.9034;QD=44.683;RBI=0.0499775;REFB=0;REVB=0.0386477;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00326376;OID=.;OPOS=128787554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr11	128805548	.	G	A	364.72	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0170199;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.331;QD=18.2361;RBI=0.0200771;REFB=0.00533476;REVB=0.0106496;RO=40;SAF=17;SAR=21;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.002448;STB=0.502658;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=-0.00981865;OID=.;OPOS=128805548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:40:42:38:38:0.475:21:17:18:22:21:17:19:23
chr11	128805557	.	T	C	405.53	PASS	AF=0.5;AO=41;DP=82;FAO=41;FDP=82;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=-0.00206393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.18;QD=19.7817;RBI=0.0286855;REFB=-0.00630373;REVB=0.0286111;RO=41;SAF=18;SAR=23;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0223679;STB=0.512411;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0045325;OID=.;OPOS=128805557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:41:41:41:41:0.5:23:18:17:24:23:18:17:24
chr11	128842873	.	T	C	229.43	PASS	AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0139051;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=344.534;QD=14.119;RBI=0.0169123;REFB=-0.0084154;REVB=0.00962679;RO=38;SAF=18;SAR=9;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204346;STB=0.511619;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0147734;OID=.;OPOS=128842873;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:38:27:27:0.415385:9:18:26:12:9:18:26:12
chr11	128868239	.	T	C	281.39	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00943399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.914;QD=19.4063;RBI=0.0107384;REFB=-0.00633991;REVB=-0.00512967;RO=28;SAF=16;SAR=14;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121247;STB=0.567461;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00889668;OID=.;OPOS=128868239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:14:16:11:17:14:16:11:17
chr11	129072915	.	C	G	111.54	PASS	AF=0.311111;AO=14;DP=45;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0258173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7163;QD=9.91492;RBI=0.0258198;REFB=0.00647096;REVB=-0.000364603;RO=30;SAF=6;SAR=8;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816695;STB=0.560423;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=-0.0159037;OID=.;OPOS=129072915;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:30:31:14:14:0.311111:8:6:15:15:8:6:16:15
chr11	129321066	.	C	T	93.6	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0157117;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.36;QD=10.3996;RBI=0.0192467;REFB=-0.00934616;REVB=-0.0111165;RO=23;SAF=7;SAR=5;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0792193;STB=0.558158;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0223484;OID=.;OPOS=129321066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:36:23:24:12:12:0.333333:5:7:15:8:5:7:16:8
chr11	129321818	.	T	G	101.84	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00842375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0352;QD=40.7343;RBI=0.0506445;REFB=0;REVB=-0.049939;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00221061;OID=.;OPOS=129321818;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chr11	129729775	.	C	T	49.57	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.0234581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.809;QD=15.2518;RBI=0.0239135;REFB=-0.0176915;REVB=-0.00464469;RO=6;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308536;STB=0.680376;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0138077;OID=.;OPOS=129729775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:4:3:5:1:4:3:5:1
chr11	129743721	.	C	T	354.29	PASS	AF=0.612245;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=49;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=1;FWDB=-0.0147496;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.468;QD=28.9213;RBI=0.0591697;REFB=-0.0237268;REVB=-0.0573018;RO=19;SAF=17;SAR=13;SRF=18;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287996;STB=0.656475;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0176504;OID=.;OPOS=129743721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:19:19:30:30:0.612245:13:17:18:1:13:17:18:1
chr11	129754644	.	A	G	207.69	PASS	AF=0.466667;AO=20;DP=45;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.00802799;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.16;QD=18.4613;RBI=0.0107132;REFB=-0.0127306;REVB=0.00709392;RO=23;SAF=9;SAR=11;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141289;STB=0.599481;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0202166;OID=.;OPOS=129754644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:24:20:21:0.466667:11:9:7:16:11:10:7:17
chr11	129758327	.	G	A	230.52	PASS	AF=0.464286;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0153739;FXX=0.0344768;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.239;QD=16.4656;RBI=0.0173177;REFB=-0.0104439;REVB=-0.00797142;RO=32;SAF=11;SAR=15;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452043;STB=0.541634;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0189253;OID=.;OPOS=129758327;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:56:32:30:26:26:0.464286:15:11:15:17:15:11:15:15
chr11	129784456	.	G	A	415.41	PASS	AF=0.431193;AO=47;DP=109;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.00107555;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=322.85;QD=15.2444;RBI=0.0203209;REFB=-0.0144842;REVB=-0.0202924;RO=62;SAF=32;SAR=15;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144768;STB=0.581536;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0183408;OID=.;OPOS=129784456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:62:62:47:47:0.431193:15:32:34:28:15:32:34:28
chr11	129784656	.	C	T	245.64	PASS	AF=0.560976;AO=23;DP=41;FAO=23;FDP=41;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0242707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.256;QD=23.9649;RBI=0.0308022;REFB=-0.00645672;REVB=0.018966;RO=18;SAF=5;SAR=18;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122844;STB=0.568902;STBP=0.375;TYPE=snp;VARB=0.00546627;OID=.;OPOS=129784656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:18:18:23:23:0.560976:18:5:6:12:18:5:6:12
chr11	129785594	.	G	A	193.23	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.00340818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.091;QD=16.4451;RBI=0.0272418;REFB=-0.0091806;REVB=0.0270277;RO=23;SAF=9;SAR=11;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148439;STB=0.539406;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.0118696;OID=.;OPOS=129785594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:23:27:20:20:0.425532:11:9:14:9:11:9:14:13
chr11	129794950	.	T	C	1664.94	PASS	AF=0.982456;AO=112;DP=114;FAO=112;FDP=114;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0184602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8166;QD=58.4191;RBI=0.0713472;REFB=-0.022566;REVB=0.0689176;RO=2;SAF=61;SAR=51;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0182524;STB=0.509614;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.000729932;OID=.;OPOS=129794950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:114:114:2:2:112:112:0.982456:51:61:0:2:51:61:0:2
chr11	129801043	.	C	T	2275.77	PASS	AF=1;AO=148;DP=149;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0474042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3009;QD=60.2852;RBI=0.0476642;REFB=-0.068136;REVB=-0.00497159;RO=0;SAF=72;SAR=76;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85252e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.47367e-05;OID=.;OPOS=129801043;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:149:151:0:0:148:151:1:76:72:0:0:79:72:0:0
chr11	129817221	.	A	G	1523.03	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0419679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0515;QD=58.5782;RBI=0.0632853;REFB=-0.0533202;REVB=0.047368;RO=0;SAF=63;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15547e-08;STB=0.503936;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.000983286;OID=.;OPOS=129817221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:104:0:1:103:103:0.990385:40:63:0:0:40:63:1:0
chr11	129830796	.	C	T	697.73	PASS	AF=0.981481;AO=48;DP=49;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.114023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.188;QD=51.684;RBI=0.114206;REFB=-0.132229;REVB=0.00645266;RO=1;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159482;STB=0.507934;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00333915;OID=.;OPOS=129830796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:49:54:1:1:48:53:0.981481:29:19:0:1:31:22:0:1
chr11	130066334	.	A	AT	66.73	PASS	AF=1;AO=2;DP=14;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398158;FXX=0.499643;HRUN=0;LEN=1;MLLD=120.767;QD=38.1312;RBI=0.0415822;REFB=0;REVB=0.0119908;RO=11;SAF=2;SAR=0;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.622114;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00107653;OID=.;OPOS=130066335;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:2:14:7:7:0:6:1:0:0:3:11:2:0:4:7
chr11	130066335	.	C	G,T	146.98	PASS	AF=0.153846,0.846154;AO=2,11;DP=14;FAO=2,11;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=2,4;FSAR=0,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308812,0.0793519;FXX=0.0713776;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=29.7219,110.416;QD=45.2231;RBI=0.0332875,0.0804525;REFB=0,0;REVB=-0.0124259,-0.0132619;RO=0;SAF=2,4;SAR=0,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.167686,-0.00596176;OID=.,.;OPOS=130066335,130066335;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:14:13:0:0:2,11:2,11:0.153846,0.846154:0,7:2,4:0:0:0,7:2,4:0:0
chr11	130271678	.	T	G	339.86	PASS	AF=0.630435;AO=28;DP=45;FAO=29;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0446856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.916;QD=29.5532;RBI=0.0459005;REFB=-0.0173431;REVB=0.0104908;RO=17;SAF=21;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180475;STB=0.603214;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0105243;OID=.;OPOS=130271678;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:17:17:28:29:0.630435:7:21:9:8:7:22:9:8
chr11	130319224	.	T	TG	39.89	PASS	AF=0.272727;AO=23;DP=90;FAO=24;FDP=88;FR=.;FRO=64;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.0280571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=10.0019;QD=1.81317;RBI=0.0616871;REFB=-0.104085;REVB=-0.0549371;RO=66;SAF=7;SAR=16;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195553;STB=0.568126;STBP=0.43;TYPE=ins;VARB=0.143576;OID=.;OPOS=130319225;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.272727:23:90:24:88:64:12:12:26:38:39:66:7:16:30:36
chr11	130339312	.	T	C	132.71	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00850256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.896;QD=15.1666;RBI=0.0162567;REFB=-0.0217205;REVB=-0.0138559;RO=20;SAF=4;SAR=11;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152974;STB=0.58916;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.02098;OID=.;OPOS=130339312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:11:4:8:12:11:4:8:12
chr11	130340962	.	A	G	520.4	PASS	AF=0.451613;AO=56;DP=124;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=0.00108397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.379;QD=16.7872;RBI=0.0096797;REFB=-0.0420146;REVB=-0.00961881;RO=67;SAF=22;SAR=34;SRF=38;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171218;STB=0.599386;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0502231;OID=.;OPOS=130340962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:67:68:56:56:0.451613:34:22:38:29:34:22:39:29
chr11	130343304	.	ACCCCCG	ACCCACG,ACCCC,ACCCCG	99.86	PASS	AF=0.114286,0.0285714,0.4;AO=2,4,11;DP=36;FAO=4,1,14;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=4,0,12;FSAR=0,1,2;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0427605,-0.131841,-0.219119;FXX=0.0540395;HRUN=5,5,5;LEN=1,2,1;MLLD=216.01,13.8658,10.2724;QD=11.413;RBI=0.0474239,0.140399,0.228428;REFB=-0.00165803,-0.0761959,-0.107846;REVB=-0.0205077,-0.0482671,0.0645484;RO=11;SAF=2,2,10;SAR=0,2,1;SRF=5;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.585255,0.0492666,0.5401;STB=0.997257,0.988464,0.776017;STBP=0.022,0.472,0.013;TYPE=snp,del,del;VARB=0.108957,0.167484,0.063028;OID=.,.,.;OPOS=130343308,130343309,130343305;OREF=C,CG,C;OALT=A,-,-;OMAPALT=ACCCACG,ACCCC,ACCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.114286,0.0285714,0.4:2,4,11:36:4,1,14:35:16:4,0,12:0,1,2:7:9:51:11:2,2,10:0,2,1:5:6
chr11	130750642	.	A	C	367.18	PASS	AF=0.487179;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0155903;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.719;QD=18.8296;RBI=0.0172162;REFB=-0.0055647;REVB=0.00730353;RO=40;SAF=23;SAR=15;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0435728;STB=0.524238;STBP=0.696;TYPE=snp;VARB=0.00765713;OID=.;OPOS=130750642;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:40:40:38:38:0.487179:15:23:26:14:15:23:26:14
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chr11	130775782	.	C	T	443.55	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.005233;FXX=0.0112347;HRUN=4;LEN=1;MLLD=265.893;QD=20.1612;RBI=0.0411515;REFB=-0.011452;REVB=0.0408174;RO=43;SAF=26;SAR=18;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300299;STB=0.511697;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0121662;OID=.;OPOS=130775782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:43:44:44:44:0.5:18:26:24:19:18:26:25:19
chr11	130776524	.	T	C	141.93	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.00225673;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.455;QD=13.8473;RBI=0.014996;REFB=-0.0368457;REVB=-0.0148252;RO=25;SAF=6;SAR=10;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626859;STB=0.536379;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0702833;OID=.;OPOS=130776524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:10:6:8:17:10:6:8:17
chr11	130776613	.	A	G	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.056504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.64;QD=15.1603;RBI=0.0565082;REFB=-0.00691135;REVB=0.00068964;RO=22;SAF=3;SAR=13;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327483;STB=0.692353;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0109824;OID=.;OPOS=130776613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:13:3:10:12:13:3:10:12
chr11	130780015	.	C	T	210.78	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.00475897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.142;QD=14.0517;RBI=0.015383;REFB=-0.0072128;REVB=0.0146283;RO=35;SAF=13;SAR=12;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0823529;STB=0.54688;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0132317;OID=.;OPOS=130780015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:12:13:21:14:12:13:21:14
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chr11	130784971	.	C	G	191.52	PASS	AF=0.558824;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0176228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5736;QD=22.5314;RBI=0.0510173;REFB=-0.00215838;REVB=0.0478769;RO=15;SAF=10;SAR=9;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583233;STB=0.532676;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00120701;OID=.;OPOS=130784971;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:15:19:19:0.558824:9:10:9:6:9:10:9:6
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chr11	131531015	.	T	G	2739.61	PASS	AF=0.988827;AO=176;DP=178;FAO=177;FDP=179;FR=.;FRO=2;FSAF=89;FSAR=88;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.024408;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.351;QD=61.2204;RBI=0.0287621;REFB=-0.14961;REVB=-0.0152153;RO=1;SAF=89;SAR=87;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00531879;STB=0.500032;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.000224949;OID=.;OPOS=131531015;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:178:179:1:2:176:177:0.988827:87:89:1:0:88:89:1:1
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chr11	131531720	.	C	T	940.64	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161446;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.946;QD=58.7902;RBI=0.0216938;REFB=0;REVB=-0.0144905;RO=0;SAF=27;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.80678e-05;OID=.;OPOS=131531720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:37:27:0:0:37:27:0:0
chr11	132177633	.	A	C,G	1350.06	PASS	AF=0.954545,0.0454545;AO=84,4;DP=88;FAO=84,4;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=42,4;FSAR=42,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118218,-0.0111656;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=319.092,283.852;QD=61.3664;RBI=0.0127089,0.0113299;REFB=0,0;REVB=-0.00466478,-0.00192273;RO=0;SAF=42,4;SAR=42,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00145226,0.0390891;OID=.,.;OPOS=132177633,132177633;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:88:88:0:0:84,4:84,4:0.954545,0.0454545:42,0:42,4:0:0:42,0:42,4:0:0
chr11	132206082	.	AT	A	30.53	PASS	AF=0.209877;AO=26;DP=83;FAO=17;FDP=81;FR=.;FRO=64;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=0.0539909;FXX=0.03571;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.67478;QD=1.50782;RBI=0.169797;REFB=-0.0479565;REVB=-0.160984;RO=35;SAF=10;SAR=16;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104592;STB=0.563803;STBP=0.575;TYPE=del;VARB=-0.0201147;OID=.;OPOS=132206083;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.209877:26:83:17:81:64:8:9:25:39:30:35:10:16:17:18
chr11	132289761	.	G	A	471.27	PASS	AF=0.555556;AO=45;DP=81;FAO=45;FDP=81;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0657677;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0005;QD=23.2725;RBI=0.0657733;REFB=-0.0187781;REVB=-0.00086035;RO=36;SAF=24;SAR=21;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00450866;STB=0.502478;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0196444;OID=.;OPOS=132289761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:36:36:45:45:0.555556:21:24:19:17:21:24:19:17
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chr11	133815980	.	GC	G,GG	240.97	PASS	AF=1,0;AO=5,14;DP=19;FAO=19,0;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7,0;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0785924,-0.0910027;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=221.99,217.393;QD=50.7311;RBI=0.139692,0.14889;REFB=0,0;REVB=-0.115487,-0.117842;RO=0;SAF=1,6;SAR=4,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00138247,-0.0115512;OID=.,.;OPOS=133815981,133815981;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:5,14:19:19,0:19:0:7,0:12,0:0:0:4:0:1,6:4,8:0:0
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chr11	134019914	.	ATTTTTTTA	ATTTTTT,ATTTTTTA	45.32	PASS	AF=0.421053,0.0526316;AO=6,2;DP=19;FAO=8,1;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3,0;FSAR=5,1;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0945792,-0.0485942;FXX=0.049975;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=22.6781,11.2785;QD=9.54204;RBI=0.103425,0.109706;REFB=-0.0623023,-0.0824303;REVB=-0.0418508,-0.0983565;RO=9;SAF=3,1;SAR=3,1;SRF=3;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.162993,0.174857;STB=0.545344,0.985759;STBP=0.797,0.542;TYPE=del,del;VARB=0.110385,-0.155261;OID=.,.;OPOS=134019921,134019915;OREF=TA,T;OALT=-,-;OMAPALT=ATTTTTT,ATTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.421053,0.0526316:6,2:19:8,1:19:10:3,0:5,1:3:7:39:9:3,1:3,1:3:6
chr11	134047243	.	T	C	696.21	PASS	AF=0.471338;AO=74;DP=157;FAO=74;FDP=157;FR=.;FRO=83;FSAF=44;FSAR=30;FSRF=45;FSRR=38;FWDB=-0.0323834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.8447;QD=17.7378;RBI=0.0337856;REFB=0.014424;REVB=-0.00963227;RO=83;SAF=44;SAR=30;SRF=45;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0513133;STB=0.528427;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.0226798;OID=.;OPOS=134047243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:157:83:83:74:74:0.471338:30:44:45:38:30:44:45:38
chr11	134151975	.	G	C	1781.19	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.933;QD=60.8954;RBI=0.0327165;REFB=0;REVB=0.029896;RO=0;SAF=70;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84033e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140397;OID=.;OPOS=134151975;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:109:117:0:0:109:117:1:39:70:0:0:44:73:0:0
chr11	134158745	.	A	G	293.24	PASS	AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0247976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.858;QD=22.9992;RBI=0.0407592;REFB=-0.0359876;REVB=0.032348;RO=21;SAF=8;SAR=21;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134803;STB=0.567519;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0250625;OID=.;OPOS=134158745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:22:29:29:0.568627:21:8:9:12:21:8:9:13
chr11	134182375	.	G	A	1247.94	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114349;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.328;QD=61.6265;RBI=0.0800075;REFB=0;REVB=0.0791861;RO=0;SAF=40;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290495;OID=.;OPOS=134182375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:41:40:0:0:41:40:0:0
chr11	134188542	.	T	C	294.65	PASS	AF=0.369565;AO=34;DP=92;FAO=34;FDP=92;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=-0.0072081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.1569;QD=12.8108;RBI=0.014594;REFB=-0.00184567;REVB=0.0126897;RO=58;SAF=15;SAR=19;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102584;STB=0.558789;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00300293;OID=.;OPOS=134188542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:58:58:34:34:0.369565:19:15:31:27:19:15:31:27
chr11	134208765	.	T	C	346.27	PASS	AF=0.674419;AO=29;DP=43;FAO=29;FDP=43;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0342044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8475;QD=32.211;RBI=0.0511605;REFB=-0.0187122;REVB=-0.0380455;RO=14;SAF=13;SAR=16;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157255;STB=0.585929;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00354251;OID=.;OPOS=134208765;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:14:14:29:29:0.674419:16:13:10:4:16:13:10:4
chr11	134208908	.	T	C	79.32	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0160342;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7113;QD=13.7941;RBI=0.0160348;REFB=-0.0215746;REVB=-0.000136007;RO=13;SAF=3;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370123;STB=0.717521;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0198451;OID=.;OPOS=134208908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:24:23:13:13:10:10:0.434783:7:3:9:4:7:3:9:4
chr11	134249321	.	T	C	1053.85	PASS	AF=1;AO=64;DP=66;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00355851;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.1;QD=59.3718;RBI=0.0763218;REFB=0;REVB=0.0762388;RO=0;SAF=42;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000406525;OID=.;OPOS=134249321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:66:71:0:0:64:71:1:22:42:0:0:29:42:0:0
chr12	90902	.	C	T	517.08	PASS	AF=0.52;AO=52;DP=100;FAO=52;FDP=100;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0405974;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.724;QD=20.683;RBI=0.040625;REFB=-0.0346121;REVB=0.00149647;RO=48;SAF=20;SAR=32;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0849346;STB=0.546882;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0308424;OID=.;OPOS=90902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:48:48:52:52:0.52:32:20:23:25:32:20:23:25
chr12	90914	.	C	T	395.32	PASS	AF=0.445652;AO=40;DP=92;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0143056;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.711;QD=17.1876;RBI=0.0161464;REFB=-0.0231365;REVB=0.00748692;RO=49;SAF=18;SAR=22;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213116;STB=0.528894;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0348681;OID=.;OPOS=90914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:49:51:40:41:0.445652:22:18:21:28:22:19:21:30
chr12	92119	.	T	C	71.08	PASS	AF=0.263158;AO=10;DP=38;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.109818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.385;QD=7.48167;RBI=0.131276;REFB=-0.0187356;REVB=-0.0719261;RO=28;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126789;STB=0.578793;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0537377;OID=.;OPOS=92119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:38:38:28:28:10:10:0.263158:5:5:11:17:5:5:11:17
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chr12	463248	.	G	C	280.24	PASS	AF=0.462687;AO=30;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00742521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.558;QD=16.7308;RBI=0.0274558;REFB=-0.00812315;REVB=-0.0264327;RO=36;SAF=23;SAR=7;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318671;STB=0.684832;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00840866;OID=.;OPOS=463248;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:36:36:30:31:0.462687:7:23:17:19:7:24:17:19
chr12	496439	.	A	T	583.61	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000367124;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=331.071;QD=58.3611;RBI=0.00994818;REFB=-0.195406;REVB=0.00994141;RO=1;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183853;STB=0.509799;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000410029;OID=.;OPOS=496439;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:40:40:1:1:39:39:0.975:25:14:0:1:25:14:0:1
chr12	520947	.	A	C	318.15	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0133487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.486;QD=18.18;RBI=0.0152189;REFB=-0.022763;REVB=0.00730933;RO=36;SAF=28;SAR=6;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368793;STB=0.708722;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0201356;OID=.;OPOS=520947;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:36:36:34:34:0.485714:6:28:18:18:6:28:18:18
chr12	547683	.	T	C	59.4	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0577612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.809;QD=15.839;RBI=0.0788108;REFB=-0.00434304;REVB=0.053617;RO=7;SAF=7;SAR=1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.539065;STB=0.822615;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0070462;OID=.;OPOS=547683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:1:7:2:5:1:7:2:5
chr12	657404	.	G	A	141.89	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0159856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.675;QD=13.8425;RBI=0.0172385;REFB=-0.0228013;REVB=0.00645189;RO=25;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209208;STB=0.51218;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0351722;OID=.;OPOS=657404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:8:8:13:12:8:8:13:12
chr12	661656	.	A	G	127.3	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=5;FWDB=0.0119402;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5654;QD=11.8419;RBI=0.0132814;REFB=-0.0194121;REVB=0.00581612;RO=28;SAF=8;SAR=7;SRF=23;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335609;STB=0.693077;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0343796;OID=.;OPOS=661656;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:7:8:23:5:7:8:23:5
chr12	662448	.	T	C	1952.25	PASS	AF=1;AO=126;DP=126;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=306.047;QD=61.9762;RBI=0.0511513;REFB=0;REVB=0.0318063;RO=0;SAF=55;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.70906e-05;OID=.;OPOS=662448;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:126:126:0:0:126:126:1:71:55:0:0:71:55:0:0
chr12	862989	.	T	C	1190.34	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0421572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6001;QD=61.0431;RBI=0.0421919;REFB=0;REVB=0.00170933;RO=0;SAF=54;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.01268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000309522;OID=.;OPOS=862989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:24:54:0:0:24:54:0:0
chr12	939302	.	A	G	805.18	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0872124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.839;QD=64.414;RBI=0.0913437;REFB=0;REVB=0.0271601;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000378441;OID=.;OPOS=939302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:19:30:0:0:20:30:0:0
chr12	974404	.	T	C	152.26	PASS	AF=0.425;AO=15;DP=39;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.00273794;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.495;QD=15.2257;RBI=0.00871222;REFB=-0.0191299;REVB=0.00827082;RO=23;SAF=1;SAR=14;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.576409;STB=0.762338;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0268563;OID=.;OPOS=974404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:23:23:15:17:0.425:14:1:10:13:15:2:10:13
chr12	987482	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.139;QD=49.5991;RBI=0.0375637;REFB=0;REVB=-0.0154554;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259002;OID=.;OPOS=987482;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr12	988894	.	G	A	117.63	PASS	AF=0.785714;AO=9;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0865595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.963;QD=33.6095;RBI=0.0938865;REFB=-0.0377108;REVB=0.0363609;RO=2;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990128;STB=0.55546;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0137641;OID=.;OPOS=988894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:14:14:2:2:9:11:0.785714:8:1:0:2:8:3:0:2
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chr12	993930	.	C	T	334.39	PASS	AF=0.659091;AO=27;DP=43;FAO=29;FDP=44;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00728925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.783;QD=30.3992;RBI=0.0177296;REFB=-0.033122;REVB=-0.0161618;RO=15;SAF=4;SAR=23;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352695;STB=0.641327;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0124563;OID=.;OPOS=993930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:15:15:27:29:0.659091:23:4:8:7:23:6:8:7
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chr12	1965369	.	G	A	433.58	PASS	AF=0.460784;AO=46;DP=101;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=0.053221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1067;QD=17.0033;RBI=0.0536958;REFB=-0.0304285;REVB=0.007125;RO=55;SAF=25;SAR=21;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121681;STB=0.572466;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0412427;OID=.;OPOS=1965369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:55:55:46:47:0.460784:21:25:23:32:21:26:23:32
chr12	1995403	.	T	C	2023.31	PASS	AF=1;AO=129;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0014584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.422;QD=62.2557;RBI=0.077685;REFB=0;REVB=0.0776713;RO=0;SAF=68;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.04022e-05;OID=.;OPOS=1995403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:130:0:0:129:130:1:61:68:0:0:61:69:0:0
chr12	2062323	.	T	TTGC	434.12	PASS	AF=0.677966;AO=35;DP=68;FAO=40;FDP=59;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.0455322;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=3;MLLD=131.082;QD=29.4316;RBI=0.0622205;REFB=-0.177701;REVB=0.0424053;RO=32;SAF=12;SAR=23;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319491;STB=0.639932;STBP=0.007;TYPE=ins;VARB=0.0802303;OID=.;OPOS=2062324;OREF=-;OALT=TGC;OMAPALT=TTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.677966:35:68:40:59:19:16:24:16:3:99:32:12:23:23:9
chr12	2062353	.	G	C	37.85	PASS	AF=0.115942;AO=8;DP=69;FAO=8;FDP=69;FR=.;FRO=61;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=-0.0391637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.386;QD=2.19431;RBI=0.0438135;REFB=-0.0258585;REVB=-0.0196424;RO=61;SAF=5;SAR=3;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176774;STB=0.631441;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.162562;OID=.;OPOS=2062353;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:69:69:61:61:8:8:0.115942:3:5:29:32:3:5:29:32
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chr12	2968458	.	T	C	663.86	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.103445;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.9399;QD=61.7542;RBI=0.116148;REFB=0;REVB=-0.0528151;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00227908;OID=.;OPOS=2968458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
chr12	2996174	.	A	G	1236.93	PASS	AF=0.97619;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=84;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0145724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.742;QD=58.9014;RBI=0.0668956;REFB=-0.0412223;REVB=0.0652891;RO=2;SAF=47;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00336854;STB=0.501779;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0018749;OID=.;OPOS=2996174;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:84:84:2:2:82:82:0.97619:35:47:1:1:35:47:1:1
chr12	2997397	.	G	A	469.62	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0605191;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.726;QD=58.7028;RBI=0.0628715;REFB=0;REVB=-0.0170373;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000257837;OID=.;OPOS=2997397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr12	3310439	.	C	T	739.37	PASS	AF=1;AO=42;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515843;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.286;QD=56.8746;RBI=0.0694276;REFB=0;REVB=0.0464677;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00186707;OID=.;OPOS=3310439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:42:52:1:14:28:0:0:19:33:0:0
chr12	3393419	.	C	T	700.8	PASS	AF=0.945455;AO=52;DP=55;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.01135;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=261.806;QD=50.9675;RBI=0.0225759;REFB=0.0578595;REVB=0.0195154;RO=3;SAF=30;SAR=22;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00944468;STB=0.50502;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=-0.00124932;OID=.;OPOS=3393419;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:55:55:3:3:52:52:0.945455:22:30:2:1:22:30:2:1
chr12	3409211	.	G	A	152.07	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0224954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.437;QD=20.2764;RBI=0.0311049;REFB=-0.0382462;REVB=-0.0214819;RO=13;SAF=7;SAR=9;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.042887;STB=0.538414;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.027434;OID=.;OPOS=3409211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:13:14:16:16:0.533333:9:7:5:8:9:7:5:9
chr12	3409277	.	C	T	594.52	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000422987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.515;QD=60.9768;RBI=0.0584857;REFB=0;REVB=0.0584842;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147917;OID=.;OPOS=3409277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr12	3724583	.	T	C	276.88	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.0428072;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.453;QD=18.1563;RBI=0.0432937;REFB=-0.00843424;REVB=0.00647236;RO=31;SAF=10;SAR=20;SRF=8;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794795;STB=0.544275;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0101164;OID=.;OPOS=3724583;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:31:31:30:30:0.491803:20:10:8:23:20:10:8:23
chr12	3749874	.	T	C	370.64	PASS	AF=0.453488;AO=39;DP=86;FAO=39;FDP=86;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00909703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.966;QD=17.2392;RBI=0.0102313;REFB=-0.0181445;REVB=0.00468235;RO=47;SAF=25;SAR=14;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152567;STB=0.585652;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0213784;OID=.;OPOS=3749874;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:47:47:39:39:0.453488:14:25:23:24:14:25:23:24
chr12	3835401	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.834;QD=37.4885;RBI=0.0457486;REFB=0;REVB=-0.00827316;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000958178;OID=.;OPOS=3835401;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr12	4411082	.	GT	TG,TT	30.51	PASS	AF=0,0.103448;AO=7,7;DP=86;FAO=0,9;FDP=87;FR=.;FRO=78;FSAF=0,7;FSAR=0,2;FSRF=51;FSRR=27;FWDB=-0.00106884,-0.00158046;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=25.6383,215.637;QD=1.40272;RBI=0.0873076,0.00715885;REFB=-0.0293091,-0.00202657;REVB=-0.0873011,0.00698222;RO=65;SAF=7,6;SAR=0,1;SRF=39;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.573213,0.339464;STB=0.5,0.636033;STBP=1,0.444;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0218654;OID=.,.;OPOS=4411082,4411082;OREF=GT,G;OALT=TG,T;OMAPALT=TG,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:30:86:87:65:78:7,7:0,9:0,0.103448:0,1:7,6:39:26:0,2:0,7:51:27
chr12	4411093	.	TC	CT,TCT,TT	176.65	PASS	AF=0.152542,0.542373,0.0338983;AO=6,12,5;DP=59;FAO=9,32,2;FDP=59;FR=.;FRO=16;FSAF=6,21,0;FSAR=3,11,2;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0423027,-0.0084756,-0.0272664;FXX=0.0166639;HRUN=11,6,1;LEN=2,1,1;MLLD=18.0464,7.5451,195.138;QD=11.9759;RBI=0.102298,0.185207,0.033049;REFB=-0.142984,-0.177111,0.0092274;REVB=0.0931415,0.185013,0.0186757;RO=20;SAF=5,8,2;SAR=1,4,3;SRF=14;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.216233,-0.0402508,-0.341037;STB=0.515118,0.511621,0.996127;STBP=0.938,0.847,0.052;TYPE=mnp,ins,snp;VARB=-0.0293353,0.129614,-0.0115259;OID=.,.,.;OPOS=4411093,4411095,4411094;OREF=TC,-,C;OALT=CT,T,T;OMAPALT=CT,TCT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:43:59:59:20:16:6,12,5:9,32,2:0.152542,0.542373,0.0338983:1,4,3:5,8,2:14:6:3,11,2:6,21,0:11:5
chr12	4414126	.	G	A	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6861;QD=39.2068;RBI=0.00233318;REFB=0;REVB=0.00233318;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.04491e-05;OID=.;OPOS=4414126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:9:0:0:0:9:0:0:0
chr12	4553332	.	A	G	927.3	PASS	AF=0.942857;AO=66;DP=70;FAO=66;FDP=70;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00450911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.6047;QD=52.9887;RBI=0.0269334;REFB=0.0223145;REVB=0.0265533;RO=4;SAF=41;SAR=25;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420245;STB=0.522286;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.00256716;OID=.;OPOS=4553332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:70:70:4:4:66:66:0.942857:25:41:1:3:25:41:1:3
chr12	4553383	.	A	G	766.37	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.675;QD=63.8645;RBI=0.0380127;REFB=0;REVB=0.0259626;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.62567e-05;OID=.;OPOS=4553383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:21:27:0:0:21:27:0:0
chr12	4554548	.	G	C	1262.81	PASS	AF=0.945055;AO=83;DP=87;FAO=86;FDP=91;FR=.;FRO=5;FSAF=34;FSAR=52;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0151794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1677;QD=55.5079;RBI=0.0513145;REFB=-0.0467472;REVB=0.049018;RO=3;SAF=32;SAR=51;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0194877;STB=0.523023;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.023121;OID=.;OPOS=4554548;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:87:91:3:5:83:86:0.945055:51:32:2:1:52:34:4:1
chr12	4600322	.	CAGAG	C	187.69	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=-0.00524095;FXX=0.0517152;HRUN=1;LEN=4;MLLD=303.483;QD=13.6501;RBI=0.0111926;REFB=-0.00214252;REVB=0.00988976;RO=34;SAF=9;SAR=13;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.363472;STB=0.70031;STBP=0.026;TYPE=del;VARB=0.00354742;OID=.;OPOS=4600323;OREF=AGAG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:22:57:22:55:33:9:13:25:8:99:34:9:13:26:8
chr12	4705317	.	C	T	355.09	PASS	AF=0.931034;AO=26;DP=28;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0385854;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5738;QD=48.9779;RBI=0.059151;REFB=-0.00209887;REVB=0.0448332;RO=2;SAF=9;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0223251;STB=0.50953;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00215012;OID=.;OPOS=4705317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:28:29:2:2:26:27:0.931034:17:9:1:1:17:10:1:1
chr12	4735737	.	A	G	1748.82	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00912021;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3478;QD=60.8287;RBI=0.0744819;REFB=0;REVB=-0.0739215;RO=0;SAF=60;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000338295;OID=.;OPOS=4735737;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:115:0:0:115:115:1:55:60:0:0:55:60:0:0
chr12	4736495	.	C	T	1153.56	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.343;QD=60.7136;RBI=0.0162659;REFB=0;REVB=0.0117465;RO=0;SAF=49;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.93254e-07;OID=.;OPOS=4736495;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:27:49:0:0:27:49:0:0
chr12	4736631	.	A	G	2208.72	PASS	AF=1;AO=139;DP=140;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00934558;FXX=0.0211253;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.0566;QD=63.5602;RBI=0.0168826;REFB=0;REVB=-0.01406;RO=0;SAF=58;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00258446;OID=.;OPOS=4736631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:140:139:0:0:139:139:1:81:58:0:0:81:58:0:0
chr12	4736677	.	G	C,T	1516.09	PASS	AF=0.896226,0.103774;AO=86,11;DP=99;FAO=95,11;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=42,0;FSAR=53,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236186,-0.0162323;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=75.0867,147.798;QD=57.2111;RBI=0.0429124,0.0204093;REFB=0,0;REVB=0.0358278,-0.0123715;RO=0;SAF=34,0;SAR=52,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00209344,0.16422;OID=.,.;OPOS=4736677,4736677;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:45:99:106:0:0:86,11:95,11:0.896226,0.103774:52,11:34,0:0:0:53,11:42,0:0:0
chr12	4736690	.	A	G	1482.27	PASS	AF=0.979381;AO=95;DP=97;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00287999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6325;QD=61.1247;RBI=0.0205273;REFB=-0.134009;REVB=0.0203242;RO=2;SAF=40;SAR=55;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00316308;STB=0.501668;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00244889;OID=.;OPOS=4736690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:97:97:2:2:95:95:0.979381:55:40:1:1:55:40:1:1
chr12	4737318	.	A	G	272.47	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.367;QD=51.8992;RBI=0.0385559;REFB=0;REVB=0.0155193;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000370455;OID=.;OPOS=4737318;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr12	4737459	.	C	T	622.95	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00686789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.025;QD=59.3284;RBI=0.0175303;REFB=-0.0938822;REVB=-0.016129;RO=1;SAF=15;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302497;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000683944;OID=.;OPOS=4737459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:42:42:1:0:41:42:1:26:15:1:0:26:16:0:0
chr12	4737715	.	C	T	857.36	PASS	AF=0.96875;AO=61;DP=64;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0415916;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.724;QD=53.5847;RBI=0.0424669;REFB=0.0178532;REVB=0.00857786;RO=1;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122616;STB=0.512816;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=-0.000159821;OID=.;OPOS=4737715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:64:64:1:2:61:62:0.96875:38:23:0:1:38:24:0:2
chr12	4763555	.	C	T	541.93	PASS	AF=0.528846;AO=55;DP=104;FAO=55;FDP=104;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0592523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2664;QD=20.8434;RBI=0.0623346;REFB=0.00144449;REVB=-0.019359;RO=49;SAF=29;SAR=26;SRF=20;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101708;STB=0.555923;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=-0.00261845;OID=.;OPOS=4763555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:49:49:55:55:0.528846:26:29:20:29:26:29:20:29
chr12	4830000	.	T	G	1617.96	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0398194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.976;QD=59.9246;RBI=0.0434739;REFB=0;REVB=-0.0174469;RO=0;SAF=75;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.48516e-05;OID=.;OPOS=4830000;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:108:0:0:107:108:1:32:75:0:0:33:75:0:0
chr12	4835882	.	T	G	1200.44	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.000446153;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.822;QD=58.5581;RBI=0.0299473;REFB=-0.157879;REVB=0.0299439;RO=2;SAF=43;SAR=37;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215104;STB=0.511361;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.000990869;OID=.;OPOS=4835882;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:2:2:80:80:0.97561:37:43:2:0:37:43:2:0
chr12	4873163	.	G	T	2344.47	PASS	AF=1;AO=141;DP=142;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.9634;QD=63.3641;RBI=0.0397858;REFB=0;REVB=-0.00239114;RO=0;SAF=67;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116178;OID=.;OPOS=4873163;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:148:0:0:141:148:1:74:67:0:0:74:74:0:0
chr12	4881766	.	C	T	937.58	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00637326;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0286;QD=58.5985;RBI=0.0149799;REFB=0;REVB=0.0135565;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000195809;OID=.;OPOS=4881766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:29:35:0:0:29:35:0:0
chr12	4921228	.	T	C	275.39	PASS	AF=0.363636;AO=32;DP=89;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=37;FSRR=19;FWDB=0.0533938;FXX=0.0222198;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9372;QD=12.5176;RBI=0.0693746;REFB=-0.0013695;REVB=0.0442938;RO=56;SAF=14;SAR=18;SRF=37;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243565;STB=0.639193;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00370128;OID=.;OPOS=4921228;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:56:56:32:32:0.363636:18:14:37:19:18:14:37:19
chr12	4921301	.	T	C	104.82	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=38;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00694899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.814;QD=10.7508;RBI=0.0070376;REFB=-0.0243186;REVB=-0.00111322;RO=26;SAF=6;SAR=5;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522814;STB=0.525652;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0522038;OID=.;OPOS=4921301;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:26:26:11:13:0.333333:5:6:13:13:6:7:13:13
chr12	4921689	.	C	T	62.52	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0168339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1264;QD=7.81496;RBI=0.0459526;REFB=-0.00991444;REVB=-0.0427582;RO=21;SAF=5;SAR=4;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142856;STB=0.616187;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0199732;OID=.;OPOS=4921689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:30:32:21:23:9:9:0.28125:4:5:9:12:4:5:9:14
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chr12	4923049	.	T	C	166.99	PASS	AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.015992;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.4806;QD=11.7183;RBI=0.0263781;REFB=0.018652;REVB=0.0209776;RO=35;SAF=10;SAR=11;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114294;STB=0.573288;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=-0.0336184;OID=.;OPOS=4923049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:36:21:21:0.368421:11:10:13:22:11:10:13:23
chr12	4923697	.	G	T	409.86	PASS	AF=0.408333;AO=41;DP=112;FAO=49;FDP=120;FR=.;FRO=71;FSAF=36;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=-0.00153829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.272;QD=13.6621;RBI=0.0122623;REFB=-0.00900574;REVB=0.0121654;RO=71;SAF=33;SAR=8;SRF=31;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442996;STB=0.686498;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0207005;OID=.;OPOS=4923697;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:120:71:71:41:49:0.408333:8:33:31:40:13:36:31:40
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chr12	5021984	.	T	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00772388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2716;QD=53.9106;RBI=0.0460432;REFB=0;REVB=0.0453907;RO=0;SAF=18;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00079995;OID=.;OPOS=5021984;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:6:18:0:0:6:18:0:0
chr12	5022041	.	G	A	69.6	PASS	AF=0.529412;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.104898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1822;QD=16.3761;RBI=0.107023;REFB=-0.0325017;REVB=-0.0212224;RO=9;SAF=5;SAR=3;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278203;STB=0.618816;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0236618;OID=.;OPOS=5022041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:8:8:9:0.529412:3:5:8:1:3:6:7:1
chr12	5022438	.	C	T	83.91	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.019698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.784;QD=10.1705;RBI=0.020569;REFB=-0.014614;REVB=-0.0059222;RO=22;SAF=3;SAR=8;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312258;STB=0.689298;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0177739;OID=.;OPOS=5022438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:8:3:12:10:8:3:12:10
chr12	5023713	.	T	C	126.73	PASS	AF=0.340909;AO=14;DP=43;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00337739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.067;QD=11.5207;RBI=0.0899578;REFB=-0.0161457;REVB=0.0898943;RO=28;SAF=7;SAR=7;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201432;STB=0.622598;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0577783;OID=.;OPOS=5023713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:28:29:14:15:0.340909:7:7:19:9:8:7:19:10
chr12	5023959	.	A	T	149.1	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0291759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7577;QD=18.637;RBI=0.0466221;REFB=0.0209912;REVB=-0.0363646;RO=16;SAF=8;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10988;STB=0.562423;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.0226076;OID=.;OPOS=5023959;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:8:8:10:6:8:8:10:6
chr12	5025094	.	T	C	503.65	PASS	AF=0.539326;AO=47;DP=88;FAO=48;FDP=89;FR=.;FRO=41;FSAF=43;FSAR=5;FSRF=39;FSRR=2;FWDB=0.00300775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.126;QD=22.6359;RBI=0.0303264;REFB=-0.00280118;REVB=0.0301769;RO=40;SAF=43;SAR=4;SRF=39;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192208;STB=0.576625;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00522997;OID=.;OPOS=5025094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:40:41:47:48:0.539326:4:43:39:1:5:43:39:2
chr12	5026471	.	C	T	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0470247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1782;QD=21.2674;RBI=0.0478009;REFB=0.000160148;REVB=-0.00857954;RO=14;SAF=10;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0717644;STB=0.540492;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=-0.00214562;OID=.;OPOS=5026471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:7:10:7:7:7:10:7:7
chr12	5154462	.	T	C,G	775.24	PASS	AF=0.928571,0.0714286;AO=51,4;DP=55;FAO=52,4;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31,0;FSAR=21,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150013,-0.0334749;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=94.7112,140.888;QD=55.3746;RBI=0.0153576,0.0349718;REFB=0,0;REVB=0.00328887,-0.0101221;RO=0;SAF=30,1;SAR=21,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00393043,0.0877563;OID=.,.;OPOS=5154462,5154462;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:15:55:56:0:0:51,4:52,4:0.928571,0.0714286:21,3:30,1:0:0:21,4:31,0:0:0
chr12	5155663	.	A	T	860.73	PASS	AF=0.497143;AO=87;DP=175;FAO=87;FDP=175;FR=.;FRO=88;FSAF=46;FSAR=41;FSRF=42;FSRR=46;FWDB=-0.0566318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.415;QD=19.6738;RBI=0.0588313;REFB=-0.0149608;REVB=0.0159362;RO=88;SAF=46;SAR=41;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470304;STB=0.525881;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0193214;OID=.;OPOS=5155663;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:175:88:88:87:87:0.497143:41:46:42:46:41:46:42:46
chr12	5674754	.	G	A	183.84	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.000585705;FXX=0.0322477;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.124;QD=24.5113;RBI=0.0258307;REFB=-0.0441583;REVB=0.0258241;RO=12;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596025;STB=0.533296;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.020014;OID=.;OPOS=5674754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:30:30:12:12:18:18:0.6:9:9:7:5:9:9:7:5
chr12	6030302	.	T	C	108.22	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0212355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.657;QD=13.5274;RBI=0.03663;REFB=-0.0168161;REVB=0.0298465;RO=14;SAF=7;SAR=6;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374161;STB=0.588105;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0277133;OID=.;OPOS=6030302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:19:13:13:0.40625:6:7:13:1:6:7:13:6
chr12	6030405	.	A	G	388.32	PASS	AF=0.637931;AO=36;DP=57;FAO=37;FDP=58;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=-0.040516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3356;QD=26.7807;RBI=0.0780172;REFB=-0.0650863;REVB=-0.0666719;RO=15;SAF=21;SAR=15;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100183;STB=0.601054;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.018966;OID=.;OPOS=6030405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:15:21:36:37:0.637931:15:21:6:9:16:21:6:15
chr12	6030437	.	A	G	349.25	PASS	AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.0128742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.269;QD=20.2461;RBI=0.0202244;REFB=0.00190576;REVB=-0.0155975;RO=33;SAF=20;SAR=16;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240596;STB=0.632841;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=-0.00169344;OID=.;OPOS=6030437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:33:33:36:36:0.521739:16:20:9:24:16:20:9:24
chr12	6054395	.	A	G	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.054865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.64;QD=56.9567;RBI=0.0566592;REFB=0;REVB=0.0141455;RO=0;SAF=9;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.6508e-05;OID=.;OPOS=6054395;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:43:9:0:0:43:9:0:0
chr12	6061069	.	T	G	176.01	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.00477088;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.96;QD=13.8048;RBI=0.0130032;REFB=-0.0143538;REVB=-0.0120963;RO=30;SAF=15;SAR=5;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107649;STB=0.57823;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0107739;OID=.;OPOS=6061069;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:31:20:20:0.392157:5:15:20:10:5:15:20:11
chr12	6091000	.	A	G	660.79	PASS	AF=0.51145;AO=65;DP=129;FAO=67;FDP=131;FR=.;FRO=64;FSAF=45;FSAR=22;FSRF=43;FSRR=21;FWDB=0.0023869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9599;QD=20.1769;RBI=0.0115944;REFB=-0.0290956;REVB=-0.011346;RO=64;SAF=45;SAR=20;SRF=43;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0213644;STB=0.500129;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0179617;OID=.;OPOS=6091000;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:131:64:64:65:67:0.51145:20:45:43:21:22:45:43:21
chr12	6105387	.	G	A	237.67	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0130485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9577;QD=18.6411;RBI=0.0171643;REFB=-0.0462759;REVB=-0.0111512;RO=24;SAF=19;SAR=6;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329288;STB=0.688958;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0345086;OID=.;OPOS=6105387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:24:26:25:25:0.490196:6:19:10:14:6:19:11:15
chr12	6127535	.	T	G	30.02	PASS	AF=0.0803571;AO=7;DP=109;FAO=9;FDP=112;FR=.;FRO=103;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=51;FSRR=52;FWDB=-0.0073585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.419;QD=1.07198;RBI=0.0160402;REFB=-0.00258718;REVB=-0.0142528;RO=101;SAF=6;SAR=1;SRF=51;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.371073;STB=0.658328;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0383956;OID=.;OPOS=6127535;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:109:112:101:103:7:9:0.0803571:1:6:51:50:3:6:51:52
chr12	6127943	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.314;QD=62.6705;RBI=0.0285386;REFB=0;REVB=-0.00185235;RO=0;SAF=15;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50349e-05;OID=.;OPOS=6127943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:29:15:0:0:29:15:0:0
chr12	6128442	.	G	GC	247.77	PASS	AF=1;AO=4;DP=39;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342344;FXX=0.205076;HRUN=0;LEN=1;MLLD=48.8348;QD=31.9707;RBI=0.0344384;REFB=0;REVB=0.00374355;RO=35;SAF=4;SAR=0;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.569612;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00487595;OID=.;OPOS=6128443;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:4:39:31:31:0:22:9:0:0:3:35:4:0:19:16
chr12	6128443	.	T	C,G	539.96	PASS	AF=0.921053,0.0526316;AO=35,2;DP=39;FAO=35,2;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=19,2;FSAR=16,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0281636,-0.0452493;FXX=0.0256345;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=49.4133,138.195;QD=56.8377;RBI=0.0347898,0.045916;REFB=-0.124783,-0.0955158;REVB=-0.0204242,-0.0077961;RO=1;SAF=19,2;SAR=16,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0239852,0;STB=0.512813,0.5;STBP=0.511,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0112584,0.0786591;OID=.,.;OPOS=6128443,6128443;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:39:38:1:1:35,2:35,2:0.921053,0.0526316:16,0:19,2:1:0:16,0:19,2:1:0
chr12	6143984	.	T	C	885.55	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000198303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.009;QD=58.0689;RBI=0.00894385;REFB=0;REVB=0.00894165;RO=0;SAF=40;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47767e-05;OID=.;OPOS=6143984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:20:40:0:0:20:41:0:0
chr12	6172202	.	T	C	2286.53	PASS	AF=1;AO=137;DP=137;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0602973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.893;QD=63.5149;RBI=0.0628733;REFB=0;REVB=0.0178126;RO=0;SAF=72;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126458;OID=.;OPOS=6172202;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:137:144:0:0:137:144:1:65:72:0:0:65:79:0:0
chr12	6174414	.	T	G	409.82	PASS	AF=0.518987;AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=79;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00246639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.7;QD=20.7505;RBI=0.0247769;REFB=-0.0294468;REVB=0.0246539;RO=38;SAF=20;SAR=21;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.03345;STB=0.51851;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0282286;OID=.;OPOS=6174414;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:38:38:41:41:0.518987:21:20:20:18:21:20:20:18
chr12	6174423	.	T	A	370.05	PASS	AF=0.506667;AO=38;DP=75;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00917814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.274;QD=19.7359;RBI=0.0402866;REFB=0.00638717;REVB=-0.0392272;RO=36;SAF=19;SAR=19;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506663;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=-0.0064166;OID=.;OPOS=6174423;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:36:37:38:38:0.506667:19:19:18:18:19:19:19:18
chr12	6204902	.	CA	C	163.11	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0162821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7112;QD=20.3888;RBI=0.0172534;REFB=-0.00653556;REVB=-0.00570703;RO=15;SAF=15;SAR=2;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23198;STB=0.633619;STBP=0.25;TYPE=del;VARB=0.00520245;OID=.;OPOS=6204903;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.53125:17:32:17:32:15:15:2:11:4:99:15:15:2:11:4
chr12	6344600	.	C	A	246.85	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0222687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.286;QD=17.9529;RBI=0.0284358;REFB=-0.00401081;REVB=0.0176833;RO=27;SAF=16;SAR=11;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674346;STB=0.547909;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0041423;OID=.;OPOS=6344600;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:27:28:27:27:0.490909:11:16:14:13:11:16:14:14
chr12	6421495	.	G	A	758.21	PASS	AF=0.509934;AO=77;DP=153;FAO=77;FDP=151;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=42;FSRR=32;FWDB=-0.027053;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.97;QD=20.085;RBI=0.0271447;REFB=-0.00361881;REVB=0.00222969;RO=72;SAF=33;SAR=44;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12404;STB=0.568164;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0037618;OID=.;OPOS=6421495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:151:72:74:77:77:0.509934:44:33:41:31:44:33:42:32
chr12	6427052	.	C	T	259.08	PASS	AF=0.356322;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=87;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.0195743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.3928;QD=11.9117;RBI=0.0230164;REFB=-0.0137594;REVB=0.0121079;RO=55;SAF=14;SAR=17;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163634;STB=0.587876;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0225456;OID=.;OPOS=6427052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:55:56:31:31:0.356322:17:14:33:22:17:14:33:23
chr12	6428116	.	T	G	319.99	PASS	AF=0.4375;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00172594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.887;QD=15.9994;RBI=0.0271528;REFB=-0.0147633;REVB=-0.0270979;RO=45;SAF=16;SAR=19;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760563;STB=0.542833;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0293687;OID=.;OPOS=6428116;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:45:45:35:35:0.4375:19:16:24:21:19:16:24:21
chr12	6439470	.	A	G	595.37	PASS	AF=0.911111;AO=40;DP=45;FAO=41;FDP=45;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0018583;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=240.077;QD=52.9221;RBI=0.0164624;REFB=-0.12432;REVB=0.0163572;RO=3;SAF=20;SAR=20;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653037;STB=0.523282;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00113099;OID=.;OPOS=6439470;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:45:45:3:4:40:41:0.911111:20:20:3:0:21:20:3:1
chr12	6442346	.	A	G	365.01	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00783793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7687;QD=52.1442;RBI=0.0117451;REFB=-0.0313372;REVB=-0.00874718;RO=1;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0238509;STB=0.512811;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0155305;OID=.;OPOS=6442346;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:19:8:0:1:19:8:0:1
chr12	6457062	.	T	C	990.57	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0581595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3115;QD=59.1387;RBI=0.0655534;REFB=0;REVB=-0.0302445;RO=0;SAF=36;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000368924;OID=.;OPOS=6457062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:31:36:0:0:31:36:0:0
chr12	6464581	.	C	T	76.67	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00744041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.257;QD=12.7789;RBI=0.0264063;REFB=-0.00907425;REVB=0.0253364;RO=14;SAF=9;SAR=1;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.519327;STB=0.81741;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0496909;OID=.;OPOS=6464581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:1:9:7:7:1:9:7:7
chr12	6484709	.	T	C	694.72	PASS	AF=1;AO=32;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.128078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4176;QD=54.4876;RBI=0.130404;REFB=0;REVB=-0.0245195;RO=0;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0017901;OID=.;OPOS=6484709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:32:51:1:22:10:0:0:22:29:0:0
chr12	6495275	.	C	A	445.47	PASS	AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.040689;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.78;QD=52.4088;RBI=0.0416517;REFB=-0.066197;REVB=0.00890321;RO=2;SAF=8;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373388;STB=0.519988;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00321996;OID=.;OPOS=6495275;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:34:2:2:32:32:0.941176:24:8:0:2:24:8:0:2
chr12	6500105	.	T	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0759931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.644;QD=37.4885;RBI=0.0788649;REFB=0;REVB=0.0210884;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137197;OID=.;OPOS=6500105;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr12	6560473	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.303;QD=51.9167;RBI=0.0128426;REFB=0;REVB=-0.000673033;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.32685e-05;OID=.;OPOS=6560473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:10:11:0:0:10:11:0:0
chr12	6562285	.	C	T	391.28	PASS	AF=0.557143;AO=38;DP=69;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=7;FWDB=-0.0121836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.245;QD=22.359;RBI=0.0172298;REFB=-0.0160002;REVB=0.012183;RO=29;SAF=26;SAR=12;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103684;STB=0.543978;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.0143434;OID=.;OPOS=6562285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:29:31:38:39:0.557143:12:26:23:6:12:27:24:7
chr12	6562293	.	C	T	401.57	PASS	AF=0.533333;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=75;FR=.;FRO=35;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.00837084;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.717;QD=21.4169;RBI=0.0138946;REFB=-0.0127539;REVB=-0.01109;RO=34;SAF=29;SAR=11;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108047;STB=0.506231;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.00912937;OID=.;OPOS=6562293;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:34:35:40:40:0.533333:11:29:25:9:11:29:25:10
chr12	6562753	.	A	G	286.09	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0187124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5097;QD=20.4353;RBI=0.0193358;REFB=-0.0166465;REVB=-0.0048703;RO=25;SAF=13;SAR=17;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10397;STB=0.566622;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00972791;OID=.;OPOS=6562753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:25:26:30:30:0.535714:17:13:14:11:17:13:15:11
chr12	6562810	.	A	G	61.81	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=34;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0251086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.932;QD=7.27128;RBI=0.0293618;REFB=-0.000972965;REVB=-0.0152207;RO=25;SAF=4;SAR=5;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134386;STB=0.58423;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.00355719;OID=.;OPOS=6562810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:25:25:9:9:0.264706:5:4:14:11:5:4:14:11
chr12	6562823	.	C	T	34.57	PASS	AF=0.193548;AO=6;DP=31;FAO=6;FDP=31;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0553542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.902;QD=4.46115;RBI=0.057175;REFB=-0.0120788;REVB=0.0143141;RO=25;SAF=3;SAR=3;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0710764;STB=0.548228;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0336233;OID=.;OPOS=6562823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:31:31:25:25:6:6:0.193548:3:3:14:11:3:3:14:11
chr12	6562836	.	G	A	35.38	PASS	AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0121756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.486;QD=5.44271;RBI=0.0201406;REFB=-0.0050781;REVB=0.0160437;RO=20;SAF=3;SAR=3;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0212789;OID=.;OPOS=6562836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:20:20:6:6:0.230769:3:3:10:10:3:3:10:10
chr12	6572048	.	A	G	181.12	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0395866;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.9138;QD=13.9322;RBI=0.0908192;REFB=0.00552858;REVB=-0.0817375;RO=30;SAF=9;SAR=12;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395583;STB=0.513953;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=-0.0105498;OID=.;OPOS=6572048;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:31:21:21:0.403846:12:9:14:16:12:9:14:17
chr12	6573146	.	T	C	346.5	PASS	AF=0.422222;AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=-0.0163986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2458;QD=15.3999;RBI=0.0766661;REFB=-0.000600083;REVB=-0.0748917;RO=50;SAF=23;SAR=15;SRF=17;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263339;STB=0.636608;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.000339856;OID=.;OPOS=6573146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:50:52:38:38:0.422222:15:23:17:33:15:23:19:33
chr12	6575044	.	G	T	277.41	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0727248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2167;QD=20.5486;RBI=0.0727271;REFB=-0.018932;REVB=-0.000570183;RO=25;SAF=16;SAR=13;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266087;STB=0.51479;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0256151;OID=.;OPOS=6575044;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:13:16:13:12:13:16:13:12
chr12	6619280	.	T	C	253.2	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=-0.00678997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.491;QD=19.1095;RBI=0.0190283;REFB=-0.0200438;REVB=0.0177756;RO=25;SAF=20;SAR=7;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654428;STB=0.530012;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0298288;OID=.;OPOS=6619280;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:26:27:27:0.509434:7:20:17:8:7:20:18:8
chr12	6619284	.	C	G	229.21	PASS	AF=0.480769;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.0102339;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.907;QD=17.6311;RBI=0.0105136;REFB=-0.00715644;REVB=-0.00240896;RO=26;SAF=17;SAR=8;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054188;STB=0.537176;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0299081;OID=.;OPOS=6619284;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:26:27:25:25:0.480769:8:17:19:7:8:17:20:7
chr12	6631169	.	C	A	240.49	PASS	AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0116852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2673;QD=21.3771;RBI=0.0208881;REFB=0.00653321;REVB=-0.0173138;RO=22;SAF=10;SAR=13;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0636784;STB=0.535684;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=-0.00557932;OID=.;OPOS=6631169;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:13:10:8:14:13:10:8:14
chr12	6637845	.	T	C	318.44	PASS	AF=0.581818;AO=32;DP=55;FAO=32;FDP=55;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00185534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.49;QD=23.1593;RBI=0.00213143;REFB=-0.0303068;REVB=-0.00104914;RO=23;SAF=21;SAR=11;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206349;STB=0.613962;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0198373;OID=.;OPOS=6637845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:23:23:32:32:0.581818:11:21:9:14:11:21:9:14
chr12	6638116	.	C	T	362.23	PASS	AF=0.580645;AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00304315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.771;QD=23.3699;RBI=0.0040686;REFB=-0.0149078;REVB=0.00270051;RO=25;SAF=20;SAR=16;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00335679;STB=0.509086;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.00717119;OID=.;OPOS=6638116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:25:26:36:36:0.580645:16:20:14:11:16:20:15:11
chr12	6639088	.	A	G	1590.33	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0572743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9124;QD=60.0125;RBI=0.0620742;REFB=0;REVB=0.0239345;RO=0;SAF=57;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148009;OID=.;OPOS=6639088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:100:106:0:0:100:106:1:43:57:0:0:46:60:0:0
chr12	6660665	.	A	G	363.84	PASS	AF=0.487179;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=0.0168829;FXX=0.0126566;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.8571;QD=18.6582;RBI=0.0319594;REFB=0.0202519;REVB=0.0271362;RO=41;SAF=18;SAR=20;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101385;STB=0.550994;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=-0.014263;OID=.;OPOS=6660665;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:41:40:38:38:0.487179:20:18:15:26:20:18:15:25
chr12	6690909	.	C	T	190.92	PASS	AF=0.363636;AO=24;DP=66;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=31;FWDB=0.0203443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.829;QD=11.5708;RBI=0.0242181;REFB=0.00189914;REVB=-0.0131389;RO=41;SAF=10;SAR=14;SRF=10;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203817;STB=0.604758;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.00255446;OID=.;OPOS=6690909;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:41:42:24:24:0.363636:14:10:10:31:14:10:11:31
chr12	6729956	.	G	A	118.91	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.0512489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.151;QD=13.2123;RBI=0.0767601;REFB=-0.0247247;REVB=-0.057146;RO=22;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.305179;STB=0.67669;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0753047;OID=.;OPOS=6729956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:6:8:6:16:6:8:6:16
chr12	6747295	.	G	A	83.9	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0489593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1377;QD=10.1697;RBI=0.14283;REFB=-0.000794802;REVB=-0.134176;RO=21;SAF=10;SAR=1;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.510626;STB=0.812299;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=-0.00634533;OID=.;OPOS=6747295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:32:33:21:22:11:11:0.333333:1:10:12:9:1:10:13:9
chr12	6835068	.	A	G	223.82	PASS	AF=0.470588;AO=23;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.010384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2971;QD=17.5543;RBI=0.0281538;REFB=-0.0347485;REVB=0.0261689;RO=27;SAF=6;SAR=17;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302085;STB=0.677262;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0584912;OID=.;OPOS=6835068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:27:27:23:24:0.470588:17:6:15:12:18:6:15:12
chr12	6835081	.	G	A	93.77	PASS	AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00043852;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.583;QD=10.1369;RBI=0.00831257;REFB=-0.0178843;REVB=0.008301;RO=24;SAF=4;SAR=8;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191176;STB=0.629409;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0359648;OID=.;OPOS=6835081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:37:24:25:12:12:0.324324:8:4:12:12:8:4:13:12
chr12	6836852	.	A	G	670.24	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0756874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8118;QD=62.3476;RBI=0.0869209;REFB=0;REVB=0.0427395;RO=0;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00156704;OID=.;OPOS=6836852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:14:29:0:0:14:29:0:0
chr12	6836913	.	G	T	117.75	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00391463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.662;QD=12.3948;RBI=0.0185555;REFB=0.00156734;REVB=-0.0181379;RO=24;SAF=10;SAR=4;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0603055;STB=0.535662;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=-0.00267273;OID=.;OPOS=6836913;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:4:10:16:8:4:10:16:8
chr12	6840209	.	G	A	94.66	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0226477;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6215;QD=10.5178;RBI=0.0230297;REFB=-0.00516953;REVB=-0.00417736;RO=22;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279135;STB=0.615187;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0164694;OID=.;OPOS=6840209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:37:36:22:24:12:12:0.333333:4:8:9:13:4:8:12:12
chr12	6858126	.	G	A	1749.37	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0485899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3965;QD=60.8478;RBI=0.051137;REFB=0;REVB=-0.015938;RO=0;SAF=40;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4984e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131249;OID=.;OPOS=6858126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:115:0:0:115:115:1:75:40:0:0:75:40:0:0
chr12	6887020	.	T	C	1607.12	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.071;QD=64.2847;RBI=0.0428734;REFB=0;REVB=0.0245849;RO=0;SAF=65;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1679e-05;OID=.;OPOS=6887020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:100:0:0:98:100:1:33:65:0:0:33:67:0:0
chr12	6926363	.	T	C	280.76	PASS	AF=0.521127;AO=20;DP=71;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0131939;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.0992;QD=15.8174;RBI=0.0438895;REFB=-0.0760435;REVB=-0.0418594;RO=19;SAF=1;SAR=19;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468157;STB=0.508821;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0961648;OID=.;OPOS=6926363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:19:34:20:37:0.521127:19:1:5:14:20:17:15:19
chr12	6928075	.	T	C	140.45	PASS	AF=0.555556;AO=14;DP=26;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0310284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.349;QD=20.8069;RBI=0.0466006;REFB=-0.0435846;REVB=0.0347686;RO=12;SAF=2;SAR=12;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323957;STB=0.694348;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0218783;OID=.;OPOS=6928075;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:12:12:14:15:0.555556:12:2:5:7:13:2:5:7
chr12	6928586	.	CA	AG	1371.42	PASS	AF=0.93;AO=92;DP=100;FAO=93;FDP=100;FR=.;FRO=7;FSAF=48;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0615963;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=46.8911;QD=54.8569;RBI=0.0626419;REFB=-0.0617877;REVB=-0.0113973;RO=5;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498098;STB=0.516126;STBP=0.287;TYPE=mnp;VARB=0.00505557;OID=.;OPOS=6928586;OREF=CA;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:100:100:5:7:92:93:0.93:45:47:0:5:45:48:2:5
chr12	6939850	.	A	G	243.79	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0586358;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=110.115;QD=15.237;RBI=0.0589115;REFB=0.00304855;REVB=0.00569361;RO=36;SAF=12;SAR=16;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0715461;STB=0.540511;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=-0.00371129;OID=.;OPOS=6939850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:36:28:28:0.4375:16:12:18:18:16:12:18:18
chr12	6941021	.	G	A	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0351832;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=234.959;QD=12.6376;RBI=0.0353079;REFB=-0.00922291;REVB=0.00296464;RO=21;SAF=5;SAR=8;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289406;STB=0.669353;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00895434;OID=.;OPOS=6941021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:8:5:14:7:8:5:14:7
chr12	6942823	.	A	G	728.87	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.061855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.84;QD=57.1662;RBI=0.0693202;REFB=0;REVB=0.031293;RO=0;SAF=31;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159436;OID=.;OPOS=6942823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:20:31:0:0:20:31:0:0
chr12	6946247	.	G	T	77.18	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0059704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.234;QD=14.7009;RBI=0.00829527;REFB=-0.0399932;REVB=0.00575898;RO=10;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171427;STB=0.622399;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0546339;OID=.;OPOS=6946247;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:21:21:10:11:10:10:0.47619:4:6:4:6:4:6:4:7
chr12	6948528	.	T	C	223.16	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0458402;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.618;QD=18.5965;RBI=0.0458406;REFB=-0.0257484;REVB=0.000192252;RO=26;SAF=12;SAR=10;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0678553;STB=0.538427;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.0221687;OID=.;OPOS=6948528;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:26:26:22:22:0.458333:10:12:16:10:10:12:16:10
chr12	6950930	.	AT	A	142.5	PASS	AF=0.482759;AO=27;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=21;FWDB=0.0133148;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.8739;QD=9.82749;RBI=0.0464591;REFB=0.0454661;REVB=0.0445102;RO=29;SAF=9;SAR=18;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240726;STB=0.512811;STBP=0.875;TYPE=del;VARB=-0.0250757;OID=.;OPOS=6950931;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.482759:27:58:28:58:30:9:19:9:21:99:29:9:18:9:20
chr12	6954875	.	C	T	277.7	PASS	AF=0.380952;AO=32;DP=85;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=0.0186895;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.704;QD=13.2238;RBI=0.0238396;REFB=-0.0276114;REVB=0.0147996;RO=48;SAF=11;SAR=21;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.082427;STB=0.552598;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0425042;OID=.;OPOS=6954875;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:48:52:32:32:0.380952:21:11:20:28:21:11:22:30
chr12	6965194	.	A	G	604.88	PASS	AF=0.555556;AO=54;DP=99;FAO=55;FDP=99;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=41;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.00398265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.198;QD=24.4396;RBI=0.0139345;REFB=-0.0199151;REVB=0.0133532;RO=42;SAF=14;SAR=40;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219792;STB=0.636006;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0229598;OID=.;OPOS=6965194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:42:44:54:55:0.555556:40:14:21:21:41:14:23:21
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chr12	7023123	.	A	G	295.74	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0470287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9311;QD=20.396;RBI=0.0524587;REFB=-0.0015673;REVB=0.0232426;RO=27;SAF=20;SAR=11;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232423;STB=0.629129;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00263083;OID=.;OPOS=7023123;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:11:20:10:17:11:20:10:17
chr12	7045174	.	TGGGGGT	CTGGGGT,TGGGGT,TGGGGTA	43.35	PASS	AF=0,0.243243,0.027027;AO=3,5,2;DP=38;FAO=0,9,1;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=0,5,1;FSAR=0,4,0;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0251519,-0.0484465,-0.0170492;FXX=0;HRUN=1,5,5;LEN=2,1,2;MLLD=81.5353,16.1933,31.873;QD=4.68597;RBI=0.0332155,0.0510146,0.0405861;REFB=0.00260064,-0.0255903,-0.0113718;REVB=-0.0216945,-0.015982,0.0368315;RO=26;SAF=3,1,2;SAR=0,4,0;SRF=13;SRR=13;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.564679,-0.365771,0.476737;STB=0.5,0.527888,0.989488;STBP=1,0.788,0.485;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0,0.0550247,0.103161;OID=.,.,.;OPOS=7045174,7045175,7045179;OREF=TG,G,GT;OALT=CT,-,TA;OMAPALT=CTGGGGT,TGGGGT,TGGGGTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:36:38:37:26:27:3,5,2:0,9,1:0,0.243243,0.027027:0,4,0:3,1,2:13:13:0,4,0:0,5,1:14:13
chr12	7055860	.	T	C	60.04	PASS	AF=0.219512;AO=9;DP=41;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=-0.0264645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.105;QD=5.85728;RBI=0.0464125;REFB=-0.00648192;REVB=-0.0381281;RO=32;SAF=1;SAR=8;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478346;STB=0.82108;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0322056;OID=.;OPOS=7055860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:41:41:32:32:9:9:0.219512:8:1:14:18:8:1:14:18
chr12	7065635	.	T	C	889.7	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.047071;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.449;QD=58.3408;RBI=0.0664774;REFB=0;REVB=0.0469422;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.19586e-05;OID=.;OPOS=7065635;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:25:36:0:0:25:36:0:0
chr12	7079215	.	T	G	727.72	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.628;QD=63.2798;RBI=0.0107496;REFB=0;REVB=-0.000174571;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.25656e-05;OID=.;OPOS=7079215;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr12	7080211	.	G	GGC	391.62	PASS	AF=1;AO=9;DP=36;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0802644;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=2;MLLD=97.4341;QD=46.0726;RBI=0.272473;REFB=0;REVB=0.260383;RO=27;SAF=9;SAR=0;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.778699;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00362173;OID=.;OPOS=7080212;OREF=-;OALT=GC;OMAPALT=GGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:9:36:34:34:0:17:17:0:0:4:27:9:0:10:17
chr12	7080212	.	T	C,G	470.8	PASS	AF=0.714286,0.257143;AO=25,9;DP=35;FAO=25,9;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=9,8;FSAR=16,1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0140458,0.00136022;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=103.663,16.1112;QD=53.8061;RBI=0.0517762,0.0469205;REFB=0.0467884,-0.122437;REVB=0.0498347,-0.0469008;RO=1;SAF=9,8;SAR=16,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0487725,-0.0524171;STB=0.526294,0.529348;STBP=0.276,0.657;TYPE=snp,snp;VARB=0.0024881,0.0842958;OID=.,.;OPOS=7080212,7080212;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:57:35:35:1:1:25,9:25,9:0.714286,0.257143:16,1:9,8:1:0:16,1:9,8:1:0
chr12	7090742	.	G	A	212.94	PASS	AF=0.45283;AO=22;DP=51;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00308332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.922;QD=16.0706;RBI=0.0240067;REFB=-0.0285527;REVB=0.0238079;RO=29;SAF=21;SAR=1;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.561268;STB=0.742072;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0371601;OID=.;OPOS=7090742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:53:29:29:22:24:0.45283:1:21:20:9:2:22:20:9
chr12	7189402	.	T	TC	41.84	PASS	AF=0.185185;AO=12;DP=55;FAO=10;FDP=54;FR=.;FRO=44;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=13;FWDB=-0.0417466;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=35.2113;QD=3.09915;RBI=0.0603881;REFB=-0.0227229;REVB=-0.0436343;RO=43;SAF=1;SAR=11;SRF=32;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.722273;STB=0.928311;STBP=0.013;TYPE=ins;VARB=0.120475;OID=.;OPOS=7189403;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.185185:12:55:10:54:44:1:9:31:13:41:43:1:11:32:11
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chr12	7241570	.	C	T	300.33	PASS	AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0490567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.944;QD=24.5163;RBI=0.0512529;REFB=-0.00788961;REVB=-0.0148426;RO=22;SAF=10;SAR=17;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712664;STB=0.539653;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.00382494;OID=.;OPOS=7241570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:17:10:10:12:17:10:10:12
chr12	7242204	.	C	T	532.67	PASS	AF=0.456;AO=55;DP=123;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=43;FSRR=25;FWDB=0.0553399;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3262;QD=17.0454;RBI=0.134171;REFB=-0.00578086;REVB=0.122227;RO=68;SAF=34;SAR=21;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01493;STB=0.520416;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.00831308;OID=.;OPOS=7242204;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:125:68:68:55:57:0.456:21:34:43:25:23:34:43:25
chr12	7242299	.	G	A	623.76	PASS	AF=0.434783;AO=67;DP=159;FAO=70;FDP=161;FR=.;FRO=91;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=49;FSRR=42;FWDB=0.00903914;FXX=0.024241;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.677;QD=15.497;RBI=0.00939386;REFB=-0.0250776;REVB=-0.00255707;RO=91;SAF=40;SAR=27;SRF=48;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0731071;STB=0.535704;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0309153;OID=.;OPOS=7242299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:161:91:91:67:70:0.434783:27:40:48:43:28:42:49:42
chr12	7281303	.	G	A	271.69	PASS	AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.00854124;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=322.477;QD=20.8996;RBI=0.00923594;REFB=-0.0145217;REVB=-0.00351425;RO=24;SAF=18;SAR=10;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100271;STB=0.555518;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.013244;OID=.;OPOS=7281303;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:24:28:28:0.538462:10:18:18:6:10:18:18:6
chr12	7281317	.	C	T	765.29	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2083;QD=56.6879;RBI=0.0343516;REFB=0;REVB=0.0319562;RO=0;SAF=37;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00049081;OID=.;OPOS=7281317;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:15:37:0:0:17:37:0:0
chr12	7463241	.	A	T	545.03	PASS	AF=0.338462;AO=54;DP=198;FAO=66;FDP=195;FR=.;FRO=129;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=57;FSRR=72;FWDB=-0.0165761;FXX=0.0151508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.699;QD=11.1801;RBI=0.0166129;REFB=-0.00673815;REVB=0.00110476;RO=110;SAF=16;SAR=38;SRF=45;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145658;STB=0.565304;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.0120467;OID=.;OPOS=7463241;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:198:195:110:129:54:66:0.338462:38:16:45:65:43:23:57:72
chr12	7551022	.	A	T	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.29;QD=59.4356;RBI=0.0260137;REFB=0;REVB=0.0163707;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.50655e-05;OID=.;OPOS=7551022;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
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chr12	7772997	.	G	A	1700.96	PASS	AF=1;AO=111;DP=113;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466516;FXX=0.0175423;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.056;QD=60.7487;RBI=0.0568617;REFB=0;REVB=0.0325096;RO=0;SAF=71;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.69294e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158043;OID=.;OPOS=7772997;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:112:0:0:111:112:1:40:71:0:0:41:71:0:0
chr12	7773058	.	C	A	1869.77	PASS	AF=1;AO=114;DP=119;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00230175;FXX=0.0238076;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.009;QD=60.8056;RBI=0.068509;REFB=0;REVB=0.0684703;RO=0;SAF=69;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151932;OID=.;OPOS=7773058;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:123:0:0:114:123:1:45:69:0:0:52:71:0:0
chr12	7773096	.	T	C	1325.88	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0885912;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.776;QD=62.3945;RBI=0.0893493;REFB=0;REVB=0.011614;RO=0;SAF=47;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.83693e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00031296;OID=.;OPOS=7773096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:38:47:0:0:38:47:0:0
chr12	7805236	.	C	G	306.06	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0453827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2424;QD=20.4038;RBI=0.0923271;REFB=-0.0175183;REVB=-0.0804034;RO=28;SAF=17;SAR=15;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861612;STB=0.547787;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0106164;OID=.;OPOS=7805236;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:15:17:12:16:15:17:12:16
chr12	7867847	.	G	C	606.02	PASS	AF=0.463235;AO=60;DP=134;FAO=63;FDP=136;FR=.;FRO=73;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=46;FSRR=27;FWDB=0.00484468;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.158;QD=17.8242;RBI=0.0752241;REFB=0.00754921;REVB=0.0750679;RO=68;SAF=38;SAR=22;SRF=44;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142026;STB=0.502764;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.00849844;OID=.;OPOS=7867847;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:136:68:73:60:63:0.463235:22:38:44:24:23:40:46:27
chr12	7894056	.	G	A	376.18	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=-0.0188529;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1989;QD=18.5768;RBI=0.0401529;REFB=-0.0370454;REVB=-0.0354517;RO=42;SAF=15;SAR=24;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753895;STB=0.541901;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0390581;OID=.;OPOS=7894056;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:42:42:39:39:0.481481:24:15:13:29:24:15:13:29
chr12	7967071	.	G	A	374.35	PASS	AF=0.933333;AO=25;DP=29;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0399797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2093;QD=49.9139;RBI=0.0591201;REFB=-0.012197;REVB=-0.0435524;RO=3;SAF=7;SAR=18;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906178;STB=0.513504;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0137664;OID=.;OPOS=7967071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:30:3:2:25:28:0.933333:18:7:2:1:19:9:1:1
chr12	7967095	.	G	A	35.75	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0216298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.938;QD=5.95779;RBI=0.0319205;REFB=-0.00780965;REVB=-0.0234749;RO=17;SAF=1;SAR=5;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338286;STB=0.71347;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0225965;OID=.;OPOS=7967095;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:24:24:17:18:6:6:0.25:5:1:7:10:5:1:7:11
chr12	8037075	.	C	A	199.87	PASS	AF=0.428571;AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0408008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.6768;QD=14.2765;RBI=0.0992681;REFB=-0.0355329;REVB=-0.0904956;RO=30;SAF=10;SAR=13;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195363;STB=0.617551;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0431687;OID=.;OPOS=8037075;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:56:30:32:23:24:0.428571:13:10:19:11:14:10:20:12
chr12	8043688	.	G	C	1400.33	PASS	AF=0.989011;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00984904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.7;QD=61.5531;RBI=0.015211;REFB=-0.0526791;REVB=0.0115918;RO=1;SAF=45;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104166;STB=0.505493;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000134048;OID=.;OPOS=8043688;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:91:1:1:90:90:0.989011:45:45:1:0:45:45:1:0
chr12	8074192	.	G	A	218.18	PASS	AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=26;FWDB=0.0217789;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.755;QD=13.6365;RBI=0.0239339;REFB=-0.0187073;REVB=-0.00992506;RO=37;SAF=8;SAR=18;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126371;STB=0.505614;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0326227;OID=.;OPOS=8074192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:37:38:26:26:0.40625:18:8:11:26:18:8:12:26
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chr12	8208083	.	TAA	ATT	132.12	PASS	AF=0.606061;AO=2;DP=21;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0291298;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=3;MLLD=62.3081;QD=16.0145;RBI=0.0776048;REFB=-0.107706;REVB=0.0719302;RO=0;SAF=0;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.515136;STBP=0.827;TYPE=mnp;VARB=0.0668973;OID=.;OPOS=8208083;OREF=TAA;OALT=ATT;OMAPALT=ATT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:21:33:0:13:2:20:0.606061:2:0:0:0:10:10:6:7
chr12	8249050	.	C	G	1020.59	PASS	AF=1;AO=68;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0724367;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0371;QD=58.3192;RBI=0.073516;REFB=-0.0383838;REVB=0.0125513;RO=0;SAF=21;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0033243;OID=.;OPOS=8249050;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:71:70:0:0:68:70:1:47:21:0:0:47:23:0:0
chr12	8329652	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0061742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7187;QD=43.4862;RBI=0.03188;REFB=0;REVB=0.0312764;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120995;OID=.;OPOS=8329652;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0
chr12	8329700	.	A	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0022604;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.327;QD=33.4282;RBI=0.0713975;REFB=0;REVB=0.0713618;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000744739;OID=.;OPOS=8329700;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr12	8329833	.	G	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.1899;QD=35.5759;RBI=0.0388414;REFB=0;REVB=0.015844;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.001632;OID=.;OPOS=8329833;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
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chr12	8376110	.	T	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.277;QD=60.6103;RBI=0.0169453;REFB=0;REVB=0.0134755;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20894e-05;OID=.;OPOS=8376110;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0
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chr12	8693333	.	G	A	129.34	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0172832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5426;QD=21.5571;RBI=0.0185979;REFB=0.0271108;REVB=0.00686816;RO=10;SAF=6;SAR=8;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984057;STB=0.555478;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=-0.00964565;OID=.;OPOS=8693333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:24:24:10:10:14:14:0.583333:8:6:3:7:8:6:3:7
chr12	8757481	.	G	A	433.29	PASS	AF=0.458333;AO=44;DP=96;FAO=44;FDP=96;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=-0.0114314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.552;QD=18.0538;RBI=0.0161739;REFB=-0.00681425;REVB=0.011442;RO=52;SAF=23;SAR=21;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528178;STB=0.529482;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00982044;OID=.;OPOS=8757481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:52:52:44:44:0.458333:21:23:30:22:21:23:30:22
chr12	8808006	.	T	C	253.1	PASS	AF=1;AO=15;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306948;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.484;QD=48.2088;RBI=0.0349226;REFB=-0.0709462;REVB=0.0166559;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00050824;OID=.;OPOS=8808006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:21:21:0:0:15:21:1:7:8:0:0:11:10:0:0
chr12	8926011	.	T	C	2586.44	PASS	AF=1;AO=163;DP=163;FAO=167;FDP=167;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.907;QD=61.9506;RBI=0.0649082;REFB=0;REVB=0.062922;RO=0;SAF=90;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.38623e-05;OID=.;OPOS=8926011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:163:167:0:0:163:167:1:73:90:0:0:76:91:0:0
chr12	8975901	.	C	T	642.24	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0522937;FXX=0.0227221;HRUN=3;LEN=1;MLLD=259.049;QD=59.7434;RBI=0.0532789;REFB=-0.0604632;REVB=0.010199;RO=1;SAF=25;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184086;STB=0.509799;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00195995;OID=.;OPOS=8975901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:43:1:1:42:42:0.976744:17:25:1:0:17:25:1:0
chr12	9004512	.	G	A	916.45	PASS	AF=1;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366246;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.031;QD=58.1876;RBI=0.0426521;REFB=0;REVB=0.0218596;RO=0;SAF=25;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00195839;OID=.;OPOS=9004512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:62:63:1:37:25:0:0:37:26:0:0
chr12	9004892	.	C	A	747.07	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.423;QD=63.5802;RBI=0.0636804;REFB=0;REVB=0.0617442;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297113;OID=.;OPOS=9004892;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:47:0:0:45:47:1:23:22:0:0:25:22:0:0
chr12	9010671	.	G	A	145.83	PASS	AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.00176591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.139;QD=25.3616;RBI=0.0181136;REFB=0.00758379;REVB=-0.0180274;RO=8;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399048;STB=0.721943;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00962844;OID=.;OPOS=9010671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:8:8:15:15:0.652174:10:5:8:0:10:5:8:0
chr12	9013755	.	C	T	140.95	PASS	AF=0.316667;AO=19;DP=60;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=1;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0213325;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.178;QD=9.39679;RBI=0.0721516;REFB=-0.003548;REVB=-0.0689259;RO=41;SAF=1;SAR=18;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.705852;STB=0.92732;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0216827;OID=.;OPOS=9013755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:41:41:19:19:0.316667:18:1:24:17:18:1:24:17
chr12	9016573	.	A	G	1208.94	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00784346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.871;QD=61.212;RBI=0.0103427;REFB=0;REVB=0.00674184;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01534e-05;OID=.;OPOS=9016573;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:40:39:0:0:40:39:0:0
chr12	9020489	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.782;QD=52.6127;RBI=0.118803;REFB=0;REVB=0.113914;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000772022;OID=.;OPOS=9020489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:8:14:0:0:8:14:0:0
chr12	9020912	.	A	G	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.00452122;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4016;QD=18.9995;RBI=0.0250715;REFB=-0.0120657;REVB=0.0246605;RO=17;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.014963;OID=.;OPOS=9020912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:8:9:9:8:8:9:9:8
chr12	9070366	.	T	A	728.63	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370209;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=252.992;QD=54.9909;RBI=0.0370226;REFB=-0.0889667;REVB=0.000358781;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407404;OID=.;OPOS=9070366;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:53:53:0:0:52:53:1:20:32:0:0:21:32:0:0
chr12	9074259	.	C	T	347.94	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0605002;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=199.946;QD=51.5464;RBI=0.062116;REFB=-0.0665346;REVB=0.0140756;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.513503;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.000857538;OID=.;OPOS=9074259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:0:1:26:26:0.962963:8:18:0:0:8:18:1:0
chr12	9086898	.	A	G	467.1	PASS	AF=0.429752;AO=52;DP=121;FAO=52;FDP=121;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=44;FSRR=25;FWDB=-0.00482628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.816;QD=15.4412;RBI=0.0295189;REFB=0.0120592;REVB=0.0291217;RO=68;SAF=25;SAR=27;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152905;STB=0.588964;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.0154647;OID=.;OPOS=9086898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:68:69:52:52:0.429752:27:25:43:25:27:25:44:25
chr12	9093001	.	G	A	79.66	PASS	AF=0.37931;AO=8;DP=26;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0225821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.2697;QD=10.9881;RBI=0.0670907;REFB=-0.0379607;REVB=0.063176;RO=18;SAF=8;SAR=0;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.768838;STB=0.760047;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0723418;OID=.;OPOS=9093001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:26:29:18:18:8:11:0.37931:0:8:8:10:2:9:8:10
chr12	9248233	.	T	C	1514.28	PASS	AF=0.989691;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0241523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.589;QD=62.4447;RBI=0.0379943;REFB=0.0154132;REVB=0.0293297;RO=1;SAF=53;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00886354;STB=0.504672;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000257893;OID=.;OPOS=9248233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:96:97:1:1:95:96:0.989691:42:53:1:0:43:53:1:0
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chr12	9571670	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.224;QD=40.7629;RBI=0.0192024;REFB=0;REVB=-0.0192024;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00027447;OID=.;OPOS=9571670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:10:0:0:0:10:0:0:0
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chr12	9578197	.	A	T	622.25	PASS	AF=0.921569;AO=47;DP=51;FAO=47;FDP=51;FR=.;FRO=4;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0180614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8669;QD=48.8039;RBI=0.0265954;REFB=-0.101497;REVB=0.0195218;RO=4;SAF=14;SAR=33;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536757;STB=0.52856;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00900138;OID=.;OPOS=9578197;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:51:51:4:4:47:47:0.921569:33:14:0:4:33:14:0:4
chr12	9578358	.	A	C	76.37	PASS	AF=0.4;AO=9;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0170618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.138;QD=12.2192;RBI=0.0259344;REFB=-0.00355538;REVB=0.0195317;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750523;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0136293;OID=.;OPOS=9578358;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:9:10:0.4:3:6:9:6:4:6:9:6
chr12	9585578	.	C	T	41.16	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0506454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.41;QD=16.4624;RBI=0.0570098;REFB=-0.0778894;REVB=0.0261754;RO=4;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.344363;STB=0.699437;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0257115;OID=.;OPOS=9585578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:3:3:4:0:3:3:4:0
chr12	9597776	.	G	A	1792.57	PASS	AF=0.983471;AO=119;DP=121;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0140241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.263;QD=59.2585;RBI=0.0144659;REFB=-0.126522;REVB=0.00354771;RO=2;SAF=65;SAR=54;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00146317;STB=0.50077;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=-1.64696e-05;OID=.;OPOS=9597776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:121:121:2:2:119:119:0.983471:54:65:1:1:54:65:1:1
chr12	9750669	.	A	G	1244.21	PASS	AF=1;AO=81;DP=83;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387508;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.91;QD=61.4425;RBI=0.0389454;REFB=0;REVB=0.00388845;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.41936e-05;OID=.;OPOS=9750669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:81:0:0:81:81:1:43:38:0:0:43:38:0:0
chr12	9833524	.	C	G	336.66	PASS	AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.00807436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.297;QD=17.2648;RBI=0.0123303;REFB=-0.00660173;REVB=0.00931885;RO=42;SAF=14;SAR=22;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109092;STB=0.56119;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.00663057;OID=.;OPOS=9833524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:42:42:36:36:0.461538:22:14:21:21:22:14:21:21
chr12	9833628	.	C	T	208.49	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=2;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=20;FWDB=-0.00473911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0053;QD=19.394;RBI=0.0586515;REFB=-0.0285593;REVB=-0.0584597;RO=22;SAF=2;SAR=19;SRF=2;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114985;STB=0.506487;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0298444;OID=.;OPOS=9833628;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:19:2:2:20:19:2:2:20
chr12	9885707	.	A	ATAAGT	351.45	PASS	AF=0.4625;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=80;FR=.;FRO=43;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0223154;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=5;MLLD=271.75;QD=17.5724;RBI=0.041913;REFB=-0.0070626;REVB=-0.0354785;RO=43;SAF=27;SAR=10;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209932;STB=0.630671;STBP=0.038;TYPE=ins;VARB=0.00840749;OID=.;OPOS=9885708;OREF=-;OALT=TAAGT;OMAPALT=ATAAGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4625:37:83:37:80:43:27:10:22:21:99:43:27:10:23:20
chr12	9905690	.	A	G	304.35	PASS	AF=0.362745;AO=37;DP=102;FAO=37;FDP=102;FR=.;FRO=65;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=34;FWDB=0.00581752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.596;QD=11.9351;RBI=0.0106984;REFB=-0.00833947;REVB=-0.00897846;RO=65;SAF=18;SAR=19;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106362;STB=0.506097;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.0151408;OID=.;OPOS=9905690;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:65:65:37:37:0.362745:19:18:31:34:19:18:31:34
chr12	9906143	.	GT	G,TG	379.98	PASS	AF=0.492308,0.323077;AO=24,18;DP=64;FAO=32,21;FDP=65;FR=.;FRO=12;FSAF=22,0;FSAR=10,21;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.154485,-0.0534287;FXX=0.0298463;HRUN=5,1;LEN=1,2;MLLD=9.85419,21.3049;QD=23.3831;RBI=0.154715,0.058559;REFB=-0.102242,-0.0480433;REVB=0.0084387,0.0239693;RO=13;SAF=17,0;SAR=7,18;SRF=9;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0.461538,0;SSSB=0.0122796,-0.852752;STB=0.520122,0.999306;STBP=0.722,0;TYPE=del,mnp;VARB=0.0850394,-0.0309226;OID=.,.;OPOS=9906144,9906143;OREF=T,GT;OALT=-,TG;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:64:65:13:12:24,18:32,21:0.492308,0.323077:7,18:17,0:9:4:10,21:22,0:9:3
chr12	9994445	.	GTGT	G	704.48	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407152;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=3;MLLD=286.062;QD=62.6203;RBI=0.0415935;REFB=0;REVB=0.00850233;RO=0;SAF=25;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=7.43842e-05;OID=.;OPOS=9994446;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:43:44:45:45:0:26:19:0:0:4:0:25:18:0:0
chr12	10015177	.	A	G	338.52	PASS	AF=0.627451;AO=32;DP=51;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00105464;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=195.202;QD=26.5504;RBI=0.0123776;REFB=-0.0140283;REVB=0.0123326;RO=19;SAF=17;SAR=15;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325953;STB=0.517868;STBP=0.765;TYPE=snp;VARB=0.00630044;OID=.;OPOS=10015177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:19:19:32:32:0.627451:15:17:11:8:15:17:11:8
chr12	10041364	.	G	A	781.85	PASS	AF=1;AO=54;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241067;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.364;QD=55.8462;RBI=0.0281046;REFB=0;REVB=-0.0144478;RO=1;SAF=28;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000591566;OID=.;OPOS=10041364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:1:0:54:56:1:26:28:1:0:27:29:0:0
chr12	10046052	.	C	A	468.66	PASS	AF=0.463636;AO=50;DP=109;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=-0.0618818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6588;QD=17.042;RBI=0.0670022;REFB=0.0287575;REVB=0.0256892;RO=59;SAF=28;SAR=22;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000667595;STB=0.505078;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=-0.0343099;OID=.;OPOS=10046052;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:59:59:50:51:0.463636:22:28:33:26:22:29:33:26
chr12	10069302	.	C	T	287.93	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.0276489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.025;QD=18.5762;RBI=0.0276495;REFB=-0.026995;REVB=0.000177083;RO=31;SAF=22;SAR=9;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0237634;OID=.;OPOS=10069302;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:31:31:31:31:0.5:9:22:22:9:9:22:22:9
chr12	10136672	.	G	A	1166.14	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00951549;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.382;QD=60.5787;RBI=0.0129496;REFB=0;REVB=0.00878336;RO=0;SAF=21;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.16272e-05;OID=.;OPOS=10136672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:77:0:0:73:77:1:52:21:0:0:56:21:0:0
chr12	10137557	.	A	C	385.7	PASS	AF=0.90625;AO=29;DP=32;FAO=29;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00166186;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=237.851;QD=48.2128;RBI=0.0180074;REFB=-0.0794881;REVB=-0.0179306;RO=3;SAF=12;SAR=17;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103104;STB=0.555517;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00061488;OID=.;OPOS=10137557;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:32:32:3:3:29:29:0.90625:17:12:3:0:17:12:3:0
chr12	10149406	.	T	C	268.46	PASS	AF=0.402597;AO=31;DP=77;FAO=31;FDP=77;FR=.;FRO=46;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00517236;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9538;QD=13.9462;RBI=0.0159037;REFB=-0.0101355;REVB=0.0150391;RO=42;SAF=18;SAR=13;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0827527;STB=0.522616;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0111707;OID=.;OPOS=10149406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:42:46:31:31:0.402597:13:18:21:21:13:18:25:21
chr12	10149851	.	C	T	1706.84	PASS	AF=0.974576;AO=115;DP=118;FAO=115;FDP=118;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00191995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.575;QD=57.859;RBI=0.0192532;REFB=0.00196966;REVB=-0.0191573;RO=3;SAF=49;SAR=66;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210934;STB=0.511109;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=-7.06836e-05;OID=.;OPOS=10149851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:118:118:3:3:115:115:0.974576:66:49:0:3:66:49:0:3
chr12	10150974	.	A	G	275.74	PASS	AF=0.526316;AO=28;DP=56;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0279087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.937;QD=19.3501;RBI=0.036155;REFB=-0.0501246;REVB=0.0229846;RO=28;SAF=15;SAR=13;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127098;STB=0.592274;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.037355;OID=.;OPOS=10150974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:28:27:28:30:0.526316:13:15:11:17:13:17:10:17
chr12	10151642	.	T	C	1913.68	PASS	AF=0.984375;AO=122;DP=125;FAO=126;FDP=128;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.021825;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6106;QD=59.8025;RBI=0.096473;REFB=-0.106898;REVB=0.0939718;RO=0;SAF=57;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507142;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.000921224;OID=.;OPOS=10151642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:125:128:0:2:122:126:0.984375:65:57:0:0:69:57:0:2
chr12	10163375	.	C	A	183.06	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.019669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5481;QD=13.3131;RBI=0.0750419;REFB=0.00314075;REVB=-0.0724184;RO=33;SAF=11;SAR=11;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174825;STB=0.599913;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=-0.00604073;OID=.;OPOS=10163375;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:33:33:22:22:0.4:11:11:22:11:11:11:22:11
chr12	10163379	.	C	T	178.82	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.0316965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.103;QD=12.5488;RBI=0.0326543;REFB=-0.0130828;REVB=0.00785072;RO=35;SAF=11;SAR=11;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198987;STB=0.613937;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0194091;OID=.;OPOS=10163379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:11:11:24:11:11:11:24:11
chr12	10165469	.	A	G	2273.24	PASS	AF=1;AO=142;DP=144;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0074664;FXX=0.00694396;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.139;QD=63.5871;RBI=0.0594508;REFB=0;REVB=0.0589801;RO=0;SAF=68;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.25513e-05;OID=.;OPOS=10165469;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:144:143:0:0:142:143:1:74:68:0:0:75:68:0:0
chr12	10167277	.	G	C	683.72	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0229953;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.543;QD=54.6976;RBI=0.0432369;REFB=-0.0824136;REVB=0.0366148;RO=1;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192048;STB=0.5102;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.000955459;OID=.;OPOS=10167277;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:50:1:1:49:49:0.98:24:25:0:1:24:25:0:1
chr12	10215654	.	C	G	333.3	PASS	AF=0.557377;AO=34;DP=62;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0398391;FXX=0.0161264;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1903;QD=21.8559;RBI=0.0484709;REFB=0.00241071;REVB=0.0276092;RO=27;SAF=18;SAR=16;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0509841;STB=0.528139;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-7.81049e-05;OID=.;OPOS=10215654;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:27:27:34:34:0.557377:16:18:16:11:16:18:16:11
chr12	10236797	.	A	G	746.35	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0278678;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.956;QD=63.5189;RBI=0.0524672;REFB=0;REVB=-0.0444544;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.52372e-05;OID=.;OPOS=10236797;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0
chr12	10236824	.	C	T	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00714813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.16;QD=62.9825;RBI=0.0280484;REFB=0;REVB=-0.0271223;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.93487e-05;OID=.;OPOS=10236824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0
chr12	10236921	.	G	T	432.22	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0359611;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.0516;QD=57.6288;RBI=0.0389154;REFB=0;REVB=0.014873;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000458718;OID=.;OPOS=10236921;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
chr12	10236942	.	C	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000603807;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=309.841;QD=55.0987;RBI=0.0276055;REFB=0;REVB=0.0275989;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.21166e-05;OID=.;OPOS=10236942;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chr12	10237014	.	T	C	160.3	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.191;QD=45.8004;RBI=0.0222876;REFB=0;REVB=-0.00149572;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207972;OID=.;OPOS=10237014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr12	10251445	.	C	G	902.24	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0478186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6241;QD=58.2093;RBI=0.0679403;REFB=0;REVB=-0.0482625;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000990198;OID=.;OPOS=10251445;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0
chr12	10271055	.	T	C	917.36	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.905;QD=58.2451;RBI=0.0414188;REFB=0;REVB=0.0237434;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.12413e-05;OID=.;OPOS=10271055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:63:0:0:60:63:1:24:36:0:0:25:38:0:0
chr12	10279702	.	C	T	135.66	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0435737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.465;QD=10.853;RBI=0.0569873;REFB=-0.00747995;REVB=-0.0367272;RO=32;SAF=8;SAR=8;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0351377;STB=0.53995;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0429483;OID=.;OPOS=10279702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:32:34:16:16:0.32:8:8:15:17:8:8:15:19
chr12	10366088	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0093947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.102;QD=43.4861;RBI=0.014209;REFB=0;REVB=-0.01066;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.13347e-05;OID=.;OPOS=10366088;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:11:1:0:0:11:1:0:0
chr12	10366229	.	CA	C,CG	87.28	PASS	AF=0.482759,0;AO=11,3;DP=29;FAO=14,0;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=2,0;FSAR=12,0;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.127251,-0.0910629;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=14.0331,28.2126;QD=12.0386;RBI=0.15982,0.131783;REFB=-0.0616855,0.00211847;REVB=-0.0966923,-0.0952586;RO=14;SAF=0,2;SAR=11,1;SRF=5;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.782861,0.329006;STB=0.65599,0.5;STBP=0.185,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0348319,0;OID=.,.;OPOS=10366230,10366230;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.482759,0:11,3:29:14,0:29:15:2,0:12,0:5:10:83:14:0,2:11,1:5:9
chr12	10367240	.	CTT	CTA,CT,CTC	736.42	PASS	AF=0.0178571,0.964286,0;AO=2,51,2;DP=56;FAO=1,54,0;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=0,33,0;FSAR=1,21,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.035847,0.0289615,0.0525296;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=1,1,1;MLLD=27.1012,26.7353,6.61387;QD=52.6017;RBI=0.0444077,0.0668849,0.06515;REFB=0.0601999,-0.041155,0.0264497;REVB=-0.0262114,-0.0602895,-0.0385378;RO=1;SAF=0,32,1;SAR=2,19,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.697199,-0.0144898,-0.25849;STB=0.989913,0.50746,0.5;STBP=0.496,0.535,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=-0.133591,0.0110975,0.00176872;OID=.,.,.;OPOS=10367242,10367241,10367242;OREF=T,T,T;OALT=A,-,C;OMAPALT=CTA,CT,CTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0178571,0.964286,0:2,51,2:56:1,54,0:56:1:0,33,0:1,21,0:1:0:4:1:0,32,1:2,19,1:1:0
chr12	10462052	.	T	G	1139.1	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.138395;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9289;QD=60.7521;RBI=0.141617;REFB=0;REVB=0.030036;RO=0;SAF=55;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487162;OID=.;OPOS=10462052;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:19:55:0:0:19:56:0:0
chr12	10467533	.	T	A	203.95	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0165234;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.617;QD=21.4682;RBI=0.0165476;REFB=-0.0238004;REVB=0.00089423;RO=19;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155872;STB=0.601463;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0234268;OID=.;OPOS=10467533;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:19:18:20:20:0.526316:11:9:12:7:11:9:12:6
chr12	10525740	.	C	T	1250.73	PASS	AF=0.987952;AO=80;DP=81;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0147204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.789;QD=60.276;RBI=0.0558009;REFB=-9.27849e-05;REVB=-0.0538242;RO=1;SAF=45;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104059;STB=0.505262;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=-3.76223e-05;OID=.;OPOS=10525740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:83:1:1:80:82:0.987952:35:45:1:0:35:47:1:0
chr12	10532111	.	T	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.704;QD=47.8224;RBI=0.0407126;REFB=0;REVB=0.00880121;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014888;OID=.;OPOS=10532111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr12	10532326	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.997;QD=61.6839;RBI=0.0111477;REFB=0;REVB=0.00389902;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.54639e-05;OID=.;OPOS=10532326;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
chr12	10560957	.	T	C	813.64	PASS	AF=0.967213;AO=37;DP=61;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0733123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.6696;QD=53.3536;RBI=0.0736124;REFB=0.0381196;REVB=0.00664086;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518512;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=-0.000336123;OID=.;OPOS=10560957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:61:61:0:2:37:59:0.967213:24:13:0:0:26:33:0:2
chr12	10562025	.	C	T	1050.86	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=73;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0233032;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.727;QD=58.3812;RBI=0.0304299;REFB=-0.0447456;REVB=0.0195688;RO=1;SAF=38;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122822;STB=0.506492;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000250955;OID=.;OPOS=10562025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:72:1:1:71:71:0.986111:33:38:1:0:33:38:1:0
chr12	10562089	.	A	C,T	1617.78	PASS	AF=0.938053,0.0530973;AO=105,7;DP=113;FAO=106,6;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=39,3;FSAR=67,3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0273609,-0.0189379;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=179.146,86.966;QD=57.2665;RBI=0.0275201,0.0389289;REFB=-0.0391054,-0.00418526;REVB=0.0029557,-0.034012;RO=0;SAF=39,3;SAR=66,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.506328,0.571194;STBP=0.25,0.516;TYPE=snp,snp;VARB=0.000610694,0.212324;OID=.,.;OPOS=10562089,10562089;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:113:113:0:1:105,7:106,6:0.938053,0.0530973:66,4:39,3:0:0:67,3:39,3:1:0
chr12	10570965	.	C	G	1049.24	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053762;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2447;QD=58.2912;RBI=0.055543;REFB=0;REVB=0.0139523;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00552703;OID=.;OPOS=10570965;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:72:0:0:69:72:1:30:39:0:0:31:41:0:0
chr12	10571042	.	A	G	1476.41	PASS	AF=0.989474;AO=93;DP=95;FAO=94;FDP=95;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0458536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.5561;QD=62.1648;RBI=0.0793153;REFB=0.00160406;REVB=0.0647175;RO=1;SAF=47;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101954;STB=0.505375;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.000320212;OID=.;OPOS=10571042;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:95:95:1:1:93:94:0.989474:46:47:0:1:46:48:0:1
chr12	10571091	.	T	G	981.73	PASS	AF=1;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203108;FXX=0.0294074;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.581;QD=59.4988;RBI=0.0225533;REFB=0;REVB=-0.00980415;RO=0;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.52897e-05;OID=.;OPOS=10571091;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:66:0:0:65:66:1:32:33:0:0:32:34:0:0
chr12	10571106	.	G	C	955.14	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0037653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.439;QD=58.7776;RBI=0.0324337;REFB=0;REVB=0.0322144;RO=0;SAF=30;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130068;OID=.;OPOS=10571106;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:35:30:0:0:35:30:0:0
chr12	10572982	.	A	G	1575.3	PASS	AF=1;AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0928637;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0836;QD=64.2978;RBI=0.115612;REFB=0;REVB=0.0688647;RO=0;SAF=52;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000753657;OID=.;OPOS=10572982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:98:0:0:98:98:1:46:52:0:0:46:52:0:0
chr12	10573094	.	CA	GG	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116498;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=325.667;QD=62.3509;RBI=0.0136761;REFB=0;REVB=0.00716355;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=1.93122e-05;OID=.;OPOS=10573094;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0
chr12	10587111	.	A	G	7731.45	PASS	AF=1;AO=488;DP=498;FAO=491;FDP=491;FR=.;FRO=0;FSAF=289;FSAR=202;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0062789;FXX=0.0140559;HRUN=5;LEN=1;MLLD=319.103;QD=62.9854;RBI=0.00638083;REFB=-0.0388926;REVB=0.00113596;RO=7;SAF=288;SAR=200;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00450446;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9084e-05;OID=.;OPOS=10587111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:498:491:7:0:488:491:1:200:288:3:4:202:289:0:0
chr12	10587631	.	C	T	923.79	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00790225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.608;QD=57.7366;RBI=0.0223309;REFB=0;REVB=0.0208859;RO=0;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000363519;OID=.;OPOS=10587631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:64:0:0:62:64:1:27:35:0:0:27:37:0:0
chr12	10588530	.	C	G	416.61	PASS	AF=0.342466;AO=50;DP=146;FAO=50;FDP=146;FR=.;FRO=96;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=62;FSRR=34;FWDB=-0.00599157;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9055;QD=11.414;RBI=0.0211829;REFB=0.0139654;REVB=0.0203179;RO=96;SAF=23;SAR=27;SRF=62;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211007;STB=0.620559;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.0285199;OID=.;OPOS=10588530;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:146:96:96:50:50:0.342466:27:23:62:34:27:23:62:34
chr12	10588581	.	T	C	377.17	PASS	AF=0.407407;AO=44;DP=108;FAO=44;FDP=108;FR=.;FRO=64;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=36;FWDB=0.0290202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.758;QD=13.9694;RBI=0.0328832;REFB=-0.0161075;REVB=-0.0154638;RO=64;SAF=31;SAR=13;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290086;STB=0.664402;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0121987;OID=.;OPOS=10588581;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:64:64:44:44:0.407407:13:31:28:36:13:31:28:36
chr12	10603669	.	G	GC	2135.09	PASS	AF=1;AO=28;DP=148;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104632;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=132.066;QD=60.57;RBI=0.105134;REFB=0;REVB=0.0102618;RO=112;SAF=4;SAR=24;SRF=76;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.63341;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=4.513e-05;OID=.;OPOS=10603670;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:28:148:141:141:0:84:57:0:0:12:112:4:24:76:36
chr12	10603670	.	T	C	1495.11	PASS	AF=0.797297;AO=110;DP=140;FAO=118;FDP=148;FR=.;FRO=30;FSAF=82;FSAR=36;FSRF=4;FSRR=26;FWDB=0.0113339;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=127.289;QD=40.4085;RBI=0.0161015;REFB=-0.0459692;REVB=0.0114368;RO=29;SAF=74;SAR=36;SRF=4;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218427;STB=0.621495;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00327581;OID=.;OPOS=10603670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:148:29:30:110:118:0.797297:36:74:4:25:36:82:4:26
chr12	10659438	.	T	C	2550.2	PASS	AF=0.994012;AO=166;DP=167;FAO=166;FDP=167;FR=.;FRO=1;FSAF=83;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00245248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.87;QD=61.0826;RBI=0.028855;REFB=-0.117388;REVB=0.0287506;RO=1;SAF=83;SAR=83;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00569936;STB=0.502994;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=6.22631e-05;OID=.;OPOS=10659438;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:167:167:1:1:166:166:0.994012:83:83:0:1:83:83:0:1
chr12	10659964	.	C	G	1050.95	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.274;QD=59.2083;RBI=0.025305;REFB=0;REVB=0.0217635;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376203;OID=.;OPOS=10659964;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:71:0:0:69:71:1:39:30:0:0:40:31:0:0
chr12	10675250	.	G	C	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4797;QD=57.7119;RBI=0.0256391;REFB=0;REVB=-0.0230832;RO=0;SAF=44;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191587;OID=.;OPOS=10675250;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:15:44:0:0:15:44:0:0
chr12	10763205	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.72;QD=44.6897;RBI=0.11253;REFB=0;REVB=0.00254032;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.26746e-05;OID=.;OPOS=10763205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:8:5:0:0:8:5:0:0
chr12	10763236	.	G	C	318.44	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=26;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0256978;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3102;QD=50.9511;RBI=0.0380979;REFB=-0.0802244;REVB=-0.028126;RO=1;SAF=11;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040273;STB=0.521721;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.00476923;OID=.;OPOS=10763236;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:26:25:1:1:24:24:0.96:13:11:1:0:13:11:1:0
chr12	10782115	.	T	C	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.874;QD=58.7812;RBI=0.0161193;REFB=0;REVB=0.00526606;RO=0;SAF=45;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.50645e-05;OID=.;OPOS=10782115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:20:45:0:0:20:45:0:0
chr12	10854625	.	G	A	730.6	PASS	AF=0.612613;AO=68;DP=111;FAO=68;FDP=111;FR=.;FRO=43;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0286112;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=254.933;QD=26.3278;RBI=0.031994;REFB=-0.0363455;REVB=-0.0143184;RO=43;SAF=42;SAR=26;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783714;STB=0.542593;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0235243;OID=.;OPOS=10854625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:43:43:68:68:0.612613:26:42:22:21:26:42:22:21
chr12	10856219	.	C	T	138.79	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0683214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.758;QD=19.8268;RBI=0.0688291;REFB=-0.0184119;REVB=-0.00834437;RO=13;SAF=6;SAR=9;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0802345;STB=0.545395;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0446603;OID=.;OPOS=10856219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:9:6:4:9:9:6:4:9
chr12	10871667	.	A	G	868.1	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0548511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0409;QD=57.8735;RBI=0.171397;REFB=0;REVB=0.162383;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171857;OID=.;OPOS=10871667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:24:36:0:0:24:36:0:0
chr12	10875488	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00251675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.052;QD=39.2068;RBI=0.00553325;REFB=0;REVB=-0.00492776;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000142044;OID=.;OPOS=10875488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr12	10958658	.	T	C	947.41	PASS	AF=0.970588;AO=65;DP=67;FAO=66;FDP=68;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.011268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.726;QD=55.7299;RBI=0.0659246;REFB=-0.195708;REVB=0.0649545;RO=2;SAF=40;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230343;STB=0.511901;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.000664227;OID=.;OPOS=10958658;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:67:68:2:2:65:66:0.970588:25:40:2:0:25:41:2:0
chr12	10959031	.	C	T	1587.51	PASS	AF=1;AO=98;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.228;QD=64.142;RBI=0.0276687;REFB=0;REVB=0.00133236;RO=0;SAF=48;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.92544e-05;OID=.;OPOS=10959031;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:98:99:1:50:48:0:0:51:48:0:0
chr12	10962115	.	A	G	689.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9975;QD=62.6689;RBI=0.0412169;REFB=0;REVB=0.00728181;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000621905;OID=.;OPOS=10962115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:28:16:0:0:28:16:0:0
chr12	10978402	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.542;QD=52.6132;RBI=0.0254325;REFB=0;REVB=-0.0119282;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.53646e-05;OID=.;OPOS=10978402;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr12	10999708	.	T	C	1169.41	PASS	AF=0.987342;AO=75;DP=77;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00614986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.414;QD=59.2105;RBI=0.102347;REFB=-0.00555037;REVB=0.102162;RO=0;SAF=59;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504064;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.000258465;OID=.;OPOS=10999708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:79:0:1:75:78:0.987342:16:59:0:0:17:61:1:0
chr12	10999780	.	C	T	1315.7	PASS	AF=0.988506;AO=80;DP=83;FAO=86;FDP=87;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=77;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00231557;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6265;QD=60.492;RBI=0.0105208;REFB=0;REVB=0.0102628;RO=0;SAF=71;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138514;OID=.;OPOS=10999780;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:87:0:0:80:86:0.988506:9:71:0:0:9:77:0:0
chr12	11001963	.	AT	A,ATT	56.78	PASS	AF=0.8,0;AO=6,2;DP=20;FAO=16,0;FDP=20;FR=.;FRO=4;FSAF=10,0;FSAR=6,0;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.208615,-0.203832;FXX=0.0475964;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=7.31932,7.29112;QD=11.3567;RBI=0.281425,0.276264;REFB=0.107332,-0.104868;REVB=-0.188891,0.186479;RO=5;SAF=3,2;SAR=3,0;SRF=4;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.229845,0.544828;STB=0.526994,0.5;STBP=0.646,1;TYPE=del,ins;VARB=0.0326653,0.0741523;OID=.,.;OPOS=11001964,11001964;OREF=T,-;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.8,0:6,2:20:16,0:20:4:10,0:6,0:3:1:11:5:3,2:3,0:4:1
chr12	11035158	.	C	CG	35.37	PASS	AF=0.636364;AO=5;DP=13;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0102275;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=30.1875;QD=12.86;RBI=0.0353018;REFB=-0.0360832;REVB=-0.0337878;RO=7;SAF=0;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.725162;STB=0.571204;STBP=0.724;TYPE=ins;VARB=0.136201;OID=.;OPOS=11035159;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.636364:5:13:7:11:4:1:6:1:3:18:7:0:5:3:4
chr12	11061122	.	T	C	769.49	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.435;QD=56.9991;RBI=0.0579932;REFB=0;REVB=0.0346925;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250116;OID=.;OPOS=11061122;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:23:31:0:0:23:31:0:0
chr12	11083356	.	A	G	260.7	PASS	AF=0.209524;AO=44;DP=211;FAO=44;FDP=210;FR=.;FRO=166;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=77;FSRR=89;FWDB=-0.0236549;FXX=0.00473911;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6531;QD=4.96569;RBI=0.0339094;REFB=-0.000361865;REVB=0.0242959;RO=167;SAF=16;SAR=28;SRF=78;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135976;STB=0.581732;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00136972;OID=.;OPOS=11083356;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:211:210:167:166:44:44:0.209524:28:16:78:89:28:16:77:89
chr12	11083677	.	T	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.812;QD=58.1418;RBI=0.0262339;REFB=0;REVB=0.00625012;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012281;OID=.;OPOS=11083677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0
chr12	11091432	.	C	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143686;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.857;QD=48.7373;RBI=0.0336745;REFB=0;REVB=0.0304552;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117073;OID=.;OPOS=11091432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr12	11138683	.	C	T	994.22	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00819061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.864;QD=57.6361;RBI=0.0235515;REFB=0.00147978;REVB=0.0220813;RO=1;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150024;STB=0.507934;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=2.78174e-06;OID=.;OPOS=11138683;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:31:37:0:1:31:37:0:1
chr12	11138852	.	C	T	1419.04	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0493589;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.566;QD=63.0684;RBI=0.0514971;REFB=0;REVB=-0.0146852;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.6097e-06;OID=.;OPOS=11138852;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:90:0:0:90:90:1:47:43:0:0:47:43:0:0
chr12	11149711	.	C	A	1080.56	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.242;QD=60.0308;RBI=0.0188097;REFB=0;REVB=0.0037902;RO=0;SAF=31;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.82171e-05;OID=.;OPOS=11149711;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:71:72:1:40:31:0:0:40:32:0:0
chr12	11149720	.	A	G	1139.41	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0170038;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.993;QD=59.1902;RBI=0.0175402;REFB=-0.126285;REVB=-0.0043043;RO=1;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119796;STB=0.506327;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00016597;OID=.;OPOS=11149720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:39:37:0:1:39:37:0:1
chr12	11149769	.	T	C	1498.19	PASS	AF=0.990291;AO=100;DP=102;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00197626;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.733;QD=58.1819;RBI=0.0722766;REFB=-0.0184241;REVB=0.0722496;RO=0;SAF=49;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18771e-08;STB=0.504761;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00020849;OID=.;OPOS=11149769;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:102:103:0:1:100:102:0.990291:51:49:0:0:52:50:0:1
chr12	11150033	.	G	T	1114.45	PASS	AF=0.986842;AO=55;DP=77;FAO=75;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0425571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.903;QD=58.6551;RBI=0.0479625;REFB=-0.0020684;REVB=0.0221201;RO=1;SAF=25;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154549;STB=0.506492;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000611895;OID=.;OPOS=11150033;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:76:1:1:55:75:0.986842:30:25:0:1:38:37:0:1
chr12	11150046	.	G	T	1013.36	PASS	AF=0.946667;AO=71;DP=75;FAO=71;FDP=75;FR=.;FRO=4;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0127305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0184;QD=54.0458;RBI=0.0138827;REFB=-0.0723933;REVB=0.00553755;RO=2;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0270022;STB=0.52777;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0129432;OID=.;OPOS=11150046;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:75:75:2:4:71:71:0.946667:34:37:0:2:34:37:0:4
chr12	11150054	.	C	T	219.76	PASS	AF=0.369863;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0134308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.479;QD=12.0416;RBI=0.0156269;REFB=-0.0210401;REVB=0.00798829;RO=44;SAF=15;SAR=12;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0845341;STB=0.548744;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0224591;OID=.;OPOS=11150054;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:44:46:27:27:0.369863:12:15:21:23:12:15:22:24
chr12	11150214	.	G	A	508.38	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00250091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.724;QD=56.4872;RBI=0.103315;REFB=0.00394326;REVB=-0.103285;RO=1;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267214;STB=0.514278;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-0.00197434;OID=.;OPOS=11150214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:17:18:0:1:17:18:0:1
chr12	11150319	.	T	C	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.659;QD=49.5969;RBI=0.0187929;REFB=0;REVB=0.0110227;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.26933e-05;OID=.;OPOS=11150319;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr12	11174302	.	A	G	44.83	PASS	AF=0.116279;AO=10;DP=86;FAO=10;FDP=86;FR=.;FRO=76;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=46;FSRR=30;FWDB=0.00999176;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=306.148;QD=2.08516;RBI=0.0155923;REFB=-0.00359472;REVB=-0.0119702;RO=76;SAF=4;SAR=6;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243174;STB=0.675345;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0291747;OID=.;OPOS=11174302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:86:86:76:76:10:10:0.116279:6:4:46:30:6:4:46:30
chr12	11174327	.	C	T	34.11	PASS	AF=0.0882353;AO=9;DP=103;FAO=9;FDP=102;FR=.;FRO=93;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=57;FSRR=36;FWDB=-0.0192907;FXX=0.0097078;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.37;QD=1.33762;RBI=0.0223348;REFB=-0.00232075;REVB=-0.0112566;RO=93;SAF=3;SAR=6;SRF=57;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309846;STB=0.740252;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0195312;OID=.;OPOS=11174327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:103:102:93:93:9:9:0.0882353:6:3:57:36:6:3:57:36
chr12	11174372	.	C	G	52.26	PASS	AF=0.129412;AO=11;DP=85;FAO=11;FDP=85;FR=.;FRO=74;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=34;FWDB=-0.0291268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3717;QD=2.45939;RBI=0.0696109;REFB=-0.00102691;REVB=-0.0632242;RO=74;SAF=5;SAR=6;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104805;STB=0.574334;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00295745;OID=.;OPOS=11174372;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:85:85:74:74:11:11:0.129412:6:5:40:34:6:5:40:34
chr12	11174380	.	C	T	53.71	PASS	AF=0.135802;AO=11;DP=81;FAO=11;FDP=81;FR=.;FRO=70;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=-0.0169082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.33;QD=2.65222;RBI=0.0173196;REFB=-0.00466308;REVB=0.00375266;RO=64;SAF=5;SAR=6;SRF=35;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113557;STB=0.599822;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0306902;OID=.;OPOS=11174380;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:81:81:64:70:11:11:0.135802:6:5:35:29:6:5:40:30
chr12	11174390	.	G	A	53.33	PASS	AF=0.134146;AO=11;DP=82;FAO=11;FDP=82;FR=.;FRO=71;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=-0.00620264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.883;QD=2.60147;RBI=0.0232653;REFB=0.000220882;REVB=-0.0224232;RO=70;SAF=5;SAR=6;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142947;STB=0.59324;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=-0.00442691;OID=.;OPOS=11174390;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:82:82:70:71:11:11:0.134146:6:5:40:30:6:5:40:31
chr12	11174397	.	T	A	60.89	PASS	AF=0.146341;AO=12;DP=80;FAO=12;FDP=82;FR=.;FRO=70;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=-0.000674072;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.972;QD=2.97047;RBI=0.0143282;REFB=0.000553478;REVB=-0.0143123;RO=68;SAF=6;SAR=6;SRF=40;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110129;STB=0.560876;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=-0.00351465;OID=.;OPOS=11174397;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:80:82:68:70:12:12:0.146341:6:6:40:28:6:6:40:30
chr12	11174416	.	A	G	49.42	PASS	AF=0.117021;AO=11;DP=94;FAO=11;FDP=94;FR=.;FRO=83;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=54;FSRR=29;FWDB=0.0199592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.508;QD=2.10314;RBI=0.0474675;REFB=0.00288016;REVB=0.0430673;RO=82;SAF=5;SAR=6;SRF=53;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232861;STB=0.668906;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.0195123;OID=.;OPOS=11174416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:94:94:82:83:11:11:0.117021:6:5:53:29:6:5:54:29
chr12	11174753	.	G	A	122.98	PASS	AF=0.451613;AO=12;DP=30;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.00662516;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.404;QD=15.8686;RBI=0.0462907;REFB=-0.0220878;REVB=0.0458141;RO=18;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215384;STB=0.611503;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.037539;OID=.;OPOS=11174753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:18:17:12:14:0.451613:5:7:14:4:6:8:13:4
chr12	11183451	.	A	T	377.28	PASS	AF=0.384615;AO=45;DP=117;FAO=45;FDP=117;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=-0.0484971;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2628;QD=12.8986;RBI=0.0719009;REFB=-0.0265588;REVB=-0.0530827;RO=71;SAF=24;SAR=21;SRF=37;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132065;STB=0.511995;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0265357;OID=.;OPOS=11183451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:71:72:45:45:0.384615:21:24:37:34:21:24:37:35
chr12	11183576	.	T	C	35.52	PASS	AF=0.0947368;AO=9;DP=95;FAO=9;FDP=95;FR=.;FRO=86;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=39;FSRR=47;FWDB=-0.00819393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.4372;QD=1.49541;RBI=0.0112826;REFB=-0.00570728;REVB=-0.00775612;RO=86;SAF=7;SAR=2;SRF=39;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369993;STB=0.787877;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0555327;OID=.;OPOS=11183576;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:95:95:86:86:9:9:0.0947368:2:7:39:47:2:7:39:47
chr12	11183642	.	A	G	47.25	PASS	AF=0.126582;AO=10;DP=79;FAO=10;FDP=79;FR=.;FRO=69;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=0.00573546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6445;QD=2.39255;RBI=0.0263993;REFB=-0.00423341;REVB=0.0257687;RO=67;SAF=7;SAR=3;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238829;STB=0.683432;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0320794;OID=.;OPOS=11183642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:79:79:67:69:10:10:0.126582:3:7:34:33:3:7:34:35
chr12	11183676	.	C	T	58.61	PASS	AF=0.157143;AO=11;DP=70;FAO=11;FDP=70;FR=.;FRO=59;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=-0.0239863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.817;QD=3.3489;RBI=0.0247229;REFB=-0.00109239;REVB=-0.00598993;RO=58;SAF=8;SAR=3;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307251;STB=0.715393;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00671405;OID=.;OPOS=11183676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:70:70:58:59:11:11:0.157143:3:8:28:30:3:8:28:31
chr12	11183697	.	C	A	43.18	PASS	AF=0.135593;AO=8;DP=59;FAO=8;FDP=59;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=-0.0489953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7312;QD=2.92778;RBI=0.0604677;REFB=-0.00651621;REVB=-0.0354373;RO=50;SAF=6;SAR=2;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329695;STB=0.742977;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0464982;OID=.;OPOS=11183697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:59:59:50:51:8:8:0.135593:2:6:24:26:2:6:24:27
chr12	11244166	.	G	C	1283.38	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00750351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.819;QD=61.8496;RBI=0.00759087;REFB=0;REVB=-0.00114831;RO=0;SAF=45;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.48547e-06;OID=.;OPOS=11244166;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:38:45:0:0:38:45:0:0
chr12	11244194	.	T	C	1080.54	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00888446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.388;QD=60.0299;RBI=0.0135361;REFB=0;REVB=-0.0102124;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.68152e-06;OID=.;OPOS=11244194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:32:40:0:0:32:40:0:0
chr12	11244725	.	C	G	777.99	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=59;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0305653;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.364;QD=53.6545;RBI=0.0342025;REFB=0.0143752;REVB=-0.0153483;RO=2;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448351;STB=0.523801;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=-0.000119714;OID=.;OPOS=11244725;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:59:58:2:2:56:56:0.965517:20:36:0:2:20:36:0:2
chr12	11338613	.	CA	GG	404.8	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180499;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=294.137;QD=55.8349;RBI=0.01805;REFB=0;REVB=6.94845e-05;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000463034;OID=.;OPOS=11338613;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0
chr12	11338781	.	C	A	975.81	PASS	AF=0.985294;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0202393;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.2529;QD=57.4004;RBI=0.0413879;REFB=-0.00154897;REVB=-0.0361017;RO=1;SAF=19;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242139;STB=0.512817;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=-0.000225706;OID=.;OPOS=11338781;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:68:1:1:66:67:0.985294:47:19:1:0:48:19:1:0
chr12	11338957	.	A	G	235.16	PASS	AF=1;AO=15;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.299;QD=49.5066;RBI=0.177543;REFB=0;REVB=0.177257;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0064021;OID=.;OPOS=11338957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:15:19:1:8:7:0:0:12:7:0:0
chr12	11338983	.	T	C	156.39	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=16;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0446741;FXX=0.062461;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.929;QD=41.7043;RBI=0.0552412;REFB=-0.0652451;REVB=0.0324933;RO=0;SAF=3;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571319;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00273884;OID=.;OPOS=11338983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:15:0:1:14:14:0.933333:11:3:0:0:11:3:1:0
chr12	11339020	.	T	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0372809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.354;QD=33.4285;RBI=0.0524295;REFB=0;REVB=0.0368644;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.62268e-06;OID=.;OPOS=11339020;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr12	11418954	.	A	G	906.55	PASS	AF=1;AO=61;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108492;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.178;QD=58.4874;RBI=0.0347828;REFB=0;REVB=0.0330475;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153739;OID=.;OPOS=11418954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:61:62:1:32:29:0:0:32:30:0:0
chr12	11420375	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113231;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.339;QD=33.4282;RBI=0.0668223;REFB=0;REVB=0.065856;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000708103;OID=.;OPOS=11420375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr12	11462275	.	A	G	710.28	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00400725;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=337.447;QD=54.6368;RBI=0.0260363;REFB=0.00730305;REVB=0.0257261;RO=1;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200325;STB=0.510634;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-4.33665e-05;OID=.;OPOS=11462275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:23:28:0:1:23:28:0:1
chr12	11506893	.	C	T	101.74	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0535765;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.2667;QD=40.696;RBI=0.0535765;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=10;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00297867;OID=.;OPOS=11506893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:0:10:0:0:0:10:0:0
chr12	12044393	.	T	TTA	582.69	PASS	AF=0.436242;AO=56;DP=187;FAO=65;FDP=149;FR=.;FRO=84;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=32;FSRR=52;FWDB=0.00537743;FXX=0.0197355;HRUN=2;LEN=2;MLLD=221.168;QD=15.6426;RBI=0.0280954;REFB=-0.0339416;REVB=-0.027576;RO=125;SAF=33;SAR=23;SRF=43;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.285662;STB=0.596534;STBP=0.061;TYPE=ins;VARB=0.0223966;OID=.;OPOS=12044394;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=TTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.436242:56:187:65:149:84:36:29:32:52:99:125:33:23:43:82
chr12	12044404	.	T	TA	514.68	PASS	AF=0.444444;AO=77;DP=185;FAO=84;FDP=189;FR=.;FRO=105;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=66;FSRR=39;FWDB=-0.0115588;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=187.025;QD=10.8927;RBI=0.0316651;REFB=-0.0200565;REVB=0.0294801;RO=107;SAF=27;SAR=50;SRF=68;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293491;STB=0.657113;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.0419244;OID=.;OPOS=12044405;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.444444:77:185:84:189:105:29:55:66:39:99:107:27:50:68:39
chr12	12045264	.	G	T	1044.32	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0953445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.963;QD=59.6753;RBI=0.100154;REFB=0;REVB=0.0306635;RO=0;SAF=15;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168149;OID=.;OPOS=12045264;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:70:0:0:67:70:1:52:15:0:0:53:17:0:0
chr12	12048234	.	C	A	31.95	PASS	AF=0.172414;AO=9;DP=28;FAO=5;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=0.0829788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.58;QD=4.40715;RBI=0.083441;REFB=-0.00552325;REVB=-0.00876988;RO=15;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373462;STB=0.599656;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0549599;OID=.;OPOS=12048234;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:28:29:15:23:9:5:0.172414:6:3:1:14:4:1:3:20
chr12	12230938	.	C	G	144.16	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0551852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7108;QD=24.0269;RBI=0.0586961;REFB=-0.00317848;REVB=-0.0199958;RO=8;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251479;STB=0.655546;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=-0.000247707;OID=.;OPOS=12230938;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:8:9:15:15:0.625:8:7:7:1:8:7:8:1
chr12	12240199	.	C	T	497.03	PASS	AF=0.566265;AO=47;DP=83;FAO=47;FDP=83;FR=.;FRO=36;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00133549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.353;QD=23.9533;RBI=0.0150035;REFB=-0.0190046;REVB=-0.014944;RO=36;SAF=31;SAR=16;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133536;STB=0.573417;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0136591;OID=.;OPOS=12240199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:36:36:47:47:0.566265:16:31:18:18:16:31:18:18
chr12	12247793	.	A	T	447.88	PASS	AF=0.626866;AO=42;DP=67;FAO=42;FDP=67;FR=.;FRO=25;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.0156781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.31;QD=26.7389;RBI=0.0215847;REFB=0.00686389;REVB=0.0148357;RO=23;SAF=31;SAR=11;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000870055;STB=0.508656;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-0.00499778;OID=.;OPOS=12247793;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:23:25:42:42:0.626866:11:31:17:6:11:31:18:7
chr12	12301898	.	C	T	1084.19	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184504;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.707;QD=60.2329;RBI=0.0352946;REFB=0;REVB=-0.030088;RO=0;SAF=20;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000491456;OID=.;OPOS=12301898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:72:0:0:72:72:1:52:20:0:0:52:20:0:0
chr12	12483275	.	G	A	613.0	PASS	AF=0.578431;AO=58;DP=101;FAO=59;FDP=102;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=31;FSRR=12;FWDB=-0.00410188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7561;QD=24.0391;RBI=0.0330614;REFB=-0.00176807;REVB=0.032806;RO=43;SAF=26;SAR=32;SRF=31;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210115;STB=0.616481;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00152508;OID=.;OPOS=12483275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:43:43:58:59:0.578431:32:26:31:12:33:26:31:12
chr12	12483318	.	C	T	628.32	PASS	AF=0.548673;AO=62;DP=113;FAO=62;FDP=113;FR=.;FRO=51;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.003048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.046;QD=22.2416;RBI=0.0241074;REFB=-0.00643306;REVB=-0.0239139;RO=51;SAF=34;SAR=28;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0332609;STB=0.518213;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.00571064;OID=.;OPOS=12483318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:51:51:62:62:0.548673:28:34:30:21:28:34:30:21
chr12	12483713	.	A	G	83.08	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0724098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8397;QD=9.4951;RBI=0.0792395;REFB=0.00762461;REVB=0.0321824;RO=24;SAF=5;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513794;STB=0.531193;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=-0.01012;OID=.;OPOS=12483713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:6:5:12:12:6:5:12:12
chr12	12510003	.	G	A	701.93	PASS	AF=0.511111;AO=69;DP=135;FAO=69;FDP=135;FR=.;FRO=66;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=-0.00467272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6381;QD=20.798;RBI=0.0439366;REFB=0.00337857;REVB=0.0436874;RO=64;SAF=43;SAR=26;SRF=40;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00168915;STB=0.508873;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-0.00416375;OID=.;OPOS=12510003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:64:66:69:69:0.511111:26:43:40:24:26:43:40:26
chr12	12514203	.	C	G	235.2	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0137999;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.739;QD=25.4268;RBI=0.0164001;REFB=-0.0166859;REVB=0.00886162;RO=15;SAF=10;SAR=12;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0402817;STB=0.522368;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.0173371;OID=.;OPOS=12514203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:12:10:6:9:12:10:6:9
chr12	12814818	.	C	T	1434.15	PASS	AF=1;AO=89;DP=94;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369015;FXX=0.0624935;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.763;QD=63.7402;RBI=0.0370001;REFB=0;REVB=-0.00269895;RO=0;SAF=47;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.28712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023942;OID=.;OPOS=12814818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:94:90:0:0:89:90:1:42:47:0:0:42:48:0:0
chr12	12871099	.	T	G	761.54	PASS	AF=0.574803;AO=68;DP=120;FAO=73;FDP=127;FR=.;FRO=54;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.0270737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.3844;QD=23.9856;RBI=0.0341944;REFB=-0.0776703;REVB=-0.0208871;RO=51;SAF=32;SAR=36;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154349;STB=0.516612;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0458614;OID=.;OPOS=12871099;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:127:51:54:68:73:0.574803:36:32:25:26:38:35:28:26
chr12	12879254	.	T	G	207.11	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0875909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0032;QD=48.7324;RBI=0.0945268;REFB=0;REVB=-0.0355406;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00167451;OID=.;OPOS=12879254;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:11:6:0:0:11:6:0:0
chr12	12941884	.	C	T	1434.4	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00311743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.621;QD=63.0506;RBI=0.0159455;REFB=0;REVB=-0.0156378;RO=0;SAF=53;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.1031e-05;OID=.;OPOS=12941884;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:38:53:0:0:38:53:0:0
chr12	12967127	.	C	T	432.16	PASS	AF=0.390625;AO=50;DP=128;FAO=50;FDP=128;FR=.;FRO=78;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=36;FSRR=42;FWDB=0.0282644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7152;QD=13.5049;RBI=0.0282716;REFB=0.00470802;REVB=-0.000641008;RO=78;SAF=17;SAR=33;SRF=36;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137952;STB=0.578341;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-0.00749047;OID=.;OPOS=12967127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:78:78:50:50:0.390625:33:17:36:42:33:17:36:42
chr12	13028653	.	A	G	548.77	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0523145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.018;QD=59.3268;RBI=0.0527222;REFB=0;REVB=-0.00654458;RO=0;SAF=9;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000179026;OID=.;OPOS=13028653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:37:0:0:34:37:1:25:9:0:0:25:12:0:0
chr12	13061294	.	C	G,T	316.4	PASS	AF=0.0833333,0.916667;AO=2,22;DP=24;FAO=2,22;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=2,16;FSAR=0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591037,0.000322776;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=16.2391,247.168;QD=52.7337;RBI=0.05918,0.00396412;REFB=0,0;REVB=-0.00300329,0.00395096;RO=0;SAF=2,16;SAR=0,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.17051e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0129806,-1.44674e-05;OID=.,.;OPOS=13061294,13061294;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:24:24:0:0:2,22:2,22:0.0833333,0.916667:0,6:2,16:0:0:0,6:2,16:0:0
chr12	13102605	.	G	A	147.18	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.00169077;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.699;QD=16.3536;RBI=0.039459;REFB=-0.00397839;REVB=0.0394227;RO=19;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13331;STB=0.589544;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0021276;OID=.;OPOS=13102605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:20:16:16:0.444444:7:9:8:11:7:9:8:12
chr12	13208552	.	C	T	209.59	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0234555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.9406;QD=12.15;RBI=0.0637046;REFB=-0.0167339;REVB=-0.0592294;RO=42;SAF=15;SAR=11;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00603868;STB=0.511936;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0262771;OID=.;OPOS=13208552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:43:26:26:0.376812:11:15:24:18:11:15:24:19
chr12	13214537	.	A	G	411.35	PASS	AF=0.47191;AO=42;DP=89;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.00954151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.275;QD=18.4878;RBI=0.0136598;REFB=-0.016198;REVB=-0.00977491;RO=47;SAF=25;SAR=17;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0203078;STB=0.511327;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0223678;OID=.;OPOS=13214537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:47:47:42:42:0.47191:17:25:27:20:17:25:27:20
chr12	13221606	.	T	C	632.22	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0023166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.334;QD=61.6797;RBI=0.0357973;REFB=0;REVB=-0.0357223;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000321186;OID=.;OPOS=13221606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr12	13364435	.	A	G	105.47	PASS	AF=0.181818;AO=17;DP=99;FAO=18;FDP=99;FR=.;FRO=81;FSAF=16;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=57;FWDB=-0.0269404;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=242.148;QD=4.26142;RBI=0.0284831;REFB=-0.000876519;REVB=-0.00924665;RO=81;SAF=15;SAR=2;SRF=24;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.666785;STB=0.921482;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0170415;OID=.;OPOS=13364435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:81:81:17:18:0.181818:2:15:24:57:2:16:24:57
chr12	13527882	.	G	A	781.97	PASS	AF=1;AO=44;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.163;QD=63.8341;RBI=0.0361674;REFB=0;REVB=0.0244619;RO=0;SAF=31;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000474427;OID=.;OPOS=13527882;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:44:49:1:13:31:0:0:15:34:0:0
chr12	13593879	.	G	A	785.84	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0531616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.98;QD=64.1501;RBI=0.0595294;REFB=0;REVB=0.0267879;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.6107e-05;OID=.;OPOS=13593879;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0
chr12	13715954	.	G	A	256.06	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.017108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.187;QD=22.7607;RBI=0.0291679;REFB=-0.0391369;REVB=0.0236238;RO=21;SAF=12;SAR=12;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994847;STB=0.55551;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0314796;OID=.;OPOS=13715954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:24:24:0.533333:12:12:13:8:12:12:13:8
chr12	13836561	.	T	A	142.32	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.00994387;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7242;QD=10.741;RBI=0.0764852;REFB=-0.0283617;REVB=0.075836;RO=32;SAF=7;SAR=11;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318053;STB=0.688692;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0425657;OID=.;OPOS=13836561;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:35:18:18:0.339623:11:7:22:10:11:7:24:11
chr12	14018777	.	G	C	856.74	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.147874;FXX=0.0161264;HRUN=5;LEN=1;MLLD=75.3721;QD=56.1799;RBI=0.160831;REFB=-0.0143287;REVB=0.0632453;RO=1;SAF=30;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154718;STB=0.508194;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.00109713;OID=.;OPOS=14018777;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:30:30:1:0:30:30:1:0
chr12	14019128	.	C	T	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0230855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.521;QD=8.8118;RBI=0.0276932;REFB=-0.014562;REVB=-0.0152963;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123879;STB=0.57561;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0447285;OID=.;OPOS=14019128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:5:5:14:9:5:5:14:9
chr12	14278844	.	G	A	238.55	PASS	AF=0.628571;AO=22;DP=35;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0198264;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9209;QD=27.2625;RBI=0.0225654;REFB=-0.0148945;REVB=0.0107755;RO=13;SAF=8;SAR=14;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693195;STB=0.538426;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00829197;OID=.;OPOS=14278844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:13:13:22:22:0.628571:14:8:6:7:14:8:6:7
chr12	14577892	.	A	T	140.09	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0559362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.8706;QD=20.7543;RBI=0.0910477;REFB=0.0248856;REVB=0.0718389;RO=12;SAF=6;SAR=9;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801109;STB=0.545393;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=-0.0110486;OID=.;OPOS=14577892;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:9:6:6:6:9:6:6:6
chr12	14587301	.	A	G	278.87	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.00483458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.719;QD=21.872;RBI=0.0177019;REFB=-0.0195071;REVB=-0.0170289;RO=23;SAF=18;SAR=10;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273377;STB=0.651703;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0150777;OID=.;OPOS=14587301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:10:18:7:16:10:18:7:16
chr12	14656768	.	G	C	524.17	PASS	AF=0.510204;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=38;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.00952304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.1862;QD=21.3947;RBI=0.0144053;REFB=0.00155125;REVB=0.0108086;RO=48;SAF=38;SAR=12;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105928;STB=0.558799;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=-0.00148969;OID=.;OPOS=14656768;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:48:48:50:50:0.510204:12:38:32:16:12:38:32:16
chr12	14688644	.	C	T	1418.63	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0250977;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.331;QD=63.0501;RBI=0.0341767;REFB=0;REVB=-0.0231982;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000165926;OID=.;OPOS=14688644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:90:0:0:90:90:1:47:43:0:0:47:43:0:0
chr12	14794062	.	G	A	1225.83	PASS	AF=0.954023;AO=83;DP=87;FAO=83;FDP=87;FR=.;FRO=4;FSAF=55;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0123395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2784;QD=56.36;RBI=0.0190144;REFB=-0.0273381;REVB=-0.0144667;RO=3;SAF=55;SAR=28;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.024101;STB=0.520924;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00516447;OID=.;OPOS=14794062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:87:87:3:4:83:83:0.954023:28:55:1:2:28:55:1:3
chr12	14827463	.	AATC	A	1156.05	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108416;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=3;MLLD=328.897;QD=49.7225;RBI=0.0131359;REFB=0;REVB=-0.00741693;RO=0;SAF=41;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=3.77171e-07;OID=.;OPOS=14827464;OREF=ATC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:92:93:93:93:0:41:52:0:0:20:0:41:51:0:0
chr12	14829893	.	A	C	3841.5	PASS	AF=0.984375;AO=250;DP=254;FAO=252;FDP=256;FR=.;FRO=4;FSAF=148;FSAR=104;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0658957;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.5193;QD=60.0235;RBI=0.0876494;REFB=-0.218289;REVB=0.0577942;RO=4;SAF=148;SAR=102;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00285614;STB=0.501406;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.00320161;OID=.;OPOS=14829893;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:254:256:4:4:250:252:0.984375:102:148:2:2:104:148:2:2
chr12	14926504	.	A	G	685.53	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00695973;FXX=0.019604;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.687;QD=54.8422;RBI=0.0078733;REFB=-0.0118374;REVB=-0.00368118;RO=1;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192048;STB=0.5102;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=1.75993e-05;OID=.;OPOS=14926504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:50:1:1:49:49:0.98:24:25:0:1:24:25:0:1
chr12	14929872	.	A	G	715.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0964677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.656;QD=62.2215;RBI=0.100981;REFB=0;REVB=0.0298504;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0009567;OID=.;OPOS=14929872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:23:22:0:0:23:23:0:0
chr12	14930299	.	TAAGC	T	500.94	PASS	AF=0.548387;AO=68;DP=126;FAO=68;FDP=124;FR=.;FRO=56;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=23;FWDB=0.00571938;FXX=0.0158718;HRUN=2;LEN=4;MLLD=274.9;QD=16.1593;RBI=0.00847735;REFB=-0.0196403;REVB=-0.00625733;RO=50;SAF=42;SAR=26;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144551;STB=0.513469;STBP=0.735;TYPE=del;VARB=0.0159305;OID=.;OPOS=14930300;OREF=AAGC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.548387:68:126:68:124:56:42:26:33:23:99:50:42:26:30:20
chr12	15081897	.	A	C	1584.61	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.746;QD=64.0248;RBI=0.125653;REFB=0;REVB=-0.118964;RO=0;SAF=46;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000160815;OID=.;OPOS=15081897;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:53:46:0:0:53:46:0:0
chr12	15095558	.	C	G	391.67	PASS	AF=0.549296;AO=37;DP=69;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0334749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.227;QD=22.0659;RBI=0.0363608;REFB=-0.0281457;REVB=0.0141964;RO=32;SAF=14;SAR=23;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182308;STB=0.582868;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0264955;OID=.;OPOS=15095558;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:71:32:32:37:39:0.549296:23:14:19:13:23:16:19:13
chr12	15103605	.	A	G	1540.39	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0773226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.155;QD=59.821;RBI=0.0844066;REFB=0;REVB=0.0338482;RO=0;SAF=59;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000469516;OID=.;OPOS=15103605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:44:59:0:0:44:59:0:0
chr12	15134353	.	A	G	367.8	PASS	AF=0.40566;AO=43;DP=105;FAO=43;FDP=106;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.000710374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2042;QD=13.8791;RBI=0.000710595;REFB=-0.0191127;REVB=1.77111e-05;RO=60;SAF=19;SAR=24;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.043169;STB=0.530021;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0207954;OID=.;OPOS=15134353;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:60:63:43:43:0.40566:24:19:29:31:24:19:31:32
chr12	15733669	.	G	A	254.03	PASS	AF=0.439394;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00182809;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=60.2415;QD=15.3958;RBI=0.0098443;REFB=-0.00182623;REVB=-0.00967307;RO=37;SAF=14;SAR=15;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231463;STB=0.51308;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00197276;OID=.;OPOS=15733669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:37:37:29:29:0.439394:15:14:17:20:15:14:17:20
chr12	16189694	.	T	A	519.26	PASS	AF=0.416058;AO=57;DP=137;FAO=57;FDP=137;FR=.;FRO=80;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=41;FSRR=39;FWDB=-0.00453274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.045;QD=15.161;RBI=0.0057498;REFB=-0.00307137;REVB=-0.00353758;RO=78;SAF=33;SAR=24;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0689472;STB=0.539286;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.00671599;OID=.;OPOS=16189694;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:78:80:57:57:0.416058:24:33:40:38:24:33:41:39
chr12	16347308	.	G	A	475.56	PASS	AF=0.369128;AO=54;DP=149;FAO=55;FDP=149;FR=.;FRO=94;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=56;FSRR=38;FWDB=-0.0164516;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6957;QD=12.7668;RBI=0.0446469;REFB=-0.00410867;REVB=-0.0415053;RO=89;SAF=30;SAR=24;SRF=51;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019454;STB=0.520691;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.00739576;OID=.;OPOS=16347308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:89:94:54:55:0.369128:24:30:51:38:24:31:56:38
chr12	16369828	.	A	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00135824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.203;QD=59.0186;RBI=0.0343417;REFB=0;REVB=0.0343148;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.77548e-05;OID=.;OPOS=16369828;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr12	16377510	.	A	G	321.21	PASS	AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.0010743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.114;QD=16.2639;RBI=0.00726124;REFB=-0.0228241;REVB=-0.00718133;RO=43;SAF=16;SAR=19;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382339;STB=0.527071;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0247561;OID=.;OPOS=16377510;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:43:44:35:35:0.443038:19:16:18:25:19:16:18:26
chr12	16397677	.	G	A	1916.49	PASS	AF=0.969466;AO=126;DP=130;FAO=127;FDP=131;FR=.;FRO=4;FSAF=64;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00796812;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.208;QD=58.5188;RBI=0.013112;REFB=-0.10813;REVB=-0.0104132;RO=4;SAF=64;SAR=62;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150688;STB=0.507752;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.000379855;OID=.;OPOS=16397677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:130:131:4:4:126:127:0.969466:62:64:1:3:63:64:1:3
chr12	16397734	.	C	A	333.05	PASS	AF=0.397849;AO=36;DP=92;FAO=37;FDP=93;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=0.00334416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4427;QD=14.3247;RBI=0.0379678;REFB=-0.00297689;REVB=-0.0378202;RO=56;SAF=13;SAR=23;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152761;STB=0.59272;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.00413383;OID=.;OPOS=16397734;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:56:56:36:37:0.397849:23:13:28:28:24:13:28:28
chr12	16430284	.	G	A	575.71	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0480113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.237;QD=60.6005;RBI=0.0496406;REFB=0;REVB=0.0126135;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000132623;OID=.;OPOS=16430284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0
chr12	18649057	.	C	T	342.88	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.00566992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.975;QD=21.43;RBI=0.007526;REFB=-0.000581035;REVB=-0.004949;RO=28;SAF=19;SAR=16;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20502;STB=0.619318;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.000508785;OID=.;OPOS=18649057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:28:29:35:35:0.546875:16:19:8:20:16:19:8:21
chr12	19329493	.	T	C	400.13	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0492906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4896;QD=53.351;RBI=0.0503974;REFB=-0.143234;REVB=0.0105039;RO=1;SAF=17;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266159;STB=0.514276;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00435498;OID=.;OPOS=19329493;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:12:17:1:0:12:17:1:0
chr12	19423103	.	A	G	337.77	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.0275336;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.2569;QD=19.8691;RBI=0.0300425;REFB=-0.0141485;REVB=-0.0120188;RO=33;SAF=25;SAR=10;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192448;STB=0.607412;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0233797;OID=.;OPOS=19423103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:33:33:35:35:0.514706:10:25:17:16:10:25:17:16
chr12	19456594	.	G	C	140.72	PASS	AF=0.535714;AO=10;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0299037;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=209.229;QD=20.1021;RBI=0.036427;REFB=-0.0388864;REVB=-0.0208013;RO=11;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151801;STB=0.599863;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0284404;OID=.;OPOS=19456594;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:11:13:10:15:0.535714:3:7:6:5:5:10:6:7
chr12	19456605	.	C	T	113.39	PASS	AF=0.481481;AO=12;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00463091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.203;QD=16.799;RBI=0.0119365;REFB=-0.0349454;REVB=0.0110015;RO=11;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34695;STB=0.629024;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0289697;OID=.;OPOS=19456605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:11:14:12:13:0.481481:6:6:10:1:7:6:10:4
chr12	19522649	.	T	G	322.64	PASS	AF=0.479452;AO=33;DP=71;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.0334798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.548;QD=17.6789;RBI=0.0335186;REFB=-0.0265218;REVB=0.00161107;RO=37;SAF=13;SAR=20;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114732;STB=0.566628;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0236203;OID=.;OPOS=19522649;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:73:37:38:33:35:0.479452:20:13:19:18:21:14:20:18
chr12	19671796	.	A	G	91.82	PASS	AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0498373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.654;QD=8.74505;RBI=0.0505719;REFB=-0.0143883;REVB=-0.00858856;RO=30;SAF=7;SAR=5;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0978479;STB=0.559899;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0353729;OID=.;OPOS=19671796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:42:42:30:30:12:12:0.285714:5:7:15:15:5:7:15:15
chr12	19672885	.	AAAG	A	75.09	PASS	AF=0.382353;AO=5;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0167679;FXX=0.0810592;HRUN=5;LEN=3;MLLD=199.204;QD=8.83355;RBI=0.0234987;REFB=0.000841124;REVB=0.0164629;RO=24;SAF=5;SAR=0;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.670484;STB=0.724274;STBP=0.056;TYPE=del;VARB=-0.0014859;OID=.;OPOS=19672886;OREF=AAG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.382353:5:34:13:34:21:10:3:9:12:75:24:5:0:12:12
chr12	19877449	.	A	G	3729.81	PASS	AF=1;AO=234;DP=236;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=146;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.956;QD=63.2171;RBI=0.0211044;REFB=0;REVB=0.0067615;RO=0;SAF=89;SAR=145;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28536e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.8037e-05;OID=.;OPOS=19877449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:236:236:0:0:234:236:1:145:89:0:0:146:90:0:0
chr12	20522252	.	G	A	105.88	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0424264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8353;QD=11.4464;RBI=0.0461035;REFB=2.04843e-05;REVB=0.0180426;RO=24;SAF=9;SAR=4;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207314;STB=0.512296;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.00169733;OID=.;OPOS=20522252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:4:9:17:7:4:9:17:7
chr12	20704503	.	CG	CC,C	1193.09	PASS	AF=0,0.595833;AO=33,106;DP=240;FAO=0,143;FDP=240;FR=.;FRO=97;FSAF=0,34;FSAR=0,109;FSRF=59;FSRR=38;FWDB=-0.155009,-0.0433155;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=16.1242,15.7152;QD=19.8849;RBI=0.155242,0.0633113;REFB=-0.00996536,-0.0710917;REVB=0.00849953,-0.0461745;RO=96;SAF=33,0;SAR=0,106;SRF=60;SRR=36;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.77411,-0.882887;STB=0.5,0.669747;STBP=1,0;TYPE=snp,del;VARB=-0.0509675,0.0494015;OID=.,.;OPOS=20704504,20704504;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.595833:33,106:240:0,143:240:97:0,34:0,109:59:38:99:96:33,0:0,106:60:36
chr12	20704509	.	T	G	1124.93	PASS	AF=0.518519;AO=111;DP=218;FAO=112;FDP=216;FR=.;FRO=104;FSAF=25;FSAR=87;FSRF=60;FSRR=44;FWDB=-0.0451892;FXX=0.00917389;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.425;QD=20.8321;RBI=0.0522798;REFB=-0.0247541;REVB=-0.026289;RO=104;SAF=25;SAR=86;SRF=60;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.348534;STB=0.693027;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0415502;OID=.;OPOS=20704509;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:218:216:104:104:111:112:0.518519:86:25:60:44:87:25:60:44
chr12	20766544	.	C	G	300.79	PASS	AF=0.515625;AO=19;DP=62;FAO=33;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0144396;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.874;QD=18.7995;RBI=0.259098;REFB=-0.02475;REVB=-0.258695;RO=16;SAF=16;SAR=3;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16682;STB=0.500474;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0153337;OID=.;OPOS=20766544;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:16:31:19:33:0.515625:3:16:15:1:17:16:15:16
chr12	20766559	.	C	T	708.84	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.049;QD=63.0083;RBI=0.0181488;REFB=0;REVB=0.00988912;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.75057e-05;OID=.;OPOS=20766559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:27:17:0:0:28:17:0:0
chr12	20903757	.	T	C	351.1	PASS	AF=0.474359;AO=37;DP=76;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.0591623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.5068;QD=18.0052;RBI=0.0600143;REFB=-0.0239052;REVB=-0.0100765;RO=39;SAF=20;SAR=17;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256165;STB=0.502091;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0258419;OID=.;OPOS=20903757;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:78:39:41:37:37:0.474359:17:20:20:19:17:20:22:19
chr12	20905250	.	C	T	460.29	PASS	AF=0.522727;AO=44;DP=86;FAO=46;FDP=88;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=8;FWDB=0.0147911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.792;QD=20.9222;RBI=0.0164517;REFB=-0.0123921;REVB=-0.00720296;RO=42;SAF=20;SAR=24;SRF=34;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308616;STB=0.656188;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0142035;OID=.;OPOS=20905250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:88:42:42:44:46:0.522727:24:20:34:8:24:22:34:8
chr12	21011480	.	T	G	1175.31	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178185;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.652;QD=61.0552;RBI=0.0417188;REFB=0;REVB=0.0377222;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.87002e-05;OID=.;OPOS=21011480;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:39:38:0:0:39:38:0:0
chr12	21011813	.	C	T	1007.46	PASS	AF=1;AO=66;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.112544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5966;QD=59.2622;RBI=0.125466;REFB=0;REVB=-0.0554573;RO=2;SAF=40;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00615971;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00110531;OID=.;OPOS=21011813;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:2:0:66:68:1:26:40:1:1:27:41:0:0
chr12	21013948	.	C	T	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0549672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1905;QD=53.91;RBI=0.0986112;REFB=0;REVB=-0.0818705;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00330147;OID=.;OPOS=21013948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr12	21015760	.	G	A	1914.91	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6207;QD=61.7713;RBI=0.0199111;REFB=0;REVB=-0.00849802;RO=0;SAF=63;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33224e-05;OID=.;OPOS=21015760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:61:63:0:0:61:63:0:0
chr12	21036411	.	A	G	1526.72	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=105;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0396633;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0371;QD=58.7201;RBI=0.0463817;REFB=-0.0613345;REVB=0.0240434;RO=1;SAF=48;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00978283;STB=0.505154;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.000470161;OID=.;OPOS=21036411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:105:104:1:1:103:103:0.990385:55:48:1:0:55:48:1:0
chr12	21054369	.	G	A	1157.45	PASS	AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0442575;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.532;QD=59.3562;RBI=0.0538034;REFB=-0.0593626;REVB=0.0305953;RO=0;SAF=49;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50877;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.000643641;OID=.;OPOS=21054369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:0:1:77:77:0.987179:28:49:0:0:28:49:0:1
chr12	21054918	.	T	C	872.06	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0054081;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.256;QD=58.1372;RBI=0.0761898;REFB=0;REVB=0.0759976;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00037805;OID=.;OPOS=21054918;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0
chr12	21176135	.	T	C	2333.01	PASS	AF=1;AO=153;DP=155;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531967;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6812;QD=60.2068;RBI=0.182074;REFB=0;REVB=0.174129;RO=0;SAF=86;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000662769;OID=.;OPOS=21176135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:155:155:0:0:153:155:1:67:86:0:0:69:86:0:0
chr12	21201663	.	G	A	411.18	PASS	AF=0.28436;AO=58;DP=209;FAO=60;FDP=211;FR=.;FRO=151;FSAF=23;FSAR=37;FSRF=75;FSRR=76;FWDB=-0.00218536;FXX=0.00938923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.543;QD=7.79478;RBI=0.0182614;REFB=-0.0126412;REVB=0.0181302;RO=151;SAF=22;SAR=36;SRF=75;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146255;STB=0.582462;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0399983;OID=.;OPOS=21201663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:209:211:151:151:58:60:0.28436:36:22:75:76:37:23:75:76
chr12	21329738	.	A	G	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0111884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.9427;QD=13.5761;RBI=0.0561312;REFB=0.00213329;REVB=0.0550049;RO=19;SAF=9;SAR=4;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126383;STB=0.574349;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=-1.4155e-05;OID=.;OPOS=21329738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:4:9:11:8:4:9:11:8
chr12	21331599	.	T	C	541.32	PASS	AF=0.446154;AO=58;DP=130;FAO=58;FDP=130;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=43;FSRR=29;FWDB=-0.00670327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.107;QD=16.656;RBI=0.0240632;REFB=-0.0128155;REVB=0.0231107;RO=72;SAF=33;SAR=25;SRF=43;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287346;STB=0.516018;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.020519;OID=.;OPOS=21331599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:72:72:58:58:0.446154:25:33:43:29:25:33:43:29
chr12	21422486	.	A	G	276.53	PASS	AF=0.43662;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00285761;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.3072;QD=15.5792;RBI=0.067455;REFB=0.002222;REVB=0.0673945;RO=40;SAF=15;SAR=16;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00885726;STB=0.505001;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=-0.00331362;OID=.;OPOS=21422486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:40:40:31:31:0.43662:16:15:19:21:16:15:19:21
chr12	21526651	.	G	A	172.09	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0816782;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.7072;QD=18.1149;RBI=0.0817823;REFB=-0.0160376;REVB=0.00412487;RO=20;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0107618;STB=0.506128;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0205529;OID=.;OPOS=21526651;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:7:11:12:8:7:11:12:8
chr12	21609773	.	A	G	105.73	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0253966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8444;QD=11.4307;RBI=0.0285269;REFB=-0.00385551;REVB=0.0129922;RO=24;SAF=10;SAR=3;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.323012;STB=0.694123;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00325518;OID=.;OPOS=21609773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:3:10:12:12:3:10:12:12
chr12	21622051	.	A	C	390.97	PASS	AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=22;FWDB=0.0111087;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.807;QD=16.637;RBI=0.0143741;REFB=-0.0078608;REVB=0.009122;RO=53;SAF=19;SAR=22;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121438;STB=0.568149;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.0115952;OID=.;OPOS=21622051;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:53:53:41:41:0.43617:22:19:31:22:22:19:31:22
chr12	21623179	.	T	C	162.19	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0651804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6606;QD=12.0143;RBI=0.0669936;REFB=0.00733828;REVB=0.0154808;RO=34;SAF=11;SAR=9;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748153;STB=0.543353;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=-0.0130162;OID=.;OPOS=21623179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:9:11:21:13:9:11:21:13
chr12	21623969	.	A	G	270.77	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.038366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.135;QD=16.9228;RBI=0.0504269;REFB=-0.0271674;REVB=0.032725;RO=33;SAF=20;SAR=10;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620413;STB=0.528716;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0302609;OID=.;OPOS=21623969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:34:30:30:0.46875:10:20:20:13:10:20:21:13
chr12	21624406	.	A	G	450.64	PASS	AF=0.52381;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.0235781;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.48;QD=21.4592;RBI=0.0381231;REFB=-0.025834;REVB=-0.0299574;RO=39;SAF=24;SAR=20;SRF=18;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714958;STB=0.533607;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0272529;OID=.;OPOS=21624406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:39:40:44:44:0.52381:20:24:18:21:20:24:19:21
chr12	21654831	.	G	T	557.67	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.755;QD=60.2886;RBI=0.049009;REFB=0;REVB=0.0360494;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106964;OID=.;OPOS=21654831;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:27:9:0:0:27:10:0:0
chr12	21712574	.	C	T	725.49	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0233742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8994;QD=56.901;RBI=0.0242185;REFB=0;REVB=0.00633909;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119144;OID=.;OPOS=21712574;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:26:23:0:0:26:25:0:0
chr12	21713402	.	T	C	1510.67	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.933;QD=63.6072;RBI=0.0316562;REFB=0;REVB=-0.00176777;RO=0;SAF=47;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.13456e-05;OID=.;OPOS=21713402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:48:47:0:0:48:47:0:0
chr12	21797029	.	A	G	694.92	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.152;QD=61.771;RBI=0.0651175;REFB=0;REVB=0.0490298;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000485264;OID=.;OPOS=21797029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:26:18:0:0:27:18:0:0
chr12	21799951	.	CTG	C,CT	277.69	PASS	AF=0.714286,0;AO=17,5;DP=35;FAO=25,0;FDP=35;FR=.;FRO=10;FSAF=13,0;FSAR=12,0;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0292595,-0.0256977;FXX=0.0277701;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=195.136,184.812;QD=31.7359;RBI=0.0397899,0.0292694;REFB=-0.0425067,-0.0396775;REVB=-0.0269651,-0.0140116;RO=8;SAF=7,5;SAR=10,0;SRF=5;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.123511,0.711762;STB=0.551683,0.5;STBP=0.345,1;TYPE=del,del;VARB=0.0100398,0;OID=.,.;OPOS=21799952,21799953;OREF=TG,G;OALT=-,-;OMAPALT=C,CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.714286,0:17,5:35:25,0:35:10:13,0:12,0:7:3:76:8:7,5:10,0:5:3
chr12	22017422	.	A	G	323.45	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.897;QD=53.909;RBI=0.0417791;REFB=0;REVB=0.0153394;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000301979;OID=.;OPOS=22017422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:17:7:0:0:17:7:0:0
chr12	22063115	.	A	G	1167.62	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.989;QD=60.6554;RBI=0.0223987;REFB=0;REVB=0.0122153;RO=0;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.77968e-05;OID=.;OPOS=22063115;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:77:0:0:74:77:1:34:40:0:0:36:41:0:0
chr12	22213786	.	C	T	308.32	PASS	AF=0.435897;AO=32;DP=77;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=0.0157235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.359;QD=15.8113;RBI=0.0234594;REFB=-0.00113681;REVB=-0.0174102;RO=43;SAF=16;SAR=16;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589363;STB=0.554855;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.00076972;OID=.;OPOS=22213786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:43:44:32:34:0.435897:16:16:19:24:16:18:19:25
chr12	22348500	.	A	G	429.69	PASS	AF=0.415254;AO=49;DP=118;FAO=49;FDP=118;FR=.;FRO=69;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=50;FWDB=0.0276099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.809;QD=14.5659;RBI=0.0281992;REFB=-0.015696;REVB=-0.00573497;RO=69;SAF=32;SAR=17;SRF=19;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.37907;STB=0.711974;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0132105;OID=.;OPOS=22348500;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:69:69:49:49:0.415254:17:32:19:50:17:32:19:50
chr12	22354921	.	A	G	536.21	PASS	AF=0.948718;AO=37;DP=39;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0142992;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.343;QD=54.9958;RBI=0.0177173;REFB=-0.0344997;REVB=0.0104612;RO=2;SAF=13;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066731;STB=0.535695;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00198554;OID=.;OPOS=22354921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:39:39:2:2:37:37:0.948718:24:13:2:0:24:13:2:0
chr12	22478425	.	A	G	1421.38	PASS	AF=0.958763;AO=93;DP=97;FAO=93;FDP=97;FR=.;FRO=4;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0293931;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=175.658;QD=58.6136;RBI=0.0323224;REFB=-0.129504;REVB=0.0134455;RO=2;SAF=51;SAR=42;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0182277;STB=0.508404;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.000844334;OID=.;OPOS=22478425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:97:97:2:4:93:93:0.958763:42:51:2:0:42:51:3:1
chr12	22814036	.	A	G	881.96	PASS	AF=0.927536;AO=64;DP=69;FAO=64;FDP=69;FR=.;FRO=5;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0292379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2353;QD=51.1282;RBI=0.0375327;REFB=-0.0504499;REVB=-0.0235341;RO=5;SAF=40;SAR=24;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0887891;STB=0.547155;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0375663;OID=.;OPOS=22814036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:69:69:5:5:64:64:0.927536:24:40:0:5:24:40:0:5
chr12	24859899	.	G	A	335.99	PASS	AF=0.514706;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=68;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.012517;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.418;QD=19.7644;RBI=0.0310626;REFB=-0.0212354;REVB=0.028429;RO=33;SAF=8;SAR=27;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23736;STB=0.632945;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0165072;OID=.;OPOS=24859899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:33:33:35:35:0.514706:27:8:15:18:27:8:15:18
chr12	24964383	.	T	C	673.42	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00973464;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4251;QD=62.6433;RBI=0.0245298;REFB=0;REVB=0.0225155;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000314125;OID=.;OPOS=24964383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chr12	24964523	.	C	T	483.02	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5848;QD=58.5482;RBI=0.0233383;REFB=0;REVB=-0.0196316;RO=1;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345573;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000103043;OID=.;OPOS=24964523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:1:0:32:33:1:13:19:0:1:14:19:0:0
chr12	24967846	.	A	G	90.35	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0247875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.002;QD=16.4266;RBI=0.0282084;REFB=-0.00217967;REVB=0.0134645;RO=11;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254322;STB=0.648363;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0027939;OID=.;OPOS=24967846;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:3:8:5:6:3:8:5:6
chr12	24968131	.	G	A	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0367596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.322;QD=43.4861;RBI=0.036972;REFB=0;REVB=0.00395728;RO=0;SAF=9;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00039179;OID=.;OPOS=24968131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:3:9:0:0:3:9:0:0
chr12	24968149	.	A	AC	226.61	PASS	AF=1;AO=2;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.469;QD=45.3225;RBI=0.0761808;REFB=0;REVB=-0.0647354;RO=18;SAF=0;SAR=2;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.571416;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000931427;OID=.;OPOS=24968150;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:20:20:20:0:11:9:0:0:4:18:0:2:11:7
chr12	24968150	.	A	C	208.46	PASS	AF=0.9;AO=18;DP=20;FAO=18;FDP=20;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0110894;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.07;QD=41.6913;RBI=0.0529522;REFB=-0.119483;REVB=0.051778;RO=2;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114285;STB=0.56243;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.00113287;OID=.;OPOS=24968150;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:20:20:2:2:18:18:0.9:7:11:0:2:7:11:0:2
chr12	24970708	.	G	A	758.01	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1462;QD=55.128;RBI=0.0364875;REFB=0;REVB=0.0220979;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00552532;OID=.;OPOS=24970708;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:55:0:0:50:55:1:27:23:0:0:31:24:0:0
chr12	25002738	.	C	G	375.77	PASS	AF=0.47561;AO=39;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.00708573;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=239.225;QD=18.3301;RBI=0.00909276;REFB=-0.0237383;REVB=-0.00569831;RO=41;SAF=28;SAR=11;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.16327;STB=0.60736;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0266116;OID=.;OPOS=25002738;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:41:43:39:39:0.47561:11:28:23:18:11:28:23:20
chr12	25147279	.	G	A,GA	45.56	PASS	AF=0,0.276596;AO=3,13;DP=50;FAO=0,13;FDP=47;FR=.;FRO=34;FSAF=0,4;FSAR=0,9;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0069231,-0.218805;FXX=0;HRUN=1,7;LEN=1,1;MLLD=359.718,7.29452;QD=3.87786;RBI=0.00719409,0.298604;REFB=-0.00126882,-0.0692784;REVB=0.00195591,0.203197;RO=30;SAF=2,7;SAR=1,6;SRF=16;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.140575,0.00593855;STB=0.5,0.718523;STBP=1,0.073;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.066361;OID=.,.;OPOS=25147279,25147280;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:47:50:47:30:34:3,13:0,13:0,0.276596:1,6:2,7:16:14:0,9:0,4:21:13
chr12	25148755	.	C	G	1359.25	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=91;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00547899;FXX=0.0219756;HRUN=4;LEN=1;MLLD=98.2717;QD=61.0897;RBI=0.0422822;REFB=-0.048927;REVB=0.0419257;RO=0;SAF=57;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.90485e-08;STB=0.504347;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00026949;OID=.;OPOS=25148755;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:89:0:1:88:88:0.988764:31:57:0:0:31:57:1:0
chr12	25242595	.	C	G	1114.4	PASS	AF=0.974359;AO=74;DP=78;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0164181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2802;QD=57.1487;RBI=0.0164302;REFB=0.0279516;REVB=0.000630095;RO=1;SAF=39;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119765;STB=0.501018;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=-0.00212906;OID=.;OPOS=25242595;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:78:78:1:2:74:76:0.974359:35:39:1:0:35:41:1:1
chr12	25243115	.	G	C	139.72	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=0.00358324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3228;QD=19.2711;RBI=0.00910524;REFB=-4.78096e-05;REVB=0.00837053;RO=12;SAF=6;SAR=9;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201403;STB=0.596895;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=-0.000163961;OID=.;OPOS=25243115;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:29:12:14:15:15:0.517241:9:6:2:10:9:6:3:11
chr12	25311489	.	G	T	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0112852;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.773;QD=15.8821;RBI=0.0139391;REFB=-0.0277411;REVB=0.00818188;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858363;STB=0.549901;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0233925;OID=.;OPOS=25311489;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:5:5:6:4:5:5:6:4
chr12	25357574	.	CAA	C,CGA	230.41	PASS	AF=0.433962,0.0566038;AO=23,3;DP=53;FAO=23,3;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=9,2;FSAR=14,1;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0050241,-0.0400164;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=169.909,161.564;QD=17.3896;RBI=0.0306188,0.0402033;REFB=-0.018698,-0.00799926;REVB=0.0302038,0.00387148;RO=27;SAF=9,2;SAR=14,1;SRF=13;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0880988,0.194442;STB=0.549956,0.665561;STBP=0.545,0.654;TYPE=del,snp;VARB=0.0293997,0.0664267;OID=.,.;OPOS=25357575,25357575;OREF=AA,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.433962,0.0566038:23,3:53:23,3:53:27:9,2:14,1:13:14:99:27:9,2:14,1:13:14
chr12	25357628	.	TA	T	69.04	PASS	AF=0.5625;AO=8;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0421047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0737;QD=17.2598;RBI=0.0567434;REFB=-0.0308651;REVB=-0.0380395;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158056;STB=0.608447;STBP=0.39;TYPE=del;VARB=0.0334699;OID=.;OPOS=25357629;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5625:8:16:9:16:7:3:6:4:3:47:7:3:5:4:3
chr12	25361091	.	T	C	1594.81	PASS	AF=0.981818;AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0709975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.439;QD=57.9932;RBI=0.0950976;REFB=-0.169385;REVB=0.0632685;RO=0;SAF=50;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61453e-08;STB=0.500677;STBP=0.863;TYPE=snp;VARB=0.000770891;OID=.;OPOS=25361091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:110:110:0:2:108:108:0.981818:58:50:0:0:58:50:1:1
chr12	25361142	.	A	G	480.69	PASS	AF=0.494737;AO=47;DP=95;FAO=47;FDP=95;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=30;FWDB=0.0222968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.57;QD=20.2397;RBI=0.0225664;REFB=-0.00995825;REVB=-0.00347782;RO=47;SAF=20;SAR=27;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395596;STB=0.526305;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0090768;OID=.;OPOS=25361142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:47:48:47:47:0.494737:27:20:18:29:27:20:18:30
chr12	25362127	.	AGA	AG,TAG	49.11	PASS	AF=0.384615,0;AO=16,2;DP=39;FAO=15,0;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=6,0;FSAR=9,0;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0670929,-0.0548735;FXX=0;HRUN=6,1;LEN=1,3;MLLD=7.99368,28.6728;QD=5.03669;RBI=0.068213,0.0580245;REFB=-0.138528,-0.0203768;REVB=-0.0123107,0.0188612;RO=17;SAF=6,2;SAR=10,0;SRF=9;SRR=8;SSEN=0.375,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.142198,0.516333;STB=0.612096,0.5;STBP=0.297,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.135087,0;OID=.,.;OPOS=25362129,25362127;OREF=A,AGA;OALT=-,TAG;OMAPALT=AG,TAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:39:39:17:24:16,2:15,0:0.384615,0:10,0:6,2:9:8:9,0:6,0:14:10
chr12	25362217	.	A	G	335.85	PASS	AF=0.566667;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0570006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.852;QD=22.3898;RBI=0.0570009;REFB=-0.0301804;REVB=-0.000195705;RO=26;SAF=17;SAR=17;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302016;STB=0.516657;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0250559;OID=.;OPOS=25362217;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:26:26:34:34:0.566667:17:17:12:14:17:17:12:14
chr12	25362465	.	G	A	190.14	PASS	AF=1;AO=13;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0504663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.444;QD=47.5348;RBI=0.0597246;REFB=0;REVB=0.0319402;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000665907;OID=.;OPOS=25362465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:13:16:1:7:6:0:0:8:8:0:0
chr12	25362552	.	A	C	124.87	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00161707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1806;QD=17.8381;RBI=0.0352814;REFB=0.0156436;REVB=0.0352443;RO=14;SAF=6;SAR=8;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12462;STB=0.571326;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.0164155;OID=.;OPOS=25362552;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:8:6:8:6:8:6:8:6
chr12	25362777	.	A	G	134.35	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0409524;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1752;QD=14.5242;RBI=0.0493517;REFB=-0.0123559;REVB=0.0275408;RO=21;SAF=10;SAR=5;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329689;STB=0.701494;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0166051;OID=.;OPOS=25362777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:21:22:15:15:0.405405:5:10:7:14:5:10:7:15
chr12	25368462	.	C	T	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285266;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.445;QD=58.7815;RBI=0.0308879;REFB=0;REVB=0.0118445;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.44434e-05;OID=.;OPOS=25368462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:28:37:0:0:28:37:0:0
chr12	25671759	.	T	A	1411.21	PASS	AF=0.979592;AO=87;DP=92;FAO=96;FDP=98;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0778098;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.7685;QD=57.6005;RBI=0.145524;REFB=-0.0948331;REVB=0.122975;RO=3;SAF=55;SAR=32;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251432;STB=0.50877;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.010251;OID=.;OPOS=25671759;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:92:98:3:2:87:96:0.979592:32:55:3:0:40:56:2:0
chr12	26217567	.	T	C	53.69	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00466762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.072;QD=7.95466;RBI=0.0305801;REFB=0.00450887;REVB=-0.0302218;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0890944;STB=0.555418;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=-0.0116077;OID=.;OPOS=26217567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:4:4:11:8:4:4:11:8
chr12	26275823	.	GCCCCG	GCCCG,GCCCGC,GCCCGCG	172.42	PASS	AF=1,0,0;AO=13,2,2;DP=19;FAO=18,0,0;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=16,0,0;FSAR=2,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062305,-0.0338861,-0.0699001;FXX=0.0526039;HRUN=4,4,0;LEN=1,2,1;MLLD=15.1817,4.53167,86.227;QD=38.316;RBI=0.175165,0.240839,0.0727793;REFB=0,0,0;REVB=0.16371,-0.238443,0.0202683;RO=1;SAF=13,0,2;SAR=0,2,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-0.697199,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,ins;VARB=0.0185501,0,0;OID=.,.,.;OPOS=26275824,26275827,26275827;OREF=C,CG,-;OALT=-,GC,G;OMAPALT=GCCCG,GCCCGC,GCCCGCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0,0:13,2,2:19:18,0,0:18:0:16,0,0:2,0,0:0:0:3:1:13,0,2:0,2,0:1:0
chr12	26491475	.	T	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144744;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=275.727;QD=53.9112;RBI=0.0338723;REFB=0;REVB=0.0306239;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27331e-05;OID=.;OPOS=26491475;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:14:10:0:0:14:10:0:0
chr12	26640045	.	CT	C	60.48	PASS	AF=0.440678;AO=14;DP=54;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=0.174201;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.41373;QD=4.10008;RBI=0.174945;REFB=-0.0776833;REVB=0.0161227;RO=34;SAF=9;SAR=5;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.083005;STB=0.523482;STBP=0.763;TYPE=del;VARB=0.105564;OID=.;OPOS=26640046;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.440678:14:54:26:59:33:19:7:23:10:60:34:9:5:24:10
chr12	26784850	.	G	A	428.53	PASS	AF=0.545455;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0388723;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.722;QD=22.2614;RBI=0.0434165;REFB=-0.0260981;REVB=0.0193376;RO=35;SAF=27;SAR=15;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203751;STB=0.612422;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0155621;OID=.;OPOS=26784850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:35:35:42:42:0.545455:15:27:14:21:15:27:14:21
chr12	26809316	.	G	A	415.35	PASS	AF=0.488372;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=86;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0204917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.37;QD=19.3187;RBI=0.0252417;REFB=-0.00413265;REVB=0.0147389;RO=44;SAF=18;SAR=24;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663348;STB=0.536895;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00690728;OID=.;OPOS=26809316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:44:44:42:42:0.488372:24:18:22:22:24:18:22:22
chr12	26810777	.	T	C	1712.21	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00253956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.898;QD=60.6091;RBI=0.0436741;REFB=0;REVB=0.0436002;RO=0;SAF=59;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.48258e-05;OID=.;OPOS=26810777;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:113:0:0:111:113:1:52:59:0:0:54:59:0:0
chr12	26810816	.	T	G	410.36	PASS	AF=0.477273;AO=41;DP=88;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.0211295;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6515;QD=18.6527;RBI=0.0570126;REFB=0.00729569;REVB=0.0529527;RO=46;SAF=20;SAR=21;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938333;STB=0.557686;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=-0.00756427;OID=.;OPOS=26810816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:46:46:41:42:0.477273:21:20:27:19:22:20:27:19
chr12	26834804	.	T	C,TACTC	1389.4	PASS	AF=0.0434783,0.945652;AO=4,85;DP=92;FAO=4,87;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=3,68;FSAR=1,19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00922903,0.0165988;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,4;MLLD=88.1089,234.478;QD=60.4089;RBI=0.0281568,0.0326925;REFB=-0.0523898,-0.0742837;REVB=0.0266013,0.0281652;RO=1;SAF=3,66;SAR=1,19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.272709,0.024275;STB=0.665771,0.512818;STBP=0.288,0.102;TYPE=snp,ins;VARB=0.0386611,1.66522e-05;OID=.,.;OPOS=26834804,26834805;OREF=T,-;OALT=C,ACTC;OMAPALT=C,TACTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:92:92:1:1:4,85:4,87:0.0434783,0.945652:1,19:3,66:0:1:1,19:3,68:0:1
chr12	26868322	.	T	C	347.92	PASS	AF=0.404255;AO=38;DP=94;FAO=38;FDP=94;FR=.;FRO=56;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=33;FWDB=0.00197328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=236.6;QD=14.805;RBI=0.0179063;REFB=2.10267e-05;REVB=0.0177973;RO=56;SAF=23;SAR=15;SRF=23;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203658;STB=0.615324;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-3.7772e-07;OID=.;OPOS=26868322;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:56:56:38:38:0.404255:15:23:23:33:15:23:23:33
chr12	26943170	.	A	T	224.92	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.015636;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=325.947;QD=19.9932;RBI=0.0190085;REFB=-0.010746;REVB=0.0108093;RO=23;SAF=14;SAR=8;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295977;STB=0.666518;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0116066;OID=.;OPOS=26943170;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:8:14:7:16:8:14:7:16
chr12	27064232	.	C	T	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.059;QD=58.7817;RBI=0.0182702;REFB=0;REVB=0.0108268;RO=0;SAF=20;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.44358e-05;OID=.;OPOS=27064232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:45:20:0:0:45:20:0:0
chr12	27175640	.	A	G	813.39	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157523;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.5698;QD=57.0802;RBI=0.0239253;REFB=0;REVB=-0.0180079;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000212595;OID=.;OPOS=27175640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:21:35:0:0:22:35:0:0
chr12	27470866	.	G	A	712.12	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0077747;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.747;QD=63.2993;RBI=0.0263857;REFB=0;REVB=-0.0252143;RO=0;SAF=30;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.78177e-05;OID=.;OPOS=27470866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:15:30:0:0:15:30:0:0
chr12	27627805	.	G	A	431.24	PASS	AF=0.552632;AO=41;DP=74;FAO=42;FDP=76;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=34;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0431362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.873;QD=22.6968;RBI=0.045151;REFB=-0.026038;REVB=0.0133374;RO=33;SAF=8;SAR=33;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319541;STB=0.675582;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0159911;OID=.;OPOS=27627805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:33:34:41:42:0.552632:33:8:17:16:34:8:17:17
chr12	27641473	.	G	A	172.1	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0453973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.501;QD=18.1157;RBI=0.046478;REFB=-0.039673;REVB=0.00996439;RO=20;SAF=6;SAR=12;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250214;STB=0.642696;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0294882;OID=.;OPOS=27641473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:12:6:12:8:12:6:12:8
chr12	27648710	.	C	T	427.12	PASS	AF=0.531646;AO=41;DP=79;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.0248976;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.139;QD=21.6264;RBI=0.0302104;REFB=-0.0187563;REVB=0.0171106;RO=35;SAF=15;SAR=26;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174977;STB=0.600925;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0210846;OID=.;OPOS=27648710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:35:37:41:42:0.531646:26:15:20:15:26:16:22:15
chr12	27648786	.	A	G	118.77	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0737131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9642;QD=22.6228;RBI=0.114034;REFB=-0.0239875;REVB=0.087006;RO=8;SAF=1;SAR=12;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494001;STB=0.788892;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.00858465;OID=.;OPOS=27648786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:12:1:4:4:12:1:4:4
chr12	27788021	.	G	A	267.07	PASS	AF=0.615385;AO=24;DP=39;FAO=24;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.106773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.8784;QD=27.3919;RBI=0.106934;REFB=-0.0616739;REVB=-0.00586152;RO=11;SAF=11;SAR=13;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0499396;STB=0.579552;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0299405;OID=.;OPOS=27788021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:11:15:24:24:0.615385:13:11:6:5:13:11:10:5
chr12	27800746	.	G	T	1517.9	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.3773;QD=58.9476;RBI=0.0594772;REFB=0;REVB=0.0583587;RO=0;SAF=45;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08171e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000715701;OID=.;OPOS=27800746;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:103:103:0:0:102:103:1:57:45:0:0:58:45:0:0
chr12	27849795	.	CA	GG,TG	467.14	PASS	AF=0.212121,0.787879;AO=7,26;DP=33;FAO=7,26;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=7,13;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360055,-0.0121771;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=2,2;MLLD=81.8045,211.983;QD=56.6233;RBI=0.0461176,0.0162473;REFB=0,0;REVB=-0.0288173,0.0107561;RO=0;SAF=7,13;SAR=0,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=-0.00198642,-0.00791631;OID=.,.;OPOS=27849795,27849795;OREF=CA,CA;OALT=GG,TG;OMAPALT=GG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:42:33:33:0:0:7,26:7,26:0.212121,0.787879:0,13:7,13:0:0:0,13:7,13:0:0
chr12	27867706	.	C	T	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.003709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.536;QD=56.1915;RBI=0.0182301;REFB=0;REVB=-0.0178488;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.63902e-05;OID=.;OPOS=27867706;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:16:12:0:0:16:12:0:0
chr12	27915718	.	A	T	920.09	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0366967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.139;QD=58.4183;RBI=0.0372482;REFB=0;REVB=0.0063857;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.5521e-05;OID=.;OPOS=27915718;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:26:37:0:0:26:37:0:0
chr12	27959201	.	G	A	243.46	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.0270818;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.257;QD=14.9819;RBI=0.0287261;REFB=-0.0205118;REVB=0.00957946;RO=37;SAF=10;SAR=18;SRF=13;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00634438;STB=0.503595;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0323409;OID=.;OPOS=27959201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:37:37:28:28:0.430769:18:10:13:24:18:10:13:24
chr12	28122893	.	A	G	283.0	PASS	AF=0.421053;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=0.0211403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.816;QD=14.8947;RBI=0.0218926;REFB=-0.019305;REVB=0.00568997;RO=43;SAF=20;SAR=12;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187243;STB=0.599937;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0343435;OID=.;OPOS=28122893;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:43:44:32:32:0.421053:12:20:19:24:12:20:20:24
chr12	28457618	.	A	C	1531.29	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00372225;FXX=0.0204061;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.059;QD=63.8039;RBI=0.0118345;REFB=0;REVB=0.0112339;RO=0;SAF=49;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230904;OID=.;OPOS=28457618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:47:49:0:0:47:49:0:0
chr12	28605426	.	G	A	1062.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00103052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.741;QD=59.855;RBI=0.0138266;REFB=0;REVB=0.0137881;RO=0;SAF=43;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.09158e-06;OID=.;OPOS=28605426;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:28:43:0:0:28:43:0:0
chr12	28658350	.	C	T	1193.61	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000904844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.595;QD=59.6806;RBI=0.0190109;REFB=-0.0401699;REVB=-0.0189894;RO=1;SAF=39;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011984;STB=0.506328;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=8.89607e-05;OID=.;OPOS=28658350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:40:39:1:0:40:39:1:0
chr12	29604392	.	C	G	72.3	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.00273412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.47;QD=8.50581;RBI=0.0138913;REFB=-0.0161787;REVB=-0.0136196;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293146;STB=0.676161;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0314486;OID=.;OPOS=29604392;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:5:5:18:6:5:5:18:6
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chr12	29617550	.	G	A	524.85	PASS	AF=0.563218;AO=47;DP=85;FAO=49;FDP=87;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=0.00746056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.632;QD=24.1309;RBI=0.0493605;REFB=-0.0247563;REVB=0.0487934;RO=38;SAF=21;SAR=26;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232919;STB=0.632206;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0161836;OID=.;OPOS=29617550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:87:38:38:47:49:0.563218:26:21:28:10:28:21:28:10
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chr12	29630081	.	G	A	166.49	PASS	AF=0.328358;AO=22;DP=67;FAO=22;FDP=67;FR=.;FRO=45;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0148555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9869;QD=9.9395;RBI=0.0150165;REFB=-0.00345181;REVB=-0.0021926;RO=43;SAF=10;SAR=12;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116682;STB=0.552798;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.00735259;OID=.;OPOS=29630081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:43:45:22:22:0.328358:12:10:24:19:12:10:24:21
chr12	29639186	.	T	C	199.75	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00989201;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.305;QD=19.9749;RBI=0.0208875;REFB=-0.0326613;REVB=0.0183967;RO=20;SAF=9;SAR=11;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884614;STB=0.54995;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.0347869;OID=.;OPOS=29639186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:11:9:11:9:11:9:11:9
chr12	29639877	.	G	C	226.97	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0556494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8721;QD=15.6533;RBI=0.0556627;REFB=-0.0335975;REVB=0.00121568;RO=32;SAF=16;SAR=10;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115021;STB=0.565167;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0463007;OID=.;OPOS=29639877;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:10:16:16:16:10:16:16:16
chr12	29648364	.	G	A	231.07	PASS	AF=0.388889;AO=27;DP=70;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.0327601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5877;QD=12.8374;RBI=0.0359867;REFB=-0.0121896;REVB=0.0148936;RO=43;SAF=16;SAR=11;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0879711;STB=0.530099;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0237428;OID=.;OPOS=29648364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:43:44:27:28:0.388889:11:16:22:21:12:16:23:21
chr12	29653884	.	T	TAG	1078.41	PASS	AF=0.438202;AO=115;DP=269;FAO=117;FDP=267;FR=.;FRO=150;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=77;FSRR=73;FWDB=0.00304767;FXX=0.0037312;HRUN=3;LEN=2;MLLD=279.156;QD=16.1559;RBI=0.0112728;REFB=-0.0186443;REVB=-0.010853;RO=140;SAF=60;SAR=55;SRF=69;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0286379;STB=0.504519;STBP=0.892;TYPE=ins;VARB=0.0220076;OID=.;OPOS=29653885;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=TAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.438202:115:269:117:267:150:61:56:77:73:99:140:60:55:69:71
chr12	30881713	.	T	C	551.16	PASS	AF=0.528302;AO=56;DP=105;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0131415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.881;QD=20.7986;RBI=0.0222005;REFB=0.00192298;REVB=0.0178931;RO=49;SAF=29;SAR=27;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0456229;STB=0.519925;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=-0.00122221;OID=.;OPOS=30881713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:49:50:56:56:0.528302:27:29:28:21:27:29:28:22
chr12	31107131	.	A	G	279.45	PASS	AF=0.462687;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=67;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0286415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.653;QD=16.6834;RBI=0.030244;REFB=-0.0205524;REVB=-0.00971411;RO=36;SAF=20;SAR=11;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905697;STB=0.550987;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0256527;OID=.;OPOS=31107131;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:36:36:31:31:0.462687:11:20:20:16:11:20:20:16
chr12	31107955	.	G	A	767.84	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.412;QD=56.8773;RBI=0.0140582;REFB=0;REVB=-0.000650244;RO=0;SAF=11;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.258e-05;OID=.;OPOS=31107955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:41:11:0:0:41:13:0:0
chr12	31135478	.	T	C	2316.0	PASS	AF=1;AO=151;DP=152;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0278898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4678;QD=60.5491;RBI=0.0833262;REFB=0;REVB=-0.0785202;RO=0;SAF=87;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000344636;OID=.;OPOS=31135478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:152:153:0:0:151:153:1:64:87:0:0:65:88:0:0
chr12	31135579	.	T	C	372.86	PASS	AF=0.333333;AO=46;DP=139;FAO=46;FDP=138;FR=.;FRO=92;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=45;FSRR=47;FWDB=-0.068052;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.405;QD=10.8076;RBI=0.0714426;REFB=-0.0211183;REVB=-0.021748;RO=91;SAF=26;SAR=20;SRF=44;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943654;STB=0.550895;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0549877;OID=.;OPOS=31135579;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:138:91:92:46:46:0.333333:20:26:44:47:20:26:45:47
chr12	31237700	.	G	A	438.47	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0224256;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.067;QD=54.8088;RBI=0.0237546;REFB=-0.0868036;REVB=0.0078342;RO=1;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252169;STB=0.513505;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000708354;OID=.;OPOS=31237700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:32:1:1:31:31:0.96875:18:13:0:1:18:13:0:1
chr12	31240862	.	A	T	837.03	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0440502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6757;QD=55.8023;RBI=0.138486;REFB=-0.0799342;REVB=0.131294;RO=1;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145176;STB=0.50769;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00350885;OID=.;OPOS=31240862;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:32:27:0:1:32:27:0:1
chr12	31240925	.	A	G	1572.72	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000921261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.935;QD=62.9089;RBI=0.041849;REFB=-0.128662;REVB=0.0418389;RO=1;SAF=47;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00903516;STB=0.504761;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000385799;OID=.;OPOS=31240925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:100:100:1:1:99:99:0.99:52:47:0:1:52:47:0:1
chr12	31242399	.	T	C	1822.4	PASS	AF=1;AO=117;DP=119;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.699;QD=61.257;RBI=0.031857;REFB=0;REVB=-0.0242544;RO=0;SAF=72;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.9317e-06;OID=.;OPOS=31242399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:119:119:0:0:117:119:1:45:72:0:0:46:73:0:0
chr12	31244748	.	G	A	267.53	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0161419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.1252;QD=21.8391;RBI=0.0362087;REFB=-0.013953;REVB=0.0324115;RO=24;SAF=11;SAR=14;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124989;STB=0.569977;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0226512;OID=.;OPOS=31244748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:14:11:14:10:14:11:14:10
chr12	31247682	.	T	C	186.96	PASS	AF=0.294118;AO=25;DP=85;FAO=25;FDP=85;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=32;FWDB=-0.00905694;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=308.209;QD=8.79831;RBI=0.0131335;REFB=-0.0117579;REVB=0.00951105;RO=60;SAF=15;SAR=10;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158911;STB=0.594264;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.028547;OID=.;OPOS=31247682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:60:60:25:25:0.294118:10:15:28:32:10:15:28:32
chr12	31249861	.	C	G	905.93	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.116903;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3299;QD=56.6208;RBI=0.122002;REFB=0.0407192;REVB=0.0349033;RO=1;SAF=51;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00917148;STB=0.504853;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.000461812;OID=.;OPOS=31249861;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:12:51:1:0:12:51:1:0
chr12	31253995	.	CG	GC,TG	771.19	PASS	AF=0.0204082,0.979592;AO=2,47;DP=49;FAO=1,48;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=1,20;FSAR=0,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00634617,0.101174;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=188.575,128.058;QD=62.9538;RBI=0.0287434,0.103232;REFB=0,0;REVB=-0.0280341,-0.0205102;RO=0;SAF=2,19;SAR=0,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0116805,0.000264798;OID=.,.;OPOS=31253995,31253995;OREF=CG,C;OALT=GC,T;OMAPALT=GC,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:49:49:0:0:2,47:1,48:0.0204082,0.979592:0,28:2,19:0:0:0,28:1,20:0:0
chr12	31255263	.	G	A	336.98	PASS	AF=0.818182;AO=27;DP=33;FAO=27;FDP=33;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0934278;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.763;QD=40.8464;RBI=0.103219;REFB=-0.0965412;REVB=0.0438798;RO=4;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883989;STB=0.508015;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.00588292;OID=.;OPOS=31255263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:33:33:4:6:27:27:0.818182:19:8:0:4:19:8:2:4
chr12	31256546	.	G	A	92.47	PASS	AF=1;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440149;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.689;QD=41.0997;RBI=0.0581044;REFB=0;REVB=0.0379316;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00038365;OID=.;OPOS=31256546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0
chr12	31256905	.	T	C	986.84	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0509804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.835;QD=58.9156;RBI=0.0549899;REFB=0;REVB=0.0206128;RO=0;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.93655e-05;OID=.;OPOS=31256905;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:43:24:0:0:43:24:0:0
chr12	31267744	.	A	C	436.37	PASS	AF=0.96875;AO=29;DP=31;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00917043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.201;QD=54.5467;RBI=0.0168871;REFB=-0.00854986;REVB=0.0141802;RO=1;SAF=13;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344827;STB=0.51723;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=5.20314e-05;OID=.;OPOS=31267744;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:32:1:1:29:31:0.96875:16:13:1:0:17:14:1:0
chr12	31282765	.	A	T	182.82	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00289845;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=332.046;QD=43.016;RBI=0.00311075;REFB=0.0504008;REVB=0.00112949;RO=1;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701691;STB=0.538413;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=-0.00134573;OID=.;OPOS=31282765;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:6:10:0:1:6:10:0:1
chr12	31282784	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0806824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.333;QD=50.4134;RBI=0.0925726;REFB=0;REVB=0.0453876;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000951062;OID=.;OPOS=31282784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr12	31283446	.	T	G	217.77	PASS	AF=0.44898;AO=19;DP=46;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=5;FWDB=0.0118282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.363;QD=17.777;RBI=0.0265933;REFB=-0.0222131;REVB=0.023818;RO=27;SAF=12;SAR=7;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216992;STB=0.653723;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0744878;OID=.;OPOS=31283446;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:49:27:27:19:22:0.44898:7:12:22:5:10:12:22:5
chr12	31285214	.	A	G	157.06	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0879832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.5272;QD=16.1083;RBI=0.103121;REFB=0.0146928;REVB=0.0537852;RO=22;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104869;STB=0.560437;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.014277;OID=.;OPOS=31285214;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:11:6:10:12:11:6:10:12
chr12	31291163	.	G	A	459.2	PASS	AF=0.429752;AO=49;DP=119;FAO=52;FDP=121;FR=.;FRO=69;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=45;FSRR=24;FWDB=-0.0121591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.981;QD=15.18;RBI=0.0156459;REFB=-0.0161715;REVB=0.00984625;RO=69;SAF=34;SAR=15;SRF=45;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497601;STB=0.526305;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0236211;OID=.;OPOS=31291163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:121:69:69:49:52:0.429752:15:34:45:24:16:36:45:24
chr12	31297871	.	G	C	192.82	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0638136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5962;QD=14.832;RBI=0.0735136;REFB=-0.0213413;REVB=0.0364976;RO=30;SAF=7;SAR=15;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257162;STB=0.647345;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0322396;OID=.;OPOS=31297871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:15:7:17:13:15:7:17:13
chr12	31300891	.	C	A	606.09	PASS	AF=0.606742;AO=54;DP=89;FAO=54;FDP=89;FR=.;FRO=35;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00875517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.15;QD=27.2399;RBI=0.0229125;REFB=-0.0273766;REVB=-0.0211738;RO=35;SAF=36;SAR=18;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305579;STB=0.51666;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0172338;OID=.;OPOS=31300891;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:35:35:54:54:0.606742:18:36:22:13:18:36:22:13
chr12	31303173	.	G	A	174.19	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0584425;FXX=0.0263089;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.431;QD=18.8316;RBI=0.0635202;REFB=-0.00583818;REVB=-0.0248856;RO=16;SAF=6;SAR=12;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.34142;STB=0.723904;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00163747;OID=.;OPOS=31303173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:37:16:19:18:18:0.486486:12:6:12:4:12:6:15:4
chr12	31604928	.	G	C	321.33	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00765293;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.529;QD=18.902;RBI=0.0161897;REFB=-0.0111039;REVB=0.0142668;RO=34;SAF=26;SAR=8;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221067;STB=0.624138;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0123512;OID=.;OPOS=31604928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:8:26:19:15:8:26:19:15
chr12	31605044	.	G	T	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0130556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.246;QD=17.1565;RBI=0.0382883;REFB=-0.0114424;REVB=-0.0359936;RO=18;SAF=12;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.041688;STB=0.565138;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0119563;OID=.;OPOS=31605044;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:20:17:17:0.459459:5:12:12:6:5:12:12:8
chr12	31648826	.	C	T	91.11	PASS	AF=0.272727;AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0214268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.582;QD=8.2825;RBI=0.0214339;REFB=-0.0105417;REVB=0.000553826;RO=32;SAF=5;SAR=7;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051235;STB=0.531444;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0277945;OID=.;OPOS=31648826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:44:44:32:32:12:12:0.272727:7:5:12:20:7:5:12:20
chr12	31659332	.	A	T	182.99	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0245255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3457;QD=17.4272;RBI=0.0342791;REFB=0.0117134;REVB=0.0239491;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138241;STB=0.578864;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=-0.0129482;OID=.;OPOS=31659332;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:8:11:10:13:8:11:10:13
chr12	31944475	.	C	T	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.00324148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.249;QD=12.0517;RBI=0.0209968;REFB=-0.0123904;REVB=-0.0207451;RO=13;SAF=3;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.346427;STB=0.705442;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0103728;OID=.;OPOS=31944475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:6:3:9:4:6:3:9:4
chr12	31944894	.	C	T	239.08	PASS	AF=0.490909;AO=26;DP=54;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0095934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.903;QD=17.3879;RBI=0.0350812;REFB=-0.0011923;REVB=-0.033744;RO=28;SAF=12;SAR=14;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00254653;STB=0.508765;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0029305;OID=.;OPOS=31944894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:28:28:26:27:0.490909:14:12:13:15:14:13:13:15
chr12	31944985	.	T	G	501.35	PASS	AF=0.521739;AO=47;DP=91;FAO=48;FDP=92;FR=.;FRO=44;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=0.00335392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.658;QD=21.7979;RBI=0.0175297;REFB=-0.0114409;REVB=0.0172058;RO=44;SAF=18;SAR=29;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163998;STB=0.593883;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0113129;OID=.;OPOS=31944985;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:44:44:47:48:0.521739:29:18:25:19:30:18:25:19
chr12	32134240	.	C	T	229.18	PASS	AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.02514;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.755;QD=13.8894;RBI=0.0251623;REFB=0.00117501;REVB=0.00105848;RO=39;SAF=11;SAR=16;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213433;STB=0.621443;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.00112174;OID=.;OPOS=32134240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:39:39:27:27:0.409091:16:11:24:15:16:11:24:15
chr12	32134638	.	T	C	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.021981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.95;QD=14.1697;RBI=0.0332628;REFB=0.000690725;REVB=0.024965;RO=12;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316368;STB=0.683866;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=-0.00274954;OID=.;OPOS=32134638;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:6:4:9:3:6:4:9:3
chr12	32135441	.	T	C	75.85	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=19;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0136283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.324;QD=15.1698;RBI=0.0295817;REFB=-0.0268083;REVB=0.0262555;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133598;STB=0.553088;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.0286277;OID=.;OPOS=32135441;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:19:20:10:10:9:10:0.5:4:5:7:3:4:6:7:3
chr12	32137447	.	C	T	216.34	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.00719722;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.069;QD=22.1886;RBI=0.0138846;REFB=-0.00437544;REVB=0.0118736;RO=18;SAF=8;SAR=13;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276426;STB=0.654532;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00322391;OID=.;OPOS=32137447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:13:8:13:5:13:8:13:5
chr12	32137512	.	C	G	185.82	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00209473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.865;QD=19.0581;RBI=0.00959339;REFB=-0.00550549;REVB=0.0093619;RO=19;SAF=7;SAR=12;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232385;STB=0.643282;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.00728921;OID=.;OPOS=32137512;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:20:19:19:0.487179:12:7:12:7:12:7:13:7
chr12	32261239	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018032;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.643;QD=37.4885;RBI=0.01826;REFB=0;REVB=0.00287676;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204328;OID=.;OPOS=32261239;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr12	32261252	.	A	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130146;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=324.38;QD=37.4885;RBI=0.0153543;REFB=0;REVB=0.00814711;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105118;OID=.;OPOS=32261252;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr12	32261419	.	G	A	239.32	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00934557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.139;QD=50.3823;RBI=0.0546017;REFB=0;REVB=-0.053796;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000707875;OID=.;OPOS=32261419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr12	32261435	.	A	G	340.42	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024109;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184;QD=54.4673;RBI=0.0474946;REFB=0;REVB=0.0409206;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000274707;OID=.;OPOS=32261435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:11:14:0:0:11:14:0:0
chr12	32481093	.	G	C	316.82	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0042126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.525;QD=20.4402;RBI=0.0116279;REFB=-0.00497903;REVB=0.010838;RO=28;SAF=16;SAR=17;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421141;STB=0.515142;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.00436894;OID=.;OPOS=32481093;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:28:29:33:33:0.532258:17:16:15:13:17:16:15:14
chr12	32490764	.	G	A	55.41	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0045469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.499;QD=10.0752;RBI=0.0225074;REFB=-0.0111611;REVB=0.0220434;RO=14;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.467468;STB=0.781938;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0110073;OID=.;OPOS=32490764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:2:6:4:10:2:6:4:10
chr12	32552769	.	C	G	109.25	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0152056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.981;QD=14.0962;RBI=0.0217485;REFB=-0.0170007;REVB=-0.0155494;RO=18;SAF=9;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294597;STB=0.517215;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0274512;OID=.;OPOS=32552769;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:4:9:12:6:4:9:12:6
chr12	32687352	.	A	G	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.00931892;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=306.082;QD=15.2931;RBI=0.0103116;REFB=-0.00462337;REVB=-0.00441437;RO=9;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101784;STB=0.559863;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00425065;OID=.;OPOS=32687352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:6:3:4:5:6:3:4:5
chr12	32735175	.	C	T	81.22	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.00226217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1905;QD=18.049;RBI=0.0174649;REFB=-0.0358325;REVB=0.0173178;RO=8;SAF=6;SAR=4;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124286;STB=0.571292;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0348808;OID=.;OPOS=32735175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:4:6:6:2:4:6:6:2
chr12	32764184	.	G	A	311.78	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-6.8561e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4207;QD=16.6284;RBI=0.0117979;REFB=0.00057105;REVB=-0.0117977;RO=41;SAF=17;SAR=17;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178725;STB=0.599944;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.000874974;OID=.;OPOS=32764184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:41:34:34:0.453333:17:17:28:13:17:17:28:13
chr12	32777362	.	G	A	107.43	PASS	AF=0.272727;AO=15;DP=55;FAO=15;FDP=55;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.0172341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.441;QD=7.81299;RBI=0.0389776;REFB=-0.0214939;REVB=-0.0349605;RO=40;SAF=7;SAR=8;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187999;STB=0.613763;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0600258;OID=.;OPOS=32777362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:40:40:15:15:0.272727:8:7:25:15:8:7:25:15
chr12	32943927	.	C	T	194.34	PASS	AF=0.380952;AO=24;DP=63;FAO=24;FDP=63;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0153978;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.649;QD=12.3389;RBI=0.0154028;REFB=-0.0150794;REVB=0.000392443;RO=39;SAF=11;SAR=13;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310972;STB=0.517913;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0166718;OID=.;OPOS=32943927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:39:39:24:24:0.380952:13:11:19:20:13:11:19:20
chr12	38710819	.	C	T	353.06	PASS	AF=0.341085;AO=44;DP=129;FAO=44;FDP=129;FR=.;FRO=85;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=46;FSRR=39;FWDB=0.0397002;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9218;QD=10.9475;RBI=0.0581024;REFB=-0.00255795;REVB=0.0424238;RO=84;SAF=18;SAR=26;SRF=46;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157999;STB=0.587116;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00483827;OID=.;OPOS=38710819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:84:85:44:44:0.341085:26:18:46:38:26:18:46:39
chr12	38712142	.	C	G	2296.38	PASS	AF=0.993151;AO=145;DP=146;FAO=145;FDP=146;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000255041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.546;QD=62.9144;RBI=0.00448184;REFB=-0.0393346;REVB=-0.00447458;RO=0;SAF=77;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.02491e-08;STB=0.503225;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=-2.632e-06;OID=.;OPOS=38712142;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:146:146:0:1:145:145:0.993151:68:77:0:0:68:77:1:0
chr12	40148894	.	TTA	T,TAA	57.7	PASS	AF=0.310345,0;AO=10,11;DP=57;FAO=9,0;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=8,0;FSAR=1,0;FSRF=18;FSRR=2;FWDB=0.158543,0.249737;FXX=0.325506;HRUN=7,7;LEN=2,1;MLLD=19.6469,8.6165;QD=7.95892;RBI=0.214763,0.283827;REFB=0.072181,-0.00600632;REVB=-0.144869,-0.134867;RO=25;SAF=9,11;SAR=1,0;SRF=23;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0694079,0.706153;STB=0.519957,0.5;STBP=0.922,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.145619,0;OID=.,.;OPOS=40148895,40148895;OREF=TA,T;OALT=-,A;OMAPALT=T,TAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.310345,0:10,11:57:9,0:29:20:8,0:1,0:18:2:58:25:9,11:1,0:23:2
chr12	40152900	.	G	A	980.26	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.138;QD=58.5228;RBI=0.0277052;REFB=0;REVB=0.0254475;RO=0;SAF=34;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21091e-05;OID=.;OPOS=40152900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:32:34:0:0:32:35:0:0
chr12	40619082	.	G	A	958.4	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119331;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.561;QD=58.9783;RBI=0.0517305;REFB=0;REVB=-0.0503353;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.51149e-05;OID=.;OPOS=40619082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:30:35:0:0:30:35:0:0
chr12	40657700	.	C	G	175.79	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=0.00641315;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.211;QD=13.267;RBI=0.0177855;REFB=-0.00358041;REVB=-0.016589;RO=32;SAF=8;SAR=13;SRF=9;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114905;STB=0.565756;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00656496;OID=.;OPOS=40657700;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:32:32:21:21:0.396226:13:8:9:23:13:8:9:23
chr12	40688695	.	T	C	607.07	PASS	AF=0.572816;AO=59;DP=103;FAO=59;FDP=103;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0194639;FXX=0.00961446;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.626;QD=23.5755;RBI=0.025582;REFB=-0.00922279;REVB=0.0166011;RO=44;SAF=28;SAR=31;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198993;STB=0.510873;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.00502334;OID=.;OPOS=40688695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:44:44:59:59:0.572816:31:28:22:22:31:28:22:22
chr12	40702911	.	G	A	487.58	PASS	AF=0.35503;AO=60;DP=168;FAO=60;FDP=169;FR=.;FRO=109;FSAF=22;FSAR=38;FSRF=61;FSRR=48;FWDB=0.000583991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.049;QD=11.5404;RBI=0.00119542;REFB=-0.00512459;REVB=-0.00104306;RO=104;SAF=22;SAR=38;SRF=56;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193758;STB=0.625008;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00896718;OID=.;OPOS=40702911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:169:104:109:60:60:0.35503:38:22:56:48:38:22:61:48
chr12	40702987	.	G	A	381.44	PASS	AF=0.330986;AO=46;DP=139;FAO=47;FDP=142;FR=.;FRO=95;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=51;FSRR=44;FWDB=0.0707051;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.281;QD=10.7449;RBI=0.0723975;REFB=-0.00440744;REVB=-0.0155621;RO=93;SAF=19;SAR=27;SRF=51;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156622;STB=0.588904;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00723081;OID=.;OPOS=40702987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:142:93:95:46:47:0.330986:27:19:51:42:28:19:51:44
chr12	40713834	.	C	A	168.69	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.000583039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.151;QD=16.0653;RBI=0.00263098;REFB=-0.0222615;REVB=-0.00256556;RO=24;SAF=9;SAR=9;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166409;STB=0.595136;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.0265903;OID=.;OPOS=40713834;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:9:9:16:8:9:9:16:8
chr12	40713873	.	A	G	236.54	PASS	AF=0.470588;AO=22;DP=52;FAO=24;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.052782;FXX=0.0192271;HRUN=8;LEN=1;MLLD=301.746;QD=18.5525;RBI=0.0528876;REFB=-0.0170593;REVB=0.00333921;RO=14;SAF=9;SAR=13;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146067;STB=0.521259;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0144271;OID=.;OPOS=40713873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:14:24:22:24:0.470588:13:9:3:11:14:10:11:13
chr12	40716260	.	T	C	346.21	PASS	AF=0.387755;AO=38;DP=100;FAO=38;FDP=98;FR=.;FRO=60;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=33;FSRR=27;FWDB=0.0497293;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9865;QD=14.1309;RBI=0.0517483;REFB=-0.0158763;REVB=0.0143138;RO=59;SAF=17;SAR=21;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119413;STB=0.562668;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0317289;OID=.;OPOS=40716260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:98:59:60:38:38:0.387755:21:17:33:26:21:17:33:27
chr12	40758652	.	T	C	204.24	PASS	AF=0.421053;AO=22;DP=56;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0147402;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.096;QD=14.3328;RBI=0.0186963;REFB=-0.016282;REVB=0.0115012;RO=33;SAF=6;SAR=16;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179153;STB=0.556913;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0199253;OID=.;OPOS=40758652;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:33:33:22:24:0.421053:16:6:14:19:16:8:14:19
chr12	40805875	.	CAAAAAAAAG	CAAAAAAAAGT,CAAAAAAAG,CAAAAAAAGC	31.69	PASS	AF=0.125,0.208333,0.0833333;AO=3,6,2;DP=26;FAO=3,5,2;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=0,4,1;FSAR=3,1,1;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0164914,-0.134214,0.00942468;FXX=0.039984;HRUN=0,8,8;LEN=1,1,2;MLLD=161.275,6.99686,22.2432;QD=5.28122;RBI=0.0178904,0.137619,0.0424371;REFB=-0.00315138,-0.10589,-0.0604205;REVB=-0.00693522,-0.0304248,0.0413773;RO=10;SAF=0,4,1;SAR=3,2,1;SRF=5;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.649379,0.173695,0;STB=0.996483,0.699117,0.561888;STBP=0.063,0.376,0.855;TYPE=ins,del,mnp;VARB=0.106905,-0.0189495,0.17536;OID=.,.,.;OPOS=40805885,40805876,40805883;OREF=-,A,AG;OALT=T,-,GC;OMAPALT=CAAAAAAAAGT,CAAAAAAAG,CAAAAAAAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.125,0.208333,0.0833333:3,6,2:26:3,5,2:24:14:0,4,1:3,1,1:8:6:15:10:0,4,1:3,2,1:5:5
chr12	40820208	.	G	A	301.79	PASS	AF=0.553571;AO=31;DP=57;FAO=31;FDP=56;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0162624;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.562;QD=21.5566;RBI=0.0200864;REFB=-0.00261447;REVB=-0.0117898;RO=25;SAF=22;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169975;STB=0.594531;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.00243099;OID=.;OPOS=40820208;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:25:25:31:31:0.553571:9:22:13:12:9:22:13:12
chr12	40821176	.	G	A	1142.66	PASS	AF=0.974684;AO=77;DP=79;FAO=77;FDP=79;FR=.;FRO=2;FSAF=52;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0242488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0899;QD=57.8563;RBI=0.0287954;REFB=-0.0478257;REVB=-0.0155297;RO=2;SAF=52;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363592;STB=0.519226;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00709714;OID=.;OPOS=40821176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:79:79:2:2:77:77:0.974684:25:52:0:2:25:52:0:2
chr12	40821839	.	C	T	622.0	PASS	AF=0.424242;AO=69;DP=165;FAO=70;FDP=165;FR=.;FRO=95;FSAF=17;FSAR=53;FSRF=25;FSRR=70;FWDB=-0.0905009;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.361;QD=15.0788;RBI=0.0906142;REFB=-0.00836977;REVB=-0.00452904;RO=93;SAF=17;SAR=52;SRF=23;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00129118;STB=0.515631;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0186536;OID=.;OPOS=40821839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:93:95:69:70:0.424242:52:17:23:70:53:17:25:70
chr12	40827579	.	C	T	295.74	PASS	AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.0528536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7192;QD=22.3198;RBI=0.0960569;REFB=0.00610789;REVB=-0.0802087;RO=23;SAF=11;SAR=19;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256791;STB=0.641958;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.0087035;OID=.;OPOS=40827579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:23:23:30:30:0.566038:19:11:16:7:19:11:16:7
chr12	40832126	.	C	T	437.81	PASS	AF=0.5375;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=80;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0409811;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.943;QD=21.8904;RBI=0.042299;REFB=-0.0126864;REVB=0.0104767;RO=35;SAF=11;SAR=32;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115487;STB=0.583409;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00792182;OID=.;OPOS=40832126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:35:37:43:43:0.5375:32:11:13:22:32:11:15:22
chr12	40832161	.	T	C	233.58	PASS	AF=0.435484;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.021879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.938;QD=15.07;RBI=0.0230577;REFB=-0.0111252;REVB=0.00727764;RO=33;SAF=4;SAR=23;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366649;STB=0.717381;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0166371;OID=.;OPOS=40832161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:33:35:27:27:0.435484:23:4:14:19:23:4:15:20
chr12	40834376	.	C	G	267.98	PASS	AF=0.397436;AO=29;DP=76;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=0.0076576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.27;QD=13.7425;RBI=0.00775053;REFB=-0.0174104;REVB=-0.00119665;RO=46;SAF=13;SAR=16;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170556;STB=0.579851;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0241746;OID=.;OPOS=40834376;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:78:46:47:29:31:0.397436:16:13:28:18:16:15:29:18
chr12	40834955	.	C	A	566.24	PASS	AF=0.418301;AO=63;DP=153;FAO=64;FDP=153;FR=.;FRO=89;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=39;FSRR=50;FWDB=-0.0112801;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.251;QD=14.8035;RBI=0.0219702;REFB=-0.0201908;REVB=-0.0188534;RO=89;SAF=36;SAR=27;SRF=39;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138743;STB=0.581285;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.037683;OID=.;OPOS=40834955;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:153:89:89:63:64:0.418301:27:36:39:50:27:37:39:50
chr12	40835734	.	C	G	407.96	PASS	AF=0.438095;AO=46;DP=106;FAO=46;FDP=105;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0318555;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9011;QD=15.5412;RBI=0.036617;REFB=-0.0250228;REVB=-0.0180564;RO=59;SAF=29;SAR=17;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159498;STB=0.589541;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.0357481;OID=.;OPOS=40835734;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:105:59:59:46:46:0.438095:17:29:28:31:17:29:28:31
chr12	40837149	.	G	A	209.44	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0272312;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.689;QD=17.8243;RBI=0.0365243;REFB=-0.0122069;REVB=-0.0243411;RO=26;SAF=13;SAR=8;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296103;STB=0.66783;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.019804;OID=.;OPOS=40837149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:8:13:8:18:8:13:8:18
chr12	40838216	.	T	C	815.22	PASS	AF=0.488372;AO=84;DP=172;FAO=84;FDP=172;FR=.;FRO=88;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=52;FSRR=36;FWDB=0.0548452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1797;QD=18.9585;RBI=0.0925205;REFB=-0.024862;REVB=0.074512;RO=88;SAF=39;SAR=45;SRF=52;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117085;STB=0.564501;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0207035;OID=.;OPOS=40838216;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:172:172:88:88:84:84:0.488372:45:39:52:36:45:39:52:36
chr12	40840325	.	T	C	950.27	PASS	AF=0.617647;AO=84;DP=136;FAO=84;FDP=136;FR=.;FRO=52;FSAF=27;FSAR=57;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=0.0288115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3438;QD=27.9491;RBI=0.032794;REFB=-0.0129106;REVB=-0.0156634;RO=52;SAF=27;SAR=57;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243103;STB=0.63192;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00926483;OID=.;OPOS=40840325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:52:52:84:84:0.617647:57:27:34:18:57:27:34:18
chr12	40857943	.	A	C	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194301;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.836;QD=63.5828;RBI=0.0352054;REFB=0;REVB=0.029358;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.3086e-05;OID=.;OPOS=40857943;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
chr12	41337435	.	C	T	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00800392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.944;QD=57.7123;RBI=0.0296753;REFB=0;REVB=-0.0285756;RO=0;SAF=27;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.96591e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.33733e-05;OID=.;OPOS=41337435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:32:27:0:0:32:27:0:0
chr12	41900463	.	G	A	183.04	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0217694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4728;QD=13.3123;RBI=0.0257545;REFB=-0.0120363;REVB=0.0137618;RO=32;SAF=13;SAR=9;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950431;STB=0.546176;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0146012;OID=.;OPOS=41900463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:32:33:22:22:0.4:9:13:16:16:9:13:17:16
chr12	41967677	.	G	A	219.22	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.0123727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.98;QD=13.9187;RBI=0.0335321;REFB=-0.00221742;REVB=-0.0311659;RO=37;SAF=10;SAR=16;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00679532;STB=0.503873;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.00263764;OID=.;OPOS=41967677;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:16:10:14:23:16:10:14:23
chr12	42475984	.	T	A	144.96	PASS	AF=0.6;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0656737;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9342;QD=23.1928;RBI=0.0711757;REFB=0.00727241;REVB=-0.0274401;RO=10;SAF=4;SAR=11;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259226;STB=0.646851;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=-0.0039245;OID=.;OPOS=42475984;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:26:25:10:10:15:15:0.6:11:4:6:4:11:4:6:4
chr12	42476798	.	T	C	217.17	PASS	AF=0.47541;AO=20;DP=59;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0317165;FXX=0.031741;HRUN=6;LEN=1;MLLD=74.5844;QD=14.2404;RBI=0.0596027;REFB=-0.0517461;REVB=-0.0504633;RO=23;SAF=14;SAR=6;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221978;STB=0.683644;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0312558;OID=.;OPOS=42476798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:61:23:32:20:29:0.47541:6:14:11:12:6:23:16:16
chr12	42839836	.	A	C	1285.2	PASS	AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0363143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5467;QD=60.48;RBI=0.0461826;REFB=0.0140433;REVB=0.0285325;RO=1;SAF=47;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00997231;STB=0.505262;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=-1.0717e-05;OID=.;OPOS=42839836;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:85:1:1:84:84:0.988235:37:47:1:0:37:47:1:0
chr12	42853520	.	A	G	732.22	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134414;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.238;QD=63.6716;RBI=0.0134656;REFB=0;REVB=-0.000807514;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.14175e-05;OID=.;OPOS=42853520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr12	43860526	.	A	G	887.45	PASS	AF=0.984127;AO=57;DP=57;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00740638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.307;QD=56.3463;RBI=0.0165184;REFB=-0.0902262;REVB=0.0147649;RO=0;SAF=25;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000171561;OID=.;OPOS=43860526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:57:63:0:1:57:62:0.984127:32:25:0:0:34:28:1:0
chr12	45269284	.	C	T	281.57	PASS	AF=0.415584;AO=32;DP=77;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=0.00459941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0088;QD=14.6269;RBI=0.0367469;REFB=-0.0032756;REVB=-0.0364579;RO=45;SAF=24;SAR=8;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106861;STB=0.560936;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.00795191;OID=.;OPOS=45269284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:45:45:32:32:0.415584:8:24:30:15:8:24:30:15
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chr12	45410075	.	A	G	1500.69	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214446;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.45;QD=59.4331;RBI=0.0223903;REFB=0;REVB=0.00643854;RO=0;SAF=67;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73319e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.6451e-05;OID=.;OPOS=45410075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:33:67:0:0:33:68:0:0
chr12	45417666	.	T	C	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0021511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.334;QD=60.9786;RBI=0.0342108;REFB=0;REVB=0.0341431;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186854;OID=.;OPOS=45417666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0
chr12	45610426	.	C	T	269.53	PASS	AF=0.508772;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=57;FR=.;FRO=28;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.000800834;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.138;QD=18.9143;RBI=0.00342447;REFB=-0.00936585;REVB=-0.00332951;RO=27;SAF=22;SAR=7;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273014;STB=0.64695;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0100793;OID=.;OPOS=45610426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:27:28:29:29:0.508772:7:22:13:14:7:22:14:14
chr12	45610529	.	C	A	899.96	PASS	AF=0.523529;AO=89;DP=170;FAO=89;FDP=170;FR=.;FRO=81;FSAF=64;FSAR=25;FSRF=47;FSRR=34;FWDB=0.0283466;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.1006;QD=21.1756;RBI=0.0338713;REFB=-0.00748725;REVB=-0.0185401;RO=76;SAF=64;SAR=25;SRF=47;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0996298;STB=0.576383;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0124421;OID=.;OPOS=45610529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:170:76:81:89:89:0.523529:25:64:47:29:25:64:47:34
chr12	45824840	.	A	T	389.04	PASS	AF=0.427184;AO=44;DP=103;FAO=44;FDP=103;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=-0.00302975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.81;QD=15.1085;RBI=0.00476807;REFB=0.00436165;REVB=-0.00368173;RO=58;SAF=20;SAR=24;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04179;STB=0.517849;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=-0.00548716;OID=.;OPOS=45824840;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:58:59:44:44:0.427184:24:20:24:34:24:20:25:34
chr12	45825730	.	C	G	196.94	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.017905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.467;QD=12.9138;RBI=0.0289385;REFB=-0.0126494;REVB=-0.0227343;RO=37;SAF=10;SAR=14;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746706;STB=0.5429;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0164739;OID=.;OPOS=45825730;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:37:37:24:24:0.393443:14:10:18:19:14:10:18:19
chr12	46321514	.	A	T	851.22	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325506;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.883;QD=57.7096;RBI=0.0362619;REFB=0;REVB=0.0159809;RO=0;SAF=39;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.84293e-05;OID=.;OPOS=46321514;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:20:39:0:0:20:39:0:0
chr12	46322449	.	C	T	1011.35	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00191435;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.752;QD=58.6292;RBI=0.0171024;REFB=0;REVB=0.0169949;RO=0;SAF=49;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8808e-05;OID=.;OPOS=46322449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:69:0:0:67:69:1:18:49:0:0:20:49:0:0
chr12	46342305	.	GTTTTTT	GTTTCTT,GTTTTTA,GTTTTT	31.58	PASS	AF=0.0444444,0.0444444,0.0888889;AO=2,2,10;DP=45;FAO=2,2,4;FDP=45;FR=.;FRO=37;FSAF=0,2,3;FSAR=2,0,1;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=-0.0526238,-0.0803054,-0.140395;FXX=0;HRUN=7,7,7;LEN=1,1,1;MLLD=253.844,226.789,8.0353;QD=2.80726;RBI=0.0537291,0.0810302,0.263588;REFB=-0.0113907,-0.00929828,-0.0748546;REVB=0.0108423,0.0108134,0.223087;RO=25;SAF=0,2,7;SAR=2,0,3;SRF=10;SRR=15;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.44242,0.529207,0.343161;STB=0.994162,0.99542,0.775149;STBP=0.206,0.11,0.296;TYPE=snp,snp,del;VARB=0.0221967,0.0733263,0.0726189;OID=.,.,.;OPOS=46342309,46342311,46342306;OREF=T,T,T;OALT=C,A,-;OMAPALT=GTTTCTT,GTTTTTA,GTTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.0444444,0.0444444,0.0888889:2,2,10:45:2,2,4:45:37:0,2,3:2,0,1:16:21:15:25:0,2,7:2,0,3:10:15
chr12	46367939	.	G	T	990.52	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00806868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=320.053;QD=59.1353;RBI=0.0206153;REFB=0;REVB=0.0189707;RO=0;SAF=42;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1333e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26287e-05;OID=.;OPOS=46367939;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:24:42:0:0:24:43:0:0
chr12	46577071	.	G	A	946.76	PASS	AF=0.943662;AO=67;DP=71;FAO=67;FDP=71;FR=.;FRO=4;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00990087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.231;QD=53.3384;RBI=0.0153328;REFB=-0.234173;REVB=-0.0117076;RO=1;SAF=35;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133112;STB=0.51286;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.00496211;OID=.;OPOS=46577071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:71:71:1:4:67:67:0.943662:32:35:1:0:32:35:3:1
chr12	46589988	.	C	T	183.51	PASS	AF=0.894737;AO=15;DP=19;FAO=17;FDP=19;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0543963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.556;QD=38.6328;RBI=0.0600124;REFB=-0.0492439;REVB=-0.025348;RO=3;SAF=11;SAR=4;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109327;STB=0.538418;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.00841127;OID=.;OPOS=46589988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:19:19:3:2:15:17:0.894737:4:11:3:0:5:12:2:0
chr12	46758494	.	A	G	358.77	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.987;QD=55.1948;RBI=0.0496482;REFB=0;REVB=0.0318266;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.62592e-05;OID=.;OPOS=46758494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:8:16:0:0:8:18:0:0
chr12	46759017	.	T	A	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00935198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.708;QD=57.2026;RBI=0.0162111;REFB=0;REVB=-0.0132416;RO=0;SAF=20;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.77877e-06;OID=.;OPOS=46759017;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:10:20:0:0:10:20:0:0
chr12	46761127	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480168;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.706;QD=46.848;RBI=0.0531482;REFB=0;REVB=0.0227841;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369122;OID=.;OPOS=46761127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:11:4:0:0:11:4:0:0
chr12	47168898	.	G	A	1539.56	PASS	AF=0.990476;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0312315;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.631;QD=58.65;RBI=0.0387382;REFB=0.0152398;REVB=0.0229181;RO=1;SAF=58;SAR=46;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811183;STB=0.504273;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=-5.71467e-05;OID=.;OPOS=47168898;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:105:1:1:104:104:0.990476:46:58:1:0:46:58:1:0
chr12	47186770	.	C	T	775.26	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000133243;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.238;QD=53.4664;RBI=0.0204441;REFB=0.0326198;REVB=-0.0204436;RO=1;SAF=28;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165422;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000188007;OID=.;OPOS=47186770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:1:2:56:56:0.965517:28:28:1:0:28:28:1:1
chr12	47470223	.	T	TTACTA	255.5	PASS	AF=0.518519;AO=26;DP=59;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00661737;FXX=0;HRUN=3;LEN=5;MLLD=298.034;QD=18.926;RBI=0.00773424;REFB=-0.0117901;REVB=-0.0040036;RO=32;SAF=15;SAR=11;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484598;STB=0.534128;STBP=0.646;TYPE=ins;VARB=0.0115637;OID=.;OPOS=47470224;OREF=-;OALT=TACTA;OMAPALT=TTACTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.518519:26:59:28:54:26:17:11:14:12:99:32:15:11:20:12
chr12	47581629	.	T	C	1588.06	PASS	AF=0.990826;AO=98;DP=102;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0406787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.163;QD=58.2773;RBI=0.114826;REFB=-0.0284769;REVB=0.107379;RO=1;SAF=58;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00810823;STB=0.504131;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000256003;OID=.;OPOS=47581629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:102:109:1:1:98:108:0.990826:40:58:1:0:48:60:1:0
chr12	47581639	.	T	G	735.48	PASS	AF=0.528986;AO=68;DP=136;FAO=73;FDP=138;FR=.;FRO=65;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.00274142;FXX=0.028167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.499;QD=21.3182;RBI=0.0443841;REFB=-0.00151936;REVB=0.0442994;RO=63;SAF=45;SAR=23;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0854006;STB=0.530718;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.00192676;OID=.;OPOS=47581639;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:138:63:65:68:73:0.528986:23:45:36:27:28:45:36:29
chr12	47740069	.	C	A	1453.78	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0211798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.563;QD=63.2077;RBI=0.0493337;REFB=0;REVB=0.0445559;RO=0;SAF=61;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148828;OID=.;OPOS=47740069;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:92:0:0:90:92:1:29:61:0:0:31:61:0:0
chr12	47758032	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.298;QD=40.763;RBI=0.0278826;REFB=0;REVB=0.0278826;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000257557;OID=.;OPOS=47758032;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:10:0:0:0:10:0:0:0
chr12	48134695	.	T	C	804.99	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0466;QD=64.3992;RBI=0.0109895;REFB=0;REVB=0.00360333;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.35652e-05;OID=.;OPOS=48134695;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:28:22:0:0:28:22:0:0
chr12	48144925	.	T	C	1097.59	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.361;QD=60.1418;RBI=0.0417802;REFB=0;REVB=0.0211894;RO=0;SAF=48;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.74593e-05;OID=.;OPOS=48144925;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:73:0:0:69:73:1:21:48:0:0:23:50:0:0
chr12	48151822	.	C	G	470.84	PASS	AF=0.37013;AO=57;DP=155;FAO=57;FDP=154;FR=.;FRO=97;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=47;FSRR=50;FWDB=0.11633;FXX=0.0064512;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.92;QD=12.2295;RBI=0.118391;REFB=0.0104986;REVB=0.0219961;RO=98;SAF=22;SAR=35;SRF=48;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117799;STB=0.563571;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=-0.017761;OID=.;OPOS=48151822;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:154:98:97:57:57:0.37013:35:22:48:50:35:22:47:50
chr12	48237735	.	CA	C,GC	105.87	PASS	AF=0.283019,0;AO=14,2;DP=55;FAO=15,0;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=9,0;FSAR=6,0;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00700161,-0.0111696;FXX=0.0535619;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=204.057,210.012;QD=7.98987;RBI=0.0325852,0.0529803;REFB=-0.000731256,-0.00259316;REVB=-0.031824,-0.0517895;RO=36;SAF=10,0;SAR=4,2;SRF=23;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.102455,-0.501714;STB=0.523778,0.5;STBP=0.847,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00234626,0;OID=.,.;OPOS=48237736,48237735;OREF=A,CA;OALT=-,GC;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:53:36:38:14,2:15,0:0.283019,0:4,2:10,0:23:13:6,0:9,0:24:14
chr12	48238757	.	A	G	313.07	PASS	AF=0.459459;AO=34;DP=74;FAO=34;FDP=74;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0117499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.518;QD=16.9228;RBI=0.0242512;REFB=-0.0209141;REVB=-0.0212146;RO=40;SAF=8;SAR=26;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193228;STB=0.609306;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0271616;OID=.;OPOS=48238757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:40:40:34:34:0.459459:26:8:16:24:26:8:16:24
chr12	48272895	.	A	G	386.79	PASS	AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0116694;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.068;QD=17.9904;RBI=0.0207178;REFB=-0.0102161;REVB=-0.0171187;RO=46;SAF=29;SAR=11;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0833955;STB=0.546763;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0159618;OID=.;OPOS=48272895;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:11:29:30:16:11:29:30:16
chr12	48373798	.	G	C	270.51	PASS	AF=0.463768;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.106078;FXX=0.0142837;HRUN=6;LEN=1;MLLD=34.7691;QD=15.682;RBI=0.167456;REFB=-0.0262072;REVB=0.129572;RO=36;SAF=20;SAR=12;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147228;STB=0.529229;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0324173;OID=.;OPOS=48373798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:36:37:32:32:0.463768:12:20:17:19:13:19:20:17
chr12	48375568	.	A	G	803.72	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000655097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.052;QD=64.2979;RBI=0.0122886;REFB=0;REVB=-0.0122711;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.91008e-05;OID=.;OPOS=48375568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:19:31:0:0:19:31:0:0
chr12	48375965	.	C	T	186.65	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0429555;FXX=0.0555247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.753;QD=43.9175;RBI=0.0627346;REFB=-0.028802;REVB=0.0457216;RO=1;SAF=8;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.053738;STB=0.529375;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00176094;OID=.;OPOS=48375965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:17:1:1:16:16:0.941176:8:8:1:0:8:8:1:0
chr12	48376291	.	G	A	366.16	PASS	AF=0.964286;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0141303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3439;QD=52.3088;RBI=0.0619312;REFB=-0.134644;REVB=0.0602976;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519985;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00238205;OID=.;OPOS=48376291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:27:28:0:1:26:27:0.964286:12:14:0:0:12:15:0:1
chr12	48380682	.	G	A	442.43	PASS	AF=0.5;AO=42;DP=87;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.0153292;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.351;QD=20.1102;RBI=0.0157358;REFB=-0.0167788;REVB=0.00355365;RO=44;SAF=23;SAR=19;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04399;STB=0.51137;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0166192;OID=.;OPOS=48380682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:44:44:42:44:0.5:19:23:22:22:21:23:22:22
chr12	48389643	.	A	C	483.31	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0725717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.4756;QD=58.583;RBI=0.0940455;REFB=0;REVB=0.0598156;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115434;OID=.;OPOS=48389643;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:25:8:0:0:25:8:0:0
chr12	48391416	.	G	T	339.6	PASS	AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0443925;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=106.832;QD=18.6085;RBI=0.0449656;REFB=-0.00513761;REVB=0.00715672;RO=33;SAF=25;SAR=11;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141517;STB=0.585724;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.00571137;OID=.;OPOS=48391416;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:33:37:36:36:0.493151:11:25:18:15:11:25:20:17
chr12	48398080	.	T	A,G	1107.48	PASS	AF=0.914634,0.0365854;AO=73,5;DP=80;FAO=75,3;FDP=82;FR=.;FRO=4;FSAF=41,0;FSAR=34,3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0350081,-0.047592;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=95.4485,61.4278;QD=54.0233;RBI=0.0768493,0.0756893;REFB=0.0419058,0.0804497;REVB=0.0684123,-0.0588546;RO=0;SAF=39,0;SAR=34,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.52777,0.5;STBP=0.038,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00071588,0.155536;OID=.,.;OPOS=48398080,48398080;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:80:82:0:4:73,5:75,3:0.914634,0.0365854:34,5:39,0:0:0:34,3:41,0:0:4
chr12	48413875	.	G	A	269.11	PASS	AF=0.330189;AO=35;DP=106;FAO=35;FDP=106;FR=.;FRO=71;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=36;FWDB=0.00258551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.731;QD=10.1552;RBI=0.0133691;REFB=-0.00953488;REVB=-0.0131167;RO=71;SAF=13;SAR=22;SRF=35;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143415;STB=0.583377;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0230816;OID=.;OPOS=48413875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:71:71:35:35:0.330189:22:13:35:36:22:13:35:36
chr12	48413944	.	C	T	161.83	PASS	AF=0.37037;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=54;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0608237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.6586;QD=11.9876;RBI=0.0610603;REFB=-0.051679;REVB=0.00537041;RO=34;SAF=6;SAR=14;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228982;STB=0.633719;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.0587243;OID=.;OPOS=48413944;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:34:20:20:0.37037:14:6:17:17:14:6:17:17
chr12	48413950	.	A	C	139.23	PASS	AF=0.333333;AO=16;DP=50;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0568394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6417;QD=10.9203;RBI=0.0798816;REFB=-0.0421662;REVB=0.056128;RO=34;SAF=5;SAR=11;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222878;STB=0.645299;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0915204;OID=.;OPOS=48413950;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:34:34:16:17:0.333333:11:5:17:17:12:5:17:17
chr12	48438140	.	CAT	CATAC,C,TAC,TAT	559.24	PASS	AF=0.431818,0.545455,0,0.0227273;AO=15,19,2,2;DP=55;FAO=19,24,0,1;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=14,21,0,1;FSAR=5,3,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00405455,0.101681,-0.0392321,-0.0604451;FXX=0.185151;HRUN=1,1,1,1;LEN=2,2,3,1;MLLD=45.4109,52.9439,74.9619,36.3401;QD=50.8395;RBI=0.137054,0.128523,0.093717,0.0604698;REFB=-0.0999339,-0.16319,0.012321,-0.0180291;REVB=0.136994,0.0786073,0.08511,0.00172782;RO=0;SAF=10,17,2,2;SAR=5,2,0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,-4.41729e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=ins,del,mnp,snp;VARB=0.0130853,0.106486,0,0.281258;OID=.,.,.,.;OPOS=48438143,48438141,48438140,48438140;OREF=-,AT,CAT,C;OALT=AC,-,TAC,T;OMAPALT=CATAC,C,TAC,TAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:55:44:0:0:15,19,2,2:19,24,0,1:0.431818,0.545455,0,0.0227273:5,2,0,0:10,17,2,2:0:0:5,3,0,0:14,21,0,1:0:0
chr12	48477422	.	A	G	355.16	PASS	AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=30;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=0.00281962;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=226.375;QD=18.9419;RBI=0.0192294;REFB=-0.0105607;REVB=-0.0190215;RO=38;SAF=30;SAR=7;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322442;STB=0.681708;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0116865;OID=.;OPOS=48477422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:7:30:20:18:7:30:20:18
chr12	48512285	.	C	A	844.16	PASS	AF=1;AO=49;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00847181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.398;QD=57.2312;RBI=0.0267235;REFB=0;REVB=0.0253451;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151071;OID=.;OPOS=48512285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:49:59:1:27:22:0:0:37:22:0:0
chr12	48512331	.	C	T	270.04	PASS	AF=0.46875;AO=28;DP=65;FAO=30;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=5;FSRR=29;FWDB=-0.000373164;FXX=0.0153822;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.174;QD=16.8773;RBI=0.0416743;REFB=-0.0473991;REVB=-0.0416726;RO=25;SAF=12;SAR=16;SRF=4;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243628;STB=0.648191;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0583708;OID=.;OPOS=48512331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:25:34:28:30:0.46875:16:12:4:21:18:12:5:29
chr12	48525861	.	A	G	180.2	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=50;FAO=20;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0360888;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8222;QD=15.0162;RBI=0.0378048;REFB=0.00964842;REVB=0.0112607;RO=26;SAF=10;SAR=5;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14584;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0100983;OID=.;OPOS=48525861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:48:26:28:15:20:0.416667:5:10:14:12:10:10:14:14
chr12	48526712	.	G	A	226.4	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=68;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00419015;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0543;QD=13.5165;RBI=0.0124751;REFB=-0.0174485;REVB=0.0117504;RO=41;SAF=11;SAR=16;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161834;STB=0.599706;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0383758;OID=.;OPOS=48526712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:41:40:27:27:0.402985:16:11:23:18:16:11:23:17
chr12	48527186	.	C	T	555.7	PASS	AF=0.491525;AO=58;DP=118;FAO=58;FDP=118;FR=.;FRO=60;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.0250127;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.901;QD=18.8374;RBI=0.0372444;REFB=-0.0273173;REVB=-0.0275954;RO=60;SAF=33;SAR=25;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134917;STB=0.50746;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0271787;OID=.;OPOS=48527186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:60:60:58:58:0.491525:25:33:35:25:25:33:35:25
chr12	48541757	.	A	G	189.0	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0455387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.876;QD=21.0002;RBI=0.0484117;REFB=-0.00324175;REVB=0.0164292;RO=16;SAF=8;SAR=11;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0922199;STB=0.562627;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00355974;OID=.;OPOS=48541757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:17:19:19:0.527778:11:8:5:11:11:8:5:12
chr12	48578325	.	A	C	715.4	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00925261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.96;QD=60.8848;RBI=0.0726666;REFB=-0.161913;REVB=0.0720751;RO=1;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0303064;STB=0.516122;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00127656;OID=.;OPOS=48578325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:47:47:1:1:46:46:0.978723:15:31:0:1:15:31:0:1
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chr12	48578809	.	T	C	769.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339781;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.626;QD=64.1206;RBI=0.03779;REFB=0;REVB=0.0165401;RO=0;SAF=15;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.05366e-05;OID=.;OPOS=48578809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:33:15:0:0:33:15:0:0
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chr12	48596875	.	C	CA	454.28	PASS	AF=0.44186;AO=76;DP=176;FAO=76;FDP=172;FR=.;FRO=96;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=54;FSRR=42;FWDB=0.0267321;FXX=0.0114936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.9219;QD=10.5645;RBI=0.0267426;REFB=-0.0251896;REVB=-0.000749535;RO=96;SAF=46;SAR=30;SRF=55;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0336369;STB=0.524708;STBP=0.558;TYPE=ins;VARB=0.0329433;OID=.;OPOS=48596876;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.44186:76:176:76:172:96:46:30:54:42:99:96:46:30:55:41
chr12	48597053	.	A	G	275.72	PASS	AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.022343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.237;QD=25.6483;RBI=0.0329296;REFB=-0.0150172;REVB=0.0241898;RO=18;SAF=14;SAR=11;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210518;STB=0.616423;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00864493;OID=.;OPOS=48597053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:11:14:5:13:11:14:5:13
chr12	48723595	.	G	A	162.98	PASS	AF=0.36;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0257114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.185;QD=13.0385;RBI=0.0292907;REFB=-0.0418762;REVB=0.0140311;RO=30;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0598383;STB=0.515678;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0996217;OID=.;OPOS=48723595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:32:18:18:0.36:10:8:15:15:10:8:15:17
chr12	48723784	.	C	T	637.97	PASS	AF=0.473684;AO=59;DP=142;FAO=72;FDP=152;FR=.;FRO=80;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=46;FSRR=34;FWDB=0.0563108;FXX=0.0193536;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.743;QD=16.7887;RBI=0.103139;REFB=-0.052329;REVB=0.0864103;RO=79;SAF=38;SAR=21;SRF=47;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0537331;STB=0.524993;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0778326;OID=.;OPOS=48723784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:152:79:80:59:72:0.473684:21:38:47:32:34:38:46:34
chr12	48739150	.	GT	GA,G	30.92	PASS	AF=0.0487805,0.219512;AO=2,14;DP=42;FAO=2,9;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=0,8;FSAR=2,1;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.0383255,-0.0315681;FXX=0.0238039;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=162.508,10.4222;QD=3.01668;RBI=0.0945641,0.0743952;REFB=-0.0159887,-0.125838;REVB=-0.0864495,-0.0673654;RO=23;SAF=0,13;SAR=2,1;SRF=16;SRR=7;SSEN=0,0.469388;SSEP=0,0;SSSB=-0.592955,0.457399;STB=0.996578,0.733307;STBP=0.05,0.189;TYPE=snp,del;VARB=0.131687,0.155236;OID=.,.;OPOS=48739151,48739151;OREF=T,T;OALT=A,-;OMAPALT=GA,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0487805,0.219512:2,14:42:2,9:41:30:0,8:2,1:21:9:27:23:0,13:2,1:16:7
chr12	48866585	.	A	C	460.51	PASS	AF=0.571429;AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=6;FWDB=-0.00299981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.541;QD=23.9228;RBI=0.0190622;REFB=-0.00443868;REVB=0.0188247;RO=33;SAF=25;SAR=19;SRF=27;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206432;STB=0.612476;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00482568;OID=.;OPOS=48866585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:33:33:44:44:0.571429:19:25:27:6:19:25:27:6
chr12	48866792	.	C	T	131.97	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00610732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.629;QD=14.6638;RBI=0.012917;REFB=-0.00790964;REVB=-0.011382;RO=21;SAF=9;SAR=6;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263259;STB=0.651978;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0200343;OID=.;OPOS=48866792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:6:9:7:14:6:9:7:14
chr12	48879951	.	T	G	554.76	PASS	AF=0.573034;AO=51;DP=89;FAO=51;FDP=89;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0087856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.083;QD=24.9328;RBI=0.0219814;REFB=-0.00375843;REVB=0.0201493;RO=38;SAF=24;SAR=27;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229763;STB=0.512578;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00279077;OID=.;OPOS=48879951;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:38:38:51:51:0.573034:27:24:19:19:27:24:19:19
chr12	48888689	.	C	G	94.71	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.011411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.394;QD=10.8236;RBI=0.0114724;REFB=0.00372139;REVB=-0.00118497;RO=22;SAF=8;SAR=4;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138903;STB=0.571306;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.00537439;OID=.;OPOS=48888689;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:22:23:12:12:0.342857:4:8:12:10:4:8:13:10
chr12	48919556	.	A	G	1227.45	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.765;QD=61.3726;RBI=0.0560158;REFB=0;REVB=0.00493914;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189205;OID=.;OPOS=48919556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:43:37:0:0:43:37:0:0
chr12	48919659	.	TG	CA,CG	248.8	PASS	AF=0.45,0.55;AO=9,11;DP=20;FAO=9,11;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=3,3;FSAR=6,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0424052,-0.0247404;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=88.2014,128.663;QD=49.76;RBI=0.0547795,0.0251552;REFB=0,0;REVB=-0.0346784,0.00454965;RO=0;SAF=3,3;SAR=6,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00812691,-2.04336e-05;OID=.,.;OPOS=48919659,48919659;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:67:20:20:0:0:9,11:9,11:0.45,0.55:6,8:3,3:0:0:6,8:3,3:0:0
chr12	48919796	.	C	T	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00681372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.713;QD=57.6807;RBI=0.028659;REFB=0;REVB=0.0278372;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.57145e-05;OID=.;OPOS=48919796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr12	48920006	.	G	A	380.41	PASS	AF=0.493671;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=79;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0535983;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6616;QD=19.2614;RBI=0.0566104;REFB=-0.0440053;REVB=-0.0182197;RO=39;SAF=22;SAR=17;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0696294;STB=0.532706;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0405575;OID=.;OPOS=48920006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:39:40:39:39:0.493671:17:22:19:20:17:22:20:20
chr12	48954040	.	A	G	298.72	PASS	AF=0.484848;AO=30;DP=65;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.00421733;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0566;QD=18.1041;RBI=0.0061681;REFB=-0.0137621;REVB=-0.00450107;RO=34;SAF=22;SAR=8;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0325556;STB=0.529393;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0204597;OID=.;OPOS=48954040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:34:34:30:32:0.484848:8:22:24:10:8:24:24:10
chr12	48954225	.	G	C	230.7	PASS	AF=0.421875;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0271167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8149;QD=14.4188;RBI=0.0272441;REFB=-0.0183645;REVB=0.00263228;RO=36;SAF=15;SAR=12;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0570832;STB=0.538979;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0278387;OID=.;OPOS=48954225;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:36:37:27:27:0.421875:12:15:22:14:12:15:23:14
chr12	49048738	.	G	T	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101192;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.975;QD=56.9999;RBI=0.0101528;REFB=0;REVB=-0.000825636;RO=0;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.27747e-05;OID=.;OPOS=49048738;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:22:32:0:0:22:32:0:0
chr12	49075811	.	T	G	742.89	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209861;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.721;QD=57.1456;RBI=0.042695;REFB=0;REVB=0.0371812;RO=0;SAF=42;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.05342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.42104e-06;OID=.;OPOS=49075811;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:10:42:0:0:10:42:0:0
chr12	49086963	.	G	A	1105.08	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.138;QD=59.7339;RBI=0.0361855;REFB=0;REVB=0.00372374;RO=0;SAF=36;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116865;OID=.;OPOS=49086963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:74:0:0:72:74:1:36:36:0:0:36:38:0:0
chr12	49177113	.	T	G	640.23	PASS	AF=0.356164;AO=77;DP=218;FAO=78;FDP=219;FR=.;FRO=141;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=93;FSRR=48;FWDB=-0.00894096;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.861;QD=11.6936;RBI=0.00987022;REFB=-0.0236892;REVB=-0.00418097;RO=139;SAF=39;SAR=38;SRF=92;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177108;STB=0.602715;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0283145;OID=.;OPOS=49177113;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:218:219:139:141:77:78:0.356164:38:39:92:47:39:39:93:48
chr12	49221622	.	G	A	283.03	PASS	AF=0.421053;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=-0.00068523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.895;QD=14.8962;RBI=0.00973914;REFB=-0.0295454;REVB=-0.009715;RO=44;SAF=17;SAR=15;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124373;STB=0.570333;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.0483941;OID=.;OPOS=49221622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:44:32:32:0.421053:15:17:18:26:15:17:18:26
chr12	49222217	.	T	C	140.59	PASS	AF=0.777778;AO=14;DP=18;FAO=14;FDP=18;FR=.;FRO=4;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0492083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.751;QD=31.2417;RBI=0.0751897;REFB=-0.0340184;REVB=-0.0568509;RO=4;SAF=11;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151902;STB=0.584975;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00448783;OID=.;OPOS=49222217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:18:18:4:4:14:14:0.777778:3:11:2:2:3:11:2:2
chr12	49230035	.	T	G	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.085901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.709;QD=16.6262;RBI=0.0861585;REFB=-0.0207196;REVB=-0.00665563;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230746;STB=0.631394;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.0107104;OID=.;OPOS=49230035;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:7:6:3:11:7:6:3:11
chr12	49237782	.	C	T	402.86	PASS	AF=0.442105;AO=40;DP=94;FAO=42;FDP=95;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.0426561;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.076;QD=16.9625;RBI=0.0426822;REFB=-0.0168829;REVB=0.00149222;RO=52;SAF=17;SAR=23;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.037311;STB=0.510848;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.0202653;OID=.;OPOS=49237782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:52:53:40:42:0.442105:23:17:24:28:23:19:25:28
chr12	49255798	.	G	C	376.62	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.00899179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.727;QD=18.5983;RBI=0.0148602;REFB=-0.0218149;REVB=-0.011831;RO=42;SAF=29;SAR=10;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187185;STB=0.60501;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0277277;OID=.;OPOS=49255798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:42:42:39:39:0.481481:10:29:24:18:10:29:24:18
chr12	49308284	.	A	G	420.46	PASS	AF=0.45098;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=102;FR=.;FRO=56;FSAF=12;FSAR=34;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=-0.00598647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.742;QD=16.4888;RBI=0.0563345;REFB=-0.011171;REVB=-0.0560156;RO=56;SAF=12;SAR=34;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370143;STB=0.707613;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0131095;OID=.;OPOS=49308284;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:56:56:46:46:0.45098:34:12:35:21:34:12:35:21
chr12	49312593	.	A	G	315.67	PASS	AF=0.350877;AO=40;DP=114;FAO=40;FDP=114;FR=.;FRO=74;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=41;FSRR=33;FWDB=0.0346358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.7853;QD=11.0763;RBI=0.0477919;REFB=-0.00394377;REVB=0.0329305;RO=74;SAF=29;SAR=11;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213506;STB=0.623591;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00826066;OID=.;OPOS=49312593;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:74:74:40:40:0.350877:11:29:41:33:11:29:41:33
chr12	49314862	.	C	A	330.77	PASS	AF=0.383178;AO=41;DP=107;FAO=41;FDP=107;FR=.;FRO=66;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=0.0373203;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6223;QD=12.3651;RBI=0.041747;REFB=-0.0244146;REVB=-0.0187085;RO=64;SAF=20;SAR=21;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046588;STB=0.54121;STBP=0.477;TYPE=snp;VARB=0.0298607;OID=.;OPOS=49314862;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:64:66:41:41:0.383178:21:20:34:30:22:19:35:31
chr12	49314994	.	A	G	131.81	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=-0.00526339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.369;QD=14.645;RBI=0.0106233;REFB=-0.0130153;REVB=0.00922769;RO=21;SAF=7;SAR=8;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237804;STB=0.636198;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00699576;OID=.;OPOS=49314994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:8:7:5:16:8:7:5:16
chr12	49332092	.	G	A	229.27	PASS	AF=0.415385;AO=27;DP=65;FAO=27;FDP=65;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=-0.0346486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.195;QD=14.1086;RBI=0.061264;REFB=-0.00422279;REVB=0.0505247;RO=37;SAF=16;SAR=11;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136035;STB=0.570063;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.011079;OID=.;OPOS=49332092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:38:27:27:0.415385:11:16:17:20:11:16:18:20
chr12	49332366	.	C	T	54.98	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.00288444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8971;QD=9.56122;RBI=0.0398314;REFB=-0.012698;REVB=-0.0397269;RO=15;SAF=7;SAR=1;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253064;STB=0.659903;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0163589;OID=.;OPOS=49332366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:23:23:15:15:8:8:0.347826:1:7:11:4:1:7:11:4
chr12	49334762	.	G	C	1223.12	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00187655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.375;QD=61.156;RBI=0.0387539;REFB=0;REVB=-0.0387084;RO=0;SAF=56;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03902e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.85876e-05;OID=.;OPOS=49334762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:23:56:0:0:24:56:0:0
chr12	49359587	.	T	G	648.38	PASS	AF=0.511811;AO=64;DP=127;FAO=65;FDP=127;FR=.;FRO=62;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=0.0337661;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.134;QD=20.4214;RBI=0.0341846;REFB=-0.0341676;REVB=0.00533319;RO=62;SAF=28;SAR=36;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273199;STB=0.502694;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0302931;OID=.;OPOS=49359587;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:62:62:64:65:0.511811:36:28:29:33:36:29:28:34
chr12	49359989	.	G	A	173.51	PASS	AF=0.44186;AO=18;DP=42;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00863226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.187;QD=16.1402;RBI=0.00894826;REFB=-0.0243806;REVB=0.00235701;RO=24;SAF=9;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51469;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.023281;OID=.;OPOS=49359989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:24:24:18:19:0.44186:9:9:12:12:9:10:12:12
chr12	49390677	.	T	C	497.96	PASS	AF=0.44;AO=54;DP=124;FAO=55;FDP=125;FR=.;FRO=70;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=33;FSRR=37;FWDB=0.0204996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.868;QD=15.9347;RBI=0.0212147;REFB=-0.0150498;REVB=0.00546172;RO=70;SAF=27;SAR=27;SRF=33;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288189;STB=0.510913;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0184082;OID=.;OPOS=49390677;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:125:70:70:54:55:0.44:27:27:33:37:28:27:33:37
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chr12	49431094	.	T	C	283.03	PASS	AF=0.476923;AO=30;DP=64;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.00817343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4793;QD=17.4172;RBI=0.0139221;REFB=-0.00670281;REVB=-0.0112703;RO=34;SAF=27;SAR=3;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340837;STB=0.649372;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0107003;OID=.;OPOS=49431094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:34:34:30:31:0.476923:3:27:24:10:4:27:24:10
chr12	49434074	.	C	A	68.5	PASS	AF=0.27027;AO=7;DP=36;FAO=10;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0634398;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=29.6942;QD=7.40573;RBI=0.102785;REFB=-0.00651982;REVB=0.0808717;RO=21;SAF=3;SAR=4;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557603;STB=0.513487;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0222365;OID=.;OPOS=49434074;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:36:37:21:27:7:10:0.27027:4:3:10:11:5:5:14:13
chr12	49444545	.	G	A	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.123636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.838;QD=10.1733;RBI=0.136562;REFB=0.0269387;REVB=0.0579932;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00995057;OID=.;OPOS=49444545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:4:2:3:6:4:2:3:6
chr12	49494962	.	A	G	433.43	PASS	AF=0.567568;AO=42;DP=74;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0395877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7927;QD=23.4287;RBI=0.0405867;REFB=0.0224338;REVB=-0.0089493;RO=32;SAF=23;SAR=19;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621997;STB=0.534177;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.0211367;OID=.;OPOS=49494962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:32:32:42:42:0.567568:19:23:15:17:19:23:15:17
chr12	49500398	.	G	A	1246.11	PASS	AF=1;AO=79;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000364669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.041;QD=61.5363;RBI=0.000831271;REFB=0;REVB=-0.000747013;RO=0;SAF=42;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.3144e-06;OID=.;OPOS=49500398;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:79:81:1:37:42:0:0:37:44:0:0
chr12	49500509	.	C	T	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.134;QD=57.545;RBI=0.0297912;REFB=0;REVB=0.026194;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.34125e-05;OID=.;OPOS=49500509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0
chr12	49522578	.	T	C	328.11	PASS	AF=1;AO=17;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154097;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.9407;QD=54.6857;RBI=0.224457;REFB=0;REVB=0.223927;RO=0;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00482488;OID=.;OPOS=49522578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:17:24:1:11:6:0:0:18:6:0:0
chr12	49522605	.	C	T	583.28	PASS	AF=0.930233;AO=40;DP=43;FAO=40;FDP=43;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0408481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8541;QD=54.2582;RBI=0.0596479;REFB=-0.00502833;REVB=-0.0434661;RO=3;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511022;STB=0.527259;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.000246538;OID=.;OPOS=49522605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:43:43:3:3:40:40:0.930233:26:14:0:3:26:14:0:3
chr12	49579696	.	C	G	864.84	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.653;QD=57.6557;RBI=0.0425386;REFB=0;REVB=0.0362321;RO=1;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200621;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.36383e-05;OID=.;OPOS=49579696;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:1:0:57:60:1:23:34:0:1:25:35:0:0
chr12	49580180	.	T	C	1567.42	PASS	AF=0.981818;AO=108;DP=110;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0632418;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.2325;QD=56.9971;RBI=0.0653149;REFB=-0.194763;REVB=-0.0163251;RO=2;SAF=38;SAR=70;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243227;STB=0.512818;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00537458;OID=.;OPOS=49580180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:110:110:2:2:108:108:0.981818:70:38:2:0:70:38:2:0
chr12	49666509	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.654;QD=33.4285;RBI=0.14081;REFB=0;REVB=-0.138427;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00458564;OID=.;OPOS=49666509;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr12	49667103	.	A	T	1171.9	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.77;QD=60.878;RBI=0.0125052;REFB=0;REVB=0.00714764;RO=0;SAF=27;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.07913e-05;OID=.;OPOS=49667103;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:50:27:0:0:50:27:0:0
chr12	50185334	.	A	G	404.81	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.582;QD=55.8358;RBI=0.0347985;REFB=0;REVB=0.0244183;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.14164e-05;OID=.;OPOS=50185334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:7:21:0:0:8:21:0:0
chr12	50189602	.	A	G	835.53	PASS	AF=1;AO=47;DP=50;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.095;QD=56.6461;RBI=0.0568906;REFB=0;REVB=0.0156248;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000521159;OID=.;OPOS=50189602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:50:59:0:0:47:59:1:27:20:0:0:31:28:0:0
chr12	50189807	.	C	A	306.28	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0062555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5599;QD=53.2661;RBI=0.0637562;REFB=0;REVB=0.0634486;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133825;OID=.;OPOS=50189807;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr12	50189834	.	T	G	272.19	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.894;QD=51.8462;RBI=0.0421169;REFB=0;REVB=0.0395526;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101506;OID=.;OPOS=50189834;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:5:15:0:0:6:15:0:0
chr12	50190653	.	C	T	604.86	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0077428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.387;QD=60.4858;RBI=0.0604995;REFB=0;REVB=0.0600019;RO=0;SAF=24;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152581;OID=.;OPOS=50190653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:16:24:0:0:16:24:0:0
chr12	50190667	.	A	T	747.08	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.961;QD=63.581;RBI=0.0323649;REFB=0;REVB=0.0272769;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.38506e-05;OID=.;OPOS=50190667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr12	50192207	.	C	CG	55.03	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0020809;FXX=0.0263089;HRUN=0;LEN=1;MLLD=62.7295;QD=5.94956;RBI=0.0215994;REFB=-0.00408628;REVB=-0.0214989;RO=23;SAF=7;SAR=6;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290827;STB=0.502089;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0988082;OID=.;OPOS=50192208;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.351351:13:37:13:37:24:7:6:13:11:55:23:7:6:13:10
chr12	50232169	.	A	T	115.76	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0041004;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.082;QD=42.0945;RBI=0.0464587;REFB=0;REVB=-0.0462774;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000340569;OID=.;OPOS=50232169;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0
chr12	50263148	.	G	A	1314.82	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0452089;FXX=0.0116266;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.589;QD=61.8737;RBI=0.0533902;REFB=0;REVB=0.0284019;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394834;OID=.;OPOS=50263148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:85:0:0:83:85:1:37:46:0:0:38:47:0:0
chr12	50348078	.	T	C	378.53	PASS	AF=0.434783;AO=40;DP=92;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=-0.00327419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.246;QD=16.4578;RBI=0.016565;REFB=-0.0445377;REVB=-0.0162382;RO=50;SAF=23;SAR=17;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254379;STB=0.512271;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=0.0509474;OID=.;OPOS=50348078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:50:52:40:40:0.434783:17:23:30:20:17:23:31:21
chr12	50352393	.	G	C	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.127484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8097;QD=14.0956;RBI=0.134495;REFB=-0.0170005;REVB=0.04286;RO=14;SAF=8;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358948;STB=0.710721;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0187199;OID=.;OPOS=50352393;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:3:8:5:9:3:8:5:9
chr12	50452708	.	C	G	2022.43	PASS	AF=1;AO=130;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.566;QD=61.7534;RBI=0.0375469;REFB=0;REVB=0.0235491;RO=0;SAF=70;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.36673e-05;OID=.;OPOS=50452708;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:131:131:0:0:130:131:1:60:70:0:0:61:70:0:0
chr12	50476158	.	G	T	1764.47	PASS	AF=0.991453;AO=116;DP=119;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.021715;FXX=0.0330551;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.61;QD=60.3237;RBI=0.0237344;REFB=-0.028653;REVB=-0.00958021;RO=1;SAF=67;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00703596;STB=0.503703;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=3.12818e-06;OID=.;OPOS=50476158;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:119:117:1:1:116:116:0.991453:49:67:1:0:49:67:1:0
chr12	50523947	.	A	G	690.74	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0219719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7052;QD=54.1757;RBI=0.0631991;REFB=-0.0815756;REVB=0.0592567;RO=1;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209158;STB=0.511107;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00296245;OID=.;OPOS=50523947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:22:28:0:1:22:28:0:1
chr12	50523964	.	T	C	583.69	PASS	AF=0.930233;AO=40;DP=43;FAO=40;FDP=43;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0786513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.573;QD=54.2972;RBI=0.0794065;REFB=-0.0334758;REVB=-0.0109256;RO=2;SAF=22;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407438;STB=0.508231;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=0.00206028;OID=.;OPOS=50523964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:43:43:2:3:40:40:0.930233:18:22:2:0:18:22:2:1
chr12	50526814	.	G	A	340.96	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00767112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=306.278;QD=54.5541;RBI=0.0635788;REFB=0;REVB=0.0631143;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187403;OID=.;OPOS=50526814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:14:10:0:0:14:11:0:0
chr12	50537815	.	A	G	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.893;QD=58.4196;RBI=0.0330117;REFB=0;REVB=0.0313856;RO=0;SAF=33;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.15076e-05;OID=.;OPOS=50537815;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:30:33:0:0:30:33:0:0
chr12	50650057	.	T	C	182.94	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.00771835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7767;QD=17.4228;RBI=0.029243;REFB=-0.0188321;REVB=0.0282061;RO=22;SAF=8;SAR=11;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101532;STB=0.541624;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0241447;OID=.;OPOS=50650057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:22:23:19:19:0.452381:11:8:7:15:11:8:8:15
chr12	50744119	.	G	A	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0335237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.047;QD=57.3853;RBI=0.0366634;REFB=0;REVB=-0.0148446;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000215959;OID=.;OPOS=50744119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0
chr12	50744171	.	T	C	1224.05	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.354;QD=61.2024;RBI=0.0340439;REFB=0;REVB=0.0119383;RO=0;SAF=41;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111756;OID=.;OPOS=50744171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:38:41:0:0:39:41:0:0
chr12	50744753	.	T	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00275559;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.953;QD=60.6103;RBI=0.00432045;REFB=0;REVB=0.00332762;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.00905e-05;OID=.;OPOS=50744753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:15:23:0:0:15:23:0:0
chr12	50749221	.	G	C	727.72	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0919255;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6166;QD=63.2801;RBI=0.0922772;REFB=0;REVB=-0.00804876;RO=0;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106171;OID=.;OPOS=50749221;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:17:29:0:0:17:29:0:0
chr12	50749227	.	T	G	643.06	PASS	AF=0.934783;AO=44;DP=47;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0153759;FXX=0.0212721;HRUN=6;LEN=1;MLLD=210.416;QD=55.918;RBI=0.0199809;REFB=-0.0375002;REVB=0.01276;RO=1;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302851;STB=0.548364;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.000219494;OID=.;OPOS=50749227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:47:46:1:3:44:43:0.934783:15:29:0:1:14:29:0:3
chr12	50749554	.	G	T	227.02	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.000632444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.205;QD=13.5537;RBI=0.022926;REFB=-0.0135573;REVB=-0.0229173;RO=40;SAF=15;SAR=12;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00587332;STB=0.503353;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0187063;OID=.;OPOS=50749554;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:12:15:22:18:12:15:22:18
chr12	50754563	.	T	G	313.39	PASS	AF=0.96;AO=23;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00140617;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.144;QD=50.1427;RBI=0.0378161;REFB=-0.108248;REVB=0.0377899;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519983;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.000476765;OID=.;OPOS=50754563;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:0:1:23:24:0.96:12:11:0:0:12:12:1:0
chr12	50821671	.	A	G	149.1	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0170267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.069;QD=18.6371;RBI=0.027874;REFB=-0.000509174;REVB=0.0220692;RO=16;SAF=4;SAR=12;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.394858;STB=0.725516;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00127195;OID=.;OPOS=50821671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:12:4:11:5:12:4:11:5
chr12	50824275	.	C	G	113.81	PASS	AF=0.304348;AO=14;DP=46;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0517989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2705;QD=9.89637;RBI=0.0575402;REFB=-0.038658;REVB=-0.0250548;RO=32;SAF=9;SAR=5;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133245;STB=0.580528;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0857815;OID=.;OPOS=50824275;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:32:32:14:14:0.304348:5:9:17:15:5:9:17:15
chr12	50870145	.	G	A	3879.73	PASS	AF=1;AO=242;DP=244;FAO=244;FDP=244;FR=.;FRO=0;FSAF=124;FSAR=120;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342072;FXX=0.00408147;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.336;QD=63.6022;RBI=0.0351657;REFB=-0.111927;REVB=0.0081546;RO=1;SAF=123;SAR=119;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00398851;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213516;OID=.;OPOS=50870145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:244:244:1:0:242:244:1:119:123:0:1:120:124:0:0
chr12	50882355	.	G	A	187.27	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.036282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2232;QD=20.245;RBI=0.0406028;REFB=-0.00358074;REVB=0.0182265;RO=17;SAF=12;SAR=7;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893329;STB=0.566301;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00381322;OID=.;OPOS=50882355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:18:19:19:0.513514:7:12:9:8:7:12:9:9
chr12	51089734	.	T	A	431.31	PASS	AF=0.61194;AO=41;DP=67;FAO=41;FDP=67;FR=.;FRO=26;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0142471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.15;QD=25.75;RBI=0.0211787;REFB=0.0116248;REVB=0.0156703;RO=26;SAF=29;SAR=12;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0448106;STB=0.524536;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=-0.00837313;OID=.;OPOS=51089734;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:26:26:41:41:0.61194:12:29:17:9:12:29:17:9
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chr12	51213765	.	T	C	189.9	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0569693;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.5938;QD=16.5131;RBI=0.0859992;REFB=-0.0379842;REVB=-0.0644234;RO=26;SAF=12;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137865;STB=0.578868;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.049075;OID=.;OPOS=51213765;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:8:12:12:14:8:12:12:14
chr12	51235317	.	A	G	719.92	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0229284;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5676;QD=61.2696;RBI=0.0250295;REFB=-0.109015;REVB=0.0100381;RO=0;SAF=30;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.31553e-08;STB=0.508193;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00197116;OID=.;OPOS=51235317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:47:0:1:46:46:0.978723:16:30:0:0:16:30:1:0
chr12	51236802	.	T	C	35.95	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0389459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0813;QD=6.25132;RBI=0.0641992;REFB=-0.0037258;REVB=-0.0510368;RO=17;SAF=3;SAR=3;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16883;STB=0.608351;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00179055;OID=.;OPOS=51236802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:3:3:11:6:3:3:11:6
chr12	51333796	.	C	CA	153.81	PASS	AF=0.521739;AO=22;DP=49;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0789288;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=21.1066;QD=13.3751;RBI=0.135196;REFB=-0.00150539;REVB=-0.109764;RO=25;SAF=4;SAR=18;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271712;STB=0.624299;STBP=0.118;TYPE=ins;VARB=0.0200933;OID=.;OPOS=51333797;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.521739:22:49:24:46:22:5:19:9:13:99:25:4:18:10:15
chr12	51354803	.	C	T	515.96	PASS	AF=0.444444;AO=56;DP=126;FAO=56;FDP=126;FR=.;FRO=70;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=45;FWDB=-0.0380325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6002;QD=16.3797;RBI=0.0556769;REFB=-0.0118558;REVB=-0.0406626;RO=70;SAF=28;SAR=28;SRF=25;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142502;STB=0.579337;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0223635;OID=.;OPOS=51354803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:70:70:56:56:0.444444:28:28:25:45:28:28:25:45
chr12	51399148	.	C	A	210.05	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0244525;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8739;QD=25.4611;RBI=0.0745908;REFB=-0.0169996;REVB=-0.0704689;RO=13;SAF=12;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113643;STB=0.506323;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0144088;OID=.;OPOS=51399148;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:13:13:20:20:0.606061:8:12:8:5:8:12:8:5
chr12	51402905	.	T	G	888.54	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00831448;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.354;QD=58.2648;RBI=0.1145;REFB=0;REVB=0.114198;RO=0;SAF=42;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213058;OID=.;OPOS=51402905;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:19:42:0:0:19:42:0:0
chr12	51442285	.	G	A	132.3	PASS	AF=0.416667;AO=13;DP=34;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0117249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.68;QD=14.7001;RBI=0.0117578;REFB=-0.00657748;REVB=-0.000879987;RO=21;SAF=2;SAR=11;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.454102;STB=0.71763;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00724545;OID=.;OPOS=51442285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:36:21:21:13:15:0.416667:11:2:11:10:12:3:11:10
chr12	51442944	.	G	A	2072.2	PASS	AF=1;AO=132;DP=133;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.305;QD=62.3218;RBI=0.0498273;REFB=0;REVB=0.0473803;RO=0;SAF=35;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.84106e-05;OID=.;OPOS=51442944;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:133:0:0:132:133:1:97:35:0:0:98:35:0:0
chr12	51518787	.	C	G	395.55	PASS	AF=0.695652;AO=32;DP=46;FAO=32;FDP=46;FR=.;FRO=14;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0407306;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.827;QD=34.3959;RBI=0.0431054;REFB=-0.045076;REVB=0.0141102;RO=14;SAF=22;SAR=10;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028639;STB=0.515615;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0196639;OID=.;OPOS=51518787;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:14:14:32:32:0.695652:10:22:9:5:10:22:9:5
chr12	51636259	.	C	T	868.46	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.703;QD=57.8976;RBI=0.0504488;REFB=0;REVB=0.00515104;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.83068e-05;OID=.;OPOS=51636259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:31:28:0:0:31:29:0:0
chr12	51639899	.	A	G	334.3	PASS	AF=0.507246;AO=34;DP=68;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=-0.0690251;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.9685;QD=19.3796;RBI=0.0700141;REFB=0.00315226;REVB=0.0117263;RO=34;SAF=15;SAR=19;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268649;STB=0.5226;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=-0.00248475;OID=.;OPOS=51639899;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:34:34:34:35:0.507246:19:15:14:20:19:16:14:20
chr12	51681903	.	T	C	1843.18	PASS	AF=1;AO=119;DP=120;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00228408;FXX=0.00812942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.819;QD=60.4322;RBI=0.021012;REFB=-0.00847753;REVB=0.0208875;RO=0;SAF=64;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98352e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.48407e-05;OID=.;OPOS=51681903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:120:122:0:0:119:122:1:55:64:0:0:55:67:0:0
chr12	51685831	.	T	C	539.47	PASS	AF=0.9;AO=36;DP=40;FAO=36;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00588345;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.684;QD=53.947;RBI=0.0182113;REFB=-0.128326;REVB=0.0172347;RO=1;SAF=8;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549407;STB=0.555523;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00261703;OID=.;OPOS=51685831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:1:2:36:36:0.9:28:8:1:0:28:8:2:0
chr12	51722311	.	C	T	464.23	PASS	AF=0.586667;AO=44;DP=75;FAO=44;FDP=75;FR=.;FRO=31;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.020457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.747;QD=24.7591;RBI=0.057599;REFB=-0.0151946;REVB=-0.0538439;RO=31;SAF=31;SAR=13;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132569;STB=0.572861;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0129097;OID=.;OPOS=51722311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:31:31:44:44:0.586667:13:31:17:14:13:31:17:14
chr12	51733734	.	G	A	635.42	PASS	AF=0.586538;AO=60;DP=103;FAO=61;FDP=104;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=-0.0354499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3424;QD=24.4394;RBI=0.0381068;REFB=-0.0546213;REVB=0.0139798;RO=42;SAF=31;SAR=29;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114026;STB=0.568878;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0474602;OID=.;OPOS=51733734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:42:43:60:61:0.586538:29:31:28:14:30:31:29:14
chr12	51737607	.	G	A	151.2	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0232911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.022;QD=20.16;RBI=0.0494211;REFB=-0.0231117;REVB=-0.0435887;RO=14;SAF=6;SAR=10;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220472;STB=0.624844;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0264604;OID=.;OPOS=51737607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:10:6:9:5:10:6:9:5
chr12	51740387	.	ACTGG	A,AATGG	702.19	PASS	AF=0.217391,0.782609;AO=10,36;DP=47;FAO=10,36;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=6,23;FSAR=4,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0260643,-0.0214571;FXX=0.0212721;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=208.888,84.1595;QD=61.0595;RBI=0.0315007,0.0310772;REFB=0,0;REVB=-0.0176902,-0.0224807;RO=0;SAF=6,23;SAR=4,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.21415e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0429659,0.00882892;OID=.,.;OPOS=51740388,51740388;OREF=CTGG,C;OALT=-,A;OMAPALT=A,AATGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.217391,0.782609:10,36:47:10,36:46:0:6,23:4,13:0:0:69:0:6,23:4,13:0:0
chr12	51740393	.	CCATATCCACTT	C	37.03	PASS	AF=0.196078;AO=10;DP=49;FAO=10;FDP=51;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.00486411;FXX=0.0377287;HRUN=2;LEN=11;MLLD=426.311;QD=2.90457;RBI=0.00544792;REFB=-0.00319054;REVB=0.00245362;RO=38;SAF=6;SAR=4;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00670309;STB=0.549903;STBP=0.797;TYPE=del;VARB=0.012407;OID=.;OPOS=51740394;OREF=CATATCCACTT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.196078:10:49:10:51:41:6:4:27:14:37:38:6:4:23:15
chr12	51740409	.	TA	GG	78.15	PASS	AF=0.2;AO=13;DP=65;FAO=13;FDP=65;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=36;FSRR=16;FWDB=0.0203152;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=153.919;QD=4.80926;RBI=0.0238712;REFB=8.20304e-05;REVB=0.0125349;RO=50;SAF=9;SAR=4;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112532;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000605626;OID=.;OPOS=51740409;OREF=TA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:65:65:50:52:13:13:0.2:4:9:35:15:4:9:36:16
chr12	51901390	.	A	G	379.59	PASS	AF=0.449438;AO=40;DP=89;FAO=40;FDP=89;FR=.;FRO=49;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0287695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2447;QD=17.0603;RBI=0.0696232;REFB=-0.0187689;REVB=-0.0634012;RO=47;SAF=15;SAR=25;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134209;STB=0.587348;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0372561;OID=.;OPOS=51901390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:47:49:40:40:0.449438:25:15:24:23:25:15:26:23
chr12	51902249	.	C	T	286.31	PASS	AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.0631769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4049;QD=15.6883;RBI=0.0664776;REFB=0.00305066;REVB=-0.0206868;RO=41;SAF=11;SAR=21;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265699;STB=0.649949;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.00855479;OID=.;OPOS=51902249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:21:11:25:16:21:11:25:16
chr12	52080965	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252694;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=298.251;QD=60.61;RBI=0.0266093;REFB=0;REVB=0.00833737;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.15417e-05;OID=.;OPOS=52080965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:25:13:0:0:25:13:0:0
chr12	52184271	.	T	C	194.22	PASS	AF=0.944444;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0209706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.185;QD=43.1606;RBI=0.0263144;REFB=-0.0661709;REVB=0.015896;RO=1;SAF=6;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0701691;STB=0.533294;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0010021;OID=.;OPOS=52184271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:18:1:1:16:17:0.944444:10:6:1:0:10:7:1:0
chr12	52200742	.	C	A	289.31	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0541372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.6017;QD=52.6022;RBI=0.0576686;REFB=0;REVB=0.0198705;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000941515;OID=.;OPOS=52200742;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chr12	52204246	.	T	C	833.73	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00038362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.602;QD=57.4982;RBI=0.0481882;REFB=0;REVB=0.0481867;RO=0;SAF=31;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.67827e-05;OID=.;OPOS=52204246;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:27:31:0:0:27:31:0:0
chr12	52211942	.	G	A,C	471.29	PASS	AF=0.909091,0.0909091;AO=30,3;DP=33;FAO=30,3;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=10,0;FSAR=20,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00750343,-0.056434;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=215.779,173.813;QD=57.1264;RBI=0.00755366,0.056531;REFB=0,0;REVB=-0.000869639,-0.0033095;RO=0;SAF=10,0;SAR=20,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00255851,0.0203929;OID=.,.;OPOS=52211942,52211942;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:33:33:0:0:30,3:30,3:0.909091,0.0909091:20,3:10,0:0:0:20,3:10,0:0:0
chr12	52215102	.	T	G	130.2	PASS	AF=0.928571;AO=12;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0266601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.581;QD=37.201;RBI=0.0391143;REFB=0.072865;REVB=0.0286211;RO=1;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0818676;STB=0.545384;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00137902;OID=.;OPOS=52215102;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:14:1:1:12:13:0.928571:7:5:1:0:8:5:1:0
chr12	52282060	.	C	T	561.21	PASS	AF=0.527778;AO=57;DP=108;FAO=57;FDP=108;FR=.;FRO=51;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.021741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4637;QD=20.7856;RBI=0.0308686;REFB=-0.0224861;REVB=0.0219135;RO=46;SAF=26;SAR=31;SRF=21;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000313112;STB=0.521189;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0203056;OID=.;OPOS=52282060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:46:51:57:57:0.527778:31:26:21:25:31:26:21:30
chr12	52282083	.	T	C	460.16	PASS	AF=0.464646;AO=45;DP=96;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=24;FSRR=29;FWDB=-0.0511384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.857;QD=18.5924;RBI=0.0518473;REFB=-0.0236232;REVB=-0.00854469;RO=50;SAF=18;SAR=27;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0195922;STB=0.534045;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0319493;OID=.;OPOS=52282083;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:99:50:53:45:46:0.464646:27:18:21:29:28:18:24:29
chr12	52282873	.	A	T	152.78	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0288716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.501;QD=13.5802;RBI=0.0528179;REFB=-0.0307831;REVB=-0.0442284;RO=28;SAF=6;SAR=11;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12402;STB=0.572515;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0424496;OID=.;OPOS=52282873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:11:6:13:15:11:6:13:15
chr12	52284233	.	T	C	610.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175386;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.906;QD=61.0533;RBI=0.0310638;REFB=0;REVB=-0.025639;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157979;OID=.;OPOS=52284233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:19:20:0:0:19:21:0:0
chr12	52284668	.	C	A	819.82	PASS	AF=0.573529;AO=70;DP=130;FAO=78;FDP=136;FR=.;FRO=58;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.0720459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.7447;QD=24.1122;RBI=0.115607;REFB=-0.0398578;REVB=0.0904126;RO=60;SAF=34;SAR=36;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120362;STB=0.505468;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0372865;OID=.;OPOS=52284668;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:136:60:58:70:78:0.573529:36:34:30:30:40:38:29:29
chr12	52471159	.	C	T	738.16	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00749653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5867;QD=62.822;RBI=0.0243616;REFB=0;REVB=0.0231795;RO=0;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027701;OID=.;OPOS=52471159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:46:47:1:32:14:0:0:33:14:0:0
chr12	52564449	.	C	T	294.02	PASS	AF=0.590909;AO=18;DP=44;FAO=26;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0981754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.546;QD=26.7287;RBI=0.151301;REFB=-0.0444422;REVB=0.115125;RO=18;SAF=17;SAR=1;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.394546;STB=0.549959;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0357876;OID=.;OPOS=52564449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:18:18:18:26:0.590909:1:17:14:4:4:22:14:4
chr12	52565321	.	A	AT	512.86	PASS	AF=0.974359;AO=5;DP=41;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0600333;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=213.687;QD=52.6009;RBI=0.0601437;REFB=-0.072728;REVB=0.00364163;RO=36;SAF=3;SAR=2;SRF=33;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.516712;STB=0.507459;STBP=0.648;TYPE=ins;VARB=0.00195223;OID=.;OPOS=52565322;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.974359:5:41:38:39:1:33:5:1:0:5:36:3:2:33:3
chr12	52565322	.	G	T	441.11	PASS	AF=0.846154;AO=33;DP=39;FAO=33;FDP=39;FR=.;FRO=6;FSAF=30;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0029553;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.942;QD=45.2416;RBI=0.0300572;REFB=-0.186185;REVB=0.0299115;RO=5;SAF=30;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188296;STB=0.595172;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.00189712;OID=.;OPOS=52565322;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:39:39:5:6:33:33:0.846154:3:30:3:2:3:30:4:2
chr12	52566047	.	G	A	37.13	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=0.0104997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.53;QD=8.25032;RBI=0.0338562;REFB=-0.0116115;REVB=-0.032187;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496201;STB=0.799199;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0184489;OID=.;OPOS=52566047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:4:2:10:2:4:2:10:2
chr12	52585570	.	C	T	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.1322;QD=61.3346;RBI=0.0367335;REFB=0;REVB=-0.00945809;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.70119e-05;OID=.;OPOS=52585570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr12	52602013	.	C	T	1982.24	PASS	AF=0.984848;AO=129;DP=131;FAO=130;FDP=132;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=59;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0224695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.193;QD=60.0679;RBI=0.0398736;REFB=-0.0626748;REVB=0.0329397;RO=1;SAF=70;SAR=59;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00674106;STB=0.506943;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.000816246;OID=.;OPOS=52602013;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:131:132:1:2:129:130:0.984848:59:70:1:0:59:71:2:0
chr12	52631313	.	A	G	360.71	PASS	AF=0.40625;AO=39;DP=95;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=30;FSAR=9;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.0228561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4882;QD=15.0297;RBI=0.0321087;REFB=-0.0207938;REVB=0.0225515;RO=54;SAF=30;SAR=9;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294654;STB=0.666574;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0299128;OID=.;OPOS=52631313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:54:57:39:39:0.40625:9:30:28:26:9:30:30:27
chr12	52639302	.	G	C	337.97	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=76;FAO=36;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=33;FWDB=-0.0621094;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.5412;QD=17.7878;RBI=0.0691163;REFB=-0.0656954;REVB=-0.030323;RO=30;SAF=17;SAR=19;SRF=6;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229327;STB=0.659623;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0320463;OID=.;OPOS=52639302;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:30:40:36:36:0.473684:19:17:6:24:19:17:7:33
chr12	52642518	.	G	A	148.54	PASS	AF=0.345455;AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0485083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.7862;QD=10.8027;RBI=0.0533384;REFB=-0.00698071;REVB=-0.0221794;RO=36;SAF=14;SAR=5;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194805;STB=0.615255;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0135397;OID=.;OPOS=52642518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:36:36:19:19:0.345455:5:14:21:15:5:14:21:15
chr12	52649887	.	T	C	237.07	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0583358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.791;QD=19.7554;RBI=0.058343;REFB=0.00991991;REVB=-0.000916803;RO=25;SAF=9;SAR=14;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19247;STB=0.608601;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.00583154;OID=.;OPOS=52649887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:14:9:15:10:14:9:15:10
chr12	52660812	.	G	A	1470.15	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0524959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5735;QD=63.2322;RBI=0.102602;REFB=0;REVB=0.0881555;RO=0;SAF=50;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00046938;OID=.;OPOS=52660812;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:93:0:0:91:93:1:41:50:0:0:42:51:0:0
chr12	52661192	.	A	G	1274.59	PASS	AF=0.976744;AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=86;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0613172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0732;QD=59.2833;RBI=0.106557;REFB=0.00902946;REVB=-0.0871465;RO=2;SAF=65;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143507;STB=0.507461;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=-0.00127517;OID=.;OPOS=52661192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:85:86:2:2:83:84:0.976744:18:65:2:0:18:66:2:0
chr12	52661196	.	G	A	1365.39	PASS	AF=0.978022;AO=89;DP=91;FAO=89;FDP=91;FR=.;FRO=2;FSAF=65;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0616309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9176;QD=60.0173;RBI=0.0678263;REFB=-0.131732;REVB=0.0283204;RO=2;SAF=65;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143591;STB=0.507574;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.00296965;OID=.;OPOS=52661196;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:91:91:2:2:89:89:0.978022:24:65:2:0:24:65:2:0
chr12	52661209	.	T	C	1396.42	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.996;QD=62.7607;RBI=0.0150737;REFB=0;REVB=-0.00122431;RO=0;SAF=65;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34512e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.48382e-05;OID=.;OPOS=52661209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:24:65:0:0:24:65:0:0
chr12	52661302	.	C	A	295.93	PASS	AF=0.958333;AO=22;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0230081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.6985;QD=49.3211;RBI=0.0910227;REFB=-0.0183344;REVB=0.0880668;RO=1;SAF=14;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031885;STB=0.516115;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.008535;OID=.;OPOS=52661302;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:22:23:0.958333:8:14:1:0:8:15:1:0
chr12	52679937	.	C	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0105969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.423;QD=47.8223;RBI=0.0107049;REFB=0;REVB=-0.00151716;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000102395;OID=.;OPOS=52679937;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
chr12	52681416	.	T	C	833.97	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0364115;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.328;QD=57.5152;RBI=0.0620383;REFB=0;REVB=0.050229;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103049;OID=.;OPOS=52681416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:25:33:0:0:25:33:0:0
chr12	52681437	.	A	G	758.71	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0396291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.347;QD=53.2431;RBI=0.0761881;REFB=-0.114128;REVB=0.0650705;RO=2;SAF=28;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324832;STB=0.517235;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.00642529;OID=.;OPOS=52681437;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:2:2:55:55:0.964912:27:28:2:0:27:28:2:0
chr12	52681925	.	A	C	1246.09	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.006;QD=61.5353;RBI=0.0296381;REFB=0;REVB=0.0212103;RO=0;SAF=31;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.35858e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157235;OID=.;OPOS=52681925;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:50:31:0:0:50:31:0:0
chr12	52695754	.	C	T	135.83	PASS	AF=0.928571;AO=12;DP=13;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.161305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.5346;QD=38.8095;RBI=0.1987;REFB=-0.147562;REVB=0.116028;RO=1;SAF=9;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0475628;STB=0.526276;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0307394;OID=.;OPOS=52695754;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:13:14:1:1:12:13:0.928571:3:9:1:0:4:9:1:0
chr12	52695787	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=349.19;QD=43.4862;RBI=0.0578062;REFB=0;REVB=-0.0566133;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.20691e-05;OID=.;OPOS=52695787;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0
chr12	52708420	.	G	A	1919.01	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00659076;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.399;QD=61.9035;RBI=0.0362419;REFB=0;REVB=0.0356376;RO=0;SAF=58;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.99067e-06;OID=.;OPOS=52708420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:66:58:0:0:66:58:0:0
chr12	52708565	.	A	G	783.88	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.015;QD=57.0098;RBI=0.0509948;REFB=0;REVB=0.0394669;RO=0;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6027e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.41098e-05;OID=.;OPOS=52708565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:23:31:0:0:24:31:0:0
chr12	52709880	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00582223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.618;QD=52.6129;RBI=0.0239941;REFB=0;REVB=0.023277;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217826;OID=.;OPOS=52709880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr12	52709883	.	T	C	289.32	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.147597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4321;QD=52.6038;RBI=0.14826;REFB=0;REVB=0.0140089;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00360295;OID=.;OPOS=52709883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr12	52710309	.	G	A	2126.26	PASS	AF=1;AO=134;DP=136;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396461;FXX=0.0145975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.654;QD=63.0004;RBI=0.0489081;REFB=0;REVB=0.0286389;RO=0;SAF=68;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92976e-05;OID=.;OPOS=52710309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:136:135:0:0:134:135:1:66:68:0:0:67:68:0:0
chr12	52710715	.	G	A	1524.99	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0075745;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7214;QD=59.8036;RBI=0.0391064;REFB=0;REVB=-0.0383659;RO=0;SAF=53;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03142e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000213481;OID=.;OPOS=52710715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:49:53:0:0:49:53:0:0
chr12	52710721	.	G	C	1578.61	PASS	AF=1;AO=97;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0466;QD=63.782;RBI=0.0748248;REFB=0;REVB=-0.0639736;RO=1;SAF=51;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101988;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.03989e-05;OID=.;OPOS=52710721;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:1:0:97:99:1:46:51:0:1:47:52:0:0
chr12	52711549	.	G	A	724.12	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.032278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.902;QD=54.6506;RBI=0.0400523;REFB=0.00712443;REVB=0.0237133;RO=0;SAF=35;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.31071e-08;STB=0.51428;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00011593;OID=.;OPOS=52711549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:0:1:52:52:0.981132:17:35:0:0:17:35:0:1
chr12	52713088	.	G	A	1457.26	PASS	AF=0.989362;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0208413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.049;QD=62.0112;RBI=0.0263393;REFB=0.0200945;REVB=-0.0161059;RO=1;SAF=37;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126395;STB=0.506492;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=-0.000310094;OID=.;OPOS=52713088;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:94:1:1:92:93:0.989362:55:37:1:0:55:38:1:0
chr12	52753861	.	C	T	1355.02	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4533;QD=61.5916;RBI=0.0726821;REFB=0;REVB=0.0684949;RO=0;SAF=42;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.519e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000501192;OID=.;OPOS=52753861;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:87:88:1:45:42:0:0:46:42:0:0
chr12	52773702	.	G	A	253.69	PASS	AF=0.469697;AO=28;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.102593;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.505;QD=15.3749;RBI=0.105742;REFB=-0.000569148;REVB=-0.0256124;RO=36;SAF=20;SAR=8;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230122;STB=0.665482;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0077369;OID=.;OPOS=52773702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:36:35:28:31:0.469697:8:20:18:18:8:23:16:19
chr12	52774158	.	G	A	170.63	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0347614;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7863;QD=13.3827;RBI=0.0355315;REFB=-0.028959;REVB=-0.00735787;RO=30;SAF=13;SAR=7;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189129;STB=0.524391;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0392814;OID=.;OPOS=52774158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:30:31:20:20:0.392157:7:13:19:11:7:13:19:12
chr12	52774235	.	A	G	750.54	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00477077;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2757;QD=63.8758;RBI=0.00958214;REFB=0;REVB=0.00831007;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.13379e-05;OID=.;OPOS=52774235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0
chr12	52774305	.	A	G	126.9	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00921266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.786;QD=19.5227;RBI=0.00988723;REFB=-0.0127517;REVB=0.00358945;RO=12;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0584636;STB=0.533285;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0169322;OID=.;OPOS=52774305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:6:8:6:6:6:8:6:6
chr12	52774370	.	G	A	33.48	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.018369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.496;QD=19.134;RBI=0.0430327;REFB=-0.0599425;REVB=0.0389152;RO=2;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491618;STB=0.529293;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0222636;OID=.;OPOS=52774370;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:3:2:1:1:3:2:1:1
chr12	52777439	.	A	G	304.33	PASS	AF=0.409639;AO=34;DP=84;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=-0.0566217;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3151;QD=14.6666;RBI=0.0567798;REFB=0.00203362;REVB=-0.00423321;RO=49;SAF=16;SAR=18;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200265;STB=0.511357;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=-0.00472967;OID=.;OPOS=52777439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:49:49:34:34:0.409639:18:16:24:25:18:16:24:25
chr12	52777502	.	A	G	1080.55	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00188717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.87;QD=60.0307;RBI=0.00441961;REFB=0;REVB=-0.00399644;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.63714e-06;OID=.;OPOS=52777502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:38:34:0:0:38:34:0:0
chr12	52777513	.	T	C	205.38	PASS	AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0206172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.166;QD=12.8363;RBI=0.0332998;REFB=0.00203477;REVB=0.0261497;RO=39;SAF=13;SAR=12;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00762778;STB=0.504377;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=-0.00248175;OID=.;OPOS=52777513;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:39:39:25:25:0.390625:12:13:20:19:12:13:20:19
chr12	52777578	.	C	T	82.7	PASS	AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0267976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.621;QD=9.18837;RBI=0.0302668;REFB=-0.0041166;REVB=-0.0140702;RO=25;SAF=4;SAR=7;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180307;STB=0.610053;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0125495;OID=.;OPOS=52777578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:36:36:25:25:11:11:0.305556:7:4:13:12:7:4:13:12
chr12	52777580	.	A	C	83.9	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0256419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.193;QD=10.1697;RBI=0.0286317;REFB=-0.00468132;REVB=-0.0127384;RO=22;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0833e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0192423;OID=.;OPOS=52777580;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:6:5:10:12:6:5:10:12
chr12	52778947	.	A	G	423.36	PASS	AF=0.432432;AO=48;DP=110;FAO=48;FDP=111;FR=.;FRO=63;FSAF=41;FSAR=7;FSRF=44;FSRR=19;FWDB=0.0275437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6915;QD=15.2562;RBI=0.0284217;REFB=-0.000263519;REVB=-0.00700976;RO=61;SAF=41;SAR=7;SRF=44;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216727;STB=0.641714;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.000612685;OID=.;OPOS=52778947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:111:61:63:48:48:0.432432:7:41:44:17:7:41:44:19
chr12	52779244	.	A	G	363.41	PASS	AF=0.431373;AO=37;DP=96;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=35;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=0.0105381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4488;QD=14.2515;RBI=0.0354059;REFB=-0.0138958;REVB=0.0338013;RO=58;SAF=35;SAR=2;SRF=31;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.652297;STB=0.679521;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0205087;OID=.;OPOS=52779244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:102:58:58:37:44:0.431373:2:35:31:27:9:35:31:27
chr12	52789509	.	T	C	323.59	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.837;QD=53.9319;RBI=0.0520829;REFB=0;REVB=-0.0464104;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.31646e-05;OID=.;OPOS=52789509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:24:0:0:23:24:1:11:12:0:0:12:12:0:0
chr12	52789597	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0447256;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.158;QD=51.1846;RBI=0.0475145;REFB=0;REVB=-0.016039;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.0409e-05;OID=.;OPOS=52789597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr12	52789605	.	T	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.224;QD=50.4128;RBI=0.0176562;REFB=0;REVB=-0.004933;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.68552e-05;OID=.;OPOS=52789605;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr12	52818377	.	C	T	479.55	PASS	AF=0.485714;AO=51;DP=105;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.0293229;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.31;QD=18.2684;RBI=0.0377131;REFB=-0.0123987;REVB=0.0237159;RO=53;SAF=23;SAR=28;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539317;STB=0.534818;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00836167;OID=.;OPOS=52818377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:53:54:51:51:0.485714:28:23:27:26:28:23:28:26
chr12	52818504	.	T	G	653.44	PASS	AF=1;AO=43;DP=80;FAO=43;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137443;FXX=0.462442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.935;QD=60.7847;RBI=0.0248228;REFB=-0.0752794;REVB=0.0206704;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000656461;OID=.;OPOS=52818504;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:80:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr12	52822258	.	A	G	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0787257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.984;QD=63.8719;RBI=0.0787435;REFB=0;REVB=0.00167317;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189002;OID=.;OPOS=52822258;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr12	52824352	.	G	A	488.31	PASS	AF=0.452991;AO=51;DP=117;FAO=53;FDP=117;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=0.00938526;FXX=0.0168053;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.498;QD=16.6942;RBI=0.0163236;REFB=-0.0176427;REVB=0.0133558;RO=64;SAF=13;SAR=38;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177609;STB=0.591321;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0342238;OID=.;OPOS=52824352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:64:64:51:53:0.452991:38:13:26:38:39:14:26:38
chr12	52825363	.	G	A	842.47	PASS	AF=0.967742;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0144192;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.685;QD=54.3531;RBI=0.0172928;REFB=-0.134288;REVB=-0.00954617;RO=0;SAF=43;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508538;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.000977972;OID=.;OPOS=52825363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:61:62:0:2:60:60:0.967742:17:43:0:0:17:43:1:1
chr12	52827740	.	G	C	245.07	PASS	AF=0.381579;AO=24;DP=77;FAO=29;FDP=76;FR=.,HEALED;FRO=47;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.0246038;FXX=0.0379699;HRUN=5;LEN=1;MLLD=137.29;QD=12.8982;RBI=0.0247324;REFB=-0.026685;REVB=-0.00251876;RO=35;SAF=17;SAR=7;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620717;STB=0.529894;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0398231;OID=.;OPOS=52827740;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:35:47:24:29:0.381579:7:17:23:12:11:18:27:20
chr12	52827818	.	T	C	754.39	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.765;QD=56.935;RBI=0.0402571;REFB=0;REVB=0.00403688;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.43652e-05;OID=.;OPOS=52827818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:26:27:0:0:26:27:0:0
chr12	52841765	.	G	A	986.59	PASS	AF=0.971429;AO=67;DP=69;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0203786;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.205;QD=56.3766;RBI=0.0221568;REFB=-0.079839;REVB=-0.0086969;RO=2;SAF=41;SAR=26;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00644175;STB=0.503067;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.000948954;OID=.;OPOS=52841765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:69:70:2:2:67:68:0.971429:26:41:1:1:27:41:1:1
chr12	52842736	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.045225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8027;QD=48.7366;RBI=0.0831239;REFB=0;REVB=0.0697444;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000638331;OID=.;OPOS=52842736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr12	52843581	.	A	G	60.32	PASS	AF=0.0982659;AO=17;DP=172;FAO=17;FDP=173;FR=.;FRO=156;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=72;FSRR=84;FWDB=0.004738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.947;QD=1.39475;RBI=0.0556413;REFB=0.00153399;REVB=-0.0554392;RO=155;SAF=7;SAR=10;SRF=72;SRR=83;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0637973;STB=0.545526;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=-0.0220396;OID=.;OPOS=52843581;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:172:173:155:156:17:17:0.0982659:10:7:72:83:10:7:72:84
chr12	52843779	.	T	C	472.58	PASS	AF=0.335135;AO=43;DP=176;FAO=62;FDP=185;FR=.;FRO=123;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=59;FSRR=64;FWDB=0.0111171;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.301;QD=10.218;RBI=0.0113749;REFB=-0.0192134;REVB=-0.00240781;RO=123;SAF=20;SAR=23;SRF=59;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181198;STB=0.578404;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0431915;OID=.;OPOS=52843779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:185:123:123:43:62:0.335135:23:20:59:64:25:37:59:64
chr12	52843783	.	T	C	170.69	PASS	AF=0.185393;AO=33;DP=178;FAO=33;FDP=178;FR=.;FRO=145;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=74;FSRR=71;FWDB=-0.0291012;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.6986;QD=3.8357;RBI=0.0904758;REFB=-0.0148157;REVB=-0.0856679;RO=145;SAF=21;SAR=12;SRF=74;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164202;STB=0.604514;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.06698;OID=.;OPOS=52843783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:178:145:145:33:33:0.185393:12:21:74:71:12:21:74:71
chr12	52843875	.	G	A	39.71	PASS	AF=0.0961538;AO=10;DP=103;FAO=10;FDP=104;FR=.;FRO=94;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=47;FSRR=47;FWDB=-0.016788;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.542;QD=1.52744;RBI=0.0173863;REFB=-0.00361334;REVB=-0.00452156;RO=93;SAF=7;SAR=3;SRF=47;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229908;STB=0.683222;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0381949;OID=.;OPOS=52843875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:103:104:93:94:10:10:0.0961538:3:7:47:46:3:7:47:47
chr12	52844265	.	T	C	490.85	PASS	AF=0.398551;AO=54;DP=135;FAO=55;FDP=138;FR=.;FRO=83;FSAF=19;FSAR=36;FSRF=31;FSRR=52;FWDB=0.00348257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.222;QD=14.2276;RBI=0.00587538;REFB=-0.0157684;REVB=-0.004732;RO=81;SAF=18;SAR=36;SRF=29;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291737;STB=0.518426;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0220806;OID=.;OPOS=52844265;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:138:81:83:54:55:0.398551:36:18:29:52:36:19:31:52
chr12	52845435	.	C	T	147.6	PASS	AF=0.272727;AO=21;DP=77;FAO=21;FDP=77;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=39;FSRR=17;FWDB=-0.0207275;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.348;QD=7.66739;RBI=0.0297544;REFB=-0.00707905;REVB=-0.021347;RO=56;SAF=18;SAR=3;SRF=39;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286997;STB=0.677768;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0156698;OID=.;OPOS=52845435;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:56:56:21:21:0.272727:3:18:39:17:3:18:39:17
chr12	52845801	.	T	C	622.94	PASS	AF=0.90566;AO=47;DP=53;FAO=48;FDP=53;FR=.;FRO=5;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0595447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.111;QD=47.0146;RBI=0.0616826;REFB=-0.0593859;REVB=0.0160987;RO=5;SAF=30;SAR=17;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00745496;STB=0.504711;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00480937;OID=.;OPOS=52845801;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:53:53:5:5:47:48:0.90566:17:30:3:2:17:31:3:2
chr12	52863038	.	G	A	331.45	PASS	AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.01646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.709;QD=18.6733;RBI=0.0421396;REFB=-0.0174974;REVB=0.0387919;RO=34;SAF=15;SAR=20;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241994;STB=0.618981;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0256314;OID=.;OPOS=52863038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:34:36:35:35:0.492958:20:15:24:10:20:15:24:12
chr12	52863213	.	C	T	376.52	PASS	AF=0.378151;AO=44;DP=118;FAO=45;FDP=119;FR=.;FRO=74;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=48;FSRR=26;FWDB=-0.00623169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.128;QD=12.6562;RBI=0.0232196;REFB=-0.020009;REVB=-0.0223677;RO=73;SAF=21;SAR=23;SRF=47;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181833;STB=0.611925;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0183417;OID=.;OPOS=52863213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:119:73:74:44:45:0.378151:23:21:47:26:24:21:48:26
chr12	52863564	.	C	T	136.36	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=47;FAO=16;FDP=48;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.00310999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.394;QD=11.3635;RBI=0.0319389;REFB=-0.00577853;REVB=0.0317871;RO=32;SAF=6;SAR=9;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252263;STB=0.622928;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0173159;OID=.;OPOS=52863564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:32:32:15:16:0.333333:9:6:20:12:9:7:20:12
chr12	52863621	.	T	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00587364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.498;QD=61.3364;RBI=0.0113384;REFB=0;REVB=-0.00969846;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.48892e-06;OID=.;OPOS=52863621;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr12	52865443	.	T	C	267.16	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0260032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4779;QD=18.4251;RBI=0.0338269;REFB=-0.0207155;REVB=-0.0216355;RO=29;SAF=9;SAR=20;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135216;STB=0.575862;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0286204;OID=.;OPOS=52865443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:20:9:13:16:20:9:13:16
chr12	52884735	.	A	G	430.58	PASS	AF=0.505882;AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.013753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.023;QD=20.2626;RBI=0.024688;REFB=-0.00611702;REVB=0.0205025;RO=40;SAF=16;SAR=27;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220913;STB=0.622336;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00847898;OID=.;OPOS=52884735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:40:42:43:43:0.505882:27:16:25:15:27:16:26:16
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chr12	52885350	.	T	C	94.61	PASS	AF=0.138889;AO=20;DP=144;FAO=20;FDP=144;FR=.;FRO=124;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=68;FSRR=56;FWDB=0.0372527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.103;QD=2.62797;RBI=0.0378801;REFB=-0.0127503;REVB=0.00686577;RO=123;SAF=8;SAR=12;SRF=67;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181092;STB=0.626249;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0285815;OID=.;OPOS=52885350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:144:144:123:124:20:20:0.138889:12:8:67:56:12:8:68:56
chr12	52885374	.	G	C	47.16	PASS	AF=0.0945946;AO=14;DP=148;FAO=14;FDP=148;FR=.;FRO=134;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=69;FSRR=65;FWDB=-0.0531923;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2501;QD=1.2746;RBI=0.0545837;REFB=-0.0101799;REVB=0.0122458;RO=131;SAF=2;SAR=12;SRF=69;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.458099;STB=0.84641;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0406657;OID=.;OPOS=52885374;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:148:148:131:134:14:14:0.0945946:12:2:69:62:12:2:69:65
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chr12	52885381	.	C	T	56.66	PASS	AF=0.104167;AO=14;DP=143;FAO=15;FDP=144;FR=.;FRO=129;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=67;FSRR=62;FWDB=-0.0141993;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.751;QD=1.57391;RBI=0.0142108;REFB=-0.0057534;REVB=0.000573323;RO=129;SAF=3;SAR=11;SRF=67;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.364449;STB=0.790567;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0441711;OID=.;OPOS=52885381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:143:144:129:129:14:15:0.104167:11:3:67:62:12:3:67:62
chr12	52886478	.	T	C	109.5	PASS	AF=0.193548;AO=18;DP=94;FAO=18;FDP=93;FR=.;FRO=75;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=61;FSRR=14;FWDB=-0.0120308;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.571;QD=4.70961;RBI=0.0431749;REFB=-0.0127977;REVB=-0.0414648;RO=74;SAF=12;SAR=6;SRF=61;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257187;STB=0.645882;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.058925;OID=.;OPOS=52886478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:74:75:18:18:0.193548:6:12:61:13:6:12:61:14
chr12	52886490	.	A	G	1567.22	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306753;FXX=0.0277752;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.65;QD=59.7035;RBI=0.0570798;REFB=0;REVB=0.0481366;RO=0;SAF=79;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217648;OID=.;OPOS=52886490;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:105:0:0:103:105:1:24:79:0:0:24:81:0:0
chr12	52886911	.	T	C	90.42	PASS	AF=0.26087;AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0153378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.521;QD=7.86258;RBI=0.0472512;REFB=-0.0198779;REVB=-0.0446926;RO=34;SAF=4;SAR=8;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170085;STB=0.605879;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0591491;OID=.;OPOS=52886911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:46:46:34:34:12:12:0.26087:8:4:16:18:8:4:16:18
chr12	52912906	.	G	T	362.99	PASS	AF=0.506494;AO=37;DP=76;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=32;FSRR=6;FWDB=0.0589799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1839;QD=18.8565;RBI=0.0920901;REFB=-0.00376545;REVB=-0.0707245;RO=39;SAF=17;SAR=20;SRF=33;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351431;STB=0.68351;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00292522;OID=.;OPOS=52912906;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:39:38:37:39:0.506494:20:17:33:6:21:18:32:6
chr12	52912909	.	G	T	339.96	PASS	AF=0.486486;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=74;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=7;FWDB=-0.00693658;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.791;QD=18.376;RBI=0.0195258;REFB=-0.00604292;REVB=0.0182522;RO=37;SAF=16;SAR=20;SRF=31;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350716;STB=0.673473;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00519428;OID=.;OPOS=52912909;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:37:38:36:36:0.486486:20:16:31:6:19:17:31:7
chr12	52938364	.	T	C	1172.7	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.582;QD=60.9197;RBI=0.0270445;REFB=0;REVB=0.0230041;RO=0;SAF=29;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.89405e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04184e-05;OID=.;OPOS=52938364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:75:77:1:46:29:0:0:48:29:0:0
chr12	52938497	.	A	C	358.12	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0501436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.139;QD=55.0952;RBI=0.0501999;REFB=0;REVB=0.00237657;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442961;OID=.;OPOS=52938497;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr12	52939407	.	AGAG	A,ATAA	306.49	PASS	AF=0.869565,0.130435;AO=20,3;DP=25;FAO=20,3;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9,3;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433166,-0.0720414;FXX=0.079968;HRUN=1,1;LEN=3,3;MLLD=233.233,101.137;QD=53.3018;RBI=0.0640872,0.0745374;REFB=0,0;REVB=0.0472319,0.0191273;RO=0;SAF=9,3;SAR=11,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.0487e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00550574,0.0161071;OID=.,.;OPOS=52939408,52939408;OREF=GAG,GAG;OALT=-,TAA;OMAPALT=A,ATAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.869565,0.130435:20,3:25:20,3:23:0:9,3:11,0:0:0:15:0:9,3:11,0:0:0
chr12	52943144	.	G	A	791.42	PASS	AF=1;AO=41;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.112451;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.832;QD=64.6059;RBI=0.118979;REFB=0;REVB=0.0388674;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00196034;OID=.;OPOS=52943144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:41:49:1:13:28:0:0:13:36:0:0
chr12	52965173	.	T	G	328.77	PASS	AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.00206545;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=245.538;QD=15.4717;RBI=0.0256645;REFB=-0.00948769;REVB=-0.0255813;RO=49;SAF=23;SAR=13;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0940871;STB=0.553234;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0103912;OID=.;OPOS=52965173;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:49:49:36:36:0.423529:13:23:27:22:13:23:27:22
chr12	52965722	.	T	C	304.1	PASS	AF=0.52459;AO=33;DP=61;FAO=32;FDP=61;FR=.;FRO=29;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0181735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.31;QD=19.941;RBI=0.0208846;REFB=-0.0338631;REVB=-0.0102903;RO=28;SAF=19;SAR=14;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0929786;STB=0.56976;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0312244;OID=.;OPOS=52965722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:28:29:33:32:0.52459:14:19:13:15:13:19:13:16
chr12	52965761	.	C	T	1023.49	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0801335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.509;QD=59.3325;RBI=0.0827823;REFB=0;REVB=0.0207733;RO=0;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.62221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304484;OID=.;OPOS=52965761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:69:0:0:67:69:1:35:32:0:0:35:34:0:0
chr12	52965782	.	T	C	271.67	PASS	AF=0.469697;AO=30;DP=61;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0900735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.4011;QD=16.4646;RBI=0.0989717;REFB=-0.00610464;REVB=-0.0410141;RO=30;SAF=15;SAR=15;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.179704;STB=0.544623;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00518176;OID=.;OPOS=52965782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:66:30:35:30:31:0.469697:15:15:9:21:16:15:14:21
chr12	52966390	.	A	T	477.01	PASS	AF=0.474747;AO=47;DP=100;FAO=47;FDP=99;FR=.;FRO=52;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=33;FWDB=0.0122886;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.159;QD=19.273;RBI=0.0227191;REFB=-0.0104539;REVB=0.0191089;RO=52;SAF=28;SAR=19;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215605;STB=0.619788;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0192643;OID=.;OPOS=52966390;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:99:52:52:47:47:0.474747:19:28:19:33:19:28:19:33
chr12	52966428	.	G	C	328.77	PASS	AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=31;FWDB=-0.00333177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.33;QD=15.4716;RBI=0.00387882;REFB=-0.0125397;REVB=0.00198608;RO=49;SAF=20;SAR=16;SRF=18;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190327;STB=0.607177;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0202556;OID=.;OPOS=52966428;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:49:49:36:36:0.423529:16:20:18:31:16:20:18:31
chr12	52985293	.	A	G	436.92	PASS	AF=0.445455;AO=48;DP=110;FAO=49;FDP=110;FR=.;FRO=61;FSAF=39;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.00694821;FXX=0.0178555;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4754;QD=15.8881;RBI=0.0648796;REFB=-0.0286005;REVB=-0.0645064;RO=60;SAF=38;SAR=10;SRF=25;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.409029;STB=0.729628;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0423485;OID=.;OPOS=52985293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:60:61:48:49:0.445455:10:38:25:35:10:39:26:35
chr12	52986187	.	T	C	210.71	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0113341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.281;QD=19.1551;RBI=0.0225312;REFB=-0.00913282;REVB=0.0194729;RO=23;SAF=11;SAR=10;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00191448;STB=0.501084;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0112071;OID=.;OPOS=52986187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:10:11:12:11:10:11:12:11
chr12	52992812	.	T	C	604.87	PASS	AF=0.555556;AO=55;DP=99;FAO=55;FDP=99;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.00650177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8513;QD=24.4393;RBI=0.0310117;REFB=0.01244;REVB=0.0303224;RO=44;SAF=28;SAR=27;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00737045;STB=0.50404;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=-0.0095268;OID=.;OPOS=52992812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:44:44:55:55:0.555556:27:28:22:22:27:28:22:22
chr12	52994955	.	G	A	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0200202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=207.53;QD=14.0968;RBI=0.0352402;REFB=-0.00208462;REVB=0.0290011;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0435331;STB=0.525501;STBP=0.814;TYPE=snp;VARB=0.00195084;OID=.;OPOS=52994955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:5:6:7:7:5:6:7:7
chr12	53003082	.	C	T	192.41	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.00725904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.248;QD=16.034;RBI=0.0218342;REFB=-0.00621376;REVB=-0.0205922;RO=27;SAF=14;SAR=6;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120424;STB=0.583246;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.00724487;OID=.;OPOS=53003082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:28:20:20:0.416667:6:14:16:11:6:14:16:12
chr12	53008372	.	C	T	462.31	PASS	AF=0.578947;AO=44;DP=76;FAO=44;FDP=76;FR=.;FRO=32;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=0.0287288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.209;QD=24.3322;RBI=0.0440139;REFB=-0.0043926;REVB=-0.0333448;RO=32;SAF=30;SAR=14;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915312;STB=0.549978;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.00413948;OID=.;OPOS=53008372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:32:32:44:44:0.578947:14:30:25:7:14:30:25:7
chr12	53011955	.	G	A	459.21	PASS	AF=0.432203;AO=51;DP=119;FAO=51;FDP=118;FR=.;FRO=67;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=37;FWDB=-0.00344185;FXX=0.0166653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.698;QD=15.5666;RBI=0.0119202;REFB=-0.000485284;REVB=0.0114125;RO=64;SAF=32;SAR=19;SRF=28;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190964;STB=0.603326;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.000483331;OID=.;OPOS=53011955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:118:64:67:51:51:0.432203:19:32:28:36:19:32:30:37
chr12	53045626	.	T	C	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00571716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.084;QD=50.4102;RBI=0.00572711;REFB=0;REVB=0.000337435;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.28489e-05;OID=.;OPOS=53045626;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr12	53045642	.	A	G	36.62	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0426755;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.356;QD=7.32363;RBI=0.0429618;REFB=-0.0142945;REVB=-0.00495185;RO=14;SAF=1;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46896;STB=0.802499;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0192697;OID=.;OPOS=53045642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:5:1:8:6:5:1:8:6
chr12	53045645	.	A	G	36.15	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.056016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.47;QD=6.57303;RBI=0.0569233;REFB=-0.000480807;REVB=0.0101225;RO=14;SAF=1;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.46896;STB=0.832223;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.000712456;OID=.;OPOS=53045645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:14:16:6:6:0.272727:5:1:8:6:5:1:10:6
chr12	53069014	.	T	C	329.99	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0508571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8406;QD=18.3327;RBI=0.0619324;REFB=-0.00700507;REVB=-0.0353436;RO=35;SAF=17;SAR=18;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500397;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.0103581;OID=.;OPOS=53069014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:35:37:35:35:0.486111:18:17:17:18:18:17:18:19
chr12	53070121	.	T	G	1059.46	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00676391;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.1184;QD=59.6881;RBI=0.0705808;REFB=0;REVB=-0.0702559;RO=0;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000531581;OID=.;OPOS=53070121;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:30:41:0:0:30:41:0:0
chr12	53070145	.	G	A	330.58	PASS	AF=0.492958;AO=35;DP=71;FAO=35;FDP=71;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.027343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.8956;QD=18.624;RBI=0.0366059;REFB=-0.0189159;REVB=0.0243382;RO=35;SAF=13;SAR=22;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206574;STB=0.621901;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0262602;OID=.;OPOS=53070145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:35:36:35:35:0.492958:22:13:21:14:22:13:22:14
chr12	53085089	.	T	C	189.78	PASS	AF=1;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.12;QD=47.4455;RBI=0.0545714;REFB=0;REVB=0.0398992;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000568894;OID=.;OPOS=53085089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:15:16:1:10:5:0:0:11:5:0:0
chr12	53086645	.	G	A	245.3	PASS	AF=0.391892;AO=29;DP=73;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0348797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.143;QD=13.2593;RBI=0.0420989;REFB=-0.0074032;REVB=0.0235738;RO=43;SAF=12;SAR=17;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0791611;STB=0.559695;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0123467;OID=.;OPOS=53086645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:43:45:29:29:0.391892:17:12:21:22:17:12:23:22
chr12	53088484	.	C	T	425.34	PASS	AF=0.505882;AO=41;DP=84;FAO=43;FDP=85;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.00289605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0497;QD=20.0158;RBI=0.0390453;REFB=-0.0229678;REVB=-0.0389378;RO=41;SAF=20;SAR=21;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0877487;STB=0.541396;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0249021;OID=.;OPOS=53088484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:41:42:41:43:0.505882:21:20:24:17:21:22:25:17
chr12	53090190	.	C	T	135.58	PASS	AF=0.326923;AO=17;DP=52;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0278788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.436;QD=10.4288;RBI=0.0581445;REFB=-0.0117517;REVB=-0.051025;RO=35;SAF=6;SAR=11;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217686;STB=0.629137;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0240223;OID=.;OPOS=53090190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:35:35:17:17:0.326923:11:6:19:16:11:6:19:16
chr12	53091566	.	C	A	523.26	PASS	AF=0.556818;AO=49;DP=88;FAO=49;FDP=88;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.0154123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.883;QD=23.7847;RBI=0.0269125;REFB=-0.0203883;REVB=-0.0220623;RO=39;SAF=30;SAR=19;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693514;STB=0.537988;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0174073;OID=.;OPOS=53091566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:39:39:49:49:0.556818:19:30:27:12:19:30:27:12
chr12	53096913	.	G	A	239.26	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.936;QD=50.3708;RBI=0.0166553;REFB=0;REVB=0.0166553;RO=0;SAF=0;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.74023e-05;OID=.;OPOS=53096913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:19:0:0:0:19:0:0:0
chr12	53162773	.	A	G	783.6	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0790006;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.906;QD=56.989;RBI=0.079131;REFB=0;REVB=0.00454195;RO=0;SAF=39;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160908;OID=.;OPOS=53162773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:15:39:0:0:16:39:0:0
chr12	53164848	.	G	A	874.35	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399144;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.324;QD=57.3343;RBI=0.0473285;REFB=0;REVB=-0.0254327;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00129098;OID=.;OPOS=53164848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:59:61:1:30:29:0:0:30:31:0:0
chr12	53165940	.	C	T	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8366;QD=62.9793;RBI=0.0462157;REFB=0;REVB=0.0200069;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000456369;OID=.;OPOS=53165940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0
chr12	53186088	.	G	C	247.34	PASS	AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=-0.00835679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.338;QD=13.7411;RBI=0.0217641;REFB=-0.00340156;REVB=-0.0200957;RO=42;SAF=21;SAR=8;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716868;STB=0.535937;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00564373;OID=.;OPOS=53186088;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:42:43:29:29:0.402778:8:21:28:14:8:21:29:14
chr12	53186122	.	G	A	741.94	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0527755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.841;QD=52.9959;RBI=0.0531208;REFB=-0.0726942;REVB=0.00604746;RO=2;SAF=40;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229835;STB=0.512191;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.000753137;OID=.;OPOS=53186122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:56:2:2:54:54:0.964286:14:40:2:0:14:40:2:0
chr12	53204614	.	C	T	525.11	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.921;QD=55.2748;RBI=0.105545;REFB=0;REVB=0.0182092;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104936;OID=.;OPOS=53204614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:38:0:0:34:38:1:17:17:0:0:19:19:0:0
chr12	53217701	.	C	A	186.66	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=35;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0208494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.407;QD=19.6479;RBI=0.0208542;REFB=-0.00899373;REVB=-0.00044822;RO=19;SAF=4;SAR=12;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0514284;STB=0.53502;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.00790835;OID=.;OPOS=53217701;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:38:19:19:16:19:0.5:12:4:4:15:14:5:4:15
chr12	53242440	.	A	G	350.89	PASS	AF=0.583333;AO=33;DP=59;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0530338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4302;QD=23.3925;RBI=0.0560613;REFB=-0.0571345;REVB=-0.0181736;RO=23;SAF=18;SAR=15;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0148867;STB=0.521727;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0447876;OID=.;OPOS=53242440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:23:25:33:35:0.583333:15:18:13:10:15:20:13:12
chr12	53242543	.	AC	A	36.69	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.253936;FXX=0.062461;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.8972;QD=9.783;RBI=0.259135;REFB=-0.0311872;REVB=0.051651;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0.362069;SSSB=0.260141;STB=0.599733;STBP=0.581;TYPE=del;VARB=0.0772112;OID=.;OPOS=53242544;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.466667:7:16:7:15:8:3:4:2:6:36:7:3:4:1:6
chr12	53294381	.	T	C	160.26	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.421;QD=45.7894;RBI=0.0660848;REFB=0;REVB=-0.0207638;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470975;OID=.;OPOS=53294381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:10:4:0:0:10:4:0:0
chr12	53343461	.	A	AC,C	611.74	PASS	AF=1,0;AO=42,2;DP=50;FAO=48,0;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29,0;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192889,-0.0152183;FXX=0.039992;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=19.0198,257.093;QD=50.9784;RBI=0.0257252,0.0164037;REFB=0,0;REVB=-0.0170214,0.00612228;RO=6;SAF=23,2;SAR=19,0;SRF=4;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0281331,0.562437;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00151797,0;OID=.,.;OPOS=53343462,53343461;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:50:48:6:0:42,2:48,0:1,0:19,0:23,2:4:2:19,0:29,0:0:0
chr12	53418991	.	A	G	34.29	PASS	AF=0.181818;AO=6;DP=33;FAO=6;FDP=33;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0321019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8961;QD=4.15609;RBI=0.0349511;REFB=-0.00190664;REVB=-0.013822;RO=27;SAF=4;SAR=2;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340884;STB=0.730055;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00398674;OID=.;OPOS=53418991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:33:33:27:27:6:6:0.181818:2:4:10:17:2:4:10:17
chr12	53433089	.	C	A	1135.08	PASS	AF=0.9625;AO=77;DP=80;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0148869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0306;QD=56.754;RBI=0.0561951;REFB=-0.0914041;REVB=0.0541874;RO=3;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333746;STB=0.517642;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.001696;OID=.;OPOS=53433089;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:80:80:3:3:77:77:0.9625:41:36:0:3:41:36:0:3
chr12	53433486	.	C	T	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00891712;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.878;QD=58.1421;RBI=0.0209136;REFB=0;REVB=0.0189172;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.94675e-05;OID=.;OPOS=53433486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0
chr12	53451849	.	G	C	226.45	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0102202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.584;QD=17.0909;RBI=0.0247584;REFB=-0.0325787;REVB=-0.0225506;RO=26;SAF=14;SAR=11;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197545;STB=0.50613;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0348631;OID=.;OPOS=53451849;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:28:25:25:0.471698:11:14:14:12:11:14:16:12
chr12	53451884	.	A	AG	52.86	PASS	AF=0.181818;AO=9;DP=53;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=-0.0177634;FXX=0.017854;HRUN=0;LEN=1;MLLD=149.851;QD=3.84453;RBI=0.0448506;REFB=-0.00159835;REVB=-0.041183;RO=41;SAF=7;SAR=2;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.414243;STB=0.781374;STBP=0.07;TYPE=ins;VARB=0.12978;OID=.;OPOS=53451885;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.181818:9:53:10:55:45:8:2:21:24:52:41:7:2:18:23
chr12	53452263	.	CCAGGTGGCAGG	C	156.46	PASS	AF=0.423729;AO=24;DP=55;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=23;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.00876384;FXX=0.063482;HRUN=2;LEN=11;MLLD=305.767;QD=10.6077;RBI=0.0194696;REFB=-0.0158741;REVB=-0.0173856;RO=21;SAF=23;SAR=1;SRF=17;SRR=4;SSEN=0.511335;SSEP=0;SSSB=0.416104;STB=0.79646;STBP=0.004;TYPE=del;VARB=0.0275742;OID=.;OPOS=53452264;OREF=CAGGTGGCAGG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.423729:24:55:25:59:34:23:2:21:13:99:21:23:1:17:4
chr12	53453413	.	C	CG	113.02	PASS	AF=0.225225;AO=57;DP=248;FAO=50;FDP=222;FR=.;FRO=172;FSAF=44;FSAR=6;FSRF=86;FSRR=86;FWDB=-0.0213258;FXX=0.0220255;HRUN=0;LEN=1;MLLD=130.215;QD=2.03636;RBI=0.0453445;REFB=-0.00278951;REVB=-0.0400167;RO=188;SAF=47;SAR=10;SRF=106;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386557;STB=0.838292;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.160859;OID=.;OPOS=53453414;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.225225:57:248:50:222:172:44:6:86:86:99:188:47:10:106:82
chr12	53453456	.	C	T	913.26	PASS	AF=0.497268;AO=90;DP=184;FAO=91;FDP=183;FR=.;FRO=92;FSAF=44;FSAR=47;FSRF=55;FSRR=37;FWDB=-0.00683876;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.297;QD=19.962;RBI=0.00715138;REFB=-0.0245038;REVB=0.00209128;RO=88;SAF=44;SAR=46;SRF=52;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916932;STB=0.5573;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0265218;OID=.;OPOS=53453456;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:183:88:92:90:91:0.497268:46:44:52:36:47:44:55:37
chr12	53456619	.	C	T	114.04	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00387611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1982;QD=18.247;RBI=0.0591234;REFB=0.0570649;REVB=-0.0589962;RO=11;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00564475;STB=0.521706;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=-0.0234941;OID=.;OPOS=53456619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:11:12:13:13:0.52:6:7:6:5:6:7:7:5
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chr12	53458391	.	G	A	460.52	PASS	AF=0.46729;AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.0020109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.563;QD=17.2157;RBI=0.00257373;REFB=-0.00661619;REVB=-0.00160635;RO=57;SAF=27;SAR=23;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547114;STB=0.530423;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.00810328;OID=.;OPOS=53458391;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:57:57:50:50:0.46729:23:27:34:23:23:27:34:23
chr12	53458589	.	C	T	65.03	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0049809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.011;QD=10.4041;RBI=0.0276633;REFB=-0.0102505;REVB=0.0272112;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103585;STB=0.529345;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0138658;OID=.;OPOS=53458589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:25:25:14:16:9:9:0.36:3:6:8:6:3:6:10:6
chr12	53459101	.	G	A	434.23	PASS	AF=0.460784;AO=47;DP=102;FAO=47;FDP=102;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.0185967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.618;QD=17.0286;RBI=0.0277059;REFB=-0.0252669;REVB=0.0205373;RO=55;SAF=21;SAR=26;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00755516;STB=0.504214;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0246948;OID=.;OPOS=53459101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:55:55:47:47:0.460784:26:21:25:30:26:21:25:30
chr12	53509339	.	GC	TT	386.49	PASS	AF=0.526316;AO=33;DP=69;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.0253554;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=216.918;QD=20.3413;RBI=0.0326999;REFB=-0.0249049;REVB=0.0206492;RO=36;SAF=17;SAR=16;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19559;STB=0.561768;STBP=0.307;TYPE=mnp;VARB=0.0227151;OID=.;OPOS=53509339;OREF=GC;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:76:36:36:33:40:0.526316:16:17:26:10:16:24:26:10
chr12	53509933	.	C	T	359.3	PASS	AF=0.387387;AO=42;DP=109;FAO=43;FDP=111;FR=.;FRO=68;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=-0.00235151;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.276;QD=12.9477;RBI=0.00424497;REFB=-0.0125915;REVB=-0.00353415;RO=67;SAF=22;SAR=20;SRF=27;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130212;STB=0.561009;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0217744;OID=.;OPOS=53509933;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:111:67:68:42:43:0.387387:20:22:27:40:21:22:28:40
chr12	53551724	.	A	G	537.33	PASS	AF=0.51;AO=48;DP=97;FAO=51;FDP=100;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.00738868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.019;QD=21.4932;RBI=0.00782481;REFB=-0.0111619;REVB=0.00257584;RO=49;SAF=25;SAR=23;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00893024;STB=0.509087;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00795675;OID=.;OPOS=53551724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:100:49:49:48:51:0.51:23:25:26:23:23:28:26:23
chr12	53586633	.	G	A	223.77	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0700437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7898;QD=19.4583;RBI=0.0715286;REFB=-0.0208086;REVB=0.014499;RO=24;SAF=8;SAR=14;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130141;STB=0.573702;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.02705;OID=.;OPOS=53586633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:14:8:12:12:14:8:12:12
chr12	53604768	.	A	G	81.24	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0237737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.273;QD=18.0526;RBI=0.0250662;REFB=-0.0284471;REVB=0.00794525;RO=7;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153826;STB=0.6109;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.00878037;OID=.;OPOS=53604768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:7:8:10:10:0.555556:5:5:5:2:5:5:6:2
chr12	53647373	.	T	C	157.11	PASS	AF=0.323077;AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=65;FR=.;FRO=44;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.00610793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.645;QD=9.66853;RBI=0.061159;REFB=-0.00246013;REVB=-0.0608533;RO=44;SAF=12;SAR=9;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229401;STB=0.513501;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.00502109;OID=.;OPOS=53647373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:44:44:21:21:0.323077:9:12:26:18:9:12:26:18
chr12	53662624	.	C	A	757.24	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.03539;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.764;QD=55.0717;RBI=0.0409363;REFB=-0.0939198;REVB=-0.020575;RO=0;SAF=24;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000320102;OID=.;OPOS=53662624;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:55:0:1:54:54:0.981818:30:24:0:0:30:24:0:1
chr12	53670545	.	C	A	272.64	PASS	AF=0.315789;AO=36;DP=109;FAO=36;FDP=114;FR=.;FRO=78;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=-0.0204157;FXX=0.0172399;HRUN=4;LEN=1;MLLD=71.4702;QD=9.56623;RBI=0.0402064;REFB=-0.00979467;REVB=-0.0346374;RO=73;SAF=25;SAR=11;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242565;STB=0.647781;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0280153;OID=.;OPOS=53670545;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:114:73:78:36:36:0.315789:11:25:36:37:11:25:38:40
chr12	53671005	.	G	A	226.34	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0132682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4586;QD=17.0825;RBI=0.015799;REFB=-0.00777795;REVB=0.00857692;RO=28;SAF=15;SAR=10;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161077;STB=0.590836;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00378162;OID=.;OPOS=53671005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:10:15:12:16:10:15:12:16
chr12	53681883	.	A	T	476.82	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511769;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.857;QD=57.7968;RBI=0.0513485;REFB=0;REVB=-0.00419481;RO=1;SAF=10;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444006;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204346;OID=.;OPOS=53681883;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:1:0:32:33:1:22:10:1:0:22:11:0:0
chr12	53682326	.	G	A	848.89	PASS	AF=0.585185;AO=77;DP=134;FAO=79;FDP=135;FR=.;FRO=56;FSAF=53;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=0.0853886;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.0407;QD=25.1523;RBI=0.0886728;REFB=-0.0108771;REVB=0.0239092;RO=54;SAF=52;SAR=25;SRF=36;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0074579;STB=0.521233;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0061616;OID=.;OPOS=53682326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:135:54:56:77:79:0.585185:25:52:36:18:26:53:35:21
chr12	53682457	.	G	A	263.7	PASS	AF=0.326531;AO=32;DP=98;FAO=32;FDP=98;FR=.;FRO=66;FSAF=28;FSAR=4;FSRF=46;FSRR=20;FWDB=0.00421247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.661;QD=10.7633;RBI=0.0164748;REFB=-0.00184863;REVB=0.0159271;RO=66;SAF=28;SAR=4;SRF=46;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.324456;STB=0.694069;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00660996;OID=.;OPOS=53682457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:66:66:32:32:0.326531:4:28:46:20:4:28:46:20
chr12	53682986	.	C	T	344.98	PASS	AF=0.445783;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.069696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.01;QD=16.6257;RBI=0.0697546;REFB=-0.0393844;REVB=-0.00285896;RO=46;SAF=10;SAR=27;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268857;STB=0.651902;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0286241;OID=.;OPOS=53682986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:46:46:37:37:0.445783:27:10:24:22:27:10:24:22
chr12	53686703	.	G	A	790.25	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.936;QD=56.4468;RBI=0.113563;REFB=0;REVB=0.112456;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00192018;OID=.;OPOS=53686703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:55:56:1:28:27:0:0:29:27:0:0
chr12	53693532	.	AA	GC	198.76	PASS	AF=1;AO=15;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102261;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=192.091;QD=46.7658;RBI=0.0133189;REFB=0;REVB=0.00853353;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00125957;OID=.;OPOS=53693532;OREF=AA;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:15:17:1:7:8:0:0:9:8:0:0
chr12	53700848	.	C	T	2064.88	PASS	AF=0.992537;AO=132;DP=132;FAO=133;FDP=134;FR=.;FRO=1;FSAF=78;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00874852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0326;QD=61.6381;RBI=0.0432317;REFB=-0.0498056;REVB=0.0423373;RO=0;SAF=78;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504504;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.00111106;OID=.;OPOS=53700848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:132:134:0:1:132:133:0.992537:54:78:0:0:55:78:0:1
chr12	53700860	.	A	G	2123.99	PASS	AF=1;AO=135;DP=136;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.186;QD=62.4703;RBI=0.0709125;REFB=0;REVB=0.0690691;RO=1;SAF=80;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00856437;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.51166e-05;OID=.;OPOS=53700860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:136:136:1:0:135:136:1:55:80:0:1:56:80:0:0
chr12	53703021	.	G	A	1284.84	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1267;QD=61.1828;RBI=0.0463138;REFB=0;REVB=0.0436593;RO=1;SAF=32;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00919718;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000677942;OID=.;OPOS=53703021;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:1:0:83:84:1:51:32:0:1:52:32:0:0
chr12	53709191	.	C	A	60.27	PASS	AF=0.225;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=40;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.014893;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.079;QD=6.02684;RBI=0.01564;REFB=-0.00576535;REVB=0.00477586;RO=31;SAF=4;SAR=5;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153513;STB=0.597497;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0284241;OID=.;OPOS=53709191;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:40:31:31:9:9:0.225:5:4:10:21:5:4:10:21
chr12	53722098	.	A	G	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.658;QD=60.6098;RBI=0.0502707;REFB=0;REVB=-0.0432299;RO=0;SAF=8;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.26572e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.91044e-05;OID=.;OPOS=53722098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:30:8:0:0:30:8:0:0
chr12	53722128	.	G	A	431.12	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.15125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.602;QD=55.6285;RBI=0.240265;REFB=0;REVB=0.186683;RO=0;SAF=5;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00777309;OID=.;OPOS=53722128;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:25:5:0:0:26:5:0:0
chr12	53777171	.	A	G	224.62	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0434907;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.875;QD=17.6173;RBI=0.0454397;REFB=-0.0140776;REVB=0.0131654;RO=27;SAF=19;SAR=5;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368389;STB=0.710089;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0214442;OID=.;OPOS=53777171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:5:19:12:15:5:19:12:15
chr12	53807907	.	CAG	C	132.46	PASS	AF=0.36;AO=15;DP=52;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=-0.0185141;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=2;MLLD=256.643;QD=10.5966;RBI=0.0203756;REFB=-0.00765569;REVB=-0.00850852;RO=33;SAF=5;SAR=10;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755652;STB=0.545405;STBP=0.639;TYPE=del;VARB=0.0145272;OID=.;OPOS=53807908;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.36:15:52:18:50:32:8:10:12:20:99:33:5:10:13:20
chr12	54067544	.	A	G	137.61	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.015646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.627;QD=39.3179;RBI=0.0279644;REFB=0.096444;REVB=-0.0231778;RO=1;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0695995;STB=0.538402;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=-0.00564174;OID=.;OPOS=54067544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:14:1:1:13:13:0.928571:7:6:1:0:7:6:1:0
chr12	54109733	.	A	G	3008.51	PASS	AF=1;AO=189;DP=191;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187297;FXX=0.0104707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8676;QD=63.6722;RBI=0.0367786;REFB=0;REVB=-0.0316522;RO=0;SAF=94;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8184e-05;OID=.;OPOS=54109733;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:191:189:0:0:189:189:1:95:94:0:0:95:94:0:0
chr12	54340077	.	G	A	1172.01	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000149836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.548;QD=60.8836;RBI=0.0059299;REFB=0;REVB=-0.005928;RO=0;SAF=42;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.26966e-06;OID=.;OPOS=54340077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:35:42:0:0:35:42:0:0
chr12	54367061	.	T	G	1030.25	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.583;QD=58.8716;RBI=0.0374631;REFB=0;REVB=0.0239209;RO=0;SAF=48;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305898;OID=.;OPOS=54367061;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:21:48:0:0:21:49:0:0
chr12	54369667	.	T	TGCCCCACTACTTTAGGGG,TTAGGGG	157.61	PASS	AF=0.928571,0;AO=8,3;DP=22;FAO=13,0;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=0,0;FSAR=13,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00302849,0.02619;FXX=0.391134;HRUN=1,2;LEN=18,6;MLLD=381.11,108.996;QD=45.0306;RBI=0.0325998,0.0314199;REFB=-0.0318519,-0.026508;REVB=0.0324588,0.0173578;RO=2;SAF=0,3;SAR=8,0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.74993;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.00238294,0.0291828;OID=.,.;OPOS=54369668,54369668;OREF=-,-;OALT=GCCCCACTACTTTAGGGG,TAGGGG;OMAPALT=TGCCCCACTACTTTAGGGG,TTAGGGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.928571,0:8,3:22:13,0:14:1:0,0:13,0:0:1:9:2:0,3:8,0:0:2
chr12	54385599	.	C	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0688632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.649;QD=57.1773;RBI=0.0707252;REFB=0;REVB=0.0161217;RO=0;SAF=12;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100275;OID=.;OPOS=54385599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:39:12:0:0:39:12:0:0
chr12	54394211	.	A	AC,C	68.79	PASS	AF=0.292683,0;AO=6,2;DP=44;FAO=12,0;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=3,0;FSAR=9,0;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0334699,-0.0214953;FXX=0.0465008;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=16.5129,91.1236;QD=6.71078;RBI=0.143561,0.0679389;REFB=-0.0310829,-0.00733257;REVB=-0.139605,-0.0644488;RO=36;SAF=1,1;SAR=5,1;SRF=12;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.252641,0.14808;STB=0.581945,0.5;STBP=0.555,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00995532,0;OID=.,.;OPOS=54394212,54394211;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:44:41:36:29:6,2:12,0:0.292683,0:5,1:1,1:12:24:9,0:3,0:10:19
chr12	54496166	.	G	T	130.64	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.015329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3233;QD=13.7514;RBI=0.041235;REFB=0.00270955;REVB=-0.0382798;RO=23;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333056;STB=0.519409;STBP=0.824;TYPE=snp;VARB=-0.00608838;OID=.;OPOS=54496166;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:8:7:10:13:8:7:10:13
chr12	54496219	.	A	G	112.25	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.011116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.215;QD=16.6298;RBI=0.0141054;REFB=-0.00738442;REVB=0.00868308;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0262873;STB=0.515128;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.00838803;OID=.;OPOS=54496219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:8:5:5:9:8:5:5:9
chr12	54799450	.	A	G	338.88	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310661;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.456;QD=52.1346;RBI=0.0310709;REFB=0;REVB=0.000546824;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00242228;OID=.;OPOS=54799450;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:23:26:1:13:10:0:0:14:12:0:0
chr12	54905815	.	C	G	933.59	PASS	AF=0.970149;AO=64;DP=68;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.137275;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.134;QD=55.7369;RBI=0.139096;REFB=-0.14843;REVB=0.0224322;RO=2;SAF=36;SAR=28;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00363026;STB=0.502105;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00136533;OID=.;OPOS=54905815;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:68:67:2:2:64:65:0.970149:28:36:1:1:28:37:1:1
chr12	54911426	.	C	T	388.44	PASS	AF=0.534247;AO=38;DP=72;FAO=39;FDP=73;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=-0.0182927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.7577;QD=21.2843;RBI=0.0211408;REFB=-0.00329228;REVB=0.0105977;RO=34;SAF=20;SAR=18;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147269;STB=0.574192;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00109842;OID=.;OPOS=54911426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:34:34:38:39:0.534247:18:20:12:22:19:20:12:22
chr12	54970454	.	T	C	421.62	PASS	AF=0.379845;AO=49;DP=129;FAO=49;FDP=129;FR=.;FRO=80;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=48;FWDB=-0.021007;FXX=0.015266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.853;QD=13.0734;RBI=0.0572308;REFB=-0.0327797;REVB=-0.053236;RO=80;SAF=26;SAR=23;SRF=32;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14197;STB=0.580471;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0770495;OID=.;OPOS=54970454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:80:80:49:49:0.379845:23:26:32:48:23:26:32:48
chr12	54971059	.	GCCCCCCCA	GCCCCCCAC	42.38	PASS	AF=0.0754717;AO=11;DP=112;FAO=8;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=93;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=57;FSRR=36;FWDB=-0.0128701;FXX=0.0701693;HRUN=7;LEN=2;MLLD=97.2768;QD=1.59919;RBI=0.0161491;REFB=-0.00559123;REVB=-0.00975467;RO=67;SAF=8;SAR=3;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176234;STB=0.643683;STBP=0.401;TYPE=mnp;VARB=0.0378271;OID=.;OPOS=54971066;OREF=CA;OALT=AC;OMAPALT=GCCCCCCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.0754717:11:112:8:106:93:6:2:57:36:26:67:8:3:40:27
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chr12	54973623	.	T	C	754.41	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00434376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.992;QD=56.9362;RBI=0.0268;REFB=0;REVB=-0.0264456;RO=0;SAF=25;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.13715e-05;OID=.;OPOS=54973623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:28:25:0:0:28:25:0:0
chr12	54974667	.	C	G	779.81	PASS	AF=0.428571;AO=87;DP=202;FAO=87;FDP=203;FR=.;FRO=116;FSAF=48;FSAR=39;FSRF=70;FSRR=46;FWDB=0.00263664;FXX=0.00490172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.457;QD=15.3657;RBI=0.0331012;REFB=-0.00907596;REVB=0.032996;RO=106;SAF=48;SAR=39;SRF=65;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619976;STB=0.530055;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0174062;OID=.;OPOS=54974667;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:202:203:106:116:87:87:0.428571:39:48:65:41:39:48:70:46
chr12	54975837	.	T	C	1799.15	PASS	AF=0.97561;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=123;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=87;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.10703;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.0661;QD=58.509;RBI=0.1076;REFB=-0.1934;REVB=-0.0110601;RO=1;SAF=33;SAR=87;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141746;STB=0.521735;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00558798;OID=.;OPOS=54975837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:122:123:1:3:120:120:0.97561:87:33:1:0:87:33:3:0
chr12	55038555	.	GAAAAAAA	GAAAAAAG,GAAAAAA	79.78	PASS	AF=0.039604,0.277228;AO=6,31;DP=108;FAO=4,28;FDP=101;FR=.;FRO=69;FSAF=0,4;FSAR=4,24;FSRF=8;FSRR=61;FWDB=-0.0160221,0.08023;FXX=0.0648088;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=137.39,7.96267;QD=3.15949;RBI=0.0303053,0.0915853;REFB=-0.0130656,-0.154215;REVB=-0.0257236,-0.0441702;RO=49;SAF=0,3;SAR=6,28;SRF=3;SRR=46;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.490184,0.122913;STB=0.995573,0.541373;STBP=0.295,0.736;TYPE=snp,del;VARB=0.188209,0.126733;OID=.,.;OPOS=55038562,55038556;OREF=A,A;OALT=G,-;OMAPALT=GAAAAAAG,GAAAAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.039604,0.277228:6,31:108:4,28:101:69:0,4:4,24:8:61:65:49:0,3:6,28:3:46
chr12	55248357	.	G	T	395.76	PASS	AF=0.40708;AO=46;DP=111;FAO=46;FDP=113;FR=.;FRO=67;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=-0.101836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.827;QD=14.0093;RBI=0.101881;REFB=-0.021474;REVB=-0.00301582;RO=65;SAF=28;SAR=18;SRF=40;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00730819;STB=0.511359;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.026677;OID=.;OPOS=55248357;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:113:65:67:46:46:0.40708:18:28:40:25:18:28:42:25
chr12	55250612	.	A	G	1025.73	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203398;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.704;QD=58.6132;RBI=0.0310392;REFB=0;REVB=0.0234462;RO=1;SAF=36;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129508;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000250918;OID=.;OPOS=55250612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:70:1:0:69:70:1:33:36:1:0:33:37:0:0
chr12	55344024	.	G	A	1463.85	PASS	AF=1;AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122341;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5253;QD=63.6457;RBI=0.0899743;REFB=0;REVB=0.0891386;RO=0;SAF=58;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000534241;OID=.;OPOS=55344024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:92:0:0:92:92:1:34:58:0:0:34:58:0:0
chr12	55344133	.	C	G	1992.35	PASS	AF=0.992308;AO=129;DP=130;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00829643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.945;QD=61.3031;RBI=0.0351179;REFB=-0.0515243;REVB=0.0341238;RO=1;SAF=60;SAR=69;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00683802;STB=0.503597;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000924774;OID=.;OPOS=55344133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:130:130:1:1:129:129:0.992308:69:60:0:1:69:60:0:1
chr12	55355033	.	C	T	1712.59	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.254;QD=60.6226;RBI=0.0345504;REFB=0;REVB=-0.029375;RO=0;SAF=46;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000254398;OID=.;OPOS=55355033;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:67:46:0:0:67:46:0:0
chr12	55368245	.	G	A	3315.55	PASS	AF=0.973214;AO=218;DP=225;FAO=218;FDP=224;FR=.;FRO=6;FSAF=125;FSAR=93;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0464075;FXX=0.00444425;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.588;QD=59.2063;RBI=0.0472647;REFB=-0.157566;REVB=0.00896051;RO=2;SAF=125;SAR=93;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00129907;STB=0.50713;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.000585242;OID=.;OPOS=55368245;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:225:224:2:6:218:218:0.973214:93:125:1:1:93:125:5:1
chr12	55421114	.	T	C	237.23	PASS	AF=0.647059;AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0539609;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.8059;QD=27.9092;RBI=0.106556;REFB=-0.00875103;REVB=-0.0918823;RO=12;SAF=10;SAR=12;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244462;STB=0.513501;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.000939486;OID=.;OPOS=55421114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:34:34:12:12:22:22:0.647059:12:10:5:7:12:10:5:7
chr12	55421250	.	C	T	161.47	PASS	AF=0.30137;AO=22;DP=73;FAO=22;FDP=73;FR=.;FRO=51;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=34;FWDB=-0.048632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.184;QD=8.84771;RBI=0.0531026;REFB=-0.0135383;REVB=-0.0213264;RO=51;SAF=11;SAR=11;SRF=17;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197804;STB=0.616338;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0455418;OID=.;OPOS=55421250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:51:51:22:22:0.30137:11:11:17:34:11:11:17:34
chr12	55421299	.	C	A	173.29	PASS	AF=0.315068;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=73;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=33;FWDB=-0.0303445;FXX=0.0135117;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4445;QD=9.49511;RBI=0.0360139;REFB=0.0107334;REVB=-0.0193962;RO=51;SAF=11;SAR=12;SRF=18;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148472;STB=0.595588;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-0.0239706;OID=.;OPOS=55421299;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:51:50:23:23:0.315068:12:11:18:33:12:11:17:33
chr12	55688267	.	G	A	256.75	PASS	AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0185402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.187;QD=19.7501;RBI=0.0200223;REFB=-0.00666971;REVB=-0.00755998;RO=24;SAF=10;SAR=17;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413356;STB=0.51514;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0084209;OID=.;OPOS=55688267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:25:27:27:0.519231:17:10:10:14:17:10:10:15
chr12	55714772	.	G	A	224.92	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.029218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.525;QD=19.9932;RBI=0.0323061;REFB=-0.026883;REVB=-0.0137836;RO=23;SAF=7;SAR=15;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194578;STB=0.610175;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.027615;OID=.;OPOS=55714772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:15:7:12:11:15:7:12:11
chr12	55714876	.	C	G	215.24	PASS	AF=0.382353;AO=26;DP=68;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.00308163;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6642;QD=12.6614;RBI=0.0141482;REFB=-0.00859657;REVB=-0.0138085;RO=41;SAF=19;SAR=7;SRF=15;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391368;STB=0.730592;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0121228;OID=.;OPOS=55714876;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:41:42:26:26:0.382353:7:19:15:26:7:19:15:27
chr12	55715119	.	G	A	138.98	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0108872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.454;QD=12.0848;RBI=0.0127023;REFB=-0.0102281;REVB=-0.00654363;RO=30;SAF=7;SAR=9;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325676;STB=0.519207;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0225802;OID=.;OPOS=55715119;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:9:7:14:16:9:7:14:16
chr12	55725746	.	A	T	363.17	PASS	AF=0.475;AO=38;DP=80;FAO=38;FDP=80;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.00305645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.128;QD=18.1585;RBI=0.0405292;REFB=-0.00405902;REVB=0.0404137;RO=42;SAF=24;SAR=14;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149758;STB=0.583739;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0038015;OID=.;OPOS=55725746;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:42:42:38:38:0.475:14:24:20:22:14:24:20:22
chr12	55794609	.	ATTTTTTTT	ATTTTTTT,ATTTTTTTA	64.4	PASS	AF=0.338235,0.0441176;AO=23,5;DP=68;FAO=23,3;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=8,2;FSAR=15,1;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.17071,-0.117809;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,1;MLLD=6.85448,23.3074;QD=3.78849;RBI=0.213241,0.123578;REFB=-0.102458,-0.0679972;REVB=0.127788,0.0373187;RO=31;SAF=10,4;SAR=13,1;SRF=10;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.11731,0.515815;STB=0.539533,0.730964;STBP=0.642,0.507;TYPE=del,snp;VARB=0.0483358,0.0984023;OID=.,.;OPOS=55794610,55794617;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=ATTTTTTT,ATTTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.338235,0.0441176:23,5:68:23,3:68:42:8,2:15,1:17:25:58:31:10,4:13,1:10:21
chr12	55794976	.	A	G	428.49	PASS	AF=0.538462;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.00491196;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=216.944;QD=21.9739;RBI=0.0217334;REFB=-0.00910562;REVB=0.0211711;RO=35;SAF=16;SAR=26;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15935;STB=0.594516;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00566621;OID=.;OPOS=55794976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:35:36:42:42:0.538462:26:16:20:15:26:16:21:15
chr12	55805864	.	T	A	435.11	PASS	AF=0.429825;AO=49;DP=114;FAO=49;FDP=114;FR=.;FRO=65;FSAF=19;FSAR=30;FSRF=22;FSRR=43;FWDB=-0.00412018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.073;QD=15.2671;RBI=0.00536597;REFB=-0.0194446;REVB=-0.0034377;RO=62;SAF=19;SAR=30;SRF=21;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0523029;STB=0.529984;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0234195;OID=.;OPOS=55805864;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:62:65:49:49:0.429825:30:19:21:41:30:19:22:43
chr12	55806238	.	A	G	468.71	PASS	AF=0.535714;AO=44;DP=83;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0255605;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.538;QD=22.3194;RBI=0.0261126;REFB=-0.0376294;REVB=-0.00534148;RO=39;SAF=18;SAR=26;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175239;STB=0.589312;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0274083;OID=.;OPOS=55806238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:39:39:44:45:0.535714:26:18:24:15:26:19:24:15
chr12	55806437	.	T	C	397.77	PASS	AF=0.350365;AO=48;DP=137;FAO=48;FDP=137;FR=.;FRO=89;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=53;FWDB=0.0166398;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.462;QD=11.6138;RBI=0.0320928;REFB=-0.00575813;REVB=0.027442;RO=89;SAF=25;SAR=23;SRF=36;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131493;STB=0.575204;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.00918633;OID=.;OPOS=55806437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:89:89:48:48:0.350365:23:25:36:53:23:25:36:53
chr12	55806558	.	A	G	163.66	PASS	AF=0.261364;AO=23;DP=89;FAO=23;FDP=88;FR=.;FRO=65;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=33;FSRR=32;FWDB=-0.0244085;FXX=0.0112347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.7358;QD=7.43922;RBI=0.0319078;REFB=-0.0197751;REVB=0.0205507;RO=64;SAF=12;SAR=11;SRF=32;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265074;STB=0.510377;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0479266;OID=.;OPOS=55806558;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:88:64:65:23:23:0.261364:11:12:32:32:11:12:33:32
chr12	55806629	.	G	C	260.08	PASS	AF=0.360465;AO=31;DP=87;FAO=31;FDP=86;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.0427289;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.437;QD=12.0965;RBI=0.0456741;REFB=0.00595551;REVB=0.0161358;RO=55;SAF=19;SAR=12;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359842;STB=0.520738;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=-0.0208829;OID=.;OPOS=55806629;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:55:55:31:31:0.360465:12:19:32:23:12:19:32:23
chr12	55807293	.	A	G	78.85	PASS	AF=0.818182;AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=11;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.033085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.534;QD=28.6726;RBI=0.149747;REFB=-0.0361785;REVB=0.146047;RO=2;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290717;STB=0.666261;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00591016;OID=.;OPOS=55807293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:11:11:2:2:9:9:0.818182:7:2:2:0:7:2:2:0
chr12	55807493	.	C	T	267.07	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0177427;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.133;QD=20.1561;RBI=0.0197764;REFB=-0.0278711;REVB=0.00873507;RO=25;SAF=16;SAR=12;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144755;STB=0.580588;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0243254;OID=.;OPOS=55807493;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:12:16:10:15:12:16:10:15
chr12	55808469	.	C	G	1491.26	PASS	AF=0.989583;AO=93;DP=94;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0471284;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8683;QD=62.136;RBI=0.0665233;REFB=0.0976199;REVB=-0.0469496;RO=0;SAF=45;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505049;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.00330555;OID=.;OPOS=55808469;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:96:0:1:93:95:0.989583:48:45:0:0:49:46:0:1
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chr12	55863381	.	A	G	392.19	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0159969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.475;QD=50.6058;RBI=0.0789772;REFB=-0.161816;REVB=0.0773402;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.531229;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0153159;OID=.;OPOS=55863381;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:0:2:29:29:0.935484:14:15:0:0:14:15:2:0
chr12	55863537	.	C	T	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0234357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.903;QD=8.25462;RBI=0.0448546;REFB=-0.0131475;REVB=0.0382453;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0414228;OID=.;OPOS=55863537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:2:4:8:4:2:4:8:4
chr12	55886294	.	G	A	255.0	PASS	AF=0.55814;AO=23;DP=44;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0417086;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.247;QD=23.721;RBI=0.10175;REFB=-0.00144237;REVB=-0.0928083;RO=18;SAF=19;SAR=4;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287865;STB=0.659189;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.000273538;OID=.;OPOS=55886294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:18:19:23:24:0.55814:4:19:10:8:4:20:11:8
chr12	55886379	.	C	T	257.03	PASS	AF=0.521739;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=46;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0304007;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.349;QD=22.3504;RBI=0.0428065;REFB=0.00491701;REVB=-0.0301363;RO=23;SAF=15;SAR=9;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168371;STB=0.583263;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=-0.0050619;OID=.;OPOS=55886379;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:23:22:24:24:0.521739:9:15:10:13:9:15:10:12
chr12	55886489	.	T	A	237.07	PASS	AF=0.41791;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.0783221;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=35.1448;QD=14.1535;RBI=0.0784664;REFB=-0.0374531;REVB=-0.00475602;RO=37;SAF=17;SAR=11;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149576;STB=0.585514;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0539033;OID=.;OPOS=55886489;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:67:37:39:28:28:0.41791:11:17:17:20:11:17:18:21
chr12	55945119	.	A	G	837.23	PASS	AF=1;AO=51;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.522;QD=57.74;RBI=0.0507925;REFB=0;REVB=0.0246325;RO=0;SAF=20;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13361e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000158171;OID=.;OPOS=55945119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:51:58:1:31:20:0:0:30:28:0:0
chr12	55945258	.	T	C	47.14	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.858;QD=13.4675;RBI=0.0284796;REFB=-0.0315433;REVB=-0.0284796;RO=7;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.016012;OID=.;OPOS=55945258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:14:14:7:7:7:7:0.5:7:0:0:7:7:0:0:7
chr12	55945856	.	A	G	259.14	PASS	AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=2;FWDB=0.0114299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4004;QD=24.1062;RBI=0.0476019;REFB=-0.0277465;REVB=0.0462093;RO=19;SAF=13;SAR=11;SRF=17;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293347;STB=0.661205;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00918724;OID=.;OPOS=55945856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:11:13:17:2:11:13:17:2
chr12	56030938	.	C	T	332.35	PASS	AF=0.381443;AO=37;DP=98;FAO=37;FDP=97;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0387872;FXX=0.010203;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.904;QD=13.7051;RBI=0.0390641;REFB=-0.00997024;REVB=-0.00464338;RO=60;SAF=15;SAR=22;SRF=28;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677989;STB=0.528286;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0131721;OID=.;OPOS=56030938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:60:60:37:37:0.381443:22:15:28:32:22:15:27:33
chr12	56031273	.	G	A	286.49	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00344042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7556;QD=24.3817;RBI=0.0512053;REFB=-0.00243474;REVB=-0.0510895;RO=21;SAF=8;SAR=18;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238953;STB=0.513298;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.00205934;OID=.;OPOS=56031273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:21:26:26:0.553191:18:8:7:14:18:8:7:14
chr12	56031611	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0908;QD=44.6894;RBI=0.0194094;REFB=0;REVB=0.0146728;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.9625e-05;OID=.;OPOS=56031611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0
chr12	56089357	.	C	T	1451.89	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0751134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.26;QD=63.1255;RBI=0.0774531;REFB=0;REVB=0.0188937;RO=0;SAF=43;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108198;OID=.;OPOS=56089357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:49:43:0:0:49:43:0:0
chr12	56115585	.	C	T	289.27	PASS	AF=0.577778;AO=25;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0433274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.377;QD=25.7129;RBI=0.0446359;REFB=-0.0269885;REVB=-0.0107286;RO=17;SAF=5;SAR=20;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155182;STB=0.547907;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.0449457;OID=.;OPOS=56115585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:17:19:25:26:0.577778:20:5:6:11:20:6:6:13
chr12	56236531	.	A	G	1741.72	PASS	AF=0.991453;AO=112;DP=112;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=103;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0562495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9361;QD=59.5461;RBI=0.0692905;REFB=-0.125037;REVB=0.0404619;RO=0;SAF=99;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502415;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.00210045;OID=.;OPOS=56236531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:112:117:0:1:112:116:0.991453:13:99:0:0:13:103:1:0
chr12	56295734	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00924349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.857;QD=43.486;RBI=0.046162;REFB=0;REVB=0.0452271;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000614171;OID=.;OPOS=56295734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:10:1:0:0:11:1:0:0
chr12	56330572	.	G	A	1443.31	PASS	AF=0.989247;AO=91;DP=94;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0365837;FXX=0.0210504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.791;QD=62.0778;RBI=0.0794554;REFB=-0.136445;REVB=0.0705322;RO=0;SAF=26;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.08947e-08;STB=0.503759;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00108087;OID=.;OPOS=56330572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:94:93:0:1:91:92:0.989247:65:26:0:0:66:26:0:1
chr12	56335107	.	A	G	435.78	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0100909;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.84;QD=54.4722;RBI=0.0196259;REFB=-0.0518348;REVB=0.016833;RO=1;SAF=14;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321576;STB=0.51723;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00185529;OID=.;OPOS=56335107;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:17:14:1:0:17:14:1:0
chr12	56348028	.	G	A	715.69	PASS	AF=0.959184;AO=46;DP=48;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0164848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.233;QD=58.4239;RBI=0.0243918;REFB=-0.169824;REVB=-0.0179781;RO=2;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347981;STB=0.51785;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00194483;OID=.;OPOS=56348028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:48:49:2:2:46:47:0.959184:26:20:0:2:27:20:0:2
chr12	56351346	.	G	A	341.19	PASS	AF=0.468354;AO=35;DP=77;FAO=37;FDP=79;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=10;FWDB=-0.00446506;FXX=0.0124984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=160.104;QD=17.2756;RBI=0.0243135;REFB=-0.00560271;REVB=-0.0239;RO=41;SAF=24;SAR=11;SRF=31;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815481;STB=0.538831;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.00461968;OID=.;OPOS=56351346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:79:41:42:35:37:0.468354:11:24:31:10:11:26:32:10
chr12	56374695	.	G	A	1236.41	PASS	AF=0.540909;AO=119;DP=221;FAO=119;FDP=220;FR=.;FRO=101;FSAF=69;FSAR=50;FSRF=60;FSRR=41;FWDB=-0.010112;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2277;QD=22.4802;RBI=0.0179853;REFB=-0.0173391;REVB=0.0148734;RO=99;SAF=69;SAR=50;SRF=60;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225201;STB=0.506716;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0112314;OID=.;OPOS=56374695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:221:220:99:101:119:119:0.540909:50:69:60:39:50:69:60:41
chr12	56398454	.	G	C,T	886.31	PASS	AF=0.444444,0.555556;AO=28,35;DP=63;FAO=28,35;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=16,21;FSAR=12,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0344905,0.00261745;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=27.5344,211.126;QD=56.2739;RBI=0.0838557,0.0148476;REFB=0,0;REVB=-0.0764342,-0.0146151;RO=0;SAF=16,21;SAR=12,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.27896e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00326207,0.0240388;OID=.,.;OPOS=56398454,56398454;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:63:63:0:0:28,35:28,35:0.444444,0.555556:12,14:16,21:0:0:12,14:16,21:0:0
chr12	56431864	.	AT	A	108.79	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=-0.0528854;FXX=0.0153822;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.2467;QD=6.79954;RBI=0.054574;REFB=-0.124105;REVB=-0.0134702;RO=30;SAF=16;SAR=15;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151978;STB=0.530819;STBP=0.642;TYPE=del;VARB=0.141806;OID=.;OPOS=56431865;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.484375:31:65:31:64:33:16:15:19:14:99:30:16:15:16:14
chr12	56435929	.	C	G	47.19	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0592918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3213;QD=11.1041;RBI=0.0618297;REFB=-0.000528577;REVB=-0.0175328;RO=9;SAF=6;SAR=1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.371799;STB=0.765078;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00439577;OID=.;OPOS=56435929;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:9:10:7:7:0.411765:1:6:5:4:1:6:5:5
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chr12	56647911	.	G	C	727.19	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0360163;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7734;QD=57.0345;RBI=0.053927;REFB=0;REVB=0.0401366;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524873;OID=.;OPOS=56647911;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0
chr12	56649601	.	A	G	2691.99	PASS	AF=1;AO=165;DP=165;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0790433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.468;QD=62.2425;RBI=0.0871028;REFB=0;REVB=0.036593;RO=0;SAF=77;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11597e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.63753e-05;OID=.;OPOS=56649601;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:165:173:0:0:165:173:1:88:77:0:0:90:83:0:0
chr12	56663299	.	GCC	GC,TAG	778.4	PASS	AF=0.804124,0.195876;AO=42,15;DP=98;FAO=78,19;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=68,0;FSAR=10,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.32785,0.0483694;FXX=0.010203;HRUN=3,1;LEN=1,3;MLLD=9.89171,118.291;QD=32.0989;RBI=0.343422,0.060887;REFB=-0.00318019,0.00898456;REVB=-0.102239,0.0369815;RO=25;SAF=41,0;SAR=1,15;SRF=24;SRR=1;SSEN=0.551402,0;SSEP=0.483906,0;SSSB=0.104976,-0.877861;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.0462317,0.10758;OID=.,.;OPOS=56663300,56663299;OREF=C,GCC;OALT=-,TAG;OMAPALT=GC,TAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:98:97:25:0:42,15:78,19:0.804124,0.195876:1,15:41,0:24:1:10,19:68,0:0:0
chr12	56722060	.	T	G	709.3	PASS	AF=0.962963;AO=51;DP=53;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.061226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2413;QD=52.5407;RBI=0.0796154;REFB=-0.0734048;REVB=0.0508919;RO=2;SAF=26;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000696368;STB=0.500713;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.00298919;OID=.;OPOS=56722060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:54:2:2:51:52:0.962963:25:26:1:1:25:27:1:1
chr12	56815922	.	C	T	1375.63	PASS	AF=0.967742;AO=90;DP=93;FAO=90;FDP=93;FR=.;FRO=3;FSAF=54;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0221081;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.515;QD=59.1668;RBI=0.0224065;REFB=0.0113395;REVB=-0.00364433;RO=3;SAF=54;SAR=36;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378667;STB=0.519996;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=-0.000466284;OID=.;OPOS=56815922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:93:93:3:3:90:90:0.967742:36:54:0:3:36:54:0:3
chr12	56822378	.	T	A	357.33	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0305035;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4973;QD=54.9735;RBI=0.133151;REFB=0;REVB=0.129609;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0019461;OID=.;OPOS=56822378;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:14:11:0:0:15:11:0:0
chr12	56825311	.	C	T	596.97	PASS	AF=0.97619;AO=40;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0254989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.355;QD=56.8547;RBI=0.0333511;REFB=-0.222506;REVB=-0.0214966;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.511106;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00448668;OID=.;OPOS=56825311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:42:42:0:1:40:41:0.97619:19:21:0:0:19:22:1:0
chr12	56827618	.	C	T	124.3	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.00285598;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.581;QD=16.0381;RBI=0.0161246;REFB=-0.0248723;REVB=-0.0158697;RO=16;SAF=6;SAR=8;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112138;STB=0.576818;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0374251;OID=.;OPOS=56827618;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:31:16:17:14:14:0.451613:8:6:5:11:8:6:5:12
chr12	56862886	.	T	C	466.94	PASS	AF=0.942857;AO=33;DP=36;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0380869;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8072;QD=53.3644;RBI=0.0395316;REFB=0.0638738;REVB=0.0105892;RO=2;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0582943;STB=0.531231;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.00182864;OID=.;OPOS=56862886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:35:2:2:33:33:0.942857:15:18:0:2:15:18:0:2
chr12	56956213	.	T	C	834.31	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00719164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.7627;QD=57.5387;RBI=0.0209644;REFB=0;REVB=0.0196923;RO=0;SAF=41;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163143;OID=.;OPOS=56956213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:17:41:0:0:17:41:0:0
chr12	56989729	.	GTTTTTTTTA	GTTTTTTA,GTTTTTTTA,GTTTTTTTAT	187.75	PASS	AF=0.0810811,0.891892,0.027027;AO=10,19,2;DP=36;FAO=3,33,1;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=2,22,1;FSAR=1,11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0963912,-0.187282,-0.176076;FXX=0;HRUN=8,8,8;LEN=2,1,2;MLLD=9.73185,7.40444,18.2333;QD=20.297;RBI=0.101523,0.197598,0.177052;REFB=-0.0220771,-0.0318126,-0.0273034;REVB=0.0318705,0.0630128,0.018556;RO=5;SAF=6,14,2;SAR=4,5,0;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.11821,0.151063,0.64233;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,mnp;VARB=0.0295899,-0.0173741,0.116744;OID=.,.,.;OPOS=56989730,56989730,56989737;OREF=TT,T,TA;OALT=-,-,AT;OMAPALT=GTTTTTTA,GTTTTTTTA,GTTTTTTTAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0810811,0.891892,0.027027:10,19,2:36:3,33,1:37:0:2,22,1:1,11,0:0:0:9:5:6,14,2:4,5,0:2:3
chr12	57039080	.	C	T	280.43	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.0522906;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.279;QD=19.012;RBI=0.0524666;REFB=-0.0190304;REVB=0.00429393;RO=27;SAF=11;SAR=19;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194805;STB=0.625342;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0181082;OID=.;OPOS=57039080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:27:29:30:30:0.508475:19:11:16:11:19:11:18:11
chr12	57106660	.	A	T	676.74	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0303353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3934;QD=60.1544;RBI=0.0510865;REFB=0.0469978;REVB=-0.0411048;RO=1;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240823;STB=0.512815;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-0.0057817;OID=.;OPOS=57106660;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:19:25:0:1:19:25:0:1
chr12	57108202	.	CA	CG,TG	1111.1	PASS	AF=0.946667,0.0533333;AO=71,4;DP=75;FAO=71,4;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=31,0;FSAR=40,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0428085,0.00197532;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,2;MLLD=78.2394,20.3557;QD=59.2586;RBI=0.0432452,0.0405809;REFB=0,0;REVB=-0.00612997,-0.0405328;RO=0;SAF=31,0;SAR=40,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.18246e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0010616,-0.008572;OID=.,.;OPOS=57108203,57108202;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:75:75:0:0:71,4:71,4:0.946667,0.0533333:40,4:31,0:0:0:40,4:31,0:0:0
chr12	57109792	.	A	G	375.64	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.455;QD=55.6502;RBI=0.0583235;REFB=0;REVB=0.00106929;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00028829;OID=.;OPOS=57109792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:18:9:0:0:18:9:0:0
chr12	57109931	.	A	T	101.85	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.891;QD=40.7389;RBI=0.0655138;REFB=0;REVB=0.064228;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000730712;OID=.;OPOS=57109931;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr12	57113567	.	G	T	405.54	PASS	AF=0.446809;AO=42;DP=94;FAO=42;FDP=94;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=20;FWDB=0.0509536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8203;QD=17.2572;RBI=0.0526018;REFB=0.0109495;REVB=-0.0130644;RO=52;SAF=26;SAR=16;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00382803;STB=0.502145;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=-0.0130451;OID=.;OPOS=57113567;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:52:52:42:42:0.446809:16:26:32:20:16:26:32:20
chr12	57114100	.	A	G	330.44	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00692803;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=169.475;QD=50.8367;RBI=0.0138544;REFB=0.0280451;REVB=-0.0119977;RO=1;SAF=4;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215948;STB=0.511619;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=-0.000278333;OID=.;OPOS=57114100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:21:4:0:1:21:4:0:1
chr12	57114307	.	A	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.094;QD=51.1845;RBI=0.0274436;REFB=0;REVB=0.0243384;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000334649;OID=.;OPOS=57114307;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr12	57133140	.	T	G	411.1	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00171374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3544;QD=56.7033;RBI=0.0614859;REFB=0;REVB=-0.061462;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00117;OID=.;OPOS=57133140;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr12	57137828	.	T	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.378;QD=60.2307;RBI=0.0381411;REFB=0;REVB=0.0308258;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.1904e-05;OID=.;OPOS=57137828;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0
chr12	57255195	.	T	C	289.9	PASS	AF=0.471429;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00933452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.5919;QD=16.5658;RBI=0.0555349;REFB=-0.0492618;REVB=0.0547448;RO=37;SAF=11;SAR=22;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202605;STB=0.613791;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0595281;OID=.;OPOS=57255195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:37:37:33:33:0.471429:22:11:20:17:22:11:20:17
chr12	57346751	.	AC	A	162.55	PASS	AF=0.5;AO=32;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.0817247;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.2555;QD=9.56171;RBI=0.0863323;REFB=0.0496629;REVB=-0.0278269;RO=30;SAF=17;SAR=15;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0.560669;SSSB=0.0561464;STB=0.558789;STBP=0.354;TYPE=del;VARB=-0.0272;OID=.;OPOS=57346752;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:32:68:34:68:34:19:15:15:19:99:30:17:15:14:16
chr12	57396805	.	A	AC	66.21	PASS	AF=0.186441;AO=27;DP=120;FAO=22;FDP=118;FR=.;FRO=96;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=69;FSRR=27;FWDB=-0.00457174;FXX=0.00840265;HRUN=0;LEN=1;MLLD=87.2373;QD=2.2443;RBI=0.0101102;REFB=-0.00456025;REVB=-0.00901747;RO=92;SAF=5;SAR=22;SRF=68;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.629111;STB=0.937586;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.0868093;OID=.;OPOS=57396806;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.186441:27:120:22:118:96:2:20:69:27:66:92:5:22:68:24
chr12	57430827	.	T	TC	70.57	PASS	AF=0.25974;AO=13;DP=84;FAO=20;FDP=77;FR=.;FRO=57;FSAF=2;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.00443057;FXX=0.0253133;HRUN=0;LEN=1;MLLD=28.6991;QD=3.66622;RBI=0.109424;REFB=0.00179569;REVB=-0.109334;RO=61;SAF=1;SAR=12;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.612021;STB=0.870558;STBP=0.001;TYPE=ins;VARB=-0.0829518;OID=.;OPOS=57430828;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.25974:13:84:20:77:57:2:18:31:26:70:61:1:12:33:28
chr12	57489648	.	C	T	625.3	PASS	AF=0.625;AO=54;DP=87;FAO=55;FDP=88;FR=.;FRO=33;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=0.00759243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9988;QD=28.4229;RBI=0.0726391;REFB=-0.0178885;REVB=-0.0722412;RO=33;SAF=34;SAR=20;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0834329;STB=0.547808;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0171201;OID=.;OPOS=57489648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:33:33:54:55:0.625:20:34:17:16:20:35:17:16
chr12	57548466	.	C	T	925.51	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00636986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.022;QD=56.9543;RBI=0.0157582;REFB=-0.163926;REVB=0.0144134;RO=1;SAF=24;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192711;STB=0.510201;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=7.42286e-05;OID=.;OPOS=57548466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:40:24:1:0:40:24:1:0
chr12	57567762	.	C	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.090283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.353;QD=51.1836;RBI=0.103656;REFB=0;REVB=0.0509262;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000937634;OID=.;OPOS=57567762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr12	57588433	.	G	A	2814.56	PASS	AF=0.983696;AO=181;DP=186;FAO=181;FDP=184;FR=.;FRO=3;FSAF=98;FSAR=83;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0049004;FXX=0.0160419;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.248;QD=61.1862;RBI=0.0218861;REFB=-0.165627;REVB=0.0213304;RO=1;SAF=98;SAR=83;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00483349;STB=0.503414;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.000336632;OID=.;OPOS=57588433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:186:184:1:3:181:181:0.983696:83:98:1:0:83:98:1:2
chr12	57589659	.	C	T	962.26	PASS	AF=0.985915;AO=66;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.132971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.983;QD=54.2118;RBI=0.138037;REFB=-0.181075;REVB=0.0370515;RO=3;SAF=29;SAR=37;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00884326;STB=0.506492;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0020681;OID=.;OPOS=57589659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:3:1:66:70:0.985915:37:29:1:2:38:32:0:1
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chr12	57590797	.	C	T	2303.95	PASS	AF=1;AO=151;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321048;FXX=0.00657851;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.802;QD=61.0318;RBI=0.0659159;REFB=0;REVB=0.0575689;RO=0;SAF=83;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95808e-05;OID=.;OPOS=57590797;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:151:151:0:0:151:151:1:68:83:0:0:68:83:0:0
chr12	57590869	.	T	C	2923.04	PASS	AF=1;AO=183;DP=183;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=332.885;QD=62.861;RBI=0.0220495;REFB=0;REVB=0.00521578;RO=0;SAF=98;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.07612e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.04728e-05;OID=.;OPOS=57590869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:183:186:0:0:183:186:1:85:98:0:0:86:100:0:0
chr12	57619362	.	G	A	989.82	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.267;QD=58.2249;RBI=0.038414;REFB=0;REVB=0.0166385;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204027;OID=.;OPOS=57619362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:66:68:1:33:33:0:0:35:33:0:0
chr12	57627074	.	G	T	703.01	PASS	AF=0.978723;AO=47;DP=48;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0754063;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.678;QD=59.8307;RBI=0.0795575;REFB=-0.0827366;REVB=0.025363;RO=1;SAF=22;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208969;STB=0.511623;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000737973;OID=.;OPOS=57627074;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:47:1:1:47:46:0.978723:25:22:1:0:25:21:1:0
chr12	57627081	.	GGC	G	111.09	PASS	AF=0.529412;AO=12;DP=35;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=16;FWDB=-0.140401;FXX=0;HRUN=6;LEN=2;MLLD=22.0111;QD=13.0696;RBI=0.241859;REFB=-0.064317;REVB=0.196935;RO=20;SAF=8;SAR=4;SRF=2;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0.509804;SSSB=0.551157;STB=0.78545;STBP=0.002;TYPE=del;VARB=0.0657664;OID=.;OPOS=57627082;OREF=GC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.529412:12:35:18:34:16:12:6:0:16:94:20:8:4:2:18
chr12	57869396	.	A	AG	35.31	PASS	AF=0.290323;AO=7;DP=32;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.0474218;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=64.3245;QD=4.55638;RBI=0.0492131;REFB=-0.0111646;REVB=-0.0131567;RO=21;SAF=7;SAR=0;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.799438;STB=0.926063;STBP=0.022;TYPE=ins;VARB=0.138583;OID=.;OPOS=57869397;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.290323:7:32:9:31:22:8:1:4:18:35:21:7:0:5:16
chr12	57873042	.	T	C	1347.3	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.718;QD=61.9446;RBI=0.021468;REFB=0;REVB=0.0164374;RO=0;SAF=39;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.68189e-05;OID=.;OPOS=57873042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:48:39:0:0:48:39:0:0
chr12	57911160	.	G	A	1188.69	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1722;QD=60.9585;RBI=0.0534845;REFB=0;REVB=0.0406699;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000245482;OID=.;OPOS=57911160;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:78:0:0:75:78:1:31:44:0:0:33:45:0:0
chr12	57927805	.	TG	CT,T	80.4	PASS	AF=0,0.330275;AO=7,30;DP=113;FAO=0,36;FDP=109;FR=.;FRO=73;FSAF=0,22;FSAR=0,14;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=-0.0175442,-0.0344892;FXX=0.0353951;HRUN=1,7;LEN=2,1;MLLD=18.9099,8.14565;QD=2.95046;RBI=0.0369098,0.0651552;REFB=-0.0516255,-0.118161;REVB=-0.0324736,-0.0552784;RO=54;SAF=3,18;SAR=4,12;SRF=27;SRR=27;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0838466,0.112865;STB=0.5,0.5801;STBP=1,0.254;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.11747;OID=.,.;OPOS=57927805,57927806;OREF=TG,G;OALT=CT,-;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:81:113:109:54:73:7,30:0,36:0,0.330275:4,12:3,18:27:27:0,14:0,22:36:37
chr12	57958313	.	A	G	1432.05	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.371;QD=62.9474;RBI=0.0370996;REFB=0;REVB=0.022307;RO=0;SAF=35;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24328e-05;OID=.;OPOS=57958313;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:88:91:0:0:88:91:1:53:35:0:0:56:35:0:0
chr12	57977003	.	C	T	220.49	PASS	AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.00558645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.243;QD=14.2252;RBI=0.0088436;REFB=0.00946629;REVB=-0.00685571;RO=36;SAF=11;SAR=15;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359531;STB=0.520445;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=-0.0156862;OID=.;OPOS=57977003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:36:36:26:26:0.419355:15:11:14:22:15:11:14:22
chr12	57977040	.	C	A	96.74	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0209738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.979;QD=12.4823;RBI=0.0214908;REFB=-0.00683913;REVB=-0.00468553;RO=19;SAF=4;SAR=8;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0979377;STB=0.55804;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.00970489;OID=.;OPOS=57977040;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:8:4:8:11:8:4:8:11
chr12	57994679	.	C	G	495.66	PASS	AF=0.473684;AO=52;DP=113;FAO=54;FDP=114;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=38;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=-0.0117472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.434;QD=17.3917;RBI=0.0124144;REFB=-0.018834;REVB=0.00401506;RO=58;SAF=15;SAR=37;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11747;STB=0.552553;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.0214301;OID=.;OPOS=57994679;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:58:60:52:54:0.473684:37:15:23:35:38:16:23:37
chr12	57994743	.	T	G	1608.18	PASS	AF=0.990826;AO=107;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=71;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0263025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4162;QD=59.0157;RBI=0.0546208;REFB=-0.0282333;REVB=-0.0478708;RO=0;SAF=36;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10022e-08;STB=0.506665;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.00325826;OID=.;OPOS=57994743;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:109:0:1:107:108:0.990826:71:36:0:0:71:37:1:0
chr12	57995089	.	T	C	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00528368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.893;QD=57.6807;RBI=0.0602527;REFB=0;REVB=0.0600206;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165425;OID=.;OPOS=57995089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr12	57995889	.	T	C	338.73	PASS	AF=0.41573;AO=37;DP=89;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.00958311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.996;QD=15.2238;RBI=0.0377812;REFB=-0.0143123;REVB=0.0365456;RO=52;SAF=19;SAR=18;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734828;STB=0.541518;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0209238;OID=.;OPOS=57995889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:52:52:37:37:0.41573:18:19:23:29:18:19:23:29
chr12	58009372	.	G	A	647.86	PASS	AF=0.464789;AO=65;DP=142;FAO=66;FDP=142;FR=.;FRO=76;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=0.0126042;FXX=0.0138879;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.317;QD=18.2497;RBI=0.0248196;REFB=-0.0162365;REVB=0.0213809;RO=74;SAF=43;SAR=22;SRF=41;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1103;STB=0.563469;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0174187;OID=.;OPOS=58009372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:74:76:65:66:0.464789:22:43:41:33:23:43:41:35
chr12	58010163	.	A	G	321.33	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=28;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.00766598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.232;QD=18.902;RBI=0.0214018;REFB=-0.0183601;REVB=-0.0199818;RO=34;SAF=28;SAR=6;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337315;STB=0.690456;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0203793;OID=.;OPOS=58010163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:6:28:18:16:6:28:18:16
chr12	58015494	.	G	A	281.64	PASS	AF=0.469697;AO=31;DP=66;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=6;FWDB=0.0530075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1253;QD=17.0688;RBI=0.0538035;REFB=-0.0143727;REVB=0.00922027;RO=34;SAF=20;SAR=11;SRF=28;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195351;STB=0.613132;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00943901;OID=.;OPOS=58015494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:34:35:31:31:0.469697:11:20:28:6:11:20:29:6
chr12	58019472	.	T	G	575.4	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0580603;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3146;QD=60.5686;RBI=0.0796165;REFB=0;REVB=-0.0544774;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00167759;OID=.;OPOS=58019472;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:27:11:0:0:27:11:0:0
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chr12	58025813	.	G	C	62.15	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0136622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.167;QD=19.1245;RBI=0.0438841;REFB=-0.0279948;REVB=-0.0417032;RO=4;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220925;STB=0.646763;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0280189;OID=.;OPOS=58025813;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:13:13:4:5:8:8:0.615385:6:2:0:4:6:2:0:5
chr12	58025980	.	C	T	91.65	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.00281358;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.3482;QD=18.3293;RBI=0.0603665;REFB=-0.0432075;REVB=-0.0603008;RO=9;SAF=10;SAR=1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.451608;STB=0.768608;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0328034;OID=.;OPOS=58025980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:1:10:5:4:1:10:5:4
chr12	58026001	.	G	A	83.31	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0225782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.597;QD=9.52163;RBI=0.0794139;REFB=-0.0177993;REVB=-0.0761367;RO=22;SAF=8;SAR=3;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11734;STB=0.61155;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0344633;OID=.;OPOS=58026001;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:35:22:24:11:11:0.314286:3:8:14:8:3:8:14:10
chr12	58026021	.	A	G	307.16	PASS	AF=0.6;AO=25;DP=45;FAO=27;FDP=45;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0402;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.449;QD=27.303;RBI=0.0402886;REFB=-0.0495158;REVB=0.00267069;RO=19;SAF=15;SAR=10;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0693373;STB=0.540511;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0282318;OID=.;OPOS=58026021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:19:18:25:27:0.6:10:15:13:6:10:17:13:5
chr12	58112189	.	A	G	195.89	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0162445;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=281.767;QD=25.2766;RBI=0.0249645;REFB=-0.00871701;REVB=-0.0189563;RO=12;SAF=7;SAR=12;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910107;STB=0.55051;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00345932;OID=.;OPOS=58112189;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:12:7:3:9:12:7:3:9
chr12	58174306	.	T	C,G	818.5	PASS	AF=0.948276,0.0517241;AO=55,3;DP=58;FAO=55,3;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21,3;FSAR=34,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104854,-0.0135841;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=134.002,151.538;QD=56.4482;RBI=0.0200126,0.0350711;REFB=0,0;REVB=0.0170458,-0.0323335;RO=0;SAF=21,3;SAR=34,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00940406,0.0642856;OID=.,.;OPOS=58174306,58174306;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:58:58:0:0:55,3:55,3:0.948276,0.0517241:34,0:21,3:0:0:34,0:21,3:0:0
chr12	58176613	.	TT	CC,TC	735.64	PASS	AF=0.0212766,0.978723;AO=2,45;DP=47;FAO=1,46;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=0,27;FSAR=1,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189033,-0.0372139;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=9.65116,43.1057;QD=62.608;RBI=0.0420064,0.0837184;REFB=0,0;REVB=-0.0375127,-0.0749927;RO=0;SAF=1,26;SAR=1,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.15971e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.098577,0.00354755;OID=.,.;OPOS=58176613,58176614;OREF=TT,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:47:47:0:0:2,45:1,46:0.0212766,0.978723:1,19:1,26:0:0:1,19:0,27:0:0
chr12	58177437	.	C	T	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0708377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5711;QD=39.2036;RBI=0.0794524;REFB=0;REVB=-0.0359821;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00146744;OID=.;OPOS=58177437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr12	58204283	.	T	C	737.86	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0692548;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=110.443;QD=54.6561;RBI=0.0702542;REFB=0.147968;REVB=0.0118079;RO=1;SAF=34;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136578;STB=0.507244;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=-0.00129834;OID=.;OPOS=58204283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:19:34:1:0:19:34:1:0
chr12	58335515	.	GGC	G,GG	339.22	PASS	AF=0.944444,0;AO=17,9;DP=37;FAO=34,0;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=29,0;FSAR=5,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.262692,0.140996;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=25.3069,13.0437;QD=37.6909;RBI=0.269742,0.14294;REFB=-0.128426,-0.102344;REVB=-0.0612638,-0.0234946;RO=9;SAF=12,9;SAR=5,0;SRF=8;SRR=1;SSEN=0.594203,0;SSEP=0,0.509542;SSSB=-0.147337,0.752247;STB=0.537014,0.5;STBP=0.165,1;TYPE=del,del;VARB=0.0236939,0;OID=.,.;OPOS=58335516,58335517;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.944444,0:17,9:37:34,0:36:2:29,0:5,0:1:1:5:9:12,9:5,0:8:1
chr12	58335626	.	A	T	1661.98	PASS	AF=1;AO=107;DP=109;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.391;QD=59.8912;RBI=0.059899;REFB=0;REVB=0.0552485;RO=0;SAF=64;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96339e-05;OID=.;OPOS=58335626;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:111:0:0:107:111:1:43:64:0:0:45:66:0:0
chr12	58350631	.	C	T	1677.0	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0328629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.729;QD=60.4324;RBI=0.0376783;REFB=0;REVB=0.0184305;RO=0;SAF=63;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.46823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.63921e-05;OID=.;OPOS=58350631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:48:63:0:0:48:63:0:0
chr12	59197107	.	G	A	297.19	PASS	AF=0.577778;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0173809;FXX=0.062487;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2298;QD=26.4166;RBI=0.0249669;REFB=-0.00746812;REVB=-0.0179235;RO=19;SAF=14;SAR=12;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196649;STB=0.608313;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0108905;OID=.;OPOS=59197107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:45:19:19:26:26:0.577778:12:14:15:4:12:14:15:4
chr12	59313248	.	G	A	347.92	PASS	AF=0.521739;AO=34;DP=68;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0111976;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.442;QD=20.1695;RBI=0.025033;REFB=-0.00496817;REVB=-0.022389;RO=34;SAF=14;SAR=20;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13257;STB=0.54836;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0037227;OID=.;OPOS=59313248;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:34:33:34:36:0.521739:20:14:19:15:20:16:18:15
chr12	59313936	.	T	G	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.114179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.232;QD=18.7669;RBI=0.11431;REFB=-0.0525303;REVB=-0.00546346;RO=3;SAF=1;SAR=5;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146968;STB=0.58791;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0204692;OID=.;OPOS=59313936;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:5:1:1:2:5:1:1:2
chr12	60127590	.	A	T	205.17	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.00859043;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=220.853;QD=15.7821;RBI=0.00863473;REFB=-0.0216875;REVB=-0.000873509;RO=28;SAF=10;SAR=13;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288886;STB=0.507633;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0302505;OID=.;OPOS=60127590;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:28:29:23:23:0.442308:13:10:13:15:13:10:13:16
chr12	60161941	.	G	GA	80.27	PASS	AF=0.514286;AO=15;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0105897;FXX=0.0277701;HRUN=4;LEN=1;MLLD=12.0434;QD=9.1738;RBI=0.0839306;REFB=-0.0464092;REVB=0.0832599;RO=18;SAF=10;SAR=5;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312891;STB=0.597335;STBP=0.26;TYPE=ins;VARB=0.0436278;OID=.;OPOS=60161942;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.514286:15:35:18:35:17:11:7:7:10:78:18:10:5:6:12
chr12	60173356	.	A	T	200.84	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0971911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.872;QD=20.5993;RBI=0.0975612;REFB=-0.00381417;REVB=0.00848982;RO=19;SAF=6;SAR=14;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164463;STB=0.593123;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00398086;OID=.;OPOS=60173356;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:14:6:9:10:14:6:9:10
chr12	60735645	.	A	G	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.054;QD=58.4197;RBI=0.0495996;REFB=0;REVB=0.0450678;RO=0;SAF=35;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6959e-05;OID=.;OPOS=60735645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:28:35:0:0:28:35:0:0
chr12	62114671	.	T	C	189.75	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.0383685;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9646;QD=16.4996;RBI=0.073694;REFB=-0.0146041;REVB=0.0629179;RO=26;SAF=11;SAR=9;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0658443;STB=0.537574;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.021421;OID=.;OPOS=62114671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:26:26:20:20:0.434783:9:11:16:10:9:11:16:10
chr12	63359168	.	G	A	662.11	PASS	AF=0.53719;AO=65;DP=120;FAO=65;FDP=121;FR=.;FRO=56;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.00274305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.14;QD=21.8881;RBI=0.00755097;REFB=-0.00659673;REVB=-0.00703511;RO=55;SAF=38;SAR=27;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488794;STB=0.52311;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.00482673;OID=.;OPOS=63359168;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:55:56:65:65:0.53719:27:38:29:26:27:38:30:26
chr12	63359409	.	C	A	164.52	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0111613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.184;QD=21.2279;RBI=0.182558;REFB=-0.0463506;REVB=-0.182216;RO=9;SAF=7;SAR=10;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224669;STB=0.572433;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0355814;OID=.;OPOS=63359409;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:9:14:17:17:0.548387:10:7:7:2:10:7:8:6
chr12	63544209	.	A	G	1539.66	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363717;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.6707;QD=59.7926;RBI=0.0558338;REFB=0;REVB=0.0423616;RO=0;SAF=57;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.7624e-05;OID=.;OPOS=63544209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:46:57:0:0:46:57:0:0
chr12	64062023	.	A	C	165.78	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=27;FWDB=-0.0124119;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.7;QD=13.8148;RBI=0.0131197;REFB=-0.00303788;REVB=-0.00425097;RO=30;SAF=9;SAR=9;SRF=3;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.444804;STB=0.749791;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00560692;OID=.;OPOS=64062023;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:30:30:18:18:0.375:9:9:3:27:9:9:3:27
chr12	64062052	.	G	A	180.9	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=29;FWDB=0.00124633;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.147;QD=12.9218;RBI=0.0169462;REFB=-0.00167722;REVB=-0.0169003;RO=34;SAF=13;SAR=9;SRF=5;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450025;STB=0.75286;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00452481;OID=.;OPOS=64062052;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:34:22:22:0.392857:9:13:5:29:9:13:5:29
chr12	64062065	.	T	C	203.06	PASS	AF=0.378788;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=34;FWDB=0.0132988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.975;QD=12.3068;RBI=0.0220857;REFB=-0.00897027;REVB=-0.017633;RO=41;SAF=17;SAR=8;SRF=7;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.510661;STB=0.787885;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0103548;OID=.;OPOS=64062065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:41:41:25:25:0.378788:8:17:7:34:8:17:7:34
chr12	64062132	.	G	A	271.7	PASS	AF=0.413333;AO=31;DP=76;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=27;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.00769082;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.974;QD=14.4907;RBI=0.0302465;REFB=-0.00211332;REVB=-0.0292524;RO=44;SAF=27;SAR=4;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.467735;STB=0.771222;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00764335;OID=.;OPOS=64062132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:44:44:31:31:0.413333:4:27:23:21:4:27:23:21
chr12	64436728	.	G	A,GA	31.93	PASS	AF=0,0.322581;AO=2,7;DP=36;FAO=0,10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=0,8;FSAR=0,2;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.0228958,-0.138324;FXX=0;HRUN=1,4;LEN=1,1;MLLD=201.474,13.1399;QD=4.11961;RBI=0.0228991,0.145698;REFB=-0.00910847,-0.0964477;REVB=-0.000387583,-0.0457649;RO=26;SAF=2,6;SAR=0,1;SRF=4;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.694906,0.711789;STB=0.5,0.878529;STBP=1,0.02;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.127142;OID=.,.;OPOS=64436728,64436729;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:33:36:31:26:21:2,7:0,10:0,0.322581:0,1:2,6:4:22:0,2:0,8:3:18
chr12	64472803	.	A	T	1362.28	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115778;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0876;QD=62.6338;RBI=0.0181307;REFB=0;REVB=-0.0139527;RO=0;SAF=51;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.73428e-05;OID=.;OPOS=64472803;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:36:51:0:0:36:51:0:0
chr12	64519806	.	T	C	676.73	PASS	AF=0.545455;AO=66;DP=121;FAO=66;FDP=121;FR=.;FRO=55;FSAF=42;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=15;FWDB=0.00746078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.973;QD=22.3711;RBI=0.00792195;REFB=-0.00808373;REVB=0.00266348;RO=53;SAF=42;SAR=24;SRF=38;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0725996;STB=0.545744;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00629641;OID=.;OPOS=64519806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:53:55:66:66:0.545455:24:42:38:15:24:42:40:15
chr12	64587633	.	C	A	724.12	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00355969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.404;QD=56.794;RBI=0.00735772;REFB=0;REVB=-0.0064393;RO=0;SAF=34;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.01675e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166177;OID=.;OPOS=64587633;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:15:34:0:0:15:36:0:0
chr12	64609562	.	C	T	727.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.716;QD=63.2846;RBI=0.0293156;REFB=0;REVB=0.0185077;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108859;OID=.;OPOS=64609562;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr12	64669090	.	C	A	816.09	PASS	AF=0.417431;AO=91;DP=220;FAO=91;FDP=218;FR=.;FRO=127;FSAF=52;FSAR=39;FSRF=48;FSRR=79;FWDB=-0.0357948;FXX=0.0090905;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9258;QD=14.9741;RBI=0.106028;REFB=0.0200746;REVB=-0.0998029;RO=123;SAF=52;SAR=39;SRF=44;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217522;STB=0.611375;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.0323002;OID=.;OPOS=64669090;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:220:218:123:127:91:91:0.417431:39:52:44:79:39:52:48:79
chr12	64712511	.	A	G	902.65	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.014;QD=58.2353;RBI=0.0412561;REFB=0;REVB=0.00327798;RO=0;SAF=29;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.49978e-05;OID=.;OPOS=64712511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:33:29:0:0:33:29:0:0
chr12	64712546	.	A	AGTT	176.08	PASS	AF=0.396226;AO=20;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0131511;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=3;MLLD=217.928;QD=13.2892;RBI=0.0150451;REFB=-0.0252895;REVB=0.00730763;RO=32;SAF=14;SAR=6;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160047;STB=0.602307;STBP=0.24;TYPE=ins;VARB=0.029307;OID=.;OPOS=64712547;OREF=-;OALT=GTT;OMAPALT=AGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.396226:20:53:21:53:32:15:6:18:14:99:32:14:6:18:14
chr12	64749600	.	A	G	754.9	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0127568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.191;QD=54.9016;RBI=0.0408164;REFB=-0.11744;REVB=0.0387717;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5098;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00094739;OID=.;OPOS=64749600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:55:55:0:1:54:54:0.981818:25:29:0:0:25:29:0:1
chr12	64838922	.	G	T	169.74	PASS	AF=0.461538;AO=17;DP=37;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00846132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.403;QD=17.4093;RBI=0.00846876;REFB=-0.0163798;REVB=-0.000355028;RO=20;SAF=3;SAR=14;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.281295;STB=0.662444;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0157825;OID=.;OPOS=64838922;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:39:20:21:17:18:0.461538:14:3:8:12:15:3:8:13
chr12	64875787	.	T	A	258.5	PASS	AF=0.519231;AO=26;DP=51;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0146305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.3;QD=19.8845;RBI=0.0152854;REFB=-0.0376894;REVB=0.00442635;RO=24;SAF=11;SAR=15;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102403;STB=0.554872;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0356298;OID=.;OPOS=64875787;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:24:25:26:27:0.519231:15:11:13:11:16:11:13:12
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chr12	65146532	.	C	T	461.13	PASS	AF=0.46729;AO=50;DP=108;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.0583974;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3045;QD=17.2385;RBI=0.0621126;REFB=0.0090041;REVB=-0.0211596;RO=56;SAF=16;SAR=34;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164624;STB=0.588057;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.0133698;OID=.;OPOS=65146532;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:56:57:50:50:0.46729:34:16:27:29:34:16:27:30
chr12	65150485	.	C	T	226.95	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0408454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7724;QD=15.652;RBI=0.0563032;REFB=0.00634383;REVB=-0.0387518;RO=32;SAF=17;SAR=9;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0367531;STB=0.520756;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=-0.010961;OID=.;OPOS=65150485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:9:17:22:10:9:17:22:10
chr12	65218695	.	CGGGGGGA	CGGGGGA,CGGGGGGAG,CGGGGGGGA,GCGGGGGA,GGGGGGGA	66.59	PASS	AF=0,0.175676,0.0135135,0.027027,0;AO=9,13,12,3,3;DP=78;FAO=0,13,1,2,0;FDP=74;FR=.;FRO=58;FSAF=0,12,1,2,0;FSAR=0,1,0,0,0;FSRF=31;FSRR=27;FWDB=0.166677,-0.0568686,-0.152243,0.0114353,-0.0089581;FXX=0.0133316;HRUN=6,1,6,1,1;LEN=1,1,1,2,1;MLLD=9.84469,16.9474,6.99955,25.907,216.493;QD=3.59937;RBI=0.174087,0.056933,0.157313,0.105011,0.0319709;REFB=0.0232731,-0.0339166,-0.0306651,0.00660224,0.000171498;REVB=-0.0502482,-0.00270697,0.0396175,-0.104387,-0.0306903;RO=34;SAF=3,13,7,3,3;SAR=6,0,5,0,0;SRF=17;SRR=17;SSEN=0.9,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-0.205825,0.776441,0.099926,0.529115,0.529115;STB=0.5,0.885852,0.989373,0.994554,0.5;STBP=1,0.009,0.493,0.199,1;TYPE=del,ins,ins,mnp,snp;VARB=0.0084478,0.11367,0.101484,0.136212,0;OID=.,.,.,.,.;OPOS=65218696,65218703,65218696,65218695,65218695;OREF=G,-,-,CG,C;OALT=-,G,G,GC,G;OMAPALT=CGGGGGA,CGGGGGGAG,CGGGGGGGA,GCGGGGGA,GGGGGGGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:57:78:74:34:58:9,13,12,3,3:0,13,1,2,0:0,0.175676,0.0135135,0.027027,0:6,0,5,0,0:3,13,7,3,3:17:17:0,1,0,0,0:0,12,1,2,0:31:27
chr12	65332873	.	TG	T,TA	229.37	PASS	AF=0.263158,0.736842;AO=3,12;DP=18;FAO=5,14;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=1,5;FSAR=4,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014426,-0.0180241;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=109.276,110.972;QD=48.288;RBI=0.0145135,0.0254998;REFB=0,0;REVB=-0.00159149,-0.018038;RO=0;SAF=0,5;SAR=3,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.017588,0.024305;OID=.,.;OPOS=65332874,65332874;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=T,TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.263158,0.736842:3,12:18:5,14:19:0:1,5:4,9:0:0:12:0:0,5:3,7:0:0
chr12	65514266	.	T	C	723.96	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.137766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7948;QD=59.0988;RBI=0.16725;REFB=-0.136549;REVB=0.0948324;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.520824;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.00794953;OID=.;OPOS=65514266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:49:0:2:47:47:0.959184:23:24:0:0:23:24:0:2
chr12	65609836	.	AC	CT	40.88	PASS	AF=0.119048;AO=10;DP=84;FAO=10;FDP=84;FR=.;FRO=74;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=50;FSRR=24;FWDB=0.0261123;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=41.444;QD=1.94659;RBI=0.123814;REFB=-0.00724365;REVB=-0.121029;RO=73;SAF=1;SAR=9;SRF=49;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.626921;STB=0.932222;STBP=0.017;TYPE=mnp;VARB=0.0673946;OID=.;OPOS=65609836;OREF=AC;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:84:84:73:74:10:10:0.119048:9:1:49:24:9:1:50:24
chr12	65857555	.	T	A	888.98	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0366768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7901;QD=56.443;RBI=0.0421482;REFB=-0.116284;REVB=0.0207675;RO=1;SAF=45;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269575;STB=0.514281;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.000930952;OID=.;OPOS=65857555;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:17:45:0:1:17:45:0:1
chr12	66358347	.	C	T	426.92	PASS	AF=0.538462;AO=42;DP=78;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0335318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7235;QD=21.8932;RBI=0.0339499;REFB=0.0024147;REVB=0.00531205;RO=36;SAF=26;SAR=16;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102565;STB=0.556648;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.00259336;OID=.;OPOS=66358347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:36:36:42:42:0.538462:16:26:18:18:16:26:18:18
chr12	66359752	.	C	A	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00798133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.339;QD=57.3858;RBI=0.00844175;REFB=0;REVB=0.00274984;RO=0;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.17595e-05;OID=.;OPOS=66359752;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:19:38:0:0:19:38:0:0
chr12	66532493	.	A	G	186.85	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0225243;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.293;QD=19.6682;RBI=0.0313593;REFB=-0.0364308;REVB=0.0218188;RO=19;SAF=12;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491355;STB=0.52783;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0401464;OID=.;OPOS=66532493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:7:12:11:8:7:12:11:8
chr12	66546100	.	A	G	541.76	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00202363;FXX=0.0270197;HRUN=4;LEN=1;MLLD=141.55;QD=60.1952;RBI=0.00952456;REFB=0;REVB=-0.00930711;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.5855e-05;OID=.;OPOS=66546100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0
chr12	66605228	.	A	G	210.29	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.01008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.646;QD=15.5769;RBI=0.0124995;REFB=-0.02274;REVB=-0.00739127;RO=29;SAF=10;SAR=14;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0647651;STB=0.528278;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0406045;OID=.;OPOS=66605228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:30:24:24:0.444444:14:10:14:15:14:10:14:16
chr12	66700273	.	G	A	180.08	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0265002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.777;QD=23.2363;RBI=0.0274201;REFB=-0.0227761;REVB=0.00704264;RO=13;SAF=7;SAR=11;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00336458;STB=0.501885;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0107294;OID=.;OPOS=66700273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:11:7:5:8:11:7:5:8
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chr12	66717784	.	T	A	472.97	PASS	AF=0.472222;AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=0.00170521;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=271.674;QD=17.5175;RBI=0.00548143;REFB=-0.0106516;REVB=0.00520944;RO=56;SAF=27;SAR=24;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0947675;STB=0.547807;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0108244;OID=.;OPOS=66717784;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:56:57:51:51:0.472222:24:27:24:32:24:27:25:32
chr12	66717910	.	G	T	348.22	PASS	AF=0.4;AO=38;DP=96;FAO=38;FDP=95;FR=.;FRO=57;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=-0.0363287;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9928;QD=14.6617;RBI=0.0619923;REFB=-0.0176226;REVB=-0.0502321;RO=56;SAF=25;SAR=13;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174317;STB=0.505822;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0191498;OID=.;OPOS=66717910;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:95:56:57:38:38:0.4:13:25:36:20:13:25:37:20
chr12	66725160	.	C	T	400.22	PASS	AF=0.418182;AO=46;DP=110;FAO=46;FDP=110;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=32;FSRF=43;FSRR=21;FWDB=-0.00419225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.196;QD=14.5535;RBI=0.0146766;REFB=-0.00592759;REVB=-0.0140652;RO=64;SAF=14;SAR=32;SRF=43;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.375005;STB=0.710744;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0149371;OID=.;OPOS=66725160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:64:64:46:46:0.418182:32:14:43:21:32:14:43:21
chr12	66725202	.	C	T	375.21	PASS	AF=0.421053;AO=40;DP=95;FAO=40;FDP=95;FR=.;FRO=55;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.0254793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.604;QD=15.7983;RBI=0.0254794;REFB=-0.0159909;REVB=7.11972e-05;RO=55;SAF=11;SAR=29;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.37564;STB=0.712119;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0223708;OID=.;OPOS=66725202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:55:55:40:40:0.421053:29:11:35:20:29:11:35:20
chr12	66731864	.	C	A	152.81	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0109827;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.778;QD=13.0049;RBI=0.0166084;REFB=-0.0263103;REVB=-0.0124587;RO=30;SAF=13;SAR=4;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134538;STB=0.579518;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.0450163;OID=.;OPOS=66731864;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:30:30:17:17:0.361702:4:13:20:10:4:13:20:10
chr12	66739539	.	A	G	237.15	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0132496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.059;QD=19.7621;RBI=0.0170522;REFB=-0.00842372;REVB=-0.0107343;RO=25;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115482;STB=0.565161;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0129319;OID=.;OPOS=66739539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:13:10:14:11:13:10:14:11
chr12	66773075	.	C	T	554.18	PASS	AF=0.44697;AO=59;DP=132;FAO=59;FDP=132;FR=.;FRO=73;FSAF=43;FSAR=16;FSRF=49;FSRR=24;FWDB=0.00297844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.308;QD=16.7934;RBI=0.00314884;REFB=-0.015781;REVB=-0.00102183;RO=73;SAF=43;SAR=16;SRF=49;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694289;STB=0.538834;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0162217;OID=.;OPOS=66773075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:132:73:73:59:59:0.44697:16:43:49:24:16:43:49:24
chr12	66786091	.	G	C	306.34	PASS	AF=1;AO=11;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.168;QD=53.2769;RBI=0.0379258;REFB=0;REVB=-0.0149933;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00047933;OID=.;OPOS=66786091;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:11:23:1:9:2:0:0:9:14:0:0
chr12	66814487	.	C	A	172.76	PASS	AF=0.315068;AO=23;DP=73;FAO=23;FDP=73;FR=.;FRO=50;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=38;FSRR=12;FWDB=-0.0289462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.542;QD=9.46621;RBI=0.0333452;REFB=-0.00377277;REVB=-0.0165535;RO=50;SAF=9;SAR=14;SRF=38;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.411615;STB=0.73749;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0113848;OID=.;OPOS=66814487;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:50:50:23:23:0.315068:14:9:38:12:14:9:38:12
chr12	68052178	.	G	T	132.56	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0210972;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=96.1243;QD=15.1501;RBI=0.0242723;REFB=-0.00981654;REVB=-0.0120022;RO=20;SAF=11;SAR=4;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152974;STB=0.58916;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0231784;OID=.;OPOS=68052178;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:4:11:12:8:4:11:12:8
chr12	68708761	.	C	T	326.51	PASS	AF=0.568966;AO=32;DP=58;FAO=33;FDP=58;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.0079373;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.365;QD=22.5181;RBI=0.00821666;REFB=-0.035964;REVB=0.00212432;RO=24;SAF=20;SAR=12;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0704841;STB=0.539769;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0235361;OID=.;OPOS=68708761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:24:25:32:33:0.568966:12:20:17:7:12:21:18:7
chr12	68720335	.	C	T	101.68	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0251973;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2142;QD=15.6431;RBI=0.040534;REFB=-0.0440437;REVB=-0.0317507;RO=14;SAF=8;SAR=4;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402532;STB=0.731348;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0487383;OID=.;OPOS=68720335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:26:14:14:12:12:0.461538:4:8:3:11:4:8:3:11
chr12	68720627	.	G	A	312.9	PASS	AF=0.338983;AO=40;DP=118;FAO=40;FDP=118;FR=.;FRO=78;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=51;FWDB=-0.0312606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.849;QD=10.6067;RBI=0.0313931;REFB=-0.00997692;REVB=0.00288085;RO=77;SAF=15;SAR=25;SRF=26;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0461547;STB=0.520538;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0230146;OID=.;OPOS=68720627;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:77:78:40:40:0.338983:25:15:26:51:25:15:27:51
chr12	68724951	.	G	T	351.1	PASS	AF=0.413043;AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=0.00960166;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.956;QD=15.2653;RBI=0.0195201;REFB=-0.00824614;REVB=0.0169954;RO=54;SAF=18;SAR=20;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273344;STB=0.515456;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0109328;OID=.;OPOS=68724951;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:54:54:38:38:0.413043:20:18:27:27:20:18:27:27
chr12	69042495	.	A	G	512.3	PASS	AF=0.618421;AO=47;DP=76;FAO=47;FDP=76;FR=.;FRO=29;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0707196;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9051;QD=26.9631;RBI=0.0709703;REFB=-0.0175429;REVB=-0.00596025;RO=29;SAF=21;SAR=26;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0480692;STB=0.526185;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.00983507;OID=.;OPOS=69042495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:29:29:47:47:0.618421:26:21:11:18:26:21:11:18
chr12	69082805	.	G	A	267.09	PASS	AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=37;FSRR=10;FWDB=0.0117459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.632;QD=13.6971;RBI=0.0358279;REFB=0.00804004;REVB=-0.0338477;RO=46;SAF=15;SAR=16;SRF=36;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.314541;STB=0.680748;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.00828585;OID=.;OPOS=69082805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:46:47:31:31:0.397436:16:15:36:10:16:15:37:10
chr12	69115698	.	G	A	672.15	PASS	AF=0.536585;AO=66;DP=123;FAO=66;FDP=123;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=43;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.0507696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3319;QD=21.8584;RBI=0.084236;REFB=-0.00212404;REVB=-0.0672172;RO=57;SAF=23;SAR=43;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156476;STB=0.585985;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.00147083;OID=.;OPOS=69115698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:57:57:66:66:0.536585:43:23:30:27:43:23:30:27
chr12	69186904	.	G	A	268.76	PASS	AF=0.520833;AO=25;DP=48;FAO=25;FDP=48;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0114824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.254;QD=22.3966;RBI=0.0152194;REFB=-0.00144906;REVB=0.00998919;RO=23;SAF=15;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00777152;STB=0.504344;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.00161134;OID=.;OPOS=69186904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:23:25:25:0.520833:10:15:14:9:10:15:14:9
chr12	69187427	.	T	A,G	606.44	PASS	AF=0.95122,0.0487805;AO=38,2;DP=40;FAO=39,2;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26,0;FSAR=13,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383122,0.0299847;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=125.72,116.621;QD=59.1646;RBI=0.0540287,0.0417802;REFB=0,0;REVB=0.0380956,-0.0290947;RO=0;SAF=25,0;SAR=13,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000634562,0.10229;OID=.,.;OPOS=69187427,69187427;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:40:41:0:0:38,2:39,2:0.95122,0.0487805:13,2:25,0:0:0:13,2:26,0:0:0
chr12	69187585	.	G	GA	824.56	PASS	AF=1;AO=62;DP=71;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0021254;FXX=0.028165;HRUN=0;LEN=1;MLLD=71.3783;QD=47.8005;RBI=0.0791648;REFB=0;REVB=-0.0791363;RO=1;SAF=23;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200828;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000234047;OID=.;OPOS=69187586;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:62:71:69:69:0:27:42:0:0:15:1:23:39:1:0
chr12	69233239	.	TA	T	35.2	PASS	AF=0.473684;AO=8;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0682573;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.61005;QD=7.40987;RBI=0.100397;REFB=-0.0324061;REVB=0.0736241;RO=10;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763832;STB=0.519956;STBP=0.893;TYPE=del;VARB=0.0268717;OID=.;OPOS=69233240;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.473684:8:19:9:19:10:6:3:7:3:34:10:5:3:7:3
chr12	69265578	.	A	G	388.62	PASS	AF=0.470588;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.00572577;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.605;QD=18.2881;RBI=0.00597819;REFB=-0.022882;REVB=-0.0017188;RO=45;SAF=13;SAR=27;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165043;STB=0.592429;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0182406;OID=.;OPOS=69265578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:45:45:40:40:0.470588:27:13:22:23:27:13:22:23
chr12	69645864	.	A	G	76.95	PASS	AF=0.75;AO=3;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00558137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.079;QD=25.6488;RBI=0.192219;REFB=-0.0499638;REVB=-0.192137;RO=1;SAF=2;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266641;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.018127;OID=.;OPOS=69645864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:12:12:1:3:3:9:0.75:1:2:0:1:3:6:2:1
chr12	69646914	.	G	A	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00531493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=321.158;QD=10.9409;RBI=0.00682934;REFB=-0.0141923;REVB=0.00428853;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22826;STB=0.650891;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0224432;OID=.;OPOS=69646914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:19:20:11:11:0.354839:7:4:11:8:7:4:12:8
chr12	69794856	.	G	A	1049.72	PASS	AF=0.948718;AO=73;DP=78;FAO=74;FDP=78;FR=.;FRO=4;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0409776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.3582;QD=53.8318;RBI=0.0453243;REFB=-0.0997333;REVB=-0.0193683;RO=5;SAF=32;SAR=41;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294043;STB=0.52325;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0273088;OID=.;OPOS=69794856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:78:78:5:4:73:74:0.948718:41:32:1:4:41:33:0:4
chr12	69971500	.	C	T	82.17	PASS	AF=0.9;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0294957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.138;QD=32.8676;RBI=0.0311692;REFB=-0.0390665;REVB=0.0100757;RO=1;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.080241;STB=0.545355;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00371643;OID=.;OPOS=69971500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:10:1:1:8:9:0.9:5:3:0:1:5:4:0:1
chr12	69971713	.	C	T	172.0	PASS	AF=0.310811;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.012366;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.91;QD=9.29734;RBI=0.0167759;REFB=-0.016008;REVB=-0.0113363;RO=51;SAF=18;SAR=5;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332182;STB=0.698607;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0350988;OID=.;OPOS=69971713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:51:51:23:23:0.310811:5:18:27:24:5:18:27:24
chr12	69972381	.	G	A	173.11	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3271;QD=46.1637;RBI=0.0535333;REFB=0;REVB=0.0484341;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00483131;OID=.;OPOS=69972381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:4:10:0:0:5:10:0:0
chr12	69986788	.	A	G	330.04	PASS	AF=0.486111;AO=35;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.00673982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.259;QD=18.3356;RBI=0.0149852;REFB=-0.0129116;REVB=0.013384;RO=37;SAF=11;SAR=24;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218819;STB=0.622522;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0109057;OID=.;OPOS=69986788;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:37:37:35:35:0.486111:24:11:20:17:24:11:20:17
chr12	70064295	.	C	T	427.57	PASS	AF=0.46;AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=100;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.00266143;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.471;QD=17.1026;RBI=0.00454953;REFB=-0.0187933;REVB=-0.00368986;RO=54;SAF=25;SAR=21;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242672;STB=0.513543;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0157993;OID=.;OPOS=70064295;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:100:54:54:46:46:0.46:21:25:28:26:21:25:28:26
chr12	70091432	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.973;QD=61.6836;RBI=0.0371961;REFB=0;REVB=0.0291565;RO=0;SAF=14;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189474;OID=.;OPOS=70091432;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:27:14:0:0:27:14:0:0
chr12	70209475	.	A	C	184.84	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=51;FAO=22;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=25;FWDB=-0.117585;FXX=0.0517152;HRUN=14;LEN=1;MLLD=189.258;QD=13.4428;RBI=0.119917;REFB=-0.0438372;REVB=-0.0235334;RO=4;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222789;STB=0.614081;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0563651;OID=.;OPOS=70209475;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:55:4:31:10:22:0.4:6:4:0:4:14:8:6:25
chr12	70273159	.	C	G	230.33	PASS	AF=0.471698;AO=21;DP=54;FAO=25;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.020215;FXX=0.0185151;HRUN=6;LEN=1;MLLD=290.01;QD=17.3836;RBI=0.0209098;REFB=-0.0205305;REVB=-0.00534539;RO=21;SAF=12;SAR=9;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178562;STB=0.615776;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0131847;OID=.;OPOS=70273159;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:21:27:21:25:0.471698:9:12:16:5:12:13:20:7
chr12	70273985	.	T	G	1142.23	PASS	AF=0.504425;AO=113;DP=226;FAO=114;FDP=226;FR=.;FRO=112;FSAF=60;FSAR=54;FSRF=49;FSRR=63;FWDB=0.0349206;FXX=0.00440509;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9813;QD=20.2164;RBI=0.0452848;REFB=-0.0364222;REVB=0.0288316;RO=112;SAF=59;SAR=54;SRF=49;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766325;STB=0.543925;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=0.0353905;OID=.;OPOS=70273985;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:226:226:112:112:113:114:0.504425:54:59:49:63:54:60:49:63
chr12	70321450	.	C	T	327.56	PASS	AF=0.961538;AO=23;DP=24;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.023733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.361;QD=50.3942;RBI=0.027469;REFB=-0.0304099;REVB=0.0138309;RO=1;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0440445;STB=0.521722;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00119814;OID=.;OPOS=70321450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:26:1:1:23:25:0.961538:10:13:0:1:11:14:0:1
chr12	70330087	.	A	G	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00938927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.925;QD=64.4145;RBI=0.0283462;REFB=0;REVB=0.0267459;RO=0;SAF=42;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81061e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001143;OID=.;OPOS=70330087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:8:42:0:0:8:42:0:0
chr12	70351684	.	C	A	282.82	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0198537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.689;QD=49.1854;RBI=0.0201827;REFB=-0.145535;REVB=0.00362975;RO=1;SAF=10;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439896;STB=0.523788;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00105499;OID=.;OPOS=70351684;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:23:23:1:1:22:22:0.956522:12:10:1:0:12:10:1:0
chr12	70352021	.	C	T	1433.07	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.653;QD=62.9922;RBI=0.0261526;REFB=0;REVB=-0.0236316;RO=0;SAF=59;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.23707e-05;OID=.;OPOS=70352021;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:31:59:0:0:32:59:0:0
chr12	70912510	.	C	T	1519.42	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379975;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.895;QD=63.3093;RBI=0.0443209;REFB=0;REVB=0.0228151;RO=0;SAF=46;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000491204;OID=.;OPOS=70912510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:95:96:1:49:46:0:0:49:47:0:0
chr12	70928616	.	G	A	334.42	PASS	AF=0.507246;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0427613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.646;QD=19.3864;RBI=0.0515672;REFB=-0.00772365;REVB=-0.0288209;RO=34;SAF=17;SAR=18;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126586;STB=0.507038;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.00572086;OID=.;OPOS=70928616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:34:34:35:35:0.507246:18:17:17:17:18:17:17:17
chr12	70928724	.	A	G	729.4	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.24;QD=57.2074;RBI=0.0290771;REFB=0;REVB=0.0271042;RO=0;SAF=25;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.49095e-05;OID=.;OPOS=70928724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:25:25:0:0:25:26:0:0
chr12	70965764	.	G	A	347.43	PASS	AF=0.45679;AO=37;DP=80;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.00569185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.782;QD=17.1569;RBI=0.0101711;REFB=-0.0137186;REVB=0.0084293;RO=42;SAF=24;SAR=13;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305146;STB=0.520596;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.00958029;OID=.;OPOS=70965764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:42:44:37:37:0.45679:13:24:26:16:13:24:27:17
chr12	70989977	.	T	C	197.14	PASS	AF=0.347222;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=19;FWDB=-0.0201279;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.208;QD=10.9519;RBI=0.0201301;REFB=-0.00770151;REVB=-0.000295755;RO=46;SAF=11;SAR=14;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186577;STB=0.600581;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0137673;OID=.;OPOS=70989977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:46:47:25:25:0.347222:14:11:28:18:14:11:28:19
chr12	71002865	.	T	A	594.76	PASS	AF=0.459259;AO=62;DP=135;FAO=62;FDP=135;FR=.;FRO=73;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=48;FSRR=25;FWDB=-0.00859933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.259;QD=17.6226;RBI=0.0135565;REFB=-0.00901252;REVB=-0.01048;RO=71;SAF=39;SAR=23;SRF=47;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342951;STB=0.516648;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0116133;OID=.;OPOS=71002865;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:71:73:62:62:0.459259:23:39:47:24:23:39:48:25
chr12	71002893	.	C	T	726.17	PASS	AF=0.443182;AO=77;DP=177;FAO=78;FDP=176;FR=.;FRO=98;FSAF=50;FSAR=28;FSRF=64;FSRR=34;FWDB=-0.0525024;FXX=0.0056494;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2674;QD=16.504;RBI=0.0610293;REFB=-0.0104852;REVB=0.0311139;RO=100;SAF=49;SAR=28;SRF=65;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150037;STB=0.507309;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0141573;OID=.;OPOS=71002893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:176:100:98:77:78:0.443182:28:49:65:35:28:50:64:34
chr12	71029733	.	C	T	1098.47	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.011225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0569;QD=60.1903;RBI=0.0137309;REFB=0;REVB=0.00790796;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.80293e-05;OID=.;OPOS=71029733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:33:40:0:0:33:40:0:0
chr12	71054946	.	C	A	1026.27	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00431346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.837;QD=59.494;RBI=0.0140812;REFB=0;REVB=0.0134042;RO=0;SAF=29;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.62679e-05;OID=.;OPOS=71054946;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:40:29:0:0:40:29:0:0
chr12	71139664	.	T	C,G	1192.77	PASS	AF=0.962963,0.0246914;AO=76,3;DP=80;FAO=78,2;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=47,0;FSAR=31,2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0143418,0.0130747;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=202.715,155.621;QD=58.9021;RBI=0.0784223,0.0570379;REFB=-0.0400444,-0.0174211;REVB=0.0770998,0.0555191;RO=0;SAF=47,0;SAR=29,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.505262,0.993266;STBP=0.522,0.232;TYPE=snp,snp;VARB=0.000585227,0.0865619;OID=.,.;OPOS=71139664,71139664;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:80:81:0:1:76,3:78,2:0.962963,0.0246914:29,3:47,0:0:0:31,2:47,0:1:0
chr12	71526593	.	G	A	278.93	PASS	AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0909987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2008;QD=27.2126;RBI=0.0910023;REFB=-0.0462264;REVB=0.000818521;RO=16;SAF=13;SAR=12;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0745185;STB=0.541144;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.0310518;OID=.;OPOS=71526593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:12:13:10:6:12:13:10:6
chr12	71960208	.	G	A	732.5	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00529458;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.785;QD=63.6954;RBI=0.015437;REFB=0;REVB=0.0145006;RO=0;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000356344;OID=.;OPOS=71960208;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:20:26:0:0:20:26:0:0
chr12	72003547	.	T	A	824.85	PASS	AF=0.433333;AO=91;DP=210;FAO=91;FDP=210;FR=.;FRO=119;FSAF=50;FSAR=41;FSRF=69;FSRR=50;FWDB=0.0305272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0425;QD=15.7114;RBI=0.0327282;REFB=-0.0142829;REVB=0.0117992;RO=118;SAF=50;SAR=41;SRF=68;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0275641;STB=0.517442;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0190202;OID=.;OPOS=72003547;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:210:118:119:91:91:0.433333:41:50:68:50:41:50:69:50
chr12	72013832	.	A	G	135.95	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0249594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.653;QD=17.542;RBI=0.031442;REFB=-0.0244022;REVB=0.0191213;RO=16;SAF=3;SAR=12;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322752;STB=0.687223;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0240947;OID=.;OPOS=72013832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:12:3:8:8:12:3:8:8
chr12	72033252	.	TAGTC	T,TAGAC	317.12	PASS	AF=0.324324,0.045045;AO=36,5;DP=114;FAO=36,5;FDP=111;FR=.;FRO=70;FSAF=20,0;FSAR=16,5;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.0263126,0.0882191;FXX=0.0263135;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=245.497,68.7709;QD=11.4278;RBI=0.0268128,0.0893814;REFB=-0.0130185,-0.0123694;REVB=-0.005155,-0.0143673;RO=70;SAF=20,0;SAR=16,5;SRF=34;SRR=36;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0799157,-0.520319;STB=0.546193,0.997821;STBP=0.484,0.013;TYPE=del,snp;VARB=0.027612,-0.00575962;OID=.,.;OPOS=72033253,72033255;OREF=AGTC,T;OALT=-,A;OMAPALT=T,TAGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.324324,0.045045:36,5:114:36,5:111:70:20,0:16,5:34:36:99:70:20,0:16,5:34:36
chr12	72071045	.	A	G	208.07	PASS	AF=0.390625;AO=25;DP=66;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0145742;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.989;QD=13.0045;RBI=0.0154336;REFB=-0.0109239;REVB=-0.0050782;RO=37;SAF=17;SAR=8;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0369157;STB=0.543775;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0152424;OID=.;OPOS=72071045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:64:37:39:25:25:0.390625:8:17:24:13:8:17:24:15
chr12	72307616	.	A	G	171.17	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0179487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.3115;QD=17.556;RBI=0.02738;REFB=0.0141446;REVB=0.0206763;RO=21;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129221;STB=0.57383;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=-0.0433841;OID=.;OPOS=72307616;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:7:11:10:11:7:11:10:11
chr12	72372862	.	A	G	236.45	PASS	AF=0.41791;AO=27;DP=66;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=-0.0477902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.589;QD=14.1163;RBI=0.049143;REFB=-0.00740184;REVB=0.0114512;RO=39;SAF=9;SAR=18;SRF=16;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.086431;STB=0.533006;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0117783;OID=.;OPOS=72372862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:39:39:27:28:0.41791:18:9:16:23:18:10:16:23
chr12	72416235	.	A	T	615.09	PASS	AF=0.467153;AO=63;DP=135;FAO=64;FDP=137;FR=.;FRO=73;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=28;FWDB=-0.00178145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.13;QD=17.9588;RBI=0.00824188;REFB=-0.00801156;REVB=-0.00804705;RO=71;SAF=39;SAR=24;SRF=44;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000679111;STB=0.503958;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.00905083;OID=.;OPOS=72416235;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:137:71:73:63:64:0.467153:24:39:44:27:25:39:45:28
chr12	73058186	.	G	A	1933.28	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000727018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.951;QD=61.865;RBI=0.00122748;REFB=0;REVB=-0.000989018;RO=0;SAF=71;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.48324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.12734e-07;OID=.;OPOS=73058186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:54:71:0:0:54:71:0:0
chr12	74851233	.	G	A	102.5	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.00634507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.444;QD=17.8255;RBI=0.0521664;REFB=-0.0162241;REVB=0.0517791;RO=10;SAF=10;SAR=2;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10371;STB=0.571321;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0154696;OID=.;OPOS=74851233;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:10:11:12:12:0.521739:2:10:9:1:2:10:10:1
chr12	74932159	.	G	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00210389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.389;QD=56.9383;RBI=0.0251875;REFB=0;REVB=0.0250995;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.48783e-05;OID=.;OPOS=74932159;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0
chr12	74932327	.	C	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277094;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=263.888;QD=44.6898;RBI=0.0395867;REFB=0;REVB=-0.0282718;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.73902e-06;OID=.;OPOS=74932327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr12	74932565	.	T	C	1083.4	PASS	AF=0.961039;AO=74;DP=78;FAO=74;FDP=77;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0289044;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3012;QD=56.2803;RBI=0.032041;REFB=-0.0106029;REVB=-0.0138261;RO=3;SAF=45;SAR=29;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0045284;STB=0.502395;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.00684157;OID=.;OPOS=74932565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:78:77:3:3:74:74:0.961039:29:45:2:1:29:45:2:1
chr12	74933166	.	G	A	803.87	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00916844;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.875;QD=57.4192;RBI=0.0425651;REFB=0;REVB=0.041566;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.53604e-05;OID=.;OPOS=74933166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0
chr12	74934634	.	G	A	233.46	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0703777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.076;QD=49.1501;RBI=0.0766034;REFB=0;REVB=0.0302498;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107489;OID=.;OPOS=74934634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:18:19:1:9:9:0:0:10:9:0:0
chr12	74934636	.	A	AC	226.25	PASS	AF=1;AO=2;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0684911;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=105.922;QD=47.6324;RBI=0.0684987;REFB=0;REVB=-0.00102132;RO=17;SAF=1;SAR=1;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0291305;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000568059;OID=.;OPOS=74934637;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:19:19:19:0:9:10:0:0:4:17:1:1:8:9
chr12	74934637	.	T	C	198.05	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=19;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0119793;FXX=0.0526039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.465;QD=44.0119;RBI=0.0120868;REFB=-0.129224;REVB=-0.00160835;RO=1;SAF=8;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0538535;STB=0.529377;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.00273523;OID=.;OPOS=74934637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:19:18:1:1:17:17:0.944444:9:8:1:0:9:8:1:0
chr12	74934909	.	AGTGTGTGT	A	380.69	PASS	AF=0.964286;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0239096;FXX=0.199943;HRUN=1;LEN=8;MLLD=243.096;QD=54.3838;RBI=0.0355853;REFB=0.013491;REVB=0.0263561;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.523792;STBP=0.287;TYPE=del;VARB=-0.00103107;OID=.;OPOS=74934910;OREF=GTGTGTGT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.964286:26:27:27:28:1:10:17:1:0:7:0:9:17:0:0
chr12	75715330	.	C	A	289.25	PASS	AF=0.360825;AO=28;DP=90;FAO=35;FDP=97;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.00427743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=336.588;QD=11.9279;RBI=0.0175596;REFB=-0.013167;REVB=-0.0170306;RO=60;SAF=12;SAR=16;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836125;STB=0.509129;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0232529;OID=.;OPOS=75715330;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:97:60:62:28:35:0.360825:16:12:30:30:18:17:31:31
chr12	75824460	.	T	C	232.63	PASS	AF=0.325843;AO=29;DP=89;FAO=29;FDP=89;FR=.;FRO=60;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=0.0391626;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.646;QD=10.4551;RBI=0.0392594;REFB=-0.00659547;REVB=-0.00275551;RO=58;SAF=18;SAR=11;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235295;STB=0.63634;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0228889;OID=.;OPOS=75824460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:58:60:29:29:0.325843:11:18:24:34:11:18:25:35
chr12	75824893	.	G	A	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6558;QD=23.2183;RBI=0.0421998;REFB=-0.0637399;REVB=0.0421998;RO=1;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0222322;OID=.;OPOS=75824893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:5:0:0:1:5:0:0:1
chr12	75893381	.	CAAAG	CAG,CAGAC	296.88	PASS	AF=0.46875,0.046875;AO=27,4;DP=66;FAO=30,3;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=14,0;FSAR=16,3;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.024429,-0.0486865;FXX=0.0153822;HRUN=3,3;LEN=2,3;MLLD=36.7477,167.925;QD=18.5553;RBI=0.0245621,0.0611188;REFB=-0.0560767,-0.0377889;REVB=-0.0025537,-0.0369478;RO=31;SAF=12,0;SAR=15,4;SRF=16;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0682148,-0.607875;STB=0.525147,0.996489;STBP=0.71,0.066;TYPE=del,mnp;VARB=0.0477612,0.0812219;OID=.,.;OPOS=75893382,75893383;OREF=AA,AAG;OALT=-,GAC;OMAPALT=CAG,CAGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.46875,0.046875:27,4:66:30,3:64:31:14,0:16,3:16:15:99:31:12,0:15,4:16:15
chr12	75893388	.	T	A	886.22	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00520609;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.906;QD=58.1128;RBI=0.0573348;REFB=0;REVB=0.0570979;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171551;OID=.;OPOS=75893388;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:32:29:0:0:32:29:0:0
chr12	75893399	.	T	G	266.21	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=57;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.00987518;FXX=0.0166639;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.974;QD=18.048;RBI=0.0334948;REFB=-0.0269752;REVB=-0.032006;RO=28;SAF=12;SAR=17;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133592;STB=0.527427;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.0344486;OID=.;OPOS=75893399;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:59:28:30:29:29:0.491525:17:12:12:16:17:12:14:16
chr12	75893404	.	CG	AG,GT	757.06	PASS	AF=0.962963,0.037037;AO=51,2;DP=54;FAO=52,2;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25,0;FSAR=27,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0524356,-0.00187658;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=82.1087,50.8828;QD=56.0782;RBI=0.0526963,0.0268213;REFB=0,0;REVB=-0.00523562,-0.0267556;RO=0;SAF=25,0;SAR=26,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.94283e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00273101,0.173805;OID=.,.;OPOS=75893404,75893404;OREF=C,CG;OALT=A,GT;OMAPALT=AG,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:54:54:0:0:51,2:52,2:0.962963,0.037037:26,2:25,0:0:0:27,2:25,0:0:0
chr12	75900588	.	A	G	564.59	PASS	AF=0.607143;AO=51;DP=85;FAO=51;FDP=84;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.00157432;FXX=0.0117633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.51;QD=26.8853;RBI=0.0211374;REFB=0.00315722;REVB=0.0210787;RO=33;SAF=19;SAR=32;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128274;STB=0.570025;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=-0.00209202;OID=.;OPOS=75900588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:33:33:51:51:0.607143:32:19:18:15:32:19:18:15
chr12	76351726	.	C	G	155.92	PASS	AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.0638345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.064;QD=10.9415;RBI=0.0771846;REFB=0.000241111;REVB=0.0433891;RO=37;SAF=6;SAR=14;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354886;STB=0.707111;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.000839352;OID=.;OPOS=76351726;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:37:37:20:20:0.350877:14:6:23:14:14:6:23:14
chr12	76424937	.	TTGC	CTGT,T	149.03	PASS	AF=0.1,0.75;AO=5,9;DP=15;FAO=2,15;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=2,5;FSAR=0,10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0818253,0.00128387;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=4,3;MLLD=206.369,166.418;QD=29.8068;RBI=0.113407,0.0746125;REFB=-0.0901241,-0.100444;REVB=0.0785218,0.0746014;RO=0;SAF=2,3;SAR=3,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.995982,0.565135;STBP=0.062,0.273;TYPE=mnp,del;VARB=0.120911,0.0331914;OID=.,.;OPOS=76424937,76424938;OREF=TTGC,TGC;OALT=CTGT,-;OMAPALT=CTGT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:20:15:20:0:3:5,9:2,15:0.1,0.75:3,6:2,3:0:0:0,10:2,5:0:3
chr12	76426110	.	GGA	G	585.15	PASS	AF=0.863636;AO=55;DP=61;FAO=57;FDP=66;FR=.;FRO=9;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=9;FWDB=0.0448261;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=2;MLLD=255.559;QD=35.4637;RBI=0.0454342;REFB=-0.0259432;REVB=0.00740878;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.584876;STBP=0.001;TYPE=del;VARB=0.00675008;OID=.;OPOS=76426111;OREF=GA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.863636:55:61:57:66:9:35:22:0:9:23:0:34:21:0:0
chr12	76427547	.	C	CTTAAT	96.17	PASS	AF=1;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360877;FXX=0.181653;HRUN=2;LEN=5;MLLD=312.912;QD=42.7434;RBI=0.0361688;REFB=0;REVB=-0.00242126;RO=3;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0496942;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000218267;OID=.;OPOS=76427548;OREF=-;OALT=TTAAT;OMAPALT=CTTAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:9:12:9:9:0:5:4:0:0:3:3:5:4:2:1
chr12	76449900	.	T	C	380.01	PASS	AF=0.967742;AO=21;DP=30;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0801561;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=86.4016;QD=49.0333;RBI=0.0801613;REFB=-0.165447;REVB=-0.000912204;RO=2;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920274;STB=0.519987;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00925421;OID=.;OPOS=76449900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:30:31:2:1:21:30:0.967742:9:12:0:2:12:18:0:1
chr12	76453966	.	G	A	727.21	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025112;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.714;QD=57.036;RBI=0.0362765;REFB=0;REVB=-0.0261797;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123291;OID=.;OPOS=76453966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:19:31:0:0:19:32:0:0
chr12	76709606	.	T	C	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000537781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.342;QD=59.6795;RBI=0.0010418;REFB=0;REVB=0.000892265;RO=0;SAF=38;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45286e-07;OID=.;OPOS=76709606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:32:38:0:0:32:38:0:0
chr12	76709610	.	T	C	1006.51	PASS	AF=1;AO=68;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276614;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.758;QD=58.3486;RBI=0.0337873;REFB=0;REVB=0.0194016;RO=0;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.60446e-05;OID=.;OPOS=76709610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:69:0:0:68:69:1:31:37:0:0:31:38:0:0
chr12	76740220	.	A	G	114.06	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0514423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.772;QD=18.249;RBI=0.0568678;REFB=-0.0158803;REVB=-0.024241;RO=12;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101714;STB=0.558193;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.0104005;OID=.;OPOS=76740220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:7:6:7:5:7:6:7:5
chr12	77256681	.	T	G	695.83	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00698638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4333;QD=52.5152;RBI=0.0671898;REFB=-0.0623515;REVB=0.0668256;RO=2;SAF=26;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0348494;STB=0.518511;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00786324;OID=.;OPOS=77256681;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:53:53:2:2:51:51:0.962264:25:26:2:0:25:26:2:0
chr12	77417509	.	G	T	269.28	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0405966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.372;QD=16.5709;RBI=0.0418196;REFB=0.00324139;REVB=-0.0100395;RO=31;SAF=14;SAR=16;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190167;STB=0.571381;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.00369751;OID=.;OPOS=77417509;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:35:30:30:0.461538:16:14:21:10:16:14:21:14
chr12	77449790	.	A	G	1646.47	PASS	AF=0.990991;AO=110;DP=112;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00291769;FXX=0.00892777;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.162;QD=59.3321;RBI=0.0128029;REFB=-0.107423;REVB=0.012466;RO=0;SAF=63;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54139e-08;STB=0.505262;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.000155686;OID=.;OPOS=77449790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:112:111:0:1:110:110:0.990991:47:63:0:0:47:63:0:1
chr12	78225374	.	A	G	1320.9	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3415;QD=62.1598;RBI=0.0294636;REFB=0;REVB=-0.0235014;RO=0;SAF=48;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.05666e-05;OID=.;OPOS=78225374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:37:48:0:0:37:48:0:0
chr12	78334194	.	A	G	719.46	PASS	AF=0.526316;AO=69;DP=132;FAO=70;FDP=133;FR=.;FRO=63;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=21;FWDB=0.066053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.748;QD=21.6378;RBI=0.0727839;REFB=-0.00818317;REVB=0.0305697;RO=62;SAF=36;SAR=33;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121471;STB=0.572519;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00579273;OID=.;OPOS=78334194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:133:62:63:69:70:0.526316:33:36:41:21:34:36:42:21
chr12	78598891	.	G	A	1065.46	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0308099;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.468;QD=60.0259;RBI=0.0515074;REFB=0;REVB=-0.0412767;RO=0;SAF=32;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.74686e-05;OID=.;OPOS=78598891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:39:32:0:0:39:32:0:0
chr12	79611374	.	C	T	421.31	PASS	AF=0.569444;AO=41;DP=72;FAO=41;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0214327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.243;QD=23.4061;RBI=0.0219045;REFB=-0.000646377;REVB=-0.00452161;RO=31;SAF=20;SAR=21;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00308315;STB=0.501694;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.000464317;OID=.;OPOS=79611374;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:31:31:41:41:0.569444:21:20:15:16:21:20:15:16
chr12	79685913	.	C	A	73.37	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.0179407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.86;QD=9.46681;RBI=0.0199953;REFB=-0.00994532;REVB=-0.00882855;RO=21;SAF=4;SAR=6;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.439519;STB=0.758613;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0415174;OID=.;OPOS=79685913;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:6:4:17:4:6:4:17:4
chr12	80014907	.	A	C,T	1660.03	PASS	AF=0.525862,0.465517;AO=61,54;DP=116;FAO=61,54;FDP=116;FR=.;FRO=1;FSAF=45,31;FSAR=16,23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00489832,-0.00487483;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=118.097,174.79;QD=57.2423;RBI=0.0200716,0.0161553;REFB=0.0596536,-0.0342399;REVB=0.0194648,0.0154022;RO=1;SAF=45,31;SAR=16,23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0103763,-0.0149611;STB=0.505493,0.507934;STBP=0.618,0.516;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000479719,0.0142446;OID=.,.;OPOS=80014907,80014907;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:116:116:1:1:61,54:61,54:0.525862,0.465517:16,23:45,31:1:0:16,23:45,31:1:0
chr12	80190650	.	C	G	582.45	PASS	AF=0.403614;AO=67;DP=166;FAO=67;FDP=166;FR=.;FRO=99;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=41;FSRR=58;FWDB=-0.0254674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.389;QD=14.035;RBI=0.0293457;REFB=-0.00949699;REVB=-0.0145801;RO=99;SAF=37;SAR=30;SRF=41;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145683;STB=0.58182;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0218117;OID=.;OPOS=80190650;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:166:99:99:67:67:0.403614:30:37:41:58:30:37:41:58
chr12	80655832	.	A	T	177.15	PASS	AF=0.38;AO=17;DP=48;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0210541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.83;QD=14.1719;RBI=0.024898;REFB=-0.0166005;REVB=-0.0132905;RO=30;SAF=1;SAR=16;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.607036;STB=0.732872;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0449236;OID=.;OPOS=80655832;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:50:30:31:17:19:0.38:16:1:13:17:16:3:14:17
chr12	80712420	.	G	A	1695.27	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.419;QD=60.5454;RBI=0.0297213;REFB=0;REVB=-0.0020041;RO=0;SAF=69;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.61903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.37505e-05;OID=.;OPOS=80712420;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:112:0:0:111:112:1:42:69:0:0:42:70:0:0
chr12	80735771	.	T	C	520.04	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00542662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.884;QD=59.433;RBI=0.0291482;REFB=0;REVB=0.0286386;RO=0;SAF=9;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76646e-05;OID=.;OPOS=80735771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:26:9:0:0:26:9:0:0
chr12	80737521	.	C	T	1268.88	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00807376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.42;QD=60.4229;RBI=0.00963697;REFB=-0.177231;REVB=-0.00526171;RO=1;SAF=41;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111436;STB=0.505881;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.000510092;OID=.;OPOS=80737521;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:42:41:0:1:42:41:0:1
chr12	80747242	.	A	G	644.33	PASS	AF=0.916667;AO=43;DP=48;FAO=44;FDP=48;FR=.;FRO=4;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.119656;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9528;QD=53.6937;RBI=0.123477;REFB=-0.193863;REVB=0.03048;RO=2;SAF=17;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052086;STB=0.549977;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00924269;OID=.;OPOS=80747242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:48:48:2:4:43:44:0.916667:26:17:2:0:26:18:4:0
chr12	80752660	.	A	G,T	797.96	PASS	AF=0.982143,0.0178571;AO=52,4;DP=56;FAO=55,1;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34,0;FSAR=21,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182014,-0.0175892;FXX=0.0175408;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=105.818,218.488;QD=56.9971;RBI=0.0185088,0.0175929;REFB=0,0;REVB=0.00335901,0.000362711;RO=0;SAF=31,3;SAR=21,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.93989e-08,4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00372884,-0.0314499;OID=.,.;OPOS=80752660,80752660;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:56:56:0:0:52,4:55,1:0.982143,0.0178571:21,1:31,3:0:0:21,1:34,0:0:0
chr12	80761430	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000285886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.539;QD=57.8849;RBI=0.00944009;REFB=0;REVB=-0.00943576;RO=0;SAF=38;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.58852e-05;OID=.;OPOS=80761430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:22:38:0:0:22:38:0:0
chr12	80761465	.	G	A	676.79	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00981901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.4449;QD=61.5261;RBI=0.0771514;REFB=0;REVB=-0.076524;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00183519;OID=.;OPOS=80761465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:22:21:0:0:22:22:0:0
chr12	80765800	.	A	G	796.06	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.024191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.639;QD=54.9009;RBI=0.028465;REFB=-0.0932374;REVB=0.0150017;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000177589;OID=.;OPOS=80765800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:35:22:0:0:35:22:0:1
chr12	80771813	.	G	A	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00454112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.38;QD=62.3509;RBI=0.008227;REFB=0;REVB=-0.00686016;RO=0;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.46507e-06;OID=.;OPOS=80771813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:13:30:0:0:13:30:0:0
chr12	80816492	.	C	T	758.8	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.5286;QD=56.2077;RBI=0.0778346;REFB=0;REVB=-0.0691868;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00135216;OID=.;OPOS=80816492;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:54:0:0:52:54:1:22:30:0:0:22:32:0:0
chr12	80818876	.	A	G	1513.52	PASS	AF=0.981132;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=106;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0449468;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.2663;QD=57.1139;RBI=0.0566648;REFB=0.0243145;REVB=-0.0345064;RO=1;SAF=60;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0078438;STB=0.501486;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=-0.00154551;OID=.;OPOS=80818876;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:105:106:1:2:104:104:0.981132:44:60:1:0:44:60:1:1
chr12	80889829	.	T	A	337.4	PASS	AF=0.425287;AO=36;DP=86;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=38;FSRR=12;FWDB=0.00964404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.333;QD=15.5127;RBI=0.0106464;REFB=-0.00950816;REVB=-0.0045097;RO=50;SAF=21;SAR=15;SRF=38;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195476;STB=0.602359;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0167772;OID=.;OPOS=80889829;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:50:50:36:37:0.425287:15:21:38:12:15:22:38:12
chr12	80899901	.	C	A	277.74	PASS	AF=0.595238;AO=24;DP=41;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0166556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.097;QD=26.4511;RBI=0.028061;REFB=-0.0182923;REVB=0.0225835;RO=17;SAF=4;SAR=20;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.499139;STB=0.780932;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0208332;OID=.;OPOS=80899901;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:17:17:24:25:0.595238:20:4:13:4:21:4:13:4
chr12	80900397	.	C	G	212.42	PASS	AF=0.40625;AO=24;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=0.00493393;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8911;QD=13.2764;RBI=0.0990643;REFB=-0.0141964;REVB=-0.0989413;RO=37;SAF=14;SAR=10;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158953;STB=0.553915;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0201059;OID=.;OPOS=80900397;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:37:38:24:26:0.40625:10:14:16:21:12:14:17:21
chr12	80935345	.	T	C	333.79	PASS	AF=0.393617;AO=37;DP=93;FAO=37;FDP=94;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=0.0109061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.8151;QD=14.2039;RBI=0.0110314;REFB=0.00630437;REVB=-0.00165798;RO=56;SAF=16;SAR=21;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909083;STB=0.557063;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=-0.00638341;OID=.;OPOS=80935345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:94:56:57:37:37:0.393617:21:16:29:27:21:16:30:27
chr12	80936082	.	C	T	152.03	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.000539322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.891;QD=13.2201;RBI=0.0100622;REFB=-0.00274806;REVB=0.0100478;RO=28;SAF=7;SAR=10;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610216;STB=0.521252;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.00392611;OID=.;OPOS=80936082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:29:17:17:0.369565:10:7:10:18:10:7:11:18
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chr12	81627238	.	C	T	178.57	PASS	AF=0.73913;AO=17;DP=23;FAO=17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0117448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9209;QD=31.0552;RBI=0.0278177;REFB=-0.042611;REVB=-0.0252168;RO=6;SAF=7;SAR=10;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0425578;STB=0.523532;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0174525;OID=.;OPOS=81627238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:6:6:17:17:0.73913:10:7:3:3:10:7:3:3
chr12	81769581	.	C	T	214.36	PASS	AF=0.38806;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=67;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0244432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8884;QD=12.7974;RBI=0.0809636;REFB=-0.0088908;REVB=-0.0771857;RO=41;SAF=19;SAR=7;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17702;STB=0.602294;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0112561;OID=.;OPOS=81769581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:41:41:26:26:0.38806:7:19:24:17:7:19:24:17
chr12	81833745	.	G	T	205.8	PASS	AF=0.342105;AO=26;DP=76;FAO=26;FDP=76;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.00496704;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.043;QD=10.8315;RBI=0.00614937;REFB=-0.00402266;REVB=0.00362536;RO=50;SAF=12;SAR=14;SRF=18;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117149;STB=0.56785;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.00619545;OID=.;OPOS=81833745;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:50:50:26:26:0.342105:14:12:18:32:14:12:18:32
chr12	82617454	.	T	G	409.35	PASS	AF=0.456522;AO=42;DP=93;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=15;FWDB=0.0116397;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.431;QD=17.798;RBI=0.0393442;REFB=-0.0271424;REVB=0.037583;RO=50;SAF=26;SAR=16;SRF=35;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0855464;STB=0.547677;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0345732;OID=.;OPOS=82617454;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:50:50:42:42:0.456522:16:26:35:15:16:26:35:15
chr12	82783668	.	C	T	464.77	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.198;QD=58.0966;RBI=0.0191229;REFB=0;REVB=-0.0126881;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.88983e-06;OID=.;OPOS=82783668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:14:17:0:0:14:18:0:0
chr12	82792787	.	C	A	438.5	PASS	AF=1;AO=25;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.038;QD=56.5803;RBI=0.0400832;REFB=0;REVB=0.0324715;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000333915;OID=.;OPOS=82792787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:25:31:1:13:12:0:0:16:15:0:0
chr12	83415719	.	G	C	285.36	PASS	AF=0.54717;AO=20;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0130716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7863;QD=21.5365;RBI=0.0194437;REFB=0.00196483;REVB=-0.0143941;RO=17;SAF=10;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722218;STB=0.554899;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=-0.00166586;OID=.;OPOS=83415719;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:17:24:20:29:0.54717:10:10:10:7:19:10:11:13
chr12	88440676	.	G	C	433.27	PASS	AF=0.393701;AO=50;DP=127;FAO=50;FDP=127;FR=.;FRO=77;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.0198964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2353;QD=13.6463;RBI=0.0214624;REFB=-0.0194613;REVB=0.00804785;RO=75;SAF=28;SAR=22;SRF=41;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0143364;STB=0.508925;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.033144;OID=.;OPOS=88440676;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:75:77:50:50:0.393701:22:28:41:34:22:28:42:35
chr12	88500847	.	T	C	316.85	PASS	AF=0.363636;AO=36;DP=100;FAO=36;FDP=99;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=0.0274705;FXX=0.009999;HRUN=4;LEN=1;MLLD=63.6797;QD=12.8018;RBI=0.0438108;REFB=0.00768803;REVB=0.0341285;RO=62;SAF=16;SAR=20;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184373;STB=0.599945;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.0141741;OID=.;OPOS=88500847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:99:62:63:36:36:0.363636:20:16:38:24:20:16:38:25
chr12	88505078	.	T	C	246.37	PASS	AF=0.952381;AO=19;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00809238;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4207;QD=46.9268;RBI=0.00998999;REFB=-0.0272903;REVB=0.00585775;RO=1;SAF=13;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340907;STB=0.517224;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00180641;OID=.;OPOS=88505078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:19:20:0.952381:6:13:1:0:6:14:1:0
chr12	88508258	.	T	C	333.66	PASS	AF=0.6;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0262125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.835;QD=24.2664;RBI=0.0496452;REFB=-0.00920582;REVB=0.042161;RO=22;SAF=18;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00763706;OID=.;OPOS=88508258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:22:22:33:33:0.6:15:18:12:10:15:18:12:10
chr12	88547277	.	T	C	769.96	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365767;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.639;QD=64.1633;RBI=0.0425595;REFB=0;REVB=0.0217589;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175529;OID=.;OPOS=88547277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0
chr12	89741904	.	T	A	205.34	PASS	AF=0.396825;AO=24;DP=62;FAO=25;FDP=63;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0240021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9445;QD=13.0375;RBI=0.0255643;REFB=-0.0020379;REVB=-0.00879954;RO=38;SAF=14;SAR=10;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333975;STB=0.529388;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.00192888;OID=.;OPOS=89741904;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:38:38:24:25:0.396825:10:14:21:17:10:15:21:17
chr12	89743223	.	G	A	1361.63	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0111178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.202;QD=61.1967;RBI=0.0204996;REFB=-0.048458;REVB=0.0172229;RO=0;SAF=41;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.000189935;OID=.;OPOS=89743223;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:88:89:0:1:88:88:0.988764:47:41:0:0:47:41:0:1
chr12	89744773	.	A	C	338.0	PASS	AF=0.576271;AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0440339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7314;QD=22.9153;RBI=0.0452719;REFB=-0.0123072;REVB=0.0105149;RO=24;SAF=21;SAR=13;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272425;STB=0.641297;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0157669;OID=.;OPOS=89744773;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:25:34:34:0.576271:13:21:6:18:13:21:7:18
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chr12	89853408	.	G	A	201.11	PASS	AF=0.393443;AO=23;DP=63;FAO=24;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0352775;FXX=0.061529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.36;QD=13.1874;RBI=0.0615166;REFB=-0.00262714;REVB=-0.0503963;RO=34;SAF=7;SAR=16;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273005;STB=0.710343;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.00489856;OID=.;OPOS=89853408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:61:34:36:23:24:0.393443:16:7:19:15:18:6:21:15
chr12	89917518	.	A	G	177.45	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0796547;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6335;QD=21.5089;RBI=0.0895486;REFB=0.00538371;REVB=0.0409155;RO=15;SAF=9;SAR=9;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134807;STB=0.575675;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=-0.000749881;OID=.;OPOS=89917518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:9:9:10:5:9:9:10:5
chr12	90028901	.	T	C	209.33	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.00892872;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=223.259;QD=13.7267;RBI=0.00907192;REFB=-0.0114781;REVB=-0.0016055;RO=36;SAF=12;SAR=13;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779118;STB=0.544467;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0135673;OID=.;OPOS=90028901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:13:12:20:16:13:12:20:16
chr12	90049367	.	C	T	181.92	PASS	AF=0.413043;AO=18;DP=45;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.000471771;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.926;QD=15.8191;RBI=0.0522276;REFB=-0.0130972;REVB=-0.0522255;RO=27;SAF=13;SAR=5;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02426;STB=0.539469;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0209844;OID=.;OPOS=90049367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:27:27:18:19:0.413043:5:13:20:7:6:13:20:7
chr12	91340273	.	G	T	167.06	PASS	AF=0.409091;AO=18;DP=44;FAO=18;FDP=44;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0104899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.484;QD=15.1869;RBI=0.0200312;REFB=-0.00257229;REVB=-0.0170649;RO=26;SAF=8;SAR=10;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0571009;STB=0.532958;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.00494345;OID=.;OPOS=91340273;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:26:18:18:0.409091:10:8:13:13:10:8:13:13
chr12	91348640	.	G	A	694.25	PASS	AF=0.468354;AO=74;DP=158;FAO=74;FDP=158;FR=.;FRO=84;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=53;FSRR=31;FWDB=0.00652373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2703;QD=17.5759;RBI=0.0380965;REFB=0.0067534;REVB=0.0375337;RO=83;SAF=39;SAR=35;SRF=53;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10769;STB=0.555733;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=-0.00564427;OID=.;OPOS=91348640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:83:84:74:74:0.468354:35:39:53:30:35:39:53:31
chr12	91348786	.	G	T	964.61	PASS	AF=0.92;AO=69;DP=75;FAO=69;FDP=75;FR=.;FRO=6;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0325684;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=244.362;QD=51.4459;RBI=0.0355991;REFB=-0.186893;REVB=0.0143735;RO=6;SAF=44;SAR=25;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602281;STB=0.531906;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00141204;OID=.;OPOS=91348786;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:75:75:6:6:69:69:0.92:25:44:6:0:25:44:6:0
chr12	91449990	.	C	T	583.62	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.186;QD=59.8583;RBI=0.0218304;REFB=0;REVB=0.00695351;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.03217e-05;OID=.;OPOS=91449990;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:25:13:0:0:26:13:0:0
chr12	92818786	.	A	G	176.25	PASS	AF=0.708333;AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0125783;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=176.442;QD=29.3744;RBI=0.0125857;REFB=-0.0347661;REVB=-0.000432505;RO=6;SAF=12;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751155;STB=0.502955;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00594238;OID=.;OPOS=92818786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:6:7:17:17:0.708333:5:12:5:1:5:12:5:2
chr12	92819139	.	A	C	81.2	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0432095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0207;QD=18.044;RBI=0.0627645;REFB=-0.0105006;REVB=0.0455228;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662608;STB=0.538383;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.0138378;OID=.;OPOS=92819139;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:3:7:5:3:3:7:5:3
chr12	92819466	.	C	T	257.73	PASS	AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.00206704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.112;QD=19.825;RBI=0.00828823;REFB=0.0115136;REVB=0.00802633;RO=24;SAF=16;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114445;STB=0.573833;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-0.0107249;OID=.;OPOS=92819466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:25:27:27:0.519231:11:16:11:13:11:16:11:14
chr12	93102295	.	G	A	1283.4	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0476821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6387;QD=61.8504;RBI=0.0477726;REFB=0;REVB=-0.00294023;RO=0;SAF=36;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00020994;OID=.;OPOS=93102295;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:47:36:0:0:47:36:0:0
chr12	93147907	.	A	T	1803.81	PASS	AF=1;AO=117;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.468;QD=61.1462;RBI=0.0503698;REFB=0;REVB=0.0430561;RO=0;SAF=74;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011274;OID=.;OPOS=93147907;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:118:0:0:117:118:1:43:74:0:0:43:75:0:0
chr12	93150102	.	T	C	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.04;QD=64.4146;RBI=0.0362954;REFB=0;REVB=0.0180036;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165459;OID=.;OPOS=93150102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0
chr12	93155535	.	G	A	1549.22	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.844;QD=63.8854;RBI=0.0455477;REFB=0;REVB=0.0333567;RO=0;SAF=52;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21374e-05;OID=.;OPOS=93155535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:45:52:0:0:45:52:0:0
chr12	93166538	.	A	G	917.57	PASS	AF=0.831325;AO=69;DP=83;FAO=69;FDP=83;FR=.;FRO=14;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00928553;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=241.583;QD=44.2203;RBI=0.0247295;REFB=-0.145772;REVB=0.02292;RO=9;SAF=32;SAR=37;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0921254;STB=0.530225;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00206414;OID=.;OPOS=93166538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:83:83:9:14:69:69:0.831325:37:32:8:1:37:32:9:5
chr12	93196422	.	T	G	251.17	PASS	AF=0.875;AO=21;DP=24;FAO=21;FDP=24;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00489306;FXX=0;HRUN=9;LEN=1;MLLD=251.73;QD=41.8618;RBI=0.0157643;REFB=-0.117967;REVB=0.0149857;RO=1;SAF=13;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341946;STB=0.506323;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0010062;OID=.;OPOS=93196422;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:24:24:1:3:21:21:0.875:8:13:1:0:8:13:2:1
chr12	93202801	.	C	T	1187.89	PASS	AF=1;AO=68;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0289819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.521;QD=60.9172;RBI=0.0465788;REFB=0;REVB=0.0364641;RO=0;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109243;OID=.;OPOS=93202801;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:68:78:1:29:39:0:0:38:40:0:0
chr12	93692934	.	G	A	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00623864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.831;QD=59.4346;RBI=0.0166232;REFB=0;REVB=0.0154081;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.65882e-05;OID=.;OPOS=93692934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr12	93803699	.	T	A	435.6	PASS	AF=0.52439;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=0.0112496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.735;QD=21.2486;RBI=0.0348086;REFB=-0.0201691;REVB=0.0329407;RO=39;SAF=18;SAR=25;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211278;STB=0.616539;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0131645;OID=.;OPOS=93803699;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:39:39:43:43:0.52439:25:18:26:13:25:18:26:13
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chr12	93968197	.	T	C	83.37	PASS	AF=0.226415;AO=11;DP=52;FAO=12;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=0.0225271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4047;QD=6.2923;RBI=0.0251087;REFB=-0.00946035;REVB=0.0110896;RO=41;SAF=4;SAR=7;SRF=30;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431804;STB=0.781215;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0224588;OID=.;OPOS=93968197;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:52:53:41:41:11:12:0.226415:7:4:30:11:8:4:30:11
chr12	93968256	.	G	A	217.87	PASS	AF=0.412698;AO=24;DP=62;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=-0.010481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.318;QD=13.8327;RBI=0.0244855;REFB=-0.0111375;REVB=-0.0221289;RO=36;SAF=16;SAR=8;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0331653;STB=0.507199;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0307667;OID=.;OPOS=93968256;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:36:37:24:26:0.412698:8:16:25:11:8:18:26:11
chr12	93968288	.	C	A	270.83	PASS	AF=0.509804;AO=17;DP=50;FAO=26;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.00247299;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.815;QD=21.2415;RBI=0.00549552;REFB=-0.00557835;REVB=-0.00490765;RO=18;SAF=12;SAR=5;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249422;STB=0.59042;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.000648571;OID=.;OPOS=93968288;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:18:23:17:26:0.509804:5:12:8:10:7:19:13:10
chr12	93968353	.	C	CT,T	304.79	PASS	AF=0.566667,0;AO=26,3;DP=61;FAO=34,0;FDP=60;FR=.;FRO=26;FSAF=26,0;FSAR=8,0;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=0.0221161,0.0134788;FXX=0.0163908;HRUN=0,3;LEN=1,1;MLLD=85.8585,82.5863;QD=20.319;RBI=0.0264323,0.0137475;REFB=-0.029626,-0.0313707;REVB=0.0144755,0.00270485;RO=31;SAF=20,1;SAR=6,2;SRF=26;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.10068,-0.540824;STB=0.526595,0.5;STBP=0.705,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0112583,0;OID=.,.;OPOS=93968354,93968353;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:31:26:26,3:34,0:0.566667,0:6,2:20,1:26:5:8,0:26,0:21:5
chr12	94132186	.	T	A	178.16	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=60;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0175032;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.224;QD=12.2868;RBI=0.042373;REFB=-0.0285061;REVB=-0.038589;RO=38;SAF=18;SAR=4;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.401741;STB=0.747045;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0277496;OID=.;OPOS=94132186;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:58:38:36:22:22:0.37931:4:18:19:19:4:18:17:19
chr12	94243853	.	C	T	222.62	PASS	AF=0.337349;AO=27;DP=82;FAO=28;FDP=83;FR=.;FRO=55;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=29;FSRR=26;FWDB=-0.0210854;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.317;QD=10.7288;RBI=0.0277141;REFB=-0.0310763;REVB=-0.0179855;RO=54;SAF=16;SAR=11;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0647686;STB=0.529595;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0628785;OID=.;OPOS=94243853;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:54:55:27:28:0.337349:11:16:29:25:12:16:29:26
chr12	94543506	.	C	T	1036.47	PASS	AF=0.9125;AO=74;DP=82;FAO=73;FDP=80;FR=.;FRO=7;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.129853;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5732;QD=51.8234;RBI=0.12986;REFB=-0.223303;REVB=0.00135805;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.520542;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0154063;OID=.;OPOS=94543506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:82:80:0:7:74:73:0.9125:39:35:0:0:38:35:5:2
chr12	94645255	.	A	G	1591.13	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163307;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.558;QD=64.2882;RBI=0.0174529;REFB=0;REVB=-0.00615725;RO=0;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.09574e-05;OID=.;OPOS=94645255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:99:0:0:99:99:1:45:54:0:0:45:54:0:0
chr12	94671743	.	G	C	1139.02	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0281103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.173;QD=59.17;RBI=0.0404224;REFB=-0.0113276;REVB=0.0290479;RO=1;SAF=35;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114027;STB=0.506023;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=5.20092e-05;OID=.;OPOS=94671743;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:41:35:0:1:41:35:0:1
chr12	94673277	.	G	A	128.84	PASS	AF=0.365854;AO=15;DP=41;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0110779;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.706;QD=12.5695;RBI=0.0110992;REFB=-0.00145026;REVB=-0.000687547;RO=26;SAF=7;SAR=8;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00555343;STB=0.503264;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.00277505;OID=.;OPOS=94673277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:26:15:15:0.365854:8:7:12:14:8:7:12:14
chr12	94673509	.	GCCCCCA	GCCCCA,GCCCCAC	266.34	PASS	AF=1,0;AO=20,3;DP=23;FAO=23,0;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0;FSAR=15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0023385,-0.19861;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=18.7924,3.41159;QD=46.3203;RBI=0.052441,0.251328;REFB=0,0;REVB=-0.0523888,-0.154012;RO=0;SAF=7,1;SAR=13,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0.365854,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.00207862,0;OID=.,.;OPOS=94673510,94673514;OREF=C,CA;OALT=-,AC;OMAPALT=GCCCCA,GCCCCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:20,3:23:23,0:23:0:8,0:15,0:0:0:4:0:7,1:13,2:0:0
chr12	94769758	.	A	G	740.41	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0446215;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.108;QD=56.9547;RBI=0.0453903;REFB=0;REVB=-0.00831853;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12504e-05;OID=.;OPOS=94769758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:21:31:0:0:21:31:0:0
chr12	94772742	.	C	T	200.77	PASS	AF=0.540541;AO=19;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0851243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.816;QD=21.7044;RBI=0.085169;REFB=-0.0326875;REVB=-0.00275797;RO=16;SAF=5;SAR=14;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501753;STB=0.526289;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0204199;OID=.;OPOS=94772742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:17:19:20:0.540541:14:5:5:11:15:5:5:12
chr12	94909268	.	C	T	65.31	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0107191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.013;QD=10.8847;RBI=0.0613824;REFB=-0.00393283;REVB=-0.0604392;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276263;STB=0.666296;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0223794;OID=.;OPOS=94909268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:3:6:6:9:3:6:6:9
chr12	94909304	.	A	G	492.8	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0417572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.086;QD=57.976;RBI=0.0916664;REFB=0;REVB=0.0816031;RO=0;SAF=7;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000725976;OID=.;OPOS=94909304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:34:0:0:30:34:1:23:7:0:0:24:10:0:0
chr12	94955644	.	G	T	157.26	PASS	AF=0.278481;AO=22;DP=79;FAO=22;FDP=79;FR=.;FRO=57;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=27;FWDB=-0.0323844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.038;QD=7.96237;RBI=0.0533772;REFB=-0.00677694;REVB=-0.0424309;RO=57;SAF=10;SAR=12;SRF=30;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0862296;STB=0.551677;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0207349;OID=.;OPOS=94955644;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:57:57:22:22:0.278481:12:10:30:27:12:10:30:27
chr12	95470600	.	A	ATCTT,T	1268.3	PASS	AF=1,0;AO=65,4;DP=92;FAO=83,0;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=41,0;FSAR=42,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414262,-0.0182507;FXX=0.0235266;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=191.684,81.4464;QD=61.1228;RBI=0.0573343,0.0184104;REFB=0,0;REVB=0.039637,-0.0024193;RO=9;SAF=33,0;SAR=32,4;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0618326,-0.767041;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=8.77726e-05,0;OID=.,.;OPOS=95470601,95470600;OREF=-,A;OALT=TCTT,T;OMAPALT=ATCTT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:92:83:9:0:65,4:83,0:1,0:32,4:33,0:7:2:42,0:41,0:0:0
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chr12	95478353	.	C	T	114.36	PASS	AF=0.288462;AO=15;DP=53;FAO=15;FDP=52;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0219885;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.385;QD=8.79658;RBI=0.0223321;REFB=-0.0087095;REVB=-0.00390267;RO=37;SAF=10;SAR=5;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05797;STB=0.535163;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.026584;OID=.;OPOS=95478353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:37:37:15:15:0.288462:5:10:23:14:5:10:23:14
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chr12	95604290	.	T	C	232.05	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.00439857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.447;QD=14.7336;RBI=0.0148069;REFB=0.00404471;REVB=-0.0141385;RO=33;SAF=5;SAR=22;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475177;STB=0.78938;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.0115603;OID=.;OPOS=95604290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:33:36:27:27:0.428571:22:5:21:12:22:5:24:12
chr12	95637234	.	C	T	64.57	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=-0.0720669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5255;QD=11.2291;RBI=0.0740351;REFB=-0.0416816;REVB=-0.0169578;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.46905;STB=0.77936;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0569984;OID=.;OPOS=95637234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:23:23:13:14:9:9:0.391304:4:5:1:12:4:5:1:13
chr12	95681554	.	C	T	278.89	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.0188931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.345;QD=16.4053;RBI=0.0189333;REFB=0.00322928;REVB=0.00123293;RO=37;SAF=13;SAR=18;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244059;STB=0.636786;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=-0.00275458;OID=.;OPOS=95681554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:37:37:31:31:0.455882:18:13:25:12:18:13:25:12
chr12	95694394	.	G	A	446.93	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.006292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.06;QD=57.6679;RBI=0.00730108;REFB=0;REVB=0.00370358;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.65508e-05;OID=.;OPOS=95694394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:18:13:0:0:18:13:0:0
chr12	95695804	.	C	A	52.86	PASS	AF=0.266667;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0633585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.733;QD=7.04769;RBI=0.107005;REFB=-0.00397948;REVB=-0.0862303;RO=21;SAF=1;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.578983;STB=0.874063;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0411722;OID=.;OPOS=95695804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:30:21:22:8:8:0.266667:7:1:13:8:7:1:14:8
chr12	95906603	.	C	A	216.71	PASS	AF=0.431034;AO=24;DP=60;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.0402746;FXX=0.0333278;HRUN=2;LEN=1;MLLD=215.017;QD=14.9455;RBI=0.0447959;REFB=-0.0156539;REVB=-0.0196119;RO=31;SAF=15;SAR=9;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234835;STB=0.639888;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.021913;OID=.;OPOS=95906603;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:58:31:33:24:25:0.431034:9:15:12:19:9:16:13:20
chr12	95927762	.	T	C	531.29	PASS	AF=0.482759;AO=56;DP=116;FAO=56;FDP=116;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=20;FWDB=0.0484951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9244;QD=18.3204;RBI=0.0700649;REFB=-0.00363003;REVB=0.05057;RO=59;SAF=30;SAR=26;SRF=39;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118034;STB=0.568726;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.00396556;OID=.;OPOS=95927762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:59:60:56:56:0.482759:26:30:39:20:26:30:40:20
chr12	96052721	.	G	A	225.03	PASS	AF=0.440678;AO=25;DP=58;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.0230328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.579;QD=15.256;RBI=0.0246275;REFB=-0.00901607;REVB=0.00871807;RO=33;SAF=15;SAR=10;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146417;STB=0.590958;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.00953472;OID=.;OPOS=96052721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:33:33:25:26:0.440678:10:15:15:18:10:16:15:18
chr12	96260947	.	A	G	584.98	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.7946;QD=59.9977;RBI=0.036266;REFB=0;REVB=-0.0341642;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000803508;OID=.;OPOS=96260947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:19:19:0:0:20:19:0:0
chr12	96284650	.	A	G	610.05	PASS	AF=0.97619;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000109181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.248;QD=58.0996;RBI=0.012237;REFB=-0.0859184;REVB=0.0122365;RO=0;SAF=9;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54184e-08;STB=0.507689;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00189993;OID=.;OPOS=96284650;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:41:42:0:1:40:41:0.97619:31:9:0:0:32:9:0:1
chr12	96288860	.	T	C	590.96	PASS	AF=0.397661;AO=68;DP=170;FAO=68;FDP=171;FR=.;FRO=103;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=45;FSRR=58;FWDB=0.0286824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.58;QD=13.8237;RBI=0.0300607;REFB=-0.0137677;REVB=0.00899787;RO=102;SAF=26;SAR=42;SRF=45;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651485;STB=0.534207;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0217229;OID=.;OPOS=96288860;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:171:102:103:68:68:0.397661:42:26:45:57:42:26:45:58
chr12	96374563	.	T	C	662.39	PASS	AF=0.894737;AO=51;DP=58;FAO=51;FDP=57;FR=.;FRO=6;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00384352;FXX=0.0172384;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.066;QD=46.4832;RBI=0.00733919;REFB=-0.023098;REVB=0.00625228;RO=6;SAF=25;SAR=26;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0309998;STB=0.516522;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.00050226;OID=.;OPOS=96374563;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:58:57:6:6:51:51:0.894737:26:25:2:4:26:25:2:4
chr12	96374614	.	C	T	465.11	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.941;QD=58.1384;RBI=0.0226454;REFB=0;REVB=0.0100872;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.91667e-05;OID=.;OPOS=96374614;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
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chr12	97098549	.	T	A,C	507.89	PASS	AF=0.0571429,0.942857;AO=3,32;DP=35;FAO=2,33;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=1,21;FSAR=1,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0494072,0.0198233;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=67.5998,50.7647;QD=58.044;RBI=0.0534157,0.0244444;REFB=0,0;REVB=-0.0203021,0.0143028;RO=0;SAF=1,21;SAR=2,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0915316,0.00655353;OID=.,.;OPOS=97098549,97098549;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:35:35:0:0:3,32:2,33:0.0571429,0.942857:2,11:1,21:0:0:1,12:1,21:0:0
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chr12	97114231	.	G	A	166.37	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0526786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.009;QD=14.7886;RBI=0.0543874;REFB=-0.00666416;REVB=0.0135258;RO=27;SAF=14;SAR=4;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.465653;STB=0.769696;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0283939;OID=.;OPOS=97114231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:4:14:9:18:4:14:9:18
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chr12	97136239	.	G	A	734.59	PASS	AF=0.979167;AO=46;DP=46;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00946255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.534;QD=61.216;RBI=0.0139193;REFB=-0.250604;REVB=0.0102082;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.508768;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000854867;OID=.;OPOS=97136239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:46:48:0:1:46:47:0.979167:18:28:0:0:19:28:1:0
chr12	97254620	.	G	A	1472.57	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.446;QD=63.3365;RBI=0.0320574;REFB=0;REVB=0.0281747;RO=0;SAF=44;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.13099e-05;OID=.;OPOS=97254620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:92:93:1:48:44:0:0:48:45:0:0
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chr12	98897267	.	C	T	632.12	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7959;QD=61.6704;RBI=0.0636621;REFB=0;REVB=0.0503967;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00109915;OID=.;OPOS=98897267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
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chr12	99640428	.	T	C	1989.69	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00432083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.361;QD=62.1777;RBI=0.0163947;REFB=0;REVB=0.015815;RO=0;SAF=63;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.21543e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.22117e-06;OID=.;OPOS=99640428;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:128:0:0:127:128:1:64:63:0:0:64:64:0:0
chr12	99640557	.	T	C	1989.89	PASS	AF=1;AO=126;DP=127;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0394249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.088;QD=62.1842;RBI=0.047309;REFB=0;REVB=0.02615;RO=0;SAF=55;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.23382e-05;OID=.;OPOS=99640557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:128:0:0:126:128:1:71:55:0:0:72:56:0:0
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chr12	101018014	.	T	C	43.6	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.0177539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7832;QD=6.01362;RBI=0.0288931;REFB=0.00287808;REVB=0.0227949;RO=22;SAF=4;SAR=3;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136586;STB=0.587392;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=-0.0211477;OID=.;OPOS=101018014;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:22:22:7:7:0.241379:3:4:15:7:3:4:15:7
chr12	101520689	.	A	G	181.33	PASS	AF=0.392857;AO=21;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0027508;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1477;QD=12.9522;RBI=0.0313884;REFB=-0.0105833;REVB=0.0312677;RO=34;SAF=9;SAR=12;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2;STB=0.624888;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0135512;OID=.;OPOS=101520689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:34:21:22:0.392857:12:9:21:13:13:9:21:13
chr12	101522078	.	C	G	200.0	PASS	AF=0.40678;AO=24;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0210632;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.265;QD=13.5594;RBI=0.0280693;REFB=-0.00641136;REVB=0.0185534;RO=35;SAF=9;SAR=15;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883059;STB=0.550618;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0104164;OID=.;OPOS=101522078;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:35:35:24:24:0.40678:15:9:16:19:15:9:16:19
chr12	101552075	.	G	A	1325.29	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0841936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5705;QD=60.9327;RBI=0.0972195;REFB=-0.115174;REVB=0.0486114;RO=1;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114156;STB=0.506023;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000765291;OID=.;OPOS=101552075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:87:87:1:1:86:86:0.988506:41:45:0:1:41:45:0:1
chr12	101560328	.	C	A	244.35	PASS	AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0156852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3422;QD=17.4537;RBI=0.0631849;REFB=-0.00405943;REVB=-0.0612071;RO=29;SAF=8;SAR=19;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218517;STB=0.6233;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.00474373;OID=.;OPOS=101560328;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:19:8:15:14:19:8:15:14
chr12	101561940	.	A	T	87.46	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0142337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.922;QD=13.456;RBI=0.0188128;REFB=-0.0175802;REVB=0.0123014;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272488;STB=0.661345;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0210753;OID=.;OPOS=101561940;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:3:8:7:8:3:8:7:8
chr12	101587518	.	C	T	260.12	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.00152642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.189;QD=16.7821;RBI=0.00172007;REFB=-0.00375739;REVB=-0.000792891;RO=33;SAF=9;SAR=20;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148622;STB=0.583881;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00520907;OID=.;OPOS=101587518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:20:9:15:18:20:9:15:18
chr12	101683929	.	C	T	304.91	PASS	AF=0.586957;AO=27;DP=46;FAO=27;FDP=46;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00716656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.953;QD=26.5137;RBI=0.00818545;REFB=-0.00728617;REVB=-0.003955;RO=18;SAF=12;SAR=15;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512186;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0050813;OID=.;OPOS=101683929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:19:27:27:0.586957:15:12:8:10:15:12:9:10
chr12	101732670	.	C	T	56.14	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0183116;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.9;QD=22.4557;RBI=0.0360832;REFB=-0.0417694;REVB=0.0310915;RO=3;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122639;STB=0.571224;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.021169;OID=.;OPOS=101732670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:11:10:3:3:7:7:0.7:4:3:2:1:4:3:2:1
chr12	101750814	.	T	A	801.31	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.798;QD=57.2364;RBI=0.0399191;REFB=0;REVB=-0.0377079;RO=0;SAF=33;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.53363e-05;OID=.;OPOS=101750814;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:23:33:0:0:23:33:0:0
chr12	101755809	.	T	C	271.38	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.00770864;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=306.135;QD=23.5981;RBI=0.0133708;REFB=-0.00482462;REVB=0.010925;RO=21;SAF=19;SAR=6;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143909;STB=0.580717;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00364709;OID=.;OPOS=101755809;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:6:19:13:8:6:19:13:8
chr12	101866174	.	C	A	621.79	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.023989;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7426;QD=62.1794;RBI=0.0858172;REFB=0;REVB=-0.0823962;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115091;OID=.;OPOS=101866174;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:26:14:0:0:26:14:0:0
chr12	102064118	.	T	C	1053.47	PASS	AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0110538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.846;QD=56.9443;RBI=0.0513019;REFB=-0.209437;REVB=-0.0500969;RO=2;SAF=36;SAR=36;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255483;STB=0.51351;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.00532365;OID=.;OPOS=102064118;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:74:74:2:2:72:72:0.972973:36:36:2:0:36:36:2:0
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chr12	102079418	.	G	A	902.68	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0334487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.047;QD=58.2374;RBI=0.0562973;REFB=0;REVB=0.0452832;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.99955e-05;OID=.;OPOS=102079418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:26:36:0:0:26:36:0:0
chr12	102108345	.	T	C	641.09	PASS	AF=0.465278;AO=46;DP=143;FAO=67;FDP=144;FR=.,HEALED;FRO=77;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=40;FWDB=-0.0986561;FXX=0.0204068;HRUN=8;LEN=1;MLLD=27.9555;QD=17.8081;RBI=0.112894;REFB=0.0122406;REVB=-0.0548814;RO=45;SAF=22;SAR=24;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103788;STB=0.5144;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.0202573;OID=.;OPOS=102108345;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:144:45:77:46:67:0.465278:24:22:21:24:33:34:37:40
chr12	102117589	.	C	T	1282.34	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00569065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3946;QD=61.7996;RBI=0.0391753;REFB=0;REVB=-0.0387597;RO=0;SAF=38;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.26493e-05;OID=.;OPOS=102117589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:45:38:0:0:45:38:0:0
chr12	102158191	.	G	A	256.48	PASS	AF=0.4;AO=19;DP=67;FAO=26;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=35;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0124092;FXX=0.0298463;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.195;QD=15.7836;RBI=0.0142047;REFB=-0.0212881;REVB=0.00691268;RO=22;SAF=15;SAR=4;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.55201;STB=0.631872;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0221649;OID=.;OPOS=102158191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:65:22:35:19:26:0.4:4:15:4:18:11:15:12:23
chr12	102158763	.	T	C	814.36	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.169;QD=56.1628;RBI=0.0571779;REFB=0;REVB=0.0374701;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105972;OID=.;OPOS=102158763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:56:58:1:26:30:0:0:27:31:0:0
chr12	102173654	.	T	C	851.19	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0870631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1479;QD=57.7078;RBI=0.0948055;REFB=0;REVB=0.0375248;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000471958;OID=.;OPOS=102173654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:30:29:0:0:30:29:0:0
chr12	102279115	.	C	T	172.04	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.0373681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7198;QD=18.1099;RBI=0.0645919;REFB=0.00296466;REVB=-0.0526853;RO=20;SAF=10;SAR=8;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0895477;STB=0.550843;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=-0.00617665;OID=.;OPOS=102279115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:8:10:13:7:8:10:13:7
chr12	102279193	.	G	A	542.17	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00584966;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2021;QD=60.2411;RBI=0.0108759;REFB=0;REVB=0.00916878;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115725;OID=.;OPOS=102279193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0
chr12	102315359	.	G	T	208.4	PASS	AF=0.488372;AO=16;DP=44;FAO=21;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.015409;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.611;QD=19.3863;RBI=0.0158425;REFB=-0.00980417;REVB=-0.00368065;RO=22;SAF=13;SAR=3;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368517;STB=0.654572;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0183193;OID=.;OPOS=102315359;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:22:22:16:21:0.488372:3:13:11:11:5:16:11:11
chr12	102321186	.	CTTTT	CTTTC,CT,CTT,CTTT,TTCTT	245.33	PASS	AF=0.219512,0.585366,0.195122,0,0;AO=4,13,6,5,2;DP=41;FAO=9,24,8,0,0;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=2,21,7,0,0;FSAR=7,3,1,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00117976,0.0618074,0.0922184,0.179291,0.0192877;FXX=0.0238039;HRUN=15,15,15,15,1;LEN=1,3,2,1,3;MLLD=241.648,11.3703,7.91978,2.52101,21.2661;QD=23.9345;RBI=0.00351298,0.0630118,0.0932,0.180083,0.0816968;REFB=-0.0165668,-0.0564183,-0.0515111,-0.0330928,0.0101296;REVB=-0.00330895,-0.0122607,-0.013491,-0.0168725,-0.0793874;RO=0;SAF=1,11,6,5,2;SAR=3,2,0,0,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=-4.86674e-08,0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1;TYPE=snp,del,del,del,mnp;VARB=0.00586829,0.0348535,-0.0685147,0.0560592,0;OID=.,.,.,.,.;OPOS=102321190,102321187,102321187,102321187,102321186;OREF=T,TTT,TT,T,CTT;OALT=C,-,-,-,TTC;OMAPALT=CTTTC,CT,CTT,CTTT,TTCTT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:58:41:41:0:0:4,13,6,5,2:9,24,8,0,0:0.219512,0.585366,0.195122,0,0:3,2,0,0,0:1,11,6,5,2:0:0:7,3,1,0,0:2,21,7,0,0:0:0
chr12	102321583	.	C	T	142.98	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=-0.0347074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1068;QD=10.791;RBI=0.0597531;REFB=-0.0216741;REVB=-0.0486398;RO=34;SAF=10;SAR=8;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21058;STB=0.608583;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0451802;OID=.;OPOS=102321583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:34:35:18:18:0.339623:8:10:25:9:8:10:25:10
chr12	102455729	.	G	A	338.17	PASS	AF=0.522388;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.00336104;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.587;QD=20.1895;RBI=0.0055923;REFB=-0.00583051;REVB=-0.00446959;RO=31;SAF=21;SAR=14;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114203;STB=0.512493;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.004772;OID=.;OPOS=102455729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:31:32:35:35:0.522388:14:21:19:12:14:21:20:12
chr12	102517699	.	T	C	270.56	PASS	AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=18;FWDB=-0.0121772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.631;QD=14.43;RBI=0.0741476;REFB=-0.0144533;REVB=0.0731408;RO=43;SAF=19;SAR=12;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00888467;STB=0.513505;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0160635;OID=.;OPOS=102517699;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:43:44:31:31:0.413333:12:19:26:17:12:19:26:18
chr12	102517804	.	G	A	143.01	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.0591497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.79;QD=10.7934;RBI=0.0668272;REFB=-0.0184892;REVB=-0.0310995;RO=34;SAF=11;SAR=7;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265565;STB=0.527203;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0405177;OID=.;OPOS=102517804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:34:35:18:18:0.339623:7:11:20:14:7:11:20:15
chr12	102545563	.	A	G	236.27	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0303365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.923;QD=17.5012;RBI=0.0303382;REFB=-0.0129828;REVB=-0.000319869;RO=27;SAF=14;SAR=12;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517474;STB=0.519985;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0230848;OID=.;OPOS=102545563;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:28:26:26:0.481481:12:14:13:14:12:14:14:14
chr12	102611196	.	AC	AA,A	193.59	PASS	AF=0.0188679,0.433962;AO=2,20;DP=53;FAO=1,23;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=1,18;FSAR=0,5;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0162159,-0.0260902;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=28.974,24.1352;QD=14.6104;RBI=0.0610285,0.119432;REFB=0.0181969,0.0392456;REVB=0.0588347,0.116547;RO=28;SAF=1,16;SAR=1,4;SRF=13;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0322576,0.384952;STB=0.99082,0.708997;STBP=0.266,0.015;TYPE=snp,del;VARB=0.0307582,-0.0432972;OID=.,.;OPOS=102611197,102611197;OREF=C,C;OALT=A,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0188679,0.433962:2,20:53:1,23:53:29:1,18:0,5:13:16:99:28:1,16:1,4:13:15
chr12	102611371	.	T	G	72.34	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.140093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9916;QD=8.51003;RBI=0.142462;REFB=3.27883e-05;REVB=-0.0258741;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00629567;OID=.;OPOS=102611371;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:5:5:12:12:5:5:12:12
chr12	103237468	.	G	C	837.1	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0042254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.02;QD=55.8067;RBI=0.0654332;REFB=-0.0654654;REVB=-0.0652966;RO=1;SAF=41;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254873;STB=0.513509;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=8.68402e-05;OID=.;OPOS=103237468;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:18:41:0:1:18:41:0:1
chr12	103246700	.	C	T	376.32	PASS	AF=1;AO=25;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.114217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.84;QD=55.7513;RBI=0.132647;REFB=0;REVB=0.0674526;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000806825;OID=.;OPOS=103246700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:25:27:1:19:6:0:0:20:7:0:0
chr12	103558235	.	G	A	164.39	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.0191705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.092;QD=13.6995;RBI=0.0227955;REFB=-0.00873699;REVB=-0.0123341;RO=29;SAF=14;SAR=4;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776908;STB=0.565141;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.0221364;OID=.;OPOS=103558235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:29:30:18:18:0.375:4:14:21:8:4:14:21:9
chr12	103670917	.	A	G	554.65	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.08696;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.193;QD=55.4648;RBI=0.0893685;REFB=-0.162544;REVB=0.0206077;RO=0;SAF=22;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529396;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00273927;OID=.;OPOS=103670917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:0:2:38:38:0.95:16:22:0:0:16:22:0:2
chr12	103696182	.	T	G	206.01	PASS	AF=0.378788;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=66;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=30;FSRR=11;FWDB=-0.0174449;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.662;QD=12.4852;RBI=0.0351767;REFB=-0.0294806;REVB=-0.0305463;RO=37;SAF=17;SAR=8;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096159;STB=0.537882;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0411038;OID=.;OPOS=103696182;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:66:37:41:25:25:0.378788:8:17:28:9:8:17:30:11
chr12	103872172	.	T	G	239.96	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.00696553;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.356;QD=20.4222;RBI=0.0796724;REFB=-0.0139808;REVB=0.0793673;RO=24;SAF=11;SAR=12;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0560942;STB=0.531571;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0123197;OID=.;OPOS=103872172;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:24:24:23:23:0.489362:12:11:10:14:12:11:10:14
chr12	104048454	.	C	A	175.15	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.0221037;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.646;QD=20.0176;RBI=0.0226095;REFB=-0.0406333;REVB=-0.00475558;RO=17;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804767;STB=0.545405;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.0347713;OID=.;OPOS=104048454;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:8:10:11:6:8:10:11:6
chr12	104067812	.	C	T	727.1	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0779344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.355;QD=63.2263;RBI=0.0781844;REFB=0;REVB=0.00624777;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166317;OID=.;OPOS=104067812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:20:25:0:0:20:26:0:0
chr12	104086631	.	C	T	651.23	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0843062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.725;QD=62.022;RBI=0.0844505;REFB=0;REVB=0.00493514;RO=0;SAF=10;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.96961e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.41389e-05;OID=.;OPOS=104086631;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:32:10:0:0:32:10:0:0
chr12	104092996	.	T	C	378.34	PASS	AF=0.351145;AO=46;DP=131;FAO=46;FDP=131;FR=.;FRO=85;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=52;FWDB=-0.00231003;FXX=0.00757518;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6445;QD=11.5523;RBI=0.00346864;REFB=-0.0228326;REVB=-0.00258752;RO=81;SAF=22;SAR=24;SRF=32;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0936289;STB=0.558798;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0346396;OID=.;OPOS=104092996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:81:85:46:46:0.351145:24:22:32:49:24:22:33:52
chr12	104100617	.	C	T	3302.11	PASS	AF=0.981818;AO=216;DP=220;FAO=216;FDP=220;FR=.;FRO=4;FSAF=119;FSAR=97;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0568198;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.3736;QD=60.0384;RBI=0.0568584;REFB=-0.125844;REVB=-0.00209413;RO=4;SAF=119;SAR=97;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00178166;STB=0.500935;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.000713563;OID=.;OPOS=104100617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:220:220:4:4:216:216:0.981818:97:119:2:2:97:119:2:2
chr12	104153004	.	C	G	358.39	PASS	AF=0.452381;AO=37;DP=84;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.00109507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.85;QD=17.0664;RBI=0.00767005;REFB=-0.0141825;REVB=-0.00759147;RO=45;SAF=19;SAR=18;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412014;STB=0.521399;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0166266;OID=.;OPOS=104153004;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:45:46:37:38:0.452381:18:19:25:20:18:20:26:20
chr12	104170991	.	G	A	544.99	PASS	AF=0.411765;AO=62;DP=154;FAO=63;FDP=153;FR=.;FRO=90;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=56;FSRR=34;FWDB=-0.0184286;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.382;QD=14.2482;RBI=0.0447916;REFB=-0.00675902;REVB=0.0408249;RO=89;SAF=34;SAR=28;SRF=56;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865604;STB=0.549227;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0184423;OID=.;OPOS=104170991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:154:153:89:90:62:63:0.411765:28:34:56:33:29:34:56:34
chr12	104171742	.	C	T	561.15	PASS	AF=0.657895;AO=46;DP=71;FAO=50;FDP=76;FR=.;FRO=26;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.00929819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.607;QD=29.5344;RBI=0.077355;REFB=-0.0529147;REVB=0.0767941;RO=25;SAF=24;SAR=22;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248522;STB=0.519992;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0310545;OID=.;OPOS=104171742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:76:25:26:46:50:0.657895:22:24:14:11:26:24:14:12
chr12	104186946	.	G	T	186.93	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0566502;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.044;QD=18.6933;RBI=0.06399;REFB=-0.0644321;REVB=-0.0297569;RO=20;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115002;STB=0.574511;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0487374;OID=.;OPOS=104186946;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:20:21:19:19:0.475:8:11:14:6:8:11:15:6
chr12	104187707	.	G	A	149.63	PASS	AF=0.34;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=50;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.00809193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3906;QD=11.9706;RBI=0.014393;REFB=-0.00563686;REVB=-0.0119029;RO=32;SAF=13;SAR=4;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674275;STB=0.55821;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.00652351;OID=.;OPOS=104187707;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:32:33:17:17:0.34:4:13:23:9:4:13:23:10
chr12	104208868	.	C	T	288.83	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.00888935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.404;QD=16.2721;RBI=0.0132111;REFB=0.00497255;REVB=0.00977311;RO=39;SAF=14;SAR=18;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00158878;STB=0.500894;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=-0.00966356;OID=.;OPOS=104208868;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:18:14:17:22:18:14:17:22
chr12	104235308	.	C	G	188.66	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=29;FSRR=2;FWDB=-0.00720405;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.983;QD=14.2388;RBI=0.0313874;REFB=-0.0485021;REVB=0.0305495;RO=31;SAF=18;SAR=4;SRF=29;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242321;STB=0.635038;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0679034;OID=.;OPOS=104235308;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:4:18:29:2:4:18:29:2
chr12	104254932	.	G	A	902.61	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0374585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.9162;QD=58.2326;RBI=0.144848;REFB=0;REVB=-0.139921;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00126268;OID=.;OPOS=104254932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:26:36:0:0:26:36:0:0
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chr12	104309428	.	G	C	433.12	PASS	AF=0.470588;AO=46;DP=97;FAO=48;FDP=102;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=-0.00628807;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.4346;QD=16.985;RBI=0.0522455;REFB=-0.0275533;REVB=-0.0518657;RO=51;SAF=27;SAR=19;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0592947;STB=0.54658;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0355412;OID=.;OPOS=104309428;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:102:51:54:46:48:0.470588:19:27:33:18:21:27:35:19
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chr12	104380734	.	G	A	161.45	PASS	AF=0.30137;AO=22;DP=73;FAO=22;FDP=73;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=0.013827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.518;QD=8.8468;RBI=0.0265572;REFB=0.00325542;REVB=-0.0226738;RO=51;SAF=15;SAR=7;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275154;STB=0.663566;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.00579792;OID=.;OPOS=104380734;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:51:51:22:22:0.30137:7:15:23:28:7:15:23:28
chr12	104413436	.	C	T	1518.58	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0060799;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.322;QD=63.9401;RBI=0.0134768;REFB=0;REVB=0.0120274;RO=0;SAF=52;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108894;OID=.;OPOS=104413436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:95:0:0:95:95:1:43:52:0:0:43:52:0:0
chr12	104512832	.	G	A	83.89	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0155853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0761;QD=10.1679;RBI=0.0384583;REFB=0.00331562;REVB=-0.0351588;RO=20;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252542;STB=0.677107;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.0190674;OID=.;OPOS=104512832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:20:22:11:11:0.333333:7:4:12:8:7:4:14:8
chr12	104512918	.	T	G	168.89	PASS	AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00567379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.021;QD=24.1271;RBI=0.0452996;REFB=-0.0242388;REVB=-0.0449429;RO=11;SAF=14;SAR=3;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2661;STB=0.650962;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0138558;OID=.;OPOS=104512918;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:3:14:6:5:3:14:6:5
chr12	104512943	.	ATTTTTTA	ATTTTT,ATTTTTA	75.23	PASS	AF=0.451613,0;AO=9,7;DP=31;FAO=14,0;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=6,0;FSAR=8,0;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.16297,-0.0594972;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=18.5265,9.93309;QD=9.70669;RBI=0.166611,0.0662331;REFB=-0.0770278,-0.089024;REVB=0.0346432,-0.0291018;RO=11;SAF=3,5;SAR=6,2;SRF=6;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.202897,0.184599;STB=0.648446,0.5;STBP=0.175,1;TYPE=del,del;VARB=0.0991399,0.0662385;OID=.,.;OPOS=104512949,104512944;OREF=TA,T;OALT=-,-;OMAPALT=ATTTTT,ATTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.451613,0:9,7:31:14,0:31:17:6,0:8,0:12:5:71:11:3,5:6,2:6:5
chr12	104645363	.	G	A	868.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00497266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.878;QD=57.8843;RBI=0.056701;REFB=0;REVB=0.0564826;RO=0;SAF=31;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220981;OID=.;OPOS=104645363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:29:31:0:0:29:31:0:0
chr12	104645405	.	T	C	990.97	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0387748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.955;QD=59.1626;RBI=0.06427;REFB=0;REVB=0.0512558;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000152983;OID=.;OPOS=104645405;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:35:31:0:0:36:31:0:0
chr12	104698582	.	A	G	145.83	PASS	AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=-0.0239347;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.615;QD=25.3617;RBI=0.0257254;REFB=-0.0524539;REVB=0.00943008;RO=8;SAF=8;SAR=7;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174828;STB=0.597574;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0268475;OID=.;OPOS=104698582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:8:8:15:15:0.652174:7:8:2:6:7:8:2:6
chr12	104709559	.	C	T	237.66	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=62;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0192974;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.693;QD=15.584;RBI=0.0471572;REFB=-0.0383007;REVB=-0.043028;RO=33;SAF=16;SAR=11;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0766816;STB=0.552365;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.024684;OID=.;OPOS=104709559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:33:34:27:27:0.442623:11:16:17:16:11:16:17:17
chr12	105245665	.	T	C	752.39	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0997478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.577;QD=56.7844;RBI=0.101304;REFB=0;REVB=0.0176873;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000394435;OID=.;OPOS=105245665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:29:23:0:0:30:23:0:0
chr12	105380143	.	G	A	672.29	PASS	AF=0.943396;AO=49;DP=53;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0188601;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.882;QD=50.7389;RBI=0.0245448;REFB=0.0249235;REVB=0.0157081;RO=1;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144816;STB=0.521731;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=-0.00106502;OID=.;OPOS=105380143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:53:53:1:3:49:50:0.943396:32:17:0:1:33:17:0:3
chr12	105380152	.	A	C	693.7	PASS	AF=0.962264;AO=49;DP=51;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.125469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0193;QD=52.3549;RBI=0.126738;REFB=-7.84505e-05;REVB=-0.0178883;RO=1;SAF=14;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0132589;STB=0.508109;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.00246306;OID=.;OPOS=105380152;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:51:53:1:2:49:51:0.962264:35:14:0:1:35:16:1:1
chr12	105546172	.	G	A	1659.59	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00923504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.445;QD=60.3489;RBI=0.0126379;REFB=0;REVB=0.00862733;RO=0;SAF=52;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4768e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.8991e-05;OID=.;OPOS=105546172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:58:52:0:0:58:52:0:0
chr12	105561664	.	C	T	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.406;QD=54.5177;RBI=0.017845;REFB=0;REVB=-0.00386845;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000114936;OID=.;OPOS=105561664;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0
chr12	105567068	.	T	A	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000104796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.41;QD=57.7116;RBI=0.0191845;REFB=0;REVB=-0.0191843;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.43056e-05;OID=.;OPOS=105567068;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0
chr12	105567070	.	T	A	830.71	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00855638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.995;QD=57.29;RBI=0.00922585;REFB=0;REVB=-0.00345029;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.97016e-06;OID=.;OPOS=105567070;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:33:24:0:0:34:24:0:0
chr12	105567087	.	T	TA	640.71	PASS	AF=1;AO=10;DP=56;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.19546;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.5905;QD=47.4602;RBI=0.215009;REFB=0;REVB=-0.0895785;RO=45;SAF=2;SAR=8;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356802;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00619839;OID=.;OPOS=105567088;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:56:54:54:0:22:32:0:0:12:45:2:8:21:24
chr12	105567089	.	T	A	550.79	PASS	AF=0.824561;AO=44;DP=55;FAO=47;FDP=57;FR=.;FRO=10;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0162564;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=45.5966;QD=38.6516;RBI=0.0162582;REFB=-0.130909;REVB=0.000243616;RO=11;SAF=20;SAR=24;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0687328;STB=0.550877;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0195404;OID=.;OPOS=105567089;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:55:57:11:10:44:47:0.824561:24:20:3:8:24:23:2:8
chr12	105568122	.	G	A	2665.22	PASS	AF=1;AO=170;DP=173;FAO=174;FDP=174;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0896377;FXX=0.011363;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8608;QD=61.2693;RBI=0.0921313;REFB=0;REVB=0.02129;RO=0;SAF=85;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00318155;OID=.;OPOS=105568122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:173:174:0:0:170:174:1:85:85:0:0:89:85:0:0
chr12	105568176	.	G	A	2078.14	PASS	AF=1;AO=131;DP=135;FAO=133;FDP=133;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385876;FXX=0.0148137;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.301;QD=62.5004;RBI=0.0425296;REFB=0;REVB=-0.0178819;RO=0;SAF=51;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15683e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.69088e-05;OID=.;OPOS=105568176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:135:133:0:0:131:133:1:80:51:0:0:81:52:0:0
chr12	106460938	.	G	C	316.05	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0676219;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.5769;QD=20.3901;RBI=0.0677284;REFB=-0.0172515;REVB=0.00379587;RO=29;SAF=23;SAR=10;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194673;STB=0.608397;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0371303;OID=.;OPOS=106460938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:10:23:14:15:10:23:14:15
chr12	106633569	.	C	T	338.18	PASS	AF=0.420455;AO=37;DP=88;FAO=37;FDP=88;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=29;FWDB=0.0595905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4336;QD=15.3717;RBI=0.0602976;REFB=-0.0278189;REVB=0.00920764;RO=51;SAF=24;SAR=13;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225623;STB=0.627576;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0342376;OID=.;OPOS=106633569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:51:51:37:37:0.420455:13:24:22:29:13:24:22:29
chr12	106647842	.	C	T	186.09	PASS	AF=0.411765;AO=20;DP=50;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.000782116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.0317;QD=14.5956;RBI=0.0649826;REFB=-0.00126953;REVB=-0.0649779;RO=29;SAF=10;SAR=10;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177286;STB=0.505613;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.000192621;OID=.;OPOS=106647842;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:29:30:20:21:0.411765:10:10:15:14:10:11:16:14
chr12	106704974	.	G	A	386.55	PASS	AF=0.470588;AO=40;DP=85;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=0.0453567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.517;QD=18.1906;RBI=0.0465599;REFB=0.00254231;REVB=-0.0105161;RO=45;SAF=22;SAR=18;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141516;STB=0.578908;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=-0.00402553;OID=.;OPOS=106704974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:45:45:40:40:0.470588:18:22:18:27:18:22:18:27
chr12	106826220	.	A	G	35.59	PASS	AF=0.109589;AO=7;DP=72;FAO=8;FDP=73;FR=.;FRO=65;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=0.00666178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.092;QD=1.95;RBI=0.0071875;REFB=-0.00674821;REVB=0.0026983;RO=65;SAF=2;SAR=5;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.239561;STB=0.72283;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0445329;OID=.;OPOS=106826220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:72:73:65:65:7:8:0.109589:5:2:32:33:6:2:32:33
chr12	106838340	.	T	C	242.37	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0123776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.218;QD=14.915;RBI=0.0139642;REFB=-0.00897055;REVB=0.00646482;RO=37;SAF=11;SAR=17;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0960648;STB=0.554516;STBP=0.46;TYPE=snp;VARB=0.01284;OID=.;OPOS=106838340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:17:11:18:19:17:11:18:19
chr12	106893863	.	G	T	1314.94	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0710144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.717;QD=61.8796;RBI=0.0792805;REFB=0;REVB=0.0352471;RO=0;SAF=54;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161409;OID=.;OPOS=106893863;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:30:54:0:0:30:55:0:0
chr12	106893930	.	A	T	1107.94	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.891;QD=59.0903;RBI=0.0250186;REFB=0;REVB=0.000355618;RO=1;SAF=45;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103937;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000443633;OID=.;OPOS=106893930;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:72:75:1:0:71:75:1:26:45:1:0:26:49:0:0
chr12	106903321	.	T	C	168.69	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0172247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.454;QD=16.0652;RBI=0.0236217;REFB=-0.0161738;REVB=0.0161646;RO=24;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202691;STB=0.615266;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0172137;OID=.;OPOS=106903321;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:10:8:6:18:10:8:6:18
chr12	106995136	.	G	C	352.88	PASS	AF=0.62963;AO=34;DP=54;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0440742;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.396;QD=26.1395;RBI=0.0588388;REFB=-0.0258968;REVB=0.0389805;RO=20;SAF=21;SAR=13;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116234;STB=0.56372;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0119589;OID=.;OPOS=106995136;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:20:20:34:34:0.62963:13:21:9:11:13:21:9:11
chr12	107090201	.	T	C	1435.33	PASS	AF=0.989362;AO=91;DP=96;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00487347;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.1796;QD=61.0778;RBI=0.0114601;REFB=-0.0643709;REVB=0.0103722;RO=2;SAF=49;SAR=42;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189529;STB=0.504853;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.00112093;OID=.;OPOS=107090201;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:96:94:2:1:91:93:0.989362:42:49:2:0:42:51:1:0
chr12	107395106	.	A	C,G	722.29	PASS	AF=0.0217391,0.978261;AO=2,44;DP=47;FAO=1,45;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=0,31;FSAR=1,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00855138,0.0415208;FXX=0.0212721;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=151.459,89.6677;QD=62.8081;RBI=0.00949787,0.0474667;REFB=0,0;REVB=0.00413322,0.0230024;RO=0;SAF=1,30;SAR=1,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.137021,-0.00146531;OID=.,.;OPOS=107395106,107395106;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:47:46:0:0:2,44:1,45:0.0217391,0.978261:1,14:1,30:0:0:1,14:0,31:0:0
chr12	107713511	.	G	C	85.04	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.02931;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.262;QD=22.6785;RBI=0.0295263;REFB=-0.00956174;REVB=0.00356765;RO=5;SAF=5;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176021;STB=0.599808;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.00636326;OID=.;OPOS=107713511;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:5:5:1:4:5:5:1:4
chr12	107713696	.	G	A	150.11	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0480453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.267;QD=19.3695;RBI=0.0497483;REFB=-0.0135739;REVB=0.0129053;RO=15;SAF=5;SAR=11;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.253096;STB=0.644166;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0167872;OID=.;OPOS=107713696;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:11:5:9:6:11:5:9:6
chr12	108082253	.	G	A	1246.09	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.061042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.166;QD=61.5354;RBI=0.0615072;REFB=0;REVB=-0.00755088;RO=0;SAF=41;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.99643e-05;OID=.;OPOS=108082253;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:40:41:0:0:40:41:0:0
chr12	108618630	.	C	T	735.17	PASS	AF=0.496552;AO=72;DP=145;FAO=72;FDP=145;FR=.;FRO=73;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=27;FSRR=46;FWDB=-0.0432166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.925;QD=20.2806;RBI=0.0455419;REFB=-0.0180065;REVB=0.0143663;RO=73;SAF=33;SAR=39;SRF=27;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820677;STB=0.545177;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.017718;OID=.;OPOS=108618630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:73:73:72:72:0.496552:39:33:27:46:39:33:27:46
chr12	108918146	.	C	T	2086.58	PASS	AF=0.992593;AO=134;DP=135;FAO=134;FDP=135;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0126242;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=274.006;QD=61.8245;RBI=0.0126734;REFB=-0.0848482;REVB=0.00111536;RO=0;SAF=61;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.72667e-08;STB=0.504064;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.000763509;OID=.;OPOS=108918146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:135:135:0:1:134:134:0.992593:73:61:0:0:73:61:1:0
chr12	108923950	.	A	G	520.54	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0450554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.677;QD=59.4902;RBI=0.0561104;REFB=0;REVB=-0.0334424;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.58879e-05;OID=.;OPOS=108923950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:14:20:0:0:14:21:0:0
chr12	108954823	.	C	T	1123.9	PASS	AF=0.986842;AO=74;DP=77;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0267857;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2321;QD=59.1529;RBI=0.0402868;REFB=0.0332639;REVB=0.0300924;RO=3;SAF=46;SAR=28;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00352894;STB=0.50877;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.00410513;OID=.;OPOS=108954823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:76:3:1:74:75:0.986842:28:46:2:1:28:47:0:1
chr12	108954862	.	G	C	318.27	PASS	AF=0.55;AO=32;DP=59;FAO=33;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0463628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.4343;QD=21.218;RBI=0.0488611;REFB=-0.00380989;REVB=0.0154238;RO=27;SAF=24;SAR=8;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190022;STB=0.609685;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0051913;OID=.;OPOS=108954862;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:27:27:32:33:0.55:8:24:15:12:8:25:15:12
chr12	108955106	.	C	CT	421.2	PASS	AF=1;AO=34;DP=39;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=24.0578;QD=45.5356;RBI=0.0478757;REFB=0;REVB=0.0437044;RO=4;SAF=16;SAR=18;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103497;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00197186;OID=.;OPOS=108955107;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:34:39:37:37:0:18:19:0:0:8:4:16:18:4:0
chr12	108955158	.	T	A	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.00258751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.934;QD=12.73;RBI=0.0108803;REFB=0.00980189;REVB=-0.0105682;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315875;STB=0.687091;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=-0.00734592;OID=.;OPOS=108955158;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:3:6:4:8:3:6:4:8
chr12	108985785	.	C	T	80.8	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0186097;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.197;QD=15.3909;RBI=0.0202251;REFB=-0.0443383;REVB=0.0079203;RO=11;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362236;STB=0.708714;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0309831;OID=.;OPOS=108985785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:22:21:11:11:10:10:0.47619:6:4:9:2:6:4:9:2
chr12	108986091	.	G	A	264.77	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.0230346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.913;QD=20.7661;RBI=0.0497284;REFB=-0.037212;REVB=0.0440718;RO=24;SAF=11;SAR=16;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250096;STB=0.638987;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0523019;OID=.;OPOS=108986091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:24:24:27:27:0.529412:16:11:17:7:16:11:17:7
chr12	109017898	.	C	T	176.73	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0219022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.016;QD=14.1386;RBI=0.0280029;REFB=-0.0275378;REVB=0.0174487;RO=29;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00949934;STB=0.513728;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.0279974;OID=.;OPOS=109017898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:31:19:19:0.38:9:10:15:14:9:10:17:14
chr12	109182049	.	T	C	170.19	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0650714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.125;QD=17.0189;RBI=0.065229;REFB=-0.0219363;REVB=-0.00453159;RO=22;SAF=11;SAR=7;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235552;STB=0.634468;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0314166;OID=.;OPOS=109182049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:7:11:8:14:7:11:8:14
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chr12	109511256	.	T	C	919.72	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0619992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.373;QD=58.395;RBI=0.0660901;REFB=0;REVB=0.0228911;RO=0;SAF=26;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159886;OID=.;OPOS=109511256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:36:26:0:0:36:27:0:0
chr12	109524149	.	A	G	205.26	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0389232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.168;QD=14.6616;RBI=0.0510418;REFB=0.00322903;REVB=0.0330189;RO=31;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176678;STB=0.607058;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=-0.00509091;OID=.;OPOS=109524149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:31:32:24:24:0.428571:12:12:10:21:12:12:10:22
chr12	109577735	.	C	T	136.29	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.00894496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.1;QD=10.9034;RBI=0.0224926;REFB=-0.00837209;REVB=0.0206375;RO=34;SAF=10;SAR=6;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0640885;STB=0.537997;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.024824;OID=.;OPOS=109577735;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:34:34:16:16:0.32:6:10:23:11:6:10:23:11
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chr12	109937534	.	G	A	591.5	PASS	AF=0.556701;AO=54;DP=96;FAO=54;FDP=97;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=14;FSRR=29;FWDB=-0.0115137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.104;QD=24.3916;RBI=0.0115292;REFB=-0.00145168;REVB=0.000597643;RO=42;SAF=21;SAR=33;SRF=14;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472588;STB=0.529904;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.00112376;OID=.;OPOS=109937534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:42:43:54:54:0.556701:33:21:14:28:33:21:14:29
chr12	109971481	.	C	G	167.91	PASS	AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0319869;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=294.506;QD=15.6194;RBI=0.032779;REFB=-0.0151454;REVB=-0.00716289;RO=25;SAF=1;SAR=17;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.58716;STB=0.853352;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0157974;OID=.;OPOS=109971481;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:17:1:10:15:17:1:10:15
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chr12	109994869	.	CA	CT,TC	172.37	PASS	AF=0.439024,0;AO=17,2;DP=43;FAO=18,0;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=11,0;FSAR=7,0;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.031344,-0.013076;FXX=0.0465008;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=196.331,175.195;QD=16.817;RBI=0.0369413,0.0218858;REFB=0.00070916,-0.00026716;REVB=-0.0195504,-0.0175501;RO=23;SAF=10,0;SAR=7,2;SRF=9;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.194915,-0.450372;STB=0.622506,0.5;STBP=0.215,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00174404,0;OID=.,.;OPOS=109994870,109994869;OREF=A,CA;OALT=T,TC;OMAPALT=CT,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:41:23:23:17,2:18,0:0.439024,0:7,2:10,0:9:14:7,0:11,0:9:14
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chr12	110383141	.	G	A	260.54	PASS	AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0187178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.034;QD=24.8128;RBI=0.0277338;REFB=-0.0263189;REVB=0.0204648;RO=18;SAF=11;SAR=13;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0980626;STB=0.554391;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0191366;OID=.;OPOS=110383141;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:13:11:6:12:13:11:6:12
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chr12	110386611	.	G	A	518.95	PASS	AF=0.592593;AO=48;DP=81;FAO=48;FDP=81;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.035485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9923;QD=25.6272;RBI=0.0723017;REFB=-0.00951308;REVB=-0.0629948;RO=33;SAF=23;SAR=25;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268258;STB=0.514662;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.00573659;OID=.;OPOS=110386611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:33:33:48:48:0.592593:25:23:17:16:25:23:17:16
chr12	110456175	.	A	G	205.45	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0092484;FXX=0.0249938;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.647;QD=21.0721;RBI=0.00981947;REFB=-0.0287572;REVB=-0.00329987;RO=18;SAF=9;SAR=11;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100554;STB=0.566864;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.0169505;OID=.;OPOS=110456175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:18:19:20:20:0.512821:11:9:6:12:11:9:6:13
chr12	110474070	.	T	C	250.5	PASS	AF=0.455882;AO=26;DP=63;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=0.057928;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2171;QD=14.735;RBI=0.0621645;REFB=-0.0155577;REVB=-0.0225558;RO=37;SAF=14;SAR=12;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0812418;STB=0.58456;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0193065;OID=.;OPOS=110474070;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:68:37:37:26:31:0.455882:12:14:17:20:12:19:17:20
chr12	110486272	.	T	C	44.29	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0103559;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.075;QD=6.81338;RBI=0.01148;REFB=-0.0155591;REVB=-0.00495448;RO=19;SAF=3;SAR=4;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713947;STB=0.545327;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0309441;OID=.;OPOS=110486272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:19:19:7:7:0.269231:4:3:7:12:4:3:7:12
chr12	110841379	.	G	A	1473.22	PASS	AF=0.598214;AO=133;DP=225;FAO=134;FDP=224;FR=.;FRO=90;FSAF=77;FSAR=57;FSRF=45;FSRR=45;FWDB=0.0185245;FXX=0.0132153;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.061;QD=26.3074;RBI=0.0200519;REFB=-0.0217916;REVB=0.00767598;RO=87;SAF=77;SAR=56;SRF=43;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0628192;STB=0.530384;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0118936;OID=.;OPOS=110841379;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:225:224:87:90:133:134:0.598214:56:77:43:44:57:77:45:45
chr12	110974890	.	T	C	117.44	PASS	AF=0.590909;AO=13;DP=22;FAO=13;FDP=22;FR=.;FRO=9;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0157038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.711;QD=21.3533;RBI=0.022059;REFB=-0.0307455;REVB=0.0154917;RO=9;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203205;STB=0.615207;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0195962;OID=.;OPOS=110974890;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:9:9:13:13:0.590909:5:8:3:6:5:8:3:6
chr12	111747963	.	C	T	218.54	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0117639;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.594;QD=16.8104;RBI=0.0160482;REFB=-0.0432468;REVB=-0.0109159;RO=20;SAF=17;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055851;STB=0.602747;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0232759;OID=.;OPOS=111747963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:52:20:28:24:24:0.461538:7:17:13:7:7:17:15:13
chr12	111760251	.	G	C	205.16	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0278558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.7851;QD=14.6545;RBI=0.0670023;REFB=-0.0178252;REVB=-0.0609374;RO=32;SAF=11;SAR=13;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0850273;STB=0.548299;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0303941;OID=.;OPOS=111760251;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:13:11:12:20:13:11:12:20
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chr12	111786082	.	G	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.847;QD=44.6885;RBI=0.0508855;REFB=0;REVB=0.0423151;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104799;OID=.;OPOS=111786082;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
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chr12	111798553	.	A	G	561.93	PASS	AF=0.5;AO=58;DP=114;FAO=60;FDP=120;FR=.;FRO=60;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=29;FWDB=0.00303825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.3069;QD=18.731;RBI=0.0157023;REFB=-0.0443031;REVB=-0.0154056;RO=54;SAF=37;SAR=21;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141558;STB=0.570151;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0328082;OID=.;OPOS=111798553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:120:54:60:58:60:0.5:21:37:26:28:21:39:31:29
chr12	111884608	.	T	C	1026.37	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.771;QD=59.4998;RBI=0.0222374;REFB=0;REVB=-0.00301078;RO=0;SAF=33;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.39174e-05;OID=.;OPOS=111884608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:36:33:0:0:36:33:0:0
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chr12	112451397	.	C	G	188.51	PASS	AF=0.444444;AO=18;DP=43;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00365949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6549;QD=16.7566;RBI=0.0458532;REFB=-0.00917966;REVB=0.045707;RO=25;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155977;STB=0.610509;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00994463;OID=.;OPOS=112451397;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:45:25:25:18:20:0.444444:10:8:15:10:12:8:15:10
chr12	112460147	.	T	G	205.87	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0103164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.22;QD=23.5284;RBI=0.0106223;REFB=-0.0147354;REVB=-0.00253111;RO=15;SAF=13;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146377;STB=0.582006;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0106621;OID=.;OPOS=112460147;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:7:13:7:8:7:13:7:8
chr12	112460749	.	A	G	416.28	PASS	AF=0.365672;AO=49;DP=137;FAO=49;FDP=134;FR=.;FRO=85;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=0.00329973;FXX=0.0218962;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.388;QD=12.4262;RBI=0.0188607;REFB=-0.00947462;REVB=0.0185698;RO=86;SAF=30;SAR=19;SRF=46;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886879;STB=0.561422;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.016995;OID=.;OPOS=112460749;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:134:86:85:49:49:0.365672:19:30:46:40:19:30:44:41
chr12	112477055	.	T	C	216.36	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0133245;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=245.027;QD=22.1906;RBI=0.0133246;REFB=-0.0262203;REVB=-5.01405e-05;RO=17;SAF=15;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165624;STB=0.609646;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0219393;OID=.;OPOS=112477055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:17:18:21:21:0.538462:6:15:9:8:6:15:9:9
chr12	112577990	.	T	C	103.53	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.015697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.253;QD=18.8238;RBI=0.0159874;REFB=-0.0201929;REVB=-0.00303374;RO=10;SAF=10;SAR=2;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260731;STB=0.651885;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0122713;OID=.;OPOS=112577990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:2:10:6:4:2:10:6:4
chr12	112667675	.	T	G	374.59	PASS	AF=0.587302;AO=34;DP=60;FAO=37;FDP=63;FR=.;FRO=26;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0111073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.739;QD=23.7836;RBI=0.0121337;REFB=-0.0228879;REVB=0.00488429;RO=26;SAF=19;SAR=15;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106583;STB=0.57139;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0231083;OID=.;OPOS=112667675;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:63:26:26:34:37:0.587302:15:19:11:15:15:22:11:15
chr12	112703732	.	A	C	243.06	PASS	AF=0.326087;AO=30;DP=92;FAO=30;FDP=92;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=47;FSRR=15;FWDB=0.00421786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.686;QD=10.5677;RBI=0.00522363;REFB=-0.00843456;REVB=0.00308155;RO=61;SAF=23;SAR=7;SRF=47;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00617927;STB=0.508027;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.020573;OID=.;OPOS=112703732;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:61:62:30:30:0.326087:7:23:47:14:7:23:47:15
chr12	112704961	.	A	G	164.8	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0203178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.832;QD=21.2643;RBI=0.0248306;REFB=-0.031758;REVB=-0.0142739;RO=14;SAF=12;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121635;STB=0.568881;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=0.0343896;OID=.;OPOS=112704961;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:5:12:8:6:5:12:8:6
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chr12	113313470	.	C	T	3016.81	PASS	AF=0.974874;AO=194;DP=199;FAO=194;FDP=199;FR=.;FRO=5;FSAF=116;FSAR=78;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0155938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.1743;QD=60.6394;RBI=0.0593192;REFB=-0.0769264;REVB=0.0572328;RO=2;SAF=116;SAR=78;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00197837;STB=0.500054;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.00720116;OID=.;OPOS=113313470;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:199:199:2:5:194:194:0.974874:78:116:1:1:78:116:3:2
chr12	113319600	.	C	T	583.1	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5307;QD=59.8048;RBI=0.0198495;REFB=0;REVB=0.0115947;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00382579;OID=.;OPOS=113319600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:12:26:0:0:12:27:0:0
chr12	113325629	.	T	C	1385.97	PASS	AF=0.97;AO=83;DP=101;FAO=97;FDP=100;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0344339;FXX=0.0196059;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.771;QD=55.439;RBI=0.0370401;REFB=-0.118698;REVB=0.0136483;RO=0;SAF=29;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513511;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.000480712;OID=.;OPOS=113325629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:101:100:0:3:83:97:0.97:54:29:0:0:54:43:0:3
chr12	113348870	.	G	A	313.0	PASS	AF=0.406977;AO=34;DP=85;FAO=35;FDP=86;FR=.;FRO=51;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=18;FWDB=-0.00953241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0562;QD=14.5581;RBI=0.0114968;REFB=-0.00677459;REVB=-0.00642731;RO=51;SAF=18;SAR=16;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126031;STB=0.579114;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0106159;OID=.;OPOS=113348870;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:51:51:34:35:0.406977:16:18:33:18:17:18:33:18
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chr12	113357202	.	C	T	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.00323627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.575;QD=14.7986;RBI=0.00326153;REFB=-0.0280994;REVB=-0.000405186;RO=13;SAF=6;SAR=5;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216462;STB=0.624791;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0190222;OID=.;OPOS=113357202;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:5:6:10:3:5:6:10:3
chr12	113357209	.	G	A	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.00162133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2452;QD=14.0964;RBI=0.0131868;REFB=-0.0266999;REVB=-0.0130868;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166702;STB=0.596848;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.022927;OID=.;OPOS=113357209;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:5:6:10:4:5:6:10:4
chr12	113357237	.	G	C	183.87	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00785725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4855;QD=17.9386;RBI=0.0289269;REFB=-0.0183926;REVB=-0.0278394;RO=22;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148808;STB=0.58433;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0107495;OID=.;OPOS=113357237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:9:10:15:7:9:10:15:7
chr12	113357442	.	G	A	163.55	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.00254391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2499;QD=13.3508;RBI=0.03837;REFB=0.00340644;REVB=0.0382856;RO=31;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15802;STB=0.591738;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=-0.00425138;OID=.;OPOS=113357442;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:9:9:11:20:9:9:11:20
chr12	113369715	.	TA	T	76.3	PASS	AF=0.244444;AO=10;DP=45;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00548989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.643;QD=6.78216;RBI=0.0113649;REFB=-0.000399062;REVB=-0.00995103;RO=33;SAF=6;SAR=4;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103404;STB=0.604745;STBP=0.419;TYPE=del;VARB=0.00217937;OID=.;OPOS=113369716;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.244444:10:45:11:45:34:7:4:17:17:76:33:6:4:17:16
chr12	113369759	.	G	C	50.08	PASS	AF=0.186047;AO=8;DP=43;FAO=8;FDP=43;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.00236881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.5073;QD=4.65845;RBI=0.00723864;REFB=-0.0030004;REVB=0.00684008;RO=35;SAF=5;SAR=3;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202552;STB=0.635501;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0246722;OID=.;OPOS=113369759;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:43:43:35:35:8:8:0.186047:3:5:16:19:3:5:16:19
chr12	113376388	.	G	A	179.88	PASS	AF=0.463415;AO=17;DP=37;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.111948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.3497;QD=17.5495;RBI=0.168613;REFB=-0.0577072;REVB=0.126088;RO=20;SAF=11;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967593;STB=0.506589;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.064575;OID=.;OPOS=113376388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:41:20:22:17:19:0.463415:6:11:11:9:8:11:13:9
chr12	113376452	.	C	T	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0171149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=148.899;QD=27.1543;RBI=0.0363591;REFB=-0.0699485;REVB=0.032079;RO=6;SAF=8;SAR=6;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526313;STB=0.52937;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.0171613;OID=.;OPOS=113376452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:6:8:4:2:6:8:4:2
chr12	113386950	.	T	C	885.36	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0628235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.881;QD=58.0562;RBI=0.0632495;REFB=0;REVB=0.00732841;RO=0;SAF=13;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.08033e-05;OID=.;OPOS=113386950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:48:13:0:0:48:13:0:0
chr12	113398919	.	G	A	275.41	PASS	AF=0.393443;AO=23;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0238005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.688;QD=18.0598;RBI=0.0279762;REFB=-0.0100783;REVB=-0.0147038;RO=29;SAF=7;SAR=16;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.344008;STB=0.682776;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0123716;OID=.;OPOS=113398919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:30:23:24:0.393443:16:7:19:10:16:8:20:10
chr12	113425154	.	C	G	75.05	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0639246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.965;QD=37.5259;RBI=0.0639496;REFB=0;REVB=0.00178713;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000398476;OID=.;OPOS=113425154;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:7:0:0:0:7:1:0:0
chr12	113435450	.	A	T	1540.58	PASS	AF=1;AO=102;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4318;QD=59.8284;RBI=0.0577055;REFB=0;REVB=0.0484054;RO=0;SAF=56;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.76668e-05;OID=.;OPOS=113435450;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:102:103:1:46:56:0:0:47:56:0:0
chr12	113448288	.	A	G	1302.17	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00266534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.761;QD=62.0082;RBI=0.0126581;REFB=0;REVB=0.0123743;RO=0;SAF=50;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.06517e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6811e-06;OID=.;OPOS=113448288;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:34:50:0:0:34:50:0:0
chr12	113553481	.	C	T	731.23	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0542951;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.167;QD=63.5851;RBI=0.060144;REFB=0;REVB=0.0258715;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259052;OID=.;OPOS=113553481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0
chr12	113612562	.	G	A	184.83	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0114086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.135;QD=18.4832;RBI=0.0165438;REFB=-0.0128317;REVB=0.0119809;RO=21;SAF=9;SAR=10;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0462776;STB=0.526288;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0110068;OID=.;OPOS=113612562;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:10:9:11:10:10:9:11:10
chr12	113796566	.	A	C	575.78	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.205;QD=60.6081;RBI=0.0312292;REFB=0;REVB=0.0292933;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146682;OID=.;OPOS=113796566;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr12	114362483	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00837093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=330.575;QD=60.6103;RBI=0.0192456;REFB=0;REVB=0.0173298;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.69403e-05;OID=.;OPOS=114362483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr12	114374887	.	T	C	444.73	PASS	AF=0.453704;AO=49;DP=108;FAO=49;FDP=108;FR=.;FRO=59;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=16;FSRR=43;FWDB=0.0289617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7939;QD=16.4713;RBI=0.0406065;REFB=-0.0392071;REVB=0.0284624;RO=58;SAF=21;SAR=28;SRF=16;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15607;STB=0.589993;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0397852;OID=.;OPOS=114374887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:58:59:49:49:0.453704:28:21:16:42:28:21:16:43
chr12	114377835	.	A	G	553.08	PASS	AF=0.504425;AO=57;DP=112;FAO=57;FDP=113;FR=.;FRO=56;FSAF=25;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=22;FWDB=-0.00248096;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.57;QD=19.5781;RBI=0.0180563;REFB=-0.0167659;REVB=-0.017885;RO=54;SAF=25;SAR=32;SRF=34;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167433;STB=0.583047;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0192839;OID=.;OPOS=114377835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:113:54:56:57:57:0.504425:32:25:34:20:32:25:34:22
chr12	114377877	.	T	C	415.44	PASS	AF=0.431193;AO=47;DP=109;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=-0.00362969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.41;QD=15.2455;RBI=0.012963;REFB=-0.00823996;REVB=0.0124445;RO=62;SAF=20;SAR=27;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219846;STB=0.623026;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00658483;OID=.;OPOS=114377877;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:62:62:47:47:0.431193:27:20:40:22:27:20:40:22
chr12	114377899	.	G	C	1510.83	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.01;QD=63.6138;RBI=0.042989;REFB=0;REVB=0.039724;RO=0;SAF=50;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.92826e-05;OID=.;OPOS=114377899;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:45:50:0:0:45:50:0:0
chr12	114383651	.	C	T	579.8	PASS	AF=0.43662;AO=61;DP=141;FAO=62;FDP=142;FR=.;FRO=80;FSAF=29;FSAR=33;FSRF=46;FSRR=34;FWDB=-0.00758871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.775;QD=16.3325;RBI=0.0129636;REFB=-0.0149648;REVB=-0.0105103;RO=79;SAF=28;SAR=33;SRF=46;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123984;STB=0.560189;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0172789;OID=.;OPOS=114383651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:142:79:80:61:62:0.43662:33:28:46:33:33:29:46:34
chr12	114386572	.	C	T	347.49	PASS	AF=0.514286;AO=36;DP=70;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0036497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.558;QD=19.8567;RBI=0.0369984;REFB=-0.00835494;REVB=-0.036818;RO=34;SAF=22;SAR=14;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125133;STB=0.56954;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0129444;OID=.;OPOS=114386572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:34:34:36:36:0.514286:14:22:16:18:14:22:16:18
chr12	114386639	.	A	G	356.6	PASS	AF=0.493333;AO=36;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0165482;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2896;QD=19.0189;RBI=0.0362074;REFB=-2.43795e-05;REVB=-0.0322045;RO=38;SAF=19;SAR=17;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497881;STB=0.533892;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=-0.000591737;OID=.;OPOS=114386639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:38:36:37:0.493333:17:19:18:20:17:20:18:20
chr12	114395651	.	T	C	415.92	PASS	AF=0.411765;AO=47;DP=117;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=28;FWDB=0.0336221;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.5539;QD=13.9804;RBI=0.043997;REFB=-0.0201851;REVB=0.0283776;RO=70;SAF=24;SAR=23;SRF=42;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0949973;STB=0.54116;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0302232;OID=.;OPOS=114395651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:119:70:70:47:49:0.411765:23:24:42:28:23:26:42:28
chr12	114793240	.	C	T	694.88	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258391;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.016;QD=63.1709;RBI=0.0340902;REFB=0;REVB=0.022237;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000238023;OID=.;OPOS=114793240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr12	114793732	.	C	CG	59.33	PASS	AF=0.310811;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=35;FSRR=16;FWDB=-0.0241847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=12.0243;QD=3.20726;RBI=0.0547695;REFB=-0.0861931;REVB=-0.0491406;RO=50;SAF=7;SAR=16;SRF=33;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.400917;STB=0.808733;STBP=0.002;TYPE=ins;VARB=0.128374;OID=.;OPOS=114793733;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.310811:23:74:23:74:51:5:18:35:16:59:50:7:16:33:17
chr12	115108136	.	T	C	257.25	PASS	AF=1;AO=16;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.995;QD=51.4508;RBI=0.124946;REFB=0;REVB=0.0303831;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000867204;OID=.;OPOS=115108136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:16:20:1:10:6:0:0:10:10:0:0
chr12	115112146	.	A	AC	42.6	PASS	AF=0.185714;AO=14;DP=72;FAO=13;FDP=70;FR=.;FRO=57;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=0.0203265;FXX=0.0140825;HRUN=0;LEN=1;MLLD=51.597;QD=2.43452;RBI=0.0355018;REFB=-0.0047195;REVB=-0.0291069;RO=57;SAF=4;SAR=10;SRF=33;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.360599;STB=0.768817;STBP=0.046;TYPE=ins;VARB=0.096564;OID=.;OPOS=115112147;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.185714:14:72:13:70:57:3:10:32:25:42:57:4:10:33:24
chr12	115120758	.	GGC	G,GG	524.8	PASS	AF=1,0;AO=21,13;DP=63;FAO=53,0;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=39,0;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.257767,-0.00871244;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=20.4648,10.1347;QD=39.6075;RBI=0.260023,0.690679;REFB=0,0;REVB=-0.0341762,0.690624;RO=21;SAF=17,13;SAR=4,0;SRF=4;SRR=17;SSEN=0.43408,0;SSEP=0,0.450091;SSSB=0.548493,0.84801;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.00441672,0;OID=.,.;OPOS=115120759,115120760;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:21,13:63:53,0:53:0:39,0:14,0:0:0:10:21:17,13:4,0:4:17
chr12	116155595	.	G	A	429.83	PASS	AF=0.456311;AO=47;DP=103;FAO=47;FDP=103;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=30;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=0.0639178;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2137;QD=16.6923;RBI=0.0856773;REFB=0.00428088;REVB=0.0570536;RO=56;SAF=17;SAR=30;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0867599;STB=0.548521;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=-0.00355309;OID=.;OPOS=116155595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:56:56:47:47:0.456311:30:17:25:31:30:17:25:31
chr12	116408538	.	A	G	449.09	PASS	AF=0.52381;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0109761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.589;QD=21.3853;RBI=0.0139413;REFB=-0.0145636;REVB=0.00859563;RO=40;SAF=24;SAR=20;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124884;STB=0.568934;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0134791;OID=.;OPOS=116408538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:40:40:44:44:0.52381:20:24:16:24:20:24:16:24
chr12	116446445	.	C	T	165.19	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0162349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.029;QD=12.4668;RBI=0.0294033;REFB=0.000712971;REVB=-0.0245149;RO=33;SAF=11;SAR=9;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094944;STB=0.55486;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=-0.00139786;OID=.;OPOS=116446445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:9:11:21:12:9:11:21:12
chr12	116586414	.	CTATATATATATATATATATATAC	ATATATATATATATATATATATAC,CTATATATATATATATATA,CTATATATATATATATATAC	355.73	PASS	AF=0.102041,0,0.612245;AO=3,8,17;DP=50;FAO=5,0,30;FDP=49;FR=.;FRO=14;FSAF=0,0,11;FSAR=5,0,19;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.146224,0.0684436,0.0993719;FXX=0.0925755;HRUN=1,1,1;LEN=1,5,4;MLLD=28.5789,86.8369,86.7273;QD=29.0391;RBI=0.156484,0.068835,0.131798;REFB=-0.147641,-0.117962,-0.165934;REVB=-0.0557305,-0.00732981,0.0865792;RO=11;SAF=0,7,4;SAR=3,1,13;SRF=4;SRR=7;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.605543,0.548863,-0.11571;STB=0.997477,0.5,0.544556;STBP=0.028,1,0.419;TYPE=snp,del,del;VARB=0.103057,0,0.11839;OID=.,.,.;OPOS=116586414,116586433,116586415;OREF=C,TATAC,TATA;OALT=A,-,-;OMAPALT=ATATATATATATATATATATATAC,CTATATATATATATATATA,CTATATATATATATATATAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:99:50:49:11:14:3,8,17:5,0,30:0.102041,0,0.612245:3,1,13:0,7,4:4:7:5,0,19:0,0,11:7:7
chr12	117014131	.	G	GA	105.0	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=35;FAO=21;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0368721;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.47822;QD=13.9999;RBI=0.135742;REFB=-0.022807;REVB=-0.130638;RO=18;SAF=5;SAR=9;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195583;STB=0.538425;STBP=0.504;TYPE=ins;VARB=0.0426836;OID=.;OPOS=117014132;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.7:14:35:21:30:9:9:12:5:4:21:18:5:9:10:8
chr12	117217141	.	T	C	779.33	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.723;QD=56.6788;RBI=0.0251017;REFB=0;REVB=0.0094041;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.12731e-05;OID=.;OPOS=117217141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:25:29:0:0:25:30:0:0
chr12	117289613	.	G	C	677.04	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0083999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.312;QD=60.1815;RBI=0.0599227;REFB=-0.0995764;REVB=0.059331;RO=1;SAF=27;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170841;STB=0.509087;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000633954;OID=.;OPOS=117289613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:17:27:1:0:17:27:1:0
chr12	117290182	.	T	C,TTTCCCC	438.72	PASS	AF=0.0294118,0.941176;AO=3,26;DP=34;FAO=1,32;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=0,6;FSAR=1,26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0857161,0.00674405;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,6;MLLD=33.72,262.585;QD=51.6136;RBI=0.0874523,0.0203506;REFB=-0.0294949,-0.13593;REVB=0.0173396,0.0192006;RO=3;SAF=2,4;SAR=1,22;SRF=1;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.255936,-0.062683;STB=0.989913,0.538436;STBP=0.496,0.112;TYPE=snp,ins;VARB=0.177236,0.00343806;OID=.,.;OPOS=117290182,117290183;OREF=T,-;OALT=C,TTCCCC;OMAPALT=C,TTTCCCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:5:34:34:3:1:3,26:1,32:0.0294118,0.941176:1,22:2,4:1:2:1,26:0,6:1:0
chr12	117383320	.	G	A	650.48	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00591741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2449;QD=61.9505;RBI=0.00841892;REFB=0;REVB=0.00598853;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.69627e-05;OID=.;OPOS=117383320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0
chr12	117465857	.	T	C	1475.89	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00206273;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.858;QD=63.479;RBI=0.0327516;REFB=0;REVB=0.0326866;RO=0;SAF=52;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.0217e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.23908e-05;OID=.;OPOS=117465857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:93:0:0:92:93:1:40:52:0:0:40:53:0:0
chr12	117584066	.	G	A	271.95	PASS	AF=0.359551;AO=32;DP=89;FAO=32;FDP=89;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0217378;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.813;QD=12.2226;RBI=0.0217588;REFB=-0.00304516;REVB=0.00095536;RO=54;SAF=22;SAR=10;SRF=27;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215577;STB=0.621021;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00654677;OID=.;OPOS=117584066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:54:57:32:32:0.359551:10:22:27:27:10:22:29:28
chr12	117593391	.	A	G	772.77	PASS	AF=0.401826;AO=88;DP=220;FAO=88;FDP=219;FR=.;FRO=131;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=69;FSRR=62;FWDB=-0.0658512;FXX=0.00454525;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.359;QD=14.1146;RBI=0.0676161;REFB=-0.0113143;REVB=-0.0153479;RO=130;SAF=41;SAR=47;SRF=68;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607726;STB=0.536354;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0104729;OID=.;OPOS=117593391;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:220:219:130:131:88:88:0.401826:47:41:68:62:47:41:69:62
chr12	117669914	.	G	A	173.5	PASS	AF=0.392857;AO=21;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=0.0394045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.603;QD=12.393;RBI=0.0407173;REFB=-0.00577566;REVB=-0.0102558;RO=32;SAF=8;SAR=13;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418615;STB=0.554746;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0104239;OID=.;OPOS=117669914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:34:21:22:0.392857:13:8:11:21:13:9:11:23
chr12	117685270	.	G	A	1455.35	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00510811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.027;QD=61.9299;RBI=0.0689812;REFB=0.0592188;REVB=0.0687918;RO=1;SAF=64;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00735132;STB=0.503875;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=-6.90381e-05;OID=.;OPOS=117685270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:1:1:93:93:0.989362:29:64:1:0:29:64:1:0
chr12	117693817	.	G	A	369.43	PASS	AF=1;AO=21;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115311;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=29.4662;QD=52.775;RBI=0.130782;REFB=0;REVB=0.0617035;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00612231;OID=.;OPOS=117693817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:21:28:1:12:9:0:0:17:11:0:0
chr12	117890947	.	T	C	335.82	PASS	AF=0.402174;AO=37;DP=92;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.00678273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.164;QD=14.601;RBI=0.0185348;REFB=-0.0146589;REVB=0.0172491;RO=55;SAF=23;SAR=14;SRF=26;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159166;STB=0.590398;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0201572;OID=.;OPOS=117890947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:55:55:37:37:0.402174:14:23:26:29:14:23:26:29
chr12	117894232	.	C	A	306.48	PASS	AF=0.37;AO=35;DP=101;FAO=37;FDP=100;FR=.;FRO=63;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=-0.0118947;FXX=0.0291234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.784;QD=12.2594;RBI=0.0168597;REFB=-0.00818765;REVB=-0.0119484;RO=65;SAF=18;SAR=17;SRF=39;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972274;STB=0.563309;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.013487;OID=.;OPOS=117894232;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:100:65:63:35:37:0.37:17:18:39:26:19:18:37:26
chr12	117977604	.	AG	A	66.25	PASS	AF=0.576923;AO=13;DP=27;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.146351;FXX=0.0370233;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.54888;QD=10.1916;RBI=0.174677;REFB=-0.11354;REVB=0.0953587;RO=13;SAF=9;SAR=4;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0817639;STB=0.503264;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.125913;OID=.;OPOS=117977605;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.576923:13:27:15:26:11:11:4:8:3:40:13:9:4:10:3
chr12	118020115	.	G	A	279.33	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0199604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.807;QD=18.9373;RBI=0.020004;REFB=-0.0240236;REVB=0.0013206;RO=29;SAF=17;SAR=13;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0175734;STB=0.509797;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0251424;OID=.;OPOS=118020115;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:29:30:30:0.508475:13:17:17:12:13:17:17:12
chr12	118199286	.	C	G	306.32	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.892;QD=53.2738;RBI=0.0154957;REFB=0;REVB=0.0117404;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.20194e-05;OID=.;OPOS=118199286;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:12:11:0:0:12:11:0:0
chr12	118467553	.	A	G	237.15	PASS	AF=0.45;AO=25;DP=63;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00515018;FXX=0.0908953;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.729;QD=15.8101;RBI=0.0103284;REFB=0.000842495;REVB=0.00895274;RO=26;SAF=12;SAR=13;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0167788;STB=0.531575;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.00676218;OID=.;OPOS=118467553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:60:26:33:25:27:0.45:13:12:12:14:14:13:14:19
chr12	118506186	.	A	T	205.17	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.00632904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.831;QD=15.7821;RBI=0.00632949;REFB=-0.0137753;REVB=-7.54425e-05;RO=29;SAF=17;SAR=6;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138265;STB=0.579086;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0143215;OID=.;OPOS=118506186;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:6:17:18:11:6:17:18:11
chr12	118509191	.	G	A	165.73	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=-0.0919184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.213;QD=14.4109;RBI=0.0960786;REFB=-0.020305;REVB=-0.0279662;RO=28;SAF=14;SAR=4;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0900914;STB=0.55257;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0452692;OID=.;OPOS=118509191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:4:14:20:8:4:14:20:8
chr12	118520170	.	G	A	253.58	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0188346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.544;QD=17.4879;RBI=0.0418955;REFB=-0.0141572;REVB=0.0374232;RO=30;SAF=9;SAR=19;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174676;STB=0.598352;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.0129555;OID=.;OPOS=118520170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:19:9:15:15:19:9:15:15
chr12	118673401	.	C	T	181.99	PASS	AF=0.422222;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.0153534;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.186;QD=16.1771;RBI=0.0191455;REFB=-0.00668857;REVB=0.0114378;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556529;STB=0.501198;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.00663533;OID=.;OPOS=118673401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:23:26:19:19:0.422222:8:11:12:11:8:11:15:11
chr12	118682751	.	C	T	182.11	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.00399711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.261;QD=16.9408;RBI=0.00421122;REFB=-0.0222381;REVB=-0.00132569;RO=24;SAF=14;SAR=5;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292286;STB=0.668248;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0296804;OID=.;OPOS=118682751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:5:14:11:13:5:14:11:13
chr12	118827781	.	G	A	175.47	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.0581827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.3783;QD=12.1013;RBI=0.0863874;REFB=-0.0234418;REVB=-0.0638557;RO=32;SAF=15;SAR=7;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844318;STB=0.510743;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0466884;OID=.;OPOS=118827781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:32:36:22:22:0.37931:7:15:24:8:7:15:24:12
chr12	118855405	.	A	G	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00689568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=332.376;QD=59.3229;RBI=0.0523566;REFB=0;REVB=0.0519005;RO=0;SAF=58;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.69416e-05;OID=.;OPOS=118855405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:10:58:0:0:10:58:0:0
chr12	119431750	.	G	T	891.55	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0328934;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.552;QD=56.606;RBI=0.039182;REFB=-0.0534801;REVB=0.0212897;RO=1;SAF=37;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185094;STB=0.509801;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000424498;OID=.;OPOS=119431750;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:63:1:1:62:62:0.984127:25:37:0:1:25:37:0:1
chr12	119596765	.	A	G	250.22	PASS	AF=0.605263;AO=23;DP=38;FAO=23;FDP=38;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.00197911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.455;QD=26.3386;RBI=0.029299;REFB=-0.0178185;REVB=0.0292321;RO=15;SAF=13;SAR=10;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17531;STB=0.59658;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0123266;OID=.;OPOS=119596765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:15:15:23:23:0.605263:10:13:12:3:10:13:12:3
chr12	119866533	.	A	G	169.12	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00963004;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.485;QD=18.2837;RBI=0.0137634;REFB=-0.0183922;REVB=-0.00983326;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237684;STB=0.513498;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0396639;OID=.;OPOS=119866533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:9:9:9:10:9:9:9:10
chr12	119871387	.	A	G	521.36	PASS	AF=0.652778;AO=47;DP=72;FAO=47;FDP=72;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0133593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.109;QD=28.9643;RBI=0.013612;REFB=-0.00691481;REVB=0.00261055;RO=25;SAF=16;SAR=31;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417286;STB=0.522688;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0109867;OID=.;OPOS=119871387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:25:25:47:47:0.652778:31:16:10:15:31:16:10:15
chr12	119942969	.	C	G	34.72	PASS	AF=0.0769231;AO=12;DP=156;FAO=12;FDP=156;FR=.;FRO=144;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=70;FSRR=74;FWDB=-0.0475556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.6099;QD=0.890137;RBI=0.0671788;REFB=-0.00129935;REVB=-0.0474494;RO=134;SAF=9;SAR=3;SRF=66;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29411;STB=0.744751;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0325707;OID=.;OPOS=119942969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:156:156:134:144:12:12:0.0769231:3:9:66:68:3:9:70:74
chr12	120067561	.	T	C	421.76	PASS	AF=0.462366;AO=43;DP=93;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0431843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.399;QD=18.1404;RBI=0.0437263;REFB=-0.00805156;REVB=0.00686344;RO=50;SAF=25;SAR=18;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406025;STB=0.522682;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.00974717;OID=.;OPOS=120067561;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:50:50:43:43:0.462366:18:25:27:23:18:25:27:23
chr12	120171995	.	T	C	360.11	PASS	AF=0.571429;AO=37;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.0248687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8997;QD=22.8643;RBI=0.0576911;REFB=0.00748246;REVB=-0.0520558;RO=25;SAF=9;SAR=28;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347876;STB=0.678156;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00757821;OID=.;OPOS=120171995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:25:27:37:36:0.571429:28:9:17:8:27:9:17:10
chr12	120189879	.	A	G	104.85	PASS	AF=0.333333;AO=13;DP=39;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0212691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.338;QD=10.7535;RBI=0.0254281;REFB=-0.0223277;REVB=0.0139361;RO=26;SAF=5;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130578;STB=0.578191;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.049162;OID=.;OPOS=120189879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:26:26:13:13:0.333333:8:5:13:13:8:5:13:13
chr12	120189888	.	T	C	103.49	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=38;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.0226207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.041;QD=10.6141;RBI=0.0701878;REFB=-0.0333221;REVB=0.0664427;RO=26;SAF=5;SAR=7;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950042;STB=0.578191;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0998792;OID=.;OPOS=120189888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:26:26:12:13:0.333333:7:5:13:13:8:5:13:13
chr12	120575549	.	A	C	1135.18	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.218;QD=60.5429;RBI=0.0313081;REFB=0;REVB=0.0136544;RO=0;SAF=45;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.5833e-05;OID=.;OPOS=120575549;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:30:45:0:0:30:45:0:0
chr12	120589064	.	G	C	1431.55	PASS	AF=0.978947;AO=92;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0471415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4031;QD=60.2757;RBI=0.0580068;REFB=0.0254143;REVB=-0.0338005;RO=2;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0220364;STB=0.511361;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=-0.00282685;OID=.;OPOS=120589064;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:95:95:2:2:92:93:0.978947:42:50:0:2:43:50:0:2
chr12	120589160	.	A	G	923.15	PASS	AF=0.984615;AO=62;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0250626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.527;QD=56.8094;RBI=0.0274756;REFB=-0.0801724;REVB=0.0112594;RO=1;SAF=32;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145261;STB=0.507244;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.000238261;OID=.;OPOS=120589160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:62:64:0.984615:30:32:1:0:30:34:1:0
chr12	120591143	.	A	G	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303133;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.151;QD=63.8719;RBI=0.0373853;REFB=0;REVB=0.0218806;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120807;OID=.;OPOS=120591143;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0
chr12	120608031	.	A	G	799.74	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.903;QD=63.9795;RBI=0.0273792;REFB=0;REVB=-0.00842219;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.22647e-05;OID=.;OPOS=120608031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:21:28:0:0:21:29:0:0
chr12	120636549	.	C	A	823.19	PASS	AF=0.9375;AO=60;DP=64;FAO=60;FDP=64;FR=.;FRO=4;FSAF=37;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.0123938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2014;QD=51.4493;RBI=0.0279653;REFB=-0.00299299;REVB=-0.025069;RO=3;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576627;STB=0.539986;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.000855986;OID=.;OPOS=120636549;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:64:64:3:4:60:60:0.9375:23:37:0:3:23:37:0:4
chr12	120661977	.	T	C	460.71	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00835865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.624;QD=57.5888;RBI=0.0179919;REFB=0;REVB=0.0159324;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119529;OID=.;OPOS=120661977;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:16:15:0:0:16:16:0:0
chr12	120662505	.	T	C	219.2	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=9;FWDB=-0.101783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8785;QD=13.9175;RBI=0.102106;REFB=-0.0141995;REVB=-0.0081186;RO=37;SAF=17;SAR=9;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122937;STB=0.56957;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0167388;OID=.;OPOS=120662505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:9:17:28:9:9:17:28:9
chr12	120730913	.	T	C	97.31	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.000665322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.295;QD=12.9748;RBI=0.0321254;REFB=-0.00117826;REVB=-0.0321185;RO=18;SAF=9;SAR=3;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387095;STB=0.52269;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00366849;OID=.;OPOS=120730913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:18:18:12:12:0.4:3:9:14:4:3:9:14:4
chr12	120730926	.	C	T	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0214132;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.588;QD=11.8307;RBI=0.0230102;REFB=-0.00056193;REVB=-0.00842292;RO=16;SAF=8;SAR=3;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292487;STB=0.540912;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.000785344;OID=.;OPOS=120730926;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:16:18:11:11:0.37931:3:8:12:4:3:8:14:4
chr12	120741382	.	G	A	52.6	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.00954161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.992;QD=6.78752;RBI=0.0283101;REFB=-0.00541087;REVB=-0.0266537;RO=23;SAF=3;SAR=5;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201057;STB=0.512788;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=0.0178406;OID=.;OPOS=120741382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:31:31:23:23:8:8:0.258065:5:3:9:14:5:3:9:14
chr12	120750517	.	A	G	246.04	PASS	AF=0.459016;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0649895;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4435;QD=16.1341;RBI=0.0659932;REFB=-0.0235091;REVB=0.0114658;RO=32;SAF=15;SAR=13;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255639;STB=0.505297;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0198183;OID=.;OPOS=120750517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:33:28:28:0.459016:13:15:18:14:13:15:18:15
chr12	120762837	.	A	G	211.52	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.00171044;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.071;QD=14.1013;RBI=0.0139201;REFB=-0.00598579;REVB=-0.0138147;RO=35;SAF=18;SAR=7;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0424363;STB=0.524252;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0113913;OID=.;OPOS=120762837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:35:35:25:25:0.416667:7:18:24:11:7:18:24:11
chr12	121017171	.	A	G	380.34	PASS	AF=0.394737;AO=45;DP=114;FAO=45;FDP=114;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=28;FSRF=40;FSRR=29;FWDB=-0.00883198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.5775;QD=13.3453;RBI=0.0268926;REFB=-0.0196565;REVB=-0.0254009;RO=67;SAF=17;SAR=28;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216092;STB=0.622168;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0244841;OID=.;OPOS=121017171;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:67:69:45:45:0.394737:28:17:39:28:28:17:40:29
chr12	121093629	.	CGTGCGT	C,CGTGTGT	38.07	PASS	AF=0.263158,0.0526316;AO=4,3;DP=21;FAO=5,1;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=4,1;FSAR=1,0;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0310317,-0.0932573;FXX=0.0951928;HRUN=1,1;LEN=6,1;MLLD=166.717,62.3295;QD=8.01482;RBI=0.194441,0.275493;REFB=-0.0246696,-0.0517823;REVB=-0.191949,-0.259228;RO=12;SAF=3,2;SAR=1,1;SRF=7;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.205016,0.0961013;STB=0.716993,0.988779;STBP=0.31,0.496;TYPE=del,snp;VARB=0.0878887,0.042177;OID=.,.;OPOS=121093630,121093633;OREF=GTGCGT,C;OALT=-,T;OMAPALT=C,CGTGTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.263158,0.0526316:4,3:21:5,1:19:13:4,1:1,0:7:6:28:12:3,2:1,1:7:5
chr12	121131891	.	C	T	1377.43	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.06;QD=62.6107;RBI=0.0522249;REFB=0;REVB=-0.0509422;RO=0;SAF=46;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.65862e-05;OID=.;OPOS=121131891;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:42:46:0:0:42:46:0:0
chr12	121174899	.	T	C	1605.92	PASS	AF=1;AO=105;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0623783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.763;QD=60.0343;RBI=0.0653809;REFB=0;REVB=0.019586;RO=0;SAF=50;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000141177;OID=.;OPOS=121174899;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:105:107:1:55:50:0:0:57:50:0:0
chr12	121175984	.	T	C	289.31	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000116226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.155;QD=52.6014;RBI=0.0212917;REFB=0;REVB=0.0212914;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159582;OID=.;OPOS=121175984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr12	121176083	.	G	A	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=3;FWDB=-0.00714159;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=279.519;QD=12.8689;RBI=0.010017;REFB=-0.00772274;REVB=-0.00702413;RO=16;SAF=8;SAR=3;SRF=13;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115667;STB=0.567454;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0092514;OID=.;OPOS=121176083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:3:8:13:3:3:8:13:3
chr12	121176679	.	C	T	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.975;QD=63.5829;RBI=0.049403;REFB=0;REVB=0.00546422;RO=0;SAF=20;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269172;OID=.;OPOS=121176679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:27:20:0:0:27:20:0:0
chr12	121221518	.	C	T	108.62	PASS	AF=0.448276;AO=12;DP=27;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.00411843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8801;QD=14.9826;RBI=0.0225822;REFB=-0.0324022;REVB=-0.0222035;RO=15;SAF=8;SAR=4;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134759;STB=0.565116;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0391862;OID=.;OPOS=121221518;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:29:15:16:12:13:0.448276:4:8:8:7:5:8:8:8
chr12	121434359	.	GGC	G,GG	146.14	PASS	AF=1,0;AO=2,2;DP=16;FAO=17,0;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.127767,-0.270835;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=22.9214,13.135;QD=34.3853;RBI=0.198002,0.318456;REFB=0,0;REVB=-0.151262,0.167519;RO=2;SAF=1,0;SAR=1,2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0.375,0;SSEP=0,0;SSSB=0.390188,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0165384,0.0130997;OID=.,.;OPOS=121434360,121434361;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:2,2:16:17,0:17:0:5,0:12,0:0:0:3:2:1,0:1,2:0:2
chr12	121434630	.	C	CTCATTCAT	128.42	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0303113;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=8;MLLD=263.29;QD=11.6747;RBI=0.0316283;REFB=-0.0151615;REVB=-0.009032;RO=29;SAF=10;SAR=5;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135344;STB=0.580534;STBP=0.483;TYPE=ins;VARB=0.0265779;OID=.;OPOS=121434631;OREF=-;OALT=TCATTCAT;OMAPALT=CTCATTCAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.340909:15:45:15:44:29:10:5:16:13:99:29:10:5:16:13
chr12	121435427	.	G	A	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=3;FWDB=0.0124172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.034;QD=19.0004;RBI=0.0244975;REFB=-0.012621;REVB=0.0211173;RO=13;SAF=9;SAR=8;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251281;STB=0.650019;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0106696;OID=.;OPOS=121435427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:13:17:17:17:0.5:8:9:11:2:8:9:14:3
chr12	121435475	.	G	A	229.11	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00520459;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.022;QD=21.3129;RBI=0.0251166;REFB=-0.028428;REVB=0.0245715;RO=17;SAF=10;SAR=12;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194558;STB=0.602419;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0319992;OID=.;OPOS=121435475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:43:17:21:22:22:0.511628:12:10:12:5:12:10:14:7
chr12	121435587	.	G	T	214.72	PASS	AF=0.512195;AO=13;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.000190842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.039;QD=20.9481;RBI=0.0927724;REFB=-0.0244729;REVB=0.0927722;RO=20;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119826;STB=0.535929;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=0.035579;OID=.;OPOS=121435587;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:13:21:0.512195:6:7:11:9:11:10:11:9
chr12	121437221	.	T	C	297.95	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.0133256;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.5099;QD=15.6818;RBI=0.0179075;REFB=-0.0441258;REVB=0.0119628;RO=39;SAF=13;SAR=20;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919522;STB=0.580596;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0259918;OID=.;OPOS=121437221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:39:43:33:33:0.434211:20:13:19:20:20:13:23:20
chr12	121437382	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.133572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.568;QD=37.4885;RBI=0.141014;REFB=0;REVB=0.0452051;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205672;OID=.;OPOS=121437382;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:7:1:0:0:7:1:0:0
chr12	121454257	.	T	A	267.06	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=53;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0289611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3631;QD=20.1556;RBI=0.0335889;REFB=0.0145578;REVB=-0.0170139;RO=25;SAF=17;SAR=11;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175974;STB=0.598035;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=-0.0139425;OID=.;OPOS=121454257;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:25:28:28:0.528302:11:17:10:15:11:17:10:15
chr12	121458400	.	C	T	416.08	PASS	AF=0.546667;AO=41;DP=75;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.00377595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.4967;QD=22.1911;RBI=0.0302745;REFB=-0.0263987;REVB=-0.0300381;RO=34;SAF=25;SAR=16;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00682816;STB=0.503763;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0234411;OID=.;OPOS=121458400;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:34:34:41:41:0.546667:16:25:21:13:16:25:21:13
chr12	121471337	.	G	A	604.88	PASS	AF=0.488189;AO=62;DP=127;FAO=62;FDP=127;FR=.;FRO=65;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.00967192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.963;QD=19.0512;RBI=0.0286341;REFB=-0.0168946;REVB=0.0269511;RO=65;SAF=31;SAR=31;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498388;STB=0.52755;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0171641;OID=.;OPOS=121471337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:65:65:62:62:0.488189:31:31:36:29:31:31:36:29
chr12	121600253	.	T	C	162.07	PASS	AF=0.305556;AO=21;DP=71;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.00553296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2225;QD=9.00361;RBI=0.0099328;REFB=0.00167857;REVB=-0.00824905;RO=50;SAF=14;SAR=7;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202832;STB=0.631456;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.00370384;OID=.;OPOS=121600253;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:50:50:21:22:0.305556:7:14:25:25:7:15:25:25
chr12	121605355	.	G	A	239.82	PASS	AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-9.28588e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.36;QD=22.3092;RBI=0.0275987;REFB=-0.0184192;REVB=-0.0275985;RO=20;SAF=17;SAR=6;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182515;STB=0.602742;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0195884;OID=.;OPOS=121605355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:6:17:11:9:6:17:11:9
chr12	121605373	.	G	A	216.34	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.028143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.516;QD=22.1885;RBI=0.0346112;REFB=-0.0139971;REVB=-0.0201471;RO=17;SAF=15;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165624;STB=0.58325;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.0124634;OID=.;OPOS=121605373;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:17:18:21:21:0.538462:6:15:9:8:6:15:10:8
chr12	121615131	.	C	G	282.84	PASS	AF=0.370787;AO=32;DP=88;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.0209193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6235;QD=12.712;RBI=0.0397578;REFB=-0.00536459;REVB=0.0338093;RO=55;SAF=19;SAR=13;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745213;STB=0.536849;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0104668;OID=.;OPOS=121615131;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:55:56:32:33:0.370787:13:19:29:26:14:19:29:27
chr12	121622239	.	C	T	120.81	PASS	AF=0.301887;AO=16;DP=54;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.00353983;FXX=0.0185151;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.946;QD=9.11796;RBI=0.00455676;REFB=-0.00398819;REVB=-0.00286944;RO=36;SAF=15;SAR=1;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.653916;STB=0.900301;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0193392;OID=.;OPOS=121622239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:36:37:16:16:0.301887:1:15:17:19:1:15:18:19
chr12	121622419	.	G	T	152.24	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0504844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4044;QD=20.9986;RBI=0.0696574;REFB=0.00692557;REVB=0.0479946;RO=13;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152971;STB=0.586102;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.00226199;OID=.;OPOS=121622419;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:8:8:9:4:8:8:9:4
chr12	121622520	.	A	T	557.12	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309783;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.3;QD=60.229;RBI=0.0374883;REFB=0;REVB=0.021112;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010384;OID=.;OPOS=121622520;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:16:20:0:0:16:21:0:0
chr12	121701681	.	G	A	143.59	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0165708;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=106.098;QD=15.5231;RBI=0.0171954;REFB=-0.0126547;REVB=0.00459252;RO=18;SAF=10;SAR=6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136325;STB=0.559365;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00894705;OID=.;OPOS=121701681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:37:18:21:16:16:0.432432:6:10:11:7:6:10:11:10
chr12	121712077	.	T	A	338.1	PASS	AF=0.576271;AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0132118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.589;QD=22.9217;RBI=0.0358317;REFB=-0.0323759;REVB=0.033307;RO=24;SAF=14;SAR=20;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129681;STB=0.579953;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0090651;OID=.;OPOS=121712077;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:25:34:34:0.576271:20:14:14:10:20:14:15:10
chr12	121853164	.	T	C	262.88	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0391215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.2486;QD=47.7963;RBI=0.0773506;REFB=0.0461167;REVB=0.066728;RO=1;SAF=17;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102024;STB=0.555499;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.00420663;OID=.;OPOS=121853164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:1:1:21:21:0.954545:4:17:0:1:4:17:0:1
chr12	121870922	.	G	A	269.03	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.145071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.6393;QD=51.2441;RBI=0.242933;REFB=0;REVB=0.194861;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00970836;OID=.;OPOS=121870922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:21:0:0:19:21:1:9:10:0:0:9:12:0:0
chr12	121871006	.	A	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187158;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=140.853;QD=47.8222;RBI=0.0714013;REFB=0;REVB=0.0689048;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120412;OID=.;OPOS=121871006;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr12	121878659	.	C	T	1665.97	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0296023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.642;QD=59.499;RBI=0.0384366;REFB=0;REVB=0.0245168;RO=0;SAF=33;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24061e-05;OID=.;OPOS=121878659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:112:0:0:107:112:1:74:33:0:0:76:36:0:0
chr12	121880520	.	G	A	1513.76	PASS	AF=0.989796;AO=96;DP=100;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.077456;FXX=0.019998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.671;QD=61.786;RBI=0.0930388;REFB=-0.0621703;REVB=0.051544;RO=2;SAF=57;SAR=39;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00375677;STB=0.506328;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.000421945;OID=.;OPOS=121880520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:98:2:1:96:97:0.989796:39:57:1:1:39:58:0:1
chr12	121881848	.	G	A	577.31	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0486585;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.539;QD=60.7695;RBI=0.0552664;REFB=0;REVB=0.0262053;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139131;OID=.;OPOS=121881848;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:36:38:1:18:18:0:0:18:20:0:0
chr12	122042844	.	A	G	160.29	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133031;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3197;QD=45.7959;RBI=0.0679923;REFB=0;REVB=0.0666782;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00330916;OID=.;OPOS=122042844;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr12	122090724	.	A	C	210.5	PASS	AF=0.625;AO=20;DP=32;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.00107964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=325.951;QD=26.3129;RBI=0.00135317;REFB=-0.0209398;REVB=0.000815751;RO=12;SAF=3;SAR=17;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272526;STB=0.653668;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0106353;OID=.;OPOS=122090724;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:12:12:20:20:0.625:17:3:5:7:17:3:5:7
chr12	122107363	.	CTTTTTTG	CTTTTT,CTTTTTG	72.78	PASS	AF=0,0.592593;AO=7,8;DP=26;FAO=0,16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=0,9;FSAR=0,7;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.0932185,0.0781983;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=13.3271,9.33994;QD=10.7822;RBI=0.28396,0.0804228;REFB=-0.0513034,-0.138462;REVB=-0.268223,0.0187842;RO=9;SAF=3,6;SAR=4,2;SRF=8;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.419664,-0.186888;STB=0.5,0.569294;STBP=1,0.422;TYPE=del,del;VARB=0,0.12626;OID=.,.;OPOS=122107369,122107364;OREF=TG,T;OALT=-,-;OMAPALT=CTTTTT,CTTTTTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.592593:7,8:26:0,16:27:11:0,9:0,7:8:3:34:9:3,6:4,2:8:1
chr12	122186268	.	C	T	376.12	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0858996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.8105;QD=55.7208;RBI=0.110266;REFB=0;REVB=0.0691367;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00227643;OID=.;OPOS=122186268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:11:15:0:0:12:15:0:0
chr12	122186317	.	G	A	516.3	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.8343;QD=59.0059;RBI=0.041841;REFB=0;REVB=0.00863511;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000841619;OID=.;OPOS=122186317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:15:19:0:0:15:20:0:0
chr12	122234089	.	T	A	787.69	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00254382;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8093;QD=57.2866;RBI=0.00254705;REFB=0;REVB=0.00012829;RO=0;SAF=37;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.85968e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000692129;OID=.;OPOS=122234089;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:18:37:0:0:18:37:0:0
chr12	122234191	.	C	A	728.98	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.726;QD=57.175;RBI=0.0391953;REFB=0;REVB=-0.0375408;RO=0;SAF=32;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000198746;OID=.;OPOS=122234191;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:19:32:0:0:19:32:0:0
chr12	122243905	.	C	T	1641.98	PASS	AF=0.990991;AO=103;DP=104;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0971227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.609;QD=59.1704;RBI=0.100036;REFB=-0.162699;REVB=0.0239646;RO=0;SAF=45;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504273;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000305979;OID=.;OPOS=122243905;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:104:111:0:1:103:110:0.990991:58:45:0:0:58:52:0:1
chr12	122248582	.	C	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303622;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=322.026;QD=58.1421;RBI=0.0337607;REFB=0;REVB=0.0147623;RO=0;SAF=3;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.97969e-05;OID=.;OPOS=122248582;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:29:3:0:0:29:3:0:0
chr12	122261456	.	G	A	2709.14	PASS	AF=1;AO=164;DP=167;FAO=182;FDP=182;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=100;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0735959;FXX=0.010869;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.596;QD=59.5414;RBI=0.0831718;REFB=-0.0533091;REVB=0.0387453;RO=0;SAF=64;SAR=100;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00183573;OID=.;OPOS=122261456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:167:182:0:0:164:182:1:100:64:0:0:100:82:0:0
chr12	122261457	.	G	A	48.92	PASS	AF=0.0815217;AO=17;DP=183;FAO=15;FDP=184;FR=.;FRO=169;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=68;FSRR=101;FWDB=-0.0899528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3852;QD=1.06357;RBI=0.0922711;REFB=-0.0187502;REVB=0.0205537;RO=166;SAF=16;SAR=1;SRF=65;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.611115;STB=0.94516;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0712191;OID=.;OPOS=122261457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:183:184:166:169:17:15:0.0815217:1:16:65:101:1:14:68:101
chr12	122295335	.	T	C	632.21	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8803;QD=61.6787;RBI=0.0182303;REFB=0;REVB=0.00868756;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261419;OID=.;OPOS=122295335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr12	122326805	.	G	A	83.9	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.00196335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.876;QD=10.1699;RBI=0.0794129;REFB=-0.00511339;REVB=0.0793886;RO=22;SAF=7;SAR=4;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174704;STB=0.603603;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0206609;OID=.;OPOS=122326805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:4:7:17:5:4:7:17:5
chr12	122326812	.	T	C	465.1	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0560825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8855;QD=58.1376;RBI=0.0598021;REFB=0;REVB=0.0207615;RO=0;SAF=24;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000626425;OID=.;OPOS=122326812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:8:24:0:0:8:24:0:0
chr12	122353796	.	A	G	639.74	PASS	AF=1;AO=33;DP=51;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273187;FXX=0.039208;HRUN=5;LEN=1;MLLD=23.6045;QD=52.2238;RBI=0.106386;REFB=0;REVB=0.102819;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0205072;OID=.;OPOS=122353796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:51:49:0:0:33:49:1:11:22:0:0:14:35:0:0
chr12	122355716	.	C	T	912.61	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.712;QD=57.9434;RBI=0.02771;REFB=0;REVB=0.0146284;RO=0;SAF=17;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.45261e-05;OID=.;OPOS=122355716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:45:17:0:0:46:17:0:0
chr12	122359408	.	G	A	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0405569;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=167.526;QD=24.3281;RBI=0.0405569;REFB=-0.0017862;REVB=0;RO=2;SAF=7;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00168743;OID=.;OPOS=122359408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:0:7:2:0:0:7:2:0
chr12	122359412	.	G	A	52.73	PASS	AF=0.7;AO=6;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.291966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.8096;QD=21.0911;RBI=0.291966;REFB=-0.143843;REVB=0;RO=4;SAF=6;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0846689;OID=.;OPOS=122359412;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:4:3:6:7:0.7:0:6:4:0:0:7:3:0
chr12	122369762	.	C	T	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0459074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9379;QD=62.6704;RBI=0.062129;REFB=0;REVB=-0.0418631;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0010571;OID=.;OPOS=122369762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0
chr12	122396395	.	C	T	1509.8	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00660957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.936;QD=63.5705;RBI=0.00676944;REFB=0;REVB=-0.00146251;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9489e-06;OID=.;OPOS=122396395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:95:0:0:92:95:1:45:47:0:0:45:50:0:0
chr12	122405912	.	G	T	231.05	PASS	AF=0.464286;AO=27;DP=56;FAO=26;FDP=56;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=-0.10769;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.4;QD=16.5033;RBI=0.117326;REFB=0.0088073;REVB=-0.0465645;RO=29;SAF=18;SAR=9;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118576;STB=0.507616;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=-0.0162617;OID=.;OPOS=122405912;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:30:27:26:0.464286:9:18:19:10:9:17:20:10
chr12	122413196	.	T	C	573.11	PASS	AF=0.46875;AO=60;DP=128;FAO=60;FDP=128;FR=.;FRO=68;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=51;FWDB=0.0314728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.969;QD=17.9098;RBI=0.0324537;REFB=-0.00491948;REVB=0.00791893;RO=68;SAF=36;SAR=24;SRF=17;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325732;STB=0.679702;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0102272;OID=.;OPOS=122413196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:68:68:60:60:0.46875:24:36:17:51:24:36:17:51
chr12	122497001	.	T	C	399.33	PASS	AF=0.42;AO=42;DP=100;FAO=42;FDP=100;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.0225788;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=289.741;QD=15.973;RBI=0.0225857;REFB=-0.0171724;REVB=-0.000556982;RO=58;SAF=14;SAR=28;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16185;STB=0.591504;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0250234;OID=.;OPOS=122497001;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:58:58:42:42:0.42:28:14:28:30:28:14:28:30
chr12	122617989	.	A	G	190.3	PASS	AF=0.575758;AO=17;DP=31;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0322186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.38;QD=23.0668;RBI=0.0322254;REFB=-0.0116839;REVB=-0.000661524;RO=14;SAF=6;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0036754;STB=0.505149;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00783412;OID=.;OPOS=122617989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:33:14:14:17:19:0.575758:11:6:5:9:12:7:5:9
chr12	122623000	.	T	C	320.52	PASS	AF=0.595745;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.00679429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.324;QD=27.2784;RBI=0.0126685;REFB=-0.00135765;REVB=-0.0106925;RO=19;SAF=17;SAR=11;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248769;STB=0.637085;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00101748;OID=.;OPOS=122623000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:19:19:28:28:0.595745:11:17:5:14:11:17:5:14
chr12	122626842	.	G	A	708.91	PASS	AF=0.496454;AO=70;DP=141;FAO=70;FDP=141;FR=.;FRO=71;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=37;FSRR=34;FWDB=-0.032198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.747;QD=20.111;RBI=0.0353549;REFB=-0.00858507;REVB=0.0146033;RO=71;SAF=32;SAR=38;SRF=37;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585082;STB=0.532269;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0130695;OID=.;OPOS=122626842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:71:71:70:70:0.496454:38:32:37:34:38:32:37:34
chr12	122628219	.	T	C	366.2	PASS	AF=0.433333;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=15;FWDB=0.0102283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.698;QD=16.2756;RBI=0.0102305;REFB=0.00245263;REVB=-0.000211352;RO=51;SAF=22;SAR=17;SRF=36;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149038;STB=0.583391;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=-0.00223637;OID=.;OPOS=122628219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:51:51:39:39:0.433333:17:22:36:15:17:22:36:15
chr12	122628516	.	A	T	354.86	PASS	AF=0.40625;AO=38;DP=94;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.0763683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7429;QD=14.7856;RBI=0.0814749;REFB=-0.0186249;REVB=-0.028391;RO=56;SAF=21;SAR=17;SRF=24;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12989;STB=0.559075;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0228313;OID=.;OPOS=122628516;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:96:56:57:38:39:0.40625:17:21:24:32:18:21:25:32
chr12	122674032	.	C	T	747.01	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00944322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.868;QD=63.575;RBI=0.0129265;REFB=0;REVB=0.00882719;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.54217e-06;OID=.;OPOS=122674032;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:31:16:0:0:31:16:0:0
chr12	122674758	.	G	A	979.25	PASS	AF=1;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261689;FXX=0.0294074;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9488;QD=59.3486;RBI=0.0364848;REFB=0;REVB=0.0254229;RO=0;SAF=44;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000584469;OID=.;OPOS=122674758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:66:0:0:66:66:1:22:44:0:0:22:44:0:0
chr12	122689181	.	C	G	118.85	PASS	AF=0.378378;AO=13;DP=36;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0508404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6448;QD=12.8486;RBI=0.0536052;REFB=-0.0110283;REVB=-0.0169933;RO=23;SAF=9;SAR=4;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100301;STB=0.575109;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0190774;OID=.;OPOS=122689181;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:23:23:13:14:0.378378:4:9:14:9:4:10:14:9
chr12	122691738	.	C	A,G,T	494.39	PASS	AF=0.885714,0.0857143,0.0285714;AO=31,2,2;DP=35;FAO=31,3,1;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0,1;FSAR=16,3,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0639951,-0.0156907,0.0779399;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=128.155,110.702,27.3676;QD=56.5015;RBI=0.0849519,0.0181489,0.0787102;REFB=0,0,0;REVB=0.05587,0.00912044,0.0109849;RO=0;SAF=15,0,1;SAR=16,2,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,snp,snp;VARB=0.00317876,0.0993712,0.206884;OID=.,.,.;OPOS=122691738,122691738,122691738;OREF=C,C,C;OALT=A,G,T;OMAPALT=A,G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:35:35:0:0:31,2,2:31,3,1:0.885714,0.0857143,0.0285714:16,2,1:15,0,1:0:0:16,3,0:15,0,1:0:0
chr12	122812503	.	G	C	255.92	PASS	AF=1;AO=15;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.298;QD=51.1843;RBI=0.0531943;REFB=0;REVB=-0.0128273;RO=0;SAF=3;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000864729;OID=.;OPOS=122812503;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:15:20:1:12:3:0:0:12:8:0:0
chr12	122989234	.	GA	G,GC	2067.12	PASS	AF=0.0583942,0.941606;AO=19,116;DP=136;FAO=8,129;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=8,77;FSAR=0,52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224381,0.0199897;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=34.3705,55.6915;QD=60.3538;RBI=0.0554568,0.169333;REFB=0,0;REVB=0.0507148,0.168149;RO=0;SAF=12,72;SAR=7,44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.31343e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.10344,0.00123064;OID=.,.;OPOS=122989235,122989235;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0583942,0.941606:19,116:136:8,129:137:0:8,77:0,52:0:0:15:0:12,72:7,44:0:0
chr12	123026606	.	A	G	111.39	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.149062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2828;QD=15.9131;RBI=0.151918;REFB=-0.0208098;REVB=0.0293151;RO=15;SAF=9;SAR=4;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385084;STB=0.721594;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0304999;OID=.;OPOS=123026606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:4:9:4:11:4:9:4:11
chr12	123087442	.	A	G	531.18	PASS	AF=1;AO=23;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.513;QD=57.4249;RBI=0.129928;REFB=0;REVB=0.00466004;RO=0;SAF=1;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.47154e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000480962;OID=.;OPOS=123087442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:23:37:1:22:1:0:0:22:15:0:0
chr12	123200247	.	G	C	468.85	PASS	AF=0.384058;AO=52;DP=140;FAO=53;FDP=138;FR=.;FRO=85;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=51;FWDB=-0.00991749;FXX=0.028167;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.535;QD=13.59;RBI=0.0195447;REFB=-0.00961001;REVB=0.0168416;RO=86;SAF=25;SAR=27;SRF=35;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0814658;STB=0.5559;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0129698;OID=.;OPOS=123200247;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:138:86:85:52:53:0.384058:27:25:35:51:27:26:34:51
chr12	123253852	.	T	C	125.92	PASS	AF=0.263889;AO=17;DP=72;FAO=19;FDP=72;FR=.;FRO=53;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=38;FSRR=15;FWDB=-0.00770908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1979;QD=6.99566;RBI=0.150907;REFB=-0.0186296;REVB=0.15071;RO=55;SAF=11;SAR=6;SRF=38;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0607686;STB=0.607647;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0301982;OID=.;OPOS=123253852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:55:53:17:19:0.263889:6:11:38:17:8:11:38:15
chr12	123253856	.	C	CAT,T	1178.75	PASS	AF=0.54023,0.413793;AO=44,37;DP=87;FAO=47,36;FDP=87;FR=.;FRO=4;FSAF=35,23;FSAR=12,13;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0234957,-0.000213083;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=139.396,74.0634;QD=54.1953;RBI=0.0235117,0.135193;REFB=-0.0571628,0.00211648;REVB=-0.000866929,-0.135193;RO=4;SAF=33,23;SAR=11,14;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.050548,0.0233825;STB=0.524615,0.514917;STBP=0.289,0.58;TYPE=ins,snp;VARB=0.0497147,0.0377243;OID=.,.;OPOS=123253857,123253856;OREF=-,C;OALT=AT,T;OMAPALT=CAT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:87:87:4:4:44,37:47,36:0.54023,0.413793:11,14:33,23:2:2:12,13:35,23:2:2
chr12	123333065	.	C	T	867.57	PASS	AF=0.983871;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0320688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.65;QD=55.9719;RBI=0.0327493;REFB=-0.000183532;REVB=0.00664136;RO=1;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154718;STB=0.507934;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0001674;OID=.;OPOS=123333065;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:62:1:1:60:61:0.983871:30:30:0:1:31:30:0:1
chr12	123339931	.	GC	G,GG	269.04	PASS	AF=0.909091,0;AO=21,13;DP=45;FAO=40,0;FDP=44;FR=.;FRO=4;FSAF=19,0;FSAR=21,0;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.136333,0.104036;FXX=0.0222173;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=10.0264,11.447;QD=24.4582;RBI=0.206456,0.190391;REFB=-0.0825225,-0.0179937;REVB=0.15504,-0.159453;RO=9;SAF=16,0;SAR=5,13;SRF=4;SRR=5;SSEN=0.513514,0;SSEP=0,0;SSSB=0.20792,-0.818345;STB=0.502277,0.5;STBP=0.923,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0678589,-0.0428293;OID=.,.;OPOS=123339932,123339932;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.909091,0:21,13:45:40,0:44:4:19,0:21,0:2:2:13:9:16,0:5,13:4:5
chr12	123340453	.	G	GC	276.2	PASS	AF=1;AO=16;DP=35;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256924;FXX=0.0740466;HRUN=1;LEN=1;MLLD=23.7079;QD=44.1913;RBI=0.105168;REFB=0;REVB=0.101982;RO=19;SAF=10;SAR=6;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176086;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00603954;OID=.;OPOS=123340454;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:16:35:25:25:0:17:8:0:0:5:19:10:6:15:4
chr12	123345736	.	C	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000156492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=331.45;QD=43.4862;RBI=0.0382257;REFB=0;REVB=0.0382253;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240635;OID=.;OPOS=123345736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:9:3:0:0:9:3:0:0
chr12	123350154	.	CCTTT	C	260.4	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158049;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=96.8461;QD=43.4002;RBI=0.0271283;REFB=0;REVB=-0.0220488;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00418184;OID=.;OPOS=123350155;OREF=CTTT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:21:21:24:24:0:12:12:0:0:5:0:10:11:0:0
chr12	123460822	.	C	CG	841.88	PASS	AF=1;AO=17;DP=117;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129164;FXX=0.217372;HRUN=0;LEN=1;MLLD=105.533;QD=37.4167;RBI=0.163252;REFB=0;REVB=0.0998382;RO=96;SAF=4;SAR=13;SRF=70;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.566843;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0021512;OID=.;OPOS=123460823;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:17:117:90:90:0:63:27:0:0:6:96:4:13:70:26
chr12	123460823	.	A	C,G	1627.68	PASS	AF=0.157895,0.842105;AO=17,93;DP=111;FAO=18,96;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=3,69;FSAR=15,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0398683,0.0420252;FXX=0.0086949;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=62.7423,133.652;QD=57.1115;RBI=0.0400786,0.100567;REFB=0,0;REVB=0.00410005,0.0913655;RO=0;SAF=4,68;SAR=13,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.07289e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.10905,0.00386404;OID=.,.;OPOS=123460823,123460823;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:55:111:114:0:0:17,93:18,96:0.157895,0.842105:13,25:4,68:0:0:15,27:3,69:0:0
chr12	123469647	.	G	T	1138.81	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0135131;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.819;QD=59.1591;RBI=0.0436641;REFB=-0.0852244;REVB=0.0415205;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506665;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000115875;OID=.;OPOS=123469647;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:0:1:76:76:0.987013:39:37:0:0:39:37:1:0
chr12	123645803	.	G	A	2064.28	PASS	AF=1;AO=132;DP=132;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0236225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.358;QD=62.5539;RBI=0.0244011;REFB=0;REVB=0.00611497;RO=0;SAF=73;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.88567e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.19993e-05;OID=.;OPOS=123645803;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:132:132:0:0:132:132:1:59:73:0:0:59:73:0:0
chr12	123664514	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0726985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.039;QD=51.9165;RBI=0.0730905;REFB=0;REVB=-0.00755982;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000365467;OID=.;OPOS=123664514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:11:10:0:0:11:10:0:0
chr12	123665695	.	A	G	489.17	PASS	AF=0.897436;AO=33;DP=39;FAO=35;FDP=39;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00997427;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.743;QD=50.1713;RBI=0.0288554;REFB=0.0220487;REVB=0.0270767;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.552602;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.00178739;OID=.;OPOS=123665695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:39:39:0:4:33:35:0.897436:17:16:0:0:18:17:4:0
chr12	123746357	.	C	G	923.42	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0676348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1004;QD=56.8256;RBI=0.0693351;REFB=-0.00324015;REVB=-0.0152604;RO=0;SAF=45;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512816;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=-0.000571247;OID=.;OPOS=123746357;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:19:45:0:0:19:45:0:1
chr12	123799974	.	A	C,G	694.48	PASS	AF=0.0444444,0.955556;AO=2,43;DP=45;FAO=2,43;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=1,24;FSAR=1,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397382,0.0579487;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=94.4846,91.5354;QD=61.7312;RBI=0.0404584,0.109542;REFB=0,0;REVB=-0.00759983,0.0929591;RO=0;SAF=1,24;SAR=1,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0730986,-0.00241534;OID=.,.;OPOS=123799974,123799974;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:45:45:0:0:2,43:2,43:0.0444444,0.955556:1,19:1,24:0:0:1,19:1,24:0:0
chr12	123810873	.	G	A	410.43	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000404679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.157;QD=56.6108;RBI=0.000878535;REFB=0;REVB=-0.000779781;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.2151e-06;OID=.;OPOS=123810873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:11:17:0:0:12:17:0:0
chr12	123879666	.	A	G	47.81	PASS	AF=0.153846;AO=8;DP=52;FAO=8;FDP=52;FR=.;FRO=44;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.00263033;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=316.587;QD=3.67731;RBI=0.00268255;REFB=-0.0037387;REVB=0.000526742;RO=44;SAF=4;SAR=4;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0249832;OID=.;OPOS=123879666;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:52:52:44:44:8:8:0.153846:4:4:22:22:4:4:22:22
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chr12	123892095	.	T	C	98.25	PASS	AF=0.177083;AO=17;DP=95;FAO=17;FDP=96;FR=.;FRO=79;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=39;FWDB=-0.0504077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9099;QD=4.09395;RBI=0.0517642;REFB=-0.00341085;REVB=0.011773;RO=78;SAF=10;SAR=7;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0958811;STB=0.567821;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0195086;OID=.;OPOS=123892095;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:95:96:78:79:17:17:0.177083:7:10:40:38:7:10:40:39
chr12	123892186	.	T	C	197.64	PASS	AF=0.362319;AO=23;DP=67;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=28;FWDB=0.00344258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.363;QD=11.4576;RBI=0.0096792;REFB=-0.0028039;REVB=-0.0090463;RO=44;SAF=15;SAR=8;SRF=16;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318687;STB=0.647613;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.004799;OID=.;OPOS=123892186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:69:44:44:23:25:0.362319:8:15:16:28:10:15:16:28
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chr12	123892590	.	C	T	36.6	PASS	AF=0.111111;AO=8;DP=73;FAO=8;FDP=72;FR=.;FRO=64;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=41;FWDB=-0.0383319;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.143;QD=2.03317;RBI=0.048232;REFB=-0.00214074;REVB=-0.0292744;RO=63;SAF=3;SAR=5;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125653;STB=0.514888;STBP=0.98;TYPE=snp;VARB=0.0164743;OID=.;OPOS=123892590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:73:72:63:64:8:8:0.111111:5:3:23:40:5:3:23:41
chr12	123892824	.	C	T	203.6	PASS	AF=0.857143;AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00390664;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=86.5356;QD=38.7812;RBI=0.0162422;REFB=-0.193891;REVB=0.0157654;RO=0;SAF=3;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.32e-08;STB=0.540493;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.00824555;OID=.;OPOS=123892824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:21:21:0:3:18:18:0.857143:15:3:0:0:15:3:1:2
chr12	123893830	.	C	T	417.98	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0371515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.231;QD=53.9323;RBI=0.0426579;REFB=-0.0266944;REVB=0.0209632;RO=1;SAF=6;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019036;STB=0.510197;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.000204283;OID=.;OPOS=123893830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:24:6:0:1:24:6:0:1
chr12	123951089	.	CTTTTC	CTTTTTC,TCTTTT,TTTTTC	94.42	PASS	AF=0.394737,0.131579,0;AO=8,3,5;DP=39;FAO=15,5,0;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=9,4,0;FSAR=6,1,0;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0625709,-0.00688748,-0.0041913;FXX=0.0256345;HRUN=4,1,1;LEN=1,6,1;MLLD=8.66584,206.816,203.602;QD=9.93905;RBI=0.0633753,0.00938004,0.00432616;REFB=-0.17352,-0.00919582,-0.00751804;REVB=0.0100658,0.00636772,0.00107176;RO=17;SAF=6,2,3;SAR=2,1,2;SRF=7;SRR=10;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.377676,0.273679,0.21266;STB=0.555481,0.753632,0.5;STBP=0.555,0.245,1;TYPE=ins,mnp,snp;VARB=0.069658,0.0504688,0;OID=.,.,.;OPOS=123951090,123951089,123951089;OREF=-,CTTTTC,C;OALT=T,TCTTTT,T;OMAPALT=CTTTTTC,TCTTTT,TTTTTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:39:38:17:18:8,3,5:15,5,0:0.394737,0.131579,0:2,1,2:6,2,3:7:10:6,1,0:9,4,0:9:9
chr12	124008073	.	A	G	1239.01	PASS	AF=1;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160971;FXX=0.0121936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.0219;QD=61.1855;RBI=0.0358082;REFB=0;REVB=-0.0319861;RO=0;SAF=55;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000114237;OID=.;OPOS=124008073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:80:81:1:25:55:0:0:25:56:0:0
chr12	124069213	.	T	C	224.18	PASS	AF=0.904762;AO=21;DP=21;FAO=19;FDP=21;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00178577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5547;QD=42.7011;RBI=0.00521223;REFB=0.0183851;REVB=-0.00489678;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.541624;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.00255613;OID=.;OPOS=124069213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:21:21:0:2:21:19:0.904762:8:13:0:0:8:11:2:0
chr12	124090453	.	A	G	1282.71	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.973;QD=61.8171;RBI=0.0332232;REFB=0;REVB=-0.0134728;RO=0;SAF=32;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.96279e-05;OID=.;OPOS=124090453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:50:32:0:0:50:33:0:0
chr12	124144018	.	C	A	464.23	PASS	AF=0.451327;AO=50;DP=113;FAO=51;FDP=113;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=-0.0239778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=309.357;QD=16.433;RBI=0.0262337;REFB=-0.0141085;REVB=-0.0106427;RO=62;SAF=25;SAR=25;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111983;STB=0.556693;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0160387;OID=.;OPOS=124144018;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:62:62:50:51:0.451327:25:25:24:38:26:25:24:38
chr12	124209331	.	A	AC	137.12	PASS	AF=1;AO=3;DP=23;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0482855;FXX=0.217297;HRUN=0;LEN=1;MLLD=52.5383;QD=30.4708;RBI=0.0539486;REFB=0;REVB=0.0240616;RO=20;SAF=0;SAR=3;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.500593;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-3.6492e-05;OID=.;OPOS=124209332;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:3:23:18:18:0:4:14:0:0:3:20:0:3:4:16
chr12	124209332	.	T	A,C	295.47	PASS	AF=0.130435,0.869565;AO=3,20;DP=23;FAO=3,20;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=0,4;FSAR=3,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273958,-0.0420902;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=145.868,125.554;QD=51.3855;RBI=0.0275906,0.0503854;REFB=0,0;REVB=-0.00327271,0.0276967;RO=0;SAF=0,4;SAR=3,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.167189,-0.000107486;OID=.,.;OPOS=124209332,124209332;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:23:23:0:0:3,20:3,20:0.130435,0.869565:3,16:0,4:0:0:3,16:0,4:0:0
chr12	124210782	.	T	C	567.86	PASS	AF=0.974359;AO=37;DP=40;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.064005;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.527;QD=58.2423;RBI=0.109722;REFB=-0.102732;REVB=0.0891195;RO=1;SAF=27;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170335;STB=0.508767;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.00164337;OID=.;OPOS=124210782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:40:39:1:1:37:38:0.974359:10:27:1:0:10:28:1:0
chr12	124229429	.	T	C	1494.44	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230249;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.259;QD=59.7776;RBI=0.0315741;REFB=0;REVB=0.0216051;RO=0;SAF=53;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149754;OID=.;OPOS=124229429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:46:53:0:0:46:54:0:0
chr12	124243707	.	T	C	955.18	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0608549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.429;QD=58.7801;RBI=0.0640951;REFB=0;REVB=0.0201212;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126612;OID=.;OPOS=124243707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:36:29:0:0:36:29:0:0
chr12	124265687	.	T	C	885.36	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.469;QD=58.0564;RBI=0.0502426;REFB=0;REVB=0.0408356;RO=0;SAF=27;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.80984e-05;OID=.;OPOS=124265687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:34:27:0:0:34:27:0:0
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chr12	124274474	.	A	G	1591.92	PASS	AF=1;AO=104;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00895445;FXX=0.0363603;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.898;QD=60.0724;RBI=0.0232121;REFB=0;REVB=0.0214154;RO=0;SAF=43;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99311e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104482;OID=.;OPOS=124274474;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:106:0:0:104:106:1:61:43:0:0:61:45:0:0
chr12	124829234	.	C	T	521.97	PASS	AF=0.401361;AO=54;DP=148;FAO=59;FDP=147;FR=.;FRO=88;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=50;FSRR=38;FWDB=0.0032944;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.175;QD=14.2031;RBI=0.00617452;REFB=-0.00800829;REVB=0.00522222;RO=88;SAF=36;SAR=18;SRF=50;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115351;STB=0.54815;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0205527;OID=.;OPOS=124829234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:147:88:88:54:59:0.401361:18:36:50:38:21:38:50:38
chr12	124829255	.	A	G	449.21	PASS	AF=0.433333;AO=31;DP=125;FAO=52;FDP=120;FR=.,HEALED;FRO=68;FSAF=33;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=0.0073287;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.392;QD=14.9737;RBI=0.00813073;REFB=-0.0358463;REVB=-0.00352121;RO=71;SAF=12;SAR=19;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176049;STB=0.545161;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0535183;OID=.;OPOS=124829255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:120:71:68:31:52:0.433333:19:12:38:33:19:33:38:30
chr12	124856660	.	T	A	503.76	PASS	AF=0.495327;AO=53;DP=107;FAO=53;FDP=107;FR=.;FRO=54;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=18;FWDB=-0.0354843;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.643;QD=18.8323;RBI=0.0683795;REFB=-0.0386521;REVB=0.0584518;RO=54;SAF=27;SAR=26;SRF=36;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144226;STB=0.579589;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0559385;OID=.;OPOS=124856660;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:54:54:53:53:0.495327:26:27:36:18:26:27:36:18
chr12	124968349	.	T	C	384.78	PASS	AF=0.965517;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0234098;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2027;QD=53.0728;RBI=0.0261885;REFB=-0.133372;REVB=0.0117396;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.517229;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00256116;OID=.;OPOS=124968349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:0:1:27:28:0.965517:14:13:0:0:14:14:0:1
chr12	125270773	.	A	G	149.16	PASS	AF=0.322581;AO=20;DP=62;FAO=20;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.00210125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.091;QD=9.62339;RBI=0.0109902;REFB=-0.0348021;REVB=0.0107875;RO=42;SAF=7;SAR=13;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.30385;STB=0.678623;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.056854;OID=.;OPOS=125270773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:42:42:20:20:0.322581:13:7:26:16:13:7:26:16
chr12	125279734	.	CA	AC,CAC	37.95	PASS	AF=0.0540541,0.162162;AO=2,10;DP=37;FAO=2,6;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=2,5;FSAR=0,1;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.00602931,-0.026566;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=2,1;MLLD=29.8907,16.6337;QD=4.10293;RBI=0.085068,0.186947;REFB=-0.0325343,-0.0590461;REVB=-0.0848541,-0.18505;RO=25;SAF=2,7;SAR=0,3;SRF=15;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.44242,0.127655;STB=0.993933,0.7462;STBP=0.21,0.249;TYPE=mnp,ins;VARB=0.103853,0.12436;OID=.,.;OPOS=125279734,125279736;OREF=CA,-;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,CAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:28:37:37:25:29:2,10:2,6:0.0540541,0.162162:0,3:2,7:15:10:0,1:2,5:17:12
chr12	125284748	.	A	G	176.63	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0263778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.622;QD=14.1304;RBI=0.027868;REFB=-0.00233467;REVB=-0.00899068;RO=31;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.04531;STB=0.526288;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.00415128;OID=.;OPOS=125284748;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:9:10:15:16:9:10:15:16
chr12	125298877	.	G	A	334.72	PASS	AF=0.386139;AO=39;DP=101;FAO=39;FDP=101;FR=.;FRO=62;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=0.00680842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.161;QD=13.2562;RBI=0.0155929;REFB=-0.00420218;REVB=0.014028;RO=60;SAF=20;SAR=19;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120236;STB=0.576884;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.00541886;OID=.;OPOS=125298877;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:60:62:39:39:0.386139:19:20:24:36:19:20:24:38
chr12	125324553	.	C	T	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00902497;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.798;QD=39.2062;RBI=0.00902497;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.0658e-05;OID=.;OPOS=125324553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:0:9:0:0:0:9:0:0
chr12	125324566	.	G	A	118.81	PASS	AF=0.857143;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0436052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.219;QD=33.9453;RBI=0.0521821;REFB=-0.142791;REVB=0.0286627;RO=1;SAF=10;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430526;STB=0.545383;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0210866;OID=.;OPOS=125324566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:13:14:1:2:12:12:0.857143:2:10:1:0:2:10:2:0
chr12	125324570	.	C	T	151.43	PASS	AF=0.833333;AO=13;DP=18;FAO=15;FDP=18;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0215476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.447;QD=33.65;RBI=0.261635;REFB=-0.0662061;REVB=0.260747;RO=5;SAF=11;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195689;STB=0.559925;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0316406;OID=.;OPOS=125324570;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:18:18:5:3:13:15:0.833333:2:11:3:2:4:11:3:0
chr12	125386076	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0198525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2028;QD=46.8468;RBI=0.133155;REFB=0;REVB=0.131667;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00346027;OID=.;OPOS=125386076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:7:8:0:0:7:8:0:0
chr12	125396377	.	A	G	244.73	PASS	AF=0.473684;AO=26;DP=59;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00417322;FXX=0.0499917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.195;QD=17.1741;RBI=0.00507656;REFB=0.0065907;REVB=-0.00289062;RO=33;SAF=19;SAR=7;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205659;STB=0.642223;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.0105352;OID=.;OPOS=125396377;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:57:33:30:26:27:0.473684:7:19:18:15:7:20:15:15
chr12	125397750	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0196933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.741;QD=56.1907;RBI=0.039747;REFB=0;REVB=-0.0345253;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000309559;OID=.;OPOS=125397750;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:8:20:0:0:8:20:0:0
chr12	125398319	.	G	A	192.84	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.00484436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.418;QD=14.8339;RBI=0.023639;REFB=-0.00743351;REVB=-0.0231373;RO=30;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101053;STB=0.557641;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.00926735;OID=.;OPOS=125398319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:11:11:12:18:11:11:12:18
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chr12	125398517	.	G	A	138.95	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00144113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.666;QD=19.8495;RBI=0.0066959;REFB=-0.0134599;REVB=0.00653898;RO=13;SAF=9;SAR=6;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0517022;STB=0.529372;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0113341;OID=.;OPOS=125398517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:6:9:7:6:6:9:7:6
chr12	125398723	.	G	T	74.65	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0188284;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.236;QD=10.6646;RBI=0.0380438;REFB=-0.00885924;REVB=0.0330578;RO=18;SAF=2;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361526;STB=0.720827;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0243032;OID=.;OPOS=125398723;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:8:2:9:9:8:2:9:9
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chr12	125398733	.	C	T	129.27	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0172784;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.1641;QD=21.5446;RBI=0.0381793;REFB=-0.00495509;REVB=-0.0340458;RO=10;SAF=8;SAR=6;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268469;STB=0.650957;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.00269632;OID=.;OPOS=125398733;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:10:10:14:14:0.583333:6:8:2:8:6:8:2:8
chr12	125399068	.	C	T	695.32	PASS	AF=0.707317;AO=57;DP=82;FAO=58;FDP=82;FR=.;FRO=24;FSAF=40;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.100944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.7586;QD=33.9179;RBI=0.123703;REFB=-0.0353057;REVB=0.0715038;RO=24;SAF=40;SAR=17;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100205;STB=0.548706;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0163365;OID=.;OPOS=125399068;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:24:24:57:58:0.707317:17:40:13:11:18:40:13:11
chr12	125399171	.	AC	A	839.72	PASS	AF=0.655914;AO=112;DP=188;FAO=122;FDP=186;FR=.;FRO=64;FSAF=87;FSAR=35;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.0376348;FXX=0.0106377;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.2691;QD=18.0586;RBI=0.0628141;REFB=0.0261899;REVB=0.0502915;RO=58;SAF=80;SAR=32;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0826081;STB=0.560076;STBP=0.029;TYPE=del;VARB=-0.00377072;OID=.;OPOS=125399172;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.655914:112:188:122:186:64:87:35:36:28:99:58:80:32:35:23
chr12	125399286	.	C	T	337.94	PASS	AF=0.413043;AO=32;DP=87;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=19;FWDB=0.039532;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9611;QD=14.6932;RBI=0.0556335;REFB=-0.0200785;REVB=0.0391446;RO=51;SAF=16;SAR=16;SRF=33;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158738;STB=0.586912;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0622585;OID=.;OPOS=125399286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:92:51:54:32:38:0.413043:16:16:33:18:19:19:35:19
chr12	125424502	.	A	G	170.32	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0239322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.301;QD=17.0323;RBI=0.0447161;REFB=-0.0156536;REVB=0.0377727;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140082;STB=0.580022;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0248129;OID=.;OPOS=125424502;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:10:8:13:9:10:8:13:9
chr12	125424510	.	T	A	181.82	PASS	AF=0.452381;AO=18;DP=40;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0107009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.934;QD=17.3157;RBI=0.0111973;REFB=-0.0092982;REVB=-0.00329673;RO=21;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215916;STB=0.63144;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00801167;OID=.;OPOS=125424510;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:42:21:23:18:19:0.452381:11:7:13:8:12:7:14:9
chr12	125432618	.	G	A	246.56	PASS	AF=0.575;AO=22;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00121372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.777;QD=24.6558;RBI=0.0258086;REFB=-0.00936105;REVB=0.0257801;RO=17;SAF=4;SAR=18;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294619;STB=0.634019;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00546349;OID=.;OPOS=125432618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:17:17:22:23:0.575:18:4:8:9:18:5:8:9
chr12	125434580	.	C	T	972.83	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.14;QD=58.9594;RBI=0.0573515;REFB=0;REVB=0.0457129;RO=0;SAF=44;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.49723e-05;OID=.;OPOS=125434580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:22:44:0:0:22:44:0:0
chr12	125434716	.	G	A	433.59	PASS	AF=0.621212;AO=41;DP=66;FAO=41;FDP=66;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.00416398;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.38;QD=26.2784;RBI=0.00626996;REFB=-0.0349418;REVB=0.00468761;RO=25;SAF=19;SAR=22;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393106;STB=0.521471;STBP=0.69;TYPE=snp;VARB=0.0219853;OID=.;OPOS=125434716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:25:25:41:41:0.621212:22:19:13:12:22:19:13:12
chr12	125437019	.	T	C	767.2	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0360795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4544;QD=56.8296;RBI=0.0392137;REFB=0;REVB=-0.0153618;RO=0;SAF=26;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52846e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000245775;OID=.;OPOS=125437019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:28:26:0:0:28:26:0:0
chr12	125438516	.	T	C	819.25	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00339835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.014;QD=56.5;RBI=0.0173919;REFB=0;REVB=0.0170567;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00214094;OID=.;OPOS=125438516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:58:0:0:55:58:1:28:27:0:0:31:27:0:0
chr12	125438523	.	C	T	867.97	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0380234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3143;QD=55.998;RBI=0.0932019;REFB=0;REVB=0.0850929;RO=1;SAF=25;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184819;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000662141;OID=.;OPOS=125438523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:62:1:0:55:62:1:30:25:1:0:32:30:0:0
chr12	125441347	.	T	C	266.13	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=50;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0114751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4494;QD=21.2904;RBI=0.0152978;REFB=-0.0288127;REVB=-0.0101166;RO=22;SAF=12;SAR=13;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0927583;STB=0.579555;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0120352;OID=.;OPOS=125441347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:22:25:25:25:0.5:13:12:13:9:13:12:16:9
chr12	125441359	.	T	C	143.08	PASS	AF=0.4;AO=14;DP=42;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.043087;FXX=0.0697512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3411;QD=14.3084;RBI=0.0441926;REFB=-0.00909264;REVB=-0.00982327;RO=24;SAF=6;SAR=8;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208022;STB=0.574908;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0178101;OID=.;OPOS=125441359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:40:24:24:14:16:0.4:8:6:15:9:8:8:15:9
chr12	125448960	.	C	T	449.84	PASS	AF=0.581081;AO=43;DP=74;FAO=43;FDP=74;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0134316;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.6;QD=24.3155;RBI=0.0139893;REFB=-0.0208563;REVB=0.00391069;RO=30;SAF=25;SAR=18;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143732;STB=0.500323;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.013987;OID=.;OPOS=125448960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:30:31:43:43:0.581081:18:25:18:12:18:25:18:13
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chr12	125834395	.	T	C	678.23	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0324782;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7827;QD=63.0914;RBI=0.0453479;REFB=0;REVB=-0.031648;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00110225;OID=.;OPOS=125834395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:43:0:0:43:43:1:22:21:0:0:22:21:0:0
chr12	126068417	.	T	C	1728.1	PASS	AF=0.983051;AO=115;DP=117;FAO=116;FDP=118;FR=.;FRO=2;FSAF=66;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0107034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.545;QD=58.5795;RBI=0.0114114;REFB=0.0074711;REVB=-0.00395688;RO=1;SAF=65;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00940276;STB=0.509802;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-5.81291e-06;OID=.;OPOS=126068417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:117:118:1:2:115:116:0.983051:50:65:0:1:50:66:0:2
chr12	126137060	.	C	T	607.3	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.027251;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.0044;QD=59.2483;RBI=0.0504585;REFB=0.0316162;REVB=0.042467;RO=1;SAF=28;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164593;STB=0.508768;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.00132121;OID=.;OPOS=126137060;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:12:28:1:0:12:28:1:0
chr12	127067932	.	A	G	51.4	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0288004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.116;QD=18.6926;RBI=0.0326206;REFB=-0.0455414;REVB=-0.015318;RO=4;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197383;STB=0.615061;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0269385;OID=.;OPOS=127067932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:3:4:1:3:3:4:1:3
chr12	127068865	.	A	G,T	415.23	PASS	AF=0.933333,0.0666667;AO=28,2;DP=30;FAO=28,2;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=8,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420886,-0.00162174;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=114.111,195.967;QD=55.3637;RBI=0.0431752,0.0397269;REFB=0,0;REVB=0.00962539,-0.0396937;RO=0;SAF=20,1;SAR=8,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=7.75204e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00101846,0.214446;OID=.,.;OPOS=127068865,127068865;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:30:30:0:0:28,2:28,2:0.933333,0.0666667:8,1:20,1:0:0:8,1:20,1:0:0
chr12	127068892	.	C	T	674.95	PASS	AF=0.977778;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0599237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.82;QD=59.9956;RBI=0.0655557;REFB=-0.0361446;REVB=-0.0265839;RO=1;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218371;STB=0.511623;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=1.96507e-05;OID=.;OPOS=127068892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:44:45:1:1:43:44:0.977778:21:22:0:1:21:23:0:1
chr12	127497881	.	A	G	126.84	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0547877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.262;QD=19.5135;RBI=0.0559409;REFB=0.0137982;REVB=0.0113003;RO=12;SAF=12;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.390503;STB=0.726891;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=-0.0165946;OID=.;OPOS=127497881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:12:12:14:14:0.538462:2:12:6:6:2:12:6:6
chr12	127650467	.	G	C	4078.25	PASS	AF=0.938144;AO=271;DP=289;FAO=273;FDP=291;FR=.;FRO=18;FSAF=154;FSAR=119;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0253933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.6454;QD=56.0585;RBI=0.0270931;REFB=-0.0234945;REVB=0.00944522;RO=16;SAF=154;SAR=117;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000623133;STB=0.502958;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.000964471;OID=.;OPOS=127650467;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:289:291:16:18:271:273:0.938144:117:154:9:7:119:154:11:7
chr12	127650471	.	AT	GG	4555.64	PASS	AF=0.961905;AO=260;DP=317;FAO=303;FDP=315;FR=.;FRO=12;FSAF=184;FSAR=119;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0532583;FXX=0.00630895;HRUN=1;LEN=2;MLLD=312.8;QD=57.8494;RBI=0.0533829;REFB=-0.0129761;REVB=0.00364595;RO=12;SAF=144;SAR=116;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011639;STB=0.507586;STBP=0.182;TYPE=mnp;VARB=0.0016589;OID=.;OPOS=127650471;OREF=AT;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:317:315:12:12:260:303:0.961905:116:144:5:7:119:184:5:7
chr12	127650538	.	A	G	9469.3	PASS	AF=0.95969;AO=614;DP=644;FAO=619;FDP=645;FR=.;FRO=26;FSAF=308;FSAR=311;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0131661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3793;QD=58.7243;RBI=0.0507368;REFB=-0.0326754;REVB=-0.0489988;RO=27;SAF=308;SAR=306;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00756818;STB=0.500098;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.00300327;OID=.;OPOS=127650538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:644:645:27:26:614:619:0.95969:306:308:11:16:311:308:13:13
chr12	127650583	.	T	G	8102.32	PASS	AF=0.944348;AO=541;DP=570;FAO=543;FDP=575;FR=.;FRO=32;FSAF=274;FSAR=269;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.0713144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2883;QD=56.364;RBI=0.0743586;REFB=0.00849756;REVB=0.0210583;RO=28;SAF=274;SAR=267;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240512;STB=0.514166;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00204487;OID=.;OPOS=127650583;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:570:575:28:32:541:543:0.944348:267:274:7:21:269:274:8:24
chr12	127650599	.	A	G	6688.63	PASS	AF=0.981982;AO=305;DP=454;FAO=436;FDP=444;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=227;FSAR=209;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0750835;FXX=0.0198671;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.462;QD=60.2579;RBI=0.079404;REFB=-0.0723204;REVB=0.0258354;RO=9;SAF=112;SAR=193;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110326;STB=0.500373;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.00142002;OID=.;OPOS=127650599;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:454:444:9:8:305:436:0.981982:193:112:5:4:209:227:4:4
chr12	127650616	.	G	A	577.31	PASS	AF=0.226829;AO=93;DP=408;FAO=93;FDP=410;FR=.;FRO=317;FSAF=45;FSAR=48;FSRF=144;FSRR=173;FWDB=-0.00478762;FXX=0.00243303;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.016;QD=5.63231;RBI=0.0082159;REFB=-0.00646026;REVB=-0.00667681;RO=314;SAF=45;SAR=48;SRF=142;SRR=172;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405578;STB=0.522948;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0305881;OID=.;OPOS=127650616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:408:410:314:317:93:93:0.226829:48:45:142:172:48:45:144:173
chr12	127650639	.	A	G	3065.92	PASS	AF=0.944223;AO=128;DP=249;FAO=237;FDP=251;FR=.;FRO=14;FSAF=89;FSAR=148;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0415195;FXX=0.0039681;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.313;QD=48.8593;RBI=0.0813395;REFB=-0.109615;REVB=0.0699446;RO=6;SAF=81;SAR=47;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120983;STB=0.511581;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00446079;OID=.;OPOS=127650639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:249:251:6:14:128:237:0.944223:47:81:3:3:148:89:8:6
chr12	127650662	.	T	C	673.95	PASS	AF=0.896552;AO=51;DP=57;FAO=52;FDP=58;FR=.;FRO=6;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0109237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.744;QD=46.4791;RBI=0.0110064;REFB=-0.0366094;REVB=-0.00134717;RO=6;SAF=13;SAR=38;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615222;STB=0.529497;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.00735315;OID=.;OPOS=127650662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:57:58:6:6:51:52:0.896552:38:13:3:3:38:14:3:3
chr12	127650669	.	A	G	164.05	PASS	AF=0.727273;AO=16;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0104877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.73;QD=29.8269;RBI=0.0167382;REFB=-0.034915;REVB=-0.0130452;RO=6;SAF=3;SAR=13;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212179;STB=0.618882;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.020434;OID=.;OPOS=127650669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:6:6:16:16:0.727273:13:3:3:3:13:3:3:3
chr12	127650883	.	G	T	109.04	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0081428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.874;QD=36.3479;RBI=0.0386463;REFB=-0.105349;REVB=0.0377787;RO=1;SAF=10;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428878;STB=0.523767;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00464326;OID=.;OPOS=127650883;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:1:10:1:0:1:10:1:0
chr12	127650890	.	G	C	89.0	PASS	AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.004393;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=285.274;QD=27.3839;RBI=0.0138484;REFB=0.0107774;REVB=-0.0131332;RO=3;SAF=9;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128039;STB=0.5713;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=-0.00220948;OID=.;OPOS=127650890;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:1:9:3:0:1:9:3:0
chr12	128778703	.	G	A	318.33	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.101265;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.8619;QD=18.1902;RBI=0.107168;REFB=-0.0292681;REVB=0.0350761;RO=35;SAF=25;SAR=9;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172813;STB=0.591659;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0282556;OID=.;OPOS=128778703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:35:36:34:34:0.485714:9:25:20:15:9:25:21:15
chr12	128899673	.	A	G	292.26	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.011627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3083;QD=17.1917;RBI=0.0446997;REFB=-0.0144106;REVB=-0.0431611;RO=36;SAF=10;SAR=22;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108777;STB=0.561185;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.02961;OID=.;OPOS=128899673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:22:10:15:21:22:10:15:21
chr12	128900005	.	G	A	241.68	PASS	AF=0.522727;AO=23;DP=44;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.00809937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.369;QD=21.9713;RBI=0.00995896;REFB=-0.033598;REVB=-0.00579493;RO=21;SAF=6;SAR=17;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0763899;STB=0.542959;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0260874;OID=.;OPOS=128900005;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:21:21:23:23:0.522727:17:6:7:14:17:6:7:14
chr12	129181810	.	A	G	2626.94	PASS	AF=0.988439;AO=171;DP=173;FAO=171;FDP=173;FR=.;FRO=2;FSAF=102;FSAR=69;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0142741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.121;QD=60.7385;RBI=0.0308554;REFB=-0.0317319;REVB=-0.0273552;RO=2;SAF=102;SAR=69;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00924052;STB=0.504854;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.000180654;OID=.;OPOS=129181810;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:173:173:2:2:171:171:0.988439:69:102:2:0:69:102:2:0
chr12	129181834	.	A	G	3010.41	PASS	AF=1;AO=190;DP=190;FAO=190;FDP=190;FR=.;FRO=0;FSAF=115;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0304906;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9381;QD=63.377;RBI=0.0374412;REFB=0;REVB=0.0217294;RO=0;SAF=115;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90472e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.70499e-05;OID=.;OPOS=129181834;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:190:190:0:0:190:190:1:75:115:0:0:75:115:0:0
chr12	129189941	.	G	A	82.06	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00944176;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=246.728;QD=32.8255;RBI=0.0322407;REFB=-0.100465;REVB=-0.0308272;RO=1;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126211;STB=0.571265;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00116076;OID=.;OPOS=129189941;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:3:6:0:1:3:6:0:1
chr12	129190021	.	A	G	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4193;QD=48.735;RBI=0.0393255;REFB=0;REVB=0.0276462;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00188493;OID=.;OPOS=129190021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr12	129190474	.	G	A	1736.05	PASS	AF=0.966942;AO=109;DP=121;FAO=117;FDP=121;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=68;FSAR=49;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0583923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.333;QD=57.3901;RBI=0.0671493;REFB=-0.158476;REVB=0.0331567;RO=1;SAF=68;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693038;STB=0.514283;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00304142;OID=.;OPOS=129190474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:121:121:1:4:109:117:0.966942:41:68:1:0:49:68:4:0
chr12	129278864	.	A	G	102.11	PASS	AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.113487;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=44.0649;QD=29.1744;RBI=0.114137;REFB=-0.0713068;REVB=-0.0121714;RO=3;SAF=4;SAR=7;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119933;STB=0.567442;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0135368;OID=.;OPOS=129278864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:14:14:3:3:11:11:0.785714:7:4:2:1:7:4:2:1
chr12	129293346	.	C	T	60.51	PASS	AF=0.230769;AO=9;DP=39;FAO=9;FDP=39;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0119666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.1;QD=6.20615;RBI=0.0161112;REFB=-0.00834728;REVB=0.0107876;RO=29;SAF=5;SAR=4;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0799301;STB=0.534807;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=0.0398759;OID=.;OPOS=129293346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:39:39:29:30:9:9:0.230769:4:5:18:11:4:5:18:12
chr12	129298735	.	C	G	428.74	PASS	AF=0.393701;AO=50;DP=125;FAO=50;FDP=127;FR=.;FRO=77;FSAF=43;FSAR=7;FSRF=60;FSRR=17;FWDB=0.0308489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9742;QD=13.5037;RBI=0.0374728;REFB=-0.0248139;REVB=-0.0212733;RO=75;SAF=43;SAR=7;SRF=60;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118263;STB=0.588666;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0854087;OID=.;OPOS=129298735;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:127:75:77:50:50:0.393701:7:43:60:15:7:43:60:17
chr12	129298779	.	C	T	39.89	PASS	AF=0.111111;AO=10;DP=90;FAO=10;FDP=90;FR=.;FRO=80;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=54;FSRR=26;FWDB=-0.0734612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1169;QD=1.77281;RBI=0.0747581;REFB=-0.0151924;REVB=-0.0138648;RO=79;SAF=4;SAR=6;SRF=54;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.335239;STB=0.730692;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.102235;OID=.;OPOS=129298779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:90:90:79:80:10:10:0.111111:6:4:54:25:6:4:54:26
chr12	129298819	.	C	T	263.85	PASS	AF=0.329897;AO=32;DP=97;FAO=32;FDP=97;FR=.;FRO=65;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=49;FWDB=-0.038031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6631;QD=10.8803;RBI=0.0385191;REFB=-0.0287001;REVB=-0.00611237;RO=65;SAF=13;SAR=19;SRF=16;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202154;STB=0.615962;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0517851;OID=.;OPOS=129298819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:65:65:32:32:0.329897:19:13:16:49:19:13:16:49
chr12	129348666	.	C	T	312.69	PASS	AF=0.636364;AO=25;DP=43;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0135963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.1484;QD=28.4261;RBI=0.0424697;REFB=-0.0645963;REVB=0.0402344;RO=16;SAF=17;SAR=8;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137456;STB=0.554755;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0388204;OID=.;OPOS=129348666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:16:16:25:28:0.636364:8:17:8:8:10:18:8:8
chr12	129360498	.	G	A	527.19	PASS	AF=0.925;AO=38;DP=40;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0225969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.8469;QD=52.7194;RBI=0.0607688;REFB=-0.211438;REVB=-0.0564112;RO=2;SAF=29;SAR=9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312287;STB=0.52541;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0205631;OID=.;OPOS=129360498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:40:40:2:3:38:37:0.925:9:29:2:0:9:28:3:0
chr12	129559557	.	C	T	167.89	PASS	AF=0.418605;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=43;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=5;FWDB=-0.00322379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.18;QD=15.6176;RBI=0.021903;REFB=-0.0277495;REVB=0.0216644;RO=25;SAF=6;SAR=12;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.446349;STB=0.753371;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0199523;OID=.;OPOS=129559557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:25:18:18:0.418605:12:6:20:5:12:6:20:5
chr12	130647709	.	G	C	3915.84	PASS	AF=1;AO=245;DP=245;FAO=245;FDP=245;FR=.;FRO=0;FSAF=119;FSAR=126;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0844737;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.665;QD=63.932;RBI=0.0951872;REFB=0;REVB=0.0438724;RO=0;SAF=119;SAR=126;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65773e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.9329e-05;OID=.;OPOS=130647709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:21:245:245:0:0:245:245:1:126:119:0:0:126:119:0:0
chr12	130649316	.	CTTTTTTTTTTT	CTTCTTTTTTTT,CTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTT	575.06	PASS	AF=0.272727,0.454545,0.0606061,0.212121;AO=10,7,3,7;DP=65;FAO=18,30,4,14;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=6,16,4,8;FSAR=12,14,0,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261172,0.0294078,-0.0486926,0.0446775;FXX=0.0149231;HRUN=13,13,13,13;LEN=1,3,1,2;MLLD=154.319,12.0773,142.359,10.3521;QD=34.8522;RBI=0.0932796,0.113966,0.0627952,0.137314;REFB=0,0,0,0;REVB=-0.0895488,-0.110106,-0.0396518,-0.129843;RO=0;SAF=3,1,3,2;SAR=7,6,0,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,-3.27427e-08;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,del,snp,del;VARB=0.0355126,0.0148142,0.0168427,-0.0369935;OID=.,.,.,.;OPOS=130649319,130649317,130649327,130649317;OREF=T,TTT,T,TT;OALT=C,-,A,-;OMAPALT=CTTCTTTTTTTT,CTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTA,CTTTTTTTTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.272727,0.454545,0.0606061,0.212121:10,7,3,7:65:18,30,4,14:66:0:6,16,4,8:12,14,0,6:0:0:99:0:3,1,3,2:7,6,0,5:0:0
chr12	130649543	.	C	G	960.05	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0113786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=109.506;QD=57.3167;RBI=0.0253439;REFB=-0.153371;REVB=0.0226459;RO=1;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136944;STB=0.507244;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00125499;OID=.;OPOS=130649543;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:34:32:0:1:34:32:0:1
chr12	130650041	.	G	A	1176.78	PASS	AF=0.891304;AO=83;DP=94;FAO=82;FDP=92;FR=.;FRO=10;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0253662;FXX=0.0212743;HRUN=6;LEN=1;MLLD=275.9;QD=51.1645;RBI=0.0285443;REFB=-0.0440861;REVB=0.0130895;RO=8;SAF=39;SAR=44;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158183;STB=0.503995;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.00228787;OID=.;OPOS=130650041;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:94:92:8:10:83:82:0.891304:44:39:3:5:44:38:5:5
chr12	130912757	.	C	T	601.13	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0134649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8621;QD=58.6472;RBI=0.0219011;REFB=-0.134654;REVB=-0.017273;RO=1;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253417;STB=0.513507;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00457915;OID=.;OPOS=130912757;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:18:22:0:1:18:22:0:1
chr12	131275484	.	G	A	990.62	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.479;QD=59.1415;RBI=0.0164891;REFB=0;REVB=-0.000941254;RO=0;SAF=41;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.78652e-05;OID=.;OPOS=131275484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:26:41:0:0:26:41:0:0
chr12	131276448	.	G	T	1226.86	PASS	AF=0.964706;AO=82;DP=85;FAO=82;FDP=85;FR=.;FRO=3;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00200398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.272;QD=57.7347;RBI=0.0152279;REFB=-0.203399;REVB=-0.0150955;RO=3;SAF=47;SAR=35;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029269;STB=0.51546;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00131987;OID=.;OPOS=131276448;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:85:85:3:3:82:82:0.964706:35:47:3:0:35:47:3:0
chr12	131296908	.	C	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000706504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.835;QD=39.2068;RBI=0.000706504;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32911e-06;OID=.;OPOS=131296908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:0:9:0:0:0:9:0:0
chr12	131299974	.	A	G	851.09	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.214;QD=57.701;RBI=0.0298268;REFB=0;REVB=0.00162662;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011573;OID=.;OPOS=131299974;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0
chr12	131306314	.	C	G	1087.99	PASS	AF=0.986486;AO=72;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0396319;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3139;QD=58.8104;RBI=0.0677924;REFB=0.0245703;REVB=0.0550011;RO=1;SAF=45;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171927;STB=0.50877;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.000398422;OID=.;OPOS=131306314;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:72:73:0.986486:27:45:0:1:28:45:0:1
chr12	131466562	.	T	C	1358.6	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.223;QD=62.4646;RBI=0.0280048;REFB=0;REVB=0.0221738;RO=0;SAF=56;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00429e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114669;OID=.;OPOS=131466562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:31:56:0:0:31:56:0:0
chr12	131590404	.	G	A	506.94	PASS	AF=0.545455;AO=48;DP=88;FAO=48;FDP=88;FR=.;FRO=40;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0138901;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.168;QD=23.0427;RBI=0.0140738;REFB=-0.00646938;REVB=-0.00226611;RO=40;SAF=24;SAR=24;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619983;STB=0.534077;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00540682;OID=.;OPOS=131590404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:40:40:48:48:0.545455:24:24:17:23:24:24:17:23
chr12	131620588	.	A	G	530.25	PASS	AF=0.561798;AO=50;DP=88;FAO=50;FDP=89;FR=.;FRO=39;FSAF=37;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=0.00198199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5871;QD=23.8314;RBI=0.00896028;REFB=-0.0348093;REVB=-0.00873833;RO=37;SAF=37;SAR=13;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103025;STB=0.512401;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0316618;OID=.;OPOS=131620588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:37:39:50:50:0.561798:13:37:27:10:13:37:28:11
chr12	131622735	.	T	C	140.7	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0093707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.7;QD=13.0887;RBI=0.0178418;REFB=-0.0311873;REVB=-0.0151828;RO=26;SAF=13;SAR=3;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.416347;STB=0.756933;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0269059;OID=.;OPOS=131622735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:27:16:16:0.372093:3:13:12:14:3:13:12:15
chr12	132237848	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.972;QD=45.8062;RBI=0.00176021;REFB=0;REVB=-0.00176021;RO=0;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.11368e-05;OID=.;OPOS=132237848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:14:0:0:0:14:0:0:0
chr12	132271113	.	T	C	1727.59	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016706;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.04;QD=60.6172;RBI=0.0169834;REFB=0;REVB=0.00305719;RO=0;SAF=67;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90878e-05;OID=.;OPOS=132271113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:114:0:0:113:114:1:46:67:0:0:46:68:0:0
chr12	132323250	.	C	G	1065.97	PASS	AF=0.535714;AO=90;DP=179;FAO=105;FDP=196;FR=.;FRO=91;FSAF=62;FSAR=43;FSRF=46;FSRR=45;FWDB=0.076727;FXX=0.0101005;HRUN=5;LEN=1;MLLD=38.3717;QD=21.7544;RBI=0.123012;REFB=-0.0543575;REVB=0.0961509;RO=89;SAF=60;SAR=30;SRF=45;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15417;STB=0.54019;STBP=0.226;TYPE=snp;VARB=0.0483285;OID=.;OPOS=132323250;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:196:89:91:90:105:0.535714:30:60:45:44:43:62:46:45
chr12	132325239	.	G	A	642.28	PASS	AF=0.451613;AO=70;DP=155;FAO=70;FDP=155;FR=.;FRO=85;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=46;FSRR=39;FWDB=-0.0208456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.162;QD=16.5751;RBI=0.0412184;REFB=-0.0245415;REVB=0.0355587;RO=84;SAF=35;SAR=35;SRF=45;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350527;STB=0.522574;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0287324;OID=.;OPOS=132325239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:155:84:85:70:70:0.451613:35:35:45:39:35:35:46:39
chr12	132326298	.	G	A	490.94	PASS	AF=0.5;AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=0.0215071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.076;QD=19.2525;RBI=0.0263961;REFB=-0.0179792;REVB=0.0153036;RO=50;SAF=16;SAR=35;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247756;STB=0.642401;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0168347;OID=.;OPOS=132326298;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:50:51:51:51:0.5:35:16:29:21:35:16:30:21
chr12	132402020	.	T	C	388.08	PASS	AF=0.403361;AO=44;DP=117;FAO=48;FDP=119;FR=.;FRO=71;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=32;FSRR=39;FWDB=-0.101;FXX=0.0165276;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2687;QD=13.0448;RBI=0.101454;REFB=-0.00561557;REVB=0.00959328;RO=73;SAF=17;SAR=27;SRF=34;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0894164;STB=0.520735;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0149537;OID=.;OPOS=132402020;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:119:73:71:44:48:0.403361:27:17:34:39:28:20:32:39
chr12	132403161	.	A	G	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.93;QD=63.8717;RBI=0.0271239;REFB=0;REVB=0.00650288;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.02109e-05;OID=.;OPOS=132403161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:35:13:0:0:35:13:0:0
chr12	132406666	.	G	C	300.17	PASS	AF=0.275641;AO=43;DP=157;FAO=43;FDP=156;FR=.;FRO=113;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=55;FSRR=58;FWDB=-0.0301619;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.7129;QD=7.69656;RBI=0.0643526;REFB=-0.0135448;REVB=-0.0568464;RO=110;SAF=19;SAR=24;SRF=53;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489707;STB=0.532678;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0497353;OID=.;OPOS=132406666;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:157:156:110:113:43:43:0.275641:24:19:53:57:24:19:55:58
chr12	132508389	.	A	G	192.16	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.00345234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5747;QD=14.7818;RBI=0.0102227;REFB=-0.0168063;REVB=0.00962206;RO=29;SAF=15;SAR=7;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0679929;STB=0.552277;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0287395;OID=.;OPOS=132508389;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:29:30:22:22:0.423077:7:15:18:11:7:15:18:12
chr12	132514288	.	C	G	72.95	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0174492;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.668;QD=10.0614;RBI=0.0234999;REFB=-0.0140452;REVB=-0.0157406;RO=19;SAF=6;SAR=4;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978809;STB=0.55871;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.0258214;OID=.;OPOS=132514288;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:29:29:19:19:10:10:0.344828:4:6:13:6:4:6:13:6
chr12	132547162	.	G	A	33.47	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=0;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.3792;QD=19.1243;RBI=0.126923;REFB=-0.0225829;REVB=-0.126923;RO=2;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00473393;OID=.;OPOS=132547162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:5:0:0:2:5:0:0:2
chr12	132588668	.	CT	CTC,TC	36.97	PASS	AF=0.37931,0;AO=11,2;DP=29;FAO=11,0;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=7,0;FSAR=4,0;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0594167,-0.091836;FXX=0;HRUN=0,3;LEN=1,2;MLLD=93.6455,91.382;QD=5.09968;RBI=0.0595007,0.0920784;REFB=-0.00483023,-0.0028311;REVB=-0.00315986,-0.00667602;RO=15;SAF=7,2;SAR=4,0;SRF=3;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.408967,0.691135;STB=0.682607,0.5;STBP=0.159,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.137335,0;OID=.,.;OPOS=132588670,132588668;OREF=-,CT;OALT=C,TC;OMAPALT=CTC,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:29:29:15:18:11,2:11,0:0.37931,0:4,0:7,2:3:12:4,0:7,0:6:12
chr12	132626425	.	G	A	359.19	PASS	AF=0.402062;AO=39;DP=97;FAO=39;FDP=97;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.0205703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.8544;QD=14.8118;RBI=0.0296451;REFB=-0.0220153;REVB=0.0213471;RO=58;SAF=19;SAR=20;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022881;STB=0.512963;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0147745;OID=.;OPOS=132626425;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:58:58:39:39:0.402062:20:19:27:31:20:19:27:31
chr12	132626668	.	T	C	103.81	PASS	AF=0.269231;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0225571;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.742;QD=7.98561;RBI=0.0380967;REFB=-0.0108439;REVB=0.0307008;RO=36;SAF=7;SAR=7;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165217;STB=0.615229;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.0422848;OID=.;OPOS=132626668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:36:38:14:14:0.269231:7:7:23:13:7:7:25:13
chr12	132633146	.	C	T	199.44	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0417657;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=99.4498;QD=19.9441;RBI=0.042697;REFB=-0.00231747;REVB=-0.00886908;RO=20;SAF=10;SAR=10;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00253641;OID=.;OPOS=132633146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:10:10:10:10:10:10:10:10
chr12	132635521	.	T	C	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0115099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.289;QD=21.2676;RBI=0.0310267;REFB=-0.0228388;REVB=-0.0288128;RO=14;SAF=11;SAR=6;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602254;STB=0.533859;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0222348;OID=.;OPOS=132635521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:6:11:10:4:6:11:10:4
chr12	132635581	.	C	T	171.08	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00105205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.4719;QD=18.0082;RBI=0.02261;REFB=-0.0553189;REVB=0.0225856;RO=18;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526287;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0574683;OID=.;OPOS=132635581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:20:18:18:0.473684:9:9:9:9:9:9:9:11
chr12	132682481	.	T	G	2603.0	PASS	AF=1;AO=167;DP=167;FAO=168;FDP=168;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.857;QD=61.9763;RBI=0.0355193;REFB=0;REVB=0.0264778;RO=0;SAF=82;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02973e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.35479e-05;OID=.;OPOS=132682481;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:167:168:0:0:167:168:1:85:82:0:0:85:83:0:0
chr12	132682484	.	A	G	2572.94	PASS	AF=1;AO=165;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0693952;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.882;QD=61.9985;RBI=0.0743956;REFB=0;REVB=0.0268144;RO=0;SAF=81;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.20713e-05;OID=.;OPOS=132682484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:166:166:0:0:165:166:1:84:81:0:0:84:82:0:0
chr12	132688137	.	A	G	1227.51	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.559;QD=61.3753;RBI=0.0367702;REFB=0;REVB=0.00639478;RO=0;SAF=38;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.26068e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.54971e-05;OID=.;OPOS=132688137;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:42:38:0:0:42:38:0:0
chr12	132862976	.	G	A	199.7	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.010261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.972;QD=19.9697;RBI=0.0225559;REFB=-0.0130403;REVB=0.0200868;RO=19;SAF=5;SAR=15;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125848;STB=0.590812;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0219331;OID=.;OPOS=132862976;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:20:20:20:0.5:15:5:7:12:15:5:8:12
chr12	133144074	.	TGGG	TGG,TGGT	258.19	PASS	AF=0.444444,0.555556;AO=6,14;DP=28;FAO=12,15;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=7,12;FSAR=5,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273007,-0.0333556;FXX=0.0357015;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=15.6278,30.1107;QD=38.2503;RBI=0.191405,0.13967;REFB=-0.034116,-0.0438746;REVB=0.189448,0.135629;RO=4;SAF=5,11;SAR=1,3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0.446154,0;SSEP=0,0;SSSB=0.443891,0.261891;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.219,-0.0497644;OID=.,.;OPOS=133144075,133144077;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=TGG,TGGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.444444,0.555556:6,14:28:12,15:27:0:7,12:5,3:0:0:69:4:5,11:1,3:1:3
chr12	133151004	.	C	G	46.39	PASS	AF=0.0786517;AO=7;DP=91;FAO=7;FDP=89;FR=.,HEALED;FRO=78;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=59;FWDB=-0.0308419;FXX=0.0219756;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.8734;QD=2.0849;RBI=0.0740533;REFB=-0.00533413;REVB=-0.0673251;RO=77;SAF=5;SAR=2;SRF=18;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.512294;STB=0.863313;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.00861016;OID=.;OPOS=133151004;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:91:89:77:78:7:7:0.0786517:2:5:18:59:2:5:19:59
chr12	133181399	.	T	C	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.194;QD=57.6807;RBI=0.0433293;REFB=0;REVB=0.0181552;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000199873;OID=.;OPOS=133181399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr12	133182818	.	G	A	173.07	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0319721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.199;QD=18.7104;RBI=0.0528429;REFB=-0.0498662;REVB=0.0420733;RO=18;SAF=6;SAR=12;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105429;STB=0.576835;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0343797;OID=.;OPOS=133182818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:19:18:18:0.486486:12:6:8:10:12:6:9:10
chr12	133196596	.	T	C,G	565.0	PASS	AF=0.947368,0.0526316;AO=35,2;DP=37;FAO=36,2;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=16,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246621,0.0127202;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=145.327,106.452;QD=59.474;RBI=0.025354,0.035292;REFB=0,0;REVB=0.0058826,-0.03292;RO=0;SAF=19,1;SAR=16,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.1382e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00163582,0.0588224;OID=.,.;OPOS=133196596,133196596;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:37:38:0:0:35,2:36,2:0.947368,0.0526316:16,1:19,1:0:0:16,1:20,1:0:0
chr12	133201947	.	T	C	564.97	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0633597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5624;QD=57.9452;RBI=0.0660393;REFB=-0.15694;REVB=-0.0186207;RO=1;SAF=18;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0253186;STB=0.513506;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00260085;OID=.;OPOS=133201947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:39:39:1:1:38:38:0.974359:20:18:1:0:20:18:1:0
chr12	133202004	.	C	T	202.64	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00578019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.4396;QD=21.9065;RBI=0.0191405;REFB=-0.0294768;REVB=0.0182469;RO=17;SAF=5;SAR=15;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21029;STB=0.61892;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0273473;OID=.;OPOS=133202004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:15:5:8:9:15:5:8:9
chr12	133208979	.	T	C	1570.16	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00705395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.679;QD=64.0881;RBI=0.0362045;REFB=0;REVB=0.0355107;RO=0;SAF=52;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01306e-05;OID=.;OPOS=133208979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:98:0:0:94:98:1:42:52:0:0:46:52:0:0
chr12	133212582	.	G	A	117.2	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0508721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.303;QD=12.0207;RBI=0.05559;REFB=-0.00121568;REVB=0.0224116;RO=23;SAF=8;SAR=6;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0405333;STB=0.545391;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.00219109;OID=.;OPOS=133212582;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:25:14:14:0.358974:6:8:14:9:6:8:16:9
chr12	133219831	.	T	C	632.84	PASS	AF=0.529412;AO=63;DP=119;FAO=63;FDP=119;FR=.;FRO=56;FSAF=41;FSAR=22;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=-0.0292367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.709;QD=21.2719;RBI=0.0339659;REFB=-0.0188072;REVB=0.0172885;RO=56;SAF=41;SAR=22;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00745821;STB=0.504097;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0270797;OID=.;OPOS=133219831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:56:56:63:63:0.529412:22:41:36:20:22:41:36:20
chr12	133236000	.	C	T	183.57	PASS	AF=0.324324;AO=24;DP=74;FAO=24;FDP=74;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=25;FWDB=-0.0277895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.595;QD=9.92265;RBI=0.0278775;REFB=-0.00713227;REVB=-0.00221332;RO=50;SAF=10;SAR=14;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967258;STB=0.556771;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.014391;OID=.;OPOS=133236000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:50:50:24:24:0.324324:14:10:25:25:14:10:25:25
chr12	133253995	.	G	A	237.91	PASS	AF=0.352941;AO=23;DP=78;FAO=30;FDP=85;FR=.;FRO=55;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=0.00237624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.509;QD=11.1959;RBI=0.00575402;REFB=-0.00227181;REVB=0.00524044;RO=55;SAF=10;SAR=13;SRF=20;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873168;STB=0.567524;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.00468442;OID=.;OPOS=133253995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:85:55:55:23:30:0.352941:13:10:20:35:16:14:20:35
chr12	133272470	.	G	T	94.44	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.00277339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3294;QD=10.7937;RBI=0.0313971;REFB=-0.00459893;REVB=-0.0312743;RO=20;SAF=8;SAR=4;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17127;STB=0.521703;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.0173805;OID=.;OPOS=133272470;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:20:23:12:12:0.342857:4:8:16:4:4:8:16:7
chr12	133294333	.	C	T	532.98	PASS	AF=0.486957;AO=56;DP=115;FAO=56;FDP=115;FR=.;FRO=59;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0522579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.4123;QD=18.5385;RBI=0.0523527;REFB=-0.0446324;REVB=0.00314865;RO=59;SAF=24;SAR=32;SRF=26;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114239;STB=0.506327;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0357242;OID=.;OPOS=133294333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:59:59:56:56:0.486957:32:24:26:33:32:24:26:33
chr12	133295353	.	C	T	276.89	PASS	AF=0.336735;AO=33;DP=98;FAO=33;FDP=98;FR=.;FRO=65;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=35;FWDB=-0.00692667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.912;QD=11.3018;RBI=0.00700093;REFB=-0.0169636;REVB=0.001017;RO=65;SAF=21;SAR=12;SRF=30;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201982;STB=0.617189;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0359587;OID=.;OPOS=133295353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:65:65:33:33:0.336735:12:21:30:35:12:21:30:35
chr12	133303973	.	C	G	79.02	PASS	AF=0.292683;AO=11;DP=40;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0544588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.9178;QD=7.70889;RBI=0.0565819;REFB=-0.0223129;REVB=-0.0153541;RO=29;SAF=10;SAR=1;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.507931;STB=0.835559;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0976415;OID=.;OPOS=133303973;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:40:41:29:29:11:12:0.292683:1:10:17:12:1:11:17:12
chr12	133306710	.	C	T	119.91	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=-0.0329865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8666;QD=14.1066;RBI=0.041498;REFB=-0.0135248;REVB=0.0251789;RO=20;SAF=7;SAR=7;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308058;STB=0.67625;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.031367;OID=.;OPOS=133306710;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:7:7:16:4:7:7:16:4
chr12	133318406	.	G	T	309.39	PASS	AF=0.365385;AO=38;DP=104;FAO=38;FDP=104;FR=.;FRO=66;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.0231219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0614;QD=11.8996;RBI=0.0232741;REFB=-0.0239127;REVB=-0.00265748;RO=64;SAF=25;SAR=13;SRF=27;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260464;STB=0.640294;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0173222;OID=.;OPOS=133318406;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:64:66:38:38:0.365385:13:25:27:37:13:25:29:37
chr12	133331364	.	G	A	372.26	PASS	AF=0.408163;AO=40;DP=98;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=29;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=26;FWDB=0.0228663;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=182.766;QD=15.1944;RBI=0.0233014;REFB=-0.00866484;REVB=-0.00448212;RO=58;SAF=29;SAR=11;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20236;STB=0.615191;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0122887;OID=.;OPOS=133331364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:58:58:40:40:0.408163:11:29:32:26:11:29:32:26
chr12	133331537	.	G	A	551.08	PASS	AF=0.528302;AO=56;DP=106;FAO=56;FDP=106;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.0120711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.296;QD=20.7956;RBI=0.0285902;REFB=-0.0287084;REVB=-0.025917;RO=50;SAF=22;SAR=34;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111119;STB=0.561188;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0280212;OID=.;OPOS=133331537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:50:50:56:56:0.528302:34:22:26:24:34:22:26:24
chr12	133363376	.	G	T	781.22	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0652766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.808;QD=63.7728;RBI=0.0659347;REFB=0;REVB=-0.00929291;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.27457e-05;OID=.;OPOS=133363376;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:22:24:0:0:22:27:0:0
chr12	133378440	.	C	T	510.34	PASS	AF=0.486486;AO=54;DP=111;FAO=54;FDP=111;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=0.0183278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.196;QD=18.3906;RBI=0.0241449;REFB=-0.000458172;REVB=0.0157184;RO=57;SAF=23;SAR=31;SRF=31;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109671;STB=0.560781;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.00082983;OID=.;OPOS=133378440;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:57:57:54:54:0.486486:31:23:31:26:31:23:31:26
chr12	133384864	.	G	A	107.28	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0114566;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.159;QD=22.5847;RBI=0.0174904;REFB=-0.00951463;REVB=0.0132159;RO=7;SAF=7;SAR=5;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101303;STB=0.557426;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0158929;OID=.;OPOS=133384864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:5:7:3:4:5:7:3:4
chr12	133393323	.	C	T	244.29	PASS	AF=0.386667;AO=29;DP=75;FAO=29;FDP=75;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.00342287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.925;QD=13.0291;RBI=0.0210756;REFB=-0.0024392;REVB=0.0207958;RO=46;SAF=19;SAR=10;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12602;STB=0.572349;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.00399014;OID=.;OPOS=133393323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:46:46:29:29:0.386667:10:19:25:21:10:19:25:21
chr12	133411987	.	G	C	1811.0	PASS	AF=0.983607;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=122;FR=.;FRO=2;FSAF=68;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0290414;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.275;QD=59.377;RBI=0.0314778;REFB=-0.0641664;REVB=-0.012143;RO=1;SAF=68;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904728;STB=0.501112;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.000362149;OID=.;OPOS=133411987;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:122:122:1:2:120:120:0.983607:52:68:0:1:52:68:1:1
chr12	133417126	.	C	T	44.41	PASS	AF=0.189189;AO=5;DP=33;FAO=7;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=22;FWDB=0.016982;FXX=0.0975372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4119;QD=4.8008;RBI=0.0171134;REFB=-0.00117802;REVB=0.00211673;RO=11;SAF=4;SAR=1;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39117;STB=0.844337;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.132555;OID=.;OPOS=133417126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:33:37:11:28:5:7:0.189189:1:4:5:6:2:5:6:22
chr12	133423695	.	A	G	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0157069;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.467;QD=14.1699;RBI=0.0353251;REFB=-0.0100504;REVB=-0.031641;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38819;STB=0.723744;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.019233;OID=.;OPOS=133423695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:4:6:2:10:4:6:2:10
chr12	133433173	.	T	C	588.84	PASS	AF=0.891304;AO=42;DP=46;FAO=41;FDP=46;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0564261;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.3353;QD=51.2032;RBI=0.0580021;REFB=-0.180301;REVB=0.0134288;RO=1;SAF=34;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136105;STB=0.535195;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0224114;OID=.;OPOS=133433173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:46:46:1:5:42:41:0.891304:8:34:1:0:8:33:5:0
chr12	133435716	.	T	G	437.69	PASS	AF=0.449541;AO=47;DP=107;FAO=49;FDP=109;FR=.;FRO=60;FSAF=15;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=19;FWDB=0.00310534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.404;QD=16.0619;RBI=0.00367953;REFB=-0.0185171;REVB=-0.00197378;RO=59;SAF=13;SAR=34;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399007;STB=0.705364;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0323419;OID=.;OPOS=133435716;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:109:59:60:47:49:0.449541:34:13:40:19:34:15:41:19
chr12	133587980	.	C	T	339.29	PASS	AF=0.530303;AO=35;DP=66;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=0.00429506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.582;QD=20.563;RBI=0.0380054;REFB=-0.0114925;REVB=-0.0377619;RO=31;SAF=20;SAR=15;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0645217;STB=0.535694;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.00962701;OID=.;OPOS=133587980;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:31:31:35:35:0.530303:15:20:20:11:15:20:20:11
chr12	133634450	.	A	C	307.25	PASS	AF=0.96;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0858459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.179;QD=49.1595;RBI=0.0860472;REFB=-0.129963;REVB=0.00588223;RO=1;SAF=8;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0543643;STB=0.526294;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000745454;OID=.;OPOS=133634450;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:25:1:1:23:24:0.96:15:8:1:0:15:9:1:0
chr12	133664124	.	G	A	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0142973;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.939;QD=7.762;RBI=0.0171793;REFB=-0.00108817;REVB=-0.00952447;RO=13;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30002;STB=0.689036;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0345659;OID=.;OPOS=133664124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:2:4:5:8:2:4:5:8
chr12	133682655	.	A	G	99.64	PASS	AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0172235;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.848;QD=26.5702;RBI=0.03538;REFB=-0.0118243;REVB=0.0309046;RO=4;SAF=3;SAR=8;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353219;STB=0.699626;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00670105;OID=.;OPOS=133682655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:8:3:4:0:8:3:4:0
chr12	133683261	.	T	C	166.07	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.000746027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.52;QD=22.143;RBI=0.00328315;REFB=-0.00457172;REVB=0.00319726;RO=13;SAF=9;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0667668;STB=0.537506;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00408803;OID=.;OPOS=133683261;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:8:9:8:5:8:9:8:5
chr12	133683280	.	A	T	104.67	PASS	AF=0.466667;AO=12;DP=28;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.00129067;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.6846;QD=13.9565;RBI=0.0385116;REFB=-0.0297851;REVB=0.03849;RO=16;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184269;STB=0.564268;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0838444;OID=.;OPOS=133683280;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:30:16:16:12:14:0.466667:6:6:11:5:6:8:11:5
chr12	133683628	.	A	T	170.12	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0131626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=114.231;QD=17.012;RBI=0.041864;REFB=-0.0187042;REVB=-0.0397409;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536527;STB=0.530692;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0262027;OID=.;OPOS=133683628;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:8:10:11:11:8:10:11:11
chr12	133683750	.	C	A	138.95	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00829541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.37;QD=19.8495;RBI=0.0156772;REFB=-0.00994422;REVB=-0.0133026;RO=13;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175965;STB=0.599867;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00848513;OID=.;OPOS=133683750;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:9:6:8:5:9:6:8:5
chr12	133697130	.	CA	GG	326.22	PASS	AF=0.404494;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=-0.00219894;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=2;MLLD=225.753;QD=14.6618;RBI=0.00223247;REFB=-0.0125266;REVB=-0.000385493;RO=51;SAF=23;SAR=13;SRF=31;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344169;STB=0.510418;STBP=0.881;TYPE=mnp;VARB=0.014169;OID=.;OPOS=133697130;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:51:53:36:36:0.404494:13:23:31:20:13:23:33:20
chr12	133768553	.	A	T	191.45	PASS	AF=0.363636;AO=23;DP=65;FAO=24;FDP=66;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=13;FWDB=0.00400502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.925;QD=11.6029;RBI=0.0226617;REFB=-0.0107929;REVB=0.022305;RO=42;SAF=6;SAR=17;SRF=29;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.462948;STB=0.771839;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0191381;OID=.;OPOS=133768553;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:42:42:23:24:0.363636:17:6:29:13:18:6:29:13
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chr12	133780851	.	G	C	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00424742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2425;QD=11.2568;RBI=0.0659467;REFB=-0.00969834;REVB=0.0658097;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166665;STB=0.59976;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0192467;OID=.;OPOS=133780851;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:4:4:8:4:4:4:8:4
chr12	133781231	.	GA	G	866.68	PASS	AF=1;AO=70;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121166;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.6834;QD=44.4451;RBI=0.181605;REFB=0;REVB=0.135275;RO=3;SAF=34;SAR=36;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118418;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00413738;OID=.;OPOS=133781232;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:70:78:78:78:0:35:43:0:0:16:3:34:36:1:2
chr12	133781428	.	A	C	1396.42	PASS	AF=0.968085;AO=91;DP=94;FAO=91;FDP=94;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0613774;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.978;QD=59.422;RBI=0.062504;REFB=-0.129866;REVB=0.0118139;RO=1;SAF=40;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00920437;STB=0.514283;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.000582088;OID=.;OPOS=133781428;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:94:94:1:3:91:91:0.968085:51:40:0:1:51:40:0:3
chr12	133781605	.	A	G	582.42	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0262044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.582;QD=58.2422;RBI=0.028993;REFB=0.0437962;REVB=0.0124067;RO=1;SAF=11;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164521;STB=0.508767;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=-0.00125156;OID=.;OPOS=133781605;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:28:11:0:1:28:11:0:1
chr12	133795960	.	A	G	691.8	PASS	AF=0.627451;AO=64;DP=102;FAO=64;FDP=102;FR=.;FRO=38;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.0198368;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.132;QD=27.1294;RBI=0.019843;REFB=-0.0271733;REVB=-0.00049618;RO=38;SAF=29;SAR=35;SRF=11;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114931;STB=0.562207;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0178768;OID=.;OPOS=133795960;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:38:38:64:64:0.627451:35:29:11:27:35:29:11:27
chr12	133803551	.	G	C	120.17	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=-0.043966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3944;QD=14.1373;RBI=0.0446329;REFB=-0.033638;REVB=0.00768695;RO=20;SAF=11;SAR=3;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117166;STB=0.56886;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0494732;OID=.;OPOS=133803551;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:3:11:14:6:3:11:14:6
chr12	133808129	.	C	T	251.54	PASS	AF=0.408451;AO=29;DP=74;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.026943;FXX=0.0405351;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.691;QD=14.1714;RBI=0.026948;REFB=-0.0184899;REVB=-0.000518499;RO=41;SAF=18;SAR=11;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064053;STB=0.530467;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.0164177;OID=.;OPOS=133808129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:71:41:42:29:29:0.408451:11:18:23:18:11:18:24:18
chr12	133810703	.	G	C	383.33	PASS	AF=0.513158;AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.0300984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.028;QD=20.1755;RBI=0.0311145;REFB=-0.00168124;REVB=0.00788651;RO=37;SAF=25;SAR=14;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209683;STB=0.616378;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00113925;OID=.;OPOS=133810703;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:37:37:39:39:0.513158:14:25:15:22:14:25:15:22
chr13	19600126	.	G	A	446.95	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.020112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.882;QD=57.6704;RBI=0.0202279;REFB=0;REVB=-0.00216264;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.91025e-05;OID=.;OPOS=19600126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0
chr13	19600200	.	C	T	316.53	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.849;QD=52.7544;RBI=0.0225324;REFB=0;REVB=-0.00997848;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253697;OID=.;OPOS=19600200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:13:10:0:0:13:11:0:0
chr13	19600475	.	C	A	1540.16	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0019846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.9059;QD=59.8119;RBI=0.00945405;REFB=0;REVB=0.0092434;RO=0;SAF=55;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90174e-05;OID=.;OPOS=19600475;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:48:55:0:0:48:55:0:0
chr13	19753585	.	GT	G,TG	1145.06	PASS	AF=0.942149,0.0578512;AO=20,7;DP=111;FAO=114,7;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=74,0;FSAR=40,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.93831,0.1046;FXX=0;HRUN=4,2;LEN=1,2;MLLD=13.0272,148.771;QD=37.8532;RBI=0.977712,0.108943;REFB=-0.00830766,-0.0179799;REVB=0.274764,-0.0304523;RO=77;SAF=1,0;SAR=19,7;SRF=67;SRR=10;SSEN=0.326923,0;SSEP=0.324136,0;SSSB=-0.823736,-0.78892;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0303994,0.10354;OID=.,.;OPOS=19753586,19753585;OREF=T,GT;OALT=-,TG;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:111:121:77:0:20,7:114,7:0.942149,0.0578512:19,7:1,0:67:10:40,7:74,0:0:0
chr13	19999927	.	T	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0164385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.441;QD=35.5759;RBI=0.0359626;REFB=0;REVB=-0.0319857;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000956964;OID=.;OPOS=19999927;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0
chr13	19999954	.	T	TGCGAA	62.37	PASS	AF=1;AO=6;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=339.283;QD=35.6393;RBI=0.0306804;REFB=0;REVB=0.0306804;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000258228;OID=.;OPOS=19999955;OREF=-;OALT=GCGAA;OMAPALT=TGCGAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:7:7:7:0:0:7:0:0:4:0:0:6:0:0
chr13	20000630	.	T	C	261.55	PASS	AF=0.956522;AO=20;DP=21;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0262328;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.234;QD=45.4867;RBI=0.114694;REFB=-0.0700522;REVB=0.111653;RO=1;SAF=17;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.026357;STB=0.513501;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.00202237;OID=.;OPOS=20000630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:23:1:1:20:22:0.956522:3:17:1:0:4:18:1:0
chr13	20038584	.	A	G	640.68	PASS	AF=0.977273;AO=41;DP=43;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0350333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.618;QD=58.2431;RBI=0.0354327;REFB=-0.0622282;REVB=0.00530543;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513507;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000356446;OID=.;OPOS=20038584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:44:0:1:41:43:0.977273:18:23:0:0:18:25:0:1
chr13	20066994	.	T	C	64.48	PASS	AF=0.121951;AO=15;DP=123;FAO=15;FDP=123;FR=.;FRO=108;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=55;FSRR=53;FWDB=-0.0203458;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=79.0617;QD=2.09677;RBI=0.0209396;REFB=0.000474427;REVB=-0.00495113;RO=108;SAF=9;SAR=6;SRF=55;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112361;STB=0.58022;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=-0.00547496;OID=.;OPOS=20066994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:123:123:108:108:15:15:0.121951:6:9:55:53:6:9:55:53
chr13	20067011	.	AGG	A,AG,CGG	1000.37	PASS	AF=0,0.837838,0.135135;AO=24,11,8;DP=102;FAO=0,93,15;FDP=111;FR=.;FRO=3;FSAF=0,42,9;FSAR=0,51,6;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.268281,-0.527474,-0.0726618;FXX=0;HRUN=3,3,1;LEN=2,1,1;MLLD=15.2259,12.8953,178.872;QD=36.0494;RBI=0.517922,1.01911,0.0756668;REFB=0.0869211,0.12769,0.0299383;REVB=0.443022,0.87199,-0.0211123;RO=53;SAF=24,11,4;SAR=0,0,4;SRF=3;SRR=50;SSEN=0,0,0;SSEP=0.570681,0.570681,0;SSSB=0.888205,0.871334,0.652075;STB=0.5,0.517238,0.571338;STBP=1,0.089,0.256;TYPE=del,del,snp;VARB=0,0.0456406,0.0840361;OID=.,.,.;OPOS=20067012,20067012,20067011;OREF=GG,G,A;OALT=-,-,C;OMAPALT=A,AG,CGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:63:102:111:53:3:24,11,8:0,93,15:0,0.837838,0.135135:0,0,4:24,11,4:3:50:0,51,6:0,42,9:3:0
chr13	20277413	.	T	C	152.88	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0397078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.668;QD=10.3649;RBI=0.0399105;REFB=-0.0270737;REVB=0.00401638;RO=39;SAF=12;SAR=8;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239307;STB=0.639863;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0472594;OID=.;OPOS=20277413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:39:39:20:20:0.338983:8:12:15:24:8:12:15:24
chr13	20398669	.	T	C	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.156941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.9522;QD=57.2012;RBI=0.163213;REFB=0;REVB=0.0448106;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00394889;OID=.;OPOS=20398669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:18:12:0:0:18:12:0:0
chr13	20398742	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00749729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.104;QD=55.0984;RBI=0.0753942;REFB=0;REVB=-0.0750205;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000533427;OID=.;OPOS=20398742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr13	20716532	.	AG	A,AT	401.3	PASS	AF=0.206897,0.793103;AO=7,19;DP=28;FAO=6,23;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=0,9;FSAR=6,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.257773,0.171395;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=54.9805,63.5205;QD=55.3515;RBI=0.276454,0.182122;REFB=0,0;REVB=0.0998998,0.0615794;RO=0;SAF=2,5;SAR=5,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.27427e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0480086,0.00821916;OID=.,.;OPOS=20716533,20716533;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.206897,0.793103:7,19:28:6,23:29:0:0,9:6,14:0:0:16:0:2,5:5,14:0:0
chr13	21205192	.	G	A	309.84	PASS	AF=0.923077;AO=24;DP=27;FAO=24;FDP=26;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0466831;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8455;QD=47.6677;RBI=0.0768935;REFB=-0.220136;REVB=0.0611008;RO=2;SAF=6;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461548;STB=0.524979;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0108862;OID=.;OPOS=21205192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:27:26:2:2:24:24:0.923077:18:6:1:1:18:6:1:1
chr13	21295920	.	A	G	370.03	PASS	AF=0.458824;AO=27;DP=85;FAO=39;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0093244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.849;QD=17.4132;RBI=0.103406;REFB=-0.0636167;REVB=-0.102985;RO=31;SAF=10;SAR=17;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111398;STB=0.557992;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0729737;OID=.;OPOS=21295920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:31:42:27:39:0.458824:17:10:15:16:22:17:23:19
chr13	21356650	.	T	A	2657.64	PASS	AF=1;AO=170;DP=170;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=95;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00379818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.499;QD=62.167;RBI=0.0433996;REFB=0;REVB=-0.0432331;RO=0;SAF=75;SAR=95;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.17701e-05;OID=.;OPOS=21356650;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:170:171:0:0:170:171:1:95:75:0:0:95:76:0:0
chr13	21383364	.	T	C	130.61	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.014621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.215;QD=13.748;RBI=0.0759356;REFB=0.0118563;REVB=0.0745147;RO=23;SAF=9;SAR=6;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00941367;STB=0.505487;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=-0.0108943;OID=.;OPOS=21383364;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:6:9:14:9:6:9:14:9
chr13	21547317	.	T	C	709.91	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0158918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.003;QD=54.6088;RBI=0.0508492;REFB=0.00690369;REVB=0.0483021;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.507689;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=5.76988e-05;OID=.;OPOS=21547317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:0:1:51:51:0.980769:32:19:0:0:32:19:0:1
chr13	21562832	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155612;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=180.314;QD=59.0187;RBI=0.0267437;REFB=0;REVB=0.0217503;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000133418;OID=.;OPOS=21562832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:14:20:0:0:14:20:0:0
chr13	21562948	.	G	A	340.64	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.409;QD=54.5025;RBI=0.079523;REFB=0;REVB=0.071795;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000732796;OID=.;OPOS=21562948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr13	21714920	.	G	A	926.5	PASS	AF=0.985294;AO=65;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0259098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.304;QD=54.4998;RBI=0.0394516;REFB=-0.132563;REVB=0.0297508;RO=3;SAF=43;SAR=22;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0601629;STB=0.510201;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0015502;OID=.;OPOS=21714920;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:3:1:65:67:0.985294:22:43:0:3:24:43:0:1
chr13	21720956	.	C	T	836.91	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0447353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5501;QD=55.7939;RBI=0.0690894;REFB=0.0592788;REVB=-0.0526507;RO=1;SAF=43;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108488;STB=0.505745;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=-0.00944226;OID=.;OPOS=21720956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:16:43:1:0:16:43:1:0
chr13	21729252	.	T	C	273.31	PASS	AF=0.324324;AO=36;DP=111;FAO=36;FDP=111;FR=.;FRO=75;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=-0.000847659;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=281.693;QD=9.84909;RBI=0.00515219;REFB=-0.0065893;REVB=-0.00508198;RO=75;SAF=29;SAR=7;SRF=34;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.44187;STB=0.759257;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0124608;OID=.;OPOS=21729252;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:75:75:36:36:0.324324:7:29:34:41:7:29:34:41
chr13	21729267	.	G	A	237.04	PASS	AF=0.304762;AO=32;DP=105;FAO=32;FDP=105;FR=.;FRO=73;FSAF=25;FSAR=7;FSRF=35;FSRR=38;FWDB=-0.000379056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.212;QD=9.03006;RBI=0.00554922;REFB=-0.0098142;REVB=-0.00553626;RO=72;SAF=25;SAR=7;SRF=35;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.377518;STB=0.728003;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0183929;OID=.;OPOS=21729267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:72:73:32:32:0.304762:7:25:35:37:7:25:35:38
chr13	21732094	.	C	T	1216.75	PASS	AF=1;AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00352207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=282.595;QD=60.8373;RBI=0.0123153;REFB=0;REVB=-0.0118009;RO=0;SAF=21;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.50301e-06;OID=.;OPOS=21732094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:79:80:1:58:21:0:0:59:21:0:0
chr13	21742311	.	C	T	390.09	PASS	AF=0.307692;AO=51;DP=168;FAO=52;FDP=169;FR=.;FRO=117;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=70;FSRR=47;FWDB=-0.0246158;FXX=0.0116952;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3199;QD=9.23291;RBI=0.0705711;REFB=-0.0174679;REVB=-0.0661388;RO=112;SAF=32;SAR=19;SRF=70;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00309873;STB=0.512424;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0250729;OID=.;OPOS=21742311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:169:112:117:51:52:0.307692:19:32:70:42:20:32:70:47
chr13	21746600	.	TG	T	95.95	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=0.00188827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.336;QD=8.34339;RBI=0.0711756;REFB=-0.0246777;REVB=-0.0711506;RO=32;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262512;STB=0.644528;STBP=0.242;TYPE=del;VARB=0.0474734;OID=.;OPOS=21746601;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.282609:13:46:13:46:33:7:6:11:22:95:32:7:6:10:22
chr13	21750538	.	G	A	449.11	PASS	AF=0.359477;AO=55;DP=153;FAO=55;FDP=153;FR=.;FRO=98;FSAF=39;FSAR=16;FSRF=70;FSRR=28;FWDB=0.0117902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6902;QD=11.7415;RBI=0.0603204;REFB=-0.012355;REVB=0.059157;RO=96;SAF=39;SAR=16;SRF=70;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.027549;STB=0.504045;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.024843;OID=.;OPOS=21750538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:153:96:98:55:55:0.359477:16:39:70:26:16:39:70:28
chr13	21750630	.	G	A	346.47	PASS	AF=0.212454;AO=58;DP=273;FAO=58;FDP=273;FR=.;FRO=215;FSAF=46;FSAR=12;FSRF=138;FSRR=77;FWDB=-0.0103981;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=236.369;QD=5.07648;RBI=0.0123455;REFB=-0.00259558;REVB=0.00665509;RO=215;SAF=46;SAR=12;SRF=138;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23906;STB=0.649578;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00882431;OID=.;OPOS=21750630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:273:273:215:215:58:58:0.212454:12:46:138:77:12:46:138:77
chr13	21752154	.	G	A	632.22	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.837;QD=61.6798;RBI=0.0242062;REFB=0;REVB=0.0212255;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.86591e-05;OID=.;OPOS=21752154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0
chr13	21949267	.	T	C	326.6	PASS	AF=0.75;AO=27;DP=36;FAO=27;FDP=36;FR=.;FRO=9;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00280426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.506;QD=36.2891;RBI=0.0130788;REFB=-0.0206729;REVB=0.0127747;RO=9;SAF=19;SAR=8;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0784707;STB=0.542824;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00933248;OID=.;OPOS=21949267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:36:36:9:9:27:27:0.75:8:19:5:4:8:19:5:4
chr13	22275394	.	A	G	1280.83	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.332;QD=61.7267;RBI=0.0704436;REFB=0;REVB=0.0509449;RO=0;SAF=47;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190733;OID=.;OPOS=22275394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:36:47:0:0:36:47:0:0
chr13	22275583	.	G	A	1458.17	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00845144;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.204;QD=62.0499;RBI=0.0252579;REFB=-0.127893;REVB=-0.023802;RO=0;SAF=52;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90048e-08;STB=0.506023;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.000792508;OID=.;OPOS=22275583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:93:94:0:1:93:93:0.989362:41:52:0:0:41:52:0:1
chr13	23251016	.	CT	C	67.61	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0129215;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=19.1566;QD=11.7584;RBI=0.0150688;REFB=0.0420541;REVB=-0.00775271;RO=12;SAF=7;SAR=4;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504152;STB=0.529358;STBP=0.802;TYPE=del;VARB=-0.037733;OID=.;OPOS=23251017;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.478261:11:23:11:23:12:7:4:7:5:67:12:7:4:7:5
chr13	23253313	.	T	C	674.89	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497077;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.775;QD=62.7801;RBI=0.0985038;REFB=0;REVB=0.085042;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00058501;OID=.;OPOS=23253313;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:41:43:1:14:27:0:0:15:28:0:0
chr13	23898509	.	T	C	1914.94	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00434591;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7679;QD=61.7723;RBI=0.0682504;REFB=0;REVB=0.0681119;RO=0;SAF=85;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246741;OID=.;OPOS=23898509;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:39:85:0:0:39:85:0:0
chr13	23898664	.	A	G	670.26	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.451;QD=62.3497;RBI=0.023614;REFB=0;REVB=0.00317469;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.75951e-05;OID=.;OPOS=23898664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
chr13	23905711	.	A	G	526.74	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.01904;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.1437;QD=56.9445;RBI=0.105585;REFB=0.130787;REVB=0.103854;RO=1;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0322556;STB=0.517232;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=-0.00257606;OID=.;OPOS=23905711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:14:22:0:1:14:22:0:1
chr13	23907677	.	C	T	920.39	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00270287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.652;QD=58.4373;RBI=0.00565728;REFB=0;REVB=-0.00496984;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.08405e-05;OID=.;OPOS=23907677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:26:36:0:0:27:36:0:0
chr13	23907909	.	A	G	836.88	PASS	AF=0.983607;AO=57;DP=58;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.02619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.284;QD=54.8772;RBI=0.0573367;REFB=0.0546199;REVB=0.0510057;RO=1;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177934;STB=0.508472;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.000329663;OID=.;OPOS=23907909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:58:61:1:1:57:60:0.983607:26:31:0:1:29:31:0:1
chr13	23909162	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173121;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.554;QD=44.6898;RBI=0.0205121;REFB=0;REVB=-0.0110016;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017936;OID=.;OPOS=23909162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
chr13	23911820	.	A	G	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00977352;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1733;QD=53.9093;RBI=0.0291671;REFB=0;REVB=-0.0274809;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000941906;OID=.;OPOS=23911820;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr13	24243200	.	T	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00399283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.584;QD=56.7064;RBI=0.0555481;REFB=0;REVB=0.0554044;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000552584;OID=.;OPOS=24243200;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr13	24243204	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0647452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.154;QD=55.0986;RBI=0.0655863;REFB=0;REVB=-0.0104699;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000685345;OID=.;OPOS=24243204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:15:11:0:0:15:11:0:0
chr13	24384049	.	ATTT	ATTC,ATT	104.6	PASS	AF=0.0375,0.35;AO=3,27;DP=81;FAO=3,28;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=0,19;FSAR=3,9;FSRF=20;FSRR=29;FWDB=-0.0535123,-0.128043;FXX=0.0123442;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=139.442,9.97643;QD=5.22976;RBI=0.0535257,0.170741;REFB=-0.00413177,-0.0890266;REVB=-0.00119596,0.112948;RO=41;SAF=0,17;SAR=3,10;SRF=15;SRR=26;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.448927,0.274436;STB=0.995926,0.672756;STBP=0.135,0.024;TYPE=snp,del;VARB=0.0343902,0.0855893;OID=.,.;OPOS=24384052,24384050;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=ATTC,ATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0375,0.35:3,27:81:3,28:80:49:0,19:3,9:20:29:91:41:0,17:3,10:15:26
chr13	24411772	.	T	C	885.1	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.545;QD=58.0393;RBI=0.054211;REFB=0;REVB=0.0499935;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106172;OID=.;OPOS=24411772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:61:0:0:59:61:1:26:33:0:0:28:33:0:0
chr13	24465743	.	A	G	781.55	PASS	AF=0.982759;AO=54;DP=57;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0419192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1917;QD=53.8997;RBI=0.0458752;REFB=-0.0757465;REVB=0.0186363;RO=2;SAF=37;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247953;STB=0.506171;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.000955424;OID=.;OPOS=24465743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:58:2:1:54:57:0.982759:17:37:2:0:17:40:1:0
chr13	24468711	.	G	C	314.82	PASS	AF=0.219828;AO=51;DP=231;FAO=51;FDP=232;FR=.;FRO=181;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=111;FSRR=70;FWDB=-0.0172418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.988;QD=5.42796;RBI=0.045486;REFB=-0.0100294;REVB=-0.0420915;RO=179;SAF=23;SAR=28;SRF=110;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206792;STB=0.624662;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.050633;OID=.;OPOS=24468711;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:231:232:179:181:51:51:0.219828:28:23:110:69:28:23:111:70
chr13	24468763	.	T	C	185.41	PASS	AF=0.177083;AO=34;DP=192;FAO=34;FDP=192;FR=.;FRO=158;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=95;FSRR=63;FWDB=-0.00851548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.189;QD=3.86264;RBI=0.00851603;REFB=-0.00899611;REVB=-9.66604e-05;RO=151;SAF=15;SAR=19;SRF=89;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18877;STB=0.629445;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0389923;OID=.;OPOS=24468763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:192:192:151:158:34:34:0.177083:19:15:89:62:19:15:95:63
chr13	24797913	.	C	T	160.5	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00283833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.111;QD=18.3431;RBI=0.0322714;REFB=0.00831304;REVB=0.0321464;RO=18;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176087;STB=0.599886;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.00365966;OID=.;OPOS=24797913;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:18:17:17:0.485714:9:8:12:6:9:8:12:6
chr13	24823695	.	A	AG	34.29	PASS	AF=0.183099;AO=16;DP=71;FAO=13;FDP=71;FR=.;FRO=58;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=41;FSRR=17;FWDB=-0.0546961;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=29.2491;QD=1.93201;RBI=0.0669036;REFB=-0.0137989;REVB=-0.0385283;RO=53;SAF=8;SAR=8;SRF=36;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224296;STB=0.844087;STBP=0.026;TYPE=ins;VARB=0.14321;OID=.;OPOS=24823696;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.183099:16:71:13:71:58:3:10:41:17:34:53:8:8:36:17
chr13	24876752	.	T	C	221.96	PASS	AF=0.6;AO=21;DP=35;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0102136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.986;QD=25.3667;RBI=0.022396;REFB=-0.0296792;REVB=-0.0199315;RO=14;SAF=10;SAR=11;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0683667;STB=0.538007;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.0319574;OID=.;OPOS=24876752;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:14:21:21:0.6:11:10:8:6:11:10:8:6
chr13	24890157	.	C	T	720.85	PASS	AF=0.526316;AO=70;DP=133;FAO=70;FDP=133;FR=.;FRO=63;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.00975581;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.941;QD=21.6796;RBI=0.018561;REFB=-0.0167444;REVB=-0.0157904;RO=62;SAF=27;SAR=43;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444176;STB=0.521206;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0144673;OID=.;OPOS=24890157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:62:63:70:70:0.526316:43:27:27:35:43:27:27:36
chr13	24890228	.	A	C	441.14	PASS	AF=0.465347;AO=47;DP=101;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0153994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.217;QD=17.4709;RBI=0.018343;REFB=0.00414498;REVB=-0.0099662;RO=54;SAF=23;SAR=24;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.06344;STB=0.535339;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=-0.00526412;OID=.;OPOS=24890228;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:54:54:47:47:0.465347:24:23:30:24:24:23:30:24
chr13	24895437	.	G	A	175.65	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262856;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.678;QD=46.8387;RBI=0.0565906;REFB=0;REVB=-0.0501155;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.90095e-05;OID=.;OPOS=24895437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:6:8:0:0:7:8:0:0
chr13	24895682	.	A	AG	1030.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=95;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642445;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.7582;QD=44.8028;RBI=0.0688119;REFB=0;REVB=-0.0246522;RO=83;SAF=11;SAR=1;SRF=55;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427598;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00053904;OID=.;OPOS=24895683;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:12:95:92:92:0:63:29:0:0:20:83:11:1:55:28
chr13	24895684	.	A	G	1119.37	PASS	AF=0.860215;AO=80;DP=93;FAO=80;FDP=93;FR=.;FRO=13;FSAF=52;FSAR=28;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0224079;FXX=0.0106372;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2729;QD=48.1448;RBI=0.0339219;REFB=-0.035583;REVB=0.0254673;RO=13;SAF=52;SAR=28;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0578106;STB=0.530678;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.00476845;OID=.;OPOS=24895684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:93:93:13:13:80:80:0.860215:28:52:11:2:28:52:11:2
chr13	25008588	.	A	G	1512.65	PASS	AF=1;AO=100;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0053669;FXX=0.0194156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1397;QD=59.9067;RBI=0.0140148;REFB=0;REVB=0.0129465;RO=0;SAF=67;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73319e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144355;OID=.;OPOS=25008588;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:101:0:0:100:101:1:33:67:0:0:33:68:0:0
chr13	25008630	.	A	G	1785.64	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00830011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.677;QD=61.0477;RBI=0.0514898;REFB=0;REVB=0.0508164;RO=0;SAF=78;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.54148e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.45065e-05;OID=.;OPOS=25008630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:117:0:0:116:117:1:38:78:0:0:39:78:0:0
chr13	25008903	.	G	T	554.15	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0748008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.822;QD=55.415;RBI=0.0774427;REFB=-0.0834669;REVB=0.0200551;RO=1;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228522;STB=0.501319;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.000862949;OID=.;OPOS=25008903;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:1:2:38:38:0.95:20:18:0:1:20:18:1:1
chr13	25009099	.	A	C	707.56	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.5488;QD=62.894;RBI=0.026813;REFB=0;REVB=-0.0241672;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000300355;OID=.;OPOS=25009099;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:22:23:0:0:22:23:0:0
chr13	25016762	.	G	A	102.35	PASS	AF=0.197674;AO=17;DP=86;FAO=17;FDP=86;FR=.;FRO=69;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=-0.0130196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.55;QD=4.76038;RBI=0.017098;REFB=-0.00778619;REVB=-0.0110829;RO=66;SAF=7;SAR=10;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111126;STB=0.56544;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=0.0298561;OID=.;OPOS=25016762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:66:69:17:17:0.197674:10:7:33:33:10:7:34:35
chr13	25020863	.	G	A	477.34	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.523;QD=57.8589;RBI=0.0178847;REFB=0;REVB=0.00198409;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.89649e-05;OID=.;OPOS=25020863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:17:14:0:0:18:15:0:0
chr13	25021154	.	C	T	272.53	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0889975;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1172;QD=51.911;RBI=0.0895388;REFB=0;REVB=0.00983069;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00202066;OID=.;OPOS=25021154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:9:12:0:0:9:12:0:0
chr13	25021200	.	A	C	296.41	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0177859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=318.972;QD=49.4022;RBI=0.0214207;REFB=-0.129542;REVB=0.0119377;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518502;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00092029;OID=.;OPOS=25021200;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:0:1:23:23:0.958333:10:13:0:0:10:13:1:0
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chr13	25021245	.	A	G	339.94	PASS	AF=0.928571;AO=25;DP=27;FAO=26;FDP=28;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0175901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9426;QD=48.5623;RBI=0.0214164;REFB=-0.0329222;REVB=0.0122169;RO=2;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771382;STB=0.541634;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00188382;OID=.;OPOS=25021245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:27:28:2:2:25:26:0.928571:11:14:0:2:11:15:0:2
chr13	25027744	.	A	G	1752.74	PASS	AF=1;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00943054;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.65;QD=60.9648;RBI=0.00956674;REFB=0;REVB=-0.00160855;RO=0;SAF=71;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.35954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.20892e-05;OID=.;OPOS=25027744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:115:0:0:115:115:1:44:71:0:0:44:71:0:0
chr13	25029218	.	C	T	391.31	PASS	AF=0.541667;AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.00467286;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1842;QD=21.7394;RBI=0.100429;REFB=-0.0232171;REVB=-0.10032;RO=31;SAF=20;SAR=19;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0546472;STB=0.542835;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0177443;OID=.;OPOS=25029218;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:31:33:39:39:0.541667:19:20:18:13:19:20:20:13
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chr13	25052261	.	C	T	837.6	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0063537;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.878;QD=57.7657;RBI=0.0585005;REFB=0;REVB=-0.0581544;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000353708;OID=.;OPOS=25052261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:28:29:0:0:28:30:0:0
chr13	25075859	.	C	T	958.68	PASS	AF=0.985075;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0147035;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.221;QD=57.2344;RBI=0.0291725;REFB=0.00942611;REVB=0.0251961;RO=1;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178214;STB=0.509431;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=1.56601e-05;OID=.;OPOS=25075859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:67:1:1:65:66:0.985075:26:39:0:1:26:40:0:1
chr13	25265103	.	A	G	206.62	PASS	AF=0.346667;AO=26;DP=75;FAO=26;FDP=75;FR=.;FRO=49;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=30;FWDB=-0.0213387;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9836;QD=11.0195;RBI=0.0399194;REFB=-0.00146051;REVB=0.0337375;RO=49;SAF=13;SAR=13;SRF=19;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126582;STB=0.573278;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.00404258;OID=.;OPOS=25265103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:49:49:26:26:0.346667:13:13:19:30:13:13:19:30
chr13	25265139	.	T	C	344.24	PASS	AF=0.387755;AO=38;DP=98;FAO=38;FDP=98;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=-0.00286488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.2454;QD=14.0507;RBI=0.102683;REFB=-0.00695561;REVB=-0.102643;RO=60;SAF=21;SAR=17;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180598;STB=0.602498;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00829257;OID=.;OPOS=25265139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:60:60:38:38:0.387755:17:21:23:37:17:21:23:37
chr13	25266932	.	C	A	39.04	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0425771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.38;QD=12.0131;RBI=0.0426354;REFB=-0.00386666;REVB=-0.00222932;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145035;STB=0.631131;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0039716;OID=.;OPOS=25266932;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:7:6:6:0.461538:2:4:3:3:2:4:3:4
chr13	25272870	.	C	T	566.56	PASS	AF=0.557895;AO=50;DP=93;FAO=53;FDP=95;FR=.;FRO=42;FSAF=39;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=0.0549792;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3243;QD=23.8553;RBI=0.0553706;REFB=0.00630445;REVB=-0.00657181;RO=42;SAF=37;SAR=13;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165018;STB=0.585881;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=-0.00359171;OID=.;OPOS=25272870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:95:42:42:50:53:0.557895:13:37:24:18:14:39:24:18
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chr13	25671206	.	A	G	41.24	PASS	AF=0.0940171;AO=11;DP=117;FAO=11;FDP=117;FR=.;FRO=106;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=53;FSRR=53;FWDB=-0.0102816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.67;QD=1.40992;RBI=0.0106355;REFB=-0.00106979;REVB=0.00272076;RO=106;SAF=10;SAR=1;SRF=53;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.497083;STB=0.89476;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00576746;OID=.;OPOS=25671206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:117:117:106:106:11:11:0.0940171:1:10:53:53:1:10:53:53
chr13	25671210	.	C	T	57.28	PASS	AF=0.112;AO=14;DP=125;FAO=14;FDP=125;FR=.;FRO=111;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=58;FSRR=53;FWDB=-0.0121661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.869;QD=1.83296;RBI=0.0477906;REFB=-0.000349848;REVB=-0.0462161;RO=111;SAF=11;SAR=3;SRF=58;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333977;STB=0.748108;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00160882;OID=.;OPOS=25671210;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:125:125:111:111:14:14:0.112:3:11:58:53:3:11:58:53
chr13	25671214	.	T	G	61.38	PASS	AF=0.116279;AO=15;DP=131;FAO=15;FDP=129;FR=.;FRO=114;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=57;FSRR=57;FWDB=0.0420575;FXX=0.0227256;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2327;QD=1.90331;RBI=0.0620432;REFB=-0.00103084;REVB=-0.0456128;RO=114;SAF=11;SAR=4;SRF=58;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281386;STB=0.711271;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0113714;OID=.;OPOS=25671214;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:131:129:114:114:15:15:0.116279:4:11:58:56:4:11:57:57
chr13	25671271	.	A	G	173.49	PASS	AF=0.165;AO=33;DP=200;FAO=33;FDP=200;FR=.;FRO=167;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=85;FSRR=82;FWDB=-0.0169068;FXX=0.00497488;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.112;QD=3.46974;RBI=0.0323711;REFB=-0.00433218;REVB=-0.0276052;RO=167;SAF=19;SAR=14;SRF=85;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0861947;STB=0.556063;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0302004;OID=.;OPOS=25671271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:200:200:167:167:33:33:0.165:14:19:85:82:14:19:85:82
chr13	25671274	.	C	T	179.53	PASS	AF=0.166667;AO=32;DP=208;FAO=35;FDP=210;FR=.;FRO=175;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=92;FSRR=83;FWDB=-0.0189512;FXX=0.00473911;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.909;QD=3.4197;RBI=0.023011;REFB=0.000424976;REVB=-0.0130523;RO=173;SAF=18;SAR=14;SRF=91;SRR=82;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470983;STB=0.538439;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=-0.009415;OID=.;OPOS=25671274;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:208:210:173:175:32:35:0.166667:14:18:91:82:15:20:92:83
chr13	25671292	.	C	T	204.03	PASS	AF=0.163265;AO=40;DP=245;FAO=40;FDP=245;FR=.;FRO=205;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=103;FSRR=102;FWDB=-0.0306569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.3838;QD=3.33103;RBI=0.113798;REFB=-0.00522744;REVB=-0.109591;RO=203;SAF=21;SAR=19;SRF=101;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0353931;STB=0.51888;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0560244;OID=.;OPOS=25671292;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:245:245:203:205:40:40:0.163265:19:21:101:102:19:21:103:102
chr13	25671310	.	TTATGA	T	79.05	PASS	AF=0.148438;AO=36;DP=261;FAO=38;FDP=256;FR=.;FRO=218;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=122;FSRR=96;FWDB=-0.00915491;FXX=0.0228999;HRUN=2;LEN=5;MLLD=322.35;QD=1.2351;RBI=0.0156357;REFB=-0.00626787;REVB=-0.0126753;RO=215;SAF=18;SAR=18;SRF=119;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0685439;STB=0.550755;STBP=0.498;TYPE=del;VARB=0.033276;OID=.;OPOS=25671311;OREF=TATGA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.148438:36:261:38:256:218:19:19:122:96:79:215:18:18:119:96
chr13	25671320	.	A	G	180.63	PASS	AF=0.148289;AO=41;DP=263;FAO=39;FDP=263;FR=.;FRO=224;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=125;FSRR=99;FWDB=-0.0154362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0929;QD=2.74725;RBI=0.0592941;REFB=-0.0103405;REVB=-0.0572496;RO=219;SAF=21;SAR=20;SRF=123;SRR=96;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639769;STB=0.538592;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0887306;OID=.;OPOS=25671320;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:263:263:219:224:41:39:0.148289:20:21:123:96:19:20:125:99
chr13	25671332	.	CA	C	58.8	PASS	AF=0.136531;AO=39;DP=273;FAO=37;FDP=271;FR=.;FRO=234;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=129;FSRR=105;FWDB=0.0221521;FXX=0.0145449;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.3723;QD=0.867847;RBI=0.0596768;REFB=0.00962597;REVB=-0.055413;RO=226;SAF=20;SAR=19;SRF=124;SRR=102;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461453;STB=0.532676;STBP=0.686;TYPE=del;VARB=-0.0523496;OID=.;OPOS=25671333;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.136531:39:273:37:271:234:19:18:129:105:58:226:20:19:124:102
chr13	25671369	.	G	T	134.57	PASS	AF=0.120996;AO=34;DP=281;FAO=34;FDP=281;FR=.;FRO=247;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=141;FSRR=106;FWDB=-0.0423948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6256;QD=1.91558;RBI=0.0441133;REFB=-0.00161245;REVB=-0.0121929;RO=245;SAF=16;SAR=18;SRF=140;SRR=105;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126634;STB=0.587476;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0155713;OID=.;OPOS=25671369;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:281:281:245:247:34:34:0.120996:18:16:140:105:18:16:141:106
chr13	25671398	.	C	T	70.05	PASS	AF=0.0877863;AO=23;DP=259;FAO=23;FDP=262;FR=.;FRO=239;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=130;FSRR=109;FWDB=-0.0124091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.861;QD=1.06943;RBI=0.0216859;REFB=-0.00294384;REVB=-0.0177846;RO=235;SAF=8;SAR=15;SRF=129;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234497;STB=0.675879;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0350581;OID=.;OPOS=25671398;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:259:262:235:239:23:23:0.0877863:15:8:129:106:15:8:130:109
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chr13	25831888	.	T	C	602.29	PASS	AF=0.48062;AO=62;DP=126;FAO=62;FDP=129;FR=.;FRO=67;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=48;FSRR=19;FWDB=0.00908796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.459;QD=18.6758;RBI=0.055188;REFB=-0.0198653;REVB=-0.0544345;RO=59;SAF=37;SAR=25;SRF=48;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20999;STB=0.566193;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0176239;OID=.;OPOS=25831888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:129:59:67:62:62:0.48062:25:37:48:11:25:37:48:19
chr13	25832831	.	CTAAAAT	C	133.13	PASS	AF=0.46875;AO=13;DP=33;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0107964;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=6;MLLD=269.014;QD=16.6417;RBI=0.0380003;REFB=-0.0077657;REVB=0.0364343;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121144;STB=0.561102;STBP=0.549;TYPE=del;VARB=0.00818702;OID=.;OPOS=25832832;OREF=TAAAAT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.46875:13:33:15:32:17:8:7:11:6:99:15:7:6:10:5
chr13	25876011	.	G	A	1358.42	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.805;QD=62.4563;RBI=0.046553;REFB=0;REVB=0.00475824;RO=0;SAF=28;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.30534e-05;OID=.;OPOS=25876011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:59:28:0:0:59:28:0:0
chr13	26043182	.	A	C	480.75	PASS	AF=0.567901;AO=45;DP=80;FAO=46;FDP=81;FR=.;FRO=35;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0525066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4715;QD=23.7409;RBI=0.0539928;REFB=-0.0152259;REVB=-0.0125806;RO=35;SAF=33;SAR=12;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126354;STB=0.572506;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0143577;OID=.;OPOS=26043182;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:35:35:45:46:0.567901:12:33:21:14:12:34:21:14
chr13	26148966	.	C	T	412.77	PASS	AF=0.352113;AO=48;DP=141;FAO=50;FDP=142;FR=.;FRO=92;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=48;FSRR=44;FWDB=-0.0709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3321;QD=11.6274;RBI=0.0950371;REFB=-0.00582466;REVB=-0.0632871;RO=92;SAF=31;SAR=17;SRF=48;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146986;STB=0.579407;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0104922;OID=.;OPOS=26148966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:142:92:92:48:50:0.352113:17:31:48:44:18:32:48:44
chr13	26273385	.	G	C	1086.96	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188059;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2765;QD=59.5593;RBI=0.0409077;REFB=-0.0338399;REVB=-0.0363287;RO=0;SAF=46;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000317318;OID=.;OPOS=26273385;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:73:73:0:0:73:73:1:27:46:0:0:27:46:0:0
chr13	26620777	.	G	A,C	941.85	PASS	AF=0.955224,0.0298507;AO=63,3;DP=67;FAO=64,2;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=33,0;FSAR=31,2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.018016,0.016007;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=162.811,28.4661;QD=56.2295;RBI=0.0201595,0.0811586;REFB=-0.0751337,-0.082889;REVB=-0.00904603,-0.0795644;RO=1;SAF=33,0;SAR=30,3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0140954,-0.727144;STB=0.50746,0.993266;STBP=0.538,0.232;TYPE=snp,snp;VARB=0.00252447,0.10753;OID=.,.;OPOS=26620777,26620777;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:67:67:1:1:63,3:64,2:0.955224,0.0298507:30,3:33,0:1:0:31,2:33,0:1:0
chr13	26620924	.	G	A	1558.4	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.568;QD=63.608;RBI=0.061759;REFB=0;REVB=0.0490871;RO=0;SAF=56;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.17752e-05;OID=.;OPOS=26620924;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:98:0:0:92:98:1:36:56:0:0:39:59:0:0
chr13	26620978	.	G	T	1237.67	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609351;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2908;QD=60.3743;RBI=0.126991;REFB=-0.0443879;REVB=0.111417;RO=0;SAF=57;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0029465;OID=.;OPOS=26620978;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:82:82:0:0:81:82:1:24:57:0:0:25:57:0:0
chr13	28009851	.	G	A	270.89	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0169272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.719;QD=16.9303;RBI=0.0170583;REFB=-0.00237767;REVB=0.00211103;RO=34;SAF=10;SAR=20;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109658;STB=0.561755;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0016684;OID=.;OPOS=28009851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:20:10:15:19:20:10:15:19
chr13	28009920	.	G	C	773.27	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0168967;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.566;QD=56.2379;RBI=0.0184364;REFB=0;REVB=-0.00737586;RO=0;SAF=26;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116218;OID=.;OPOS=28009920;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:55:0:0:53:55:1:27:26:0:0:27:28:0:0
chr13	28143229	.	A	G	213.81	PASS	AF=0.341772;AO=26;DP=75;FAO=27;FDP=79;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.0687824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.2738;QD=10.8256;RBI=0.0713385;REFB=-0.00400321;REVB=-0.018925;RO=49;SAF=13;SAR=13;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804083;STB=0.525851;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.00416388;OID=.;OPOS=28143229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:79:49:52:26:27:0.341772:13:13:21:28:14:13:23:29
chr13	28537240	.	GAA	GA,GAC	549.52	PASS	AF=0.027027,0.972973;AO=5,31;DP=37;FAO=1,36;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=1,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00977745,0.0388663;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=26.0864,44.5243;QD=59.4072;RBI=0.207578,0.125758;REFB=0,0;REVB=-0.207348,-0.119601;RO=0;SAF=4,17;SAR=1,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0668817,0.00373467;OID=.,.;OPOS=28537241,28537242;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=GA,GAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.027027,0.972973:5,31:37:1,36:37:0:0,21:1,15:0:0:4:0:4,17:1,14:0:0
chr13	28537317	.	G	A	488.58	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0544725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.877;QD=55.8372;RBI=0.120362;REFB=-0.0689579;REVB=0.10733;RO=1;SAF=16;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283217;STB=0.515143;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00333863;OID=.;OPOS=28537317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:18:16:1:0:18:16:1:0
chr13	28610183	.	A	G	769.5	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00905353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.294;QD=56.9997;RBI=0.00967502;REFB=0;REVB=-0.0034117;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.06677e-06;OID=.;OPOS=28610183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0
chr13	28624294	.	G	A	1453.34	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.606;QD=63.1889;RBI=0.0411862;REFB=0;REVB=-0.0215197;RO=0;SAF=56;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104687;OID=.;OPOS=28624294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:36:56:0:0:36:56:0:0
chr13	28636084	.	G	A	990.64	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.884;QD=59.1429;RBI=0.0303224;REFB=0;REVB=0.0114142;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.5478e-05;OID=.;OPOS=28636084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:30:37:0:0:30:37:0:0
chr13	28636182	.	C	T	446.17	PASS	AF=0.511628;AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00914132;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=222.588;QD=20.752;RBI=0.0123923;REFB=-0.0118464;REVB=0.00836694;RO=42;SAF=24;SAR=20;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192131;STB=0.510633;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.013126;OID=.;OPOS=28636182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:42:42:44:44:0.511628:20:24:22:20:20:24:22:20
chr13	28835527	.	T	C,TC	1627.05	PASS	AF=0.018018,0.981982;AO=5,102;DP=114;FAO=2,109;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=2,58;FSAR=0,51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259885,0.0371274;FXX=0.0263135;HRUN=4,0;LEN=1,1;MLLD=253.323,274.84;QD=58.6323;RBI=0.0279579,0.0385585;REFB=0,0;REVB=-0.0103073,-0.0104075;RO=5;SAF=5,55;SAR=0,47;SRF=2;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.755783,0.012388;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00516531,4.32286e-05;OID=.,.;OPOS=28835527,28835528;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:114:111:5:0:5,102:2,109:0.018018,0.981982:0,47:5,55:2:3:0,51:2,58:0:0
chr13	28869147	.	G	GGATATAAAC	60.23	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=37;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=0.00845107;FXX=0.0270197;HRUN=2;LEN=9;MLLD=283.246;QD=6.69196;RBI=0.0096244;REFB=-0.00414191;REVB=-0.00460528;RO=27;SAF=2;SAR=4;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380335;STB=0.662315;STBP=0.27;TYPE=ins;VARB=0.0126423;OID=.;OPOS=28869148;OREF=-;OALT=GATATAAAC;OMAPALT=GGATATAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.25:6:37:9:36:27:4:5:18:9:60:27:2:4:18:9
chr13	28883061	.	G	A	465.1	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.917;QD=58.1368;RBI=0.0272995;REFB=0;REVB=0.00820364;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46648e-05;OID=.;OPOS=28883061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr13	28970917	.	C	T	101.78	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.035001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3333;QD=40.7134;RBI=0.0602939;REFB=0;REVB=0.0490947;RO=0;SAF=9;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000781544;OID=.;OPOS=28970917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:1:9:0:0:1:9:0:0
chr13	29275102	.	T	C	529.76	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019211;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.361;QD=58.8617;RBI=0.0198763;REFB=0;REVB=0.00509936;RO=0;SAF=18;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000795807;OID=.;OPOS=29275102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:36:0:0:33:36:1:15:18:0:0:18:18:0:0
chr13	29275129	.	C	T	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0597551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.978;QD=57.2017;RBI=0.0607428;REFB=0;REVB=0.0109094;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000156857;OID=.;OPOS=29275129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr13	29599410	.	C	T	321.18	PASS	AF=0.443038;AO=35;DP=79;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0171094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.148;QD=16.2621;RBI=0.0257815;REFB=-0.021512;REVB=0.0192862;RO=43;SAF=20;SAR=15;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0820035;STB=0.540123;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0454793;OID=.;OPOS=29599410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:43:44:35:35:0.443038:15:20:21:22:15:20:22:22
chr13	29600415	.	A	G	286.93	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=57;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0116053;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.57;QD=20.4949;RBI=0.0230726;REFB=-0.0189883;REVB=0.0199415;RO=25;SAF=18;SAR=12;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344163;STB=0.507458;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0122906;OID=.;OPOS=29600415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:25:26:30:30:0.535714:12:18:16:9:12:18:16:10
chr13	29600599	.	T	TC	54.15	PASS	AF=0.118519;AO=21;DP=140;FAO=16;FDP=135;FR=.;FRO=119;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=72;FSRR=47;FWDB=-0.035694;FXX=0.0492923;HRUN=0;LEN=1;MLLD=64.9026;QD=1.60455;RBI=0.0406694;REFB=-0.00446653;REVB=0.0194921;RO=115;SAF=20;SAR=1;SRF=68;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.588132;STB=0.891593;STBP=0.001;TYPE=ins;VARB=0.101999;OID=.;OPOS=29600600;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.118519:21:140:16:135:119:15:1:72:47:54:115:20:1:68:47
chr13	29898768	.	A	C	107.99	PASS	AF=0.393939;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=33;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.019028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.907;QD=13.0897;RBI=0.0223122;REFB=-0.0105722;REVB=0.0116521;RO=20;SAF=5;SAR=8;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381561;STB=0.522354;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0118533;OID=.;OPOS=29898768;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:20:20:13:13:0.393939:8:5:7:13:8:5:7:13
chr13	30003036	.	AC	A	278.25	PASS	AF=0.366667;AO=33;DP=94;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=-0.00565304;FXX=0.0217368;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.564;QD=12.3665;RBI=0.0823384;REFB=-0.0160262;REVB=0.0821441;RO=57;SAF=21;SAR=12;SRF=23;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255477;STB=0.656593;STBP=0.032;TYPE=del;VARB=0.0189205;OID=.;OPOS=30003037;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.366667:33:94:33:90:57:21:12:22:35:99:57:21:12:23:34
chr13	30084173	.	G	A	1610.25	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.698;QD=59.639;RBI=0.031049;REFB=0;REVB=-0.00038272;RO=0;SAF=76;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.7013e-05;OID=.;OPOS=30084173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:108:0:0:105:108:1:29:76:0:0:31:77:0:0
chr13	30087768	.	C	T	210.47	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0110323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.576;QD=19.1339;RBI=0.0284588;REFB=-0.019941;REVB=-0.0262334;RO=23;SAF=8;SAR=13;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100952;STB=0.505715;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.034728;OID=.;OPOS=30087768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:13:8:9:14:13:8:9:14
chr13	30087778	.	T	A	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.755;QD=62.0208;RBI=0.0220218;REFB=0;REVB=0.015081;RO=0;SAF=18;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.17634e-06;OID=.;OPOS=30087778;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:24:18:0:0:24:18:0:0
chr13	30091714	.	G	A	1579.14	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00356672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.718;QD=59.5904;RBI=0.0144408;REFB=0;REVB=0.0139934;RO=0;SAF=71;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000499736;OID=.;OPOS=30091714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:106:0:0:105:106:1:34:71:0:0:34:72:0:0
chr13	30091817	.	AAG	A,AA,AAC	2435.85	PASS	AF=0.968944,0,0.0310559;AO=49,24,82;DP=162;FAO=156,0,5;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=77,0,4;FSAR=79,0,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.141813,0.0852204,0.0723343;FXX=0;HRUN=5,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=175.726,170.681,162.735;QD=60.5181;RBI=0.170024,0.130494,0.13409;REFB=0,0,0;REVB=-0.0937931,-0.0988235,-0.112906;RO=0;SAF=48,23,9;SAR=1,1,73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-3.33141e-08,-6.66402e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-6.81843e-07,0,0.020796;OID=.,.,.;OPOS=30091818,30091819,30091819;OREF=AG,G,G;OALT=-,-,C;OMAPALT=A,AA,AAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.968944,0,0.0310559:49,24,82:162:156,0,5:161:0:77,0,4:79,0,1:0:0:9:0:48,23,9:1,1,73:0:0
chr13	30107067	.	G	C	294.57	PASS	AF=0.345455;AO=38;DP=110;FAO=38;FDP=110;FR=.;FRO=72;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=-0.0225508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.276;QD=10.7118;RBI=0.025232;REFB=-0.00299354;REVB=0.0113188;RO=72;SAF=15;SAR=23;SRF=39;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167388;STB=0.596491;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00718227;OID=.;OPOS=30107067;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:72:72:38:38:0.345455:23:15:39:33:23:15:39:33
chr13	30339472	.	C	T	162.96	PASS	AF=0.36;AO=18;DP=50;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0219767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.379;QD=13.0366;RBI=0.0823325;REFB=-0.0167096;REVB=-0.0793452;RO=32;SAF=9;SAR=9;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341795;STB=0.519978;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.027372;OID=.;OPOS=30339472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:32:32:18:18:0.36:9:9:17:15:9:9:17:15
chr13	30781111	.	C	A	184.82	PASS	AF=0.475;AO=20;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.00931553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.928;QD=18.4816;RBI=0.0115391;REFB=-0.014185;REVB=-0.00680971;RO=19;SAF=4;SAR=16;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080139;STB=0.521213;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0241994;OID=.;OPOS=30781111;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:21:20:19:0.475:16:4:5:14:15:4:5:16
chr13	31036642	.	C	G	193.76	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00217392;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1165;QD=15.1965;RBI=0.0168394;REFB=-0.0182781;REVB=0.0166985;RO=29;SAF=9;SAR=13;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0746387;STB=0.542611;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0381378;OID=.;OPOS=31036642;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:29:29:22:22:0.431373:13:9:14:15:13:9:14:15
chr13	31036681	.	A	G	492.76	PASS	AF=0.918919;AO=34;DP=37;FAO=34;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0263793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.011;QD=53.2711;RBI=0.0266125;REFB=-0.074497;REVB=-0.00351488;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.522714;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00174472;OID=.;OPOS=31036681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:37:0:2:34:34:0.918919:21:13:0:0:21:13:0:2
chr13	31287979	.	G	GTA	518.28	PASS	AF=0.971429;AO=27;DP=50;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0623761;FXX=0.255265;HRUN=1;LEN=2;MLLD=111.394;QD=59.2324;RBI=0.142955;REFB=-0.0938244;REVB=0.128629;RO=20;SAF=10;SAR=17;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10334;STB=0.512188;STBP=0.541;TYPE=ins;VARB=0.00627773;OID=.;OPOS=31287980;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=GTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.971429:27:50:34:35:1:14:20:0:1:7:20:10:17:10:10
chr13	31287981	.	G	A	136.83	PASS	AF=0.32;AO=16;DP=50;FAO=16;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0478995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2458;QD=10.9466;RBI=0.0580677;REFB=-0.0386997;REVB=-0.0328252;RO=32;SAF=9;SAR=7;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208533;STB=0.639539;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0672403;OID=.;OPOS=31287981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:32:34:16:16:0.32:7:9:12:20:7:9:12:22
chr13	31480827	.	A	G	59.7	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0674803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.938;QD=34.1118;RBI=0.0674803;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0195503;OID=.;OPOS=31480827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:0:6:0:0:0:7:0:0
chr13	31531009	.	G	A	180.43	PASS	AF=0.307692;AO=24;DP=77;FAO=24;FDP=78;FR=.;FRO=54;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=28;FWDB=0.0184438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0052;QD=9.25289;RBI=0.018459;REFB=-0.00720759;REVB=-0.000750542;RO=53;SAF=10;SAR=14;SRF=25;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651487;STB=0.545416;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0168558;OID=.;OPOS=31531009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:53:54:24:24:0.307692:14:10:25:28:14:10:26:28
chr13	31728703	.	T	C	220.91	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.00249666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.08;QD=18.0334;RBI=0.00645205;REFB=-0.0144966;REVB=-0.00594942;RO=26;SAF=15;SAR=7;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011596;STB=0.509545;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0335465;OID=.;OPOS=31728703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:27:22:22:0.44898:7:15:18:8:7:15:18:9
chr13	31821240	.	C	T	1061.97	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2463;QD=59.8293;RBI=0.036147;REFB=0;REVB=-0.0204717;RO=0;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.54837e-05;OID=.;OPOS=31821240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:43:28:0:0:43:28:0:0
chr13	31821992	.	T	C	918.13	PASS	AF=0.985075;AO=61;DP=63;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.031276;FXX=0.0563301;HRUN=5;LEN=1;MLLD=132.084;QD=54.814;RBI=0.0401545;REFB=-0.0207081;REVB=0.0251832;RO=1;SAF=28;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140901;STB=0.50704;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00197215;OID=.;OPOS=31821992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:67:1:1:61:66:0.985075:33:28:0:1:35:31:0:1
chr13	31821993	.	T	C	35.82	PASS	AF=0.112676;AO=6;DP=69;FAO=8;FDP=71;FR=.;FRO=63;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.0114683;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.7894;QD=2.018;RBI=0.0215381;REFB=-0.0307197;REVB=0.0182309;RO=63;SAF=2;SAR=4;SRF=29;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143461;STB=0.535124;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0770906;OID=.;OPOS=31821993;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:69:71:63:63:6:8:0.112676:4:2:29:34:4:4:29:34
chr13	31891746	.	G	A	937.98	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2445;QD=58.6239;RBI=0.0621463;REFB=0;REVB=0.0512869;RO=0;SAF=25;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000470372;OID=.;OPOS=31891746;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:38:25:0:0:39:25:0:0
chr13	32360547	.	A	G	1135.26	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=309.727;QD=60.5471;RBI=0.0259664;REFB=0;REVB=-0.00430529;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.62362e-05;OID=.;OPOS=32360547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:31:44:0:0:31:44:0:0
chr13	32376718	.	A	G	626.18	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0595718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1855;QD=61.0911;RBI=0.0596032;REFB=0;REVB=-0.00193371;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000555713;OID=.;OPOS=32376718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:19:21:0:0:19:22:0:0
chr13	32660137	.	T	G	1499.77	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00627767;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.518;QD=63.8199;RBI=0.0135254;REFB=0;REVB=0.0119803;RO=0;SAF=43;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.55822e-06;OID=.;OPOS=32660137;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:94:0:0:94:94:1:51:43:0:0:51:43:0:0
chr13	32676114	.	A	G	140.09	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00432066;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=205.494;QD=12.7351;RBI=0.0184482;REFB=-0.00583409;REVB=0.0179352;RO=28;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.049575;STB=0.529034;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.011274;OID=.;OPOS=32676114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:7:9:17:11:7:9:17:11
chr13	32783110	.	GC	G	64.16	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0229834;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.0655;QD=5.96829;RBI=0.0755391;REFB=-0.053549;REVB=-0.0719578;RO=25;SAF=12;SAR=4;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267593;STB=0.805313;STBP=0.005;TYPE=del;VARB=0.0752661;OID=.;OPOS=32783111;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.372093:16:41:16:43:27:14:2:13:14:64:25:12:4:13:12
chr13	32832149	.	T	C	324.33	PASS	AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0225652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.449;QD=19.6563;RBI=0.0444879;REFB=-0.0105232;REVB=0.0383404;RO=32;SAF=12;SAR=22;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133929;STB=0.574582;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0130145;OID=.;OPOS=32832149;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:22:12:16:16:22:12:16:16
chr13	32863847	.	C	T	256.3	PASS	AF=0.394737;AO=30;DP=75;FAO=30;FDP=76;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=34;FWDB=-0.0447281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.403;QD=13.4895;RBI=0.0452821;REFB=0.00335946;REVB=0.00706125;RO=45;SAF=12;SAR=18;SRF=12;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152334;STB=0.590852;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=-0.00646084;OID=.;OPOS=32863847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:45:46:30:30:0.394737:18:12:12:33:18:12:12:34
chr13	32885654	.	T	C	282.07	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0503753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.332;QD=51.2855;RBI=0.0522215;REFB=0;REVB=0.0137628;RO=0;SAF=10;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170054;OID=.;OPOS=32885654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:11:10:0:0:12:10:0:0
chr13	32906729	.	A	C	182.84	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.0158484;FXX=0.0222173;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.382;QD=16.6218;RBI=0.0523811;REFB=-0.016465;REVB=-0.049926;RO=25;SAF=7;SAR=12;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0973723;STB=0.555499;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0227586;OID=.;OPOS=32906729;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:25:25:19:19:0.431818:12:7:7:18:12:7:7:18
chr13	32913055	.	A	G	1752.96	PASS	AF=1;AO=112;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2346;QD=60.447;RBI=0.0270561;REFB=0;REVB=0.020674;RO=0;SAF=63;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.85606e-05;OID=.;OPOS=32913055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:116:0:0:112:116:1:49:63:0:0:49:67:0:0
chr13	32914277	.	A	G	322.24	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=0.00018813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.776;QD=28.0208;RBI=0.0564614;REFB=-0.0185221;REVB=0.056461;RO=18;SAF=15;SAR=13;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142882;STB=0.578648;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.0122693;OID=.;OPOS=32914277;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:13:15:6:12:13:15:6:12
chr13	32915005	.	G	C	575.61	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00386191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5267;QD=60.5908;RBI=0.0054221;REFB=0;REVB=-0.00380589;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104256;OID=.;OPOS=32915005;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0
chr13	32929387	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0299067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.326;QD=44.6895;RBI=0.0320232;REFB=0;REVB=-0.0114489;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000767742;OID=.;OPOS=32929387;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr13	32976640	.	TTTG	T	237.02	PASS	AF=0.419355;AO=37;DP=95;FAO=39;FDP=93;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=-0.00514942;FXX=0.0210504;HRUN=3;LEN=3;MLLD=181.763;QD=10.1944;RBI=0.00525265;REFB=-0.010434;REVB=-0.00103624;RO=56;SAF=12;SAR=25;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24896;STB=0.611881;STBP=0.08;TYPE=del;VARB=0.00518364;OID=.;OPOS=32976641;OREF=TTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.419355:37:95:39:93:54:13:26:28:26:99:56:12:25:31:25
chr13	32976645	.	T	A	397.17	PASS	AF=0.445652;AO=41;DP=95;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=-0.000902634;FXX=0.0315756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.428;QD=17.2682;RBI=0.00272309;REFB=-0.0039049;REVB=0.00256914;RO=54;SAF=13;SAR=28;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213492;STB=0.60244;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.00532011;OID=.;OPOS=32976645;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:92:54:51:41:41:0.445652:28:13:28:26:28:13:25:26
chr13	32976648	.	G	C	392.99	PASS	AF=0.445652;AO=40;DP=91;FAO=41;FDP=92;FR=.;FRO=51;FSAF=13;FSAR=28;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.0195491;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9314;QD=17.0865;RBI=0.0347997;REFB=0.00914616;REVB=-0.0287897;RO=51;SAF=13;SAR=27;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174254;STB=0.60244;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=-0.0157376;OID=.;OPOS=32976648;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:51:51:40:41:0.445652:27:13:25:26:28:13:25:26
chr13	33002122	.	GTC	CGT,GT	345.31	PASS	AF=0.0169492,0.79661;AO=6,30;DP=60;FAO=1,47;FDP=59;FR=.;FRO=11;FSAF=1,36;FSAR=0,11;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.023745,0.192101;FXX=0.0166639;HRUN=1,5;LEN=3,1;MLLD=16.7721,12.1959;QD=23.4107;RBI=0.120308,0.280788;REFB=0.00975033,-0.0956639;REVB=-0.117941,0.20479;RO=16;SAF=2,26;SAR=4,4;SRF=14;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.568989,-0.0115569;STB=0.98369,0.514013;STBP=0.59,0.748;TYPE=mnp,del;VARB=0.0714005,0.0699939;OID=.,.;OPOS=33002122,33002124;OREF=GTC,C;OALT=CGT,-;OMAPALT=CGT,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:41:60:59:16:11:6,30:1,47:0.0169492,0.79661:4,4:2,26:14:2:0,11:1,36:9:2
chr13	33590851	.	T	C	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.022;QD=58.5857;RBI=0.0167735;REFB=0;REVB=-0.00521807;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.53702e-05;OID=.;OPOS=33590851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:11:22:0:0:11:22:0:0
chr13	33634983	.	C	T	452.43	PASS	AF=0.418033;AO=51;DP=122;FAO=51;FDP=122;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=50;FSRR=21;FWDB=-0.0138832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.128;QD=14.8337;RBI=0.0203269;REFB=-0.0164349;REVB=0.0148472;RO=70;SAF=18;SAR=33;SRF=49;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347975;STB=0.697687;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0110323;OID=.;OPOS=33634983;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:70:71:51:51:0.418033:33:18:49:21:33:18:50:21
chr13	33635463	.	T	C	1629.9	PASS	AF=1;AO=104;DP=105;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.18;QD=59.8127;RBI=0.0435456;REFB=0;REVB=0.0368315;RO=0;SAF=33;SAR=71;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.60243e-05;OID=.;OPOS=33635463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:109:0:0:104:109:1:71:33:0:0:73:36:0:0
chr13	33635835	.	T	C	689.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00911458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.085;QD=62.669;RBI=0.0230838;REFB=0;REVB=0.0212082;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145542;OID=.;OPOS=33635835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0
chr13	33678505	.	C	T	151.2	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=1;FWDB=0.00112688;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.451;QD=20.1601;RBI=0.0174947;REFB=-0.0153579;REVB=0.0174584;RO=14;SAF=13;SAR=3;SRF=13;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179486;STB=0.599893;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0128292;OID=.;OPOS=33678505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:3:13:13:1:3:13:13:1
chr13	33703656	.	T	C	447.61	PASS	AF=0.480392;AO=47;DP=98;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0318211;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.735;QD=17.5533;RBI=0.0356621;REFB=-0.00680993;REVB=0.0160997;RO=51;SAF=24;SAR=23;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374718;STB=0.520825;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.00714008;OID=.;OPOS=33703656;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:102:51:53:47:49:0.480392:23:24:24:27:23:26:26:27
chr13	35745239	.	G	A	400.87	PASS	AF=0.369231;AO=26;DP=129;FAO=48;FDP=130;FR=.;FRO=82;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=40;FSRR=42;FWDB=0.0148672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.524;QD=12.3343;RBI=0.0195182;REFB=-0.0140872;REVB=0.0126463;RO=81;SAF=5;SAR=21;SRF=39;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397233;STB=0.547278;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0279567;OID=.;OPOS=35745239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:130:81:82:26:48:0.369231:21:5:39:42:21:27:40:42
chr13	36048509	.	TTAAA	T	215.21	PASS	AF=0.666667;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=36;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0427878;FXX=0.0769034;HRUN=3;LEN=4;MLLD=241.432;QD=23.9125;RBI=0.0474444;REFB=-0.0533699;REVB=0.020498;RO=13;SAF=10;SAR=14;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786119;STB=0.556028;STBP=0.314;TYPE=del;VARB=0.0197667;OID=.;OPOS=36048510;OREF=TAAA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:24:41:24:36:12:10:14:7:5:69:13:10:14:7:6
chr13	36639771	.	A	C	585.31	PASS	AF=0.86;AO=42;DP=50;FAO=43;FDP=50;FR=.;FRO=7;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0609675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6829;QD=46.8247;RBI=0.0973828;REFB=-0.0472356;REVB=0.0759367;RO=8;SAF=16;SAR=26;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113175;STB=0.54578;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.0585286;OID=.;OPOS=36639771;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:50:50:8:7:42:43:0.86:26:16:6:2:26:17:5:2
chr13	36744910	.	C	T	332.15	PASS	AF=0.385417;AO=37;DP=96;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=-0.0765804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.451;QD=13.8394;RBI=0.0802358;REFB=-0.00660025;REVB=-0.0239421;RO=55;SAF=14;SAR=23;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0439775;STB=0.50745;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.00936106;OID=.;OPOS=36744910;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:55:59:37:37:0.385417:23:14:23:32:23:14:23:36
chr13	36801415	.	C	T	1420.28	PASS	AF=0.970297;AO=98;DP=101;FAO=98;FDP=101;FR=.;FRO=3;FSAF=61;FSAR=37;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0163643;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.286;QD=56.2488;RBI=0.0187737;REFB=-0.0290122;REVB=0.00920107;RO=3;SAF=61;SAR=37;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227537;STB=0.511998;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.000141889;OID=.;OPOS=36801415;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:101:101:3:3:98:98:0.970297:37:61:3:0:37:61:3:0
chr13	36828237	.	T	C	1189.41	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.159076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.067;QD=59.4706;RBI=0.220677;REFB=-0.109806;REVB=0.152949;RO=1;SAF=22;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0210229;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00490272;OID=.;OPOS=36828237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:78:80:1:0:77:80:1:55:22:1:0:57:23:0:0
chr13	36855375	.	C	T	1067.53	PASS	AF=0.948718;AO=74;DP=78;FAO=74;FDP=78;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0437398;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.4732;QD=54.7449;RBI=0.0444559;REFB=-0.0218796;REVB=0.0079475;RO=1;SAF=34;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011681;STB=0.502092;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.000518402;OID=.;OPOS=36855375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:78:78:1:4:74:74:0.948718:40:34:0:1:40:34:2:2
chr13	36855405	.	A	G	775.62	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0104342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.384;QD=53.491;RBI=0.0278965;REFB=-0.193995;REVB=0.0258716;RO=2;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348923;STB=0.518512;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.000386442;OID=.;OPOS=36855405;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:2:2:56:56:0.965517:26:30:0:2:26:30:0:2
chr13	36857639	.	T	C	1008.21	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0922731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2617;QD=59.3065;RBI=0.156292;REFB=0;REVB=0.126146;RO=0;SAF=49;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144686;OID=.;OPOS=36857639;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:19:49:0:0:19:49:0:0
chr13	36877978	.	T	C	301.96	PASS	AF=0.857143;AO=25;DP=30;FAO=24;FDP=28;FR=.;FRO=4;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0240136;FXX=0.0666445;HRUN=7;LEN=1;MLLD=220.518;QD=43.1376;RBI=0.0240219;REFB=0.0636046;REVB=0.000630775;RO=4;SAF=19;SAR=6;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00348117;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000398687;OID=.;OPOS=36877978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:30:28:4:4:25:24:0.857143:6:19:3:1:6:18:3:1
chr13	36886469	.	T	C	754.42	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.252;QD=56.9376;RBI=0.0518066;REFB=0;REVB=0.0389445;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205038;OID=.;OPOS=36886469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0
chr13	36939688	.	C	T	1198.87	PASS	AF=0.952941;AO=81;DP=86;FAO=81;FDP=85;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.00946488;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2097;QD=56.4174;RBI=0.0345289;REFB=-0.0061405;REVB=-0.0332064;RO=4;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0386073;STB=0.520403;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.000800586;OID=.;OPOS=36939688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:86:85:4:4:81:81:0.952941:47:34:0:4:47:34:0:4
chr13	36939758	.	A	G	1969.72	PASS	AF=1;AO=127;DP=127;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000178129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.847;QD=62.0385;RBI=0.0294541;REFB=0;REVB=0.0294536;RO=0;SAF=53;SAR=74;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.19829e-05;OID=.;OPOS=36939758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:127:0:0:127:127:1:74:53:0:0:74:53:0:0
chr13	37269835	.	G	A	1188.97	PASS	AF=0.963855;AO=80;DP=83;FAO=80;FDP=83;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0351263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.393;QD=57.2997;RBI=0.0395635;REFB=-0.0285108;REVB=0.0182048;RO=2;SAF=33;SAR=47;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278272;STB=0.509443;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.00225485;OID=.;OPOS=37269835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:83:83:2:3:80:80:0.963855:47:33:2:0:47:33:2:1
chr13	37271163	.	C	A	786.73	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0921404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.766;QD=55.2089;RBI=0.0925224;REFB=-0.0317739;REVB=-0.00839883;RO=1;SAF=32;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192399;STB=0.5102;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.00035309;OID=.;OPOS=37271163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:24:32:0:1:24:32:0:1
chr13	37271428	.	GCA	G	191.39	PASS	AF=1;AO=12;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.16202;FXX=0.111049;HRUN=1;LEN=2;MLLD=169.813;QD=47.8473;RBI=0.19402;REFB=0;REVB=0.10674;RO=0;SAF=1;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00282271;OID=.;OPOS=37271429;OREF=CA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:12:16:16:16:0:3:13:0:0:3:0:1:11:0:0
chr13	37372429	.	T	C	631.89	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4329;QD=61.6481;RBI=0.0312102;REFB=0;REVB=0.0264591;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000615042;OID=.;OPOS=37372429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:14:27:0:0:14:27:0:0
chr13	37580139	.	G	A	230.35	PASS	AF=0.481481;AO=25;DP=53;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.025349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.328;QD=17.0632;RBI=0.0253805;REFB=-0.010489;REVB=0.00126358;RO=26;SAF=14;SAR=11;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192069;STB=0.612591;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0119939;OID=.;OPOS=37580139;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:26:28:25:26:0.481481:11:14:9:17:11:15:10:18
chr13	37583831	.	G	A	145.52	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0306418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.688;QD=16.1693;RBI=0.031109;REFB=-0.0178401;REVB=0.00537155;RO=19;SAF=6;SAR=10;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0457626;STB=0.514687;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0242629;OID=.;OPOS=37583831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:20:16:16:0.444444:10:6:8:11:10:6:8:12
chr13	37625601	.	T	C	306.23	PASS	AF=1;AO=19;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209068;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.2164;QD=53.2572;RBI=0.022372;REFB=0;REVB=-0.00796297;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144588;OID=.;OPOS=37625601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:19:23:1:8:11:0:0:8:15:0:0
chr13	37678884	.	C	G	354.2	PASS	AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=8;FWDB=-0.0644319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.186;QD=18.8904;RBI=0.0839491;REFB=-0.0322484;REVB=0.0538142;RO=38;SAF=23;SAR=14;SRF=30;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171127;STB=0.594504;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0326216;OID=.;OPOS=37678884;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:14:23:30:8:14:23:30:8
chr13	37679268	.	G	T	463.4	PASS	AF=0.970588;AO=31;DP=32;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0423523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.8604;QD=54.5174;RBI=0.0454302;REFB=-0.0643012;REVB=-0.0164374;RO=0;SAF=25;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16261e-08;STB=0.538437;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00650979;OID=.;OPOS=37679268;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:34:0:1:31:33:0.970588:6:25:0:0:6:27:0:1
chr13	37679535	.	G	C	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00210618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.025;QD=58.6004;RBI=0.00678823;REFB=0;REVB=-0.00645322;RO=0;SAF=44;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.68666e-06;OID=.;OPOS=37679535;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:20:44:0:0:20:44:0:0
chr13	37679729	.	C	T	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0765311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.611;QD=53.9108;RBI=0.0765322;REFB=0;REVB=-0.00041717;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00084115;OID=.;OPOS=37679729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr13	37679776	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00737946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.9376;QD=44.6898;RBI=0.00769093;REFB=0;REVB=-0.00216659;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107597;OID=.;OPOS=37679776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0
chr13	38357471	.	G	A	446.03	PASS	AF=0.535714;AO=42;DP=85;FAO=45;FDP=84;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0353661;FXX=0.0454494;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.12;QD=21.2393;RBI=0.0420508;REFB=0.002425;REVB=-0.0227488;RO=37;SAF=27;SAR=15;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043893;STB=0.551701;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.00171486;OID=.;OPOS=38357471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:37:39:42:45:0.535714:15:27:22:15:15:30:22:17
chr13	38924083	.	A	T	1777.9	PASS	AF=0.983471;AO=118;DP=120;FAO=119;FDP=121;FR=.;FRO=2;FSAF=60;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0107358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9065;QD=58.7736;RBI=0.017384;REFB=-0.13502;REVB=0.0136728;RO=2;SAF=60;SAR=58;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160942;STB=0.508332;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.000816255;OID=.;OPOS=38924083;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:120:121:2:2:118:119:0.983471:58:60:0:2:59:60:0:2
chr13	38924263	.	T	C	1096.9	PASS	AF=0.973684;AO=74;DP=77;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0163297;FXX=0.0256377;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.6991;QD=57.7315;RBI=0.0841122;REFB=-0.10532;REVB=-0.0825118;RO=2;SAF=42;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00342327;STB=0.50181;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0028172;OID=.;OPOS=38924263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:77:76:2:2:74:74:0.973684:32:42:1:1:32:42:1:1
chr13	38932207	.	TAT	TTA,TTT	94.27	PASS	AF=0.475,0;AO=15,9;DP=119;FAO=19,0;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=13,0;FSAR=6,0;FSRF=19;FSRR=2;FWDB=-0.0895225,-0.0140203;FXX=0.436558;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=14.8367,173.352;QD=9.42745;RBI=0.206233,0.0934442;REFB=-0.146898,-0.00875642;REVB=-0.185789,0.0923864;RO=59;SAF=10,8;SAR=5,1;SRF=47;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.203822,0.20338;STB=0.64852,0.5;STBP=0.182,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0544474,0.223937;OID=.,.;OPOS=38932208,38932208;OREF=AT,A;OALT=TA,T;OMAPALT=TTA,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.475,0:15,9:119:19,0:40:21:13,0:6,0:19:2:96:59:10,8:5,1:47:12
chr13	39261567	.	G	GGCT,T	323.59	PASS	AF=0.391304,0;AO=31,5;DP=107;FAO=36,0;FDP=92;FR=.;FRO=56;FSAF=16,0;FSAR=20,0;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0336988,-0.0190722;FXX=0.0612182;HRUN=2,2;LEN=3,1;MLLD=173.879,60.7924;QD=14.0692;RBI=0.0342168,0.029406;REFB=-0.0550379,-0.0365843;REVB=0.00593151,-0.0223822;RO=71;SAF=16,1;SAR=15,4;SRF=27;SRR=44;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.16075,-0.205967;STB=0.532002,0.5;STBP=0.628,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.086575,0;OID=.,.;OPOS=39261568,39261567;OREF=-,G;OALT=GCT,T;OMAPALT=GGCT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:92:71:56:31,5:36,0:0.391304,0:15,4:16,1:27:44:20,0:16,0:22:34
chr13	39262057	.	G	A	1513.35	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.31;QD=59.9347;RBI=0.0340899;REFB=0;REVB=0.00621661;RO=0;SAF=45;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.02261e-05;OID=.;OPOS=39262057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:100:101:1:55:45:0:0:55:46:0:0
chr13	39262435	.	C	G	152.78	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0050721;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=161.504;QD=13.5805;RBI=0.0188924;REFB=-0.00909767;REVB=0.0181988;RO=27;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0871903;STB=0.535478;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0110164;OID=.;OPOS=39262435;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:27:28:17:17:0.377778:10:7:9:18:10:7:10:18
chr13	39263713	.	GT	CG,G,GC	573.76	PASS	AF=0.025,0.475,0.5;AO=2,16,22;DP=41;FAO=1,19,20;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=0,15,15;FSAR=1,4,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0284455,-0.0064315,-0.00960059;FXX=0.0243843;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=20.1796,51.965,51.7541;QD=57.3759;RBI=0.0303825,0.00643424,0.102177;REFB=0,0,0;REVB=-0.0106748,-0.00018803,-0.101725;RO=0;SAF=1,14,15;SAR=1,2,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,-5.79751e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0.158284,-0.00568484,0.029336;OID=.,.,.;OPOS=39263713,39263714,39263714;OREF=GT,T,T;OALT=CG,-,C;OMAPALT=CG,G,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:74:41:40:0:0:2,16,22:1,19,20:0.025,0.475,0.5:1,2,7:1,14,15:0:0:1,4,5:0,15,15:0:0
chr13	39264690	.	T	C	378.98	PASS	AF=0.688889;AO=31;DP=45;FAO=31;FDP=45;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.00312655;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.382;QD=33.6874;RBI=0.0183916;REFB=-0.0291496;REVB=0.0181239;RO=14;SAF=15;SAR=16;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171612;STB=0.593379;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0122885;OID=.;OPOS=39264690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:14:14:31:31:0.688889:16:15:11:3:16:15:11:3
chr13	39266167	.	T	C	233.87	PASS	AF=0.724138;AO=21;DP=29;FAO=21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0315973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.918;QD=32.2574;RBI=0.0358374;REFB=0.00255861;REVB=0.0169096;RO=8;SAF=11;SAR=10;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051041;STB=0.528026;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=-0.000259036;OID=.;OPOS=39266167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:8:8:21:21:0.724138:10:11:5:3:10:11:5:3
chr13	39266484	.	G	A	352.56	PASS	AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0520349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.37;QD=21.0486;RBI=0.0528727;REFB=4.13501e-05;REVB=-0.00937553;RO=31;SAF=26;SAR=10;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220105;STB=0.622396;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=-0.000394845;OID=.;OPOS=39266484;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:31:31:36:36:0.537313:10:26:15:16:10:26:15:16
chr13	39430313	.	A	AT	982.26	PASS	AF=1;AO=11;DP=107;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0576143;FXX=0.100908;HRUN=0;LEN=1;MLLD=167.596;QD=40.0921;RBI=0.0621676;REFB=0;REVB=0.023354;RO=93;SAF=0;SAR=11;SRF=53;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.669384;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000441862;OID=.;OPOS=39430314;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:11:107:98:98:0:54:44:0:0:21:93:0:11:53:40
chr13	39430314	.	C	G,T	1537.71	PASS	AF=0.127273,0.854545;AO=12,93;DP=108;FAO=14,94;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=0,55;FSAR=14,39;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0031347,-0.00371063;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=75.4122,226.615;QD=55.9167;RBI=0.00692799,0.00918846;REFB=-0.0236932,-0.00162601;REVB=-0.00617824,0.0084059;RO=2;SAF=0,55;SAR=12,38;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.836514,-0.0169269;STB=0.998738,0.508927;STBP=0.002,0.249;TYPE=snp,snp;VARB=0.0293157,0.000612193;OID=.,.;OPOS=39430314,39430314;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:61:108:110:2:2:12,93:14,94:0.127273,0.854545:12,38:0,55:2:0:14,39:0,55:2:0
chr13	39433579	.	CT	C	52.76	PASS	AF=0.4375;AO=18;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0353406;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.69943;QD=4.39631;RBI=0.188788;REFB=-0.0482387;REVB=0.18545;RO=24;SAF=14;SAR=4;SRF=9;SRR=15;SSEN=0.37037;SSEP=0;SSSB=0.420074;STB=0.713162;STBP=0.023;TYPE=del;VARB=0.0587651;OID=.;OPOS=39433580;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4375:18:48:21:48:27:16:5:11:16:52:24:14:4:9:15
chr13	39433606	.	A	G	221.61	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=0.02856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.733;QD=16.1172;RBI=0.0288298;REFB=-0.0271664;REVB=-0.00393515;RO=29;SAF=12;SAR=13;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133372;STB=0.565166;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.0301594;OID=.;OPOS=39433606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:30:25:25:0.454545:13:12:18:11:13:12:18:12
chr13	39455266	.	G	A	428.55	PASS	AF=0.545455;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0338996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.543;QD=22.2621;RBI=0.0356713;REFB=-0.0363691;REVB=-0.0111022;RO=35;SAF=22;SAR=20;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0157557;STB=0.508681;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0288667;OID=.;OPOS=39455266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:35:35:42:42:0.545455:20:22:19:16:20:22:19:16
chr13	39540589	.	TC	T	370.06	PASS	AF=0.506667;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=75;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.00873394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.957;QD=19.7363;RBI=0.0159779;REFB=-0.00647791;REVB=-0.0133795;RO=37;SAF=28;SAR=10;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954975;STB=0.553235;STBP=0.416;TYPE=del;VARB=0.00630741;OID=.;OPOS=39540590;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.506667:38:76:38:75:37:28:10:24:13:99:37:28:10:24:13
chr13	39586343	.	G	C	326.03	PASS	AF=0.350427;AO=38;DP=114;FAO=41;FDP=117;FR=.;FRO=76;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=31;FWDB=-0.00515824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.156;QD=11.1464;RBI=0.0376191;REFB=-0.00884834;REVB=0.0372637;RO=74;SAF=16;SAR=22;SRF=43;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181768;STB=0.629842;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0174484;OID=.;OPOS=39586343;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:117:74:76:38:41:0.350427:22:16:43:31:25:16:45:31
chr13	39587677	.	A	G	66.5	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0416218;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.381;QD=26.6013;RBI=0.0698269;REFB=-0.084283;REVB=-0.0560662;RO=2;SAF=3;SAR=5;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459355;STB=0.526249;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.0237974;OID=.;OPOS=39587677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:10:10:2:2:8:8:0.8:5:3:1:1:5:3:1:1
chr13	39587865	.	A	C	207.85	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0237103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.488;QD=17.6889;RBI=0.0241352;REFB=-0.0178594;REVB=-0.00450858;RO=26;SAF=15;SAR=6;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22527;STB=0.62901;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0315871;OID=.;OPOS=39587865;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:6:15:13:13:6:15:13:13
chr13	39587889	.	T	C	226.01	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.0254512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6538;QD=16.4372;RBI=0.0408822;REFB=-0.0252479;REVB=-0.0319936;RO=28;SAF=18;SAR=6;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266735;STB=0.645032;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0204581;OID=.;OPOS=39587889;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:29:24:24:0.436364:6:18:14:14:6:18:15:14
chr13	40229841	.	CA	AG,CAG	299.94	PASS	AF=0.0540541,0.945946;AO=2,23;DP=37;FAO=2,35;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=2,21;FSAR=0,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354356,0.187181;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=57.476,12.0629;QD=32.4261;RBI=0.0582609,0.197729;REFB=-0.0137888,-0.052715;REVB=-0.0462456,-0.0637185;RO=8;SAF=2,15;SAR=0,8;SRF=5;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.55315,0.0140417;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,ins;VARB=-0.0335798,0.0555011;OID=.,.;OPOS=40229841,40229843;OREF=CA,-;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,CAG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:37:37:8:0:2,23:2,35:0.0540541,0.945946:0,8:2,15:5:3:0,14:2,21:0:0
chr13	40229891	.	G	A	745.18	PASS	AF=1;AO=53;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4235;QD=50.5205;RBI=0.196104;REFB=-0.199644;REVB=0.193085;RO=6;SAF=38;SAR=15;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155926;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0209463;OID=.;OPOS=40229891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:59:6:0:53:59:1:15:38:0:6:21:38:0:0
chr13	40229957	.	T	A	1342.78	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00304906;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.562;QD=62.455;RBI=0.015691;REFB=0;REVB=0.0153919;RO=0;SAF=61;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.7969e-05;OID=.;OPOS=40229957;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:86:0:0:86:86:1:25:61:0:0:25:61:0:0
chr13	40230229	.	C	T	1394.6	PASS	AF=0.989011;AO=86;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0330765;FXX=0.0108684;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.555;QD=61.3012;RBI=0.0342642;REFB=-0.13166;REVB=0.00894334;RO=0;SAF=40;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504949;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000195662;OID=.;OPOS=40230229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:91:0:1:86:90:0.989011:46:40:0:0:50:40:0:1
chr13	40230294	.	T	C	2638.25	PASS	AF=1;AO=170;DP=170;FAO=170;FDP=170;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.875;QD=62.0764;RBI=0.0491913;REFB=0;REVB=0.0423776;RO=0;SAF=91;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.50697e-05;OID=.;OPOS=40230294;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:170:170:0:0:170:170:1:79:91:0:0:79:91:0:0
chr13	40238175	.	C	T	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00685929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.811;QD=56.938;RBI=0.0307237;REFB=0;REVB=0.0299482;RO=0;SAF=19;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.59768e-05;OID=.;OPOS=40238175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:34:19:0:0:34:19:0:0
chr13	41515371	.	C	T	549.47	PASS	AF=0.467742;AO=58;DP=124;FAO=58;FDP=124;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=35;FSRR=31;FWDB=-0.019298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3892;QD=17.7248;RBI=0.0802201;REFB=-0.00590266;REVB=-0.0778643;RO=66;SAF=26;SAR=32;SRF=35;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786996;STB=0.543718;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00667653;OID=.;OPOS=41515371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:66:66:58:58:0.467742:32:26:35:31:32:26:35:31
chr13	41634954	.	G	A	127.73	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0184522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.381;QD=11.8818;RBI=0.0321986;REFB=-0.0124377;REVB=-0.0263868;RO=28;SAF=9;SAR=6;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0723332;STB=0.542799;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0187601;OID=.;OPOS=41634954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:28:28:15:15:0.348837:6:9:15:13:6:9:15:13
chr13	41657340	.	C	T	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0117386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.829;QD=16.9316;RBI=0.0562398;REFB=-0.00738714;REVB=-0.0550011;RO=12;SAF=9;SAR=3;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245037;STB=0.642602;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0197091;OID=.;OPOS=41657340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:3:9:6:6:3:9:6:6
chr13	41705495	.	A	G	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.777;QD=61.684;RBI=0.038123;REFB=0;REVB=0.0366397;RO=0;SAF=30;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107319;OID=.;OPOS=41705495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:11:30:0:0:11:30:0:0
chr13	41706800	.	A	G	668.06	PASS	AF=0.977778;AO=43;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0258152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.901;QD=59.3826;RBI=0.0313848;REFB=0.0648271;REVB=0.0178489;RO=0;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514279;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=-4.57804e-05;OID=.;OPOS=41706800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:0:1:43:44:0.977778:16:27:0:0:17:27:0:1
chr13	41834744	.	C	T	269.28	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=65;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.0366455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0984;QD=16.5711;RBI=0.0388446;REFB=-0.0435946;REVB=-0.0128843;RO=35;SAF=16;SAR=14;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.10001;STB=0.5562;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0219557;OID=.;OPOS=41834744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:35:30:30:0.461538:14:16:15:20:14:16:15:20
chr13	41902939	.	T	C	1212.78	PASS	AF=0.987654;AO=63;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0348016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4164;QD=59.8902;RBI=0.0378197;REFB=-0.0584736;REVB=0.0148047;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505617;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00334648;OID=.;OPOS=41902939;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:0:1:63:80:0.987654:31:32:0:0:36:44:1:0
chr13	42032572	.	T	C	1302.16	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.040439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.061;QD=62.0078;RBI=0.0418149;REFB=0;REVB=0.0106382;RO=0;SAF=37;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.99643e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.55184e-05;OID=.;OPOS=42032572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:47:37:0:0:47:37:0:0
chr13	42442546	.	A	G	188.7	PASS	AF=0.415094;AO=21;DP=52;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0353605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.63;QD=14.2415;RBI=0.0355232;REFB=-0.00408577;REVB=0.00339632;RO=29;SAF=14;SAR=7;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226474;STB=0.591465;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00663809;OID=.;OPOS=42442546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:29:31:21:22:0.415094:7:14:13:16:8:14:15:16
chr13	42465713	.	C	T	223.88	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.0162905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.828;QD=19.468;RBI=0.0198956;REFB=-0.00848683;REVB=0.0114217;RO=24;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123185;STB=0.569657;STBP=0.38;TYPE=snp;VARB=0.00755489;OID=.;OPOS=42465713;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:13:9:13:11:13:9:13:11
chr13	42703682	.	T	C	242.3	PASS	AF=0.430769;AO=28;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0268169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.8162;QD=14.9107;RBI=0.0293634;REFB=-0.00814383;REVB=-0.0119609;RO=37;SAF=17;SAR=11;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0960648;STB=0.554516;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.0531636;OID=.;OPOS=42703682;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:37:37:28:28:0.430769:11:17:19:18:11:17:19:18
chr13	42772717	.	G	T	1132.37	PASS	AF=0.987013;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0154627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.135;QD=58.8247;RBI=0.0160365;REFB=-0.118575;REVB=0.0042513;RO=1;SAF=44;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106344;STB=0.505616;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000257273;OID=.;OPOS=42772717;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:1:1:76:76:0.987013:32:44:1:0:32:44:1:0
chr13	42793479	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.013606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.4745;QD=59.8393;RBI=0.0307517;REFB=0;REVB=0.027578;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000218967;OID=.;OPOS=42793479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
chr13	42803341	.	T	C	2010.55	PASS	AF=0.992366;AO=130;DP=131;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=77;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0200613;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1716;QD=61.3909;RBI=0.0466042;REFB=-0.0848528;REVB=0.0420654;RO=1;SAF=77;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00888251;STB=0.504672;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00107603;OID=.;OPOS=42803341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:131:131:1:1:130:130:0.992366:53:77:0:1:53:77:0:1
chr13	43364660	.	G	A	231.64	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0243236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9076;QD=19.7139;RBI=0.0245228;REFB=-0.0096466;REVB=0.00311938;RO=24;SAF=9;SAR=14;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0973648;STB=0.554626;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0102377;OID=.;OPOS=43364660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:24:24:23:23:0.489362:14:9:7:17:14:9:7:17
chr13	43463388	.	TAAAAAAAT	ATAAAAAAT,TAAAAAAT,TAAAAAATA	64.77	PASS	AF=0,0.5,0;AO=2,12,3;DP=33;FAO=0,17,0;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=0,3,0;FSAR=0,14,0;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.151468,-0.0711259,-0.229887;FXX=0.0285633;HRUN=1,7,7;LEN=2,1,2;MLLD=14.5159,9.95,23.7801;QD=7.62014;RBI=0.15352,0.0711388,0.23167;REFB=-0.0637893,-0.108393,-0.0561976;REVB=-0.0250159,-0.00135299,-0.0286905;RO=14;SAF=0,1,3;SAR=2,11,0;SRF=2;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.437459,-0.150663,0.770458;STB=0.5,0.589358,0.5;STBP=1,0.43,1;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0.0342403,0.113936,0;OID=.,.,.;OPOS=43463388,43463389,43463395;OREF=TA,A,AT;OALT=AT,-,TA;OMAPALT=ATAAAAAAT,TAAAAAAT,TAAAAAATA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:64:33:34:14:17:2,12,3:0,17,0:0,0.5,0:2,11,0:0,1,3:2:12:0,14,0:0,3,0:5:12
chr13	43469157	.	G	A	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.445;QD=57.0007;RBI=0.0508036;REFB=0;REVB=-0.0467026;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000122237;OID=.;OPOS=43469157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:25:29:0:0:25:29:0:0
chr13	43469211	.	G	A	979.82	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00312165;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.314;QD=57.6366;RBI=0.0149112;REFB=-0.125336;REVB=-0.0145808;RO=1;SAF=38;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016016;STB=0.508472;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000211511;OID=.;OPOS=43469211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:68:1:1:67:67:0.985294:29:38:0:1:29:38:0:1
chr13	43788158	.	G	A	785.88	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.192;QD=64.1534;RBI=0.0174467;REFB=0;REVB=-0.0025613;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.7706e-05;OID=.;OPOS=43788158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:18:30:0:0:18:31:0:0
chr13	44457925	.	A	G	917.94	PASS	AF=0.572414;AO=83;DP=147;FAO=83;FDP=145;FR=.;FRO=62;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=0.0590658;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.573;QD=25.3225;RBI=0.0596314;REFB=-0.0220314;REVB=0.00819353;RO=61;SAF=45;SAR=38;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507329;STB=0.530612;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0116692;OID=.;OPOS=44457925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:145:61:62:83:83:0.572414:38:45:37:24:38:45:38:24
chr13	45554013	.	A	G	257.83	PASS	AF=0.323529;AO=33;DP=101;FAO=33;FDP=102;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=42;FSRR=27;FWDB=-0.0108104;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=268.153;QD=10.1109;RBI=0.0108209;REFB=-0.0127447;REVB=0.000476401;RO=65;SAF=17;SAR=16;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0798858;STB=0.563544;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0187671;OID=.;OPOS=45554013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:65:69:33:33:0.323529:16:17:38:27:16:17:42:27
chr13	45563531	.	C	G	320.27	PASS	AF=0.378947;AO=36;DP=96;FAO=36;FDP=95;FR=.;FRO=59;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=33;FSRR=26;FWDB=0.00741255;FXX=0.0104156;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.912;QD=13.4851;RBI=0.0530697;REFB=-0.00597844;REVB=-0.0525495;RO=59;SAF=19;SAR=17;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0344926;STB=0.519683;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0142167;OID=.;OPOS=45563531;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:95:59:59:36:36:0.378947:17:19:33:26:17:19:33:26
chr13	45580336	.	GA	G	30.49	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0152245;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=16.5543;QD=7.17314;RBI=0.108621;REFB=-0.0664969;REVB=-0.107549;RO=10;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.467859;STB=0.815233;STBP=0.09;TYPE=del;VARB=0.0800146;OID=.;OPOS=45580337;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.352941:6:17:6:17:11:5:1:4:7:30:10:5:1:4:6
chr13	45914702	.	GT	G	37.15	PASS	AF=0.357143;AO=16;DP=29;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.051325;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=9.59813;QD=5.3075;RBI=0.068404;REFB=-0.107998;REVB=-0.04522;RO=11;SAF=11;SAR=5;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11353;STB=0.545366;STBP=0.757;TYPE=del;VARB=0.109045;OID=.;OPOS=45914703;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.357143:16:29:10:28:18:6:4:12:6:37:11:11:5:6:5
chr13	45914710	.	GA	G	36.28	PASS	AF=0.4;AO=11;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0192983;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.5237;QD=5.80408;RBI=0.0200308;REFB=-0.103132;REVB=0.00536764;RO=11;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235046;STB=0.580483;STBP=0.515;TYPE=del;VARB=0.140519;OID=.;OPOS=45914711;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:11:25:10:25:15:4:6:8:7:36:11:4:7:7:4
chr13	46067593	.	G	A	872.25	PASS	AF=0.954545;AO=62;DP=65;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0476235;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6377;QD=52.8637;RBI=0.048966;REFB=-0.0371874;REVB=-0.0113873;RO=3;SAF=22;SAR=40;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601309;STB=0.531905;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00162051;OID=.;OPOS=46067593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:65:66:3:3:62:63:0.954545:40:22:3:0:41:22:3:0
chr13	46077381	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=330.65;QD=50.4135;RBI=0.012885;REFB=0;REVB=0.00243763;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.86231e-05;OID=.;OPOS=46077381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr13	46103935	.	A	G	926.75	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467374;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.233;QD=57.0305;RBI=0.159615;REFB=-0.120162;REVB=0.152619;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161858;OID=.;OPOS=46103935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:65:65:0:0:64:65:1:31:33:0:0:32:33:0:0
chr13	46108853	.	TG	AG,CA	1248.9	PASS	AF=0.0365854,0.963415;AO=3,79;DP=84;FAO=3,79;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=3,38;FSAR=0,41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00746529,-1.78767e-05;FXX=0.0238067;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=37.2563,171.282;QD=60.9218;RBI=0.00799333,0.00466554;REFB=0,0;REVB=-0.00285706,-0.00466551;RO=0;SAF=3,38;SAR=0,41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0339987,-0.00134164;OID=.,.;OPOS=46108853,46108853;OREF=T,TG;OALT=A,CA;OMAPALT=AG,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:84:82:0:0:3,79:3,79:0.0365854,0.963415:0,41:3,38:0:0:0,41:3,38:0:0
chr13	46115731	.	C	A	1635.66	PASS	AF=0.982301;AO=109;DP=112;FAO=111;FDP=113;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0213152;FXX=0.00877116;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8578;QD=57.8994;RBI=0.0356843;REFB=-0.0442956;REVB=0.0286187;RO=3;SAF=48;SAR=61;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116483;STB=0.500885;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.001379;OID=.;OPOS=46115731;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:112:113:3:2:109:111:0.982301:61:48:2:1:61:50:1:1
chr13	46137837	.	T	C	2305.58	PASS	AF=1;AO=151;DP=153;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00958852;FXX=0.013071;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.596;QD=61.075;RBI=0.0593789;REFB=0;REVB=0.0585996;RO=0;SAF=85;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.27832e-05;OID=.;OPOS=46137837;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:153:151:0:0:151:151:1:66:85:0:0:66:85:0:0
chr13	46170609	.	C	T	286.43	PASS	AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.00435455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.552;QD=15.6947;RBI=0.0080691;REFB=-0.0251773;REVB=0.00679325;RO=40;SAF=20;SAR=12;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260674;STB=0.523451;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0332702;OID=.;OPOS=46170609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:40:41:32:32:0.438356:12:20:24:16:12:20:24:17
chr13	46541673	.	T	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344898;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.749;QD=60.9786;RBI=0.0454311;REFB=0;REVB=0.0295709;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.93651e-05;OID=.;OPOS=46541673;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:14:25:0:0:14:25:0:0
chr13	46562935	.	A	G	801.32	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.772;QD=57.2369;RBI=0.0291651;REFB=0;REVB=-0.000543212;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.61487e-05;OID=.;OPOS=46562935;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:24:31:0:0:24:32:0:0
chr13	46629944	.	A	G	638.77	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0606158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.806;QD=59.4201;RBI=0.0609085;REFB=-0.0188184;REVB=0.00596362;RO=1;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268094;STB=0.514279;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.000453706;OID=.;OPOS=46629944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:17:25:0:1:17:25:0:1
chr13	46638826	.	G	A	150.93	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=-0.0282301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.784;QD=12.8454;RBI=0.0387585;REFB=-0.0148217;REVB=0.0265571;RO=28;SAF=12;SAR=5;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775601;STB=0.553249;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0239568;OID=.;OPOS=46638826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:28:30:17:17:0.361702:5:12:18:10:5:12:19:11
chr13	46641481	.	T	C	1439.8	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023891;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.536;QD=63.2878;RBI=0.0257826;REFB=0;REVB=0.00969331;RO=0;SAF=51;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75811e-05;OID=.;OPOS=46641481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:40:51:0:0:40:51:0:0
chr13	46656669	.	A	G	2228.57	PASS	AF=1;AO=140;DP=144;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03173;FXX=0.0277759;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.136;QD=63.6735;RBI=0.032891;REFB=0;REVB=0.00866162;RO=0;SAF=73;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.20409e-05;OID=.;OPOS=46656669;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:144:140:0:0:140:140:1:67:73:0:0:67:73:0:0
chr13	46700642	.	G	T	1184.57	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00361362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.461;QD=59.9781;RBI=0.0912869;REFB=0;REVB=0.0912153;RO=0;SAF=44;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.47499e-05;OID=.;OPOS=46700642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:79:0:0:68:79:1:24:44:0:0:33:46:0:0
chr13	46708291	.	T	C	787.92	PASS	AF=0.966667;AO=57;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0103847;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=211.579;QD=52.528;RBI=0.0307204;REFB=-0.231609;REVB=0.028912;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517235;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.000655489;OID=.;OPOS=46708291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:60:60:0:2:57:58:0.966667:27:30:0:0:28:30:0:2
chr13	46801970	.	A	G	279.54	PASS	AF=0.557692;AO=28;DP=51;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=0.0342485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.707;QD=21.5028;RBI=0.0342803;REFB=-0.00121145;REVB=0.00147588;RO=23;SAF=5;SAR=23;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702886;STB=0.554804;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00102447;OID=.;OPOS=46801970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:23:23:28:29:0.557692:23:5:3:20:23:6:3:20
chr13	46802177	.	A	G	156.93	PASS	AF=0.313433;AO=21;DP=68;FAO=21;FDP=67;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.00622377;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.721;QD=9.3688;RBI=0.0211892;REFB=-0.019148;REVB=0.0202545;RO=46;SAF=14;SAR=7;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.315645;STB=0.6861;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0269132;OID=.;OPOS=46802177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:46:46:21:21:0.313433:7:14:18:28:7:14:18:28
chr13	46948660	.	A	G	33.26	PASS	AF=0.146341;AO=6;DP=41;FAO=6;FDP=41;FR=.;FRO=35;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.0544066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.2114;QD=3.24472;RBI=0.0584737;REFB=-0.00965936;REVB=0.0214265;RO=33;SAF=2;SAR=4;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250098;STB=0.676834;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.033869;OID=.;OPOS=46948660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:41:41:33:35:6:6:0.146341:4:2:18:15:4:2:19:16
chr13	47260054	.	T	C	1179.51	PASS	AF=0.952381;AO=80;DP=84;FAO=80;FDP=84;FR=.;FRO=4;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0189167;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2888;QD=56.167;RBI=0.0334059;REFB=-0.157125;REVB=-0.0275339;RO=4;SAF=54;SAR=26;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178302;STB=0.509432;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.00639748;OID=.;OPOS=47260054;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:84:84:4:4:80:80:0.952381:26:54:2:2:26:54:2:2
chr13	47273458	.	G	C	841.88	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00230012;FXX=0.0333278;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.787;QD=58.0603;RBI=0.00236345;REFB=0;REVB=0.000543428;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000313753;OID=.;OPOS=47273458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0
chr13	47279454	.	A	G	1540.35	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0158371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.494;QD=63.5197;RBI=0.0179666;REFB=0;REVB=0.00848431;RO=0;SAF=44;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.29311e-05;OID=.;OPOS=47279454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:52:44:0:0:53:44:0:0
chr13	47308109	.	A	G	2645.64	PASS	AF=1;AO=169;DP=174;FAO=173;FDP=173;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=94;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00319948;FXX=0.0114279;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2498;QD=61.1709;RBI=0.0240852;REFB=0;REVB=0.0238717;RO=0;SAF=79;SAR=90;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.31176e-05;OID=.;OPOS=47308109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:174:173:0:0:169:173:1:90:79:0:0:94:79:0:0
chr13	47315984	.	T	C	876.11	PASS	AF=0.984375;AO=59;DP=60;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0707936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.673;QD=54.7571;RBI=0.0708029;REFB=0.00757339;REVB=0.00114742;RO=1;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140845;STB=0.50746;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.000473577;OID=.;OPOS=47315984;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:64:1:1:59:63:0.984375:33:26:0:1:33:30:0:1
chr13	47354101	.	C	T	147.16	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.000522845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4252;QD=16.8187;RBI=0.0543152;REFB=-0.000223261;REVB=0.0543126;RO=19;SAF=12;SAR=4;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13644;STB=0.578843;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.00221754;OID=.;OPOS=47354101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:4:12:12:7:4:12:12:7
chr13	47469940	.	G	A	478.08	PASS	AF=0.484536;AO=47;DP=97;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.0118346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.241;QD=19.7145;RBI=0.011916;REFB=-0.00165436;REVB=0.00139084;RO=49;SAF=30;SAR=17;SRF=28;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0651547;STB=0.531951;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=0.00180959;OID=.;OPOS=47469940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:49:50:47:47:0.484536:17:30:28:21:17:30:29:21
chr13	47470824	.	C	T	303.7	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259727;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1183;QD=52.8171;RBI=0.0846274;REFB=0;REVB=0.0805433;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147604;OID=.;OPOS=47470824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:6:15:0:0:7:16:0:0
chr13	48033224	.	G	A	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2591;QD=64.414;RBI=0.0400969;REFB=0;REVB=0.0290255;RO=0;SAF=38;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11564e-05;OID=.;OPOS=48033224;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:12:38:0:0:12:38:0:0
chr13	48547467	.	A	T	740.35	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6369;QD=56.9498;RBI=0.068955;REFB=0;REVB=-0.0554275;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000162453;OID=.;OPOS=48547467;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:27:24:0:0:27:25:0:0
chr13	49107241	.	T	C	557.1	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0383528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.955;QD=60.2268;RBI=0.0400151;REFB=0;REVB=0.0114136;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128426;OID=.;OPOS=49107241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:24:13:0:0:24:13:0:0
chr13	49794650	.	C	A	631.2	PASS	AF=0.525;AO=63;DP=120;FAO=63;FDP=120;FR=.;FRO=57;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=33;FWDB=-0.0193702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.732;QD=21.0401;RBI=0.0205479;REFB=-0.0224637;REVB=0.00685656;RO=57;SAF=36;SAR=27;SRF=24;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129929;STB=0.571406;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0351764;OID=.;OPOS=49794650;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:57:57:63:63:0.525:27:36:24:33:27:36:24:33
chr13	49840024	.	A	G	727.7	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4386;QD=57.0744;RBI=0.0551809;REFB=0;REVB=-0.0129328;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000403612;OID=.;OPOS=49840024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:48:51:1:22:26:0:0:23:28:0:0
chr13	49866869	.	G	C	731.31	PASS	AF=0.603448;AO=66;DP=117;FAO=70;FDP=116;FR=.;FRO=46;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.00452783;FXX=0.0333306;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2904;QD=25.2177;RBI=0.00929329;REFB=-0.00879583;REVB=-0.00811567;RO=41;SAF=34;SAR=32;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0193027;STB=0.502958;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00964046;OID=.;OPOS=49866869;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:116:41:46:66:70:0.603448:32:34:20:21:34:36:24:22
chr13	50008301	.	A	G	1026.3	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124847;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.875;QD=59.4955;RBI=0.0298284;REFB=0;REVB=0.0270899;RO=0;SAF=36;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.36169e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100317;OID=.;OPOS=50008301;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:33:36:0:0:33:36:0:0
chr13	50050620	.	A	G	754.0	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.100684;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.5828;QD=56.9056;RBI=0.113178;REFB=0;REVB=0.0516911;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000592087;OID=.;OPOS=50050620;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:21:32:0:0:21:32:0:0
chr13	50057097	.	G	A	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00390972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8385;QD=58.5839;RBI=0.0815232;REFB=0;REVB=-0.0814294;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0013824;OID=.;OPOS=50057097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0
chr13	50057633	.	A	G	553.61	PASS	AF=0.408163;AO=60;DP=148;FAO=60;FDP=147;FR=.;FRO=87;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=41;FSRR=46;FWDB=0.000691563;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.917;QD=15.0641;RBI=0.00666065;REFB=-0.027685;REVB=-0.00662465;RO=86;SAF=33;SAR=27;SRF=41;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0768614;STB=0.546615;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.0413186;OID=.;OPOS=50057633;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:147:86:87:60:60:0.408163:27:33:41:45:27:33:41:46
chr13	50080847	.	A	G	573.23	PASS	AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0711647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2964;QD=55.9251;RBI=0.0712479;REFB=-0.167558;REVB=0.00344365;RO=2;SAF=25;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360381;STB=0.519221;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00400287;OID=.;OPOS=50080847;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:41:2:2:39:39:0.95122:14:25:2:0:14:25:2:0
chr13	50106584	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0434424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.532;QD=40.7629;RBI=0.0584173;REFB=0;REVB=0.0390556;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.29521e-05;OID=.;OPOS=50106584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0
chr13	50123622	.	G	C	785.07	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147007;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3894;QD=57.096;RBI=0.0997954;REFB=0;REVB=0.0987067;RO=0;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.49259e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000884409;OID=.;OPOS=50123622;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:23:32:0:0:23:32:0:0
chr13	50126382	.	G	A	123.1	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0681787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.5649;QD=37.8783;RBI=0.0695406;REFB=-0.0159804;REVB=-0.0136954;RO=1;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818676;STB=0.545378;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0245011;OID=.;OPOS=50126382;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:5:7:0:1:5:7:0:1
chr13	50141345	.	G	A	792.13	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140387;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.607;QD=56.5807;RBI=0.0344672;REFB=0;REVB=0.0314786;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000402894;OID=.;OPOS=50141345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:54:56:1:33:21:0:0:34:22:0:0
chr13	50206065	.	G	C	113.01	PASS	AF=0.2;AO=32;DP=137;FAO=28;FDP=140;FR=.;FRO=112;FSAF=1;FSAR=27;FSRF=56;FSRR=56;FWDB=-0.032028;FXX=0.0666622;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.2674;QD=3.22882;RBI=0.05233;REFB=-0.0248861;REVB=-0.041384;RO=95;SAF=0;SAR=32;SRF=56;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.812893;STB=0.948455;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.201318;OID=.;OPOS=50206065;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:140:95:112:32:28:0.2:32:0:56:39:27:1:56:56
chr13	50206328	.	G	C	318.89	PASS	AF=0.432099;AO=34;DP=80;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.0125033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.041;QD=15.7474;RBI=0.0140985;REFB=-0.0100831;REVB=0.00651437;RO=44;SAF=22;SAR=12;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132383;STB=0.514451;STBP=0.842;TYPE=snp;VARB=0.0157862;OID=.;OPOS=50206328;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:44:46:34:35:0.432099:12:22:29:15:13:22:30:16
chr13	50207133	.	A	G	152.34	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.0443018;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.126;QD=21.0126;RBI=0.0444097;REFB=-0.0133324;REVB=0.00309383;RO=13;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140495;STB=0.5793;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0113152;OID=.;OPOS=50207133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:7:9:5:8:7:9:5:8
chr13	50273831	.	T	C	293.24	PASS	AF=0.568627;AO=29;DP=51;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0456386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5932;QD=22.9991;RBI=0.0464127;REFB=-0.0226027;REVB=-0.00844167;RO=22;SAF=16;SAR=13;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309802;STB=0.517135;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.00544628;OID=.;OPOS=50273831;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:22:22:29:29:0.568627:13:16:13:9:13:16:13:9
chr13	50273970	.	C	T	199.49	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0506263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3929;QD=15.6464;RBI=0.065527;REFB=-0.0111704;REVB=-0.0416025;RO=27;SAF=12;SAR=10;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.196228;STB=0.583869;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00951703;OID=.;OPOS=50273970;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:27:29:22:22:0.431373:10:12:20:7:10:12:20:9
chr13	50283819	.	T	C	311.77	PASS	AF=0.371429;AO=36;DP=103;FAO=39;FDP=105;FR=.;FRO=66;FSAF=8;FSAR=31;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.0286523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.135;QD=11.8769;RBI=0.02875;REFB=-0.0235145;REVB=-0.00236855;RO=66;SAF=8;SAR=28;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361518;STB=0.720807;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0391219;OID=.;OPOS=50283819;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:105:66:66:36:39:0.371429:28:8:34:32:31:8:34:32
chr13	50296115	.	C	T	541.7	PASS	AF=1;AO=29;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.6132;QD=58.5622;RBI=0.0747773;REFB=0;REVB=-0.0636633;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00036783;OID=.;OPOS=50296115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:29:37:1:8:21:0:0:10:27:0:0
chr13	50296116	.	G	T	51.15	PASS	AF=0.210526;AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.00459473;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=71.3505;QD=5.38454;RBI=0.0297251;REFB=-0.0294504;REVB=0.0293678;RO=30;SAF=6;SAR=2;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0261304;STB=0.517198;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00548054;OID=.;OPOS=50296116;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:38:38:30:30:8:8:0.210526:2:6:22:8:2:6:22:8
chr13	50502223	.	TA	AT,T	89.52	PASS	AF=0.107143,0.464286;AO=3,11;DP=32;FAO=3,13;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=0,3;FSAR=3,10;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.032915,0.0202438;FXX=0.124961;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=114.105,10.3746;QD=12.7885;RBI=0.0344436,0.116708;REFB=-0.0260279,-0.113297;REVB=-0.0101472,-0.114939;RO=9;SAF=0,2;SAR=3,9;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.740238,-0.49372;STB=0.996896,0.723321;STBP=0.033,0.032;TYPE=mnp,del;VARB=0.088633,0.0510373;OID=.,.;OPOS=50502223,50502224;OREF=TA,A;OALT=AT,-;OMAPALT=AT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:52:32:28:9:12:3,11:3,13:0.107143,0.464286:3,9:0,2:7:2:3,10:0,3:8:4
chr13	50587718	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.275;QD=40.7623;RBI=0.0583401;REFB=0;REVB=0.0496068;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000523852;OID=.;OPOS=50587718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr13	50588480	.	A	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336914;FXX=0;HRUN=32;LEN=1;MLLD=86.7932;QD=33.4255;RBI=0.0336914;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105928;OID=.;OPOS=50588480;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr13	50588490	.	T	C	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0109918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2777;QD=16.8224;RBI=0.127648;REFB=-0.0313576;REVB=0.127174;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292301;STB=0.666293;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0503062;OID=.;OPOS=50588490;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:2:5:5:0:2:5:5:0
chr13	50588492	.	T	C	143.71	PASS	AF=0.823529;AO=14;DP=17;FAO=14;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0740392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.716;QD=33.815;RBI=0.082479;REFB=-0.0661463;REVB=0.0363455;RO=3;SAF=12;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101073;STB=0.555482;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0156235;OID=.;OPOS=50588492;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:17:17:3:3:14:14:0.823529:2:12:3:0:2:12:3:0
chr13	50588494	.	T	C	143.72	PASS	AF=0.823529;AO=14;DP=17;FAO=14;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0640246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0908;QD=33.817;RBI=0.0731814;REFB=-0.125325;REVB=0.0354454;RO=2;SAF=12;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069999;STB=0.555482;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0344706;OID=.;OPOS=50588494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:17:17:2:3:14:14:0.823529:2:12:2:0:2:12:3:0
chr13	50588496	.	T	C	177.46	PASS	AF=0.888889;AO=16;DP=18;FAO=16;FDP=18;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.016616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.828;QD=39.4351;RBI=0.0303786;REFB=-0.114508;REVB=0.0254316;RO=1;SAF=14;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.031564;STB=0.533293;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0237611;OID=.;OPOS=50588496;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:18:18:1:2:16:16:0.888889:2:14:1:0:2:14:2:0
chr13	50590423	.	G	A,C	616.02	PASS	AF=0.0454545,0.909091;AO=2,40;DP=44;FAO=2,40;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=2,33;FSAR=0,7;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0689743,0.0620457;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=28.0176,117.459;QD=56.0017;RBI=0.0695688,0.0626348;REFB=0.00374109,-0.0327569;REVB=-0.00907534,0.00856967;RO=1;SAF=2,33;SAR=0,7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.0140049;STB=0.992443,0.525883;STBP=0.312,0.253;TYPE=snp,snp;VARB=0.0439335,0.000526244;OID=.,.;OPOS=50590423,50590423;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:44:44:1:2:2,40:2,40:0.0454545,0.909091:0,7:2,33:1:0:0,7:2,33:1:1
chr13	50591480	.	T	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.496;QD=62.3503;RBI=0.0322952;REFB=0;REVB=0.028508;RO=0;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150557;OID=.;OPOS=50591480;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:20:23:0:0:20:23:0:0
chr13	50656582	.	T	A	2354.45	PASS	AF=1;AO=147;DP=148;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150553;FXX=0.0067563;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.277;QD=64.0666;RBI=0.0411259;REFB=0;REVB=0.0382711;RO=0;SAF=78;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7993e-05;OID=.;OPOS=50656582;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:148:147:0:0:147:147:1:69:78:0:0:69:78:0:0
chr13	51387124	.	A	G	165.43	PASS	AF=0.362069;AO=22;DP=58;FAO=21;FDP=58;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.015759;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6221;QD=11.4088;RBI=0.0237038;REFB=-0.0277394;REVB=0.0177067;RO=35;SAF=12;SAR=10;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589674;STB=0.545412;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0987431;OID=.;OPOS=51387124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:37:22:21:0.362069:10:12:21:14:10:11:22:15
chr13	51594741	.	T	G	385.42	PASS	AF=0.5125;AO=31;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.00836879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.8674;QD=19.2709;RBI=0.0456385;REFB=-0.00955981;REVB=-0.0448647;RO=30;SAF=14;SAR=17;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245433;STB=0.63303;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0142436;OID=.;OPOS=51594741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:30:39:31:41:0.5125:17:14:22:8:24:17:27:12
chr13	51603768	.	T	C	151.0	PASS	AF=0.351852;AO=19;DP=54;FAO=19;FDP=54;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0109662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.501;QD=11.185;RBI=0.0470139;REFB=0.00250141;REVB=-0.0457171;RO=35;SAF=14;SAR=5;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0697754;STB=0.541018;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=-0.0055753;OID=.;OPOS=51603768;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:35:35:19:19:0.351852:5:14:24:11:5:14:24:11
chr13	51918558	.	G	A	331.31	PASS	AF=0.428571;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=-0.0255077;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3921;QD=15.7767;RBI=0.0490555;REFB=-0.00852729;REVB=-0.0419023;RO=48;SAF=18;SAR=18;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210991;STB=0.511898;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00822725;OID=.;OPOS=51918558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:48:48:36:36:0.428571:18:18:23:25:18:18:23:25
chr13	51922708	.	GTTTG	GTTG,GTTGT	76.75	PASS	AF=0.2,0.1;AO=11,3;DP=50;FAO=10,5;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=9,5;FSAR=1,0;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.281402,-0.0906561;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=18.3277,101.727;QD=6.13974;RBI=0.281546,0.0907586;REFB=-0.016929,0.0138396;REVB=-0.00899133,-0.0043121;RO=30;SAF=9,3;SAR=2,0;SRF=13;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.471879,0.575357;STB=0.867201,0.997806;STBP=0.014,0.016;TYPE=del,mnp;VARB=0.0352749,0.0490158;OID=.,.;OPOS=51922709,51922711;OREF=T,TG;OALT=-,GT;OMAPALT=GTTG,GTTGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.2,0.1:11,3:50:10,5:50:35:9,5:1,0:17:18:44:30:9,3:2,0:13:17
chr13	51997199	.	C	T	204.51	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0130305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.041;QD=22.7235;RBI=0.0233981;REFB=0.000856174;REVB=0.0194339;RO=16;SAF=11;SAR=9;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186696;STB=0.604294;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=-0.000805049;OID=.;OPOS=51997199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:16:16:20:20:0.555556:9:11:5:11:9:11:5:11
chr13	52440130	.	A	G	203.12	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00560121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.437;QD=21.959;RBI=0.00713408;REFB=-0.00351041;REVB=-0.00441831;RO=17;SAF=13;SAR=7;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00264095;STB=0.501482;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00411001;OID=.;OPOS=52440130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:7:13:11:6:7:13:11:6
chr13	52515354	.	A	G	185.92	PASS	AF=0.342466;AO=17;DP=66;FAO=25;FDP=73;FR=.;FRO=48;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.0454626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.139;QD=10.1872;RBI=0.0462139;REFB=-0.0106481;REVB=0.00829884;RO=48;SAF=7;SAR=10;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181178;STB=0.554055;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0254203;OID=.;OPOS=52515354;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:73:48:48:17:25:0.342466:10:7:27:21:13:12:27:21
chr13	52515982	.	A	AAC	517.95	PASS	AF=0.581395;AO=45;DP=90;FAO=50;FDP=86;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.00427051;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=268.894;QD=24.0906;RBI=0.0107888;REFB=-0.0130031;REVB=0.00990766;RO=44;SAF=24;SAR=21;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110543;STB=0.566239;STBP=0.171;TYPE=ins;VARB=0.00674106;OID=.;OPOS=52515983;OREF=-;OALT=AC;OMAPALT=AAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.581395:45:90:50:86:36:26:24:13:23:99:44:24:21:18:26
chr13	52523808	.	C	T	197.95	PASS	AF=0.425926;AO=22;DP=53;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.00451998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.483;QD=14.6628;RBI=0.0081912;REFB=-0.0142893;REVB=-0.00683122;RO=31;SAF=7;SAR=15;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.3885;STB=0.725945;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0185859;OID=.;OPOS=52523808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:31:31:22:23:0.425926:15:7:22:9:16:7:22:9
chr13	52524488	.	T	C	341.06	PASS	AF=0.622642;AO=33;DP=52;FAO=33;FDP=53;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=-0.0139393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8714;QD=25.7405;RBI=0.071586;REFB=-0.013672;REVB=-0.0702157;RO=19;SAF=11;SAR=22;SRF=3;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139117;STB=0.582044;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0073058;OID=.;OPOS=52524488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:19:20:33:33:0.622642:22:11:3:16:22:11:3:17
chr13	52544805	.	C	G	524.17	PASS	AF=0.510204;AO=50;DP=98;FAO=50;FDP=98;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.0115259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4409;QD=21.3947;RBI=0.0161364;REFB=0.0104583;REVB=0.0112933;RO=48;SAF=28;SAR=22;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108566;STB=0.559976;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=-0.0121102;OID=.;OPOS=52544805;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:48:48:50:50:0.510204:22:28:21:27:22:28:21:27
chr13	52548140	.	A	C	504.08	PASS	AF=0.45;AO=54;DP=119;FAO=54;FDP=120;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=45;FSRR=21;FWDB=0.0394693;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2925;QD=16.8025;RBI=0.0972409;REFB=0.0224745;REVB=0.0888705;RO=56;SAF=33;SAR=21;SRF=41;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121049;STB=0.541652;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=-0.00842533;OID=.;OPOS=52548140;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:120:56:66:54:54:0.45:21:33:41:15:21:33:45:21
chr13	52603194	.	G	T	408.34	PASS	AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0202091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=193.105;QD=20.4171;RBI=0.0202271;REFB=-0.00128847;REVB=0.000852524;RO=39;SAF=28;SAR=13;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227011;STB=0.626135;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00239269;OID=.;OPOS=52603194;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:13:28:17:22:13:28:17:22
chr13	52603775	.	C	T	122.89	PASS	AF=0.451613;AO=13;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0161476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0096;QD=15.8564;RBI=0.0350415;REFB=-0.0235884;REVB=-0.0310992;RO=16;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835315;STB=0.580533;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0339981;OID=.;OPOS=52603775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:17:13:14:0.451613:6:7:10:6:7:7:11:6
chr13	52605362	.	T	A	39.54	PASS	AF=0.16;AO=7;DP=48;FAO=8;FDP=50;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=30;FSRR=12;FWDB=-0.0369876;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=38.2313;QD=3.16343;RBI=0.03908;REFB=-0.0317419;REVB=-0.012616;RO=40;SAF=1;SAR=6;SRF=28;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.606698;STB=0.918654;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.185418;OID=.;OPOS=52605362;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:48:50:40:42:7:8:0.16:6:1:28:12:7:1:30:12
chr13	52605367	.	T	A	80.34	PASS	AF=0.3;AO=7;DP=43;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=9;FWDB=0.043604;FXX=0.019604;HRUN=6;LEN=1;MLLD=38.2127;QD=6.42707;RBI=0.043805;REFB=-0.0233631;REVB=0.00419176;RO=32;SAF=5;SAR=2;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383202;STB=0.727008;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0555805;OID=.;OPOS=52605367;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:43:50:32:35:7:15:0.3:2:5:22:10:9:6:26:9
chr13	52952470	.	C	CT,T	56.51	PASS	AF=0.170732,0;AO=13,3;DP=83;FAO=14,0;FDP=82;FR=.;FRO=68;FSAF=13,0;FSAR=1,0;FSRF=39;FSRR=29;FWDB=-0.026409,-0.0308734;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=63.2599,245.261;QD=2.7566;RBI=0.0814934,0.0348908;REFB=-0.00831866,0.000984079;REVB=-0.0770956,-0.0162543;RO=67;SAF=13,3;SAR=0,0;SRF=37;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.700598,0.396983;STB=0.881695,0.5;STBP=0.007,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.179533,0;OID=.,.;OPOS=52952471,52952470;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:83:82:67:68:13,3:14,0:0.170732,0:0,0:13,3:37:30:1,0:13,0:39:29
chr13	52971893	.	G	A	133.36	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.000940694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8419;QD=15.6889;RBI=0.0907091;REFB=0.0145127;REVB=0.0907042;RO=19;SAF=10;SAR=5;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19362;STB=0.612091;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.0194902;OID=.;OPOS=52971893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:5:10:9:10:5:10:9:10
chr13	53035783	.	T	C	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.5159;QD=58.5848;RBI=0.0294747;REFB=0;REVB=-0.0172236;RO=0;SAF=24;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.19407e-05;OID=.;OPOS=53035783;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:9:24:0:0:9:24:0:0
chr13	53035925	.	A	G	519.22	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.32;QD=59.3394;RBI=0.0649039;REFB=0;REVB=0.01287;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267842;OID=.;OPOS=53035925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr13	53050479	.	G	A	174.81	PASS	AF=0.296296;AO=23;DP=81;FAO=24;FDP=81;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=-0.0861224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0853;QD=8.63243;RBI=0.0974261;REFB=-0.00483596;REVB=-0.0455497;RO=57;SAF=16;SAR=7;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130435;STB=0.553526;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0180955;OID=.;OPOS=53050479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:57:57:23:24:0.296296:7:16:34:23:8:16:34:23
chr13	53422553	.	A	G	191.58	PASS	AF=0.403509;AO=23;DP=57;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0597655;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.0471;QD=13.4439;RBI=0.0834682;REFB=-0.0065116;REVB=-0.0582669;RO=34;SAF=17;SAR=6;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327151;STB=0.688645;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.00397822;OID=.;OPOS=53422553;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:34:34:23:23:0.403509:6:17:15:19:6:17:15:19
chr13	53608632	.	C	T	421.88	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0414276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.224;QD=56.2503;RBI=0.0414564;REFB=0;REVB=-0.00154414;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.30625e-05;OID=.;OPOS=53608632;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:29:30:1:17:12:0:0:17:13:0:0
chr13	55748673	.	T	C	1279.06	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243176;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1234;QD=61.6414;RBI=0.113662;REFB=0;REVB=0.11103;RO=0;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14462e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106887;OID=.;OPOS=55748673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:82:83:1:46:36:0:0:46:37:0:0
chr13	60324979	.	G	A	435.63	PASS	AF=0.430894;AO=47;DP=116;FAO=53;FDP=123;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=-0.0458319;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.4928;QD=14.1668;RBI=0.0482013;REFB=-0.0224075;REVB=0.0149265;RO=69;SAF=30;SAR=17;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0966473;STB=0.513374;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0316451;OID=.;OPOS=60324979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:123:69:70:47:53:0.430894:17:30:38:31:23:30:38:32
chr13	60348377	.	G	A	57.92	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.00613982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.431;QD=13.6271;RBI=0.135157;REFB=-0.02554;REVB=-0.135017;RO=8;SAF=7;SAR=1;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194344;STB=0.599716;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0127625;OID=.;OPOS=60348377;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:9:8:8:0.470588:1:7:6:2:1:7:7:2
chr13	61057936	.	A	G	458.18	PASS	AF=0.464646;AO=46;DP=99;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=0.0763708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.137;QD=18.5124;RBI=0.0818788;REFB=-0.00711983;REVB=-0.0295236;RO=53;SAF=27;SAR=19;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035596;STB=0.519827;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.00874444;OID=.;OPOS=61057936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:53:53:46:46:0.464646:19:27:33:20:19:27:33:20
chr13	61986918	.	C	A	288.98	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3435;QD=52.5416;RBI=0.0479114;REFB=0;REVB=-0.0411559;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000314736;OID=.;OPOS=61986918;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0
chr13	64413891	.	T	A	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00517671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.596;QD=17.2297;RBI=0.00929914;REFB=0.0126719;REVB=0.00772501;RO=6;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21129;STB=0.624664;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=-0.0143025;OID=.;OPOS=64413891;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:2:6:3:3:2:6:3:3
chr13	64415080	.	AG	AC,A,GA	153.49	PASS	AF=0.0217391,0.26087,0.217391;AO=3,12,9;DP=47;FAO=1,12,10;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=1,9,10;FSAR=0,3,0;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0542514,-0.131482,-0.0460932;FXX=0.041658;HRUN=5,5,1;LEN=1,1,2;MLLD=35.0196,12.3515,53.6715;QD=13.3473;RBI=0.0559905,0.151464,0.0558887;REFB=0.00324507,-0.0924172,-0.00876011;REVB=-0.0138462,0.0751933,-0.0316063;RO=19;SAF=2,10,9;SAR=1,2,0;SRF=10;SRR=9;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.156136,0.386567,0.763969;STB=0.98857,0.639095,0.998607;STBP=0.462,0.245,0.003;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.0878458,0.0794824,0.103133;OID=.,.,.;OPOS=64415081,64415081,64415080;OREF=G,G,AG;OALT=C,-,GA;OMAPALT=AC,A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:57:47:46:19:23:3,12,9:1,12,10:0.0217391,0.26087,0.217391:1,2,0:2,10,9:10:9:0,3,0:1,9,10:13:10
chr13	67800935	.	G	A	806.67	PASS	AF=0.910448;AO=59;DP=67;FAO=61;FDP=67;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0295379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.082;QD=48.1592;RBI=0.0307158;REFB=-0.057366;REVB=0.00842478;RO=5;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825127;STB=0.536851;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00149768;OID=.;OPOS=67800935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:67:67:5:6:59:61:0.910448:26:33:0:5:26:35:1:5
chr13	67802339	.	A	T	1559.19	PASS	AF=1;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176449;FXX=0.0095229;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.619;QD=59.9688;RBI=0.020567;REFB=0;REVB=0.010567;RO=0;SAF=58;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.52646e-05;OID=.;OPOS=67802339;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:104:0:0:104:104:1:46:58:0:0:46:58:0:0
chr13	70681598	.	T	C	469.03	PASS	AF=0.5;AO=46;DP=91;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0182246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.842;QD=20.3925;RBI=0.0618504;REFB=-0.015951;REVB=-0.0591044;RO=45;SAF=29;SAR=17;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701924;STB=0.545524;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.019078;OID=.;OPOS=70681598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:92:45:46:46:46:0.5:17:29:25:20:17:29:25:21
chr13	73280182	.	T	C	689.35	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.03473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.392;QD=62.6683;RBI=0.0480783;REFB=0;REVB=0.0332467;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186436;OID=.;OPOS=73280182;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:22:22:0:0:22:22:0:0
chr13	73301655	.	A	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=343.072;QD=60.6103;RBI=0.027003;REFB=0;REVB=0.0248903;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.53219e-05;OID=.;OPOS=73301655;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:14:24:0:0:14:24:0:0
chr13	73301728	.	T	A,C	128.25	PASS	AF=0.166667,0.833333;AO=2,10;DP=12;FAO=2,10;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2,6;FSAR=0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0577738,-0.030514;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=41.2565,82.449;QD=42.7486;RBI=0.0578302,0.0817648;REFB=0,0;REVB=-0.00255219,0.0758576;RO=0;SAF=2,6;SAR=0,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0262561,-0.00202048;OID=.,.;OPOS=73301728,73301728;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:12:12:0:0:2,10:2,10:0.166667,0.833333:0,4:2,6:0:0:0,4:2,6:0:0
chr13	73319171	.	T	C	542.23	PASS	AF=0.513761;AO=54;DP=106;FAO=56;FDP=109;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.00460596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.364;QD=19.8982;RBI=0.0248317;REFB=-0.0340394;REVB=-0.0244008;RO=52;SAF=20;SAR=34;SRF=28;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152861;STB=0.576052;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0255485;OID=.;OPOS=73319171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:109:52:53:54:56:0.513761:34:20:28:24:34:22:29:24
chr13	73329358	.	G	A	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.818;QD=60.9771;RBI=0.0111387;REFB=0;REVB=0.00444501;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17672e-05;OID=.;OPOS=73329358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
chr13	73343039	.	C	T	557.84	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.038315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.15;QD=60.3068;RBI=0.0443356;REFB=0;REVB=-0.022307;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125734;OID=.;OPOS=73343039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:14:22:0:0:14:23:0:0
chr13	73349359	.	G	C	785.21	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.326;QD=57.106;RBI=0.069782;REFB=0;REVB=0.026242;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000357584;OID=.;OPOS=73349359;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0
chr13	73369642	.	A	G	1186.83	PASS	AF=1;AO=76;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0528983;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5192;QD=60.0926;RBI=0.0661825;REFB=0;REVB=0.039773;RO=0;SAF=30;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0034681;OID=.;OPOS=73369642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:76:79:1:46:30:0:0:48:31:0:0
chr13	73650112	.	C	A	467.04	PASS	AF=1;AO=13;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.847;QD=56.6107;RBI=0.0234097;REFB=0;REVB=-0.0206661;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0010414;OID=.;OPOS=73650112;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:13:33:1:3:10:0:0:8:25:0:0
chr13	73650117	.	G	A	532.75	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.684;QD=59.1945;RBI=0.0425589;REFB=0;REVB=0.0238435;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.10367e-05;OID=.;OPOS=73650117;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:10:25:0:0:10:26:0:0
chr13	74863339	.	C	A	820.11	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0147804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.715;QD=55.6004;RBI=0.0168626;REFB=0.00453214;REVB=-0.00811701;RO=1;SAF=24;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192485;STB=0.510201;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-9.86753e-05;OID=.;OPOS=74863339;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:34:24:1:0:34:24:1:0
chr13	74988714	.	C	T	4533.07	PASS	AF=0.914454;AO=309;DP=338;FAO=310;FDP=339;FR=.;FRO=29;FSAF=187;FSAR=123;FSRF=4;FSRR=25;FWDB=0.0322763;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.42;QD=53.4876;RBI=0.0334629;REFB=-0.0739658;REVB=-0.00883228;RO=8;SAF=187;SAR=122;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115538;STB=0.540872;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00339169;OID=.;OPOS=74988714;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:338:339:8:29:309:310:0.914454:122:187:3:5:123:187:4:25
chr13	75814018	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0056768;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.58;QD=46.848;RBI=0.0476773;REFB=0;REVB=0.0473382;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000261409;OID=.;OPOS=75814018;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0
chr13	75814317	.	CA	C	37.5	PASS	AF=0.434783;AO=13;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.130867;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=9.03325;QD=6.52129;RBI=0.170226;REFB=-0.108719;REVB=0.108861;RO=10;SAF=10;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0.371429;SSEP=0;SSSB=0.3825;STB=0.641907;STBP=0.28;TYPE=del;VARB=0.105814;OID=.;OPOS=75814318;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.434783:13:23:10:23:13:7:3:6:7:37:10:10:3:3:7
chr13	75814349	.	A	T	202.02	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.00136727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.492;QD=21.2649;RBI=0.0175397;REFB=-0.0330299;REVB=0.0174863;RO=18;SAF=10;SAR=10;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467648;STB=0.52629;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0194271;OID=.;OPOS=75814349;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:10:10:8:10:10:10:8:10
chr13	75814384	.	C	T	221.88	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0370323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.415;QD=18.4896;RBI=0.0480923;REFB=-0.00104983;REVB=-0.0306836;RO=26;SAF=11;SAR=11;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0734584;STB=0.541629;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00092302;OID=.;OPOS=75814384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:11:11:15:11:11:11:15:11
chr13	75876389	.	G	A	390.66	PASS	AF=0.393162;AO=46;DP=117;FAO=46;FDP=117;FR=.;FRO=71;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=44;FSRR=27;FWDB=-0.0193591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.931;QD=13.356;RBI=0.0377617;REFB=-0.00300933;REVB=0.0324217;RO=71;SAF=31;SAR=15;SRF=44;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0641959;STB=0.536449;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00619192;OID=.;OPOS=75876389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:71:71:46:46:0.393162:15:31:44:27:15:31:44:27
chr13	75884216	.	C	T	929.03	PASS	AF=0.970149;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0484603;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.926;QD=55.4644;RBI=0.0521116;REFB=0.0742414;REVB=-0.0191632;RO=1;SAF=24;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011663;STB=0.503631;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=-0.000283894;OID=.;OPOS=75884216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:66:67:1:2:64:65:0.970149:40:24:0:1:40:25:1:1
chr13	75936519	.	C	G	397.19	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00282906;FXX=0.0344709;HRUN=4;LEN=1;MLLD=306.988;QD=56.7422;RBI=0.0114833;REFB=0;REVB=0.0111294;RO=0;SAF=20;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17423e-05;OID=.;OPOS=75936519;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:8:20:0:0:8:20:0:0
chr13	76055820	.	G	C	544.84	PASS	AF=0.55914;AO=51;DP=92;FAO=52;FDP=93;FR=.;FRO=41;FSAF=46;FSAR=6;FSRF=32;FSRR=9;FWDB=-0.0305435;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.4288;QD=23.434;RBI=0.0459867;REFB=-0.00575589;REVB=0.0343784;RO=41;SAF=45;SAR=6;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168733;STB=0.595813;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.00522418;OID=.;OPOS=76055820;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:41:41:51:52:0.55914:6:45:32:9:6:46:32:9
chr13	76124151	.	C	T	1327.75	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0635788;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6945;QD=61.0459;RBI=0.0723132;REFB=-0.0208247;REVB=-0.0344518;RO=0;SAF=35;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507041;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000406652;OID=.;OPOS=76124151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:88:87:0:1:86:86:0.988506:51:35:0:0:51:35:1:0
chr13	76378459	.	T	C	1620.87	PASS	AF=0.973451;AO=110;DP=114;FAO=110;FDP=113;FR=.;FRO=3;FSAF=78;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0336753;FXX=0.00877116;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.901;QD=57.3758;RBI=0.0378512;REFB=-0.153071;REVB=0.0172825;RO=1;SAF=78;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0146021;STB=0.501363;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.00095065;OID=.;OPOS=76378459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:114:113:1:3:110:110:0.973451:32:78:0:1:32:78:2:1
chr13	76709108	.	G	A	748.35	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.95;QD=63.6894;RBI=0.0574783;REFB=0;REVB=0.0472257;RO=0;SAF=35;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64128e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127658;OID=.;OPOS=76709108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:47:0:0:45:47:1:10:35:0:0:10:37:0:0
chr13	76709223	.	C	A	1516.95	PASS	AF=0.971963;AO=70;DP=109;FAO=104;FDP=107;FR=.;FRO=3;FSAF=68;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0193763;FXX=0.0183469;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9014;QD=56.7086;RBI=0.0501327;REFB=-0.0155637;REVB=0.0462369;RO=1;SAF=68;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00690421;STB=0.509864;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00288282;OID=.;OPOS=76709223;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:109:107:1:3:70:104:0.971963:2:68:1:0:36:68:1:2
chr13	77458008	.	C	G	160.47	PASS	AF=0.4;AO=17;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.0369315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3964;QD=14.2638;RBI=0.039106;REFB=-0.0119058;REVB=-0.0128587;RO=26;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0306575;STB=0.511099;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0285636;OID=.;OPOS=77458008;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:26:27:17:18:0.4:9:8:13:13:9:9:14:13
chr13	77570078	.	T	G	300.44	PASS	AF=0.4;AO=33;DP=84;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=-0.0139657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.006;QD=14.1383;RBI=0.0335105;REFB=-0.018507;REVB=0.0304617;RO=51;SAF=25;SAR=8;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121477;STB=0.55035;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0250505;OID=.;OPOS=77570078;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:51:51:33:34:0.4:8:25:34:17:9:25:34:17
chr13	77738664	.	A	G	490.22	PASS	AF=0.575;AO=46;DP=81;FAO=46;FDP=80;FR=.;FRO=34;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=0.0267938;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.811;QD=24.5111;RBI=0.0420242;REFB=0.000534786;REVB=0.0323748;RO=32;SAF=21;SAR=25;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922716;STB=0.506015;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.000355803;OID=.;OPOS=77738664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:32:34:46:46:0.575:25:21:15:17:25:21:16:18
chr13	77751892	.	C	T	329.84	PASS	AF=0.428571;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.00526081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.37;QD=15.7064;RBI=0.00966187;REFB=-0.0114208;REVB=-0.00810405;RO=47;SAF=21;SAR=15;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00914374;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0150969;OID=.;OPOS=77751892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:47:48:36:36:0.428571:15:21:27:20:15:21:28:20
chr13	78146301	.	C	T	1212.1	PASS	AF=1;AO=79;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0860738;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8092;QD=60.6049;RBI=0.102494;REFB=0;REVB=-0.0556439;RO=0;SAF=37;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228224;OID=.;OPOS=78146301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:80:80:0:0:79:80:1:42:37:0:0:42:38:0:0
chr13	78192207	.	T	C	65.3	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00670782;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.687;QD=10.8828;RBI=0.0278649;REFB=-0.00541105;REVB=0.0270455;RO=15;SAF=6;SAR=3;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145524;STB=0.588033;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0110043;OID=.;OPOS=78192207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:3:6:8:7:3:6:8:7
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chr13	78273060	.	T	TG	42.55	PASS	AF=0.205479;AO=12;DP=74;FAO=15;FDP=73;FR=.;FRO=58;FSAF=14;FSAR=1;FSRF=40;FSRR=18;FWDB=-0.0895222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.1474;QD=2.33151;RBI=0.145261;REFB=-0.00243095;REVB=0.114396;RO=60;SAF=11;SAR=1;SRF=43;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.397648;STB=0.830668;STBP=0.025;TYPE=ins;VARB=-0.00756103;OID=.;OPOS=78273061;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.205479:12:74:15:73:58:14:1:40:18:42:60:11:1:43:17
chr13	78338016	.	A	G	748.98	PASS	AF=0.948276;AO=55;DP=58;FAO=55;FDP=58;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0543475;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.625;QD=51.6535;RBI=0.0627472;REFB=-0.0746981;REVB=0.0313619;RO=1;SAF=21;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219159;STB=0.515485;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00260928;OID=.;OPOS=78338016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:58:58:1:3:55:55:0.948276:34:21:1:0:34:21:2:1
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chr13	78477674	.	A	G	837.12	PASS	AF=1;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562196;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.821;QD=57.7321;RBI=0.0579168;REFB=0;REVB=-0.0139179;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.2292e-05;OID=.;OPOS=78477674;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:58:0:0:58:58:1:35:23:0:0:35:23:0:0
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chr13	80910786	.	C	A	488.23	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00316384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3122;QD=55.7976;RBI=0.0704692;REFB=0.0805156;REVB=-0.0703982;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513506;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.00464384;OID=.;OPOS=80910786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:0:1:34:34:0.971429:16:18:0:0:16:18:1:0
chr13	80910792	.	T	G	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.00298543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.705;QD=11.1977;RBI=0.00720976;REFB=-0.00403369;REVB=0.00656261;RO=22;SAF=7;SAR=5;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418302;STB=0.524958;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.00487273;OID=.;OPOS=80910792;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:5:7:12:10:5:7:12:10
chr13	80910851	.	A	C	141.34	PASS	AF=0.576923;AO=14;DP=25;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.00828789;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.42;QD=21.7444;RBI=0.011117;REFB=-0.00921776;REVB=0.00740937;RO=11;SAF=12;SAR=2;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173528;STB=0.545391;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.00665501;OID=.;OPOS=80910851;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:25:26:11:11:14:15:0.576923:2:12:8:3:3:12:8:3
chr13	80911525	.	G	A	493.41	PASS	AF=0.597403;AO=46;DP=77;FAO=46;FDP=77;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.006493;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=245.817;QD=25.6319;RBI=0.00712119;REFB=-0.03846;REVB=-0.00292443;RO=31;SAF=21;SAR=25;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0202478;STB=0.511068;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0252876;OID=.;OPOS=80911525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:31:31:46:46:0.597403:25:21:15:16:25:21:15:16
chr13	86367009	.	C	A	867.12	PASS	AF=1;AO=52;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.713;QD=57.808;RBI=0.0240647;REFB=0;REVB=0.0162658;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226532;OID=.;OPOS=86367009;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:52:60:1:27:25:0:0:30:30:0:0
chr13	86367973	.	CTTTTTC	CTTTTC,CTTTTCT	220.1	PASS	AF=1,0;AO=12,3;DP=18;FAO=20,0;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188741,-0.146604;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=18.2016,3.47205;QD=44.0203;RBI=0.0700146,0.205667;REFB=0,0;REVB=-0.0674227,-0.144244;RO=0;SAF=7,3;SAR=5,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.00515901,0;OID=.,.;OPOS=86367974,86367978;OREF=T,TC;OALT=-,CT;OMAPALT=CTTTTC,CTTTTCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:12,3:18:20,0:20:0:14,0:6,0:0:0:4:0:7,3:5,0:0:0
chr13	86369120	.	C	T	402.48	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00365034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.204;QD=55.5148;RBI=0.00605095;REFB=0;REVB=0.00482587;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360538;OID=.;OPOS=86369120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:29:0:0:27:29:1:12:15:0:0:12:17:0:0
chr13	88330318	.	A	AC,C	36.55	PASS	AF=0.166667,0;AO=7,2;DP=50;FAO=8,0;FDP=48;FR=.;FRO=40;FSAF=7,0;FSAR=1,0;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0243631,-0.0129508;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=22.9032,40.3892;QD=3.04587;RBI=0.0244711,0.016135;REFB=-0.0301066,-0.0146182;REVB=0.00229655,0.00962375;RO=40;SAF=6,2;SAR=1,0;SRF=21;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.433819,0.403343;STB=0.843892,0.5;STBP=0.048,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.096146,0;OID=.,.;OPOS=88330319,88330318;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:50:48:40:40:7,2:8,0:0.166667,0:1,0:6,2:21:19:1,0:7,0:20:20
chr13	88331241	.	T	TTGTA	172.5	PASS	AF=0.772727;AO=16;DP=22;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0188812;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=300.327;QD=31.3628;RBI=0.0193371;REFB=-0.0488909;REVB=-0.00417416;RO=5;SAF=8;SAR=8;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0430179;STB=0.529377;STBP=0.64;TYPE=ins;VARB=0.00723959;OID=.;OPOS=88331242;OREF=-;OALT=TGTA;OMAPALT=TTGTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.772727:16:22:17:22:5:8:9:3:2:28:5:8:8:3:2
chr13	91434105	.	G	C	152.9	PASS	AF=0.352941;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=51;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.0301577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.193;QD=11.9918;RBI=0.032184;REFB=-0.0154041;REVB=-0.0112393;RO=33;SAF=10;SAR=8;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569272;STB=0.533297;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0320319;OID=.;OPOS=91434105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:33:33:18:18:0.352941:8:10:20:13:8:10:20:13
chr13	92345579	.	C	T	322.83	PASS	AF=0.363636;AO=40;DP=110;FAO=40;FDP=110;FR=.;FRO=70;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=43;FSRR=27;FWDB=-0.0344264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.722;QD=11.7391;RBI=0.0871972;REFB=-0.0130285;REVB=-0.0801136;RO=69;SAF=23;SAR=17;SRF=42;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384352;STB=0.52576;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0224681;OID=.;OPOS=92345579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:69:70:40:40:0.363636:17:23:42:27:17:23:43:27
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chr13	95672950	.	A	G	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000214833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.984;QD=63.8713;RBI=0.015007;REFB=0;REVB=0.0150055;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.60471e-05;OID=.;OPOS=95672950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:27:21:0:0:27:21:0:0
chr13	95673135	.	C	T	695.06	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0301205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7785;QD=60.4397;RBI=0.0506235;REFB=0.0546392;REVB=-0.0406878;RO=1;SAF=26;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177343;STB=0.50943;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.0139612;OID=.;OPOS=95673135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:19:26:1:0:19:26:1:0
chr13	95673938	.	TA	T,TG	1646.47	PASS	AF=0.168142,0.831858;AO=20,91;DP=113;FAO=19,94;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=12,52;FSAR=7,42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151285,0.0242584;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=100.796,119.831;QD=58.2821;RBI=0.0290207,0.0371998;REFB=0,0;REVB=0.0247655,0.028202;RO=0;SAF=14,49;SAR=6,42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.5931e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0018565,0.00117378;OID=.,.;OPOS=95673939,95673939;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.168142,0.831858:20,91:113:19,94:113:0:12,52:7,42:0:0:93:0:14,49:6,42:0:0
chr13	95858978	.	T	C	273.69	PASS	AF=0.705882;AO=21;DP=34;FAO=24;FDP=34;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=-0.0263094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.854;QD=32.1982;RBI=0.0319244;REFB=0.00108785;REVB=0.0180826;RO=8;SAF=5;SAR=16;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291901;STB=0.65708;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00040025;OID=.;OPOS=95858978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:8:10:21:24:0.705882:16:5:6:2:17:7:8:2
chr13	95858996	.	T	C	145.83	PASS	AF=0.652174;AO=15;DP=23;FAO=15;FDP=23;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0110086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.783;QD=25.3616;RBI=0.0186707;REFB=-0.0383956;REVB=-0.01508;RO=8;SAF=5;SAR=10;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262065;STB=0.64686;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0137763;OID=.;OPOS=95858996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:23:23:8:8:15:15:0.652174:10:5:6:2:10:5:6:2
chr13	95861804	.	A	G	423.69	PASS	AF=0.462366;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0396994;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.782;QD=18.2233;RBI=0.0397076;REFB=-0.0246371;REVB=0.000808951;RO=49;SAF=25;SAR=18;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145857;STB=0.576117;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0222499;OID=.;OPOS=95861804;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:49:50:43:43:0.462366:18:25:21:28:18:25:22:28
chr13	96506664	.	A	G	475.26	PASS	AF=0.483146;AO=36;DP=91;FAO=43;FDP=89;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=0.0336975;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.422;QD=21.3599;RBI=0.0337271;REFB=-0.0239427;REVB=-0.00141293;RO=40;SAF=15;SAR=21;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217204;STB=0.598654;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0225391;OID=.;OPOS=96506664;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:89:40:42:36:43:0.483146:21:15:26:14:23:20:28:14
chr13	96540141	.	T	C	3733.92	PASS	AF=0.98008;AO=242;DP=248;FAO=246;FDP=251;FR=.;FRO=5;FSAF=112;FSAR=134;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0215899;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.7139;QD=59.5046;RBI=0.0489916;REFB=-0.0436082;REVB=0.0439779;RO=5;SAF=111;SAR=131;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00548498;STB=0.502904;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.00198563;OID=.;OPOS=96540141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:248:251:5:5:242:246:0.98008:131:111:3:2:134:112:3:2
chr13	96540143	.	T	C	3861.19	PASS	AF=1;AO=247;DP=248;FAO=250;FDP=250;FR=.;FRO=0;FSAF=114;FSAR=136;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167361;FXX=0.00398391;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.7;QD=61.7791;RBI=0.0735106;REFB=0;REVB=0.0715801;RO=1;SAF=114;SAR=133;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00357054;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.04389e-05;OID=.;OPOS=96540143;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:19:248:250:1:0:247:250:1:133:114:0:1:136:114:0:0
chr13	96540204	.	T	G	1221.33	PASS	AF=0.419255;AO=133;DP=322;FAO=135;FDP=322;FR=.;FRO=187;FSAF=51;FSAR=84;FSRF=89;FSRR=98;FWDB=0.00472509;FXX=0.00617265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.928;QD=15.1718;RBI=0.0210763;REFB=-0.0185428;REVB=0.0205398;RO=186;SAF=50;SAR=83;SRF=89;SRR=97;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110591;STB=0.558873;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0276337;OID=.;OPOS=96540204;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:322:322:186:187:133:135:0.419255:83:50:89:97:84:51:89:98
chr13	96638636	.	A	C	1402.32	PASS	AF=0.934579;AO=100;DP=107;FAO=100;FDP=107;FR=.;FRO=7;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0201573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.339;QD=52.4232;RBI=0.0244233;REFB=-0.0887993;REVB=0.0137907;RO=6;SAF=54;SAR=46;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222482;STB=0.507327;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.000758351;OID=.;OPOS=96638636;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:107:107:6:7:100:100:0.934579:46:54:2:4:46:54:3:4
chr13	96821982	.	G	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00231559;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.701;QD=57.1775;RBI=0.0194196;REFB=0;REVB=0.0192811;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.6917e-05;OID=.;OPOS=96821982;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0
chr13	97484830	.	A	G	612.23	PASS	AF=0.473684;AO=63;DP=133;FAO=63;FDP=133;FR=.;FRO=70;FSAF=41;FSAR=22;FSRF=32;FSRR=38;FWDB=-0.00268227;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=312.133;QD=18.4129;RBI=0.00600536;REFB=-0.0121584;REVB=-0.00537307;RO=69;SAF=41;SAR=22;SRF=32;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18189;STB=0.604983;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0137855;OID=.;OPOS=97484830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:69:70:63:63:0.473684:22:41:32:37:22:41:32:38
chr13	97489434	.	T	A	271.63	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.000611059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.104;QD=14.6826;RBI=0.033357;REFB=-0.0324141;REVB=0.0333514;RO=43;SAF=17;SAR=14;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139396;STB=0.507903;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.0368159;OID=.;OPOS=97489434;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:14:17:23:20:14:17:23:20
chr13	97489457	.	G	A	827.18	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00314667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.778;QD=57.0472;RBI=0.00744522;REFB=0;REVB=-0.00674757;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.99567e-05;OID=.;OPOS=97489457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:23:34:0:0:23:35:0:0
chr13	97639414	.	C	T	407.85	PASS	AF=0.571429;AO=40;DP=70;FAO=40;FDP=70;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.00333514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.997;QD=23.3057;RBI=0.00334696;REFB=-0.00460476;REVB=0.000281023;RO=30;SAF=18;SAR=22;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116622;STB=0.564071;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.00314149;OID=.;OPOS=97639414;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:30:30:40:40:0.571429:22:18:18:12:22:18:18:12
chr13	97639879	.	GA	G	637.26	PASS	AF=0.461538;AO=63;DP=142;FAO=66;FDP=143;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=36;FWDB=0.00514057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.833;QD=17.8253;RBI=0.0133678;REFB=-0.024057;REVB=0.0123399;RO=75;SAF=34;SAR=29;SRF=42;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0200164;STB=0.50117;STBP=0.983;TYPE=del;VARB=0.0296717;OID=.;OPOS=97639880;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.461538:63:142:66:143:77:35:31:41:36:99:75:34:29:42:33
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chr13	98645253	.	A	G	245.25	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.032314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.537;QD=15.8224;RBI=0.0361055;REFB=-0.0206703;REVB=0.0161064;RO=34;SAF=18;SAR=10;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199214;STB=0.612594;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.031423;OID=.;OPOS=98645253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:10:18:15:19:10:18:15:19
chr13	98829176	.	T	C	488.98	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444539;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.317;QD=59.2704;RBI=0.044467;REFB=0;REVB=0.00108044;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110712;OID=.;OPOS=98829176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:19:14:0:0:19:14:0:0
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chr13	99100547	.	T	C	460.18	PASS	AF=0.464646;AO=46;DP=99;FAO=46;FDP=99;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.00555356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.189;QD=18.593;RBI=0.0133268;REFB=0.000917358;REVB=-0.0121146;RO=52;SAF=21;SAR=25;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0961873;STB=0.548465;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=-0.00131768;OID=.;OPOS=99100547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:52:53:46:46:0.464646:25:21:29:23:25:21:29:24
chr13	99112680	.	C	T	339.3	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00951852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.1248;QD=54.2875;RBI=0.0475076;REFB=0;REVB=0.0465443;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000832461;OID=.;OPOS=99112680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:7:17:0:0:7:18:0:0
chr13	99324524	.	T	C	374.17	PASS	AF=0.688889;AO=30;DP=45;FAO=31;FDP=45;FR=.;FRO=14;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0373314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6021;QD=33.2597;RBI=0.0974967;REFB=-0.0528254;REVB=0.0900665;RO=14;SAF=17;SAR=13;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392732;STB=0.515142;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=0.0235618;OID=.;OPOS=99324524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:14:14:30:31:0.688889:13:17:7:7:14:17:7:7
chr13	99376181	.	C	T	266.59	PASS	AF=0.447761;AO=25;DP=63;FAO=30;FDP=67;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00930157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.458;QD=15.916;RBI=0.0173749;REFB=0.000757253;REVB=0.0146754;RO=37;SAF=18;SAR=7;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233768;STB=0.548748;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-0.000658176;OID=.;OPOS=99376181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:67:37:37:25:30:0.447761:7:18:19:18:12:18:19:18
chr13	99447005	.	T	C	1664.0	PASS	AF=0.991071;AO=111;DP=113;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0468068;FXX=0.00884877;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8471;QD=59.4286;RBI=0.0477896;REFB=-0.0847047;REVB=0.00964186;RO=0;SAF=58;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504672;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.000300636;OID=.;OPOS=99447005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:113:112:0:1:111:111:0.991071:53:58:0:0:53:58:0:1
chr13	99448441	.	T	A	428.98	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00333435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.988;QD=57.1968;RBI=0.0147643;REFB=0;REVB=-0.0143828;RO=0;SAF=21;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.68093e-05;OID=.;OPOS=99448441;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:9:21:0:0:9:21:0:0
chr13	99457431	.	T	G	711.07	PASS	AF=0.44;AO=75;DP=173;FAO=77;FDP=175;FR=.;FRO=98;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=59;FSRR=39;FWDB=0.0232903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.301;QD=16.253;RBI=0.0245357;REFB=-0.00588387;REVB=0.00771756;RO=98;SAF=44;SAR=31;SRF=59;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161506;STB=0.510192;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.00743975;OID=.;OPOS=99457431;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:175:98:98:75:77:0.44:31:44:59:39:32:45:59:39
chr13	99853443	.	T	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2463;QD=33.4285;RBI=0.0837387;REFB=0;REVB=-0.0837387;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00775107;OID=.;OPOS=99853443;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0
chr13	99907214	.	T	C	589.82	PASS	AF=0.541284;AO=59;DP=109;FAO=59;FDP=109;FR=.;FRO=50;FSAF=29;FSAR=30;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=0.0184494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.693;QD=21.6447;RBI=0.0199734;REFB=-0.00707079;REVB=0.00765235;RO=49;SAF=29;SAR=30;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0997904;STB=0.558813;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00496564;OID=.;OPOS=99907214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:49:50:59:59:0.541284:30:29:30:19:30:29:31:19
chr13	100004108	.	G	A	96.16	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.040478;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.557;QD=34.9662;RBI=0.0413943;REFB=-0.219762;REVB=-0.00866148;RO=1;SAF=7;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596689;STB=0.533268;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0125135;OID=.;OPOS=100004108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:11:11:1:1:10:10:0.909091:3:7:1:0:3:7:1:0
chr13	100188585	.	A	T	105.87	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.00297102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.036;QD=21.1739;RBI=0.0117477;REFB=-0.0243021;REVB=0.0113658;RO=7;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00793731;STB=0.517213;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.0125436;OID=.;OPOS=100188585;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:20:7:8:12:12:0.6:7:5:3:4:7:5:3:5
chr13	100436131	.	CAT	C	1282.53	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343061;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=2;MLLD=170.383;QD=61.0731;RBI=0.0369027;REFB=0;REVB=0.0135978;RO=0;SAF=54;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.01268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000399478;OID=.;OPOS=100436132;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:78:79:84:84:0:57:27:0:0:7:0:54:24:0:0
chr13	100518580	.	A	G	1464.49	PASS	AF=0.989691;AO=94;DP=98;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0389841;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0977;QD=60.3912;RBI=0.0427449;REFB=-0.17156;REVB=-0.0175319;RO=0;SAF=56;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504273;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00115651;OID=.;OPOS=100518580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:98:97:0:1:94:96:0.989691:38:56:0:0:38:58:1:0
chr13	100537232	.	T	C	936.74	PASS	AF=0.956522;AO=66;DP=69;FAO=66;FDP=69;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0274029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.036;QD=54.3037;RBI=0.0311292;REFB=-0.0495923;REVB=0.0147685;RO=3;SAF=40;SAR=26;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00521385;STB=0.502762;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0019183;OID=.;OPOS=100537232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:69:69:3:3:66:66:0.956522:26:40:2:1:26:40:2:1
chr13	100945533	.	G	A	1339.73	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0328129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.205;QD=62.3132;RBI=0.0378484;REFB=0;REVB=-0.0188631;RO=0;SAF=33;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98109e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.14588e-05;OID=.;OPOS=100945533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:53:33:0:0:53:33:0:0
chr13	101184775	.	G	T	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0154372;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.722;QD=11.9536;RBI=0.0154984;REFB=-0.0299258;REVB=-0.00137571;RO=11;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132829;STB=0.580431;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.041359;OID=.;OPOS=101184775;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:6:2:4:7:6:2:4:7
chr13	101287365	.	T	C	740.2	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.476;QD=56.9386;RBI=0.0324557;REFB=0;REVB=-0.00704504;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106664;OID=.;OPOS=101287365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:33:18:0:0:33:19:0:0
chr13	101287404	.	G	A	739.08	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000456506;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=241.447;QD=54.7467;RBI=0.0212226;REFB=-0.0636778;REVB=0.0212177;RO=1;SAF=20;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140652;STB=0.50746;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=1.79262e-05;OID=.;OPOS=101287404;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:33:20:0:1:33:20:0:1
chr13	101289969	.	C	T	1399.97	PASS	AF=0.98913;AO=88;DP=90;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00719321;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.388;QD=60.8682;RBI=0.0323668;REFB=-0.102315;REVB=0.0315574;RO=1;SAF=33;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00853897;STB=0.504273;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.000500171;OID=.;OPOS=101289969;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:90:92:1:1:88:91:0.98913:55:33:0:1:58:33:0:1
chr13	101720300	.	T	G	358.88	PASS	AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0110556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.181;QD=19.938;RBI=0.0112444;REFB=-0.0201456;REVB=-0.00205198;RO=35;SAF=23;SAR=14;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0971345;STB=0.553972;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0196613;OID=.;OPOS=101720300;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:35:35:37:37:0.513889:14:23:18:17:14:23:18:17
chr13	101736075	.	A	G	333.07	PASS	AF=0.530303;AO=33;DP=63;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0150665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3125;QD=20.1861;RBI=0.151726;REFB=-0.00418447;REVB=-0.150976;RO=30;SAF=23;SAR=10;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211114;STB=0.633723;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00452136;OID=.;OPOS=101736075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:66:30:31:33:35:0.530303:10:23:14:16:10:25:14:17
chr13	102366825	.	A	G	293.42	PASS	AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=30;FSAR=3;FSRF=39;FSRR=7;FWDB=-0.0161998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5236;QD=14.8569;RBI=0.029198;REFB=-0.00948667;REVB=-0.0242918;RO=46;SAF=30;SAR=3;SRF=39;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15929;STB=0.591653;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0185159;OID=.;OPOS=102366825;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:3:30:39:7:3:30:39:7
chr13	102431351	.	G	C	982.6	PASS	AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0087529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.248;QD=56.1484;RBI=0.00895588;REFB=-0.115525;REVB=0.00189595;RO=1;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160186;STB=0.502145;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.000177001;OID=.;OPOS=102431351;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:70:70:1:2:68:68:0.971429:29:39:0:1:29:39:1:1
chr13	103275386	.	T	C	230.07	PASS	AF=0.358974;AO=28;DP=78;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0122611;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2275;QD=11.7986;RBI=0.0286437;REFB=-0.00134264;REVB=0.0258868;RO=50;SAF=15;SAR=13;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00478179;STB=0.50276;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.00497487;OID=.;OPOS=103275386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:50:50:28:28:0.358974:13:15:27:23:13:15:27:23
chr13	103339365	.	A	G	258.47	PASS	AF=0.533333;AO=24;DP=46;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00637624;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.445;QD=22.9752;RBI=0.00805028;REFB=-0.0110758;REVB=0.00491431;RO=21;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019872;STB=0.511102;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0101561;OID=.;OPOS=103339365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:21:21:24:24:0.533333:12:12:10:11:12:12:10:11
chr13	103346805	.	C	CG	306.07	PASS	AF=1;AO=3;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0526683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.588;QD=43.7241;RBI=0.0884577;REFB=0;REVB=-0.0710691;RO=26;SAF=1;SAR=2;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0150457;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000252938;OID=.;OPOS=103346806;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:3:29:28:28:0:9:19:0:0:6:26:1:2:9:17
chr13	103346806	.	C	G	317.29	PASS	AF=0.892857;AO=25;DP=28;FAO=25;FDP=28;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0205741;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=269.607;QD=45.3267;RBI=0.0290403;REFB=-0.107145;REVB=0.0204951;RO=3;SAF=8;SAR=17;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00303005;STB=0.501638;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.000889935;OID=.;OPOS=103346806;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:28:28:3:3:25:25:0.892857:17:8:1:2:17:8:1:2
chr13	103384824	.	GT	AT,TA	663.36	PASS	AF=0.934783,0.0434783;AO=40,2;DP=44;FAO=43,2;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=23,0;FSAR=20,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0218837,0.0201424;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=137.635,151.678;QD=57.6836;RBI=0.0226487,0.0209397;REFB=-0.15943,-0.0244895;REVB=0.00583644,0.00572299;RO=1;SAF=21,0;SAR=19,2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0240441,0;STB=0.512189,0.5;STBP=0.322,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00108347,0.100397;OID=.,.;OPOS=103384824,103384824;OREF=G,GT;OALT=A,TA;OMAPALT=AT,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:44:46:1:1:40,2:43,2:0.934783,0.0434783:19,2:21,0:0:1:20,2:23,0:0:1
chr13	103385014	.	TA	T,TG	989.55	PASS	AF=0.0294118,0.970588;AO=9,58;DP=68;FAO=2,66;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=2,20;FSAR=0,46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176347,0.0212637;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=174.328,195.824;QD=58.2087;RBI=0.0345779,0.0502945;REFB=0,0;REVB=0.0297431,0.0455784;RO=0;SAF=2,19;SAR=7,39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.47594e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0454027,0.000200356;OID=.,.;OPOS=103385015,103385015;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0294118,0.970588:9,58:68:2,66:68:0:2,20:0,46:0:0:5:0:2,19:7,39:0:0
chr13	103385299	.	A	C	689.86	PASS	AF=0.928571;AO=51;DP=57;FAO=52;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00971824;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.389;QD=49.2759;RBI=0.0104683;REFB=-0.141276;REVB=0.00389124;RO=2;SAF=26;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000696368;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00125776;OID=.;OPOS=103385299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:57:56:2:2:51:52:0.928571:25:26:1:1:26:26:1:1
chr13	103385798	.	T	C	500.89	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.037922;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.7618;QD=58.9284;RBI=0.0388659;REFB=0;REVB=0.0085137;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255596;OID=.;OPOS=103385798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:22:12:0:0:22:12:0:0
chr13	103386116	.	C	G	382.58	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0166956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.579;QD=52.7696;RBI=0.0298196;REFB=-0.076733;REVB=0.0247076;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513504;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00372224;OID=.;OPOS=103386116;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:0:1:28:28:0.965517:10:18:0:0:10:18:1:0
chr13	103386283	.	A	G	2492.96	PASS	AF=1;AO=162;DP=162;FAO=162;FDP=162;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00437611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.126;QD=61.5547;RBI=0.00643306;REFB=0;REVB=0.00471529;RO=0;SAF=82;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.8841e-07;OID=.;OPOS=103386283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:162:162:0:0:162:162:1:80:82:0:0:80:82:0:0
chr13	103388220	.	A	G	747.6	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.026;QD=56.4229;RBI=0.0418843;REFB=0;REVB=0.031739;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011108;OID=.;OPOS=103388220;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:53:0:0:50:53:1:23:27:0:0:25:28:0:0
chr13	103388370	.	C	T	154.3	PASS	AF=0.308824;AO=21;DP=68;FAO=21;FDP=68;FR=.;FRO=47;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.00798631;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.646;QD=9.07661;RBI=0.037304;REFB=-0.0190197;REVB=0.0364391;RO=47;SAF=7;SAR=14;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139942;STB=0.583252;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0321765;OID=.;OPOS=103388370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:47:47:21:21:0.308824:14:7:21:26:14:7:21:26
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chr13	103394003	.	G	A	69.62	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0117361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.113;QD=16.3811;RBI=0.0313371;REFB=-0.0334634;REVB=0.0290565;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274707;STB=0.657229;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0236038;OID=.;OPOS=103394003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:7:1:4:5:7:1
chr13	103394716	.	T	C	452.28	PASS	AF=0.611111;AO=43;DP=72;FAO=44;FDP=72;FR=.;FRO=28;FSAF=33;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=0.00888656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.896;QD=25.1267;RBI=0.0456561;REFB=-0.0208292;REVB=0.0447829;RO=28;SAF=33;SAR=10;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186761;STB=0.51886;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0177243;OID=.;OPOS=103394716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:28:28:43:44:0.611111:10:33:22:6:11:33:22:6
chr13	103395819	.	C	T	1229.75	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00995647;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.876;QD=59.9878;RBI=0.0104872;REFB=-0.101534;REVB=-0.003294;RO=1;SAF=42;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111412;STB=0.505881;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.000301658;OID=.;OPOS=103395819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:82:1:1:81:81:0.987805:39:42:1:0:39:42:1:0
chr13	103396716	.	C	G	301.79	PASS	AF=0.5625;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0485164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.02;QD=25.1491;RBI=0.0570171;REFB=0.00073516;REVB=0.0299519;RO=21;SAF=16;SAR=11;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20294;STB=0.612475;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=-0.00110867;OID=.;OPOS=103396716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:21:27:27:0.5625:11:16:7:14:11:16:7:14
chr13	103397583	.	C	G	389.86	PASS	AF=0.487805;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=82;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0242305;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0992;QD=19.0176;RBI=0.0283941;REFB=-0.00644691;REVB=0.0148023;RO=42;SAF=25;SAR=15;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0742625;STB=0.54138;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.00715731;OID=.;OPOS=103397583;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:42:42:40:40:0.487805:15:25:23:19:15:25:23:19
chr13	103397937	.	T	G	234.37	PASS	AF=0.578947;AO=21;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=0.00387363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.162;QD=24.6708;RBI=0.0106411;REFB=-0.00568209;REVB=0.00991099;RO=16;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285607;STB=0.659562;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00491907;OID=.;OPOS=103397937;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:21:22:0.578947:8:13:15:1:9:13:15:1
chr13	103400083	.	G	A	183.53	PASS	AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=11;FSRR=28;FWDB=0.0389883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.306;QD=11.8405;RBI=0.0472361;REFB=-0.0113754;REVB=-0.0266677;RO=39;SAF=7;SAR=16;SRF=11;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.029048;STB=0.516764;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0256707;OID=.;OPOS=103400083;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:39:39:23:23:0.370968:16:7:11:28:16:7:11:28
chr13	103400729	.	G	A	130.63	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0425427;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=155.658;QD=22.7182;RBI=0.0452247;REFB=-0.00686203;REVB=0.0153424;RO=9;SAF=9;SAR=5;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357377;STB=0.700327;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0147443;OID=.;OPOS=103400729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:5:9:1:8:5:9:1:8
chr13	103402522	.	C	T	403.22	PASS	AF=0.6;AO=39;DP=65;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.022622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.408;QD=24.8133;RBI=0.0227272;REFB=-0.0379042;REVB=-0.00218388;RO=26;SAF=20;SAR=19;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374068;STB=0.520494;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0251193;OID=.;OPOS=103402522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:26:26:39:39:0.6:19:20:12:14:19:20:12:14
chr13	103410782	.	T	C	158.2	PASS	AF=0.566667;AO=16;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.019344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8216;QD=21.0931;RBI=0.0525661;REFB=0.00497382;REVB=0.0488774;RO=13;SAF=4;SAR=12;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1969;STB=0.618896;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=-0.0044125;OID=.;OPOS=103410782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:16:17:0.566667:12:4:6:7:13:4:6:7
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chr13	103528337	.	G	A	756.79	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0196407;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.707;QD=61.7788;RBI=0.0197454;REFB=-0.0653898;REVB=0.00203042;RO=1;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019199;STB=0.5102;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00493764;OID=.;OPOS=103528337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:49:1:1:48:48:0.979592:24:24:0:1:24:24:0:1
chr13	106119446	.	G	A	568.85	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0478266;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.3652;QD=59.8785;RBI=0.0506125;REFB=0;REVB=-0.0165602;RO=0;SAF=25;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000967117;OID=.;OPOS=106119446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:11:25:0:0:12:26:0:0
chr13	107144320	.	G	A	263.49	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00226483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.593;QD=19.5179;RBI=0.0201602;REFB=-0.00483027;REVB=-0.0200325;RO=26;SAF=13;SAR=15;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0308883;STB=0.517229;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.00518831;OID=.;OPOS=107144320;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:15:13:13:13:15:13:13:13
chr13	107145463	.	G	C	2351.56	PASS	AF=1;AO=142;DP=142;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=91;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.206;QD=63.9881;RBI=0.0360879;REFB=0;REVB=0.00339093;RO=0;SAF=87;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40284e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71343e-05;OID=.;OPOS=107145463;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:147:0:0:142:147:1:55:87:0:0:56:91:0:0
chr13	107821309	.	ATTTTTTTTTT	ATTTTTTTTT,ATTTTTTTTTA	238.86	PASS	AF=0.861538,0.138462;AO=26,8;DP=61;FAO=56,9;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34,5;FSAR=22,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.158535,0.082279;FXX=0;HRUN=10,10;LEN=1,1;MLLD=4.926,10.3889;QD=14.6992;RBI=0.35196,0.209425;REFB=0.238178,0.139749;REVB=-0.314233,-0.192585;RO=11;SAF=19,5;SAR=7,3;SRF=9;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0624001,-0.215402;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00188513,0.00206333;OID=.,.;OPOS=107821310,107821319;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=ATTTTTTTTT,ATTTTTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.861538,0.138462:26,8:61:56,9:65:0:34,5:22,4:0:0:29:11:19,5:7,3:9:2
chr13	108863591	.	G	A	239.94	PASS	AF=0.430769;AO=27;DP=65;FAO=28;FDP=65;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=-0.0138883;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.825;QD=14.7656;RBI=0.0166987;REFB=-0.0104331;REVB=-0.00927164;RO=36;SAF=15;SAR=12;SRF=9;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302456;STB=0.663324;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0236111;OID=.;OPOS=108863591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:36:37:27:28:0.430769:12:15:9:27:13:15:9:28
chr13	108885972	.	G	T	50.05	PASS	AF=0.186047;AO=8;DP=43;FAO=8;FDP=43;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00756856;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.543;QD=4.65589;RBI=0.0316021;REFB=-0.00805362;REVB=-0.0306824;RO=35;SAF=4;SAR=4;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0173131;STB=0.511599;STBP=0.938;TYPE=snp;VARB=0.0484338;OID=.;OPOS=108885972;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:43:43:35:35:8:8:0.186047:4:4:18:17:4:4:18:17
chr13	109518578	.	T	C	416.86	PASS	AF=0.443299;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.00656056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.47;QD=17.1899;RBI=0.0157681;REFB=-0.0191123;REVB=0.0143384;RO=54;SAF=20;SAR=23;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713627;STB=0.539991;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0224971;OID=.;OPOS=109518578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:54:54:43:43:0.443299:23:20:29:25:23:20:29:25
chr13	109661359	.	C	G	575.78	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.238;QD=60.608;RBI=0.0218375;REFB=0;REVB=0.0191147;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131906;OID=.;OPOS=109661359;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
chr13	109717928	.	A	G	108.64	PASS	AF=0.916667;AO=9;DP=10;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0467692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.566;QD=36.2117;RBI=0.0539114;REFB=0.0863369;REVB=0.0268157;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555452;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.00116607;OID=.;OPOS=109717928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:12:0:1:9:11:0.916667:3:6:0:0:4:7:0:1
chr13	109779906	.	C	T	240.98	PASS	AF=0.4;AO=27;DP=69;FAO=28;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=10;FWDB=0.112487;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=43.7452;QD=13.7702;RBI=0.169088;REFB=-0.0270856;REVB=-0.126243;RO=32;SAF=13;SAR=14;SRF=29;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.410829;STB=0.669941;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0346113;OID=.;OPOS=109779906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:32:41:27:28:0.4:14:13:29:3:15:13:31:10
chr13	109793474	.	T	C	391.66	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2597;QD=55.9515;RBI=0.154063;REFB=0;REVB=-0.112311;RO=0;SAF=24;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00455752;OID=.;OPOS=109793474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:4:24:0:0:4:24:0:0
chr13	109793720	.	A	C	2125.13	PASS	AF=0.985294;AO=122;DP=129;FAO=134;FDP=136;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=59;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0635164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.571;QD=62.5039;RBI=0.0720576;REFB=0;REVB=0.0340288;RO=0;SAF=50;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.83711e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102392;OID=.;OPOS=109793720;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:129:136:0:0:122:134:0.985294:72:50:0:0:75:59:0:0
chr13	110407083	.	A	AT	65.39	PASS	AF=0.328125;AO=13;DP=65;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=0.0157707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=13.6841;QD=4.08709;RBI=0.0158596;REFB=-0.0390895;REVB=-0.0016767;RO=50;SAF=3;SAR=10;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.448392;STB=0.601674;STBP=0.256;TYPE=ins;VARB=0.0524433;OID=.;OPOS=110407084;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.328125:13:65:21:64:43:9:12:25:18:65:50:3:10:30:20
chr13	110408608	.	C	T	340.77	PASS	AF=0.425287;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0324873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.771;QD=15.6674;RBI=0.0446763;REFB=-0.0206843;REVB=-0.0306683;RO=49;SAF=13;SAR=24;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165884;STB=0.599945;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.016527;OID=.;OPOS=110408608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:49:50:37:37:0.425287:24:13:25:24:24:13:26:24
chr13	110435953	.	A	G	121.57	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.0397209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.664;QD=15.1965;RBI=0.0639071;REFB=-0.00259833;REVB=-0.0500636;RO=18;SAF=8;SAR=6;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214209;STB=0.622482;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00748754;OID=.;OPOS=110435953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:6:8:14:4:6:8:14:4
chr13	110436232	.	G	A	175.13	PASS	AF=0.514286;AO=14;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0514662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.706;QD=20.0145;RBI=0.0532726;REFB=-0.0151215;REVB=0.013755;RO=14;SAF=2;SAR=12;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20692;STB=0.666444;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0176687;OID=.;OPOS=110436232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:14:17:14:18:0.514286:12:2:4:10:16:2:5:12
chr13	110819586	.	G	A	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.947;QD=58.781;RBI=0.0269099;REFB=0;REVB=0.015808;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.57845e-05;OID=.;OPOS=110819586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:27:38:0:0:27:38:0:0
chr13	110839550	.	T	G	1428.01	PASS	AF=1;AO=87;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=61;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453131;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1856;QD=57.1205;RBI=0.0456282;REFB=0;REVB=0.00535273;RO=0;SAF=48;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.57206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00445964;OID=.;OPOS=110839550;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:100:0:0:87:100:1:39:48:0:0:39:61:0:0
chr13	110843985	.	T	C	599.64	PASS	AF=0.901961;AO=46;DP=51;FAO=46;FDP=51;FR=.;FRO=5;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0174332;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.218;QD=47.0306;RBI=0.0258134;REFB=-0.149352;REVB=0.0190372;RO=2;SAF=22;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00170451;STB=0.51194;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00269789;OID=.;OPOS=110843985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:51:51:2:5:46:46:0.901961:24:22:1:1:24:22:3:2
chr13	110857823	.	C	T	850.45	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.286;QD=57.6573;RBI=0.0137643;REFB=0;REVB=-0.000613511;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.21701e-05;OID=.;OPOS=110857823;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:29:29:0:0:29:30:0:0
chr13	110857895	.	A	G,T	742.66	PASS	AF=0.94,0.04;AO=46,2;DP=49;FAO=47,2;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=20,2;FSAR=27,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0581563,0.0633839;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=86.0193,9.88218;QD=59.4131;RBI=0.0617848,0.0647389;REFB=-0.0675729,-0.102708;REVB=0.0208615,-0.0131756;RO=0;SAF=20,2;SAR=26,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.51219,0.5;STBP=0.311,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00219899,-0.0124997;OID=.,.;OPOS=110857895,110857895;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:49:50:0:1:46,2:47,2:0.94,0.04:26,0:20,2:0:0:27,0:20,2:1:0
chr13	111077197	.	G	A	1422.25	PASS	AF=0.95283;AO=100;DP=106;FAO=101;FDP=106;FR=.;FRO=5;FSAF=58;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.00401807;FXX=0.00934492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.505;QD=53.6699;RBI=0.0265841;REFB=-0.0364135;REVB=0.0262787;RO=4;SAF=58;SAR=42;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00597769;STB=0.508382;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.00138348;OID=.;OPOS=111077197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:106:106:4:5:100:101:0.95283:42:58:2:2:43:58:2:3
chr13	111090928	.	C	CG,G	54.77	PASS	AF=0.262295,0.0163934;AO=9,6;DP=73;FAO=16,1;FDP=61;FR=.;FRO=44;FSAF=12,1;FSAR=4,0;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=-0.00871115,-0.00965171;FXX=0.0895389;HRUN=0,4;LEN=1,1;MLLD=67.7163,76.2485;QD=3.59124;RBI=0.0429058,0.0492792;REFB=-0.0134791,-0.00846555;REVB=-0.0420122,-0.0483248;RO=51;SAF=7,3;SAR=2,3;SRF=30;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.25961,-0.101788;STB=0.710252,0.990397;STBP=0.058,0.292;TYPE=ins,snp;VARB=0.182117,0.0278535;OID=.,.;OPOS=111090929,111090928;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:73:61:51:44:9,6:16,1:0.262295,0.0163934:2,3:7,3:30:21:4,0:12,1:21:23
chr13	111098226	.	C	T	223.74	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=0.00248943;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=182.363;QD=12.7849;RBI=0.00809622;REFB=-0.0199773;REVB=-0.00770399;RO=43;SAF=17;SAR=10;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340285;STB=0.693742;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0324523;OID=.;OPOS=111098226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:43:43:27:27:0.385714:10:17:13:30:10:17:13:30
chr13	111102042	.	G	A	323.0	PASS	AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0234512;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.5749;QD=21.8982;RBI=0.0262546;REFB=-0.0184431;REVB=-0.0118045;RO=26;SAF=23;SAR=10;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399246;STB=0.522089;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0117532;OID=.;OPOS=111102042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:10:23:17:9:10:23:17:9
chr13	111102126	.	C	T	74.67	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0262613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.133;QD=10.6672;RBI=0.0268634;REFB=-0.011891;REVB=-0.00565544;RO=18;SAF=7;SAR=3;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167346;STB=0.60135;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0230059;OID=.;OPOS=111102126;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:3:7:10:8:3:7:10:8
chr13	111109157	.	G	A	460.46	PASS	AF=0.571429;AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=77;FR=.;FRO=33;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0500146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.662;QD=23.9202;RBI=0.0659969;REFB=-0.0491794;REVB=0.0430596;RO=33;SAF=23;SAR=21;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177981;STB=0.509765;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.02786;OID=.;OPOS=111109157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:33:33:44:44:0.571429:21:23:18:15:21:23:18:15
chr13	111109190	.	C	T	98.07	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=30;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0124657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.057;QD=13.076;RBI=0.0280557;REFB=-0.00570803;REVB=0.0251342;RO=16;SAF=1;SAR=11;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.628905;STB=0.893025;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00827182;OID=.;OPOS=111109190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:30:30:16:18:12:12:0.4:11:1:10:6:11:1:12:6
chr13	111109618	.	G	C	134.26	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=-0.0111163;FXX=0.0512689;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0151;QD=14.5146;RBI=0.05198;REFB=-0.00887081;REVB=0.0507774;RO=22;SAF=10;SAR=5;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307074;STB=0.678336;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0140141;OID=.;OPOS=111109618;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:37:22:22:15:15:0.405405:5:10:8:14:5:10:8:14
chr13	111109859	.	A	G	329.52	PASS	AF=0.472973;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0050722;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.702;QD=17.8121;RBI=0.00720831;REFB=-0.0157494;REVB=0.00512177;RO=39;SAF=14;SAR=21;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15532;STB=0.586907;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.0252716;OID=.;OPOS=111109859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:39:39:35:35:0.472973:21:14:22:17:21:14:22:17
chr13	111109882	.	A	G	306.16	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=-0.014377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3971;QD=15.3078;RBI=0.0160357;REFB=-0.0144105;REVB=0.00710254;RO=46;SAF=16;SAR=18;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183726;STB=0.60344;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0144261;OID=.;OPOS=111109882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:18:16:30:16:18:16:30:16
chr13	111111173	.	G	A	249.14	PASS	AF=0.357143;AO=30;DP=83;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=37;FSRR=17;FWDB=-0.0126458;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.185;QD=11.8639;RBI=0.0140388;REFB=-0.00320075;REVB=-0.00609674;RO=53;SAF=20;SAR=10;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398849;STB=0.513505;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.00630635;OID=.;OPOS=111111173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:53:54:30:30:0.357143:10:20:37:16:10:20:37:17
chr13	111111235	.	G	A	277.7	PASS	AF=0.449275;AO=31;DP=69;FAO=31;FDP=69;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.0271602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.537;QD=16.0987;RBI=0.0294124;REFB=-0.0348341;REVB=0.0112878;RO=38;SAF=17;SAR=14;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13655;STB=0.576581;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0311405;OID=.;OPOS=111111235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:38:38:31:31:0.449275:14:17:26:12:14:17:26:12
chr13	111134858	.	T	C	354.49	PASS	AF=0.5625;AO=34;DP=62;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0182016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.493;QD=22.1554;RBI=0.0306995;REFB=-0.0176046;REVB=0.0247216;RO=28;SAF=25;SAR=9;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015556;STB=0.529273;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=0.0119303;OID=.;OPOS=111134858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:28:28:34:36:0.5625:9:25:21:7:11:25:21:7
chr13	111145633	.	C	T	516.97	PASS	AF=0.947368;AO=36;DP=38;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0469902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.6631;QD=54.4179;RBI=0.0728393;REFB=-0.0889624;REVB=0.0556551;RO=1;SAF=20;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228293;STB=0.523796;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.00620247;OID=.;OPOS=111145633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:38:38:1:2:36:36:0.947368:16:20:1:0:16:20:2:0
chr13	111154058	.	T	A	874.75	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.994;QD=57.3606;RBI=0.0331655;REFB=0;REVB=0.010559;RO=0;SAF=39;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000465788;OID=.;OPOS=111154058;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:21:39:0:0:21:40:0:0
chr13	111154061	.	T	C	874.45	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0224538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.046;QD=57.3406;RBI=0.0384999;REFB=0;REVB=0.0312741;RO=0;SAF=40;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114916;OID=.;OPOS=111154061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:20:40:0:0:21:40:0:0
chr13	111155773	.	T	C	871.51	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00393199;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.003;QD=58.1004;RBI=0.00548902;REFB=0;REVB=0.00382999;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.86006e-05;OID=.;OPOS=111155773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:30:30:0:0:30:30:0:0
chr13	111156499	.	C	T	2253.15	PASS	AF=0.986301;AO=123;DP=146;FAO=144;FDP=146;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=73;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0938393;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.4084;QD=61.7302;RBI=0.096982;REFB=-0.0577997;REVB=-0.0244887;RO=1;SAF=60;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0078526;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00252162;OID=.;OPOS=111156499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:146:146:1:0:123:144:0.986301:63:60:1:0:71:73:0:0
chr13	111176393	.	A	G	614.08	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319348;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.8891;QD=59.9101;RBI=0.0375757;REFB=0;REVB=-0.0198015;RO=0;SAF=11;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130078;OID=.;OPOS=111176393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:38:41:1:27:11:0:0:30:11:0:0
chr13	111279817	.	A	G	313.03	PASS	AF=0.347826;AO=38;DP=113;FAO=40;FDP=115;FR=.;FRO=75;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=42;FSRR=33;FWDB=0.0101534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0228;QD=10.888;RBI=0.0284695;REFB=-0.00317396;REVB=-0.0265973;RO=74;SAF=15;SAR=23;SRF=42;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197038;STB=0.604115;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.00708607;OID=.;OPOS=111279817;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:115:74:75:38:40:0.347826:23:15:42:32:24:16:42:33
chr13	111298392	.	A	G	340.38	PASS	AF=0.576271;AO=34;DP=60;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0416205;FXX=0.0327815;HRUN=4;LEN=1;MLLD=84.9328;QD=23.0765;RBI=0.0422885;REFB=-0.0362056;REVB=-0.00748659;RO=20;SAF=17;SAR=17;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169517;STB=0.610108;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0129673;OID=.;OPOS=111298392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:20:25:34:34:0.576271:17:17:5:15:17:17:6:19
chr13	111315405	.	G	A	416.74	PASS	AF=0.967742;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0448358;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.3662;QD=53.773;RBI=0.0825729;REFB=-0.099912;REVB=0.06934;RO=1;SAF=27;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016949;STB=0.508766;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.00456476;OID=.;OPOS=111315405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:31:1:1:29:30:0.967742:2:27:1:0:2:28:1:0
chr13	111319754	.	T	C	1324.89	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=87;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0184744;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=119.589;QD=60.9143;RBI=0.0191791;REFB=0.0721729;REVB=-0.00515118;RO=1;SAF=48;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123045;STB=0.506492;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.00036032;OID=.;OPOS=111319754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:87:87:1:1:86:86:0.988506:38:48:0:1:38:48:0:1
chr13	111340101	.	T	A	46.47	PASS	AF=0.35;AO=5;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0136487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.263;QD=9.2932;RBI=0.253784;REFB=0.00124874;REVB=0.253416;RO=11;SAF=3;SAR=2;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267754;STB=0.666222;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00235879;OID=.;OPOS=111340101;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:20:20:11:13:5:7:0.35:2:3:9:2:4:3:9:4
chr13	111365104	.	A	G	284.35	PASS	AF=0.421053;AO=31;DP=76;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=35;FSRR=9;FWDB=-0.0011084;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9646;QD=14.9658;RBI=0.00713952;REFB=-0.0303184;REVB=0.00705296;RO=44;SAF=24;SAR=7;SRF=35;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0321104;STB=0.536342;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.034322;OID=.;OPOS=111365104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:44:44:31:32:0.421053:7:24:35:9:8:24:35:9
chr13	111368164	.	T	G	207.34	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.441;QD=48.7853;RBI=0.0250387;REFB=0;REVB=0.0127722;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140819;OID=.;OPOS=111368164;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:17:0:0:15:17:1:8:7:0:0:10:7:0:0
chr13	111373019	.	G	A	144.69	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0169925;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.311;QD=14.469;RBI=0.0214494;REFB=-0.0080745;REVB=-0.0130894;RO=23;SAF=7;SAR=9;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258604;STB=0.634807;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0264561;OID=.;OPOS=111373019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:24:16:16:0.4:9:7:16:7:9:7:16:8
chr13	111531885	.	C	A	792.96	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00147471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.374;QD=56.6397;RBI=0.00879129;REFB=0;REVB=0.00866672;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.09113e-06;OID=.;OPOS=111531885;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:56:0:0:51:56:1:23:28:0:0:24:32:0:0
chr13	111532288	.	G	A	455.07	PASS	AF=0.454545;AO=50;DP=109;FAO=50;FDP=110;FR=.;FRO=60;FSAF=35;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=35;FWDB=0.00517147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.882;QD=16.5481;RBI=0.0125802;REFB=-0.0154727;REVB=-0.0114681;RO=59;SAF=35;SAR=15;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293501;STB=0.660311;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.014848;OID=.;OPOS=111532288;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:110:59:60:50:50:0.454545:15:35:24:35:15:35:25:35
chr13	111563052	.	C	T	772.85	PASS	AF=0.524823;AO=74;DP=141;FAO=74;FDP=141;FR=.;FRO=67;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=37;FSRR=30;FWDB=0.0226562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.32;QD=21.9248;RBI=0.0315033;REFB=-0.0231963;REVB=-0.0218897;RO=67;SAF=41;SAR=33;SRF=37;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00158994;STB=0.500872;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0205949;OID=.;OPOS=111563052;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:67:67:74:74:0.524823:33:41:37:30:33:41:37:30
chr13	111806245	.	A	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0778069;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.655;QD=53.911;RBI=0.0786156;REFB=0;REVB=0.0112471;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000709017;OID=.;OPOS=111806245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0
chr13	111870037	.	T	C	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.119;QD=63.5826;RBI=0.0629899;REFB=0;REVB=0.0571332;RO=0;SAF=34;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000320208;OID=.;OPOS=111870037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:13:34:0:0:13:34:0:0
chr13	111980537	.	C	T	1786.47	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.955;QD=61.076;RBI=0.0305991;REFB=0;REVB=0.0204996;RO=0;SAF=53;SAR=63;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.90991e-05;OID=.;OPOS=111980537;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:117:0:0:116:117:1:63:53:0:0:64:53:0:0
chr13	112725791	.	G	A	141.29	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.024558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.4441;QD=21.7373;RBI=0.100578;REFB=-0.00766667;REVB=-0.0975341;RO=11;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29491;STB=0.666444;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0193473;OID=.;OPOS=112725791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:10:5:8:3:10:5:8:3
chr13	113086775	.	A	G	153.46	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.107403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.9199;QD=13.9505;RBI=0.124639;REFB=-0.0189556;REVB=0.063242;RO=26;SAF=13;SAR=4;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188634;STB=0.626848;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0340015;OID=.;OPOS=113086775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:27:17:17:0.386364:4:13:16:10:4:13:16:11
chr13	113473629	.	G	A	116.98	PASS	AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.0580081;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.702;QD=10.6341;RBI=0.0617087;REFB=-0.00319665;REVB=-0.0210481;RO=29;SAF=7;SAR=7;SRF=23;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339187;STB=0.681593;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00831473;OID=.;OPOS=113473629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:29:30:14:14:0.318182:7:7:23:6:7:7:23:7
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chr13	113540649	.	G	T	229.36	PASS	AF=0.411765;AO=27;DP=67;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=30;FWDB=0.0151449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.392;QD=13.4916;RBI=0.024681;REFB=-0.0150521;REVB=-0.019488;RO=40;SAF=12;SAR=15;SRF=10;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213463;STB=0.610547;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0246044;OID=.;OPOS=113540649;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:40:40:27:28:0.411765:15:12:10:30:16:12:10:30
chr13	113622956	.	C	A	107.25	PASS	AF=0.631579;AO=12;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.154818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.994;QD=22.5794;RBI=0.157364;REFB=-0.0680704;REVB=0.0281896;RO=7;SAF=4;SAR=8;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067621;STB=0.538396;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0287667;OID=.;OPOS=113622956;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:7:7:12:12:0.631579:8:4:3:4:8:4:3:4
chr13	113656216	.	C	T	691.84	PASS	AF=0.544;AO=66;DP=123;FAO=68;FDP=125;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=40;FSRF=23;FSRR=34;FWDB=0.00422601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.805;QD=22.1388;RBI=0.00556304;REFB=-0.028766;REVB=-0.00361777;RO=55;SAF=28;SAR=38;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362676;STB=0.50389;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.0212994;OID=.;OPOS=113656216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:125:55:57:66:68:0.544:38:28:21:34:40:28:23:34
chr13	113720476	.	C	T	109.25	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0367011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.7856;QD=14.0969;RBI=0.0382356;REFB=-0.0038772;REVB=0.0107235;RO=18;SAF=3;SAR=10;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130454;STB=0.576797;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00376931;OID=.;OPOS=113720476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:10:3:6:12:10:3:6:12
chr13	113728781	.	G	A	903.55	PASS	AF=0.505618;AO=90;DP=178;FAO=90;FDP=178;FR=.;FRO=88;FSAF=38;FSAR=52;FSRF=43;FSRR=45;FWDB=-0.039819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.961;QD=20.3045;RBI=0.0416529;REFB=-0.0167316;REVB=-0.0122235;RO=88;SAF=38;SAR=52;SRF=43;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605677;STB=0.533292;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0151579;OID=.;OPOS=113728781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:178:88:88:90:90:0.505618:52:38:43:45:52:38:43:45
chr13	113747070	.	A	C	386.71	PASS	AF=0.52;AO=39;DP=76;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0236248;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0139;QD=20.6246;RBI=0.0784495;REFB=-0.0150053;REVB=-0.0748077;RO=37;SAF=26;SAR=13;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942115;STB=0.557662;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0101139;OID=.;OPOS=113747070;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:37:36:39:39:0.52:13:26:21:16:13:26:20:16
chr13	113747124	.	A	G	937.6	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.165;QD=58.5998;RBI=0.0323041;REFB=0;REVB=0.00636874;RO=0;SAF=43;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.72439e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113336;OID=.;OPOS=113747124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:21:43:0:0:21:43:0:0
chr13	113747135	.	T	C	772.04	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0576859;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.866;QD=57.1882;RBI=0.0594497;REFB=0;REVB=0.0143736;RO=0;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.19417e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000811421;OID=.;OPOS=113747135;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:17:36:0:0:18:36:0:0
chr13	113792753	.	T	TC	284.99	PASS	AF=1;AO=5;DP=31;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0557439;FXX=0.156201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.873;QD=42.2201;RBI=0.0557465;REFB=-0.0892044;REVB=-0.000547048;RO=24;SAF=1;SAR=4;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.440804;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000438247;OID=.;OPOS=113792754;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:31:27:27:0:13:14:0:0:4:24:1:4:14:10
chr13	113792754	.	T	C	281.08	PASS	AF=0.75;AO=24;DP=31;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0139978;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.04;QD=35.1347;RBI=0.0185789;REFB=-0.0457443;REVB=0.0122164;RO=5;SAF=13;SAR=11;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108078;STB=0.541632;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0033372;OID=.;OPOS=113792754;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:31:32:5:8:24:24:0.75:11:13:1:4:11:13:3:5
chr13	113801737	.	C	T	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.123;QD=58.6003;RBI=0.0230406;REFB=0;REVB=0.0176838;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.37602e-06;OID=.;OPOS=113801737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:26:38:0:0:26:38:0:0
chr13	113812962	.	G	A	580.01	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243441;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.249;QD=61.0533;RBI=0.0941604;REFB=0;REVB=0.0909591;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217577;OID=.;OPOS=113812962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:22:16:0:0:22:16:0:0
chr13	113818900	.	A	G	1098.7	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0541174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7879;QD=60.2026;RBI=0.056266;REFB=0;REVB=0.0154003;RO=0;SAF=46;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460477;OID=.;OPOS=113818900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:27:46:0:0:27:46:0:0
chr13	113965176	.	C	A	230.26	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00404307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.616;QD=46.0526;RBI=0.0413933;REFB=0.00567669;REVB=0.0411954;RO=1;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0612242;STB=0.533298;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=6.09421e-05;OID=.;OPOS=113965176;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:7:12:0:1:7:12:0:1
chr13	114078558	.	A	C	325.73	PASS	AF=0.409091;AO=36;DP=88;FAO=36;FDP=88;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.00277883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.617;QD=14.806;RBI=0.0704723;REFB=-0.00826136;REVB=-0.0704175;RO=51;SAF=20;SAR=16;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00684535;STB=0.501278;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0100644;OID=.;OPOS=114078558;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:51:52:36:36:0.409091:16:20:28:23:16:20:29:23
chr13	114152755	.	C	T	178.95	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0158293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.438;QD=12.5575;RBI=0.0509546;REFB=-0.033944;REVB=-0.0484335;RO=35;SAF=8;SAR=14;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103708;STB=0.559944;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0487186;OID=.;OPOS=114152755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:14:8:16:19:14:8:16:19
chr13	114154419	.	G	A	315.96	PASS	AF=0.532258;AO=31;DP=60;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00872831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.883;QD=20.3843;RBI=0.0194476;REFB=-0.0158895;REVB=0.0173789;RO=24;SAF=19;SAR=12;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091575;STB=0.558846;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0122616;OID=.;OPOS=114154419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:62:24:29:31:33:0.532258:12:19:12:12:13:20:14:15
chr13	114156093	.	C	T	342.05	PASS	AF=0.530303;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=66;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0335453;FXX=0.0294074;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9962;QD=20.73;RBI=0.080184;REFB=0.0143052;REVB=0.0728299;RO=33;SAF=19;SAR=16;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103369;STB=0.542833;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.0121282;OID=.;OPOS=114156093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:66:33:31:35:35:0.530303:16:19:14:19:16:19:14:17
chr13	114175004	.	C	T	290.43	PASS	AF=0.402439;AO=33;DP=82;FAO=33;FDP=82;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=-0.00432962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.743;QD=14.1674;RBI=0.0116477;REFB=-0.0125505;REVB=-0.0108131;RO=49;SAF=17;SAR=16;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0377857;STB=0.521469;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0189658;OID=.;OPOS=114175004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:49:49:33:33:0.402439:16:17:27:22:16:17:27:22
chr13	114175032	.	G	A	220.59	PASS	AF=0.364865;AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=74;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.00508893;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.541;QD=11.924;RBI=0.00655744;REFB=-0.00622693;REVB=0.00413555;RO=46;SAF=12;SAR=15;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0846174;STB=0.555514;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0132555;OID=.;OPOS=114175032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:46:47:27:27:0.364865:15:12:24:22:15:12:25:22
chr13	114204175	.	C	T	208.35	PASS	AF=0.351351;AO=26;DP=75;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0910504;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3361;QD=11.2623;RBI=0.092755;REFB=-0.00240498;REVB=-0.0177009;RO=48;SAF=8;SAR=18;SRF=20;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133704;STB=0.577919;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.00150115;OID=.;OPOS=114204175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:48:48:26:26:0.351351:18:8:20:28:18:8:20:28
chr13	114303764	.	C	T	633.63	PASS	AF=0.647059;AO=55;DP=85;FAO=55;FDP=85;FR=.;FRO=30;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=0.0115096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.29;QD=29.818;RBI=0.0160741;REFB=-0.035697;REVB=-0.0112208;RO=29;SAF=27;SAR=28;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933275;STB=0.555726;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0181681;OID=.;OPOS=114303764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:29:30:55:55:0.647059:28:27:10:19:28:27:10:20
chr13	114309226	.	G	A	479.73	PASS	AF=0.485714;AO=50;DP=105;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.0390117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.765;QD=18.2756;RBI=0.0647079;REFB=-0.021999;REVB=-0.0516255;RO=53;SAF=36;SAR=14;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1437;STB=0.579602;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.023019;OID=.;OPOS=114309226;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:53:54:50:51:0.485714:14:36:31:22:14:37:32:22
chr13	114312354	.	T	G	1047.95	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.215;QD=59.0395;RBI=0.0149909;REFB=0;REVB=0.00625185;RO=0;SAF=45;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161508;OID=.;OPOS=114312354;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:71:0:0:68:71:1:23:45:0:0:25:46:0:0
chr13	114322289	.	A	G	318.57	PASS	AF=0.472973;AO=31;DP=70;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=6;FWDB=-0.00197154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.453;QD=17.2198;RBI=0.0322905;REFB=-0.0116863;REVB=0.0322302;RO=39;SAF=19;SAR=12;SRF=33;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262904;STB=0.631003;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0119987;OID=.;OPOS=114322289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:74:39:39:31:35:0.472973:12:19:33:6:13:22:33:6
chr13	114453616	.	T	C	44.0	PASS	AF=0.269231;AO=7;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0872052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.358;QD=6.76871;RBI=0.0876373;REFB=-0.00548607;REVB=-0.00869162;RO=19;SAF=6;SAR=1;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.48202;STB=0.813829;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.026209;OID=.;OPOS=114453616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:26:26:19:19:7:7:0.269231:1:6:9:10:1:6:9:10
chr13	114453619	.	C	G	44.17	PASS	AF=0.269231;AO=8;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.187075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.1209;QD=6.79524;RBI=0.195852;REFB=-0.0266498;REVB=-0.0579751;RO=18;SAF=7;SAR=1;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.5308;STB=0.813829;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.051575;OID=.;OPOS=114453619;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:26:18:19:8:7:0.269231:1:7:8:10:1:6:9:10
chr13	114453873	.	G	C	211.74	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0236803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0178;QD=19.6964;RBI=0.0650256;REFB=-0.033386;REVB=0.0605605;RO=22;SAF=15;SAR=6;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211772;STB=0.620317;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0344128;OID=.;OPOS=114453873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:6:15:11:11:6:15:11:11
chr13	114453912	.	C	T	186.9	PASS	AF=0.423077;AO=20;DP=50;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00102286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.664;QD=14.3767;RBI=0.0162756;REFB=-0.0354388;REVB=-0.0162435;RO=27;SAF=13;SAR=7;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137497;STB=0.611007;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0372782;OID=.;OPOS=114453912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:27:30:20:22:0.423077:7:13:14:13:7:15:15:15
chr13	114453966	.	G	C	233.44	PASS	AF=0.5;AO=25;DP=53;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0369729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.417;QD=17.292;RBI=0.039832;REFB=-0.0344687;REVB=-0.0148186;RO=26;SAF=12;SAR=13;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870828;STB=0.555363;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0507913;OID=.;OPOS=114453966;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:26:27:25:27:0.5:13:12:10:16:13:14:11:16
chr13	114453997	.	CAT	C,CGT	201.01	PASS	AF=0.463415,0.0487805;AO=18,3;DP=44;FAO=19,2;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=7,1;FSAR=12,1;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.000653533,-0.0655388;FXX=0.0681663;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=150.027,112.731;QD=19.6106;RBI=0.0151315,0.0670179;REFB=-0.0135727,-0.0325908;REVB=0.0151173,-0.0140023;RO=17;SAF=6,2;SAR=12,1;SRF=8;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.125776,0.214282;STB=0.569758,0.5;STBP=0.376,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0337965,-0.0652069;OID=.,.;OPOS=114453998,114453998;OREF=AT,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.463415,0.0487805:18,3:44:19,2:41:20:7,1:12,1:10:10:99:17:6,2:12,1:8:9
chr13	114507965	.	C	T	414.02	PASS	AF=0.434343;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0136743;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.163;QD=16.728;RBI=0.0137372;REFB=-0.0129414;REVB=0.00131242;RO=54;SAF=15;SAR=28;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233256;STB=0.526946;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0245246;OID=.;OPOS=114507965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:54:56:43:43:0.434343:28:15:20:34:28:15:22:34
chr13	114514771	.	C	A	362.1	PASS	AF=0.414894;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=-0.0067349;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=267.435;QD=15.4084;RBI=0.0122783;REFB=-0.0179148;REVB=-0.0102663;RO=55;SAF=20;SAR=19;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0602847;STB=0.534043;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0245212;OID=.;OPOS=114514771;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:55:55:39:39:0.414894:19:20:25:30:19:20:25:30
chr13	114524944	.	A	G	612.62	PASS	AF=0.397727;AO=70;DP=176;FAO=70;FDP=176;FR=.;FRO=106;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=59;FSRR=47;FWDB=-0.00275019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.297;QD=13.9231;RBI=0.0193074;REFB=-0.0306747;REVB=-0.0191106;RO=106;SAF=36;SAR=34;SRF=59;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453949;STB=0.525538;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0416285;OID=.;OPOS=114524944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:176:106:106:70:70:0.397727:34:36:59:47:34:36:59:47
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chr13	114623880	.	G	A	464.41	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.073;QD=58.0516;RBI=0.0283953;REFB=0;REVB=-0.0149549;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.13012e-05;OID=.;OPOS=114623880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:19:12:0:0:19:13:0:0
chr13	114747187	.	G	C	236.84	PASS	AF=0.490196;AO=25;DP=51;FAO=25;FDP=51;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=24;FWDB=-0.00170803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2818;QD=18.5757;RBI=0.0166274;REFB=0.0206317;REVB=0.0165394;RO=26;SAF=5;SAR=20;SRF=2;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201187;STB=0.611036;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=-0.0305543;OID=.;OPOS=114747187;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:26:25:25:0.490196:20:5:2:24:20:5:2:24
chr13	114762198	.	C	T	355.7	PASS	AF=0.513889;AO=35;DP=71;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00527923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.234;QD=19.7611;RBI=0.00594991;REFB=-0.00216586;REVB=-0.0027443;RO=35;SAF=23;SAR=12;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135192;STB=0.553972;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00219506;OID=.;OPOS=114762198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:35:35:35:37:0.513889:12:23:18:17:14:23:18:17
chr13	114780764	.	A	G	817.71	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0405356;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.27;QD=57.3829;RBI=0.0417596;REFB=0;REVB=-0.0100364;RO=0;SAF=11;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.44915e-05;OID=.;OPOS=114780764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:46:11:0:0:46:11:0:0
chr13	115002305	.	G	A	164.29	PASS	AF=0.242718;AO=24;DP=102;FAO=25;FDP=103;FR=.;FRO=78;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=47;FSRR=31;FWDB=0.0062388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3816;QD=6.38034;RBI=0.0166298;REFB=0.00171594;REVB=-0.0154151;RO=78;SAF=14;SAR=10;SRF=47;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248074;STB=0.532937;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=-0.00310346;OID=.;OPOS=115002305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:78:78:24:25:0.242718:10:14:47:31:11:14:47:31
chr13	115004914	.	C	T	158.65	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.005618;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.265;QD=16.2713;RBI=0.0167359;REFB=-0.00926208;REVB=-0.0157648;RO=22;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104869;STB=0.560437;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.013548;OID=.;OPOS=115004914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:22:22:17:17:0.435897:11:6:10:12:11:6:10:12
chr13	115004935	.	T	C	157.87	PASS	AF=0.53125;AO=15;DP=30;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0594404;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.0449;QD=19.7331;RBI=0.0648714;REFB=-0.0153983;REVB=0.0259836;RO=15;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182502;STB=0.557553;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.041053;OID=.;OPOS=115004935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:32:15:15:15:17:0.53125:10:5:8:7:10:7:8:7
chr13	115009384	.	G	A	544.31	PASS	AF=0.539216;AO=54;DP=100;FAO=55;FDP=102;FR=.;FRO=47;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=-0.0199707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.71;QD=21.3455;RBI=0.0275019;REFB=-0.0153175;REVB=0.0189083;RO=46;SAF=32;SAR=22;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716376;STB=0.555658;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0129612;OID=.;OPOS=115009384;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:102:46:47:54:55:0.539216:22:32:31:15:24:31:32:15
chr13	115010041	.	A	G	129.17	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=24;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=-0.00830083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.392;QD=21.5284;RBI=0.0304881;REFB=0.00214293;REVB=0.0293364;RO=9;SAF=9;SAR=5;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216917;STB=0.603508;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.00218957;OID=.;OPOS=115010041;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:9:10:14:14:0.583333:5:9:3:6:5:9:4:6
chr13	115030714	.	T	C	178.18	PASS	AF=0.348485;AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0308298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.725;QD=10.7985;RBI=0.0388441;REFB=-0.00494274;REVB=0.0236303;RO=42;SAF=9;SAR=14;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199513;STB=0.62293;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.00929303;OID=.;OPOS=115030714;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:42:43:23:23:0.348485:14:9:24:18:14:9:25:18
chr13	115090019	.	G	A	214.1	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00501438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.269;QD=14.7656;RBI=0.0157716;REFB=-0.00478554;REVB=-0.0149533;RO=33;SAF=16;SAR=9;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292517;STB=0.516603;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.0078126;OID=.;OPOS=115090019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:9:16:22:11:9:16:22:11
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chr13	115090193	.	G	A	59.74	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0575257;FXX=0.0869187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.806;QD=11.3798;RBI=0.0578109;REFB=-0.00533846;REVB=0.00573484;RO=12;SAF=1;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399995;STB=0.776954;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00975931;OID=.;OPOS=115090193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:23:21:12:13:8:8:0.380952:7:1:5:7:7:1:6:7
chr13	115090931	.	C	T	36.38	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0287957;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.336;QD=6.92899;RBI=0.0303383;REFB=-0.0174786;REVB=-0.00955087;RO=15;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873336;STB=0.555379;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.0317627;OID=.;OPOS=115090931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:4:2:4:11:4:2:4:11
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chr14	20181502	.	C	T	119.67	PASS	AF=0.283333;AO=17;DP=60;FAO=17;FDP=60;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=11;FWDB=0.00898773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1947;QD=7.97774;RBI=0.104696;REFB=-0.00719575;REVB=-0.104309;RO=43;SAF=13;SAR=4;SRF=32;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330097;STB=0.519976;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0138152;OID=.;OPOS=20181502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:43:43:17:17:0.283333:4:13:32:11:4:13:32:11
chr14	20216298	.	T	C	2119.86	PASS	AF=0.985714;AO=136;DP=141;FAO=138;FDP=140;FR=.;FRO=2;FSAF=84;FSAR=54;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0203525;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2846;QD=60.5674;RBI=0.0450069;REFB=-0.0950262;REVB=0.0401422;RO=4;SAF=82;SAR=54;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226218;STB=0.505881;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.00588103;OID=.;OPOS=20216298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:141:140:4:2:136:138:0.985714:54:82:4:0:54:84:2:0
chr14	20216426	.	A	C	241.27	PASS	AF=0.305556;AO=31;DP=107;FAO=33;FDP=108;FR=.;FRO=75;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=41;FWDB=-0.00116458;FXX=0.00917347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.954;QD=8.93579;RBI=0.00314048;REFB=-0.0106259;REVB=-0.00291657;RO=74;SAF=15;SAR=16;SRF=33;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.045453;STB=0.542831;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0212428;OID=.;OPOS=20216426;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:74:75:31:33:0.305556:16:15:33:41:16:17:34:41
chr14	20295834	.	T	C	397.32	PASS	AF=0.306358;AO=53;DP=173;FAO=53;FDP=173;FR=.;FRO=120;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=57;FSRR=63;FWDB=0.0247508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.324;QD=9.18657;RBI=0.0249104;REFB=-0.010839;REVB=-0.00281535;RO=120;SAF=19;SAR=34;SRF=57;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143413;STB=0.583659;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0229266;OID=.;OPOS=20295834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:173:120:120:53:53:0.306358:34:19:57:63:34:19:57:63
chr14	20403909	.	T	C	926.56	PASS	AF=0.605839;AO=83;DP=138;FAO=83;FDP=137;FR=.;FRO=54;FSAF=38;FSAR=45;FSRF=16;FSRR=38;FWDB=0.0475013;FXX=0.00724585;HRUN=6;LEN=1;MLLD=166.758;QD=27.053;RBI=0.0480372;REFB=-0.0154974;REVB=0.00715532;RO=43;SAF=38;SAR=45;SRF=12;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115317;STB=0.564813;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00999898;OID=.;OPOS=20403909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:137:43:54:83:83:0.605839:45:38:12:31:45:38:16:38
chr14	20404076	.	A	T	128.03	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.013979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.005;QD=20.4854;RBI=0.020697;REFB=-0.0275348;REVB=-0.0152628;RO=11;SAF=9;SAR=5;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283868;STB=0.66079;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.00615385;OID=.;OPOS=20404076;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:5:9:3:8:5:9:3:8
chr14	20404091	.	G	A	102.5	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0231231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4573;QD=17.8262;RBI=0.0406565;REFB=-0.0018288;REVB=-0.0334406;RO=11;SAF=8;SAR=4;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389112;STB=0.721873;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00137542;OID=.;OPOS=20404091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:4:8:2:9:4:8:2:9
chr14	20404736	.	G	A	168.71	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=3.867e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.604;QD=16.0673;RBI=0.00389781;REFB=-0.0256087;REVB=-0.00389762;RO=23;SAF=6;SAR=12;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347112;STB=0.707471;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0168086;OID=.;OPOS=20404736;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:23:24:18:18:0.428571:12:6:16:7:12:6:17:7
chr14	20404767	.	A	G	89.53	PASS	AF=0.478261;AO=11;DP=23;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0106431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.321;QD=15.5712;RBI=0.0123587;REFB=-0.0233048;REVB=-0.00628191;RO=11;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0783488;STB=0.523766;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0273534;OID=.;OPOS=20404767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:12:11:11:0.478261:5:6:5:6:5:6:6:6
chr14	20443872	.	C	G	244.24	PASS	AF=0.426471;AO=27;DP=65;FAO=29;FDP=68;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.000587154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.026;QD=14.3673;RBI=0.00615759;REFB=-0.0322227;REVB=-0.00612953;RO=35;SAF=17;SAR=10;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610899;STB=0.523902;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.038378;OID=.;OPOS=20443872;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:68:35:39:27:29:0.426471:10:17:24:11:10:19:27:12
chr14	20443943	.	A	G	173.07	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0162255;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.95;QD=18.7107;RBI=0.0212207;REFB=-0.00155661;REVB=0.0136767;RO=19;SAF=9;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237684;STB=0.513498;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.00198704;OID=.;OPOS=20443943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:9:9:9:10:9:9:9:10
chr14	20444012	.	A	T	57.92	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0448997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3004;QD=13.6294;RBI=0.0586346;REFB=-0.0575513;REVB=-0.0377098;RO=9;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200579;STB=0.620366;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0398975;OID=.;OPOS=20444012;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:6:2:4:5:6:2:4:5
chr14	20444026	.	T	G	46.73	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00603507;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.374;QD=10.3841;RBI=0.0294891;REFB=-0.011711;REVB=-0.0288649;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125396;STB=0.555391;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.019678;OID=.;OPOS=20444026;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:10:11:7:7:0.388889:5:2:4:6:5:2:4:7
chr14	20444193	.	A	C	312.02	PASS	AF=0.336134;AO=39;DP=119;FAO=40;FDP=119;FR=.;FRO=79;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=38;FSRR=41;FWDB=0.0014582;FXX=0.0165276;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1513;QD=10.4881;RBI=0.00148124;REFB=0.00343907;REVB=0.000260252;RO=80;SAF=21;SAR=18;SRF=39;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0591243;STB=0.545814;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=-0.00700066;OID=.;OPOS=20444193;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:80:79:39:40:0.336134:18:21:39:41:18:22:38:41
chr14	20444441	.	C	A	334.69	PASS	AF=0.507246;AO=34;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0190505;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.964;QD=19.4021;RBI=0.0225034;REFB=-0.0277029;REVB=0.0119784;RO=32;SAF=15;SAR=19;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873224;STB=0.53844;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0183088;OID=.;OPOS=20444441;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:32:34:34:35:0.507246:19:15:11:21:20:15:12:22
chr14	20444490	.	C	T	197.7	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0232733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.921;QD=18.8287;RBI=0.0288818;REFB=-0.0154817;REVB=-0.017103;RO=22;SAF=6;SAR=14;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113182;STB=0.564449;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0186817;OID=.;OPOS=20444490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:14:6:9:13:14:6:9:13
chr14	20444588	.	T	C	160.44	PASS	AF=0.53125;AO=16;DP=31;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0399843;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.945;QD=20.0553;RBI=0.0408849;REFB=-0.0175544;REVB=-0.00853406;RO=15;SAF=7;SAR=9;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326017;STB=0.505697;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0166197;OID=.;OPOS=20444588;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:15:15:16:17:0.53125:9:7:6:9:10:7:6:9
chr14	20444607	.	C	G	208.75	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0144873;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.403;QD=23.8576;RBI=0.0189932;REFB=-0.0339824;REVB=-0.0122825;RO=15;SAF=14;SAR=6;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193409;STB=0.608582;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.017297;OID=.;OPOS=20444607;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:15:15:20:20:0.571429:6:14:7:8:6:14:7:8
chr14	20470737	.	G	A	454.03	PASS	AF=0.483871;AO=45;DP=89;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=17;FWDB=8.71405e-05;FXX=0.0106372;HRUN=5;LEN=1;MLLD=238.498;QD=19.5282;RBI=0.0012785;REFB=0.00235651;REVB=0.00127553;RO=44;SAF=25;SAR=20;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116061;STB=0.547656;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=-0.00220664;OID=.;OPOS=20470737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:93:44:48:45:45:0.483871:20:25:30:14:20:25:31:17
chr14	20470903	.	T	C	314.35	PASS	AF=0.465753;AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=73;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=0.000443463;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.428;QD=17.2247;RBI=0.00115629;REFB=-0.0055996;REVB=-0.00106787;RO=37;SAF=12;SAR=22;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0257044;STB=0.503519;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.00591972;OID=.;OPOS=20470903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:37:39:34:34:0.465753:22:12:14:23:22:12:14:25
chr14	20482471	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0528915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.811;QD=33.4285;RBI=0.0528915;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000819375;OID=.;OPOS=20482471;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr14	20482703	.	A	G	416.69	PASS	AF=0.494118;AO=42;DP=85;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=28;FWDB=0.000664844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.223;QD=19.6088;RBI=0.00568139;REFB=-0.029527;REVB=0.00564236;RO=42;SAF=26;SAR=16;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234729;STB=0.635492;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0315547;OID=.;OPOS=20482703;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:42:43:42:42:0.494118:16:26:15:27:16:26:15:28
chr14	20482919	.	A	C	380.81	PASS	AF=0.5;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=0.00130071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.439;QD=19.5284;RBI=0.0051423;REFB=-0.0112529;REVB=0.00497508;RO=39;SAF=18;SAR=21;SRF=29;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251226;STB=0.638768;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00726803;OID=.;OPOS=20482919;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:39:39:39:39:0.5:21:18:29:10:21:18:29:10
chr14	20502120	.	C	T	250.38	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0334202;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.769;QD=20.0302;RBI=0.0338099;REFB=-0.00123833;REVB=-0.0051186;RO=26;SAF=10;SAR=14;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421909;STB=0.52379;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.000954371;OID=.;OPOS=20502120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:26:24:24:0.48:14:10:12:14:14:10:12:14
chr14	20528207	.	G	A	105.67	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0183048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.093;QD=14.0895;RBI=0.0505134;REFB=-0.0489226;REVB=-0.0470801;RO=17;SAF=11;SAR=2;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439484;STB=0.760549;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.125358;OID=.;OPOS=20528207;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:2:11:8:9:2:11:8:9
chr14	20528321	.	A	G	45.05	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00760545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.003;QD=7.83533;RBI=0.0204881;REFB=-0.00302252;REVB=-0.0190242;RO=16;SAF=6;SAR=1;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402921;STB=0.761037;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0358675;OID=.;OPOS=20528321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:16:16:7:7:0.304348:1:6:9:7:1:6:9:7
chr14	20528359	.	G	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0881;QD=52.6131;RBI=0.0355624;REFB=0;REVB=-0.0132581;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00113192;OID=.;OPOS=20528359;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:6:16:0:0:6:16:0:0
chr14	20528362	.	A	G	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00237123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=315.743;QD=8.24622;RBI=0.00261725;REFB=-0.00147873;REVB=0.00110784;RO=15;SAF=6;SAR=1;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296779;STB=0.691662;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00227414;OID=.;OPOS=20528362;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:1:6:10:5:1:6:10:5
chr14	20528448	.	TCATAGATTTGCTCACTGAC	T	126.87	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.0092432;FXX=0;HRUN=1;LEN=19;MLLD=568.362;QD=11.2777;RBI=0.0273002;REFB=-0.00585964;REVB=-0.0256878;RO=27;SAF=13;SAR=2;SRF=22;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109082;STB=0.618866;STBP=0.382;TYPE=del;VARB=0.00991382;OID=.;OPOS=20528449;OREF=CATAGATTTGCTCACTGAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:15:45:15:45:30:13:2:23:7:99:27:13:2:22:5
chr14	20528505	.	T	A	251.13	PASS	AF=0.446154;AO=27;DP=63;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.0135591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.833;QD=15.4542;RBI=0.0584378;REFB=-0.0206917;REVB=0.056843;RO=36;SAF=19;SAR=8;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226048;STB=0.501325;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0275913;OID=.;OPOS=20528505;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:65:36:36:27:29:0.446154:8:19:26:10:8:21:26:10
chr14	20528528	.	G	A	337.6	PASS	AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.00216296;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=265.681;QD=20.1555;RBI=0.0161199;REFB=-0.0141791;REVB=-0.0159742;RO=32;SAF=25;SAR=10;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593055;STB=0.532976;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0146278;OID=.;OPOS=20528528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:10:25:21:11:10:25:21:11
chr14	20529019	.	C	T	356.64	PASS	AF=0.380531;AO=43;DP=113;FAO=43;FDP=113;FR=.;FRO=70;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=34;FSRR=36;FWDB=-0.043888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.752;QD=12.6243;RBI=0.0442473;REFB=-0.00615856;REVB=0.00562749;RO=68;SAF=21;SAR=22;SRF=32;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191989;STB=0.501647;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0115087;OID=.;OPOS=20529019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:68:70:43:43:0.380531:22:21:32:36:22:21:34:36
chr14	20529043	.	C	G	368.07	PASS	AF=0.443182;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.0280162;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.0732;QD=16.7304;RBI=0.0322378;REFB=-0.0053557;REVB=0.0159489;RO=49;SAF=19;SAR=20;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022826;STB=0.512814;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.00566166;OID=.;OPOS=20529043;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:49:49:39:39:0.443182:20:19:25:24:20:19:25:24
chr14	20586042	.	G	C	228.43	PASS	AF=0.388889;AO=24;DP=68;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.00237462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.366;QD=12.6903;RBI=0.00542132;REFB=-0.00699445;REVB=-0.00487359;RO=41;SAF=13;SAR=11;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588155;STB=0.527758;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0104071;OID=.;OPOS=20586042;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:72:41:44:24:28:0.388889:11:13:20:21:14:14:20:24
chr14	20586432	.	C	T	241.71	PASS	AF=0.376623;AO=29;DP=78;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=-0.0118732;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.454;QD=12.5562;RBI=0.0159245;REFB=-0.00547049;REVB=-0.0106122;RO=48;SAF=15;SAR=14;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118007;STB=0.567522;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.0139784;OID=.;OPOS=20586432;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:48:48:29:29:0.376623:14:15:30:18:14:15:30:18
chr14	20665790	.	T	A	146.81	PASS	AF=0.470588;AO=15;DP=33;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0112395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.934;QD=17.2721;RBI=0.0266188;REFB=-0.00555549;REVB=-0.0241296;RO=18;SAF=11;SAR=4;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243262;STB=0.606161;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.00512463;OID=.;OPOS=20665790;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:18:18:15:16:0.470588:4:11:9:9:5:11:9:9
chr14	20665840	.	G	A	175.97	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0388115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6386;QD=20.7022;RBI=0.0429824;REFB=-0.0726322;REVB=-0.0184704;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0983768;STB=0.555494;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0694624;OID=.;OPOS=20665840;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:8:10:7:9:8:10:7:9
chr14	20665887	.	G	C	211.92	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.00454108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4826;QD=16.6214;RBI=0.0384449;REFB=-0.0379744;REVB=-0.0381757;RO=28;SAF=12;SAR=11;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.227624;STB=0.628273;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0347777;OID=.;OPOS=20665887;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:11:12:8:20:11:12:8:20
chr14	20691888	.	C	A	373.92	PASS	AF=0.578125;AO=37;DP=66;FAO=37;FDP=64;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0396421;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1115;QD=23.3697;RBI=0.0414098;REFB=-0.0459786;REVB=-0.0119697;RO=27;SAF=21;SAR=16;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196092;STB=0.510779;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.0260651;OID=.;OPOS=20691888;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:64:27:27:37:37:0.578125:16:21:16:11:16:21:16:11
chr14	20691962	.	C	G	424.12	PASS	AF=0.634921;AO=40;DP=63;FAO=40;FDP=63;FR=.;FRO=23;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0257808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6069;QD=26.9281;RBI=0.0632926;REFB=-0.0147808;REVB=-0.057804;RO=23;SAF=23;SAR=17;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0838394;STB=0.545657;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0165673;OID=.;OPOS=20691962;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:23:23:40:40:0.634921:17:23:16:7:17:23:16:7
chr14	20697600	.	T	G	492.65	PASS	AF=0.404412;AO=55;DP=136;FAO=55;FDP=136;FR=.;FRO=81;FSAF=41;FSAR=14;FSRF=46;FSRR=35;FWDB=0.0112506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2956;QD=14.4896;RBI=0.0391555;REFB=-0.0128299;REVB=-0.0375044;RO=80;SAF=41;SAR=14;SRF=46;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207407;STB=0.622512;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0264417;OID=.;OPOS=20697600;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:80:81:55:55:0.404412:14:41:46:34:14:41:46:35
chr14	20698068	.	G	T	135.78	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.11487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.8612;QD=27.1562;RBI=0.192313;REFB=-0.0252329;REVB=-0.154237;RO=6;SAF=8;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127659;STB=0.571326;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.0013013;OID=.;OPOS=20698068;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:6:8:2:4:6:8:2:4
chr14	20698239	.	T	C	406.9	PASS	AF=0.506173;AO=41;DP=81;FAO=41;FDP=81;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=32;FWDB=0.00238862;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.59;QD=20.0939;RBI=0.0170082;REFB=0.0137849;REVB=-0.0168396;RO=40;SAF=21;SAR=20;SRF=8;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278384;STB=0.653042;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.00664229;OID=.;OPOS=20698239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:40:40:41:41:0.506173:20:21:8:32:20:21:8:32
chr14	20698298	.	T	G	384.08	PASS	AF=0.454545;AO=40;DP=88;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.0853369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.69;QD=17.4582;RBI=0.101557;REFB=0.00381696;REVB=-0.0550577;RO=47;SAF=16;SAR=24;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105536;STB=0.5507;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=-0.00509777;OID=.;OPOS=20698298;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:47:48:40:40:0.454545:24:16:14:33:24:16:15:33
chr14	20711469	.	C	T	355.74	PASS	AF=0.363636;AO=43;DP=120;FAO=44;FDP=121;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=36;FSRR=41;FWDB=-0.0234115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.226;QD=11.7601;RBI=0.023508;REFB=-0.0202461;REVB=0.00212796;RO=77;SAF=24;SAR=19;SRF=36;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101484;STB=0.549527;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.038857;OID=.;OPOS=20711469;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:121:77:77:43:44:0.363636:19:24:36:41:20:24:36:41
chr14	20764585	.	A	C	171.18	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=51;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=-0.0126449;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.8544;QD=13.4261;RBI=0.0183022;REFB=-0.013713;REVB=-0.0132317;RO=31;SAF=10;SAR=10;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153325;STB=0.58815;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.0131738;OID=.;OPOS=20764585;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:31:31:20:20:0.392157:10:10:11:20:10:10:11:20
chr14	20770036	.	T	C	886.77	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.69;QD=57.2111;RBI=0.0895374;REFB=0;REVB=0.0846343;RO=1;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014984;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000530444;OID=.;OPOS=20770036;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:1:0:61:62:1:31:30:0:1:32:30:0:0
chr14	20784407	.	C	A	296.06	PASS	AF=0.484848;AO=32;DP=66;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0404008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.855;QD=17.9428;RBI=0.0416177;REFB=-0.0057222;REVB=-0.00999038;RO=33;SAF=24;SAR=8;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127108;STB=0.565994;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.00109212;OID=.;OPOS=20784407;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:33:34:32:32:0.484848:8:24:21:12:8:24:22:12
chr14	20824181	.	T	C	560.79	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600303;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.378;QD=60.626;RBI=0.0607231;REFB=0;REVB=0.00914684;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000413951;OID=.;OPOS=20824181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:26:11:0:0:26:11:0:0
chr14	20837701	.	G	C	242.81	PASS	AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0120325;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=270.862;QD=22.5866;RBI=0.0134765;REFB=-0.0374186;REVB=0.00606916;RO=20;SAF=6;SAR=17;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0909417;STB=0.551076;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.0293359;OID=.;OPOS=20837701;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:20:20:23:23:0.534884:17:6:7:13:17:6:7:13
chr14	20841707	.	C	T	232.26	PASS	AF=0.564103;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.000554712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.349;QD=23.8213;RBI=0.0255455;REFB=-0.0229596;REVB=0.0255395;RO=15;SAF=15;SAR=7;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0441354;STB=0.512184;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0151994;OID=.;OPOS=20841707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:15:17:22:22:0.564103:7:15:11:4:7:15:12:5
chr14	20846331	.	G	GC	69.18	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=35;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0305435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.7307;QD=8.13899;RBI=0.0731975;REFB=-0.0902798;REVB=-0.0665205;RO=21;SAF=2;SAR=12;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468932;STB=0.666405;STBP=0.129;TYPE=ins;VARB=0.109647;OID=.;OPOS=20846332;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.411765:14:35:14:34:20:3:11:9:11:69:21:2:12:11:10
chr14	20847202	.	A	G	183.06	PASS	AF=0.4;AO=21;DP=55;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.00900057;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.184;QD=13.3134;RBI=0.0139228;REFB=-0.0125599;REVB=0.0106224;RO=33;SAF=8;SAR=13;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478585;STB=0.509361;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0182739;OID=.;OPOS=20847202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:33:33:21:22:0.4:13:8:14:19:13:9:14:19
chr14	20850093	.	C	T	447.75	PASS	AF=0.511628;AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=34;FSRR=8;FWDB=-0.00418417;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.885;QD=20.8254;RBI=0.0446447;REFB=-0.0186107;REVB=0.0444482;RO=42;SAF=25;SAR=19;SRF=34;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226304;STB=0.624114;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0230327;OID=.;OPOS=20850093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:42:42:44:44:0.511628:19:25:34:8:19:25:34:8
chr14	20852029	.	A	G	135.84	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.000719204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.409;QD=17.5273;RBI=0.00608787;REFB=-0.0122217;REVB=0.00604524;RO=16;SAF=6;SAR=9;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254966;STB=0.645381;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00806046;OID=.;OPOS=20852029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:9:6:11:5:9:6:11:5
chr14	20852770	.	G	T	246.67	PASS	AF=0.451613;AO=27;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=0.00726466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.674;QD=15.9141;RBI=0.0341572;REFB=-0.0257503;REVB=-0.0333757;RO=34;SAF=21;SAR=6;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0580458;STB=0.539187;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0369298;OID=.;OPOS=20852770;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:34:34:27:28:0.451613:6:21:25:9:6:22:25:9
chr14	20852817	.	G	A	146.61	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.100697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.28;QD=13.9629;RBI=0.103138;REFB=-0.0229394;REVB=0.0223061;RO=25;SAF=10;SAR=7;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144918;STB=0.583241;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0588982;OID=.;OPOS=20852817;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:7:10:18:7:7:10:18:7
chr14	20854734	.	A	G	1250.27	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0204976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.128;QD=60.2541;RBI=0.0226868;REFB=-0.155408;REVB=-0.00972324;RO=0;SAF=28;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44411e-08;STB=0.504586;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000221836;OID=.;OPOS=20854734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:0:1:82:82:0.987952:54:28:0:0:54:28:0:1
chr14	20863677	.	C	A	512.69	PASS	AF=0.578313;AO=47;DP=82;FAO=48;FDP=83;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0148437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.05;QD=24.708;RBI=0.0152854;REFB=0.0167106;REVB=-0.00364787;RO=35;SAF=22;SAR=25;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00855932;STB=0.509307;STBP=0.855;TYPE=snp;VARB=-0.0129927;OID=.;OPOS=20863677;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:35:35:47:48:0.578313:25:22:16:19:25:23:16:19
chr14	20897064	.	C	T	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.211;QD=50.4098;RBI=0.0366669;REFB=0;REVB=0.00582977;RO=0;SAF=16;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405946;OID=.;OPOS=20897064;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:3:16:0:0:3:16:0:0
chr14	20897676	.	T	C	343.12	PASS	AF=0.430233;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=86;FR=.;FRO=49;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=-0.00214402;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.23;QD=15.9591;RBI=0.00580076;REFB=-0.02167;REVB=0.00538999;RO=50;SAF=23;SAR=14;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00175422;STB=0.50566;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0271606;OID=.;OPOS=20897676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:50:49:37:37:0.430233:14:23:31:19:14:23:30:19
chr14	20898308	.	C	T	68.08	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0431032;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.819;QD=14.3321;RBI=0.0433546;REFB=-0.0222074;REVB=-0.00466179;RO=10;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033981;STB=0.519956;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.0496323;OID=.;OPOS=20898308;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:10:10:9:9:0.473684:3:6:7:3:3:6:7:3
chr14	20916958	.	T	C	76.63	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0299269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.206;QD=12.7717;RBI=0.0410192;REFB=-0.0255449;REVB=0.0280527;RO=14;SAF=9;SAR=1;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.467302;STB=0.786787;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0431858;OID=.;OPOS=20916958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:1:9:8:6:1:9:8:6
chr14	20920250	.	T	C	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.0222139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.35;QD=8.81206;RBI=0.0287505;REFB=-0.0280544;REVB=0.0182519;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246742;STB=0.515121;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0451756;OID=.;OPOS=20920250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:5:5:11:12:5:5:11:12
chr14	20940515	.	C	T	242.74	PASS	AF=0.391892;AO=28;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0180977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.924;QD=13.1213;RBI=0.018323;REFB=-0.00341293;REVB=-0.00286483;RO=45;SAF=12;SAR=16;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315299;STB=0.529837;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=0.00462172;OID=.;OPOS=20940515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:45:45:28:29:0.391892:16:12:18:27:16:13:18:27
chr14	20940606	.	G	A	303.41	PASS	AF=0.336207;AO=39;DP=115;FAO=39;FDP=116;FR=.;FRO=77;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=39;FSRR=38;FWDB=0.000888576;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.237;QD=10.4624;RBI=0.0385458;REFB=-0.000233298;REVB=-0.0385355;RO=76;SAF=19;SAR=20;SRF=39;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029726;STB=0.512814;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.000499315;OID=.;OPOS=20940606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:116:76:77:39:39:0.336207:20:19:39:37:20:19:39:38
chr14	20940626	.	C	T	488.36	PASS	AF=0.425197;AO=54;DP=127;FAO=54;FDP=127;FR=.;FRO=73;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=35;FWDB=-0.0155451;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=326.025;QD=15.3815;RBI=0.0156259;REFB=-0.000194882;REVB=0.00158707;RO=73;SAF=25;SAR=29;SRF=38;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0590335;STB=0.533107;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0002758;OID=.;OPOS=20940626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:73:73:54:54:0.425197:29:25:38:35:29:25:38:35
chr14	20942744	.	A	G	162.83	PASS	AF=0.323529;AO=19;DP=65;FAO=22;FDP=68;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=-0.0123351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.278;QD=9.57848;RBI=0.0403343;REFB=-0.0164312;REVB=-0.0384018;RO=46;SAF=13;SAR=6;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.341382;STB=0.663012;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.0235339;OID=.;OPOS=20942744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:68:46:46:19:22:0.323529:6:13:18:28:8:14:18:28
chr14	21024619	.	A	G	657.79	PASS	AF=0.588785;AO=63;DP=107;FAO=63;FDP=107;FR=.;FRO=44;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=0.018357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1667;QD=24.5904;RBI=0.0276333;REFB=-0.00792192;REVB=0.0206548;RO=44;SAF=37;SAR=26;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497471;STB=0.527121;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.004745;OID=.;OPOS=21024619;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:44:44:63:63:0.588785:26:37:23:21:26:37:23:21
chr14	21024786	.	A	G	633.44	PASS	AF=0.460993;AO=65;DP=141;FAO=65;FDP=141;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=38;FSRR=38;FWDB=-0.00662943;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=281.114;QD=17.9699;RBI=0.0088263;REFB=-0.00633504;REVB=0.00582702;RO=75;SAF=28;SAR=37;SRF=37;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0609391;STB=0.537637;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.00685638;OID=.;OPOS=21024786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:75:76:65:65:0.460993:37:28:37:38:37:28:38:38
chr14	21081996	.	C	T	1261.53	PASS	AF=0.90625;AO=87;DP=97;FAO=87;FDP=96;FR=.;FRO=9;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.00684048;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2542;QD=52.5637;RBI=0.0530028;REFB=-0.107502;REVB=0.0525596;RO=9;SAF=39;SAR=48;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607526;STB=0.532156;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00339435;OID=.;OPOS=21081996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:97:96:9:9:87:87:0.90625:48:39:1:8:48:39:1:8
chr14	21099400	.	G	A	973.01	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.486;QD=58.9702;RBI=0.0529648;REFB=0;REVB=0.0306257;RO=0;SAF=21;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.60481e-05;OID=.;OPOS=21099400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:44:21:0:0:45:21:0:0
chr14	21101155	.	C	T	881.5	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0498149;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.488;QD=57.8035;RBI=0.0610989;REFB=0;REVB=0.0353773;RO=0;SAF=31;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000100244;OID=.;OPOS=21101155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:61:0:0:59:61:1:28:31:0:0:28:33:0:0
chr14	21109141	.	C	T	754.83	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.065;QD=56.9681;RBI=0.0489881;REFB=0;REVB=0.0412222;RO=0;SAF=41;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184043;OID=.;OPOS=21109141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:11:41:0:0:12:41:0:0
chr14	21109170	.	T	A	801.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00642292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.52;QD=57.2371;RBI=0.0450085;REFB=0;REVB=-0.0445478;RO=0;SAF=41;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000447614;OID=.;OPOS=21109170;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:15:41:0:0:15:41:0:0
chr14	21149930	.	T	C	308.3	PASS	AF=0.380435;AO=35;DP=92;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=32;FWDB=-0.0120358;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.288;QD=13.4042;RBI=0.0158885;REFB=-0.00277806;REVB=0.0103723;RO=57;SAF=20;SAR=15;SRF=25;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143668;STB=0.581997;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.00534764;OID=.;OPOS=21149930;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:57:57:35:35:0.380435:15:20:25:32:15:20:25:32
chr14	21151483	.	T	G	1224.82	PASS	AF=0.56338;AO=115;DP=209;FAO=120;FDP=213;FR=.;FRO=93;FSAF=63;FSAR=57;FSRF=49;FSRR=44;FWDB=0.0324389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4149;QD=23.0013;RBI=0.0329269;REFB=-0.0315977;REVB=0.00564735;RO=94;SAF=58;SAR=57;SRF=50;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227634;STB=0.500824;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0281652;OID=.;OPOS=21151483;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:209:213:94:93:115:120:0.56338:57:58:50:44:57:63:49:44
chr14	21152167	.	G	C	265.51	PASS	AF=0.538462;AO=27;DP=51;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.000687749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.156;QD=20.4235;RBI=0.0248852;REFB=-0.00146827;REVB=0.0248757;RO=24;SAF=12;SAR=15;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185879;STB=0.592578;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00227759;OID=.;OPOS=21152167;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:24:24:27:28:0.538462:15:12:16:8:15:13:16:8
chr14	21167576	.	A	T	169.84	PASS	AF=0.349206;AO=22;DP=64;FAO=22;FDP=63;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.0224881;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2761;QD=10.7834;RBI=0.0862097;REFB=-0.0113145;REVB=-0.083225;RO=39;SAF=8;SAR=14;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29963;STB=0.686112;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0310907;OID=.;OPOS=21167576;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:39:41:22:22:0.349206:14:8:25:14:14:8:27:14
chr14	21168055	.	T	C	214.07	PASS	AF=0.321429;AO=27;DP=83;FAO=27;FDP=84;FR=.;FRO=57;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=31;FWDB=0.00546934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.185;QD=10.194;RBI=0.028971;REFB=-0.00690689;REVB=-0.0284501;RO=52;SAF=10;SAR=17;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0848706;STB=0.560394;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0124449;OID=.;OPOS=21168055;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:52:57:27:27:0.321429:17:10:23:29:17:10:26:31
chr14	21168084	.	C	T	127.34	PASS	AF=0.309091;AO=17;DP=55;FAO=17;FDP=55;FR=.;FRO=38;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.10459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0365;QD=9.26088;RBI=0.11231;REFB=-0.00983402;REVB=-0.0409205;RO=37;SAF=6;SAR=11;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643875;STB=0.54994;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0167038;OID=.;OPOS=21168084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:37:38:17:17:0.309091:11:6:15:22:11:6:16:22
chr14	21215997	.	C	T	187.5	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.003171;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.583;QD=13.8889;RBI=0.0163406;REFB=-0.0163036;REVB=-0.01603;RO=32;SAF=13;SAR=9;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301236;STB=0.517285;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.015827;OID=.;OPOS=21215997;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:9:13:18:14:9:13:18:14
chr14	21216499	.	C	T	747.09	PASS	AF=1;AO=38;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00989051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.256;QD=63.5824;RBI=0.0228627;REFB=0;REVB=-0.0206126;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.61647e-05;OID=.;OPOS=21216499;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:38:47:1:20:18:0:0:29:18:0:0
chr14	21238318	.	G	A	446.98	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.771;QD=57.6749;RBI=0.0461713;REFB=0;REVB=0.0346289;RO=0;SAF=7;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000395276;OID=.;OPOS=21238318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:24:7:0:0:24:7:0:0
chr14	21238798	.	T	C	223.56	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0145723;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.01;QD=14.9038;RBI=0.0160163;REFB=-0.0196538;REVB=0.00664605;RO=34;SAF=12;SAR=14;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183856;STB=0.603983;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0239744;OID=.;OPOS=21238798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:14:12:22:12:14:12:22:12
chr14	21250366	.	T	C	1370.84	PASS	AF=1;AO=80;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=35;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00902719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2887;QD=61.6107;RBI=0.0800749;REFB=0;REVB=0.0795644;RO=0;SAF=35;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.30416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222978;OID=.;OPOS=21250366;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:80:89:1:45:35:0:0:54:35:0:0
chr14	21360216	.	C	G	489.87	PASS	AF=1;AO=29;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0397424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.041;QD=55.9852;RBI=0.285028;REFB=0;REVB=0.282244;RO=0;SAF=23;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016631;OID=.;OPOS=21360216;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:29:35:1:6:23:0:0:12:23:0:0
chr14	21387994	.	A	G	811.62	PASS	AF=0.567164;AO=75;DP=133;FAO=76;FDP=134;FR=.;FRO=58;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=29;FWDB=0.00397112;FXX=0.0218962;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.463;QD=24.2275;RBI=0.00883281;REFB=-0.00846831;REVB=0.00788979;RO=57;SAF=40;SAR=35;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0195027;STB=0.517142;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.011407;OID=.;OPOS=21387994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:134:57:58:75:76:0.567164:35:40:29:28:35:41:29:29
chr14	21388266	.	G	C	357.15	PASS	AF=0.641509;AO=34;DP=53;FAO=34;FDP=53;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0117533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.558;QD=26.9549;RBI=0.0437009;REFB=-0.0176695;REVB=-0.0420908;RO=19;SAF=16;SAR=18;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00203507;STB=0.501113;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0109292;OID=.;OPOS=21388266;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:19:19:34:34:0.641509:18:16:9:10:18:16:9:10
chr14	21424365	.	A	G	467.2	PASS	AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.0109687;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.094;QD=21.986;RBI=0.0117269;REFB=-0.029565;REVB=0.00414824;RO=37;SAF=31;SAR=14;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0125637;STB=0.506125;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0230297;OID=.;OPOS=21424365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:37:40:45:45:0.529412:14:31:25:12:14:31:28:12
chr14	21463050	.	G	C	340.01	PASS	AF=0.425287;AO=37;DP=87;FAO=37;FDP=87;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0233645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.09;QD=15.6325;RBI=0.0244555;REFB=0.0130068;REVB=-0.007223;RO=50;SAF=18;SAR=19;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0544557;STB=0.53071;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=-0.0126727;OID=.;OPOS=21463050;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:50:50:37:37:0.425287:19:18:27:23:19:18:27:23
chr14	21467913	.	T	G	1015.02	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.177;QD=58.8415;RBI=0.036975;REFB=0;REVB=0.0299107;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000437192;OID=.;OPOS=21467913;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:68:69:1:33:35:0:0:33:36:0:0
chr14	21486137	.	G	C	1222.85	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0463089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.451;QD=60.3878;RBI=0.0719146;REFB=0;REVB=-0.05502;RO=0;SAF=32;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62891e-06;OID=.;OPOS=21486137;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:77:81:0:0:77:81:1:45:32:0:0:45:36:0:0
chr14	21486387	.	G	A	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.00535772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5748;QD=9.7602;RBI=0.00617339;REFB=0.00543452;REVB=0.00306686;RO=12;SAF=4;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125019;STB=0.50767;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=-0.0144612;OID=.;OPOS=21486387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:3:4:7:5:3:4:7:5
chr14	21486590	.	C	T	122.31	PASS	AF=0.293103;AO=17;DP=58;FAO=17;FDP=58;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.00948098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.502;QD=8.43497;RBI=0.0251321;REFB=-0.00558171;REVB=-0.0232751;RO=36;SAF=7;SAR=10;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101744;STB=0.588131;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00771739;OID=.;OPOS=21486590;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:41:17:17:0.293103:10:7:18:18:10:7:22:19
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chr14	21500455	.	T	A	170.34	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0038385;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.478;QD=17.0335;RBI=0.0328805;REFB=-0.0135168;REVB=-0.0326557;RO=22;SAF=13;SAR=5;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351447;STB=0.701476;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0108874;OID=.;OPOS=21500455;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:5:13:8:14:5:13:8:14
chr14	21501151	.	G	T	185.6	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0175172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5153;QD=13.7479;RBI=0.0564305;REFB=0.00500398;REVB=0.0536428;RO=31;SAF=16;SAR=6;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170588;STB=0.610581;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.00807559;OID=.;OPOS=21501151;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:32:22:22:0.407407:6:16:18:13:6:16:18:14
chr14	21502345	.	A	G	337.49	PASS	AF=0.522388;AO=35;DP=67;FAO=35;FDP=67;FR=.;FRO=32;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0185955;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.149;QD=20.1484;RBI=0.0186642;REFB=-0.0536725;REVB=0.00159987;RO=32;SAF=22;SAR=13;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00328766;STB=0.501824;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0482504;OID=.;OPOS=21502345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:32:32:35:35:0.522388:13:22:20:12:13:22:20:12
chr14	21511458	.	G	C	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.125089;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.8383;QD=12.7377;RBI=0.127844;REFB=-0.00340759;REVB=-0.0263963;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0930819;STB=0.555418;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.00995734;OID=.;OPOS=21511458;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:4:4:4:6:4:4:4:6
chr14	21511497	.	C	T	87.86	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.00356935;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.284;QD=12.5519;RBI=0.0619212;REFB=-0.0173245;REVB=-0.0618183;RO=16;SAF=8;SAR=3;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246768;STB=0.666349;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0131597;OID=.;OPOS=21511497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:29:28:16:17:11:11:0.392857:3:8:8:8:3:8:8:9
chr14	21526079	.	C	T	87.47	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00337675;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=240.975;QD=13.4568;RBI=0.0253326;REFB=-0.0252951;REVB=0.0251066;RO=11;SAF=4;SAR=7;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235046;STB=0.599815;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0388375;OID=.;OPOS=21526079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:25:26:11:15:11:11:0.423077:7:4:7:4:7:4:8:7
chr14	21549893	.	G	C	278.35	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0214825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.605;QD=48.4081;RBI=0.0616147;REFB=-0.016557;REVB=0.0577484;RO=1;SAF=12;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369717;STB=0.519982;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000497476;OID=.;OPOS=21549893;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:23:1:1:22:22:0.956522:10:12:1:0:10:12:1:0
chr14	21550473	.	G	GC	45.7	PASS	AF=0.135802;AO=29;DP=167;FAO=22;FDP=162;FR=.;FRO=140;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=61;FSRR=79;FWDB=-0.0208653;FXX=0.0240949;HRUN=0;LEN=1;MLLD=77.4188;QD=1.12834;RBI=0.071858;REFB=-0.0110685;REVB=-0.068762;RO=131;SAF=20;SAR=9;SRF=57;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322411;STB=0.825124;STBP=0.002;TYPE=ins;VARB=0.239318;OID=.;OPOS=21550474;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.135802:29:167:22:162:140:18:4:61:79:45:131:20:9:57:74
chr14	21551058	.	G	A	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000401465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.573;QD=56.1906;RBI=0.0222148;REFB=0;REVB=0.0222112;RO=0;SAF=19;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000101293;OID=.;OPOS=21551058;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:9:19:0:0:9:19:0:0
chr14	21551069	.	T	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362787;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.697;QD=55.0986;RBI=0.0363377;REFB=0;REVB=-0.00206842;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122971;OID=.;OPOS=21551069;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0
chr14	21556963	.	A	AT	344.55	PASS	AF=1;AO=27;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0638092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.6019;QD=43.0689;RBI=0.125246;REFB=0;REVB=0.107772;RO=5;SAF=17;SAR=10;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0695804;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00672811;OID=.;OPOS=21556964;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:27:32:32:32:0:19:13:0:0:6:5:17:10:2:3
chr14	21562560	.	T	C	801.23	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3093;QD=57.231;RBI=0.0426215;REFB=0;REVB=-0.039491;RO=0;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000565841;OID=.;OPOS=21562560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:21:35:0:0:21:35:0:0
chr14	21570273	.	T	C	549.9	PASS	AF=0.95;AO=37;DP=39;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00598089;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.985;QD=54.9901;RBI=0.0344749;REFB=0.00150393;REVB=0.0339521;RO=2;SAF=17;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.003913;STB=0.502658;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-4.55146e-05;OID=.;OPOS=21570273;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:39:40:2:2:37:38:0.95:20:17:1:1:21:17:1:1
chr14	21570614	.	A	C	1088.81	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.114;QD=59.661;RBI=0.0211989;REFB=0;REVB=0.0146322;RO=0;SAF=22;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160231;OID=.;OPOS=21570614;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:50:22:0:0:50:23:0:0
chr14	21623117	.	C	T	351.16	PASS	AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.000327344;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=356.67;QD=18.0081;RBI=0.0157329;REFB=-0.00544618;REVB=0.0157295;RO=41;SAF=22;SAR=15;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00898413;STB=0.505019;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=0.00582147;OID=.;OPOS=21623117;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:41:41:37:37:0.474359:15:22:24:17:15:22:24:17
chr14	21623290	.	T	C	253.46	PASS	AF=0.326316;AO=31;DP=95;FAO=31;FDP=95;FR=.;FRO=64;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=40;FWDB=0.00524759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.639;QD=10.6719;RBI=0.0100236;REFB=-0.00533328;REVB=0.0085402;RO=63;SAF=15;SAR=16;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138246;STB=0.573724;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0125032;OID=.;OPOS=21623290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:63:64:31:31:0.326316:16:15:23:40:16:15:24:40
chr14	21623489	.	C	T	198.16	PASS	AF=0.606061;AO=19;DP=31;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0140806;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.502;QD=24.0196;RBI=0.0160538;REFB=-0.0423441;REVB=0.00771128;RO=12;SAF=9;SAR=10;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398011;STB=0.504583;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.0195128;OID=.;OPOS=21623489;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:33:12:13:19:20:0.606061:10:9:5:7:11:9:6:7
chr14	21623836	.	G	A	290.03	PASS	AF=0.463768;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=69;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.0547793;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.1579;QD=16.8131;RBI=0.0606236;REFB=-0.0251994;REVB=-0.0259703;RO=33;SAF=10;SAR=22;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298979;STB=0.642093;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0266106;OID=.;OPOS=21623836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:69:33:37:32:32:0.463768:22:10:21:12:22:10:21:16
chr14	21756212	.	C	T	111.42	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0130167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.573;QD=15.9168;RBI=0.0155083;REFB=-0.0180662;REVB=-0.00843053;RO=15;SAF=5;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139734;STB=0.580879;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0280338;OID=.;OPOS=21756212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:8:5:8:7:8:5:8:7
chr14	21770730	.	A	G	923.39	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0365921;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.467;QD=56.8242;RBI=0.0388367;REFB=0.0455439;REVB=0.0130117;RO=1;SAF=24;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192711;STB=0.510201;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.000116309;OID=.;OPOS=21770730;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:40:24:1:0:40:24:1:0
chr14	21778792	.	T	C	366.43	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235728;FXX=0.0714031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.214;QD=56.3744;RBI=0.0515721;REFB=0;REVB=0.0458694;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284525;OID=.;OPOS=21778792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:14:12:0:0:14:12:0:0
chr14	21796784	.	G	C	40.29	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.0763453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0561;QD=14.6525;RBI=0.0838032;REFB=0.0298236;REVB=-0.0345597;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120202;STB=0.571205;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=-0.0676815;OID=.;OPOS=21796784;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:2:4:4:1:2:4:4:1
chr14	21829129	.	C	G	1607.64	PASS	AF=0.990991;AO=108;DP=110;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=54;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00625624;FXX=0.00892777;HRUN=4;LEN=1;MLLD=102.119;QD=57.9331;RBI=0.00677576;REFB=-0.135559;REVB=0.002602;RO=2;SAF=55;SAR=53;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000319582;STB=0.504424;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00123635;OID=.;OPOS=21829129;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:110:111:2:1:108:110:0.990991:53:55:1:1:54:56:1:0
chr14	21831052	.	T	C	1044.31	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.022;QD=59.6749;RBI=0.091913;REFB=0;REVB=0.0913323;RO=0;SAF=48;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117556;OID=.;OPOS=21831052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:22:48:0:0:22:48:0:0
chr14	21871653	.	C	T	807.78	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00125477;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1687;QD=55.7087;RBI=0.010314;REFB=-0.126376;REVB=-0.0102374;RO=1;SAF=32;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145113;STB=0.50769;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.000543369;OID=.;OPOS=21871653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:58:1:1:57:57:0.982759:25:32:1:0:25:32:1:0
chr14	21945415	.	A	G	501.44	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8248;QD=58.9926;RBI=0.0575868;REFB=0;REVB=-0.0527814;RO=0;SAF=24;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000682526;OID=.;OPOS=21945415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:10:24:0:0:10:24:0:0
chr14	21967438	.	G	A	972.01	PASS	AF=0.957746;AO=68;DP=71;FAO=68;FDP=71;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0348077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=325.804;QD=54.7612;RBI=0.0416507;REFB=-0.0331412;REVB=0.0228737;RO=2;SAF=38;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00321836;STB=0.504624;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.000906075;OID=.;OPOS=21967438;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:71:71:2:3:68:68:0.957746:30:38:1:1:30:38:2:1
chr14	21967916	.	A	G,T	624.14	PASS	AF=0.952381,0.047619;AO=36,2;DP=38;FAO=40,2;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=20,2;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438217,0.0335358;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=192.163,145.733;QD=59.4415;RBI=0.0473315,0.0351605;REFB=0,0;REVB=0.0178865,0.0105645;RO=0;SAF=20,2;SAR=16,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.9376e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00127389,0.00284241;OID=.,.;OPOS=21967916,21967916;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:38:42:0:0:36,2:40,2:0.952381,0.047619:16,0:20,2:0:0:20,0:20,2:0:0
chr14	21992111	.	GCCCCCA	GCCCC,GCCCCA	54.9	PASS	AF=0,0.631579;AO=3,8;DP=19;FAO=0,12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=0,6;FSAR=0,6;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0690202,-0.0502539;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=17.8696,8.75809;QD=11.5578;RBI=0.080171,0.167117;REFB=-0.00703736,-0.0899912;REVB=0.0407873,0.159382;RO=7;SAF=2,3;SAR=1,5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.102358,-0.158056;STB=0.5,0.526272;STBP=1,0.806;TYPE=del,del;VARB=0,0.0996964;OID=.,.;OPOS=21992116,21992112;OREF=CA,C;OALT=-,-;OMAPALT=GCCCC,GCCCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.631579:3,8:19:0,12:19:7:0,6:0,6:4:3:21:7:2,3:1,5:4:3
chr14	21993498	.	G	A	135.19	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0375631;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2633;QD=16.8988;RBI=0.0505738;REFB=-0.030727;REVB=-0.0338634;RO=18;SAF=9;SAR=6;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0669461;STB=0.559923;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0554122;OID=.;OPOS=21993498;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:32:18:17:15:15:0.46875:6:9:12:6:6:9:12:5
chr14	22038450	.	G	A	545.12	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00417703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0358;QD=57.3807;RBI=0.00471571;REFB=-0.0292788;REVB=0.0021887;RO=1;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240105;STB=0.512814;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000712436;OID=.;OPOS=22038450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:19:18:0:1:19:18:0:1
chr14	22038659	.	T	C	513.18	PASS	AF=1;AO=27;DP=36;FAO=34;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0694887;FXX=0.0555401;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.137;QD=60.3738;RBI=0.13712;REFB=0;REVB=0.118208;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114893;OID=.;OPOS=22038659;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:34:0:0:27:34:1:6:21:0:0:11:23:0:0
chr14	22102374	.	T	C	143.57	PASS	AF=0.421053;AO=15;DP=37;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0240603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.72;QD=15.1122;RBI=0.0308733;REFB=-0.00782339;REVB=-0.0193459;RO=22;SAF=10;SAR=5;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.083897;STB=0.561964;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0102019;OID=.;OPOS=22102374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:22:22:15:16:0.421053:5:10:13:9:5:11:13:9
chr14	22102439	.	C	G	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.00697151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.332;QD=14.6579;RBI=0.00698204;REFB=0.00122498;REVB=0.000383238;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122807;STB=0.57132;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.00182258;OID=.;OPOS=22102439;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:17:17:13:13:0.433333:6:7:7:10:6:7:7:10
chr14	22102592	.	T	C	41.98	PASS	AF=0.184211;AO=7;DP=38;FAO=7;FDP=38;FR=.;FRO=31;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.00961828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.909;QD=4.41849;RBI=0.0115019;REFB=-0.0198345;REVB=0.00630731;RO=31;SAF=2;SAR=5;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315258;STB=0.713674;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0652941;OID=.;OPOS=22102592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:38:38:31:31:7:7:0.184211:5:2:17:14:5:2:17:14
chr14	22102612	.	T	C	51.0	PASS	AF=0.210526;AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.036793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.374;QD=5.36795;RBI=0.0390383;REFB=0.00545914;REVB=0.0130485;RO=30;SAF=2;SAR=6;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.380372;STB=0.749376;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.00644488;OID=.;OPOS=22102612;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:38:38:30:30:8:8:0.210526:6:2:17:13:6:2:17:13
chr14	22133416	.	A	G	230.57	PASS	AF=0.368421;AO=26;DP=75;FAO=28;FDP=76;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=42;FWDB=0.0103288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.342;QD=12.1351;RBI=0.0134888;REFB=-0.0161392;REVB=-0.00867543;RO=47;SAF=6;SAR=20;SRF=6;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182949;STB=0.617576;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0192346;OID=.;OPOS=22133416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:47:48:26:28:0.368421:20:6:6:41:21:7:6:42
chr14	22133648	.	G	A	382.91	PASS	AF=0.470588;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=85;FR=.;FRO=45;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.0158679;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8874;QD=18.0192;RBI=0.0621007;REFB=-0.00184878;REVB=0.0600392;RO=45;SAF=19;SAR=21;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139081;STB=0.577493;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0056191;OID=.;OPOS=22133648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:45:45:40:40:0.470588:21:19:28:17:21:19:28:17
chr14	22133997	.	A	G	555.06	PASS	AF=0.582418;AO=50;DP=88;FAO=53;FDP=91;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.00366698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.583;QD=24.398;RBI=0.00552296;REFB=-0.00758044;REVB=-0.00412993;RO=38;SAF=19;SAR=31;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17929;STB=0.57953;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00704152;OID=.;OPOS=22133997;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:91:38:38:50:53:0.582418:31:19:23:15:31:22:23:15
chr14	22204568	.	G	A	577.26	PASS	AF=0.47619;AO=60;DP=125;FAO=60;FDP=126;FR=.;FRO=66;FSAF=30;FSAR=30;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=0.0162244;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=98.7571;QD=18.3258;RBI=0.0243531;REFB=-0.0128655;REVB=-0.0181615;RO=65;SAF=30;SAR=30;SRF=34;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216565;STB=0.507934;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0118353;OID=.;OPOS=22204568;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:126:65:66:60:60:0.47619:30:30:34:31:30:30:34:32
chr14	22236756	.	G	C	273.97	PASS	AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.000573655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2435;QD=15.2207;RBI=0.0187716;REFB=-0.00239607;REVB=0.0187628;RO=41;SAF=25;SAR=6;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17308;STB=0.598921;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.00406244;OID=.;OPOS=22236756;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:41:41:31:31:0.430556:6:25:28:13:6:25:28:13
chr14	22237070	.	C	T	422.96	PASS	AF=0.455446;AO=46;DP=102;FAO=46;FDP=101;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.00502915;FXX=0.00980296;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.239;QD=16.7509;RBI=0.00833163;REFB=-0.0193101;REVB=-0.00664256;RO=55;SAF=28;SAR=18;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219873;STB=0.622701;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0211974;OID=.;OPOS=22237070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:55:55:46:46:0.455446:18:28:21:34:18:28:21:34
chr14	22237127	.	C	T	1097.93	PASS	AF=0.961538;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00615074;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=240.499;QD=56.3041;RBI=0.0187447;REFB=-0.148981;REVB=0.0177068;RO=2;SAF=33;SAR=42;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00298944;STB=0.504166;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=-2.47655e-05;OID=.;OPOS=22237127;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:78:78:2:3:75:75:0.961538:42:33:1:1:42:33:1:2
chr14	22309847	.	T	C	302.8	PASS	AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.00687034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.879;QD=17.059;RBI=0.0174393;REFB=-0.00743943;REVB=-0.016029;RO=37;SAF=20;SAR=13;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114732;STB=0.57188;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.00918798;OID=.;OPOS=22309847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:37:38:33:33:0.464789:13:20:18:19:13:20:18:20
chr14	22309948	.	T	C	114.05	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.039326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4892;QD=18.2485;RBI=0.0394807;REFB=-0.0266048;REVB=0.00349239;RO=12;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379419;STB=0.521706;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0177241;OID=.;OPOS=22309948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:6:7:7:5:6:7:7:5
chr14	22314985	.	T	C	385.94	PASS	AF=0.423077;AO=44;DP=104;FAO=44;FDP=104;FR=.;FRO=60;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=30;FWDB=0.0234143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.772;QD=14.8439;RBI=0.0237277;REFB=-0.00921844;REVB=-0.0038439;RO=60;SAF=23;SAR=21;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0233105;STB=0.513117;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0126033;OID=.;OPOS=22314985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:60:60:44:44:0.423077:21:23:30:30:21:23:30:30
chr14	22315212	.	A	G	461.18	PASS	AF=0.46729;AO=48;DP=106;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=39;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=0.0174573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.958;QD=17.2403;RBI=0.0316266;REFB=-0.0288773;REVB=-0.026372;RO=56;SAF=37;SAR=11;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.195417;STB=0.612517;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0446319;OID=.;OPOS=22315212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:56:57:48:50:0.46729:11:37:34:22:11:39:35:22
chr14	22337393	.	G	A	1164.34	PASS	AF=1;AO=64;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.2798;QD=60.4852;RBI=0.144995;REFB=0;REVB=-0.0719861;RO=0;SAF=28;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000722956;OID=.;OPOS=22337393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:64:77:1:36:28:0:0:37:40:0:0
chr14	22356491	.	G	T	1150.68	PASS	AF=0.91954;AO=80;DP=87;FAO=80;FDP=87;FR=.;FRO=7;FSAF=34;FSAR=46;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0156707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3915;QD=52.9048;RBI=0.0582178;REFB=-0.0219245;REVB=0.056069;RO=5;SAF=34;SAR=46;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00284422;STB=0.512006;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0106794;OID=.;OPOS=22356491;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:87:87:5:7:80:80:0.91954:46:34:2:3:46:34:4:3
chr14	22356551	.	T	C	1102.6	PASS	AF=1;AO=74;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8787;QD=57.2782;RBI=0.134765;REFB=-0.0559427;REVB=0.134089;RO=3;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399257;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00525099;OID=.;OPOS=22356551;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:77:77:3:0:74:77:1:34:40:0:3:37:40:0:0
chr14	22362971	.	A	G	1877.98	PASS	AF=0.941176;AO=128;DP=136;FAO=128;FDP=136;FR=.;FRO=8;FSAF=68;FSAR=60;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0227968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.1413;QD=55.2346;RBI=0.0249594;REFB=-0.0539581;REVB=-0.0101626;RO=8;SAF=68;SAR=60;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105065;STB=0.505539;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0301551;OID=.;OPOS=22362971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:136:136:8:8:128:128:0.941176:60:68:5:3:60:68:5:3
chr14	22386449	.	C	T	790.61	PASS	AF=0.427136;AO=84;DP=199;FAO=85;FDP=199;FR=.;FRO=114;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=43;FSRR=71;FWDB=-0.0129897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.88;QD=15.8917;RBI=0.0170343;REFB=-0.00659188;REVB=-0.0110197;RO=114;SAF=37;SAR=47;SRF=44;SRR=70;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0575147;STB=0.540818;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.00713978;OID=.;OPOS=22386449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:199:114:114:84:85:0.427136:47:37:44:70:47:38:43:71
chr14	22392304	.	G	A	149.46	PASS	AF=0.322581;AO=18;DP=61;FAO=20;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0257122;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0583;QD=9.64243;RBI=0.0257135;REFB=0.00568874;REVB=-0.00026025;RO=43;SAF=10;SAR=8;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0030788;STB=0.548339;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=-0.0429752;OID=.;OPOS=22392304;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:43:42:18:20:0.322581:8:10:24:19:10:10:24:18
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chr14	22392626	.	A	C	408.33	PASS	AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0100197;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.7504;QD=20.4164;RBI=0.0173051;REFB=-0.0182714;REVB=0.0141093;RO=39;SAF=22;SAR=19;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020979;STB=0.511622;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0171601;OID=.;OPOS=22392626;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:39:39:41:41:0.5125:19:22:20:19:19:22:20:19
chr14	22392703	.	G	C	360.12	PASS	AF=0.571429;AO=36;DP=63;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.000881568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.784;QD=22.8645;RBI=0.00439387;REFB=-0.0273827;REVB=0.00430453;RO=27;SAF=23;SAR=13;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0982378;STB=0.554186;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0165602;OID=.;OPOS=22392703;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:27:27:36:36:0.571429:13:23:14:13:13:23:14:13
chr14	22509188	.	T	C	422.32	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00698537;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3146;QD=54.4933;RBI=0.00897109;REFB=-0.00487721;REVB=-0.00562894;RO=1;SAF=12;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0372625;STB=0.519987;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0025369;OID=.;OPOS=22509188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:31:1:1:30:30:0.967742:18:12:1:0:18:12:1:0
chr14	22555013	.	T	C	1111.36	PASS	AF=0.987013;AO=75;DP=77;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0311445;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.3928;QD=57.7331;RBI=0.0374338;REFB=-0.163481;REVB=0.0207679;RO=2;SAF=45;SAR=30;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205638;STB=0.505375;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00643041;OID=.;OPOS=22555013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:77:2:1:75:76:0.987013:30:45:2:0:30:46:1:0
chr14	22591988	.	C	A	230.02	PASS	AF=0.564103;AO=19;DP=39;FAO=22;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0145667;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=198.383;QD=23.5917;RBI=0.0153477;REFB=-0.0524585;REVB=-0.00483355;RO=12;SAF=7;SAR=12;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152827;STB=0.558087;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.030301;OID=.;OPOS=22591988;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:12:17:19:22:0.564103:12:7:7:5:12:10:10:7
chr14	22600490	.	C	T	249.97	PASS	AF=0.466667;AO=27;DP=59;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0299892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.076;QD=16.6647;RBI=0.0358609;REFB=-0.0279711;REVB=0.0196636;RO=32;SAF=19;SAR=8;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295054;STB=0.648672;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.025672;OID=.;OPOS=22600490;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:32:32:27:28:0.466667:8:19:13:19:9:19:13:19
chr14	22600863	.	G	A	349.02	PASS	AF=0.45122;AO=37;DP=82;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.00540243;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=357.968;QD=17.0255;RBI=0.00562553;REFB=-0.00546062;REVB=0.00156853;RO=45;SAF=17;SAR=20;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0937944;STB=0.552603;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.00679044;OID=.;OPOS=22600863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:45:45:37:37:0.45122:20:17:25:20:20:17:25:20
chr14	22616547	.	A	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0385639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.903;QD=60.9782;RBI=0.0521969;REFB=0;REVB=0.0351758;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369998;OID=.;OPOS=22616547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr14	22631678	.	C	T	778.48	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.992;QD=56.617;RBI=0.0261931;REFB=0;REVB=0.023231;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.62964e-05;OID=.;OPOS=22631678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:55:0:0:53:55:1:21:32:0:0:21:34:0:0
chr14	22636784	.	A	C	826.7	PASS	AF=0.897059;AO=64;DP=71;FAO=61;FDP=68;FR=.;FRO=7;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.020477;FXX=0.0422476;HRUN=6;LEN=1;MLLD=210.755;QD=48.6296;RBI=0.032732;REFB=-0.046386;REVB=0.0255358;RO=7;SAF=36;SAR=28;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025149;STB=0.511624;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.000466663;OID=.;OPOS=22636784;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:71:68:7:7:64:61:0.897059:28:36:3:4:28:33:3:4
chr14	22636874	.	C	T	306.32	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5606;QD=53.2727;RBI=0.0307886;REFB=0;REVB=0.00912458;RO=0;SAF=10;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000616696;OID=.;OPOS=22636874;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:13:10:0:0:13:10:0:0
chr14	22670458	.	C	T	1538.93	PASS	AF=0.990476;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0247688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5118;QD=58.6259;RBI=0.0732504;REFB=-0.0909337;REVB=0.0689357;RO=1;SAF=53;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0088696;STB=0.504672;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.00138771;OID=.;OPOS=22670458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:105:1:1:104:104:0.990476:51:53:1:0:51:53:1:0
chr14	22670975	.	G	A	650.96	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0833317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4989;QD=61.996;RBI=0.111121;REFB=0;REVB=-0.0735099;RO=0;SAF=27;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013149;OID=.;OPOS=22670975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:15:27:0:0:15:27:0:0
chr14	22671141	.	C	T	359.96	PASS	AF=0.569231;AO=36;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00651273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.6623;QD=22.1512;RBI=0.0237999;REFB=-0.0291685;REVB=-0.0228915;RO=28;SAF=16;SAR=20;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128659;STB=0.575063;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0279009;OID=.;OPOS=22671141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:28:28:36:37:0.569231:20:16:17:11:21:16:17:11
chr14	22690209	.	A	C	920.07	PASS	AF=0.984848;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0548376;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1855;QD=55.7619;RBI=0.0548654;REFB=-0.0431505;REVB=0.00174591;RO=2;SAF=47;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196755;STB=0.505153;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0170497;OID=.;OPOS=22690209;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:2:1:64:65:0.984848:17:47:2:0:17:48:1:0
chr14	22695084	.	C	T	682.75	PASS	AF=0.961538;AO=48;DP=50;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0127522;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.067;QD=52.5193;RBI=0.0319018;REFB=-0.106581;REVB=0.0292422;RO=1;SAF=27;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171068;STB=0.502339;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.00510864;OID=.;OPOS=22695084;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:52:1:2:48:50:0.961538:21:27:1:0:22:28:1:1
chr14	22887459	.	CG	C	644.8	PASS	AF=1;AO=56;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0737746;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=20.0687;QD=44.4688;RBI=0.130236;REFB=0;REVB=0.107325;RO=1;SAF=32;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0.492754;SSSB=-0.0145081;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00453204;OID=.;OPOS=22887460;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:56:58:58:58:0:34:24:0:0:12:1:32:24:1:0
chr14	22891883	.	G	C	524.02	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00127321;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9069;QD=59.8874;RBI=0.00678344;REFB=0;REVB=-0.00666288;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000276189;OID=.;OPOS=22891883;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0
chr14	22942890	.	G	T	1309.52	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.541;QD=61.6247;RBI=0.0248972;REFB=0;REVB=0.0175584;RO=0;SAF=43;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0003107;OID=.;OPOS=22942890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:41:43:0:0:41:44:0:0
chr14	22947903	.	C	T	696.15	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00743136;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.697;QD=60.5345;RBI=0.0165666;REFB=-0.142243;REVB=0.0148063;RO=1;SAF=28;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164911;STB=0.508768;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000683979;OID=.;OPOS=22947903;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:17:28:1:0:17:28:1:0
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chr14	22972783	.	AC	A	908.63	PASS	AF=1;AO=73;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0855142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=23.0363;QD=47.8226;RBI=0.195378;REFB=0;REVB=-0.17567;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00385358;OID=.;OPOS=22972784;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:73:76:76:76:0:35:41:0:0:16:0:34:39:0:0
chr14	22972815	.	C	T	301.51	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0213131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=314.834;QD=16.7506;RBI=0.0232839;REFB=-0.0203122;REVB=0.00937499;RO=39;SAF=11;SAR=22;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204806;STB=0.615313;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0223623;OID=.;OPOS=22972815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:39:39:33:33:0.458333:22:11:21:18:22:11:21:18
chr14	22975700	.	T	G	389.97	PASS	AF=0.356061;AO=47;DP=133;FAO=47;FDP=132;FR=.;FRO=85;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=45;FSRR=40;FWDB=0.0053277;FXX=0.00751823;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.733;QD=11.8174;RBI=0.0210291;REFB=-0.00719014;REVB=-0.020343;RO=85;SAF=23;SAR=24;SRF=45;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0450274;STB=0.525762;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0126819;OID=.;OPOS=22975700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:132:85:85:47:47:0.356061:24:23:45:40:24:23:45:40
chr14	22978335	.	C	T	1899.32	PASS	AF=1;AO=122;DP=124;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0369227;FXX=0.0156238;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.674;QD=60.2958;RBI=0.0369418;REFB=-0.0797723;REVB=0.00118742;RO=1;SAF=57;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0082617;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00268203;OID=.;OPOS=22978335;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:124:126:1:0:122:126:1:65:57:1:0:65:61:0:0
chr14	22984586	.	A	C	612.06	PASS	AF=0.59375;AO=48;DP=95;FAO=57;FDP=96;FR=.;FRO=39;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0175364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.333;QD=25.5026;RBI=0.029815;REFB=-0.0188581;REVB=0.0241124;RO=32;SAF=38;SAR=10;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289213;STB=0.57775;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00948929;OID=.;OPOS=22984586;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:32:39:48:57:0.59375:10:38:15:17:19:38:19:20
chr14	22988972	.	G	C	203.4	PASS	AF=0.329114;AO=26;DP=79;FAO=26;FDP=79;FR=.;FRO=53;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.0123683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=332.012;QD=10.2987;RBI=0.0124201;REFB=0.00319331;REVB=-0.00113293;RO=53;SAF=15;SAR=11;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100308;STB=0.558332;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=-0.00644208;OID=.;OPOS=22988972;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:53:53:26:26:0.329114:11:15:35:18:11:15:35:18
chr14	22993278	.	A	AG	482.04	PASS	AF=1;AO=46;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0496808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.4752;QD=37.8067;RBI=0.0603403;REFB=0;REVB=-0.0342456;RO=3;SAF=29;SAR=17;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0461894;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000626782;OID=.;OPOS=22993279;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:46:51:51:51:0:34:17:0:0:10:3:29:17:3:0
chr14	22997524	.	A	G	2291.52	PASS	AF=0.993506;AO=142;DP=145;FAO=153;FDP=154;FR=.;FRO=1;FSAF=74;FSAR=79;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00429162;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.7773;QD=59.52;RBI=0.0427887;REFB=-0.0638971;REVB=0.0425729;RO=3;SAF=70;SAR=72;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00683226;STB=0.503355;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.000626629;OID=.;OPOS=22997524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:145:154:3:1:142:153:0.993506:72:70:2:1:79:74:1:0
chr14	22998590	.	AG	A	957.35	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331768;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=29.4158;QD=47.2765;RBI=0.037391;REFB=0;REVB=-0.0172451;RO=0;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000280532;OID=.;OPOS=22998591;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:81:81:81:81:0:37:44:0:0:17:0:37:44:0:0
chr14	22998619	.	AC	A	835.33	PASS	AF=1;AO=69;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105707;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.7793;QD=47.0606;RBI=0.107114;REFB=0;REVB=0.0173076;RO=0;SAF=29;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000505535;OID=.;OPOS=22998620;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:69:71:71:71:0:30:41:0:0:15:0:29:40:0:0
chr14	23000062	.	T	C	937.59	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475962;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.7293;QD=58.5996;RBI=0.0529333;REFB=0;REVB=0.0231634;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281816;OID=.;OPOS=23000062;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:34:30:0:0:34:30:0:0
chr14	23025932	.	A	T	2356.04	PASS	AF=0.987342;AO=154;DP=159;FAO=156;FDP=158;FR=.;FRO=2;FSAF=55;FSAR=101;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0567535;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.153;QD=59.6467;RBI=0.0612902;REFB=-0.0960664;REVB=0.0231414;RO=2;SAF=55;SAR=99;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00378928;STB=0.502041;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.000402578;OID=.;OPOS=23025932;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:159:158:2:2:154:156:0.987342:99:55:1:1:101:55:1:1
chr14	23044002	.	G	T	785.04	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.258;QD=64.0845;RBI=0.0338284;REFB=0;REVB=0.0335395;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011962;OID=.;OPOS=23044002;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0
chr14	23081223	.	T	C	706.95	PASS	AF=0.963636;AO=51;DP=54;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0702697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.6414;QD=51.4145;RBI=0.0883036;REFB=0.016089;REVB=0.0534761;RO=0;SAF=14;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512495;STBP=0.437;TYPE=snp;VARB=0.00295932;OID=.;OPOS=23081223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:54:55:0:2:51:53:0.963636:37:14:0:0:39:14:0:2
chr14	23235808	.	G	A	220.51	PASS	AF=0.311111;AO=28;DP=90;FAO=28;FDP=90;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=-0.0148072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.001;QD=9.80029;RBI=0.0150912;REFB=-0.0127861;REVB=0.002914;RO=62;SAF=14;SAR=14;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0189133;STB=0.511103;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.0273401;OID=.;OPOS=23235808;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:62:62:28:28:0.311111:14:14:32:30:14:14:32:30
chr14	23236524	.	C	T	948.24	PASS	AF=0.985075;AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0259824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.159;QD=56.6114;RBI=0.0375966;REFB=-0.0677778;REVB=0.0271738;RO=1;SAF=45;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010382;STB=0.505375;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=0.000349573;OID=.;OPOS=23236524;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:67:1:1:64:66:0.985075:19:45:1:0:20:46:1:0
chr14	23240328	.	T	A	565.78	PASS	AF=0.527273;AO=55;DP=110;FAO=58;FDP=110;FR=.;FRO=52;FSAF=32;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=19;FWDB=-0.0248653;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.4991;QD=20.5739;RBI=0.0330382;REFB=-0.0120056;REVB=-0.0217541;RO=50;SAF=29;SAR=26;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.080895;STB=0.539923;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0141349;OID=.;OPOS=23240328;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:50:52:55:58:0.527273:26:29:31:19:26:32:33:19
chr14	23240713	.	T	TAGC	136.04	PASS	AF=0.355556;AO=13;DP=49;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.0372282;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=3;MLLD=264.198;QD=12.0927;RBI=0.0373117;REFB=-0.02462;REVB=-0.00249416;RO=36;SAF=5;SAR=8;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00537113;STB=0.56153;STBP=0.556;TYPE=ins;VARB=0.0380524;OID=.;OPOS=23240714;OREF=-;OALT=AGC;OMAPALT=TAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.355556:13:49:16:45:29:7:9:10:19:99:36:5:8:14:22
chr14	23242827	.	AT	AC,CG	800.74	PASS	AF=0.982456,0.0175439;AO=52,2;DP=57;FAO=56,1;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=24,1;FSAR=32,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00974374,-0.030781;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,2;MLLD=50.1908,149.949;QD=56.1925;RBI=0.0137532,0.0311743;REFB=0,0;REVB=0.00970622,-0.00493596;RO=0;SAF=22,2;SAR=30,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00222329,-0.0138788;OID=.,.;OPOS=23242828,23242827;OREF=T,AT;OALT=C,CG;OMAPALT=AC,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:57:57:0:0:52,2:56,1:0.982456,0.0175439:30,0:22,2:0:0:32,0:24,1:0:0
chr14	23248112	.	A	G	215.96	PASS	AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0175097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.0154;QD=15.1547;RBI=0.0455298;REFB=-0.0201966;REVB=0.0420282;RO=32;SAF=11;SAR=14;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151217;STB=0.585706;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0326224;OID=.;OPOS=23248112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:14:11:19:13:14:11:19:13
chr14	23282110	.	A	G	65.73	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.0021824;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.542;QD=11.432;RBI=0.020295;REFB=-0.0114535;REVB=-0.0201773;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310035;STB=0.685308;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0207278;OID=.;OPOS=23282110;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:3:6:5:9:3:6:5:9
chr14	23282449	.	C	T	139.44	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0395347;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.29;QD=12.3945;RBI=0.0410302;REFB=-0.00748883;REVB=0.0109765;RO=28;SAF=6;SAR=10;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0204977;STB=0.502955;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.0160018;OID=.;OPOS=23282449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:29:16:16:0.355556:10:6:11:17:10:6:11:18
chr14	23299286	.	T	C	766.38	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00249451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.294;QD=63.8651;RBI=0.0188217;REFB=0;REVB=0.0186557;RO=0;SAF=26;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.34767e-05;OID=.;OPOS=23299286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:22:26:0:0:22:26:0:0
chr14	23303641	.	A	C	562.17	PASS	AF=0.95122;AO=37;DP=43;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0243415;FXX=0.0465008;HRUN=5;LEN=1;MLLD=199.245;QD=54.8456;RBI=0.0399392;REFB=-0.161379;REVB=0.0316644;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.504514;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00181957;OID=.;OPOS=23303641;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:43:41:0:2:37:39:0.95122:15:22:0:0:16:23:1:1
chr14	23306048	.	C	T	358.08	PASS	AF=0.848485;AO=28;DP=33;FAO=28;FDP=33;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0482771;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=259.368;QD=43.4043;RBI=0.0499435;REFB=-0.0588496;REVB=0.0127937;RO=4;SAF=4;SAR=24;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715382;STB=0.517229;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.000535756;OID=.;OPOS=23306048;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:33:33:4:5:28:28:0.848485:24:4:0:4:24:4:1:4
chr14	23321900	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.19;QD=52.6131;RBI=0.0210236;REFB=0;REVB=0.0153238;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169309;OID=.;OPOS=23321900;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr14	23371255	.	G	GGGC	66.5	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=10;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0239498;FXX=0;HRUN=3;LEN=3;MLLD=260.952;QD=26.6016;RBI=0.0309904;REFB=-0.0277416;REVB=0.0196676;RO=2;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426219;STB=0.749246;STBP=0.031;TYPE=ins;VARB=0.00954365;OID=.;OPOS=23371256;OREF=-;OALT=GGC;OMAPALT=GGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.8:8:10:8:10:2:7:1:0:2:10:2:7:1:0:2
chr14	23374435	.	G	A	906.59	PASS	AF=1;AO=49;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00516416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.719;QD=58.4899;RBI=0.0456344;REFB=0;REVB=0.0453413;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000315292;OID=.;OPOS=23374435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:49:62:1:22:27:0:0:35:27:0:0
chr14	23374862	.	C	T	450.84	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182806;FXX=0.0312402;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.36;QD=58.1729;RBI=0.038691;REFB=0;REVB=-0.0341001;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.42204e-05;OID=.;OPOS=23374862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr14	23398902	.	C	T	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0601003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.343;QD=63.8711;RBI=0.10958;REFB=0;REVB=0.0916277;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000444817;OID=.;OPOS=23398902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:18:30:0:0:18:30:0:0
chr14	23398990	.	T	G	676.84	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0344948;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.066;QD=60.1634;RBI=0.0363746;REFB=-0.132157;REVB=0.0115419;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509799;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.001022;OID=.;OPOS=23398990;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:0:1:44:44:0.977778:19:25:0:0:19:25:1:0
chr14	23426181	.	G	GA	116.93	PASS	AF=1;AO=2;DP=15;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.076251;FXX=0.133244;HRUN=0;LEN=1;MLLD=60.6692;QD=35.9796;RBI=0.0775281;REFB=0;REVB=0.014014;RO=12;SAF=2;SAR=0;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505787;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00353556;OID=.;OPOS=23426182;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:15:13:13:0:10:3:0:0:3:12:2:0:8:4
chr14	23426182	.	C	A	144.62	PASS	AF=1;AO=12;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.170961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.6105;QD=38.5643;RBI=0.173654;REFB=-0.10727;REVB=0.0304662;RO=2;SAF=8;SAR=4;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100229;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00745119;OID=.;OPOS=23426182;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:14:15:2:0:12:15:1:4:8:2:0:4:11:0:0
chr14	23530622	.	T	C	143.33	PASS	AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.0669486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.191;QD=9.88483;RBI=0.0800501;REFB=-0.0143873;REVB=-0.0438851;RO=39;SAF=13;SAR=6;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337604;STB=0.698718;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0562977;OID=.;OPOS=23530622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:39:39:19:19:0.327586:6:13:15:24:6:13:15:24
chr14	23548783	.	A	AGAACGT	348.72	PASS	AF=0.352459;AO=39;DP=124;FAO=43;FDP=122;FR=.;FRO=79;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=-0.0142762;FXX=0.0161277;HRUN=1;LEN=6;MLLD=261.71;QD=11.4335;RBI=0.0191246;REFB=-0.0186861;REVB=-0.0127256;RO=79;SAF=19;SAR=20;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513675;STB=0.543011;STBP=0.477;TYPE=ins;VARB=0.0337655;OID=.;OPOS=23548784;OREF=-;OALT=GAACGT;OMAPALT=AGAACGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.352459:39:124:43:122:79:20:23:42:37:99:79:19:20:42:37
chr14	23549319	.	A	G	162.55	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=0.00309781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.462;QD=19.7024;RBI=0.00310255;REFB=-0.0285405;REVB=-0.000171365;RO=16;SAF=8;SAR=9;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249604;STB=0.63985;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0264111;OID=.;OPOS=23549319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:9:8:3:13:9:8:3:13
chr14	23549379	.	C	G	781.39	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00209585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.772;QD=63.7865;RBI=0.0374115;REFB=0;REVB=0.0373527;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.99852e-05;OID=.;OPOS=23549379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:49:0:0:45:49:1:16:29:0:0:19:30:0:0
chr14	23549785	.	T	C	231.3	PASS	AF=0.318681;AO=29;DP=91;FAO=29;FDP=91;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=26;FWDB=-0.00126365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.598;QD=10.1672;RBI=0.00918048;REFB=-0.0171235;REVB=-0.00909309;RO=62;SAF=15;SAR=14;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742292;STB=0.543349;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0536301;OID=.;OPOS=23549785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:62:62:29:29:0.318681:14:15:36:26:14:15:36:26
chr14	23567369	.	C	T	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0691729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.418;QD=24.328;RBI=0.0696193;REFB=-0.0033587;REVB=-0.00787115;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223089;STB=0.631145;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00353536;OID=.;OPOS=23567369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:1:6:1:1:1:6:1:1
chr14	23567774	.	T	A	180.6	PASS	AF=0.403846;AO=19;DP=51;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0142157;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.962;QD=13.8923;RBI=0.0335835;REFB=-0.0134335;REVB=-0.0304265;RO=22;SAF=13;SAR=6;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00260317;STB=0.523969;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0178441;OID=.;OPOS=23567774;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:22:31:19:21:0.403846:6:13:15:7:8:13:18:13
chr14	23569106	.	A	G	610.37	PASS	AF=0.953488;AO=41;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0324534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.669;QD=56.7783;RBI=0.0332107;REFB=0.0392044;REVB=-0.00705178;RO=2;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0446315;STB=0.523798;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.00189253;OID=.;OPOS=23569106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:43:43:2:2:41:41:0.953488:20:21:0:2:20:21:0:2
chr14	23571671	.	A	T	1098.7	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0219662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.717;QD=60.2026;RBI=0.0227541;REFB=0;REVB=-0.00593588;RO=0;SAF=27;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.00243e-05;OID=.;OPOS=23571671;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:46:27:0:0:46:27:0:0
chr14	23595721	.	A	G	304.14	PASS	AF=0.588235;AO=29;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0281939;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.339;QD=23.8544;RBI=0.029597;REFB=-0.00536358;REVB=-0.00900502;RO=21;SAF=25;SAR=4;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291338;STB=0.630969;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.00553209;OID=.;OPOS=23595721;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:21:29:30:0.588235:4:25:13:8:5:25:13:8
chr14	23598952	.	A	G	979.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.947;QD=58.4578;RBI=0.0358538;REFB=0;REVB=0.0102935;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322775;OID=.;OPOS=23598952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:65:67:1:28:37:0:0:30:37:0:0
chr14	23744826	.	TTCC	ATCT	106.61	PASS	AF=0.314286;AO=5;DP=29;FAO=11;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=19;FWDB=-0.0388469;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=4;MLLD=158.576;QD=12.1838;RBI=0.0551532;REFB=-0.0305343;REVB=-0.0391509;RO=14;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.344701;STB=0.554364;STBP=0.811;TYPE=mnp;VARB=0.0506115;OID=.;OPOS=23744826;OREF=TTCC;OALT=ATCT;OMAPALT=ATCT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:29:35:14:22:5:11:0.314286:3:2:2:12:9:2:3:19
chr14	23746269	.	C	G	340.66	PASS	AF=0.445783;AO=36;DP=84;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=14;FWDB=-0.0108199;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.046;QD=16.4174;RBI=0.0112057;REFB=-0.0318879;REVB=-0.0029151;RO=48;SAF=27;SAR=9;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543573;STB=0.543894;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0387503;OID=.;OPOS=23746269;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:48:46:36:37:0.445783:9:27:34:14:9:28:32:14
chr14	23777374	.	A	G	1525.75	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0204282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.806;QD=59.8331;RBI=0.0258265;REFB=0;REVB=0.0158019;RO=0;SAF=45;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08171e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.73371e-06;OID=.;OPOS=23777374;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:57:45:0:0:57:45:0:0
chr14	23779877	.	C	A	225.18	PASS	AF=0.479167;AO=18;DP=46;FAO=23;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.0293416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.394;QD=18.7652;RBI=0.0305983;REFB=-0.0298198;REVB=0.0086791;RO=20;SAF=14;SAR=4;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204267;STB=0.532197;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0324995;OID=.;OPOS=23779877;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:48:20:24:18:23:0.479167:4:14:12:8:8:15:17:7
chr14	23861811	.	A	G	58.4	PASS	AF=0.380952;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.00887274;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.906;QD=11.1231;RBI=0.0274587;REFB=0.00348428;REVB=-0.0259856;RO=13;SAF=6;SAR=2;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266423;STB=0.516089;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=-0.00511498;OID=.;OPOS=23861811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:22:21:13:13:8:8:0.380952:2:6:10:3:2:6:10:3
chr14	23866189	.	G	A	167.45	PASS	AF=0.333333;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=21;FWDB=-0.00646644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.277;QD=10.1484;RBI=0.00655371;REFB=0.00390143;REVB=-0.00106596;RO=44;SAF=11;SAR=11;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.025839;STB=0.515138;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=-0.00678748;OID=.;OPOS=23866189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:44:44:22:22:0.333333:11:11:23:21:11:11:23:21
chr14	23944505	.	G	A	297.2	PASS	AF=0.492308;AO=32;DP=65;FAO=32;FDP=65;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0131057;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.834;QD=18.2892;RBI=0.0158213;REFB=-0.0315179;REVB=0.00886304;RO=33;SAF=10;SAR=22;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195853;STB=0.609785;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0291104;OID=.;OPOS=23944505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:33:33:32:32:0.492308:22:10:17:16:22:10:17:16
chr14	23944514	.	C	A	213.61	PASS	AF=0.45283;AO=23;DP=52;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0228532;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.289;QD=16.1213;RBI=0.0233496;REFB=-0.0191905;REVB=0.00478911;RO=29;SAF=9;SAR=14;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125424;STB=0.579643;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0187396;OID=.;OPOS=23944514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:29:29:23:24:0.45283:14:9:15:14:15:9:15:14
chr14	23947374	.	G	A	471.27	PASS	AF=0.485437;AO=50;DP=104;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=-0.0458;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.052;QD=18.3018;RBI=0.0458349;REFB=0.0041974;REVB=-0.00178776;RO=51;SAF=22;SAR=28;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09947;STB=0.564753;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.00412725;OID=.;OPOS=23947374;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:103:51:53:50:50:0.485437:28:22:28:23:28:22:30:23
chr14	24037238	.	TCCCCCCCCT	TCCCCCCC,TCCCCCCCCC,TCCCCCCCT	65.25	PASS	AF=0.333333,0,0;AO=8,2,5;DP=37;FAO=12,0,0;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=10,0,0;FSAR=2,0,0;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.129167,-0.0906294,-0.0440388;FXX=0.0270197;HRUN=8,6,8;LEN=2,1,1;MLLD=19.0147,13.1832,8.50111;QD=7.24976;RBI=0.145599,0.202119,0.225588;REFB=-0.00809237,-0.0108154,0.00289192;REVB=-0.0671931,0.180661,-0.221247;RO=11;SAF=8,1,3;SAR=0,1,2;SRF=5;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.78323,0.0465033,0.154572;STB=0.687142,0.5,0.5;STBP=0.169,1,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.00292074,0,0.052851;OID=.,.,.;OPOS=24037246,24037247,24037239;OREF=CT,T,C;OALT=-,C,-;OMAPALT=TCCCCCCC,TCCCCCCCCC,TCCCCCCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333,0,0:8,2,5:37:12,0,0:36:24:10,0,0:2,0,0:15:9:63:11:8,1,3:0,1,2:5:6
chr14	24261219	.	T	C	1540.48	PASS	AF=0.981308;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0248703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0273;QD=57.5881;RBI=0.0548751;REFB=-0.0577749;REVB=0.0489156;RO=2;SAF=64;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00407609;STB=0.502148;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00889019;OID=.;OPOS=24261219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:107:107:2:2:105:105:0.981308:41:64:1:1:41:64:1:1
chr14	24261273	.	G	C	1045.19	PASS	AF=0.96;AO=72;DP=75;FAO=72;FDP=75;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0516436;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.576;QD=55.7433;RBI=0.0546792;REFB=-0.044763;REVB=0.0179655;RO=1;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137071;STB=0.507793;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.0027261;OID=.;OPOS=24261273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:75:75:1:3:72:72:0.96:34:38:0:1:34:38:1:2
chr14	24261275	.	C	T	1109.31	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00757443;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.589;QD=59.9626;RBI=0.0124279;REFB=0;REVB=-0.009853;RO=0;SAF=39;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102431;OID=.;OPOS=24261275;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:34:39:0:0:35:39:0:0
chr14	24261340	.	A	G	447.37	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.149539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1908;QD=57.7246;RBI=0.149688;REFB=0;REVB=-0.00666547;RO=0;SAF=12;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00263417;OID=.;OPOS=24261340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:18:12:0:0:18:13:0:0
chr14	24458162	.	G	C	801.31	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0107883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1996;QD=57.2366;RBI=0.0783066;REFB=0;REVB=-0.0775599;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000607718;OID=.;OPOS=24458162;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:29:26:0:0:30:26:0:0
chr14	24459493	.	G	A	70.68	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.025494;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=48.8939;QD=7.24898;RBI=0.0336942;REFB=0.00714944;REVB=0.0220308;RO=27;SAF=4;SAR=6;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533681;STB=0.510617;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=-0.0213061;OID=.;OPOS=24459493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:37:39:27:29:10:10:0.25641:6:4:12:15:6:4:12:17
chr14	24459520	.	T	C	93.39	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=38;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0602556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.614;QD=9.83045;RBI=0.0606753;REFB=-0.0240915;REVB=0.00712402;RO=26;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376385;STB=0.52269;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0575305;OID=.;OPOS=24459520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:38:38:26:26:12:12:0.315789:7:5:10:16:7:5:10:16
chr14	24470138	.	C	T	361.7	PASS	AF=0.423913;AO=37;DP=90;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=-0.0171339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.429;QD=15.7261;RBI=0.0185471;REFB=-0.0186293;REVB=0.00710086;RO=51;SAF=25;SAR=12;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159664;STB=0.578663;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0419032;OID=.;OPOS=24470138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:92:51:53:37:39:0.423913:12:25:27:24:14:25:27:26
chr14	24505722	.	C	G	189.5	PASS	AF=0.333333;AO=24;DP=74;FAO=25;FDP=75;FR=.;FRO=50;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=-0.010716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.659;QD=10.1068;RBI=0.0159381;REFB=-0.0198171;REVB=-0.0117979;RO=50;SAF=12;SAR=12;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115442;STB=0.553606;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0406261;OID=.;OPOS=24505722;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:50:50:24:25:0.333333:12:12:30:20:12:13:30:20
chr14	24507010	.	C	A	477.7	PASS	AF=0.534884;AO=46;DP=86;FAO=46;FDP=86;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0380548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.2219;QD=22.2186;RBI=0.0448814;REFB=-0.00880903;REVB=-0.0237943;RO=40;SAF=26;SAR=20;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0765522;STB=0.542199;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.00920273;OID=.;OPOS=24507010;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:40:40:46:46:0.534884:20:26:19:21:20:26:19:21
chr14	24527220	.	C	T	235.02	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0117645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.681;QD=25.4071;RBI=0.0217265;REFB=-0.0438061;REVB=0.0182657;RO=15;SAF=11;SAR=11;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121721;STB=0.567507;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0272428;OID=.;OPOS=24527220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:11:11:10:5:11:11:10:5
chr14	24529209	.	C	T	437.42	PASS	AF=0.583333;AO=42;DP=72;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0227773;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.821;QD=24.3013;RBI=0.0249113;REFB=-0.0211087;REVB=0.010088;RO=29;SAF=17;SAR=25;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110941;STB=0.554409;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0122102;OID=.;OPOS=24529209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:29:30:42:42:0.583333:25:17:16:13:25:17:16:14
chr14	24529260	.	C	T	337.53	PASS	AF=0.611111;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0157468;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.204;QD=25.0023;RBI=0.0157521;REFB=-0.0107302;REVB=-0.000408393;RO=19;SAF=14;SAR=19;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0688371;STB=0.557527;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00674296;OID=.;OPOS=24529260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:19:21:33:33:0.611111:19:14:10:9:19:14:12:9
chr14	24529890	.	A	C,G	252.26	PASS	AF=0.05,0.95;AO=2,17;DP=20;FAO=1,19;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0,9;FSAR=1,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0977291,-0.0647098;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=61.8545,105.131;QD=50.4511;RBI=0.118646,0.0994791;REFB=0,0;REVB=0.0672742,0.0755562;RO=0;SAF=0,8;SAR=2,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.126e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0427883,-0.00445317;OID=.,.;OPOS=24529890,24529890;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:20:20:0:0:2,17:1,19:0.05,0.95:2,9:0,8:0:0:1,10:0,9:0:0
chr14	24543547	.	CT	CC,C	38.38	PASS	AF=0.0178571,0.178571;AO=4,14;DP=57;FAO=1,10;FDP=56;FR=.;FRO=45;FSAF=1,9;FSAR=0,1;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.164366,-0.130491;FXX=0.0175408;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=35.0952,16.5848;QD=2.7415;RBI=0.165912,0.153824;REFB=-0.0348703,-0.0784224;REVB=-0.0225966,-0.0814476;RO=38;SAF=4,12;SAR=0,2;SRF=17;SRR=21;SSEN=0,0;SSEP=0,0.230169;SSSB=0.5969,0.525146;STB=0.989766,0.86529;STBP=0.475,0.019;TYPE=snp,del;VARB=0.0905126,0.132154;OID=.,.;OPOS=24543548,24543548;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0178571,0.178571:4,14:57:1,10:56:45:1,9:0,1:23:22:38:38:4,12:0,2:17:21
chr14	24543808	.	G	C	253.19	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00374528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.86;QD=19.1089;RBI=0.0107238;REFB=-0.0270589;REVB=0.0100485;RO=25;SAF=16;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0637919;STB=0.546196;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0147863;OID=.;OPOS=24543808;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:26:27:27:0.509434:11:16:13:12:11:16:13:13
chr14	24545375	.	C	T	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00347625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.5291;QD=53.91;RBI=0.032662;REFB=0;REVB=0.0324765;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348918;OID=.;OPOS=24545375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chr14	24551796	.	A	AC,C	126.48	PASS	AF=0.180952,0.0857143;AO=24,9;DP=106;FAO=19,9;FDP=105;FR=.;FRO=77;FSAF=3,8;FSAR=16,1;FSRF=32;FSRR=45;FWDB=-0.0766072,-0.0813406;FXX=0.00943307;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=54.3086,64.0311;QD=4.81816;RBI=0.0766644,0.0814168;REFB=-0.00536353,-0.000911753;REVB=0.00296299,-0.00352193;RO=71;SAF=4,8;SAR=20,1;SRF=30;SRR=41;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.379806,0.540507;STB=0.753398,0.901119;STBP=0.019,0.027;TYPE=ins,snp;VARB=0.123263,0.0519548;OID=.,.;OPOS=24551797,24551796;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:106:105:71:77:24,9:19,9:0.180952,0.0857143:20,1:4,8:30:41:16,1:3,8:32:45
chr14	24567498	.	A	C	1954.8	PASS	AF=1;AO=125;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0133244;FXX=0.0078734;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9008;QD=62.057;RBI=0.0693915;REFB=0;REVB=-0.0681002;RO=0;SAF=74;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000540995;OID=.;OPOS=24567498;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:126:0:0:125:126:1:51:74:0:0:51:75:0:0
chr14	24579527	.	A	G	42.37	PASS	AF=0.230769;AO=4;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=19;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=1;FWDB=-0.0278871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.6;QD=6.51777;RBI=0.0514746;REFB=-0.0182317;REVB=0.043266;RO=15;SAF=3;SAR=1;SRF=14;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.382061;STB=0.696526;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0783345;OID=.;OPOS=24579527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:26:26:15:19:4:6:0.230769:1:3:14:1:1:5:18:1
chr14	24587639	.	G	A	1012.06	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00993813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.459;QD=57.832;RBI=0.0134429;REFB=-0.063636;REVB=-0.00905231;RO=1;SAF=53;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00883766;STB=0.504672;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.000279074;OID=.;OPOS=24587639;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:16:53:1:0:16:53:1:0
chr14	24587667	.	C	T	1208.96	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.85;QD=61.2131;RBI=0.0432152;REFB=0;REVB=0.0135998;RO=0;SAF=60;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.28156e-05;OID=.;OPOS=24587667;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:19:60:0:0:19:60:0:0
chr14	24607541	.	TCTC	T	183.13	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=-0.00224183;FXX=0.0338926;HRUN=1;LEN=3;MLLD=234.029;QD=12.8511;RBI=0.00227301;REFB=-0.0217349;REVB=-0.000375171;RO=33;SAF=6;SAR=16;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408151;STB=0.747444;STBP=0.005;TYPE=del;VARB=0.0342155;OID=.;OPOS=24607542;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.385965:22:59:22:57:35:6:16:24:11:99:33:6:16:22:11
chr14	24614361	.	T	G	937.57	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.638;QD=58.5982;RBI=0.0561403;REFB=0;REVB=0.0495153;RO=0;SAF=27;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.31521e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176872;OID=.;OPOS=24614361;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:36:27:0:0:37:27:0:0
chr14	24615435	.	T	C	1282.49	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7875;QD=61.8066;RBI=0.030035;REFB=0;REVB=0.00953365;RO=0;SAF=56;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134071;OID=.;OPOS=24615435;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:26:56:0:0:27:56:0:0
chr14	24617238	.	C	T	1030.1	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0235181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.03;QD=58.0335;RBI=0.0554059;REFB=-0.109924;REVB=0.0501669;RO=0;SAF=26;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505616;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.000476099;OID=.;OPOS=24617238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:0:1:70:70:0.985915:44:26:0:0:44:26:0:1
chr14	24629744	.	G	A	417.19	PASS	AF=0.443299;AO=43;DP=97;FAO=43;FDP=97;FR=.;FRO=54;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=33;FSRR=21;FWDB=0.00617801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.247;QD=17.2038;RBI=0.00861738;REFB=-0.00439399;REVB=-0.00600762;RO=53;SAF=24;SAR=19;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.065083;STB=0.530089;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.00487233;OID=.;OPOS=24629744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:53:54:43:43:0.443299:19:24:33:20:19:24:33:21
chr14	24641838	.	C	T	272.89	PASS	AF=0.916667;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=24;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.070312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.165;QD=45.4811;RBI=0.0731163;REFB=-0.0331959;REVB=0.0200555;RO=2;SAF=7;SAR=15;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114979;STB=0.562441;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00121535;OID=.;OPOS=24641838;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:24:2:2:22:22:0.916667:15:7:2:0:15:7:2:0
chr14	24642348	.	C	T	611.05	PASS	AF=0.953488;AO=40;DP=43;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00667943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.895;QD=56.8417;RBI=0.0189406;REFB=-0.152992;REVB=0.0177238;RO=1;SAF=21;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218106;STB=0.521729;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.00302144;OID=.;OPOS=24642348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:43:43:1:2:40:41:0.953488:19:21:1:0:19:22:2:0
chr14	24646406	.	G	GGAA	518.87	PASS	AF=1;AO=33;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154922;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=232.889;QD=57.6523;RBI=0.0239486;REFB=0;REVB=0.0182628;RO=2;SAF=20;SAR=13;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0444566;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000281559;OID=.;OPOS=24646407;OREF=-;OALT=GAA;OMAPALT=GGAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:33:36:36:36:0:22:14:0:0:4:2:20:13:2:0
chr14	24647814	.	T	C	729.75	PASS	AF=1;AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0764723;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.539;QD=63.4561;RBI=0.0856662;REFB=0;REVB=0.0386093;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000248474;OID=.;OPOS=24647814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:45:46:1:21:24:0:0:21:25:0:0
chr14	24653965	.	C	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113128;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.182;QD=61.6838;RBI=0.113387;REFB=0;REVB=-0.00766232;RO=0;SAF=8;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.8059e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000608554;OID=.;OPOS=24653965;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:33:8:0:0:33:8:0:0
chr14	24654489	.	T	C	724.08	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0403941;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.395;QD=59.1083;RBI=0.0858656;REFB=-0.00943002;REVB=-0.0757709;RO=1;SAF=27;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171015;STB=0.51785;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.000522778;OID=.;OPOS=24654489;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:49:49:1:2:47:47:0.959184:20:27:1:0:20:27:2:0
chr14	24657407	.	T	G	1327.15	PASS	AF=1;AO=52;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=54;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0714043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.447;QD=62.4543;RBI=0.131523;REFB=0;REVB=0.110452;RO=0;SAF=41;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000494046;OID=.;OPOS=24657407;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:85:0:0:52:85:1:11:41:0:0:31:54:0:0
chr14	24682767	.	C	T	447.47	PASS	AF=0.517647;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0423309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0938;QD=21.0572;RBI=0.0653826;REFB=-0.0154574;REVB=0.0498296;RO=41;SAF=19;SAR=25;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0917767;STB=0.550756;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0132479;OID=.;OPOS=24682767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:41:41:44:44:0.517647:25:19:22:19:25:19:22:19
chr14	24683266	.	CA	C	154.67	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0599105;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.9635;QD=12.6258;RBI=0.113583;REFB=-0.00191472;REVB=-0.0964981;RO=25;SAF=12;SAR=12;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0181252;STB=0.510196;STBP=0.892;TYPE=del;VARB=-0.00275672;OID=.;OPOS=24683267;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.489796:24:49:24:49:25:12:12:12:13:99:25:12:12:12:13
chr14	24702789	.	C	T	274.3	PASS	AF=0.376471;AO=32;DP=85;FAO=32;FDP=85;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=30;FSRR=23;FWDB=0.0121124;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.397;QD=12.9084;RBI=0.0121922;REFB=-0.00419381;REVB=-0.00139217;RO=51;SAF=16;SAR=16;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0738407;STB=0.541151;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00672765;OID=.;OPOS=24702789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:51:53:32:32:0.376471:16:16:29:22:16:16:30:23
chr14	24728326	.	C	T	226.83	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.00342569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.148;QD=15.6435;RBI=0.00928168;REFB=-0.000252594;REVB=-0.00862637;RO=31;SAF=15;SAR=11;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279734;STB=0.508124;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.00024531;OID=.;OPOS=24728326;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:32:26:26:0.448276:11:15:17:14:11:15:18:14
chr14	24729687	.	C	T	719.61	PASS	AF=0.530303;AO=66;DP=128;FAO=70;FDP=132;FR=.;FRO=62;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=39;FSRR=23;FWDB=-0.00257915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.788;QD=21.8064;RBI=0.0445382;REFB=-0.0245951;REVB=0.0444635;RO=60;SAF=38;SAR=28;SRF=37;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365261;STB=0.534473;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.0208379;OID=.;OPOS=24729687;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:132:60:62:66:70:0.530303:28:38:37:23:31:39:39:23
chr14	24736027	.	G	A	639.36	PASS	AF=0.934783;AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0373191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.6672;QD=55.5961;RBI=0.0480986;REFB=-0.0891127;REVB=0.0303441;RO=0;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.520333;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00574577;OID=.;OPOS=24736027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:46:46:0:3:43:43:0.934783:27:16:0:0:27:16:2:1
chr14	24736961	.	T	C	1116.94	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.038;QD=60.3753;RBI=0.0245234;REFB=0;REVB=-0.0182229;RO=0;SAF=35;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80413e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.87483e-06;OID=.;OPOS=24736961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:39:35:0:0:39:35:0:0
chr14	24760764	.	G	A	322.72	PASS	AF=0.432099;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=81;FR=.;FRO=46;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0365897;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.036;QD=15.9369;RBI=0.0392617;REFB=-0.0195137;REVB=-0.0142363;RO=44;SAF=20;SAR=15;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00327787;STB=0.503595;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0179416;OID=.;OPOS=24760764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:44:46:35:35:0.432099:15:20:25:19:15:20:26:20
chr14	24771256	.	T	C	1657.9	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.222;QD=60.2872;RBI=0.0557865;REFB=0;REVB=0.0546023;RO=0;SAF=52;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.11981e-05;OID=.;OPOS=24771256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:110:0:0:106:110:1:54:52:0:0:55:55:0:0
chr14	24786293	.	T	G	323.13	PASS	AF=0.833333;AO=25;DP=35;FAO=25;FDP=30;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0100641;FXX=0.142816;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.604;QD=43.0844;RBI=0.010779;REFB=-0.0187019;REVB=-0.00386031;RO=0;SAF=6;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.575693;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.0049546;OID=.;OPOS=24786293;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:35:30:0:5:25:25:0.833333:19:6:0:0:19:6:3:2
chr14	24786976	.	T	C	754.4	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.641;QD=56.9358;RBI=0.0537381;REFB=0;REVB=0.0436911;RO=0;SAF=38;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020663;OID=.;OPOS=24786976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:15:38:0:0:15:38:0:0
chr14	24793600	.	G	A	279.64	PASS	AF=0.956522;AO=21;DP=22;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0546921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.692;QD=48.6325;RBI=0.0612041;REFB=-0.187223;REVB=0.0274721;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519982;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00166203;OID=.;OPOS=24793600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:22:23:0:1:21:22:0.956522:9:12:0:0:10:12:1:0
chr14	24795495	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00617919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.659;QD=51.1843;RBI=0.0191685;REFB=0;REVB=-0.0181453;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000191475;OID=.;OPOS=24795495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr14	24802018	.	G	A	217.39	PASS	AF=0.421875;AO=25;DP=63;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.00605835;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.298;QD=13.5866;RBI=0.0121406;REFB=-0.0168097;REVB=0.010521;RO=34;SAF=11;SAR=14;SRF=10;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153802;STB=0.591533;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0290244;OID=.;OPOS=24802018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:34:37:25:27:0.421875:14:11:10:24:14:13:12:25
chr14	24805463	.	G	T	425.91	PASS	AF=0.518072;AO=41;DP=76;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0136364;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=45.5352;QD=20.5255;RBI=0.0313122;REFB=-0.043204;REVB=0.028187;RO=34;SAF=17;SAR=24;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119299;STB=0.563575;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0600554;OID=.;OPOS=24805463;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:83:34:40:41:43:0.518072:24:17:19:15:26:17:21:19
chr14	24821299	.	C	T	236.13	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0017758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.969;QD=19.2757;RBI=0.0342791;REFB=-0.00820523;REVB=-0.0342331;RO=25;SAF=15;SAR=8;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235256;STB=0.62376;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0109775;OID=.;OPOS=24821299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:26:23:23:0.469388:8:15:10:15:8:15:11:15
chr14	24838937	.	C	T	355.24	PASS	AF=0.457831;AO=37;DP=86;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.00689427;FXX=0.0348797;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4883;QD=17.1199;RBI=0.0133948;REFB=-0.040133;REVB=0.0114843;RO=44;SAF=17;SAR=20;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170252;STB=0.591892;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0449411;OID=.;OPOS=24838937;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:83:44:45:37:38:0.457831:20:17:28:16:20:18:29:16
chr14	24839090	.	TG	T	36.74	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=18;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.160565;FXX=0.111049;HRUN=7;LEN=1;MLLD=10.6363;QD=9.18614;RBI=0.230492;REFB=-0.0922862;REVB=-0.165365;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.464204;STB=0.721819;STBP=0.169;TYPE=del;VARB=0.0981007;OID=.;OPOS=24839091;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:7:18:8:16:8:5:3:8:0:34:9:4:3:9:0
chr14	24839165	.	C	T	254.43	PASS	AF=0.384615;AO=30;DP=78;FAO=30;FDP=78;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=18;FWDB=0.0253672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.3532;QD=13.0474;RBI=0.0651694;REFB=-0.00547414;REVB=-0.0600296;RO=47;SAF=16;SAR=14;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0905527;STB=0.557056;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.00944996;OID=.;OPOS=24839165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:47:48:30:30:0.384615:14:16:29:18:14:16:30:18
chr14	24846757	.	A	G	338.07	PASS	AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=25;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0118099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.186;QD=28.7719;RBI=0.0141745;REFB=-0.025619;REVB=-0.00783852;RO=18;SAF=25;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229644;STB=0.628039;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0185393;OID=.;OPOS=24846757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:4:25:12:6:4:25:12:6
chr14	24868619	.	AGGGGC	AGGG,AGGGC,CGGGGC	122.84	PASS	AF=0.23913,0.108696,0.152174;AO=7,7,7;DP=50;FAO=11,5,7;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=7,4,0;FSAR=4,1,7;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.217519,-0.352565,-0.0594971;FXX=0.079984;HRUN=4,4,1;LEN=2,1,1;MLLD=16.5598,9.80347,37.4907;QD=10.6817;RBI=0.280745,0.366815,0.153098;REFB=-0.0314351,-0.0179317,-0.042471;REVB=-0.177492,-0.101248,-0.141064;RO=15;SAF=2,7,0;SAR=5,0,7;SRF=9;SRR=6;SSEN=0.509542,0.509542,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.342331,0.731833,-0.77058;STB=0.5443,0.614878,0.998667;STBP=0.771,0.674,0.001;TYPE=del,del,snp;VARB=0.046433,-0.0902582,0.175724;OID=.,.,.;OPOS=24868623,24868620,24868619;OREF=GC,G,A;OALT=-,-,C;OMAPALT=AGGG,AGGGC,CGGGGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:50:46:15:23:7,7,7:11,5,7:0.23913,0.108696,0.152174:5,0,7:2,7,0:9:6:4,1,7:7,4,0:16:7
chr14	24888335	.	T	C	916.49	PASS	AF=0.929577;AO=66;DP=71;FAO=66;FDP=71;FR=.;FRO=5;FSAF=19;FSAR=47;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0242311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.0074;QD=51.6334;RBI=0.0285235;REFB=-0.0747433;REVB=-0.0150481;RO=4;SAF=19;SAR=47;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0896453;STB=0.542385;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0289319;OID=.;OPOS=24888335;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:71:71:4:5:66:66:0.929577:47:19:4:0:47:19:4:1
chr14	24898558	.	C	T	1264.19	PASS	AF=0.92;AO=92;DP=100;FAO=92;FDP=100;FR=.;FRO=8;FSAF=45;FSAR=47;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0526534;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.334;QD=50.5675;RBI=0.0542159;REFB=-0.1854;REVB=-0.0129225;RO=2;SAF=46;SAR=46;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201629;STB=0.540807;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00216723;OID=.;OPOS=24898558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:100:100:2:8:92:92:0.92:46:46:2:0:47:45:8:0
chr14	24906534	.	G	A	298.24	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=25;FWDB=-0.0425077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2015;QD=15.6968;RBI=0.0463259;REFB=-0.0232789;REVB=-0.0184171;RO=42;SAF=20;SAR=13;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199418;STB=0.605996;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0472829;OID=.;OPOS=24906534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:42:43:33:33:0.434211:13:20:17:25:13:20:18:25
chr14	24907508	.	C	CA	285.63	PASS	AF=0.387097;AO=55;DP=163;FAO=60;FDP=155;FR=.;FRO=95;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=42;FSRR=53;FWDB=-0.030442;FXX=0.0189861;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.3489;QD=7.37097;RBI=0.0304445;REFB=-0.0364285;REVB=-0.000388027;RO=107;SAF=24;SAR=31;SRF=51;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046727;STB=0.525331;STBP=0.613;TYPE=ins;VARB=0.045865;OID=.;OPOS=24907509;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.387097:55:163:60:155:95:29:31:42:53:99:107:24:31:51:56
chr14	24907552	.	C	T	423.86	PASS	AF=0.395161;AO=48;DP=125;FAO=49;FDP=124;FR=.;FRO=75;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=43;FWDB=0.00168671;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.691;QD=13.673;RBI=0.0144808;REFB=-0.0107742;REVB=-0.0143822;RO=75;SAF=22;SAR=26;SRF=32;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344404;STB=0.526009;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0156062;OID=.;OPOS=24907552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:124:75:75:48:49:0.395161:26:22:32:43:26:23:32:43
chr14	24907580	.	G	A	220.76	PASS	AF=0.369863;AO=27;DP=72;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0107413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.096;QD=12.0965;RBI=0.0117808;REFB=-0.00443452;REVB=-0.00483853;RO=42;SAF=15;SAR=12;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0844311;STB=0.521456;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.00807693;OID=.;OPOS=24907580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:42:46:27:27:0.369863:12:15:20:22:12:15:24:22
chr14	24909362	.	T	C	235.06	PASS	AF=0.383562;AO=28;DP=74;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0208732;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.915;QD=12.8802;RBI=0.0255321;REFB=-0.00241981;REVB=-0.0147036;RO=45;SAF=22;SAR=6;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269104;STB=0.656202;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00341693;OID=.;OPOS=24909362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:45:45:28:28:0.383562:6:22:26:19:6:22:26:19
chr14	24909475	.	C	G	274.19	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.00401037;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.6;QD=24.9265;RBI=0.0298383;REFB=-0.0228386;REVB=-0.0295676;RO=19;SAF=20;SAR=5;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.178268;STB=0.599913;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0146881;OID=.;OPOS=24909475;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:5:20:12:7:5:20:12:7
chr14	24909628	.	GC	GA,G	780.75	PASS	AF=0.753247,0.194805;AO=32,10;DP=75;FAO=58,15;FDP=77;FR=.;FRO=4;FSAF=32,9;FSAR=26,6;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=-0.00441652,-0.187182;FXX=0.0609682;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=91.109,7.4713;QD=40.5584;RBI=0.012624,0.523195;REFB=0.00200449,-0.00342057;REVB=-0.0118262,-0.488565;RO=3;SAF=24,3;SAR=8,7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0,0.494118;SSEP=0,0.470588;SSSB=0.0843968,-0.0160541;STB=0.535702,0.624835;STBP=0.046,0.055;TYPE=snp,del;VARB=0.0133318,-0.197933;OID=.,.;OPOS=24909629,24909629;OREF=C,C;OALT=A,-;OMAPALT=GA,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.753247,0.194805:32,10:75:58,15:77:4:32,9:26,6:0:4:55:3:24,3:8,7:1:2
chr14	24909731	.	C	T	88.9	PASS	AF=0.24;AO=12;DP=50;FAO=12;FDP=50;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.0631764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0704;QD=7.11195;RBI=0.0716828;REFB=-0.00870078;REVB=-0.03387;RO=38;SAF=1;SAR=11;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.468448;STB=0.809868;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0375212;OID=.;OPOS=24909731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:50:50:38:38:12:12:0.24:11:1:13:25:11:1:13:25
chr14	24910210	.	C	A	658.86	PASS	AF=0.511628;AO=66;DP=129;FAO=66;FDP=129;FR=.;FRO=63;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=30;FSRR=33;FWDB=0.0207676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.586;QD=20.4296;RBI=0.0222195;REFB=-0.0147161;REVB=0.00790023;RO=58;SAF=30;SAR=36;SRF=28;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241812;STB=0.510635;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.0120343;OID=.;OPOS=24910210;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:58:63:66:66:0.511628:36:30:28:30:36:30:30:33
chr14	24910973	.	TT	GA	187.92	PASS	AF=0.347826;AO=24;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.0366885;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=105.249;QD=10.8937;RBI=0.0436433;REFB=-0.0102557;REVB=0.0236367;RO=45;SAF=13;SAR=11;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00939187;STB=0.505463;STBP=0.964;TYPE=mnp;VARB=0.0182927;OID=.;OPOS=24910973;OREF=TT;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:45:45:24:24:0.347826:11:13:24:21:11:13:24:21
chr14	24911452	.	T	C	89.1	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.076079;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.9;QD=13.7076;RBI=0.0760881;REFB=-0.00429287;REVB=0.0011717;RO=15;SAF=2;SAR=9;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291871;STB=0.517209;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.00336685;OID=.;OPOS=24911452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:27:26:15:15:11:11:0.423077:9:2:3:12:9:2:3:12
chr14	24970942	.	A	G	289.27	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0091818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9705;QD=52.5942;RBI=0.0264159;REFB=0;REVB=0.0247689;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000433226;OID=.;OPOS=24970942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr14	24976657	.	G	T	615.59	PASS	AF=0.591398;AO=55;DP=93;FAO=55;FDP=93;FR=.;FRO=38;FSAF=35;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0158984;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4441;QD=26.4768;RBI=0.0399875;REFB=0.0254763;REVB=0.0366912;RO=37;SAF=35;SAR=20;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538712;STB=0.536219;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=-0.0163296;OID=.;OPOS=24976657;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:37:38:55:55:0.591398:20:35:21:16:20:35:21:17
chr14	25102160	.	C	T	1359.27	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0053261;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2633;QD=62.4954;RBI=0.00535492;REFB=0;REVB=-0.000554844;RO=0;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.68375e-05;OID=.;OPOS=25102160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:42:44:0:0:43:44:0:0
chr14	26916677	.	TA	T,TT	41.79	PASS	AF=0.222222,0.0555556;AO=11,2;DP=33;FAO=8,2;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=4,2;FSAR=4,0;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.0711184,0.0222479;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=11.4219,19.0839;QD=4.64291;RBI=0.0916531,0.0827898;REFB=-0.104626,-0.0744316;REVB=-0.0578139,-0.0797445;RO=20;SAF=4,2;SAR=7,0;SRF=17;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.493842,0.396346;STB=0.705455,0.992235;STBP=0.265,0.383;TYPE=del,snp;VARB=0.144243,-0.0229216;OID=.,.;OPOS=26916678,26916678;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.222222,0.0555556:11,2:33:8,2:36:26:4,2:4,0:20:6:30:20:4,2:7,0:17:3
chr14	28102476	.	CTA	C,CTC	585.35	PASS	AF=0.456693,0.0393701;AO=51,6;DP=129;FAO=58,5;FDP=127;FR=.;FRO=64;FSAF=29,1;FSAR=29,4;FSRF=25;FSRR=39;FWDB=-0.00403178,-0.0175532;FXX=0.0155027;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=203.156,97.2066;QD=18.4363;RBI=0.010708,0.0312591;REFB=-0.0398104,-0.0175851;REVB=-0.00991999,0.0258654;RO=64;SAF=24,1;SAR=27,5;SRF=25;SRR=39;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0803878,-0.282588;STB=0.557358,0.706571;STBP=0.242,0.443;TYPE=del,snp;VARB=0.0495446,0.0491161;OID=.,.;OPOS=28102477,28102478;OREF=TA,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.456693,0.0393701:51,6:129:58,5:127:64:29,1:29,4:25:39:99:64:24,1:27,5:25:39
chr14	29261304	.	TAAAAA	TAAAA,TAAAAAAAC,TAAAAAAC	189.75	PASS	AF=0.133333,0.6,0;AO=4,11,5;DP=31;FAO=4,18,0;FDP=30;FR=.;FRO=8;FSAF=2,9,0;FSAR=2,9,0;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0033739,-0.0350733,-0.0296001;FXX=0.0322477;HRUN=8,8,8;LEN=1,3,2;MLLD=4.27851,180.608,180.674;QD=25.2999;RBI=0.0325542,0.0359358,0.0309167;REFB=-0.25826,-0.0612857,-0.0672571;REVB=0.0323789,0.00782593,0.00892625;RO=5;SAF=4,5,3;SAR=0,6,2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.700982,-0.0801957,0;STB=0.582928,0.538419,0.5;STBP=0.82,0.589,1;TYPE=del,ins,ins;VARB=-0.0636455,0.0265892,0;OID=.,.,.;OPOS=29261305,29261310,29261310;OREF=A,-,-;OALT=-,AAC,AC;OMAPALT=TAAAA,TAAAAAAAC,TAAAAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.133333,0.6,0:4,11,5:31:4,18,0:30:8:2,9,0:2,9,0:5:3:33:5:4,5,3:0,6,2:3:2
chr14	30045978	.	C	T	315.94	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=27;FWDB=0.0159548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.94;QD=17.5524;RBI=0.0179603;REFB=-0.0184081;REVB=-0.0082472;RO=37;SAF=24;SAR=10;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378736;STB=0.71716;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00892585;OID=.;OPOS=30045978;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:37:38:34:34:0.472222:10:24:11:26:10:24:11:27
chr14	30066929	.	A	G	215.97	PASS	AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.012717;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.605;QD=15.1561;RBI=0.0169627;REFB=-0.0151206;REVB=0.0112254;RO=32;SAF=6;SAR=19;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163749;STB=0.59367;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.0267767;OID=.;OPOS=30066929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:19:6:12:20:19:6:12:20
chr14	30125660	.	A	G	48.6	PASS	AF=0.242424;AO=7;DP=32;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0206502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4491;QD=5.89149;RBI=0.0271731;REFB=-0.00646035;REVB=-0.0176621;RO=25;SAF=3;SAR=4;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0613722;STB=0.581189;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0225374;OID=.;OPOS=30125660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:32:33:25:25:7:8:0.242424:4:3:12:13:5:3:12:13
chr14	31059969	.	G	A	112.98	PASS	AF=0.291667;AO=14;DP=48;FAO=14;FDP=48;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0302845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4742;QD=9.41521;RBI=0.0361884;REFB=-0.014328;REVB=-0.0198103;RO=34;SAF=9;SAR=5;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316616;STB=0.519203;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0320862;OID=.;OPOS=31059969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:34:34:14:14:0.291667:5:9:21:13:5:9:21:13
chr14	31099738	.	A	G	462.2	PASS	AF=0.463636;AO=51;DP=110;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.0264062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4338;QD=16.8073;RBI=0.03151;REFB=-0.0277847;REVB=0.0171928;RO=59;SAF=27;SAR=24;SRF=31;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00385262;STB=0.502145;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0574258;OID=.;OPOS=31099738;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:59:59:51:51:0.463636:24:27:31:28:24:27:31:28
chr14	31355096	.	C	G	412.87	PASS	AF=0.532468;AO=40;DP=77;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.00448971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.673;QD=21.4478;RBI=0.0134514;REFB=-0.0311203;REVB=-0.01268;RO=36;SAF=18;SAR=22;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160668;STB=0.581459;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0232461;OID=.;OPOS=31355096;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:36:36:40:41:0.532468:22:18:23:13:22:19:23:13
chr14	31359847	.	T	A	728.92	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00992352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.673;QD=57.1699;RBI=0.0359516;REFB=0;REVB=0.0345549;RO=0;SAF=18;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176854;OID=.;OPOS=31359847;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:33:18:0:0:33:18:0:0
chr14	31420098	.	C	T	205.37	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0975719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.988;QD=14.6689;RBI=0.098333;REFB=-0.00918943;REVB=-0.0122109;RO=30;SAF=17;SAR=7;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250745;STB=0.628505;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0184966;OID=.;OPOS=31420098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:30:32:24:24:0.428571:7:17:14:16:7:17:16:16
chr14	31578762	.	C	T	1008.4	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.873;QD=59.3174;RBI=0.0401104;REFB=0;REVB=0.02182;RO=0;SAF=33;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116664;OID=.;OPOS=31578762;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:35:33:0:0:35:33:0:0
chr14	31582380	.	A	G	726.9	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0415245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.441;QD=52.8652;RBI=0.0670459;REFB=-0.101119;REVB=0.052639;RO=1;SAF=36;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01291;STB=0.513508;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.00991594;OID=.;OPOS=31582380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:1:2:53:53:0.963636:17:36:1:0:17:36:2:0
chr14	31582526	.	T	C	2339.39	PASS	AF=0.986667;AO=147;DP=149;FAO=148;FDP=150;FR=.;FRO=2;FSAF=69;FSAR=79;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0306302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.733;QD=62.3838;RBI=0.0336452;REFB=-0.0464534;REVB=0.013921;RO=1;SAF=69;SAR=78;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00605862;STB=0.506249;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.000315158;OID=.;OPOS=31582526;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:149:150:1:2:147:148:0.986667:78:69:0:1:79:69:0:2
chr14	31583173	.	G	A	436.82	PASS	AF=0.45283;AO=48;DP=107;FAO=48;FDP=106;FR=.;FRO=58;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=30;FSRR=28;FWDB=-0.0165278;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.248;QD=16.4836;RBI=0.0196362;REFB=-0.00232962;REVB=-0.0106026;RO=56;SAF=17;SAR=31;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163191;STB=0.592237;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.00261318;OID=.;OPOS=31583173;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:106:56:58:48:48:0.45283:31:17:29:27:31:17:30:28
chr14	31598248	.	A	G	338.06	PASS	AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00386282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.6687;QD=28.7713;RBI=0.0780796;REFB=0.00905241;REVB=-0.077984;RO=18;SAF=16;SAR=13;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362113;STB=0.519927;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=-0.0085499;OID=.;OPOS=31598248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:13:16:9:9:13:16:9:9
chr14	31612253	.	TTAAAAAT	TAAAAT,TTAAAAAA,TTAAAAT	164.0	PASS	AF=0.5,0,0.2;AO=11,2,9;DP=34;FAO=15,0,6;FDP=30;FR=.;FRO=9;FSAF=11,0,4;FSAR=4,0,2;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0207366,0.00236214,-0.167932;FXX=0.0322477;HRUN=5,1,5;LEN=2,1,1;MLLD=21.0003,218.081,12.5966;QD=21.8663;RBI=0.0373854,0.0209505,0.16802;REFB=-0.106516,0.00336279,-0.126301;REVB=-0.0311072,-0.0208169,0.00543907;RO=9;SAF=9,0,5;SAR=2,2,4;SRF=1;SRR=8;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.552628,-0.476258,0.372859;STB=0.699147,0.5,0.749249;STBP=0.021,1,0.154;TYPE=del,snp,del;VARB=0.0672526,0,0.112291;OID=.,.,.;OPOS=31612254,31612260,31612255;OREF=TA,T,A;OALT=-,A,-;OMAPALT=TAAAAT,TTAAAAAA,TTAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5,0,0.2:11,2,9:34:15,0,6:30:9:11,0,4:4,0,2:2:7:54:9:9,0,5:2,2,4:1:8
chr14	31619392	.	T	C	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.612;QD=57.3853;RBI=0.0477499;REFB=0;REVB=0.00418741;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.60325e-05;OID=.;OPOS=31619392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:23:34:0:0:23:34:0:0
chr14	31647241	.	G	A	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00664089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.5417;QD=59.8556;RBI=0.0754857;REFB=0;REVB=-0.075193;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000401018;OID=.;OPOS=31647241;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:35:36:0:0:35:36:0:0
chr14	31763142	.	T	G	398.14	PASS	AF=0.557143;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=70;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=0.000812298;FXX=0.0277739;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.747;QD=22.751;RBI=0.0123551;REFB=-0.0133897;REVB=0.0123284;RO=32;SAF=16;SAR=23;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248262;STB=0.643863;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0101286;OID=.;OPOS=31763142;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:70:32:31:39:39:0.557143:23:16:23:9:23:16:23:8
chr14	31819047	.	C	T	187.72	PASS	AF=0.410714;AO=22;DP=55;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.00303794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.987;QD=13.4083;RBI=0.0100847;REFB=-0.0143644;REVB=-0.00961626;RO=32;SAF=17;SAR=5;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115273;STB=0.590079;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0501888;OID=.;OPOS=31819047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:32:33:22:23:0.410714:5:17:22:10:5:18:22:11
chr14	31819913	.	A	G	138.95	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=0.000757623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2634;QD=19.8493;RBI=0.0717638;REFB=-0.00351007;REVB=0.0717598;RO=13;SAF=6;SAR=9;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0131368;STB=0.507453;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00486828;OID=.;OPOS=31819913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:9:6:5:8:9:6:5:8
chr14	31864485	.	G	C	743.36	PASS	AF=0.546154;AO=71;DP=131;FAO=71;FDP=130;FR=.;FRO=59;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=35;FSRR=24;FWDB=-0.0298557;FXX=0.00763301;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.84;QD=22.8725;RBI=0.0424783;REFB=-0.0212713;REVB=0.0302167;RO=59;SAF=34;SAR=37;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0946189;STB=0.551747;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.017441;OID=.;OPOS=31864485;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:130:59:59:71:71:0.546154:37:34:35:24:37:34:35:24
chr14	31917203	.	T	C	295.59	PASS	AF=0.428571;AO=33;DP=77;FAO=33;FDP=77;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=0.0824543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.412;QD=15.3555;RBI=0.0868119;REFB=-0.01197;REVB=0.0271587;RO=44;SAF=19;SAR=14;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635034;STB=0.535809;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0157722;OID=.;OPOS=31917203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:44:44:33:33:0.428571:14:19:28:16:14:19:28:16
chr14	31926435	.	GA	G,GG	309.86	PASS	AF=0.375,0.225;AO=30,17;DP=78;FAO=30,18;FDP=80;FR=.;FRO=32;FSAF=15,0;FSAR=15,18;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0625464,-0.0458885;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=11.6931,24.5795;QD=15.4931;RBI=0.0851716,0.0898284;REFB=-0.120305,-0.0945423;REVB=-0.0578113,0.0772229;RO=26;SAF=18,0;SAR=12,17;SRF=15;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0.322289,0;SSSB=0.0199844,-0.826119;STB=0.548355,0.999311;STBP=0.486,0;TYPE=del,snp;VARB=0.077125,0.0417987;OID=.,.;OPOS=31926436,31926436;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.375,0.225:30,17:78:30,18:80:32:15,0:15,18:19:13:99:26:18,0:12,17:15:11
chr14	31952257	.	A	G	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=3;FWDB=-0.0123279;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.273;QD=17.3207;RBI=0.0131298;REFB=0.0105117;REVB=-0.00451821;RO=18;SAF=9;SAR=7;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268139;STB=0.650997;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.00575892;OID=.;OPOS=31952257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:7:9:15:3:7:9:15:3
chr14	31952754	.	A	G	47.19	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.00386539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.485;QD=11.1041;RBI=0.00847922;REFB=-0.0192562;REVB=0.00754691;RO=10;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258458;STB=0.655317;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0328225;OID=.;OPOS=31952754;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:3:4:3:7:3:4:3:7
chr14	32071665	.	G	A	301.67	PASS	AF=0.351852;AO=38;DP=108;FAO=38;FDP=108;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.00483749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.536;QD=11.173;RBI=0.0428095;REFB=-0.0141542;REVB=-0.0425353;RO=69;SAF=25;SAR=13;SRF=36;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159324;STB=0.587887;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0190079;OID=.;OPOS=32071665;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:69:70:38:38:0.351852:13:25:36:33:13:25:37:33
chr14	32414145	.	C	A,G	749.78	PASS	AF=0.907407,0.0925926;AO=49,5;DP=54;FAO=49,5;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=29,5;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000388351,0.0494477;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=115.86,17.573;QD=55.5396;RBI=0.0442451,0.0539024;REFB=0,0;REVB=0.0442434,-0.0214569;RO=0;SAF=29,5;SAR=20,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000472844,0.0509147;OID=.,.;OPOS=32414145,32414145;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:23:54:54:0:0:49,5:49,5:0.907407,0.0925926:20,0:29,5:0:0:20,0:29,5:0:0
chr14	32419330	.	AC	A,AT	772.79	PASS	AF=0.107143,0.892857;AO=6,50;DP=56;FAO=6,50;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=6,22;FSAR=0,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000493327,0.00158354;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=121.983,141.861;QD=55.1992;RBI=0.0172706,0.040689;REFB=0,0;REVB=0.0172635,0.0406582;RO=0;SAF=6,22;SAR=0,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.15703e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0242526,0.000101015;OID=.,.;OPOS=32419331,32419331;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.107143,0.892857:6,50:56:6,50:56:0:6,22:0,28:0:0:21:0:6,22:0,28:0:0
chr14	33046387	.	A	AG	667.97	PASS	AF=1;AO=12;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0868259;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=132.965;QD=52.3895;RBI=0.174983;REFB=0;REVB=-0.151922;RO=39;SAF=1;SAR=11;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.668489;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000399333;OID=.;OPOS=33046388;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:12:51:51:51:0:26:25:0:0:4:39:1:11:25:14
chr14	33046388	.	A	G	466.54	PASS	AF=0.769231;AO=40;DP=52;FAO=40;FDP=52;FR=.;FRO=12;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=0.00173402;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.667;QD=35.8874;RBI=0.0310333;REFB=-0.00608162;REVB=0.0309848;RO=12;SAF=26;SAR=14;SRF=1;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.245024;STB=0.632229;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.000176911;OID=.;OPOS=33046388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:52:52:12:12:40:40:0.769231:14:26:1:11:14:26:1:11
chr14	33293122	.	A	G	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0451722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.108;QD=15.293;RBI=0.0471032;REFB=-0.0110574;REVB=0.0133488;RO=9;SAF=1;SAR=8;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.559542;STB=0.834962;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0389511;OID=.;OPOS=33293122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:8:1:6:3:8:1:6:3
chr14	33293531	.	T	A	311.66	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=-0.000125729;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.264;QD=16.622;RBI=0.0190398;REFB=-0.00974511;REVB=0.0190394;RO=41;SAF=12;SAR=22;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29423;STB=0.66502;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.00560769;OID=.;OPOS=33293531;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:41:34:34:0.453333:22:12:27:14:22:12:27:14
chr14	33294042	.	G	A	163.83	PASS	AF=0.314286;AO=22;DP=70;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.071626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8076;QD=9.3617;RBI=0.079434;REFB=-0.00478872;REVB=-0.0343435;RO=47;SAF=19;SAR=3;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.387441;STB=0.74351;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0109557;OID=.;OPOS=33294042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:47:48:22:22:0.314286:3:19:29:18:3:19:29:19
chr14	34393602	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.076458;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.953;QD=40.7629;RBI=0.0858683;REFB=0;REVB=0.0390838;RO=0;SAF=3;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00182329;OID=.;OPOS=34393602;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:7:3:0:0:7:3:0:0
chr14	34395148	.	GA	G,GG	750.68	PASS	AF=0.944444,0.0555556;AO=50,4;DP=56;FAO=51,3;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=19,1;FSAR=32,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531682,0.0461241;FXX=0.0181785;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=299.113,282.994;QD=55.6055;RBI=0.0595476,0.0517082;REFB=0,0;REVB=0.0268153,0.0233733;RO=1;SAF=18,2;SAR=32,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0254311,-0.166656;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0021176,0.037675;OID=.,.;OPOS=34395149,34395149;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.944444,0.0555556:50,4:56:51,3:54:0:19,1:32,2:0:0:9:1:18,2:32,2:1:0
chr14	35062312	.	C	T	441.45	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00669709;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.692;QD=58.8593;RBI=0.00794836;REFB=0;REVB=0.00428083;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000855769;OID=.;OPOS=35062312;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0
chr14	35099099	.	A	G	224.63	PASS	AF=0.488889;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0395149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9424;QD=19.9667;RBI=0.0396802;REFB=-0.0228011;REVB=-0.00361865;RO=23;SAF=16;SAR=6;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136369;STB=0.507685;STBP=0.929;TYPE=snp;VARB=0.0342435;OID=.;OPOS=35099099;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:23:22:22:0.488889:6:16:17:6:6:16:17:6
chr14	35242828	.	G	A	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00170628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.223;QD=10.9409;RBI=0.0510757;REFB=-0.0302413;REVB=-0.0510471;RO=20;SAF=8;SAR=3;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21057;STB=0.627206;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.049042;OID=.;OPOS=35242828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:3:8:11:9:3:8:11:9
chr14	35591174	.	T	C	307.75	PASS	AF=0.348214;AO=39;DP=112;FAO=39;FDP=112;FR=.;FRO=73;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.0748671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9135;QD=10.991;RBI=0.0879663;REFB=-0.0195885;REVB=-0.0461843;RO=73;SAF=20;SAR=19;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398574;STB=0.522924;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.027942;OID=.;OPOS=35591174;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:73:73:39:39:0.348214:19:20:40:33:19:20:40:33
chr14	35592538	.	C	G	426.46	PASS	AF=0.693878;AO=34;DP=49;FAO=34;FDP=49;FR=.;FRO=15;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.0188003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9625;QD=34.8134;RBI=0.0189836;REFB=-0.0308628;REVB=0.00263203;RO=15;SAF=15;SAR=19;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145038;STB=0.507893;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0113563;OID=.;OPOS=35592538;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:15:15:34:34:0.693878:19:15:7:8:19:15:7:8
chr14	36003547	.	GGC	G,GG	201.86	PASS	AF=0,1;AO=5,7;DP=26;FAO=0,30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.229414,-0.21272;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=8.08194,10.4326;QD=26.9152;RBI=0.279975,0.265994;REFB=0.0414085,0.015747;REVB=-0.160485,0.159697;RO=0;SAF=0,1;SAR=5,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.5,0;SSEP=0,0.533333;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0350349,0.0152112;OID=.,.;OPOS=36003548,36003549;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:5,7:26:0,30:30:0:0,10:0,20:0:0:3:0:0,1:5,6:0:0
chr14	36004075	.	A	G	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.143;QD=49.5981;RBI=0.0659637;REFB=0;REVB=-0.0220057;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000482372;OID=.;OPOS=36004075;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:3:15:0:0:3:15:0:0
chr14	36004215	.	TTGGGGGGC	GGGGCGGCG,TTGGGGGC	143.09	PASS	AF=0.186441,0.40678;AO=3,12;DP=61;FAO=11,24;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=11,15;FSAR=0,9;FSRF=1;FSRR=23;FWDB=-0.100096,-0.231409;FXX=0.0483793;HRUN=2,6;LEN=9,1;MLLD=169.101,8.12939;QD=9.70118;RBI=0.109369,0.242256;REFB=-0.0238029,-0.169021;REVB=-0.0440715,-0.0716791;RO=16;SAF=3,0;SAR=0,12;SRF=0;SRR=16;SSEN=0,0.714286;SSEP=0,0;SSSB=0.854465,0;STB=0.999376,0.769047;STBP=0,0;TYPE=mnp,del;VARB=0.266694,0.0543322;OID=.,.;OPOS=36004215,36004217;OREF=TTGGGGGGC,G;OALT=GGGGCGGCG,-;OMAPALT=GGGGCGGCG,TTGGGGGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:69:61:59:16:24:3,12:11,24:0.186441,0.40678:0,12:3,0:0:16:0,9:11,15:1:23
chr14	36004247	.	C	CG	56.73	PASS	AF=0.206522;AO=23;DP=92;FAO=19;FDP=92;FR=.;FRO=73;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=45;FWDB=-0.0445129;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=41.6335;QD=2.46653;RBI=0.0969244;REFB=-0.0137071;REVB=-0.0860985;RO=69;SAF=14;SAR=9;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246572;STB=0.768961;STBP=0.017;TYPE=ins;VARB=0.0597438;OID=.;OPOS=36004248;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.206522:23:92:19:92:73:14:5:28:45:56:69:14:9:28:41
chr14	36789729	.	T	G	918.93	PASS	AF=1;AO=58;DP=61;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.486;QD=57.4329;RBI=0.0639707;REFB=0;REVB=0.0128614;RO=1;SAF=26;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177973;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200613;OID=.;OPOS=36789729;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:64:1:0:58:64:1:32:26:1:0:35:29:0:0
chr14	36789775	.	A	T	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00142152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.231;QD=60.9772;RBI=0.0182757;REFB=0;REVB=-0.0182203;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.31673e-05;OID=.;OPOS=36789775;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chr14	36789795	.	G	A	223.17	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0814687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.126;QD=49.5937;RBI=0.081588;REFB=0;REVB=0.00441022;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000950263;OID=.;OPOS=36789795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
chr14	36840650	.	A	T	1631.62	PASS	AF=1;AO=108;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.232;QD=59.876;RBI=0.0278231;REFB=0;REVB=0.0196093;RO=0;SAF=67;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.81254e-05;OID=.;OPOS=36840650;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:108:109:1:41:67:0:0:42:67:0:0
chr14	37063123	.	C	T	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0503254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.311;QD=55.6546;RBI=0.0671312;REFB=0;REVB=0.0444291;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.41258e-05;OID=.;OPOS=37063123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr14	37063294	.	A	G	621.64	PASS	AF=0.921569;AO=46;DP=50;FAO=47;FDP=51;FR=.;FRO=4;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00799734;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.678;QD=48.7559;RBI=0.0285329;REFB=-0.011135;REVB=0.0273892;RO=4;SAF=26;SAR=20;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00993666;STB=0.50596;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.000195844;OID=.;OPOS=37063294;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:50:51:4:4:46:47:0.921569:20:26:2:2:20:27:2:2
chr14	37135753	.	G	C	1191.54	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.752;QD=61.1046;RBI=0.0539991;REFB=0;REVB=0.0216846;RO=0;SAF=37;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.98571e-05;OID=.;OPOS=37135753;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:78:0:0:76:78:1:39:37:0:0:39:39:0:0
chr14	37180685	.	T	C	534.65	PASS	AF=0.590361;AO=49;DP=84;FAO=49;FDP=83;FR=.;FRO=34;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.0657874;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.379;QD=25.7661;RBI=0.0660508;REFB=-0.0207717;REVB=-0.00589216;RO=34;SAF=32;SAR=17;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228787;STB=0.625199;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0228885;OID=.;OPOS=37180685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:34:34:49:49:0.590361:17:32:12:22:17:32:12:22
chr14	37203697	.	G	A	451.17	PASS	AF=0.466667;AO=49;DP=105;FAO=49;FDP=105;FR=.;FRO=56;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=28;FWDB=-0.0366768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.6536;QD=17.1872;RBI=0.0367862;REFB=-0.0254676;REVB=0.00283566;RO=54;SAF=22;SAR=27;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657448;STB=0.527333;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0401702;OID=.;OPOS=37203697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:54:56:49:49:0.466667:27:22:28:26:27:22:28:28
chr14	37344229	.	A	AG	146.07	PASS	AF=0.421053;AO=15;DP=39;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0134986;FXX=0.0256345;HRUN=0;LEN=1;MLLD=197.127;QD=15.3759;RBI=0.0135796;REFB=-0.0126302;REVB=-0.00148113;RO=22;SAF=3;SAR=12;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26636;STB=0.692353;STBP=0.082;TYPE=ins;VARB=0.0312432;OID=.;OPOS=37344230;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.421053:15:39:16:38:22:3:13:10:12:99:22:3:12:9:13
chr14	37641880	.	C	A	323.43	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.153882;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.9485;QD=53.9042;RBI=0.154901;REFB=0;REVB=-0.0177354;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00238468;OID=.;OPOS=37641880;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:17:7:0:0:17:7:0:0
chr14	37642592	.	T	G	87.92	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.043464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.3943;QD=19.5375;RBI=0.0732662;REFB=-0.0338472;REVB=0.0589814;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404954;STB=0.689206;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0167873;OID=.;OPOS=37642592;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:18:18:8:6:8:8:0.444444:5:3:7:1:5:3:5:1
chr14	38061742	.	C	T	612.13	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.499;QD=61.2125;RBI=0.0785248;REFB=0;REVB=0.0700853;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000341335;OID=.;OPOS=38061742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr14	38218343	.	A	G	251.53	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.00995138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.793;QD=17.0526;RBI=0.0282039;REFB=-0.0181723;REVB=-0.02639;RO=31;SAF=15;SAR=13;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183684;STB=0.510321;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0186452;OID=.;OPOS=38218343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:13:15:16:15:13:15:16:15
chr14	38260034	.	T	C	383.3	PASS	AF=0.370968;AO=46;DP=124;FAO=46;FDP=124;FR=.;FRO=78;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=-0.0207095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.46;QD=12.3645;RBI=0.0207096;REFB=-0.017438;REVB=-2.51521e-05;RO=77;SAF=27;SAR=19;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0465622;STB=0.522945;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.027668;OID=.;OPOS=38260034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:77:78:46:46:0.370968:19:27:42:35:19:27:43:35
chr14	38680648	.	A	G	129.37	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.00320321;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.5137;QD=13.2691;RBI=0.0150258;REFB=-0.0085595;REVB=0.0146804;RO=24;SAF=12;SAR=3;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0770945;STB=0.545391;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=0.0148606;OID=.;OPOS=38680648;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:3:12:18:6:3:12:18:6
chr14	38680740	.	G	A	317.33	PASS	AF=0.607843;AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=51;FR=.;FRO=20;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0253526;FXX=0.0192271;HRUN=4;LEN=1;MLLD=142.272;QD=24.8887;RBI=0.0405688;REFB=-0.0404958;REVB=0.0316714;RO=19;SAF=20;SAR=11;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870988;STB=0.539785;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0263453;OID=.;OPOS=38680740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:19:20:31:31:0.607843:11:20:10:9:11:20:11:9
chr14	38681113	.	G	A	1393.82	PASS	AF=0.948454;AO=92;DP=97;FAO=92;FDP=97;FR=.;FRO=5;FSAF=46;FSAR=46;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0337762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.892;QD=57.477;RBI=0.0349302;REFB=-0.0309659;REVB=0.00890459;RO=2;SAF=46;SAR=46;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201629;STB=0.505154;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00012793;OID=.;OPOS=38681113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:97:97:2:5:92:92:0.948454:46:46:0:2:46:46:3:2
chr14	38681269	.	C	T	1116.92	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0485827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4932;QD=60.374;RBI=0.0505093;REFB=0;REVB=-0.0138169;RO=0;SAF=27;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09191e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000199638;OID=.;OPOS=38681269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:47:27:0:0:47:27:0:0
chr14	38725285	.	G	A	142.7	PASS	AF=0.6;AO=15;DP=25;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0446087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.41;QD=22.8313;RBI=0.046093;REFB=-0.0241129;REVB=-0.0116031;RO=10;SAF=11;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189223;STB=0.60721;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.013966;OID=.;OPOS=38725285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:10:10:15:15:0.6:4:11:5:5:4:11:5:5
chr14	39556185	.	G	C	527.46	PASS	AF=0.524752;AO=53;DP=101;FAO=53;FDP=101;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0987362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.67;QD=20.8895;RBI=0.0989193;REFB=-0.0104382;REVB=0.00601667;RO=48;SAF=19;SAR=34;SRF=26;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162732;STB=0.589788;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0118253;OID=.;OPOS=39556185;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:48:48:53:53:0.524752:34:19:26:22:34:19:26:22
chr14	39618946	.	A	G	120.79	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0832673;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.048;QD=13.4208;RBI=0.0858361;REFB=-0.0218653;REVB=-0.0208422;RO=19;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13069;STB=0.61096;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0516028;OID=.;OPOS=39618946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:19:22:14:14:0.388889:7:7:7:12:7:7:7:15
chr14	39648629	.	C	T	146.37	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.01267;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=311.979;QD=16.728;RBI=0.0162778;REFB=-0.00729043;REVB=0.0102196;RO=19;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230244;STB=0.631421;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0121937;OID=.;OPOS=39648629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:9:7:13:6:9:7:13:6
chr14	39650234	.	A	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0339468;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.225;QD=40.7629;RBI=0.0376907;REFB=0;REVB=0.0163769;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112059;OID=.;OPOS=39650234;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr14	39650824	.	C	T	38.17	PASS	AF=0.4;AO=5;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0191499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.843;QD=10.1782;RBI=0.100716;REFB=-0.0383711;REVB=-0.0988783;RO=5;SAF=5;SAR=0;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.730294;STB=0.812863;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0999302;OID=.;OPOS=39650824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:5:9:5:6:0.4:0:5:3:2:1:5:3:6
chr14	39650924	.	A	G	161.81	PASS	AF=0.695652;AO=16;DP=23;FAO=16;FDP=23;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0355379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5968;QD=28.14;RBI=0.0417728;REFB=-0.0344512;REVB=0.0219551;RO=7;SAF=10;SAR=6;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14158;STB=0.578221;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.0146158;OID=.;OPOS=39650924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:23:23:7:7:16:16:0.695652:6:10:6:1:6:10:6:1
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chr14	39716201	.	A	G	507.74	PASS	AF=0.5;AO=49;DP=98;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0348419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.7266;QD=20.724;RBI=0.0374968;REFB=-0.00791326;REVB=0.0138582;RO=49;SAF=31;SAR=18;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019698;STB=0.510909;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=0.00830749;OID=.;OPOS=39716201;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:49:49:49:49:0.5:18:31:30:19:18:31:30:19
chr14	39722023	.	G	C	89.46	PASS	AF=0.244898;AO=12;DP=49;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0515543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.5999;QD=7.30284;RBI=0.0517382;REFB=0.00343107;REVB=-0.00435913;RO=34;SAF=5;SAR=7;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00601742;STB=0.532817;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=-0.0139043;OID=.;OPOS=39722023;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:49:49:34:37:12:12:0.244898:7:5:14:20:7:5:17:20
chr14	39736680	.	T	C	769.66	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029575;FXX=0.020404;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.921;QD=64.1384;RBI=0.0392855;REFB=0;REVB=0.0258586;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89498e-05;OID=.;OPOS=39736680;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr14	39777676	.	G	C	1149.34	PASS	AF=0.472441;AO=120;DP=247;FAO=120;FDP=254;FR=.;FRO=134;FSAF=58;FSAR=62;FSRF=78;FSRR=56;FWDB=-0.0624573;FXX=0.0116727;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1077;QD=18.0999;RBI=0.0641087;REFB=-0.0506257;REVB=0.0144572;RO=123;SAF=58;SAR=62;SRF=68;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0639742;STB=0.551968;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0382453;OID=.;OPOS=39777676;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:247:254:123:134:120:120:0.472441:62:58:68:55:62:58:78:56
chr14	39784012	.	A	G	72.68	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.00553032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3976;QD=8.8102;RBI=0.0104803;REFB=-0.0187116;REVB=0.00890232;RO=22;SAF=8;SAR=2;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330287;STB=0.721736;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.0590965;OID=.;OPOS=39784012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:22:23:10:10:0.30303:2:8:12:10:2:8:12:11
chr14	39784014	.	A	G	315.63	PASS	AF=0.787879;AO=26;DP=33;FAO=26;FDP=33;FR=.;FRO=7;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.0451798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3849;QD=38.258;RBI=0.0489456;REFB=-0.0804639;REVB=0.0188272;RO=7;SAF=19;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252967;STB=0.63813;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0181091;OID=.;OPOS=39784014;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:33:33:7:7:26:26:0.787879:7:19:1:6:7:19:1:6
chr14	39818028	.	A	G	335.74	PASS	AF=0.444444;AO=35;DP=83;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=-0.000936484;FXX=0.0240935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.707;QD=16.5798;RBI=0.0369981;REFB=-0.0183294;REVB=0.0369863;RO=45;SAF=21;SAR=14;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456985;STB=0.515781;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0199518;OID=.;OPOS=39818028;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:81:45:45:35:36:0.444444:14:21:25:20:15:21:25:20
chr14	39819734	.	T	G	1179.14	PASS	AF=0.987342;AO=77;DP=80;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0330832;FXX=0.0124984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.911;QD=59.7031;RBI=0.0402409;REFB=-0.00215466;REVB=0.0229092;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.506171;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=5.82701e-05;OID=.;OPOS=39819734;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:79:0:1:77:78:0.987342:39:38:0:0:40:38:0:1
chr14	39868646	.	C	A	519.99	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00487934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.84;QD=59.4276;RBI=0.0175741;REFB=0;REVB=0.0168832;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.83689e-05;OID=.;OPOS=39868646;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr14	42360633	.	T	C	1207.93	PASS	AF=0.987654;AO=72;DP=73;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00639816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.858;QD=59.6508;RBI=0.073801;REFB=-0.135929;REVB=0.0735232;RO=0;SAF=42;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1178e-08;STB=0.506492;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.000358251;OID=.;OPOS=42360633;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:81:0:1:72:80:0.987654:30:42:0:0:38:42:0:1
chr14	42998026	.	T	C	421.68	PASS	AF=0.842105;AO=32;DP=38;FAO=32;FDP=38;FR=.;FRO=6;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0343728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.9073;QD=44.3878;RBI=0.0477274;REFB=-0.0628954;REVB=0.0331121;RO=4;SAF=20;SAR=12;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0846904;STB=0.535692;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0058614;OID=.;OPOS=42998026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:38:38:4:6:32:32:0.842105:12:20:4:0:12:20:5:1
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chr14	44975510	.	C	T	561.41	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=41;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00477706;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=249.299;QD=56.1413;RBI=0.00610621;REFB=-0.128457;REVB=0.00380336;RO=2;SAF=19;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000456372;OID=.;OPOS=44975510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:41:40:2:2:38:38:0.95:19:19:1:1:19:19:1:1
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chr14	45650900	.	A	G	83.45	PASS	AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0562877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.624;QD=9.81813;RBI=0.0564463;REFB=-0.0116044;REVB=-0.00422777;RO=23;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122495;STB=0.573641;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0450539;OID=.;OPOS=45650900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:6:5:8:15:6:5:8:15
chr14	45664721	.	C	G	306.94	PASS	AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0120543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.07;QD=18.055;RBI=0.0577116;REFB=-0.0239626;REVB=0.0564387;RO=35;SAF=21;SAR=12;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24393;STB=0.636281;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0188185;OID=.;OPOS=45664721;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:12:21:13:22:12:21:13:22
chr14	45665468	.	C	G	300.76	PASS	AF=0.576923;AO=29;DP=51;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0107756;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.671;QD=23.1357;RBI=0.0260051;REFB=-0.00783063;REVB=-0.0236676;RO=22;SAF=19;SAR=10;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127579;STB=0.558784;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.00581479;OID=.;OPOS=45665468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:22:22:29:30:0.576923:10:19:11:11:11:19:11:11
chr14	45696037	.	T	G	93.81	PASS	AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.000201278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=319.579;QD=10.1416;RBI=0.000546716;REFB=0.00140833;REVB=-0.000508317;RO=25;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022417;STB=0.513491;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=-0.00473735;OID=.;OPOS=45696037;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:37:25:25:12:12:0.324324:6:6:12:13:6:6:12:13
chr14	45711594	.	T	C	182.01	PASS	AF=0.315789;AO=24;DP=76;FAO=24;FDP=76;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.0295503;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.115;QD=9.57938;RBI=0.0618238;REFB=-0.0203511;REVB=0.0543044;RO=50;SAF=8;SAR=16;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176091;STB=0.618081;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0351921;OID=.;OPOS=45711594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:50:52:24:24:0.315789:16:8:24:26:16:8:26:26
chr14	47309495	.	AG	A,AT	751.27	PASS	AF=0.0185185,0.981481;AO=12,37;DP=54;FAO=1,53;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=1,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139032,-0.0130619;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=101.458,107.628;QD=55.6495;RBI=0.0306147,0.0429092;REFB=0,0;REVB=0.0272757,0.0408728;RO=0;SAF=2,16;SAR=10,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.7558e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0594674,0.00209393;OID=.,.;OPOS=47309496,47309496;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0185185,0.981481:12,37:54:1,53:54:0:0,21:1,32:0:0:5:0:2,16:10,21:0:0
chr14	47341131	.	C	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.811;QD=49.5992;RBI=0.0459782;REFB=0;REVB=-0.00791506;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346235;OID=.;OPOS=47341131;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
chr14	47528470	.	T	C	805.17	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226975;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.3668;QD=64.4134;RBI=0.0227;REFB=0;REVB=-0.000337975;RO=0;SAF=17;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019839;OID=.;OPOS=47528470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:33:17:0:0:33:17:0:0
chr14	47528540	.	T	C	199.94	PASS	AF=0.362319;AO=25;DP=69;FAO=25;FDP=69;FR=.;FRO=44;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0139462;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=196.389;QD=11.5909;RBI=0.0157508;REFB=-0.0086531;REVB=-0.00732071;RO=44;SAF=7;SAR=18;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186232;STB=0.608491;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0164123;OID=.;OPOS=47528540;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:44:44:25:25:0.362319:18:7:19:25:18:7:19:25
chr14	47528551	.	T	A	463.89	PASS	AF=0.641791;AO=43;DP=67;FAO=43;FDP=67;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=0.00703866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.448;QD=27.6951;RBI=0.0124411;REFB=-0.028629;REVB=0.0102585;RO=23;SAF=18;SAR=25;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105964;STB=0.547408;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0102101;OID=.;OPOS=47528551;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:23:24:43:43:0.641791:25:18:6:17:25:18:7:17
chr14	50195679	.	A	G	1896.4	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0293729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.609;QD=61.6714;RBI=0.0359577;REFB=0;REVB=0.020741;RO=0;SAF=71;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.01963e-05;OID=.;OPOS=50195679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:52:71:0:0:52:71:0:0
chr14	50251369	.	A	G,T	949.01	PASS	AF=0.924242,0.0757576;AO=61,5;DP=66;FAO=61,5;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33,5;FSAR=28,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119298,-0.0186174;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=175.688,120.23;QD=57.516;RBI=0.0315785,0.0280189;REFB=0,0;REVB=-0.0292384,-0.0209393;RO=0;SAF=33,5;SAR=28,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000943138,0.185161;OID=.,.;OPOS=50251369,50251369;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:66:66:0:0:61,5:61,5:0.924242,0.0757576:28,0:33,5:0:0:28,0:33,5:0:0
chr14	50298962	.	T	A	507.72	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00142293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.054;QD=56.4136;RBI=0.0414211;REFB=0.0888896;REVB=0.0413966;RO=1;SAF=19;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239852;STB=0.512813;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.000453194;OID=.;OPOS=50298962;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:16:19:1:0:16:19:1:0
chr14	50477643	.	G	C	728.99	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2377;QD=57.1753;RBI=0.0988702;REFB=0;REVB=-0.0982109;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000657692;OID=.;OPOS=50477643;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:26:25:0:0:26:25:0:0
chr14	50535374	.	C	A	211.64	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=8;FWDB=-0.00648538;FXX=0.0163908;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.59;QD=14.1092;RBI=0.00949647;REFB=-0.0171954;REVB=0.00693706;RO=31;SAF=21;SAR=4;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108476;STB=0.567509;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0240567;OID=.;OPOS=50535374;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:31:35:25:25:0.416667:4:21:24:7:4:21:27:8
chr14	50575408	.	C	T	195.89	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00198652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.8379;QD=25.2761;RBI=0.00418049;REFB=-0.0137411;REVB=-0.00367834;RO=12;SAF=5;SAR=14;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352802;STB=0.697293;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00403515;OID=.;OPOS=50575408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:14:5:9:3:14:5:9:3
chr14	50575411	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.362;QD=57.6806;RBI=0.0456792;REFB=0;REVB=0.0321359;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172415;OID=.;OPOS=50575411;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr14	50583083	.	G	T	242.67	PASS	AF=0.6875;AO=21;DP=31;FAO=22;FDP=32;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0567567;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.4128;QD=30.3337;RBI=0.0578547;REFB=-0.0596998;REVB=0.011218;RO=10;SAF=12;SAR=9;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100585;STB=0.56029;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0289111;OID=.;OPOS=50583083;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:31:32:10:10:21:22:0.6875:9:12:4:6:9:13:4:6
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chr14	50623657	.	G	A	1135.28	PASS	AF=0.854369;AO=88;DP=103;FAO=88;FDP=103;FR=.;FRO=15;FSAF=46;FSAR=42;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0214499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3176;QD=44.0884;RBI=0.0310704;REFB=-0.0926059;REVB=-0.0224783;RO=15;SAF=46;SAR=42;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0701143;STB=0.537233;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0101316;OID=.;OPOS=50623657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:103:103:15:15:88:88:0.854369:42:46:4:11:42:46:4:11
chr14	50623669	.	G	A	156.89	PASS	AF=0.23;AO=23;DP=100;FAO=23;FDP=100;FR=.;FRO=77;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=44;FSRR=33;FWDB=-0.0791979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.475;QD=6.27549;RBI=0.0916993;REFB=-0.00788851;REVB=-0.0462219;RO=77;SAF=7;SAR=16;SRF=44;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.331523;STB=0.703879;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0436028;OID=.;OPOS=50623669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:77:77:23:23:0.23:16:7:44:33:16:7:44:33
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chr14	50623683	.	A	G	781.93	PASS	AF=0.682692;AO=71;DP=104;FAO=71;FDP=104;FR=.;FRO=33;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0179125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4559;QD=30.0742;RBI=0.0580891;REFB=-0.0807942;REVB=0.0552584;RO=33;SAF=43;SAR=28;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126584;STB=0.568262;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0457058;OID=.;OPOS=50623683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:33:33:71:71:0.682692:28:43:13:20:28:43:13:20
chr14	50704331	.	C	T	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.17;QD=55.656;RBI=0.0286465;REFB=0;REVB=0.0132397;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210977;OID=.;OPOS=50704331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chr14	50713679	.	T	A,G	381.68	PASS	AF=0.178571,0.821429;AO=5,23;DP=28;FAO=5,23;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=5,12;FSAR=0,11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0078364,0.0220405;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=196.087,166.691;QD=54.526;RBI=0.0792746,0.0600302;REFB=0,0;REVB=0.0788864,0.0558376;RO=0;SAF=5,12;SAR=0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0494357,-0.0213437;OID=.,.;OPOS=50713679,50713679;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:23:28:28:0:0:5,23:5,23:0.178571,0.821429:0,11:5,12:0:0:0,11:5,12:0:0
chr14	50769717	.	G	A	99.39	PASS	AF=0.444444;AO=11;DP=26;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0865214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0563;QD=14.7249;RBI=0.0899094;REFB=0.00338698;REVB=-0.0244488;RO=15;SAF=1;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467914;STB=0.677626;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.00134592;OID=.;OPOS=50769717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:15:15:11:12:0.444444:10:1:6:9:10:2:6:9
chr14	50778816	.	A	C	120.76	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0368966;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=168.952;QD=15.0955;RBI=0.0459734;REFB=-0.0394323;REVB=-0.0274262;RO=12;SAF=10;SAR=4;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226992;STB=0.531868;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0445609;OID=.;OPOS=50778816;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:12:18:14:14:0.4375:4:10:11:1:4:10:12:6
chr14	50786004	.	A	G	155.98	PASS	AF=0.64;AO=10;DP=24;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.09253;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=39.0357;QD=24.9569;RBI=0.161339;REFB=-0.152796;REVB=0.132169;RO=6;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109203;STB=0.516109;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0492648;OID=.;OPOS=50786004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:24:25:6:9:10:16:0.64:5:5:2:4:10:6:3:6
chr14	50788213	.	C	T	447.85	PASS	AF=0.565789;AO=43;DP=77;FAO=43;FDP=76;FR=.;FRO=33;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.00745142;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.317;QD=23.5709;RBI=0.0374337;REFB=-0.00239402;REVB=-0.0366846;RO=33;SAF=24;SAR=19;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101457;STB=0.505574;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.00171601;OID=.;OPOS=50788213;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:33:33:43:43:0.565789:19:24:18:15:19:24:18:15
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chr14	50799126	.	G	C	364.18	PASS	AF=0.536232;AO=37;DP=69;FAO=37;FDP=69;FR=.;FRO=32;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.0143764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2917;QD=21.1117;RBI=0.0307085;REFB=-0.00359894;REVB=0.0271354;RO=32;SAF=20;SAR=17;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451072;STB=0.524927;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.00269233;OID=.;OPOS=50799126;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:32:32:37:37:0.536232:17:20:19:13:17:20:19:13
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chr14	50802840	.	A	G	139.47	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=45;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00972985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.6415;QD=12.3973;RBI=0.0415999;REFB=-0.0232275;REVB=0.040446;RO=28;SAF=6;SAR=10;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320514;STB=0.694958;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0308644;OID=.;OPOS=50802840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:29:16:16:0.355556:10:6:19:9:10:6:20:9
chr14	50824839	.	G	A	270.11	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=50;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0173772;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.589;QD=22.0494;RBI=0.0332205;REFB=-0.063234;REVB=0.0283132;RO=23;SAF=15;SAR=10;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142568;STB=0.590092;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.035753;OID=.;OPOS=50824839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:23:24:25:25:0.510204:10:15:10:13:10:15:10:14
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chr14	50935150	.	A	G	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00346166;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=210.944;QD=58.2396;RBI=0.026574;REFB=0;REVB=0.0263476;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.00314e-05;OID=.;OPOS=50935150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:26:36:0:0:26:36:0:0
chr14	51057727	.	G	A	871.43	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0144354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.271;QD=56.221;RBI=0.0476658;REFB=-0.160307;REVB=0.0454274;RO=1;SAF=27;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171613;STB=0.509088;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000878644;OID=.;OPOS=51057727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:34:27:1:0:34:27:1:0
chr14	51192659	.	G	A	3179.02	PASS	AF=0.981221;AO=209;DP=214;FAO=209;FDP=213;FR=.;FRO=4;FSAF=125;FSAR=84;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0370587;FXX=0.00930189;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.6236;QD=59.6998;RBI=0.0371285;REFB=-0.164852;REVB=-0.00227613;RO=4;SAF=125;SAR=84;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0056571;STB=0.50297;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.000788509;OID=.;OPOS=51192659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:214:213:4:4:209:209:0.981221:84:125:3:1:84:125:3:1
chr14	51204996	.	C	T	834.35	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0277918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9314;QD=57.5413;RBI=0.0350496;REFB=0;REVB=0.0213563;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.09624e-05;OID=.;OPOS=51204996;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr14	51223789	.	C	T	94.71	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=20;FWDB=0.0293032;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=250.724;QD=10.8236;RBI=0.0293507;REFB=-0.0099116;REVB=-0.00166906;RO=23;SAF=5;SAR=7;SRF=3;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.358546;STB=0.706539;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0129239;OID=.;OPOS=51223789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:23:23:12:12:0.342857:7:5:3:20:7:5:3:20
chr14	51224374	.	T	G	143.0	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=-0.00957947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.476;QD=10.7924;RBI=0.0176767;REFB=-0.0118704;REVB=-0.014856;RO=35;SAF=9;SAR=9;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0801768;STB=0.547118;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=0.0139882;OID=.;OPOS=51224374;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:35:35:18:18:0.339623:9:9:20:15:9:9:20:15
chr14	51224417	.	G	C	154.66	PASS	AF=0.36;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0291803;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5204;QD=12.3726;RBI=0.0350088;REFB=-0.00185189;REVB=-0.0193424;RO=33;SAF=9;SAR=9;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0836898;STB=0.559934;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00159259;OID=.;OPOS=51224417;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:33:32:18:18:0.36:9:9:19:14:9:9:19:13
chr14	51237701	.	A	G	571.65	PASS	AF=0.577778;AO=52;DP=90;FAO=52;FDP=90;FR=.;FRO=38;FSAF=42;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.0783659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.2059;QD=25.4066;RBI=0.0812446;REFB=-0.0164473;REVB=0.0214353;RO=37;SAF=42;SAR=10;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.384609;STB=0.718217;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0208283;OID=.;OPOS=51237701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:37:38:52:52:0.577778:10:42:14:23:10:42:14:24
chr14	51239067	.	C	G	1199.91	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0171042;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3492;QD=58.532;RBI=0.0324631;REFB=-0.0561948;REVB=0.0275917;RO=0;SAF=54;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509089;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00119039;OID=.;OPOS=51239067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:0:2:80:80:0.97561:26:54:0:0:26:54:2:0
chr14	51324884	.	A	G	338.83	PASS	AF=0.625;AO=31;DP=52;FAO=35;FDP=56;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.00627826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.761;QD=24.2018;RBI=0.0335664;REFB=-0.0194677;REVB=0.0329741;RO=16;SAF=18;SAR=13;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128322;STB=0.588782;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.00936329;OID=.;OPOS=51324884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:56:16:21:31:35:0.625:13:18:6:10:15:20:7:14
chr14	51324893	.	AAAG	AA,A	108.75	PASS	AF=0.38,0;AO=8,6;DP=41;FAO=19,0;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=14,0;FSAR=5,0;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0139233,-0.0164679;FXX=0.019604;HRUN=5,5;LEN=2,3;MLLD=228.96,226.288;QD=8.6996;RBI=0.015988,0.0187487;REFB=-0.0118588,-0.0129189;REVB=-0.00785858,-0.00896227;RO=6;SAF=6,3;SAR=2,3;SRF=1;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.426988,0.280783;STB=0.751806,0.5;STBP=0.008,1;TYPE=del,del;VARB=0.0157094,0.0170033;OID=.,.;OPOS=51324895,51324894;OREF=AG,AAG;OALT=-,-;OMAPALT=AA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.38,0:8,6:41:19,0:50:31:14,0:5,0:10:21:96:6:6,3:2,3:1:5
chr14	51370852	.	C	G	213.94	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00903088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.472;QD=20.8719;RBI=0.0160276;REFB=-0.017401;REVB=-0.0132412;RO=20;SAF=14;SAR=7;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27628;STB=0.655588;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0208287;OID=.;OPOS=51370852;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:7:14:7:13:7:14:7:13
chr14	51446216	.	T	G	526.97	PASS	AF=0.4;AO=58;DP=147;FAO=58;FDP=145;FR=.;FRO=87;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=42;FSRR=45;FWDB=-0.00387281;FXX=0.0136045;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.5738;QD=14.537;RBI=0.00439826;REFB=-0.00748189;REVB=-0.00208471;RO=86;SAF=29;SAR=29;SRF=42;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123249;STB=0.510341;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0137857;OID=.;OPOS=51446216;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:145:86:87:58:58:0.4:29:29:42:44:29:29:42:45
chr14	51710861	.	A	G	1246.06	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0529956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.027;QD=61.5336;RBI=0.0603714;REFB=0;REVB=0.0289167;RO=0;SAF=36;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.85053e-05;OID=.;OPOS=51710861;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:80:81:1:44:36:0:0:44:37:0:0
chr14	51722690	.	T	C	919.08	PASS	AF=0.955882;AO=65;DP=68;FAO=65;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0159351;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.0268;QD=54.0634;RBI=0.0184085;REFB=-0.188926;REVB=-0.00921654;RO=0;SAF=40;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502392;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.00486718;OID=.;OPOS=51722690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:68:68:0:3:65:65:0.955882:25:40:0:0:25:40:2:1
chr14	52174876	.	C	T	398.97	PASS	AF=0.526316;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=-0.0204557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.148;QD=20.9982;RBI=0.0205421;REFB=-0.00361034;REVB=-0.00188233;RO=36;SAF=21;SAR=19;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0742897;STB=0.541039;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.00349762;OID=.;OPOS=52174876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:36:36:40:40:0.526316:19:21:22:14:19:21:22:14
chr14	52182081	.	T	A	252.56	PASS	AF=0.375;AO=30;DP=80;FAO=30;FDP=80;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=33;FSRR=17;FWDB=0.00189219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3727;QD=12.6281;RBI=0.0383454;REFB=-0.00969396;REVB=-0.0382987;RO=48;SAF=25;SAR=5;SRF=33;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228391;STB=0.654644;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0230075;OID=.;OPOS=52182081;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:48:50:30:30:0.375:5:25:33:15:5:25:33:17
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chr14	52418655	.	G	A	375.05	PASS	AF=0.68;AO=34;DP=50;FAO=34;FDP=50;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.00714811;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.938;QD=30.0044;RBI=0.0164188;REFB=-0.0285475;REVB=0.0147812;RO=16;SAF=12;SAR=22;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165243;STB=0.59019;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.00826505;OID=.;OPOS=52418655;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:16:16:34:34:0.68:22:12:10:6:22:12:10:6
chr14	52470889	.	A	G	113.37	PASS	AF=0.297872;AO=14;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=22;FWDB=-0.00230459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.278;QD=9.6488;RBI=0.00439539;REFB=-0.013226;REVB=0.00374277;RO=30;SAF=3;SAR=11;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215246;STB=0.608527;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0464179;OID=.;OPOS=52470889;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:33:14:14:0.297872:11:3:11:19:11:3:11:22
chr14	52478315	.	A	G	406.1	PASS	AF=0.555556;AO=39;DP=71;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.011054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.483;QD=22.561;RBI=0.0145047;REFB=-0.0118647;REVB=-0.0093913;RO=31;SAF=18;SAR=21;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605364;STB=0.530711;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00932593;OID=.;OPOS=52478315;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:31:32:39:40:0.555556:21:18:12:19:21:19:13:19
chr14	52496387	.	C	A	968.03	PASS	AF=0.971014;AO=67;DP=70;FAO=67;FDP=69;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0139283;FXX=0.0142837;HRUN=4;LEN=1;MLLD=294.759;QD=56.1177;RBI=0.0245938;REFB=-0.0141844;REVB=0.0202696;RO=2;SAF=31;SAR=36;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00205397;STB=0.501087;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=2.69576e-06;OID=.;OPOS=52496387;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:70:69:2:2:67:67:0.971014:36:31:1:1:36:31:1:1
chr14	52496407	.	C	T	836.97	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0368059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5951;QD=55.798;RBI=0.0504919;REFB=-0.0362888;REVB=-0.0345653;RO=1;SAF=26;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017801;STB=0.509431;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00170602;OID=.;OPOS=52496407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:33:26:1:0:33:26:1:0
chr14	52505517	.	G	A	206.95	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=-0.0053599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.216;QD=17.2457;RBI=0.0122059;REFB=-0.0132323;REVB=-0.0109662;RO=27;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160802;STB=0.591629;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0166975;OID=.;OPOS=52505517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:9:12:11:16:9:12:11:16
chr14	52507429	.	A	G	2954.79	PASS	AF=1;AO=186;DP=187;FAO=187;FDP=187;FR=.;FRO=0;FSAF=90;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161543;FXX=0.00531887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.389;QD=63.2041;RBI=0.0248079;REFB=0;REVB=0.0188274;RO=0;SAF=89;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.89893e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01685e-05;OID=.;OPOS=52507429;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:187:187:0:0:186:187:1:97:89:0:0:97:90:0:0
chr14	52509501	.	T	C	558.82	PASS	AF=0.487603;AO=58;DP=117;FAO=59;FDP=121;FR=.;FRO=62;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.047791;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.87;QD=18.4734;RBI=0.0479278;REFB=-0.0556543;REVB=0.00361818;RO=58;SAF=40;SAR=18;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168708;STB=0.561803;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0630971;OID=.;OPOS=52509501;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:121:58:62:58:59:0.487603:18:40:30:28:20:39:34:28
chr14	52520368	.	C	T	284.12	PASS	AF=0.370787;AO=33;DP=86;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=-0.00577341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.466;QD=12.7694;RBI=0.00758006;REFB=-0.0287914;REVB=-0.00491173;RO=53;SAF=18;SAR=15;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593038;STB=0.55099;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.052783;OID=.;OPOS=52520368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:89:53:56:33:33:0.370787:15:18:26:27:15:18:26:30
chr14	52520853	.	A	G	1247.27	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430923;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.467;QD=61.5938;RBI=0.0463915;REFB=0;REVB=0.0171822;RO=0;SAF=31;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.91607e-05;OID=.;OPOS=52520853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:81:0:0:79:81:1:48:31:0:0:48:33:0:0
chr14	52535648	.	G	T	666.52	PASS	AF=0.956522;AO=44;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0251136;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.525;QD=57.958;RBI=0.0473411;REFB=-0.0355597;REVB=0.0401308;RO=2;SAF=19;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00566436;STB=0.503017;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.00189738;OID=.;OPOS=52535648;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:46:46:2:2:44:44:0.956522:25:19:1:1:25:19:1:1
chr14	52536512	.	T	C	501.61	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00286209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1075;QD=59.0124;RBI=0.0302306;REFB=0;REVB=0.0300948;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000503722;OID=.;OPOS=52536512;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:16:18:0:0:16:18:0:0
chr14	52735108	.	C	T	486.4	PASS	AF=0.495146;AO=51;DP=103;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0250884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.42;QD=18.8892;RBI=0.0358684;REFB=-0.0243121;REVB=-0.0256343;RO=51;SAF=26;SAR=25;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354794;STB=0.514476;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0253323;OID=.;OPOS=52735108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:51:52:51:51:0.495146:25:26:28:23:25:26:28:24
chr14	52736153	.	TCTC	T	240.96	PASS	AF=0.451613;AO=26;DP=64;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=8.53213e-05;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=3;MLLD=221.444;QD=15.5456;RBI=0.0264633;REFB=-0.0197776;REVB=-0.0264631;RO=33;SAF=14;SAR=12;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0675696;STB=0.548353;STBP=0.511;TYPE=del;VARB=0.0252825;OID=.;OPOS=52736154;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.451613:26:64:28:62:34:14:14:20:14:99:33:14:12:20:13
chr14	52741950	.	A	G	206.76	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=0.0182725;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=191.695;QD=17.5963;RBI=0.0184028;REFB=-0.00727014;REVB=0.00218594;RO=25;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0347428;STB=0.508122;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0168153;OID=.;OPOS=52741950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:25:26:21:21:0.446809:11:10:11:14:11:10:12:14
chr14	52906081	.	T	G	982.48	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=69;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0154912;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.297;QD=57.7929;RBI=0.0260508;REFB=-0.0582587;REVB=0.0209444;RO=1;SAF=26;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0113879;STB=0.506022;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=7.62342e-07;OID=.;OPOS=52906081;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:68:1:1:67:67:0.985294:41:26:0:1:41:26:0:1
chr14	52907353	.	C	T	1097.48	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.411;QD=60.1357;RBI=0.0194163;REFB=0;REVB=-0.00977282;RO=0;SAF=43;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41298e-05;OID=.;OPOS=52907353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:30:43:0:0:30:43:0:0
chr14	52937255	.	C	T	520.79	PASS	AF=0.583333;AO=47;DP=82;FAO=49;FDP=84;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=9;FWDB=0.0162148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.63;QD=24.7997;RBI=0.0269864;REFB=-0.0104425;REVB=-0.0215719;RO=35;SAF=23;SAR=24;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197267;STB=0.604993;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0042107;OID=.;OPOS=52937255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:84:35:35:47:49:0.583333:24:23:26:9:25:24:26:9
chr14	53345378	.	G	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.445;QD=57.6794;RBI=0.0248973;REFB=0;REVB=-0.0181876;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.05259e-05;OID=.;OPOS=53345378;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0
chr14	53394708	.	T	A	183.0	PASS	AF=0.403509;AO=22;DP=54;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=0.028088;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=100.005;QD=12.8424;RBI=0.0304002;REFB=0.00855388;REVB=0.0116291;RO=26;SAF=12;SAR=10;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14408;STB=0.605975;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-0.000549269;OID=.;OPOS=53394708;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:57:26:34:22:23:0.403509:10:12:18:8:10:13:25:9
chr14	53417158	.	G	C	203.96	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0051294;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.49;QD=21.4694;RBI=0.00983224;REFB=-0.0255415;REVB=0.00838822;RO=17;SAF=5;SAR=15;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159398;STB=0.58056;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0274616;OID=.;OPOS=53417158;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:17:18:20:20:0.526316:15:5:7:10:15:5:7:11
chr14	53513354	.	T	C	253.56	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0144285;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=139.015;QD=17.4866;RBI=0.0248301;REFB=0.00112341;REVB=0.0202077;RO=27;SAF=10;SAR=18;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811688;STB=0.576867;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=-0.00145079;OID=.;OPOS=53513354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:30:28:28:0.482759:18:10:12:15:18:10:15:15
chr14	53529669	.	A	T	729.48	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00634843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.536;QD=57.2144;RBI=0.0063857;REFB=0;REVB=0.00068888;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.28328e-06;OID=.;OPOS=53529669;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:51:0:0:48:51:1:21:27:0:0:24:27:0:0
chr14	53619463	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236476;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.684;QD=52.6127;RBI=0.134653;REFB=0;REVB=0.132561;RO=0;SAF=19;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132752;OID=.;OPOS=53619463;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:3:19:0:0:3:19:0:0
chr14	53619480	.	T	C,TGCCGCC	265.29	PASS	AF=0.121212,0.606061;AO=4,19;DP=33;FAO=4,20;FDP=33;FR=.;FRO=9;FSAF=4,17;FSAR=0,3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0236677,-0.0406181;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,6;MLLD=95.4993,167.13;QD=32.1561;RBI=0.0665405,0.044313;REFB=-0.0183416,-0.0568982;REVB=-0.062189,0.0177148;RO=9;SAF=4,16;SAR=0,3;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.642322,0.0663329;STB=0.995756,0.541357;STBP=0.209,0.706;TYPE=snp,ins;VARB=0.0423604,0.0262907;OID=.,.;OPOS=53619480,53619481;OREF=T,-;OALT=C,GCCGCC;OMAPALT=C,TGCCGCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:66:33:33:9:9:4,19:4,20:0.121212,0.606061:0,3:4,16:7:2:0,3:4,17:7:2
chr14	53619544	.	G	A	1013.94	PASS	AF=1;AO=67;DP=68;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0479597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.256;QD=57.9393;RBI=0.0807937;REFB=0;REVB=0.0650192;RO=0;SAF=42;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.93036e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00038769;OID=.;OPOS=53619544;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:70:0:0:67:70:1:25:42:0:0:26:44:0:0
chr14	54875276	.	C	A	47.97	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0729787;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2972;QD=9.59466;RBI=0.0780639;REFB=-0.0108704;REVB=-0.0277142;RO=13;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34615;STB=0.713673;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.015641;OID=.;OPOS=54875276;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:20:20:13:13:7:7:0.35:2:5:5:8:2:5:5:8
chr14	54875514	.	A	G	181.28	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0743745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7187;QD=16.4801;RBI=0.0752864;REFB=0.00143332;REVB=0.0116823;RO=25;SAF=7;SAR=12;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153533;STB=0.588141;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.000106781;OID=.;OPOS=54875514;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:25:25:19:19:0.431818:12:7:13:12:12:7:13:12
chr14	54903542	.	T	C	36.14	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.0163938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.334;QD=6.57127;RBI=0.0301613;REFB=-0.00778454;REVB=0.0253169;RO=16;SAF=2;SAR=4;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11206;STB=0.571206;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0404504;OID=.;OPOS=54903542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:4:2:4:12:4:2:4:12
chr14	54996872	.	G	A	244.1	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0204753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.172;QD=18.7766;RBI=0.0265367;REFB=0.00565782;REVB=-0.0168807;RO=26;SAF=14;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0346149;STB=0.519388;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=-0.00452604;OID=.;OPOS=54996872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:12:14:15:11:12:14:15:11
chr14	55255673	.	C	T	799.4	PASS	AF=0.551471;AO=72;DP=131;FAO=75;FDP=136;FR=.;FRO=61;FSAF=36;FSAR=39;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=0.027833;FXX=0.0144917;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.081;QD=23.5117;RBI=0.0307414;REFB=-0.0464779;REVB=-0.0130521;RO=56;SAF=36;SAR=36;SRF=29;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143072;STB=0.505299;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0435062;OID=.;OPOS=55255673;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:136:56:61:72:75:0.551471:36:36:29:27:39:36:30:31
chr14	55308770	.	C	A	1542.75	PASS	AF=1;AO=94;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.065952;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5114;QD=63.6187;RBI=0.0877207;REFB=0;REVB=0.0578381;RO=0;SAF=62;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.26736e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103603;OID=.;OPOS=55308770;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:97:0:0:94:97:1:32:62:0:0:35:62:0:0
chr14	55458040	.	A	G	407.3	PASS	AF=0.412281;AO=47;DP=114;FAO=47;FDP=114;FR=.;FRO=67;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=41;FWDB=-0.0150475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.775;QD=14.2911;RBI=0.0154505;REFB=-0.0217269;REVB=-0.00350581;RO=66;SAF=13;SAR=34;SRF=26;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140437;STB=0.576237;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0290908;OID=.;OPOS=55458040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:66:67:47:47:0.412281:34:13:26:40:34:13:26:41
chr14	55511362	.	CTTTTTC	CTTTTC,CTTTTTT,CTTTTTTCTTC	205.67	PASS	AF=0,0.0612245,0.255102;AO=12,6,16;DP=100;FAO=0,6,25;FDP=98;FR=.;FRO=67;FSAF=0,3,13;FSAR=0,3,12;FSRF=34;FSRR=33;FWDB=-0.0970895,0.0129711,-0.00750629;FXX=0.0101;HRUN=5,2,5;LEN=1,1,4;MLLD=14.601,35.72,231.238;QD=8.39452;RBI=0.116187,0.0137579,0.0122454;REFB=-0.0174626,0.00242464,-0.00972254;REVB=-0.0638205,-0.00458584,-0.00967498;RO=53;SAF=6,3,10;SAR=6,3,6;SRF=27;SRR=26;SSEN=0.369863,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0117159,-0.0107244,0.144698;STB=0.5,0.506827,0.509131;STBP=1,0.922,0.955;TYPE=del,snp,ins;VARB=0,-6.37004e-05,0.0217555;OID=.,.,.;OPOS=55511363,55511368,55511366;OREF=T,C,-;OALT=-,T,TTTC;OMAPALT=CTTTTC,CTTTTTT,CTTTTTTCTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0.0612245,0.255102:12,6,16:100:0,6,25:98:67:0,3,13:0,3,12:34:33:99:53:6,3,10:6,3,6:27:26
chr14	55512273	.	C	A	64.07	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00590417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4893;QD=9.49158;RBI=0.0228718;REFB=0.0310939;REVB=0.0220966;RO=18;SAF=4;SAR=5;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620281;STB=0.537732;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=-0.0582654;OID=.;OPOS=55512273;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:5:4:7:11:5:4:7:11
chr14	55513848	.	G	C	159.48	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0164549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.174;QD=17.7196;RBI=0.0529625;REFB=-0.0377339;REVB=0.0503415;RO=19;SAF=3;SAR=14;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.387982;STB=0.724801;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0623595;OID=.;OPOS=55513848;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:19:19:17:17:0.472222:14:3:10:9:14:3:10:9
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chr14	55605036	.	A	C	557.54	PASS	AF=0.464567;AO=52;DP=120;FAO=59;FDP=127;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=36;FSRR=32;FWDB=0.0367709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.3;QD=17.5603;RBI=0.0502597;REFB=-0.019211;REVB=-0.0342629;RO=64;SAF=21;SAR=31;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111801;STB=0.529339;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0206385;OID=.;OPOS=55605036;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:127:64:68:52:59:0.464567:31:21:33:31:31:28:36:32
chr14	55619311	.	A	G	46.61	PASS	AF=0.388889;AO=5;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.0434193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.641;QD=10.3582;RBI=0.044839;REFB=-5.8333e-05;REVB=0.0111937;RO=11;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247279;STB=0.624653;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.00159513;OID=.;OPOS=55619311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:5:7:0.388889:2:3:4:7:3:4:4:7
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chr14	55818517	.	T	A	116.19	PASS	AF=0.24;AO=18;DP=74;FAO=18;FDP=75;FR=.;FRO=57;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=31;FSRR=26;FWDB=-0.00917667;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.5154;QD=6.19681;RBI=0.0520133;REFB=0.00256242;REVB=0.0511974;RO=56;SAF=14;SAR=4;SRF=30;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.327614;STB=0.69976;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=-0.0062916;OID=.;OPOS=55818517;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:56:57:18:18:0.24:4:14:30:26:4:14:31:26
chr14	55818706	.	T	C	233.47	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0258791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.751;QD=16.9796;RBI=0.0266292;REFB=-0.00429682;REVB=-0.00627587;RO=29;SAF=6;SAR=20;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362005;STB=0.705353;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00448042;OID=.;OPOS=55818706;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:29:26:26:0.472727:20:6:17:12:20:6:17:12
chr14	55819791	.	G	A	251.4	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0215625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2393;QD=17.0438;RBI=0.0314201;REFB=0.00470878;REVB=0.0228535;RO=31;SAF=8;SAR=20;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.316249;STB=0.678261;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00303349;OID=.;OPOS=55819791;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:20:8:19:12:20:8:19:12
chr14	55834828	.	T	A,TAAA	110.32	PASS	AF=0.04,0.26;AO=3,8;DP=54;FAO=2,13;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=1,11;FSAR=1,2;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.0176743,-0.0835214;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=1,3;MLLD=178.397,37.0237;QD=8.82526;RBI=0.0194229,0.0876049;REFB=-0.000721636,0.00705942;REVB=-0.0080541,-0.0264347;RO=36;SAF=2,6;SAR=1,2;SRF=17;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.192777,0.342856;STB=0.51338,0.782285;STBP=0.847,0.024;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0126317,-0.0361569;OID=.,.;OPOS=55834828,55834829;OREF=T,-;OALT=A,AAA;OMAPALT=A,TAAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:96:54:50:36:35:3,8:2,13:0.04,0.26:1,2:2,6:17:19:1,2:1,11:18:17
chr14	55835773	.	A	AAAT	251.62	PASS	AF=0.517857;AO=24;DP=63;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.019135;FXX=0;HRUN=4;LEN=3;MLLD=237.891;QD=17.9731;RBI=0.0239746;REFB=-0.00620572;REVB=-0.0144442;RO=38;SAF=9;SAR=15;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190557;STB=0.501867;STBP=0.999;TYPE=ins;VARB=0.00561357;OID=.;OPOS=55835774;OREF=-;OALT=AAT;OMAPALT=AAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.517857:24:63:29:56:27:13:16:12:15:99:38:9:15:21:17
chr14	55864130	.	A	G	252.78	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00903913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.128;QD=21.0647;RBI=0.0196554;REFB=-0.013406;REVB=0.0174537;RO=23;SAF=12;SAR=12;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209814;STB=0.604084;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.012307;OID=.;OPOS=55864130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:23:24:24:24:0.5:12:12:17:6:12:12:17:7
chr14	55907172	.	C	G	532.73	PASS	AF=0.390244;AO=62;DP=163;FAO=64;FDP=164;FR=.;FRO=100;FSAF=46;FSAR=18;FSRF=79;FSRR=21;FWDB=-0.0275153;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.056;QD=12.9933;RBI=0.0285688;REFB=-0.0070352;REVB=-0.00768661;RO=99;SAF=44;SAR=18;SRF=78;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109269;STB=0.556363;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0185932;OID=.;OPOS=55907172;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:164:99:100:62:64:0.390244:18:44:78:21:18:46:79:21
chr14	56958247	.	C	T	1133.51	PASS	AF=0.95122;AO=76;DP=80;FAO=78;FDP=82;FR=.;FRO=4;FSAF=47;FSAR=31;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0268312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.059;QD=55.2932;RBI=0.0301514;REFB=-0.0129627;REVB=-0.0137546;RO=4;SAF=45;SAR=31;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0402234;STB=0.520403;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00818157;OID=.;OPOS=56958247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:80:82:4:4:76:78:0.95122:31:45:4:0:31:47:4:0
chr14	57052511	.	G	T	924.37	PASS	AF=0.575163;AO=88;DP=153;FAO=88;FDP=153;FR=.;FRO=65;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=35;FSRR=30;FWDB=-0.0178836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.072;QD=24.1665;RBI=0.0364176;REFB=-0.0274148;REVB=-0.0317241;RO=63;SAF=52;SAR=36;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403143;STB=0.522847;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0167975;OID=.;OPOS=57052511;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:153:63:65:88:88:0.575163:36:52:34:29:36:52:35:30
chr14	57099859	.	G	A	652.63	PASS	AF=1;AO=35;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.8559;QD=62.155;RBI=0.0609553;REFB=0;REVB=0.017509;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000683694;OID=.;OPOS=57099859;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:35:42:1:10:25:0:0:13:29:0:0
chr14	57101682	.	A	G	1156.84	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0208016;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2918;QD=60.8865;RBI=0.0208164;REFB=0;REVB=0.000785302;RO=0;SAF=23;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.76403e-05;OID=.;OPOS=57101682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:76:0:0:76:76:1:53:23:0:0:53:23:0:0
chr14	57102534	.	G	A	278.64	PASS	AF=0.365591;AO=26;DP=85;FAO=34;FDP=93;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=8;FSRR=51;FWDB=0.0341154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.379;QD=11.9843;RBI=0.0353247;REFB=-0.0147246;REVB=0.00916364;RO=57;SAF=13;SAR=13;SRF=8;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.435907;STB=0.706024;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0231659;OID=.;OPOS=57102534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:93:57:59:26:34:0.365591:13:13:8:49:19:15:8:51
chr14	57672715	.	C	T	372.49	PASS	AF=0.396396;AO=45;DP=111;FAO=44;FDP=111;FR=.;FRO=67;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=29;FSRR=38;FWDB=-0.0255086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7489;QD=13.4229;RBI=0.04256;REFB=-0.0124063;REVB=-0.0340686;RO=65;SAF=21;SAR=24;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0378664;STB=0.526931;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0218536;OID=.;OPOS=57672715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:65:67:45:44:0.396396:24:21:28:37:23:21:29:38
chr14	57672871	.	A	G	300.26	PASS	AF=0.452055;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=-0.0167361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.452;QD=16.4524;RBI=0.02954;REFB=0.00135828;REVB=0.0243416;RO=40;SAF=28;SAR=5;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427667;STB=0.74451;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.000994241;OID=.;OPOS=57672871;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:40:40:33:33:0.452055:5:28:20:20:5:28:20:20
chr14	57675185	.	C	T	188.73	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0370607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.223;QD=14.2436;RBI=0.0375057;REFB=-0.0137162;REVB=0.00575983;RO=31;SAF=7;SAR=15;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272972;STB=0.656597;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0270429;OID=.;OPOS=57675185;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:15:7:18:13:15:7:18:13
chr14	57676330	.	G	T	515.88	PASS	AF=0.4375;AO=56;DP=127;FAO=56;FDP=128;FR=.;FRO=72;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=-0.0923792;FXX=0.00775134;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0496;QD=16.1212;RBI=0.0950393;REFB=0.0202065;REVB=-0.0223285;RO=71;SAF=29;SAR=27;SRF=29;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109237;STB=0.564493;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=-0.027994;OID=.;OPOS=57676330;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:128:71:72:56:56:0.4375:27:29:29:42:27:29:29:43
chr14	57741550	.	A	G	54.67	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.000607208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.722;QD=7.81039;RBI=0.013585;REFB=-0.0126227;REVB=-0.0135714;RO=20;SAF=6;SAR=2;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196171;STB=0.624665;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0324587;OID=.;OPOS=57741550;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:28:28:20:20:8:8:0.285714:2:6:12:8:2:6:12:8
chr14	57866623	.	A	G,T	785.46	PASS	AF=0.931034,0.0517241;AO=52,4;DP=58;FAO=54,3;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=26,0;FSAR=28,3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0482868,-0.04907;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=77.8257,21.5888;QD=54.1694;RBI=0.0506618,0.0491586;REFB=-0.0484509,-0.0144112;REVB=0.0153296,-0.00294993;RO=2;SAF=25,1;SAR=27,3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0336162,0.210252;STB=0.508769,0.5;STBP=0.526,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00525778,0.059561;OID=.,.;OPOS=57866623,57866623;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:58:58:2:1:52,4:54,3:0.931034,0.0517241:27,3:25,1:0:2:28,3:26,0:0:1
chr14	57876265	.	G	A	1881.0	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0435003;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7698;QD=61.6722;RBI=0.0495846;REFB=0;REVB=-0.0237983;RO=0;SAF=83;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.24584e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000336405;OID=.;OPOS=57876265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:39:83:0:0:39:83:0:0
chr14	57876575	.	T	C	988.38	PASS	AF=1;AO=25;DP=64;FAO=67;FDP=67;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.143509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.6584;QD=59.0075;RBI=0.28742;REFB=0;REVB=0.249029;RO=0;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00604011;OID=.;OPOS=57876575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:67:0:0:25:67:1:6:19:0:0:39:28:0:0
chr14	57938124	.	C	T	646.24	PASS	AF=0.941176;AO=48;DP=51;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0182109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.716;QD=50.6854;RBI=0.0200195;REFB=-0.0101504;REVB=-0.00831517;RO=3;SAF=31;SAR=17;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433808;STB=0.523067;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.00817287;OID=.;OPOS=57938124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:51:51:3:3:48:48:0.941176:17:31:3:0:17:31:3:0
chr14	57938260	.	T	C	740.34	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3602;QD=56.9491;RBI=0.0346577;REFB=0;REVB=0.0261668;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337782;OID=.;OPOS=57938260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:27:25:0:0:27:25:0:0
chr14	57945689	.	G	A	805.17	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0988801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.388;QD=64.4138;RBI=0.106242;REFB=0;REVB=0.0388596;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127842;OID=.;OPOS=57945689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0
chr14	57948380	.	T	C	784.32	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0637401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.602;QD=56.0229;RBI=0.0707053;REFB=0;REVB=0.0306013;RO=0;SAF=11;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295733;OID=.;OPOS=57948380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:56:0:0:53:56:1:42:11:0:0:45:11:0:0
chr14	57957664	.	T	A	1682.33	PASS	AF=0.99115;AO=112;DP=114;FAO=112;FDP=113;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00503634;FXX=0.00877116;HRUN=4;LEN=1;MLLD=341.912;QD=59.5516;RBI=0.00596132;REFB=0.0275431;REVB=0.00318945;RO=1;SAF=67;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104336;STB=0.505494;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-5.74225e-07;OID=.;OPOS=57957664;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:114:113:1:1:112:112:0.99115:45:67:0:1:45:67:0:1
chr14	58304280	.	G	A	1914.81	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.394;QD=61.7682;RBI=0.0351002;REFB=0;REVB=0.0221745;RO=0;SAF=62;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110154;OID=.;OPOS=58304280;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:62:62:0:0:62:62:0:0
chr14	58605790	.	G	A	282.11	PASS	AF=0.410256;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.013815;FXX=0.0126566;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.003;QD=14.467;RBI=0.0139736;REFB=-0.00407883;REVB=-0.00209941;RO=45;SAF=12;SAR=20;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273792;STB=0.648643;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.00502084;OID=.;OPOS=58605790;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:45:46:32:32:0.410256:20:12:29:16:20:12:29:17
chr14	58605952	.	G	A	207.74	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=0.0602513;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.469;QD=15.108;RBI=0.0641293;REFB=-0.0266988;REVB=-0.0219622;RO=31;SAF=14;SAR=10;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980391;STB=0.555511;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0374723;OID=.;OPOS=58605952;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:10:14:21:10:10:14:21:10
chr14	58831142	.	A	G	420.3	PASS	AF=1;AO=15;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00570864;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=201.511;QD=56.0395;RBI=0.00595342;REFB=0;REVB=-0.00168955;RO=0;SAF=7;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9568e-05;OID=.;OPOS=58831142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:30:0:0:15:30:1:8:7:0:0:15:15:0:0
chr14	58839148	.	GTTTTTTTTCA	GTTTTTTTCA,GTTTTTTTCAT	53.27	PASS	AF=0.423077,0;AO=20,2;DP=52;FAO=22,0;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=13,0;FSAR=9,0;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0443564,-0.144028;FXX=0;HRUN=8,8;LEN=1,3;MLLD=7.36583,17.8634;QD=4.09786;RBI=0.125116,0.150511;REFB=-0.0756469,-0.0486465;REVB=0.116989,-0.0437;RO=22;SAF=12,1;SAR=8,1;SRF=12;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0517722,-0.0433315;STB=0.533898,0.5;STBP=0.736,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0527619,0;OID=.,.;OPOS=58839149,58839156;OREF=T,TCA;OALT=-,CAT;OMAPALT=GTTTTTTTCA,GTTTTTTTCAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.423077,0:20,2:52:22,0:52:30:13,0:9,0:16:14:55:22:12,1:8,1:12:10
chr14	58839339	.	A	C	573.49	PASS	AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0283463;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=221.678;QD=55.9501;RBI=0.0356497;REFB=0.0247647;REVB=0.0216192;RO=1;SAF=15;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302234;STB=0.531234;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=-0.000109658;OID=.;OPOS=58839339;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:41:41:1:2:39:39:0.95122:24:15:1:0:24:15:2:0
chr14	58896083	.	T	A	223.11	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=54;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.059096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.557;QD=16.5268;RBI=0.0591025;REFB=-0.0128429;REVB=0.0008784;RO=29;SAF=12;SAR=13;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100735;STB=0.556823;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0131657;OID=.;OPOS=58896083;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:29:29:25:25:0.462963:13:12:17:12:13:12:17:12
chr14	58917454	.	G	A	1462.83	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0431777;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.553;QD=62.2482;RBI=0.050107;REFB=-0.164793;REVB=0.0254243;RO=0;SAF=25;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07289e-08;STB=0.503649;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00165254;OID=.;OPOS=58917454;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:95:94:0:1:93:93:0.989362:68:25:0:0:68:25:0:1
chr14	58937416	.	T	C	323.75	PASS	AF=0.4;AO=36;DP=90;FAO=36;FDP=90;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=25;FWDB=-0.0339044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6037;QD=14.3887;RBI=0.0433652;REFB=-0.00497387;REVB=-0.0270376;RO=54;SAF=18;SAR=18;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391281;STB=0.52221;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0098977;OID=.;OPOS=58937416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:54:54:36:36:0.4:18:18:29:25:18:18:29:25
chr14	58941425	.	C	T	218.99	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0253642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.863;QD=23.675;RBI=0.0273705;REFB=-0.00524041;REVB=0.0102859;RO=16;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704467;STB=0.503933;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.00443555;OID=.;OPOS=58941425;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:12:9:7:9:12:9:7:9
chr14	58953746	.	C	G	816.93	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0033;QD=57.3286;RBI=0.0322901;REFB=0;REVB=-0.0206452;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.53148e-05;OID=.;OPOS=58953746;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0
chr14	59006820	.	T	C	517.19	PASS	AF=0.585366;AO=48;DP=82;FAO=48;FDP=82;FR=.;FRO=34;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0102925;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5246;QD=25.2286;RBI=0.0509558;REFB=0.0130363;REVB=0.0499055;RO=34;SAF=28;SAR=20;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268858;STB=0.5147;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=-0.00778597;OID=.;OPOS=59006820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:34:34:48:48:0.585366:20:28:21:13:20:28:21:13
chr14	59789727	.	G	A	1005.22	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0936961;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.1291;QD=59.1304;RBI=0.123218;REFB=0;REVB=-0.0800238;RO=0;SAF=44;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.11549e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.001579;OID=.;OPOS=59789727;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:68:0:0:67:68:1:23:44:0:0:23:45:0:0
chr14	59797235	.	A	G	771.27	PASS	AF=0.966102;AO=56;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0101772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.491;QD=52.2895;RBI=0.0315202;REFB=-0.107321;REVB=0.029832;RO=1;SAF=35;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132829;STB=0.513884;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000881267;OID=.;OPOS=59797235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:59:59:1:2:56:57:0.966102:21:35:1:0:22:35:2:0
chr14	59835972	.	A	C	82.07	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0134737;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=282.378;QD=32.8286;RBI=0.0241918;REFB=-0.152847;REVB=0.0200924;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984833;STB=0.555432;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00159083;OID=.;OPOS=59835972;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:5:4:1:0:5:4:1:0
chr14	60004844	.	C	T	326.69	PASS	AF=0.961538;AO=24;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00350936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9097;QD=50.2603;RBI=0.0159083;REFB=0.000549947;REVB=-0.0155164;RO=1;SAF=11;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040273;STB=0.519984;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.000506668;OID=.;OPOS=60004844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:24:25:0.961538:13:11:1:0:13:12:1:0
chr14	60031996	.	G	A	1476.03	PASS	AF=0.980583;AO=101;DP=103;FAO=101;FDP=103;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0046487;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.206;QD=57.3215;RBI=0.0101416;REFB=0.0557153;REVB=0.00901339;RO=2;SAF=56;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166407;STB=0.50877;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=6.72727e-06;OID=.;OPOS=60031996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:103:103:2:2:101:101:0.980583:45:56:2:0:45:56:2:0
chr14	60043422	.	A	G	1116.25	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.498;QD=60.3381;RBI=0.0455822;REFB=0;REVB=0.00236262;RO=0;SAF=42;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98661e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.91597e-05;OID=.;OPOS=60043422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:31:42:0:0:31:43:0:0
chr14	60063472	.	A	G	1773.85	PASS	AF=0.983333;AO=117;DP=120;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=63;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0333154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2265;QD=59.1283;RBI=0.0452059;REFB=-0.0681357;REVB=0.0305558;RO=2;SAF=62;SAR=55;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000958124;STB=0.500567;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00255902;OID=.;OPOS=60063472;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:120:120:2:2:117:118:0.983333:55:62:1:1:55:63:1:1
chr14	60212633	.	C	T	419.9	PASS	AF=0.472527;AO=36;DP=85;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.00153052;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.55;QD=18.457;RBI=0.0339023;REFB=-0.0150041;REVB=0.0338678;RO=48;SAF=20;SAR=16;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775453;STB=0.515858;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0180701;OID=.;OPOS=60212633;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:91:48:48:36:43:0.472527:16:20:23:25:22:21:22:26
chr14	60574539	.	A	G	560.82	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0071509;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4367;QD=60.6288;RBI=0.0159569;REFB=0;REVB=0.0142649;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018375;OID=.;OPOS=60574539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0
chr14	60575240	.	T	C	445.44	PASS	AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00304609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.972;QD=52.405;RBI=0.0733385;REFB=-0.0266566;REVB=0.0732752;RO=2;SAF=8;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103249;STB=0.555519;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0139532;OID=.;OPOS=60575240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:34:34:2:2:32:32:0.941176:24:8:2:0:24:8:2:0
chr14	60575512	.	G	A	55.97	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0598279;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.444;QD=9.32808;RBI=0.0617338;REFB=-0.00988286;REVB=-0.0152214;RO=16;SAF=2;SAR=6;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291729;STB=0.681336;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0134533;OID=.;OPOS=60575512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:25:24:16:16:8:8:0.333333:6:2:8:8:6:2:8:8
chr14	60575869	.	A	G	1515.25	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0108602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.895;QD=62.4846;RBI=0.0166123;REFB=-0.128995;REVB=0.0125708;RO=1;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00958021;STB=0.505049;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.000453752;OID=.;OPOS=60575869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:97:1:1:96:96:0.989691:49:47:0:1:49:47:0:1
chr14	60576241	.	G	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.863;QD=42.1826;RBI=0.0330717;REFB=0;REVB=-0.0106767;RO=0;SAF=3;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000316135;OID=.;OPOS=60576241;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:8:3:0:0:8:3:0:0
chr14	60576637	.	A	T	1425.41	PASS	AF=0.978723;AO=92;DP=94;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0142848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=266.723;QD=60.6557;RBI=0.0259367;REFB=-0.0809158;REVB=0.0216485;RO=2;SAF=43;SAR=49;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00132043;STB=0.500696;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00134423;OID=.;OPOS=60576637;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:94:94:2:2:92:92:0.978723:49:43:1:1:49:43:1:1
chr14	60576951	.	A	G	779.78	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.707;QD=63.6553;RBI=0.0236089;REFB=0;REVB=0.0187232;RO=0;SAF=13;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.61818e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134402;OID=.;OPOS=60576951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:35:13:0:0:35:14:0:0
chr14	60581863	.	G	A	1017.99	PASS	AF=0.923077;AO=72;DP=78;FAO=72;FDP=78;FR=.;FRO=6;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0010489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.197;QD=52.2044;RBI=0.0180196;REFB=-0.00554998;REVB=0.017989;RO=6;SAF=41;SAR=31;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144144;STB=0.50764;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.000496878;OID=.;OPOS=60581863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:78:78:6:6:72:72:0.923077:31:41:4:2:31:41:4:2
chr14	60581935	.	C	T	1568.51	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000895945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.757;QD=64.0209;RBI=0.0112254;REFB=0;REVB=-0.0111896;RO=0;SAF=50;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.35849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.41098e-06;OID=.;OPOS=60581935;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:48:50:0:0:48:50:0:0
chr14	60582053	.	G	A	601.15	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00410605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.012;QD=58.6486;RBI=0.032962;REFB=-0.103934;REVB=0.0327053;RO=1;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240441;STB=0.512814;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000876843;OID=.;OPOS=60582053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:19:21:0:1:19:21:0:1
chr14	60864583	.	G	T	1830.13	PASS	AF=0.98374;AO=121;DP=123;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00890088;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=267.225;QD=59.5166;RBI=0.0287439;REFB=-0.136874;REVB=0.0273311;RO=1;SAF=51;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00922324;STB=0.509614;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.000248478;OID=.;OPOS=60864583;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:123:123:1:2:121:121:0.98374:70:51:1:0:70:51:2:0
chr14	60900113	.	C	T	1264.75	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00292568;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.226;QD=61.6952;RBI=0.0163543;REFB=0;REVB=0.0160905;RO=0;SAF=38;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.15311e-05;OID=.;OPOS=60900113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:44:38:0:0:44:38:0:0
chr14	60903757	.	G	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.057288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.95;QD=54.5163;RBI=0.0582904;REFB=0;REVB=-0.0107634;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000380056;OID=.;OPOS=60903757;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr14	60923783	.	C	T	353.19	PASS	AF=0.625;AO=30;DP=48;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0250341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.3097;QD=29.4328;RBI=0.0262254;REFB=-0.0299363;REVB=-0.00781444;RO=17;SAF=21;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242341;STB=0.624913;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0104719;OID=.;OPOS=60923783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:17:18:30:30:0.625:9:21:6:11:9:21:7:11
chr14	60932752	.	G	A	318.83	PASS	AF=0.583333;AO=27;DP=47;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0608995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3854;QD=26.569;RBI=0.0625334;REFB=0.0130832;REVB=-0.0142012;RO=20;SAF=7;SAR=20;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397723;STB=0.507241;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=-0.0246381;OID=.;OPOS=60932752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:20:20:27:28:0.583333:20:7:6:14:20:8:6:14
chr14	61124940	.	A	G	244.84	PASS	AF=0.482143;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0164482;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.763;QD=17.4887;RBI=0.0221431;REFB=-0.0158423;REVB=-0.0148247;RO=28;SAF=12;SAR=15;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829605;STB=0.53782;STBP=0.587;TYPE=snp;VARB=0.0132152;OID=.;OPOS=61124940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:28:29:27:27:0.482143:15:12:15:13:15:12:15:14
chr14	61176485	.	T	C	86.25	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0268035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.336;QD=12.3211;RBI=0.0349506;REFB=-0.00606293;REVB=0.0224302;RO=17;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332324;STB=0.697616;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0175071;OID=.;OPOS=61176485;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:3:8:7:10:3:8:7:10
chr14	61177188	.	G	A	176.28	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0198105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.732;QD=20.7383;RBI=0.0289569;REFB=-0.00628113;REVB=-0.0211198;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00586403;STB=0.503308;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.00825601;OID=.;OPOS=61177188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:8:10:9:7:8:10:9:7
chr14	61445967	.	A	G	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.05;QD=60.6097;RBI=0.0259108;REFB=0;REVB=0.0173175;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132414;OID=.;OPOS=61445967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:12:26:0:0:12:26:0:0
chr14	61449328	.	T	A	1256.97	PASS	AF=0.915789;AO=86;DP=95;FAO=87;FDP=95;FR=.;FRO=8;FSAF=49;FSAR=38;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0369971;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=262.528;QD=52.9252;RBI=0.037048;REFB=-0.0730122;REVB=0.00194041;RO=5;SAF=48;SAR=38;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0255624;STB=0.505293;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.00195737;OID=.;OPOS=61449328;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:95:95:5:8:86:87:0.915789:38:48:4:1:38:49:5:3
chr14	61453739	.	C	CT,CTT,T	174.57	PASS	AF=0.882353,0,0.117647;AO=7,3,5;DP=18;FAO=15,0,2;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8,0,0;FSAR=7,0,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.152651,-0.0898443,-0.0365142;FXX=0.105208;HRUN=2,2,1;LEN=1,2,1;MLLD=14.4601,12.3183,176.563;QD=41.0759;RBI=0.285984,0.160737,0.0866757;REFB=0,0,0;REVB=-0.241835,-0.133283,-0.0786091;RO=3;SAF=5,1,2;SAR=2,2,3;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0295447,-0.255936,-0.165639;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=ins,ins,snp;VARB=-0.0893885,0.0503252,0.0700581;OID=.,.,.;OPOS=61453740,61453740,61453739;OREF=-,-,C;OALT=T,TT,T;OMAPALT=CT,CTT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/3:11:18:17:3:0:7,3,5:15,0,2:0.882353,0,0.117647:2,2,3:5,1,2:2:1:7,0,2:8,0,0:0:0
chr14	61509924	.	T	C	490.88	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0495464;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.213;QD=56.1005;RBI=0.057964;REFB=-0.179424;REVB=0.0300829;RO=1;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217449;STB=0.511621;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.00109226;OID=.;OPOS=61509924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:35:35:1:1:34:34:0.971429:21:13:0:1:21:13:0:1
chr14	61747644	.	A	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.531;QD=33.4285;RBI=0.0508417;REFB=0;REVB=0.0456018;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000651249;OID=.;OPOS=61747644;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr14	61924239	.	G	A	328.8	PASS	AF=0.576271;AO=33;DP=58;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.0219302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.269;QD=22.2916;RBI=0.0433342;REFB=0.00106588;REVB=-0.0373754;RO=25;SAF=12;SAR=21;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275907;STB=0.641297;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.0011198;OID=.;OPOS=61924239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:25:25:33:34:0.576271:21:12:18:7:21:13:18:7
chr14	61924241	.	A	C	306.46	PASS	AF=0.533333;AO=31;DP=58;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.012532;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=159.493;QD=20.4306;RBI=0.0257046;REFB=-0.00986185;REVB=0.0224427;RO=25;SAF=12;SAR=19;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234367;STB=0.609663;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0126237;OID=.;OPOS=61924241;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:25:28:31:32:0.533333:19:12:17:8:19:13:18:10
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chr14	62037421	.	C	T	231.94	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.018293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.158;QD=14.7262;RBI=0.0201139;REFB=-0.0255075;REVB=0.00836277;RO=36;SAF=13;SAR=14;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15085;STB=0.585247;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0269631;OID=.;OPOS=62037421;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:14:13:12:24:14:13:12:24
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chr14	62462766	.	T	C	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.517;QD=56.1906;RBI=0.0375607;REFB=0;REVB=0.00684891;RO=0;SAF=11;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170591;OID=.;OPOS=62462766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:17:11:0:0:17:11:0:0
chr14	62463129	.	G	T	266.58	PASS	AF=0.528302;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=53;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=0.00463977;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.101;QD=20.1195;RBI=0.0107013;REFB=-0.00300858;REVB=0.00964312;RO=25;SAF=17;SAR=11;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272211;STB=0.65115;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00138584;OID=.;OPOS=62463129;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:25:25:28:28:0.528302:11:17:7:18:11:17:7:18
chr14	62463214	.	C	T	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.237;QD=54.5168;RBI=0.0247236;REFB=0;REVB=-0.00153544;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015452;OID=.;OPOS=62463214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr14	63174616	.	T	C	1495.09	PASS	AF=1;AO=86;DP=100;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0612123;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.005;QD=59.2115;RBI=0.0633692;REFB=0;REVB=0.0163926;RO=0;SAF=57;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000446853;OID=.;OPOS=63174616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:101:0:0:86:101:1:29:57:0:0:40:61:0:0
chr14	63174960	.	C	T	225.47	PASS	AF=0.440678;AO=25;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0225129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.693;QD=15.286;RBI=0.0239626;REFB=-0.0309192;REVB=0.00820813;RO=33;SAF=11;SAR=14;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0785118;STB=0.534387;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0345545;OID=.;OPOS=63174960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:33:33:25:26:0.440678:14:11:12:21:15:11:12:21
chr14	63758432	.	A	G	309.18	PASS	AF=0.384615;AO=35;DP=91;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.0364746;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.452;QD=13.5902;RBI=0.0413275;REFB=-0.0100537;REVB=-0.0194312;RO=56;SAF=17;SAR=18;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00385498;STB=0.502199;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0132777;OID=.;OPOS=63758432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:56:56:35:35:0.384615:18:17:27:29:18:17:27:29
chr14	63779665	.	T	A	182.2	PASS	AF=0.359375;AO=23;DP=65;FAO=23;FDP=64;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0127623;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.346;QD=11.3874;RBI=0.015995;REFB=-0.0257401;REVB=0.00964181;RO=39;SAF=8;SAR=15;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262949;STB=0.652042;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0366489;OID=.;OPOS=63779665;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:39:41:23:23:0.359375:15:8:23:16:15:8:24:17
chr14	63842235	.	T	C	185.82	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0182915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.34;QD=19.0582;RBI=0.0204706;REFB=0.0191532;REVB=0.00919039;RO=20;SAF=16;SAR=3;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.532099;STB=0.804388;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=-0.0141155;OID=.;OPOS=63842235;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:3:16:6:14:3:16:6:14
chr14	64118045	.	T	C	497.8	PASS	AF=0.481818;AO=53;DP=110;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=20;FWDB=0.0114442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.935;QD=18.1019;RBI=0.0121545;REFB=-0.0112595;REVB=0.00409404;RO=57;SAF=34;SAR=19;SRF=37;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00775022;STB=0.504297;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0107323;OID=.;OPOS=64118045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:57:57:53:53:0.481818:19:34:37:20:19:34:37:20
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chr14	64497930	.	G	A	279.6	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000812304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.338;QD=48.626;RBI=0.0144758;REFB=-0.0894072;REVB=-0.014453;RO=1;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401764;STB=0.521719;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00390129;OID=.;OPOS=64497930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:11:11:0:1:11:11:0:1
chr14	64498037	.	G	A	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00970237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.214;QD=53.9112;RBI=0.0596086;REFB=0;REVB=0.0588137;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144392;OID=.;OPOS=64498037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0
chr14	64519035	.	A	G	341.0	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0820146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2392;QD=54.5592;RBI=0.0821379;REFB=0;REVB=0.00449909;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010094;OID=.;OPOS=64519035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:12:12:0:0:12:13:0:0
chr14	64519455	.	A	G	130.29	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.6897;QD=43.431;RBI=0.115632;REFB=0;REVB=0.112509;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00258912;OID=.;OPOS=64519455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr14	64522674	.	G	C	393.22	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00469761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0175;QD=56.1735;RBI=0.0707447;REFB=0;REVB=0.0705886;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00144399;OID=.;OPOS=64522674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr14	64522843	.	A	G	723.63	PASS	AF=1;AO=49;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6913;QD=56.7553;RBI=0.133391;REFB=0;REVB=0.119878;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00216968;OID=.;OPOS=64522843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:49:51:1:26:23:0:0:27:24:0:0
chr14	64551688	.	C	T	1206.37	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469705;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.086;QD=61.0818;RBI=0.0472134;REFB=0;REVB=-0.00478283;RO=0;SAF=53;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08692e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000523562;OID=.;OPOS=64551688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:77:79:1:24:53:0:0:25:54:0:0
chr14	64612845	.	C	T	191.76	PASS	AF=0.410714;AO=20;DP=53;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0155683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.109;QD=13.6969;RBI=0.0288994;REFB=-0.00978307;REVB=0.0243475;RO=33;SAF=10;SAR=10;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146923;STB=0.617052;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0150065;OID=.;OPOS=64612845;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:56:33:33:20:23:0.410714:10:10:21:12:13:10:21:12
chr14	64612858	.	C	A	175.84	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=-0.0247088;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.882;QD=13.2706;RBI=0.0349073;REFB=-0.013807;REVB=-0.0246575;RO=32;SAF=9;SAR=12;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203622;STB=0.616912;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0329643;OID=.;OPOS=64612858;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:32:32:21:21:0.396226:12:9:20:12:12:9:20:12
chr14	64637147	.	C	A	210.82	PASS	AF=0.416667;AO=25;DP=60;FAO=25;FDP=60;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.00292742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3439;QD=14.0547;RBI=0.0266326;REFB=-0.00573294;REVB=0.0264712;RO=35;SAF=13;SAR=12;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00584961;STB=0.503335;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.00792789;OID=.;OPOS=64637147;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:35:35:25:25:0.416667:12:13:18:17:12:13:18:17
chr14	64640665	.	C	G	1094.76	PASS	AF=0.441948;AO=118;DP=269;FAO=118;FDP=267;FR=.;FRO=149;FSAF=60;FSAR=58;FSRF=86;FSRR=63;FWDB=-0.116143;FXX=0.00743467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3338;QD=16.4009;RBI=0.116966;REFB=-0.00509691;REVB=-0.0138467;RO=117;SAF=60;SAR=58;SRF=60;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00394453;STB=0.538396;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00466459;OID=.;OPOS=64640665;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:269:267:117:149:118:118:0.441948:58:60:60:57:58:60:86:63
chr14	64656855	.	T	C	175.15	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=0.0164346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.593;QD=20.0176;RBI=0.0307982;REFB=-0.00721288;REVB=0.0260467;RO=17;SAF=12;SAR=6;SRF=15;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229698;STB=0.627784;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.00456313;OID=.;OPOS=64656855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:6:12:15:2:6:12:15:2
chr14	64657684	.	C	A	406.64	PASS	AF=0.425926;AO=46;DP=110;FAO=46;FDP=108;FR=.;FRO=62;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=44;FSRR=18;FWDB=-0.019293;FXX=0.0181802;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.122;QD=15.0607;RBI=0.0239922;REFB=-0.00788449;REVB=-0.0142621;RO=60;SAF=34;SAR=12;SRF=44;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00754707;STB=0.521463;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.00919739;OID=.;OPOS=64657684;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:108:60:62:46:46:0.425926:12:34:44:16:12:34:44:18
chr14	64855041	.	T	C	645.65	PASS	AF=0.433735;AO=62;DP=158;FAO=72;FDP=166;FR=.;FRO=94;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=53;FSRR=41;FWDB=-0.0246744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.625;QD=15.5577;RBI=0.0286139;REFB=-0.0108467;REVB=0.014489;RO=93;SAF=38;SAR=24;SRF=52;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0593474;STB=0.519497;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0126218;OID=.;OPOS=64855041;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:166:93:94:62:72:0.433735:24:38:52:41:29:43:53:41
chr14	64882380	.	A	G	601.71	PASS	AF=0.97561;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0286362;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=288.56;QD=58.7034;RBI=0.0582628;REFB=-0.174381;REVB=0.0507398;RO=1;SAF=28;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407079;STB=0.51999;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.000676139;OID=.;OPOS=64882380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:40:41:1:1:39:40:0.97561:11:28:0:1:12:28:0:1
chr14	64908845	.	G	A	1501.21	PASS	AF=0.962963;AO=104;DP=108;FAO=104;FDP=108;FR=.;FRO=4;FSAF=57;FSAR=47;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.00310273;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.887;QD=55.6002;RBI=0.0197599;REFB=-0.0315333;REVB=0.0195148;RO=4;SAF=57;SAR=47;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0143316;STB=0.507558;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.00122375;OID=.;OPOS=64908845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:108:108:4:4:104:104:0.962963:47:57:3:1:47:57:3:1
chr14	64935720	.	C	T	59.28	PASS	AF=0.571429;AO=7;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00192242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.386;QD=16.9367;RBI=0.0253929;REFB=-0.0218074;REVB=0.02532;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218735;STB=0.599771;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.023616;OID=.;OPOS=64935720;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:7:8:0.571429:3:4:5:1:3:5:5:1
chr14	65008251	.	C	T	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0618968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0851;QD=58.1403;RBI=0.062301;REFB=0;REVB=-0.00708512;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000700176;OID=.;OPOS=65008251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr14	65016702	.	T	G	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.284;QD=58.5878;RBI=0.0258771;REFB=0;REVB=-0.0171615;RO=0;SAF=30;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.15807e-06;OID=.;OPOS=65016702;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:3:30:0:0:3:30:0:0
chr14	65031534	.	C	T	568.89	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.613;QD=58.3472;RBI=0.0302485;REFB=-0.104117;REVB=-0.00110228;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000804344;OID=.;OPOS=65031534;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:37:39:0:0:37:39:1:21:16:0:0:21:18:0:0
chr14	65216165	.	G	A	326.6	PASS	AF=0.5;AO=35;DP=70;FAO=35;FDP=70;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00843095;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.259;QD=18.6626;RBI=0.0784578;REFB=-0.0140825;REVB=0.0780035;RO=33;SAF=18;SAR=17;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0805088;STB=0.528625;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0172612;OID=.;OPOS=65216165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:33:35:35:35:0.5:17:18:20:13:17:18:20:15
chr14	65241228	.	A	G	428.39	PASS	AF=0.411765;AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=0.0226464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.4193;QD=14.3997;RBI=0.0507799;REFB=-0.00899675;REVB=-0.0454504;RO=70;SAF=30;SAR=19;SRF=29;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206305;STB=0.61618;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0147799;OID=.;OPOS=65241228;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:70:70:49:49:0.411765:19:30:29:41:19:30:29:41
chr14	65242044	.	C	T	130.65	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0511773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.73;QD=13.7531;RBI=0.0519407;REFB=-0.0134879;REVB=-0.00887209;RO=23;SAF=11;SAR=4;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399634;STB=0.733022;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0205849;OID=.;OPOS=65242044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:4:11:8:15:4:11:8:15
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chr14	65260227	.	T	G	275.75	PASS	AF=0.581395;AO=25;DP=43;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0213461;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.965;QD=25.6509;RBI=0.0220247;REFB=-0.00855519;REVB=0.00542514;RO=18;SAF=12;SAR=13;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269005;STB=0.514913;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.00687943;OID=.;OPOS=65260227;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:18:18:25:25:0.581395:13:12:8:10:13:12:8:10
chr14	65263300	.	C	T	180.82	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0297145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.616;QD=13.9094;RBI=0.0298766;REFB=-0.00313857;REVB=0.00310805;RO=29;SAF=9;SAR=12;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902056;STB=0.552436;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00756594;OID=.;OPOS=65263300;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:31:21:21:0.403846:12:9:15:14:12:9:16:15
chr14	65263347	.	C	T	463.35	PASS	AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.00589548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.761;QD=21.8047;RBI=0.0250463;REFB=-0.018831;REVB=0.0243426;RO=39;SAF=22;SAR=23;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201502;STB=0.516981;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0112494;OID=.;OPOS=65263347;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:39:40:45:45:0.529412:23:22:20:19:23:22:21:19
chr14	65412748	.	G	C	252.78	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.011137;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.971;QD=21.0647;RBI=0.0134703;REFB=-0.0141416;REVB=-0.00757737;RO=24;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183948;STB=0.603009;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0145187;OID=.;OPOS=65412748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:11:13:8:16:11:13:8:16
chr14	65417070	.	C	A	360.79	PASS	AF=0.481013;AO=38;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.0624613;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.549;QD=18.2677;RBI=0.0686066;REFB=-0.0134453;REVB=0.0283804;RO=40;SAF=15;SAR=23;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525081;STB=0.5367;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0338801;OID=.;OPOS=65417070;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:40:41:38:38:0.481013:23:15:18:22:23:15:19:22
chr14	65419293	.	A	G	300.49	PASS	AF=0.574468;AO=26;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0442011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.6808;QD=25.5738;RBI=0.0471548;REFB=0.00974874;REVB=-0.0164269;RO=21;SAF=11;SAR=15;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433403;STB=0.502391;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=-0.0066912;OID=.;OPOS=65419293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:20:26:27:0.574468:15:11:10:11:15:12:9:11
chr14	65543057	.	T	A,TA	37.54	PASS	AF=0,0.538462;AO=2,4;DP=27;FAO=0,14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=0,10;FSAR=0,4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.015894,-0.100577;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=1,1;MLLD=251.356,7.78827;QD=5.77571;RBI=0.0202313,0.198158;REFB=-0.00770704,-0.129622;REVB=0.0125174,0.170736;RO=19;SAF=2,2;SAR=0,2;SRF=9;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.526746,0.0299437;STB=0.5,0.646839;STBP=1,0.126;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.173265;OID=.,.;OPOS=65543057,65543058;OREF=T,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:38:27:26:19:12:2,4:0,14:0,0.538462:0,2:2,2:9:10:0,4:0,10:5:7
chr14	65878807	.	C	T	279.13	PASS	AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0234656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.4768;QD=27.2325;RBI=0.0306134;REFB=-0.0606946;REVB=0.0196608;RO=16;SAF=14;SAR=11;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0426942;STB=0.523603;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0427496;OID=.;OPOS=65878807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:11:14:8:8:11:14:8:8
chr14	66028446	.	A	G	930.64	PASS	AF=0.942857;AO=66;DP=70;FAO=66;FDP=70;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=58;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0528341;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=305.815;QD=53.1792;RBI=0.0541443;REFB=-0.0630507;REVB=0.0118392;RO=0;SAF=8;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599966;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000275447;OID=.;OPOS=66028446;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:70:70:0:4:66:66:0.942857:58:8:0:0:58:8:4:0
chr14	66209471	.	CTTAAA	CTAAA,CTAA,CTAAAT,CTTAA	1045.93	PASS	AF=0.848837,0.0116279,0.127907,0.0116279;AO=20,11,9,11;DP=86;FAO=73,1,11,1;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0,11,0;FSAR=38,1,0,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00798514,-0.168823,-0.0610327,-0.36109;FXX=0;HRUN=2,2,2,4;LEN=1,2,4,1;MLLD=17.553,10.5244,156.76,12.6298;QD=48.6477;RBI=0.93781,0.456248,0.066805,0.451983;REFB=-0.0107381,-0.0613418,-0.0889268,-0.0559359;REVB=0.937776,0.423864,-0.0271646,-0.27185;RO=25;SAF=20,11,9,0;SAR=0,0,0,11;SRF=0;SRR=25;SSEN=0,0,0,0.41791;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.88793,0.881353,0.879461,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,mnp,del;VARB=0.0211069,-0.0401528,0.13112,0.146781;OID=.,.,.,.;OPOS=66209472,66209473,66209473,66209474;OREF=T,TA,TAAA,A;OALT=-,-,AAAT,-;OMAPALT=CTAAA,CTAA,CTAAAT,CTTAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.848837,0.0116279,0.127907,0.0116279:20,11,9,11:86:73,1,11,1:86:0:35,0,11,0:38,1,0,1:0:0:40:25:20,11,9,0:0,0,0,11:0:25
chr14	66479652	.	G	T	112.28	PASS	AF=0.275862;AO=16;DP=58;FAO=16;FDP=58;FR=.;FRO=42;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=33;FWDB=-0.0325312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.06;QD=7.7431;RBI=0.032595;REFB=-0.0117698;REVB=-0.00203924;RO=42;SAF=4;SAR=12;SRF=9;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0592085;STB=0.535671;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0314248;OID=.;OPOS=66479652;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:42:42:16:16:0.275862:12:4:9:33:12:4:9:33
chr14	66479768	.	A	C	299.1	PASS	AF=0.390805;AO=34;DP=87;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=-0.0461874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.0584;QD=13.7518;RBI=0.046635;REFB=-0.00934372;REVB=-0.00644526;RO=53;SAF=16;SAR=18;SRF=18;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142396;STB=0.580776;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0228342;OID=.;OPOS=66479768;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:53:53:34:34:0.390805:18:16:18:35:18:16:18:35
chr14	66479771	.	G	A	298.27	PASS	AF=0.386364;AO=34;DP=88;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=36;FWDB=0.0234719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7636;QD=13.5577;RBI=0.0237944;REFB=-0.010497;REVB=0.0039041;RO=54;SAF=16;SAR=18;SRF=18;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150295;STB=0.585318;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0167859;OID=.;OPOS=66479771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:54:54:34:34:0.386364:18:16:18:36:18:16:18:36
chr14	67147816	.	T	C	73.41	PASS	AF=0.322581;AO=10;DP=31;FAO=10;FDP=31;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.0583606;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5289;QD=9.47174;RBI=0.0670837;REFB=0.00870231;REVB=0.0330798;RO=21;SAF=7;SAR=3;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0860954;STB=0.551901;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=-0.0129085;OID=.;OPOS=67147816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:21:21:10:10:0.322581:3:7:16:5:3:7:16:5
chr14	67667019	.	C	T	52.92	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0858818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.981;QD=21.1692;RBI=0.086629;REFB=-0.0594653;REVB=-0.0113537;RO=3;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175667;STB=0.599755;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.021409;OID=.;OPOS=67667019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:6:1:0:3:6:1:0:3
chr14	67671701	.	C	T	75.08	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=27;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0436765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3549;QD=11.1223;RBI=0.0643835;REFB=-0.0130416;REVB=0.0473033;RO=17;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128126;STB=0.507677;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.012544;OID=.;OPOS=67671701;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:27:27:17:17:10:10:0.37037:6:4:7:10:6:4:7:10
chr14	67769177	.	A	C	1006.78	PASS	AF=0.5;AO=98;DP=191;FAO=98;FDP=196;FR=.;FRO=98;FSAF=55;FSAR=43;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=0.013494;FXX=0.00507588;HRUN=4;LEN=1;MLLD=162.738;QD=20.5465;RBI=0.0162293;REFB=-0.0121452;REVB=-0.00901675;RO=93;SAF=55;SAR=43;SRF=55;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273051;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0158628;OID=.;OPOS=67769177;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:196:93:98:98:98:0.5:43:55:55:38:43:55:55:43
chr14	67800316	.	G	A	680.63	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.16;QD=61.8753;RBI=0.0262547;REFB=0;REVB=-0.00270199;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01197e-05;OID=.;OPOS=67800316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:42:44:1:19:23:0:0:20:24:0:0
chr14	67800815	.	G	A	547.59	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00443888;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.813;QD=54.7591;RBI=0.0648659;REFB=-0.158293;REVB=0.0647138;RO=1;SAF=22;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208236;STB=0.521728;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0103393;OID=.;OPOS=67800815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:39:40:1:2:38:38:0.95:16:22:1:0:16:22:2:0
chr14	67815761	.	A	G	200.16	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00545901;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.937;QD=19.0632;RBI=0.0137652;REFB=-0.0220919;REVB=0.0126365;RO=21;SAF=14;SAR=6;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.256977;STB=0.636222;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0408836;OID=.;OPOS=67815761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:21:22:20:20:0.47619:6:14:9:12:6:14:10:12
chr14	67849161	.	TAGAT	AGTAT,ATATT,TAGTA,TAGTAT,TATAT	67.51	PASS	AF=0.0943396,0.0377358,0,0.113208,0;AO=5,2,2,7,3;DP=54;FAO=5,2,0,6,0;FDP=53;FR=.;FRO=40;FSAF=5,2,0,4,0;FSAR=0,0,0,2,0;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0105238,-0.0270792,0.000915042,-0.0110136,-0.0246524;FXX=0.0185151;HRUN=4,4,1,0,1;LEN=3,4,2,1,1;MLLD=96.1489,105.924,84.1357,85.6659,80.442;QD=5.09545;RBI=0.06242,0.126253,0.0606031,0.0702288,0.246735;REFB=-0.00802723,-0.0022619,-0.0097967,-0.0101371,-0.00747331;REVB=-0.0615265,-0.123315,-0.0605962,-0.0693598,-0.245501;RO=31;SAF=5,2,1,1,2;SAR=0,0,1,6,1;SRF=16;SRR=15;SSEN=0,0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0,0;SSSB=0.638816,0.445343,-0.0141561,-0.475702,0.156472;STB=0.998138,0.995744,0.5,0.721526,0.5;STBP=0.004,0.101,1,0.271,1;TYPE=mnp,mnp,mnp,ins,snp;VARB=-0.0196649,0.208509,0,0.135106,0.141258;OID=.,.,.,.,.;OPOS=67849161,67849161,67849164,67849164,67849163;OREF=TAG,TAGA,AT,-,G;OALT=AGT,ATAT,TA,T,T;OMAPALT=AGTAT,ATATT,TAGTA,TAGTAT,TATAT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/4:24:54:53:31:40:5,2,2,7,3:5,2,0,6,0:0.0943396,0.0377358,0,0.113208,0:0,0,1,6,1:5,2,1,1,2:16:15:0,0,0,2,0:5,2,0,4,0:16:24
chr14	67850106	.	A	G	375.62	PASS	AF=0.506494;AO=37;DP=77;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=-0.00620668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.0775;QD=19.5125;RBI=0.0708361;REFB=-0.0260708;REVB=0.0705637;RO=39;SAF=27;SAR=10;SRF=29;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163184;STB=0.511622;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.0287038;OID=.;OPOS=67850106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:39:38:37:39:0.506494:10:27:29:10:11:28:28:10
chr14	67938818	.	G	A	100.23	PASS	AF=0.26;AO=13;DP=50;FAO=13;FDP=50;FR=.;FRO=37;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=7;FWDB=-0.0164924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.794;QD=8.0184;RBI=0.0324429;REFB=-0.0128079;REVB=0.0279381;RO=37;SAF=8;SAR=5;SRF=30;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.274853;STB=0.664126;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0211565;OID=.;OPOS=67938818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:37:37:13:13:0.26:5:8:30:7:5:8:30:7
chr14	67939483	.	T	C	51.23	PASS	AF=0.216216;AO=8;DP=37;FAO=8;FDP=37;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0783931;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7297;QD=5.53798;RBI=0.0888645;REFB=-0.0079845;REVB=-0.0418502;RO=28;SAF=5;SAR=3;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109243;STB=0.585989;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0626142;OID=.;OPOS=67939483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:37:37:28:29:8:8:0.216216:3:5:15:13:3:5:15:14
chr14	68029118	.	C	A	513.77	PASS	AF=0.571429;AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=34;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0135824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.029;QD=24.4654;RBI=0.0143641;REFB=-0.0112781;REVB=0.00467398;RO=36;SAF=34;SAR=14;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22317;STB=0.622791;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0146615;OID=.;OPOS=68029118;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:36:36:48:48:0.571429:14:34:16:20:14:34:16:20
chr14	68042574	.	A	G	569.79	PASS	AF=0.522523;AO=58;DP=111;FAO=58;FDP=111;FR=.;FRO=53;FSAF=43;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0109459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7146;QD=20.533;RBI=0.0119009;REFB=-0.0236049;REVB=0.00467103;RO=52;SAF=43;SAR=15;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.25129;STB=0.635642;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0191564;OID=.;OPOS=68042574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:52:53:58:58:0.522523:15:43:25:27:15:43:26:27
chr14	68053149	.	A	G	296.85	PASS	AF=0.419753;AO=33;DP=80;FAO=34;FDP=81;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=0.00876284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.53;QD=14.6592;RBI=0.0255578;REFB=-0.0232658;REVB=-0.0240086;RO=46;SAF=14;SAR=19;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105489;STB=0.572992;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0279945;OID=.;OPOS=68053149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:46:47:33:34:0.419753:19:14:15:31:19:15:15:32
chr14	68053802	.	T	C	483.31	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00480407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1954;QD=58.5833;RBI=0.0410654;REFB=0;REVB=-0.0407834;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000376355;OID=.;OPOS=68053802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr14	68053977	.	A	C	1546.47	PASS	AF=0.972477;AO=106;DP=109;FAO=106;FDP=109;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0382939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.6388;QD=56.7512;RBI=0.038328;REFB=0.0725985;REVB=0.00161628;RO=0;SAF=40;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511109;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=-0.00579812;OID=.;OPOS=68053977;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:109:109:0:3:106:106:0.972477:66:40:0:0:66:40:0:3
chr14	68055613	.	C	G	158.15	PASS	AF=0.293333;AO=21;DP=74;FAO=22;FDP=75;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=2;FSRF=28;FSRR=25;FWDB=-0.00507934;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.878;QD=8.43451;RBI=0.00571252;REFB=0.00149062;REVB=0.00261404;RO=52;SAF=19;SAR=2;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.564837;STB=0.848677;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00921774;OID=.;OPOS=68055613;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:52:53:21:22:0.293333:2:19:27:25:2:20:28:25
chr14	68172894	.	C	T	135.95	PASS	AF=0.483871;AO=14;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.00931173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.965;QD=17.5419;RBI=0.0108127;REFB=-0.0328646;REVB=-0.00549602;RO=16;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178685;STB=0.513496;STBP=0.894;TYPE=snp;VARB=0.0168664;OID=.;OPOS=68172894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:14:15:0.483871:5:9:10:6:6:9:10:6
chr14	68213744	.	G	A	753.48	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0433838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7455;QD=56.8667;RBI=0.0677271;REFB=0;REVB=0.0520078;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000489157;OID=.;OPOS=68213744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:19:33:0:0:20:33:0:0
chr14	68213792	.	A	G	191.63	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0280643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.731;QD=15.6429;RBI=0.0391302;REFB=-0.0372264;REVB=0.0272685;RO=29;SAF=12;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190792;STB=0.609647;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.036326;OID=.;OPOS=68213792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:8:12:12:17:8:12:12:17
chr14	68234539	.	T	C	891.16	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=64;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0561488;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.956;QD=56.5813;RBI=0.0657639;REFB=-0.0375149;REVB=0.0342375;RO=1;SAF=38;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012264;STB=0.506491;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000310567;OID=.;OPOS=68234539;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:63:1:1:62:62:0.984127:24:38:1:0:24:38:1:0
chr14	68249803	.	A	C	57.93	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00167802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.955;QD=13.631;RBI=0.0186876;REFB=-0.0101513;REVB=-0.0186121;RO=9;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149044;STB=0.588021;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0109597;OID=.;OPOS=68249803;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:4:4:6:3:4:4:6:3
chr14	68264867	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0743816;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=322.547;QD=50.4124;RBI=0.0757257;REFB=0;REVB=0.0142041;RO=0;SAF=3;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00074763;OID=.;OPOS=68264867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:12:19:1:9:3:0:0:9:10:0:0
chr14	68274558	.	C	G	822.66	PASS	AF=0.580153;AO=76;DP=129;FAO=76;FDP=131;FR=.;FRO=55;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=30;FSRR=25;FWDB=-0.000524425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.107;QD=25.1195;RBI=0.0378086;REFB=-0.0203671;REVB=-0.0378049;RO=53;SAF=47;SAR=29;SRF=30;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0414408;STB=0.531955;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0123552;OID=.;OPOS=68274558;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:131:53:55:76:76:0.580153:29:47:30:23:29:47:30:25
chr14	68616597	.	G	A	323.42	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0833083;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.957;QD=53.903;RBI=0.0977487;REFB=0;REVB=-0.0511325;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00320797;OID=.;OPOS=68616597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:12:12:0:0:12:12:0:0
chr14	68935789	.	T	C	1138.06	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132327;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9079;QD=60.6966;RBI=0.0198116;REFB=0;REVB=-0.0147443;RO=0;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000128221;OID=.;OPOS=68935789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:40:35:0:0:40:35:0:0
chr14	68944343	.	CTTTTTTTTTTTTTT	CTTTCTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTC	129.87	PASS	AF=0.125,0.291667,0.333333,0.25;AO=3,3,7,4;DP=25;FAO=3,7,8,6;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=0,7,8,6;FSAR=3,0,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0289848,-0.156234,-0.299911,-0.0610959;FXX=0.0768935;HRUN=14,14,14,14;LEN=1,2,1,1;MLLD=252.788,5.68053,3.79719,21.4397;QD=21.6451;RBI=0.0423608,0.160684,0.305426,0.0628692;REFB=-0.00416591,-0.0265313,-0.0261783,-0.0309481;REVB=0.0308921,0.0375518,0.0577795,0.0148266;RO=1;SAF=0,3,7,4;SAR=3,0,0,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.727144,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=snp,del,del,snp;VARB=0.000344322,0.0193946,0.0633277,-0.101492;OID=.,.,.,.;OPOS=68944347,68944344,68944344,68944357;OREF=T,TT,T,T;OALT=C,-,-,C;OMAPALT=CTTTCTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTT,CTTTTTTTTTTTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/4:0.125,0.291667,0.333333,0.25:3,3,7,4:25:3,7,8,6:24:0:0,7,8,6:3,0,0,0:0:0:37:1:0,3,7,4:3,0,0,0:1:0
chr14	69012355	.	C	G	1079.66	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019265;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.527;QD=59.1595;RBI=0.0258432;REFB=0;REVB=0.0172258;RO=1;SAF=26;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101718;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.97827e-05;OID=.;OPOS=69012355;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:73:73:1:0:72:73:1:46:26:0:1:47:26:0:0
chr14	69259662	.	C	A	239.67	PASS	AF=0.3625;AO=29;DP=80;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0173776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.358;QD=11.9837;RBI=0.0175992;REFB=-0.0348438;REVB=-0.00278433;RO=50;SAF=24;SAR=5;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.420838;STB=0.742081;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0432424;OID=.;OPOS=69259662;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:50:51:29:29:0.3625:5:24:25:25:5:24:26:25
chr14	69262441	.	A	G	818.06	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.74;QD=57.408;RBI=0.0166728;REFB=0;REVB=-0.0128535;RO=0;SAF=36;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.71113e-05;OID=.;OPOS=69262441;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:19:36:0:0:20:37:0:0
chr14	69263074	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036682;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.0938;QD=50.4131;RBI=0.0402633;REFB=0;REVB=0.0166002;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00157294;OID=.;OPOS=69263074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0
chr14	69345647	.	C	T	84.23	PASS	AF=0.384615;AO=8;DP=26;FAO=10;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0140936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.946;QD=12.9585;RBI=0.0141418;REFB=-0.00722082;REVB=-0.00116714;RO=15;SAF=1;SAR=7;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.399313;STB=0.652721;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=-0.0148042;OID=.;OPOS=69345647;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:26:26:15:15:8:10:0.384615:7:1:6:9:8:2:6:9
chr14	69352230	.	G	A	216.38	PASS	AF=0.314607;AO=28;DP=87;FAO=28;FDP=89;FR=.;FRO=61;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=43;FSRR=18;FWDB=-0.00455122;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.0011;QD=9.72501;RBI=0.0529918;REFB=-0.00260299;REVB=0.052796;RO=59;SAF=9;SAR=19;SRF=41;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.415317;STB=0.770215;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00680638;OID=.;OPOS=69352230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:89:59:61:28:28:0.314607:19:9:41:18:20:8:43:18
chr14	69695792	.	G	A	885.34	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7263;QD=58.0549;RBI=0.051698;REFB=0;REVB=0.0476016;RO=0;SAF=22;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000508149;OID=.;OPOS=69695792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:39:22:0:0:39:22:0:0
chr14	69703158	.	A	G	2298.76	PASS	AF=0.986486;AO=146;DP=148;FAO=146;FDP=148;FR=.;FRO=2;FSAF=74;FSAR=72;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0248856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.903;QD=62.1288;RBI=0.0249497;REFB=-0.0763183;REVB=0.00178714;RO=2;SAF=74;SAR=72;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126785;STB=0.506666;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.000128935;OID=.;OPOS=69703158;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:148:148:2:2:146:146:0.986486:72:74:2:0:72:74:2:0
chr14	69704553	.	G	T	1209.6	PASS	AF=0.987805;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.015342;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.623;QD=59.005;RBI=0.0492868;REFB=-0.0959653;REVB=0.0468382;RO=0;SAF=45;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.30416e-08;STB=0.506848;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00142199;OID=.;OPOS=69704553;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:82:0:1:80:81:0.987805:35:45:0:0:36:45:0:1
chr14	69799806	.	C	T	212.05	PASS	AF=0.645161;AO=20;DP=31;FAO=20;FDP=31;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0758781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4525;QD=27.3614;RBI=0.0761479;REFB=-0.000488877;REVB=-0.00640473;RO=11;SAF=10;SAR=10;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263867;STB=0.645028;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00236481;OID=.;OPOS=69799806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:11:11:20:20:0.645161:10:10:1:10:10:10:1:10
chr14	69799892	.	A	G	152.36	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=-0.010257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.13;QD=21.0155;RBI=0.0197281;REFB=-0.00721211;REVB=-0.0168521;RO=12;SAF=7;SAR=9;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21755;STB=0.633334;STBP=0.163;TYPE=snp;VARB=0.00603145;OID=.;OPOS=69799892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:12:13:16:16:0.551724:9:7:2:10:9:7:2:11
chr14	69820946	.	C	A	56.02	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=-0.000811929;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.233;QD=9.33725;RBI=0.00292027;REFB=-0.0277402;REVB=-0.00280513;RO=13;SAF=4;SAR=4;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453288;STB=0.791184;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.019942;OID=.;OPOS=69820946;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:25:24:13:16:8:8:0.333333:4:4:12:1:4:4:15:1
chr14	69922552	.	T	C	487.68	PASS	AF=0.522222;AO=47;DP=90;FAO=47;FDP=90;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=0.0130365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.56;QD=21.6748;RBI=0.0248184;REFB=-0.0161357;REVB=0.0211188;RO=43;SAF=18;SAR=29;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940138;STB=0.551954;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0167452;OID=.;OPOS=69922552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:43:43:47:47:0.522222:29:18:21:22:29:18:21:22
chr14	70037611	.	A	T	345.14	PASS	AF=0.445783;AO=37;DP=83;FAO=37;FDP=83;FR=.;FRO=46;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=-0.0066359;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.507;QD=16.633;RBI=0.00963146;REFB=-0.00518882;REVB=0.00698067;RO=46;SAF=16;SAR=21;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088481;STB=0.549711;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.00580348;OID=.;OPOS=70037611;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:46:46:37:37:0.445783:21:16:24:22:21:16:24:22
chr14	70038786	.	A	G	340.71	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00449465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.1875;QD=54.5137;RBI=0.00675307;REFB=0;REVB=0.00504004;RO=0;SAF=9;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174086;OID=.;OPOS=70038786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:16:9:0:0:16:9:0:0
chr14	70180778	.	C	G	346.88	PASS	AF=0.394231;AO=41;DP=103;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.0210716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.656;QD=13.3414;RBI=0.0235204;REFB=-0.012734;REVB=-0.0104498;RO=62;SAF=17;SAR=24;SRF=27;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022689;STB=0.508666;STBP=0.901;TYPE=snp;VARB=0.0169563;OID=.;OPOS=70180778;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:62:63:41:41:0.394231:24:17:27:35:24:17:27:36
chr14	70634087	.	A	G	1975.61	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=82;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300844;FXX=0.0155027;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.229;QD=62.224;RBI=0.0509759;REFB=0;REVB=-0.0411518;RO=0;SAF=82;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.38975e-05;OID=.;OPOS=70634087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:127:0:0:127:127:1:45:82:0:0:45:82:0:0
chr14	70712880	.	A	C	246.54	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00408974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.868;QD=46.9601;RBI=0.0303982;REFB=0.0712107;REVB=0.0301219;RO=1;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297497;STB=0.516113;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=-0.00454729;OID=.;OPOS=70712880;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:15:5:0:1:15:5:0:1
chr14	70713586	.	T	G	420.53	PASS	AF=0.494118;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=85;FR=.;FRO=43;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.0111187;FXX=0.034087;HRUN=3;LEN=1;MLLD=220.654;QD=19.7897;RBI=0.0157328;REFB=-0.0208918;REVB=0.0111309;RO=41;SAF=24;SAR=18;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350705;STB=0.517233;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0214493;OID=.;OPOS=70713586;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:85:41:43:42:42:0.494118:18:24:25:16:18:24:26:17
chr14	70713720	.	AATC	A	392.23	PASS	AF=0.495726;AO=53;DP=122;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.0135381;FXX=0.0330551;HRUN=3;LEN=3;MLLD=306.766;QD=13.4095;RBI=0.0165476;REFB=-0.0144825;REVB=-0.00951533;RO=58;SAF=25;SAR=28;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139636;STB=0.56402;STBP=0.201;TYPE=del;VARB=0.0140701;OID=.;OPOS=70713721;OREF=ATC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.495726:53:122:58:117:59:28:30:36:23:99:58:25:28:36:22
chr14	70713858	.	T	C	319.09	PASS	AF=0.353982;AO=32;DP=104;FAO=40;FDP=113;FR=.;FRO=73;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=33;FSRR=40;FWDB=0.0331664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.221;QD=11.2953;RBI=0.0340414;REFB=-0.00934036;REVB=0.00766866;RO=70;SAF=9;SAR=23;SRF=31;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207695;STB=0.517776;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0243893;OID=.;OPOS=70713858;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:113:70:73:32:40:0.353982:23:9:31:39:23:17:33:40
chr14	70827773	.	T	C	817.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0731371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.265;QD=57.3845;RBI=0.0744135;REFB=0;REVB=0.0137235;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000904362;OID=.;OPOS=70827773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
chr14	70839389	.	A	C	230.94	PASS	AF=0.59375;AO=14;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.00185061;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=226.631;QD=28.8678;RBI=0.00780606;REFB=-0.0318405;REVB=-0.00758352;RO=7;SAF=8;SAR=6;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275045;STB=0.639862;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0235709;OID=.;OPOS=70839389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:32:32:7:7:14:19:0.59375:6:8:7:0:10:9:7:0
chr14	70924249	.	A	G	594.28	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00828537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.782;QD=60.9515;RBI=0.0441511;REFB=0;REVB=0.0433667;RO=0;SAF=27;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115179;OID=.;OPOS=70924249;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:11:27:0:0:12:27:0:0
chr14	70924450	.	C	T	35.21	PASS	AF=0.222222;AO=6;DP=27;FAO=6;FDP=27;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.000341354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.315;QD=5.21558;RBI=0.0226143;REFB=-0.00969941;REVB=-0.0226118;RO=21;SAF=4;SAR=2;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117537;STB=0.578677;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0215515;OID=.;OPOS=70924450;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:27:27:21:21:6:6:0.222222:2:4:12:9:2:4:12:9
chr14	70924501	.	C	G	298.69	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0279565;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.224;QD=49.7816;RBI=0.0384045;REFB=-0.0505172;REVB=-0.0263314;RO=1;SAF=10;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440445;STB=0.523789;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000696547;OID=.;OPOS=70924501;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:25:24:1:1:23:23:0.958333:13:10:1:0:13:10:1:0
chr14	70924566	.	CA	GT	99.24	PASS	AF=0.444444;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.000361072;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=164.901;QD=14.7015;RBI=0.0256336;REFB=-0.0228128;REVB=-0.025631;RO=15;SAF=3;SAR=9;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208684;STB=0.512175;STBP=0.941;TYPE=mnp;VARB=0.0178672;OID=.;OPOS=70924566;OREF=CA;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:15:15:12:12:0.444444:9:3:4:11:9:3:4:11
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chr14	70925257	.	A	G	214.25	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00890661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.789;QD=45.1041;RBI=0.00895044;REFB=-0.0197343;REVB=0.00088468;RO=1;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0611153;STB=0.533296;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00185972;OID=.;OPOS=70925257;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:7:11:0:1:7:11:0:1
chr14	71109152	.	C	CG	246.76	PASS	AF=1;AO=3;DP=29;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.154;QD=41.127;RBI=0.0858263;REFB=0;REVB=-0.0805771;RO=26;SAF=0;SAR=3;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.549722;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00028533;OID=.;OPOS=71109153;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:3:29:24:24:0:11:13:0:0:5:26:0:3:12:14
chr14	71109153	.	C	G	330.41	PASS	AF=0.964286;AO=25;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0287296;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.165;QD=47.2018;RBI=0.0515135;REFB=0.0510295;REVB=0.042758;RO=3;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0895847;STB=0.51514;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.000247422;OID=.;OPOS=71109153;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:28:28:3:1:25:27:0.964286:14:11:0:3:16:11:0:1
chr14	71199452	.	G	A	276.18	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=28;FSRR=4;FWDB=-0.0143186;FXX=0.0312451;HRUN=5;LEN=1;MLLD=250.952;QD=17.8179;RBI=0.0147909;REFB=-0.00824988;REVB=-0.00370796;RO=30;SAF=24;SAR=6;SRF=26;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100196;STB=0.565178;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.00568345;OID=.;OPOS=71199452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:62:30:32:30:30:0.483871:6:24:26:4:6:24:28:4
chr14	71204973	.	C	T	353.56	PASS	AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=28;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.0121134;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.894;QD=23.9705;RBI=0.0130203;REFB=-0.0311995;REVB=0.00477433;RO=23;SAF=28;SAR=7;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654776;STB=0.530594;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0228938;OID=.;OPOS=71204973;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:23:24:35:35:0.59322:7:28:17:6:7:28:18:6
chr14	71374702	.	G	A	794.91	PASS	AF=0.508982;AO=77;DP=166;FAO=85;FDP=167;FR=.;FRO=82;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=0.0430126;FXX=0.00595203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2252;QD=19.0397;RBI=0.0569225;REFB=-0.0234645;REVB=0.0372839;RO=79;SAF=36;SAR=41;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0704618;STB=0.509089;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0264421;OID=.;OPOS=71374702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:167:79:82:77:85:0.508982:41:36:43:36:42:43:43:39
chr14	71444788	.	G	A	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.00319519;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=287.27;QD=15.8821;RBI=0.0271784;REFB=-0.00320836;REVB=0.0269899;RO=10;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.4918;STB=0.777345;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00364866;OID=.;OPOS=71444788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:6:4:10:0:6:4:10:0
chr14	71577480	.	G	A	246.85	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0289577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.56;QD=17.9529;RBI=0.0313725;REFB=-0.0116027;REVB=-0.0120701;RO=28;SAF=12;SAR=15;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506952;STB=0.528434;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0127573;OID=.;OPOS=71577480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:15:12:14:14:15:12:14:14
chr14	71915415	.	T	G,TGTG	509.33	PASS	AF=0.0571429,0.942857;AO=2,33;DP=36;FAO=2,33;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=1,17;FSAR=1,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.100596,-0.00588817;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,3;MLLD=50.9945,239.363;QD=58.2095;RBI=0.101076,0.00623387;REFB=0,0;REVB=-0.0098367,-0.00204709;RO=1;SAF=1,17;SAR=1,16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.25849,-0.0266901;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00588147,-0.000371074;OID=.,.;OPOS=71915415,71915416;OREF=T,-;OALT=G,GTG;OMAPALT=G,TGTG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:36:35:1:0:2,33:2,33:0.0571429,0.942857:1,16:1,17:1:0:1,16:1,17:0:0
chr14	72055468	.	A	C,T	719.09	PASS	AF=0.960784,0.0392157;AO=48,2;DP=50;FAO=49,2;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27,0;FSAR=22,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310814,0.0012308;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=93.361,68.948;QD=56.3995;RBI=0.0622502,0.0325904;REFB=0,0;REVB=0.0539355,0.0325671;RO=0;SAF=26,0;SAR=22,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.46901e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000321113,0.0545018;OID=.,.;OPOS=72055468,72055468;OREF=A,A;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:50:51:0:0:48,2:49,2:0.960784,0.0392157:22,2:26,0:0:0:22,2:27,0:0:0
chr14	72117156	.	T	C	625.44	PASS	AF=1;AO=41;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0261336;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.7152;QD=58.1804;RBI=0.14805;REFB=-0.0543992;REVB=0.145725;RO=2;SAF=32;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0934331;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00685196;OID=.;OPOS=72117156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:43:43:2:0:41:43:1:9:32:0:2:11:32:0:0
chr14	72945012	.	T	C	659.75	PASS	AF=0.462069;AO=66;DP=145;FAO=67;FDP=145;FR=.;FRO=78;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=53;FSRR=25;FWDB=0.00040934;FXX=0.00684885;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.251;QD=18.2;RBI=0.00197798;REFB=-0.00755038;REVB=-0.00193516;RO=78;SAF=33;SAR=33;SRF=53;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175599;STB=0.592788;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00835647;OID=.;OPOS=72945012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:78:78:66:67:0.462069:33:33:53:25:33:34:53:25
chr14	73014061	.	T	C	136.02	PASS	AF=0.321429;AO=17;DP=56;FAO=18;FDP=56;FR=.;FRO=38;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0437002;FXX=0.0175408;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.3386;QD=9.71569;RBI=0.0500017;REFB=-0.0062971;REVB=-0.0242995;RO=39;SAF=1;SAR=16;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.613141;STB=0.888982;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0190954;OID=.;OPOS=73014061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:39:38:17:18:0.321429:16:1:17:22:17:1:17:21
chr14	73079291	.	G	GA,GAA	308.52	PASS	AF=0,1;AO=14,9;DP=29;FAO=0,27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0,19;FSAR=0,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.445465,0.235874;FXX=0.0357015;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=13.3631,24.9174;QD=45.7073;RBI=0.546669,0.291216;REFB=0,0;REVB=0.316872,0.170793;RO=5;SAF=12,5;SAR=2,4;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.204037,-0.028019;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.0174514;OID=.,.;OPOS=73079292,73079292;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:14,9:29:0,27:27:0:0,19:0,8:0:0:6:5:12,5:2,4:3:2
chr14	73240486	.	A	G	88.13	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0646617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3066;QD=39.1688;RBI=0.103948;REFB=0;REVB=0.0813883;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00943911;OID=.;OPOS=73240486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr14	73358945	.	A	C	2396.1	PASS	AF=0.977011;AO=158;DP=166;FAO=170;FDP=174;FR=.;FRO=4;FSAF=90;FSAR=80;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0456229;FXX=0.011363;HRUN=4;LEN=1;MLLD=119.017;QD=55.0828;RBI=0.045694;REFB=-0.157552;REVB=0.00254861;RO=3;SAF=78;SAR=80;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179441;STB=0.505091;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00201524;OID=.;OPOS=73358945;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:166:174:3:4:158:170:0.977011:80:78:3:0:80:90:3:1
chr14	73358946	.	A	C	31.98	PASS	AF=0.0693642;AO=10;DP=171;FAO=12;FDP=173;FR=.;FRO=161;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=80;FSRR=81;FWDB=-0.0169929;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.1741;QD=0.739316;RBI=0.0293812;REFB=-0.00797803;REVB=-0.0239686;RO=161;SAF=9;SAR=1;SRF=80;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.415957;STB=0.90765;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.015756;OID=.;OPOS=73358946;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:171:173:161:161:10:12:0.0693642:1:9:80:81:1:11:80:81
chr14	73360819	.	T	TTGTC	665.76	PASS	AF=0.84127;AO=51;DP=63;FAO=53;FDP=63;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=41;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.00762214;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=292.936;QD=42.2705;RBI=0.0239403;REFB=-0.00296384;REVB=0.0226945;RO=10;SAF=12;SAR=39;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151626;STB=0.506022;STBP=0.869;TYPE=ins;VARB=0.000498333;OID=.;OPOS=73360820;OREF=-;OALT=TGTC;OMAPALT=TTGTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.84127:51:63:53:63:10:12:41:2:8:55:10:12:39:2:8
chr14	73404752	.	G	C	64.45	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0201104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.921;QD=9.91549;RBI=0.0332514;REFB=-0.00129796;REVB=-0.0264807;RO=17;SAF=4;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283174;STB=0.517203;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.00306469;OID=.;OPOS=73404752;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:5:4:8:9:5:4:8:9
chr14	73422259	.	C	G	435.52	PASS	AF=0.567568;AO=42;DP=75;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.00673996;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.813;QD=23.5414;RBI=0.0177063;REFB=-0.0247669;REVB=-0.0163734;RO=32;SAF=28;SAR=14;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258356;STB=0.642133;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00293192;OID=.;OPOS=73422259;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:32:32:42:42:0.567568:14:28:11:21:14:28:11:21
chr14	73425462	.	G	A	150.4	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0225899;FXX=0.0263089;HRUN=4;LEN=1;MLLD=85.9233;QD=16.2593;RBI=0.0228553;REFB=-0.0232751;REVB=-0.00347261;RO=16;SAF=8;SAR=8;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221033;STB=0.628421;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0107792;OID=.;OPOS=73425462;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:16:19:16:16:0.432432:8:8:4:12:8:8:5:14
chr14	73440864	.	C	T	800.97	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00853683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.876;QD=57.2123;RBI=0.0108185;REFB=0;REVB=0.00664555;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12815e-05;OID=.;OPOS=73440864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr14	73448583	.	G	A	138.35	PASS	AF=0.340426;AO=16;DP=47;FAO=16;FDP=47;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0183733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1148;QD=11.7748;RBI=0.0593907;REFB=-0.0210889;REVB=-0.0564772;RO=30;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176641;STB=0.594475;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.037012;OID=.;OPOS=73448583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:30:31:16:16:0.340426:6:10:14:16:6:10:15:16
chr14	73459917	.	C	T	1713.21	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00498284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.512;QD=60.6446;RBI=0.0444005;REFB=0;REVB=0.0441201;RO=0;SAF=67;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.46359e-05;OID=.;OPOS=73459917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:46:67:0:0:46:67:0:0
chr14	73465003	.	A	G	651.49	PASS	AF=0.955556;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0699794;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.173;QD=57.9099;RBI=0.0805257;REFB=-0.0956101;REVB=0.0398405;RO=1;SAF=21;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218287;STB=0.521729;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00115363;OID=.;OPOS=73465003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:44:45:1:2:42:43:0.955556:21:21:1:0:21:22:2:0
chr14	73716774	.	G	A	378.03	PASS	AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.00148714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6963;QD=18.9015;RBI=0.00524704;REFB=-0.00964114;REVB=-0.00503188;RO=38;SAF=21;SAR=18;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12723;STB=0.563186;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.010177;OID=.;OPOS=73716774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:38:41:39:39:0.4875:18:21:15:23:18:21:17:24
chr14	73727509	.	T	G	100.73	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00418824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.404;QD=16.1176;RBI=0.00468123;REFB=0.000897723;REVB=-0.00209106;RO=12;SAF=3;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171635;STB=0.585215;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.000542833;OID=.;OPOS=73727509;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:13:12:12:0.48:9:3:5:7:9:3:5:8
chr14	73735366	.	C	T	568.08	PASS	AF=0.571429;AO=52;DP=91;FAO=52;FDP=91;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0435758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.6;QD=24.9707;RBI=0.0436341;REFB=-0.0334623;REVB=-0.00225479;RO=39;SAF=27;SAR=25;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250961;STB=0.513737;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0135567;OID=.;OPOS=73735366;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:39:39:52:52:0.571429:25:27:19:20:25:27:19:20
chr14	73957772	.	A	G	175.94	PASS	AF=1;AO=13;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0721612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8873;QD=46.9176;RBI=0.0721636;REFB=0;REVB=0.00059372;RO=0;SAF=9;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00318689;OID=.;OPOS=73957772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:13:15:1:4:9:0:0:5:10:0:0
chr14	73958375	.	T	C	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00865486;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=308.787;QD=63.2865;RBI=0.0132314;REFB=0;REVB=0.0100082;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.97257e-06;OID=.;OPOS=73958375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:19:27:0:0:19:27:0:0
chr14	73958812	.	T	C	954.76	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.782;QD=57.864;RBI=0.0243279;REFB=0;REVB=-0.00922441;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.40946e-05;OID=.;OPOS=73958812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:66:0:0:61:66:1:27:34:0:0:29:37:0:0
chr14	73963383	.	T	C	1228.6	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.381;QD=61.4301;RBI=0.0800134;REFB=0;REVB=0.0701681;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010164;OID=.;OPOS=73963383;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:78:80:0:0:77:80:1:42:35:0:0:45:35:0:0
chr14	73989859	.	C	T	331.45	PASS	AF=0.433735;AO=36;DP=84;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0116544;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.145;QD=15.9734;RBI=0.0241432;REFB=-0.0147312;REVB=0.021144;RO=47;SAF=15;SAR=21;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116426;STB=0.56562;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0227428;OID=.;OPOS=73989859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:47:47:36:36:0.433735:21:15:25:22:21:15:25:22
chr14	74058832	.	C	T	37.11	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.07444;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.681;QD=8.24769;RBI=0.0782559;REFB=-0.0313716;REVB=0.0241387;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469147;STB=0.798934;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0493461;OID=.;OPOS=74058832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:1:5:5:7:1:5:5:7
chr14	74060487	.	G	C	379.43	PASS	AF=0.425743;AO=42;DP=100;FAO=43;FDP=101;FR=.;FRO=58;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.0345476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7194;QD=15.0268;RBI=0.0391671;REFB=0.00313031;REVB=0.0184533;RO=58;SAF=20;SAR=22;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110128;STB=0.513134;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.000661903;OID=.;OPOS=74060487;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:58:58:42:43:0.425743:22:20:27:31:22:21:27:31
chr14	74061968	.	T	C	731.84	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0630929;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.0175;QD=63.638;RBI=0.0793665;REFB=0;REVB=0.0481489;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.68335e-05;OID=.;OPOS=74061968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr14	74083846	.	C	T	284.14	PASS	AF=0.625;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.044465;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.155;QD=28.4141;RBI=0.0445186;REFB=-0.0429341;REVB=0.00218346;RO=15;SAF=17;SAR=8;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109146;STB=0.56039;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0267114;OID=.;OPOS=74083846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:15:15:25:25:0.625:8:17:8:7:8:17:8:7
chr14	74168625	.	G	A,T	1077.11	PASS	AF=0.958904,0.0410959;AO=69,3;DP=73;FAO=70,3;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=29,3;FSAR=41,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297173,-0.0275108;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=214.385,10.1047;QD=59.0195;RBI=0.0320429,0.0988927;REFB=0,0;REVB=0.0119847,-0.0949891;RO=1;SAF=28,3;SAR=41,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0165827,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000362753,0.109927;OID=.,.;OPOS=74168625,74168625;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:73:73:1:0:69,3:70,3:0.958904,0.0410959:41,0:28,3:1:0:41,0:29,3:0:0
chr14	74196686	.	T	C	1228.07	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.555;QD=61.4034;RBI=0.0616027;REFB=0;REVB=0.056476;RO=0;SAF=54;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.87872e-05;OID=.;OPOS=74196686;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:25:54:0:0:26:54:0:0
chr14	74196791	.	CT	C,CC	716.48	PASS	AF=0.113208,0.886792;AO=15,37;DP=52;FAO=6,47;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=6,10;FSAR=0,37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0629865,0.128533;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=47.1742,61.6316;QD=54.074;RBI=0.0803578,0.129514;REFB=0,0;REVB=-0.0499007,-0.0159048;RO=0;SAF=15,0;SAR=0,37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0934916,0.0111367;OID=.,.;OPOS=74196792,74196792;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.113208,0.886792:15,37:52:6,47:53:0:6,10:0,37:0:0:11:0:15,0:0,37:0:0
chr14	74196844	.	T	C	724.29	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00515825;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=282.23;QD=54.6636;RBI=0.0210326;REFB=-0.128959;REVB=0.0203903;RO=1;SAF=10;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447794;STB=0.5238;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.000204251;OID=.;OPOS=74196844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:42:10:1:0:42:10:1:0
chr14	74196872	.	G	C	236.48	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=45;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=0.0433188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.185;QD=20.5631;RBI=0.0449275;REFB=-0.00491342;REVB=0.0119147;RO=23;SAF=5;SAR=17;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128477;STB=0.528943;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.00700383;OID=.;OPOS=74196872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:23:23:22:23:0.5:17:5:5:18:17:6:5:18
chr14	74203789	.	G	A	236.6	PASS	AF=0.578947;AO=21;DP=40;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0508797;FXX=0.0731529;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.5742;QD=24.9056;RBI=0.0564204;REFB=0.0225365;REVB=-0.0243826;RO=17;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0137421;STB=0.50724;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=-0.025052;OID=.;OPOS=74203789;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:38:17:16:21:22:0.578947:12:9:7:10:12:10:7:9
chr14	74206481	.	T	C	766.39	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0663;QD=63.8656;RBI=0.0456135;REFB=0;REVB=-0.0168089;RO=0;SAF=37;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00032525;OID=.;OPOS=74206481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:11:37:0:0:11:37:0:0
chr14	74206658	.	G	A	38.15	PASS	AF=0.4;AO=5;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=-0.000682299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.843;QD=10.1733;RBI=0.0508706;REFB=0.00403815;REVB=0.050866;RO=8;SAF=1;SAR=4;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.676688;STB=0.84537;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=-0.0127526;OID=.;OPOS=74206658;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:8:9:5:6:0.4:4:1:8:0:4:2:9:0
chr14	74340797	.	A	T	1118.19	PASS	AF=0.987013;AO=74;DP=76;FAO=76;FDP=77;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0269061;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2655;QD=58.0876;RBI=0.0313469;REFB=-0.165255;REVB=0.0160839;RO=1;SAF=34;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011681;STB=0.506171;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00719808;OID=.;OPOS=74340797;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:77:1:1:74:76:0.987013:40:34:0:1:40:36:0:1
chr14	74404756	.	T	C	411.11	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0677689;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=249.452;QD=56.7047;RBI=0.0682421;REFB=0;REVB=0.00802323;RO=0;SAF=8;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142908;OID=.;OPOS=74404756;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:21:8:0:0:21:8:0:0
chr14	74425056	.	C	A	346.15	PASS	AF=0.545455;AO=28;DP=65;FAO=36;FDP=66;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.0603958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.352;QD=20.9785;RBI=0.0606851;REFB=-0.0100843;REVB=-0.00591843;RO=22;SAF=7;SAR=21;SRF=5;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0243902;STB=0.518942;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0133443;OID=.;OPOS=74425056;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:22:30:28:36:0.545455:21:7:5:17:23:13:12:18
chr14	74428000	.	A	T	267.53	PASS	AF=0.510204;AO=25;DP=49;FAO=25;FDP=49;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00231317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.714;QD=21.839;RBI=0.0250737;REFB=-0.00695434;REVB=0.0249668;RO=24;SAF=12;SAR=13;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126394;STB=0.570676;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00478853;OID=.;OPOS=74428000;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:24:25:25:0.510204:13:12:15:9:13:12:15:9
chr14	74428445	.	G	A	130.98	PASS	AF=0.313725;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=51;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=24;FWDB=-0.00914153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0188;QD=10.2732;RBI=0.0579212;REFB=-0.00119332;REVB=-0.0571953;RO=35;SAF=13;SAR=3;SRF=11;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.555568;STB=0.829391;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=2.59829e-05;OID=.;OPOS=74428445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:35:35:16:16:0.313725:3:13:11:24:3:13:11:24
chr14	74441684	.	G	A	53.31	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=28;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.130226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2113;QD=7.61537;RBI=0.130239;REFB=-0.00524815;REVB=-0.00179284;RO=20;SAF=6;SAR=2;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398056;STB=0.749375;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00732385;OID=.;OPOS=74441684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:20:20:8:8:0.285714:2:6:8:12:2:6:8:12
chr14	74489735	.	G	A	651.68	PASS	AF=0.47482;AO=66;DP=139;FAO=66;FDP=139;FR=.;FRO=73;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=29;FSRR=44;FWDB=-0.0621659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.662;QD=18.7534;RBI=0.0722726;REFB=-0.0201491;REVB=-0.0368608;RO=72;SAF=36;SAR=30;SRF=29;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133848;STB=0.57735;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0262172;OID=.;OPOS=74489735;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:72:73:66:66:0.47482:30:36:29:43:30:36:29:44
chr14	74514674	.	A	T	1098.58	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00314028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.14;QD=60.1961;RBI=0.0215498;REFB=0;REVB=-0.0213198;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.95365e-05;OID=.;OPOS=74514674;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:32:40:0:0:33:40:0:0
chr14	74523869	.	A	G	151.18	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.0023323;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.915;QD=20.1571;RBI=0.0431813;REFB=-0.0158503;REVB=0.0431183;RO=14;SAF=9;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110236;STB=0.562422;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.006544;OID=.;OPOS=74523869;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:7:9:6:8:7:9:6:8
chr14	74523949	.	G	A	437.4	PASS	AF=0.583333;AO=42;DP=72;FAO=42;FDP=72;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0102135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9049;QD=24.3001;RBI=0.0795395;REFB=0.015941;REVB=-0.078881;RO=30;SAF=26;SAR=16;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0416855;STB=0.522874;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=-0.0108373;OID=.;OPOS=74523949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:30:30:42:42:0.583333:16:26:17:13:16:26:17:13
chr14	74711991	.	G	A	180.91	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0596718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6687;QD=16.8286;RBI=0.0654429;REFB=0.0153041;REVB=-0.0268711;RO=24;SAF=12;SAR=7;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132079;STB=0.575676;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=-0.0221669;OID=.;OPOS=74711991;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:7:12:12:12:7:12:12:12
chr14	74726475	.	G	A	172.13	PASS	AF=0.473684;AO=15;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0151656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.841;QD=18.1184;RBI=0.0306743;REFB=-0.0178878;REVB=0.026663;RO=18;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11279;STB=0.502955;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0160953;OID=.;OPOS=74726475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:20:15:18:0.473684:10:5:8:10:10:8:9:11
chr14	74874345	.	G	A	130.04	PASS	AF=0.3;AO=18;DP=60;FAO=18;FDP=60;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.00512229;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.525;QD=8.66904;RBI=0.0232162;REFB=-0.0130826;REVB=-0.0226441;RO=42;SAF=10;SAR=8;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092896;STB=0.555494;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0355468;OID=.;OPOS=74874345;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:42:42:18:18:0.3:8:10:20:22:8:10:20:22
chr14	74876181	.	T	G	2312.26	PASS	AF=0.968944;AO=156;DP=160;FAO=156;FDP=161;FR=.;FRO=5;FSAF=87;FSAR=69;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0113089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4469;QD=57.4475;RBI=0.0114972;REFB=-0.0305156;REVB=-0.00207213;RO=4;SAF=87;SAR=69;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00927563;STB=0.507639;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.00293357;OID=.;OPOS=74876181;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:160:161:4:5:156:156:0.968944:69:87:3:1:69:87:4:1
chr14	74943295	.	T	C	670.25	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00324006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.293;QD=62.349;RBI=0.011806;REFB=0;REVB=0.0113527;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.02755e-05;OID=.;OPOS=74943295;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:16:26:0:0:17:26:0:0
chr14	74967627	.	A	AG	33.3	PASS	AF=0.0792683;AO=19;DP=170;FAO=13;FDP=164;FR=.;FRO=151;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=67;FSRR=84;FWDB=0.0167048;FXX=0.0120475;HRUN=0;LEN=1;MLLD=151.558;QD=0.812269;RBI=0.0335515;REFB=5.98843e-05;REVB=-0.0290974;RO=147;SAF=14;SAR=5;SRF=68;SRR=79;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.335961;STB=0.92748;STBP=0;TYPE=ins;VARB=-0.0137592;OID=.;OPOS=74967628;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.0792683:19:170:13:164:151:12:1:67:84:33:147:14:5:68:79
chr14	74971769	.	C	T	726.87	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0302833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.53;QD=52.8636;RBI=0.0318409;REFB=-0.081256;REVB=0.00983693;RO=0;SAF=28;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501032;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00360109;OID=.;OPOS=74971769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:0:2:53:53:0.963636:25:28:0:0:25:28:1:1
chr14	74976452	.	C	T	1062.08	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149906;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.638;QD=59.8357;RBI=0.0462589;REFB=0;REVB=-0.0437627;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104636;OID=.;OPOS=74976452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:27:44:0:0:27:44:0:0
chr14	74991855	.	A	G	538.3	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.917;QD=59.8116;RBI=0.0534621;REFB=0;REVB=-0.0207139;RO=0;SAF=25;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.58193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121156;OID=.;OPOS=74991855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:11:25:0:0:11:25:0:0
chr14	74992800	.	A	G	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0161986;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.31;QD=56.9569;RBI=0.0168486;REFB=0;REVB=0.00463462;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.3387e-05;OID=.;OPOS=74992800;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:23:29:0:0:23:29:0:0
chr14	75200854	.	A	G	86.1	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0138745;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1813;QD=11.1101;RBI=0.0182265;REFB=-0.0312036;REVB=0.0118197;RO=20;SAF=3;SAR=8;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21057;STB=0.627206;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0376349;OID=.;OPOS=75200854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:32:31:20:20:11:11:0.354839:8:3:9:11:8:3:9:11
chr14	75279395	.	T	A	319.04	PASS	AF=0.571429;AO=28;DP=50;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0134764;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.484;QD=26.0437;RBI=0.0225995;REFB=-0.0168072;REVB=0.0181417;RO=19;SAF=17;SAR=11;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215091;STB=0.536816;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.017102;OID=.;OPOS=75279395;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:19:21:28:28:0.571429:11:17:11:8:11:17:11:10
chr14	75359670	.	G	A	286.3	PASS	AF=0.545455;AO=28;DP=56;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=23;FWDB=0.0604632;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.429;QD=20.8216;RBI=0.060917;REFB=-0.0326409;REVB=0.00742229;RO=26;SAF=9;SAR=19;SRF=3;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224974;STB=0.631505;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0198411;OID=.;OPOS=75359670;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:26:25:28:30:0.545455:19:9:3:23:21:9:2:23
chr14	75367807	.	C	T	454.38	PASS	AF=0.322222;AO=58;DP=181;FAO=58;FDP=180;FR=.;FRO=122;FSAF=28;FSAR=30;FSRF=71;FSRR=51;FWDB=-0.0476798;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7469;QD=10.0973;RBI=0.0619347;REFB=-0.0123852;REVB=-0.0395289;RO=120;SAF=28;SAR=30;SRF=69;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107637;STB=0.566988;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.0247855;OID=.;OPOS=75367807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:180:120:122:58:58:0.322222:30:28:69:51:30:28:71:51
chr14	75386576	.	G	A	321.31	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.00537724;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.067;QD=18.9005;RBI=0.00559461;REFB=-0.055841;REVB=0.0015443;RO=32;SAF=24;SAR=10;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136061;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0588891;OID=.;OPOS=75386576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:32:34:34:34:0.5:10:24:23:9:10:24:24:10
chr14	75388183	.	C	T	121.81	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0485174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.958;QD=17.4007;RBI=0.0498946;REFB=-0.0555833;REVB=0.0116418;RO=14;SAF=5;SAR=8;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412168;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0377583;OID=.;OPOS=75388183;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:13:14:0.5:8:5:6:8:8:6:6:8
chr14	75412908	.	A	C,G	1222.03	PASS	AF=0.0833333,0.904762;AO=7,76;DP=84;FAO=7,76;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=6,37;FSAR=1,39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=7.73059e-05,-0.00202284;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=108.26,96.2504;QD=58.1918;RBI=0.0484839,0.00792843;REFB=0.0415478,-0.0379551;REVB=-0.0484838,-0.00766603;RO=1;SAF=6,37;SAR=1,39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0674964,-0.012618;STB=0.538356,0.506665;STBP=0.653,0.318;TYPE=snp,snp;VARB=0.125697,0.00590896;OID=.,.;OPOS=75412908,75412908;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:23:84:84:1:1:7,76:7,76:0.0833333,0.904762:1,39:6,37:1:0:1,39:6,37:1:0
chr14	75483812	.	T	C	671.58	PASS	AF=0.532258;AO=66;DP=123;FAO=66;FDP=124;FR=.;FRO=58;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=40;FSRR=18;FWDB=-0.054972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.282;QD=21.6638;RBI=0.0555494;REFB=-0.0265051;REVB=-0.00798887;RO=57;SAF=30;SAR=36;SRF=39;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192339;STB=0.608664;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0259791;OID=.;OPOS=75483812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:124:57:58:66:66:0.532258:36:30:39:18:36:30:40:18
chr14	75513828	.	G	A	150.51	PASS	AF=0.404762;AO=16;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.00762373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2142;QD=14.3347;RBI=0.101349;REFB=0.0145844;REVB=-0.101062;RO=25;SAF=6;SAR=10;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234134;STB=0.646886;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=-0.022799;OID=.;OPOS=75513828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:16:17:0.404762:10:6:15:10:11:6:15:10
chr14	75513883	.	T	C	716.47	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331748;FXX=0.019604;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.2016;QD=57.3175;RBI=0.0678026;REFB=0;REVB=0.0591323;RO=0;SAF=23;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000739371;OID=.;OPOS=75513883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:27:23:0:0:27:23:0:0
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chr14	75574087	.	C	T	164.64	PASS	AF=0.377358;AO=19;DP=50;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0013822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.135;QD=12.4257;RBI=0.0128475;REFB=-0.015048;REVB=-0.0127729;RO=31;SAF=12;SAR=7;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160735;STB=0.623675;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0305767;OID=.;OPOS=75574087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:53:31:33:19:20:0.377358:7:12:15:16:7:13:15:18
chr14	75590822	.	G	A	324.6	PASS	AF=0.404494;AO=36;DP=89;FAO=36;FDP=89;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=34;FSRR=19;FWDB=-0.000171796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9213;QD=14.5887;RBI=0.0224481;REFB=-0.0391286;REVB=-0.0224475;RO=53;SAF=23;SAR=13;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00298326;STB=0.501692;STBP=0.985;TYPE=snp;VARB=0.0425924;OID=.;OPOS=75590822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:53:53:36:36:0.404494:13:23:34:19:13:23:34:19
chr14	75590846	.	A	T	510.2	PASS	AF=0.551724;AO=48;DP=88;FAO=48;FDP=87;FR=.;FRO=39;FSAF=33;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0243799;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.583;QD=23.4575;RBI=0.0259521;REFB=-0.0339473;REVB=0.00889556;RO=39;SAF=33;SAR=15;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111392;STB=0.561377;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0198231;OID=.;OPOS=75590846;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:39:39:48:48:0.551724:15:33:22:17:15:33:22:17
chr14	75746690	.	C	T	303.25	PASS	AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0290665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.3382;QD=25.8081;RBI=0.0378901;REFB=-0.0165242;REVB=0.0243063;RO=18;SAF=8;SAR=19;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0162015;STB=0.524067;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0185411;OID=.;OPOS=75746690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:20:27:27:0.574468:19:8:5:13:19:8:5:15
chr14	75758885	.	A	G	294.04	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.0118921;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4019;QD=19.6026;RBI=0.0135153;REFB=0.00254492;REVB=-0.00642196;RO=29;SAF=22;SAR=9;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.37649;STB=0.709542;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00192847;OID=.;OPOS=75758885;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:60:29:29:31:31:0.516667:9:22:8:21:9:22:8:21
chr14	75904660	.	A	G	758.14	PASS	AF=0.382609;AO=88;DP=230;FAO=88;FDP=230;FR=.;FRO=142;FSAF=43;FSAR=45;FSRF=82;FSRR=60;FWDB=-0.00383164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.648;QD=13.1851;RBI=0.103396;REFB=-0.0300221;REVB=-0.103325;RO=141;SAF=43;SAR=45;SRF=81;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0936521;STB=0.554721;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=0.0561348;OID=.;OPOS=75904660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:230:230:141:142:88:88:0.382609:45:43:81:60:45:43:82:60
chr14	75937022	.	G	A	140.69	PASS	AF=0.372093;AO=16;DP=43;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=-0.0610907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.178;QD=13.0874;RBI=0.062268;REFB=-0.00689547;REVB=-0.0120513;RO=25;SAF=12;SAR=4;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0731796;STB=0.507683;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0126501;OID=.;OPOS=75937022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:27:16:16:0.372093:4:12:20:5:4:12:20:7
chr14	76045362	.	T	C	220.43	PASS	AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0155042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.373;QD=24.4926;RBI=0.0155471;REFB=-0.0246065;REVB=0.00115362;RO=15;SAF=7;SAR=14;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117647;STB=0.565159;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0190686;OID=.;OPOS=76045362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:14:7:3:12:14:7:3:12
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chr14	76045963	.	C	G	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.100191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3291;QD=11.0196;RBI=0.110747;REFB=-0.00308412;REVB=-0.0471877;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.271446;STB=0.666111;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.00857681;OID=.;OPOS=76045963;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:4:2:5:3:4:2:5:3
chr14	76156609	.	C	T	478.25	PASS	AF=1;AO=27;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.917;QD=57.97;RBI=0.0482113;REFB=0;REVB=0.046581;RO=0;SAF=9;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000522415;OID=.;OPOS=76156609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:27:33:1:18:9:0:0:20:13:0:0
chr14	76175565	.	C	A	556.97	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00884772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.803;QD=60.2126;RBI=0.00884997;REFB=0;REVB=-0.000199547;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51657e-05;OID=.;OPOS=76175565;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0
chr14	76175594	.	G	A	371.18	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.766;QD=54.9899;RBI=0.0279934;REFB=0;REVB=0.0177517;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000532394;OID=.;OPOS=76175594;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:9:17:0:0:10:17:0:0
chr14	76224153	.	T	A	1070.77	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00491966;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.784;QD=58.6723;RBI=0.110776;REFB=-0.106112;REVB=0.110667;RO=1;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154986;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132326;OID=.;OPOS=76224153;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:71:73:1:0:70:73:1:30:40:0:1:33:40:0:0
chr14	76368544	.	T	C	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00229974;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.641;QD=64.4154;RBI=0.0370917;REFB=0;REVB=0.0370203;RO=0;SAF=30;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.42818e-05;OID=.;OPOS=76368544;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:20:30:0:0:20:30:0:0
chr14	76619167	.	A	C	438.78	PASS	AF=0.914286;AO=24;DP=35;FAO=32;FDP=35;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00511619;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=108.725;QD=50.146;RBI=0.0259903;REFB=0.0292726;REVB=0.0254817;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.514277;STBP=0.7;TYPE=snp;VARB=-0.000465701;OID=.;OPOS=76619167;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:35:35:0:3:24:32:0.914286:10:14:0:0:16:16:1:2
chr14	76662446	.	C	T	888.58	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0608589;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1019;QD=58.2675;RBI=0.0617057;REFB=0;REVB=-0.0101875;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000202751;OID=.;OPOS=76662446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:60:61:1:30:30:0:0:30:31:0:0
chr14	76905777	.	C	A	619.51	PASS	AF=0.604396;AO=55;DP=91;FAO=55;FDP=91;FR=.;FRO=36;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0105168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.485;QD=27.2313;RBI=0.0124005;REFB=-0.000798644;REVB=0.00657038;RO=35;SAF=34;SAR=21;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0975657;STB=0.548369;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.000596211;OID=.;OPOS=76905777;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:35:36:55:55:0.604396:21:34:17:18:21:34:18:18
chr14	76957887	.	T	C	1059.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000419577;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1996;QD=59.6869;RBI=0.0188527;REFB=0;REVB=0.018848;RO=0;SAF=40;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18246e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130977;OID=.;OPOS=76957887;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:31:40:0:0:31:40:0:0
chr14	77246020	.	G	A	307.04	PASS	AF=0.722222;AO=26;DP=34;FAO=26;FDP=36;FR=.;FRO=10;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0476997;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=38.2058;QD=34.115;RBI=0.0895427;REFB=-0.0841592;REVB=0.0757802;RO=8;SAF=13;SAR=13;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.054001;STB=0.527756;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0299721;OID=.;OPOS=77246020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:34:36:8:10:26:26:0.722222:13:13:5:3:13:13:6:4
chr14	77294876	.	T	C	205.07	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=0.00629913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.492;QD=16.4057;RBI=0.0362004;REFB=-0.00999143;REVB=0.0356481;RO=29;SAF=11;SAR=10;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1708;STB=0.597214;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0162118;OID=.;OPOS=77294876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:10:11:20:9:10:11:20:9
chr14	77332367	.	C	T	1351.99	PASS	AF=0.947368;AO=90;DP=95;FAO=90;FDP=95;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00910042;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=160.423;QD=56.9258;RBI=0.0178438;REFB=-0.183782;REVB=0.0153487;RO=1;SAF=33;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00824369;STB=0.521004;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00165456;OID=.;OPOS=77332367;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:95:95:1:5:90:90:0.947368:57:33:0:1:57:33:0:5
chr14	77336521	.	G	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026836;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.875;QD=60.2307;RBI=0.0271595;REFB=0;REVB=-0.00417929;RO=0;SAF=33;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.7801e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148543;OID=.;OPOS=77336521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:4:33:0:0:4:33:0:0
chr14	77492891	.	G	A	942.04	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138585;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.304;QD=58.8777;RBI=0.026251;REFB=0;REVB=0.0222948;RO=0;SAF=26;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.68619e-05;OID=.;OPOS=77492891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:63:64:1:37:26:0:0:37:27:0:0
chr14	77494557	.	C	T	334.82	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.00410571;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9858;QD=16.9529;RBI=0.120467;REFB=-0.0270758;REVB=0.120397;RO=42;SAF=20;SAR=16;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307541;STB=0.524066;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0352013;OID=.;OPOS=77494557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:42:43:36:36:0.455696:16:20:22:20:16:20:22:21
chr14	77494682	.	G	A	959.53	PASS	AF=0.971831;AO=63;DP=67;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.130686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.2689;QD=54.0582;RBI=0.214076;REFB=-0.0659755;REVB=0.169557;RO=3;SAF=32;SAR=31;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149691;STB=0.500613;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.00804034;OID=.;OPOS=77494682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:67:71:3:2:63:69:0.971831:31:32:1:2:36:33:1:1
chr14	77697967	.	A	G	1549.16	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5376;QD=63.8829;RBI=0.0422997;REFB=0;REVB=-0.0315793;RO=0;SAF=51;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.23119e-05;OID=.;OPOS=77697967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:97:97:1:46:51:0:0:46:51:0:0
chr14	77703057	.	A	G	574.34	PASS	AF=0.952381;AO=38;DP=40;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0135564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.774;QD=54.6989;RBI=0.0161824;REFB=-0.0328216;REVB=0.00883721;RO=1;SAF=12;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374416;STB=0.533316;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.00448346;OID=.;OPOS=77703057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:42:1:2:38:40:0.952381:26:12:1:0:26:14:2:0
chr14	77723259	.	G	C	879.91	PASS	AF=0.983871;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0208228;FXX=0.0461467;HRUN=5;LEN=1;MLLD=108.497;QD=56.7685;RBI=0.0235415;REFB=-0.0345346;REVB=0.0109825;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.506847;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.000161902;OID=.;OPOS=77723259;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:62:0:1:60:61:0.983871:24:36:0:0:25:36:1:0
chr14	77735581	.	C	G	172.85	PASS	AF=0.388889;AO=20;DP=53;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=-0.0488189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.3208;QD=12.8036;RBI=0.150261;REFB=-0.0250836;REVB=-0.142109;RO=32;SAF=13;SAR=7;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122723;STB=0.565159;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0325729;OID=.;OPOS=77735581;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:32:33:20:21:0.388889:7:13:24:8:7:14:25:8
chr14	77745193	.	A	C	958.23	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00498924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.183;QD=57.2075;RBI=0.00872473;REFB=-0.0293986;REVB=-0.0071574;RO=1;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149975;STB=0.507934;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.000150363;OID=.;OPOS=77745193;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:31:35:0:1:31:35:0:1
chr14	77746112	.	T	C	83.57	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.105189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.611;QD=20.8929;RBI=0.105287;REFB=0.0051631;REVB=-0.00453533;RO=6;SAF=4;SAR=6;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0459658;STB=0.526264;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=-0.00461455;OID=.;OPOS=77746112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:6:4:2:4:6:4:2:4
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chr14	77751925	.	C	T	1500.05	PASS	AF=0.989796;AO=95;DP=97;FAO=97;FDP=98;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0351197;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.2908;QD=61.2264;RBI=0.0522145;REFB=-0.160493;REVB=-0.0386388;RO=2;SAF=33;SAR=62;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278678;STB=0.507245;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.00272709;OID=.;OPOS=77751925;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:97:98:2:1:95:97:0.989796:62:33:2:0:63:34:1:0
chr14	77786863	.	C	A	51.65	PASS	AF=0.228571;AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0483191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8585;QD=5.90289;RBI=0.0629631;REFB=-0.01071;REVB=-0.0403684;RO=27;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157281;STB=0.599771;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0245861;OID=.;OPOS=77786863;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:35:35:27:27:8:8:0.228571:5:3:7:20:5:3:7:20
chr14	77794283	.	T	C	1751.68	PASS	AF=1;AO=115;DP=116;FAO=115;FDP=115;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365331;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.902;QD=60.928;RBI=0.0540916;REFB=0;REVB=-0.0398902;RO=0;SAF=47;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28385e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.50965e-05;OID=.;OPOS=77794283;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:115:0:0:115:115:1:68:47:0:0:68:47:0:0
chr14	77926011	.	C	T	854.08	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0617656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.9287;QD=56.0053;RBI=0.0667089;REFB=0.052774;REVB=-0.0252009;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=-0.00678818;OID=.;OPOS=77926011;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:0:1:60:60:0.983607:32:28:0:0:32:28:1:0
chr14	77928525	.	A	G	753.58	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0330403;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.765;QD=61.5169;RBI=0.03423;REFB=-0.0966132;REVB=0.00894603;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511623;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00158485;OID=.;OPOS=77928525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:0:1:48:48:0.979592:21:27:0:0:21:27:0:1
chr14	77935520	.	G	A	1179.93	PASS	AF=0.952381;AO=80;DP=84;FAO=80;FDP=84;FR=.;FRO=4;FSAF=46;FSAR=34;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0478206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.886;QD=56.187;RBI=0.0484263;REFB=-0.0912375;REVB=0.00763506;RO=2;SAF=46;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201389;STB=0.520828;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.00139834;OID=.;OPOS=77935520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:84:84:2:4:80:80:0.952381:34:46:2:0:34:46:4:0
chr14	77951124	.	C	T	1153.55	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.774;QD=60.7129;RBI=0.027112;REFB=0;REVB=0.0247338;RO=0;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.63309e-05;OID=.;OPOS=77951124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:31:45:0:0:31:45:0:0
chr14	77976325	.	T	C	670.05	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.041;QD=62.3302;RBI=0.031608;REFB=0;REVB=0.0230729;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.95149e-05;OID=.;OPOS=77976325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0
chr14	77987958	.	C	A	426.45	PASS	AF=0.96875;AO=29;DP=30;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0109199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.2743;QD=53.3057;RBI=0.0366161;REFB=-0.0140833;REVB=-0.0349499;RO=1;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0266159;STB=0.513505;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.00116084;OID=.;OPOS=77987958;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:32:1:1:29:31:0.96875:17:12:0:1:18:13:0:1
chr14	78014103	.	G	A	215.11	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=2;FWDB=-0.0274614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.316;QD=21.5109;RBI=0.0284497;REFB=-0.0245123;REVB=0.00743348;RO=19;SAF=12;SAR=9;SRF=17;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.296818;STB=0.663989;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0241158;OID=.;OPOS=78014103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:9:12:17:2:9:12:17:2
chr14	78028803	.	A	G	598.49	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224939;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.014;QD=61.3834;RBI=0.0267448;REFB=0;REVB=-0.0144676;RO=0;SAF=10;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111378;OID=.;OPOS=78028803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:28:10:0:0:28:11:0:0
chr14	78174473	.	A	C	1528.51	PASS	AF=1;AO=102;DP=104;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160587;FXX=0.0192289;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5782;QD=59.9416;RBI=0.022448;REFB=0;REVB=-0.0156854;RO=0;SAF=36;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40639e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00026335;OID=.;OPOS=78174473;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:104:102:0:0:102:102:1:66:36:0:0:66:36:0:0
chr14	78184566	.	C	A	367.23	PASS	AF=0.493506;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=77;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.00139724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.446;QD=19.0768;RBI=0.0126422;REFB=-0.019309;REVB=-0.0125647;RO=39;SAF=19;SAR=19;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0583489;STB=0.53245;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0183877;OID=.;OPOS=78184566;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:39:39:38:38:0.493506:19:19:17:22:19:19:17:22
chr14	78197365	.	C	T	177.75	PASS	AF=0.5625;AO=17;DP=31;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0335436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.403;QD=22.2183;RBI=0.0417538;REFB=-0.0427263;REVB=-0.0248639;RO=13;SAF=12;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0804595;STB=0.576524;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.028358;OID=.;OPOS=78197365;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:13:14:17:18:0.5625:5:12:8:5:5:13:8:6
chr14	78287414	.	T	C	260.48	PASS	AF=0.509091;AO=28;DP=55;FAO=28;FDP=55;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.0594613;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5237;QD=18.944;RBI=0.0713562;REFB=-0.0397364;REVB=0.0394469;RO=26;SAF=13;SAR=15;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228008;STB=0.633712;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0276257;OID=.;OPOS=78287414;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:27:28:28:0.509091:15:13:19:7:15:13:20:7
chr14	78366967	.	A	G	51.55	PASS	AF=0.636364;AO=6;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0177627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.3982;QD=18.7437;RBI=0.0699321;REFB=0.0465144;REVB=-0.0676387;RO=4;SAF=1;SAR=5;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.297985;STB=0.58797;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=-0.0171233;OID=.;OPOS=78366967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:6:7:0.636364:5:1:2:2:5:2:2:2
chr14	79270093	.	G	A	606.24	PASS	AF=0.492063;AO=60;DP=124;FAO=62;FDP=126;FR=.;FRO=64;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.0174631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.985;QD=19.2456;RBI=0.0196439;REFB=-0.0144187;REVB=-0.00899577;RO=64;SAF=32;SAR=28;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273691;STB=0.507244;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0126936;OID=.;OPOS=79270093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:126:64:64:60:62:0.492063:28:32:36:28:28:34:36:28
chr14	80963383	.	A	AGC	955.84	PASS	AF=0.909091;AO=52;DP=86;FAO=70;FDP=77;FR=.;FRO=7;FSAF=47;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=0.00247237;FXX=0.0833234;HRUN=0;LEN=2;MLLD=289.366;QD=49.6542;RBI=0.00431665;REFB=-0.0139783;REVB=0.00353849;RO=13;SAF=40;SAR=12;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211546;STB=0.552477;STBP=0.005;TYPE=ins;VARB=0.000559486;OID=.;OPOS=80963384;OREF=-;OALT=GC;OMAPALT=AGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.909091:52:86:70:77:7:47:23:1:6:29:13:40:12:4:9
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chr14	86088056	.	T	C	820.33	PASS	AF=0.983051;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0220815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.536;QD=55.6158;RBI=0.0253756;REFB=-0.0440179;REVB=-0.0125032;RO=0;SAF=24;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25003e-08;STB=0.510201;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00138169;OID=.;OPOS=86088056;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:59:0:1:57:58:0.983051:33:24:0:0:34:24:1:0
chr14	86091415	.	G	A	223.87	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0185442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1058;QD=19.4667;RBI=0.0296301;REFB=-0.0089576;REVB=-0.0231097;RO=24;SAF=7;SAR=15;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139823;STB=0.579324;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.00972964;OID=.;OPOS=86091415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:22:22:0.478261:15:7:11:13:15:7:11:13
chr14	86093948	.	AG	A,GA	176.51	PASS	AF=0.516667,0.0333333;AO=12,16;DP=60;FAO=31,2;FDP=60;FR=.;FRO=27;FSAF=25,2;FSAR=6,0;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0585295,-0.101145;FXX=0.0322529;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=11.0386,34.7043;QD=11.7671;RBI=0.0772692,0.113291;REFB=-0.105382,0.0116738;REVB=0.0504462,-0.0510357;RO=27;SAF=6,16;SAR=6,0;SRF=10;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.148748,0.828047;STB=0.73232,0.995887;STBP=0.002,0.106;TYPE=del,mnp;VARB=0.137039,0.109223;OID=.,.;OPOS=86093949,86093948;OREF=G,AG;OALT=-,GA;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:27:27:12,16:31,2:0.516667,0.0333333:6,0:6,16:10:17:6,0:25,2:10:17
chr14	88400353	.	C	T	172.1	PASS	AF=0.473684;AO=17;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.036855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5113;QD=18.1157;RBI=0.0753087;REFB=-0.0202226;REVB=-0.0656743;RO=15;SAF=6;SAR=11;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179024;STB=0.533296;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0234312;OID=.;OPOS=88400353;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:15:20:17:18:0.473684:11:6:5:10:11:7:9:11
chr14	88400449	.	TG	CA	212.86	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0280138;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=2;MLLD=207.666;QD=18.921;RBI=0.0381577;REFB=-0.0284341;REVB=0.0259083;RO=24;SAF=6;SAR=15;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218916;STB=0.624875;STBP=0.121;TYPE=mnp;VARB=0.0282513;OID=.;OPOS=88400449;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:24:24:21:21:0.466667:15:6:12:12:15:6:12:12
chr14	88401213	.	T	C	181.7	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0111919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.8012;QD=16.9019;RBI=0.0570963;REFB=-0.0280058;REVB=0.0559886;RO=24;SAF=9;SAR=10;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0662337;STB=0.537857;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.036816;OID=.;OPOS=88401213;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:10:9:13:11:10:9:13:11
chr14	88407875	.	T	A	222.7	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0106201;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.118;QD=12.3721;RBI=0.0131179;REFB=-0.0195067;REVB=-0.00770021;RO=45;SAF=15;SAR=12;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12035;STB=0.56918;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0286233;OID=.;OPOS=88407875;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:45:45:27:27:0.375:12:15:20:25:12:15:20:25
chr14	88407888	.	A	G	212.15	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=69;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0651489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9045;QD=12.2987;RBI=0.0653014;REFB=0.00228921;REVB=0.00446071;RO=42;SAF=14;SAR=12;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668989;STB=0.545622;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=-0.00770097;OID=.;OPOS=88407888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:43:26:26:0.376812:12:14:20:22:12:14:20:23
chr14	88411947	.	T	C	819.05	PASS	AF=0.567164;AO=76;DP=135;FAO=76;FDP=134;FR=.;FRO=58;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.0019213;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5349;QD=24.4493;RBI=0.0152413;REFB=-0.0108077;REVB=0.0151197;RO=57;SAF=43;SAR=33;SRF=27;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728903;STB=0.536214;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.00896355;OID=.;OPOS=88411947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:134:57:58:76:76:0.567164:33:43:27:30:33:43:28:30
chr14	88414211	.	G	A	334.42	PASS	AF=0.406593;AO=37;DP=91;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=34;FWDB=-0.0526421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1083;QD=14.6996;RBI=0.0526494;REFB=-0.0310897;REVB=-0.000876579;RO=53;SAF=14;SAR=23;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00112777;STB=0.505061;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0481302;OID=.;OPOS=88414211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:53:54:37:37:0.406593:23:14:20:33:23:14:20:34
chr14	88453422	.	AGGA	AG,AGA,AGAA	204.79	PASS	AF=0,0.9,0.05;AO=6,9,4;DP=21;FAO=0,18,1;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=0,6,0;FSAR=0,12,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.192574,0.00078471,0.208755;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=15.1816,20.1253,15.6962;QD=40.9583;RBI=0.228153,0.163012,0.212192;REFB=-0.0115645,0.00635247,0.0215791;REVB=-0.122347,-0.16301,-0.0380396;RO=1;SAF=2,4,0;SAR=4,5,4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0962265,0.080744,0;STB=0.5,0.519978,0.5;STBP=1,0.61,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.056199,-0.0132989,-0.0201677;OID=.,.,.;OPOS=88453424,88453423,88453424;OREF=GA,G,G;OALT=-,-,A;OMAPALT=AG,AGA,AGAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.9,0.05:6,9,4:21:0,18,1:20:1:0,6,0:0,12,1:0:1:5:1:2,4,0:4,5,4:0:1
chr14	88459795	.	C	T	120.08	PASS	AF=0.294118;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.0131049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.243;QD=9.41792;RBI=0.0306313;REFB=0.00512294;REVB=-0.0276865;RO=36;SAF=8;SAR=7;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390089;STB=0.523529;STBP=0.8;TYPE=snp;VARB=-0.00654648;OID=.;OPOS=88459795;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:36:36:15:15:0.294118:7:8:18:18:7:8:18:18
chr14	88477413	.	C	T	905.06	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0393395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4951;QD=54.8522;RBI=0.067766;REFB=-0.0832697;REVB=-0.0551782;RO=2;SAF=25;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236054;STB=0.512496;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00443124;OID=.;OPOS=88477413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:39:25:0:2:39:25:0:2
chr14	88477882	.	A	C	298.6	PASS	AF=0.386364;AO=33;DP=87;FAO=34;FDP=88;FR=.;FRO=54;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.00874702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.728;QD=13.5725;RBI=0.028619;REFB=-0.0141345;REVB=-0.0272496;RO=54;SAF=21;SAR=12;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190793;STB=0.615211;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0225122;OID=.;OPOS=88477882;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:54:54:33:34:0.386364:12:21:25:29:12:22:25:29
chr14	88651827	.	AC	CA,TA	92.26	PASS	AF=0.217949,0;AO=8,5;DP=78;FAO=17,0;FDP=78;FR=.,HEALED;FRO=59;FSAF=1,0;FSAR=16,0;FSRF=27;FSRR=32;FWDB=-0.0511177,-0.0706384;FXX=0.0126566;HRUN=5,5;LEN=2,2;MLLD=42.9112,74.4391;QD=4.73121;RBI=0.0660624,0.0886467;REFB=-0.0780901,-0.022656;REVB=0.0418476,-0.0535579;RO=56;SAF=1,0;SAR=7,5;SRF=26;SRR=30;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.444565,-0.549283;STB=0.902651,0.5;STBP=0.003,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0672262,0;OID=.,.;OPOS=88651827,88651827;OREF=AC,AC;OALT=CA,TA;OMAPALT=CA,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:78:78:56:59:8,5:17,0:0.217949,0:7,5:1,0:26:30:16,0:1,0:27:32
chr14	88701528	.	G	A	270.27	PASS	AF=0.289062;AO=37;DP=128;FAO=37;FDP=128;FR=.;FRO=91;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=48;FSRR=43;FWDB=0.00401832;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.799;QD=8.44597;RBI=0.0188647;REFB=-0.00384308;REVB=-0.0184317;RO=90;SAF=24;SAR=13;SRF=47;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15712;STB=0.589424;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0128694;OID=.;OPOS=88701528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:90:91:37:37:0.289062:13:24:47:43:13:24:48:43
chr14	88792816	.	T	G	271.73	PASS	AF=0.363636;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=0.000118975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.539;QD=12.3514;RBI=0.00661236;REFB=-0.00403061;REVB=-0.00661129;RO=56;SAF=20;SAR=12;SRF=32;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0619902;STB=0.535692;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.00757103;OID=.;OPOS=88792816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:56:56:32:32:0.363636:12:20:32:24:12:20:32:24
chr14	88852279	.	TG	T,TT	746.61	PASS	AF=1,0;AO=55,4;DP=62;FAO=61,0;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=46,0;FSAR=15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282832,-0.00884846;FXX=0.0161264;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=19.8473,7.57805;QD=48.9578;RBI=0.0573599,0.0400595;REFB=-0.06389,-0.0163444;REVB=-0.0499021,-0.03907;RO=1;SAF=43,1;SAR=12,3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.289157,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0108392,-0.272709;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00338849,0;OID=.,.;OPOS=88852280,88852280;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:55,4:62:61,0:61:0:46,0:15,0:0:0:3:1:43,1:12,3:1:0
chr14	89094243	.	G	C	70.21	PASS	AF=0.243902;AO=10;DP=41;FAO=10;FDP=41;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0281022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2173;QD=6.84962;RBI=0.0414396;REFB=0.0101969;REVB=0.030455;RO=27;SAF=6;SAR=4;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0365322;STB=0.536012;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=-0.0385495;OID=.;OPOS=89094243;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:41:41:27:31:10:10:0.243902:4:6:17:10:4:6:20:11
chr14	89154624	.	T	C	156.66	PASS	AF=0.447368;AO=16;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0325924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.343;QD=16.4905;RBI=0.0425842;REFB=-0.00446643;REVB=0.0274071;RO=21;SAF=12;SAR=4;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294822;STB=0.635595;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0109466;OID=.;OPOS=89154624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:21:21:16:17:0.447368:4:12:10:11:5:12:10:11
chr14	89750819	.	A	G	368.25	PASS	AF=0.610169;AO=36;DP=59;FAO=36;FDP=59;FR=.;FRO=23;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.000149357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.695;QD=24.966;RBI=0.00839414;REFB=-0.0230954;REVB=0.00839281;RO=23;SAF=23;SAR=13;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14978;STB=0.582232;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0306376;OID=.;OPOS=89750819;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:23:23:36:36:0.610169:13:23:10:13:13:23:10:13
chr14	89867978	.	T	C	1605.5	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.028233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8094;QD=64.2199;RBI=0.0284196;REFB=0;REVB=-0.00325161;RO=0;SAF=52;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.90138e-05;OID=.;OPOS=89867978;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:100:0:0:99:100:1:47:52:0:0:47:53:0:0
chr14	89884022	.	A	C	424.34	PASS	AF=0.634921;AO=40;DP=63;FAO=40;FDP=63;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0147394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.519;QD=26.9423;RBI=0.0254708;REFB=-0.0125723;REVB=-0.0207729;RO=22;SAF=20;SAR=20;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118485;STB=0.571394;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00819741;OID=.;OPOS=89884022;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:22:23:40:40:0.634921:20:20:15:7:20:20:16:7
chr14	90095445	.	T	C	175.92	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0165862;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.376;QD=17.592;RBI=0.0215115;REFB=-0.00731094;REVB=-0.0136983;RO=22;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151944;STB=0.586981;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.00746733;OID=.;OPOS=90095445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:7:11:10:12:7:11:10:12
chr14	90178913	.	T	C	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131829;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.382;QD=51.1825;RBI=0.0174515;REFB=0;REVB=0.0114353;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112863;OID=.;OPOS=90178913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr14	90178934	.	C	T	88.95	PASS	AF=0.611111;AO=10;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00871327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.095;QD=19.7671;RBI=0.0236836;REFB=-0.0422818;REVB=0.0220225;RO=7;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0211612;STB=0.510186;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0311249;OID=.;OPOS=90178934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:18:18:7:7:10:11:0.611111:4:6:4:3:5:6:4:3
chr14	90303383	.	A	G	114.63	PASS	AF=0.213115;AO=9;DP=61;FAO=13;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0343383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.264;QD=7.51646;RBI=0.0364603;REFB=-0.00774643;REVB=0.0122572;RO=42;SAF=3;SAR=6;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179581;STB=0.692453;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.04094;OID=.;OPOS=90303383;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:61:61:42:44:9:13:0.213115:6:3:20:22:10:3:20:24
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chr14	90303445	.	T	C	143.41	PASS	AF=0.294118;AO=20;DP=68;FAO=20;FDP=68;FR=.;FRO=48;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.0100718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.244;QD=8.43603;RBI=0.0113537;REFB=-0.00113093;REVB=-0.00524082;RO=47;SAF=5;SAR=15;SRF=20;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233819;STB=0.635448;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00667606;OID=.;OPOS=90303445;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:47:48:20:20:0.294118:15:5:20:27:15:5:20:28
chr14	90341494	.	G	A	253.34	PASS	AF=0.379747;AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=-0.0037492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2574;QD=12.8271;RBI=0.0364755;REFB=-0.0220427;REVB=-0.0362823;RO=49;SAF=14;SAR=16;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0415585;STB=0.523794;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0242573;OID=.;OPOS=90341494;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:49:49:30:30:0.379747:16:14:21:28:16:14:21:28
chr14	90358176	.	G	A	183.16	PASS	AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0294247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.1488;QD=11.8169;RBI=0.0814922;REFB=-0.00368244;REVB=0.0759945;RO=37;SAF=12;SAR=11;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784809;STB=0.559271;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.00900754;OID=.;OPOS=90358176;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:37:39:23:23:0.370968:11:12:22:15:11:12:24:15
chr14	90390968	.	T	A	56.29	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0125989;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.365;QD=8.66043;RBI=0.0218154;REFB=0.00472488;REVB=0.0178096;RO=18;SAF=6;SAR=2;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113585;STB=0.57124;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=-0.0119404;OID=.;OPOS=90390968;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:26:26:18:18:8:8:0.307692:2:6:12:6:2:6:12:6
chr14	90398907	.	G	A	529.3	PASS	AF=0.5;AO=55;DP=112;FAO=55;FDP=110;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=32;FSRF=23;FSRR=32;FWDB=-0.00293989;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.811;QD=19.2473;RBI=0.0209734;REFB=-0.0151216;REVB=0.0207664;RO=55;SAF=23;SAR=32;SRF=23;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0139433;OID=.;OPOS=90398907;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:110:55:55:55:55:0.5:32:23:23:32:32:23:23:32
chr14	90745422	.	T	C	1283.35	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0004507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.832;QD=61.8484;RBI=0.00996027;REFB=0;REVB=0.00995007;RO=0;SAF=44;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.94808e-05;OID=.;OPOS=90745422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:39:44:0:0:39:44:0:0
chr14	90767607	.	C	T	1519.33	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0349824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9245;QD=63.3054;RBI=0.0651497;REFB=0;REVB=0.054961;RO=0;SAF=60;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.12276e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011925;OID=.;OPOS=90767607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:96:0:0:94:96:1:34:60:0:0:35:61:0:0
chr14	90865462	.	C	G	717.38	PASS	AF=0.962264;AO=50;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0319683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.307;QD=54.1421;RBI=0.0338056;REFB=0.021478;REVB=0.0109931;RO=1;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200269;STB=0.510634;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=-0.000663926;OID=.;OPOS=90865462;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:50:51:0.962264:23:27:0:1:23:28:0:1
chr14	90871478	.	T	C	154.27	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00379208;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.98;QD=14.692;RBI=0.0117113;REFB=-0.0101762;REVB=0.0110804;RO=25;SAF=7;SAR=10;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231386;STB=0.633456;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.0186682;OID=.;OPOS=90871478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:25:17:17:0.404762:10:7:16:9:10:7:16:9
chr14	91123575	.	T	C	358.05	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0499445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5489;QD=55.084;RBI=0.0593768;REFB=0;REVB=-0.0321117;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000703025;OID=.;OPOS=91123575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:17:9:0:0:17:9:0:0
chr14	91161862	.	C	T	2240.84	PASS	AF=0.413153;AO=245;DP=593;FAO=245;FDP=593;FR=.;FRO=348;FSAF=146;FSAR=99;FSRF=213;FSRR=135;FWDB=-0.0166372;FXX=0.00670006;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.591;QD=15.1153;RBI=0.0166404;REFB=-0.0227087;REVB=0.000328351;RO=344;SAF=146;SAR=99;SRF=210;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159149;STB=0.509877;STBP=0.654;TYPE=snp;VARB=0.0249316;OID=.;OPOS=91161862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:593:593:344:348:245:245:0.413153:99:146:210:134:99:146:213:135
chr14	91165572	.	G	A	1840.9	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0015864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.249;QD=61.3634;RBI=0.00809302;REFB=0;REVB=-0.00793601;RO=0;SAF=67;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.26982e-05;OID=.;OPOS=91165572;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:53:67:0:0:53:67:0:0
chr14	91316262	.	G	A	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0476652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9168;QD=23.2183;RBI=0.139538;REFB=0.0715663;REVB=0.131144;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277405;STB=0.66592;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=-0.0122975;OID=.;OPOS=91316262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:4:1:1:0:4:1:1:0
chr14	91316481	.	A	G	270.17	PASS	AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.0251059;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=70.4614;QD=14.409;RBI=0.0518026;REFB=-0.0121795;REVB=0.0453122;RO=44;SAF=14;SAR=17;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120014;STB=0.56808;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0343794;OID=.;OPOS=91316481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:44:44:31:31:0.413333:17:14:25:19:17:14:25:19
chr14	91316521	.	T	C	279.91	PASS	AF=0.405063;AO=32;DP=79;FAO=32;FDP=79;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.000802268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.56;QD=14.1724;RBI=0.0130423;REFB=-0.0159857;REVB=-0.0130176;RO=46;SAF=13;SAR=19;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186842;STB=0.59978;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0218172;OID=.;OPOS=91316521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:46:47:32:32:0.405063:19:13:27:19:19:13:27:20
chr14	91413794	.	G	A	576.36	PASS	AF=0.442029;AO=61;DP=138;FAO=61;FDP=138;FR=.;FRO=77;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=46;FSRR=31;FWDB=-0.0326319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.165;QD=16.706;RBI=0.0462912;REFB=-0.00552195;REVB=0.0328334;RO=76;SAF=35;SAR=26;SRF=45;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0187066;STB=0.513529;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00678932;OID=.;OPOS=91413794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:76:77:61:61:0.442029:26:35:45:31:26:35:46:31
chr14	91671124	.	G	A	513.57	PASS	AF=0.514286;AO=52;DP=104;FAO=54;FDP=105;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=0.0958639;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.9261;QD=19.5646;RBI=0.119026;REFB=-0.000705903;REVB=0.0705497;RO=47;SAF=21;SAR=31;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000365999;STB=0.507689;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.00390296;OID=.;OPOS=91671124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:47:51:52:54:0.514286:31:21:19:28:32:22:20:31
chr14	91700846	.	G	A	248.25	PASS	AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=-0.0209544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.3;QD=13.9857;RBI=0.110955;REFB=-0.0265537;REVB=0.108958;RO=41;SAF=16;SAR=13;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140505;STB=0.572484;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0451654;OID=.;OPOS=91700846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:41:42:29:29:0.408451:13:16:17:24:13:16:18:24
chr14	91717214	.	C	T	545.66	PASS	AF=0.456693;AO=58;DP=127;FAO=58;FDP=127;FR=.;FRO=69;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=0.020106;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.122;QD=17.1863;RBI=0.0205403;REFB=-0.00333908;REVB=0.00420119;RO=69;SAF=25;SAR=33;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116907;STB=0.565077;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00328995;OID=.;OPOS=91717214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:69:69:58:58:0.456693:33:25:38:31:33:25:38:31
chr14	91766410	.	C	T	1163.71	PASS	AF=0.513393;AO=115;DP=224;FAO=115;FDP=224;FR=.;FRO=109;FSAF=63;FSAR=52;FSRF=36;FSRR=73;FWDB=-0.0515362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.973;QD=20.7805;RBI=0.0526619;REFB=-0.00337506;REVB=-0.0108304;RO=108;SAF=63;SAR=52;SRF=35;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196054;STB=0.604682;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00385284;OID=.;OPOS=91766410;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:224:224:108:109:115:115:0.513393:52:63:35:73:52:63:36:73
chr14	91883129	.	G	A	189.07	PASS	AF=0.527778;AO=19;DP=36;FAO=19;FDP=36;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0816753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.606;QD=21.0076;RBI=0.0903919;REFB=0.00318466;REVB=-0.0387278;RO=17;SAF=10;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0522087;STB=0.529381;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.00836287;OID=.;OPOS=91883129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:17:19:19:0.527778:9:10:10:7:9:10:10:7
chr14	91883499	.	G	A	69.05	PASS	AF=0.204082;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=49;FR=.;FRO=39;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=25;FWDB=-0.0544593;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.574;QD=5.6369;RBI=0.0558141;REFB=-0.00857228;REVB=-0.0122233;RO=37;SAF=2;SAR=8;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262024;STB=0.659439;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0534887;OID=.;OPOS=91883499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:50:49:37:39:10:10:0.204082:8:2:14:23:8:2:14:25
chr14	92084004	.	C	A,G	754.59	PASS	AF=0.0208333,0.979167;AO=2,45;DP=48;FAO=1,47;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=1,27;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233085,0.0496321;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=31.959,78.5254;QD=62.8828;RBI=0.0254328,0.0551459;REFB=0,0;REVB=-0.0101756,0.024036;RO=0;SAF=2,25;SAR=0,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.09779e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.090937,0.00148176;OID=.,.;OPOS=92084004,92084004;OREF=C,C;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:48:48:0:0:2,45:1,47:0.0208333,0.979167:0,20:2,25:0:0:0,20:1,27:0:0
chr14	92088016	.	G	A	999.99	PASS	AF=0.985507;AO=69;DP=70;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0151699;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.322;QD=57.9706;RBI=0.0415505;REFB=-0.0306755;REVB=-0.0386823;RO=1;SAF=45;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0103906;STB=0.505616;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000121636;OID=.;OPOS=92088016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:69:1:1:69:68:0.985507:24:45:1:0:24:44:1:0
chr14	92181405	.	G	A	726.89	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0262545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.773;QD=52.8645;RBI=0.0349111;REFB=0.000727801;REVB=0.0230105;RO=2;SAF=33;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277009;STB=0.5147;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.000180088;OID=.;OPOS=92181405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:2:2:53:53:0.963636:20:33:2:0:20:33:2:0
chr14	92249101	.	T	C	497.4	PASS	AF=0.5;AO=47;DP=96;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.00564921;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.394;QD=20.725;RBI=0.00626752;REFB=-0.0309226;REVB=-0.00271446;RO=47;SAF=28;SAR=19;SRF=22;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116531;STB=0.55261;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0263268;OID=.;OPOS=92249101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:47:48:47:48:0.5:19:28:22:25:20:28:23:25
chr14	92249126	.	G	A	1218.26	PASS	AF=0.987805;AO=75;DP=75;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0169194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.801;QD=59.4271;RBI=0.0411152;REFB=0.00658929;REVB=0.0374726;RO=0;SAF=36;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6999e-08;STB=0.506665;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=3.61151e-05;OID=.;OPOS=92249126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:82:0:1:75:81:0.987805:39:36:0:0:44:37:1:0
chr14	92268615	.	T	G	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0583899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.623;QD=56.9561;RBI=0.0685219;REFB=0;REVB=0.0358591;RO=0;SAF=37;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000375278;OID=.;OPOS=92268615;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:15:37:0:0:15:37:0:0
chr14	92280037	.	T	C	206.24	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00385574;FXX=0.0681663;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.725;QD=20.1213;RBI=0.0214418;REFB=-0.00206087;REVB=0.0210923;RO=20;SAF=9;SAR=11;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449437;STB=0.5111;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.00411781;OID=.;OPOS=92280037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:20:21:20:20:0.487805:11:9:8:12:11:9:9:12
chr14	92344300	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2537;QD=39.2068;RBI=0.0676875;REFB=0;REVB=0.0458429;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00576027;OID=.;OPOS=92344300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr14	92347680	.	A	G	812.69	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.9653;QD=57.0309;RBI=0.0227354;REFB=0;REVB=-0.00453939;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000413588;OID=.;OPOS=92347680;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:29:26:0:0:29:28:0:0
chr14	92537223	.	G	T	315.16	PASS	AF=0.454545;AO=34;DP=76;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0462726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0539;QD=16.3719;RBI=0.0470681;REFB=0.00438323;REVB=-0.00861705;RO=42;SAF=20;SAR=14;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.064419;STB=0.542529;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00493039;OID=.;OPOS=92537223;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:42:42:34:35:0.454545:14:20:22:20:14:21:22:20
chr14	92537354	.	C	G	112.6	PASS	AF=0.285714;AO=14;DP=49;FAO=14;FDP=49;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=0.0275816;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=187.978;QD=9.19155;RBI=0.0285079;REFB=-0.00461478;REVB=-0.00720802;RO=34;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138105;STB=0.59171;STBP=0.419;TYPE=snp;VARB=0.0111202;OID=.;OPOS=92537354;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:34:35:14:14:0.285714:7:7:13:21:7:7:13:22
chr14	92537379	.	T	C	41.88	PASS	AF=0.179487;AO=7;DP=39;FAO=7;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=-0.0631126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.56;QD=4.29557;RBI=0.0839027;REFB=-0.00503039;REVB=-0.0552853;RO=27;SAF=4;SAR=3;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41537;STB=0.703709;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0543301;OID=.;OPOS=92537379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:39:39:27:32:7:7:0.179487:3:4:6:21:3:4:10:22
chr14	92548785	.	C	T	143.0	PASS	AF=0.339623;AO=18;DP=53;FAO=18;FDP=53;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=-0.0861448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.8686;QD=10.7921;RBI=0.0965342;REFB=0.00461293;REVB=-0.0435651;RO=34;SAF=10;SAR=8;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0707403;STB=0.529882;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=-0.00754209;OID=.;OPOS=92548785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:34:35:18:18:0.339623:8:10:21:13:8:10:21:14
chr14	92549586	.	G	A	289.49	PASS	AF=0.484848;AO=30;DP=64;FAO=32;FDP=66;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.00787749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.771;QD=17.5449;RBI=0.00826055;REFB=-0.00613871;REVB=-0.00248635;RO=33;SAF=16;SAR=14;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734824;STB=0.562461;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.00813468;OID=.;OPOS=92549586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:66:33:34:30:32:0.484848:14:16:15:18:14:18:15:19
chr14	92559678	.	G	C	207.94	PASS	AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0223432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.655;QD=13.4152;RBI=0.0223543;REFB=-0.00396418;REVB=-0.00070448;RO=35;SAF=9;SAR=16;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217964;STB=0.639888;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00264944;OID=.;OPOS=92559678;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:37:25:25:0.403226:16:9:20:15:16:9:22:15
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chr14	92588002	.	T	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0869161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.011;QD=47.8222;RBI=0.086922;REFB=0;REVB=0.00101588;RO=0;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136353;OID=.;OPOS=92588002;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:7:9:0:0:7:9:0:0
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chr14	92920371	.	C	T	760.66	PASS	AF=0.503226;AO=78;DP=155;FAO=78;FDP=155;FR=.;FRO=77;FSAF=27;FSAR=51;FSRF=34;FSRR=43;FWDB=0.00043238;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=177.877;QD=19.6299;RBI=0.0218663;REFB=-0.00998147;REVB=0.021862;RO=77;SAF=27;SAR=51;SRF=34;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919638;STB=0.550704;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0108214;OID=.;OPOS=92920371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:155:77:77:78:78:0.503226:51:27:34:43:51:27:34:43
chr14	92958522	.	A	C	354.0	PASS	AF=0.625;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=48;FR=.;FRO=18;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0169614;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.935;QD=29.4996;RBI=0.031218;REFB=-0.0106909;REVB=-0.0262083;RO=17;SAF=17;SAR=13;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102348;STB=0.566622;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00615887;OID=.;OPOS=92958522;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:17:18:30:30:0.625:13:17:7:10:13:17:7:11
chr14	93118038	.	A	G	1313.94	PASS	AF=1;AO=84;DP=86;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508653;FXX=0.0344788;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.632;QD=62.5686;RBI=0.0513372;REFB=0;REVB=0.00694459;RO=0;SAF=39;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.93822e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.64241e-05;OID=.;OPOS=93118038;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:84:0:0:84:84:1:45:39:0:0:45:39:0:0
chr14	93118393	.	G	A	116.01	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0069327;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8454;QD=18.5616;RBI=0.0800999;REFB=-0.00603107;REVB=0.0797993;RO=13;SAF=11;SAR=2;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.57133;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=0.00872149;OID=.;OPOS=93118393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:25:13:12:13:13:0.52:2:11:11:2:2:11:11:1
chr14	93118668	.	C	T	548.86	PASS	AF=1;AO=36;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0010431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.73;QD=57.7742;RBI=0.074375;REFB=-0.0632954;REVB=0.0743676;RO=1;SAF=29;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0622357;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105631;OID=.;OPOS=93118668;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:38:38:1:0:36:38:1:7:29:0:1:8:30:0:0
chr14	93119407	.	C	T	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00665845;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.364;QD=58.2396;RBI=0.0317967;REFB=0;REVB=0.0310918;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.62611e-05;OID=.;OPOS=93119407;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:34:28:0:0:34:28:0:0
chr14	93178191	.	A	G	1457.35	PASS	AF=0.989362;AO=93;DP=94;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0407537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.5962;QD=62.0149;RBI=0.0410158;REFB=-0.0313194;REVB=0.00462923;RO=0;SAF=51;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.8776e-08;STB=0.505881;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.000618226;OID=.;OPOS=93178191;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:94:0:1:93:93:0.989362:42:51:0:0:42:51:0:1
chr14	93180727	.	A	G	176.21	PASS	AF=0.396226;AO=20;DP=52;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0136503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.913;QD=13.299;RBI=0.0225701;REFB=-0.0230088;REVB=-0.0179744;RO=32;SAF=12;SAR=8;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0410768;STB=0.535546;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0370769;OID=.;OPOS=93180727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:32:32:20:21:0.396226:8:12:18:14:8:13:18:14
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chr14	93185129	.	C	T	420.8	PASS	AF=0.512195;AO=42;DP=82;FAO=42;FDP=82;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00954593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.525;QD=20.5268;RBI=0.0117274;REFB=-0.0215387;REVB=-0.00681222;RO=39;SAF=19;SAR=23;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0970914;STB=0.559647;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0198826;OID=.;OPOS=93185129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:39:40:42:42:0.512195:23:19:22:17:23:19:23:17
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chr14	93943998	.	G	A	415.24	PASS	AF=0.427273;AO=47;DP=110;FAO=47;FDP=110;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.0104139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.262;QD=15.0996;RBI=0.0167021;REFB=-0.00393836;REVB=0.013058;RO=63;SAF=26;SAR=21;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126617;STB=0.571068;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00948051;OID=.;OPOS=93943998;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:63:63:47:47:0.427273:21:26:27:36:21:26:27:36
chr14	93994954	.	G	A	704.67	PASS	AF=0.483444;AO=73;DP=151;FAO=73;FDP=151;FR=.;FRO=78;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=35;FSRR=43;FWDB=-0.0308461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1381;QD=18.6666;RBI=0.0311005;REFB=0.0121345;REVB=0.0039699;RO=77;SAF=32;SAR=41;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152452;STB=0.505426;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=-0.0131785;OID=.;OPOS=93994954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:77:78:73:73:0.483444:41:32:35:42:41:32:35:43
chr14	94103602	.	G	A	208.51	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00203452;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.864;QD=17.3756;RBI=0.00214164;REFB=-0.00571964;REVB=0.00066883;RO=26;SAF=13;SAR=8;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0428005;STB=0.537154;STBP=0.678;TYPE=snp;VARB=0.00629556;OID=.;OPOS=94103602;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:48:26:27:21:21:0.4375:8:13:15:11:8:13:15:12
chr14	94391699	.	G	A	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0784374;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.108;QD=12.7288;RBI=0.0810152;REFB=-0.00649619;REVB=0.0202739;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286527;STB=0.666349;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.00184619;OID=.;OPOS=94391699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:5:4:2:10:5:4:2:10
chr14	94410275	.	CA	C	1344.19	PASS	AF=1;AO=115;DP=119;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0396312;FXX=0.00840265;HRUN=4;LEN=1;MLLD=20.8552;QD=45.5657;RBI=0.0519987;REFB=0;REVB=-0.0336635;RO=0;SAF=67;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000171257;OID=.;OPOS=94410276;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:115:119:118:118:0:69:49:0:0:25:0:67:48:0:0
chr14	94417421	.	G	A	615.68	PASS	AF=0.39011;AO=70;DP=181;FAO=71;FDP=182;FR=.;FRO=111;FSAF=25;FSAR=46;FSRF=61;FSRR=50;FWDB=0.0129673;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.214;QD=13.5314;RBI=0.0332126;REFB=-0.0227749;REVB=-0.0305766;RO=108;SAF=25;SAR=45;SRF=60;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216098;STB=0.622369;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0365351;OID=.;OPOS=94417421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:182:108:111:70:71:0.39011:45:25:60:48:46:25:61:50
chr14	94417541	.	A	G	801.23	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.824;QD=57.2309;RBI=0.0159903;REFB=0;REVB=-0.0106787;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.46971e-06;OID=.;OPOS=94417541;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:35:21:0:0:35:21:0:0
chr14	94417586	.	G	A	94.22	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=0.0309359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.609;QD=10.4687;RBI=0.0331616;REFB=-0.0497005;REVB=0.0119441;RO=23;SAF=9;SAR=3;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.436053;STB=0.769833;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0665337;OID=.;OPOS=94417586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:23:24:12:12:0.333333:3:9:8:15:3:9:8:16
chr14	94421446	.	C	G	359.17	PASS	AF=0.402062;AO=39;DP=97;FAO=39;FDP=97;FR=.;FRO=58;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.0116725;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.112;QD=14.8112;RBI=0.0219719;REFB=-0.0150042;REVB=-0.018615;RO=58;SAF=10;SAR=29;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247391;STB=0.641285;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0249768;OID=.;OPOS=94421446;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:58:58:39:39:0.402062:29:10:27:31:29:10:27:31
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chr14	94564035	.	A	G	518.51	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0380904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7106;QD=57.6122;RBI=0.053998;REFB=0;REVB=0.0382741;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000612048;OID=.;OPOS=94564035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:35:36:0:0:34:36:1:16:18:0:0:18:18:0:0
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chr14	94582130	.	T	C,TGGCCATGGC	327.57	PASS	AF=0.185185,0.777778;AO=6,19;DP=28;FAO=5,21;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=5,11;FSAR=0,10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0499388,-0.00805339;FXX=0.0357015;HRUN=1,2;LEN=1,9;MLLD=158.647,278.252;QD=48.5282;RBI=0.0508556,0.0136721;REFB=-0.0375649,-0.116263;REVB=0.0096127,0.0110485;RO=2;SAF=5,10;SAR=1,9;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.144764,-0.0834716;STB=0.5,0.521719;STBP=1,0.51;TYPE=snp,ins;VARB=0.0408462,0.00632283;OID=.,.;OPOS=94582130,94582131;OREF=T,-;OALT=C,GGCCATGGC;OMAPALT=C,TGGCCATGGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:29:28:27:2:1:6,19:5,21:0.185185,0.777778:1,9:5,10:2:0:0,10:5,11:1:0
chr14	94582926	.	C	G	1142.25	PASS	AF=0.95122;AO=78;DP=82;FAO=78;FDP=82;FR=.;FRO=4;FSAF=34;FSAR=44;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.042277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.0608;QD=55.7193;RBI=0.048535;REFB=-0.150376;REVB=0.0238391;RO=0;SAF=34;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47622e-08;STB=0.527771;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.00298569;OID=.;OPOS=94582926;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:82:82:0:4:78:78:0.95122:44:34:0:0:44:34:4:0
chr14	94756450	.	T	A	233.43	PASS	AF=0.472727;AO=26;DP=55;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0356642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6209;QD=16.9765;RBI=0.0362115;REFB=-0.0109481;REVB=-0.00627188;RO=27;SAF=15;SAR=11;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120468;STB=0.550032;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.00998346;OID=.;OPOS=94756450;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:27:29:26:26:0.472727:11:15:12:15:11:15:14:15
chr14	94756750	.	T	C	484.62	PASS	AF=0.516484;AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=-0.01015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.793;QD=21.302;RBI=0.0133754;REFB=-0.036739;REVB=0.00871093;RO=41;SAF=15;SAR=32;SRF=12;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0260332;STB=0.511995;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0362978;OID=.;OPOS=94756750;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:41:44:47:47:0.516484:32:15:12:29:32:15:15:29
chr14	94756794	.	T	C	334.42	PASS	AF=0.546875;AO=34;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0333581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5561;QD=20.9013;RBI=0.0473803;REFB=-0.0154047;REVB=0.0336471;RO=30;SAF=14;SAR=20;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0396852;STB=0.539149;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.018597;OID=.;OPOS=94756794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:30:29:34:35:0.546875:20:14:11:19:20:15:10:19
chr14	94776221	.	A	C	1853.15	PASS	AF=0.991803;AO=121;DP=125;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=61;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0153228;FXX=0.0239981;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.423;QD=60.7591;RBI=0.0211675;REFB=-0.212852;REVB=0.014604;RO=1;SAF=60;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00785179;STB=0.504132;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.00106029;OID=.;OPOS=94776221;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:125:122:1:1:121:121:0.991803:61:60:1:0:61:60:1:0
chr14	94929541	.	G	A	406.04	PASS	AF=0.441176;AO=45;DP=102;FAO=45;FDP=102;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.0110541;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=98.2418;QD=15.923;RBI=0.0125749;REFB=-0.0132958;REVB=0.00599465;RO=56;SAF=32;SAR=13;SRF=31;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173278;STB=0.593706;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0246087;OID=.;OPOS=94929541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:56:57:45:45:0.441176:13:32:31:25:13:32:32:25
chr14	94931105	.	A	G	149.23	PASS	AF=0.322581;AO=19;DP=62;FAO=20;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.00936221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.035;QD=9.62794;RBI=0.015626;REFB=0.00781026;REVB=-0.0125109;RO=41;SAF=9;SAR=10;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0118798;STB=0.516113;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=-0.00897534;OID=.;OPOS=94931105;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:41:42:19:20:0.322581:10:9:19:22:10:10:20:22
chr14	94933473	.	C	A	424.16	PASS	AF=0.472527;AO=43;DP=91;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=25;FWDB=0.0119582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.435;QD=18.6442;RBI=0.0148437;REFB=0.000947705;REVB=-0.00879421;RO=48;SAF=26;SAR=17;SRF=23;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120536;STB=0.567241;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.000749132;OID=.;OPOS=94933473;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:48:48:43:43:0.472527:17:26:23:25:17:26:23:25
chr14	94933640	.	A	T	166.49	PASS	AF=0.328358;AO=22;DP=67;FAO=22;FDP=67;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.007197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.217;QD=9.93973;RBI=0.0165682;REFB=-0.00794642;REVB=-0.0149234;RO=44;SAF=13;SAR=9;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104379;STB=0.56902;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0160024;OID=.;OPOS=94933640;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:44:45:22:22:0.328358:9:13:22:22:9:13:22:23
chr14	94933695	.	G	A	148.61	PASS	AF=0.345455;AO=19;DP=55;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.00240893;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6698;QD=10.808;RBI=0.0435476;REFB=0.00713237;REVB=0.0434809;RO=36;SAF=9;SAR=10;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293772;STB=0.517223;STBP=0.844;TYPE=snp;VARB=-0.0121851;OID=.;OPOS=94933695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:36:36:19:19:0.345455:10:9:18:18:10:9:18:18
chr14	94935566	.	G	A	275.6	PASS	AF=0.491803;AO=30;DP=61;FAO=30;FDP=61;FR=.;FRO=31;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0190662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.276;QD=18.0723;RBI=0.022966;REFB=-0.016586;REVB=-0.0128031;RO=29;SAF=18;SAR=12;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745867;STB=0.55996;STBP=0.378;TYPE=snp;VARB=0.0169991;OID=.;OPOS=94935566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:29:31:30:30:0.491803:12:18:15:14:12:18:15:16
chr14	95033356	.	C	T	815.54	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0047412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.01;QD=57.2305;RBI=0.00515485;REFB=0;REVB=-0.00202324;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68221e-06;OID=.;OPOS=95033356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:27:30:0:0:27:30:0:0
chr14	95053890	.	G	A	588.17	PASS	AF=0.545455;AO=54;DP=99;FAO=54;FDP=99;FR=.;FRO=45;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.00159939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.34;QD=23.7646;RBI=0.0150074;REFB=-0.0226513;REVB=-0.014922;RO=45;SAF=34;SAR=20;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0832986;STB=0.545793;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0201152;OID=.;OPOS=95053890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:45:45:54:54:0.545455:20:34:24:21:20:34:24:21
chr14	95054176	.	T	C	273.56	PASS	AF=0.526316;AO=28;DP=56;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0272586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.901;QD=19.1971;RBI=0.0281172;REFB=-0.0199957;REVB=0.00689551;RO=27;SAF=15;SAR=13;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0476899;STB=0.524574;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.021167;OID=.;OPOS=95054176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:27:27:28:30:0.526316:13:15:13:14:14:16:13:14
chr14	95235358	.	G	A	1125.79	PASS	AF=0.417808;AO=122;DP=293;FAO=122;FDP=292;FR=.;FRO=170;FSAF=59;FSAR=63;FSRF=101;FSRR=69;FWDB=0.0112571;FXX=0.00341285;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.329;QD=15.4218;RBI=0.0134528;REFB=-0.0166581;REVB=0.00736585;RO=169;SAF=59;SAR=63;SRF=100;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112397;STB=0.564127;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.0213573;OID=.;OPOS=95235358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:293:292:169:170:122:122:0.417808:63:59:100:69:63:59:101:69
chr14	95555205	.	C	T	1190.37	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.009156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1225;QD=61.0445;RBI=0.0135484;REFB=0;REVB=0.00998636;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110565;OID=.;OPOS=95555205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:39:39:0:0:39:39:0:0
chr14	95660242	.	A	G	150.88	PASS	AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0104899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.607;QD=12.5729;RBI=0.0150094;REFB=-0.00665391;REVB=0.0107351;RO=30;SAF=6;SAR=11;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549036;STB=0.523781;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.011397;OID=.;OPOS=95660242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:31:17:17:0.354167:11:6:12:18:11:6:12:19
chr14	95884323	.	G	A	152.89	PASS	AF=0.404762;AO=16;DP=41;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0999798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.0207;QD=14.5604;RBI=0.11085;REFB=-0.0444947;REVB=0.0478718;RO=24;SAF=5;SAR=11;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24468;STB=0.664523;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0538472;OID=.;OPOS=95884323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:24:25:16:17:0.404762:11:5:13:11:12:5:14:11
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chr14	95906022	.	C	CA	485.01	PASS	AF=1;AO=10;DP=49;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.221814;FXX=0.163232;HRUN=0;LEN=1;MLLD=122.762;QD=47.3181;RBI=0.232443;REFB=0;REVB=0.0694853;RO=39;SAF=1;SAR=9;SRF=9;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287907;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0014907;OID=.;OPOS=95906023;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:10:49:41:41:0:11:30:0:0:3:39:1:9:9:30
chr14	95906023	.	G	A,C	705.51	PASS	AF=0.77551,0.204082;AO=38,10;DP=49;FAO=38,10;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=9,1;FSAR=29,9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0542506,-0.0221012;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=157.58,42.0778;QD=57.5925;RBI=0.066263,0.0276605;REFB=-0.0732011,-0.0134891;REVB=0.0380481,-0.0166325;RO=1;SAF=9,1;SAR=29,9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.049227,-0.290714;STB=0.526302,0.666259;STBP=0.147,0.073;TYPE=snp,snp;VARB=0.00335842,0.156142;OID=.,.;OPOS=95906023,95906023;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:61:49:49:1:1:38,10:38,10:0.77551,0.204082:29,9:9,1:1:0:29,9:9,1:1:0
chr14	95934137	.	A	T	628.64	PASS	AF=0.471014;AO=64;DP=139;FAO=65;FDP=138;FR=.;FRO=73;FSAF=31;FSAR=34;FSRF=52;FSRR=21;FWDB=-0.0143374;FXX=0.0142847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.286;QD=18.2213;RBI=0.0555479;REFB=-0.0133251;REVB=-0.0536657;RO=72;SAF=31;SAR=33;SRF=51;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213415;STB=0.623335;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0168071;OID=.;OPOS=95934137;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:138:72:73:64:65:0.471014:33:31:51:21:34:31:52:21
chr14	95999820	.	T	C	627.41	PASS	AF=0.575758;AO=56;DP=99;FAO=57;FDP=99;FR=.;FRO=42;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=-0.0419926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.778;QD=25.3498;RBI=0.0423578;REFB=-0.0132639;REVB=-0.00554954;RO=41;SAF=31;SAR=25;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0830327;STB=0.552974;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0163612;OID=.;OPOS=95999820;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:41:42:56:57:0.575758:25:31:27:14:26:31:28:14
chr14	96131432	.	A	G	923.23	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0411204;FXX=0.0156226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6147;QD=58.6178;RBI=0.0411403;REFB=0;REVB=0.0012803;RO=0;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000277478;OID=.;OPOS=96131432;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:63:0:0:63:63:1:40:23:0:0:40:23:0:0
chr14	96136794	.	A	G	87.46	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.000480459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.4121;QD=13.4555;RBI=0.0814912;REFB=-0.00817624;REVB=0.0814898;RO=15;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106918;STB=0.562392;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0165166;OID=.;OPOS=96136794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:4:7:11:4:4:7:11:4
chr14	96178688	.	C	T	350.61	PASS	AF=0.388889;AO=42;DP=108;FAO=42;FDP=108;FR=.;FRO=66;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.000230851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.25;QD=12.9857;RBI=0.00188817;REFB=-0.00158532;REVB=0.00187401;RO=63;SAF=15;SAR=27;SRF=37;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244363;STB=0.651244;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0034723;OID=.;OPOS=96178688;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:63:66:42:42:0.388889:27:15:37:26:27:15:40:26
chr14	96556914	.	T	C	1108.9	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.411;QD=59.9406;RBI=0.0576839;REFB=0;REVB=0.0567927;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175604;OID=.;OPOS=96556914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:32:41:0:0:33:41:0:0
chr14	96557121	.	T	C	538.26	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.477;QD=59.8071;RBI=0.0299227;REFB=0;REVB=0.0248077;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000414608;OID=.;OPOS=96557121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:14:22:0:0:14:22:0:0
chr14	96558549	.	G	A	145.37	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.028985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.359;QD=17.6201;RBI=0.0477682;REFB=-0.0356667;REVB=0.0379694;RO=17;SAF=8;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265217;STB=0.515133;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.0365038;OID=.;OPOS=96558549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:8:8:8:9:8:8:8:9
chr14	96558595	.	C	T	176.27	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0275543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.549;QD=20.7382;RBI=0.0437823;REFB=-0.0294216;REVB=-0.0340242;RO=15;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719337;STB=0.555494;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0318624;OID=.;OPOS=96558595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:16:18:18:0.529412:10:8:8:7:10:8:9:7
chr14	96558694	.	C	T	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.00667004;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=270.632;QD=17.1566;RBI=0.00733383;REFB=-0.0277503;REVB=0.00304888;RO=20;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144153;STB=0.582682;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.0276134;OID=.;OPOS=96558694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:11:6:10:10:11:6:10:10
chr14	96558881	.	C	G	851.57	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00832766;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=270.791;QD=57.7334;RBI=0.0189891;REFB=0;REVB=0.0170656;RO=0;SAF=17;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.57065e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.49218e-05;OID=.;OPOS=96558881;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:40:17:0:0:40:19:0:0
chr14	96559250	.	C	T	109.26	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0220918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.914;QD=14.0975;RBI=0.0298148;REFB=0.00720592;REVB=0.0200218;RO=18;SAF=5;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117074;STB=0.568421;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.00829041;OID=.;OPOS=96559250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:8:5:9:9:8:5:9:9
chr14	96559459	.	C	A	754.42	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000114029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.364;QD=56.9371;RBI=0.0151405;REFB=0;REVB=-0.01514;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.31833e-05;OID=.;OPOS=96559459;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:31:22:0:0:31:22:0:0
chr14	96559731	.	AG	AC,GC	680.09	PASS	AF=0.913043,0.0652174;AO=42,3;DP=47;FAO=42,3;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=21,3;FSAR=21,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0677508,-0.00775057;FXX=0.0212721;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=93.3443,156.019;QD=59.1383;RBI=0.076094,0.00792265;REFB=-0.0803528,-0.028789;REVB=0.034643,-0.00164227;RO=0;SAF=21,3;SAR=21,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.511622,0.994936;STBP=0.51,0.122;TYPE=snp,mnp;VARB=0.000441778,-0.0320072;OID=.,.;OPOS=96559732,96559731;OREF=G,AG;OALT=C,GC;OMAPALT=AC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:47:46:0:1:42,3:42,3:0.913043,0.0652174:21,0:21,3:0:0:21,0:21,3:0:1
chr14	96560083	.	A	T	1568.41	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133096;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.932;QD=64.0168;RBI=0.0222765;REFB=0;REVB=0.0178633;RO=0;SAF=47;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.73029e-05;OID=.;OPOS=96560083;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:51:47:0:0:51:47:0:0
chr14	96671207	.	GGGTGGGGAC	G	410.97	PASS	AF=0.662162;AO=44;DP=67;FAO=49;FDP=74;FR=.;FRO=25;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.021518;FXX=0.108421;HRUN=4;LEN=9;MLLD=250.94;QD=22.2146;RBI=0.0310078;REFB=-0.0290378;REVB=0.0223261;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533955;STBP=0.454;TYPE=del;VARB=0.01152;OID=.;OPOS=96671208;OREF=GGTGGGGAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.662162:44:67:49:74:25:32:17:14:11:99:0:28:16:0:0
chr14	96707457	.	A	G	651.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0067047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.715;QD=62.0208;RBI=0.00939779;REFB=0;REVB=-0.00658525;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.14152e-07;OID=.;OPOS=96707457;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:21:21:0:0:21:21:0:0
chr14	96708667	.	T	C	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.53;QD=57.6807;RBI=0.0424094;REFB=0;REVB=0.0330213;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198152;OID=.;OPOS=96708667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr14	96709359	.	A	AC,C	459.01	PASS	AF=1,0;AO=32,2;DP=39;FAO=35,0;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10662,0.0570211;FXX=0.0789266;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=20.6221,4.38798;QD=52.4582;RBI=0.137859,0.0798522;REFB=0,0;REVB=0.0873905,0.0559015;RO=4;SAF=9,2;SAR=23,0;SRF=2;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0543668,0.623114;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0107171,0;OID=.,.;OPOS=96709360,96709359;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:39:35:4:0:32,2:35,0:1,0:23,0:9,2:2:2:23,0:12,0:0:0
chr14	96709499	.	G	A	45.54	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.441;QD=26.0256;RBI=0.126908;REFB=-0.0816425;REVB=0.126908;RO=1;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0311037;OID=.;OPOS=96709499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:6:0:0:1:6:0:0:1
chr14	96730142	.	A	G	1993.95	PASS	AF=0.992308;AO=128;DP=129;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=80;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0196687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.486;QD=61.3522;RBI=0.0233719;REFB=-0.138405;REVB=0.0126249;RO=1;SAF=79;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00597794;STB=0.503105;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000496923;OID=.;OPOS=96730142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:129:130:1:1:128:129:0.992308:49:79:1:0:49:80:1:0
chr14	96730718	.	G	A	1161.33	PASS	AF=0.975;AO=75;DP=78;FAO=78;FDP=80;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0389418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0818;QD=58.0664;RBI=0.0525352;REFB=-0.130201;REVB=0.0352631;RO=3;SAF=41;SAR=34;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00880922;STB=0.501295;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0101529;OID=.;OPOS=96730718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:78:80:3:2:75:78:0.975:34:41:2:1:35:43:1:1
chr14	96771959	.	A	G	164.72	PASS	AF=0.298701;AO=23;DP=78;FAO=23;FDP=77;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.0147618;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.137;QD=8.557;RBI=0.0147653;REFB=-0.00682078;REVB=0.000321209;RO=53;SAF=12;SAR=11;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144951;STB=0.502261;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0131256;OID=.;OPOS=96771959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:53:54:23:23:0.298701:11:12:27:26:11:12:28:26
chr14	96781912	.	T	C	368.46	PASS	AF=0.448276;AO=39;DP=87;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.00130575;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2099;QD=16.9408;RBI=0.0369224;REFB=-0.0260921;REVB=-0.0368993;RO=47;SAF=21;SAR=18;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0892296;STB=0.544147;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0407419;OID=.;OPOS=96781912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:47:48:39:39:0.448276:18:21:21:26:18:21:22:26
chr14	96782951	.	AT	ATA,TA	31.35	PASS	AF=0.242424,0;AO=5,2;DP=33;FAO=8,0;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=7,0;FSAR=1,0;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.0514636,0.0126021;FXX=0;HRUN=2,4;LEN=1,2;MLLD=17.8065,25.6839;QD=3.80053;RBI=0.0523434,0.0268336;REFB=-0.0302696,-0.0203928;REVB=-0.0095565,0.0236902;RO=25;SAF=5,2;SAR=0,0;SRF=11;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.686269,0.509229;STB=0.852718,0.5;STBP=0.032,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0952218,0.0299087;OID=.,.;OPOS=96782953,96782951;OREF=-,AT;OALT=A,TA;OMAPALT=ATA,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:33:33:25:25:5,2:8,0:0.242424,0:0,0:5,2:11:14:1,0:7,0:11:14
chr14	96797724	.	G	A	521.13	PASS	AF=0.509434;AO=54;DP=106;FAO=54;FDP=106;FR=.;FRO=52;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.0136217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.407;QD=19.6654;RBI=0.0172572;REFB=-0.00844806;REVB=-0.0105953;RO=52;SAF=34;SAR=20;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169528;STB=0.593693;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0113834;OID=.;OPOS=96797724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:52:52:54:54:0.509434:20:34:23:29:20:34:23:29
chr14	96829290	.	G	A	231.5	PASS	AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=-0.0207011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.639;QD=12.3464;RBI=0.0329235;REFB=-0.0172959;REVB=-0.0256012;RO=47;SAF=14;SAR=14;SRF=31;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174741;STB=0.599931;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0235515;OID=.;OPOS=96829290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:47:47:28:28:0.373333:14:14:31:16:14:14:31:16
chr14	96851111	.	C	T	191.97	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0198203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8942;QD=11.8137;RBI=0.0204316;REFB=-0.00276073;REVB=-0.00496074;RO=41;SAF=15;SAR=9;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203532;STB=0.617662;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00545911;OID=.;OPOS=96851111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:41:41:24:24:0.369231:9:15:18:23:9:15:18:23
chr14	96917802	.	G	A	116.16	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.0270349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.336;QD=11.3328;RBI=0.0479244;REFB=-0.0237023;REVB=-0.0395711;RO=26;SAF=8;SAR=6;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28395;STB=0.675444;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0305152;OID=.;OPOS=96917802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:26:27:14:14:0.341463:6:8:8:18:6:8:8:19
chr14	96922752	.	C	G	715.94	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00606705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.595;QD=56.1517;RBI=0.0700566;REFB=0;REVB=0.0697934;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325361;OID=.;OPOS=96922752;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:24:26:0:0:25:26:0:0
chr14	97321689	.	C	T	1320.9	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00588272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6019;QD=62.1598;RBI=0.0132371;REFB=0;REVB=-0.0118581;RO=0;SAF=44;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.29775e-05;OID=.;OPOS=97321689;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:41:44:0:0:41:44:0:0
chr14	97410013	.	T	C	131.31	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.00623277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8455;QD=14.1952;RBI=0.029929;REFB=-0.016733;REVB=0.0292728;RO=22;SAF=8;SAR=7;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264628;STB=0.652294;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0117294;OID=.;OPOS=97410013;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:7:8:6:16:7:8:6:16
chr14	98112541	.	T	G	773.17	PASS	AF=0.487805;AO=80;DP=165;FAO=80;FDP=164;FR=.;FRO=84;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=49;FSRR=35;FWDB=0.0371088;FXX=0.00606024;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.148;QD=18.8577;RBI=0.037158;REFB=-0.0148356;REVB=-0.00191118;RO=84;SAF=40;SAR=40;SRF=49;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0774191;STB=0.542672;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0159195;OID=.;OPOS=98112541;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:164:84:84:80:80:0.487805:40:40:49:35:40:40:49:35
chr14	98435696	.	T	C	2440.59	PASS	AF=1;AO=158;DP=160;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152025;FXX=0.0185174;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.89;QD=61.3985;RBI=0.0365604;REFB=0;REVB=0.0332498;RO=1;SAF=75;SAR=83;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.005698;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.4888e-05;OID=.;OPOS=98435696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:160:159:1:0:158:159:1:83:75:0:1:84:75:0:0
chr14	98444369	.	T	C	892.43	PASS	AF=1;AO=60;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.654;QD=56.6619;RBI=0.0263052;REFB=0;REVB=0.0211308;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013593;OID=.;OPOS=98444369;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:60:63:1:24:36:0:0:27:36:0:0
chr14	98817896	.	T	C	1120.68	PASS	AF=0.986842;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0392075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.7975;QD=58.9833;RBI=0.0428709;REFB=0.0303725;REVB=-0.0173401;RO=1;SAF=43;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145558;STB=0.50769;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-0.00326521;OID=.;OPOS=98817896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:76:1:1:75:75:0.986842:32:43:0:1:32:43:0:1
chr14	99636395	.	T	C	324.82	PASS	AF=0.366972;AO=40;DP=110;FAO=40;FDP=109;FR=.;FRO=69;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=-0.0289773;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.246;QD=11.9201;RBI=0.0297111;REFB=0.00199938;REVB=0.0065628;RO=69;SAF=15;SAR=25;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133409;STB=0.576432;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=-0.00296276;OID=.;OPOS=99636395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:109:69:69:40:40:0.366972:25:15:34:35:25:15:34:35
chr14	99876505	.	A	G	254.9	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000295958;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.05;QD=50.9806;RBI=0.0344991;REFB=0;REVB=0.0344979;RO=0;SAF=16;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.77007e-05;OID=.;OPOS=99876505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:3:16:0:0:3:17:0:0
chr14	100070030	.	G	A	158.15	PASS	AF=0.472222;AO=15;DP=34;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0846151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9567;QD=17.5719;RBI=0.171453;REFB=-0.0247041;REVB=0.149119;RO=19;SAF=9;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.072901;STB=0.56693;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0244417;OID=.;OPOS=100070030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:36:19:19:15:17:0.472222:6:9:10:9:6:11:10:9
chr14	100141689	.	T	C	477.81	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00168165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.147;QD=56.2131;RBI=0.0733401;REFB=0;REVB=0.0733208;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00333003;OID=.;OPOS=100141689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:34:0:0:32:34:1:16:16:0:0:18:16:0:0
chr14	100189287	.	C	T	283.13	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.018237;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.857;QD=17.4231;RBI=0.0267598;REFB=-0.0060764;REVB=0.0195831;RO=34;SAF=12;SAR=19;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240374;STB=0.634492;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00504633;OID=.;OPOS=100189287;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:19:12:22:12:19:12:22:12
chr14	100375707	.	C	T	2261.01	PASS	AF=1;AO=141;DP=143;FAO=143;FDP=143;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0153683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8522;QD=63.2451;RBI=0.01948;REFB=0;REVB=-0.0119702;RO=0;SAF=77;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.88594e-05;OID=.;OPOS=100375707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:143:143:0:0:141:143:1:64:77:0:0:65:78:0:0
chr14	100380948	.	T	C	1099.15	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.241;QD=60.2274;RBI=0.0526577;REFB=0;REVB=0.00962251;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.78233e-05;OID=.;OPOS=100380948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:39:33:0:0:39:34:0:0
chr14	100411737	.	C	A	172.52	PASS	AF=0.514286;AO=16;DP=34;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0756884;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.9869;QD=19.7161;RBI=0.11921;REFB=-0.03995;REVB=-0.0920997;RO=18;SAF=13;SAR=3;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299989;STB=0.695953;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0404754;OID=.;OPOS=100411737;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:18:17:16:18:0.514286:3:13:10:8:3:15:9:8
chr14	100411767	.	C	T	157.86	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0463487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.624;QD=25.258;RBI=0.0470098;REFB=-0.0367586;REVB=-0.00785596;RO=9;SAF=12;SAR=4;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0241852;STB=0.513497;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0180791;OID=.;OPOS=100411767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:4:12:7:2:4:12:7:2
chr14	100411771	.	T	G	142.39	PASS	AF=0.625;AO=14;DP=23;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0522094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9306;QD=23.7314;RBI=0.0729578;REFB=-0.0717033;REVB=0.0509609;RO=8;SAF=11;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334373;STB=0.512803;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.060983;OID=.;OPOS=100411771;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:24:8:9:14:15:0.625:3:11:6:2:3:12:7:2
chr14	100411774	.	G	A	306.52	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8831;QD=53.3073;RBI=0.0723352;REFB=0;REVB=0.0368435;RO=0;SAF=17;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58081e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134613;OID=.;OPOS=100411774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:5:17:0:0:5:18:0:0
chr14	100607595	.	C	T	349.14	PASS	AF=0.521739;AO=36;DP=69;FAO=36;FDP=69;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0145597;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9169;QD=20.2401;RBI=0.0175942;REFB=-0.00430541;REVB=-0.00987783;RO=32;SAF=19;SAR=17;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102941;STB=0.563718;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00486815;OID=.;OPOS=100607595;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:32:33:36:36:0.521739:17:19:13:19:17:19:13:20
chr14	100615665	.	T	C	2235.95	PASS	AF=1;AO=141;DP=141;FAO=141;FDP=141;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00225299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.573;QD=63.4313;RBI=0.036623;REFB=0;REVB=0.0365536;RO=0;SAF=77;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.97235e-05;OID=.;OPOS=100615665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:141:141:0:0:141:141:1:64:77:0:0:64:77:0:0
chr14	100625902	.	C	T	669.29	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1321;QD=62.2591;RBI=0.0483733;REFB=0;REVB=0.0458563;RO=0;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000500111;OID=.;OPOS=100625902;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:22:20:0:0:23:20:0:0
chr14	100758502	.	G	A	574.36	PASS	AF=0.53211;AO=58;DP=109;FAO=58;FDP=109;FR=.;FRO=51;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=30;FSRR=21;FWDB=-0.0419405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.063;QD=21.0775;RBI=0.0642086;REFB=-0.0180532;REVB=-0.0486183;RO=50;SAF=33;SAR=25;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00949499;STB=0.509211;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0159087;OID=.;OPOS=100758502;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:50:51:58:58:0.53211:25:33:29:21:25:33:30:21
chr14	100759046	.	C	A	436.19	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.126128;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.526;QD=56.2825;RBI=0.126199;REFB=0;REVB=-0.00422943;RO=0;SAF=18;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00352124;OID=.;OPOS=100759046;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:31:0:0:28:31:1:10:18:0:0:10:21:0:0
chr14	100759277	.	C	T	1207.98	PASS	AF=0.964286;AO=81;DP=84;FAO=81;FDP=84;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.020815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=120.248;QD=57.5227;RBI=0.0454313;REFB=-0.0260774;REVB=0.0403824;RO=2;SAF=44;SAR=37;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00198539;STB=0.504445;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.000317118;OID=.;OPOS=100759277;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:84:84:2:3:81:81:0.964286:37:44:1:1:37:44:2:1
chr14	100792482	.	C	A	1136.2	PASS	AF=0.987179;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0362953;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.072;QD=58.2666;RBI=0.0532775;REFB=-0.124023;REVB=0.0390019;RO=1;SAF=37;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012618;STB=0.506665;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00125056;OID=.;OPOS=100792482;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:77:78:1:1:76:77:0.987179:39:37:1:0:40:37:1:0
chr14	100795139	.	G	T	44.88	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0269986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.576;QD=7.47974;RBI=0.0395371;REFB=-0.00210159;REVB=0.0288835;RO=16;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147359;STB=0.611451;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.00762771;OID=.;OPOS=100795139;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:23:24:16:17:7:7:0.291667:4:3:9:7:4:3:10:7
chr14	100808845	.	G	A	699.03	PASS	AF=0.980392;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0601945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.786;QD=54.8256;RBI=0.0665786;REFB=0.164558;REVB=0.0284488;RO=1;SAF=15;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303352;STB=0.515145;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=-0.000941515;OID=.;OPOS=100808845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:51:1:1:49:50:0.980392:34:15:1:0:34:16:1:0
chr14	100832391	.	T	C	1173.69	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0323399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7472;QD=59.4274;RBI=0.0327017;REFB=-0.137084;REVB=0.00485126;RO=1;SAF=43;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108815;STB=0.505746;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000868008;OID=.;OPOS=100832391;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:35:43:1:0:35:43:1:0
chr14	100847523	.	T	C	685.85	PASS	AF=0.957447;AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.02557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.1813;QD=58.3701;RBI=0.0256054;REFB=-0.0569687;REVB=-0.00134593;RO=2;SAF=21;SAR=24;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0426715;STB=0.522717;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0159487;OID=.;OPOS=100847523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:47:47:2:2:45:45:0.957447:24:21:2:0:24:21:2:0
chr14	100847707	.	A	G	490.94	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=20;FSAR=31;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.00776141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.953;QD=19.2524;RBI=0.0243886;REFB=-0.00830147;REVB=-0.0231207;RO=50;SAF=20;SAR=30;SRF=25;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.092075;STB=0.56007;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.011126;OID=.;OPOS=100847707;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:50:51:50:51:0.5:30:20:25:25:31:20:26:25
chr14	100847930	.	A	G	343.24	PASS	AF=0.596491;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0144828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.281;QD=24.087;RBI=0.0154009;REFB=-0.00533228;REVB=-0.00523791;RO=23;SAF=17;SAR=17;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478693;STB=0.5263;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00283172;OID=.;OPOS=100847930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:23:23:34:34:0.596491:17:17:13:10:17:17:13:10
chr14	100996312	.	T	C	575.78	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00116234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.9;QD=60.6079;RBI=0.0250725;REFB=0;REVB=-0.0250456;RO=0;SAF=12;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.00926e-05;OID=.;OPOS=100996312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:26:12:0:0:26:12:0:0
chr14	101005215	.	T	C	595.73	PASS	AF=1;AO=27;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.181;QD=61.1004;RBI=0.0919816;REFB=0;REVB=0.0870105;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00244685;OID=.;OPOS=101005215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:27:39:1:14:13:0:0:25:14:0:0
chr14	101005236	.	A	G	575.76	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0183786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1611;QD=60.6063;RBI=0.0191084;REFB=0;REVB=0.00523042;RO=0;SAF=13;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000122509;OID=.;OPOS=101005236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:25:13:0:0:25:13:0:0
chr14	101138230	.	A	C	280.87	PASS	AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=0.0342115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4603;QD=14.4034;RBI=0.0453348;REFB=0.0163543;REVB=0.0297459;RO=45;SAF=17;SAR=15;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043671;STB=0.53123;STBP=0.66;TYPE=snp;VARB=-0.0229328;OID=.;OPOS=101138230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:45:46:32:32:0.410256:15:17:22:23:15:17:22:24
chr14	101198417	.	A	G	1561.86	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00235177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.215;QD=59.4994;RBI=0.0395939;REFB=0;REVB=0.039524;RO=0;SAF=76;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.99456e-05;OID=.;OPOS=101198417;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:105:0:0:103:105:1:27:76:0:0:27:78:0:0
chr14	101200644	.	T	TC	81.68	PASS	AF=1;AO=3;DP=16;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-6.81685e-05;FXX=0.356888;HRUN=0;LEN=1;MLLD=126.465;QD=36.3027;RBI=0.0490648;REFB=0;REVB=-0.0490647;RO=12;SAF=0;SAR=3;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.569201;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00967138;OID=.;OPOS=101200645;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:3:16:9:9:0:0:9:0:0:3:12:0:3:3:9
chr14	101200645	.	T	C,G	132.69	PASS	AF=0.6875,0.1875;AO=11,3;DP=16;FAO=11,3;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=3,0;FSAR=8,3;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.000637447,0.0906198;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=148.328,18.3269;QD=33.1724;RBI=0.0249249,0.0913875;REFB=-0.0468981,-0.267003;REVB=0.0249167,-0.0118208;RO=2;SAF=3,0;SAR=8,3;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0998761,0;STB=0.55546,0.5;STBP=0.509,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00816519,0.22557;OID=.,.;OPOS=101200645,101200645;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:16:16:2:2:11,3:11,3:0.6875,0.1875:8,3:3,0:0:2:8,3:3,0:0:2
chr14	101302211	.	G	T	693.06	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520151;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.751;QD=63.005;RBI=0.0648417;REFB=0;REVB=0.0387153;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.21444e-05;OID=.;OPOS=101302211;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:44:44:1:28:16:0:0:28:16:0:0
chr14	101347160	.	C	A	187.86	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.00423044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.775;QD=20.3094;RBI=0.00858584;REFB=-0.00914204;REVB=-0.00747129;RO=18;SAF=9;SAR=10;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736315;STB=0.541504;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00819115;OID=.;OPOS=101347160;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:10:9:7:11:10:9:7:11
chr14	101348584	.	C	G	205.33	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.0502975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3291;QD=14.6667;RBI=0.050889;REFB=0.00136664;REVB=-0.00773673;RO=31;SAF=10;SAR=14;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223684;STB=0.634394;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.000931211;OID=.;OPOS=101348584;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:31:32:24:24:0.428571:14:10:20:11:14:10:21:11
chr14	101349017	.	A	G	1531.17	PASS	AF=0.981308;AO=104;DP=106;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0166744;FXX=0.0092584;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.1583;QD=57.24;RBI=0.016697;REFB=-0.0998525;REVB=0.000869276;RO=2;SAF=50;SAR=54;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000689431;STB=0.500446;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.000849797;OID=.;OPOS=101349017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:106:107:2:2:104:105:0.981308:54:50:1:1:55:50:1:1
chr14	101350298	.	T	C	902.67	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0689644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.733;QD=58.2371;RBI=0.0698569;REFB=0;REVB=-0.011131;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0006202;OID=.;OPOS=101350298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:26:36:0:0:26:36:0:0
chr14	101507727	.	C	T	391.58	PASS	AF=0.603175;AO=38;DP=63;FAO=38;FDP=63;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.0393654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.973;QD=24.8621;RBI=0.0430666;REFB=-0.000323948;REVB=0.0174669;RO=25;SAF=15;SAR=23;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23334;STB=0.627725;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=5.55762e-05;OID=.;OPOS=101507727;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:25:25:38:38:0.603175:23:15:18:7:23:15:18:7
chr14	101512836	.	A	G	2027.13	PASS	AF=1;AO=130;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.326;QD=62.3733;RBI=0.0141048;REFB=0;REVB=0.00493249;RO=0;SAF=60;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.06475e-05;OID=.;OPOS=101512836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:130:0:0:130:130:1:70:60:0:0:70:60:0:0
chr14	101522556	.	T	C	1515.44	PASS	AF=1;AO=94;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000983582;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.311;QD=63.1433;RBI=0.00490587;REFB=0;REVB=-0.00480626;RO=0;SAF=45;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244427;OID=.;OPOS=101522556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:96:0:0:94:96:1:49:45:0:0:50:46:0:0
chr14	102391577	.	G	C	1596.24	PASS	AF=1;AO=86;DP=107;FAO=106;FDP=106;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140504;FXX=0.00934492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.4947;QD=60.2356;RBI=0.149183;REFB=0;REVB=0.14852;RO=0;SAF=39;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131739;OID=.;OPOS=102391577;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:106:0:0:86:106:1:47:39:0:0:66:40:0:0
chr14	102463407	.	A	G	1979.98	PASS	AF=0.93662;AO=133;DP=142;FAO=133;FDP=142;FR=.;FRO=9;FSAF=60;FSAR=73;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.0166099;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.209;QD=55.7742;RBI=0.018975;REFB=-0.202417;REVB=-0.00917401;RO=1;SAF=60;SAR=73;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00785622;STB=0.534878;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00150072;OID=.;OPOS=102463407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:142:142:1:9:133:133:0.93662:73:60:1:0:73:60:9:0
chr14	102481579	.	C	T	298.95	PASS	AF=0.445946;AO=33;DP=74;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=0.0119288;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.164;QD=16.1593;RBI=0.0333848;REFB=-0.00957897;REVB=-0.0311809;RO=39;SAF=14;SAR=19;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134848;STB=0.588853;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0149197;OID=.;OPOS=102481579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:39:41:33:33:0.445946:19:14:22:17:19:14:24:17
chr14	102493761	.	A	G	833.22	PASS	AF=0.983871;AO=59;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0879927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9739;QD=53.7561;RBI=0.0880177;REFB=-0.126208;REVB=-0.00209522;RO=3;SAF=15;SAR=44;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0854638;STB=0.514281;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00595534;OID=.;OPOS=102493761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:3:1:59:61:0.983871:44:15:3:0:44:17:1:0
chr14	102514227	.	T	C	740.79	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521433;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.445;QD=56.9839;RBI=0.0572509;REFB=0;REVB=0.0236377;RO=0;SAF=39;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.05892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140099;OID=.;OPOS=102514227;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:13:39:0:0:13:39:0:0
chr14	102676533	.	A	G	152.55	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00941965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.51;QD=21.041;RBI=0.0781203;REFB=-0.000259467;REVB=0.0775503;RO=13;SAF=11;SAR=5;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190679;STB=0.608154;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.000395142;OID=.;OPOS=102676533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:5:11:6:7:5:11:6:7
chr14	102808330	.	C	T	70.5	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0241254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7511;QD=17.6244;RBI=0.0243929;REFB=-0.0165715;REVB=-0.00360281;RO=7;SAF=8;SAR=1;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378665;STB=0.726651;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0195901;OID=.;OPOS=102808330;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:1:8:4:3:1:8:4:3
chr14	102808655	.	G	C	175.49	PASS	AF=0.434783;AO=18;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0234332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.828;QD=15.2597;RBI=0.0529676;REFB=-0.0385041;REVB=-0.0475022;RO=25;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116321;STB=0.543435;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0555051;OID=.;OPOS=102808655;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:25:26:18:20:0.434783:8:10:11:14:10:10:11:15
chr14	102814945	.	G	A	478.8	PASS	AF=0.592105;AO=45;DP=76;FAO=45;FDP=76;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=0.000505649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.233;QD=25.1998;RBI=0.0134384;REFB=-0.012611;REVB=0.0134289;RO=31;SAF=24;SAR=21;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158509;STB=0.586416;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0105338;OID=.;OPOS=102814945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:31:31:45:45:0.592105:21:24:23:8:21:24:23:8
chr14	102894593	.	G	A	159.94	PASS	AF=0.372549;AO=20;DP=52;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0302376;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9917;QD=12.5442;RBI=0.0681476;REFB=0.00139493;REVB=0.0610719;RO=32;SAF=8;SAR=12;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0633515;STB=0.516761;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=-0.0030893;OID=.;OPOS=102894593;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:32:32:20:19:0.372549:12:8:11:21:12:7:11:21
chr14	102965367	.	TCACCACACCACACCACACCA	TCACCACACCACACCA,TCACCACACCACACCACACCT	256.47	PASS	AF=0.869565,0.0869565;AO=15,2;DP=23;FAO=20,2;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=15,1;FSAR=5,1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0828839,0.0958462;FXX=0.0416493;HRUN=1,1;LEN=5,1;MLLD=177.517,68.6984;QD=44.6027;RBI=0.163752,0.109636;REFB=-0.0883969,-0.237801;REVB=0.141227,-0.0532303;RO=1;SAF=14,1;SAR=1,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0314901,-0.25849;STB=0.516113,0.665164;STBP=0.64,0.662;TYPE=del,snp;VARB=0.0132979,0.256491;OID=.,.;OPOS=102965368,102965387;OREF=CACCA,A;OALT=-,T;OMAPALT=TCACCACACCACACCA,TCACCACACCACACCACACCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.869565,0.0869565:15,2:23:20,2:23:1:15,1:5,1:1:0:10:1:14,1:1,1:1:0
chr14	102965435	.	A	G	785.8	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.824;QD=64.1468;RBI=0.135329;REFB=0;REVB=0.133233;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000705;OID=.;OPOS=102965435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:20:29:0:0:20:29:0:0
chr14	102965437	.	A	T	769.96	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0456016;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.041;QD=64.1633;RBI=0.0536616;REFB=0;REVB=-0.0282854;RO=0;SAF=29;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.53218e-05;OID=.;OPOS=102965437;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:19:29:0:0:19:29:0:0
chr14	103161736	.	A	AG,G	834.46	PASS	AF=0.984375,0.015625;AO=52,11;DP=66;FAO=63,1;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=33,0;FSAR=30,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0235849,-0.0479029;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=20.0639,5.78517;QD=52.154;RBI=0.0447677,0.177859;REFB=0,0;REVB=-0.0380513,-0.171287;RO=3;SAF=33,0;SAR=19,11;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00354868,-0.824264;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00317044,0.0911953;OID=.,.;OPOS=103161737,103161736;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:66:64:3:0:52,11:63,1:0.984375,0.015625:19,11:33,0:2:1:30,1:33,0:0:0
chr14	103193028	.	G	A	1101.78	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0252498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3053;QD=59.5554;RBI=0.0310924;REFB=0;REVB=0.0181434;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.51959e-05;OID=.;OPOS=103193028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:73:74:1:35:38:0:0:36:38:0:0
chr14	103388999	.	T	C	229.4	PASS	AF=0.536585;AO=21;DP=40;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.00129061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.573;QD=22.3805;RBI=0.0265861;REFB=-0.00841525;REVB=-0.0265548;RO=17;SAF=17;SAR=4;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.332383;STB=0.721699;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00978775;OID=.;OPOS=103388999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:17:19:21:22:0.536585:4:17:8:9:4:18:8:11
chr14	103389003	.	G	C	225.58	PASS	AF=0.52381;AO=21;DP=41;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.011401;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.925;QD=21.4842;RBI=0.0217676;REFB=-0.0241806;REVB=-0.0185431;RO=20;SAF=17;SAR=4;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405847;STB=0.734457;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0139225;OID=.;OPOS=103389003;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:20:20:21:22:0.52381:4:17:8:12:4:18:8:12
chr14	103440473	.	G	C	181.03	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0223757;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.313;QD=12.9306;RBI=0.0226382;REFB=-0.0278067;REVB=-0.00343753;RO=34;SAF=8;SAR=14;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211534;STB=0.512184;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0436448;OID=.;OPOS=103440473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:34:34:22:22:0.392857:14:8:13:21:14:8:13:21
chr14	103570354	.	G	T	87.47	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.312;QD=38.8768;RBI=0.0511576;REFB=0;REVB=0.0458618;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000602795;OID=.;OPOS=103570354;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0
chr14	103576415	.	A	G	1428.89	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0246485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3712;QD=62.8085;RBI=0.0625342;REFB=0;REVB=0.0574716;RO=0;SAF=45;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.38494e-05;OID=.;OPOS=103576415;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:46:45:0:0:46:45:0:0
chr14	103576443	.	TC	CG	1173.45	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160616;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=2;MLLD=166.393;QD=60.9582;RBI=0.0251479;REFB=0;REVB=0.0193505;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=7.09422e-05;OID=.;OPOS=103576443;OREF=TC;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:42:34:0:0:43:34:0:0
chr14	103593950	.	C	G	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.692;QD=60.6102;RBI=0.0232178;REFB=0;REVB=0.010822;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.68868e-05;OID=.;OPOS=103593950;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
chr14	103602278	.	A	G	750.93	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438133;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.196;QD=63.9093;RBI=0.0470805;REFB=0;REVB=0.0172327;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202443;OID=.;OPOS=103602278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
chr14	103807442	.	T	A	378.04	PASS	AF=0.4875;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0153113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6955;QD=18.9018;RBI=0.0470326;REFB=0.0153382;REVB=-0.0444705;RO=40;SAF=15;SAR=24;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.061779;STB=0.529043;STBP=0.647;TYPE=snp;VARB=-0.0228155;OID=.;OPOS=103807442;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:40:41:39:39:0.4875:24:15:18:22:24:15:18:23
chr14	103808153	.	A	G	362.71	PASS	AF=0.40625;AO=39;DP=98;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=32;FSAR=7;FSRF=40;FSRR=17;FWDB=0.0153298;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.183;QD=15.113;RBI=0.0620428;REFB=-0.0401805;REVB=0.0601191;RO=56;SAF=32;SAR=7;SRF=39;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187025;STB=0.603715;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.045546;OID=.;OPOS=103808153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:96:56:57:39:39:0.40625:7:32:39:17:7:32:40:17
chr14	103808199	.	T	TAAAC	389.71	PASS	AF=0.655172;AO=32;DP=63;FAO=38;FDP=58;FR=.;FRO=20;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.0311523;FXX=0.0491723;HRUN=2;LEN=4;MLLD=201.761;QD=26.8762;RBI=0.031843;REFB=0.00223241;REVB=-0.00659626;RO=23;SAF=24;SAR=8;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130548;STB=0.543285;STBP=0.49;TYPE=ins;VARB=-0.00172564;OID=.;OPOS=103808200;OREF=-;OALT=AAAC;OMAPALT=TAAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.655172:32:63:38:58:20:29:9:17:3:99:23:24:8:20:3
chr14	103808472	.	C	T	374.54	PASS	AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0255437;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.6948;QD=49.9392;RBI=0.0257179;REFB=0.0101057;REVB=0.00298813;RO=2;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0663506;STB=0.535689;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=-0.00454899;OID=.;OPOS=103808472;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:30:30:2:2:28:28:0.933333:13:15:0:2:13:15:0:2
chr14	103852725	.	C	T	1171.68	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0667048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.17;QD=60.8666;RBI=0.0670751;REFB=0;REVB=-0.00703824;RO=0;SAF=39;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165148;OID=.;OPOS=103852725;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:38:39:0:0:38:39:0:0
chr14	103934488	.	T	C	1347.28	PASS	AF=0.941176;AO=96;DP=102;FAO=96;FDP=102;FR=.;FRO=6;FSAF=44;FSAR=52;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00319912;FXX=0.0097078;HRUN=6;LEN=1;MLLD=253.631;QD=52.8344;RBI=0.00470395;REFB=-0.0649111;REVB=-0.00344859;RO=3;SAF=44;SAR=52;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312359;STB=0.512313;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.000274313;OID=.;OPOS=103934488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:102:102:3:6:96:96:0.941176:52:44:3:0:52:44:4:2
chr14	103986255	.	C	T	1718.15	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475767;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.085;QD=60.8194;RBI=0.0689055;REFB=0;REVB=0.0498439;RO=0;SAF=67;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015691;OID=.;OPOS=103986255;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:113:0:0:106:113:1:39:67:0:0:41:72:0:0
chr14	103988180	.	G	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.074909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5024;QD=33.4266;RBI=0.167916;REFB=0;REVB=0.150281;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0170151;OID=.;OPOS=103988180;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
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chr14	104001517	.	G	A	495.65	PASS	AF=0.921053;AO=35;DP=39;FAO=35;FDP=38;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00848154;FXX=0.0256345;HRUN=6;LEN=1;MLLD=185.57;QD=52.1732;RBI=0.0195932;REFB=-0.0990071;REVB=0.0176624;RO=2;SAF=30;SAR=5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301787;STB=0.523796;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.000778955;OID=.;OPOS=104001517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:39:38:2:3:35:35:0.921053:5:30:2:0:5:30:3:0
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chr14	104167075	.	C	T	486.93	PASS	AF=0.560976;AO=45;DP=82;FAO=46;FDP=82;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0747086;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1088;QD=23.7529;RBI=0.0749117;REFB=-0.0223254;REVB=0.00551249;RO=36;SAF=17;SAR=28;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190179;STB=0.607364;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0179567;OID=.;OPOS=104167075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:36:36:45:46:0.560976:28:17:22:14:29:17:22:14
chr14	104167545	.	G	A	146.81	PASS	AF=0.414634;AO=16;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0833431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9845;QD=14.3227;RBI=0.0928156;REFB=-0.021238;REVB=-0.0408493;RO=25;SAF=5;SAR=11;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403637;STB=0.568551;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0376429;OID=.;OPOS=104167545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:24:16:17:0.414634:11:5:7:18:11:6:6:18
chr14	104178186	.	A	G	149.16	PASS	AF=0.322581;AO=20;DP=62;FAO=20;FDP=62;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=0.00263595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.1531;QD=9.62339;RBI=0.0290315;REFB=0.00913663;REVB=-0.0289116;RO=42;SAF=13;SAR=7;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0089714;STB=0.505295;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=-0.0191882;OID=.;OPOS=104178186;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:42:42:20:20:0.322581:7:13:27:15:7:13:27:15
chr14	104178442	.	ACAG	ACAGGCCCGGCGTGGA,TGGA	378.92	PASS	AF=0.857143,0.142857;AO=16,4;DP=32;FAO=24,4;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14,4;FSAR=10,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00621998,0.00384927;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=12,4;MLLD=478.167,149.18;QD=54.132;RBI=0.0197704,0.0168042;REFB=0,0;REVB=0.0187665,0.0163574;RO=4;SAF=13,4;SAR=3,0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.121826,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,mnp;VARB=-0.000119888,0.00573015;OID=.,.;OPOS=104178446,104178442;OREF=-,ACAG;OALT=GCCCGGCGTGGA,TGGA;OMAPALT=ACAGGCCCGGCGTGGA,TGGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:32:28:4:0:16,4:24,4:0.857143,0.142857:3,0:13,4:4:0:10,0:14,4:0:0
chr14	104194196	.	C	G	2754.54	PASS	AF=0.994382;AO=177;DP=177;FAO=177;FDP=178;FR=.;FRO=1;FSAF=110;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0111122;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.271;QD=61.8997;RBI=0.0348794;REFB=-0.0878627;REVB=0.033062;RO=0;SAF=110;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503703;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.000248653;OID=.;OPOS=104194196;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:177:178:0:1:177:177:0.994382:67:110:0:0:67:110:0:1
chr14	104199356	.	C	T	639.02	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0279026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2097;QD=59.4439;RBI=0.0659639;REFB=-0.119609;REVB=0.059772;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.509799;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00286959;OID=.;OPOS=104199356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:43:43:0:1:42:42:0.976744:17:25:0:0:17:25:1:0
chr14	104429453	.	A	G	1134.18	PASS	AF=0.9625;AO=77;DP=80;FAO=77;FDP=80;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0180091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.17;QD=56.7092;RBI=0.0983988;REFB=-0.0418628;REVB=0.0967368;RO=2;SAF=32;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00415859;STB=0.503178;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.000622502;OID=.;OPOS=104429453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:80:80:2:3:77:77:0.9625:45:32:1:1:45:32:1:2
chr14	104465037	.	T	C	1357.88	PASS	AF=0.92;AO=90;DP=98;FAO=92;FDP=100;FR=.;FRO=8;FSAF=43;FSAR=49;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=0.0439394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3616;QD=54.3151;RBI=0.105262;REFB=0.00187958;REVB=0.0956525;RO=8;SAF=43;SAR=47;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0804174;STB=0.542544;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.000831548;OID=.;OPOS=104465037;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:98:100:8:8:90:92:0.92:47:43:8:0:49:43:8:0
chr14	104480201	.	C	A	1492.39	PASS	AF=0.990196;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0255933;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2425;QD=58.5253;RBI=0.0256094;REFB=-0.0508035;REVB=0.000908134;RO=1;SAF=46;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0102019;STB=0.505375;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.000212763;OID=.;OPOS=104480201;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:102:102:1:1:101:101:0.990196:55:46:1:0:55:46:1:0
chr14	104559623	.	T	C	1077.68	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0129877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.928;QD=59.8712;RBI=0.0961578;REFB=0;REVB=0.0952767;RO=0;SAF=40;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191029;OID=.;OPOS=104559623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:67:72:0:0:67:72:1:27:40:0:0:31:41:0:0
chr14	104641792	.	C	T	292.05	PASS	AF=0.555556;AO=30;DP=54;FAO=30;FDP=54;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00677548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.173;QD=21.6333;RBI=0.0355548;REFB=0.00458676;REVB=0.0349032;RO=22;SAF=24;SAR=6;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0818583;STB=0.559098;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=-0.00356782;OID=.;OPOS=104641792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:24:30:30:0.555556:6:24:16:6:6:24:17:7
chr14	104642341	.	A	G	655.52	PASS	AF=0.455782;AO=67;DP=147;FAO=67;FDP=147;FR=.;FRO=80;FSAF=14;FSAR=53;FSRF=19;FSRR=61;FWDB=-0.0235783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.567;QD=17.8372;RBI=0.0236497;REFB=-0.010391;REVB=-0.00183612;RO=80;SAF=14;SAR=53;SRF=19;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0410321;STB=0.522863;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.011473;OID=.;OPOS=104642341;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:80:80:67:67:0.455782:53:14:19:61:53:14:19:61
chr14	104643409	.	A	G	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.032452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.657;QD=9.75983;RBI=0.0347707;REFB=1.80216e-05;REVB=-0.0124848;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324104;STB=0.69515;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=-0.00117948;OID=.;OPOS=104643409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:4:3:9:3:4:3:9:3
chr14	104643421	.	T	C	46.01	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00342697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.064;QD=9.20251;RBI=0.0137441;REFB=-0.0216803;REVB=0.01331;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.272725;STB=0.666222;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0279243;OID=.;OPOS=104643421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:20:20:13:13:7:7:0.35:4:3:9:4:4:3:9:4
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chr14	104643859	.	A	G	162.15	PASS	AF=0.5;AO=15;DP=32;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.015705;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.203;QD=19.0763;RBI=0.0326785;REFB=-0.0212964;REVB=0.0286572;RO=17;SAF=9;SAR=6;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0458804;STB=0.559372;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0220664;OID=.;OPOS=104643859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:34:17:17:15:17:0.5:6:9:11:6:8:9:11:6
chr14	104644099	.	T	C	126.99	PASS	AF=0.666667;AO=13;DP=20;FAO=14;FDP=21;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.034171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.6;QD=24.1889;RBI=0.0469832;REFB=-0.0760448;REVB=-0.0322454;RO=7;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203985;STB=0.618887;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0414451;OID=.;OPOS=104644099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:20:21:7:7:13:14:0.666667:7:6:1:6:7:7:1:6
chr14	104646326	.	A	C	412.83	PASS	AF=0.629032;AO=40;DP=63;FAO=39;FDP=62;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=28;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00517811;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.732;QD=26.6343;RBI=0.0135181;REFB=-0.0411521;REVB=0.0124871;RO=22;SAF=11;SAR=29;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167684;STB=0.583288;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0250528;OID=.;OPOS=104646326;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:22:23:40:39:0.629032:29:11:11:11:28:11:11:12
chr14	104646448	.	G	A	393.44	PASS	AF=0.431373;AO=44;DP=102;FAO=44;FDP=102;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=37;FWDB=0.0333346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.875;QD=15.4292;RBI=0.0866587;REFB=-0.0180636;REVB=0.0799909;RO=58;SAF=25;SAR=19;SRF=21;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20634;STB=0.615604;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0198821;OID=.;OPOS=104646448;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:58:58:44:44:0.431373:19:25:21:37:19:25:21:37
chr14	104646771	.	T	C	211.72	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0157148;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2453;QD=19.6951;RBI=0.0607014;REFB=-0.000931041;REVB=-0.0586319;RO=22;SAF=11;SAR=10;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226349;STB=0.627078;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=-0.000285007;OID=.;OPOS=104646771;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:10:11:6:16:10:11:6:16
chr14	104647224	.	C	T	405.59	PASS	AF=0.493976;AO=41;DP=84;FAO=41;FDP=83;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0307027;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1985;QD=19.5466;RBI=0.0319414;REFB=-0.0104612;REVB=-0.00880925;RO=43;SAF=22;SAR=19;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199729;STB=0.505615;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.00982988;OID=.;OPOS=104647224;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:43:42:41:41:0.493976:19:22:24:19:19:22:23:19
chr14	104710651	.	C	T	90.35	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00407777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5505;QD=16.4266;RBI=0.0309797;REFB=0.0147135;REVB=0.0307102;RO=11;SAF=10;SAR=1;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.5401;STB=0.822802;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.0134457;OID=.;OPOS=104710651;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:1:10:5:6:1:10:5:6
chr14	105058498	.	A	G	759.81	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00901807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.504;QD=53.3201;RBI=0.0472768;REFB=-0.107113;REVB=0.0464087;RO=2;SAF=30;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303913;STB=0.516123;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00165018;OID=.;OPOS=105058498;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:57:57:2:2:55:55:0.964912:25:30:2:0:25:30:2:0
chr14	105070791	.	G	T	88.2	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0917156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2462;QD=39.2009;RBI=0.128038;REFB=0;REVB=0.0893425;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000138982;OID=.;OPOS=105070791;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr14	105167807	.	C	T	1153.17	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0125072;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=175.915;QD=60.6933;RBI=0.0256283;REFB=0;REVB=0.0223692;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.84902e-05;OID=.;OPOS=105167807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:35:41:0:0:35:41:0:0
chr14	105177351	.	CA	C,CG	2272.7	PASS	AF=0.974026,0.025974;AO=123,27;DP=153;FAO=150,4;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=64,0;FSAR=86,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00703721,0.0152729;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=71.3283,61.1654;QD=59.0311;RBI=0.0118587,0.0289945;REFB=0,0;REVB=-0.00954501,-0.024646;RO=0;SAF=63,0;SAR=60,27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000623827,0.0171805;OID=.,.;OPOS=105177352,105177352;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.974026,0.025974:123,27:153:150,4:154:0:64,0:86,4:0:0:7:0:63,0:60,27:0:0
chr14	105179194	.	T	C	1877.85	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.394;QD=61.5689;RBI=0.0309795;REFB=0;REVB=0.022069;RO=0;SAF=75;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04499e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8384e-05;OID=.;OPOS=105179194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:122:0:0:121:122:1:46:75:0:0:46:76:0:0
chr14	105180565	.	T	C	967.84	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0474988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1464;QD=58.6567;RBI=0.0599561;REFB=0;REVB=-0.0365869;RO=0;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000568107;OID=.;OPOS=105180565;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:33:32:0:0:33:33:0:0
chr14	105180706	.	A	C	820.53	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.151;QD=56.588;RBI=0.0122296;REFB=0;REVB=-0.00310931;RO=0;SAF=24;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103287;OID=.;OPOS=105180706;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:58:0:0:55:58:1:31:24:0:0:34:24:0:0
chr14	105196230	.	A	C	47.66	PASS	AF=0.4375;AO=6;DP=15;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0455416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.263;QD=11.9159;RBI=0.107378;REFB=-0.0208463;REVB=0.0972424;RO=9;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.504538;STB=0.805709;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0176012;OID=.;OPOS=105196230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:16:9:9:6:7:0.4375:4:2:8:1:5:2:8:1
chr14	105196235	.	G	A	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0236908;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=189.545;QD=15.2927;RBI=0.0931943;REFB=-0.0123366;REVB=0.0901328;RO=9;SAF=3;SAR=6;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.448105;STB=0.758111;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0167021;OID=.;OPOS=105196235;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:6:3:8:1:6:3:8:1
chr14	105196365	.	T	C	528.72	PASS	AF=0.44186;AO=57;DP=129;FAO=57;FDP=129;FR=.;FRO=72;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=-0.0320872;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.8715;QD=16.3943;RBI=0.0496432;REFB=-0.00326234;REVB=-0.0378795;RO=72;SAF=26;SAR=31;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112888;STB=0.563003;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00311854;OID=.;OPOS=105196365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:72:72:57:57:0.44186:31:26:41:31:31:26:41:31
chr14	105205649	.	T	TC	64.25	PASS	AF=0.25;AO=10;DP=45;FAO=11;FDP=44;FR=.;FRO=33;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=-0.0976502;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=31.7009;QD=5.84115;RBI=0.141418;REFB=-0.00350979;REVB=-0.102291;RO=34;SAF=2;SAR=8;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.543044;STB=0.85493;STBP=0.014;TYPE=ins;VARB=-0.0155452;OID=.;OPOS=105205650;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.25:10:45:11:44:33:2:9:23:10:64:34:2:8:23:11
chr14	105211221	.	C	T	190.7	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.00863803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.597;QD=15.2556;RBI=0.00897127;REFB=-0.0038283;REVB=-0.00242242;RO=28;SAF=12;SAR=8;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208877;STB=0.637661;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00448278;OID=.;OPOS=105211221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:30:20:20:0.4:8:12:11:17:8:12:11:19
chr14	105213343	.	A	G	291.2	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.055892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0401;QD=17.1296;RBI=0.0561569;REFB=-0.0213511;REVB=0.00544733;RO=36;SAF=21;SAR=11;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205141;STB=0.615238;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.0251507;OID=.;OPOS=105213343;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:11:21:16:20:11:21:16:20
chr14	105220209	.	G	GA	425.47	PASS	AF=0.425197;AO=18;DP=145;FAO=54;FDP=127;FR=.;FRO=73;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=-0.0205673;FXX=0.0863247;HRUN=0;LEN=1;MLLD=222.973;QD=13.4006;RBI=0.0462593;REFB=0.0127457;REVB=-0.0414356;RO=125;SAF=14;SAR=4;SRF=49;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.459817;STB=0.54688;STBP=0.372;TYPE=ins;VARB=-0.0213467;OID=.;OPOS=105220210;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.425197:18:145:54:127:73:23:31:37:36:99:125:14:4:49:76
chr14	105220210	.	G	A	333.95	PASS	AF=0.304965;AO=42;DP=141;FAO=43;FDP=141;FR=.;FRO=98;FSAF=8;FSAR=35;FSRF=55;FSRR=43;FWDB=0.00494901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.774;QD=9.47386;RBI=0.00536937;REFB=-0.015276;REVB=0.00208263;RO=93;SAF=8;SAR=34;SRF=52;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.463999;STB=0.77929;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0301314;OID=.;OPOS=105220210;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:93:98:42:43:0.304965:34:8:52:41:35:8:55:43
chr14	105222037	.	C	T	1373.0	PASS	AF=0.625;AO=119;DP=192;FAO=120;FDP=192;FR=.;FRO=72;FSAF=60;FSAR=60;FSRF=41;FSRR=31;FWDB=0.025446;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.687;QD=28.6041;RBI=0.0361895;REFB=-0.00345857;REVB=0.0257328;RO=72;SAF=59;SAR=60;SRF=41;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0514083;STB=0.526037;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.00227775;OID=.;OPOS=105222037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:192:192:72:72:119:120:0.625:60:59:41:31:60:60:41:31
chr14	105267579	.	A	G	50.48	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.030184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.132;QD=16.8274;RBI=0.0641979;REFB=-0.0187177;REVB=-0.0566595;RO=5;SAF=4;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258094;STB=0.650752;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0154007;OID=.;OPOS=105267579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:12:12:5:5:7:7:0.583333:3:4:1:4:3:4:1:4
chr14	105268228	.	G	A	188.82	PASS	AF=0.692308;AO=17;DP=25;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.00134332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3488;QD=29.0489;RBI=0.0119347;REFB=-0.0137681;REVB=0.0118589;RO=7;SAF=10;SAR=7;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694714;STB=0.504499;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00238028;OID=.;OPOS=105268228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:25:26:7:8:17:18:0.692308:7:10:5:2:7:11:5:3
chr14	105269779	.	T	C	206.11	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.0174229;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.432;QD=16.825;RBI=0.0266529;REFB=-0.0182783;REVB=-0.0201698;RO=28;SAF=15;SAR=6;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264588;STB=0.652023;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0238821;OID=.;OPOS=105269779;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:6:15:13:15:6:15:13:15
chr14	105360100	.	GA	G,GC	33.3	PASS	AF=0.290323,0;AO=9,4;DP=31;FAO=9,0;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=8,0;FSAR=1,0;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.109397,-0.0959188;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=58.7257,81.1533;QD=4.2972;RBI=0.142319,0.106648;REFB=-0.0294264,-0.0682917;REVB=0.0910328,0.0466193;RO=17;SAF=8,4;SAR=1,0;SRF=3;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.699593,0.777682;STB=0.894249,0.5;STBP=0.013,1;TYPE=del,snp;VARB=0.11401,0.104425;OID=.,.;OPOS=105360101,105360101;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.290323,0:9,4:31:9,0:31:22:8,0:1,0:7:15:34:17:8,4:1,0:3:14
chr14	105393556	.	G	C	377.36	PASS	AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=28;FSRF=26;FSRR=7;FWDB=-0.0403296;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5416;QD=21.26;RBI=0.0414572;REFB=-0.0180115;REVB=0.00960332;RO=33;SAF=10;SAR=28;SRF=26;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.438332;STB=0.742141;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0129863;OID=.;OPOS=105393556;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:28:10:26:7:28:10:26:7
chr14	105398450	.	T	TC	63.39	PASS	AF=0.7;AO=10;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.118191;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=32.318;QD=12.6775;RBI=0.12243;REFB=-0.02899;REVB=0.0319379;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0858363;STB=0.521708;STBP=0.724;TYPE=ins;VARB=0.195426;OID=.;OPOS=105398451;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.7:10:20:14:20:6:8:6:3:3:36:10:5:5:6:4
chr14	105405599	.	G	C	317.01	PASS	AF=0.478873;AO=34;DP=71;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.00478022;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.11;QD=17.8595;RBI=0.008179;REFB=-0.0165272;REVB=0.00663669;RO=37;SAF=12;SAR=22;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104657;STB=0.558634;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0159686;OID=.;OPOS=105405599;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:37:37:34:34:0.478873:22:12:17:20:22:12:17:20
chr14	105405942	.	G	A	292.77	PASS	AF=0.384615;AO=31;DP=88;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=29;FWDB=0.0571178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.391;QD=12.8688;RBI=0.061382;REFB=-0.0358864;REVB=-0.022479;RO=54;SAF=14;SAR=17;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126309;STB=0.519763;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0570204;OID=.;OPOS=105405942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:91:54:56:31:35:0.384615:17:14:25:29:17:18:27:29
chr14	105406238	.	A	C	136.15	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.00712141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.466;QD=17.5674;RBI=0.00777283;REFB=0.0011521;REVB=-0.00311487;RO=16;SAF=8;SAR=7;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.366125;STB=0.705648;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.0012062;OID=.;OPOS=105406238;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:7:8:2:14:7:8:2:14
chr14	105407031	.	A	G	123.13	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.0270416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.025;QD=16.417;RBI=0.0454108;REFB=-0.0339713;REVB=0.0364815;RO=16;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0380144;OID=.;OPOS=105407031;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:7:7:8:8:7:7:8:8
chr14	105407208	.	T	C	198.7	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=0.0124452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9023;QD=19.3856;RBI=0.0187424;REFB=-0.0207395;REVB=0.014014;RO=20;SAF=15;SAR=5;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568813;STB=0.523785;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0222978;OID=.;OPOS=105407208;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:21:20:20:0.487805:5:15:14:6:5:15:15:6
chr14	105407798	.	T	C	112.22	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.014303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.702;QD=16.6251;RBI=0.0193629;REFB=0.0281781;REVB=0.0130516;RO=14;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.034656;STB=0.519969;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.0355087;OID=.;OPOS=105407798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:14:14:13:13:0.481481:7:6:7:7:7:6:7:7
chr14	105408030	.	A	G	191.55	PASS	AF=0.408163;AO=20;DP=49;FAO=20;FDP=49;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0176431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.777;QD=15.6371;RBI=0.034785;REFB=-0.00650487;REVB=-0.0299786;RO=29;SAF=7;SAR=13;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106623;STB=0.561492;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0144825;OID=.;OPOS=105408030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:29:20:20:0.408163:13:7:13:16:13:7:13:16
chr14	105408182	.	T	G	271.11	PASS	AF=0.666667;AO=24;DP=36;FAO=24;FDP=36;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00814172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.827;QD=30.1238;RBI=0.0191696;REFB=-0.0510073;REVB=0.0173547;RO=12;SAF=9;SAR=15;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788774;STB=0.543441;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0370813;OID=.;OPOS=105408182;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:36:36:12:12:24:24:0.666667:15:9:6:6:15:9:6:6
chr14	105408315	.	T	C	520.16	PASS	AF=0.538462;AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=91;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.0234333;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=83.282;QD=22.8644;RBI=0.0234508;REFB=0.0195847;REVB=0.000906661;RO=41;SAF=29;SAR=20;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468824;STB=0.520949;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.0210704;OID=.;OPOS=105408315;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:41:42:49:49:0.538462:20:29:22:19:20:29:23:19
chr14	105408811	.	A	G	262.09	PASS	AF=0.585366;AO=23;DP=40;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0227923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1028;QD=25.5698;RBI=0.0453602;REFB=-0.0055236;REVB=-0.0392181;RO=17;SAF=19;SAR=4;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253676;STB=0.646919;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.00486011;OID=.;OPOS=105408811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:17:17:23:24:0.585366:4:19:10:7:4:20:10:7
chr14	105408827	.	A	C	259.66	PASS	AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=20;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0726059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2071;QD=24.7299;RBI=0.0740808;REFB=-0.0577729;REVB=0.0147087;RO=18;SAF=20;SAR=4;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247509;STB=0.639403;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.055107;OID=.;OPOS=105408827;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:4:20:11:7:4:20:11:7
chr14	105408955	.	A	G	146.37	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.033828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.581;QD=16.7276;RBI=0.0648158;REFB=-0.0262258;REVB=-0.055288;RO=19;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842285;STB=0.548326;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0311624;OID=.;OPOS=105408955;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:9:7:10:9:9:7:10:9
chr14	105409959	.	G	T	375.16	PASS	AF=0.39823;AO=43;DP=111;FAO=45;FDP=113;FR=.;FRO=68;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=41;FSRR=27;FWDB=0.0783968;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.1966;QD=13.2798;RBI=0.121735;REFB=-0.00726432;REVB=0.0931304;RO=68;SAF=30;SAR=13;SRF=41;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114331;STB=0.574214;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0127672;OID=.;OPOS=105409959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:113:68:68:43:45:0.39823:13:30:41:27:13:32:41:27
chr14	105410183	.	T	C	183.87	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0114688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.546;QD=17.9388;RBI=0.0185674;REFB=-0.0190373;REVB=0.0146019;RO=22;SAF=6;SAR=13;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304272;STB=0.673391;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0269322;OID=.;OPOS=105410183;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:13:6:14:8:13:6:14:8
chr14	105410775	.	A	G	131.64	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0235023;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.283;QD=16.9857;RBI=0.0511908;REFB=-0.00463244;REVB=-0.0454768;RO=16;SAF=4;SAR=11;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384167;STB=0.720226;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00610533;OID=.;OPOS=105410775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:11:4:11:5:11:4:11:5
chr14	105410827	.	C	T	144.77	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.014461;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.961;QD=15.6509;RBI=0.0174858;REFB=-0.00318251;REVB=0.00983027;RO=21;SAF=6;SAR=10;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282106;STB=0.662054;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00491235;OID=.;OPOS=105410827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:10:6:14:7:10:6:14:7
chr14	105411700	.	A	G	178.93	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.039339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1686;QD=15.2285;RBI=0.039339;REFB=-0.0189952;REVB=-2.92837e-05;RO=28;SAF=11;SAR=8;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00794639;STB=0.504582;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.0130826;OID=.;OPOS=105411700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:8:11:16:12:8:11:16:12
chr14	105411781	.	G	A	223.56	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.00370433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.887;QD=14.9037;RBI=0.0282327;REFB=-0.00231776;REVB=0.0279886;RO=34;SAF=20;SAR=6;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839802;STB=0.547907;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.00441027;OID=.;OPOS=105411781;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:34:34:26:26:0.433333:6:20:24:10:6:20:24:10
chr14	105412066	.	C	T	33.51	PASS	AF=0.153846;AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.054892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0386;QD=3.43651;RBI=0.0632711;REFB=0.00148525;REVB=-0.0314658;RO=33;SAF=1;SAR=5;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.376593;STB=0.775687;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=-0.0228815;OID=.;OPOS=105412066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:39:39:33:33:6:6:0.153846:5:1:15:18:5:1:15:18
chr14	105412259	.	GG	CC	261.8	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0330446;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=91.6458;QD=17.167;RBI=0.0352732;REFB=-0.0118324;REVB=0.0123391;RO=32;SAF=11;SAR=18;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864879;STB=0.548618;STBP=0.483;TYPE=mnp;VARB=0.0140069;OID=.;OPOS=105412259;OREF=GG;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:18:11:15:17:18:11:15:17
chr14	105412561	.	C	T	70.49	PASS	AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=-0.000834603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.726;QD=7.04919;RBI=0.0149448;REFB=-0.00522424;REVB=-0.0149215;RO=30;SAF=8;SAR=2;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.503789;STB=0.814923;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00815302;OID=.;OPOS=105412561;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:40:40:30:30:10:10:0.25:2:8:11:19:2:8:11:19
chr14	105413204	.	G	T	346.76	PASS	AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0151716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.805;QD=22.3718;RBI=0.0404123;REFB=-0.0236475;REVB=0.0374563;RO=27;SAF=16;SAR=19;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101078;STB=0.505573;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0192489;OID=.;OPOS=105413204;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:27:27:35:35:0.564516:19:16:12:15:19:16:12:15
chr14	105413223	.	A	G	422.65	PASS	AF=0.531646;AO=42;DP=79;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=-0.0160887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.38;QD=21.3999;RBI=0.0182678;REFB=-0.0110749;REVB=-0.00865269;RO=34;SAF=19;SAR=23;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110113;STB=0.54132;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0124641;OID=.;OPOS=105413223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:34:37:42:42:0.531646:23:19:20:14:23:19:20:17
chr14	105414238	.	C	A	81.95	PASS	AF=0.261905;AO=11;DP=43;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.014522;FXX=0.0232504;HRUN=3;LEN=1;MLLD=228.096;QD=7.80494;RBI=0.0290681;REFB=-0.00633276;REVB=0.0251807;RO=31;SAF=6;SAR=5;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0816562;STB=0.55057;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0148703;OID=.;OPOS=105414238;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:43:42:31:31:11:11:0.261905:5:6:19:12:5:6:19:12
chr14	105414252	.	C	T	72.18	PASS	AF=0.25;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.235985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.5085;QD=7.2183;RBI=0.24849;REFB=0.00372529;REVB=0.0778366;RO=19;SAF=3;SAR=7;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201317;STB=0.6996;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00749806;OID=.;OPOS=105414252;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:40:40:19:30:10:10:0.25:7:3:6:13:7:3:17:13
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chr14	105414629	.	G	A	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00336843;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.176;QD=17.1566;RBI=0.0200959;REFB=-0.015417;REVB=0.0198116;RO=19;SAF=7;SAR=10;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293785;STB=0.652002;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0152248;OID=.;OPOS=105414629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:20:17:17:0.459459:10:7:14:5:10:7:14:6
chr14	105414790	.	A	G	301.78	PASS	AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0341013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8951;QD=17.0018;RBI=0.047355;REFB=0.0133668;REVB=-0.0328572;RO=37;SAF=11;SAR=22;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226888;STB=0.621284;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=-0.0328362;OID=.;OPOS=105414790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:37:38:33:33:0.464789:22:11:21:16:22:11:21:17
chr14	105414810	.	C	G	322.9	PASS	AF=0.507463;AO=34;DP=67;FAO=34;FDP=67;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.068721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.565;QD=19.2775;RBI=0.0689405;REFB=-0.0215394;REVB=0.00549618;RO=33;SAF=11;SAR=23;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205505;STB=0.614677;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0197357;OID=.;OPOS=105414810;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:33:33:34:34:0.507463:23:11:18:15:23:11:18:15
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chr14	105415469	.	T	C	753.82	PASS	AF=0.537313;AO=72;DP=136;FAO=72;FDP=134;FR=.;FRO=62;FSAF=48;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.0209543;FXX=0.0147048;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.4717;QD=22.5021;RBI=0.0230976;REFB=-0.00844195;REVB=-0.00971674;RO=62;SAF=48;SAR=24;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107678;STB=0.559123;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00615059;OID=.;OPOS=105415469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:134:62:62:72:72:0.537313:24:48:34:28:24:48:34:28
chr14	105415497	.	T	C	107.74	PASS	AF=0.173913;AO=20;DP=115;FAO=20;FDP=115;FR=.;FRO=95;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=64;FSRR=31;FWDB=0.013172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.713;QD=3.74753;RBI=0.0232548;REFB=-0.00099682;REVB=0.0191646;RO=95;SAF=8;SAR=12;SRF=64;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.339146;STB=0.71504;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.00480243;OID=.;OPOS=105415497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:115:95:95:20:20:0.173913:12:8:64:31:12:8:64:31
chr14	105415577	.	G	A	83.66	PASS	AF=0.202899;AO=14;DP=69;FAO=14;FDP=69;FR=.;FRO=55;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=0.0293098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9504;QD=4.84994;RBI=0.0293454;REFB=-0.00770865;REVB=-0.00144363;RO=55;SAF=8;SAR=6;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602451;STB=0.538408;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0387216;OID=.;OPOS=105415577;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:69:69:55:55:14:14:0.202899:6:8:34:21:6:8:34:21
chr14	105415587	.	G	A	87.96	PASS	AF=0.236364;AO=12;DP=54;FAO=13;FDP=55;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.00569676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.816;QD=6.397;RBI=0.0218912;REFB=-0.00352265;REVB=0.021137;RO=42;SAF=7;SAR=5;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0455095;STB=0.502954;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00983107;OID=.;OPOS=105415587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:54:55:42:42:12:13:0.236364:5:7:26:16:5:8:26:16
chr14	105415607	.	C	G	40.51	PASS	AF=0.145833;AO=7;DP=48;FAO=7;FDP=48;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=-0.0131475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.843;QD=3.37603;RBI=0.0180167;REFB=-0.0083652;REVB=0.0123185;RO=41;SAF=6;SAR=1;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28238;STB=0.711153;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0340602;OID=.;OPOS=105415607;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:48:48:41:41:7:7:0.145833:1:6:28:13:1:6:28:13
chr14	105415608	.	G	C	164.41	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=6;FWDB=-0.0165557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.55;QD=13.7005;RBI=0.0178018;REFB=-0.00764523;REVB=0.00654332;RO=30;SAF=10;SAR=8;SRF=24;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280215;STB=0.66004;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0123234;OID=.;OPOS=105415608;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:8:10:24:6:8:10:24:6
chr14	105415659	.	G	A	72.34	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.0139509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0598;QD=8.51052;RBI=0.0459886;REFB=-0.0150362;REVB=0.0438215;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293146;STB=0.676161;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0195078;OID=.;OPOS=105415659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:5:5:18:6:5:5:18:6
chr14	105416010	.	T	C	176.65	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.00458662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.43;QD=14.132;RBI=0.0379692;REFB=-0.0115339;REVB=-0.0376911;RO=30;SAF=11;SAR=8;SRF=20;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971105;STB=0.563812;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.0197967;OID=.;OPOS=105416010;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:30:31:19:19:0.38:8:11:20:10:8:11:21:10
chr14	105416087	.	C	T	196.67	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=61;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0522076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7582;QD=12.8965;RBI=0.0545777;REFB=-0.00858032;REVB=0.0159087;RO=33;SAF=12;SAR=12;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107802;STB=0.590091;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00600608;OID=.;OPOS=105416087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:37:24:24:0.393443:12:12:20:13:12:12:24:13
chr14	105416220	.	T	A	251.08	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.00322133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.748;QD=19.6925;RBI=0.00866973;REFB=-0.0214292;REVB=0.00804905;RO=25;SAF=14;SAR=12;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190037;STB=0.51063;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0197478;OID=.;OPOS=105416220;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:12:14:14:11:12:14:14:11
chr14	105416230	.	A	G	275.56	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0626952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4392;QD=20.4119;RBI=0.0644734;REFB=-0.0621388;REVB=-0.0150374;RO=25;SAF=15;SAR=14;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00229955;STB=0.501278;STBP=0.976;TYPE=snp;VARB=0.0258827;OID=.;OPOS=105416230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:14:15:13:12:14:15:13:12
chr14	105416685	.	C	G	234.99	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=0.0220852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6633;QD=15.4089;RBI=0.137271;REFB=-0.00771333;REVB=-0.135483;RO=34;SAF=14;SAR=13;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24768;STB=0.638727;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00737539;OID=.;OPOS=105416685;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:13:14:26:8:13:14:26:8
chr14	105416784	.	A	G	144.11	PASS	AF=0.298507;AO=20;DP=67;FAO=20;FDP=67;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=-0.00772419;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=84.6421;QD=8.60353;RBI=0.0492923;REFB=-0.00673579;REVB=-0.0486834;RO=47;SAF=12;SAR=8;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158682;STB=0.593461;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.015281;OID=.;OPOS=105416784;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:47:47:20:20:0.298507:8:12:34:13:8:12:34:13
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chr14	105416872	.	T	C	138.61	PASS	AF=0.306452;AO=19;DP=63;FAO=19;FDP=62;FR=.;FRO=43;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.026509;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.81;QD=8.94276;RBI=0.0614162;REFB=-0.0252865;REVB=-0.0554006;RO=44;SAF=12;SAR=7;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00603225;STB=0.502729;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0501998;OID=.;OPOS=105416872;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:44:43:19:19:0.306452:7:12:28:16:7:12:27:16
chr14	105416959	.	A	G	196.8	PASS	AF=0.42;AO=20;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0199371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.49;QD=15.7441;RBI=0.0526738;REFB=-0.012024;REVB=-0.0487549;RO=29;SAF=11;SAR=9;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0338792;STB=0.531761;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0208155;OID=.;OPOS=105416959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:20:21:0.42:9:11:15:14:9:12:15:14
chr14	105416971	.	T	G	192.47	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0145211;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.675;QD=16.3805;RBI=0.0178036;REFB=-0.0144442;REVB=-0.0103007;RO=27;SAF=11;SAR=9;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0056272;STB=0.503223;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0271393;OID=.;OPOS=105416971;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:27:27:20:20:0.425532:9:11:15:12:9:11:15:12
chr14	105417102	.	T	C	118.04	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00638596;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.542;QD=11.2418;RBI=0.0110764;REFB=-0.00955393;REVB=-0.00905017;RO=25;SAF=7;SAR=7;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216762;STB=0.523776;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0292999;OID=.;OPOS=105417102;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:25:28:14:14:0.333333:7:7:13:12:7:7:15:13
chr14	105417147	.	A	G	176.65	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.00200135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.38;QD=14.1321;RBI=0.0063014;REFB=-0.00527549;REVB=-0.00597514;RO=31;SAF=7;SAR=12;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.321754;STB=0.685527;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.011837;OID=.;OPOS=105417147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:31:31:19:19:0.38:12:7:21:10:12:7:21:10
chr14	105417765	.	AG	AA,CA	122.92	PASS	AF=0.470588,0;AO=2,14;DP=34;FAO=16,0;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=6,0;FSAR=10,0;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.0181909,0.00940093;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=232.951,218.507;QD=14.4605;RBI=0.0216369,0.00966623;REFB=-0.0430367,-0.0359638;REVB=0.0117151,-0.00224911;RO=18;SAF=1,5;SAR=1,9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-0.143297;STB=0.568095,0.5;STBP=0.454,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0677269,0;OID=.,.;OPOS=105417766,105417765;OREF=G,AG;OALT=A,CA;OMAPALT=AA,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:2,14:16,0:0.470588,0:1,9:1,5:9:9:10,0:6,0:9:9
chr14	105417768	.	C	A	110.16	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0130443;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.493;QD=13.7698;RBI=0.01333;REFB=-0.0273141;REVB=0.00274521;RO=19;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123637;STB=0.507235;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0253396;OID=.;OPOS=105417768;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:32:19:19:13:13:0.40625:7:6:9:10:7:6:9:10
chr14	105417774	.	G	A	148.13	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0199293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.264;QD=17.9553;RBI=0.045195;REFB=-0.000148225;REVB=0.0405636;RO=17;SAF=7;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236638;STB=0.513497;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.000382508;OID=.;OPOS=105417774;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:9:7:7:10:9:7:7:10
chr14	105417837	.	A	G	144.47	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0134198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.181;QD=15.618;RBI=0.0233896;REFB=-0.0124427;REVB=0.0191567;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0851303;STB=0.549091;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0154309;OID=.;OPOS=105417837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:9:7:11:10:9:7:11:10
chr14	105417894	.	C	G	183.9	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0145021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.878;QD=17.9413;RBI=0.0203208;REFB=-0.0180307;REVB=0.0142345;RO=22;SAF=7;SAR=12;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250898;STB=0.642708;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0136353;OID=.;OPOS=105417894;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:12:7:14:8:12:7:14:8
chr14	105418194	.	A	G	242.15	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0163403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.307;QD=16.9928;RBI=0.023071;REFB=-0.00709178;REVB=-0.0162869;RO=30;SAF=22;SAR=5;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38526;STB=0.719445;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0155171;OID=.;OPOS=105418194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:5:22:14:16:5:22:14:16
chr14	105418264	.	G	A	325.76	PASS	AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.000560106;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.411;QD=24.1305;RBI=0.00874099;REFB=-0.0156985;REVB=-0.00872303;RO=22;SAF=23;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215397;STB=0.619152;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00959832;OID=.;OPOS=105418264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:22:32:32:0.592593:9:23:10:12:9:23:10:12
chr14	105418344	.	T	G	188.1	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0506126;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.138;QD=19.2927;RBI=0.0524847;REFB=0.013595;REVB=0.0138927;RO=19;SAF=10;SAR=9;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467664;STB=0.512182;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=-0.0155256;OID=.;OPOS=105418344;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:19:20:19:19:0.487179:9:10:11:8:9:10:11:9
chr14	105418391	.	C	T	278.31	PASS	AF=0.595238;AO=25;DP=42;FAO=25;FDP=42;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0319386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.619;QD=26.506;RBI=0.051458;REFB=-0.0461033;REVB=0.0403466;RO=16;SAF=15;SAR=10;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653582;STB=0.545419;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.018641;OID=.;OPOS=105418391;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:16:17:25:25:0.595238:10:15:11:5:10:15:12:5
chr14	105418502	.	G	T	72.53	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.00159852;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.094;QD=8.53279;RBI=0.00163278;REFB=-0.0113043;REVB=0.000332718;RO=23;SAF=4;SAR=6;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138861;STB=0.5998;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0290365;OID=.;OPOS=105418502;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:34:23:24:10:10:0.294118:6:4:12:11:6:4:13:11
chr14	105418504	.	G	T	82.3	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.011214;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=118.942;QD=9.40534;RBI=0.0131515;REFB=-0.00114091;REVB=-0.00687076;RO=24;SAF=5;SAR=6;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0980574;STB=0.559478;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0186906;OID=.;OPOS=105418504;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:35:35:24:24:11:11:0.314286:6:5:13:11:6:5:13:11
chr14	105418535	.	C	G	42.14	PASS	AF=0.189189;AO=7;DP=37;FAO=7;FDP=37;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0189804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.594;QD=4.55553;RBI=0.0242745;REFB=-0.0112116;REVB=-0.0151326;RO=30;SAF=4;SAR=3;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.085884;STB=0.557973;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.045835;OID=.;OPOS=105418535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:37:37:30:30:7:7:0.189189:3:4:15:15:3:4:15:15
chr14	105418638	.	A	G	156.13	PASS	AF=0.386364;AO=16;DP=45;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=-0.00552142;FXX=0.0434688;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.892;QD=14.1938;RBI=0.013919;REFB=0.00119165;REVB=0.0127771;RO=29;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0264837;STB=0.526432;STBP=0.807;TYPE=snp;VARB=-0.00233359;OID=.;OPOS=105418638;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:29:27:16:17:0.386364:7:9:17:12:7:10:17:10
chr14	105419234	.	T	C	232.21	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0271535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6496;QD=23.2207;RBI=0.0289539;REFB=0.00227014;REVB=-0.0100506;RO=17;SAF=12;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126138;STB=0.520529;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=-0.00218272;OID=.;OPOS=105419234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:17:18:22:22:0.55:10:12:9:8:10:12:9:9
chr14	105419557	.	G	A	158.7	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0122052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=303.717;QD=17.1564;RBI=0.0122797;REFB=-0.00336277;REVB=0.00135044;RO=19;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.051485;STB=0.515905;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.00308141;OID=.;OPOS=105419557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:20:17:17:0.459459:8:9:9:10:8:9:10:10
chr14	105419559	.	A	G	40.6	PASS	AF=0.472222;AO=18;DP=34;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0125923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.7136;QD=4.51102;RBI=0.072964;REFB=-0.101454;REVB=-0.0718692;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0983768;STB=0.588131;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.410848;OID=.;OPOS=105419559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:34:36:16:19:18:17:0.472222:8:10:7:9:7:10:8:11
chr14	105419568	.	A	G	162.52	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00935727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.913;QD=19.699;RBI=0.0359776;REFB=-0.00232849;REVB=-0.0347394;RO=16;SAF=12;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243487;STB=0.638613;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00294617;OID=.;OPOS=105419568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:16:17:17:0.515152:5:12:7:9:5:12:7:9
chr14	105420215	.	T	C	414.48	PASS	AF=0.639344;AO=39;DP=62;FAO=39;FDP=61;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0138118;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.445;QD=27.1788;RBI=0.0146012;REFB=-0.0213065;REVB=0.00473599;RO=22;SAF=21;SAR=18;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055512;STB=0.530287;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0152785;OID=.;OPOS=105420215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:22:22:39:39:0.639344:18:21:10:12:18:21:10:12
chr14	105609335	.	A	G	670.24	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.751;QD=62.3476;RBI=0.0892272;REFB=0;REVB=-0.0881588;RO=0;SAF=25;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.98888e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148932;OID=.;OPOS=105609335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:17:25:0:0:17:26:0:0
chr14	105611282	.	A	G	708.55	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00930852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.533;QD=62.9825;RBI=0.0247134;REFB=0;REVB=0.0228933;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.55629e-05;OID=.;OPOS=105611282;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr14	105615648	.	C	T	1339.55	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.129;QD=62.3047;RBI=0.0339635;REFB=0;REVB=-0.00515703;RO=0;SAF=43;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.70988e-05;OID=.;OPOS=105615648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:43:43:0:0:43:43:0:0
chr14	105643619	.	G	A	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244811;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=173.385;QD=55.6559;RBI=0.0534397;REFB=0;REVB=0.0475024;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000189602;OID=.;OPOS=105643619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr14	105643652	.	A	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0174759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.089;QD=46.8479;RBI=0.0438532;REFB=0;REVB=0.0402206;RO=0;SAF=11;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000441696;OID=.;OPOS=105643652;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:4:11:0:0:4:11:0:0
chr14	105716034	.	C	T	207.18	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0175245;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.894;QD=24.3737;RBI=0.0290631;REFB=0.00246376;REVB=-0.0231852;RO=14;SAF=15;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.31575;STB=0.677231;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.00132568;OID=.;OPOS=105716034;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:5:15:5:9:5:15:5:9
chr14	105722726	.	T	C	187.32	PASS	AF=0.575758;AO=17;DP=31;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0781309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.565;QD=22.7053;RBI=0.0789475;REFB=-0.0416705;REVB=0.0113257;RO=14;SAF=13;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124478;STB=0.519979;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0318948;OID=.;OPOS=105722726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:33:14:14:17:19:0.575758:4:13:9:5:6:13:9:5
chr14	105916420	.	C	T	1179.32	PASS	AF=0.952381;AO=80;DP=84;FAO=80;FDP=84;FR=.;FRO=4;FSAF=41;FSAR=39;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0510018;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=81.3718;QD=56.1583;RBI=0.0673646;REFB=0.0269124;REVB=0.0440091;RO=4;SAF=41;SAR=39;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0214091;STB=0.51132;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=-0.000358987;OID=.;OPOS=105916420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:84:84:4:4:80:80:0.952381:39:41:3:1:39:41:3:1
chr14	105930406	.	G	A	223.79	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00945757;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.351;QD=24.1939;RBI=0.0164252;REFB=-0.0384715;REVB=-0.0134292;RO=16;SAF=8;SAR=13;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00489017;STB=0.50273;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.037892;OID=.;OPOS=105930406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:13:8:6:10:13:8:6:10
chr14	105935824	.	G	A	573.13	PASS	AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.032565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.553;QD=55.9147;RBI=0.0481974;REFB=-0.00236621;REVB=0.0355318;RO=2;SAF=24;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111001;STB=0.505926;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.000727234;OID=.;OPOS=105935824;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:41:2:2:39:39:0.95122:15:24:1:1:15:24:1:1
chr14	105953595	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0548062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.76;QD=45.8068;RBI=0.0574809;REFB=0;REVB=-0.0173301;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00091396;OID=.;OPOS=105953595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chr14	105962234	.	T	C	977.6	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.782;QD=58.3642;RBI=0.0467848;REFB=0;REVB=-0.039424;RO=0;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185449;OID=.;OPOS=105962234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:26:40:0:0:27:40:0:0
chr14	105962369	.	A	C,G	1494.09	PASS	AF=0.0208333,0.979167;AO=4,91;DP=95;FAO=2,94;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=1,40;FSAR=1,54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104006,0.0033618;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=111.434,136.469;QD=62.2537;RBI=0.0128785,0.00396943;REFB=0,0;REVB=-0.00759494,-0.00211061;RO=0;SAF=3,37;SAR=1,54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.86674e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.130586,0.000563134;OID=.,.;OPOS=105962369,105962369;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:95:96:0:0:4,91:2,94:0.0208333,0.979167:1,54:3,37:0:0:1,54:1,40:0:0
chr14	105963700	.	C	T	311.38	PASS	AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.0160249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3438;QD=19.1615;RBI=0.0690101;REFB=-0.0471539;REVB=-0.0671237;RO=32;SAF=19;SAR=14;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132839;STB=0.573616;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0437556;OID=.;OPOS=105963700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:32:32:33:33:0.507692:14:19:23:9:14:19:23:9
chr14	105964215	.	CGG	CGC,CG,C	56.56	PASS	AF=0.0869565,0.347826,0.130435;AO=3,6,4;DP=23;FAO=2,8,3;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=0,2,0;FSAR=2,6,3;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-7.26864e-05,0.146257,0.0682848;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=1,1,2;MLLD=151.118,9.29255,18.9659;QD=9.83575;RBI=0.0528751,0.293291,0.144068;REFB=-0.0104573,-0.0979151,-0.0649484;REVB=-0.052875,-0.254222,-0.126857;RO=9;SAF=0,2,0;SAR=3,4,4;SRF=8;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.780801,-0.504538,-0.798025;STB=0.997493,0.824304,0.997945;STBP=0.016,0.031,0.004;TYPE=snp,del,del;VARB=0.0942221,0.0180299,0.0009123;OID=.,.,.;OPOS=105964217,105964216,105964216;OREF=G,G,GG;OALT=C,-,-;OMAPALT=CGC,CG,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0869565,0.347826,0.130435:3,6,4:23:2,8,3:23:10:0,2,0:2,6,3:9:1:25:9:0,2,0:3,4,4:8:1
chr14	105996341	.	C	G	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0203289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.165;QD=13.2059;RBI=0.0682808;REFB=-0.00340816;REVB=0.0651844;RO=6;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372539;STB=0.713771;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00237025;OID=.;OPOS=105996341;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:2:4:6:0:2:4:6:0
chr14	106053430	.	A	G	1172.0	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00911694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.326;QD=60.8832;RBI=0.0544784;REFB=0;REVB=-0.0537101;RO=0;SAF=45;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000122417;OID=.;OPOS=106053430;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:32:45:0:0:32:45:0:0
chr14	106053559	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.973;QD=35.5759;RBI=0.0308304;REFB=0;REVB=0.00709871;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000868727;OID=.;OPOS=106053559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr14	106066454	.	T	C	1253.23	PASS	AF=0.987952;AO=81;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.018128;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.124;QD=60.3968;RBI=0.0284899;REFB=0.0394603;REVB=0.0219784;RO=1;SAF=44;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106407;STB=0.505617;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-6.69282e-05;OID=.;OPOS=106066454;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:83:83:1:1:81:82:0.987952:37:44:1:0:38:44:1:0
chr14	106090927	.	G	T	5034.39	PASS	AF=1;AO=317;DP=321;FAO=319;FDP=319;FR=.;FRO=0;FSAF=202;FSAR=117;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0302135;FXX=0.0123835;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.681;QD=63.1271;RBI=0.0302952;REFB=0;REVB=0.00222373;RO=1;SAF=202;SAR=115;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00412977;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.11005e-05;OID=.;OPOS=106090927;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:27:321:319:1:0:317:319:1:115:202:0:1:117:202:0:0
chr14	106091555	.	C	T	323.28	PASS	AF=0.479452;AO=23;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0333388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3949;QD=17.7138;RBI=0.0407918;REFB=-0.00670313;REVB=0.0235052;RO=30;SAF=18;SAR=5;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.322367;STB=0.507435;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.00985132;OID=.;OPOS=106091555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:30:38:23:35:0.479452:5:18:15:15:17:18:19:19
chr14	106091696	.	AT	AC,CG	425.64	PASS	AF=0.650794,0;AO=33,3;DP=63;FAO=41,0;FDP=63;FR=.;FRO=22;FSAF=21,0;FSAR=20,0;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0248397,0.00146969;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=75.1503,251.123;QD=27.025;RBI=0.0493664,0.0081632;REFB=-0.0323633,-0.00308445;REVB=0.0426619,-0.0080298;RO=18;SAF=16,0;SAR=17,3;SRF=11;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0813283,-0.647452;STB=0.527527,0.5;STBP=0.555,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0103133,0;OID=.,.;OPOS=106091697,106091696;OREF=T,AT;OALT=C,CG;OMAPALT=AC,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:18:22:33,3:41,0:0.650794,0:17,3:16,0:11:7:20,0:21,0:13:9
chr14	106092152	.	G	A	539.63	PASS	AF=0.318182;AO=70;DP=223;FAO=70;FDP=220;FR=.;FRO=150;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=88;FSRR=62;FWDB=-0.00414227;FXX=0.0134523;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.5598;QD=9.81146;RBI=0.0263598;REFB=-0.00619787;REVB=0.0260323;RO=147;SAF=40;SAR=30;SRF=85;SRR=62;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00817532;STB=0.510635;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0103926;OID=.;OPOS=106092152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:223:220:147:150:70:70:0.318182:30:40:85:62:30:40:88:62
chr14	106092215	.	G	A	336.27	PASS	AF=0.309353;AO=41;DP=139;FAO=43;FDP=139;FR=.;FRO=96;FSAF=9;FSAR=34;FSRF=41;FSRR=55;FWDB=0.0475711;FXX=0.0141834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4486;QD=9.67675;RBI=0.0722971;REFB=-0.0192164;REVB=0.0544414;RO=98;SAF=9;SAR=32;SRF=43;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302606;STB=0.679636;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0623332;OID=.;OPOS=106092215;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:98:96:41:43:0.309353:32:9:43:55:34:9:41:55
chr14	106092347	.	G	A	206.17	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=22;FWDB=0.0483282;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.402;QD=15.8593;RBI=0.0518389;REFB=-0.0357502;REVB=0.0187527;RO=29;SAF=9;SAR=14;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161798;STB=0.591167;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0405453;OID=.;OPOS=106092347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:14:9:7:22:14:9:7:22
chr14	106092383	.	C	G	232.77	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0105069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5408;QD=24.5016;RBI=0.0105277;REFB=-0.0133063;REVB=0.000660886;RO=16;SAF=4;SAR=18;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206638;STB=0.616321;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.00988973;OID=.;OPOS=106092383;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:18:4:6:10:18:4:6:10
chr14	106109573	.	T	C	252.77	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.028974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.646;QD=21.0643;RBI=0.0289953;REFB=-0.014484;REVB=-0.00111111;RO=24;SAF=19;SAR=5;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150483;STB=0.585231;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0235115;OID=.;OPOS=106109573;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:24:24:0.5:5:19:16:8:5:19:16:8
chr14	106109752	.	A	C	1852.91	PASS	AF=1;AO=119;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0770177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.1158;QD=60.7511;RBI=0.0770232;REFB=0;REVB=0.000919136;RO=0;SAF=83;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51472e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106732;OID=.;OPOS=106109752;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:119:122:1:36:83:0:0:39:83:0:0
chr14	106110057	.	G	A	1181.21	PASS	AF=0.387283;AO=132;DP=345;FAO=134;FDP=346;FR=.;FRO=212;FSAF=74;FSAR=60;FSRF=113;FSRR=99;FWDB=0.0418123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.9399;QD=13.6556;RBI=0.0419713;REFB=-0.013232;REVB=0.0036507;RO=212;SAF=72;SAR=60;SRF=113;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013721;STB=0.511875;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0240631;OID=.;OPOS=106110057;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:345:346:212:212:132:134:0.387283:60:72:113:99:60:74:113:99
chr14	106110137	.	C	T	325.27	PASS	AF=0.236111;AO=51;DP=216;FAO=51;FDP=216;FR=.;FRO=165;FSAF=31;FSAR=20;FSRF=94;FSRR=71;FWDB=0.00786382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9282;QD=6.02343;RBI=0.0376556;REFB=-0.00629364;REVB=0.0368253;RO=165;SAF=31;SAR=20;SRF=94;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498338;STB=0.530152;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0151529;OID=.;OPOS=106110137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:216:216:165:165:51:51:0.236111:20:31:94:71:20:31:94:71
chr14	106110914	.	G	T	455.23	PASS	AF=0.261905;AO=66;DP=252;FAO=66;FDP=252;FR=.;FRO=186;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=92;FSRR=94;FWDB=-0.00953778;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.283;QD=7.22581;RBI=0.025643;REFB=-0.0131641;REVB=-0.0238032;RO=184;SAF=41;SAR=25;SRF=92;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152716;STB=0.594681;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0341922;OID=.;OPOS=106110914;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:252:252:184:186:66:66:0.261905:25:41:92:92:25:41:92:94
chr14	106110966	.	C	T	595.63	PASS	AF=0.316667;AO=76;DP=241;FAO=76;FDP=240;FR=.;FRO=164;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=78;FSRR=86;FWDB=0.0303697;FXX=0.00414921;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.4407;QD=9.9272;RBI=0.0425727;REFB=-0.00401485;REVB=-0.0298349;RO=164;SAF=47;SAR=29;SRF=78;SRR=86;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170578;STB=0.598534;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00895375;OID=.;OPOS=106110966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:241:240:164:164:76:76:0.316667:29:47:78:86:29:47:78:86
chr14	106173790	.	A	G	1470.08	PASS	AF=1;AO=91;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00284791;FXX=0.0208312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3658;QD=62.5564;RBI=0.00425204;REFB=0;REVB=-0.0031574;RO=0;SAF=36;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00241442;OID=.;OPOS=106173790;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:94:0:0:91:94:1:55:36:0:0:57:37:0:0
chr14	106188230	.	C	T	601.26	PASS	AF=0.97561;AO=38;DP=39;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0713187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.102;QD=58.659;RBI=0.0714536;REFB=0.0332107;REVB=0.00438863;RO=1;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0208236;STB=0.510633;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.000752228;OID=.;OPOS=106188230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:41:1:1:38:40:0.97561:22:16:0:1:23:17:0:1
chr14	106204113	.	C	T	1558.77	PASS	AF=0.981481;AO=105;DP=108;FAO=106;FDP=108;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.025855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.062;QD=57.7323;RBI=0.0303879;REFB=-0.0263495;REVB=0.0159668;RO=0;SAF=54;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509432;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=2.92973e-05;OID=.;OPOS=106204113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:108:108:0:2:105:106:0.981481:51:54:0:0:52:54:0:2
chr14	106207843	.	T	C	1751.66	PASS	AF=0.991453;AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0682461;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.526;QD=59.8858;RBI=0.0773774;REFB=-0.00250421;REVB=0.0364655;RO=1;SAF=58;SAR=58;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00811791;STB=0.504273;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000174224;OID=.;OPOS=106207843;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:117:117:1:1:116:116:0.991453:58:58:0:1:58:58:0:1
chr14	106209119	.	T	C	1200.41	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0242443;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.831;QD=58.5567;RBI=0.0386541;REFB=-0.0316975;REVB=0.0301057;RO=2;SAF=50;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00614456;STB=0.503246;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.000770446;OID=.;OPOS=106209119;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:2:2:80:80:0.97561:30:50:1:1:30:50:1:1
chr14	106209340	.	T	C	1112.23	PASS	AF=0.974026;AO=71;DP=75;FAO=75;FDP=77;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00641534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.7;QD=57.778;RBI=0.0324631;REFB=-0.055822;REVB=0.0318229;RO=1;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160259;STB=0.508195;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.000680787;OID=.;OPOS=106209340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:77:1:1:71:75:0.974026:29:42:0:1:30:45:0:1
chr14	106235762	.	GCCCGC	GCCCAT	58.96	PASS	AF=0.117647;AO=10;DP=122;FAO=14;FDP=119;FR=.,HEALED;FRO=105;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=57;FSRR=48;FWDB=-0.00764077;FXX=0.0245881;HRUN=1;LEN=2;MLLD=135.294;QD=1.98177;RBI=0.00949952;REFB=-0.00842809;REVB=-0.00564441;RO=83;SAF=8;SAR=2;SRF=40;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.382599;STB=0.732978;STBP=0.077;TYPE=mnp;VARB=0.0623553;OID=.;OPOS=106235766;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=GCCCAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.117647:10:122:14:119:105:11:3:57:48:59:83:8:2:40:43
chr14	106236472	.	C	CG	53.41	PASS	AF=0.224299;AO=28;DP=107;FAO=24;FDP=107;FR=.;FRO=83;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=41;FSRR=42;FWDB=0.0107461;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=76.3936;QD=1.9967;RBI=0.0131593;REFB=-0.00949678;REVB=0.00759533;RO=79;SAF=25;SAR=3;SRF=38;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.575451;STB=0.884462;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.173631;OID=.;OPOS=106236473;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.224299:28:107:24:107:83:22:2:41:42:53:79:25:3:38:41
chr14	106237624	.	C	T	275.57	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307037;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.255;QD=52.49;RBI=0.0403054;REFB=0;REVB=0.0261114;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000256464;OID=.;OPOS=106237624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr14	106237642	.	T	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.432;QD=51.1841;RBI=0.0363143;REFB=0;REVB=-0.0130345;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.74793e-05;OID=.;OPOS=106237642;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr14	106303846	.	C	T	740.78	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0527464;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.66;QD=56.9831;RBI=0.0568193;REFB=0;REVB=0.0211246;RO=0;SAF=32;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228385;OID=.;OPOS=106303846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:20:32:0:0:20:32:0:0
chr14	106307012	.	C	T	200.65	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00353611;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.93;QD=19.1096;RBI=0.0388011;REFB=-0.0210612;REVB=0.0386396;RO=22;SAF=13;SAR=7;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326779;STB=0.5185;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0252254;OID=.;OPOS=106307012;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:22:22:20:20:0.47619:7:13:15:7:7:13:15:7
chr14	106307418	.	G	A	422.63	PASS	AF=0.291457;AO=58;DP=204;FAO=58;FDP=199;FR=.;FRO=141;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=68;FSRR=73;FWDB=0.00216988;FXX=0.0292669;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.829;QD=8.49515;RBI=0.0143521;REFB=-0.0091149;REVB=0.0141871;RO=140;SAF=36;SAR=22;SRF=67;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173365;STB=0.599125;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0264182;OID=.;OPOS=106307418;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:204:199:140:141:58:58:0.291457:22:36:67:73:22:36:68:73
chr14	106321330	.	G	A	180.66	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0204544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.334;QD=16.424;RBI=0.0233658;REFB=-0.0053153;REVB=0.0112951;RO=24;SAF=10;SAR=9;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268539;STB=0.660223;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0056183;OID=.;OPOS=106321330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:25:19:19:0.431818:9:10:6:18:9:10:6:19
chr14	106321590	.	C	A	1424.26	PASS	AF=0.961538;AO=99;DP=104;FAO=100;FDP=104;FR=.;FRO=4;FSAF=68;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0176702;FXX=0.0095229;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.109;QD=54.7794;RBI=0.0415686;REFB=0.0113306;REVB=0.037626;RO=4;SAF=67;SAR=32;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055679;STB=0.529406;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.000187175;OID=.;OPOS=106321590;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:104:104:4:4:99:100:0.961538:32:67:0:4:32:68:0:4
chr14	106321663	.	T	C	461.89	PASS	AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=0.00305761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.44;QD=21.4832;RBI=0.0204416;REFB=-0.00736895;REVB=-0.0202116;RO=41;SAF=31;SAR=14;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121799;STB=0.567475;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.00665744;OID=.;OPOS=106321663;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:14:31:23:18:14:31:23:18
chr14	106321913	.	G	A	211.75	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0360308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.17;QD=19.6972;RBI=0.0502443;REFB=-0.044981;REVB=0.0350181;RO=22;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0691752;STB=0.539133;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0397344;OID=.;OPOS=106321913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:8:13:12:10:8:13:12:10
chr14	106329435	.	T	G	784.06	PASS	AF=0.893939;AO=59;DP=66;FAO=59;FDP=66;FR=.;FRO=7;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0109117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1786;QD=47.5187;RBI=0.037664;REFB=-0.0347684;REVB=0.0360487;RO=6;SAF=25;SAR=34;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135215;STB=0.500526;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00411363;OID=.;OPOS=106329435;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:66:66:6:7:59:59:0.893939:34:25:3:3:34:25:3:4
chr14	106329451	.	GTA	ACC	710.24	PASS	AF=0.980769;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.033956;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=151.157;QD=54.6336;RBI=0.0552985;REFB=-0.136001;REVB=0.0436453;RO=1;SAF=16;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136468;STB=0.50704;STBP=0.606;TYPE=mnp;VARB=0.00266998;OID=.;OPOS=106329451;OREF=GTA;OALT=ACC;OMAPALT=ACC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:52:1:1:50:51:0.980769:34:16:0:1:35:16:0:1
chr14	106347371	.	T	A	4621.56	PASS	AF=0.473373;AO=467;DP=961;FAO=480;FDP=1014;FR=.;FRO=534;FSAF=205;FSAR=275;FSRF=227;FSRR=307;FWDB=-0.013938;FXX=0.00294982;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.9567;QD=18.231;RBI=0.01494;REFB=-0.0416083;REVB=0.00537916;RO=488;SAF=194;SAR=273;SRF=181;SRR=307;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0431622;STB=0.501071;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0423802;OID=.;OPOS=106347371;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:961:1014:488:534:467:480:0.473373:273:194:181:307:275:205:227:307
chr14	106347420	.	T	C	4283.76	PASS	AF=0.49652;AO=427;DP=862;FAO=428;FDP=862;FR=.;FRO=434;FSAF=168;FSAR=260;FSRF=167;FSRR=267;FWDB=-0.00335727;FXX=0.00231479;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6164;QD=19.8782;RBI=0.0296294;REFB=-0.0259723;REVB=0.0294386;RO=432;SAF=167;SAR=260;SRF=166;SRR=266;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00661835;STB=0.504088;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0261731;OID=.;OPOS=106347420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:862:862:432:434:427:428:0.49652:260:167:166:266:260:168:167:267
chr14	106370603	.	G	C	594.25	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0688532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.4552;QD=60.9484;RBI=0.0886845;REFB=0;REVB=0.0558944;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000185505;OID=.;OPOS=106370603;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:24:15:0:0:24:15:0:0
chr14	106385332	.	G	C	1612.42	PASS	AF=0.973684;AO=110;DP=114;FAO=111;FDP=114;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=52;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0213022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7959;QD=56.5762;RBI=0.0310284;REFB=-0.120294;REVB=0.0225605;RO=1;SAF=58;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811506;STB=0.512394;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.00101625;OID=.;OPOS=106385332;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:114:114:1:3:110:111:0.973684:52:58:1:0:52:59:3:0
chr14	106478137	.	C	T	228.64	PASS	AF=0.305263;AO=29;DP=95;FAO=29;FDP=95;FR=.;FRO=66;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=34;FWDB=-0.0149874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.175;QD=9.62699;RBI=0.0576164;REFB=-0.0103432;REVB=0.0556329;RO=65;SAF=13;SAR=16;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0339206;STB=0.52553;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0248257;OID=.;OPOS=106478137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:65:66:29:29:0.305263:16:13:31:34:16:13:32:34
chr14	106478194	.	C	T	328.96	PASS	AF=0.297468;AO=47;DP=158;FAO=47;FDP=158;FR=.;FRO=111;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=58;FSRR=53;FWDB=0.0208856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9902;QD=8.32796;RBI=0.132944;REFB=-0.0385824;REVB=-0.131293;RO=107;SAF=25;SAR=22;SRF=57;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000951607;STB=0.521683;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0536632;OID=.;OPOS=106478194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:107:111:47:47:0.297468:22:25:57:50:21:26:58:53
chr14	106478311	.	A	ACCACTG	176.42	PASS	AF=0.241071;AO=27;DP=114;FAO=27;FDP=112;FR=.;FRO=85;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=44;FSRR=41;FWDB=-0.0282743;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=6;MLLD=274.161;QD=6.30057;RBI=0.030254;REFB=-0.0172785;REVB=0.0107642;RO=86;SAF=15;SAR=12;SRF=45;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405434;STB=0.528921;STBP=0.7;TYPE=ins;VARB=0.0520529;OID=.;OPOS=106478312;OREF=-;OALT=CCACTG;OMAPALT=ACCACTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.241071:27:114:27:112:85:15:12:44:41:99:86:15:12:45:41
chr14	106478355	.	CC	GT	57.96	PASS	AF=0.15942;AO=10;DP=69;FAO=11;FDP=69;FR=.;FRO=58;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.0264743;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=189.906;QD=3.35986;RBI=0.0311057;REFB=-0.00571667;REVB=-0.0163303;RO=57;SAF=3;SAR=7;SRF=26;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200608;STB=0.587913;STBP=0.577;TYPE=mnp;VARB=0.0495071;OID=.;OPOS=106478355;OREF=CC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:69:69:57:58:10:11:0.15942:7:3:26:31:7:4:27:31
chr14	106478513	.	C	G	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.363;QD=60.9786;RBI=0.0495741;REFB=0;REVB=0.00799528;RO=0;SAF=9;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.68708e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109734;OID=.;OPOS=106478513;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:30:9:0:0:30:9:0:0
chr14	106494269	.	T	C	273.21	PASS	AF=0.340206;AO=33;DP=98;FAO=33;FDP=97;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=0.0300695;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.905;QD=11.2665;RBI=0.0307719;REFB=-0.0238032;REVB=0.00653744;RO=64;SAF=19;SAR=14;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0692148;STB=0.529766;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0767335;OID=.;OPOS=106494269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:64:64:33:33:0.340206:14:19:33:31:14:19:34:30
chr14	106539280	.	A	G	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0553032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.3084;QD=59.432;RBI=0.0643006;REFB=0;REVB=0.0328045;RO=0;SAF=28;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111414;OID=.;OPOS=106539280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:7:28:0:0:7:28:0:0
chr14	106552667	.	A	G	190.93	PASS	AF=1;AO=13;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0869845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.301;QD=47.7334;RBI=0.0954951;REFB=0;REVB=0.0394082;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00231201;OID=.;OPOS=106552667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:13:16:1:9:4:0:0:9:7:0:0
chr14	106573248	.	C	A	38.04	PASS	AF=0.4;AO=5;DP=14;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.00562257;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.397;QD=10.145;RBI=0.0109446;REFB=-0.0168326;REVB=0.00938999;RO=9;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264433;STB=0.59968;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.024081;OID=.;OPOS=106573248;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:15:9:9:5:6:0.4:2:3:3:6:3:3:3:6
chr14	106573251	.	G	A	138.95	PASS	AF=0.875;AO=13;DP=16;FAO=14;FDP=16;FR=.;FRO=2;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00481216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.961;QD=34.7381;RBI=0.024913;REFB=-0.0185328;REVB=0.0244438;RO=2;SAF=6;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00929408;STB=0.509078;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.00275489;OID=.;OPOS=106573251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:16:16:2:2:13:14:0.875:7:6:1:1:8:6:1:1
chr14	106573311	.	C	T	65.31	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0207667;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.696;QD=10.8848;RBI=0.0230901;REFB=-0.0292992;REVB=-0.0100944;RO=15;SAF=5;SAR=4;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0920876;STB=0.555432;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0373304;OID=.;OPOS=106573311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:4:5:7:8:4:5:7:8
chr14	106573662	.	A	G	338.05	PASS	AF=0.617021;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=47;FR=.;FRO=18;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0138029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2958;QD=28.7704;RBI=0.115908;REFB=0.0145556;REVB=0.115083;RO=18;SAF=21;SAR=8;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253852;STB=0.640347;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00557241;OID=.;OPOS=106573662;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:18:18:29:29:0.617021:8:21:7:11:8:21:7:11
chr14	106586290	.	C	T	137.47	PASS	AF=0.372093;AO=14;DP=41;FAO=16;FDP=43;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00433383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.144;QD=12.7883;RBI=0.0278254;REFB=-0.0140665;REVB=-0.0274858;RO=27;SAF=8;SAR=6;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998837;STB=0.5916;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0264561;OID=.;OPOS=106586290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:43:27:27:14:16:0.372093:6:8:13:14:6:10:13:14
chr14	106667592	.	G	A	93.67	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.0258361;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.282;QD=11.709;RBI=0.0400984;REFB=-0.0238846;REVB=0.0306655;RO=20;SAF=3;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.334531;STB=0.69965;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0237527;OID=.;OPOS=106667592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:33:32:20:20:12:12:0.375:9:3:11:9:9:3:11:9
chr14	106667786	.	T	C	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.333;QD=11.0197;RBI=0.0101364;REFB=-0.00538326;REVB=0.0101364;RO=8;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0103218;OID=.;OPOS=106667786;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:6:0:0:8:6:0:0:8
chr14	106780634	.	G	A	1533.35	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00243359;FXX=0.0103082;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.428;QD=63.8896;RBI=0.0389467;REFB=0;REVB=0.0388705;RO=0;SAF=53;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11189e-05;OID=.;OPOS=106780634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:96:0:0:96:96:1:43:53:0:0:43:53:0:0
chr14	106780817	.	A	C	273.87	PASS	AF=1;AO=17;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.130405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.524;QD=52.1653;RBI=0.130703;REFB=0;REVB=0.00882313;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000740806;OID=.;OPOS=106780817;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:17:21:1:10:7:0:0:10:11:0:0
chr14	106780956	.	AG	A	511.2	PASS	AF=1;AO=45;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286778;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.4126;QD=43.5063;RBI=0.0585973;REFB=0;REVB=0.0511002;RO=0;SAF=14;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0016489;OID=.;OPOS=106780957;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:45:48:47:47:0:15:32:0:0:10:0:14:31:0:0
chr14	106791119	.	A	G	923.69	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.35;QD=57.7307;RBI=0.0474059;REFB=0;REVB=0.0133034;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442075;OID=.;OPOS=106791119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:29:34:0:0:29:35:0:0
chr14	106791200	.	GC	AG	491.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182392;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=2;MLLD=246.434;QD=59.5553;RBI=0.0187958;REFB=0;REVB=0.00454024;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000503189;OID=.;OPOS=106791200;OREF=GC;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr14	106866565	.	C	A	1547.3	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000961369;FXX=0.0188661;HRUN=4;LEN=1;MLLD=157.335;QD=59.5117;RBI=0.00100112;REFB=-0.0488094;REVB=-0.000279303;RO=0;SAF=37;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113498;OID=.;OPOS=106866565;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:104:104:0:0:104:104:1:67:37:0:0:67:37:0:0
chr14	106877551	.	A	C	777.94	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2373;QD=63.5053;RBI=0.0831715;REFB=0;REVB=0.07846;RO=0;SAF=32;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000246701;OID=.;OPOS=106877551;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:14:32:0:0:17:32:0:0
chr14	106926328	.	A	C	282.07	PASS	AF=0.421053;AO=31;DP=75;FAO=32;FDP=76;FR=.;FRO=44;FSAF=10;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.0424954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.4708;QD=14.8458;RBI=0.0995308;REFB=-0.012972;REVB=0.0900029;RO=44;SAF=9;SAR=22;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232265;STB=0.61531;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0202642;OID=.;OPOS=106926328;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:44:44:31:32:0.421053:22:9:22:22:22:10:22:22
chr14	106926362	.	C	T	189.28	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0206758;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.88;QD=13.0537;RBI=0.0226034;REFB=-0.00819198;REVB=0.0091339;RO=35;SAF=9;SAR=14;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130914;STB=0.575276;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.0106937;OID=.;OPOS=106926362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:14:9:18:17:14:9:18:17
chr14	106926388	.	T	C	156.53	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0182076;FXX=0.039208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.915;QD=12.7778;RBI=0.0195533;REFB=-0.00373614;REVB=-0.00712834;RO=31;SAF=8;SAR=10;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0429843;STB=0.525086;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0160818;OID=.;OPOS=106926388;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:49:31:31:18:18:0.367347:10:8:15:16:10:8:15:16
chr14	106926456	.	A	C	46.75	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0244693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.559;QD=10.389;RBI=0.06303;REFB=-0.000748267;REVB=0.0580865;RO=11;SAF=4;SAR=3;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.270151;STB=0.660622;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0140061;OID=.;OPOS=106926456;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:3:4:9:2:3:4:9:2
chr14	106926649	.	C	A	78.64	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=0.0673423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.081;QD=14.9786;RBI=0.0695154;REFB=-0.00106036;REVB=-0.0172454;RO=11;SAF=4;SAR=6;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.362236;STB=0.708714;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.00098482;OID=.;OPOS=106926649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:6:4:9:2:6:4:9:2
chr14	106963101	.	C	T	474.75	PASS	AF=0.410853;AO=53;DP=131;FAO=53;FDP=129;FR=.;FRO=76;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=48;FSRR=28;FWDB=0.00106857;FXX=0.015266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.886;QD=14.7209;RBI=0.0169909;REFB=-0.00134029;REVB=0.0169572;RO=66;SAF=28;SAR=25;SRF=43;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124013;STB=0.561443;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00240469;OID=.;OPOS=106963101;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:129:66:76:53:53:0.410853:25:28:43:23:25:28:48:28
chr14	106993886	.	A	G	258.56	PASS	AF=0.954545;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00432541;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.092;QD=47.0115;RBI=0.0293543;REFB=-0.080524;REVB=0.0290338;RO=1;SAF=8;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0541413;STB=0.529383;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00158015;OID=.;OPOS=106993886;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:22:1:1:20:21:0.954545:12:8:1:0:13:8:1:0
chr14	106993945	.	T	C	220.43	PASS	AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0577765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.101;QD=24.4921;RBI=0.0801672;REFB=-0.0239312;REVB=0.0555757;RO=15;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0289103;STB=0.516114;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0109976;OID=.;OPOS=106993945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:12:9:7:8:12:9:7:8
chr14	106994009	.	GCT	TTC	243.27	PASS	AF=0.647059;AO=16;DP=35;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0541843;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=3;MLLD=254.38;QD=28.6194;RBI=0.0565025;REFB=-0.0383717;REVB=0.0160187;RO=12;SAF=5;SAR=11;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0883617;STB=0.519982;STBP=0.729;TYPE=mnp;VARB=0.0285422;OID=.;OPOS=106994009;OREF=GCT;OALT=TTC;OMAPALT=TTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:35:34:12:12:16:22:0.647059:11:5:5:7:14:8:5:7
chr14	106994015	.	G	A	254.01	PASS	AF=0.657143;AO=22;DP=34;FAO=23;FDP=35;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0745931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.652;QD=29.0293;RBI=0.0752761;REFB=-0.0356881;REVB=0.0101169;RO=12;SAF=7;SAR=15;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0702354;STB=0.525584;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0100935;OID=.;OPOS=106994015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:34:35:12:12:22:23:0.657143:15:7:5:7:15:8:5:7
chr14	106994063	.	C	T	195.89	PASS	AF=0.612903;AO=19;DP=31;FAO=19;FDP=31;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.0189509;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=268.795;QD=25.2766;RBI=0.0193265;REFB=-0.0107102;REVB=-0.00379159;RO=12;SAF=7;SAR=12;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152827;STB=0.585274;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.00520343;OID=.;OPOS=106994063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:12:12:19:19:0.612903:12:7:7:5:12:7:7:5
chr14	107013129	.	A	C	85.47	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.00171758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0333;QD=22.7932;RBI=0.0398817;REFB=0.0708677;REVB=0.0398447;RO=4;SAF=3;SAR=7;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113004;STB=0.608468;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.0322599;OID=.;OPOS=107013129;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:15:15:4:5:10:10:0.666667:7:3:2:2:7:3:3:2
chr14	107034920	.	C	T	35.61	PASS	AF=0.0862069;AO=10;DP=116;FAO=10;FDP=116;FR=.;FRO=106;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=50;FSRR=56;FWDB=-0.00901226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.875;QD=1.22788;RBI=0.0152412;REFB=-0.00120141;REVB=-0.0122912;RO=106;SAF=6;SAR=4;SRF=50;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145207;STB=0.616208;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0217484;OID=.;OPOS=107034920;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:116:116:106:106:10:10:0.0862069:4:6:50:56:4:6:50:56
chr14	107034967	.	T	C	93.67	PASS	AF=0.188235;AO=16;DP=83;FAO=16;FDP=85;FR=.;FRO=69;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=43;FSRR=26;FWDB=-0.0672476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8932;QD=4.40804;RBI=0.0774566;REFB=-0.0103263;REVB=-0.0384354;RO=67;SAF=10;SAR=6;SRF=41;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0173661;STB=0.501565;STBP=0.996;TYPE=snp;VARB=0.0414048;OID=.;OPOS=107034967;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:83:85:67:69:16:16:0.188235:6:10:41:26:6:10:43:26
chr14	107035020	.	C	T	68.4	PASS	AF=0.158537;AO=13;DP=82;FAO=13;FDP=82;FR=.;FRO=69;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=44;FSRR=25;FWDB=0.0577596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.5469;QD=3.33682;RBI=0.0813316;REFB=-0.00792566;REVB=0.0572596;RO=68;SAF=9;SAR=4;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0833087;STB=0.551715;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0643953;OID=.;OPOS=107035020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:82:82:68:69:13:13:0.158537:4:9:43:25:4:9:44:25
chr14	107048702	.	G	A	376.15	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590785;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.381;QD=55.7261;RBI=0.0590905;REFB=0;REVB=0.00118666;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00036509;OID=.;OPOS=107048702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:15:11:0:0:16:11:0:0
chr14	107048749	.	C	G	396.77	PASS	AF=0.794872;AO=31;DP=39;FAO=31;FDP=39;FR=.;FRO=8;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.0335374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.115;QD=40.694;RBI=0.036312;REFB=-0.0366499;REVB=-0.0139213;RO=8;SAF=14;SAR=17;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294051;STB=0.515903;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.0136646;OID=.;OPOS=107048749;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:39:39:8:8:31:31:0.794872:17:14:3:5:17:14:3:5
chr14	107048885	.	C	T	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0524042;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.562;QD=11.8301;RBI=0.0524758;REFB=-0.0208131;REVB=0.00273932;RO=18;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309174;STB=0.682607;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0239713;OID=.;OPOS=107048885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:7:4:12:6:7:4:12:6
chr14	107078567	.	T	C	620.19	PASS	AF=0.56;AO=57;DP=100;FAO=56;FDP=100;FR=.;FRO=44;FSAF=32;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=12;FWDB=-0.0200089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.454;QD=24.8075;RBI=0.021367;REFB=-0.0364322;REVB=-0.00749611;RO=42;SAF=33;SAR=24;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129974;STB=0.571404;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0219548;OID=.;OPOS=107078567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:42:44:57:56:0.56:24:33:31:11:24:32:32:12
chr14	107078790	.	C	T	395.15	PASS	AF=0.450549;AO=41;DP=90;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.000772914;FXX=0.0108684;HRUN=3;LEN=1;MLLD=192.776;QD=17.3691;RBI=0.00624426;REFB=-0.0402861;REVB=0.00619624;RO=49;SAF=27;SAR=14;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190207;STB=0.601956;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0512124;OID=.;OPOS=107078790;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:49:50:41:41:0.450549:14:27:23:26:14:27:24:26
chr14	107095326	.	C	T	1309.9	PASS	AF=0.977273;AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0469801;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.042;QD=59.5411;RBI=0.0473369;REFB=-0.169762;REVB=-0.00580054;RO=1;SAF=39;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997443;STB=0.501066;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00156179;OID=.;OPOS=107095326;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:88:88:1:2:86:86:0.977273:47:39:0:1:47:39:1:1
chr14	107113785	.	C	T	32.62	PASS	AF=0.106061;AO=7;DP=66;FAO=7;FDP=66;FR=.;FRO=59;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=36;FSRR=23;FWDB=-0.0501466;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.765;QD=1.97724;RBI=0.0559455;REFB=-0.00308827;REVB=-0.0248036;RO=59;SAF=3;SAR=4;SRF=36;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209268;STB=0.657802;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0373962;OID=.;OPOS=107113785;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:66:66:59:59:7:7:0.106061:4:3:36:23:4:3:36:23
chr14	107113846	.	A	T	156.06	PASS	AF=0.23;AO=23;DP=100;FAO=23;FDP=100;FR=.;FRO=77;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=-0.0447065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.197;QD=6.24249;RBI=0.0581499;REFB=-0.0028254;REVB=-0.0371852;RO=77;SAF=9;SAR=14;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191882;STB=0.61808;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0211062;OID=.;OPOS=107113846;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:77:77:23:23:0.23:14:9:42:35:14:9:42:35
chr14	107113851	.	C	T	398.67	PASS	AF=0.42;AO=39;DP=98;FAO=42;FDP=100;FR=.;FRO=58;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=0.0230926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.29;QD=15.9469;RBI=0.0257466;REFB=-0.0287054;REVB=-0.011385;RO=58;SAF=22;SAR=17;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104101;STB=0.561575;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.037236;OID=.;OPOS=107113851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:100:58:58:39:42:0.42:17:22:27:31:18:24:27:31
chr14	107113855	.	A	G	153.14	PASS	AF=0.227723;AO=23;DP=102;FAO=23;FDP=101;FR=.;FRO=78;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=43;FSRR=35;FWDB=-0.00797591;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.631;QD=6.06493;RBI=0.00799735;REFB=-0.0179152;REVB=0.000585176;RO=78;SAF=9;SAR=14;SRF=43;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199085;STB=0.622649;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0216213;OID=.;OPOS=107113855;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:78:78:23:23:0.227723:14:9:43:35:14:9:43:35
chr14	107113858	.	A	G	151.94	PASS	AF=0.22549;AO=23;DP=102;FAO=23;FDP=102;FR=.;FRO=79;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=42;FSRR=37;FWDB=-0.00698492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.049;QD=5.95842;RBI=0.00709019;REFB=-0.0123207;REVB=-0.00121727;RO=79;SAF=9;SAR=14;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175757;STB=0.608601;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.0359936;OID=.;OPOS=107113858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:79:79:23:23:0.22549:14:9:42:37:14:9:42:37
chr14	107113968	.	C	A	115.68	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=42;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0114347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.478;QD=11.0169;RBI=0.0150591;REFB=-0.0222663;REVB=-0.00979918;RO=28;SAF=8;SAR=6;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803216;STB=0.547876;STBP=0.686;TYPE=snp;VARB=0.0515924;OID=.;OPOS=107113968;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:28:28:14:14:0.333333:6:8:14:14:6:8:14:14
chr14	107114009	.	T	C	134.81	PASS	AF=0.8125;AO=11;DP=16;FAO=13;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.103286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.3696;QD=33.7014;RBI=0.153093;REFB=-0.135365;REVB=-0.113002;RO=2;SAF=7;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399473;STB=0.505147;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0150938;OID=.;OPOS=107114009;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:16:16:2:2:11:13:0.8125:4:7:1:1:6:7:1:1
chr14	107114193	.	A	G	207.82	PASS	AF=0.446809;AO=21;DP=47;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00953562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.234;QD=17.687;RBI=0.00955313;REFB=-0.0178144;REVB=-0.000577991;RO=26;SAF=16;SAR=5;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213582;STB=0.622745;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0217084;OID=.;OPOS=107114193;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:26:21:21:0.446809:5:16:15:11:5:16:15:11
chr14	107131164	.	A	C	51.44	PASS	AF=0.222222;AO=8;DP=36;FAO=8;FDP=36;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.00132327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.076;QD=5.71576;RBI=0.0345567;REFB=-0.00506775;REVB=-0.0345313;RO=28;SAF=5;SAR=3;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665171;STB=0.543368;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0206667;OID=.;OPOS=107131164;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:36:36:28:28:8:8:0.222222:3:5:16:12:3:5:16:12
chr14	107131410	.	A	G	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0430926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2803;QD=8.24577;RBI=0.129065;REFB=-0.000193477;REVB=0.121659;RO=15;SAF=3;SAR=4;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32668;STB=0.699491;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0145805;OID=.;OPOS=107131410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:4:3:11:4:4:3:11:4
chr14	107170005	.	T	C	265.29	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.00942248;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=194.217;QD=17.9858;RBI=0.020282;REFB=-0.0125289;REVB=-0.0179604;RO=30;SAF=20;SAR=9;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242835;STB=0.636378;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0124984;OID=.;OPOS=107170005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:9:20:13:17:9:20:13:17
chr14	107170055	.	G	A	376.16	PASS	AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=0.00925237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.444;QD=21.192;RBI=0.0212624;REFB=-0.0252205;REVB=-0.0191437;RO=33;SAF=20;SAR=18;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145501;STB=0.580169;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0128271;OID=.;OPOS=107170055;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:33:33:38:38:0.535211:18:20:23:10:18:20:23:10
chr14	107170062	.	A	G	375.83	PASS	AF=0.535211;AO=38;DP=71;FAO=38;FDP=71;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=10;FWDB=0.0220491;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.147;QD=21.1736;RBI=0.0223179;REFB=-0.0454554;REVB=0.00345344;RO=32;SAF=22;SAR=16;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0938614;STB=0.557246;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.039286;OID=.;OPOS=107170062;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:32:33:38:38:0.535211:16:22:22:10:16:22:23:10
chr14	107170077	.	C	T	311.3	PASS	AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=0.0720818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2368;QD=19.1568;RBI=0.0724168;REFB=-0.0114999;REVB=0.00695813;RO=30;SAF=19;SAR=14;SRF=23;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173446;STB=0.606837;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0158844;OID=.;OPOS=107170077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:30:32:33:33:0.507692:14:19:23:7:14:19:25:7
chr14	107170128	.	C	T	283.75	PASS	AF=0.530612;AO=26;DP=49;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=0.0219523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.893;QD=23.1635;RBI=0.0222712;REFB=-0.0196857;REVB=-0.00375581;RO=22;SAF=16;SAR=10;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186176;STB=0.60968;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0183803;OID=.;OPOS=107170128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:22:23:26:26:0.530612:10:16:18:4:10:16:19:4
chr14	107170207	.	C	T	159.77	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0186232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1148;QD=26.6288;RBI=0.035598;REFB=-0.000698847;REVB=0.030338;RO=8;SAF=11;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0425913;STB=0.523779;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.00221436;OID=.;OPOS=107170207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:5:11:5:3:5:11:5:3
chr14	107170219	.	C	G	114.06	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.00655994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.723;QD=18.2489;RBI=0.0378904;REFB=-0.0444029;REVB=-0.0373182;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991777;STB=0.556873;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0325362;OID=.;OPOS=107170219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:5:8:6:6:5:8:6:6
chr14	107178832	.	A	G	1904.56	PASS	AF=0.992;AO=122;DP=125;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=57;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0117563;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.9506;QD=60.946;RBI=0.0352747;REFB=-0.077055;REVB=-0.033258;RO=1;SAF=67;SAR=55;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00703814;STB=0.503703;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000793828;OID=.;OPOS=107178832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:125:125:1:1:122:124:0.992:55:67:1:0:57:67:1:0
chr14	107178941	.	T	A	323.68	PASS	AF=0.384615;AO=39;DP=103;FAO=40;FDP=104;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=34;FSRR=30;FWDB=0.0536716;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3304;QD=12.4493;RBI=0.0568449;REFB=-0.0121782;REVB=0.0187269;RO=64;SAF=24;SAR=15;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0942367;STB=0.559671;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.025011;OID=.;OPOS=107178941;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:64:64:39:40:0.384615:15:24:34:30:15:25:34:30
chr14	107178965	.	A	C	208.89	PASS	AF=0.321429;AO=27;DP=84;FAO=27;FDP=84;FR=.;FRO=57;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=25;FWDB=-0.00693944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.59;QD=9.94729;RBI=0.0100544;REFB=-0.0101617;REVB=0.00727564;RO=55;SAF=20;SAR=7;SRF=30;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248499;STB=0.637342;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0281928;OID=.;OPOS=107178965;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:55:57:27:27:0.321429:7:20:30:25:7:20:32:25
chr14	107179013	.	A	G	117.6	PASS	AF=0.274194;AO=17;DP=62;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=0.0324764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5859;QD=7.58728;RBI=0.0405422;REFB=0.00500408;REVB=0.0242683;RO=45;SAF=14;SAR=3;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330388;STB=0.704763;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=-0.0098729;OID=.;OPOS=107179013;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:45:45:17:17:0.274194:3:14:27:18:3:14:27:18
chr14	107179017	.	A	G	116.63	PASS	AF=0.269841;AO=17;DP=63;FAO=17;FDP=63;FR=.;FRO=46;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.00966098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.948;QD=7.40486;RBI=0.024624;REFB=-0.00706952;REVB=-0.0226497;RO=45;SAF=14;SAR=3;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330388;STB=0.714332;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00922697;OID=.;OPOS=107179017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:45:46:17:17:0.269841:3:14:27:18:3:14:27:19
chr14	107179106	.	C	T	127.72	PASS	AF=0.256757;AO=19;DP=74;FAO=19;FDP=74;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=37;FSRR=18;FWDB=0.0194446;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.4998;QD=6.90361;RBI=0.0197143;REFB=-0.013564;REVB=0.00324937;RO=55;SAF=10;SAR=9;SRF=37;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183008;STB=0.61028;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0413485;OID=.;OPOS=107179106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:55:55:19:19:0.256757:9:10:37:18:9:10:37:18
chr14	107211211	.	G	A	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00321319;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.342;QD=8.25617;RBI=0.00573036;REFB=-0.00760244;REVB=0.00474473;RO=12;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343123;STB=0.713605;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00735171;OID=.;OPOS=107211211;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:4:2:8:4:4:2:8:4
chr15	20170150	.	C	T	812.23	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.694;QD=56.9986;RBI=0.0467539;REFB=0;REVB=0.00407203;RO=0;SAF=26;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000170875;OID=.;OPOS=20170150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:56:57:1:30:26:0:0:30:27:0:0
chr15	20301105	.	C	T	552.62	PASS	AF=0.284133;AO=77;DP=271;FAO=77;FDP=271;FR=.;FRO=194;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=96;FSRR=98;FWDB=0.0392331;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.685;QD=8.15675;RBI=0.0399627;REFB=-0.0131279;REVB=-0.00760135;RO=194;SAF=34;SAR=43;SRF=96;SRR=98;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0654529;STB=0.538318;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0333103;OID=.;OPOS=20301105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:271:271:194:194:77:77:0.284133:43:34:96:98:43:34:96:98
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chr15	20462585	.	A	G	328.93	PASS	AF=0.382353;AO=39;DP=102;FAO=39;FDP=102;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=0.00502739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.067;QD=12.8993;RBI=0.00812511;REFB=-0.0160546;REVB=0.006383;RO=63;SAF=22;SAR=17;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0611917;STB=0.534794;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.0275543;OID=.;OPOS=20462585;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:63:63:39:39:0.382353:17:22:39:24:17:22:39:24
chr15	20462603	.	G	T	144.78	PASS	AF=0.219048;AO=23;DP=105;FAO=23;FDP=105;FR=.;FRO=82;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=46;FSRR=36;FWDB=0.0205097;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.142;QD=5.51553;RBI=0.0344802;REFB=0.00129523;REVB=0.0277171;RO=79;SAF=12;SAR=11;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283706;STB=0.530755;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=-0.00271699;OID=.;OPOS=20462603;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:79:82:23:23:0.219048:11:12:43:36:11:12:46:36
chr15	20462613	.	G	C	61.95	PASS	AF=0.127451;AO=13;DP=101;FAO=13;FDP=102;FR=.;FRO=89;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=51;FSRR=38;FWDB=0.00650264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.445;QD=2.42949;RBI=0.0377149;REFB=-0.00634855;REVB=-0.03715;RO=88;SAF=5;SAR=8;SRF=51;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236579;STB=0.660528;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0402251;OID=.;OPOS=20462613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:101:102:88:89:13:13:0.127451:8:5:51:37:8:5:51:38
chr15	20476942	.	C	T	228.6	PASS	AF=0.190698;AO=41;DP=214;FAO=41;FDP=215;FR=.;FRO=174;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=89;FSRR=85;FWDB=-0.0376198;FXX=0.00462942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.814;QD=4.25309;RBI=0.0887687;REFB=-0.00254929;REVB=-0.080403;RO=171;SAF=20;SAR=21;SRF=87;SRR=84;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269467;STB=0.519156;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.0101468;OID=.;OPOS=20476942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:214:215:171:174:41:41:0.190698:21:20:87:84:21:20:89:85
chr15	20588685	.	A	G	168.76	PASS	AF=0.189873;AO=24;DP=158;FAO=30;FDP=158;FR=.,HEALED;FRO=128;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=64;FSRR=64;FWDB=-0.0418042;FXX=0.00628891;HRUN=5;LEN=1;MLLD=88.2416;QD=4.27232;RBI=0.0445862;REFB=-0.00236623;REVB=-0.0155028;RO=104;SAF=8;SAR=16;SRF=49;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181106;STB=0.609422;STBP=0.207;TYPE=snp;VARB=0.00622268;OID=.;OPOS=20588685;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:104:128:24:30:0.189873:16:8:49:55:19:11:64:64
chr15	20588705	.	C	A	282.83	PASS	AF=0.270833;AO=39;DP=145;FAO=39;FDP=144;FR=.;FRO=105;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=46;FSRR=59;FWDB=0.00404784;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3486;QD=7.85632;RBI=0.0386882;REFB=-0.0133545;REVB=-0.0384758;RO=99;SAF=19;SAR=20;SRF=44;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520438;STB=0.535862;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0348081;OID=.;OPOS=20588705;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:144:99:105:39:39:0.270833:20:19:44:55:20:19:46:59
chr15	20613928	.	G	A	58.78	PASS	AF=0.0993789;AO=15;DP=161;FAO=16;FDP=161;FR=.;FRO=145;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=69;FSRR=76;FWDB=-0.0382574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.5319;QD=1.46028;RBI=0.0459576;REFB=-0.0106383;REVB=-0.0254652;RO=143;SAF=5;SAR=10;SRF=69;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178833;STB=0.5923;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0550766;OID=.;OPOS=20613928;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:161:161:143:145:15:16:0.0993789:10:5:69:74:10:6:69:76
chr15	20645751	.	G	A	54.0	PASS	AF=0.243243;AO=7;DP=35;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.000771794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.654;QD=5.83729;RBI=0.0169718;REFB=-0.0155182;REVB=0.0169543;RO=26;SAF=2;SAR=5;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17733;STB=0.654301;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0486962;OID=.;OPOS=20645751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:35:37:26:28:7:9:0.243243:5:2:11:15:7:2:11:17
chr15	20645827	.	A	G	119.32	PASS	AF=0.291667;AO=15;DP=50;FAO=14;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=27;FWDB=0.0578048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9164;QD=9.943;RBI=0.0606932;REFB=-0.0126959;REVB=-0.0185006;RO=30;SAF=6;SAR=9;SRF=3;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399533;STB=0.704468;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.0174027;OID=.;OPOS=20645827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:48:30:32:15:14:0.291667:9:6:3:27:8:6:5:27
chr15	20648687	.	GCAGA	G	50.0	PASS	AO=45;DP=284;LEN=4;RO=239;SAF=29;SAR=23;SRF=168;SRR=64;TYPE=del;FR=.;OID=.;OPOS=20648688;OREF=CAGA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:RO:AO:SAR:SAF:SRF:SRR	0/1:99:284:239:45:23:29:168:64
chr15	20874897	.	A	G	2826.99	PASS	AF=0.624365;AO=246;DP=394;FAO=246;FDP=394;FR=.;FRO=148;FSAF=126;FSAR=120;FSRF=74;FSRR=74;FWDB=0.0332084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.272;QD=28.7004;RBI=0.036172;REFB=-0.0341098;REVB=-0.0143393;RO=148;SAF=126;SAR=120;SRF=74;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00851658;STB=0.504582;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0190192;OID=.;OPOS=20874897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:394:394:148:148:246:246:0.624365:120:126:74:74:120:126:74:74
chr15	20874927	.	T	A	1653.26	PASS	AF=0.451031;AO=158;DP=372;FAO=175;FDP=388;FR=.;FRO=213;FSAF=90;FSAR=85;FSRF=101;FSRR=112;FWDB=-0.000672611;FXX=0.00257063;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.629;QD=17.0439;RBI=0.0118117;REFB=-0.00758707;REVB=0.0117925;RO=208;SAF=84;SAR=74;SRF=100;SRR=108;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0520891;STB=0.522005;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=0.0094422;OID=.;OPOS=20874927;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:372:388:208:213:158:175:0.451031:74:84:100:108:85:90:101:112
chr15	20876452	.	G	A	51.84	PASS	AF=0.0807175;AO=18;DP=223;FAO=18;FDP=223;FR=.;FRO=205;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=131;FSRR=74;FWDB=-0.0168603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7884;QD=0.929859;RBI=0.0297824;REFB=-0.00301715;REVB=-0.0245504;RO=205;SAF=14;SAR=4;SRF=131;SRR=74;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183952;STB=0.652924;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0417399;OID=.;OPOS=20876452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:223:223:205:205:18:18:0.0807175:4:14:131:74:4:14:131:74
chr15	20876515	.	A	G	2118.11	PASS	AF=0.693548;AO=169;DP=246;FAO=172;FDP=248;FR=.;FRO=76;FSAF=103;FSAR=69;FSRF=51;FSRR=25;FWDB=0.0267502;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.336;QD=34.163;RBI=0.0325658;REFB=-0.0237917;REVB=0.018573;RO=75;SAF=100;SAR=69;SRF=50;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044967;STB=0.523239;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.00926608;OID=.;OPOS=20876515;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:246:248:75:76:169:172:0.693548:69:100:50:25:69:103:51:25
chr15	22368855	.	T	C	416.55	PASS	AF=0.279621;AO=59;DP=211;FAO=59;FDP=211;FR=.;FRO=152;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=76;FSRR=76;FWDB=0.010732;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=194.317;QD=7.89673;RBI=0.0108408;REFB=-0.00818486;REVB=0.00153224;RO=152;SAF=28;SAR=31;SRF=76;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311558;STB=0.518322;STBP=0.732;TYPE=snp;VARB=0.0183986;OID=.;OPOS=22368855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:211:211:152:152:59:59:0.279621:31:28:76:76:31:28:76:76
chr15	22368862	.	G	A	890.0	PASS	AF=0.481283;AO=89;DP=187;FAO=90;FDP=187;FR=.;FRO=97;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=52;FSRR=45;FWDB=0.0312776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2267;QD=19.0375;RBI=0.0446368;REFB=-0.0243695;REVB=-0.0318458;RO=97;SAF=44;SAR=45;SRF=51;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0296467;STB=0.52446;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.0272101;OID=.;OPOS=22368862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:187:187:97:97:89:90:0.481283:45:44:51:46:46:44:52:45
chr15	22368905	.	G	A	203.11	PASS	AF=0.213333;AO=32;DP=150;FAO=32;FDP=150;FR=.;FRO=118;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=61;FSRR=57;FWDB=-0.00230565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.256;QD=5.41631;RBI=0.00740175;REFB=-0.0064136;REVB=-0.00703349;RO=118;SAF=21;SAR=11;SRF=61;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181528;STB=0.612804;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=0.0299133;OID=.;OPOS=22368905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:118:118:32:32:0.213333:11:21:61:57:11:21:61:57
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chr15	22369132	.	G	A	306.84	PASS	AF=0.275;AO=44;DP=160;FAO=44;FDP=160;FR=.;FRO=116;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=56;FSRR=60;FWDB=0.0225506;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.496;QD=7.67088;RBI=0.0243467;REFB=-0.00257702;REVB=-0.00917785;RO=116;SAF=23;SAR=21;SRF=56;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0489315;STB=0.528948;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.00723169;OID=.;OPOS=22369132;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:160:116:116:44:44:0.275:21:23:56:60:21:23:56:60
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chr15	22382655	.	A	C	98.48	PASS	AF=0.174757;AO=18;DP=104;FAO=18;FDP=103;FR=.;FRO=85;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=50;FSRR=35;FWDB=-0.0195621;FXX=0.0282992;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.604;QD=3.82435;RBI=0.0211075;REFB=-0.0112058;REVB=-0.0079278;RO=79;SAF=7;SAR=11;SRF=45;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225663;STB=0.660523;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0868896;OID=.;OPOS=22382655;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:104:103:79:85:18:18:0.174757:11:7:45:34:11:7:50:35
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chr15	22382739	.	A	G	1179.97	PASS	AF=0.952381;AO=80;DP=84;FAO=80;FDP=84;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=31;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0127716;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=272.961;QD=56.189;RBI=0.020313;REFB=-0.185281;REVB=0.0157957;RO=3;SAF=49;SAR=31;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0281055;STB=0.519603;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.000777561;OID=.;OPOS=22382739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:84:84:3:4:80:80:0.952381:31:49:3:0:31:49:4:0
chr15	22382821	.	G	C	344.6	PASS	AF=0.25;AO=50;DP=200;FAO=50;FDP=200;FR=.;FRO=150;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=78;FSRR=72;FWDB=-0.0245603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.671;QD=6.89204;RBI=0.032199;REFB=-0.0133047;REVB=0.0208223;RO=148;SAF=28;SAR=22;SRF=77;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0499787;STB=0.530205;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.0296817;OID=.;OPOS=22382821;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:200:200:148:150:50:50:0.25:22:28:77:71:22:28:78:72
chr15	22382828	.	C	A	353.17	PASS	AF=0.253589;AO=53;DP=209;FAO=53;FDP=209;FR=.;FRO=156;FSAF=28;FSAR=25;FSRF=79;FSRR=77;FWDB=0.00736864;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.058;QD=6.7593;RBI=0.0223263;REFB=0.00298483;REVB=0.0210753;RO=156;SAF=28;SAR=25;SRF=79;SRR=77;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273879;STB=0.516356;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=-0.0145831;OID=.;OPOS=22382828;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:209:209:156:156:53:53:0.253589:25:28:79:77:25:28:79:77
chr15	22383064	.	C	A	225.02	PASS	AF=0.202128;AO=37;DP=187;FAO=38;FDP=188;FR=.;FRO=150;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=82;FSRR=68;FWDB=0.0041305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.61;QD=4.78772;RBI=0.00573983;REFB=-0.010971;REVB=0.00398554;RO=150;SAF=22;SAR=15;SRF=82;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626429;STB=0.547908;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.02954;OID=.;OPOS=22383064;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:187:188:150:150:37:38:0.202128:15:22:82:68:15:23:82:68
chr15	22383066	.	A	G	708.65	PASS	AF=0.417112;AO=78;DP=187;FAO=78;FDP=187;FR=.;FRO=109;FSAF=47;FSAR=31;FSRF=60;FSRR=49;FWDB=-0.00866559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.7765;QD=15.1582;RBI=0.0323213;REFB=0.00249273;REVB=0.031138;RO=109;SAF=47;SAR=31;SRF=60;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.055863;STB=0.53129;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=-0.00463063;OID=.;OPOS=22383066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:187:187:109:109:78:78:0.417112:31:47:60:49:31:47:60:49
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chr15	22414005	.	C	T	1247.42	PASS	AF=0.484848;AO=127;DP=263;FAO=128;FDP=264;FR=.;FRO=136;FSAF=75;FSAR=53;FSRF=74;FSRR=62;FWDB=-0.00470477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.114;QD=18.9003;RBI=0.00483606;REFB=-0.0117829;REVB=0.00111922;RO=135;SAF=74;SAR=53;SRF=74;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330366;STB=0.522028;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.0169211;OID=.;OPOS=22414005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:263:264:135:136:127:128:0.484848:53:74:74:61:53:75:74:62
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chr15	22440297	.	A	G	957.65	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298235;FXX=0.0441112;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.348;QD=58.9324;RBI=0.0448647;REFB=0;REVB=0.0335171;RO=0;SAF=47;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00320531;OID=.;OPOS=22440297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:63:65:1:16:47:0:0:16:49:0:0
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chr15	22448406	.	G	A	125.3	PASS	AF=0.303571;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=-0.0091683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.266;QD=8.95001;RBI=0.011242;REFB=-0.0159095;REVB=0.00650575;RO=38;SAF=3;SAR=14;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.422973;STB=0.750892;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0598162;OID=.;OPOS=22448406;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:38:39:17:17:0.303571:14:3:19:19:14:3:19:20
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chr15	22448752	.	C	T	136.93	PASS	AF=0.171233;AO=25;DP=147;FAO=25;FDP=146;FR=.;FRO=121;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=69;FSRR=52;FWDB=0.0124002;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.53;QD=3.7515;RBI=0.0339049;REFB=-0.00111363;REVB=0.0315559;RO=122;SAF=15;SAR=10;SRF=69;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0451639;STB=0.525403;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00500172;OID=.;OPOS=22448752;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:146:122:121:25:25:0.171233:10:15:69:53:10:15:69:52
chr15	22840279	.	G	T	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0103691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.537;QD=12.7823;RBI=0.0215328;REFB=-0.0129426;REVB=-0.0188718;RO=14;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302009;STB=0.677085;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=0.0150645;OID=.;OPOS=22840279;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:6:4:10:4:6:4:10:4
chr15	22873784	.	C	T	318.12	PASS	AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00650818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.964;QD=15.5183;RBI=0.00785897;REFB=-0.0257277;REVB=0.00440533;RO=47;SAF=13;SAR=22;SRF=24;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144644;STB=0.581797;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.0189547;OID=.;OPOS=22873784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:47:47:35:35:0.426829:22:13:24:23:22:13:24:23
chr15	22926229	.	G	A	872.96	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156589;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.177;QD=58.1974;RBI=0.0250816;REFB=0;REVB=-0.019593;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000843263;OID=.;OPOS=22926229;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:31:29:0:0:31:29:0:0
chr15	22960868	.	G	C	205.85	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0386256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.318;QD=23.5255;RBI=0.0388359;REFB=0.000107671;REVB=0.00403653;RO=15;SAF=8;SAR=12;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154021;STB=0.58612;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=-0.000358493;OID=.;OPOS=22960868;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:12:8:9:6:12:8:9:6
chr15	23006364	.	GA	G	49.36	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=31;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0303926;FXX=0.0322477;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.2645;QD=6.58184;RBI=0.180228;REFB=-0.0632822;REVB=-0.177647;RO=16;SAF=5;SAR=5;SRF=11;SRR=5;SSEN=0.326087;SSEP=0;SSSB=-0.194738;STB=0.633127;STBP=0.286;TYPE=del;VARB=0.0615445;OID=.;OPOS=23006365;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:10:31:12:30:18:6:6:13:5:49:16:5:5:11:5
chr15	23052632	.	T	C,G	670.9	PASS	AF=0.914894,0.0425532;AO=43,2;DP=47;FAO=43,2;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=18,2;FSAR=25,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0410041,0.0696599;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=157.303,18.7851;QD=57.0977;RBI=0.0414368,0.0730749;REFB=-0.127922,-0.125996;REVB=0.00597284,0.0220782;RO=1;SAF=18,2;SAR=25,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0253725,0;STB=0.526303,0.5;STBP=0.136,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00374365,0.00568236;OID=.,.;OPOS=23052632,23052632;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:47:47:1:2:43,2:43,2:0.914894,0.0425532:25,0:18,2:1:0:25,0:18,2:2:0
chr15	23059394	.	C	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.151;QD=59.8391;RBI=0.0173475;REFB=0;REVB=-0.00828002;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.12992e-05;OID=.;OPOS=23059394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr15	23098401	.	C	T	576.5	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0085957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.469;QD=60.6843;RBI=0.0576072;REFB=0;REVB=0.0569623;RO=0;SAF=26;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206087;OID=.;OPOS=23098401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:35:38:1:9:26:0:0:11:27:0:0
chr15	23098449	.	C	T	722.0	PASS	AF=0.861538;AO=56;DP=65;FAO=56;FDP=65;FR=.;FRO=9;FSAF=41;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=0;FWDB=0.015553;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.625;QD=44.4305;RBI=0.0656722;REFB=-0.00306326;REVB=0.0638039;RO=9;SAF=41;SAR=15;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0929921;STB=0.549434;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.000547332;OID=.;OPOS=23098449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:65:65:9:9:56:56:0.861538:15:41:9:0:15:41:9:0
chr15	23158337	.	G	GC	636.94	PASS	AF=1;AO=12;DP=86;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.162012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=10.1602;QD=29.9735;RBI=0.210352;REFB=0.0402822;REVB=-0.134164;RO=74;SAF=11;SAR=1;SRF=29;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.623073;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000164619;OID=.;OPOS=23158338;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:12:86:85:85:0:39:46:0:0:13:74:11:1:29:45
chr15	23158339	.	G	C	971.66	PASS	AF=0.858824;AO=72;DP=85;FAO=73;FDP=85;FR=.;FRO=12;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=-0.00426029;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.9215;QD=45.7253;RBI=0.103372;REFB=-0.0470998;REVB=-0.103284;RO=13;SAF=26;SAR=46;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187623;STB=0.590884;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00597316;OID=.;OPOS=23158339;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:85:85:13:12:72:73:0.858824:46:26:13:0:46:27:12:0
chr15	23259835	.	C	T	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.107;QD=49.5985;RBI=0.0446239;REFB=0;REVB=0.0379869;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000582938;OID=.;OPOS=23259835;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
chr15	23261950	.	A	G	472.05	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0354337;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4376;QD=55.5351;RBI=0.0410823;REFB=-0.116564;REVB=-0.0207895;RO=0;SAF=14;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.71297e-08;STB=0.512813;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00316192;OID=.;OPOS=23261950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:0:1:33:33:0.970588:19:14:0:0:19:14:0:1
chr15	23326356	.	G	C	61.25	PASS	AF=0.25;AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=6;FWDB=-0.00846073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.86;QD=6.80559;RBI=0.00852755;REFB=-0.0040213;REVB=-0.00106541;RO=27;SAF=2;SAR=7;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.594057;STB=0.860321;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0079968;OID=.;OPOS=23326356;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:36:36:27:27:9:9:0.25:7:2:21:6:7:2:21:6
chr15	23686598	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00330023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.416;QD=42.1823;RBI=0.00676362;REFB=0;REVB=-0.00590381;RO=0;SAF=8;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000126112;OID=.;OPOS=23686598;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:3:8:0:0:3:8:0:0
chr15	23686673	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00749158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3095;QD=51.9166;RBI=0.0611573;REFB=0;REVB=0.0606967;RO=0;SAF=20;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78928e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00184409;OID=.;OPOS=23686673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:1:20:0:0:1:20:0:0
chr15	23687214	.	C	G	1314.16	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221874;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7955;QD=61.8429;RBI=0.0279259;REFB=0;REVB=-0.016958;RO=0;SAF=28;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000557088;OID=.;OPOS=23687214;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:85:0:0:83:85:1:55:28:0:0:57:28:0:0
chr15	23688944	.	A	G	1102.04	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0089914;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5555;QD=60.3858;RBI=0.0160022;REFB=0;REVB=0.0132372;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83709e-05;OID=.;OPOS=23688944;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:32:41:0:0:32:41:0:0
chr15	23889033	.	G	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0408852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.946;QD=48.737;RBI=0.0422936;REFB=0;REVB=0.0108233;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358741;OID=.;OPOS=23889033;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0
chr15	24921771	.	G	C	180.3	PASS	AF=0.307692;AO=24;DP=77;FAO=24;FDP=78;FR=.;FRO=54;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=-0.0647241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1497;QD=9.24622;RBI=0.0650105;REFB=-0.00626718;REVB=0.00609605;RO=49;SAF=12;SAR=12;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584886;STB=0.56405;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0124032;OID=.;OPOS=24921771;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:49:54:24:24:0.307692:12:12:27:22:12:12:32:22
chr15	24922230	.	C	G	96.57	PASS	AF=0.342857;AO=10;DP=33;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0393299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2604;QD=11.0371;RBI=0.0407764;REFB=-0.0395277;REVB=0.0107645;RO=21;SAF=3;SAR=7;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155879;STB=0.66637;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.06376;OID=.;OPOS=24922230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:33:35:21:23:10:12:0.342857:7:3:9:12:9:3:11:12
chr15	24923390	.	C	T	203.6	PASS	AF=0.526316;AO=14;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0803116;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.3178;QD=21.4314;RBI=0.154736;REFB=-0.0362163;REVB=0.132262;RO=17;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253949;STB=0.583704;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0432159;OID=.;OPOS=24923390;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:17:18:14:20:0.526316:7:7:4:13:11:9:5:13
chr15	24925133	.	T	G	103.33	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0556197;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.1533;QD=18.7877;RBI=0.0590229;REFB=-0.00487195;REVB=-0.0197523;RO=10;SAF=6;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159197;STB=0.590762;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.00852191;OID=.;OPOS=24925133;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:6:6:3:7:6:6:3:7
chr15	25307562	.	A	G	833.5	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.308;QD=57.483;RBI=0.0347821;REFB=0;REVB=0.0315377;RO=0;SAF=41;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.47831e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.55444e-05;OID=.;OPOS=25307562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:58:0:0:55:58:1:14:41:0:0:15:43:0:0
chr15	25423956	.	C	T	182.15	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0229027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.809;QD=16.9444;RBI=0.0261388;REFB=-0.0229225;REVB=-0.0125978;RO=24;SAF=9;SAR=10;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187431;STB=0.606688;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0323428;OID=.;OPOS=25423956;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:10:9:16:8:10:9:16:8
chr15	25425643	.	C	T	382.4	PASS	AF=0.654545;AO=36;DP=56;FAO=36;FDP=55;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0225577;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.659;QD=27.8112;RBI=0.0238915;REFB=-0.0237355;REVB=0.00787114;RO=19;SAF=15;SAR=21;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103595;STB=0.556543;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0101725;OID=.;OPOS=25425643;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:19:19:36:36:0.654545:21:15:11:8:21:15:11:8
chr15	25429458	.	A	G	273.3	PASS	AF=0.685714;AO=24;DP=35;FAO=24;FDP=35;FR=.;FRO=11;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.085666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.642;QD=31.2339;RBI=0.0908127;REFB=0.0173431;REVB=0.0301375;RO=11;SAF=18;SAR=6;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0536778;STB=0.529388;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=-0.00905223;OID=.;OPOS=25429458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:11:11:24:24:0.685714:6:18:9:2:6:18:9:2
chr15	25434642	.	C	T	361.97	PASS	AF=0.469136;AO=38;DP=81;FAO=38;FDP=81;FR=.;FRO=43;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=33;FSRR=10;FWDB=-0.00993257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.006;QD=17.8749;RBI=0.0311982;REFB=-0.00593098;REVB=-0.0295749;RO=43;SAF=23;SAR=15;SRF=33;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168767;STB=0.593594;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00711728;OID=.;OPOS=25434642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:43:43:38:38:0.469136:15:23:33:10:15:23:33:10
chr15	25438493	.	A	G	415.65	PASS	AF=0.446602;AO=46;DP=103;FAO=46;FDP=103;FR=.;FRO=57;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.0469748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3878;QD=16.1417;RBI=0.0540758;REFB=-0.0252074;REVB=-0.0267874;RO=56;SAF=27;SAR=19;SRF=28;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864812;STB=0.543916;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0472379;OID=.;OPOS=25438493;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:56:57:46:46:0.446602:19:27:28:28:19:27:29:28
chr15	25926179	.	C	T	675.24	PASS	AF=0.59596;AO=59;DP=100;FAO=59;FDP=99;FR=.;FRO=40;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=20;FWDB=0.0150447;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.974;QD=27.2824;RBI=0.0152578;REFB=-0.0202682;REVB=-0.00254078;RO=38;SAF=34;SAR=25;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0365782;STB=0.531239;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0290157;OID=.;OPOS=25926179;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:99:38:40:59:59:0.59596:25:34:20:18:25:34:20:20
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chr15	28362459	.	G	A	770.59	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0143553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.584;QD=55.042;RBI=0.02067;REFB=-0.0683891;REVB=0.0148719;RO=1;SAF=36;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0241604;STB=0.512816;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00342654;OID=.;OPOS=28362459;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:1:1:55:55:0.982143:19:36:0:1:19:36:0:1
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chr15	28422609	.	C	T	1135.25	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.72;QD=60.5467;RBI=0.0175904;REFB=0;REVB=0.00937581;RO=0;SAF=43;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.46582e-05;OID=.;OPOS=28422609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:32:43:0:0:32:43:0:0
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chr15	28632793	.	G	A	64.86	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0194003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.913;QD=10.3769;RBI=0.0206237;REFB=-0.0208212;REVB=-0.00699754;RO=15;SAF=2;SAR=7;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147874;STB=0.621926;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0490974;OID=.;OPOS=28632793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:24:25:15:16:9:9:0.36:7:2:5:10:7:2:6:10
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chr15	29410238	.	A	G	437.88	PASS	AF=0.4375;AO=49;DP=112;FAO=49;FDP=112;FR=.;FRO=63;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=38;FWDB=-0.0054391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.775;QD=15.6386;RBI=0.0187183;REFB=-0.0125104;REVB=-0.0179107;RO=63;SAF=32;SAR=17;SRF=25;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258537;STB=0.644865;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0178958;OID=.;OPOS=29410238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:63:63:49:49:0.4375:17:32:25:38:17:32:25:38
chr15	29415560	.	G	A	182.12	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0395362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.702;QD=16.9413;RBI=0.0417705;REFB=-0.0160259;REVB=0.0134781;RO=24;SAF=12;SAR=7;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00687748;STB=0.503933;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0115033;OID=.;OPOS=29415560;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:7:12:15:9:7:12:15:9
chr15	29415698	.	A	G	1546.91	PASS	AF=1;AO=93;DP=99;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02682;FXX=0.0202;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.624;QD=63.7901;RBI=0.0272714;REFB=0;REVB=0.0049412;RO=0;SAF=60;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000364117;OID=.;OPOS=29415698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:97:0:0:93:97:1:33:60:0:0:36:61:0:0
chr15	29418520	.	C	T	310.36	PASS	AF=0.551724;AO=32;DP=58;FAO=32;FDP=58;FR=.;FRO=26;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0328872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.7048;QD=21.4041;RBI=0.0330677;REFB=-0.0294473;REVB=-0.00345038;RO=25;SAF=22;SAR=10;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0304119;STB=0.522945;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.021129;OID=.;OPOS=29418520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:25:26:32:32:0.551724:10:22:18:7:10:22:19:7
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chr15	30008889	.	G	A	847.6	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126627;FXX=0.0166639;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.392;QD=57.4642;RBI=0.0149388;REFB=0;REVB=-0.00792621;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.74692e-05;OID=.;OPOS=30008889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:60:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0
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chr15	31362654	.	G	A	132.17	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00172019;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.234;QD=13.9122;RBI=0.00331214;REFB=-0.0194034;REVB=-0.00283041;RO=22;SAF=12;SAR=3;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393032;STB=0.722566;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0291153;OID=.;OPOS=31362654;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:23:15:15:0.394737:3:12:10:12:3:12:11:12
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chr15	33023951	.	T	C	638.12	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.354;QD=60.7732;RBI=0.0641018;REFB=0;REVB=0.0351579;RO=1;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0302369;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000525406;OID=.;OPOS=33023951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:1:0:40:42:1:15:25:0:1:16:26:0:0
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chr15	33024567	.	C	T	54.32	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0890821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.7589;QD=8.69066;RBI=0.0890978;REFB=-0.00756552;REVB=0.00167117;RO=17;SAF=4;SAR=4;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.298145;STB=0.679608;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00959044;OID=.;OPOS=33024567;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:4:4:13:4:4:4:13:4
chr15	33024767	.	A	G	575.04	PASS	AF=0.64557;AO=51;DP=79;FAO=51;FDP=79;FR=.;FRO=28;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00535608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.561;QD=29.116;RBI=0.0201971;REFB=-0.0466436;REVB=0.019474;RO=28;SAF=27;SAR=24;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192351;STB=0.510444;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0282001;OID=.;OPOS=33024767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:28:28:51:51:0.64557:24:27:14:14:24:27:14:14
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chr15	33025979	.	C	T	87.3	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.0892232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0366;QD=13.4302;RBI=0.0901187;REFB=0.0100689;REVB=-0.0126722;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272488;STB=0.661345;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=-0.0195594;OID=.;OPOS=33025979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:3:8:7:8:3:8:7:8
chr15	33026667	.	A	T	128.7	PASS	AF=0.454545;AO=14;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0300668;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.0262;QD=15.5996;RBI=0.0364623;REFB=-0.081312;REVB=0.0206274;RO=18;SAF=2;SAR=12;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478053;STB=0.721898;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.104139;OID=.;OPOS=33026667;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:14:15:0.454545:12:2:10:8:12:3:10:8
chr15	33091079	.	A	G	291.29	PASS	AF=0.457143;AO=32;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.029498;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.1729;QD=16.6449;RBI=0.029577;REFB=0.00300598;REVB=0.00216035;RO=37;SAF=15;SAR=17;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941476;STB=0.545426;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.00292702;OID=.;OPOS=33091079;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:37:38:32:32:0.457143:17:15:21:16:17:15:21:17
chr15	33191023	.	A	G	1039.99	PASS	AF=1;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175318;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.353;QD=59.4278;RBI=0.0192596;REFB=0;REVB=0.00797288;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.8649e-05;OID=.;OPOS=33191023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:69:70:1:30:39:0:0:31:39:0:0
chr15	33261232	.	G	A	62.25	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00249849;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.6827;QD=35.5741;RBI=0.00249849;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.73711e-05;OID=.;OPOS=33261232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:0:7:0:0:0:7:0:0
chr15	33359574	.	C	A	740.98	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0774691;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.4709;QD=56.9986;RBI=0.0782557;REFB=0;REVB=-0.0110674;RO=1;SAF=24;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192104;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000805813;OID=.;OPOS=33359574;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:1:0:50:52:1:26:24:1:0:26:26:0:0
chr15	33445983	.	G	A	54.0	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0314039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.248;QD=8.30761;RBI=0.0346062;REFB=-0.00840035;REVB=-0.0145391;RO=18;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251967;STB=0.653498;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00601332;OID=.;OPOS=33445983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:18:18:8:8:0.307692:4:4:5:13:4:4:5:13
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chr15	34522985	.	C	G	1575.02	PASS	AF=1;AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0359321;FXX=0.019998;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0779;QD=64.2864;RBI=0.0517996;REFB=0;REVB=0.0373107;RO=0;SAF=51;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.38824e-05;OID=.;OPOS=34522985;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:98:0:0:98:98:1:47:51:0:0:47:51:0:0
chr15	34524995	.	G	T	1207.25	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.264;QD=61.1264;RBI=0.0225563;REFB=0;REVB=0.000330329;RO=0;SAF=32;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.65984e-05;OID=.;OPOS=34524995;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:77:79:1:45:32:0:0:45:34:0:0
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chr15	34648935	.	G	T	113.09	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0219172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.761;QD=17.3989;RBI=0.0348453;REFB=-0.0217168;REVB=-0.0270893;RO=13;SAF=9;SAR=4;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391457;STB=0.723805;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.025755;OID=.;OPOS=34648935;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:4:9:3:10:4:9:3:10
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chr15	35045312	.	T	A	36.87	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0572415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.221;QD=7.76204;RBI=0.060379;REFB=-0.007499;REVB=-0.0192103;RO=13;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125021;STB=0.578691;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0149131;OID=.;OPOS=35045312;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:13:13:6:6:0.315789:3:3:8:5:3:3:8:5
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chr15	35256624	.	C	G	579.41	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228788;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.256;QD=60.9907;RBI=0.0229955;REFB=0;REVB=0.00231376;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.14457e-05;OID=.;OPOS=35256624;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:38:0:0:38:38:1:12:26:0:0:12:26:0:0
chr15	35272234	.	C	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.893;QD=33.4285;RBI=0.0560205;REFB=0;REVB=-0.0178147;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000393606;OID=.;OPOS=35272234;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
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chr15	37173267	.	G	A	169.84	PASS	AF=0.34375;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=64;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0399881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.4359;QD=10.6148;RBI=0.103208;REFB=-0.0182248;REVB=-0.0951469;RO=41;SAF=12;SAR=10;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0730491;STB=0.549089;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0288552;OID=.;OPOS=37173267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:41:42:22:22:0.34375:10:12:25:16:10:12:26:16
chr15	38230437	.	GA	G	125.33	PASS	AF=0.488636;AO=39;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.131043;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=8.26898;QD=5.69696;RBI=0.215882;REFB=-0.0319236;REVB=-0.171559;RO=36;SAF=15;SAR=24;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126596;STB=0.560316;STBP=0.284;TYPE=del;VARB=0.0373585;OID=.;OPOS=38230438;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.488636:39:88:43:88:45:17:26:23:22:99:36:15:24:19:17
chr15	38233869	.	T	C	990.65	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=350.345;QD=59.1432;RBI=0.0132322;REFB=0;REVB=0.00214762;RO=0;SAF=30;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.46128e-06;OID=.;OPOS=38233869;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:36:30:0:0:36:31:0:0
chr15	38235521	.	T	A	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419951;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9901;QD=58.1403;RBI=0.0998577;REFB=0;REVB=0.0905979;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00161472;OID=.;OPOS=38235521;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0
chr15	38614525	.	G	A	1340.76	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00717113;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=345.464;QD=62.3607;RBI=0.0140147;REFB=0;REVB=0.012041;RO=0;SAF=43;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.16871e-06;OID=.;OPOS=38614525;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:86:0:0:82:86:1:39:43:0:0:40:46:0:0
chr15	38643574	.	T	C	904.01	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282789;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.048;QD=58.3231;RBI=0.0431285;REFB=0;REVB=0.0325634;RO=0;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029571;OID=.;OPOS=38643574;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:29:33:0:0:29:33:0:0
chr15	38857631	.	C	G	200.95	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.014396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.258;QD=15.1658;RBI=0.0323101;REFB=0.00611932;REVB=-0.0289258;RO=30;SAF=10;SAR=13;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13075;STB=0.574404;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=-0.00706991;OID=.;OPOS=38857631;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:13:10:17:13:13:10:17:13
chr15	39545032	.	T	G	1521.78	PASS	AF=0.979798;AO=97;DP=99;FAO=97;FDP=99;FR=.;FRO=2;FSAF=57;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0237051;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.449;QD=61.4861;RBI=0.0272402;REFB=-0.110721;REVB=0.0134199;RO=1;SAF=57;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117088;STB=0.512193;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.000395764;OID=.;OPOS=39545032;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:99:99:1:2:97:97:0.979798:40:57:0:1:40:57:0:2
chr15	39545148	.	C	T	301.79	PASS	AF=0.5625;AO=27;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.0124183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.721;QD=25.1492;RBI=0.0138218;REFB=-0.00428648;REVB=0.00606842;RO=21;SAF=13;SAR=14;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257972;STB=0.642104;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0043813;OID=.;OPOS=39545148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:21:27:27:0.5625:14:13:17:4:14:13:17:4
chr15	39545268	.	G	A	854.09	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-5.33732e-05;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.569;QD=57.9041;RBI=0.0253366;REFB=0;REVB=-0.0253365;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.8484e-05;OID=.;OPOS=39545268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:25:34:0:0:25:34:0:0
chr15	39546114	.	A	G	143.99	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00554918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.0987;QD=15.1567;RBI=0.0267703;REFB=0.00374206;REVB=0.0261888;RO=21;SAF=9;SAR=7;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106066;STB=0.571343;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=-0.00266436;OID=.;OPOS=39546114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:22:16:16:0.421053:7:9:14:7:7:9:15:7
chr15	39879717	.	G	A	232.95	PASS	AF=0.383562;AO=27;DP=72;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0175541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.662;QD=12.7645;RBI=0.0176457;REFB=-0.00838738;REVB=0.00179607;RO=45;SAF=17;SAR=10;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132228;STB=0.560396;STBP=0.443;TYPE=snp;VARB=0.0136951;OID=.;OPOS=39879717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:45:45:27:28:0.383562:10:17:23:22:11:17:23:22
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chr15	40226415	.	GCCCCCG	GCCCC,GCCCCG	129.53	PASS	AF=0,1;AO=4,11;DP=25;FAO=0,29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=0,26;FSAR=0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.11711,0.116826;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=9.74683,7.19993;QD=17.8656;RBI=0.210539,0.161254;REFB=0.131863,0.0211326;REVB=0.174962,0.111151;RO=6;SAF=4,11;SAR=0,0;SRF=6;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0,0.0236893;OID=.,.;OPOS=40226420,40226416;OREF=CG,C;OALT=-,-;OMAPALT=GCCCC,GCCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,1:4,11:25:0,29:29:0:0,26:0,3:0:0:4:6:4,11:0,0:6:0
chr15	40226495	.	T	C	1438.49	PASS	AF=0.96875;AO=92;DP=96;FAO=93;FDP=96;FR=.;FRO=3;FSAF=57;FSAR=36;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00541314;FXX=0.0103082;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.179;QD=59.9371;RBI=0.00570854;REFB=-4.05618e-05;REVB=0.00181257;RO=3;SAF=56;SAR=36;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247176;STB=0.512818;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=7.91075e-06;OID=.;OPOS=40226495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:96:96:3:3:92:93:0.96875:36:56:3:0:36:57:3:0
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chr15	40265799	.	A	G	83.46	PASS	AF=0.323529;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=21;FWDB=0.0148044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1475;QD=9.81924;RBI=0.0313344;REFB=-0.0071961;REVB=-0.0276166;RO=22;SAF=3;SAR=8;SRF=2;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306889;STB=0.68479;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0140938;OID=.;OPOS=40265799;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:34:22:23:11:11:0.323529:8:3:2:20:8:3:2:21
chr15	40327290	.	A	G	3837.02	PASS	AF=1;AO=248;DP=250;FAO=248;FDP=248;FR=.;FRO=0;FSAF=163;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030207;FXX=0.0119517;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.576;QD=61.8874;RBI=0.0330379;REFB=0.00504777;REVB=0.0133805;RO=1;SAF=163;SAR=85;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00557461;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.32618e-06;OID=.;OPOS=40327290;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:250:248:1:0:248:248:1:85:163:0:1:85:163:0:0
chr15	40327301	.	G	A	3779.08	PASS	AF=1;AO=236;DP=242;FAO=238;FDP=238;FR=.;FRO=0;FSAF=148;FSAR=90;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307396;FXX=0.0165282;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9588;QD=63.514;RBI=0.0417957;REFB=0;REVB=-0.0283189;RO=0;SAF=148;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168632;OID=.;OPOS=40327301;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:242:238:0:0:236:238:1:88:148:0:0:90:148:0:0
chr15	40328575	.	G	C	1056.45	PASS	AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0352084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.51;QD=57.1054;RBI=0.0671425;REFB=-0.153628;REVB=0.0571707;RO=2;SAF=29;SAR=43;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214887;STB=0.511361;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00143781;OID=.;OPOS=40328575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:74:74:2:2:72:72:0.972973:43:29:0:2:43:29:0:2
chr15	40330564	.	CT	TC,TT	510.1	PASS	AF=0,0.860465;AO=5,37;DP=43;FAO=0,37;FDP=43;FR=.;FRO=6;FSAF=0,14;FSAR=0,23;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.02398,-0.0564936;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=2,1;MLLD=242.329,62.4611;QD=47.4516;RBI=0.0311005,0.0754576;REFB=0.0214104,-0.0119139;REVB=-0.019804,-0.0500232;RO=1;SAF=0,14;SAR=5,23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.767767,-0.0322723;STB=0.5,0.531869;STBP=1,0.366;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.000245246;OID=.,.;OPOS=40330564,40330564;OREF=CT,C;OALT=TC,T;OMAPALT=TC,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:32:43:43:1:6:5,37:0,37:0,0.860465:5,23:0,14:1:0:0,23:0,14:1:5
chr15	40383347	.	T	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00989132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.328;QD=57.1775;RBI=0.0364254;REFB=0;REVB=0.0350567;RO=0;SAF=33;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-8.62909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.05125e-05;OID=.;OPOS=40383347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:18:33:0:0:18:33:0:0
chr15	40383779	.	A	C	79.41	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.00359103;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=307.706;QD=15.8821;RBI=0.0123148;REFB=0.00679042;REVB=-0.0117796;RO=10;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.033981;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00693998;OID=.;OPOS=40383779;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:9:10:0.5:3:6:7:3:3:7:7:3
chr15	40426913	.	C	A	351.87	PASS	AF=0.422222;AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0408442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.356;QD=15.6385;RBI=0.0438111;REFB=-0.0155846;REVB=-0.0158482;RO=52;SAF=21;SAR=17;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0932379;STB=0.552604;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0233813;OID=.;OPOS=40426913;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:52:52:38:38:0.422222:17:21:24:28:17:21:24:28
chr15	40477831	.	G	A	972.08	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00155375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6183;QD=58.9136;RBI=0.00958091;REFB=0;REVB=-0.00945408;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.33382e-05;OID=.;OPOS=40477831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:28:37:0:0:28:38:0:0
chr15	40488851	.	G	A	235.22	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.0335035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.252;QD=25.429;RBI=0.0335261;REFB=-0.0244439;REVB=0.00123014;RO=15;SAF=13;SAR=9;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163877;STB=0.590474;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0131985;OID=.;OPOS=40488851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:9:13:12:3:9:13:12:3
chr15	40558087	.	G	A	595.09	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0692379;FXX=0.0232504;HRUN=4;LEN=1;MLLD=105.232;QD=56.6751;RBI=0.0785445;REFB=-0.0612704;REVB=0.0370858;RO=1;SAF=7;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0623004;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00266361;OID=.;OPOS=40558087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:39:42:1:0:38:42:1:31:7:1:0:31:11:0:0
chr15	40573675	.	G	T	988.84	PASS	AF=0.972222;AO=65;DP=71;FAO=70;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=49;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0399597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.8472;QD=54.9354;RBI=0.0691632;REFB=-0.123747;REVB=0.0564514;RO=0;SAF=48;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.33797e-08;STB=0.511625;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.00188718;OID=.;OPOS=40573675;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:71:72:0:1:65:70:0.972222:17:48:0:0:21:49:0:1
chr15	40573716	.	A	G	1254.4	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00970308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.7272;QD=61.1905;RBI=0.0103445;REFB=0;REVB=-0.00358593;RO=0;SAF=54;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.81814e-05;OID=.;OPOS=40573716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:81:82:1:27:54:0:0:28:54:0:0
chr15	40581543	.	T	C	1378.87	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=324.106;QD=62.6759;RBI=0.0370686;REFB=0;REVB=0.0216954;RO=0;SAF=37;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.00059e-05;OID=.;OPOS=40581543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:88:0:0:85:88:1:48:37:0:0:49:39:0:0
chr15	40582797	.	CTG	C,GTC	227.18	PASS	AF=0.4,0.05;AO=24,3;DP=60;FAO=24,3;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=14,3;FSAR=10,0;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0119811,0.00748173;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,3;MLLD=165.407,131.176;QD=15.1452;RBI=0.0264311,0.0430045;REFB=-0.00627979,0.00921258;REVB=-0.0235597,-0.0423487;RO=32;SAF=14,3;SAR=10,0;SRF=14;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.146274,0.565111;STB=0.59176,0.996866;STBP=0.257,0.054;TYPE=del,mnp;VARB=0.00764041,-0.00408295;OID=.,.;OPOS=40582798,40582797;OREF=TG,CTG;OALT=-,GTC;OMAPALT=C,GTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:32:33:24,3:24,3:0.4,0.05:10,0:14,3:14:18:10,0:14,3:14:19
chr15	40583876	.	T	G	352.82	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.3053;QD=52.2694;RBI=0.0585081;REFB=0;REVB=0.0559239;RO=0;SAF=7;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0103692;OID=.;OPOS=40583876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:19:7:0:0:20:7:0:0
chr15	40589001	.	CA	CG,TG	1050.48	PASS	AF=0.930556,0.0694444;AO=66,5;DP=72;FAO=67,5;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=37,5;FSAR=30,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00415913,-0.00428547;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,2;MLLD=225.969,79.1007;QD=58.3599;RBI=0.00804411,0.00469996;REFB=0,0;REVB=-0.00688544,0.00192985;RO=0;SAF=36,5;SAR=30,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.000225592,-0.025725;OID=.,.;OPOS=40589002,40589001;OREF=A,CA;OALT=G,TG;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:18:72:72:0:0:66,5:67,5:0.930556,0.0694444:30,0:36,5:0:0:30,0:37,5:0:0
chr15	40590134	.	G	A	965.24	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0156781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.437;QD=57.6265;RBI=0.0284271;REFB=0;REVB=-0.0237128;RO=1;SAF=21;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106171;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.45926e-05;OID=.;OPOS=40590134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:1:0:65:67:1:44:21:0:1:46:21:0:0
chr15	40633138	.	A	T	283.5	PASS	AF=0.526316;AO=29;DP=56;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-0.00653907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2383;QD=19.895;RBI=0.0265406;REFB=-0.0195561;REVB=0.0257224;RO=26;SAF=16;SAR=13;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441436;STB=0.523061;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0216648;OID=.;OPOS=40633138;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:26:27:29:30:0.526316:13:16:13:13:13:17:14:13
chr15	40655845	.	C	G	45.52	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0343689;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.2184;QD=26.0093;RBI=0.0600772;REFB=-0.0594711;REVB=-0.0492753;RO=1;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789211;STB=0.54531;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.00591963;OID=.;OPOS=40655845;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:1:5:1:0:1:5:1:0
chr15	40655873	.	G	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00460421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.328;QD=44.6881;RBI=0.0920206;REFB=0;REVB=0.0919053;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106118;OID=.;OPOS=40655873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr15	40656141	.	T	C	140.1	PASS	AF=0.555556;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=27;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0298083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.95;QD=20.7548;RBI=0.0366763;REFB=-0.021727;REVB=-0.0213686;RO=12;SAF=2;SAR=13;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.401125;STB=0.732025;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0319417;OID=.;OPOS=40656141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:12:12:15:15:0.555556:13:2:6:6:13:2:6:6
chr15	40662501	.	G	A	169.19	PASS	AF=0.384615;AO=20;DP=52;FAO=20;FDP=52;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=26;FWDB=0.0219533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.926;QD=13.0147;RBI=0.0274892;REFB=-0.0433631;REVB=-0.0165441;RO=31;SAF=8;SAR=12;SRF=6;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242745;STB=0.643943;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0682426;OID=.;OPOS=40662501;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:32:20:20:0.384615:12:8:6:25:12:8:6:26
chr15	40710723	.	G	A	414.35	PASS	AF=0.434343;AO=42;DP=98;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0480686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0112;QD=16.7415;RBI=0.0543456;REFB=-0.0155515;REVB=0.0253545;RO=56;SAF=31;SAR=11;SRF=26;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299653;STB=0.672735;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0157928;OID=.;OPOS=40710723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:99:56:56:42:43:0.434343:11:31:26:30:11:32:26:30
chr15	40751555	.	C	A	650.88	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.8314;QD=61.9883;RBI=0.056133;REFB=0;REVB=0.0389982;RO=0;SAF=29;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000430348;OID=.;OPOS=40751555;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:12:29:0:0:13:29:0:0
chr15	40760444	.	T	A	222.01	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00883756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9588;QD=14.5582;RBI=0.0758856;REFB=0.00539479;REVB=0.0753693;RO=33;SAF=9;SAR=17;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201407;STB=0.615692;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=-0.00900513;OID=.;OPOS=40760444;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:33:35:26:26:0.42623:17:9:18:15:17:9:19:16
chr15	40764549	.	G	A	422.97	PASS	AF=0.467391;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=92;FR=.;FRO=49;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.0102747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.795;QD=18.3899;RBI=0.0106572;REFB=-0.0256169;REVB=-0.00282937;RO=47;SAF=29;SAR=14;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143161;STB=0.582163;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0255587;OID=.;OPOS=40764549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:47:49:43:43:0.467391:14:29:25:22:14:29:26:23
chr15	40849408	.	C	T	396.16	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=81;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=10;FWDB=0.00591701;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1163;QD=19.8078;RBI=0.0254472;REFB=-0.00927785;REVB=-0.0247497;RO=40;SAF=25;SAR=15;SRF=30;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124783;STB=0.568933;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.00927546;OID=.;OPOS=40849408;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:40:40:40:40:0.5:15:25:30:10:15:25:30:10
chr15	40856989	.	C	T	167.16	PASS	AF=0.4375;AO=13;DP=35;FAO=14;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.00519445;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.879;QD=20.895;RBI=0.0318393;REFB=-0.0254861;REVB=0.0314127;RO=17;SAF=4;SAR=9;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330187;STB=0.571326;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.0303692;OID=.;OPOS=40856989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:32:17:14:13:14:0.4375:9:4:11:6:8:6:8:6
chr15	40866404	.	T	G	83.9	PASS	AF=0.333333;AO=11;DP=33;FAO=11;FDP=33;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00173288;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=214.999;QD=10.1699;RBI=0.0244646;REFB=-0.00369445;REVB=-0.0244032;RO=22;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155754;STB=0.593059;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00711572;OID=.;OPOS=40866404;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:33:33:22:22:11:11:0.333333:6:5:7:15:6:5:7:15
chr15	40886017	.	C	T	201.35	PASS	AF=0.678571;AO=19;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0184677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.545;QD=28.7639;RBI=0.0404374;REFB=-0.00909176;REVB=0.0359739;RO=8;SAF=10;SAR=9;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0809901;STB=0.526288;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.00377593;OID=.;OPOS=40886017;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:8:9:19:19:0.678571:9:10:3:5:9:10:4:5
chr15	40886020	.	C	G	217.75	PASS	AF=0.714286;AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=28;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=-0.00605598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1612;QD=31.1077;RBI=0.0271242;REFB=-0.021998;REVB=-0.0264395;RO=8;SAF=11;SAR=9;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0907077;STB=0.54995;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0108521;OID=.;OPOS=40886020;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:28:28:8:8:20:20:0.714286:9:11:3:5:9:11:3:5
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chr15	40915894	.	T	C	324.68	PASS	AF=0.454545;AO=35;DP=77;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0057734;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2915;QD=16.8664;RBI=0.00618882;REFB=-0.011779;REVB=0.00222923;RO=41;SAF=22;SAR=13;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0681444;STB=0.532794;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.020571;OID=.;OPOS=40915894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:41:42:35:35:0.454545:13:22:23:18:13:22:24:18
chr15	41063244	.	C	T	67.39	PASS	AF=0.5625;AO=8;DP=17;FAO=9;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0264664;FXX=0.0587889;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.828;QD=16.8484;RBI=0.0749379;REFB=0.00886603;REVB=-0.0701086;RO=5;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121731;STB=0.538372;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=-0.0022298;OID=.;OPOS=41063244;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:17:16:5:7:8:9:0.5625:2:6:3:2:2:7:5:2
chr15	41105926	.	T	G	417.98	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.010414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.472;QD=53.9323;RBI=0.0244136;REFB=-0.0317768;REVB=0.022081;RO=1;SAF=13;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345091;STB=0.518506;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.00167514;OID=.;OPOS=41105926;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:17:13:1:0:17:13:1:0
chr15	41148163	.	C	T	148.6	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0443545;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.5982;QD=16.983;RBI=0.0449545;REFB=0.00495466;REVB=0.00732026;RO=19;SAF=9;SAR=7;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181939;STB=0.604112;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=-0.00421597;OID=.;OPOS=41148163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:7:9:7:12:7:9:7:12
chr15	41148199	.	C	T	450.91	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221398;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.259;QD=58.1824;RBI=0.0238789;REFB=0;REVB=-0.00894601;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000209919;OID=.;OPOS=41148199;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr15	41148250	.	C	T	37.04	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.00520974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.168;QD=9.25958;RBI=0.0231945;REFB=-0.00608289;REVB=0.0226018;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357304;STB=0.719306;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.01431;OID=.;OPOS=41148250;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:2:4:3:7:2:4:3:7
chr15	41149161	.	G	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.593;QD=35.5759;RBI=0.0279355;REFB=0;REVB=0.0114059;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000326478;OID=.;OPOS=41149161;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:6:1:0:0:6:1:0:0
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chr15	41271718	.	C	T	1877.27	PASS	AF=1;AO=116;DP=117;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000590652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.75;QD=61.55;RBI=0.0372302;REFB=0;REVB=0.0372255;RO=0;SAF=57;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.83607e-05;OID=.;OPOS=41271718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:122:0:0:116:122:1:59:57:0:0:64:58:0:0
chr15	41476209	.	T	C	635.88	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441406;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4994;QD=62.0369;RBI=0.0238126;REFB=0;REVB=-0.0233999;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121842;OID=.;OPOS=41476209;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr15	41476465	.	G	A	318.38	PASS	AF=0.485714;AO=34;DP=70;FAO=34;FDP=70;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.015065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.033;QD=18.193;RBI=0.0150651;REFB=-0.0048871;REVB=-6.19526e-05;RO=36;SAF=9;SAR=25;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289559;STB=0.662605;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00562594;OID=.;OPOS=41476465;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:36:36:34:34:0.485714:25:9:20:16:25:9:20:16
chr15	41483682	.	A	G	478.07	PASS	AF=0.608108;AO=42;DP=70;FAO=45;FDP=74;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.00199873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1011;QD=25.8414;RBI=0.021882;REFB=-0.0339611;REVB=0.0217905;RO=22;SAF=13;SAR=29;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162067;STB=0.626573;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.025391;OID=.;OPOS=41483682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:74:22:29:42:45:0.608108:29:13:12:10:32:13:17:12
chr15	41484287	.	C	A	257.76	PASS	AF=0.676471;AO=23;DP=34;FAO=23;FDP=34;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.00636283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=325.267;QD=30.3242;RBI=0.0122548;REFB=-0.0187784;REVB=0.0104735;RO=11;SAF=8;SAR=15;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276352;STB=0.652041;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0080261;OID=.;OPOS=41484287;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:11:11:23:23:0.676471:15:8:9:2:15:8:9:2
chr15	41484314	.	C	T	251.18	PASS	AF=0.758621;AO=21;DP=29;FAO=22;FDP=29;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00970097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.009;QD=34.6458;RBI=0.0416985;REFB=-0.0115228;REVB=0.0405544;RO=8;SAF=6;SAR=15;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250411;STB=0.601911;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.00518931;OID=.;OPOS=41484314;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:29:29:8:7:21:22:0.758621:15:6:6:2:15:7:5:2
chr15	41509288	.	T	A	39.63	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0206956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.368;QD=13.2086;RBI=0.0548009;REFB=-0.0120931;REVB=0.0507428;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327571;STB=0.687061;STBP=0.76;TYPE=snp;VARB=0.0185912;OID=.;OPOS=41509288;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:1:5:6:0:1:5:6:0
chr15	41805237	.	C	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00238178;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.199;QD=50.4124;RBI=0.0877909;REFB=0;REVB=-0.0877586;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000175182;OID=.;OPOS=41805237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:5:14:0:0:5:14:0:0
chr15	41815516	.	G	C	873.98	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430888;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.536;QD=58.265;RBI=0.0434424;REFB=0;REVB=0.00553137;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.55136e-05;OID=.;OPOS=41815516;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:33:27:0:0:33:27:0:0
chr15	41820200	.	C	T	468.4	PASS	AF=0.894737;AO=34;DP=38;FAO=34;FDP=38;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0289442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.133;QD=49.305;RBI=0.032341;REFB=-0.139367;REVB=0.0144281;RO=1;SAF=16;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0283217;STB=0.529394;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00143363;OID=.;OPOS=41820200;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:38:38:1:4:34:34:0.894737:18:16:1:0:18:16:3:1
chr15	41991315	.	A	T	766.35	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1934;QD=63.8624;RBI=0.0217051;REFB=0;REVB=0.0175466;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.48852e-05;OID=.;OPOS=41991315;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0
chr15	42026764	.	C	T	2109.82	PASS	AF=1;AO=133;DP=133;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.583;QD=62.513;RBI=0.0510188;REFB=0;REVB=0.0475413;RO=0;SAF=79;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76961e-05;OID=.;OPOS=42026764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:135:0:0:133:135:1:54:79:0:0:55:80:0:0
chr15	42041712	.	G	A	306.66	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.812;QD=53.3317;RBI=0.0288118;REFB=0;REVB=0.0106093;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124141;OID=.;OPOS=42041712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:12:10:0:0:13:10:0:0
chr15	42110289	.	ACCC	ACC,ACCG	61.5	PASS	AF=0.265625,0;AO=22,3;DP=65;FAO=17,0;FDP=64;FR=.;FRO=47;FSAF=16,0;FSAR=1,0;FSRF=35;FSRR=12;FWDB=-0.188558,-0.042357;FXX=0.0153822;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=13.205,93.6312;QD=3.84345;RBI=0.203587,0.0813721;REFB=-0.145526,-0.00934955;REVB=-0.0767707,-0.0694788;RO=35;SAF=21,3;SAR=1,0;SRF=23;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0.54955,0;SSSB=0.594689,0.465622;STB=0.802604,0.5;STBP=0.035,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0415426,0.151064;OID=.,.;OPOS=42110290,42110292;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=ACC,ACCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.265625,0:22,3:65:17,0:64:47:16,0:1,0:35:12:61:35:21,3:1,0:23:12
chr15	42111753	.	G	A	330.08	PASS	AF=1;AO=2;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.220229;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=53.4599;QD=55.014;RBI=0.220229;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=2;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139817;OID=.;OPOS=42111753;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:24:0:0:2:24:1:0:2:0:0:0:24:0:0
chr15	42113045	.	G	A	216.38	PASS	AF=0.346154;AO=27;DP=78;FAO=27;FDP=78;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.000116307;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.833;QD=11.0962;RBI=0.0108899;REFB=-0.0149467;REVB=-0.0108893;RO=51;SAF=6;SAR=21;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31704;STB=0.686125;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0298566;OID=.;OPOS=42113045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:51:51:27:27:0.346154:21:6:24:27:21:6:24:27
chr15	42129083	.	C	T	726.62	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.418;QD=63.1843;RBI=0.0594792;REFB=0;REVB=0.0535379;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180827;OID=.;OPOS=42129083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:20:24:0:0:20:26:0:0
chr15	42134097	.	C	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.015;QD=48.7368;RBI=0.0507207;REFB=0;REVB=0.0440353;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000599483;OID=.;OPOS=42134097;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr15	42135988	.	C	T	3578.53	PASS	AF=0.995745;AO=229;DP=240;FAO=234;FDP=235;FR=.;FRO=1;FSAF=125;FSAR=109;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0322856;FXX=0.0208325;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.111;QD=60.9112;RBI=0.0607806;REFB=-0.206765;REVB=0.0514968;RO=2;SAF=123;SAR=106;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0076849;STB=0.502283;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00108842;OID=.;OPOS=42135988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:240:235:2:1:229:234:0.995745:106:123:2:0:109:125:0:1
chr15	42138321	.	A	G	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.351;QD=45.8068;RBI=0.10945;REFB=0;REVB=0.106566;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000460146;OID=.;OPOS=42138321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0
chr15	42139642	.	C	T	665.04	PASS	AF=0.957447;AO=44;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0634113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.33;QD=56.5993;RBI=0.0731634;REFB=-0.0732473;REVB=0.0364952;RO=2;SAF=9;SAR=35;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0361527;STB=0.513883;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00104104;OID=.;OPOS=42139642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:47:47:2:2:44:45:0.957447:35:9:1:1:35:10:0:2
chr15	42149472	.	T	C	2249.57	PASS	AF=0.986207;AO=142;DP=147;FAO=143;FDP=145;FR=.;FRO=2;FSAF=63;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00980526;FXX=0.0136045;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.379;QD=62.0572;RBI=0.0326486;REFB=-0.0254048;REVB=0.0311414;RO=0;SAF=63;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506172;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.000319643;OID=.;OPOS=42149472;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:147:145:0:2:142:143:0.986207:79:63:0:0:80:63:0:2
chr15	42149506	.	G	C	1500.87	PASS	AF=0.962963;AO=104;DP=108;FAO=104;FDP=108;FR=.;FRO=4;FSAF=40;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0102392;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.105;QD=55.5876;RBI=0.0178013;REFB=-0.0851047;REVB=0.0145618;RO=4;SAF=40;SAR=64;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00853832;STB=0.504504;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.000777743;OID=.;OPOS=42149506;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:108:108:4:4:104:104:0.962963:64:40:2:2:64:40:2:2
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chr15	42284974	.	G	A	337.05	PASS	AF=0.455696;AO=35;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.00977904;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.593;QD=17.0657;RBI=0.0217465;REFB=-0.00668171;REVB=-0.0194237;RO=43;SAF=20;SAR=15;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193703;STB=0.598832;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.00947543;OID=.;OPOS=42284974;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:43:43:35:36:0.455696:15:20:16:27:16:20:16:27
chr15	42287578	.	G	A	326.05	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.000367406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.707;QD=17.3892;RBI=0.011801;REFB=0.00187064;REVB=0.0117953;RO=40;SAF=19;SAR=16;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104038;STB=0.558107;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=-0.0036837;OID=.;OPOS=42287578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:40:35:35:0.466667:16:19:26:14:16:19:26:14
chr15	42287606	.	T	C	395.93	PASS	AF=0.512821;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0269999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.18;QD=20.304;RBI=0.0281937;REFB=-0.00759521;REVB=-0.00811734;RO=37;SAF=24;SAR=16;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0530616;STB=0.536824;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00921933;OID=.;OPOS=42287606;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:37:38:40:40:0.512821:16:24:20:17:16:24:20:18
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chr15	42342818	.	G	A	506.44	PASS	AF=0.44;AO=55;DP=125;FAO=55;FDP=125;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=49;FSRR=21;FWDB=-0.00533215;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.467;QD=16.2061;RBI=0.00578322;REFB=-0.0163741;REVB=0.00223915;RO=63;SAF=22;SAR=33;SRF=44;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.280876;STB=0.663495;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0110712;OID=.;OPOS=42342818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:63:70:55:55:0.44:33:22:44:19:33:22:49:21
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chr15	42361118	.	T	TG	38.98	PASS	AF=0.186441;AO=14;DP=60;FAO=11;FDP=59;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.0953106;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=38.2104;QD=2.64262;RBI=0.146901;REFB=-0.016196;REVB=-0.111785;RO=46;SAF=11;SAR=3;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329359;STB=0.754737;STBP=0.088;TYPE=ins;VARB=0.105617;OID=.;OPOS=42361119;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.186441:14:60:11:59:48:9:2:26:22:38:46:11:3:25:21
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chr15	42444918	.	C	G	81.78	PASS	AF=0.272727;AO=11;DP=43;FAO=12;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=23;FWDB=-0.0719715;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=24.9004;QD=7.43428;RBI=0.0837029;REFB=-0.0509572;REVB=0.042735;RO=24;SAF=9;SAR=2;SRF=4;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.65439;STB=0.88599;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.117325;OID=.;OPOS=42444918;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:43:44:24:29:11:12:0.272727:2:9:4:20:2:10:6:23
chr15	42444920	.	GA	AC	76.53	PASS	AF=0.255814;AO=10;DP=44;FAO=11;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0946617;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=33.0413;QD=7.11912;RBI=0.193712;REFB=-0.0207352;REVB=-0.169007;RO=27;SAF=9;SAR=1;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.672477;STB=0.861488;STBP=0.015;TYPE=mnp;VARB=0.058164;OID=.;OPOS=42444920;OREF=GA;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:44:43:27:32:10:11:0.255814:1:9:8:19:2:9:9:23
chr15	42445554	.	G	T	281.41	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.00165468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.965;QD=19.4077;RBI=0.0250631;REFB=-0.00391437;REVB=-0.0250084;RO=28;SAF=19;SAR=11;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239251;STB=0.633244;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00518668;OID=.;OPOS=42445554;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:28:28:30:30:0.517241:11:19:10:18:11:19:10:18
chr15	42528523	.	G	A	224.61	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00521355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.617;QD=17.6167;RBI=0.00753592;REFB=-0.0235076;REVB=-0.00544142;RO=27;SAF=19;SAR=5;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235645;STB=0.634532;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.022415;OID=.;OPOS=42528523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:5:19:16:11:5:19:16:11
chr15	42529739	.	T	C	203.57	PASS	AF=0.540541;AO=19;DP=36;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0100127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.888;QD=22.0073;RBI=0.0327685;REFB=-0.0281253;REVB=0.0312013;RO=17;SAF=15;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159169;STB=0.596909;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0234858;OID=.;OPOS=42529739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:17:17:19:20:0.540541:4:15:11:6:4:16:11:6
chr15	42553217	.	AAT	A,AA,AAA	350.08	PASS	AF=1,0,0;AO=10,10,5;DP=26;FAO=26,0,0;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10,0,0;FSAR=16,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02977,0.012562,0.00142884;FXX=0;HRUN=7,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=326.182,322.754,317.541;QD=53.8582;RBI=0.0514472,0.0473953,0.0488836;REFB=0,0,0;REVB=-0.041959,-0.0457002,-0.0488627;RO=1;SAF=7,3,0;SAR=3,7,5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.126911,0.0596689,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.000789023,-0.0166946,0;OID=.,.,.;OPOS=42553218,42553219,42553219;OREF=AT,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=A,AA,AAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0,0:10,10,5:26:26,0,0:26:0:10,0,0:16,0,0:0:0:4:1:7,3,0:3,7,5:0:1
chr15	42568547	.	C	G	617.01	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014179;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.085;QD=61.7009;RBI=0.024282;REFB=0;REVB=0.0197123;RO=0;SAF=15;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136599;OID=.;OPOS=42568547;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:25:15:0:0:25:15:0:0
chr15	42570718	.	A	G	375.99	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0692353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.48;QD=55.7021;RBI=0.0789654;REFB=0;REVB=0.0379737;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346725;OID=.;OPOS=42570718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:11:15:0:0:11:16:0:0
chr15	42575963	.	A	G	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000782378;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.094;QD=58.6004;RBI=0.090429;REFB=0;REVB=0.0904256;RO=0;SAF=24;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293036;OID=.;OPOS=42575963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:40:24:0:0:40:24:0:0
chr15	42579948	.	T	C	891.46	PASS	AF=1;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.026797;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.232;QD=58.4566;RBI=0.0268596;REFB=0;REVB=-0.00183249;RO=0;SAF=36;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.28661e-05;OID=.;OPOS=42579948;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:61:0:0:61:61:1:25:36:0:0:25:36:0:0
chr15	42681199	.	G	A	208.43	PASS	AF=0.351351;AO=26;DP=75;FAO=26;FDP=74;FR=.;FRO=48;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0511835;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1969;QD=11.2666;RBI=0.0546132;REFB=-0.00805529;REVB=-0.0190486;RO=48;SAF=16;SAR=10;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131233;STB=0.576212;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00847271;OID=.;OPOS=42681199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:48:48:26:26:0.351351:10:16:24:24:10:16:24:24
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chr15	43531411	.	G	C	67.42	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.00584082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.182;QD=13.4846;RBI=0.0304125;REFB=0.00746775;REVB=0.0298463;RO=11;SAF=5;SAR=4;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166393;STB=0.597497;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=-0.0133933;OID=.;OPOS=43531411;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:4:5:8:3:4:5:8:3
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chr15	44061802	.	C	T	799.73	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0362322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.4219;QD=57.1236;RBI=0.0381516;REFB=0;REVB=0.0119488;RO=0;SAF=20;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167964;OID=.;OPOS=44061802;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:35:20:0:0:36:20:0:0
chr15	44120559	.	T	G	1089.06	PASS	AF=1;AO=49;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.118509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.374;QD=58.083;RBI=0.126136;REFB=0;REVB=0.0431983;RO=0;SAF=29;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000424907;OID=.;OPOS=44120559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:49:75:1:20:29:0:0:35:40:0:0
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chr15	44943757	.	A	G	868.21	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00568221;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=296.893;QD=57.8808;RBI=0.0128125;REFB=0;REVB=0.0114836;RO=0;SAF=36;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.9695e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.08202e-06;OID=.;OPOS=44943757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:24:36:0:0:24:36:0:0
chr15	44966389	.	T	C	255.9	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00429839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8707;QD=51.1811;RBI=0.0445419;REFB=0;REVB=-0.044334;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000842879;OID=.;OPOS=44966389;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr15	45047134	.	G	A	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.082;QD=60.9769;RBI=0.030518;REFB=0;REVB=0.0229812;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011012;OID=.;OPOS=45047134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0
chr15	45047550	.	C	T	651.82	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.792;QD=62.0783;RBI=0.0420635;REFB=0;REVB=0.0366858;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.89348e-05;OID=.;OPOS=45047550;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:23:18:0:0:24:18:0:0
chr15	45047573	.	C	T	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.623;QD=60.6092;RBI=0.0354012;REFB=0;REVB=0.0123416;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.57815e-05;OID=.;OPOS=45047573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0
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chr15	45400358	.	C	G	825.06	PASS	AF=0.910448;AO=45;DP=66;FAO=61;FDP=67;FR=.;FRO=6;FSAF=50;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0160141;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=205.891;QD=49.2571;RBI=0.0209808;REFB=0.0867167;REVB=0.0135552;RO=0;SAF=35;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.64128e-08;STB=0.502074;STBP=0.994;TYPE=snp;VARB=-0.000813143;OID=.;OPOS=45400358;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:66:67:0:6:45:61:0.910448:10:35:0:0:11:50:5:1
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chr15	45408933	.	T	C	1084.42	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0235103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.255;QD=58.6174;RBI=0.0350469;REFB=-0.128968;REVB=0.0259914;RO=1;SAF=34;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013709;STB=0.507244;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.000614979;OID=.;OPOS=45408933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:39:34:1:0:39:34:1:0
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chr15	45457458	.	G	T	1614.64	PASS	AF=0.944;AO=112;DP=124;FAO=118;FDP=125;FR=.;FRO=7;FSAF=64;FSAR=54;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.000492937;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.0016;QD=51.6686;RBI=0.129311;REFB=-0.19611;REVB=0.12931;RO=12;SAF=64;SAR=48;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441732;STB=0.509711;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.01926;OID=.;OPOS=45457458;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:124:125:12:7:112:118:0.944:48:64:4:8:54:64:5:2
chr15	45467540	.	C	G	412.33	PASS	AF=1;AO=25;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0700342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.753;QD=56.8736;RBI=0.0721145;REFB=0;REVB=0.0171967;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.5563e-05;OID=.;OPOS=45467540;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:25:29:1:15:10:0:0:15:14:0:0
chr15	45491082	.	G	A	265.21	PASS	AF=0.461538;AO=30;DP=66;FAO=30;FDP=65;FR=.;FRO=35;FSAF=27;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.00628057;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.181;QD=16.3204;RBI=0.0505105;REFB=-0.0203552;REVB=0.0501185;RO=36;SAF=27;SAR=3;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.468747;STB=0.760976;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.020946;OID=.;OPOS=45491082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:65:36:35:30:30:0.461538:3:27:21:15:3:27:21:14
chr15	45653707	.	T	C	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0209791;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=326.543;QD=60.6103;RBI=0.0276962;REFB=0;REVB=0.018082;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.33216e-05;OID=.;OPOS=45653707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:23:15:0:0:23:15:0:0
chr15	45654327	.	A	G	1486.95	PASS	AF=0.989691;AO=95;DP=97;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00171198;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.004;QD=61.3177;RBI=0.0861469;REFB=-0.142938;REVB=0.0861299;RO=1;SAF=70;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00672699;STB=0.503545;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.00270304;OID=.;OPOS=45654327;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:97:1:1:95:96:0.989691:25:70:1:0:26:70:1:0
chr15	45661678	.	T	A	1877.86	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.29;QD=61.5693;RBI=0.0256545;REFB=0;REVB=0.0208564;RO=0;SAF=72;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.83711e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.26465e-05;OID=.;OPOS=45661678;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:122:122:1:50:72:0:0:50:72:0:0
chr15	45694866	.	GCCCCG	GCCC,GCCCG	83.76	PASS	AF=0.625,0;AO=8,2;DP=15;FAO=10,0;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=7,0;FSAR=3,0;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.145888,-0.0119869;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=38.3679,20.2201;QD=20.9408;RBI=0.148277,0.040375;REFB=-0.0584936,-0.0431672;REVB=0.0265058,-0.0385545;RO=5;SAF=5,2;SAR=3,0;SRF=3;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0175135,0.589598;STB=0.514676,0.5;STBP=0.967,1;TYPE=del,del;VARB=0.0417248,0;OID=.,.;OPOS=45694870,45694867;OREF=CG,C;OALT=-,-;OMAPALT=GCCC,GCCCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.625,0:8,2:15:10,0:16:6:7,0:3,0:4:2:37:5:5,2:3,0:3:2
chr15	45694891	.	G	A	38.29	PASS	AF=0.4;AO=5;DP=14;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.196923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=41.7729;QD=10.2094;RBI=0.232897;REFB=-0.0191018;REVB=0.124348;RO=8;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0987559;STB=0.533223;STBP=0.909;TYPE=snp;VARB=0.0488997;OID=.;OPOS=45694891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:15:8:9:5:6:0.4:2:3:4:4:3:3:5:4
chr15	45695695	.	G	A	2532.61	PASS	AF=0.971098;AO=168;DP=173;FAO=168;FDP=173;FR=.;FRO=5;FSAF=80;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0603815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4773;QD=58.5575;RBI=0.0812831;REFB=-0.0927617;REVB=0.0544153;RO=3;SAF=80;SAR=88;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159453;STB=0.513811;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00139159;OID=.;OPOS=45695695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:173:173:3:5:168:168:0.971098:88:80:0:3:88:80:0:5
chr15	45779810	.	G	A	417.36	PASS	AF=0.5;AO=42;DP=84;FAO=42;FDP=84;FR=.;FRO=42;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=-0.0221869;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.066;QD=19.8744;RBI=0.0229403;REFB=0.000863109;REVB=0.00583079;RO=42;SAF=26;SAR=16;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152541;STB=0.584734;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=-0.00115973;OID=.;OPOS=45779810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:42:42:42:42:0.5:16:26:19:23:16:26:19:23
chr15	45781192	.	G	A	310.6	PASS	AF=0.447368;AO=34;DP=76;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=14;FWDB=0.0604175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7914;QD=16.3473;RBI=0.0670205;REFB=-0.0205445;REVB=0.0290082;RO=42;SAF=19;SAR=15;SRF=28;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109308;STB=0.561271;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0116292;OID=.;OPOS=45781192;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:42:42:34:34:0.447368:15:19:28:14:15:19:28:14
chr15	48052595	.	A	C	390.77	PASS	AF=0.416667;AO=44;DP=107;FAO=45;FDP=108;FR=.;FRO=63;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=41;FSRR=22;FWDB=0.00596175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.563;QD=14.473;RBI=0.00863416;REFB=0.00190348;REVB=-0.00624551;RO=63;SAF=22;SAR=22;SRF=41;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157849;STB=0.581783;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=-0.00232617;OID=.;OPOS=48052595;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:63:63:44:45:0.416667:22:22:41:22:22:23:41:22
chr15	48053229	.	C	A	194.58	PASS	AF=0.444444;AO=19;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=0.000602993;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.2807;QD=17.296;RBI=0.104443;REFB=-0.0311852;REVB=-0.104441;RO=25;SAF=11;SAR=8;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148152;STB=0.57136;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=0.0371879;OID=.;OPOS=48053229;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:19:20:0.444444:8:11:18:7:8:12:18:7
chr15	48056219	.	A	G	506.81	PASS	AF=0.494949;AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=43;FSRR=7;FWDB=0.0256241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0141;QD=20.4772;RBI=0.0256407;REFB=0.00392998;REVB=-0.000922966;RO=50;SAF=21;SAR=28;SRF=43;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381952;STB=0.709066;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00210314;OID=.;OPOS=48056219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:50:50:49:49:0.494949:28:21:43:7:28:21:43:7
chr15	48058071	.	G	A	190.08	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0357225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.53;QD=13.1087;RBI=0.0414148;REFB=-0.0348246;REVB=-0.0209544;RO=35;SAF=8;SAR=15;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00576295;STB=0.503308;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0389649;OID=.;OPOS=48058071;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:15:8:12:23:15:8:12:23
chr15	48063076	.	T	C	1766.62	PASS	AF=1;AO=116;DP=116;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.424;QD=60.918;RBI=0.02174;REFB=0;REVB=0.0135953;RO=0;SAF=78;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.54148e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43493e-05;OID=.;OPOS=48063076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:116:116:0:0:116:116:1:38:78:0:0:38:78:0:0
chr15	48426484	.	A	G	754.41	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00958896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.467;QD=56.9369;RBI=0.0529145;REFB=0;REVB=0.0520384;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.80498e-05;OID=.;OPOS=48426484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:32:21:0:0:32:21:0:0
chr15	48441554	.	T	C	302.78	PASS	AF=0.464789;AO=33;DP=71;FAO=33;FDP=71;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=20;FWDB=0.0312618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6134;QD=17.058;RBI=0.0415808;REFB=0.00400126;REVB=-0.0274165;RO=38;SAF=19;SAR=14;SRF=18;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0979402;STB=0.554949;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=-0.00427828;OID=.;OPOS=48441554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:38:38:33:33:0.464789:14:19:18:20:14:19:18:20
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chr15	48460927	.	C	T	1808.73	PASS	AF=1;AO=119;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0418219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.298;QD=60.2909;RBI=0.0468972;REFB=-0.125844;REVB=-0.0212197;RO=1;SAF=67;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904675;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00047158;OID=.;OPOS=48460927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:120:120:1:0:119:120:1:52:67:0:1:53:67:0:0
chr15	48495508	.	C	T	1074.83	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.081;QD=59.7128;RBI=0.0205221;REFB=0;REVB=0.00935108;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.09882e-05;OID=.;OPOS=48495508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:30:40:0:0:31:41:0:0
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chr15	48701029	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307511;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=284.233;QD=59.0182;RBI=0.030873;REFB=0;REVB=0.00274025;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.17252e-05;OID=.;OPOS=48701029;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chr15	48702457	.	C	A	892.83	PASS	AF=0.941176;AO=64;DP=68;FAO=64;FDP=68;FR=.;FRO=4;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.00514671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.353;QD=52.5192;RBI=0.0202454;REFB=-0.000410856;REVB=0.0195803;RO=4;SAF=27;SAR=37;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649856;STB=0.534472;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=-0.000104492;OID=.;OPOS=48702457;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:68:68:4:4:64:64:0.941176:37:27:4:0:37:27:4:0
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chr15	48807637	.	C	T	1832.27	PASS	AF=0.991736;AO=120;DP=122;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=63;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00139627;FXX=0.0162588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6512;QD=60.5708;RBI=0.0160445;REFB=0.0269366;REVB=0.0159836;RO=1;SAF=57;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00826089;STB=0.504347;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.00220577;OID=.;OPOS=48807637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:122:121:1:1:120:120:0.991736:63:57:1:0:63:57:1:0
chr15	49118087	.	C	T	147.94	PASS	AF=0.350877;AO=18;DP=56;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=0.00102196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.556;QD=10.3819;RBI=0.037494;REFB=-0.0174324;REVB=-0.0374801;RO=37;SAF=12;SAR=6;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561797;STB=0.51998;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0298644;OID=.;OPOS=49118087;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:37:37:18:20:0.350877:6:12:23:14:7:13:23:14
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chr15	49282543	.	T	C	494.03	PASS	AF=0.652174;AO=45;DP=69;FAO=45;FDP=69;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0283434;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.137;QD=28.6395;RBI=0.0353723;REFB=-0.0414603;REVB=-0.0211625;RO=22;SAF=18;SAR=27;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170961;STB=0.592982;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.020817;OID=.;OPOS=49282543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:22:24:45:45:0.652174:27:18:15:7:27:18:16:8
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chr15	50274641	.	T	G	353.58	PASS	AF=0.480519;AO=35;DP=76;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0682428;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.891;QD=18.3679;RBI=0.0682723;REFB=-0.00531697;REVB=-0.00200458;RO=41;SAF=21;SAR=14;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625799;STB=0.551971;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00668463;OID=.;OPOS=50274641;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:41:40:35:37:0.480519:14:21:22:19:14:23:21:19
chr15	50311135	.	C	A	514.92	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.4587;QD=58.8477;RBI=0.0503908;REFB=0;REVB=-0.0118474;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000370819;OID=.;OPOS=50311135;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:20:14:0:0:20:15:0:0
chr15	50311148	.	A	G	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00120079;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.176;QD=59.8394;RBI=0.00560687;REFB=0;REVB=-0.00547678;RO=0;SAF=16;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.12366e-05;OID=.;OPOS=50311148;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:20:16:0:0:20:16:0:0
chr15	50474766	.	A	C	347.72	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0171152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.237;QD=51.5137;RBI=0.0274517;REFB=-0.0520467;REVB=0.0214632;RO=1;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0545422;STB=0.529389;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.00053735;OID=.;OPOS=50474766;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:27:27:1:1:26:26:0.962963:8:18:0:1:8:18:0:1
chr15	50646783	.	C	T	57.08	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0979291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1845;QD=28.5399;RBI=0.0983237;REFB=-0.136271;REVB=0.00880038;RO=0;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538356;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0351897;OID=.;OPOS=50646783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:0:1:7:7:0.875:6:1:0:0:6:1:0:1
chr15	50773755	.	G	A	766.46	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.322;QD=63.8718;RBI=0.0427139;REFB=0;REVB=0.0102668;RO=0;SAF=12;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04037e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201251;OID=.;OPOS=50773755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:35:12:0:0:36:12:0:0
chr15	50853015	.	G	A	227.95	PASS	AF=0.35443;AO=28;DP=79;FAO=28;FDP=79;FR=.;FRO=51;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=-0.0297856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0263;QD=11.5415;RBI=0.0305845;REFB=-0.0146234;REVB=0.00694456;RO=50;SAF=14;SAR=14;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.08889;STB=0.544272;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.0366267;OID=.;OPOS=50853015;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:50:51:28:28:0.35443:14:14:29:21:14:14:29:22
chr15	50853054	.	G	A	472.21	PASS	AF=0.60274;AO=21;DP=74;FAO=44;FDP=73;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=25;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0142905;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=29.7762;QD=25.8742;RBI=0.261465;REFB=0.0672418;REVB=-0.261074;RO=15;SAF=10;SAR=11;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0572686;STB=0.50099;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=-0.0206104;OID=.;OPOS=50853054;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:73:15:25:21:44:0.60274:11:10:6:9:21:23:13:12
chr15	50867082	.	G	A	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.21408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7581;QD=15.3783;RBI=0.218446;REFB=-0.0527583;REVB=-0.0434555;RO=14;SAF=2;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250011;STB=0.647867;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0301899;OID=.;OPOS=50867082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:10:2:5:9:10:2:5:9
chr15	50897064	.	AT	A	60.36	PASS	AF=0.451613;AO=15;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=-0.0859159;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.9473;QD=7.78892;RBI=0.101743;REFB=-0.117674;REVB=-0.0544988;RO=15;SAF=12;SAR=3;SRF=6;SRR=9;SSEN=0.38209;SSEP=0;SSSB=0.393257;STB=0.725542;STBP=0.038;TYPE=del;VARB=0.118864;OID=.;OPOS=50897065;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.451613:15:31:14:31:17:11:3:7:10:60:15:12:3:6:9
chr15	50981098	.	T	C	221.86	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=8;FWDB=0.0316925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.573;QD=18.4881;RBI=0.0324128;REFB=-0.0344099;REVB=-0.00679503;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102583;STB=0.557949;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.0523246;OID=.;OPOS=50981098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:9:13:18:8:9:13:18:8
chr15	51217361	.	T	C	594.26	PASS	AF=0.491935;AO=58;DP=122;FAO=61;FDP=124;FR=.;FRO=63;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=35;FSRR=28;FWDB=-0.00499051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=317.555;QD=19.1695;RBI=0.00499274;REFB=-0.00645273;REVB=0.000149251;RO=62;SAF=28;SAR=30;SRF=35;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0761425;STB=0.540641;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.00624896;OID=.;OPOS=51217361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:124:62:63:58:61:0.491935:30:28:35:27:32:29:35:28
chr15	51294832	.	G	A	441.12	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=88;FAO=44;FDP=88;FR=.;FRO=44;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=29;FWDB=0.0151899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2161;QD=20.0508;RBI=0.0719362;REFB=-0.00915343;REVB=-0.0703142;RO=44;SAF=21;SAR=23;SRF=15;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124257;STB=0.56872;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0041367;OID=.;OPOS=51294832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:44:44:44:44:0.5:23:21:15:29:23:21:15:29
chr15	51502844	.	A	C	2046.66	PASS	AF=0.992754;AO=131;DP=135;FAO=137;FDP=138;FR=.;FRO=1;FSAF=82;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0483529;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.8802;QD=59.3234;RBI=0.188746;REFB=-0.143122;REVB=0.182448;RO=4;SAF=80;SAR=51;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212324;STB=0.50303;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00374074;OID=.;OPOS=51502844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:135:138:4:1:131:137:0.992754:51:80:1:3:55:82:1:0
chr15	51502986	.	G	A	1963.64	PASS	AF=1;AO=127;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113453;FXX=0.00775134;HRUN=3;LEN=1;MLLD=131.998;QD=61.3638;RBI=0.0140833;REFB=-0.0801594;REVB=0.00834407;RO=1;SAF=75;SAR=52;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00905033;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000342278;OID=.;OPOS=51502986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:128:128:1:0:127:128:1:52:75:0:1:53:75:0:0
chr15	51503881	.	T	A	447.03	PASS	AF=1;AO=28;DP=35;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109679;FXX=0.0856898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.012;QD=55.879;RBI=0.094583;REFB=0;REVB=0.093945;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00288782;OID=.;OPOS=51503881;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:35:32:0:0:28:32:1:11:17:0:0:15:17:0:0
chr15	51503897	.	G	A	435.85	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0654642;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.765;QD=54.4806;RBI=0.0667369;REFB=0.00439578;REVB=-0.0129713;RO=1;SAF=16;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282674;STB=0.515142;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.000115228;OID=.;OPOS=51503897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:15:16:1:0:15:16:1:0
chr15	51529112	.	T	C	1954.9	PASS	AF=0.992188;AO=127;DP=128;FAO=127;FDP=128;FR=.;FRO=1;FSAF=74;FSAR=53;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00850949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1774;QD=61.0905;RBI=0.00860587;REFB=-0.079787;REVB=0.00128435;RO=1;SAF=74;SAR=53;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00637866;STB=0.503355;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-9.37969e-05;OID=.;OPOS=51529112;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:128:128:1:1:127:127:0.992188:53:74:1:0:53:74:1:0
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chr15	52667552	.	G	A	1415.32	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.62;QD=62.9032;RBI=0.0252533;REFB=0;REVB=-0.018396;RO=0;SAF=46;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.50948e-06;OID=.;OPOS=52667552;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:43:46:0:0:43:47:0:0
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chr15	54008889	.	GA	G	215.75	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=67;FAO=33;FDP=66;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0449632;FXX=0.0149231;HRUN=2;LEN=1;MLLD=25.9189;QD=13.0758;RBI=0.052822;REFB=-0.0140464;REVB=-0.0277213;RO=31;SAF=21;SAR=13;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333257;STB=0.532144;STBP=0.627;TYPE=del;VARB=0.0196359;OID=.;OPOS=54008890;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:34:67:33:66:33:21:12:19:14:99:31:21:13:18:13
chr15	54306925	.	G	A	1395.08	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.082639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1376;QD=62.7001;RBI=0.0850877;REFB=0;REVB=-0.0202659;RO=0;SAF=44;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431616;OID=.;OPOS=54306925;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:89:0:0:87:89:1:43:44:0:0:43:46:0:0
chr15	54624313	.	T	A	379.53	PASS	AF=0.4875;AO=38;DP=81;FAO=39;FDP=80;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=0.00187794;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.575;QD=18.9763;RBI=0.0117618;REFB=-0.0058085;REVB=0.0116109;RO=41;SAF=21;SAR=17;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.083098;STB=0.538442;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00520806;OID=.;OPOS=54624313;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:41:41:38:39:0.4875:17:21:19:22:18:21:19:22
chr15	54841874	.	A	G	116.21	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0211208;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.614;QD=11.3379;RBI=0.0211212;REFB=-0.000930612;REVB=-0.000123384;RO=25;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380445;STB=0.723821;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00126545;OID=.;OPOS=54841874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:27:14:14:0.341463:4:10:9:16:4:10:10:17
chr15	55619796	.	T	C	755.82	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495354;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.322;QD=57.0431;RBI=0.0497169;REFB=0;REVB=0.00424373;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.95518e-05;OID=.;OPOS=55619796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:22:30:0:0:23:30:0:0
chr15	55632859	.	G	T	883.58	PASS	AF=0.984375;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0275197;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.9577;QD=55.2236;RBI=0.0370204;REFB=-0.153623;REVB=0.0247623;RO=2;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0349353;STB=0.509088;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00500055;OID=.;OPOS=55632859;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:2:1:62:63:0.984375:26:36:0:2:27:36:0:1
chr15	55759193	.	T	C	337.41	PASS	AF=0.9;AO=25;DP=29;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.140599;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.8538;QD=44.9884;RBI=0.167627;REFB=-0.0988735;REVB=0.091272;RO=2;SAF=11;SAR=14;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00834051;STB=0.555514;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0134167;OID=.;OPOS=55759193;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:29:30:2:3:25:27:0.9:14:11:1:1:15:12:3:0
chr15	56121060	.	A	C	81.16	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0357283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=103.192;QD=18.0357;RBI=0.0368346;REFB=-0.00483327;REVB=0.00895999;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0468762;STB=0.526974;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.00749545;OID=.;OPOS=56121060;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:3:7:6:2:3:7:6:2
chr15	56139153	.	T	C	423.21	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0540546;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.454;QD=56.4276;RBI=0.0961724;REFB=0;REVB=0.0795438;RO=0;SAF=26;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123587;OID=.;OPOS=56139153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:3:26:0:0:3:27:0:0
chr15	56140995	.	T	A	320.11	PASS	AF=0.4375;AO=35;DP=80;FAO=35;FDP=80;FR=.;FRO=45;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=30;FSRR=15;FWDB=-0.00411471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.476;QD=16.0054;RBI=0.00481427;REFB=-0.0280953;REVB=-0.00249927;RO=45;SAF=18;SAR=17;SRF=30;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153584;STB=0.586159;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0326001;OID=.;OPOS=56140995;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:45:45:35:35:0.4375:17:18:30:15:17:18:30:15
chr15	56152729	.	T	C	395.95	PASS	AF=0.512821;AO=40;DP=78;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0338444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.379;QD=20.3051;RBI=0.0354333;REFB=-0.00856529;REVB=-0.0104918;RO=38;SAF=22;SAR=18;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135841;STB=0.575218;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0087222;OID=.;OPOS=56152729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:38:38:40:40:0.512821:18:22:15:23:18:22:15:23
chr15	56152872	.	C	T	594.86	PASS	AF=0.568421;AO=54;DP=95;FAO=54;FDP=95;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.00496576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.619;QD=25.0469;RBI=0.0603539;REFB=-0.024017;REVB=-0.0601492;RO=41;SAF=27;SAR=27;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144511;STB=0.578919;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0147105;OID=.;OPOS=56152872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:41:41:54:54:0.568421:27:27:28:13:27:27:28:13
chr15	56207811	.	T	G	171.21	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=39;FAO=18;FDP=39;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.0135532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.801;QD=17.5598;RBI=0.0202472;REFB=-0.023317;REVB=0.0150419;RO=21;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0151842;STB=0.508661;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0222404;OID=.;OPOS=56207811;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:21:21:18:18:0.461538:8:10:12:9:8:10:12:9
chr15	56208535	.	G	A	292.76	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0238683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.929;QD=17.2211;RBI=0.0297039;REFB=-0.0121317;REVB=-0.0176813;RO=36;SAF=16;SAR=16;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262221;STB=0.514697;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0154655;OID=.;OPOS=56208535;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:16:16:19:17:16:16:19:17
chr15	56258659	.	A	T	228.85	PASS	AF=0.489362;AO=22;DP=46;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.0126573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.673;QD=19.4763;RBI=0.0300268;REFB=-0.0376542;REVB=0.0272287;RO=23;SAF=13;SAR=9;SRF=18;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188066;STB=0.602352;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0579805;OID=.;OPOS=56258659;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:23:24:22:23:0.489362:9:13:18:5:9:14:19:5
chr15	56322148	.	C	T	340.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.132024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7384;QD=54.5144;RBI=0.139887;REFB=0;REVB=-0.0462388;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00337432;OID=.;OPOS=56322148;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr15	56322156	.	T	C	340.71	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.8469;QD=54.5131;RBI=0.0673773;REFB=0;REVB=-0.0312604;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000626519;OID=.;OPOS=56322156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr15	56383237	.	G	A	447.61	PASS	AF=0.517647;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.00808324;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.884;QD=21.064;RBI=0.0193414;REFB=-0.00568117;REVB=-0.0175713;RO=39;SAF=22;SAR=22;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0545786;STB=0.541158;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.00593148;OID=.;OPOS=56383237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:39:41:44:44:0.517647:22:22:22:17:22:22:24:17
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chr15	56387931	.	C	T	1230.96	PASS	AF=0.987805;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0192606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1824;QD=60.0467;RBI=0.0258369;REFB=-0.0769834;REVB=-0.0172214;RO=0;SAF=33;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28649e-08;STB=0.505153;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.000666482;OID=.;OPOS=56387931;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:82:0:1:81:81:0.987805:48:33:0:0:48:33:0:1
chr15	56721264	.	G	A	339.23	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275972;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.414;QD=54.2766;RBI=0.0485201;REFB=0;REVB=-0.0399073;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117841;OID=.;OPOS=56721264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:8:16:0:0:8:17:0:0
chr15	56923714	.	G	A	873.82	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.11;QD=57.2997;RBI=0.0268957;REFB=0;REVB=0.0153823;RO=0;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.30982e-05;OID=.;OPOS=56923714;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:59:61:1:29:30:0:0:31:30:0:0
chr15	56946980	.	T	G	397.89	PASS	AF=0.526316;AO=40;DP=76;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.00230644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4963;QD=20.9417;RBI=0.0686226;REFB=-0.0153208;REVB=0.0685839;RO=36;SAF=22;SAR=18;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152079;STB=0.583744;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0188098;OID=.;OPOS=56946980;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:36:36:40:40:0.526316:18:22:26:10:18:22:26:10
chr15	56959028	.	C	T	406.55	PASS	AF=0.377953;AO=48;DP=127;FAO=48;FDP=127;FR=.;FRO=79;FSAF=13;FSAR=35;FSRF=34;FSRR=45;FWDB=-0.0433541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.522;QD=12.8047;RBI=0.0439171;REFB=-0.00710567;REVB=-0.00700964;RO=78;SAF=13;SAR=35;SRF=34;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202122;STB=0.612613;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00819258;OID=.;OPOS=56959028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:78:79:48:48:0.377953:35:13:34:44:35:13:34:45
chr15	56968865	.	C	T	223.78	PASS	AF=0.472727;AO=22;DP=51;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00909757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.106;QD=16.2748;RBI=0.0132676;REFB=-0.0964319;REVB=-0.00965731;RO=29;SAF=11;SAR=11;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171759;STB=0.53189;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.0986406;OID=.;OPOS=56968865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:55:29:29:22:26:0.472727:11:11:15:14:11:15:15:14
chr15	57213283	.	A	G	60.75	PASS	AF=0.236842;AO=9;DP=38;FAO=9;FDP=38;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=0.0100791;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.05;QD=6.39523;RBI=0.0137404;REFB=0.00785751;REVB=-0.00933862;RO=29;SAF=3;SAR=6;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102596;STB=0.565887;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=-0.0294629;OID=.;OPOS=57213283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:38:38:29:29:9:9:0.236842:6:3:12:17:6:3:12:17
chr15	57731335	.	A	C	313.29	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0584886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4854;QD=50.1256;RBI=0.0647868;REFB=-0.0551447;REVB=0.0278641;RO=1;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0264929;STB=0.514274;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0155552;OID=.;OPOS=57731335;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:1:1:24:24:0.96:17:7:0:1:17:7:0:1
chr15	57731573	.	C	T	185.9	PASS	AF=0.487179;AO=19;DP=39;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0854434;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4125;QD=19.0671;RBI=0.14498;REFB=-3.11242e-05;REVB=0.117127;RO=20;SAF=14;SAR=5;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281394;STB=0.660588;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00425448;OID=.;OPOS=57731573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:20:20:19:19:0.487179:5:14:9:11:5:14:9:11
chr15	57731728	.	A	G	955.17	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00144026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.892;QD=58.7798;RBI=0.00924024;REFB=0;REVB=0.0091273;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68862e-05;OID=.;OPOS=57731728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:30:35:0:0:30:35:0:0
chr15	57835903	.	T	G	153.82	PASS	AF=0.369565;AO=18;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0248067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4067;QD=13.3754;RBI=0.0310623;REFB=0.029576;REVB=0.0186947;RO=28;SAF=12;SAR=6;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218007;STB=0.606172;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=-0.0472258;OID=.;OPOS=57835903;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:29:18:17:0.369565:6:12:13:15:6:11:14:15
chr15	57840127	.	T	C	662.54	PASS	AF=0.546218;AO=65;DP=119;FAO=65;FDP=119;FR=.;FRO=54;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.000213353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.348;QD=22.2702;RBI=0.0897901;REFB=-0.0182113;REVB=0.0897899;RO=54;SAF=42;SAR=23;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477123;STB=0.526161;STBP=0.544;TYPE=snp;VARB=0.018663;OID=.;OPOS=57840127;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:54:54:65:65:0.546218:23:42:32:22:23:42:32:22
chr15	57918069	.	A	G	486.19	PASS	AF=0.6;AO=45;DP=75;FAO=45;FDP=75;FR=.;FRO=30;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.0219397;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.095;QD=25.9302;RBI=0.0237643;REFB=0.0013483;REVB=-0.00913184;RO=30;SAF=24;SAR=21;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048805;STB=0.526679;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=-0.000563654;OID=.;OPOS=57918069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:30:30:45:45:0.6:21:24:14:16:21:24:14:16
chr15	57918090	.	A	G	937.49	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160141;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6317;QD=58.593;RBI=0.0401687;REFB=0;REVB=0.0368385;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449369;OID=.;OPOS=57918090;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0
chr15	57925836	.	C	T	201.52	PASS	AF=0.413793;AO=23;DP=57;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0136652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.507;QD=13.898;RBI=0.0612933;REFB=-0.0245284;REVB=-0.0597505;RO=34;SAF=11;SAR=12;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100636;STB=0.568909;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0242787;OID=.;OPOS=57925836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:34:34:23:24:0.413793:12:11:13:21:12:12:13:21
chr15	57967219	.	T	C	1568.52	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.65;QD=64.0212;RBI=0.0169792;REFB=0;REVB=0.00860545;RO=0;SAF=49;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62743e-05;OID=.;OPOS=57967219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:49:49:0:0:49:49:0:0
chr15	58444720	.	A	T	1321.6	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00622743;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=345.481;QD=62.1928;RBI=0.0180173;REFB=0;REVB=0.0169068;RO=0;SAF=61;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.96597e-05;OID=.;OPOS=58444720;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:85:0:0:84:85:1:23:61:0:0:23:62:0:0
chr15	58471368	.	C	T	890.86	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00584307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.166;QD=57.4747;RBI=0.0271034;REFB=0;REVB=0.0264661;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93077e-05;OID=.;OPOS=58471368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:62:0:0:57:62:1:23:34:0:0:26:36:0:0
chr15	58476281	.	A	G	977.29	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0350116;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.248;QD=59.2295;RBI=0.0353645;REFB=0;REVB=0.00498343;RO=0;SAF=39;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254832;OID=.;OPOS=58476281;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:27:39:0:0:27:39:0:0
chr15	58833993	.	G	A	1303.0	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0212683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0465;QD=60.6048;RBI=0.0235048;REFB=-0.035863;REVB=-0.0100068;RO=0;SAF=53;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07334e-08;STB=0.504672;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000430887;OID=.;OPOS=58833993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:0:1:85:85:0.988372:32:53:0:0:32:53:1:0
chr15	58837957	.	A	G	562.69	PASS	AF=0.487805;AO=54;DP=118;FAO=60;FDP=123;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=37;FSRR=26;FWDB=-0.00420543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7169;QD=18.2987;RBI=0.0134327;REFB=-0.0278001;REVB=0.0127574;RO=62;SAF=22;SAR=32;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166427;STB=0.596059;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0254107;OID=.;OPOS=58837957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:123:62:63:54:60:0.487805:32:22:36:26:36:24:37:26
chr15	58838010	.	A	G	1380.06	PASS	AF=0.85124;AO=100;DP=122;FAO=103;FDP=121;FR=.;FRO=18;FSAF=52;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=17;FWDB=0.0419211;FXX=0.00819605;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.638;QD=45.6217;RBI=0.0421086;REFB=-0.0244329;REVB=0.00396911;RO=0;SAF=49;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.18771e-08;STB=0.566745;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.010524;OID=.;OPOS=58838010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:122:121:0:18:100:103:0.85124:51:49:0:0:51:52:1:17
chr15	58853079	.	C	A	303.1	PASS	AF=1;AO=19;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.165;QD=52.7128;RBI=0.0791935;REFB=0;REVB=0.0760395;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000503324;OID=.;OPOS=58853079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:19:23:1:5:14:0:0:6:17:0:0
chr15	58853109	.	A	G	358.95	PASS	AF=0.931034;AO=27;DP=29;FAO=27;FDP=29;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0305456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.729;QD=49.5098;RBI=0.09008;REFB=-0.160149;REVB=0.084743;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.549962;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.00236358;OID=.;OPOS=58853109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:29:29:0:2:27:27:0.931034:9:18:0:0:9:18:0:2
chr15	58860963	.	C	A	213.53	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.000270493;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=331.413;QD=16.1155;RBI=0.00587445;REFB=-0.00658276;REVB=0.00586822;RO=29;SAF=7;SAR=17;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0601538;STB=0.534167;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.00771238;OID=.;OPOS=58860963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:17:7:10:19:17:7:10:19
chr15	58892410	.	T	C	196.7	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0116471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.634;QD=18.2975;RBI=0.0150738;REFB=-0.0148491;REVB=0.00956901;RO=23;SAF=13;SAR=7;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420163;STB=0.523905;STBP=0.806;TYPE=snp;VARB=0.0139771;OID=.;OPOS=58892410;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:23:20:20:0.465116:7:13:14:9:7:13:14:9
chr15	58983318	.	G	C	238.3	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=5;FWDB=0.00205183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.47;QD=16.1561;RBI=0.0278534;REFB=6.49231e-05;REVB=-0.0277777;RO=32;SAF=18;SAR=9;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209189;STB=0.616363;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=-0.000381826;OID=.;OPOS=58983318;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:9:18:27:5:9:18:27:5
chr15	58983425	.	G	C	972.85	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.787;QD=58.9606;RBI=0.0279857;REFB=0;REVB=0.00514794;RO=0;SAF=45;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47552e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.69783e-05;OID=.;OPOS=58983425;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:21:45:0:0:21:45:0:0
chr15	58983588	.	T	A	868.14	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.3047;QD=57.8761;RBI=0.0212009;REFB=0;REVB=-0.00426052;RO=0;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.59723e-05;OID=.;OPOS=58983588;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:26:33:0:0:27:33:0:0
chr15	59147037	.	A	T	363.05	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244553;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.488;QD=55.8539;RBI=0.0437749;REFB=0;REVB=0.0363068;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000577846;OID=.;OPOS=59147037;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr15	59147413	.	T	A	330.42	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00054726;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.188;QD=50.8341;RBI=0.0383729;REFB=0.155282;REVB=0.038369;RO=1;SAF=9;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0487725;STB=0.526294;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=-0.00167018;OID=.;OPOS=59147413;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:16:9:1:0:16:9:1:0
chr15	59147800	.	C	T	176.25	PASS	AF=0.708333;AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0380903;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.06;QD=29.3755;RBI=0.0420655;REFB=-0.0502329;REVB=-0.0178503;RO=6;SAF=3;SAR=14;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115794;STB=0.551117;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0164595;OID=.;OPOS=59147800;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:6:7:17:17:0.708333:14:3:2:4:14:3:2:5
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chr15	59911421	.	A	T	1348.64	PASS	AF=1;AO=68;DP=91;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0670686;FXX=0.0659268;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.663;QD=63.4655;RBI=0.0799236;REFB=0;REVB=0.0434694;RO=0;SAF=54;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42547e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00273922;OID=.;OPOS=59911421;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:91:85:0:0:68:85:1:14:54:0:0:30:55:0:0
chr15	59911970	.	A	C	1920.41	PASS	AF=1;AO=124;DP=124;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00985841;FXX=0.0158718;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8877;QD=61.9487;RBI=0.0159947;REFB=0;REVB=0.0125953;RO=0;SAF=76;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000499321;OID=.;OPOS=59911970;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:124:124:0:0:124:124:1:48:76:0:0:48:76:0:0
chr15	59912625	.	G	A	635.18	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.173;QD=60.4937;RBI=0.0177833;REFB=0;REVB=-0.0142474;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.8034e-05;OID=.;OPOS=59912625;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:16:25:0:0:16:26:0:0
chr15	59931372	.	GAAAGT	G	413.03	PASS	AF=0.836735;AO=40;DP=44;FAO=41;FDP=49;FR=.;FRO=8;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0324829;FXX=0.0925755;HRUN=3;LEN=5;MLLD=208.725;QD=33.7166;RBI=0.0482257;REFB=-0.0621097;REVB=0.0356452;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.363008;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.514537;STBP=0.673;TYPE=del;VARB=0.0132413;OID=.;OPOS=59931373;OREF=AAAGT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.836735:40:44:41:49:8:22:19:5:3:27:0:21:19:0:0
chr15	60678298	.	T	A	190.85	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.647;QD=47.7123;RBI=0.0379818;REFB=0;REVB=0.0151803;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115016;OID=.;OPOS=60678298;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:16:0:0:14:16:1:5:9:0:0:5:11:0:0
chr15	60690089	.	A	C,G	114.11	PASS	AF=0.181818,0.818182;AO=2,9;DP=11;FAO=2,9;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0,2;FSAR=2,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0348556,-0.0269866;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=134.934,86.9388;QD=41.4944;RBI=0.0378373,0.0270129;REFB=0,0;REVB=-0.0147224,-0.00119034;RO=0;SAF=0,2;SAR=2,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0998899,0.00458608;OID=.,.;OPOS=60690089,60690089;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:11:11:0:0:2,9:2,9:0.181818,0.818182:2,7:0,2:0:0:2,7:0,2:0:0
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chr15	60724118	.	C	G	501.44	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=239.088;QD=58.9934;RBI=0.0241817;REFB=0;REVB=0.0133797;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.42686e-05;OID=.;OPOS=60724118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:17:16:0:0:17:17:0:0
chr15	60734697	.	A	G	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0201444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.948;QD=59.0181;RBI=0.0227894;REFB=0;REVB=-0.0106564;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.93983e-05;OID=.;OPOS=60734697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr15	60789798	.	G	T	740.12	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0369766;FXX=0.0188644;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4139;QD=56.9324;RBI=0.0404465;REFB=0;REVB=-0.0163905;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000114998;OID=.;OPOS=60789798;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:29:23:0:0:29:23:0:0
chr15	62202482	.	C	T	1949.49	PASS	AF=0.544379;AO=183;DP=337;FAO=184;FDP=338;FR=.;FRO=154;FSAF=95;FSAR=89;FSRF=89;FSRR=65;FWDB=0.024267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.348;QD=23.0709;RBI=0.0243994;REFB=0.00866078;REVB=0.00253835;RO=147;SAF=94;SAR=89;SRF=82;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.036287;STB=0.528153;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.0069035;OID=.;OPOS=62202482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:337:338:147:154:183:184:0.544379:89:94:82:65:89:95:89:65
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chr15	63008528	.	AG	A,AT	364.42	PASS	AF=0.90625,0.046875;AO=31,4;DP=66;FAO=58,3;FDP=64;FR=.;FRO=3;FSAF=32,2;FSAR=26,1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.288079,0.0133239;FXX=0.0302984;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=9.70074,127.295;QD=22.776;RBI=0.413191,0.0532601;REFB=-0.215052,-0.0357186;REVB=0.296205,0.0515666;RO=24;SAF=20,3;SAR=11,1;SRF=10;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0.511628,0;SSSB=0.184782,0.369782;STB=0.505719,0.5;STBP=0.739,1;TYPE=del,snp;VARB=0.142914,-0.101773;OID=.,.;OPOS=63008529,63008529;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=A,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.90625,0.046875:31,4:66:58,3:64:3:32,2:26,1:2:1:10:24:20,3:11,1:10:14
chr15	63009804	.	C	T	650.79	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0712719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.741;QD=61.9804;RBI=0.0997612;REFB=0;REVB=0.0698041;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000554031;OID=.;OPOS=63009804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
chr15	63047778	.	C	T	1358.6	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0833238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4565;QD=62.4644;RBI=0.102216;REFB=0;REVB=0.0592047;RO=0;SAF=54;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000521309;OID=.;OPOS=63047778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:33:54:0:0:33:54:0:0
chr15	63351840	.	C	A	247.35	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0665632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.2204;QD=49.4707;RBI=0.0734489;REFB=0;REVB=0.0310496;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00073563;OID=.;OPOS=63351840;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr15	63433766	.	G	A	755.42	PASS	AF=0.949153;AO=51;DP=54;FAO=56;FDP=59;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00690752;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2128;QD=51.2146;RBI=0.0114728;REFB=-0.0212832;REVB=-0.00916034;RO=3;SAF=30;SAR=21;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00846949;STB=0.502262;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.023592;OID=.;OPOS=63433766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:54:59:3:3:51:56:0.949153:21:30:2:1:21:35:2:1
chr15	63433785	.	G	A	315.42	PASS	AF=0.571429;AO=32;DP=56;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00540678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.573;QD=22.5303;RBI=0.00731748;REFB=-0.0136128;REVB=-0.00493074;RO=23;SAF=22;SAR=10;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0674355;STB=0.530437;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.00762932;OID=.;OPOS=63433785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:23:24:32:32:0.571429:10:22:14:9:10:22:15:9
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chr15	64385851	.	T	C	651.11	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000899501;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.506;QD=62.0108;RBI=0.00125389;REFB=0;REVB=0.000873575;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.45136e-05;OID=.;OPOS=64385851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:23:19:0:0:23:19:0:0
chr15	64418397	.	G	A	374.44	PASS	AF=1;AO=23;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0031264;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2998;QD=55.4729;RBI=0.0172373;REFB=0;REVB=0.0169514;RO=0;SAF=5;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198256;OID=.;OPOS=64418397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:23:27:1:18:5:0:0:20:7:0:0
chr15	64430607	.	T	C	239.33	PASS	AF=1;AO=9;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0613472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.508;QD=50.3852;RBI=0.0818788;REFB=0;REVB=0.0542278;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000647676;OID=.;OPOS=64430607;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:9:19:1:2:7:0:0:8:11:0:0
chr15	64634884	.	C	A	641.6	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.728;QD=59.6834;RBI=0.0643588;REFB=0;REVB=-0.038959;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171085;OID=.;OPOS=64634884;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:43:0:0:41:43:1:22:19:0:0:22:21:0:0
chr15	64737225	.	G	A	617.01	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0321804;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.349;QD=61.7014;RBI=0.0338453;REFB=0;REVB=0.0104846;RO=0;SAF=25;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.42586e-05;OID=.;OPOS=64737225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:15:25:0:0:15:25:0:0
chr15	64792532	.	G	T	1190.43	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0041768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.525;QD=61.0478;RBI=0.0425693;REFB=0;REVB=-0.0423639;RO=0;SAF=37;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4281e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.44524e-05;OID=.;OPOS=64792532;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:78:78:1:41:37:0:0:41:37:0:0
chr15	64792896	.	G	A	1087.08	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145561;FXX=0.0270234;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.533;QD=60.3931;RBI=0.0463825;REFB=0;REVB=-0.0440392;RO=0;SAF=38;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.45503e-05;OID=.;OPOS=64792896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:34:38:0:0:34:38:0:0
chr15	64793617	.	A	G	905.79	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245114;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.734;QD=58.4378;RBI=0.0282648;REFB=0;REVB=0.0140744;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.40221e-05;OID=.;OPOS=64793617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:62:62:1:35:27:0:0:35:27:0:0
chr15	64915106	.	C	T	923.32	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00883964;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.2655;QD=56.8198;RBI=0.0348381;REFB=-0.108546;REVB=0.0336979;RO=1;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171708;STB=0.509088;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00241635;OID=.;OPOS=64915106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:1:1:64:64:0.984615:27:37:0:1:27:37:0:1
chr15	64977364	.	T	A	77.86	PASS	AF=0.244898;AO=12;DP=49;FAO=12;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=25;FWDB=-0.0212961;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=181.111;QD=6.35563;RBI=0.029896;REFB=-0.00544015;REVB=-0.0209821;RO=36;SAF=10;SAR=2;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.596299;STB=0.859317;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0425511;OID=.;OPOS=64977364;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:49:49:36:37:12:12:0.244898:2:10:11:25:2:10:12:25
chr15	65041622	.	C	A	374.32	PASS	AF=0.933333;AO=28;DP=30;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00857776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6399;QD=49.9095;RBI=0.040293;REFB=-0.0865466;REVB=0.0393694;RO=1;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300185;STB=0.531228;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.0146462;OID=.;OPOS=65041622;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:30:30:1:2:28:28:0.933333:15:13:0:1:15:13:0:2
chr15	65108479	.	T	C	834.32	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.9085;QD=57.539;RBI=0.0639011;REFB=0;REVB=0.0627152;RO=0;SAF=40;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000520189;OID=.;OPOS=65108479;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:18:40:0:0:18:40:0:0
chr15	65153690	.	G	A	1216.53	PASS	AF=1;AO=60;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0160672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.909;QD=61.5964;RBI=0.0574581;REFB=0;REVB=0.0551659;RO=0;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000252042;OID=.;OPOS=65153690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:60:79:1:32:28:0:0:51:28:0:0
chr15	65157482	.	C	T	711.31	PASS	AF=0.980769;AO=48;DP=49;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0448519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.571;QD=54.7164;RBI=0.0724807;REFB=-0.118833;REVB=0.0569365;RO=1;SAF=40;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0552153;STB=0.5294;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.000955024;OID=.;OPOS=65157482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:49:52:1:1:48:51:0.980769:8:40:0:1:8:43:0:1
chr15	65159797	.	T	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.954;QD=35.5754;RBI=0.00778069;REFB=0;REVB=-0.00778069;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.19023e-05;OID=.;OPOS=65159797;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0
chr15	65347405	.	G	A	808.35	PASS	AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0634558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.333;QD=53.8898;RBI=0.0749252;REFB=-0.0457467;REVB=0.039839;RO=2;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0362473;STB=0.519224;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.00088549;OID=.;OPOS=65347405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:60:60:2:2:58:58:0.966667:25:33:0:2:25:33:0:2
chr15	65369951	.	A	G	82.05	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0166592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4568;QD=32.8211;RBI=0.0364711;REFB=0.0367856;REVB=-0.032444;RO=1;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0984833;STB=0.555432;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.0127554;OID=.;OPOS=65369951;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:1:1:9:9:0.9:5:4:1:0:5:4:1:0
chr15	65370353	.	T	C	1732.91	PASS	AF=1;AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.040506;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0558;QD=60.8039;RBI=0.040898;REFB=0;REVB=0.00564888;RO=0;SAF=65;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29464e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000161571;OID=.;OPOS=65370353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:115:114:0:0:114:114:1:49:65:0:0:49:65:0:0
chr15	65449169	.	C	T	972.8	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00845556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.914;QD=58.9576;RBI=0.011119;REFB=0;REVB=0.00722058;RO=0;SAF=38;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.07259e-05;OID=.;OPOS=65449169;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:28:38:0:0:28:38:0:0
chr15	65489128	.	C	T	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302347;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.564;QD=62.3509;RBI=0.0518781;REFB=0;REVB=0.0421569;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015194;OID=.;OPOS=65489128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:29:14:0:0:29:14:0:0
chr15	65489688	.	T	C	1264.69	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.024;QD=61.6921;RBI=0.050327;REFB=0;REVB=-0.0469755;RO=0;SAF=45;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.95125e-05;OID=.;OPOS=65489688;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:37:45:0:0:37:45:0:0
chr15	65490901	.	T	C	884.6	PASS	AF=0.927536;AO=64;DP=69;FAO=64;FDP=69;FR=.;FRO=5;FSAF=50;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0167782;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=251.463;QD=51.281;RBI=0.018457;REFB=0.0124394;REVB=0.00769095;RO=5;SAF=50;SAR=14;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0726624;STB=0.538644;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.000303773;OID=.;OPOS=65490901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:69:69:5:5:64:64:0.927536:14:50:2:3:14:50:2:3
chr15	65494212	.	A	G	410.67	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0587084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4281;QD=56.6447;RBI=0.0749322;REFB=0;REVB=0.0465635;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000258929;OID=.;OPOS=65494212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr15	65553246	.	C	T	1320.3	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00820868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4848;QD=62.1317;RBI=0.0693038;REFB=0;REVB=-0.068816;RO=0;SAF=39;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000228337;OID=.;OPOS=65553246;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:46:39:0:0:46:39:0:0
chr15	65621857	.	T	C	648.62	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.190131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2974;QD=61.7735;RBI=0.194504;REFB=0;REVB=0.0410149;RO=0;SAF=9;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54184e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00103527;OID=.;OPOS=65621857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:42:0:0:40:42:1:31:9:0:0:33:9:0:0
chr15	65667724	.	A	G	763.86	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.528;QD=63.6549;RBI=0.0596013;REFB=0;REVB=0.0113729;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206759;OID=.;OPOS=65667724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:22:25:0:0:22:26:0:0
chr15	65676617	.	T	C	306.33	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00407593;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.525;QD=53.275;RBI=0.0256914;REFB=0;REVB=0.025366;RO=0;SAF=15;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114871;OID=.;OPOS=65676617;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:8:15:0:0:8:15:0:0
chr15	65676726	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00633511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.201;QD=56.7064;RBI=0.0278267;REFB=0;REVB=0.027096;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.65699e-05;OID=.;OPOS=65676726;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr15	65687536	.	C	T	562.56	PASS	AF=0.5;AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=116;FR=.;FRO=58;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=0.00286741;FXX=0.00854628;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.317;QD=19.3987;RBI=0.00430931;REFB=-0.0132554;REVB=-0.00321685;RO=58;SAF=36;SAR=22;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490097;STB=0.527093;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0132965;OID=.;OPOS=65687536;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:116:58:58:58:58:0.5:22:36:33:25:22:36:33:25
chr15	65689213	.	G	A	293.36	PASS	AF=0.458333;AO=32;DP=72;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.000489656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3415;QD=16.2975;RBI=0.144419;REFB=-0.022131;REVB=0.144418;RO=36;SAF=18;SAR=14;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331283;STB=0.510198;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.0518303;OID=.;OPOS=65689213;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:39:32:33:0.458333:14:18:19:17:15:18:22:17
chr15	65748564	.	ATTT	AT,ATTA,ATT	458.73	PASS	AF=0.0925926,0.148148,0.759259;AO=6,10,16;DP=53;FAO=5,8,41;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=5,8,21;FSAR=0,0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0453815,-0.0536221,-0.074579;FXX=0.0181785;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=11.2973,173.771,10.863;QD=33.9801;RBI=0.544819,0.116593,1.06741;REFB=0,0,0;REVB=0.542926,0.103531,1.06481;RO=16;SAF=6,10,16;SAR=0,0,0;SRF=1;SRR=15;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.842437,0.8581,0.870682;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.06969,0.10777,-0.0440494;OID=.,.,.;OPOS=65748565,65748567,65748565;OREF=TT,T,T;OALT=-,A,-;OMAPALT=AT,ATTA,ATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0.0925926,0.148148,0.759259:6,10,16:53:5,8,41:54:0:5,8,21:0,0,20:0:0:38:16:6,10,16:0,0,0:1:15
chr15	65916527	.	A	T	1785.67	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00221586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.285;QD=61.0485;RBI=0.0171063;REFB=0;REVB=-0.0169622;RO=0;SAF=58;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.90113e-05;OID=.;OPOS=65916527;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:59:58:0:0:59:58:0:0
chr15	66011630	.	A	G	1442.3	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.84;QD=62.7088;RBI=0.0396628;REFB=0;REVB=0.0227654;RO=0;SAF=48;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.36978e-05;OID=.;OPOS=66011630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:43:48:0:0:44:48:0:0
chr15	66023799	.	G	T	351.35	PASS	AF=0.962963;AO=26;DP=28;FAO=26;FDP=27;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0345791;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.2455;QD=52.0523;RBI=0.0481093;REFB=-0.0905757;REVB=-0.0334483;RO=1;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488217;STB=0.526295;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00646611;OID=.;OPOS=66023799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:28:27:1:1:26:26:0.962963:9:17:0:1:9:17:0:1
chr15	66191077	.	A	G	228.17	PASS	AF=0.409091;AO=27;DP=66;FAO=27;FDP=66;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=0.0232825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.3782;QD=13.8286;RBI=0.0470928;REFB=-0.0120215;REVB=0.0409348;RO=39;SAF=17;SAR=10;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157371;STB=0.508975;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0268481;OID=.;OPOS=66191077;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:39:39:27:27:0.409091:10:17:24:15:10:17:24:15
chr15	66257408	.	T	C	594.32	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0547181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.4391;QD=60.9557;RBI=0.0986951;REFB=0;REVB=0.0821379;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000277782;OID=.;OPOS=66257408;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr15	66274690	.	T	C	519.81	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0115;QD=59.407;RBI=0.0343359;REFB=0;REVB=0.0277585;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121963;OID=.;OPOS=66274690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr15	66411441	.	C	T	185.23	PASS	AF=0.333333;AO=24;DP=72;FAO=24;FDP=72;FR=.;FRO=48;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.0155732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.692;QD=10.2905;RBI=0.0304187;REFB=-0.0103346;REVB=0.02613;RO=47;SAF=9;SAR=15;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225418;STB=0.624896;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0181513;OID=.;OPOS=66411441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:47:48:24:24:0.333333:15:9:27:20:15:9:27:21
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chr15	66644521	.	C	G	306.34	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00570733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.126;QD=53.2771;RBI=0.00835125;REFB=0;REVB=0.00609669;RO=0;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.36726e-05;OID=.;OPOS=66644521;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:8:14:0:0:9:14:0:0
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chr15	67768151	.	G	C	1434.27	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.706;QD=63.0449;RBI=0.0375555;REFB=0;REVB=0.032648;RO=0;SAF=40;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.93782e-05;OID=.;OPOS=67768151;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:91:0:0:91:91:1:51:40:0:0:51:40:0:0
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chr15	68583175	.	T	C	1312.28	PASS	AF=0.977273;AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0248451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.878;QD=59.6492;RBI=0.0406315;REFB=-0.142419;REVB=0.0321503;RO=0;SAF=47;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.512497;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00168419;OID=.;OPOS=68583175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:88:88:0:2:86:86:0.977273:39:47:0:0:39:47:0:2
chr15	68603625	.	C	T	1587.81	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.825;QD=64.1538;RBI=0.0639958;REFB=0;REVB=0.0344643;RO=0;SAF=52;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013275;OID=.;OPOS=68603625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:47:52:0:0:47:52:0:0
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chr15	68612556	.	T	C	1275.7	PASS	AF=0.988235;AO=81;DP=84;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0453517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.252;QD=60.0329;RBI=0.0516167;REFB=-0.0509881;REVB=0.0246476;RO=2;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210352;STB=0.505375;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.000713849;OID=.;OPOS=68612556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:85:2:1:81:84:0.988235:44:37:0:2:46:38:0:1
chr15	68624290	.	G	A	1193.49	PASS	AF=0.987342;AO=76;DP=81;FAO=78;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267424;FXX=0.0246883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.256;QD=60.4297;RBI=0.0386678;REFB=0;REVB=0.0279291;RO=0;SAF=29;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000253282;OID=.;OPOS=68624290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:79:0:0:76:78:0.987342:47:29:0:0:47:31:0:0
chr15	68624396	.	A	C	439.95	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.398;QD=56.7682;RBI=0.0235433;REFB=0;REVB=0.0124579;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115524;OID=.;OPOS=68624396;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:29:31:1:12:17:0:0:12:19:0:0
chr15	68628143	.	C	T	1343.56	PASS	AF=0.907407;AO=98;DP=108;FAO=98;FDP=108;FR=.;FRO=10;FSAF=40;FSAR=58;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.0485934;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.959;QD=49.7614;RBI=0.0563661;REFB=-0.117178;REVB=0.0285627;RO=8;SAF=40;SAR=58;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680221;STB=0.546319;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00235459;OID=.;OPOS=68628143;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:108:108:8:10:98:98:0.907407:58:40:7:1:58:40:9:1
chr15	68649587	.	G	A	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.904;QD=64.4149;RBI=0.0478811;REFB=0;REVB=0.0430183;RO=0;SAF=33;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56458e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168451;OID=.;OPOS=68649587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:17:33:0:0:17:33:0:0
chr15	69238272	.	G	T	240.65	PASS	AF=0.589744;AO=21;DP=38;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00845466;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.838;QD=24.6825;RBI=0.0126456;REFB=-0.0188642;REVB=0.00940371;RO=16;SAF=12;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104009;STB=0.534491;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0153675;OID=.;OPOS=69238272;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:16:16:21:23:0.589744:9:12:7:9:11:12:7:9
chr15	69238445	.	G	A	46.76	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0483441;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=241.315;QD=10.3903;RBI=0.0486246;REFB=-0.0143946;REVB=0.00521592;RO=11;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160434;STB=0.509776;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0231596;OID=.;OPOS=69238445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:5:2:3:8:5:2:3:8
chr15	69325581	.	C	T	632.55	PASS	AF=0.6;AO=56;DP=95;FAO=57;FDP=95;FR=.;FRO=38;FSAF=40;FSAR=17;FSRF=31;FSRR=7;FWDB=0.0257846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3157;QD=26.6335;RBI=0.0511;REFB=-0.0433973;REVB=0.0441176;RO=37;SAF=40;SAR=16;SRF=30;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0903167;STB=0.556972;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0299252;OID=.;OPOS=69325581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:37:38:56:57:0.6:16:40:30:7:17:40:31:7
chr15	69327825	.	C	T	152.87	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=59;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.00138764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.755;QD=10.3637;RBI=0.0242796;REFB=-0.00969404;REVB=-0.0242399;RO=38;SAF=14;SAR=6;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207846;STB=0.506018;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.017404;OID=.;OPOS=69327825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:38:39:20:20:0.338983:6:14:26:12:6:14:27:12
chr15	69328226	.	C	T	302.9	PASS	AF=0.533333;AO=31;DP=61;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0124615;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0022;QD=20.1931;RBI=0.0152846;REFB=-0.0170437;REVB=0.00885054;RO=29;SAF=9;SAR=22;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213915;STB=0.630051;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0171152;OID=.;OPOS=69328226;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:29:28:31:32:0.533333:22:9:15:14:23:9:15:13
chr15	69542968	.	G	A	186.45	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.0170228;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.1275;QD=18.6453;RBI=0.0692583;REFB=-0.0490109;REVB=0.0671338;RO=20;SAF=8;SAR=11;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161163;STB=0.578864;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0321075;OID=.;OPOS=69542968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:20:21:19:19:0.475:11:8:12:8:11:8:12:9
chr15	69561518	.	G	A	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=-0.0411789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.711;QD=14.7983;RBI=0.0442378;REFB=-7.63078e-05;REVB=0.0161642;RO=13;SAF=10;SAR=1;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.633793;STB=0.87642;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.000635507;OID=.;OPOS=69561518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:1:10:4:9:1:10:4:9
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chr15	69697756	.	G	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.747;QD=60.9781;RBI=0.03245;REFB=0;REVB=0.0290842;RO=0;SAF=19;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000238326;OID=.;OPOS=69697756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:20:19:0:0:20:19:0:0
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chr15	69732736	.	C	T	1072.41	PASS	AF=0.973333;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=58;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0278348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.9334;QD=57.1949;RBI=0.0356557;REFB=-0.177927;REVB=0.0222835;RO=1;SAF=58;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0080873;STB=0.508472;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00251573;OID=.;OPOS=69732736;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:75:75:1:2:73:73:0.973333:15:58:1:0:15:58:2:0
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chr15	69750313	.	G	C	389.62	PASS	AF=0.679245;AO=36;DP=53;FAO=36;FDP=53;FR=.;FRO=17;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0244811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6824;QD=29.4055;RBI=0.0551299;REFB=-0.0166106;REVB=-0.0493961;RO=17;SAF=30;SAR=6;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12227;STB=0.56697;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0155979;OID=.;OPOS=69750313;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:17:17:36:36:0.679245:6:30:12:5:6:30:12:5
chr15	70341337	.	A	G	86.41	PASS	AF=0.354839;AO=10;DP=32;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=4;FWDB=0.00798081;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=87.9773;QD=11.1494;RBI=0.135251;REFB=-0.0223116;REVB=0.135016;RO=20;SAF=9;SAR=1;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22764;STB=0.519195;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.062027;OID=.;OPOS=70341337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:32:31:20:20:10:11:0.354839:1:9:16:4:2:9:16:4
chr15	70345626	.	C	T	376.8	PASS	AF=0.384615;AO=45;DP=117;FAO=45;FDP=117;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=35;FWDB=-0.00150372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.949;QD=12.882;RBI=0.0104939;REFB=-0.0180638;REVB=-0.0103856;RO=69;SAF=24;SAR=21;SRF=35;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.027928;STB=0.511995;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0303108;OID=.;OPOS=70345626;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:69:72:45:45:0.384615:21:24:35:34:21:24:37:35
chr15	70346922	.	GC	CG,GT	241.82	PASS	AF=0,0.621622;AO=2,20;DP=37;FAO=0,23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=0,14;FSAR=0,9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.0940786,0.10096;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=2,1;MLLD=39.2617,49.8357;QD=26.1423;RBI=0.112341,0.101176;REFB=0.0737267,-0.00475573;REVB=-0.0613985,-0.00661312;RO=12;SAF=2,11;SAR=0,9;SRF=6;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.561268,0.0339322;STB=0.5,0.514693;STBP=1,0.835;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.00512676;OID=.,.;OPOS=70346922,70346923;OREF=GC,C;OALT=CG,T;OMAPALT=CG,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:37:37:12:14:2,20:0,23:0,0.621622:0,9:2,11:6:6:0,9:0,14:8:6
chr15	70347362	.	C	A	175.67	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.766;QD=46.8456;RBI=0.0764049;REFB=0;REVB=0.0542207;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137725;OID=.;OPOS=70347362;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0
chr15	70347816	.	A	AG	476.1	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0376593;FXX=0.0294031;HRUN=0;LEN=1;MLLD=121.498;QD=57.7095;RBI=0.0377734;REFB=0;REVB=0.00293476;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000322492;OID=.;OPOS=70347817;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:33:34:33:33:0:16:17:0:0:4:0:16:17:0:0
chr15	70347920	.	T	C	178.22	PASS	AF=0.395833;AO=18;DP=47;FAO=19;FDP=48;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0161392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.732;QD=14.8515;RBI=0.0745827;REFB=-0.0197067;REVB=-0.0728156;RO=29;SAF=16;SAR=2;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.622638;STB=0.868189;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0135096;OID=.;OPOS=70347920;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:29:29:18:19:0.395833:2:16:10:19:2:17:10:19
chr15	70350607	.	C	T	342.06	PASS	AF=0.481013;AO=32;DP=79;FAO=38;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=-0.0173703;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.492;QD=17.3195;RBI=0.269372;REFB=-0.044733;REVB=-0.268812;RO=20;SAF=23;SAR=9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0577386;STB=0.635039;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0160921;OID=.;OPOS=70350607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:20:41:32:38:0.481013:9:23:13:7:15:23:14:27
chr15	70351788	.	T	C	861.05	PASS	AF=1;AO=51;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0801001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.984;QD=57.4032;RBI=0.0802674;REFB=0;REVB=0.00517929;RO=0;SAF=24;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138617;OID=.;OPOS=70351788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:51:60:1:27:24:0:0:29:31:0:0
chr15	70366863	.	T	A	393.58	PASS	AF=0.450549;AO=40;DP=90;FAO=41;FDP=91;FR=.;FRO=50;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0295443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.4437;QD=17.3002;RBI=0.0296696;REFB=-0.0183891;REVB=0.0027244;RO=50;SAF=18;SAR=22;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694294;STB=0.54465;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.0285475;OID=.;OPOS=70366863;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:50:50:40:41:0.450549:22:18:26:24:23:18:26:24
chr15	70371777	.	C	G	151.17	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0645726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3251;QD=20.1557;RBI=0.0765652;REFB=0.0236101;REVB=-0.0411413;RO=14;SAF=7;SAR=9;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129841;STB=0.573188;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.0107762;OID=.;OPOS=70371777;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:9:7:4:10:9:7:4:10
chr15	70960068	.	G	A	138.95	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00060071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.033;QD=19.8495;RBI=0.0157215;REFB=-0.00937209;REVB=0.01571;RO=13;SAF=10;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046223;STB=0.52628;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00501665;OID=.;OPOS=70960068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:5:10:8:5:5:10:8:5
chr15	70964274	.	T	G	108.6	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0168068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.311;QD=13.5747;RBI=0.0486529;REFB=0.00475005;REVB=0.0456579;RO=19;SAF=9;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180198;STB=0.606048;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.00522371;OID=.;OPOS=70964274;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:4:9:10:9:4:9:10:9
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chr15	70994283	.	G	A	123.79	PASS	AF=0.298246;AO=17;DP=56;FAO=17;FDP=57;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0493272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.695;QD=8.68705;RBI=0.0517163;REFB=-0.0151623;REVB=-0.015537;RO=39;SAF=10;SAR=7;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176399;STB=0.596594;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.0751183;OID=.;OPOS=70994283;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:39:40:17:17:0.298246:7:10:17:22:7:10:18:22
chr15	71046514	.	C	T	516.83	PASS	AF=0.532609;AO=49;DP=92;FAO=49;FDP=92;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0373882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.995;QD=22.471;RBI=0.0457588;REFB=-0.00454251;REVB=0.0263816;RO=43;SAF=20;SAR=29;SRF=20;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494695;STB=0.527261;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.00372549;OID=.;OPOS=71046514;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:43:43:49:49:0.532609:29:20:20:23:29:20:20:23
chr15	71125093	.	G	A	194.54	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0296239;FXX=0.0508388;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1646;QD=13.8955;RBI=0.0423061;REFB=-0.000852286;REVB=0.0302032;RO=32;SAF=14;SAR=9;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112676;STB=0.574067;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=-0.00276184;OID=.;OPOS=71125093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:56:32:33:23:23:0.410714:9:14:16:16:9:14:16:17
chr15	71125204	.	A	G	98.44	PASS	AF=0.25;AO=12;DP=54;FAO=13;FDP=52;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=23;FWDB=0.030221;FXX=0.0877039;HRUN=5;LEN=1;MLLD=75.0641;QD=7.57209;RBI=0.0307837;REFB=-0.00727177;REVB=-0.00585908;RO=32;SAF=9;SAR=3;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375782;STB=0.708139;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0175746;OID=.;OPOS=71125204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:54:52:32:39:12:13:0.25:3:9:14:18:4:9:16:23
chr15	71184278	.	G	T	669.61	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0538563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.9379;QD=62.2893;RBI=0.0549219;REFB=0;REVB=0.0107665;RO=0;SAF=14;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00057005;OID=.;OPOS=71184278;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:29:14:0:0:29:14:0:0
chr15	71184495	.	A	G	679.72	PASS	AF=0.659091;AO=58;DP=88;FAO=58;FDP=88;FR=.;FRO=30;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=0.0374304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.954;QD=30.8964;RBI=0.0380634;REFB=-0.0918648;REVB=-0.006913;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.562627;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00689536;OID=.;OPOS=71184495;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:0:30:58:58:0.659091:28:30:0:0:28:30:21:9
chr15	71403406	.	T	C	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.447;QD=60.9778;RBI=0.0465981;REFB=0;REVB=0.0185107;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000223911;OID=.;OPOS=71403406;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0
chr15	71953045	.	G	A	1026.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035384;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=300.132;QD=59.5018;RBI=0.0432087;REFB=0;REVB=0.0247984;RO=0;SAF=27;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56939e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.89339e-05;OID=.;OPOS=71953045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:42:27:0:0:42:27:0:0
chr15	72070067	.	A	G	86.3	PASS	AF=0.392857;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=28;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0268518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5134;QD=12.3288;RBI=0.0476866;REFB=-0.0044697;REVB=-0.0394081;RO=17;SAF=3;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332324;STB=0.697616;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.00532686;OID=.;OPOS=72070067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:17:17:11:11:0.392857:8:3:10:7:8:3:10:7
chr15	72070075	.	G	A	132.31	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0139358;FXX=0.0740466;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.106;QD=21.1691;RBI=0.0170552;REFB=0.00213867;REVB=0.00983227;RO=11;SAF=8;SAR=6;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.228296;STB=0.629034;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=-0.00115176;OID=.;OPOS=72070075;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:26:25:11:11:14:14:0.56:6:8:3:8:6:8:3:8
chr15	72073003	.	C	T	177.13	PASS	AF=0.289157;AO=24;DP=83;FAO=24;FDP=83;FR=.;FRO=59;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=36;FWDB=-0.00329059;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.056;QD=8.53649;RBI=0.00372427;REFB=-0.00785856;REVB=0.00174418;RO=56;SAF=8;SAR=16;SRF=20;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311958;STB=0.543822;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0168449;OID=.;OPOS=72073003;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:56:59:24:24:0.289157:16:8:20:36:16:8:23:36
chr15	72105928	.	AC	A	959.26	PASS	AF=1;AO=81;DP=84;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150431;FXX=0.0116266;HRUN=5;LEN=1;MLLD=23.3892;QD=45.1417;RBI=0.0335392;REFB=0;REVB=-0.0299763;RO=0;SAF=34;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000554645;OID=.;OPOS=72105929;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:81:84:85:85:0:36:49:0:0:18:0:34:47:0:0
chr15	72191073	.	T	C	520.05	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.587;QD=59.4348;RBI=0.02672;REFB=0;REVB=-0.00662151;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.64972e-05;OID=.;OPOS=72191073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
chr15	72191266	.	C	T	1035.04	PASS	AF=0.972603;AO=70;DP=73;FAO=71;FDP=73;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0539969;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4262;QD=56.7143;RBI=0.0703395;REFB=-0.111876;REVB=0.0450775;RO=3;SAF=41;SAR=29;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0201052;STB=0.502172;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.010929;OID=.;OPOS=72191266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:73:73:3:2:70:71:0.972603:29:41:1:2:30:41:1:1
chr15	72432583	.	A	G	538.55	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0696108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.65;QD=59.8394;RBI=0.0698749;REFB=0;REVB=0.00606886;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000309617;OID=.;OPOS=72432583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:22:13:0:0:23:13:0:0
chr15	72433144	.	A	G	1062.42	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.009;QD=59.8548;RBI=0.0272237;REFB=0;REVB=0.00888084;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121943;OID=.;OPOS=72433144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:34:36:0:0:35:36:0:0
chr15	72637795	.	T	C	740.37	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.067;QD=56.9519;RBI=0.0294375;REFB=0;REVB=-0.0131156;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144888;OID=.;OPOS=72637795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:25:27:0:0:25:27:0:0
chr15	72638892	.	T	C	1138.99	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217109;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.917;QD=60.7464;RBI=0.0249945;REFB=0;REVB=0.012384;RO=0;SAF=39;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6999e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.71169e-05;OID=.;OPOS=72638892;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:75:75:1:36:39:0:0:36:39:0:0
chr15	72879653	.	A	ATTG	441.73	PASS	AF=0.735849;AO=38;DP=54;FAO=39;FDP=53;FR=.;FRO=14;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0146074;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=281.253;QD=33.3378;RBI=0.0146652;REFB=-0.00558097;REVB=-0.00130017;RO=15;SAF=26;SAR=12;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0877366;STB=0.556973;STBP=0.21;TYPE=ins;VARB=0.00148641;OID=.;OPOS=72879654;OREF=-;OALT=TTG;OMAPALT=ATTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.735849:38:54:39:53:14:27:12:7:7:99:15:26:12:8:7
chr15	72904208	.	A	G	100.74	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.018141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.418;QD=16.1191;RBI=0.0204706;REFB=-0.0122076;REVB=0.00948416;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.243637;STB=0.640296;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0119328;OID=.;OPOS=72904208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:7:5:9:4:7:5:9:4
chr15	72904212	.	A	G	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.000736394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.221;QD=18.6449;RBI=0.0579207;REFB=-0.0125976;REVB=-0.0579161;RO=13;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162718;STB=0.592465;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0182731;OID=.;OPOS=72904212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:7:7:9:4:7:7:9:4
chr15	72904223	.	C	T	109.93	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0156806;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.53;QD=14.6579;RBI=0.017498;REFB=-0.0169168;REVB=-0.00776511;RO=15;SAF=9;SAR=4;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277322;STB=0.662901;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0121137;OID=.;OPOS=72904223;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:15:17:13:13:0.433333:4:9:6:9:4:9:7:10
chr15	72968522	.	T	C	170.25	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=43;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.0204063;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.709;QD=16.2142;RBI=0.0238776;REFB=-0.0223636;REVB=-0.0123984;RO=24;SAF=13;SAR=5;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199228;STB=0.615249;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0381531;OID=.;OPOS=72968522;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:24:24:18:18:0.428571:5:13:13:11:5:13:13:11
chr15	72987588	.	G	T	665.28	PASS	AF=0.956522;AO=45;DP=46;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0977486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3936;QD=57.8508;RBI=0.122504;REFB=0.0446543;REVB=-0.0738398;RO=1;SAF=23;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199954;STB=0.521729;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=-0.0141639;OID=.;OPOS=72987588;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:46:46:1:2:45:44:0.956522:22:23:1:0:22:22:2:0
chr15	73002035	.	G	A	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000606492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.315;QD=60.2307;RBI=0.0185537;REFB=0;REVB=0.0185438;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.8511e-05;OID=.;OPOS=73002035;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:17:20:0:0:17:20:0:0
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chr15	73052845	.	A	G	695.51	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0284831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.343;QD=60.4795;RBI=0.0349135;REFB=-0.0800946;REVB=0.0201908;RO=1;SAF=24;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191802;STB=0.5102;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000739396;OID=.;OPOS=73052845;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:21:24:1:0:21:24:1:0
chr15	73067234	.	T	C	601.77	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00872594;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.935;QD=61.7203;RBI=0.00998215;REFB=0;REVB=0.00484781;RO=0;SAF=27;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.81486e-05;OID=.;OPOS=73067234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:12:27:0:0:12:27:0:0
chr15	73545732	.	T	C	64.78	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0121497;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.397;QD=10.3652;RBI=0.012785;REFB=-0.00378357;REVB=-0.00398007;RO=16;SAF=4;SAR=5;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145075;STB=0.586972;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.00537119;OID=.;OPOS=73545732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:5:4:5:11:5:4:5:11
chr15	73614114	.	T	C	132.61	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0154749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8764;QD=15.1559;RBI=0.0223186;REFB=-0.0164937;REVB=0.0160826;RO=20;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0665023;STB=0.538411;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0153251;OID=.;OPOS=73614114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:20:20:15:15:0.428571:8:7:8:12:8:7:8:12
chr15	73614708	.	TGTG	T,TGG	206.83	PASS	AF=0.471698,0;AO=6,6;DP=53;FAO=25,0;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=12,0;FSAR=13,0;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00447196,-0.00825537;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=210.642,211.634;QD=15.6094;RBI=0.01667,0.0152313;REFB=-0.0410267,-0.0213462;REVB=0.016059,-0.0128001;RO=39;SAF=5,1;SAR=1,5;SRF=17;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.462998,-0.353256;STB=0.527251,0.5;STBP=0.713,1;TYPE=del,del;VARB=0.0411953,0;OID=.,.;OPOS=73614709,73614710;OREF=GTG,T;OALT=-,-;OMAPALT=T,TGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.471698,0:6,6:53:25,0:53:28:12,0:13,0:12:16:99:39:5,1:1,5:17:22
chr15	73614713	.	T	G	41.61	PASS	AF=0.115385;AO=6;DP=51;FAO=6;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=0.0751345;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=19.4575;QD=3.20075;RBI=0.143735;REFB=-0.00864084;REVB=0.122534;RO=27;SAF=5;SAR=1;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.49769;STB=0.868465;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0597069;OID=.;OPOS=73614713;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:51:52:27:43:6:6:0.115385:1:5:11:16:1:5:16:27
chr15	73614834	.	T	C	118.92	PASS	AF=0.857143;AO=12;DP=14;FAO=12;FDP=14;FR=.;FRO=2;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0208535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.909;QD=33.9784;RBI=0.0331272;REFB=0.0394271;REVB=0.0257399;RO=2;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149612;STB=0.583194;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=-0.000737743;OID=.;OPOS=73614834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:14:14:2:2:12:12:0.857143:5:7:0:2:5:7:0:2
chr15	73994806	.	C	T	187.4	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.0138499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.567;QD=14.6981;RBI=0.0212476;REFB=-0.0252746;REVB=-0.0161135;RO=29;SAF=15;SAR=6;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109217;STB=0.555501;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.0256539;OID=.;OPOS=73994806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:30:21:21:0.411765:6:15:18:11:6:15:19:11
chr15	73994847	.	C	A	121.22	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0724405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0711;QD=15.1522;RBI=0.0740514;REFB=-0.0238822;REVB=0.0153615;RO=16;SAF=7;SAR=7;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174377;STB=0.562412;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0701561;OID=.;OPOS=73994847;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:18:14:14:0.4375:7:7:5:11:7:7:7:11
chr15	73995165	.	A	C	214.15	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0168231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.9325;QD=14.7688;RBI=0.019132;REFB=-0.000264825;REVB=-0.00911142;RO=32;SAF=16;SAR=9;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.143001;STB=0.573828;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-2.20676e-05;OID=.;OPOS=73995165;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:33:25:25:0.431034:9:16:16:16:9:16:17:16
chr15	73995173	.	C	T	220.51	PASS	AF=0.419355;AO=26;DP=62;FAO=26;FDP=62;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.020355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.671;QD=14.2266;RBI=0.0839106;REFB=-0.00658366;REVB=0.0814043;RO=35;SAF=15;SAR=11;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926565;STB=0.545078;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.00946752;OID=.;OPOS=73995173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:36:26:26:0.419355:11:15:17:18:11:15:18:18
chr15	73996066	.	G	A	135.77	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0138961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.038;QD=27.1539;RBI=0.0246594;REFB=0.0125058;REVB=0.0203712;RO=5;SAF=12;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204037;STB=0.666388;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.00672927;OID=.;OPOS=73996066;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:5:6:14:14:0.7:2:12:3:2:2:12:3:3
chr15	73996101	.	G	A	174.12	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=25;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0276686;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7337;QD=27.859;RBI=0.0290727;REFB=-0.0317961;REVB=-0.00892591;RO=8;SAF=14;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170465;STB=0.595621;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0159267;OID=.;OPOS=73996101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:8:8:17:17:0.68:3:14:5:3:3:14:5:3
chr15	74000729	.	G	C	460.81	PASS	AF=0.46729;AO=50;DP=107;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=41;FSRR=16;FWDB=0.00763457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.605;QD=17.2266;RBI=0.0590112;REFB=-0.021523;REVB=0.0585152;RO=57;SAF=29;SAR=21;SRF=41;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14089;STB=0.578028;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0327902;OID=.;OPOS=74000729;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:57:57:50:50:0.46729:21:29:41:16:21:29:41:16
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chr15	74003533	.	G	A	220.12	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=0.0072327;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.94;QD=17.6095;RBI=0.054879;REFB=-0.00908876;REVB=-0.0544003;RO=26;SAF=16;SAR=6;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0840968;STB=0.556468;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0140624;OID=.;OPOS=74003533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:26:28:22:22:0.44:6:16:17:9:6:16:18:10
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chr15	74032783	.	A	G	199.67	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0389608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6067;QD=19.967;RBI=0.0389802;REFB=-0.0129702;REVB=-0.0012314;RO=20;SAF=11;SAR=9;SRF=5;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261958;STB=0.64692;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0240115;OID=.;OPOS=74032783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:20:20:20:20:0.5:9:11:5:15:9:11:5:15
chr15	74244278	.	C	G	255.27	PASS	AF=0.434783;AO=27;DP=66;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.00902858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.893;QD=14.7985;RBI=0.0108421;REFB=-0.0303278;REVB=0.006003;RO=36;SAF=6;SAR=21;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343913;STB=0.70733;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0508983;OID=.;OPOS=74244278;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:69:36:39:27:30:0.434783:21:6:19:17:24:6:20:19
chr15	74244344	.	C	T	563.84	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00942605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.135;QD=57.8301;RBI=0.0162684;REFB=-0.0891125;REVB=0.0132593;RO=1;SAF=12;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374416;STB=0.519989;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.000344765;OID=.;OPOS=74244344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:26:12:1:0:26:12:1:0
chr15	74275676	.	A	G	40.28	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.15304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.448;QD=14.6473;RBI=0.153068;REFB=-0.04898;REVB=-0.00292877;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333798;STB=0.691819;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0683438;OID=.;OPOS=74275676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:4:2:0:5:4:2:0:5
chr15	74277795	.	T	C	2983.33	PASS	AF=1;AO=188;DP=189;FAO=188;FDP=188;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0419453;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.425;QD=63.4751;RBI=0.042393;REFB=0;REVB=-0.00614469;RO=0;SAF=102;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.89533e-05;OID=.;OPOS=74277795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:189:188:0:0:188:188:1:86:102:0:0:86:102:0:0
chr15	74328116	.	A	G	296.09	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0860977;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.9252;QD=49.3487;RBI=0.100203;REFB=0.00647942;REVB=-0.0512615;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.519983;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=-0.00387749;OID=.;OPOS=74328116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:24:0:1:23:23:0.958333:11:12:0:0:11:12:1:0
chr15	74328141	.	G	T	323.41	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0498973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6963;QD=53.9018;RBI=0.0585986;REFB=0;REVB=0.0307254;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000476989;OID=.;OPOS=74328141;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr15	74368293	.	A	G	1238.25	PASS	AF=0.711268;AO=97;DP=142;FAO=101;FDP=142;FR=.;FRO=41;FSAF=38;FSAR=63;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.00113152;FXX=0.0206882;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.033;QD=34.8804;RBI=0.0237237;REFB=0.0176519;REVB=-0.0236967;RO=37;SAF=38;SAR=59;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0362964;STB=0.519125;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00367795;OID=.;OPOS=74368293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:142:142:37:41:97:101:0.711268:59:38:17:20:63:38:18:23
chr15	74368297	.	C	G	1237.52	PASS	AF=0.687075;AO=104;DP=147;FAO=101;FDP=147;FR=.;FRO=46;FSAF=38;FSAR=63;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.00666925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.489;QD=33.6741;RBI=0.00875415;REFB=0.00593665;REVB=-0.00567064;RO=43;SAF=38;SAR=66;SRF=18;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310143;STB=0.505009;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=-0.00596939;OID=.;OPOS=74368297;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:43:46:104:101:0.687075:66:38:18:25:63:38:18:28
chr15	74427791	.	AC	A	34.79	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.126203;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=13.6475;QD=6.05005;RBI=0.149951;REFB=-0.058908;REVB=-0.0809817;RO=10;SAF=6;SAR=3;SRF=2;SRR=8;SSEN=0.5375;SSEP=0;SSSB=0.400047;STB=0.896344;STBP=0.008;TYPE=del;VARB=0.0629484;OID=.;OPOS=74427792;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.391304:9:23:9:23:14:8:1:3:11:34:10:6:3:2:8
chr15	74467856	.	G	A	120.82	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0117368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.154;QD=14.6443;RBI=0.0297635;REFB=-0.0250278;REVB=0.0273517;RO=19;SAF=9;SAR=5;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0453628;STB=0.526279;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.0302912;OID=.;OPOS=74467856;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:5:9:13:6:5:9:13:6
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chr15	74622678	.	G	A	183.56	PASS	AF=0.642857;AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0137735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9325;QD=26.2235;RBI=0.0540859;REFB=-0.0290228;REVB=0.0523028;RO=10;SAF=6;SAR=12;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114781;STB=0.564029;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0294194;OID=.;OPOS=74622678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:10:10:18:18:0.642857:12:6:5:5:12:6:5:5
chr15	74702778	.	G	A	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0088246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.587;QD=15.3789;RBI=0.0182045;REFB=-0.030629;REVB=0.0159226;RO=14;SAF=3;SAR=9;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121912;STB=0.571303;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.022309;OID=.;OPOS=74702778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:9:3:5:9:9:3:5:9
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chr15	74703929	.	T	C	1409.95	PASS	AF=0.958763;AO=91;DP=94;FAO=93;FDP=97;FR=.;FRO=4;FSAF=50;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0467534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.6978;QD=58.1423;RBI=0.0467953;REFB=-0.0430579;REVB=0.0019797;RO=3;SAF=48;SAR=43;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287037;STB=0.508817;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0141996;OID=.;OPOS=74703929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:94:97:3:4:91:93:0.958763:43:48:3:0:43:50:3:1
chr15	74706943	.	G	A	700.09	PASS	AF=0.472973;AO=70;DP=148;FAO=70;FDP=148;FR=.;FRO=78;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=38;FSRR=40;FWDB=0.0584919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7907;QD=18.9214;RBI=0.0692397;REFB=-0.00297543;REVB=0.0370517;RO=78;SAF=39;SAR=31;SRF=38;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668614;STB=0.537034;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00447951;OID=.;OPOS=74706943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:148:78:78:70:70:0.472973:31:39:38:40:31:39:38:40
chr15	74709975	.	G	A	311.97	PASS	AF=0.961538;AO=24;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0816154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.599;QD=47.9946;RBI=0.0822215;REFB=-0.143399;REVB=0.009965;RO=2;SAF=13;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00596561;STB=0.521722;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00136457;OID=.;OPOS=74709975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:26:26:2:1:24:25:0.961538:11:13:1:1:11:14:0:1
chr15	74710593	.	C	T	565.38	PASS	AF=0.928571;AO=39;DP=42;FAO=39;FDP=42;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0306227;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=276.471;QD=53.8452;RBI=0.0435195;REFB=-0.142241;REVB=0.0309224;RO=2;SAF=18;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00353302;STB=0.50922;STBP=0.725;TYPE=snp;VARB=0.000803776;OID=.;OPOS=74710593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:42:42:2:3:39:39:0.928571:21:18:1:1:21:18:1:2
chr15	74749015	.	A	G	685.64	PASS	AF=0.893939;AO=36;DP=62;FAO=59;FDP=66;FR=.;FRO=7;FSAF=32;FSAR=27;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.035726;FXX=0.0294074;HRUN=7;LEN=1;MLLD=113.358;QD=41.5538;RBI=0.0539732;REFB=-0.173577;REVB=0.0404569;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.533808;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0108773;OID=.;OPOS=74749015;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:62:66:0:7:36:59:0.893939:16:20:0:0:27:32:6:1
chr15	74836316	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.74;QD=47.8223;RBI=0.0506971;REFB=0;REVB=0.0482919;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000729084;OID=.;OPOS=74836316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr15	74888196	.	A	G	191.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0884;QD=47.8205;RBI=0.0431644;REFB=0;REVB=0.0256574;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124748;OID=.;OPOS=74888196;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr15	74889163	.	C	T	1013.03	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0593614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.056;QD=57.8874;RBI=0.0612292;REFB=0;REVB=0.0150081;RO=0;SAF=37;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.32196e-05;OID=.;OPOS=74889163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:70:0:0:65:70:1:28:37:0:0:32:38:0:0
chr15	74912496	.	CA	AG	39.38	PASS	AF=0.0895522;AO=12;DP=133;FAO=12;FDP=134;FR=.;FRO=122;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=57;FSRR=65;FWDB=-0.0572133;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=57.7646;QD=1.17552;RBI=0.0787228;REFB=-0.00879784;REVB=-0.0540733;RO=111;SAF=11;SAR=1;SRF=52;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.534614;STB=0.91366;STBP=0.003;TYPE=mnp;VARB=0.175121;OID=.;OPOS=74912496;OREF=CA;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:133:134:111:122:12:12:0.0895522:1:11:52:59:1:11:57:65
chr15	75012985	.	T	C	237.25	PASS	AF=0.405797;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.00615679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.192;QD=13.7537;RBI=0.0556295;REFB=-0.0201617;REVB=-0.0552878;RO=39;SAF=18;SAR=10;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579703;STB=0.551385;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0212318;OID=.;OPOS=75012985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:39:41:28:28:0.405797:10:18:23:16:10:18:23:18
chr15	75013643	.	G	A	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00821806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.783;QD=14.2621;RBI=0.00947646;REFB=-0.00803961;REVB=-0.00471877;RO=24;SAF=10;SAR=6;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86862e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0141058;OID=.;OPOS=75013643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:6:10:15:9:6:10:15:9
chr15	75047426	.	C	T	109.9	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=30;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.106797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9426;QD=14.1808;RBI=0.108295;REFB=-0.0474517;REVB=0.0179456;RO=17;SAF=5;SAR=8;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.305281;STB=0.688722;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0312697;OID=.;OPOS=75047426;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:17:18:13:13:0.419355:8:5:12:5:8:5:13:5
chr15	75081078	.	G	A	231.9	PASS	AF=0.464286;AO=25;DP=57;FAO=26;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0103339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.109;QD=16.5643;RBI=0.0150503;REFB=-0.0217514;REVB=0.0109418;RO=26;SAF=13;SAR=12;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529666;STB=0.515224;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0328739;OID=.;OPOS=75081078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:26:30:25:26:0.464286:12:13:12:14:12:14:17:13
chr15	75091247	.	C	T	240.85	PASS	AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.00557011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.708;QD=14.5972;RBI=0.0118474;REFB=-0.0151191;REVB=0.0104563;RO=38;SAF=17;SAR=11;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00199619;STB=0.501133;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0234682;OID=.;OPOS=75091247;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:11:17:23:15:11:17:23:15
chr15	75091664	.	G	A	463.61	PASS	AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=24;FWDB=0.0147829;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.702;QD=21.5631;RBI=0.0216997;REFB=-0.0280584;REVB=0.0158852;RO=41;SAF=22;SAR=23;SRF=17;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0642548;STB=0.535458;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0225981;OID=.;OPOS=75091664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:23:22:17:24:23:22:17:24
chr15	75093103	.	C	G	85.12	PASS	AF=0.413793;AO=10;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0288858;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=34.029;QD=11.7408;RBI=0.124203;REFB=-0.0695601;REVB=-0.120797;RO=11;SAF=6;SAR=4;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122798;STB=0.585219;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0133047;OID=.;OPOS=75093103;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:11:17:10:12:0.413793:4:6:8:3:4:8:9:8
chr15	75131661	.	A	G	130.64	PASS	AF=0.394737;AO=15;DP=38;FAO=15;FDP=38;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.00385551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.449;QD=13.7517;RBI=0.00801496;REFB=-0.0192603;REVB=-0.00702671;RO=23;SAF=5;SAR=10;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403909;STB=0.733045;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0167701;OID=.;OPOS=75131661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:23:23:15:15:0.394737:10:5:17:6:10:5:17:6
chr15	75137734	.	TGA	ATG,TG	33.51	PASS	AF=0,0.325581;AO=2,16;DP=43;FAO=0,14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=0,5;FSAR=0,9;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.00245704,0.0354267;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=3,1;MLLD=94.5704,9.73392;QD=3.11698;RBI=0.0417382,0.0976709;REFB=-0.0230196,-0.119459;REVB=-0.0416659,0.0910195;RO=20;SAF=0,7;SAR=2,9;SRF=13;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.58092,-0.202938;STB=0.5,0.631917;STBP=1,0.216;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.193539;OID=.,.;OPOS=75137734,75137736;OREF=TGA,A;OALT=ATG,-;OMAPALT=ATG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:34:43:43:20:29:2,16:0,14:0,0.325581:2,9:0,7:13:7:0,9:0,5:16:13
chr15	75195033	.	T	G	35.9	PASS	AF=0.105882;AO=10;DP=85;FAO=9;FDP=85;FR=.;FRO=76;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=41;FSRR=35;FWDB=-0.00216888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.916;QD=1.68934;RBI=0.0787749;REFB=-0.00030686;REVB=-0.078745;RO=74;SAF=9;SAR=1;SRF=40;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.481063;STB=0.853727;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0215274;OID=.;OPOS=75195033;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:85:85:74:76:10:9:0.105882:1:9:40:34:1:8:41:35
chr15	75336729	.	A	G	566.24	PASS	AF=0.614458;AO=51;DP=83;FAO=51;FDP=83;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0181116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.023;QD=27.2887;RBI=0.0228204;REFB=-0.0209198;REVB=-0.0138831;RO=32;SAF=23;SAR=28;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789895;STB=0.543029;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0105602;OID=.;OPOS=75336729;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:32:32:51:51:0.614458:28:23:18:14:28:23:18:14
chr15	75498548	.	A	G	1144.67	PASS	AF=1;AO=72;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0482543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.689;QD=60.246;RBI=0.055127;REFB=0;REVB=0.0266552;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118923;OID=.;OPOS=75498548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:76:0:0:72:76:1:40:32:0:0:42:34:0:0
chr15	75499602	.	C	A	214.37	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0238526;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0046;QD=17.1496;RBI=0.0239271;REFB=-0.0441233;REVB=0.0018871;RO=26;SAF=7;SAR=16;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16086;STB=0.583418;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0629725;OID=.;OPOS=75499602;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:26:27:23:23:0.46:16:7:12:14:16:7:12:15
chr15	75499619	.	T	C	801.59	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00526106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.508;QD=57.2565;RBI=0.00704688;REFB=0;REVB=0.00468825;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.19027e-05;OID=.;OPOS=75499619;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:56:0:0:53:56:1:32:21:0:0:33:23:0:0
chr15	75499861	.	G	A	215.85	PASS	AF=0.438596;AO=25;DP=57;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=6;FWDB=-0.02236;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=78.7157;QD=15.1472;RBI=0.0373487;REFB=-0.0257901;REVB=-0.0299158;RO=32;SAF=21;SAR=4;SRF=26;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.048465;STB=0.527615;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0461369;OID=.;OPOS=75499861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:32:32:25:25:0.438596:4:21:26:6:4:21:26:6
chr15	75503147	.	G	A	803.11	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0429263;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.518;QD=55.3867;RBI=0.0517461;REFB=-0.0479752;REVB=0.0288963;RO=1;SAF=22;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209528;STB=0.511107;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000970618;OID=.;OPOS=75503147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:35:22:1:0:35:22:1:0
chr15	75650836	.	G	A	404.61	PASS	AF=0.655172;AO=38;DP=58;FAO=38;FDP=58;FR=.;FRO=20;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0205882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.807;QD=27.9038;RBI=0.0256228;REFB=-0.0139049;REVB=-0.0152531;RO=20;SAF=24;SAR=14;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870526;STB=0.547503;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.00739436;OID=.;OPOS=75650836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:20:20:38:38:0.655172:14:24:10:10:14:24:10:10
chr15	75932129	.	G	T	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0463433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.165;QD=11.597;RBI=0.0463668;REFB=-0.00998401;REVB=-0.00147336;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149667;STB=0.588097;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0432811;OID=.;OPOS=75932129;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:7:5:6:15:7:5:6:15
chr15	75970070	.	C	T	79.41	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=19;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00191927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.917;QD=15.8821;RBI=0.0156526;REFB=-0.0178625;REVB=0.0155345;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040409;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0142146;OID=.;OPOS=75970070;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:19:20:10:10:9:10:0.5:4:5:6:4:4:6:6:4
chr15	75971505	.	T	C	202.01	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=2;FWDB=-0.011952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.135;QD=21.2641;RBI=0.0178371;REFB=-0.00439469;REVB=-0.0132405;RO=18;SAF=11;SAR=9;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302482;STB=0.667438;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0061748;OID=.;OPOS=75971505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:9:11:16:2:9:11:16:2
chr15	75971676	.	G	T	407.4	PASS	AF=0.393443;AO=47;DP=123;FAO=48;FDP=122;FR=.;FRO=74;FSAF=12;FSAR=36;FSRF=11;FSRR=63;FWDB=-0.041715;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.345;QD=13.3573;RBI=0.0474732;REFB=-0.0277953;REVB=-0.0226619;RO=72;SAF=11;SAR=36;SRF=11;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132072;STB=0.589253;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0346186;OID=.;OPOS=75971676;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:122:72:74:47:48:0.393443:36:11:11:61:36:12:11:63
chr15	75972027	.	A	C	85.31	PASS	AF=0.615385;AO=7;DP=14;FAO=8;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.158;QD=26.2507;RBI=0.0425153;REFB=-0.0208508;REVB=0.0425153;RO=3;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0323421;OID=.;OPOS=75972027;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:14:13:3:3:7:8:0.615385:7:0:0:3:8:0:0:3
chr15	75977139	.	T	C	302.61	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.010189;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5147;QD=16.8117;RBI=0.0111983;REFB=-0.0341897;REVB=0.00464617;RO=38;SAF=19;SAR=14;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1227;STB=0.575712;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0405705;OID=.;OPOS=75977139;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:38:39:33:33:0.458333:14:19:17:21:14:19:17:22
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chr15	75979782	.	G	T	430.75	PASS	AF=0.418803;AO=49;DP=117;FAO=49;FDP=117;FR=.;FRO=68;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.0749003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.639;QD=14.7266;RBI=0.0760776;REFB=-0.0317576;REVB=0.0133325;RO=67;SAF=32;SAR=17;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155787;STB=0.58412;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0530216;OID=.;OPOS=75979782;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:67:68:49:49:0.418803:17:32:34:33:17:32:35:33
chr15	75980112	.	A	G	204.46	PASS	AF=0.444444;AO=23;DP=53;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0204407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.512;QD=15.145;RBI=0.0206064;REFB=-0.0153785;REVB=-0.00260752;RO=30;SAF=10;SAR=13;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652416;STB=0.546836;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0117108;OID=.;OPOS=75980112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:30:30:23:24:0.444444:13:10:15:15:14:10:15:15
chr15	75981507	.	A	G	236.67	PASS	AF=0.481481;AO=23;DP=55;FAO=26;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.00731585;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.501;QD=17.5312;RBI=0.0376756;REFB=-0.0234068;REVB=-0.0369585;RO=18;SAF=9;SAR=14;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196173;STB=0.511103;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0382927;OID=.;OPOS=75981507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:18:27:23:26:0.481481:14:9:3:15:15:11:12:15
chr15	75982072	.	G	A	271.14	PASS	AF=0.164634;AO=54;DP=331;FAO=54;FDP=328;FR=.;FRO=274;FSAF=14;FSAR=40;FSRF=119;FSRR=155;FWDB=0.000389519;FXX=0.00906317;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.0139;QD=3.30664;RBI=0.0144644;REFB=-0.00444354;REVB=0.0144591;RO=268;SAF=14;SAR=40;SRF=117;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248731;STB=0.660806;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0123153;OID=.;OPOS=75982072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:331:328:268:274:54:54:0.164634:40:14:117:151:40:14:119:155
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chr15	76136768	.	C	T	800.85	PASS	AF=0.474286;AO=82;DP=173;FAO=83;FDP=175;FR=.;FRO=92;FSAF=29;FSAR=54;FSRF=37;FSRR=55;FWDB=-0.00183734;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=265.583;QD=18.3052;RBI=0.00224871;REFB=-0.0116254;REVB=0.0012965;RO=87;SAF=28;SAR=54;SRF=36;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0729645;STB=0.529956;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0113785;OID=.;OPOS=76136768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:175:87:92:82:83:0.474286:54:28:36:51:54:29:37:55
chr15	76191802	.	G	A	1127.43	PASS	AF=0.986842;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0344046;FXX=0.0256377;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5656;QD=59.3385;RBI=0.0358617;REFB=-0.0707847;REVB=-0.0101184;RO=0;SAF=40;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71047e-08;STB=0.50704;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.000177843;OID=.;OPOS=76191802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:76:0:1:75:75:0.986842:35:40:0:0:35:40:0:1
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chr15	76630303	.	T	C	679.8	PASS	AF=0.427746;AO=74;DP=177;FAO=74;FDP=173;FR=.;FRO=99;FSAF=28;FSAR=46;FSRF=43;FSRR=56;FWDB=-0.0597637;FXX=0.0225976;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.024;QD=15.7178;RBI=0.059834;REFB=-0.00995787;REVB=0.00289951;RO=94;SAF=28;SAR=46;SRF=38;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0273992;STB=0.533477;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0112311;OID=.;OPOS=76630303;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:173:94:99:74:74:0.427746:46:28:38:56:46:28:43:56
chr15	76630717	.	C	T	73.83	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0195064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.625;QD=9.84393;RBI=0.0280971;REFB=-0.00535336;REVB=-0.0202225;RO=20;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111111;STB=0.567431;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.00810232;OID=.;OPOS=76630717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:4:6:10:10:4:6:10:10
chr15	76673921	.	G	A	290.95	PASS	AF=0.29771;AO=39;DP=131;FAO=39;FDP=131;FR=.;FRO=92;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=31;FSRR=61;FWDB=-0.015851;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.088;QD=8.88407;RBI=0.0313876;REFB=-0.0102269;REVB=-0.0270911;RO=92;SAF=15;SAR=24;SRF=31;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0614419;STB=0.535921;STBP=0.641;TYPE=snp;VARB=0.0245428;OID=.;OPOS=76673921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:92:92:39:39:0.29771:24:15:31:61:24:15:31:61
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chr15	77907784	.	G	A	317.46	PASS	AF=0.443038;AO=33;DP=77;FAO=35;FDP=79;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=-0.00308589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.469;QD=16.074;RBI=0.00792997;REFB=-0.0125156;REVB=0.00730491;RO=40;SAF=13;SAR=20;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10533;STB=0.581586;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0177553;OID=.;OPOS=77907784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:79:40:44:33:35:0.443038:20:13:20:20:21:14:24:20
chr15	78207625	.	A	G	123.29	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0324744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2541;QD=41.0975;RBI=0.0370861;REFB=0;REVB=0.0179106;RO=0;SAF=1;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00603387;OID=.;OPOS=78207625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:10:1:0:0:11:1:0:0
chr15	78207876	.	C	T	88.1	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=0.0647138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.664;QD=14.0964;RBI=0.0671406;REFB=-0.00670631;REVB=0.0178883;RO=14;SAF=3;SAR=8;SRF=1;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287531;STB=0.662926;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.00790271;OID=.;OPOS=78207876;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:14:14:11:11:0.44:8:3:1:13:8:3:1:13
chr15	78208880	.	G	A	479.76	PASS	AF=0.547619;AO=46;DP=84;FAO=46;FDP=84;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0158976;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4188;QD=22.8455;RBI=0.0394686;REFB=-0.0429659;REVB=0.0361252;RO=38;SAF=17;SAR=29;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0447891;STB=0.52466;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0306942;OID=.;OPOS=78208880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:38:38:46:46:0.547619:29:17:16:22:29:17:16:22
chr15	78209131	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00917155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.5839;QD=45.8044;RBI=0.030253;REFB=0;REVB=0.0288293;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00136879;OID=.;OPOS=78209131;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0
chr15	78209436	.	C	T	523.8	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014167;FXX=0.0277701;HRUN=3;LEN=1;MLLD=286.062;QD=59.863;RBI=0.0142943;REFB=0;REVB=-0.0019034;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.23551e-05;OID=.;OPOS=78209436;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:13:22:0:0:13:22:0:0
chr15	78211345	.	A	G	594.54	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00384474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.93;QD=60.9783;RBI=0.0086778;REFB=0;REVB=-0.0077796;RO=0;SAF=14;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.86388e-05;OID=.;OPOS=78211345;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:24:14:0:0:25:14:0:0
chr15	78276660	.	A	G	593.8	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0257237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1607;QD=60.9023;RBI=0.0301785;REFB=0;REVB=0.0157807;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.57004e-05;OID=.;OPOS=78276660;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:19:20:0:0:19:20:0:0
chr15	78317837	.	C	G	300.33	PASS	AF=0.55102;AO=27;DP=49;FAO=27;FDP=49;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.0350907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.244;QD=24.5164;RBI=0.0351396;REFB=-0.000344224;REVB=-0.00185341;RO=22;SAF=10;SAR=17;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0712664;STB=0.539653;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.000537811;OID=.;OPOS=78317837;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:22:22:27:27:0.55102:17:10:10:12:17:10:10:12
chr15	78403004	.	A	G	582.21	PASS	AF=0.975;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0239233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.072;QD=58.2214;RBI=0.0423264;REFB=-0.0553006;REVB=0.0349171;RO=0;SAF=25;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517232;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.000580057;OID=.;OPOS=78403004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:40:0:1:38:39:0.975:13:25:0:0:14:25:0:1
chr15	78565478	.	C	T	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.791;QD=57.1775;RBI=0.0360657;REFB=0;REVB=0.0342689;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.36959e-05;OID=.;OPOS=78565478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0
chr15	78587910	.	A	G	1586.56	PASS	AF=1;AO=97;DP=97;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.794;QD=64.1035;RBI=0.0302381;REFB=0;REVB=0.0222398;RO=0;SAF=49;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.76596e-05;OID=.;OPOS=78587910;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:99:0:0:97:99:1:48:49:0:0:50:49:0:0
chr15	78632830	.	C	G	1026.34	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0145979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6985;QD=59.498;RBI=0.0483536;REFB=0;REVB=0.0460974;RO=0;SAF=37;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268979;OID=.;OPOS=78632830;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:32:37:0:0:32:37:0:0
chr15	78633595	.	T	G	1010.71	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.764;QD=59.4533;RBI=0.05855;REFB=0;REVB=0.0534034;RO=0;SAF=35;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.53728e-05;OID=.;OPOS=78633595;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:68:0:0:64:68:1:29:35:0:0:33:35:0:0
chr15	78758677	.	G	C	745.19	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00108017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.459;QD=63.4201;RBI=0.0200291;REFB=0;REVB=0.02;RO=0;SAF=27;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71386e-05;OID=.;OPOS=78758677;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:19:27:0:0:20:27:0:0
chr15	78780104	.	T	C	718.96	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0246371;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.419;QD=61.1878;RBI=0.0252831;REFB=0.024134;REVB=0.00567886;RO=1;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200022;STB=0.510634;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=-4.03645e-05;OID=.;OPOS=78780104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:47:1:1:46:46:0.978723:23:23:0:1:23:23:0:1
chr15	78789488	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.239;QD=56.7066;RBI=0.0264104;REFB=0;REVB=0.0175081;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.70118e-05;OID=.;OPOS=78789488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0
chr15	78834965	.	GA	G	48.7	PASS	AF=0.608696;AO=10;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0697962;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=7.95709;QD=8.4695;RBI=0.0734197;REFB=-0.060642;REVB=-0.0227803;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0.387255;SSSB=-0.128055;STB=0.50632;STBP=0.959;TYPE=del;VARB=0.0644553;OID=.;OPOS=78834966;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.608696:10:23:14:23:9:6:8:4:5:32:9:4:6:5:4
chr15	78841220	.	T	C	152.78	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00669605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.429;QD=13.5807;RBI=0.0111307;REFB=-0.0144095;REVB=-0.00889128;RO=28;SAF=12;SAR=5;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336446;STB=0.696337;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=0.0134731;OID=.;OPOS=78841220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:5:12:11:17:5:12:11:17
chr15	78885574	.	T	A	283.64	PASS	AF=0.410256;AO=32;DP=78;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=0.0022184;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.443;QD=14.5455;RBI=0.0143826;REFB=-0.00817388;REVB=0.0142105;RO=46;SAF=7;SAR=25;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.409063;STB=0.733869;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0129154;OID=.;OPOS=78885574;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:46:46:32:32:0.410256:25:7:27:19:25:7:27:19
chr15	78887709	.	G	GTCTC	419.41	PASS	AF=0.525;AO=41;DP=81;FAO=42;FDP=80;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.0036195;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=276.172;QD=20.9703;RBI=0.0130301;REFB=-0.0282754;REVB=0.0125173;RO=39;SAF=18;SAR=23;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132224;STB=0.571395;STBP=0.189;TYPE=ins;VARB=0.0227459;OID=.;OPOS=78887710;OREF=-;OALT=TCTC;OMAPALT=GTCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.525:41:81:42:80:38:18:24:22:16:99:39:18:23:23:16
chr15	78893864	.	C	T	471.02	PASS	AF=0.46789;AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=109;FR=.;FRO=58;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=0.00605219;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.382;QD=17.285;RBI=0.0077635;REFB=-0.0208846;REVB=0.00486241;RO=58;SAF=32;SAR=19;SRF=38;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286023;STB=0.515898;STBP=0.766;TYPE=snp;VARB=0.0207244;OID=.;OPOS=78893864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:58:58:51:51:0.46789:19:32:38:20:19:32:38:20
chr15	78911181	.	T	C	52.92	PASS	AF=0.275862;AO=7;DP=28;FAO=8;FDP=29;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0104428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.533;QD=7.29898;RBI=0.0157045;REFB=-0.0103349;REVB=-0.0117294;RO=20;SAF=5;SAR=2;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052215;STB=0.57126;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0220875;OID=.;OPOS=78911181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:28:29:20:21:7:8:0.275862:2:5:15:5:3:5:15:6
chr15	79054900	.	C	G	289.67	PASS	AF=1;AO=15;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.2921;QD=52.6673;RBI=0.122078;REFB=0;REVB=0.0568215;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00548147;OID=.;OPOS=79054900;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:15:22:1:6:9:0:0:6:16:0:0
chr15	79058413	.	G	A	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0197486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.893;QD=23.2176;RBI=0.0243389;REFB=0.0271631;REVB=0.0142259;RO=1;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277405;STB=0.66592;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=-0.000756268;OID=.;OPOS=79058413;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:4:1:1:0:4:1:1:0
chr15	79058445	.	G	A	43.25	PASS	AF=0.857143;AO=5;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0078096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.954;QD=24.7142;RBI=0.067307;REFB=-0.0502129;REVB=0.0668524;RO=2;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190062;STB=0.666027;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.00460018;OID=.;OPOS=79058445;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:2:1:5:6:0.857143:4:1:1:1:5:1:1:0
chr15	79058572	.	T	G	84.96	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5239;QD=37.7597;RBI=0.0442531;REFB=0;REVB=0.0344766;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00456028;OID=.;OPOS=79058572;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:8:9:1:2:6:0:0:2:7:0:0
chr15	79058923	.	G	A	894.81	PASS	AF=0.984375;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0189571;FXX=0.0153822;HRUN=4;LEN=1;MLLD=100.957;QD=55.9253;RBI=0.0632365;REFB=-0.0753608;REVB=0.0603282;RO=2;SAF=43;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0471292;STB=0.512191;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.000612304;OID=.;OPOS=79058923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:2:1:62:63:0.984375:19:43:0:2:20:43:0:1
chr15	79066581	.	G	A	1412.37	PASS	AF=0.961538;AO=99;DP=104;FAO=100;FDP=104;FR=.;FRO=4;FSAF=54;FSAR=46;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.019859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.526;QD=54.3218;RBI=0.033742;REFB=-0.178827;REVB=0.027279;RO=3;SAF=54;SAR=45;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00681923;STB=0.501548;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.00256239;OID=.;OPOS=79066581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:104:104:3:4:99:100:0.961538:45:54:2:1:46:54:2:2
chr15	79082108	.	C	T	787.03	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286169;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.125;QD=64.2471;RBI=0.0559887;REFB=0;REVB=0.0481229;RO=0;SAF=21;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00019347;OID=.;OPOS=79082108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:26:21:0:0:27:22:0:0
chr15	79089007	.	T	C	770.48	PASS	AF=0.982143;AO=56;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0140113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.119;QD=55.0343;RBI=0.0721175;REFB=0.0213408;REVB=0.0707433;RO=0;SAF=41;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=-0.00173837;OID=.;OPOS=79089007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:0:1:56:55:0.982143:15:41:0:0:15:40:1:0
chr15	79185877	.	A	G	153.59	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0119121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.624;QD=21.942;RBI=0.012899;REFB=0.0066715;REVB=-0.0049484;RO=12;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11081;STB=0.562422;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=-0.00444518;OID=.;OPOS=79185877;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:7:9:5:7:7:9:5:7
chr15	79185898	.	C	A	166.03	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0651546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3588;QD=22.1369;RBI=0.0686629;REFB=0.00756241;REVB=-0.0216672;RO=13;SAF=9;SAR=8;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111111;STB=0.562427;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=-0.010272;OID=.;OPOS=79185898;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:8:9:5:8:8:9:5:8
chr15	79189580	.	C	CTT,CTTT,T	113.01	PASS	AF=0.40625,0,0;AO=8,4,2;DP=34;FAO=13,0,0;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=8,0,0;FSAR=5,0,0;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.093213,-0.0621509,-0.00781546;FXX=0.0856898;HRUN=2,2,1;LEN=2,3,1;MLLD=29.9406,29.9279,239.618;QD=14.126;RBI=0.249748,0.170186,0.0423256;REFB=-0.0108136,-0.00664541,-0.0032468;REVB=-0.231701,-0.158431,-0.0415977;RO=18;SAF=5,2,2;SAR=3,2,0;SRF=13;SRR=5;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.121057,-0.263015,0.444428;STB=0.543976,0.5,0.5;STBP=0.701,1,1;TYPE=ins,ins,snp;VARB=0.00250214,0,0;OID=.,.,.;OPOS=79189581,79189581,79189580;OREF=-,-,C;OALT=TT,TTT,T;OMAPALT=CTT,CTTT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:32:18:19:8,4,2:13,0,0:0.40625,0,0:3,2,0:5,2,2:13:5:5,0,0:8,0,0:13:6
chr15	79217690	.	G	C	604.28	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263914;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7813;QD=60.4276;RBI=0.061604;REFB=0;REVB=0.0556646;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000506193;OID=.;OPOS=79217690;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:19:19:0:0:21:19:0:0
chr15	79224747	.	C	T	299.15	PASS	AF=0.390805;AO=34;DP=86;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.0246527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.546;QD=13.7541;RBI=0.0316418;REFB=-0.0147453;REVB=-0.0198355;RO=50;SAF=21;SAR=13;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00261212;STB=0.508904;STBP=0.92;TYPE=snp;VARB=0.0244838;OID=.;OPOS=79224747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:50:53:34:34:0.390805:13:21:31:19:13:21:32:21
chr15	79231518	.	A	G	280.25	PASS	AF=0.517241;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=58;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0178096;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.028;QD=19.3278;RBI=0.0271708;REFB=-0.0211422;REVB=-0.02052;RO=26;SAF=6;SAR=24;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205574;STB=0.603698;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0424782;OID=.;OPOS=79231518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:26:28:30:30:0.517241:24:6:10:16:24:6:10:18
chr15	79231526	.	A	AG	234.93	PASS	AF=0.628571;AO=17;DP=48;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00760531;FXX=0.0789266;HRUN=0;LEN=1;MLLD=212.641;QD=26.8492;RBI=0.0246106;REFB=-0.0264303;REVB=-0.023406;RO=30;SAF=3;SAR=14;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275065;STB=0.576197;STBP=0.29;TYPE=ins;VARB=0.0209723;OID=.;OPOS=79231527;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.628571:17:48:22:35:13:5:17:5:8:99:30:3:14:11:19
chr15	79231527	.	A	G	32.49	PASS	AF=0.125;AO=6;DP=48;FAO=6;FDP=48;FR=.;FRO=42;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=29;FWDB=-0.0416394;FXX=0;HRUN=10;LEN=1;MLLD=182.62;QD=2.70763;RBI=0.0453624;REFB=-0.00661638;REVB=-0.0179976;RO=42;SAF=1;SAR=5;SRF=13;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220769;STB=0.672418;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0404523;OID=.;OPOS=79231527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:48:48:42:42:6:6:0.125:5:1:13:29:5:1:13:29
chr15	79277247	.	A	C	2280.4	PASS	AF=1;AO=143;DP=143;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.849;QD=63.3443;RBI=0.027749;REFB=0;REVB=-0.000842067;RO=0;SAF=82;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21229e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62152e-05;OID=.;OPOS=79277247;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:143:144:0:0:143:144:1:61:82:0:0:61:83:0:0
chr15	79277297	.	CT	C,CC	1334.25	PASS	AF=0.0107527,0.989247;AO=21,71;DP=93;FAO=1,92;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=0,46;FSAR=1,46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180865,0.131678;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=130.406,142.602;QD=57.3872;RBI=0.0182602,0.131714;REFB=0,0;REVB=-0.00251249,-0.00307913;RO=0;SAF=20,25;SAR=1,46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.78928e-08,4.50978e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0521548,0.00335189;OID=.,.;OPOS=79277298,79277298;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0107527,0.989247:21,71:93:1,92:93:0:0,46:1,46:0:0:3:0:20,25:1,46:0:0
chr15	79277511	.	A	G	519.92	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00966363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.703;QD=59.4199;RBI=0.0277596;REFB=0;REVB=0.0260232;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00030814;OID=.;OPOS=79277511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:19:15:0:0:19:16:0:0
chr15	79296172	.	G	A	289.66	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=25;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0224879;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=127.97;QD=18.9939;RBI=0.0403235;REFB=-0.019548;REVB=-0.0334706;RO=30;SAF=25;SAR=6;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271771;STB=0.65326;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0341467;OID=.;OPOS=79296172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:6:25:17:13:6:25:17:13
chr15	79298523	.	G	A	386.69	PASS	AF=0.527027;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=74;FR=.;FRO=35;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0125919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.122;QD=20.9024;RBI=0.0246304;REFB=-0.00353043;REVB=0.0211684;RO=35;SAF=28;SAR=11;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.26488;STB=0.647199;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00305183;OID=.;OPOS=79298523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:35:35:39:39:0.527027:11:28:15:20:11:28:15:20
chr15	79586361	.	T	C	39.34	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=-0.0265569;FXX=0.0951928;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.103;QD=8.28138;RBI=0.026587;REFB=-0.00431987;REVB=-0.00126541;RO=15;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433819;STB=0.841495;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0120115;OID=.;OPOS=79586361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:21:19:15:13:6:6:0.315789:3:3:2:13:3:3:0:13
chr15	79587964	.	C	A	374.84	PASS	AF=0.631579;AO=36;DP=57;FAO=36;FDP=57;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0103889;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=309.815;QD=26.3049;RBI=0.0104988;REFB=-0.00483317;REVB=-0.00151486;RO=21;SAF=21;SAR=15;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409013;STB=0.522376;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.00241862;OID=.;OPOS=79587964;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:21:21:36:36:0.631579:15:21:11:10:15:21:11:10
chr15	79589174	.	C	G	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00345022;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.378;QD=17.2298;RBI=0.0387671;REFB=0.00428508;REVB=0.0386133;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246937;STB=0.642528;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=-0.00455634;OID=.;OPOS=79589174;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:4:4:5:1:4:4:5:1
chr15	79590208	.	A	G	135.72	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-4.70242e-05;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.971;QD=15.5107;RBI=0.00611207;REFB=-0.00326437;REVB=0.00611189;RO=20;SAF=8;SAR=7;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17989;STB=0.603639;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.00447583;OID=.;OPOS=79590208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:20:20:15:15:0.428571:7:8:7:13:7:8:7:13
chr15	79606137	.	G	A	834.4	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00402837;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.793;QD=57.5448;RBI=0.0298544;REFB=0;REVB=0.0295813;RO=0;SAF=34;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.56851e-05;OID=.;OPOS=79606137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:24:34:0:0:24:34:0:0
chr15	79614418	.	A	G	1516.55	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00100012;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.315;QD=63.8549;RBI=0.00211499;REFB=0;REVB=-0.00186359;RO=0;SAF=39;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.98793e-07;OID=.;OPOS=79614418;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:56:39:0:0:56:39:0:0
chr15	79749155	.	C	T	385.16	PASS	AF=0.513158;AO=33;DP=77;FAO=39;FDP=76;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=-0.00837255;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.064;QD=20.2716;RBI=0.00887865;REFB=-0.00835648;REVB=0.00295481;RO=33;SAF=17;SAR=16;SRF=7;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.271783;STB=0.604381;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00750829;OID=.;OPOS=79749155;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:76:33:37:33:39:0.513158:16:17:7:26:19:20:11:26
chr15	79750127	.	A	G	195.0	PASS	AF=0.575758;AO=18;DP=33;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0700177;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.493;QD=23.6366;RBI=0.0723927;REFB=-0.0338387;REVB=0.0183907;RO=14;SAF=14;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137687;STB=0.548966;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0102241;OID=.;OPOS=79750127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:14:14:18:19:0.575758:4:14:9:5:5:14:9:5
chr15	79750256	.	A	G	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0175311;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0509;QD=11.2567;RBI=0.0253842;REFB=-0.00460931;REVB=-0.018358;RO=12;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0829008;STB=0.549876;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.00432977;OID=.;OPOS=79750256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:4:4:5:7:4:4:5:7
chr15	79750307	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.015815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.98;QD=50.4124;RBI=0.0432569;REFB=0;REVB=-0.0402622;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000634728;OID=.;OPOS=79750307;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr15	79750493	.	TG	T	69.14	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0318283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.9705;QD=14.5567;RBI=0.11986;REFB=-0.0600785;REVB=-0.115557;RO=9;SAF=1;SAR=9;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.667743;STB=0.889297;STBP=0.003;TYPE=del;VARB=0.0404852;OID=.;OPOS=79750494;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.526316:10:19:10:19:9:1:9:8:1:61:9:1:9:8:1
chr15	79761231	.	T	C	236.64	PASS	AF=0.45;AO=26;DP=59;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.010208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.388;QD=15.776;RBI=0.0115771;REFB=-0.0251944;REVB=-0.00546124;RO=33;SAF=19;SAR=7;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.318279;STB=0.660109;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0339332;OID=.;OPOS=79761231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:33:33:26:27:0.45:7:19:14:19:8:19:14:19
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chr15	80137560	.	T	C	462.23	PASS	AF=0.480392;AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=0.00800649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.894;QD=18.1265;RBI=0.0341633;REFB=-0.000748904;REVB=-0.0332118;RO=53;SAF=23;SAR=26;SRF=33;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142693;STB=0.579125;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.000922496;OID=.;OPOS=80137560;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:53:53:49:49:0.480392:26:23:33:20:26:23:33:20
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chr15	80216148	.	G	C,GC	67.46	PASS	AF=0,0.358491;AO=2,13;DP=57;FAO=0,19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=0,9;FSAR=0,10;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0447097,0.103618;FXX=0;HRUN=2,4;LEN=1,1;MLLD=21.6788,11.4646;QD=5.09142;RBI=0.0516799,0.109506;REFB=-0.0201275,-0.0512611;REVB=-0.0259202,0.035425;RO=40;SAF=2,5;SAR=0,8;SRF=18;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.437383,-0.0814306;STB=0.5,0.516881;STBP=1,0.839;TYPE=snp,ins;VARB=0.0326891,0.0572869;OID=.,.;OPOS=80216148,80216149;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:66:57:53:40:34:2,13:0,19:0,0.358491:0,8:2,5:18:22:0,10:0,9:17:17
chr15	80216165	.	G	T	219.84	PASS	AF=0.44;AO=21;DP=49;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0215061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.965;QD=17.5875;RBI=0.0241176;REFB=-0.00550962;REVB=-0.0109154;RO=28;SAF=9;SAR=12;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.142358;STB=0.565158;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00439795;OID=.;OPOS=80216165;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:28:28:21:22:0.44:12:9:16:12:12:10:16:12
chr15	80216176	.	G	T	140.06	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0290485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.535;QD=12.7322;RBI=0.0309;REFB=-0.0220811;REVB=-0.0105354;RO=28;SAF=9;SAR=7;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0293432;STB=0.51722;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0746389;OID=.;OPOS=80216176;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:7:9:15:13:7:9:15:13
chr15	80216516	.	A	C	189.28	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=33;FWDB=-0.0223187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.177;QD=13.0536;RBI=0.0236194;REFB=-0.0183072;REVB=-0.00773011;RO=35;SAF=6;SAR=17;SRF=2;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.339251;STB=0.687954;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.027534;OID=.;OPOS=80216516;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:17:6:2:33:17:6:2:33
chr15	80216532	.	A	T	336.75	PASS	AF=0.604167;AO=28;DP=47;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=28;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0363056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.408;QD=28.0622;RBI=0.047819;REFB=-0.0158898;REVB=0.0311218;RO=19;SAF=1;SAR=27;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.564531;STB=0.826673;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0153616;OID=.;OPOS=80216532;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:19:19:28:29:0.604167:27:1:6:13:28:1:6:13
chr15	80216931	.	T	C	85.77	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.000142727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=334.684;QD=11.8307;RBI=0.0044387;REFB=-0.00658505;REVB=0.0044364;RO=18;SAF=4;SAR=7;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412848;STB=0.740789;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.016513;OID=.;OPOS=80216931;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:7:4:14:4:7:4:14:4
chr15	80217100	.	A	G	494.15	PASS	AF=0.495238;AO=51;DP=104;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.00308021;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5088;QD=18.8248;RBI=0.0302995;REFB=-0.0283309;REVB=0.0301425;RO=53;SAF=26;SAR=25;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139268;STB=0.580922;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0247239;OID=.;OPOS=80217100;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:53:53:51:52:0.495238:25:26:35:18:26:26:35:18
chr15	80259964	.	C	T	177.05	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0556028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3453;QD=12.2103;RBI=0.12885;REFB=0.0333389;REVB=-0.116235;RO=36;SAF=16;SAR=6;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.290314;STB=0.668736;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.0566928;OID=.;OPOS=80259964;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:36:36:22:22:0.37931:6:16:17:19:6:16:17:19
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chr15	80263345	.	A	C	326.66	PASS	AF=0.618182;AO=29;DP=55;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=-0.0294453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.713;QD=23.7568;RBI=0.0333883;REFB=0.0198727;REVB=-0.0157401;RO=18;SAF=16;SAR=13;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162617;STB=0.580449;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.013579;OID=.;OPOS=80263345;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:18:21:29:34:0.618182:13:16:14:4:13:21:17:4
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chr15	80472561	.	C	T	783.99	PASS	AF=0.490909;AO=81;DP=168;FAO=81;FDP=165;FR=.;FRO=84;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=44;FSRR=40;FWDB=0.0252068;FXX=0.0178561;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2591;QD=19.0058;RBI=0.0693943;REFB=-0.036711;REVB=0.0646544;RO=82;SAF=47;SAR=34;SRF=43;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518579;STB=0.529208;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0420974;OID=.;OPOS=80472561;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:165:82:84:81:81:0.490909:34:47:43:39:34:47:44:40
chr15	80672506	.	T	C	74.19	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0183637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1378;QD=10.2334;RBI=0.0218066;REFB=-0.0202354;REVB=-0.0117602;RO=18;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123941;STB=0.521696;STBP=0.871;TYPE=snp;VARB=0.029038;OID=.;OPOS=80672506;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:29:18:19:10:10:0.344828:6:4:7:11:6:4:7:12
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chr15	81582868	.	G	A	1529.99	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.872;QD=63.7496;RBI=0.0401238;REFB=0;REVB=0.0316405;RO=0;SAF=42;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.69587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.40166e-05;OID=.;OPOS=81582868;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:95:96:1:53:42:0:0:54:42:0:0
chr15	81600995	.	A	G	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0535897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.096;QD=61.3346;RBI=0.0536341;REFB=0;REVB=0.00218056;RO=0;SAF=11;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.55568e-05;OID=.;OPOS=81600995;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:29:11:0:0:29:11:0:0
chr15	81624768	.	C	T	751.93	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.952;QD=56.7491;RBI=0.0537452;REFB=0;REVB=0.0518924;RO=0;SAF=30;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48867e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000271542;OID=.;OPOS=81624768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:53:0:0:49:53:1:19:30:0:0:22:31:0:0
chr15	81625336	.	G	A	314.81	PASS	AF=0.571429;AO=29;DP=54;FAO=32;FDP=56;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.00949743;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.655;QD=22.4865;RBI=0.0205579;REFB=-0.019755;REVB=-0.0182326;RO=22;SAF=12;SAR=17;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138407;STB=0.558786;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0211768;OID=.;OPOS=81625336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:56:22:24:29:32:0.571429:17:12:13:9:19:13:13:11
chr15	81625385	.	C	T	301.78	PASS	AF=0.5625;AO=26;DP=48;FAO=27;FDP=48;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.00690495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.699;QD=25.1481;RBI=0.0186633;REFB=-0.0337407;REVB=-0.017339;RO=21;SAF=11;SAR=15;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119491;STB=0.572263;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0212767;OID=.;OPOS=81625385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:21:21:26:27:0.5625:15:11:12:9:16:11:12:9
chr15	81636267	.	C	T	767.27	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.071146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.256;QD=63.9391;RBI=0.0771834;REFB=0;REVB=0.0299254;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112217;OID=.;OPOS=81636267;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:20:27:0:0:20:28:0:0
chr15	81637284	.	G	A	758.63	PASS	AF=0.462428;AO=80;DP=173;FAO=80;FDP=173;FR=.;FRO=93;FSAF=51;FSAR=29;FSRF=61;FSRR=32;FWDB=-0.00862705;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=297.56;QD=17.5406;RBI=0.0128507;REFB=-0.0168656;REVB=-0.00952449;RO=92;SAF=51;SAR=29;SRF=60;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154067;STB=0.510769;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0187225;OID=.;OPOS=81637284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:173:92:93:80:80:0.462428:29:51:60:32:29:51:61:32
chr15	82335891	.	G	A	84.03	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=4;FWDB=0.00293657;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.5733;QD=10.5032;RBI=0.0148749;REFB=-0.0275089;REVB=-0.0145822;RO=21;SAF=7;SAR=4;SRF=17;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223664;STB=0.631371;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0847149;OID=.;OPOS=82335891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:4:7:17:4:4:7:17:4
chr15	82384094	.	C	G	164.13	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=18;FWDB=0.013655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.482;QD=12.8732;RBI=0.0172169;REFB=-0.0113243;REVB=0.0104862;RO=32;SAF=10;SAR=9;SRF=14;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955434;STB=0.555497;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0112765;OID=.;OPOS=82384094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:9:10:14:18:9:10:14:18
chr15	82512429	.	C	G	1026.34	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.711;QD=59.4979;RBI=0.0581268;REFB=0;REVB=-0.0449214;RO=0;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.13961e-05;OID=.;OPOS=82512429;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:30:39:0:0:30:39:0:0
chr15	82555242	.	A	G	726.05	PASS	AF=1;AO=39;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.673;QD=63.1345;RBI=0.0933657;REFB=0;REVB=0.0886854;RO=0;SAF=25;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155586;OID=.;OPOS=82555242;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:39:46:1:14:25:0:0:19:27:0:0
chr15	82558034	.	G	C	740.43	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.407;QD=56.9563;RBI=0.0125557;REFB=0;REVB=0.00279066;RO=0;SAF=34;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19096e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.03483e-05;OID=.;OPOS=82558034;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:18:34:0:0:18:34:0:0
chr15	82563991	.	C	T	632.17	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00383582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.886;QD=61.6749;RBI=0.025559;REFB=0;REVB=-0.0252695;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.47712e-05;OID=.;OPOS=82563991;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0
chr15	82574879	.	T	C	594.52	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.095;QD=60.976;RBI=0.0275323;REFB=0;REVB=0.0250155;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.21907e-05;OID=.;OPOS=82574879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:13:26:0:0:13:26:0:0
chr15	82636940	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00863673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2231;QD=43.4856;RBI=0.173123;REFB=0;REVB=-0.172908;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00632108;OID=.;OPOS=82636940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr15	82636963	.	G	A	45.99	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0308175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.707;QD=9.19784;RBI=0.0375073;REFB=-0.0105924;REVB=-0.0213795;RO=13;SAF=1;SAR=6;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.343745;STB=0.71926;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.060013;OID=.;OPOS=82636963;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:6:1:5:8:6:1:5:8
chr15	82637060	.	C	CT	295.08	PASS	AF=1;AO=6;DP=38;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0969007;FXX=0.447251;HRUN=0;LEN=1;MLLD=119.247;QD=56.2048;RBI=0.139053;REFB=0;REVB=-0.0997294;RO=31;SAF=6;SAR=0;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.737474;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000135786;OID=.;OPOS=82637061;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:6:38:21:21:0:16:5:0:0:3:31:6:0:10:21
chr15	82637061	.	C	T	402.22	PASS	AF=0.815789;AO=31;DP=38;FAO=31;FDP=38;FR=.;FRO=7;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0812627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.502;QD=42.3386;RBI=0.0986716;REFB=-0.167937;REVB=0.0559683;RO=7;SAF=10;SAR=21;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192495;STB=0.604247;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0134862;OID=.;OPOS=82637061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:38:38:7:7:31:31:0.815789:21:10:6:1:21:10:6:1
chr15	82637078	.	C	CT	398.01	PASS	AF=1;AO=6;DP=36;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0306914;FXX=0.19439;HRUN=0;LEN=1;MLLD=134.364;QD=54.8984;RBI=0.137802;REFB=0;REVB=-0.134341;RO=30;SAF=6;SAR=0;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.748198;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00305271;OID=.;OPOS=82637079;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:6:36:29:29:0:15:14:0:0:3:30:6:0:9:21
chr15	82637079	.	C	T	390.6	PASS	AF=0.833333;AO=30;DP=36;FAO=30;FDP=36;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0444767;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.898;QD=43.3999;RBI=0.0483704;REFB=-0.202922;REVB=0.0190137;RO=6;SAF=9;SAR=21;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230598;STB=0.624913;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00705315;OID=.;OPOS=82637079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:36:36:6:6:30:30:0.833333:21:9:6:0:21:9:6:0
chr15	83215251	.	T	C	206.99	PASS	AF=1;AO=15;DP=16;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00353783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.053;QD=48.7042;RBI=0.0467711;REFB=0;REVB=0.0466371;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000300859;OID=.;OPOS=83215251;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:17:0:0:15:17:1:7:8:0:0:8:9:0:0
chr15	83224696	.	C	T	1848.53	PASS	AF=0.991803;AO=120;DP=121;FAO=121;FDP=122;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0126972;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.591;QD=60.6076;RBI=0.0319667;REFB=-0.0805524;REVB=0.0293369;RO=1;SAF=54;SAR=66;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00714322;STB=0.503759;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.000265539;OID=.;OPOS=83224696;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:121:122:1:1:120:121:0.991803:66:54:0:1:66:55:0:1
chr15	83297138	.	C	T	817.91	PASS	AF=1;AO=49;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.278;QD=57.3973;RBI=0.0839896;REFB=0;REVB=0.080339;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276529;OID=.;OPOS=83297138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:49:57:1:27:22:0:0:35:22:0:0
chr15	83680287	.	A	G	2485.21	PASS	AF=0.993865;AO=162;DP=163;FAO=162;FDP=163;FR=.;FRO=1;FSAF=86;FSAR=76;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0324328;FXX=0.0121205;HRUN=3;LEN=1;MLLD=188.24;QD=60.9867;RBI=0.0332178;REFB=-0.1151;REVB=0.00717866;RO=1;SAF=86;SAR=76;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00621998;STB=0.503268;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.000150352;OID=.;OPOS=83680287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:163:163:1:1:162:162:0.993865:76:86:0:1:76:86:0:1
chr15	84442272	.	T	C	380.82	PASS	AF=0.5;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=9;FWDB=0.0259715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.536;QD=19.529;RBI=0.0349412;REFB=-0.00903965;REVB=-0.0233746;RO=39;SAF=26;SAR=13;SRF=30;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108521;STB=0.559971;STBP=0.368;TYPE=snp;VARB=0.00788165;OID=.;OPOS=84442272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:39:39:39:39:0.5:13:26:30:9:13:26:30:9
chr15	84488636	.	A	G	423.59	PASS	AF=0.447619;AO=47;DP=105;FAO=47;FDP=105;FR=.;FRO=58;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=33;FSRR=25;FWDB=0.0221484;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.543;QD=16.1368;RBI=0.0228247;REFB=0.00702223;REVB=-0.00551475;RO=58;SAF=20;SAR=27;SRF=33;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.141452;STB=0.579084;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=-0.00625099;OID=.;OPOS=84488636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:58:58:47:47:0.447619:27:20:33:25:27:20:33:25
chr15	84493651	.	T	C	724.77	PASS	AF=0.483221;AO=71;DP=148;FAO=72;FDP=149;FR=.;FRO=77;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=0.0354828;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.2864;QD=19.4569;RBI=0.0384589;REFB=-0.0038035;REVB=-0.0148343;RO=77;SAF=38;SAR=33;SRF=42;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00969099;STB=0.50917;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.00439332;OID=.;OPOS=84493651;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:149:77:77:71:72:0.483221:33:38:42:35:34:38:42:35
chr15	84539619	.	C	G,T	773.58	PASS	AF=0.963636,0.0363636;AO=53,2;DP=55;FAO=53,2;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28,2;FSAR=25,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0614064,0.0175172;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=97.3276,181.245;QD=56.26;RBI=0.067158,0.0207535;REFB=0,0;REVB=0.0271928,-0.0111289;RO=0;SAF=28,2;SAR=25,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00140609,0.071684;OID=.,.;OPOS=84539619,84539619;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:55:55:0:0:53,2:53,2:0.963636,0.0363636:25,0:28,2:0:0:25,0:28,2:0:0
chr15	84581889	.	G	A	489.4	PASS	AF=0.755102;AO=37;DP=50;FAO=37;FDP=49;FR=.;FRO=12;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=0.036242;FXX=0.019996;HRUN=3;LEN=1;MLLD=99.4438;QD=39.9508;RBI=0.0364156;REFB=-0.0331604;REVB=0.00355116;RO=10;SAF=26;SAR=11;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0974108;STB=0.566031;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00621463;OID=.;OPOS=84581889;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:50:49:10:12:37:37:0.755102:11:26:9:1:11:26:11:1
chr15	84581904	.	T	C	766.44	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.016;QD=63.8703;RBI=0.0638721;REFB=0;REVB=0.0611386;RO=0;SAF=38;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.36352e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000803537;OID=.;OPOS=84581904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:10:38:0:0:10:38:0:0
chr15	84582124	.	G	T	642.06	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.849;QD=61.1484;RBI=0.0550278;REFB=0;REVB=0.0475896;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00162752;OID=.;OPOS=84582124;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:31:10:0:0:31:11:0:0
chr15	84639350	.	C	T	457.98	PASS	AF=0.438776;AO=41;DP=102;FAO=43;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=42;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=16;FSRR=26;FWDB=0.0408107;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.537;QD=18.6928;RBI=0.0408808;REFB=-0.013251;REVB=0.00239331;RO=36;SAF=15;SAR=26;SRF=10;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0825164;STB=0.504671;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=0.0162635;OID=.;OPOS=84639350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:98:36:42:41:43:0.438776:26:15:10:26:27:16:16:26
chr15	84651045	.	A	G	34.01	PASS	AF=0.171429;AO=6;DP=35;FAO=6;FDP=35;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00294947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.867;QD=3.8873;RBI=0.0626183;REFB=-0.0095482;REVB=-0.0625488;RO=29;SAF=3;SAR=3;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144901;STB=0.59968;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.028802;OID=.;OPOS=84651045;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:35:35:29:29:6:6:0.171429:3:3:18:11:3:3:18:11
chr15	84651185	.	C	A	238.87	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0201953;FXX=0.0327815;HRUN=4;LEN=1;MLLD=125.969;QD=16.1944;RBI=0.0209414;REFB=-0.0122035;REVB=-0.00553981;RO=32;SAF=11;SAR=16;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902906;STB=0.550982;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0165843;OID=.;OPOS=84651185;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:59:32:32:27:27:0.457627:16:11:16:16:16:11:16:16
chr15	84651290	.	T	C	471.0	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00969865;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.815;QD=58.8747;RBI=0.0202328;REFB=0;REVB=0.0177568;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000430563;OID=.;OPOS=84651290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
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chr15	85163998	.	G	C	722.76	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.942;QD=61.5113;RBI=0.0736087;REFB=0;REVB=0.0724202;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148945;OID=.;OPOS=85163998;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:22:22:0:0:25:22:0:0
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chr15	85333953	.	A	G	1558.31	PASS	AF=1;AO=98;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00992928;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=276.099;QD=62.962;RBI=0.0333491;REFB=-0.0939671;REVB=0.0318366;RO=0;SAF=73;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73172e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204518;OID=.;OPOS=85333953;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:99:99:0:0:98:99:1:25:73:0:0:25:74:0:0
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chr15	85360101	.	T	C	941.01	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0215792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.083;QD=57.0309;RBI=0.0269298;REFB=0.0539669;REVB=-0.0161107;RO=1;SAF=39;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178214;STB=0.509431;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.000350038;OID=.;OPOS=85360101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:26:39:0:1:26:39:0:1
chr15	85383640	.	G	A	334.47	PASS	AF=0.507246;AO=35;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.00602928;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=227.428;QD=19.3898;RBI=0.0126463;REFB=-0.0140498;REVB=0.0111165;RO=32;SAF=19;SAR=16;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370165;STB=0.521185;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0109526;OID=.;OPOS=85383640;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:32:34:35:35:0.507246:16:19:16:16:16:19:17:17
chr15	85383839	.	G	A	941.21	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.016949;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=296.981;QD=57.0432;RBI=0.0246891;REFB=-0.152337;REVB=0.0179522;RO=1;SAF=32;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141005;STB=0.50746;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00022408;OID=.;OPOS=85383839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:33:32:0:1:33:32:0:1
chr15	85399645	.	C	T	244.09	PASS	AF=0.522727;AO=21;DP=43;FAO=23;FDP=44;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.0109957;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.277;QD=22.1896;RBI=0.0179584;REFB=-0.00634143;REVB=0.0141985;RO=20;SAF=12;SAR=9;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163059;STB=0.615905;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00741329;OID=.;OPOS=85399645;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:20:21:21:23:0.522727:9:12:15:5:11:12:16:5
chr15	85401259	.	C	T	1650.77	PASS	AF=0.991071;AO=111;DP=114;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0269146;FXX=0.0175423;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.7737;QD=58.956;RBI=0.0762144;REFB=-0.144755;REVB=0.0713038;RO=1;SAF=48;SAR=63;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00747675;STB=0.503936;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.00259338;OID=.;OPOS=85401259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:114:112:1:1:111:111:0.991071:63:48:0:1:63:48:0:1
chr15	85401419	.	T	C	1470.91	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0372565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.728;QD=63.2649;RBI=0.0409348;REFB=0;REVB=0.0169591;RO=0;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.49339e-05;OID=.;OPOS=85401419;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:93:0:0:91:93:1:44:47:0:0:46:47:0:0
chr15	85402610	.	G	A	469.67	PASS	AF=0.555556;AO=45;DP=81;FAO=45;FDP=81;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.00872574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0531;QD=23.1934;RBI=0.0590931;REFB=0.00885585;REVB=0.0584453;RO=36;SAF=15;SAR=30;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972004;STB=0.553547;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=-0.00666808;OID=.;OPOS=85402610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:36:36:45:45:0.555556:30:15:16:20:30:15:16:20
chr15	85405994	.	CT	CC,C	341.87	PASS	AF=0.513514,0.324324;AO=17,12;DP=36;FAO=19,12;FDP=37;FR=.;FRO=6;FSAF=13,11;FSAR=6,1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00767288,-0.0927461;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=33.6305,22.4342;QD=36.9586;RBI=0.184189,0.117655;REFB=-0.0997975,-0.0963692;REVB=0.184029,0.0723944;RO=7;SAF=13,11;SAR=4,1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0.59901;SSSB=0.288,0.57431;STB=0.59081,0.808166;STBP=0.163,0.006;TYPE=snp,del;VARB=0.0202793,0.0774338;OID=.,.;OPOS=85405995,85405995;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.513514,0.324324:17,12:36:19,12:37:6:13,11:6,1:2:4:93:7:13,11:4,1:2:5
chr15	85411941	.	A	G	775.15	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0406546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.681;QD=53.4584;RBI=0.0546235;REFB=-0.176639;REVB=-0.0364818;RO=2;SAF=23;SAR=33;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0392437;STB=0.520826;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.00567806;OID=.;OPOS=85411941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:2:2:56:56:0.965517:33:23:2:0:33:23:2:0
chr15	85447431	.	G	A	1668.07	PASS	AF=0.991071;AO=111;DP=115;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0533555;FXX=0.0260847;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.595;QD=59.5739;RBI=0.0594638;REFB=-0.090718;REVB=0.0262514;RO=0;SAF=66;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53129e-08;STB=0.503759;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.000145639;OID=.;OPOS=85447431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:115:112:0:1:111:111:0.991071:45:66:0:0:45:66:1:0
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chr15	85476441	.	G	A	670.23	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.563;QD=62.3473;RBI=0.0313113;REFB=0;REVB=0.00803648;RO=0;SAF=4;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=8.15207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112349;OID=.;OPOS=85476441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:39:4:0:0:39:4:0:0
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chr15	86123462	.	T	C	250.21	PASS	AF=0.48;AO=24;DP=50;FAO=24;FDP=50;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00788883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.272;QD=20.0171;RBI=0.0228864;REFB=0.00359986;REVB=-0.0214839;RO=25;SAF=18;SAR=6;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122916;STB=0.58529;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=-0.00350234;OID=.;OPOS=86123462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:25:26:24:24:0.48:6:18:16:9:6:18:16:10
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chr15	86123924	.	C	T	285.48	PASS	AF=0.557692;AO=29;DP=52;FAO=29;FDP=52;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.00493987;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.934;QD=21.96;RBI=0.0378384;REFB=-0.0178458;REVB=0.0375145;RO=22;SAF=19;SAR=10;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0231723;STB=0.501465;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0135154;OID=.;OPOS=86123924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:22:23:29:29:0.557692:10:19:15:7:10:19:15:8
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chr15	86940622	.	T	C	1550.85	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017818;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.583;QD=63.9528;RBI=0.0348349;REFB=0;REVB=0.0299331;RO=0;SAF=67;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.82577e-05;OID=.;OPOS=86940622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:97:0:0:95:97:1:28:67:0:0:30:67:0:0
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chr15	89173732	.	T	C	1181.69	PASS	AF=0.9875;AO=78;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0594924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2846;QD=59.0843;RBI=0.0594989;REFB=0.0243366;REVB=-0.000876498;RO=2;SAF=38;SAR=40;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242587;STB=0.506328;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.000736474;OID=.;OPOS=89173732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:2:1:78:79:0.9875:40:38:2:0:40:39:1:0
chr15	89174748	.	G	C	726.85	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.022099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.788;QD=52.8615;RBI=0.0347414;REFB=-0.0445934;REVB=-0.0268067;RO=1;SAF=30;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154473;STB=0.502442;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.00989136;OID=.;OPOS=89174748;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:55:55:1:2:53:53:0.963636:23:30:1:0:23:30:1:1
chr15	89193497	.	A	T	710.46	PASS	AF=1;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336824;FXX=0.0384541;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1265;QD=56.8371;RBI=0.0960466;REFB=0;REVB=0.0899469;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103111;OID=.;OPOS=89193497;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr15	89195178	.	G	C	1081.0	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.914;QD=60.0554;RBI=0.0343061;REFB=0;REVB=0.0235103;RO=0;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.54823e-05;OID=.;OPOS=89195178;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:72:0:0:69:72:1:31:38:0:0:32:40:0:0
chr15	89195245	.	C	T	826.13	PASS	AF=0.967213;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0825397;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.5955;QD=54.1727;RBI=0.0825899;REFB=-0.132098;REVB=0.0028796;RO=2;SAF=38;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00968338;STB=0.505134;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0122447;OID=.;OPOS=89195245;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:62:61:2:2:59:59:0.967213:21:38:1:1:21:38:1:1
chr15	89195526	.	A	G	711.86	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302001;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.961;QD=63.276;RBI=0.0304395;REFB=0;REVB=-0.0038099;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.03121e-05;OID=.;OPOS=89195526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:16:29:0:0:16:29:0:0
chr15	89386652	.	G	A	36.37	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00168934;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.521;QD=6.92812;RBI=0.0231474;REFB=-0.0309289;REVB=0.0230857;RO=15;SAF=2;SAR=4;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292794;STB=0.686886;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0799871;OID=.;OPOS=89386652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:4:2:9:6:4:2:9:6
chr15	89391160	.	C	A	415.81	PASS	AF=0.482759;AO=42;DP=88;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.0105671;FXX=0.0113623;HRUN=5;LEN=1;MLLD=233.129;QD=19.1177;RBI=0.0161405;REFB=-0.00743427;REVB=-0.0122005;RO=43;SAF=24;SAR=18;SRF=12;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.261652;STB=0.643022;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00825174;OID=.;OPOS=89391160;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:43:45:42:42:0.482759:18:24:12:31:18:24:13:32
chr15	89392745	.	T	C	2775.7	PASS	AF=1;AO=174;DP=176;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221681;FXX=0.00561766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9028;QD=62.7276;RBI=0.0230009;REFB=0;REVB=0.00613326;RO=0;SAF=78;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.33915e-05;OID=.;OPOS=89392745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:176:177:0:0:174:177:1:96:78:0:0:97:80:0:0
chr15	89398105	.	C	T	96.19	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=-0.0115754;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.312;QD=12.0243;RBI=0.0124854;REFB=-0.00857008;REVB=-0.00467901;RO=20;SAF=4;SAR=8;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130519;STB=0.577644;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0140448;OID=.;OPOS=89398105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:8:4:9:11:8:4:9:11
chr15	89398330	.	G	A	216.86	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.00620148;FXX=0.0243843;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.03;QD=21.6856;RBI=0.00957149;REFB=-0.0151697;REVB=-0.00729075;RO=19;SAF=5;SAR=16;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431629;STB=0.743039;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0223068;OID=.;OPOS=89398330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:19:19:21:21:0.525:16:5:14:5:16:5:14:5
chr15	89398605	.	G	T	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0399106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.762;QD=12.637;RBI=0.042788;REFB=-0.0117683;REVB=-0.0154258;RO=21;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154159;STB=0.509077;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0166708;OID=.;OPOS=89398605;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:6:7:11:10:6:7:11:10
chr15	89398631	.	T	A	99.57	PASS	AF=0.428571;AO=7;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0129192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.417;QD=14.2244;RBI=0.0187151;REFB=-0.0407336;REVB=0.0135407;RO=12;SAF=6;SAR=1;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474209;STB=0.571312;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0934495;OID=.;OPOS=89398631;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:12:16:7:12:0.428571:1:6:10:2:6:6:10:6
chr15	89400339	.	A	C	403.85	PASS	AF=0.540541;AO=40;DP=75;FAO=40;FDP=74;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00483342;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.435;QD=21.8296;RBI=0.00564923;REFB=-0.0307595;REVB=-0.00292435;RO=33;SAF=18;SAR=22;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102945;STB=0.563311;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.0269842;OID=.;OPOS=89400339;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:74:33:34:40:40:0.540541:22:18:19:14:22:18:20:14
chr15	89401109	.	A	G	765.96	PASS	AF=0.591667;AO=71;DP=121;FAO=71;FDP=120;FR=.;FRO=49;FSAF=40;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.0111172;FXX=0.0243883;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.257;QD=25.5321;RBI=0.0115178;REFB=0.0040973;REVB=0.00301115;RO=48;SAF=40;SAR=31;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474501;STB=0.530294;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=-0.0033314;OID=.;OPOS=89401109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:120:48:49:71:71:0.591667:31:40:24:24:31:40:24:25
chr15	89401615	.	T	G	594.48	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0462676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0851;QD=60.9724;RBI=0.0472415;REFB=0;REVB=-0.00954277;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165448;OID=.;OPOS=89401615;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr15	89402051	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0282025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.605;QD=48.7373;RBI=0.0288418;REFB=0;REVB=0.00603879;RO=0;SAF=2;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.91206e-05;OID=.;OPOS=89402051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:15:2:0:0:15:2:0:0
chr15	89402239	.	T	C	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04967;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.379;QD=59.8364;RBI=0.0523624;REFB=0;REVB=0.0165746;RO=0;SAF=20;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.9376e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000113706;OID=.;OPOS=89402239;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:16:20:0:0:16:20:0:0
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chr15	90168108	.	C	T	1072.76	PASS	AF=0.986301;AO=67;DP=74;FAO=72;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0248889;FXX=0.0135117;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.2389;QD=58.7814;RBI=0.0252537;REFB=-0.110143;REVB=0.0042769;RO=1;SAF=32;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145389;STB=0.506847;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00140706;OID=.;OPOS=90168108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:74:73:1:1:67:72:0.986301:35:32:1:0:36:36:1:0
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chr15	90170237	.	C	T	214.49	PASS	AF=0.431034;AO=24;DP=57;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0111606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.616;QD=14.7926;RBI=0.0112624;REFB=-0.0150014;REVB=-0.001511;RO=33;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769306;STB=0.531831;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0237707;OID=.;OPOS=90170237;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:33:33:24:25:0.431034:12:12:14:19:13:12:14:19
chr15	90174789	.	C	T	545.48	PASS	AF=0.533981;AO=54;DP=103;FAO=55;FDP=103;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=0.0401444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4401;QD=21.1836;RBI=0.0422119;REFB=-0.00436343;REVB=0.0130488;RO=47;SAF=22;SAR=32;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981519;STB=0.5537;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00451619;OID=.;OPOS=90174789;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:47:48:54:55:0.533981:32:22:14:33:33:22:14:34
chr15	90174824	.	C	T	617.12	PASS	AF=0.635294;AO=54;DP=86;FAO=54;FDP=85;FR=.;FRO=31;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.019351;FXX=0.0116266;HRUN=4;LEN=1;MLLD=123.343;QD=29.0411;RBI=0.0194484;REFB=-0.0156046;REVB=-0.00194363;RO=30;SAF=25;SAR=29;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0864574;STB=0.539871;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0148027;OID=.;OPOS=90174824;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:30:31:54:54:0.635294:29:25:10:20:29:25:11:20
chr15	90176073	.	C	A	397.38	PASS	AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.0827351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.898;QD=20.6429;RBI=0.083298;REFB=-0.0135781;REVB=0.00966722;RO=37;SAF=32;SAR=8;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232602;STB=0.630065;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0184804;OID=.;OPOS=90176073;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:37:37:40:40:0.519481:8:32:22:15:8:32:22:15
chr15	90176432	.	T	G	1981.4	PASS	AF=1;AO=122;DP=122;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.703;QD=61.9188;RBI=0.0380705;REFB=0;REVB=0.00929512;RO=0;SAF=58;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.06958e-05;OID=.;OPOS=90176432;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:122:128:0:0:122:128:1:64:58:0:0:67:61:0:0
chr15	90191827	.	T	C	214.24	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0229311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.246;QD=45.1039;RBI=0.0331513;REFB=0.0743862;REVB=-0.0239411;RO=1;SAF=13;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340316;STB=0.518498;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=-0.00198025;OID=.;OPOS=90191827;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:18:18:0.947368:5:13:1:0:5:13:1:0
chr15	90195967	.	C	G	1238.4	PASS	AF=0.965116;AO=83;DP=86;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00955909;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.3089;QD=57.5999;RBI=0.0615104;REFB=-0.131351;REVB=-0.0607631;RO=1;SAF=46;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101856;STB=0.507782;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0040971;OID=.;OPOS=90195967;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:86:86:1:3:83:83:0.965116:37:46:1:0:37:46:1:2
chr15	90196002	.	G	A	275.05	PASS	AF=0.430556;AO=31;DP=72;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.0514202;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3781;QD=15.2804;RBI=0.0553022;REFB=0.00533141;REVB=-0.0203541;RO=39;SAF=17;SAR=14;SRF=23;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041435;STB=0.535496;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.0034792;OID=.;OPOS=90196002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:39:41:31:31:0.430556:14:17:23:16:14:17:25:16
chr15	90196008	.	C	T	220.24	PASS	AF=0.40625;AO=26;DP=67;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=0.015244;FXX=0.0447694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.287;QD=13.7647;RBI=0.018203;REFB=-0.0135658;REVB=-0.0099483;RO=38;SAF=16;SAR=10;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.039533;STB=0.522596;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0120123;OID=.;OPOS=90196008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:64:38:38:26:26:0.40625:10:16:22:16:10:16:22:16
chr15	90210257	.	G	A	848.5	PASS	AF=0.463158;AO=83;DP=186;FAO=88;FDP=190;FR=.;FRO=102;FSAF=42;FSAR=46;FSRF=67;FSRR=35;FWDB=-0.00199112;FXX=0.00523533;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.299;QD=17.863;RBI=0.00758329;REFB=-0.0298909;REVB=-0.00731722;RO=103;SAF=38;SAR=45;SRF=68;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199872;STB=0.595749;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0288169;OID=.;OPOS=90210257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:190:103:102:83:88:0.463158:45:38:68:35:46:42:67:35
chr15	90213229	.	G	C	1154.11	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290995;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.277;QD=60.7428;RBI=0.0370601;REFB=0;REVB=0.0229493;RO=0;SAF=49;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135379;OID=.;OPOS=90213229;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:27:49:0:0:27:49:0:0
chr15	90226947	.	C	A	385.3	PASS	AF=0.465116;AO=39;DP=85;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0091368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2795;QD=17.921;RBI=0.0299339;REFB=-0.0104376;REVB=-0.0285054;RO=46;SAF=9;SAR=30;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.317003;STB=0.681901;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0102574;OID=.;OPOS=90226947;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:46:46:39:40:0.465116:30:9:24:22:31:9:24:22
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chr15	90245253	.	C	T	48.23	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=15;FR=.;FRO=8;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0268518;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.76;QD=12.861;RBI=0.0316699;REFB=-0.00887335;REVB=0.0167919;RO=8;SAF=1;SAR=6;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300057;STB=0.68509;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0179054;OID=.;OPOS=90245253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:8:8:7:7:0.466667:6:1:3:5:6:1:3:5
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chr15	90347784	.	G	A	232.66	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.00880802;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.742;QD=23.2664;RBI=0.00913323;REFB=-0.0122115;REVB=0.00241553;RO=18;SAF=11;SAR=11;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00659645;OID=.;OPOS=90347784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:11:11:9:9:11:11:9:9
chr15	90617539	.	C	T	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00107345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.523;QD=15.3788;RBI=0.0573122;REFB=-0.00244757;REVB=0.0573021;RO=14;SAF=2;SAR=10;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.531007;STB=0.810268;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0140355;OID=.;OPOS=90617539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:10:2:10:4:10:2:10:4
chr15	90623052	.	T	C	464.61	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.379;QD=58.0767;RBI=0.0225081;REFB=0;REVB=0.0193916;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.08454e-05;OID=.;OPOS=90623052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr15	90709545	.	G	A	188.7	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0131884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6039;QD=14.2416;RBI=0.0560128;REFB=0.0162676;REVB=0.054438;RO=30;SAF=14;SAR=8;SRF=21;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711423;STB=0.526292;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=-0.0257879;OID=.;OPOS=90709545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:31:22:22:0.415094:8:14:21:9:8:14:21:10
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chr15	90768320	.	C	T	151.52	PASS	AF=0.333333;AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=60;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=32;FWDB=-0.013563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.098;QD=10.1012;RBI=0.041211;REFB=-0.0184884;REVB=0.0389152;RO=40;SAF=7;SAR=13;SRF=8;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203593;STB=0.617543;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0253459;OID=.;OPOS=90768320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:40:40:20:20:0.333333:13:7:8:32:13:7:8:32
chr15	90771750	.	T	G	165.27	PASS	AF=0.4;AO=12;DP=50;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=-0.022346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.677;QD=12.0196;RBI=0.024337;REFB=-0.0298128;REVB=0.00964076;RO=31;SAF=8;SAR=4;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0142917;STB=0.519838;STBP=0.82;TYPE=snp;VARB=0.0775861;OID=.;OPOS=90771750;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:55:31:33:12:22:0.4:4:8:21:10:8:14:22:11
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chr15	90784250	.	T	C	470.75	PASS	AF=0.46789;AO=50;DP=108;FAO=51;FDP=109;FR=.;FRO=58;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=30;FWDB=-0.00133112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.223;QD=17.2753;RBI=0.0141277;REFB=-0.0149123;REVB=0.0140648;RO=57;SAF=27;SAR=23;SRF=28;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0467629;STB=0.53534;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0131847;OID=.;OPOS=90784250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:109:57:58:50:51:0.46789:23:27:28:29:23:28:28:30
chr15	90794102	.	G	A	140.19	PASS	AF=0.517241;AO=14;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.00774905;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.843;QD=19.337;RBI=0.00857157;REFB=-0.0376465;REVB=0.00366388;RO=15;SAF=7;SAR=7;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0299972;STB=0.516107;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0342457;OID=.;OPOS=90794102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:14:14:15:0.517241:7:7:7:8:8:7:7:7
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chr15	90794845	.	G	A	88.09	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=-0.00575922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.118;QD=14.095;RBI=0.00964743;REFB=-0.0249116;REVB=0.00773979;RO=12;SAF=5;SAR=6;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0343697;STB=0.514679;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0187163;OID=.;OPOS=90794845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:12:14:11:11:0.44:6:5:5:7:6:5:6:8
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chr15	90818827	.	G	A	36.36	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=15;FSRR=0;FWDB=0.0191299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.489;QD=6.92579;RBI=0.0191299;REFB=-0.01884;REVB=0;RO=15;SAF=6;SAR=0;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0366293;OID=.;OPOS=90818827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:0:6:15:0:0:6:15:0
chr15	90819132	.	C	T	142.41	PASS	AF=0.382353;AO=11;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00446248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.143;QD=16.7546;RBI=0.0476078;REFB=-0.0187306;REVB=-0.0473982;RO=17;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118806;STB=0.552988;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.0403938;OID=.;OPOS=90819132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:34:34:17:18:11:13:0.382353:4:7:11:6:4:9:11:7
chr15	90819641	.	A	C	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.000553419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6419;QD=13.8493;RBI=0.0394198;REFB=-0.000636057;REVB=0.039416;RO=24;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217597;STB=0.501546;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=0.00165413;OID=.;OPOS=90819641;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:41:24:25:16:16:0.390244:7:9:13:11:7:9:14:11
chr15	90819876	.	T	C	68.75	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0533764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.724;QD=15.277;RBI=0.0887318;REFB=-0.0316043;REVB=0.0708823;RO=9;SAF=4;SAR=5;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198782;STB=0.615147;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.0368633;OID=.;OPOS=90819876;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:5:4:2:7:5:4:2:7
chr15	90820063	.	T	C	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=-0.00340423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.797;QD=11.2569;RBI=0.0368097;REFB=-0.0185848;REVB=-0.0366519;RO=11;SAF=7;SAR=1;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.424693;STB=0.749249;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0167713;OID=.;OPOS=90820063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:11:12:8:8:0.4:1:7:6:5:1:7:7:5
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chr15	90892585	.	G	C	83.46	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0422518;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.7956;QD=20.8661;RBI=0.0589709;REFB=-0.0203702;REVB=-0.0411383;RO=6;SAF=9;SAR=1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296836;STB=0.674571;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00837917;OID=.;OPOS=90892585;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:1:9:4:2:1:9:4:2
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chr15	91045408	.	G	A	209.32	PASS	AF=0.361111;AO=22;DP=73;FAO=26;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=45;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=32;FSRR=13;FWDB=-0.0223624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.838;QD=11.629;RBI=0.0224836;REFB=-0.0290367;REVB=0.00233144;RO=36;SAF=7;SAR=15;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.340676;STB=0.655209;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0456005;OID=.;OPOS=91045408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:36:45:22:26:0.361111:15:7:23:13:14:12:32:13
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chr15	91185204	.	G	A	273.7	PASS	AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0293083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.219;QD=21.0536;RBI=0.050534;REFB=-0.041222;REVB=0.0411668;RO=23;SAF=24;SAR=4;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41186;STB=0.744321;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0256234;OID=.;OPOS=91185204;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:23:24:28:28:0.538462:4:24:11:12:4:24:11:13
chr15	91185994	.	C	T	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00407682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.085;QD=59.0183;RBI=0.0131132;REFB=0;REVB=0.0124634;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.84822e-05;OID=.;OPOS=91185994;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr15	91424574	.	G	C	2922.79	PASS	AF=0.86166;AO=97;DP=256;FAO=218;FDP=253;FR=.;FRO=35;FSAF=95;FSAR=123;FSRF=32;FSRR=3;FWDB=0.0131066;FXX=0.0155636;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.518;QD=46.2102;RBI=0.0157078;REFB=-0.0160106;REVB=0.00865753;RO=0;SAF=0;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.566157;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00341486;OID=.;OPOS=91424574;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:256:253:0:35:97:218:0.86166:97:0:0:0:123:95:32:3
chr15	91428290	.	C	T	628.06	PASS	AF=0.897959;AO=43;DP=48;FAO=44;FDP=49;FR=.;FRO=5;FSAF=31;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.018363;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.352;QD=51.27;RBI=0.0368462;REFB=-0.200102;REVB=0.0319444;RO=4;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124529;STB=0.558827;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.00431204;OID=.;OPOS=91428290;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:48:49:4:5:43:44:0.897959:13:30:0:4:13:31:1:4
chr15	91428589	.	T	G	1456.14	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018954;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.097;QD=63.3106;RBI=0.0427697;REFB=0;REVB=0.0383405;RO=0;SAF=50;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000202815;OID=.;OPOS=91428589;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:91:92:1:41:50:0:0:42:50:0:0
chr15	91428636	.	G	A	1321.65	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0230928;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.365;QD=62.1951;RBI=0.0964965;REFB=0;REVB=0.0936925;RO=0;SAF=58;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.45543e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240123;OID=.;OPOS=91428636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:26:58:0:0:27:58:0:0
chr15	91430436	.	T	C	1359.95	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.042;QD=61.8158;RBI=0.0431555;REFB=0;REVB=0.0403857;RO=0;SAF=36;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.44431e-05;OID=.;OPOS=91430436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:88:0:0:85:88:1:49:36:0:0:50:38:0:0
chr15	91449654	.	T	C	568.55	PASS	AF=0.447761;AO=60;DP=135;FAO=60;FDP=134;FR=.;FRO=74;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=44;FSRR=30;FWDB=-0.018933;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.253;QD=16.9716;RBI=0.040774;REFB=-0.0176357;REVB=0.0361117;RO=74;SAF=39;SAR=21;SRF=44;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590164;STB=0.532947;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0213579;OID=.;OPOS=91449654;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:134:74:74:60:60:0.447761:21:39:44:30:21:39:44:30
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chr15	91452595	.	A	G	972.85	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.177;QD=58.9605;RBI=0.0402345;REFB=0;REVB=-0.02775;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.71208e-06;OID=.;OPOS=91452595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:33:33:0:0:33:33:0:0
chr15	91474236	.	T	C	226.79	PASS	AF=0.402985;AO=26;DP=66;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=-0.0136818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.45;QD=13.5399;RBI=0.0292656;REFB=-0.014743;REVB=-0.0258705;RO=36;SAF=19;SAR=7;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457904;STB=0.502644;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0230835;OID=.;OPOS=91474236;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:36:40:26:27:0.402985:7:19:25:11:8:19:28:12
chr15	91474738	.	G	C	437.51	PASS	AF=0.406504;AO=50;DP=123;FAO=50;FDP=123;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=50;FSRR=23;FWDB=-0.00179397;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.433;QD=14.228;RBI=0.00371284;REFB=-0.0136054;REVB=0.00325067;RO=72;SAF=29;SAR=21;SRF=50;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126374;STB=0.565222;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0178833;OID=.;OPOS=91474738;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:72:73:50:50:0.406504:21:29:50:22:21:29:50:23
chr15	91478544	.	A	C	87.42	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0242459;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.182;QD=13.4491;RBI=0.0250268;REFB=-0.0156802;REVB=0.00620322;RO=15;SAF=7;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324673;STB=0.51905;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.0212784;OID=.;OPOS=91478544;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:4:7:10:5:4:7:10:5
chr15	91503195	.	C	T	226.97	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0271511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1859;QD=17.1297;RBI=0.0675919;REFB=-0.000897473;REVB=0.061899;RO=27;SAF=17;SAR=8;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124659;STB=0.562862;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00366113;OID=.;OPOS=91503195;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:28:25:25:0.471698:8:17:15:12:8:17:16:12
chr15	91509592	.	T	C	727.24	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0572249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4863;QD=63.2379;RBI=0.0573594;REFB=0;REVB=-0.0039251;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000782945;OID=.;OPOS=91509592;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:17:28:0:0:17:29:0:0
chr15	91517479	.	G	A	280.39	PASS	AF=0.508197;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=61;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.018381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0334;QD=18.3864;RBI=0.0230222;REFB=-0.0300325;REVB=0.0138621;RO=30;SAF=14;SAR=17;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0763654;STB=0.542492;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0335307;OID=.;OPOS=91517479;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:30:30:31:31:0.508197:17:14:11:19:17:14:11:19
chr15	91524841	.	G	T	1096.14	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.172;QD=60.0626;RBI=0.0281712;REFB=0;REVB=0.0223118;RO=0;SAF=37;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.93924e-05;OID=.;OPOS=91524841;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:35:37:0:0:35:38:0:0
chr15	91525197	.	C	T	96.53	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.0474231;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.775;QD=12.4561;RBI=0.0513103;REFB=-0.00980059;REVB=-0.0195906;RO=19;SAF=7;SAR=5;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00467161;STB=0.502758;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.00994744;OID=.;OPOS=91525197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:5:7:11:8:5:7:11:8
chr15	91543761	.	C	T	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0416298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.374;QD=54.5164;RBI=0.0419453;REFB=0;REVB=-0.00513451;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000307426;OID=.;OPOS=91543761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:18:7:0:0:18:7:0:0
chr15	91548601	.	G	A	226.76	PASS	AF=0.448276;AO=26;DP=58;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00528929;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.103;QD=15.6383;RBI=0.00594394;REFB=-0.00862014;REVB=0.0027118;RO=32;SAF=14;SAR=12;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375774;STB=0.52126;STBP=0.762;TYPE=snp;VARB=0.00982235;OID=.;OPOS=91548601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:32:32:26:26:0.448276:12:14:16:16:12:14:16:16
chr15	91795203	.	C	G	350.73	PASS	AF=0.447059;AO=37;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=-0.00512637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.04;QD=16.5051;RBI=0.0580144;REFB=0.010621;REVB=0.0577875;RO=46;SAF=20;SAR=17;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209714;STB=0.615701;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=-0.00972946;OID=.;OPOS=91795203;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:46:47:37:38:0.447059:17:20:15:31:17:21:16:31
chr15	91811749	.	G	A	371.72	PASS	AF=0.480392;AO=33;DP=95;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0411355;FXX=0.0377323;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.5647;QD=14.5771;RBI=0.0566835;REFB=-0.0515334;REVB=0.0389986;RO=40;SAF=19;SAR=14;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745245;STB=0.531526;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0127397;OID=.;OPOS=91811749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:102:40:53:33:49:0.480392:14:19:20:20:22:27:26:27
chr15	91811750	.	T	A	32.6	PASS	AF=0.0841121;AO=8;DP=102;FAO=9;FDP=107;FR=.;FRO=98;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=52;FSRR=46;FWDB=-0.0203446;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=132.974;QD=1.21855;RBI=0.0243871;REFB=-0.00374588;REVB=-0.0134473;RO=94;SAF=2;SAR=6;SRF=52;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327161;STB=0.780372;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0186902;OID=.;OPOS=91811750;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:102:107:94:98:8:9:0.0841121:6:2:52:42:7:2:52:46
chr15	91825027	.	C	T	237.17	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0168036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.039;QD=19.7644;RBI=0.0336318;REFB=-0.0154576;REVB=-0.0291331;RO=25;SAF=15;SAR=8;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123154;STB=0.506952;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0272394;OID=.;OPOS=91825027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:8:15:16:9:8:15:16:9
chr15	91836627	.	A	G	337.88	PASS	AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=0.0290863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.58;QD=17.5522;RBI=0.0297071;REFB=0.00359625;REVB=-0.00604151;RO=41;SAF=21;SAR=15;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0453181;STB=0.525372;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=-0.00351802;OID=.;OPOS=91836627;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:41:41:36:36:0.467532:15:21:22:19:15:21:22:19
chr15	91836683	.	T	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00883332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.132;QD=56.9383;RBI=0.0302951;REFB=0;REVB=0.0289787;RO=0;SAF=34;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.99545e-05;OID=.;OPOS=91836683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:19:34:0:0:19:34:0:0
chr15	92638193	.	G	A	1677.4	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.156;QD=60.4468;RBI=0.0167629;REFB=0;REVB=0.0115258;RO=0;SAF=55;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16517e-05;OID=.;OPOS=92638193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:111:0:0:111:111:1:56:55:0:0:56:55:0:0
chr15	92647645	.	G	C	632.25	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.748;QD=61.6828;RBI=0.0323169;REFB=0;REVB=-0.00593003;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27484e-05;OID=.;OPOS=92647645;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:31:10:0:0:31:10:0:0
chr15	92694207	.	C	T	265.81	PASS	AF=0.333333;AO=32;DP=96;FAO=32;FDP=96;FR=.;FRO=64;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=32;FWDB=-0.0280666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.997;QD=11.0753;RBI=0.0686216;REFB=-0.021462;REVB=-0.0626194;RO=63;SAF=12;SAR=20;SRF=32;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154528;STB=0.585052;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.0421355;OID=.;OPOS=92694207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:63:64:32:32:0.333333:20:12:32:31:20:12:32:32
chr15	93198671	.	A	G	1587.15	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0680317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7293;QD=64.1274;RBI=0.0689299;REFB=0;REVB=-0.0110914;RO=0;SAF=52;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.28099e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00045784;OID=.;OPOS=93198671;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:47:52:0:0:47:52:0:0
chr15	93198678	.	TTGGAGCTGGA	TTGGA,TTGGAGCTGCC	1019.57	PASS	AF=0.805556,0.194444;AO=36,23;DP=68;FAO=58,14;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=31,8;FSAR=27,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00300472,-0.00733736;FXX=0.0136968;HRUN=1,2;LEN=6,2;MLLD=209.414,83.4024;QD=56.6428;RBI=0.0251689,0.0158723;REFB=0,0;REVB=0.0249889,-0.0140746;RO=0;SAF=10,18;SAR=26,5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0134406,0.00726683;OID=.,.;OPOS=93198679,93198687;OREF=TGGAGC,GA;OALT=-,CC;OMAPALT=TTGGA,TTGGAGCTGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.805556,0.194444:36,23:68:58,14:72:0:31,8:27,6:0:0:93:0:10,18:26,5:0:0
chr15	93510603	.	A	G	698.03	PASS	AF=0.938776;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=49;FR=.;FRO=3;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0336437;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.316;QD=56.9816;RBI=0.0344065;REFB=-0.0365497;REVB=0.00720454;RO=1;SAF=26;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229252;STB=0.514382;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00119436;OID=.;OPOS=93510603;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:49:49:1:3:46:46:0.938776:20:26:0:1:20:26:1:2
chr15	93521604	.	A	G	982.34	PASS	AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0218883;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.954;QD=56.1339;RBI=0.0234473;REFB=-0.0594449;REVB=-0.008407;RO=1;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165801;STB=0.502599;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00122783;OID=.;OPOS=93521604;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:70:70:1:2:68:68:0.971429:28:40:0:1:28:40:1:1
chr15	93568999	.	T	C	152.0	PASS	AF=0.485714;AO=15;DP=33;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.0377189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.4883;QD=17.3715;RBI=0.0377235;REFB=-0.00269681;REVB=0.000593231;RO=18;SAF=7;SAR=8;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292813;STB=0.629996;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00238728;OID=.;OPOS=93568999;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:35:18:18:15:17:0.485714:8:7:14:4:8:9:14:4
chr15	93569004	.	G	A	187.93	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=-0.00465667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.148;QD=20.3167;RBI=0.0111422;REFB=0.0172587;REVB=-0.0101224;RO=18;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182772;STB=0.60231;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.00225228;OID=.;OPOS=93569004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:18:18:19:19:0.513514:8:11:14:4:8:11:14:4
chr15	93570241	.	T	C	2337.64	PASS	AF=0.981132;AO=156;DP=159;FAO=156;FDP=159;FR=.;FRO=3;FSAF=67;FSAR=89;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0175591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.777;QD=58.8085;RBI=0.0201893;REFB=-0.0905886;REVB=0.00996421;RO=1;SAF=67;SAR=89;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704773;STB=0.510948;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.000161338;OID=.;OPOS=93570241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:159:159:1:3:156:156:0.981132:89:67:1:0:89:67:3:0
chr15	93588264	.	G	C	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0356061;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.207;QD=23.2183;RBI=0.0390434;REFB=0.00750517;REVB=-0.0160184;RO=1;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.277405;STB=0.66592;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=-0.00121592;OID=.;OPOS=93588264;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:1:4:0:1:1:4:0:1
chr15	93588336	.	A	C	850.62	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.525;QD=57.6695;RBI=0.0421218;REFB=0;REVB=0.0178003;RO=0;SAF=22;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235146;OID=.;OPOS=93588336;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:37:22:0:0:37:22:0:0
chr15	93609460	.	A	T	1207.22	PASS	AF=0.975904;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0111966;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=113.199;QD=58.1792;RBI=0.0456681;REFB=0.00865848;REVB=-0.0442742;RO=2;SAF=54;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0350277;STB=0.517853;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=7.85001e-05;OID=.;OPOS=93609460;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:83:2:2:80:81:0.975904:26:54:0:2:27:54:0:2
chr15	93616933	.	C	G	1539.55	PASS	AF=0.990476;AO=104;DP=105;FAO=104;FDP=105;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.058287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4735;QD=58.6494;RBI=0.0659758;REFB=-0.108655;REVB=0.0309102;RO=0;SAF=71;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503496;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.000727213;OID=.;OPOS=93616933;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:105:0:1:104:104:0.990476:33:71:0:0:33:71:1:0
chr15	93616975	.	A	G	649.74	PASS	AF=1;AO=40;DP=43;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0015337;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.717;QD=61.8798;RBI=0.00221517;REFB=0;REVB=0.00159836;RO=0;SAF=11;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.85138e-05;OID=.;OPOS=93616975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:42:0:0:40:42:1:29:11:0:0:29:13:0:0
chr15	93750256	.	G	T	753.47	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00624438;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.929;QD=61.5078;RBI=0.0211443;REFB=-0.187717;REVB=0.0202012;RO=1;SAF=20;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229399;STB=0.51219;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=0.00317135;OID=.;OPOS=93750256;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:28:20:1:0:28:20:1:0
chr15	94304132	.	C	T	210.11	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=0.00473038;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3079;QD=13.7774;RBI=0.0445787;REFB=-0.0306049;REVB=-0.044327;RO=36;SAF=16;SAR=9;SRF=27;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129288;STB=0.573278;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0297217;OID=.;OPOS=94304132;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:9:16:27:9:9:16:27:9
chr15	94304189	.	T	C	296.24	PASS	AF=0.423077;AO=33;DP=78;FAO=33;FDP=78;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0156458;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.445;QD=15.1919;RBI=0.0199356;REFB=-0.0328749;REVB=-0.0123546;RO=40;SAF=15;SAR=18;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116973;STB=0.583283;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0498302;OID=.;OPOS=94304189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:40:45:33:33:0.423077:18:15:23:17:18:15:27:18
chr15	94841691	.	G	A	275.12	PASS	AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=2;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=36;FWDB=-0.00218218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9915;QD=15.4996;RBI=0.031524;REFB=0.00667963;REVB=0.0314483;RO=39;SAF=2;SAR=29;SRF=4;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133045;STB=0.572316;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.00836477;OID=.;OPOS=94841691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:39:40:31:31:0.43662:29:2:4:35:29:2:4:36
chr15	94945719	.	G	T	117.07	PASS	AF=0.333333;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=42;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0134618;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.786;QD=11.1494;RBI=0.0248551;REFB=-0.0181112;REVB=-0.0208939;RO=27;SAF=9;SAR=5;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101276;STB=0.574359;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.0198368;OID=.;OPOS=94945719;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:27:28:14:14:0.333333:5:9:15:12:5:9:15:13
chr15	96327938	.	C	T	147.23	PASS	AF=0.369565;AO=16;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0128654;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.747;QD=12.8024;RBI=0.0130131;REFB=-0.00897953;REVB=-0.00195478;RO=28;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106419;STB=0.588131;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0143066;OID=.;OPOS=96327938;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:29:16:17:0.369565:7:9:13:15:7:10:13:16
chr15	97896933	.	A	C	183.36	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=0.00620908;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.05;QD=13.3354;RBI=0.00782518;REFB=-0.00799112;REVB=0.00476243;RO=33;SAF=10;SAR=12;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317698;STB=0.518256;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00992388;OID=.;OPOS=97896933;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:33:33:22:22:0.4:12:10:16:17:12:10:16:17
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chr15	98015489	.	A	G	219.17	PASS	AF=0.412698;AO=26;DP=63;FAO=26;FDP=63;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=0.0674746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.288;QD=13.9153;RBI=0.0704278;REFB=-0.00304599;REVB=0.0201807;RO=37;SAF=9;SAR=17;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568242;STB=0.5323;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00339119;OID=.;OPOS=98015489;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:37:37:26:26:0.412698:17:9:11:26:17:9:11:26
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chr15	98301844	.	GC	G,GT	258.6	PASS	AF=0.1,0.9;AO=2,16;DP=20;FAO=2,18;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=1,17;FSAR=1,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00747505,0.00587557;FXX=0.0475964;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=129.003,140.938;QD=51.72;RBI=0.0398134,0.0591262;REFB=0,0;REVB=0.0391054,0.0588336;RO=0;SAF=1,16;SAR=1,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0386689,0.0037718;OID=.,.;OPOS=98301845,98301845;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=G,GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.1,0.9:2,16:20:2,18:20:0:1,17:1,1:0:0:5:0:1,16:1,0:0:0
chr15	98513845	.	T	C	352.45	PASS	AF=0.480519;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0119616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.394;QD=18.3093;RBI=0.0120378;REFB=-0.0139265;REVB=0.00135227;RO=40;SAF=20;SAR=17;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00886939;STB=0.504948;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.016344;OID=.;OPOS=98513845;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:40:40:37:37:0.480519:17:20:22:18:17:20:22:18
chr15	98515752	.	A	G	532.28	PASS	AF=0.576471;AO=49;DP=88;FAO=49;FDP=85;FR=.;FRO=36;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=8;FSRR=28;FWDB=-0.0161057;FXX=0.034087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1239;QD=25.0484;RBI=0.0376441;REFB=-0.0408361;REVB=0.0340247;RO=35;SAF=20;SAR=29;SRF=8;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146336;STB=0.583984;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0256582;OID=.;OPOS=98515752;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:85:35:36:49:49:0.576471:29:20:8:27:29:20:8:28
chr15	98995081	.	A	G	1153.97	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0219138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.204;QD=60.7355;RBI=0.0272285;REFB=0;REVB=0.016161;RO=0;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6485e-05;OID=.;OPOS=98995081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:76:0:0:74:76:1:34:40:0:0:34:42:0:0
chr15	99023968	.	T	G	133.68	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0113525;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.984;QD=15.7268;RBI=0.0208007;REFB=-0.0265574;REVB=0.0174295;RO=17;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112057;STB=0.59132;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.0178214;OID=.;OPOS=99023968;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:19:15:15:0.441176:8:7:10:7:8:7:12:7
chr15	99465473	.	C	T	437.86	PASS	AF=0.530864;AO=43;DP=81;FAO=43;FDP=81;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00417463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.681;QD=21.6227;RBI=0.0198365;REFB=-0.033871;REVB=0.0193923;RO=38;SAF=25;SAR=18;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136471;STB=0.575339;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0228863;OID=.;OPOS=99465473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:38:38:43:43:0.530864:18:25:16:22:18:25:16:22
chr15	99478225	.	G	A	1302.42	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.792;QD=62.0198;RBI=0.0501553;REFB=0;REVB=0.0450381;RO=0;SAF=29;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.76251e-05;OID=.;OPOS=99478225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:54:29:0:0:55:29:0:0
chr15	99502434	.	ATT	ATA,ATAT,AT	241.88	PASS	AF=0,0.162963,0.244444;AO=5,19,34;DP=139;FAO=0,22,33;FDP=135;FR=.;FRO=80;FSAF=0,9,14;FSAR=0,13,19;FSRF=55;FSRR=25;FWDB=-0.0119978,-0.0121297,0.0446167;FXX=0.0145975;HRUN=7,0,7;LEN=1,1,1;MLLD=214.192,215.409,7.7855;QD=7.16668;RBI=0.108126,0.134323,0.159148;REFB=-0.0173935,-0.0142756,-0.171326;REVB=-0.107458,-0.133774,-0.152766;RO=69;SAF=1,7,15;SAR=4,12,19;SRF=51;SRR=18;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.518191,-0.443348,-0.337761;STB=0.5,0.708519,0.680232;STBP=1,0.045,0.024;TYPE=snp,ins,del;VARB=0,0.0481577,0.128135;OID=.,.,.;OPOS=99502436,99502436,99502435;OREF=T,-,T;OALT=A,A,-;OMAPALT=ATA,ATAT,AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0.162963,0.244444:5,19,34:139:0,22,33:135:80:0,9,14:0,13,19:55:25:63:69:1,7,15:4,12,19:51:18
chr15	99503199	.	GGTGTGTGTGTGTGTA	GGTGTGTGTGTGTA,GGTGTGTGTGTGTATG	534.72	PASS	AF=0.947368,0.0526316;AO=27,2;DP=34;FAO=36,2;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26,1;FSAR=10,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575144,-0.00197857;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,3;MLLD=124.303,92.9355;QD=56.2863;RBI=0.0986121,0.0504481;REFB=0,0;REVB=0.0801027,0.0504093;RO=0;SAF=23,1;SAR=4,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.00823828,0.0407459;OID=.,.;OPOS=99503200,99503212;OREF=GT,GTA;OALT=-,ATG;OMAPALT=GGTGTGTGTGTGTA,GGTGTGTGTGTGTATG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.947368,0.0526316:27,2:34:36,2:38:0:26,1:10,1:0:0:9:0:23,1:4,1:0:0
chr15	99504437	.	C	T	2122.06	PASS	AF=0.978723;AO=137;DP=141;FAO=138;FDP=141;FR=.;FRO=3;FSAF=85;FSAR=53;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0200349;FXX=0.013985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.874;QD=60.2004;RBI=0.0200499;REFB=-0.182367;REVB=-0.000774497;RO=3;SAF=84;SAR=53;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166738;STB=0.508669;STBP=0.214;TYPE=snp;VARB=0.00114863;OID=.;OPOS=99504437;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:141:141:3:3:137:138:0.978723:53:84:3:0:53:85:3:0
chr15	99511793	.	C	G	593.13	PASS	AF=0.5625;AO=54;DP=96;FAO=54;FDP=96;FR=.;FRO=42;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=23;FWDB=0.0147037;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.543;QD=24.7139;RBI=0.0206949;REFB=-0.0171813;REVB=-0.014563;RO=42;SAF=21;SAR=33;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.052603;STB=0.528835;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0118337;OID=.;OPOS=99511793;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:42:42:54:54:0.5625:33:21:19:23:33:21:19:23
chr15	99511804	.	A	AC	321.69	PASS	AF=0.541176;AO=46;DP=88;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.093713;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.4708;QD=15.1384;RBI=0.120162;REFB=-0.0199619;REVB=0.0752115;RO=42;SAF=16;SAR=30;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.158309;STB=0.555531;STBP=0.312;TYPE=ins;VARB=0.0218847;OID=.;OPOS=99511805;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.541176:46:88:46:85:39:16:30:18:21:99:42:16:30:22:20
chr15	99653800	.	T	C	1479.48	PASS	AF=0.990099;AO=99;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0429455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6924;QD=58.5932;RBI=0.193754;REFB=-0.0650939;REVB=0.188935;RO=1;SAF=45;SAR=54;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00870378;STB=0.504504;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.00195501;OID=.;OPOS=99653800;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:101:1:1:99:100:0.990099:54:45:0:1:55:45:0:1
chr15	99670989	.	T	C	416.92	PASS	AF=0.967742;AO=21;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.091677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.723;QD=53.7959;RBI=0.100999;REFB=-0.117572;REVB=0.0423804;RO=1;SAF=6;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0297929;STB=0.512812;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00334899;OID=.;OPOS=99670989;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:21:30:0.967742:15:6:0:1:19:11:0:1
chr15	99671760	.	T	C	2307.66	PASS	AF=1;AO=151;DP=151;FAO=151;FDP=151;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00766237;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=138.681;QD=61.13;RBI=0.0539004;REFB=0;REVB=-0.053353;RO=0;SAF=83;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.75793e-05;OID=.;OPOS=99671760;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:151:151:0:0:151:151:1:68:83:0:0:68:83:0:0
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chr15	99715352	.	A	G	1005.47	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152862;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0617;QD=59.1452;RBI=0.0342369;REFB=0;REVB=-0.0306349;RO=0;SAF=29;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.64858e-05;OID=.;OPOS=99715352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:39:29:0:0:39:29:0:0
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chr15	100246942	.	G	A	704.51	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167541;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.873;QD=62.623;RBI=0.0282473;REFB=0;REVB=0.0227422;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.0639e-05;OID=.;OPOS=100246942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:21:23:0:0:22:23:0:0
chr15	100252805	.	G	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599039;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.409;QD=43.4859;RBI=0.0753151;REFB=0;REVB=0.0456495;RO=0;SAF=6;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000537619;OID=.;OPOS=100252805;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:6:6:0:0:6:6:0:0
chr15	100256618	.	A	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.655;QD=62.3505;RBI=0.0173425;REFB=0;REVB=0.012548;RO=0;SAF=29;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.13233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112884;OID=.;OPOS=100256618;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:14:29:0:0:14:29:0:0
chr15	100257713	.	T	TCAGATTGGGGCTAAAACAC,TCAGATTGGGGCTTAAAACAC	208.46	PASS	AF=0,0.730769;AO=9,6;DP=27;FAO=0,19;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=0,11;FSAR=0,8;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.0250194,0.038085;FXX=0.0370233;HRUN=1,1;LEN=19,20;MLLD=477.019,497.622;QD=32.0716;RBI=0.0318826,0.0428496;REFB=-0.0264061,-0.0309056;REVB=0.0197618,0.0196374;RO=8;SAF=9,1;SAR=0,5;SRF=6;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.770443,-0.542893;STB=0.5,0.537776;STBP=1,0.54;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.00623509;OID=.,.;OPOS=100257714,100257714;OREF=-,-;OALT=CAGATTGGGGCTAAAACAC,CAGATTGGGGCTTAAAACAC;OMAPALT=TCAGATTGGGGCTAAAACAC,TCAGATTGGGGCTTAAAACAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.730769:9,6:27:0,19:26:7:0,11:0,8:5:2:45:8:9,1:0,5:6:2
chr15	100257796	.	C	CCAGCTGTTG	472.29	PASS	AF=0.773585;AO=38;DP=55;FAO=41;FDP=53;FR=.;FRO=12;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0148283;FXX=0;HRUN=3;LEN=9;MLLD=353.333;QD=35.6447;RBI=0.0323418;REFB=-0.0134781;REVB=-0.0287422;RO=14;SAF=19;SAR=19;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0355109;STB=0.502761;STBP=0.936;TYPE=ins;VARB=0.00371497;OID=.;OPOS=100257797;OREF=-;OALT=CAGCTGTTG;OMAPALT=CCAGCTGTTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.773585:38:55:41:53:12:21:20:6:6:83:14:19:19:8:6
chr15	100269680	.	G	C	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.188;QD=57.7124;RBI=0.0365262;REFB=0;REVB=0.0292732;RO=0;SAF=39;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105499;OID=.;OPOS=100269680;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:20:39:0:0:20:39:0:0
chr15	100269796	.	A	G	367.39	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.954;QD=54.4284;RBI=0.0528273;REFB=0;REVB=-0.00815314;RO=0;SAF=7;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00454191;OID=.;OPOS=100269796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:27:0:0:25:27:1:18:7:0:0:18:9:0:0
chr15	100332743	.	A	G	81.23	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00981569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.248;QD=18.0505;RBI=0.0377396;REFB=-0.051002;REVB=-0.0364408;RO=8;SAF=9;SAR=1;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240747;STB=0.642515;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0438284;OID=.;OPOS=100332743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:1:9:6:2:1:9:6:2
chr15	100332799	.	A	C	98.56	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0326192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.1399;QD=14.0806;RBI=0.0875699;REFB=-0.0153668;REVB=-0.0812679;RO=16;SAF=9;SAR=3;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270626;STB=0.659715;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0221458;OID=.;OPOS=100332799;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:3:9:8:8:3:9:8:8
chr15	100332807	.	C	T	109.26	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0123542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.9216;QD=14.0974;RBI=0.148929;REFB=-0.0522425;REVB=-0.148415;RO=18;SAF=9;SAR=4;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254806;STB=0.649248;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.0545042;OID=.;OPOS=100332807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:4:9:8:10:4:9:8:10
chr15	100333075	.	C	T	89.0	PASS	AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0166264;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=186.051;QD=27.3836;RBI=0.0166745;REFB=0.0284885;REVB=0.00126604;RO=3;SAF=5;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680236;STB=0.538385;STBP=0.694;TYPE=snp;VARB=-0.00247471;OID=.;OPOS=100333075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:5:5:2:1:5:5:2:1
chr15	100345096	.	C	T	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0392215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.231;QD=10.0339;RBI=0.0447084;REFB=-0.000664952;REVB=-0.0214596;RO=7;SAF=1;SAR=4;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.404236;STB=0.732751;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00120262;OID=.;OPOS=100345096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:4:1:0:7:4:1:0:7
chr15	100636586	.	G	A	1268.21	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00145919;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8927;QD=61.8637;RBI=0.0231279;REFB=0;REVB=0.0230818;RO=0;SAF=57;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385596;OID=.;OPOS=100636586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:82:0:0:82:82:1:25:57:0:0:25:57:0:0
chr15	100672237	.	T	G	266.49	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0028406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.3534;QD=50.7604;RBI=0.12624;REFB=0;REVB=0.126208;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00186092;OID=.;OPOS=100672237;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:11:9:0:0:12:9:0:0
chr15	100794363	.	C	T	435.79	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.065416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7956;QD=54.4733;RBI=0.0664638;REFB=0.0399636;REVB=0.0117551;RO=1;SAF=17;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266551;STB=0.514277;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.0071208;OID=.;OPOS=100794363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:1:1:31:31:0.96875:14:17:1:0:14:17:1:0
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chr15	100821467	.	G	A	582.03	PASS	AF=0.416667;AO=64;DP=168;FAO=70;FDP=168;FR=.;FRO=98;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=70;FSRR=28;FWDB=-0.0383205;FXX=0.00591681;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.813;QD=13.8579;RBI=0.062508;REFB=-0.0341504;REVB=0.0493842;RO=69;SAF=31;SAR=33;SRF=44;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143378;STB=0.617515;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0661697;OID=.;OPOS=100821467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:69:98:64:70:0.416667:33:31:44:25:34:36:70:28
chr15	100821576	.	G	A	323.32	PASS	AF=0.391304;AO=33;DP=93;FAO=36;FDP=92;FR=.,HEALED;FRO=55;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=-0.0214735;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.936;QD=14.0573;RBI=0.0715431;REFB=-0.0146623;REVB=0.0682445;RO=35;SAF=16;SAR=17;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519822;STB=0.582373;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0172589;OID=.;OPOS=100821576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:35:55:33:36:0.391304:17:16:15:20:18:18:20:35
chr15	100942962	.	T	C	367.75	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.223041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.541;QD=54.4817;RBI=0.223085;REFB=0;REVB=0.00443191;RO=0;SAF=8;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000623836;OID=.;OPOS=100942962;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:25:27:1:17:8:0:0:17:10:0:0
chr15	101041896	.	T	C	805.23	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.655;QD=64.4183;RBI=0.0935283;REFB=0;REVB=0.0875258;RO=0;SAF=32;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000553007;OID=.;OPOS=101041896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:17:32:0:0:17:33:0:0
chr15	101109818	.	G	A	61.26	PASS	AF=0.25;AO=9;DP=36;FAO=9;FDP=36;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00822124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.698;QD=6.80677;RBI=0.0185084;REFB=-0.014981;REVB=0.0165823;RO=27;SAF=5;SAR=4;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173848;STB=0.609518;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0401087;OID=.;OPOS=101109818;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:36:36:27:27:9:9:0.25:4:5:11:16:4:5:11:16
chr15	101110096	.	T	C	358.35	PASS	AF=0.452381;AO=38;DP=84;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.10028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.522;QD=17.0644;RBI=0.100503;REFB=-0.000211062;REVB=0.00668328;RO=46;SAF=15;SAR=23;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00350997;STB=0.501967;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=0.00111366;OID=.;OPOS=101110096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:46:46:38:38:0.452381:23:15:18:28:23:15:18:28
chr15	101113862	.	C	T	548.18	PASS	AF=0.464;AO=58;DP=125;FAO=58;FDP=125;FR=.;FRO=67;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=40;FSRR=27;FWDB=0.00302764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.24;QD=17.5419;RBI=0.00310546;REFB=-0.0135863;REVB=-0.000690854;RO=67;SAF=33;SAR=25;SRF=40;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276962;STB=0.515386;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0194433;OID=.;OPOS=101113862;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:67:67:58:58:0.464:25:33:40:27:25:33:40:27
chr15	101421673	.	G	A	785.86	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.935;QD=64.1521;RBI=0.0285183;REFB=0;REVB=0.00239813;RO=0;SAF=14;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.22152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165434;OID=.;OPOS=101421673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:35:14:0:0:35:14:0:0
chr15	101562793	.	G	A	91.22	PASS	AF=0.52381;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=21;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0314165;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.589;QD=17.3756;RBI=0.0314847;REFB=-0.00873231;REVB=-0.00207168;RO=10;SAF=6;SAR=5;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200531;STB=0.615182;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0171087;OID=.;OPOS=101562793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:10:10:11:11:0.52381:5:6:3:7:5:6:3:7
chr15	101591923	.	A	G	1490.39	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.825;QD=63.421;RBI=0.0419761;REFB=0;REVB=0.0402157;RO=0;SAF=39;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.63971e-05;OID=.;OPOS=101591923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:94:0:0:91:94:1:52:39:0:0:54:40:0:0
chr15	101595257	.	G	A	1099.42	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.655;QD=60.2422;RBI=0.0354395;REFB=0;REVB=0.00994262;RO=0;SAF=25;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.50978e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.50958e-05;OID=.;OPOS=101595257;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:46:25:0:0:46:27:0:0
chr15	101606120	.	G	A	244.03	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=19;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=-0.0195607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0953;QD=18.7714;RBI=0.0661091;REFB=-0.0324511;REVB=0.063149;RO=26;SAF=19;SAR=7;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0830598;STB=0.546725;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0282537;OID=.;OPOS=101606120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:26:26:26:26:0.5:7:19:17:9:7:19:17:9
chr15	101606261	.	C	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.425;QD=48.7373;RBI=0.056194;REFB=0;REVB=0.00643853;RO=0;SAF=5;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00035704;OID=.;OPOS=101606261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:12:5:0:0:12:5:0:0
chr15	101607450	.	T	C	714.33	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0268812;FXX=0.0370302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.275;QD=54.9484;RBI=0.0273599;REFB=-0.125762;REVB=-0.00509591;RO=0;SAF=21;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511623;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.000529628;OID=.;OPOS=101607450;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:52:0:1:51:51:0.980769:30:21:0:0:30:21:1:0
chr15	101607535	.	C	G	93.82	PASS	AF=0.324324;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.058441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4271;QD=10.1426;RBI=0.0585318;REFB=-0.0043354;REVB=-0.00325946;RO=24;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316429;STB=0.67222;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0058233;OID=.;OPOS=101607535;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:36:37:24:25:12:12:0.324324:5:7:7:17:5:7:8:17
chr15	101717680	.	G	T	555.31	PASS	AF=0.625;AO=50;DP=80;FAO=50;FDP=80;FR=.;FRO=30;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=-0.00116803;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.358;QD=27.7656;RBI=0.00308421;REFB=-0.0320686;REVB=0.00285449;RO=30;SAF=26;SAR=24;SRF=23;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172031;STB=0.593304;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0192765;OID=.;OPOS=101717680;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:30:30:50:50:0.625:24:26:23:7:24:26:23:7
chr15	101827855	.	C	T	539.84	PASS	AF=0.568182;AO=50;DP=88;FAO=50;FDP=88;FR=.;FRO=38;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.00668008;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.103;QD=24.5382;RBI=0.0261729;REFB=-0.00593507;REVB=-0.025306;RO=38;SAF=23;SAR=27;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154995;STB=0.584804;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00658458;OID=.;OPOS=101827855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:38:38:50:50:0.568182:27:23:25:13:27:23:25:13
chr15	101910550	.	G	A	973.82	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.047;QD=59.0196;RBI=0.0241348;REFB=0;REVB=0.00806401;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.65676e-05;OID=.;OPOS=101910550;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:65:66:1:30:35:0:0:30:36:0:0
chr15	102192548	.	A	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0774044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.537;QD=40.763;RBI=0.0774857;REFB=0;REVB=-0.00354742;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000549724;OID=.;OPOS=102192548;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:2:8:0:0:2:8:0:0
chr15	102223771	.	G	A	373.09	PASS	AF=0.520548;AO=38;DP=73;FAO=38;FDP=73;FR=.;FRO=35;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=-0.040641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.6434;QD=20.4432;RBI=0.0418071;REFB=-0.017631;REVB=0.00980518;RO=35;SAF=24;SAR=14;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239422;STB=0.513254;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0108692;OID=.;OPOS=102223771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:35:35:38:38:0.520548:14:24:23:12:14:24:23:12
chr15	102224341	.	G	A	566.35	PASS	AF=0.565217;AO=52;DP=92;FAO=52;FDP=92;FR=.;FRO=40;FSAF=39;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0256389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.763;QD=24.6238;RBI=0.0312388;REFB=-0.00875614;REVB=-0.0178467;RO=40;SAF=39;SAR=13;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268675;STB=0.648087;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00558856;OID=.;OPOS=102224341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:40:40:52:52:0.565217:13:39:18:22:13:39:18:22
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chr16	103517	.	A	C	1101.93	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0248187;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.526;QD=60.3796;RBI=0.0248817;REFB=0;REVB=-0.00176967;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.6591e-05;OID=.;OPOS=103517;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:33:40:0:0:33:40:0:0
chr16	108585	.	T	C	784.67	PASS	AF=1;AO=44;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0420412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.804;QD=64.0548;RBI=0.0431888;REFB=0;REVB=0.00988969;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00029412;OID=.;OPOS=108585;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:44:49:1:22:22:0:0:25:24:0:0
chr16	113636	.	G	A	106.33	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00776497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.468;QD=11.8142;RBI=0.0159448;REFB=-0.0207953;REVB=0.0139263;RO=23;SAF=4;SAR=9;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494294;STB=0.529366;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0488032;OID=.;OPOS=113636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:9:4:8:15:9:4:8:15
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chr16	113886	.	GC	CG,G	392.94	PASS	AF=0,1;AO=3,26;DP=30;FAO=0,30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=0,17;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00852294,0.154527;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=2,1;MLLD=155.147,21.6442;QD=52.3922;RBI=0.0416331,0.159613;REFB=0,0;REVB=-0.0407514,0.039969;RO=0;SAF=0,16;SAR=3,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-7.71087e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0,0.00857823;OID=.,.;OPOS=113886,113887;OREF=GC,C;OALT=CG,-;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/2:4:30:30:0:0:3,26:0,30:0,1:3,10:0,16:0:0:0,13:0,17:0:0
chr16	230802	.	C	A	182.99	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0108493;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=203.57;QD=17.4276;RBI=0.0109523;REFB=-0.0316277;REVB=0.00149829;RO=23;SAF=8;SAR=11;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117757;STB=0.566861;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0368533;OID=.;OPOS=230802;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:11:8:7:16:11:8:7:16
chr16	304514	.	C	T	288.52	PASS	AF=0.392857;AO=33;DP=84;FAO=33;FDP=84;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=35;FSRR=16;FWDB=-0.000547921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.388;QD=13.7388;RBI=0.0114675;REFB=-0.00991344;REVB=0.0114544;RO=51;SAF=22;SAR=11;SRF=35;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237316;STB=0.513505;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.015136;OID=.;OPOS=304514;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:51:51:33:33:0.392857:11:22:35:16:11:22:35:16
chr16	319511	.	A	G	244.26	PASS	AF=0.547619;AO=23;DP=42;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0139255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.075;QD=23.263;RBI=0.0139436;REFB=-0.0166512;REVB=0.000708749;RO=19;SAF=7;SAR=16;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106008;STB=0.559387;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0158251;OID=.;OPOS=319511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:19:19:23:23:0.547619:16:7:8:11:16:7:8:11
chr16	321465	.	A	G	415.26	PASS	AF=0.65;AO=39;DP=60;FAO=39;FDP=60;FR=.;FRO=21;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0260555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.376;QD=27.6843;RBI=0.0380796;REFB=-0.0243757;REVB=0.02777;RO=21;SAF=19;SAR=20;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845459;STB=0.546052;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0180794;OID=.;OPOS=321465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:21:21:39:39:0.65:20:19:13:8:20:19:13:8
chr16	322934	.	C	T	210.54	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.035677;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3387;QD=25.5197;RBI=0.051046;REFB=0.00649961;REVB=0.0365081;RO=13;SAF=8;SAR=12;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257122;STB=0.642718;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.00246893;OID=.;OPOS=322934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:13:13:20:20:0.606061:12:8:10:3:12:8:10:3
chr16	336660	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271622;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.43;QD=62.6708;RBI=0.0305879;REFB=0;REVB=0.0140653;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010704;OID=.;OPOS=336660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
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chr16	427516	.	T	C	54.32	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0107606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.377;QD=8.69175;RBI=0.0387235;REFB=-0.0163203;REVB=-0.0371984;RO=17;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0323108;STB=0.51995;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.033244;OID=.;OPOS=427516;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:4:4:9:8:4:4:9:8
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chr16	449345	.	G	C	350.18	PASS	AF=0.6;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.0479194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1974;QD=28.0144;RBI=0.0562585;REFB=-0.00653552;REVB=-0.0294746;RO=19;SAF=22;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313744;STB=0.66559;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00341363;OID=.;OPOS=449345;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:19:20:30:30:0.6:8:22:6:13:8:22:7:13
chr16	449659	.	G	A	31.6	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0263423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.192;QD=14.0434;RBI=0.0263423;REFB=0.00658358;REVB=0;RO=4;SAF=5;SAR=0;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00395595;OID=.;OPOS=449659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:0:5:4:0:0:5:4:0
chr16	450140	.	C	CAG	99.86	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0297912;FXX=0;HRUN=0;LEN=2;MLLD=99.7125;QD=15.3623;RBI=0.0300041;REFB=-0.0125252;REVB=-0.0035677;RO=14;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781007;STB=0.545378;STBP=0.655;TYPE=ins;VARB=0.0149746;OID=.;OPOS=450141;OREF=-;OALT=AG;OMAPALT=CAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.461538:12:26:12:26:14:7:5:7:7:99:14:7:5:7:7
chr16	450165	.	T	C	111.17	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=-0.105086;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.5365;QD=15.3331;RBI=0.117064;REFB=-0.0490504;REVB=-0.0515832;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00477241;STB=0.521244;STBP=0.809;TYPE=snp;VARB=0.0507752;OID=.;OPOS=450165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:29:15:16:13:13:0.448276:6:7:8:7:6:7:8:8
chr16	456416	.	T	G	803.11	PASS	AF=1;AO=51;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=46;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00939922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.918;QD=56.3585;RBI=0.230979;REFB=0;REVB=0.230788;RO=0;SAF=45;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00034258;OID=.;OPOS=456416;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:57:0:0:51:57:1:6:45:0:0:11:46:0:0
chr16	547297	.	T	C	150.95	PASS	AF=0.354167;AO=17;DP=48;FAO=17;FDP=48;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0013224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.878;QD=12.5791;RBI=0.00376613;REFB=-0.00365603;REVB=0.00352633;RO=31;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500547;STB=0.529377;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.00712611;OID=.;OPOS=547297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:31:31:17:17:0.354167:8:9:15:16:8:9:15:16
chr16	570557	.	T	C	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00595355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.116;QD=59.0161;RBI=0.00866608;REFB=0;REVB=0.00629732;RO=0;SAF=16;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.85089e-05;OID=.;OPOS=570557;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:18:16:0:0:18:16:0:0
chr16	572178	.	ATTTTTTA	ATTTTTA,ATTTTTAT,TTATTTGA	70.5	PASS	AF=0.454545,0,0.0606061;AO=10,6,2;DP=36;FAO=15,0,2;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=7,0,0;FSAR=8,0,2;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.012921,-0.300601,-0.00515695;FXX=0.0833102;HRUN=6,6,1;LEN=1,2,7;MLLD=8.91664,16.8895,143.48;QD=8.54589;RBI=0.101852,0.328115,0.0276142;REFB=-0.186795,-0.0793744,-0.0176975;REVB=-0.101029,-0.131525,-0.0271284;RO=11;SAF=3,5,0;SAR=7,1,2;SRF=3;SRR=8;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.0294979,0.561709,-0.496917;STB=0.547763,0.5,0.993395;STBP=0.615,1,0.292;TYPE=del,mnp,mnp;VARB=0.119009,0,0.0617405;OID=.,.,.;OPOS=572179,572184,572178;OREF=T,TA,ATTTTTT;OALT=-,AT,TTATTTG;OMAPALT=ATTTTTA,ATTTTTAT,TTATTTGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:36:33:11:16:10,6,2:15,0,2:0.454545,0,0.0606061:7,1,2:3,5,0:3:8:8,0,2:7,0,0:6:10
chr16	601632	.	T	C	2566.11	PASS	AF=1;AO=141;DP=166;FAO=166;FDP=166;FR=.;FRO=0;FSAF=93;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101396;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7103;QD=61.834;RBI=0.0175985;REFB=0;REVB=0.0143838;RO=0;SAF=71;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.23847e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.31556e-06;OID=.;OPOS=601632;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:166:166:0:0:141:166:1:70:71:0:0:73:93:0:0
chr16	602313	.	C	A	259.06	PASS	AF=0.55814;AO=24;DP=43;FAO=24;FDP=43;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=0.0166453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.501;QD=24.0982;RBI=0.0167523;REFB=-0.0362184;REVB=-0.00189042;RO=19;SAF=13;SAR=11;SRF=12;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0723735;STB=0.540242;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0146339;OID=.;OPOS=602313;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:19:19:24:24:0.55814:11:13:12:7:11:13:12:7
chr16	602531	.	GTA	GTAC,GTC,TAC	228.02	PASS	AF=0.568182,0,0;AO=16,2,5;DP=47;FAO=25,0,0;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=20,0,0;FSAR=5,0,0;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.215073,0.0287844,-0.0343358;FXX=0;HRUN=1,1,3;LEN=1,1,3;MLLD=16.863,106.109,18.5643;QD=20.7291;RBI=0.21994,0.0296049,0.0529445;REFB=-0.0931993,-0.000986479,-0.0390907;REVB=0.0460101,-0.00692138,0.0403011;RO=24;SAF=12,2,5;SAR=4,0,0;SRF=9;SRR=15;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.395556,0.547397,0.71188;STB=0.752259,0.5,0.5;STBP=0.001,1,1;TYPE=ins,snp,mnp;VARB=0.111185,0,0;OID=.,.,.;OPOS=602534,602533,602531;OREF=-,A,GTA;OALT=C,C,TAC;OMAPALT=GTAC,GTC,TAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:44:24:19:16,2,5:25,0,0:0.568182,0,0:4,0,0:12,2,5:9:15:5,0,0:20,0,0:5:14
chr16	603471	.	A	G	901.03	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465404;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.234;QD=58.1307;RBI=0.0465421;REFB=0;REVB=0.000400577;RO=0;SAF=18;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.64286e-05;OID=.;OPOS=603471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:43:18:0:0:43:19:0:0
chr16	622565	.	A	G	315.72	PASS	AF=0.478873;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=71;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=28;FSRR=9;FWDB=-0.016597;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0747;QD=17.7869;RBI=0.0479087;REFB=-0.0252727;REVB=-0.044942;RO=31;SAF=26;SAR=8;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0267062;STB=0.505717;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.035657;OID=.;OPOS=622565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:71:31:37:34:34:0.478873:8:26:23:8:8:26:28:9
chr16	624114	.	A	G	74.47	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0476999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5717;QD=22.9152;RBI=0.0586654;REFB=-0.0122533;REVB=-0.034152;RO=4;SAF=4;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107529;STB=0.561271;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0095133;OID=.;OPOS=624114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:5:4:1:3:5:4:1:3
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chr16	632073	.	C	T	343.21	PASS	AF=0.596491;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0144804;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.515;QD=24.0852;RBI=0.0237677;REFB=-0.0081294;REVB=-0.0188473;RO=23;SAF=20;SAR=14;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819107;STB=0.545047;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.00443074;OID=.;OPOS=632073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:23:23:34:34:0.596491:14:20:11:12:14:20:11:12
chr16	632113	.	GCG	CGA,GCA	202.42	PASS	AF=0,0.373134;AO=3,24;DP=66;FAO=0,25;FDP=67;FR=.;FRO=42;FSAF=0,12;FSAR=0,13;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.000987245,-0.00340842;FXX=0.0147037;HRUN=5,4;LEN=3,1;MLLD=197.681,202.259;QD=12.085;RBI=0.0127733,0.011469;REFB=-0.0309894,-0.0299055;REVB=0.0127351,0.0109508;RO=27;SAF=3,11;SAR=0,13;SRF=17;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.512187,-0.159552;STB=0.5,0.571881;STBP=1,0.387;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0340216;OID=.,.;OPOS=632113,632115;OREF=GCG,G;OALT=CGA,A;OMAPALT=CGA,GCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:66:67:27:42:3,24:0,25:0,0.373134:0,13:3,11:17:10:0,13:0,12:25:17
chr16	632138	.	C	T	317.92	PASS	AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=16;FWDB=0.0112134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.143;QD=15.5081;RBI=0.0228016;REFB=-0.020837;REVB=0.0198538;RO=46;SAF=16;SAR=19;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194729;STB=0.614527;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0172022;OID=.;OPOS=632138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:46:47:35:35:0.426829:19:16:30:16:19:16:31:16
chr16	632180	.	G	C	286.66	PASS	AF=0.383721;AO=33;DP=86;FAO=33;FDP=86;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=-0.0263737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.141;QD=13.3331;RBI=0.0265094;REFB=-0.00583015;REVB=0.00267802;RO=52;SAF=9;SAR=24;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.406573;STB=0.73626;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00718173;OID=.;OPOS=632180;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:52:53:33:33:0.383721:24:9:34:18:24:9:35:18
chr16	632198	.	T	A	218.66	PASS	AF=0.3375;AO=26;DP=81;FAO=27;FDP=80;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=0.0216126;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.74;QD=10.933;RBI=0.0216435;REFB=-0.0114206;REVB=0.00115585;RO=46;SAF=5;SAR=21;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.515597;STB=0.794383;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00888384;OID=.;OPOS=632198;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:46:53:26:27:0.3375:21:5:30:16:21:6:36:17
chr16	632225	.	T	C	217.2	PASS	AF=0.350649;AO=27;DP=77;FAO=27;FDP=77;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=22;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.0122363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.7464;QD=11.2831;RBI=0.019182;REFB=-0.0259361;REVB=-0.0147723;RO=50;SAF=5;SAR=22;SRF=30;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.489312;STB=0.785492;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0167395;OID=.;OPOS=632225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:50:50:27:27:0.350649:22:5:30:20:22:5:30:20
chr16	632230	.	CG	C,CC	181.42	PASS	AF=0.314286,0.0285714;AO=17,7;DP=70;FAO=22,2;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=4,1;FSAR=18,1;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.00764798,-0.0328463;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=198.426,203.288;QD=10.3668;RBI=0.00768841,0.032868;REFB=-0.0158051,-0.0110217;REVB=-0.000787441,-0.00119519;RO=45;SAF=0,5;SAR=17,2;SRF=25;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.7973,0.199783;STB=0.780075,0.56189;STBP=0,0.835;TYPE=del,snp;VARB=0.0111692,0.0520319;OID=.,.;OPOS=632231,632231;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.314286,0.0285714:17,7:70:22,2:70:46:4,1:18,1:26:20:99:45:0,5:17,2:25:20
chr16	632233	.	T	C	171.96	PASS	AF=0.328571;AO=21;DP=69;FAO=23;FDP=70;FR=.;FRO=47;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0965218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.0543;QD=9.82633;RBI=0.117904;REFB=-0.0120395;REVB=-0.0677114;RO=48;SAF=3;SAR=18;SRF=28;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.550468;STB=0.75173;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0221524;OID=.;OPOS=632233;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:48:47:21:23:0.328571:18:3:28:20:18:5:27:20
chr16	633125	.	T	C	848.9	PASS	AF=0.468085;AO=87;DP=188;FAO=88;FDP=188;FR=.;FRO=100;FSAF=32;FSAR=56;FSRF=64;FSRR=36;FWDB=-0.00767262;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8851;QD=18.0618;RBI=0.0380984;REFB=-0.0146859;REVB=0.0373178;RO=101;SAF=32;SAR=55;SRF=65;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.265496;STB=0.646121;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0224548;OID=.;OPOS=633125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:188:101:100:87:88:0.468085:55:32:65:36:56:32:64:36
chr16	633353	.	TG	CA	526.11	PASS	AF=0.392405;AO=61;DP=159;FAO=62;FDP=158;FR=.;FRO=96;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=53;FSRR=43;FWDB=-0.0238138;FXX=0.00628891;HRUN=1;LEN=2;MLLD=232.848;QD=13.3193;RBI=0.0268366;REFB=-0.0109868;REVB=-0.0123737;RO=85;SAF=19;SAR=42;SRF=42;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201218;STB=0.64326;STBP=0.005;TYPE=mnp;VARB=0.0196466;OID=.;OPOS=633353;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:158:85:96:61:62:0.392405:42:19:42:43:42:20:53:43
chr16	633764	.	G	A	546.34	PASS	AF=0.491379;AO=57;DP=116;FAO=57;FDP=116;FR=.;FRO=59;FSAF=16;FSAR=41;FSRF=19;FSRR=40;FWDB=-0.0137419;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.223;QD=18.8393;RBI=0.0143773;REFB=-0.00390466;REVB=0.00422692;RO=59;SAF=16;SAR=41;SRF=19;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0458973;STB=0.525439;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00430532;OID=.;OPOS=633764;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:59:59:57:57:0.491379:41:16:19:40:41:16:19:40
chr16	678843	.	C	T	716.19	PASS	AF=0.514706;AO=70;DP=136;FAO=70;FDP=136;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=47;FSRF=40;FSRR=26;FWDB=0.0465922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.431;QD=21.0643;RBI=0.048076;REFB=-0.0360458;REVB=0.0118518;RO=64;SAF=23;SAR=47;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250092;STB=0.638106;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0362567;OID=.;OPOS=678843;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:64:66:70:70:0.514706:47:23:39:25:47:23:40:26
chr16	679814	.	T	C	2165.74	PASS	AF=0.97351;AO=143;DP=150;FAO=147;FDP=151;FR=.;FRO=4;FSAF=65;FSAR=82;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0199182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5014;QD=57.3707;RBI=0.0199246;REFB=0.00568729;REVB=-0.000507068;RO=3;SAF=62;SAR=81;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00925601;STB=0.508248;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.00098348;OID=.;OPOS=679814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:150:151:3:4:143:147:0.97351:81:62:2:1:82:65:3:1
chr16	701656	.	C	T	536.94	PASS	AF=0.829787;AO=39;DP=47;FAO=39;FDP=47;FR=.;FRO=8;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=5;FWDB=0.0156222;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.892;QD=45.6972;RBI=0.0306862;REFB=0.0367987;REVB=0.0264119;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510562;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=-0.00498167;OID=.;OPOS=701656;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:47:47:0:8:39:39:0.829787:22:17:0:0:22:17:3:5
chr16	705360	.	T	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0398745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.193;QD=53.911;RBI=0.045879;REFB=0;REVB=0.0226916;RO=0;SAF=4;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.63292e-05;OID=.;OPOS=705360;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:20:4:0:0:20:4:0:0
chr16	705844	.	T	C	803.39	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0166008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8015;QD=55.4058;RBI=0.0665524;REFB=-0.0408971;REVB=-0.0644487;RO=1;SAF=22;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209528;STB=0.511107;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.00643994;OID=.;OPOS=705844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:35:22:1:0:35:22:1:0
chr16	705919	.	CG	CC,GC	679.51	PASS	AF=0.518519,0.444444;AO=27,24;DP=54;FAO=28,24;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=13,8;FSAR=15,16;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0262499,-0.01162;FXX=0;HRUN=3,2;LEN=1,2;MLLD=32.7616,234.313;QD=50.3342;RBI=0.0264572,0.0175616;REFB=-0.137846,-0.0321063;REVB=-0.00330521,-0.0131676;RO=1;SAF=12,8;SAR=15,16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0371713,-0.0544279;STB=0.502391,0.514274;STBP=0.883,0.765;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0238846,0.016672;OID=.,.;OPOS=705920,705919;OREF=G,CG;OALT=C,GC;OMAPALT=CC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:54:54:1:2:27,24:28,24:0.518519,0.444444:15,16:12,8:1:0:15,16:13,8:1:1
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chr16	708275	.	C	A	2167.12	PASS	AF=1;AO=135;DP=136;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627279;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.767;QD=62.8151;RBI=0.0823261;REFB=0;REVB=0.0533178;RO=0;SAF=76;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000796681;OID=.;OPOS=708275;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:136:138:0:0:135:138:1:59:76:0:0:61:77:0:0
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chr16	722331	.	C	G,T	586.75	PASS	AF=0.0487805,0.926829;AO=2,39;DP=41;FAO=2,38;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=0,17;FSAR=2,21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.103686,0.0372549;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=9.9765,176.845;QD=57.2436;RBI=0.145908,0.039508;REFB=0.197892,-0.142179;REVB=-0.102657,0.0131513;RO=0;SAF=0,18;SAR=2,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.34792e-08;STB=0.993266,0.514278;STBP=0.232,0.306;TYPE=snp,snp;VARB=0.128849,0.0055831;OID=.,.;OPOS=722331,722331;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:41:41:0:1:2,39:2,38:0.0487805,0.926829:2,21:0,18:0:0:2,21:0,17:1:0
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chr16	735921	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0410619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7302;QD=50.4132;RBI=0.0706571;REFB=0;REVB=0.0575009;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340623;OID=.;OPOS=735921;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:5:14:0:0:5:14:0:0
chr16	740404	.	C	G	497.73	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0854986;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.9684;QD=58.5559;RBI=0.137419;REFB=0;REVB=0.107582;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00520318;OID=.;OPOS=740404;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:33:34:1:16:17:0:0:16:18:0:0
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chr16	774520	.	C	T	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0771252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6306;QD=16.1989;RBI=0.0892652;REFB=-0.0188833;REVB=-0.0449442;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165639;STB=0.599599;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0465082;OID=.;OPOS=774520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:1:2:2:3:1:2
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chr16	818802	.	G	A	141.27	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=-0.0156277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.675;QD=13.4541;RBI=0.034242;REFB=-0.00710336;REVB=-0.0304679;RO=25;SAF=7;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0865243;STB=0.562422;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0162354;OID=.;OPOS=818802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:25:26:16:16:0.380952:9:7:13:12:9:7:14:12
chr16	820888	.	T	C	601.24	PASS	AF=0.386598;AO=53;DP=175;FAO=75;FDP=194;FR=.;FRO=119;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=72;FSRR=47;FWDB=-0.0251673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.322;QD=12.3968;RBI=0.0255713;REFB=-0.0217449;REVB=0.00452774;RO=110;SAF=48;SAR=5;SRF=63;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.534179;STB=0.522962;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0246623;OID=.;OPOS=820888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:194:110:119:53:75:0.386598:5:48:63:47:27:48:72:47
chr16	820944	.	T	A	667.65	PASS	AF=0.390625;AO=75;DP=193;FAO=75;FDP=192;FR=.;FRO=117;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=57;FSRR=60;FWDB=0.0204115;FXX=0.0103087;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8599;QD=13.9094;RBI=0.02931;REFB=-0.0301086;REVB=-0.0210344;RO=110;SAF=45;SAR=30;SRF=50;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15478;STB=0.569602;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0342049;OID=.;OPOS=820944;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:193:192:110:117:75:75:0.390625:30:45:50:60:30:45:57:60
chr16	839184	.	T	C	821.26	PASS	AF=0.485549;AO=84;DP=174;FAO=84;FDP=173;FR=.;FRO=89;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=46;FSRR=43;FWDB=-0.0101332;FXX=0.0057468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.015;QD=18.9887;RBI=0.0121197;REFB=-0.016471;REVB=-0.00664872;RO=84;SAF=49;SAR=35;SRF=42;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0767303;STB=0.534761;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0163436;OID=.;OPOS=839184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:174:173:84:89:84:84:0.485549:35:49:42:42:35:49:46:43
chr16	839262	.	A	G	2302.98	PASS	AF=1;AO=145;DP=146;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0889302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.16;QD=60.2086;RBI=0.0896437;REFB=0;REVB=0.0112874;RO=1;SAF=61;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00773214;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194847;OID=.;OPOS=839262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:146:153:1:0:145:153:1:84:61:1:0:84:69:0:0
chr16	839996	.	T	C	42.28	PASS	AF=0.194444;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=36;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.10255;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.4603;QD=4.69725;RBI=0.126872;REFB=0.00676812;REVB=-0.0746989;RO=27;SAF=3;SAR=4;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192232;STB=0.51216;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=-0.0401081;OID=.;OPOS=839996;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:35:36:27:29:7:7:0.194444:4:3:12:15:4:3:12:17
chr16	840378	.	A	G	318.82	PASS	AF=0.583333;AO=28;DP=48;FAO=28;FDP=48;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0240818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7827;QD=26.5686;RBI=0.0888361;REFB=-0.0182383;REVB=-0.0855097;RO=20;SAF=16;SAR=12;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100698;STB=0.555517;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0118356;OID=.;OPOS=840378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:20:20:28:28:0.583333:12:16:14:6:12:16:14:6
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chr16	1004554	.	C	T	432.42	PASS	AF=0.518072;AO=42;DP=82;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.0230156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.178;QD=20.8397;RBI=0.0325548;REFB=-0.0319489;REVB=-0.0230238;RO=40;SAF=27;SAR=15;SRF=15;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23736;STB=0.634498;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0310663;OID=.;OPOS=1004554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:40:40:42:43:0.518072:15:27:15:25:15:28:15:25
chr16	1034834	.	T	C	1415.03	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0554;QD=62.89;RBI=0.0283618;REFB=0;REVB=-0.0185228;RO=0;SAF=48;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30324e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47727e-05;OID=.;OPOS=1034834;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:41:48:0:0:42:48:0:0
chr16	1115904	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.645;QD=44.6896;RBI=0.0291735;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=13;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000588789;OID=.;OPOS=1115904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:0:13:0:0:0:13:0:0
chr16	1116106	.	C	T	244.26	PASS	AF=0.575;AO=21;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=-0.0157708;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.621;QD=24.4263;RBI=0.0250684;REFB=-0.0138766;REVB=0.0194861;RO=15;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149992;STB=0.55441;STBP=0.481;TYPE=snp;VARB=0.00740725;OID=.;OPOS=1116106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:15:17:21:23:0.575:8:13:12:3:8:15:13:4
chr16	1116169	.	A	G	533.63	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00741911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.016;QD=59.2924;RBI=0.0323169;REFB=0;REVB=0.0314538;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220202;OID=.;OPOS=1116169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:14:21:0:0:15:21:0:0
chr16	1116445	.	A	G	305.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0393481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.879;QD=53.1416;RBI=0.0987762;REFB=0;REVB=0.0906006;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000401726;OID=.;OPOS=1116445;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:10:11:0:0:11:12:0:0
chr16	1129504	.	G	A	62.48	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=-0.0239864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.593;QD=8.06253;RBI=0.0341632;REFB=-0.0158719;REVB=0.0243265;RO=21;SAF=5;SAR=4;SRF=19;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.45029;STB=0.732439;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0225078;OID=.;OPOS=1129504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:21:22:9:9:0.290323:4:5:19:2:4:5:19:3
chr16	1129872	.	C	T	82.06	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0463699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.195;QD=32.822;RBI=0.0497566;REFB=-0.0696423;REVB=0.0180431;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545355;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0113864;OID=.;OPOS=1129872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:10:10:0:1:9:9:0.9:4:5:0:0:4:5:1:0
chr16	1131181	.	C	T	1645.85	PASS	AF=1;AO=108;DP=111;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=77;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203959;FXX=0.0180164;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.9304;QD=60.3983;RBI=0.0240417;REFB=0;REVB=0.0127283;RO=0;SAF=76;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155188;OID=.;OPOS=1131181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:109:0:0:108:109:1:32:76:0:0:32:77:0:0
chr16	1131393	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.0892;QD=53.2767;RBI=0.0769781;REFB=0;REVB=-0.0695171;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000556589;OID=.;OPOS=1131393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
chr16	1250419	.	A	G	68.64	PASS	AF=0.277778;AO=10;DP=36;FAO=10;FDP=36;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0231847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7578;QD=7.62613;RBI=0.0553526;REFB=-0.0150116;REVB=-0.0502632;RO=26;SAF=9;SAR=1;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.574583;STB=0.864565;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0567225;OID=.;OPOS=1250419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:36:36:26:26:10:10:0.277778:1:9:12:14:1:9:12:14
chr16	1252369	.	C	T	779.77	PASS	AF=0.890625;AO=57;DP=64;FAO=57;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0264741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.24;QD=48.7355;RBI=0.0789189;REFB=-0.151013;REVB=0.0743459;RO=3;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0627305;STB=0.53666;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.000912925;OID=.;OPOS=1252369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:64:64:3:5:57:57:0.890625:21:36:0:3:21:36:1:4
chr16	1260481	.	T	C	899.14	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00111332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.892;QD=58.0089;RBI=0.0331175;REFB=0;REVB=-0.0330988;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.0235e-05;OID=.;OPOS=1260481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:29:32:0:0:30:32:0:0
chr16	1261219	.	A	G	1361.97	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050574;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.203;QD=62.6193;RBI=0.051154;REFB=0;REVB=-0.00768154;RO=0;SAF=61;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.80797e-05;OID=.;OPOS=1261219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:87:0:0:87:87:1:26:61:0:0:26:61:0:0
chr16	1261222	.	A	G	1377.31	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00096439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7477;QD=62.6051;RBI=0.0258037;REFB=0;REVB=-0.0257856;RO=0;SAF=61;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.16754e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000140584;OID=.;OPOS=1261222;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:27:61:0:0:27:61:0:0
chr16	1261282	.	T	C	1186.42	PASS	AF=0.963855;AO=80;DP=84;FAO=80;FDP=83;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0166752;FXX=0.0119033;HRUN=4;LEN=1;MLLD=292.87;QD=57.177;RBI=0.0203711;REFB=0.0313578;REVB=0.0117012;RO=3;SAF=48;SAR=32;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0189129;STB=0.509998;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=-6.01513e-05;OID=.;OPOS=1261282;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:84:83:3:3:80:80:0.963855:32:48:1:2:32:48:1:2
chr16	1265600	.	G	A	342.07	PASS	AF=0.630435;AO=29;DP=47;FAO=29;FDP=46;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.00598474;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.328;QD=29.7454;RBI=0.0131063;REFB=-0.0525958;REVB=0.01166;RO=17;SAF=13;SAR=16;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0940853;STB=0.551688;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0179797;OID=.;OPOS=1265600;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:17:17:29:29:0.630435:16:13:10:7:16:13:10:7
chr16	1268494	.	C	T	186.24	PASS	AF=0.818182;AO=17;DP=22;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0240089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.7013;QD=33.8625;RBI=0.0368791;REFB=-0.0860484;REVB=0.0279935;RO=4;SAF=8;SAR=9;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182147;STB=0.590811;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.039374;OID=.;OPOS=1268494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:22:22:4:4:17:18:0.818182:9:8:4:0:9:9:4:0
chr16	1269029	.	T	C	279.52	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000486357;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.401;QD=48.6128;RBI=0.0393408;REFB=-0.0423061;REVB=0.0393377;RO=1;SAF=13;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342405;STB=0.518502;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00136898;OID=.;OPOS=1269029;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:9:13:1:0:9:13:1:0
chr16	1269047	.	G	C,GC	31.48	PASS	AF=0,0.35;AO=3,2;DP=19;FAO=0,7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=0,6;FSAR=0,1;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=-0.0134288,0.127324;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=158.708,18.9527;QD=6.29573;RBI=0.0326429,0.127415;REFB=-0.0013175,-0.0383378;REVB=-0.0297528,0.0048347;RO=14;SAF=3,1;SAR=0,1;SRF=7;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.626624,0;STB=0.5,0.79904;STBP=1,0.072;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.123449;OID=.,.;OPOS=1269047,1269048;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:32:19:20:14:13:3,2:0,7:0,0.35:0,1:3,1:7:7:0,1:0,6:6:7
chr16	1270162	.	G	A	1011.24	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154604;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5148;QD=59.4844;RBI=0.0738518;REFB=0;REVB=0.0722154;RO=0;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000414721;OID=.;OPOS=1270162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:36:32:0:0:36:32:0:0
chr16	1270349	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0497107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.172;QD=50.4129;RBI=0.0504861;REFB=0;REVB=0.00881469;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000853948;OID=.;OPOS=1270349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr16	1271890	.	G	T	596.15	PASS	AF=1;AO=39;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0660219;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.997;QD=58.1605;RBI=0.243294;REFB=0;REVB=0.234165;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00190061;OID=.;OPOS=1271890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:41:41:0:0:39:41:1:17:22:0:0:19:22:0:0
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chr16	1272865	.	G	A	2764.05	PASS	AF=1;AO=173;DP=173;FAO=177;FDP=177;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00117577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.658;QD=62.4645;RBI=0.032475;REFB=0;REVB=0.0324537;RO=0;SAF=76;SAR=97;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.14339e-05;OID=.;OPOS=1272865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:173:177:0:0:173:177:1:97:76:0:0:101:76:0:0
chr16	1278744	.	C	T	208.83	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=0.0187425;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=148.435;QD=25.3128;RBI=0.043109;REFB=-0.0454759;REVB=0.0388214;RO=13;SAF=10;SAR=10;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.191267;STB=0.605959;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0165876;OID=.;OPOS=1278744;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:10:10:3:10:10:10:3:10
chr16	1278767	.	C	T	128.66	PASS	AF=0.636364;AO=13;DP=21;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0293521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.744;QD=23.3925;RBI=0.0296399;REFB=-0.0143885;REVB=0.00412052;RO=8;SAF=5;SAR=8;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196076;STB=0.616286;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00990626;OID=.;OPOS=1278767;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:22:8:8:13:14:0.636364:8:5:1:7:8:6:1:7
chr16	1279574	.	C	G	97.67	PASS	AF=0.4;AO=11;DP=29;FAO=12;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0203922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.81;QD=13.022;RBI=0.037695;REFB=-0.0225902;REVB=-0.0317029;RO=18;SAF=4;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881603;STB=0.517017;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0384709;OID=.;OPOS=1279574;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:30:18:18:11:12:0.4:7:4:8:10:7:5:8:10
chr16	1279584	.	T	C	182.1	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.0112373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.712;QD=16.9393;RBI=0.0188493;REFB=-0.00968995;REVB=-0.0151333;RO=24;SAF=12;SAR=7;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132079;STB=0.575676;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0220195;OID=.;OPOS=1279584;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:24:24:19:19:0.44186:7:12:12:12:7:12:12:12
chr16	1279623	.	G	A	227.76	PASS	AF=0.468085;AO=19;DP=50;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.0200846;FXX=0.059988;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.4615;QD=19.3837;RBI=0.0362658;REFB=-0.00624127;REVB=-0.0301963;RO=17;SAF=9;SAR=10;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0522087;STB=0.510629;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0170909;OID=.;OPOS=1279623;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:47:17:25:19:22:0.468085:10:9:7:10:11:11:12:13
chr16	1279704	.	A	G	172.13	PASS	AF=0.473684;AO=17;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0104422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.1892;QD=18.1189;RBI=0.0104903;REFB=-0.021991;REVB=0.00100431;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748639;STB=0.555494;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0272651;OID=.;OPOS=1279704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:17:18:0.473684:9:8:11:9:10:8:11:9
chr16	1279710	.	G	A	158.99	PASS	AF=0.459459;AO=15;DP=35;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.001919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.272;QD=17.188;RBI=0.01158;REFB=-0.0510279;REVB=0.0114199;RO=18;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0963035;STB=0.574991;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0331541;OID=.;OPOS=1279710;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:37:18:20:15:17:0.459459:9:6:9:9:10:7:11:9
chr16	1279714	.	A	G	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0496493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.99;QD=17.3209;RBI=0.0570655;REFB=-0.0280361;REVB=-0.0281322;RO=17;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135474;STB=0.591128;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0575935;OID=.;OPOS=1279714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:18:16:16:0.470588:9:7:10:7:9:7:11:7
chr16	1279717	.	C	T	133.92	PASS	AF=0.454545;AO=12;DP=30;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.107017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.238;QD=16.2327;RBI=0.107224;REFB=-0.0222771;REVB=-0.00665819;RO=18;SAF=4;SAR=8;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.282827;STB=0.57821;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0193827;OID=.;OPOS=1279717;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:33:18:18:12:15:0.454545:8:4:11:7:8:7:11:7
chr16	1279732	.	C	A	116.61	PASS	AF=0.541667;AO=11;DP=25;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.139953;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.1838;QD=19.4346;RBI=0.166493;REFB=-0.0602016;REVB=-0.090183;RO=11;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783488;STB=0.503221;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0514834;OID=.;OPOS=1279732;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:25:24:11:11:11:13:0.541667:6:5:6:5:6:7:6:5
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chr16	1306346	.	C	T	54.22	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.00104866;FXX=0.0832639;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.81;QD=19.7165;RBI=0.046664;REFB=-0.0914722;REVB=0.0466522;RO=4;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298189;STB=0.675156;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0358514;OID=.;OPOS=1306346;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:12:11:4:4:7:7:0.636364:2:5:1:3:2:5:1:3
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chr16	1306559	.	AGGA	AGA,AGAG,CGGA	143.29	PASS	AF=0.351351,0.0810811,0.0810811;AO=11,4,3;DP=39;FAO=13,3,3;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=10,3,0;FSAR=3,0,3;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0563534,0.0480265,0.00447279;FXX=0.0512689;HRUN=2,2,1;LEN=1,2,1;MLLD=22.2847,26.3613,91.5104;QD=15.4907;RBI=0.0877239,0.102597,0.0384358;REFB=-0.0269157,-0.0433811,0.00521626;REVB=-0.0672293,-0.0906625,-0.0381746;RO=15;SAF=9,4,0;SAR=2,0,3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.277675,0.643696,-0.656613;STB=0.613308,0.99558,0.996836;STBP=0.322,0.126,0.033;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.00117338,0.134809,0.0592274;OID=.,.,.;OPOS=1306560,1306561,1306559;OREF=G,GA,A;OALT=-,AG,C;OMAPALT=AGA,AGAG,CGGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:39:37:15:18:11,4,3:13,3,3:0.351351,0.0810811,0.0810811:2,0,3:9,4,0:9:6:3,0,3:10,3,0:11:7
chr16	1306671	.	G	A	338.14	PASS	AF=0.576271;AO=34;DP=58;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0400688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7676;QD=22.9247;RBI=0.0588521;REFB=-0.00464362;REVB=0.0431052;RO=24;SAF=14;SAR=20;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129681;STB=0.579953;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.00242455;OID=.;OPOS=1306671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:24:25:34:34:0.576271:20:14:14:10:20:14:15:10
chr16	1306680	.	C	T	176.76	PASS	AF=0.396226;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=53;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0847893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9601;QD=13.34;RBI=0.0850442;REFB=-0.0233492;REVB=0.00657834;RO=32;SAF=11;SAR=10;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0576337;STB=0.533182;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0216205;OID=.;OPOS=1306680;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:32:21:21:0.396226:10:11:15:17:10:11:15:17
chr16	1306681	.	G	A	308.0	PASS	AF=0.588235;AO=30;DP=51;FAO=30;FDP=51;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0704678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.679;QD=24.1569;RBI=0.0705386;REFB=-0.0109847;REVB=0.00315895;RO=21;SAF=13;SAR=17;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0680038;STB=0.537524;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00968901;OID=.;OPOS=1306681;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:21:21:30:30:0.588235:17:13:11:10:17:13:11:10
chr16	1306918	.	C	T	130.48	PASS	AF=0.267606;AO=19;DP=71;FAO=19;FDP=71;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=0.00581451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.297;QD=7.351;RBI=0.028665;REFB=-0.0031295;REVB=-0.0280691;RO=50;SAF=9;SAR=10;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0649953;STB=0.523076;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0166733;OID=.;OPOS=1306918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:50:52:19:19:0.267606:10:9:21:29:10:9:23:29
chr16	1306921	.	G	A	130.52	PASS	AF=0.267606;AO=19;DP=71;FAO=19;FDP=71;FR=.;FRO=52;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.00962969;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=264.664;QD=7.35303;RBI=0.0134399;REFB=-0.007107;REVB=-0.00937544;RO=52;SAF=9;SAR=10;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0381405;STB=0.523076;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0230407;OID=.;OPOS=1306921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:52:52:19:19:0.267606:10:9:23:29:10:9:23:29
chr16	1306927	.	C	T	120.28	PASS	AF=0.253521;AO=18;DP=71;FAO=18;FDP=71;FR=.;FRO=53;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=0.0193942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.833;QD=6.77637;RBI=0.0370111;REFB=-0.0226394;REVB=0.0315228;RO=52;SAF=9;SAR=9;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702638;STB=0.549242;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0184555;OID=.;OPOS=1306927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:52:53:18:18:0.253521:9:9:23:29:9:9:23:30
chr16	1306971	.	A	G	120.24	PASS	AF=0.253521;AO=18;DP=71;FAO=18;FDP=71;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.00424148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.165;QD=6.7742;RBI=0.00586589;REFB=-0.00500272;REVB=0.00405197;RO=53;SAF=10;SAR=8;SRF=29;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103388;STB=0.506322;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0277731;OID=.;OPOS=1306971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:53:53:18:18:0.253521:8:10:29:24:8:10:29:24
chr16	1306973	.	A	G	120.28	PASS	AF=0.253521;AO=18;DP=71;FAO=18;FDP=71;FR=.;FRO=53;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=24;FWDB=-0.0120339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4685;QD=6.77633;RBI=0.0134775;REFB=-0.00339533;REVB=-0.00606869;RO=51;SAF=10;SAR=8;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160928;STB=0.506322;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.00989599;OID=.;OPOS=1306973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:51:53:18:18:0.253521:8:10:29:22:8:10:29:24
chr16	1306981	.	G	A	239.58	PASS	AF=0.411765;AO=28;DP=68;FAO=28;FDP=68;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.00597173;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.048;QD=14.0932;RBI=0.0129025;REFB=-0.000955942;REVB=0.0114374;RO=40;SAF=14;SAR=14;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103452;STB=0.558782;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.00320229;OID=.;OPOS=1306981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:40:40:28:28:0.411765:14:14:24:16:14:14:24:16
chr16	1306986	.	C	T	113.65	PASS	AF=0.253731;AO=16;DP=66;FAO=17;FDP=67;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.0358365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.52;QD=6.78528;RBI=0.0387515;REFB=0.00464355;REVB=0.0147452;RO=50;SAF=9;SAR=7;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.027842;STB=0.536629;STBP=0.755;TYPE=snp;VARB=-0.0100576;OID=.;OPOS=1306986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:50:50:16:17:0.253731:7:9:27:23:7:10:27:23
chr16	1307050	.	C	T	36.38	PASS	AF=0.12069;AO=7;DP=58;FAO=7;FDP=58;FR=.;FRO=51;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=0.0159786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.493;QD=2.50906;RBI=0.0213278;REFB=-0.00352974;REVB=-0.0141267;RO=51;SAF=5;SAR=2;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204296;STB=0.653991;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0339154;OID=.;OPOS=1307050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:58:58:51:51:7:7:0.12069:2:5:28:23:2:5:28:23
chr16	1308073	.	G	A	203.23	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0116806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.357;QD=21.9707;RBI=0.0267299;REFB=-0.0214887;REVB=0.0240427;RO=17;SAF=16;SAR=4;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110482;STB=0.562433;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.00212187;OID=.;OPOS=1308073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:17:20:20:0.540541:4:16:12:5:4:16:12:5
chr16	1311333	.	A	G	1319.89	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.110448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.893;QD=62.1125;RBI=0.124894;REFB=0;REVB=0.0583085;RO=0;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227557;OID=.;OPOS=1311333;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:76:85:0:0:76:85:1:29:47:0:0:32:53:0:0
chr16	1312546	.	T	A	868.26	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0240883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.303;QD=57.884;RBI=0.0291545;REFB=0;REVB=0.0164237;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.66725e-05;OID=.;OPOS=1312546;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0
chr16	1312826	.	A	G	1161.42	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.668;QD=60.3333;RBI=0.0362828;REFB=0;REVB=0.0169576;RO=0;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264896;OID=.;OPOS=1312826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:29:47:0:0:30:47:0:0
chr16	1364365	.	A	G	161.68	PASS	AF=0.391304;AO=17;DP=45;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.00914364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.82;QD=14.0594;RBI=0.0225714;REFB=-0.0211627;REVB=0.0206365;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323778;STB=0.709466;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0179106;OID=.;OPOS=1364365;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:26:28:17:18:0.391304:10:7:19:7:11:7:21:7
chr16	1370597	.	G	C	594.48	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.253;QD=60.9727;RBI=0.044564;REFB=0;REVB=0.0142557;RO=0;SAF=22;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135042;OID=.;OPOS=1370597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:17:22:0:0:17:22:0:0
chr16	1370614	.	C	G	426.54	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000469175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.652;QD=56.8721;RBI=0.0273165;REFB=0;REVB=0.0273125;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.40244e-05;OID=.;OPOS=1370614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:12:17:0:0:13:17:0:0
chr16	1370630	.	A	G	306.29	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0612205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4466;QD=53.2672;RBI=0.0692317;REFB=0;REVB=-0.0323276;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000757366;OID=.;OPOS=1370630;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr16	1374818	.	A	G	72.35	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.00206777;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=299.286;QD=8.5118;RBI=0.00677979;REFB=-0.00244246;REVB=-0.00645677;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293146;STB=0.676161;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.00593671;OID=.;OPOS=1374818;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:5:5:18:6:5:5:18:6
chr16	1389153	.	C	A	1263.63	PASS	AF=0.944444;AO=85;DP=91;FAO=85;FDP=90;FR=.;FRO=5;FSAF=43;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0816073;FXX=0.0217368;HRUN=4;LEN=1;MLLD=42.4093;QD=56.1613;RBI=0.104922;REFB=-0.181802;REVB=0.0659454;RO=5;SAF=43;SAR=42;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.032127;STB=0.516985;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0104124;OID=.;OPOS=1389153;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:91:90:5:5:85:85:0.944444:42:43:1:4:42:43:1:4
chr16	1391871	.	C	G	445.97	PASS	AF=0.511628;AO=44;DP=86;FAO=44;FDP=86;FR=.;FRO=42;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0202795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.14;QD=20.7426;RBI=0.0269727;REFB=-0.00101697;REVB=-0.0177839;RO=41;SAF=23;SAR=21;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0728995;STB=0.545865;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.000652068;OID=.;OPOS=1391871;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:41:42:44:44:0.511628:21:23:18:23:21:23:18:24
chr16	1394507	.	A	C	1319.39	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.735;QD=62.089;RBI=0.0418589;REFB=0;REVB=0.0235565;RO=0;SAF=43;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.11157e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.27617e-05;OID=.;OPOS=1394507;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:77:85:0:0:77:85:1:34:43:0:0:41:44:0:0
chr16	1397815	.	C	T	44.66	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.00802862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.03;QD=7.44254;RBI=0.0115361;REFB=-0.0169575;REVB=-0.00828387;RO=17;SAF=6;SAR=1;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172632;STB=0.611882;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0605968;OID=.;OPOS=1397815;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:1:6:13:4:1:6:13:4
chr16	1419947	.	A	G	428.99	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0272655;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.651;QD=57.1981;RBI=0.0273734;REFB=0;REVB=0.00242854;RO=0;SAF=10;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.93659e-05;OID=.;OPOS=1419947;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:20:10:0:0:20:10:0:0
chr16	1433766	.	T	C	2140.99	PASS	AF=1;AO=133;DP=135;FAO=136;FDP=136;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101415;FXX=0.00729874;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.92;QD=62.9704;RBI=0.0428075;REFB=0;REVB=0.0415889;RO=0;SAF=88;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.83048e-05;OID=.;OPOS=1433766;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:135:136:0:0:133:136:1:45:88:0:0:48:88:0:0
chr16	1447278	.	A	G	719.57	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0189215;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.843;QD=61.2398;RBI=0.019505;REFB=0.0429052;REVB=0.00473487;RO=1;SAF=18;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164967;STB=0.508768;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.000191546;OID=.;OPOS=1447278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:47:1:1:46:46:0.978723:28:18:0:1:28:18:0:1
chr16	1484392	.	G	C	1153.45	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00657032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2518;QD=60.708;RBI=0.1264;REFB=0;REVB=0.126229;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000648141;OID=.;OPOS=1484392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
chr16	1484473	.	A	G	1172.01	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00436666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.78;QD=60.8835;RBI=0.00958752;REFB=0;REVB=-0.00853539;RO=0;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.27041e-06;OID=.;OPOS=1484473;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:41:36:0:0:41:36:0:0
chr16	1503879	.	T	A	1105.61	PASS	AF=0.60355;AO=101;DP=170;FAO=102;FDP=169;FR=.;FRO=67;FSAF=50;FSAR=52;FSRF=33;FSRR=34;FWDB=-0.0470193;FXX=0.00588201;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2543;QD=26.1683;RBI=0.0641888;REFB=-0.0139435;REVB=-0.0436966;RO=67;SAF=50;SAR=51;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0128376;STB=0.500928;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00785095;OID=.;OPOS=1503879;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:169:67:67:101:102:0.60355:51:50:32:35:52:50:33:34
chr16	1536372	.	G	A	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00307421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=174.07;QD=13.486;RBI=0.0180642;REFB=-0.0349986;REVB=0.0178007;RO=11;SAF=8;SAR=1;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.447363;STB=0.77345;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0345769;OID=.;OPOS=1536372;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:1:8:6:5:1:8:6:5
chr16	1536535	.	C	T	143.87	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00768387;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4667;QD=15.1439;RBI=0.0131156;REFB=-0.00241187;REVB=0.010629;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384175;STB=0.509987;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.00379483;OID=.;OPOS=1536535;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:22:16:16:0.421053:9:7:10:11:9:7:10:12
chr16	1537454	.	CT	C,CC	49.07	PASS	AF=0.21875,0.03125;AO=5,2;DP=33;FAO=7,1;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=3,1;FSAR=4,0;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.010845,0.0208193;FXX=0.0302939;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=208.465,213.702;QD=6.13321;RBI=0.0108666,0.0208767;REFB=-0.00733242,-0.00675621;REVB=-0.000683919,-0.00154746;RO=21;SAF=2,1;SAR=3,1;SRF=8;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0232415,0.116694;STB=0.523297,0.990558;STBP=0.949,0.264;TYPE=del,snp;VARB=0.0479428,0.0560236;OID=.,.;OPOS=1537455,1537455;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.21875,0.03125:5,2:33:7,1:32:24:3,1:4,0:11:13:38:21:2,1:3,1:8:13
chr16	1537839	.	G	A	240.5	PASS	AF=0.367089;AO=29;DP=79;FAO=29;FDP=79;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=34;FSRR=16;FWDB=0.0209256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.233;QD=12.1772;RBI=0.0279721;REFB=-0.00389974;REVB=0.0185624;RO=50;SAF=15;SAR=14;SRF=34;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18158;STB=0.603805;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.0196619;OID=.;OPOS=1537839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:50:50:29:29:0.367089:14:15:34:16:14:15:34:16
chr16	1537872	.	C	G	490.97	PASS	AF=0.5;AO=51;DP=102;FAO=51;FDP=102;FR=.;FRO=51;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=0.0129513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.181;QD=19.2537;RBI=0.0130614;REFB=-0.0163304;REVB=0.00169203;RO=50;SAF=35;SAR=16;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668477;STB=0.533291;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.0155841;OID=.;OPOS=1537872;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:50:51:51:51:0.5:16:35:31:19:16:35:32:19
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chr16	1538433	.	A	G	480.96	PASS	AF=0.5;AO=47;DP=94;FAO=47;FDP=94;FR=.;FRO=47;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.0292286;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.2253;QD=20.4663;RBI=0.0300853;REFB=-0.0134986;REVB=-0.00712818;RO=47;SAF=31;SAR=16;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.252741;STB=0.640141;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0201081;OID=.;OPOS=1538433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:47:47:47:47:0.5:16:31:18:29:16:31:18:29
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chr16	1573890	.	G	A	506.15	PASS	AF=0.5;AO=53;DP=106;FAO=53;FDP=106;FR=.;FRO=53;FSAF=34;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=17;FWDB=0.0190279;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.061;QD=19.1;RBI=0.0566983;REFB=-0.0323078;REVB=0.0534101;RO=52;SAF=34;SAR=19;SRF=35;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0310797;STB=0.520744;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.02818;OID=.;OPOS=1573890;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:52:53:53:53:0.5:19:34:35:17:19:34:36:17
chr16	1574863	.	G	A	366.17	PASS	AF=0.433333;AO=39;DP=90;FAO=39;FDP=90;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=0.0523346;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.3869;QD=16.2743;RBI=0.0530286;REFB=-0.0122804;REVB=-0.00855098;RO=51;SAF=21;SAR=18;SRF=34;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131806;STB=0.573876;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.0134487;OID=.;OPOS=1574863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:51:51:39:39:0.433333:18:21:34:17:18:21:34:17
chr16	1591962	.	G	A	573.95	PASS	AF=0.423841;AO=64;DP=151;FAO=64;FDP=151;FR=.;FRO=87;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=54;FSRR=33;FWDB=-0.0138946;FXX=0.00657851;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.709;QD=15.2039;RBI=0.0139001;REFB=-0.0210654;REVB=-0.000389717;RO=87;SAF=32;SAR=32;SRF=54;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12443;STB=0.569515;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.0230032;OID=.;OPOS=1591962;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:87:87:64:64:0.423841:32:32:54:33:32:32:54:33
chr16	1608082	.	A	G	462.39	PASS	AF=0.471698;AO=48;DP=106;FAO=50;FDP=106;FR=.;FRO=56;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=32;FSRR=24;FWDB=-0.023428;FXX=0.0185168;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.906;QD=17.4488;RBI=0.033768;REFB=-0.0166773;REVB=0.0243188;RO=56;SAF=23;SAR=25;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123236;STB=0.548174;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.0192466;OID=.;OPOS=1608082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:56:56:48:50:0.471698:25:23:34:22:26:24:32:24
chr16	1614097	.	A	G	652.97	PASS	AF=0.5;AO=64;DP=133;FAO=66;FDP=132;FR=.;FRO=66;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=23;FWDB=-0.0617651;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.576;QD=19.7869;RBI=0.0617699;REFB=-0.00167569;REVB=-0.000771828;RO=65;SAF=35;SAR=29;SRF=43;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106977;STB=0.561263;STBP=0.185;TYPE=snp;VARB=0.00136607;OID=.;OPOS=1614097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:132:65:66:64:66:0.5:29:35:43:22:31:35:43:23
chr16	1814440	.	A	G	105.81	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=-0.0284418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.541;QD=11.4393;RBI=0.0322512;REFB=-0.0222719;REVB=-0.0152054;RO=22;SAF=8;SAR=5;SRF=18;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248098;STB=0.627733;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0581476;OID=.;OPOS=1814440;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:24:13:13:0.351351:5:8:18:4:5:8:19:5
chr16	1818503	.	G	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259303;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.384;QD=52.6124;RBI=0.0521187;REFB=0;REVB=0.0452104;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0006555;OID=.;OPOS=1818503;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr16	1820992	.	T	A	393.69	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00329575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.651;QD=56.2416;RBI=0.0442036;REFB=0;REVB=0.0440806;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.78967e-05;OID=.;OPOS=1820992;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:28:0:0:26:28:1:8:18:0:0:10:18:0:0
chr16	1827836	.	T	C	356.02	PASS	AF=0.638298;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=47;FR=.;FRO=17;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.0026748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.041;QD=30.2993;RBI=0.0208518;REFB=-0.0242274;REVB=0.0206795;RO=17;SAF=17;SAR=13;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145047;STB=0.507954;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0192938;OID=.;OPOS=1827836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:17:17:30:30:0.638298:13:17:10:7:13:17:10:7
chr16	1836796	.	C	A	311.65	PASS	AF=0.443038;AO=30;DP=80;FAO=35;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=44;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.019054;FXX=0.0246883;HRUN=5;LEN=1;MLLD=110.317;QD=15.7797;RBI=0.0199704;REFB=-0.0215518;REVB=0.00597991;RO=31;SAF=16;SAR=14;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137482;STB=0.539963;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.0186908;OID=.;OPOS=1836796;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:79:31:44:30:35:0.443038:14:16:17:14:16:19:27:17
chr16	1838640	.	T	C	1081.98	PASS	AF=0.539267;AO=97;DP=188;FAO=103;FDP=191;FR=.;FRO=88;FSAF=64;FSAR=39;FSRF=51;FSRR=37;FWDB=0.00759204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.676;QD=22.6592;RBI=0.00959202;REFB=-0.0163733;REVB=-0.00586241;RO=86;SAF=61;SAR=36;SRF=51;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0326525;STB=0.520266;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0147012;OID=.;OPOS=1838640;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:188:191:86:88:97:103:0.539267:36:61:51:35:39:64:51:37
chr16	1842209	.	A	G	205.03	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=-0.00859276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.161;QD=16.4027;RBI=0.126162;REFB=-0.0134922;REVB=-0.125869;RO=27;SAF=10;SAR=11;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.142763;STB=0.576852;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.016359;OID=.;OPOS=1842209;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:29:21:21:0.42:11:10:9:18:11:10:10:19
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chr16	2048826	.	C	G	135.04	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.00486414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.539;QD=16.8805;RBI=0.0183792;REFB=-0.0114737;REVB=0.0177239;RO=17;SAF=1;SAR=14;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.612181;STB=0.863579;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0125445;OID=.;OPOS=2048826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:14:1:9:8:14:1:9:8
chr16	2049640	.	A	G	337.93	PASS	AF=0.576271;AO=34;DP=59;FAO=34;FDP=59;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.0110726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.7369;QD=22.9107;RBI=0.0828819;REFB=0.0191773;REVB=-0.082139;RO=24;SAF=19;SAR=15;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758153;STB=0.533581;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=-0.0126533;OID=.;OPOS=2049640;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:25:34:34:0.576271:15:19:11:13:15:19:12:13
chr16	2070568	.	A	C	235.15	PASS	AF=0.313725;AO=30;DP=96;FAO=32;FDP=102;FR=.;FRO=70;FSAF=6;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=44;FWDB=-0.128109;FXX=0.0097078;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.6787;QD=9.22148;RBI=0.129575;REFB=-0.0210398;REVB=-0.0194314;RO=64;SAF=5;SAR=25;SRF=20;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242094;STB=0.664421;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0280587;OID=.;OPOS=2070568;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:102:64:70:30:32:0.313725:25:5:20:44:26:6:26:44
chr16	2159321	.	G	A	76.68	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0119749;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2982;QD=12.78;RBI=0.0362809;REFB=-0.0344589;REVB=0.0342477;RO=14;SAF=2;SAR=8;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215705;STB=0.512794;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.053339;OID=.;OPOS=2159321;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:8:2:3:11:8:2:3:11
chr16	2160494	.	C	T	278.97	PASS	AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0350169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.414;QD=27.2167;RBI=0.0357752;REFB=-0.0101369;REVB=0.0073267;RO=16;SAF=11;SAR=14;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0468602;STB=0.525876;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00804126;OID=.;OPOS=2160494;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:14:11:6:10:14:11:6:10
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chr16	2259639	.	G	C,GC	36.69	PASS	AF=0,0.205128;AO=3,7;DP=40;FAO=0,8;FDP=39;FR=.;FRO=31;FSAF=0,1;FSAR=0,7;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0613959,-0.0852959;FXX=0.0249938;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=36.0002,19.5437;QD=3.76319;RBI=0.0986081,0.086351;REFB=-0.0360191,-0.0517889;REVB=-0.0771628,-0.0134574;RO=30;SAF=2,0;SAR=1,7;SRF=18;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0731887,-0.734033;STB=0.5,0.879571;STBP=1,0.025;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.147769;OID=.,.;OPOS=2259639,2259640;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:37:40:39:30:31:3,7:0,8:0,0.205128:1,7:2,0:18:12:0,7:0,1:19:12
chr16	2263507	.	C	T	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.00582594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.949;QD=13.486;RBI=0.0343336;REFB=0.000806313;REVB=-0.0338357;RO=11;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.33333;STB=0.69952;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=-0.001495;OID=.;OPOS=2263507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:7:2:6:5:7:2:6:5
chr16	2303353	.	T	C	32.5	PASS	AF=0.625;AO=3;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.012112;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.137;QD=16.2504;RBI=0.090742;REFB=-0.0314061;REVB=0.08993;RO=3;SAF=1;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255936;STB=0.704971;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0523644;OID=.;OPOS=2303353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:3:5:0.625:2:1:2:1:4:1:2:1
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chr16	2367336	.	G	A	76.59	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=23;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=13;FWDB=0.103866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.447;QD=12.2536;RBI=0.110574;REFB=-0.00864771;REVB=-0.0379268;RO=14;SAF=7;SAR=1;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.690488;STB=0.918953;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0256326;OID=.;OPOS=2367336;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:23:25:14:15:8:10:0.4:1:7:2:12:1:9:2:13
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chr16	2822036	.	C	T	106.86	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=0.00740933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.641;QD=12.2124;RBI=0.010911;REFB=-0.015017;REVB=-0.00800952;RO=19;SAF=10;SAR=3;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295049;STB=0.571312;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0173208;OID=.;OPOS=2822036;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:22:13:13:0.371429:3:10:15:4:3:10:15:7
chr16	2871555	.	G	A	700.02	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341687;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.705;QD=62.224;RBI=0.0665659;REFB=0;REVB=0.0571272;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00030838;OID=.;OPOS=2871555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:16:28:0:0:17:28:0:0
chr16	2980603	.	GC	G	38.98	PASS	AF=0.263158;AO=9;DP=39;FAO=10;FDP=38;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0820068;FXX=0.0256345;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.7284;QD=4.10269;RBI=0.103814;REFB=-0.0104296;REVB=0.0636572;RO=28;SAF=8;SAR=1;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.599077;STB=0.889298;STBP=0.012;TYPE=del;VARB=0.00796182;OID=.;OPOS=2980604;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.263158:9:39:10:38:28:9:1:11:17:38:28:8:1:11:17
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chr16	2986840	.	G	C	63.69	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.0475966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.736;QD=9.0992;RBI=0.047645;REFB=-0.0510857;REVB=0.00214801;RO=19;SAF=3;SAR=6;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.524017;STB=0.807976;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0310422;OID=.;OPOS=2986840;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:19:19:9:9:0.321429:6:3:16:3:6:3:16:3
chr16	3017852	.	G	A	359.52	PASS	AF=0.513889;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=72;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=11;FWDB=0.0164466;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=203.407;QD=19.9735;RBI=0.0256553;REFB=-0.0136841;REVB=-0.0196902;RO=34;SAF=26;SAR=11;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00329138;STB=0.509799;STBP=0.904;TYPE=snp;VARB=0.0130085;OID=.;OPOS=3017852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:34:35:37:37:0.513889:11:26:24:10:11:26:24:11
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chr16	3207446	.	G	A	1044.38	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247562;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.868;QD=59.679;RBI=0.0276984;REFB=0;REVB=0.0124231;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.94079e-05;OID=.;OPOS=3207446;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:29:41:0:0:29:41:0:0
chr16	3208911	.	G	A	54.42	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244322;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.477;QD=36.2816;RBI=0.0256104;REFB=0;REVB=-0.00767876;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000673006;OID=.;OPOS=3208911;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr16	3208914	.	T	C	33.6	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0598003;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.941;QD=19.2018;RBI=0.0651033;REFB=-0.0113297;REVB=0.0257364;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121807;STB=0.62455;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00344481;OID=.;OPOS=3208914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:1:2:5:5:0.714286:2:3:1:0:2:3:2:0
chr16	3230588	.	G	A	289.59	PASS	AF=1;AO=20;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.434;QD=52.6527;RBI=0.0258926;REFB=0;REVB=0.00470998;RO=2;SAF=11;SAR=9;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00843034;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.91086e-05;OID=.;OPOS=3230588;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:2:0:20:22:1:9:11:1:1:10:12:0:0
chr16	3254470	.	T	C	885.35	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.068407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.3566;QD=58.0559;RBI=0.0951211;REFB=0;REVB=-0.0660947;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.0579e-05;OID=.;OPOS=3254470;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0
chr16	3254972	.	T	C	785.12	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.228;QD=57.0999;RBI=0.0245341;REFB=0;REVB=-0.00422558;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.88897e-05;OID=.;OPOS=3254972;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:37:18:0:0:37:18:0:0
chr16	3266071	.	A	G	631.96	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035944;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3951;QD=61.6549;RBI=0.0383719;REFB=0;REVB=0.0134324;RO=0;SAF=29;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000634007;OID=.;OPOS=3266071;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:12:29:0:0:12:29:0:0
chr16	3293888	.	C	T	135.08	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=0.000734556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.725;QD=16.8844;RBI=0.0482283;REFB=-0.0104442;REVB=0.0482227;RO=17;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0512395;STB=0.529373;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.00948147;OID=.;OPOS=3293888;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:7:8:10:7:7:8:10:7
chr16	3293922	.	A	T	153.18	PASS	AF=0.358491;AO=14;DP=52;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0547633;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=43.9695;QD=11.5604;RBI=0.0652288;REFB=-0.0179104;REVB=0.035437;RO=22;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198983;STB=0.665043;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.035153;OID=.;OPOS=3293922;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:22:34:14:19:0.358491:5:9:10:12:5:14:17:17
chr16	3297073	.	A	G	91.86	PASS	AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0487913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.772;QD=8.74843;RBI=0.0537665;REFB=-0.0100204;REVB=-0.0225886;RO=30;SAF=8;SAR=4;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272085;STB=0.666389;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0355838;OID=.;OPOS=3297073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:42:42:30:30:12:12:0.285714:4:8:13:17:4:8:13:17
chr16	3297175	.	T	C	526.66	PASS	AF=0.569767;AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0315559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.6129;QD=24.4959;RBI=0.0331225;REFB=0.0124917;REVB=0.010066;RO=37;SAF=32;SAR=17;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158398;STB=0.586974;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=-0.00991467;OID=.;OPOS=3297175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:37:37:49:49:0.569767:17:32:17:20:17:32:17:20
chr16	3297181	.	C	T	543.4	PASS	AF=0.581395;AO=50;DP=86;FAO=50;FDP=86;FR=.;FRO=36;FSAF=33;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0182848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7501;QD=25.2745;RBI=0.0349942;REFB=0.0147633;REVB=0.0298372;RO=36;SAF=33;SAR=17;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151196;STB=0.58289;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=-0.00834348;OID=.;OPOS=3297181;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:36:36:50:50:0.581395:17:33:17:19:17:33:17:19
chr16	3299749	.	G	A	345.47	PASS	AF=0.408602;AO=36;DP=91;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=-0.000100383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.123;QD=14.859;RBI=0.0131356;REFB=-0.00856278;REVB=0.0131352;RO=55;SAF=19;SAR=17;SRF=36;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13684;STB=0.561708;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.00652746;OID=.;OPOS=3299749;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:93:55:55:36:38:0.408602:17:19:36:19:17:21:36:19
chr16	3405994	.	A	G	1216.02	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.973;QD=60.8012;RBI=0.0228384;REFB=0;REVB=0.0164959;RO=0;SAF=51;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123429;OID=.;OPOS=3405994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:78:80:1:27:51:0:0:28:52:0:0
chr16	3406387	.	C	G	719.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0605394;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.1821;QD=51.3743;RBI=0.0998386;REFB=0;REVB=-0.0793897;RO=0;SAF=37;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000255301;OID=.;OPOS=3406387;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:41:56:1:4:37:0:0:16:40:0:0
chr16	3419934	.	G	T	717.92	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.876;QD=62.4275;RBI=0.0303279;REFB=0;REVB=0.000638962;RO=0;SAF=22;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000110533;OID=.;OPOS=3419934;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:22:22:0:0:23:23:0:0
chr16	3422279	.	C	A	78.15	PASS	AF=0.47619;AO=8;DP=19;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0269517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.213;QD=14.8852;RBI=0.0281159;REFB=-0.0604177;REVB=0.00800692;RO=11;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043798;STB=0.523762;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0457842;OID=.;OPOS=3422279;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:19:21:11:11:8:10:0.47619:4:4:5:6:5:5:5:6
chr16	3452193	.	T	C,G	884.88	PASS	AF=0.0483871,0.951613;AO=3,59;DP=62;FAO=3,59;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=0,29;FSAR=3,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00237589,0.0149919;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=172.217,63.1525;QD=57.0893;RBI=0.00513071,0.0233599;REFB=0,0;REVB=0.00454746,0.0179144;RO=0;SAF=0,29;SAR=3,30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.164407,-0.00196644;OID=.,.;OPOS=3452193,3452193;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:62:62:0:0:3,59:3,59:0.0483871,0.951613:3,30:0,29:0:0:3,30:0,29:0:0
chr16	3486285	.	C	A	365.26	PASS	AF=0.354331;AO=44;DP=118;FAO=45;FDP=127;FR=.;FRO=82;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=48;FWDB=-0.0233557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.385;QD=11.5042;RBI=0.0438524;REFB=-0.0133569;REVB=-0.0371153;RO=72;SAF=29;SAR=15;SRF=34;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209011;STB=0.647979;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0251791;OID=.;OPOS=3486285;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:127:72:82:44:45:0.354331:15:29:34:38:16:29:34:48
chr16	3490922	.	G	C	73.83	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=15;FWDB=-0.0930205;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7721;QD=9.84349;RBI=0.100889;REFB=0.00176785;REVB=-0.0390618;RO=19;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260924;STB=0.66637;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=-0.0112729;OID=.;OPOS=3490922;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:19:20:10:10:0.333333:5:5:5:14:5:5:5:15
chr16	3533577	.	C	G	1152.42	PASS	AF=1;AO=49;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125371;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.0631;QD=59.8658;RBI=0.256784;REFB=0;REVB=0.224099;RO=1;SAF=21;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0165122;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0043001;OID=.;OPOS=3533577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:1:0:49:77:1:28:21:0:1:44:33:0:0
chr16	3535116	.	T	C	2027.16	PASS	AF=1;AO=130;DP=130;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0530871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2268;QD=62.3743;RBI=0.0536981;REFB=0;REVB=-0.00807745;RO=0;SAF=75;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148855;OID=.;OPOS=3535116;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:130:130:0:0:130:130:1:55:75:0:0:55:75:0:0
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chr16	3536872	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0070565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.207;QD=45.8064;RBI=0.0162758;REFB=0;REVB=0.0146666;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000351419;OID=.;OPOS=3536872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr16	3558381	.	T	C	163.76	PASS	AF=0.367347;AO=18;DP=49;FAO=18;FDP=49;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=1;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.00779978;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.4;QD=13.3679;RBI=0.047386;REFB=-0.00958789;REVB=-0.0467397;RO=31;SAF=17;SAR=1;SRF=23;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.475915;STB=0.7923;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0249093;OID=.;OPOS=3558381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:31:31:18:18:0.367347:1:17:23:8:1:17:23:8
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chr16	3583173	.	C	T	275.1	PASS	AF=0.43662;AO=31;DP=71;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.0238996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.754;QD=15.4986;RBI=0.0244239;REFB=-0.02725;REVB=-0.00503337;RO=40;SAF=17;SAR=14;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732603;STB=0.541375;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.0307764;OID=.;OPOS=3583173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:40:40:31:31:0.43662:14:17:19:21:14:17:19:21
chr16	3613150	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.473;QD=44.6898;RBI=0.0165638;REFB=0;REVB=0.00327456;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.34227e-05;OID=.;OPOS=3613150;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr16	3639139	.	A	G	2319.24	PASS	AF=1;AO=145;DP=145;FAO=145;FDP=145;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=77;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00697025;FXX=0.0136045;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.509;QD=63.9791;RBI=0.00707906;REFB=0;REVB=-0.00123642;RO=0;SAF=68;SAR=77;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.02491e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32778e-06;OID=.;OPOS=3639139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:145:145:0:0:145:145:1:77:68:0:0:77:68:0:0
chr16	3639827	.	G	A	321.4	PASS	AF=0.622222;AO=27;DP=45;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.111528;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.1504;QD=28.5689;RBI=0.113503;REFB=-0.0246478;REVB=0.0210794;RO=17;SAF=5;SAR=22;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308996;STB=0.623385;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0134304;OID=.;OPOS=3639827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:17:17:27:28:0.622222:22:5:9:8:22:6:8:9
chr16	3656482	.	C	T	160.39	PASS	AF=0.33871;AO=20;DP=61;FAO=21;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.0375073;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=151.306;QD=10.3477;RBI=0.0375954;REFB=-0.0233362;REVB=0.00257137;RO=32;SAF=8;SAR=12;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23617;STB=0.633361;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0389474;OID=.;OPOS=3656482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:32:41:20:21:0.33871:12:8:20:12:12:9:26:15
chr16	3707747	.	G	A	542.0	PASS	AF=0.53125;AO=50;DP=96;FAO=51;FDP=96;FR=.;FRO=45;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.0887347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.695;QD=22.5832;RBI=0.0937929;REFB=-0.0139535;REVB=0.0303851;RO=45;SAF=33;SAR=17;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135363;STB=0.566983;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0098068;OID=.;OPOS=3707747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:45:45:50:51:0.53125:17:33:23:22:18:33:23:22
chr16	3795292	.	G	T	64.46	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.026784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.118;QD=9.9164;RBI=0.0271514;REFB=-0.00154501;REVB=-0.0044513;RO=17;SAF=4;SAR=5;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912882;STB=0.555432;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.00383273;OID=.;OPOS=3795292;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:5:4:9:8:5:4:9:8
chr16	3795363	.	G	A	96.19	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0470201;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.537;QD=12.0241;RBI=0.0632119;REFB=-0.0143855;REVB=-0.0422475;RO=20;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0322295;OID=.;OPOS=3795363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:6:6:10:10:6:6:10:10
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chr16	4015316	.	A	G	708.19	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00110362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.38;QD=62.9502;RBI=0.0239646;REFB=0;REVB=-0.0239392;RO=1;SAF=22;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208755;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000333528;OID=.;OPOS=4015316;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:1:0:44:45:1:22:22:1:0:22:23:0:0
chr16	4016676	.	A	G	1513.53	PASS	AF=1;AO=100;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.796;QD=59.354;RBI=0.0126998;REFB=0;REVB=0.00498727;RO=0;SAF=66;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.66358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153009;OID=.;OPOS=4016676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:100:102:1:34:66:0:0:36:66:0:0
chr16	4027605	.	C	T	321.73	PASS	AF=0.592593;AO=32;DP=54;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.040208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0882;QD=23.8321;RBI=0.0739815;REFB=0.00130377;REVB=0.0621014;RO=22;SAF=21;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0525141;STB=0.528949;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.000336585;OID=.;OPOS=4027605;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:22:22:32:32:0.592593:11:21:13:9:11:21:13:9
chr16	4033436	.	T	C	84.72	PASS	AF=0.588235;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=17;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00984912;FXX=0.0555247;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.756;QD=19.933;RBI=0.010779;REFB=-0.0155155;REVB=-0.00437981;RO=7;SAF=4;SAR=6;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222514;STB=0.627655;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00692925;OID=.;OPOS=4033436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:18:17:7:7:10:10:0.588235:6:4:5:2:6:4:5:2
chr16	4164364	.	C	T	650.78	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8058;QD=61.9791;RBI=0.027803;REFB=0;REVB=0.00746904;RO=0;SAF=24;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000500052;OID=.;OPOS=4164364;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:18:24:0:0:18:24:0:0
chr16	4165432	.	T	C,G	504.22	PASS	AF=0.971429,0.0285714;AO=31,3;DP=34;FAO=34,1;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=21,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340316,0.0113929;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=77.8964,135.373;QD=57.625;RBI=0.0705794,0.0114217;REFB=0,0;REVB=0.0618328,-0.000811145;RO=0;SAF=12,1;SAR=19,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.47712e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00700309,0.161544;OID=.,.;OPOS=4165432,4165432;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:34:35:0:0:31,3:34,1:0.971429,0.0285714:19,2:12,1:0:0:21,1:13,0:0:0
chr16	4242093	.	C	T	246.31	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=0.0636672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.728;QD=15.8911;RBI=0.0897826;REFB=-0.0330935;REVB=-0.063304;RO=33;SAF=16;SAR=12;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643713;STB=0.526048;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0359132;OID=.;OPOS=4242093;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:34:28:28:0.451613:12:16:21:12:12:16:21:13
chr16	4245693	.	A	G	546.41	PASS	AF=0.542553;AO=51;DP=94;FAO=51;FDP=94;FR=.;FRO=43;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.0103304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=209.84;QD=23.2514;RBI=0.034268;REFB=-0.0250646;REVB=0.0326738;RO=42;SAF=29;SAR=22;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628586;STB=0.538876;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.0187671;OID=.;OPOS=4245693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:42:43:51:51:0.542553:22:29:27:15:22:29:28:15
chr16	4257131	.	C	G	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0703902;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.511;QD=16.199;RBI=0.100868;REFB=-0.0376834;REVB=0.0722466;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.496916;STB=0.798796;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0158287;OID=.;OPOS=4257131;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:4:1:3:0:4:1:3:0
chr16	4257281	.	A	C	88.21	PASS	AF=1;AO=6;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0773488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2319;QD=39.2049;RBI=0.0776656;REFB=0;REVB=0.00700793;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0043754;OID=.;OPOS=4257281;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:6:9:1:4:2:0:0:5:4:0:0
chr16	4257286	.	T	C	95.33	PASS	AF=0.909091;AO=10;DP=11;FAO=10;FDP=11;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0316439;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=271.43;QD=34.6655;RBI=0.0326716;REFB=0.00345114;REVB=0.00812997;RO=1;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0990155;STB=0.555443;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=-0.000374655;OID=.;OPOS=4257286;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:11:11:1:1:10:10:0.909091:4:6:0:1:4:6:0:1
chr16	4257686	.	A	G	77.51	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.0108927;FXX=0.0999667;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.3;QD=11.4834;RBI=0.0218857;REFB=-0.0215197;REVB=-0.0189825;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.03914;STB=0.538383;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0346539;OID=.;OPOS=4257686;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:30:27:15:17:10:10:0.37037:3:7:10:5:3:7:11:6
chr16	4257729	.	C	T	64.45	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=26;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0223435;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.03;QD=9.91523;RBI=0.0287839;REFB=-0.0117865;REVB=-0.0181461;RO=17;SAF=5;SAR=4;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283174;STB=0.517203;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0587314;OID=.;OPOS=4257729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:26:26:17:17:9:9:0.346154:4:5:9:8:4:5:9:8
chr16	4258005	.	C	G	77.52	PASS	AF=0.434783;AO=9;DP=22;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=11;FWDB=0.0291157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.013;QD=13.4815;RBI=0.0292273;REFB=-0.0191887;REVB=-0.00255187;RO=13;SAF=5;SAR=4;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.392213;STB=0.737298;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0192648;OID=.;OPOS=4258005;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:23:13:13:9:10:0.434783:4:5:2:11:4:6:2:11
chr16	4307646	.	A	G	317.72	PASS	AF=0.426829;AO=33;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=27;FWDB=0.0245272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7688;QD=15.4987;RBI=0.102996;REFB=-0.0225127;REVB=0.100033;RO=49;SAF=20;SAR=13;SRF=21;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186489;STB=0.599943;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0330249;OID=.;OPOS=4307646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:49:47:33:35:0.426829:13:20:21:28:14:21:20:27
chr16	4310468	.	C	G	2206.81	PASS	AF=0.993197;AO=135;DP=138;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=85;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0539477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.147;QD=60.0493;RBI=0.0618289;REFB=-0.14634;REVB=0.0302067;RO=2;SAF=76;SAR=59;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00177492;STB=0.504065;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.00163904;OID=.;OPOS=4310468;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:138:147:2:1:135:146:0.993197:59:76:1:1:61:85:0:1
chr16	4386814	.	T	C	1438.34	PASS	AF=0.989247;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00491494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.33;QD=61.8641;RBI=0.0194332;REFB=-0.0129991;REVB=0.0188014;RO=1;SAF=57;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.013351;STB=0.507041;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.000147899;OID=.;OPOS=4386814;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:93:1:1:92:92:0.989247:35:57:0:1:35:57:0:1
chr16	4414987	.	G	A	340.72	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.631;QD=54.5149;RBI=0.0363226;REFB=0;REVB=0.0237218;RO=0;SAF=19;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169684;OID=.;OPOS=4414987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:6:19:0:0:6:19:0:0
chr16	4431202	.	A	G	2348.12	PASS	AF=1;AO=149;DP=150;FAO=155;FDP=155;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0859638;FXX=0.00640985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.143;QD=60.5967;RBI=0.0863076;REFB=0;REVB=0.0076958;RO=1;SAF=83;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00569637;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186793;OID=.;OPOS=4431202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:155:1:0:149:155:1:66:83:1:0:66:89:0:0
chr16	4432029	.	A	C	538.42	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.084;QD=59.8244;RBI=0.0260049;REFB=0;REVB=0.00678448;RO=0;SAF=6;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50008e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.6494e-05;OID=.;OPOS=4432029;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:30:6:0:0:30:6:0:0
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chr16	4476089	.	T	C	401.3	PASS	AF=0.482353;AO=40;DP=84;FAO=41;FDP=85;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=26;FWDB=0.014362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.37;QD=18.8847;RBI=0.0156505;REFB=-0.0227897;REVB=0.00621858;RO=43;SAF=18;SAR=22;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516635;STB=0.528376;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0195255;OID=.;OPOS=4476089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:43:44:40:41:0.482353:22:18:17:26:22:19:18:26
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chr16	4625938	.	A	T	39.04	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00299814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.723;QD=12.0114;RBI=0.0966124;REFB=-0.00224949;REVB=0.0965659;RO=7;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.505451;STB=0.809724;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0128501;OID=.;OPOS=4625938;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:5:1:5:2:5:1:5:2
chr16	4707252	.	G	A	178.84	PASS	AF=0.387755;AO=19;DP=50;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0231278;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7486;QD=14.5994;RBI=0.0233632;REFB=-0.0114728;REVB=-0.0033079;RO=29;SAF=5;SAR=14;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.252413;STB=0.658647;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0317448;OID=.;OPOS=4707252;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:29:30:19:19:0.387755:14:5:14:15:14:5:15:15
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chr16	4709131	.	C	A	181.31	PASS	AF=0.772727;AO=17;DP=22;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.0240383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7595;QD=32.9653;RBI=0.0301175;REFB=-0.00278832;REVB=-0.0181445;RO=5;SAF=9;SAR=8;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135111;STB=0.574382;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=-0.000468702;OID=.;OPOS=4709131;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:22:22:5:5:17:17:0.772727:8:9:1:4:8:9:1:4
chr16	4721468	.	T	C	251.08	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.013765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.272;QD=19.6922;RBI=0.0501073;REFB=0.00264928;REVB=0.0481795;RO=25;SAF=9;SAR=17;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290716;STB=0.662544;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.00595498;OID=.;OPOS=4721468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:25:25:26:26:0.509804:17:9:17:8:17:9:17:8
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chr16	4748825	.	C	T	126.7	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=0.0612099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8333;QD=12.6701;RBI=0.0614363;REFB=-0.0193418;REVB=-0.00526958;RO=25;SAF=6;SAR=9;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0910528;STB=0.553123;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0476789;OID=.;OPOS=4748825;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:9:6:8:17:9:6:8:17
chr16	4752134	.	A	G	253.12	PASS	AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0145751;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.965;QD=15.1113;RBI=0.0452325;REFB=-0.0158748;REVB=-0.04282;RO=38;SAF=20;SAR=9;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0943582;STB=0.553595;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=0.0212369;OID=.;OPOS=4752134;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:9:20:23:15:9:20:23:15
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chr16	4815608	.	A	G	575.76	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0247888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.4899;QD=60.6067;RBI=0.0818807;REFB=0;REVB=-0.0780382;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000299781;OID=.;OPOS=4815608;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:12:26:0:0:12:26:0:0
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chr16	4837545	.	A	G	210.61	PASS	AF=0.477273;AO=20;DP=43;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.0228424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.414;QD=19.1465;RBI=0.0323194;REFB=-0.0338406;REVB=0.0228641;RO=21;SAF=12;SAR=8;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238229;STB=0.636817;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0255235;OID=.;OPOS=4837545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:21:23:20:21:0.477273:8:12:7:14:9:12:7:16
chr16	4846068	.	T	C	353.54	PASS	AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00849429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.057;QD=23.9691;RBI=0.0335317;REFB=-0.0181583;REVB=0.032438;RO=23;SAF=21;SAR=14;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732561;STB=0.546737;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.0129894;OID=.;OPOS=4846068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:23:24:35:35:0.59322:14:21:16:7:14:21:17:7
chr16	4847524	.	T	C	97.27	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=43;FAO=12;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=0.0396388;FXX=0.0731529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.271;QD=10.2385;RBI=0.0541582;REFB=-0.0115335;REVB=0.0369035;RO=21;SAF=6;SAR=6;SRF=1;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.510784;STB=0.631375;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0268177;OID=.;OPOS=4847524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:43:38:21:26:12:12:0.315789:6:6:1:20:6:6:8:18
chr16	4855279	.	A	G	124.88	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00641872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.667;QD=17.8399;RBI=0.00891719;REFB=-0.0120495;REVB=0.00619002;RO=14;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0732887;STB=0.542107;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0109023;OID=.;OPOS=4855279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:4:10:9:5:4:10:9:5
chr16	4861709	.	G	C	902.7	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.311;QD=58.2387;RBI=0.0327476;REFB=0;REVB=0.0298154;RO=0;SAF=34;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82325e-05;OID=.;OPOS=4861709;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:28:34:0:0:28:34:0:0
chr16	4923091	.	G	A	465.78	PASS	AF=0.422764;AO=52;DP=120;FAO=52;FDP=123;FR=.;FRO=71;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=46;FSRR=25;FWDB=-0.0180047;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=227.733;QD=15.1474;RBI=0.0180268;REFB=-0.0164614;REVB=-0.000893003;RO=67;SAF=30;SAR=22;SRF=44;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835767;STB=0.542489;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0222852;OID=.;OPOS=4923091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:123:67:71:52:52:0.422764:22:30:44:23:22:30:46:25
chr16	4930100	.	C	T	600.02	PASS	AF=0.580645;AO=51;DP=92;FAO=54;FDP=93;FR=.;FRO=39;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0299055;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.5764;QD=25.8072;RBI=0.0357178;REFB=0.0139371;REVB=-0.01953;RO=38;SAF=25;SAR=26;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130639;STB=0.559118;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=-0.012747;OID=.;OPOS=4930100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:38:39:51:54:0.580645:26:25:25:13:27:27:25:14
chr16	4933939	.	G	C	97.92	PASS	AF=0.413793;AO=9;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0416503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.416;QD=13.5063;RBI=0.0434907;REFB=-0.0165818;REVB=0.0125175;RO=14;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0163296;STB=0.517213;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0194912;OID=.;OPOS=4933939;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:14:17:9:12:0.413793:5:4:6:8:6:6:8:9
chr16	4934549	.	G	A	71.64	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0570525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.622;QD=19.1049;RBI=0.0720742;REFB=-0.0630492;REVB=-0.044042;RO=6;SAF=8;SAR=1;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.504538;STB=0.799198;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0421896;OID=.;OPOS=4934549;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:1:8:2:4:1:8:2:4
chr16	4934564	.	C	G	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=0.0172451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.116;QD=12.7388;RBI=0.0325146;REFB=-0.0148675;REVB=-0.0275646;RO=9;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.458547;STB=0.788796;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.015837;OID=.;OPOS=4934564;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:9:10:8:8:0.444444:2:6:2:7:2:6:2:8
chr16	4938160	.	T	G	820.18	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00414076;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.545;QD=55.6056;RBI=0.0151461;REFB=-0.0568783;REVB=0.0145691;RO=1;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149748;STB=0.507934;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=2.31613e-05;OID=.;OPOS=4938160;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:31:27:0:1:31:27:0:1
chr16	4940809	.	A	G	2272.92	PASS	AF=1;AO=142;DP=143;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00380553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0137;QD=63.1368;RBI=0.0381261;REFB=0;REVB=-0.0379357;RO=0;SAF=56;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.37449e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.75762e-05;OID=.;OPOS=4940809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:143:144:0:0:142:144:1:86:56:0:0:87:57:0:0
chr16	4942099	.	C	T	277.45	PASS	AF=0.390244;AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=0.0103302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.631;QD=13.5342;RBI=0.0108121;REFB=-0.0055359;REVB=0.00319186;RO=45;SAF=15;SAR=17;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0483207;STB=0.517627;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00764443;OID=.;OPOS=4942099;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:45:50:32:32:0.390244:17:15:19:26:17:15:22:28
chr16	4944518	.	C	G	452.96	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213318;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.609;QD=58.4465;RBI=0.0228184;REFB=0;REVB=-0.00810145;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360789;OID=.;OPOS=4944518;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0
chr16	4945687	.	G	T	706.78	PASS	AF=0.518797;AO=68;DP=133;FAO=69;FDP=133;FR=.;FRO=64;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=0.0175219;FXX=0.00746213;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.721;QD=21.2565;RBI=0.0221575;REFB=-0.0410287;REVB=-0.0135624;RO=64;SAF=36;SAR=32;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0293274;STB=0.512727;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0393293;OID=.;OPOS=4945687;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:64:64:68:69:0.518797:32:36:36:28:32:37:36:28
chr16	5053552	.	T	C	340.36	PASS	AF=0.644444;AO=28;DP=44;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0215139;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.453;QD=30.2545;RBI=0.0217341;REFB=-0.00842582;REVB=-0.00308619;RO=12;SAF=5;SAR=23;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0635943;STB=0.608879;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00587465;OID=.;OPOS=5053552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:12:16:28:29:0.644444:23:5:3:9:23:6:7:9
chr16	5074952	.	C	T	438.59	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.072;QD=56.5918;RBI=0.0331538;REFB=0;REVB=0.0331383;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00175832;OID=.;OPOS=5074952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:15:15:0:0:15:16:0:0
chr16	5075542	.	G	A	1346.94	PASS	AF=0.988889;AO=84;DP=85;FAO=89;FDP=90;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0442694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.032;QD=59.8641;RBI=0.0451773;REFB=-0.11107;REVB=-0.00901175;RO=1;SAF=47;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00997231;STB=0.504761;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.000447831;OID=.;OPOS=5075542;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:85:90:1:1:84:89:0.988889:37:47:1:0:37:52:1:0
chr16	5077985	.	C	T	554.74	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0456271;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.129;QD=55.4741;RBI=0.0658679;REFB=-0.0782423;REVB=0.0475052;RO=2;SAF=5;SAR=33;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0275613;STB=0.514698;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00078615;OID=.;OPOS=5077985;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:2:2:38:38:0.95:33:5:0:2:33:5:0:2
chr16	5132636	.	C	T	275.06	PASS	AF=0.530612;AO=24;DP=47;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.048159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.347;QD=22.4537;RBI=0.0505886;REFB=-0.0331112;REVB=-0.0154895;RO=23;SAF=14;SAR=10;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161976;STB=0.505614;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0337578;OID=.;OPOS=5132636;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:23:23:24:26:0.530612:10:14:13:10:11:15:13:10
chr16	5139186	.	G	C	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0294058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.923;QD=11.0198;RBI=0.0377938;REFB=-0.00868323;REVB=-0.0237418;RO=8;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.373885;STB=0.734403;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=0.0238121;OID=.;OPOS=5139186;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:1:5:4:4:1:5:4:4
chr16	5139217	.	C	G	152.4	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00385573;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=310.821;QD=40.6389;RBI=0.0464507;REFB=-0.0113685;REVB=0.0462904;RO=1;SAF=9;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0478651;STB=0.526279;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=0.000371128;OID=.;OPOS=5139217;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:5:9:1:0:5:9:1:0
chr16	5140561	.	C	T	322.15	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=46;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0102728;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.542;QD=28.0134;RBI=0.0189299;REFB=-0.0156466;REVB=-0.0159;RO=18;SAF=19;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176549;STB=0.59761;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0138617;OID=.;OPOS=5140561;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:18:28:28:0.608696:9:19:8:10:9:19:8:10
chr16	5517197	.	CTT	CTC,CTCT,CT	58.28	PASS	AF=0.75,0,0.25;AO=3,2,2;DP=9;FAO=6,0,2;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2,0,2;FSAR=4,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238296,-0.0235001,-0.0994008;FXX=0.110988;HRUN=12,0,12;LEN=1,1,1;MLLD=114.833,111.231,9.48951;QD=29.1408;RBI=0.169589,0.20956,0.221546;REFB=0,0,0;REVB=0.167906,0.208238,0.197995;RO=0;SAF=2,0,1;SAR=1,2,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,ins,del;VARB=0.0343404,0,-0.170057;OID=.,.,.;OPOS=5517199,5517199,5517198;OREF=T,-,T;OALT=C,C,-;OMAPALT=CTC,CTCT,CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.75,0,0.25:3,2,2:9:6,0,2:8:0:2,0,2:4,0,0:0:0:10:0:2,0,1:1,2,1:0:0
chr16	5649140	.	T	TTAGGAAA	611.6	PASS	AF=1;AO=37;DP=50;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341696;FXX=0.113611;HRUN=1;LEN=7;MLLD=336.718;QD=62.7287;RBI=0.0344512;REFB=0;REVB=-0.00439576;RO=9;SAF=21;SAR=16;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0368563;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=8.38509e-06;OID=.;OPOS=5649141;OREF=-;OALT=TAGGAAA;OMAPALT=TTAGGAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:37:50:39:39:0:23:16:0:0:3:9:21:16:6:3
chr16	6533549	.	C	A	103.51	PASS	AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0151337;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.175;QD=9.85796;RBI=0.0173301;REFB=-0.00320457;REVB=-0.0084443;RO=29;SAF=3;SAR=10;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.475344;STB=0.785287;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.00564599;OID=.;OPOS=6533549;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:29:29:13:13:0.309524:10:3:19:10:10:3:19:10
chr16	6923966	.	A	G	1293.02	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0536533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.2906;QD=61.5722;RBI=0.0898898;REFB=0;REVB=0.0721215;RO=0;SAF=46;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.12122e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000624378;OID=.;OPOS=6923966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:37:46:0:0:38:46:0:0
chr16	7054010	.	A	T	116.23	PASS	AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.00195271;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=161.416;QD=20.2137;RBI=0.0109446;REFB=0.00324418;REVB=-0.010769;RO=10;SAF=8;SAR=5;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.309496;STB=0.675067;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.00229569;OID=.;OPOS=7054010;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:23:23:10:10:13:13:0.565217:5:8:2:8:5:8:2:8
chr16	7054011	.	A	T	64.2	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0219917;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=78.1448;QD=10.7;RBI=0.0219926;REFB=-0.0252455;REVB=-0.000195145;RO=15;SAF=1;SAR=8;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.570485;STB=0.850192;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00271017;OID=.;OPOS=7054011;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:24:24:15:15:9:9:0.375:8:1:9:6:8:1:9:6
chr16	7760884	.	T	G	698.16	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=54;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=21;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0224668;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.781;QD=52.6917;RBI=0.0263944;REFB=-0.055251;REVB=0.0138531;RO=2;SAF=21;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00645825;STB=0.503431;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00025565;OID=.;OPOS=7760884;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:54:53:2:2:51:51:0.962264:30:21:1:1:30:21:1:1
chr16	7761529	.	C	T	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223999;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.597;QD=60.9772;RBI=0.0299116;REFB=0;REVB=0.0198228;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145334;OID=.;OPOS=7761529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
chr16	8722629	.	G	C	81.37	PASS	AF=0.555556;AO=9;DP=17;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.000878869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.598;QD=18.0828;RBI=0.0213179;REFB=-0.00997153;REVB=0.0212998;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.355513;STB=0.681541;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00573305;OID=.;OPOS=8722629;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:18:8:8:9:10:0.555556:3:6:8:0:3:7:8:0
chr16	8728953	.	C	T	1757.03	PASS	AF=0.991453;AO=116;DP=118;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0314714;FXX=0.00847386;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.269;QD=60.0695;RBI=0.0322457;REFB=-0.126152;REVB=0.00702399;RO=0;SAF=63;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14374e-08;STB=0.504672;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.000359087;OID=.;OPOS=8728953;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:118:117:0:1:116:116:0.991453:53:63:0:0:53:63:0:1
chr16	8729124	.	G	A	141.24	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0330311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5293;QD=13.4513;RBI=0.0511794;REFB=0.00573093;REVB=0.0390932;RO=26;SAF=9;SAR=7;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146985;STB=0.585692;STBP=0.413;TYPE=snp;VARB=-0.00929179;OID=.;OPOS=8729124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:7:9:11:15:7:9:11:15
chr16	8736028	.	T	C	1500.08	PASS	AF=0.980952;AO=102;DP=104;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0230078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5757;QD=57.146;RBI=0.0515936;REFB=-0.00325946;REVB=-0.0461794;RO=1;SAF=41;SAR=61;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114312;STB=0.511626;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-9.98429e-05;OID=.;OPOS=8736028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:104:105:1:2:102:103:0.980952:61:41:1:0:61:42:2:0
chr16	8738427	.	T	C	740.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00119302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.827;QD=56.9569;RBI=0.0256089;REFB=0;REVB=0.0255811;RO=0;SAF=36;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.69911e-05;OID=.;OPOS=8738427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:16:36:0:0:16:36:0:0
chr16	8738499	.	G	A	972.72	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.8777;QD=58.9529;RBI=0.0685579;REFB=0;REVB=0.033331;RO=0;SAF=39;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.91393e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000381408;OID=.;OPOS=8738499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:27:39:0:0:27:39:0:0
chr16	8738579	.	A	G	715.79	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0359627;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.711;QD=60.9187;RBI=0.0526109;REFB=-0.168876;REVB=0.0384004;RO=1;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.02089;STB=0.511106;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00101692;OID=.;OPOS=8738579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:47:47:1:1:46:46:0.978723:22:24:0:1:22:24:0:1
chr16	8739954	.	G	A	854.44	PASS	AF=1;AO=52;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.076597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2722;QD=57.928;RBI=0.103084;REFB=0;REVB=0.0689864;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000825436;OID=.;OPOS=8739954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:59:0:0:52:59:1:24:28:0:0:29:30:0:0
chr16	8740015	.	A	C	734.15	PASS	AF=0.979167;AO=46;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00092015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1398;QD=61.179;RBI=0.0129094;REFB=-0.114543;REVB=-0.0128765;RO=1;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177403;STB=0.50943;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00267487;OID=.;OPOS=8740015;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:48:1:1:46:47:0.979167:26:20:0:1:26:21:0:1
chr16	8740418	.	T	C	834.29	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00597732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1266;QD=57.5374;RBI=0.00621836;REFB=0;REVB=-0.00171454;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.9322e-05;OID=.;OPOS=8740418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:33:25:0:0:33:25:0:0
chr16	8740503	.	G	A	748.79	PASS	AF=1;AO=39;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0660545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.725;QD=63.7265;RBI=0.0748046;REFB=0;REVB=0.0351073;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015234;OID=.;OPOS=8740503;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:39:47:1:23:16:0:0:29:18:0:0
chr16	8839954	.	A	G	764.79	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0113714;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.426;QD=63.7322;RBI=0.0273175;REFB=0;REVB=0.0248382;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.41468e-05;OID=.;OPOS=8839954;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:25:22:0:0:25:23:0:0
chr16	8841960	.	T	C	1308.13	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0508781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.036;QD=61.5591;RBI=0.0675005;REFB=0;REVB=0.0443592;RO=0;SAF=55;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000228007;OID=.;OPOS=8841960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:85:0:0:81:85:1:26:55:0:0:27:58:0:0
chr16	8875763	.	T	C	247.41	PASS	AF=0.547619;AO=22;DP=43;FAO=23;FDP=42;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0188522;FXX=0.0454442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.048;QD=23.5627;RBI=0.0206339;REFB=-0.0340609;REVB=0.00838747;RO=17;SAF=8;SAR=14;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00904992;STB=0.538428;STBP=0.588;TYPE=snp;VARB=0.0294617;OID=.;OPOS=8875763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:17:19:22:23:0.547619:14:8:6:11:14:9:9:10
chr16	8877854	.	C	G	286.11	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=28;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=-0.00558116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.268;QD=20.4366;RBI=0.0755864;REFB=-0.0141255;REVB=-0.07538;RO=26;SAF=28;SAR=2;SRF=21;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.292548;STB=0.666527;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.011014;OID=.;OPOS=8877854;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:2:28:21:5:2:28:21:5
chr16	8904954	.	C	T	365.16	PASS	AF=0.434783;AO=38;DP=89;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=-0.05295;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5467;QD=15.8764;RBI=0.0684113;REFB=-0.047971;REVB=-0.0433176;RO=51;SAF=21;SAR=17;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0437675;STB=0.542789;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0440035;OID=.;OPOS=8904954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:92:51:52:38:40:0.434783:17:21:26:25:17:23:26:26
chr16	8952248	.	A	G	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0287417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.937;QD=63.583;RBI=0.0289345;REFB=0;REVB=0.00333509;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.01715e-05;OID=.;OPOS=8952248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:29:18:0:0:29:18:0:0
chr16	8953081	.	C	G	372.33	PASS	AF=0.368852;AO=45;DP=122;FAO=45;FDP=122;FR=.;FRO=77;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=44;FSRR=33;FWDB=-0.0119667;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=296.68;QD=12.2075;RBI=0.0200773;REFB=-0.0227533;REVB=-0.0161213;RO=76;SAF=24;SAR=21;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360319;STB=0.524218;STBP=0.707;TYPE=snp;VARB=0.0380718;OID=.;OPOS=8953081;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:76:77:45:45:0.368852:21:24:43:33:21:24:44:33
chr16	8979046	.	A	G	937.2	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.703;QD=58.5751;RBI=0.04963;REFB=0;REVB=-0.01622;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.68978e-05;OID=.;OPOS=8979046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:63:64:1:26:37:0:0:26:38:0:0
chr16	9030444	.	C	G	699.03	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0176134;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.887;QD=54.8257;RBI=0.112813;REFB=-0.13996;REVB=0.11143;RO=0;SAF=42;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81061e-08;STB=0.50588;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.00184973;OID=.;OPOS=9030444;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:0:1:50:50:0.980392:8:42:0:0:8:42:1:0
chr16	9030527	.	C	CG	32.81	PASS	AF=0.139241;AO=13;DP=79;FAO=11;FDP=79;FR=.;FRO=68;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=44;FSRR=24;FWDB=0.000672516;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=18.5232;QD=1.66147;RBI=0.095861;REFB=-0.0239255;REVB=-0.0958587;RO=65;SAF=11;SAR=2;SRF=43;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301941;STB=0.821644;STBP=0.054;TYPE=ins;VARB=0.10766;OID=.;OPOS=9030528;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.139241:13:79:11:79:68:10:1:44:24:32:65:11:2:43:22
chr16	9693953	.	C	G	279.6	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0360591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.962;QD=48.626;RBI=0.0521244;REFB=-0.0591877;REVB=0.037639;RO=1;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542958;STB=0.529385;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00306436;OID=.;OPOS=9693953;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:8:14:0:1:8:14:0:1
chr16	9693997	.	C	G	289.25	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00234758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.404;QD=52.5916;RBI=0.0435321;REFB=0;REVB=0.0434688;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000393895;OID=.;OPOS=9693997;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:7:14:0:0:8:14:0:0
chr16	9857368	.	GGAAAA	GAAA,GGAAAC,GGAAA	32.38	PASS	AF=0.166667,0,0;AO=7,2,6;DP=43;FAO=6,0,0;FDP=36;FR=.;FRO=30;FSAF=5,0,0;FSAR=1,0,0;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.121584,0.000641029,-0.245121;FXX=0.0769034;HRUN=5,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=27.5328,77.3981,13.6175;QD=3.5973;RBI=0.141638,0.0417934,0.268669;REFB=-0.0293166,0.00191348,-0.0419319;REVB=0.0726537,0.0417884,-0.109993;RO=27;SAF=6,2,4;SAR=1,0,2;SRF=15;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0.45339;SSSB=0.417836,0.448702,0.137604;STB=0.737737,0.5,0.5;STBP=0.263,1,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.127671,0.0656697,0;OID=.,.,.;OPOS=9857369,9857373,9857370;OREF=GA,A,A;OALT=-,C,-;OMAPALT=GAAA,GGAAAC,GGAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.166667,0,0:7,2,6:43:6,0,0:36:30:5,0,0:1,0,0:18:12:31:27:6,2,4:1,0,2:15:12
chr16	10315838	.	T	C	296.35	PASS	AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0242003;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9557;QD=28.912;RBI=0.0370415;REFB=-0.0297331;REVB=-0.0280432;RO=15;SAF=11;SAR=15;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117869;STB=0.564922;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0166635;OID=.;OPOS=10315838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:15:11:9:6:15:11:9:6
chr16	10524656	.	GGAC	G	459.75	PASS	AF=1;AO=37;DP=44;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340364;FXX=0.133304;HRUN=2;LEN=3;MLLD=202.049;QD=47.1534;RBI=0.064295;REFB=0;REVB=0.0545469;RO=0;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000276483;OID=.;OPOS=10524657;OREF=GAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:37:44:39:39:0:21:18:0:0:8:0:21:16:0:0
chr16	10525036	.	A	G	315.3	PASS	AF=0.421687;AO=34;DP=82;FAO=35;FDP=83;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=13;FWDB=0.00477875;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.639;QD=15.1954;RBI=0.0048273;REFB=-0.0143539;REVB=0.000682917;RO=48;SAF=24;SAR=10;SRF=35;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294089;STB=0.510632;STBP=0.897;TYPE=snp;VARB=0.0176669;OID=.;OPOS=10525036;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:48:48:34:35:0.421687:10:24:35:13:10:25:35:13
chr16	10575824	.	C	A	638.4	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0696915;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.5741;QD=59.3861;RBI=0.0697208;REFB=0.071917;REVB=-0.00202239;RO=1;SAF=22;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208598;STB=0.511106;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.00330695;OID=.;OPOS=10575824;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:20:22:1:0:20:22:1:0
chr16	10769958	.	T	C,G	883.47	PASS	AF=0.935484,0.0645161;AO=58,4;DP=62;FAO=58,4;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=45,2;FSAR=13,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182044,-0.0151221;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=224.673,180.458;QD=56.9979;RBI=0.0235611,0.0179721;REFB=0,0;REVB=0.0149575,0.00971168;RO=0;SAF=45,2;SAR=13,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00281792,0.0484544;OID=.,.;OPOS=10769958,10769958;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:62:62:0:0:58,4:58,4:0.935484,0.0645161:13,2:45,2:0:0:13,2:45,2:0:0
chr16	10788406	.	G	T	114.71	PASS	AF=0.318182;AO=14;DP=44;FAO=14;FDP=44;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.00922456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.827;QD=10.4281;RBI=0.0140806;REFB=-0.00977811;REVB=-0.0106382;RO=30;SAF=6;SAR=8;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333863;STB=0.519972;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0195715;OID=.;OPOS=10788406;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:30:30:14:14:0.318182:8:6:12:18:8:6:12:18
chr16	10813648	.	C	T	729.0	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106289;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.428;QD=57.1768;RBI=0.0465803;REFB=0;REVB=0.0453515;RO=0;SAF=35;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.87758e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89224e-05;OID=.;OPOS=10813648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:15:35:0:0:16:35:0:0
chr16	10989219	.	C	G	988.16	PASS	AF=0.933333;AO=69;DP=75;FAO=70;FDP=75;FR=.;FRO=5;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0547232;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=67.8772;QD=52.7016;RBI=0.0552733;REFB=-0.142632;REVB=-0.00777905;RO=0;SAF=34;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.532458;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00546978;OID=.;OPOS=10989219;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:75:75:0:5:69:70:0.933333:35:34:0:0:36:34:0:5
chr16	10995933	.	A	G	750.74	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.056;QD=56.6594;RBI=0.058457;REFB=0;REVB=0.0430332;RO=0;SAF=22;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176764;OID=.;OPOS=10995933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:29:22:0:0:29:24:0:0
chr16	11001421	.	C	A	248.4	PASS	AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=0.00162722;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.746;QD=13.9943;RBI=0.0440152;REFB=-0.00713426;REVB=0.0439851;RO=42;SAF=13;SAR=16;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785555;STB=0.544716;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.0165164;OID=.;OPOS=11001421;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:16:13:22:20:16:13:22:20
chr16	11001743	.	G	A	149.49	PASS	AF=0.447368;AO=16;DP=37;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.0151238;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=70.3755;QD=15.7363;RBI=0.042801;REFB=-0.014802;REVB=-0.04004;RO=21;SAF=10;SAR=6;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0967593;STB=0.541619;STBP=0.701;TYPE=snp;VARB=0.0307693;OID=.;OPOS=11001743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:21:21:16:17:0.447368:6:10:15:6:6:11:15:6
chr16	11002133	.	C	G	393.27	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0406601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.549;QD=56.1808;RBI=0.0422979;REFB=0;REVB=0.0116563;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000401289;OID=.;OPOS=11002133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr16	11002904	.	G	A	1258.9	PASS	AF=0.976471;AO=82;DP=84;FAO=83;FDP=85;FR=.;FRO=2;FSAF=54;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0282803;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.2701;QD=59.2423;RBI=0.076576;REFB=0.00683549;REVB=0.0711626;RO=2;SAF=54;SAR=28;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00792266;STB=0.503887;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.000126687;OID=.;OPOS=11002904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:84:85:2:2:82:83:0.976471:28:54:1:1:29:54:1:1
chr16	11002927	.	A	G	1572.99	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00409246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.846;QD=59.9235;RBI=0.0364266;REFB=0;REVB=0.036196;RO=0;SAF=60;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.46438e-05;OID=.;OPOS=11002927;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:105:0:0:105:105:1:45:60:0:0:45:60:0:0
chr16	11016045	.	C	T	115.3	PASS	AF=0.285714;AO=16;DP=56;FAO=16;FDP=56;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0139036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.169;QD=8.23563;RBI=0.0257632;REFB=-0.0123198;REVB=-0.0216895;RO=40;SAF=7;SAR=9;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132458;STB=0.579901;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0281055;OID=.;OPOS=11016045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:40:40:16:16:0.285714:9:7:22:18:9:7:22:18
chr16	11154770	.	G	A	125.72	PASS	AF=0.307692;AO=16;DP=52;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=0.00213913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.791;QD=9.67069;RBI=0.0059565;REFB=-0.0162764;REVB=0.00555913;RO=36;SAF=6;SAR=10;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386221;STB=0.727018;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0177592;OID=.;OPOS=11154770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:36:36:16:16:0.307692:10:6:26:10:10:6:26:10
chr16	11361895	.	C	G	332.19	PASS	AF=0.385417;AO=37;DP=94;FAO=37;FDP=96;FR=.;FRO=59;FSAF=10;FSAR=27;FSRF=43;FSRR=16;FWDB=0.000478699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.865;QD=13.8413;RBI=0.00655971;REFB=-0.00400895;REVB=-0.00654222;RO=57;SAF=10;SAR=27;SRF=41;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.463263;STB=0.768804;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00683277;OID=.;OPOS=11361895;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:96:57:59:37:37:0.385417:27:10:41:16:27:10:43:16
chr16	11362729	.	G	A	371.51	PASS	AF=0.569231;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=65;FR=.;FRO=28;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.0185734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8638;QD=22.862;RBI=0.043499;REFB=-0.0155168;REVB=0.0393343;RO=27;SAF=21;SAR=16;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0196092;STB=0.517437;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0137337;OID=.;OPOS=11362729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:27:28:37:37:0.569231:16:21:16:11:16:21:17:11
chr16	11367143	.	G	A	623.36	PASS	AF=0.90566;AO=48;DP=53;FAO=48;FDP=53;FR=.;FRO=5;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0464003;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.478;QD=47.0461;RBI=0.052029;REFB=-0.0701262;REVB=0.0235377;RO=1;SAF=29;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159482;STB=0.539191;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.000581324;OID=.;OPOS=11367143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:53:53:1:5:48:48:0.90566:19:29:1:0:19:29:1:4
chr16	11367154	.	C	T	726.89	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170803;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.2561;QD=57.0106;RBI=0.0236021;REFB=0;REVB=0.0162887;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148133;OID=.;OPOS=11367154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0
chr16	11374866	.	G	T	1356.51	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8175;QD=62.3683;RBI=0.0312031;REFB=0;REVB=0.0286341;RO=0;SAF=36;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235753;OID=.;OPOS=11374866;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:51:36:0:0:51:36:0:0
chr16	11387117	.	A	G	2027.25	PASS	AF=1;AO=129;DP=129;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0205498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.801;QD=62.3768;RBI=0.0230345;REFB=0;REVB=-0.0104064;RO=0;SAF=47;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.15575e-06;OID=.;OPOS=11387117;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:129:130:0:0:129:130:1:82:47:0:0:83:47:0:0
chr16	11387129	.	C	A	645.11	PASS	AF=0.528926;AO=64;DP=121;FAO=64;FDP=121;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=41;FSRF=18;FSRR=39;FWDB=0.00196499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.384;QD=21.3259;RBI=0.014177;REFB=-0.00718741;REVB=-0.0140402;RO=57;SAF=23;SAR=41;SRF=18;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411562;STB=0.522572;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.0064978;OID=.;OPOS=11387129;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:57:57:64:64:0.528926:41:23:18:39:41:23:18:39
chr16	11387164	.	T	C	340.31	PASS	AF=0.41573;AO=35;DP=87;FAO=37;FDP=89;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=35;FWDB=-0.00488456;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.075;QD=15.2946;RBI=0.00977901;REFB=-0.0116278;REVB=0.00847173;RO=52;SAF=15;SAR=20;SRF=17;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111597;STB=0.548403;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0118401;OID=.;OPOS=11387164;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:89:52:52:35:37:0.41573:20:15:17:35:22:15:17:35
chr16	11540711	.	CT	C,CC	626.4	PASS	AF=0.0243902,0.97561;AO=6,33;DP=41;FAO=1,40;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=1,11;FSAR=0,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0702347,0.0982692;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=120.318,143.034;QD=61.1123;RBI=0.091428,0.1054;REFB=0,0;REVB=0.0585334,0.0381103;RO=0;SAF=6,4;SAR=0,29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0302804,0.00074186;OID=.,.;OPOS=11540712,11540712;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0243902,0.97561:6,33:41:1,40:41:0:1,11:0,29:0:0:4:0:6,4:0,29:0:0
chr16	11541896	.	G	A	506.3	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507776;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8849;QD=59.5642;RBI=0.0531255;REFB=0;REVB=0.0156192;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00183423;OID=.;OPOS=11541896;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:34:0:0:34:34:1:22:12:0:0:22:12:0:0
chr16	11542894	.	C	T	420.69	PASS	AF=0.44898;AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.0195598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.663;QD=17.1708;RBI=0.0212207;REFB=-0.0207783;REVB=0.00822995;RO=54;SAF=21;SAR=23;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.040596;STB=0.522717;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.023063;OID=.;OPOS=11542894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:54:54:44:44:0.44898:23:21:28:26:23:21:28:26
chr16	11544673	.	G	A	33.43	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0504863;FXX=0.0908265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.288;QD=13.3727;RBI=0.0570915;REFB=-0.00604236;REVB=-0.0266567;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00850845;OID=.;OPOS=11544673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:10:5:5:5:5:0.5:3:2:2:3:3:2:2:3
chr16	11553842	.	G	C	462.65	PASS	AF=0.447368;AO=51;DP=114;FAO=51;FDP=114;FR=.;FRO=63;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=-0.0349364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.9026;QD=16.2335;RBI=0.0349367;REFB=-0.0205205;REVB=-0.000120752;RO=63;SAF=26;SAR=25;SRF=34;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295859;STB=0.516522;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.0342025;OID=.;OPOS=11553842;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:63:63:51:51:0.447368:25:26:34:29:25:26:34:29
chr16	11554867	.	C	T	395.88	PASS	AF=0.519481;AO=39;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=0.0220711;FXX=0.0128189;HRUN=4;LEN=1;MLLD=103.536;QD=20.5652;RBI=0.0248974;REFB=-0.0202138;REVB=-0.0115217;RO=36;SAF=17;SAR=22;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127536;STB=0.569176;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0193468;OID=.;OPOS=11554867;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:36:37:39:40:0.519481:22:17:21:15:22:18:22:15
chr16	11556121	.	A	G	513.44	PASS	AF=0.571429;AO=48;DP=84;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0115093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.965;QD=24.4495;RBI=0.0116085;REFB=-0.0389651;REVB=-0.00151507;RO=33;SAF=22;SAR=26;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00284297;STB=0.505985;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0287893;OID=.;OPOS=11556121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:33:36:48:48:0.571429:26:22:15:18:26:22:17:19
chr16	11650325	.	G	A	353.82	PASS	AF=0.725;AO=29;DP=40;FAO=29;FDP=40;FR=.;FRO=11;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=0.0330155;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.0788;QD=35.3824;RBI=0.0350833;REFB=0.00606999;REVB=0.0118666;RO=11;SAF=21;SAR=8;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538641;STB=0.529391;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=-0.00192389;OID=.;OPOS=11650325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:40:40:11:11:29:29:0.725:8:21:7:4:8:21:7:4
chr16	11658459	.	A	AT	755.32	PASS	AF=1;AO=45;DP=50;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013121;FXX=0.020404;HRUN=0;LEN=1;MLLD=195.426;QD=62.9429;RBI=0.0245983;REFB=0;REVB=0.0208067;RO=3;SAF=27;SAR=18;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494049;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00184837;OID=.;OPOS=11658460;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:45:50:48:48:0:30:18:0:0:4:3:27:18:3:0
chr16	11769948	.	C	T	36.38	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0483117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.096;QD=6.929;RBI=0.0517932;REFB=-0.0109634;REVB=0.0186686;RO=15;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.323033;STB=0.71347;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.00976819;OID=.;OPOS=11769948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:5:1:6:9:5:1:6:9
chr16	11769963	.	C	T	54.0	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0130399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.42;QD=8.30758;RBI=0.0192003;REFB=-0.0130365;REVB=0.0140929;RO=18;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0163863;STB=0.510178;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0278382;OID=.;OPOS=11769963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:18:18:8:8:0.307692:5:3:7:11:5:3:7:11
chr16	11770777	.	A	G	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00303788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.079;QD=13.5764;RBI=0.0474916;REFB=-0.0147833;REVB=-0.0473943;RO=19;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145442;STB=0.585233;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.0250571;OID=.;OPOS=11770777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:8:5:10:9:8:5:10:9
chr16	11771094	.	C	G	57.93	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.155711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8569;QD=13.6308;RBI=0.156042;REFB=0.000810317;REVB=-0.01016;RO=9;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250633;STB=0.646722;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=-0.0125765;OID=.;OPOS=11771094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:4:4:2:7:4:4:2:7
chr16	11771353	.	C	A	103.88	PASS	AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0134471;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=150.36;QD=10.1347;RBI=0.0160227;REFB=-0.010438;REVB=0.00871219;RO=28;SAF=8;SAR=5;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132854;STB=0.580028;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0161163;OID=.;OPOS=11771353;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:28:28:13:13:0.317073:5:8:14:14:5:8:14:14
chr16	11772599	.	GT	GTTCTGA,G	129.77	PASS	AF=0.32,0;AO=14,7;DP=51;FAO=16,0;FDP=50;FR=.;FRO=34;FSAF=8,0;FSAR=8,0;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0185827,-0.00879243;FXX=0.019604;HRUN=6,6;LEN=5,1;MLLD=301.325,10.0571;QD=10.3819;RBI=0.0255449,0.08532;REFB=-0.00863895,-0.00186099;REVB=-0.0175279,-0.0848658;RO=26;SAF=8,4;SAR=6,3;SRF=10;SRR=16;SSEN=0,0.588235;SSEP=0,0.450617;SSSB=0.20259,0.219624;STB=0.53995,0.5;STBP=0.713,1;TYPE=ins,del;VARB=0.0190377,0.00746747;OID=.,.;OPOS=11772601,11772600;OREF=-,T;OALT=TCTGA,-;OMAPALT=GTTCTGA,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.32,0:14,7:51:16,0:50:34:8,0:8,0:15:19:99:26:8,4:6,3:10:16
chr16	11773662	.	C	G	83.08	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=4;FWDB=0.000201374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.737;QD=9.49525;RBI=0.00407852;REFB=-0.00168806;REVB=-0.00407354;RO=23;SAF=6;SAR=5;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338356;STB=0.706221;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.00384227;OID=.;OPOS=11773662;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:23:24:11:11:0.314286:5:6:19:4:5:6:20:4
chr16	11852354	.	A	C	173.28	PASS	AF=0.486486;AO=17;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0987572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.7233;QD=18.7328;RBI=0.118804;REFB=-0.00366174;REVB=0.0660407;RO=19;SAF=8;SAR=9;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00286962;STB=0.515135;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00865824;OID=.;OPOS=11852354;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:19:19:17:18:0.486486:9:8:9:10:10:8:9:10
chr16	11969724	.	G	C	651.35	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.725;QD=62.0335;RBI=0.0345637;REFB=0;REVB=0.0299442;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000239337;OID=.;OPOS=11969724;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:23:18:0:0:24:18:0:0
chr16	12021332	.	G	A	101.81	PASS	AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0685177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.38;QD=29.0879;RBI=0.0700469;REFB=-0.0567084;REVB=0.0145563;RO=1;SAF=4;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0994753;STB=0.636115;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.00913973;OID=.;OPOS=12021332;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:14:14:1:3:11:11:0.785714:7:4:1:0:7:4:3:0
chr16	12027474	.	CAT	C,CGT	194.99	PASS	AF=1,0;AO=14,2;DP=17;FAO=16,0;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7,0;FSAR=9,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594387,0.0955651;FXX=0.0587889;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=157.041,36.0903;QD=48.747;RBI=0.0606061,0.101805;REFB=0,0;REVB=0.0118383,-0.035093;RO=0;SAF=6,0;SAR=8,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000359334,0;OID=.,.;OPOS=12027475,12027475;OREF=AT,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:14,2:17:16,0:16:0:7,0:9,0:0:0:4:0:6,0:8,2:0:0
chr16	12060163	.	A	G	850.24	PASS	AF=0.953125;AO=60;DP=64;FAO=61;FDP=64;FR=.;FRO=3;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0490208;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=206.59;QD=53.1402;RBI=0.0673948;REFB=-0.106338;REVB=0.0462496;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.52112;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00111753;OID=.;OPOS=12060163;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:64:64:0:3:60:61:0.953125:27:33:0:0:27:34:3:0
chr16	12162969	.	A	G	1549.25	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0063417;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.2;QD=63.8865;RBI=0.0063762;REFB=0;REVB=0.000662433;RO=0;SAF=39;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70333e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.44927e-06;OID=.;OPOS=12162969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:0:0:96:97:1:57:39:0:0:57:40:0:0
chr16	12183686	.	C	T	769.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0616909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.268;QD=57.0004;RBI=0.0809199;REFB=0;REVB=0.0523666;RO=0;SAF=21;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.70667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000538768;OID=.;OPOS=12183686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:33:21:0:0:33:21:0:0
chr16	12621176	.	C	G	943.32	PASS	AF=1;AO=65;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.885;QD=56.3173;RBI=0.112591;REFB=0;REVB=0.0267747;RO=1;SAF=27;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171739;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00323439;OID=.;OPOS=12621176;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:67:67:1:0:65:67:1:38:27:1:0:38:29:0:0
chr16	12666984	.	T	A	120.72	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0536457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.602;QD=14.6327;RBI=0.0542085;REFB=-0.0115134;REVB=-0.0077914;RO=19;SAF=12;SAR=2;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.42007;STB=0.749583;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0233286;OID=.;OPOS=12666984;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:2:12:10:9:2:12:10:9
chr16	12667393	.	G	A	674.23	PASS	AF=0.5;AO=67;DP=135;FAO=67;FDP=134;FR=.;FRO=67;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=43;FSRR=24;FWDB=-0.0232001;FXX=0.00740686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.102;QD=20.1263;RBI=0.0232152;REFB=-0.0135079;REVB=0.000837854;RO=67;SAF=41;SAR=26;SRF=43;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0287126;STB=0.51582;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.00954494;OID=.;OPOS=12667393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:134:67:67:67:67:0.5:26:41:43:24:26:41:43:24
chr16	12667409	.	C	G	631.39	PASS	AF=0.520661;AO=64;DP=123;FAO=63;FDP=121;FR=.;FRO=58;FSAF=41;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=0.00419635;FXX=0.0162588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.569;QD=20.8725;RBI=0.0109482;REFB=-0.0138;REVB=-0.0101121;RO=58;SAF=41;SAR=23;SRF=38;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137259;STB=0.502311;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0137921;OID=.;OPOS=12667409;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:121:58:58:64:63:0.520661:23:41:38:20:22:41:38:20
chr16	12667945	.	C	T	368.64	PASS	AF=0.321678;AO=46;DP=143;FAO=46;FDP=143;FR=.;FRO=97;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=48;FSRR=49;FWDB=-0.0224744;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8379;QD=10.3116;RBI=0.0294103;REFB=0.0134024;REVB=0.0189702;RO=97;SAF=23;SAR=23;SRF=48;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00603342;STB=0.503495;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=-0.0322369;OID=.;OPOS=12667945;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:97:97:46:46:0.321678:23:23:48:49:23:23:48:49
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chr16	13002359	.	T	C	1246.11	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00116789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.846;QD=61.5362;RBI=0.00387901;REFB=0;REVB=-0.00369902;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.67534e-06;OID=.;OPOS=13002359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:43:38:0:0:43:38:0:0
chr16	14041958	.	T	C	185.6	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0177472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6394;QD=13.7478;RBI=0.0192979;REFB=0.0153008;REVB=-0.00757923;RO=32;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129425;STB=0.574008;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=-0.0187092;OID=.;OPOS=14041958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:11:11:12:20:11:11:12:20
chr16	14046149	.	AT	A	100.01	PASS	AF=0.494845;AO=38;DP=100;FAO=48;FDP=97;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=28;FWDB=0.0421202;FXX=0.029997;HRUN=8;LEN=1;MLLD=6.95352;QD=4.12419;RBI=0.0850542;REFB=-0.0736719;REVB=0.0738925;RO=36;SAF=21;SAR=17;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0948535;STB=0.536067;STBP=0.501;TYPE=del;VARB=0.0892942;OID=.;OPOS=14046150;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.494845:38:100:48:97:49:24:24:21:28:99:36:21:17:16:20
chr16	14304175	.	A	C	392.6	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.083814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1099;QD=56.085;RBI=0.0893519;REFB=0;REVB=0.0309672;RO=0;SAF=3;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000955396;OID=.;OPOS=14304175;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:24:3:0:0:24:4:0:0
chr16	14311035	.	T	C	1584.61	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636571;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.068;QD=64.0247;RBI=0.0661273;REFB=0;REVB=0.0179049;RO=0;SAF=44;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.274e-05;OID=.;OPOS=14311035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:99:0:0:89:99:1:45:44:0:0:45:54:0:0
chr16	14356373	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154901;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.6056;QD=62.6705;RBI=0.018315;REFB=0;REVB=0.00977236;RO=0;SAF=25;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.87975e-05;OID=.;OPOS=14356373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:19:25:0:0:19:25:0:0
chr16	14356920	.	A	C	884.67	PASS	AF=0.954545;AO=63;DP=66;FAO=63;FDP=66;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00749217;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.24;QD=53.6164;RBI=0.0215173;REFB=-0.0346751;REVB=0.0201708;RO=2;SAF=37;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248416;STB=0.503725;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=9.57471e-05;OID=.;OPOS=14356920;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:66:66:2:3:63:63:0.954545:26:37:2:0:26:37:2:1
chr16	14359205	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00157511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.875;QD=51.9167;RBI=0.0332459;REFB=0;REVB=0.0332086;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.87117e-05;OID=.;OPOS=14359205;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:6:15:0:0:6:15:0:0
chr16	14359233	.	T	A	306.3	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0482696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2792;QD=53.2702;RBI=0.0485204;REFB=0;REVB=0.00492606;RO=0;SAF=17;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000888149;OID=.;OPOS=14359233;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:6:17:0:0:6:17:0:0
chr16	14369420	.	T	TC	237.85	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0120399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=33.6677;QD=50.0741;RBI=0.13776;REFB=0;REVB=0.137233;RO=1;SAF=13;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340907;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0070694;OID=.;OPOS=14369421;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:19:20:19:19:0:13:6:0:0:4:1:13:6:1:0
chr16	14742400	.	T	G	373.53	PASS	AF=0.40367;AO=39;DP=104;FAO=44;FDP=109;FR=.;FRO=65;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=39;FSRR=26;FWDB=0.00919472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.621;QD=13.7074;RBI=0.0434876;REFB=-0.00734353;REVB=0.0425044;RO=61;SAF=24;SAR=15;SRF=37;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00997201;STB=0.508537;STBP=0.887;TYPE=snp;VARB=0.00901628;OID=.;OPOS=14742400;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:109:61:65:39:44:0.40367:15:24:37:24:17:27:39:26
chr16	14969016	.	T	A	83.37	PASS	AF=0.202899;AO=13;DP=68;FAO=14;FDP=69;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=-0.0219377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.648;QD=4.83318;RBI=0.0219753;REFB=-0.0133015;REVB=-0.00128522;RO=55;SAF=9;SAR=4;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147983;STB=0.551347;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0481033;OID=.;OPOS=14969016;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:68:69:55:55:13:14:0.202899:4:9:32:23:5:9:32:23
chr16	14988868	.	A	G	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0756068;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.7536;QD=11.9196;RBI=0.0807655;REFB=-0.0121627;REVB=-0.0284022;RO=9;SAF=5;SAR=2;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.439266;STB=0.76201;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00848341;OID=.;OPOS=14988868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:2:5:2:7:2:5:2:7
chr16	14989420	.	C	T	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0145333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.084;QD=11.0924;RBI=0.0153322;REFB=-0.0289747;REVB=0.00488464;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231237;STB=0.6423;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.032448;OID=.;OPOS=14989420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:3:2:4:2:3:2:4:2
chr16	15083131	.	A	T	189.82	PASS	AF=0.215827;AO=30;DP=140;FAO=30;FDP=139;FR=.;FRO=109;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=52;FSRR=57;FWDB=-0.00206306;FXX=0.0141834;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.356;QD=5.46251;RBI=0.0154868;REFB=-0.0149667;REVB=0.0153488;RO=109;SAF=18;SAR=12;SRF=52;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155948;STB=0.596477;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0351837;OID=.;OPOS=15083131;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:139:109:109:30:30:0.215827:12:18:52:57:12:18:52:57
chr16	15083383	.	G	A	460.73	PASS	AF=0.677419;AO=42;DP=62;FAO=42;FDP=62;FR=.;FRO=20;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.00679298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.351;QD=29.7245;RBI=0.0728249;REFB=0.0118906;REVB=0.0725074;RO=20;SAF=28;SAR=14;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196109;STB=0.606689;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.00184435;OID=.;OPOS=15083383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:20:20:42:42:0.677419:14:28:7:13:14:28:7:13
chr16	15098047	.	C	G	454.7	PASS	AF=0.425;AO=51;DP=120;FAO=51;FDP=120;FR=.;FRO=69;FSAF=40;FSAR=11;FSRF=37;FSRR=32;FWDB=0.000698268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=300.183;QD=15.1568;RBI=0.0204672;REFB=-0.00895677;REVB=-0.0204553;RO=69;SAF=40;SAR=11;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299699;STB=0.66997;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.011192;OID=.;OPOS=15098047;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:69:69:51:51:0.425:11:40:37:32:11:40:37:32
chr16	15110077	.	C	T	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00051748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.6541;QD=14.2616;RBI=0.00655193;REFB=-0.00291351;REVB=-0.00653146;RO=23;SAF=13;SAR=3;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353145;STB=0.721913;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00699973;OID=.;OPOS=15110077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:24:16:16:0.4:3:13:12:11:3:13:12:12
chr16	15116625	.	G	T	769.09	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.983;QD=56.9695;RBI=0.044095;REFB=0;REVB=0.0136145;RO=0;SAF=27;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198048;OID=.;OPOS=15116625;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:27:27:0:0:27:27:0:0
chr16	15129970	.	A	G	307.29	PASS	AF=0.722222;AO=26;DP=36;FAO=26;FDP=36;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0133172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.0258;QD=34.1428;RBI=0.06755;REFB=-0.001699;REVB=-0.0662243;RO=10;SAF=15;SAR=11;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140731;STB=0.576864;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-2.03569e-05;OID=.;OPOS=15129970;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:36:36:10:10:26:26:0.722222:11:15:3:7:11:15:3:7
chr16	15131962	.	A	G	379.28	PASS	AF=0.451613;AO=37;DP=85;FAO=42;FDP=93;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=32;FSRR=19;FWDB=0.0163753;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.6916;QD=16.3132;RBI=0.0242259;REFB=-0.0186296;REVB=-0.0178535;RO=48;SAF=17;SAR=20;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206053;STB=0.557249;STBP=0.374;TYPE=snp;VARB=0.0269181;OID=.;OPOS=15131962;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:93:48:51:37:42:0.451613:20:17:32:16:20:22:32:19
chr16	15131974	.	G	T	367.25	PASS	AF=0.438202;AO=38;DP=88;FAO=39;FDP=89;FR=.;FRO=50;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=-0.0280099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7304;QD=16.5057;RBI=0.0330343;REFB=-0.0149268;REVB=-0.0175131;RO=50;SAF=21;SAR=17;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902775;STB=0.543817;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0177703;OID=.;OPOS=15131974;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:50:50:38:39:0.438202:17:21:32:18:17:22:32:18
chr16	15133889	.	T	G	515.54	PASS	AF=0.4375;AO=56;DP=128;FAO=56;FDP=128;FR=.;FRO=72;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=45;FSRR=27;FWDB=-0.00363422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.508;QD=16.1105;RBI=0.00679888;REFB=-0.00918861;REVB=-0.00574606;RO=72;SAF=24;SAR=32;SRF=45;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195753;STB=0.609233;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0120222;OID=.;OPOS=15133889;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:72:72:56:56:0.4375:32:24:45:27:32:24:45:27
chr16	15155407	.	G	A	164.82	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0809969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.68;QD=21.2674;RBI=0.0814865;REFB=-0.0250633;REVB=0.00891906;RO=13;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127272;STB=0.551664;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.0186559;OID=.;OPOS=15155407;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:14:17:17:0.548387:8:9:9:4:8:9:9:5
chr16	15178499	.	G	A	98.66	PASS	AF=0.178947;AO=17;DP=95;FAO=17;FDP=95;FR=.;FRO=78;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=49;FSRR=29;FWDB=-0.0187196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.896;QD=4.15422;RBI=0.0338224;REFB=-0.0116153;REVB=-0.0281697;RO=75;SAF=8;SAR=9;SRF=48;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213694;STB=0.627764;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0558209;OID=.;OPOS=15178499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:95:95:75:78:17:17:0.178947:9:8:48:27:9:8:49:29
chr16	15221957	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00347162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.461;QD=44.6892;RBI=0.0828186;REFB=0;REVB=-0.0827458;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00154626;OID=.;OPOS=15221957;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr16	15248720	.	C	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0545334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9964;QD=33.4249;RBI=0.0545334;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0031393;OID=.;OPOS=15248720;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr16	15696480	.	A	AAGGAAAGAAGGAGGGAGGCAGAG	53.11	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0130365;FXX=0;HRUN=2;LEN=23;MLLD=361.652;QD=21.2451;RBI=0.0259057;REFB=-0.0479176;REVB=0.0223865;RO=3;SAF=2;SAR=5;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21311;STB=0.624624;STBP=0.278;TYPE=ins;VARB=0.0200212;OID=.;OPOS=15696481;OREF=-;OALT=AGGAAAGAAGGAGGGAGGCAGAG;OMAPALT=AAGGAAAGAAGGAGGGAGGCAGAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.7:7:10:7:10:3:2:5:2:1:15:3:2:5:2:1
chr16	15781054	.	A	G	195.19	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0151051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.021;QD=14.1958;RBI=0.0174786;REFB=-0.00158999;REVB=0.00879422;RO=32;SAF=11;SAR=12;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221385;STB=0.512647;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.00214238;OID=.;OPOS=15781054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:32:23:23:0.418182:12:11:16:16:12:11:16:16
chr16	15820863	.	C	T	551.84	PASS	AF=0.440299;AO=59;DP=134;FAO=59;FDP=134;FR=.;FRO=75;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=27;FSRR=48;FWDB=0.0207615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.285;QD=16.473;RBI=0.0225063;REFB=-0.020797;REVB=-0.00868869;RO=71;SAF=25;SAR=34;SRF=27;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043987;STB=0.536918;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0229878;OID=.;OPOS=15820863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:71:75:59:59:0.440299:34:25:27:44:34:25:27:48
chr16	15839034	.	G	A	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=7;FWDB=0.0648607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.0605;QD=14.6531;RBI=0.0724153;REFB=-0.023611;REVB=0.0322036;RO=8;SAF=6;SAR=2;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.502688;STB=0.793435;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0298274;OID=.;OPOS=15839034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:2:6:1:7:2:6:1:7
chr16	15842023	.	G	A	336.27	PASS	AF=0.604167;AO=29;DP=48;FAO=29;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00735857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.529;QD=28.0221;RBI=0.0100377;REFB=-0.0185862;REVB=-0.00682692;RO=19;SAF=16;SAR=13;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0198057;STB=0.510909;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0121229;OID=.;OPOS=15842023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:19:19:29:29:0.604167:13:16:11:8:13:16:11:8
chr16	15843899	.	G	A	301.83	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0026598;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=332.586;QD=52.4928;RBI=0.0366702;REFB=0;REVB=0.0365736;RO=0;SAF=20;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78928e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.06825e-05;OID=.;OPOS=15843899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:1:20:0:0:3:20:0:0
chr16	15850204	.	A	G	446.99	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0417735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.858;QD=57.6757;RBI=0.0479588;REFB=0;REVB=0.0235589;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.03347e-05;OID=.;OPOS=15850204;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:21:10:0:0:21:10:0:0
chr16	15892481	.	C	A	107.63	PASS	AF=0.916667;AO=6;DP=7;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0834661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.195;QD=35.8766;RBI=0.097615;REFB=-0.0665962;REVB=0.0506171;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.571292;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0006511;OID=.;OPOS=15892481;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:12:0:1:6:11:0.916667:5:1:0:0:8:3:1:0
chr16	15959756	.	G	A	151.99	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0305332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.829;QD=13.2169;RBI=0.037253;REFB=-0.00170638;REVB=-0.0213428;RO=27;SAF=9;SAR=8;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277166;STB=0.53604;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0356559;OID=.;OPOS=15959756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:29:17:17:0.369565:8:9:15:12:8:9:17:12
chr16	15959776	.	G	T	152.78	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.00947872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.701;QD=13.5804;RBI=0.0124554;REFB=-0.012408;REVB=0.00808025;RO=27;SAF=10;SAR=7;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00474575;STB=0.512181;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.0209526;OID=.;OPOS=15959776;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:27:28:17:17:0.377778:7:10:16:11:7:10:17:11
chr16	15961351	.	T	C	361.72	PASS	AF=0.414894;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=34;FWDB=-0.00259405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.91;QD=15.3924;RBI=0.0135816;REFB=-0.0160308;REVB=-0.0133316;RO=55;SAF=24;SAR=15;SRF=21;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239771;STB=0.635264;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0333882;OID=.;OPOS=15961351;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:55:55:39:39:0.414894:15:24:21:34:15:24:21:34
chr16	15961356	.	C	T	307.97	PASS	AF=0.380435;AO=36;DP=92;FAO=35;FDP=92;FR=.;FRO=57;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=35;FWDB=-0.0467891;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7959;QD=13.3901;RBI=0.0468144;REFB=0.00392464;REVB=-0.00153861;RO=56;SAF=23;SAR=13;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.279234;STB=0.648565;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.0135126;OID=.;OPOS=15961356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:56:57:36:35:0.380435:13:23:21:35:13:22:22:35
chr16	15961369	.	G	A	283.23	PASS	AF=0.366667;AO=33;DP=90;FAO=33;FDP=90;FR=.;FRO=57;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=0.0160691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.581;QD=12.5881;RBI=0.0318542;REFB=-0.0259983;REVB=-0.0275041;RO=57;SAF=16;SAR=17;SRF=21;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129542;STB=0.574093;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.045835;OID=.;OPOS=15961369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:57:57:33:33:0.366667:17:16:21:36:17:16:21:36
chr16	15967361	.	T	A,TCTA	95.87	PASS	AF=0.0697674,0.232558;AO=3,10;DP=43;FAO=3,10;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=0,6;FSAR=3,4;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0281864,-0.0150684;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,3;MLLD=103.684,213.574;QD=8.91783;RBI=0.0370687,0.0473987;REFB=-0.000319239,-0.0126748;REVB=-0.0240752,-0.0449397;RO=30;SAF=0,6;SAR=3,4;SRF=16;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.560482,0.0807581;STB=0.996583,0.550917;STBP=0.065,0.674;TYPE=snp,ins;VARB=-0.0112539,0.0343584;OID=.,.;OPOS=15967361,15967362;OREF=T,-;OALT=A,CTA;OMAPALT=A,TCTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:72:43:43:30:30:3,10:3,10:0.0697674,0.232558:3,4:0,6:16:14:3,4:0,6:16:14
chr16	15971028	.	C	G	1158.86	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7847;QD=58.6762;RBI=0.0728278;REFB=0;REVB=0.0705048;RO=0;SAF=48;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00383583;OID=.;OPOS=15971028;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:79:0:0:75:79:1:27:48:0:0:29:50:0:0
chr16	15973653	.	TG	AT,T,TT	315.92	PASS	AF=0,0.833333,0.166667;AO=13,4,7;DP=24;FAO=0,20,4;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14,4;FSAR=0,6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187777,-0.0059606,-0.00926279;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=192.391,201.134,188.066;QD=52.654;RBI=0.102226,0.134368,0.164057;REFB=0,0,0;REVB=-0.100487,-0.134235,-0.163795;RO=0;SAF=10,4,4;SAR=3,0,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,-0.00713922,0.0197653;OID=.,.,.;OPOS=15973653,15973654,15973654;OREF=TG,G,G;OALT=AT,-,T;OMAPALT=AT,T,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:21:24:24:0:0:13,4,7:0,20,4:0,0.833333,0.166667:3,0,3:10,4,4:0:0:0,6,0:0,14,4:0:0
chr16	16162019	.	T	C	325.88	PASS	AF=0.423529;AO=33;DP=81;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0385075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0145;QD=15.3354;RBI=0.0842421;REFB=-0.0158099;REVB=0.0749259;RO=48;SAF=16;SAR=17;SRF=30;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146005;STB=0.564671;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.0261198;OID=.;OPOS=16162019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:85:48:49:33:36:0.423529:17:16:30:18:18:18:30:19
chr16	16236789	.	A	G	245.9	PASS	AF=0.376623;AO=29;DP=79;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=28;FWDB=-0.00671068;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.03;QD=12.7741;RBI=0.00671068;REFB=-0.011195;REVB=-4.99466e-06;RO=45;SAF=8;SAR=21;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17587;STB=0.599927;STBP=0.184;TYPE=snp;VARB=0.0122204;OID=.;OPOS=16236789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:77:45:48:29:29:0.376623:21:8:19:26:21:8:20:28
chr16	16271357	.	T	C	1227.5	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000421942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.355;QD=61.3751;RBI=0.00177113;REFB=0;REVB=-0.00172014;RO=0;SAF=44;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.2214e-06;OID=.;OPOS=16271357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:80:0:0:80:80:1:36:44:0:0:36:44:0:0
chr16	16272670	.	T	C	1213.85	PASS	AF=1;AO=64;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.2147;QD=59.9433;RBI=0.161375;REFB=0;REVB=0.156772;RO=0;SAF=44;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00205269;OID=.;OPOS=16272670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:64:81:1:20:44:0:0:36:45:0:0
chr16	16302586	.	T	C	105.17	PASS	AF=0.236111;AO=15;DP=70;FAO=17;FDP=72;FR=.;FRO=55;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0101264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.481;QD=5.84294;RBI=0.0244037;REFB=-0.012816;REVB=-0.0222036;RO=55;SAF=11;SAR=4;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.34984;STB=0.743813;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.0396962;OID=.;OPOS=16302586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:55:55:15:17:0.236111:4:11:25:30:4:13:25:30
chr16	16468294	.	C	T	209.78	PASS	AF=0.625;AO=19;DP=32;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0611192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.082;QD=26.2229;RBI=0.0614053;REFB=-0.0108855;REVB=-0.00592007;RO=12;SAF=6;SAR=13;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126868;STB=0.579063;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00630623;OID=.;OPOS=16468294;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:12:12:19:20:0.625:13:6:2:10:13:7:2:10
chr16	17201138	.	T	C	431.3	PASS	AF=0.538462;AO=42;DP=80;FAO=42;FDP=78;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.035472;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7158;QD=22.1177;RBI=0.0355757;REFB=-0.0281987;REVB=-0.00271424;RO=34;SAF=23;SAR=19;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388683;STB=0.509221;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0118498;OID=.;OPOS=17201138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:78:34:36:42:42:0.538462:19:23:17:17:19:23:19:17
chr16	18823192	.	A	G	476.54	PASS	AF=0.560976;AO=46;DP=82;FAO=46;FDP=82;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.0168511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.441;QD=23.2459;RBI=0.0182154;REFB=-0.0179137;REVB=0.00691678;RO=36;SAF=21;SAR=25;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210326;STB=0.615135;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.020095;OID=.;OPOS=18823192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:36:36:46:46:0.560976:25:21:26:10:25:21:26:10
chr16	18823379	.	T	C	1281.84	PASS	AF=0.872727;AO=95;DP=110;FAO=96;FDP=110;FR=.;FRO=14;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.000767558;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=176.42;QD=46.6125;RBI=0.00556636;REFB=-0.0693049;REVB=0.00551319;RO=5;SAF=58;SAR=37;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.039139;STB=0.513473;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.00112954;OID=.;OPOS=18823379;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:110:110:5:14:95:96:0.872727:37:58:5:0:37:59:10:4
chr16	18839362	.	T	C	311.64	PASS	AF=0.453333;AO=34;DP=75;FAO=34;FDP=75;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=27;FWDB=0.0384581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.35;QD=16.6207;RBI=0.0391305;REFB=-0.00285688;REVB=0.00722307;RO=41;SAF=19;SAR=15;SRF=14;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209135;STB=0.617102;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00533549;OID=.;OPOS=18839362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:41:34:34:0.453333:15:19:14:27:15:19:14:27
chr16	18839496	.	G	C	446.66	PASS	AF=0.608696;AO=42;DP=69;FAO=42;FDP=69;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=22;FWDB=0.0302158;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.853;QD=25.8932;RBI=0.0396998;REFB=-0.0354144;REVB=0.0257503;RO=27;SAF=17;SAR=25;SRF=5;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169719;STB=0.59225;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0207776;OID=.;OPOS=18839496;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:27:27:42:42:0.608696:25:17:5:22:25:17:5:22
chr16	18849858	.	C	T	306.01	PASS	AF=0.411765;AO=34;DP=84;FAO=35;FDP=85;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.00106117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.311;QD=14.4006;RBI=0.00147992;REFB=-0.00832797;REVB=-0.00103154;RO=49;SAF=16;SAR=18;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835472;STB=0.531882;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0109936;OID=.;OPOS=18849858;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:85:49:50:34:35:0.411765:18:16:27:22:18:17:27:23
chr16	18861335	.	A	G	193.11	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0271345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2138;QD=14.855;RBI=0.0423954;REFB=-0.0129925;REVB=0.0325743;RO=30;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460055;STB=0.526292;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0115166;OID=.;OPOS=18861335;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:12:10:15:15:12:10:15:15
chr16	19041595	.	G	A	558.18	PASS	AF=0.536082;AO=52;DP=97;FAO=52;FDP=97;FR=.;FRO=45;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.00156801;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=252.726;QD=23.0175;RBI=0.00559652;REFB=-0.019116;REVB=0.00537237;RO=45;SAF=27;SAR=25;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684552;STB=0.53762;STBP=0.447;TYPE=snp;VARB=0.0186727;OID=.;OPOS=19041595;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:45:45:52:52:0.536082:25:27:27:18:25:27:27:18
chr16	19067933	.	G	A	473.35	PASS	AF=0.440678;AO=52;DP=120;FAO=52;FDP=118;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=-0.0780705;FXX=0.0166653;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9765;QD=16.0458;RBI=0.0781503;REFB=-0.0266662;REVB=0.00353079;RO=66;SAF=23;SAR=29;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0730982;STB=0.540887;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.0233118;OID=.;OPOS=19067933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:118:66:66:52:52:0.440678:29:23:34:32:29:23:34:32
chr16	19079037	.	G	A	39.04	PASS	AF=0.461538;AO=3;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0059919;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=121.749;QD=12.0124;RBI=0.0120281;REFB=-0.0270597;REVB=-0.0104294;RO=6;SAF=1;SAR=2;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167835;STB=0.688929;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0494058;OID=.;OPOS=19079037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:7:3:6:0.461538:2:1:3:3:5:1:3:4
chr16	19080184	.	C	T	422.19	PASS	AF=0.462366;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=93;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0419147;FXX=0.0106372;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4228;QD=18.1587;RBI=0.0443685;REFB=-0.0191719;REVB=-0.0145506;RO=50;SAF=19;SAR=24;SRF=24;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370214;STB=0.520677;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=0.0336914;OID=.;OPOS=19080184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:93:50:50:43:43:0.462366:24:19:24:26:24:19:24:26
chr16	19080227	.	C	CTG,CTGA,G	982.46	PASS	AF=0.941176,0,0.0588235;AO=55,8,3;DP=69;FAO=64,0,4;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=27,0,1;FSAR=37,0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108995,-0.00744375,0.014266;FXX=0.0144907;HRUN=0,0,1;LEN=2,3,1;MLLD=299.514,287.062,56.2776;QD=57.7917;RBI=0.0167568,0.0135553,0.0187499;REFB=0,0,0;REVB=0.0127276,0.0113286,0.0121672;RO=3;SAF=26,0,0;SAR=29,8,3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.0513367,-0.819744,-0.767807;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=ins,ins,snp;VARB=0.00462028,-0.0144486,-0.0108967;OID=.,.,.;OPOS=19080228,19080228,19080227;OREF=-,-,C;OALT=TG,TGA,G;OMAPALT=CTG,CTGA,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/3:14:69:68:3:0:55,8,3:64,0,4:0.941176,0,0.0588235:29,8,3:26,0,0:3:0:37,0,3:27,0,1:0:0
chr16	19085298	.	C	T	542.49	PASS	AF=0.385542;AO=64;DP=165;FAO=64;FDP=166;FR=.;FRO=102;FSAF=27;FSAR=37;FSRF=46;FSRR=56;FWDB=-0.00689573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.453;QD=13.0722;RBI=0.0319918;REFB=-0.00527077;REVB=-0.0312398;RO=101;SAF=27;SAR=37;SRF=46;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370175;STB=0.518221;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0078376;OID=.;OPOS=19085298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:166:101:102:64:64:0.385542:37:27:46:55:37:27:46:56
chr16	19089562	.	C	G	267.29	PASS	AF=0.5;AO=29;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0516977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5938;QD=18.434;RBI=0.0584011;REFB=-0.0105359;REVB=-0.0271668;RO=29;SAF=16;SAR=13;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0947273;STB=0.55282;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0141888;OID=.;OPOS=19089562;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:29:29:29:29:0.5:13:16:19:10:13:16:19:10
chr16	19128048	.	G	A	342.84	PASS	AF=0.596491;AO=33;DP=56;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0155824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.792;QD=24.0591;RBI=0.0491184;REFB=-0.0408771;REVB=-0.0465812;RO=23;SAF=12;SAR=21;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186147;STB=0.592422;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0261515;OID=.;OPOS=19128048;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:23:23:33:34:0.596491:21:12:14:9:21:13:14:9
chr16	19128433	.	T	TA	48.53	PASS	AF=0.47541;AO=12;DP=62;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0413569;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=7.60213;QD=3.18235;RBI=0.115732;REFB=-0.132689;REVB=0.108091;RO=49;SAF=5;SAR=7;SRF=23;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066054;STB=0.540268;STBP=0.556;TYPE=ins;VARB=0.136767;OID=.;OPOS=19128434;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.47541:12:62:29:61:32:14:15:13:19:48:49:5:7:23:26
chr16	19128436	.	G	A	144.54	PASS	AF=0.344262;AO=16;DP=56;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.0353661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6011;QD=9.47787;RBI=0.037655;REFB=-0.0135319;REVB=0.0129282;RO=40;SAF=9;SAR=7;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161406;STB=0.514272;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0986222;OID=.;OPOS=19128436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:61:40:40:16:21:0.344262:7:9:17:23:12:9:18:22
chr16	19128437	.	G	T	98.12	PASS	AF=0.245902;AO=17;DP=61;FAO=15;FDP=61;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=24;FWDB=-0.0302503;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7668;QD=6.434;RBI=0.0303321;REFB=-0.00311551;REVB=0.00222687;RO=39;SAF=5;SAR=12;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237136;STB=0.613481;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0491048;OID=.;OPOS=19128437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:61:61:39:46:17:15:0.245902:12:5:19:20:10:5:22:24
chr16	19128995	.	C	A	456.18	PASS	AF=0.5;AO=45;DP=90;FAO=45;FDP=90;FR=.;FRO=45;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0190223;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.738;QD=20.2746;RBI=0.0805079;REFB=0.00406154;REVB=-0.0782283;RO=45;SAF=27;SAR=18;SRF=18;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180357;STB=0.599956;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=-0.00532902;OID=.;OPOS=19128995;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:45:45:45:45:0.5:18:27:18:27:18:27:18:27
chr16	19129393	.	G	A	34.92	PASS	AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=-0.059676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.4821;QD=4.81646;RBI=0.104726;REFB=-0.0682517;REVB=-0.0860594;RO=23;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392085;STB=0.52623;STBP=0.949;TYPE=snp;VARB=0.130677;OID=.;OPOS=19129393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:23:23:6:6:0.206897:4:2:7:16:4:2:7:16
chr16	19129401	.	ATTTTA	ATTTA,ATTTAT	202.59	PASS	AF=0.95,0;AO=15,2;DP=22;FAO=19,0;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=5,0;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.1159,-0.11536;FXX=0.0908678;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=16.721,4.59193;QD=40.5173;RBI=0.238859,0.14305;REFB=0.0672653,-0.133635;REVB=0.208855,-0.0845892;RO=1;SAF=4,1;SAR=11,1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0396758,0.25849;STB=0.517223,0.5;STBP=0.639,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.019354,0;OID=.,.;OPOS=19129402,19129405;OREF=T,TA;OALT=-,AT;OMAPALT=ATTTA,ATTTAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.95,0:15,2:22:19,0:20:1:5,0:14,0:0:1:5:1:4,1:11,1:0:1
chr16	19129513	.	GT	AC,CG	417.39	PASS	AF=0.532468,0;AO=41,3;DP=80;FAO=41,0;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=19,0;FSAR=22,0;FSRF=28;FSRR=8;FWDB=0.017017,-0.0108264;FXX=0.0374953;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=173.494,92.1694;QD=21.6827;RBI=0.0179154,0.0202562;REFB=-0.0124848,-0.00237808;REVB=-0.00560218,0.0171203;RO=34;SAF=19,0;SAR=22,3;SRF=27;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.269122,-0.692053;STB=0.644572,0.5;STBP=0.014,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0096519,0;OID=.,.;OPOS=19129513,19129513;OREF=GT,GT;OALT=AC,CG;OMAPALT=AC,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:77:34:36:41,3:41,0:0.532468,0:22,3:19,0:27:7:22,0:19,0:28:8
chr16	19129614	.	T	C	118.82	PASS	AF=0.619048;AO=13;DP=21;FAO=13;FDP=21;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0197575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.758;QD=22.6317;RBI=0.02247;REFB=-0.000763667;REVB=-0.0107025;RO=8;SAF=7;SAR=6;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145706;STB=0.581968;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.000414592;OID=.;OPOS=19129614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:21:21:8:8:13:13:0.619048:6:7:6:2:6:7:6:2
chr16	19131105	.	G	A	179.0	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.0421301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.8384;QD=13.7695;RBI=0.0481562;REFB=0.00275806;REVB=0.0233253;RO=31;SAF=10;SAR=11;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107983;STB=0.561985;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.00420074;OID=.;OPOS=19131105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:11:10:18:13:11:10:18:13
chr16	19131435	.	A	G	214.19	PASS	AF=0.666667;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0128481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.236;QD=28.5584;RBI=0.0131233;REFB=-0.0252103;REVB=0.00267347;RO=10;SAF=14;SAR=6;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253508;STB=0.640699;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0252842;OID=.;OPOS=19131435;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:10:10:20:20:0.666667:6:14:3:7:6:14:3:7
chr16	19132369	.	GTTTTTTTTTTTTT	GTTTTTTTTTTT,GTTTTTTTTTTTT,GTTTTTTTTTTTTA	63.71	PASS	AF=0.333333,0.2,0.333333;AO=4,2,4;DP=17;FAO=5,3,5;FDP=15;FR=.;FRO=2;FSAF=1,3,5;FSAR=4,0,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00573579,0.00106699,-0.0525292;FXX=0.166574;HRUN=13,13,13;LEN=2,1,1;MLLD=11.0301,3.89004,18.2493;QD=16.9887;RBI=0.10856,0.260571,0.173614;REFB=-0.167096,-0.267216,-0.191355;REVB=-0.108409,-0.260568,-0.165476;RO=3;SAF=1,2,4;SAR=3,0,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.490704,0,0;STB=0.748924,0.5,0.5;STBP=0.099,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.119129,-0.0739883,-0.0524826;OID=.,.,.;OPOS=19132370,19132370,19132382;OREF=TT,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=GTTTTTTTTTTT,GTTTTTTTTTTTT,GTTTTTTTTTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.333333,0.2,0.333333:4,2,4:17:5,3,5:15:2:1,3,5:4,0,0:2:0:23:3:1,2,4:3,0,0:3:0
chr16	19132447	.	A	C	57.99	PASS	AF=0.470588;AO=8;DP=17;FAO=8;FDP=17;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.0315875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.386;QD=13.6448;RBI=0.0345302;REFB=-0.0382323;REVB=-0.0139487;RO=9;SAF=7;SAR=1;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398438;STB=0.743945;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0201978;OID=.;OPOS=19132447;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:9:9:8:8:0.470588:1:7:5:4:1:7:5:4
chr16	19132780	.	T	C	494.37	PASS	AF=0.495238;AO=52;DP=105;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.0510024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.81;QD=18.8329;RBI=0.0547969;REFB=-0.00866605;REVB=0.0200365;RO=53;SAF=26;SAR=26;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00860019;STB=0.50476;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.00875523;OID=.;OPOS=19132780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:53:53:52:52:0.495238:26:26:26:27:26:26:26:27
chr16	19336855	.	A	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.868;QD=39.2067;RBI=0.0178318;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000380476;OID=.;OPOS=19336855;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:0:9:0:0:0:9:0:0
chr16	19509937	.	TG	CA,TGCA	1003.74	PASS	AF=0.0361446,0.855422;AO=3,70;DP=83;FAO=3,71;FDP=83;FR=.;FRO=9;FSAF=2,39;FSAR=1,32;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.00908296,0.0243971;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=2,2;MLLD=122.008,211.51;QD=48.3731;RBI=0.0109021,0.0244787;REFB=-0.0127217,-0.0370114;REVB=-0.00602957,0.0019969;RO=9;SAF=2,39;SAR=1,31;SRF=1;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.562113,0.09575;STB=0.855607,0.549282;STBP=0.441,0.011;TYPE=mnp,ins;VARB=0.0401599,0.00109498;OID=.,.;OPOS=19509937,19509939;OREF=TG,-;OALT=CA,CA;OMAPALT=CA,TGCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:36:83:83:9:9:3,70:3,71:0.0361446,0.855422:1,31:2,39:1:8:1,32:2,39:1:8
chr16	19509976	.	C	T	1453.45	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5268;QD=63.1934;RBI=0.0288097;REFB=0;REVB=-0.0217399;RO=0;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000168326;OID=.;OPOS=19509976;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:41:51:0:0:41:51:0:0
chr16	19514483	.	C	T	1038.97	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5672;QD=59.3696;RBI=0.0499908;REFB=0;REVB=-0.0424917;RO=0;SAF=24;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.34603e-05;OID=.;OPOS=19514483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:45:24:0:0:45:25:0:0
chr16	19547747	.	C	G	243.62	PASS	AF=1;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0432893;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.6581;QD=51.2876;RBI=0.0617975;REFB=0;REVB=0.0441018;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00227924;OID=.;OPOS=19547747;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr16	19548461	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000506351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.917;QD=55.0984;RBI=0.0204072;REFB=0;REVB=0.0204009;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.34337e-05;OID=.;OPOS=19548461;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:10:16:0:0:10:16:0:0
chr16	19548670	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00953743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.0706;QD=55.0983;RBI=0.00999608;REFB=0;REVB=0.00299316;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215058;OID=.;OPOS=19548670;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr16	19680546	.	T	C	369.77	PASS	AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=31;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0139395;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.005;QD=21.7509;RBI=0.0139528;REFB=0.00258756;REVB=0.000610147;RO=29;SAF=31;SAR=6;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369924;STB=0.725191;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00100925;OID=.;OPOS=19680546;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:29:31:37:37:0.544118:6:31:14:15:6:31:14:17
chr16	19868687	.	G	C	1353.18	PASS	AF=0.919192;AO=91;DP=100;FAO=91;FDP=99;FR=.;FRO=8;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00637082;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.785;QD=54.6738;RBI=0.0208433;REFB=-0.0156254;REVB=-0.0198458;RO=7;SAF=42;SAR=49;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342364;STB=0.523359;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.00154973;OID=.;OPOS=19868687;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:100:99:7:8:91:91:0.919192:49:42:5:2:49:42:6:2
chr16	20043330	.	T	C	180.91	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.000159882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7095;QD=12.9224;RBI=0.0228466;REFB=-0.0248179;REVB=0.0228461;RO=34;SAF=14;SAR=8;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147695;STB=0.585205;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0286801;OID=.;OPOS=20043330;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:34:22:22:0.392857:8:14:17:17:8:14:17:17
chr16	20334679	.	C	T	349.56	PASS	AF=0.394495;AO=41;DP=105;FAO=43;FDP=109;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=0.0212872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.067;QD=12.828;RBI=0.0228438;REFB=-0.00300177;REVB=-0.00828818;RO=63;SAF=14;SAR=27;SRF=31;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167396;STB=0.58845;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=0.00467472;OID=.;OPOS=20334679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:109:63:66:41:43:0.394495:27:14:31:32:27:16:34:32
chr16	20370810	.	C	T	144.02	PASS	AF=0.253012;AO=21;DP=83;FAO=21;FDP=83;FR=.;FRO=62;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=0.00145127;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=311.329;QD=6.94056;RBI=0.0028237;REFB=-0.0101828;REVB=0.00242221;RO=62;SAF=7;SAR=14;SRF=23;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506967;STB=0.530943;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0295726;OID=.;OPOS=20370810;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:62:62:21:21:0.253012:14:7:23:39:14:7:23:39
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chr16	20441084	.	T	C	93.87	PASS	AF=0.190476;AO=16;DP=84;FAO=16;FDP=84;FR=.;FRO=68;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0202362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.899;QD=4.46982;RBI=0.0269353;REFB=-0.00811593;REVB=-0.0177766;RO=67;SAF=11;SAR=5;SRF=30;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299847;STB=0.697395;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0260596;OID=.;OPOS=20441084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:84:84:67:68:16:16:0.190476:5:11:30:37:5:11:30:38
chr16	20471450	.	G	A	89.88	PASS	AF=0.478261;AO=9;DP=21;FAO=11;FDP=23;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=0.00924977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.563;QD=15.6318;RBI=0.0107887;REFB=-0.0089331;REVB=0.0055531;RO=11;SAF=8;SAR=1;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272723;STB=0.677566;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0078492;OID=.;OPOS=20471450;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:21:23:11:12:9:11:0.478261:1:8:8:3:1:10:9:3
chr16	20476852	.	T	C	613.71	PASS	AF=0.97619;AO=36;DP=37;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0362499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.404;QD=58.4485;RBI=0.0363477;REFB=-0.0288431;REVB=0.00266471;RO=1;SAF=22;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208029;STB=0.509086;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.00113686;OID=.;OPOS=20476852;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:42:1:1:36:41:0.97619:14:22:1:0:14:27:1:0
chr16	20477004	.	C	T	247.49	PASS	AF=0.466667;AO=12;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0566238;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=134.984;QD=16.4993;RBI=0.0605706;REFB=-0.0714061;REVB=0.0215069;RO=25;SAF=9;SAR=3;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.239511;STB=0.602903;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0546048;OID=.;OPOS=20477004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:25:31:12:28:0.466667:3:9:14:11:18:10:17:14
chr16	20488696	.	A	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0615048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.648;QD=35.5759;RBI=0.0668718;REFB=0;REVB=-0.0262487;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000861868;OID=.;OPOS=20488696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr16	20552075	.	G	T	2408.86	PASS	AF=1;AO=150;DP=150;FAO=150;FDP=150;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=84;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00109391;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.455;QD=64.2363;RBI=0.0193934;REFB=0;REVB=0.0193625;RO=0;SAF=66;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.11068e-05;OID=.;OPOS=20552075;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:150:0:0:150:150:1:84:66:0:0:84:66:0:0
chr16	20576048	.	C	A	556.78	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.299;QD=60.1926;RBI=0.026288;REFB=0;REVB=0.00427743;RO=0;SAF=22;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.19202e-05;OID=.;OPOS=20576048;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:14:22:0:0:15:22:0:0
chr16	20635418	.	C	T	482.74	PASS	AF=0.5;AO=48;DP=95;FAO=48;FDP=96;FR=.;FRO=48;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=0.0166023;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.5259;QD=20.1141;RBI=0.0277303;REFB=-0.0725151;REVB=0.022211;RO=47;SAF=30;SAR=18;SRF=14;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287797;STB=0.663199;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.073208;OID=.;OPOS=20635418;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:47:48:48:48:0.5:18:30:14:33:18:30:14:34
chr16	20636814	.	G	A	508.21	PASS	AF=0.5;AO=49;DP=98;FAO=49;FDP=98;FR=.;FRO=49;FSAF=36;FSAR=13;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=-0.00142049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.543;QD=20.7432;RBI=0.0195642;REFB=-0.0278149;REVB=-0.0195125;RO=49;SAF=36;SAR=13;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131428;STB=0.573103;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0236023;OID=.;OPOS=20636814;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:49:49:49:49:0.5:13:36:30:19:13:36:30:19
chr16	20638576	.	A	T	1348.49	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0592923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7984;QD=61.9997;RBI=0.0711567;REFB=0;REVB=0.0393409;RO=0;SAF=50;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000459307;OID=.;OPOS=20638576;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:87:0:0:86:87:1:36:50:0:0:36:51:0:0
chr16	20648702	.	G	A	245.28	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.016421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.159;QD=15.5735;RBI=0.0345617;REFB=-0.00539902;REVB=0.0304115;RO=34;SAF=17;SAR=11;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103459;STB=0.564059;STBP=0.392;TYPE=snp;VARB=0.00603749;OID=.;OPOS=20648702;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:34:35:28:28:0.444444:11:17:24:10:11:17:25:10
chr16	20748331	.	C	A	337.18	PASS	AF=0.406593;AO=37;DP=91;FAO=37;FDP=91;FR=.;FRO=54;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=-0.0248573;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.2485;QD=14.8209;RBI=0.0248969;REFB=-0.0286364;REVB=-0.00140219;RO=54;SAF=18;SAR=19;SRF=24;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0441237;STB=0.524987;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=0.0508264;OID=.;OPOS=20748331;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:54:54:37:37:0.406593:19:18:24:30:19:18:24:30
chr16	20753123	.	T	C	1643.56	PASS	AF=0.990991;AO=110;DP=111;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.004862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.397;QD=59.2275;RBI=0.0263295;REFB=-0.18867;REVB=0.0258767;RO=1;SAF=53;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00825611;STB=0.504347;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.00140339;OID=.;OPOS=20753123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:111:111:1:1:110:110:0.990991:57:53:0:1:57:53:0:1
chr16	20796387	.	G	C	486.06	PASS	AF=0.495146;AO=51;DP=104;FAO=51;FDP=103;FR=.;FRO=52;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.0221091;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6816;QD=18.876;RBI=0.0461239;REFB=-0.00101433;REVB=0.0404797;RO=52;SAF=29;SAR=22;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0805874;STB=0.544636;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.00123075;OID=.;OPOS=20796387;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:103:52:52:51:51:0.495146:22:29:25:27:22:29:25:27
chr16	20809283	.	C	A	260.83	PASS	AF=0.360465;AO=31;DP=85;FAO=31;FDP=86;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=37;FSRR=18;FWDB=-0.00157836;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3467;QD=12.1314;RBI=0.0320536;REFB=-0.0131399;REVB=-0.0320147;RO=53;SAF=19;SAR=12;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101689;STB=0.541037;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0309893;OID=.;OPOS=20809283;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:53:55:31:31:0.360465:12:19:37:16:12:19:37:18
chr16	20811681	.	C	T	110.29	PASS	AF=0.304348;AO=11;DP=43;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.00125737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.398;QD=9.5907;RBI=0.0152921;REFB=-0.0117153;REVB=0.0152403;RO=31;SAF=7;SAR=4;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537584;STB=0.534435;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.0248956;OID=.;OPOS=20811681;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:46:31:32:11:14:0.304348:4:7:21:10:5:9:22:10
chr16	20855309	.	A	G	1355.23	PASS	AF=0.967391;AO=89;DP=92;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=59;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00142606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0742;QD=58.923;RBI=0.00779;REFB=-0.00902109;REVB=-0.00765836;RO=3;SAF=59;SAR=30;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225851;STB=0.511928;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.002018;OID=.;OPOS=20855309;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:92:92:3:3:89:89:0.967391:30:59:1:2:30:59:1:2
chr16	20873767	.	T	G	242.63	PASS	AF=0.522727;AO=19;DP=47;FAO=23;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.00336501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.895;QD=22.0568;RBI=0.0104493;REFB=-0.0309506;REVB=0.00989266;RO=16;SAF=5;SAR=14;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313621;STB=0.618072;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0417622;OID=.;OPOS=20873767;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:44:16:21:19:23:0.522727:14:5:10:6:17:6:10:11
chr16	20959918	.	G	A	182.98	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.00665647;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.192;QD=14.3516;RBI=0.00668986;REFB=-0.00201387;REVB=-0.000667591;RO=30;SAF=7;SAR=14;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211161;STB=0.621503;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0027048;OID=.;OPOS=20959918;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:30:30:21:21:0.411765:14:7:16:14:14:7:16:14
chr16	20966273	.	G	A	530.31	PASS	AF=0.583333;AO=48;DP=84;FAO=49;FDP=84;FR=.;FRO=35;FSAF=43;FSAR=6;FSRF=30;FSRR=5;FWDB=-0.00700916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.459;QD=25.2527;RBI=0.0101275;REFB=-0.0214267;REVB=0.00731015;RO=35;SAF=43;SAR=5;SRF=30;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0742356;STB=0.519202;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0196018;OID=.;OPOS=20966273;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:35:35:48:49:0.583333:5:43:30:5:6:43:30:5
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chr16	20975069	.	G	A	285.21	PASS	AF=0.525424;AO=30;DP=58;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=3;FSRR=25;FWDB=0.00898447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.956;QD=19.3362;RBI=0.0240215;REFB=-0.0230604;REVB=0.0222781;RO=28;SAF=11;SAR=19;SRF=3;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264877;STB=0.649364;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.01448;OID=.;OPOS=20975069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:28:28:30:31:0.525424:19:11:3:25:19:12:3:25
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chr16	20981162	.	T	C	361.85	PASS	AF=0.414894;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=23;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.0124109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.218;QD=15.3978;RBI=0.0341191;REFB=-0.0201545;REVB=0.0317818;RO=53;SAF=23;SAR=16;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102415;STB=0.547898;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0241264;OID=.;OPOS=20981162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:53:55:39:39:0.414894:16:23:26:27:16:23:28:27
chr16	20986610	.	A	G	31.63	PASS	AF=0.091954;AO=8;DP=87;FAO=8;FDP=87;FR=.;FRO=79;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=33;FSRR=46;FWDB=-0.014236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.844;QD=1.45441;RBI=0.0363088;REFB=-0.00269911;REVB=0.0334015;RO=78;SAF=7;SAR=1;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.509543;STB=0.890683;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0319053;OID=.;OPOS=20986610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:87:87:78:79:8:8:0.091954:1:7:32:46:1:7:33:46
chr16	20996441	.	A	C	122.45	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0666401;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3177;QD=14.8429;RBI=0.0803409;REFB=-0.0140499;REVB=0.0448749;RO=19;SAF=11;SAR=3;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134401;STB=0.578826;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.0182422;OID=.;OPOS=20996441;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:33:19:19:14:14:0.424242:3:11:13:6:3:11:13:6
chr16	21008690	.	T	C	264.43	PASS	AF=0.382716;AO=31;DP=81;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=26;FWDB=-0.0165544;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=245.263;QD=13.058;RBI=0.0173305;REFB=-0.00875001;REVB=-0.00512813;RO=49;SAF=10;SAR=21;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188458;STB=0.602972;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0118352;OID=.;OPOS=21008690;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:49:50:31:31:0.382716:21:10:24:25:21:10:24:26
chr16	21045369	.	A	G	325.34	PASS	AF=0.636364;AO=28;DP=43;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0012284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.637;QD=29.5764;RBI=0.012543;REFB=0.0157845;REVB=0.0124827;RO=15;SAF=15;SAR=13;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00152024;STB=0.509797;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=-0.0113927;OID=.;OPOS=21045369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:44:15:16:28:28:0.636364:13:15:8:7:13:15:9:7
chr16	21078693	.	T	G	700.71	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0221329;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.685;QD=60.9311;RBI=0.0413621;REFB=0.00569167;REVB=0.0349422;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510634;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.000232447;OID=.;OPOS=21078693;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:46:0:1:45:45:0.978261:23:22:0:0:23:22:0:1
chr16	21132298	.	T	C	1246.09	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5395;QD=61.5353;RBI=0.0197818;REFB=0;REVB=-0.00667779;RO=0;SAF=44;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.47319e-05;OID=.;OPOS=21132298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:37:44:0:0:37:44:0:0
chr16	21132338	.	T	C	940.76	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.04195;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.753;QD=58.7976;RBI=0.0509855;REFB=0;REVB=0.0289779;RO=0;SAF=30;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.30114e-05;OID=.;OPOS=21132338;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:64:64:1:34:30:0:0:34:30:0:0
chr16	21132749	.	A	C	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043285;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.938;QD=60.2306;RBI=0.0433386;REFB=0;REVB=0.00215477;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151107;OID=.;OPOS=21132749;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:14:23:0:0:14:23:0:0
chr16	21145648	.	C	T	774.89	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1497;QD=63.2565;RBI=0.0245209;REFB=0;REVB=0.00653012;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00164247;OID=.;OPOS=21145648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:23:25:0:0:23:26:0:0
chr16	21145657	.	G	A	727.77	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00224551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.919;QD=63.284;RBI=0.0277222;REFB=0;REVB=0.0276311;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149924;OID=.;OPOS=21145657;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr16	21151980	.	T	C	1456.75	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0354404;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.621;QD=63.3371;RBI=0.0373321;REFB=0;REVB=0.0117331;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.498e-05;OID=.;OPOS=21151980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:92:0:0:92:92:1:42:50:0:0:42:50:0:0
chr16	21190853	.	A	C	922.05	PASS	AF=0.955882;AO=65;DP=69;FAO=65;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0225551;FXX=0.0144907;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.751;QD=54.2384;RBI=0.0233469;REFB=-0.00536867;REVB=0.00602905;RO=3;SAF=35;SAR=30;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0387826;STB=0.520542;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.000493523;OID=.;OPOS=21190853;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:69:68:3:3:65:65:0.955882:30:35:3:0:30:35:3:0
chr16	21217061	.	G	A	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0490211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4587;QD=63.8708;RBI=0.0574892;REFB=0;REVB=0.0300323;RO=0;SAF=19;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000197111;OID=.;OPOS=21217061;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:29:19:0:0:29:19:0:0
chr16	21222672	.	C	A	1115.99	PASS	AF=0.962025;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.000229244;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.567;QD=56.506;RBI=0.0130057;REFB=-0.00310942;REVB=0.0130037;RO=3;SAF=43;SAR=33;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318733;STB=0.51685;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=3.81045e-05;OID=.;OPOS=21222672;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:79:79:3:3:76:76:0.962025:33:43:3:0:33:43:3:0
chr16	21531133	.	C	G	45.82	PASS	AF=0.121951;AO=10;DP=84;FAO=10;FDP=82;FR=.;FRO=72;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=37;FWDB=0.0122218;FXX=0.0238067;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.0089;QD=2.23491;RBI=0.0284963;REFB=-0.00464439;REVB=0.0257423;RO=73;SAF=5;SAR=5;SRF=35;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0247982;STB=0.512171;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0645104;OID=.;OPOS=21531133;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:84:82:73:72:10:10:0.121951:5:5:35:38:5:5:35:37
chr16	21531154	.	G	C	142.33	PASS	AF=0.206897;AO=24;DP=116;FAO=24;FDP=116;FR=.;FRO=92;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=49;FSRR=43;FWDB=-0.0493188;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.346;QD=4.90794;RBI=0.050907;REFB=-0.00842298;REVB=-0.0126164;RO=92;SAF=12;SAR=12;SRF=49;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0412828;STB=0.525841;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0412341;OID=.;OPOS=21531154;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:92:92:24:24:0.206897:12:12:49:43:12:12:49:43
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chr16	21531457	.	T	C	77.61	PASS	AF=0.222222;AO=11;DP=53;FAO=12;FDP=54;FR=.;FRO=42;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=-0.0385418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.1509;QD=5.74885;RBI=0.0753069;REFB=-0.00441608;REVB=-0.0646967;RO=42;SAF=6;SAR=5;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622354;STB=0.509538;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0211924;OID=.;OPOS=21531457;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:53:54:42:42:11:12:0.222222:5:6:25:17:5:7:25:17
chr16	21531473	.	G	A	108.83	PASS	AF=0.272727;AO=15;DP=55;FAO=15;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.106054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1065;QD=7.91474;RBI=0.109978;REFB=-0.023867;REVB=-0.0291144;RO=31;SAF=10;SAR=5;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141254;STB=0.55256;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0509957;OID=.;OPOS=21531473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:40:15:15:0.272727:5:10:17:14:5:10:24:16
chr16	21531494	.	T	C	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.118;QD=58.4197;RBI=0.0444545;REFB=0;REVB=0.0296204;RO=0;SAF=38;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.81224e-05;OID=.;OPOS=21531494;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:25:38:0:0:25:38:0:0
chr16	21531609	.	C	T	167.32	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.114683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5687;QD=41.8303;RBI=0.115254;REFB=-0.0429422;REVB=0.0114534;RO=1;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0434393;STB=0.523778;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0162322;OID=.;OPOS=21531609;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:1:1:15:15:0.9375:10:5:0:1:10:5:0:1
chr16	21658389	.	G	A	181.32	PASS	AF=0.377049;AO=23;DP=60;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=24;FWDB=0.00337065;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.733;QD=11.8896;RBI=0.0499942;REFB=-0.0289168;REVB=-0.0498804;RO=37;SAF=10;SAR=13;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0620437;STB=0.542486;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0474823;OID=.;OPOS=21658389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:37:38:23:23:0.377049:13:10:14:23:13:10:14:24
chr16	21689879	.	T	A	219.73	PASS	AF=0.311111;AO=28;DP=90;FAO=28;FDP=90;FR=.;FRO=62;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.0261276;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=293.183;QD=9.76596;RBI=0.0261276;REFB=-0.0119364;REVB=-1.08098e-05;RO=62;SAF=14;SAR=14;SRF=33;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378351;STB=0.522206;STBP=0.782;TYPE=snp;VARB=0.0251999;OID=.;OPOS=21689879;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:62:62:28:28:0.311111:14:14:33:29:14:14:33:29
chr16	21690559	.	G	A	94.36	PASS	AF=0.363636;AO=13;DP=31;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.0654779;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=33.5783;QD=11.4382;RBI=0.143453;REFB=-0.0507307;REVB=-0.127638;RO=18;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0932572;STB=0.626659;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0700398;OID=.;OPOS=21690559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:31:33:18:21:13:12:0.363636:6:7:8:10:5:7:8:13
chr16	21730449	.	C	T	225.87	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0364916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.414;QD=20.534;RBI=0.0376163;REFB=-0.0314582;REVB=-0.0091297;RO=21;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181635;STB=0.612603;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0377423;OID=.;OPOS=21730449;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:21:22:22:22:0.5:13:9:13:8:13:9:14:8
chr16	21742188	.	G	A	35.75	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.016927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.377;QD=5.95775;RBI=0.017032;REFB=-0.001115;REVB=-0.00188832;RO=18;SAF=2;SAR=4;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424601;STB=0.768454;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00736218;OID=.;OPOS=21742188;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:24:24:18:18:6:6:0.25:4:2:13:5:4:2:13:5
chr16	21747662	.	G	A	38.77	PASS	AF=0.116883;AO=8;DP=76;FAO=9;FDP=77;FR=.;FRO=68;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=30;FSRR=38;FWDB=-0.0430271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.236;QD=2.01393;RBI=0.0465872;REFB=-0.00485457;REVB=-0.0178615;RO=66;SAF=7;SAR=1;SRF=30;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.493004;STB=0.890569;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0880511;OID=.;OPOS=21747662;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:76:77:66:68:8:9:0.116883:1:7:30:36:1:8:30:38
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chr16	22161136	.	T	C	140.29	PASS	AF=0.322034;AO=12;DP=58;FAO=19;FDP=59;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.107065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9644;QD=9.51148;RBI=0.107895;REFB=-0.1079;REVB=0.0133606;RO=36;SAF=2;SAR=10;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.44241;STB=0.587097;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0858278;OID=.;OPOS=22161136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:36:40:12:19:0.322034:10:2:18:18:11:8:22:18
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chr16	22269867	.	A	G	885.36	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310149;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.311;QD=58.0565;RBI=0.0479583;REFB=0;REVB=0.0365797;RO=0;SAF=32;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.07008e-05;OID=.;OPOS=22269867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:29:32:0:0:29:32:0:0
chr16	22357850	.	C	CAG,G	919.91	PASS	AF=0.953125,0.046875;AO=58,3;DP=67;FAO=61,3;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32,3;FSAR=29,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00217204,-0.00457775;FXX=0.0302984;HRUN=0,1;LEN=2,1;MLLD=240.524,54.3453;QD=57.4942;RBI=0.0179332,0.021166;REFB=0,0;REVB=0.0178011,-0.0206651;RO=3;SAF=29,3;SAR=29,0;SRF=1;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0154418,0.712642;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00237864,0.0274918;OID=.,.;OPOS=22357851,22357850;OREF=-,C;OALT=AG,G;OMAPALT=CAG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:67:64:3:0:58,3:61,3:0.953125,0.046875:29,0:29,3:1:2:29,0:32,3:0:0
chr16	23360199	.	T	C	160.26	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0730363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.361;QD=45.7879;RBI=0.0821994;REFB=0;REVB=-0.0377153;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190193;OID=.;OPOS=23360199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:7:7:0:0:7:7:0:0
chr16	23489711	.	C	G	594.25	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00199654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.35;QD=60.9489;RBI=0.0167437;REFB=0;REVB=0.0166242;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.30631e-05;OID=.;OPOS=23489711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:22:17:0:0:22:17:0:0
chr16	23490353	.	T	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.55;QD=44.6898;RBI=0.0334082;REFB=0;REVB=0.00354011;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240485;OID=.;OPOS=23490353;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr16	23536684	.	T	C	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.133;QD=58.1412;RBI=0.0270402;REFB=0;REVB=0.0201617;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127572;OID=.;OPOS=23536684;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr16	23546561	.	G	C	785.18	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0036453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7312;QD=57.1037;RBI=0.114851;REFB=0;REVB=-0.114793;RO=0;SAF=46;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00102391;OID=.;OPOS=23546561;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:9:46:0:0:9:46:0:0
chr16	23563501	.	C	T	3368.64	PASS	AF=1;AO=216;DP=217;FAO=216;FDP=216;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=158;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264483;FXX=0.00460808;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.534;QD=62.3823;RBI=0.0321857;REFB=0;REVB=0.0183414;RO=0;SAF=58;SAR=158;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.95224e-05;OID=.;OPOS=23563501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:217:216:0:0:216:216:1:158:58:0:0:158:58:0:0
chr16	23585061	.	T	C	556.63	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00119211;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.459;QD=60.1764;RBI=0.005465;REFB=0;REVB=-0.0053334;RO=0;SAF=5;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.18619e-06;OID=.;OPOS=23585061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:32:5:0:0:32:5:0:0
chr16	23677006	.	A	G	420.8	PASS	AF=0.488636;AO=41;DP=88;FAO=43;FDP=88;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=0.0189955;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.291;QD=19.1274;RBI=0.0219152;REFB=-0.00194884;REVB=0.0109293;RO=45;SAF=23;SAR=18;SRF=13;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.251564;STB=0.635124;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00467212;OID=.;OPOS=23677006;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:45:45:41:43:0.488636:18:23:13:32:19:24:13:32
chr16	23701255	.	A	G	198.71	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0152718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.661;QD=19.3861;RBI=0.0160219;REFB=-0.0173879;REVB=-0.00484507;RO=21;SAF=10;SAR=10;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107847;STB=0.560915;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.017587;OID=.;OPOS=23701255;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:10:10:13:8:10:10:13:8
chr16	23701538	.	A	G	202.0	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.0392543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.325;QD=21.2633;RBI=0.0392861;REFB=-0.0215013;REVB=-0.00158043;RO=17;SAF=9;SAR=11;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810706;STB=0.556396;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0114427;OID=.;OPOS=23701538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:17:18:20:20:0.526316:11:9:6:11:11:9:6:12
chr16	23711925	.	C	G	536.78	PASS	AF=0.555556;AO=48;DP=89;FAO=50;FDP=90;FR=.;FRO=40;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.00719087;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.936;QD=23.8571;RBI=0.037644;REFB=-0.00778302;REVB=-0.0369508;RO=40;SAF=26;SAR=22;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693875;STB=0.504474;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.00386151;OID=.;OPOS=23711925;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:40:40:48:50:0.555556:22:26:22:18:23:27:22:18
chr16	24166130	.	T	C	389.96	PASS	AF=0.541667;AO=39;DP=72;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=10;FSRR=23;FWDB=-0.00543675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.048;QD=21.6643;RBI=0.0202125;REFB=-0.0104391;REVB=-0.0194675;RO=31;SAF=22;SAR=17;SRF=10;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192291;STB=0.617919;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00840662;OID=.;OPOS=24166130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:31:33:39:39:0.541667:17:22:10:21:17:22:10:23
chr16	24202458	.	C	T	1062.11	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00229637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2311;QD=59.8371;RBI=0.0432211;REFB=0;REVB=0.0431601;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000337203;OID=.;OPOS=24202458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0
chr16	24564879	.	GTATATA	GTATA,GTATAT	320.78	PASS	AF=1,0;AO=14,2;DP=19;FAO=24,0;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6,0;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.169656,0.146616;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=216.874,197.734;QD=53.4632;RBI=0.210895,0.18433;REFB=0,0;REVB=0.125273,0.111719;RO=0;SAF=4,0;SAR=10,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.63386e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.00106954,0;OID=.,.;OPOS=24564880,24564885;OREF=TA,A;OALT=-,-;OMAPALT=GTATA,GTATAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:14,2:19:24,0:24:0:6,0:18,0:0:0:4:0:4,0:10,2:0:0
chr16	24583406	.	A	G	170.07	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=14;FWDB=0.0156593;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=61.7769;QD=17.0067;RBI=0.0505066;REFB=-0.0152276;REVB=-0.0480177;RO=20;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0418177;STB=0.545405;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.0102482;OID=.;OPOS=24583406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:40:20:22:18:18:0.45:10:8:8:12:10:8:8:14
chr16	24834233	.	C	T	239.7	PASS	AF=0.459016;AO=27;DP=61;FAO=28;FDP=61;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0123746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.922;QD=15.7178;RBI=0.0272241;REFB=-0.0215679;REVB=0.0242492;RO=34;SAF=14;SAR=13;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133746;STB=0.557337;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.0372601;OID=.;OPOS=24834233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:33:27:28:0.459016:13:14:13:21:14:14:13:20
chr16	24902194	.	T	C	1989.76	PASS	AF=0.992308;AO=129;DP=130;FAO=129;FDP=130;FR=.;FRO=1;FSAF=94;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0577332;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=74.9232;QD=61.2233;RBI=0.0585869;REFB=-0.0486222;REVB=0.00996522;RO=0;SAF=94;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507041;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.000159727;OID=.;OPOS=24902194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:130:130:0:1:129:129:0.992308:35:94:0:0:35:94:0:1
chr16	25043277	.	G	A	613.2	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.8796;QD=61.32;RBI=0.163773;REFB=0;REVB=0.160762;RO=0;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0026593;OID=.;OPOS=25043277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:20:20:0:0:20:20:0:0
chr16	25137289	.	G	C	350.82	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.904;QD=53.9724;RBI=0.0537478;REFB=0;REVB=-0.0111351;RO=0;SAF=11;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000272353;OID=.;OPOS=25137289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:14:11:0:0:14:12:0:0
chr16	25137385	.	G	A	370.54	PASS	AF=0.4;AO=40;DP=100;FAO=40;FDP=100;FR=.;FRO=60;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=0.00763802;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.3288;QD=14.8215;RBI=0.0152283;REFB=-0.0109017;REVB=-0.0131743;RO=59;SAF=31;SAR=9;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.334485;STB=0.696523;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00889965;OID=.;OPOS=25137385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:59:60:40:40:0.4:9:31:29:30:9:31:29:31
chr16	25137449	.	A	T	449.99	PASS	AF=0.483871;AO=44;DP=91;FAO=45;FDP=93;FR=.;FRO=48;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=15;FWDB=-0.00205584;FXX=0.0106372;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.314;QD=19.3545;RBI=0.0122068;REFB=-0.0232768;REVB=0.0120324;RO=46;SAF=21;SAR=23;SRF=31;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180155;STB=0.612718;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0313487;OID=.;OPOS=25137449;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:93:46:48:44:45:0.483871:23:21:31:15:24:21:33:15
chr16	25239805	.	G	C	133.44	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.00217161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.871;QD=15.6983;RBI=0.0707944;REFB=0.0369221;REVB=0.0707611;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0577034;STB=0.533289;STBP=0.748;TYPE=snp;VARB=-0.0450601;OID=.;OPOS=25239805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:8:7:10:9:8:7:10:9
chr16	27238110	.	C	T	556.21	PASS	AF=0.625;AO=48;DP=78;FAO=50;FDP=80;FR=.;FRO=30;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=-0.0177115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.903;QD=27.8105;RBI=0.0179658;REFB=0.00141001;REVB=0.00301193;RO=29;SAF=28;SAR=20;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102216;STB=0.566984;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.00101651;OID=.;OPOS=27238110;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:80:29:30:48:50:0.625:20:28:21:8:22:28:22:8
chr16	27356203	.	A	G	696.45	PASS	AF=1;AO=44;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00157515;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.034;QD=61.9064;RBI=0.13882;REFB=0;REVB=0.138811;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104678;OID=.;OPOS=27356203;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:47:45:0:0:44:45:1:16:28:0:0:17:28:0:0
chr16	27371158	.	C	T	800.61	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0423306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4264;QD=64.0489;RBI=0.0450577;REFB=0;REVB=-0.0154373;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00046475;OID=.;OPOS=27371158;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0
chr16	27732959	.	GCT	CTG,GCTG	49.09	PASS	AF=0.0465116,0.302326;AO=6,7;DP=39;FAO=2,13;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=0,3;FSAR=2,10;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0282779,0.144865;FXX=0.0227221;HRUN=1,5;LEN=3,1;MLLD=61.803,7.26711;QD=4.56612;RBI=0.0450578,0.17869;REFB=-0.00334017,-0.138318;REVB=-0.0350795,0.104614;RO=19;SAF=0,1;SAR=6,6;SRF=9;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.710835,-0.439766;STB=0.993405,0.607298;STBP=0.319,0.394;TYPE=mnp,ins;VARB=0.144961,0.134614;OID=.,.;OPOS=27732959,27732962;OREF=GCT,-;OALT=CTG,G;OMAPALT=CTG,GCTG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:38:39:43:19:28:6,7:2,13:0.0465116,0.302326:6,6:0,1:9:10:2,10:0,3:10:18
chr16	27772901	.	G	A	745.35	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0335776;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=210.237;QD=53.2396;RBI=0.0337505;REFB=0.0171974;REVB=0.00341219;RO=1;SAF=27;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.017135;STB=0.517851;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=-0.000117345;OID=.;OPOS=27772901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:56:1:2:54:54:0.964286:27:27:1:0:27:27:2:0
chr16	27974487	.	T	C,G	758.84	PASS	AF=0.981481,0.0185185;AO=52,2;DP=54;FAO=53,1;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=18,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00665823,-0.000376498;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=91.2005,129.636;QD=56.2106;RBI=0.0550154,0.00145486;REFB=0,0;REVB=-0.054611,-0.0014053;RO=0;SAF=34,1;SAR=18,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.19096e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000333387,0.0984228;OID=.,.;OPOS=27974487,27974487;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:54:54:0:0:52,2:53,1:0.981481,0.0185185:18,1:34,1:0:0:18,1:35,0:0:0
chr16	28145165	.	T	A	81.96	PASS	AF=0.289474;AO=11;DP=38;FAO=11;FDP=38;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.0426658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.205;QD=8.62778;RBI=0.0433001;REFB=-0.00488887;REVB=-0.0073846;RO=27;SAF=2;SAR=9;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356989;STB=0.723682;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.0100112;OID=.;OPOS=28145165;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:38:38:27:27:11:11:0.289474:9:2:12:15:9:2:12:15
chr16	28222690	.	G	A	59.39	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.107579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.329;QD=15.8364;RBI=0.108054;REFB=0.00358189;REVB=0.010119;RO=7;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.665802;STB=0.887966;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.0101186;OID=.;OPOS=28222690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:1:7:0:7:1:7:0:7
chr16	28354077	.	G	A	205.2	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.0734561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.7211;QD=15.7844;RBI=0.0789282;REFB=-0.0268089;REVB=0.0288767;RO=29;SAF=20;SAR=3;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286821;STB=0.666496;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0270469;OID=.;OPOS=28354077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:3:20:20:9:3:20:20:9
chr16	28354223	.	G	C	100.6	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=23;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=12;FSRR=0;FWDB=0.0617194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.2613;QD=16.7661;RBI=0.0617194;REFB=-0.0185721;REVB=0;RO=12;SAF=11;SAR=0;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0193027;OID=.;OPOS=28354223;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:23:24:12:12:11:12:0.5:0:11:12:0:0:12:12:0
chr16	28508447	.	A	G	158.05	PASS	AF=0.64;AO=16;DP=25;FAO=16;FDP=25;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0106158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.696;QD=25.2873;RBI=0.0115566;REFB=-0.0402113;REVB=-0.00456705;RO=9;SAF=10;SAR=6;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288507;STB=0.516109;STBP=0.853;TYPE=snp;VARB=0.0148389;OID=.;OPOS=28508447;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:9:9:16:16:0.64:6:10:6:3:6:10:6:3
chr16	28508716	.	T	C	246.76	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0608377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.297;QD=47.0027;RBI=0.073164;REFB=-0.172309;REVB=0.0406416;RO=1;SAF=15;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297497;STB=0.516113;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.00222719;OID=.;OPOS=28508716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:21:21:1:1:20:20:0.952381:5:15:1:0:5:15:1:0
chr16	28550117	.	C	G	142.42	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0126607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.0268;QD=13.8948;RBI=0.0274913;REFB=-0.0826902;REVB=-0.0244025;RO=24;SAF=11;SAR=5;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203965;STB=0.608979;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0559967;OID=.;OPOS=28550117;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:24:25:16:16:0.390244:5:11:12:12:5:11:13:12
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chr16	28617485	.	C	T	1358.03	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00292943;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.392;QD=62.438;RBI=0.00293072;REFB=0;REVB=8.68551e-05;RO=0;SAF=36;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.2037e-06;OID=.;OPOS=28617485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:51:36:0:0:51:36:0:0
chr16	28617507	.	C	T	123.71	PASS	AF=0.196262;AO=21;DP=107;FAO=21;FDP=107;FR=.;FRO=86;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=54;FWDB=-0.0333425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.923;QD=4.62448;RBI=0.0599983;REFB=-0.00387942;REVB=-0.0498806;RO=86;SAF=14;SAR=7;SRF=32;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360993;STB=0.725989;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0424134;OID=.;OPOS=28617507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:86:86:21:21:0.196262:7:14:32:54:7:14:32:54
chr16	28617552	.	C	G	182.29	PASS	AF=0.239316;AO=22;DP=118;FAO=28;FDP=117;FR=.,HEALED;FRO=89;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=56;FWDB=0.0199273;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.882;QD=6.23202;RBI=0.0219992;REFB=-0.00715093;REVB=-0.00932017;RO=76;SAF=12;SAR=10;SRF=25;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269234;STB=0.699511;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0218754;OID=.;OPOS=28617552;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:117:76:89:22:28:0.239316:10:12:25:51:10:18:33:56
chr16	28619911	.	T	C	166.69	PASS	AF=0.277108;AO=23;DP=84;FAO=23;FDP=83;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0211226;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.614;QD=8.03301;RBI=0.022452;REFB=-0.00745372;REVB=-0.00761104;RO=60;SAF=12;SAR=11;SRF=27;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0863542;STB=0.551679;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0125709;OID=.;OPOS=28619911;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:60:60:23:23:0.277108:11:12:27:33:11:12:27:33
chr16	28619920	.	A	G	201.08	PASS	AF=0.317073;AO=26;DP=82;FAO=26;FDP=82;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=31;FWDB=-0.0262808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.633;QD=9.80852;RBI=0.026284;REFB=-0.022491;REVB=0.000413815;RO=55;SAF=13;SAR=13;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737742;STB=0.536557;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=0.0433328;OID=.;OPOS=28619920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:55:56:26:26:0.317073:13:13:24:31:13:13:25:31
chr16	28621311	.	T	C	220.6	PASS	AF=0.280702;AO=30;DP=110;FAO=32;FDP=114;FR=.;FRO=82;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=36;FSRR=46;FWDB=0.0122824;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0151;QD=7.74026;RBI=0.0473209;REFB=-0.0146399;REVB=-0.0456991;RO=77;SAF=16;SAR=14;SRF=35;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0951376;STB=0.588181;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.058748;OID=.;OPOS=28621311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:114:77:82:30:32:0.280702:14:16:35:42:14:18:36:46
chr16	28842311	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00355527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.817;QD=50.4135;RBI=0.0199377;REFB=0;REVB=0.0196181;RO=0;SAF=13;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41848e-05;OID=.;OPOS=28842311;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:6:13:0:0:6:13:0:0
chr16	28846506	.	A	AC	31.36	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.12117;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=109.493;QD=5.70212;RBI=0.121423;REFB=-0.000975708;REVB=-0.00783931;RO=15;SAF=5;SAR=2;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342331;STB=0.615062;STBP=0.509;TYPE=ins;VARB=-0.0343419;OID=.;OPOS=28846507;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.318182:7:23:7:22:15:4:3:6:9:31:15:5:2:6:9
chr16	28909622	.	G	A	385.23	PASS	AF=0.575758;AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00764674;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=251.241;QD=23.3471;RBI=0.0375405;REFB=-0.0133661;REVB=-0.0367535;RO=28;SAF=17;SAR=21;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0683424;STB=0.53758;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0102096;OID=.;OPOS=28909622;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:28:28:38:38:0.575758:21:17:15:13:21:17:15:13
chr16	28915527	.	G	A	820.17	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00296486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.212;QD=55.6046;RBI=0.0323847;REFB=0.0324553;REVB=0.0322487;RO=1;SAF=22;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209573;STB=0.511107;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=-6.90927e-05;OID=.;OPOS=28915527;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:36:22:1:0:36:22:1:0
chr16	28944396	.	C	G	727.52	PASS	AF=0.948276;AO=52;DP=56;FAO=55;FDP=58;FR=.;FRO=3;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0858913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.6296;QD=50.1739;RBI=0.0899872;REFB=-0.22209;REVB=0.0268401;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526306;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00975305;OID=.;OPOS=28944396;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:58:0:3:52:55:0.948276:28:24:0:0:28:27:3:0
chr16	28944700	.	G	T	569.8	PASS	AF=0.491667;AO=58;DP=120;FAO=59;FDP=120;FR=.;FRO=61;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=23;FWDB=0.0223296;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.279;QD=18.9932;RBI=0.02583;REFB=-0.00456228;REVB=0.0129836;RO=61;SAF=33;SAR=25;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.051407;STB=0.524467;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=0.00517582;OID=.;OPOS=28944700;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:61:61:58:59:0.491667:25:33:38:23:25:34:38:23
chr16	28990506	.	C	CG,G	48.21	PASS	AF=0.183673,0.0612245;AO=9,4;DP=51;FAO=9,3;FDP=49;FR=.;FRO=37;FSAF=5,2;FSAR=4,1;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=-0.00173898,0.0109856;FXX=0;HRUN=0,2;LEN=1,1;MLLD=55.6316,67.546;QD=3.93575;RBI=0.0646638,0.072526;REFB=-0.012006,-0.0117067;REVB=-0.0646404,-0.0716892;RO=36;SAF=5,2;SAR=4,2;SRF=14;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.201229,0.122994;STB=0.639515,0.748507;STBP=0.367,0.472;TYPE=ins,snp;VARB=0.182863,0.095664;OID=.,.;OPOS=28990507,28990506;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:51:49:36:37:9,4:9,3:0.183673,0.0612245:4,2:5,2:14:22:4,1:5,2:14:23
chr16	28993369	.	C	T	177.27	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0266317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7834;QD=12.2256;RBI=0.027476;REFB=0.000187897;REVB=-0.00675888;RO=35;SAF=11;SAR=11;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0456179;STB=0.517226;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.000203233;OID=.;OPOS=28993369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:36:22:22:0.37931:11:11:16:19:11:11:17:19
chr16	28995757	.	C	A	731.87	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310028;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.085;QD=62.2867;RBI=0.0365628;REFB=0;REVB=0.0193821;RO=0;SAF=19;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000267665;OID=.;OPOS=28995757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:27:19:0:0:27:20:0:0
chr16	29057392	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00195215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.674;QD=40.7619;RBI=0.0174698;REFB=0;REVB=0.0173604;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00021379;OID=.;OPOS=29057392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr16	29063626	.	C	A	36.49	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=19;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0568333;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.8941;QD=7.68125;RBI=0.0622213;REFB=-0.0160189;REVB=-0.0253272;RO=11;SAF=5;SAR=1;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272391;STB=0.640492;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.113934;OID=.;OPOS=29063626;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:19:19:11:13:6:6:0.315789:1:5:7:4:1:5:9:4
chr16	29124421	.	T	C	401.67	PASS	AF=0.476744;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=0.0111173;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2251;QD=18.6823;RBI=0.0174411;REFB=-0.00447975;REVB=0.0134387;RO=45;SAF=22;SAR=19;SRF=24;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00306761;STB=0.50171;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.00527629;OID=.;OPOS=29124421;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:45:45:41:41:0.476744:19:22:24:21:19:22:24:21
chr16	29580611	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.11639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0349;QD=52.6123;RBI=0.11817;REFB=0;REVB=-0.0204333;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00331547;OID=.;OPOS=29580611;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr16	29624886	.	T	C	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=0.0579626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.065;QD=15.2589;RBI=0.0582099;REFB=-0.0332952;REVB=-0.00536022;RO=6;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293682;STB=0.666317;STBP=0.756;TYPE=snp;VARB=0.0144583;OID=.;OPOS=29624886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:6:1:0:6:6:1:0:6
chr16	29679989	.	A	G	745.86	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256128;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.851;QD=60.8867;RBI=0.0315644;REFB=0;REVB=0.0184471;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00188987;OID=.;OPOS=29679989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:49:0:0:45:49:1:17:28:0:0:21:28:0:0
chr16	29680256	.	T	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.324;QD=48.7373;RBI=0.0232859;REFB=0;REVB=0.0168421;RO=0;SAF=1;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.64082e-06;OID=.;OPOS=29680256;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:16:1:0:0:16:1:0:0
chr16	29680389	.	A	C	491.52	PASS	AF=0.589744;AO=46;DP=78;FAO=46;FDP=78;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.00539592;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.359;QD=25.2062;RBI=0.0186288;REFB=-0.0214577;REVB=0.0178302;RO=32;SAF=25;SAR=21;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561322;STB=0.530713;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0148049;OID=.;OPOS=29680389;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:32:32:46:46:0.589744:21:25:15:17:21:25:15:17
chr16	29708350	.	A	G	411.05	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0327832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6715;QD=56.6969;RBI=0.0508306;REFB=0;REVB=-0.038846;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00150503;OID=.;OPOS=29708350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr16	29790864	.	G	A	836.76	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0153293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2365;QD=55.7839;RBI=0.0775043;REFB=-0.0743321;REVB=0.0759732;RO=1;SAF=27;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171544;STB=0.509088;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00279065;OID=.;OPOS=29790864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:32:27:1:0:32:27:1:0
chr16	29791561	.	T	G	1419.64	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=47;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0115921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3782;QD=61.7234;RBI=0.0374715;REFB=-0.113766;REVB=-0.0356334;RO=1;SAF=47;SAR=44;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0106514;STB=0.505617;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00153572;OID=.;OPOS=29791561;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:1:1:91:91:0.98913:44:47:0:1:44:47:0:1
chr16	29791721	.	G	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0186632;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6064;QD=51.9164;RBI=0.0338619;REFB=0;REVB=-0.0282544;RO=0;SAF=7;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00105605;OID=.;OPOS=29791721;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:14:7:0:0:14:7:0:0
chr16	29814234	.	G	A	1054.13	PASS	AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=44;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0272612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=261.036;QD=56.9801;RBI=0.0501348;REFB=-0.0169497;REVB=0.0420753;RO=2;SAF=28;SAR=44;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325832;STB=0.517237;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.000949287;OID=.;OPOS=29814234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:74:74:2:2:72:72:0.972973:44:28:2:0:44:28:2:0
chr16	29821744	.	G	A	1283.43	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.756;QD=61.8519;RBI=0.0243316;REFB=0;REVB=-0.0187147;RO=0;SAF=51;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.13387e-05;OID=.;OPOS=29821744;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:32:51:0:0:32:51:0:0
chr16	29825126	.	T	C	886.72	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.7709;QD=57.2077;RBI=0.0175353;REFB=0;REVB=0.00819655;RO=0;SAF=30;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.52883e-05;OID=.;OPOS=29825126;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:62:0:0:60:62:1:30:30:0:0:31:31:0:0
chr16	29826538	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=9;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00594818;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.265;QD=42.1811;RBI=0.00723511;REFB=0;REVB=0.00411897;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.70488e-05;OID=.;OPOS=29826538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:9:11:1:3:6:0:0:4:7:0:0
chr16	29897041	.	AG	A	97.28	PASS	AF=1;AO=10;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.225719;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.1573;QD=24.319;RBI=0.275172;REFB=-0.0648404;REVB=0.157387;RO=5;SAF=8;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0.529412;SSSB=0.160449;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0457381;OID=.;OPOS=29897042;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:10:16:16:16:0:12:4:0:0:5:5:8:2:3:2
chr16	29899123	.	G	T	149.09	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0656191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9028;QD=18.6367;RBI=0.07383;REFB=-0.0137038;REVB=0.0338379;RO=16;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166872;STB=0.595118;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0172917;OID=.;OPOS=29899123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:6:10:7:9:6:10:7:9
chr16	29908433	.	C	G	774.14	PASS	AF=0.965517;AO=57;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0389591;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.389;QD=53.389;RBI=0.0448629;REFB=-0.0980034;REVB=-0.0222456;RO=0;SAF=30;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.518512;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.00251642;OID=.;OPOS=29908433;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:0:2:57:56:0.965517:27:30:0:0:26:30:0:2
chr16	29918034	.	T	C	99.91	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=14;FSRR=0;FWDB=0.0108915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.793;QD=15.3709;RBI=0.0663453;REFB=-0.00762849;REVB=0.0654452;RO=14;SAF=11;SAR=1;SRF=14;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352121;STB=0.694232;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0105927;OID=.;OPOS=29918034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:1:11:14:0:1:11:14:0
chr16	29994922	.	C	T	128.04	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.0196995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.078;QD=20.4857;RBI=0.0209715;REFB=-0.0438379;REVB=0.00719266;RO=11;SAF=3;SAR=11;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383862;STB=0.521709;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.029348;OID=.;OPOS=29994922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:11:3:2:9:11:3:2:9
chr16	29998200	.	A	G	422.93	PASS	AF=0.569444;AO=40;DP=72;FAO=41;FDP=72;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=-0.00368586;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.413;QD=23.4961;RBI=0.0294444;REFB=-0.0171448;REVB=-0.0292128;RO=31;SAF=23;SAR=17;SRF=9;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223025;STB=0.625191;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.010194;OID=.;OPOS=29998200;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:31:31:40:41:0.569444:17:23:9:22:17:24:9:22
chr16	30005703	.	CCT	CC,C	36.76	PASS	AF=0,0.318182;AO=3,9;DP=24;FAO=0,7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=0,5;FSAR=0,2;FSRF=14;FSRR=1;FWDB=-0.230745,-0.191812;FXX=0;HRUN=4,5;LEN=1,2;MLLD=8.26537,21.1873;QD=6.68421;RBI=0.331934,0.235304;REFB=-0.121243,-0.0694067;REVB=0.238615,0.136295;RO=10;SAF=3,8;SAR=0,1;SRF=7;SRR=3;SSEN=0.442529,0;SSEP=0,0;SSSB=0.597037,0.297103;STB=0.5,0.716554;STBP=1,0.443;TYPE=del,del;VARB=0,0.112998;OID=.,.;OPOS=30005705,30005704;OREF=T,CT;OALT=-,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.318182:3,9:24:0,7:22:15:0,5:0,2:14:1:36:10:3,8:0,1:7:3
chr16	30018500	.	C	T	107.96	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.031839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4373;QD=14.891;RBI=0.101798;REFB=0.0179955;REVB=0.0966903;RO=16;SAF=10;SAR=3;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233108;STB=0.636714;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.0218684;OID=.;OPOS=30018500;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:3:10:9:7:3:10:9:7
chr16	30021402	.	C	T	257.77	PASS	AF=0.545455;AO=24;DP=44;FAO=24;FDP=44;FR=.;FRO=20;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=3;FSRR=17;FWDB=0.00490516;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=283.867;QD=23.4336;RBI=0.0102189;REFB=-0.0261039;REVB=-0.00896465;RO=20;SAF=16;SAR=8;SRF=3;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405018;STB=0.724462;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0169315;OID=.;OPOS=30021402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:20:20:24:24:0.545455:8:16:3:17:8:16:3:17
chr16	30034986	.	G	A	110.66	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00367042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.81;QD=15.2639;RBI=0.00571202;REFB=-0.0526591;REVB=-0.00437666;RO=14;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0412168;STB=0.530339;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0514668;OID=.;OPOS=30034986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:16:13:13:0.448276:5:8:8:6:5:8:9:7
chr16	30081367	.	G	T	322.51	PASS	AF=0.395604;AO=36;DP=91;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=8;FSRF=44;FSRR=11;FWDB=0.0156865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.017;QD=14.1764;RBI=0.0319746;REFB=-0.0239967;REVB=0.0278623;RO=55;SAF=28;SAR=8;SRF=44;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350116;STB=0.519845;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0403852;OID=.;OPOS=30081367;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:55:55:36:36:0.395604:8:28:44:11:8:28:44:11
chr16	30097630	.	C	T	78.59	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00803953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.425;QD=13.668;RBI=0.0532644;REFB=-0.0279414;REVB=0.0526542;RO=12;SAF=4;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170018;STB=0.578788;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0198218;OID=.;OPOS=30097630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:23:23:12:13:10:10:0.434783:6:4:7:5:6:4:7:6
chr16	30106221	.	G	A	133.49	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00127515;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7163;QD=16.686;RBI=0.0165778;REFB=-0.0255687;REVB=0.0165286;RO=16;SAF=7;SAR=8;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14199;STB=0.594918;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0732831;OID=.;OPOS=30106221;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:17:15:15:0.46875:8:7:10:6:8:7:11:6
chr16	30119525	.	C	A	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.342;QD=64.1538;RBI=0.0295618;REFB=0;REVB=2.181e-05;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48191e-05;OID=.;OPOS=30119525;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0
chr16	30198151	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.33;QD=47.8224;RBI=0.0144805;REFB=0;REVB=-0.00421907;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.33762e-05;OID=.;OPOS=30198151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:3:13:0:0:3:13:0:0
chr16	30393660	.	G	A	724.43	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0205221;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.578;QD=59.1373;RBI=0.020565;REFB=-0.143713;REVB=0.00132818;RO=2;SAF=27;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0058354;STB=0.503104;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.000488048;OID=.;OPOS=30393660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:49:2:2:47:47:0.959184:20:27:1:1:20:27:1:1
chr16	30408765	.	C	T	805.14	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.2924;QD=64.4114;RBI=0.0355793;REFB=0;REVB=-0.0212601;RO=0;SAF=21;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.64258e-05;OID=.;OPOS=30408765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:29:21:0:0:29:21:0:0
chr16	30536994	.	A	G	135.78	PASS	AF=0.7;AO=14;DP=20;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.0162898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.279;QD=27.1559;RBI=0.0195192;REFB=-0.010658;REVB=0.0107538;RO=6;SAF=12;SAR=2;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385962;STB=0.71963;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00719549;OID=.;OPOS=30536994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:6:6:14:14:0.7:2:12:2:4:2:12:2:4
chr16	30545684	.	CCGGGGC	CCGGG,CCGGGC,CGGGC	142.65	PASS	AF=0,1,0;AO=4,4,9;DP=25;FAO=0,20,0;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=0,5,0;FSAR=0,15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.421259,0.196133,-0.147755;FXX=0;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,2;MLLD=8.37632,9.37437,8.52098;QD=28.53;RBI=0.422102,0.251013,0.22058;REFB=0,0,0;REVB=-0.0266551,0.156651,-0.16378;RO=4;SAF=1,0,3;SAR=3,4,6;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-0.687804,0.0514675;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.00762513,0.0347667,0;OID=.,.,.;OPOS=30545689,30545686,30545685;OREF=GC,G,CG;OALT=-,-,-;OMAPALT=CCGGG,CCGGGC,CGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1,0:4,4,9:25:0,20,0:20:0:0,5,0:0,15,0:0:0:3:4:1,0,3:3,4,6:1:3
chr16	30680467	.	G	A	676.86	PASS	AF=0.545455;AO=66;DP=121;FAO=66;FDP=121;FR=.;FRO=55;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.0151258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.326;QD=22.3754;RBI=0.015174;REFB=-0.0101454;REVB=-0.00120862;RO=55;SAF=31;SAR=35;SRF=24;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.027817;STB=0.515231;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.00840581;OID=.;OPOS=30680467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:55:55:66:66:0.545455:35:31:24:31:35:31:24:31
chr16	30724070	.	G	T	1116.73	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6414;QD=60.3638;RBI=0.0305792;REFB=0;REVB=0.00531125;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172553;OID=.;OPOS=30724070;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:74:0:0:73:74:1:39:34:0:0:40:34:0:0
chr16	30734963	.	C	A	182.89	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0534034;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.457;QD=43.033;RBI=0.067914;REFB=-0.0922131;REVB=0.041957;RO=1;SAF=9;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481057;STB=0.526283;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.0010235;OID=.;OPOS=30734963;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:7:9:1:0:7:9:1:0
chr16	30745938	.	TA	AT,GT,T	35.59	PASS	AF=0.0125,0,0.225;AO=3,7,27;DP=80;FAO=1,0,18;FDP=80;FR=.;FRO=61;FSAF=0,0,12;FSAR=1,0,6;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=-0.0294087,-0.117398,-0.176981;FXX=0;HRUN=1,1,7;LEN=2,2,1;MLLD=142.044,29.5742,7.3952;QD=1.77967;RBI=0.0416022,0.117563,0.18669;REFB=-0.0230703,-0.0849704,-0.185232;REVB=-0.0294257,-0.00622474,0.0594205;RO=41;SAF=0,6,20;SAR=3,1,7;SRF=12;SRR=29;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.424715,0.611302,0.460966;STB=0.988947,0.5,0.672078;STBP=0.495,1,0.108;TYPE=mnp,mnp,del;VARB=0.129492,0,0.190569;OID=.,.,.;OPOS=30745938,30745938,30745939;OREF=TA,TA,A;OALT=AT,GT,-;OMAPALT=AT,GT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:35:80:80:41:61:3,7,27:1,0,18:0.0125,0,0.225:3,1,7:0,6,20:12:29:1,0,6:0,0,12:27:34
chr16	30762640	.	C	T	582.43	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0214109;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=206.336;QD=58.2434;RBI=0.022785;REFB=0.04503;REVB=0.00779304;RO=1;SAF=22;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208334;STB=0.511105;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=-0.000119469;OID=.;OPOS=30762640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:17:22:1:0:17:22:1:0
chr16	30779716	.	A	G	2465.39	PASS	AF=1;AO=156;DP=157;FAO=161;FDP=161;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0448811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.341;QD=61.252;RBI=0.0519978;REFB=0;REVB=0.0262575;RO=0;SAF=57;SAR=99;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.1699e-05;OID=.;OPOS=30779716;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:157:161:0:0:156:161:1:99:57:0:0:101:60:0:0
chr16	30780828	.	A	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0316862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.877;QD=58.1421;RBI=0.0332832;REFB=0;REVB=-0.0101861;RO=0;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.32181e-05;OID=.;OPOS=30780828;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:9:23:0:0:9:23:0:0
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chr16	30964940	.	A	G	747.41	PASS	AF=0.918033;AO=56;DP=61;FAO=56;FDP=61;FR=.;FRO=5;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0702533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.8998;QD=49.0108;RBI=0.0770099;REFB=-0.0953791;REVB=-0.0315435;RO=5;SAF=31;SAR=25;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070205;STB=0.5373;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.0401931;OID=.;OPOS=30964940;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:61:61:5:5:56:56:0.918033:25:31:5:0:25:31:5:0
chr16	30999142	.	A	G	455.04	PASS	AF=0.76087;AO=35;DP=46;FAO=35;FDP=46;FR=.;FRO=11;FSAF=32;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0.00360656;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0718;QD=39.5684;RBI=0.026343;REFB=-0.00455199;REVB=-0.026095;RO=0;SAF=32;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.823298;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0019704;OID=.;OPOS=30999142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:46:46:0:11:35:35:0.76087:3:32:0:0:3:32:0:11
chr16	30999462	.	T	C	1116.81	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.021642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.669;QD=60.3679;RBI=0.0833656;REFB=0;REVB=-0.0805074;RO=0;SAF=46;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000697275;OID=.;OPOS=30999462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:28:46:0:0:28:46:0:0
chr16	31075175	.	G	A,C	737.64	PASS	AF=0.90566,0.0943396;AO=47,6;DP=53;FAO=48,5;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=24,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234821,-0.0214676;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=116.981,83.6847;QD=55.6705;RBI=0.032461,0.0271145;REFB=0,0;REVB=0.0224123,-0.0165631;RO=0;SAF=24,0;SAR=23,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00543667,0.129205;OID=.,.;OPOS=31075175,31075175;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:53:53:0:0:47,6:48,5:0.90566,0.0943396:23,6:24,0:0:0:24,5:24,0:0:0
chr16	31075708	.	C	G	306.06	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.1;QD=53.2284;RBI=0.0397113;REFB=0;REVB=-0.00324351;RO=0;SAF=12;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000271936;OID=.;OPOS=31075708;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:11:12:0:0:11:12:0:0
chr16	31088347	.	G	A	1377.25	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0150055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.0112;QD=62.6022;RBI=0.0322676;REFB=0;REVB=0.0285663;RO=0;SAF=41;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255501;OID=.;OPOS=31088347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:88:0:0:88:88:1:47:41:0:0:47:41:0:0
chr16	31088625	.	A	G	571.45	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.938;QD=60.1527;RBI=0.071557;REFB=0;REVB=0.0673564;RO=0;SAF=26;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.14899e-05;OID=.;OPOS=31088625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:38:0:0:35:38:1:9:26:0:0:11:27:0:0
chr16	31093892	.	A	G	612.82	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.525;QD=59.7877;RBI=0.0310856;REFB=0;REVB=0.015614;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220596;OID=.;OPOS=31093892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:40:41:1:14:26:0:0:15:26:0:0
chr16	31099011	.	T	C	277.6	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0255809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.064;QD=20.5627;RBI=0.0656942;REFB=-0.00394954;REVB=-0.0605091;RO=25;SAF=20;SAR=9;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219412;STB=0.622375;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=0.00239667;OID=.;OPOS=31099011;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:9:20:11:14:9:20:11:14
chr16	31121793	.	G	A	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.334;QD=37.4867;RBI=0.0201006;REFB=0;REVB=0.00996959;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000467661;OID=.;OPOS=31121793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr16	31141826	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00217125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.412;QD=51.9163;RBI=0.0428926;REFB=0;REVB=0.0428376;RO=0;SAF=16;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000563975;OID=.;OPOS=31141826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:5:16:0:0:5:16:0:0
chr16	31141880	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00469097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.81;QD=52.6126;RBI=0.0695748;REFB=0;REVB=0.0694165;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000391476;OID=.;OPOS=31141880;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
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chr16	33630022	.	A	T	321.31	PASS	AF=0.363636;AO=40;DP=110;FAO=40;FDP=110;FR=.;FRO=70;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=-0.00148602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.207;QD=11.684;RBI=0.0132202;REFB=-0.00403369;REVB=-0.0131364;RO=70;SAF=21;SAR=19;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0519188;STB=0.529693;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.00647192;OID=.;OPOS=33630022;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:70:70:40:40:0.363636:19:21:40:30:19:21:40:30
chr16	33961317	.	G	A	43.02	PASS	AF=0.21875;AO=6;DP=31;FAO=7;FDP=32;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=19;FWDB=0.0234232;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.488;QD=5.37738;RBI=0.0324755;REFB=-7.24081e-05;REVB=0.0224948;RO=25;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134621;STB=0.545331;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.00112772;OID=.;OPOS=33961317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:31:32:25:25:6:7:0.21875:4:2:6:19:5:2:6:19
chr16	33961327	.	G	T	35.04	PASS	AF=0.214286;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.00107102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.593;QD=5.00556;RBI=0.0349994;REFB=-0.0150275;REVB=-0.034983;RO=22;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275166;STB=0.678052;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0298739;OID=.;OPOS=33961327;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:28:28:22:22:6:6:0.214286:3:3:6:16:3:3:6:16
chr16	33961370	.	A	C	31.66	PASS	AF=0.555556;AO=4;DP=8;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0337259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.844;QD=14.0731;RBI=0.0507296;REFB=-0.0210034;REVB=0.0378954;RO=3;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.357477;STB=0.651584;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00406062;OID=.;OPOS=33961370;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:8:9:3:4:4:5:0.555556:2:2:0:3:2:3:1:3
chr16	33961702	.	C	A	35.56	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0477304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.81;QD=5.68901;RBI=0.0674878;REFB=0.000585717;REVB=-0.0477117;RO=19;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235388;STB=0.659768;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=-0.00430654;OID=.;OPOS=33961702;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:5:1:6:13:5:1:6:13
chr16	33961705	.	A	G	35.74	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0731494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.096;QD=5.95705;RBI=0.093592;REFB=-0.00608887;REVB=-0.0583835;RO=17;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206131;STB=0.624531;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0403894;OID=.;OPOS=33961705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:24:24:17:18:6:6:0.25:5:1:5:12:5:1:5:13
chr16	33962422	.	C	A	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0488298;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.568;QD=16.1976;RBI=0.0593402;REFB=-0.0168175;REVB=0.0337181;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0436878;STB=0.526212;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0600654;OID=.;OPOS=33962422;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:2:3:2:1:2:3:2:1
chr16	33962435	.	G	A	87.12	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=15;FAO=7;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0257386;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.3419;QD=24.8901;RBI=0.0851834;REFB=-0.00362098;REVB=0.0812018;RO=4;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.290716;STB=0.66626;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00906862;OID=.;OPOS=33962435;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:15:14:4:4:7:7:0.5:3:4:4:0:3:4:4:0
chr16	33962500	.	T	G	34.07	PASS	AF=0.0925926;AO=5;DP=53;FAO=5;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=47;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=32;FWDB=-0.0249073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.486;QD=2.52357;RBI=0.024928;REFB=-0.0025767;REVB=0.0010154;RO=45;SAF=4;SAR=1;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.507526;STB=0.872979;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.0555066;OID=.;OPOS=33962500;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:53:54:45:47:5:5:0.0925926:1:4:14:31:1:4:15:32
chr16	33962542	.	T	A	45.62	PASS	AF=0.134328;AO=9;DP=67;FAO=9;FDP=67;FR=.;FRO=58;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=39;FWDB=0.0187567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8957;QD=2.72361;RBI=0.0216018;REFB=-0.00166114;REVB=0.0107158;RO=58;SAF=4;SAR=5;SRF=19;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149764;STB=0.604594;STBP=0.568;TYPE=snp;VARB=0.0102752;OID=.;OPOS=33962542;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:67:67:58:58:9:9:0.134328:5:4:19:39:5:4:19:39
chr16	33962560	.	AGG	ACA	455.85	PASS	AF=0.5625;AO=36;DP=65;FAO=36;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=18;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=15;FWDB=-0.0173828;FXX=0.0153822;HRUN=2;LEN=2;MLLD=180.821;QD=28.4905;RBI=0.0201811;REFB=-0.0409455;REVB=0.0102525;RO=18;SAF=12;SAR=24;SRF=3;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1202;STB=0.565183;STBP=0.249;TYPE=mnp;VARB=0.0165971;OID=.;OPOS=33962561;OREF=GG;OALT=CA;OMAPALT=ACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5625:36:65:36:64:18:12:24:3:15:99:18:12:24:3:15
chr16	33962570	.	G	A	253.12	PASS	AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0188549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.597;QD=15.1115;RBI=0.0231069;REFB=0.00622284;REVB=-0.0133576;RO=38;SAF=7;SAR=22;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212833;STB=0.621531;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.00472475;OID=.;OPOS=33962570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:22:7:16:22:22:7:16:22
chr16	33962619	.	G	A	168.17	PASS	AF=0.392157;AO=20;DP=54;FAO=20;FDP=51;FR=.;FRO=31;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0446919;FXX=0.0727141;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.252;QD=13.1901;RBI=0.0450297;REFB=-0.00660306;REVB=0.00550485;RO=29;SAF=4;SAR=16;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308253;STB=0.685508;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.00627267;OID=.;OPOS=33962619;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:51:29:31:20:20:0.392157:16:4:13:16:16:4:14:17
chr16	33962641	.	G	T	129.38	PASS	AF=0.340909;AO=15;DP=44;FAO=15;FDP=44;FR=.;FRO=29;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0036139;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8172;QD=11.7621;RBI=0.0333511;REFB=-0.00080964;REVB=-0.0331547;RO=29;SAF=3;SAR=12;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.324432;STB=0.695363;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.00361953;OID=.;OPOS=33962641;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:29:29:15:15:0.340909:12:3:13:16:12:3:13:16
chr16	33962907	.	AGGA	GGGG,TGGG	65.75	PASS	AF=0.0689655,0.137931;AO=2,4;DP=29;FAO=2,4;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=1,1;FSAR=1,3;FSRF=18;FSRR=1;FWDB=-0.00749194,0.0044354;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=4,4;MLLD=174.21,182.47;QD=9.06912;RBI=0.0248364,0.0323885;REFB=-0.00998306,-0.00678616;REVB=0.0236795,0.0320834;RO=17;SAF=1,1;SAR=1,3;SRF=16;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.605052,-0.710953;STB=0.903355,0.933481;STBP=0.766,0.471;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0553989,-0.00146243;OID=.,.;OPOS=33962907,33962907;OREF=AGGA,AGGA;OALT=GGGG,TGGG;OMAPALT=GGGG,TGGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:23:29:29:17:19:2,4:2,4:0.0689655,0.137931:1,3:1,1:16:1:1,3:1,1:18:1
chr16	33962923	.	G	A	105.53	PASS	AF=0.325;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0120383;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.035;QD=10.5527;RBI=0.0171592;REFB=0.0109665;REVB=0.0122278;RO=28;SAF=8;SAR=5;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518065;STB=0.516104;STBP=0.928;TYPE=snp;VARB=-0.0460815;OID=.;OPOS=33962923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:28:27:13:13:0.325:5:8:16:12:5:8:16:11
chr16	33962930	.	G	T	103.47	PASS	AF=0.309524;AO=13;DP=42;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.0272743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.534;QD=9.85417;RBI=0.0278274;REFB=-0.00497099;REVB=-0.00552052;RO=29;SAF=8;SAR=5;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114476;STB=0.56918;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0308694;OID=.;OPOS=33962930;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:29:29:13:13:0.309524:5:8:15:14:5:8:15:14
chr16	33962978	.	AT	GC	31.5	PASS	AF=0.115385;AO=6;DP=52;FAO=6;FDP=52;FR=.;FRO=46;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0100331;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=144.381;QD=2.42283;RBI=0.0100404;REFB=0.00031174;REVB=0.000384587;RO=46;SAF=1;SAR=5;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.436576;STB=0.832225;STBP=0.13;TYPE=mnp;VARB=-0.00130824;OID=.;OPOS=33962978;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:52:52:46:46:6:6:0.115385:5:1:25:21:5:1:25:21
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chr16	33963000	.	T	C	197.71	PASS	AF=0.425926;AO=21;DP=53;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=0.0129816;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.22;QD=14.6454;RBI=0.0386269;REFB=-0.00255058;REVB=0.0363802;RO=32;SAF=8;SAR=13;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127336;STB=0.572767;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.00385396;OID=.;OPOS=33963000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:32:31:21:23:0.425926:13:8:16:16:14:9:16:15
chr16	33963002	.	G	A	88.53	PASS	AF=0.236364;AO=13;DP=55;FAO=13;FDP=55;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=0.0172019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.631;QD=6.43828;RBI=0.0577778;REFB=-0.000595933;REVB=-0.0551577;RO=39;SAF=8;SAR=5;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215081;STB=0.657299;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00683343;OID=.;OPOS=33963002;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:55:55:39:42:13:13:0.236364:5:8:17:22:5:8:17:25
chr16	33963003	.	A	G	135.35	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=52;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.00928988;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.438;QD=10.0259;RBI=0.0572247;REFB=-0.0174266;REVB=0.0564656;RO=37;SAF=5;SAR=10;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246202;STB=0.675122;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0147235;OID=.;OPOS=33963003;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:54:37:36:15:18:0.333333:10:5:20:17:13:5:19:17
chr16	33963015	.	T	C	990.0	PASS	AF=0.669291;AO=85;DP=127;FAO=85;FDP=127;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=57;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=-0.00309801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.352;QD=31.1811;RBI=0.0375584;REFB=-0.028451;REVB=0.0374305;RO=42;SAF=28;SAR=57;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143275;STB=0.57734;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0144657;OID=.;OPOS=33963015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:42:42:85:85:0.669291:57:28:23:19:57:28:23:19
chr16	33963020	.	C	A	1649.96	PASS	AF=0.796296;AO=101;DP=164;FAO=129;FDP=162;FR=.,HEALED;FRO=33;FSAF=39;FSAR=90;FSRF=19;FSRR=14;FWDB=0.0760467;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.691;QD=40.7398;RBI=0.0810978;REFB=-0.0507118;REVB=0.0281736;RO=34;SAF=26;SAR=75;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183651;STB=0.562732;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0134544;OID=.;OPOS=33963020;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:162:34:33:101:129:0.796296:75:26:20:14:90:39:19:14
chr16	33963046	.	T	C	6894.56	PASS	AF=0.94274;AO=423;DP=452;FAO=461;FDP=489;FR=.;FRO=28;FSAF=205;FSAR=256;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-3.76008e-05;FXX=0.00204077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.671;QD=56.3972;RBI=0.11043;REFB=-0.0430943;REVB=0.11043;RO=28;SAF=203;SAR=220;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00184956;STB=0.501136;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.00553188;OID=.;OPOS=33963046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:452:489:28:28:423:461:0.94274:220:203:13:15:256:205:13:15
chr16	33963086	.	A	G	7861.48	PASS	AF=0.945455;AO=521;DP=549;FAO=520;FDP=550;FR=.;FRO=30;FSAF=225;FSAR=295;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.050389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9346;QD=57.1744;RBI=0.0517184;REFB=-0.033293;REVB=0.0116508;RO=24;SAF=227;SAR=294;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00162514;STB=0.503735;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.00726972;OID=.;OPOS=33963086;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:549:550:24:30:521:520:0.945455:294:227:10:14:295:225:15:15
chr16	33963106	.	T	C	8175.08	PASS	AF=0.975926;AO=526;DP=541;FAO=527;FDP=540;FR=.;FRO=13;FSAF=231;FSAR=296;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0152095;FXX=0.00368997;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.072;QD=60.5561;RBI=0.0261246;REFB=-0.103292;REVB=0.0212407;RO=12;SAF=231;SAR=295;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00262745;STB=0.502446;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.00133091;OID=.;OPOS=33963106;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:541:540:12:13:526:527:0.975926:295:231:6:6:296:231:7:6
chr16	33963108	.	A	G	8179.2	PASS	AF=0.975926;AO=519;DP=532;FAO=527;FDP=540;FR=.;FRO=13;FSAF=234;FSAR=293;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00211766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.531;QD=60.5867;RBI=0.00762994;REFB=-0.0245815;REVB=0.00733018;RO=13;SAF=229;SAR=290;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00631879;STB=0.503326;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.000909889;OID=.;OPOS=33963108;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:532:540:13:13:519:527:0.975926:290:229:4:9:293:234:4:9
chr16	33963175	.	C	G	7149.88	PASS	AF=0.976842;AO=462;DP=475;FAO=464;FDP=475;FR=.;FRO=11;FSAF=203;FSAR=261;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.012729;FXX=0.00419278;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.822;QD=60.2095;RBI=0.0334991;REFB=0.0166384;REVB=-0.0309865;RO=10;SAF=202;SAR=260;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00564046;STB=0.501738;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=-0.00090186;OID=.;OPOS=33963175;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:475:475:10:11:462:464:0.976842:260:202:3:7:261:203:4:7
chr16	33963202	.	A	G	4930.64	PASS	AF=1;AO=314;DP=314;FAO=314;FDP=314;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=181;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.625;QD=62.8107;RBI=0.0237923;REFB=0;REVB=0.0203443;RO=0;SAF=133;SAR=181;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53112e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.41203e-06;OID=.;OPOS=33963202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:27:314:314:0:0:314:314:1:181:133:0:0:181:133:0:0
chr16	33963210	.	AT	GC	3775.49	PASS	AF=1;AO=236;DP=242;FAO=239;FDP=239;FR=.;FRO=0;FSAF=95;FSAR=144;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000358822;FXX=0.0123962;HRUN=1;LEN=2;MLLD=186.386;QD=63.1881;RBI=0.00154744;REFB=0;REVB=0.00150527;RO=0;SAF=92;SAR=144;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.20056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=6.4779e-05;OID=.;OPOS=33963210;OREF=AT;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:242:239:0:0:236:239:1:144:92:0:0:144:95:0:0
chr16	33963224	.	T	C	2803.13	PASS	AF=0.989011;AO=180;DP=183;FAO=180;FDP=182;FR=.;FRO=2;FSAF=86;FSAR=94;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00811019;FXX=0.010869;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0389;QD=61.6073;RBI=0.0183529;REFB=-0.137668;REVB=0.0164637;RO=1;SAF=86;SAR=94;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00550367;STB=0.500245;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.00175796;OID=.;OPOS=33963224;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:183:182:1:2:180:180:0.989011:94:86:1:0:94:86:1:1
chr16	33963248	.	T	C	1969.1	PASS	AF=0.956204;AO=131;DP=137;FAO=131;FDP=137;FR=.;FRO=6;FSAF=60;FSAR=71;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00175885;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.712;QD=57.4919;RBI=0.0353721;REFB=-0.0158246;REVB=0.0353284;RO=5;SAF=60;SAR=71;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00407982;STB=0.501851;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.000905784;OID=.;OPOS=33963248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:137:137:5:6:131:131:0.956204:71:60:2:3:71:60:3:3
chr16	33963279	.	T	C	2152.38	PASS	AF=0.949045;AO=153;DP=157;FAO=149;FDP=157;FR=.;FRO=8;FSAF=69;FSAR=80;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00325019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.8525;QD=54.8378;RBI=0.0443674;REFB=-0.00820168;REVB=0.0442482;RO=4;SAF=73;SAR=80;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0110306;STB=0.508284;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.00143701;OID=.;OPOS=33963279;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:157:157:4:8:153:149:0.949045:80:73:1:3:80:69:5:3
chr16	33963283	.	C	CGG,G	2126.84	PASS	AF=0.958621,0.0206897;AO=103,8;DP=162;FAO=139,3;FDP=145;FR=.;FRO=3;FSAF=66,3;FSAR=73,0;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0630961,-0.0247637;FXX=0.0202689;HRUN=2,1;LEN=2,1;MLLD=35.2116,174.896;QD=58.6714;RBI=0.0669231,0.0257552;REFB=0.0165508,-0.0280424;REVB=0.0223066,-0.00707742;RO=32;SAF=40,8;SAR=63,0;SRF=21;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.121493,0.678962;STB=0.504061,0.99438;STBP=0.462,0.271;TYPE=ins,snp;VARB=-0.000744688,0.025958;OID=.,.;OPOS=33963284,33963283;OREF=-,C;OALT=GG,G;OMAPALT=CGG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:162:145:32:3:103,8:139,3:0.958621,0.0206897:63,0:40,8:21:11:73,0:66,3:2:1
chr16	33963288	.	CA	CG,GG	2096.84	PASS	AF=0.954248,0;AO=127,11;DP=156;FAO=146,0;FDP=153;FR=.;FRO=7;FSAF=70,0;FSAR=76,0;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.0210641,0.00985213;FXX=0.0192295;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=120.98,85.5253;QD=54.8194;RBI=0.0309357,0.0122144;REFB=-0.0447893,-0.017356;REVB=0.0226566,0.00721989;RO=7;SAF=52,10;SAR=75,1;SRF=2;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0127089,0.567703;STB=0.508884,0.5;STBP=0.323,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.00160633,0;OID=.,.;OPOS=33963289,33963288;OREF=A,CA;OALT=G,GG;OMAPALT=CG,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:156:153:7:7:127,11:146,0:0.954248,0:75,1:52,10:2:5:76,0:70,0:2:5
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chr16	33963424	.	A	G	715.84	PASS	AF=0.635417;AO=54;DP=90;FAO=61;FDP=96;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.00601814;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.755;QD=29.8265;RBI=0.00646306;REFB=-0.0184373;REVB=-0.00235651;RO=36;SAF=20;SAR=34;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139653;STB=0.553247;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.00349503;OID=.;OPOS=33963424;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:96:36:35:54:61:0.635417:34:20:20:16:35:26:20:15
chr16	33963427	.	T	C	640.75	PASS	AF=0.614583;AO=51;DP=89;FAO=59;FDP=96;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.000964535;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.178;QD=26.698;RBI=0.0239524;REFB=-0.0375337;REVB=0.023933;RO=32;SAF=24;SAR=27;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208525;STB=0.535038;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.00765293;OID=.;OPOS=33963427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:96:32:37:51:59:0.614583:27:24:16:16:34:25:19:18
chr16	33963437	.	T	C	829.82	PASS	AF=0.635593;AO=75;DP=118;FAO=75;FDP=118;FR=.;FRO=43;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.00909947;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.7373;QD=28.1295;RBI=0.0130068;REFB=-0.00479256;REVB=-0.00929391;RO=39;SAF=31;SAR=44;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0641684;STB=0.519319;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.00794799;OID=.;OPOS=33963437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:39:43:75:75:0.635593:44:31:20:19:44:31:20:23
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chr16	33963477	.	GTTT	AGAC,GTTC	679.96	PASS	AF=0.542056,0.0747664;AO=58,8;DP=108;FAO=58,8;FDP=107;FR=.;FRO=41;FSAF=21,4;FSAR=37,4;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.013383,-0.00820435;FXX=0.0092584;HRUN=1,3;LEN=4,1;MLLD=195.221,96.2673;QD=25.4189;RBI=0.0232162,0.035327;REFB=-0.00514394,-0.00964242;REVB=0.0189708,0.0343611;RO=40;SAF=21,4;SAR=37,4;SRF=23;SRR=17;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.16372,-0.091478;STB=0.58495,0.550894;STBP=0.049,0.74;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00760544,-0.0274828;OID=.,.;OPOS=33963477,33963480;OREF=GTTT,T;OALT=AGAC,C;OMAPALT=AGAC,GTTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:40:41:58,8:58,8:0.542056,0.0747664:37,4:21,4:23:17:37,4:21,4:23:18
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chr16	33963770	.	C	A	33.49	PASS	AF=0.109375;AO=7;DP=64;FAO=7;FDP=64;FR=.;FRO=57;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=29;FSRR=28;FWDB=-0.00605523;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=122.655;QD=2.09341;RBI=0.0162332;REFB=0.0057843;REVB=-0.0150615;RO=57;SAF=6;SAR=1;SRF=29;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425384;STB=0.831528;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=-0.0113586;OID=.;OPOS=33963770;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:64:64:57:57:7:7:0.109375:1:6:29:28:1:6:29:28
chr16	33963772	.	CGGG	CGG,CGGC	458.14	PASS	AF=0.354167,0.479167;AO=16,22;DP=64;FAO=17,23;FDP=48;FR=.;FRO=8;FSAF=10,13;FSAR=7,10;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0170333,-0.00878871;FXX=0.272686;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=20.6395,23.4156;QD=38.178;RBI=0.0195647,0.0140176;REFB=0.0690378,0.0717014;REVB=0.00962521,0.0109202;RO=8;SAF=9,12;SAR=7,10;SRF=6;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.115989,-0.101449;STB=0.554393,0.549091;STBP=0.468,0.4;TYPE=del,snp;VARB=-0.0419011,-0.0180561;OID=.,.;OPOS=33963773,33963775;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=CGG,CGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.354167,0.479167:16,22:64:17,23:48:8:10,13:7,10:6:2:99:8:9,12:7,10:6:2
chr16	33963778	.	G	A	45.82	PASS	AF=0.120482;AO=10;DP=83;FAO=10;FDP=83;FR=.;FRO=73;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=37;FSRR=36;FWDB=0.00186369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.166;QD=2.20839;RBI=0.0204608;REFB=-0.00306094;REVB=0.0203758;RO=73;SAF=6;SAR=4;SRF=37;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112979;STB=0.582358;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0243772;OID=.;OPOS=33963778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:83:83:73:73:10:10:0.120482:4:6:37:36:4:6:37:36
chr16	33963783	.	G	C,T	1061.1	PASS	AF=0.313953,0.593023;AO=27,50;DP=85;FAO=27,51;FDP=86;FR=.;FRO=8;FSAF=8,28;FSAR=19,23;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.00290045,0.0202224;FXX=0.0114929;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=132.383,166.537;QD=49.3535;RBI=0.00604589,0.0206038;REFB=0.00497855,-0.00393017;REVB=0.00530473,-0.00394629;RO=8;SAF=8,27;SAR=19,23;SRF=6;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.206783,-0.0548375;STB=0.612816,0.527655;STBP=0.027,0.295;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0119682,0.00349101;OID=.,.;OPOS=33963783,33963783;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:85:86:8:8:27,50:27,51:0.313953,0.593023:19,23:8,27:6:2:19,23:8,28:6:2
chr16	33963809	.	G	C	1622.72	PASS	AF=0.838926;AO=122;DP=147;FAO=125;FDP=149;FR=.;FRO=24;FSAF=27;FSAR=98;FSRF=20;FSRR=4;FWDB=0.0232145;FXX=0.0132442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7993;QD=43.563;RBI=0.110538;REFB=-0.0495515;REVB=0.108072;RO=24;SAF=25;SAR=97;SRF=20;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250204;STB=0.625793;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00721044;OID=.;OPOS=33963809;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:149:24:24:122:125:0.838926:97:25:20:4:98:27:20:4
chr16	33963816	.	TG	GA	1215.56	PASS	AF=0.650307;AO=105;DP=167;FAO=106;FDP=163;FR=.;FRO=57;FSAF=23;FSAR=83;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.0213972;FXX=0.0355009;HRUN=1;LEN=2;MLLD=108.544;QD=29.8296;RBI=0.0243868;REFB=-0.0334817;REVB=0.0116994;RO=57;SAF=23;SAR=82;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.293625;STB=0.659892;STBP=0;TYPE=mnp;VARB=0.0254484;OID=.;OPOS=33963816;OREF=TG;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:163:57:57:105:106:0.650307:82:23:34:23:83:23:34:23
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chr16	33963991	.	A	G	12482.5	PASS	AF=0.945455;AO=823;DP=881;FAO=832;FDP=880;FR=.;FRO=48;FSAF=378;FSAR=454;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.0434936;FXX=0.00339747;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.172;QD=56.7385;RBI=0.0449938;REFB=-0.0333756;REVB=0.0115214;RO=47;SAF=372;SAR=451;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0127133;STB=0.507087;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0020267;OID=.;OPOS=33963991;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:881:880:47:48:823:832:0.945455:451:372:27:20:454:378:28:20
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chr16	33964091	.	T	C	3159.52	PASS	AF=0.897541;AO=178;DP=242;FAO=219;FDP=244;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=66;FSAR=153;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0656644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.538;QD=51.7954;RBI=0.0656647;REFB=-0.0408865;REVB=-0.000207013;RO=24;SAF=26;SAR=152;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955007;STB=0.508575;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.00645391;OID=.;OPOS=33964091;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:242:244:24:24:178:219:0.897541:152:26:9:15:153:66:9:15
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chr16	33964233	.	C	T	95.59	PASS	AF=0.25;AO=13;DP=50;FAO=13;FDP=52;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0106054;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=129.048;QD=7.35293;RBI=0.0142058;REFB=-0.0254613;REVB=-0.00945151;RO=37;SAF=8;SAR=5;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.026063;STB=0.520093;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0413775;OID=.;OPOS=33964233;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:50:52:37:39:13:13:0.25:5:8:22:15:5:8:23:16
chr16	33964238	.	T	G	117.55	PASS	AF=0.244444;AO=11;DP=45;FAO=11;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.00913849;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.831;QD=10.4488;RBI=0.0294933;REFB=-0.00198181;REVB=-0.0280418;RO=28;SAF=5;SAR=6;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176595;STB=0.581351;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.001767;OID=.;OPOS=33964238;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:45:45:28:30:11:11:0.244444:6:5:17:11:6:5:17:13
chr16	33964242	.	CA	CG,GG	112.32	PASS	AF=0.2,0.133333;AO=9,5;DP=44;FAO=9,6;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=4,5;FSAR=5,1;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=0.0129059,1.80951e-05;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=124.401,184.356;QD=9.98391;RBI=0.0217635,0.0267687;REFB=-0.0212095,-0.0125045;REVB=-0.0175239,-0.0267687;RO=30;SAF=4,4;SAR=5,1;SRF=17;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.145585,0.299333;STB=0.593016,0.759901;STBP=0.554,0.203;TYPE=snp,mnp;VARB=0.0191482,0.0292171;OID=.,.;OPOS=33964243,33964242;OREF=A,CA;OALT=G,GG;OMAPALT=CG,GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:44:45:30:30:9,5:9,6:0.2,0.133333:5,1:4,4:17:13:5,1:4,5:17:13
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chr16	33965459	.	C	T	46.0	PASS	AF=0.108108;AO=12;DP=108;FAO=12;FDP=111;FR=.;FRO=99;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=45;FSRR=54;FWDB=0.0206032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2445;QD=1.65772;RBI=0.0545283;REFB=-0.0051201;REVB=-0.0504861;RO=95;SAF=3;SAR=9;SRF=44;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269342;STB=0.695309;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0467715;OID=.;OPOS=33965459;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:108:111:95:99:12:12:0.108108:9:3:44:51:9:3:45:54
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chr16	33965487	.	C	T	31.96	PASS	AF=0.0825688;AO=9;DP=109;FAO=9;FDP=109;FR=.;FRO=100;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=47;FSRR=53;FWDB=-0.02307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.891;QD=1.17267;RBI=0.0248453;REFB=-0.00360112;REVB=0.00922315;RO=98;SAF=8;SAR=1;SRF=45;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480565;STB=0.886199;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0265476;OID=.;OPOS=33965487;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:109:109:98:100:9:9:0.0825688:1:8:45:53:1:8:47:53
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chr16	33965539	.	G	GC	44.89	PASS	AF=0.182796;AO=20;DP=96;FAO=17;FDP=93;FR=.;FRO=76;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=37;FSRR=39;FWDB=-0.0186117;FXX=0.0510152;HRUN=3;LEN=1;MLLD=16.4022;QD=1.93077;RBI=0.229702;REFB=-0.0432306;REVB=-0.228947;RO=75;SAF=15;SAR=5;SRF=38;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.321482;STB=0.736207;STBP=0.039;TYPE=ins;VARB=0.0908193;OID=.;OPOS=33965540;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.182796:20:96:17:93:76:13:4:37:39:44:75:15:5:38:37
chr16	33965553	.	CAG	CA,CG,CGG	906.97	PASS	AF=0.730337,0.247191,0;AO=28,14,8;DP=89;FAO=65,22,0;FDP=89;FR=.;FRO=2;FSAF=33,14,0;FSAR=32,8,0;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00833896,-0.017487,-0.0178491;FXX=0;HRUN=3,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=12.274,161.807,166.704;QD=40.7625;RBI=1.06894,0.0240204,0.0850872;REFB=0.0825598,-0.00247947,-0.0123659;REVB=1.06891,-0.0164677,-0.083194;RO=33;SAF=28,13,1;SAR=0,1,7;SRF=2;SRR=31;SSEN=0.396318,0,0;SSEP=0.346804,0,0;SSSB=0.888419,0.816885,0.230461;STB=0.514701,0.533304,0.5;STBP=0.22,0.417,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.059421,-0.0237659,0;OID=.,.,.;OPOS=33965555,33965554,33965554;OREF=G,A,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=CA,CG,CGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.730337,0.247191,0:28,14,8:89:65,22,0:89:2:33,14,0:32,8,0:2:0:99:33:28,13,1:0,1,7:2:31
chr16	33965560	.	TT	AC	184.58	PASS	AF=0.244186;AO=22;DP=87;FAO=21;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=60;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=31;FWDB=-0.0196625;FXX=0.0114929;HRUN=3;LEN=2;MLLD=239.272;QD=8.58514;RBI=0.019775;REFB=-0.00306047;REVB=0.00210642;RO=60;SAF=14;SAR=8;SRF=29;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187815;STB=0.601326;STBP=0.288;TYPE=mnp;VARB=0.00663407;OID=.;OPOS=33965560;OREF=TT;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:60:60:22:21:0.244186:8:14:29:31:8:13:29:31
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chr16	46565019	.	T	G	951.52	PASS	AF=0.957143;AO=65;DP=71;FAO=67;FDP=70;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0239822;FXX=0.0140825;HRUN=5;LEN=1;MLLD=228.979;QD=54.3725;RBI=0.0291023;REFB=-0.152106;REVB=0.0164862;RO=2;SAF=33;SAR=32;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0277691;STB=0.520542;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.000650567;OID=.;OPOS=46565019;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:71:70:2:3:65:67:0.957143:32:33:2:0:32:35:3:0
chr16	46590024	.	T	C	987.34	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444818;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.9539;QD=58.9456;RBI=0.0847252;REFB=0;REVB=-0.0721092;RO=0;SAF=36;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000210817;OID=.;OPOS=46590024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:30:36:0:0:30:37:0:0
chr16	46642286	.	G	A	61.05	PASS	AF=0.272727;AO=5;DP=23;FAO=6;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.180258;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.8027;QD=11.1;RBI=0.211687;REFB=-0.0528155;REVB=-0.110989;RO=9;SAF=3;SAR=2;SRF=9;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.518874;STB=0.699503;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0844887;OID=.;OPOS=46642286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:23:22:9:11:5:6:0.272727:2:3:9:0:2:4:10:1
chr16	46655210	.	A	G	735.03	PASS	AF=1;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00493095;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.997;QD=63.9159;RBI=0.0111073;REFB=0;REVB=0.00995281;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.88293e-05;OID=.;OPOS=46655210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:46:0:0:46:46:1:24:22:0:0:24:22:0:0
chr16	46696284	.	G	A	972.8	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0307048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.945;QD=58.9579;RBI=0.0336677;REFB=0;REVB=-0.0138104;RO=0;SAF=32;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75585e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000164019;OID=.;OPOS=46696284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:34:32:0:0:34:32:0:0
chr16	46773999	.	C	A	427.18	PASS	AF=0.630769;AO=40;DP=64;FAO=41;FDP=65;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00153093;FXX=0.0151492;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.2096;QD=26.2882;RBI=0.0141015;REFB=-0.000373741;REVB=-0.0140182;RO=24;SAF=24;SAR=16;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0789428;STB=0.531235;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00513039;OID=.;OPOS=46773999;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:24:24:40:41:0.630769:16:24:17:7:17:24:16:8
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chr16	48234327	.	C	T	262.12	PASS	AF=0.585366;AO=24;DP=41;FAO=24;FDP=41;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.042973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.452;QD=25.5724;RBI=0.042988;REFB=-0.0369387;REVB=0.00113693;RO=17;SAF=12;SAR=12;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154173;STB=0.585297;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0272016;OID=.;OPOS=48234327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:17:17:24:24:0.585366:12:12:5:12:12:12:5:12
chr16	48258198	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181693;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.19;QD=60.6102;RBI=0.0335611;REFB=0;REVB=0.0282175;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.4726e-05;OID=.;OPOS=48258198;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0
chr16	48396190	.	C	T	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0438831;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1627;QD=8.81166;RBI=0.0482166;REFB=-0.00746664;REVB=0.0199778;RO=22;SAF=6;SAR=4;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217222;STB=0.60507;STBP=0.471;TYPE=snp;VARB=0.0215695;OID=.;OPOS=48396190;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:22:23:10:10:0.30303:4:6:17:5:4:6:17:6
chr16	49670390	.	A	G	341.96	PASS	AF=0.644444;AO=28;DP=44;FAO=29;FDP=45;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0299024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.943;QD=30.3965;RBI=0.0309324;REFB=-0.0259076;REVB=0.00791607;RO=16;SAF=17;SAR=11;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307017;STB=0.521724;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.0158912;OID=.;OPOS=49670390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:16:16:28:29:0.644444:11:17:9:7:11:18:9:7
chr16	49672520	.	A	G	233.44	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0466413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6196;QD=24.5723;RBI=0.112776;REFB=-0.0522714;REVB=-0.10268;RO=16;SAF=10;SAR=12;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610537;STB=0.53395;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0340849;OID=.;OPOS=49672520;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:12:10:6:10:12:10:6:10
chr16	50059279	.	C	A	83.57	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0235572;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=253.949;QD=33.4289;RBI=0.027072;REFB=-0.177446;REVB=0.0133399;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.555432;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.00156527;OID=.;OPOS=50059279;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:10:10:0:1:9:9:0.9:5:4:0:0:5:4:1:0
chr16	50069312	.	C	G	153.4	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=44;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0132377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2067;QD=13.9458;RBI=0.0161372;REFB=-0.00673484;REVB=-0.00922886;RO=26;SAF=11;SAR=6;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118371;STB=0.582074;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0109109;OID=.;OPOS=50069312;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:27:17:17:0.386364:6:11:14:12:6:11:14:13
chr16	50069772	.	A	G	1109.83	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.753;QD=59.991;RBI=0.0271565;REFB=0;REVB=-0.00922944;RO=0;SAF=34;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.83754e-05;OID=.;OPOS=50069772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:40:34:0:0:40:34:0:0
chr16	50071011	.	C	CTTTAG,T	397.75	PASS	AF=0.825,0;AO=24,2;DP=39;FAO=33,0;FDP=40;FR=.;FRO=7;FSAF=10,0;FSAR=23,0;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=0.00485476,-0.0259398;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=5,1;MLLD=196.017,118.389;QD=39.7754;RBI=0.0214168,0.0364688;REFB=-0.0425649,0.0211982;REVB=-0.0208593,-0.0256339;RO=9;SAF=7,0;SAR=17,2;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.257473,-0.694553;STB=0.579782,0.5;STBP=0.039,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00329521,0;OID=.,.;OPOS=50071012,50071011;OREF=-,C;OALT=TTTAG,T;OMAPALT=CTTTAG,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:39:40:9:7:24,2:33,0:0.825,0:17,2:7,0:7:2:23,0:10,0:5:2
chr16	50106594	.	T	C	451.3	PASS	AF=0.414634;AO=51;DP=123;FAO=51;FDP=123;FR=.;FRO=72;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=0.0479558;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.4975;QD=14.6763;RBI=0.0500647;REFB=-0.0070521;REVB=-0.0143775;RO=71;SAF=25;SAR=26;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0702168;STB=0.543114;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.00921641;OID=.;OPOS=50106594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:71:72:51:51:0.414634:26:25:30:41:26:25:30:42
chr16	50263762	.	G	A	394.24	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.702;QD=56.3197;RBI=0.0647803;REFB=0;REVB=0.0576297;RO=0;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265609;OID=.;OPOS=50263762;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:28:0:0:26:28:1:7:19:0:0:8:20:0:0
chr16	50265818	.	C	T	180.11	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0353651;FXX=0.0555401;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1374;QD=21.1888;RBI=0.0370322;REFB=0.00978942;REVB=0.010986;RO=18;SAF=5;SAR=13;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166538;STB=0.554201;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=-0.0413185;OID=.;OPOS=50265818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:34:18:16:18:18:0.529412:13:5:8:10:13:5:6:10
chr16	50326661	.	A	G	1503.4	PASS	AF=0.989583;AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0384174;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.85;QD=62.6417;RBI=0.0448942;REFB=0.0196689;REVB=0.0232291;RO=1;SAF=48;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00977679;STB=0.505154;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-8.13677e-06;OID=.;OPOS=50326661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:98:96:1:1:95:95:0.989583:47:48:1:0:47:48:1:0
chr16	50642201	.	G	C	686.2	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100183;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0309;QD=60.9959;RBI=0.0251686;REFB=0;REVB=0.0230888;RO=1;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017728;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000533925;OID=.;OPOS=50642201;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:1:0:44:45:1:26:18:0:1:27:18:0:0
chr16	51171175	.	C	T	1930.11	PASS	AF=1;AO=124;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.017117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2297;QD=61.7635;RBI=0.0384306;REFB=0;REVB=-0.0344082;RO=0;SAF=49;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.70799e-05;OID=.;OPOS=51171175;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:125:0:0:124:125:1:75:49:0:0:75:50:0:0
chr16	51173558	.	CG	C,CA	1197.25	PASS	AF=0.0987654,0.901235;AO=10,70;DP=81;FAO=8,73;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=3,41;FSAR=5,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0245195,-0.0321118;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=81.1339,106.706;QD=59.1233;RBI=0.109023,0.0937259;REFB=0,0;REVB=0.10623,0.0880533;RO=0;SAF=4,39;SAR=6,31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00695422,-0.00246663;OID=.,.;OPOS=51173559,51173559;OREF=G,G;OALT=-,A;OMAPALT=C,CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0987654,0.901235:10,70:81:8,73:81:0:3,41:5,32:0:0:16:0:4,39:6,31:0:0
chr16	51705448	.	C	T	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.593;QD=57.1765;RBI=0.0498493;REFB=0;REVB=0.00748915;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217928;OID=.;OPOS=51705448;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:32:19:0:0:32:19:0:0
chr16	53283966	.	G	A	296.58	PASS	AF=0.534483;AO=23;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.00530735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.729;QD=20.4539;RBI=0.0528519;REFB=-0.0373183;REVB=0.0525848;RO=26;SAF=15;SAR=8;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755847;STB=0.535691;STBP=0.589;TYPE=snp;VARB=0.0339288;OID=.;OPOS=53283966;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:26:27:23:31:0.534483:8:15:15:11:15:16:16:11
chr16	53325691	.	G	A	251.07	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0338886;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.136;QD=19.6914;RBI=0.0411907;REFB=-0.0134305;REVB=-0.0234143;RO=24;SAF=13;SAR=13;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179636;STB=0.58817;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0162184;OID=.;OPOS=53325691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:24:25:26:26:0.509804:13:13:17:7:13:13:17:8
chr16	53326860	.	G	A	217.5	PASS	AF=0.40625;AO=26;DP=64;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.0541448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.981;QD=13.5939;RBI=0.0541929;REFB=-0.0434263;REVB=-0.00228344;RO=38;SAF=15;SAR=11;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0533183;STB=0.530464;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0556975;OID=.;OPOS=53326860;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:38:38:26:26:0.40625:11:15:20:18:11:15:20:18
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chr16	53358439	.	A	G	212.42	PASS	AF=0.466667;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=45;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.0361551;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6563;QD=18.8813;RBI=0.0382961;REFB=-0.00546638;REVB=-0.0126254;RO=24;SAF=8;SAR=13;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301036;STB=0.669947;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0106975;OID=.;OPOS=53358439;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:24:24:21:21:0.466667:13:8:17:7:13:8:17:7
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chr16	53404203	.	C	A	785.07	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0288812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0682;QD=57.0957;RBI=0.0730241;REFB=0;REVB=-0.0670701;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00104066;OID=.;OPOS=53404203;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:34:21:0:0:34:21:0:0
chr16	53682949	.	C	T	541.33	PASS	AF=0.513761;AO=56;DP=108;FAO=56;FDP=109;FR=.;FRO=53;FSAF=38;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.0263534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.354;QD=19.8653;RBI=0.0828914;REFB=-0.0249921;REVB=-0.0785906;RO=52;SAF=38;SAR=18;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.215824;STB=0.624184;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0182457;OID=.;OPOS=53682949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:109:52:53:56:56:0.513761:18:38:23:29:18:38:23:30
chr16	53945351	.	G	A	321.33	PASS	AF=0.395604;AO=35;DP=90;FAO=36;FDP=91;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=39;FWDB=0.0296846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4375;QD=14.1245;RBI=0.0300412;REFB=-0.0136546;REVB=0.00461504;RO=55;SAF=10;SAR=25;SRF=16;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00679704;STB=0.509798;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0367879;OID=.;OPOS=53945351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:55:55:35:36:0.395604:25:10:16:39:26:10:16:39
chr16	54967096	.	C	A	859.56	PASS	AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.117761;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.105;QD=54.5755;RBI=0.117806;REFB=-0.123115;REVB=0.00326669;RO=1;SAF=14;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325181;STB=0.533322;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.000538925;OID=.;OPOS=54967096;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:63:1:2:61:61:0.968254:47:14:1:0:47:14:2:0
chr16	55325460	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00783229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.096;QD=59.4348;RBI=0.0672141;REFB=0;REVB=-0.0667562;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000403632;OID=.;OPOS=55325460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:19:16:0:0:19:16:0:0
chr16	55519535	.	G	C	447.57	PASS	AF=0.517647;AO=44;DP=85;FAO=44;FDP=85;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.00984645;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=176.569;QD=21.0621;RBI=0.0111022;REFB=-0.023067;REVB=0.00512905;RO=38;SAF=25;SAR=19;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547835;STB=0.520539;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0263807;OID=.;OPOS=55519535;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:38:41:44:44:0.517647:19:25:24:14:19:25:25:16
chr16	55523705	.	T	C,G	902.84	PASS	AF=0.952381,0.047619;AO=60,3;DP=63;FAO=60,3;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=33,3;FSAR=27,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00173003,-0.00752341;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=122.955,154.858;QD=57.3229;RBI=0.00922668,0.0256533;REFB=0,0;REVB=0.00906304,-0.0245253;RO=0;SAF=33,3;SAR=27,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.7886e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00176147,0.0641094;OID=.,.;OPOS=55523705,55523705;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:63:63:0:0:60,3:60,3:0.952381,0.047619:27,0:33,3:0:0:27,0:33,3:0:0
chr16	55527113	.	G	A	241.55	PASS	AF=0.489362;AO=23;DP=47;FAO=23;FDP=47;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0143394;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.455;QD=20.5573;RBI=0.0394279;REFB=-0.0182525;REVB=-0.0367279;RO=23;SAF=10;SAR=13;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191387;STB=0.596247;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0257845;OID=.;OPOS=55527113;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:23:24:23:23:0.489362:13:10:15:8:13:10:15:9
chr16	55562466	.	G	A	1079.28	PASS	AF=0.506977;AO=108;DP=212;FAO=109;FDP=215;FR=.;FRO=106;FSAF=59;FSAR=50;FSRF=66;FSRR=40;FWDB=-0.0250382;FXX=0.00462942;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.06;QD=20.0796;RBI=0.0320709;REFB=-0.0261211;REVB=-0.0200408;RO=103;SAF=58;SAR=50;SRF=64;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0760535;STB=0.54065;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0240283;OID=.;OPOS=55562466;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:212:215:103:106:108:109:0.506977:50:58:64:39:50:59:66:40
chr16	55571563	.	G	A	234.41	PASS	AF=0.388889;AO=28;DP=72;FAO=28;FDP=72;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.00529768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.534;QD=13.0229;RBI=0.00841208;REFB=-0.0249648;REVB=-0.00653434;RO=44;SAF=19;SAR=9;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0504301;STB=0.528932;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0349123;OID=.;OPOS=55571563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:44:44:28:28:0.388889:9:19:28:16:9:19:28:16
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chr16	55608587	.	G	A	555.37	PASS	AF=0.450382;AO=59;DP=131;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=46;FSRR=26;FWDB=0.0366572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.801;QD=16.9578;RBI=0.0468801;REFB=-0.020257;REVB=0.0292232;RO=72;SAF=36;SAR=23;SRF=46;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300102;STB=0.516707;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0220238;OID=.;OPOS=55608587;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:72:72:59:59:0.450382:23:36:46:26:23:36:46:26
chr16	55719117	.	A	G	476.58	PASS	AF=0.424;AO=53;DP=125;FAO=53;FDP=125;FR=.;FRO=72;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=47;FSRR=25;FWDB=-0.0136189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.08;QD=15.2507;RBI=0.0226184;REFB=-0.00976592;REVB=-0.0180587;RO=70;SAF=33;SAR=20;SRF=47;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535934;STB=0.518632;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.014167;OID=.;OPOS=55719117;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:70:72:53:53:0.424:20:33:47:23:20:33:47:25
chr16	55731835	.	G	A	734.62	PASS	AF=0.979167;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.000699924;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.571;QD=61.2185;RBI=0.0290638;REFB=-0.106454;REVB=0.0290554;RO=0;SAF=16;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507933;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00135317;OID=.;OPOS=55731835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:48:48:0:1:47:47:0.979167:31:16:0:0:31:16:0:1
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chr16	55862883	.	C	A	45.62	PASS	AF=0.134328;AO=9;DP=67;FAO=9;FDP=67;FR=.;FRO=58;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.0121379;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=225.298;QD=2.72367;RBI=0.0407064;REFB=-0.00833986;REVB=-0.0388547;RO=58;SAF=3;SAR=6;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1447;STB=0.603929;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=0.0550475;OID=.;OPOS=55862883;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:67:67:58:58:9:9:0.134328:6:3:26:32:6:3:26:32
chr16	55866894	.	T	TA	254.99	PASS	AF=0.491228;AO=26;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00206222;FXX=0.0172384;HRUN=0;LEN=1;MLLD=265.881;QD=17.894;RBI=0.0347678;REFB=-0.0137359;REVB=-0.0347066;RO=31;SAF=16;SAR=10;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218881;STB=0.579943;STBP=0.262;TYPE=ins;VARB=0.0143248;OID=.;OPOS=55866895;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.491228:26:57:28:57:29:16:12:12:17:99:31:16:10:12:19
chr16	55883618	.	T	C	1660.4	PASS	AF=1;AO=108;DP=109;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00892906;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.771;QD=60.3781;RBI=0.0244935;REFB=0;REVB=0.0228079;RO=0;SAF=53;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023392;OID=.;OPOS=55883618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:110:0:0:108:110:1:55:53:0:0:56:54:0:0
chr16	55905636	.	A	G	1251.15	PASS	AF=1;AO=81;DP=82;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0514996;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.3446;QD=61.7852;RBI=0.0522919;REFB=0;REVB=0.00906811;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000349049;OID=.;OPOS=55905636;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:81:0:0:81:81:1:43:38:0:0:43:38:0:0
chr16	55907811	.	C	T	207.55	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0204653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.001;QD=15.0943;RBI=0.0206028;REFB=-0.009703;REVB=0.00237705;RO=30;SAF=8;SAR=16;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105337;STB=0.552587;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.00930864;OID=.;OPOS=55907811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:30:31:24:24:0.436364:16:8:13:17:16:8:13:18
chr16	56228066	.	A	G,T	1254.84	PASS	AF=0.917647,0.0705882;AO=76,7;DP=84;FAO=78,6;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=51,5;FSAR=27,1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0101097,-0.00471238;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=116.148,120.205;QD=59.0513;RBI=0.0127563,0.00858085;REFB=-0.0936295,-0.00390578;REVB=0.00777919,-0.00717108;RO=0;SAF=50,6;SAR=26,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.99741e-08,0;STB=0.504853,0.54531;STBP=0.526,0.659;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00459303,0.0815976;OID=.,.;OPOS=56228066,56228066;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:19:84:85:0:1:76,7:78,6:0.917647,0.0705882:26,1:50,6:0:0:27,1:51,5:1:0
chr16	56395610	.	G	A	227.02	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.00151511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.366;QD=13.5533;RBI=0.0260318;REFB=-0.0234418;REVB=-0.0259877;RO=40;SAF=16;SAR=11;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123816;STB=0.570739;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.032499;OID=.;OPOS=56395610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:11:16:19:21:11:16:19:21
chr16	56396486	.	C	T	202.02	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.00169243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.108;QD=21.2649;RBI=0.012768;REFB=-0.0148915;REVB=-0.0126553;RO=18;SAF=14;SAR=6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0853248;STB=0.548143;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0137242;OID=.;OPOS=56396486;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:6:14:11:7:6:14:11:7
chr16	56510299	.	A	C	142.6	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0091101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8462;QD=14.2596;RBI=0.0334441;REFB=0.0126777;REVB=0.0321794;RO=24;SAF=8;SAR=8;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0430056;STB=0.524969;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=-0.0204696;OID=.;OPOS=56510299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:8:8:11:13:8:8:11:13
chr16	56545175	.	T	C	130.03	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0217385;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.607;QD=13.336;RBI=0.0292552;REFB=-0.004578;REVB=0.0195782;RO=24;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189194;STB=0.609619;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.00296481;OID=.;OPOS=56545175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:8:7:7:17:8:7:7:17
chr16	56548501	.	C	T	785.77	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0114894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.01;QD=64.1447;RBI=0.0429418;REFB=0;REVB=0.0413762;RO=0;SAF=26;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114955;OID=.;OPOS=56548501;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:23:26:0:0:23:26:0:0
chr16	56601720	.	A	G	820.58	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0332777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.928;QD=55.6328;RBI=0.0385814;REFB=0;REVB=0.0195223;RO=1;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0184904;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73939e-05;OID=.;OPOS=56601720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:58:59:1:0:57:59:1:25:32:0:1:26:33:0:0
chr16	56601722	.	T	C	710.28	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00882138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.6472;QD=54.6366;RBI=0.00954342;REFB=-0.0458218;REVB=0.00364144;RO=1;SAF=32;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144898;STB=0.507689;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=-4.03252e-05;OID=.;OPOS=56601722;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:19:32:1:0:19:32:1:0
chr16	56667282	.	C	A	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.532;QD=58.1421;RBI=0.0606441;REFB=0;REVB=0.0480883;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237092;OID=.;OPOS=56667282;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:18:14:0:0:18:14:0:0
chr16	56686469	.	TC	T,TT	865.94	PASS	AF=0.0634921,0.936508;AO=20,43;DP=63;FAO=4,59;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=1,32;FSAR=3,27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0795014,-0.00919944;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=36.3816,43.7271;QD=54.9805;RBI=0.0867805,0.04558;REFB=0,0;REVB=0.0347904,0.044642;RO=0;SAF=1,32;SAR=19,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.97126e-08,3.61286e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0365345,0.0363387;OID=.,.;OPOS=56686470,56686470;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0634921,0.936508:20,43:63:4,59:63:0:1,32:3,27:0:0:8:0:1,32:19,11:0:0
chr16	56693004	.	C	T	258.58	PASS	AF=0.460317;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=63;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.010167;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=81.6135;QD=16.4177;RBI=0.0998387;REFB=-0.00308013;REVB=-0.0993197;RO=34;SAF=18;SAR=11;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118634;STB=0.566882;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0050129;OID=.;OPOS=56693004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:34:34:29:29:0.460317:11:18:17:17:11:18:17:17
chr16	56701294	.	T	A	107.01	PASS	AF=0.666667;AO=11;DP=17;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.02169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.063;QD=23.7794;RBI=0.0368854;REFB=-0.0630364;REVB=0.0298342;RO=6;SAF=9;SAR=2;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364473;STB=0.655971;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00460885;OID=.;OPOS=56701294;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:18:6:6:11:12:0.666667:2:9:2:4:3:9:2:4
chr16	56782222	.	G	C	32.73	PASS	AF=0.155556;AO=7;DP=46;FAO=7;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.179138;FXX=0.0217344;HRUN=3;LEN=1;MLLD=34.8708;QD=2.90927;RBI=0.187062;REFB=-0.040504;REVB=0.0538677;RO=24;SAF=7;SAR=0;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.744544;STB=0.799042;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.175288;OID=.;OPOS=56782222;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:46:45:24:38:7:7:0.155556:0:7:10:14:1:6:21:17
chr16	56855496	.	C	G	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0198572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.634;QD=63.5821;RBI=0.0532335;REFB=0;REVB=0.0493912;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000265466;OID=.;OPOS=56855496;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:21:26:0:0:21:26:0:0
chr16	56868700	.	A	G	884.39	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0276959;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=149.297;QD=57.9924;RBI=0.0276994;REFB=0;REVB=0.000442089;RO=0;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.14244e-05;OID=.;OPOS=56868700;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:38:23:0:0:38:23:0:0
chr16	56873495	.	C	T	1886.94	PASS	AF=0.976562;AO=124;DP=128;FAO=125;FDP=128;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0280776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.6;QD=58.9669;RBI=0.0299562;REFB=0.00660078;REVB=0.0104412;RO=3;SAF=65;SAR=59;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00857831;STB=0.504574;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.000638956;OID=.;OPOS=56873495;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:128:128:3:3:124:125:0.976562:59:65:1:2:59:66:1:2
chr16	56901065	.	A	G	189.34	PASS	AF=0.316456;AO=23;DP=76;FAO=25;FDP=79;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=37;FWDB=-0.0166769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.851;QD=9.58705;RBI=0.030929;REFB=-0.0285692;REVB=0.0260477;RO=53;SAF=14;SAR=9;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329438;STB=0.663255;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0372364;OID=.;OPOS=56901065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:79:53:54:23:25:0.316456:9:14:17:36:11:14:17:37
chr16	56904587	.	C	G	637.81	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00636551;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4872;QD=59.3309;RBI=0.0296772;REFB=0.0619662;REVB=-0.0289865;RO=1;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218287;STB=0.511622;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.013613;OID=.;OPOS=56904587;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:21:21:0:1:21:21:0:1
chr16	56966043	.	CGGGG	CGGGC,CGGG,GCGGG	241.86	PASS	AF=0.171429,0.771429,0;AO=6,15,3;DP=37;FAO=6,27,0;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=1,16,0;FSAR=5,11,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00372813,0.498139,0.265249;FXX=0.0540395;HRUN=5,5,1;LEN=1,1,2;MLLD=178.532,8.83366,13.1051;QD=27.6413;RBI=0.0183318,0.523603,0.271632;REFB=-0.0106317,-0.0245635,-0.00305285;REVB=-0.0179487,0.161302,-0.0585397;RO=10;SAF=1,8,0;SAR=5,7,3;SRF=8;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.597745,-0.194206,-0.747687;STB=0.624528,0.506591,0.5;STBP=0.369,0.86,1;TYPE=snp,del,mnp;VARB=0.0407624,0.0767892,0;OID=.,.,.;OPOS=56966047,56966044,56966043;OREF=G,G,CG;OALT=C,-,GC;OMAPALT=CGGGC,CGGG,GCGGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:31:37:35:10:2:6,15,3:6,27,0:0.171429,0.771429,0:5,7,3:1,8,0:8:2:5,11,0:1,16,0:1:1
chr16	57059427	.	C	T	211.75	PASS	AF=0.488372;AO=21;DP=43;FAO=21;FDP=43;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.00156247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=250.997;QD=19.6972;RBI=0.025601;REFB=-0.0200453;REVB=-0.0255533;RO=22;SAF=13;SAR=8;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166943;STB=0.509425;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0215181;OID=.;OPOS=57059427;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:22:21:21:0.488372:8:13:14:8:8:13:14:8
chr16	57060340	.	T	C	162.52	PASS	AF=0.515152;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.153341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2755;QD=19.6994;RBI=0.153342;REFB=0.000406594;REVB=-0.000277638;RO=15;SAF=7;SAR=10;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101757;STB=0.57339;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=-0.00549012;OID=.;OPOS=57060340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:15:16:17:17:0.515152:10:7:8:7:10:7:9:7
chr16	57060353	.	T	C	135.95	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0487819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.252;QD=17.542;RBI=0.0490881;REFB=-0.0402123;REVB=0.00547453;RO=16;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147222;STB=0.584302;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.0374159;OID=.;OPOS=57060353;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:9:6:9:7:9:6:9:7
chr16	57067595	.	A	T	157.74	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0194877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.434;QD=11.2668;RBI=0.0242095;REFB=-0.0239378;REVB=0.0143641;RO=34;SAF=11;SAR=9;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748153;STB=0.558337;STBP=0.573;TYPE=snp;VARB=0.0376838;OID=.;OPOS=57067595;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:34:36:20:20:0.357143:9:11:21:13:9:11:23:13
chr16	57068106	.	AC	GT	360.09	PASS	AF=0.560606;AO=35;DP=66;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00687415;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=2;MLLD=110.821;QD=21.8233;RBI=0.0219455;REFB=-0.0125319;REVB=0.0208411;RO=29;SAF=15;SAR=20;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732694;STB=0.537552;STBP=0.517;TYPE=mnp;VARB=0.0101492;OID=.;OPOS=57068106;OREF=AC;OALT=GT;OMAPALT=GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:29:29:35:37:0.560606:20:15:15:14:21:16:15:14
chr16	57071113	.	TA	CG,TG	331.8	PASS	AF=0.36,0.64;AO=10,14;DP=26;FAO=9,16;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=4,8;FSAR=5,8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0497563,0.0231515;FXX=0.0740466;HRUN=1,2;LEN=2,1;MLLD=84.6145,76.7216;QD=53.0873;RBI=0.0923599,0.0550243;REFB=0,0;REVB=-0.0778117,-0.0499168;RO=0;SAF=5,6;SAR=5,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0338748,-0.000285592;OID=.,.;OPOS=57071113,57071114;OREF=TA,A;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:67:26:25:0:0:10,14:9,16:0.36,0.64:5,8:5,6:0:0:5,8:4,8:0:0
chr16	57073683	.	G	C	937.35	PASS	AF=1;AO=38;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8512;QD=58.5845;RBI=0.122552;REFB=0;REVB=-0.120998;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000844269;OID=.;OPOS=57073683;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:38:64:1:22:16:0:0:36:28:0:0
chr16	57392732	.	G	GC	97.18	PASS	AF=1;AO=4;DP=19;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.154262;FXX=0.473435;HRUN=0;LEN=1;MLLD=104.509;QD=38.8712;RBI=0.154266;REFB=0;REVB=-0.00113494;RO=15;SAF=3;SAR=1;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0806035;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0215254;OID=.;OPOS=57392733;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:4:19:10:10:0:10:0:0:0:3:15:3:1:12:3
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chr16	57595999	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00504954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.758;QD=59.4349;RBI=0.0071018;REFB=0;REVB=0.00499376;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.87871e-05;OID=.;OPOS=57595999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr16	57601792	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00421671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.01;QD=45.8068;RBI=0.0123565;REFB=0;REVB=0.0116147;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.1395e-05;OID=.;OPOS=57601792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr16	57689385	.	C	G	287.38	PASS	AF=0.4125;AO=28;DP=75;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.00832817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.887;QD=14.3689;RBI=0.00998912;REFB=-0.0154895;REVB=0.00551581;RO=45;SAF=13;SAR=15;SRF=29;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192352;STB=0.594538;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0249346;OID=.;OPOS=57689385;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:80:45:47:28:33:0.4125:15:13:29:16:18:15:29:18
chr16	57689883	.	T	C	75.03	PASS	AF=0.297297;AO=10;DP=35;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0589352;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.0283;QD=8.11134;RBI=0.0840739;REFB=-0.0171721;REVB=-0.0599588;RO=25;SAF=4;SAR=6;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18386;STB=0.648512;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0416662;OID=.;OPOS=57689883;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:35:37:25:26:10:11:0.297297:6:4:14:11:7:4:15:11
chr16	57698931	.	A	G	196.68	PASS	AF=0.465116;AO=20;DP=43;FAO=20;FDP=43;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0230605;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2232;QD=18.2954;RBI=0.0673654;REFB=-0.00352484;REVB=0.0632955;RO=22;SAF=15;SAR=5;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274828;STB=0.537275;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.00656069;OID=.;OPOS=57698931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:22:23:20:20:0.465116:5:15:16:6:5:15:16:7
chr16	57702274	.	G	T	36.72	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.00220279;FXX=0.039984;HRUN=4;LEN=1;MLLD=198.577;QD=6.12029;RBI=0.0205568;REFB=-0.01279;REVB=0.0204384;RO=18;SAF=3;SAR=3;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193723;STB=0.62461;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.034571;OID=.;OPOS=57702274;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:25:24:18:18:6:6:0.25:3:3:12:6:3:3:12:6
chr16	57722328	.	C	T	341.16	PASS	AF=0.622642;AO=33;DP=53;FAO=33;FDP=53;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0679581;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8769;QD=25.7482;RBI=0.0686968;REFB=-0.0376934;REVB=0.0100472;RO=20;SAF=10;SAR=23;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184315;STB=0.60143;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.0235629;OID=.;OPOS=57722328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:20:20:33:33:0.622642:23:10:11:9:23:10:11:9
chr16	57723752	.	A	G	233.4	PASS	AF=0.383562;AO=27;DP=73;FAO=28;FDP=73;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=24;FWDB=0.0166456;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2353;QD=12.7892;RBI=0.0389282;REFB=0.00367197;REVB=-0.0351898;RO=46;SAF=11;SAR=16;SRF=22;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.078771;STB=0.523792;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=-0.00618477;OID=.;OPOS=57723752;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:46:45:27:28:0.383562:16:11:22:24:16:12:21:24
chr16	57734173	.	T	C	196.17	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=39;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.000588316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.151;QD=19.6169;RBI=0.000653033;REFB=-0.0200512;REVB=-0.000283437;RO=19;SAF=10;SAR=9;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467664;STB=0.524975;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0180925;OID=.;OPOS=57734173;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:19:20:19:20:0.5:9:10:11:8:10:10:11:9
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chr16	57761248	.	C	T	152.14	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.000708718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.693;QD=13.2296;RBI=0.0197204;REFB=-0.0444993;REVB=-0.0197076;RO=29;SAF=10;SAR=7;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0776268;STB=0.545401;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0751818;OID=.;OPOS=57761248;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:7:10:15:14:7:10:15:14
chr16	57762401	.	T	C	683.41	PASS	AF=0.523438;AO=67;DP=129;FAO=67;FDP=128;FR=.;FRO=61;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=-0.000556943;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.48;QD=21.3564;RBI=0.00239663;REFB=-0.0177927;REVB=0.00233102;RO=59;SAF=29;SAR=38;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.007923;STB=0.503208;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0193749;OID=.;OPOS=57762401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:128:59:61:67:67:0.523438:38:29:25:34:38:29:26:35
chr16	57764895	.	C	T	400.23	PASS	AF=0.476744;AO=41;DP=86;FAO=41;FDP=86;FR=.;FRO=45;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=0.0349525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.827;QD=18.6152;RBI=0.0353147;REFB=-0.0241105;REVB=-0.00504483;RO=45;SAF=26;SAR=15;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0120112;STB=0.506696;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0257156;OID=.;OPOS=57764895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:45:45:41:41:0.476744:15:26:28:17:15:26:28:17
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chr16	57795394	.	G	A	129.42	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0139113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.322;QD=12.942;RBI=0.0154449;REFB=-0.0252978;REVB=0.00670971;RO=25;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285998;STB=0.516756;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.029028;OID=.;OPOS=57795394;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:7:8:14:11:7:8:14:11
chr16	57805176	.	A	G	570.03	PASS	AF=0.491667;AO=59;DP=118;FAO=59;FDP=120;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=39;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.015721;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.064;QD=19.001;RBI=0.0425533;REFB=-0.0344187;REVB=0.0395428;RO=59;SAF=20;SAR=39;SRF=27;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114646;STB=0.565195;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0327695;OID=.;OPOS=57805176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:120:59:61:59:59:0.491667:39:20:27:32:39:20:28:33
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chr16	57996960	.	C	T	351.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9026;QD=52.0674;RBI=0.122516;REFB=0;REVB=0.0385832;RO=0;SAF=10;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0038553;OID=.;OPOS=57996960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:27:0:0:24:27:1:14:10:0:0:17:10:0:0
chr16	58019396	.	G	A	278.92	PASS	AF=0.4;AO=32;DP=80;FAO=32;FDP=80;FR=.;FRO=48;FSAF=3;FSAR=29;FSRF=4;FSRR=44;FWDB=0.0241912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.932;QD=13.9458;RBI=0.0251531;REFB=-0.00390622;REVB=-0.00688916;RO=47;SAF=3;SAR=29;SRF=4;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0273611;STB=0.518946;STBP=0.9;TYPE=snp;VARB=0.00609522;OID=.;OPOS=58019396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:47:48:32:32:0.4:29:3:4:43:29:3:4:44
chr16	58030634	.	C	T	1151.55	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0591935;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.277;QD=60.6077;RBI=0.0596545;REFB=0;REVB=0.00740215;RO=0;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.7602e-05;OID=.;OPOS=58030634;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:40:35:0:0:40:36:0:0
chr16	58030741	.	G	A	267.18	PASS	AF=0.631579;AO=24;DP=37;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0036639;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.545;QD=28.1241;RBI=0.0245097;REFB=-0.023421;REVB=-0.0242343;RO=13;SAF=10;SAR=14;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0724971;STB=0.550418;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0156149;OID=.;OPOS=58030741;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:13:14:24:24:0.631579:14:10:4:9:14:10:4:10
chr16	58080009	.	C	T	255.63	PASS	AF=0.954545;AO=20;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.132415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.7562;QD=46.4787;RBI=0.146112;REFB=-0.0841144;REVB=0.0617665;RO=1;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061324;STB=0.533301;STBP=0.246;TYPE=snp;VARB=0.0122974;OID=.;OPOS=58080009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:1:1:20:21:0.954545:7:13:0:1:7:14:0:1
chr16	58191966	.	C	T	638.15	PASS	AF=0.976744;AO=40;DP=41;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0189221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1869;QD=59.3625;RBI=0.0696811;REFB=-0.0790785;REVB=0.0670627;RO=1;SAF=27;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170572;STB=0.508768;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00364817;OID=.;OPOS=58191966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:43:1:1:40:42:0.976744:13:27:1:0:14:28:1:0
chr16	58318604	.	T	C	149.67	PASS	AF=0.283784;AO=21;DP=74;FAO=21;FDP=74;FR=.;FRO=53;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.00089933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.11;QD=8.09038;RBI=0.00964237;REFB=-0.00715375;REVB=-0.00960034;RO=53;SAF=6;SAR=15;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258069;STB=0.655583;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0163521;OID=.;OPOS=58318604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:53:53:21:21:0.283784:15:6:26:27:15:6:26:27
chr16	58327646	.	A	G	367.83	PASS	AF=0.5;AO=38;DP=76;FAO=38;FDP=76;FR=.;FRO=38;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0140833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.0668;QD=19.3596;RBI=0.0486014;REFB=-0.0168315;REVB=-0.0465162;RO=38;SAF=27;SAR=11;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0558839;STB=0.531131;STBP=0.619;TYPE=snp;VARB=0.0236306;OID=.;OPOS=58327646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:38:38:38:38:0.5:11:27:25:13:11:27:25:13
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chr16	58542901	.	G	A	447.72	PASS	AF=0.462264;AO=48;DP=105;FAO=49;FDP=106;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=0.0139865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5615;QD=16.8951;RBI=0.0555209;REFB=-0.0247388;REVB=0.0537303;RO=56;SAF=27;SAR=21;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0619149;STB=0.53332;STBP=0.556;TYPE=snp;VARB=0.0272793;OID=.;OPOS=58542901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:106:56:57:48:49:0.462264:21:27:35:21:21:28:36:21
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chr16	66432423	.	TC	CT	488.64	PASS	AF=1;AO=33;DP=37;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260168;FXX=0.0810592;HRUN=1;LEN=2;MLLD=95.2561;QD=57.4867;RBI=0.0548467;REFB=-0.0584088;REVB=0.0482834;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00101543;OID=.;OPOS=66432423;OREF=TC;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:37:34:0:0:33:34:1:10:23:0:0:11:23:0:0
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chr16	68025801	.	G	C	789.44	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744396;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8379;QD=57.4136;RBI=0.0778941;REFB=0;REVB=0.0229397;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00151575;OID=.;OPOS=68025801;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:26:29:0:0:26:29:0:0
chr16	68057096	.	T	C	1301.97	PASS	AF=1;AO=84;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0644653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.4254;QD=61.9986;RBI=0.0673369;REFB=0;REVB=0.0194546;RO=0;SAF=38;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-2.981e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000167747;OID=.;OPOS=68057096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:84:84:1:46:38:0:0:46:38:0:0
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chr16	68398924	.	C	T	255.25	PASS	AF=0.5;AO=24;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0409856;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.121;QD=21.2705;RBI=0.0523595;REFB=-0.0190205;REVB=-0.0325837;RO=22;SAF=14;SAR=10;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330443;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0193245;OID=.;OPOS=68398924;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:24:24:24:0.5:10:14:12:10:10:14:14:10
chr16	68569440	.	T	G	465.09	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169496;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.537;QD=58.1367;RBI=0.0185543;REFB=0;REVB=0.00754809;RO=0;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02243e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.10517e-05;OID=.;OPOS=68569440;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:9:23:0:0:9:23:0:0
chr16	68569459	.	T	C	525.36	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000545984;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.398;QD=60.0413;RBI=0.0322546;REFB=0;REVB=0.03225;RO=0;SAF=24;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305895;OID=.;OPOS=68569459;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:10:24:0:0:10:25:0:0
chr16	68598007	.	A	G	200.94	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.00255839;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8037;QD=15.1654;RBI=0.0361498;REFB=0.000925509;REVB=0.0360592;RO=30;SAF=12;SAR=11;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111989;STB=0.563582;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=-0.000231256;OID=.;OPOS=68598007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:11:12:19:11:11:12:19:11
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chr16	68721533	.	G	C	428.97	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0253239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.203;QD=57.1961;RBI=0.033392;REFB=0;REVB=0.0217652;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.08386e-05;OID=.;OPOS=68721533;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chr16	68725783	.	G	A	770.41	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109956;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.2061;QD=62.8908;RBI=0.130848;REFB=0;REVB=0.0709292;RO=0;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00267661;OID=.;OPOS=68725783;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:46:49:1:17:29:0:0:18:31:0:0
chr16	68729785	.	C	A	619.24	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0524172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.727;QD=60.4136;RBI=0.0524246;REFB=0;REVB=0.000883728;RO=0;SAF=19;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00137791;OID=.;OPOS=68729785;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:41:0:0:37:41:1:18:19:0:0:18:23:0:0
chr16	68771371	.	C	CT	134.88	PASS	AF=1;AO=2;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0343313;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=194.455;QD=41.5012;RBI=0.102153;REFB=0;REVB=-0.0962107;RO=11;SAF=1;SAR=1;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.515617;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000255703;OID=.;OPOS=68771372;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:2:13:13:13:0:11:2:0:0:4:11:1:1:10:1
chr16	68771372	.	C	T	105.25	PASS	AF=0.846154;AO=11;DP=13;FAO=11;FDP=13;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0415601;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=199.447;QD=32.3831;RBI=0.0904845;REFB=-0.054082;REVB=-0.0803754;RO=2;SAF=10;SAR=1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253844;STB=0.644841;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.00366837;OID=.;OPOS=68771372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:13:13:2:2:11:11:0.846154:1:10:1:1:1:10:1:1
chr16	68869449	.	A	G	358.73	PASS	AF=1;AO=24;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461788;FXX=0.0357015;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.769;QD=53.1446;RBI=0.049283;REFB=0;REVB=-0.0172143;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142665;OID=.;OPOS=68869449;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:24:27:1:8:16:0:0:9:18:0:0
chr16	68919559	.	T	C	936.84	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.021896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.252;QD=58.5527;RBI=0.0290299;REFB=0;REVB=0.0190605;RO=0;SAF=25;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103158;OID=.;OPOS=68919559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:39:25:0:0:39:25:0:0
chr16	69143577	.	A	G	244.35	PASS	AF=0.482143;AO=27;DP=56;FAO=27;FDP=56;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0108383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2979;QD=17.4537;RBI=0.0108504;REFB=-0.0231408;REVB=0.000511602;RO=29;SAF=16;SAR=11;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00608498;STB=0.503417;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0206681;OID=.;OPOS=69143577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:29:29:27:27:0.482143:11:16:17:12:11:16:17:12
chr16	69499731	.	T	C	186.83	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=38;FAO=19;FDP=38;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0312526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.0755;QD=19.666;RBI=0.0483078;REFB=-0.0258345;REVB=-0.0368364;RO=19;SAF=4;SAR=15;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1825;STB=0.604276;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0397401;OID=.;OPOS=69499731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:19:19:19:19:0.5:15:4:7:12:15:4:7:12
chr16	69704122	.	C	CTG	439.55	PASS	AF=1;AO=29;DP=35;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338184;FXX=0.0908816;HRUN=5;LEN=2;MLLD=252.606;QD=58.6066;RBI=0.0716086;REFB=0;REVB=0.0631197;RO=4;SAF=14;SAR=15;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052492;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000162403;OID=.;OPOS=69704123;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:29:35:30:30:0:13:17:0:0:3:4:14:15:1:3
chr16	69704204	.	CT	C	73.1	PASS	AF=0.8;AO=8;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.205881;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=9.89471;QD=19.4932;RBI=0.207199;REFB=-0.0701174;REVB=0.0233326;RO=4;SAF=1;SAR=7;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467971;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0701468;OID=.;OPOS=69704205;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.8:8:15:12:15:3:4:8:1:2:7:4:1:7:3:1
chr16	69733460	.	G	A	1044.33	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.055535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0296;QD=59.6759;RBI=0.0684797;REFB=0;REVB=-0.0400666;RO=0;SAF=32;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000388087;OID=.;OPOS=69733460;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:38:32:0:0:38:32:0:0
chr16	69733665	.	T	G	193.13	PASS	AF=0.410714;AO=23;DP=56;FAO=23;FDP=56;FR=.;FRO=33;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.0151745;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.702;QD=13.7952;RBI=0.0243263;REFB=-0.0160584;REVB=0.0190133;RO=33;SAF=15;SAR=8;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178031;STB=0.510195;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0230976;OID=.;OPOS=69733665;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:33:33:23:23:0.410714:8:15:21:12:8:15:21:12
chr16	69735271	.	T	A	1538.38	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0441525;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.461;QD=62.1567;RBI=0.0691048;REFB=0;REVB=0.0531604;RO=0;SAF=62;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10899e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442245;OID=.;OPOS=69735271;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:99:0:0:95:99:1:33:62:0:0:33:66:0:0
chr16	69736851	.	G	A	104.33	PASS	AF=0.342105;AO=12;DP=36;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0231574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.8116;QD=10.9825;RBI=0.129509;REFB=0.0300151;REVB=-0.127422;RO=24;SAF=7;SAR=5;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481035;STB=0.510622;STBP=0.936;TYPE=snp;VARB=-0.0660168;OID=.;OPOS=69736851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:38:24:25:12:13:0.342105:5:7:15:9:5:8:15:10
chr16	69745145	.	G	A	147.62	PASS	AF=0.459459;AO=16;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0145486;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.454;QD=15.9594;RBI=0.0171511;REFB=-0.0216154;REVB=-0.00908289;RO=20;SAF=10;SAR=6;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134671;STB=0.531878;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0295715;OID=.;OPOS=69745145;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:16:17:0.459459:6:10:15:5:6:11:14:6
chr16	69814950	.	G	A	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0220306;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.613;QD=12.3958;RBI=0.0253681;REFB=0.00278756;REVB=0.0125776;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471002;STB=0.776909;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.00240031;OID=.;OPOS=69814950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:3:2:5:0:3:2:5:0
chr16	69814953	.	G	A	30.99	PASS	AF=0.5;AO=5;DP=10;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.00530479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.023;QD=12.3959;RBI=0.00640355;REFB=0.0145203;REVB=0.00358673;RO=5;SAF=2;SAR=3;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.471002;STB=0.776909;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=-0.0135302;OID=.;OPOS=69814953;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:10:10:5:5:5:5:0.5:3:2:5:0:3:2:5:0
chr16	69963355	.	G	A	386.69	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0319369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.836;QD=55.2408;RBI=0.0322192;REFB=0;REVB=0.00425553;RO=0;SAF=18;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012686;OID=.;OPOS=69963355;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:28:0:0:25:28:1:7:18:0:0:7:21:0:0
chr16	69967897	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.159;QD=62.6708;RBI=0.0265624;REFB=0;REVB=-0.0217626;RO=0;SAF=21;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.41396e-05;OID=.;OPOS=69967897;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:23:21:0:0:23:21:0:0
chr16	69970329	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0397436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.216;QD=55.0986;RBI=0.0695361;REFB=0;REVB=0.0570589;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015926;OID=.;OPOS=69970329;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
chr16	69973297	.	C	T	1555.96	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.688;QD=59.8445;RBI=0.0324142;REFB=0;REVB=0.01162;RO=0;SAF=50;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.05171e-05;OID=.;OPOS=69973297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:104:0:0:104:104:1:54:50:0:0:54:50:0:0
chr16	69973824	.	AGG	AAC,AAG,AG	677.15	PASS	AF=0,0,1;AO=2,25,28;DP=57;FAO=0,0,57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,25;FSAR=0,0,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.250046,-0.600291,-0.196408;FXX=0;HRUN=3,3,3;LEN=2,1,1;MLLD=92.9186,7.31696,17.6001;QD=47.5191;RBI=0.250346,0.60053,0.197941;REFB=0,0,0;REVB=-0.0122439,-0.0169642,0.0245858;RO=0;SAF=2,22,0;SAR=0,3,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0.397173;SSSB=0,-4.65945e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,snp,del;VARB=0,0.0206056,-0.00296389;OID=.,.,.;OPOS=69973825,69973825,69973825;OREF=GG,G,G;OALT=AC,A,-;OMAPALT=AAC,AAG,AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	3/3:0,0,1:2,25,28:57:0,0,57:57:0:0,0,25:0,0,32:0:0:4:0:2,22,0:0,3,28:0:0
chr16	69988373	.	T	C	709.41	PASS	AF=1;AO=49;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0680705;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.8834;QD=56.7525;RBI=0.131594;REFB=0;REVB=0.112621;RO=1;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209097;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00138745;OID=.;OPOS=69988373;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:1:0:49:50:1:22:27:0:1:23:27:0:0
chr16	70010516	.	ATGT	A	51.73	PASS	AF=0.636364;AO=6;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0227133;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=227.84;QD=18.8105;RBI=0.07793;REFB=-0.0397181;REVB=0.0745466;RO=5;SAF=4;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0553146;STB=0.52624;STBP=0.929;TYPE=del;VARB=0.0184465;OID=.;OPOS=70010517;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.636364:6:11:7:11:4:4:3:2:2:22:5:4:2:3:2
chr16	70010589	.	T	C	140.9	PASS	AF=0.277778;AO=20;DP=73;FAO=20;FDP=72;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=40;FWDB=-0.00670434;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.347;QD=7.82756;RBI=0.0412192;REFB=-0.00900023;REVB=0.0406703;RO=51;SAF=13;SAR=7;SRF=12;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.468102;STB=0.777123;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0134058;OID=.;OPOS=70010589;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:51:52:20:20:0.277778:7:13:12:39:7:13:12:40
chr16	70010610	.	C	T	225.66	PASS	AF=0.337349;AO=28;DP=84;FAO=28;FDP=83;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=42;FWDB=0.0258724;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.091;QD=10.8753;RBI=0.0378796;REFB=0.00097099;REVB=-0.0276673;RO=55;SAF=19;SAR=9;SRF=13;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.473849;STB=0.770713;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=-0.00245211;OID=.;OPOS=70010610;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:55:55:28:28:0.337349:9:19:13:42:9:19:13:42
chr16	70016573	.	G	A	1246.1	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.018097;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.409;QD=61.5356;RBI=0.0428337;REFB=0;REVB=0.038823;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.43206e-05;OID=.;OPOS=70016573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:43:38:0:0:43:38:0:0
chr16	70064261	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.6694;QD=33.4285;RBI=0.0292095;REFB=0;REVB=-0.00149184;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00232229;OID=.;OPOS=70064261;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chr16	70161263	.	T	C	190.9	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00798933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.533;QD=47.7251;RBI=0.0136915;REFB=0;REVB=0.0111188;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127629;OID=.;OPOS=70161263;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:5:10:0:0:5:11:0:0
chr16	70164334	.	A	G	356.92	PASS	AF=0.276243;AO=49;DP=179;FAO=50;FDP=181;FR=.;FRO=131;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=65;FSRR=66;FWDB=0.00457821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.481;QD=7.88782;RBI=0.00828716;REFB=-0.0108593;REVB=-0.00690775;RO=130;SAF=22;SAR=27;SRF=65;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628165;STB=0.526235;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.026682;OID=.;OPOS=70164334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:181:130:131:49:50:0.276243:27:22:65:65:27:23:65:66
chr16	70165914	.	T	C	137.81	PASS	AF=0.327273;AO=18;DP=55;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=-0.0363582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4394;QD=10.0223;RBI=0.0420441;REFB=-0.00635057;REVB=0.0211138;RO=37;SAF=14;SAR=4;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36038;STB=0.715299;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0238809;OID=.;OPOS=70165914;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:37:37:18:18:0.327273:4:14:18:19:4:14:18:19
chr16	70190401	.	C	T	65.32	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0302242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.852;QD=10.8864;RBI=0.0634472;REFB=0.00985427;REVB=0.0557857;RO=15;SAF=8;SAR=1;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480808;STB=0.7992;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=-0.00830153;OID=.;OPOS=70190401;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:15:15:9:9:0.375:1:8:8:7:1:8:8:7
chr16	70191029	.	T	G	678.14	PASS	AF=0.48227;AO=68;DP=141;FAO=68;FDP=141;FR=.;FRO=73;FSAF=43;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=37;FWDB=-0.00821172;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.061;QD=19.238;RBI=0.0146396;REFB=-0.0339492;REVB=-0.0121196;RO=73;SAF=43;SAR=25;SRF=36;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134358;STB=0.574423;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0268592;OID=.;OPOS=70191029;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:73:73:68:68:0.48227:25:43:36:37:25:43:36:37
chr16	70191161	.	C	T	596.35	PASS	AF=0.466165;AO=62;DP=133;FAO=62;FDP=133;FR=.;FRO=71;FSAF=18;FSAR=44;FSRF=34;FSRR=37;FWDB=-0.0469681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5214;QD=17.9355;RBI=0.0469782;REFB=-0.00481007;REVB=-0.000974081;RO=71;SAF=18;SAR=44;SRF=34;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198538;STB=0.610747;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00426073;OID=.;OPOS=70191161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:71:71:62:62:0.466165:44:18:34:37:44:18:34:37
chr16	70191333	.	T	C	1510.74	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431521;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.247;QD=63.6102;RBI=0.0556488;REFB=0;REVB=0.0351381;RO=0;SAF=45;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144398;OID=.;OPOS=70191333;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:50:45:0:0:50:45:0:0
chr16	70191556	.	G	A	411.25	PASS	AF=0.33557;AO=51;DP=148;FAO=50;FDP=149;FR=.;FRO=99;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=50;FSRR=49;FWDB=0.00473509;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=39.8302;QD=11.0404;RBI=0.008208;REFB=-0.00817358;REVB=-0.00670449;RO=87;SAF=30;SAR=21;SRF=43;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105026;STB=0.564007;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0220494;OID=.;OPOS=70191556;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:149:87:99:51:50:0.33557:21:30:43:44:20:30:50:49
chr16	70191566	.	A	G	1931.06	PASS	AF=0.929078;AO=131;DP=141;FAO=131;FDP=141;FR=.;FRO=10;FSAF=67;FSAR=64;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0878083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5152;QD=54.7817;RBI=0.0883793;REFB=-0.0272454;REVB=0.0100302;RO=6;SAF=67;SAR=64;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0148079;STB=0.506284;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.00176739;OID=.;OPOS=70191566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:141:141:6:10:131:131:0.929078:64:67:2:4:64:67:6:4
chr16	70287172	.	T	TG	248.55	PASS	AF=1;AO=5;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.14019;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=11.2702;QD=31.0684;RBI=0.23738;REFB=0;REVB=-0.191562;RO=27;SAF=3;SAR=2;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.052991;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.011807;OID=.;OPOS=70287173;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:32:32:32:0:18:14:0:0:5:27:3:2:15:12
chr16	70287177	.	A	G	480.94	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000829336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.9926;QD=58.2961;RBI=0.0667318;REFB=0;REVB=-0.0667266;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00117784;OID=.;OPOS=70287177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:33:0:0:31:33:1:13:18:0:0:14:19:0:0
chr16	70303580	.	G	A	611.47	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=44;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0121821;FXX=0.0681663;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.397;QD=59.6552;RBI=0.0215396;REFB=0.0977082;REVB=0.0177637;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.513507;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=-0.000912081;OID=.;OPOS=70303580;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:41:0:1:40:40:0.97561:22:18:0:0:22:18:1:0
chr16	70395387	.	C	T	616.56	PASS	AF=0.953488;AO=41;DP=44;FAO=41;FDP=43;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0619765;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.874;QD=57.3548;RBI=0.0619867;REFB=-0.173112;REVB=-0.00112344;RO=2;SAF=16;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.055096;STB=0.529397;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.00400839;OID=.;OPOS=70395387;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:44:43:2:2:41:41:0.953488:25:16:2:0:25:16:2:0
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chr16	70902683	.	G	A	96.73	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0191508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.786;QD=12.4812;RBI=0.0222314;REFB=0.0110751;REVB=-0.0112907;RO=19;SAF=2;SAR=10;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.431099;STB=0.75901;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=-0.0129639;OID=.;OPOS=70902683;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:10:2:10:9:10:2:10:9
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chr16	70954774	.	A	G	93.81	PASS	AF=0.324324;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0235958;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=188.299;QD=10.142;RBI=0.0773683;REFB=-0.00147516;REVB=-0.0736824;RO=24;SAF=7;SAR=5;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148288;STB=0.56861;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.00759693;OID=.;OPOS=70954774;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:36:37:24:25:12:12:0.324324:5:7:17:7:5:7:17:8
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chr16	70954915	.	G	T	848.66	PASS	AF=0.953846;AO=59;DP=64;FAO=62;FDP=65;FR=.;FRO=3;FSAF=25;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0160784;FXX=0.0714184;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.812;QD=52.2249;RBI=0.0162822;REFB=-0.0963737;REVB=-0.00256772;RO=2;SAF=25;SAR=34;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00482397;STB=0.512566;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00151557;OID=.;OPOS=70954915;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:64:65:2:3:59:62:0.953846:34:25:1:1:37:25:2:1
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chr16	70975667	.	T	C	473.52	PASS	AF=0.380282;AO=53;DP=141;FAO=54;FDP=142;FR=.;FRO=88;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=59;FSRR=29;FWDB=-0.00539213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.104;QD=13.3386;RBI=0.0145131;REFB=-0.0152857;REVB=0.0134743;RO=87;SAF=21;SAR=32;SRF=59;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.301463;STB=0.658815;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0195119;OID=.;OPOS=70975667;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:142:87:88:53:54:0.380282:32:21:59:28:32:22:59:29
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chr16	71094434	.	G	A	585.8	PASS	AF=0.242021;AO=90;DP=376;FAO=91;FDP=376;FR=.;FRO=285;FSAF=34;FSAR=57;FSRF=145;FSRR=140;FWDB=-0.0113168;FXX=0.00265245;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.0585;QD=6.23193;RBI=0.0203001;REFB=-0.00555174;REVB=0.016853;RO=262;SAF=34;SAR=56;SRF=140;SRR=122;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19684;STB=0.603669;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0169322;OID=.;OPOS=71094434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:376:376:262:285:90:91:0.242021:56:34:140:122:57:34:145:140
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chr16	71103269	.	T	C	1875.87	PASS	AF=0.494709;AO=187;DP=379;FAO=187;FDP=378;FR=.;FRO=191;FSAF=98;FSAR=89;FSRF=85;FSRR=106;FWDB=0.00947342;FXX=0.00526302;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.25;QD=19.8505;RBI=0.010478;REFB=-0.0135325;REVB=-0.00447682;RO=186;SAF=98;SAR=89;SRF=83;SRR=103;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0707943;STB=0.539872;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0127759;OID=.;OPOS=71103269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:379:378:186:191:187:187:0.494709:89:98:83:103:89:98:85:106
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chr16	71237702	.	C	T	184.61	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0113023;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.828;QD=17.5814;RBI=0.0147847;REFB=-0.0056407;REVB=-0.00953127;RO=23;SAF=5;SAR=14;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494088;STB=0.528271;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.00881918;OID=.;OPOS=71237702;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:23:23:19:19:0.452381:14:5:7:16:14:5:7:16
chr16	71264523	.	T	A	126.07	PASS	AF=0.326087;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=-0.0567971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4008;QD=10.9628;RBI=0.0602342;REFB=-0.00231972;REVB=0.0200559;RO=27;SAF=2;SAR=13;SRF=6;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173923;STB=0.696117;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.00547953;OID=.;OPOS=71264523;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:46:27:31:15:15:0.326087:13:2:6:21:13:2:10:21
chr16	71264561	.	A	G	128.99	PASS	AF=0.320755;AO=16;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0169737;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.902;QD=9.73517;RBI=0.0267887;REFB=-0.00324569;REVB=-0.020725;RO=36;SAF=2;SAR=14;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.386912;STB=0.668432;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00967016;OID=.;OPOS=71264561;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:36:36:16:17:0.320755:14:2:13:23:14:3:13:23
chr16	71318577	.	T	C	160.27	PASS	AF=0.33871;AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.00951891;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=159.391;QD=10.34;RBI=0.00951954;REFB=-0.00261494;REVB=-0.000109573;RO=40;SAF=14;SAR=7;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193474;STB=0.622103;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00321219;OID=.;OPOS=71318577;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:40:41:21:21:0.33871:7:14:20:20:7:14:20:21
chr16	71319539	.	C	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415786;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.672;QD=52.613;RBI=0.0429337;REFB=0;REVB=0.0107014;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125633;OID=.;OPOS=71319539;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr16	71319646	.	G	A	1026.16	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0385114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.2143;QD=59.4876;RBI=0.0450574;REFB=0;REVB=0.0233889;RO=0;SAF=35;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.68946e-05;OID=.;OPOS=71319646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:34:35:0:0:34:35:0:0
chr16	71418291	.	T	C	238.16	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0905135;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.333;QD=16.1467;RBI=0.0913045;REFB=0.00338482;REVB=0.0119926;RO=29;SAF=16;SAR=11;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0386579;STB=0.50065;STBP=0.99;TYPE=snp;VARB=-0.00205724;OID=.;OPOS=71418291;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:29:32:27:27:0.457627:11:16:16:13:11:16:19:13
chr16	71483345	.	G	T	253.95	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0181052;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.09;QD=21.6124;RBI=0.0181221;REFB=-0.00239355;REVB=0.000783526;RO=21;SAF=17;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0862405;STB=0.532331;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.00251429;OID=.;OPOS=71483345;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:23:24:24:0.510638:7:17:13:8:7:17:15:8
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chr16	71509685	.	C	G	89.77	PASS	AF=0.25;AO=12;DP=48;FAO=12;FDP=48;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=0.0125308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.437;QD=7.48108;RBI=0.0134876;REFB=-0.00794313;REVB=0.0049896;RO=36;SAF=6;SAR=6;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202812;STB=0.624805;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.0275755;OID=.;OPOS=71509685;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:48:48:36:36:12:12:0.25:6:6:24:12:6:6:24:12
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chr16	71660310	.	G	A	532.1	PASS	AF=0.87234;AO=38;DP=47;FAO=41;FDP=47;FR=.;FRO=6;FSAF=29;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.111142;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=34.9928;QD=45.2849;RBI=0.18632;REFB=-0.22532;REVB=0.149542;RO=5;SAF=28;SAR=10;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0896561;STB=0.519736;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0399851;OID=.;OPOS=71660310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:47:47:5:6:38:41:0.87234:10:28:2:3:12:29:5:1
chr16	71668634	.	T	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0371036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.53;QD=53.2765;RBI=0.0376727;REFB=0;REVB=0.00652348;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03845e-05;OID=.;OPOS=71668634;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chr16	71674882	.	C	G	306.25	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016304;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.3005;QD=53.2601;RBI=0.0323636;REFB=0;REVB=0.0279568;RO=0;SAF=13;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000821737;OID=.;OPOS=71674882;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:10:13:0:0:10:13:0:0
chr16	71678932	.	T	C	688.95	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00250444;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.143;QD=62.6322;RBI=0.0777579;REFB=0;REVB=-0.0777176;RO=0;SAF=32;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00012616;OID=.;OPOS=71678932;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:12:32:0:0:12:32:0:0
chr16	71679057	.	C	T	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.905;QD=59.0177;RBI=0.013863;REFB=0;REVB=-0.0090829;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.95005e-05;OID=.;OPOS=71679057;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr16	71800384	.	T	A	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.543;QD=57.2022;RBI=0.0394967;REFB=0;REVB=-0.0198947;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.91229e-05;OID=.;OPOS=71800384;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0
chr16	71886530	.	T	A	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.456;QD=56.7065;RBI=0.0239004;REFB=0;REVB=-0.0191713;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.28123e-05;OID=.;OPOS=71886530;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0
chr16	71887152	.	ACCCCCCCT	ACCCCCCT,ACCCCCCTC,CACCCCCCT	41.93	PASS	AF=0.315789,0,0.0263158;AO=10,2,2;DP=42;FAO=12,0,1;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=7,0,0;FSAR=5,0,1;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0931845,-0.0209806,0.0126164;FXX=0.0256345;HRUN=7,7,1;LEN=1,2,2;MLLD=8.47932,62.7582,19.346;QD=4.41373;RBI=0.103524,0.0914189,0.0675954;REFB=-0.117688,-0.00630102,-0.0637366;REVB=-0.0450978,-0.0889789,-0.0664076;RO=19;SAF=5,0,1;SAR=5,2,1;SRF=5;SRR=14;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.260924,-0.43349,0.252086;STB=0.622023,0.5,0.987958;STBP=0.312,1,0.467;TYPE=del,mnp,mnp;VARB=0.03807,0,0.0341601;OID=.,.,.;OPOS=71887153,71887159,71887152;OREF=C,CT,AC;OALT=-,TC,CA;OMAPALT=ACCCCCCT,ACCCCCCTC,CACCCCCCT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:42:38:19:25:10,2,2:12,0,1:0.315789,0,0.0263158:5,2,1:5,0,1:5:14:5,0,1:7,0,0:10:15
chr16	71889173	.	C	T	1246.11	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0077771;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=363.283;QD=61.5363;RBI=0.0101418;REFB=0;REVB=0.00650947;RO=0;SAF=30;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40248e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.95671e-06;OID=.;OPOS=71889173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:51:30:0:0:51:30:0:0
chr16	71890489	.	C	G	942.69	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000341014;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.113;QD=58.9178;RBI=0.0250427;REFB=0;REVB=0.0250403;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.50594e-05;OID=.;OPOS=71890489;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:64:0:0:65:64:1:30:35:0:0:29:35:0:0
chr16	71981414	.	C	CTTTG	885.68	PASS	AF=0.915493;AO=59;DP=73;FAO=65;FDP=71;FR=.;FRO=6;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.00792927;FXX=0.013887;HRUN=3;LEN=4;MLLD=250.902;QD=49.8975;RBI=0.0138239;REFB=-0.121266;REVB=-0.0113237;RO=8;SAF=37;SAR=22;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297039;STB=0.517467;STBP=0.344;TYPE=ins;VARB=0.00942755;OID=.;OPOS=71981415;OREF=-;OALT=TTTG;OMAPALT=CTTTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.915493:59:73:65:71:6:42:23:5:1:24:8:37:22:6:2
chr16	71983772	.	G	C	1175.82	PASS	AF=0.987342;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0145297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.668;QD=59.5354;RBI=0.0285636;REFB=-0.0394117;REVB=0.024592;RO=0;SAF=40;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000156514;OID=.;OPOS=71983772;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:79:0:1:77:78:0.987342:37:40:0:0:38:40:1:0
chr16	71986946	.	A	G	1197.05	PASS	AF=1;AO=78;DP=80;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00680583;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5402;QD=61.3874;RBI=0.00720958;REFB=0;REVB=-0.00237882;RO=0;SAF=58;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.0323e-05;OID=.;OPOS=71986946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:80:78:0:0:78:78:1:20:58:0:0:20:58:0:0
chr16	71986995	.	G	A	785.45	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.092;QD=64.1186;RBI=0.0231943;REFB=0;REVB=0.0143367;RO=0;SAF=31;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.42746e-05;OID=.;OPOS=71986995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:49:0:0:46:49:1:15:31:0:0:15:34:0:0
chr16	71988106	.	C	T	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0326986;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.002;QD=63.2862;RBI=0.0419833;REFB=0;REVB=0.0263325;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.34738e-05;OID=.;OPOS=71988106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0
chr16	72001136	.	G	A	926.25	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00101881;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.404;QD=58.8094;RBI=0.00456493;REFB=0;REVB=0.00444979;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.48551e-05;OID=.;OPOS=72001136;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:29:34:0:0:29:34:0:0
chr16	72007399	.	C	T	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171478;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.281;QD=59.0153;RBI=0.0405573;REFB=0;REVB=0.0367539;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120432;OID=.;OPOS=72007399;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
chr16	72011181	.	G	T	1022.02	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00882517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0451;QD=59.2477;RBI=0.0102985;REFB=0;REVB=0.00530802;RO=0;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.01094e-05;OID=.;OPOS=72011181;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:69:0:0:68:69:1:29:39:0:0:29:40:0:0
chr16	72011193	.	A	C	1067.52	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3964;QD=59.3066;RBI=0.0810082;REFB=0;REVB=0.0751495;RO=0;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00104064;OID=.;OPOS=72011193;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:68:72:0:0:68:72:1:28:40:0:0:32:40:0:0
chr16	72011261	.	A	G	1605.72	PASS	AF=0.941176;AO=112;DP=119;FAO=112;FDP=119;FR=.;FRO=7;FSAF=57;FSAR=55;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=0.024166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.3707;QD=53.9738;RBI=0.0249093;REFB=-0.00681235;REVB=-0.0060397;RO=7;SAF=57;SAR=55;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0548187;STB=0.52892;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.00595908;OID=.;OPOS=72011261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:119:119:7:7:112:112:0.941176:55:57:7:0:55:57:7:0
chr16	72013797	.	G	C	594.49	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.493;QD=60.9738;RBI=0.0203815;REFB=0;REVB=-0.00407779;RO=0;SAF=15;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000104791;OID=.;OPOS=72013797;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:38:39:1:23:15:0:0:23:16:0:0
chr16	72020134	.	T	C	994.21	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0132754;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7831;QD=57.6353;RBI=0.0357347;REFB=-0.186547;REVB=-0.0331772;RO=1;SAF=39;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011966;STB=0.506327;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0104128;OID=.;OPOS=72020134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:69:69:1:1:68:68:0.985507:29:39:1:0:29:39:1:0
chr16	72020294	.	G	A	365.54	PASS	AF=0.875;AO=28;DP=32;FAO=28;FDP=32;FR=.;FRO=4;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0448272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.899;QD=45.6927;RBI=0.0691996;REFB=-0.225674;REVB=-0.0527172;RO=3;SAF=12;SAR=16;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0433253;STB=0.540511;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=0.00982876;OID=.;OPOS=72020294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:32:32:3:4:28:28:0.875:16:12:2:1:16:12:3:1
chr16	72020323	.	A	G	393.31	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.714;QD=56.1871;RBI=0.0199159;REFB=0;REVB=0.00740873;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.39817e-05;OID=.;OPOS=72020323;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:15:13:0:0:15:13:0:0
chr16	72032231	.	T	A	857.15	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.86;QD=57.1433;RBI=0.0412883;REFB=0;REVB=0.0324071;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.11342e-05;OID=.;OPOS=72032231;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:60:0:0:55:60:1:26:29:0:0:31:29:0:0
chr16	72042682	.	A	C	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324103;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.62;QD=57.1058;RBI=0.0479311;REFB=0;REVB=0.0353124;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106573;OID=.;OPOS=72042682;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0
chr16	72110589	.	G	A	288.81	PASS	AF=0.545455;AO=30;DP=55;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=0.0191739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8577;QD=21.0045;RBI=0.0247992;REFB=-0.0107771;REVB=0.0157277;RO=23;SAF=18;SAR=12;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00711446;STB=0.518784;STBP=0.789;TYPE=snp;VARB=0.0160031;OID=.;OPOS=72110589;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:23:25:30:30:0.545455:12:18:14:9:12:18:14:11
chr16	72132583	.	A	C	384.92	PASS	AF=0.52;AO=39;DP=73;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.00248128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.2845;QD=20.5289;RBI=0.0238684;REFB=0.010691;REVB=0.0237391;RO=34;SAF=25;SAR=14;SRF=23;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328074;STB=0.501113;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=-0.0150154;OID=.;OPOS=72132583;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:75:34:36:39:39:0.52:14:25:23:11:14:25:23:13
chr16	72821644	.	C	T	36.96	PASS	AF=0.315789;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=19;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.0391913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.036;QD=7.78041;RBI=0.0399049;REFB=-0.0234557;REVB=-0.00751275;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223205;STB=0.651755;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.125189;OID=.;OPOS=72821644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:18:19:12:13:6:6:0.315789:2:4:10:2:2:4:11:2
chr16	72821648	.	G	A	91.24	PASS	AF=0.458333;AO=10;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.061452;FXX=0.0768935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.249;QD=15.2066;RBI=0.234634;REFB=-0.0169437;REVB=0.226444;RO=14;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121367;STB=0.624791;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0723415;OID=.;OPOS=72821648;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:24:24:14:13:10:11:0.458333:4:6:10:4:5:6:10:3
chr16	72827758	.	T	C	628.59	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.443;QD=61.3257;RBI=0.0325796;REFB=0;REVB=0.0197423;RO=0;SAF=23;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.4733e-05;OID=.;OPOS=72827758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:38:41:1:15:23:0:0:16:25:0:0
chr16	72832135	.	T	A	740.41	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.265;QD=56.9542;RBI=0.037666;REFB=0;REVB=0.0169135;RO=0;SAF=31;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.93989e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127763;OID=.;OPOS=72832135;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:21:31:0:0:21:31:0:0
chr16	72993831	.	A	C	100.08	PASS	AF=0.324324;AO=7;DP=38;FAO=12;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=25;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.0957224;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9097;QD=10.8192;RBI=0.101064;REFB=-0.0565214;REVB=-0.0324229;RO=11;SAF=6;SAR=1;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20937;STB=0.5416;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0811127;OID=.;OPOS=72993831;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:11:25:7:12:0.324324:1:6:8:3:4:8:18:7
chr16	73143402	.	C	CAGA	162.15	PASS	AF=0.344262;AO=20;DP=63;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=16;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.00787527;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=3;MLLD=250.415;QD=10.6327;RBI=0.0140451;REFB=0.00809714;REVB=0.0116295;RO=40;SAF=16;SAR=4;SRF=24;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278688;STB=0.626735;STBP=0.183;TYPE=ins;VARB=-0.0131165;OID=.;OPOS=73143403;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=CAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.344262:20:63:21:61:40:16:5:24:16:99:40:16:4:24:16
chr16	74366531	.	A	C	187.94	PASS	AF=0.403509;AO=21;DP=54;FAO=23;FDP=57;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=0.00941009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.755;QD=13.1886;RBI=0.00952753;REFB=-0.021467;REVB=0.00149134;RO=31;SAF=6;SAR=15;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.427423;STB=0.705712;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0250966;OID=.;OPOS=74366531;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:57:31:34:21:23:0.403509:15:6:22:9:15:8:24:10
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chr16	74425314	.	G	A	33.71	PASS	AF=0.1;AO=8;DP=79;FAO=8;FDP=80;FR=.;FRO=72;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=54;FSRR=18;FWDB=-0.0325708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.391;QD=1.6855;RBI=0.110806;REFB=-0.00582476;REVB=0.105911;RO=71;SAF=6;SAR=2;SRF=53;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00541414;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0712733;OID=.;OPOS=74425314;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:79:80:71:72:8:8:0.1:2:6:53:18:2:6:54:18
chr16	74425358	.	G	A	203.48	PASS	AF=0.215686;AO=31;DP=153;FAO=33;FDP=153;FR=.;FRO=120;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=88;FSRR=32;FWDB=-0.00237234;FXX=0.0129024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.556;QD=5.31978;RBI=0.0475157;REFB=-0.00378325;REVB=-0.0474564;RO=121;SAF=23;SAR=8;SRF=89;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0105661;STB=0.525194;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00983753;OID=.;OPOS=74425358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:153:121:120:31:33:0.215686:8:23:89:32:8:25:88:32
chr16	74425548	.	A	G	859.97	PASS	AF=0.552632;AO=83;DP=150;FAO=84;FDP=152;FR=.;FRO=68;FSAF=49;FSAR=35;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.00669319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.3148;QD=22.6307;RBI=0.0298659;REFB=-0.0337472;REVB=0.0291063;RO=66;SAF=49;SAR=34;SRF=33;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0746532;STB=0.531242;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0285375;OID=.;OPOS=74425548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:152:66:68:83:84:0.552632:34:49:33:33:35:49:35:33
chr16	74425569	.	C	T	151.53	PASS	AF=0.198473;AO=26;DP=131;FAO=26;FDP=131;FR=.;FRO=105;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=56;FSRR=49;FWDB=-0.0152996;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.245;QD=4.62697;RBI=0.0272381;REFB=-0.0177018;REVB=-0.0225352;RO=103;SAF=13;SAR=13;SRF=55;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0431996;STB=0.526697;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.0852455;OID=.;OPOS=74425569;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:103:105:26:26:0.198473:13:13:55:48:13:13:56:49
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chr16	74425795	.	G	A	333.76	PASS	AF=0.309353;AO=43;DP=139;FAO=43;FDP=139;FR=.;FRO=96;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=49;FSRR=47;FWDB=0.0302292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2092;QD=9.60467;RBI=0.068394;REFB=-0.0490713;REVB=-0.0613509;RO=92;SAF=24;SAR=19;SRF=47;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0557712;STB=0.533138;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0118572;OID=.;OPOS=74425795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:92:96:43:43:0.309353:19:24:47:45:19:24:49:47
chr16	74425826	.	G	A	227.02	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.00166051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.455;QD=13.5534;RBI=0.00496414;REFB=-0.0238672;REVB=0.00467818;RO=39;SAF=20;SAR=7;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333438;STB=0.685435;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0282126;OID=.;OPOS=74425826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:39:40:27:27:0.402985:7:20:17:22:7:20:18:22
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chr16	74664743	.	T	C	484.4	PASS	AF=0.666667;AO=44;DP=66;FAO=44;FDP=66;FR=.;FRO=22;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=-0.0235794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.9815;QD=29.3575;RBI=0.0245937;REFB=-0.0391527;REVB=-0.00699023;RO=22;SAF=24;SAR=20;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0280419;STB=0.515229;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.018441;OID=.;OPOS=74664743;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:22:22:44:44:0.666667:20:24:11:11:20:24:11:11
chr16	74664810	.	A	T	809.69	PASS	AF=1;AO=49;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2118;QD=56.8203;RBI=0.110172;REFB=0;REVB=0.0401695;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013601;OID=.;OPOS=74664810;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:49:57:1:24:25:0:0:27:30:0:0
chr16	74664811	.	G	T	43.47	PASS	AF=0.135593;AO=8;DP=59;FAO=8;FDP=59;FR=.;FRO=51;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0500396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5796;QD=2.94736;RBI=0.0724766;REFB=-0.0445648;REVB=0.0524299;RO=51;SAF=5;SAR=3;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140089;STB=0.600604;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0668806;OID=.;OPOS=74664811;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:59:59:51:51:8:8:0.135593:3:5:26:25:3:5:26:25
chr16	74670458	.	C	T	414.94	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0464895;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2347;QD=57.2333;RBI=0.0492873;REFB=0;REVB=0.0163697;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000395878;OID=.;OPOS=74670458;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:20:9:0:0:20:9:0:0
chr16	74695079	.	G	T	1116.51	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0159083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2172;QD=60.3518;RBI=0.049179;REFB=0;REVB=-0.046535;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000206518;OID=.;OPOS=74695079;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:38:36:0:0:38:36:0:0
chr16	74750405	.	G	A	670.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144395;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=116.325;QD=62.3484;RBI=0.0265454;REFB=0;REVB=0.0222747;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116463;OID=.;OPOS=74750405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:23:20:0:0:23:20:0:0
chr16	75203269	.	A	C	78.62	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.00308233;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.762;QD=14.9752;RBI=0.0077227;REFB=-0.00928917;REVB=0.00708092;RO=9;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128055;STB=0.622399;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00964639;OID=.;OPOS=75203269;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:19:21:9:11:10:10:0.47619:4:6:4:5:4:6:4:7
chr16	75238103	.	C	T	1581.97	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0818013;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7144;QD=63.9181;RBI=0.0842705;REFB=0;REVB=0.0202501;RO=0;SAF=49;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000600828;OID=.;OPOS=75238103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:99:0:0:99:99:1:50:49:0:0:50:49:0:0
chr16	75258617	.	C	T	159.59	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0100033;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=160.304;QD=17.7319;RBI=0.0147765;REFB=-0.0242313;REVB=-0.0108756;RO=17;SAF=6;SAR=11;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210219;STB=0.594481;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.019123;OID=.;OPOS=75258617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:36:17:19:17:17:0.472222:11:6:10:7:11:6:10:9
chr16	75269267	.	A	G	556.98	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0329127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.702;QD=60.2141;RBI=0.0346668;REFB=0;REVB=0.0108875;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001752;OID=.;OPOS=75269267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:23:14:0:0:23:14:0:0
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chr16	75271146	.	CCG	CCC,CC,C	106.41	PASS	AF=0,0.153846,0.123077;AO=6,22,18;DP=133;FAO=0,20,16;FDP=130;FR=.;FRO=94;FSAF=0,4,16;FSAR=0,16,0;FSRF=45;FSRR=49;FWDB=0.136559,-0.0203055,-0.156156;FXX=0.0225547;HRUN=4,4,4;LEN=1,1,2;MLLD=17.5564,10.3443,18.6222;QD=3.27399;RBI=0.14765,0.168878,0.1919;REFB=-0.0555477,-0.110984,-0.0543974;REVB=-0.0561431,-0.167653,-0.111538;RO=77;SAF=5,4,16;SAR=1,18,2;SRF=35;SRR=42;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.393362,-0.387229,0.574257;STB=0.5,0.750689,0.999307;STBP=1,0.018,0;TYPE=snp,del,del;VARB=0,0.161978,0.172893;OID=.,.,.;OPOS=75271148,75271148,75271147;OREF=G,G,CG;OALT=C,-,-;OMAPALT=CCC,CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.153846,0.123077:6,22,18:133:0,20,16:130:94:0,4,16:0,16,0:45:49:35:77:5,4,16:1,18,2:35:42
chr16	75563330	.	G	A	111.4	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.0539451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4525;QD=15.9147;RBI=0.0674463;REFB=0.00857078;REVB=0.0404836;RO=14;SAF=4;SAR=9;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.361002;STB=0.692012;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=-0.00517527;OID=.;OPOS=75563330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:15:13:13:0.464286:9:4:10:4:9:4:10:5
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chr16	75564287	.	T	C	82.31	PASS	AF=0.297297;AO=11;DP=37;FAO=11;FDP=37;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0567696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.1016;QD=8.89836;RBI=0.0622981;REFB=-0.0201144;REVB=-0.0256567;RO=25;SAF=2;SAR=9;SRF=7;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16099;STB=0.624747;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0460798;OID=.;OPOS=75564287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:37:37:25:26:11:11:0.297297:9:2:7:18:9:2:8:18
chr16	75565420	.	A	G	740.43	PASS	AF=1;AO=44;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226954;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.937;QD=56.9562;RBI=0.0242316;REFB=0;REVB=-0.00849051;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.98117e-05;OID=.;OPOS=75565420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:44:52:1:15:29:0:0:21:31:0:0
chr16	75574030	.	C	T	389.38	PASS	AF=0.59375;AO=38;DP=64;FAO=38;FDP=64;FR=.;FRO=26;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.00881329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.978;QD=24.3362;RBI=0.0140746;REFB=-0.00777399;REVB=-0.0109736;RO=26;SAF=23;SAR=15;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0799415;STB=0.543896;STBP=0.416;TYPE=snp;VARB=0.00291485;OID=.;OPOS=75574030;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:26:26:38:38:0.59375:15:23:13:13:15:23:13:13
chr16	75590092	.	G	C	415.2	PASS	AF=0.457447;AO=40;DP=91;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.0207411;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.5865;QD=17.668;RBI=0.0405939;REFB=-0.056106;REVB=0.0348951;RO=51;SAF=21;SAR=19;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0151825;STB=0.522245;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0690445;OID=.;OPOS=75590092;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:94:51:51:40:43:0.457447:19:21:26:25:22:21:27:24
chr16	75590113	.	C	G	543.44	PASS	AF=0.536842;AO=51;DP=95;FAO=51;FDP=95;FR=.;FRO=44;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=0.00162513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.384;QD=22.8815;RBI=0.019306;REFB=-0.019788;REVB=-0.0192375;RO=43;SAF=26;SAR=25;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178306;STB=0.50454;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.0201659;OID=.;OPOS=75590113;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:43:44:51:51:0.536842:25:26:21:22:25:26:22:22
chr16	75646576	.	G	T	595.25	PASS	AF=0.530973;AO=59;DP=112;FAO=60;FDP=113;FR=.;FRO=53;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.00743794;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.763;QD=21.071;RBI=0.0154264;REFB=-0.0429071;REVB=-0.0135148;RO=51;SAF=27;SAR=32;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0276153;STB=0.511239;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0218726;OID=.;OPOS=75646576;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:113:51:53:59:60:0.530973:32:27:25:26:32:28:26:27
chr16	75646685	.	G	T	94.92	PASS	AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=22;FWDB=-0.062818;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.0822;QD=10.2618;RBI=0.0632324;REFB=0.0150424;REVB=-0.00722734;RO=25;SAF=9;SAR=3;SRF=4;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.596663;STB=0.861619;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=-0.0565633;OID=.;OPOS=75646685;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:37:37:25:25:12:12:0.324324:3:9:4:21:3:9:3:22
chr16	75728368	.	A	G	1173.33	PASS	AF=0.987342;AO=76;DP=77;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0152143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8917;QD=59.4092;RBI=0.0205127;REFB=-0.17193;REVB=-0.0137585;RO=1;SAF=34;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137144;STB=0.50704;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.0020491;OID=.;OPOS=75728368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:79:1:1:76:78:0.987342:42:34:1:0:43:35:1:0
chr16	76311602	.	G	GT	745.84	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504868;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.0459;QD=45.8975;RBI=0.0921303;REFB=0;REVB=0.0770654;RO=1;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154834;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00241544;OID=.;OPOS=76311603;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:64:65:65:65:0:34:31:0:0:14:1:34:30:0:1
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chr16	76532583	.	A	G	972.2	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00975093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.523;QD=58.9211;RBI=0.0121327;REFB=0;REVB=0.00721946;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.72808e-05;OID=.;OPOS=76532583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:66:0:0:63:66:1:35:28:0:0:36:30:0:0
chr16	76587202	.	T	G	610.23	PASS	AF=0.56701;AO=55;DP=98;FAO=55;FDP=97;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.00968625;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.2934;QD=25.1641;RBI=0.0711515;REFB=-0.00376954;REVB=-0.0704891;RO=41;SAF=28;SAR=27;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117172;STB=0.55804;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.00240794;OID=.;OPOS=76587202;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:97:41:42:55:55:0.56701:27:28:27:14:27:28:27:15
chr16	76587331	.	T	C	660.38	PASS	AF=0.503817;AO=66;DP=131;FAO=66;FDP=131;FR=.;FRO=65;FSAF=21;FSAR=45;FSRF=37;FSRR=28;FWDB=-0.0398719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.388;QD=20.1642;RBI=0.0411108;REFB=-0.0125986;REVB=-0.0100164;RO=65;SAF=21;SAR=45;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235122;STB=0.629938;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0091375;OID=.;OPOS=76587331;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:65:65:66:66:0.503817:45:21:37:28:45:21:37:28
chr16	76902847	.	T	C	538.56	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.089;QD=59.8394;RBI=0.0589655;REFB=0;REVB=0.0430784;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280633;OID=.;OPOS=76902847;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:10:26:0:0:10:26:0:0
chr16	76902850	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.778;QD=59.8389;RBI=0.0136912;REFB=0;REVB=-0.00845749;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000179046;OID=.;OPOS=76902850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:10:26:0:0:10:26:0:0
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chr16	77328895	.	C	T	489.58	PASS	AF=0.495238;AO=51;DP=106;FAO=52;FDP=105;FR=.;FRO=53;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=0.00608214;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.532;QD=18.6506;RBI=0.029806;REFB=-0.00740119;REVB=0.0291788;RO=52;SAF=29;SAR=22;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0631149;STB=0.534057;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.00555013;OID=.;OPOS=77328895;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:105:52:53:51:52:0.495238:22:29:26:26:23:29:26:27
chr16	77328990	.	C	A	532.5	PASS	AF=0.549451;AO=48;DP=89;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.0256418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6954;QD=23.4065;RBI=0.0322383;REFB=-0.0253814;REVB=0.0195399;RO=41;SAF=20;SAR=28;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191683;STB=0.518175;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0159489;OID=.;OPOS=77328990;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:91:41:41:48:50:0.549451:28:20:18:23:30:20:18:23
chr16	77353973	.	G	T	941.01	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0142405;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.788;QD=57.0311;RBI=0.0342627;REFB=-0.079833;REVB=0.0311631;RO=1;SAF=33;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.014534;STB=0.50769;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00084285;OID=.;OPOS=77353973;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:32:33:0:1:32:33:0:1
chr16	77359919	.	A	T	1306.07	PASS	AF=0.988372;AO=85;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00467018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.867;QD=60.7475;RBI=0.0129518;REFB=-0.0249502;REVB=0.0120805;RO=1;SAF=42;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011146;STB=0.505881;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=3.01121e-05;OID=.;OPOS=77359919;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:1:1:85:85:0.988372:43:42:1:0:43:42:1:0
chr16	77389956	.	A	G	747.08	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.094;QD=63.5815;RBI=0.059505;REFB=0;REVB=0.00254283;RO=0;SAF=15;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131007;OID=.;OPOS=77389956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:32:15:0:0:32:15:0:0
chr16	77401545	.	A	G	2816.31	PASS	AF=1;AO=177;DP=178;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=81;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.059;QD=62.5848;RBI=0.0325785;REFB=0;REVB=0.0279018;RO=0;SAF=97;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.33275e-05;OID=.;OPOS=77401545;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:178:180:0:0:177:180:1:80:97:0:0:81:99:0:0
chr16	77769369	.	C	T	3989.77	PASS	AF=1;AO=256;DP=258;FAO=257;FDP=257;FR=.;FRO=0;FSAF=110;FSAR=147;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0626184;FXX=0.011538;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.183;QD=62.0976;RBI=0.0692273;REFB=-0.0583812;REVB=0.0295188;RO=1;SAF=110;SAR=146;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00325419;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.15043e-05;OID=.;OPOS=77769369;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:258:257:1:0:256:257:1:146:110:0:1:147:110:0:0
chr16	77822740	.	A	G	483.45	PASS	AF=0.505376;AO=46;DP=92;FAO=47;FDP=93;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=-0.00933922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.078;QD=20.7935;RBI=0.0303917;REFB=-0.0119413;REVB=0.0289211;RO=45;SAF=28;SAR=18;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.012721;STB=0.517926;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=0.0144118;OID=.;OPOS=77822740;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:45:46:46:47:0.505376:18:28:28:17:19:28:29:17
chr16	77910349	.	C	T	623.38	PASS	AF=0.571429;AO=55;DP=97;FAO=56;FDP=98;FR=.;FRO=42;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=14;FSRR=28;FWDB=0.0104541;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.665;QD=25.4441;RBI=0.019577;REFB=-0.0076575;REVB=0.0165521;RO=41;SAF=29;SAR=26;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163307;STB=0.57871;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00495335;OID=.;OPOS=77910349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:41:42:55:56:0.571429:26:29:13:28:27:29:14:28
chr16	78013123	.	C	T	1131.77	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0269249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.337;QD=60.3613;RBI=0.0383256;REFB=0;REVB=-0.0272746;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104563;OID=.;OPOS=78013123;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:39:34:0:0:40:35:0:0
chr16	78013882	.	A	T	472.71	PASS	AF=0.46789;AO=51;DP=109;FAO=51;FDP=109;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=24;FWDB=-0.0268592;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.791;QD=17.3472;RBI=0.0337612;REFB=-0.0148235;REVB=-0.0204549;RO=58;SAF=22;SAR=29;SRF=34;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147547;STB=0.582047;STBP=0.129;TYPE=snp;VARB=0.0212824;OID=.;OPOS=78013882;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:58:58:51:51:0.46789:29:22:34:24:29:22:34:24
chr16	78063000	.	T	C	651.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0578683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=133.628;QD=62.02;RBI=0.0719998;REFB=0;REVB=0.0428396;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000642322;OID=.;OPOS=78063000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:20:22:0:0:20:22:0:0
chr16	78063064	.	G	T	358.13	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300911;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0174;QD=55.097;RBI=0.0392772;REFB=0;REVB=0.0252433;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00010943;OID=.;OPOS=78063064;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
chr16	78065139	.	A	G	902.71	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014653;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=292.295;QD=58.2394;RBI=0.014748;REFB=0;REVB=0.00167119;RO=0;SAF=31;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.29671e-05;OID=.;OPOS=78065139;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:31:31:0:0:31:31:0:0
chr16	78312497	.	C	A	239.65	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.00183132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=305.218;QD=18.0872;RBI=0.00632699;REFB=-0.0112377;REVB=0.00605616;RO=27;SAF=15;SAR=11;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157261;STB=0.587722;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0115858;OID=.;OPOS=78312497;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:11:15:20:7:11:15:20:7
chr16	78586531	.	T	C	1503.85	PASS	AF=1;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0920463;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6318;QD=59.5583;RBI=0.0923799;REFB=0;REVB=-0.00784349;RO=0;SAF=39;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.32893e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000560566;OID=.;OPOS=78586531;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:101:0:0:101:101:1:62:39:0:0:63:38:0:0
chr16	79245786	.	A	G	315.96	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=25;FWDB=0.00293018;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.347;QD=17.5534;RBI=0.00736299;REFB=-0.0188994;REVB=-0.00675483;RO=36;SAF=17;SAR=17;SRF=13;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128137;STB=0.583286;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.0305684;OID=.;OPOS=79245786;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:38:34:34:0.472222:17:17:13:23:17:17:13:25
chr16	79245820	.	G	T	245.19	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00419863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5797;QD=15.5677;RBI=0.0505924;REFB=-0.0401443;REVB=0.0504179;RO=34;SAF=12;SAR=16;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182225;STB=0.609788;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0400739;OID=.;OPOS=79245820;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:34:35:28:28:0.444444:16:12:21:13:16:12:22:13
chr16	79245930	.	G	C	393.07	PASS	AF=0.680851;AO=32;DP=47;FAO=32;FDP=47;FR=.;FRO=15;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=0.00184676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.85;QD=33.4531;RBI=0.0323537;REFB=-0.0175102;REVB=0.0323009;RO=15;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144371;STB=0.578465;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0175455;OID=.;OPOS=79245930;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:15:15:32:32:0.680851:14:18:12:3:14:18:12:3
chr16	79245956	.	C	G	803.9	PASS	AF=1;AO=55;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0030988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.512;QD=56.4139;RBI=0.0517386;REFB=0;REVB=0.0516458;RO=1;SAF=37;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0254644;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.82257e-05;OID=.;OPOS=79245956;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:57:1:0:55:57:1:18:37:0:1:19:38:0:0
chr16	79245961	.	T	C	837.06	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0409937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.459;QD=55.804;RBI=0.0458849;REFB=0.0214898;REVB=0.0206142;RO=1;SAF=38;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219355;STB=0.511624;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=-0.00133495;OID=.;OPOS=79245961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:21:38:0:1:21:38:0:1
chr16	79633805	.	TGCC	T	293.41	PASS	AF=1;AO=15;DP=25;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0799388;FXX=0.119952;HRUN=1;LEN=3;MLLD=220.34;QD=53.3469;RBI=0.0910115;REFB=0;REVB=0.0435072;RO=0;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0004698;OID=.;OPOS=79633806;OREF=GCC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:15:25:22:22:0:3:19:0:0:3:0:0:15:0:0
chr16	79634579	.	A	C	209.31	PASS	AF=0.409836;AO=25;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.0123316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7021;QD=13.7255;RBI=0.0178123;REFB=-0.00945928;REVB=0.0128534;RO=36;SAF=19;SAR=6;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244493;STB=0.640983;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0169821;OID=.;OPOS=79634579;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:36:36:25:25:0.409836:6:19:20:16:6:19:20:16
chr16	81010073	.	C	T	85.79	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0380293;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.917;QD=11.8336;RBI=0.0839562;REFB=-0.00967974;REVB=-0.0748493;RO=18;SAF=7;SAR=4;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361346;STB=0.712216;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.0398001;OID=.;OPOS=81010073;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:4:7:5:13:4:7:5:13
chr16	81050965	.	A	T	837.07	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0116846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.683;QD=55.8045;RBI=0.0235453;REFB=0.0628436;REVB=-0.0204414;RO=1;SAF=33;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140845;STB=0.50746;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.00144569;OID=.;OPOS=81050965;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:1:1:59:59:0.983333:26:33:1:0:26:33:1:0
chr16	81056441	.	T	G	223.86	PASS	AF=0.478261;AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0223586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.609;QD=19.466;RBI=0.0223608;REFB=-0.00652451;REVB=0.000315164;RO=24;SAF=11;SAR=10;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061468;STB=0.521719;STBP=0.787;TYPE=snp;VARB=0.00868897;OID=.;OPOS=81056441;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:24:24:21:22:0.478261:10:11:11:13:11:11:11:13
chr16	81061827	.	G	A	540.26	PASS	AF=0.5;AO=56;DP=112;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=16;FSAR=40;FSRF=26;FSRR=30;FWDB=0.0107102;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4805;QD=19.2951;RBI=0.0208584;REFB=-0.0159057;REVB=-0.0178987;RO=55;SAF=16;SAR=40;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169771;STB=0.599962;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00889074;OID=.;OPOS=81061827;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:55:56:56:56:0.5:40:16:25:30:40:16:26:30
chr16	81062171	.	C	T	109.85	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.00861707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.631;QD=12.2057;RBI=0.0152938;REFB=-0.00479427;REVB=0.0126351;RO=18;SAF=5;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246357;STB=0.571326;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00334776;OID=.;OPOS=81062171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:22:14:14:0.388889:9:5:11:7:8:6:12:10
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chr16	81077915	.	T	C	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.023246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.855;QD=21.0138;RBI=0.0246436;REFB=0.00561314;REVB=-0.0081813;RO=7;SAF=5;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117729;STB=0.566892;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=-0.00331986;OID=.;OPOS=81077915;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:6:5:2:5:6:5:2:5
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chr16	81095363	.	C	T	102.72	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=27;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0111861;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.991;QD=15.8029;RBI=0.0123912;REFB=-0.0294633;REVB=0.00533034;RO=14;SAF=5;SAR=7;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113119;STB=0.506568;STBP=0.946;TYPE=snp;VARB=0.0225982;OID=.;OPOS=81095363;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:26:14:14:12:12:0.461538:7:5:6:8:7:5:6:8
chr16	81142257	.	T	C	158.72	PASS	AF=0.447368;AO=13;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0872745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2714;QD=16.7072;RBI=0.0950922;REFB=-0.0416317;REVB=0.0377583;RO=21;SAF=6;SAR=7;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137569;STB=0.60724;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0314068;OID=.;OPOS=81142257;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:13:17:0.447368:7:6:7:14:8:9:7:14
chr16	81145807	.	C	G	716.09	PASS	AF=0.507246;AO=69;DP=138;FAO=70;FDP=138;FR=.;FRO=68;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=44;FSRR=24;FWDB=0.0170756;FXX=0.00719373;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3995;QD=20.7563;RBI=0.0234667;REFB=-0.000804547;REVB=0.016097;RO=67;SAF=38;SAR=31;SRF=44;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0970364;STB=0.545345;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00112002;OID=.;OPOS=81145807;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:67:68:69:70:0.507246:31:38:44:23:31:39:44:24
chr16	81151122	.	A	C	1171.92	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000467045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.351;QD=60.8788;RBI=0.00745383;REFB=0;REVB=0.00743919;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.74427e-05;OID=.;OPOS=81151122;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:39:38:0:0:39:38:0:0
chr16	81157324	.	G	A	691.55	PASS	AF=0.928571;AO=52;DP=56;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=19;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00462533;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7884;QD=49.3963;RBI=0.00882076;REFB=-0.143649;REVB=0.00751081;RO=4;SAF=19;SAR=33;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019366;STB=0.510305;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0124429;OID=.;OPOS=81157324;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:56:56:4:4:52:52:0.928571:33:19:2:2:33:19:2:2
chr16	81157385	.	G	T	728.97	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276832;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2132;QD=57.1744;RBI=0.0980975;REFB=0;REVB=0.0941103;RO=0;SAF=19;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139854;OID=.;OPOS=81157385;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:32:19:0:0:32:19:0:0
chr16	81161473	.	G	GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC	63.61	PASS	AF=0.188679;AO=7;DP=54;FAO=10;FDP=53;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=36;FSRR=7;FWDB=-0.0233319;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=22;MLLD=338.474;QD=4.80096;RBI=0.0283241;REFB=-0.0121007;REVB=-0.0160586;RO=44;SAF=6;SAR=1;SRF=37;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037583;STB=0.647999;STBP=0.479;TYPE=ins;VARB=0.0416171;OID=.;OPOS=81161474;OREF=-;OALT=TACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC;OMAPALT=GTACTGCCAAGCCTGGGGAAAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.188679:7:54:10:53:43:7:3:36:7:63:44:6:1:37:7
chr16	81161552	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0237016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.719;QD=51.9165;RBI=0.0277731;REFB=0;REVB=-0.0144768;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000267558;OID=.;OPOS=81161552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0
chr16	81161569	.	T	G	241.39	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102979;FXX=0.049975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.4593;QD=50.8187;RBI=0.0103842;REFB=0;REVB=-0.00133576;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204644;OID=.;OPOS=81161569;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:18:19:1:9:9:0:0:10:9:0:0
chr16	81161571	.	T	C	260.16	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0032401;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.127;QD=52.0315;RBI=0.0394012;REFB=0;REVB=0.0392677;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.60305e-05;OID=.;OPOS=81161571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:18:20:1:9:9:0:0:10:10:0:0
chr16	81161578	.	G	A	250.67	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00276617;FXX=0.0454339;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.053;QD=47.7475;RBI=0.087492;REFB=-0.0146376;REVB=0.0874482;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.526289;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0010279;OID=.;OPOS=81161578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:21:0:1:20:20:0.952381:9:11:0:0:9:11:0:1
chr16	81161608	.	T	C	167.45	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0238602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.57;QD=41.8635;RBI=0.0599066;REFB=-0.0208273;REVB=0.0549499;RO=0;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529373;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=0.00195217;OID=.;OPOS=81161608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:16:0:1:15:15:0.9375:7:8:0:0:7:8:1:0
chr16	81173136	.	T	C	1098.55	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00629123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.674;QD=60.1946;RBI=0.0457354;REFB=0;REVB=-0.0453007;RO=0;SAF=40;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93225e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000221086;OID=.;OPOS=81173136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:33:40:0:0:33:40:0:0
chr16	81173193	.	C	T	496.96	PASS	AF=0.559524;AO=47;DP=84;FAO=47;FDP=84;FR=.;FRO=37;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00900911;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=181.684;QD=23.6649;RBI=0.0135072;REFB=-0.0196546;REVB=-0.0100639;RO=36;SAF=25;SAR=22;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252823;STB=0.508127;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0246469;OID=.;OPOS=81173193;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:36:37:47:47:0.559524:22:25:18:18:22:25:19:18
chr16	81174978	.	A	G	817.12	PASS	AF=0.534722;AO=77;DP=144;FAO=77;FDP=144;FR=.;FRO=67;FSAF=34;FSAR=43;FSRF=32;FSRR=35;FWDB=-0.0136233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.953;QD=22.6977;RBI=0.0139143;REFB=-0.0173464;REVB=0.00283079;RO=65;SAF=34;SAR=43;SRF=31;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298708;STB=0.516935;STBP=0.67;TYPE=snp;VARB=0.0126532;OID=.;OPOS=81174978;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:144:144:65:67:77:77:0.534722:43:34:31:34:43:34:32:35
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chr16	81174999	.	A	G	744.53	PASS	AF=0.496599;AO=71;DP=147;FAO=73;FDP=147;FR=.;FRO=74;FSAF=29;FSAR=44;FSRF=34;FSRR=40;FWDB=-0.0161414;FXX=0.0134219;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.075;QD=20.2592;RBI=0.0171691;REFB=-0.0134652;REVB=-0.005851;RO=76;SAF=29;SAR=42;SRF=35;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.04985;STB=0.532249;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0154572;OID=.;OPOS=81174999;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:76:74:71:73:0.496599:42:29:35:41:44:29:34:40
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chr16	81185416	.	A	G	646.64	PASS	AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0419484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7879;QD=57.4787;RBI=0.0564849;REFB=-0.103444;REVB=0.0378268;RO=0;SAF=31;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41862e-08;STB=0.512065;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00267712;OID=.;OPOS=81185416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:45:45:0:2:43:43:0.955556:12:31:0:0:12:31:1:1
chr16	81187634	.	GG	CT	84.52	PASS	AF=0.34375;AO=10;DP=33;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.00483733;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=2;MLLD=222.103;QD=10.5648;RBI=0.0108935;REFB=-0.0136103;REVB=0.00976061;RO=21;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.389581;STB=0.74429;STBP=0.08;TYPE=mnp;VARB=0.0319682;OID=.;OPOS=81187634;OREF=GG;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:33:32:21:21:10:11:0.34375:4:6:5:16:4:7:5:16
chr16	81187709	.	T	A	239.46	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.041813;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.2813;QD=18.0722;RBI=0.0419376;REFB=-0.0077951;REVB=-0.00323035;RO=27;SAF=16;SAR=10;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221368;STB=0.624182;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0143201;OID=.;OPOS=81187709;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:10:16:10:17:10:16:10:17
chr16	81190601	.	T	C	1015.15	PASS	AF=1;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288721;FXX=0.0285673;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.011;QD=59.7146;RBI=0.056149;REFB=0;REVB=0.0481572;RO=0;SAF=46;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.75496e-05;OID=.;OPOS=81190601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:68:0:0:68:68:1:22:46:0:0:22:46:0:0
chr16	81190613	.	A	G	1080.04	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.3684;QD=60.0022;RBI=0.0490673;REFB=0;REVB=0.0479672;RO=0;SAF=47;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312425;OID=.;OPOS=81190613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:24:47:0:0:25:47:0:0
chr16	81193321	.	C	T	372.04	PASS	AF=0.40404;AO=40;DP=99;FAO=40;FDP=99;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=31;FSRR=28;FWDB=0.00762079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.506;QD=15.0321;RBI=0.068279;REFB=-0.00475474;REVB=0.0678524;RO=49;SAF=15;SAR=25;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175093;STB=0.591213;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.0132329;OID=.;OPOS=81193321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:49:59:40:40:0.40404:25:15:27:22:25:15:31:28
chr16	81194382	.	T	C	767.1	PASS	AF=0.576;AO=72;DP=125;FAO=72;FDP=125;FR=.;FRO=53;FSAF=33;FSAR=39;FSRF=20;FSRR=33;FWDB=0.0134848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.063;QD=24.5473;RBI=0.0160936;REFB=-0.0171333;REVB=-0.00878434;RO=53;SAF=33;SAR=39;SRF=20;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0638476;STB=0.534764;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=0.0104303;OID=.;OPOS=81194382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:53:53:72:72:0.576:39:33:20:33:39:33:20:33
chr16	81198306	.	C	A	269.7	PASS	AF=0.43662;AO=30;DP=72;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.012749;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.941;QD=15.1944;RBI=0.0170734;REFB=-0.0211855;REVB=-0.0113562;RO=37;SAF=21;SAR=9;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0279497;STB=0.506575;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0269877;OID=.;OPOS=81198306;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:37:40:30:31:0.43662:9:21:25:12:9:22:28:12
chr16	81199520	.	T	C	153.42	PASS	AF=0.338983;AO=20;DP=60;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=-0.0440654;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.143;QD=10.4016;RBI=0.0613911;REFB=-0.0113312;REVB=-0.0427446;RO=39;SAF=9;SAR=11;SRF=12;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166358;STB=0.596767;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0220629;OID=.;OPOS=81199520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:39:39:20:20:0.338983:11:9:12:27:11:9:12:27
chr16	81199538	.	T	C	175.75	PASS	AF=0.372881;AO=22;DP=59;FAO=22;FDP=59;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=26;FWDB=-0.00561168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2393;QD=11.9152;RBI=0.030087;REFB=0.00643641;REVB=0.0295591;RO=37;SAF=9;SAR=13;SRF=11;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129425;STB=0.574404;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=-0.00781533;OID=.;OPOS=81199538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:37:37:22:22:0.372881:13:9:11:26:13:9:11:26
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chr16	81199554	.	CA	TG	180.92	PASS	AF=0.403846;AO=20;DP=51;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=22;FWDB=0.0593474;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=181.957;QD=13.9166;RBI=0.0593518;REFB=-0.0278324;REVB=-0.000719159;RO=30;SAF=8;SAR=12;SRF=9;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111754;STB=0.586129;STBP=0.349;TYPE=mnp;VARB=0.0408585;OID=.;OPOS=81199554;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:30:31:20:21:0.403846:12:8:9:21:12:9:9:22
chr16	81209207	.	T	C	206.81	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00580971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.033;QD=48.6607;RBI=0.0132022;REFB=0;REVB=0.0118551;RO=0;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119958;OID=.;OPOS=81209207;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:9:8:0:0:9:8:0:0
chr16	81213378	.	A	G	374.08	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.44;QD=55.4197;RBI=0.0377304;REFB=0;REVB=0.0377288;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.87407e-05;OID=.;OPOS=81213378;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
chr16	81232275	.	G	A	632.19	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025103;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.858;QD=61.6767;RBI=0.0391041;REFB=0;REVB=0.0299828;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160367;OID=.;OPOS=81232275;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
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chr16	81241098	.	C	T	871.28	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0200007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.347;QD=56.2115;RBI=0.0297791;REFB=-0.124626;REVB=0.0220627;RO=1;SAF=29;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159989;STB=0.508472;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.000675648;OID=.;OPOS=81241098;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:32:29:1:0:32:29:1:0
chr16	81241100	.	G	C	977.04	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188953;FXX=0.0294074;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.815;QD=59.2145;RBI=0.0372965;REFB=0;REVB=0.0321558;RO=0;SAF=34;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.70483e-05;OID=.;OPOS=81241100;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:31:34:0:0:31:35:0:0
chr16	81242102	.	G	A	817.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-7.93079e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.348;QD=57.3851;RBI=0.0604122;REFB=0;REVB=-0.0604122;RO=0;SAF=36;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000224516;OID=.;OPOS=81242102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:21:36:0:0:21:36:0:0
chr16	81242194	.	T	C	908.14	PASS	AF=1;AO=54;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0552275;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.471;QD=58.5899;RBI=0.0674011;REFB=0;REVB=0.0386371;RO=0;SAF=29;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112642;OID=.;OPOS=81242194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:54:62:1:25:29:0:0:25:37:0:0
chr16	81248716	.	C	T	3433.66	PASS	AF=0.982456;AO=223;DP=229;FAO=224;FDP=228;FR=.;FRO=4;FSAF=118;FSAR=106;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0107034;FXX=0.00869527;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5156;QD=60.2396;RBI=0.0126122;REFB=-0.21252;REVB=-0.00667126;RO=2;SAF=117;SAR=106;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00807475;STB=0.503929;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00182691;OID=.;OPOS=81248716;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:229:228:2:4:223:224:0.982456:106:117:2:0:106:118:3:1
chr16	81279120	.	T	C	222.85	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0158918;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.485;QD=16.5076;RBI=0.0399569;REFB=-0.0027429;REVB=-0.0366606;RO=28;SAF=16;SAR=9;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680509;STB=0.530781;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.00455708;OID=.;OPOS=81279120;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:28:29:25:25:0.462963:9:16:16:12:9:16:17:12
chr16	81295902	.	T	C	80.95	PASS	AF=0.268293;AO=11;DP=41;FAO=11;FDP=41;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00718808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.843;QD=7.89731;RBI=0.0222226;REFB=-0.00338944;REVB=0.021028;RO=30;SAF=5;SAR=6;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0253056;STB=0.515667;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00616197;OID=.;OPOS=81295902;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:41:41:30:30:11:11:0.268293:6:5:13:17:6:5:13:17
chr16	81413521	.	GTT	GTG,G,GT	1153.86	PASS	AF=0.541667,0.0763889,0.375;AO=44,24,16;DP=154;FAO=78,11,54;FDP=144;FR=.;FRO=1;FSAF=41,9,37;FSAR=37,2,17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00166512,-0.0287324,-0.0352333;FXX=0.0649308;HRUN=12,12,12;LEN=1,2,1;MLLD=244.09,7.67097,5.76026;QD=32.0517;RBI=0.00486478,0.0644575,0.0582261;REFB=0.0191614,0.120198,0.125509;REVB=-0.00457094,-0.0576994,-0.0463561;RO=13;SAF=24,21,13;SAR=20,3,3;SRF=7;SRR=6;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.00298527,0.342421,0.280762;STB=0.506023,0.526269,0.506664;STBP=0.518,0.669,0.626;TYPE=snp,del,del;VARB=0.0115096,-0.0289781,0.0100077;OID=.,.,.;OPOS=81413523,81413522,81413522;OREF=T,TT,T;OALT=G,-,-;OMAPALT=GTG,G,GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.541667,0.0763889,0.375:44,24,16:154:78,11,54:144:1:41,9,37:37,2,17:1:0:99:13:24,21,13:20,3,3:7:6
chr16	81497952	.	A	G	270.04	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0111617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.834;QD=22.9824;RBI=0.012499;REFB=-0.00857058;REVB=0.00562519;RO=22;SAF=10;SAR=15;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123338;STB=0.56891;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.00878436;OID=.;OPOS=81497952;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:15:10:12:10:15:10:12:10
chr16	81679151	.	A	G	351.53	PASS	AF=0.44186;AO=37;DP=87;FAO=38;FDP=86;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=38;FSRR=10;FWDB=0.0421614;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.24;QD=16.3503;RBI=0.042793;REFB=-0.00576488;REVB=-0.00732496;RO=47;SAF=23;SAR=14;SRF=37;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.185729;STB=0.60106;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.00407246;OID=.;OPOS=81679151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:47:48:37:38:0.44186:14:23:37:10:14:24:38:10
chr16	81726863	.	C	G	524.17	PASS	AF=0.397351;AO=60;DP=151;FAO=60;FDP=151;FR=.;FRO=91;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=54;FSRR=37;FWDB=-0.0279425;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.073;QD=13.8852;RBI=0.0380108;REFB=-0.00720958;REVB=-0.025769;RO=91;SAF=35;SAR=25;SRF=54;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011097;STB=0.506255;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=0.0121272;OID=.;OPOS=81726863;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:91:91:60:60:0.397351:25:35:54:37:25:35:54:37
chr16	81743328	.	A	G	501.71	PASS	AF=0.490741;AO=53;DP=108;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=0.0343339;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6599;QD=18.5818;RBI=0.0343402;REFB=-0.00720739;REVB=0.000657994;RO=55;SAF=37;SAR=16;SRF=34;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0837118;STB=0.546489;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.00764507;OID=.;OPOS=81743328;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:55:55:53:53:0.490741:16:37:34:21:16:37:34:21
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chr16	81941319	.	C	T	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.694;QD=63.2865;RBI=0.0313207;REFB=0;REVB=0.0290749;RO=0;SAF=28;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.06241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.63333e-05;OID=.;OPOS=81941319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:18:28:0:0:18:28:0:0
chr16	81971403	.	T	C	608.51	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149844;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3543;QD=60.8509;RBI=0.0200114;REFB=0;REVB=0.0132636;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000737271;OID=.;OPOS=81971403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:40:0:0:38:40:1:12:26:0:0:12:28:0:0
chr16	81995543	.	G	T	160.25	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.962;QD=45.7869;RBI=0.0871196;REFB=0;REVB=0.0610828;RO=0;SAF=11;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174001;OID=.;OPOS=81995543;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:3:11:0:0:3:11:0:0
chr16	82182354	.	G	A	562.72	PASS	AF=0.553191;AO=47;DP=89;FAO=52;FDP=94;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.00917796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.667;QD=23.9456;RBI=0.0114892;REFB=-0.00420598;REVB=0.00691135;RO=42;SAF=20;SAR=27;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.084739;STB=0.563734;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.00340031;OID=.;OPOS=82182354;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:94:42:42:47:52:0.553191:27:20:22:20:32:20:22:20
chr16	82203742	.	T	C	35.38	PASS	AF=0.230769;AO=6;DP=26;FAO=6;FDP=26;FR=.;FRO=20;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.106627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8867;QD=5.44284;RBI=0.112173;REFB=0.00829458;REVB=0.0348348;RO=20;SAF=1;SAR=5;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216233;STB=0.647587;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.0242671;OID=.;OPOS=82203742;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:26:26:20:20:6:6:0.230769:5:1:6:14:5:1:6:14
chr16	82203758	.	C	T	35.55	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0515728;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9655;QD=5.68873;RBI=0.0729192;REFB=0.0153644;REVB=0.0515505;RO=19;SAF=1;SAR=5;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165686;STB=0.611827;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=-0.0372279;OID=.;OPOS=82203758;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:5:1:5:14:5:1:5:14
chr16	82203768	.	G	T	36.16	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0806329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.264;QD=6.57391;RBI=0.0810645;REFB=-0.0198864;REVB=0.00835385;RO=16;SAF=1;SAR=5;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143816;STB=0.594887;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.0127295;OID=.;OPOS=82203768;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:5:1:4:12:5:1:4:12
chr16	82673047	.	C	T	1246.11	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00770456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=293.509;QD=61.5363;RBI=0.0319053;REFB=0;REVB=0.030961;RO=0;SAF=51;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40248e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.22185e-05;OID=.;OPOS=82673047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:30:51:0:0:30:51:0:0
chr16	82892037	.	A	G	362.21	PASS	AF=0.571429;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.039875;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.1795;QD=22.9972;RBI=0.073393;REFB=-0.00871684;REVB=0.0616158;RO=27;SAF=15;SAR=21;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0513413;STB=0.528286;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.00716486;OID=.;OPOS=82892037;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:63:27:27:36:36:0.571429:21:15:13:14:21:15:13:14
chr16	82903030	.	A	C	68.82	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.129209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.5237;QD=15.2929;RBI=0.129684;REFB=0.00139201;REVB=-0.0110844;RO=9;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187606;STB=0.609518;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.00640477;OID=.;OPOS=82903030;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:5:4:6:3:5:4:6:3
chr16	83817019	.	A	G	393.28	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00288419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.861;QD=56.1826;RBI=0.0072301;REFB=0;REVB=0.00662992;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.75326e-05;OID=.;OPOS=83817019;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:20:8:0:0:20:8:0:0
chr16	83941865	.	G	C	303.49	PASS	AF=0.563636;AO=30;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0225123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.136;QD=22.0718;RBI=0.0269443;REFB=-0.0140783;REVB=-0.0148052;RO=24;SAF=15;SAR=15;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0668615;STB=0.543298;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0101863;OID=.;OPOS=83941865;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:24:30:31:0.563636:15:15:10:14:15:16:10:14
chr16	83983071	.	C	T	116.16	PASS	AF=0.341463;AO=14;DP=41;FAO=14;FDP=41;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.0190516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.874;QD=11.3327;RBI=0.0212612;REFB=-0.0274392;REVB=0.00943792;RO=27;SAF=5;SAR=9;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.370222;STB=0.71732;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0499167;OID=.;OPOS=83983071;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:27:14:14:0.341463:9:5:19:8:9:5:19:8
chr16	83984776	.	A	C	775.0	PASS	AF=0.965517;AO=56;DP=58;FAO=56;FDP=58;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00935104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.5505;QD=53.4481;RBI=0.00946448;REFB=-0.0111525;REVB=0.00146094;RO=2;SAF=11;SAR=45;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030591;STB=0.516246;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.00154381;OID=.;OPOS=83984776;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:58:2:2:56:56:0.965517:45:11:1:1:45:11:1:1
chr16	83984844	.	A	C	948.8	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00170304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.262;QD=58.3875;RBI=0.0126684;REFB=0;REVB=0.0125534;RO=0;SAF=33;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9548e-05;OID=.;OPOS=83984844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:31:33:0:0:32:33:0:0
chr16	83984850	.	C	G	902.71	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194257;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.796;QD=58.2394;RBI=0.0211679;REFB=0;REVB=0.00840969;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.64241e-05;OID=.;OPOS=83984850;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:31:30:0:0:32:30:0:0
chr16	84070500	.	C	G	52.61	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=2.59551e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.158;QD=6.78806;RBI=0.000912324;REFB=-0.00329476;REVB=0.000911955;RO=23;SAF=2;SAR=6;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.412741;STB=0.761261;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0157457;OID=.;OPOS=84070500;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:31:31:23:23:8:8:0.258065:6:2:14:9:6:2:14:9
chr16	84100173	.	C	T	162.51	PASS	AF=0.382979;AO=17;DP=45;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0078078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.826;QD=13.8305;RBI=0.0256205;REFB=-0.0138305;REVB=-0.0244018;RO=28;SAF=12;SAR=5;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158385;STB=0.617277;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0197208;OID=.;OPOS=84100173;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:28:29:17:18:0.382979:5:12:16:12:5:13:16:13
chr16	84115483	.	G	A	341.5	PASS	AF=0.392157;AO=40;DP=102;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=39;FWDB=-0.0230762;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.878;QD=13.3922;RBI=0.0231473;REFB=-0.00623099;REVB=-0.00181223;RO=61;SAF=16;SAR=24;SRF=23;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0256095;STB=0.518509;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.0108876;OID=.;OPOS=84115483;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:61:62:40:40:0.392157:24:16:23:38:24:16:23:39
chr16	84213658	.	G	C	64.68	PASS	AF=0.109375;AO=7;DP=64;FAO=7;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=48;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0694378;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=29.6;QD=4.04273;RBI=0.0748599;REFB=-0.0616198;REVB=0.0279713;RO=33;SAF=6;SAR=1;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39655;STB=0.810785;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0903442;OID=.;OPOS=84213658;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:64:64:33:48:7:7:0.109375:1:6:19:14:1:6:26:22
chr16	84213660	.	CT	TG	30.64	PASS	AF=0.102941;AO=8;DP=68;FAO=7;FDP=68;FR=.;FRO=61;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=30;FWDB=-0.0793068;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=42.7784;QD=1.80234;RBI=0.170773;REFB=-0.0119524;REVB=-0.151241;RO=54;SAF=6;SAR=2;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325717;STB=0.833072;STBP=0.09;TYPE=mnp;VARB=0.12164;OID=.;OPOS=84213660;OREF=CT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:68:68:54:61:8:7:0.102941:2:6:26:28:1:6:31:30
chr16	84217062	.	C	T	624.5	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.018;QD=60.9272;RBI=0.0367105;REFB=0;REVB=0.00662228;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015651;OID=.;OPOS=84217062;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chr16	84228199	.	G	T	828.28	PASS	AF=0.938462;AO=60;DP=65;FAO=61;FDP=65;FR=.;FRO=4;FSAF=28;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0310993;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=162.828;QD=50.9709;RBI=0.0452515;REFB=-0.107751;REVB=0.0328714;RO=3;SAF=28;SAR=32;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0422093;STB=0.528562;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.00104209;OID=.;OPOS=84228199;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:65:65:3:4:60:61:0.938462:32:28:0:3:33:28:0:4
chr16	84228237	.	A	C	708.52	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00947359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.247;QD=62.9797;RBI=0.0627382;REFB=0;REVB=0.0620188;RO=0;SAF=12;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201147;OID=.;OPOS=84228237;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:33:12:0:0:33:12:0:0
chr16	84228305	.	C	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0265426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.9;QD=44.6898;RBI=0.0371027;REFB=0;REVB=-0.025925;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000672776;OID=.;OPOS=84228305;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:12:1:0:0:12:1:0:0
chr16	84228770	.	G	C	365.21	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0226953;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.759;QD=52.1723;RBI=0.0500557;REFB=-0.0860422;REVB=0.0446149;RO=1;SAF=6;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0216358;STB=0.511619;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.000508272;OID=.;OPOS=84228770;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:1:1:27:27:0.964286:21:6:0:1:21:6:0:1
chr16	84228873	.	C	T	433.82	PASS	AF=0.494505;AO=42;DP=88;FAO=45;FDP=91;FR=.;FRO=46;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=31;FWDB=0.00164418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8363;QD=19.0688;RBI=0.0874579;REFB=0.00312692;REVB=0.0874424;RO=46;SAF=27;SAR=15;SRF=15;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29378;STB=0.647646;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=-0.00266823;OID=.;OPOS=84228873;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:91:46:46:42:45:0.494505:15:27:15:31:17:28:15:31
chr16	84229559	.	T	C	817.68	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0574674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9523;QD=57.3808;RBI=0.0608563;REFB=0;REVB=0.0200248;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000204959;OID=.;OPOS=84229559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:23:34:0:0:23:34:0:0
chr16	84230376	.	T	C	382.01	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218284;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.072;QD=56.594;RBI=0.022065;REFB=0;REVB=0.0032224;RO=0;SAF=1;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000367146;OID=.;OPOS=84230376;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:27:0:0:27:27:1:26:1:0:0:26:1:0:0
chr16	84230500	.	A	C	2375.61	PASS	AF=1;AO=146;DP=150;FAO=149;FDP=149;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165438;FXX=0.00666622;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.095;QD=63.7747;RBI=0.0168753;REFB=0;REVB=0.00332829;RO=0;SAF=59;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71313e-05;OID=.;OPOS=84230500;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:150:149:0:0:146:149:1:87:59:0:0:88:61:0:0
chr16	84256269	.	C	T	232.32	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0168793;FXX=0.0454442;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.4;QD=22.1257;RBI=0.0384979;REFB=-0.00652247;REVB=0.0346003;RO=20;SAF=12;SAR=10;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0469145;STB=0.526292;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.00568323;OID=.;OPOS=84256269;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:42:20:20:22:22:0.52381:10:12:12:8:10:12:12:8
chr16	84270381	.	G	A	530.22	PASS	AF=0.401316;AO=61;DP=152;FAO=61;FDP=152;FR=.;FRO=91;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=54;FSRR=37;FWDB=-0.0265667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.6771;QD=13.9532;RBI=0.0310023;REFB=-0.00750733;REVB=0.0159798;RO=91;SAF=36;SAR=25;SRF=54;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00356486;STB=0.502007;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0114051;OID=.;OPOS=84270381;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:152:91:91:61:61:0.401316:25:36:54:37:25:36:54:37
chr16	84270476	.	G	A	346.33	PASS	AF=0.45122;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.0193642;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.568;QD=16.8943;RBI=0.0194907;REFB=-0.0110019;REVB=0.00221749;RO=44;SAF=13;SAR=24;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0829723;STB=0.541585;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00902655;OID=.;OPOS=84270476;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:44:45:37:37:0.45122:24:13:19:25:24:13:19:26
chr16	84360533	.	A	G	240.08	PASS	AF=0.465517;AO=27;DP=58;FAO=27;FDP=58;FR=.;FRO=31;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0670347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9216;QD=16.5575;RBI=0.0758111;REFB=-0.0284404;REVB=0.0354072;RO=31;SAF=8;SAR=19;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.193248;STB=0.609399;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=0.033654;OID=.;OPOS=84360533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:31:31:27:27:0.465517:19:8:15:16:19:8:15:16
chr16	84402275	.	G	C	351.34	PASS	AF=0.368;AO=24;DP=125;FAO=46;FDP=125;FR=.,HEALED;FRO=79;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=55;FSRR=24;FWDB=-0.0660901;FXX=0.00793588;HRUN=5;LEN=1;MLLD=210.178;QD=11.2429;RBI=0.0685788;REFB=0.00319309;REVB=-0.018307;RO=59;SAF=8;SAR=16;SRF=40;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.395633;STB=0.572975;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.00640111;OID=.;OPOS=84402275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:59:79:24:46:0.368:16:8:40:19:19:27:55:24
chr16	84438505	.	C	T	129.6	PASS	AF=0.314815;AO=17;DP=54;FAO=17;FDP=54;FR=.;FRO=37;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0344093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.3928;QD=9.59988;RBI=0.0785379;REFB=0.00445866;REVB=-0.0705989;RO=37;SAF=9;SAR=8;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0803301;STB=0.54777;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=-0.00920454;OID=.;OPOS=84438505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:37:37:17:17:0.314815:8:9:17:20:8:9:17:20
chr16	84438512	.	G	A	777.39	PASS	AF=0.932203;AO=54;DP=59;FAO=55;FDP=59;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0276347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6677;QD=52.704;RBI=0.0322371;REFB=-0.16264;REVB=0.0165998;RO=2;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.031395;STB=0.516123;STBP=0.239;TYPE=snp;VARB=0.00291544;OID=.;OPOS=84438512;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:59:59:2:2:54:55:0.932203:29:25:0:2:30:25:0:2
chr16	84444349	.	A	C	729.01	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000184717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.693;QD=57.1775;RBI=0.0220945;REFB=0;REVB=0.0220938;RO=0;SAF=16;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.5765e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.30525e-05;OID=.;OPOS=84444349;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:35:16:0:0:35:16:0:0
chr16	84476200	.	A	T	199.72	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=40;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0174334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.909;QD=19.9718;RBI=0.0178077;REFB=-0.0255331;REVB=0.00363207;RO=19;SAF=6;SAR=14;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0161041;STB=0.52904;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0326479;OID=.;OPOS=84476200;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:20:20:20:0.5:14:6:6:13:14:6:7:13
chr16	84485573	.	C	A	1214.29	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0517213;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.8477;QD=61.4829;RBI=0.0992899;REFB=0;REVB=0.0847549;RO=0;SAF=42;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00106944;OID=.;OPOS=84485573;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:37:42:0:0:37:42:0:0
chr16	84493144	.	C	G	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.181;QD=64.4154;RBI=0.0729627;REFB=0;REVB=0.0675803;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191976;OID=.;OPOS=84493144;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0
chr16	84494020	.	G	T	576.84	PASS	AF=1;AO=37;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025464;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=129.356;QD=57.6839;RBI=0.0258275;REFB=0;REVB=-0.00431765;RO=1;SAF=14;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322723;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290247;OID=.;OPOS=84494020;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:39:40:1:0:37:40:1:23:14:1:0:24:16:0:0
chr16	84516309	.	G	A	1264.39	PASS	AF=1;AO=61;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0588142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.208;QD=60.9346;RBI=0.063437;REFB=0;REVB=0.0237727;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000306809;OID=.;OPOS=84516309;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:61:83:1:36:25:0:0:38:45:0:0
chr16	84516310	.	T	A	133.75	PASS	AF=0.240964;AO=20;DP=82;FAO=20;FDP=83;FR=.;FRO=63;FSAF=19;FSAR=1;FSRF=26;FSRR=37;FWDB=-0.0151302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.277;QD=6.44578;RBI=0.030963;REFB=-0.0668372;REVB=-0.0270145;RO=62;SAF=19;SAR=1;SRF=26;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.705858;STB=0.940856;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0123424;OID=.;OPOS=84516310;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:62:63:20:20:0.240964:1:19:26:36:1:19:26:37
chr16	84520325	.	T	C	282.69	PASS	AF=1;AO=13;DP=23;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0571961;FXX=0.0434594;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.7937;QD=51.3975;RBI=0.079315;REFB=0;REVB=0.0549498;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00437611;OID=.;OPOS=84520325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:22:0:0:13:22:1:3:10:0:0:10:12:0:0
chr16	84520396	.	A	G	942.97	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=67;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0154643;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.297;QD=57.1495;RBI=0.0306107;REFB=-0.104889;REVB=-0.0264173;RO=0;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50704;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.000251345;OID=.;OPOS=84520396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:66:0:1:65:65:0.984848:30:35:0:0:30:35:1:0
chr16	84520537	.	T	C	1270.08	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.036841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2117;QD=60.48;RBI=0.0370141;REFB=-0.126971;REVB=-0.00357612;RO=1;SAF=49;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00956859;STB=0.505049;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00143136;OID=.;OPOS=84520537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:84:84:1:1:83:83:0.988095:34:49:1:0:34:49:1:0
chr16	84522897	.	G	C	800.97	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0257374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4736;QD=57.212;RBI=0.0354058;REFB=0;REVB=0.0243138;RO=0;SAF=30;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.29784e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000449781;OID=.;OPOS=84522897;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:26:30:0:0:26:30:0:0
chr16	84778685	.	A	G	77.28	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0208698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6795;QD=13.4408;RBI=0.0283807;REFB=0.00450233;REVB=-0.0192332;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917417;STB=0.554343;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=-0.00132556;OID=.;OPOS=84778685;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:3:7:8:5:3:7:8:5
chr16	84778690	.	C	T	116.21	PASS	AF=0.565217;AO=13;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=0.0146391;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=250.095;QD=20.2097;RBI=0.0245486;REFB=-0.0279903;REVB=-0.0197061;RO=10;SAF=8;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0696635;STB=0.539509;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0159466;OID=.;OPOS=84778690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:10:10:13:13:0.565217:5:8:7:3:5:8:7:3
chr16	84778694	.	T	C	120.37	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0166333;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.498;QD=24.0731;RBI=0.0265588;REFB=-0.0120377;REVB=-0.0207052;RO=7;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285713;STB=0.516104;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0288473;OID=.;OPOS=84778694;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:5:8:4:3:5:8:4:3
chr16	84778697	.	G	C	120.35	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0654626;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5462;QD=24.0708;RBI=0.0832137;REFB=-0.0375024;REVB=-0.0513729;RO=7;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0285713;STB=0.516104;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0162407;OID=.;OPOS=84778697;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:5:8:4:3:5:8:4:3
chr16	84883102	.	C	T	647.98	PASS	AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00196525;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.083;QD=57.5979;RBI=0.00740868;REFB=0.112511;REVB=-0.00714327;RO=1;SAF=20;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229007;STB=0.523798;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=-0.00142675;OID=.;OPOS=84883102;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:45:45:1:2:43:43:0.955556:23:20:1:0:23:20:2:0
chr16	84906098	.	C	G	633.1	PASS	AF=0.342105;AO=78;DP=229;FAO=78;FDP=228;FR=.;FRO=150;FSAF=40;FSAR=38;FSRF=80;FSRR=70;FWDB=-0.02422;FXX=0.00869527;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.997;QD=11.107;RBI=0.047118;REFB=-0.0115949;REVB=-0.0404166;RO=148;SAF=40;SAR=38;SRF=80;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318451;STB=0.51351;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.0211359;OID=.;OPOS=84906098;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:229:228:148:150:78:78:0.342105:38:40:80:68:38:40:80:70
chr16	84922859	.	C	T	724.34	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.032154;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.801;QD=54.6671;RBI=0.0436905;REFB=-0.0411397;REVB=0.02958;RO=0;SAF=23;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.84538e-08;STB=0.508471;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000371086;OID=.;OPOS=84922859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:0:1:52:52:0.981132:29:23:0:0:29:23:0:1
chr16	85008645	.	G	A	295.79	PASS	AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0227438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.272;QD=22.3241;RBI=0.0231161;REFB=-0.00404166;REVB=0.00413164;RO=22;SAF=23;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168103;STB=0.608009;STBP=0.114;TYPE=snp;VARB=0.00904564;OID=.;OPOS=85008645;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:22:23:30:30:0.566038:7:23:13:9:7:23:13:10
chr16	85009463	.	T	C	273.9	PASS	AF=0.483871;AO=30;DP=62;FAO=30;FDP=62;FR=.;FRO=32;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00825535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0441;QD=17.6707;RBI=0.00914178;REFB=-0.0161732;REVB=-0.003927;RO=32;SAF=23;SAR=7;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282318;STB=0.659486;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0104156;OID=.;OPOS=85009463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:32:32:30:30:0.483871:7:23:16:16:7:23:16:16
chr16	85009970	.	A	C,G	1192.93	PASS	AF=0.037037,0.950617;AO=3,77;DP=81;FAO=3,77;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=3,56;FSAR=0,21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00268239,-0.00838653;FXX=0.0121936;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=75.707,165.67;QD=58.9099;RBI=0.0118888,0.02581;REFB=0.0299586,0.0454143;REVB=-0.0115823,0.0244095;RO=0;SAF=3,56;SAR=0,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.42054e-08;STB=0.5,0.504424;STBP=1,0.611;TYPE=snp,snp;VARB=0.00922944,-0.00102974;OID=.,.;OPOS=85009970,85009970;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:81:81:0:1:3,77:3,77:0.037037,0.950617:0,21:3,56:0:0:0,21:3,56:1:0
chr16	85010055	.	A	AC,C	31.82	PASS	AF=0.2,0;AO=5,2;DP=39;FAO=8,0;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=2,0;FSAR=6,0;FSRF=9;FSRR=23;FWDB=-0.0339856,-0.0114163;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=16.909,175.666;QD=3.18187;RBI=0.0688169,0.0173239;REFB=-0.0394788,0.00222224;REVB=0.0598394,-0.0130302;RO=32;SAF=2,0;SAR=3,2;SRF=9;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.154247,-0.368562;STB=0.532175,0.5;STBP=0.872,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.15284,0;OID=.,.;OPOS=85010056,85010055;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:39:40:32:32:5,2:8,0:0.2,0:3,2:2,0:9:23:6,0:2,0:9:23
chr16	85112002	.	T	G	293.4	PASS	AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.0359461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1651;QD=14.8556;RBI=0.036018;REFB=0.0013969;REVB=-0.00227438;RO=46;SAF=11;SAR=22;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0652105;STB=0.537014;STBP=0.58;TYPE=snp;VARB=-0.00131156;OID=.;OPOS=85112002;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:22:11:18:28:22:11:18:28
chr16	85697090	.	G	A	203.52	PASS	AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=-0.00451178;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.896;QD=12.7199;RBI=0.0661362;REFB=-0.0124581;REVB=-0.0659822;RO=38;SAF=13;SAR=12;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0210532;STB=0.504377;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.01959;OID=.;OPOS=85697090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:38:39:25:25:0.390625:12:13:19:19:12:13:20:19
chr16	85705880	.	C	T	261.11	PASS	AF=0.364706;AO=31;DP=85;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=32;FWDB=0.0192633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.176;QD=12.2877;RBI=0.0322816;REFB=0.000860494;REVB=0.0259043;RO=54;SAF=17;SAR=14;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154729;STB=0.588799;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-0.000789868;OID=.;OPOS=85705880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:54:54:31:31:0.364706:14:17:22:32:14:17:22:32
chr16	85705901	.	G	A	263.2	PASS	AF=0.330097;AO=34;DP=105;FAO=34;FDP=103;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=41;FWDB=0.011316;FXX=0.0190458;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.055;QD=10.2212;RBI=0.0113922;REFB=-0.00842008;REVB=0.00131553;RO=69;SAF=17;SAR=17;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108897;STB=0.56307;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0162394;OID=.;OPOS=85705901;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:103:69:69:34:34:0.330097:17:17:28:41:17:17:28:41
chr16	85706047	.	A	C	1032.66	PASS	AF=0.947368;AO=72;DP=76;FAO=72;FDP=76;FR=.;FRO=4;FSAF=29;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0764309;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6129;QD=54.3506;RBI=0.076477;REFB=-0.181388;REVB=-0.00265379;RO=1;SAF=29;SAR=43;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108729;STB=0.505306;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.00781756;OID=.;OPOS=85706047;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:76:76:1:4:72:72:0.947368:43:29:0:1:43:29:2:2
chr16	85707289	.	C	G	194.94	PASS	AF=0.444444;AO=20;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00411319;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=214.133;QD=17.3276;RBI=0.00426055;REFB=-0.0316371;REVB=-0.00111083;RO=25;SAF=12;SAR=8;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0401324;STB=0.522913;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.0361615;OID=.;OPOS=85707289;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:25:25:20:20:0.444444:8:12:14:11:8:12:14:11
chr16	85711860	.	C	T	535.99	PASS	AF=0.518868;AO=53;DP=103;FAO=55;FDP=106;FR=.;FRO=51;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=20;FSRR=31;FWDB=-0.0214758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.418;QD=20.2259;RBI=0.021588;REFB=-0.0306048;REVB=-0.0021985;RO=50;SAF=25;SAR=28;SRF=19;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.081436;STB=0.530424;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0283588;OID=.;OPOS=85711860;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:106:50:51:53:55:0.518868:28:25:19:31:30:25:20:31
chr16	85814899	.	T	C,TAGTC	375.13	PASS	AF=0,0.875;AO=3,28;DP=36;FAO=0,28;FDP=32;FR=.;FRO=4;FSAF=0,22;FSAR=0,6;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0131054,-0.0303131;FXX=0.11108;HRUN=1,1;LEN=1,4;MLLD=97.4135,193.748;QD=46.8912;RBI=0.023919,0.0312338;REFB=0.0468661,-0.0101686;REVB=-0.0200091,0.00752791;RO=4;SAF=2,22;SAR=1,6;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0848588,0.0121779;STB=0.5,0.506574;STBP=1,0.897;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.00201291;OID=.,.;OPOS=85814899,85814900;OREF=T,-;OALT=C,AGTC;OMAPALT=C,TAGTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:21:36:32:4:4:3,28:0,28:0,0.875:1,6:2,22:3:1:0,6:0,22:3:1
chr16	85838653	.	T	C	1464.4	PASS	AF=0.962264;AO=101;DP=106;FAO=102;FDP=106;FR=.;FRO=4;FSAF=57;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0165431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.738;QD=55.2603;RBI=0.0550456;REFB=-0.142233;REVB=0.0525009;RO=3;SAF=57;SAR=44;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00569449;STB=0.502249;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.00417051;OID=.;OPOS=85838653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:106:106:3:4:101:102:0.962264:44:57:2:1:45:57:2:2
chr16	86069722	.	A	G	651.19	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.1725;QD=62.0185;RBI=0.024432;REFB=0;REVB=0.000755699;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000293026;OID=.;OPOS=86069722;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:26:16:0:0:26:16:0:0
chr16	86069738	.	C	G	560.87	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0238976;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.125;QD=60.6343;RBI=0.0323505;REFB=0;REVB=0.021805;RO=0;SAF=18;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.68991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190456;OID=.;OPOS=86069738;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:37:37:1:19:18:0:0:19:18:0:0
chr16	86069788	.	GT	TG	334.48	PASS	AF=0.903226;AO=25;DP=31;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0129045;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=141.524;QD=43.1581;RBI=0.0129238;REFB=-0.094057;REVB=-0.000706456;RO=3;SAF=12;SAR=13;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0369702;STB=0.519616;STBP=0.484;TYPE=mnp;VARB=0.00850362;OID=.;OPOS=86069788;OREF=GT;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:31:31:3:3:25:28:0.903226:13:12:2:1:15:13:2:1
chr16	86069827	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0217097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=202.227;QD=61.3362;RBI=0.0248952;REFB=0;REVB=0.0121845;RO=0;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.78877e-05;OID=.;OPOS=86069827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:22:17:0:0:23:17:0:0
chr16	86547496	.	C	T	195.85	PASS	AF=0.288889;AO=26;DP=90;FAO=26;FDP=90;FR=.;FRO=64;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=-0.0171837;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.1265;QD=8.70433;RBI=0.0379475;REFB=0.00775954;REVB=0.0338338;RO=64;SAF=18;SAR=8;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221615;STB=0.632327;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=-0.0187469;OID=.;OPOS=86547496;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:64:64:26:26:0.288889:8:18:33:31:8:18:33:31
chr16	86565826	.	C	G	949.58	PASS	AF=0.875;AO=70;DP=80;FAO=70;FDP=80;FR=.;FRO=10;FSAF=49;FSAR=21;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0460897;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=54.7778;QD=47.4788;RBI=0.0538188;REFB=-0.162475;REVB=-0.0277884;RO=10;SAF=49;SAR=21;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574294;STB=0.530479;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0107634;OID=.;OPOS=86565826;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:80:80:10:10:70:70:0.875:21:49:9:1:21:49:9:1
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chr16	86614583	.	C	T	68.96	PASS	AF=0.888889;AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0250225;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=160.555;QD=30.651;RBI=0.0256174;REFB=-0.0713916;REVB=0.00548835;RO=1;SAF=6;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674964;STB=0.533253;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00119159;OID=.;OPOS=86614583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:9:1:1:7:8:0.888889:1:6:1:0:1:7:1:0
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chr16	87436764	.	A	G	756.46	PASS	AF=0.979592;AO=43;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0171894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.664;QD=61.7519;RBI=0.0177127;REFB=-0.0711905;REVB=-0.00427372;RO=1;SAF=19;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0240734;STB=0.510634;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.000264144;OID=.;OPOS=87436764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:43:48:0.979592:24:19:1:0:25:23:1:0
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chr16	87445839	.	C	T	412.5	PASS	AF=0.546667;AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00102534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1932;QD=21.9997;RBI=0.0316068;REFB=0.00363797;REVB=-0.0315901;RO=33;SAF=17;SAR=24;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00799879;STB=0.512336;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=-0.00314863;OID=.;OPOS=87445839;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:33:34:41:41:0.546667:24:17:14:19:24:17:15:19
chr16	87446053	.	G	A	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=0.0246829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=190.149;QD=9.11036;RBI=0.0246835;REFB=-0.0176529;REVB=0.000162512;RO=16;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205275;STB=0.624707;STBP=0.417;TYPE=snp;VARB=0.048203;OID=.;OPOS=87446053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:4:4:5:11:4:4:5:11
chr16	87446368	.	C	T	251.7	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.016534;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.753;QD=17.0641;RBI=0.0260385;REFB=-0.0340088;REVB=-0.0201154;RO=30;SAF=16;SAR=12;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0270048;STB=0.522372;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.0231636;OID=.;OPOS=87446368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:31:28:28:0.474576:12:16:18:12:12:16:19:12
chr16	87678144	.	T	C	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.0180143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.31;QD=9.76019;RBI=0.0259381;REFB=0.000624351;REVB=0.0186621;RO=12;SAF=5;SAR=2;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308108;STB=0.68046;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=-0.00634326;OID=.;OPOS=87678144;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:2:5:11:1:2:5:11:1
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chr16	88061150	.	C	T	351.18	PASS	AF=0.707317;AO=28;DP=40;FAO=29;FDP=41;FR=.;FRO=12;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.0626606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1812;QD=34.2616;RBI=0.0982053;REFB=-0.0518559;REVB=0.075617;RO=12;SAF=11;SAR=17;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136498;STB=0.500866;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0189769;OID=.;OPOS=88061150;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:40:41:12:12:28:29:0.707317:17:11:5:7:17:12:5:7
chr16	88105725	.	G	A	520.04	PASS	AF=0.544444;AO=49;DP=90;FAO=49;FDP=90;FR=.;FRO=41;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.015595;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.044;QD=23.1128;RBI=0.0513707;REFB=-0.0430317;REVB=0.0489464;RO=38;SAF=32;SAR=17;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0413616;STB=0.521473;STBP=0.685;TYPE=snp;VARB=0.029258;OID=.;OPOS=88105725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:38:41:49:49:0.544444:17:32:23:15:17:32:25:16
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chr16	88123697	.	C	A	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109926;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3763;QD=59.8366;RBI=0.0903305;REFB=0;REVB=0.0896591;RO=0;SAF=29;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122238;OID=.;OPOS=88123697;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:7:29:0:0:7:29:0:0
chr16	88124525	.	A	G	71.64	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.0225863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.28;QD=19.1047;RBI=0.0595362;REFB=-0.0286265;REVB=-0.0550855;RO=6;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267143;STB=0.649737;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0294073;OID=.;OPOS=88124525;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:2:7:6:0:2:7:6:0
chr16	88134285	.	A	G	646.92	PASS	AF=0.956522;AO=42;DP=43;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0409332;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=50.0978;QD=56.2537;RBI=0.062035;REFB=-0.085716;REVB=-0.0466135;RO=1;SAF=26;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177147;STB=0.517849;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.00289415;OID=.;OPOS=88134285;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:43:46:1:2:42:44:0.956522:16:26:1:0:17:27:2:0
chr16	88494947	.	T	C	1004.21	PASS	AF=1;AO=58;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0344773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.2475;QD=58.2152;RBI=0.120964;REFB=0;REVB=-0.115946;RO=0;SAF=28;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193993;OID=.;OPOS=88494947;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:69:0:0:58:69:1:30:28:0:0:32:37:0:0
chr16	88494976	.	A	C	1313.62	PASS	AF=1;AO=79;DP=80;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.728;QD=61.8172;RBI=0.0263892;REFB=0;REVB=-0.00382989;RO=1;SAF=40;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011984;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.30786e-05;OID=.;OPOS=88494976;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:85:1:0:79:85:1:39:40:0:1:43:42:0:0
chr16	88495654	.	A	G	375.68	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.7531;QD=55.6557;RBI=0.0200963;REFB=0;REVB=0.0173442;RO=0;SAF=12;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139596;OID=.;OPOS=88495654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:26:27:1:14:12:0:0:14:13:0:0
chr16	88496008	.	T	C	280.31	PASS	AF=0.450704;AO=25;DP=64;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=7;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=-0.0201638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.164;QD=15.7923;RBI=0.0216738;REFB=-0.0469839;REVB=-0.00794824;RO=39;SAF=2;SAR=23;SRF=17;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.554136;STB=0.645756;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0606633;OID=.;OPOS=88496008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:71:39:39:25:32:0.450704:23:2:17:22:25:7:17:22
chr16	88496531	.	C	G	531.22	PASS	AF=0.478632;AO=56;DP=117;FAO=56;FDP=117;FR=.;FRO=61;FSAF=37;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=-0.0166917;FXX=0.00847386;HRUN=5;LEN=1;MLLD=278.43;QD=18.1613;RBI=0.0171693;REFB=-0.0139383;REVB=-0.00402142;RO=52;SAF=37;SAR=19;SRF=29;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967204;STB=0.548944;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0123702;OID=.;OPOS=88496531;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:52:61:56:56:0.478632:19:37:29:23:19:37:35:26
chr16	88498221	.	C	T	171.26	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=55;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=23;FWDB=-0.0063277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.688;QD=12.4553;RBI=0.0101436;REFB=-0.0138095;REVB=-0.00792793;RO=32;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140744;STB=0.59536;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0175806;OID=.;OPOS=88498221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:32:34:21:21:0.381818:11:10:11:21:11:10:11:23
chr16	88498297	.	T	G	538.5	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.389;QD=59.8333;RBI=0.0558984;REFB=0;REVB=-0.0478596;RO=0;SAF=4;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000110528;OID=.;OPOS=88498297;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:32:4:0:0:32:4:0:0
chr16	88498477	.	A	C	61.94	PASS	AF=0.264706;AO=9;DP=33;FAO=9;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0307462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.874;QD=7.28666;RBI=0.0353984;REFB=-0.00619837;REVB=-0.0175419;RO=24;SAF=6;SAR=3;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287784;STB=0.69189;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.0310033;OID=.;OPOS=88498477;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:33:34:24:25:9:9:0.264706:3:6:10:14:3:6:10:15
chr16	88498681	.	A	G	44.77	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0391589;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.387;QD=7.46151;RBI=0.0391955;REFB=-0.00933725;REVB=-0.00169291;RO=17;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220682;STB=0.640604;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0446238;OID=.;OPOS=88498681;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:2:5:9:8:2:5:9:8
chr16	88499539	.	C	G	883.07	PASS	AF=0.489011;AO=89;DP=182;FAO=89;FDP=182;FR=.;FRO=93;FSAF=54;FSAR=35;FSRF=55;FSRR=38;FWDB=-0.00972341;FXX=0.00546418;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.595;QD=19.4081;RBI=0.0151633;REFB=-0.0199503;REVB=-0.0116354;RO=85;SAF=54;SAR=35;SRF=48;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0388056;STB=0.508184;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=0.015718;OID=.;OPOS=88499539;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:182:182:85:93:89:89:0.489011:35:54:48:37:35:54:55:38
chr16	88500430	.	G	T	106.74	PASS	AF=0.27451;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=51;FR=.;FRO=37;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.00241885;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.005;QD=8.37178;RBI=0.00495809;REFB=-0.0142217;REVB=-0.00432803;RO=35;SAF=5;SAR=9;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219244;STB=0.615218;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.027676;OID=.;OPOS=88500430;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:35:37:14:14:0.27451:9:5:19:16:9:5:19:18
chr16	88502482	.	C	T	103.4	PASS	AF=0.448276;AO=12;DP=28;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0194615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.496;QD=14.2623;RBI=0.0196064;REFB=-0.00405566;REVB=0.00237907;RO=16;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109071;STB=0.578821;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.00630777;OID=.;OPOS=88502482;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:29:16:16:12:13:0.448276:4:8:9:7:4:9:9:7
chr16	88502505	.	A	G	385.4	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00024584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.5096;QD=53.1587;RBI=0.024784;REFB=-0.136378;REVB=-0.0247828;RO=1;SAF=17;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0265944;STB=0.514276;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00205619;OID=.;OPOS=88502505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:29:29:1:1:28:28:0.965517:11:17:1:0:11:17:1:0
chr16	88504868	.	A	G	1649.81	PASS	AF=0.990991;AO=109;DP=112;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0367478;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.424;QD=59.4528;RBI=0.0470011;REFB=-0.0697668;REVB=-0.0293036;RO=1;SAF=67;SAR=42;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00703302;STB=0.503649;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.000116164;OID=.;OPOS=88504868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:112:111:1:1:109:110:0.990991:42:67:1:0:42:68:1:0
chr16	88505635	.	A	C,G	900.41	PASS	AF=0.0441176,0.911765;AO=3,63;DP=68;FAO=3,62;FDP=68;FR=.;FRO=3;FSAF=0,48;FSAR=3,14;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-8.22702e-05,0.059828;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=233.267,66.2692;QD=52.9654;RBI=0.0127199,0.0673511;REFB=0.0132005,-0.0693375;REVB=-0.0127196,0.030932;RO=2;SAF=0,48;SAR=3,15;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0588824;STB=0.5,0.548371;STBP=1,0.009;TYPE=snp,snp;VARB=0.19285,0.000405848;OID=.,.;OPOS=88505635,88505635;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:10:68:68:2:3:3,63:3,62:0.0441176,0.911765:3,15:0,48:0:2:3,14:0,48:0:3
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chr16	88535341	.	G	A	1701.47	PASS	AF=0.982759;AO=114;DP=116;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=62;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0159852;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=271.607;QD=58.6713;RBI=0.0180406;REFB=-0.0137618;REVB=0.00836273;RO=2;SAF=62;SAR=52;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179105;STB=0.509432;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=1.84076e-05;OID=.;OPOS=88535341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:116:116:2:2:114:114:0.982759:52:62:0:2:52:62:0:2
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chr16	88599023	.	A	G	653.08	PASS	AF=0.37037;AO=72;DP=211;FAO=80;FDP=216;FR=.;FRO=136;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=56;FSRR=80;FWDB=-0.00864315;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.024;QD=12.0941;RBI=0.014445;REFB=-0.0132884;REVB=-0.0115739;RO=130;SAF=24;SAR=48;SRF=50;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.063476;STB=0.515973;STBP=0.716;TYPE=snp;VARB=0.0216836;OID=.;OPOS=88599023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:211:216:130:136:72:80:0.37037:48:24:50:80:49:31:56:80
chr16	88644005	.	A	G	277.88	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0901815;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.1788;QD=48.3265;RBI=0.0902388;REFB=-0.0423845;REVB=-0.00321524;RO=1;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0615001;STB=0.533302;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.00357987;OID=.;OPOS=88644005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:7:15:0:1:7:15:0:1
chr16	88713236	.	A	G	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00742108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.266;QD=51.1846;RBI=0.0238043;REFB=0;REVB=0.022618;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127766;OID=.;OPOS=88713236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr16	88713501	.	A	G	288.67	PASS	AF=0.457143;AO=24;DP=70;FAO=32;FDP=70;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=12;FWDB=-0.00180299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.614;QD=16.4952;RBI=0.0150344;REFB=-0.0237587;REVB=-0.0149259;RO=38;SAF=14;SAR=10;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113469;STB=0.534862;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0235614;OID=.;OPOS=88713501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:38:38:24:32:0.457143:10:14:26:12:12:20:26:12
chr16	88717386	.	T	C	1251.0	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0294449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.042;QD=60.2891;RBI=0.0443674;REFB=-0.157977;REVB=-0.0331883;RO=1;SAF=46;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129728;STB=0.506848;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.000568119;OID=.;OPOS=88717386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:83:83:1:1:82:82:0.987952:36:46:0:1:36:46:0:1
chr16	88724347	.	G	T	715.3	PASS	AF=0.962963;AO=52;DP=54;FAO=52;FDP=54;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0408459;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.381;QD=52.9849;RBI=0.0485952;REFB=-0.199174;REVB=0.0263269;RO=0;SAF=29;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.84538e-08;STB=0.520825;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00169394;OID=.;OPOS=88724347;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:54:54:0:2:52:52:0.962963:23:29:0:0:23:29:0:2
chr16	88747995	.	G	C	318.95	PASS	AF=0.675;AO=27;DP=41;FAO=27;FDP=40;FR=.;FRO=13;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=0.0251153;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5451;QD=31.8953;RBI=0.03659;REFB=-0.0873208;REVB=0.0266092;RO=13;SAF=18;SAR=9;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125847;STB=0.56858;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0321972;OID=.;OPOS=88747995;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:13:13:27:27:0.675:9:18:11:2:9:18:11:2
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chr16	88779739	.	A	G	1047.22	PASS	AF=0.986111;AO=70;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0159335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.228;QD=58.1789;RBI=0.0160272;REFB=-0.0887299;REVB=0.00173053;RO=0;SAF=40;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506022;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000484552;OID=.;OPOS=88779739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:0:1:70:71:0.986111:30:40:0:0:30:41:1:0
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chr16	88781040	.	A	G	935.59	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.721;QD=58.4743;RBI=0.0240538;REFB=0;REVB=0.0214765;RO=0;SAF=39;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.74485e-05;OID=.;OPOS=88781040;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:62:64:1:23:39:0:0:23:41:0:0
chr16	88781125	.	T	C	450.73	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.036929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2988;QD=54.6334;RBI=0.0459506;REFB=-0.00570498;REVB=0.0273443;RO=0;SAF=8;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529393;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=8.12653e-06;OID=.;OPOS=88781125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:0:1:32:32:0.969697:24:8:0:0:24:8:1:0
chr16	88782676	.	A	G	1200.61	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00709088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.072;QD=60.7902;RBI=0.0252619;REFB=0;REVB=0.0242463;RO=0;SAF=42;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43944e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.51058e-05;OID=.;OPOS=88782676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:78:79:1:36:42:0:0:37:42:0:0
chr16	88783449	.	C	G	750.51	PASS	AF=1;AO=53;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.8131;QD=54.5823;RBI=0.0855874;REFB=0;REVB=0.082306;RO=0;SAF=21;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00202765;OID=.;OPOS=88783449;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:53:55:1:32:21:0:0:34:21:0:0
chr16	88783521	.	T	C	1139.16	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154263;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8696;QD=60.7553;RBI=0.0155837;REFB=0;REVB=-0.00220912;RO=0;SAF=24;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000748696;OID=.;OPOS=88783521;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:51:24:0:0:51:24:0:0
chr16	88787704	.	G	C	1419.2	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00828369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.313;QD=61.7046;RBI=0.0323458;REFB=0.027009;REVB=0.0312671;RO=1;SAF=43;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108962;STB=0.505746;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=-0.00103632;OID=.;OPOS=88787704;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:1:1:91:91:0.98913:48:43:1:0:48:43:1:0
chr16	88788477	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0225677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3524;QD=37.4882;RBI=0.0441072;REFB=0;REVB=-0.0378965;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00383273;OID=.;OPOS=88788477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr16	88792047	.	A	G	732.44	PASS	AF=0.979592;AO=46;DP=48;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0312271;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.1326;QD=59.7907;RBI=0.0490435;REFB=-0.0356713;REVB=-0.0378171;RO=1;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191868;STB=0.50943;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00515592;OID=.;OPOS=88792047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:49:1:1:46:48:0.979592:24:22:0:1:26:22:0:1
chr16	88792097	.	A	G	570.59	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00405504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.719;QD=60.0619;RBI=0.00479048;REFB=0;REVB=-0.00255055;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.09707e-06;OID=.;OPOS=88792097;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:38:0:0:36:38:1:19:17:0:0:20:18:0:0
chr16	88803124	.	T	C	1498.79	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00195534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7937;QD=63.1071;RBI=0.019462;REFB=0;REVB=-0.0193635;RO=0;SAF=60;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.12276e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.21496e-05;OID=.;OPOS=88803124;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:94:95:1:34:60:0:0:34:61:0:0
chr16	88803982	.	C	G	582.79	PASS	AF=0.975;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.092819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.5524;QD=58.279;RBI=0.09674;REFB=-0.130794;REVB=0.0272626;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.51999;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00521427;OID=.;OPOS=88803982;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:40:0:1:38:39:0.975:12:26:0:0:12:27:0:1
chr16	88804734	.	A	G	574.96	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0692883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.0409;QD=60.5217;RBI=0.0695346;REFB=0;REVB=0.00584802;RO=0;SAF=15;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000632822;OID=.;OPOS=88804734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:22:15:0:0:22:16:0:0
chr16	88804924	.	TC	T	398.51	PASS	AF=0.972973;AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.14157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=21.1101;QD=43.0823;RBI=0.141866;REFB=-0.0391971;REVB=0.00916061;RO=1;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301623;STB=0.515143;STBP=0.311;TYPE=del;VARB=0.00766483;OID=.;OPOS=88804925;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.972973:35:37:36:37:1:20:16:0:1:4:1:20:15:0:1
chr16	88805183	.	G	A	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0212;QD=53.9103;RBI=0.0405698;REFB=0;REVB=-0.0134297;RO=0;SAF=18;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0004526;OID=.;OPOS=88805183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:6:18:0:0:6:18:0:0
chr16	88805231	.	G	A	175.62	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0865119;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.0501;QD=46.832;RBI=0.0872975;REFB=0;REVB=0.0116855;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00363629;OID=.;OPOS=88805231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:3:12:0:0:3:12:0:0
chr16	88805236	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112715;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.828;QD=46.848;RBI=0.0586668;REFB=0;REVB=0.0575739;RO=0;SAF=12;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00058989;OID=.;OPOS=88805236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:3:12:0:0:3:12:0:0
chr16	88808743	.	A	G	490.01	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0177628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.593;QD=56.0006;RBI=0.0274607;REFB=-0.057996;REVB=0.0209421;RO=1;SAF=17;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267062;STB=0.514277;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000920248;OID=.;OPOS=88808743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:17:17:1:0:17:17:1:0
chr16	88809773	.	G	C	1720.44	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=114;FDP=114;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.075;QD=60.3662;RBI=0.0748219;REFB=0;REVB=0.0503161;RO=0;SAF=63;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.81494e-05;OID=.;OPOS=88809773;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:114:0:0:112:114:1:49:63:0:0:49:65:0:0
chr16	88872145	.	T	C	888.38	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214321;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.2157;QD=58.2543;RBI=0.0449581;REFB=0;REVB=0.0395208;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000700611;OID=.;OPOS=88872145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0
chr16	88872229	.	A	G	312.46	PASS	AF=0.472222;AO=33;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=0.0226209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.344;QD=17.3587;RBI=0.0257624;REFB=-0.0207219;REVB=-0.0123286;RO=38;SAF=12;SAR=21;SRF=21;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183513;STB=0.591005;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0169766;OID=.;OPOS=88872229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:38:38:33:34:0.472222:21:12:21:17:21:13:21:17
chr16	88872511	.	T	C	205.36	PASS	AF=0.428571;AO=24;DP=56;FAO=24;FDP=56;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=20;FWDB=0.0364662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.564;QD=14.6683;RBI=0.0367621;REFB=-0.0212682;REVB=0.00465454;RO=32;SAF=12;SAR=12;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125692;STB=0.57137;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0298598;OID=.;OPOS=88872511;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:32:24:24:0.428571:12:12:12:20:12:12:12:20
chr16	88874632	.	C	G	1053.36	PASS	AF=0.44898;AO=108;DP=243;FAO=110;FDP=245;FR=.;FRO=135;FSAF=61;FSAR=49;FSRF=68;FSRR=67;FWDB=0.0567463;FXX=0.00406488;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.5699;QD=17.1977;RBI=0.0577125;REFB=0.0102946;REVB=0.0105159;RO=134;SAF=59;SAR=49;SRF=68;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389339;STB=0.528173;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=-0.0104181;OID=.;OPOS=88874632;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:243:245:134:135:108:110:0.44898:49:59:68:66:49:61:68:67
chr16	88884466	.	C	T	157.9	PASS	AF=0.328125;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=64;FR=.;FRO=43;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.107578;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.609;QD=9.86844;RBI=0.109182;REFB=-0.0165376;REVB=0.0186472;RO=43;SAF=8;SAR=13;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2771;STB=0.66215;STBP=0.074;TYPE=snp;VARB=0.0453263;OID=.;OPOS=88884466;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:43:43:21:21:0.328125:13:8:27:16:13:8:27:16
chr16	88902183	.	G	A	379.29	PASS	AF=0.434783;AO=40;DP=93;FAO=40;FDP=92;FR=.;FRO=52;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=0.0211925;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.326;QD=16.4911;RBI=0.0311365;REFB=-0.0251972;REVB=-0.0228114;RO=51;SAF=25;SAR=15;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589074;STB=0.528557;STBP=0.634;TYPE=snp;VARB=0.0363897;OID=.;OPOS=88902183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:51:52:40:40:0.434783:15:25:29:22:15:25:30:22
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chr16	89167431	.	G	C	385.88	PASS	AF=0.414141;AO=38;DP=96;FAO=41;FDP=99;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=40;FSRR=18;FWDB=0.0453807;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.88;QD=15.5909;RBI=0.0837534;REFB=0.0039936;REVB=0.0703934;RO=58;SAF=25;SAR=13;SRF=40;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0381008;STB=0.550241;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=-0.00219021;OID=.;OPOS=89167431;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:99:58:58:38:41:0.414141:13:25:40:18:16:25:40:18
chr16	89167443	.	T	C	336.48	PASS	AF=0.372727;AO=41;DP=112;FAO=41;FDP=110;FR=.;FRO=69;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=47;FSRR=22;FWDB=0.00936644;FXX=0.0178555;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.373;QD=12.2358;RBI=0.0183977;REFB=-0.0151789;REVB=0.0158349;RO=66;SAF=26;SAR=15;SRF=44;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0384818;STB=0.532313;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0223952;OID=.;OPOS=89167443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:110:66:69:41:41:0.372727:15:26:44:22:15:26:47:22
chr16	89167458	.	C	A	429.95	PASS	AF=0.423729;AO=42;DP=119;FAO=50;FDP=118;FR=.,HEALED;FRO=67;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=0.0235056;FXX=0.00840265;HRUN=5;LEN=1;MLLD=141.541;QD=14.5746;RBI=0.0610693;REFB=-0.0289896;REVB=-0.0563644;RO=41;SAF=28;SAR=14;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.05576;STB=0.504179;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0132823;OID=.;OPOS=89167458;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:118:41:67:42:50:0.423729:14:28:25:16:19:31:42:25
chr16	89180765	.	A	T	190.01	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.0383744;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.518;QD=13.104;RBI=0.039141;REFB=-0.0164216;REVB=-0.00770904;RO=35;SAF=12;SAR=11;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0222449;STB=0.512771;STBP=0.878;TYPE=snp;VARB=0.0287317;OID=.;OPOS=89180765;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:35:35:23:23:0.396552:11:12:19:16:11:12:19:16
chr16	89180883	.	G	A	729.1	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.598;QD=57.1846;RBI=0.0363781;REFB=0;REVB=0.00773099;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107432;OID=.;OPOS=89180883;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:23:27:0:0:24:27:0:0
chr16	89211662	.	C	G	300.63	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=52;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00188516;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.26;QD=23.1253;RBI=0.0555744;REFB=-0.0375295;REVB=0.0555424;RO=22;SAF=21;SAR=9;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.236374;STB=0.631057;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.016414;OID=.;OPOS=89211662;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:22:22:30:30:0.576923:9:21:9:13:9:21:9:13
chr16	89217507	.	C	T	154.92	PASS	AF=0.36;AO=18;DP=51;FAO=18;FDP=50;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.000174439;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.656;QD=12.3933;RBI=0.0204091;REFB=0.00180728;REVB=-0.0204083;RO=32;SAF=10;SAR=8;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162183;STB=0.59461;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.004413;OID=.;OPOS=89217507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:32:32:18:18:0.36:8:10:13:19:8:10:13:19
chr16	89234723	.	A	G	818.41	PASS	AF=0.449735;AO=85;DP=193;FAO=85;FDP=189;FR=.;FRO=104;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=56;FSRR=48;FWDB=0.00386441;FXX=0.0207243;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.317;QD=17.3209;RBI=0.00631095;REFB=-0.0288099;REVB=-0.00498943;RO=102;SAF=38;SAR=47;SRF=54;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810898;STB=0.550312;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.018346;OID=.;OPOS=89234723;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:193:189:102:104:85:85:0.449735:47:38:54:48:47:38:56:48
chr16	89234760	.	A	G	691.14	PASS	AF=0.424581;AO=75;DP=179;FAO=76;FDP=179;FR=.;FRO=103;FSAF=35;FSAR=41;FSRF=43;FSRR=60;FWDB=-0.0163247;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=310.531;QD=15.4444;RBI=0.0163263;REFB=-0.00970224;REVB=-0.000228912;RO=103;SAF=34;SAR=41;SRF=43;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375874;STB=0.525019;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0128616;OID=.;OPOS=89234760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:179:179:103:103:75:76:0.424581:41:34:43:60:41:35:43:60
chr16	89235258	.	C	A	403.22	PASS	AF=0.6;AO=39;DP=65;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=26;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=-0.00926637;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=235.29;QD=24.8132;RBI=0.0180816;REFB=-0.0353123;REVB=0.0155267;RO=26;SAF=13;SAR=26;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129973;STB=0.571391;STBP=0.176;TYPE=snp;VARB=0.016365;OID=.;OPOS=89235258;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:26:26:39:39:0.6:26:13:13:13:26:13:13:13
chr16	89238228	.	G	A	284.57	PASS	AF=0.333333;AO=37;DP=111;FAO=37;FDP=111;FR=.;FRO=74;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=50;FSRR=24;FWDB=0.00297773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.404;QD=10.2548;RBI=0.00917764;REFB=-0.031169;REVB=-0.00868114;RO=73;SAF=23;SAR=14;SRF=49;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0617178;STB=0.539009;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.0522173;OID=.;OPOS=89238228;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:73:74:37:37:0.333333:14:23:49:24:14:23:50:24
chr16	89245890	.	G	T	271.04	PASS	AF=0.3875;AO=30;DP=82;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=22;FWDB=0.0340631;FXX=0.0243873;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8147;QD=13.5518;RBI=0.0353157;REFB=-0.0410457;REVB=0.00932248;RO=43;SAF=16;SAR=14;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00161312;STB=0.501628;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0605558;OID=.;OPOS=89245890;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:80:43:49:30:31:0.3875:14:16:23:20:14:17:27:22
chr16	89246670	.	T	C	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0137227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.778;QD=59.4355;RBI=0.0199644;REFB=0;REVB=-0.0145005;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.93742e-05;OID=.;OPOS=89246670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr16	89251851	.	A	G	483.31	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00192174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.153;QD=58.5834;RBI=0.0174668;REFB=0;REVB=-0.0173608;RO=0;SAF=7;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.44409e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000339457;OID=.;OPOS=89251851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:26:7:0:0:26:7:0:0
chr16	89256695	.	G	A	438.54	PASS	AF=0.689655;AO=40;DP=58;FAO=40;FDP=58;FR=.;FRO=18;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0102974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.44;QD=30.2438;RBI=0.0117847;REFB=-0.0285554;REVB=-0.00573085;RO=18;SAF=28;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588322;STB=0.531984;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0118666;OID=.;OPOS=89256695;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:18:18:40:40:0.689655:12:28:11:7:12:28:11:7
chr16	89259993	.	A	G	1495.47	PASS	AF=0.945946;AO=105;DP=110;FAO=105;FDP=111;FR=.;FRO=6;FSAF=47;FSAR=58;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00166916;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.6341;QD=53.8908;RBI=0.0602868;REFB=-0.0137982;REVB=-0.0602637;RO=4;SAF=46;SAR=59;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021972;STB=0.502861;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.000929219;OID=.;OPOS=89259993;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:110:111:4:6:105:105:0.945946:59:46:3:1:58:47:3:3
chr16	89265087	.	A	G	337.31	PASS	AF=0.388889;AO=39;DP=106;FAO=42;FDP=108;FR=.;FRO=66;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=43;FSRR=23;FWDB=0.041585;FXX=0.00917347;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.9972;QD=12.493;RBI=0.0423108;REFB=-0.0221487;REVB=-0.00780327;RO=67;SAF=21;SAR=18;SRF=44;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133528;STB=0.564835;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0365044;OID=.;OPOS=89265087;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:108:67:66:39:42:0.388889:18:21:44:23:19:23:43:23
chr16	89265100	.	GC	AT	284.58	PASS	AF=0.357143;AO=33;DP=104;FAO=35;FDP=98;FR=.;FRO=63;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=38;FSRR=25;FWDB=-0.00407296;FXX=0.0576868;HRUN=4;LEN=2;MLLD=241.861;QD=11.6154;RBI=0.00810621;REFB=-0.00866375;REVB=-0.00700868;RO=62;SAF=20;SAR=13;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00811251;STB=0.502126;STBP=0.989;TYPE=mnp;VARB=0.0157648;OID=.;OPOS=89265100;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:98:62:63:33:35:0.357143:13:20:38:24:14:21:38:25
chr16	89265466	.	AC	CG,GC	507.08	PASS	AF=0.0571429,0.942857;AO=2,32;DP=34;FAO=2,33;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=2,12;FSAR=0,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0644125,0.0619864;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=48.681,74.3869;QD=57.9523;RBI=0.0800018,0.0804548;REFB=0,0;REVB=0.047448,0.05129;RO=0;SAF=2,11;SAR=0,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=1.46745e-05,0.0183386;OID=.,.;OPOS=89265466,89265466;OREF=AC,A;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:34:35:0:0:2,32:2,33:0.0571429,0.942857:0,21:2,11:0:0:0,21:2,12:0:0
chr16	89291210	.	G	GGTGA	1026.1	PASS	AF=0.9125;AO=68;DP=82;FAO=73;FDP=80;FR=.;FRO=7;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0220089;FXX=0.0123442;HRUN=2;LEN=4;MLLD=313.894;QD=51.3051;RBI=0.0223777;REFB=-0.021185;REVB=0.0040462;RO=8;SAF=39;SAR=29;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399386;STB=0.515804;STBP=0.377;TYPE=ins;VARB=0.00193108;OID=.;OPOS=89291211;OREF=-;OALT=GTGA;OMAPALT=GGTGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.9125:68:82:73:80:7:44:29:3:4:27:8:39:29:3:5
chr16	89291951	.	C	T	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.014;QD=56.7066;RBI=0.0287597;REFB=0;REVB=0.0216702;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.734e-05;OID=.;OPOS=89291951;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr16	89293271	.	A	C	260.89	PASS	AF=0.416667;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=72;FR=.;FRO=42;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-0.00262331;FXX=0.0136968;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.997;QD=14.4938;RBI=0.0106485;REFB=-0.0162587;REVB=0.0103203;RO=42;SAF=17;SAR=13;SRF=17;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165264;STB=0.593688;STBP=0.198;TYPE=snp;VARB=0.0208458;OID=.;OPOS=89293271;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:42:42:30:30:0.416667:13:17:17:25:13:17:17:25
chr16	89293614	.	A	G	789.26	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131738;FXX=0.019996;HRUN=4;LEN=1;MLLD=342.085;QD=64.4297;RBI=0.0150718;REFB=0;REVB=-0.0073218;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.5352e-05;OID=.;OPOS=89293614;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0
chr16	89294184	.	G	A	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0171478;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.776;QD=57.1761;RBI=0.0236838;REFB=0;REVB=0.0163362;RO=0;SAF=29;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.79919e-06;OID=.;OPOS=89294184;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:22:29:0:0:22:29:0:0
chr16	89294381	.	T	C	289.27	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3428;QD=52.5942;RBI=0.0315229;REFB=0;REVB=0.02813;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000612732;OID=.;OPOS=89294381;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr16	89294439	.	G	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0180744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.035;QD=48.7373;RBI=0.0378828;REFB=0;REVB=-0.033293;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000214594;OID=.;OPOS=89294439;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0
chr16	89294511	.	C	T	392.31	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0463951;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=237.128;QD=50.6199;RBI=0.054001;REFB=0.0841457;REVB=0.0276335;RO=2;SAF=15;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0581366;STB=0.531229;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=-0.000907617;OID=.;OPOS=89294511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:2:2:29:29:0.935484:14:15:2:0:14:15:2:0
chr16	89294697	.	C	T	490.91	PASS	AF=1;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101982;FXX=0.0571265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4952;QD=59.5039;RBI=0.0431675;REFB=0;REVB=0.0419455;RO=0;SAF=12;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.36118e-05;OID=.;OPOS=89294697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:33:0:0:33:33:1:21:12:0:0:21:12:0:0
chr16	89299200	.	C	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.176;QD=44.6898;RBI=0.0629052;REFB=0;REVB=-0.0241927;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000419987;OID=.;OPOS=89299200;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:3:10:0:0:3:10:0:0
chr16	89299227	.	C	T	239.45	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0315383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.615;QD=50.4113;RBI=0.0544606;REFB=0;REVB=0.0443992;RO=0;SAF=14;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000638428;OID=.;OPOS=89299227;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:5:14:0:0:5:14:0:0
chr16	89299280	.	T	A	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.5144;QD=53.9109;RBI=0.030969;REFB=0;REVB=-0.0245813;RO=0;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108772;OID=.;OPOS=89299280;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:5:19:0:0:5:19:0:0
chr16	89299890	.	A	G	62.79	PASS	AF=0.888889;AO=7;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.124332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.3283;QD=27.905;RBI=0.145986;REFB=-0.0915855;REVB=0.076508;RO=2;SAF=6;SAR=1;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125389;STB=0.533253;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0386071;OID=.;OPOS=89299890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:2:1:7:8:0.888889:1:6:2:0:1:7:1:0
chr16	89299899	.	A	G	83.03	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0342534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4486;QD=33.2115;RBI=0.111703;REFB=-0.207064;REVB=0.106321;RO=1;SAF=8;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524171;STB=0.529348;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0389174;OID=.;OPOS=89299899;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:10:10:1:1:9:9:0.9:1:8:1:0:1:8:1:0
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chr16	89300147	.	A	G	119.58	PASS	AF=1;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0851294;FXX=0.0832639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7917;QD=43.4846;RBI=0.087889;REFB=0;REVB=0.0218512;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00654774;OID=.;OPOS=89300147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0
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chr16	89590168	.	T	C,TATCTC	1039.68	PASS	AF=0.0909091,0.795455;AO=8,67;DP=88;FAO=8,70;FDP=88;FR=.;FRO=10;FSAF=7,39;FSAR=1,31;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=-0.00765692,-0.0140762;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,5;MLLD=97.4877,230.16;QD=47.2582;RBI=0.00865454,0.0165415;REFB=-0.032483,-0.047707;REVB=0.00403394,0.00868809;RO=11;SAF=7,36;SAR=1,31;SRF=11;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.391928,-0.124651;STB=0.707998,0.556802;STBP=0.787,0.01;TYPE=snp,ins;VARB=0.00186474,0.0030399;OID=.,.;OPOS=89590168,89590169;OREF=T,-;OALT=C,ATCTC;OMAPALT=C,TATCTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:44:88:88:11:10:8,67:8,70:0.0909091,0.795455:1,31:7,36:11:0:1,31:7,39:10:0
chr16	89590243	.	G	A	1440.87	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.623;QD=62.6467;RBI=0.023189;REFB=0;REVB=0.0207036;RO=0;SAF=53;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000972008;OID=.;OPOS=89590243;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:38:53:0:0:38:54:0:0
chr16	89652191	.	C	T	40.45	PASS	AF=0.1125;AO=9;DP=81;FAO=9;FDP=80;FR=.;FRO=71;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=43;FSRR=28;FWDB=-0.0388017;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.175;QD=2.02268;RBI=0.0571723;REFB=-0.00496978;REVB=-0.0419892;RO=62;SAF=6;SAR=3;SRF=41;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0072613;STB=0.558425;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.040576;OID=.;OPOS=89652191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:81:80:62:71:9:9:0.1125:3:6:41:21:3:6:43:28
chr16	89653999	.	TTGAG	T	117.18	PASS	AF=0.328571;AO=22;DP=72;FAO=23;FDP=70;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=-0.0316973;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=4;MLLD=242.594;QD=6.69604;RBI=0.0318005;REFB=-0.0234704;REVB=0.00256022;RO=45;SAF=14;SAR=8;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0964435;STB=0.58434;STBP=0.354;TYPE=del;VARB=0.0498933;OID=.;OPOS=89654000;OREF=TGAG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.328571:22:72:23:70:47:15:8:25:22:99:45:14:8:25:20
chr16	89662990	.	T	C	317.92	PASS	AF=0.426829;AO=34;DP=81;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0521489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5746;QD=15.5085;RBI=0.0757056;REFB=-0.0061631;REVB=-0.0548801;RO=45;SAF=13;SAR=21;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420548;STB=0.527622;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.00314585;OID=.;OPOS=89662990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:45:47:34:35:0.426829:21:13:19:26:21:14:21:26
chr16	89663025	.	C	T	195.6	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.0172382;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.533;QD=12.6192;RBI=0.0435116;REFB=-0.0227003;REVB=-0.0399513;RO=38;SAF=12;SAR=12;SRF=16;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0841905;STB=0.548347;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0415811;OID=.;OPOS=89663025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:38:38:24:24:0.387097:12:12:16:22:12:12:16:22
chr16	89712374	.	A	C,G	535.39	PASS	AF=0.947368,0.0263158;AO=35,2;DP=38;FAO=36,1;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=24,1;FSAR=12,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0193875,-0.0769184;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=102.717,57.7618;QD=56.3573;RBI=0.0588103,0.0919513;REFB=-0.177087,-0.163676;REVB=0.0555227,0.0503845;RO=1;SAF=23,2;SAR=12,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0199081,0;STB=0.510198,0.5;STBP=0.594,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00414003,0.0895467;OID=.,.;OPOS=89712374,89712374;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:38:38:1:1:35,2:36,1:0.947368,0.0263158:12,0:23,2:1:0:12,0:24,1:1:0
chr16	89712380	.	G	A	714.66	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.107;QD=62.1447;RBI=0.0491763;REFB=0;REVB=0.044226;RO=0;SAF=32;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000372332;OID=.;OPOS=89712380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:13:32:0:0:14:32:0:0
chr16	89713563	.	C	G	1185.12	PASS	AF=0.97561;AO=79;DP=83;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=33;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0877257;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.446;QD=57.8109;RBI=0.0886474;REFB=-0.154866;REVB=0.0127498;RO=1;SAF=46;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010181;STB=0.510414;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.00104231;OID=.;OPOS=89713563;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:83:82:1:2:79:80:0.97561:33:46:1:0:33:47:2:0
chr16	89724313	.	C	G	74.9	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.7775;QD=37.4523;RBI=0.106095;REFB=0;REVB=0.105413;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00348256;OID=.;OPOS=89724313;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:4:3:0:0:5:3:0:0
chr16	89760652	.	C	G,T	1043.03	PASS	AF=0.0422535,0.957746;AO=3,67;DP=70;FAO=3,68;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=0,36;FSAR=3,32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0355306,-0.0263706;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=71.7035,152.562;QD=58.7624;RBI=0.0371616,0.029246;REFB=0,0;REVB=-0.0108885,0.0126461;RO=0;SAF=0,35;SAR=3,32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.62221e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0731314,0.000178425;OID=.,.;OPOS=89760652,89760652;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:70:71:0:0:3,67:3,68:0.0422535,0.957746:3,32:0,35:0:0:3,32:0,36:0:0
chr16	89760712	.	G	A	613.18	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0168366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.174;QD=61.3175;RBI=0.055776;REFB=0;REVB=0.0531742;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112646;OID=.;OPOS=89760712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:13:26:0:0:14:26:0:0
chr16	89763214	.	T	C	1012.26	PASS	AF=0.985915;AO=54;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=41;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00217947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.789;QD=57.0289;RBI=0.0357635;REFB=-0.0378293;REVB=0.035697;RO=1;SAF=32;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020938;STB=0.508472;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.000488877;OID=.;OPOS=89763214;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:71:1:1:54:70:0.985915:22:32:0:1:29:41:0:1
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chr16	89782989	.	A	G	598.61	PASS	AF=0.97561;AO=36;DP=37;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00229186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0082;QD=58.4007;RBI=0.00242425;REFB=0.0144892;REVB=-0.00079018;RO=1;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239982;STB=0.512189;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=-0.00848113;OID=.;OPOS=89782989;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:41:1:1:36:40:0.97561:19:17:0:1:20:20:0:1
chr16	89783187	.	C	T	777.04	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0625414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.0116;QD=56.512;RBI=0.0758279;REFB=0;REVB=0.0428772;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000148828;OID=.;OPOS=89783187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:55:0:0:52:55:1:24:28:0:0:25:30:0:0
chr16	89789898	.	T	C,G	1886.19	PASS	AF=0.975806,0.0241935;AO=119,5;DP=124;FAO=121,3;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=70,3;FSAR=51,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0507972,-0.0048365;FXX=0.00799936;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=73.0771,169.095;QD=60.8449;RBI=0.0518297,0.00692107;REFB=0,0;REVB=0.0102938,-0.00495071;RO=0;SAF=68,5;SAR=51,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00122528,0.126008;OID=.,.;OPOS=89789898,89789898;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:124:124:0:0:119,5:121,3:0.975806,0.0241935:51,0:68,5:0:0:51,0:70,3:0:0
chr16	89804624	.	G	C	351.4	PASS	AF=0.474359;AO=36;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=12;FWDB=-0.0555142;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=189.38;QD=18.0202;RBI=0.0555144;REFB=-0.01484;REVB=-0.000131374;RO=30;SAF=18;SAR=18;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0822854;STB=0.602458;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0137149;OID=.;OPOS=89804624;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:30:41:36:37:0.474359:18:18:18:12:18:19:29:12
chr16	89806347	.	A	T	1283.37	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.757;QD=61.8494;RBI=0.0427394;REFB=0;REVB=0.0190363;RO=0;SAF=44;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.1876e-05;OID=.;OPOS=89806347;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:39:44:0:0:39:44:0:0
chr16	89836322	.	A	AT	339.35	PASS	AF=1;AO=3;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0987319;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=164.639;QD=48.4788;RBI=0.109656;REFB=0;REVB=0.0477127;RO=25;SAF=3;SAR=0;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.493966;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00161598;OID=.;OPOS=89836323;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:3:28:28:28:0:21:7:0:0:4:25:3:0:18:7
chr16	89836323	.	C	T	317.15	PASS	AF=0.892857;AO=25;DP=28;FAO=25;FDP=28;FR=.;FRO=3;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0398451;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.742;QD=45.3077;RBI=0.0643034;REFB=0.0523955;REVB=0.0504707;RO=3;SAF=18;SAR=7;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713041;STB=0.538432;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=-0.000778863;OID=.;OPOS=89836323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:28:28:3:3:25:25:0.892857:7:18:3:0:7:18:3:0
chr16	89845194	.	A	G	742.9	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0558924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.998;QD=59.4322;RBI=0.0560883;REFB=-0.0590041;REVB=-0.00468402;RO=2;SAF=24;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00134591;OID=.;OPOS=89845194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:24:24:1:1:24:24:1:1
chr16	89849480	.	C	T	676.75	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00485978;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.856;QD=60.1558;RBI=0.0125326;REFB=-0.000255254;REVB=0.011552;RO=1;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268299;STB=0.514279;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=3.91765e-05;OID=.;OPOS=89849480;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:17:27:0:1:17:27:0:1
chr16	89866043	.	T	C	575.4	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00990558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1852;QD=60.5687;RBI=0.0430879;REFB=0;REVB=0.0419338;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000495918;OID=.;OPOS=89866043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
chr16	89986154	.	G	A	598.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=37;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.4622;QD=59.806;RBI=0.130615;REFB=0;REVB=0.0814517;RO=2;SAF=19;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467253;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116421;OID=.;OPOS=89986154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:40:2:0:35:40:1:16:19:2:0:16:24:0:0
chr16	90037828	.	G	A	432.85	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156369;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9839;QD=57.7138;RBI=0.0314726;REFB=0;REVB=0.0273132;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000478028;OID=.;OPOS=90037828;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr16	90038786	.	C	A	1062.27	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.044734;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.762;QD=59.8462;RBI=0.0453031;REFB=0;REVB=0.00715805;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.26399e-05;OID=.;OPOS=90038786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0
chr16	90095484	.	C	T	1652.87	PASS	AF=0.973913;AO=112;DP=115;FAO=112;FDP=115;FR=.;FRO=3;FSAF=64;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0151077;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=200.627;QD=57.4912;RBI=0.0357712;REFB=-0.046596;REVB=0.0324243;RO=1;SAF=64;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00978854;STB=0.515149;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.000663092;OID=.;OPOS=90095484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:115:115:1:3:112:112:0.973913:48:64:0:1:48:64:0:3
chr16	90096052	.	CCTT	C,GCTC	729.18	PASS	AF=0.980769,0.0192308;AO=51,3;DP=57;FAO=51,1;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0;FSAR=46,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322657,0.00242157;FXX=0.0370302;HRUN=2,2;LEN=3,4;MLLD=243.15,136.592;QD=56.0905;RBI=0.0378594,0.00466906;REFB=0,0;REVB=0.0198056,-0.00399201;RO=0;SAF=5,2;SAR=46,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.57138e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.000232082,0.00258353;OID=.,.;OPOS=90096053,90096052;OREF=CTT,CCTT;OALT=-,GCTC;OMAPALT=C,GCTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:57:52:0:0:51,3:51,1:0.980769,0.0192308:46,1:5,2:0:0:46,1:5,0:0:0
chr16	90097748	.	C	T	207.66	PASS	AF=1;AO=16;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00916635;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.5083;QD=46.1474;RBI=0.139254;REFB=0;REVB=0.138952;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00762239;OID=.;OPOS=90097748;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:16:18:1:4:12:0:0:6:12:0:0
chr16	90109711	.	A	G	349.33	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0863351;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.7235;QD=53.7439;RBI=0.121453;REFB=0;REVB=-0.0854224;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00239986;OID=.;OPOS=90109711;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:12:13:0:0:12:14:0:0
chr16	90110027	.	G	A	635.87	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361918;FXX=0.0238039;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.883;QD=62.0362;RBI=0.0410562;REFB=0;REVB=0.0193847;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190511;OID=.;OPOS=90110027;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr16	90110284	.	G	A	499.62	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0183775;FXX=0.0540395;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.611;QD=57.0998;RBI=0.0251134;REFB=-0.170107;REVB=0.0171158;RO=1;SAF=18;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0252651;STB=0.513506;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00160664;OID=.;OPOS=90110284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:1:1:34:34:0.971429:16:18:1:0:16:18:1:0
chr16	90110289	.	C	A	513.96	PASS	AF=1;AO=31;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00674473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0122;QD=58.7385;RBI=0.0953496;REFB=0;REVB=0.0951107;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100775;OID=.;OPOS=90110289;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:31:35:1:11:20:0:0:15:20:0:0
chr16	90130136	.	C	T	897.64	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.183;QD=57.912;RBI=0.0628395;REFB=0;REVB=0.0619797;RO=0;SAF=48;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143389;OID=.;OPOS=90130136;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:62:0:0:60:62:1:12:48:0:0:13:49:0:0
chr16	90160238	.	C	T	88.2	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00395939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.181;QD=39.1992;RBI=0.0460679;REFB=0;REVB=0.0458975;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119653;OID=.;OPOS=90160238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr16	90160246	.	G	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0177786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.681;QD=39.2063;RBI=0.0355538;REFB=0;REVB=-0.0307895;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000253394;OID=.;OPOS=90160246;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr16	90160793	.	G	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.14365;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.4177;QD=44.6891;RBI=0.143796;REFB=0;REVB=-0.00647878;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00694619;OID=.;OPOS=90160793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0
chr16	90160953	.	T	C	207.19	PASS	AF=1;AO=12;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.96;QD=48.7506;RBI=0.0769248;REFB=0;REVB=0.0626983;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147729;OID=.;OPOS=90160953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:12:17:1:4:8:0:0:8:9:0:0
chr16	90161034	.	C	A	502.97	PASS	AF=1;AO=27;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.058;QD=59.1727;RBI=0.0496743;REFB=0;REVB=-0.012724;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000378477;OID=.;OPOS=90161034;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:27:34:1:15:12:0:0:16:18:0:0
chr16	90161065	.	A	T	526.48	PASS	AF=0.972973;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.055031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.366;QD=56.9166;RBI=0.0626961;REFB=0.0947726;REVB=0.0300398;RO=1;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.021769;STB=0.511621;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000635677;OID=.;OPOS=90161065;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:1:1:36:36:0.972973:21:15:0:1:21:15:0:1
chr16	90161231	.	T	C	175.63	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00618748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0908;QD=46.8353;RBI=0.0445793;REFB=0;REVB=0.0441478;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00143917;OID=.;OPOS=90161231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0
chr16	90161578	.	G	A	123.15	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0821892;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.7665;QD=37.8915;RBI=0.0839529;REFB=0.00208808;REVB=0.017118;RO=1;SAF=6;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069361;STB=0.538398;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0025775;OID=.;OPOS=90161578;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:6:6:1:0:6:6:1:0
chr16	90161585	.	C	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314191;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.802;QD=42.1826;RBI=0.0316545;REFB=0;REVB=-0.00385403;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000438323;OID=.;OPOS=90161585;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr16	90161590	.	G	A	106.14	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0439757;FXX=0.0908265;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.7228;QD=42.4554;RBI=0.0516616;REFB=0;REVB=0.0271119;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00152092;OID=.;OPOS=90161590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:5:5:0:0:5:5:0:0
chr16	90161592	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.602;QD=42.1825;RBI=0.0258952;REFB=0;REVB=-0.0113652;RO=0;SAF=5;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000446654;OID=.;OPOS=90161592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:6:5:0:0:6:5:0:0
chr16	90232832	.	A	C	62.34	PASS	AF=0.153846;AO=12;DP=78;FAO=12;FDP=78;FR=.;FRO=66;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=41;FSRR=25;FWDB=-0.068001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.768;QD=3.19667;RBI=0.0740648;REFB=-0.00967475;REVB=-0.0293508;RO=66;SAF=7;SAR=5;SRF=41;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491216;STB=0.533279;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0777596;OID=.;OPOS=90232832;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:78:78:66:66:12:12:0.153846:5:7:41:25:5:7:41:25
chr17	6115	.	G	C	1472.58	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0178099;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.532;QD=63.3368;RBI=0.0368284;REFB=0;REVB=0.0322357;RO=0;SAF=41;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.41693e-05;OID=.;OPOS=6115;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:52:41:0:0:52:41:0:0
chr17	6157	.	A	G	1062.39	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.687;QD=59.8531;RBI=0.0135593;REFB=0;REVB=-0.00204397;RO=0;SAF=28;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.6809e-05;OID=.;OPOS=6157;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:43:28:0:0:43:28:0:0
chr17	181474	.	T	C	1879.79	PASS	AF=1;AO=121;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187641;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.084;QD=61.6325;RBI=0.0296212;REFB=0;REVB=-0.02292;RO=0;SAF=71;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.91843e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.27592e-06;OID=.;OPOS=181474;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:0:0:121:122:1:50:71:0:0:50:72:0:0
chr17	181479	.	C	A	953.35	PASS	AF=0.653543;AO=83;DP=127;FAO=83;FDP=127;FR=.;FRO=44;FSAF=48;FSAR=35;FSRF=29;FSRR=15;FWDB=0.0344259;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=111.455;QD=30.0268;RBI=0.0352502;REFB=-0.0252193;REVB=0.00757816;RO=41;SAF=48;SAR=35;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.035349;STB=0.528943;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.0113118;OID=.;OPOS=181479;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:41:44:83:83:0.653543:35:48:26:15:35:48:29:15
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chr17	465775	.	G	A	383.31	PASS	AF=0.454545;AO=39;DP=87;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=0.00390876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4186;QD=17.4231;RBI=0.0151343;REFB=-0.0279771;REVB=0.0146208;RO=47;SAF=20;SAR=19;SRF=28;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0811901;STB=0.545432;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0569331;OID=.;OPOS=465775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:47:48:39:40:0.454545:19:20:28:19:20:20:28:20
chr17	505129	.	A	C	751.87	PASS	AF=0.642857;AO=63;DP=100;FAO=63;FDP=98;FR=.;FRO=35;FSAF=20;FSAR=43;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=0.046153;FXX=0.019998;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.321;QD=30.6887;RBI=0.0471709;REFB=-0.0342154;REVB=0.0097462;RO=33;SAF=20;SAR=43;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547685;STB=0.544289;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0190211;OID=.;OPOS=505129;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:98:33:35:63:63:0.642857:43:20:13:20:43:20:15:20
chr17	600735	.	A	G	573.55	PASS	AF=0.517241;AO=57;DP=115;FAO=60;FDP=116;FR=.;FRO=56;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=21;FSRR=35;FWDB=0.12097;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8245;QD=19.7777;RBI=0.121565;REFB=-0.0042354;REVB=0.0120127;RO=56;SAF=28;SAR=29;SRF=21;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104707;STB=0.568133;STBP=0.14;TYPE=snp;VARB=0.0032261;OID=.;OPOS=600735;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:116:56:56:57:60:0.517241:29:28:21:35:29:31:21:35
chr17	636266	.	A	AGGGCC	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0124706;FXX=0;HRUN=3;LEN=5;MLLD=392.836;QD=33.4285;RBI=0.0127872;REFB=0;REVB=-0.00282823;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000103941;OID=.;OPOS=636267;OREF=-;OALT=GGGCC;OMAPALT=AGGGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:6:6:6:0:5:1:0:0:4:0:5:1:0:0
chr17	648186	.	G	A	617.31	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0081309;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.241;QD=61.7309;RBI=0.0400651;REFB=0;REVB=0.0392313;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0002284;OID=.;OPOS=648186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr17	648498	.	C	T	613.33	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00450889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.143;QD=61.3331;RBI=0.00829549;REFB=0;REVB=-0.00696313;RO=0;SAF=22;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.9788e-05;OID=.;OPOS=648498;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:18:22:0:0:18:22:0:0
chr17	649232	.	C	T	876.84	PASS	AF=0.96875;AO=63;DP=63;FAO=62;FDP=64;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0266984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5652;QD=54.8025;RBI=0.0269731;REFB=-0.0489375;REVB=-0.0038395;RO=0;SAF=37;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502584;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00555345;OID=.;OPOS=649232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:64:0:2:63:62:0.96875:26:37:0:0:26:36:1:1
chr17	649547	.	G	C	256.92	PASS	AF=1;AO=16;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0462671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.7722;QD=51.3833;RBI=0.222853;REFB=0;REVB=0.217997;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00507439;OID=.;OPOS=649547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:16:20:1:8:8:0:0:12:8:0:0
chr17	649935	.	G	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.89;QD=52.6128;RBI=0.0250338;REFB=0;REVB=-0.0110478;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000153312;OID=.;OPOS=649935;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr17	650206	.	C	T	834.37	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.2205;QD=57.5429;RBI=0.036015;REFB=0;REVB=0.0277301;RO=0;SAF=26;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.09576e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000308869;OID=.;OPOS=650206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:32:26:0:0:32:26:0:0
chr17	685640	.	G	T	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3488;QD=60.6092;RBI=0.131426;REFB=0;REVB=0.129564;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0016406;OID=.;OPOS=685640;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:19:19:0:0:19:19:0:0
chr17	704017	.	A	G	106.31	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=-0.01672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.7975;QD=11.8126;RBI=0.0281929;REFB=-0.00268441;REVB=-0.0226998;RO=23;SAF=11;SAR=2;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399383;STB=0.523772;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.00315008;OID=.;OPOS=704017;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:2:11:19:4:2:11:19:4
chr17	908529	.	A	G	126.77	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=-0.0223032;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8126;QD=16.9021;RBI=0.0478155;REFB=-0.0411516;REVB=0.0422953;RO=16;SAF=3;SAR=11;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.047337;STB=0.548951;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0418168;OID=.;OPOS=908529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:15:14:15:0.5:11:3:4:12:12:3:4:11
chr17	925764	.	A	G	616.3	PASS	AF=0.5;AO=62;DP=129;FAO=62;FDP=124;FR=.;FRO=62;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=33;FSRR=29;FWDB=-0.0181484;FXX=0.0387567;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.782;QD=19.8806;RBI=0.019754;REFB=-0.00508642;REVB=-0.00780094;RO=65;SAF=30;SAR=32;SRF=38;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0930722;STB=0.524173;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.00497468;OID=.;OPOS=925764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:124:65:62:62:62:0.5:32:30:38:27:32:30:33:29
chr17	970413	.	C	T	188.27	PASS	AF=0.85;AO=17;DP=20;FAO=17;FDP=20;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0053678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.495;QD=37.654;RBI=0.072323;REFB=-0.0152839;REVB=0.0721235;RO=3;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181817;STB=0.59988;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.000707783;OID=.;OPOS=970413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:20:20:3:3:17:17:0.85:6:11:0:3:6:11:0:3
chr17	1183354	.	T	C	226.91	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0443232;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6116;QD=45.3813;RBI=0.0878414;REFB=0.00930572;REVB=-0.0758391;RO=1;SAF=14;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317459;STB=0.517223;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=-0.00743834;OID=.;OPOS=1183354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:5:14:1:0:5:14:1:0
chr17	1183464	.	A	G	1047.9	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0266819;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.065;QD=59.8799;RBI=0.029156;REFB=0;REVB=-0.0117536;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000157454;OID=.;OPOS=1183464;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:40:30:0:0:40:30:0:0
chr17	1201721	.	C	T	149.07	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0135985;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=247.231;QD=18.6334;RBI=0.0137031;REFB=-0.0266362;REVB=0.00169011;RO=16;SAF=12;SAR=4;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300156;STB=0.672184;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0239338;OID=.;OPOS=1201721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:4:12:7:9:4:12:7:9
chr17	1209772	.	G	A	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.00693152;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.456;QD=13.2053;RBI=0.0656729;REFB=-0.00470668;REVB=-0.0653061;RO=6;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.345446;STB=0.713468;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.00226686;OID=.;OPOS=1209772;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:1:5:3:3:1:5:3:3
chr17	1384066	.	A	G	952.53	PASS	AF=1;AO=47;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=48;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335181;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.548;QD=58.6173;RBI=0.0647545;REFB=0;REVB=-0.0554048;RO=0;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.17026e-05;OID=.;OPOS=1384066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:47:65:1:15:32:0:0:17:48:0:0
chr17	1384067	.	C	G	131.46	PASS	AF=0.287879;AO=18;DP=65;FAO=19;FDP=66;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=0.00420518;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=108.737;QD=7.96698;RBI=0.0321225;REFB=-0.0152999;REVB=0.0318461;RO=47;SAF=16;SAR=2;SRF=32;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380649;STB=0.666465;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.00214412;OID=.;OPOS=1384067;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:47:47:18:19:0.287879:2:16:32:15:3:16:32:15
chr17	1478411	.	T	C	61.22	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0125151;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.9234;QD=18.8383;RBI=0.013935;REFB=-0.0715461;REVB=0.00612832;RO=5;SAF=7;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101851;STB=0.559836;STBP=0.774;TYPE=snp;VARB=0.0466084;OID=.;OPOS=1478411;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:1:7:4:1:1:7:4:1
chr17	1489088	.	C	G	850.27	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0832677;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.456;QD=57.6455;RBI=0.0839848;REFB=0;REVB=-0.0109514;RO=0;SAF=33;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339398;OID=.;OPOS=1489088;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:58:59:1:25:33:0:0:26:33:0:0
chr17	1516480	.	TG	AG,CG,GA	1197.68	PASS	AF=0.037037,0.925926,0.037037;AO=3,72,3;DP=78;FAO=3,75,3;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=0,34,3;FSAR=3,41,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04844,0.0878748,0.0639917;FXX=0.0121936;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,2;MLLD=18.0727,132.028,48.1558;QD=59.1445;RBI=0.0557898,0.087978,0.0768777;REFB=0,0,0;REVB=-0.027678,0.00425947,-0.0426056;RO=0;SAF=0,33,3;SAR=3,39,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,snp,mnp;VARB=0.0423649,-0.000595098,0.0597722;OID=.,.,.;OPOS=1516480,1516480,1516480;OREF=T,T,TG;OALT=A,C,GA;OMAPALT=AG,CG,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:8:78:81:0:0:3,72,3:3,75,3:0.037037,0.925926,0.037037:3,39,0:0,33,3:0:0:3,41,0:0,34,3:0:0
chr17	1538546	.	C	T	2243.96	PASS	AF=0.993333;AO=147;DP=151;FAO=149;FDP=150;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=80;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0210454;FXX=0.00662208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.405;QD=59.8389;RBI=0.0537355;REFB=-0.0511596;REVB=0.0494429;RO=1;SAF=67;SAR=80;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704566;STB=0.503597;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=7.423e-05;OID=.;OPOS=1538546;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:151:150:1:1:147:149:0.993333:80:67:1:0:80:69:1:0
chr17	1538628	.	C	G	2127.16	PASS	AF=0.992754;AO=136;DP=138;FAO=137;FDP=138;FR=.;FRO=1;FSAF=76;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0284986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.961;QD=61.6567;RBI=0.0385121;REFB=-0.0240085;REVB=-0.025904;RO=1;SAF=76;SAR=60;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00785724;STB=0.504065;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.000646179;OID=.;OPOS=1538628;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:138:138:1:1:136:137:0.992754:60:76:0:1:61:76:0:1
chr17	1542153	.	G	A	452.66	PASS	AF=0.829268;AO=34;DP=41;FAO=34;FDP=41;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.00272276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.879;QD=44.1615;RBI=0.022441;REFB=-0.0245775;REVB=-0.0222752;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.502957;STBP=0.945;TYPE=snp;VARB=0.0147486;OID=.;OPOS=1542153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:41:41:0:7:34:34:0.829268:20:14:0:0:20:14:3:4
chr17	1542190	.	G	A	490.23	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0421418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.918;QD=56.0263;RBI=0.0494547;REFB=-0.15414;REVB=0.0258812;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.511105;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00170607;OID=.;OPOS=1542190;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:0:1:34:34:0.971429:22:12:0:0:22:12:0:1
chr17	1611433	.	A	G	45.55	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00866255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.7364;QD=26.0261;RBI=0.0117339;REFB=-0.0672128;REVB=0.00791489;RO=1;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123249;STB=0.571194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00975265;OID=.;OPOS=1611433;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:1:1:6:6:0.857143:3:3:1:0:3:3:1:0
chr17	1628301	.	CGGGGGC	CGGGGC,CGGGGCG	164.64	PASS	AF=1,0;AO=12,3;DP=17;FAO=18,0;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5,0;FSAR=13,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.231899,-0.078263;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=14.8343,170.776;QD=36.5861;RBI=0.231935,0.0807245;REFB=-0.023891,0.0078795;REVB=0.00407735,-0.0197826;RO=1;SAF=1,3;SAR=11,0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.293687,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0203134,0;OID=.,.;OPOS=1628302,1628306;OREF=G,GC;OALT=-,CG;OMAPALT=CGGGGC,CGGGGCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:12,3:17:18,0:18:0:5,0:13,0:0:0:3:1:1,3:11,0:1:0
chr17	1630208	.	C	T	383.26	PASS	AF=0.567164;AO=38;DP=67;FAO=38;FDP=67;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=26;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.0108846;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.562;QD=22.8812;RBI=0.0296184;REFB=-0.0409021;REVB=0.0275458;RO=29;SAF=12;SAR=26;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2486;STB=0.637181;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0177119;OID=.;OPOS=1630208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:29:29:38:38:0.567164:26:12:18:11:26:12:18:11
chr17	1630395	.	T	C	268.36	PASS	AF=0.5;AO=28;DP=58;FAO=29;FDP=58;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0038212;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2402;QD=18.5075;RBI=0.0360655;REFB=-0.0166293;REVB=-0.0358625;RO=27;SAF=14;SAR=14;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146798;STB=0.568674;STBP=0.317;TYPE=snp;VARB=0.0157891;OID=.;OPOS=1630395;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:29:28:29:0.5:14:14:9:18:14:15:11:18
chr17	1630584	.	A	G	256.84	PASS	AF=0.571429;AO=23;DP=41;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0183825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.665;QD=24.4606;RBI=0.018975;REFB=-0.0130582;REVB=-0.00470482;RO=18;SAF=9;SAR=14;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434061;STB=0.512185;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.00860179;OID=.;OPOS=1630584;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:18:18:23:24:0.571429:14:9:8:10:14:10:8:10
chr17	1636934	.	A	G	591.26	PASS	AF=0.512821;AO=59;DP=118;FAO=60;FDP=117;FR=.;FRO=57;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=38;FSRR=19;FWDB=0.00302389;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.541;QD=20.2139;RBI=0.0104567;REFB=-0.0412407;REVB=-0.0100099;RO=56;SAF=34;SAR=25;SRF=37;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775172;STB=0.542334;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0297094;OID=.;OPOS=1636934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:117:56:57:59:60:0.512821:25:34:37:19:25:35:38:19
chr17	1637074	.	A	G	429.74	PASS	AF=0.444444;AO=44;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=35;FSRR=20;FWDB=-0.0201115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.6343;QD=17.363;RBI=0.0816277;REFB=-0.0386794;REVB=-0.0791114;RO=55;SAF=24;SAR=20;SRF=35;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0919257;STB=0.551379;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.0314611;OID=.;OPOS=1637074;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:55:55:44:44:0.444444:20:24:35:20:20:24:35:20
chr17	1637302	.	A	G	470.13	PASS	AF=0.484536;AO=45;DP=96;FAO=47;FDP=97;FR=.,HEALED;FRO=50;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0601896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2365;QD=19.3868;RBI=0.0614346;REFB=-0.0331286;REVB=0.0123055;RO=38;SAF=17;SAR=28;SRF=13;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318284;STB=0.529479;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0314169;OID=.;OPOS=1637302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:38:50:45:47:0.484536:28:17:13:25:28:19:23:27
chr17	1639458	.	A	G	296.0	PASS	AF=0.533333;AO=30;DP=57;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0423239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.6171;QD=19.7332;RBI=0.097047;REFB=-0.0206661;REVB=-0.0873316;RO=26;SAF=12;SAR=18;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117237;STB=0.545996;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0254089;OID=.;OPOS=1639458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:60:26:28:30:32:0.533333:18:12:14:12:18:14:15:13
chr17	1673177	.	T	TG	31.82	PASS	AF=0.197183;AO=15;DP=71;FAO=14;FDP=71;FR=.;FRO=57;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=0.0712574;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.9558;QD=1.79256;RBI=0.0754784;REFB=-0.0802639;REVB=-0.0248869;RO=56;SAF=9;SAR=6;SRF=33;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138169;STB=0.554061;STBP=0.651;TYPE=ins;VARB=0.184394;OID=.;OPOS=1673178;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.197183:15:71:14:71:57:9:5:33:24:31:56:9:6:33:23
chr17	1673276	.	C	T	437.95	PASS	AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=37;FSRF=15;FSRR=33;FWDB=0.00769301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0763;QD=19.0414;RBI=0.0757316;REFB=-0.0018299;REVB=0.0753399;RO=47;SAF=7;SAR=37;SRF=15;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226397;STB=0.624169;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.00291673;OID=.;OPOS=1673276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:47:48:44:44:0.478261:37:7:15:32:37:7:15:33
chr17	1674429	.	T	C	114.5	PASS	AF=0.311111;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=45;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0202995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0684;QD=10.1775;RBI=0.0209447;REFB=-0.0116839;REVB=0.00515859;RO=29;SAF=4;SAR=10;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.273039;STB=0.745393;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0163576;OID=.;OPOS=1674429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:45:29:31:14:14:0.311111:10:4:15:14:11:3:17:14
chr17	1680002	.	T	C	340.55	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0379066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.0363;QD=54.4878;RBI=0.0436458;REFB=0;REVB=0.0216344;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00145149;OID=.;OPOS=1680002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0
chr17	1684605	.	G	T	199.48	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=0.0031949;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=370.036;QD=15.6454;RBI=0.00339685;REFB=-0.00889592;REVB=0.00115378;RO=29;SAF=13;SAR=9;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00483884;STB=0.50276;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.0113958;OID=.;OPOS=1684605;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:9:13:17:12:9:13:17:12
chr17	1686410	.	T	C	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.804;QD=64.1537;RBI=0.025659;REFB=0;REVB=0.00520516;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.64937e-05;OID=.;OPOS=1686410;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr17	1690752	.	G	A	890.38	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0361412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.704;QD=56.5323;RBI=0.1353;REFB=-0.0584869;REVB=0.130384;RO=1;SAF=38;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019264;STB=0.510201;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00239722;OID=.;OPOS=1690752;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:24:38:0:1:24:38:0:1
chr17	1707977	.	G	A	428.54	PASS	AF=0.545455;AO=42;DP=77;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.00440765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9777;QD=22.2616;RBI=0.0219603;REFB=-0.00564665;REVB=-0.0215134;RO=34;SAF=18;SAR=24;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0104339;STB=0.513201;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00517417;OID=.;OPOS=1707977;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:34:35:42:42:0.545455:24:18:15:19:24:18:16:19
chr17	1782957	.	C	T	257.52	PASS	AF=0.530612;AO=25;DP=50;FAO=26;FDP=49;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0131955;FXX=0.039208;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.068;QD=21.0219;RBI=0.0211994;REFB=1.10689e-05;REVB=0.016592;RO=23;SAF=12;SAR=13;SRF=15;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147024;STB=0.588718;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=0.000250897;OID=.;OPOS=1782957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:23:23:25:26:0.530612:13:12:15:8:14:12:15:8
chr17	1801144	.	C	T	1264.75	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00767767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.803;QD=61.6949;RBI=0.00985976;REFB=0;REVB=0.00618614;RO=0;SAF=46;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14462e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.59866e-07;OID=.;OPOS=1801144;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:36:46:0:0:36:46:0:0
chr17	1839674	.	G	C	1587.12	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0445697;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.2187;QD=64.1263;RBI=0.0621577;REFB=0;REVB=-0.0433257;RO=0;SAF=64;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000535413;OID=.;OPOS=1839674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:35:64:0:0:35:64:0:0
chr17	1840468	.	C	T	2658.99	PASS	AF=1;AO=171;DP=171;FAO=171;FDP=171;FR=.;FRO=0;FSAF=99;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00695123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.907;QD=62.1985;RBI=0.0436539;REFB=0;REVB=0.0430969;RO=0;SAF=99;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.42424e-05;OID=.;OPOS=1840468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:171:171:0:0:171:171:1:72:99:0:0:72:99:0:0
chr17	1943888	.	T	C	705.01	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.999;QD=62.6675;RBI=0.0688649;REFB=0;REVB=0.067397;RO=0;SAF=26;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243558;OID=.;OPOS=1943888;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:45:0:0:42:45:1:16:26:0:0:17:28:0:0
chr17	1962394	.	C	T	296.8	PASS	AF=0.757576;AO=25;DP=33;FAO=25;FDP=33;FR=.;FRO=8;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.0093847;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=112.605;QD=35.9757;RBI=0.0521154;REFB=-0.0170044;REVB=0.0512635;RO=8;SAF=18;SAR=7;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168074;STB=0.590844;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0145177;OID=.;OPOS=1962394;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:33:33:8:8:25:25:0.757576:7:18:8:0:7:18:8:0
chr17	2091765	.	C	T	437.8	PASS	AF=0.4375;AO=49;DP=112;FAO=49;FDP=112;FR=.;FRO=63;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=0.0347331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.344;QD=15.6357;RBI=0.0391495;REFB=-0.0103039;REVB=-0.0180635;RO=63;SAF=34;SAR=15;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275109;STB=0.654522;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0217487;OID=.;OPOS=2091765;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:63:63:49:49:0.4375:15:34:27:36:15:34:27:36
chr17	2186100	.	C	T	504.42	PASS	AF=0.571429;AO=47;DP=83;FAO=48;FDP=84;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=29;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.0142641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.909;QD=24.02;RBI=0.0145263;REFB=-0.0343853;REVB=0.00274706;RO=36;SAF=18;SAR=29;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0420098;STB=0.52832;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.0219619;OID=.;OPOS=2186100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:36:36:47:48:0.571429:29:18:12:24:29:19:12:24
chr17	2202943	.	T	C	201.27	PASS	AF=0.413793;AO=24;DP=58;FAO=24;FDP=58;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.0128043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.64;QD=13.8806;RBI=0.0128852;REFB=-0.00841461;REVB=-0.00144107;RO=30;SAF=11;SAR=13;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105728;STB=0.575652;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0135408;OID=.;OPOS=2202943;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:34:24:24:0.413793:13:11:17:13:13:11:20:14
chr17	2203167	.	T	G	237.09	PASS	AF=0.479167;AO=23;DP=48;FAO=23;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.00348995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8005;QD=19.7578;RBI=0.0406168;REFB=-0.0113747;REVB=-0.0404666;RO=25;SAF=15;SAR=8;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0123154;STB=0.506952;STBP=0.94;TYPE=snp;VARB=0.0116808;OID=.;OPOS=2203167;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:25:25:23:23:0.479167:8:15:16:9:8:15:16:9
chr17	2203348	.	T	C	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151711;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.316;QD=37.4852;RBI=0.0729569;REFB=0;REVB=-0.0713621;RO=0;SAF=4;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000766499;OID=.;OPOS=2203348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:4:4:0:0:4:4:0:0
chr17	2203453	.	A	G	93.19	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=19;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-1.06825e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.545;QD=18.6387;RBI=0.00776732;REFB=-0.0312572;REVB=-0.00776731;RO=8;SAF=7;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280231;STB=0.636115;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0269099;OID=.;OPOS=2203453;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:19:20:8:9:11:11:0.55:4:7:2:6:4:7:3:6
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chr17	2236404	.	T	C	52.27	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=30;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=18;FWDB=-0.111517;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=74.4414;QD=6.74505;RBI=0.112811;REFB=-0.00969765;REVB=0.0170366;RO=22;SAF=3;SAR=5;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267715;STB=0.632738;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0139926;OID=.;OPOS=2236404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:31:22:23:8:8:0.258065:5:3:4:18:5:3:5:18
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chr17	2268311	.	G	A	2152.68	PASS	AF=0.952703;AO=141;DP=149;FAO=141;FDP=148;FR=.;FRO=7;FSAF=94;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0265264;FXX=0.0133324;HRUN=4;LEN=1;MLLD=119.532;QD=58.1805;RBI=0.0392022;REFB=-0.182258;REVB=0.0288645;RO=2;SAF=94;SAR=47;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197992;STB=0.534648;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00249524;OID=.;OPOS=2268311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:149:148:2:7:141:141:0.952703:47:94:0:2:47:94:0:7
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chr17	2318550	.	G	C	202.63	PASS	AF=0.402985;AO=23;DP=63;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=8;FWDB=0.00761501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7359;QD=12.0976;RBI=0.00958091;REFB=-0.0229568;REVB=-0.00581424;RO=38;SAF=6;SAR=17;SRF=31;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.552963;STB=0.740507;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0194143;OID=.;OPOS=2318550;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:67:38:40:23:27:0.402985:17:6:31:7:17:10:32:8
chr17	2585113	.	C	T	526.4	PASS	AF=0.544444;AO=48;DP=92;FAO=49;FDP=90;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=-0.0100965;FXX=0.0322546;HRUN=4;LEN=1;MLLD=179.465;QD=23.3957;RBI=0.0163454;REFB=-0.057282;REVB=-0.0128543;RO=29;SAF=26;SAR=22;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111904;STB=0.56366;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0431579;OID=.;OPOS=2585113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:90:29:41:48:49:0.544444:22:26:11:18:23:26:16:25
chr17	2588722	.	TAA	T	102.31	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0186958;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=2;MLLD=163.062;QD=12.7882;RBI=0.0197497;REFB=0.000249554;REVB=-0.00636528;RO=17;SAF=4;SAR=11;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21177;STB=0.622468;STBP=0.254;TYPE=del;VARB=-0.000491281;OID=.;OPOS=2588723;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.46875:15:33:15:32:17:4:11:8:9:99:17:4:11:8:9
chr17	2595964	.	G	A	45.61	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0144135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.749;QD=8.68854;RBI=0.0355545;REFB=-0.0125648;REVB=0.0325019;RO=14;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0885977;STB=0.555391;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.0402442;OID=.;OPOS=2595964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:14:14:7:7:0.333333:2:5:9:5:2:5:9:5
chr17	2598261	.	GTTTTT	GTTTT,GTTTTC	124.21	PASS	AF=0.615385,0.115385;AO=13,3;DP=25;FAO=16,3;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=4,1;FSAR=12,2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0766322,0.083897;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=14.8298,19.7492;QD=19.1088;RBI=0.163337,0.0908972;REFB=-0.12099,-0.0666398;REVB=0.144244,0.0349798;RO=8;SAF=3,1;SAR=10,2;SRF=3;SRR=5;SSEN=0.312849,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.125311,-0.047266;STB=0.567478,0.570939;STBP=0.405,0.917;TYPE=del,snp;VARB=0.106288,-0.0295221;OID=.,.;OPOS=2598262,2598266;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=GTTTT,GTTTTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.615385,0.115385:13,3:25:16,3:26:7:4,1:12,2:3:4:28:8:3,1:10,2:3:5
chr17	2600186	.	G	A	601.88	PASS	AF=0.356784;AO=71;DP=199;FAO=71;FDP=199;FR=.;FRO=128;FSAF=39;FSAR=32;FSRF=69;FSRR=59;FWDB=0.0761711;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.2447;QD=12.0981;RBI=0.0771148;REFB=-0.0182687;REVB=0.0120273;RO=127;SAF=39;SAR=32;SRF=68;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157456;STB=0.506636;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.0343977;OID=.;OPOS=2600186;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:199:127:128:71:71:0.356784:32:39:68:59:32:39:69:59
chr17	2606715	.	G	A	2529.24	PASS	AF=1;AO=164;DP=164;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=96;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00852477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.282;QD=61.6887;RBI=0.0177101;REFB=0;REVB=0.0155233;RO=0;SAF=68;SAR=96;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.15665e-05;OID=.;OPOS=2606715;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:164:164:0:0:164:164:1:96:68:0:0:96:68:0:0
chr17	2868935	.	T	C	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.035176;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.967;QD=57.6806;RBI=0.0417851;REFB=0;REVB=0.022553;RO=0;SAF=19;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150302;OID=.;OPOS=2868935;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:12:19:0:0:12:19:0:0
chr17	2883588	.	C	A	274.1	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00433265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0151;QD=24.9185;RBI=0.043932;REFB=-0.047766;REVB=0.0437178;RO=17;SAF=14;SAR=11;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226004;STB=0.508311;STBP=0.925;TYPE=snp;VARB=0.026324;OID=.;OPOS=2883588;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:17:19:25:25:0.568182:11:14:9:8:11:14:11:8
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chr17	2929674	.	T	C	213.27	PASS	AF=0.382353;AO=25;DP=67;FAO=26;FDP=68;FR=.;FRO=42;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.04201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.046;QD=12.5453;RBI=0.0440202;REFB=-0.0147204;REVB=-0.0131506;RO=41;SAF=19;SAR=6;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297461;STB=0.673431;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.025723;OID=.;OPOS=2929674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:41:42:25:26:0.382353:6:19:21:20:6:20:22:20
chr17	2930339	.	G	A	202.68	PASS	AF=0.428571;AO=20;DP=47;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0281707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.531;QD=16.5456;RBI=0.0341859;REFB=-0.0171398;REVB=-0.0193672;RO=27;SAF=5;SAR=15;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32844;STB=0.652023;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0280798;OID=.;OPOS=2930339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:49:27:28:20:21:0.428571:15:5:15:12:15:6:15:13
chr17	2940759	.	A	G	436.4	PASS	AF=0.52439;AO=43;DP=82;FAO=43;FDP=82;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=-0.0630094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.005;QD=21.2879;RBI=0.0681302;REFB=-0.00684795;REVB=-0.0259141;RO=38;SAF=16;SAR=27;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.020455;STB=0.506349;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.00708508;OID=.;OPOS=2940759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:38:39:43:43:0.52439:27:16:15:23:27:16:15:24
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chr17	3101076	.	G	C	685.87	PASS	AF=0.957447;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00183463;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=268.771;QD=58.372;RBI=0.0325242;REFB=-0.0518019;REVB=0.0324724;RO=1;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.025391;STB=0.504423;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.00072177;OID=.;OPOS=3101076;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:46:47:1:2:45:45:0.957447:18:27:0:1:18:27:1:1
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chr17	3337057	.	A	G	465.11	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0323965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4933;QD=58.1391;RBI=0.0369449;REFB=0;REVB=-0.0177593;RO=0;SAF=19;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000345016;OID=.;OPOS=3337057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:13:19:0:0:13:19:0:0
chr17	3343519	.	T	C	352.57	PASS	AF=0.537313;AO=36;DP=67;FAO=36;FDP=67;FR=.;FRO=31;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0171256;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.8615;QD=21.0489;RBI=0.0427995;REFB=0.00517532;REVB=-0.0392239;RO=31;SAF=21;SAR=15;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571398;STB=0.531628;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=-0.00382629;OID=.;OPOS=3343519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:31:31:36:36:0.537313:15:21:16:15:15:21:16:15
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chr17	3446885	.	T	C	162.56	PASS	AF=0.413043;AO=13;DP=40;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=0.031206;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.429;QD=14.1358;RBI=0.03131;REFB=-0.018009;REVB=0.00254963;RO=26;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255481;STB=0.661309;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.0235076;OID=.;OPOS=3446885;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:46:26:27:13:19:0.413043:6:7:8:18:8:11:8:19
chr17	3447914	.	C	T	101.87	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0649953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.326;QD=40.7491;RBI=0.108059;REFB=0;REVB=0.0863272;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00121473;OID=.;OPOS=3447914;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr17	3458072	.	T	C,G	1004.54	PASS	AF=0.942029,0.057971;AO=63,4;DP=67;FAO=65,4;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=35,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135999,0.0162377;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=150.547,104.82;QD=58.2343;RBI=0.0318991,0.0564392;REFB=0,0;REVB=-0.0288547,-0.0540529;RO=0;SAF=30,0;SAR=33,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000673198,0.124185;OID=.,.;OPOS=3458072,3458072;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:12:67:69:0:0:63,4:65,4:0.942029,0.057971:33,4:30,0:0:0:35,4:30,0:0:0
chr17	3486702	.	G	A,T	271.79	PASS	AF=0.904762,0.0952381;AO=19,2;DP=21;FAO=19,2;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7,2;FSAR=12,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000831709,-0.000228821;FXX=0.0454339;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=186.926,154.694;QD=51.7694;RBI=0.00519389,0.00901198;REFB=0,0;REVB=0.00512687,0.00900908;RO=0;SAF=7,2;SAR=12,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00283287,0.0171761;OID=.,.;OPOS=3486702,3486702;OREF=G,G;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:21:21:0:0:19,2:19,2:0.904762,0.0952381:12,0:7,2:0:0:12,0:7,2:0:0
chr17	3492269	.	A	C	40.28	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0339683;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.862;QD=14.6476;RBI=0.0350257;REFB=-0.0644485;REVB=-0.00854102;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229845;STB=0.635942;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0388252;OID=.;OPOS=3492269;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:5:6:6:0.545455:3:3:1:4:3:3:1:4
chr17	3514028	.	G	C	635.9	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0705273;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4796;QD=62.0386;RBI=0.0706638;REFB=0;REVB=0.00438906;RO=0;SAF=16;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000601755;OID=.;OPOS=3514028;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:41:0:0:41:41:1:25:16:0:0:25:16:0:0
chr17	3553526	.	A	G	683.6	PASS	AF=0.957447;AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0103997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5246;QD=58.1791;RBI=0.0259856;REFB=0.0232918;REVB=0.0238138;RO=2;SAF=28;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103566;STB=0.505514;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=-0.0028951;OID=.;OPOS=3553526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:47:47:2:2:45:45:0.957447:17:28:1:1:17:28:1:1
chr17	3559823	.	G	A	313.01	PASS	AF=0.492537;AO=33;DP=66;FAO=33;FDP=67;FR=.;FRO=34;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.0167713;FXX=0.0289813;HRUN=3;LEN=1;MLLD=94.2615;QD=18.6873;RBI=0.0197627;REFB=-0.0197107;REVB=-0.010454;RO=33;SAF=24;SAR=9;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156693;STB=0.582226;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.0190172;OID=.;OPOS=3559823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:33:34:33:33:0.492537:9:24:19:14:9:24:20:14
chr17	3561396	.	C	T	1529.67	PASS	AF=0.972222;AO=105;DP=108;FAO=105;FDP=108;FR=.;FRO=3;FSAF=62;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.000427293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=228.407;QD=56.6545;RBI=0.013224;REFB=-0.133591;REVB=0.0132171;RO=3;SAF=62;SAR=43;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0224069;STB=0.511809;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.000618227;OID=.;OPOS=3561396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:108:108:3:3:105:105:0.972222:43:62:3:0:43:62:3:0
chr17	3564068	.	G	A	167.41	PASS	AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-0.0113695;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.082;QD=23.0911;RBI=0.0384622;REFB=5.17289e-06;REVB=0.0367434;RO=11;SAF=3;SAR=14;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390302;STB=0.740069;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.000728851;OID=.;OPOS=3564068;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:11:12:17:17:0.586207:14:3:7:4:14:3:8:4
chr17	3564073	.	A	G	210.49	PASS	AF=0.625;AO=20;DP=32;FAO=20;FDP=32;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0168898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.057;QD=26.3117;RBI=0.0220358;REFB=0.00188286;REVB=0.0141531;RO=12;SAF=4;SAR=16;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.366553;STB=0.705655;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.00299754;OID=.;OPOS=3564073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:12:12:20:20:0.625:16:4:8:4:16:4:8:4
chr17	3564084	.	T	C	176.25	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0375425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.403;QD=20.7349;RBI=0.0375509;REFB=-0.0065525;REVB=0.000793736;RO=16;SAF=4;SAR=14;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.453092;STB=0.756463;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.00734475;OID=.;OPOS=3564084;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:14:4:12:4:14:4:12:4
chr17	3564378	.	C	T	117.15	PASS	AF=0.358974;AO=14;DP=39;FAO=14;FDP=39;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0295347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.764;QD=12.015;RBI=0.0313044;REFB=-0.0225874;REVB=-0.0103764;RO=25;SAF=2;SAR=12;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.538456;STB=0.822082;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.046117;OID=.;OPOS=3564378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:25:25:14:14:0.358974:12:2:15:10:12:2:15:10
chr17	3564400	.	TT	AG,TG	681.47	PASS	AF=0.6,0.4;AO=27,18;DP=46;FAO=27,18;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=11,4;FSAR=16,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0457915,-0.0254197;FXX=0.0217344;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=73.5296,80.4984;QD=60.5751;RBI=0.0567386,0.0361853;REFB=0,0;REVB=0.0335023,0.025753;RO=0;SAF=11,4;SAR=16,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.5146e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.00338975,0.0288996;OID=.,.;OPOS=3564400,3564401;OREF=TT,T;OALT=AG,G;OMAPALT=AG,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:46:45:0:0:27,18:27,18:0.6,0.4:16,14:11,4:0:0:16,14:11,4:0:0
chr17	3568012	.	A	G	303.32	PASS	AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=-0.00076683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.294;QD=25.8142;RBI=0.00125921;REFB=-0.021453;REVB=-0.000998787;RO=20;SAF=11;SAR=16;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046122;STB=0.525517;STBP=0.719;TYPE=snp;VARB=0.0160993;OID=.;OPOS=3568012;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:20:20:27:27:0.574468:16:11:7:13:16:11:7:13
chr17	3577146	.	C	T	295.77	PASS	AF=0.566038;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0317227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.067;QD=22.3222;RBI=0.0339041;REFB=-0.031534;REVB=-0.0119649;RO=22;SAF=18;SAR=12;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14718;STB=0.590848;STBP=0.148;TYPE=snp;VARB=0.0262531;OID=.;OPOS=3577146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:22:23:30:30:0.566038:12:18:9:13:12:18:9:14
chr17	3594276	.	TG	T,TT	167.41	PASS	AF=0.488889,0.0444444;AO=20,2;DP=45;FAO=22,2;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=7,1;FSAR=15,1;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.141831,0.0768402;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=16.7608,24.2364;QD=14.8812;RBI=0.14738,0.0784868;REFB=-0.0171918,-0.0322176;REVB=-0.0400588,-0.0159926;RO=21;SAF=6,1;SAR=14,1;SRF=7;SRR=14;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0352518,0.167057;STB=0.518502,0.694004;STBP=0.849,0.714;TYPE=del,snp;VARB=0.0319095,-0.0691182;OID=.,.;OPOS=3594277,3594277;OREF=G,G;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.488889,0.0444444:20,2:45:22,2:45:21:7,1:15,1:6:15:99:21:6,1:14,1:7:14
chr17	3628076	.	G	A	153.61	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=-0.0035157;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=318.429;QD=21.9446;RBI=0.0204077;REFB=-0.030715;REVB=0.0201026;RO=12;SAF=7;SAR=9;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14855;STB=0.583234;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0230034;OID=.;OPOS=3628076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:9:7:3:9:9:7:3:9
chr17	3649214	.	G	A	113.79	PASS	AF=0.304348;AO=14;DP=46;FAO=14;FDP=46;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0265199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.911;QD=9.8946;RBI=0.0288046;REFB=-0.00477665;REVB=0.0112427;RO=31;SAF=9;SAR=5;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220238;STB=0.622464;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0126724;OID=.;OPOS=3649214;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:31:32:14:14:0.304348:5:9:14:17:5:9:15:17
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chr17	3772784	.	C	T	248.61	PASS	AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.00499119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.2575;QD=25.4983;RBI=0.033639;REFB=-0.0270907;REVB=-0.0332667;RO=15;SAF=16;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128295;STB=0.561348;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0135112;OID=.;OPOS=3772784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:15:16:23:23:0.589744:7:16:8:7:7:16:9:7
chr17	3772870	.	GA	G,GG	192.02	PASS	AF=0.5,0.5;AO=5,9;DP=18;FAO=9,9;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0;FSAR=9,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=16.7934,23.0982;QD=42.6704;RBI=0.321269,0.236367;REFB=0,0;REVB=0.321269,0.236367;RO=2;SAF=0,0;SAR=5,9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0437156,0.00365242;OID=.,.;OPOS=3772871,3772871;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.5,0.5:5,9:18:9,9:18:0:0,0:9,9:0:0:35:2:0,0:5,9:0:2
chr17	3785562	.	GC	G	402.55	PASS	AF=1;AO=34;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.050816;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.0798;QD=37.4466;RBI=0.287739;REFB=0;REVB=0.283216;RO=7;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=7;SSEN=0.411765;SSEP=0;SSSB=0.138622;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0100388;OID=.;OPOS=3785563;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:34:42:43:43:0:15:28:0:0:8:7:14:20:0:7
chr17	3787726	.	G	A	203.97	PASS	AF=0.540541;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=37;FR=.;FRO=17;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=10;FWDB=0.0126377;FXX=0.0263089;HRUN=5;LEN=1;MLLD=168.116;QD=22.051;RBI=0.0168628;REFB=-0.0326166;REVB=-0.0111644;RO=13;SAF=16;SAR=4;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.295809;STB=0.708631;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0172489;OID=.;OPOS=3787726;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:37:13:17:20:20:0.540541:4:16:6:7:4:16:7:10
chr17	3818788	.	G	A	766.43	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0407999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.814;QD=63.8693;RBI=0.0424723;REFB=0;REVB=0.011801;RO=0;SAF=23;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.12809e-05;OID=.;OPOS=3818788;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:25:23:0:0:25:23:0:0
chr17	3818830	.	A	G	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00338171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.6551;QD=64.4147;RBI=0.00553524;REFB=0;REVB=0.00438211;RO=0;SAF=28;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.28692e-06;OID=.;OPOS=3818830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:22:28:0:0:22:28:0:0
chr17	3819002	.	T	C	655.41	PASS	AF=1;AO=41;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152406;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.385;QD=60.9679;RBI=0.0495163;REFB=0;REVB=0.0471126;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018892;OID=.;OPOS=3819002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:41:43:1:17:24:0:0:19:24:0:0
chr17	3828702	.	T	C	220.87	PASS	AF=0.488889;AO=20;DP=44;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.00840056;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.1;QD=19.6328;RBI=0.0183734;REFB=-0.0267984;REVB=-0.0163406;RO=24;SAF=14;SAR=6;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280439;STB=0.631456;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0241127;OID=.;OPOS=3828702;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:24:23:20:22:0.488889:6:14:10:14:7:15:10:13
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chr17	4337412	.	C	G	265.99	PASS	AF=0.392405;AO=29;DP=77;FAO=31;FDP=79;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.0229989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.233;QD=13.468;RBI=0.0405803;REFB=-0.0255697;REVB=0.0334337;RO=46;SAF=11;SAR=18;SRF=27;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221765;STB=0.627497;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0299404;OID=.;OPOS=4337412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:79:46:48:29:31:0.392405:18:11:27:19:20:11:27:21
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chr17	4446457	.	G	A	285.1	PASS	AF=0.541667;AO=26;DP=48;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0202814;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=297.077;QD=23.7582;RBI=0.0300885;REFB=-0.0210225;REVB=0.0222256;RO=22;SAF=12;SAR=14;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0690176;STB=0.538432;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.0174261;OID=.;OPOS=4446457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:22:22:26:26:0.541667:14:12:12:10:14:12:12:10
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chr17	4453508	.	C	T	502.48	PASS	AF=0.580247;AO=47;DP=81;FAO=47;FDP=81;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=13;FWDB=-0.0312693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4369;QD=24.8137;RBI=0.032294;REFB=-0.0155281;REVB=-0.00807039;RO=34;SAF=25;SAR=22;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0663278;STB=0.536286;STBP=0.464;TYPE=snp;VARB=0.0150778;OID=.;OPOS=4453508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:34:34:47:47:0.580247:22:25:21:13:22:25:21:13
chr17	4455500	.	T	C	834.38	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0434316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.577;QD=57.5436;RBI=0.0450452;REFB=0;REVB=-0.0119484;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000139035;OID=.;OPOS=4455500;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:31:27:0:0:31:27:0:0
chr17	4458598	.	G	C	277.34	PASS	AF=0.492063;AO=30;DP=62;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=-0.0119603;FXX=0.0156226;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.512;QD=17.6091;RBI=0.0169096;REFB=-0.0376749;REVB=-0.0119535;RO=30;SAF=18;SAR=12;SRF=11;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.207558;STB=0.635172;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0469019;OID=.;OPOS=4458598;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:30:32:30:31:0.492063:12:18:11:19:12:19:11:21
chr17	4461748	.	G	A	410.45	PASS	AF=0.942857;AO=26;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.050149;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=174.314;QD=46.9084;RBI=0.099507;REFB=-0.107623;REVB=0.085946;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.519618;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0041885;OID=.;OPOS=4461748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:35:35:0:2:26:33:0.942857:8:18:0:0:8:25:1:1
chr17	4463023	.	G	A	1992.14	PASS	AF=0.918367;AO=135;DP=147;FAO=135;FDP=147;FR=.;FRO=12;FSAF=65;FSAR=70;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0376572;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=178.82;QD=54.208;RBI=0.0399509;REFB=-0.0120858;REVB=0.0133419;RO=8;SAF=65;SAR=70;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0417564;STB=0.508319;STBP=0.496;TYPE=snp;VARB=0.000130877;OID=.;OPOS=4463023;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:147:147:8:12:135:135:0.918367:70:65:7:1:70:65:7:5
chr17	4495740	.	G	A	720.01	PASS	AF=1;AO=42;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0273658;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=150.269;QD=61.2775;RBI=0.231043;REFB=0;REVB=0.229417;RO=5;SAF=20;SAR=22;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0954768;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000734924;OID=.;OPOS=4495740;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:5:0:42:47:1:22:20:0:5:27:20:0:0
chr17	4497160	.	T	C	587.01	PASS	AF=0.952381;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0300014;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.775;QD=55.9055;RBI=0.039052;REFB=-0.0384996;REVB=0.0249996;RO=2;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390336;STB=0.51999;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.00468438;OID=.;OPOS=4497160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:42:2:2:39:40:0.952381:23:16:0:2:24:16:0:2
chr17	4545581	.	C	T	481.55	PASS	AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.176014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.467;QD=53.5058;RBI=0.176774;REFB=-0.10679;REVB=0.0163724;RO=2;SAF=15;SAR=19;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0583286;STB=0.531232;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00149132;OID=.;OPOS=4545581;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:36:2:2:34:34:0.944444:19:15:2:0:19:15:2:0
chr17	4575283	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00950224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.195;QD=48.7373;RBI=0.0211737;REFB=0;REVB=-0.0189218;RO=0;SAF=16;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.10632e-05;OID=.;OPOS=4575283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:1:16:0:0:1:16:0:0
chr17	4620497	.	C	T	499.4	PASS	AF=0.945946;AO=35;DP=37;FAO=35;FDP=37;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0219881;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.7101;QD=53.9893;RBI=0.0484904;REFB=-0.0256486;REVB=-0.0432185;RO=2;SAF=24;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215572;STB=0.511539;STBP=0.567;TYPE=snp;VARB=0.00684187;OID=.;OPOS=4620497;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:37:37:2:2:35:35:0.945946:11:24:1:1:11:24:1:1
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chr17	4649378	.	T	C	242.02	PASS	AF=0.628571;AO=22;DP=35;FAO=22;FDP=35;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0437992;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5151;QD=27.6599;RBI=0.052131;REFB=-0.0367363;REVB=0.0282714;RO=13;SAF=12;SAR=10;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00472495;STB=0.502615;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0145875;OID=.;OPOS=4649378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:13:13:22:22:0.628571:10:12:7:6:10:12:7:6
chr17	4686414	.	A	C	428.77	PASS	AF=0.444444;AO=39;DP=95;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.038944;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.283;QD=17.3242;RBI=0.0407284;REFB=-0.0257875;REVB=-0.0119232;RO=54;SAF=21;SAR=18;SRF=23;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115352;STB=0.56319;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0357949;OID=.;OPOS=4686414;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:99:54:55:39:44:0.444444:18:21:23:31:19:25:25:30
chr17	4689313	.	G	C	72.04	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0608569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.899;QD=8.47556;RBI=0.0630216;REFB=-0.0125712;REVB=0.0163757;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956655;STB=0.558707;STBP=0.697;TYPE=snp;VARB=0.0467599;OID=.;OPOS=4689313;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:5:5:10:14:5:5:10:14
chr17	4689572	.	T	C	520.0	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.974;QD=59.4282;RBI=0.0305378;REFB=0;REVB=-0.0155468;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000288615;OID=.;OPOS=4689572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
chr17	4692559	.	G	T	448.85	PASS	AF=0.944444;AO=24;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0327511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.251;QD=49.8723;RBI=0.0400914;REFB=-0.192405;REVB=0.0231233;RO=2;SAF=9;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0188647;STB=0.501638;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00242947;OID=.;OPOS=4692559;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:36:36:2:2:24:34:0.944444:15:9:1:1:18:16:1:1
chr17	4693170	.	T	C	423.83	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.505;QD=56.5106;RBI=0.0305501;REFB=0;REVB=0.0216787;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00046857;OID=.;OPOS=4693170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:20:9:0:0:20:10:0:0
chr17	4701402	.	C	T	239.65	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00667898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=216.797;QD=18.0872;RBI=0.0145229;REFB=-0.0161937;REVB=0.012896;RO=27;SAF=8;SAR=18;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170545;STB=0.596138;STBP=0.208;TYPE=snp;VARB=0.0187157;OID=.;OPOS=4701402;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:18:8:13:14:18:8:13:14
chr17	4712395	.	A	T	86.4	PASS	AF=0.458333;AO=7;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0305147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.743;QD=14.4004;RBI=0.0308961;REFB=-0.0121764;REVB=0.0048399;RO=12;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102163;STB=0.626645;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0170428;OID=.;OPOS=4712395;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:24:24:12:13:7:11:0.458333:4:3:4:8:5:6:4:9
chr17	4712617	.	C	T	179.71	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=45;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0290544;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.886;QD=15.6273;RBI=0.0298674;REFB=-0.00244696;REVB=0.0069213;RO=25;SAF=5;SAR=14;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38058;STB=0.701451;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.00195112;OID=.;OPOS=4712617;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:25:27:19:19:0.413043:14:5:16:9:14:5:16:11
chr17	4718776	.	G	A	254.57	PASS	AF=0.510638;AO=23;DP=46;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0261995;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.5845;QD=21.6657;RBI=0.0303853;REFB=-0.0338154;REVB=0.01539;RO=23;SAF=12;SAR=11;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.038794;STB=0.531888;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0322138;OID=.;OPOS=4718776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:23:23:23:24:0.510638:11:12:13:10:12:12:13:10
chr17	4722127	.	TGGGGGC	TGGGGC,TGGGGG,TGGGGGT	60.12	PASS	AF=0.333333,0.166667,0.333333;AO=2,2,3;DP=12;FAO=4,2,4;FDP=12;FR=.;FRO=2;FSAF=2,0,0;FSAR=2,2,4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.216958,0.0325068,0.0298238;FXX=0;HRUN=5,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=10.55,85.0639,104.565;QD=20.0405;RBI=0.317834,0.0327699,0.029973;REFB=-0.148616,0.000111987,0.000389249;REVB=0.232267,-0.00414412,-0.00298674;RO=4;SAF=1,0,0;SAR=1,2,3;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0,0;SSEP=0.341772,0,0;SSSB=0.237547,-0.569412,-0.642277;STB=0.66592,0.5,0.5;STBP=0.397,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.16389,0.056718,-0.0119998;OID=.,.,.;OPOS=4722128,4722133,4722133;OREF=G,C,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=TGGGGC,TGGGGG,TGGGGGT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.333333,0.166667,0.333333:2,2,3:12:4,2,4:12:2:2,0,0:2,2,4:0:2:22:4:1,0,0:1,2,3:1:3
chr17	4794848	.	T	TC	136.98	PASS	AF=0.444444;AO=37;DP=81;FAO=36;FDP=81;FR=.;FRO=45;FSAF=2;FSAR=34;FSRF=8;FSRR=37;FWDB=-0.0208952;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=10.7691;QD=6.76432;RBI=0.0422597;REFB=-0.142633;REVB=-0.0367324;RO=43;SAF=2;SAR=35;SRF=8;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369862;STB=0.705245;STBP=0.049;TYPE=ins;VARB=0.113069;OID=.;OPOS=4794849;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.444444:37:81:36:81:45:2:34:8:37:99:43:2:35:8:35
chr17	4796271	.	C	T	164.09	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.00455389;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.877;QD=12.8701;RBI=0.023157;REFB=-0.03022;REVB=0.0227048;RO=32;SAF=11;SAR=8;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018117;STB=0.510537;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.0596488;OID=.;OPOS=4796271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:8:11:18:14:8:11:18:14
chr17	4796274	.	T	C	740.41	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.995;QD=56.9543;RBI=0.0421918;REFB=0;REVB=-0.0385512;RO=0;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.54643e-05;OID=.;OPOS=4796274;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:22:30:0:0:22:30:0:0
chr17	4796286	.	C	T	731.86	PASS	AF=0.916667;AO=54;DP=60;FAO=55;FDP=60;FR=.;FRO=5;FSAF=31;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.034765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.671;QD=48.7908;RBI=0.039032;REFB=-0.117102;REVB=0.017745;RO=4;SAF=31;SAR=23;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00980514;STB=0.503082;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.00144815;OID=.;OPOS=4796286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:60:60:4:5:54:55:0.916667:23:31:2:2:24:31:3:2
chr17	4797305	.	G	A	173.02	PASS	AF=0.360656;AO=22;DP=61;FAO=22;FDP=61;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.0418678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6122;QD=11.3453;RBI=0.0596448;REFB=-0.00627763;REVB=-0.0424805;RO=39;SAF=11;SAR=11;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.070575;STB=0.540947;STBP=0.648;TYPE=snp;VARB=0.0142657;OID=.;OPOS=4797305;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:39:39:22:22:0.360656:11:11:22:17:11:11:22:17
chr17	4801163	.	C	A	36.61	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=14;FWDB=0;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=201.488;QD=7.32164;RBI=0.00307404;REFB=-0.00700942;REVB=-0.00307404;RO=13;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0165004;OID=.;OPOS=4801163;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:13:14:6:6:0.3:6:0:0:13:6:0:0:14
chr17	4801285	.	C	T	56.83	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=0;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=11;FWDB=0;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=121.19;QD=11.9636;RBI=0.026389;REFB=-0.00699956;REVB=-0.026389;RO=10;SAF=0;SAR=8;SRF=0;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000826093;OID=.;OPOS=4801285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:10:11:8:8:0.421053:8:0:0:10:8:0:0:11
chr17	4801286	.	C	T	79.49	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=10;FWDB=-0.170868;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=162.284;QD=15.8976;RBI=0.170901;REFB=-0.0558928;REVB=-0.00335919;RO=9;SAF=1;SAR=9;SRF=0;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299338;STB=0.678324;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.00488109;OID=.;OPOS=4801286;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:20:20:9:10:10:10:0.5:9:1:0:9:9:1:0:10
chr17	4801287	.	CA	C,CC	247.83	PASS	AF=0.45,0.55;AO=7,11;DP=20;FAO=9,11;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=1,1;FSAR=8,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00558003,0.00642188;FXX=0.0475964;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=238.649,240.149;QD=49.5652;RBI=0.0276538,0.0295333;REFB=0,0;REVB=0.0270849,0.0288266;RO=0;SAF=0,1;SAR=7,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0104357,0.00266789;OID=.,.;OPOS=4801288,4801288;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.45,0.55:7,11:20:9,11:20:0:1,1:8,10:0:0:47:0:0,1:7,10:0:0
chr17	4802329	.	G	A	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0355666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.2189;QD=19.1083;RBI=0.0360211;REFB=-0.0108954;REVB=0.00570401;RO=6;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787225;STB=0.545355;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.0118826;OID=.;OPOS=4802329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:4:5:4:2:4:5:4:2
chr17	4862630	.	T	A,TCA	205.98	PASS	AF=0.333333,0.458333;AO=8,11;DP=31;FAO=8,11;FDP=24;FR=.;FRO=5;FSAF=1,9;FSAR=7,2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0446818,-0.029569;FXX=0.039984;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=46.0703,71.6251;QD=34.3299;RBI=0.104748,0.0332396;REFB=-0.059282,-0.0709669;REVB=0.0947403,0.0151837;RO=11;SAF=1,9;SAR=7,2;SRF=5;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.424693,0.373023;STB=0.856199,0.608529;STBP=0.006,0.463;TYPE=snp,ins;VARB=0.0458253,0.111575;OID=.,.;OPOS=4862630,4862631;OREF=T,-;OALT=A,CA;OMAPALT=A,TCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:64:31:24:11:5:8,11:8,11:0.333333,0.458333:7,2:1,9:5:6:7,2:1,9:5:0
chr17	4926882	.	A	G	1826.96	PASS	AF=1;AO=118;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233677;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.722;QD=60.8986;RBI=0.0313437;REFB=0;REVB=0.0208896;RO=0;SAF=56;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000446089;OID=.;OPOS=4926882;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:120:0:0:118:120:1:62:56:0:0:62:58:0:0
chr17	4936898	.	C	T	65.78	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0208272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.607;QD=11.4399;RBI=0.0423522;REFB=-0.0423411;REVB=-0.0368773;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0910242;STB=0.554337;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0562581;OID=.;OPOS=4936898;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:4:5:9:5:4:5:9:5
chr17	4937575	.	T	C	33.47	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00288265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.36;QD=19.1285;RBI=0.0316066;REFB=0.0897543;REVB=-0.0314749;RO=2;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281149;STB=0.666029;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.0130706;OID=.;OPOS=4937575;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:2:3:0:2:2:3:0:2
chr17	4996915	.	AC	A	239.14	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.811;QD=50.3446;RBI=0.0416031;REFB=0;REVB=0.0104918;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000301436;OID=.;OPOS=4996916;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:18:18:19:19:0:12:7:0:0:4:0:11:7:0:0
chr17	4997039	.	G	C	233.87	PASS	AF=0.724138;AO=21;DP=29;FAO=21;FDP=29;FR=.;FRO=8;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0349426;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1587;QD=32.2576;RBI=0.0357515;REFB=0.0341807;REVB=0.00756196;RO=8;SAF=17;SAR=4;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212867;STB=0.618057;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.013241;OID=.;OPOS=4997039;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:29:29:8:8:21:21:0.724138:4:17:4:4:4:17:4:4
chr17	4997433	.	G	A	113.85	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.0109445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.9205;QD=18.2166;RBI=0.0109599;REFB=-0.0787908;REVB=-0.000579593;RO=12;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234295;STB=0.633942;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.0723859;OID=.;OPOS=4997433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:12:12:13:13:0.52:5:8:4:8:5:8:4:8
chr17	4997787	.	A	G	817.72	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189463;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.111;QD=57.3836;RBI=0.0191679;REFB=0;REVB=-0.00290678;RO=0;SAF=36;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.95376e-05;OID=.;OPOS=4997787;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:56:57:0:0:56:57:1:20:36:0:0:21:36:0:0
chr17	4998030	.	G	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9809;QD=45.8066;RBI=0.0177081;REFB=0;REVB=-0.0104903;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000594783;OID=.;OPOS=4998030;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr17	4998586	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.054088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.98;QD=45.8068;RBI=0.0558444;REFB=0;REVB=0.0138957;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000369774;OID=.;OPOS=4998586;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr17	4998852	.	G	C	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00456513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.362;QD=53.9106;RBI=0.00959786;REFB=0;REVB=-0.00844267;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.06392e-05;OID=.;OPOS=4998852;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chr17	5036274	.	C	A	50.76	PASS	AF=0.152542;AO=9;DP=59;FAO=9;FDP=59;FR=.;FRO=50;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.0202562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.265;QD=3.44159;RBI=0.0253785;REFB=-0.00326492;REVB=-0.0152891;RO=50;SAF=5;SAR=4;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436562;STB=0.530236;STBP=0.811;TYPE=snp;VARB=0.0177953;OID=.;OPOS=5036274;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:59:59:50:50:9:9:0.152542:4:5:26:24:4:5:26:24
chr17	5036281	.	G	C	52.95	PASS	AF=0.163636;AO=9;DP=55;FAO=9;FDP=55;FR=.;FRO=46;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.0376733;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.996;QD=3.85067;RBI=0.0395656;REFB=-0.00785339;REVB=-0.0120897;RO=46;SAF=5;SAR=4;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149254;STB=0.510181;STBP=0.959;TYPE=snp;VARB=0.0647697;OID=.;OPOS=5036281;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:55:55:46:46:9:9:0.163636:4:5:25:21:4:5:25:21
chr17	5037281	.	T	C,G	617.17	PASS	AF=0.97561,0.0243902;AO=39,2;DP=41;FAO=40,1;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14,0;FSAR=26,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00673989,-0.0133012;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=87.1232,43.7893;QD=60.2121;RBI=0.0924248,0.0138192;REFB=0,0;REVB=0.0921788,-0.00374799;RO=0;SAF=14,0;SAR=25,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000519418,0.0985998;OID=.,.;OPOS=5037281,5037281;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:41:41:0:0:39,2:40,1:0.97561,0.0243902:25,2:14,0:0:0:26,1:14,0:0:0
chr17	5042705	.	T	C	31.85	PASS	AF=0.173913;AO=7;DP=47;FAO=8;FDP=46;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.0371701;FXX=0.0212721;HRUN=5;LEN=1;MLLD=23.1884;QD=2.76943;RBI=0.209059;REFB=-0.0538475;REVB=-0.205728;RO=26;SAF=4;SAR=3;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205924;STB=0.505799;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.193264;OID=.;OPOS=5042705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:47:46:26:38:7:8:0.173913:3:4:19:7:3:5:24:14
chr17	5042894	.	T	C	1620.8	PASS	AF=1;AO=105;DP=105;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00783737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.056;QD=60.0295;RBI=0.0129459;REFB=0;REVB=0.010304;RO=0;SAF=44;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.76711e-05;OID=.;OPOS=5042894;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:108:0:0:105:108:1:61:44:0:0:61:47:0:0
chr17	5044794	.	G	A	472.03	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0199856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.822;QD=55.5331;RBI=0.0230161;REFB=-0.0980119;REVB=0.0114156;RO=1;SAF=12;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373388;STB=0.519988;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.000373238;OID=.;OPOS=5044794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:21:12:1:0:21:12:1:0
chr17	5074195	.	T	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.769;QD=56.7065;RBI=0.0366424;REFB=0;REVB=-0.00231404;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.7551e-05;OID=.;OPOS=5074195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chr17	5084763	.	G	A	536.38	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00818794;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2697;QD=59.5981;RBI=0.00882805;REFB=0;REVB=-0.00330032;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00132682;OID=.;OPOS=5084763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:24:11:0:0:25:11:0:0
chr17	5126674	.	A	C,G	582.9	PASS	AF=0.0512821,0.948718;AO=2,37;DP=39;FAO=2,37;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=2,20;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00254548,0.0022494;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=203.923,240.546;QD=59.7844;RBI=0.0164951,0.0121665;REFB=0,0;REVB=0.0162975,0.0119568;RO=0;SAF=2,20;SAR=0,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.71161e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0558785,-0.00256372;OID=.,.;OPOS=5126674,5126674;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:39:39:0:0:2,37:2,37:0.0512821,0.948718:0,17:2,20:0:0:0,17:2,20:0:0
chr17	5280440	.	T	C	804.71	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0654;QD=64.3768;RBI=0.0378116;REFB=0;REVB=0.0232463;RO=0;SAF=44;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84987e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000502084;OID=.;OPOS=5280440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:6:44:0:0:6:44:0:0
chr17	5284698	.	A	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.194;QD=58.1421;RBI=0.0335994;REFB=0;REVB=0.0300991;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103518;OID=.;OPOS=5284698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0
chr17	5284719	.	T	C	495.8	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00388966;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.1;QD=58.329;RBI=0.0248511;REFB=0;REVB=0.0245448;RO=0;SAF=24;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138674;OID=.;OPOS=5284719;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:9:24:0:0:10:24:0:0
chr17	5284770	.	G	A	582.46	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0220028;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.501;QD=58.2459;RBI=0.0220041;REFB=-0.112862;REVB=0.000238533;RO=1;SAF=25;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0183853;STB=0.509799;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.000299978;OID=.;OPOS=5284770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:14:25:1:0:14:25:1:0
chr17	5287297	.	AGGGT	AGGT,AGGTA	712.21	PASS	AF=1,0;AO=46,2;DP=49;FAO=50,0;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28,0;FSAR=22,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.129393,-0.0622926;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,2;MLLD=22.2625,4.2283;QD=56.9768;RBI=0.15834,0.103543;REFB=0,0;REVB=-0.0912629,-0.0827091;RO=0;SAF=27,0;SAR=19,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.537815,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.00513538,0;OID=.,.;OPOS=5287298,5287300;OREF=G,GT;OALT=-,TA;OMAPALT=AGGT,AGGTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:46,2:49:50,0:50:0:28,0:22,0:0:0:4:0:27,0:19,2:0:0
chr17	5288760	.	A	G	397.14	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0904216;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.939;QD=56.7349;RBI=0.090435;REFB=0;REVB=-0.00155654;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431765;OID=.;OPOS=5288760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:14:13:0:0:14:14:0:0
chr17	5288769	.	CA	C	319.73	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3638;QD=51.1574;RBI=0.107874;REFB=0;REVB=0.106289;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00154428;OID=.;OPOS=5288770;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:24:25:25:25:0:11:14:0:0:4:0:11:13:0:0
chr17	5288794	.	G	C	450.64	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00860206;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.7435;QD=58.1473;RBI=0.0679555;REFB=0;REVB=-0.0674089;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115334;OID=.;OPOS=5288794;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chr17	5289580	.	A	G	632.08	PASS	AF=1;AO=40;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.743;QD=61.6666;RBI=0.0449032;REFB=0;REVB=0.000273552;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000150747;OID=.;OPOS=5289580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:40:41:1:19:21:0:0:20:21:0:0
chr17	5290033	.	T	C	785.81	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0718786;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.3561;QD=64.1479;RBI=0.0776858;REFB=0;REVB=0.0294712;RO=1;SAF=36;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0375874;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000506998;OID=.;OPOS=5290033;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:1:0:48:49:1:12:36:0:1:13:36:0:0
chr17	5290703	.	G	A	1153.6	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.778;QD=60.7159;RBI=0.0204271;REFB=0;REVB=0.0131674;RO=0;SAF=34;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.6391e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.06136e-05;OID=.;OPOS=5290703;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:42:34:0:0:42:34:0:0
chr17	5294976	.	T	A	767.25	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179226;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.353;QD=56.833;RBI=0.0246076;REFB=0;REVB=-0.0168617;RO=0;SAF=22;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000845387;OID=.;OPOS=5294976;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:31:22:0:0:32:22:0:0
chr17	5308377	.	C	T	1054.14	PASS	AF=0.972973;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0145743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=291.516;QD=56.9803;RBI=0.0293893;REFB=-0.111641;REVB=0.025521;RO=2;SAF=43;SAR=29;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00515698;STB=0.502727;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0011513;OID=.;OPOS=5308377;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:74:74:2:2:72:72:0.972973:29:43:1:1:29:43:1:1
chr17	5326089	.	C	T	632.23	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00760898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.327;QD=61.681;RBI=0.0438817;REFB=0;REVB=0.043217;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131464;OID=.;OPOS=5326089;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0
chr17	5326145	.	C	G	523.92	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0651561;FXX=0.0277701;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.414;QD=59.8768;RBI=0.0665992;REFB=0;REVB=0.0137892;RO=0;SAF=17;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.65518e-05;OID=.;OPOS=5326145;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:18:17:0:0:18:17:0:0
chr17	5326162	.	G	A	465.07	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.030902;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.0985;QD=58.1341;RBI=0.0344835;REFB=0;REVB=0.0153028;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130063;OID=.;OPOS=5326162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:17:15:0:0:17:15:0:0
chr17	5328633	.	G	A	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0239474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.191;QD=49.5989;RBI=0.0361441;REFB=0;REVB=0.0270725;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000284673;OID=.;OPOS=5328633;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:4:14:0:0:4:14:0:0
chr17	5334850	.	G	A	483.23	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.8177;QD=58.5737;RBI=0.0450706;REFB=0;REVB=0.0306634;RO=0;SAF=13;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000568295;OID=.;OPOS=5334850;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:20:13:0:0:20:13:0:0
chr17	5334873	.	GA	G,GG	692.39	PASS	AF=0.9375,0.0625;AO=41,3;DP=48;FAO=45,3;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21,2;FSAR=24,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0262188,-0.0127742;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=25.7562,7.34393;QD=57.6995;RBI=0.103952,0.0320931;REFB=0,0;REVB=-0.100591,-0.0294413;RO=0;SAF=21,2;SAR=20,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.02085e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000690296,-0.0329168;OID=.,.;OPOS=5334874,5334874;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.9375,0.0625:41,3:48:45,3:48:0:21,2:24,1:0:0:13:0:21,2:20,1:0:0
chr17	5347576	.	G	A	749.35	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271957;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.527;QD=63.774;RBI=0.0306898;REFB=0;REVB=0.0142217;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168473;OID=.;OPOS=5347576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr17	5487164	.	C	G	2152.59	PASS	AF=0.978873;AO=139;DP=142;FAO=139;FDP=142;FR=.;FRO=3;FSAF=81;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0523827;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3529;QD=60.6362;RBI=0.0760872;REFB=-0.096761;REVB=0.0551844;RO=1;SAF=81;SAR=58;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00583396;STB=0.505407;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=0.00176275;OID=.;OPOS=5487164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:142:142:1:3:139:139:0.978873:58:81:1:0:58:81:1:2
chr17	5991344	.	C	T	1102.12	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292413;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.885;QD=60.3902;RBI=0.0445758;REFB=0;REVB=0.0336445;RO=0;SAF=35;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010068;OID=.;OPOS=5991344;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:38:35:0:0:38:35:0:0
chr17	6014176	.	A	G	1098.6	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0455405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.346;QD=60.1973;RBI=0.0474661;REFB=0;REVB=-0.0133826;RO=0;SAF=43;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.16073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.71843e-05;OID=.;OPOS=6014176;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:29:43:0:0:29:44:0:0
chr17	6110583	.	C	A	167.42	PASS	AF=0.45;AO=15;DP=38;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=0.00785638;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.539;QD=16.7415;RBI=0.0157424;REFB=-0.00366637;REVB=0.0136418;RO=23;SAF=11;SAR=4;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133455;STB=0.605958;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.00380761;OID=.;OPOS=6110583;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:40:23:22:15:18:0.45:4:11:19:4:5:13:19:3
chr17	6329917	.	C	T	100.76	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.00328055;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.65;QD=15.5021;RBI=0.0106379;REFB=-0.0303639;REVB=-0.0101194;RO=11;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113581;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.037637;OID=.;OPOS=6329917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:11:14:12:12:0.461538:6:6:7:4:6:6:7:7
chr17	6330068	.	T	C	638.0	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190078;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.795;QD=62.2441;RBI=0.030994;REFB=0;REVB=0.0244813;RO=0;SAF=10;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.09277e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130912;OID=.;OPOS=6330068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:31:10:0:0:31:10:0:0
chr17	6331803	.	T	C	817.73	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00583305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0046;QD=57.3847;RBI=0.0220384;REFB=0;REVB=0.0212525;RO=0;SAF=22;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000217004;OID=.;OPOS=6331803;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:35:22:0:0:35:22:0:0
chr17	6337247	.	C	G	257.38	PASS	AF=0.519231;AO=27;DP=52;FAO=27;FDP=52;FR=.;FRO=25;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.000891153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.449;QD=19.7986;RBI=0.10294;REFB=0.00624225;REVB=0.102936;RO=25;SAF=22;SAR=5;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.209702;STB=0.618376;STBP=0.127;TYPE=snp;VARB=-0.00187184;OID=.;OPOS=6337247;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:25:25:27:27:0.519231:5:22:16:9:5:22:16:9
chr17	6353679	.	A	C	708.56	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=296.093;QD=62.9829;RBI=0.0436505;REFB=0;REVB=0.0350054;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.09163e-05;OID=.;OPOS=6353679;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:45:0:0:44:45:1:18:26:0:0:18:27:0:0
chr17	6364753	.	A	G	1994.89	PASS	AF=1;AO=100;DP=128;FAO=128;FDP=128;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506489;FXX=0.00775134;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.876;QD=62.3403;RBI=0.050856;REFB=0;REVB=0.0045844;RO=0;SAF=59;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.3262e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107553;OID=.;OPOS=6364753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:128:128:0:0:100:128:1:41:59:0:0:42:86:0:0
chr17	6373682	.	G	A	153.26	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00970704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0719;QD=11.5667;RBI=0.0306933;REFB=-0.0307685;REVB=-0.0291179;RO=34;SAF=10;SAR=9;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189649;STB=0.610125;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0389574;OID=.;OPOS=6373682;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:34:34:19:19:0.358491:9:10:12:22:9:10:12:22
chr17	6381939	.	G	A	545.2	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0125055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.554;QD=57.3897;RBI=0.0215857;REFB=0.0183032;REVB=0.0175942;RO=1;SAF=23;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.019929;STB=0.510633;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-0.000981298;OID=.;OPOS=6381939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:14:23:1:0:14:23:1:0
chr17	6406883	.	C	T	589.09	PASS	AF=0.469231;AO=61;DP=130;FAO=61;FDP=130;FR=.;FRO=69;FSAF=29;FSAR=32;FSRF=38;FSRR=31;FWDB=0.000382103;FXX=0.0151504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.832;QD=18.1259;RBI=0.0290406;REFB=-0.00471744;REVB=-0.0290381;RO=69;SAF=29;SAR=32;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0719203;STB=0.539901;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.00648716;OID=.;OPOS=6406883;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:69:69:61:61:0.469231:32:29:38:31:32:29:38:31
chr17	6483046	.	T	C	1472.56	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00843137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.515;QD=63.336;RBI=0.0270248;REFB=0;REVB=-0.0256759;RO=0;SAF=46;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.84749e-05;OID=.;OPOS=6483046;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:47:46:0:0:47:46:0:0
chr17	6493198	.	T	C	2848.94	PASS	AF=1;AO=178;DP=179;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=97;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220075;FXX=0.00543449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4456;QD=62.2719;RBI=0.0224382;REFB=0;REVB=-0.00437515;RO=0;SAF=94;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.35328e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000280565;OID=.;OPOS=6493198;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:179:183:0:0:178:183:1:84:94:0:0:86:97:0:0
chr17	6511781	.	A	G	1134.68	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.045;QD=60.5165;RBI=0.0223909;REFB=0;REVB=0.0188793;RO=0;SAF=29;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.79632e-05;OID=.;OPOS=6511781;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:44:29:0:0:46:29:0:0
chr17	6513329	.	G	A	581.46	PASS	AF=0.569892;AO=53;DP=93;FAO=53;FDP=93;FR=.;FRO=40;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.0175239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.806;QD=25.0089;RBI=0.019672;REFB=-0.0182859;REVB=-0.00893869;RO=39;SAF=36;SAR=17;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0334998;STB=0.51428;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0133947;OID=.;OPOS=6513329;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:39:40:53:53:0.569892:17:36:25:14:17:36:26:14
chr17	6515387	.	A	G	740.53	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0466017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=270.657;QD=56.9639;RBI=0.0498975;REFB=0;REVB=0.0178337;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.1814e-05;OID=.;OPOS=6515387;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:26:25:0:0:26:26:0:0
chr17	6515454	.	C	T	386.38	PASS	AF=1;AO=25;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0155439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.617;QD=55.1965;RBI=0.0372409;REFB=0;REVB=0.0338419;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102294;OID=.;OPOS=6515454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:25:28:1:10:15:0:0:13:15:0:0
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chr17	6546259	.	T	C	249.73	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.000693571;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=290.149;QD=18.4987;RBI=0.0211154;REFB=-0.00584957;REVB=0.021104;RO=26;SAF=10;SAR=17;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150845;STB=0.594335;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.00537186;OID=.;OPOS=6546259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:27:27:27:0.5:17:10:14:12:17:10:15:12
chr17	6556538	.	G	C	1539.91	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0402;QD=59.8023;RBI=0.0681344;REFB=0;REVB=0.0622854;RO=0;SAF=54;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95759e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000345771;OID=.;OPOS=6556538;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:49:54:0:0:49:54:0:0
chr17	6556541	.	A	T	1498.29	PASS	AF=0.990385;AO=102;DP=104;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0276138;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=295.769;QD=57.6265;RBI=0.0511463;REFB=-0.163266;REVB=0.0430514;RO=0;SAF=54;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03919e-08;STB=0.504586;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.000395014;OID=.;OPOS=6556541;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:104:104:0:1:102:103:0.990385:48:54:0:0:49:54:1:0
chr17	6558768	.	C	T	227.67	PASS	AF=0.95;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0175075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.5542;QD=45.5339;RBI=0.0280967;REFB=-0.0409479;REVB=-0.0219753;RO=1;SAF=9;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0483018;STB=0.523785;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.029828;OID=.;OPOS=6558768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:20:1:1:18:19:0.95:9:9:1:0:9:10:1:0
chr17	6663894	.	GC	AG	131.3	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.00492861;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=113.679;QD=14.1948;RBI=0.0256884;REFB=-0.0105385;REVB=0.0252111;RO=22;SAF=6;SAR=9;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32525;STB=0.687268;STBP=0.079;TYPE=mnp;VARB=0.0203855;OID=.;OPOS=6663894;OREF=GC;OALT=AG;OMAPALT=AG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:9:6:16:6:9:6:16:6
chr17	6902742	.	C	CA	278.63	PASS	AF=0.958333;AO=3;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0602733;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=225.07;QD=46.4382;RBI=0.062508;REFB=-0.0750319;REVB=0.0165647;RO=21;SAF=0;SAR=3;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.598305;STB=0.519983;STBP=0.51;TYPE=ins;VARB=0.00277191;OID=.;OPOS=6902743;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.958333:3:24:23:24:1:11:12:0:1:6:21:0:3:11:10
chr17	6902743	.	G	A	237.75	PASS	AF=0.875;AO=20;DP=24;FAO=21;FDP=24;FR=.;FRO=3;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.00415862;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.778;QD=39.6255;RBI=0.0261349;REFB=-0.23171;REVB=0.025802;RO=3;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13106;STB=0.565156;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.00552591;OID=.;OPOS=6902743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:24:24:3:3:20:21:0.875:9:11:0:3:10:11:0:3
chr17	6902760	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.069121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.764;QD=51.9166;RBI=0.0852058;REFB=0;REVB=0.0498229;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000623956;OID=.;OPOS=6902760;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr17	6905061	.	T	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0703123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.598;QD=56.1916;RBI=0.0729643;REFB=0;REVB=0.0194927;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000283331;OID=.;OPOS=6905061;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr17	6909838	.	A	G	534.8	PASS	AF=0.549451;AO=50;DP=91;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.0145874;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=247.731;QD=23.5077;RBI=0.014935;REFB=-0.0213106;REVB=-0.00320351;RO=40;SAF=30;SAR=20;SRF=21;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.062328;STB=0.540524;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.0161924;OID=.;OPOS=6909838;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:40:41:50:50:0.549451:20:30:21:19:20:30:21:20
chr17	6919093	.	T	C	123.98	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0140432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.998;QD=17.1002;RBI=0.018817;REFB=-0.0523865;REVB=0.0125247;RO=14;SAF=3;SAR=11;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163346;STB=0.62245;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.0409447;OID=.;OPOS=6919093;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:15:14:14:0.482759:11:3:5:9:11:3:6:9
chr17	6920257	.	C	T	380.8	PASS	AF=0.5;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=0.0143919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.728;QD=19.528;RBI=0.0144329;REFB=-0.0122547;REVB=0.00108708;RO=38;SAF=18;SAR=21;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104093;STB=0.563818;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.0106592;OID=.;OPOS=6920257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:38:39:39:39:0.5:21:18:22:16:21:18:23:16
chr17	6929924	.	T	C	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000683338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.148;QD=59.142;RBI=0.0313138;REFB=0;REVB=-0.0313064;RO=0;SAF=39;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.9e-05;OID=.;OPOS=6929924;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:28:39:0:0:28:39:0:0
chr17	6941625	.	C	T	113.09	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0229028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.595;QD=17.3987;RBI=0.0373023;REFB=-0.0142157;REVB=0.0294436;RO=13;SAF=2;SAR=10;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0950073;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0208167;OID=.;OPOS=6941625;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:12:13:0.5:10:2:3:10:10:3:3:10
chr17	6942108	.	C	T	310.08	PASS	AF=0.742857;AO=26;DP=35;FAO=26;FDP=35;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00500278;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=248.83;QD=35.4382;RBI=0.0410115;REFB=-0.0255719;REVB=0.0407052;RO=9;SAF=13;SAR=13;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785839;STB=0.542824;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0106697;OID=.;OPOS=6942108;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:35:35:9:9:26:26:0.742857:13:13:6:3:13:13:6:3
chr17	6943266	.	G	A	145.69	PASS	AF=0.333333;AO=17;DP=57;FAO=19;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=22;FSRR=16;FWDB=-0.172935;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=73.4423;QD=10.2241;RBI=0.172938;REFB=-0.0166932;REVB=-0.000936409;RO=29;SAF=13;SAR=4;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.33145;STB=0.669446;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0272383;OID=.;OPOS=6943266;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:38:17:19:0.333333:4:13:14:15:4:15:22:16
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chr17	6945087	.	G	T	87.32	PASS	AF=0.26087;AO=12;DP=46;FAO=12;FDP=46;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=6;FWDB=-0.000155618;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=167.137;QD=7.59288;RBI=0.03607;REFB=-0.00572445;REVB=0.0360697;RO=32;SAF=7;SAR=5;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353138;STB=0.694186;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0434895;OID=.;OPOS=6945087;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:46:46:32:34:12:12:0.26087:5:7:27:5:5:7:28:6
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chr17	6981353	.	G	C	243.55	PASS	AF=0.4375;AO=28;DP=64;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=-0.0331274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.0696;QD=15.2218;RBI=0.0566925;REFB=-0.0579695;REVB=-0.0460068;RO=33;SAF=16;SAR=12;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197467;STB=0.586605;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.0593211;OID=.;OPOS=6981353;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:36:28:28:0.4375:12:16:12:21:12:16:15:21
chr17	6981397	.	A	G	884.42	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.262;QD=57.9949;RBI=0.0347397;REFB=0;REVB=0.0115215;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.23713e-05;OID=.;OPOS=6981397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:34:26:0:0:35:26:0:0
chr17	7097340	.	T	C	176.28	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.0170376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.041;QD=20.7382;RBI=0.0181113;REFB=-0.0359658;REVB=-0.00614334;RO=16;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521025;STB=0.529379;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0203366;OID=.;OPOS=7097340;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:9:9:7:9:9:9:7:9
chr17	7099811	.	G	A	258.95	PASS	AF=0.571429;AO=23;DP=41;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=0.0112498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.566;QD=24.6616;RBI=0.0433091;REFB=-0.0254141;REVB=0.0418225;RO=18;SAF=14;SAR=9;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131239;STB=0.55995;STBP=0.373;TYPE=snp;VARB=0.0173896;OID=.;OPOS=7099811;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:18:18:23:24:0.571429:9:14:8:10:10:14:8:10
chr17	7123240	.	T	C,TGGGCGTGCAGGACGC	59.68	PASS	AF=0.0547945,0.109589;AO=4,8;DP=75;FAO=4,8;FDP=73;FR=.;FRO=61;FSAF=3,7;FSAR=1,1;FSRF=37;FSRR=24;FWDB=-0.0194649,-0.0263047;FXX=0.0266631;HRUN=1,3;LEN=1,15;MLLD=118.52,314.748;QD=3.27018;RBI=0.020529,0.0294079;REFB=-0.00083414,-0.00668186;REVB=-0.00652374,-0.0131487;RO=59;SAF=3,7;SAR=1,1;SRF=36;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.150027,0.379241;STB=0.651363,0.798217;STBP=0.6,0.119;TYPE=snp,ins;VARB=0.0224849,0.0623331;OID=.,.;OPOS=7123240,7123241;OREF=T,-;OALT=C,GGGCGTGCAGGACGC;OMAPALT=C,TGGGCGTGCAGGACGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:38:75:73:59:61:4,8:4,8:0.0547945,0.109589:1,1:3,7:36:23:1,1:3,7:37:24
chr17	7127718	.	T	C	193.17	PASS	AF=0.425532;AO=20;DP=47;FAO=20;FDP=47;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=-0.0143137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.466;QD=16.4398;RBI=0.0213036;REFB=-0.0235569;REVB=-0.0157785;RO=26;SAF=9;SAR=11;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185687;STB=0.613082;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0181344;OID=.;OPOS=7127718;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:26:27:20:20:0.425532:11:9:7:19:11:9:7:20
chr17	7129840	.	T	C	49.6	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.00472298;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.151;QD=15.2619;RBI=0.0680836;REFB=-0.0120914;REVB=0.0679196;RO=6;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183303;STB=0.609426;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00572867;OID=.;OPOS=7129840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:5:2:3:3:5:2:3:3
chr17	7132556	.	C	T	372.85	PASS	AF=0.47561;AO=38;DP=82;FAO=39;FDP=82;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=29;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.00677624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.724;QD=18.1876;RBI=0.0119012;REFB=-0.0186105;REVB=0.00978377;RO=43;SAF=9;SAR=29;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.39236;STB=0.704421;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0242034;OID=.;OPOS=7132556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:43:43:38:39:0.47561:29:9:27:16:29:10:27:16
chr17	7133162	.	G	A	1102.83	PASS	AF=0.53886;AO=102;DP=191;FAO=104;FDP=193;FR=.;FRO=89;FSAF=63;FSAR=41;FSRF=43;FSRR=46;FWDB=-0.0118611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.692;QD=22.8565;RBI=0.013397;REFB=-0.00584293;REVB=0.0062286;RO=88;SAF=61;SAR=41;SRF=42;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104012;STB=0.557738;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.00753147;OID=.;OPOS=7133162;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:193:88:89:102:104:0.53886:41:61:42:46:41:63:43:46
chr17	7133609	.	G	A	387.91	PASS	AF=0.637931;AO=32;DP=53;FAO=37;FDP=58;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=0.0677375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=39.232;QD=26.7523;RBI=0.116964;REFB=-0.0624163;REVB=0.0953534;RO=21;SAF=12;SAR=20;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0323249;STB=0.507183;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0350268;OID=.;OPOS=7133609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:58:21:21:32:37:0.637931:20:12:7:14:24:13:7:14
chr17	7134129	.	A	G	356.08	PASS	AF=0.603448;AO=35;DP=58;FAO=35;FDP=58;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0662442;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.5639;QD=24.5573;RBI=0.0671839;REFB=0.0191052;REVB=0.0111975;RO=23;SAF=14;SAR=21;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120885;STB=0.566395;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=-0.00772992;OID=.;OPOS=7134129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:23:23:35:35:0.603448:21:14:13:10:21:14:13:10
chr17	7147350	.	T	TC	313.17	PASS	AF=0.466667;AO=53;DP=122;FAO=56;FDP=120;FR=.;FRO=64;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=-0.0349467;FXX=0.00826378;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.6073;QD=10.4391;RBI=0.047066;REFB=0.0453929;REVB=-0.0315267;RO=67;SAF=23;SAR=30;SRF=33;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0589829;STB=0.53011;STBP=0.574;TYPE=ins;VARB=-0.0569697;OID=.;OPOS=7147351;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.466667:53:122:56:120:64:24:32:31:33:99:67:23:30:33:34
chr17	7154534	.	G	A	347.46	PASS	AF=0.45679;AO=37;DP=81;FAO=37;FDP=81;FR=.;FRO=44;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=28;FSRR=16;FWDB=-0.00549637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.865;QD=17.1584;RBI=0.00991317;REFB=-0.00463747;REVB=0.00824991;RO=44;SAF=19;SAR=18;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11982;STB=0.566989;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.00578589;OID=.;OPOS=7154534;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:44:44:37:37:0.45679:18:19:28:16:18:19:28:16
chr17	7163723	.	A	C	223.87	PASS	AF=0.478261;AO=18;DP=46;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.00870222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9701;QD=19.4668;RBI=0.0148501;REFB=0.00559018;REVB=-0.0120332;RO=23;SAF=4;SAR=14;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402396;STB=0.63624;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.00443203;OID=.;OPOS=7163723;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:24:18:22:0.478261:14:4:14:9:14:8:15:9
chr17	7163739	.	A	G	226.01	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0027901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.392;QD=20.5466;RBI=0.00513075;REFB=-0.00302395;REVB=-0.0043058;RO=22;SAF=8;SAR=14;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165118;STB=0.593134;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.00205353;OID=.;OPOS=7163739;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:14:8:12:10:14:8:12:10
chr17	7185788	.	T	C	752.49	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0355154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.916;QD=56.7919;RBI=0.0411317;REFB=0;REVB=0.0207478;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75821e-05;OID=.;OPOS=7185788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:53:0:0:48:53:1:31:17:0:0:34:19:0:0
chr17	7187123	.	T	C	218.99	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0547451;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.637;QD=23.6748;RBI=0.056701;REFB=-0.0114778;REVB=0.0147644;RO=16;SAF=13;SAR=8;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189967;STB=0.606116;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0123787;OID=.;OPOS=7187123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:8:13:6:10:8:13:6:10
chr17	7213694	.	C	A	557.11	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.551;QD=60.2276;RBI=0.0315615;REFB=0;REVB=-0.0291099;RO=0;SAF=13;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000108171;OID=.;OPOS=7213694;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:24:13:0:0:24:13:0:0
chr17	7217463	.	T	C	1102.46	PASS	AF=0.986667;AO=72;DP=73;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0112928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.538;QD=58.7978;RBI=0.0185326;REFB=-0.0731536;REVB=0.0146945;RO=0;SAF=44;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21139e-08;STB=0.505375;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.000296786;OID=.;OPOS=7217463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:73:75:0:1:72:74:0.986667:28:44:0:0:28:46:1:0
chr17	7219230	.	A	G	543.55	PASS	AF=0.973684;AO=36;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0637083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.18;QD=57.2157;RBI=0.0658961;REFB=-0.168628;REVB=-0.0168389;RO=1;SAF=22;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208029;STB=0.510633;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00609654;OID=.;OPOS=7219230;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:38:1:1:36:37:0.973684:14:22:1:0:14:23:1:0
chr17	7221385	.	G	A	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152037;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.37;QD=58.9625;RBI=0.039394;REFB=0;REVB=0.036342;RO=0;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.75385e-05;OID=.;OPOS=7221385;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:26:40:0:0:26:40:0:0
chr17	7224921	.	C	G	464.24	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3046;QD=58.0303;RBI=0.0581698;REFB=0;REVB=0.0314599;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000659898;OID=.;OPOS=7224921;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:17:14:0:0:18:14:0:0
chr17	7254315	.	G	A	34.89	PASS	AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=0.0275999;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.9539;QD=4.81195;RBI=0.0307404;REFB=-0.00881605;REVB=0.0135359;RO=21;SAF=4;SAR=2;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604803;STB=0.512777;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0299022;OID=.;OPOS=7254315;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:21:23:6:6:0.206897:2:4:13:8:2:4:15:8
chr17	7257455	.	G	T	227.1	PASS	AF=0.402985;AO=26;DP=66;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00981099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5378;QD=13.558;RBI=0.0342868;REFB=-0.023033;REVB=-0.0328532;RO=39;SAF=18;SAR=8;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146785;STB=0.559095;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0189451;OID=.;OPOS=7257455;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:67:39:40:26:27:0.402985:8:18:22:17:9:18:23:17
chr17	7286266	.	C	T	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0187432;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.564;QD=14.7986;RBI=0.0202224;REFB=-0.0326067;REVB=-0.00759182;RO=13;SAF=10;SAR=1;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.370286;STB=0.724121;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0399268;OID=.;OPOS=7286266;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:1:10:9:4:1:10:9:4
chr17	7286326	.	T	A	208.57	PASS	AF=0.76;AO=19;DP=25;FAO=19;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0143338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=206.093;QD=33.371;RBI=0.0257649;REFB=-0.0470754;REVB=-0.0214097;RO=6;SAF=12;SAR=7;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0605126;STB=0.533298;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.0289409;OID=.;OPOS=7286326;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:6:6:19:19:0.76:7:12:3:3:7:12:3:3
chr17	7292107	.	G	A	1199.79	PASS	AF=0.964286;AO=81;DP=84;FAO=81;FDP=84;FR=.;FRO=3;FSAF=43;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0199101;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.561;QD=57.1328;RBI=0.0869813;REFB=-0.126052;REVB=0.0846719;RO=1;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0122979;STB=0.518983;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00172212;OID=.;OPOS=7292107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:84:84:1:3:81:81:0.964286:38:43:0:1:38:43:0:3
chr17	7293715	.	C	T	288.82	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=0.0139107;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.6227;QD=16.2717;RBI=0.0142994;REFB=-0.0182553;REVB=-0.0033116;RO=39;SAF=15;SAR=17;SRF=29;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266311;STB=0.648656;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.013547;OID=.;OPOS=7293715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:39:39:32:32:0.450704:17:15:29:10:17:15:29:10
chr17	7297452	.	A	G	193.14	PASS	AF=0.375;AO=24;DP=64;FAO=24;FDP=64;FR=.;FRO=40;FSAF=22;FSAR=2;FSRF=27;FSRR=13;FWDB=-0.00343051;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.866;QD=12.0714;RBI=0.0227214;REFB=-0.00513771;REVB=-0.0224609;RO=36;SAF=22;SAR=2;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480565;STB=0.770737;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0121526;OID=.;OPOS=7297452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:36:40:24:24:0.375:2:22:23:13:2:22:27:13
chr17	7318396	.	C	T	1087.53	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00265219;FXX=0.0133316;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.695;QD=58.7853;RBI=0.0405619;REFB=-0.0966529;REVB=0.0404751;RO=1;SAF=38;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122856;STB=0.506492;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.000976592;OID=.;OPOS=7318396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:75:74:1:1:73:73:0.986486:35:38:1:0:35:38:1:0
chr17	7322245	.	A	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=352.85;QD=58.1421;RBI=0.0244769;REFB=0;REVB=0.0161344;RO=0;SAF=18;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.25104e-05;OID=.;OPOS=7322245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:14:18:0:0:14:18:0:0
chr17	7339627	.	C	T	339.19	PASS	AF=0.473684;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=76;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0425889;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.9514;QD=17.8523;RBI=0.0451621;REFB=-0.0185441;REVB=0.0150267;RO=39;SAF=18;SAR=18;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0597056;STB=0.539452;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0309599;OID=.;OPOS=7339627;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:39:40:36:36:0.473684:18:18:22:17:18:18:23:17
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chr17	7366348	.	A	C	36.46	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=11;FWDB=-0.0928898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.064;QD=8.10204;RBI=0.0982139;REFB=-0.0285111;REVB=-0.0318975;RO=11;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336785;STB=0.713773;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0870919;OID=.;OPOS=7366348;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:18:18:11:12:6:6:0.333333:4:2:1:10:4:2:1:11
chr17	7386055	.	C	T	1749.4	PASS	AF=0.952;AO=119;DP=125;FAO=119;FDP=125;FR=.;FRO=6;FSAF=60;FSAR=59;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.0319664;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.446;QD=55.9807;RBI=0.0359441;REFB=-0.203755;REVB=0.0164355;RO=2;SAF=60;SAR=59;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0155678;STB=0.523806;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00119726;OID=.;OPOS=7386055;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:125:125:2:6:119:119:0.952:59:60:2:0:59:60:6:0
chr17	7386279	.	TG	CA	954.12	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390214;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=146.801;QD=58.7153;RBI=0.0402849;REFB=0;REVB=0.0100101;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-6.55237e-05;OID=.;OPOS=7386279;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:32:32:0:0:32:33:0:0
chr17	7400137	.	T	C	487.04	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00829824;FXX=0.0294031;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.4558;QD=59.0353;RBI=0.0144797;REFB=0;REVB=-0.011866;RO=0;SAF=26;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44409e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000190657;OID=.;OPOS=7400137;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:7:26:0:0:7:26:0:0
chr17	7402600	.	T	C	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.027;QD=60.6094;RBI=0.0493619;REFB=0;REVB=0.0434406;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000344411;OID=.;OPOS=7402600;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:18:20:0:0:18:20:0:0
chr17	7404107	.	T	C	972.87	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.803;QD=58.962;RBI=0.0257002;REFB=0;REVB=-0.0204464;RO=0;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.76081e-05;OID=.;OPOS=7404107;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:66:0:0:64:66:1:26:38:0:0:26:40:0:0
chr17	7404991	.	T	C	1230.72	PASS	AF=1;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0412337;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3271;QD=61.5361;RBI=0.0585947;REFB=0;REVB=-0.0416308;RO=0;SAF=36;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.97301e-05;OID=.;OPOS=7404991;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:80:0:0:80:80:1:44:36:0:0:44:36:0:0
chr17	7412403	.	T	C	354.51	PASS	AF=0.333333;AO=45;DP=135;FAO=45;FDP=135;FR=.;FRO=90;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=51;FSRR=39;FWDB=-0.0396097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9926;QD=10.5041;RBI=0.0858574;REFB=0.0139997;REVB=-0.0761745;RO=90;SAF=24;SAR=21;SRF=51;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0388103;STB=0.522378;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=-0.0279061;OID=.;OPOS=7412403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:90:90:45:45:0.333333:21:24:51:39:21:24:51:39
chr17	7416683	.	A	G	109.05	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.029209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.155;QD=36.3495;RBI=0.0302904;REFB=-0.143238;REVB=0.00802107;RO=1;SAF=10;SAR=1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0428878;STB=0.523767;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.00645709;OID=.;OPOS=7416683;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:1:10:1:0:1:10:1:0
chr17	7460517	.	G	C	124.92	PASS	AF=0.276923;AO=18;DP=65;FAO=18;FDP=65;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=31;FWDB=0.00921726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1774;QD=7.68733;RBI=0.0404488;REFB=-0.0185622;REVB=-0.0393846;RO=47;SAF=10;SAR=8;SRF=16;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.254451;STB=0.652015;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0188914;OID=.;OPOS=7460517;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:47:47:18:18:0.276923:8:10:16:31:8:10:16:31
chr17	7460559	.	T	G	729.9	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0640634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.183;QD=62.119;RBI=0.0832391;REFB=0;REVB=0.0531472;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0005303;OID=.;OPOS=7460559;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:45:47:1:28:17:0:0:29:18:0:0
chr17	7462555	.	G	A	449.27	PASS	AF=0.52381;AO=44;DP=84;FAO=44;FDP=84;FR=.;FRO=40;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.0243595;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=249.735;QD=21.3936;RBI=0.0254895;REFB=-0.0264254;REVB=0.00750552;RO=38;SAF=20;SAR=24;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383543;STB=0.533607;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0239142;OID=.;OPOS=7462555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:38:40:44:44:0.52381:24:20:19:19:24:20:21:19
chr17	7462969	.	A	G	670.0	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112956;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.1596;QD=62.3257;RBI=0.0234981;REFB=0;REVB=-0.0206051;RO=0;SAF=31;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72514e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.75811e-05;OID=.;OPOS=7462969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:11:31:0:0:11:32:0:0
chr17	7470285	.	CA	C	1590.33	PASS	AF=1;AO=132;DP=144;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=89;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246409;FXX=0.0138879;HRUN=3;LEN=1;MLLD=19.7367;QD=44.798;RBI=0.0332712;REFB=0;REVB=-0.0223561;RO=0;SAF=85;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00017721;OID=.;OPOS=7470286;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:132:144:142:142:0:89:53:0:0:30:0:85:47:0:0
chr17	7475159	.	A	T	328.79	PASS	AF=0.48;AO=33;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=12;FSRR=27;FWDB=0.0017284;FXX=0.0506265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.833;QD=17.5352;RBI=0.00633013;REFB=-0.0161004;REVB=-0.0060896;RO=42;SAF=12;SAR=21;SRF=16;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184622;STB=0.515143;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0196673;OID=.;OPOS=7475159;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:42:39:33:36:0.48:21:12:16:26:24:12:12:27
chr17	7475161	.	A	T	117.98	PASS	AF=0.269841;AO=17;DP=68;FAO=17;FDP=63;FR=.;FRO=46;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=-0.0171876;FXX=0.0735186;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.727;QD=7.49054;RBI=0.0190203;REFB=-0.0152807;REVB=-0.0081461;RO=51;SAF=2;SAR=15;SRF=22;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478031;STB=0.763699;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0284503;OID=.;OPOS=7475161;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:63:51:46:17:17:0.269841:15:2:22:29:15:2:17:29
chr17	7477938	.	G	C	783.98	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.236;QD=63.9985;RBI=0.0451333;REFB=0;REVB=0.0431474;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.38372e-05;OID=.;OPOS=7477938;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:49:0:0:48:49:1:31:17:0:0:32:17:0:0
chr17	7479892	.	C	T	312.35	PASS	AF=0.368932;AO=36;DP=101;FAO=38;FDP=103;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=0.00973598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.8737;QD=12.1301;RBI=0.0104743;REFB=-0.0126855;REVB=0.00386285;RO=64;SAF=23;SAR=13;SRF=36;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0893774;STB=0.569686;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.026297;OID=.;OPOS=7479892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:103:64:65:36:38:0.368932:13:23:36:28:13:25:36:29
chr17	7482125	.	A	G	350.03	PASS	AF=0.6;AO=30;DP=50;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=0.0620377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9138;QD=28.002;RBI=0.0649504;REFB=-0.0211326;REVB=-0.0192321;RO=20;SAF=8;SAR=22;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115806;STB=0.564058;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.0179097;OID=.;OPOS=7482125;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:20:20:30:30:0.6:22:8:8:12:22:8:8:12
chr17	7490378	.	T	TC	45.06	PASS	AF=0.857143;AO=3;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0426192;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=34.3781;QD=25.7467;RBI=0.0426192;REFB=-0.0358862;REVB=0;RO=3;SAF=3;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0165636;OID=.;OPOS=7490379;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.857143:3:7:6:7:1:6:0:1:0:6:3:3:0:3:0
chr17	7530271	.	C	T	151.13	PASS	AF=0.533333;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.000334884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.79;QD=20.1499;RBI=0.00626869;REFB=0.00894539;REVB=-0.00625974;RO=14;SAF=6;SAR=10;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.220472;STB=0.624844;STBP=0.178;TYPE=snp;VARB=-0.00650422;OID=.;OPOS=7530271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:14:14:16:16:0.533333:10:6:9:5:10:6:9:5
chr17	7560835	.	T	G	127.19	PASS	AF=0.538462;AO=13;DP=25;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0733609;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0865;QD=19.5669;RBI=0.078121;REFB=-0.0276843;REVB=0.0268528;RO=12;SAF=9;SAR=4;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0248839;STB=0.526277;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0329683;OID=.;OPOS=7560835;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:26:12:12:13:14:0.538462:4:9:8:4:4:10:8:4
chr17	7577427	.	G	A	38.15	PASS	AF=0.4;AO=5;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00851725;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.9483;QD=10.1731;RBI=0.00981836;REFB=-0.0158519;REVB=-0.00488433;RO=9;SAF=3;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0717807;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00748052;OID=.;OPOS=7577427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:5:6:0.4:2:3:6:3:2:4:6:3
chr17	7578115	.	T	C	203.26	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00600037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.839;QD=47.8266;RBI=0.0691502;REFB=0;REVB=0.0688894;RO=0;SAF=12;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00704079;OID=.;OPOS=7578115;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:16:17:1:4:12:0:0:5:12:0:0
chr17	7614601	.	G	A	101.86	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.00937826;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.363;QD=8.85716;RBI=0.0108876;REFB=-0.0121586;REVB=0.00553062;RO=33;SAF=3;SAR=10;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260302;STB=0.661209;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0232643;OID=.;OPOS=7614601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:10:3:14:19:10:3:14:19
chr17	7637996	.	G	A	310.35	PASS	AF=0.441558;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=77;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=0.000365876;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.971;QD=16.1223;RBI=0.0121438;REFB=-0.00842752;REVB=-0.0121383;RO=43;SAF=13;SAR=21;SRF=28;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263028;STB=0.64777;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0142994;OID=.;OPOS=7637996;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:43:43:34:34:0.441558:21:13:28:15:21:13:28:15
chr17	7673928	.	C	G	918.63	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00671935;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.4673;QD=58.3257;RBI=0.0403239;REFB=0;REVB=0.0397601;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124515;OID=.;OPOS=7673928;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:30:32:0:0:31:32:0:0
chr17	7681412	.	C	G	1190.84	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00157437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.1108;QD=61.0687;RBI=0.0170749;REFB=0;REVB=-0.0170021;RO=0;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100831;OID=.;OPOS=7681412;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:76:78:1:29:47:0:0:30:48:0:0
chr17	7735063	.	T	G	363.0	PASS	AF=0.653846;AO=34;DP=52;FAO=34;FDP=52;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0615875;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.7859;QD=27.923;RBI=0.0653868;REFB=-0.046666;REVB=0.0219639;RO=17;SAF=11;SAR=23;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.060029;STB=0.525366;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0225502;OID=.;OPOS=7735063;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:17:18:34:34:0.653846:23:11:7:10:23:11:7:11
chr17	7750232	.	T	C	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0129592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.589;QD=18.767;RBI=0.0463521;REFB=-0.0185577;REVB=0.0445037;RO=3;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.365022;STB=0.713603;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.000797116;OID=.;OPOS=7750232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:2:4:0:3:2:4:0:3
chr17	7750516	.	C	G	64.37	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0558607;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.934;QD=23.4073;RBI=0.0564747;REFB=-0.0790649;REVB=0.00830471;RO=3;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.156255;STB=0.588042;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0125955;OID=.;OPOS=7750516;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:7:1:0:3:7:1:0:3
chr17	7751778	.	G	A	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.00347574;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.228;QD=11.0896;RBI=0.0122199;REFB=-0.0263669;REVB=-0.0117152;RO=6;SAF=2;SAR=3;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621951;STB=0.538311;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=0.0213544;OID=.;OPOS=7751778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:3:2:2:4:3:2:2:4
chr17	7752531	.	ACAGAAGGAGCAT	A	120.53	PASS	AF=0.424242;AO=12;DP=30;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.0208147;FXX=0;HRUN=1;LEN=12;MLLD=300.125;QD=14.6099;RBI=0.0232081;REFB=-0.014544;REVB=-0.0102648;RO=12;SAF=10;SAR=2;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116823;STB=0.614347;STBP=0.315;TYPE=del;VARB=0.0190884;OID=.;OPOS=7752532;OREF=CAGAAGGAGCAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.424242:12:30:14:33:19:11:3:12:7:99:12:10:2:9:3
chr17	7760397	.	G	A	841.1	PASS	AF=0.505952;AO=85;DP=168;FAO=85;FDP=168;FR=.;FRO=83;FSAF=53;FSAR=32;FSRF=44;FSRR=39;FWDB=0.0443443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.5375;QD=20.0261;RBI=0.0468262;REFB=0.00268036;REVB=0.0150425;RO=83;SAF=53;SAR=32;SRF=44;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0871679;STB=0.547972;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=-0.00284965;OID=.;OPOS=7760397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:168:83:83:85:85:0.505952:32:53:44:39:32:53:44:39
chr17	7760704	.	A	G	698.21	PASS	AF=0.535433;AO=66;DP=127;FAO=68;FDP=127;FR=.;FRO=59;FSAF=20;FSAR=48;FSRF=19;FSRR=40;FWDB=0.0263699;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.117;QD=21.9908;RBI=0.0283069;REFB=-0.00100701;REVB=0.0102912;RO=59;SAF=18;SAR=48;SRF=19;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0519138;STB=0.515414;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.00206628;OID=.;OPOS=7760704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:59:59:66:68:0.535433:48:18:19:40:48:20:19:40
chr17	7761512	.	C	A	181.37	PASS	AF=0.44186;AO=17;DP=41;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0130944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7542;QD=16.8713;RBI=0.0761908;REFB=-0.0292324;REVB=0.0750572;RO=23;SAF=12;SAR=5;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109992;STB=0.528467;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.023751;OID=.;OPOS=7761512;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:43:23:24:17:19:0.44186:5:12:14:9:7:12:14:10
chr17	7808437	.	G	A	566.12	PASS	AF=0.408805;AO=65;DP=159;FAO=65;FDP=159;FR=.;FRO=94;FSAF=25;FSAR=40;FSRF=54;FSRR=40;FWDB=-0.00252258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.848;QD=14.2421;RBI=0.00746952;REFB=-0.0140755;REVB=-0.00703067;RO=94;SAF=25;SAR=40;SRF=54;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200017;STB=0.612368;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0251753;OID=.;OPOS=7808437;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:94:94:65:65:0.408805:40:25:54:40:40:25:54:40
chr17	7815594	.	A	G	337.03	PASS	AF=0.402174;AO=38;DP=93;FAO=37;FDP=92;FR=.;FRO=55;FSAF=6;FSAR=31;FSRF=18;FSRR=37;FWDB=-0.00592828;FXX=0.0107515;HRUN=5;LEN=1;MLLD=308.854;QD=14.6533;RBI=0.00644264;REFB=-0.00828116;REVB=-0.00252254;RO=53;SAF=6;SAR=32;SRF=17;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249613;STB=0.645743;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0110182;OID=.;OPOS=7815594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:92:53:55:38:37:0.402174:32:6:17:36:31:6:18:37
chr17	7842957	.	C	T	466.3	PASS	AF=0.661538;AO=42;DP=64;FAO=43;FDP=65;FR=.;FRO=22;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00338297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.657;QD=28.6952;RBI=0.0092666;REFB=-0.0376963;REVB=-0.00862701;RO=22;SAF=31;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11276;STB=0.552138;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0160971;OID=.;OPOS=7842957;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:22:22:42:43:0.661538:11:31:13:9:12:31:13:9
chr17	7843053	.	C	T	303.82	PASS	AF=1;AO=19;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0993352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.695;QD=52.8376;RBI=0.100998;REFB=0;REVB=0.018249;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00774975;OID=.;OPOS=7843053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:19:23:1:11:8:0:0:12:11:0:0
chr17	7847955	.	C	A	306.28	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2358;QD=53.2658;RBI=0.0110297;REFB=0;REVB=0.0110297;RO=1;SAF=0;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000270853;OID=.;OPOS=7847955;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:1:0:22:23:1:22:0:0:1:23:0:0:0
chr17	7849087	.	C	G	1524.95	PASS	AF=1;AO=96;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01917;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.4825;QD=62.8846;RBI=0.0226748;REFB=0;REVB=-0.0121101;RO=1;SAF=68;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00692389;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00289553;OID=.;OPOS=7849087;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:97:97:1:0:96:97:1:28:68:1:0:28:69:0:0
chr17	7910025	.	C	T	287.95	PASS	AF=0.565217;AO=26;DP=46;FAO=26;FDP=46;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.0318692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3627;QD=25.0388;RBI=0.0453006;REFB=-0.0637687;REVB=0.0321947;RO=18;SAF=10;SAR=16;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.208379;STB=0.594521;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0242437;OID=.;OPOS=7910025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:18:20:26:26:0.565217:16:10:12:6:16:10:12:8
chr17	7910840	.	T	C	33.51	PASS	AF=0.153846;AO=6;DP=39;FAO=6;FDP=39;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.00591157;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=365.257;QD=3.43667;RBI=0.0105389;REFB=0.000246131;REVB=-0.0087248;RO=33;SAF=5;SAR=1;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.454727;STB=0.824984;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=-0.00103331;OID=.;OPOS=7910840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:39:39:33:33:6:6:0.153846:1:5:15:18:1:5:15:18
chr17	7942901	.	C	G	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.049991;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.086;QD=33.4285;RBI=0.0638144;REFB=0;REVB=0.0396634;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000752119;OID=.;OPOS=7942901;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr17	8022065	.	G	A	125.85	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0148748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.627;QD=18.6444;RBI=0.0175698;REFB=-0.0176506;REVB=0.00935084;RO=13;SAF=7;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162718;STB=0.592465;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.027659;OID=.;OPOS=8022065;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:7:7:9:4:7:7:9:4
chr17	8023057	.	A	C	221.52	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.0102654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.484;QD=18.4598;RBI=0.0124383;REFB=-0.0157844;REVB=-0.00702376;RO=26;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116405;STB=0.565978;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0284075;OID=.;OPOS=8023057;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:12:10:15:11:12:10:15:11
chr17	8023059	.	A	C	221.88	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=-0.00502203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.09;QD=18.49;RBI=0.0164655;REFB=-0.0154611;REVB=0.015681;RO=26;SAF=10;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116405;STB=0.565978;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0239137;OID=.;OPOS=8023059;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:12:10:15:11:12:10:15:11
chr17	8023143	.	G	A	228.63	PASS	AF=0.46;AO=22;DP=49;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0132727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.8584;QD=18.2901;RBI=0.0273829;REFB=0.00331322;REVB=0.0239512;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713905;STB=0.549956;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=-0.0170004;OID=.;OPOS=8023143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:27:27:22:23:0.46:13:9:13:14:14:9:13:14
chr17	8024237	.	T	C	483.31	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.046485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.3019;QD=58.5836;RBI=0.0982911;REFB=0;REVB=-0.0866042;RO=0;SAF=9;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00174056;OID=.;OPOS=8024237;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:24:9:0:0:24:9:0:0
chr17	8048169	.	T	C	236.72	PASS	AF=0.405797;AO=28;DP=69;FAO=28;FDP=69;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=25;FWDB=0.013544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.2718;QD=13.7226;RBI=0.0144344;REFB=-0.0209901;REVB=-0.00499116;RO=41;SAF=19;SAR=9;SRF=16;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301744;STB=0.672093;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0480615;OID=.;OPOS=8048169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:41:41:28:28:0.405797:9:19:16:25:9:19:16:25
chr17	8062583	.	A	G	364.46	PASS	AF=0.590164;AO=36;DP=61;FAO=36;FDP=61;FR=.;FRO=25;FSAF=33;FSAR=3;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=0.0165076;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=301.898;QD=23.8988;RBI=0.0165376;REFB=-0.00623622;REVB=-0.000994906;RO=25;SAF=33;SAR=3;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.441076;STB=0.748513;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00359802;OID=.;OPOS=8062583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:25:25:36:36:0.590164:3:33:15:10:3:33:15:10
chr17	8076778	.	C	T	236.11	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0171366;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.403;QD=19.2738;RBI=0.0173891;REFB=0.00279378;REVB=0.0029521;RO=26;SAF=12;SAR=11;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0885263;STB=0.549957;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-0.00386414;OID=.;OPOS=8076778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:11:12:16:10:11:12:16:10
chr17	8076802	.	T	A	241.9	PASS	AF=0.509434;AO=24;DP=50;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.0228222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1569;QD=18.2563;RBI=0.0339036;REFB=-0.0175192;REVB=-0.0250719;RO=24;SAF=14;SAR=10;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775434;STB=0.547718;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.0199803;OID=.;OPOS=8076802;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:53:24:26:24:27:0.509434:10:14:16:8:13:14:16:10
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chr17	8090908	.	A	G	219.79	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.0230234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.8603;QD=17.5833;RBI=0.0268079;REFB=0.0072268;REVB=0.0137326;RO=28;SAF=18;SAR=4;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150943;STB=0.58687;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=-0.00745012;OID=.;OPOS=8090908;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:4:18:20:8:4:18:20:8
chr17	8092694	.	T	G	303.62	PASS	AF=0.532258;AO=31;DP=61;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0034997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9554;QD=19.5884;RBI=0.00863096;REFB=-0.0248706;REVB=-0.00788959;RO=29;SAF=20;SAR=11;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054802;STB=0.509678;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0301122;OID=.;OPOS=8092694;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:29:29:31:33:0.532258:11:20:17:12:13:20:17:12
chr17	8108331	.	A	G	194.09	PASS	AF=0.59375;AO=18;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0602907;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.982;QD=24.2617;RBI=0.0603002;REFB=-0.053503;REVB=0.00107045;RO=13;SAF=5;SAR=13;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215387;STB=0.626724;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0684535;OID=.;OPOS=8108331;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:13:18:19:0.59375:13:5:7:6:14:5:7:6
chr17	8108339	.	G	A	120.02	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0554889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6551;QD=14.1199;RBI=0.0676416;REFB=-0.0333001;REVB=0.038683;RO=19;SAF=4;SAR=10;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150708;STB=0.576808;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0276958;OID=.;OPOS=8108339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:20:14:14:0.411765:10:4:8:11:10:4:8:12
chr17	8124268	.	G	C	291.41	PASS	AF=0.407407;AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.0171873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.73;QD=14.3904;RBI=0.024842;REFB=-0.0056609;REVB=0.0179366;RO=48;SAF=18;SAR=15;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622421;STB=0.535286;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0068343;OID=.;OPOS=8124268;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:48:48:33:33:0.407407:15:18:29:19:15:18:29:19
chr17	8132763	.	T	C	36.54	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00794084;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.595;QD=20.8786;RBI=0.0385435;REFB=-0.134348;REVB=0.0377167;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121807;STB=0.62455;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00787567;OID=.;OPOS=8132763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:7:7:1:2:5:5:0.714286:2:3:1:0:2:3:2:0
chr17	8135061	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0904988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.517;QD=44.6885;RBI=0.0906426;REFB=0;REVB=0.00510325;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00085904;OID=.;OPOS=8135061;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:5:8:0:0:5:8:0:0
chr17	8141707	.	T	C	785.87	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130283;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.421;QD=64.1528;RBI=0.0155948;REFB=0;REVB=-0.00857103;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.30533e-05;OID=.;OPOS=8141707;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0
chr17	8157310	.	C	T	1053.92	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127602;FXX=0.013887;HRUN=4;LEN=1;MLLD=340.434;QD=59.3757;RBI=0.0283448;REFB=-0.0331518;REVB=0.0253102;RO=0;SAF=44;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.68174e-05;OID=.;OPOS=8157310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:72:71:0:0:71:71:1:27:44:0:0:27:44:0:0
chr17	8158911	.	A	AC	45.89	PASS	AF=0.321429;AO=8;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.000992695;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=76.3087;QD=6.55542;RBI=0.0193161;REFB=-0.000184013;REVB=-0.0192905;RO=19;SAF=1;SAR=7;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.428491;STB=0.790427;STBP=0.082;TYPE=ins;VARB=-0.00757972;OID=.;OPOS=8158912;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.321429:8:28:9:28:19:1:8:8:11:45:19:1:7:8:11
chr17	8161149	.	C	T	195.19	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0068063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.208;QD=14.196;RBI=0.0144937;REFB=-0.00131689;REVB=-0.0127962;RO=30;SAF=9;SAR=14;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330271;STB=0.683819;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.00176545;OID=.;OPOS=8161149;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:30:32:23:23:0.418182:14:9:22:8:14:9:23:9
chr17	8192922	.	C	T	52.92	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.797;QD=21.1691;RBI=0.00966238;REFB=0.000176907;REVB=-0.00966238;RO=3;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00146467;OID=.;OPOS=8192922;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:7:0:0:3:7:0:0:3
chr17	8216468	.	T	C	304.14	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0452254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.352;QD=52.8945;RBI=0.0538645;REFB=0;REVB=0.0292583;RO=0;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78933e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00020643;OID=.;OPOS=8216468;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:16:5:0:0:17:6:0:0
chr17	8224276	.	T	C	101.89	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0011667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.824;QD=8.86031;RBI=0.00503034;REFB=-0.00316006;REVB=-0.00489317;RO=33;SAF=4;SAR=9;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183476;STB=0.612723;STBP=0.376;TYPE=snp;VARB=0.0154379;OID=.;OPOS=8224276;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:9:4:15:18:9:4:15:18
chr17	8232991	.	A	AT	164.51	PASS	AF=0.426966;AO=32;DP=88;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0661552;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=13.9606;QD=7.3937;RBI=0.115195;REFB=0.0252215;REVB=-0.0943048;RO=51;SAF=15;SAR=17;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0861342;STB=0.55815;STBP=0.355;TYPE=ins;VARB=-0.0604995;OID=.;OPOS=8232992;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.426966:32:88:38:89:51:17:21:28:23:99:51:15:17:28:23
chr17	8243469	.	T	C	74.14	PASS	AF=0.434783;AO=8;DP=22;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0294386;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.351;QD=12.8938;RBI=0.0340482;REFB=-0.00955811;REVB=-0.017107;RO=11;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0117224;STB=0.521696;STBP=0.896;TYPE=snp;VARB=0.0134163;OID=.;OPOS=8243469;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:22:23:11:13:8:10:0.434783:3:5:7:4:5:5:7:6
chr17	8243661	.	G	A	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0115237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.024;QD=15.6999;RBI=0.0149327;REFB=0.000420467;REVB=-0.00949679;RO=19;SAF=7;SAR=8;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14909;STB=0.585548;STBP=0.398;TYPE=snp;VARB=-0.00133229;OID=.;OPOS=8243661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:8:7:6:13:8:7:6:13
chr17	8243785	.	A	G	255.27	PASS	AF=0.446154;AO=29;DP=65;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0132861;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.711;QD=15.709;RBI=0.0162341;REFB=-0.00582189;REVB=0.00932869;RO=35;SAF=16;SAR=13;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917074;STB=0.544072;STBP=0.551;TYPE=snp;VARB=0.00671965;OID=.;OPOS=8243785;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:35:36:29:29:0.446154:13:16:16:19:13:16:17:19
chr17	8296440	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00545331;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=178.581;QD=40.7629;RBI=0.00580372;REFB=0;REVB=-0.0019861;RO=0;SAF=2;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.30272e-05;OID=.;OPOS=8296440;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:8:2:0:0:8:2:0:0
chr17	8339283	.	C	G,T	674.67	PASS	AF=0.0454545,0.954545;AO=2,42;DP=44;FAO=2,42;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=0,23;FSAR=2,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00447626,0.0538507;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=34.6231,132.199;QD=61.3337;RBI=0.00570954,0.112122;REFB=0,0;REVB=-0.00354428,0.0983436;RO=0;SAF=1,22;SAR=1,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.171346,0.000243366;OID=.,.;OPOS=8339283,8339283;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:44:44:0:0:2,42:2,42:0.0454545,0.954545:1,20:1,22:0:0:2,19:0,23:0:0
chr17	8339307	.	G	A	639.28	PASS	AF=0.934783;AO=43;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0314878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3389;QD=55.5891;RBI=0.0893187;REFB=-0.136894;REVB=0.0835844;RO=2;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040792;STB=0.510117;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=0.0101022;OID=.;OPOS=8339307;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:46:46:2:3:43:43:0.934783:22:21:0:2:22:21:1:2
chr17	8378932	.	A	G	1153.48	PASS	AF=0.987179;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00929212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.954;QD=59.1531;RBI=0.0516155;REFB=-0.0436952;REVB=0.0507722;RO=1;SAF=46;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101785;STB=0.505375;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000293895;OID=.;OPOS=8378932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:1:1:77:77:0.987179:31:46:1:0:31:46:1:0
chr17	8383894	.	A	G	765.78	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0275186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.501;QD=63.8153;RBI=0.0479808;REFB=0;REVB=0.039305;RO=0;SAF=25;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000392081;OID=.;OPOS=8383894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:23:25:0:0:23:25:0:0
chr17	8416901	.	C	T	1186.84	PASS	AF=0.9875;AO=77;DP=79;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.108777;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.5918;QD=59.342;RBI=0.135399;REFB=-0.130386;REVB=0.0806259;RO=1;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0129652;STB=0.506665;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.00334325;OID=.;OPOS=8416901;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:79:80:1:1:77:79:0.9875:36:41:0:1:37:42:0:1
chr17	8424270	.	G	A	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0163254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.617;QD=54.823;RBI=0.0165469;REFB=-0.0989939;REVB=0.0026983;RO=1;SAF=34;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136468;STB=0.507243;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.000779853;OID=.;OPOS=8424270;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:16:34:1:0:16:34:1:0
chr17	8450357	.	C	A	911.8	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=66;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0200858;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.906;QD=55.2608;RBI=0.030542;REFB=-0.152233;REVB=0.0230082;RO=2;SAF=34;SAR=30;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0269723;STB=0.514281;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.000767341;OID=.;OPOS=8450357;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:66:66:2:2:64:64:0.969697:30:34:2:0:30:34:2:0
chr17	8644854	.	C	T	65.68	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0179113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.4182;QD=11.4228;RBI=0.108058;REFB=-0.0383549;REVB=0.106563;RO=14;SAF=7;SAR=2;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.435168;STB=0.76178;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0620082;OID=.;OPOS=8644854;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:2:7:5:9:2:7:5:9
chr17	8647931	.	G	C	612.1	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0865056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.0829;QD=61.2104;RBI=0.0884806;REFB=0;REVB=-0.0185899;RO=0;SAF=27;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00101905;OID=.;OPOS=8647931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:13:27:0:0:13:27:0:0
chr17	8659680	.	TGGA	T	152.05	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=40;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0100241;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=3;MLLD=248.318;QD=15.5947;RBI=0.0204677;REFB=-0.00336067;REVB=0.017845;RO=19;SAF=4;SAR=16;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.516207;STB=0.791371;STBP=0.001;TYPE=del;VARB=0.00276477;OID=.;OPOS=8659681;OREF=GGA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.512821:20:40:20:39:19:4:16:15:4:99:19:4:16:15:4
chr17	8701116	.	G	A	166.73	PASS	AF=0.38;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=50;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=-0.0262241;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.462;QD=13.338;RBI=0.0276285;REFB=-0.0308111;REVB=0.0086967;RO=30;SAF=10;SAR=9;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114534;STB=0.554084;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.0369666;OID=.;OPOS=8701116;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:30:31:19:19:0.38:9:10:19:11:9:10:19:12
chr17	8701423	.	A	G	279.02	PASS	AF=0.609756;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=41;FR=.;FRO=16;FSAF=19;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0321947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.663;QD=27.2216;RBI=0.0322;REFB=0.00278413;REVB=0.000588208;RO=16;SAF=19;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170943;STB=0.595099;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=-0.00215586;OID=.;OPOS=8701423;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:16:16:25:25:0.609756:6:19:9:7:6:19:9:7
chr17	8701799	.	G	T	186.97	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.00502013;FXX=0.0465008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.603;QD=18.2412;RBI=0.0217134;REFB=-0.0193976;REVB=-0.0211251;RO=19;SAF=10;SAR=9;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138931;STB=0.610575;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0174912;OID=.;OPOS=8701799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:41:19:22:19:19:0.463415:9:10:7:12:9:10:7:15
chr17	8725214	.	A	AG	324.21	PASS	AF=1;AO=28;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.13354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=28.4583;QD=44.7186;RBI=0.134583;REFB=0;REVB=-0.0167181;RO=2;SAF=7;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115702;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00492772;OID=.;OPOS=8725215;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:28:30:29:29:0:8:21:0:0:6:2:7:21:2:0
chr17	8792029	.	A	G	119.74	PASS	AF=0.424242;AO=14;DP=33;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=-0.0733718;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.8931;QD=14.5137;RBI=0.0749666;REFB=-0.0203526;REVB=0.0153808;RO=19;SAF=5;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171518;STB=0.599854;STBP=0.359;TYPE=snp;VARB=0.0475435;OID=.;OPOS=8792029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:19:19:14:14:0.424242:9:5:10:9:9:5:10:9
chr17	8792514	.	G	A	295.61	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.00436746;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0468;QD=20.3871;RBI=0.00959097;REFB=-0.00720789;REVB=-0.00853886;RO=27;SAF=21;SAR=10;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174333;STB=0.597092;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0117545;OID=.;OPOS=8792514;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:10:21:13:14:10:21:13:14
chr17	9395231	.	G	A	518.28	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262791;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.149;QD=59.2316;RBI=0.0280734;REFB=0;REVB=-0.00987534;RO=0;SAF=19;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.20118e-05;OID=.;OPOS=9395231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:16:19:0:0:16:19:0:0
chr17	9471711	.	T	G	368.38	PASS	AF=0.903226;AO=28;DP=31;FAO=28;FDP=31;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0483101;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=175.327;QD=47.5329;RBI=0.0499106;REFB=-0.104042;REVB=-0.0125381;RO=3;SAF=15;SAR=13;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844048;STB=0.545422;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=0.00107713;OID=.;OPOS=9471711;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:31:31:3:3:28:28:0.903226:13:15:3:0:13:15:3:0
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chr17	9515777	.	G	A	791.63	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0925947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1406;QD=56.5449;RBI=0.0927006;REFB=0;REVB=0.00443044;RO=0;SAF=17;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.08382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155974;OID=.;OPOS=9515777;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:56:0:0:54:56:1:37:17:0:0:37:19:0:0
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chr17	9712255	.	G	A	226.91	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=0.0188572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.295;QD=21.1084;RBI=0.0283374;REFB=-0.0313154;REVB=-0.0211523;RO=20;SAF=13;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161935;STB=0.625417;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0248014;OID=.;OPOS=9712255;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:20:21:22:22:0.511628:9:13:8:12:8:14:8:13
chr17	9725101	.	G	A	220.4	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0580455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.984;QD=16.0294;RBI=0.0593936;REFB=-0.0321821;REVB=-0.0125825;RO=29;SAF=13;SAR=12;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302481;STB=0.525527;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.0347478;OID=.;OPOS=9725101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:30:25:25:0.454545:12:13:16:13:12:13:17:13
chr17	9725338	.	G	A	524.52	PASS	AF=0.466667;AO=56;DP=120;FAO=56;FDP=120;FR=.;FRO=64;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=25;FWDB=-0.0248472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.463;QD=17.4841;RBI=0.0374307;REFB=-0.017417;REVB=0.0279943;RO=64;SAF=28;SAR=28;SRF=39;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105066;STB=0.558313;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.0156536;OID=.;OPOS=9725338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:64:64:56:56:0.466667:28:28:39:25:28:28:39:25
chr17	9725347	.	A	G	498.65	PASS	AF=0.490741;AO=52;DP=107;FAO=53;FDP=108;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=33;FSRR=22;FWDB=-0.0315002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.247;QD=18.4686;RBI=0.0382235;REFB=-0.016463;REVB=-0.0216512;RO=55;SAF=29;SAR=23;SRF=33;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399734;STB=0.527275;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0377167;OID=.;OPOS=9725347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:55:55:52:53:0.490741:23:29:33:22:24:29:33:22
chr17	9745903	.	A	G	293.46	PASS	AF=0.417722;AO=33;DP=79;FAO=33;FDP=79;FR=.;FRO=46;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=-0.0203849;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.6392;QD=14.8585;RBI=0.0219653;REFB=-0.0156713;REVB=-0.00818108;RO=46;SAF=19;SAR=14;SRF=14;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273746;STB=0.654103;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0192377;OID=.;OPOS=9745903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:46:46:33:33:0.417722:14:19:14:32:14:19:14:32
chr17	9764531	.	A	G	657.25	PASS	AF=0.561404;AO=64;DP=114;FAO=64;FDP=114;FR=.;FRO=50;FSAF=35;FSAR=29;FSRF=16;FSRR=34;FWDB=0.0100265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.8;QD=23.0613;RBI=0.0100265;REFB=0.00787443;REVB=-7.71071e-06;RO=50;SAF=35;SAR=29;SRF=16;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18051;STB=0.598504;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.00778924;OID=.;OPOS=9764531;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:114:50:50:64:64:0.561404:29:35:16:34:29:35:16:34
chr17	9769199	.	T	C	160.9	PASS	AF=0.391304;AO=18;DP=46;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=-0.0188762;FXX=0.0212721;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.2505;QD=13.9915;RBI=0.100546;REFB=0.0113314;REVB=0.0987582;RO=28;SAF=14;SAR=4;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219194;STB=0.580911;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=-0.0258;OID=.;OPOS=9769199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:28:28:18:18:0.391304:4:14:17:11:5:13:17:11
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chr17	10206595	.	T	C	1237.92	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269619;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.078;QD=61.1316;RBI=0.0278107;REFB=0;REVB=0.00681864;RO=0;SAF=41;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111591;OID=.;OPOS=10206595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:39:41:0:0:40:41:0:0
chr17	10222149	.	A	G	1460.91	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032956;FXX=0.0212743;HRUN=2;LEN=1;MLLD=208.037;QD=63.5178;RBI=0.0341893;REFB=0;REVB=-0.00909991;RO=0;SAF=51;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.99529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.78371e-05;OID=.;OPOS=10222149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:92:0:0:92:92:1:41:51:0:0:41:51:0:0
chr17	10223697	.	G	T	710.17	PASS	AF=1;AO=40;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.083;QD=63.1262;RBI=0.0339918;REFB=0;REVB=0.003952;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000171629;OID=.;OPOS=10223697;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:40:45:1:21:19:0:0:23:22:0:0
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chr17	10243717	.	G	A	350.0	PASS	AF=0.5625;AO=35;DP=63;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.0306019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.1096;QD=21.8751;RBI=0.0307603;REFB=-0.02993;REVB=-0.00311807;RO=28;SAF=19;SAR=16;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0232157;STB=0.507038;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0342574;OID=.;OPOS=10243717;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:28:28:35:36:0.5625:16:19:16:12:16:20:16:12
chr17	10318635	.	CA	C,CG	1214.84	PASS	AF=0.154762,0.845238;AO=13,68;DP=83;FAO=13,71;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=13,32;FSAR=0,39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00695052,0.0288225;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=99.433,116.141;QD=57.8497;RBI=0.0679275,0.0699609;REFB=0,0;REVB=0.067571,0.0637479;RO=0;SAF=13,31;SAR=0,37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0349369,-0.0012906;OID=.,.;OPOS=10318636,10318636;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.154762,0.845238:13,68:83:13,71:84:0:13,32:0,39:0:0:48:0:13,31:0,37:0:0
chr17	10346781	.	T	C	1024.84	PASS	AF=0.959459;AO=71;DP=74;FAO=71;FDP=74;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0554003;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.755;QD=55.3966;RBI=0.0555701;REFB=-0.0894226;REVB=-0.00434051;RO=2;SAF=15;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221137;STB=0.507359;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.00332719;OID=.;OPOS=10346781;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:74:74:2:3:71:71:0.959459:56:15:1:1:56:15:1:2
chr17	10348354	.	T	C	708.5	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0144123;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.987;QD=62.9775;RBI=0.0521791;REFB=0;REVB=0.0501492;RO=0;SAF=25;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.2077e-05;OID=.;OPOS=10348354;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:20:25:0:0:20:25:0:0
chr17	10350385	.	ATTT	AT,ATTC,ATT	743.76	PASS	AF=0,0.117021,0.882979;AO=29,9,18;DP=93;FAO=0,11,83;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=0,11,50;FSAR=0,0,33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.237303,-0.0999667,-0.499408;FXX=0.0105252;HRUN=4,4,4;LEN=2,1,1;MLLD=10.8413,217.15,10.0908;QD=31.6491;RBI=0.532435,0.146957,1.07108;REFB=0.104404,-0.0107869,0.0814174;REVB=0.476629,0.107718,0.947525;RO=32;SAF=29,9,18;SAR=0,0,0;SRF=1;SRR=31;SSEN=0.452899,0,0.452899;SSEP=0,0,0;SSSB=0.89185,0.874198,0.885245;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,del;VARB=0.017073,0.153377,-0.0499087;OID=.,.,.;OPOS=10350386,10350388,10350386;OREF=TT,T,T;OALT=-,C,-;OMAPALT=AT,ATTC,ATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.117021,0.882979:29,9,18:93:0,11,83:94:0:0,11,50:0,0,33:0:0:48:32:29,9,18:0,0,0:1:31
chr17	10355371	.	C	T	728.93	PASS	AF=0.979592;AO=46;DP=47;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.04759;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.1136;QD=59.5042;RBI=0.222428;REFB=-0.140441;REVB=0.217278;RO=1;SAF=24;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191868;STB=0.5102;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.0110084;OID=.;OPOS=10355371;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:49:1:1:46:48:0.979592:22:24:1:0:24:24:1:0
chr17	10355763	.	T	C	1605.29	PASS	AF=1;AO=107;DP=107;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00800199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.114;QD=60.0109;RBI=0.0438108;REFB=0;REVB=0.0430738;RO=0;SAF=48;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.65686e-05;OID=.;OPOS=10355763;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:107:0:0:107:107:1:59:48:0:0:59:48:0:0
chr17	10363410	.	A	G	3090.48	PASS	AF=1;AO=200;DP=202;FAO=200;FDP=200;FR=.;FRO=0;FSAF=102;FSAR=98;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330507;FXX=0.0196069;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.432;QD=61.8097;RBI=0.033141;REFB=0;REVB=-0.00244481;RO=0;SAF=102;SAR=98;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.23452e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.99486e-05;OID=.;OPOS=10363410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:202:200:0:0:200:200:1:98:102:0:0:98:102:0:0
chr17	10415840	.	A	G	853.09	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0223919;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.557;QD=55.0379;RBI=0.0240939;REFB=0;REVB=0.00889482;RO=1;SAF=33;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017801;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00063685;OID=.;OPOS=10415840;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:60:62:1:0:59:62:1:26:33:0:1:27:35:0:0
chr17	10427924	.	G	A,C	1044.71	PASS	AF=0.933333,0.04;AO=70,3;DP=75;FAO=70,3;FDP=75;FR=.;FRO=2;FSAF=24,3;FSAR=46,0;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0439055,0.0220963;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=208.468,134.83;QD=55.7181;RBI=0.0452582,0.02223;REFB=-0.0805669,-0.108017;REVB=0.0109824,-0.00243454;RO=2;SAF=24,3;SAR=46,0;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.020113,0.74993;STB=0.510635,0.995982;STBP=0.419,0.058;TYPE=snp,snp;VARB=0.000902728,0.104782;OID=.,.;OPOS=10427924,10427924;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:75:75:2:2:70,3:70,3:0.933333,0.04:46,0:24,3:0:2:46,0:24,3:0:2
chr17	10448769	.	A	T	1523.81	PASS	AF=0.990385;AO=103;DP=105;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=42;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0106903;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.519;QD=58.6081;RBI=0.0168331;REFB=-0.016309;REVB=-0.0130026;RO=1;SAF=42;SAR=61;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00771574;STB=0.504064;STBP=0.476;TYPE=snp;VARB=0.000102677;OID=.;OPOS=10448769;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:104:1:1:103:103:0.990385:61:42:0:1:61:42:0:1
chr17	10450816	.	T	C	2011.18	PASS	AF=0.992366;AO=129;DP=130;FAO=130;FDP=131;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00320784;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.892;QD=61.4101;RBI=0.0340523;REFB=-0.0284961;REVB=0.0339009;RO=1;SAF=79;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00597814;STB=0.503144;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=2.19846e-05;OID=.;OPOS=10450816;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:130:131:1:1:129:130:0.992366:50:79:1:0:51:79:1:0
chr17	10536018	.	G	A	1601.04	PASS	AF=1;AO=101;DP=105;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342562;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.367;QD=59.852;RBI=0.0761501;REFB=0;REVB=0.06801;RO=0;SAF=41;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.25502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141114;OID=.;OPOS=10536018;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:107:0:0:101:107:1:60:41:0:0:60:47:0:0
chr17	10541515	.	C	T	1018.85	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.108153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9792;QD=58.2199;RBI=0.122604;REFB=0;REVB=0.0577483;RO=1;SAF=29;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160211;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0022831;OID=.;OPOS=10541515;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:70:1:0:69:70:1:40:29:1:0:40:30:0:0
chr17	10542471	.	T	G	1428.69	PASS	AF=0.978723;AO=92;DP=95;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0252929;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.997;QD=60.7954;RBI=0.0484694;REFB=-0.0884824;REVB=0.0413468;RO=2;SAF=50;SAR=42;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00176636;STB=0.500932;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.00314439;OID=.;OPOS=10542471;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:95:94:2:2:92:92:0.978723:42:50:1:1:42:50:1:1
chr17	10542765	.	A	G	1190.45	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.06;QD=61.0489;RBI=0.0172115;REFB=0;REVB=0.00159611;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.67968e-05;OID=.;OPOS=10542765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:39:38:0:0:39:39:0:0
chr17	10542886	.	T	C	920.01	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0512782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.658;QD=58.4136;RBI=0.0513746;REFB=0;REVB=0.00314528;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000194938;OID=.;OPOS=10542886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0
chr17	10543463	.	T	C	2177.5	PASS	AF=1;AO=134;DP=134;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0777077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.004;QD=63.116;RBI=0.0790747;REFB=0;REVB=0.0146398;RO=0;SAF=52;SAR=82;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148972;OID=.;OPOS=10543463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:134:138:0:0:134:138:1:82:52:0:0:83:55:0:0
chr17	10544416	.	G	T	785.74	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0117195;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.884;QD=64.142;RBI=0.0258864;REFB=0;REVB=0.0230816;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.30842e-05;OID=.;OPOS=10544416;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:29:20:0:0:29:20:0:0
chr17	10614442	.	A	G	192.4	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=8;FSRR=20;FWDB=0.0522747;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.0261;QD=16.0334;RBI=0.0537024;REFB=-0.0023127;REVB=0.0123005;RO=28;SAF=6;SAR=14;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0174267;STB=0.50999;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0050346;OID=.;OPOS=10614442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:28:28:20:20:0.416667:14:6:8:20:14:6:8:20
chr17	10617803	.	G	T	46.24	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=13;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0357299;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.133;QD=13.2124;RBI=0.0552912;REFB=-0.00965612;REVB=-0.0421959;RO=7;SAF=5;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413635;STB=0.768342;STBP=0.11;TYPE=snp;VARB=0.0126723;OID=.;OPOS=10617803;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:13:14:7:7:6:7:0.5:1:5:3:4:1:6:3:4
chr17	11511457	.	C	T	220.43	PASS	AF=0.583333;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0090073;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=306.495;QD=24.4926;RBI=0.0104269;REFB=-0.026466;REVB=0.00525256;RO=15;SAF=9;SAR=12;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736264;STB=0.540945;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0190412;OID=.;OPOS=11511457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:15:21:21:0.583333:12:9:5:10:12:9:5:10
chr17	11523082	.	A	G	806.63	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00898989;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.63;QD=56.6056;RBI=0.00958291;REFB=0;REVB=-0.00331875;RO=0;SAF=35;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.86274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00018627;OID=.;OPOS=11523082;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:57:0:0:54:57:1:19:35:0:0:19:38:0:0
chr17	11583089	.	T	C	1339.74	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.664;QD=62.3136;RBI=0.0487311;REFB=0;REVB=0.0469755;RO=0;SAF=51;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.84682e-05;OID=.;OPOS=11583089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:34:51:0:0:35:51:0:0
chr17	11648332	.	C	T	692.1	PASS	AF=0.96;AO=42;DP=46;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.162472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6908;QD=55.3681;RBI=0.162473;REFB=-0.200578;REVB=-0.000393704;RO=2;SAF=17;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0084084;STB=0.500834;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0055413;OID=.;OPOS=11648332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:46:50:2:2:42:48:0.96:25:17:1:1:25:23:1:1
chr17	11651057	.	A	G	172.93	PASS	AF=0.486486;AO=17;DP=36;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0732528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.563;QD=18.6948;RBI=0.0761946;REFB=0.000775433;REVB=-0.0209678;RO=17;SAF=4;SAR=13;SRF=3;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755876;STB=0.529378;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=-0.00471964;OID=.;OPOS=11651057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:17:19:17:18:0.486486:13:4:3:14:14:4:5:14
chr17	11713596	.	G	A	277.02	PASS	AF=0.390244;AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=82;FR=.;FRO=50;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.0177067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.845;QD=13.513;RBI=0.0539465;REFB=-0.0133494;REVB=-0.0509577;RO=50;SAF=21;SAR=11;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214046;STB=0.622387;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0185998;OID=.;OPOS=11713596;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:50:50:32:32:0.390244:11:21:23:27:11:21:23:27
chr17	11757556	.	C	G	306.87	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.00745528;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.2137;QD=15.5378;RBI=0.00940305;REFB=0.0073666;REVB=0.00573028;RO=44;SAF=16;SAR=18;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119939;STB=0.560795;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=-0.00791554;OID=.;OPOS=11757556;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:44:45:34:34:0.43038:18:16:26:18:18:16:26:19
chr17	11786951	.	T	C	216.05	PASS	AF=0.438596;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=57;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.0154653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.714;QD=15.1614;RBI=0.0409087;REFB=-3.25418e-06;REVB=0.0378727;RO=30;SAF=15;SAR=10;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138904;STB=0.590841;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.000181892;OID=.;OPOS=11786951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:57:30:32:25:25:0.438596:10:15:22:8:10:15:24:8
chr17	11787936	.	A	G	234.95	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0229459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.205;QD=18.7956;RBI=0.0232443;REFB=-0.00433421;REVB=-0.00371252;RO=27;SAF=13;SAR=10;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218298;STB=0.623184;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.00367633;OID=.;OPOS=11787936;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:10:13:9:18:10:13:9:18
chr17	11833287	.	A	G	585.01	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0516322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.242;QD=60.0007;RBI=0.0596239;REFB=0;REVB=0.0298183;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000407482;OID=.;OPOS=11833287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:37:39:1:14:23:0:0:14:25:0:0
chr17	11833365	.	G	A	174.95	PASS	AF=1;AO=9;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.255294;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.023;QD=46.6542;RBI=0.255652;REFB=0;REVB=-0.0135256;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000846743;OID=.;OPOS=11833365;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:9:15:1:5:4:0:0:5:10:0:0
chr17	11835331	.	G	A	1661.16	PASS	AF=0.991071;AO=112;DP=112;FAO=111;FDP=112;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0122119;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.399;QD=59.327;RBI=0.0453532;REFB=-0.0485361;REVB=-0.0436781;RO=0;SAF=64;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41465e-08;STB=0.505262;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.000195103;OID=.;OPOS=11835331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:112:112:0:1:112:111:0.991071:48:64:0:0:47:64:0:1
chr17	12647729	.	T	C	129.42	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.00310677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.758;QD=12.942;RBI=0.00693693;REFB=-0.0200688;REVB=0.00620233;RO=25;SAF=8;SAR=7;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285998;STB=0.516756;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.0311609;OID=.;OPOS=12647729;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:7:8:14:11:7:8:14:11
chr17	12656111	.	T	C	262.08	PASS	AF=0.529412;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=51;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.0034452;FXX=0.105245;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.32;QD=20.5554;RBI=0.0166344;REFB=-0.00117431;REVB=0.0162737;RO=19;SAF=7;SAR=20;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186368;STB=0.609051;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.000697555;OID=.;OPOS=12656111;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:51:19:24:27:27:0.529412:20:7:9:10:20:7:11:13
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chr17	12894832	.	A	G	124.86	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.0231993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9549;QD=17.8367;RBI=0.0549179;REFB=-0.00239871;REVB=-0.0497772;RO=14;SAF=4;SAR=10;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474378;STB=0.768875;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.000946255;OID=.;OPOS=12894832;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:10:4:12:2:10:4:12:2
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chr17	14139891	.	A	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00333735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.9;QD=42.1826;RBI=0.0651777;REFB=0;REVB=0.0650922;RO=0;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000819145;OID=.;OPOS=14139891;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:2:9:0:0:2:9:0:0
chr17	14140080	.	C	T	246.86	PASS	AF=0.490909;AO=26;DP=54;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=24;FWDB=-0.0329962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.336;QD=17.9534;RBI=0.0337809;REFB=-0.0226347;REVB=0.00723876;RO=28;SAF=11;SAR=15;SRF=4;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.281571;STB=0.646964;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0291366;OID=.;OPOS=14140080;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:28:28:26:27:0.490909:15:11:4:24:16:11:4:24
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chr17	14248422	.	CT	C,CC	235.81	PASS	AF=0.0526316,0.947368;AO=3,16;DP=19;FAO=1,18;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=1,5;FSAR=0,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0538066,0.0482896;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=93.8393,101.403;QD=49.6436;RBI=0.062991,0.0515112;REFB=0,0;REVB=-0.0327524,-0.0179308;RO=0;SAF=2,4;SAR=1,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.07465e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0120654,0.0274048;OID=.,.;OPOS=14248423,14248423;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0526316,0.947368:3,16:19:1,18:19:0:1,5:0,13:0:0:4:0:2,4:1,12:0:0
chr17	14249167	.	C	T	816.97	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0413445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.824;QD=57.3311;RBI=0.0463582;REFB=0;REVB=0.0209695;RO=0;SAF=36;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.05885e-05;OID=.;OPOS=14249167;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:54:57:0:0:54:57:1:18:36:0:0:19:38:0:0
chr17	14673567	.	C	CA	62.89	PASS	AF=0.403846;AO=18;DP=57;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=0.0242977;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.86708;QD=4.83776;RBI=0.175505;REFB=0.0215817;REVB=-0.173815;RO=35;SAF=9;SAR=9;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160146;STB=0.534038;STBP=0.681;TYPE=ins;VARB=-0.0935357;OID=.;OPOS=14673568;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.403846:18:57:21:52:31:10:11:13:18:62:35:9:9:18:17
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chr17	15343524	.	C	CCTT	446.79	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=195.931;QD=57.6508;RBI=0.0287129;REFB=0;REVB=0.0287129;RO=1;SAF=0;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=9.21645e-05;OID=.;OPOS=15343525;OREF=-;OALT=CTT;OMAPALT=CCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:30:31:31:31:0:0:31:0:0:4:1:0:30:0:1
chr17	15492409	.	T	C	75.2	PASS	AF=1;AO=6;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.755;QD=37.5987;RBI=0.0544911;REFB=0;REVB=0.0526825;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011066;OID=.;OPOS=15492409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:6:8:1:3:3:0:0:4:4:0:0
chr17	15496727	.	T	G	347.4	PASS	AF=0.507042;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00769276;FXX=0.0273935;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0516;QD=19.5721;RBI=0.06932;REFB=-0.0188774;REVB=0.0688919;RO=37;SAF=15;SAR=21;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0890367;STB=0.562613;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0297316;OID=.;OPOS=15496727;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:71:37:35:36:36:0.507042:21:15:19:18:21:15:19:16
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chr17	15620481	.	C	T	151.31	PASS	AF=0.247191;AO=22;DP=89;FAO=22;FDP=89;FR=.;FRO=67;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=44;FWDB=-0.00369321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3319;QD=6.80024;RBI=0.0281915;REFB=-0.00787526;REVB=-0.0279485;RO=67;SAF=11;SAR=11;SRF=23;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19526;STB=0.617876;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0297904;OID=.;OPOS=15620481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:67:67:22:22:0.247191:11:11:23:44:11:11:23:44
chr17	15690281	.	C	T	771.28	PASS	AF=0.982143;AO=44;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0402803;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.8853;QD=55.0916;RBI=0.253092;REFB=-0.0976733;REVB=0.249866;RO=1;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268299;STB=0.509088;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.00529008;OID=.;OPOS=15690281;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:56:56:1:1:44:55:0.982143:17:27:0:1:27:28:0:1
chr17	15690294	.	CCTTCTT	CCTT,CCTTCTC	868.75	PASS	AF=0.934426,0.0655738;AO=55,4;DP=61;FAO=57,4;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=29,2;FSAR=28,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124133,-0.0706947;FXX=0.0161264;HRUN=1,2;LEN=3,1;MLLD=160.064,47.8825;QD=56.9675;RBI=0.0206299,0.0810527;REFB=0,0;REVB=0.0164774,-0.0396459;RO=0;SAF=28,2;SAR=27,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.4002e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00104648,-0.0586747;OID=.,.;OPOS=15690295,15690300;OREF=CTT,T;OALT=-,C;OMAPALT=CCTT,CCTTCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.934426,0.0655738:55,4:61:57,4:61:0:29,2:28,2:0:0:16:0:28,2:27,2:0:0
chr17	15690793	.	T	C	2048.8	PASS	AF=1;AO=130;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0136629;FXX=0.00757518;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.347;QD=62.5589;RBI=0.0206093;REFB=0;REVB=0.0154294;RO=0;SAF=50;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.38009e-06;OID=.;OPOS=15690793;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:131:0:0:130:131:1:80:50:0:0:80:51:0:0
chr17	15690928	.	G	C	1163.71	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.06;QD=60.4525;RBI=0.0150709;REFB=0;REVB=0.0110535;RO=0;SAF=26;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99741e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92102e-05;OID=.;OPOS=15690928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:76:77:1:50:26:0:0:51:26:0:0
chr17	16068287	.	A	T	31.51	PASS	AF=0.0865385;AO=8;DP=104;FAO=9;FDP=104;FR=.;FRO=95;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=56;FSRR=39;FWDB=-0.0180195;FXX=0.0188661;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.366;QD=1.21174;RBI=0.0276621;REFB=-0.000269252;REVB=0.0209878;RO=91;SAF=7;SAR=1;SRF=55;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.347347;STB=0.83248;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00634319;OID=.;OPOS=16068287;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:104:104:91:95:8:9:0.0865385:1:7:55:36:1:8:56:39
chr17	16068340	.	C	T	207.33	PASS	AF=0.221519;AO=29;DP=151;FAO=35;FDP=158;FR=.;FRO=123;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=68;FSRR=55;FWDB=-0.00463038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.044;QD=5.24877;RBI=0.0215034;REFB=-0.0135654;REVB=-0.0209989;RO=119;SAF=21;SAR=8;SRF=67;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2222;STB=0.537641;STBP=0.613;TYPE=snp;VARB=0.0448702;OID=.;OPOS=16068340;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:158:119:123:29:35:0.221519:8:21:67:52:14:21:68:55
chr17	16068343	.	G	A	221.5	PASS	AF=0.223602;AO=36;DP=163;FAO=36;FDP=161;FR=.;FRO=125;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=69;FSRR=56;FWDB=-0.02023;FXX=0.0182916;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6619;QD=5.50319;RBI=0.0374855;REFB=-0.0141759;REVB=-0.031558;RO=126;SAF=22;SAR=14;SRF=68;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0926118;STB=0.547237;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0374678;OID=.;OPOS=16068343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:161:126:125:36:36:0.223602:14:22:68:58:14:22:69:56
chr17	16068362	.	C	T	383.24	PASS	AF=0.292135;AO=52;DP=180;FAO=52;FDP=178;FR=.;FRO=126;FSAF=34;FSAR=18;FSRF=69;FSRR=57;FWDB=-0.0046937;FXX=0.0111105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.795;QD=8.61209;RBI=0.0214013;REFB=-0.0103553;REVB=-0.0208803;RO=127;SAF=34;SAR=18;SRF=69;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139815;STB=0.578988;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.020236;OID=.;OPOS=16068362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:178:127:126:52:52:0.292135:18:34:69:58:18:34:69:57
chr17	16068377	.	C	G	406.07	PASS	AF=0.3;AO=54;DP=182;FAO=54;FDP=180;FR=.;FRO=126;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=72;FSRR=54;FWDB=0.00494861;FXX=0.0109884;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.545;QD=9.02369;RBI=0.0055223;REFB=0.000525755;REVB=0.00245092;RO=121;SAF=33;SAR=21;SRF=68;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604255;STB=0.528835;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=-0.000654712;OID=.;OPOS=16068377;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:182:180:121:126:54:54:0.3:21:33:68:53:21:33:72:54
chr17	16068383	.	G	A	485.05	PASS	AF=0.324468;AO=59;DP=187;FAO=61;FDP=188;FR=.;FRO=127;FSAF=40;FSAR=21;FSRF=73;FSRR=54;FWDB=-0.0100575;FXX=0.00529073;HRUN=1;LEN=1;MLLD=335.475;QD=10.3202;RBI=0.0105029;REFB=-0.00491897;REVB=-0.00302624;RO=128;SAF=40;SAR=19;SRF=73;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13686;STB=0.558328;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.00981207;OID=.;OPOS=16068383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:187:188:128:127:59:61:0.324468:19:40:73:55:21:40:73:54
chr17	16068396	.	G	A	546.07	PASS	AF=0.356757;AO=63;DP=183;FAO=66;FDP=185;FR=.;FRO=119;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=67;FSRR=52;FWDB=-0.0259115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.684;QD=11.807;RBI=0.0346304;REFB=-0.00804837;REVB=0.0229751;RO=111;SAF=43;SAR=20;SRF=65;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118676;STB=0.571406;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0253265;OID=.;OPOS=16068396;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:183:185:111:119:63:66:0.356757:20:43:65:46:22:44:67:52
chr17	16068463	.	C	T	173.72	PASS	AF=0.193548;AO=30;DP=155;FAO=30;FDP=155;FR=.;FRO=125;FSAF=24;FSAR=6;FSRF=62;FSRR=63;FWDB=-0.0248799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.693;QD=4.48311;RBI=0.029064;REFB=-0.00452525;REVB=-0.0150234;RO=125;SAF=24;SAR=6;SRF=62;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.410959;STB=0.762246;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.017783;OID=.;OPOS=16068463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:155:125:125:30:30:0.193548:6:24:62:63:6:24:62:63
chr17	16322676	.	T	C	337.75	PASS	AF=0.411111;AO=37;DP=90;FAO=37;FDP=90;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=18;FWDB=0.0335158;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.0963;QD=15.0109;RBI=0.0382653;REFB=-0.0133551;REVB=0.0184643;RO=53;SAF=18;SAR=19;SRF=35;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180751;STB=0.60186;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=0.020314;OID=.;OPOS=16322676;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:53:53:37:37:0.411111:19:18:35:18:19:18:35:18
chr17	16524929	.	C	A	850.55	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00895636;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.945;QD=57.6643;RBI=0.0101269;REFB=0;REVB=0.00472631;RO=0;SAF=24;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.31293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.76942e-06;OID=.;OPOS=16524929;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:34:24:0:0:34:25:0:0
chr17	16635980	.	G	A	272.51	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0582388;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.683;QD=51.9069;RBI=0.0593751;REFB=0;REVB=-0.0115602;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00194843;OID=.;OPOS=16635980;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr17	16735618	.	G	A	411.1	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0160502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.56;QD=56.7035;RBI=0.0709175;REFB=0;REVB=0.0690773;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000330537;OID=.;OPOS=16735618;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:14:14:0:0:14:15:0:0
chr17	16746358	.	G	A	632.15	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0418186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4799;QD=61.6735;RBI=0.0423281;REFB=0;REVB=-0.00654766;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000272142;OID=.;OPOS=16746358;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr17	16829159	.	C	T	60.06	PASS	AF=0.219512;AO=9;DP=40;FAO=9;FDP=41;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.0280853;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=187.504;QD=5.85968;RBI=0.0326673;REFB=0.000157652;REVB=-0.0166845;RO=31;SAF=3;SAR=6;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258426;STB=0.677029;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=-0.000798499;OID=.;OPOS=16829159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:40:41:31:32:9:9:0.219512:6:3:17:14:6:3:18:14
chr17	16842912	.	A	G	482.5	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342568;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.706;QD=56.7644;RBI=0.0589394;REFB=0;REVB=0.0479617;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0023432;OID=.;OPOS=16842912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:34:0:0:32:34:1:15:17:0:0:16:18:0:0
chr17	16855878	.	C	T	288.23	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0779657;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=92.8664;QD=52.4046;RBI=0.086488;REFB=0;REVB=0.037437;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000671332;OID=.;OPOS=16855878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr17	16892265	.	G	A	184.83	PASS	AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=17;FWDB=-0.0516796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.7473;QD=12.1197;RBI=0.0574818;REFB=0.0107084;REVB=0.0251672;RO=37;SAF=14;SAR=9;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0455764;STB=0.536051;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=-0.0177801;OID=.;OPOS=16892265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:37:38:23:23:0.377049:9:14:21:16:9:14:21:17
chr17	16892273	.	A	G	137.37	PASS	AF=0.327273;AO=18;DP=56;FAO=18;FDP=55;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.040728;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2935;QD=9.99049;RBI=0.0512014;REFB=0.00328359;REVB=0.0310292;RO=36;SAF=10;SAR=8;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316134;STB=0.528424;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=-0.00406618;OID=.;OPOS=16892273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:36:37:18:18:0.327273:8:10:19:17:8:10:19:18
chr17	17039561	.	CCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC	CCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC,CCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA	322.37	PASS	AF=1,0;AO=12,3;DP=24;FAO=24,0;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0;FSAR=7,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.11537,0.0970088;FXX=0.11107;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=96.8166,79.8103;QD=53.7286;RBI=0.149854,0.137771;REFB=0,0;REVB=0.0956354,0.0978273;RO=0;SAF=9,3;SAR=3,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.00168309,0;OID=.,.;OPOS=17039562,17039594;OREF=CAG,GC;OALT=-,-;OMAPALT=CCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGC,CCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:12,3:24:24,0:24:0:17,0:7,0:0:0:3:0:9,3:3,0:0:0
chr17	17046024	.	C	A	638.48	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0817253;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.9437;QD=59.3934;RBI=0.0906203;REFB=-0.0220456;REVB=-0.0391537;RO=1;SAF=27;SAR=15;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170712;STB=0.509087;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00478818;OID=.;OPOS=17046024;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:15:27:1:0:15:27:1:0
chr17	17062241	.	C	G	4276.03	PASS	AF=0.908257;AO=299;DP=330;FAO=297;FDP=327;FR=.;FRO=30;FSAF=156;FSAR=141;FSRF=20;FSRR=10;FWDB=0.0136013;FXX=0.00909063;HRUN=5;LEN=1;MLLD=209.655;QD=52.3062;RBI=0.0261096;REFB=-0.104524;REVB=0.0222871;RO=20;SAF=159;SAR=140;SRF=16;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032198;STB=0.513023;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00113349;OID=.;OPOS=17062241;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:330:327:20:30:299:297:0.908257:140:159:16:4:141:156:20:10
chr17	17069105	.	G	A	788.54	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025666;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.696;QD=57.3484;RBI=0.035297;REFB=0;REVB=0.0242308;RO=0;SAF=27;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000211714;OID=.;OPOS=17069105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:28:27:0:0:28:27:0:0
chr17	17168164	.	G	A	538.53	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.055442;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.805;QD=59.8366;RBI=0.0559913;REFB=0;REVB=0.00782373;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.85787e-05;OID=.;OPOS=17168164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:14:21:0:0:14:22:0:0
chr17	17179481	.	G	A	588.75	PASS	AF=0.891304;AO=41;DP=46;FAO=41;FDP=46;FR=.;FRO=5;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0586611;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.61;QD=51.1957;RBI=0.0591131;REFB=0.0202053;REVB=0.00729626;RO=3;SAF=20;SAR=21;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228343;STB=0.512189;STBP=0.681;TYPE=snp;VARB=-0.0101259;OID=.;OPOS=17179481;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:46:46:3:5:41:41:0.891304:21:20:2:1:21:20:3:2
chr17	17250159	.	C	T	169.48	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0161723;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.773;QD=16.535;RBI=0.0727927;REFB=-0.000893105;REVB=0.0709735;RO=22;SAF=10;SAR=8;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536527;STB=0.519104;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.00131599;OID=.;OPOS=17250159;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:23:18:18:0.439024:8:10:11:11:8:10:12:11
chr17	17326363	.	G	A	156.21	PASS	AF=0.447368;AO=11;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=-0.0838411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.705;QD=16.4431;RBI=0.088223;REFB=-0.0231125;REVB=-0.0274585;RO=13;SAF=1;SAR=10;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14812;STB=0.571343;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0415992;OID=.;OPOS=17326363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:13:21:11:17:0.447368:10:1:2:11:11:6:10:11
chr17	17326604	.	CA	TG	416.16	PASS	AF=0.546667;AO=41;DP=74;FAO=41;FDP=75;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.00992155;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=182.868;QD=22.1951;RBI=0.00992279;REFB=-0.018928;REVB=0.000156717;RO=33;SAF=26;SAR=15;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501241;STB=0.536065;STBP=0.556;TYPE=mnp;VARB=0.0126245;OID=.;OPOS=17326604;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:33:34:41:41:0.546667:15:26:19:14:15:26:19:15
chr17	17397982	.	T	C	1584.51	PASS	AF=0.948276;AO=110;DP=116;FAO=110;FDP=116;FR=.;FRO=6;FSAF=61;FSAR=49;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0863908;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=79.6536;QD=54.6381;RBI=0.0864584;REFB=-0.150012;REVB=-0.00341752;RO=3;SAF=61;SAR=49;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0281754;STB=0.511549;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.00249004;OID=.;OPOS=17397982;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:116:116:3:6:110:110:0.948276:49:61:0:3:49:61:2:4
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chr17	17697099	.	G	A	343.66	PASS	AF=1;AO=2;DP=16;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.154394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.924;QD=52.8701;RBI=0.260338;REFB=0;REVB=0.209615;RO=0;SAF=2;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00225996;OID=.;OPOS=17697099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:26:0:0:2:26:1:0:2:0:0:12:14:0:0
chr17	17700525	.	T	TA	42.62	PASS	AF=0.185714;AO=11;DP=70;FAO=13;FDP=70;FR=.;FRO=57;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=35;FSRR=22;FWDB=-0.0249983;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=135.432;QD=2.43517;RBI=0.030223;REFB=-0.00514328;REVB=-0.0169857;RO=57;SAF=1;SAR=10;SRF=35;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.625953;STB=0.926398;STBP=0.001;TYPE=ins;VARB=0.166918;OID=.;OPOS=17700526;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.185714:11:70:13:70:57:1:12:35:22:42:57:1:10:35:22
chr17	17715101	.	G	A	754.42	PASS	AF=1;AO=50;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.458;QD=56.9375;RBI=0.0370934;REFB=0;REVB=0.0354053;RO=2;SAF=20;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00752343;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105313;OID=.;OPOS=17715101;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:2:0:50:53:1:30:20:1:1:31:22:0:0
chr17	17896089	.	TCCG	TC,TCG,TTCG	680.58	PASS	AF=0,0.979167,0.0208333;AO=5,35,6;DP=47;FAO=0,47,1;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=0,41,1;FSAR=0,6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.191762,-0.122239,0.170562;FXX=0.020404;HRUN=2,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=5.57061,20.9186,5.17698;QD=56.7152;RBI=0.191764,0.124129,0.487695;REFB=0,0,0;REVB=0.000896404,-0.0215773,-0.456897;RO=0;SAF=5,35,0;SAR=0,0,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0,-0.0089328,0.14023;OID=.,.,.;OPOS=17896091,17896090,17896090;OREF=CG,C,C;OALT=-,-,T;OMAPALT=TC,TCG,TTCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.979167,0.0208333:5,35,6:47:0,47,1:48:0:0,41,1:0,6,0:0:0:4:0:5,35,0:0,0,6:0:0
chr17	17896205	.	C	T	1798.19	PASS	AF=0.983607;AO=118;DP=122;FAO=120;FDP=122;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0558965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.134;QD=58.9571;RBI=0.0597399;REFB=0.0336616;REVB=0.0210818;RO=3;SAF=41;SAR=77;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0007332;STB=0.506328;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-7.66531e-05;OID=.;OPOS=17896205;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:122:122:3:2:118:120:0.983607:77:41:1:2:78:42:0:2
chr17	17997146	.	C	G	400.08	PASS	AF=0.525641;AO=34;DP=77;FAO=41;FDP=78;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=0.141566;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.7551;QD=20.5169;RBI=0.142772;REFB=0.07664;REVB=-0.0185173;RO=23;SAF=15;SAR=19;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274901;STB=0.587171;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.0668608;OID=.;OPOS=17997146;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:23:37:34:41:0.525641:19:15:11:12:22:19:24:13
chr17	18003671	.	T	G	561.53	PASS	AF=0.95122;AO=38;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.044524;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.6;QD=54.7837;RBI=0.0510372;REFB=-0.0908236;REVB=0.0249481;RO=2;SAF=24;SAR=14;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0374593;STB=0.519221;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0023832;OID=.;OPOS=18003671;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:41:2:2:38:39:0.95122:14:24:2:0:14:25:2:0
chr17	18025527	.	A	G	486.11	PASS	AF=0.477064;AO=52;DP=110;FAO=52;FDP=109;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.00315615;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.4693;QD=17.8387;RBI=0.0182871;REFB=-0.00575528;REVB=0.0180126;RO=57;SAF=28;SAR=24;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552633;STB=0.530659;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=0.0129362;OID=.;OPOS=18025527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:109:57:57:52:52:0.477064:24:28:34:23:24:28:34:23
chr17	18027845	.	G	A	101.79	PASS	AF=0.411765;AO=11;DP=31;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=-0.00149766;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=68.8598;QD=11.9757;RBI=0.0413283;REFB=-0.00614535;REVB=0.0413011;RO=20;SAF=7;SAR=4;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0969096;STB=0.52937;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.034902;OID=.;OPOS=18027845;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:34:20:20:11:14:0.411765:4:7:11:9:7:7:11:9
chr17	18041507	.	C	T	919.56	PASS	AF=0.970149;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=31;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00296114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.4255;QD=54.8989;RBI=0.0247633;REFB=-0.188166;REVB=-0.0245856;RO=1;SAF=34;SAR=30;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136897;STB=0.514281;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00476555;OID=.;OPOS=18041507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:66:67:1:2:64:65:0.970149:30:34:1:0:31:34:2:0
chr17	18043856	.	A	AC,C	32.74	PASS	AF=0.122449,0;AO=8,2;DP=49;FAO=6,0;FDP=49;FR=.;FRO=43;FSAF=1,0;FSAR=5,0;FSRF=28;FSRR=15;FWDB=-0.0343371,-0.0463983;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=59.8013,194.552;QD=2.67234;RBI=0.0856346,0.0575285;REFB=-0.00827542,-0.00802937;REVB=-0.078449,-0.0340107;RO=39;SAF=4,1;SAR=4,1;SRF=24;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.141522,-0.0969769;STB=0.877703,0.5;STBP=0.108,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0987627,0.13413;OID=.,.;OPOS=18043857,18043856;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:49:49:39:43:8,2:6,0:0.122449,0:4,1:4,1:24:15:5,0:1,0:28:15
chr17	18046898	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320325;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1474;QD=44.6897;RBI=0.0320325;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=13;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013723;OID=.;OPOS=18046898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:0:13:0:0:0:13:0:0
chr17	18047189	.	G	A,C	728.66	PASS	AF=0.961538,0.0384615;AO=50,2;DP=52;FAO=50,2;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27,2;FSAR=23,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016244,-0.0197969;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=136.803,11.6235;QD=56.0504;RBI=0.0436633,0.0296917;REFB=0,0;REVB=0.0405292,0.0221288;RO=0;SAF=27,2;SAR=23,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000156357,0.112028;OID=.,.;OPOS=18047189,18047189;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:52:52:0:0:50,2:50,2:0.961538,0.0384615:23,0:27,2:0:0:23,0:27,2:0:0
chr17	18052867	.	T	C	796.32	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.129177;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.2522;QD=56.8798;RBI=0.129183;REFB=0;REVB=0.00127339;RO=0;SAF=44;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000839218;OID=.;OPOS=18052867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:12:44:0:0:12:44:0:0
chr17	18077175	.	T	C	1571.7	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00394689;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.914;QD=64.1509;RBI=0.0052992;REFB=0;REVB=0.00353604;RO=0;SAF=48;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.7711e-07;OID=.;OPOS=18077175;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:50:48:0:0:50:48:0:0
chr17	18087299	.	C	T	101.89	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.544;QD=40.7565;RBI=0.0661489;REFB=0;REVB=-0.0507131;RO=0;SAF=9;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.8593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.65079e-05;OID=.;OPOS=18087299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:1:9:0:0:1:9:0:0
chr17	18137141	.	A	G	581.05	PASS	AF=0.384181;AO=67;DP=176;FAO=68;FDP=177;FR=.;FRO=109;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=50;FSRR=59;FWDB=0.0152517;FXX=0.0111726;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.355;QD=13.131;RBI=0.0157656;REFB=-0.018232;REVB=0.00399223;RO=109;SAF=38;SAR=29;SRF=48;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138424;STB=0.570743;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0233723;OID=.;OPOS=18137141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:177:109:109:67:68:0.384181:29:38:48:61:29:39:50:59
chr17	18148485	.	G	A	64.35	PASS	AF=0.727273;AO=8;DP=11;FAO=8;FDP=11;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0131458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.17;QD=23.3998;RBI=0.0144737;REFB=0.0321439;REVB=-0.00605619;RO=3;SAF=5;SAR=3;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203264;STB=0.615125;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=-0.00392907;OID=.;OPOS=18148485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:11:11:3:3:8:8:0.727273:3:5:3:0:3:5:3:0
chr17	18167397	.	G	T	99.9	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.0413434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.287;QD=15.3687;RBI=0.0638715;REFB=-0.00392594;REVB=0.0486856;RO=13;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.309193;STB=0.656002;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0070308;OID=.;OPOS=18167397;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:14:12:12:0.461538:7:5:10:3:7:5:10:4
chr17	18167505	.	T	C	801.04	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00813171;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1639;QD=64.0833;RBI=0.0741136;REFB=0;REVB=0.0736661;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000788271;OID=.;OPOS=18167505;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:48:50:1:16:32:0:0:18:32:0:0
chr17	18167684	.	G	A	304.67	PASS	AF=0.471429;AO=32;DP=70;FAO=33;FDP=70;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0109049;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=266.672;QD=17.4094;RBI=0.0172419;REFB=-0.0325689;REVB=-0.0133554;RO=37;SAF=17;SAR=15;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169803;STB=0.500866;STBP=0.978;TYPE=snp;VARB=0.0392767;OID=.;OPOS=18167684;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:37:37:32:33:0.471429:15:17:19:18:16:17:19:18
chr17	18181550	.	GGC	G,GG,GGG	60.33	PASS	AF=0.4,0,0;AO=6,5,2;DP=35;FAO=12,0,0;FDP=30;FR=.;FRO=18;FSAF=10,0,0;FSAR=2,0,0;FSRF=18;FSRR=0;FWDB=0.104441,0.0825969,-0.0235619;FXX=0;HRUN=7,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=18.1606,9.92326,11.6728;QD=8.04429;RBI=0.239129,0.204186,0.0473108;REFB=-0.0707747,-0.119794,-0.0428559;REVB=-0.215116,-0.186734,-0.0410262;RO=17;SAF=6,5,0;SAR=0,0,2;SRF=17;SRR=0;SSEN=0,0.355556,0;SSEP=0,0.305263,0;SSSB=0,0,-0.854459;STB=0.736607,0.5,0.5;STBP=0.421,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.117319,0.0736748,0;OID=.,.,.;OPOS=18181551,18181552,18181552;OREF=GC,C,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=G,GG,GGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4,0,0:6,5,2:35:12,0,0:30:18:10,0,0:2,0,0:18:0:54:17:6,5,0:0,0,2:17:0
chr17	18219835	.	T	C	64.87	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0114825;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.925;QD=10.379;RBI=0.0119322;REFB=0.00169502;REVB=-0.00324488;RO=16;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433491;STB=0.763038;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=-0.00999748;OID=.;OPOS=18219835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:2:7:6:10:2:7:6:10
chr17	18220770	.	G	A	747.01	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1411;QD=63.5755;RBI=0.0997981;REFB=0;REVB=-0.0968386;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00144798;OID=.;OPOS=18220770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr17	18221010	.	A	G	58.61	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.00768452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.2507;QD=14.6537;RBI=0.0262398;REFB=-0.00586679;REVB=0.0250894;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213273;STB=0.624707;STBP=0.369;TYPE=snp;VARB=0.018752;OID=.;OPOS=18221010;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:4:4:2:6:4:4:2:6
chr17	18230380	.	T	C,G	685.36	PASS	AF=0.520833,0.458333;AO=25,20;DP=46;FAO=25,22;FDP=48;FR=.;FRO=1;FSAF=9,10;FSAR=16,12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0426631,0.048246;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=129.207,119.953;QD=57.1135;RBI=0.0502404,0.0577912;REFB=0.0296635,0.0276362;REVB=0.0265322,0.0318141;RO=1;SAF=9,8;SAR=16,12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0281249,0.0368683;STB=0.515139,0.519982;STBP=0.519,0.51;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00942704,0.0220118;OID=.,.;OPOS=18230380,18230380;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:46:48:1:1:25,20:25,22:0.520833,0.458333:16,12:9,8:0:1:16,12:9,10:0:1
chr17	18236339	.	G	A	154.8	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00103162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.228;QD=14.7426;RBI=0.00164324;REFB=-0.0209073;REVB=-0.00127906;RO=24;SAF=13;SAR=4;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260364;STB=0.666455;STBP=0.093;TYPE=snp;VARB=0.0233681;OID=.;OPOS=18236339;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:25:17:17:0.404762:4:13:13:11:4:13:13:12
chr17	18256979	.	C	T	271.87	PASS	AF=0.517857;AO=29;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.0239989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.3944;QD=19.4193;RBI=0.0339152;REFB=-0.0121695;REVB=0.0239645;RO=27;SAF=12;SAR=17;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154579;STB=0.586147;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0112002;OID=.;OPOS=18256979;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:27:27:29:29:0.517857:17:12:16:11:17:12:16:11
chr17	18284262	.	G	A	359.27	PASS	AF=0.666667;AO=30;DP=45;FAO=30;FDP=45;FR=.;FRO=15;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=3;FWDB=-0.0219787;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.578;QD=31.9347;RBI=0.0240941;REFB=-0.0387813;REVB=0.00987239;RO=15;SAF=18;SAR=12;SRF=12;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131043;STB=0.571383;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0093221;OID=.;OPOS=18284262;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:15:15:30:30:0.666667:12:18:12:3:12:18:12:3
chr17	18291544	.	A	G	274.96	PASS	AF=0.305785;AO=37;DP=116;FAO=37;FDP=121;FR=.;FRO=84;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=30;FSRR=54;FWDB=-0.0300655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0192;QD=9.08943;RBI=0.0385338;REFB=-0.0300335;REVB=-0.0241023;RO=77;SAF=17;SAR=20;SRF=29;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0981287;STB=0.572301;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0390609;OID=.;OPOS=18291544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:121:77:84:37:37:0.305785:20:17:29:48:20:17:30:54
chr17	18291559	.	T	C	326.87	PASS	AF=0.320611;AO=42;DP=131;FAO=42;FDP=131;FR=.;FRO=89;FSAF=18;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=57;FWDB=-0.0184692;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.916;QD=9.98069;RBI=0.0259994;REFB=-0.0397802;REVB=-0.0182991;RO=89;SAF=18;SAR=24;SRF=32;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0838592;STB=0.54851;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.0843268;OID=.;OPOS=18291559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:89:89:42:42:0.320611:24:18:32:57:24:18:32:57
chr17	18380154	.	A	G	585.78	PASS	AF=0.408537;AO=67;DP=164;FAO=67;FDP=164;FR=.;FRO=97;FSAF=48;FSAR=19;FSRF=62;FSRR=35;FWDB=-0.0144709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.418;QD=14.2873;RBI=0.0221476;REFB=-0.0146443;REVB=-0.0167663;RO=96;SAF=48;SAR=19;SRF=61;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0991037;STB=0.553593;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0221737;OID=.;OPOS=18380154;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:164:96:97:67:67:0.408537:19:48:61:35:19:48:62:35
chr17	18528623	.	A	G	1365.15	PASS	AF=0.938144;AO=91;DP=97;FAO=91;FDP=97;FR=.;FRO=6;FSAF=50;FSAR=41;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0166237;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.0636;QD=56.2949;RBI=0.0317002;REFB=-0.0151194;REVB=-0.0269918;RO=6;SAF=50;SAR=41;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013871;STB=0.507331;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=0.00858995;OID=.;OPOS=18528623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:97:97:6:6:91:91:0.938144:41:50:4:2:41:50:4:2
chr17	18542519	.	T	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00224513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.735;QD=51.9161;RBI=0.0729224;REFB=0;REVB=0.0728878;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00090415;OID=.;OPOS=18542519;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:6:15:0:0:6:15:0:0
chr17	18565350	.	G	C	626.05	PASS	AF=0.477612;AO=64;DP=134;FAO=64;FDP=134;FR=.;FRO=70;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=-0.00904834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.763;QD=18.6879;RBI=0.011912;REFB=-0.0358091;REVB=0.00774754;RO=70;SAF=26;SAR=38;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129832;STB=0.571944;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=0.0284969;OID=.;OPOS=18565350;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:134:70:70:64:64:0.477612:38:26:38:32:38:26:38:32
chr17	18565423	.	G	A	524.36	PASS	AF=0.451613;AO=54;DP=127;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=37;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=-0.00390674;FXX=0.0236202;HRUN=2;LEN=1;MLLD=296.746;QD=16.9148;RBI=0.0106202;REFB=-0.00411103;REVB=-0.00987552;RO=67;SAF=18;SAR=36;SRF=32;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15137;STB=0.584416;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.00530799;OID=.;OPOS=18565423;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:124:67:68:54:56:0.451613:36:18:32:35:37:19:33:35
chr17	18566129	.	G	GT	56.07	PASS	AF=0.45;AO=8;DP=21;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0477353;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=18.9571;QD=11.2147;RBI=0.0508785;REFB=-0.0204494;REVB=0.0176058;RO=13;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442988;STB=0.810772;STBP=0.03;TYPE=ins;VARB=0.0363793;OID=.;OPOS=18566130;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.45:8:21:9:20:11:8:1:5:6:55:13:7:1:7:6
chr17	18610134	.	T	G	361.67	PASS	AF=0.414894;AO=39;DP=94;FAO=39;FDP=94;FR=.;FRO=55;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0641601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.807;QD=15.3902;RBI=0.0662615;REFB=-0.00862441;REVB=-0.0165549;RO=55;SAF=17;SAR=22;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0573943;STB=0.532437;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.012546;OID=.;OPOS=18610134;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:55:55:39:39:0.414894:22:17:27:28:22:17:27:28
chr17	18684642	.	G	T	148.95	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0257082;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=73.1023;QD=18.6181;RBI=0.0283988;REFB=-0.0140688;REVB=0.0120656;RO=15;SAF=13;SAR=3;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241737;STB=0.628853;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.0130051;OID=.;OPOS=18684642;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:16:16:16:0.5:3:13:9:6:3:13:10:6
chr17	18694277	.	G	A	380.09	PASS	AF=0.878788;AO=29;DP=33;FAO=29;FDP=33;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0468768;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.647;QD=46.0709;RBI=0.0497803;REFB=-0.104984;REVB=0.0167524;RO=3;SAF=17;SAR=12;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014477;STB=0.510722;STBP=0.754;TYPE=snp;VARB=0.00252634;OID=.;OPOS=18694277;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:33:33:3:4:29:29:0.878788:12:17:2:1:12:17:2:2
chr17	18702220	.	T	C	2259.32	PASS	AF=0.974843;AO=153;DP=158;FAO=155;FDP=159;FR=.;FRO=4;FSAF=71;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0575552;FXX=0.00624961;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.6085;QD=56.8382;RBI=0.0951161;REFB=-0.155346;REVB=0.0757263;RO=4;SAF=69;SAR=84;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00239681;STB=0.505275;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.00560068;OID=.;OPOS=18702220;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:158:159:4:4:153:155:0.974843:84:69:2:2:84:71:1:3
chr17	18709578	.	A	G	50.46	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=-0.021542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1104;QD=16.821;RBI=0.021619;REFB=-0.00952302;REVB=-0.00182277;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.363051;STB=0.713672;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.00551677;OID=.;OPOS=18709578;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:2:5:1:4:2:5:1:4
chr17	18775900	.	A	G	330.84	PASS	AF=0.433735;AO=35;DP=82;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.00543474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.3078;QD=15.9443;RBI=0.00855956;REFB=-0.00978114;REVB=0.00661284;RO=47;SAF=16;SAR=19;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0328269;STB=0.50972;STBP=0.885;TYPE=snp;VARB=0.0117708;OID=.;OPOS=18775900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:47:47:35:36:0.433735:19:16:23:24:19:17:23:24
chr17	18855611	.	T	C	46.01	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=11;FSRR=2;FWDB=-0.023806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.653;QD=9.20218;RBI=0.0259976;REFB=-0.0128615;REVB=0.0104475;RO=13;SAF=6;SAR=1;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229881;STB=0.514244;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0655304;OID=.;OPOS=18855611;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:20:20:13:13:7:7:0.35:1:6:11:2:1:6:11:2
chr17	18874720	.	C	G	91.06	PASS	AF=0.233333;AO=14;DP=60;FAO=14;FDP=60;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=33;FSRR=13;FWDB=-0.0425249;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2883;QD=6.07076;RBI=0.0483128;REFB=0.0222561;REVB=0.0229294;RO=45;SAF=13;SAR=1;SRF=33;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.430647;STB=0.797684;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.0697008;OID=.;OPOS=18874720;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:60:60:45:46:14:14:0.233333:1:13:33:12:1:13:33:13
chr17	18907029	.	A	G	362.97	PASS	AF=0.521127;AO=37;DP=72;FAO=37;FDP=71;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=-0.0043204;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.3398;QD=20.4491;RBI=0.0462152;REFB=-0.0202817;REVB=-0.0460129;RO=32;SAF=17;SAR=20;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0602428;STB=0.533518;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0101366;OID=.;OPOS=18907029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:32:34:37:37:0.521127:20:17:17:15:20:17:18:16
chr17	18918396	.	G	C	197.69	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.0534874;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.0822;QD=18.8279;RBI=0.0974545;REFB=0.00274133;REVB=0.0814645;RO=22;SAF=13;SAR=7;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.340016;STB=0.691944;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=-0.00235837;OID=.;OPOS=18918396;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:7:13:6:16:7:13:6:16
chr17	18923180	.	C	T	612.9	PASS	AF=0.504065;AO=61;DP=124;FAO=62;FDP=123;FR=.;FRO=61;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=27;FSRR=34;FWDB=0.0268419;FXX=0.00806387;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.847;QD=19.9316;RBI=0.0272234;REFB=-0.0348075;REVB=0.00454156;RO=61;SAF=35;SAR=26;SRF=27;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119029;STB=0.560495;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0278759;OID=.;OPOS=18923180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:123:61:61:61:62:0.504065:26:35:27:34:27:35:27:34
chr17	19216917	.	T	C	62.41	PASS	AF=1;AO=5;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.225737;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3927;QD=35.6628;RBI=0.225741;REFB=0;REVB=-0.00120617;RO=0;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0203199;OID=.;OPOS=19216917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:5:7:1:5:0:0:0:5:2:0:0
chr17	19232078	.	T	C	1065.71	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00368547;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.107;QD=60.0403;RBI=0.0775082;REFB=0;REVB=-0.0774205;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000283807;OID=.;OPOS=19232078;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:38:33:0:0:38:33:0:0
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chr17	19240997	.	C	A	78.15	PASS	AF=0.22;AO=11;DP=50;FAO=11;FDP=50;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.000287631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.463;QD=6.25169;RBI=0.024596;REFB=-0.0199865;REVB=-0.0245943;RO=39;SAF=8;SAR=3;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518181;STB=0.533271;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.030174;OID=.;OPOS=19240997;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:50:50:39:39:11:11:0.22:3:8:27:12:3:8:27:12
chr17	19246919	.	G	T	54.97	PASS	AF=0.347826;AO=8;DP=23;FAO=8;FDP=23;FR=.;FRO=15;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0247349;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=138.358;QD=9.55967;RBI=0.0419064;REFB=-0.0115393;REVB=-0.0338279;RO=15;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106688;STB=0.565057;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0325756;OID=.;OPOS=19246919;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:23:23:15:15:8:8:0.347826:4:4:6:9:4:4:6:9
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chr17	19284071	.	G	C	641.68	PASS	AF=0.52459;AO=64;DP=122;FAO=64;FDP=122;FR=.;FRO=58;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=27;FSRR=31;FWDB=-0.00370526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.6496;QD=21.0387;RBI=0.0381869;REFB=-0.00640005;REVB=-0.0380068;RO=58;SAF=36;SAR=28;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0842001;STB=0.546282;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.00477072;OID=.;OPOS=19284071;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:58:58:64:64:0.52459:28:36:27:31:28:36:27:31
chr17	19284650	.	C	T	194.34	PASS	AF=0.59375;AO=19;DP=32;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0345991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.376;QD=24.2919;RBI=0.102257;REFB=0.0304174;REVB=0.0962256;RO=13;SAF=11;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0300096;STB=0.516761;STBP=0.834;TYPE=snp;VARB=-0.00994136;OID=.;OPOS=19284650;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:13:19:19:0.59375:8:11:7:6:8:11:7:6
chr17	19286463	.	C	T	146.85	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=21;FWDB=-0.0297414;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.714;QD=11.2961;RBI=0.0301479;REFB=-0.0188178;REVB=0.00493433;RO=33;SAF=9;SAR=9;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117326;STB=0.57684;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0443421;OID=.;OPOS=19286463;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:33:34:18:18:0.346154:9:9:13:20:9:9:13:21
chr17	19290440	.	T	C,TC	74.37	PASS	AF=0,0.244681;AO=9,20;DP=147;FAO=0,23;FDP=94;FR=.;FRO=71;FSAF=0,9;FSAR=0,14;FSRF=22;FSRR=49;FWDB=-0.217789,-0.116104;FXX=0.36052;HRUN=1,5;LEN=1,1;MLLD=28.4642,10.7673;QD=3.16458;RBI=0.225427,0.121746;REFB=-0.0548308,-0.129334;REVB=-0.0581848,-0.0366324;RO=112;SAF=8,7;SAR=1,13;SRF=38;SRR=74;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.550659,0.0150163;STB=0.5,0.566378;STBP=1,0.521;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0232479;OID=.,.;OPOS=19290440,19290441;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:76:147:94:112:71:9,20:0,23:0,0.244681:1,13:8,7:38:74:0,14:0,9:22:49
chr17	19290446	.	G	C	559.58	PASS	AF=0.422819;AO=52;DP=140;FAO=63;FDP=149;FR=.;FRO=86;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=29;FSRR=57;FWDB=-0.00268865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.281;QD=15.0221;RBI=0.0294443;REFB=-0.028157;REVB=-0.0293213;RO=82;SAF=23;SAR=29;SRF=25;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154393;STB=0.572305;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0329824;OID=.;OPOS=19290446;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:149:82:86:52:63:0.422819:29:23:25:57:34:29:29:57
chr17	19319015	.	C	T	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0235161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.619;QD=13.4417;RBI=0.038935;REFB=0.0134425;REVB=0.031031;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945612;STB=0.555448;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=-0.0112293;OID=.;OPOS=19319015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:4:6:9:4:4:6:9:4
chr17	19319374	.	T	C	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0354334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.2992;QD=23.2183;RBI=0.0354334;REFB=0.0107257;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00682752;OID=.;OPOS=19319374;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:0:5:1:0:0:5:1:0
chr17	19460972	.	G	A	71.38	PASS	AF=0.27027;AO=10;DP=37;FAO=10;FDP=37;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00384412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.573;QD=7.71672;RBI=0.00586415;REFB=-0.00552873;REVB=-0.00442842;RO=27;SAF=8;SAR=2;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.289182;STB=0.683802;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0172632;OID=.;OPOS=19460972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:37:37:27:27:10:10:0.27027:2:8:16:11:2:8:16:11
chr17	19578873	.	A	T	1003.26	PASS	AF=1;AO=67;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000446741;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.778;QD=59.0151;RBI=0.00297552;REFB=0;REVB=0.00294179;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000386778;OID=.;OPOS=19578873;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:67:68:1:39:28:0:0:39:29:0:0
chr17	19595585	.	C	T	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00367249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5214;QD=12.7295;RBI=0.0211059;REFB=0.00941534;REVB=0.0207839;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0311955;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0110916;OID=.;OPOS=19595585;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:11:12:9:9:0.428571:3:6:7:4:3:6:8:4
chr17	19608773	.	G	A	301.31	PASS	AF=0.351852;AO=38;DP=108;FAO=38;FDP=108;FR=.;FRO=70;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=32;FWDB=0.043757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.879;QD=11.1596;RBI=0.0446176;REFB=-0.0253813;REVB=0.00872128;RO=70;SAF=17;SAR=21;SRF=38;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107405;STB=0.561738;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.0442919;OID=.;OPOS=19608773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:70:70:38:38:0.351852:21:17:38:32:21:17:38:32
chr17	19617236	.	G	T	422.38	PASS	AF=0.532468;AO=41;DP=79;FAO=41;FDP=77;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.00791961;FXX=0.0493766;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.294;QD=21.9415;RBI=0.0235255;REFB=-0.0313655;REVB=-0.0221524;RO=34;SAF=19;SAR=22;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0921411;STB=0.548405;STBP=0.36;TYPE=snp;VARB=0.0254;OID=.;OPOS=19617236;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:77:34:36:41:41:0.532468:22:19:12:22:22:19:13:23
chr17	19642952	.	G	C	278.87	PASS	AF=0.54902;AO=28;DP=51;FAO=28;FDP=51;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00597755;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=297.422;QD=21.8722;RBI=0.00805139;REFB=-0.0136452;REVB=-0.00539387;RO=23;SAF=16;SAR=12;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408841;STB=0.522711;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.00882939;OID=.;OPOS=19642952;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:23:23:28:28:0.54902:12:16:12:11:12:16:12:11
chr17	19644472	.	A	T	492.11	PASS	AF=0.54023;AO=47;DP=87;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=29;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.0137717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.212;QD=22.6257;RBI=0.0204033;REFB=0.00145152;REVB=0.0150544;RO=38;SAF=29;SAR=18;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125697;STB=0.516156;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=-0.00127396;OID=.;OPOS=19644472;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:38:40:47:47:0.54023:18:29:24:14:18:29:26:14
chr17	19645938	.	A	C	981.94	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282552;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.819;QD=58.6231;RBI=0.0524626;REFB=0;REVB=-0.0442037;RO=0;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.85592e-05;OID=.;OPOS=19645938;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:26:40:0:0:26:41:0:0
chr17	19678475	.	G	A	465.1	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.95;QD=58.1375;RBI=0.013962;REFB=0;REVB=-0.00878445;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.59315e-06;OID=.;OPOS=19678475;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:16:16:0:0:16:16:0:0
chr17	19713740	.	C	T	1579.41	PASS	AF=0.990826;AO=104;DP=105;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=72;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.080484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.0653;QD=57.9599;RBI=0.0867632;REFB=-0.136872;REVB=-0.0324065;RO=0;SAF=69;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.33703e-08;STB=0.503448;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0082936;OID=.;OPOS=19713740;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:105:109:0:1:104:108:0.990826:35:69:0:0:36:72:1:0
chr17	19729495	.	T	C	1177.04	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00549963;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.611;QD=61.1449;RBI=0.0755104;REFB=0;REVB=0.0753099;RO=0;SAF=45;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201544;OID=.;OPOS=19729495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:77:0:0:77:77:1:32:45:0:0:32:45:0:0
chr17	19768092	.	TTA	T,TAA	114.77	PASS	AF=0.234375,0;AO=27,16;DP=138;FAO=30,0;FDP=128;FR=.;FRO=98;FSAF=15,0;FSAR=15,0;FSRF=36;FSRR=62;FWDB=-0.0552478,-0.0484276;FXX=0.00775134;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=16.1556,16.0986;QD=3.58661;RBI=0.133117,0.17283;REFB=-0.0609707,-0.0155902;REVB=0.121111,-0.165907;RO=83;SAF=12,6;SAR=15,10;SRF=34;SRR=49;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0440888,-0.0456694;STB=0.601498,0.5;STBP=0.218,1;TYPE=del,snp;VARB=0.173633,0.033506;OID=.,.;OPOS=19768093,19768093;OREF=TA,T;OALT=-,A;OMAPALT=T,TAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.234375,0:27,16:138:30,0:128:98:15,0:15,0:36:62:99:83:12,6:15,10:34:49
chr17	20107773	.	T	C	742.31	PASS	AF=0.964286;AO=54;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0107361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3465;QD=53.0224;RBI=0.0298381;REFB=-0.0449406;REVB=-0.0278397;RO=1;SAF=38;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0122428;STB=0.512816;STBP=0.436;TYPE=snp;VARB=0.0010617;OID=.;OPOS=20107773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:56:1:2:54:54:0.964286:16:38:1:0:16:38:2:0
chr17	20108239	.	A	T	375.61	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.336;QD=55.6462;RBI=0.0426664;REFB=0;REVB=0.0410054;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131034;OID=.;OPOS=20108239;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:10:16:0:0:11:16:0:0
chr17	20109189	.	C	T	905.95	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0246826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5378;QD=56.6221;RBI=0.0246922;REFB=0.00299018;REVB=-0.000688371;RO=1;SAF=43;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108572;STB=0.505745;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=-0.000162628;OID=.;OPOS=20109189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:1:1:63:63:0.984375:20:43:1:0:20:43:1:0
chr17	20163529	.	A	G	527.7	PASS	AF=1;AO=28;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0960833;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.954;QD=50.2575;RBI=0.0996436;REFB=0;REVB=0.0263979;RO=0;SAF=9;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.62669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0188719;OID=.;OPOS=20163529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:28:42:1:19:9:0:0:19:23:0:0
chr17	20244264	.	G	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=265.484;QD=50.4134;RBI=0.0535543;REFB=0;REVB=0.0484639;RO=0;SAF=6;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.851e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000395245;OID=.;OPOS=20244264;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:13:6:0:0:13:6:0:0
chr17	20370735	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0103067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.383;QD=33.4285;RBI=0.0103067;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000117646;OID=.;OPOS=20370735;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr17	20769862	.	T	A	67.89	PASS	AF=0.189655;AO=11;DP=59;FAO=11;FDP=58;FR=.;FRO=47;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=-0.0112759;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.793;QD=4.68188;RBI=0.0395148;REFB=-0.00151979;REVB=-0.0378718;RO=47;SAF=6;SAR=5;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363374;STB=0.523767;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.00877212;OID=.;OPOS=20769862;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:59:58:47:47:11:11:0.189655:5:6:27:20:5:6:27:20
chr17	20769866	.	G	A	66.45	PASS	AF=0.186441;AO=11;DP=59;FAO=11;FDP=59;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=28;FSRR=20;FWDB=-0.0163328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.0626;QD=4.50486;RBI=0.0339014;REFB=0.00145533;REVB=-0.0297076;RO=46;SAF=6;SAR=5;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0246786;STB=0.531194;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=-0.0245947;OID=.;OPOS=20769866;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:59:59:46:48:11:11:0.186441:5:6:26:20:5:6:28:20
chr17	20769896	.	G	T	106.81	PASS	AF=0.253968;AO=16;DP=63;FAO=16;FDP=63;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.00642019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.409;QD=6.78133;RBI=0.0509517;REFB=-0.0147257;REVB=-0.0505456;RO=47;SAF=10;SAR=6;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901275;STB=0.555485;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.0297946;OID=.;OPOS=20769896;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:47:47:16:16:0.253968:6:10:26:21:6:10:26:21
chr17	20769899	.	G	T	103.94	PASS	AF=0.258065;AO=16;DP=62;FAO=16;FDP=62;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0120305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.9;QD=6.70572;RBI=0.0280221;REFB=-0.00530587;REVB=-0.0253082;RO=46;SAF=10;SAR=6;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0751708;STB=0.54616;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0194834;OID=.;OPOS=20769899;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:46:46:16:16:0.258065:6:10:26:20:6:10:26:20
chr17	20769904	.	G	A	113.2	PASS	AF=0.253731;AO=17;DP=67;FAO=17;FDP=67;FR=.;FRO=50;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=-0.0126334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8235;QD=6.7585;RBI=0.0510519;REFB=0.000499521;REVB=-0.0494641;RO=50;SAF=11;SAR=6;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.086217;STB=0.553009;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.00393552;OID=.;OPOS=20769904;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:50:50:17:17:0.253731:6:11:29:21:6:11:29:21
chr17	20769954	.	T	G	144.26	PASS	AF=0.298507;AO=20;DP=67;FAO=20;FDP=67;FR=.;FRO=47;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.039135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.495;QD=8.61249;RBI=0.0416387;REFB=-0.0223014;REVB=-0.0142207;RO=45;SAF=8;SAR=12;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.205684;STB=0.607036;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0457495;OID=.;OPOS=20769954;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:45:47:20:20:0.298507:12:8:26:19:12:8:26:21
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chr17	20769968	.	G	A	94.62	PASS	AF=0.245614;AO=14;DP=57;FAO=14;FDP=57;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=-0.0267048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.804;QD=6.63978;RBI=0.0267049;REFB=-0.0196161;REVB=7.28737e-05;RO=43;SAF=5;SAR=9;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190029;STB=0.61815;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0444565;OID=.;OPOS=20769968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:57:57:43:43:14:14:0.245614:9:5:22:21:9:5:22:21
chr17	20769995	.	C	T	89.41	PASS	AF=0.27907;AO=10;DP=41;FAO=12;FDP=43;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=0.0478302;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.606;QD=8.31763;RBI=0.0490478;REFB=-0.0155968;REVB=0.0108609;RO=31;SAF=3;SAR=7;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332829;STB=0.74077;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0425433;OID=.;OPOS=20769995;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:41:43:31:31:10:12:0.27907:7:3:18:13:9:3:18:13
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chr17	20924523	.	G	A	154.96	PASS	AF=0.592593;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=27;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0323666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.618;QD=22.9576;RBI=0.0330796;REFB=-0.0416137;REVB=0.00683094;RO=10;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.137454;STB=0.555487;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0206288;OID=.;OPOS=20924523;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:10:11:16:16:0.592593:8:8:7:3:8:8:7:4
chr17	21117589	.	C	A	76.14	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0327124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.34;QD=12.1822;RBI=0.0327174;REFB=-0.00855123;REVB=-0.000570226;RO=15;SAF=5;SAR=5;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101015;STB=0.559882;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.013597;OID=.;OPOS=21117589;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:25:25:15:15:10:10:0.4:5:5:6:9:5:5:6:9
chr17	21132915	.	C	T	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374016;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.6973;QD=49.5982;RBI=0.0406101;REFB=0;REVB=-0.0158208;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328926;OID=.;OPOS=21132915;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:10:8:0:0:10:8:0:0
chr17	21144074	.	G	A	1200.35	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.000823126;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.925;QD=58.5539;RBI=0.000842935;REFB=-0.0452149;REVB=0.000181667;RO=1;SAF=38;SAR=42;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0111399;STB=0.500611;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.000522041;OID=.;OPOS=21144074;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:1:2:80:80:0.97561:42:38:0:1:42:38:1:1
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chr17	21144352	.	G	A	388.08	PASS	AF=1;AO=25;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292194;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=115.441;QD=53.528;RBI=0.0303667;REFB=0;REVB=0.00826815;RO=0;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99383e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00516872;OID=.;OPOS=21144352;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:25:29:1:11:14:0:0:15:14:0:0
chr17	21194769	.	C	T	41.35	PASS	AF=0.166667;AO=7;DP=42;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.019555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.254;QD=3.93851;RBI=0.0521486;REFB=-0.00842523;REVB=-0.0483433;RO=35;SAF=5;SAR=2;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248463;STB=0.673247;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=0.0340528;OID=.;OPOS=21194769;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:42:42:35:35:7:7:0.166667:2:5:18:17:2:5:18:17
chr17	21194771	.	A	T	41.36	PASS	AF=0.166667;AO=7;DP=42;FAO=7;FDP=42;FR=.;FRO=35;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.044454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3727;QD=3.93886;RBI=0.0444883;REFB=0.00781948;REVB=-0.00174632;RO=35;SAF=5;SAR=2;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248463;STB=0.673247;STBP=0.345;TYPE=snp;VARB=-0.0461516;OID=.;OPOS=21194771;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:42:42:35:35:7:7:0.166667:2:5:18:17:2:5:18:17
chr17	21194785	.	T	C	59.16	PASS	AF=0.2;AO=9;DP=45;FAO=9;FDP=45;FR=.;FRO=36;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.0185985;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.764;QD=5.25858;RBI=0.0371732;REFB=0.00318163;REVB=-0.032186;RO=36;SAF=5;SAR=4;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.034012;STB=0.522338;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=-0.0188655;OID=.;OPOS=21194785;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:45:45:36:36:9:9:0.2:4:5:19:17:4:5:19:17
chr17	21194820	.	G	A	67.81	PASS	AF=0.2;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=26;FWDB=-0.0176881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.531;QD=5.42486;RBI=0.0245814;REFB=-0.0083004;REVB=-0.0170698;RO=37;SAF=7;SAR=3;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380041;STB=0.762676;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0222508;OID=.;OPOS=21194820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:50:50:37:40:10:10:0.2:3:7:14:23:3:7:14:26
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chr17	21199403	.	C	T	300.9	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=-0.00689444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.928;QD=16.7165;RBI=0.113889;REFB=-0.00453285;REVB=-0.11368;RO=37;SAF=16;SAR=17;SRF=28;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256503;STB=0.625346;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00605587;OID=.;OPOS=21199403;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:37:39:33:33:0.458333:17:16:28:9:17:16:28:11
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chr17	21203893	.	T	C	297.88	PASS	AF=0.44;AO=33;DP=75;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.00221172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.494;QD=15.887;RBI=0.00280405;REFB=-0.0117536;REVB=0.00172366;RO=41;SAF=18;SAR=15;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0807096;STB=0.538811;STBP=0.593;TYPE=snp;VARB=0.0180758;OID=.;OPOS=21203893;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:41:42:33:33:0.44:15:18:19:22:15:18:20:22
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chr17	21203934	.	G	A	205.0	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0211005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1291;QD=16.4002;RBI=0.0287979;REFB=-0.0118623;REVB=0.0195981;RO=29;SAF=15;SAR=6;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.250093;STB=0.644028;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0150387;OID=.;OPOS=21203934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:6:15:14:15:6:15:14:15
chr17	21203941	.	G	A	34.07	PASS	AF=0.15;AO=6;DP=40;FAO=6;FDP=40;FR=.;FRO=34;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00184925;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3664;QD=3.40729;RBI=0.0141238;REFB=-0.00392445;REVB=0.0140022;RO=32;SAF=4;SAR=2;SRF=20;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538743;STB=0.571184;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0317676;OID=.;OPOS=21203941;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:40:40:32:34:6:6:0.15:2:4:20:12:2:4:20:14
chr17	21203949	.	C	T	155.19	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.00155511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.5879;QD=18.2577;RBI=0.041569;REFB=-0.0789376;REVB=0.0415399;RO=15;SAF=12;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15853;STB=0.566847;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.0792718;OID=.;OPOS=21203949;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:15:17:17:17:0.5:5:12:8:7:5:12:10:7
chr17	21203964	.	C	G	34.72	PASS	AF=0.2;AO=6;DP=30;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0296638;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.5103;QD=4.62976;RBI=0.119222;REFB=0.0207268;REVB=-0.115473;RO=24;SAF=4;SAR=2;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104477;STB=0.571184;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=-0.0897422;OID=.;OPOS=21203964;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:30:30:24:24:6:6:0.2:2:4:14:10:2:4:14:10
chr17	21204187	.	G	T	291.41	PASS	AF=0.407407;AO=33;DP=81;FAO=33;FDP=81;FR=.;FRO=48;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.0227041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.118;QD=14.3905;RBI=0.0229282;REFB=-0.0155779;REVB=0.00319776;RO=48;SAF=23;SAR=10;SRF=27;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153808;STB=0.587743;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.014635;OID=.;OPOS=21204187;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:48:48:33:33:0.407407:10:23:27:21:10:23:27:21
chr17	21204192	.	C	T	299.24	PASS	AF=0.390805;AO=34;DP=87;FAO=34;FDP=87;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=32;FSRR=21;FWDB=0.013427;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.911;QD=13.758;RBI=0.0160448;REFB=0.0067331;REVB=0.00878351;RO=52;SAF=22;SAR=12;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0579181;STB=0.528367;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=-0.00897168;OID=.;OPOS=21204192;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:52:53:34:34:0.390805:12:22:31:21:12:22:32:21
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chr17	21207813	.	T	G	115.79	PASS	AF=0.142857;AO=25;DP=175;FAO=25;FDP=175;FR=.;FRO=150;FSAF=4;FSAR=21;FSRF=81;FSRR=69;FWDB=-0.0325261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0937;QD=2.64659;RBI=0.0354602;REFB=0.00228552;REVB=0.0141237;RO=148;SAF=4;SAR=21;SRF=80;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.490537;STB=0.831897;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.00910872;OID=.;OPOS=21207813;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:175:175:148:150:25:25:0.142857:21:4:80:68:21:4:81:69
chr17	21207834	.	C	T	101.9	PASS	AF=0.133721;AO=23;DP=173;FAO=23;FDP=172;FR=.;FRO=149;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=70;FSRR=79;FWDB=-0.0110946;FXX=0.00578001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.218;QD=2.36972;RBI=0.0347816;REFB=-0.00695694;REVB=-0.0329647;RO=144;SAF=13;SAR=10;SRF=66;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134393;STB=0.582214;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0414606;OID=.;OPOS=21207834;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:172:144:149:23:23:0.133721:10:13:66:78:10:13:70:79
chr17	21207835	.	G	A	109.96	PASS	AF=0.140351;AO=24;DP=170;FAO=24;FDP=171;FR=.;FRO=147;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=79;FSRR=68;FWDB=0.0118549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.1115;QD=2.57206;RBI=0.017482;REFB=0.00332673;REVB=-0.0128484;RO=145;SAF=4;SAR=20;SRF=78;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.477532;STB=0.824774;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.028142;OID=.;OPOS=21207835;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:170:171:145:147:24:24:0.140351:20:4:78:67:20:4:79:68
chr17	21207844	.	C	T	317.0	PASS	AF=0.279503;AO=45;DP=162;FAO=45;FDP=161;FR=.;FRO=116;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=54;FSRR=62;FWDB=-0.0171153;FXX=0.00617246;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.81;QD=7.87564;RBI=0.0192852;REFB=-0.0120665;REVB=-0.00888746;RO=113;SAF=23;SAR=22;SRF=53;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510862;STB=0.532804;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0308006;OID=.;OPOS=21207844;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:161:113:116:45:45:0.279503:22:23:53:60:22:23:54:62
chr17	21208413	.	C	T	216.37	PASS	AF=0.346154;AO=27;DP=78;FAO=27;FDP=78;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=27;FWDB=0.018767;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.703;QD=11.0961;RBI=0.0356755;REFB=-0.00431765;REVB=-0.0303404;RO=51;SAF=15;SAR=12;SRF=24;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956843;STB=0.555514;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.0079917;OID=.;OPOS=21208413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:51:51:27:27:0.346154:12:15:24:27:12:15:24:27
chr17	21208449	.	G	T	165.47	PASS	AF=0.354839;AO=20;DP=63;FAO=22;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.00717191;FXX=0.0158705;HRUN=6;LEN=1;MLLD=221.285;QD=10.6757;RBI=0.028045;REFB=-0.00443755;REVB=-0.0271124;RO=28;SAF=13;SAR=7;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0322884;STB=0.543244;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0100176;OID=.;OPOS=21208449;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:62:28:40:20:22:0.354839:7:13:19:9:9:13:21:19
chr17	21215483	.	C	T	1028.76	PASS	AF=0.518325;AO=98;DP=192;FAO=99;FDP=191;FR=.;FRO=92;FSAF=56;FSAR=43;FSRF=57;FSRR=35;FWDB=-0.00497893;FXX=0.00520806;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.381;QD=21.5447;RBI=0.0057294;REFB=-0.0134677;REVB=-0.00283483;RO=92;SAF=55;SAR=43;SRF=57;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527294;STB=0.526601;STBP=0.452;TYPE=snp;VARB=0.0130413;OID=.;OPOS=21215483;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:192:191:92:92:98:99:0.518325:43:55:57:35:43:56:57:35
chr17	21215537	.	C	A	529.02	PASS	AF=0.377246;AO=63;DP=168;FAO=63;FDP=167;FR=.;FRO=104;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=68;FSRR=36;FWDB=0.00440612;FXX=0.00595203;HRUN=6;LEN=1;MLLD=232.412;QD=12.6711;RBI=0.00450553;REFB=-0.0105035;REVB=-0.000941261;RO=101;SAF=34;SAR=29;SRF=65;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115355;STB=0.572346;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.017186;OID=.;OPOS=21215537;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:167:101:104:63:63:0.377246:29:34:65:36:29:34:68:36
chr17	21215552	.	C	T	566.0	PASS	AF=0.4;AO=66;DP=165;FAO=66;FDP=165;FR=.;FRO=99;FSAF=31;FSAR=35;FSRF=64;FSRR=35;FWDB=-0.000357974;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.238;QD=13.7211;RBI=0.0191142;REFB=-0.00939046;REVB=0.0191109;RO=93;SAF=31;SAR=35;SRF=58;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159753;STB=0.605065;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0155991;OID=.;OPOS=21215552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:165:165:93:99:66:66:0.4:35:31:58:35:35:31:64:35
chr17	21215557	.	G	A	705.67	PASS	AF=0.480769;AO=73;DP=156;FAO=75;FDP=156;FR=.;FRO=81;FSAF=37;FSAR=38;FSRF=50;FSRR=31;FWDB=0.00332894;FXX=0.0249984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.959;QD=18.0942;RBI=0.00337648;REFB=-0.00853418;REVB=-0.000564624;RO=76;SAF=35;SAR=38;SRF=46;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115964;STB=0.564243;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0139811;OID=.;OPOS=21215557;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:156:76:81:73:75:0.480769:38:35:46:30:38:37:50:31
chr17	21216788	.	C	T	139.44	PASS	AF=0.311475;AO=19;DP=61;FAO=19;FDP=61;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=23;FSRR=19;FWDB=0.0028647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.202;QD=9.1434;RBI=0.0357703;REFB=-0.00672156;REVB=0.0356555;RO=42;SAF=13;SAR=6;SRF=23;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1686;STB=0.600629;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.0142235;OID=.;OPOS=21216788;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:42:42:19:19:0.311475:6:13:23:19:6:13:23:19
chr17	21216846	.	G	C	79.71	PASS	AF=0.244444;AO=11;DP=45;FAO=11;FDP=45;FR=.;FRO=34;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0381829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.139;QD=7.08504;RBI=0.0382806;REFB=0.0022232;REVB=0.00273336;RO=34;SAF=9;SAR=2;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.36049;STB=0.731588;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.00529517;OID=.;OPOS=21216846;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:45:45:34:34:11:11:0.244444:2:9:19:15:2:9:19:15
chr17	21217513	.	G	A	269.74	PASS	AF=0.430556;AO=30;DP=71;FAO=31;FDP=72;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.0132893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.05;QD=14.9857;RBI=0.027339;REFB=-0.0141962;REVB=0.0238917;RO=41;SAF=15;SAR=15;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0621136;STB=0.52559;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0148289;OID=.;OPOS=21217513;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:41:41:30:31:0.430556:15:15:18:23:16:15:18:23
chr17	21217547	.	T	C	296.73	PASS	AF=0.434211;AO=33;DP=76;FAO=33;FDP=76;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.00577081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.824;QD=15.6174;RBI=0.0181078;REFB=-0.005856;REVB=-0.0171636;RO=41;SAF=16;SAR=17;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0508651;STB=0.52827;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0119274;OID=.;OPOS=21217547;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:41:43:33:33:0.434211:17:16:22:19:17:16:23:20
chr17	21217586	.	G	T	251.84	PASS	AF=0.357143;AO=29;DP=85;FAO=30;FDP=84;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.00531084;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.043;QD=11.9921;RBI=0.00576733;REFB=-0.00973279;REVB=0.00224877;RO=52;SAF=18;SAR=11;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028708;STB=0.527759;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.00911509;OID=.;OPOS=21217586;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:84:52:54:29:30:0.357143:11:18:31:21:11:19:32:22
chr17	21217595	.	GCGGGGGCA	GCGGGGCA,GCGGGGCAG,GGGGGGCA,GGGGGGGCA	290.04	PASS	AF=0.0909091,0.0519481,0.272727,0.103896;AO=12,3,10,14;DP=80;FAO=7,4,21,8;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=4,4,16,1;FSAR=3,0,5,7;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0923449,0.0824685,-0.00283166,-0.00379443;FXX=0.0722804;HRUN=5,5,1,1;LEN=1,3,1,1;MLLD=7.91506,23.9702,161.805,164.241;QD=15.0672;RBI=0.224759,0.11851,0.0265447,0.0409322;REFB=-0.253735,-0.146422,-0.0421673,-0.0342049;REVB=0.204913,0.0851085,-0.0263932,-0.040756;RO=25;SAF=11,3,10,3;SAR=1,0,0,11;SRF=12;SRR=13;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.595496,0.577457,0.769958,-0.327112;STB=0.503302,0.996965,0.644765,0.869117;STBP=0.999,0.076,0.117,0.037;TYPE=del,mnp,del,snp;VARB=0.196644,0.213978,0.0292661,0.0616077;OID=.,.,.,.;OPOS=21217597,21217601,21217596,21217596;OREF=G,GCA,C,C;OALT=-,CAG,-,G;OMAPALT=GCGGGGCA,GCGGGGCAG,GGGGGGCA,GGGGGGGCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0.0909091,0.0519481,0.272727,0.103896:12,3,10,14:80:7,4,21,8:77:37:4,4,16,1:3,0,5,7:21:16:99:25:11,3,10,3:1,0,0,11:12:13
chr17	21217660	.	C	T	223.72	PASS	AF=0.329412;AO=28;DP=86;FAO=28;FDP=85;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=28;FSRR=29;FWDB=0.000171389;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.557;QD=10.5282;RBI=0.0138577;REFB=-0.00679067;REVB=0.0138566;RO=56;SAF=18;SAR=10;SRF=27;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187312;STB=0.604055;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0123883;OID=.;OPOS=21217660;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:56:57:28:28:0.329412:10:18:27:29:10:18:28:29
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chr17	21319007	.	GG	AC,GC	478.01	PASS	AF=0.333333,0.177083;AO=32,17;DP=96;FAO=32,17;FDP=96;FR=.;FRO=47;FSAF=18,11;FSAR=14,6;FSRF=22;FSRR=25;FWDB=0.00783258,0.00439589;FXX=0.0103082;HRUN=4,4;LEN=2,1;MLLD=239.355,221.121;QD=19.9171;RBI=0.0117994,0.00690941;REFB=-0.0102725,-0.0164654;REVB=0.0088248,0.00533068;RO=46;SAF=18,11;SAR=14,6;SRF=22;SRR=24;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0877156,0.205209;STB=0.556225,0.632496;STBP=0.454,0.203;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0232731,-0.00750925;OID=.,.;OPOS=21319007,21319008;OREF=GG,G;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:46:47:32,17:32,17:0.333333,0.177083:14,6:18,11:22:24:14,6:18,11:22:25
chr17	21319069	.	G	A	256.76	PASS	AF=0.246667;AO=37;DP=150;FAO=37;FDP=150;FR=.;FRO=113;FSAF=23;FSAR=14;FSRF=64;FSRR=49;FWDB=0.0240862;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3376;QD=6.84693;RBI=0.0250499;REFB=-0.00867709;REVB=0.00688145;RO=113;SAF=23;SAR=14;SRF=64;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071629;STB=0.543283;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.0345295;OID=.;OPOS=21319069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:113:113:37:37:0.246667:14:23:64:49:14:23:64:49
chr17	21319079	.	C	A	291.48	PASS	AF=0.268456;AO=40;DP=149;FAO=40;FDP=149;FR=.;FRO=109;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=63;FSRR=46;FWDB=-0.0118484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9065;QD=7.82506;RBI=0.0119047;REFB=0.0119511;REVB=-0.00115589;RO=109;SAF=25;SAR=15;SRF=63;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0604393;STB=0.53601;STBP=0.598;TYPE=snp;VARB=-0.0317706;OID=.;OPOS=21319079;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:109:109:40:40:0.268456:15:25:63:46:15:25:63:46
chr17	21319087	.	G	A	283.01	PASS	AF=0.268966;AO=39;DP=145;FAO=39;FDP=145;FR=.;FRO=106;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=60;FSRR=46;FWDB=0.0156101;FXX=0.00684885;HRUN=2;LEN=1;MLLD=289.588;QD=7.80722;RBI=0.0156439;REFB=0.00200302;REVB=-0.00102793;RO=105;SAF=25;SAR=14;SRF=60;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0896859;STB=0.557591;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=-0.00474605;OID=.;OPOS=21319087;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:105:106:39:39:0.268966:14:25:60:45:14:25:60:46
chr17	21319110	.	G	A	286.45	PASS	AF=0.282609;AO=39;DP=138;FAO=39;FDP=138;FR=.;FRO=99;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=56;FSRR=43;FWDB=0.0431199;FXX=0.00719373;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.8596;QD=8.30281;RBI=0.0437339;REFB=-0.0181439;REVB=-0.00730276;RO=99;SAF=24;SAR=15;SRF=56;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0625678;STB=0.537018;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.022786;OID=.;OPOS=21319110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:138:99:99:39:39:0.282609:15:24:56:43:15:24:56:43
chr17	21319121	.	C	T	356.61	PASS	AF=0.319149;AO=45;DP=141;FAO=45;FDP=141;FR=.;FRO=96;FSAF=18;FSAR=27;FSRF=60;FSRR=36;FWDB=-0.0401713;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.9413;QD=10.1166;RBI=0.0469264;REFB=-0.00499273;REVB=-0.0242561;RO=93;SAF=18;SAR=27;SRF=58;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256293;STB=0.649935;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0152415;OID=.;OPOS=21319121;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:93:96:45:45:0.319149:27:18:58:35:27:18:60:36
chr17	21319171	.	G	A	323.39	PASS	AF=0.318182;AO=41;DP=130;FAO=42;FDP=132;FR=.;FRO=90;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=48;FSRR=42;FWDB=-0.0153237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4116;QD=9.79973;RBI=0.0195905;REFB=-0.00767329;REVB=0.0122054;RO=89;SAF=24;SAR=17;SRF=47;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0683823;STB=0.543057;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0211778;OID=.;OPOS=21319171;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:132:89:90:41:42:0.318182:17:24:47:42:17:25:48:42
chr17	21319208	.	C	T	205.79	PASS	AF=0.293478;AO=26;DP=92;FAO=27;FDP=92;FR=.;FRO=65;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=45;FWDB=0.00842071;FXX=0.0107515;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.104;QD=8.9472;RBI=0.0217004;REFB=-0.0186975;REVB=-0.02;RO=62;SAF=14;SAR=12;SRF=19;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274113;STB=0.647427;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.052472;OID=.;OPOS=21319208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:62:65:26:27:0.293478:12:14:19:43:13:14:20:45
chr17	21319230	.	G	C	165.86	PASS	AF=0.277108;AO=23;DP=83;FAO=23;FDP=83;FR=.;FRO=60;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=36;FWDB=0.0258624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.38;QD=7.99305;RBI=0.0308388;REFB=-0.0231914;REVB=-0.0167979;RO=60;SAF=12;SAR=11;SRF=24;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146496;STB=0.587426;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0609198;OID=.;OPOS=21319230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:60:60:23:23:0.277108:11:12:24:36:11:12:24:36
chr17	21319251	.	C	T	57.04	PASS	AF=0.129032;AO=12;DP=93;FAO=12;FDP=93;FR=.;FRO=81;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=29;FSRR=52;FWDB=-0.00836599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.84;QD=2.45332;RBI=0.0382723;REFB=-0.00182608;REVB=0.0373468;RO=79;SAF=4;SAR=8;SRF=28;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0286838;STB=0.523769;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0214075;OID=.;OPOS=21319251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:93:93:79:81:12:12:0.129032:8:4:28:51:8:4:29:52
chr17	21319272	.	C	T	108.74	PASS	AF=0.175439;AO=20;DP=113;FAO=20;FDP=114;FR=.;FRO=94;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=57;FWDB=-0.018135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.888;QD=3.81536;RBI=0.0425254;REFB=-0.00637558;REVB=-0.0384647;RO=92;SAF=7;SAR=13;SRF=37;SRR=55;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0704096;STB=0.538567;STBP=0.728;TYPE=snp;VARB=0.0414424;OID=.;OPOS=21319272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:92:94:20:20:0.175439:13:7:37:55:13:7:37:57
chr17	21319285	.	C	T	117.48	PASS	AF=0.176;AO=22;DP=125;FAO=22;FDP=125;FR=.;FRO=103;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=45;FSRR=58;FWDB=0.0232584;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5553;QD=3.75921;RBI=0.0366948;REFB=-0.0117509;REVB=0.0283823;RO=103;SAF=8;SAR=14;SRF=45;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.096813;STB=0.562916;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.061611;OID=.;OPOS=21319285;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:103:103:22:22:0.176:14:8:45:58:14:8:45:58
chr17	21319302	.	T	C	787.75	PASS	AF=0.574803;AO=55;DP=130;FAO=73;FDP=127;FR=.;FRO=54;FSAF=33;FSAR=40;FSRF=25;FSRR=29;FWDB=0.0174686;FXX=0.0230751;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9063;QD=24.811;RBI=0.01752;REFB=-0.0227437;REVB=-0.00134049;RO=52;SAF=33;SAR=22;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106745;STB=0.504676;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0316216;OID=.;OPOS=21319302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:127:52:54:55:73:0.574803:22:33:25:27:40:33:25:29
chr17	21319311	.	C	T	155.69	PASS	AF=0.184932;AO=27;DP=147;FAO=27;FDP=146;FR=.;FRO=119;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=54;FSRR=65;FWDB=0.0112471;FXX=0.00680226;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.141;QD=4.26533;RBI=0.0159087;REFB=-0.00248994;REVB=-0.0112513;RO=118;SAF=13;SAR=14;SRF=54;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0305721;STB=0.52263;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0228762;OID=.;OPOS=21319311;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:146:118:119:27:27:0.184932:14:13:54:64:14:13:54:65
chr17	21319369	.	G	A	180.6	PASS	AF=0.192771;AO=32;DP=168;FAO=32;FDP=166;FR=.;FRO=134;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=72;FSRR=62;FWDB=-0.013614;FXX=0.0119041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.687;QD=4.35187;RBI=0.0179498;REFB=-0.00691961;REVB=-0.0116985;RO=136;SAF=15;SAR=17;SRF=72;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775734;STB=0.555146;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.0389836;OID=.;OPOS=21319369;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:166:136:134:32:32:0.192771:17:15:72:64:17:15:72:62
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chr17	21319399	.	A	G	473.59	PASS	AF=0.3625;AO=58;DP=161;FAO=58;FDP=160;FR=.;FRO=102;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=57;FSRR=45;FWDB=-0.0257171;FXX=0.0123449;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.845;QD=11.8397;RBI=0.0269306;REFB=-0.0128132;REVB=-0.00799316;RO=103;SAF=30;SAR=28;SRF=58;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0516668;STB=0.52658;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.0176427;OID=.;OPOS=21319399;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:161:160:103:102:58:58:0.3625:28:30:58:45:28:30:57:45
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chr17	21319452	.	G	A	95.28	PASS	AF=0.163636;AO=18;DP=110;FAO=18;FDP=110;FR=.;FRO=92;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=57;FSRR=35;FWDB=-0.0108033;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.0085;QD=3.4647;RBI=0.0200198;REFB=-0.00573031;REVB=-0.0168548;RO=88;SAF=10;SAR=8;SRF=53;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605662;STB=0.554806;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0286234;OID=.;OPOS=21319452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:110:110:88:92:18:18:0.163636:8:10:53:35:8:10:57:35
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chr17	21319473	.	G	A	305.47	PASS	AF=0.364583;AO=34;DP=96;FAO=35;FDP=96;FR=.;FRO=61;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=35;FSRR=26;FWDB=0.0135275;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.829;QD=12.728;RBI=0.0156186;REFB=-0.0121197;REVB=0.00780688;RO=62;SAF=20;SAR=14;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00876479;STB=0.501519;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0201955;OID=.;OPOS=21319473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:62:61:34:35:0.364583:14:20:36:26:15:20:35:26
chr17	21319488	.	C	T	44.83	PASS	AF=0.116279;AO=10;DP=85;FAO=10;FDP=86;FR=.;FRO=76;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=47;FSRR=29;FWDB=-0.00503269;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=137.92;QD=2.08515;RBI=0.0161274;REFB=0.000140609;REVB=-0.015322;RO=75;SAF=6;SAR=4;SRF=47;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0338712;STB=0.517039;STBP=0.934;TYPE=snp;VARB=-0.00175748;OID=.;OPOS=21319488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:85:86:75:76:10:10:0.116279:4:6:47:28:4:6:47:29
chr17	21319519	.	G	C	99.45	PASS	AF=0.184783;AO=17;DP=92;FAO=17;FDP=92;FR=.;FRO=75;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=45;FSRR=30;FWDB=-0.0271177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.018;QD=4.32371;RBI=0.0271288;REFB=-0.00636348;REVB=-0.000777633;RO=75;SAF=10;SAR=7;SRF=45;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153711;STB=0.509922;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0475726;OID=.;OPOS=21319519;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:75:75:17:17:0.184783:7:10:45:30:7:10:45:30
chr17	21319523	.	C	T	98.8	PASS	AF=0.177083;AO=17;DP=96;FAO=17;FDP=96;FR=.;FRO=79;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=46;FSRR=33;FWDB=-0.0139025;FXX=0.0103082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.996;QD=4.11653;RBI=0.0251303;REFB=-0.00242014;REVB=-0.0209345;RO=78;SAF=9;SAR=8;SRF=45;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0605728;STB=0.54383;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0157319;OID=.;OPOS=21319523;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:96:96:78:79:17:17:0.177083:8:9:45:33:8:9:46:33
chr17	21319527	.	C	T	113.58	PASS	AF=0.186275;AO=19;DP=102;FAO=19;FDP=102;FR=.;FRO=83;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=51;FSRR=32;FWDB=-0.0119837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.179;QD=4.454;RBI=0.0217832;REFB=-0.0026577;REVB=-0.0181907;RO=82;SAF=11;SAR=8;SRF=50;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403686;STB=0.529883;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0214586;OID=.;OPOS=21319527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:82:83:19:19:0.186275:8:11:50:32:8:11:51:32
chr17	21319543	.	G	A	142.33	PASS	AF=0.206897;AO=24;DP=116;FAO=24;FDP=116;FR=.;FRO=92;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=51;FSRR=41;FWDB=0.0262294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.724;QD=4.90784;RBI=0.027817;REFB=-0.0134649;REVB=-0.00926306;RO=92;SAF=15;SAR=9;SRF=51;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0922915;STB=0.557987;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.042821;OID=.;OPOS=21319543;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:116:92:92:24:24:0.206897:9:15:51:41:9:15:51:41
chr17	21319560	.	G	T	187.56	PASS	AF=0.215827;AO=29;DP=139;FAO=30;FDP=139;FR=.;FRO=109;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=62;FSRR=47;FWDB=-0.0180619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2726;QD=5.39735;RBI=0.047935;REFB=0.0135295;REVB=0.0444019;RO=109;SAF=19;SAR=10;SRF=62;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115321;STB=0.552899;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=-0.0486801;OID=.;OPOS=21319560;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:109:109:29:30:0.215827:10:19:62:47:11:19:62:47
chr17	21319650	.	CGAG	C	428.24	PASS	AF=0.295918;AO=45;DP=189;FAO=58;FDP=196;FR=.;FRO=138;FSAF=38;FSAR=20;FSRF=75;FSRR=63;FWDB=-0.0157841;FXX=0.0344811;HRUN=1;LEN=3;MLLD=220.128;QD=8.73967;RBI=0.0161716;REFB=-0.0155009;REVB=0.00351879;RO=131;SAF=26;SAR=19;SRF=71;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0452318;STB=0.582535;STBP=0.13;TYPE=del;VARB=0.0358249;OID=.;OPOS=21319651;OREF=GAG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.295918:45:189:58:196:138:38:20:75:63:99:131:26:19:71:60
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chr17	21319716	.	G	A	334.82	PASS	AF=0.276471;AO=47;DP=173;FAO=47;FDP=170;FR=.;FRO=123;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=71;FSRR=52;FWDB=0.00172909;FXX=0.0285698;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.597;QD=7.87819;RBI=0.00238027;REFB=-0.00148034;REVB=-0.00163583;RO=113;SAF=31;SAR=16;SRF=66;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0972601;STB=0.563609;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.00114578;OID=.;OPOS=21319716;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:173:170:113:123:47:47:0.276471:16:31:66:47:16:31:71:52
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chr17	21320212	.	A	G	397.2	PASS	AF=0.526316;AO=38;DP=74;FAO=40;FDP=76;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00413978;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.272;QD=20.905;RBI=0.00894812;REFB=-0.0162647;REVB=0.00793292;RO=33;SAF=19;SAR=19;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0382058;STB=0.501319;STBP=0.989;TYPE=snp;VARB=0.0140723;OID=.;OPOS=21320212;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:76:33:36:38:40:0.526316:19:19:15:18:21:19:17:19
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chr17	21320279	.	C	T	286.67	PASS	AF=0.284672;AO=39;DP=134;FAO=39;FDP=137;FR=.;FRO=98;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=49;FSRR=49;FWDB=0.00235741;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2114;QD=8.36988;RBI=0.0459731;REFB=-0.00781528;REVB=-0.0459126;RO=95;SAF=22;SAR=17;SRF=48;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0712466;STB=0.546046;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0168296;OID=.;OPOS=21320279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:137:95:98:39:39:0.284672:17:22:48:47:17:22:49:49
chr17	21320350	.	G	A	263.76	PASS	AF=0.270073;AO=37;DP=137;FAO=37;FDP=137;FR=.;FRO=100;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=48;FSRR=52;FWDB=-0.00173883;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.756;QD=7.70108;RBI=0.0201501;REFB=0.000208371;REVB=-0.0200749;RO=100;SAF=21;SAR=16;SRF=48;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107484;STB=0.563946;STBP=0.379;TYPE=snp;VARB=-0.000598488;OID=.;OPOS=21320350;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:100:100:37:37:0.270073:16:21:48:52:16:21:48:52
chr17	21320365	.	T	C	270.34	PASS	AF=0.291339;AO=37;DP=127;FAO=37;FDP=127;FR=.;FRO=90;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=46;FSRR=44;FWDB=-0.0106183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.7556;QD=8.51457;RBI=0.0113521;REFB=-0.00174833;REVB=-0.00401527;RO=90;SAF=16;SAR=21;SRF=46;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.094925;STB=0.555905;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.00692057;OID=.;OPOS=21320365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:90:90:37:37:0.291339:21:16:46:44:21:16:46:44
chr17	21320392	.	CAAAAAAAAAAAAT	CAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAT	190.89	PASS	AF=0.383333,0.433333;AO=9,13;DP=62;FAO=23,26;FDP=60;FR=.;FRO=11;FSAF=8,7;FSAR=15,19;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.0265455,-1.11962;FXX=0.0322529;HRUN=2,12;LEN=1,1;MLLD=26.5221,3.06511;QD=12.7257;RBI=0.0380362,1.11978;REFB=0.00738583,-0.167386;REVB=0.0272414,0.0189852;RO=6;SAF=1,2;SAR=8,11;SRF=0;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.243413,0.194202;STB=0.505613,0.5345;STBP=0.957,0.586;TYPE=del,del;VARB=-0.00781346,0.38791;OID=.,.;OPOS=21320405,21320393;OREF=T,A;OALT=-,-;OMAPALT=CAAAAAAAAAAAA,CAAAAAAAAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.383333,0.433333:9,13:62:23,26:60:11:8,7:15,19:4:7:79:6:1,2:8,11:0:6
chr17	21320787	.	G	A	199.33	PASS	AF=0.227941;AO=31;DP=136;FAO=31;FDP=136;FR=.;FRO=105;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=13;FSRR=92;FWDB=-0.026476;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.074;QD=5.86265;RBI=0.0439703;REFB=-0.011037;REVB=-0.0351057;RO=105;SAF=13;SAR=18;SRF=13;SRR=92;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.438808;STB=0.753312;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0359827;OID=.;OPOS=21320787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:136:136:105:105:31:31:0.227941:18:13:13:92:18:13:13:92
chr17	21320796	.	C	T	634.26	PASS	AF=0.5;AO=64;DP=128;FAO=64;FDP=128;FR=.;FRO=64;FSAF=12;FSAR=52;FSRF=11;FSRR=53;FWDB=-0.00272165;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=263.424;QD=19.8206;RBI=0.00815943;REFB=-0.0173756;REVB=-0.00769213;RO=64;SAF=12;SAR=52;SRF=11;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236486;STB=0.513025;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0182926;OID=.;OPOS=21320796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:64:64:64:64:0.5:52:12:11:53:52:12:11:53
chr17	21320798	.	G	C	539.6	PASS	AF=0.511811;AO=64;DP=126;FAO=65;FDP=127;FR=.;FRO=62;FSAF=13;FSAR=52;FSRF=11;FSRR=51;FWDB=0.0333513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.409;QD=16.9952;RBI=0.0431292;REFB=-0.0540019;REVB=0.0273463;RO=57;SAF=13;SAR=51;SRF=10;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.037655;STB=0.517583;STBP=0.769;TYPE=snp;VARB=0.083316;OID=.;OPOS=21320798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:127:57:62:64:65:0.511811:51:13:10:47:52:13:11:51
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chr17	21825565	.	G	T	696.29	PASS	AF=0.365639;AO=82;DP=226;FAO=83;FDP=227;FR=.;FRO=144;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=73;FSRR=71;FWDB=-0.0135177;FXX=0.00438577;HRUN=3;LEN=1;MLLD=295.139;QD=12.2694;RBI=0.0166756;REFB=-0.0088363;REVB=0.00976463;RO=143;SAF=35;SAR=47;SRF=72;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0864521;STB=0.546675;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.0146477;OID=.;OPOS=21825565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:226:227:143:144:82:83:0.365639:47:35:72:71:47:36:73:71
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chr17	26092631	.	A	G	1660.65	PASS	AF=1;AO=108;DP=109;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0427611;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.08;QD=60.3874;RBI=0.0469481;REFB=0;REVB=-0.0193806;RO=0;SAF=56;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.59964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.89361e-06;OID=.;OPOS=26092631;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:110:0:0:108:110:1:52:56:0:0:52:58:0:0
chr17	26604230	.	C	CA	127.28	PASS	AF=0.515152;AO=4;DP=35;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0208741;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=227.131;QD=15.4278;RBI=0.0634446;REFB=-0.0295601;REVB=0.0599123;RO=29;SAF=0;SAR=4;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.62967;STB=0.57339;STBP=0.399;TYPE=ins;VARB=0.0348462;OID=.;OPOS=26604231;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.515152:4:35:17:33:16:7:10:9:7:99:29:0:4:16:13
chr17	26604231	.	G	A	115.9	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=33;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.013494;FXX=0.0908816;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.892;QD=15.4528;RBI=0.0310639;REFB=-0.0101792;REVB=0.02798;RO=16;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230345;STB=0.505147;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0120715;OID=.;OPOS=26604231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:30:16:17:13:13:0.433333:6:7:9:7:6:7:9:8
chr17	26671945	.	A	AG	965.08	PASS	AF=1;AO=80;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.2392;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.3098;QD=41.5086;RBI=0.270632;REFB=0;REVB=0.12659;RO=12;SAF=63;SAR=17;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0714512;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00504206;OID=.;OPOS=26671946;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:80:93:93:93:0:70:23:0:0:18:12:63:17:7:5
chr17	26676135	.	C	T	1320.23	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0772544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3962;QD=62.1285;RBI=0.0772706;REFB=0;REVB=-0.00158389;RO=0;SAF=45;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487382;OID=.;OPOS=26676135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:40:45:0:0:40:45:0:0
chr17	26694861	.	G	A	771.4	PASS	AF=0.982143;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=56;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.028529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9043;QD=55.1003;RBI=0.0878036;REFB=-0.152098;REVB=0.0830396;RO=1;SAF=22;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209431;STB=0.511107;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0037784;OID=.;OPOS=26694861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:56:56:1:1:55:55:0.982143:33:22:1:0:33:22:1:0
chr17	26708300	.	T	C	1215.91	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0430139;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.704;QD=60.0451;RBI=0.0446673;REFB=-0.0133384;REVB=0.0120404;RO=1;SAF=39;SAR=41;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114082;STB=0.506023;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000223074;OID=.;OPOS=26708300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:81:1:1:80:80:0.987654:41:39:0:1:41:39:0:1
chr17	26708302	.	G	T	1201.14	PASS	AF=0.97561;AO=79;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0598927;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=261.959;QD=58.5921;RBI=0.062292;REFB=-0.132407;REVB=0.0171217;RO=2;SAF=38;SAR=41;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0225308;STB=0.511902;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.000915033;OID=.;OPOS=26708302;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:2:2:79:80:0.97561:41:38:0:2:41:39:0:2
chr17	26727721	.	GA	G	942.44	PASS	AF=1;AO=73;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0320791;FXX=0.0129853;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.4976;QD=49.602;RBI=0.0532981;REFB=0;REVB=-0.0425631;RO=0;SAF=41;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.0011086;OID=.;OPOS=26727722;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:73:75:76:76:0:42:34:0:0:17:0:41:32:0:0
chr17	26818572	.	TCG	CTC,TC	124.42	PASS	AF=0.0188679,0.528302;AO=6,23;DP=53;FAO=1,28;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=1,22;FSAR=0,6;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00247421,0.104436;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=3,1;MLLD=58.3272,9.52135;QD=9.39003;RBI=0.044552,0.254432;REFB=-0.000157913,-0.144006;REVB=0.0444833,0.23201;RO=23;SAF=6,17;SAR=0,6;SRF=8;SRR=15;SSEN=0,0.3125;SSEP=0,0;SSSB=0.747789,0.361335;STB=0.992106,0.712798;STBP=0.236,0.002;TYPE=mnp,del;VARB=0.0944507,0.163921;OID=.,.;OPOS=26818572,26818574;OREF=TCG,G;OALT=CTC,-;OMAPALT=CTC,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:53:53:23:24:6,23:1,28:0.0188679,0.528302:0,6:6,17:8:15:0,6:1,22:9:15
chr17	27009749	.	C	T	975.02	PASS	AF=0.985294;AO=67;DP=68;FAO=67;FDP=68;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0322618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.338;QD=57.3542;RBI=0.0366743;REFB=-0.0125298;REVB=0.0174409;RO=1;SAF=27;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116688;STB=0.506171;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000156407;OID=.;OPOS=27009749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:68:1:1:67:67:0.985294:40:27:0:1:40:27:0:1
chr17	27030690	.	C	T	399.0	PASS	AF=0.471264;AO=41;DP=87;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0355185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.0572;QD=18.345;RBI=0.0598621;REFB=-0.023412;REVB=-0.0481862;RO=46;SAF=25;SAR=16;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648471;STB=0.536214;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.0270213;OID=.;OPOS=27030690;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:46:46:41:41:0.471264:16:25:25:21:16:25:25:21
chr17	27185827	.	C	T	785.0	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00315582;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2892;QD=57.0908;RBI=0.00589613;REFB=0;REVB=-0.00498048;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.54169e-05;OID=.;OPOS=27185827;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:26:29:0:0:26:29:0:0
chr17	27207453	.	G	A	465.12	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0191064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.554;QD=58.1397;RBI=0.0219227;REFB=0;REVB=0.0107494;RO=0;SAF=12;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.38698e-05;OID=.;OPOS=27207453;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:20:12:0:0:20:12:0:0
chr17	27286851	.	T	C	559.67	PASS	AF=0.495726;AO=58;DP=117;FAO=58;FDP=117;FR=.;FRO=59;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0437528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.6381;QD=19.134;RBI=0.0438106;REFB=-0.00870846;REVB=0.00224788;RO=59;SAF=33;SAR=25;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0865704;STB=0.547864;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00900156;OID=.;OPOS=27286851;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:59:59:58:58:0.495726:25:33:28:31:25:33:28:31
chr17	27290968	.	CTG	CTC,CTGG,TGG	184.38	PASS	AF=0,0.428571,0;AO=3,19,3;DP=81;FAO=0,36,0;FDP=84;FR=.;FRO=48;FSAF=0,25,0;FSAR=0,11,0;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=-0.247959,0.293568,0.123146;FXX=0;HRUN=3,3,4;LEN=1,1,2;MLLD=137.933,16.4812,20.468;QD=8.7801;RBI=0.248945,0.293809,0.143951;REFB=-0.0184452,0.0873263,0.0271902;REVB=-0.0221291,0.011911,0.074546;RO=40;SAF=3,9,3;SAR=0,10,0;SRF=21;SRR=19;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.49448,-0.0587583,0.49448;STB=0.5,0.595183,0.5;STBP=1,0.154,1;TYPE=snp,ins,mnp;VARB=0,-0.0751706,0;OID=.,.,.;OPOS=27290970,27290970,27290968;OREF=G,-,CT;OALT=C,G,TG;OMAPALT=CTC,CTGG,TGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:81:84:40:48:3,19,3:0,36,0:0,0.428571,0:0,10,0:3,9,3:21:19:0,11,0:0,25,0:26:22
chr17	27422053	.	C	T	613.35	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.120616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.056;QD=61.3349;RBI=0.120785;REFB=0;REVB=0.00639613;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000666134;OID=.;OPOS=27422053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:19:21:0:0:19:21:0:0
chr17	27424316	.	G	A	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.00197542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=244.451;QD=15.7004;RBI=0.00344618;REFB=-0.0104447;REVB=0.0028238;RO=19;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0868987;STB=0.549935;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0130809;OID=.;OPOS=27424316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:6:9:13:6:6:9:13:6
chr17	27425172	.	G	A	161.47	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=13;FWDB=0.0535894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.926;QD=18.996;RBI=0.0538772;REFB=-0.0224041;REVB=0.0055616;RO=17;SAF=8;SAR=9;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212378;STB=0.619587;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0370992;OID=.;OPOS=27425172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:9:8:4:13:9:8:4:13
chr17	27438469	.	G	A	533.37	PASS	AF=0.8;AO=40;DP=50;FAO=40;FDP=50;FR=.;FRO=10;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0238707;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=79.3916;QD=42.6696;RBI=0.0515398;REFB=-0.0928025;REVB=0.0456787;RO=6;SAF=26;SAR=14;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123883;STB=0.532311;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=0.0040352;OID=.;OPOS=27438469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:50:50:6:10:40:40:0.8:14:26:1:5:14:26:5:5
chr17	27441077	.	C	G	666.98	PASS	AF=1;AO=31;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.676;QD=60.6349;RBI=0.128108;REFB=0;REVB=0.0342882;RO=0;SAF=16;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00308945;OID=.;OPOS=27441077;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:31:44:1:15:16:0:0:20:24:0:0
chr17	27580756	.	C	T	188.88	PASS	AF=0.352941;AO=24;DP=68;FAO=24;FDP=68;FR=.;FRO=44;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=23;FWDB=0.0112888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.485;QD=11.1104;RBI=0.0149094;REFB=-0.0157108;REVB=-0.00973925;RO=44;SAF=13;SAR=11;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0716952;STB=0.541632;STBP=0.636;TYPE=snp;VARB=0.0267156;OID=.;OPOS=27580756;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:44:44:24:24:0.352941:11:13:21:23:11:13:21:23
chr17	27588806	.	C	A	129.97	PASS	AF=0.517241;AO=13;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.00121472;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=52.2996;QD=17.9263;RBI=0.020276;REFB=-0.0857883;REVB=0.0202396;RO=11;SAF=4;SAR=9;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336491;STB=0.679775;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0481095;OID=.;OPOS=27588806;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:11:14:13:15:0.517241:9:4:8:3:9:6:11:3
chr17	27588980	.	CAG	C	90.83	PASS	AF=0.458333;AO=10;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.012533;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=2;MLLD=210.678;QD=15.1381;RBI=0.0125625;REFB=-0.0150742;REVB=-0.000860638;RO=13;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11072;STB=0.586311;STBP=0.479;TYPE=del;VARB=0.011727;OID=.;OPOS=27588981;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.458333:10:24:11:24:13:5:6:8:5:90:13:5:5:8:5
chr17	27835138	.	C	T	167.47	PASS	AF=0.9375;AO=15;DP=16;FAO=15;FDP=16;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00888945;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.079;QD=41.8678;RBI=0.0257135;REFB=-0.0223381;REVB=0.024128;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526281;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.000551716;OID=.;OPOS=27835138;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:16:0:1:15:15:0.9375:9:6:0:0:9:6:0:1
chr17	27889578	.	T	C	1339.16	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.331;QD=62.2864;RBI=0.0453014;REFB=0;REVB=0.0425095;RO=0;SAF=44;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.06769e-05;OID=.;OPOS=27889578;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:42:44:0:0:42:44:0:0
chr17	27889963	.	C	G	249.23	PASS	AF=0.466667;AO=23;DP=55;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.012572;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=295.363;QD=16.6152;RBI=0.0166326;REFB=-0.0157599;REVB=0.0108898;RO=32;SAF=16;SAR=7;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115562;STB=0.581571;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0171461;OID=.;OPOS=27889963;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:60:32:32:23:28:0.466667:7:16:19:13:7:21:20:12
chr17	27889986	.	T	C	710.43	PASS	AF=0.980769;AO=51;DP=52;FAO=51;FDP=52;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0171975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.122;QD=54.6486;RBI=0.0215328;REFB=-0.0710829;REVB=0.0129579;RO=1;SAF=35;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132664;STB=0.50704;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.000327764;OID=.;OPOS=27889986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:52:1:1:51:51:0.980769:16:35:1:0:16:35:1:0
chr17	27901975	.	A	G	487.28	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00293789;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.69;QD=59.0641;RBI=0.0761385;REFB=0;REVB=-0.0760818;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000395622;OID=.;OPOS=27901975;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:12:21:0:0:12:21:0:0
chr17	27904711	.	G	A	362.5	PASS	AF=0.653846;AO=34;DP=52;FAO=34;FDP=52;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.031477;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.1131;QD=27.8843;RBI=0.0325245;REFB=-0.0508525;REVB=-0.0081881;RO=18;SAF=19;SAR=15;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0727578;STB=0.539749;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0351147;OID=.;OPOS=27904711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:18:18:34:34:0.653846:15:19:8:10:15:19:8:10
chr17	27905380	.	G	A	572.54	PASS	AF=0.465116;AO=60;DP=129;FAO=60;FDP=129;FR=.;FRO=69;FSAF=31;FSAR=29;FSRF=26;FSRR=43;FWDB=0.000489105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.258;QD=17.7531;RBI=0.0100442;REFB=-0.0104601;REVB=-0.0100323;RO=69;SAF=31;SAR=29;SRF=26;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13434;STB=0.574493;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0123465;OID=.;OPOS=27905380;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:69:69:60:60:0.465116:29:31:26:43:29:31:26:43
chr17	27959903	.	G	A	433.05	PASS	AF=0.7;AO=34;DP=49;FAO=35;FDP=50;FR=.;FRO=15;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0405655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.61;QD=34.6441;RBI=0.0408182;REFB=0.00188769;REVB=0.00453552;RO=15;SAF=17;SAR=17;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0562408;STB=0.525759;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=-0.000743918;OID=.;OPOS=27959903;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:15:15:34:35:0.7:17:17:6:9:18:17:6:9
chr17	28268800	.	A	C	232.05	PASS	AF=0.428571;AO=27;DP=63;FAO=27;FDP=63;FR=.;FRO=36;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.0332652;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6926;QD=14.7331;RBI=0.0819772;REFB=0.015134;REVB=0.0749246;RO=36;SAF=11;SAR=16;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0665201;STB=0.537787;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=-0.0180338;OID=.;OPOS=28268800;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:36:36:27:27:0.428571:16:11:17:19:16:11:17:19
chr17	28296327	.	T	G	73.66	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.0667395;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.4354;QD=10.1606;RBI=0.0712945;REFB=-0.00936549;REVB=0.0250748;RO=19;SAF=5;SAR=5;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260924;STB=0.654892;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0248358;OID=.;OPOS=28296327;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:29:29:19:19:10:10:0.344828:5:5:14:5:5:5:14:5
chr17	28320248	.	T	A	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0317557;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.14;QD=59.8559;RBI=0.0317628;REFB=0;REVB=0.000670794;RO=0;SAF=43;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.32923e-05;OID=.;OPOS=28320248;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:28:43:0:0:28:43:0:0
chr17	28381141	.	C	G	179.69	PASS	AF=0.413043;AO=19;DP=46;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0147665;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.797;QD=15.6253;RBI=0.0147856;REFB=0.00768592;REVB=0.000751026;RO=27;SAF=7;SAR=12;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156226;STB=0.590068;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=-0.0125903;OID=.;OPOS=28381141;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:27:27:19:19:0.413043:12:7:14:13:12:7:14:13
chr17	28407876	.	T	G	469.17	PASS	AF=0.485437;AO=49;DP=102;FAO=50;FDP=103;FR=.;FRO=53;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=37;FSRR=16;FWDB=0.0120565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1147;QD=18.2201;RBI=0.0364231;REFB=-0.0190537;REVB=0.0343698;RO=53;SAF=30;SAR=19;SRF=37;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0866518;STB=0.553698;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0203253;OID=.;OPOS=28407876;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:103:53:53:49:50:0.485437:19:30:37:16:20:30:37:16
chr17	28444183	.	A	C	174.99	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.0793279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.6118;QD=19.9989;RBI=0.105219;REFB=-0.0319908;REVB=-0.0691242;RO=16;SAF=8;SAR=10;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113292;STB=0.545405;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0325219;OID=.;OPOS=28444183;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:17:18:18:0.514286:10:8:5:11:10:8:6:11
chr17	28511978	.	G	A	115.58	PASS	AF=0.8;AO=12;DP=15;FAO=12;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00709047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.294;QD=30.8213;RBI=0.0645113;REFB=-0.103953;REVB=0.0641204;RO=3;SAF=10;SAR=2;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117832;STB=0.565118;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.019971;OID=.;OPOS=28511978;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:15:15:3:3:12:12:0.8:2:10:3:0:2:10:3:0
chr17	28601208	.	C	T	687.26	PASS	AF=0.618557;AO=56;DP=93;FAO=60;FDP=97;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=0.0284523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.9379;QD=28.3405;RBI=0.0382748;REFB=-0.0226655;REVB=-0.0256012;RO=37;SAF=22;SAR=34;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0902858;STB=0.530871;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=0.01385;OID=.;OPOS=28601208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:97:37:37:56:60:0.618557:34:22:19:18:34:26:19:18
chr17	28794020	.	A	G	1401.34	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429296;FXX=0.0111099;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.0793;QD=62.9815;RBI=0.0641405;REFB=0;REVB=0.0476556;RO=0;SAF=57;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000390916;OID=.;OPOS=28794020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:89:0:0:89:89:1:32:57:0:0:32:57:0:0
chr17	28853530	.	A	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.772;QD=59.0187;RBI=0.0485067;REFB=0;REVB=0.0327565;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155569;OID=.;OPOS=28853530;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr17	28900708	.	G	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00414758;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=294.835;QD=52.6132;RBI=0.0134837;REFB=0;REVB=0.01283;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.06442e-05;OID=.;OPOS=28900708;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:13:9:0:0:13:9:0:0
chr17	29253862	.	A	G	46.79	PASS	AF=0.102564;AO=8;DP=80;FAO=8;FDP=78;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=66;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=47;FSRR=19;FWDB=-0.119418;FXX=0.0370325;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.0053;QD=2.39932;RBI=0.119427;REFB=-0.0158374;REVB=-0.00148069;RO=53;SAF=2;SAR=6;SRF=36;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.483461;STB=0.853969;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.171762;OID=.;OPOS=29253862;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:80:78:53:66:8:8:0.102564:6:2:36:17:6:2:47:19
chr17	29486152	.	G	A	385.12	PASS	AF=0.52;AO=39;DP=74;FAO=39;FDP=75;FR=.;FRO=36;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.00145968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.74;QD=20.5397;RBI=0.0111649;REFB=-0.0120436;REVB=-0.0110691;RO=34;SAF=25;SAR=14;SRF=21;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0212423;STB=0.529568;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0102309;OID=.;OPOS=29486152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:34:36:39:39:0.52:14:25:21:13:14:25:21:15
chr17	29496819	.	C	T	201.29	PASS	AF=0.678571;AO=19;DP=28;FAO=19;FDP=28;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0314995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.327;QD=28.755;RBI=0.0317008;REFB=-0.00825132;REVB=-0.00356697;RO=9;SAF=4;SAR=15;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.372551;STB=0.707916;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0075143;OID=.;OPOS=29496819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:28:28:9:9:19:19:0.678571:15:4:7:2:15:4:7:2
chr17	29508775	.	G	A	105.32	PASS	AF=0.342105;AO=13;DP=38;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.033092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.943;QD=11.0866;RBI=0.0349304;REFB=-0.00309545;REVB=-0.0111828;RO=25;SAF=9;SAR=4;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157691;STB=0.594562;STBP=0.458;TYPE=snp;VARB=0.0106854;OID=.;OPOS=29508775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:25:25:13:13:0.342105:4:9:14:11:4:9:14:11
chr17	29553485	.	G	A	76.66	PASS	AF=0.203704;AO=6;DP=56;FAO=11;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=43;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=-0.000362658;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.5299;QD=5.67837;RBI=0.0379689;REFB=-0.00017858;REVB=-0.0379671;RO=28;SAF=0;SAR=6;SRF=7;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.618516;STB=0.633531;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.0036701;OID=.;OPOS=29553485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:56:54:28:43:6:11:0.203704:6:0:7:21:9:2:13:30
chr17	29632241	.	T	C	421.53	PASS	AF=0.531646;AO=41;DP=78;FAO=42;FDP=79;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=31;FSRF=14;FSRR=23;FWDB=0.00684068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5197;QD=21.3434;RBI=0.0657012;REFB=-0.0197361;REVB=0.0653441;RO=37;SAF=11;SAR=30;SRF=14;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11277;STB=0.566074;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.0338445;OID=.;OPOS=29632241;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:79:37:37:41:42:0.531646:30:11:14:23:31:11:14:23
chr17	29845591	.	C	T	99.61	PASS	AF=0.342105;AO=12;DP=37;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.217779;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.9662;QD=10.4857;RBI=0.21937;REFB=-0.027083;REVB=0.0263758;RO=25;SAF=1;SAR=11;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.543016;STB=0.740506;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0640865;OID=.;OPOS=29845591;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:38:25:25:12:13:0.342105:11:1:11:14:11:2:11:14
chr17	29855661	.	G	A	237.66	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.019811;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.056;QD=19.4009;RBI=0.0261978;REFB=-0.0141556;REVB=-0.0171419;RO=26;SAF=13;SAR=10;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133007;STB=0.594989;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.016713;OID=.;OPOS=29855661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:49:26:26:23:23:0.469388:10:13:11:15:10:13:10:16
chr17	29859016	.	G	A	251.7	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.00333661;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8022;QD=17.0644;RBI=0.0292299;REFB=-0.0222697;REVB=0.0290388;RO=31;SAF=13;SAR=15;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13826;STB=0.577563;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=0.031569;OID=.;OPOS=29859016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:15:13:19:12:15:13:19:12
chr17	29859506	.	G	T	663.19	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0338459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.3579;QD=58.9498;RBI=0.0963273;REFB=-0.0743264;REVB=0.0901854;RO=1;SAF=28;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164729;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0143945;OID=.;OPOS=29859506;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:43:45:1:0:42:45:1:14:28:1:0:14:31:0:0
chr17	29890870	.	C	G	619.93	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0184869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.117;QD=59.0407;RBI=0.0473936;REFB=0.0853684;REVB=-0.0436393;RO=1;SAF=23;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199652;STB=0.510633;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00237579;OID=.;OPOS=29890870;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:18:23:1:0:18:23:1:0
chr17	30183857	.	T	C	760.37	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.614;QD=62.071;RBI=0.0346824;REFB=-0.0128752;REVB=0.0296566;RO=1;SAF=32;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0144774;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00128554;OID=.;OPOS=30183857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:49:49:1:0:48:49:1:16:32:1:0:16:33:0:0
chr17	30222002	.	T	C	742.14	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.072567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.146;QD=61.8452;RBI=0.0737459;REFB=0;REVB=0.0131334;RO=1;SAF=29;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0159381;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042497;OID=.;OPOS=30222002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:47:48:1:0:46:48:1:17:29:1:0:17:31:0:0
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chr17	31340682	.	C	T	1428.12	PASS	AF=0.978947;AO=91;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0530579;FXX=0.0306091;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5813;QD=60.1314;RBI=0.0536241;REFB=-0.0124221;REVB=-0.00777211;RO=2;SAF=32;SAR=59;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157967;STB=0.508195;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00212329;OID=.;OPOS=31340682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:95:95:2:2:91:93:0.978947:59:32:0:2:60:33:0:2
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chr17	31618732	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00924949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.778;QD=48.7352;RBI=0.0331104;REFB=0;REVB=0.0317923;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355439;OID=.;OPOS=31618732;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr17	32483237	.	A	G	187.93	PASS	AF=0.347826;AO=24;DP=69;FAO=24;FDP=69;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=18;FWDB=-0.0219645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.507;QD=10.8946;RBI=0.0323104;REFB=-0.00261853;REVB=-0.0236965;RO=45;SAF=9;SAR=15;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.249813;STB=0.645042;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.0070133;OID=.;OPOS=32483237;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:45:45:24:24:0.347826:15:9:27:18:15:9:27:18
chr17	32483270	.	C	G	205.61	PASS	AF=0.390625;AO=25;DP=64;FAO=25;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0814879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4066;QD=12.8506;RBI=0.0815592;REFB=-0.0156118;REVB=0.00340994;RO=28;SAF=12;SAR=13;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147504;STB=0.582025;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0196997;OID=.;OPOS=32483270;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:28:39:25:25:0.390625:13:12:13:15:13:12:24:15
chr17	32583269	.	T	C	1084.31	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0345056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=290.02;QD=58.6111;RBI=0.0561071;REFB=-0.0040283;REVB=0.0442422;RO=1;SAF=28;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0103967;STB=0.505493;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.000125831;OID=.;OPOS=32583269;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:45:28:0:1:45:28:0:1
chr17	32583911	.	C	T	1079.66	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139565;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.7132;QD=59.981;RBI=0.0144372;REFB=0;REVB=-0.0036943;RO=1;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126095;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.77596e-05;OID=.;OPOS=32583911;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:1:0:71:72:1:37:34:0:1:38:34:0:0
chr17	32647831	.	A	C	153.31	PASS	AF=0.358491;AO=18;DP=52;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.0167361;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.7187;QD=11.5703;RBI=0.0171577;REFB=-0.0184538;REVB=-0.0037798;RO=34;SAF=6;SAR=12;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22316;STB=0.604727;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0336598;OID=.;OPOS=32647831;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:34:34:18:19:0.358491:12:6:18:16:12:7:18:16
chr17	32904586	.	C	T	1264.54	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00528015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6839;QD=61.6847;RBI=0.0673321;REFB=0;REVB=-0.0671247;RO=0;SAF=54;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.44411e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000449663;OID=.;OPOS=32904586;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:28:54:0:0:28:54:0:0
chr17	32953258	.	G	A	322.67	PASS	AF=0.636364;AO=24;DP=40;FAO=28;FDP=44;FR=.;FRO=16;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0442324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.9297;QD=29.3338;RBI=0.183617;REFB=-0.0678785;REVB=0.178209;RO=16;SAF=15;SAR=9;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0935671;STB=0.526297;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.043393;OID=.;OPOS=32953258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:44:16:16:24:28:0.636364:9:15:8:8:12:16:8:8
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chr17	33288882	.	T	G	1123.32	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.068965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.336;QD=59.1221;RBI=0.0692761;REFB=0;REVB=0.00655795;RO=0;SAF=15;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0036051;OID=.;OPOS=33288882;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:76:0:0:69:76:1:54:15:0:0:54:22:0:0
chr17	33289113	.	AAG	A,AGG	70.67	PASS	AF=0.352941,0;AO=12,2;DP=44;FAO=12,0;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=4,0;FSAR=8,0;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0176675,0.0142304;FXX=0.0810592;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=22.5463,17.7633;QD=8.31463;RBI=0.0588183,0.0462397;REFB=-0.0755134,-0.0230316;REVB=-0.0561022,-0.0439955;RO=26;SAF=2,1;SAR=10,1;SRF=15;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.493685,-0.0713032;STB=0.553101,0.5;STBP=0.675,1;TYPE=del,snp;VARB=0.150691,0;OID=.,.;OPOS=33289114,33289114;OREF=AG,A;OALT=-,G;OMAPALT=A,AGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.352941,0:12,2:44:12,0:34:22:4,0:8,0:9:13:71:26:2,1:10,1:15:11
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chr17	33348399	.	C	CG	38.95	PASS	AF=0.255814;AO=10;DP=43;FAO=11;FDP=43;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0178408;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=79.2487;QD=3.62298;RBI=0.017948;REFB=-0.00853234;REVB=-0.00195816;RO=33;SAF=1;SAR=9;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.654341;STB=0.919281;STBP=0.006;TYPE=ins;VARB=0.130835;OID=.;OPOS=33348400;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.255814:10:43:11:43:32:1:10:22:10:38:33:1:9:22:11
chr17	33448818	.	T	C	666.07	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=51;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.036636;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=39.6917;QD=52.2407;RBI=0.0820005;REFB=-0.0314823;REVB=-0.0733613;RO=2;SAF=29;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00699852;STB=0.503721;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=-0.000437386;OID=.;OPOS=33448818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:51:51:2:2:49:49:0.960784:20:29:1:1:20:29:1:1
chr17	33454415	.	C	A	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0348034;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=218.918;QD=59.4356;RBI=0.0352229;REFB=0;REVB=0.00541954;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115346;OID=.;OPOS=33454415;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
chr17	33464864	.	C	T	868.11	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0300205;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1395;QD=57.8739;RBI=0.0567534;REFB=0;REVB=0.0481634;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178656;OID=.;OPOS=33464864;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:25:35:0:0:25:35:0:0
chr17	33469279	.	G	C	223.19	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.141199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1991;QD=49.5987;RBI=0.161102;REFB=0;REVB=-0.0775686;RO=0;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00685982;OID=.;OPOS=33469279;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:12:6:0:0:12:6:0:0
chr17	33520965	.	G	A	336.69	PASS	AF=0.461538;AO=36;DP=78;FAO=36;FDP=78;FR=.;FRO=42;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=24;FWDB=0.0100728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.516;QD=17.2659;RBI=0.0302407;REFB=-0.0271625;REVB=-0.0285139;RO=42;SAF=30;SAR=6;SRF=18;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.45376;STB=0.757416;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.02022;OID=.;OPOS=33520965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:42:42:36:36:0.461538:6:30:18:24:6:30:18:24
chr17	33521276	.	C	T	143.04	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0011631;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1054;QD=14.3043;RBI=0.101586;REFB=-0.0386561;REVB=-0.10158;RO=23;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00280785;STB=0.512723;STBP=0.931;TYPE=snp;VARB=0.0511374;OID=.;OPOS=33521276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:23:24:16:16:0.4:7:9:13:10:7:9:14:10
chr17	33680807	.	G	A	176.92	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0321745;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5642;QD=44.2306;RBI=0.03221;REFB=0;REVB=-0.00151303;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00674641;OID=.;OPOS=33680807;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:14:16:1:8:6:0:0:10:6:0:0
chr17	33680840	.	T	C	554.63	PASS	AF=0.95;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0226043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.2063;QD=55.4633;RBI=0.0353647;REFB=0.0255869;REVB=0.0271975;RO=2;SAF=20;SAR=18;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00246896;STB=0.501319;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=-0.0068797;OID=.;OPOS=33680840;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:40:40:2:2:38:38:0.95:18:20:1:1:18:20:1:1
chr17	33689926	.	T	C	2351.71	PASS	AF=0.987342;AO=156;DP=158;FAO=156;FDP=158;FR=.;FRO=2;FSAF=100;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0363085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.2955;QD=59.5371;RBI=0.0555495;REFB=0.0120263;REVB=-0.0420409;RO=2;SAF=100;SAR=56;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00368543;STB=0.501937;STBP=0.779;TYPE=snp;VARB=-0.00201255;OID=.;OPOS=33689926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:158:158:2:2:156:156:0.987342:56:100:1:1:56:100:1:1
chr17	33690466	.	C	A	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0141879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.47;QD=15.8821;RBI=0.0142284;REFB=-0.00659524;REVB=-0.00107297;RO=10;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.172412;STB=0.599808;STBP=0.424;TYPE=snp;VARB=0.00778108;OID=.;OPOS=33690466;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:5:5:3:7:5:5:3:7
chr17	33749546	.	A	G	242.62	PASS	AF=0.444444;AO=27;DP=62;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0478643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.399;QD=15.4045;RBI=0.0478654;REFB=-0.011728;REVB=0.000321008;RO=34;SAF=6;SAR=21;SRF=12;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165123;STB=0.594522;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0159255;OID=.;OPOS=33749546;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:63:34:35:27:28:0.444444:21:6:12:22:22:6:12:23
chr17	33749919	.	A	C	178.73	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.00229856;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.859;QD=22.3411;RBI=0.0145217;REFB=-0.0182057;REVB=-0.0143386;RO=14;SAF=5;SAR=13;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299453;STB=0.668922;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0151571;OID=.;OPOS=33749919;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:13:5:9:5:13:5:9:5
chr17	33768199	.	G	A	535.63	PASS	AF=0.5;AO=56;DP=112;FAO=56;FDP=112;FR=.;FRO=56;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=43;FSRR=13;FWDB=-0.0329297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.957;QD=19.1295;RBI=0.0367907;REFB=-0.00734219;REVB=-0.0164072;RO=54;SAF=29;SAR=27;SRF=42;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235283;STB=0.626247;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00999394;OID=.;OPOS=33768199;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:112:112:54:56:56:56:0.5:27:29:42:12:27:29:43:13
chr17	33768334	.	T	G	158.72	PASS	AF=0.304348;AO=21;DP=65;FAO=21;FDP=69;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=-0.00539428;FXX=0.0416609;HRUN=5;LEN=1;MLLD=120.935;QD=9.20123;RBI=0.0159718;REFB=-0.00732175;REVB=-0.0150333;RO=44;SAF=7;SAR=14;SRF=26;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29451;STB=0.660041;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.023326;OID=.;OPOS=33768334;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:69:44:48:21:21:0.304348:14:7:26:18:14:7:27:21
chr17	33768354	.	C	T	117.17	PASS	AF=0.301887;AO=15;DP=52;FAO=16;FDP=53;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=20;FWDB=-0.0381543;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.4135;QD=8.84311;RBI=0.0596203;REFB=-0.00882035;REVB=0.045813;RO=37;SAF=4;SAR=11;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246443;STB=0.66294;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0168188;OID=.;OPOS=33768354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:37:37:15:16:0.301887:11:4:17:20:12:4:17:20
chr17	33769034	.	G	A	233.59	PASS	AF=0.337209;AO=29;DP=86;FAO=29;FDP=86;FR=.;FRO=57;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=34;FSRR=23;FWDB=0.00105905;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.9779;QD=10.8648;RBI=0.038293;REFB=0.00611201;REVB=-0.0382783;RO=57;SAF=18;SAR=11;SRF=34;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290274;STB=0.51688;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=-0.0178276;OID=.;OPOS=33769034;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:57:57:29:29:0.337209:11:18:34:23:11:18:34:23
chr17	33769038	.	C	A	128.0	PASS	AF=0.215054;AO=20;DP=93;FAO=20;FDP=93;FR=.;FRO=73;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=-0.0121512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.925;QD=5.50547;RBI=0.012776;REFB=-0.012132;REVB=0.00394653;RO=73;SAF=14;SAR=6;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202155;STB=0.627453;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0339257;OID=.;OPOS=33769038;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:73:73:20:20:0.215054:6:14:40:33:6:14:40:33
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chr17	33901965	.	C	G	528.63	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0132148;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.813;QD=60.4147;RBI=0.0143274;REFB=0;REVB=-0.00553553;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000397492;OID=.;OPOS=33901965;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr17	34050934	.	C	T	557.72	PASS	AF=0.457364;AO=58;DP=129;FAO=59;FDP=129;FR=.;FRO=70;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=0.0366115;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3248;QD=17.2937;RBI=0.0533898;REFB=0.00797404;REVB=0.0388597;RO=71;SAF=22;SAR=36;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183263;STB=0.608774;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=-0.00765353;OID=.;OPOS=34050934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:71:70:58:59:0.457364:36:22:40:31:37:22:40:30
chr17	34069578	.	C	T	228.38	PASS	AF=0.472727;AO=24;DP=54;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=0.0777805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.806;QD=16.6096;RBI=0.0780839;REFB=-0.0124865;REVB=0.00687613;RO=29;SAF=13;SAR=11;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253997;STB=0.65473;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0164841;OID=.;OPOS=34069578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:29:29:24:26:0.472727:11:13:8:21:11:15:8:21
chr17	34070289	.	C	T	252.88	PASS	AF=0.42029;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=0.0140404;FXX=0.028165;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.5516;QD=14.6599;RBI=0.0439005;REFB=-0.0118822;REVB=0.0415948;RO=40;SAF=18;SAR=11;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00467843;STB=0.502655;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.0209272;OID=.;OPOS=34070289;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:40:40:29:29:0.42029:11:18:25:15:11:18:25:15
chr17	34070299	.	G	A	258.52	PASS	AF=0.410959;AO=30;DP=73;FAO=30;FDP=73;FR=.;FRO=43;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.016494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.023;QD=14.1654;RBI=0.0773084;REFB=-0.0263884;REVB=0.0755284;RO=41;SAF=18;SAR=12;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0409648;STB=0.511356;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0426074;OID=.;OPOS=34070299;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:41:43:30:30:0.410959:12:18:23:18:12:18:25:18
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chr17	34091078	.	C	G	460.57	PASS	AF=0.375887;AO=53;DP=140;FAO=53;FDP=141;FR=.;FRO=88;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=64;FWDB=0.00640429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0014;QD=13.0659;RBI=0.0570801;REFB=-0.0383926;REVB=-0.0567197;RO=87;SAF=29;SAR=24;SRF=24;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293117;STB=0.667306;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0518896;OID=.;OPOS=34091078;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:141:87:88:53:53:0.375887:24:29:24:63:24:29:24:64
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chr17	34093663	.	G	A	129.05	PASS	AF=0.285714;AO=14;DP=67;FAO=18;FDP=63;FR=.;FRO=45;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=31;FSRR=14;FWDB=-0.0331107;FXX=0.0596926;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.545;QD=8.19388;RBI=0.0383899;REFB=-0.00861768;REVB=-0.0194285;RO=36;SAF=1;SAR=13;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.702979;STB=0.775837;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0490861;OID=.;OPOS=34093663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:63:36:45:14:18:0.285714:13:1:24:12:13:5:31:14
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chr17	34100350	.	G	C,GC	1034.4	PASS	AF=0.0277778,0.958333;AO=3,64;DP=83;FAO=2,69;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=0,21;FSAR=2,48;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.046561,0.00912548;FXX=0.0136968;HRUN=2,0;LEN=1,1;MLLD=192.825,217.349;QD=57.4667;RBI=0.0586265,0.0453207;REFB=-0.137505,-0.0795967;REVB=0.0356251,0.0443925;RO=12;SAF=0,17;SAR=3,47;SRF=10;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.760258,-0.193746;STB=0.5,0.505153;STBP=1,0.617;TYPE=snp,ins;VARB=-0.00137015,0.00133271;OID=.,.;OPOS=34100350,34100351;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:83:72:12:1:3,64:2,69:0.0277778,0.958333:3,47:0,17:10:2:2,48:0,21:0:1
chr17	34182341	.	G	A	279.72	PASS	AF=0.541667;AO=25;DP=47;FAO=26;FDP=48;FR=.;FRO=22;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0111989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.822;QD=23.31;RBI=0.0367053;REFB=-0.017422;REVB=0.0349551;RO=22;SAF=15;SAR=10;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0319934;STB=0.510196;STBP=0.907;TYPE=snp;VARB=0.0156501;OID=.;OPOS=34182341;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:22:22:25:26:0.541667:10:15:14:8:10:16:14:8
chr17	34195739	.	T	C	337.15	PASS	AF=0.611111;AO=33;DP=54;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00790038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.833;QD=24.9739;RBI=0.00948054;REFB=-0.0112172;REVB=-0.00524066;RO=21;SAF=13;SAR=20;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256958;STB=0.6408;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00577919;OID=.;OPOS=34195739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:21:21:33:33:0.611111:20:13:16:5:20:13:16:5
chr17	34215825	.	T	C	326.83	PASS	AF=0.394231;AO=39;DP=103;FAO=41;FDP=104;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=0.00879692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.429;QD=12.5704;RBI=0.029585;REFB=-0.0190264;REVB=-0.0282469;RO=62;SAF=20;SAR=19;SRF=30;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312108;STB=0.526995;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.0404813;OID=.;OPOS=34215825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:104:62:63:39:41:0.394231:19:20:30:32:19:22:31:32
chr17	34216624	.	G	C	121.55	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.000329597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9553;QD=15.1935;RBI=0.0763817;REFB=-0.0306933;REVB=0.076381;RO=18;SAF=5;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246357;STB=0.642653;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.0448562;OID=.;OPOS=34216624;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:18:18:14:14:0.4375:9:5:11:7:9:5:11:7
chr17	34257637	.	T	C	271.88	PASS	AF=0.517857;AO=28;DP=56;FAO=29;FDP=56;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=-0.019469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.866;QD=19.4202;RBI=0.0475186;REFB=-0.024097;REVB=0.0433472;RO=27;SAF=18;SAR=10;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0472824;STB=0.532687;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0354585;OID=.;OPOS=34257637;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:27:27:28:29:0.517857:10:18:16:11:10:19:16:11
chr17	34264859	.	A	G	521.42	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=22;FSRR=28;FWDB=-0.0160355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.597;QD=20.857;RBI=0.0176872;REFB=-0.0125891;REVB=-0.00746312;RO=50;SAF=26;SAR=24;SRF=22;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0721649;STB=0.53992;STBP=0.461;TYPE=snp;VARB=0.0121744;OID=.;OPOS=34264859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:50:50:50:50:0.5:24:26:22:28:24:26:22:28
chr17	34328461	.	A	G	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.969;QD=62.6709;RBI=0.0519233;REFB=0;REVB=-0.0350199;RO=0;SAF=36;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.42054e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.04427e-05;OID=.;OPOS=34328461;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:8:36:0:0:8:36:0:0
chr17	34340284	.	C	T	1491.68	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100462;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.16;QD=63.4759;RBI=0.0141855;REFB=0;REVB=0.0100151;RO=0;SAF=56;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.37672e-05;OID=.;OPOS=34340284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:38:56:0:0:38:56:0:0
chr17	34391783	.	C	T	230.86	PASS	AF=0.45614;AO=25;DP=56;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=0.0286992;FXX=0.0172384;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.5364;QD=16.2003;RBI=0.0352408;REFB=-0.0345383;REVB=0.0204518;RO=31;SAF=16;SAR=9;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.246949;STB=0.645749;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0446939;OID=.;OPOS=34391783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:31:31:25:26:0.45614:9:16:12:19:9:17:12:19
chr17	34431287	.	G	T	1327.7	PASS	AF=1;AO=80;DP=82;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.614;QD=61.7537;RBI=0.0371515;REFB=0;REVB=0.0307304;RO=0;SAF=43;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.97813e-05;OID=.;OPOS=34431287;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:86:0:0:80:86:1:37:43:0:0:39:47:0:0
chr17	34431961	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0315258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.835;QD=42.1824;RBI=0.0324529;REFB=0;REVB=0.00770163;RO=0;SAF=2;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000123917;OID=.;OPOS=34431961;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:9:2:0:0:9:2:0:0
chr17	34871721	.	T	C	286.23	PASS	AF=0.553191;AO=26;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00511317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.487;QD=24.3604;RBI=0.0125461;REFB=-0.0206637;REVB=0.0114569;RO=20;SAF=16;SAR=10;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714021;STB=0.524457;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0100834;OID=.;OPOS=34871721;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:20:21:26:26:0.553191:10:16:14:6:10:16:14:7
chr17	34893326	.	A	G	302.23	PASS	AF=0.516129;AO=32;DP=62;FAO=32;FDP=62;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=0.00348764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.067;QD=19.4987;RBI=0.019763;REFB=-0.0136308;REVB=0.0194528;RO=30;SAF=14;SAR=18;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256597;STB=0.514277;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0284522;OID=.;OPOS=34893326;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:30:30:32:32:0.516129:18:14:14:16:18:14:14:16
chr17	34958598	.	G	C	765.58	PASS	AF=0.506849;AO=74;DP=146;FAO=74;FDP=146;FR=.;FRO=72;FSAF=48;FSAR=26;FSRF=52;FSRR=20;FWDB=-0.00127236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.309;QD=20.9748;RBI=0.00354206;REFB=-0.0195036;REVB=0.00330564;RO=71;SAF=48;SAR=26;SRF=51;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0697505;STB=0.540755;STBP=0.358;TYPE=snp;VARB=0.0184463;OID=.;OPOS=34958598;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:146:71:72:74:74:0.506849:26:48:51:20:26:48:52:20
chr17	35478362	.	T	C	309.46	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00676996;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.057;QD=51.5759;RBI=0.0225347;REFB=0;REVB=-0.0214937;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000775332;OID=.;OPOS=35478362;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:12:11:0:0:12:12:0:0
chr17	35696804	.	G	A	37.06	PASS	AF=0.3;AO=4;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00373421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.966;QD=7.41165;RBI=0.0189517;REFB=-0.0185876;REVB=0.0185801;RO=14;SAF=3;SAR=1;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359137;STB=0.666111;STBP=0.365;TYPE=snp;VARB=0.0394423;OID=.;OPOS=35696804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:14:14:4:6:0.3:1:3:6:8:2:4:6:8
chr17	35743010	.	C	G	779.65	PASS	AF=0.966102;AO=56;DP=60;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0217902;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.3219;QD=52.8574;RBI=0.0282489;REFB=-0.0295156;REVB=0.0179774;RO=3;SAF=36;SAR=20;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00248408;STB=0.505528;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.00669888;OID=.;OPOS=35743010;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:60:59:3:2:56:57:0.966102:20:36:2:1:20:37:1:1
chr17	35771468	.	C	T	463.36	PASS	AF=0.942857;AO=32;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0415671;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.7205;QD=52.9549;RBI=0.0416965;REFB=-0.016162;REVB=-0.00328292;RO=2;SAF=10;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0405767;STB=0.520821;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.000187087;OID=.;OPOS=35771468;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:35:35:2:2:32:33:0.942857:22:10:0:2:23:10:0:2
chr17	35873399	.	TA	T	1407.05	PASS	AF=1;AO=111;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0176548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.5594;QD=48.1042;RBI=0.0357309;REFB=0;REVB=-0.0310646;RO=0;SAF=66;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53129e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000485244;OID=.;OPOS=35873400;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:111:117:117:117:0:71:46:0:0:25:0:66:45:0:0
chr17	35902225	.	C	G	1028.82	PASS	AF=1;AO=66;DP=69;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.103007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8385;QD=55.612;RBI=0.104612;REFB=0;REVB=-0.0182515;RO=0;SAF=26;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000753572;OID=.;OPOS=35902225;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:74:0:0:66:74:1:40:26:0:0:40:34:0:0
chr17	36358847	.	T	A	2057.0	PASS	AF=0.985185;AO=133;DP=136;FAO=133;FDP=135;FR=.;FRO=2;FSAF=82;FSAR=51;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0573148;FXX=0.0073524;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3167;QD=60.9481;RBI=0.100076;REFB=-0.167135;REVB=0.0820383;RO=2;SAF=82;SAR=51;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114514;STB=0.506023;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00294557;OID=.;OPOS=36358847;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:136:135:2:2:133:133:0.985185:51:82:2:0:51:82:2:0
chr17	36635721	.	C	T	727.68	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00366716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.9137;QD=63.2763;RBI=0.0199512;REFB=0;REVB=0.0196113;RO=0;SAF=32;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125013;OID=.;OPOS=36635721;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:14:32:0:0:14:32:0:0
chr17	36636059	.	C	CG	118.43	PASS	AF=1;AO=11;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.158875;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=17.2119;QD=36.4403;RBI=0.158875;REFB=0;REVB=0;RO=2;SAF=11;SAR=0;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0181755;OID=.;OPOS=36636060;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:11:13:13:13:0:13:0:0:0:3:2:11:0:2:0
chr17	36646386	.	A	G	2842.35	PASS	AF=0.984127;AO=185;DP=190;FAO=186;FDP=189;FR=.;FRO=3;FSAF=115;FSAR=71;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0079573;FXX=0.00526288;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.376;QD=60.1556;RBI=0.0657752;REFB=-0.210009;REVB=0.0652921;RO=0;SAF=115;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.25338e-08;STB=0.510344;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00139942;OID=.;OPOS=36646386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:190:189:0:3:185:186:0.984127:70:115:0:0:71:115:0:3
chr17	36654005	.	C	T	46.73	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.0178326;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.9771;QD=10.3852;RBI=0.0901809;REFB=-0.00484755;REVB=0.0884002;RO=11;SAF=5;SAR=2;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.28385;STB=0.666294;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0155983;OID=.;OPOS=36654005;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:2:5:10:1:2:5:10:1
chr17	36699322	.	A	G	226.35	PASS	AF=0.480769;AO=23;DP=50;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=0.0184301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.788;QD=17.4115;RBI=0.0706057;REFB=-0.013905;REVB=0.0681579;RO=26;SAF=16;SAR=7;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196773;STB=0.584986;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.00942397;OID=.;OPOS=36699322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:26:27:23:25:0.480769:7:16:13:13:9:16:13:14
chr17	36700163	.	C	T	1442.28	PASS	AF=0.501754;AO=143;DP=285;FAO=143;FDP=285;FR=.;FRO=142;FSAF=82;FSAR=61;FSRF=73;FSRR=69;FWDB=-0.00538705;FXX=0.00349638;HRUN=5;LEN=1;MLLD=158.878;QD=20.2426;RBI=0.00578574;REFB=-0.00462789;REVB=0.00211055;RO=141;SAF=82;SAR=61;SRF=73;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0511236;STB=0.529949;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00537738;OID=.;OPOS=36700163;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:285:285:141:142:143:143:0.501754:61:82:73:68:61:82:73:69
chr17	36731195	.	T	C	221.87	PASS	AF=0.458333;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=48;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.0458342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.0624;QD=18.4894;RBI=0.0476487;REFB=-0.0197894;REVB=0.013024;RO=26;SAF=13;SAR=9;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184307;STB=0.603572;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0138406;OID=.;OPOS=36731195;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:26:26:22:22:0.458333:9:13:20:6:9:13:20:6
chr17	36861983	.	T	C	805.12	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0675239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6803;QD=64.4099;RBI=0.0717749;REFB=0;REVB=0.0243345;RO=0;SAF=6;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84987e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000841664;OID=.;OPOS=36861983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:44:6:0:0:44:6:0:0
chr17	36868130	.	G	A	111.16	PASS	AF=0.464286;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.055502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.3302;QD=15.8805;RBI=0.0562524;REFB=-0.0708649;REVB=0.00915775;RO=15;SAF=7;SAR=6;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0664503;STB=0.538402;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0242763;OID=.;OPOS=36868130;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:15:15:13:13:0.464286:6:7:7:8:6:7:7:8
chr17	36878952	.	TCTC	T	392.76	PASS	AF=0.493827;AO=35;DP=80;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.00690012;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=3;MLLD=210.625;QD=19.3957;RBI=0.0110057;REFB=-0.0409092;REVB=-0.00857397;RO=39;SAF=5;SAR=30;SRF=13;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278488;STB=0.591836;STBP=0.149;TYPE=del;VARB=0.0398319;OID=.;OPOS=36878953;OREF=CTC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.493827:35:80:40:81:41:9:31:15:26:99:39:5:30:13:26
chr17	36906401	.	T	A	96.2	PASS	AF=0.375;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=32;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=5;FWDB=0.00566757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.719;QD=12.0244;RBI=0.0202328;REFB=-0.0177673;REVB=-0.0194228;RO=20;SAF=7;SAR=5;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189795;STB=0.610941;STBP=0.41;TYPE=snp;VARB=0.0251399;OID=.;OPOS=36906401;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:32:32:20:20:12:12:0.375:5:7:15:5:5:7:15:5
chr17	36906480	.	G	A	137.91	PASS	AF=0.6;AO=14;DP=24;FAO=15;FDP=25;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.113224;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=43.5845;QD=22.0651;RBI=0.133159;REFB=-0.046082;REVB=0.0700829;RO=10;SAF=7;SAR=7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736238;STB=0.553121;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0808251;OID=.;OPOS=36906480;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:24:25:10:10:14:15:0.6:7:7:4:6:7:8:4:6
chr17	36909061	.	A	G	515.01	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0650773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.676;QD=58.8578;RBI=0.0675233;REFB=0;REVB=-0.0180094;RO=0;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177182;OID=.;OPOS=36909061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:22:12:0:0:22:13:0:0
chr17	36909499	.	A	T	247.0	PASS	AF=0.509804;AO=26;DP=52;FAO=26;FDP=51;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.0128369;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.664;QD=19.3726;RBI=0.0128582;REFB=-0.0118261;REVB=0.00073847;RO=26;SAF=12;SAR=14;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.170353;STB=0.605891;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00774626;OID=.;OPOS=36909499;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:26:25:26:26:0.509804:14:12:17:9:14:12:17:8
chr17	36922839	.	C	G	218.04	PASS	AF=0.40625;AO=25;DP=62;FAO=26;FDP=64;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.0137753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.707;QD=13.6273;RBI=0.0990083;REFB=-0.0207917;REVB=-0.0980454;RO=35;SAF=21;SAR=4;SRF=24;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.235023;STB=0.627265;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0114617;OID=.;OPOS=36922839;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:35:38:25:26:0.40625:4:21:24:11:4:22:27:11
chr17	36926731	.	T	G	463.48	PASS	AF=0.529412;AO=45;DP=85;FAO=45;FDP=85;FR=.;FRO=40;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.03218;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4299;QD=21.811;RBI=0.0426285;REFB=-0.0256792;REVB=0.0279577;RO=37;SAF=26;SAR=19;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835938;STB=0.535196;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.0209677;OID=.;OPOS=36926731;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:37:40:45:45:0.529412:19:26:25:12:19:26:26:14
chr17	36926767	.	G	A	421.23	PASS	AF=0.518519;AO=41;DP=80;FAO=42;FDP=81;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.018357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.642;QD=20.8016;RBI=0.0191432;REFB=-0.0395123;REVB=0.00542994;RO=34;SAF=26;SAR=15;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0923615;STB=0.524579;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0247496;OID=.;OPOS=36926767;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:34:39:41:42:0.518519:15:26:25:9:16:26:26:13
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chr17	37017969	.	T	G	188.64	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0617863;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3134;QD=14.2372;RBI=0.0696487;REFB=0.0153568;REVB=0.0321463;RO=31;SAF=9;SAR=13;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0775949;STB=0.544462;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.0187805;OID=.;OPOS=37017969;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:13:9:15:16:13:9:15:16
chr17	37070658	.	A	G	287.93	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=62;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=20;FSRR=11;FWDB=-0.0324029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.6952;QD=18.5758;RBI=0.033771;REFB=-0.0326515;REVB=0.00951516;RO=30;SAF=10;SAR=21;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.278478;STB=0.663051;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0266298;OID=.;OPOS=37070658;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:30:31:31:31:0.5:21:10:19:11:21:10:20:11
chr17	37076331	.	G	A	508.73	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0398526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.956;QD=56.525;RBI=0.064081;REFB=-0.174167;REVB=-0.0501812;RO=1;SAF=24;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0190966;STB=0.510198;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.000863781;OID=.;OPOS=37076331;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:1:1:35:35:0.972222:11:24:1:0:11:24:1:0
chr17	37101380	.	T	C	692.62	PASS	AF=0.928571;AO=41;DP=56;FAO=52;FDP=56;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.00664032;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=145.332;QD=49.4725;RBI=0.0319364;REFB=-0.0868975;REVB=0.0312384;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501375;STBP=0.905;TYPE=snp;VARB=0.000757803;OID=.;OPOS=37101380;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:56:56:0:4:41:52:0.928571:18:23:0:0:27:25:2:2
chr17	37213317	.	C	A	229.25	PASS	AF=0.65625;AO=20;DP=32;FAO=21;FDP=32;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0116939;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9428;QD=28.6561;RBI=0.0630766;REFB=-0.020973;REVB=0.0619832;RO=11;SAF=8;SAR=12;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217967;STB=0.6112;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0175729;OID=.;OPOS=37213317;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:32:32:11:11:20:21:0.65625:12:8:1:10:13:8:1:10
chr17	37228765	.	A	G	325.78	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=53;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=0.020215;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.39;QD=24.587;RBI=0.0444237;REFB=-0.00994378;REVB=-0.0395578;RO=21;SAF=17;SAR=15;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0291181;STB=0.516004;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.00374597;OID=.;OPOS=37228765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:21:21:32:32:0.603774:15:17:12:9:15:17:12:9
chr17	37263830	.	G	T	226.43	PASS	AF=0.471698;AO=25;DP=53;FAO=25;FDP=53;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00902179;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=302.82;QD=17.0892;RBI=0.0156684;REFB=-0.0150354;REVB=-0.0128104;RO=28;SAF=14;SAR=11;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155638;STB=0.587637;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0162968;OID=.;OPOS=37263830;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:28:25:25:0.471698:11:14:11:17:11:14:11:17
chr17	37356597	.	C	T	521.02	PASS	AF=0.482456;AO=55;DP=115;FAO=55;FDP=114;FR=.;FRO=59;FSAF=29;FSAR=26;FSRF=28;FSRR=31;FWDB=0.0288295;FXX=0.0086949;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.231;QD=18.2815;RBI=0.0320118;REFB=-0.0196306;REVB=-0.0139145;RO=58;SAF=29;SAR=26;SRF=27;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571821;STB=0.527263;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0275803;OID=.;OPOS=37356597;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:114:58:59:55:55:0.482456:26:29:27:31:26:29:28:31
chr17	37410892	.	C	G	1396.44	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0397672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.147;QD=62.7613;RBI=0.0397846;REFB=0;REVB=-0.00117629;RO=0;SAF=52;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.69567e-05;OID=.;OPOS=37410892;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:37:52:0:0:37:52:0:0
chr17	37776073	.	A	G	104.85	PASS	AF=0.295455;AO=13;DP=44;FAO=13;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.0155616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.264;QD=9.53171;RBI=0.0233832;REFB=-0.0196351;REVB=0.0174531;RO=26;SAF=4;SAR=9;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224025;STB=0.682028;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0368578;OID=.;OPOS=37776073;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:26:30:13:13:0.295455:9:4:13:13:9:4:17:13
chr17	37898543	.	T	C	728.99	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0552398;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.29;QD=57.1759;RBI=0.0775516;REFB=0;REVB=0.0544318;RO=0;SAF=39;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.98453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.37498e-06;OID=.;OPOS=37898543;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:11:39:0:0:12:39:0:0
chr17	38121993	.	G	A	1890.88	PASS	AF=0.992126;AO=122;DP=123;FAO=126;FDP=127;FR=.;FRO=1;FSAF=71;FSAR=55;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0166427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.4906;QD=59.5552;RBI=0.0200592;REFB=-0.0670594;REVB=0.0111978;RO=0;SAF=70;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503496;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00527738;OID=.;OPOS=38121993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:123:127:0:1:122:126:0.992126:52:70:0:0:55:71:1:0
chr17	38131187	.	C	A	819.81	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0405161;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3781;QD=55.5804;RBI=0.0417359;REFB=0.0202703;REVB=-0.0100166;RO=1;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140815;STB=0.50746;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.000186064;OID=.;OPOS=38131187;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:1:1:58:58:0.983051:33:25:0:1:33:25:0:1
chr17	38246286	.	A	G	676.65	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.015893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.907;QD=60.1465;RBI=0.0196049;REFB=-0.0405468;REVB=0.0114788;RO=1;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.017728;STB=0.50943;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.000147466;OID=.;OPOS=38246286;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:26:18:0:1:26:18:0:1
chr17	38340928	.	A	G	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.0403061;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.104;QD=16.4544;RBI=0.0416134;REFB=-0.0267508;REVB=-0.0103484;RO=4;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248791;STB=0.642482;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.0178042;OID=.;OPOS=38340928;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:5:1:0:4:5:1:0:4
chr17	38350583	.	G	A	102.53	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.0252125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.469;QD=17.8318;RBI=0.0456978;REFB=-0.0454725;REVB=0.0381133;RO=11;SAF=6;SAR=6;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0377853;STB=0.521703;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0358967;OID=.;OPOS=38350583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:23:23:11:11:12:12:0.521739:6:6:5:6:6:6:5:6
chr17	38457151	.	G	A	297.1	PASS	AF=0.445946;AO=32;DP=73;FAO=33;FDP=74;FR=.;FRO=41;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=-0.00749956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.37;QD=16.0596;RBI=0.00939407;REFB=-0.0300953;REVB=0.0056573;RO=40;SAF=14;SAR=18;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.183232;STB=0.598482;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.039799;OID=.;OPOS=38457151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:40:41:32:33:0.445946:18:14:25:15:18:15:26:15
chr17	38513802	.	GGGGCC	CGGGCC,G,GC,GGC,GGGC,TCGGGC	929.17	PASS	AF=0,0.356164,0.0410959,0.164384,0.438356,0;AO=3,18,8,8,14,3;DP=76;FAO=0,26,3,12,32,0;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=0,26,3,5,8,0;FSAR=0,0,0,7,24,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179369,0.0488582,0.0556666,0.0809918,0.124264,0.0218176;FXX=0.0519413;HRUN=4,4,4,4,4,4;LEN=1,5,4,3,2,5;MLLD=20.2454,34.072,28.3357,27.6546,24.7587,22.6173;QD=50.9136;RBI=0.288689,0.0573412,0.0595728,0.0905515,0.158707,0.0619271;REFB=0,0,0,0,0,0;REVB=-0.288131,0.0300148,0.0212168,0.0404956,0.0987236,-0.0579565;RO=1;SAF=0,18,8,5,3,0;SAR=3,0,0,3,11,3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0.445946,0.445946,0.445946,0.445946,0;SSEP=0,0,0,0,0,0;SSSB=-0.727144,0,0,-0.080241,-0.128919,-0.727144;STB=0.5,0.5,0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1,1,1;TYPE=snp,del,del,del,del,mnp;VARB=0,0.00435883,-0.0677038,-0.0320866,0.0390571,0;OID=.,.,.,.,.,.;OPOS=38513802,38513803,38513803,38513804,38513805,38513802;OREF=G,GGGCC,GGGC,GGC,GC,GGGGC;OALT=C,-,-,-,-,TCGGG;OMAPALT=CGGGCC,G,GC,GGC,GGGC,TCGGGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/5:99:76:73:1:0:3,18,8,8,14,3:0,26,3,12,32,0:0,0.356164,0.0410959,0.164384,0.438356,0:3,0,0,3,11,3:0,18,8,5,3,0:1:0:0,0,0,7,24,0:0,26,3,5,8,0:0:0
chr17	38519971	.	G	A	946.11	PASS	AF=0.513812;AO=93;DP=181;FAO=93;FDP=181;FR=.;FRO=88;FSAF=46;FSAR=47;FSRF=46;FSRR=42;FWDB=0.0247953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.818;QD=20.9084;RBI=0.0285943;REFB=-0.0213269;REVB=-0.0142418;RO=88;SAF=46;SAR=47;SRF=46;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249015;STB=0.513658;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0249219;OID=.;OPOS=38519971;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:181:181:88:88:93:93:0.513812:47:46:46:42:47:46:46:42
chr17	38600092	.	G	A	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.056924;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.432;QD=42.1826;RBI=0.088342;REFB=0;REVB=0.0675572;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00279637;OID=.;OPOS=38600092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:5:6:0:0:5:6:0:0
chr17	38784927	.	G	A	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.000192036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.582;QD=9.75998;RBI=0.00565742;REFB=-0.0078317;REVB=0.00565416;RO=12;SAF=6;SAR=1;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369272;STB=0.733907;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0203071;OID=.;OPOS=38784927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:12:12:7:7:0.368421:1:6:7:5:1:6:7:5
chr17	38855772	.	T	C	902.07	PASS	AF=0.955224;AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=67;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0137884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.701;QD=53.855;RBI=0.0598917;REFB=-0.0293621;REVB=0.0582829;RO=2;SAF=44;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0209857;STB=0.501084;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.00199761;OID=.;OPOS=38855772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:67:67:2:3:64:64:0.955224:20:44:2:0:20:44:2:1
chr17	38857446	.	C	A	1529.1	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.487;QD=63.7127;RBI=0.0322299;REFB=0;REVB=0.0242049;RO=0;SAF=59;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.56743e-05;OID=.;OPOS=38857446;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:96:0:0:96:96:1:37:59:0:0:37:59:0:0
chr17	38858134	.	CA	C,CT	1295.95	PASS	AF=0.931818,0.0681818;AO=77,8;DP=87;FAO=82,6;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=21,0;FSAR=61,6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0839338,0.0718578;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=223.546,205.661;QD=58.9067;RBI=0.0839398,0.0719257;REFB=0,0;REVB=-0.00100986,-0.00312344;RO=0;SAF=20,0;SAR=57,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.56014e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-8.56504e-05,0.00512889;OID=.,.;OPOS=38858135,38858135;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=C,CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.931818,0.0681818:77,8:87:82,6:88:0:21,0:61,6:0:0:18:0:20,0:57,8:0:0
chr17	38910712	.	T	G	245.28	PASS	AF=0.391892;AO=29;DP=74;FAO=29;FDP=74;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=28;FSRR=17;FWDB=-0.0375524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.731;QD=13.2583;RBI=0.0499428;REFB=-0.0209439;REVB=0.0329258;RO=45;SAF=15;SAR=14;SRF=28;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112549;STB=0.564155;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0249125;OID=.;OPOS=38910712;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:45:45:29:29:0.391892:14:15:28:17:14:15:28:17
chr17	38911212	.	G	A	598.28	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014537;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.344;QD=61.3616;RBI=0.0232206;REFB=0;REVB=-0.0181072;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.91745e-05;OID=.;OPOS=38911212;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0
chr17	38911327	.	C	G	143.47	PASS	AF=0.340909;AO=14;DP=42;FAO=15;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=27;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=0.0947443;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.836;QD=13.0424;RBI=0.0951756;REFB=-0.00792533;REVB=-0.00905114;RO=26;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361256;STB=0.733022;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0365319;OID=.;OPOS=38911327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:26:27:14:15:0.340909:4:10:10:16:4:11:10:17
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chr17	38935812	.	A	G	850.92	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3588;QD=57.6896;RBI=0.0271095;REFB=0;REVB=-0.0238297;RO=0;SAF=41;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49224e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.6389e-05;OID=.;OPOS=38935812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:18:41:0:0:18:41:0:0
chr17	38936659	.	C	T	353.97	PASS	AF=0.431818;AO=38;DP=88;FAO=38;FDP=88;FR=.;FRO=50;FSAF=8;FSAR=30;FSRF=30;FSRR=20;FWDB=0.036051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.699;QD=16.0894;RBI=0.0360542;REFB=0.00068925;REVB=0.000482211;RO=49;SAF=8;SAR=30;SRF=30;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430894;STB=0.740125;STBP=0;TYPE=snp;VARB=-0.000454682;OID=.;OPOS=38936659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:49:50:38:38:0.431818:30:8:30:19:30:8:30:20
chr17	38938316	.	C	T	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0033266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.788;QD=13.4862;RBI=0.0150625;REFB=-0.00145052;REVB=-0.0146905;RO=11;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259257;STB=0.651856;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00222787;OID=.;OPOS=38938316;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:4:5:3:8:4:5:3:8
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chr17	38978536	.	A	C	179.79	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000619432;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.855;QD=47.9429;RBI=0.00251777;REFB=0;REVB=0.00244039;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.01981e-06;OID=.;OPOS=38978536;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0
chr17	38990834	.	G	C	1408.66	PASS	AF=1;AO=72;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=51;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.811;QD=62.6071;RBI=0.0697906;REFB=0;REVB=0.0638696;RO=0;SAF=45;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27032e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00042278;OID=.;OPOS=38990834;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:72:90:1:27:45:0:0:39:51:0:0
chr17	38991003	.	T	C	660.6	PASS	AF=0.52381;AO=65;DP=126;FAO=66;FDP=126;FR=.;FRO=60;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=19;FSRR=41;FWDB=0.00864248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.183;QD=20.9715;RBI=0.0126744;REFB=-0.0322725;REVB=0.00927078;RO=59;SAF=32;SAR=33;SRF=18;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163072;STB=0.587276;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0311817;OID=.;OPOS=38991003;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:59:60:65:66:0.52381:33:32:18:41:33:33:19:41
chr17	38991032	.	T	A	592.3	PASS	AF=0.484127;AO=61;DP=126;FAO=61;FDP=126;FR=.;FRO=65;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=24;FSRR=41;FWDB=0.0479102;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5731;QD=18.8032;RBI=0.0482723;REFB=-0.0278054;REVB=-0.00590119;RO=64;SAF=30;SAR=31;SRF=23;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123106;STB=0.56336;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0402723;OID=.;OPOS=38991032;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:64:65:61:61:0.484127:31:30:23:41:31:30:24:41
chr17	39036508	.	G	A	208.83	PASS	AF=0.606061;AO=20;DP=33;FAO=20;FDP=33;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=10;FWDB=-0.0235477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.4884;QD=25.3121;RBI=0.0418465;REFB=0.00234032;REVB=-0.0345924;RO=13;SAF=5;SAR=15;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0183368;STB=0.510194;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=-0.00514611;OID=.;OPOS=39036508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:13:13:20:20:0.606061:15:5:3:10:15:5:3:10
chr17	39081713	.	A	G	1843.21	PASS	AF=1;AO=120;DP=120;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00602231;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.31;QD=61.4403;RBI=0.0120465;REFB=0;REVB=0.0104332;RO=0;SAF=45;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.11218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.49933e-06;OID=.;OPOS=39081713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:120:120:0:0:120:120:1:75:45:0:0:75:45:0:0
chr17	39084504	.	T	C	1243.8	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0249702;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.605;QD=61.4221;RBI=0.0686392;REFB=0;REVB=0.0639362;RO=0;SAF=35;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180792;OID=.;OPOS=39084504;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:78:81:0:0:78:81:1:43:35:0:0:46:35:0:0
chr17	39182945	.	G	A	164.81	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=31;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0126228;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.763;QD=21.2661;RBI=0.0303539;REFB=-0.0419133;REVB=0.0276048;RO=14;SAF=6;SAR=11;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.338122;STB=0.689821;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0183182;OID=.;OPOS=39182945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:14:14:17:17:0.548387:11:6:11:3:11:6:11:3
chr17	39190758	.	T	C	85.76	PASS	AF=0.37931;AO=11;DP=29;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=10;FWDB=-0.0182497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.882;QD=11.8293;RBI=0.032169;REFB=-0.0104201;REVB=-0.0264913;RO=18;SAF=4;SAR=7;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0881603;STB=0.552534;STBP=0.679;TYPE=snp;VARB=0.0245787;OID=.;OPOS=39190758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:29:29:18:18:11:11:0.37931:7:4:8:10:7:4:8:10
chr17	39334133	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.506;QD=33.4285;RBI=0.0206714;REFB=0;REVB=0.0206714;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000556293;OID=.;OPOS=39334133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0
chr17	39334456	.	G	A	668.92	PASS	AF=0.961538;AO=49;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.137683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.437;QD=51.4551;RBI=0.1726;REFB=-0.0663239;REVB=0.104086;RO=3;SAF=28;SAR=21;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0105559;STB=0.517235;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.00707251;OID=.;OPOS=39334456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:52:52:3:2:49:50:0.961538:21:28:2:1:22:28:2:0
chr17	39340707	.	C	T	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.046647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.665;QD=60.6102;RBI=0.0470646;REFB=0;REVB=0.00625537;RO=0;SAF=29;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000138787;OID=.;OPOS=39340707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:9:29:0:0:9:29:0:0
chr17	39341158	.	G	A	796.95	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0149658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4235;QD=54.9618;RBI=0.0151244;REFB=-0.108753;REVB=-0.00218465;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=0.00059728;OID=.;OPOS=39341158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:0:1:57:57:0.982759:28:29:0:0:28:29:0:1
chr17	39341266	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.036027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.524;QD=57.6807;RBI=0.0397346;REFB=0;REVB=0.0167599;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000118202;OID=.;OPOS=39341266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:17:14:0:0:17:14:0:0
chr17	39341293	.	AT	A,AA	335.58	PASS	AF=0.08,0.92;AO=6,19;DP=25;FAO=2,23;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=0,10;FSAR=2,13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124859,0.0343306;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=304.777,315.589;QD=53.6925;RBI=0.0124921,0.0343429;REFB=0,0;REVB=0.000393799,-0.000918339;RO=0;SAF=4,6;SAR=2,13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-3.851e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00833378,0.000457791;OID=.,.;OPOS=39341294,39341294;OREF=T,T;OALT=-,A;OMAPALT=A,AA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.08,0.92:6,19:25:2,23:25:0:0,10:2,13:0:0:7:0:4,6:2,13:0:0
chr17	39341473	.	G	C	689.16	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00786539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.6323;QD=62.6505;RBI=0.0218917;REFB=0;REVB=-0.02043;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000137366;OID=.;OPOS=39341473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:16:28:0:0:16:28:0:0
chr17	39346518	.	T	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0749981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.646;QD=40.7629;RBI=0.0832231;REFB=0;REVB=-0.0360746;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000501472;OID=.;OPOS=39346518;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr17	39383335	.	C	G	727.6	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.088624;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.6518;QD=63.2698;RBI=0.103391;REFB=0;REVB=0.0532494;RO=0;SAF=29;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00122764;OID=.;OPOS=39383335;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:17:29:0:0:17:29:0:0
chr17	39388811	.	C	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=365.693;QD=35.5759;RBI=0.00129766;REFB=0;REVB=-0.00129766;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.35346e-05;OID=.;OPOS=39388811;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0
chr17	39406589	.	A	G	2256.35	PASS	AF=1;AO=143;DP=146;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0467815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.706;QD=61.8177;RBI=0.0496639;REFB=-0.0861046;REVB=0.0166733;RO=3;SAF=58;SAR=85;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239564;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000672862;OID=.;OPOS=39406589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:146:146:3:0:143:146:1:85:58:3:0:85:61:0:0
chr17	39406673	.	T	G	2007.63	PASS	AF=0.931034;AO=135;DP=145;FAO=135;FDP=145;FR=.;FRO=10;FSAF=54;FSAR=81;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.0437724;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=98.2169;QD=55.3828;RBI=0.0443392;REFB=-0.142174;REVB=0.00706726;RO=8;SAF=54;SAR=81;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0110289;STB=0.514284;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00223324;OID=.;OPOS=39406673;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:145:145:8:10:135:135:0.931034:81:54:4:4:81:54:6:4
chr17	39422677	.	C	T	1507.65	PASS	AF=1;AO=93;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0953191;FXX=0.0104156;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.72;QD=63.48;RBI=0.0955072;REFB=0;REVB=-0.00599052;RO=0;SAF=38;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243896;OID=.;OPOS=39422677;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:95:0:0:93:95:1:55:38:0:0:56:39:0:0
chr17	39458476	.	A	T	1272.33	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=85;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00354691;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.953;QD=60.5872;RBI=0.00992538;REFB=-0.0638039;REVB=0.00926998;RO=1;SAF=44;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119894;STB=0.506328;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=-0.000108713;OID=.;OPOS=39458476;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:84:1:1:83:83:0.988095:39:44:0:1:39:44:0:1
chr17	39458573	.	TGTACAGATGGTTG	T	950.71	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00407742;FXX=0;HRUN=1;LEN=13;MLLD=378.061;QD=58.5049;RBI=0.0107229;REFB=0;REVB=0.00991747;RO=0;SAF=22;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=9.48642e-05;OID=.;OPOS=39458574;OREF=GTACAGATGGTTG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:63:64:65:65:0:24:41:0:0:5:0:22:41:0:0
chr17	39458893	.	G	A	989.84	PASS	AF=0.958333;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=28;FSAR=41;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.0174897;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=112.886;QD=54.991;RBI=0.0285161;REFB=-0.0348545;REVB=-0.0225228;RO=2;SAF=28;SAR=41;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325689;STB=0.525416;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.000358805;OID=.;OPOS=39458893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:72:72:2:3:69:69:0.958333:41:28:2:0:41:28:3:0
chr17	39464046	.	G	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.303;QD=35.5759;RBI=0.046098;REFB=0;REVB=0.0211194;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000637847;OID=.;OPOS=39464046;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr17	39464487	.	G	C	806.15	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044412;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.563;QD=55.5964;RBI=0.0680803;REFB=-0.138114;REVB=0.0515995;RO=0;SAF=20;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.57266e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00185146;OID=.;OPOS=39464487;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:57:58:0:0:56:58:1:36:20:0:0:37:21:0:0
chr17	39464736	.	C	G	409.28	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.055879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.3;QD=56.453;RBI=0.105137;REFB=0;REVB=0.0890582;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000716247;OID=.;OPOS=39464736;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:7:21:0:0:8:21:0:0
chr17	39465094	.	C	T	537.54	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.04;QD=59.7264;RBI=0.0486322;REFB=0;REVB=0.0277479;RO=0;SAF=30;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281049;OID=.;OPOS=39465094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:36:0:0:34:36:1:4:30:0:0:4:32:0:0
chr17	39465389	.	T	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00567488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.004;QD=50.413;RBI=0.013096;REFB=0;REVB=0.0118026;RO=0;SAF=12;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116277;OID=.;OPOS=39465389;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:7:12:0:0:7:12:0:0
chr17	39471929	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391349;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=332.121;QD=44.6898;RBI=0.0391446;REFB=0;REVB=-0.000874555;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000231838;OID=.;OPOS=39471929;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr17	39503163	.	G	A,C	836.53	PASS	AF=0.90625,0.046875;AO=58,3;DP=64;FAO=58,3;FDP=64;FR=.;FRO=3;FSAF=38,2;FSAR=20,1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0376363,0.0198752;FXX=0.0153822;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=54.649,195.834;QD=52.2832;RBI=0.0395921,0.0232865;REFB=-0.206573,-0.0981297;REVB=0.01229,0.0121343;RO=3;SAF=38,2;SAR=20,1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00117889,0;STB=0.500625,0.5;STBP=0.956,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00616123,0.0597259;OID=.,.;OPOS=39503163,39503163;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:64:64:3:3:58,3:58,3:0.90625,0.046875:20,1:38,2:2:1:20,1:38,2:2:1
chr17	39521751	.	C	G	475.86	PASS	AF=0.367089;AO=58;DP=158;FAO=58;FDP=158;FR=.;FRO=100;FSAF=33;FSAR=25;FSRF=62;FSRR=38;FWDB=-0.0146298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.191;QD=12.047;RBI=0.0162051;REFB=-0.0112676;REVB=-0.0069695;RO=100;SAF=33;SAR=25;SRF=62;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0584981;STB=0.533217;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=0.0176685;OID=.;OPOS=39521751;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:158:158:100:100:58:58:0.367089:25:33:62:38:25:33:62:38
chr17	39578424	.	G	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0792672;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.612;QD=61.6835;RBI=0.0882889;REFB=0;REVB=0.0388797;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000201438;OID=.;OPOS=39578424;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0
chr17	39579059	.	G	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0274726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.402;QD=54.5161;RBI=0.104166;REFB=0;REVB=0.100478;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000991981;OID=.;OPOS=39579059;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr17	39579112	.	G	A	493.78	PASS	AF=1;AO=34;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0798782;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=49.9438;QD=53.3811;RBI=0.206341;REFB=-0.114845;REVB=0.190253;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00650466;OID=.;OPOS=39579112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:38:37:0:0:34:37:1:17:17:0:0:20:17:0:0
chr17	39580559	.	T	A	958.43	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00702542;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.942;QD=58.9802;RBI=0.0248049;REFB=0;REVB=0.0237892;RO=0;SAF=29;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.66577e-06;OID=.;OPOS=39580559;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:65:0:0:65:65:1:36:29:0:0:36:29:0:0
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chr17	39580660	.	T	C	310.21	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106357;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.522;QD=53.9495;RBI=0.0363243;REFB=0;REVB=0.0347323;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205366;OID=.;OPOS=39580660;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
chr17	39593768	.	A	G	1298.82	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369992;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.871;QD=61.8487;RBI=0.0539656;REFB=0;REVB=-0.0392855;RO=0;SAF=48;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.10069e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.34214e-06;OID=.;OPOS=39593768;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:35:48:0:0:36:48:0:0
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chr17	39595537	.	G	A	72.65	PASS	AF=0.148936;AO=14;DP=94;FAO=14;FDP=94;FR=.;FRO=80;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=0.0349569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.714;QD=3.09151;RBI=0.0352103;REFB=-0.00499999;REVB=0.00421648;RO=80;SAF=6;SAR=8;SRF=42;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120158;STB=0.581702;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0339479;OID=.;OPOS=39595537;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:94:94:80:80:14:14:0.148936:8:6:42:38:8:6:42:38
chr17	39595539	.	A	G	72.66	PASS	AF=0.148936;AO=14;DP=94;FAO=14;FDP=94;FR=.;FRO=80;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=42;FSRR=38;FWDB=-0.0119361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.4936;QD=3.09213;RBI=0.052628;REFB=-0.0219135;REVB=-0.0512565;RO=79;SAF=6;SAR=8;SRF=42;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128376;STB=0.581702;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0329821;OID=.;OPOS=39595539;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:94:94:79:80:14:14:0.148936:8:6:42:37:8:6:42:38
chr17	39616430	.	G	T	431.49	PASS	AF=0.888889;AO=32;DP=36;FAO=32;FDP=36;FR=.;FRO=4;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0420593;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.894;QD=47.9432;RBI=0.1408;REFB=-0.170338;REVB=0.134372;RO=1;SAF=20;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227759;STB=0.514916;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=0.0187725;OID=.;OPOS=39616430;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:36:36:1:4:32:32:0.888889:12:20:1:0:12:20:3:1
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chr17	39619219	.	G	A	272.33	PASS	AF=0.376471;AO=30;DP=83;FAO=32;FDP=85;FR=.;FRO=53;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=20;FWDB=0.00985594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.939;QD=12.8155;RBI=0.0187045;REFB=-0.0184532;REVB=0.0158971;RO=52;SAF=17;SAR=13;SRF=32;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0551969;STB=0.518791;STBP=0.796;TYPE=snp;VARB=0.0320874;OID=.;OPOS=39619219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:85:52:53:30:32:0.376471:13:17:32:20:13:19:33:20
chr17	39620565	.	C	T	270.04	PASS	AF=0.531915;AO=25;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0330439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.782;QD=22.9817;RBI=0.0341159;REFB=-0.0144314;REVB=0.00848507;RO=22;SAF=10;SAR=15;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0079192;STB=0.504421;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.00911653;OID=.;OPOS=39620565;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:22:22:25:25:0.531915:15:10:9:13:15:10:9:13
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chr17	39623363	.	T	C	512.86	PASS	AF=0.521277;AO=49;DP=94;FAO=49;FDP=94;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=0.0183548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.481;QD=21.8238;RBI=0.0207225;REFB=-0.038686;REVB=0.00961904;RO=45;SAF=24;SAR=25;SRF=20;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0394018;STB=0.52173;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0299499;OID=.;OPOS=39623363;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:45:45:49:49:0.521277:25:24:20:25:25:24:20:25
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chr17	39633118	.	TGGGGGC	GGGTGGC,TGGGGC,TGGGGCG,TTGGGGC	62.42	PASS	AF=0,0.3,0.05,0;AO=2,13,3,6;DP=55;FAO=0,18,3,0;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=0,13,3,0;FSAR=0,5,0,0;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=-0.271941,-0.286711,-0.0505925,0.0213952;FXX=0;HRUN=3,5,5,5;LEN=4,1,2,1;MLLD=183.702,8.66445,102.15,13.6697;QD=4.16115;RBI=0.273439,0.296895,0.0568664,0.0372714;REFB=-0.00658009,-0.176415,-0.00712552,-0.120329;REVB=-0.0285824,-0.0770934,-0.0259652,0.0305189;RO=23;SAF=2,3,3,3;SAR=0,10,0,3;SRF=5;SRR=18;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.651923,0.0206022,0.713833,0.350455;STB=0.5,0.793248,0.997941,0.5;STBP=1,0.007,0.002,1;TYPE=mnp,del,mnp,snp;VARB=0,0.0646035,-0.133383,0;OID=.,.,.,.;OPOS=39633118,39633119,39633123,39633119;OREF=TGGG,G,GC,G;OALT=GGGT,-,CG,T;OMAPALT=GGGTGGC,TGGGGC,TGGGGCG,TTGGGGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:54:55:60:23:39:2,13,3,6:0,18,3,0:0,0.3,0.05,0:0,10,0,3:2,3,3,3:5:18:0,5,0,0:0,13,3,0:10:29
chr17	39633317	.	A	G	406.97	PASS	AF=1;AO=20;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0441;QD=56.1343;RBI=0.0729716;REFB=0;REVB=-0.0633152;RO=0;SAF=18;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19193e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000345565;OID=.;OPOS=39633317;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:20:29:1:2:18:0:0:8:21:0:0
chr17	39633318	.	C	G	48.21	PASS	AF=0.310345;AO=8;DP=28;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=2;FWDB=0.0807818;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=27.833;QD=6.65001;RBI=0.0957825;REFB=-0.0425052;REVB=-0.0514645;RO=20;SAF=3;SAR=5;SRF=18;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.569441;STB=0.839474;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.103608;OID=.;OPOS=39633318;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:28:29:20:20:8:9:0.310345:5:3:18:2:6:3:18:2
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chr17	39633354	.	C	T	106.79	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0146463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.058;QD=12.205;RBI=0.059707;REFB=0.00560108;REVB=-0.0578827;RO=21;SAF=8;SAR=5;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0984012;STB=0.545384;STBP=0.683;TYPE=snp;VARB=-0.00858839;OID=.;OPOS=39633354;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:21:22:13:13:0.371429:5:8:11:10:5:8:12:10
chr17	39634625	.	A	G	217.13	PASS	AF=0.689655;AO=19;DP=28;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=0.0116616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.623;QD=29.9492;RBI=0.0131387;REFB=-0.0631173;REVB=-0.00605254;RO=8;SAF=10;SAR=9;SRF=3;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0809901;STB=0.532839;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=0.0280669;OID=.;OPOS=39634625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:28:29:8:9:19:20:0.689655:9:10:3:5:9:11:4:5
chr17	39637244	.	A	G	189.08	PASS	AF=0.308642;AO=23;DP=79;FAO=25;FDP=81;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=37;FSRR=19;FWDB=-0.0167262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.844;QD=9.33749;RBI=0.0326655;REFB=-0.0252886;REVB=0.0280583;RO=56;SAF=14;SAR=9;SRF=37;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.066335;STB=0.57181;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.0561182;OID=.;OPOS=39637244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:56:56:23:25:0.308642:9:14:37:19:11:14:37:19
chr17	39643646	.	G	A	79.33	PASS	AF=0.261905;AO=9;DP=40;FAO=11;FDP=42;FR=.;FRO=31;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0108489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.234;QD=7.55477;RBI=0.0267354;REFB=-0.0138697;REVB=-0.0244353;RO=31;SAF=5;SAR=4;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162634;STB=0.657837;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.049917;OID=.;OPOS=39643646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:40:42:31:31:9:11:0.261905:4:5:13:18:4:7:13:18
chr17	39646021	.	A	G	728.99	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.082165;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.391;QD=57.1757;RBI=0.102247;REFB=0;REVB=0.0608561;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350616;OID=.;OPOS=39646021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0
chr17	39659194	.	T	C	1184.29	PASS	AF=1;AO=77;DP=79;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00833496;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.483;QD=60.7326;RBI=0.0180406;REFB=0;REVB=0.0159998;RO=0;SAF=50;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.82258e-05;OID=.;OPOS=39659194;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:78:0:0:77:78:1:27:50:0:0:27:51:0:0
chr17	39659913	.	G	A	728.97	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00919047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5688;QD=57.1741;RBI=0.0300254;REFB=0;REVB=0.0285843;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306955;OID=.;OPOS=39659913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0
chr17	39661689	.	G	A	113.69	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00168824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=229.003;QD=37.8975;RBI=0.0440196;REFB=-0.0944513;REVB=0.0439873;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00059466;OID=.;OPOS=39661689;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:11:12:0:0:11:12:1:7:4:0:0:8:4:0:0
chr17	39670912	.	G	C	664.68	PASS	AF=0.956522;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=46;FR=.;FRO=2;FSAF=9;FSAR=35;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0762608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0771;QD=57.7982;RBI=0.0762992;REFB=0.00104365;REVB=-0.00242135;RO=1;SAF=9;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0493531;STB=0.549976;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=-0.0012947;OID=.;OPOS=39670912;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:45:46:1:2:44:44:0.956522:35:9:1:0:35:9:2:0
chr17	39674641	.	T	C	1559.99	PASS	AF=1;AO=97;DP=100;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151441;FXX=0.029997;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.408;QD=64.3294;RBI=0.0186909;REFB=0;REVB=0.0109548;RO=0;SAF=42;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010242;OID=.;OPOS=39674641;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:97:0:0:97:97:1:55:42:0:0:55:42:0:0
chr17	39681475	.	A	G	569.62	PASS	AF=1;AO=36;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0641114;FXX=0.0499875;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.4143;QD=59.9602;RBI=0.0667314;REFB=0;REVB=0.0185151;RO=1;SAF=23;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0199188;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000291235;OID=.;OPOS=39681475;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:1:0:36:38:1:13:23:1:0:13:25:0:0
chr17	39684410	.	G	A	101.86	PASS	AF=1;AO=7;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.104844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.5936;QD=40.7439;RBI=0.106175;REFB=0;REVB=-0.0167629;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00681213;OID=.;OPOS=39684410;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:7:10:1:5:2:0:0:6:4:0:0
chr17	39723990	.	T	A	109.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.7622;QD=39.9628;RBI=0.138628;REFB=0;REVB=-0.0705623;RO=0;SAF=5;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00670755;OID=.;OPOS=39723990;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:10:11:1:5:5:0:0:5:6:0:0
chr17	39727816	.	T	G	373.34	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.3113;QD=55.3092;RBI=0.113543;REFB=0;REVB=-0.00397922;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00177844;OID=.;OPOS=39727816;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr17	39728050	.	G	A	101.79	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.9631;QD=40.7178;RBI=0.00648118;REFB=0;REVB=0.00648118;RO=0;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358399;OID=.;OPOS=39728050;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:10:0:0:0:10:0:0:0
chr17	39742718	.	A	G	741.64	PASS	AF=0.979592;AO=46;DP=47;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0501335;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.622;QD=60.542;RBI=0.0505635;REFB=-0.10734;REVB=-0.00658051;RO=1;SAF=12;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0375629;STB=0.517234;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00516748;OID=.;OPOS=39742718;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:49:1:1:46:48:0.979592:34:12:1:0:34:14:1:0
chr17	39742894	.	G	A	332.75	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00572343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.962;QD=53.2406;RBI=0.0163337;REFB=0;REVB=0.0152981;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.8451e-05;OID=.;OPOS=39742894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:12:12:0:0:13:12:0:0
chr17	39742898	.	GC	AT	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419249;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=168.35;QD=52.6132;RBI=0.0586333;REFB=0;REVB=0.0409899;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00056249;OID=.;OPOS=39742898;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr17	39743081	.	G	A	888.53	PASS	AF=0.984127;AO=62;DP=63;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0537629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.854;QD=56.4148;RBI=0.0720524;REFB=-0.0341725;REVB=0.0479698;RO=1;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.016002;STB=0.508472;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.000853217;OID=.;OPOS=39743081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:63:63:1:1:62:62:0.984127:29:33:0:1:29:33:0:1
chr17	39766504	.	A	G	197.69	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0452185;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=41.2681;QD=43.931;RBI=0.0496872;REFB=-0.0267812;REVB=-0.0205938;RO=1;SAF=9;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0482085;STB=0.526285;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00267851;OID=.;OPOS=39766504;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:8:9:1:0:8:9:1:0
chr17	39767744	.	A	G	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.5333;QD=53.9102;RBI=0.0474769;REFB=0;REVB=0.0460202;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000476522;OID=.;OPOS=39767744;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:8:16:0:0:8:16:0:0
chr17	39786864	.	CG	C,CA,CC	849.95	PASS	AF=1,0,0;AO=24,32,4;DP=60;FAO=59,0,0;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28,0,0;FSAR=31,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0112585,0.00396404,-0.00107667;FXX=0.0166639;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,1;MLLD=124.525,104.999,107.26;QD=57.6239;RBI=0.0357743,0.462669,0.0451175;REFB=0,0,0;REVB=0.0339566,-0.462652,0.0451046;RO=0;SAF=24,1,4;SAR=0,31,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.000344207,0,0;OID=.,.,.;OPOS=39786865,39786865,39786865;OREF=G,G,G;OALT=-,A,C;OMAPALT=C,CA,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0,0:24,32,4:60:59,0,0:59:0:28,0,0:31,0,0:0:0:5:0:24,1,4:0,31,0:0:0
chr17	39871700	.	G	A	871.74	PASS	AF=0.969231;AO=62;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0506406;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.818;QD=53.6458;RBI=0.069148;REFB=-0.102489;REVB=0.0470849;RO=3;SAF=33;SAR=29;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0463674;STB=0.516124;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00397623;OID=.;OPOS=39871700;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:65:65:3:2:62:63:0.969231:29:33:0:3:30:33:0:2
chr17	39874267	.	T	A,G	1298.51	PASS	AF=0.964706,0.0352941;AO=81,4;DP=85;FAO=82,3;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42,0;FSAR=40,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267663,0.0392766;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=154.125,69.1073;QD=61.1065;RBI=0.037914,0.0414656;REFB=0,0;REVB=0.0268521,0.0132948;RO=0;SAF=42,0;SAR=39,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00183206,0.0712825;OID=.,.;OPOS=39874267,39874267;OREF=T,T;OALT=A,G;OMAPALT=A,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:85:85:0:0:81,4:82,3:0.964706,0.0352941:39,4:42,0:0:0:40,3:42,0:0:0
chr17	39874283	.	T	A	1208.6	PASS	AF=0.987654;AO=80;DP=81;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0075364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7675;QD=59.6842;RBI=0.0320166;REFB=0.0662859;REVB=-0.031117;RO=0;SAF=37;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505746;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.00137863;OID=.;OPOS=39874283;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:81:81:0:1:80:80:0.987654:43:37:0:0:43:37:0:1
chr17	39879729	.	CAGA	C,CAGC,CAGG	484.69	PASS	AF=0.885714,0.0285714,0.0857143;AO=24,2,3;DP=35;FAO=31,1,3;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=22,0,3;FSAR=9,1,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00215632,-0.0913754,-0.140401;FXX=0;HRUN=1,2,2;LEN=3,1,1;MLLD=231.271,53.4791,33.6603;QD=55.3936;RBI=0.0240426,0.0975299,0.22294;REFB=0,0,0;REVB=-0.0239458,-0.0340971,-0.173176;RO=0;SAF=17,0,3;SAR=7,2,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,snp,snp;VARB=0.0138267,0.0169915,-0.00498789;OID=.,.,.;OPOS=39879730,39879732,39879732;OREF=AGA,A,A;OALT=-,C,G;OMAPALT=C,CAGC,CAGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.885714,0.0285714,0.0857143:24,2,3:35:31,1,3:35:0:22,0,3:9,1,0:0:0:13:0:17,0,3:7,2,0:0:0
chr17	39880340	.	A	C	538.52	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=277.216;QD=59.8358;RBI=0.023073;REFB=0;REVB=-0.00672078;RO=0;SAF=23;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21415e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.4607e-05;OID=.;OPOS=39880340;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:13:23:0:0:13:23:0:0
chr17	39880545	.	C	T	940.93	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0429228;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=154.433;QD=57.0259;RBI=0.0458006;REFB=0.0274578;REVB=0.0159788;RO=1;SAF=10;SAR=55;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00851385;STB=0.504503;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=-1.77756e-05;OID=.;OPOS=39880545;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:55:10:0:1:55:10:0:1
chr17	39880573	.	G	A	720.64	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0802981;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=136.41;QD=62.6643;RBI=0.0823705;REFB=0;REVB=0.0183608;RO=0;SAF=2;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78902e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172764;OID=.;OPOS=39880573;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:42:2:0:0:43:3:0:0
chr17	39881289	.	G	C	705.98	PASS	AF=0.979592;AO=45;DP=47;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.057244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.148;QD=57.6312;RBI=0.0982534;REFB=0.0821982;REVB=0.0798553;RO=1;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018429;STB=0.511623;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.00127026;OID=.;OPOS=39881289;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:49:1:1:45:48:0.979592:25:20:0:1:27:21:1:0
chr17	39883559	.	G	A	241.86	PASS	AF=0.909091;AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=22;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0231255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.685;QD=43.9746;RBI=0.0550246;REFB=-0.189539;REVB=0.0499291;RO=1;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.061324;STB=0.562436;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00538714;OID=.;OPOS=39883559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:22:22:1:2:20:20:0.909091:7:13:0:1:7:13:0:2
chr17	39883595	.	T	C,G	345.84	PASS	AF=0.884615,0.115385;AO=22,3;DP=25;FAO=23,3;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13,1;FSAR=10,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116448,0.0091888;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=266.03,227.887;QD=53.2061;RBI=0.0244932,0.0290354;REFB=0,0;REVB=0.021548,0.0275431;RO=0;SAF=12,1;SAR=10,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000826869,0.00745416;OID=.,.;OPOS=39883595,39883595;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:25:26:0:0:22,3:23,3:0.884615,0.115385:10,2:12,1:0:0:10,2:13,1:0:0
chr17	39884091	.	G	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000565995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=321.842;QD=55.6561;RBI=0.0113436;REFB=0;REVB=0.0113295;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.63615e-05;OID=.;OPOS=39884091;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr17	39884583	.	G	A	1047.88	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0568956;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5784;QD=58.2155;RBI=0.0983575;REFB=-0.081645;REVB=0.0802315;RO=0;SAF=48;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510635;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00168633;OID=.;OPOS=39884583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:0:1:71:71:0.986111:23:48:0:0:23:48:0:1
chr17	39890576	.	C	T	895.51	PASS	AF=0.45283;AO=96;DP=213;FAO=96;FDP=212;FR=.;FRO=116;FSAF=55;FSAR=41;FSRF=57;FSRR=59;FWDB=-0.000710256;FXX=0.00469462;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.359;QD=16.8964;RBI=0.00366692;REFB=-0.0138156;REVB=0.00359748;RO=116;SAF=55;SAR=41;SRF=57;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810949;STB=0.544977;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.0184717;OID=.;OPOS=39890576;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:213:212:116:116:96:96:0.45283:41:55:57:59:41:55:57:59
chr17	39890715	.	A	G,T	1113.06	PASS	AF=0.025974,0.974026;AO=3,70;DP=74;FAO=2,75;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=2,42;FSAR=0,33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00918976,0.028721;FXX=0.0128189;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=155.504,190.105;QD=57.8213;RBI=0.00951222,0.0301007;REFB=0,0;REVB=-0.00245573,0.00900892;RO=0;SAF=3,37;SAR=0,33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.018284,0.00199858;OID=.,.;OPOS=39890715,39890715;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:74:77:0:0:3,70:2,75:0.025974,0.974026:0,33:3,37:0:0:0,33:2,42:0:0
chr17	39914037	.	C	CG	42.06	PASS	AF=0.209677;AO=14;DP=65;FAO=13;FDP=62;FR=.;FRO=49;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.00903255;FXX=0.0158705;HRUN=0;LEN=1;MLLD=88.1787;QD=2.7138;RBI=0.0108632;REFB=-0.00525432;REVB=-0.00603511;RO=49;SAF=2;SAR=12;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494942;STB=0.895864;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.136892;OID=.;OPOS=39914038;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.209677:14:65:13:62:49:1:12:25:24:42:49:2:12:25:24
chr17	39925712	.	G	A	214.69	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-2.79898e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.086;QD=21.4694;RBI=0.0183521;REFB=-0.0078486;REVB=0.018352;RO=19;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0423572;STB=0.523787;STBP=0.767;TYPE=snp;VARB=0.00552359;OID=.;OPOS=39925712;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:19:21:21:0.525:10:11:9:10:10:11:9:10
chr17	39959189	.	C	G	729.21	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0010953;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.934;QD=57.1932;RBI=0.0298068;REFB=0;REVB=0.0297867;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.10021e-05;OID=.;OPOS=39959189;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:24:25:0:0:24:27:0:0
chr17	39967442	.	T	C	670.28	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00535492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.086;QD=62.3519;RBI=0.00535545;REFB=0;REVB=-7.5693e-05;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.63625e-06;OID=.;OPOS=39967442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:26:16:0:0:27:16:0:0
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chr17	39983820	.	G	A	284.07	PASS	AF=0.370787;AO=33;DP=89;FAO=33;FDP=89;FR=.;FRO=56;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=30;FSRR=26;FWDB=0.00590727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.182;QD=12.7672;RBI=0.00769404;REFB=-0.0100246;REVB=-0.00492975;RO=55;SAF=14;SAR=19;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112751;STB=0.570217;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.01273;OID=.;OPOS=39983820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:55:56:33:33:0.370787:19:14:29:26:19:14:30:26
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chr17	40010979	.	G	A	277.72	PASS	AF=0.385542;AO=32;DP=82;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.0268898;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.708;QD=13.3842;RBI=0.0320716;REFB=-0.0257028;REVB=-0.0174793;RO=50;SAF=15;SAR=17;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0547408;STB=0.525229;STBP=0.718;TYPE=snp;VARB=0.0323729;OID=.;OPOS=40010979;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:50:51:32:32:0.385542:17:15:26:24:17:15:26:25
chr17	40048613	.	A	G	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0189365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.3;QD=59.3229;RBI=0.0363696;REFB=0;REVB=0.0310509;RO=0;SAF=32;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.7284e-05;OID=.;OPOS=40048613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:36:32:0:0:36:32:0:0
chr17	40065774	.	T	G	282.14	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.0120677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.27;QD=22.5715;RBI=0.0127228;REFB=-0.0140299;REVB=0.00402985;RO=24;SAF=18;SAR=8;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280348;STB=0.657019;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0125395;OID=.;OPOS=40065774;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:8:18:9:15:8:18:9:15
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chr17	40126133	.	G	A	1501.73	PASS	AF=1;AO=94;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00229068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.759;QD=63.2309;RBI=0.0167644;REFB=0;REVB=0.0166072;RO=0;SAF=56;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.24697e-05;OID=.;OPOS=40126133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:94:95:1:38:56:0:0:39:56:0:0
chr17	40142302	.	T	C	442.03	PASS	AF=0.494382;AO=44;DP=89;FAO=44;FDP=89;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=20;FWDB=0.0131498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.491;QD=19.8664;RBI=0.0251009;REFB=0.00672765;REVB=0.0213808;RO=45;SAF=22;SAR=22;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0506123;STB=0.528077;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=-0.00653828;OID=.;OPOS=40142302;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:45:45:44:44:0.494382:22:22:25:20:22:22:25:20
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chr17	40459737	.	C	T	101.29	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0304212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.5755;QD=16.8815;RBI=0.0323184;REFB=-0.0400816;REVB=0.0109101;RO=12;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.374635;STB=0.717016;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.0164333;OID=.;OPOS=40459737;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:9:3:8:4:9:3:8:4
chr17	40461462	.	G	C,GC	84.45	PASS	AF=0,0.294118;AO=3,6;DP=51;FAO=0,15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=0,14;FSAR=0,1;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0224681,0.108505;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=182.992,15.9415;QD=6.62314;RBI=0.0298399,0.109975;REFB=-0.00621981,-0.0192691;REVB=-0.0196368,-0.0179222;RO=42;SAF=3,4;SAR=0,2;SRF=30;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.418695,-0.06555;STB=0.5,0.840607;STBP=1,0.015;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.048881;OID=.,.;OPOS=40461462,40461463;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:85:51:51:42:36:3,6:0,15:0,0.294118:0,2:3,4:30:12:0,1:0,14:23:13
chr17	40475650	.	G	GA	66.35	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=36;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=-0.0662194;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=12.9082;QD=8.04281;RBI=0.0662194;REFB=0.00788804;REVB=-0.000100746;RO=26;SAF=10;SAR=0;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.75581;STB=0.599854;STBP=0.36;TYPE=ins;VARB=-0.0311833;OID=.;OPOS=40475651;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.454545:10:36:15:33:18:12:3:12:6:66:26:10:0:14:12
chr17	40672538	.	T	A	194.44	PASS	AF=0.442308;AO=22;DP=50;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.00824064;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6758;QD=14.9572;RBI=0.00838573;REFB=-0.0281148;REVB=-0.00155314;RO=22;SAF=16;SAR=6;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.262202;STB=0.588155;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=0.0352259;OID=.;OPOS=40672538;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:22:29:22:23:0.442308:6:16:10:12:7:16:16:13
chr17	40689455	.	T	C	1051.18	PASS	AF=0.986486;AO=68;DP=71;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0346923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.1823;QD=56.8206;RBI=0.10125;REFB=-0.0225773;REVB=0.095121;RO=2;SAF=46;SAR=22;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0108344;STB=0.505049;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.00205242;OID=.;OPOS=40689455;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:71:74:2:1:68:73:0.986486:22:46:1:1:24:49:1:0
chr17	40696233	.	C	G	531.11	PASS	AF=0.883721;AO=38;DP=43;FAO=38;FDP=43;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.213712;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=33.6389;QD=49.4054;RBI=0.216141;REFB=-0.168964;REVB=0.0323141;RO=4;SAF=14;SAR=24;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0713697;STB=0.528482;STBP=0.35;TYPE=snp;VARB=0.0250093;OID=.;OPOS=40696233;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:43:43:4:5:38:38:0.883721:24:14:3:1:24:14:3:2
chr17	40699291	.	G	A	487.11	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00501638;FXX=0.0294031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.097;QD=59.0432;RBI=0.130112;REFB=0;REVB=0.130015;RO=0;SAF=26;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44409e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000481952;OID=.;OPOS=40699291;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:33:0:0:33:33:1:7:26:0:0:7:26:0:0
chr17	40699332	.	T	C,G	654.88	PASS	AF=0.953488,0.0465116;AO=41,2;DP=44;FAO=41,2;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=30,0;FSAR=11,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152195,-0.00739039;FXX=0.0227221;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=209.739,158.009;QD=60.9187;RBI=0.0272983,0.0165453;REFB=0,0;REVB=0.0226619,-0.014803;RO=0;SAF=30,0;SAR=11,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000674008,0.183126;OID=.,.;OPOS=40699332,40699332;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:44:43:0:0:41,2:41,2:0.953488,0.0465116:11,2:30,0:0:0:11,2:30,0:0:0
chr17	40716368	.	C	G	35.57	PASS	AF=0.2;AO=9;DP=35;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=0.0058498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.908;QD=4.06478;RBI=0.156503;REFB=-0.0115154;REVB=-0.156394;RO=26;SAF=1;SAR=8;SRF=22;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.736672;STB=0.919117;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.18553;OID=.;OPOS=40716368;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:35:35:26:28:9:7:0.2:8:1:22:4:6:1:22:6
chr17	40822678	.	C	T	1428.33	PASS	AF=0.943925;AO=101;DP=107;FAO=101;FDP=107;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=66;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00527649;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.966;QD=53.3954;RBI=0.0466539;REFB=-0.0270058;REVB=0.0463545;RO=6;SAF=35;SAR=66;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559842;STB=0.529583;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.000309945;OID=.;OPOS=40822678;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:107:107:6:6:101:101:0.943925:66:35:5:1:66:35:5:1
chr17	41116234	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0496276;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.073;QD=52.6125;RBI=0.0548405;REFB=0;REVB=-0.0233363;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00185355;OID=.;OPOS=41116234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0
chr17	41121152	.	G	A	306.06	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=18;FWDB=-0.0595383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.3302;QD=20.4042;RBI=0.0606419;REFB=-0.0209832;REVB=0.0115162;RO=28;SAF=19;SAR=13;SRF=10;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197804;STB=0.609663;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0217968;OID=.;OPOS=41121152;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:13:19:10:18:13:19:10:18
chr17	41121209	.	GGC	G,GG,GGG	573.09	PASS	AF=0.923077,0,0.0769231;AO=9,7,15;DP=31;FAO=36,0,3;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19,0,0;FSAR=17,0,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028495,-0.033381,-0.0349064;FXX=0;HRUN=5,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=220.49,220.222,217.294;QD=58.7788;RBI=0.077125,0.0785414,0.079562;REFB=0,0,0;REVB=0.071668,0.0710947,0.0714959;RO=0;SAF=5,4,9;SAR=4,3,6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.0043259,-0.0137494,-0.0139797;OID=.,.,.;OPOS=41121210,41121211,41121211;OREF=GC,C,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=G,GG,GGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.923077,0,0.0769231:9,7,15:31:36,0,3:39:0:19,0,0:17,0,3:0:0:16:0:5,4,9:4,3,6:0:0
chr17	41121217	.	G	A	205.95	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.00154469;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=210.099;QD=23.5375;RBI=0.0117325;REFB=-0.00277137;REVB=0.0116304;RO=15;SAF=8;SAR=12;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103819;STB=0.558081;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.000867061;OID=.;OPOS=41121217;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:15:20:20:0.571429:12:8:8:7:12:8:8:7
chr17	41133071	.	T	C	375.66	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00681212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.02;QD=55.6537;RBI=0.0151988;REFB=0;REVB=0.0135867;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.87145e-05;OID=.;OPOS=41133071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:13:14:0:0:13:14:0:0
chr17	41165493	.	ATGT	CTGT,GGTG,GTGT	787.34	PASS	AF=0.0357143,0,0.964286;AO=3,2,47;DP=56;FAO=2,0,54;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,36;FSAR=2,0,18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0187228,-0.0240556,0.0186546;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,4,1;MLLD=88.2418,87.0248,135.96;QD=56.2387;RBI=0.0189229,0.0246651,0.0193991;REFB=0,0,0;REVB=0.00274476,0.00544915,0.00532276;RO=0;SAF=0,2,30;SAR=3,0,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,mnp,snp;VARB=0.0477066,0,0.0005844;OID=.,.,.;OPOS=41165493,41165493,41165493;OREF=A,ATGT,A;OALT=C,GGTG,G;OMAPALT=CTGT,GGTG,GTGT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/3:8:56:56:0:0:3,2,47:2,0,54:0.0357143,0,0.964286:3,0,17:0,2,30:0:0:2,0,18:0,0,36:0:0
chr17	41165878	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0365838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6635;QD=57.2023;RBI=0.0618979;REFB=0;REVB=0.0499297;RO=0;SAF=8;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000695039;OID=.;OPOS=41165878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:22:8:0:0:22:8:0:0
chr17	41244982	.	A	G	101.9	PASS	AF=0.282609;AO=13;DP=46;FAO=13;FDP=46;FR=.;FRO=33;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.00322189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8508;QD=8.86056;RBI=0.0141045;REFB=-0.000781863;REVB=0.0137316;RO=33;SAF=1;SAR=12;SRF=13;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.530807;STB=0.839338;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00257541;OID=.;OPOS=41244982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:33:33:13:13:0.282609:12:1:13:20:12:1:13:20
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chr17	41332804	.	T	C,TC	86.07	PASS	AF=0.888889,0.111111;AO=7,2;DP=9;FAO=8,1;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4,1;FSAR=4,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111873,-0.0377121;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=44.5486,24.397;QD=38.2549;RBI=0.139053,0.118749;REFB=0,0;REVB=0.0825844,0.112602;RO=0;SAF=3,2;SAR=4,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0112192,0.0134956;OID=.,.;OPOS=41332804,41332805;OREF=T,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:9:9:0:0:7,2:8,1:0.888889,0.111111:4,0:3,2:0:0:4,0:4,1:0:0
chr17	41478004	.	TAAAAAT	TAAAA,TAAAAT	31.32	PASS	AF=0.235294,0.0294118;AO=8,7;DP=35;FAO=8,1;FDP=34;FR=.;FRO=25;FSAF=6,1;FSAR=2,0;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.158522,-0.167181;FXX=0.0285633;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=21.6487,11.4302;QD=3.68505;RBI=0.179969,0.210168;REFB=-0.0810795,-0.0981141;REVB=-0.0852024,-0.127362;RO=17;SAF=6,5;SAR=2,2;SRF=9;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.265764,0.220682;STB=0.631227,0.987958;STBP=0.496,0.471;TYPE=del,del;VARB=0.191715,0.0886506;OID=.,.;OPOS=41478009,41478005;OREF=AT,A;OALT=-,-;OMAPALT=TAAAA,TAAAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.235294,0.0294118:8,7:35:8,1:34:25:6,1:2,0:15:10:27:17:6,5:2,2:9:8
chr17	41843979	.	C	G	800.36	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0341536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.3838;QD=64.029;RBI=0.0468955;REFB=0;REVB=-0.032136;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000755262;OID=.;OPOS=41843979;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:22:27:0:0:22:28:0:0
chr17	41846508	.	A	G	964.4	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00574553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.258;QD=58.4482;RBI=0.0841653;REFB=0;REVB=0.083969;RO=0;SAF=42;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109371;OID=.;OPOS=41846508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:66:0:0:62:66:1:20:42:0:0:21:45:0:0
chr17	41907079	.	C	T	361.85	PASS	AF=0.625;AO=35;DP=56;FAO=35;FDP=56;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0410291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.1212;QD=25.8462;RBI=0.0535363;REFB=0.00295738;REVB=-0.0343911;RO=21;SAF=18;SAR=17;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00652641;STB=0.503573;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=-0.00178505;OID=.;OPOS=41907079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:21:21:35:35:0.625:17:18:11:10:17:18:11:10
chr17	41959808	.	T	C	4853.17	PASS	AF=0.947059;AO=321;DP=340;FAO=322;FDP=340;FR=.;FRO=18;FSAF=195;FSAR=127;FSRF=17;FSRR=1;FWDB=-0.0121915;FXX=0.00293247;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.206;QD=57.0961;RBI=0.0127988;REFB=-0.0649686;REVB=-0.00389557;RO=18;SAF=195;SAR=126;SRF=17;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0360188;STB=0.518926;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00395604;OID=.;OPOS=41959808;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:340:340:18:18:321:322:0.947059:126:195:17:1:127:195:17:1
chr17	41960343	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00898947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.484;QD=55.6557;RBI=0.0304712;REFB=0;REVB=0.029115;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.18325e-05;OID=.;OPOS=41960343;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr17	41960633	.	CG	GC	2059.32	PASS	AF=1;AO=130;DP=135;FAO=132;FDP=132;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0575203;FXX=0.0222206;HRUN=1;LEN=2;MLLD=159.028;QD=62.4037;RBI=0.0592927;REFB=0;REVB=0.0143886;RO=0;SAF=74;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.07652e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000114668;OID=.;OPOS=41960633;OREF=CG;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:135:132:0:0:130:132:1:56:74:0:0:58:74:0:0
chr17	41961451	.	T	C	483.27	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.602;QD=58.5783;RBI=0.0257951;REFB=0;REVB=0.017871;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.94892e-05;OID=.;OPOS=41961451;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:16:16:0:0:16:17:0:0
chr17	41994794	.	C	T	817.94	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.037;QD=57.3995;RBI=0.0578548;REFB=0;REVB=0.0531008;RO=1;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219211;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014756;OID=.;OPOS=41994794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:1:0:56:57:1:21:35:0:1:22:35:0:0
chr17	42030743	.	G	C	1413.18	PASS	AF=0.978947;AO=90;DP=93;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=73;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00727161;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=45.9641;QD=59.5024;RBI=0.0796356;REFB=-0.120641;REVB=0.079303;RO=3;SAF=71;SAR=19;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0406906;STB=0.523804;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00539747;OID=.;OPOS=42030743;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:93:95:3:2:90:93:0.978947:19:71:1:2:20:73:0:2
chr17	42084772	.	A	G	386.71	PASS	AF=0.43617;AO=39;DP=92;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=27;FWDB=-0.0019475;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.25;QD=16.4555;RBI=0.0102134;REFB=0.00524322;REVB=-0.010026;RO=53;SAF=19;SAR=20;SRF=26;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00346104;STB=0.512189;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=-0.00673238;OID=.;OPOS=42084772;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:94:53:53:39:41:0.43617:20:19:26:27:20:21:26:27
chr17	42152103	.	G	A	638.82	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0690241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.031;QD=59.4248;RBI=0.0692003;REFB=0.00487407;REVB=0.0049354;RO=1;SAF=28;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0164729;STB=0.508768;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=-0.000223506;OID=.;OPOS=42152103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:1:1:42:42:0.976744:14:28:1:0:14:28:1:0
chr17	42155685	.	T	TA	31.66	PASS	AF=0.35;AO=6;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.103008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.7336;QD=6.33153;RBI=0.126393;REFB=-0.0638542;REVB=0.0732432;RO=14;SAF=4;SAR=2;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11111;STB=0.624625;STBP=0.412;TYPE=ins;VARB=0.134781;OID=.;OPOS=42155686;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.35:6:20:7:20:13:5:2:7:6:31:14:4:2:8:6
chr17	42164885	.	G	C	152.37	PASS	AF=0.933333;AO=14;DP=15;FAO=14;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00715818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3358;QD=40.6326;RBI=0.0177293;REFB=0.0322056;REVB=0.01622;RO=1;SAF=3;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128919;STB=0.571319;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.000898411;OID=.;OPOS=42164885;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:15:15:1:1:14:14:0.933333:11:3:1:0:11:3:1:0
chr17	42213347	.	G	A	1439.67	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=63;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.598;QD=62.5944;RBI=0.0242448;REFB=0;REVB=0.0190532;RO=0;SAF=29;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.69531e-05;OID=.;OPOS=42213347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:87:92:0:0:87:92:1:58:29:0:0:63:29:0:0
chr17	42225547	.	A	C	255.15	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00958225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.142;QD=51.0306;RBI=0.021347;REFB=0;REVB=0.0190755;RO=0;SAF=6;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.98773e-05;OID=.;OPOS=42225547;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:14:6:0:0:14:6:0:0
chr17	42248346	.	A	T	595.69	PASS	AF=0.952381;AO=40;DP=43;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0389312;FXX=0.0232504;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7738;QD=56.7325;RBI=0.042814;REFB=-0.0602935;REVB=-0.0178156;RO=1;SAF=12;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164593;STB=0.51123;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.0156747;OID=.;OPOS=42248346;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:43:42:1:2:40:40:0.952381:28:12:0:1:28:12:1:1
chr17	42254526	.	C	CG	212.83	PASS	AF=1;AO=4;DP=34;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0612184;FXX=0.176419;HRUN=0;LEN=1;MLLD=46.2167;QD=30.404;RBI=0.0635987;REFB=-0.0651719;REVB=0.0172367;RO=29;SAF=4;SAR=0;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.62967;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00402195;OID=.;OPOS=42254527;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:4:34:28:28:0:12:16:0:0:3:29:4:0:13:16
chr17	42254527	.	T	C,G	474.8	PASS	AF=0.117647,0.882353;AO=4,29;DP=33;FAO=4,30;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=4,13;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00365445,-0.00282413;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=191.951,79.1886;QD=55.8592;RBI=0.00370193,0.00431857;REFB=0,0;REVB=-0.000591032,-0.00326715;RO=0;SAF=4,13;SAR=0,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.00751908,-0.00241638;OID=.,.;OPOS=42254527,42254527;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:20:33:34:0:0:4,29:4,30:0.117647,0.882353:0,16:4,13:0:0:0,17:4,13:0:0
chr17	42255097	.	T	C	730.93	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216745;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.864;QD=62.2066;RBI=0.0235841;REFB=0;REVB=0.0092966;RO=0;SAF=14;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.54599e-05;OID=.;OPOS=42255097;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:32:14:0:0:32:15:0:0
chr17	42270291	.	A	G	834.93	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.418;QD=57.5815;RBI=0.0152074;REFB=0;REVB=0.00327245;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.24411e-05;OID=.;OPOS=42270291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:23:34:0:0:24:34:0:0
chr17	42287519	.	C	T	754.35	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297083;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.4099;QD=56.9319;RBI=0.066304;REFB=0;REVB=-0.059276;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000223579;OID=.;OPOS=42287519;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:20:33:0:0:20:33:0:0
chr17	42381555	.	GAC	G	421.83	PASS	AF=0.457447;AO=43;DP=95;FAO=43;FDP=94;FR=.;FRO=51;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=28;FWDB=-0.0194458;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=270.773;QD=17.9504;RBI=0.028005;REFB=-0.00896637;REVB=-0.0201529;RO=50;SAF=23;SAR=20;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110239;STB=0.545433;STBP=0.443;TYPE=del;VARB=0.0122227;OID=.;OPOS=42381556;OREF=AC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.457447:43:95:43:94:51:23:20:23:28:99:50:23:20:21:29
chr17	42392622	.	T	C	2197.59	PASS	AF=1;AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138001;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.36;QD=63.24;RBI=0.0206488;REFB=0;REVB=-0.01536;RO=0;SAF=70;SAR=69;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.76822e-06;OID=.;OPOS=42392622;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:139:139:0:0:139:139:1:69:70:0:0:69:70:0:0
chr17	42398052	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0391379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=207.286;QD=44.6898;RBI=0.0409402;REFB=0;REVB=-0.0120138;RO=0;SAF=12;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119825;OID=.;OPOS=42398052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:1:12:0:0:1:12:0:0
chr17	42398757	.	C	A	259.96	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106113;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.532;QD=51.991;RBI=0.0426745;REFB=0;REVB=0.0413342;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016021;OID=.;OPOS=42398757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:5:15:0:0:5:15:0:0
chr17	42427630	.	T	C	224.61	PASS	AF=0.470588;AO=24;DP=51;FAO=24;FDP=51;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.0389364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3403;QD=17.6162;RBI=0.0466634;REFB=-0.00625934;REVB=-0.0257184;RO=27;SAF=15;SAR=9;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.067977;STB=0.538429;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.00534823;OID=.;OPOS=42427630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:27:27:24:24:0.470588:9:15:15:12:9:15:15:12
chr17	42466832	.	C	T	175.15	PASS	AF=0.514286;AO=18;DP=35;FAO=18;FDP=35;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0189106;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.698;QD=20.0175;RBI=0.0245582;REFB=-0.00562214;REVB=-0.0156683;RO=17;SAF=7;SAR=11;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.31443;STB=0.676736;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00265545;OID=.;OPOS=42466832;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:17:18:18:0.514286:11:7:13:4:11:7:13:4
chr17	42474719	.	G	A	277.42	PASS	AF=0.5;AO=30;DP=60;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.0100975;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.54;QD=18.4949;RBI=0.0110687;REFB=-0.0256429;REVB=-0.00453398;RO=30;SAF=17;SAR=13;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0601557;STB=0.53361;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.015745;OID=.;OPOS=42474719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:30:30:30:30:0.5:13:17:15:15:13:17:15:15
chr17	42475983	.	G	C	327.35	PASS	AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=0.00450648;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.856;QD=17.6943;RBI=0.00645551;REFB=-0.0130063;REVB=-0.00462226;RO=39;SAF=16;SAR=19;SRF=29;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266696;STB=0.648139;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0149802;OID=.;OPOS=42475983;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:39:39:35:35:0.472973:19:16:29:10:19:16:29:10
chr17	42786213	.	G	C	138.95	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0165455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.661;QD=19.8494;RBI=0.0165959;REFB=-0.0181722;REVB=0.00129251;RO=13;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121067;STB=0.56863;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.018053;OID=.;OPOS=42786213;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:8:7:8:5:8:7:8:5
chr17	42851729	.	C	T	37.04	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.00158726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8956;QD=8.23205;RBI=0.00202457;REFB=-0.0388534;REVB=-0.00125678;RO=12;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.367359;STB=0.721627;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0543022;OID=.;OPOS=42851729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:3:3:2:10:3:3:2:10
chr17	42852604	.	G	T	350.86	PASS	AF=0.529412;AO=36;DP=68;FAO=36;FDP=68;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=-0.0365921;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6588;QD=20.6388;RBI=0.0508966;REFB=-0.043346;REVB=0.0353762;RO=32;SAF=11;SAR=25;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0962655;STB=0.553475;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0386749;OID=.;OPOS=42852604;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:32:32:36:36:0.529412:25:11:13:19:25:11:13:19
chr17	42852610	.	T	C	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.014;QD=59.1421;RBI=0.0416581;REFB=0;REVB=-0.0343456;RO=0;SAF=24;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.00223e-05;OID=.;OPOS=42852610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:43:24:0:0:43:24:0:0
chr17	42854610	.	T	C	180.14	PASS	AF=0.385965;AO=21;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.00175009;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2076;QD=12.6413;RBI=0.0477137;REFB=-0.0123832;REVB=0.0476816;RO=35;SAF=14;SAR=7;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.078171;STB=0.523788;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0288963;OID=.;OPOS=42854610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:35:21:22:0.385965:7:14:21:14:8:14:21:14
chr17	42855554	.	T	C	264.98	PASS	AF=0.428571;AO=30;DP=72;FAO=30;FDP=70;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.058616;FXX=0.0277739;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.556;QD=15.1416;RBI=0.0647618;REFB=-0.0418183;REVB=0.0275364;RO=36;SAF=18;SAR=12;SRF=24;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0684277;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0476398;OID=.;OPOS=42855554;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:70:36:40:30:30:0.428571:12:18:24:12:12:18:24:16
chr17	42857430	.	G	A	282.24	PASS	AF=0.346535;AO=34;DP=100;FAO=35;FDP=101;FR=.;FRO=66;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=43;FWDB=0.00741314;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.3575;QD=11.1777;RBI=0.0083603;REFB=-0.0260191;REVB=0.00386522;RO=66;SAF=24;SAR=10;SRF=23;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.399225;STB=0.714718;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0209042;OID=.;OPOS=42857430;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:66:66:34:35:0.346535:10:24:23:43:11:24:23:43
chr17	42857517	.	C	T	179.02	PASS	AF=0.385965;AO=22;DP=57;FAO=22;FDP=57;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0395527;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.691;QD=12.5626;RBI=0.0402468;REFB=-0.0225396;REVB=0.00744256;RO=35;SAF=19;SAR=3;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.587181;STB=0.841238;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0232346;OID=.;OPOS=42857517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:35:35:22:22:0.385965:3:19:12:23:3:19:12:23
chr17	42857945	.	T	C	511.44	PASS	AF=0.462185;AO=55;DP=119;FAO=55;FDP=119;FR=.;FRO=64;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=33;FSRR=31;FWDB=0.0240434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.6822;QD=17.1913;RBI=0.0252633;REFB=-0.0120199;REVB=0.00775562;RO=64;SAF=22;SAR=33;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.113334;STB=0.563117;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0201062;OID=.;OPOS=42857945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:64:64:55:55:0.462185:33:22:33:31:33:22:33:31
chr17	42880753	.	C	T	206.96	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.0208082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5595;QD=17.2466;RBI=0.026533;REFB=-0.00175413;REVB=-0.0164628;RO=27;SAF=14;SAR=7;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18975;STB=0.608589;STBP=0.216;TYPE=snp;VARB=0.00125339;OID=.;OPOS=42880753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:27:21:21:0.4375:7:14:13:14:7:14:13:14
chr17	42925559	.	C	T	138.97	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.00656775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.715;QD=12.0843;RBI=0.0171849;REFB=-0.0312994;REVB=-0.0158804;RO=30;SAF=6;SAR=10;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176641;STB=0.604264;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0335314;OID=.;OPOS=42925559;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:30:30:16:16:0.347826:10:6:16:14:10:6:16:14
chr17	43003484	.	T	C	414.85	PASS	AF=0.597015;AO=40;DP=67;FAO=40;FDP=67;FR=.;FRO=27;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=-0.018075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1888;QD=24.767;RBI=0.0576872;REFB=-0.0561895;REVB=0.0547823;RO=27;SAF=27;SAR=13;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242943;STB=0.513298;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0410863;OID=.;OPOS=43003484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:27:27:40:40:0.597015:13:27:19:8:13:27:19:8
chr17	43010064	.	G	A	146.31	PASS	AF=0.265823;AO=21;DP=79;FAO=21;FDP=79;FR=.;FRO=58;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=38;FSRR=20;FWDB=0.0163313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.072;QD=7.40793;RBI=0.0218967;REFB=-0.000625986;REVB=0.014586;RO=57;SAF=13;SAR=8;SRF=37;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0391192;STB=0.528471;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.00177217;OID=.;OPOS=43010064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:57:58:21:21:0.265823:8:13:37:20:8:13:38:20
chr17	43159024	.	A	G	30.42	PASS	AF=0.109091;AO=6;DP=55;FAO=6;FDP=55;FR=.;FRO=49;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=0.00333006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.993;QD=2.21226;RBI=0.00985063;REFB=-0.00113137;REVB=-0.00927069;RO=48;SAF=5;SAR=1;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.380106;STB=0.793648;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00754618;OID=.;OPOS=43159024;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:55:55:48:49:6:6:0.109091:1:5:25:23:1:5:26:23
chr17	43171154	.	C	T	351.86	PASS	AF=0.422222;AO=38;DP=90;FAO=38;FDP=90;FR=.;FRO=52;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=-0.00367464;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4851;QD=15.6383;RBI=0.0169479;REFB=-0.00584429;REVB=-0.0165447;RO=52;SAF=17;SAR=21;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.209164;STB=0.617587;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00597831;OID=.;OPOS=43171154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:52:52:38:38:0.422222:21:17:34:18:21:17:34:18
chr17	43181287	.	A	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0075762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.791;QD=60.2307;RBI=0.0292711;REFB=0;REVB=0.0282737;RO=0;SAF=26;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.07931e-05;OID=.;OPOS=43181287;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:11:26:0:0:11:26:0:0
chr17	43183028	.	G	A	364.17	PASS	AF=0.343511;AO=45;DP=131;FAO=45;FDP=131;FR=.;FRO=86;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=49;FWDB=0.00632617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.99;QD=11.1198;RBI=0.00642911;REFB=-0.000880804;REVB=-0.00114586;RO=86;SAF=26;SAR=19;SRF=37;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167558;STB=0.596248;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00161133;OID=.;OPOS=43183028;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:86:86:45:45:0.343511:19:26:37:49:19:26:37:49
chr17	43183108	.	G	A	548.55	PASS	AF=0.430657;AO=59;DP=137;FAO=59;FDP=137;FR=.;FRO=78;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=41;FWDB=-0.0336067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.469;QD=16.0161;RBI=0.0336145;REFB=0.00181138;REVB=-0.000722799;RO=78;SAF=31;SAR=28;SRF=37;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0519289;STB=0.529053;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.00238042;OID=.;OPOS=43183108;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:137:78:78:59:59:0.430657:28:31:37:41:28:31:37:41
chr17	43183420	.	C	T	527.11	PASS	AF=0.470588;AO=55;DP=118;FAO=56;FDP=119;FR=.;FRO=63;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=36;FSRR=27;FWDB=-0.014019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.686;QD=17.7181;RBI=0.040854;REFB=-0.00917287;REVB=0.0383734;RO=63;SAF=31;SAR=24;SRF=36;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00761255;STB=0.50958;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.00868419;OID=.;OPOS=43183420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:119:63:63:55:56:0.470588:24:31:36:27:25:31:36:27
chr17	43192549	.	T	TC	207.84	PASS	AF=1;AO=18;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.4098;QD=39.5882;RBI=0.100048;REFB=0;REVB=0.0944166;RO=1;SAF=6;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367456;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00686477;OID=.;OPOS=43192550;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:18:20:21:21:0:7:14:0:0:4:1:6:12:0:1
chr17	43192821	.	A	G	73.08	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0283737;FXX=0.0587889;HRUN=2;LEN=1;MLLD=85.2129;QD=18.2695;RBI=0.029061;REFB=-0.0373341;REVB=-0.00628277;RO=6;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545351;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0302512;OID=.;OPOS=43192821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:17:16:6:7:9:9:0.5625:3:6:4:2:3:6:4:3
chr17	43227766	.	T	TTTGG	524.5	PASS	AF=0.947368;AO=33;DP=40;FAO=36;FDP=38;FR=.;FRO=2;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00430346;FXX=0.0499875;HRUN=3;LEN=4;MLLD=320.282;QD=55.2109;RBI=0.0113364;REFB=-0.0047929;REVB=-0.0104878;RO=3;SAF=13;SAR=20;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0438735;STB=0.53844;STBP=0.081;TYPE=ins;VARB=0.000252024;OID=.;OPOS=43227767;OREF=-;OALT=TTGG;OMAPALT=TTTGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.947368:33:40:36:38:2:12:24:2:0:9:3:13:20:2:1
chr17	43229299	.	A	C	50.47	PASS	AF=0.583333;AO=7;DP=12;FAO=7;FDP=12;FR=.;FRO=5;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0105247;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.041;QD=16.823;RBI=0.0195698;REFB=-0.0352201;REVB=0.0164987;RO=5;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775494;STB=0.54533;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.0298819;OID=.;OPOS=43229299;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:5:5:7:7:0.583333:5:2:1:4:5:2:1:4
chr17	43318774	.	TGGGGC	TGGGC,TGGGCG,TGGGCGC	228.7	PASS	AF=0,0,1;AO=3,12,2;DP=18;FAO=0,0,18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,4;FSAR=0,0,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0664116,-0.0608111,0.00450242;FXX=0;HRUN=4,4,0;LEN=1,2,1;MLLD=11.6759,189.263,207.664;QD=50.8234;RBI=0.0713704,0.0644681,0.0171214;REFB=0,0,0;REVB=-0.0261388,-0.0214044,0.0165188;RO=0;SAF=1,2,0;SAR=2,10,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.347518,0,0;SSEP=0.373984,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,ins;VARB=0,0.0825847,-0.00183842;OID=.,.,.;OPOS=43318775,43318778,43318778;OREF=G,GC,-;OALT=-,CG,C;OMAPALT=TGGGC,TGGGCG,TGGGCGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	3/3:0,0,1:3,12,2:18:0,0,18:18:0:0,0,4:0,0,14:0:0:4:0:1,2,0:2,10,2:0:0
chr17	43319770	.	C	T	280.88	PASS	AF=0.388235;AO=31;DP=83;FAO=33;FDP=85;FR=.;FRO=52;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=16;FSRR=36;FWDB=0.0834249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.939;QD=13.2178;RBI=0.0884781;REFB=-0.0164568;REVB=-0.0294733;RO=52;SAF=10;SAR=21;SRF=16;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187557;STB=0.537714;STBP=0.646;TYPE=snp;VARB=0.0233527;OID=.;OPOS=43319770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:85:52:52:31:33:0.388235:21:10:16:36:21:12:16:36
chr17	43333125	.	C	T	360.4	PASS	AF=0.463415;AO=37;DP=81;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=22;FSRR=22;FWDB=-0.00778132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.023;QD=17.5804;RBI=0.0312514;REFB=-0.0132877;REVB=0.0302672;RO=43;SAF=16;SAR=21;SRF=21;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0542095;STB=0.542834;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.0214822;OID=.;OPOS=43333125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:43:44:37:38:0.463415:21:16:21:22:22:16:22:22
chr17	43333785	.	AAGAC	A	323.76	PASS	AF=0.65;AO=38;DP=64;FAO=39;FDP=60;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0022906;FXX=0.0908953;HRUN=2;LEN=4;MLLD=222.725;QD=21.5838;RBI=0.0181864;REFB=-0.0601784;REVB=0.0180416;RO=19;SAF=18;SAR=20;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.064372;STB=0.52184;STBP=0.646;TYPE=del;VARB=0.0316487;OID=.;OPOS=43333786;OREF=AGAC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.65:38:64:39:60:21:18:21:11:10:99:19:18:20:11:8
chr17	43340936	.	G	A	145.59	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00298394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.683;QD=11.1996;RBI=0.00578195;REFB=-0.0126642;REVB=0.00495248;RO=31;SAF=11;SAR=7;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240009;STB=0.610988;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0613198;OID=.;OPOS=43340936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:34:18:18:0.346154:7:11:12:19:7:11:15:19
chr17	43342141	.	G	C	360.49	PASS	AF=0.463415;AO=36;DP=80;FAO=38;FDP=82;FR=.;FRO=44;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=38;FSRR=6;FWDB=-0.0107141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.916;QD=17.5848;RBI=0.0155357;REFB=-0.0130439;REVB=0.0112502;RO=44;SAF=24;SAR=12;SRF=38;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24;STB=0.643852;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.0212953;OID=.;OPOS=43342141;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:82:44:44:36:38:0.463415:12:24:38:6:14:24:38:6
chr17	43364293	.	C	CG	367.8	PASS	AF=1;AO=31;DP=34;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134666;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=29.873;QD=47.4581;RBI=0.0195074;REFB=0;REVB=0.0141135;RO=2;SAF=15;SAR=16;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0582199;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00181083;OID=.;OPOS=43364294;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:31:34:31:31:0:15:16:0:0:7:2:15:16:2:0
chr17	43923180	.	G	A	769.46	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0294172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.867;QD=56.9973;RBI=0.0467006;REFB=0;REVB=0.0362708;RO=0;SAF=42;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000118601;OID=.;OPOS=43923180;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:12:42:0:0:12:42:0:0
chr17	43923898	.	A	G	255.81	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6439;QD=51.1629;RBI=0.0666633;REFB=0;REVB=-0.0496039;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100363;OID=.;OPOS=43923898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
chr17	43924292	.	G	A	632.75	PASS	AF=0.451389;AO=64;DP=143;FAO=65;FDP=144;FR=.;FRO=79;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=59;FSRR=20;FWDB=0.0522077;FXX=0.00689608;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.152;QD=17.5764;RBI=0.0923341;REFB=0.000682508;REVB=0.0761573;RO=77;SAF=37;SAR=27;SRF=57;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16893;STB=0.594525;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=6.32398e-05;OID=.;OPOS=43924292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:144:77:79:64:65:0.451389:27:37:57:20:27:38:59:20
chr17	43924412	.	T	C	1592.29	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321237;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.261;QD=60.0862;RBI=0.0330486;REFB=0;REVB=0.00776413;RO=0;SAF=54;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.38345e-05;OID=.;OPOS=43924412;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:52:54:0:0:52:54:0:0
chr17	44061025	.	C	T	595.98	PASS	AF=0.453237;AO=62;DP=137;FAO=63;FDP=139;FR=.;FRO=76;FSAF=45;FSAR=18;FSRF=42;FSRR=34;FWDB=0.013105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.157;QD=17.1505;RBI=0.0131606;REFB=-0.0176451;REVB=-0.00120872;RO=69;SAF=45;SAR=17;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18806;STB=0.599045;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0141327;OID=.;OPOS=44061025;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:139:69:76:62:63:0.453237:17:45:38:31:18:45:42:34
chr17	44067382	.	T	C	149.8	PASS	AF=0.421053;AO=14;DP=39;FAO=16;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=-0.0421398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.4849;QD=15.7683;RBI=0.0520405;REFB=-0.12765;REVB=-0.0305361;RO=15;SAF=9;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103377;STB=0.503593;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0597994;OID=.;OPOS=44067382;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:15:21:14:16:0.421053:5:9:8:7:6:10:13:8
chr17	44077044	.	T	C	128.45	PASS	AF=1;AO=9;DP=10;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0855896;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.47;QD=42.8175;RBI=0.0873576;REFB=0;REVB=0.0174864;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000513331;OID=.;OPOS=44077044;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:12:0:0:9:12:1:4:5:0:0:5:7:0:0
chr17	44104670	.	A	G	130.63	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00378764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4893;QD=22.718;RBI=0.0932587;REFB=-0.0376244;REVB=-0.0931817;RO=9;SAF=3;SAR=11;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283077;STB=0.6614;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0255002;OID=.;OPOS=44104670;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:9:9:14:14:0.608696:11:3:5:4:11:3:5:4
chr17	44109474	.	G	A,C	727.97	PASS	AF=0.957447,0.0425532;AO=45,2;DP=47;FAO=45,2;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28,0;FSAR=17,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244855,0.0756416;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=136.837,12.6096;QD=61.9551;RBI=0.0406587,0.0972557;REFB=0,0;REVB=0.0324591,-0.0611311;RO=0;SAF=28,0;SAR=17,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000277151,0.120095;OID=.,.;OPOS=44109474,44109474;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:47:47:0:0:45,2:45,2:0.957447,0.0425532:17,2:28,0:0:0:17,2:28,0:0:0
chr17	44144993	.	C	G	496.35	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00118435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.934;QD=58.3935;RBI=0.0532866;REFB=0;REVB=0.0532734;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116974;OID=.;OPOS=44144993;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:34:0:0:31:34:1:13:18:0:0:16:18:0:0
chr17	44998563	.	G	A	580.7	PASS	AF=0.48;AO=60;DP=126;FAO=60;FDP=125;FR=.;FRO=65;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=-0.0330768;FXX=0.00793588;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.2464;QD=18.5823;RBI=0.0887645;REFB=-0.0115262;REVB=-0.0823715;RO=64;SAF=25;SAR=35;SRF=25;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0250943;STB=0.517236;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.012858;OID=.;OPOS=44998563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:125:64:65:60:60:0.48:35:25:25:39:35:25:25:40
chr17	45000529	.	G	C	282.07	PASS	AF=0.415584;AO=32;DP=76;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=20;FSRR=25;FWDB=-0.0395301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.782;QD=14.6528;RBI=0.0395302;REFB=-0.0253196;REVB=9.56848e-05;RO=44;SAF=12;SAR=20;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0844705;STB=0.542346;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.0339365;OID=.;OPOS=45000529;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:44:45:32:32:0.415584:20:12:20:24:20:12:20:25
chr17	45000547	.	G	C	925.22	PASS	AF=1;AO=63;DP=65;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0387062;FXX=0.0307645;HRUN=4;LEN=1;MLLD=62.1378;QD=58.7443;RBI=0.0387123;REFB=0;REVB=0.000686815;RO=0;SAF=23;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000363159;OID=.;OPOS=45000547;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:63:0:0:63:63:1:40:23:0:0:40:23:0:0
chr17	45008570	.	G	A	35.56	PASS	AF=0.24;AO=6;DP=25;FAO=6;FDP=25;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.00402925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.535;QD=5.68927;RBI=0.024022;REFB=-0.0119803;REVB=-0.0236817;RO=19;SAF=4;SAR=2;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0230557;STB=0.515102;STBP=0.961;TYPE=snp;VARB=0.0464561;OID=.;OPOS=45008570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:19:19:6:6:0.24:2:4:13:6:2:4:13:6
chr17	45214519	.	A	G	39.05	PASS	AF=0.461538;AO=6;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.00241672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.798;QD=12.0153;RBI=0.00242643;REFB=-0.00893577;REVB=0.000216871;RO=7;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484388;STB=0.529316;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.017653;OID=.;OPOS=45214519;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:7:7:6:6:0.461538:2:4:5:2:2:4:5:2
chr17	45214527	.	TA	CT	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.00306128;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=253.068;QD=10.1733;RBI=0.0113803;REFB=-0.0101647;REVB=0.0109609;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0114641;OID=.;OPOS=45214527;OREF=TA;OALT=CT;OMAPALT=CT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:2:4:6:3:2:4:6:3
chr17	45214558	.	G	A	54.64	PASS	AF=0.380952;AO=7;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.00394204;FXX=0.0454339;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.0008;QD=10.4084;RBI=0.0176127;REFB=-0.0624491;REVB=-0.0171659;RO=14;SAF=4;SAR=3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.65795e-08;STB=0.506313;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0211808;OID=.;OPOS=45214558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:21:21:14:13:7:8:0.380952:3:4:8:6:3:5:8:5
chr17	45214631	.	G	A	34.89	PASS	AF=0.206897;AO=6;DP=29;FAO=6;FDP=29;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0128327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.212;QD=4.81177;RBI=0.0522599;REFB=-0.00376991;REVB=-0.0506598;RO=22;SAF=4;SAR=2;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.248483;STB=0.68122;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0180214;OID=.;OPOS=45214631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:29:29:22:23:6:6:0.206897:2:4:10:12:2:4:10:13
chr17	45214682	.	A	G	35.04	PASS	AF=0.214286;AO=6;DP=28;FAO=6;FDP=28;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.02026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.202;QD=5.00548;RBI=0.0233456;REFB=-0.00946504;REVB=-0.0115995;RO=22;SAF=4;SAR=2;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.296846;STB=0.697035;STBP=0.332;TYPE=snp;VARB=0.0183254;OID=.;OPOS=45214682;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:28:28:22:22:6:6:0.214286:2:4:9:13:2:4:9:13
chr17	45234298	.	G	C	57.29	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=-0.0489438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.8369;QD=12.7301;RBI=0.0492318;REFB=0.00227572;REVB=0.00531725;RO=10;SAF=2;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.258322;STB=0.655832;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=-0.00290097;OID=.;OPOS=45234298;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:6:2:5:5:6:2:5:5
chr17	45234343	.	T	G	107.42	PASS	AF=0.382353;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=6;FWDB=-0.00314354;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=353.285;QD=12.6376;RBI=0.0126906;REFB=-0.00545004;REVB=0.0122951;RO=21;SAF=4;SAR=9;SRF=15;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.411017;STB=0.739911;STBP=0.049;TYPE=snp;VARB=0.00751928;OID=.;OPOS=45234343;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:21:21:13:13:0.382353:9:4:15:6:9:4:15:6
chr17	45234360	.	A	C	106.86	PASS	AF=0.371429;AO=13;DP=34;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00482125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.633;QD=12.2127;RBI=0.0127675;REFB=-0.0150215;REVB=0.0118222;RO=21;SAF=4;SAR=9;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.326158;STB=0.704037;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0234294;OID=.;OPOS=45234360;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:21:22:13:13:0.371429:9:4:13:8:9:4:14:8
chr17	45234403	.	TT	GG	95.68	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.000870992;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=128.082;QD=11.5972;RBI=0.000871121;REFB=-0.0059473;REVB=1.50043e-05;RO=21;SAF=4;SAR=8;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302979;STB=0.679703;STBP=0.115;TYPE=mnp;VARB=0.00884204;OID=.;OPOS=45234403;OREF=TT;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:8:4:13:8:8:4:13:8
chr17	45234406	.	CA	C	34.15	PASS	AF=0.176471;AO=6;DP=34;FAO=6;FDP=34;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0661962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.195;QD=4.01804;RBI=0.066201;REFB=-0.00932438;REVB=-0.00079656;RO=27;SAF=4;SAR=2;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221173;STB=0.639526;STBP=0.482;TYPE=del;VARB=0.0305854;OID=.;OPOS=45234407;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.176471:6:34:6:34:28:4:2:14:14:34:27:4:2:13:14
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chr17	45234420	.	T	G	96.72	PASS	AF=0.387097;AO=11;DP=30;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=7;FWDB=-0.00776643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5482;QD=12.4797;RBI=0.0165357;REFB=-0.0166756;REVB=-0.0145983;RO=17;SAF=5;SAR=6;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136212;STB=0.629419;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0217215;OID=.;OPOS=45234420;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:30:31:17:19:11:12:0.387097:6:5:10:7:7:5:12:7
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chr17	45438886	.	CAGTG	C,CAGTT	318.7	PASS	AF=0.630435,0.0217391;AO=28,4;DP=59;FAO=29,1;FDP=46;FR=.;FRO=16;FSAF=14,1;FSAR=15,0;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0129417,-0.0381307;FXX=0.115362;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=214.927,81.5115;QD=27.7133;RBI=0.0141186,0.0446963;REFB=-0.0336325,0.00632075;REVB=-0.00564314,-0.0233198;RO=20;SAF=13,1;SAR=15,3;SRF=8;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0488892,-0.190729;STB=0.506131,0.989595;STBP=0.951,0.473;TYPE=del,snp;VARB=0.0202793,-0.0508617;OID=.,.;OPOS=45438887,45438890;OREF=AGTG,G;OALT=-,T;OMAPALT=C,CAGTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.630435,0.0217391:28,4:59:29,1:46:16:14,1:15,0:8:8:99:20:13,1:15,3:8:12
chr17	45447802	.	G	A	506.65	PASS	AF=0.494949;AO=49;DP=99;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=-0.0459502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8048;QD=20.4706;RBI=0.11858;REFB=-0.0160229;REVB=-0.109315;RO=50;SAF=30;SAR=19;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680799;STB=0.537756;STBP=0.474;TYPE=snp;VARB=0.0150069;OID=.;OPOS=45447802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:50:50:49:49:0.494949:19:30:27:23:19:30:27:23
chr17	45451894	.	G	A	2045.01	PASS	AF=1;AO=130;DP=131;FAO=131;FDP=131;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0858586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.0133;QD=62.4429;RBI=0.0858738;REFB=0;REVB=-0.00161385;RO=0;SAF=66;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.98038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000244083;OID=.;OPOS=45451894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:131:0:0:130:131:1:64:66:0:0:64:67:0:0
chr17	45490251	.	C	T	414.84	PASS	AF=0.482759;AO=42;DP=86;FAO=42;FDP=87;FR=.;FRO=45;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0261384;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8006;QD=19.0733;RBI=0.0441575;REFB=0.00068403;REVB=-0.0355903;RO=43;SAF=28;SAR=14;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00796595;STB=0.512814;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=-0.000928463;OID=.;OPOS=45490251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:43:45:42:42:0.482759:14:28:29:14:14:28:29:16
chr17	45567593	.	ATC	A	79.19	PASS	AF=0.314286;AO=10;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.0184615;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=2;MLLD=227.198;QD=9.05072;RBI=0.043092;REFB=-0.0409641;REVB=-0.0389371;RO=23;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330237;STB=0.644926;STBP=0.322;TYPE=del;VARB=0.060713;OID=.;OPOS=45567594;OREF=TC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.314286:10:35:11:35:24:5:6:6:18:79:23:5:5:5:18
chr17	45569814	.	GA	G,GG	508.68	PASS	AF=0.0857143,0.914286;AO=8,27;DP=35;FAO=3,32;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=2,23;FSAR=1,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00831808,-0.00572342;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=196.716,207.389;QD=58.1352;RBI=0.00885521,0.0079861;REFB=0,0;REVB=-0.00303716,-0.00556958;RO=0;SAF=7,18;SAR=1,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=4.78849e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00824018,0.00891577;OID=.,.;OPOS=45569815,45569815;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0857143,0.914286:8,27:35:3,32:35:0:2,23:1,9:0:0:9:0:7,18:1,9:0:0
chr17	45700384	.	C	A,CCTA	242.61	PASS	AF=0.0416667,0.458333;AO=2,22;DP=52;FAO=2,22;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=2,12;FSAR=0,10;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=-0.0710689,-0.0107264;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,3;MLLD=67.1152,200.235;QD=20.2176;RBI=0.0863225,0.0107938;REFB=-0.00740518,-0.0501086;REVB=-0.0489978,-0.00120472;RO=28;SAF=2,12;SAR=0,10;SRF=18;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.411757,-0.09777;STB=0.992395,0.609663;STBP=0.353,0.178;TYPE=snp,ins;VARB=0.0153384,0.0469813;OID=.,.;OPOS=45700384,45700385;OREF=C,-;OALT=A,CTA;OMAPALT=A,CCTA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:52:48:28:24:2,22:2,22:0.0416667,0.458333:0,10:2,12:18:10:0,10:2,12:18:6
chr17	45700408	.	C	G	283.76	PASS	AF=0.75;AO=24;DP=33;FAO=24;FDP=32;FR=.;FRO=8;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0193581;FXX=0.0302939;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.564;QD=35.4705;RBI=0.0268519;REFB=-0.0627596;REVB=-0.0186088;RO=8;SAF=15;SAR=9;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40172e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0227845;OID=.;OPOS=45700408;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:33:32:8:8:24:24:0.75:9:15:5:3:9:15:5:3
chr17	45760349	.	T	C	759.0	PASS	AF=0.964912;AO=54;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0256554;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=314.924;QD=53.2628;RBI=0.0355763;REFB=0.0280636;REVB=0.0246471;RO=1;SAF=31;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200481;STB=0.502946;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=-9.199e-05;OID=.;OPOS=45760349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:1:2:54:55:0.964912:23:31:0:1:23:32:1:1
chr17	45760429	.	T	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216653;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.71;QD=58.142;RBI=0.0294887;REFB=0;REVB=0.020005;RO=0;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106583;OID=.;OPOS=45760429;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:12:20:0:0:12:20:0:0
chr17	45760433	.	T	C	432.07	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000821769;FXX=0.0322477;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.43;QD=57.6093;RBI=0.0385955;REFB=0;REVB=0.0385868;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196729;OID=.;OPOS=45760433;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0
chr17	45760958	.	TA	T	144.54	PASS	AF=0.575758;AO=19;DP=34;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00800639;FXX=0.0294031;HRUN=3;LEN=1;MLLD=24.7133;QD=17.5203;RBI=0.128055;REFB=0.0132499;REVB=0.127805;RO=13;SAF=6;SAR=13;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227534;STB=0.61474;STBP=0.135;TYPE=del;VARB=0.000305749;OID=.;OPOS=45760959;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.575758:19:34:19:33:14:6:13:8:6:80:13:6:13:8:5
chr17	45774151	.	G	A	255.84	PASS	AF=0.491228;AO=27;DP=56;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=8;FWDB=0.0341537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.261;QD=17.9536;RBI=0.0944102;REFB=-0.00543207;REVB=0.0880159;RO=29;SAF=19;SAR=8;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228415;STB=0.506168;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.00831731;OID=.;OPOS=45774151;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:29:29:27:28:0.491228:8:19:21:8:8:20:21:8
chr17	45885687	.	A	G	1610.3	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0298413;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.811;QD=60.1982;RBI=0.0314711;REFB=0;REVB=0.00999647;RO=0;SAF=66;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.87293e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.11348e-05;OID=.;OPOS=45885687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:107:0:0:107:107:1:41:66:0:0:41:66:0:0
chr17	45915788	.	T	C	446.81	PASS	AF=1;AO=30;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6461;QD=57.6526;RBI=0.0418072;REFB=0;REVB=0.0333658;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268654;OID=.;OPOS=45915788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:30:31:1:16:14:0:0:17:14:0:0
chr17	45994044	.	C	T	787.22	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192959;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.4294;QD=57.2521;RBI=0.0330075;REFB=0;REVB=0.0267799;RO=0;SAF=45;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.71233e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181352;OID=.;OPOS=45994044;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:10:45:0:0:10:45:0:0
chr17	45994094	.	T	C	923.59	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0728207;FXX=0.0156226;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2911;QD=58.6403;RBI=0.0760722;REFB=0;REVB=-0.0220028;RO=0;SAF=55;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000736676;OID=.;OPOS=45994094;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:8:55:0:0:8:55:0:0
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chr17	45994154	.	G	A	267.94	PASS	AF=1;AO=18;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0354922;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5758;QD=51.037;RBI=0.0686928;REFB=0;REVB=-0.0588134;RO=0;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.27948e-05;OID=.;OPOS=45994154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:18:21:1:16:2:0:0:17:4:0:0
chr17	46002744	.	G	T	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00274576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.672;QD=60.9786;RBI=0.0166178;REFB=0;REVB=0.0163894;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.8214e-05;OID=.;OPOS=46002744;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:15:24:0:0:15:24:0:0
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chr17	46026156	.	A	G	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=173.645;QD=60.2307;RBI=0.0313019;REFB=0;REVB=-0.0290696;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.59189e-05;OID=.;OPOS=46026156;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:13:24:0:0:13:24:0:0
chr17	46029962	.	ACTCT	A	124.69	PASS	AF=0.303571;AO=16;DP=56;FAO=17;FDP=56;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=10;FWDB=-0.0197738;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=4;MLLD=295.303;QD=8.90645;RBI=0.0229418;REFB=-0.0129259;REVB=-0.0116328;RO=39;SAF=7;SAR=9;SRF=29;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.354307;STB=0.686405;STBP=0.108;TYPE=del;VARB=0.0311757;OID=.;OPOS=46029963;OREF=CTCT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.303571:16:56:17:56:39:8:9:29:10:99:39:7:9:29:10
chr17	46059071	.	T	C	248.6	PASS	AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=0.0116977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.069;QD=25.4979;RBI=0.011701;REFB=-0.019428;REVB=0.000278303;RO=16;SAF=6;SAR=17;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104682;STB=0.505809;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.0103902;OID=.;OPOS=46059071;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:17:6:4:12:17:6:4:12
chr17	46136133	.	G	C	274.22	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.033565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.915;QD=24.9287;RBI=0.0337167;REFB=-0.00538403;REVB=0.00319437;RO=19;SAF=13;SAR=12;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158156;STB=0.587635;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.00553651;OID=.;OPOS=46136133;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:12:13:6:13:12:13:6:13
chr17	46136751	.	G	C	311.56	PASS	AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0007895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.569;QD=19.1729;RBI=0.0294689;REFB=-0.0148626;REVB=0.0294584;RO=32;SAF=12;SAR=21;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0972274;STB=0.554219;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0156028;OID=.;OPOS=46136751;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:32:32:33:33:0.507692:21:12:15:17:21:12:15:17
chr17	46137055	.	GCTGGAC	G	113.97	PASS	AF=0.285714;AO=15;DP=54;FAO=16;FDP=56;FR=.;FRO=40;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=0.00310498;FXX=0;HRUN=1;LEN=6;MLLD=299.7;QD=8.14084;RBI=0.0169155;REFB=-0.0122075;REVB=-0.016628;RO=34;SAF=12;SAR=3;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.38385;STB=0.76435;STBP=0.024;TYPE=del;VARB=0.028556;OID=.;OPOS=46137056;OREF=CTGGAC;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.285714:15:54:16:56:40:13:3:19:21:99:34:12:3:17:17
chr17	46147945	.	G	A	163.35	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.0191167;FXX=0.0526177;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.202;QD=18.1499;RBI=0.0201086;REFB=-0.0109744;REVB=-0.0062373;RO=19;SAF=11;SAR=6;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214496;STB=0.620565;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.0135005;OID=.;OPOS=46147945;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:36:19:19:17:17:0.472222:6:11:16:3:6:11:16:3
chr17	46166073	.	G	A	462.05	PASS	AF=0.318919;AO=59;DP=186;FAO=59;FDP=185;FR=.;FRO=126;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=37;FSRR=89;FWDB=-0.017165;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.73;QD=9.99017;RBI=0.025255;REFB=-0.00944318;REVB=-0.0185251;RO=125;SAF=25;SAR=34;SRF=37;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159312;STB=0.593256;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0320045;OID=.;OPOS=46166073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:186:185:125:126:59:59:0.318919:34:25:37:88:34:25:37:89
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chr17	46474117	.	C	T	271.69	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=10;FWDB=-0.0100056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.639;QD=14.6858;RBI=0.0150438;REFB=-0.00162572;REVB=-0.0112341;RO=43;SAF=21;SAR=10;SRF=33;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110934;STB=0.562462;STBP=0.418;TYPE=snp;VARB=0.00263728;OID=.;OPOS=46474117;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:10:21:33:10:10:21:33:10
chr17	46507417	.	G	A	700.42	PASS	AF=0.527132;AO=63;DP=130;FAO=68;FDP=129;FR=.,HEALED;FRO=61;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=30;FSRR=31;FWDB=-0.0558683;FXX=0.00769172;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.672;QD=21.7185;RBI=0.0569548;REFB=-0.0166405;REVB=0.011072;RO=38;SAF=23;SAR=40;SRF=10;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0781031;STB=0.545887;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.0104534;OID=.;OPOS=46507417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:129:38:61:63:68:0.527132:40:23:10:28:41:27:30:31
chr17	46607021	.	T	C	2336.7	PASS	AF=0.981132;AO=156;DP=159;FAO=156;FDP=159;FR=.;FRO=3;FSAF=83;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0321335;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.2619;QD=58.785;RBI=0.0346223;REFB=-0.0464237;REVB=0.0128896;RO=3;SAF=83;SAR=73;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0071569;STB=0.503763;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00622238;OID=.;OPOS=46607021;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:159:159:3:3:156:156:0.981132:73:83:1:2:73:83:1:2
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chr17	46629593	.	G	T	722.04	PASS	AF=0.901639;AO=55;DP=61;FAO=55;FDP=61;FR=.;FRO=6;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0631852;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=122.164;QD=47.3469;RBI=0.0781598;REFB=-0.167337;REVB=0.0460062;RO=2;SAF=25;SAR=30;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0030286;STB=0.5373;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.00240885;OID=.;OPOS=46629593;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:61:61:2:6:55:55:0.901639:30:25:1:1:30:25:5:1
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chr17	46653036	.	AAT	A,AA,AAA	738.06	PASS	AF=0.0273973,0.479452,0;AO=24,38,18;DP=158;FAO=4,70,0;FDP=146;FR=.;FRO=72;FSAF=1,21,0;FSAR=3,49,0;FSRF=24;FSRR=48;FWDB=0.0099695,0.0434692,0.0603358;FXX=0.0266649;HRUN=7,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=238.299,241.341,240.413;QD=20.2208;RBI=0.0148745,0.0447706,0.0612153;REFB=-0.01071,-0.00868662,-0.00710337;REVB=-0.011039,-0.0107159,-0.0103396;RO=75;SAF=12,7,9;SAR=12,31,9;SRF=26;SRR=49;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.192103,-0.24879,0.19585;STB=0.594733,0.519796,0.5;STBP=0.754,0.65,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00981797,0.0138735,-0.0295692;OID=.,.,.;OPOS=46653037,46653038,46653038;OREF=AT,T,T;OALT=-,-,A;OMAPALT=A,AA,AAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0273973,0.479452,0:24,38,18:158:4,70,0:146:72:1,21,0:3,49,0:24:48:99:75:12,7,9:12,31,9:26:49
chr17	46670520	.	T	C	732.48	PASS	AF=0.947368;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=57;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00389746;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=197.464;QD=51.4023;RBI=0.0191746;REFB=-0.0288679;REVB=-0.0187743;RO=3;SAF=45;SAR=9;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290655;STB=0.515458;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00144601;OID=.;OPOS=46670520;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:57:57:3:3:54:54:0.947368:9:45:2:1:9:45:2:1
chr17	46684929	.	A	G	263.75	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0808919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.531;QD=26.3747;RBI=0.0827558;REFB=-0.0107623;REVB=0.017465;RO=16;SAF=8;SAR=16;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300653;STB=0.666528;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00535136;OID=.;OPOS=46684929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:16:8:12:4:16:8:12:4
chr17	46688256	.	T	C	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0543357;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.589;QD=51.1822;RBI=0.0546021;REFB=0;REVB=-0.00538641;RO=0;SAF=11;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000879708;OID=.;OPOS=46688256;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:9:11:0:0:9:11:0:0
chr17	46689679	.	GC	G,GA	116.64	PASS	AF=0.8,0;AO=2,10;DP=15;FAO=12,0;FDP=15;FR=.;FRO=3;FSAF=5,0;FSAR=7,0;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00443571,-0.0150232;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=262.076,257.914;QD=31.1043;RBI=0.0251863,0.0156616;REFB=-0.0346254,-0.0188555;REVB=0.0247926,0.00442581;RO=3;SAF=2,3;SAR=0,7;SRF=1;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.666583,-0.0160541;STB=0.517213,0.5;STBP=0.804,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00405266,0.0350736;OID=.,.;OPOS=46689680,46689680;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=G,GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.8,0:2,10:15:12,0:15:3:5,0:7,0:1:2:15:3:2,3:0,7:1:2
chr17	46842983	.	T	C	753.52	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0246482;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2297;QD=61.5118;RBI=0.0280944;REFB=-0.0702783;REVB=0.0134819;RO=1;SAF=39;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119136;STB=0.506326;STBP=0.65;TYPE=snp;VARB=0.00126779;OID=.;OPOS=46842983;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:9:39:1:0:9:39:1:0
chr17	46847364	.	C	A	105.48	PASS	AF=0.269231;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00357321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.4847;QD=8.11392;RBI=0.0240745;REFB=-0.00768179;REVB=0.0238078;RO=38;SAF=5;SAR=9;SRF=20;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.203576;STB=0.62482;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0290745;OID=.;OPOS=46847364;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:38:38:14:14:0.269231:9:5:20:18:9:5:20:18
chr17	46881748	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191319;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.93;QD=61.6838;RBI=0.0203723;REFB=0;REVB=0.00699998;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.98686e-05;OID=.;OPOS=46881748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr17	46894377	.	A	C	164.26	PASS	AF=0.391304;AO=17;DP=45;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=-0.0267155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.209;QD=14.2831;RBI=0.0318855;REFB=-0.0352151;REVB=-0.0174059;RO=26;SAF=7;SAR=10;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132375;STB=0.576838;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0668663;OID=.;OPOS=46894377;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:26:28:17:18:0.391304:10:7:14:12:10:8:16:12
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chr17	46926615	.	G	A	313.07	PASS	AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=4;FWDB=0.0242973;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.9031;QD=19.5666;RBI=0.0523875;REFB=-0.00548062;REVB=0.0464122;RO=31;SAF=24;SAR=9;SRF=27;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173365;STB=0.595279;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00656303;OID=.;OPOS=46926615;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:9:24:27:4:9:24:27:4
chr17	46934007	.	A	C	538.51	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525526;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3371;QD=59.8345;RBI=0.0682241;REFB=0;REVB=0.0435057;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000594831;OID=.;OPOS=46934007;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chr17	46939658	.	C	G	85.27	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=0.00170367;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=321.421;QD=11.3693;RBI=0.00537761;REFB=-0.00950214;REVB=-0.0051006;RO=19;SAF=8;SAR=3;SRF=14;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0128913;STB=0.507678;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0150438;OID=.;OPOS=46939658;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:3:8:14:5:3:8:14:5
chr17	46970836	.	A	G	1073.7	PASS	AF=1;AO=68;DP=70;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000403296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.016;QD=58.833;RBI=0.0485106;REFB=0;REVB=0.0485089;RO=1;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150024;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.5795e-05;OID=.;OPOS=46970836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:70:73:1:0:68:73:1:31:37:0:1:35:38:0:0
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chr17	46972479	.	ATCTC	A	182.7	PASS	AF=0.4;AO=20;DP=56;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.00651853;FXX=0.0350816;HRUN=1;LEN=4;MLLD=265.805;QD=13.2876;RBI=0.0168731;REFB=-0.0216695;REVB=0.0155631;RO=30;SAF=4;SAR=16;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359759;STB=0.693688;STBP=0.025;TYPE=del;VARB=0.0292823;OID=.;OPOS=46972480;OREF=TCTC;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:20:56:22:55:33:5:17:17:16:99:30:4:16:15:15
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chr17	47007963	.	C	T	209.13	PASS	AF=0.512195;AO=19;DP=39;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0107543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.702;QD=20.403;RBI=0.0178978;REFB=-0.033949;REVB=0.0143064;RO=20;SAF=12;SAR=7;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0679889;STB=0.565157;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0502902;OID=.;OPOS=47007963;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:41:20:20:19:21:0.512195:7:12:14:6:9:12:14:6
chr17	47014632	.	A	G	73.83	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0126857;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.294;QD=9.84367;RBI=0.032;REFB=-0.00138362;REVB=-0.0293781;RO=19;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0813642;STB=0.567431;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.00187778;OID=.;OPOS=47014632;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:19:20:10:10:0.333333:4:6:10:9:4:6:10:10
chr17	47014651	.	CT	C	165.39	PASS	AF=0.642857;AO=17;DP=29;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.00778562;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.99;QD=23.6266;RBI=0.0497429;REFB=-0.00447135;REVB=-0.0491298;RO=10;SAF=9;SAR=8;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471163;STB=0.535675;STBP=0.667;TYPE=del;VARB=0.00304894;OID=.;OPOS=47014652;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.642857:17:29:18:28:10:9:9:6:4:77:10:9:8:6:4
chr17	47014675	.	C	T	403.96	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.143;QD=55.7182;RBI=0.0190542;REFB=0;REVB=0.0128932;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461698;OID=.;OPOS=47014675;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:14:14:0:0:15:14:0:0
chr17	47026836	.	G	C	135.07	PASS	AF=0.46875;AO=15;DP=32;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.000431241;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.885;QD=16.8839;RBI=0.00816334;REFB=-0.0212442;REVB=0.00815195;RO=17;SAF=6;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121036;STB=0.569527;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0127398;OID=.;OPOS=47026836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:17:15:15:0.46875:9:6:9:8:9:6:9:8
chr17	47036042	.	C	A	167.31	PASS	AF=0.368421;AO=21;DP=57;FAO=21;FDP=57;FR=.;FRO=36;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.0385291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.176;QD=11.7413;RBI=0.0453473;REFB=-0.00579251;REVB=0.0239141;RO=36;SAF=14;SAR=7;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0345084;STB=0.519981;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0110367;OID=.;OPOS=47036042;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:36:36:21:21:0.368421:7:14:25:11:7:14:25:11
chr17	47039132	.	T	C	113.68	PASS	AF=0.565217;AO=12;DP=23;FAO=13;FDP=23;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00849558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.39;QD=19.7711;RBI=0.0444581;REFB=-0.0220211;REVB=-0.0436389;RO=10;SAF=9;SAR=3;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.144193;STB=0.545383;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0083683;OID=.;OPOS=47039132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:10:10:12:13:0.565217:3:9:6:4:4:9:6:4
chr17	47241604	.	T	C	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.925;QD=57.1052;RBI=0.0194152;REFB=0;REVB=-0.00427727;RO=0;SAF=18;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.85968e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.60952e-05;OID=.;OPOS=47241604;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:37:18:0:0:37:18:0:0
chr17	47297297	.	T	C	1774.21	PASS	AF=0.983333;AO=118;DP=120;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=56;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0404113;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=228.432;QD=59.1402;RBI=0.040412;REFB=0.0653171;REVB=-0.00023114;RO=2;SAF=56;SAR=62;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150731;STB=0.507935;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=-0.00011325;OID=.;OPOS=47297297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:120:120:2:2:118:118:0.983333:62:56:0:2:62:56:0:2
chr17	47300823	.	G	A	74.21	PASS	AF=0.344828;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=29;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.00501161;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=240.696;QD=10.2362;RBI=0.0201083;REFB=-0.00495602;REVB=0.0194738;RO=19;SAF=8;SAR=2;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759402;STB=0.545369;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0116915;OID=.;OPOS=47300823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:29:29:19:19:10:10:0.344828:2:8:16:3:2:8:16:3
chr17	47373417	.	T	C	174.08	PASS	AF=0.5;AO=18;DP=36;FAO=18;FDP=36;FR=.;FRO=18;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=6;FWDB=0.0238735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.655;QD=19.3427;RBI=0.101843;REFB=-0.0139279;REVB=0.0990056;RO=18;SAF=13;SAR=5;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0590125;STB=0.533544;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.0244099;OID=.;OPOS=47373417;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:18:18:18:18:0.5:5:13:12:6:5:13:12:6
chr17	47587819	.	C	T	1257.67	PASS	AF=0.988095;AO=76;DP=77;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0417901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.8279;QD=59.8889;RBI=0.0469427;REFB=-0.129231;REVB=0.0213825;RO=1;SAF=23;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00884626;STB=0.504672;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.000573455;OID=.;OPOS=47587819;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:84:1:1:76:83:0.988095:53:23:0:1:53:30:0:1
chr17	47888852	.	A	G	375.66	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.649;QD=55.6527;RBI=0.0723106;REFB=0;REVB=0.0546618;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0015585;OID=.;OPOS=47888852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
chr17	47903381	.	C	T	1113.14	PASS	AF=0.974359;AO=74;DP=76;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=51;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0160154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.129;QD=57.0843;RBI=0.0171165;REFB=0.00590037;REVB=0.00604004;RO=2;SAF=49;SAR=25;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0363451;STB=0.519226;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=4.43339e-07;OID=.;OPOS=47903381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:76:78:2:2:74:76:0.974359:25:49:0:2:25:51:0:2
chr17	48067439	.	G	A	150.0	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0670271;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.2052;QD=19.3543;RBI=0.067028;REFB=-0.00130702;REVB=0.000350442;RO=15;SAF=5;SAR=11;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0464188;STB=0.526284;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.00241586;OID=.;OPOS=48067439;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:11:5:4:11:11:5:4:11
chr17	48067953	.	T	C	264.46	PASS	AF=0.382716;AO=31;DP=81;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.0195389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.579;QD=13.0598;RBI=0.0559617;REFB=-0.0167783;REVB=0.0524399;RO=49;SAF=15;SAR=16;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0718647;STB=0.54687;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.0307323;OID=.;OPOS=48067953;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:49:50:31:31:0.382716:16:15:27:22:16:15:28:22
chr17	48070878	.	C	T	524.33	PASS	AF=0.46281;AO=56;DP=121;FAO=56;FDP=121;FR=.;FRO=65;FSAF=28;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=31;FWDB=-0.00846419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.641;QD=17.3333;RBI=0.0153481;REFB=-0.00682243;REVB=-0.0128032;RO=64;SAF=28;SAR=28;SRF=34;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.029981;STB=0.512392;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.00742585;OID=.;OPOS=48070878;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:64:65:56:56:0.46281:28:28:34:30:28:28:34:31
chr17	48167543	.	A	AC,C	30.1	PASS	AF=0.212121,0;AO=5,2;DP=33;FAO=7,0;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=4,0;FSAR=3,0;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.0262209,-0.055033;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,1;MLLD=17.1447,172.161;QD=3.64815;RBI=0.0296643,0.0559147;REFB=-0.0315146,-0.000913443;REVB=-0.0138722,-0.00989031;RO=26;SAF=3,1;SAR=2,1;SRF=7;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.381651,0.233393;STB=0.726722,0.5;STBP=0.228,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0930905,0;OID=.,.;OPOS=48167544,48167543;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:33:33:26:26:5,2:7,0:0.212121,0:2,1:3,1:7:19:3,0:4,0:7:19
chr17	48183471	.	G	A	310.26	PASS	AF=0.702703;AO=28;DP=39;FAO=26;FDP=37;FR=.;FRO=11;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.012605;FXX=0.0512689;HRUN=8;LEN=1;MLLD=178.261;QD=33.5416;RBI=0.0303165;REFB=-0.0149764;REVB=0.0275718;RO=10;SAF=14;SAR=14;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.242847;STB=0.657031;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.00610248;OID=.;OPOS=48183471;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:39:37:10:11:28:26:0.702703:14:14:10:0:14:12:11:0
chr17	48258140	.	T	C	803.4	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0310489;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.281;QD=55.407;RBI=0.0429625;REFB=-0.0145969;REVB=0.0296941;RO=1;SAF=37;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125779;STB=0.506664;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.000283827;OID=.;OPOS=48258140;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:20:37:1:0:20:37:1:0
chr17	48258321	.	C	T	330.39	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0105993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.988;QD=50.8286;RBI=0.0423955;REFB=0.085813;REVB=0.0410491;RO=1;SAF=20;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0226465;STB=0.512185;STBP=0.633;TYPE=snp;VARB=-0.00312076;OID=.;OPOS=48258321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:5:20:1:0:5:20:1:0
chr17	48262775	.	A	G	116.24	PASS	AF=1;AO=8;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102772;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=352.853;QD=42.2693;RBI=0.0201242;REFB=0;REVB=0.0173021;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000599891;OID=.;OPOS=48262775;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:8:11:1:6:2:0:0:8:3:0:0
chr17	48265495	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00272422;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.504;QD=37.4879;RBI=0.0278538;REFB=0;REVB=-0.0277203;RO=0;SAF=5;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00045212;OID=.;OPOS=48265495;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:3:5:0:0:3:5:0:0
chr17	48268223	.	A	G	723.61	PASS	AF=0.981132;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0260603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.342;QD=54.6124;RBI=0.0394117;REFB=-0.0499189;REVB=0.0295659;RO=1;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177719;STB=0.50943;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.00290709;OID=.;OPOS=48268223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:53:1:1:52:52:0.981132:26:26:0:1:26:26:0:1
chr17	48269903	.	A	G	1633.15	PASS	AF=1;AO=109;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.083966;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=107.134;QD=59.3873;RBI=0.0972582;REFB=0;REVB=0.0490803;RO=1;SAF=64;SAR=45;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0104317;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.46416e-05;OID=.;OPOS=48269903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:1:0:109:110:1:45:64:0:1:46:64:0:0
chr17	48276971	.	G	C	255.74	PASS	AF=0.446154;AO=28;DP=64;FAO=29;FDP=65;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=0.00147621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.321;QD=15.738;RBI=0.0161369;REFB=-0.0184398;REVB=-0.0160692;RO=36;SAF=16;SAR=12;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439225;STB=0.53295;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=0.0207017;OID=.;OPOS=48276971;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:65:36:36:28:29:0.446154:12:16:19:17:12:17:19:17
chr17	48356260	.	G	C	177.2	PASS	AF=0.37931;AO=22;DP=58;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=0.00935817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.157;QD=12.2206;RBI=0.016288;REFB=-0.0215967;REVB=0.0133313;RO=29;SAF=13;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1088;STB=0.574065;STBP=0.406;TYPE=snp;VARB=0.0285392;OID=.;OPOS=48356260;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:29:36:22:22:0.37931:9:13:14:15:9:13:17:19
chr17	48434610	.	G	A	156.43	PASS	AF=0.615385;AO=16;DP=26;FAO=16;FDP=26;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.00308277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.357;QD=24.0667;RBI=0.00745215;REFB=-0.0371839;REVB=0.00678462;RO=10;SAF=3;SAR=13;SRF=2;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0139096;STB=0.507803;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0320986;OID=.;OPOS=48434610;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:26:10:10:16:16:0.615385:13:3:2:8:13:3:2:8
chr17	48457722	.	G	C	568.06	PASS	AF=0.491803;AO=60;DP=122;FAO=60;FDP=122;FR=.;FRO=62;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=28;FSRR=34;FWDB=0.00548258;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=37.7578;QD=18.625;RBI=0.0635814;REFB=-0.0673179;REVB=0.0633446;RO=62;SAF=32;SAR=28;SRF=28;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0750276;STB=0.541471;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0663267;OID=.;OPOS=48457722;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:62:62:60:60:0.491803:28:32:28:34:28:32:28:34
chr17	48598785	.	G	A	392.29	PASS	AF=0.43617;AO=41;DP=95;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=25;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=26;FWDB=0.0392803;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.33;QD=16.693;RBI=0.0408615;REFB=-0.00700038;REVB=-0.0112571;RO=53;SAF=25;SAR=16;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102917;STB=0.557889;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0127052;OID=.;OPOS=48598785;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:94:53:53:41:41:0.43617:16:25:27:26:16:25:27:26
chr17	48599450	.	A	T	144.38	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.014407;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.818;QD=24.0639;RBI=0.0149463;REFB=0.0103109;REVB=0.00397897;RO=9;SAF=4;SAR=11;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550669;STB=0.530992;STBP=0.708;TYPE=snp;VARB=-0.00617735;OID=.;OPOS=48599450;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:24:24:9:9:15:15:0.625:11:4:3:6:11:4:3:6
chr17	48603503	.	C	T	84.79	PASS	AF=0.354839;AO=11;DP=31;FAO=11;FDP=31;FR=.;FRO=20;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0046015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.111;QD=10.9404;RBI=0.032199;REFB=-0.000865112;REVB=-0.0318685;RO=20;SAF=5;SAR=6;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00493524;STB=0.502953;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00117912;OID=.;OPOS=48603503;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:31:31:20:20:11:11:0.354839:6:5:9:11:6:5:9:11
chr17	48606537	.	C	G	164.48	PASS	AF=0.548387;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=31;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0366597;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.9037;QD=21.2235;RBI=0.0371561;REFB=0.00972585;REVB=-0.00605363;RO=13;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213792;STB=0.634174;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.00959951;OID=.;OPOS=48606537;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:13:14:17:17:0.548387:10:7:9:4:10:7:10:4
chr17	48607614	.	G	A	78.64	PASS	AF=0.47619;AO=10;DP=21;FAO=10;FDP=21;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0268395;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=265.636;QD=14.9787;RBI=0.0393905;REFB=-0.0400946;REVB=0.0288315;RO=11;SAF=2;SAR=8;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279975;STB=0.666296;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0372598;OID=.;OPOS=48607614;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:21:21:11:11:10:10:0.47619:8:2:5:6:8:2:5:6
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chr17	48610272	.	G	C	646.43	PASS	AF=0.533333;AO=52;DP=109;FAO=64;FDP=120;FR=.;FRO=56;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=40;FSRR=16;FWDB=-0.00265033;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.778;QD=21.5477;RBI=0.0390235;REFB=-0.0346738;REVB=0.0389334;RO=57;SAF=39;SAR=13;SRF=41;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0376576;STB=0.545441;STBP=0.372;TYPE=snp;VARB=0.0252965;OID=.;OPOS=48610272;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:120:57:56:52:64:0.533333:13:39:41:16:24:40:40:16
chr17	48613837	.	A	G	428.47	PASS	AF=0.411765;AO=49;DP=119;FAO=49;FDP=119;FR=.;FRO=70;FSAF=29;FSAR=20;FSRF=40;FSRR=30;FWDB=0.0115696;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.927;QD=14.4022;RBI=0.0116175;REFB=-0.0136533;REVB=0.00105397;RO=70;SAF=29;SAR=20;SRF=40;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219378;STB=0.512362;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.0202506;OID=.;OPOS=48613837;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:70:70:49:49:0.411765:20:29:40:30:20:29:40:30
chr17	48614248	.	T	C	346.81	PASS	AF=0.564516;AO=35;DP=62;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=9;FWDB=-0.0272147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.16;QD=22.375;RBI=0.102114;REFB=-0.00581141;REVB=-0.0984212;RO=26;SAF=14;SAR=21;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19576;STB=0.615319;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.00575477;OID=.;OPOS=48614248;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:26:27:35:35:0.564516:21:14:17:9:21:14:18:9
chr17	48625463	.	AC	AA,CA	56.84	PASS	AF=0.1,0.166667;AO=2,4;DP=29;FAO=3,5;FDP=30;FR=.;FRO=22;FSAF=1,2;FSAR=2,3;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0442905,0.020836;FXX=0.0322477;HRUN=6,1;LEN=1,2;MLLD=59.2108,80.3728;QD=7.57907;RBI=0.16532,0.0211778;REFB=-0.0820733,-0.124377;REVB=0.159276,0.00378944;RO=22;SAF=0,3;SAR=2,1;SRF=9;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.46253,0.378521;STB=0.570941,0.507662;STBP=0.9,0.997;TYPE=snp,mnp;VARB=0.021046,0.0349859;OID=.,.;OPOS=48625464,48625463;OREF=C,AC;OALT=A,CA;OMAPALT=AA,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:17:29:30:22:22:2,4:3,5:0.1,0.166667:2,1:0,3:9:13:2,3:1,2:9:13
chr17	48626506	.	C	T	37.15	PASS	AF=0.333333;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=18;FR=.;FRO=12;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0051767;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.535;QD=8.2558;RBI=0.00533894;REFB=-0.00531389;REVB=-0.00130616;RO=12;SAF=4;SAR=2;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181968;STB=0.61499;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.00907618;OID=.;OPOS=48626506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:12:12:6:6:0.333333:2:4:6:6:2:4:6:6
chr17	48629458	.	A	G	452.01	PASS	AF=0.48913;AO=45;DP=92;FAO=45;FDP=92;FR=.;FRO=47;FSAF=34;FSAR=11;FSRF=30;FSRR=17;FWDB=-0.0229884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5712;QD=19.6524;RBI=0.0985854;REFB=0.00503323;REVB=-0.0958677;RO=44;SAF=34;SAR=11;SRF=30;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0844626;STB=0.574844;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.0171642;OID=.;OPOS=48629458;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:44:47:45:45:0.48913:11:34:30:14:11:34:30:17
chr17	48653354	.	C	A	758.35	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0425751;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.162;QD=53.2174;RBI=0.04858;REFB=-0.0697323;REVB=0.0233961;RO=1;SAF=28;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165384;STB=0.517235;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.000732757;OID=.;OPOS=48653354;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:1:2:55:55:0.964912:27:28:1:0:27:28:2:0
chr17	48703915	.	A	AC	93.71	PASS	AF=0.272727;AO=25;DP=90;FAO=24;FDP=88;FR=.;FRO=64;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=50;FWDB=0.04182;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=31.2847;QD=4.25955;RBI=0.0726918;REFB=-0.0352012;REVB=-0.0594574;RO=62;SAF=17;SAR=8;SRF=16;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.474889;STB=0.863388;STBP=0;TYPE=ins;VARB=0.169977;OID=.;OPOS=48703916;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.272727:25:90:24:88:64:19:5:14:50:93:62:17:8:16:46
chr17	48712705	.	G	A	1201.28	PASS	AF=0.97561;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=82;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0571302;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=79.2217;QD=58.599;RBI=0.0797641;REFB=-0.132545;REVB=0.0556638;RO=0;SAF=44;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28538e-08;STB=0.51351;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00203159;OID=.;OPOS=48712705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:82:82:0:2:80:80:0.97561:36:44:0:0:36:44:0:2
chr17	48712711	.	C	G	1193.2	PASS	AF=0.975904;AO=80;DP=83;FAO=81;FDP=83;FR=.;FRO=2;FSAF=44;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0161189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.9621;QD=57.5037;RBI=0.0572709;REFB=-0.201132;REVB=0.0549557;RO=0;SAF=44;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.28538e-08;STB=0.513155;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00305619;OID=.;OPOS=48712711;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:83:83:0:2:80:81:0.975904:36:44:0:0:37:44:0:2
chr17	48761012	.	GCCCCCA	GCCCCAC	34.65	PASS	AF=0.833333;AO=2;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0972155;FXX=0;HRUN=5;LEN=2;MLLD=25.3358;QD=23.0993;RBI=0.0972155;REFB=-0.0790412;REVB=0;RO=1;SAF=2;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0410299;OID=.;OPOS=48761017;OREF=CA;OALT=AC;OMAPALT=GCCCCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.833333:2:6:5:6:1:5:0:1:0:6:1:2:0:1:0
chr17	48834080	.	A	G	50.74	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0176428;FXX=0;HRUN=27;LEN=1;MLLD=49.0843;QD=18.45;RBI=0.0182009;REFB=-0.00170385;REVB=0.00447295;RO=3;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2378;STB=0.567381;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0241788;OID=.;OPOS=48834080;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:10:11:3:4:7:7:0.636364:4:3:0:3:4:3:1:3
chr17	48917333	.	C	T	301.91	PASS	AF=0.402299;AO=33;DP=85;FAO=35;FDP=87;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.00851202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.149;QD=13.8807;RBI=0.0195859;REFB=-0.00855598;REVB=0.0176395;RO=49;SAF=19;SAR=14;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0909373;STB=0.565752;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=0.0173348;OID=.;OPOS=48917333;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:87:49:52:33:35:0.402299:14:19:24:25:15:20:24:28
chr17	48940422	.	T	C	728.14	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00602362;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.453;QD=57.1087;RBI=0.045002;REFB=0;REVB=0.044597;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000370889;OID=.;OPOS=48940422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0
chr17	49077038	.	A	AT	68.3	PASS	AF=0.361111;AO=5;DP=39;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=1;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.0051158;FXX=0.0769034;HRUN=0;LEN=1;MLLD=152.271;QD=7.5894;RBI=0.00915158;REFB=-0.000116804;REVB=-0.00758815;RO=34;SAF=0;SAR=5;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.63364;STB=0.883518;STBP=0.003;TYPE=ins;VARB=0.000209515;OID=.;OPOS=49077039;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.361111:5:39:13:36:23:1:12:13:10:68:34:0:5:17:17
chr17	49077039	.	C	T	81.62	PASS	AF=0.282051;AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=15;FWDB=-0.00745677;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.917;QD=8.37089;RBI=0.0310318;REFB=0.000191649;REVB=-0.0301226;RO=28;SAF=4;SAR=7;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121025;STB=0.574741;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=-0.00086843;OID=.;OPOS=49077039;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:39:39:28:28:11:11:0.282051:7:4:13:15:7:4:13:15
chr17	49350802	.	A	C	381.73	PASS	AF=0.5;AO=38;DP=78;FAO=39;FDP=78;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.00369113;FXX=0.0126566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=263.471;QD=19.576;RBI=0.0373597;REFB=-0.0194214;REVB=0.037177;RO=39;SAF=28;SAR=10;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205954;STB=0.600982;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0205919;OID=.;OPOS=49350802;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:39:39:38:39:0.5:10:28:21:18:11:28:21:18
chr17	51063068	.	A	G	210.71	PASS	AF=0.477273;AO=21;DP=44;FAO=21;FDP=44;FR=.;FRO=23;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0190797;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1366;QD=19.1558;RBI=0.0307058;REFB=-0.0160106;REVB=0.0240585;RO=23;SAF=13;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.092644;STB=0.552522;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0230643;OID=.;OPOS=51063068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:23:23:21:21:0.477273:8:13:12:11:8:13:12:11
chr17	51901084	.	A	G	159.25	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00533421;FXX=0.114253;HRUN=3;LEN=1;MLLD=250.282;QD=20.5489;RBI=0.00617369;REFB=-0.010824;REVB=0.00310815;RO=13;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00810966;STB=0.521712;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.00876531;OID=.;OPOS=51901084;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:31:13:15:16:16:0.516129:6:10:8:5:6:10:10:5
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chr17	53076799	.	G	A	117.6	PASS	AF=0.274194;AO=17;DP=62;FAO=17;FDP=62;FR=.;FRO=45;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=29;FWDB=0.00399986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.623;QD=7.58683;RBI=0.0303068;REFB=-0.00619456;REVB=-0.0300417;RO=45;SAF=4;SAR=13;SRF=16;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174865;STB=0.607341;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0139398;OID=.;OPOS=53076799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:45:45:17:17:0.274194:13:4:16:29:13:4:16:29
chr17	53076986	.	G	A	96.56	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.00791509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.6049;QD=13.795;RBI=0.0291113;REFB=-0.0437955;REVB=-0.0280146;RO=16;SAF=10;SAR=2;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129746;STB=0.576783;STBP=0.607;TYPE=snp;VARB=0.0255063;OID=.;OPOS=53076986;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:28:28:16:16:12:12:0.428571:2:10:12:4:2:10:12:4
chr17	53238728	.	G	A	777.74	PASS	AF=0.42233;AO=87;DP=206;FAO=87;FDP=206;FR=.;FRO=119;FSAF=43;FSAR=44;FSRF=71;FSRR=48;FWDB=0.0294615;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.617;QD=15.1017;RBI=0.078832;REFB=-0.000366146;REVB=0.0731198;RO=117;SAF=43;SAR=44;SRF=70;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106944;STB=0.559059;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.000682344;OID=.;OPOS=53238728;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:206:206:117:119:87:87:0.42233:44:43:70:47:44:43:71:48
chr17	53485186	.	C	T	31.6	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0726354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7926;QD=14.0435;RBI=0.0743004;REFB=-0.0216657;REVB=-0.0156411;RO=4;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0543107;STB=0.533194;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.0065521;OID=.;OPOS=53485186;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:1:4:3:1:1:4:3:1
chr17	53851228	.	C	T	1567.91	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0779672;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4692;QD=63.9965;RBI=0.0908039;REFB=0;REVB=0.0465453;RO=0;SAF=56;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000576182;OID=.;OPOS=53851228;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:42:56:0:0:42:56:0:0
chr17	54305255	.	C	CT,T	61.53	PASS	AF=0.315068,0.0136986;AO=14,3;DP=74;FAO=23,1;FDP=73;FR=.;FRO=49;FSAF=13,1;FSAR=10,0;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.20001,-0.019134;FXX=0;HRUN=7,1;LEN=1,1;MLLD=6.87304,258.338;QD=3.3713;RBI=0.29329,0.0226582;REFB=-0.0629754,0.003944;REVB=-0.214511,-0.0121362;RO=51;SAF=5,1;SAR=9,2;SRF=29;SRR=22;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.259053,-0.210802;STB=0.53768,0.989799;STBP=0.669,0.489;TYPE=ins,snp;VARB=0.0765623,0.0533031;OID=.,.;OPOS=54305256,54305255;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:74:73:51:49:14,3:23,1:0.315068,0.0136986:9,2:5,1:29:22:10,0:13,1:25:24
chr17	54450038	.	C	A	575.96	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00389073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=327.723;QD=60.6277;RBI=0.042108;REFB=0;REVB=0.0419278;RO=0;SAF=28;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.38917e-05;OID=.;OPOS=54450038;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:9:28:0:0:10:28:0:0
chr17	54450134	.	G	A	608.56	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.080174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.159;QD=60.8556;RBI=0.0804713;REFB=0;REVB=0.00691132;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222921;OID=.;OPOS=54450134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:19:20:0:0:19:21:0:0
chr17	54534634	.	G	A	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00334304;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.399;QD=54.517;RBI=0.103089;REFB=0;REVB=-0.103035;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000440877;OID=.;OPOS=54534634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
chr17	54672292	.	GGC	G,GG	702.95	PASS	AF=0.989899,0;AO=13,27;DP=98;FAO=98,0;FDP=99;FR=.;FRO=1;FSAF=57,0;FSAR=41,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.282057,-0.186339;FXX=0.0571374;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=13.0324,6.66812;QD=28.4019;RBI=0.284435,0.689845;REFB=-0.124715,-0.0573602;REVB=0.0367033,0.664202;RO=33;SAF=10,26;SAR=3,1;SRF=4;SRR=29;SSEN=0,0;SSEP=0,0.375;SSSB=0.664732,0.818882;STB=0.504347,0.5;STBP=0.493,1;TYPE=del,del;VARB=0.0120835,0;OID=.,.;OPOS=54672293,54672294;OREF=GC,C;OALT=-,-;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.989899,0:13,27:98:98,0:99:1:57,0:41,0:1:0:5:33:10,26:3,1:4:29
chr17	54921494	.	A	C	664.22	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210747;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.389;QD=61.7877;RBI=0.04338;REFB=0;REVB=0.0379167;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000371755;OID=.;OPOS=54921494;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:42:43:1:20:22:0:0:20:23:0:0
chr17	54978794	.	G	A	351.16	PASS	AF=0.474359;AO=37;DP=78;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=14;FWDB=0.00534208;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.775;QD=18.0082;RBI=0.00702196;REFB=-0.0271994;REVB=0.00455743;RO=41;SAF=27;SAR=10;SRF=27;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0810411;STB=0.545429;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.0305139;OID=.;OPOS=54978794;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:41:41:37:37:0.474359:10:27:27:14:10:27:27:14
chr17	55027850	.	T	C	296.81	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.05328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=101.265;QD=49.4676;RBI=0.0535707;REFB=-0.171641;REVB=0.00557284;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.526293;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00515779;OID=.;OPOS=55027850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:0:1:23:23:0.958333:14:9:0:0:14:9:1:0
chr17	55182811	.	CTT	CT,CTC	610.33	PASS	AF=0.98,0.02;AO=44,4;DP=50;FAO=49,1;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29,1;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.125575,0.0638853;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=19.4406,4.76216;QD=48.8263;RBI=0.137682,0.0802641;REFB=0,0;REVB=0.0564542,0.04859;RO=0;SAF=25,3;SAR=19,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000435898,0.132074;OID=.,.;OPOS=55182812,55182813;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=CT,CTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.98,0.02:44,4:50:49,1:50:0:29,1:20,0:0:0:5:0:25,3:19,1:0:0
chr17	55183203	.	T	C	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.915;QD=60.6096;RBI=0.0500125;REFB=0;REVB=0.0267286;RO=0;SAF=28;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000321289;OID=.;OPOS=55183203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:10:28:0:0:10:28:0:0
chr17	55183716	.	T	C	871.41	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00883455;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.2545;QD=58.0942;RBI=0.0233934;REFB=0;REVB=0.0216611;RO=0;SAF=46;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162053;OID=.;OPOS=55183716;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:14:46:0:0:14:46:0:0
chr17	55822171	.	T	C	184.39	PASS	AF=0.328767;AO=24;DP=73;FAO=24;FDP=73;FR=.;FRO=49;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.0199123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.77;QD=10.1034;RBI=0.03347;REFB=-0.0223914;REVB=-0.0269024;RO=49;SAF=12;SAR=12;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350777;STB=0.520531;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0492194;OID=.;OPOS=55822171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:49:49:24:24:0.328767:12:12:26:23:12:12:26:23
chr17	55822214	.	T	A	234.46	PASS	AF=0.325843;AO=29;DP=89;FAO=29;FDP=89;FR=.;FRO=60;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=25;FWDB=-0.00983107;FXX=0.0219756;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1895;QD=10.5375;RBI=0.0317644;REFB=-0.00663055;REVB=0.0302047;RO=54;SAF=13;SAR=16;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120182;STB=0.590254;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.00681049;OID=.;OPOS=55822214;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:54:60:29:29:0.325843:16:13:30:24:16:13:35:25
chr17	55822467	.	G	A	348.86	PASS	AF=0.408602;AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0281192;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.9364;QD=15.0049;RBI=0.0311643;REFB=0.00204997;REVB=0.0134358;RO=55;SAF=22;SAR=16;SRF=25;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130115;STB=0.573657;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=-0.00369488;OID=.;OPOS=55822467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:55:55:38:38:0.408602:16:22:25:30:16:22:25:30
chr17	56247101	.	C	A	561.19	PASS	AF=0.464567;AO=59;DP=128;FAO=59;FDP=127;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=35;FSRR=33;FWDB=0.00987033;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.907;QD=17.6752;RBI=0.0141319;REFB=-0.0142387;REVB=0.0101137;RO=67;SAF=26;SAR=33;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0642772;STB=0.539809;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.013811;OID=.;OPOS=56247101;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:127:67:68:59:59:0.464567:33:26:34:33:33:26:35:33
chr17	56382230	.	AGGGGC	AGGGCG	67.7	PASS	AF=0.189189;AO=11;DP=75;FAO=14;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=60;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=34;FWDB=-0.00379329;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=79.4005;QD=3.65972;RBI=0.0602072;REFB=-0.00643213;REVB=-0.0600875;RO=49;SAF=10;SAR=1;SRF=24;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.567838;STB=0.785306;STBP=0.034;TYPE=mnp;VARB=0.159608;OID=.;OPOS=56382234;OREF=GC;OALT=CG;OMAPALT=AGGGCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.189189:11:75:14:74:60:11:3:26:34:65:49:10:1:24:25
chr17	56382308	.	G	T	365.19	PASS	AF=0.636364;AO=35;DP=55;FAO=35;FDP=55;FR=.;FRO=20;FSAF=26;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.00329151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.226;QD=26.5591;RBI=0.0166641;REFB=0.00302609;REVB=0.0163358;RO=20;SAF=26;SAR=9;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255951;STB=0.640759;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=-0.00133279;OID=.;OPOS=56382308;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:20:20:35:35:0.636364:9:26:8:12:9:26:8:12
chr17	56382477	.	C	T	193.79	PASS	AF=0.328947;AO=25;DP=76;FAO=25;FDP=76;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.00615186;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.429;QD=10.1996;RBI=0.0126455;REFB=-0.0112966;REVB=-0.0110482;RO=48;SAF=9;SAR=16;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.16198;STB=0.615291;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0243048;OID=.;OPOS=56382477;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:48:51:25:25:0.328947:16:9:24:24:16:9:27:24
chr17	56383187	.	C	T	123.99	PASS	AF=0.56;AO=13;DP=24;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=9;FWDB=0.115133;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.5804;QD=19.8382;RBI=0.115669;REFB=0.00901524;REVB=0.01113;RO=11;SAF=4;SAR=9;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126109;STB=0.588119;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.000738942;OID=.;OPOS=56383187;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:25:11:11:13:14:0.56:9:4:2:9:9:5:2:9
chr17	56383690	.	G	A	180.91	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=16;FWDB=0.00577318;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=225.408;QD=12.9224;RBI=0.0184342;REFB=-0.00763202;REVB=-0.0175069;RO=33;SAF=8;SAR=14;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192285;STB=0.602554;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0155038;OID=.;OPOS=56383690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:33:34:22:22:0.392857:14:8:18:15:14:8:18:16
chr17	56383744	.	T	C	379.03	PASS	AF=0.541667;AO=38;DP=73;FAO=39;FDP=72;FR=.;FRO=33;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.0208429;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2042;QD=21.0575;RBI=0.0283399;REFB=-0.0294201;REVB=0.0192022;RO=31;SAF=21;SAR=17;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0823554;STB=0.538442;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.0240365;OID=.;OPOS=56383744;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:31:33:38:39:0.541667:17:21:14:17:18:21:15:18
chr17	56386118	.	A	G	826.46	PASS	AF=0.580153;AO=76;DP=132;FAO=76;FDP=131;FR=.;FRO=55;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=34;FSRR=21;FWDB=0.0301024;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.851;QD=25.2355;RBI=0.0310718;REFB=-0.0650271;REVB=0.00770082;RO=54;SAF=47;SAR=29;SRF=33;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00590112;STB=0.500106;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0496706;OID=.;OPOS=56386118;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:132:131:54:55:76:76:0.580153:29:47:33:21:29:47:34:21
chr17	56386358	.	T	A	1111.7	PASS	AF=0.542714;AO=108;DP=200;FAO=108;FDP=199;FR=.;FRO=91;FSAF=104;FSAR=4;FSRF=76;FSRR=15;FWDB=-0.00319704;FXX=0.0148508;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.056;QD=22.3458;RBI=0.0288696;REFB=-0.00199188;REVB=-0.0286921;RO=90;SAF=104;SAR=4;SRF=76;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.395421;STB=0.732878;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.00149048;OID=.;OPOS=56386358;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:200:199:90:91:108:108:0.542714:4:104:76:14:4:104:76:15
chr17	56388238	.	C	G	253.52	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=0.00410218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1569;QD=17.4841;RBI=0.0638617;REFB=-0.0106268;REVB=-0.0637298;RO=30;SAF=17;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100826;STB=0.556634;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0099632;OID=.;OPOS=56388238;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:11:17:15:15:11:17:15:15
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chr17	56448297	.	C	T	439.5	PASS	AF=0.623188;AO=24;DP=72;FAO=43;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=0.0503057;FXX=0.0416609;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0878;QD=25.4784;RBI=0.0503503;REFB=-0.0468022;REVB=-0.00211803;RO=26;SAF=19;SAR=5;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306557;STB=0.574435;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0111681;OID=.;OPOS=56448297;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:69:26:26:24:43:0.623188:5:19:20:6:18:25:20:6
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chr17	56585872	.	G	C	167.45	PASS	AF=0.333333;AO=22;DP=66;FAO=22;FDP=66;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.00505709;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.707;QD=10.1486;RBI=0.015062;REFB=-0.00590914;REVB=0.0141876;RO=44;SAF=8;SAR=14;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0813417;STB=0.547782;STBP=0.591;TYPE=snp;VARB=0.0142392;OID=.;OPOS=56585872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:44:44:22:22:0.333333:14:8:19:25:14:8:19:25
chr17	56598439	.	T	C	485.02	PASS	AF=0.546512;AO=46;DP=86;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=0.00471784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.161;QD=22.5592;RBI=0.0126246;REFB=-0.00162873;REVB=0.01171;RO=39;SAF=23;SAR=23;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11766;STB=0.55928;STBP=0.245;TYPE=snp;VARB=0.00198794;OID=.;OPOS=56598439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:39:39:46:47:0.546512:23:23:25:14:23:24:25:14
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chr17	56636854	.	T	C	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0431698;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=299.391;QD=63.2868;RBI=0.0493865;REFB=0;REVB=0.0239873;RO=0;SAF=24;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.67246e-05;OID=.;OPOS=56636854;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:22:24:0:0:22:24:0:0
chr17	56636908	.	T	C	80.87	PASS	AF=0.305556;AO=9;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.190544;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.5363;QD=8.98551;RBI=0.190931;REFB=-0.0515617;REVB=-0.0121364;RO=27;SAF=6;SAR=3;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180834;STB=0.680509;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.044408;OID=.;OPOS=56636908;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:80:36:36:27:25:9:11:0.305556:3:6:14:13:3:8:12:13
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chr17	56709169	.	A	G	146.34	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0468344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.737;QD=16.7243;RBI=0.0501112;REFB=-0.0114032;REVB=-0.0178235;RO=18;SAF=5;SAR=11;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234065;STB=0.649255;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0135011;OID=.;OPOS=56709169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:18:19:16:16:0.457143:11:5:10:8:11:5:11:8
chr17	56709172	.	G	A	146.37	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=-0.00839287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.322;QD=16.728;RBI=0.0264876;REFB=-0.0242377;REVB=-0.0251227;RO=19;SAF=5;SAR=11;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259379;STB=0.649255;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0245122;OID=.;OPOS=56709172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:19:16:16:0.457143:11:5:11:8:11:5:11:8
chr17	56738919	.	G	A	44.93	PASS	AF=0.304348;AO=7;DP=23;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0454325;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.4333;QD=7.81345;RBI=0.0509913;REFB=-0.00401481;REVB=0.0231516;RO=16;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.183097;STB=0.616089;STBP=0.455;TYPE=snp;VARB=0.0159773;OID=.;OPOS=56738919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:23:23:16:16:7:7:0.304348:2:5:9:7:2:5:9:7
chr17	56743948	.	G	A	99.37	PASS	AF=0.342105;AO=12;DP=36;FAO=13;FDP=38;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.00726883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0784;QD=10.4599;RBI=0.0525946;REFB=-0.00678124;REVB=-0.0520899;RO=24;SAF=7;SAR=5;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0481035;STB=0.540921;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.0159147;OID=.;OPOS=56743948;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:38:24:25:12:13:0.342105:5:7:15:9:6:7:15:10
chr17	56755092	.	TA	T,TC	167.99	PASS	AF=0.388889,0;AO=22,2;DP=55;FAO=21,0;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=15,0;FSAR=6,0;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.134707,-0.165932;FXX=0.0181785;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=23.2164,65.949;QD=12.4433;RBI=0.137019,0.166099;REFB=-0.0156637,0.00517565;REVB=-0.025064,0.00745329;RO=29;SAF=15,2;SAR=7,0;SRF=21;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0497246,0.380995;STB=0.509795,0.5;STBP=0.943,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00701938,0;OID=.,.;OPOS=56755093,56755093;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=T,TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.388889,0:22,2:55:21,0:54:33:15,0:6,0:24:9:99:29:15,2:7,0:21:8
chr17	56756977	.	A	G	182.28	PASS	AF=0.365079;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=0.0448124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7994;QD=11.5731;RBI=0.0623658;REFB=0.00882855;REVB=0.0433744;RO=40;SAF=8;SAR=15;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.32447;STB=0.687173;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=-0.0080901;OID=.;OPOS=56756977;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:40:40:23:23:0.365079:15:8:26:14:15:8:26:14
chr17	57059119	.	GAAA	GAA,GAAT	1327.4	PASS	AF=0.98913,0.0108696;AO=61,25;DP=92;FAO=91,1;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47,1;FSAR=44,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.114015,-0.0661564;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=23.3445,14.8984;QD=57.7133;RBI=0.137351,0.301905;REFB=0,0;REVB=-0.0765894,-0.294568;RO=0;SAF=40,4;SAR=21,21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.661e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0011909,-0.0182399;OID=.,.;OPOS=57059120,57059122;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=GAA,GAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.98913,0.0108696:61,25:92:91,1:92:0:47,1:44,0:0:0:3:0:40,4:21,21:0:0
chr17	57287454	.	A	G	373.18	PASS	AF=0.458824;AO=40;DP=86;FAO=39;FDP=85;FR=.;FRO=46;FSAF=31;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=0.018842;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.449;QD=17.5615;RBI=0.0203556;REFB=-0.0123929;REVB=-0.00770265;RO=45;SAF=32;SAR=8;SRF=25;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.288057;STB=0.667314;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0201024;OID=.;OPOS=57287454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:45:46:40:39:0.458824:8:32:25:20:8:31:25:21
chr17	57290383	.	G	A	293.62	PASS	AF=0.525424;AO=31;DP=59;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0140342;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.109;QD=19.9063;RBI=0.0147913;REFB=-0.0144444;REVB=-0.00467148;RO=28;SAF=15;SAR=16;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0137695;STB=0.507654;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0185689;OID=.;OPOS=57290383;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:28:28:31:31:0.525424:16:15:14:14:16:15:14:14
chr17	57477235	.	T	G	466.15	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0302785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6502;QD=58.2688;RBI=0.0302854;REFB=0;REVB=-0.000646149;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000170967;OID=.;OPOS=57477235;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:30:32:1:13:17:0:0:15:17:0:0
chr17	57477616	.	G	A	1410.94	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.753;QD=62.0195;RBI=0.0311572;REFB=0;REVB=0.0173238;RO=0;SAF=45;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.12023e-05;OID=.;OPOS=57477616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:86:91:0:0:86:91:1:41:45:0:0:43:48:0:0
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chr17	57951973	.	G	A	274.43	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=16;FWDB=-0.0770636;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.629;QD=24.3934;RBI=0.0780209;REFB=-0.0244511;REVB=-0.0121845;RO=20;SAF=9;SAR=16;SRF=4;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145851;STB=0.580585;STBP=0.252;TYPE=snp;VARB=0.0229646;OID=.;OPOS=57951973;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:45:20:20:25:25:0.555556:16:9:4:16:16:9:4:16
chr17	57963537	.	A	G	308.24	PASS	AF=0.627907;AO=25;DP=42;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=2;FWDB=0.0477512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.691;QD=28.6738;RBI=0.0563446;REFB=-0.023319;REVB=0.0299089;RO=16;SAF=17;SAR=8;SRF=14;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17025;STB=0.59253;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.012025;OID=.;OPOS=57963537;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:16:16:25:27:0.627907:8:17:14:2:9:18:14:2
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chr17	58031412	.	A	G	180.08	PASS	AF=0.580645;AO=18;DP=31;FAO=18;FDP=31;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00291937;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=294.091;QD=23.2362;RBI=0.00987441;REFB=-0.0239561;REVB=-0.00943299;RO=13;SAF=6;SAR=12;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161584;STB=0.590805;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0203635;OID=.;OPOS=58031412;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:13:13:18:18:0.580645:12:6:7:6:12:6:7:6
chr17	58179753	.	C	T	511.01	PASS	AF=0.454545;AO=55;DP=121;FAO=55;FDP=121;FR=.;FRO=66;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=43;FSRR=23;FWDB=-0.0102026;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.434;QD=16.8928;RBI=0.0488484;REFB=-0.00821776;REVB=-0.0477711;RO=65;SAF=22;SAR=33;SRF=42;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236658;STB=0.635131;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0136364;OID=.;OPOS=58179753;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:65:66:55:55:0.454545:33:22:42:23:33:22:43:23
chr17	58355629	.	C	T	155.94	PASS	AF=0.350877;AO=20;DP=57;FAO=20;FDP=57;FR=.;FRO=37;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=13;FWDB=-0.0918027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.6092;QD=10.943;RBI=0.0918906;REFB=-0.000689563;REVB=0.00401714;RO=37;SAF=4;SAR=16;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502545;STB=0.794029;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00025433;OID=.;OPOS=58355629;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:37:37:20:20:0.350877:16:4:24:13:16:4:24:13
chr17	58786625	.	A	G	1419.85	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0120778;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.5933;QD=61.7325;RBI=0.0377983;REFB=-0.108926;REVB=0.0358167;RO=0;SAF=64;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02153e-08;STB=0.509089;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00133485;OID=.;OPOS=58786625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:0:1:91:91:0.98913:27:64:0:0:27:64:0:1
chr17	58824567	.	T	C	776.06	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0902177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.3293;QD=56.441;RBI=0.102485;REFB=0;REVB=0.0486204;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00177374;OID=.;OPOS=58824567;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:54:55:1:29:25:0:0:29:26:0:0
chr17	59477903	.	C	A	64.07	PASS	AF=0.333333;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=0.0219538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.311;QD=9.49242;RBI=0.0349014;REFB=-0.0172973;REVB=-0.0271319;RO=18;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299589;STB=0.679637;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.034913;OID=.;OPOS=59477903;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:27:18:18:9:9:0.333333:4:5:5:13:4:5:5:13
chr17	59482166	.	C	G	224.95	PASS	AF=0.564103;AO=20;DP=38;FAO=22;FDP=39;FR=.;FRO=17;FSAF=21;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0305535;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.862;QD=23.0714;RBI=0.0692925;REFB=-0.0348728;REVB=-0.0621927;RO=18;SAF=19;SAR=1;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.478342;STB=0.755074;STBP=0.041;TYPE=snp;VARB=0.0142882;OID=.;OPOS=59482166;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:18:17:20:22:0.564103:1:19:13:5:1:21:13:4
chr17	59482169	.	C	G	221.78	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=21;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.00761187;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.232;QD=22.178;RBI=0.0391387;REFB=-0.0101846;REVB=-0.0383914;RO=13;SAF=21;SAR=1;SRF=10;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402001;STB=0.787133;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0127541;OID=.;OPOS=59482169;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:13:18:22:22:0.55:1:21:10:3:1:21:13:5
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chr17	59485555	.	C	T	138.85	PASS	AF=0.535714;AO=15;DP=28;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.00354472;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=120.297;QD=19.8355;RBI=0.00814107;REFB=-0.0207012;REVB=0.00732885;RO=13;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132271;STB=0.574782;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.0368546;OID=.;OPOS=59485555;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:13:13:15:15:0.535714:7:8:9:4:7:8:9:4
chr17	59760174	.	G	A	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.66;QD=60.6092;RBI=0.0216637;REFB=0;REVB=-0.00841085;RO=0;SAF=21;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81249e-05;OID=.;OPOS=59760174;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:17:21:0:0:17:21:0:0
chr17	59760996	.	A	G	357.69	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00946879;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.239;QD=55.0287;RBI=0.0656631;REFB=0;REVB=0.0649768;RO=0;SAF=10;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.71087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000446098;OID=.;OPOS=59760996;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:16:10:0:0:16:10:0:0
chr17	59763114	.	A	T	545.16	PASS	AF=0.973684;AO=36;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0168067;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.5144;QD=57.3852;RBI=0.0518653;REFB=-0.000440171;REVB=0.0490667;RO=2;SAF=23;SAR=13;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0147385;STB=0.518508;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.000689948;OID=.;OPOS=59763114;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:2:1:36:37:0.973684:13:23:1:1:13:24:0:1
chr17	59763347	.	A	G	866.09	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0368858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.232;QD=57.739;RBI=0.0415662;REFB=0;REVB=0.0191622;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.86776e-05;OID=.;OPOS=59763347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:60:0:0:57:60:1:25:32:0:0:26:34:0:0
chr17	59763465	.	T	C	766.42	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000346868;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.9;QD=63.8682;RBI=0.0336048;REFB=0;REVB=0.033603;RO=0;SAF=27;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113439;OID=.;OPOS=59763465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:21:27:0:0:21:27:0:0
chr17	59955426	.	T	G	854.13	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0124653;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.427;QD=56.0083;RBI=0.0149795;REFB=-0.117936;REVB=0.00830677;RO=1;SAF=36;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129304;STB=0.506847;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.000279382;OID=.;OPOS=59955426;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:24:36:1:0:24:36:1:0
chr17	59984988	.	C	T	227.82	PASS	AF=0.473684;AO=21;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=4;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.00721553;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.009;QD=15.9871;RBI=0.0179817;REFB=-0.00557142;REVB=0.0164705;RO=30;SAF=4;SAR=17;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200311;STB=0.651692;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.0168701;OID=.;OPOS=59984988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:21:27:0.473684:17:4:10:20:23:4:10:20
chr17	60040329	.	C	T	375.62	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0213667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.518;QD=55.6474;RBI=0.0221071;REFB=0;REVB=0.00567345;RO=0;SAF=8;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.27526e-05;OID=.;OPOS=60040329;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:19:8:0:0:19:8:0:0
chr17	60043884	.	G	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.875;QD=57.8844;RBI=0.0262451;REFB=0;REVB=-0.0203709;RO=0;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.38749e-06;OID=.;OPOS=60043884;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:33:27:0:0:33:27:0:0
chr17	60043929	.	T	C	902.58	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242371;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.615;QD=58.231;RBI=0.0372238;REFB=0;REVB=0.028252;RO=0;SAF=28;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.47594e-05;OID=.;OPOS=60043929;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:34:28:0:0:34:28:0:0
chr17	60083208	.	G	T	801.28	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0591279;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.9352;QD=57.2343;RBI=0.0602398;REFB=0;REVB=0.0115208;RO=0;SAF=22;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000322612;OID=.;OPOS=60083208;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:34:22:0:0:34:22:0:0
chr17	60345508	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0162084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.688;QD=42.1819;RBI=0.0349329;REFB=0;REVB=0.030945;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00030684;OID=.;OPOS=60345508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr17	60348325	.	G	A	1715.67	PASS	AF=1;AO=113;DP=114;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00462706;FXX=0.00877116;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.4751;QD=60.7317;RBI=0.0445745;REFB=0;REVB=0.0443336;RO=0;SAF=47;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000186887;OID=.;OPOS=60348325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:114:113:0:0:113:113:1:66:47:0:0:66:47:0:0
chr17	60351457	.	G	A	2540.16	PASS	AF=1;AO=163;DP=166;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=86;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500819;FXX=0.017963;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.342;QD=61.9551;RBI=0.0605332;REFB=0;REVB=-0.0340011;RO=0;SAF=85;SAR=78;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.22985e-05;OID=.;OPOS=60351457;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:166:164:0:0:163:164:1:78:85:0:0:78:86:0:0
chr17	60493386	.	A	G	46.29	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0698556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.985;QD=10.2874;RBI=0.0698988;REFB=0.00329372;REVB=0.00245672;RO=11;SAF=3;SAR=4;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116701;STB=0.571224;STBP=0.703;TYPE=snp;VARB=-0.00159161;OID=.;OPOS=60493386;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:4:3:6:5:4:3:6:5
chr17	60503892	.	A	G	109.05	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0306053;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.6651;QD=36.3488;RBI=0.0460447;REFB=-0.0950486;REVB=0.034401;RO=1;SAF=3;SAR=8;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127515;STB=0.571292;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00518795;OID=.;OPOS=60503892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:8:3:1:0:8:3:1:0
chr17	60599561	.	A	G	218.92	PASS	AF=0.397059;AO=26;DP=68;FAO=27;FDP=68;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=26;FSRR=15;FWDB=0.0287822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.4257;QD=12.8776;RBI=0.10028;REFB=-0.0152824;REVB=0.0960602;RO=41;SAF=14;SAR=12;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103857;STB=0.570125;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0258859;OID=.;OPOS=60599561;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:41:41:26:27:0.397059:12:14:26:15:13:14:26:15
chr17	60683503	.	A	G	1225.65	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230513;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.614;QD=61.2827;RBI=0.0484107;REFB=0;REVB=0.0425703;RO=0;SAF=38;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.42134e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.00889e-05;OID=.;OPOS=60683503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:78:80:1:40:38:0:0:41:39:0:0
chr17	60742279	.	C	T	70.79	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.014969;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.733;QD=7.26079;RBI=0.0171802;REFB=-0.000939459;REVB=0.00843141;RO=28;SAF=5;SAR=5;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169718;STB=0.615166;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.002549;OID=.;OPOS=60742279;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:28:29:10:10:0.25641:5:5:18:10:5:5:19:10
chr17	60753904	.	A	C	774.45	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0357718;FXX=0.0357079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0981;QD=57.3663;RBI=0.037393;REFB=0;REVB=-0.0108908;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000215389;OID=.;OPOS=60753904;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:20:34:0:0:20:34:0:0
chr17	60758273	.	G	C	302.51	PASS	AF=0.458333;AO=33;DP=73;FAO=33;FDP=72;FR=.;FRO=39;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=-0.0246318;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9732;QD=16.8063;RBI=0.0584157;REFB=0.00254046;REVB=-0.0529686;RO=40;SAF=14;SAR=19;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122734;STB=0.562092;STBP=0.335;TYPE=snp;VARB=-0.0047911;OID=.;OPOS=60758273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:40:39:33:33:0.458333:19:14:22:18:19:14:21:18
chr17	60766224	.	A	G	575.77	PASS	AF=0.558824;AO=57;DP=102;FAO=57;FDP=102;FR=.;FRO=45;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=21;FWDB=-0.0421186;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.7274;QD=22.5794;RBI=0.0434259;REFB=-0.0219615;REVB=-0.0105751;RO=44;SAF=31;SAR=26;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00127929;STB=0.504674;STBP=0.919;TYPE=snp;VARB=0.0125122;OID=.;OPOS=60766224;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:44:45:57:57:0.558824:26:31:24:20:26:31:24:21
chr17	60766892	.	T	TC	135.69	PASS	AF=0.415584;AO=31;DP=79;FAO=32;FDP=77;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=13;FSRR=32;FWDB=-0.0658153;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=55.9626;QD=7.04892;RBI=0.0659658;REFB=-0.0118514;REVB=0.00445306;RO=48;SAF=10;SAR=21;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0383015;STB=0.505491;STBP=0.949;TYPE=ins;VARB=0.158581;OID=.;OPOS=60766893;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.415584:31:79:32:77:45:9:23:13:32:99:48:10:21:14:34
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chr17	61564052	.	A	G	270.72	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=25;FWDB=-0.0137156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.69;QD=16.9203;RBI=0.0390401;REFB=-0.0204976;REVB=-0.0365515;RO=34;SAF=13;SAR=17;SRF=9;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.167445;STB=0.59342;STBP=0.206;TYPE=snp;VARB=0.0164527;OID=.;OPOS=61564052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:34:34:30:30:0.46875:17:13:9:25:17:13:9:25
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chr17	61607708	.	T	C	215.12	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0319724;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.769;QD=12.4709;RBI=0.0396829;REFB=-0.0275913;REVB=-0.0235053;RO=42;SAF=11;SAR=15;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0833333;STB=0.541118;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0535666;OID=.;OPOS=61607708;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:42:43:26:26:0.376812:15:11:21:21:15:11:21:22
chr17	61611423	.	T	C	207.97	PASS	AF=0.403226;AO=24;DP=60;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.00567277;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.414;QD=13.4173;RBI=0.00757524;REFB=-0.0102199;REVB=-0.00502035;RO=36;SAF=15;SAR=9;SRF=22;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154218;STB=0.503353;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0134967;OID=.;OPOS=61611423;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:62:36:37:24:25:0.403226:9:15:22:14:10:15:22:15
chr17	61771128	.	C	G	194.62	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00447934;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3941;QD=15.2641;RBI=0.0104168;REFB=-0.00728771;REVB=-0.00940455;RO=29;SAF=14;SAR=8;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203877;STB=0.511617;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.00969648;OID=.;OPOS=61771128;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:51:29:29:22:22:0.431373:8:14:19:10:8:14:19:10
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chr17	61838259	.	G	A	216.32	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.017033;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=86.9414;QD=22.1871;RBI=0.0688788;REFB=0.00851362;REVB=-0.0667396;RO=18;SAF=11;SAR=10;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110708;STB=0.561985;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=-0.00391144;OID=.;OPOS=61838259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:10:11:7:11:10:11:7:11
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chr17	61901197	.	T	A	267.2	PASS	AF=0.631579;AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=0.00490865;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.381;QD=28.1266;RBI=0.0288441;REFB=-0.0166336;REVB=-0.0284234;RO=14;SAF=13;SAR=11;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117484;STB=0.56468;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00885335;OID=.;OPOS=61901197;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:14:14:24:24:0.631579:11:13:10:4:11:13:10:4
chr17	61903445	.	G	C	678.21	PASS	AF=0.515385;AO=66;DP=129;FAO=67;FDP=130;FR=.;FRO=63;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=23;FSRR=40;FWDB=-0.0168244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.016;QD=20.868;RBI=0.0255825;REFB=0.000600702;REVB=-0.0192718;RO=63;SAF=39;SAR=27;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199062;STB=0.604345;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=-0.000482443;OID=.;OPOS=61903445;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:130:63:63:66:67:0.515385:27:39:23:40:28:39:23:40
chr17	61906846	.	T	C	162.76	PASS	AF=0.382979;AO=17;DP=45;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.0121579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.81;QD=13.8521;RBI=0.0131049;REFB=-0.0142731;REVB=0.00489137;RO=28;SAF=8;SAR=9;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674743;STB=0.523783;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.019514;OID=.;OPOS=61906846;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:47:28:29:17:18:0.382979:9:8:13:15:10:8:14:15
chr17	61908271	.	C	T	392.04	PASS	AF=0.44086;AO=41;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=42;FSRR=10;FWDB=-0.0194882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.776;QD=16.8619;RBI=0.0355142;REFB=-0.0156976;REVB=-0.0296896;RO=52;SAF=26;SAR=15;SRF=42;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199549;STB=0.61073;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0243236;OID=.;OPOS=61908271;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:52:52:41:41:0.44086:15:26:42:10:15:26:42:10
chr17	61908556	.	C	T	259.45	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=55;FAO=28;FDP=56;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0041102;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.583;QD=18.5324;RBI=0.0151984;REFB=-0.0226247;REVB=-0.0146321;RO=26;SAF=12;SAR=14;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0685819;STB=0.535689;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0392424;OID=.;OPOS=61908556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:26:28:26:28:0.5:14:12:14:12:15:13:15:13
chr17	61910167	.	G	A	739.14	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.409;QD=56.8565;RBI=0.0299003;REFB=0;REVB=0.0156576;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.62559e-05;OID=.;OPOS=61910167;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:52:0:0:49:52:1:21:28:0:0:23:29:0:0
chr17	62018773	.	T	C	777.14	PASS	AF=0.6;AO=72;DP=120;FAO=72;FDP=120;FR=.;FRO=48;FSAF=34;FSAR=38;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.000609925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.132;QD=25.9048;RBI=0.00190585;REFB=-0.0091601;REVB=-0.00180562;RO=48;SAF=34;SAR=38;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102598;STB=0.505575;STBP=0.893;TYPE=snp;VARB=0.00560619;OID=.;OPOS=62018773;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:48:48:72:72:0.6:38:34:22:26:38:34:22:26
chr17	62020348	.	T	C	265.4	PASS	AF=0.382716;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=81;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.00534924;FXX=0.0121936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.663;QD=13.1063;RBI=0.00706285;REFB=-0.0224004;REVB=0.00461189;RO=50;SAF=14;SAR=17;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0952167;STB=0.55446;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0454773;OID=.;OPOS=62020348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:81:50:50:31:31:0.382716:17:14:27:23:17:14:27:23
chr17	62028877	.	C	T	451.78	PASS	AF=0.352941;AO=25;DP=69;FAO=24;FDP=68;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=-0.00766319;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.026;QD=26.5756;RBI=0.00908705;REFB=-0.00958058;REVB=0.00488366;RO=24;SAF=18;SAR=7;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.212096;STB=0.64273;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0384559;OID=.;OPOS=62028877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:68:24:24:25:24:0.352941:7:18:12:12:6:18:12:12
chr17	62041068	.	T	C	2333.32	PASS	AF=0.993243;AO=146;DP=147;FAO=147;FDP=148;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0502894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.34;QD=63.0626;RBI=0.076437;REFB=-0.138324;REVB=0.0575639;RO=0;SAF=58;SAR=88;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.502824;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=0.00221243;OID=.;OPOS=62041068;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:147:148:0:1:146:147:0.993243:88:58:0:0:88:59:0:1
chr17	62079286	.	G	A	210.07	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=37;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.032325;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.172;QD=24.0076;RBI=0.0323314;REFB=-0.00624753;REVB=0.000640688;RO=14;SAF=12;SAR=8;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0898413;STB=0.530091;STBP=0.715;TYPE=snp;VARB=0.00673834;OID=.;OPOS=62079286;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:35:14:15:20:20:0.571429:8:12:10:4:8:12:10:5
chr17	62079334	.	A	G	83.48	PASS	AF=0.323529;AO=11;DP=34;FAO=11;FDP=34;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0913234;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.8694;QD=9.82152;RBI=0.0916299;REFB=-0.00542802;REVB=-0.00748798;RO=23;SAF=8;SAR=3;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151375;STB=0.592415;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0095164;OID=.;OPOS=62079334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:34:34:23:23:11:11:0.323529:3:8:14:9:3:8:14:9
chr17	62121480	.	T	A,C	713.63	PASS	AF=0.0434783,0.956522;AO=2,44;DP=47;FAO=2,44;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=0,27;FSAR=2,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017947,0.0089449;FXX=0.0212721;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=107.141,186.69;QD=62.0545;RBI=0.0419109,0.0729356;REFB=0,0;REVB=-0.0378738,0.072385;RO=0;SAF=0,27;SAR=2,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.54734e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0676345,0.000855527;OID=.,.;OPOS=62121480,62121480;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:47:46:0:0:2,44:2,44:0.0434783,0.956522:2,17:0,27:0:0:2,17:0,27:0:0
chr17	62125272	.	A	G	1433.96	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.118;QD=63.0313;RBI=0.0452289;REFB=0;REVB=0.0437934;RO=0;SAF=42;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.03926e-05;OID=.;OPOS=62125272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:89:91:0:0:89:91:1:47:42:0:0:49:42:0:0
chr17	62141455	.	A	G	1312.1	PASS	AF=0.988506;AO=85;DP=88;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0271777;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6036;QD=60.3266;RBI=0.0312107;REFB=-0.0734359;REVB=0.0153453;RO=1;SAF=44;SAR=41;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106453;STB=0.505493;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.00130543;OID=.;OPOS=62141455;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:88:87:1:1:85:86:0.988506:41:44:1:0:41:45:1:0
chr17	62223477	.	A	G	77.29	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=-0.0237101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.921;QD=13.4412;RBI=0.1134;REFB=-0.0154137;REVB=-0.110893;RO=13;SAF=7;SAR=3;SRF=12;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.299057;STB=0.670322;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0216623;OID=.;OPOS=62223477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:13:13:10:10:0.434783:3:7:12:1:3:7:12:1
chr17	62496064	.	T	C	219.82	PASS	AF=0.44;AO=22;DP=50;FAO=22;FDP=50;FR=.;FRO=28;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00197675;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=175.54;QD=17.5853;RBI=0.0233414;REFB=-0.0134454;REVB=0.0232576;RO=28;SAF=11;SAR=11;SRF=17;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10549;STB=0.559946;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0238856;OID=.;OPOS=62496064;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:28:22:22:0.44:11:11:17:11:11:11:17:11
chr17	62782689	.	T	C	1375.0	PASS	AF=0.968085;AO=88;DP=94;FAO=91;FDP=94;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=54;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0337756;FXX=0.0105252;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3046;QD=58.5107;RBI=0.0731099;REFB=-0.0614263;REVB=0.0648403;RO=3;SAF=36;SAR=52;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378597;STB=0.519476;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0146509;OID=.;OPOS=62782689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:94:94:3:3:88:91:0.968085:52:36:3:0:54:37:3:0
chr17	63532517	.	G	A	99.98	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=25;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00151001;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.3102;QD=15.9964;RBI=0.0432589;REFB=-0.0465036;REVB=0.0432325;RO=13;SAF=6;SAR=6;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345229;STB=0.519967;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0505327;OID=.;OPOS=63532517;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:13:13:12:12:0.48:6:6:6:7:6:6:6:7
chr17	63533768	.	G	A	120.37	PASS	AF=0.65;AO=13;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0322143;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=229.468;QD=24.0732;RBI=0.0561223;REFB=-0.040068;REVB=0.0459559;RO=7;SAF=8;SAR=5;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166666;STB=0.593087;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.0227736;OID=.;OPOS=63533768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:7:7:13:13:0.65:5:8:6:1:5:8:6:1
chr17	63533789	.	T	C	340.11	PASS	AF=1;AO=22;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181617;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.95;QD=54.4183;RBI=0.0627037;REFB=0;REVB=0.0600159;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000590565;OID=.;OPOS=63533789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:22:25:1:10:12:0:0:12:13:0:0
chr17	63534250	.	T	C	723.09	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.101;QD=56.7127;RBI=0.0700946;REFB=0;REVB=0.0685231;RO=0;SAF=37;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.32377e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000227107;OID=.;OPOS=63534250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:50:51:1:13:37:0:0:14:37:0:0
chr17	63554307	.	A	G	792.59	PASS	AF=0.458564;AO=82;DP=178;FAO=83;FDP=181;FR=.;FRO=98;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=67;FSRR=31;FWDB=-0.0378125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.1901;QD=17.5157;RBI=0.0379271;REFB=-0.0211654;REVB=-0.00294616;RO=96;SAF=46;SAR=36;SRF=65;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116843;STB=0.56582;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0189866;OID=.;OPOS=63554307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:178:181:96:98:82:83:0.458564:36:46:65:31:36:47:67:31
chr17	63822357	.	T	C	67.23	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=11;FWDB=-0.0263574;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.788;QD=11.6919;RBI=0.0937681;REFB=-0.0133734;REVB=-0.0899875;RO=14;SAF=7;SAR=2;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.540018;STB=0.819168;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0103187;OID=.;OPOS=63822357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:23:23:14:14:9:9:0.391304:2:7:3:11:2:7:3:11
chr17	64023624	.	T	C	603.35	PASS	AF=0.55;AO=55;DP=100;FAO=55;FDP=100;FR=.;FRO=45;FSAF=33;FSAR=22;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0133908;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=247.804;QD=24.1338;RBI=0.0169065;REFB=-0.00971694;REVB=-0.0103207;RO=41;SAF=33;SAR=22;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127171;STB=0.590328;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00776914;OID=.;OPOS=64023624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:41:45:55:55:0.55:22:33:18:23:22:33:18:27
chr17	64023642	.	A	G	303.67	PASS	AF=0.353535;AO=35;DP=100;FAO=35;FDP=99;FR=.;FRO=64;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=38;FSRR=26;FWDB=0.0136484;FXX=0.009999;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.545;QD=12.2696;RBI=0.0140106;REFB=-0.00890522;REVB=-0.00316503;RO=64;SAF=13;SAR=22;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247924;STB=0.642531;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0126182;OID=.;OPOS=64023642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:99:64:64:35:35:0.353535:22:13:38:26:22:13:38:26
chr17	64025331	.	A	G	257.26	PASS	AF=0.453125;AO=27;DP=64;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=-0.00676654;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.264;QD=16.0786;RBI=0.0158686;REFB=-0.0127114;REVB=0.0143536;RO=33;SAF=13;SAR=14;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0915618;STB=0.514029;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0196878;OID=.;OPOS=64025331;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:35:27:29:0.453125:14:13:19:14:14:15:19:16
chr17	64208230	.	G	A	1026.4	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0228952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.487;QD=59.5014;RBI=0.0232739;REFB=0;REVB=-0.0041812;RO=0;SAF=49;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.28744e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.13914e-05;OID=.;OPOS=64208230;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:20:49:0:0:20:49:0:0
chr17	64210757	.	C	A	159.83	PASS	AF=0.375;AO=17;DP=47;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=-0.00270693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6311;QD=13.3191;RBI=0.0126425;REFB=-0.0149143;REVB=0.0123493;RO=29;SAF=11;SAR=6;SRF=7;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.417327;STB=0.705543;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0176893;OID=.;OPOS=64210757;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:29:30:17:18:0.375:6:11:7:22:7:11:8:22
chr17	64783081	.	G	A	1226.75	PASS	AF=1;AO=80;DP=83;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0151015;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.002;QD=60.5803;RBI=0.0163125;REFB=0;REVB=-0.00616776;RO=1;SAF=34;SAR=46;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0101822;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000411432;OID=.;OPOS=64783081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:83:81:1:0:80:81:1:46:34:0:1:47:34:0:0
chr17	64785022	.	G	A	236.27	PASS	AF=0.481481;AO=26;DP=54;FAO=26;FDP=54;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.00480542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.654;QD=17.5012;RBI=0.0118851;REFB=-0.0294413;REVB=0.0108703;RO=28;SAF=12;SAR=14;SRF=21;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263316;STB=0.646953;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0242697;OID=.;OPOS=64785022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:28:28:26:26:0.481481:14:12:21:7:14:12:21:7
chr17	64801021	.	A	G	483.32	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.469;QD=58.5841;RBI=0.13051;REFB=0;REVB=0.0121706;RO=0;SAF=26;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.44409e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00123266;OID=.;OPOS=64801021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:7:26:0:0:7:26:0:0
chr17	65027740	.	G	C	145.24	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00777318;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=344.42;QD=44.6898;RBI=0.0127235;REFB=0;REVB=-0.010073;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.83925e-06;OID=.;OPOS=65027740;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:5:7:0:0:6:7:0:0
chr17	65066879	.	A	G	753.0	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00345973;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.113;QD=64.0854;RBI=0.0332862;REFB=0;REVB=0.0331059;RO=0;SAF=22;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.43628e-05;OID=.;OPOS=65066879;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:25:22:0:0:25:22:0:0
chr17	65104666	.	T	G	1011.35	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0448498;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.109;QD=57.7913;RBI=0.0458577;REFB=0.0177343;REVB=-0.00956169;RO=1;SAF=38;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0150047;STB=0.507934;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-2.94568e-05;OID=.;OPOS=65104666;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:31:38:0:1:31:38:0:1
chr17	65104743	.	G	A	1494.18	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0504654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.934;QD=63.5823;RBI=0.0787631;REFB=0;REVB=0.060472;RO=0;SAF=44;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166784;OID=.;OPOS=65104743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:88:94:0:0:88:94:1:44:44:0:0:50:44:0:0
chr17	65110436	.	A	G	412.76	PASS	AF=0.477273;AO=42;DP=87;FAO=42;FDP=88;FR=.;FRO=46;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=0.0241094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.634;QD=18.7618;RBI=0.0288749;REFB=-0.00217363;REVB=-0.0158902;RO=45;SAF=24;SAR=18;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0566629;STB=0.526303;STBP=0.674;TYPE=snp;VARB=0.00199064;OID=.;OPOS=65110436;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:45:46:42:42:0.477273:18:24:23:22:18:24:24:22
chr17	65362552	.	T	A	467.84	PASS	AF=0.426087;AO=47;DP=117;FAO=49;FDP=115;FR=.,HEALED;FRO=59;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=0.00937916;FXX=0.00861995;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.152;QD=16.2727;RBI=0.018102;REFB=-0.0395998;REVB=0.0154826;RO=46;SAF=23;SAR=24;SRF=34;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.223296;STB=0.562666;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.044869;OID=.;OPOS=65362552;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:115:46:59:47:49:0.426087:24:23:34:12:23:26:38:21
chr17	65404916	.	AAG	A	110.06	PASS	AF=0.484848;AO=15;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.0562418;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=34.5704;QD=13.3401;RBI=0.0979455;REFB=-0.0257678;REVB=0.0801884;RO=17;SAF=7;SAR=8;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00364105;STB=0.51722;STBP=0.843;TYPE=del;VARB=0.0318258;OID=.;OPOS=65404917;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.484848:15:33:16:33:17:7:9:8:9:99:17:7:8:8:9
chr17	65453288	.	C	T	356.54	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=14;FWDB=-0.0440537;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.0704;QD=19.2724;RBI=0.0486657;REFB=0.00685887;REVB=-0.0206791;RO=37;SAF=17;SAR=20;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144976;STB=0.580509;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=-0.0087554;OID=.;OPOS=65453288;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:20:17:23:14:20:17:23:14
chr17	65574283	.	A	G,T	913.85	PASS	AF=0.859155,0.084507;AO=60,6;DP=70;FAO=61,6;FDP=71;FR=.;FRO=4;FSAF=32,4;FSAR=29,2;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0237435,0.0179959;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=116.743,32.1419;QD=51.4847;RBI=0.036503,0.0235343;REFB=-0.0652576,-0.00370064;REVB=0.0277258,0.015166;RO=2;SAF=32,4;SAR=28,2;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.032518,0.284202;STB=0.501516,0.571183;STBP=0.907,0.714;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00311109,0.101907;OID=.,.;OPOS=65574283,65574283;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:25:70:71:2:4:60,6:61,6:0.859155,0.084507:28,2:32,4:0:2:29,2:32,4:2:2
chr17	65717525	.	T	C	708.5	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.963;QD=62.978;RBI=0.0362148;REFB=0;REVB=0.0290582;RO=0;SAF=24;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129146;OID=.;OPOS=65717525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:21:24:0:0:21:24:0:0
chr17	65978851	.	T	G	741.25	PASS	AF=0.96;AO=48;DP=50;FAO=48;FDP=50;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0443445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3801;QD=59.2997;RBI=0.0769766;REFB=-0.0904711;REVB=0.0629203;RO=2;SAF=31;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119379;STB=0.506349;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.00187277;OID=.;OPOS=65978851;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:50:2:2:48:48:0.96:17:31:1:1:17:31:1:1
chr17	65988049	.	T	C	282.47	PASS	AF=0.476923;AO=31;DP=65;FAO=31;FDP=65;FR=.;FRO=34;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0081075;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.2778;QD=17.3828;RBI=0.0101095;REFB=-0.0310178;REVB=0.00603906;RO=34;SAF=19;SAR=12;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107816;STB=0.560489;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0326621;OID=.;OPOS=65988049;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:34:34:31:31:0.476923:12:19:17:17:12:19:17:17
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chr17	65989086	.	CCG	CC,C,GCC	149.13	PASS	AF=0,0.75,0;AO=5,5,4;DP=20;FAO=0,15,0;FDP=20;FR=.;FRO=5;FSAF=0,2,0;FSAR=0,13,0;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0872736,0.0453811,-0.0598228;FXX=0;HRUN=3,3,3;LEN=1,2,3;MLLD=18.2339,34.7309,87.7796;QD=29.8251;RBI=0.14529,0.265183,0.0738434;REFB=-0.0741405,-0.107059,0.00302134;REVB=0.116157,0.261271,-0.0432906;RO=6;SAF=0,2,0;SAR=5,3,4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.764618,-0.231237,-0.742829;STB=0.5,0.735474,0.5;STBP=1,0.009,1;TYPE=del,del,mnp;VARB=0,0.0537027,0;OID=.,.,.;OPOS=65989088,65989087,65989086;OREF=G,CG,CCG;OALT=-,-,GCC;OMAPALT=CC,C,GCC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:23:20:20:6:5:5,5,4:0,15,0:0,0.75,0:5,3,4:0,2,0:4:2:0,13,0:0,2,0:4:1
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chr17	66016096	.	C	T	168.68	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=0.106287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1006;QD=16.0646;RBI=0.106389;REFB=0.00377587;REVB=-0.00464513;RO=24;SAF=6;SAR=12;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213163;STB=0.622811;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=-0.00136447;OID=.;OPOS=66016096;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:24:24:18:18:0.428571:12:6:13:11:12:6:13:11
chr17	66039350	.	A	G	431.76	PASS	AF=0.444444;AO=48;DP=108;FAO=48;FDP=108;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=41;FSRR=19;FWDB=0.0461131;FXX=0.0181802;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9334;QD=15.991;RBI=0.0461869;REFB=0.00994632;REVB=0.00260985;RO=60;SAF=26;SAR=22;SRF=41;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144115;STB=0.580283;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=-0.0128979;OID=.;OPOS=66039350;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:60:60:48:48:0.444444:22:26:41:19:22:26:41:19
chr17	66246416	.	A	G	1026.41	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112998;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.535;QD=59.5018;RBI=0.0158747;REFB=0;REVB=0.0111499;RO=0;SAF=50;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.45441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.44216e-07;OID=.;OPOS=66246416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:19:50:0:0:19:50:0:0
chr17	66253095	.	T	A	382.8	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0265528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.809;QD=52.8004;RBI=0.0268799;REFB=-0.187924;REVB=0.00418046;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517229;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.00391346;OID=.;OPOS=66253095;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:0:1:28:28:0.965517:14:14:0:0:14:14:0:1
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chr17	66342985	.	G	T	436.51	PASS	AF=0.518072;AO=43;DP=84;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=31;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=27;FWDB=0.000294995;FXX=0.0119033;HRUN=4;LEN=1;MLLD=276.652;QD=21.0365;RBI=0.0309034;REFB=-0.00679078;REVB=-0.030902;RO=40;SAF=31;SAR=12;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.353502;STB=0.695934;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.00655217;OID=.;OPOS=66342985;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:83:40:40:43:43:0.518072:12:31:13:27:12:31:13:27
chr17	66364749	.	T	C	322.23	PASS	AF=0.595745;AO=26;DP=46;FAO=28;FDP=47;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0186863;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.2609;QD=27.4236;RBI=0.0374136;REFB=0.0120624;REVB=-0.032413;RO=19;SAF=13;SAR=13;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020035;STB=0.510631;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=-0.00750878;OID=.;OPOS=66364749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:19:19:26:28:0.595745:13:13:9:10:14:14:9:10
chr17	66364804	.	T	C	416.65	PASS	AF=0.545455;AO=39;DP=76;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=-0.0149025;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.389;QD=21.6443;RBI=0.0177195;REFB=0.0149086;REVB=0.00958616;RO=33;SAF=21;SAR=18;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0194252;STB=0.504335;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.00965409;OID=.;OPOS=66364804;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:33:35:39:42:0.545455:18:21:17:16:20:22:18:17
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chr17	66522023	.	C	T	385.03	PASS	AF=0.465116;AO=40;DP=86;FAO=40;FDP=86;FR=.;FRO=46;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=17;FWDB=0.0123766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.5873;QD=17.9085;RBI=0.0127039;REFB=-0.00987478;REVB=0.00286531;RO=46;SAF=25;SAR=15;SRF=29;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00555673;STB=0.503104;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0115652;OID=.;OPOS=66522023;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:46:46:40:40:0.465116:15:25:29:17:15:25:29:17
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chr17	66533655	.	A	G	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411564;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.027;QD=57.712;RBI=0.0462439;REFB=0;REVB=-0.0210867;RO=0;SAF=40;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.7823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.79583e-05;OID=.;OPOS=66533655;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:19:40:0:0:19:40:0:0
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chr17	66539847	.	C	T	270.57	PASS	AF=0.413333;AO=31;DP=75;FAO=31;FDP=75;FR=.;FRO=44;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.00134548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9914;QD=14.4304;RBI=0.0398453;REFB=0.00650877;REVB=0.0398225;RO=43;SAF=14;SAR=17;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0852993;STB=0.554947;STBP=0.467;TYPE=snp;VARB=-0.00884107;OID=.;OPOS=66539847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:43:44:31:31:0.413333:17:14:23:20:17:14:24:20
chr17	66872802	.	G	C	1751.03	PASS	AF=0.991525;AO=116;DP=118;FAO=117;FDP=118;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=56;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0111296;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.0775;QD=59.3569;RBI=0.02705;REFB=-0.0897133;REVB=-0.0246543;RO=1;SAF=60;SAR=56;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00784965;STB=0.504064;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=0.000674635;OID=.;OPOS=66872802;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:118:118:1:1:116:117:0.991525:56:60:1:0:56:61:1:0
chr17	66880538	.	C	A,CA	50.76	PASS	AF=0.0136986,0.164384;AO=4,11;DP=75;FAO=1,12;FDP=73;FR=.;FRO=60;FSAF=0,5;FSAR=1,7;FSRF=27;FSRR=33;FWDB=-0.0438019,-0.0330428;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=1,1;MLLD=106.425,114.347;QD=2.78161;RBI=0.0504146,0.0427447;REFB=0.00304903,0.0010977;REVB=-0.0249605,-0.0271161;RO=59;SAF=1,8;SAR=3,3;SRF=24;SRR=35;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.165482,0.386235;STB=0.989085,0.528254;STBP=0.493,0.843;TYPE=snp,ins;VARB=0.0200376,0.0593232;OID=.,.;OPOS=66880538,66880539;OREF=C,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:41:75:73:59:60:4,11:1,12:0.0136986,0.164384:3,3:1,8:24:35:1,7:0,5:27:33
chr17	66985992	.	T	G	277.6	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=24;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.0177211;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=274.821;QD=20.5631;RBI=0.0206716;REFB=-0.00159799;REVB=0.0106432;RO=24;SAF=24;SAR=5;SRF=13;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.310613;STB=0.687879;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.000964332;OID=.;OPOS=66985992;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:24:25:29:29:0.537037:5:24:13:11:5:24:13:12
chr17	67028260	.	T	C	368.13	PASS	AF=0.443182;AO=39;DP=85;FAO=39;FDP=88;FR=.;FRO=49;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.017631;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.677;QD=16.7331;RBI=0.0541557;REFB=-0.00875227;REVB=-0.0512053;RO=45;SAF=16;SAR=23;SRF=27;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181054;STB=0.622276;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=0.0108168;OID=.;OPOS=67028260;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:88:45:49:39:39:0.443182:23:16:27:18:23:16:31:18
chr17	67031457	.	C	T	851.19	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5908;QD=57.7077;RBI=0.0472248;REFB=0;REVB=-0.0449864;RO=0;SAF=25;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000431333;OID=.;OPOS=67031457;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:34:25:0:0:34:25:0:0
chr17	67101718	.	C	T	786.91	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0389192;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.309;QD=55.2221;RBI=0.0402696;REFB=0.0315668;REVB=0.0103413;RO=1;SAF=25;SAR=31;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0149682;STB=0.507934;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=-0.00103195;OID=.;OPOS=67101718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:31:25:0:1:31:25:0:1
chr17	67160234	.	ATGGTTTTAT	A	127.34	PASS	AF=0.3125;AO=15;DP=52;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=0.00199729;FXX=0.039992;HRUN=1;LEN=9;MLLD=301.46;QD=10.6112;RBI=0.00244977;REFB=-0.0011268;REVB=0.00141852;RO=34;SAF=10;SAR=5;SRF=16;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230513;STB=0.647688;STBP=0.175;TYPE=del;VARB=0.0033115;OID=.;OPOS=67160235;OREF=TGGTTTTAT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.3125:15:52:15:48:33:10:5:15:18:99:34:10:5:16:18
chr17	67218762	.	T	C	457.36	PASS	AF=0.484211;AO=43;DP=92;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=0.00445718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=321.293;QD=19.2573;RBI=0.0177434;REFB=-0.0150274;REVB=0.0171745;RO=47;SAF=23;SAR=20;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0983726;STB=0.557579;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0175032;OID=.;OPOS=67218762;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:95:47:49:43:46:0.484211:20:23:30:17:22:24:31:18
chr17	67267317	.	T	C	483.3	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00917239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.454;QD=58.5823;RBI=0.0123978;REFB=0;REVB=0.00834108;RO=0;SAF=31;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.05502e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.73353e-05;OID=.;OPOS=67267317;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:2:31:0:0:2:31:0:0
chr17	67273882	.	C	A	1644.49	PASS	AF=1;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282512;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.4471;QD=60.3483;RBI=0.0355691;REFB=0;REVB=0.0216108;RO=0;SAF=63;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.61771e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157544;OID=.;OPOS=67273882;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:109:0:0:109:109:1:46:63:0:0:46:63:0:0
chr17	67982157	.	C	T	1264.67	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0135159;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.808;QD=61.6912;RBI=0.016571;REFB=0;REVB=0.00958743;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.3101e-06;OID=.;OPOS=67982157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:82:0:0:81:82:1:36:45:0:0:36:46:0:0
chr17	68174279	.	G	A	192.08	PASS	AF=0.416667;AO=20;DP=48;FAO=20;FDP=48;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.0391546;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.92;QD=16.0063;RBI=0.0391708;REFB=-0.030529;REVB=-0.00112756;RO=27;SAF=12;SAR=8;SRF=18;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709175;STB=0.548625;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0465749;OID=.;OPOS=68174279;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:27:28:20:20:0.416667:8:12:18:9:8:12:19:9
chr17	70943990	.	T	C	632.16	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.906;QD=61.6737;RBI=0.0508178;REFB=0;REVB=0.0461741;RO=0;SAF=20;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001346;OID=.;OPOS=70943990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:21:20:0:0:21:20:0:0
chr17	71166701	.	A	G	577.37	PASS	AF=0.597701;AO=52;DP=88;FAO=52;FDP=87;FR=.;FRO=35;FSAF=22;FSAR=30;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=0.0264201;FXX=0.0113623;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7843;QD=26.5457;RBI=0.0407159;REFB=-0.0166188;REVB=-0.0309801;RO=33;SAF=22;SAR=30;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228691;STB=0.513971;STBP=0.768;TYPE=snp;VARB=0.00974722;OID=.;OPOS=71166701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:33:35:52:52:0.597701:30:22:15:18:30:22:16:19
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chr17	71167133	.	T	C	107.59	PASS	AF=0.631579;AO=11;DP=19;FAO=12;FDP=19;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0618703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.8093;QD=22.65;RBI=0.0636749;REFB=-0.00775625;REVB=0.0150521;RO=7;SAF=2;SAR=9;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108456;STB=0.517212;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0109267;OID=.;OPOS=71167133;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:19:19:7:7:11:12:0.631579:9:2:2:5:9:3:2:5
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chr17	71192663	.	G	A	84.29	PASS	AF=0.34375;AO=11;DP=32;FAO=11;FDP=32;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=3;FWDB=-0.0377135;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3776;QD=10.5357;RBI=0.0487329;REFB=0.0112262;REVB=0.0308641;RO=21;SAF=8;SAR=3;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.202967;STB=0.618863;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=-0.0458261;OID=.;OPOS=71192663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:32:32:21:21:11:11:0.34375:3:8:18:3:3:8:18:3
chr17	71192873	.	A	G	144.75	PASS	AF=0.432432;AO=16;DP=37;FAO=16;FDP=37;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00156804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.51;QD=15.6481;RBI=0.0146374;REFB=-0.0142258;REVB=0.0145532;RO=21;SAF=7;SAR=9;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222638;STB=0.627753;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0134016;OID=.;OPOS=71192873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:21:21:16:16:0.432432:9:7:14:7:9:7:14:7
chr17	71196809	.	A	G	446.78	PASS	AF=0.457944;AO=49;DP=107;FAO=49;FDP=107;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=35;FWDB=0.0403855;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5165;QD=16.702;RBI=0.0416027;REFB=0.00401923;REVB=-0.00999007;RO=58;SAF=22;SAR=27;SRF=23;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518258;STB=0.528875;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.00553579;OID=.;OPOS=71196809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:58:58:49:49:0.457944:27:22:23:35:27:22:23:35
chr17	71197748	.	G	A	80.18	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0248808;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.3238;QD=16.8793;RBI=0.050922;REFB=-0.0306302;REVB=0.0444296;RO=9;SAF=4;SAR=6;SRF=8;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.38493;STB=0.71961;STBP=0.092;TYPE=snp;VARB=0.0283796;OID=.;OPOS=71197748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:6:4:8:1:6:4:8:1
chr17	71205854	.	A	G	132.47	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=29;FAO=15;FDP=30;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0185212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.189;QD=17.6624;RBI=0.107097;REFB=-0.0504827;REVB=-0.105483;RO=14;SAF=8;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1854;STB=0.599867;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0413788;OID=.;OPOS=71205854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:30:14:15:14:15:0.5:6:8:5:9:6:9:6:9
chr17	71232687	.	T	C	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.058016;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.723;QD=43.4862;RBI=0.0624109;REFB=0;REVB=0.0230056;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000507395;OID=.;OPOS=71232687;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:8:4:0:0:8:4:0:0
chr17	71232804	.	C	A	845.54	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0523628;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5077;QD=55.4452;RBI=0.0995427;REFB=0.0524016;REVB=-0.0846574;RO=0;SAF=41;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31043e-08;STB=0.506022;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=-0.00138247;OID=.;OPOS=71232804;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:61:0:1:60:60:0.983607:19:41:0:0:19:41:1:0
chr17	71232807	.	T	C	852.43	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.014716;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.316;QD=55.8969;RBI=0.051329;REFB=-0.0138357;REVB=-0.0491742;RO=1;SAF=41;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113736;STB=0.506022;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=-4.08117e-06;OID=.;OPOS=71232807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:19:41:1:0:19:41:1:0
chr17	71232881	.	G	C	1158.23	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.045775;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5014;QD=60.9597;RBI=0.0693363;REFB=0;REVB=0.0520785;RO=0;SAF=42;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00149435;OID=.;OPOS=71232881;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:76:0:0:75:76:1:33:42:0:0:34:42:0:0
chr17	71233130	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0720111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.098;QD=48.7361;RBI=0.0851966;REFB=0;REVB=0.0455287;RO=0;SAF=4;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113327;OID=.;OPOS=71233130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:13:4:0:0:13:4:0:0
chr17	71238433	.	G	A	1715.58	PASS	AF=1;AO=113;DP=115;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00795387;FXX=0.0173898;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2749;QD=60.7286;RBI=0.0212753;REFB=0;REVB=0.0197325;RO=0;SAF=67;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40416e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.43242e-06;OID=.;OPOS=71238433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:115:113:0:0:113:113:1:46:67:0:0:46:67:0:0
chr17	71239214	.	GAA	GTT	658.48	PASS	AF=1;AO=35;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135052;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=198.47;QD=62.7124;RBI=0.224329;REFB=0;REVB=0.179121;RO=0;SAF=22;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00897976;OID=.;OPOS=71239215;OREF=AA;OALT=TT;OMAPALT=GTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:35:42:42:42:0:28:14:0:0:4:0:22:13:0:0
chr17	71239225	.	T	G	64.91	PASS	AF=0.290323;AO=11;DP=33;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=-0.00735848;FXX=0.0605877;HRUN=24;LEN=1;MLLD=111.29;QD=8.37552;RBI=0.00920212;REFB=0.00698844;REVB=0.00552555;RO=22;SAF=8;SAR=3;SRF=19;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217939;STB=0.675369;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=-0.00170651;OID=.;OPOS=71239225;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:33:31:22:22:11:9:0.290323:3:8:19:3:3:6:19:3
chr17	71239234	.	T	G	188.18	PASS	AF=0.642857;AO=19;DP=29;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.0132135;FXX=0.0344709;HRUN=24;LEN=1;MLLD=207.891;QD=26.8823;RBI=0.0151278;REFB=0.00829194;REVB=-0.00736574;RO=10;SAF=15;SAR=4;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111497;STB=0.545407;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=-0.000873114;OID=.;OPOS=71239234;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:29:28:10:10:19:18:0.642857:4:15:9:1:3:15:9:1
chr17	71244630	.	C	T	984.74	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00642423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.875;QD=58.7904;RBI=0.0271362;REFB=0;REVB=0.0263648;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.38929e-05;OID=.;OPOS=71244630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:31:35:0:0:31:36:0:0
chr17	71334473	.	G	A	271.7	PASS	AF=0.538462;AO=28;DP=52;FAO=28;FDP=52;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=19;FWDB=-0.00444877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=310.29;QD=20.8996;RBI=0.0130068;REFB=-0.0153206;REVB=-0.0122223;RO=24;SAF=7;SAR=21;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0474271;STB=0.526298;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.0103514;OID=.;OPOS=71334473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:24:24:28:28:0.538462:21:7:5:19:21:7:5:19
chr17	71365314	.	A	G	1713.11	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.241;QD=60.6411;RBI=0.0306237;REFB=0;REVB=0.0149621;RO=0;SAF=51;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31804e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.30529e-05;OID=.;OPOS=71365314;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:62:51:0:0:62:51:0:0
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chr17	71752500	.	C	CT	1435.95	PASS	AF=1;AO=98;DP=100;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288192;FXX=0.0297;HRUN=0;LEN=1;MLLD=209.759;QD=58.6101;RBI=0.0307927;REFB=0;REVB=0.0108465;RO=0;SAF=55;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.423e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=3.63995e-05;OID=.;OPOS=71752501;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:98:100:98:98:0:55:43:0:0:8:0:55:43:0:0
chr17	72209858	.	A	G	330.6	PASS	AF=0.589286;AO=33;DP=55;FAO=33;FDP=56;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=-0.147579;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.556;QD=23.6141;RBI=0.147971;REFB=0.00223971;REVB=-0.0107642;RO=22;SAF=8;SAR=25;SRF=3;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112395;STB=0.539854;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=-0.00289638;OID=.;OPOS=72209858;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:22:23:33:33:0.589286:25:8:3:19:25:8:4:19
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chr17	72308319	.	G	A	1176.73	PASS	AF=0.987342;AO=78;DP=79;FAO=78;FDP=79;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0152981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.8656;QD=59.5814;RBI=0.0347668;REFB=-0.127083;REVB=0.0312201;RO=1;SAF=46;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101798;STB=0.505375;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000638365;OID=.;OPOS=72308319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:79:79:1:1:78:78:0.987342:32:46:1:0:32:46:1:0
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chr17	72346855	.	T	C	470.1	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000670157;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.993;QD=58.7624;RBI=0.013826;REFB=0;REVB=-0.0138098;RO=0;SAF=22;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000509537;OID=.;OPOS=72346855;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:32:0:0:32:32:1:10:22:0:0:10:22:0:0
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chr17	72351761	.	A	G	1386.26	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=58;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0117397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.02;QD=62.304;RBI=0.0172058;REFB=0;REVB=0.0125785;RO=0;SAF=58;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.27681e-05;OID=.;OPOS=72351761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:89:0:0:86:89:1:28:58:0:0:31:58:0:0
chr17	72366695	.	C	A	728.93	PASS	AF=0.932203;AO=54;DP=59;FAO=55;FDP=59;FR=.;FRO=4;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.081323;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.2587;QD=49.4187;RBI=0.0842873;REFB=-0.131144;REVB=0.0221565;RO=4;SAF=24;SAR=30;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399221;STB=0.503104;STBP=0.912;TYPE=snp;VARB=0.00962218;OID=.;OPOS=72366695;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:59:59:4:4:54:55:0.932203:30:24:3:1:30:25:2:2
chr17	72368550	.	T	C	187.24	PASS	AF=0.411765;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=8;FSRR=22;FWDB=-0.01806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.8688;QD=14.6856;RBI=0.024621;REFB=0.0197658;REVB=-0.0167341;RO=30;SAF=10;SAR=11;SRF=8;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219784;STB=0.62489;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=-0.0149913;OID=.;OPOS=72368550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:30:30:21:21:0.411765:11:10:8:22:11:10:8:22
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chr17	72429927	.	G	A	264.96	PASS	AF=0.491525;AO=29;DP=59;FAO=29;FDP=59;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0507196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4213;QD=17.9635;RBI=0.0787019;REFB=-0.0352136;REVB=0.060179;RO=30;SAF=12;SAR=17;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284145;STB=0.65821;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0257583;OID=.;OPOS=72429927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:30:30:29:29:0.491525:17:12:22:8:17:12:22:8
chr17	72439700	.	T	G	144.42	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=263.053;QD=44.4368;RBI=0.0291471;REFB=0;REVB=0.017601;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124148;OID=.;OPOS=72439700;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:13:0:0:12:13:1:5:7:0:0:5:8:0:0
chr17	72439773	.	AGGGGGC	AGGG,AGGGC,AGGGGC,AGGGGCC	472.37	PASS	AF=0,0.313725,0.686275,0;AO=9,12,18,2;DP=50;FAO=0,16,35,0;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12,22,0;FSAR=0,4,13,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.194361,-0.162742,-0.312225,-0.018097;FXX=0.0377287;HRUN=5,5,5,5;LEN=3,2,1,1;MLLD=12.2292,11.7632,11.7525,4.68848;QD=37.0484;RBI=0.198881,0.163049,0.312778,0.0741731;REFB=0.205828,0.157768,0.111683,0.0281976;REVB=0.0421577,0.009999,0.0185899,-0.0719316;RO=2;SAF=9,9,8,1;SAR=0,3,10,1;SRF=1;SRR=1;SSEN=0.414179,0.414179,0.414179,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.803614,0.0812822,-0.0102827,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=del,del,del,snp;VARB=-0.00396471,0.0276343,-0.118595,0.0948513;OID=.,.,.,.;OPOS=72439777,72439774,72439774,72439778;OREF=GGC,GG,G,G;OALT=-,-,-,C;OMAPALT=AGGG,AGGGC,AGGGGC,AGGGGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.313725,0.686275,0:9,12,18,2:50:0,16,35,0:51:0:0,12,22,0:0,4,13,0:0:0:48:2:9,9,8,1:0,3,10,1:1:1
chr17	72439808	.	TG	T	268.56	PASS	AF=0.473118;AO=41;DP=93;FAO=44;FDP=93;FR=.;FRO=49;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=23;FWDB=-0.201328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.6971;QD=11.5509;RBI=0.213624;REFB=0.0177098;REVB=-0.0714296;RO=49;SAF=23;SAR=18;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298464;STB=0.52005;STBP=0.732;TYPE=del;VARB=-0.0279592;OID=.;OPOS=72439809;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.473118:41:93:44:93:49:25:19:26:23:99:49:23:18:26:23
chr17	72469958	.	A	G	1004.48	PASS	AF=0.591195;AO=94;DP=159;FAO=94;FDP=159;FR=.;FRO=65;FSAF=53;FSAR=41;FSRF=24;FSRR=41;FWDB=-0.0050533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8109;QD=25.2699;RBI=0.0286854;REFB=-0.0335775;REVB=-0.0282368;RO=65;SAF=53;SAR=41;SRF=24;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146035;STB=0.579218;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0246466;OID=.;OPOS=72469958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:159:159:65:65:94:94:0.591195:41:53:24:41:41:53:24:41
chr17	72584764	.	C	T	492.47	PASS	AF=0.54023;AO=47;DP=86;FAO=47;FDP=87;FR=.;FRO=40;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=-0.00227151;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8285;QD=22.6421;RBI=0.0222889;REFB=-0.00764845;REVB=-0.0221728;RO=38;SAF=15;SAR=32;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261328;STB=0.634088;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00678598;OID=.;OPOS=72584764;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:38:40:47:47:0.54023:32:15:24:14:32:15:24:16
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chr17	72589114	.	C	G	209.65	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=70;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=19;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.0261891;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.458;QD=12.1535;RBI=0.0264528;REFB=-0.00941336;REVB=-0.00372582;RO=41;SAF=7;SAR=19;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347688;STB=0.688738;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0321251;OID=.;OPOS=72589114;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:41:43:26:26:0.376812:19:7:24:17:19:7:24:19
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chr17	72590267	.	T	C	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.018651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.732;QD=12.7821;RBI=0.0277119;REFB=-0.0186201;REVB=-0.020496;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.141152;STB=0.583171;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.033607;OID=.;OPOS=72590267;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:5:5:5:9:5:5:5:9
chr17	72700943	.	A	G	147.37	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=27;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=-0.026541;FXX=0.0714031;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.0958;QD=22.6729;RBI=0.0326991;REFB=-0.0290414;REVB=-0.0190999;RO=12;SAF=10;SAR=5;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0759351;STB=0.529373;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0228383;OID=.;OPOS=72700943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:27:26:12:11:15:15:0.576923:5:10:9:3:5:10:8:3
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chr17	72744798	.	G	C	52.92	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0507703;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.748;QD=21.1694;RBI=0.0508904;REFB=-0.0401256;REVB=-0.00349479;RO=3;SAF=6;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368547;STB=0.719257;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0118977;OID=.;OPOS=72744798;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:1:6:1:2:1:6:1:2
chr17	72773794	.	C	A	304.16	PASS	AF=0.574468;AO=27;DP=47;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.00535887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.252;QD=25.886;RBI=0.0172137;REFB=-0.020373;REVB=-0.0163583;RO=20;SAF=7;SAR=20;SRF=9;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171986;STB=0.595828;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0144225;OID=.;OPOS=72773794;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:20:20:27:27:0.574468:20:7:9:11:20:7:9:11
chr17	72784932	.	G	A	47.41	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00487426;FXX=0.0475964;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2387;QD=9.48152;RBI=0.0878464;REFB=-0.0147732;REVB=0.0877111;RO=13;SAF=6;SAR=1;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.473679;STB=0.79904;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0332163;OID=.;OPOS=72784932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:20:20:13:13:7:7:0.35:1:6:6:7:1:6:6:7
chr17	72834158	.	C	G	52.95	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.2724;QD=21.1814;RBI=0.0133422;REFB=-0.0104439;REVB=0.0133422;RO=3;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00527601;OID=.;OPOS=72834158;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:7:0:0:3:7:0:0:3
chr17	72838649	.	C	A	971.06	PASS	AF=0.48731;AO=96;DP=197;FAO=96;FDP=197;FR=.;FRO=101;FSAF=33;FSAR=63;FSRF=40;FSRR=61;FWDB=-0.00726821;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.153;QD=19.7169;RBI=0.00772234;REFB=-0.0208734;REVB=0.00260915;RO=101;SAF=33;SAR=63;SRF=40;SRR=61;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0528722;STB=0.529162;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0211824;OID=.;OPOS=72838649;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:197:197:101:101:96:96:0.48731:63:33:40:61:63:33:40:61
chr17	72838739	.	G	A	632.76	PASS	AF=0.529412;AO=63;DP=119;FAO=63;FDP=119;FR=.;FRO=56;FSAF=13;FSAR=50;FSRF=11;FSRR=45;FWDB=-0.0103986;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.547;QD=21.2692;RBI=0.0114006;REFB=-0.0127633;REVB=-0.00467374;RO=56;SAF=13;SAR=50;SRF=11;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0130916;STB=0.507185;STBP=0.921;TYPE=snp;VARB=0.0106951;OID=.;OPOS=72838739;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:56:56:63:63:0.529412:50:13:11:45:50:13:11:45
chr17	72851110	.	G	A	114.05	PASS	AF=0.52;AO=13;DP=25;FAO=13;FDP=25;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0289166;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.828;QD=18.2479;RBI=0.0695438;REFB=-0.046796;REVB=0.0632469;RO=11;SAF=10;SAR=3;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136262;STB=0.610503;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0239448;OID=.;OPOS=72851110;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:25:11:12:13:13:0.52:3:10:7:4:3:10:7:5
chr17	72851133	.	A	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0327361;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.183;QD=53.2771;RBI=0.0476566;REFB=0;REVB=0.0346338;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000788463;OID=.;OPOS=72851133;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr17	72860253	.	A	G	348.36	PASS	AF=0.375;AO=41;DP=111;FAO=42;FDP=112;FR=.;FRO=70;FSAF=14;FSAR=28;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.0271667;FXX=0.00884877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.691;QD=12.4414;RBI=0.0278285;REFB=-0.00274974;REVB=0.00603297;RO=69;SAF=14;SAR=27;SRF=37;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218562;STB=0.625706;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.00401966;OID=.;OPOS=72860253;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:112:69:70:41:42:0.375:27:14:37:32:28:14:37:33
chr17	72862593	.	C	T	609.03	PASS	AF=0.413174;AO=69;DP=167;FAO=69;FDP=167;FR=.;FRO=98;FSAF=44;FSAR=25;FSRF=42;FSRR=56;FWDB=-0.00566404;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=117.92;QD=14.5874;RBI=0.0330646;REFB=-0.0124928;REVB=0.0325759;RO=97;SAF=44;SAR=25;SRF=41;SRR=56;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225452;STB=0.623695;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0176155;OID=.;OPOS=72862593;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:167:167:97:98:69:69:0.413174:25:44:41:56:25:44:42:56
chr17	72889685	.	G	A	627.22	PASS	AF=0.583333;AO=33;DP=105;FAO=56;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=40;FSAF=51;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=39;FWDB=0.0667844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.636;QD=26.1342;RBI=0.0708585;REFB=-0.0367933;REVB=-0.0236806;RO=52;SAF=28;SAR=5;SRF=11;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.6505;STB=0.896015;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0042803;OID=.;OPOS=72889685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:96:52:40:33:56:0.583333:5:28:11:41:5:51:1:39
chr17	72889696	.	A	G	485.05	PASS	AF=0.597403;AO=46;DP=77;FAO=46;FDP=77;FR=.;FRO=31;FSAF=41;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=30;FWDB=-0.0828239;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.842;QD=25.1976;RBI=0.091084;REFB=-0.0280789;REVB=-0.037901;RO=31;SAF=41;SAR=5;SRF=1;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.676996;STB=0.872167;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0314353;OID=.;OPOS=72889696;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:31:31:46:46:0.597403:5:41:1:30:5:41:1:30
chr17	72927123	.	G	T	368.97	PASS	AF=0.933333;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=30;FR=.;FRO=2;FSAF=2;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00135283;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.684;QD=49.1956;RBI=0.0269866;REFB=-0.112699;REVB=0.0269527;RO=2;SAF=1;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0344541;STB=0.518506;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.000913916;OID=.;OPOS=72927123;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:30:2:2:27:28:0.933333:26:1:0:2:26:2:0:2
chr17	72937851	.	G	A	225.32	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0273887;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.1591;QD=20.4839;RBI=0.0326916;REFB=-0.0553789;REVB=-0.0178493;RO=22;SAF=17;SAR=5;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241631;STB=0.637364;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0490488;OID=.;OPOS=72937851;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:5:17:12:10:5:17:12:10
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chr17	72948369	.	A	G	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.168;QD=57.1762;RBI=0.0359945;REFB=0;REVB=0.034253;RO=0;SAF=27;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162294;OID=.;OPOS=72948369;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:24:27:0:0:24:27:0:0
chr17	72949146	.	C	T	392.7	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0271368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.119;QD=50.6707;RBI=0.0312702;REFB=-0.224943;REVB=0.0155375;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.53331;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.00298775;OID=.;OPOS=72949146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:0:2:29:29:0.935484:15:14:0:0:15:14:2:0
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chr17	73037868	.	C	G	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167677;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=331.814;QD=57.68;RBI=0.0356239;REFB=0;REVB=0.031431;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120659;OID=.;OPOS=73037868;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:9:22:0:0:9:22:0:0
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chr17	73059820	.	C	G	1397.8	PASS	AF=0.894737;AO=102;DP=114;FAO=102;FDP=114;FR=.;FRO=12;FSAF=49;FSAR=53;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.0450813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.949;QD=49.0455;RBI=0.0641658;REFB=-0.156605;REVB=0.0456609;RO=6;SAF=49;SAR=53;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155065;STB=0.510841;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.00250915;OID=.;OPOS=73059820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:114:114:6:12:102:102:0.894737:53:49:2:4:53:49:7:5
chr17	73060073	.	T	C	631.05	PASS	AF=0.941176;AO=47;DP=50;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0428048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.884;QD=49.4938;RBI=0.0568029;REFB=-0.102557;REVB=0.0373405;RO=0;SAF=10;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51898;STBP=0.465;TYPE=snp;VARB=0.0013745;OID=.;OPOS=73060073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:50:51:0:3:47:48:0.941176:37:10:0:0:38:10:0:3
chr17	73060111	.	G	A	563.79	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0217663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.772;QD=57.8245;RBI=0.0246857;REFB=0.048449;REVB=0.0116451;RO=1;SAF=4;SAR=34;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0135871;STB=0.507243;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=-0.00060112;OID=.;OPOS=73060111;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:34:4:0:1:34:4:0:1
chr17	73085975	.	G	A	492.1	PASS	AF=0.971429;AO=34;DP=35;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0134607;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.782;QD=56.2402;RBI=0.0360438;REFB=-0.112855;REVB=0.033436;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.521726;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.000903577;OID=.;OPOS=73085975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:35:35:0:1:34:34:0.971429:11:23:0:0:11:23:0:1
chr17	73127217	.	G	C	223.5	PASS	AF=0.617647;AO=20;DP=34;FAO=21;FDP=34;FR=.;FRO=13;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.010732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.6583;QD=26.2939;RBI=0.0810649;REFB=0.036733;REVB=0.0803514;RO=13;SAF=11;SAR=9;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10307;STB=0.547782;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=-0.0203934;OID=.;OPOS=73127217;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:13:13:20:21:0.617647:9:11:9:4:9:12:9:4
chr17	73221439	.	C	T	1274.54	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=86;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0330128;FXX=0.0232531;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.908;QD=60.6925;RBI=0.041627;REFB=-0.0158735;REVB=0.0253567;RO=1;SAF=30;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00885353;STB=0.504672;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=-2.14352e-06;OID=.;OPOS=73221439;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:84:1:1:83:83:0.988095:53:30:0:1:53:30:0:1
chr17	73222847	.	C	T	682.95	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0319989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.188;QD=62.086;RBI=0.0349656;REFB=0;REVB=0.0140949;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.55514e-05;OID=.;OPOS=73222847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:43:44:1:28:15:0:0:29:15:0:0
chr17	73222865	.	G	A	501.62	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024253;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=232.027;QD=59.0146;RBI=0.0256948;REFB=0;REVB=-0.00848597;RO=0;SAF=11;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.85771e-05;OID=.;OPOS=73222865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:23:11:0:0:23:11:0:0
chr17	73230856	.	C	T	1675.46	PASS	AF=0.958678;AO=115;DP=121;FAO=116;FDP=121;FR=.;FRO=5;FSAF=54;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.00351148;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.0459;QD=55.3871;RBI=0.0393163;REFB=-0.114703;REVB=0.0391592;RO=4;SAF=54;SAR=61;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301209;STB=0.519377;STBP=0.047;TYPE=snp;VARB=0.0025237;OID=.;OPOS=73230856;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:121:121:4:5:115:116:0.958678:61:54:0:4:62:54:0:5
chr17	73258479	.	C	T	1084.32	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00573745;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=263.41;QD=58.6117;RBI=0.050484;REFB=0.0156659;REVB=0.050157;RO=1;SAF=36;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0129584;STB=0.506847;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=2.28547e-05;OID=.;OPOS=73258479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:1:1:73:73:0.986486:37:36:1:0:37:36:1:0
chr17	73262989	.	C	T	72.26	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0394471;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.4858;QD=8.50124;RBI=0.0461736;REFB=-0.0188172;REVB=-0.0239985;RO=24;SAF=5;SAR=5;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0956655;STB=0.558707;STBP=0.663;TYPE=snp;VARB=0.0456598;OID=.;OPOS=73262989;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:34:34:24:24:10:10:0.294118:5:5:14:10:5:5:14:10
chr17	73268630	.	G	A	94.2	PASS	AF=0.461538;AO=10;DP=25;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.00172578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.978;QD=14.4925;RBI=0.00355388;REFB=-0.0158909;REVB=0.00310673;RO=14;SAF=2;SAR=8;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.455361;STB=0.785196;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.017905;OID=.;OPOS=73268630;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:25:26:14:14:10:12:0.461538:8:2:9:5:10:2:9:5
chr17	73269530	.	A	G	1245.35	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6537;QD=61.4989;RBI=0.0552963;REFB=0;REVB=-0.0492404;RO=0;SAF=36;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000448696;OID=.;OPOS=73269530;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:45:36:0:0:45:36:0:0
chr17	73269676	.	C	T	1101.93	PASS	AF=1;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0609768;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6821;QD=60.38;RBI=0.0639174;REFB=0;REVB=-0.0191639;RO=0;SAF=38;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.90268e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000132638;OID=.;OPOS=73269676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:73:0:0:73:73:1:35:38:0:0:35:38:0:0
chr17	73279624	.	A	G	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.358;QD=58.4192;RBI=0.0165822;REFB=0;REVB=-0.00579946;RO=0;SAF=24;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.93811e-05;OID=.;OPOS=73279624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:39:24:0:0:39:24:0:0
chr17	73315368	.	C	T	1105.77	PASS	AF=0.986667;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=75;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0350806;FXX=0.0131562;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.916;QD=58.9746;RBI=0.0445122;REFB=-0.0141989;REVB=0.0273987;RO=1;SAF=53;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.008844;STB=0.504672;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00241726;OID=.;OPOS=73315368;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:76:75:1:1:74:74:0.986667:21:53:1:0:21:53:1:0
chr17	73402246	.	C	A	101.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-7.67034e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.127;QD=40.7617;RBI=0.100125;REFB=0;REVB=-0.100125;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00262629;OID=.;OPOS=73402246;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr17	73488794	.	C	T	213.45	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=0.091916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.546;QD=16.1095;RBI=0.0941809;REFB=-0.0222494;REVB=-0.0205303;RO=29;SAF=12;SAR=12;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116742;STB=0.565984;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0255216;OID=.;OPOS=73488794;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:12:12:18:11:12:12:18:11
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chr17	73518203	.	G	C	215.56	PASS	AF=0.341772;AO=27;DP=79;FAO=27;FDP=79;FR=.;FRO=52;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=24;FSRR=28;FWDB=-0.0311026;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.301;QD=10.9144;RBI=0.0339778;REFB=-0.0285187;REVB=-0.0136792;RO=52;SAF=13;SAR=14;SRF=24;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0226344;STB=0.513148;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0484324;OID=.;OPOS=73518203;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:52:52:27:27:0.341772:14:13:24:28:14:13:24:28
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chr17	73519413	.	C	T	271.77	PASS	AF=0.418919;AO=31;DP=74;FAO=31;FDP=74;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0055242;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.1795;QD=14.6901;RBI=0.0317355;REFB=-0.0122397;REVB=0.031251;RO=43;SAF=19;SAR=12;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581561;STB=0.53301;STBP=0.664;TYPE=snp;VARB=0.0168791;OID=.;OPOS=73519413;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:43:43:31:31:0.418919:12:19:24:19:12:19:24:19
chr17	73552185	.	G	A	66.76	PASS	AF=0.346154;AO=9;DP=27;FAO=9;FDP=26;FR=.;FRO=17;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.0322271;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.8648;QD=10.2706;RBI=0.0598862;REFB=-0.0191298;REVB=0.0504754;RO=17;SAF=3;SAR=6;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0485249;STB=0.529348;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.045286;OID=.;OPOS=73552185;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:27:26:17:17:9:9:0.346154:6:3:5:12:6:3:5:12
chr17	73587268	.	C	T	118.85	PASS	AF=0.388889;AO=14;DP=36;FAO=14;FDP=36;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0162471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8736;QD=13.2052;RBI=0.0194092;REFB=0.00179767;REVB=0.0106183;RO=22;SAF=8;SAR=6;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0700618;STB=0.540926;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.00433363;OID=.;OPOS=73587268;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:22:22:14:14:0.388889:6:8:14:8:6:8:14:8
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chr17	73588058	.	G	T	358.09	PASS	AF=0.5625;AO=36;DP=64;FAO=36;FDP=64;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=9;FWDB=-0.030888;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.646;QD=22.3809;RBI=0.0334009;REFB=0.0128186;REVB=-0.0127104;RO=28;SAF=20;SAR=16;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100233;STB=0.55513;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=-0.011612;OID=.;OPOS=73588058;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:28:28:36:36:0.5625:16:20:19:9:16:20:19:9
chr17	73588067	.	A	G	399.11	PASS	AF=0.58209;AO=39;DP=67;FAO=39;FDP=67;FR=.;FRO=28;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0436817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.7244;QD=23.8274;RBI=0.051802;REFB=0.0192644;REVB=0.0278453;RO=28;SAF=20;SAR=19;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0993945;STB=0.554504;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=-0.0123374;OID=.;OPOS=73588067;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:28:28:39:39:0.58209:19:20:18:10:19:20:18:10
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chr17	73615983	.	G	A	156.08	PASS	AF=0.377358;AO=19;DP=52;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0683821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2336;QD=11.7796;RBI=0.0850216;REFB=-0.0280786;REVB=0.0505229;RO=31;SAF=13;SAR=6;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286432;STB=0.675496;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0936122;OID=.;OPOS=73615983;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:31:33:19:20:0.377358:6:13:13:18:6:14:14:19
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chr17	73625478	.	T	C	1624.4	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0440794;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=251.705;QD=60.1629;RBI=0.0442901;REFB=0;REVB=-0.00431495;RO=0;SAF=54;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.28751e-05;OID=.;OPOS=73625478;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:54:54:0:0:54:54:0:0
chr17	73627319	.	CT	CC,C	48.11	PASS	AF=0.0833333,0.291667;AO=2,6;DP=24;FAO=2,7;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=2,6;FSAR=0,1;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.0554382,-0.0245489;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=32.8145,21.0262;QD=8.01878;RBI=0.0661571,0.0364288;REFB=-0.0210838,-0.0279229;REVB=-0.0361023,0.0269148;RO=15;SAF=2,5;SAR=0,1;SRF=3;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.691135,0.633411;STB=0.997062,0.895582;STBP=0.019,0.035;TYPE=snp,del;VARB=0.0772903,0.0253113;OID=.,.;OPOS=73627320,73627320;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0833333,0.291667:2,6:24:2,7:24:15:2,6:0,1:3:12:34:15:2,5:0,1:3:12
chr17	73627565	.	A	G	1320.91	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0321523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.1166;QD=62.1606;RBI=0.0324553;REFB=0;REVB=0.0044244;RO=0;SAF=41;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.92022e-05;OID=.;OPOS=73627565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:44:41:0:0:44:41:0:0
chr17	73687495	.	G	A	244.81	PASS	AF=0.4375;AO=27;DP=65;FAO=28;FDP=64;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=5;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=-0.0192667;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.649;QD=15.3008;RBI=0.0435984;REFB=-0.028983;REVB=-0.0391103;RO=36;SAF=23;SAR=4;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.393382;STB=0.691822;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0326103;OID=.;OPOS=73687495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:64:36:36:27:28:0.4375:4:23:20:16:5:23:20:16
chr17	73698557	.	C	T	658.35	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0323168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.05;QD=59.8498;RBI=0.0351714;REFB=-0.128136;REVB=-0.0138798;RO=0;SAF=17;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75441e-08;STB=0.514279;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00107927;OID=.;OPOS=73698557;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:44:44:0:1:43:43:0.977273:26:17:0:0:26:17:1:0
chr17	73750859	.	C	G	206.97	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0566097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.045;QD=48.6993;RBI=0.0678358;REFB=0;REVB=-0.0373769;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174854;OID=.;OPOS=73750859;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
chr17	73753503	.	T	C,G	601.14	PASS	AF=0.95,0.05;AO=38,2;DP=40;FAO=38,2;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23,2;FSAR=15,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112348,-0.012713;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=161.766,113.995;QD=60.1142;RBI=0.0244076,0.0180083;REFB=0,0;REVB=-0.0216681,-0.0127545;RO=0;SAF=23,2;SAR=15,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000592854,0.101393;OID=.,.;OPOS=73753503,73753503;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:40:40:0:0:38,2:38,2:0.95,0.05:15,0:23,2:0:0:15,0:23,2:0:0
chr17	73773735	.	ACC	AC,ACA	815.17	PASS	AF=0.918033,0.0819672;AO=56,5;DP=61;FAO=56,5;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33,1;FSAR=23,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232895,0.018289;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=24.4493,8.84009;QD=53.4539;RBI=0.0738085,0.0556258;REFB=0,0;REVB=-0.0700378,-0.0525332;RO=0;SAF=33,1;SAR=23,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0101186,-0.088787;OID=.,.;OPOS=73773736,73773737;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=AC,ACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.918033,0.0819672:56,5:61:56,5:61:0:33,1:23,4:0:0:22:0:33,1:23,4:0:0
chr17	73819525	.	C	T	1888.5	PASS	AF=0.947761;AO=127;DP=134;FAO=127;FDP=134;FR=.;FRO=7;FSAF=58;FSAR=69;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0433686;FXX=0.00740686;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.571;QD=56.373;RBI=0.0470224;REFB=-0.146554;REVB=0.0181734;RO=7;SAF=58;SAR=69;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398308;STB=0.520997;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.00132758;OID=.;OPOS=73819525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:134:134:7:7:127:127:0.947761:69:58:6:1:69:58:6:1
chr17	73824121	.	T	C	3097.09	PASS	AF=1;AO=202;DP=203;FAO=202;FDP=202;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=93;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0397973;FXX=0.00492587;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.8495;QD=61.3284;RBI=0.041048;REFB=0.0511868;REVB=-0.0100559;RO=1;SAF=109;SAR=93;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00434995;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000396856;OID=.;OPOS=73824121;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:203:202:1:0:202:202:1:93:109:1:0:93:109:0:0
chr17	73827205	.	T	C	2362.8	PASS	AF=0.993631;AO=155;DP=158;FAO=156;FDP=157;FR=.;FRO=1;FSAF=92;FSAR=64;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0599891;FXX=0.00632871;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.156;QD=60.1987;RBI=0.0615132;REFB=0.0642533;REVB=0.013608;RO=1;SAF=91;SAR=64;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00519942;STB=0.502702;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-0.000139732;OID=.;OPOS=73827205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:158:157:1:1:155:156:0.993631:64:91:1:0:64:92:1:0
chr17	73831016	.	G	A	697.82	PASS	AF=0.962264;AO=51;DP=53;FAO=51;FDP=53;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00830059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.082;QD=52.6658;RBI=0.0222965;REFB=0.0208842;REVB=0.0206939;RO=2;SAF=27;SAR=24;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00209533;STB=0.501113;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=-0.000132984;OID=.;OPOS=73831016;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:53:53:2:2:51:51:0.962264:24:27:1:1:24:27:1:1
chr17	73836162	.	C	G	255.82	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0143874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.931;QD=51.1642;RBI=0.0206663;REFB=0;REVB=-0.0148357;RO=0;SAF=15;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.00629e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000885375;OID=.;OPOS=73836162;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:4:15:0:0:4:16:0:0
chr17	73839137	.	G	A	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0599579;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=242.181;QD=39.2068;RBI=0.0607313;REFB=0;REVB=-0.00966148;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000434628;OID=.;OPOS=73839137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr17	73918077	.	C	T	190.75	PASS	AF=0.3125;AO=25;DP=80;FAO=25;FDP=80;FR=.;FRO=55;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=31;FWDB=-0.0098254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.802;QD=9.53743;RBI=0.0111639;REFB=-0.00971439;REVB=-0.00530042;RO=53;SAF=9;SAR=16;SRF=22;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0674909;STB=0.55516;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0229872;OID=.;OPOS=73918077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:53:55:25:25:0.3125:16:9:22:31:16:9:24:31
chr17	73949540	.	G	C	928.95	PASS	AF=1;AO=49;DP=63;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0638;QD=58.0595;RBI=0.0141305;REFB=0;REVB=0.00286156;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000236715;OID=.;OPOS=73949540;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:64:0:0:49:64:1:29:20:0:0:31:33:0:0
chr17	73997474	.	G	A	474.09	PASS	AF=0.918919;AO=34;DP=37;FAO=34;FDP=37;FR=.;FRO=3;FSAF=23;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0101181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=129.972;QD=51.2528;RBI=0.0170637;REFB=-0.0021854;REVB=0.0137403;RO=2;SAF=23;SAR=11;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0389367;STB=0.530595;STBP=0.267;TYPE=snp;VARB=0.000109017;OID=.;OPOS=73997474;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:37:37:2:3:34:34:0.918919:11:23:2:0:11:23:3:0
chr17	74014628	.	G	A	1116.9	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0259294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.578;QD=60.3732;RBI=0.0379076;REFB=0;REVB=0.0276523;RO=0;SAF=36;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000336839;OID=.;OPOS=74014628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:38:36:0:0:38:36:0:0
chr17	74014668	.	T	C	747.04	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0449094;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3611;QD=63.5782;RBI=0.0784091;REFB=0;REVB=0.0642739;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00083883;OID=.;OPOS=74014668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:47:0:0:42:47:1:19:23:0:0:23:24:0:0
chr17	74017554	.	G	T	118.99	PASS	AF=0.246575;AO=18;DP=72;FAO=18;FDP=73;FR=.;FRO=55;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=17;FWDB=-0.00187543;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.426;QD=6.51975;RBI=0.0180526;REFB=-0.0117162;REVB=0.0179549;RO=54;SAF=8;SAR=10;SRF=37;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291168;STB=0.680292;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.0275923;OID=.;OPOS=74017554;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:54:55:18:18:0.246575:10:8:37:17:10:8:38:17
chr17	74017573	.	C	G	106.77	PASS	AF=0.220779;AO=17;DP=77;FAO=17;FDP=77;FR=.;FRO=60;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=-0.042253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.169;QD=5.54648;RBI=0.0423229;REFB=-0.00991383;REVB=-0.00243071;RO=58;SAF=7;SAR=10;SRF=37;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.27519;STB=0.66747;STBP=0.126;TYPE=snp;VARB=0.0375161;OID=.;OPOS=74017573;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:58:60:17:17:0.220779:10:7:37:21:10:7:38:22
chr17	74017594	.	A	G	66.44	PASS	AF=0.171429;AO=12;DP=70;FAO=12;FDP=70;FR=.;FRO=58;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=36;FSRR=22;FWDB=0.0141656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6462;QD=3.79629;RBI=0.0266419;REFB=-0.00472076;REVB=-0.0225639;RO=56;SAF=3;SAR=9;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.430549;STB=0.790089;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0173839;OID=.;OPOS=74017594;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:70:70:56:58:12:12:0.171429:9:3:34:22:9:3:36:22
chr17	74076415	.	G	A	494.62	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00214237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7034;QD=58.1902;RBI=0.0543879;REFB=0;REVB=0.0543457;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000871621;OID=.;OPOS=74076415;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:13:20:0:0:13:21:0:0
chr17	74076642	.	G	A	97.4	PASS	AF=1;AO=9;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288997;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.132;QD=38.9588;RBI=0.0392124;REFB=0;REVB=-0.0265032;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00271178;OID=.;OPOS=74076642;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:9:10:1:4:5:0:0:4:6:0:0
chr17	74275160	.	C	T	305.64	PASS	AF=0.533333;AO=32;DP=60;FAO=32;FDP=60;FR=.;FRO=28;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=6;FWDB=0.0493519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.339;QD=20.3762;RBI=0.0495781;REFB=0.0129395;REVB=-0.00473018;RO=28;SAF=19;SAR=13;SRF=22;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174505;STB=0.596141;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=-0.00909853;OID=.;OPOS=74275160;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:28:28:32:32:0.533333:13:19:22:6:13:19:22:6
chr17	74387284	.	C	T	479.35	PASS	AF=0.541176;AO=46;DP=85;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=-0.00175071;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.404;QD=22.5577;RBI=0.0161304;REFB=-0.0353574;REVB=0.0160351;RO=38;SAF=23;SAR=23;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0649305;STB=0.529399;STBP=0.562;TYPE=snp;VARB=0.0293916;OID=.;OPOS=74387284;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:38:39:46:46:0.541176:23:23:22:16:23:23:22:17
chr17	74467017	.	G	C	446.1	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0422776;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.178;QD=57.5611;RBI=0.0423945;REFB=0;REVB=0.00314626;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000247789;OID=.;OPOS=74467017;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:31:0:0:29:31:1:12:17:0:0:12:19:0:0
chr17	74475024	.	G	A	192.87	PASS	AF=0.894737;AO=17;DP=19;FAO=17;FDP=19;FR=.;FRO=2;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.015224;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=153.613;QD=40.605;RBI=0.123922;REFB=-0.0472047;REVB=0.122983;RO=2;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.091435;STB=0.549942;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.0019409;OID=.;OPOS=74475024;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:19:19:2:2:17:17:0.894737:9:8:0:2:9:8:0:2
chr17	74475975	.	C	A	869.3	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0624822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.241;QD=57.9531;RBI=0.15274;REFB=0;REVB=0.139376;RO=0;SAF=38;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000206481;OID=.;OPOS=74475975;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:60:0:0:58:60:1:20:38:0:0:21:39:0:0
chr17	74524651	.	TT	GG	109.03	PASS	AF=0.916667;AO=11;DP=12;FAO=11;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00541408;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=124.227;QD=36.3421;RBI=0.0340783;REFB=0.0343139;REVB=0.0336455;RO=1;SAF=9;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.177567;STB=0.599799;STBP=0.166;TYPE=mnp;VARB=-0.00208363;OID=.;OPOS=74524651;OREF=TT;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:12:12:1:1:11:11:0.916667:2:9:0:1:2:9:0:1
chr17	74541129	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.8377;QD=52.6125;RBI=0.0180376;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=22;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000344517;OID=.;OPOS=74541129;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:0:22:0:0:0:22:0:0
chr17	74652491	.	T	C	937.58	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.708;QD=58.5986;RBI=0.0292804;REFB=0;REVB=0.0163555;RO=0;SAF=40;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.12658e-05;OID=.;OPOS=74652491;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:24:40:0:0:24:40:0:0
chr17	74652501	.	AT	AA,TA	761.74	PASS	AF=0.0740741,0.925926;AO=4,46;DP=50;FAO=4,50;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=4,34;FSAR=0,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0866919,0.0849808;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=264.686,286.865;QD=56.4251;RBI=0.15086,0.106047;REFB=0,0;REVB=0.123464,0.0634362;RO=0;SAF=4,32;SAR=0,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.0709893,0.00502658;OID=.,.;OPOS=74652502,74652501;OREF=T,AT;OALT=A,TA;OMAPALT=AA,TA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:50:54:0:0:4,46:4,50:0.0740741,0.925926:0,14:4,32:0:0:0,16:4,34:0:0
chr17	74732507	.	A	G	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00874583;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.615;QD=58.0608;RBI=0.0222168;REFB=0;REVB=0.020423;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116063;OID=.;OPOS=74732507;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0
chr17	74733099	.	G	A	4596.34	PASS	AF=1;AO=286;DP=293;FAO=289;FDP=289;FR=.;FRO=0;FSAF=151;FSAR=138;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337734;FXX=0.0136514;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.665;QD=63.6172;RBI=0.049088;REFB=0.00189409;REVB=0.0356228;RO=1;SAF=151;SAR=135;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00314777;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.49228e-05;OID=.;OPOS=74733099;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:293:289:1:0:286:289:1:135:151:1:0:138:151:0:0
chr17	74846671	.	C	A	233.97	PASS	AF=0.435484;AO=26;DP=62;FAO=27;FDP=62;FR=.;FRO=35;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.0718834;FXX=0.0158705;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.265;QD=15.095;RBI=0.0741609;REFB=-0.00649954;REVB=-0.0182376;RO=35;SAF=14;SAR=12;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139025;STB=0.587125;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0207403;OID=.;OPOS=74846671;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:35:35:26:27:0.435484:12:14:14:21:12:15:14:21
chr17	74857676	.	A	G	1566.76	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00762347;FXX=0.0101;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.095;QD=63.9495;RBI=0.0230421;REFB=0;REVB=0.0217444;RO=0;SAF=47;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.29342e-05;OID=.;OPOS=74857676;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:97:98:1:50:47:0:0:51:47:0:0
chr17	74878259	.	G	A	585.1	PASS	AF=0.408537;AO=67;DP=163;FAO=67;FDP=164;FR=.;FRO=97;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=46;FSRR=51;FWDB=-0.00760009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.946;QD=14.2707;RBI=0.0283512;REFB=-0.0125784;REVB=0.0273135;RO=92;SAF=37;SAR=30;SRF=45;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654012;STB=0.546186;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0149916;OID=.;OPOS=74878259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:164:92:97:67:67:0.408537:30:37:45:47:30:37:46:51
chr17	74921129	.	C	T	213.93	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=13;FWDB=0.0320098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.02;QD=20.8715;RBI=0.0403505;REFB=-0.0224511;REVB=-0.0245669;RO=20;SAF=11;SAR=10;SRF=7;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150015;STB=0.584217;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0265407;OID=.;OPOS=74921129;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:10:11:7:13:10:11:7:13
chr17	74936576	.	G	A	251.52	PASS	AF=0.45;AO=26;DP=59;FAO=27;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=29;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00544794;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8059;QD=16.7677;RBI=0.0200898;REFB=-0.0358662;REVB=0.019337;RO=29;SAF=10;SAR=16;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.250466;STB=0.62654;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0355401;OID=.;OPOS=74936576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:60:29:29:26:27:0.45:16:10:19:10:16:11:19:10
chr17	74942478	.	C	T	589.86	PASS	AF=0.541284;AO=59;DP=109;FAO=59;FDP=109;FR=.;FRO=50;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.00120392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.153;QD=21.6461;RBI=0.00169181;REFB=-0.0142915;REVB=0.00118861;RO=49;SAF=24;SAR=35;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0518885;STB=0.52241;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.012513;OID=.;OPOS=74942478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:49:50:59:59:0.541284:35:24:17:32:35:24:18:32
chr17	75158104	.	C	T	698.59	PASS	AF=0.474359;AO=74;DP=156;FAO=74;FDP=156;FR=.;FRO=82;FSAF=43;FSAR=31;FSRF=43;FSRR=39;FWDB=0.0122709;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.389;QD=17.9126;RBI=0.0124576;REFB=-0.00958723;REVB=0.00214893;RO=71;SAF=43;SAR=31;SRF=41;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00330406;STB=0.530295;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=0.00927004;OID=.;OPOS=75158104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:156:71:82:74:74:0.474359:31:43:41:30:31:43:43:39
chr17	75158213	.	T	G	402.57	PASS	AF=0.436893;AO=45;DP=103;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.00210775;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=249.695;QD=15.6336;RBI=0.0115222;REFB=-0.0165229;REVB=-0.0113277;RO=58;SAF=22;SAR=23;SRF=26;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0408378;STB=0.522894;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.0264554;OID=.;OPOS=75158213;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:58:58:45:45:0.436893:23:22:26:32:23:22:26:32
chr17	75158261	.	C	G	746.88	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7403;QD=63.5646;RBI=0.0334471;REFB=0;REVB=-0.0279288;RO=0;SAF=22;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000330397;OID=.;OPOS=75158261;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:46:47:1:24:22:0:0:25:22:0:0
chr17	75190846	.	A	C	865.39	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.087;QD=57.6926;RBI=0.0973949;REFB=0;REVB=0.094557;RO=0;SAF=38;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.22967e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208666;OID=.;OPOS=75190846;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:21:38:0:0:21:39:0:0
chr17	75209657	.	A	T	141.34	PASS	AF=0.576923;AO=15;DP=26;FAO=15;FDP=26;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.0279098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.583;QD=21.7443;RBI=0.0297781;REFB=-0.0492992;REVB=-0.0103817;RO=11;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219625;STB=0.622885;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0322612;OID=.;OPOS=75209657;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:11:11:15:15:0.576923:7:8:9:2:7:8:9:2
chr17	75210054	.	C	T	247.33	PASS	AF=0.402778;AO=29;DP=72;FAO=29;FDP=72;FR=.;FRO=43;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=29;FSRR=14;FWDB=-0.00108049;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.255;QD=13.7403;RBI=0.0121618;REFB=-0.0291622;REVB=0.0121137;RO=43;SAF=19;SAR=10;SRF=29;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225031;STB=0.512812;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0316267;OID=.;OPOS=75210054;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:43:43:29:29:0.402778:10:19:29:14:10:19:29:14
chr17	75303298	.	T	C	1048.09	PASS	AF=0.986111;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=72;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=43;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0206952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.746;QD=58.227;RBI=0.0229123;REFB=-0.135115;REVB=0.00983285;RO=1;SAF=28;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165877;STB=0.508769;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0023164;OID=.;OPOS=75303298;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:72:72:1:1:71:71:0.986111:43:28:1:0:43:28:1:0
chr17	75401191	.	C	T	477.48	PASS	AF=0.452174;AO=52;DP=117;FAO=52;FDP=115;FR=.;FRO=63;FSAF=25;FSAR=27;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=0.00831037;FXX=0.0170926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.01;QD=16.6079;RBI=0.0236819;REFB=-0.02422;REVB=-0.0221759;RO=62;SAF=25;SAR=27;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012732;STB=0.511226;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.026074;OID=.;OPOS=75401191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:115:62:63:52:52:0.452174:27:25:29:33:27:25:29:34
chr17	75425078	.	G	C	1356.65	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000817917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.851;QD=62.3748;RBI=0.0401994;REFB=0;REVB=0.0401911;RO=0;SAF=39;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.10525e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.21375e-05;OID=.;OPOS=75425078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:87:0:0:82:87:1:43:39:0:0:48:39:0:0
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chr17	75425456	.	A	G	92.52	PASS	AF=0.4;AO=9;DP=26;FAO=10;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.0235929;FXX=0.0384468;HRUN=4;LEN=1;MLLD=186.927;QD=14.8025;RBI=0.0262744;REFB=-0.0296682;REVB=0.0115638;RO=10;SAF=5;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0498364;STB=0.578788;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0259901;OID=.;OPOS=75425456;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:26:25:10:13:9:10:0.4:4:5:5:5:4:6:6:7
chr17	75425863	.	G	A	61.6	PASS	AF=0.615385;AO=7;DP=12;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.0217842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323.072;QD=18.9537;RBI=0.0844524;REFB=-0.0342276;REVB=0.0815944;RO=5;SAF=5;SAR=2;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292301;STB=0.666323;STBP=0.272;TYPE=snp;VARB=0.021608;OID=.;OPOS=75425863;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:12:13:5:5:7:8:0.615385:2:5:5:0:3:5:5:0
chr17	75426630	.	T	C	92.22	PASS	AF=0.55;AO=11;DP=20;FAO=11;FDP=20;FR=.;FRO=9;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0481898;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7832;QD=18.4437;RBI=0.0561837;REFB=0.00387214;REVB=-0.0288851;RO=9;SAF=10;SAR=1;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.522722;STB=0.810104;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.00474994;OID=.;OPOS=75426630;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:9:9:11:11:0.55:1:10:4:5:1:10:4:5
chr17	75426849	.	A	G	94.56	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0717465;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.7704;QD=21.0133;RBI=0.0958922;REFB=0.0162824;REVB=-0.0636219;RO=7;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0178658;STB=0.510186;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=-0.0174948;OID=.;OPOS=75426849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:5:6:4:3:5:6:4:3
chr17	75441182	.	C	T	172.21	PASS	AF=0.310811;AO=23;DP=74;FAO=23;FDP=74;FR=.;FRO=51;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.00803142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.869;QD=9.30857;RBI=0.0127525;REFB=-0.0101131;REVB=-0.00990574;RO=47;SAF=9;SAR=14;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114159;STB=0.595661;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00904217;OID=.;OPOS=75441182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:47:51:23:23:0.310811:14:9:23:24:14:9:27:24
chr17	75442081	.	G	A	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0078627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.811;QD=11.9534;RBI=0.0110739;REFB=-0.00972292;REVB=0.00779801;RO=11;SAF=7;SAR=1;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.600034;STB=0.862071;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0125331;OID=.;OPOS=75442081;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:1:7:3:8:1:7:3:8
chr17	75442154	.	C	T	77.6	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=26;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=-0.0224331;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.32;QD=12.4163;RBI=0.0502529;REFB=-0.0140818;REVB=-0.0449679;RO=15;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.364728;STB=0.71611;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0267358;OID=.;OPOS=75442154;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:26:25:15:15:10:10:0.4:3:7:5:10:3:7:5:10
chr17	75442402	.	C	A	249.45	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.0447835;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.2756;QD=18.4781;RBI=0.0448268;REFB=-0.00445356;REVB=0.00196978;RO=27;SAF=14;SAR=13;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0989762;STB=0.555363;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.00792027;OID=.;OPOS=75442402;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:13:14:11:16:13:14:11:16
chr17	75443039	.	T	C	343.22	PASS	AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0474416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.487;QD=18.8067;RBI=0.0499303;REFB=-0.00370843;REVB=-0.0155669;RO=36;SAF=18;SAR=18;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749054;STB=0.534228;STBP=0.579;TYPE=snp;VARB=0.00369046;OID=.;OPOS=75443039;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:36:37:36:36:0.493151:18:18:21:15:18:18:21:16
chr17	75478481	.	C	T	699.08	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0560586;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=231.225;QD=54.8299;RBI=0.0560592;REFB=-0.0833977;REVB=-0.000276039;RO=0;SAF=26;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.10374e-08;STB=0.50943;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000198961;OID=.;OPOS=75478481;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:51:51:0:1:50:50:0.980392:24:26:0:0:24:26:1:0
chr17	75494705	.	A	G	1171.94	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.628;QD=60.8802;RBI=0.0601945;REFB=0;REVB=0.0537105;RO=0;SAF=35;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226558;OID=.;OPOS=75494705;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:42:35:0:0:42:35:0:0
chr17	75495065	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.21;QD=56.1916;RBI=0.0292752;REFB=0;REVB=0.0113532;RO=0;SAF=10;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.73945e-05;OID=.;OPOS=75495065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:18:10:0:0:18:10:0:0
chr17	75495397	.	T	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00408169;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.4769;QD=50.4121;RBI=0.0378979;REFB=0;REVB=0.0376775;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000645368;OID=.;OPOS=75495397;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr17	75496342	.	T	C	115.99	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.7436;QD=42.1798;RBI=0.0249156;REFB=0;REVB=-0.0249156;RO=0;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00120098;OID=.;OPOS=75496342;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:11:0:0:0:11:0:0:0
chr17	75496361	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.9345;QD=42.1821;RBI=0.00727656;REFB=0;REVB=0.00727656;RO=0;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000160744;OID=.;OPOS=75496361;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:11:0:0:0:11:0:0:0
chr17	75559019	.	C	T	251.11	PASS	AF=0.533333;AO=23;DP=45;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00449564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=300.849;QD=22.3212;RBI=0.0196138;REFB=-0.00314613;REVB=-0.0190916;RO=21;SAF=14;SAR=9;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0525437;STB=0.540507;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.00278645;OID=.;OPOS=75559019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:21:21:23:24:0.533333:9:14:14:7:10:14:14:7
chr17	76060866	.	C	G	1463.13	PASS	AF=0.979167;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.017688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.8965;QD=60.9636;RBI=0.019321;REFB=-0.0959032;REVB=-0.00777398;RO=1;SAF=47;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00998174;STB=0.510414;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=0.000972841;OID=.;OPOS=76060866;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:96:96:1:2:94:94:0.979167:47:47:0:1:47:47:0:2
chr17	76060954	.	A	C	727.71	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0080224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.8395;QD=63.2794;RBI=0.0121068;REFB=0;REVB=0.0090673;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.4346e-06;OID=.;OPOS=76060954;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:18:27:0:0:19:27:0:0
chr17	76063047	.	A	G	667.22	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0227871;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.328;QD=62.067;RBI=0.0746286;REFB=0;REVB=0.0710646;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000547999;OID=.;OPOS=76063047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0
chr17	76093866	.	T	C	747.04	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00482905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.3317;QD=63.5779;RBI=0.0327909;REFB=0;REVB=-0.0324333;RO=0;SAF=18;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000479073;OID=.;OPOS=76093866;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:29:18:0:0:29:18:0:0
chr17	76105731	.	C	T	1577.73	PASS	AF=0.981651;AO=107;DP=110;FAO=107;FDP=109;FR=.;FRO=2;FSAF=81;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00406681;FXX=0.00909008;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.912;QD=57.8984;RBI=0.0265414;REFB=-0.0453376;REVB=0.026228;RO=1;SAF=81;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0179016;STB=0.518515;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=3.51619e-05;OID=.;OPOS=76105731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:110:109:1:2:107:107:0.981651:26:81:0:1:26:81:0:2
chr17	76105754	.	G	A	1640.85	PASS	AF=0.990991;AO=109;DP=113;FAO=110;FDP=111;FR=.;FRO=1;FSAF=81;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0217688;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.022;QD=59.1297;RBI=0.0273632;REFB=-0.117612;REVB=0.016579;RO=1;SAF=80;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00589756;STB=0.503067;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.000532312;OID=.;OPOS=76105754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:113:111:1:1:109:110:0.990991:29:80:1:0:29:81:1:0
chr17	76113954	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0318449;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.324;QD=51.9167;RBI=0.0424276;REFB=0;REVB=0.0280358;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000486924;OID=.;OPOS=76113954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr17	76121864	.	A	G	251.64	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0188029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.784;QD=20.542;RBI=0.0227613;REFB=0.000435377;REVB=-0.0128268;RO=25;SAF=19;SAR=5;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260215;STB=0.648051;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-0.000982885;OID=.;OPOS=76121864;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:5:19:14:11:5:19:14:11
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chr17	76131070	.	G	A	489.04	PASS	AF=0.546512;AO=44;DP=85;FAO=47;FDP=86;FR=.;FRO=39;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.0134341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2959;QD=22.7459;RBI=0.033291;REFB=-0.0122558;REVB=0.0304601;RO=39;SAF=23;SAR=21;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146146;STB=0.573691;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0110828;OID=.;OPOS=76131070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:86:39:39:44:47:0.546512:21:23:27:12:22:25:27:12
chr17	76134828	.	C	A	157.69	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=17;FWDB=0.0446909;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.073;QD=16.1729;RBI=0.0571177;REFB=-0.0213795;REVB=-0.0355691;RO=21;SAF=8;SAR=9;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.230532;STB=0.63985;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0335781;OID=.;OPOS=76134828;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:21:22:17:17:0.435897:9:8:5:16:9:8:5:17
chr17	76157266	.	T	C	347.07	PASS	AF=0.607143;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0204979;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.293;QD=24.791;RBI=0.0269646;REFB=-0.034551;REVB=-0.0175193;RO=22;SAF=17;SAR=17;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0325182;STB=0.517847;STBP=0.772;TYPE=snp;VARB=0.0238171;OID=.;OPOS=76157266;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:22:22:34:34:0.607143:17:17:12:10:17:17:12:10
chr17	76157326	.	C	G	145.57	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=35;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0146234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.338;QD=16.1745;RBI=0.0166858;REFB=-0.0107078;REVB=-0.00803558;RO=19;SAF=7;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842285;STB=0.534921;STBP=0.662;TYPE=snp;VARB=0.00940426;OID=.;OPOS=76157326;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:19:20:16:16:0.444444:9:7:10:9:9:7:10:10
chr17	76178748	.	T	C	263.51	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.105004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.69;QD=19.5189;RBI=0.105041;REFB=-0.0141672;REVB=0.00276607;RO=26;SAF=8;SAR=20;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0229464;STB=0.512811;STBP=0.889;TYPE=snp;VARB=0.0185056;OID=.;OPOS=76178748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:20:8:8:18:20:8:8:18
chr17	76183043	.	A	G	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0128485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.4294;QD=14.7983;RBI=0.0143938;REFB=-0.0743304;REVB=0.00648823;RO=13;SAF=7;SAR=4;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0572116;STB=0.533274;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=0.0213133;OID=.;OPOS=76183043;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:4:7:9:4:4:7:9:4
chr17	76187108	.	G	C	126.19	PASS	AF=0.326087;AO=15;DP=46;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=0.0204501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.971;QD=10.9728;RBI=0.0336706;REFB=-0.014996;REVB=0.026749;RO=31;SAF=11;SAR=4;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.29801;STB=0.678763;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.0274947;OID=.;OPOS=76187108;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:31:31:15:15:0.326087:4:11:15:16:4:11:15:16
chr17	76188753	.	C	A	180.84	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=52;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=0.0137754;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.06;QD=13.911;RBI=0.0336098;REFB=-0.0162705;REVB=0.0306571;RO=31;SAF=11;SAR=10;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0747104;STB=0.542921;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0167088;OID=.;OPOS=76188753;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:31:31:21:21:0.403846:10:11:14:17:10:11:14:17
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chr17	76219591	.	G	A	689.2	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170878;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.1828;QD=62.6546;RBI=0.0240791;REFB=0;REVB=0.016965;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000354285;OID=.;OPOS=76219591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0
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chr17	76268010	.	C	T	54.74	PASS	AF=0.777778;AO=7;DP=9;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0317981;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=61.1595;QD=24.3279;RBI=0.0440201;REFB=0.00132775;REVB=-0.0304409;RO=2;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174483;STB=0.599732;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=-0.000337696;OID=.;OPOS=76268010;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:9:9:2:2:7:7:0.777778:4:3:0:2:4:3:0:2
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chr17	76367052	.	A	G	348.14	PASS	AF=0.486842;AO=35;DP=73;FAO=37;FDP=76;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0351557;FXX=0.0379699;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2975;QD=18.323;RBI=0.0667361;REFB=-0.0476522;REVB=-0.0567255;RO=35;SAF=20;SAR=15;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775422;STB=0.553555;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=0.0713932;OID=.;OPOS=76367052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:76:35:39:35:37:0.486842:15:20:17:18:17:20:17:22
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chr17	76423097	.	G	A	1246.11	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137825;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.396;QD=61.5362;RBI=0.0167562;REFB=0;REVB=-0.00952959;RO=0;SAF=56;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.81319e-06;OID=.;OPOS=76423097;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:25:56:0:0:25:56:0:0
chr17	76433898	.	T	C	481.47	PASS	AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0402433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.713;QD=53.4965;RBI=0.0571138;REFB=-0.0555551;REVB=0.0405274;RO=2;SAF=15;SAR=19;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00618158;STB=0.503309;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00221875;OID=.;OPOS=76433898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:36:2:2:34:34:0.944444:19:15:1:1:19:15:1:1
chr17	76449505	.	G	C	757.71	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00533363;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=266.868;QD=55.1059;RBI=0.0116288;REFB=0.0106907;REVB=0.0103335;RO=1;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159744;STB=0.508471;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=-0.000145935;OID=.;OPOS=76449505;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:1:1:54:54:0.981818:29:25:0:1:29:25:0:1
chr17	76451921	.	A	G	1021.05	PASS	AF=0.972222;AO=69;DP=71;FAO=70;FDP=72;FR=.;FRO=2;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0234099;FXX=0.0136968;HRUN=3;LEN=1;MLLD=153.855;QD=56.725;RBI=0.0238986;REFB=0.0297147;REVB=0.00480813;RO=2;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236245;STB=0.512192;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=-0.00120923;OID=.;OPOS=76451921;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:71:72:2:2:69:70:0.972222:39:30:0:2:40:30:0:2
chr17	76462770	.	G	A	2258.16	PASS	AF=0.986301;AO=143;DP=145;FAO=144;FDP=146;FR=.;FRO=2;FSAF=71;FSAR=73;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0276936;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.509;QD=61.8673;RBI=0.0405182;REFB=-0.095948;REVB=0.0295769;RO=1;SAF=70;SAR=73;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00646973;STB=0.500095;STBP=0.858;TYPE=snp;VARB=0.000316084;OID=.;OPOS=76462770;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:145:146:1:2:143:144:0.986301:73:70:0:1:73:71:1:1
chr17	76487605	.	C	CG,G	53.58	PASS	AF=0.138462,0;AO=18,6;DP=135;FAO=18,0;FDP=130;FR=.;FRO=112;FSAF=16,0;FSAR=2,0;FSRF=55;FSRR=57;FWDB=0.0848517,0.0554357;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=19.2492,34.2451;QD=1.64866;RBI=0.162748,0.134409;REFB=-0.0345577,-0.00680621;REVB=-0.138878,-0.122445;RO=109;SAF=14,6;SAR=4,0;SRF=52;SRR=57;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.3842,0.496139;STB=0.868807,0.5;STBP=0.004,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0815224,0;OID=.,.;OPOS=76487606,76487605;OREF=-,C;OALT=G,G;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:135:130:109:112:18,6:18,0:0.138462,0:4,0:14,6:52:57:2,0:16,0:55:57
chr17	76491127	.	TG	CC	1299.67	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00162211;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=264.827;QD=61.8891;RBI=0.0134225;REFB=0;REVB=-0.0133241;RO=0;SAF=51;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-1.12774e-05;OID=.;OPOS=76491127;OREF=TG;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:84:0:0:83:84:1:32:51:0:0:32:52:0:0
chr17	76496492	.	A	G	2299.56	PASS	AF=0.993506;AO=131;DP=155;FAO=153;FDP=154;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=52;FSAR=101;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312831;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.846;QD=59.7289;RBI=0.0667127;REFB=-0.0207784;REVB=0.0589233;RO=1;SAF=47;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100043;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00175865;OID=.;OPOS=76496492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:155:154:1:0:131:153:0.993506:84:47:1:0:101:52:0:0
chr17	76497920	.	C	A	1039.93	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0490011;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.4519;QD=59.4246;RBI=0.0520094;REFB=0;REVB=0.0174319;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000609389;OID=.;OPOS=76497920;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:40:30:0:0:40:30:0:0
chr17	76498692	.	C	T	1169.87	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.467;QD=60.7723;RBI=0.0488544;REFB=0;REVB=0.00901853;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.68899e-05;OID=.;OPOS=76498692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:77:0:0:71:77:1:35:36:0:0:35:42:0:0
chr17	76502847	.	C	T	106.3	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.0321577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.621;QD=11.8108;RBI=0.032267;REFB=-0.0214382;REVB=-0.00265403;RO=23;SAF=8;SAR=5;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282608;STB=0.66642;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0459575;OID=.;OPOS=76502847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:5:8:8:15:5:8:8:15
chr17	76503593	.	T	C	559.18	PASS	AF=0.450382;AO=59;DP=134;FAO=59;FDP=131;FR=.;FRO=72;FSAF=27;FSAR=32;FSRF=29;FSRR=43;FWDB=0.00608136;FXX=0.0223864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.6014;QD=17.0742;RBI=0.00722088;REFB=-0.00244789;REVB=-0.00389335;RO=68;SAF=27;SAR=32;SRF=25;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881867;STB=0.530511;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.00393505;OID=.;OPOS=76503593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:134:131:68:72:59:59:0.450382:32:27:25:43:32:27:29:43
chr17	76503624	.	C	T	629.78	PASS	AF=0.516393;AO=57;DP=116;FAO=63;FDP=122;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=34;FWDB=0.023144;FXX=0.00812942;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.333;QD=20.6485;RBI=0.0233842;REFB=-0.03156;REVB=0.0033432;RO=59;SAF=20;SAR=37;SRF=25;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0716316;STB=0.50549;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0308563;OID=.;OPOS=76503624;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:122:59:59:57:63:0.516393:37:20:25:34:37:26:25:34
chr17	76525565	.	A	G	152.77	PASS	AF=0.377778;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0193461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.7756;QD=13.5795;RBI=0.0661;REFB=0.00817514;REVB=-0.0632055;RO=28;SAF=10;SAR=7;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610216;STB=0.535478;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=-0.0156018;OID=.;OPOS=76525565;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:28:28:17:17:0.377778:7:10:18:10:7:10:18:10
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chr17	77039852	.	G	A	223.74	PASS	AF=0.385714;AO=27;DP=70;FAO=27;FDP=70;FR=.;FRO=43;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0165522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.699;QD=12.785;RBI=0.0255454;REFB=-0.0245054;REVB=0.0194574;RO=43;SAF=7;SAR=20;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292282;STB=0.668841;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=0.0376321;OID=.;OPOS=77039852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:43:43:27:27:0.385714:20:7:22:21:20:7:22:21
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chr17	77704912	.	T	C	353.53	PASS	AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=6;FWDB=0.0100846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.856;QD=23.9684;RBI=0.0183282;REFB=-0.0221228;REVB=0.0153043;RO=24;SAF=14;SAR=21;SRF=18;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255202;STB=0.639922;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0162207;OID=.;OPOS=77704912;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:21:14:18:6:21:14:18:6
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chr17	78055758	.	T	G	176.1	PASS	AF=0.529412;AO=17;DP=33;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.0160966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.08;QD=20.7171;RBI=0.0197925;REFB=-0.0125903;REVB=0.0115171;RO=16;SAF=12;SAR=5;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137385;STB=0.586365;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0147622;OID=.;OPOS=78055758;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:34:16:16:17:18:0.529412:5:12:9:7:5:13:9:7
chr17	78063957	.	A	G	351.43	PASS	AF=0.480519;AO=37;DP=77;FAO=37;FDP=77;FR=.;FRO=40;FSAF=28;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0960101;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.777;QD=18.2563;RBI=0.0960103;REFB=-0.025047;REVB=0.000158475;RO=40;SAF=28;SAR=9;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225491;STB=0.626792;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.0346422;OID=.;OPOS=78063957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:40:40:37:37:0.480519:9:28:22:18:9:28:22:18
chr17	78063964	.	A	G	319.86	PASS	AF=0.492754;AO=34;DP=69;FAO=34;FDP=69;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=14;FWDB=0.0472393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.3564;QD=18.5423;RBI=0.053474;REFB=-0.00845648;REVB=0.0250582;RO=34;SAF=25;SAR=9;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154743;STB=0.581345;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.00972042;OID=.;OPOS=78063964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:34:35:34:34:0.492754:9:25:20:14:9:25:21:14
chr17	78063966	.	A	G	315.47	PASS	AF=0.5;AO=34;DP=68;FAO=34;FDP=68;FR=.;FRO=34;FSAF=25;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=-0.028185;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.879;QD=18.5572;RBI=0.0298964;REFB=-0.0903918;REVB=-0.00996979;RO=34;SAF=25;SAR=9;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154743;STB=0.586681;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.0806352;OID=.;OPOS=78063966;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:34:34:34:34:0.5:9:25:20:14:9:25:20:14
chr17	78063996	.	A	G	157.73	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0149374;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.959;QD=14.0205;RBI=0.0481725;REFB=-0.0476959;REVB=-0.0457981;RO=27;SAF=13;SAR=5;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192363;STB=0.612057;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.104495;OID=.;OPOS=78063996;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:5:13:15:12:5:13:15:12
chr17	78064015	.	G	C	291.12	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.120042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.0373;QD=48.5195;RBI=0.125602;REFB=-0.0519716;REVB=0.0369578;RO=1;SAF=15;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0297929;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0173848;OID=.;OPOS=78064015;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:22:24:1:0:21:24:1:6:15:1:0:7:17:0:0
chr17	78064064	.	G	A	65.51	PASS	AF=0.8;AO=7;DP=9;FAO=8;FDP=10;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0485056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=134.794;QD=26.2039;RBI=0.077319;REFB=-0.134273;REVB=0.0602116;RO=2;SAF=1;SAR=6;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125389;STB=0.562356;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.00681995;OID=.;OPOS=78064064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:9:10:2:2:7:8:0.8:6:1:0:2:7:1:0:2
chr17	78071052	.	T	C	801.27	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.031179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.224;QD=57.2336;RBI=0.0385161;REFB=0;REVB=0.0226134;RO=0;SAF=31;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.07966e-05;OID=.;OPOS=78071052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:25:31:0:0:25:31:0:0
chr17	78073355	.	A	G	423.21	PASS	AF=0.444444;AO=43;DP=99;FAO=44;FDP=99;FR=.;FRO=55;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.0386569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6184;QD=17.0994;RBI=0.046101;REFB=-0.00466131;REVB=-0.0251186;RO=54;SAF=29;SAR=14;SRF=25;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217938;STB=0.60728;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=0.00534215;OID=.;OPOS=78073355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:54:55:43:44:0.444444:14:29:25:29:15:29:26:29
chr17	78073562	.	A	G	94.7	PASS	AF=0.342857;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=35;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.0110729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.233;QD=10.8233;RBI=0.014996;REFB=-0.00112012;REVB=0.010113;RO=21;SAF=5;SAR=7;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213959;STB=0.596995;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.00140958;OID=.;OPOS=78073562;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:35:21:23:12:12:0.342857:7:5:13:8:7:5:13:10
chr17	78078709	.	T	C	1624.42	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=71;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173417;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=240.277;QD=60.1636;RBI=0.0272549;REFB=0;REVB=0.0210261;RO=0;SAF=71;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.99016e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92814e-05;OID=.;OPOS=78078709;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:37:71:0:0:37:71:0:0
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chr17	78079669	.	G	A	755.9	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0167093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.253;QD=54.9742;RBI=0.0741483;REFB=-0.152117;REVB=0.072241;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5102;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00106815;OID=.;OPOS=78079669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:55:55:0:1:54:54:0.981818:24:30:0:0:24:30:0:1
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chr17	78092063	.	G	A	184.79	PASS	AF=0.642857;AO=18;DP=28;FAO=18;FDP=28;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0376593;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=317.942;QD=26.399;RBI=0.0377383;REFB=-0.0278923;REVB=-0.00244037;RO=10;SAF=15;SAR=3;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.359405;STB=0.702866;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0145831;OID=.;OPOS=78092063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:10:10:18:18:0.642857:3:15:4:6:3:15:4:6
chr17	78113832	.	G	A	218.13	PASS	AF=0.567568;AO=20;DP=36;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0506654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.118;QD=23.5819;RBI=0.0514462;REFB=0.00629445;REVB=0.00892874;RO=15;SAF=16;SAR=4;SRF=5;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.402383;STB=0.720979;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.00731837;OID=.;OPOS=78113832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:15:16:20:21:0.567568:4:16:5:10:4:17:6:10
chr17	78157995	.	G	A	430.61	PASS	AF=0.573333;AO=40;DP=73;FAO=43;FDP=75;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.026095;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.323;QD=22.9656;RBI=0.0314668;REFB=-0.0406855;REVB=0.0175844;RO=32;SAF=15;SAR=25;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.129448;STB=0.54578;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0295223;OID=.;OPOS=78157995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:75:32:32:40:43:0.573333:25:15:17:15:26:17:16:16
chr17	78162170	.	G	A	471.32	PASS	AF=0.494949;AO=49;DP=102;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.00338731;FXX=0.0294089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.9517;QD=19.0431;RBI=0.0258107;REFB=-0.0224611;REVB=0.0255875;RO=50;SAF=34;SAR=15;SRF=23;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225601;STB=0.62544;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0421311;OID=.;OPOS=78162170;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:99:50:50:49:49:0.494949:15:34:23:27:15:34:23:27
chr17	78166385	.	C	T	1085.58	PASS	AF=0.444867;AO=117;DP=263;FAO=117;FDP=263;FR=.;FRO=146;FSAF=58;FSAR=59;FSRF=68;FSRR=78;FWDB=0.101506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.959;QD=16.5107;RBI=0.101789;REFB=-0.0131547;REVB=-0.00759312;RO=146;SAF=58;SAR=59;SRF=68;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030017;STB=0.516642;STBP=0.63;TYPE=snp;VARB=0.0240288;OID=.;OPOS=78166385;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:263:263:146:146:117:117:0.444867:59:58:68:78:59:58:68:78
chr17	78169391	.	GCC	GAG,G	1563.17	PASS	AF=0.0672269,0.87395;AO=8,53;DP=119;FAO=8,104;FDP=119;FR=.;FRO=7;FSAF=8,55;FSAR=0,49;FSRF=7;FSRR=0;FWDB=-0.0908095,-0.159267;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=2,2;MLLD=136.338,30.6492;QD=52.5436;RBI=0.111684,0.903889;REFB=0.0686364,0.0819832;REVB=0.0650153,0.889746;RO=50;SAF=8,53;SAR=0,0;SRF=7;SRR=43;SSEN=0,0;SSEP=0,0.342294;SSSB=0.818152,0.892245;STB=0.5,0.529909;STBP=1,0.023;TYPE=mnp,del;VARB=0.0812766,-0.0146582;OID=.,.;OPOS=78169392,78169392;OREF=CC,CC;OALT=AG,-;OMAPALT=GAG,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0672269,0.87395:8,53:119:8,104:119:7:8,55:0,49:7:0:25:50:8,53:0,0:7:43
chr17	78171944	.	G	C	453.85	PASS	AF=1;AO=19;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.101355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=31.5826;QD=56.7316;RBI=0.22057;REFB=0;REVB=0.195904;RO=0;SAF=7;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00495233;OID=.;OPOS=78171944;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:19:32:1:12:7:0:0:23:9:0:0
chr17	78178893	.	C	T	770.51	PASS	AF=1;AO=54;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.265618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.764;QD=54.071;RBI=0.270699;REFB=0;REVB=0.0522022;RO=3;SAF=9;SAR=45;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13376;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00866802;OID=.;OPOS=78178893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:57:57:3:0:54:57:1:45:9:3:0:45:12:0:0
chr17	78219065	.	C	A	537.09	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00994707;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.443;QD=59.6767;RBI=0.037568;REFB=0;REVB=0.0362272;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192798;OID=.;OPOS=78219065;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr17	78226506	.	C	G	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=10;FWDB=0.0429109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8556;QD=11.953;RBI=0.0612955;REFB=-0.00341484;REVB=0.0437698;RO=11;SAF=2;SAR=6;SRF=1;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.240651;STB=0.639715;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.00441873;OID=.;OPOS=78226506;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:6:2:1:10:6:2:1:10
chr17	78293189	.	A	T	1285.36	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00637368;FXX=0.0119033;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.84;QD=61.9453;RBI=0.0224315;REFB=0;REVB=0.0215069;RO=0;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.30777e-05;OID=.;OPOS=78293189;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:41:42:0:0:41:42:0:0
chr17	78298938	.	A	G	972.8	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0128625;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.9565;QD=58.9574;RBI=0.0255199;REFB=0;REVB=-0.0220413;RO=0;SAF=13;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000151523;OID=.;OPOS=78298938;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:53:13:0:0:53:13:0:0
chr17	78341776	.	G	A	253.94	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0172863;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.067;QD=21.6121;RBI=0.032139;REFB=-0.0213855;REVB=0.0270942;RO=23;SAF=18;SAR=6;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229244;STB=0.629514;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0136337;OID=.;OPOS=78341776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:6:18:12:11:6:18:12:11
chr17	78346431	.	G	A	384.31	PASS	AF=0.506494;AO=39;DP=78;FAO=39;FDP=77;FR=.;FRO=38;FSAF=20;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0145605;FXX=0.0128189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.867;QD=19.9644;RBI=0.0227527;REFB=-0.0192228;REVB=0.0174837;RO=38;SAF=20;SAR=19;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825018;STB=0.545735;STBP=0.445;TYPE=snp;VARB=0.0181838;OID=.;OPOS=78346431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:77:38:38:39:39:0.506494:19:20:23:15:19:20:23:15
chr17	78444658	.	T	G	861.19	PASS	AF=1;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301852;FXX=0.0483793;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2514;QD=58.3858;RBI=0.0477599;REFB=0;REVB=0.0370117;RO=0;SAF=36;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014202;OID=.;OPOS=78444658;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:59:0:0:59:59:1:23:36:0:0:23:36:0:0
chr17	78444679	.	T	C	591.96	PASS	AF=0.654321;AO=52;DP=78;FAO=53;FDP=81;FR=.;FRO=28;FSAF=33;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=11;FWDB=0.00738511;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.81;QD=29.2325;RBI=0.0218426;REFB=-0.0483329;REVB=0.0205563;RO=25;SAF=33;SAR=19;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0222251;STB=0.505682;STBP=0.891;TYPE=snp;VARB=0.0237477;OID=.;OPOS=78444679;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:81:25:28:52:53:0.654321:19:33:15:10:20:33:17:11
chr17	78445702	.	A	G	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00523043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.422;QD=59.8557;RBI=0.00784218;REFB=0;REVB=-0.00584316;RO=0;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.27774e-07;OID=.;OPOS=78445702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:41:30:0:0:41:30:0:0
chr17	78854223	.	A	G	289.44	PASS	AF=0.577778;AO=26;DP=45;FAO=26;FDP=45;FR=.;FRO=19;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=0.0200289;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2404;QD=25.7282;RBI=0.0485127;REFB=0.0269803;REVB=-0.0441851;RO=19;SAF=13;SAR=13;SRF=13;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140573;STB=0.577719;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=-0.0200313;OID=.;OPOS=78854223;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:19:19:26:26:0.577778:13:13:13:6:13:13:13:6
chr17	78896529	.	C	T	391.6	PASS	AF=0.549296;AO=39;DP=71;FAO=39;FDP=71;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.116913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.728;QD=22.0621;RBI=0.118009;REFB=-0.0238753;REVB=0.0160458;RO=30;SAF=14;SAR=25;SRF=22;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292443;STB=0.647407;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0125073;OID=.;OPOS=78896529;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:30:32:39:39:0.549296:25:14:22:8:25:14:22:10
chr17	78919558	.	C	T	298.37	PASS	AF=0.345455;AO=38;DP=110;FAO=38;FDP=110;FR=.;FRO=72;FSAF=19;FSAR=19;FSRF=39;FSRR=33;FWDB=0.00589001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.848;QD=10.8498;RBI=0.0203275;REFB=0.0033576;REVB=0.0194554;RO=71;SAF=19;SAR=19;SRF=38;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398379;STB=0.527258;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.00669517;OID=.;OPOS=78919558;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:71:72:38:38:0.345455:19:19:38:33:19:19:39:33
chr17	78921117	.	C	T	498.6	PASS	AF=0.481818;AO=53;DP=110;FAO=53;FDP=110;FR=.;FRO=57;FSAF=17;FSAR=36;FSRF=21;FSRR=36;FWDB=-0.0314786;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.1775;QD=18.131;RBI=0.0411834;REFB=-0.0138039;REVB=-0.0265551;RO=54;SAF=17;SAR=36;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507724;STB=0.527767;STBP=0.599;TYPE=snp;VARB=0.0133892;OID=.;OPOS=78921117;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:54:57:53:53:0.481818:36:17:20:34:36:17:21:36
chr17	78935197	.	C	T	316.3	PASS	AF=0.426829;AO=35;DP=82;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.0310469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.934;QD=15.4292;RBI=0.0427253;REFB=-0.0201712;REVB=-0.0293521;RO=47;SAF=18;SAR=17;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0179175;STB=0.510113;STBP=0.906;TYPE=snp;VARB=0.0228627;OID=.;OPOS=78935197;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:47:47:35:35:0.426829:17:18:25:22:17:18:25:22
chr17	78978654	.	A	G	280.23	PASS	AF=0.508475;AO=30;DP=59;FAO=30;FDP=59;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=4;FSRR=25;FWDB=0.0470238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.683;QD=18.9989;RBI=0.0471008;REFB=-0.0230704;REVB=0.0026919;RO=28;SAF=14;SAR=16;SRF=4;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.291423;STB=0.665797;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0271953;OID=.;OPOS=78978654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:28:29:30:30:0.508475:16:14:4:24:16:14:4:25
chr17	79006850	.	T	C	657.49	PASS	AF=0.528455;AO=64;DP=123;FAO=65;FDP=123;FR=.;FRO=58;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=40;FSRR=18;FWDB=-0.00575957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.586;QD=21.3817;RBI=0.00585413;REFB=-0.011212;REVB=-0.00104794;RO=58;SAF=45;SAR=19;SRF=40;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0138585;STB=0.501466;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0127097;OID=.;OPOS=79006850;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:58:58:64:65:0.528455:19:45:40:18:20:45:40:18
chr17	79059230	.	C	T	832.3	PASS	AF=0.441748;AO=90;DP=206;FAO=91;FDP=206;FR=.;FRO=115;FSAF=50;FSAR=41;FSRF=66;FSRR=49;FWDB=-0.0318301;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.771;QD=16.1611;RBI=0.0403558;REFB=-0.0283899;REVB=-0.0248079;RO=113;SAF=49;SAR=41;SRF=64;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0221899;STB=0.513826;STBP=0.739;TYPE=snp;VARB=0.0290984;OID=.;OPOS=79059230;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:206:206:113:115:90:91:0.441748:41:49:64:49:41:50:66:49
chr17	79082862	.	G	A	196.27	PASS	AF=0.454545;AO=18;DP=42;FAO=20;FDP=44;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=-0.0326533;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.81;QD=17.843;RBI=0.0424171;REFB=-0.016216;REVB=0.0270735;RO=17;SAF=4;SAR=14;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.255477;STB=0.680372;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0620592;OID=.;OPOS=79082862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:17:24:18:20:0.454545:14:4:8:9:14:6:15:9
chr17	79086413	.	C	G	163.63	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.0195352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.044;QD=20.4541;RBI=0.0196077;REFB=-0.00718006;REVB=0.00168403;RO=15;SAF=3;SAR=14;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254537;STB=0.64596;STBP=0.128;TYPE=snp;VARB=0.00937686;OID=.;OPOS=79086413;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:17:17:0.53125:14:3:6:9:14:3:6:9
chr17	79091103	.	G	T	175.5	PASS	AF=1;AO=12;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0621364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.807;QD=46.7993;RBI=0.0679382;REFB=0;REVB=0.0274712;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000933873;OID=.;OPOS=79091103;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:12:15:1:7:5:0:0:9:6:0:0
chr17	79093822	.	A	G	93.99	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.0476044;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.1179;QD=11.0578;RBI=0.131751;REFB=-0.0164571;REVB=-0.12285;RO=22;SAF=4;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.279135;STB=0.666389;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.027281;OID=.;OPOS=79093822;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:34:34:22:22:12:12:0.352941:8:4:13:9:8:4:13:9
chr17	79095144	.	G	A	1170.43	PASS	AF=0.963415;AO=79;DP=82;FAO=79;FDP=82;FR=.;FRO=3;FSAF=46;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.050195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=123.916;QD=57.094;RBI=0.0626451;REFB=-0.0867263;REVB=0.0374817;RO=3;SAF=46;SAR=33;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0411056;STB=0.521734;STBP=0.061;TYPE=snp;VARB=0.00986535;OID=.;OPOS=79095144;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:82:82:3:3:79:79:0.963415:33:46:0:3:33:46:0:3
chr17	79095629	.	C	A	168.73	PASS	AF=0.428571;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=42;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0548375;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.973;QD=16.0694;RBI=0.0549469;REFB=-0.0144915;REVB=0.00346619;RO=23;SAF=13;SAR=5;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173098;STB=0.590803;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0308446;OID=.;OPOS=79095629;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:24:18:18:0.428571:5:13:13:10:5:13:14:10
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chr17	79171967	.	A	G	730.66	PASS	AF=1;AO=46;DP=47;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025834;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.151;QD=63.5352;RBI=0.0696265;REFB=0;REVB=-0.0646565;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172744;OID=.;OPOS=79171967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:46:0:0:46:46:1:29:17:0:0:29:17:0:0
chr17	79173184	.	T	C	556.99	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022915;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.197;QD=60.2153;RBI=0.0352258;REFB=0;REVB=0.0267537;RO=0;SAF=25;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292207;OID=.;OPOS=79173184;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:12:25:0:0:12:25:0:0
chr17	79173223	.	G	GC	239.85	PASS	AF=1;AO=7;DP=46;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0437257;FXX=0.311042;HRUN=0;LEN=1;MLLD=80.7835;QD=30.9479;RBI=0.04457;REFB=0;REVB=-0.00863383;RO=39;SAF=0;SAR=7;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.726517;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000582643;OID=.;OPOS=79173224;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:7:46:31:31:0:16:15:0:0:3:39:0:7:25:14
chr17	79173224	.	T	C,G	653.57	PASS	AF=0.782609,0.195652;AO=37,8;DP=46;FAO=36,9;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=25,0;FSAR=11,9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00789955,-0.0452406;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=78.3817,170.221;QD=56.832;RBI=0.0229085,0.0452423;REFB=0.00400364,-0.0510138;REVB=0.0215035,-0.000393753;RO=0;SAF=25,0;SAR=12,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.521727,0.5;STBP=0.178,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00857287,0.176279;OID=.,.;OPOS=79173224,79173224;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:56:46:46:0:1:37,8:36,9:0.782609,0.195652:12,8:25,0:0:0:11,9:25,0:0:1
chr17	79174221	.	T	C	3133.71	PASS	AF=1;AO=201;DP=203;FAO=203;FDP=203;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=118;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0147663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.785;QD=61.7481;RBI=0.029884;REFB=0;REVB=0.025981;RO=0;SAF=84;SAR=117;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90929e-05;OID=.;OPOS=79174221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:17:203:203:0:0:201:203:1:117:84:0:0:118:85:0:0
chr17	79182778	.	T	C	141.86	PASS	AF=0.333333;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=51;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.034292;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.7289;QD=11.1261;RBI=0.04389;REFB=0.0052917;REVB=0.0273932;RO=34;SAF=10;SAR=7;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.47182e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00817697;OID=.;OPOS=79182778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:34:34:17:17:0.333333:7:10:20:14:7:10:20:14
chr17	79202956	.	T	C	217.3	PASS	AF=0.468085;AO=17;DP=47;FAO=22;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=3;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.00230731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.31;QD=18.4932;RBI=0.00440693;REFB=-0.00797726;REVB=-0.00375464;RO=19;SAF=2;SAR=15;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.310447;STB=0.713642;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.00505197;OID=.;OPOS=79202956;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:19:24:17:22:0.468085:15:2:6:13:19:3:10:14
chr17	79219500	.	AATG	A	157.76	PASS	AF=0.263514;AO=33;DP=150;FAO=39;FDP=148;FR=.;FRO=109;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=65;FSRR=44;FWDB=-0.0138315;FXX=0.0512788;HRUN=2;LEN=3;MLLD=245.596;QD=4.26374;RBI=0.0260918;REFB=-0.00320312;REVB=-0.0221239;RO=76;SAF=16;SAR=17;SRF=37;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00236847;STB=0.543136;STBP=0.545;TYPE=del;VARB=0.00912014;OID=.;OPOS=79219501;OREF=ATG;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.263514:33:150:39:148:109:21:18:65:44:99:76:16:17:37:39
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chr17	79220224	.	G	C	314.16	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0080177;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8551;QD=20.2682;RBI=0.131775;REFB=-0.0402721;REVB=0.131531;RO=28;SAF=13;SAR=20;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.148446;STB=0.574781;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0604058;OID=.;OPOS=79220224;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:28:29:33:33:0.532258:20:13:16:12:20:13:16:13
chr17	79226362	.	G	A	396.87	PASS	AF=0.512821;AO=40;DP=79;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0110743;FXX=0.0126566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.9883;QD=20.3525;RBI=0.0400077;REFB=-0.0235447;REVB=0.0384444;RO=38;SAF=19;SAR=21;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.071055;STB=0.539335;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.0265363;OID=.;OPOS=79226362;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:78:38:38:40:40:0.512821:21:19:15:23:21:19:15:23
chr17	79244802	.	T	C	332.68	PASS	AF=0.6;AO=31;DP=54;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0213303;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.6;QD=24.1952;RBI=0.021516;REFB=-0.0257588;REVB=0.00282079;RO=21;SAF=16;SAR=15;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757813;STB=0.536891;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0224912;OID=.;OPOS=79244802;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:21:22:31:33:0.6:15:16:13:8:15:18:14:8
chr17	79263549	.	C	A	435.84	PASS	AF=0.36;AO=52;DP=150;FAO=54;FDP=150;FR=.;FRO=96;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=56;FSRR=40;FWDB=-0.000471435;FXX=0.0196066;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.244;QD=11.6223;RBI=0.0125592;REFB=-0.0204339;REVB=0.0125504;RO=95;SAF=21;SAR=31;SRF=57;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219427;STB=0.599914;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0487587;OID=.;OPOS=79263549;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:95:96:52:54:0.36:31:21:57:38:31:23:56:40
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chr17	79422387	.	G	A	1282.21	PASS	AF=0.483395;AO=130;DP=271;FAO=131;FDP=271;FR=.;FRO=140;FSAF=91;FSAR=40;FSRF=80;FSRR=60;FWDB=-0.00424359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6692;QD=18.9256;RBI=0.0315226;REFB=-0.019822;REVB=0.0312357;RO=135;SAF=90;SAR=40;SRF=77;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125225;STB=0.57088;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0239061;OID=.;OPOS=79422387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:271:271:135:140:130:131:0.483395:40:90:77:58:40:91:80:60
chr17	79428598	.	G	A	737.22	PASS	AF=0.496732;AO=76;DP=153;FAO=76;FDP=153;FR=.;FRO=77;FSAF=49;FSAR=27;FSRF=49;FSRR=28;FWDB=0.0191976;FXX=0.00649309;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.63;QD=19.2737;RBI=0.0352772;REFB=-0.0222897;REVB=0.0295962;RO=75;SAF=49;SAR=27;SRF=47;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0176851;STB=0.504586;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0223929;OID=.;OPOS=79428598;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:153:75:77:76:76:0.496732:27:49:47:28:27:49:49:28
chr17	79478019	.	G	A	792.94	PASS	AF=0.966102;AO=57;DP=59;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00340852;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=147.127;QD=53.7586;RBI=0.0168426;REFB=-0.0193612;REVB=0.0164941;RO=2;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0470812;STB=0.524991;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.000231038;OID=.;OPOS=79478019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:59:59:2:2:57:57:0.966102:19:38:0:2:19:38:0:2
chr17	79479366	.	G	T	294.15	PASS	AF=0.735294;AO=25;DP=34;FAO=25;FDP=34;FR=.;FRO=9;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0662722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2587;QD=34.6064;RBI=0.0662723;REFB=-0.0680255;REVB=-9.64378e-05;RO=9;SAF=16;SAR=9;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.153312;STB=0.583873;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.021039;OID=.;OPOS=79479366;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:34:34:9:9:25:25:0.735294:9:16:3:6:9:16:3:6
chr17	79507107	.	CGGG	CCGG,CGG,CGGC	382.2	PASS	AF=0.193548,0.612903,0.193548;AO=9,8,11;DP=29;FAO=6,19,6;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=2,9,5;FSAR=4,10,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.197299,0.0170508,-0.0132065;FXX=0;HRUN=3,3,3;LEN=1,1,1;MLLD=19.5193,20.5367,10.8692;QD=49.3156;RBI=0.223997,0.0181324,0.04223;REFB=0,0,0;REVB=0.106055,-0.00616871,-0.0401119;RO=0;SAF=3,1,10;SAR=6,7,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,-4.78849e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=0.033358,-0.000918535,0.0992052;OID=.,.,.;OPOS=79507108,79507108,79507110;OREF=G,G,G;OALT=C,-,C;OMAPALT=CCGG,CGG,CGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0.193548,0.612903,0.193548:9,8,11:29:6,19,6:31:0:2,9,5:4,10,1:0:0:27:0:3,1,10:6,7,1:0:0
chr17	79507170	.	T	C	516.13	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000861556;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.492;QD=58.9862;RBI=0.0523773;REFB=0;REVB=0.0523702;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000775775;OID=.;OPOS=79507170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:35:0:0:33:35:1:13:20:0:0:15:20:0:0
chr17	79508400	.	T	C	837.17	PASS	AF=0.983333;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0202652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.541;QD=55.811;RBI=0.027356;REFB=-0.055499;REVB=0.0183759;RO=1;SAF=30;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159925;STB=0.508472;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.000128385;OID=.;OPOS=79508400;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:60:1:1:59:59:0.983333:29:30:0:1:29:30:0:1
chr17	79511135	.	A	G	1576.75	PASS	AF=1;AO=104;DP=104;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000427503;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.327;QD=60.0668;RBI=0.0101932;REFB=0;REVB=-0.0101842;RO=0;SAF=61;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.99311e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.15429e-05;OID=.;OPOS=79511135;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:104:105:0:0:104:105:1:43:61:0:0:43:62:0:0
chr17	79514129	.	G	A	228.31	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0361569;FXX=0.0526039;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.959;QD=50.7363;RBI=0.0420383;REFB=0;REVB=0.0214453;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0006075;OID=.;OPOS=79514129;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:4:14:0:0:4:14:0:0
chr17	79514832	.	G	A	688.41	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0164075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.269;QD=61.1918;RBI=0.111601;REFB=0;REVB=0.110388;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012168;OID=.;OPOS=79514832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:23:20:0:0:25:20:0:0
chr17	79525118	.	T	G	613.21	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162509;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.38;QD=61.3205;RBI=0.0239091;REFB=0;REVB=0.0175371;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116838;OID=.;OPOS=79525118;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:23:16:0:0:24:16:0:0
chr17	79589242	.	G	A	1453.49	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=273.375;QD=63.1951;RBI=0.0317888;REFB=0;REVB=0.0150305;RO=0;SAF=41;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99529e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.92367e-05;OID=.;OPOS=79589242;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:51:41:0:0:51:41:0:0
chr17	79596811	.	C	T	657.76	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00189915;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=359.198;QD=59.7968;RBI=0.0229821;REFB=-0.0548559;REVB=0.0229035;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510633;STBP=0.493;TYPE=snp;VARB=0.00100579;OID=.;OPOS=79596811;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:0:1:43:43:0.977273:23:20:0:0:23:20:0:1
chr17	79609410	.	G	T	382.47	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00736775;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.312;QD=54.6378;RBI=0.0362317;REFB=0;REVB=0.0354747;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000725532;OID=.;OPOS=79609410;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:17:10:0:0:17:11:0:0
chr17	79612161	.	C	T	1760.43	PASS	AF=0.959677;AO=119;DP=125;FAO=119;FDP=124;FR=.;FRO=5;FSAF=73;FSAR=46;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00337109;FXX=0.00799936;HRUN=5;LEN=1;MLLD=252.126;QD=56.7879;RBI=0.0458754;REFB=-0.119176;REVB=0.0457513;RO=5;SAF=73;SAR=46;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015103;STB=0.507958;STBP=0.387;TYPE=snp;VARB=0.000326472;OID=.;OPOS=79612161;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:125:124:5:5:119:119:0.959677:46:73:4:1:46:73:4:1
chr17	79612333	.	G	A	246.52	PASS	AF=0.952381;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000392909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.8423;QD=46.957;RBI=0.00878556;REFB=-0.0567575;REVB=0.00877677;RO=1;SAF=3;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13066;STB=0.57135;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.00142869;OID=.;OPOS=79612333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:21:21:1:1:20:20:0.952381:17:3:1:0:17:3:1:0
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chr17	79612413	.	T	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522529;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.274;QD=55.6561;RBI=0.0662154;REFB=0;REVB=0.0406708;RO=0;SAF=18;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000812042;OID=.;OPOS=79612413;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:9:18:0:0:9:18:0:0
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chr17	79614480	.	CA	C,CG	401.25	PASS	AF=1,0;AO=3,24;DP=28;FAO=28,0;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0;FSAR=11,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.127729,-0.13356;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=164.587,154.594;QD=57.3206;RBI=0.130149,0.14195;REFB=0,0;REVB=0.0249801,-0.0480789;RO=0;SAF=3,13;SAR=0,11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.000418096,0.0293979;OID=.,.;OPOS=79614481,79614481;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:3,24:28:28,0:28:0:17,0:11,0:0:0:4:0:3,13:0,11:0:0
chr17	79614932	.	TTAAC	T	289.94	PASS	AF=0.9;AO=24;DP=29;FAO=27;FDP=30;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0282009;FXX=0.0624805;HRUN=3;LEN=4;MLLD=312.22;QD=38.6586;RBI=0.0290254;REFB=0.0248341;REVB=-0.00686919;RO=0;SAF=7;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.00363171;OID=.;OPOS=79614933;OREF=TAAC;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.9:24:29:27:30:3:9:18:1:2:10:0:7:17:0:0
chr17	79637349	.	T	C,G	1866.4	PASS	AF=0.927419,0.0725806;AO=115,9;DP=124;FAO=115,9;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=42,9;FSAR=73,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00480808,-0.0170185;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=231.02,183.247;QD=60.2066;RBI=0.0110601,0.0173635;REFB=0,0;REVB=0.00996033,0.00344417;RO=0;SAF=42,9;SAR=73,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.42309e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000532623,0.0561167;OID=.,.;OPOS=79637349,79637349;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:22:124:124:0:0:115,9:115,9:0.927419,0.0725806:73,0:42,9:0:0:73,0:42,9:0:0
chr17	79825897	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0304611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.417;QD=48.7373;RBI=0.0329702;REFB=0;REVB=-0.0126156;RO=0;SAF=15;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.95117e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.2387e-05;OID=.;OPOS=79825897;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:2:15:0:0:2:15:0:0
chr17	79826498	.	G	C	117.69	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00239428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.3517;QD=12.3881;RBI=0.0958802;REFB=-0.0410728;REVB=-0.0958503;RO=24;SAF=9;SAR=5;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787639;STB=0.546155;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.0789471;OID=.;OPOS=79826498;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:5:9:17:7:5:9:17:7
chr17	79872241	.	A	G	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395745;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=269.335;QD=59.142;RBI=0.0409978;REFB=0;REVB=0.0107086;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.44593e-05;OID=.;OPOS=79872241;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:30:37:0:0:30:37:0:0
chr17	79891147	.	T	C	885.41	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0290859;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.65;QD=58.0599;RBI=0.0384032;REFB=0;REVB=0.0250763;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242112;OID=.;OPOS=79891147;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:27:34:0:0:27:34:0:0
chr17	79899272	.	A	G	173.15	PASS	AF=0.338028;AO=9;DP=72;FAO=24;FDP=71;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=47;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=0.0176917;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=27.8534;QD=9.75491;RBI=0.0602261;REFB=-0.0391089;REVB=0.0575689;RO=29;SAF=6;SAR=3;SRF=24;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.247377;STB=0.512185;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.0898487;OID=.;OPOS=79899272;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:71:29:47:9:24:0.338028:3:6:24:5:7:17:34:13
chr17	79899495	.	G	A	533.62	PASS	AF=0.456;AO=57;DP=125;FAO=57;FDP=125;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=28;FSRR=40;FWDB=0.000718442;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=239.416;QD=17.0758;RBI=0.00212727;REFB=-0.023211;REVB=0.00200228;RO=68;SAF=28;SAR=29;SRF=28;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0778243;STB=0.543292;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0280465;OID=.;OPOS=79899495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:68:68:57:57:0.456:29:28:28:40:29:28:28:40
chr17	79899647	.	TCCCCC	TCCCC,TCCCCA	67.9	PASS	AF=0.24,0.06;AO=12,3;DP=50;FAO=12,3;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=9,3;FSAR=3,0;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0220233,0.108124;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=13.2891,25.9339;QD=5.43238;RBI=0.0359537,0.133989;REFB=-0.0601305,-0.0542823;REVB=0.028419,0.0791343;RO=30;SAF=9,3;SAR=3,0;SRF=12;SRR=18;SSEN=0.529412,0;SSEP=0,0;SSSB=0.408127,0.591044;STB=0.75747,0.99703;STBP=0.06,0.04;TYPE=del,snp;VARB=0.103248,0.0211298;OID=.,.;OPOS=79899648,79899652;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=TCCCC,TCCCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.24,0.06:12,3:50:12,3:50:35:9,3:3,0:14:21:51:30:9,3:3,0:12:18
chr17	79899698	.	G	A	150.12	PASS	AF=0.516129;AO=16;DP=31;FAO=16;FDP=31;FR=.;FRO=15;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=12;FWDB=-0.00105844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=118.372;QD=19.3697;RBI=0.0276029;REFB=-0.0218767;REVB=0.0275826;RO=15;SAF=10;SAR=6;SRF=3;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.350444;STB=0.697443;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.0190345;OID=.;OPOS=79899698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:15:15:16:16:0.516129:6:10:3:12:6:10:3:12
chr17	79912164	.	G	A	115.54	PASS	AF=0.325581;AO=14;DP=43;FAO=14;FDP=43;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0529745;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=152.489;QD=10.7479;RBI=0.0534833;REFB=-0.00403714;REVB=0.00735949;RO=29;SAF=11;SAR=3;SRF=11;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.463432;STB=0.777376;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00965797;OID=.;OPOS=79912164;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:29:29:14:14:0.325581:3:11:11:18:3:11:11:18
chr17	79974415	.	TG	T	32.14	PASS	AF=0.257143;AO=9;DP=35;FAO=9;FDP=35;FR=.;FRO=26;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.0857623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=18.0176;QD=3.67356;RBI=0.0863368;REFB=-0.0102856;REVB=0.00994339;RO=26;SAF=0;SAR=9;SRF=18;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.795848;STB=0.893554;STBP=0.012;TYPE=del;VARB=0.023891;OID=.;OPOS=79974416;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.257143:9:35:9:35:26:1:8:17:9:32:26:0:9:18:8
chr17	80013235	.	A	G	1246.06	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0490395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.937;QD=61.5339;RBI=0.0504665;REFB=0;REVB=0.0119165;RO=0;SAF=38;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000101168;OID=.;OPOS=80013235;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:43:38:0:0:43:38:0:0
chr17	80041950	.	G	A	689.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521143;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=218.775;QD=62.669;RBI=0.0637669;REFB=0;REVB=0.0367467;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96242e-05;OID=.;OPOS=80041950;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0
chr17	80099639	.	C	A	937.5	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261776;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2049;QD=58.5937;RBI=0.0594363;REFB=0;REVB=-0.0533611;RO=0;SAF=31;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000251936;OID=.;OPOS=80099639;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:33:31:0:0:33:31:0:0
chr17	80103737	.	T	C	734.5	PASS	AF=0.94;AO=46;DP=50;FAO=47;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=8;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0298066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.253;QD=58.7602;RBI=0.0391696;REFB=-0.14329;REVB=0.0254131;RO=2;SAF=7;SAR=39;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0235051;STB=0.512495;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.00176684;OID=.;OPOS=80103737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:50:50:2:2:46:47:0.94:39:7:0:2:39:8:0:2
chr17	80136418	.	C	T	1062.02	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0997678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.6928;QD=59.8322;RBI=0.102993;REFB=0;REVB=0.0255724;RO=0;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000836117;OID=.;OPOS=80136418;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:30:41:0:0:30:41:0:0
chr17	80151881	.	G	A,C	2173.36	PASS	AF=0.933333,0.0533333;AO=140,8;DP=152;FAO=140,8;FDP=150;FR=.;FRO=2;FSAF=90,8;FSAR=50,0;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0198859,-0.0121538;FXX=0.013157;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=135.766,140.225;QD=57.9563;RBI=0.0486359,0.0187153;REFB=-0.0902207,-0.0399413;REVB=0.0443848,-0.0142319;RO=1;SAF=90,8;SAR=50,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00941381,0.803989;STB=0.502188,0.997707;STBP=0.766,0.096;TYPE=snp,snp;VARB=0.00101362,0.156589;OID=.,.;OPOS=80151881,80151881;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:152:150:1:2:140,8:140,8:0.933333,0.0533333:50,0:90,8:0:1:50,0:90,8:1:1
chr17	80159566	.	T	C	1416.17	PASS	AF=0.961165;AO=99;DP=103;FAO=99;FDP=103;FR=.;FRO=4;FSAF=36;FSAR=63;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0416367;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.4929;QD=54.9969;RBI=0.0658188;REFB=0.0142242;REVB=-0.0509755;RO=4;SAF=36;SAR=63;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.030434;STB=0.516065;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=-0.0120176;OID=.;OPOS=80159566;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:103:103:4:4:99:99:0.961165:63:36:3:1:63:36:3:1
chr17	80195581	.	G	GC	503.99	PASS	AF=1;AO=5;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0662959;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=103.654;QD=50.399;RBI=0.0788429;REFB=0;REVB=0.0426738;RO=34;SAF=0;SAR=5;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.64437;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000275706;OID=.;OPOS=80195582;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:40:40:40:0:19:21:0:0:4:34:0:5:18:16
chr17	80195582	.	T	C	457.23	PASS	AF=0.85;AO=34;DP=40;FAO=34;FDP=40;FR=.;FRO=6;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0054432;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.702;QD=45.7231;RBI=0.0396955;REFB=-0.0409225;REVB=0.0393205;RO=5;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125756;STB=0.55422;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00302783;OID=.;OPOS=80195582;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:40:40:5:6:34:34:0.85:16:18:0:5:16:18:1:5
chr17	80218800	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=3.25867e-05;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=123.801;QD=37.4885;RBI=3.25867e-05;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.30075e-07;OID=.;OPOS=80218800;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:0:8:0:0:0:8:0:0
chr17	80280865	.	G	A	1127.46	PASS	AF=0.962025;AO=76;DP=79;FAO=76;FDP=79;FR=.;FRO=3;FSAF=38;FSAR=38;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0174667;FXX=0.0246883;HRUN=5;LEN=1;MLLD=154.493;QD=57.0864;RBI=0.0225628;REFB=-0.102052;REVB=0.0142827;RO=2;SAF=38;SAR=38;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242528;STB=0.506327;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.000504141;OID=.;OPOS=80280865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:79:79:2:3:76:76:0.962025:38:38:2:0:38:38:2:1
chr17	80373452	.	C	T	742.2	PASS	AF=1;AO=51;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.129752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.7433;QD=52.0841;RBI=0.144962;REFB=-0.227185;REVB=0.0646419;RO=1;SAF=25;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184631;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0311526;OID=.;OPOS=80373452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:57:1:0:51:57:1:26:25:1:0:28:29:0:0
chr17	80377690	.	T	G	255.84	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00564436;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.0742;QD=51.1671;RBI=0.0893805;REFB=0;REVB=0.0892021;RO=0;SAF=12;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147803;OID=.;OPOS=80377690;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:8:12:0:0:8:12:0:0
chr17	80391684	.	A	G	1814.96	PASS	AF=0.991736;AO=119;DP=120;FAO=120;FDP=121;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0255684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.332;QD=59.9987;RBI=0.0257151;REFB=-0.0377711;REVB=0.00274327;RO=1;SAF=35;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.013376;STB=0.506848;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.000217804;OID=.;OPOS=80391684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:120:121:1:1:119:120:0.991736:84:35:1:0:84:36:1:0
chr17	80394530	.	G	T	335.39	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.7665;QD=51.5982;RBI=0.153894;REFB=-0.0944334;REVB=0.142308;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00847712;OID=.;OPOS=80394530;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:26:26:0:0:25:26:1:10:15:0:0:11:15:0:0
chr17	80401946	.	A	G	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=-0.0543461;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.3992;QD=12.7301;RBI=0.0756283;REFB=-0.010823;REVB=-0.0525942;RO=12;SAF=7;SAR=2;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.436487;STB=0.760275;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0260586;OID=.;OPOS=80401946;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:2:7:4:8:2:7:4:8
chr17	80452592	.	G	C	229.96	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0800554;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.233;QD=45.9914;RBI=0.0934618;REFB=-0.0795306;REVB=0.0482312;RO=1;SAF=6;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0705879;STB=0.53842;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.00176269;OID=.;OPOS=80452592;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:20:20:1:1:19:19:0.95:13:6:1:0:13:6:1:0
chr17	80481088	.	T	C	338.37	PASS	AF=0.627451;AO=32;DP=51;FAO=32;FDP=51;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.015916;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.103;QD=26.5391;RBI=0.0166268;REFB=-0.0245698;REVB=0.00480953;RO=19;SAF=15;SAR=17;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251449;STB=0.637162;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0210973;OID=.;OPOS=80481088;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:19:19:32:32:0.627451:17:15:16:3:17:15:16:3
chr17	80521405	.	TC	T	33.04	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=-0.0158026;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.4598;QD=6.60839;RBI=0.0528885;REFB=-0.0641824;REVB=-0.0504724;RO=11;SAF=0;SAR=8;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0.362069;SSSB=-0.73424;STB=0.55249;STBP=0.834;TYPE=del;VARB=0.0604777;OID=.;OPOS=80521406;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:8:19:8:20:12:1:7:2:10:33:11:0:8:2:9
chr17	80585094	.	C	T	103.94	PASS	AF=0.317073;AO=13;DP=41;FAO=13;FDP=41;FR=.;FRO=28;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00828241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.057;QD=10.1408;RBI=0.0157537;REFB=-0.0174758;REVB=0.0134008;RO=27;SAF=7;SAR=6;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.146659;STB=0.574513;STBP=0.574;TYPE=snp;VARB=0.0366402;OID=.;OPOS=80585094;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:27:28:13:13:0.317073:6:7:11:16:6:7:12:16
chr17	80614933	.	T	C	393.33	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0221506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3519;QD=56.1905;RBI=0.0380675;REFB=0;REVB=0.0309595;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000597501;OID=.;OPOS=80614933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:8:19:0:0:8:20:0:0
chr17	80615040	.	A	C	1245.94	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.071;QD=61.5278;RBI=0.032228;REFB=0;REVB=-0.010862;RO=0;SAF=47;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.56918e-05;OID=.;OPOS=80615040;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:34:47:0:0:34:47:0:0
chr17	80626104	.	T	C	264.81	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=63;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=27;FSAR=2;FSRF=29;FSRR=3;FWDB=0.0123196;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.2719;QD=17.3647;RBI=0.0171126;REFB=-0.0267261;REVB=-0.0118771;RO=31;SAF=27;SAR=2;SRF=28;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0901376;STB=0.546524;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.0679064;OID=.;OPOS=80626104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:61:31:32:29:29:0.47541:2:27:28:3:2:27:29:3
chr17	80674643	.	C	G	446.97	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00499557;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.274;QD=57.6734;RBI=0.110396;REFB=0;REVB=-0.110283;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000547446;OID=.;OPOS=80674643;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
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chr17	80708601	.	C	G	46.76	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.000732359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=279.657;QD=10.3902;RBI=0.0030422;REFB=-0.00387154;REVB=0.00295273;RO=11;SAF=4;SAR=3;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.293282;STB=0.676457;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.00572652;OID=.;OPOS=80708601;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:3:4:3:8:3:4:3:8
chr17	80788465	.	T	C	220.55	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.00510545;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.706;QD=16.0398;RBI=0.0184693;REFB=-0.0133496;REVB=-0.0177496;RO=29;SAF=17;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.259277;STB=0.638984;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0214037;OID=.;OPOS=80788465;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:29:30:25:25:0.454545:8:17:12:17:8:17:13:17
chr17	80788492	.	A	G	218.63	PASS	AF=0.448276;AO=24;DP=56;FAO=26;FDP=58;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.00820838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.566;QD=15.078;RBI=0.0131376;REFB=-0.0137234;REVB=-0.0102576;RO=30;SAF=15;SAR=9;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125562;STB=0.582146;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.015112;OID=.;OPOS=80788492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:58:30:32:24:26:0.448276:9:15:15:15:10:16:15:17
chr17	80887451	.	A	G	197.06	PASS	AF=0.347222;AO=25;DP=72;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=14;FSAR=11;FSRF=29;FSRR=18;FWDB=-0.0239005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.799;QD=10.9476;RBI=0.0341696;REFB=-0.0301725;REVB=-0.0244198;RO=47;SAF=14;SAR=11;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0656678;STB=0.538081;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0394998;OID=.;OPOS=80887451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:47:47:25:25:0.347222:11:14:29:18:11:14:29:18
chr17	80895171	.	T	C	170.3	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.037742;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.637;QD=17.0303;RBI=0.039737;REFB=-0.0403053;REVB=-0.0124328;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0393929;OID=.;OPOS=80895171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:9:9:11:11:9:9:11:11
chr17	80895745	.	T	C	275.15	PASS	AF=0.380952;AO=32;DP=84;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=0.000453667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.312;QD=13.1025;RBI=0.000477108;REFB=-0.0204628;REVB=0.000147712;RO=52;SAF=23;SAR=9;SRF=31;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150612;STB=0.586678;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0268179;OID=.;OPOS=80895745;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:52:52:32:32:0.380952:9:23:31:21:9:23:31:21
chr17	80895769	.	A	G	261.62	PASS	AF=0.378049;AO=31;DP=82;FAO=31;FDP=82;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=29;FSRR=22;FWDB=0.0155221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1922;QD=12.7621;RBI=0.0862672;REFB=-0.00645631;REVB=-0.0848592;RO=51;SAF=22;SAR=9;SRF=29;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169465;STB=0.597655;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=0.0106989;OID=.;OPOS=80895769;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:51:51:31:31:0.378049:9:22:29:22:9:22:29:22
chr17	80895933	.	A	G	223.57	PASS	AF=1;AO=16;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0382389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.817;QD=49.6816;RBI=0.112847;REFB=0;REVB=0.10617;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000885582;OID=.;OPOS=80895933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:16:18:1:10:6:0:0:12:6:0:0
chr17	80899281	.	G	A	149.1	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=32;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0078424;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=235.087;QD=18.6371;RBI=0.00784838;REFB=-0.0224837;REVB=0.00030635;RO=16;SAF=6;SAR=10;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0574449;STB=0.532745;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0212767;OID=.;OPOS=80899281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:16:16:16:16:0.5:10:6:7:9:10:6:7:9
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chr18	47492	.	G	A	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=0.00989187;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.95;QD=9.11039;RBI=0.0103174;REFB=-0.0072919;REVB=0.00293253;RO=16;SAF=7;SAR=1;SRF=16;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.476698;STB=0.766318;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0144707;OID=.;OPOS=47492;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:1:7:16:0:1:7:16:0
chr18	48104	.	T	C	31.42	PASS	AF=0.102941;AO=7;DP=68;FAO=7;FDP=68;FR=.;FRO=61;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=28;FSRR=33;FWDB=-0.00904708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6177;QD=1.84844;RBI=0.072631;REFB=-0.00747024;REVB=0.0720654;RO=61;SAF=4;SAR=3;SRF=28;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129032;STB=0.599718;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0795528;OID=.;OPOS=48104;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:68:68:61:61:7:7:0.102941:3:4:28:33:3:4:28:33
chr18	49546	.	G	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.8422;QD=35.5758;RBI=0.0397074;REFB=0;REVB=-0.0397074;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00304219;OID=.;OPOS=49546;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0
chr18	49548	.	TT	GC	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=320.187;QD=35.5759;RBI=0.0128896;REFB=0;REVB=-0.0128896;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=-0.000138936;OID=.;OPOS=49548;OREF=TT;OALT=GC;OMAPALT=GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0
chr18	224131	.	G	A	294.19	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0042211;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.996;QD=17.5636;RBI=0.0198014;REFB=-0.00833208;REVB=0.0193463;RO=35;SAF=13;SAR=19;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231226;STB=0.629176;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.0110975;OID=.;OPOS=224131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:19:13:23:12:19:13:23:12
chr18	252559	.	G	A	740.83	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268165;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.956;QD=56.9869;RBI=0.0308488;REFB=0;REVB=-0.0152487;RO=0;SAF=20;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.00761e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.33031e-05;OID=.;OPOS=252559;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:32:20:0:0:32:20:0:0
chr18	334742	.	C	T	276.79	PASS	AF=0.310924;AO=37;DP=119;FAO=37;FDP=119;FR=.;FRO=82;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=44;FSRR=38;FWDB=0.0322877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.064;QD=9.30396;RBI=0.0340827;REFB=-0.0133701;REVB=0.0109149;RO=78;SAF=19;SAR=18;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0141604;STB=0.515915;STBP=0.835;TYPE=snp;VARB=0.0268092;OID=.;OPOS=334742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:78:82:37:37:0.310924:18:19:41:37:18:19:44:38
chr18	334758	.	T	C	1588.76	PASS	AF=1;AO=104;DP=105;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00932985;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.457;QD=59.3929;RBI=0.0531657;REFB=0;REVB=0.0523407;RO=0;SAF=50;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000192683;OID=.;OPOS=334758;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:105:107:0:0:104:107:1:54:50:0:0:55:52:0:0
chr18	334994	.	A	G	785.56	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.668;QD=57.1316;RBI=0.0207208;REFB=0;REVB=0.0139936;RO=0;SAF=38;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.22487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.98677e-05;OID=.;OPOS=334994;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:54:55:1:16:38:0:0:17:38:0:0
chr18	580623	.	T	C	207.66	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=21;FWDB=0.0122913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.8663;QD=15.1025;RBI=0.0254889;REFB=-0.0199445;REVB=-0.0223296;RO=30;SAF=15;SAR=9;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.280982;STB=0.666532;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0184275;OID=.;OPOS=580623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:30:31:24:24:0.436364:9:15:10:20:9:15:10:21
chr18	658064	.	G	C	484.4	PASS	AF=0.48;AO=46;DP=99;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=18;FWDB=-0.0100588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.377;QD=19.376;RBI=0.0177022;REFB=-0.0260759;REVB=-0.0145668;RO=52;SAF=20;SAR=26;SRF=34;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.206352;STB=0.611066;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0299438;OID=.;OPOS=658064;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:52:52:46:48:0.48:26:20:34:18:27:21:34:18
chr18	662247	.	A	G	571.62	PASS	AF=0.58427;AO=52;DP=89;FAO=52;FDP=89;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=15;FWDB=-0.0211304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0028;QD=25.6909;RBI=0.0211327;REFB=-0.0364909;REVB=-0.000306314;RO=37;SAF=21;SAR=31;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145935;STB=0.579786;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0266862;OID=.;OPOS=662247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:37:37:52:52:0.58427:31:21:22:15:31:21:22:15
chr18	691266	.	A	G	130.0	PASS	AF=0.384615;AO=15;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=0.00724244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.602;QD=13.3336;RBI=0.0294222;REFB=-0.0142178;REVB=-0.0285169;RO=24;SAF=8;SAR=7;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787323;STB=0.546014;STBP=0.659;TYPE=snp;VARB=0.0231167;OID=.;OPOS=691266;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:24:24:15:15:0.384615:7:8:11:13:7:8:11:13
chr18	722009	.	TAA	T	543.64	PASS	AF=1;AO=42;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00827286;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=168.981;QD=47.2728;RBI=0.023788;REFB=0;REVB=0.0223032;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=6.60969e-05;OID=.;OPOS=722010;OREF=AA;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:42:45:46:46:0:24:22:0:0:10:0:21:21:0:0
chr18	722402	.	T	C	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0708348;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.197;QD=59.0184;RBI=0.0994236;REFB=0;REVB=0.0697674;RO=0;SAF=17;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000629307;OID=.;OPOS=722402;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:17:17:0:0:17:17:0:0
chr18	724612	.	A	G	415.61	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156929;FXX=0.0333222;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.1477;QD=57.3261;RBI=0.0610074;REFB=0;REVB=0.0589546;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00220401;OID=.;OPOS=724612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr18	907675	.	G	A	321.9	PASS	AF=0.448718;AO=34;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=10;FSRR=33;FWDB=-0.0217042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.3212;QD=16.5075;RBI=0.0294287;REFB=-0.0284315;REVB=0.0198741;RO=42;SAF=14;SAR=20;SRF=9;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.21065;STB=0.61384;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=0.0417958;OID=.;OPOS=907675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:42:43:34:35:0.448718:20:14:9:33:20:15:10:33
chr18	907710	.	A	G	326.17	PASS	AF=0.523077;AO=34;DP=65;FAO=34;FDP=65;FR=.;FRO=31;FSAF=6;FSAR=28;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0427914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.5643;QD=20.0718;RBI=0.0463825;REFB=0.0250792;REVB=-0.0178952;RO=31;SAF=6;SAR=28;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251177;STB=0.641128;STBP=0.045;TYPE=snp;VARB=-0.0211434;OID=.;OPOS=907710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:31:34:34:0.523077:28:6:12:19:28:6:12:19
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chr18	3067278	.	A	G	343.13	PASS	AF=0.596491;AO=34;DP=57;FAO=34;FDP=57;FR=.;FRO=23;FSAF=18;FSAR=16;FSRF=20;FSRR=3;FWDB=0.00117481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.799;QD=24.0796;RBI=0.0406558;REFB=-0.0216116;REVB=-0.0406388;RO=23;SAF=18;SAR=16;SRF=20;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256775;STB=0.639925;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0210986;OID=.;OPOS=3067278;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:23:23:34:34:0.596491:16:18:20:3:16:18:20:3
chr18	3075503	.	C	CAAA	1287.62	PASS	AF=1;AO=76;DP=91;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00112385;FXX=0.0988902;HRUN=0;LEN=3;MLLD=250.821;QD=62.8106;RBI=0.0223712;REFB=0;REVB=0.022343;RO=6;SAF=35;SAR=41;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0177034;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=1.53265e-06;OID=.;OPOS=3075504;OREF=-;OALT=AAA;OMAPALT=CAAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:76:91:82:82:0:39:43:0:0:7:6:35:41:2:4
chr18	3075712	.	C	A	1244.79	PASS	AF=0.965116;AO=83;DP=86;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=43;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00915324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.5264;QD=57.8973;RBI=0.0386259;REFB=0.0152612;REVB=-0.0375257;RO=3;SAF=40;SAR=43;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0342003;STB=0.518068;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=-0.00752466;OID=.;OPOS=3075712;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:86:86:3:3:83:83:0.965116:43:40:3:0:43:40:3:0
chr18	3168816	.	G	A	248.13	PASS	AF=0.376623;AO=29;DP=77;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=27;FWDB=0.00536374;FXX=0.0253133;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.321;QD=12.8898;RBI=0.0366889;REFB=-0.0204779;REVB=-0.0362947;RO=47;SAF=11;SAR=18;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0755394;STB=0.537789;STBP=0.625;TYPE=snp;VARB=0.0299966;OID=.;OPOS=3168816;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:47:48:29:29:0.376623:18:11:21:26:18:11:21:27
chr18	3173964	.	G	A	179.06	PASS	AF=0.348485;AO=23;DP=66;FAO=23;FDP=66;FR=.;FRO=43;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=-0.00318263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6591;QD=10.8519;RBI=0.0164411;REFB=0.00056318;REVB=-0.0161301;RO=42;SAF=16;SAR=7;SRF=24;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.150821;STB=0.597613;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.00214072;OID=.;OPOS=3173964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:42:43:23:23:0.348485:7:16:24:18:7:16:24:19
chr18	3176040	.	C	G,T	694.14	PASS	AF=0.955556,0.0444444;AO=43,2;DP=45;FAO=43,2;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=23,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00414745,-0.00745735;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=201.538,55.7107;QD=61.7012;RBI=0.0235795,0.0100981;REFB=0,0;REVB=0.0232119,-0.00680878;RO=0;SAF=20,1;SAR=23,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000414078,0.156044;OID=.,.;OPOS=3176040,3176040;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:45:45:0:0:43,2:43,2:0.955556,0.0444444:23,1:20,1:0:0:23,1:20,1:0:0
chr18	3176063	.	C	T	168.86	PASS	AF=0.388889;AO=20;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=0.0232433;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.9967;QD=12.5083;RBI=0.0712481;REFB=-0.00204676;REVB=0.0673502;RO=34;SAF=6;SAR=14;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.287874;STB=0.632782;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00942227;OID=.;OPOS=3176063;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:34:33:20:21:0.388889:14:6:19:15:14:7:18:15
chr18	3188976	.	A	G	1873.8	PASS	AF=1;AO=121;DP=121;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00207332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.461;QD=61.4362;RBI=0.0132712;REFB=0;REVB=0.0131082;RO=0;SAF=38;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.46524e-06;OID=.;OPOS=3188976;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:122:0:0:121:122:1:83:38:0:0:83:39:0:0
chr18	3215156	.	C	G	251.53	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=-0.0106158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.867;QD=20.5332;RBI=0.0152174;REFB=-0.0257238;REVB=-0.0109029;RO=24;SAF=15;SAR=9;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50819;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0301649;OID=.;OPOS=3215156;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:25:24:24:0.489796:9:15:15:9:9:15:16:9
chr18	3215158	.	C	G	251.62	PASS	AF=0.489796;AO=24;DP=49;FAO=24;FDP=49;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.00321957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.088;QD=20.5403;RBI=0.0285908;REFB=0.00776527;REVB=0.0284089;RO=25;SAF=15;SAR=9;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014566;STB=0.50819;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=-0.007489;OID=.;OPOS=3215158;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:25:25:24:24:0.489796:9:15:16:9:9:15:16:9
chr18	3256112	.	A	G	156.96	PASS	AF=0.35;AO=17;DP=57;FAO=21;FDP=60;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=17;FWDB=0.0221102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.563;QD=10.4641;RBI=0.0221477;REFB=-0.0171224;REVB=0.0012893;RO=39;SAF=7;SAR=10;SRF=22;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.176399;STB=0.556908;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.0234974;OID=.;OPOS=3256112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:60:39:39:17:21:0.35:10:7:22:17:11:10:22:17
chr18	3571217	.	T	C	889.27	PASS	AF=0.984127;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0502058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2123;QD=56.4617;RBI=0.144833;REFB=-0.0967634;REVB=0.135853;RO=0;SAF=34;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.00266049;OID=.;OPOS=3571217;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:63:0:1:61:62:0.984127:27:34:0:0:28:34:0:1
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chr18	3656058	.	T	C	148.14	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=-0.00939499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.903;QD=17.9561;RBI=0.0466362;REFB=-0.0110613;REVB=0.04568;RO=17;SAF=9;SAR=7;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0785036;STB=0.544692;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0155282;OID=.;OPOS=3656058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:16:16:0.484848:7:9:11:6:7:9:11:6
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chr18	5396258	.	G	A	228.35	PASS	AF=0.298077;AO=31;DP=104;FAO=31;FDP=104;FR=.;FRO=73;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=48;FSRR=25;FWDB=-0.00287244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.364;QD=8.78287;RBI=0.0392076;REFB=-0.00498945;REVB=-0.0391022;RO=73;SAF=15;SAR=16;SRF=48;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207042;STB=0.620998;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.0145606;OID=.;OPOS=5396258;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:73:73:31:31:0.298077:16:15:48:25:16:15:48:25
chr18	5410574	.	A	G	1153.6	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0235382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.579;QD=60.7158;RBI=0.0248705;REFB=0;REVB=-0.00803081;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9285e-05;OID=.;OPOS=5410574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
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chr18	5960165	.	G	A	2035.83	PASS	AF=0.992424;AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=132;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.013939;FXX=0.00751823;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.951;QD=61.6918;RBI=0.0168231;REFB=-0.0422859;REVB=-0.00941907;RO=1;SAF=61;SAR=70;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00772787;STB=0.504064;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000390793;OID=.;OPOS=5960165;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:133:132:1:1:131:131:0.992424:70:61:1:0:70:61:1:0
chr18	6046717	.	T	C	2295.09	PASS	AF=0.993197;AO=145;DP=150;FAO=146;FDP=147;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0112162;FXX=0.0199987;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3353;QD=62.4514;RBI=0.0355972;REFB=-0.131011;REVB=0.033784;RO=1;SAF=79;SAR=66;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00598201;STB=0.503144;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.000439975;OID=.;OPOS=6046717;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:150:147:1:1:145:146:0.993197:66:79:1:0:67:79:1:0
chr18	6455000	.	C	T	383.85	PASS	AF=0.454545;AO=39;DP=87;FAO=40;FDP=88;FR=.;FRO=48;FSAF=22;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=26;FWDB=-0.0194839;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.2596;QD=17.4477;RBI=0.0265149;REFB=-0.0283009;REVB=0.0179838;RO=48;SAF=21;SAR=18;SRF=22;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0787315;STB=0.549975;STBP=0.422;TYPE=snp;VARB=0.0370282;OID=.;OPOS=6455000;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:88:48:48:39:40:0.454545:18:21:22:26:18:22:22:26
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chr18	6889973	.	A	G	1207.42	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139735;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.047;QD=61.1351;RBI=0.0325491;REFB=0;REVB=0.0293971;RO=0;SAF=47;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.73596e-05;OID=.;OPOS=6889973;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:31:47:0:0:31:48:0:0
chr18	6890434	.	A	G	1098.67	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372601;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.529;QD=60.2012;RBI=0.0441122;REFB=0;REVB=0.0236129;RO=0;SAF=47;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2476e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.03807e-05;OID=.;OPOS=6890434;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:26:47:0:0:26:47:0:0
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chr18	9117867	.	T	C	579.0	PASS	AF=0.604651;AO=52;DP=87;FAO=52;FDP=86;FR=.;FRO=34;FSAF=14;FSAR=38;FSRF=20;FSRR=14;FWDB=0.00765399;FXX=0.0114929;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.593;QD=26.9304;RBI=0.0248706;REFB=-0.0222441;REVB=0.0236636;RO=34;SAF=14;SAR=38;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.254742;STB=0.639547;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00933597;OID=.;OPOS=9117867;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:86:34:34:52:52:0.604651:38:14:20:14:38:14:20:14
chr18	9255718	.	G	A	40.42	PASS	AF=0.545455;AO=6;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0937048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8875;QD=14.697;RBI=0.0971438;REFB=-0.00647488;REVB=-0.0256187;RO=5;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.601011;STB=0.856027;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0219046;OID=.;OPOS=9255718;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:11:11:5:5:6:6:0.545455:1:5:0:5:1:5:0:5
chr18	9255982	.	A	G	243.67	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=63;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=-0.0154574;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=47.8625;QD=15.4711;RBI=0.0178622;REFB=-0.0145214;REVB=-0.00895134;RO=35;SAF=17;SAR=11;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255984;STB=0.644269;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0111426;OID=.;OPOS=9255982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:35:35:28:28:0.444444:11:17:12:23:11:17:12:23
chr18	9518126	.	G	A	1498.76	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0879643;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.0096;QD=59.9505;RBI=0.0913239;REFB=0;REVB=0.0245428;RO=0;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00066274;OID=.;OPOS=9518126;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:100:0:0:100:100:1:54:46:0:0:54:46:0:0
chr18	9562042	.	C	T	851.04	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0152649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.121;QD=57.6978;RBI=0.0239433;REFB=0;REVB=-0.0184463;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.92355e-05;OID=.;OPOS=9562042;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:33:26:0:0:33:26:0:0
chr18	9618005	.	A	G	805.18	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000250739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5595;QD=64.4147;RBI=0.090295;REFB=0;REVB=0.0902947;RO=0;SAF=29;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.20481e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102184;OID=.;OPOS=9618005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:21:29:0:0:21:29:0:0
chr18	9618049	.	C	T	766.17	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00579154;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.233;QD=63.8472;RBI=0.0180368;REFB=0;REVB=-0.0170817;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.01095e-05;OID=.;OPOS=9618049;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0
chr18	9887856	.	GG	CA	200.58	PASS	AF=0.428571;AO=20;DP=48;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0143687;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=155.276;QD=16.3741;RBI=0.0156823;REFB=-0.00668874;REVB=-0.00628292;RO=27;SAF=15;SAR=5;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.360537;STB=0.688439;STBP=0.025;TYPE=mnp;VARB=0.011676;OID=.;OPOS=9887856;OREF=GG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:27:28:20:21:0.428571:5:15:11:16:6:15:11:17
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chr18	9954785	.	TAAAAAAAAAT	TAAAAAAAAT,TAAAAAAATAA	173.14	PASS	AF=0.780488,0.219512;AO=9,5;DP=44;FAO=32,9;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=14,9;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426246,0.0325968;FXX=0.0681663;HRUN=9,9;LEN=1,3;MLLD=5.78416,23.7539;QD=16.8918;RBI=0.652799,0.178159;REFB=0.0908154,0.020539;REVB=0.651406,0.175152;RO=13;SAF=7,5;SAR=2,0;SRF=3;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.519322,0.781912;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=-0.0391185,0.056563;OID=.,.;OPOS=9954786,9954793;OREF=A,AAT;OALT=-,TAA;OMAPALT=TAAAAAAAAT,TAAAAAAATAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.780488,0.219512:9,5:44:32,9:41:0:14,9:18,0:0:0:49:13:7,5:2,0:3:10
chr18	10454960	.	C	G	402.48	PASS	AF=0.9375;AO=27;DP=29;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0992346;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.5692;QD=50.3097;RBI=0.099917;REFB=-0.0321084;REVB=-0.0116582;RO=2;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0516177;STB=0.527759;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.00443262;OID=.;OPOS=10454960;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:29:32:2:2:27:30:0.9375:17:10:0:2:17:13:0:2
chr18	10487918	.	C	T	1527.89	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.019;QD=63.6621;RBI=0.0287617;REFB=0;REVB=0.0153276;RO=0;SAF=52;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.67486e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125018;OID=.;OPOS=10487918;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:96:0:0:95:96:1:43:52:0:0:43:53:0:0
chr18	10741011	.	G	A	700.8	PASS	AF=0.945455;AO=52;DP=55;FAO=52;FDP=55;FR=.;FRO=3;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0082927;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=302.455;QD=50.9675;RBI=0.0237534;REFB=-0.0876392;REVB=0.0222589;RO=2;SAF=30;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.040906;STB=0.513547;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.000813841;OID=.;OPOS=10741011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:55:55:2:3:52:52:0.945455:22:30:0:2:22:30:1:2
chr18	10748603	.	A	T	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=256.5;QD=58.5858;RBI=0.0279073;REFB=0;REVB=0.000335624;RO=0;SAF=22;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.91581e-05;OID=.;OPOS=10748603;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:11:22:0:0:11:22:0:0
chr18	10752666	.	C	T	619.63	PASS	AF=1;AO=40;DP=42;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101784;FXX=0.0476077;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.583;QD=61.9628;RBI=0.0125112;REFB=0;REVB=0.00727529;RO=0;SAF=14;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011834;OID=.;OPOS=10752666;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:40:0:0:40:40:1:26:14:0:0:26:14:0:0
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chr18	10763007	.	T	C	800.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00581523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3522;QD=57.1569;RBI=0.0361977;REFB=0;REVB=-0.0357275;RO=0;SAF=36;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.75811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000278735;OID=.;OPOS=10763007;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:56:0:0:55:56:1:19:36:0:0:19:37:0:0
chr18	10787047	.	G	A	524.35	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0256381;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.616;QD=59.9258;RBI=0.0256584;REFB=0;REVB=0.00102059;RO=0;SAF=18;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11116e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.75279e-05;OID=.;OPOS=10787047;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:17:18:0:0:17:18:0:0
chr18	11609754	.	G	A	675.79	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0402222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.984;QD=60.0699;RBI=0.040927;REFB=-0.0794453;REVB=0.00756283;RO=1;SAF=27;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170841;STB=0.509087;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=0.000491885;OID=.;OPOS=11609754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:45:45:1:1:44:44:0.977778:17:27:1:0:17:27:1:0
chr18	11609863	.	G	A,C	1436.6	PASS	AF=0.956989,0.0430108;AO=88,4;DP=92;FAO=89,4;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=47,1;FSAR=42,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268901,-0.00617052;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=169.784,139.792;QD=61.7893;RBI=0.0273261,0.023557;REFB=0,0;REVB=-0.00486163,-0.0227344;RO=0;SAF=47,1;SAR=41,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.86674e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000429146,0.230244;OID=.,.;OPOS=11609863,11609863;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:92:93:0:0:88,4:89,4:0.956989,0.0430108:41,3:47,1:0:0:42,3:47,1:0:0
chr18	11609903	.	CA	GG	1446.91	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369573;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=334.93;QD=62.9093;RBI=0.0369589;REFB=0;REVB=0.000344196;RO=0;SAF=44;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=8.09843e-05;OID=.;OPOS=11609903;OREF=CA;OALT=GG;OMAPALT=GG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:48:44:0:0:48:44:0:0
chr18	11610052	.	T	C	1025.64	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176708;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.607;QD=59.4572;RBI=0.0264777;REFB=0;REVB=0.0197183;RO=0;SAF=51;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.64454e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.77029e-05;OID=.;OPOS=11610052;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:18:51:0:0:18:51:0:0
chr18	11610073	.	G	A	990.39	PASS	AF=0.958333;AO=69;DP=72;FAO=69;FDP=72;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0412415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.0234;QD=55.0216;RBI=0.0412662;REFB=-0.166845;REVB=0.00142787;RO=1;SAF=48;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00974824;STB=0.515147;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00318287;OID=.;OPOS=11610073;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:72:72:1:3:69:69:0.958333:21:48:1:0:21:48:3:0
chr18	11610163	.	G	C	1022.79	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051118;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9431;QD=59.2923;RBI=0.0717522;REFB=0;REVB=0.050352;RO=1;SAF=42;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0111219;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000800614;OID=.;OPOS=11610163;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:1:0:68:69:1:26:42:1:0:26:43:0:0
chr18	11610349	.	G	A	560.59	PASS	AF=1;AO=30;DP=39;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0411377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.04;QD=60.604;RBI=0.0940814;REFB=0;REVB=0.0846109;RO=0;SAF=8;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000728451;OID=.;OPOS=11610349;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:37:0:0:30:37:1:22:8:0:0:29:8:0:0
chr18	11610362	.	G	C	483.1	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169754;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=184.775;QD=56.8352;RBI=0.0336824;REFB=0;REVB=0.0290919;RO=0;SAF=7;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000952967;OID=.;OPOS=11610362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:34:0:0:32:34:1:25:7:0:0:27:7:0:0
chr18	11610382	.	C	A	323.43	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138206;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.9639;QD=53.9053;RBI=0.0139454;REFB=0;REVB=-0.00186138;RO=0;SAF=5;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111421;OID=.;OPOS=11610382;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:19:5:0:0:19:5:0:0
chr18	11619521	.	G	A	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00674885;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.6668;QD=18.7669;RBI=0.0898605;REFB=-0.000747623;REVB=0.0896067;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354507;STB=0.713466;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00895255;OID=.;OPOS=11619521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:1:5:1:2:1:5:1:2
chr18	11619523	.	C	A	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0143325;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.814;QD=18.767;RBI=0.0327063;REFB=-0.00565656;REVB=0.0293987;RO=3;SAF=5;SAR=1;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.354507;STB=0.713466;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=0.00378636;OID=.;OPOS=11619523;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:1:5:1:2:1:5:1:2
chr18	11619552	.	C	T	211.51	PASS	AF=1;AO=10;DP=18;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.16191;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.839;QD=49.7664;RBI=0.162675;REFB=0;REVB=0.0157658;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130363;OID=.;OPOS=11619552;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:17:0:0:10:17:1:6:4:0:0:8:9:0:0
chr18	11619799	.	ATGT	A	928.92	PASS	AF=0.970149;AO=63;DP=67;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0391864;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=216.36;QD=55.4579;RBI=0.0499169;REFB=-0.0874986;REVB=0.0309213;RO=2;SAF=40;SAR=23;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00842919;STB=0.504756;STBP=0.786;TYPE=del;VARB=0.00313672;OID=.;OPOS=11619800;OREF=TGT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.970149:63:67:65:67:2:42:23:1:1:6:2:40:23:1:1
chr18	11621414	.	C	CG	133.1	PASS	AF=1;AO=11;DP=21;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.210504;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=12.4233;QD=31.3175;RBI=0.210504;REFB=-0.0490071;REVB=0;RO=10;SAF=11;SAR=0;SRF=10;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0347852;OID=.;OPOS=11621415;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:11:21:17:17:0:17:0:0:0:3:10:11:0:10:0
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chr18	11639356	.	G	C	2823.92	PASS	AF=1;AO=177;DP=177;FAO=180;FDP=180;FR=.;FRO=0;FSAF=108;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011398;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.539;QD=62.7537;RBI=0.060509;REFB=0;REVB=0.0594258;RO=0;SAF=107;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.11096e-05;OID=.;OPOS=11639356;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:177:180:0:0:177:180:1:70:107:0:0:72:108:0:0
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chr18	12124265	.	GAC	ACA,GACA	40.26	PASS	AF=0,0.666667;AO=2,4;DP=12;FAO=0,6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=0,5;FSAR=0,1;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.118413,0.207489;FXX=0;HRUN=1,0;LEN=3,1;MLLD=36.6841,21.8281;QD=17.8946;RBI=0.118719,0.229091;REFB=-0.0427856,-0.103985;REVB=0.00851989,0.0971138;RO=6;SAF=2,3;SAR=0,1;SRF=4;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.562437,0.0959372;STB=0.5,0.713466;STBP=1,0.136;TYPE=mnp,ins;VARB=0,0.127252;OID=.,.;OPOS=12124265,12124268;OREF=GAC,-;OALT=ACA,A;OMAPALT=ACA,GACA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:14:12:9:6:3:2,4:0,6:0,0.666667:0,1:2,3:4:2:0,1:0,5:1:2
chr18	12254956	.	G	A	318.48	PASS	AF=0.375;AO=36;DP=96;FAO=36;FDP=96;FR=.;FRO=60;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=36;FSRR=24;FWDB=0.0388497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.2723;QD=13.27;RBI=0.0654169;REFB=-0.00585655;REVB=0.0526314;RO=59;SAF=26;SAR=10;SRF=35;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159492;STB=0.587715;STBP=0.225;TYPE=snp;VARB=0.0123888;OID=.;OPOS=12254956;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:59:60:36:36:0.375:10:26:35:24:10:26:36:24
chr18	12274104	.	G	T	688.21	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0669135;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0942;QD=61.1746;RBI=0.0735201;REFB=0;REVB=0.0304596;RO=0;SAF=28;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0013935;OID=.;OPOS=12274104;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:45:0:0:41:45:1:13:28:0:0:13:32:0:0
chr18	12308793	.	G	C	2982.25	PASS	AF=1;AO=185;DP=185;FAO=189;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=103;FSAR=86;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375962;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.939;QD=63.1163;RBI=0.0581229;REFB=0;REVB=0.0443261;RO=0;SAF=101;SAR=84;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107137;OID=.;OPOS=12308793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:185:189:0:0:185:189:1:84:101:0:0:86:103:0:0
chr18	12658600	.	A	G	708.91	PASS	AF=0.59292;AO=67;DP=113;FAO=67;FDP=113;FR=.;FRO=46;FSAF=45;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.000423159;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=340.185;QD=25.0942;RBI=0.0218714;REFB=-0.00787052;REVB=-0.0218673;RO=46;SAF=45;SAR=22;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0870946;STB=0.547494;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.00465704;OID=.;OPOS=12658600;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:46:46:67:67:0.59292:22:45:26:20:22:45:26:20
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chr18	12978803	.	A	G	447.35	PASS	AF=0.368794;AO=52;DP=141;FAO=52;FDP=141;FR=.;FRO=89;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=55;FWDB=0.00434983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.095;QD=12.6907;RBI=0.0180243;REFB=-0.00788535;REVB=0.0174915;RO=87;SAF=32;SAR=20;SRF=34;SRR=53;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244787;STB=0.645107;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0110525;OID=.;OPOS=12978803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:141:141:87:89:52:52:0.368794:20:32:34:53:20:32:34:55
chr18	12984144	.	C	A	594.18	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0802724;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2888;QD=60.941;RBI=0.081212;REFB=0;REVB=0.0123177;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000498735;OID=.;OPOS=12984144;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:37:39:1:21:16:0:0:21:18:0:0
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chr18	13068109	.	G	A	972.88	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00253467;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.315;QD=58.9626;RBI=0.0476614;REFB=0;REVB=-0.0475939;RO=0;SAF=44;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.98126e-05;OID=.;OPOS=13068109;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:22:44:0:0:22:44:0:0
chr18	13068132	.	T	C	927.13	PASS	AF=1;AO=49;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=42;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.149805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.561;QD=58.8656;RBI=0.150588;REFB=0;REVB=0.0153357;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325788;OID=.;OPOS=13068132;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:49:63:1:21:28:0:0:21:42:0:0
chr18	13069782	.	C	T	594.39	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0200621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.032;QD=60.9635;RBI=0.035527;REFB=0;REVB=0.0293202;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102476;OID=.;OPOS=13069782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:38:39:1:14:24:0:0:14:25:0:0
chr18	13095591	.	G	A	2121.41	PASS	AF=1;AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=76;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326204;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=91.9402;QD=62.8565;RBI=0.033729;REFB=0;REVB=-0.00857648;RO=0;SAF=76;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.14298e-05;OID=.;OPOS=13095591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:135:135:0:0:135:135:1:59:76:0:0:59:76:0:0
chr18	13095609	.	T	C	1797.12	PASS	AF=1;AO=117;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.046108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.944;QD=60.9193;RBI=0.0535256;REFB=0;REVB=0.0271854;RO=0;SAF=67;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.56177e-05;OID=.;OPOS=13095609;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:118:0:0:117:118:1:50:67:0:0:50:68:0:0
chr18	13116432	.	G	T	3147.14	PASS	AF=0.963303;AO=210;DP=219;FAO=210;FDP=218;FR=.;FRO=8;FSAF=123;FSAR=87;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.00375951;FXX=0.004566;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.959;QD=57.7456;RBI=0.00891176;REFB=-0.0708156;REVB=0.00807995;RO=3;SAF=123;SAR=87;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0114756;STB=0.510978;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.000717074;OID=.;OPOS=13116432;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:219:218:3:8:210:210:0.963303:87:123:3:0:87:123:7:1
chr18	13650245	.	T	TTGC	199.85	PASS	AF=0.347222;AO=25;DP=89;FAO=25;FDP=72;FR=.;FRO=47;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=23;FWDB=-0.00495899;FXX=0.0270234;HRUN=3;LEN=3;MLLD=210.548;QD=11.1029;RBI=0.0107315;REFB=-0.0488886;REVB=-0.00951703;RO=64;SAF=10;SAR=15;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212626;STB=0.572975;STBP=0.374;TYPE=ins;VARB=0.089241;OID=.;OPOS=13650246;OREF=-;OALT=TGC;OMAPALT=TTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.347222:25:89:25:72:47:10:15:24:23:99:64:10:15:37:27
chr18	13715334	.	A	G	220.83	PASS	AF=0.478261;AO=20;DP=43;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.168084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.668;QD=19.2029;RBI=0.168917;REFB=-0.0114795;REVB=0.0167536;RO=23;SAF=8;SAR=12;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00853815;STB=0.518502;STBP=0.81;TYPE=snp;VARB=0.0128878;OID=.;OPOS=13715334;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:46:23:24:20:22:0.478261:12:8:9:14:13:9:9:15
chr18	13760290	.	T	C	522.58	PASS	AF=0.505051;AO=49;DP=99;FAO=50;FDP=99;FR=.;FRO=49;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=25;FWDB=0.0190417;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.9566;QD=21.1143;RBI=0.0347306;REFB=-0.00612146;REVB=-0.0290453;RO=48;SAF=27;SAR=22;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458625;STB=0.534945;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.00570016;OID=.;OPOS=13760290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:48:49:49:50:0.505051:22:27:24:24:22:28:24:25
chr18	13826007	.	G	T	219.03	PASS	AF=0.350649;AO=27;DP=76;FAO=27;FDP=77;FR=.;FRO=50;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=23;FSRR=27;FWDB=-0.00943409;FXX=0.0128189;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.927;QD=11.3781;RBI=0.0097232;REFB=-0.0108758;REVB=-0.0023534;RO=49;SAF=17;SAR=10;SRF=22;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.2024;STB=0.61119;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.0184134;OID=.;OPOS=13826007;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:49:50:27:27:0.350649:10:17:22:27:10:17:23:27
chr18	13826508	.	C	T	460.43	PASS	AF=0.517241;AO=45;DP=87;FAO=45;FDP=87;FR=.;FRO=42;FSAF=19;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.00127626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.568;QD=21.1691;RBI=0.004918;REFB=-0.0219666;REVB=0.00474952;RO=40;SAF=19;SAR=26;SRF=20;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671383;STB=0.538007;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.0200044;OID=.;OPOS=13826508;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:40:42:45:45:0.517241:26:19:20:20:26:19:21:21
chr18	13826837	.	A	C	75.04	PASS	AF=0.212121;AO=5;DP=37;FAO=7;FDP=33;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=22;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=0.0040276;FXX=0.108079;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.378;QD=9.09621;RBI=0.00476591;REFB=-0.00649398;REVB=-0.00254801;RO=17;SAF=2;SAR=3;SRF=4;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.214099;STB=0.685231;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0830224;OID=.;OPOS=13826837;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:37:33:17:22:5:7:0.212121:3:2:4:13:3:4:7:15
chr18	14105016	.	C	A	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0222468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.521;QD=57.6804;RBI=0.0240082;REFB=0;REVB=0.00902636;RO=0;SAF=11;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190973;OID=.;OPOS=14105016;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:20:11:0:0:20:11:0:0
chr18	14105853	.	C	A	892.64	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0023253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.682;QD=57.5899;RBI=0.0127919;REFB=0;REVB=-0.0125788;RO=0;SAF=39;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.01474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00317088;OID=.;OPOS=14105853;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:22:39:0:0:23:39:0:0
chr18	14105923	.	T	C	800.65	PASS	AF=0.951613;AO=58;DP=62;FAO=59;FDP=62;FR=.;FRO=3;FSAF=35;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0176316;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=263.18;QD=51.6545;RBI=0.0200007;REFB=-0.233718;REVB=0.00944221;RO=1;SAF=34;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136737;STB=0.512961;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=0.000780044;OID=.;OPOS=14105923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:62:62:1:3:58:59:0.951613:24:34:1:0:24:35:1:2
chr18	14186497	.	G	C	740.41	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186145;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.121;QD=56.9547;RBI=0.0212686;REFB=0;REVB=0.0102885;RO=0;SAF=27;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.34581e-05;OID=.;OPOS=14186497;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:25:27:0:0:25:27:0:0
chr18	14187273	.	C	G	62.38	PASS	AF=0.28125;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=32;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0176549;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.431;QD=7.79758;RBI=0.0328121;REFB=-0.00407759;REVB=-0.0276575;RO=22;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.466156;STB=0.798019;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.017255;OID=.;OPOS=14187273;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:32:22:23:9:9:0.28125:2:7:8:14:2:7:8:15
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chr18	14759244	.	G	C	301.1	PASS	AF=0.4;AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=0.00246452;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.641;QD=14.1694;RBI=0.0523341;REFB=0.00377871;REVB=-0.0522761;RO=51;SAF=15;SAR=19;SRF=21;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0316191;STB=0.51796;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=-0.00531327;OID=.;OPOS=14759244;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:51:51:34:34:0.4:19:15:21:30:19:15:21:30
chr18	14779969	.	C	G	221.2	PASS	AF=0.350649;AO=27;DP=74;FAO=27;FDP=77;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=-0.00232134;FXX=0.0374953;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.122;QD=11.4909;RBI=0.0111909;REFB=-0.00773944;REVB=-0.0109475;RO=47;SAF=12;SAR=15;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119358;STB=0.549096;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0151828;OID=.;OPOS=14779969;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:77:47:50:27:27:0.350649:15:12:26:21:15:12:26:24
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chr18	14848820	.	C	T	447.55	PASS	AF=0.790698;AO=34;DP=44;FAO=34;FDP=43;FR=.;FRO=9;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0175628;FXX=0.0227221;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.806;QD=41.6322;RBI=0.0338147;REFB=-0.0547151;REVB=0.028896;RO=6;SAF=16;SAR=18;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00821866;STB=0.528909;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00505236;OID=.;OPOS=14848820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:44:43:6:9:34:34:0.790698:18:16:3:3:18:16:3:6
chr18	14848821	.	G	A	43.37	PASS	AF=0.173913;AO=5;DP=43;FAO=8;FDP=46;FR=.;FRO=38;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.00867228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.248;QD=3.77088;RBI=0.033941;REFB=-0.0025006;REVB=-0.0328144;RO=35;SAF=2;SAR=3;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0337836;STB=0.561641;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.0123105;OID=.;OPOS=14848821;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:43:46:35:38:5:8:0.173913:3:2:15:20:5:3:17:21
chr18	14850375	.	G	A	117.79	PASS	AF=0.451613;AO=13;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=15;FWDB=0.0106728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.934;QD=15.1982;RBI=0.0221505;REFB=-0.00227073;REVB=-0.0194097;RO=17;SAF=1;SAR=12;SRF=2;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.120688;STB=0.581956;STBP=0.684;TYPE=snp;VARB=0.00183908;OID=.;OPOS=14850375;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:13:14:0.451613:12:1:2:15:13:1:2:15
chr18	18529872	.	A	G	74.58	PASS	AF=0.211538;AO=8;DP=49;FAO=11;FDP=52;FR=.;FRO=41;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=32;FSRR=9;FWDB=0.0214764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.303;QD=5.73668;RBI=0.0365388;REFB=-0.0100263;REVB=0.029561;RO=40;SAF=6;SAR=2;SRF=31;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0419938;STB=0.693142;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0288822;OID=.;OPOS=18529872;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:49:52:40:41:8:11:0.211538:2:6:31:9:5:6:32:9
chr18	18529880	.	G	A	88.79	PASS	AF=0.236364;AO=13;DP=55;FAO=13;FDP=55;FR=.;FRO=42;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=9;FWDB=-0.0341359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.619;QD=6.45729;RBI=0.0512257;REFB=-0.00772486;REVB=-0.0381944;RO=41;SAF=6;SAR=7;SRF=32;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.390555;STB=0.739542;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=0.021255;OID=.;OPOS=18529880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:55:55:41:42:13:13:0.236364:7:6:32:9:7:6:33:9
chr18	19034556	.	T	C	1953.05	PASS	AF=1;AO=123;DP=124;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0721128;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.973;QD=62.0016;RBI=0.072245;REFB=0;REVB=-0.00436748;RO=0;SAF=65;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.57464e-05;OID=.;OPOS=19034556;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:124:126:0:0:123:126:1:58:65:0:0:58:68:0:0
chr18	19079853	.	A	G	1540.56	PASS	AF=1;AO=103;DP=103;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282919;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.84;QD=59.8277;RBI=0.0320306;REFB=0;REVB=0.0150175;RO=0;SAF=54;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.95759e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.29814e-05;OID=.;OPOS=19079853;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:103:0:0:103:103:1:49:54:0:0:49:54:0:0
chr18	19100758	.	A	ATCT,T	237.47	PASS	AF=0.575,0;AO=20,2;DP=41;FAO=23,0;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=9,0;FSAR=14,0;FSRF=16;FSRR=1;FWDB=-0.0083507,-0.0676695;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=155.664,48.5605;QD=23.7472;RBI=0.0146901,0.0679274;REFB=-0.0614147,-0.0288726;REVB=0.0120858,0.00591302;RO=18;SAF=9,0;SAR=11,2;SRF=17;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.408898,-0.799984;STB=0.721478,0.5;STBP=0.002,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.0375845,0;OID=.,.;OPOS=19100759,19100758;OREF=-,A;OALT=TCT,T;OMAPALT=ATCT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:40:18:17:20,2:23,0:0.575,0:11,2:9,0:17:1:14,0:9,0:16:1
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chr18	19154143	.	G	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00122902;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.061;QD=56.1912;RBI=0.0436025;REFB=0;REVB=-0.0435852;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000423238;OID=.;OPOS=19154143;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
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chr18	19373993	.	G	A	195.19	PASS	AF=0.418182;AO=23;DP=55;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00401656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.344;QD=14.1959;RBI=0.00665672;REFB=-0.00710014;REVB=0.00530841;RO=31;SAF=9;SAR=14;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.15915;STB=0.582328;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00603752;OID=.;OPOS=19373993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:32:23:23:0.418182:14:9:17:14:14:9:17:15
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chr18	19408971	.	CAAA	CAA,CAAT	288.89	PASS	AF=0.675676,0.324324;AO=5,3;DP=37;FAO=25,12;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=7,12;FSAR=18,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12159,0.0837313;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=8.20687,175.529;QD=31.2317;RBI=1.0412,0.11818;REFB=0,0;REVB=1.03408,0.0834;RO=17;SAF=5,3;SAR=0,0;SRF=0;SRR=17;SSEN=0.34375,0;SSEP=0,0;SSSB=0.861835,0.857131;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0115247,0.0856626;OID=.,.;OPOS=19408972,19408974;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=CAA,CAAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.675676,0.324324:5,3:37:25,12:37:0:7,12:18,0:0:0:91:17:5,3:0,0:0:17
chr18	19449304	.	A	G	353.22	PASS	AF=0.59322;AO=35;DP=59;FAO=35;FDP=59;FR=.;FRO=24;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0385056;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.0117;QD=23.9472;RBI=0.068226;REFB=0.0260201;REVB=-0.0563214;RO=24;SAF=20;SAR=15;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407537;STB=0.522375;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=-0.0180306;OID=.;OPOS=19449304;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:24:24:35:35:0.59322:15:20:15:9:15:20:15:9
chr18	19450386	.	T	C	81.26	PASS	AF=0.275;AO=11;DP=40;FAO=11;FDP=40;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.00681932;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=90.3086;QD=8.12635;RBI=0.0295235;REFB=-0.0186964;REVB=0.0287252;RO=29;SAF=6;SAR=5;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.233502;STB=0.642612;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0244229;OID=.;OPOS=19450386;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:40:40:29:29:11:11:0.275:5:6:10:19:5:6:10:19
chr18	19508949	.	G	A	162.39	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0472113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.462;QD=43.3029;RBI=0.0474753;REFB=0;REVB=-0.00499967;RO=0;SAF=4;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000563975;OID=.;OPOS=19508949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:15:15:0:0:14:15:1:10:4:0:0:11:4:0:0
chr18	19840623	.	A	G	1305.33	PASS	AF=1;AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0768207;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.1969;QD=62.1588;RBI=0.0768702;REFB=0;REVB=0.00275618;RO=0;SAF=39;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.03564e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000413355;OID=.;OPOS=19840623;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:84:0:0:83:84:1:44:39:0:0:45:39:0:0
chr18	19995753	.	T	C	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00502244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.821;QD=64.1537;RBI=0.00745772;REFB=0;REVB=0.00551295;RO=0;SAF=25;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.91721e-07;OID=.;OPOS=19995753;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:24:25:0:0:24:25:0:0
chr18	19996011	.	G	A	137.97	PASS	AF=0.736842;AO=14;DP=19;FAO=14;FDP=19;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0253534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7046;QD=29.0471;RBI=0.106152;REFB=-0.0171374;REVB=0.10308;RO=5;SAF=7;SAR=7;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471926;STB=0.526278;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0110686;OID=.;OPOS=19996011;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:19:19:5:5:14:14:0.736842:7:7:3:2:7:7:3:2
chr18	20838286	.	G	T	186.79	PASS	AF=0.383333;AO=24;DP=61;FAO=23;FDP=60;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.132048;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.7317;QD=12.4523;RBI=0.155017;REFB=-0.0399985;REVB=-0.081201;RO=36;SAF=17;SAR=7;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175972;STB=0.586843;STBP=0.34;TYPE=snp;VARB=0.0599165;OID=.;OPOS=20838286;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:36:37:24:23:0.383333:7:17:20:16:7:16:21:16
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chr18	20957586	.	TTG	T,TT,TTT	37.89	PASS	AF=0.0227273,0.113636,0;AO=26,27,6;DP=136;FAO=3,15,0;FDP=132;FR=.;FRO=114;FSAF=2,13,0;FSAR=1,2,0;FSRF=56;FSRR=58;FWDB=0.000911244,0.0178408,0.0162558;FXX=0.00751823;HRUN=5,6,6;LEN=2,1,1;MLLD=22.401,11.0068,19.3531;QD=1.14806;RBI=0.332423,0.296606,0.0464707;REFB=-0.0252778,-0.0644378,-0.0365854;REVB=-0.332422,-0.296069,0.0435347;RO=75;SAF=5,18,0;SAR=21,9,6;SRF=47;SRR=28;SSEN=0,0.722222,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.526218,0.0537161,-0.614156;STB=0.669328,0.849185,0.5;STBP=0.554,0.009,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.162482,0.155132,0;OID=.,.,.;OPOS=20957587,20957588,20957588;OREF=TG,G,G;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0227273,0.113636,0:26,27,6:136:3,15,0:132:114:2,13,0:1,2,0:56:58:28:75:5,18,0:21,9,6:47:28
chr18	21017836	.	T	C	454.49	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00774015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.313;QD=56.8117;RBI=0.0127659;REFB=0;REVB=0.0101518;RO=0;SAF=13;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.90252e-05;OID=.;OPOS=21017836;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:31:32:1:18:13:0:0:19:13:0:0
chr18	21100240	.	C	T	1955.81	PASS	AF=0.977612;AO=129;DP=134;FAO=131;FDP=134;FR=.;FRO=3;FSAF=74;FSAR=57;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0262834;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.3;QD=58.3823;RBI=0.0266322;REFB=-0.189183;REVB=0.00429573;RO=5;SAF=72;SAR=57;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0318599;STB=0.509932;STBP=0.153;TYPE=snp;VARB=0.0014688;OID=.;OPOS=21100240;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:134:134:5:3:129:131:0.977612:57:72:5:0:57:74:3:0
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chr18	21511089	.	A	G	1767.08	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=75;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0642146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.127;QD=60.934;RBI=0.0661585;REFB=0;REVB=-0.0159194;RO=0;SAF=74;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.91839e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.48912e-05;OID=.;OPOS=21511089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:116:0:0:115:116:1:41:74:0:0:41:75:0:0
chr18	21513768	.	C	T	520.26	PASS	AF=0.451613;AO=56;DP=124;FAO=56;FDP=124;FR=.;FRO=68;FSAF=26;FSAR=30;FSRF=43;FSRR=25;FWDB=-0.015095;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.0577;QD=16.7826;RBI=0.0151468;REFB=-0.0001245;REVB=0.00125157;RO=68;SAF=26;SAR=30;SRF=43;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164319;STB=0.591397;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-7.18199e-05;OID=.;OPOS=21513768;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:124:68:68:56:56:0.451613:30:26:43:25:30:26:43:25
chr18	21710321	.	C	T	2673.05	PASS	AF=1;AO=171;DP=171;FAO=172;FDP=172;FR=.;FRO=0;FSAF=81;FSAR=91;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.02013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.442;QD=62.1639;RBI=0.022702;REFB=0;REVB=-0.0104958;RO=0;SAF=80;SAR=91;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.94473e-05;OID=.;OPOS=21710321;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:171:172:0:0:171:172:1:91:80:0:0:91:81:0:0
chr18	21735784	.	G	A	343.18	PASS	AF=0.493151;AO=36;DP=73;FAO=36;FDP=73;FR=.;FRO=37;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=-0.0313093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0121;QD=18.8042;RBI=0.0462229;REFB=-0.0315915;REVB=-0.0340041;RO=37;SAF=21;SAR=15;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114464;STB=0.563515;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.0392892;OID=.;OPOS=21735784;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:37:37:36:36:0.493151:15:21:26:11:15:21:26:11
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chr18	25616451	.	A	T	433.45	PASS	AF=0.621212;AO=41;DP=66;FAO=41;FDP=66;FR=.;FRO=25;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=6.98305e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.446;QD=26.2695;RBI=0.00585213;REFB=-0.0332588;REVB=0.00585171;RO=25;SAF=18;SAR=23;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0841575;STB=0.545972;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0216876;OID=.;OPOS=25616451;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:25:25:41:41:0.621212:23:18:14:11:23:18:14:11
chr18	28570025	.	G	T	917.69	PASS	AF=1;AO=62;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0520153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.1977;QD=58.2663;RBI=0.0575986;REFB=0;REVB=0.0247388;RO=0;SAF=30;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000122889;OID=.;OPOS=28570025;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:62:63:1:32:30:0:0:33:30:0:0
chr18	28586964	.	A	G	1453.3	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00683363;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.679;QD=63.1871;RBI=0.0317114;REFB=0;REVB=0.0309664;RO=0;SAF=37;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.44697e-05;OID=.;OPOS=28586964;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:92:0:0:90:92:1:53:37:0:0:55:37:0:0
chr18	28587982	.	C	CT,T	36.09	PASS	AF=0.207547,0.0188679;AO=6,8;DP=54;FAO=11,1;FDP=53;FR=.;FRO=41;FSAF=10,1;FSAR=1,0;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=-0.130783,-0.0330563;FXX=0.036357;HRUN=3,2;LEN=1,1;MLLD=14.0547,29.8507;QD=2.72378;RBI=0.13588,0.0463146;REFB=-0.0794288,-0.0485073;REVB=0.0368697,0.0324396;RO=38;SAF=5,8;SAR=1,0;SRF=15;SRR=23;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.497628,0.734891;STB=0.89476,0.9911;STBP=0.005,0.273;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00239322,0.138209;OID=.,.;OPOS=28587983,28587982;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:54:53:38:41:6,8:11,1:0.207547,0.0188679:1,0:5,8:15:23:1,0:10,1:18:23
chr18	28605852	.	A	C	324.06	PASS	AF=0.622222;AO=27;DP=44;FAO=28;FDP=45;FR=.;FRO=17;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.0024586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.097;QD=28.8053;RBI=0.0265679;REFB=-0.0170872;REVB=0.0264539;RO=17;SAF=18;SAR=9;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226076;STB=0.61157;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00775392;OID=.;OPOS=28605852;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:17:17:27:28:0.622222:9:18:6:11:10:18:6:11
chr18	28610988	.	C	T	789.79	PASS	AF=0.907692;AO=59;DP=65;FAO=59;FDP=65;FR=.;FRO=6;FSAF=43;FSAR=16;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0147815;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.6741;QD=48.6025;RBI=0.0147815;REFB=0.00832817;REVB=-8.38302e-06;RO=5;SAF=43;SAR=16;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0236603;STB=0.52607;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=-0.00530937;OID=.;OPOS=28610988;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:65:65:5:6:59:59:0.907692:16:43:3:2:16:43:3:3
chr18	28611061	.	A	T	1394.37	PASS	AF=1;AO=86;DP=89;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0044449;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3281;QD=61.2908;RBI=0.0815643;REFB=0;REVB=0.0814431;RO=0;SAF=57;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00609098;OID=.;OPOS=28611061;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:91:0:0:86:91:1:29:57:0:0:32:59:0:0
chr18	28611139	.	A	C	745.14	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109023;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=122.289;QD=63.4158;RBI=0.0269254;REFB=0;REVB=0.0246194;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129663;OID=.;OPOS=28611139;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:20:27:0:0:20:27:0:0
chr18	28720147	.	C	T	671.95	PASS	AF=0.51938;AO=66;DP=128;FAO=67;FDP=129;FR=.;FRO=62;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=0.011232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.307;QD=20.8355;RBI=0.0148883;REFB=-0.0257021;REVB=-0.00977263;RO=61;SAF=34;SAR=32;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020398;STB=0.510768;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0179121;OID=.;OPOS=28720147;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:129:61:62:66:67:0.51938:32:34:30:31:32:35:31:31
chr18	28722039	.	G	A	1152.11	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0440207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6192;QD=60.6376;RBI=0.0440248;REFB=0;REVB=0.000600436;RO=0;SAF=45;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000265242;OID=.;OPOS=28722039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:75:76:1:30:45:0:0:30:46:0:0
chr18	28722103	.	T	C	1208.21	PASS	AF=1;AO=64;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=48;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.356;QD=61.1751;RBI=0.0555361;REFB=0;REVB=0.0478258;RO=0;SAF=36;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21899e-05;OID=.;OPOS=28722103;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:64:79:1:28:36:0:0:31:48:0:0
chr18	28722104	.	A	C	86.78	PASS	AF=0.1875;AO=15;DP=80;FAO=15;FDP=80;FR=.;FRO=65;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=36;FSRR=29;FWDB=-0.0325125;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=66.2884;QD=4.3391;RBI=0.0713815;REFB=-0.00602775;REVB=0.0635472;RO=65;SAF=12;SAR=3;SRF=36;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343511;STB=0.726942;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.00216378;OID=.;OPOS=28722104;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:80:80:65:65:15:15:0.1875:3:12:36:29:3:12:36:29
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chr18	28968371	.	G	A	2406.04	PASS	AF=0.9875;AO=121;DP=161;FAO=158;FDP=160;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=80;FSAR=78;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0656057;FXX=0.00621079;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.3274;QD=60.151;RBI=0.265235;REFB=0;REVB=0.256993;RO=0;SAF=75;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.04499e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00242671;OID=.;OPOS=28968371;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:161:160:0:0:121:158:0.9875:46:75:0:0:78:80:0:0
chr18	28968959	.	C	T	1064.24	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0529316;FXX=0.013887;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.77;QD=59.9573;RBI=0.062018;REFB=0;REVB=0.0323184;RO=0;SAF=34;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.19402e-05;OID=.;OPOS=28968959;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:37:34:0:0:37:34:0:0
chr18	28986333	.	A	C	926.76	PASS	AF=0.984615;AO=64;DP=65;FAO=64;FDP=65;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=30;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0380874;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.528;QD=57.0312;RBI=0.038137;REFB=-0.0262844;REVB=0.00194504;RO=0;SAF=34;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.507244;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.000106168;OID=.;OPOS=28986333;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:65:0:1:64:64:0.984615:30:34:0:0:30:34:1:0
chr18	28993183	.	A	G	361.75	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425116;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.5608;QD=55.6539;RBI=0.0453586;REFB=0;REVB=0.0158166;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000492433;OID=.;OPOS=28993183;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chr18	28993501	.	C	A	62.25	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00506102;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=51.1122;QD=35.5733;RBI=0.0107948;REFB=0;REVB=0.00953487;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124023;OID=.;OPOS=28993501;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:5:2:0:0:5:2:0:0
chr18	29046606	.	G	A	634.91	PASS	AF=0.467626;AO=65;DP=140;FAO=65;FDP=139;FR=.;FRO=74;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=46;FSRR=28;FWDB=0.0205918;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.275;QD=18.2707;RBI=0.0205926;REFB=-0.0121299;REVB=0.000175348;RO=74;SAF=37;SAR=28;SRF=46;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517124;STB=0.528654;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0121729;OID=.;OPOS=29046606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:139:74:74:65:65:0.467626:28:37:46:28:28:37:46:28
chr18	29055957	.	A	G	2258.45	PASS	AF=1;AO=142;DP=143;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=83;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00233751;FXX=0.00699252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.0086;QD=63.6184;RBI=0.0529394;REFB=0;REVB=0.0528877;RO=0;SAF=83;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000484838;OID=.;OPOS=29055957;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:143:142:0:0:142:142:1:59:83:0:0:59:83:0:0
chr18	29104698	.	C	T	728.48	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0489663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.554;QD=63.3463;RBI=0.0592977;REFB=0;REVB=0.0334443;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.52595e-05;OID=.;OPOS=29104698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:24:21:0:0:25:21:0:0
chr18	29122799	.	G	A	184.34	PASS	AF=0.592593;AO=10;DP=28;FAO=16;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.00648755;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.57;QD=27.3089;RBI=0.0505801;REFB=-0.0374764;REVB=0.0501623;RO=8;SAF=7;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0662608;STB=0.581988;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0423127;OID=.;OPOS=29122799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:28:27:8:9:10:16:0.592593:3:7:5:3:9:7:6:3
chr18	29125854	.	A	G	105.76	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0455373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.586;QD=11.434;RBI=0.0462933;REFB=-0.00532798;REVB=0.00833178;RO=24;SAF=2;SAR=11;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.408339;STB=0.748252;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0128509;OID=.;OPOS=29125854;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:24:24:13:13:0.351351:11:2:11:13:11:2:11:13
chr18	29126670	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=259.198;QD=58.5877;RBI=0.0388378;REFB=0;REVB=0.0340481;RO=0;SAF=11;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00012853;OID=.;OPOS=29126670;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:22:11:0:0:22:11:0:0
chr18	29178513	.	G	C	569.71	PASS	AF=0.458015;AO=60;DP=131;FAO=60;FDP=131;FR=.;FRO=71;FSAF=38;FSAR=22;FSRF=46;FSRR=25;FWDB=-0.0121156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.033;QD=17.3956;RBI=0.0183082;REFB=-0.0182456;REVB=0.0137261;RO=71;SAF=38;SAR=22;SRF=46;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0153388;STB=0.508528;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0229908;OID=.;OPOS=29178513;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:131:131:71:71:60:60:0.458015:22:38:46:25:22:38:46:25
chr18	29204762	.	A	G	182.57	PASS	AF=0.452381;AO=17;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=8;FWDB=-0.0838645;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.1313;QD=17.3874;RBI=0.0869156;REFB=-0.0227966;REVB=0.0228267;RO=20;SAF=10;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0610493;STB=0.569549;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.0176266;OID=.;OPOS=29204762;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:23:17:19:0.452381:7:10:13:7:9:10:15:8
chr18	29339910	.	G	T	124.99	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.953;QD=41.6619;RBI=0.0340586;REFB=0;REVB=0.0140863;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00101325;OID=.;OPOS=29339910;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0
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chr18	29710880	.	A	AAG,G	1254.52	PASS	AF=0.92,0;AO=82,8;DP=110;FAO=92,0;FDP=100;FR=.;FRO=8;FSAF=41,0;FSAR=51,0;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0347411,0.0343549;FXX=0.0384578;HRUN=2,2;LEN=2,1;MLLD=314.622,187.127;QD=50.1809;RBI=0.0348325,0.0351001;REFB=0.00782304,-0.00397887;REVB=0.00252159,-0.00719476;RO=14;SAF=37,3;SAR=45,5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0261343,0.020009;STB=0.514471,0.5;STBP=0.32,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00140114,0;OID=.,.;OPOS=29710881,29710880;OREF=-,A;OALT=AG,G;OMAPALT=AAG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:110:100:14:8:82,8:92,0:0.92,0:45,5:37,3:5:9:51,0:41,0:5:3
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chr18	29795101	.	T	C	1593.83	PASS	AF=1;AO=89;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.594;QD=64.3971;RBI=0.0863494;REFB=0;REVB=0.0849145;RO=0;SAF=54;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119336;OID=.;OPOS=29795101;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:89:99:1:35:54:0:0:45:54:0:0
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chr18	30050356	.	C	T	999.14	PASS	AF=0.945946;AO=71;DP=75;FAO=70;FDP=74;FR=.;FRO=4;FSAF=39;FSAR=31;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.123997;FXX=0.0133316;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1621;QD=54.0078;RBI=0.124476;REFB=-0.0463201;REVB=-0.0109097;RO=4;SAF=39;SAR=32;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0460647;STB=0.524383;STBP=0.091;TYPE=snp;VARB=0.019134;OID=.;OPOS=30050356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:75:74:4:4:71:70:0.945946:32:39:4:0:31:39:4:0
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chr18	30846894	.	TA	T,TT	903.68	PASS	AF=0.015873,0.984127;AO=12,51;DP=63;FAO=1,62;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=1,41;FSAR=0,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242446,0.0326268;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=133.998,144.538;QD=57.3764;RBI=0.0918639,0.0758211;REFB=0,0;REVB=-0.0886069,-0.0684421;RO=0;SAF=11,31;SAR=1,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.23983e-08,4.13361e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0269093,0.00172773;OID=.,.;OPOS=30846895,30846895;OREF=A,A;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.015873,0.984127:12,51:63:1,62:63:0:1,41:0,21:0:0:5:0:11,31:1,20:0:0
chr18	31320229	.	A	G	139.92	PASS	AF=0.333333;AO=18;DP=54;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0142403;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.2386;QD=10.3646;RBI=0.0196849;REFB=-0.017955;REVB=-0.0135908;RO=33;SAF=9;SAR=9;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0501683;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0356644;OID=.;OPOS=31320229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:33:36:18:18:0.333333:9:9:15:18:9:9:18:18
chr18	31324934	.	A	G	203.45	PASS	AF=0.571429;AO=19;DP=35;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00376474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.985;QD=23.2517;RBI=0.00404589;REFB=-0.0399193;REVB=-0.00148189;RO=15;SAF=13;SAR=6;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129356;STB=0.579535;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0325336;OID=.;OPOS=31324934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:15:15:19:20:0.571429:6:13:8:7:6:14:8:7
chr18	32826088	.	A	G	223.92	PASS	AF=0.478261;AO=21;DP=45;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.0561786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3346;QD=19.4713;RBI=0.0926756;REFB=-0.016193;REVB=0.073707;RO=24;SAF=8;SAR=13;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264895;STB=0.65611;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0221044;OID=.;OPOS=32826088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:24:24:21:22:0.478261:13:8:16:8:14:8:16:8
chr18	32888546	.	C	A	482.65	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0353852;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1494;QD=58.5033;RBI=0.0574336;REFB=0;REVB=-0.0452383;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00146877;OID=.;OPOS=32888546;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:32:33:1:16:16:0:0:16:17:0:0
chr18	32917644	.	T	C	690.1	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0171085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.5578;QD=62.7367;RBI=0.0344389;REFB=0;REVB=0.0298888;RO=0;SAF=28;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376672;OID=.;OPOS=32917644;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:15:28:0:0:16:28:0:0
chr18	32947616	.	A	ATTTTAT,ATTTTATT	425.11	PASS	AF=0.891892,0;AO=25,5;DP=40;FAO=33,0;FDP=37;FR=.;FRO=4;FSAF=18,0;FSAR=15,0;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0110772,-0.0126694;FXX=0.0512689;HRUN=4,4;LEN=6,7;MLLD=284.59,276.918;QD=45.9579;RBI=0.0271978,0.0316355;REFB=-0.000407976,-0.0009535;REVB=-0.0248398,-0.0289878;RO=8;SAF=13,3;SAR=12,2;SRF=5;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.046837,-0.0255761;STB=0.504947,0.5;STBP=0.914,1;TYPE=ins,ins;VARB=0.000248786,0;OID=.,.;OPOS=32947617,32947617;OREF=-,-;OALT=TTTTAT,TTTTATT;OMAPALT=ATTTTAT,ATTTTATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.891892,0:25,5:40:33,0:37:4:18,0:15,0:2:2:23:8:13,3:12,2:5:3
chr18	33290678	.	C	CTGAT,T	532.22	PASS	AF=0.425532,0.12766;AO=40,12;DP=94;FAO=40,12;FDP=94;FR=.;FRO=42;FSAF=25,12;FSAR=15,0;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.00598355,-0.0121281;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=213.228,122.882;QD=22.6478;RBI=0.0305857,0.0207859;REFB=-0.0058455,-0.00244495;REVB=0.0299947,0.0168809;RO=42;SAF=25,12;SAR=15,0;SRF=22;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0964821,0.745445;STB=0.55377,0.998952;STBP=0.364,0;TYPE=ins,snp;VARB=0.00903183,-0.0102556;OID=.,.;OPOS=33290679,33290678;OREF=-,C;OALT=TGAT,T;OMAPALT=CTGAT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:42:42:40,12:40,12:0.425532,0.12766:15,0:25,12:22:20:15,0:25,12:22:20
chr18	33557466	.	A	G	356.57	PASS	AF=0.5;AO=37;DP=74;FAO=37;FDP=74;FR=.;FRO=37;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0254926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.17;QD=19.2738;RBI=0.0271753;REFB=-0.00245479;REVB=-0.00941406;RO=37;SAF=26;SAR=11;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160966;STB=0.589901;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00261931;OID=.;OPOS=33557466;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:37:37:37:37:0.5:11:26:20:17:11:26:20:17
chr18	33572779	.	G	A,GA	41.14	PASS	AF=0,0.45;AO=3,5;DP=21;FAO=0,9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=0,8;FSAR=0,1;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.00714595,0.01282;FXX=0;HRUN=1,5;LEN=1,1;MLLD=262.446,8.60609;QD=8.22852;RBI=0.0127105,0.168983;REFB=-0.00941568,-0.147487;REVB=0.0105115,0.168496;RO=13;SAF=3,5;SAR=0,0;SRF=5;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.671217,0.741485;STB=0.5,0.84124;STBP=1,0.015;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.198042;OID=.,.;OPOS=33572779,33572780;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:34:21:20:13:11:3,5:0,9:0,0.45:0,0:3,5:5:8:0,1:0,8:4:7
chr18	33647254	.	A	C	689.42	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.583;QD=62.6744;RBI=0.0464416;REFB=0;REVB=0.0244587;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290996;OID=.;OPOS=33647254;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:21:22:0:0:22:22:0:0
chr18	33706614	.	C	G	1537.47	PASS	AF=1;AO=95;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00691577;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.469;QD=63.4007;RBI=0.0493819;REFB=0;REVB=0.0488953;RO=1;SAF=58;SAR=37;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00810635;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000210798;OID=.;OPOS=33706614;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:97:1:0:95:97:1:37:58:1:0:38:59:0:0
chr18	33721325	.	C	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000219806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.5216;QD=52.612;RBI=0.0533732;REFB=0;REVB=-0.0533727;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00109163;OID=.;OPOS=33721325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr18	33721376	.	G	C	30.52	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.00421705;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=202.861;QD=11.0986;RBI=0.0042691;REFB=-0.0375328;REVB=-0.000664588;RO=5;SAF=3;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538311;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0311691;OID=.;OPOS=33721376;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:5:6:5:5:0.454545:2:3:3:2:2:3:4:2
chr18	33779821	.	C	A	1485.24	PASS	AF=1;AO=99;DP=102;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000444861;FXX=0.0388312;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.432;QD=60.0099;RBI=0.00194212;REFB=0;REVB=-0.00189048;RO=0;SAF=54;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00048192;OID=.;OPOS=33779821;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:99:0:0:99:99:1:45:54:0:0:45:54:0:0
chr18	33779855	.	C	T	1233.17	PASS	AF=0.943182;AO=83;DP=88;FAO=83;FDP=88;FR=.;FRO=5;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.00297794;FXX=0.0222198;HRUN=4;LEN=1;MLLD=101.822;QD=56.0533;RBI=0.0244286;REFB=-0.156303;REVB=0.0242464;RO=5;SAF=49;SAR=34;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00107054;STB=0.500566;STBP=0.995;TYPE=snp;VARB=0.00181908;OID=.;OPOS=33779855;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:88:88:5:5:83:83:0.943182:34:49:3:2:34:49:3:2
chr18	33779896	.	A	G	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.677;QD=60.7161;RBI=0.0296389;REFB=0;REVB=-0.0118918;RO=0;SAF=41;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.29643e-05;OID=.;OPOS=33779896;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:35:41:0:0:35:41:0:0
chr18	33780020	.	A	G	766.57	PASS	AF=1;AO=41;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0320147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.4409;QD=55.7503;RBI=0.0498256;REFB=0;REVB=0.0381791;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00119693;OID=.;OPOS=33780020;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:41:55:1:22:19:0:0:27:28:0:0
chr18	33780021	.	C	G	78.88	PASS	AF=0.214286;AO=11;DP=55;FAO=12;FDP=56;FR=.;FRO=44;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.0358935;FXX=0.0175408;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.4942;QD=5.6343;RBI=0.0381471;REFB=-0.0825059;REVB=0.0129175;RO=44;SAF=7;SAR=4;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222942;STB=0.666389;STBP=0.2;TYPE=snp;VARB=0.0455919;OID=.;OPOS=33780021;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:55:56:44:44:11:12:0.214286:4:7:20:24:4:8:20:24
chr18	33785093	.	G	A	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261634;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.499;QD=60.7161;RBI=0.0497751;REFB=0;REVB=0.0423442;RO=0;SAF=43;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.66218e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.49884e-05;OID=.;OPOS=33785093;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:33:43:0:0:33:43:0:0
chr18	33785185	.	A	G	854.09	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00935983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.467;QD=56.0057;RBI=0.0162585;REFB=-0.0200055;REVB=-0.013294;RO=1;SAF=27;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0140874;STB=0.50746;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000596562;OID=.;OPOS=33785185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:61:61:1:1:60:60:0.983607:33:27:0:1:33:27:0:1
chr18	33831189	.	C	A	450.39	PASS	AF=0.45045;AO=51;DP=105;FAO=50;FDP=111;FR=.;FRO=61;FSAF=16;FSAR=34;FSRF=26;FSRR=35;FWDB=0.0298134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.0836;QD=16.2301;RBI=0.0807905;REFB=-0.0224741;REVB=-0.0750884;RO=54;SAF=16;SAR=35;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.167422;STB=0.563955;STBP=0.265;TYPE=snp;VARB=0.0403153;OID=.;OPOS=33831189;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:111:54:61:51:50:0.45045:35:16:26:28:34:16:26:35
chr18	34647176	.	T	C	208.71	PASS	AF=0.456522;AO=21;DP=46;FAO=21;FDP=46;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.0183037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.213;QD=18.1487;RBI=0.0199639;REFB=-0.0125711;REVB=-0.00797087;RO=25;SAF=11;SAR=10;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15601;STB=0.588395;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0160593;OID=.;OPOS=34647176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:25:25:21:21:0.456522:10:11:9:16:10:11:9:16
chr18	34647323	.	T	A	248.76	PASS	AF=0.534884;AO=23;DP=43;FAO=23;FDP=43;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0107856;FXX=0.0444346;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.251;QD=23.1406;RBI=0.0144817;REFB=-0.0194956;REVB=-0.00966392;RO=19;SAF=13;SAR=10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0745436;STB=0.553706;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0162507;OID=.;OPOS=34647323;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:19:20:23:23:0.534884:10:13:9:10:10:13:9:11
chr18	34664093	.	A	G	197.71	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0317381;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=258.292;QD=18.8291;RBI=0.0341149;REFB=-0.0150197;REVB=0.0125106;RO=22;SAF=11;SAR=9;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0881007;STB=0.54995;STBP=0.559;TYPE=snp;VARB=0.0164609;OID=.;OPOS=34664093;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:9:11:10:12:9:11:10:12
chr18	34809591	.	G	A	68.8	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=5;FWDB=-0.0197371;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.143;QD=15.2887;RBI=0.0226001;REFB=-0.0190186;REVB=0.0110095;RO=9;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101784;STB=0.559863;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.016377;OID=.;OPOS=34809591;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:18:18:9:9:9:9:0.5:6:3:4:5:6:3:4:5
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chr18	39761342	.	C	T	277.6	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0408604;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=195.006;QD=20.563;RBI=0.041188;REFB=0.00867227;REVB=0.00518433;RO=25;SAF=10;SAR=19;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0498781;STB=0.527758;STBP=0.68;TYPE=snp;VARB=-0.007242;OID=.;OPOS=39761342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:19:10:10:15:19:10:10:15
chr18	40323497	.	G	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.839;QD=52.6132;RBI=0.014327;REFB=0;REVB=-0.00291066;RO=0;SAF=16;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17051e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.08554e-05;OID=.;OPOS=40323497;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:6:16:0:0:6:16:0:0
chr18	42533130	.	A	G	1135.25	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00743535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.491;QD=60.5466;RBI=0.0260902;REFB=0;REVB=0.0250083;RO=0;SAF=35;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71047e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.40368e-05;OID=.;OPOS=42533130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:40:35:0:0:40:35:0:0
chr18	43206985	.	A	G	2351.03	PASS	AF=1;AO=147;DP=147;FAO=147;FDP=147;FR=.;FRO=0;FSAF=64;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.18;QD=63.9737;RBI=0.018079;REFB=0;REVB=-0.0132026;RO=0;SAF=64;SAR=83;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.8393e-07;OID=.;OPOS=43206985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:147:147:0:0:147:147:1:83:64:0:0:83:64:0:0
chr18	43246156	.	G	A	319.15	PASS	AF=0.371429;AO=39;DP=105;FAO=39;FDP=105;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=33;FSRR=33;FWDB=-0.00347418;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.432;QD=12.1583;RBI=0.00898166;REFB=-0.00959587;REVB=0.00828253;RO=64;SAF=21;SAR=18;SRF=33;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0249642;STB=0.524217;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0148789;OID=.;OPOS=43246156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:64:66:39:39:0.371429:18:21:33:31:18:21:33:33
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chr18	43307338	.	C	A	993.99	PASS	AF=1;AO=58;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0434224;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.904;QD=59.3429;RBI=0.0455204;REFB=0;REVB=0.0136603;RO=0;SAF=25;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017109;OID=.;OPOS=43307338;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:58:67:1:33:25:0:0:35:32:0:0
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chr18	43316538	.	A	G	573.37	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0520047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.168;QD=60.3542;RBI=0.0627714;REFB=0;REVB=0.0351534;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000398895;OID=.;OPOS=43316538;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
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chr18	45696158	.	G	A	390.75	PASS	AF=1;AO=24;DP=26;FAO=28;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.391;QD=55.8209;RBI=0.046518;REFB=0;REVB=3.108e-05;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000312905;OID=.;OPOS=45696158;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:28:0:0:24:28:1:18:6:0:0:19:9:0:0
chr18	45696204	.	T	C	538.52	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.625;QD=59.8359;RBI=0.050463;REFB=0;REVB=-0.0269262;RO=0;SAF=15;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.00802e-05;OID=.;OPOS=45696204;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:21:15:0:0:21:15:0:0
chr18	45696256	.	A	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00267498;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.081;QD=53.9111;RBI=0.0216095;REFB=0;REVB=0.0214433;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.20017e-05;OID=.;OPOS=45696256;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chr18	45711740	.	T	C	446.66	PASS	AF=0.581081;AO=42;DP=73;FAO=43;FDP=74;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=31;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0149401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.454;QD=24.144;RBI=0.0310408;REFB=-0.0183459;REVB=0.0272089;RO=31;SAF=11;SAR=31;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144785;STB=0.568565;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0137687;OID=.;OPOS=45711740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:31:31:42:43:0.581081:31:11:13:18:31:12:13:18
chr18	46001932	.	A	G	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00532244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=360.527;QD=57.712;RBI=0.039384;REFB=0;REVB=-0.0390227;RO=0;SAF=52;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.54021e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.2142e-05;OID=.;OPOS=46001932;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:7:52:0:0:7:52:0:0
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chr18	46284587	.	T	C	790.23	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0512917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.2946;QD=55.455;RBI=0.0537818;REFB=-0.0989462;REVB=0.0161753;RO=1;SAF=39;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269235;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000872015;OID=.;OPOS=46284587;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:57:57:1:0:56:57:1:17:39:0:1:18:39:0:0
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chr18	46474746	.	C	T	101.59	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=24;FAO=12;FDP=24;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0249765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.685;QD=16.9316;RBI=0.0301015;REFB=-0.00688455;REVB=-0.016801;RO=12;SAF=10;SAR=2;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.425784;STB=0.749531;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0187178;OID=.;OPOS=46474746;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:24:24:12:12:12:12:0.5:2:10:5:7:2:10:5:7
chr18	46545924	.	A	G	1641.95	PASS	AF=1;AO=109;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=85;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.574;QD=60.2549;RBI=0.0523307;REFB=0;REVB=0.0109378;RO=0;SAF=24;SAR=85;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.13927e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.96568e-05;OID=.;OPOS=46545924;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:109:0:0:109:109:1:85:24:0:0:85:24:0:0
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chr18	50923713	.	A	G	217.57	PASS	AF=0.552632;AO=21;DP=38;FAO=21;FDP=38;FR=.;FRO=17;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0228225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.826;QD=22.9023;RBI=0.026822;REFB=-0.0151049;REVB=-0.0140909;RO=16;SAF=19;SAR=2;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330266;STB=0.681838;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0451341;OID=.;OPOS=50923713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:17:21:21:0.552632:2:19:11:5:2:19:12:5
chr18	50936994	.	T	C	346.16	PASS	AF=0.378378;AO=42;DP=111;FAO=42;FDP=111;FR=.;FRO=69;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=49;FSRR=20;FWDB=0.00894423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.684;QD=12.4744;RBI=0.0191945;REFB=-0.00800254;REVB=0.0169832;RO=69;SAF=24;SAR=18;SRF=49;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159598;STB=0.590256;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0118689;OID=.;OPOS=50936994;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:111:69:69:42:42:0.378378:18:24:49:20:18:24:49:20
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chr18	51795957	.	GCGACGAC	GCGAC,GCGA,GCGGCGAC	886.89	PASS	AF=0.919355,0,0.0806452;AO=37,13,5;DP=62;FAO=57,0,5;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26,0,3;FSAR=31,0,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0594043,-0.0228883,0.0363771;FXX=0.0158705;HRUN=1,1,1;LEN=3,4,1;MLLD=163.871,171.967,54.0229;QD=57.219;RBI=0.0889716,0.038933,0.057229;REFB=0,0,0;REVB=0.066235,0.0314945,0.0441799;RO=0;SAF=23,0,3;SAR=14,13,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-3.91909e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00348386,0,0.0088053;OID=.,.,.;OPOS=51795958,51795961,51795960;OREF=CGA,CGAC,A;OALT=-,-,G;OMAPALT=GCGAC,GCGA,GCGGCGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.919355,0,0.0806452:37,13,5:62:57,0,5:62:0:26,0,3:31,0,2:0:0:21:0:23,0,3:14,13,2:0:0
chr18	51820805	.	G	A	519.78	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.418;QD=59.4036;RBI=0.027883;REFB=0;REVB=0.0208028;RO=0;SAF=21;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000137251;OID=.;OPOS=51820805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:14:21:0:0:14:21:0:0
chr18	52265308	.	A	C	758.59	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0558808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.1776;QD=53.2343;RBI=0.056674;REFB=0.00549056;REVB=0.00944876;RO=1;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219159;STB=0.504381;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=-0.00106523;OID=.;OPOS=52265308;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:1:2:55:55:0.964912:21:34:0:1:21:34:1:1
chr18	52570281	.	G	A	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00733238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.447;QD=57.2025;RBI=0.0561926;REFB=0;REVB=0.0557122;RO=0;SAF=18;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000114678;OID=.;OPOS=52570281;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:12:18:0:0:12:18:0:0
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chr18	55034359	.	T	C	458.88	PASS	AF=0.564103;AO=44;DP=77;FAO=44;FDP=78;FR=.;FRO=34;FSAF=22;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=20;FWDB=0.00595691;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.26;QD=23.5324;RBI=0.0060355;REFB=-0.0323224;REVB=0.000970807;RO=33;SAF=22;SAR=22;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0591672;STB=0.538444;STBP=0.451;TYPE=snp;VARB=0.0272773;OID=.;OPOS=55034359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:33:34:44:44:0.564103:22:22:14:19:22:22:14:20
chr18	55143766	.	C	T	282.43	PASS	AF=0.438356;AO=32;DP=73;FAO=32;FDP=73;FR=.;FRO=41;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=28;FSRR=13;FWDB=0.00992923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.985;QD=15.4758;RBI=0.0152675;REFB=-0.0169212;REVB=0.0115977;RO=41;SAF=19;SAR=13;SRF=28;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0941204;STB=0.552909;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0328482;OID=.;OPOS=55143766;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:41:41:32:32:0.438356:13:19:28:13:13:19:28:13
chr18	55144035	.	C	T	118.47	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.00936109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.408;QD=12.807;RBI=0.0206066;REFB=-0.00923189;REVB=-0.0183576;RO=23;SAF=3;SAR=11;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230725;STB=0.637465;STBP=0.24;TYPE=snp;VARB=0.00971488;OID=.;OPOS=55144035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:11:3:9:14:11:3:9:14
chr18	55144045	.	G	A	206.04	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=49;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=4;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.0191278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.0503;QD=16.8199;RBI=0.0197014;REFB=-0.00502678;REVB=-0.00471972;RO=28;SAF=4;SAR=17;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.262142;STB=0.652012;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0135556;OID=.;OPOS=55144045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:28:28:21:21:0.428571:17:4:11:17:17:4:11:17
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chr18	55145765	.	G	C	115.16	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0249873;FXX=0.0370233;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.911;QD=17.7172;RBI=0.0254345;REFB=-0.00418031;REVB=-0.00474877;RO=13;SAF=7;SAR=6;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0677773;STB=0.538863;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.00423921;OID=.;OPOS=55145765;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:6:7:8:5:6:7:8:5
chr18	55145906	.	C	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0071071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.156;QD=59.8388;RBI=0.0276662;REFB=0;REVB=0.0267378;RO=0;SAF=24;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000141159;OID=.;OPOS=55145906;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:12:24:0:0:12:24:0:0
chr18	55146453	.	T	C	885.43	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00553017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.242;QD=58.0611;RBI=0.00803307;REFB=0;REVB=-0.00582644;RO=0;SAF=37;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.37203e-07;OID=.;OPOS=55146453;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:24:37:0:0:24:37:0:0
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chr18	55315732	.	G	T	624.83	PASS	AF=0.436709;AO=69;DP=160;FAO=69;FDP=158;FR=.;FRO=89;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=44;FSRR=45;FWDB=-0.0102253;FXX=0.0124992;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.445;QD=15.8185;RBI=0.0277158;REFB=-0.0147447;REVB=0.0257606;RO=88;SAF=35;SAR=34;SRF=43;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0187045;STB=0.507244;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.0200204;OID=.;OPOS=55315732;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:160:158:88:89:69:69:0.436709:34:35:43:45:34:35:44:45
chr18	55317653	.	G	A	354.07	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=60;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.000718748;FXX=0.0322529;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.913;QD=23.605;RBI=0.00426578;REFB=-0.0068769;REVB=0.00420479;RO=25;SAF=20;SAR=15;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00881832;STB=0.504852;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.00458899;OID=.;OPOS=55317653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:25:25:35:35:0.583333:15:20:14:11:15:20:14:11
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chr18	55335240	.	A	G	39.62	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0238592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.832;QD=13.2054;RBI=0.0292857;REFB=-0.0163122;REVB=-0.0169821;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.138347;STB=0.583063;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0101052;OID=.;OPOS=55335240;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:3:3:4:2:3:3:4:2
chr18	55336626	.	A	G	267.97	PASS	AF=0.54;AO=27;DP=51;FAO=27;FDP=50;FR=.;FRO=23;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.00200711;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.571;QD=21.4379;RBI=0.00295627;REFB=-0.0188947;REVB=0.00217049;RO=21;SAF=16;SAR=11;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130188;STB=0.592524;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0209114;OID=.;OPOS=55336626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:21:23:27:27:0.54:11:16:9:12:11:16:9:14
chr18	55342156	.	T	C	451.53	PASS	AF=0.41129;AO=50;DP=125;FAO=51;FDP=124;FR=.;FRO=73;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=33;FWDB=0.0251392;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.277;QD=14.5655;RBI=0.0276081;REFB=-0.0168316;REVB=0.0114117;RO=73;SAF=25;SAR=25;SRF=40;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0504664;STB=0.533952;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0180827;OID=.;OPOS=55342156;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:124:73:73:50:51:0.41129:25:25:40:33:26:25:40:33
chr18	55346232	.	A	G	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0631381;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2554;QD=37.4885;RBI=0.0634279;REFB=0;REVB=0.00605655;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00459093;OID=.;OPOS=55346232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:2:6:0:0:2:6:0:0
chr18	55362532	.	T	G	940.99	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0541336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.817;QD=57.03;RBI=0.0649578;REFB=0.0697751;REVB=0.0359036;RO=0;SAF=27;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.04073e-08;STB=0.506491;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=-9.75871e-05;OID=.;OPOS=55362532;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:65:66:0:1:65:65:0.984848:38:27:0:0:38:27:0:1
chr18	55364852	.	A	G	1089.26	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0251718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.442;QD=59.6854;RBI=0.0263443;REFB=0;REVB=-0.00777181;RO=0;SAF=45;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000347173;OID=.;OPOS=55364852;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:71:73:1:26:45:0:0:26:47:0:0
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chr18	55711878	.	CGG	CGC,CG	763.33	PASS	AF=0.219512,0.780488;AO=21,20;DP=84;FAO=18,64;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=0,48;FSAR=18,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.053725,0.808259;FXX=0.0238067;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=192.179,12.1562;QD=37.2355;RBI=0.0547082,0.808625;REFB=0,0;REVB=-0.0103256,-0.0243104;RO=39;SAF=0,7;SAR=21,13;SRF=39;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.894736,-0.667442;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0872806,-0.0505851;OID=.,.;OPOS=55711880,55711879;OREF=G,G;OALT=C,-;OMAPALT=CGC,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.219512,0.780488:21,20:84:18,64:82:0:0,48:18,16:0:0:99:39:0,7:21,13:39:0
chr18	56148796	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00384314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.948;QD=49.5992;RBI=0.015618;REFB=0;REVB=0.0151378;RO=0;SAF=5;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.07673e-05;OID=.;OPOS=56148796;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:13:5:0:0:13:5:0:0
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chr18	56202418	.	T	C	276.14	PASS	AF=1;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254105;FXX=0.0454339;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.125;QD=52.5985;RBI=0.0429755;REFB=0;REVB=0.0346584;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00114644;OID=.;OPOS=56202418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
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chr18	56203411	.	G	C	382.58	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00623095;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=135.717;QD=52.7694;RBI=0.0261103;REFB=-0.0345453;REVB=0.0253559;RO=1;SAF=21;SAR=7;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216544;STB=0.51162;STBP=0.637;TYPE=snp;VARB=0.000786886;OID=.;OPOS=56203411;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:7:21:1:0:7:21:1:0
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chr18	56203891	.	G	T	407.69	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00091582;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=105.21;QD=54.3582;RBI=0.0766075;REFB=-0.0648533;REVB=0.076602;RO=1;SAF=15;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300429;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000578845;OID=.;OPOS=56203891;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:30:30:1:0:29:30:1:14:15:1:0:14:16:0:0
chr18	56203898	.	T	G	381.06	PASS	AF=1;AO=19;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0421713;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=325.148;QD=56.4531;RBI=0.0458717;REFB=0;REVB=-0.0180497;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000298667;OID=.;OPOS=56203898;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:19:27:1:14:5:0:0:14:13:0:0
chr18	56204250	.	A	C	695.8	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0126587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.7838;QD=60.5045;RBI=0.0380939;REFB=0.0322276;REVB=0.0359291;RO=1;SAF=25;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018429;STB=0.5098;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=-0.00400738;OID=.;OPOS=56204250;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:20:25:1:0:20:25:1:0
chr18	56204644	.	T	G	800.23	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0310818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.61;QD=56.1566;RBI=0.0671198;REFB=0;REVB=0.0594894;RO=0;SAF=34;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.77753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000367826;OID=.;OPOS=56204644;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:57:0:0:54:57:1:20:34:0:0:21:36:0:0
chr18	56204747	.	G	A	1399.78	PASS	AF=1;AO=87;DP=90;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00120545;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=257.9;QD=62.9116;RBI=0.0012701;REFB=0;REVB=0.000400061;RO=0;SAF=52;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.97286e-07;OID=.;OPOS=56204747;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:89:0:0:87:89:1:35:52:0:0:37:52:0:0
chr18	56246442	.	T	C	693.95	PASS	AF=1;AO=26;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.236155;FXX=0.0192271;HRUN=3;LEN=1;MLLD=28.2418;QD=54.4278;RBI=0.239544;REFB=0;REVB=-0.040152;RO=0;SAF=9;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00875414;OID=.;OPOS=56246442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:26:51:1:17:9:0:0:26:25:0:0
chr18	56247180	.	T	C	850.78	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00715487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.568;QD=57.6798;RBI=0.0205316;REFB=0;REVB=0.0192446;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.36495e-05;OID=.;OPOS=56247180;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:35:24:0:0:35:24:0:0
chr18	56247567	.	A	G	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00432981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.257;QD=52.6119;RBI=0.0182051;REFB=0;REVB=-0.0176827;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000122551;OID=.;OPOS=56247567;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr18	56247600	.	C	A,T	255.11	PASS	AF=0.863636,0.0909091;AO=19,2;DP=22;FAO=19,2;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=13,1;FSAR=6,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0143993,0.00373394;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=176.03,147.431;QD=46.3836;RBI=0.0193618,0.0150717;REFB=0.0919808,0.0351981;REVB=0.0129438,0.0146019;RO=1;SAF=13,1;SAR=6,1;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0705879,0.25849;STB=0.53842,0.665164;STBP=0.263,0.662;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00319805,0.221009;OID=.,.;OPOS=56247600,56247600;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:22:22:1:1:19,2:19,2:0.863636,0.0909091:6,1:13,1:0:1:6,1:13,1:0:1
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chr18	56470264	.	T	TG,TGG	295.66	PASS	AF=0,1;AO=4,20;DP=26;FAO=0,26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=0,17;FSAR=0,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0720229,-0.0397086;FXX=0.0370233;HRUN=2,2;LEN=1,2;MLLD=20.0031,35.9237;QD=45.4861;RBI=0.388364,0.228162;REFB=0,0;REVB=0.381628,0.22468;RO=1;SAF=0,17;SAR=4,3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.13066;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=0,0.00715862;OID=.,.;OPOS=56470265,56470265;OREF=-,-;OALT=G,GG;OMAPALT=TG,TGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:4,20:26:0,26:26:0:0,17:0,9:0:0:5:1:0,17:4,3:0:1
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chr18	59805532	.	T	C	723.26	PASS	AF=0.931034;AO=54;DP=57;FAO=54;FDP=58;FR=.;FRO=4;FSAF=23;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0408701;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.4678;QD=49.8803;RBI=0.0548484;REFB=-0.00493284;REVB=0.0365785;RO=2;SAF=23;SAR=31;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294362;STB=0.512446;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00368308;OID=.;OPOS=59805532;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:57:58:2:4:54:54:0.931034:31:23:0:2:31:23:1:3
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chr18	59807635	.	T	A,C	172.41	PASS	AF=0.133333,0.866667;AO=2,13;DP=15;FAO=2,13;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=1,4;FSAR=1,9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0215823,0.0294671;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=209.95,88.5768;QD=45.9761;RBI=0.0246132,0.0515167;REFB=0,0;REVB=-0.0118328,0.042257;RO=0;SAF=1,4;SAR=1,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0316511,-0.0149975;OID=.,.;OPOS=59807635,59807635;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:15:15:0:0:2,13:2,13:0.133333,0.866667:1,9:1,4:0:0:1,9:1,4:0:0
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chr18	59814324	.	G	C	759.37	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.097;QD=56.2498;RBI=0.0337707;REFB=0;REVB=0.00396838;RO=0;SAF=19;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346802;OID=.;OPOS=59814324;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:34:19:0:0:34:20:0:0
chr18	60027241	.	C	T	501.53	PASS	AF=0.527473;AO=48;DP=91;FAO=48;FDP=91;FR=.;FRO=43;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=-0.0326639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.341;QD=22.0452;RBI=0.0341848;REFB=-0.0142582;REVB=-0.0100829;RO=43;SAF=25;SAR=23;SRF=27;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0924115;STB=0.550877;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00872335;OID=.;OPOS=60027241;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:43:43:48:48:0.527473:23:25:27:16:23:25:27:16
chr18	60036083	.	A	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0170002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.834;QD=58.5867;RBI=0.034451;REFB=0;REVB=0.0299644;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.02313e-05;OID=.;OPOS=60036083;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:14:19:0:0:14:19:0:0
chr18	60111488	.	G	A	82.7	PASS	AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=17;FWDB=-0.0463036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.9448;QD=9.18862;RBI=0.048203;REFB=0.0168718;REVB=0.0133978;RO=25;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158628;STB=0.59569;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.0224817;OID=.;OPOS=60111488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:36:36:25:25:11:11:0.305556:6:5:8:17:6:5:8:17
chr18	60191428	.	G	A	88.13	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216618;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.9198;QD=39.1675;RBI=0.0216618;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=8;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00140244;OID=.;OPOS=60191428;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:9:0:0:8:9:1:0:8:0:0:0:9:0:0
chr18	60237388	.	A	G	687.55	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0426225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.2969;QD=62.5046;RBI=0.0428433;REFB=0;REVB=-0.00434405;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281838;OID=.;OPOS=60237388;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:19:24:0:0:19:25:0:0
chr18	60241732	.	C	T	86.86	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=27;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.0166041;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=234.689;QD=12.8689;RBI=0.0188249;REFB=-0.0334567;REVB=0.00887019;RO=16;SAF=10;SAR=1;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317065;STB=0.694003;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=0.0375133;OID=.;OPOS=60241732;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:27:27:16:16:11:11:0.407407:1:10:12:4:1:10:12:4
chr18	60244856	.	A	G	2886.58	PASS	AF=1;AO=181;DP=181;FAO=183;FDP=183;FR=.;FRO=0;FSAF=94;FSAR=89;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.027317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.324;QD=63.0946;RBI=0.0615063;REFB=0;REVB=0.0551073;RO=0;SAF=94;SAR=87;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16977e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.39699e-05;OID=.;OPOS=60244856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:181:183:0:0:181:183:1:87:94:0:0:89:94:0:0
chr18	60562298	.	A	T	1144.17	PASS	AF=1;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339568;FXX=0.0384566;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.566;QD=61.0221;RBI=0.0404506;REFB=0;REVB=-0.0219816;RO=0;SAF=49;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.68918e-05;OID=.;OPOS=60562298;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:75:0:0:75:75:1:26:49:0:0:26:49:0:0
chr18	60985775	.	GCCCCCG	GCCCC,GCCCCG,GCCCCGG	148.72	PASS	AF=0.933333,0,0;AO=7,3,3;DP=17;FAO=14,0,0;FDP=15;FR=.;FRO=1;FSAF=4,0,0;FSAR=10,0,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.229595,0.237957,0.0373576;FXX=0;HRUN=5,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=25.8823,13.1295,6.6806;QD=39.659;RBI=0.262146,0.238772,0.108123;REFB=0.131878,-0.0398734,-0.1906;REVB=0.126519,0.0197069,-0.101464;RO=1;SAF=3,0,2;SAR=4,3,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.124421,-0.727144,-0.163246;STB=0.555473,0.5,0.5;STBP=0.255,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00377743,0,0.145163;OID=.,.,.;OPOS=60985780,60985776,60985780;OREF=CG,C,C;OALT=-,-,G;OMAPALT=GCCCC,GCCCCG,GCCCCGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.933333,0,0:7,3,3:17:14,0,0:15:1:4,0,0:10,0,0:1:0:3:1:3,0,2:4,3,1:1:0
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chr18	61387312	.	G	A	1263.99	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0259114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.551;QD=61.6579;RBI=0.0346618;REFB=0;REVB=-0.0230227;RO=0;SAF=46;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14462e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000158312;OID=.;OPOS=61387312;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:36:46:0:0:36:46:0:0
chr18	61387333	.	T	A	1190.06	PASS	AF=1;AO=77;DP=78;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00156824;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.337;QD=61.0288;RBI=0.0185167;REFB=0;REVB=0.0184502;RO=0;SAF=41;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.79198e-05;OID=.;OPOS=61387333;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:78:0:0:77:78:1:36:41:0:0:36:42:0:0
chr18	61387389	.	G	A	937.51	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0627773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.4875;QD=58.5942;RBI=0.0764336;REFB=0;REVB=-0.0436017;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175481;OID=.;OPOS=61387389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:32:32:0:0:32:32:0:0
chr18	61390316	.	C	A	426.16	PASS	AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.020026;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=177.618;QD=51.6554;RBI=0.0215492;REFB=-0.144622;REVB=0.00795764;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509548;STBP=0.761;TYPE=snp;VARB=0.0013695;OID=.;OPOS=61390316;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:33:0:2:31:31:0.939394:11:20:0:0:11:20:1:1
chr18	61390332	.	C	T	613.43	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0170313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.342;QD=61.3434;RBI=0.0204946;REFB=0;REVB=0.0114001;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.03557e-05;OID=.;OPOS=61390332;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:13:26:0:0:13:27:0:0
chr18	61390361	.	T	C	613.23	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207952;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.119;QD=61.3229;RBI=0.0299559;REFB=0;REVB=0.021562;RO=0;SAF=28;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.48718e-05;OID=.;OPOS=61390361;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:11:28:0:0:12:28:0:0
chr18	61390570	.	T	G	575.8	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370683;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=248.59;QD=60.6103;RBI=0.0374297;REFB=0;REVB=0.00518903;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.94595e-05;OID=.;OPOS=61390570;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:21:17:0:0:21:17:0:0
chr18	61564394	.	A	G	152.45	PASS	AF=0.358491;AO=17;DP=50;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0252252;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2145;QD=11.5057;RBI=0.0835033;REFB=-0.0194911;REVB=0.0796021;RO=33;SAF=10;SAR=7;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149475;STB=0.535677;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=0.0411693;OID=.;OPOS=61564394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:53:33:34:17:19:0.358491:7:10:15:18:9:10:16:18
chr18	61570503	.	C	G	325.01	PASS	AF=0.382353;AO=39;DP=104;FAO=39;FDP=102;FR=.;FRO=63;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=30;FWDB=-0.00738205;FXX=0.0285687;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.5994;QD=12.7455;RBI=0.00738562;REFB=0.00285445;REVB=-0.000229382;RO=60;SAF=17;SAR=22;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0687994;STB=0.554407;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=-0.00430029;OID=.;OPOS=61570503;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:102:60:63:39:39:0.382353:22:17:30:30:22:17:33:30
chr18	61570529	.	C	G	177.94	PASS	AF=0.306667;AO=23;DP=81;FAO=23;FDP=75;FR=.;FRO=52;FSAF=5;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=25;FWDB=-0.0164297;FXX=0.0740649;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.238;QD=9.4902;RBI=0.0218213;REFB=-0.00849568;REVB=-0.0143608;RO=52;SAF=5;SAR=18;SRF=27;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.381728;STB=0.72798;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0365923;OID=.;OPOS=61570529;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:75:52:52:23:23:0.306667:18:5:27:25:18:5:27:25
chr18	61575213	.	T	G	585.11	PASS	AF=0.5;AO=60;DP=120;FAO=60;FDP=120;FR=.;FRO=60;FSAF=28;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=26;FWDB=0.00829418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.619;QD=19.5035;RBI=0.00830407;REFB=-0.0129242;REVB=-0.000405272;RO=59;SAF=28;SAR=32;SRF=33;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0831214;STB=0.549873;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.010469;OID=.;OPOS=61575213;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:59:60:60:60:0.5:32:28:33:26:32:28:34:26
chr18	61575232	.	A	G	686.27	PASS	AF=0.503704;AO=68;DP=135;FAO=68;FDP=135;FR=.;FRO=67;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=43;FSRR=24;FWDB=-0.00369954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.121;QD=20.334;RBI=0.0051091;REFB=-0.0162716;REVB=0.00352368;RO=67;SAF=32;SAR=36;SRF=43;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153439;STB=0.584391;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0140448;OID=.;OPOS=61575232;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:135:135:67:67:68:68:0.503704:36:32:43:24:36:32:43:24
chr18	61582867	.	A	G	265.28	PASS	AF=0.3875;AO=30;DP=79;FAO=31;FDP=80;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=0.00155838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.494;QD=13.2641;RBI=0.0165689;REFB=-0.00935014;REVB=0.0164955;RO=49;SAF=14;SAR=16;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0471377;STB=0.535951;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=0.016033;OID=.;OPOS=61582867;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:49:49:30:31:0.3875:16:14:25:24:17:14:25:24
chr18	61587053	.	G	A	67.8	PASS	AF=0.2;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=25;FSRR=15;FWDB=-0.0324573;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.6549;QD=5.42374;RBI=0.0385095;REFB=0.0120556;REVB=0.0207245;RO=39;SAF=7;SAR=3;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114632;STB=0.567427;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.0164982;OID=.;OPOS=61587053;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:50:50:39:40:10:10:0.2:3:7:24:15:3:7:25:15
chr18	61587067	.	C	T	81.58	PASS	AF=0.222222;AO=12;DP=54;FAO=12;FDP=54;FR=.;FRO=42;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=27;FSRR=15;FWDB=-0.00427027;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.139;QD=6.04295;RBI=0.00905748;REFB=-0.00511212;REVB=-0.00798766;RO=42;SAF=10;SAR=2;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300179;STB=0.696346;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0162616;OID=.;OPOS=61587067;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:54:54:42:42:12:12:0.222222:2:10:27:15:2:10:27:15
chr18	61600384	.	C	T	154.67	PASS	AF=0.386364;AO=17;DP=45;FAO=17;FDP=44;FR=.;FRO=27;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=0.0201857;FXX=0.0222173;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.248;QD=14.0607;RBI=0.0239884;REFB=0.00250373;REVB=0.0129607;RO=27;SAF=7;SAR=10;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151563;STB=0.588131;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=-0.00470726;OID=.;OPOS=61600384;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:27:27:17:17:0.386364:10:7:15:12:10:7:15:12
chr18	62036875	.	G	A	1339.38	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.534;QD=62.2967;RBI=0.0199646;REFB=0;REVB=0.00719977;RO=0;SAF=44;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.10342e-05;OID=.;OPOS=62036875;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:86:0:0:85:86:1:41:44:0:0:41:45:0:0
chr18	63489378	.	C	T	1613.6	PASS	AF=1;AO=106;DP=109;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152272;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8661;QD=59.2147;RBI=0.0238879;REFB=0;REVB=-0.0184056;RO=1;SAF=50;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839996;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000290269;OID=.;OPOS=63489378;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:109:109:1:0:106:109:1:56:50:0:1:57:52:0:0
chr18	63530016	.	A	G	1146.08	PASS	AF=0.987179;AO=76;DP=78;FAO=77;FDP=78;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=48;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.046026;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.43;QD=58.7734;RBI=0.0647112;REFB=-0.0576673;REVB=-0.045488;RO=1;SAF=28;SAR=48;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016599;STB=0.508472;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.000362432;OID=.;OPOS=63530016;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:78:78:1:1:76:77:0.987179:48:28:1:0:48:29:1:0
chr18	64176269	.	G	A	296.35	PASS	AF=0.44;AO=32;DP=74;FAO=33;FDP=75;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=17;FWDB=0.0115732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2924;QD=15.8053;RBI=0.0136394;REFB=-0.0144141;REVB=0.00721769;RO=42;SAF=12;SAR=20;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221176;STB=0.630091;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0215805;OID=.;OPOS=64176269;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:75:42:42:32:33:0.44:20:12:25:17:21:12:25:17
chr18	65179829	.	G	A	258.51	PASS	AF=0.405405;AO=29;DP=74;FAO=30;FDP=74;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=19;FWDB=-0.00123627;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.317;QD=13.9736;RBI=0.0369094;REFB=-0.0239299;REVB=-0.0368887;RO=44;SAF=15;SAR=14;SRF=25;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0539794;STB=0.520857;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.033546;OID=.;OPOS=65179829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:44:44:29:30:0.405405:14:15:25:19:14:16:25:19
chr18	66504093	.	A	C	1530.92	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.166;QD=63.1309;RBI=0.0508262;REFB=0;REVB=0.0323167;RO=0;SAF=50;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00013556;OID=.;OPOS=66504093;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:97:0:0:93:97:1:43:50:0:0:45:52:0:0
chr18	66504459	.	A	T	857.21	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00251197;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=219.318;QD=57.1474;RBI=0.086934;REFB=0;REVB=0.0868977;RO=0;SAF=40;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.7823e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178693;OID=.;OPOS=66504459;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:19:40:0:0:20:40:0:0
chr18	66513615	.	A	G	563.63	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0361995;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8208;QD=57.808;RBI=0.0362134;REFB=0.00115231;REVB=-0.00100116;RO=1;SAF=29;SAR=9;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0158876;STB=0.50847;STBP=0.64;TYPE=snp;VARB=0.000368106;OID=.;OPOS=66513615;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:9:29:1:0:9:29:1:0
chr18	66526176	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336983;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.088;QD=37.4885;RBI=0.0745809;REFB=0;REVB=0.0665337;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00198823;OID=.;OPOS=66526176;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:5:3:0:0:5:3:0:0
chr18	67345034	.	T	C	1609.66	PASS	AF=1;AO=107;DP=108;FAO=107;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157376;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.605;QD=60.1741;RBI=0.0443099;REFB=0;REVB=0.041421;RO=0;SAF=55;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00017672;OID=.;OPOS=67345034;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:107:0:0:107:107:1:52:55:0:0:52:55:0:0
chr18	67365668	.	A	G	902.46	PASS	AF=0.984375;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0319612;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.776;QD=56.4037;RBI=0.0571252;REFB=0.154235;REVB=0.0473474;RO=0;SAF=36;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51662e-08;STB=0.506665;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.000378509;OID=.;OPOS=67365668;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:0:1:62:63:0.984375:26:36:0:0:26:37:1:0
chr18	67531642	.	T	C	951.68	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0572878;FXX=0.0151492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.487;QD=58.5648;RBI=0.0769244;REFB=0;REVB=0.0513368;RO=0;SAF=16;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000516899;OID=.;OPOS=67531642;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:65:0:0:61:65:1:45:16:0:0:47:18:0:0
chr18	67718688	.	A	G	1033.25	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0202195;FXX=0.0140825;HRUN=3;LEN=1;MLLD=224.585;QD=59.0426;RBI=0.0277388;REFB=-0.0917731;REVB=0.0189899;RO=0;SAF=27;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181023;OID=.;OPOS=67718688;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:71:70:0:0:70:70:1:43:27:0:0:43:27:0:0
chr18	67863773	.	A	G	175.21	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=-0.0503797;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6554;QD=14.9117;RBI=0.0522442;REFB=0.0102849;REVB=-0.0138328;RO=28;SAF=14;SAR=5;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.333249;STB=0.693184;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=-0.0150874;OID=.;OPOS=67863773;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:5:14:12:16:5:14:12:16
chr18	67863850	.	T	TCTC	640.33	PASS	AF=0.934783;AO=42;DP=46;FAO=43;FDP=46;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0267335;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=212.815;QD=55.6807;RBI=0.0267336;REFB=-0.0543423;REVB=-9.69444e-05;RO=4;SAF=19;SAR=23;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0486263;STB=0.513178;STBP=0.482;TYPE=ins;VARB=0.00290543;OID=.;OPOS=67863851;OREF=-;OALT=CTC;OMAPALT=TCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.934783:42:46:43:46:3:20:23:2:1:13:4:19:23:3:1
chr18	67871343	.	A	C	1084.38	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=37;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0610377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.4955;QD=58.6154;RBI=0.0856503;REFB=-0.096758;REVB=0.0600864;RO=0;SAF=36;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.89682e-08;STB=0.506847;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00178131;OID=.;OPOS=67871343;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:0:1:73:73:0.986486:37:36:0:0:37:36:1:0
chr18	67992684	.	C	T	246.85	PASS	AF=0.490909;AO=27;DP=55;FAO=27;FDP=55;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=0.0338894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6851;QD=17.9525;RBI=0.0422123;REFB=0.00237467;REVB=-0.0251672;RO=28;SAF=12;SAR=15;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115002;STB=0.564269;STBP=0.391;TYPE=snp;VARB=-0.00199556;OID=.;OPOS=67992684;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:28:28:27:27:0.490909:15:12:9:19:15:12:9:19
chr18	67995834	.	A	T	199.35	PASS	AF=0.442308;AO=20;DP=50;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=11;FWDB=-0.00607386;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.769;QD=15.3345;RBI=0.00677486;REFB=-0.0373668;REVB=-0.00300116;RO=30;SAF=11;SAR=9;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088702;STB=0.531705;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.0366192;OID=.;OPOS=67995834;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:52:30:29:20:23:0.442308:9:11:19:11:10:13:18:11
chr18	68180082	.	G	A	95.18	PASS	AF=0.352941;AO=12;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.0410017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=187.502;QD=11.1977;RBI=0.0410128;REFB=-0.0133867;REVB=-0.000954545;RO=22;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00846107;STB=0.505042;STBP=0.993;TYPE=snp;VARB=0.0267879;OID=.;OPOS=68180082;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:22:22:12:12:0.352941:7:5:9:13:7:5:9:13
chr18	70209177	.	C	T	534.65	PASS	AF=0.549451;AO=50;DP=91;FAO=50;FDP=91;FR=.;FRO=41;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=22;FSRR=19;FWDB=-0.00175058;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=141.791;QD=23.5012;RBI=0.00350276;REFB=-0.0629416;REVB=0.00303394;RO=39;SAF=21;SAR=29;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0954395;STB=0.552972;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0472899;OID=.;OPOS=70209177;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:39:41:50:50:0.549451:29:21:21:18:29:21:22:19
chr18	70417396	.	C	T	955.16	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0181727;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.092;QD=58.7793;RBI=0.0183118;REFB=0;REVB=0.00225252;RO=0;SAF=45;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.87489e-05;OID=.;OPOS=70417396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:20:45:0:0:20:45:0:0
chr18	70532840	.	T	G	1713.12	PASS	AF=1;AO=113;DP=113;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00940283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.793;QD=60.6416;RBI=0.0141838;REFB=0;REVB=-0.0106192;RO=0;SAF=53;SAR=60;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.28518e-07;OID=.;OPOS=70532840;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:113:113:0:0:113:113:1:60:53:0:0:60:53:0:0
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chr18	72103782	.	T	C	831.86	PASS	AF=0.485714;AO=85;DP=176;FAO=85;FDP=175;FR=.;FRO=90;FSAF=48;FSAR=37;FSRF=49;FSRR=41;FWDB=-0.0125387;FXX=0.0056815;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0554;QD=19.0139;RBI=0.0198305;REFB=0.00876508;REVB=0.0153633;RO=88;SAF=48;SAR=37;SRF=49;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00739636;STB=0.510566;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=-0.00843278;OID=.;OPOS=72103782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:175:88:90:85:85:0.485714:37:48:49:39:37:48:49:41
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chr18	72223591	.	G	GTGC	901.83	PASS	AF=0.88;AO=64;DP=80;FAO=66;FDP=75;FR=.;FRO=9;FSAF=47;FSAR=19;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=0.0704874;FXX=0.0506265;HRUN=1;LEN=3;MLLD=224.715;QD=48.0974;RBI=0.105991;REFB=-0.185918;REVB=0.0791552;RO=12;SAF=46;SAR=18;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0188926;STB=0.506612;STBP=0.776;TYPE=ins;VARB=0.0233813;OID=.;OPOS=72223592;OREF=-;OALT=TGC;OMAPALT=GTGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.88:64:80:66:75:9:47:19:6:3:42:12:46:18:8:4
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chr18	72228124	.	A	G	1820.48	PASS	AF=1;AO=117;DP=118;FAO=119;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0357127;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.664;QD=61.1926;RBI=0.0398967;REFB=0;REVB=-0.0177863;RO=0;SAF=61;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.72573e-05;OID=.;OPOS=72228124;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:119:0:0:117:119:1:56:61:0:0:56:63:0:0
chr18	72238472	.	C	A	228.34	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00320455;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0538;QD=21.7464;RBI=0.0224806;REFB=0.0149456;REVB=-0.022251;RO=20;SAF=7;SAR=15;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246907;STB=0.638884;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-0.014263;OID=.;OPOS=72238472;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:15:7:12:8:15:7:12:8
chr18	72343008	.	T	C	446.77	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0604788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.29;QD=57.6472;RBI=0.0685121;REFB=0;REVB=0.0321905;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000482249;OID=.;OPOS=72343008;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
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chr18	77894844	.	G	A	230.52	PASS	AF=0.95;AO=19;DP=20;FAO=19;FDP=20;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0381633;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.888;QD=46.103;RBI=0.050899;REFB=-0.0822454;REVB=0.033679;RO=1;SAF=13;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0340907;STB=0.518499;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.00133334;OID=.;OPOS=77894844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:20:20:1:1:19:19:0.95:6:13:1:0:6:13:1:0
chr18	77897478	.	C	G	1967.91	PASS	AF=1;AO=126;DP=126;FAO=127;FDP=127;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00220485;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0952;QD=61.9815;RBI=0.00573425;REFB=0;REVB=-0.00529342;RO=0;SAF=65;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.50787e-06;OID=.;OPOS=77897478;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:126:127:0:0:126:127:1:61:65:0:0:61:66:0:0
chr19	362283	.	C	T	194.05	PASS	AF=0.247934;AO=30;DP=121;FAO=30;FDP=121;FR=.;FRO=91;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=56;FSRR=35;FWDB=0.00468792;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.1486;QD=6.41485;RBI=0.01471;REFB=0.00144643;REVB=-0.013943;RO=91;SAF=19;SAR=11;SRF=56;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0237971;STB=0.514411;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=-0.00347989;OID=.;OPOS=362283;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:91:91:30:30:0.247934:11:19:56:35:11:19:56:35
chr19	372661	.	C	A	68.58	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0401179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.9455;QD=14.4386;RBI=0.0879659;REFB=-0.0136197;REVB=-0.0782851;RO=9;SAF=6;SAR=3;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283852;STB=0.689242;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-4.81258e-05;OID=.;OPOS=372661;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:10:9:9:0.473684:3:6:3:6:3:6:3:7
chr19	407900	.	A	G	1219.76	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226851;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.427;QD=60.9881;RBI=0.0389801;REFB=0;REVB=0.0316992;RO=0;SAF=63;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.8514e-05;OID=.;OPOS=407900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:16:63:0:0:17:63:0:0
chr19	422238	.	G	T	1062.0	PASS	AF=0.507109;AO=106;DP=211;FAO=107;FDP=211;FR=.;FRO=104;FSAF=51;FSAR=56;FSRF=58;FSRR=46;FWDB=0.0173303;FXX=0.00471676;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.609;QD=20.1326;RBI=0.0173437;REFB=-0.0380532;REVB=-0.00068183;RO=103;SAF=50;SAR=56;SRF=57;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732965;STB=0.539883;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=0.0316917;OID=.;OPOS=422238;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:211:211:103:104:106:107:0.507109:56:50:57:46:56:51:58:46
chr19	453160	.	A	G	1053.55	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00766919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.912;QD=59.3551;RBI=0.0079433;REFB=0;REVB=-0.00206871;RO=0;SAF=37;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000213414;OID=.;OPOS=453160;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:71:0:0:68:71:1:31:37:0:0:33:38:0:0
chr19	498524	.	A	G	206.08	PASS	AF=0.428571;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=49;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=21;FWDB=0.00232242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.532;QD=16.8225;RBI=0.00463351;REFB=0.00506922;REVB=-0.00400946;RO=27;SAF=9;SAR=12;SRF=7;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176622;STB=0.607267;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=-0.00724336;OID=.;OPOS=498524;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:49:27:28:21:21:0.428571:12:9:7:20:12:9:7:21
chr19	501725	.	G	A	88.91	PASS	AF=0.769231;AO=10;DP=13;FAO=10;FDP=13;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0146;QD=27.3566;RBI=0.000396672;REFB=-0.013235;REVB=-0.000396672;RO=3;SAF=0;SAR=10;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0354507;OID=.;OPOS=501725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:13:13:3:3:10:10:0.769231:10:0:0:3:10:0:0:3
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chr19	579010	.	G	A	214.32	PASS	AF=0.947368;AO=18;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00872507;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.6943;QD=45.1189;RBI=0.0589491;REFB=-0.165373;REVB=0.0582999;RO=0;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.55549;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.00822355;OID=.;OPOS=579010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:19:19:0:1:18:18:0.947368:4:14:0:0:4:14:0:1
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chr19	580665	.	T	C	1348.15	PASS	AF=1;AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0370852;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.06;QD=62.7048;RBI=0.0533854;REFB=0;REVB=0.0384016;RO=0;SAF=53;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07334e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125684;OID=.;OPOS=580665;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:86:0:0:85:86:1:32:53:0:0:33:53:0:0
chr19	582505	.	G	A	282.12	PASS	AF=1;AO=20;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0636572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.56;QD=51.2936;RBI=0.0705721;REFB=0;REVB=0.030466;RO=1;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0438656;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00252564;OID=.;OPOS=582505;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:1:0:20:22:1:10:10:0:1:11:11:0:0
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chr19	582927	.	T	A	776.66	PASS	AF=0.90625;AO=57;DP=62;FAO=58;FDP=64;FR=.;FRO=6;FSAF=21;FSAR=37;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00237665;FXX=0.0447694;HRUN=7;LEN=1;MLLD=229.464;QD=48.5415;RBI=0.013446;REFB=-0.0638622;REVB=-0.0132343;RO=5;SAF=21;SAR=36;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0051376;STB=0.50292;STBP=0.918;TYPE=snp;VARB=0.000439486;OID=.;OPOS=582927;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:62:64:5:6:57:58:0.90625:36:21:2:3:37:21:2:4
chr19	605171	.	T	C	2011.2	PASS	AF=1;AO=126;DP=126;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=72;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0947435;FXX=0.00769172;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.926;QD=62.3627;RBI=0.0948324;REFB=0;REVB=0.00410636;RO=0;SAF=69;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000237039;OID=.;OPOS=605171;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:126:129:0:0:126:129:1:57:69:0:0:57:72:0:0
chr19	613307	.	C	T	424.18	PASS	AF=0.634921;AO=40;DP=63;FAO=40;FDP=63;FR=.;FRO=23;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=0.0201041;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.837;QD=26.9321;RBI=0.0284391;REFB=-0.0263316;REVB=0.0201149;RO=23;SAF=21;SAR=19;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0312846;STB=0.517069;STBP=0.753;TYPE=snp;VARB=0.026216;OID=.;OPOS=613307;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:23:23:40:40:0.634921:19:21:11:12:19:21:11:12
chr19	613898	.	T	C	1415.35	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00242881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2602;QD=62.9043;RBI=0.048322;REFB=0;REVB=0.048261;RO=0;SAF=59;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156667;OID=.;OPOS=613898;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:31:59:0:0:31:59:0:0
chr19	618722	.	G	A	200.85	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=0.0210917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.451;QD=20.6;RBI=0.035032;REFB=-0.0288979;REVB=0.027971;RO=19;SAF=4;SAR=16;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.291795;STB=0.666481;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0249369;OID=.;OPOS=618722;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:19:19:20:20:0.512821:16:4:9:10:16:4:9:10
chr19	619021	.	G	C	301.63	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00409497;FXX=0.039984;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.564;QD=50.271;RBI=0.00423802;REFB=-0.128529;REVB=-0.00109178;RO=0;SAF=22;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.47154e-08;STB=0.666479;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.00105432;OID=.;OPOS=619021;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:24:24:0:1:23:23:0.958333:1:22:0:0:1:22:0:1
chr19	621063	.	A	G	347.51	PASS	AF=0.408602;AO=38;DP=93;FAO=38;FDP=93;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=29;FWDB=-0.0331304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0647;QD=14.9464;RBI=0.0398683;REFB=0.0115486;REVB=-0.0221779;RO=54;SAF=26;SAR=12;SRF=26;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220136;STB=0.630698;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.013269;OID=.;OPOS=621063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:54:55:38:38:0.408602:12:26:26:28:12:26:26:29
chr19	621070	.	G	A	335.37	PASS	AF=0.386139;AO=39;DP=101;FAO=39;FDP=101;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=0.0211226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=138.022;QD=13.2821;RBI=0.0230555;REFB=-0.019549;REVB=-0.0092407;RO=58;SAF=25;SAR=14;SRF=30;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135355;STB=0.598907;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0404996;OID=.;OPOS=621070;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:58:62:39:39:0.386139:14:25:30:28:14:25:30:32
chr19	621712	.	A	G	434.01	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0705912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.8982;QD=54.2513;RBI=0.165726;REFB=-0.0135901;REVB=-0.14994;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.511104;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=-0.00384569;OID=.;OPOS=621712;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:0:1:31:31:0.96875:9:22:0:0:9:22:1:0
chr19	622336	.	T	G	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0577184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.8134;QD=46.8477;RBI=0.0742724;REFB=0;REVB=-0.0467438;RO=0;SAF=1;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264701;OID=.;OPOS=622336;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:14:1:0:0:14:1:0:0
chr19	625198	.	A	G	1132.17	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00970652;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.8;QD=60.3822;RBI=0.0158498;REFB=0;REVB=0.01253;RO=0;SAF=34;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.96464e-05;OID=.;OPOS=625198;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:75:0:0:73:75:1:39:34:0:0:41:34:0:0
chr19	632915	.	G	A	164.4	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=11;FWDB=0.00436061;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=231.287;QD=13.6996;RBI=0.00786742;REFB=-0.0142918;REVB=0.00654838;RO=30;SAF=8;SAR=10;SRF=19;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200646;STB=0.616313;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0228588;OID=.;OPOS=632915;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:10:8:19:11:10:8:19:11
chr19	641215	.	T	C	149.61	PASS	AF=0.318182;AO=21;DP=64;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=36;FSRR=9;FWDB=-0.00952938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.128;QD=9.06697;RBI=0.0453697;REFB=-0.0100855;REVB=-0.0443577;RO=41;SAF=12;SAR=9;SRF=34;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320822;STB=0.666532;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0302579;OID=.;OPOS=641215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:66:41:45:21:21:0.318182:9:12:34:7:9:12:36:9
chr19	687078	.	G	A	350.11	PASS	AF=0.652174;AO=28;DP=44;FAO=30;FDP=46;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=0.00258253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1935;QD=30.444;RBI=0.0570413;REFB=-0.0199686;REVB=0.0569828;RO=16;SAF=16;SAR=12;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123287;STB=0.566023;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.0144445;OID=.;OPOS=687078;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:46:16:16:28:30:0.652174:12:16:12:4:13:17:12:4
chr19	687112	.	G	A	73.69	PASS	AF=0.526316;AO=9;DP=18;FAO=10;FDP=19;FR=.,HEALED;FRO=9;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=0.0182971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.987;QD=15.5137;RBI=0.060052;REFB=-0.0191369;REVB=0.0571967;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.240193;STB=0.650903;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.0289533;OID=.;OPOS=687112;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:18:19:7:9:9:10:0.526316:4:5:6:1:4:6:8:1
chr19	691909	.	T	C	1590.76	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0202571;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.562;QD=64.2733;RBI=0.0349444;REFB=0;REVB=0.0284738;RO=0;SAF=50;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00015342;OID=.;OPOS=691909;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:49:50:0:0:49:50:0:0
chr19	731144	.	A	G	1434.65	PASS	AF=1;AO=91;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293715;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.6261;QD=62.376;RBI=0.0295894;REFB=0;REVB=-0.00358376;RO=1;SAF=46;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0101937;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120983;OID=.;OPOS=731144;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:92:92:1:0:91:92:1:45:46:1:0:45:47:0:0
chr19	748273	.	G	C	43.8	PASS	AF=0.097561;AO=8;DP=83;FAO=8;FDP=82;FR=.,HEALED;FRO=71;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=31;FSRR=40;FWDB=-0.00368936;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.1785;QD=2.13644;RBI=0.0048221;REFB=0.00065603;REVB=-0.00310503;RO=71;SAF=7;SAR=1;SRF=31;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.499497;STB=0.882149;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.0126832;OID=.;OPOS=748273;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:83:82:71:71:8:8:0.097561:1:7:31:40:1:7:31:40
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chr19	804612	.	C	T	350.07	PASS	AF=0.618182;AO=34;DP=56;FAO=34;FDP=55;FR=.;FRO=21;FSAF=26;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=0;FWDB=-0.0125396;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.926;QD=25.4599;RBI=0.0151961;REFB=-0.0366412;REVB=-0.00858369;RO=21;SAF=26;SAR=8;SRF=21;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.267039;STB=0.643768;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0160953;OID=.;OPOS=804612;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:21:21:34:34:0.618182:8:26:21:0:8:26:21:0
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chr19	810573	.	C	A	369.51	PASS	AF=0.560606;AO=37;DP=65;FAO=37;FDP=66;FR=.;FRO=29;FSAF=25;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.00660281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.9374;QD=22.3946;RBI=0.00746639;REFB=-0.00868845;REVB=0.00348567;RO=28;SAF=25;SAR=12;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0289263;STB=0.510199;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.00270752;OID=.;OPOS=810573;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:66:28:29:37:37:0.560606:12:25:18:10:12:25:19:10
chr19	815319	.	C	T	196.38	PASS	AF=0.782609;AO=18;DP=23;FAO=18;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0576159;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.274;QD=34.1527;RBI=0.0649663;REFB=-0.0798418;REVB=0.0300171;RO=5;SAF=9;SAR=9;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0395097;STB=0.521715;STBP=0.759;TYPE=snp;VARB=0.0223168;OID=.;OPOS=815319;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:23:23:5:5:18:18:0.782609:9:9:2:3:9:9:2:3
chr19	844020	.	G	A	657.1	PASS	AF=0.977778;AO=42;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0263622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.732;QD=58.4093;RBI=0.0350549;REFB=-0.127929;REVB=0.0231058;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513507;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00147785;OID=.;OPOS=844020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:45:45:0:1:42:44:0.977778:26:16:0:0:26:18:1:0
chr19	919893	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.775;QD=33.4285;RBI=0.0128009;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125595;OID=.;OPOS=919893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr19	964434	.	G	A	205.94	PASS	AF=0.571429;AO=19;DP=34;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.026764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.285;QD=23.5363;RBI=0.0270018;REFB=-0.0227991;REVB=-0.00357574;RO=15;SAF=7;SAR=12;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.234412;STB=0.613523;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.00678786;OID=.;OPOS=964434;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:15:15:19:20:0.571429:12:7:10:5:12:8:10:5
chr19	965043	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0345599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.277;QD=61.6834;RBI=0.0381218;REFB=0;REVB=-0.0160899;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.25069e-05;OID=.;OPOS=965043;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:17:24:0:0:17:24:0:0
chr19	966693	.	C	T	1026.4	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.6866;QD=59.5014;RBI=0.0612803;REFB=0;REVB=0.0583217;RO=0;SAF=30;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289967;OID=.;OPOS=966693;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:39:30:0:0:39:30:0:0
chr19	971933	.	A	G	165.1	PASS	AF=1;AO=12;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.150225;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.16;QD=47.1709;RBI=0.152624;REFB=0;REVB=0.0269554;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000661966;OID=.;OPOS=971933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:12:14:1:7:5:0:0:8:6:0:0
chr19	971949	.	G	A	137.97	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0313181;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.9041;QD=39.4212;RBI=0.110981;REFB=-0.156745;REVB=0.106471;RO=0;SAF=5;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60098e-08;STB=0.529367;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.012627;OID=.;OPOS=971949;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:14:14:0:1:13:13:0.928571:8:5:0:0:8:5:0:1
chr19	984533	.	T	C	335.88	PASS	AF=0.507246;AO=35;DP=68;FAO=35;FDP=69;FR=.;FRO=34;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0331058;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.054;QD=19.4712;RBI=0.0331086;REFB=-0.0211028;REVB=-0.000430763;RO=32;SAF=11;SAR=24;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0882147;STB=0.568783;STBP=0.274;TYPE=snp;VARB=0.0192735;OID=.;OPOS=984533;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:69:32:34:35:35:0.507246:24:11:13:19:24:11:15:19
chr19	984554	.	C	G	173.09	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.00848045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.179;QD=18.7119;RBI=0.0230383;REFB=-0.0447379;REVB=-0.0214206;RO=19;SAF=8;SAR=10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266391;STB=0.515135;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0433857;OID=.;OPOS=984554;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:10:8:9:10:10:8:9:10
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chr19	1036552	.	T	C	1594.65	PASS	AF=0.990826;AO=106;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=79;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.023883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.559;QD=58.5193;RBI=0.0328479;REFB=-0.0789492;REVB=0.0225519;RO=0;SAF=78;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.79767e-08;STB=0.508473;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.000592603;OID=.;OPOS=1036552;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:109:0:1:106:108:0.990826:28:78:0:0:29:79:0:1
chr19	1038995	.	A	C	3819.1	PASS	AF=1;AO=237;DP=238;FAO=241;FDP=241;FR=.;FRO=0;FSAF=109;FSAR=132;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00720994;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.521;QD=63.3875;RBI=0.00951876;REFB=0;REVB=-0.00621479;RO=0;SAF=107;SAR=130;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.04837e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89175e-05;OID=.;OPOS=1038995;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:21:238:241:0:0:237:241:1:130:107:0:0:132:109:0:0
chr19	1041352	.	A	G	97.92	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=-0.0278812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.199;QD=13.5056;RBI=0.0331383;REFB=-0.025881;REVB=-0.0179104;RO=17;SAF=6;SAR=6;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207284;STB=0.6205;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0291304;OID=.;OPOS=1041352;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:6:6:12:5:6:6:12:5
chr19	1042809	.	A	G	144.18	PASS	AF=0.625;AO=15;DP=24;FAO=15;FDP=24;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=12;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00963913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.326;QD=24.0303;RBI=0.0121345;REFB=-0.000977524;REVB=0.00737112;RO=9;SAF=3;SAR=12;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292983;STB=0.666419;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.000509194;OID=.;OPOS=1042809;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:24:24:9:9:15:15:0.625:12:3:5:4:12:3:5:4
chr19	1047002	.	A	G	482.73	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.03423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5926;QD=58.5131;RBI=0.0753984;REFB=0;REVB=-0.0671806;RO=0;SAF=16;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00156703;OID=.;OPOS=1047002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:17:16:0:0:17:16:0:0
chr19	1047161	.	A	G	1541.97	PASS	AF=1;AO=91;DP=94;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.498;QD=59.3066;RBI=0.0293624;REFB=0;REVB=-0.00537712;RO=0;SAF=40;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.55808e-05;OID=.;OPOS=1047161;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:94:104:0:0:91:104:1:51:40:0:0:56:48:0:0
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chr19	1056065	.	A	G	99.64	PASS	AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0200191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.672;QD=26.5702;RBI=0.0230106;REFB=0.00215417;REVB=-0.0113456;RO=4;SAF=2;SAR=9;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0518926;STB=0.529356;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=-0.000361859;OID=.;OPOS=1056065;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:9:2:1:3:9:2:1:3
chr19	1059004	.	A	G	225.41	PASS	AF=0.511628;AO=22;DP=43;FAO=22;FDP=43;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.0593148;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.7096;QD=20.9687;RBI=0.0741839;REFB=-0.000299352;REVB=-0.0445533;RO=21;SAF=13;SAR=9;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0691418;STB=0.538768;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.00223764;OID=.;OPOS=1059004;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:21:21:22:22:0.511628:9:13:14:7:9:13:14:7
chr19	1064193	.	G	A	683.88	PASS	AF=0.476821;AO=72;DP=151;FAO=72;FDP=151;FR=.;FRO=79;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=50;FSRR=29;FWDB=0.0279119;FXX=0.013071;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.688;QD=18.116;RBI=0.0308169;REFB=-0.0229955;REVB=0.0130617;RO=79;SAF=40;SAR=32;SRF=50;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748494;STB=0.541342;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0201218;OID=.;OPOS=1064193;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:151:79:79:72:72:0.476821:32:40:50:29:32:40:50:29
chr19	1068734	.	T	C	637.25	PASS	AF=0.44;AO=66;DP=148;FAO=66;FDP=150;FR=.;FRO=84;FSAF=40;FSAR=26;FSRF=45;FSRR=39;FWDB=0.00653324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.804;QD=16.9932;RBI=0.0246699;REFB=-0.034941;REVB=-0.0237891;RO=80;SAF=40;SAR=26;SRF=43;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694573;STB=0.540528;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0374774;OID=.;OPOS=1068734;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:150:80:84:66:66:0.44:26:40:43:37:26:40:45:39
chr19	1068738	.	G	A	623.51	PASS	AF=0.436242;AO=65;DP=149;FAO=65;FDP=149;FR=.;FRO=84;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=39;FWDB=0.0629592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.248;QD=16.7385;RBI=0.0649876;REFB=-0.0179738;REVB=0.0161099;RO=83;SAF=40;SAR=25;SRF=44;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0883249;STB=0.54641;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.0123569;OID=.;OPOS=1068738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:149:83:84:65:65:0.436242:25:40:44:39:25:40:45:39
chr19	1074000	.	A	T	637.16	PASS	AF=0.507937;AO=64;DP=126;FAO=64;FDP=126;FR=.;FRO=62;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=-0.00888113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.965;QD=20.2274;RBI=0.00896709;REFB=-0.0274697;REVB=0.00123863;RO=61;SAF=36;SAR=28;SRF=34;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0046081;STB=0.50704;STBP=0.879;TYPE=snp;VARB=0.0181931;OID=.;OPOS=1074000;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:126:61:62:64:64:0.507937:28:36:34:27:28:36:34:28
chr19	1077985	.	A	G	137.88	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0425041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.397;QD=19.0176;RBI=0.0427075;REFB=-0.0294715;REVB=-0.00416285;RO=14;SAF=11;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.278882;STB=0.659775;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0196296;OID=.;OPOS=1077985;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:4:11:6:8:4:11:6:8
chr19	1081617	.	A	G	207.28	PASS	AF=1;AO=14;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.123328;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.632;QD=48.7725;RBI=0.21536;REFB=0;REVB=0.176551;RO=0;SAF=12;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0103364;OID=.;OPOS=1081617;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:14:17:1:2:12:0:0:5:12:0:0
chr19	1094004	.	G	A	1188.19	PASS	AF=1;AO=75;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246307;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=291.645;QD=60.9326;RBI=0.0246308;REFB=0;REVB=7.5751e-05;RO=1;SAF=45;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155095;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.25466e-05;OID=.;OPOS=1094004;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:1:0:75:78:1:30:45:0:1:33:45:0:0
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chr19	1110829	.	G	A	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=6;DP=12;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0300835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.06;QD=15.2591;RBI=0.0350743;REFB=-0.0164476;REVB=-0.018033;RO=6;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372539;STB=0.6871;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0198629;OID=.;OPOS=1110829;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:12:13:6:6:6:7:0.538462:4:2:0:6:5:2:0:6
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chr19	1119963	.	A	G	452.62	PASS	AF=0.54321;AO=42;DP=79;FAO=44;FDP=81;FR=.;FRO=37;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.00590848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.14;QD=22.3513;RBI=0.0167813;REFB=-0.011892;REVB=-0.0157067;RO=37;SAF=17;SAR=25;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242111;STB=0.510978;STBP=0.85;TYPE=snp;VARB=0.0101482;OID=.;OPOS=1119963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:81:37:37:42:44:0.54321:25:17:16:21:26:18:16:21
chr19	1122147	.	G	A	253.93	PASS	AF=0.474576;AO=27;DP=60;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=25;FSRR=6;FWDB=-0.0268339;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.59;QD=17.2154;RBI=0.0273668;REFB=-0.0117831;REVB=0.00537425;RO=28;SAF=18;SAR=9;SRF=25;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.257173;STB=0.581444;STBP=0.316;TYPE=snp;VARB=0.0197032;OID=.;OPOS=1122147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:59:28:31:27:28:0.474576:9:18:25:3:9:19:25:6
chr19	1122676	.	C	T	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.031502;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.194;QD=18.8866;RBI=0.0369667;REFB=-0.045195;REVB=-0.0193432;RO=5;SAF=6;SAR=2;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.121731;STB=0.57124;STBP=0.638;TYPE=snp;VARB=0.0264527;OID=.;OPOS=1122676;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:2:6:3:2:2:6:3:2
chr19	1124053	.	A	G	66.34	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0515866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.602;QD=12.0625;RBI=0.0537867;REFB=-0.0466945;REVB=0.0152262;RO=12;SAF=4;SAR=5;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0535863;STB=0.555432;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0687705;OID=.;OPOS=1124053;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:22:12:13:9:9:0.409091:5:4:6:6:5:4:7:6
chr19	1222012	.	G	C	93.83	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=36;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0415491;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3134;QD=10.4256;RBI=0.052159;REFB=-0.0121167;REVB=0.0315315;RO=24;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316429;STB=0.687213;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0256363;OID=.;OPOS=1222012;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:36:36:24:24:12:12:0.333333:5:7:7:17:5:7:7:17
chr19	1231141	.	GT	CG,GC	655.29	PASS	AF=0.0208333,0.979167;AO=5,43;DP=52;FAO=1,47;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=0,43;FSAR=1,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453239,0.0595132;FXX=0.0769083;HRUN=5,1;LEN=2,1;MLLD=117.97,152.09;QD=54.6077;RBI=0.0610808,0.0690287;REFB=0,0;REVB=0.0409464,0.0349733;RO=0;SAF=0,40;SAR=5,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.275757,0.00314837;OID=.,.;OPOS=1231141,1231142;OREF=GT,T;OALT=CG,C;OMAPALT=CG,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:52:48:0:0:5,43:1,47:0.0208333,0.979167:5,3:0,40:0:0:1,4:0,43:0:0
chr19	1231217	.	T	TC	51.76	PASS	AF=0.138614;AO=48;DP=203;FAO=28;FDP=202;FR=.;FRO=174;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=111;FSRR=63;FWDB=-0.0382359;FXX=0.00492587;HRUN=0;LEN=1;MLLD=83.6936;QD=1.02502;RBI=0.055768;REFB=-0.00711772;REVB=-0.0405966;RO=150;SAF=11;SAR=37;SRF=105;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.55235;STB=0.834417;STBP=0.002;TYPE=ins;VARB=0.189683;OID=.;OPOS=1231218;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.138614:48:203:28:202:174:6:22:111:63:51:150:11:37:105:45
chr19	1258801	.	AG	GA	42.29	PASS	AF=0.243243;AO=7;DP=35;FAO=9;FDP=37;FR=.;FRO=28;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=28;FSRR=0;FWDB=-0.0475354;FXX=0;HRUN=10;LEN=2;MLLD=32.2589;QD=4.57179;RBI=0.0475354;REFB=-0.0242317;REVB=0;RO=18;SAF=7;SAR=0;SRF=18;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0287989;OID=.;OPOS=1258801;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:35:37:18:28:7:9:0.243243:0:7:18:0:0:9:28:0
chr19	1272040	.	T	C	5489.62	PASS	AF=1;AO=347;DP=350;FAO=350;FDP=350;FR=.;FRO=0;FSAF=146;FSAR=204;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012139;FXX=0.00284892;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.339;QD=62.7386;RBI=0.0128793;REFB=0;REVB=0.00430357;RO=0;SAF=146;SAR=201;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79725e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.16973e-06;OID=.;OPOS=1272040;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:30:350:350:0:0:347:350:1:201:146:0:0:204:146:0:0
chr19	1277275	.	G	C	544.92	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00717014;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4819;QD=60.5462;RBI=0.0215854;REFB=0;REVB=0.0203597;RO=0;SAF=24;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461119;OID=.;OPOS=1277275;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:11:24:0:0:12:24:0:0
chr19	1278847	.	C	T	188.51	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.0035574;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.412;QD=13.0007;RBI=0.0212217;REFB=-0.0166293;REVB=0.0209214;RO=34;SAF=13;SAR=10;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153189;STB=0.593673;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0239255;OID=.;OPOS=1278847;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:35:23:23:0.396552:10:13:24:10:10:13:25:10
chr19	1321754	.	G	A	236.12	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=-0.00449188;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=285.204;QD=19.2749;RBI=0.00539249;REFB=-0.0165952;REVB=-0.00298361;RO=26;SAF=6;SAR=17;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347928;STB=0.697582;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0179217;OID=.;OPOS=1321754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:17:6:16:10:17:6:16:10
chr19	1357082	.	T	C	412.1	PASS	AF=0.396694;AO=47;DP=121;FAO=48;FDP=121;FR=.;FRO=73;FSAF=29;FSAR=19;FSRF=46;FSRR=27;FWDB=0.00522026;FXX=0.00819605;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.149;QD=13.6232;RBI=0.00817327;REFB=-0.0132041;REVB=-0.00628898;RO=74;SAF=29;SAR=18;SRF=47;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0207925;STB=0.516485;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.0234057;OID=.;OPOS=1357082;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:74:73:47:48:0.396694:18:29:47:27:19:29:46:27
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chr19	1360692	.	G	A	285.83	PASS	AF=0.37931;AO=33;DP=86;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=13;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.0111936;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=192.733;QD=13.1414;RBI=0.0120362;REFB=-0.0122733;REVB=-0.0044242;RO=53;SAF=13;SAR=20;SRF=24;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0653577;STB=0.532354;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0190796;OID=.;OPOS=1360692;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:87:53:54:33:33:0.37931:20:13:24:29:20:13:24:30
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chr19	1507401	.	A	AC	31.43	PASS	AF=0.36;AO=7;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.123646;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=18.0172;QD=5.02874;RBI=0.134496;REFB=-0.0208807;REVB=0.0529216;RO=16;SAF=6;SAR=1;SRF=5;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.587714;STB=0.879862;STBP=0.01;TYPE=ins;VARB=0.0485406;OID=.;OPOS=1507402;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.36:7:25:9:25:16:8:1:5:11:31:16:6:1:5:11
chr19	1510661	.	A	G	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.9624;QD=43.4849;RBI=0.0730503;REFB=0;REVB=-0.0716575;RO=0;SAF=11;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23983e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00180911;OID=.;OPOS=1510661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:1:11:0:0:1:11:0:0
chr19	1533972	.	C	G	371.99	PASS	AF=0.408163;AO=40;DP=98;FAO=40;FDP=98;FR=.;FRO=58;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.024056;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5048;QD=15.1832;RBI=0.0364072;REFB=-0.0259302;REVB=0.0273275;RO=57;SAF=15;SAR=25;SRF=35;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.246836;STB=0.634451;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.0623471;OID=.;OPOS=1533972;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:57:58:40:40:0.408163:25:15:35:22:25:15:35:23
chr19	1534042	.	T	C	248.86	PASS	AF=0.444444;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=63;FR=.;FRO=35;FSAF=7;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0571588;FXX=0.0596926;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.1601;QD=15.8004;RBI=0.0701921;REFB=-0.0298974;REVB=-0.0407407;RO=35;SAF=7;SAR=21;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175486;STB=0.599924;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=0.0199259;OID=.;OPOS=1534042;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:63:35:35:28:28:0.444444:21:7:14:21:21:7:14:21
chr19	1535084	.	G	A	687.63	PASS	AF=0.472603;AO=69;DP=146;FAO=69;FDP=146;FR=.;FRO=77;FSAF=39;FSAR=30;FSRF=52;FSRR=25;FWDB=0.00272014;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.665;QD=18.8393;RBI=0.00290861;REFB=-0.0175087;REVB=0.00102998;RO=77;SAF=39;SAR=30;SRF=52;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108616;STB=0.559983;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0180554;OID=.;OPOS=1535084;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:146:77:77:69:69:0.472603:30:39:52:25:30:39:52:25
chr19	1535193	.	GCCC	G,GCCA	497.31	PASS	AF=0.5,0.1;AO=33,14;DP=80;FAO=40,8;FDP=80;FR=.;FRO=32;FSAF=23,8;FSAR=17,0;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=-0.00867557,-0.0399125;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=3,1;MLLD=45.3313,213.035;QD=24.8653;RBI=0.00904995,0.0425919;REFB=-0.0339237,-0.0250121;REVB=0.00257606,-0.0148683;RO=27;SAF=16,14;SAR=17,0;SRF=15;SRR=12;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0574416,0.78847;STB=0.505671,0.998378;STBP=0.931,0.007;TYPE=del,snp;VARB=0.0187864,0.0723134;OID=.,.;OPOS=1535194,1535196;OREF=CCC,C;OALT=-,A;OMAPALT=G,GCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5,0.1:33,14:80:40,8:80:32:23,8:17,0:18:14:99:27:16,14:17,0:15:12
chr19	1535205	.	G	C	369.11	PASS	AF=0.552239;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=67;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0163581;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.7067;QD=22.0365;RBI=0.0477218;REFB=-0.0407729;REVB=-0.0448306;RO=31;SAF=20;SAR=17;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00651972;STB=0.503245;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0313145;OID=.;OPOS=1535205;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:31:30:37:37:0.552239:17:20:17:14:17:20:16:14
chr19	1609267	.	A	G	392.17	PASS	AF=0.935484;AO=29;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0121006;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=295.843;QD=50.602;RBI=0.060158;REFB=0.0126201;REVB=-0.0589285;RO=1;SAF=23;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.01983;STB=0.527849;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=-0.000144938;OID=.;OPOS=1609267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:1:2:29:29:0.935484:6:23:1:0:6:23:1:1
chr19	1624007	.	A	G	4511.87	PASS	AF=0.993056;AO=286;DP=288;FAO=286;FDP=288;FR=.;FRO=2;FSAF=160;FSAR=126;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0306871;FXX=0.00346009;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.2594;QD=62.6649;RBI=0.0308348;REFB=0.00888365;REVB=0.00301456;RO=1;SAF=161;SAR=125;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00295289;STB=0.503105;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=-0.000458559;OID=.;OPOS=1624007;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:288:288:1:2:286:286:0.993056:125:161:1:0:126:160:2:0
chr19	1796166	.	C	T	313.27	PASS	AF=0.515625;AO=32;DP=63;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00475917;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.52;QD=19.5791;RBI=0.0100483;REFB=-0.0097291;REVB=0.00884975;RO=29;SAF=12;SAR=20;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210913;STB=0.606871;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0108664;OID=.;OPOS=1796166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:64:29:31:32:33:0.515625:20:12:18:11:21:12:18:13
chr19	1796943	.	C	T	184.89	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0289538;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=260.962;QD=18.4888;RBI=0.0303102;REFB=-0.0275328;REVB=-0.00896562;RO=18;SAF=15;SAR=4;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383697;STB=0.692086;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.0359917;OID=.;OPOS=1796943;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:21:19:19:0.475:4:15:7:11:4:15:10:11
chr19	1810605	.	T	C	51.52	PASS	AF=0.241379;AO=7;DP=29;FAO=7;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0123302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.468;QD=7.10631;RBI=0.0270295;REFB=-0.0147502;REVB=-0.0240532;RO=19;SAF=6;SAR=1;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.593786;STB=0.872776;STBP=0.039;TYPE=snp;VARB=0.0499023;OID=.;OPOS=1810605;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:29:29:19:21:7:7:0.241379:1:6:6:13:1:6:7:14
chr19	1811547	.	A	G	180.96	PASS	AF=0.403846;AO=21;DP=51;FAO=21;FDP=52;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=23;FWDB=0.0164631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.252;QD=13.9199;RBI=0.0413771;REFB=-0.0186244;REVB=-0.0379609;RO=29;SAF=14;SAR=7;SRF=8;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.382852;STB=0.731502;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0100845;OID=.;OPOS=1811547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:29:31:21:21:0.403846:7:14:8:21:7:14:8:23
chr19	1819112	.	A	G	521.57	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=36;FSRR=14;FWDB=0.00243468;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=233.165;QD=20.8626;RBI=0.0160171;REFB=-0.0316928;REVB=-0.0158309;RO=49;SAF=27;SAR=23;SRF=36;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179029;STB=0.591877;STBP=0.088;TYPE=snp;VARB=0.0286994;OID=.;OPOS=1819112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:49:50:50:50:0.5:23:27:36:13:23:27:36:14
chr19	1821637	.	A	G	188.5	PASS	AF=0.4;AO=19;DP=50;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0366071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.562;QD=15.0799;RBI=0.036895;REFB=-0.0120785;REVB=-0.00459972;RO=28;SAF=12;SAR=7;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139408;STB=0.540942;STBP=0.608;TYPE=snp;VARB=0.0193913;OID=.;OPOS=1821637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:28:30:19:20:0.4:7:12:14:14:8:12:16:14
chr19	1880950	.	T	C	1153.6	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0241207;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.23;QD=60.716;RBI=0.0337175;REFB=0;REVB=0.0235597;RO=0;SAF=29;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.27908e-05;OID=.;OPOS=1880950;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:47:29:0:0:47:29:0:0
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chr19	1912986	.	C	T	124.22	PASS	AF=0.3125;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=48;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=0.0184868;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3882;QD=10.3516;RBI=0.0333184;REFB=0.00126059;REVB=-0.0277192;RO=33;SAF=9;SAR=6;SRF=8;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.39651;STB=0.732016;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00384875;OID=.;OPOS=1912986;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:33:33:15:15:0.3125:6:9:8:25:6:9:8:25
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chr19	1997363	.	A	G	324.54	PASS	AF=0.515152;AO=34;DP=66;FAO=34;FDP=66;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=-0.0101537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7803;QD=19.6692;RBI=0.0273018;REFB=-0.0151473;REVB=0.0253434;RO=32;SAF=15;SAR=19;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212412;STB=0.617683;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0175541;OID=.;OPOS=1997363;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:32:32:34:34:0.515152:19:15:22:10:19:15:22:10
chr19	2041032	.	T	C	920.07	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00778343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.441;QD=58.4173;RBI=0.0198957;REFB=0;REVB=-0.01831;RO=0;SAF=39;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.51964e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.15287e-05;OID=.;OPOS=2041032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:24:39:0:0:24:39:0:0
chr19	2046687	.	GCCCCT	GCCCCG,GCCCT	44.68	PASS	AF=0,0.259259;AO=2,23;DP=56;FAO=0,14;FDP=54;FR=.;FRO=40;FSAF=0,9;FSAR=0,5;FSRF=15;FSRR=25;FWDB=-0.100463,-0.0460329;FXX=0.0357079;HRUN=1,4;LEN=1,1;MLLD=70.4143,10.0425;QD=3.30999;RBI=0.113214,0.158224;REFB=-0.0233084,-0.160149;REVB=-0.0521965,-0.15138;RO=27;SAF=2,12;SAR=0,11;SRF=9;SRR=18;SSEN=0,0;SSEP=0,0.333333;SSSB=0.5571,0.178956;STB=0.5,0.692045;STBP=1,0.108;TYPE=snp,del;VARB=0.113764,0.145219;OID=.,.;OPOS=2046692,2046688;OREF=T,C;OALT=G,-;OMAPALT=GCCCCG,GCCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.259259:2,23:56:0,14:54:40:0,9:0,5:15:25:46:27:2,12:0,11:9:18
chr19	2046694	.	CAG	AGA,CGA	294.11	PASS	AF=0,0.566667;AO=3,20;DP=63;FAO=0,34;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=23;FSAF=0,5;FSAR=0,29;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=-0.0909118,-0.0731187;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,2;MLLD=37.0146,25.7343;QD=19.6076;RBI=0.0997303,0.0967609;REFB=-0.0211409,-0.0927112;REVB=-0.0410021,0.0633745;RO=19;SAF=0,0;SAR=3,20;SRF=15;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.727768,-0.863792;STB=0.5,0.784558;STBP=1,0;TYPE=mnp,mnp;VARB=0,0.174737;OID=.,.;OPOS=2046694,2046695;OREF=CAG,AG;OALT=AGA,GA;OMAPALT=AGA,CGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:63:60:19:23:3,20:0,34:0,0.566667:3,20:0,0:15:4:0,29:0,5:17:6
chr19	2050823	.	G	T	218.1	PASS	AF=0.446429;AO=25;DP=56;FAO=25;FDP=56;FR=.;FRO=31;FSAF=3;FSAR=22;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=0.0107975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.721;QD=15.5785;RBI=0.0112541;REFB=-0.00642063;REVB=-0.00317312;RO=30;SAF=3;SAR=22;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.532591;STB=0.802635;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.00956459;OID=.;OPOS=2050823;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:30:31:25:25:0.446429:22:3:17:13:22:3:17:14
chr19	2078409	.	A	G	54.66	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=12;FWDB=-0.044338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.0557;QD=9.11019;RBI=0.176459;REFB=-0.000375521;REVB=-0.170797;RO=16;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.509185;STB=0.807002;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=-0.00944351;OID=.;OPOS=2078409;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:2:6:4:12:2:6:4:12
chr19	2078488	.	T	C	127.83	PASS	AF=0.297872;AO=12;DP=47;FAO=14;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=31;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0185618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.845;QD=10.8791;RBI=0.0297649;REFB=-0.0176105;REVB=-0.0232682;RO=31;SAF=8;SAR=4;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.06868;STB=0.522152;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0352651;OID=.;OPOS=2078488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:31:31:12:14:0.297872:4:8:19:12:5:9:19:12
chr19	2097986	.	T	C	213.77	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.0313545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.7113;QD=16.1337;RBI=0.0382128;REFB=-0.0501922;REVB=0.021843;RO=28;SAF=10;SAR=14;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245425;STB=0.628379;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0390991;OID=.;OPOS=2097986;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:29:24:24:0.45283:14:10:19:9:14:10:19:10
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chr19	2250469	.	G	A	242.09	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=48;FAO=24;FDP=48;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=-0.0133202;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.891;QD=20.1739;RBI=0.0133884;REFB=-0.0463228;REVB=0.00135001;RO=24;SAF=9;SAR=14;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239571;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0392773;OID=.;OPOS=2250469;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:23:24:0.5:14:9:10:14:14:10:10:14
chr19	2251817	.	T	C	620.18	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5919;QD=60.5052;RBI=0.0653587;REFB=0;REVB=-0.0637717;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000811197;OID=.;OPOS=2251817;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chr19	2252990	.	C	G	415.08	PASS	AF=0.597015;AO=40;DP=67;FAO=40;FDP=67;FR=.;FRO=27;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00222015;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=237.275;QD=24.7806;RBI=0.013756;REFB=-0.0170891;REVB=0.0135757;RO=27;SAF=26;SAR=14;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130046;STB=0.571392;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.011034;OID=.;OPOS=2252990;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:27:27:40:40:0.597015:14:26:13:14:14:26:13:14
chr19	2278755	.	C	T	543.14	PASS	AF=0.973684;AO=34;DP=37;FAO=37;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0153821;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.438;QD=57.1724;RBI=0.0216615;REFB=-0.0271195;REVB=0.0152516;RO=1;SAF=12;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0207798;STB=0.510633;STBP=0.508;TYPE=snp;VARB=0.00174924;OID=.;OPOS=2278755;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:38:1:1:34:37:0.973684:22:12:0:1:23:14:0:1
chr19	2280885	.	G	A	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00379954;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=181.146;QD=16.199;RBI=0.0110188;REFB=-0.0189713;REVB=0.0103429;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116878;STB=0.57112;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0133575;OID=.;OPOS=2280885;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:1:4:2:1:1:4:2:1
chr19	2339949	.	T	C	231.51	PASS	AF=0.421875;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=64;FR=.;FRO=37;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.00574813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.001;QD=14.4696;RBI=0.0438338;REFB=-0.0439858;REVB=-0.0434552;RO=34;SAF=11;SAR=16;SRF=11;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0873435;STB=0.533956;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.0267186;OID=.;OPOS=2339949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:64:34:37:27:27:0.421875:16:11:11:23:16:11:13:24
chr19	2339958	.	T	C	786.88	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=38;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0131579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.288;QD=55.2198;RBI=0.0152728;REFB=-0.0165279;REVB=0.00775419;RO=1;SAF=18;SAR=38;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0254704;STB=0.513509;STBP=0.273;TYPE=snp;VARB=0.000128985;OID=.;OPOS=2339958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:38:18:1:0:38:18:1:0
chr19	2341047	.	C	T	87.31	PASS	AF=0.352941;AO=11;DP=34;FAO=12;FDP=34;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=0.0687039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1951;QD=10.2719;RBI=0.076157;REFB=-0.0120157;REVB=-0.0328582;RO=23;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.453271;STB=0.791214;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0254146;OID=.;OPOS=2341047;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:34:34:23:22:11:12:0.352941:3:8:7:16:3:9:6:16
chr19	2341059	.	GT	AC	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0339189;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=188.827;QD=52.6132;RBI=0.0424001;REFB=0;REVB=0.0254417;RO=0;SAF=11;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000363259;OID=.;OPOS=2341059;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:11:11:0:0:11:11:0:0
chr19	2344022	.	G	A	82.55	PASS	AF=0.37931;AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0158212;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8497;QD=11.3858;RBI=0.0158583;REFB=-0.0304819;REVB=-0.00108355;RO=18;SAF=6;SAR=4;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0123941;STB=0.516748;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.0552424;OID=.;OPOS=2344022;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:28:29:18:18:10:11:0.37931:4:6:11:7:4:7:11:7
chr19	2353368	.	G	A	80.17	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=0.0188454;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.291;QD=16.8781;RBI=0.0293054;REFB=-0.0337766;REVB=0.0224423;RO=9;SAF=3;SAR=7;SRF=1;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20428;STB=0.616236;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0222618;OID=.;OPOS=2353368;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:7:3:1:8:7:3:1:8
chr19	2353372	.	T	C	68.8	PASS	AF=0.5;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=18;FR=.;FRO=9;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0175909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.045;QD=15.2881;RBI=0.027638;REFB=-0.0156966;REVB=-0.0213171;RO=7;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.174375;STB=0.636106;STBP=0.407;TYPE=snp;VARB=0.00936935;OID=.;OPOS=2353372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:17:18:7:9:9:9:0.5:6:3:1:6:6:3:1:8
chr19	2389872	.	G	C	510.98	PASS	AF=0.791667;AO=38;DP=48;FAO=38;FDP=48;FR=.;FRO=10;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0255954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.847;QD=42.5812;RBI=0.0310287;REFB=-0.00648611;REVB=0.0175401;RO=10;SAF=17;SAR=21;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205133;STB=0.511056;STBP=0.815;TYPE=snp;VARB=0.0011544;OID=.;OPOS=2389872;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:48:48:10:10:38:38:0.791667:21:17:5:5:21:17:5:5
chr19	2396556	.	C	T	33.0	PASS	AF=0.3125;AO=3;DP=16;FAO=5;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0171666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.395;QD=8.24945;RBI=0.115188;REFB=-0.0270366;REVB=0.113902;RO=8;SAF=3;SAR=0;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.660908;STB=0.567295;STBP=0.733;TYPE=snp;VARB=0.0321092;OID=.;OPOS=2396556;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:16:16:8:10:3:5:0.3125:0:3:4:4:2:3:5:5
chr19	2396611	.	C	T	38.56	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0126974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.453;QD=11.0169;RBI=0.0256888;REFB=0.000984723;REVB=-0.0223314;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236249;STB=0.642419;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=-0.00178274;OID=.;OPOS=2396611;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:3:3:6:2:3:3:6:2
chr19	2398849	.	A	G	502.46	PASS	AF=0.433071;AO=55;DP=127;FAO=55;FDP=127;FR=.;FRO=72;FSAF=22;FSAR=33;FSRF=30;FSRR=42;FWDB=-0.00962393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.579;QD=15.8253;RBI=0.0269362;REFB=-0.0124193;REVB=-0.0251582;RO=71;SAF=22;SAR=33;SRF=30;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235069;STB=0.5098;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0136753;OID=.;OPOS=2398849;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:71:72:55:55:0.433071:33:22:30:41:33:22:30:42
chr19	2408486	.	T	C	148.33	PASS	AF=0.414634;AO=16;DP=41;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00733317;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.1837;QD=14.4715;RBI=0.0073541;REFB=-0.00544535;REVB=-0.000554444;RO=23;SAF=7;SAR=9;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.041821;STB=0.517221;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0160287;OID=.;OPOS=2408486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:24:16:17:0.414634:9:7:11:12:9:8:12:12
chr19	2408495	.	T	G	154.93	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.00384867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2441;QD=15.8898;RBI=0.0283021;REFB=-0.00673295;REVB=-0.0280392;RO=22;SAF=8;SAR=9;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0733111;STB=0.542119;STBP=0.665;TYPE=snp;VARB=0.00872196;OID=.;OPOS=2408495;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:9:8:12:10:9:8:12:10
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chr19	2410332	.	T	C	233.69	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0424485;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6862;QD=24.5986;RBI=0.0675929;REFB=-0.0310012;REVB=-0.0526016;RO=16;SAF=10;SAR=12;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0610537;STB=0.53395;STBP=0.631;TYPE=snp;VARB=0.0238072;OID=.;OPOS=2410332;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:12:10:6:10:12:10:6:10
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chr19	2433890	.	A	G	153.93	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=0.00110891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.596;QD=11.617;RBI=0.0396115;REFB=-0.0187914;REVB=-0.039596;RO=32;SAF=6;SAR=13;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10715;STB=0.587002;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0355814;OID=.;OPOS=2433890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:34:19:19:0.358491:13:6:13:19:13:6:15:19
chr19	2833802	.	A	G	410.52	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0473376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.299;QD=56.623;RBI=0.0903287;REFB=0;REVB=0.0769313;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000382976;OID=.;OPOS=2833802;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:29:0:0:27:29:1:10:17:0:0:10:19:0:0
chr19	2833864	.	G	A	730.58	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000409971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.3325;QD=56.1985;RBI=0.0217467;REFB=0;REVB=0.0217429;RO=0;SAF=40;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0011316;OID=.;OPOS=2833864;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:52:0:0:51:52:1:11:40:0:0:12:40:0:0
chr19	2853566	.	A	G	206.98	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110482;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.457;QD=48.7015;RBI=0.0178133;REFB=0;REVB=-0.0139732;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.1244e-05;OID=.;OPOS=2853566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr19	2896818	.	C	T	1303.84	PASS	AF=0.988372;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=86;FR=.;FRO=1;FSAF=49;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00643267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2474;QD=60.6436;RBI=0.0202102;REFB=-0.0899138;REVB=-0.0191591;RO=1;SAF=48;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00976682;STB=0.505049;STBP=0.527;TYPE=snp;VARB=0.000782639;OID=.;OPOS=2896818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:86:1:1:84:85:0.988372:36:48:1:0:36:49:1:0
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chr19	2939289	.	A	C	40.02	PASS	AF=0.411765;AO=5;DP=16;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=0.00366081;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.6175;QD=9.41584;RBI=0.141896;REFB=0.0062206;REVB=0.141849;RO=10;SAF=5;SAR=0;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.706086;STB=0.576693;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0126496;OID=.;OPOS=2939289;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:16:17:10:10:5:7:0.411765:0:5:6:4:2:5:6:4
chr19	2939396	.	T	C	65.77	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0224421;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.275;QD=11.4376;RBI=0.0500349;REFB=-0.00391133;REVB=-0.0447196;RO=14;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247851;STB=0.650796;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0152325;OID=.;OPOS=2939396;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:14:14:9:9:0.391304:2:7:8:6:2:7:8:6
chr19	2939401	.	C	G	66.28	PASS	AF=0.409091;AO=9;DP=22;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0157354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.253;QD=12.0518;RBI=0.0308197;REFB=-0.0162716;REVB=-0.0265;RO=13;SAF=7;SAR=2;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.274631;STB=0.666262;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0177961;OID=.;OPOS=2939401;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:22:22:13:13:9:9:0.409091:2:7:7:6:2:7:7:6
chr19	2994903	.	T	C	2399.68	PASS	AF=1;AO=140;DP=144;FAO=158;FDP=158;FR=.;FRO=0;FSAF=70;FSAR=88;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.573;QD=60.7513;RBI=0.106655;REFB=0;REVB=0.0045813;RO=0;SAF=54;SAR=86;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.011e-05;OID=.;OPOS=2994903;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:144:158:0:0:140:158:1:86:54:0:0:88:70:0:0
chr19	2994921	.	G	A	1002.16	PASS	AF=0.575758;AO=95;DP=164;FAO=95;FDP=165;FR=.;FRO=70;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=23;FSRR=47;FWDB=-0.0413819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.177;QD=24.2948;RBI=0.0521102;REFB=-0.0478001;REVB=0.0316703;RO=69;SAF=41;SAR=54;SRF=22;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0902884;STB=0.545074;STBP=0.204;TYPE=snp;VARB=0.034505;OID=.;OPOS=2994921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:164:165:69:70:95:95:0.575758:54:41:22:47:54:41:23:47
chr19	2997897	.	G	A	169.49	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=41;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.000110785;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.025;QD=16.5356;RBI=0.0134351;REFB=-0.00962442;REVB=0.0134347;RO=23;SAF=10;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333225;STB=0.519104;STBP=0.832;TYPE=snp;VARB=0.00772061;OID=.;OPOS=2997897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:23:23:18:18:0.439024:8:10:12:11:8:10:12:11
chr19	3000663	.	G	A	397.41	PASS	AF=0.519481;AO=40;DP=77;FAO=40;FDP=77;FR=.;FRO=37;FSAF=31;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=11;FWDB=0.010722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.2595;QD=20.6448;RBI=0.0107325;REFB=-0.0270806;REVB=0.000475328;RO=37;SAF=31;SAR=9;SRF=26;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.084884;STB=0.547195;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0209432;OID=.;OPOS=3000663;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:37:37:40:40:0.519481:9:31:26:11:9:31:26:11
chr19	3014639	.	A	G	137.88	PASS	AF=0.517241;AO=15;DP=29;FAO=15;FDP=29;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0301765;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.394;QD=19.018;RBI=0.0345673;REFB=1.20391e-05;REVB=-0.0168606;RO=14;SAF=5;SAR=10;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874813;STB=0.549932;STBP=0.651;TYPE=snp;VARB=7.18155e-05;OID=.;OPOS=3014639;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:14:14:15:15:0.517241:10:5:6:8:10:5:6:8
chr19	3028853	.	GC	G	69.47	PASS	AF=0.65;AO=11;DP=20;FAO=13;FDP=20;FR=.;FRO=7;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=-0.014492;FXX=0.0475964;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.0634;QD=13.8949;RBI=0.106441;REFB=-0.0602678;REVB=0.10545;RO=7;SAF=10;SAR=1;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0962028;STB=0.571305;STBP=0.715;TYPE=del;VARB=0.0846826;OID=.;OPOS=3028854;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.65:11:20:13:20:7:12:1:6:1:25:7:10:1:6:1
chr19	3028871	.	G	C	130.64	PASS	AF=0.608696;AO=14;DP=23;FAO=14;FDP=23;FR=.;FRO=9;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0116215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.963;QD=22.7198;RBI=0.0144335;REFB=-0.0399171;REVB=-0.00855967;RO=8;SAF=11;SAR=3;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0912885;STB=0.504581;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0203887;OID=.;OPOS=3028871;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:23:23:8:9:14:14:0.608696:3:11:7:1:3:11:7:2
chr19	3062857	.	T	C	725.06	PASS	AF=0.377778;AO=85;DP=226;FAO=85;FDP=225;FR=.;FRO=140;FSAF=38;FSAR=47;FSRF=60;FSRR=80;FWDB=-0.0022806;FXX=0.00442458;HRUN=2;LEN=1;MLLD=102.811;QD=12.8899;RBI=0.010734;REFB=-0.0215907;REVB=0.0104889;RO=138;SAF=38;SAR=47;SRF=58;SRR=80;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0298025;STB=0.51166;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0451235;OID=.;OPOS=3062857;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:226:225:138:140:85:85:0.377778:47:38:58:80:47:38:60:80
chr19	3119239	.	C	T	686.2	PASS	AF=0.957447;AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00713687;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=223.751;QD=58.3997;RBI=0.0110479;REFB=-0.209031;REVB=-0.00843334;RO=2;SAF=33;SAR=12;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0720805;STB=0.538444;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.00165808;OID=.;OPOS=3119239;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:47:47:2:2:45:45:0.957447:12:33:0:2:12:33:0:2
chr19	3150238	.	A	G	805.17	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00256476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.073;QD=64.4135;RBI=0.0062506;REFB=0;REVB=0.00570018;RO=0;SAF=22;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.41472e-06;OID=.;OPOS=3150238;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:27:22:0:0:27:23:0:0
chr19	3155902	.	G	A	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00571396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.473;QD=58.4195;RBI=0.00900298;REFB=0;REVB=0.00695732;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.0733e-05;OID=.;OPOS=3155902;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:33:30:0:0:33:30:0:0
chr19	3186085	.	G	T	1525.68	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.214;QD=59.8307;RBI=0.050949;REFB=0;REVB=0.028994;RO=0;SAF=52;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136535;OID=.;OPOS=3186085;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:50:52:0:0:50:52:0:0
chr19	3207422	.	T	C	166.13	PASS	AF=0.68;AO=15;DP=23;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0226778;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.034;QD=26.5803;RBI=0.0793743;REFB=-0.0603579;REVB=0.0760657;RO=8;SAF=10;SAR=5;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287518;STB=0.507683;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0297157;OID=.;OPOS=3207422;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:23:25:8:8:15:17:0.68:5:10:5:3:6:11:5:3
chr19	3207646	.	A	G	57.31	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0354796;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9747;QD=12.7356;RBI=0.0357339;REFB=0.0053234;REVB=0.00425589;RO=10;SAF=2;SAR=6;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1654;STB=0.599733;STBP=0.565;TYPE=snp;VARB=-0.00415624;OID=.;OPOS=3207646;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:6:2:4:6:6:2:4:6
chr19	3208890	.	T	C	351.74	PASS	AF=0.367521;AO=43;DP=116;FAO=43;FDP=117;FR=.;FRO=74;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=25;FSRR=49;FWDB=-0.0360364;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.7993;QD=12.0253;RBI=0.0362274;REFB=-0.014138;REVB=-0.00371548;RO=72;SAF=17;SAR=26;SRF=25;SRR=47;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561182;STB=0.538639;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.0216439;OID=.;OPOS=3208890;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:117:72:74:43:43:0.367521:26:17:25:47:26:17:25:49
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chr19	3543397	.	C	T	237.4	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0289964;FXX=0.0263089;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.952;QD=25.6653;RBI=0.0294262;REFB=-0.00414765;REVB=-0.00501076;RO=15;SAF=9;SAR=13;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918485;STB=0.551075;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.00327736;OID=.;OPOS=3543397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:15:15:22:22:0.594595:13:9:8:7:13:9:8:7
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chr19	3595923	.	G	A	162.87	PASS	AF=0.515152;AO=16;DP=32;FAO=17;FDP=33;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=14;FWDB=0.071445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.112;QD=19.7419;RBI=0.0720006;REFB=-0.0444743;REVB=-0.00892702;RO=16;SAF=4;SAR=12;SRF=2;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.161774;STB=0.607366;STBP=0.327;TYPE=snp;VARB=0.0342177;OID=.;OPOS=3595923;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:33:16:16:16:17:0.515152:12:4:2:14:12:5:2:14
chr19	3611765	.	A	G	176.28	PASS	AF=0.529412;AO=18;DP=34;FAO=18;FDP=34;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=0.00464523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=319.013;QD=20.7383;RBI=0.0135456;REFB=-0.00847194;REVB=0.0127242;RO=16;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0521025;STB=0.529379;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.00636349;OID=.;OPOS=3611765;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:16:18:18:0.529412:9:9:7:9:9:9:7:9
chr19	3611972	.	G	A	626.07	PASS	AF=0.570093;AO=61;DP=107;FAO=61;FDP=107;FR=.;FRO=46;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=21;FSRR=25;FWDB=-0.0155657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.1124;QD=23.4043;RBI=0.0335079;REFB=0.0197192;REVB=0.0296731;RO=45;SAF=35;SAR=26;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839168;STB=0.550739;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=-0.024661;OID=.;OPOS=3611972;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:45:46:61:61:0.570093:26:35:21:24:26:35:21:25
chr19	3614403	.	T	C	569.43	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=40;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00430517;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.644;QD=58.4033;RBI=0.054996;REFB=0.156122;REVB=0.0548272;RO=1;SAF=24;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191259;STB=0.510199;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=-0.000930183;OID=.;OPOS=3614403;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:39:1:1:38:38:0.974359:14:24:1:0:14:24:1:0
chr19	3653525	.	C	T	324.42	PASS	AF=0.459459;AO=30;DP=73;FAO=34;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.0321;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=226.046;QD=17.5361;RBI=0.0323351;REFB=-0.0128498;REVB=0.00389152;RO=29;SAF=14;SAR=16;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.135077;STB=0.597999;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.00934227;OID=.;OPOS=3653525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:74:29:38:30:34:0.459459:16:14:18:11:18:16:25:13
chr19	3728609	.	G	A	625.81	PASS	AF=0.977273;AO=32;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0386328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.803;QD=56.8922;RBI=0.0888984;REFB=-0.0986495;REVB=0.0800652;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510199;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.00170792;OID=.;OPOS=3728609;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:0:1:32:43:0.977273:21:11:0:0:24:19:0:1
chr19	3730041	.	C	T	632.21	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0182587;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0707;QD=61.6787;RBI=0.0584267;REFB=0;REVB=0.0555004;RO=0;SAF=26;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000279786;OID=.;OPOS=3730041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:15:26:0:0:15:26:0:0
chr19	3731985	.	G	A	67.43	PASS	AF=0.45;AO=9;DP=20;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=0.000810784;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.057;QD=13.486;RBI=0.0134308;REFB=-0.0290681;REVB=0.0134063;RO=11;SAF=4;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769224;STB=0.545355;STBP=0.741;TYPE=snp;VARB=0.0357068;OID=.;OPOS=3731985;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:20:20:11:11:9:9:0.45:5:4:4:7:5:4:4:7
chr19	3736222	.	T	TG	51.62	PASS	AF=0.458333;AO=8;DP=23;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=0.0307733;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=13.7272;QD=8.60255;RBI=0.0853772;REFB=-0.0806388;REVB=-0.0796383;RO=15;SAF=2;SAR=6;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.43557;STB=0.817603;STBP=0.013;TYPE=ins;VARB=0.087388;OID=.;OPOS=3736223;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.458333:8:23:11:24:13:2:9:10:3:51:15:2:6:10:5
chr19	3736239	.	G	A	35.74	PASS	AF=0.25;AO=6;DP=24;FAO=6;FDP=24;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0198048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.254;QD=5.95637;RBI=0.138444;REFB=-0.00529036;REVB=0.13702;RO=18;SAF=4;SAR=2;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.311994;STB=0.70205;STBP=0.279;TYPE=snp;VARB=0.00919285;OID=.;OPOS=3736239;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:24:24:18:18:6:6:0.25:2:4:7:11:2:4:7:11
chr19	3738649	.	A	C	966.7	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0805;QD=57.7133;RBI=0.0262286;REFB=0;REVB=-0.0178332;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422783;OID=.;OPOS=3738649;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:35:31:0:0:35:32:0:0
chr19	3738971	.	A	G	766.97	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.024932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.9884;QD=56.8124;RBI=0.0287314;REFB=0;REVB=-0.0142791;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000326022;OID=.;OPOS=3738971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:26:27:0:0:27:27:0:0
chr19	3740658	.	T	G	1571.98	PASS	AF=0.99;AO=98;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0149094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.117;QD=62.879;RBI=0.0313203;REFB=-0.0688519;REVB=0.0275439;RO=1;SAF=48;SAR=50;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0097792;STB=0.505154;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000198335;OID=.;OPOS=3740658;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:100:1:1:98:99:0.99:50:48:1:0:51:48:1:0
chr19	3750205	.	T	TGG	149.73	PASS	AF=0.4;AO=21;DP=67;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=8;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.0495471;FXX=0;HRUN=4;LEN=2;MLLD=28.0361;QD=9.21384;RBI=0.0502844;REFB=0.00396346;REVB=0.00857935;RO=36;SAF=6;SAR=15;SRF=17;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.219603;STB=0.584348;STBP=0.278;TYPE=ins;VARB=-0.00493998;OID=.;OPOS=3750206;OREF=-;OALT=GG;OMAPALT=TGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4:21:67:26:65:39:8:18:17:22:99:36:6:15:17:19
chr19	3750615	.	T	C	92.97	PASS	AF=0.307692;AO=12;DP=39;FAO=12;FDP=39;FR=.;FRO=27;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.00192855;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.114;QD=9.53519;RBI=0.00193104;REFB=0.00653766;REVB=-9.80059e-05;RO=27;SAF=8;SAR=4;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.046513;STB=0.528254;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=-0.0216696;OID=.;OPOS=3750615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:39:39:27:27:12:12:0.307692:4:8:17:10:4:8:17:10
chr19	3750622	.	A	C	105.27	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=38;FAO=13;FDP=39;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=9;FWDB=0.038329;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1752;QD=10.7969;RBI=0.0391069;REFB=-0.00798471;REVB=-0.00776131;RO=26;SAF=8;SAR=4;SRF=17;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0161919;STB=0.529366;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0120079;OID=.;OPOS=3750622;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:26:26:12:13:0.333333:4:8:17:9:4:9:17:9
chr19	3752515	.	G	A	282.21	PASS	AF=0.52;AO=26;DP=50;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0104077;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=79.5262;QD=22.5764;RBI=0.0526644;REFB=-0.0162522;REVB=0.0516257;RO=24;SAF=12;SAR=14;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.174947;STB=0.597488;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0226536;OID=.;OPOS=3752515;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:24:24:26:26:0.52:14:12:16:8:14:12:16:8
chr19	3752874	.	A	G	173.73	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=-0.00968077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.999;QD=12.869;RBI=0.037676;REFB=-0.0098387;REVB=-0.036411;RO=33;SAF=14;SAR=7;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700052;STB=0.540501;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.020249;OID=.;OPOS=3752874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:7:14:20:13:7:14:20:13
chr19	3762698	.	C	T	1541.95	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.888;QD=63.5857;RBI=0.0572857;REFB=0;REVB=0.0279371;RO=0;SAF=53;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.69587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107257;OID=.;OPOS=3762698;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:97:0:0:95:97:1:42:53:0:0:44:53:0:0
chr19	3767265	.	C	T	572.13	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.698;QD=60.2239;RBI=0.0465709;REFB=0;REVB=0.0322227;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193851;OID=.;OPOS=3767265;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:36:38:1:22:14:0:0:22:16:0:0
chr19	3771880	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0671923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.053;QD=33.4285;RBI=0.0679635;REFB=0;REVB=-0.0102093;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00285447;OID=.;OPOS=3771880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:4:2:0:0:4:2:0:0
chr19	3831525	.	C	A	77.97	PASS	AF=0.555556;AO=8;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00605015;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.9097;QD=17.3268;RBI=0.143961;REFB=-0.0655152;REVB=0.143834;RO=8;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.105859;STB=0.5998;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0608404;OID=.;OPOS=3831525;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:18:18:8:8:8:10:0.555556:4:4:5:3:6:4:5:3
chr19	3831709	.	C	T	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=7;DP=19;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.00961201;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.868;QD=9.76096;RBI=0.0452329;REFB=-0.0151292;REVB=0.0441999;RO=11;SAF=5;SAR=2;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0160434;STB=0.528223;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0245353;OID=.;OPOS=3831709;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:19:19:11:12:7:7:0.368421:2:5:8:3:2:5:9:3
chr19	3831765	.	G	A	209.28	PASS	AF=0.555556;AO=20;DP=36;FAO=20;FDP=36;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=0;FWDB=-0.00723019;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.593;QD=23.2529;RBI=0.00768695;REFB=-0.00823959;REVB=0.0026103;RO=15;SAF=12;SAR=8;SRF=15;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.351562;STB=0.699844;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00589107;OID=.;OPOS=3831765;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:15:16:20:20:0.555556:8:12:15:0:8:12:16:0
chr19	3831834	.	T	A	87.47	PASS	AF=0.545455;AO=10;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=12;FSAR=0;FSRF=10;FSRR=0;FWDB=0.143309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4128;QD=15.9028;RBI=0.143309;REFB=-0.167858;REVB=0;RO=12;SAF=10;SAR=0;SRF=12;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.105904;OID=.;OPOS=3831834;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:22:22:12:10:10:12:0.545455:0:10:12:0:0:12:10:0
chr19	3977486	.	A	G	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0342457;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.074;QD=59.0165;RBI=0.0582613;REFB=0;REVB=0.047134;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.12884e-05;OID=.;OPOS=3977486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr19	3979408	.	A	G	784.61	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244161;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.5724;QD=64.0498;RBI=0.0743884;REFB=0;REVB=0.0702672;RO=0;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.30731e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319918;OID=.;OPOS=3979408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:22:27:0:0:22:27:0:0
chr19	4028783	.	C	T	508.5	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0180045;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.984;QD=56.5002;RBI=0.0190172;REFB=-0.121557;REVB=-0.00612281;RO=0;SAF=11;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.510198;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.00123069;OID=.;OPOS=4028783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:36:36:0:1:35:35:0.972222:24:11:0:0:24:11:0:1
chr19	4033462	.	T	C	2885.22	PASS	AF=0.994595;AO=184;DP=186;FAO=184;FDP=185;FR=.;FRO=1;FSAF=110;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0808832;FXX=0.00537606;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.67;QD=62.3832;RBI=0.0811656;REFB=-0.102333;REVB=0.00676494;RO=1;SAF=110;SAR=74;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00639049;STB=0.503355;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=6.08093e-05;OID=.;OPOS=4033462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:186:185:1:1:184:184:0.994595:74:110:0:1:74:110:0:1
chr19	4042858	.	G	A	657.76	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0066542;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.314;QD=59.7964;RBI=0.0430172;REFB=0.150011;REVB=0.0424994;RO=1;SAF=24;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0191664;STB=0.510199;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-0.00131344;OID=.;OPOS=4042858;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:19:24:1:0:19:24:1:0
chr19	4042923	.	A	G	1171.99	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0505814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.4193;QD=60.8826;RBI=0.0516259;REFB=0;REVB=-0.0103323;RO=0;SAF=53;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000242268;OID=.;OPOS=4042923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:76:77:1:23:53:0:0:24:53:0:0
chr19	4043024	.	T	C	1247.23	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.082923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.063;QD=61.5915;RBI=0.0869675;REFB=0;REVB=-0.026213;RO=0;SAF=30;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111106;OID=.;OPOS=4043024;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:77:81:0:0:77:81:1:47:30:0:0:47:34:0:0
chr19	4101062	.	G	T	81.59	PASS	AF=0.282051;AO=11;DP=39;FAO=11;FDP=39;FR=.;FRO=28;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.00880649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.941;QD=8.36806;RBI=0.0309501;REFB=-0.015236;REVB=-0.0296707;RO=28;SAF=6;SAR=5;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0114211;STB=0.507029;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0372946;OID=.;OPOS=4101062;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:81:39:39:28:28:11:11:0.282051:5:6:15:13:5:6:15:13
chr19	4180836	.	C	T	582.79	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0307657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.485;QD=58.279;RBI=0.0474506;REFB=-0.178433;REVB=0.0361251;RO=0;SAF=27;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.51999;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.000890082;OID=.;OPOS=4180836;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:0:1:39:39:0.975:12:27:0:0:12:27:0:1
chr19	4186395	.	T	G	229.68	PASS	AF=0.5;AO=19;DP=42;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0115681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.115;QD=19.9722;RBI=0.0121505;REFB=-0.0199637;REVB=0.00371658;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0556529;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0222002;OID=.;OPOS=4186395;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:46:23:23:19:23:0.5:8:11:12:11:11:12:12:11
chr19	4200156	.	G	A	657.09	PASS	AF=1;AO=43;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.083207;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.9985;QD=58.4077;RBI=0.15625;REFB=-0.131493;REVB=0.132253;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0119688;OID=.;OPOS=4200156;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:45:45:0:0:43:45:1:21:22:0:0:23:22:0:0
chr19	4210356	.	G	A	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409301;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.999;QD=55.0982;RBI=0.0453159;REFB=0;REVB=-0.0194488;RO=0;SAF=22;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.50493e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142008;OID=.;OPOS=4210356;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:4:22:0:0:4:22:0:0
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chr19	4325433	.	G	A	79.01	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=7;FWDB=0.00916305;FXX=0.0416493;HRUN=5;LEN=1;MLLD=264.672;QD=13.7417;RBI=0.0216852;REFB=-0.00141533;REVB=0.0196541;RO=12;SAF=3;SAR=7;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198747;STB=0.599791;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.00230587;OID=.;OPOS=4325433;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:22:23:12:13:10:10:0.434783:7:3:6:6:7:3:6:7
chr19	4333711	.	C	T	1577.23	PASS	AF=0.990826;AO=105;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=66;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0302094;FXX=0.0180164;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.3657;QD=57.88;RBI=0.0861385;REFB=-0.00985369;REVB=0.0806674;RO=4;SAF=66;SAR=39;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00906976;STB=0.503759;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00131992;OID=.;OPOS=4333711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:109:109:4:1:105:108:0.990826:39:66:3:1:42:66:1:0
chr19	4352959	.	A	G	61.72	PASS	AF=0.615385;AO=5;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=5;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.085;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.077;QD=18.991;RBI=0.0941193;REFB=-0.0296659;REVB=0.0404158;RO=2;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413629;STB=0.777112;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0189502;OID=.;OPOS=4352959;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:2:5:5:8:0.615385:1:4:0:2:2:6:0:5
chr19	4357555	.	A	G	1199.78	PASS	AF=0.987654;AO=79;DP=82;FAO=80;FDP=81;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0282697;FXX=0.0121936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.156;QD=59.2482;RBI=0.0392022;REFB=0.0200938;REVB=0.0271594;RO=1;SAF=35;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0133333;STB=0.507041;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=-0.000327259;OID=.;OPOS=4357555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:81:1:1:79:80:0.987654:44:35:1:0:45:35:1:0
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chr19	4511725	.	T	C	455.88	PASS	AF=0.971429;AO=29;DP=32;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0813507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.4331;QD=52.1002;RBI=0.0830543;REFB=0.0143538;REVB=0.0167355;RO=2;SAF=12;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0106369;STB=0.512188;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=-0.0150537;OID=.;OPOS=4511725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:32:35:2:1:29:34:0.971429:17:12:1:1:20:14:0:1
chr19	4511730	.	T	C	538.54	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000538179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.087;QD=59.8374;RBI=0.0414939;REFB=0;REVB=-0.0414904;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.46813e-05;OID=.;OPOS=4511730;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0
chr19	4511737	.	T	C	125.78	PASS	AF=0.365854;AO=14;DP=38;FAO=15;FDP=41;FR=.;FRO=26;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.0134943;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=35.893;QD=12.2707;RBI=0.0202722;REFB=-0.0424511;REVB=-0.0151283;RO=24;SAF=5;SAR=9;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0206544;STB=0.515131;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.064406;OID=.;OPOS=4511737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:41:24:26:14:15:0.365854:9:5:9:15:9:6:11:15
chr19	4511746	.	A	T	191.2	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=48;FAO=20;FDP=50;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=19;FWDB=0.022763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.395;QD=15.2962;RBI=0.0416734;REFB=-0.00754304;REVB=0.0349073;RO=28;SAF=9;SAR=9;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112677;STB=0.55097;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.00310202;OID=.;OPOS=4511746;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:50:28:30:18:20:0.4:9:9:11:17:11:9:11:19
chr19	4511791	.	A	C	146.08	PASS	AF=0.307692;AO=20;DP=65;FAO=20;FDP=65;FR=.;FRO=45;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.0357354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.793;QD=8.98931;RBI=0.037316;REFB=-0.00380487;REVB=-0.0107457;RO=44;SAF=9;SAR=11;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482634;STB=0.535177;STBP=0.73;TYPE=snp;VARB=0.00711564;OID=.;OPOS=4511791;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:44:45:20:20:0.307692:11:9:18:26:11:9:18:27
chr19	4511830	.	A	G	156.03	PASS	AF=0.318182;AO=21;DP=66;FAO=21;FDP=66;FR=.;FRO=45;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=26;FWDB=0.00259464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.818;QD=9.4562;RBI=0.020594;REFB=-0.00998004;REVB=-0.0204299;RO=45;SAF=13;SAR=8;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225885;STB=0.633112;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.0408374;OID=.;OPOS=4511830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:45:45:21:21:0.318182:8:13:19:26:8:13:19:26
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chr19	4511927	.	G	A	261.49	PASS	AF=0.369048;AO=31;DP=84;FAO=31;FDP=84;FR=.;FRO=53;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=30;FWDB=-0.0283439;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3486;QD=12.4521;RBI=0.0406436;REFB=-0.0133852;REVB=0.0291295;RO=53;SAF=20;SAR=11;SRF=23;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23332;STB=0.634097;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0168321;OID=.;OPOS=4511927;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:53:53:31:31:0.369048:11:20:23:30:11:20:23:30
chr19	4511929	.	A	G	246.01	PASS	AF=0.364706;AO=29;DP=83;FAO=31;FDP=85;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=30;FWDB=0.00630347;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6607;QD=11.5769;RBI=0.0238476;REFB=-0.0181882;REVB=-0.0229995;RO=52;SAF=18;SAR=11;SRF=22;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219146;STB=0.62875;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.028751;OID=.;OPOS=4511929;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:85:52:54:29:31:0.364706:11:18:22:30:11:20:24:30
chr19	4511955	.	T	C	1565.72	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.157;QD=63.2616;RBI=0.0407888;REFB=0;REVB=0.0239455;RO=0;SAF=51;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00047041;OID=.;OPOS=4511955;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:99:0:0:96:99:1:45:51:0:0:46:53:0:0
chr19	4512669	.	T	C	1933.36	PASS	AF=1;AO=125;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0222086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3981;QD=61.8676;RBI=0.0374928;REFB=0;REVB=0.0302074;RO=0;SAF=69;SAR=56;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.44067e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.09562e-05;OID=.;OPOS=4512669;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:125:0:0:125:125:1:56:69:0:0:56:69:0:0
chr19	4513143	.	CA	TG	159.64	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0019182;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=215.939;QD=45.6118;RBI=0.0534031;REFB=0;REVB=0.0533686;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.000480899;OID=.;OPOS=4513143;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:13:14:1:3:10:0:0:3:11:0:0
chr19	4513559	.	A	G	661.51	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0403907;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.465;QD=61.5358;RBI=0.0559864;REFB=0;REVB=0.0387695;RO=0;SAF=19;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000404617;OID=.;OPOS=4513559;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:23:19:0:0:24:19:0:0
chr19	4525046	.	A	G	46.76	PASS	AF=0.388889;AO=6;DP=17;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=-0.0151448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.808;QD=10.3901;RBI=0.0221829;REFB=-0.0221956;REVB=0.0162085;RO=11;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.238861;STB=0.599733;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.022304;OID=.;OPOS=4525046;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:17:18:11:11:6:7:0.388889:3:3:3:8:4:3:3:8
chr19	4538599	.	G	A	915.92	PASS	AF=0.572414;AO=83;DP=145;FAO=83;FDP=145;FR=.;FRO=62;FSAF=43;FSAR=40;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.0124773;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=305.891;QD=25.2668;RBI=0.0153584;REFB=-0.011929;REVB=0.00895517;RO=62;SAF=43;SAR=40;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00152757;STB=0.500832;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.0085018;OID=.;OPOS=4538599;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:62:62:83:83:0.572414:40:43:32:30:40:43:32:30
chr19	4653370	.	C	G	169.13	PASS	AF=0.294872;AO=23;DP=78;FAO=23;FDP=78;FR=.;FRO=55;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=35;FWDB=-0.00287665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.8402;QD=8.6735;RBI=0.0556626;REFB=-0.00457935;REVB=-0.0555882;RO=54;SAF=10;SAR=13;SRF=20;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0786046;STB=0.55168;STBP=0.612;TYPE=snp;VARB=0.0126507;OID=.;OPOS=4653370;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:54:55:23:23:0.294872:13:10:20:34:13:10:20:35
chr19	4654163	.	A	C	157.04	PASS	AF=0.435897;AO=17;DP=39;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00450564;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2253;QD=16.1065;RBI=0.0128764;REFB=-0.000747419;REVB=0.0120624;RO=22;SAF=11;SAR=6;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0589381;STB=0.53394;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.00112063;OID=.;OPOS=4654163;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:22:17:17:0.435897:6:11:13:9:6:11:13:9
chr19	4655166	.	A	G	223.16	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0717072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.565;QD=49.5905;RBI=0.103783;REFB=0;REVB=0.0750267;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181859;OID=.;OPOS=4655166;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr19	4655546	.	G	C	139.52	PASS	AF=0.355556;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=45;FR=.;FRO=29;FSAF=2;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0957312;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.0165;QD=12.4014;RBI=0.098172;REFB=0.0142111;REVB=-0.0217547;RO=28;SAF=2;SAR=14;SRF=9;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.330708;STB=0.717621;STBP=0.066;TYPE=snp;VARB=-0.0602048;OID=.;OPOS=4655546;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:28:29:16:16:0.355556:14:2:9:19:14:2:10:19
chr19	4658047	.	A	G	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0249051;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.722;QD=12.7823;RBI=0.0284179;REFB=-0.0274103;REVB=0.0136863;RO=14;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0998889;STB=0.559202;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0230218;OID=.;OPOS=4658047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:4:6:7:7:4:6:7:7
chr19	4670313	.	C	G	32.32	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0625415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=35.6593;QD=16.1588;RBI=0.117977;REFB=-0.060526;REVB=0.100035;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23409;STB=0.635921;STBP=0.698;TYPE=snp;VARB=0.0537896;OID=.;OPOS=4670313;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:1:4:3:0:1:4:3:0
chr19	4685259	.	G	A	253.35	PASS	AF=0.379747;AO=30;DP=79;FAO=30;FDP=79;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0301503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.935;QD=12.828;RBI=0.0531184;REFB=-0.017484;REVB=0.0437324;RO=47;SAF=22;SAR=8;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.237905;STB=0.651745;STBP=0.053;TYPE=snp;VARB=0.0211996;OID=.;OPOS=4685259;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:47:49:30:30:0.379747:8:22:25:22:8:22:25:24
chr19	4685276	.	A	C	303.03	PASS	AF=0.409639;AO=34;DP=83;FAO=34;FDP=83;FR=.;FRO=49;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0385069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.7804;QD=14.6037;RBI=0.0605535;REFB=0.0234665;REVB=-0.0467327;RO=49;SAF=22;SAR=12;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147784;STB=0.58402;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=-0.0272033;OID=.;OPOS=4685276;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:49:49:34:34:0.409639:12:22:25:24:12:22:25:24
chr19	4724069	.	G	A	771.92	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141904;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.723;QD=64.3268;RBI=0.088317;REFB=0;REVB=0.0871695;RO=0;SAF=37;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.14038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00069835;OID=.;OPOS=4724069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:11:37:0:0:11:37:0:0
chr19	4724157	.	G	A	156.25	PASS	AF=0.425;AO=17;DP=40;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.0315705;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.251;QD=15.6252;RBI=0.0350784;REFB=-0.0124979;REVB=-0.0152904;RO=23;SAF=9;SAR=8;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00767178;STB=0.50442;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0144678;OID=.;OPOS=4724157;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:23:17:17:0.425:8:9:12:11:8:9:12:11
chr19	4769740	.	C	A	396.34	PASS	AF=0.512821;AO=39;DP=77;FAO=40;FDP=78;FR=.;FRO=38;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=0.0423814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.815;QD=20.3254;RBI=0.0424406;REFB=-0.0122594;REVB=-0.0022408;RO=38;SAF=24;SAR=15;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00947718;STB=0.510199;STBP=0.873;TYPE=snp;VARB=0.0114436;OID=.;OPOS=4769740;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:38:38:39:40:0.512821:15:24:23:15:15:25:23:15
chr19	4772202	.	A	C	142.83	PASS	AF=0.327586;AO=19;DP=58;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0349547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.3033;QD=9.85033;RBI=0.0898829;REFB=-0.0122231;REVB=-0.0828076;RO=39;SAF=3;SAR=16;SRF=25;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.561502;STB=0.832356;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0250724;OID=.;OPOS=4772202;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:39:39:19:19:0.327586:16:3:25:14:16:3:25:14
chr19	4794257	.	T	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0552595;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.905;QD=61.3364;RBI=0.061832;REFB=0;REVB=-0.0277413;RO=0;SAF=19;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.12416e-05;OID=.;OPOS=4794257;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:21:19:0:0:21:19:0:0
chr19	4794948	.	A	AAACCTCAC	149.39	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00441346;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=8;MLLD=302.122;QD=45.9661;RBI=0.0312935;REFB=0;REVB=0.0309807;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000159908;OID=.;OPOS=4794949;OREF=-;OALT=AACCTCAC;OMAPALT=AAACCTCAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:13:14:13:13:0:6:7:0:0:4:0:6:7:0:0
chr19	4816719	.	G	A	90.35	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.00600662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.958;QD=16.4269;RBI=0.0101169;REFB=-0.000415925;REVB=0.00814072;RO=11;SAF=1;SAR=10;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.632409;STB=0.873014;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.000907826;OID=.;OPOS=4816719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:10:1:8:3:10:1:8:3
chr19	4818378	.	T	C	312.44	PASS	AF=0.515625;AO=31;DP=62;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=20;FWDB=0.00435556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.984;QD=19.5275;RBI=0.0226471;REFB=-0.0256855;REVB=-0.0222243;RO=31;SAF=12;SAR=19;SRF=11;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306998;STB=0.534749;STBP=0.609;TYPE=snp;VARB=0.0188454;OID=.;OPOS=4818378;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:64:31:31:31:33:0.515625:19:12:11:20:19:14:11:20
chr19	4847713	.	A	G	1028.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.748;QD=58.7541;RBI=0.0246334;REFB=0;REVB=0.000347042;RO=0;SAF=26;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.10038e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89908e-05;OID=.;OPOS=4847713;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:66:70:0:0:65:70:1:39:26:0:0:40:30:0:0
chr19	4847874	.	A	G	840.54	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0572349;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=111.806;QD=56.9861;RBI=0.0622234;REFB=0;REVB=0.0244112;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145893;OID=.;OPOS=4847874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:59:0:0:57:59:1:28:29:0:0:29:30:0:0
chr19	4852106	.	A	G	1106.97	PASS	AF=1;AO=73;DP=75;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000441396;FXX=0.0266631;HRUN=2;LEN=1;MLLD=122.543;QD=60.6556;RBI=0.00702335;REFB=0;REVB=0.00700947;RO=0;SAF=52;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.44365e-05;OID=.;OPOS=4852106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:73:0:0:73:73:1:21:52:0:0:21:52:0:0
chr19	4852137	.	C	T	1000.78	PASS	AF=0.971831;AO=69;DP=71;FAO=69;FDP=71;FR=.;FRO=2;FSAF=46;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0318368;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.714;QD=56.382;RBI=0.0353995;REFB=-0.134592;REVB=0.0154773;RO=0;SAF=46;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.520827;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.000837719;OID=.;OPOS=4852137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:71:71:0:2:69:69:0.971831:23:46:0:0:23:46:0:2
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chr19	4945917	.	C	G,T	601.29	PASS	AF=0.05,0.95;AO=3,37;DP=40;FAO=2,38;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=2,18;FSAR=0,20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109095,0.0569394;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=16.9602,80.8114;QD=60.1287;RBI=0.0679555,0.057646;REFB=0,0;REVB=-0.0670741,0.00899797;RO=0;SAF=2,18;SAR=1,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.68991e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.108364,0.000690059;OID=.,.;OPOS=4945917,4945917;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:40:40:0:0:3,37:2,38:0.05,0.95:1,19:2,18:0:0:0,20:2,18:0:0
chr19	4945974	.	T	C	237.32	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0062063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.1252;QD=49.9615;RBI=0.0713241;REFB=0;REVB=0.0710535;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00130286;OID=.;OPOS=4945974;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:7:11:0:0:8:11:0:0
chr19	4950770	.	C	T	281.22	PASS	AF=0.54717;AO=28;DP=52;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.02604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.658;QD=21.224;RBI=0.0354382;REFB=-0.0102001;REVB=0.0240371;RO=24;SAF=15;SAR=13;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132722;STB=0.564159;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00820739;OID=.;OPOS=4950770;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:24:24:28:29:0.54717:13:15:9:15:14:15:9:15
chr19	4954454	.	C	T	791.71	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.97;QD=63.3364;RBI=0.0359258;REFB=0;REVB=0.0252398;RO=0;SAF=34;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240969;OID=.;OPOS=4954454;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:50:0:0:45:50:1:11:34:0:0:13:37:0:0
chr19	4954679	.	G	GC	324.93	PASS	AF=1;AO=18;DP=33;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233545;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=19.2801;QD=40.616;RBI=0.129244;REFB=0;REVB=-0.127116;RO=15;SAF=18;SAR=0;SRF=2;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.866731;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00317476;OID=.;OPOS=4954680;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:18:33:32:32:0:19:13:0:0:6:15:18:0:2:13
chr19	5041178	.	T	C	1320.68	PASS	AF=1;AO=84;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00759745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6663;QD=62.1498;RBI=0.104013;REFB=0;REVB=0.103735;RO=0;SAF=56;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000409437;OID=.;OPOS=5041178;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:84:85:1:28:56:0:0:28:57:0:0
chr19	5110794	.	A	G	689.35	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.158625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.253;QD=62.6678;RBI=0.158625;REFB=0;REVB=0.000164783;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0011534;OID=.;OPOS=5110794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:26:18:0:0:26:18:0:0
chr19	5114116	.	T	G	2210.18	PASS	AF=1;AO=139;DP=139;FAO=140;FDP=140;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00972966;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.659;QD=63.1479;RBI=0.0125043;REFB=0;REVB=0.00785432;RO=0;SAF=78;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.94593e-06;OID=.;OPOS=5114116;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:139:140:0:0:139:140:1:61:78:0:0:61:79:0:0
chr19	5135392	.	A	G	1479.24	PASS	AF=0.96;AO=96;DP=100;FAO=96;FDP=100;FR=.;FRO=4;FSAF=70;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0196115;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=208.184;QD=59.1695;RBI=0.0232887;REFB=-0.045274;REVB=0.0125599;RO=4;SAF=70;SAR=26;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449152;STB=0.523731;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00191231;OID=.;OPOS=5135392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:100:100:4:4:96:96:0.96:26:70:1:3:26:70:1:3
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chr19	5210782	.	G	A	176.51	PASS	AF=0.452381;AO=18;DP=41;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.00387211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.658;QD=16.8107;RBI=0.024849;REFB=-0.0331885;REVB=0.0245455;RO=22;SAF=8;SAR=10;SRF=8;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0795846;STB=0.569549;STBP=0.441;TYPE=snp;VARB=0.0361012;OID=.;OPOS=5210782;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:22:23:18:19:0.452381:10:8:8:14:10:9:8:15
chr19	5214697	.	A	G	1011.74	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110617;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.959;QD=59.5143;RBI=0.0711905;REFB=0;REVB=-0.0703258;RO=0;SAF=40;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000208365;OID=.;OPOS=5214697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:28:40:0:0:28:40:0:0
chr19	5225802	.	G	A	179.0	PASS	AF=0.404255;AO=19;DP=47;FAO=19;FDP=47;FR=.;FRO=28;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.0699401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.921;QD=15.2343;RBI=0.0710155;REFB=-0.00943663;REVB=0.0123118;RO=28;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.118707;STB=0.568467;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0115631;OID=.;OPOS=5225802;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:28:19:19:0.404255:11:8:15:13:11:8:15:13
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chr19	5766090	.	T	C	428.82	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0337645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.2271;QD=57.1757;RBI=0.0468703;REFB=0;REVB=-0.0325082;RO=0;SAF=13;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00081501;OID=.;OPOS=5766090;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:17:13:0:0:17:13:0:0
chr19	5772897	.	C	T	639.25	PASS	AF=0.574074;AO=61;DP=107;FAO=62;FDP=108;FR=.;FRO=46;FSAF=33;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=26;FWDB=0.0280281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.739;QD=23.676;RBI=0.0284302;REFB=-0.000928783;REVB=-0.00476487;RO=45;SAF=32;SAR=29;SRF=19;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0794458;STB=0.541454;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00134682;OID=.;OPOS=5772897;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:108:45:46:61:62:0.574074:29:32:19:26:29:33:20:26
chr19	5776207	.	C	T	342.89	PASS	AF=0.546875;AO=35;DP=64;FAO=35;FDP=64;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=25;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0179651;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=190.599;QD=21.4307;RBI=0.0181957;REFB=-0.0232893;REVB=0.00288771;RO=26;SAF=10;SAR=25;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214134;STB=0.645846;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0206593;OID=.;OPOS=5776207;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:26:29:35:35:0.546875:25:10:14:12:25:10:17:12
chr19	5778517	.	A	T	183.87	PASS	AF=0.407407;AO=21;DP=57;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=20;FSRR=12;FWDB=0.00419303;FXX=0.0847314;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3365;QD=13.6202;RBI=0.023932;REFB=-0.00756033;REVB=0.0235618;RO=30;SAF=10;SAR=11;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12648;STB=0.574008;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0217232;OID=.;OPOS=5778517;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:54:30:32:21:22:0.407407:11:10:18:12:11:11:20:12
chr19	5783905	.	G	A	214.18	PASS	AF=0.538462;AO=20;DP=38;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=4;FWDB=0.075209;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.2263;QD=21.9666;RBI=0.14155;REFB=-0.0170223;REVB=0.119916;RO=18;SAF=12;SAR=8;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162719;STB=0.599911;STBP=0.236;TYPE=snp;VARB=0.021076;OID=.;OPOS=5783905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:18:18:20:21:0.538462:8:12:14:4:9:12:14:4
chr19	5784370	.	C	T	47.18	PASS	AF=0.411765;AO=7;DP=17;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=0.014479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.266;QD=11.1009;RBI=0.0153231;REFB=-0.000629845;REVB=0.00501538;RO=10;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.257384;STB=0.650814;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.00301578;OID=.;OPOS=5784370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:17:17:10:10:7:7:0.411765:5:2:1:9:5:2:1:9
chr19	5786815	.	G	A	207.32	PASS	AF=0.588235;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=34;FR=.;FRO=14;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=0.00922702;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=315.106;QD=24.3901;RBI=0.041033;REFB=-0.0224571;REVB=-0.0399822;RO=14;SAF=16;SAR=4;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692562;STB=0.538425;STBP=0.714;TYPE=snp;VARB=0.016845;OID=.;OPOS=5786815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:14:14:20:20:0.588235:4:16:12:2:4:16:12:2
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chr19	5866654	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0108286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.755;QD=39.2068;RBI=0.04107;REFB=0;REVB=0.0396168;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000585811;OID=.;OPOS=5866654;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr19	5866736	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0384685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.573;QD=33.4283;RBI=0.0449224;REFB=0;REVB=-0.0231991;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00568235;OID=.;OPOS=5866736;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chr19	5867177	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0500662;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.079;QD=44.6882;RBI=0.0723939;REFB=0;REVB=0.0522901;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00105671;OID=.;OPOS=5867177;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr19	5867748	.	G	T	190.04	PASS	AF=1;AO=13;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0489114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.773;QD=47.5094;RBI=0.173905;REFB=0;REVB=0.166886;RO=0;SAF=8;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60098e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00234778;OID=.;OPOS=5867748;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:13:16:1:5:8:0:0:8:8:0:0
chr19	5892954	.	T	C	712.46	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0066362;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.627;QD=63.3294;RBI=0.0322503;REFB=0;REVB=-0.0315601;RO=0;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.49331e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000155085;OID=.;OPOS=5892954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:16:29:0:0:16:29:0:0
chr19	6042059	.	C	T	303.37	PASS	AF=0.563636;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=55;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0113884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.775;QD=22.063;RBI=0.0114173;REFB=-0.00414036;REVB=0.000811097;RO=24;SAF=10;SAR=21;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214773;STB=0.619085;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00360537;OID=.;OPOS=6042059;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:24:24:31:31:0.563636:21:10:14:10:21:10:14:10
chr19	6156483	.	T	C	514.91	PASS	AF=0.514563;AO=53;DP=103;FAO=53;FDP=103;FR=.;FRO=50;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=24;FWDB=0.0074357;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.356;QD=19.9965;RBI=0.0352778;REFB=-0.0261003;REVB=0.0344853;RO=49;SAF=27;SAR=26;SRF=25;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000671184;STB=0.50513;STBP=0.93;TYPE=snp;VARB=0.0286104;OID=.;OPOS=6156483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:49:50:53:53:0.514563:26:27:25:24:26:27:26:24
chr19	6210698	.	G	A	88.79	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.00342663;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.597;QD=14.7979;RBI=0.00343913;REFB=-0.0122702;REVB=-0.000292874;RO=13;SAF=3;SAR=8;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.264456;STB=0.65544;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0200616;OID=.;OPOS=6210698;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:8:3:7:6:8:3:7:6
chr19	6312210	.	A	G	465.92	PASS	AF=0.484536;AO=45;DP=95;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=32;FWDB=0.0385014;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.875;QD=19.213;RBI=0.0394582;REFB=-0.0291742;REVB=0.00863647;RO=49;SAF=19;SAR=26;SRF=17;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0733268;STB=0.53489;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0277319;OID=.;OPOS=6312210;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:97:49:50:45:47:0.484536:26:19:17:32:27:20:18:32
chr19	6312290	.	T	C	177.46	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0299708;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.54;QD=21.5099;RBI=0.0323014;REFB=-0.0150501;REVB=0.0120472;RO=15;SAF=8;SAR=10;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125134;STB=0.570392;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.00685523;OID=.;OPOS=6312290;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:10:8:9:6:10:8:9:6
chr19	6415443	.	T	C	676.46	PASS	AF=1;AO=29;DP=48;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0696802;FXX=0.104145;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.8253;QD=62.9267;RBI=0.0757434;REFB=0;REVB=0.0296941;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0012194;OID=.;OPOS=6415443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:48:43:0:0:29:43:1:8:21:0:0:20:23:0:0
chr19	6417855	.	G	A	46.0	PASS	AF=0.35;AO=7;DP=20;FAO=7;FDP=20;FR=.;FRO=13;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00516332;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=177.258;QD=9.19956;RBI=0.0241976;REFB=-0.0127331;REVB=-0.0236403;RO=13;SAF=3;SAR=4;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.194284;STB=0.619384;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.025712;OID=.;OPOS=6417855;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:20:20:13:13:7:7:0.35:4:3:8:5:4:3:8:5
chr19	6419275	.	A	G	165.38	PASS	AF=0.323529;AO=22;DP=63;FAO=22;FDP=68;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=21;FWDB=-0.0554785;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=44.6302;QD=9.72814;RBI=0.0840291;REFB=0.00854648;REVB=-0.0631112;RO=41;SAF=10;SAR=12;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145181;STB=0.559946;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=-0.0214593;OID=.;OPOS=6419275;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:68:41:46:22:22:0.323529:12:10:24:17:12:10:25:21
chr19	6427408	.	G	A	199.48	PASS	AF=0.431373;AO=22;DP=51;FAO=22;FDP=51;FR=.;FRO=29;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00521594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.442;QD=15.6452;RBI=0.145789;REFB=-0.0114297;REVB=0.145696;RO=29;SAF=13;SAR=9;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.1088;STB=0.562105;STBP=0.454;TYPE=snp;VARB=0.0180285;OID=.;OPOS=6427408;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:29:22:22:0.431373:9:13:14:15:9:13:14:15
chr19	6466567	.	CT	C	1319.47	PASS	AF=1;AO=114;DP=141;FAO=142;FDP=142;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.17114;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.9164;QD=37.1681;RBI=0.214697;REFB=-0.0319313;REVB=0.129637;RO=14;SAF=66;SAR=48;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.02884;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00606344;OID=.;OPOS=6466568;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:114:141:142:142:0:87:55:0:0:20:14:66:48:10:4
chr19	6468935	.	GC	CG,G	95.47	PASS	AF=0.0434783,0.956522;AO=3,9;DP=24;FAO=1,22;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=0,12;FSAR=1,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0908889,0.0119234;FXX=0.0416493;HRUN=1,7;LEN=2,1;MLLD=12.5465,6.58522;QD=16.6033;RBI=0.123817,0.214025;REFB=-0.0035552,-0.118758;REVB=0.0840832,0.213692;RO=8;SAF=2,7;SAR=1,2;SRF=2;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.413961,0.437433;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,del;VARB=0.0140252,0.0853504;OID=.,.;OPOS=6468935,6468936;OREF=GC,C;OALT=CG,-;OMAPALT=CG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:24:23:8:0:3,9:1,22:0.0434783,0.956522:1,2:2,7:2:6:1,10:0,12:0:0
chr19	6535080	.	T	C	2525.53	PASS	AF=1;AO=164;DP=164;FAO=164;FDP=164;FR=.;FRO=0;FSAF=100;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0063414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.535;QD=61.5982;RBI=0.0409241;REFB=0;REVB=-0.0404298;RO=0;SAF=100;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.51942e-05;OID=.;OPOS=6535080;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:164:164:0:0:164:164:1:64:100:0:0:64:100:0:0
chr19	6586268	.	G	A	52.36	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0134214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.869;QD=6.54486;RBI=0.0349243;REFB=-0.0100871;REVB=-0.0322424;RO=24;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.147667;STB=0.593524;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0322914;OID=.;OPOS=6586268;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:24:24:8:8:0.25:4:4:9:15:4:4:9:15
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chr19	6669934	.	G	A	286.44	PASS	AF=0.469697;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=3;FSAR=28;FSRF=19;FSRR=16;FWDB=0.00760996;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.753;QD=17.3601;RBI=0.0106931;REFB=-0.0290111;REVB=-0.00751207;RO=33;SAF=3;SAR=28;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.538975;STB=0.823276;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0239593;OID=.;OPOS=6669934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:66:33:35:31:31:0.469697:28:3:17:16:28:3:19:16
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chr19	6679511	.	C	T	335.9	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.0396189;FXX=0.0365809;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.7547;QD=17.0074;RBI=0.0407056;REFB=-0.0437394;REVB=0.00934294;RO=41;SAF=9;SAR=27;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320955;STB=0.682651;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0277426;OID=.;OPOS=6679511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:41:43:36:36:0.455696:27:9:23:18:27:9:24:19
chr19	6696597	.	G	A	272.53	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0332774;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.421;QD=51.9103;RBI=0.0694965;REFB=0;REVB=-0.0610113;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000139545;OID=.;OPOS=6696597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:6:15:0:0:6:15:0:0
chr19	6697406	.	A	G	1541.06	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.617;QD=59.8468;RBI=0.0324793;REFB=0;REVB=-0.0123828;RO=0;SAF=55;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.56971e-05;OID=.;OPOS=6697406;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:103:0:0:102:103:1:47:55:0:0:47:56:0:0
chr19	6702157	.	C	G	1091.4	PASS	AF=0.973684;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=76;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00667199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.329;QD=57.4419;RBI=0.108718;REFB=-0.164855;REVB=0.108513;RO=0;SAF=33;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511901;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.00251675;OID=.;OPOS=6702157;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:76:76:0:2:74:74:0.973684:41:33:0:0:41:33:0:2
chr19	6709704	.	C	T	108.85	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0226742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.938;QD=24.1899;RBI=0.0227756;REFB=-0.0439625;REVB=0.00214648;RO=6;SAF=7;SAR=5;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157135;STB=0.588097;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0142467;OID=.;OPOS=6709704;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:5:7:5:1:5:7:5:1
chr19	6709848	.	C	T	184.83	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00900985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.3386;QD=18.4828;RBI=0.0139585;REFB=0.0151539;REVB=-0.0106613;RO=21;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0845586;STB=0.547896;STBP=0.576;TYPE=snp;VARB=-0.0340052;OID=.;OPOS=6709848;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:8:11:14:7:8:11:14:7
chr19	6713291	.	C	T	67.11	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.110756;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5929;QD=11.6704;RBI=0.115939;REFB=-0.0129308;REVB=0.0342769;RO=14;SAF=2;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377757;STB=0.691844;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0431383;OID=.;OPOS=6713291;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:24:23:14:14:9:9:0.391304:7:2:8:6:7:2:7:7
chr19	6731057	.	T	C	647.09	PASS	AF=0.955556;AO=43;DP=45;FAO=43;FDP=45;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0299813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2279;QD=57.5187;RBI=0.0345716;REFB=-0.135879;REVB=0.0172139;RO=2;SAF=26;SAR=17;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00910618;STB=0.504852;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00457486;OID=.;OPOS=6731057;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:45:45:2:2:43:43:0.955556:17:26:1:1:17:26:1:1
chr19	6737481	.	T	C	605.75	PASS	AF=1;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218277;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.985;QD=60.5747;RBI=0.0332875;REFB=0;REVB=-0.0251319;RO=0;SAF=23;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000442991;OID=.;OPOS=6737481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:40:0:0:39:40:1:16:23:0:0:17:23:0:0
chr19	6737509	.	G	A,C	563.56	PASS	AF=0.947368,0.0526316;AO=36,2;DP=38;FAO=36,2;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=21,0;FSAR=15,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0533297,0.018885;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=153.011,109.405;QD=59.3221;RBI=0.0608101,0.0338471;REFB=0,0;REVB=0.0292202,0.0280889;RO=0;SAF=21,0;SAR=15,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000256943,0.136003;OID=.,.;OPOS=6737509,6737509;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:38:38:0:0:36,2:36,2:0.947368,0.0526316:15,2:21,0:0:0:15,2:21,0:0:0
chr19	6751243	.	AGGGGGGCT	AGGGGGCTG,GAGGGGGCT	115.08	PASS	AF=0.186275,0;AO=9,4;DP=101;FAO=19,0;FDP=102;FR=.,HEALED;FRO=66;FSAF=18,0;FSAR=1,0;FSRF=26;FSRR=40;FWDB=-0.0224197,-0.0858999;FXX=0;HRUN=6,1;LEN=3,2;MLLD=19.9374,21.6215;QD=4.51286;RBI=0.0994525,0.10272;REFB=-0.0837054,-0.0800013;REVB=-0.0968925,-0.056325;RO=48;SAF=7,3;SAR=2,1;SRF=15;SRR=33;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.528059,0.432025;STB=0.943252,0.5;STBP=0,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0534874,0.0535196;OID=.,.;OPOS=6751249,6751243;OREF=GCT,AG;OALT=CTG,GA;OMAPALT=AGGGGGCTG,GAGGGGGCT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:101:102:48:66:9,4:19,0:0.186275,0:2,1:7,3:15:33:1,0:18,0:26:40
chr19	6833777	.	A	G	1496.11	PASS	AF=1;AO=99;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197532;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.8707;QD=59.8443;RBI=0.0270835;REFB=0;REVB=0.0185291;RO=0;SAF=51;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.47889e-06;OID=.;OPOS=6833777;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:99:100:1:48:51:0:0:49:51:0:0
chr19	6833989	.	G	T	463.55	PASS	AF=0.944444;AO=31;DP=33;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.00268317;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=54.569;QD=51.505;RBI=0.116561;REFB=0.135217;REVB=0.116531;RO=2;SAF=13;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664988;STB=0.535693;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.00346162;OID=.;OPOS=6833989;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:36:2:2:31:34:0.944444:18:13:2:0:21:13:2:0
chr19	6897464	.	C	G	280.94	PASS	AF=0.455882;AO=28;DP=67;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.0222303;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.739;QD=16.526;RBI=0.0300826;REFB=-0.0437803;REVB=0.0202676;RO=39;SAF=9;SAR=19;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204972;STB=0.555519;STBP=0.434;TYPE=snp;VARB=0.0474548;OID=.;OPOS=6897464;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:68:39:37:28:31:0.455882:19:9:20:19:19:12:18:19
chr19	6901891	.	G	A	530.23	PASS	AF=0.583333;AO=49;DP=84;FAO=49;FDP=84;FR=.;FRO=35;FSAF=26;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=15;FWDB=0.0190422;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2053;QD=25.249;RBI=0.0213523;REFB=-0.0200391;REVB=-0.00965996;RO=35;SAF=26;SAR=23;SRF=20;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0312698;STB=0.5171;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=0.0147152;OID=.;OPOS=6901891;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:35:35:49:49:0.583333:23:26:20:15:23:26:20:15
chr19	6903920	.	A	G	529.46	PASS	AF=0.631579;AO=48;DP=76;FAO=48;FDP=76;FR=.;FRO=28;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=18;FSRR=10;FWDB=-0.0229085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.956;QD=27.8664;RBI=0.0233182;REFB=-0.0468679;REVB=0.00435198;RO=28;SAF=27;SAR=21;SRF=18;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0557146;STB=0.530291;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.0157895;OID=.;OPOS=6903920;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:28:28:48:48:0.631579:21:27:18:10:21:27:18:10
chr19	6904137	.	C	T	143.31	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=-0.00226764;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.9677;QD=14.6985;RBI=0.0240796;REFB=0.00327576;REVB=-0.0239726;RO=23;SAF=12;SAR=4;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.216566;STB=0.626696;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=-0.00953242;OID=.;OPOS=6904137;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:23:23:16:16:0.410256:4:12:13:10:4:12:13:10
chr19	6913811	.	A	G	863.59	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100874;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.5464;QD=57.5725;RBI=0.0204122;REFB=0;REVB=-0.0177455;RO=0;SAF=24;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193293;OID=.;OPOS=6913811;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:59:60:1:35:24:0:0:35:25:0:0
chr19	6919624	.	A	C	902.6	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0289697;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.4292;QD=58.2325;RBI=0.0304365;REFB=0;REVB=-0.0093345;RO=0;SAF=42;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000367953;OID=.;OPOS=6919624;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:20:42:0:0:20:42:0:0
chr19	6919753	.	A	G	347.84	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0714781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.951;QD=53.513;RBI=0.0718105;REFB=0;REVB=-0.00690202;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0019813;OID=.;OPOS=6919753;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:9:15:0:0:9:17:0:0
chr19	6974564	.	C	T	570.93	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.073;QD=58.5569;RBI=0.026514;REFB=0;REVB=-0.00227384;RO=0;SAF=17;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.53998e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127875;OID=.;OPOS=6974564;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:38:39:0:0:38:39:1:21:17:0:0:21:18:0:0
chr19	7005905	.	T	A	539.26	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0330493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.5546;QD=56.764;RBI=0.0374691;REFB=0;REVB=0.0176543;RO=0;SAF=19;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.71297e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0141312;OID=.;OPOS=7005905;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:38:0:0:33:38:1:14:19:0:0:15:23:0:0
chr19	7112265	.	G	A	101.84	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0459599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.5021;QD=40.7359;RBI=0.0868664;REFB=0;REVB=-0.0737121;RO=0;SAF=4;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00108408;OID=.;OPOS=7112265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:6:4:0:0:6:4:0:0
chr19	7141775	.	G	A	244.06	PASS	AF=0.5;AO=26;DP=51;FAO=26;FDP=52;FR=.;FRO=26;FSAF=20;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=0.00471048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4021;QD=18.7742;RBI=0.00482689;REFB=-0.0100066;REVB=-0.0010537;RO=24;SAF=20;SAR=6;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.336554;STB=0.69291;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00851718;OID=.;OPOS=7141775;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:24:26:26:26:0.5:6:20:10:14:6:20:11:15
chr19	7166376	.	C	T	239.58	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=19;FWDB=-0.00963278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.726;QD=18.0817;RBI=0.0179073;REFB=-0.00191276;REVB=-0.0150957;RO=27;SAF=16;SAR=10;SRF=8;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.28417;STB=0.658972;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00310425;OID=.;OPOS=7166376;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:27:27:26:26:0.490566:10:16:8:19:10:16:8:19
chr19	7267805	.	GT	G	85.17	PASS	AF=0.448276;AO=10;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=1;FWDB=0.196901;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=17.2643;QD=11.7472;RBI=0.217269;REFB=-0.0315926;REVB=0.0918467;RO=16;SAF=0;SAR=10;SRF=15;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.8581;STB=0.88574;STBP=0.001;TYPE=del;VARB=0.0419703;OID=.;OPOS=7267806;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.448276:10:29:13:29:16:2:11:15:1:70:16:0:10:15:1
chr19	7504982	.	C	T	228.32	PASS	AF=0.52381;AO=22;DP=42;FAO=22;FDP=42;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0142901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2228;QD=21.7445;RBI=0.0156585;REFB=-0.0228739;REVB=-0.00640151;RO=20;SAF=15;SAR=7;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0306732;STB=0.517226;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0359693;OID=.;OPOS=7504982;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:20:20:22:22:0.52381:7:15:13:7:7:15:13:7
chr19	7528734	.	A	G	148.13	PASS	AF=0.484848;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0186444;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.7826;QD=17.9557;RBI=0.0578417;REFB=0.00673154;REVB=-0.0547544;RO=16;SAF=10;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.166872;STB=0.581292;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=-0.00906297;OID=.;OPOS=7528734;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:17:16:16:0.484848:6:10:7:9:6:10:8:9
chr19	7533767	.	T	G	141.93	PASS	AF=0.322034;AO=19;DP=59;FAO=19;FDP=59;FR=.;FRO=40;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=-0.0253459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.533;QD=9.62221;RBI=0.0298476;REFB=-0.0167071;REVB=-0.0157628;RO=39;SAF=10;SAR=9;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160846;STB=0.585019;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0320012;OID=.;OPOS=7533767;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:39:40:19:19:0.322034:9:10:15:24:9:10:16:24
chr19	7533850	.	A	G	249.47	PASS	AF=0.414286;AO=29;DP=70;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=22;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=26;FWDB=-0.011413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.767;QD=14.2551;RBI=0.0194621;REFB=-0.0140898;REVB=-0.0157644;RO=39;SAF=22;SAR=7;SRF=15;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.394432;STB=0.736888;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.034199;OID=.;OPOS=7533850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:39:41:29:29:0.414286:7:22:15:24:7:22:15:26
chr19	7538039	.	A	G	530.04	PASS	AF=0.478632;AO=56;DP=117;FAO=56;FDP=117;FR=.;FRO=61;FSAF=25;FSAR=31;FSRF=40;FSRR=21;FWDB=0.00143134;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.212;QD=18.1209;RBI=0.023733;REFB=-0.0313096;REVB=0.0236898;RO=61;SAF=25;SAR=31;SRF=40;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19486;STB=0.607805;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0346494;OID=.;OPOS=7538039;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:61:61:56:56:0.478632:31:25:40:21:31:25:40:21
chr19	7538117	.	A	G	285.75	PASS	AF=0.37931;AO=33;DP=87;FAO=33;FDP=87;FR=.;FRO=54;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=38;FSRR=16;FWDB=-0.0226152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2243;QD=13.1379;RBI=0.0257173;REFB=-0.00596931;REVB=0.0122446;RO=54;SAF=16;SAR=17;SRF=38;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237636;STB=0.634778;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.00271221;OID=.;OPOS=7538117;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:54:54:33:33:0.37931:17:16:38:16:17:16:38:16
chr19	7547074	.	A	C	134.24	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.00314443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.177;QD=16.2717;RBI=0.00861718;REFB=-0.00679982;REVB=-0.00802299;RO=18;SAF=11;SAR=4;SRF=6;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.383468;STB=0.721012;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.00732238;OID=.;OPOS=7547074;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:4:11:6:12:4:11:6:12
chr19	7565912	.	A	G	39.6	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=-0.190668;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.1267;QD=13.201;RBI=0.191024;REFB=0.00262938;REVB=-0.011656;RO=5;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120202;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0304664;OID=.;OPOS=7565912;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:5:6:6:6:0.5:4:2:1:4:4:2:2:4
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chr19	7573297	.	T	C	144.47	PASS	AF=0.363636;AO=17;DP=53;FAO=20;FDP=55;FR=.;FRO=35;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=0.0154788;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.041;QD=10.5068;RBI=0.0303639;REFB=-0.00774034;REVB=-0.0261222;RO=35;SAF=1;SAR=16;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.754968;STB=0.816595;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0135393;OID=.;OPOS=7573297;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:35:35:17:20:0.363636:16:1:26:9:16:4:25:10
chr19	7573301	.	C	T	142.32	PASS	AF=0.345455;AO=19;DP=48;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=3;FSAR=16;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.0624268;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=32.9552;QD=10.3507;RBI=0.0637229;REFB=-0.034709;REVB=-0.012787;RO=29;SAF=3;SAR=16;SRF=19;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.546929;STB=0.855728;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0373228;OID=.;OPOS=7573301;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:55:29:36:19:19:0.345455:16:3:19:10:16:3:26:10
chr19	7694393	.	G	A	690.81	PASS	AF=0.530303;AO=57;DP=120;FAO=70;FDP=132;FR=.;FRO=62;FSAF=50;FSAR=20;FSRF=24;FSRR=38;FWDB=0.0211412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.386;QD=20.9336;RBI=0.0225443;REFB=-0.0393971;REVB=0.00782919;RO=62;SAF=48;SAR=9;SRF=24;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.493564;STB=0.662052;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0375751;OID=.;OPOS=7694393;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:132:62:62:57:70:0.530303:9:48:24:38:20:50:24:38
chr19	7698320	.	C	T	322.39	PASS	AF=0.448718;AO=35;DP=78;FAO=35;FDP=78;FR=.;FRO=43;FSAF=30;FSAR=5;FSRF=13;FSRR=30;FWDB=-2.6547e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.623;QD=16.5327;RBI=0.0278242;REFB=-0.0221383;REVB=0.0278241;RO=43;SAF=30;SAR=5;SRF=13;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.5827;STB=0.829838;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0172684;OID=.;OPOS=7698320;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:43:43:35:35:0.448718:5:30:13:30:5:30:13:30
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chr19	7705440	.	C	CTG	79.15	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=3;FWDB=-0.000424096;FXX=0.079968;HRUN=1;LEN=2;MLLD=222.976;QD=13.7647;RBI=0.0193352;REFB=-0.0364748;REVB=-0.0193306;RO=14;SAF=8;SAR=2;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0215705;STB=0.526261;STBP=0.87;TYPE=ins;VARB=0.0496511;OID=.;OPOS=7705441;OREF=-;OALT=TG;OMAPALT=CTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.434783:10:25:10:23:13:8:2:10:3:79:14:8:2:11:3
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chr19	7711221	.	T	C	1498.02	PASS	AF=1;AO=98;DP=103;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00873911;FXX=0.0384578;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.331;QD=59.9209;RBI=0.0217535;REFB=0;REVB=0.0199209;RO=0;SAF=51;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.01112e-05;OID=.;OPOS=7711221;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:103:100:0:0:98:100:1:47:51:0:0:47:53:0:0
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chr19	7928462	.	T	C	1242.36	PASS	AF=1;AO=75;DP=76;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0458092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.529;QD=61.351;RBI=0.0546044;REFB=0;REVB=0.0297179;RO=0;SAF=26;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135089;OID=.;OPOS=7928462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:76:81:0:0:75:81:1:49:26:0:0:50:31:0:0
chr19	7928788	.	A	C	520.58	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0244249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.468;QD=59.4949;RBI=0.028723;REFB=0;REVB=-0.0151142;RO=0;SAF=23;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00018592;OID=.;OPOS=7928788;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:11:23:0:0:12:23:0:0
chr19	7934076	.	GC	AC,G	161.51	PASS	AF=0.388889,0.555556;AO=7,7;DP=18;FAO=7,10;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=6,3;FSAR=1,7;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0669661,0.28112;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=1,1;MLLD=68.9442,17.7126;QD=35.8913;RBI=0.090424,0.285312;REFB=-0.0447703,0.0558137;REVB=0.0607622,0.0487303;RO=4;SAF=6,0;SAR=1,7;SRF=4;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.219787,-0.819748;STB=0.538356,0.57128;STBP=0.653,0.275;TYPE=snp,del;VARB=0.0445297,0.125852;OID=.,.;OPOS=7934076,7934077;OREF=G,C;OALT=A,-;OMAPALT=AC,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:48:18:18:4:1:7,7:7,10:0.388889,0.555556:1,7:6,0:4:0:1,7:6,3:1:0
chr19	7936208	.	A	G	57.32	PASS	AF=0.444444;AO=8;DP=18;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=-0.0285866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.372;QD=12.7375;RBI=0.0759119;REFB=-0.00643037;REVB=-0.0703237;RO=10;SAF=6;SAR=2;SRF=9;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214881;STB=0.624738;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.0139467;OID=.;OPOS=7936208;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:10:10:8:8:0.444444:2:6:9:1:2:6:9:1
chr19	7938306	.	A	AG,G	641.64	PASS	AF=0.979167,0.0208333;AO=35,6;DP=48;FAO=47,1;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=33,0;FSAR=14,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0460832,-0.0042357;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=20.215,123.907;QD=53.4696;RBI=0.0528492,0.0479736;REFB=0,0;REVB=0.0258725,-0.0477863;RO=7;SAF=30,1;SAR=5,5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.27935,-0.160904;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.0018885,0.0618767;OID=.,.;OPOS=7938307,7938306;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:48:48:7:0:35,6:47,1:0.979167,0.0208333:5,5:30,1:2:5:14,1:33,0:0:0
chr19	7944348	.	TC	T	365.19	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.018635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.0601;QD=47.1211;RBI=0.0187864;REFB=0;REVB=0.0023802;RO=0;SAF=20;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000820981;OID=.;OPOS=7944349;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:31:31:31:31:0:20:11:0:0:7:0:20:11:0:0
chr19	7951933	.	G	C	153.93	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=-0.0016659;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.838;QD=11.6171;RBI=0.00940049;REFB=-0.0131138;REVB=-0.0092517;RO=34;SAF=16;SAR=3;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.442973;STB=0.76341;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0224266;OID=.;OPOS=7951933;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:34:34:19:19:0.358491:3:16:17:17:3:16:17:17
chr19	7963914	.	A	C	568.11	PASS	AF=1;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00981004;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.469;QD=58.2675;RBI=0.0355914;REFB=-0.0699415;REVB=0.0342127;RO=1;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228522;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00170682;OID=.;OPOS=7963914;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:39:39:1:0:38:39:1:20:18:0:1:21:18:0:0
chr19	7963949	.	A	G	411.1	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=8.34389e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.1787;QD=56.7039;RBI=0.0119847;REFB=0;REVB=-0.0119844;RO=0;SAF=13;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000241718;OID=.;OPOS=7963949;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:16:13:0:0:16:13:0:0
chr19	7963976	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.839;QD=52.6128;RBI=0.043426;REFB=0;REVB=0.015823;RO=0;SAF=10;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000431763;OID=.;OPOS=7963976;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:12:10:0:0:12:10:0:0
chr19	7965339	.	C	T	404.6	PASS	AF=0.401709;AO=46;DP=118;FAO=47;FDP=117;FR=.;FRO=70;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=39;FSRR=31;FWDB=-0.0144152;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.028;QD=13.8323;RBI=0.0151529;REFB=-0.0105366;REVB=0.00467044;RO=70;SAF=34;SAR=12;SRF=39;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219689;STB=0.611811;STBP=0.059;TYPE=snp;VARB=0.0191759;OID=.;OPOS=7965339;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:117:70:70:46:47:0.401709:12:34:39:31:13:34:39:31
chr19	7965552	.	C	G	239.89	PASS	AF=0.41791;AO=28;DP=67;FAO=28;FDP=67;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=21;FSRR=18;FWDB=0.0190358;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.2383;QD=14.3217;RBI=0.0687987;REFB=0.00976224;REVB=0.0661128;RO=39;SAF=13;SAR=15;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758463;STB=0.5431;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=-0.00930876;OID=.;OPOS=7965552;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:39:39:28:28:0.41791:15:13:21:18:15:13:21:18
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chr19	8121360	.	A	G	132.71	PASS	AF=0.428571;AO=15;DP=35;FAO=15;FDP=35;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0254989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.011;QD=15.1663;RBI=0.0329762;REFB=-0.0199536;REVB=0.0209101;RO=19;SAF=6;SAR=9;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123511;STB=0.586091;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.0155124;OID=.;OPOS=8121360;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:19:20:15:15:0.428571:9:6:10:9:9:6:11:9
chr19	8122737	.	G	A	346.08	PASS	AF=0.607143;AO=34;DP=56;FAO=34;FDP=56;FR=.;FRO=22;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.0550077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.0949;QD=24.72;RBI=0.0806151;REFB=-0.022813;REVB=-0.0589317;RO=20;SAF=22;SAR=12;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0397308;STB=0.535191;STBP=0.541;TYPE=snp;VARB=0.0118769;OID=.;OPOS=8122737;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:20:22:34:34:0.607143:12:22:14:6:12:22:16:6
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chr19	8138054	.	C	A	138.88	PASS	AF=0.421053;AO=14;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00859099;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.7938;QD=14.6191;RBI=0.0110233;REFB=-0.0206148;REVB=-0.00690712;RO=22;SAF=8;SAR=6;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.168078;STB=0.588126;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.0413261;OID=.;OPOS=8138054;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:14:16:0.421053:6:8:9:13:7:9:9:13
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chr19	8152725	.	A	G	756.62	PASS	AF=0.670213;AO=62;DP=94;FAO=63;FDP=94;FR=.;FRO=31;FSAF=34;FSAR=29;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0107841;FXX=0.0105252;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8267;QD=32.1968;RBI=0.0126357;REFB=-0.00126226;REVB=-0.00658526;RO=31;SAF=33;SAR=29;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0497555;STB=0.529084;STBP=0.426;TYPE=snp;VARB=0.00277487;OID=.;OPOS=8152725;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:31:31:62:63:0.670213:29:33:14:17:29:34:14:17
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chr19	8176009	.	C	T	141.85	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.100716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.672;QD=13.839;RBI=0.102162;REFB=-0.0230641;REVB=-0.0171268;RO=25;SAF=4;SAR=12;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18464;STB=0.60855;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0273941;OID=.;OPOS=8176009;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:12:4:10:15:12:4:10:15
chr19	8176569	.	G	A	229.17	PASS	AF=0.677419;AO=21;DP=31;FAO=21;FDP=31;FR=.;FRO=10;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=0.0173879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.886;QD=29.5699;RBI=0.0843052;REFB=-0.00831501;REVB=0.0824926;RO=10;SAF=11;SAR=10;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13033;STB=0.571798;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00354938;OID=.;OPOS=8176569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:31:10:10:21:21:0.677419:10:11:3:7:10:11:3:7
chr19	8176640	.	C	T	224.22	PASS	AF=0.6;AO=21;DP=36;FAO=21;FDP=35;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=-0.00724579;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.5237;QD=25.6248;RBI=0.00868817;REFB=0.0314366;REVB=0.00479403;RO=14;SAF=12;SAR=9;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=-0.0065516;OID=.;OPOS=8176640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:14:14:21:21:0.6:9:12:8:6:9:12:8:6
chr19	8176919	.	C	T	598.31	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00369141;FXX=0.0249938;HRUN=4;LEN=1;MLLD=277.569;QD=61.3649;RBI=0.0205899;REFB=0;REVB=0.0202563;RO=0;SAF=16;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43889e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.69482e-05;OID=.;OPOS=8176919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:39:39:1:23:16:0:0:23:16:0:0
chr19	8176945	.	T	C	182.98	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=-0.0317191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4128;QD=17.4264;RBI=0.0552148;REFB=0.00875261;REVB=0.0451948;RO=23;SAF=4;SAR=15;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.342129;STB=0.697447;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=-0.0199246;OID=.;OPOS=8176945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:23:19:19:0.452381:15:4:12:11:15:4:12:11
chr19	8188812	.	C	T	316.9	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0342894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.589;QD=20.4451;RBI=0.0348444;REFB=-0.0153729;REVB=0.00619452;RO=29;SAF=23;SAR=10;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135772;STB=0.575578;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0138261;OID=.;OPOS=8188812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:29:29:33:33:0.532258:10:23:16:13:10:23:16:13
chr19	8191184	.	C	T	133.25	PASS	AF=0.46875;AO=13;DP=30;FAO=15;FDP=32;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=0.0259731;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.972;QD=16.6565;RBI=0.0286786;REFB=-0.0764705;REVB=-0.0121598;RO=17;SAF=7;SAR=6;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00884949;STB=0.53841;STBP=0.676;TYPE=snp;VARB=0.0535333;OID=.;OPOS=8191184;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:32:17:17:13:15:0.46875:6:7:9:8:6:9:9:8
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chr19	8191248	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322493;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.244;QD=55.0986;RBI=0.0339227;REFB=0;REVB=0.0105232;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127646;OID=.;OPOS=8191248;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
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chr19	8196444	.	C	T	912.91	PASS	AF=1;AO=44;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0151607;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.717;QD=58.8977;RBI=0.0638717;REFB=0;REVB=0.0620463;RO=0;SAF=31;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000264627;OID=.;OPOS=8196444;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:62:0:0:44:62:1:13:31:0:0:22:40:0:0
chr19	8212263	.	G	A	306.85	PASS	AF=0.478261;AO=33;DP=70;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=26;FSAR=7;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.014692;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.0894;QD=17.7881;RBI=0.014893;REFB=0.0114425;REVB=-0.00243826;RO=35;SAF=26;SAR=7;SRF=25;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0946185;STB=0.567229;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=-0.00752887;OID=.;OPOS=8212263;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:35:36:33:33:0.478261:7:26:25:10:7:26:25:11
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chr19	8454236	.	A	G	412.6	PASS	AF=0.639344;AO=39;DP=61;FAO=39;FDP=61;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.0404601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.408;QD=27.0559;RBI=0.0495291;REFB=-0.0187089;REVB=-0.0285677;RO=22;SAF=17;SAR=22;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018058;STB=0.509849;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=0.0161667;OID=.;OPOS=8454236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:22:22:39:39:0.639344:22:17:9:13:22:17:9:13
chr19	8468337	.	C	T	913.23	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0872163;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1579;QD=57.0767;RBI=0.115167;REFB=-0.064382;REVB=0.0752119;RO=1;SAF=30;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154807;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00251245;OID=.;OPOS=8468337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:64:64:1:0:63:64:1:33:30:1:0:33:31:0:0
chr19	8553630	.	C	T	1469.74	PASS	AF=1;AO=98;DP=101;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00374067;FXX=0.0297;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.955;QD=59.9892;RBI=0.0285255;REFB=0;REVB=0.0282791;RO=0;SAF=59;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.43696e-06;OID=.;OPOS=8553630;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:98:0:0:98:98:1:39:59:0:0:39:59:0:0
chr19	8555964	.	AC	A	78.58	PASS	AF=0.586207;AO=11;DP=28;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.174459;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=11.7254;QD=10.839;RBI=0.253515;REFB=-0.0672377;REVB=-0.18394;RO=12;SAF=2;SAR=9;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0.309524;SSSB=-0.275208;STB=0.519208;STBP=0.861;TYPE=del;VARB=0.0566762;OID=.;OPOS=8555965;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.586207:11:28:17:29:12:5:12:4:8:54:12:2:9:5:7
chr19	8563456	.	C	G	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0478029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.6551;QD=35.5749;RBI=0.0936607;REFB=0;REVB=-0.0805431;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0104718;OID=.;OPOS=8563456;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr19	8578035	.	T	C	752.42	PASS	AF=1;AO=50;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265424;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.806;QD=56.7863;RBI=0.062466;REFB=0;REVB=0.0565465;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000240541;OID=.;OPOS=8578035;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:50:53:1:26:24:0:0:29:24:0:0
chr19	8612914	.	G	A	179.15	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0304561;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.982;QD=22.3942;RBI=0.0440796;REFB=-0.0137549;REVB=0.0318659;RO=13;SAF=6;SAR=12;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0217653;STB=0.523784;STBP=0.79;TYPE=snp;VARB=0.0176335;OID=.;OPOS=8612914;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:13:14:18:18:0.5625:12:6:4:9:12:6:4:10
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chr19	8669931	.	G	C	1254.3	PASS	AF=1;AO=82;DP=83;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0682753;FXX=0.0120467;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.636;QD=61.1855;RBI=0.0766051;REFB=-0.0573247;REVB=0.0347393;RO=0;SAF=47;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.16565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103479;OID=.;OPOS=8669931;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:83:82:0:0:82:82:1:35:47:0:0:35:47:0:0
chr19	8808373	.	G	T	1863.96	PASS	AF=1;AO=121;DP=122;FAO=122;FDP=122;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0682932;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.7664;QD=61.1136;RBI=0.104268;REFB=0;REVB=0.0787896;RO=1;SAF=56;SAR=65;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840742;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000396663;OID=.;OPOS=8808373;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:122:1:0:121:122:1:65:56:1:0:65:57:0:0
chr19	8808900	.	A	G	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0292427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.291;QD=44.6897;RBI=0.0297776;REFB=0;REVB=0.00561889;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339312;OID=.;OPOS=8808900;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0
chr19	8808942	.	A	G	160.3	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0641268;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4797;QD=45.8006;RBI=0.096654;REFB=0;REVB=-0.072317;RO=0;SAF=13;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0060869;OID=.;OPOS=8808942;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:1:13:0:0:1:13:0:0
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chr19	9005719	.	A	G	593.97	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0620291;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.055;QD=60.9198;RBI=0.0621601;REFB=0;REVB=0.00403467;RO=0;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000318875;OID=.;OPOS=9005719;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:24:15:0:0:24:15:0:0
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chr19	9057687	.	A	G	1551.9	PASS	AF=1;AO=97;DP=98;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369582;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.622;QD=63.9957;RBI=0.0388077;REFB=0;REVB=0.0118376;RO=0;SAF=40;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.58683e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.94676e-05;OID=.;OPOS=9057687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:97:0:0:97:97:1:57:40:0:0:57:40:0:0
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chr19	9058907	.	G	C	232.69	PASS	AF=0.472727;AO=24;DP=54;FAO=26;FDP=55;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0164744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.601;QD=16.9229;RBI=0.054566;REFB=-0.0296647;REVB=0.0520196;RO=29;SAF=21;SAR=3;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.51277;STB=0.758394;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0164195;OID=.;OPOS=9058907;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:29:29:24:26:0.472727:3:21:13:16:4:22:13:16
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chr19	9060605	.	G	A	1843.97	PASS	AF=1;AO=120;DP=121;FAO=120;FDP=120;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0123143;FXX=0.00826378;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.883;QD=61.4658;RBI=0.0858141;REFB=0;REVB=0.0849259;RO=0;SAF=73;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.06139e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00032446;OID=.;OPOS=9060605;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:120:0:0:120:120:1:47:73:0:0:47:73:0:0
chr19	9060812	.	T	C	1142.03	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0607227;FXX=0.0259707;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.978;QD=60.9085;RBI=0.0622653;REFB=0;REVB=0.0137736;RO=0;SAF=32;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.10542e-05;OID=.;OPOS=9060812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:74:75:1:42:32:0:0:42:33:0:0
chr19	9061559	.	C	G	801.29	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.041452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.01;QD=57.235;RBI=0.0464012;REFB=0;REVB=-0.0208519;RO=0;SAF=34;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.43892e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.87491e-05;OID=.;OPOS=9061559;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:22:34:0:0:22:34:0:0
chr19	9062415	.	T	G	1190.42	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0405722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.515;QD=61.0472;RBI=0.0497998;REFB=0;REVB=0.0288776;RO=0;SAF=38;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.781e-06;OID=.;OPOS=9062415;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:39:38:0:0:40:38:0:0
chr19	9062544	.	T	G	695.84	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0716545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.2925;QD=61.8525;RBI=0.104717;REFB=0;REVB=-0.0763633;RO=0;SAF=27;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0018129;OID=.;OPOS=9062544;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:44:45:1:17:27:0:0:17:28:0:0
chr19	9065203	.	T	C	238.99	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=43;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=0.0831249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.002;QD=20.7818;RBI=0.0851427;REFB=-0.0438379;REVB=0.0184264;RO=22;SAF=9;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00423538;STB=0.521803;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.0545571;OID=.;OPOS=9065203;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:46:22:23:20:23:0.5:11:9:10:12:12:11:10:13
chr19	9065510	.	G	A	213.89	PASS	AF=0.376812;AO=26;DP=71;FAO=26;FDP=69;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.00931033;FXX=0.028165;HRUN=3;LEN=1;MLLD=48.9691;QD=12.3994;RBI=0.0557043;REFB=-0.0122154;REVB=0.0549208;RO=45;SAF=15;SAR=11;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000960837;STB=0.517782;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0126694;OID=.;OPOS=9065510;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:69:45:43:26:26:0.376812:11:15:26:19:11:15:26:17
chr19	9066259	.	T	C	546.52	PASS	AF=0.386905;AO=63;DP=166;FAO=65;FDP=168;FR=.;FRO=103;FSAF=43;FSAR=22;FSRF=73;FSRR=30;FWDB=0.0044948;FXX=0.00591681;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.925;QD=13.0124;RBI=0.0938434;REFB=-0.0024249;REVB=0.0937357;RO=102;SAF=42;SAR=21;SRF=73;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0618289;STB=0.532989;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.00423755;OID=.;OPOS=9066259;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:166:168:102:103:63:65:0.386905:21:42:73:29:22:43:73:30
chr19	9066874	.	G	T	648.45	PASS	AF=0.496183;AO=65;DP=133;FAO=65;FDP=131;FR=.;FRO=66;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=27;FSRR=39;FWDB=-0.0156312;FXX=0.0150365;HRUN=2;LEN=1;MLLD=154.246;QD=19.8;RBI=0.0276822;REFB=-0.027395;REVB=-0.0228466;RO=66;SAF=33;SAR=32;SRF=27;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0899371;STB=0.549598;STBP=0.305;TYPE=snp;VARB=0.0241056;OID=.;OPOS=9066874;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:131:66:66:65:65:0.496183:32:33:27:39:32:33:27:39
chr19	9068530	.	C	T	496.43	PASS	AF=0.505263;AO=48;DP=95;FAO=48;FDP=95;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=0.0112897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.247;QD=20.9024;RBI=0.017636;REFB=-0.00273756;REVB=-0.0135489;RO=47;SAF=24;SAR=24;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0095102;STB=0.505261;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00222044;OID=.;OPOS=9068530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:47:47:48:48:0.505263:24:24:23:24:24:24:23:24
chr19	9069792	.	G	A	800.8	PASS	AF=0.535714;AO=56;DP=140;FAO=75;FDP=140;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=65;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=0.262705;FXX=0.0070917;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1573;QD=22.88;RBI=0.289234;REFB=0.0243567;REVB=0.121006;RO=36;SAF=29;SAR=27;SRF=2;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331528;STB=0.556576;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=-0.0156621;OID=.;OPOS=9069792;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:140:36:65:56:75:0.535714:27:29:2:34:37:38:25:40
chr19	9069892	.	A	C	672.72	PASS	AF=0.453416;AO=72;DP=162;FAO=73;FDP=161;FR=.;FRO=88;FSAF=38;FSAR=35;FSRF=41;FSRR=47;FWDB=1.27767e-06;FXX=0.00617246;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.201;QD=16.7134;RBI=0.00321915;REFB=-0.00461929;REVB=0.00321915;RO=84;SAF=38;SAR=34;SRF=40;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0500577;STB=0.529834;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.00636051;OID=.;OPOS=9069892;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:161:84:88:72:73:0.453416:34:38:40:44:35:38:41:47
chr19	9070079	.	C	G	183.4	PASS	AF=0.463415;AO=19;DP=41;FAO=19;FDP=41;FR=.;FRO=22;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.0146637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.377;QD=17.8929;RBI=0.021453;REFB=-0.00724745;REVB=-0.0156591;RO=22;SAF=8;SAR=11;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.24189;STB=0.63714;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0100447;OID=.;OPOS=9070079;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:22:22:19:19:0.463415:11:8:15:7:11:8:15:7
chr19	9070194	.	A	G	713.16	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.656;QD=62.0142;RBI=0.0449928;REFB=0;REVB=0.0388788;RO=0;SAF=17;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.96886e-05;OID=.;OPOS=9070194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:28:17:0:0:29:17:0:0
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chr19	9070837	.	G	A	1443.61	PASS	AF=0.978947;AO=93;DP=95;FAO=93;FDP=95;FR=.;FRO=2;FSAF=64;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0192001;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.4139;QD=60.7837;RBI=0.0216465;REFB=0.0590161;REVB=0.00999644;RO=2;SAF=64;SAR=29;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0315719;STB=0.516663;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=-0.000542579;OID=.;OPOS=9070837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:95:95:2:2:93:93:0.978947:29:64:0:2:29:64:0:2
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chr19	9071834	.	G	C	328.25	PASS	AF=0.472973;AO=35;DP=74;FAO=35;FDP=74;FR=.;FRO=39;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=9;FSRR=30;FWDB=0.0265384;FXX=0.0133316;HRUN=3;LEN=1;MLLD=155.727;QD=17.7433;RBI=0.02655;REFB=-0.0262154;REVB=0.000785315;RO=39;SAF=16;SAR=19;SRF=9;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221177;STB=0.622652;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.0232983;OID=.;OPOS=9071834;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:39:39:35:35:0.472973:19:16:9:30:19:16:9:30
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chr19	9204307	.	A	G	582.4	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.000534773;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.136;QD=58.2395;RBI=0.00909531;REFB=-0.0185714;REVB=-0.00907957;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.516121;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.000153992;OID=.;OPOS=9204307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:0:1:39:39:0.975:15:24:0:0:15:24:0:1
chr19	9213026	.	T	C	832.83	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0740551;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.9674;QD=56.4627;RBI=0.0794466;REFB=0;REVB=-0.0287682;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000629013;OID=.;OPOS=9213026;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:59:0:0:58:59:1:35:23:0:0:36:23:0:0
chr19	9213079	.	A	C	804.59	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0363164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.8834;QD=64.3673;RBI=0.0557741;REFB=0;REVB=0.0423305;RO=0;SAF=20;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000967636;OID=.;OPOS=9213079;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:49:50:1:29:20:0:0:30:20:0:0
chr19	9213132	.	A	G	483.19	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0469799;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.8385;QD=58.5679;RBI=0.0661513;REFB=0;REVB=0.0465713;RO=0;SAF=17;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.60901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00100678;OID=.;OPOS=9213132;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:16:17:0:0:16:17:0:0
chr19	9225685	.	T	C	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0619811;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.497;QD=19.0003;RBI=0.0742796;REFB=-0.00635087;REVB=-0.0409365;RO=17;SAF=7;SAR=10;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.104463;STB=0.55937;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.0162412;OID=.;OPOS=9225685;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:10:7:9:8:10:7:9:8
chr19	9226017	.	C	G	91.11	PASS	AF=0.272727;AO=12;DP=44;FAO=12;FDP=44;FR=.;FRO=32;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=24;FSRR=8;FWDB=-0.00237841;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=290.55;QD=8.2825;RBI=0.0147612;REFB=-0.00413962;REVB=-0.0145683;RO=32;SAF=5;SAR=7;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384109;STB=0.729888;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0114884;OID=.;OPOS=9226017;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:44:44:32:32:12:12:0.272727:7:5:24:8:7:5:24:8
chr19	9226192	.	A	G	40.48	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.0636846;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.9775;QD=11.5663;RBI=0.0909938;REFB=-0.0125423;REVB=0.0649935;RO=8;SAF=3;SAR=3;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116777;STB=0.571195;STBP=0.699;TYPE=snp;VARB=0.0152962;OID=.;OPOS=9226192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:14:14:8:8:6:6:0.428571:3:3:5:3:3:3:5:3
chr19	9236697	.	AG	AGATGGT,GT	131.08	PASS	AF=0.333333,0.047619;AO=13,2;DP=43;FAO=14,2;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=6,0;FSAR=8,2;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0149457,-0.0285008;FXX=0.0232504;HRUN=1,3;LEN=5,2;MLLD=243.074,136.979;QD=12.4835;RBI=0.0153286,0.033506;REFB=-0.0365478,-0.0252962;REVB=0.00340461,-0.017617;RO=26;SAF=5,0;SAR=8,2;SRF=11;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0446188,-0.445644;STB=0.503644,0.993988;STBP=1,0.199;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0589748,0.0293747;OID=.,.;OPOS=9236699,9236697;OREF=-,AG;OALT=ATGGT,GT;OMAPALT=AGATGGT,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:42:26:26:13,2:14,2:0.333333,0.047619:8,2:5,0:11:15:8,2:6,0:11:15
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chr19	9298512	.	C	T	274.22	PASS	AF=0.568182;AO=25;DP=44;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=19;FSRF=4;FSRR=15;FWDB=0.0166297;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=246.036;QD=24.9293;RBI=0.0179321;REFB=-0.0123302;REVB=-0.00670914;RO=19;SAF=6;SAR=19;SRF=4;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0320237;STB=0.517753;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00994082;OID=.;OPOS=9298512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:19:19:25:25:0.568182:19:6:4:15:19:6:4:15
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chr19	9449888	.	A	G	761.61	PASS	AF=0.52518;AO=73;DP=139;FAO=73;FDP=139;FR=.;FRO=66;FSAF=31;FSAR=42;FSRF=42;FSRR=24;FWDB=-0.0273706;FXX=0.00714235;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.372;QD=21.9168;RBI=0.0310871;REFB=-0.0210147;REVB=0.0147397;RO=65;SAF=31;SAR=42;SRF=42;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.188742;STB=0.599738;STBP=0.013;TYPE=snp;VARB=0.0205586;OID=.;OPOS=9449888;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:139:65:66:73:73:0.52518:42:31:42:23:42:31:42:24
chr19	9452026	.	ACT	ACA,A	301.32	PASS	AF=0.125,0.479167;AO=6,21;DP=48;FAO=6,23;FDP=48;FR=.;FRO=19;FSAF=5,13;FSAR=1,10;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.0275163,-0.0162659;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,2;MLLD=53.9658,217.076;QD=25.1096;RBI=0.0302545,0.0174884;REFB=-0.0617993,-0.0212147;REVB=-0.0125774,0.00642353;RO=16;SAF=5,11;SAR=1,10;SRF=8;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.416902,0.0184479;STB=0.736808,0.506324;STBP=0.232,0.94;TYPE=snp,del;VARB=0.0428151,0.0266337;OID=.,.;OPOS=9452028,9452027;OREF=T,CT;OALT=A,-;OMAPALT=ACA,A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.125,0.479167:6,21:48:6,23:48:19:5,13:1,10:11:8:99:16:5,11:1,10:8:8
chr19	9453655	.	C	T	299.0	PASS	AF=0.576923;AO=30;DP=53;FAO=30;FDP=52;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=-0.0120388;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9771;QD=23.0001;RBI=0.0120584;REFB=-0.00520742;REVB=0.000686006;RO=22;SAF=11;SAR=19;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140959;STB=0.577989;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.00960316;OID=.;OPOS=9453655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:52:22:22:30:30:0.576923:19:11:12:10:19:11:12:10
chr19	9490814	.	C	T	202.02	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0151273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.232;QD=21.2649;RBI=0.0272007;REFB=-0.00803901;REVB=0.0226062;RO=18;SAF=11;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523046;STB=0.529383;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.00722124;OID=.;OPOS=9490814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:9:11:11:7:9:11:11:7
chr19	9492141	.	C	T	354.96	PASS	AF=0.506849;AO=36;DP=72;FAO=37;FDP=73;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=0.00983078;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.5954;QD=19.4498;RBI=0.0480658;REFB=-0.0252574;REVB=-0.0470497;RO=36;SAF=16;SAR=20;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221917;STB=0.614424;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0153502;OID=.;OPOS=9492141;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:36:36:36:37:0.506849:20:16:25:11:20:17:25:11
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chr19	10071063	.	T	C	191.24	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.089;QD=47.8103;RBI=0.0163791;REFB=0;REVB=0.00163529;RO=0;SAF=3;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000136888;OID=.;OPOS=10071063;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:13:3:0:0:13:3:0:0
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chr19	10090649	.	A	G	256.13	PASS	AF=0.913043;AO=21;DP=23;FAO=21;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=1;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0468318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.2399;QD=44.5435;RBI=0.0763974;REFB=-0.0796308;REVB=-0.0603601;RO=2;SAF=1;SAR=20;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0439889;STB=0.523787;STBP=0.614;TYPE=snp;VARB=0.0169134;OID=.;OPOS=10090649;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:23:23:2:2:21:21:0.913043:20:1:0:2:20:1:0:2
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chr19	10132859	.	T	A	42.23	PASS	AF=0.666667;AO=6;DP=9;FAO=6;FDP=9;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.652;QD=18.767;RBI=0.0110128;REFB=0.00870726;REVB=-0.0110128;RO=3;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.036242;OID=.;OPOS=10132859;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:9:3:3:6:6:0.666667:6:0:0:3:6:0:0:3
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chr19	10218524	.	C	G	386.25	PASS	AF=0.64;AO=32;DP=50;FAO=32;FDP=50;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=0.0129189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9721;QD=30.8997;RBI=0.0378756;REFB=-0.0400156;REVB=-0.0356042;RO=18;SAF=19;SAR=13;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0892925;STB=0.548783;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.0284884;OID=.;OPOS=10218524;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:18:18:32:32:0.64:13:19:13:5:13:19:13:5
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chr19	10229297	.	C	A	51.03	PASS	AF=0.210526;AO=8;DP=38;FAO=8;FDP=38;FR=.;FRO=30;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.00999109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.201;QD=5.37182;RBI=0.0186544;REFB=-0.00213596;REVB=-0.0157533;RO=30;SAF=4;SAR=4;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0322366;OID=.;OPOS=10229297;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:38:38:30:30:8:8:0.210526:4:4:15:15:4:4:15:15
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chr19	10334663	.	T	G	34.15	PASS	AF=0.833333;AO=4;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.01278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.202;QD=22.7693;RBI=0.01278;REFB=-0.0428419;REVB=0;RO=1;SAF=4;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00918888;OID=.;OPOS=10334663;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:4:5:0.833333:0:4:1:0:0:5:1:0
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chr19	10404510	.	C	CG	37.55	PASS	AF=0.215686;AO=10;DP=52;FAO=11;FDP=51;FR=.;FRO=40;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=0.176839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=19.4993;QD=2.94475;RBI=0.176878;REFB=-0.0212992;REVB=0.00373328;RO=41;SAF=2;SAR=8;SRF=22;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.424369;STB=0.786521;STBP=0.054;TYPE=ins;VARB=0.0973021;OID=.;OPOS=10404511;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.215686:10:52:11:51:40:2:9:21:19:37:41:2:8:22:19
chr19	10404581	.	G	A	153.76	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=27;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=9;FWDB=0.0462856;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.949;QD=21.9655;RBI=0.0465919;REFB=-0.0653301;REVB=-0.00533382;RO=11;SAF=5;SAR=11;SRF=2;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116304;STB=0.531876;STBP=0.735;TYPE=snp;VARB=0.0395476;OID=.;OPOS=10404581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:27:28:11:12:16:16:0.571429:11:5:2:9:11:5:3:9
chr19	10419130	.	C	T	72.92	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.00885162;FXX=0.0587889;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.375;QD=18.23;RBI=0.0170201;REFB=-0.0152145;REVB=0.0145373;RO=5;SAF=2;SAR=7;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143326;STB=0.613759;STBP=0.377;TYPE=snp;VARB=0.0127124;OID=.;OPOS=10419130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:17:16:5:7:9:9:0.5625:7:2:2:3:7:2:3:4
chr19	10426422	.	A	C	70.58	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0106376;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.178;QD=17.6438;RBI=0.0721419;REFB=-0.0532481;REVB=-0.0713533;RO=7;SAF=7;SAR=2;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301282;STB=0.676989;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.0389432;OID=.;OPOS=10426422;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:2:7:3:4:2:7:3:4
chr19	10426628	.	T	C	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.00893181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5686;QD=10.0339;RBI=0.100667;REFB=0.0184809;REVB=-0.10027;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413035;STB=0.749164;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=-0.0336857;OID=.;OPOS=10426628;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:2:3:1:6:2:3:1:6
chr19	10428991	.	GGC	G,GGG	71.81	PASS	AF=0.188525,0;AO=22,11;DP=141;FAO=23,0;FDP=122;FR=.;FRO=99;FSAF=7,0;FSAR=16,0;FSRF=38;FSRR=61;FWDB=-0.0708061,0.0277551;FXX=0.0161277;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=19.1357,17.2638;QD=2.35456;RBI=0.134636,0.141064;REFB=-0.0734263,0.00577485;REVB=-0.114514,0.138307;RO=92;SAF=7,1;SAR=15,10;SRF=37;SRR=55;SSEN=0.30137,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.115336,-0.444604;STB=0.571818,0.5;STBP=0.46,1;TYPE=del,snp;VARB=0.194504,0;OID=.,.;OPOS=10428992,10428993;OREF=GC,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.188525,0:22,11:141:23,0:122:99:7,0:16,0:38:61:72:92:7,1:15,10:37:55
chr19	10431798	.	C	CT	166.02	PASS	AF=0.761905;AO=6;DP=24;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0660934;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=190.543;QD=31.6237;RBI=0.0663734;REFB=-0.0319942;REVB=-0.0060897;RO=16;SAF=1;SAR=5;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.416902;STB=0.52378;STBP=0.753;TYPE=ins;VARB=0.00761785;OID=.;OPOS=10431799;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=CT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.761905:6:24:16:21:5:8:8:2:3:28:16:1:5:8:8
chr19	10431799	.	G	T	77.3	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=23;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.00524301;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=158.578;QD=13.4427;RBI=0.00826931;REFB=-0.0225581;REVB=-0.00639471;RO=12;SAF=6;SAR=4;SRF=3;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316368;STB=0.660708;STBP=0.222;TYPE=snp;VARB=0.00821501;OID=.;OPOS=10431799;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:23:23:12:13:10:10:0.434783:4:6:3:9:4:6:4:9
chr19	10449392	.	A	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.039852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.79;QD=56.1916;RBI=0.0400848;REFB=0;REVB=0.00431391;RO=0;SAF=22;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.35572e-05;OID=.;OPOS=10449392;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:6:22:0:0:6:22:0:0
chr19	10450285	.	G	A	63.01	PASS	AF=0.3;AO=9;DP=30;FAO=9;FDP=30;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=-0.00304896;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.217;QD=8.40116;RBI=0.00565111;REFB=0.00537806;REVB=0.00475804;RO=21;SAF=7;SAR=2;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15909;STB=0.59976;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=-0.00993608;OID=.;OPOS=10450285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:30:30:21:21:9:9:0.3:2:7:14:7:2:7:14:7
chr19	10475649	.	C	T	461.97	PASS	AF=0.5625;AO=44;DP=80;FAO=45;FDP=80;FR=.;FRO=35;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=22;FWDB=-0.0102559;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.911;QD=23.0985;RBI=0.0110567;REFB=-0.0112459;REVB=-0.00413128;RO=35;SAF=22;SAR=22;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103692;STB=0.560949;STBP=0.229;TYPE=snp;VARB=0.00984477;OID=.;OPOS=10475649;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:35:35:44:45:0.5625:22:22:13:22:22:23:13:22
chr19	10475652	.	C	A	307.24	PASS	AF=0.43038;AO=34;DP=79;FAO=34;FDP=79;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=0.137065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.208;QD=15.5564;RBI=0.140345;REFB=-0.0243433;REVB=0.0301634;RO=45;SAF=12;SAR=22;SRF=23;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.164682;STB=0.593164;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.016561;OID=.;OPOS=10475652;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:45:45:34:34:0.43038:22:12:23:22:22:12:23:22
chr19	10527666	.	G	A	306.59	PASS	AF=0.485294;AO=33;DP=68;FAO=33;FDP=68;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0911233;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.9738;QD=18.0349;RBI=0.0940861;REFB=0.00881778;REVB=0.0234248;RO=35;SAF=21;SAR=12;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0208152;STB=0.511621;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=-0.0059062;OID=.;OPOS=10527666;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:35:35:33:33:0.485294:12:21:23:12:12:21:23:12
chr19	10577843	.	C	A	239.65	PASS	AF=0.490566;AO=26;DP=53;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0146371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.071;QD=18.0871;RBI=0.020626;REFB=-0.0206873;REVB=-0.0145324;RO=26;SAF=14;SAR=12;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694935;STB=0.547023;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0113736;OID=.;OPOS=10577843;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:26:27:26:26:0.490566:12:14:16:10:12:14:17:10
chr19	10579474	.	T	G	299.11	PASS	AF=0.627907;AO=25;DP=42;FAO=27;FDP=43;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0279017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.772;QD=27.8244;RBI=0.131688;REFB=-0.0684404;REVB=0.128698;RO=16;SAF=11;SAR=14;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130191;STB=0.566961;STBP=0.243;TYPE=snp;VARB=0.0582161;OID=.;OPOS=10579474;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:43:16:16:25:27:0.627907:14:11:10:6:15:12:10:6
chr19	10579837	.	A	AT,T	33.15	PASS	AF=0.285714,0.047619;AO=3,2;DP=22;FAO=6,1;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=2,1;FSAR=4,0;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0348952,-0.0235461;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=13.9915,122.522;QD=6.31488;RBI=0.245267,0.0238948;REFB=-0.0700801,-0.00299321;REVB=0.242772,-0.00406768;RO=16;SAF=2,1;SAR=1,1;SRF=10;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0496198,-0.127296;STB=0.74925,0.985671;STBP=0.165,0.541;TYPE=ins,snp;VARB=0.143348,0.152001;OID=.,.;OPOS=10579838,10579837;OREF=-,A;OALT=T,T;OMAPALT=AT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:22:21:16:14:3,2:6,1:0.285714,0.047619:1,1:2,1:10:6:4,0:2,1:10:4
chr19	10599965	.	G	A	277.59	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0106604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.737;QD=20.5625;RBI=0.0127084;REFB=-0.00369386;REVB=-0.00691803;RO=25;SAF=20;SAR=9;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.15365;STB=0.585713;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.00444835;OID=.;OPOS=10599965;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:9:20:13:12:9:20:13:12
chr19	10600442	.	G	C	239.43	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0185632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.234;QD=50.4055;RBI=0.0320512;REFB=0;REVB=0.0261283;RO=0;SAF=5;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180351;OID=.;OPOS=10600442;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:14:5:0:0:14:5:0:0
chr19	10668452	.	A	G	223.15	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142274;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.1946;QD=49.5893;RBI=0.0292653;REFB=0;REVB=-0.0255742;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000344144;OID=.;OPOS=10668452;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:7:11:0:0:7:11:0:0
chr19	10670184	.	C	G	708.53	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.072;QD=62.9801;RBI=0.0518086;REFB=0;REVB=0.0380857;RO=0;SAF=26;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15971e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000427929;OID=.;OPOS=10670184;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:19:26:0:0:19:26:0:0
chr19	10683477	.	A	G	727.42	PASS	AF=1;AO=43;DP=52;FAO=51;FDP=51;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=38;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0141438;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.054;QD=57.0527;RBI=0.0156896;REFB=0;REVB=0.00679079;RO=0;SAF=31;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41862e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00016395;OID=.;OPOS=10683477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:51:0:0:43:51:1:12:31:0:0:13:38:0:0
chr19	10692000	.	T	C	1295.95	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00189039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.383;QD=61.7119;RBI=0.0341427;REFB=0;REVB=-0.0340903;RO=0;SAF=34;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.9064e-05;OID=.;OPOS=10692000;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:84:0:0:83:84:1:49:34:0:0:49:35:0:0
chr19	10738639	.	C	T	279.71	PASS	AF=0.675676;AO=24;DP=37;FAO=25;FDP=37;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=17;FSRF=9;FSRR=3;FWDB=-0.0111682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.5412;QD=30.2385;RBI=0.0563088;REFB=-0.0146814;REVB=0.0551902;RO=12;SAF=8;SAR=16;SRF=9;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.256695;STB=0.643535;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.00562331;OID=.;OPOS=10738639;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:37:12:12:24:25:0.675676:16:8:9:3:17:8:9:3
chr19	10742170	.	A	G	170.32	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.0414765;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.9206;QD=17.032;RBI=0.0419778;REFB=0.00711599;REVB=-0.00646851;RO=22;SAF=11;SAR=7;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.151944;STB=0.586981;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=-0.0120865;OID=.;OPOS=10742170;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:7:11:10:12:7:11:10:12
chr19	10794375	.	CT	CC,C	281.63	PASS	AF=0,1;AO=4,16;DP=26;FAO=0,26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=0,22;FSAR=0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.105137,0.022694;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=8.08947,16.5673;QD=43.3271;RBI=0.269949,0.299946;REFB=0,0;REVB=0.248634,0.299086;RO=2;SAF=4,16;SAR=0,0;SRF=1;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.725637,0.843697;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.0477764,0.0207544;OID=.,.;OPOS=10794376,10794376;OREF=T,T;OALT=C,-;OMAPALT=CC,C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/2:0,1:4,16:26:0,26:26:0:0,22:0,4:0:0:3:2:4,16:0,0:1:1
chr19	10794630	.	G	T	445.79	PASS	AF=0.398438;AO=51;DP=128;FAO=51;FDP=128;FR=.;FRO=77;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=49;FSRR=28;FWDB=0.0166341;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.015;QD=13.9309;RBI=0.0252615;REFB=-0.0131337;REVB=0.0190118;RO=77;SAF=34;SAR=17;SRF=49;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357561;STB=0.520223;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.017734;OID=.;OPOS=10794630;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:77:77:51:51:0.398438:17:34:49:28:17:34:49:28
chr19	10939792	.	T	C	2402.76	PASS	AF=1;AO=156;DP=156;FAO=157;FDP=157;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=124;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00167577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.749;QD=61.2169;RBI=0.00332662;REFB=0;REVB=0.00287371;RO=0;SAF=33;SAR=123;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.49665e-07;OID=.;OPOS=10939792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:156:157:0:0:156:157:1:123:33:0:0:124:33:0:0
chr19	10941991	.	A	T	36.6	PASS	AF=0.3;AO=4;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=14;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=13;FWDB=-0.0346424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.463;QD=7.32069;RBI=0.0348705;REFB=-0.00489488;REVB=-0.00398147;RO=8;SAF=2;SAR=2;SRF=0;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.567148;STB=0.856376;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00987868;OID=.;OPOS=10941991;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:8:14:4:6:0.3:2:2:0:8:2:4:1:13
chr19	10943338	.	G	A	74.52	PASS	AF=0.294118;AO=10;DP=34;FAO=10;FDP=34;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.00397269;FXX=0.0285633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.205;QD=8.76723;RBI=0.00548388;REFB=-0.0105121;REVB=0.00378031;RO=24;SAF=6;SAR=4;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0197651;STB=0.512171;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0217391;OID=.;OPOS=10943338;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:34:34:24:24:10:10:0.294118:4:6:14:10:4:6:14:10
chr19	11034846	.	C	T	85.03	PASS	AF=0.666667;AO=10;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.113931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.211;QD=22.6757;RBI=0.122276;REFB=-0.0409891;REVB=0.0443972;RO=5;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671499;STB=0.538382;STBP=0.711;TYPE=snp;VARB=0.00715834;OID=.;OPOS=11034846;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:15:5:5:10:10:0.666667:3:7:3:2:3:7:3:2
chr19	11105608	.	T	C	131.51	PASS	AF=0.305085;AO=16;DP=57;FAO=18;FDP=59;FR=.;FRO=41;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=18;FWDB=-0.0430951;FXX=0.0327815;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.861;QD=8.91593;RBI=0.0602618;REFB=-0.00685466;REVB=-0.0421224;RO=41;SAF=9;SAR=7;SRF=23;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00183754;STB=0.536022;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.020506;OID=.;OPOS=11105608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:59:41:41:16:18:0.305085:7:9:23:18:7:11:23:18
chr19	11106600	.	C	T	105.23	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=-0.0411232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5503;QD=23.3848;RBI=0.0879694;REFB=-0.0150291;REVB=-0.0777657;RO=6;SAF=6;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0459658;STB=0.526264;STBP=0.808;TYPE=snp;VARB=0.0092153;OID=.;OPOS=11106600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:18:18:6:6:10:10:0.555556:4:6:4:2:4:6:4:2
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chr19	11233941	.	A	G	125.87	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0191092;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.203;QD=17.3609;RBI=0.0205433;REFB=-0.00192831;REVB=-0.00754103;RO=14;SAF=3;SAR=11;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.232012;STB=0.62245;STBP=0.257;TYPE=snp;VARB=0.00372727;OID=.;OPOS=11233941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:29:14:15:14:14:0.482759:11:3:6:8:11:3:6:9
chr19	11242133	.	G	A	358.14	PASS	AF=0.447059;AO=38;DP=85;FAO=38;FDP=85;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0032423;FXX=0.0116266;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.178;QD=16.8539;RBI=0.00505075;REFB=-0.00671062;REVB=0.00387267;RO=47;SAF=18;SAR=20;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0781789;STB=0.543858;STBP=0.491;TYPE=snp;VARB=0.00943831;OID=.;OPOS=11242133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:47:47:38:38:0.447059:20:18:26:21:20:18:26:21
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chr19	11277232	.	G	A	556.99	PASS	AF=0.53271;AO=56;DP=106;FAO=57;FDP=107;FR=.;FRO=50;FSAF=38;FSAR=19;FSRF=31;FSRR=19;FWDB=-0.00333313;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.4218;QD=20.8219;RBI=0.0137844;REFB=-0.0112372;REVB=0.0133753;RO=50;SAF=38;SAR=18;SRF=31;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0561792;STB=0.524129;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0112905;OID=.;OPOS=11277232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:50:50:56:57:0.53271:18:38:31:19:19:38:31:19
chr19	11303943	.	A	G	263.73	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=40;FAO=24;FDP=40;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00298061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.0386;QD=26.3728;RBI=0.00645509;REFB=-0.00956627;REVB=-0.00572575;RO=16;SAF=18;SAR=6;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162976;STB=0.590828;STBP=0.192;TYPE=snp;VARB=0.00580303;OID=.;OPOS=11303943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:16:16:24:24:0.6:6:18:9:7:6:18:9:7
chr19	11319491	.	G	A	87.45	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=1;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0107642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.312;QD=13.4539;RBI=0.016903;REFB=-0.0110509;REVB=0.0130324;RO=15;SAF=1;SAR=10;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.634159;STB=0.879228;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0229037;OID=.;OPOS=11319491;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:10:1:10:5:10:1:10:5
chr19	11319636	.	G	A	551.75	PASS	AF=0.733333;AO=41;DP=60;FAO=44;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=11;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0153272;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.7002;QD=36.783;RBI=0.0862243;REFB=-0.00714111;REVB=0.0848511;RO=10;SAF=23;SAR=18;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0224881;STB=0.518264;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.00499683;OID=.;OPOS=11319636;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:60:60:10:11:41:44:0.733333:18:23:5:5:20:24:5:6
chr19	11326119	.	A	G	287.94	PASS	AF=0.5;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=62;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.0025063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.966;QD=18.5768;RBI=0.00820245;REFB=-0.0341098;REVB=0.00781017;RO=30;SAF=16;SAR=15;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.044706;STB=0.516152;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.0216082;OID=.;OPOS=11326119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:30:31:31:31:0.5:15:16:17:13:15:16:17:14
chr19	11326125	.	C	T	261.84	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00803946;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.226;QD=17.17;RBI=0.0247024;REFB=-0.018628;REVB=0.0233575;RO=32;SAF=16;SAR=13;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192832;STB=0.510825;STBP=0.876;TYPE=snp;VARB=0.0277893;OID=.;OPOS=11326125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:13:16:17:15:13:16:17:15
chr19	11327608	.	T	C	237.65	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0176672;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.674;QD=19.3998;RBI=0.075239;REFB=-0.0347911;REVB=-0.0731353;RO=24;SAF=17;SAR=6;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.312623;STB=0.679835;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0423998;OID=.;OPOS=11327608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:24:26:23:23:0.469388:6:17:10:14:6:17:11:15
chr19	11327626	.	A	G	316.74	PASS	AF=0.532258;AO=33;DP=62;FAO=33;FDP=62;FR=.;FRO=29;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.00345537;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=106.854;QD=20.4346;RBI=0.0295818;REFB=-0.00170932;REVB=-0.0293793;RO=28;SAF=24;SAR=9;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268091;STB=0.658127;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00334107;OID=.;OPOS=11327626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:28:29:33:33:0.532258:9:24:12:16:9:24:12:17
chr19	11358799	.	G	A	153.37	PASS	AF=0.56;AO=9;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.,HEALED;FRO=6;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0687917;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.3739;QD=24.5388;RBI=0.0703002;REFB=-0.118085;REVB=0.0144848;RO=6;SAF=5;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0787225;STB=0.517216;STBP=0.819;TYPE=snp;VARB=0.0264999;OID=.;OPOS=11358799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:25:25:6:6:9:14:0.56:4:5:4:2:4:10:4:2
chr19	11363146	.	A	T	637.18	PASS	AF=0.941176;AO=48;DP=52;FAO=48;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=40;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0300516;FXX=0.0192271;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.5206;QD=49.9752;RBI=0.035199;REFB=-0.00625255;REVB=-0.0183268;RO=1;SAF=8;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552153;STB=0.549429;STBP=0.056;TYPE=snp;VARB=-0.000222293;OID=.;OPOS=11363146;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:52:51:1:3:48:48:0.941176:40:8:1:0:40:8:2:1
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chr19	11459652	.	G	A	337.17	PASS	AF=0.611111;AO=33;DP=54;FAO=33;FDP=54;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=12;FSRR=9;FWDB=-0.00138602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=255.882;QD=24.9754;RBI=0.0178225;REFB=-0.00191875;REVB=0.0177685;RO=21;SAF=21;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0488853;STB=0.526865;STBP=0.618;TYPE=snp;VARB=0.00135341;OID=.;OPOS=11459652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:21:21:33:33:0.611111:12:21:12:9:12:21:12:9
chr19	11510624	.	C	CG	32.92	PASS	AF=0.234043;AO=16;DP=52;FAO=11;FDP=47;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0505241;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=17.8149;QD=2.80143;RBI=0.197879;REFB=-0.0309527;REVB=-0.19132;RO=36;SAF=13;SAR=3;SRF=19;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378021;STB=0.880286;STBP=0.01;TYPE=ins;VARB=0.155847;OID=.;OPOS=11510625;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.234043:16:52:11:47:36:10:1:17:19:32:36:13:3:19:17
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chr19	11526765	.	G	T	341.5	PASS	AF=0.392157;AO=39;DP=101;FAO=40;FDP=102;FR=.;FRO=62;FSAF=17;FSAR=23;FSRF=40;FSRR=22;FWDB=0.00524875;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=217.304;QD=13.3921;RBI=0.020978;REFB=-0.00322724;REVB=0.0203108;RO=62;SAF=17;SAR=22;SRF=40;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222876;STB=0.631439;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00519515;OID=.;OPOS=11526765;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:62:62:39:40:0.392157:22:17:40:22:23:17:40:22
chr19	11569316	.	G	A	186.93	PASS	AF=0.358209;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=17;FWDB=0.0361585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8875;QD=11.1597;RBI=0.0365598;REFB=-0.0241064;REVB=-0.0054024;RO=42;SAF=13;SAR=11;SRF=25;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596909;STB=0.54095;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0638587;OID=.;OPOS=11569316;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:42:43:24:24:0.358209:11:13:25:17:11:13:26:17
chr19	11598483	.	T	C	526.56	PASS	AF=0.569767;AO=47;DP=84;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=18;FSRR=19;FWDB=0.00110912;FXX=0.0227247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.597;QD=24.491;RBI=0.0106791;REFB=-0.0332516;REVB=0.0106213;RO=37;SAF=20;SAR=27;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0495657;STB=0.534418;STBP=0.495;TYPE=snp;VARB=0.0264718;OID=.;OPOS=11598483;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:86:37:37:47:49:0.569767:27:20:18:19:29:20:18:19
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chr19	11661119	.	A	G	185.48	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=22;FWDB=0.0110827;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.178;QD=13.7395;RBI=0.0188447;REFB=-0.00498312;REVB=0.0152413;RO=32;SAF=14;SAR=8;SRF=10;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.326285;STB=0.686112;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0115404;OID=.;OPOS=11661119;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:8:14:10:22:8:14:10:22
chr19	11664068	.	A	G	341.1	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226415;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.532;QD=54.5761;RBI=0.0777276;REFB=0;REVB=0.0743569;RO=0;SAF=20;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.83186e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000268578;OID=.;OPOS=11664068;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:4:20:0:0:5:20:0:0
chr19	11833719	.	G	A	136.16	PASS	AF=0.326923;AO=17;DP=51;FAO=17;FDP=52;FR=.;FRO=35;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=0.00617704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.042;QD=10.4738;RBI=0.00723763;REFB=-0.0150538;REVB=0.00377192;RO=32;SAF=9;SAR=8;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13609;STB=0.586417;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0291753;OID=.;OPOS=11833719;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:32:35:17:17:0.326923:8:9:13:19:8:9:14:21
chr19	11891003	.	G	A	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0195518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.152;QD=62.6708;RBI=0.0229124;REFB=0;REVB=0.0119459;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.08664e-05;OID=.;OPOS=11891003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0
chr19	11892728	.	C	A	496.26	PASS	AF=0.538462;AO=39;DP=91;FAO=49;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.0388395;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=29.4333;QD=21.8135;RBI=0.041509;REFB=-0.0289;REVB=0.0146455;RO=35;SAF=13;SAR=26;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.088365;STB=0.556498;STBP=0.29;TYPE=snp;VARB=0.0331359;OID=.;OPOS=11892728;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:35:41:39:49:0.538462:26:13:15:20:32:17:19:22
chr19	11892743	.	A	G	486.18	PASS	AF=0.516484;AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=15;FSAR=32;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0218466;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.7345;QD=21.3705;RBI=0.028447;REFB=0.0156993;REVB=0.0182198;RO=44;SAF=15;SAR=32;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108186;STB=0.559933;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=-0.0142097;OID=.;OPOS=11892743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:44:44:47:47:0.516484:32:15:19:25:32:15:19:25
chr19	11892935	.	G	C	121.5	PASS	AF=0.4375;AO=14;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=-0.0314769;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.518;QD=15.1878;RBI=0.0358177;REFB=-0.0113717;REVB=-0.0170914;RO=17;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0552695;STB=0.519203;STBP=0.864;TYPE=snp;VARB=0.00851509;OID=.;OPOS=11892935;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:17:18:14:14:0.4375:9:5:7:10:9:5:7:11
chr19	11943697	.	G	A	306.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00406959;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.109;QD=53.2811;RBI=0.0466017;REFB=0;REVB=0.0464236;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174326;OID=.;OPOS=11943697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:22:23:1:13:9:0:0:14:9:0:0
chr19	12186272	.	G	A	323.0	PASS	AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=23;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=-0.0031651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.317;QD=21.8982;RBI=0.013565;REFB=-0.0158179;REVB=0.0131906;RO=25;SAF=10;SAR=23;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.086013;STB=0.541151;STBP=0.521;TYPE=snp;VARB=0.0123978;OID=.;OPOS=12186272;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:25:26:33:33:0.559322:23:10:10:15:23:10:10:16
chr19	12222381	.	C	G	645.87	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00206172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.708;QD=61.5112;RBI=0.0401855;REFB=0;REVB=0.0401325;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.1955e-05;OID=.;OPOS=12222381;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:20:21:0:0:21:21:0:0
chr19	12222393	.	GTTTTT	AGTTTT,GTTTT,GTTTTC	33.26	PASS	AF=0,0.122449,0.0612245;AO=2,12,4;DP=49;FAO=0,6,3;FDP=49;FR=.;FRO=40;FSAF=0,1,1;FSAR=0,5,2;FSRF=21;FSRR=19;FWDB=-0.0968552,-0.113058,-0.0403758;FXX=0;HRUN=1,5,5;LEN=2,1,1;MLLD=28.2415,11.3461,27.1187;QD=2.71504;RBI=0.0989072,0.116395,0.093027;REFB=-0.0554868,-0.103413,-0.0559152;REVB=0.0200427,0.0276706,0.0838082;RO=28;SAF=2,5,2;SAR=0,7,2;SRF=14;SRR=14;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.46666,-0.096537,0;STB=0.5,0.819798,0.675759;STBP=1,0.123,0.542;TYPE=mnp,del,snp;VARB=0,0.163778,0.0375122;OID=.,.,.;OPOS=12222393,12222394,12222398;OREF=GT,T,T;OALT=AG,-,C;OMAPALT=AGTTTT,GTTTT,GTTTTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:19:49:49:28:40:2,12,4:0,6,3:0,0.122449,0.0612245:0,7,2:2,5,2:14:14:0,5,2:0,1,1:21:19
chr19	12222861	.	T	C	1235.36	PASS	AF=0.987805;AO=80;DP=82;FAO=81;FDP=82;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0269721;FXX=0.0120467;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.057;QD=60.2616;RBI=0.0272538;REFB=0.0128586;REVB=0.00390854;RO=1;SAF=47;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141304;STB=0.507461;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=3.49305e-06;OID=.;OPOS=12222861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:82:82:1:1:80:81:0.987805:33:47:0:1:33:48:0:1
chr19	12253327	.	C	T	2141.5	PASS	AF=0.972028;AO=139;DP=143;FAO=139;FDP=143;FR=.;FRO=4;FSAF=63;FSAR=76;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0385257;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9655;QD=59.9022;RBI=0.0775709;REFB=-0.127579;REVB=-0.0673276;RO=4;SAF=63;SAR=76;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00250658;STB=0.501319;STBP=0.908;TYPE=snp;VARB=0.00315228;OID=.;OPOS=12253327;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:143:143:4:4:139:139:0.972028:76:63:2:2:76:63:2:2
chr19	12256912	.	C	T	528.08	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0476867;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5761;QD=58.6754;RBI=0.0572743;REFB=0;REVB=-0.0317227;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304924;OID=.;OPOS=12256912;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:15:20:0:0:15:21:0:0
chr19	12383540	.	G	C	868.25	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00588795;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.422;QD=57.8835;RBI=0.0085294;REFB=0;REVB=0.00617112;RO=0;SAF=33;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.7886e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26245e-05;OID=.;OPOS=12383540;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:27:33:0:0:27:33:0:0
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chr19	12920935	.	G	A	377.28	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=81;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=17;FSRR=25;FWDB=-9.82033e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.613;QD=18.6313;RBI=0.0318234;REFB=-0.00590166;REVB=0.0318233;RO=40;SAF=22;SAR=17;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126403;STB=0.582189;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.00393606;OID=.;OPOS=12920935;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:81:40:42:39:39:0.481481:17:22:17:23:17:22:17:25
chr19	12921186	.	T	C	36.61	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0845258;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7295;QD=7.32284;RBI=0.0858484;REFB=0.0302886;REVB=0.0150116;RO=14;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11111;STB=0.571184;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=-0.0573437;OID=.;OPOS=12921186;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:4:2:6:8:4:2:6:8
chr19	12924157	.	C	T	247.08	PASS	AF=0.575;AO=23;DP=40;FAO=23;FDP=40;FR=.;FRO=17;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0207182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=285.115;QD=24.7076;RBI=0.0237943;REFB=0.00135243;REVB=-0.0117016;RO=17;SAF=18;SAR=5;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0812719;STB=0.545413;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=-0.000819161;OID=.;OPOS=12924157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:17:17:23:23:0.575:5:18:12:5:5:18:12:5
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chr19	13031210	.	T	C	57.03	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0700842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.251;QD=28.5164;RBI=0.0717334;REFB=0.00180224;REVB=0.0152932;RO=1;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173072;STB=0.599698;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.00299415;OID=.;OPOS=13031210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:5:2:1:0:5:2:1:0
chr19	13035006	.	G	A	219.72	PASS	AF=0.311111;AO=28;DP=90;FAO=28;FDP=90;FR=.;FRO=62;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=32;FSRR=30;FWDB=0.00465947;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.072;QD=9.76528;RBI=0.0225793;REFB=-0.0104479;REVB=-0.0220933;RO=62;SAF=15;SAR=13;SRF=32;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0230335;STB=0.513525;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0199382;OID=.;OPOS=13035006;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:62:62:28:28:0.311111:13:15:32:30:13:15:32:30
chr19	13041102	.	TC	TCC,T	36.76	PASS	AF=0.0588235,0.588235;AO=2,8;DP=17;FAO=1,10;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=0,2;FSAR=1,8;FSRF=0;FSRR=6;FWDB=-0.0699034,0.0695507;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=8.25663,8.55172;QD=8.64971;RBI=0.258765,0.253064;REFB=-0.0153697,0.0123658;REVB=-0.249144,0.243319;RO=6;SAF=0,2;SAR=2,6;SRF=0;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.294909;STB=0.5,0.636145;STBP=1,0.318;TYPE=ins,del;VARB=0.11061,0.133087;OID=.,.;OPOS=13041103,13041103;OREF=-,C;OALT=C,-;OMAPALT=TCC,T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0588235,0.588235:2,8:17:1,10:17:6:0,2:1,8:0:6:16:6:0,2:2,6:0:6
chr19	13215808	.	C	CG	48.93	PASS	AF=0.230769;AO=8;DP=40;FAO=9;FDP=39;FR=.;FRO=30;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=24;FWDB=0.128455;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=102.779;QD=5.01867;RBI=0.12905;REFB=-0.000201341;REVB=-0.0123808;RO=31;SAF=7;SAR=1;SRF=7;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.68513;STB=0.874375;STBP=0.035;TYPE=ins;VARB=0.031959;OID=.;OPOS=13215809;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.230769:8:40:9:39:30:7:2:6:24:48:31:7:1:7:24
chr19	13246731	.	C	T	66.27	PASS	AF=0.5625;AO=7;DP=15;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.121015;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=39.9093;QD=16.5676;RBI=0.126941;REFB=-0.0797067;REVB=0.0383316;RO=6;SAF=7;SAR=0;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.758609;STB=0.726651;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0709385;OID=.;OPOS=13246731;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:16:6:7:7:9:0.5625:0:7:4:2:1:8:4:3
chr19	13317561	.	T	G	242.6	PASS	AF=0.511111;AO=23;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=3;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=0.0150961;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9308;QD=21.5643;RBI=0.0160609;REFB=-0.033766;REVB=0.00548268;RO=22;SAF=20;SAR=3;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319606;STB=0.68304;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0244377;OID=.;OPOS=13317561;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:22:22:23:23:0.511111:3:20:14:8:3:20:14:8
chr19	13319693	.	A	G	101.22	PASS	AF=1;AO=7;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269236;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8162;QD=40.4865;RBI=0.0269236;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0188671;OID=.;OPOS=13319693;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:7:10:1:0:7:0:0:0:10:0:0
chr19	13368350	.	C	T	246.67	PASS	AF=0.84;AO=21;DP=25;FAO=21;FDP=25;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0292494;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.843;QD=39.4676;RBI=0.0301614;REFB=0.0747262;REVB=0.00736117;RO=4;SAF=9;SAR=12;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.166784;STB=0.590823;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=-0.00355468;OID=.;OPOS=13368350;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:25:25:4:4:21:21:0.84:12:9:4:0:12:9:4:0
chr19	13414594	.	C	T	200.86	PASS	AF=0.512821;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=0.0561432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.4557;QD=20.6013;RBI=0.0579403;REFB=-0.00841464;REVB=-0.0143183;RO=18;SAF=15;SAR=5;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0317902;STB=0.52629;STBP=0.813;TYPE=snp;VARB=0.00651251;OID=.;OPOS=13414594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:19:20:20:0.512821:5:15:14:4:5:15:15:4
chr19	13445208	.	C	T	211.89	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=-0.00401666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.07;QD=16.6185;RBI=0.0357219;REFB=-0.0226985;REVB=-0.0354953;RO=28;SAF=16;SAR=7;SRF=11;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.298993;STB=0.670006;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0178203;OID=.;OPOS=13445208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:7:16:11:17:7:16:11:17
chr19	13868669	.	G	A	99.96	PASS	AF=0.461538;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0195431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.555;QD=15.379;RBI=0.0284065;REFB=1.1645e-05;REVB=0.0206154;RO=14;SAF=4;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162033;STB=0.594432;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=-1.84368e-05;OID=.;OPOS=13868669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:14:14:12:12:0.461538:8:4:7:7:8:4:7:7
chr19	13873863	.	C	A	152.69	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0174927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=90.7862;QD=21.0604;RBI=0.0346158;REFB=-0.0530377;REVB=0.0298706;RO=13;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.042887;STB=0.524199;STBP=0.804;TYPE=snp;VARB=0.0419009;OID=.;OPOS=13873863;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:7:9:8:5:7:9:8:5
chr19	13885309	.	C	T	197.28	PASS	AF=0.730769;AO=18;DP=25;FAO=19;FDP=26;FR=.;FRO=7;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.0229674;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.902;QD=30.3501;RBI=0.0260256;REFB=-0.0513809;REVB=-0.0122405;RO=7;SAF=13;SAR=5;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0905855;STB=0.554396;STBP=0.381;TYPE=snp;VARB=0.0157914;OID=.;OPOS=13885309;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:25:26:7:7:18:19:0.730769:5:13:4:3:5:14:4:3
chr19	13885484	.	A	G	225.99	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.0512245;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5239;QD=20.5443;RBI=0.0563131;REFB=0.0207031;REVB=0.0233928;RO=22;SAF=9;SAR=13;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200242;STB=0.612603;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=-0.0141474;OID=.;OPOS=13885484;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:13:9:14:8:13:9:14:8
chr19	13900059	.	A	G	188.7	PASS	AF=0.415094;AO=22;DP=53;FAO=22;FDP=53;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=18;FSRR=13;FWDB=-0.00501382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.305;QD=14.2416;RBI=0.00544195;REFB=-0.0115819;REVB=-0.00211575;RO=31;SAF=12;SAR=10;SRF=18;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0363894;STB=0.520814;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.0150077;OID=.;OPOS=13900059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:31:31:22:22:0.415094:10:12:18:13:10:12:18:13
chr19	13900981	.	G	A	426.47	PASS	AF=0.451923;AO=46;DP=104;FAO=47;FDP=104;FR=.;FRO=57;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=36;FSRR=21;FWDB=-0.0281193;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0638;QD=16.4026;RBI=0.0337573;REFB=0.0210426;REVB=-0.0186778;RO=57;SAF=20;SAR=26;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.192769;STB=0.600201;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=-0.0334461;OID=.;OPOS=13900981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:57:57:46:47:0.451923:26:20:36:21:26:21:36:21
chr19	13942221	.	A	G	78.51	PASS	AF=0.4;AO=10;DP=25;FAO=10;FDP=25;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=0.0438204;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8681;QD=12.5617;RBI=0.0718484;REFB=0.0163981;REVB=0.0569383;RO=14;SAF=8;SAR=2;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.276263;STB=0.691881;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=-0.0124257;OID=.;OPOS=13942221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:25:25:14:15:10:10:0.4:2:8:8:6:2:8:8:7
chr19	13947292	.	T	C	248.61	PASS	AF=0.589744;AO=23;DP=39;FAO=23;FDP=39;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0386405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.652;QD=25.4983;RBI=0.0401332;REFB=-0.000991739;REVB=0.0108437;RO=16;SAF=9;SAR=14;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217594;STB=0.620738;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.000286071;OID=.;OPOS=13947292;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:16:16:23:23:0.589744:14:9:11:5:14:9:11:5
chr19	13988416	.	A	G	592.86	PASS	AF=0.5625;AO=54;DP=96;FAO=54;FDP=96;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=-0.0125495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.9688;QD=24.7025;RBI=0.0594165;REFB=-0.0708509;REVB=-0.0580761;RO=42;SAF=28;SAR=26;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0337982;STB=0.518512;STBP=0.71;TYPE=snp;VARB=0.0564291;OID=.;OPOS=13988416;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:42:42:54:54:0.5625:26:28:20:22:26:28:20:22
chr19	14000170	.	T	C	458.46	PASS	AF=0.542169;AO=35;DP=83;FAO=45;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=38;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=15;FWDB=-0.00329372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.1633;QD=22.0944;RBI=0.0263492;REFB=-0.00786248;REVB=0.0261425;RO=37;SAF=23;SAR=12;SRF=23;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0357835;STB=0.508221;STBP=0.892;TYPE=snp;VARB=0.0127799;OID=.;OPOS=14000170;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:37:38:35:45:0.542169:12:23:23:14:17:28:23:15
chr19	14000400	.	A	G	195.17	PASS	AF=0.418182;AO=22;DP=54;FAO=23;FDP=55;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.0222318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.861;QD=14.1943;RBI=0.0358826;REFB=-0.00283698;REVB=-0.0281657;RO=31;SAF=17;SAR=5;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267854;STB=0.672733;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=0.00524472;OID=.;OPOS=14000400;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:55:31:32:22:23:0.418182:5:17:17:14:5:18:17:15
chr19	14000870	.	C	T	315.54	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=72;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.005189;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.662;QD=17.53;RBI=0.0164325;REFB=-0.0172593;REVB=-0.0155918;RO=36;SAF=21;SAR=13;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18616;STB=0.617578;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.0288155;OID=.;OPOS=14000870;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:36:38:34:34:0.472222:13:21:15:21:13:21:15:23
chr19	14015711	.	C	A	147.27	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.101837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0097;QD=17.3254;RBI=0.101842;REFB=-0.00415459;REVB=0.000967312;RO=18;SAF=8;SAR=8;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0049388;OID=.;OPOS=14015711;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:8:8:9:9:8:8:9:9
chr19	14030689	.	T	C	273.47	PASS	AF=0.568182;AO=24;DP=45;FAO=25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=0.00622286;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.2249;QD=24.8607;RBI=0.0747158;REFB=-0.0428339;REVB=0.0744562;RO=18;SAF=16;SAR=8;SRF=15;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.153891;STB=0.599927;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.0479728;OID=.;OPOS=14030689;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:18:19:24:25:0.568182:8:16:15:3:9:16:16:3
chr19	14072639	.	GA	G	30.05	PASS	AF=0.37931;AO=10;DP=27;FAO=11;FDP=29;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.168961;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.71448;QD=4.14514;RBI=0.182666;REFB=-0.104937;REVB=-0.0694195;RO=15;SAF=6;SAR=4;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0714454;STB=0.541327;STBP=0.758;TYPE=del;VARB=0.141851;OID=.;OPOS=14072640;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.37931:10:27:11:29:18:6:5:11:7:30:15:6:4:10:5
chr19	14073254	.	GCC	GC,G	190.23	PASS	AF=0.909091,0;AO=12,4;DP=38;FAO=30,0;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=26,0;FSAR=4,0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.231456,-0.114213;FXX=0.153807;HRUN=4,4;LEN=1,2;MLLD=10.5002,11.3702;QD=23.0586;RBI=0.277691,0.147548;REFB=0.0848392,0.0589342;REVB=0.153428,0.0934127;RO=3;SAF=12,4;SAR=0,0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0.333333,0.333333;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.527255,0.5;STBP=0.619,1;TYPE=del,del;VARB=-0.0122409,0;OID=.,.;OPOS=14073255,14073255;OREF=C,CC;OALT=-,-;OMAPALT=GC,G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.909091,0:12,4:38:30,0:33:3:26,0:4,0:3:0:6:3:12,4:0,0:3:0
chr19	14083761	.	T	C	389.95	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0747995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.3035;QD=55.7064;RBI=0.0882971;REFB=0;REVB=0.0469193;RO=0;SAF=16;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000462319;OID=.;OPOS=14083761;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:12:16:0:0:12:16:0:0
chr19	14142705	.	C	T	72.9	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=-0.0291088;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=259.974;QD=19.4392;RBI=0.0358052;REFB=-0.0605232;REVB=-0.0208492;RO=2;SAF=6;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12621;STB=0.646763;STBP=0.307;TYPE=snp;VARB=0.0512125;OID=.;OPOS=14142705;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:15:15:2:5:8:8:0.533333:2:6:2:0:2:6:5:0
chr19	14153293	.	T	C	115.34	PASS	AF=0.424242;AO=12;DP=31;FAO=14;FDP=33;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=0.0143692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.756;QD=13.9804;RBI=0.0143805;REFB=-0.0166192;REVB=-0.000569454;RO=18;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.113436;STB=0.586084;STBP=0.409;TYPE=snp;VARB=0.0189542;OID=.;OPOS=14153293;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:33:18:19:12:14:0.424242:6:6:7:11:6:8:8:11
chr19	14512489	.	G	A	493.6	PASS	AF=0.925;AO=31;DP=40;FAO=37;FDP=40;FR=.;FRO=3;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00116436;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=83.535;QD=49.3604;RBI=0.0049227;REFB=-0.122871;REVB=0.00478302;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513506;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.00708615;OID=.;OPOS=14512489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:40:40:0:3:31:37:0.925:14:17:0:0:18:19:1:2
chr19	14582468	.	G	A	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410817;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.719;QD=51.9166;RBI=0.0742426;REFB=0;REVB=0.0618406;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000592664;OID=.;OPOS=14582468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr19	14590236	.	C	T	1008.26	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00754474;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.154;QD=59.3093;RBI=0.0597485;REFB=0;REVB=0.0592703;RO=0;SAF=27;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000198777;OID=.;OPOS=14590236;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:41:27:0:0:41:27:0:0
chr19	14752325	.	C	T	1678.89	PASS	AF=1;AO=111;DP=115;FAO=113;FDP=113;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115267;FXX=0.0173898;HRUN=2;LEN=1;MLLD=247.066;QD=59.4297;RBI=0.0283644;REFB=-0.147605;REVB=0.0259166;RO=0;SAF=67;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000346703;OID=.;OPOS=14752325;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:115:113:0:0:111:113:1:44:67:0:0:45:68:0:0
chr19	14769339	.	C	G	960.86	PASS	AF=0.411985;AO=105;DP=264;FAO=110;FDP=267;FR=.;FRO=157;FSAF=75;FSAR=35;FSRF=120;FSRR=37;FWDB=0.0376904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7867;QD=14.3949;RBI=0.0481205;REFB=-0.0132791;REVB=0.0299168;RO=156;SAF=73;SAR=32;SRF=120;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976189;STB=0.558272;STBP=0.151;TYPE=snp;VARB=0.0172213;OID=.;OPOS=14769339;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:264:267:156:157:105:110:0.411985:32:73:120:36:35:75:120:37
chr19	14817548	.	T	A	200.62	PASS	AF=0.433962;AO=23;DP=53;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0441981;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.9188;QD=15.1414;RBI=0.0456285;REFB=-0.0221816;REVB=-0.0113353;RO=30;SAF=11;SAR=12;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0216143;STB=0.512305;STBP=0.861;TYPE=snp;VARB=0.0429989;OID=.;OPOS=14817548;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:30:30:23:23:0.433962:12:11:15:15:12:11:15:15
chr19	14829749	.	C	T	479.3	PASS	AF=0.541176;AO=46;DP=85;FAO=46;FDP=85;FR=.;FRO=39;FSAF=30;FSAR=16;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.0253168;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.483;QD=22.5552;RBI=0.0314245;REFB=-0.0263344;REVB=-0.0186161;RO=39;SAF=30;SAR=16;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333661;STB=0.518387;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0249682;OID=.;OPOS=14829749;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:39:39:46:46:0.541176:16:30:24:15:16:30:24:15
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chr19	14875388	.	G	A	149.82	PASS	AF=0.5;AO=16;DP=33;FAO=16;FDP=32;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0147136;FXX=0.0302939;HRUN=4;LEN=1;MLLD=184.382;QD=18.727;RBI=0.0182095;REFB=-0.00324254;REVB=0.0107282;RO=15;SAF=8;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283782;STB=0.531211;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.00325739;OID=.;OPOS=14875388;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:32:15:16:16:16:0.5:8:8:7:8:8:8:7:9
chr19	14910437	.	TC	T,TT	503.13	PASS	AF=0.0540541,0.918919;AO=6,29;DP=37;FAO=2,34;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=0,8;FSAR=2,26;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0113369,0.043104;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=172.653,185.379;QD=54.3928;RBI=0.0125986,0.0433793;REFB=-0.049274,-0.0394757;REVB=0.00549551,0.00487879;RO=1;SAF=3,5;SAR=3,24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.123249,0.0190217;STB=0.5,0.509428;STBP=1,0.638;TYPE=del,snp;VARB=0.0282071,0.00165254;OID=.,.;OPOS=14910438,14910438;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0540541,0.918919:6,29:37:2,34:37:1:0,8:2,26:0:1:8:1:3,5:3,24:0:1
chr19	14910573	.	C	T	397.82	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.033524;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.463;QD=54.8721;RBI=0.0359667;REFB=0;REVB=0.0130285;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000366989;OID=.;OPOS=14910573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:27:29:1:17:10:0:0:19:10:0:0
chr19	14938616	.	T	C	228.89	PASS	AF=0.45614;AO=26;DP=57;FAO=26;FDP=57;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=16;FWDB=-0.0245522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.802;QD=16.0626;RBI=0.0342422;REFB=-0.00217168;REVB=-0.0238687;RO=30;SAF=15;SAR=11;SRF=15;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0737818;STB=0.550981;STBP=0.484;TYPE=snp;VARB=0.00158573;OID=.;OPOS=14938616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:31:26:26:0.45614:11:15:15:15:11:15:15:16
chr19	14974930	.	G	A	868.23	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.895;QD=57.8822;RBI=0.0278545;REFB=0;REVB=0.0126526;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.029e-05;OID=.;OPOS=14974930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:28:32:0:0:28:32:0:0
chr19	14975040	.	G	A	138.97	PASS	AF=0.347826;AO=16;DP=46;FAO=16;FDP=46;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=23;FWDB=-0.0160104;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.972;QD=12.0842;RBI=0.0171085;REFB=-0.00225473;REVB=-0.00603076;RO=29;SAF=13;SAR=3;SRF=6;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.614409;STB=0.848849;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00885399;OID=.;OPOS=14975040;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:30:16:16:0.347826:3:13:6:23:3:13:7:23
chr19	14975368	.	A	G	74.97	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0225616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.9126;QD=37.4835;RBI=0.0225616;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=7;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00150717;OID=.;OPOS=14975368;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:0:7:0:0:0:8:0:0
chr19	14991643	.	G	A	226.01	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.00251102;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=264.539;QD=20.5465;RBI=0.0132862;REFB=-0.00506536;REVB=-0.0130468;RO=22;SAF=14;SAR=8;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0899181;STB=0.550415;STBP=0.561;TYPE=snp;VARB=0.00523875;OID=.;OPOS=14991643;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:8:14:16:6:8:14:16:6
chr19	15052983	.	T	TATC	504.19	PASS	AF=0.9;AO=35;DP=41;FAO=36;FDP=40;FR=.;FRO=4;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.027653;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=306.712;QD=50.4188;RBI=0.0283455;REFB=-0.0263701;REVB=0.0062274;RO=5;SAF=12;SAR=23;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.1133;STB=0.545429;STBP=0.112;TYPE=ins;VARB=0.00255987;OID=.;OPOS=15052984;OREF=-;OALT=ATC;OMAPALT=TATC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.9:35:41:36:40:4:12:24:3:1:19:5:12:23:4:1
chr19	15063757	.	A	G	752.12	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.064809;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.2651;QD=56.7636;RBI=0.0718139;REFB=0;REVB=0.0309359;RO=0;SAF=25;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000266912;OID=.;OPOS=15063757;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:27:25:0:0:27:26:0:0
chr19	15083693	.	C	A	537.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0587052;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.746;QD=59.7486;RBI=0.102926;REFB=0;REVB=0.0845431;RO=0;SAF=22;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.65945e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00247906;OID=.;OPOS=15083693;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:25:36:1:3:22:0:0:11:25:0:0
chr19	15131330	.	G	A	234.71	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=39;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0101855;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6856;QD=24.7059;RBI=0.0102119;REFB=-0.00135862;REVB=0.000733847;RO=16;SAF=7;SAR=15;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12008;STB=0.566417;STBP=0.4;TYPE=snp;VARB=0.000478675;OID=.;OPOS=15131330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:16:16:22:22:0.578947:15:7:3:13:15:7:3:13
chr19	15133762	.	G	C	1245.94	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00308481;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9523;QD=61.5279;RBI=0.00471443;REFB=0;REVB=0.00356508;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.03608e-06;OID=.;OPOS=15133762;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:36:45:0:0:36:45:0:0
chr19	15133787	.	C	A	84.72	PASS	AF=0.205882;AO=14;DP=68;FAO=14;FDP=68;FR=.;FRO=54;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=34;FSRR=20;FWDB=0.0039479;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.879;QD=4.98333;RBI=0.00646461;REFB=-0.00568399;REVB=-0.0051191;RO=53;SAF=6;SAR=8;SRF=34;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260673;STB=0.655527;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0221025;OID=.;OPOS=15133787;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:68:68:53:54:14:14:0.205882:8:6:34:19:8:6:34:20
chr19	15198263	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.034692;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.868;QD=49.599;RBI=0.0462345;REFB=0;REVB=-0.030563;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00116614;OID=.;OPOS=15198263;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0
chr19	15198292	.	C	G	49.57	PASS	AF=0.538462;AO=6;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.054962;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=131.809;QD=15.2515;RBI=0.0563898;REFB=-0.0408578;REVB=0.0126091;RO=4;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119263;STB=0.609426;STBP=0.546;TYPE=snp;VARB=0.0218405;OID=.;OPOS=15198292;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:4:6:6:7:0.538462:2:4:2:2:2:5:3:3
chr19	15198507	.	T	C	236.6	PASS	AF=0.611111;AO=22;DP=36;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0353972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.7192;QD=26.2886;RBI=0.0549973;REFB=-0.0476434;REVB=-0.042092;RO=14;SAF=13;SAR=9;SRF=9;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0379631;STB=0.521034;STBP=0.801;TYPE=snp;VARB=0.0429799;OID=.;OPOS=15198507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:14:14:22:22:0.611111:9:13:9:5:9:13:9:5
chr19	15198631	.	A	C	441.09	PASS	AF=0.544304;AO=41;DP=79;FAO=43;FDP=79;FR=.;FRO=36;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=0.0106373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=309.208;QD=22.3338;RBI=0.0148374;REFB=-0.00622479;REVB=-0.0103439;RO=35;SAF=24;SAR=17;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0126092;STB=0.511664;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.00442135;OID=.;OPOS=15198631;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:35:36:41:43:0.544304:17:24:21:14:19:24:21:15
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chr19	15225348	.	T	C	42.75	PASS	AF=0.212121;AO=7;DP=33;FAO=7;FDP=33;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.095981;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=43.1905;QD=5.18234;RBI=0.095981;REFB=0.00794217;REVB=3.86168e-05;RO=26;SAF=4;SAR=3;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130174;STB=0.585962;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=-0.0395751;OID=.;OPOS=15225348;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:33:33:26:26:7:7:0.212121:3:4:12:14:3:4:12:14
chr19	15226970	.	G	A	187.75	PASS	AF=0.513514;AO=19;DP=37;FAO=19;FDP=37;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.001241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.833;QD=20.2969;RBI=0.0326934;REFB=-0.0316642;REVB=0.0326698;RO=17;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0957355;STB=0.566503;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.049203;OID=.;OPOS=15226970;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:17:18:19:19:0.513514:10:9:10:7:10:9:11:7
chr19	15233581	.	C	A	96.74	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.00845141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.766;QD=12.4824;RBI=0.0190969;REFB=-0.0346983;REVB=-0.017125;RO=19;SAF=6;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272843;STB=0.516102;STBP=0.944;TYPE=snp;VARB=0.0478286;OID=.;OPOS=15233581;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:31:31:19:19:12:12:0.387097:6:6:10:9:6:6:10:9
chr19	15270805	.	C	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.064407;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.6232;QD=39.2046;RBI=0.064407;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00316125;OID=.;OPOS=15270805;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:0:9:0:0:0:9:0:0
chr19	15271771	.	G	A	92.45	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0118817;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.136;QD=41.0891;RBI=0.0118817;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.93221e-05;OID=.;OPOS=15271771;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:0:9:0:0:0:9:0:0
chr19	15278057	.	A	G	1080.55	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0036246;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.96;QD=60.0303;RBI=0.00394256;REFB=0;REVB=0.00155114;RO=0;SAF=40;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.1568e-06;OID=.;OPOS=15278057;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:72:0:0:72:72:1:32:40:0:0:32:40:0:0
chr19	15285052	.	T	C,G	582.37	PASS	AF=0.948718,0.0512821;AO=37,2;DP=39;FAO=37,2;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=20,1;FSAR=17,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00412933,0.00267962;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=225.885,174.959;QD=59.7298;RBI=0.00550504,0.0231495;REFB=0,0;REVB=0.00364061,0.0229939;RO=0;SAF=20,1;SAR=17,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.71161e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0020547,0.0522993;OID=.,.;OPOS=15285052,15285052;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:39:39:0:0:37,2:37,2:0.948718,0.0512821:17,1:20,1:0:0:17,1:20,1:0:0
chr19	15292437	.	T	C	1575.39	PASS	AF=1;AO=85;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=65;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0879497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7471;QD=63.0154;RBI=0.0891683;REFB=-0.0860281;REVB=0.0146916;RO=1;SAF=50;SAR=35;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00938119;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102319;OID=.;OPOS=15292437;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:100:100:1:0:85:100:1:35:50:1:0:35:65:0:0
chr19	15295134	.	G	A	990.52	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.062561;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.7499;QD=59.1357;RBI=0.0695111;REFB=0;REVB=0.0302971;RO=0;SAF=31;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000607652;OID=.;OPOS=15295134;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:36:31:0:0:36:31:0:0
chr19	15298135	.	G	GA	57.37	PASS	AF=0.238095;AO=6;DP=55;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0854381;FXX=0.207508;HRUN=0;LEN=1;MLLD=22.0888;QD=5.46378;RBI=0.0947662;REFB=-0.00121319;REVB=0.0409997;RO=49;SAF=0;SAR=6;SRF=26;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.632909;STB=0.65809;STBP=0.284;TYPE=ins;VARB=0.0209675;OID=.;OPOS=15298136;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.238095:6:55:10:42:32:3:7:16:16:57:49:0:6:26:23
chr19	15298136	.	C	A	106.92	PASS	AF=0.272727;AO=15;DP=56;FAO=15;FDP=55;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.0532325;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.884;QD=7.77602;RBI=0.0541571;REFB=-0.0137814;REVB=0.00996417;RO=40;SAF=8;SAR=7;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158328;STB=0.596029;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0275686;OID=.;OPOS=15298136;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:40:40:15:15:0.272727:7:8:16:24:7:8:16:24
chr19	15302844	.	T	C	397.42	PASS	AF=1;AO=25;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.049778;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8018;QD=56.7742;RBI=0.0564029;REFB=0;REVB=-0.0265224;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000260177;OID=.;OPOS=15302844;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:25:28:1:10:15:0:0:11:17:0:0
chr19	15508362	.	G	C	1694.34	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00261637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.869;QD=60.5123;RBI=0.00411287;REFB=0;REVB=-0.00317337;RO=0;SAF=48;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.09948e-06;OID=.;OPOS=15508362;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:64:48:0:0:64:48:0:0
chr19	15533821	.	A	G	449.9	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0498965;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.81;QD=54.5338;RBI=0.0563781;REFB=-0.0479162;REVB=0.0262456;RO=1;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239419;STB=0.512812;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.00122606;OID=.;OPOS=15533821;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:19:13:0:1:19:13:0:1
chr19	15540461	.	GC	CG,GCG	35.64	PASS	AF=0,0.186047;AO=4,14;DP=88;FAO=0,16;FDP=86;FR=.;FRO=70;FSAF=0,5;FSAR=0,11;FSRF=28;FSRR=42;FWDB=-0.0059463,-0.0942298;FXX=0;HRUN=5,0;LEN=2,1;MLLD=53.1494,51.5781;QD=1.65768;RBI=0.0444041,0.10383;REFB=-0.0074003,-0.00551925;REVB=-0.0440042,-0.043605;RO=63;SAF=0,2;SAR=4,12;SRF=27;SRR=36;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.465272,-0.420184;STB=0.5,0.577924;STBP=1,0.544;TYPE=mnp,ins;VARB=0,0.127061;OID=.,.;OPOS=15540461,15540463;OREF=GC,-;OALT=CG,G;OMAPALT=CG,GCG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:35:88:86:63:70:4,14:0,16:0,0.186047:4,12:0,2:27:36:0,11:0,5:28:42
chr19	15549939	.	C	T	400.2	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0785898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.818;QD=53.3599;RBI=0.175566;REFB=-0.0881251;REVB=0.156994;RO=1;SAF=18;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0251798;STB=0.513504;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0163684;OID=.;OPOS=15549939;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:11:18:1:0:11:18:1:0
chr19	15569378	.	G	C	250.55	PASS	AF=0.467742;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=62;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0201189;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.536;QD=16.1648;RBI=0.0340652;REFB=-0.0396526;REVB=-0.0274895;RO=33;SAF=16;SAR=13;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348332;STB=0.519583;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0527792;OID=.;OPOS=15569378;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:33:29:29:0.467742:13:16:17:16:13:16:17:16
chr19	15580694	.	G	A	228.21	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=45;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=0.00582985;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.406;QD=20.7463;RBI=0.014882;REFB=-0.0461118;REVB=0.0136926;RO=22;SAF=12;SAR=10;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0806656;STB=0.545413;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0228085;OID=.;OPOS=15580694;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:44:22:22:22:22:0.5:10:12:10:12:10:12:10:12
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chr19	15587103	.	C	T	311.86	PASS	AF=0.472222;AO=34;DP=73;FAO=34;FDP=72;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=10;FWDB=-0.0720654;FXX=0.0136968;HRUN=4;LEN=1;MLLD=64.0869;QD=17.3258;RBI=0.0723295;REFB=-0.0115724;REVB=0.00617609;RO=38;SAF=14;SAR=20;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.29941;STB=0.666574;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0172389;OID=.;OPOS=15587103;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:38:38:34:34:0.472222:20:14:28:10:20:14:28:10
chr19	15726487	.	G	T	341.01	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0832287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.372;QD=54.5622;RBI=0.123713;REFB=0;REVB=0.0915307;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000813946;OID=.;OPOS=15726487;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:8:16:0:0:8:17:0:0
chr19	15726560	.	G	T	67.38	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=-0.0144355;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.633;QD=11.718;RBI=0.0352339;REFB=-0.0156442;REVB=0.032141;RO=14;SAF=6;SAR=3;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145537;STB=0.586031;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0260507;OID=.;OPOS=15726560;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:23:23:14:14:9:9:0.391304:3:6:11:3:3:6:11:3
chr19	15730498	.	G	GC	1396.32	PASS	AF=1;AO=86;DP=95;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352535;FXX=0.0219756;HRUN=0;LEN=1;MLLD=58.0735;QD=62.756;RBI=0.0742211;REFB=0;REVB=-0.0653143;RO=5;SAF=44;SAR=42;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0300068;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.000355775;OID=.;OPOS=15730499;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:86:95:89:89:0:47:42:0:0:7:5:44:42:4:1
chr19	15739597	.	A	C	91.79	PASS	AF=0.285714;AO=12;DP=42;FAO=12;FDP=42;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.00378225;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.336;QD=8.74207;RBI=0.00378494;REFB=-0.00921899;REVB=-0.000142793;RO=28;SAF=8;SAR=4;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116751;STB=0.57614;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0224252;OID=.;OPOS=15739597;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:91:42:42:28:30:12:12:0.285714:4:8:16:12:4:8:17:13
chr19	15757927	.	T	C	385.29	PASS	AF=0.575758;AO=38;DP=66;FAO=38;FDP=66;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00913411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.104;QD=23.3507;RBI=0.0096993;REFB=-0.00770066;REVB=0.0032626;RO=28;SAF=15;SAR=23;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832282;STB=0.545802;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.00579791;OID=.;OPOS=15757927;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:28:28:38:38:0.575758:23:15:14:14:23:15:14:14
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chr19	15763721	.	G	A	217.21	PASS	AF=0.350649;AO=27;DP=77;FAO=27;FDP=77;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=27;FSRR=23;FWDB=0.00536399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.448;QD=11.2835;RBI=0.00799225;REFB=-0.0172;REVB=-0.00592483;RO=50;SAF=10;SAR=17;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.191699;STB=0.61119;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0403834;OID=.;OPOS=15763721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:50:50:27:27:0.350649:17:10:27:23:17:10:27:23
chr19	15769379	.	G	C	86.72	PASS	AF=0.297297;AO=8;DP=38;FAO=11;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=16;FWDB=-0.00432441;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.804;QD=9.37506;RBI=0.00475337;REFB=-0.00806918;REVB=0.00197331;RO=22;SAF=3;SAR=5;SRF=6;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.133332;STB=0.522687;STBP=0.867;TYPE=snp;VARB=0.0232242;OID=.;OPOS=15769379;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:38:37:22:24:8:11:0.297297:5:3:6:16:7:4:8:16
chr19	15769529	.	GC	TT	136.22	PASS	AF=0.483871;AO=14;DP=30;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0328048;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=242.336;QD=17.5771;RBI=0.0332948;REFB=-0.0225415;REVB=0.00569122;RO=16;SAF=8;SAR=6;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.123893;STB=0.549291;STBP=0.606;TYPE=mnp;VARB=0.0258537;OID=.;OPOS=15769529;OREF=GC;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:31:16:16:14:15:0.483871:6:8:7:9:7:8:7:9
chr19	15769625	.	A	G	271.35	PASS	AF=0.543478;AO=25;DP=46;FAO=25;FDP=46;FR=.;FRO=21;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.0596842;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.922;QD=23.5956;RBI=0.0596852;REFB=-0.00324602;REVB=0.000351791;RO=21;SAF=13;SAR=12;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00312376;STB=0.501741;STBP=0.973;TYPE=snp;VARB=0.00279012;OID=.;OPOS=15769625;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:21:25:25:0.543478:12:13:11:10:12:13:11:10
chr19	15784061	.	C	A	765.74	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0669228;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.9079;QD=63.8119;RBI=0.0703138;REFB=0;REVB=0.0215724;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000845133;OID=.;OPOS=15784061;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0
chr19	15784386	.	C	T	501.65	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0184017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8088;QD=59.018;RBI=0.0186134;REFB=0;REVB=0.00279869;RO=0;SAF=13;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000259057;OID=.;OPOS=15784386;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:21:13:0:0:21:13:0:0
chr19	15789098	.	A	G	833.85	PASS	AF=0.968254;AO=56;DP=59;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=36;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.104372;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.7749;QD=52.9428;RBI=0.108881;REFB=-0.183583;REVB=0.0310117;RO=3;SAF=32;SAR=24;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0231841;STB=0.502954;STBP=0.86;TYPE=snp;VARB=0.0129929;OID=.;OPOS=15789098;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:59:63:3:2:56:61:0.968254:24:32:1:2:25:36:1:1
chr19	15789140	.	A	G	854.07	PASS	AF=0.983607;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=61;FR=.;FRO=1;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00183132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.376;QD=56.0044;RBI=0.0249606;REFB=-0.0153987;REVB=0.0248933;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.507934;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000743279;OID=.;OPOS=15789140;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:60:61:0:1:60:60:0.983607:31:29:0:0:31:29:0:1
chr19	15791180	.	C	T	883.35	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0342196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.214;QD=57.9246;RBI=0.0536255;REFB=0;REVB=0.0412882;RO=0;SAF=34;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03209e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000207171;OID=.;OPOS=15791180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:59:61:1:25:34:0:0:27:34:0:0
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chr19	15918455	.	G	A	177.34	PASS	AF=0.413043;AO=16;DP=43;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0389258;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.312;QD=15.4205;RBI=0.0433685;REFB=-0.0260048;REVB=0.0191209;RO=27;SAF=9;SAR=7;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242347;STB=0.612131;STBP=0.218;TYPE=snp;VARB=0.0375925;OID=.;OPOS=15918455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:46:27:27:16:19:0.413043:7:9:9:18:9:10:9:18
chr19	15918691	.	G	A	322.82	PASS	AF=0.363636;AO=40;DP=110;FAO=40;FDP=110;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=41;FWDB=0.0158736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.423;QD=11.7387;RBI=0.029743;REFB=-0.0235221;REVB=-0.025153;RO=69;SAF=25;SAR=15;SRF=28;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241123;STB=0.633418;STBP=0.046;TYPE=snp;VARB=0.042328;OID=.;OPOS=15918691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:69:70:40:40:0.363636:15:25:28:41:15:25:29:41
chr19	15996820	.	G	A	195.01	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=27;FSRR=11;FWDB=0.0140224;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.804;QD=12.5812;RBI=0.0145274;REFB=-0.0047761;REVB=-0.00379684;RO=37;SAF=14;SAR=10;SRF=27;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165369;STB=0.582321;STBP=0.324;TYPE=snp;VARB=0.00488384;OID=.;OPOS=15996820;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:37:38:24:24:0.387097:10:14:27:10:10:14:27:11
chr19	16024662	.	G	C	127.07	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=48;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0185653;FXX=0.020829;HRUN=3;LEN=1;MLLD=179.957;QD=10.8143;RBI=0.0330538;REFB=-0.0154613;REVB=-0.0273475;RO=32;SAF=10;SAR=5;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196019;STB=0.617486;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0300129;OID=.;OPOS=16024662;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:32:32:15:15:0.319149:5:10:16:16:5:10:16:16
chr19	16025176	.	C	T	183.14	PASS	AF=0.62069;AO=17;DP=28;FAO=18;FDP=29;FR=.;FRO=11;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0708425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.2573;QD=25.2607;RBI=0.0725515;REFB=-0.0327418;REVB=0.0156543;RO=11;SAF=6;SAR=11;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758887;STB=0.525867;STBP=0.763;TYPE=snp;VARB=0.0159272;OID=.;OPOS=16025176;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:28:29:11:11:17:18:0.62069:11:6:5:6:11:7:5:6
chr19	16034714	.	A	G	1134.16	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0192575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2736;QD=60.4885;RBI=0.0266825;REFB=0;REVB=-0.018469;RO=0;SAF=54;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.808e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.68036e-06;OID=.;OPOS=16034714;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:20:54:0:0:21:54:0:0
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chr19	16045141	.	T	C	882.24	PASS	AF=1;AO=43;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=26;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0940429;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.583;QD=57.8517;RBI=0.104804;REFB=0;REVB=0.046259;RO=0;SAF=15;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360667;OID=.;OPOS=16045141;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:43:61:1:28:15:0:0:35:26:0:0
chr19	16136923	.	T	C	410.35	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000710762;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.164;QD=54.713;RBI=0.0378743;REFB=0;REVB=0.0378676;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292866;OID=.;OPOS=16136923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:30:0:0:27:30:1:8:19:0:0:8:22:0:0
chr19	16145533	.	A	G	1104.76	PASS	AF=1;AO=57;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214894;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.2012;QD=60.5346;RBI=0.125278;REFB=0;REVB=0.123421;RO=0;SAF=34;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00337791;OID=.;OPOS=16145533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:57:73:1:23:34:0:0:31:42:0:0
chr19	16145539	.	G	A	1132.11	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0108817;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.458;QD=60.3791;RBI=0.0135745;REFB=0;REVB=-0.00811517;RO=0;SAF=43;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.54571e-05;OID=.;OPOS=16145539;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:75:0:0:74:75:1:31:43:0:0:32:43:0:0
chr19	16145653	.	G	A	1918.32	PASS	AF=1;AO=124;DP=125;FAO=124;FDP=124;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=75;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148358;FXX=0.00799936;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.358;QD=61.8813;RBI=0.0281339;REFB=0;REVB=-0.0239043;RO=0;SAF=49;SAR=75;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.33775e-05;OID=.;OPOS=16145653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:125:124:0:0:124:124:1:75:49:0:0:75:49:0:0
chr19	16145731	.	C	A	1206.22	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00227125;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=63.1692;QD=61.0747;RBI=0.0343684;REFB=0;REVB=-0.0342932;RO=0;SAF=30;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00018355;OID=.;OPOS=16145731;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:79:79:1:49:30:0:0:49:30:0:0
chr19	16146400	.	A	G	1896.41	PASS	AF=1;AO=123;DP=123;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=79;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00392077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.976;QD=61.6717;RBI=0.00392422;REFB=0;REVB=0.000164444;RO=0;SAF=79;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02311e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.53426e-06;OID=.;OPOS=16146400;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:123:123:0:0:123:123:1:44:79:0:0:44:79:0:0
chr19	16244326	.	G	C	979.83	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00116219;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6392;QD=58.497;RBI=0.0465139;REFB=0;REVB=0.0464994;RO=0;SAF=44;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0037558;OID=.;OPOS=16244326;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:22:44:0:0:22:45:0:0
chr19	16268207	.	TAA	TA,T	235.65	PASS	AF=1,0;AO=24,5;DP=31;FAO=31,0;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17,0;FSAR=14,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.24861,-0.129668;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=10.8024,9.31561;QD=30.4064;RBI=0.275232,0.143784;REFB=0,0;REVB=-0.118091,-0.0621298;RO=1;SAF=12,3;SAR=12,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0370602,-0.121807;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=-0.0144463,0;OID=.,.;OPOS=16268208,16268208;OREF=A,AA;OALT=-,-;OMAPALT=TA,T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:24,5:31:31,0:31:0:17,0:14,0:0:0:5:1:12,3:12,2:1:0
chr19	16275655	.	C	T	846.96	PASS	AF=0.744444;AO=62;DP=87;FAO=67;FDP=90;FR=.;FRO=23;FSAF=34;FSAR=33;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0129009;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=195.878;QD=37.6429;RBI=0.0440141;REFB=-0.0028551;REVB=0.0420809;RO=0;SAF=32;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.525889;STBP=0.394;TYPE=snp;VARB=0.000606937;OID=.;OPOS=16275655;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:90:0:23:62:67:0.744444:30:32:0:0:33:34:14:9
chr19	16301312	.	A	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0100308;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.686;QD=51.9166;RBI=0.0665525;REFB=0;REVB=0.0657923;RO=0;SAF=18;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000640913;OID=.;OPOS=16301312;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:3:18:0:0:3:18:0:0
chr19	16339715	.	C	T	1525.53	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0785648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.6921;QD=59.8245;RBI=0.086115;REFB=0;REVB=0.0352615;RO=0;SAF=49;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.03142e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000398639;OID=.;OPOS=16339715;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:102:0:0:102:102:1:53:49:0:0:53:49:0:0
chr19	16438062	.	A	AC	72.57	PASS	AF=0.325;AO=13;DP=40;FAO=13;FDP=40;FR=.;FRO=27;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.0473375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.1613;QD=7.25705;RBI=0.0549082;REFB=0.012278;REVB=-0.0278222;RO=27;SAF=2;SAR=11;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.524428;STB=0.817661;STBP=0.014;TYPE=ins;VARB=-0.0335755;OID=.;OPOS=16438063;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.325:13:40:13:40:27:2:11:16:11:72:27:2:11:16:11
chr19	16591464	.	G	A	264.89	PASS	AF=0.483333;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=60;FR=.;FRO=31;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=17;FWDB=-0.0457226;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.939;QD=17.6595;RBI=0.046416;REFB=-0.0174605;REVB=-0.00799337;RO=31;SAF=14;SAR=15;SRF=14;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0287648;STB=0.516118;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0211617;OID=.;OPOS=16591464;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:31:31:29:29:0.483333:15:14:14:17:15:14:14:17
chr19	16601194	.	C	T	369.48	PASS	AF=0.448276;AO=39;DP=87;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=34;FSAR=5;FSRF=35;FSRR=13;FWDB=-0.00935888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.126;QD=16.9875;RBI=0.0126288;REFB=-0.036227;REVB=0.00847927;RO=48;SAF=34;SAR=5;SRF=35;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244277;STB=0.639415;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0431844;OID=.;OPOS=16601194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:48:48:39:39:0.448276:5:34:35:13:5:34:35:13
chr19	16685939	.	G	A	904.85	PASS	AF=0.523529;AO=89;DP=171;FAO=89;FDP=170;FR=.;FRO=81;FSAF=57;FSAR=32;FSRF=34;FSRR=47;FWDB=-0.0191444;FXX=0.0116272;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.421;QD=21.2905;RBI=0.0287777;REFB=-0.0262317;REVB=-0.021486;RO=78;SAF=57;SAR=32;SRF=32;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.199923;STB=0.607258;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0282985;OID=.;OPOS=16685939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:171:170:78:81:89:89:0.523529:32:57:32:46:32:57:34:47
chr19	16790859	.	C	T	387.92	PASS	AF=0.358779;AO=44;DP=130;FAO=47;FDP=131;FR=.;FRO=84;FSAF=31;FSAR=16;FSRF=52;FSRR=32;FWDB=0.00375612;FXX=0.0150365;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8542;QD=11.8448;RBI=0.0858665;REFB=-0.00800824;REVB=0.0857843;RO=84;SAF=30;SAR=14;SRF=52;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.079481;STB=0.528397;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0211878;OID=.;OPOS=16790859;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:131:84:84:44:47:0.358779:14:30:52:32:16:31:52:32
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chr19	16860105	.	G	A	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468283;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.205;QD=60.9786;RBI=0.0484445;REFB=0;REVB=0.0124087;RO=0;SAF=14;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165119;OID=.;OPOS=16860105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:25:14:0:0:25:14:0:0
chr19	16899838	.	A	T	1872.06	PASS	AF=0.976378;AO=124;DP=127;FAO=124;FDP=127;FR=.;FRO=3;FSAF=75;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0403928;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=161.633;QD=58.9626;RBI=0.0518628;REFB=-0.0546763;REVB=-0.0325294;RO=0;SAF=75;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506689;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.000775394;OID=.;OPOS=16899838;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:127:127:0:3:124:124:0.976378:49:75:0:0:49:75:1:2
chr19	16899930	.	G	A	336.73	PASS	AF=0.376147;AO=41;DP=109;FAO=41;FDP=109;FR=.;FRO=68;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=35;FWDB=0.0039857;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.846;QD=12.3571;RBI=0.0142796;REFB=-0.000274267;REVB=-0.0137121;RO=66;SAF=19;SAR=22;SRF=32;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0233023;STB=0.513689;STBP=0.831;TYPE=snp;VARB=0.000845679;OID=.;OPOS=16899930;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:66:68:41:41:0.376147:22:19:32:34:22:19:33:35
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chr19	17025292	.	G	A	102.51	PASS	AF=0.521739;AO=12;DP=23;FAO=12;FDP=23;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=2;FWDB=-0.00128961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.955;QD=17.8274;RBI=0.00245266;REFB=0.00615861;REVB=-0.00208625;RO=11;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.151439;STB=0.586075;STBP=0.44;TYPE=snp;VARB=-0.00225225;OID=.;OPOS=17025292;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:23:23:11:11:12:12:0.521739:4:8:9:2:4:8:9:2
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chr19	17108053	.	C	T	194.26	PASS	AF=0.612903;AO=15;DP=32;FAO=19;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=12;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.00855764;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.065;QD=25.066;RBI=0.020088;REFB=-0.0131178;REVB=0.018174;RO=13;SAF=8;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132271;STB=0.514691;STBP=0.875;TYPE=snp;VARB=0.00470191;OID=.;OPOS=17108053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:32:31:13:12:15:19:0.612903:7:8:9:4:7:12:8:4
chr19	17108135	.	C	T	105.82	PASS	AF=0.351351;AO=13;DP=37;FAO=13;FDP=37;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.00997435;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=301.223;QD=11.4396;RBI=0.0275495;REFB=-0.00403982;REVB=-0.0256805;RO=22;SAF=10;SAR=3;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.316968;STB=0.694123;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0071468;OID=.;OPOS=17108135;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:24:13:13:0.351351:3:10:11:11:3:10:12:12
chr19	17111297	.	A	G,T	768.52	PASS	AF=0.927273,0.0727273;AO=50,4;DP=54;FAO=51,4;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26,2;FSAR=25,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0625452,-0.0363587;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=78.707,107.384;QD=55.8925;RBI=0.0637109,0.0365659;REFB=0,0;REVB=-0.0121318,-0.00388665;RO=0;SAF=25,2;SAR=25,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000246485,0.0721136;OID=.,.;OPOS=17111297,17111297;OREF=A,A;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:54:55:0:0:50,4:51,4:0.927273,0.0727273:25,2:25,2:0:0:25,2:26,2:0:0
chr19	17113147	.	A	G	95.57	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=33;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00304376;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.9939;QD=11.5841;RBI=0.0307798;REFB=-0.00302445;REVB=0.030629;RO=21;SAF=8;SAR=4;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160135;STB=0.59558;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0113091;OID=.;OPOS=17113147;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:33:33:21:21:12:12:0.363636:4:8:11:10:4:8:11:10
chr19	17160720	.	G	A	561.45	PASS	AF=0.547368;AO=52;DP=94;FAO=52;FDP=95;FR=.;FRO=43;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=-0.0135296;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.465;QD=23.64;RBI=0.0293077;REFB=-0.0142721;REVB=-0.0259979;RO=42;SAF=28;SAR=24;SRF=19;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0700728;STB=0.533212;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.0105424;OID=.;OPOS=17160720;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:42:43:52:52:0.547368:24:28:19:23:24:28:20:23
chr19	17163661	.	C	T	236.51	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.0152453;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.885;QD=15.7675;RBI=0.0253765;REFB=0.0118568;REVB=0.0202867;RO=33;SAF=14;SAR=13;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262751;STB=0.51484;STBP=0.865;TYPE=snp;VARB=-0.015698;OID=.;OPOS=17163661;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:13:14:18:15:13:14:18:15
chr19	17170885	.	C	T	192.96	PASS	AF=0.558824;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=34;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=0.000510045;FXX=0.0285633;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.644;QD=22.7005;RBI=0.00788942;REFB=-0.0188324;REVB=-0.00787291;RO=14;SAF=9;SAR=10;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.181401;STB=0.584528;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0155876;OID=.;OPOS=17170885;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:34:14:15:19:19:0.558824:10:9:10:4:10:9:10:5
chr19	17273893	.	G	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0068072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.375;QD=61.3364;RBI=0.0710766;REFB=0;REVB=0.0707498;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000180387;OID=.;OPOS=17273893;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr19	17303774	.	T	G	1510.79	PASS	AF=1;AO=95;DP=95;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.589;QD=63.6124;RBI=0.0425146;REFB=0;REVB=0.00296003;RO=0;SAF=46;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.80908e-05;OID=.;OPOS=17303774;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:95:95:0:0:95:95:1:49:46:0:0:49:46:0:0
chr19	17305440	.	T	C	920.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.028427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.1791;QD=58.419;RBI=0.0547456;REFB=0;REVB=0.0467866;RO=0;SAF=42;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.8689e-05;OID=.;OPOS=17305440;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:21:42:0:0:21:42:0:0
chr19	17306031	.	T	C	74.95	PASS	AF=1;AO=6;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.798;QD=37.4729;RBI=0.0313298;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155992;OID=.;OPOS=17306031;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:6:8:1:0:6:0:0:0:8:0:0
chr19	17312992	.	C	T	804.96	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267034;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.0859;QD=64.3968;RBI=0.0340262;REFB=0;REVB=0.0210881;RO=0;SAF=24;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.10374e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.15127e-05;OID=.;OPOS=17312992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:26:24:0:0:26:24:0:0
chr19	17316782	.	T	C	753.5	PASS	AF=0.979592;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0174353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=199.66;QD=61.5102;RBI=0.03955;REFB=-0.028385;REVB=0.0354995;RO=1;SAF=24;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.019199;STB=0.5102;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.000572475;OID=.;OPOS=17316782;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:49:1:1:48:48:0.979592:24:24:0:1:24:24:0:1
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chr19	17330060	.	T	C	1624.3	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00324226;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.9405;QD=60.1594;RBI=0.0584706;REFB=0;REVB=-0.0583806;RO=0;SAF=62;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.67537e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000289649;OID=.;OPOS=17330060;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:46:62:0:0:46:62:0:0
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chr19	17463214	.	C	T	73.43	PASS	AF=0.3125;AO=9;DP=31;FAO=10;FDP=32;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=0.0767287;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=44.8157;QD=9.17832;RBI=0.0997303;REFB=-0.0234557;REVB=0.0637091;RO=22;SAF=6;SAR=3;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810958;STB=0.522683;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0561226;OID=.;OPOS=17463214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:31:32:22:22:9:10:0.3125:3:6:16:6:3:7:16:6
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chr19	17556054	.	A	G	180.58	PASS	AF=0.422222;AO=18;DP=44;FAO=19;FDP=45;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=16;FWDB=0.0125781;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.402;QD=16.0519;RBI=0.057278;REFB=-0.0126475;REVB=0.0558798;RO=21;SAF=13;SAR=5;SRF=5;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.443452;STB=0.709917;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00769932;OID=.;OPOS=17556054;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:21:26:18:19:0.422222:5:13:5:16:5:14:10:16
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chr19	17648350	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0336858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.954;QD=45.8068;RBI=0.0366084;REFB=0;REVB=0.0143332;RO=0;SAF=1;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.12061e-05;OID=.;OPOS=17648350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:13:14:1:12:1:0:0:13:1:0:0
chr19	17651370	.	A	G	143.48	PASS	AF=1;AO=11;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.139974;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.954;QD=44.1483;RBI=0.149765;REFB=0;REVB=0.0532625;RO=0;SAF=6;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00271065;OID=.;OPOS=17651370;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:11:13:1:5:6:0:0:5:8:0:0
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chr19	17692324	.	T	G	475.31	PASS	AF=1;AO=30;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00350193;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.414;QD=57.6133;RBI=0.0101282;REFB=0;REVB=0.00950348;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00041443;OID=.;OPOS=17692324;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:30:33:1:19:11:0:0:22:11:0:0
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chr19	17741047	.	A	G	123.98	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=0.0128811;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=230.314;QD=17.1002;RBI=0.0150118;REFB=0.0158532;REVB=-0.00770927;RO=15;SAF=7;SAR=7;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.211553;STB=0.620527;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=-0.0118174;OID=.;OPOS=17741047;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:7:7:11:4:7:7:11:4
chr19	17746946	.	GA	G,GG	1488.14	PASS	AF=0.0105263,0.989474;AO=32,57;DP=91;FAO=1,94;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=0,43;FSAR=1,51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0366004,0.0482703;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=275.438,288.183;QD=62.6583;RBI=0.0437871,0.0535602;REFB=0,0;REVB=0.0240359,0.0232092;RO=0;SAF=26,12;SAR=6,45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0165724,0.000849349;OID=.,.;OPOS=17746947,17746947;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0105263,0.989474:32,57:91:1,94:95:0:0,43:1,51:0:0:5:0:26,12:6,45:0:0
chr19	17777508	.	C	G	446.98	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112118;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4246;QD=57.6747;RBI=0.0116096;REFB=0;REVB=0.00301278;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.91457e-05;OID=.;OPOS=17777508;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:9:22:0:0:9:22:0:0
chr19	17831199	.	T	TG	30.3	PASS	AF=0.232558;AO=8;DP=43;FAO=10;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=-0.036433;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=85.0138;QD=2.81858;RBI=0.0470217;REFB=-0.00692734;REVB=-0.0297267;RO=34;SAF=8;SAR=0;SRF=13;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.747574;STB=0.894929;STBP=0.009;TYPE=ins;VARB=0.16272;OID=.;OPOS=17831200;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.232558:8:43:10:43:33:9:1:13:20:30:34:8:0:13:21
chr19	17922795	.	G	A	278.12	PASS	AF=0.553191;AO=25;DP=47;FAO=26;FDP=47;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=-0.00515143;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.4429;QD=23.67;RBI=0.0509745;REFB=-0.0262449;REVB=0.0507135;RO=20;SAF=18;SAR=7;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301822;STB=0.537521;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0197083;OID=.;OPOS=17922795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:20:21:25:26:0.553191:7:18:15:5:8:18:16:5
chr19	17932138	.	T	C	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.00565734;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.436;QD=11.2563;RBI=0.0483705;REFB=0.0145839;REVB=-0.0480385;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126983;STB=0.576728;STBP=0.596;TYPE=snp;VARB=-0.0307841;OID=.;OPOS=17932138;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:3:5:6:6:3:5:6:6
chr19	17932289	.	C	CT,T	109.38	PASS	AF=0.833333,0.0833333;AO=3,8;DP=12;FAO=10,1;FDP=12;FR=.;FRO=1;FSAF=0,1;FSAR=10,0;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0426251,0.0974697;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=74.0997,66.7748;QD=36.4611;RBI=0.197022,0.116416;REFB=-0.0488324,-0.0607254;REVB=0.192356,0.0636581;RO=1;SAF=0,1;SAR=3,7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.0589957;STB=0.5,0.989913;STBP=1,0.496;TYPE=ins,snp;VARB=0.0119914,0.0153032;OID=.,.;OPOS=17932290,17932289;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:12:12:1:1:3,8:10,1:0.833333,0.0833333:3,7:0,1:0:1:10,0:0,1:0:1
chr19	18109063	.	G	A	64.12	PASS	AF=0.321429;AO=8;DP=27;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=17;FWDB=0.039352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0308;QD=9.16053;RBI=0.0432224;REFB=-0.0301567;REVB=0.0178772;RO=19;SAF=1;SAR=7;SRF=2;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0538833;STB=0.510182;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0819041;OID=.;OPOS=18109063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:27:28:19:19:8:9:0.321429:7:1:2:17:8:1:2:17
chr19	18123738	.	T	C	815.66	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00882056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=346.185;QD=57.2391;RBI=0.00960547;REFB=0;REVB=0.00380299;RO=0;SAF=31;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17526e-05;OID=.;OPOS=18123738;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:24:31:0:0:24:33:0:0
chr19	18180413	.	C	G	287.63	PASS	AF=0.350515;AO=34;DP=97;FAO=34;FDP=97;FR=.;FRO=63;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=31;FSRR=32;FWDB=-0.0257016;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=40.0013;QD=11.8611;RBI=0.0704131;REFB=-0.0138438;REVB=0.0655548;RO=59;SAF=16;SAR=18;SRF=28;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00442089;STB=0.513965;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.025847;OID=.;OPOS=18180413;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:59:63:34:34:0.350515:18:16:28:31:18:16:31:32
chr19	18180451	.	A	G	288.44	PASS	AF=0.392857;AO=33;DP=84;FAO=33;FDP=84;FR=.;FRO=51;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=0.0404156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9505;QD=13.7352;RBI=0.0437521;REFB=-0.0245384;REVB=-0.016758;RO=51;SAF=17;SAR=16;SRF=27;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0152101;STB=0.508665;STBP=0.899;TYPE=snp;VARB=0.0312194;OID=.;OPOS=18180451;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:51:51:33:33:0.392857:16:17:27:24:16:17:27:24
chr19	18186575	.	G	A	193.72	PASS	AF=0.473684;AO=20;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=15;FSRR=15;FWDB=-0.0282452;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=133.096;QD=13.5945;RBI=0.0286124;REFB=-0.00752381;REVB=-0.00456901;RO=28;SAF=3;SAR=17;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.407848;STB=0.570417;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0643665;OID=.;OPOS=18186575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:28:30:20:27:0.473684:17:3:13:15:17:10:15:15
chr19	18186618	.	T	C	277.54	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=0.00355471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.144;QD=20.5583;RBI=0.0235572;REFB=-0.0314984;REVB=-0.0232874;RO=23;SAF=11;SAR=18;SRF=10;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0463556;STB=0.548311;STBP=0.45;TYPE=snp;VARB=0.0195732;OID=.;OPOS=18186618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:23:25:29:29:0.537037:18:11:10:13:18:11:12:13
chr19	18191664	.	C	G	170.33	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.0199132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.682;QD=17.0333;RBI=0.0263395;REFB=0.0145461;REVB=0.0172405;RO=22;SAF=11;SAR=7;SRF=11;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109005;STB=0.56243;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=-0.016565;OID=.;OPOS=18191664;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:7:11:11:11:7:11:11:11
chr19	18234441	.	C	T	203.35	PASS	AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.0686014;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.59;QD=14.2699;RBI=0.0849225;REFB=0.00238835;REVB=0.0500567;RO=33;SAF=12;SAR=12;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0769306;STB=0.543823;STBP=0.59;TYPE=snp;VARB=-0.00312796;OID=.;OPOS=18234441;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:12:12:14:19:12:12:14:19
chr19	18245512	.	C	T	126.18	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=-0.00536521;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.514;QD=16.8236;RBI=0.0149474;REFB=-0.0139153;REVB=0.0139513;RO=16;SAF=10;SAR=4;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157511;STB=0.591261;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.0131531;OID=.;OPOS=18245512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:4:10:9:7:4:10:9:7
chr19	18248146	.	T	C	173.09	PASS	AF=0.486486;AO=18;DP=37;FAO=18;FDP=37;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=14;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0271255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.045;QD=18.7119;RBI=0.0296432;REFB=-0.0249244;REVB=-0.0119553;RO=19;SAF=4;SAR=14;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.269045;STB=0.654488;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=0.0239776;OID=.;OPOS=18248146;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:19:19:18:18:0.486486:14:4:9:10:14:4:9:10
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chr19	18288947	.	A	C	146.85	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0125354;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.967;QD=11.2962;RBI=0.0543776;REFB=-0.0120581;REVB=0.0529131;RO=34;SAF=12;SAR=6;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.192046;STB=0.613204;STBP=0.248;TYPE=snp;VARB=0.0171305;OID=.;OPOS=18288947;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:34:34:18:18:0.346154:6:12:17:17:6:12:17:17
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chr19	18306990	.	G	C	201.91	PASS	AF=0.333333;AO=22;DP=74;FAO=26;FDP=78;FR=.;FRO=52;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=26;FWDB=0.0202248;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.4029;QD=10.3543;RBI=0.0680537;REFB=-0.021842;REVB=0.0649789;RO=52;SAF=14;SAR=8;SRF=26;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.164334;STB=0.634747;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0481621;OID=.;OPOS=18306990;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:78:52:52:22:26:0.333333:8:14:26:26:8:18:26:26
chr19	18311199	.	A	G	262.79	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.00805838;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8267;QD=17.232;RBI=0.0517697;REFB=0.0293152;REVB=0.0511386;RO=33;SAF=18;SAR=11;SRF=19;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445573;STB=0.514888;STBP=0.83;TYPE=snp;VARB=-0.0090091;OID=.;OPOS=18311199;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:33:32:29:29:0.47541:11:18:19:14:11:18:19:13
chr19	18329240	.	T	C	354.82	PASS	AF=0.571429;AO=34;DP=61;FAO=36;FDP=63;FR=.;FRO=27;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=11;FSRR=16;FWDB=0.00112184;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=38.2856;QD=22.528;RBI=0.00807996;REFB=-0.0567047;REVB=-0.0080017;RO=27;SAF=16;SAR=18;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0509841;STB=0.527935;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0527194;OID=.;OPOS=18329240;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:63:27:27:34:36:0.571429:18:16:11:16:19:17:11:16
chr19	18329784	.	C	T	431.68	PASS	AF=0.44898;AO=44;DP=98;FAO=44;FDP=98;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=39;FSRR=15;FWDB=-0.0203713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.647;QD=17.6194;RBI=0.0378257;REFB=-0.0104606;REVB=0.0318716;RO=54;SAF=20;SAR=24;SRF=39;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260305;STB=0.644747;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0160469;OID=.;OPOS=18329784;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:54:54:44:44:0.44898:24:20:39:15:24:20:39:15
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chr19	18359037	.	G	A	128.04	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=3;FWDB=0.00571718;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.91;QD=20.4858;RBI=0.0261078;REFB=-0.0197746;REVB=0.0254742;RO=11;SAF=4;SAR=10;SRF=8;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.347298;STB=0.697387;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.0249554;OID=.;OPOS=18359037;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:25:25:11:11:14:14:0.56:10:4:8:3:10:4:8:3
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chr19	18369120	.	G	A	221.64	PASS	AF=0.375;AO=26;DP=72;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0187651;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.2852;QD=12.3135;RBI=0.0192224;REFB=-0.0076885;REVB=-0.00416789;RO=45;SAF=14;SAR=12;SRF=22;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0544526;STB=0.518505;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.00801939;OID=.;OPOS=18369120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:45:45:26:27:0.375:12:14:22:23:13:14:22:23
chr19	18369211	.	T	G	98.42	PASS	AF=0.254902;AO=13;DP=51;FAO=13;FDP=51;FR=.;FRO=38;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=-0.0273472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2762;QD=7.71916;RBI=0.0373353;REFB=0.00812284;REVB=0.0254177;RO=38;SAF=2;SAR=11;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365441;STB=0.732919;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=-0.0203178;OID=.;OPOS=18369211;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:51:51:38:38:13:13:0.254902:11:2:15:23:11:2:15:23
chr19	18369270	.	C	T	50.58	PASS	AF=0.2;AO=8;DP=40;FAO=8;FDP=40;FR=.;FRO=32;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=24;FWDB=-0.0084234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.217;QD=5.0579;RBI=0.0160179;REFB=-0.00171301;REVB=-0.0136243;RO=32;SAF=1;SAR=7;SRF=8;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245413;STB=0.669708;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.00943576;OID=.;OPOS=18369270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:50:40:40:32:32:8:8:0.2:7:1:8:24:7:1:8:24
chr19	18369581	.	G	T	83.65	PASS	AF=0.666667;AO=8;DP=15;FAO=10;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0688721;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=33.3937;QD=22.3063;RBI=0.143145;REFB=0.0893058;REVB=0.125487;RO=5;SAF=7;SAR=1;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101851;STB=0.580463;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=-0.0360843;OID=.;OPOS=18369581;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:15:15:5:5:8:10:0.666667:1:7:4:1:1:9:4:1
chr19	18369596	.	GT	AC	81.23	PASS	AF=0.555556;AO=10;DP=18;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.0301421;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=115.703;QD=18.0506;RBI=0.0340204;REFB=0.0196387;REVB=-0.0157747;RO=8;SAF=9;SAR=1;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.368125;STB=0.719451;STBP=0.122;TYPE=mnp;VARB=-0.00916945;OID=.;OPOS=18369596;OREF=GT;OALT=AC;OMAPALT=AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:18:18:8:8:10:10:0.555556:1:9:5:3:1:9:5:3
chr19	18370063	.	A	AG	254.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=29;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00748719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=17.0075;QD=39.1498;RBI=0.222528;REFB=0;REVB=-0.222402;RO=5;SAF=13;SAR=11;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108078;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00903024;OID=.;OPOS=18370064;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:24:29:26:26:0:13:13:0:0:5:5:13:11:1:4
chr19	18370160	.	A	AG,AGG	112.51	PASS	AF=1,0;AO=12,3;DP=18;FAO=18,0;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=15,0;FSAR=3,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.152858,-0.0761995;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=9.56115,9.62007;QD=25.0027;RBI=0.216341,0.121416;REFB=-0.00530841,-0.001689;REVB=0.153094,0.0945283;RO=3;SAF=10,3;SAR=2,0;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0986653,0.664835;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-0.00247105,0.0254993;OID=.,.;OPOS=18370161,18370161;OREF=-,-;OALT=G,GG;OMAPALT=AG,AGG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1,0:12,3:18:18,0:18:0:15,0:3,0:0:0:4:3:10,3:2,0:2:1
chr19	18370571	.	T	C	56.28	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=20;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=8;FWDB=0.00620667;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.749;QD=11.257;RBI=0.0123553;REFB=-0.032157;REVB=-0.0106831;RO=12;SAF=6;SAR=2;SRF=4;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413789;STB=0.749375;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.03236;OID=.;OPOS=18370571;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:12:12:8:8:0.4:2:6:4:8:2:6:4:8
chr19	18375563	.	G	A	213.94	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00669911;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=197.143;QD=20.8719;RBI=0.0374665;REFB=-0.0253821;REVB=0.0368628;RO=20;SAF=11;SAR=10;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154875;STB=0.586775;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0195657;OID=.;OPOS=18375563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:10:11:14:6:10:11:14:6
chr19	18375608	.	G	A	355.16	PASS	AF=0.493333;AO=37;DP=75;FAO=37;FDP=75;FR=.;FRO=38;FSAF=32;FSAR=5;FSRF=30;FSRR=8;FWDB=0.00241343;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=313.807;QD=18.9419;RBI=0.0649772;REFB=-0.000659854;REVB=0.0649324;RO=38;SAF=32;SAR=5;SRF=30;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129804;STB=0.572959;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.000764338;OID=.;OPOS=18375608;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:38:37:37:0.493333:5:32:30:8:5:32:30:8
chr19	18375659	.	C	T	748.67	PASS	AF=0.493243;AO=72;DP=149;FAO=73;FDP=148;FR=.;FRO=75;FSAF=46;FSAR=27;FSRF=54;FSRR=21;FWDB=0.000339771;FXX=0.00671096;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.111;QD=20.2344;RBI=0.0328982;REFB=0.0014852;REVB=-0.0328965;RO=69;SAF=46;SAR=26;SRF=53;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.130167;STB=0.550109;STBP=0.262;TYPE=snp;VARB=-0.00298362;OID=.;OPOS=18375659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:149:148:69:75:72:73:0.493243:26:46:53:16:27:46:54:21
chr19	18375815	.	G	A	412.91	PASS	AF=0.45;AO=45;DP=100;FAO=45;FDP=100;FR=.;FRO=55;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=31;FSRR=24;FWDB=0.018135;FXX=0.0196059;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.0375;QD=16.5166;RBI=0.041468;REFB=-0.032624;REVB=0.0372924;RO=52;SAF=24;SAR=21;SRF=30;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0422197;STB=0.516771;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=0.0241219;OID=.;OPOS=18375815;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:52:55:45:45:0.45:21:24:30:22:21:24:31:24
chr19	18375846	.	G	A	223.56	PASS	AF=0.433333;AO=26;DP=60;FAO=26;FDP=60;FR=.;FRO=34;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=0.0155069;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.738;QD=14.9041;RBI=0.0155465;REFB=-0.0236151;REVB=0.00110797;RO=33;SAF=12;SAR=14;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0826887;STB=0.554945;STBP=0.475;TYPE=snp;VARB=0.0329961;OID=.;OPOS=18375846;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:34:26:26:0.433333:14:12:18:15:14:12:19:15
chr19	18375882	.	G	C	125.07	PASS	AF=0.307692;AO=16;DP=51;FAO=16;FDP=52;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=15;FWDB=-0.0363757;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.732;QD=9.62062;RBI=0.0418303;REFB=-0.00376945;REVB=-0.0206539;RO=35;SAF=8;SAR=8;SRF=21;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115234;STB=0.557621;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00588144;OID=.;OPOS=18375882;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:52:35:36:16:16:0.307692:8:8:21:14:8:8:21:15
chr19	18376407	.	T	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.998;QD=53.2772;RBI=0.0560063;REFB=0;REVB=0.047085;RO=0;SAF=16;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000412359;OID=.;OPOS=18376407;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:7:16:0:0:7:16:0:0
chr19	18376517	.	C	T	161.6	PASS	AF=0.53125;AO=12;DP=32;FAO=17;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-8.22353e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=344.2;QD=20.2004;RBI=0.00607049;REFB=-0.0121418;REVB=0.00606993;RO=15;SAF=7;SAR=5;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0484683;STB=0.556352;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0104537;OID=.;OPOS=18376517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:15:15:12:17:0.53125:5:7:8:7:6:11:8:7
chr19	18376522	.	T	G	482.19	PASS	AF=1;AO=24;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0634196;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=285.363;QD=58.4467;RBI=0.0638237;REFB=0;REVB=0.00717021;RO=0;SAF=12;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000146275;OID=.;OPOS=18376522;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:24:33:1:12:12:0:0:15:18:0:0
chr19	18377274	.	A	G	411.12	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0150646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.5882;QD=56.7064;RBI=0.066649;REFB=0;REVB=0.0649242;RO=0;SAF=27;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000631314;OID=.;OPOS=18377274;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:28:29:1:1:27:0:0:1:28:0:0
chr19	18377496	.	C	G	1025.93	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00769895;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.8535;QD=59.474;RBI=0.0406454;REFB=0;REVB=-0.0399096;RO=0;SAF=40;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000242566;OID=.;OPOS=18377496;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:29:40:0:0:29:40:0:0
chr19	18377761	.	A	G	69.64	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=17;FAO=9;FDP=17;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0361111;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.271;QD=16.3854;RBI=0.0361351;REFB=-0.0788773;REVB=-0.00131563;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163174;STB=0.594396;STBP=0.468;TYPE=snp;VARB=0.0417412;OID=.;OPOS=18377761;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:17:8:8:9:9:0.529412:4:5:6:2:4:5:6:2
chr19	18378219	.	A	G	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.191;QD=56.9381;RBI=0.0194581;REFB=0;REVB=-0.015093;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.55237e-05;OID=.;OPOS=18378219;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:26:27:0:0:26:27:0:0
chr19	18392894	.	C	T	86.85	PASS	AF=0.315789;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=38;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=0.066088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1614;QD=9.14229;RBI=0.0851396;REFB=0.00754188;REVB=0.0536761;RO=25;SAF=9;SAR=3;SRF=8;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.466736;STB=0.768795;STBP=0.03;TYPE=snp;VARB=-0.00844805;OID=.;OPOS=18392894;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:37:38:25:26:12:12:0.315789:3:9:8:17:3:9:9:17
chr19	18392913	.	A	G	96.9	PASS	AF=0.309524;AO=12;DP=39;FAO=13;FDP=42;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=21;FWDB=-0.00148408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.7372;QD=9.22861;RBI=0.0533235;REFB=-0.0115698;REVB=-0.0533029;RO=24;SAF=9;SAR=3;SRF=5;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.554248;STB=0.815884;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.018594;OID=.;OPOS=18392913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:39:42:24:29:12:13:0.309524:3:9:5:19:3:10:8:21
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chr19	18553580	.	CAGAT	C	159.69	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.01661;FXX=0;HRUN=1;LEN=4;MLLD=303.23;QD=16.8098;RBI=0.0279536;REFB=-0.0253149;REVB=0.0224836;RO=18;SAF=8;SAR=9;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.074462;STB=0.503102;STBP=0.955;TYPE=del;VARB=0.0291448;OID=.;OPOS=18553581;OREF=AGAT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.447368:17:38:17:38:21:8:9:10:11:99:18:8:9:7:11
chr19	18562438	.	C	T	334.56	PASS	AF=0.557377;AO=32;DP=59;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0271338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.981;QD=21.9384;RBI=0.0307999;REFB=-0.0363241;REVB=0.0145736;RO=27;SAF=18;SAR=14;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0976323;STB=0.550695;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.0173484;OID=.;OPOS=18562438;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:61:27:27:32:34:0.557377:14:18:12:15:15:19:12:15
chr19	18679379	.	C	G	166.01	PASS	AF=0.566667;AO=17;DP=30;FAO=17;FDP=30;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=4;FSRR=9;FWDB=0.0648323;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7879;QD=22.1339;RBI=0.0920037;REFB=0.0187104;REVB=0.0652798;RO=13;SAF=5;SAR=12;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0124999;STB=0.507034;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=-0.0096028;OID=.;OPOS=18679379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:13:13:17:17:0.566667:12:5:4:9:12:5:4:9
chr19	18684563	.	C	T	184.53	PASS	AF=0.809524;AO=17;DP=21;FAO=17;FDP=21;FR=.;FRO=4;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00780947;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=205.314;QD=35.1476;RBI=0.0144042;REFB=-0.0207611;REVB=0.0121035;RO=4;SAF=9;SAR=8;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0102057;STB=0.505611;STBP=0.915;TYPE=snp;VARB=0.00464586;OID=.;OPOS=18684563;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:21:21:4:4:17:17:0.809524:8:9:2:2:8:9:2:2
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chr19	19023853	.	T	C	202.01	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=38;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0335653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.422;QD=21.2646;RBI=0.0667572;REFB=-0.0243641;REVB=0.0577052;RO=18;SAF=10;SAR=10;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467648;STB=0.52629;STBP=0.75;TYPE=snp;VARB=0.0249425;OID=.;OPOS=19023853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:18:18:20:20:0.526316:10:10:10:8:10:10:10:8
chr19	19040312	.	G	C	130.17	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0697671;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7492;QD=43.3888;RBI=0.0703327;REFB=0;REVB=0.00890167;RO=0;SAF=8;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00298285;OID=.;OPOS=19040312;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:4:8:0:0:4:8:0:0
chr19	19049198	.	G	A	598.92	PASS	AF=0.638554;AO=53;DP=83;FAO=53;FDP=83;FR=.;FRO=30;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.0328424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.414;QD=28.8636;RBI=0.0341982;REFB=-0.0263792;REVB=0.00953381;RO=28;SAF=27;SAR=26;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0060142;STB=0.508641;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0127976;OID=.;OPOS=19049198;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:28:30:53:53:0.638554:26:27:14:14:26:27:16:14
chr19	19136541	.	C	T	131.25	PASS	AF=0.405405;AO=15;DP=37;FAO=15;FDP=37;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.00588183;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.352;QD=14.1887;RBI=0.0104099;REFB=-0.00511109;REVB=0.00858893;RO=22;SAF=12;SAR=3;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106364;STB=0.562411;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0149176;OID=.;OPOS=19136541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:22:22:15:15:0.405405:3:12:16:6:3:12:16:6
chr19	19230868	.	A	G	2296.67	PASS	AF=1;AO=140;DP=142;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=80;FSAR=66;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0334534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.645;QD=62.9224;RBI=0.0481825;REFB=0;REVB=0.0346759;RO=2;SAF=80;SAR=60;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155825;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.29e-05;OID=.;OPOS=19230868;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:142:146:2:0:140:146:1:60:80:0:2:66:80:0:0
chr19	19249238	.	G	A	530.63	PASS	AF=0.401316;AO=61;DP=152;FAO=61;FDP=152;FR=.;FRO=91;FSAF=22;FSAR=39;FSRF=33;FSRR=58;FWDB=0.0158113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.229;QD=13.9638;RBI=0.0162423;REFB=-0.0163346;REVB=0.00371694;RO=91;SAF=22;SAR=39;SRF=33;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00228152;STB=0.501285;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0327604;OID=.;OPOS=19249238;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:152:152:91:91:61:61:0.401316:39:22:33:58:39:22:33:58
chr19	19267910	.	G	A	120.18	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.00924596;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.1076;QD=14.1383;RBI=0.053561;REFB=-0.0342677;REVB=0.0527569;RO=20;SAF=8;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0295884;STB=0.517217;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.0213839;OID=.;OPOS=19267910;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:6:8:12:8:6:8:12:8
chr19	19338942	.	G	A	284.6	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=9;FSRR=24;FWDB=0.011441;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.4418;QD=17.7876;RBI=0.0129523;REFB=-0.00286107;REVB=0.00607165;RO=33;SAF=16;SAR=15;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223896;STB=0.624549;STBP=0.072;TYPE=snp;VARB=0.00713402;OID=.;OPOS=19338942;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:15:16:9:24:15:16:9:24
chr19	19339285	.	G	A	454.79	PASS	AF=0.481132;AO=48;DP=107;FAO=51;FDP=106;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=28;FSRR=27;FWDB=0.00164519;FXX=0.00934492;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.481;QD=17.1619;RBI=0.00173605;REFB=-0.0135387;REVB=-0.000554279;RO=54;SAF=25;SAR=23;SRF=28;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00220472;STB=0.50037;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0142463;OID=.;OPOS=19339285;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:106:54:55:48:51:0.481132:23:25:28:26:25:26:28:27
chr19	19446936	.	G	A	402.2	PASS	AF=0.418182;AO=46;DP=111;FAO=46;FDP=110;FR=.;FRO=64;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=36;FSRR=28;FWDB=-0.0390728;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7741;QD=14.6256;RBI=0.039092;REFB=-0.00308854;REVB=-0.00122646;RO=62;SAF=27;SAR=19;SRF=36;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00663617;STB=0.514592;STBP=0.803;TYPE=snp;VARB=0.00634961;OID=.;OPOS=19446936;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:110:62:64:46:46:0.418182:19:27:36:26:19:27:36:28
chr19	19449686	.	G	T	359.27	PASS	AF=0.452381;AO=38;DP=83;FAO=38;FDP=84;FR=.;FRO=46;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=0.0217025;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=193.27;QD=17.108;RBI=0.0280351;REFB=-0.0113862;REVB=-0.0177473;RO=44;SAF=21;SAR=17;SRF=24;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00695167;STB=0.506976;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.012267;OID=.;OPOS=19449686;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:44:46:38:38:0.452381:17:21:24:20:17:21:26:20
chr19	19449719	.	C	T	504.32	PASS	AF=0.533333;AO=48;DP=90;FAO=48;FDP=90;FR=.;FRO=42;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=0.0210439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.113;QD=22.414;RBI=0.0405616;REFB=-0.0176095;REVB=0.0346756;RO=41;SAF=25;SAR=23;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748579;STB=0.54607;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.0168777;OID=.;OPOS=19449719;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:41:42:48:48:0.533333:23:25:25:16:23:25:26:16
chr19	19456096	.	A	C	474.6	PASS	AF=0.628571;AO=44;DP=70;FAO=44;FDP=70;FR=.;FRO=26;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=8;FSRR=18;FWDB=-0.0474547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.3289;QD=27.12;RBI=0.106843;REFB=-0.00271932;REVB=-0.0957261;RO=26;SAF=24;SAR=20;SRF=8;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160896;STB=0.58759;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=-0.000290419;OID=.;OPOS=19456096;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:26:26:44:44:0.628571:20:24:8:18:20:24:8:18
chr19	19466601	.	G	A	587.68	PASS	AF=0.54;AO=54;DP=98;FAO=54;FDP=100;FR=.;FRO=46;FSAF=13;FSAR=41;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.0218993;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=207.101;QD=23.5071;RBI=0.021973;REFB=-0.0177201;REVB=-0.00179881;RO=44;SAF=13;SAR=41;SRF=18;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169118;STB=0.586221;STBP=0.079;TYPE=snp;VARB=0.0140568;OID=.;OPOS=19466601;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:100:44:46:54:54:0.54:41:13:18:26:41:13:18:28
chr19	19467085	.	G	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0228594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=298.604;QD=56.7066;RBI=0.0228715;REFB=0;REVB=-0.000744068;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.77036e-05;OID=.;OPOS=19467085;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chr19	19467937	.	T	C	289.81	PASS	AF=0.92;AO=22;DP=24;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0337666;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.1197;QD=46.3696;RBI=0.0437659;REFB=0.0336548;REVB=0.0278437;RO=2;SAF=11;SAR=11;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.501741;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=-0.0144783;OID=.;OPOS=19467937;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:24:25:2:2:22:23:0.92:11:11:1:1:12:11:1:1
chr19	19468710	.	C	G	202.23	PASS	AF=0.512195;AO=18;DP=38;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=11;FWDB=0.0279463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.24;QD=19.7301;RBI=0.0307986;REFB=-0.0284981;REVB=0.0129444;RO=19;SAF=7;SAR=11;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302987;STB=0.510628;STBP=0.924;TYPE=snp;VARB=0.0249996;OID=.;OPOS=19468710;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:41:19:20:18:21:0.512195:11:7:8:11:12:9:9:11
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chr19	19606634	.	G	A	191.86	PASS	AF=0.369231;AO=24;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=0.00976995;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.1021;QD=11.8065;RBI=0.0390361;REFB=-0.0123319;REVB=0.0377937;RO=38;SAF=16;SAR=8;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.100688;STB=0.539292;STBP=0.661;TYPE=snp;VARB=0.0216067;OID=.;OPOS=19606634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:38:41:24:24:0.369231:8:16:22:16:8:16:25:16
chr19	19625547	.	A	G	283.24	PASS	AF=0.319444;AO=19;DP=72;FAO=23;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=39;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=0.00361738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.273;QD=15.7354;RBI=0.0346272;REFB=-0.0186328;REVB=-0.0344377;RO=39;SAF=14;SAR=5;SRF=26;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0967711;STB=0.538889;STBP=0.673;TYPE=snp;VARB=0.0588073;OID=.;OPOS=19625547;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:39:39:19:23:0.319444:5:14:26:13:9:14:26:13
chr19	19627078	.	C	A	217.81	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=12;FWDB=0.023036;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.7845;QD=16.7543;RBI=0.0340878;REFB=0.0109394;REVB=0.0251261;RO=28;SAF=5;SAR=19;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.385359;STB=0.720017;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=-0.0111947;OID=.;OPOS=19627078;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:28:28:24:24:0.461538:19:5:16:12:19:5:16:12
chr19	19654117	.	G	C	415.58	PASS	AF=0.434343;AO=43;DP=99;FAO=43;FDP=99;FR=.;FRO=56;FSAF=27;FSAR=16;FSRF=35;FSRR=21;FWDB=-0.0216562;FXX=0.009999;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.848;QD=16.7912;RBI=0.0453869;REFB=-0.0184581;REVB=0.0398871;RO=56;SAF=27;SAR=16;SRF=35;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00312896;STB=0.501757;STBP=0.977;TYPE=snp;VARB=0.0260275;OID=.;OPOS=19654117;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:56:56:43:43:0.434343:16:27:35:21:16:27:35:21
chr19	19735257	.	G	T	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034876;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.3;QD=61.684;RBI=0.0389718;REFB=0;REVB=0.0173916;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.21446e-05;OID=.;OPOS=19735257;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0
chr19	19789528	.	A	G	654.87	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00973566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=315.48;QD=60.9184;RBI=0.0241749;REFB=0;REVB=0.0221278;RO=0;SAF=25;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.1719e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.62065e-05;OID=.;OPOS=19789528;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:41:43:1:16:25:0:0:18:25:0:0
chr19	19855654	.	C	T	166.36	PASS	AF=0.4;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=45;FR=.;FRO=27;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=7;FWDB=0.00953883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.924;QD=14.7874;RBI=0.0342868;REFB=-0.0232232;REVB=-0.0329332;RO=27;SAF=10;SAR=8;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201434;STB=0.615266;STBP=0.266;TYPE=snp;VARB=0.0349888;OID=.;OPOS=19855654;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:27:27:18:18:0.4:8:10:20:7:8:10:20:7
chr19	19910250	.	T	C	500.69	PASS	AF=0.573171;AO=47;DP=82;FAO=47;FDP=82;FR=.;FRO=35;FSAF=21;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0428494;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=100.497;QD=24.4238;RBI=0.0442597;REFB=0.00272408;REVB=0.0110836;RO=35;SAF=21;SAR=26;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0370373;STB=0.520287;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.0022259;OID=.;OPOS=19910250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:35:35:47:47:0.573171:26:21:14:21:26:21:14:21
chr19	20003109	.	A	G	150.9	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0725066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.5355;QD=43.1154;RBI=0.0824729;REFB=0;REVB=0.039301;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00447421;OID=.;OPOS=20003109;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:13:14:1:6:7:0:0:6:8:0:0
chr19	20044041	.	G	T	48.88	PASS	AF=0.466667;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0220754;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.81;QD=13.036;RBI=0.129102;REFB=-0.0226731;REVB=-0.127201;RO=5;SAF=6;SAR=1;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275355;STB=0.749165;STBP=0.143;TYPE=snp;VARB=0.00394988;OID=.;OPOS=20044041;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:48:16:15:5:8:7:7:0.466667:1:6:3:2:1:6:4:4
chr19	20117685	.	G	A	280.87	PASS	AF=0.54717;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.000294861;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.253;QD=21.1975;RBI=0.00683187;REFB=-0.0176261;REVB=0.0068255;RO=24;SAF=15;SAR=14;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122849;STB=0.568017;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=0.0196317;OID=.;OPOS=20117685;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:53:24:24:29:29:0.54717:14:15:16:8:14:15:16:8
chr19	20135066	.	G	T	92.19	PASS	AF=0.292683;AO=12;DP=41;FAO=12;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=5;FWDB=-0.0126416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.694;QD=8.99389;RBI=0.0127992;REFB=-0.000976264;REVB=0.00200255;RO=29;SAF=7;SAR=5;SRF=24;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.320574;STB=0.688635;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00370746;OID=.;OPOS=20135066;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:41:41:29:29:12:12:0.292683:5:7:24:5:5:7:24:5
chr19	20150125	.	T	C	120.18	PASS	AF=0.411765;AO=14;DP=34;FAO=14;FDP=34;FR=.;FRO=20;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0192265;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.77;QD=14.1389;RBI=0.0263431;REFB=-0.01064;REVB=-0.0180084;RO=20;SAF=10;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.232219;STB=0.636159;STBP=0.215;TYPE=snp;VARB=0.0257367;OID=.;OPOS=20150125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:20:20:14:14:0.411765:4:10:10:10:4:10:10:10
chr19	20150175	.	G	C	147.22	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.000341957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.693;QD=17.3203;RBI=0.0100241;REFB=-0.0161142;REVB=-0.0100183;RO=17;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0236638;STB=0.503727;STBP=0.97;TYPE=snp;VARB=0.0270297;OID=.;OPOS=20150175;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:18:16:16:0.470588:7:9:10:7:7:9:10:8
chr19	20228941	.	A	G	43.68	PASS	AF=0.75;AO=6;DP=8;FAO=6;FDP=8;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0275039;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=180.692;QD=21.8396;RBI=0.0357778;REFB=-0.0415635;REVB=-0.022882;RO=2;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0159881;OID=.;OPOS=20228941;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:8:2:2:6:6:0.75:3:3:1:1:3:3:1:1
chr19	20229486	.	G	A	89.81	PASS	AF=0.44;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=2;FWDB=-0.00261804;FXX=0.0384468;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.619;QD=14.3701;RBI=0.0184009;REFB=0.000604406;REVB=0.0182137;RO=14;SAF=4;SAR=7;SRF=12;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.447146;STB=0.756357;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=-0.00277553;OID=.;OPOS=20229486;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:26:25:14:14:11:11:0.44:7:4:12:2:7:4:12:2
chr19	20369503	.	C	G	1041.74	PASS	AF=0.52356;AO=98;DP=189;FAO=100;FDP=191;FR=.;FRO=91;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=46;FSRR=45;FWDB=-0.0144987;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3405;QD=21.8165;RBI=0.0371037;REFB=-0.00747845;REVB=-0.0341537;RO=90;SAF=45;SAR=53;SRF=45;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0357902;STB=0.521735;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00786461;OID=.;OPOS=20369503;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:189:191:90:91:98:100:0.52356:53:45:45:45:54:46:46:45
chr19	20808149	.	A	G	1084.26	PASS	AF=0.986486;AO=73;DP=74;FAO=73;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0428222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.96;QD=58.6085;RBI=0.0887291;REFB=-0.0309168;REVB=0.0777117;RO=0;SAF=32;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506022;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=0.000497599;OID=.;OPOS=20808149;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:74:74:0:1:73:73:0.986486:41:32:0:0:41:32:0:1
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chr19	21606429	.	G	T	87.96	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00917146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.298;QD=13.5326;RBI=0.010048;REFB=-0.0257529;REVB=-0.00410443;RO=14;SAF=7;SAR=4;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0654098;STB=0.561929;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.0280716;OID=.;OPOS=21606429;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:14:15:11:11:0.423077:4:7:8:6:4:7:8:7
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chr19	21719401	.	T	C	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0176385;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=182.362;QD=51.9167;RBI=0.0261247;REFB=0;REVB=0.0192713;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139573;OID=.;OPOS=21719401;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr19	21719449	.	G	A	66.32	PASS	AF=0.409091;AO=8;DP=21;FAO=9;FDP=22;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.0119739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=328.563;QD=12.059;RBI=0.0240243;REFB=-0.00639613;REVB=-0.0208277;RO=13;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168369;STB=0.555432;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.0112097;OID=.;OPOS=21719449;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:22:13:13:8:9:0.409091:5:3:7:6:5:4:7:6
chr19	21948570	.	T	C	143.88	PASS	AF=0.333333;AO=19;DP=56;FAO=19;FDP=57;FR=.;FRO=38;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=-0.0522315;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.8085;QD=10.0968;RBI=0.0547123;REFB=-0.0129993;REVB=-0.0162882;RO=37;SAF=10;SAR=9;SRF=18;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0447508;STB=0.517542;STBP=0.845;TYPE=snp;VARB=0.0318562;OID=.;OPOS=21948570;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:57:37:38:19:19:0.333333:9:10:18:19:9:10:19:19
chr19	22115982	.	A	G	191.28	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00308078;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9475;QD=47.8188;RBI=0.0304959;REFB=0;REVB=0.0303399;RO=0;SAF=6;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00115947;OID=.;OPOS=22115982;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:10:6:0:0:10:6:0:0
chr19	22115990	.	G	A	59.36	PASS	AF=0.533333;AO=8;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0441239;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8197;QD=15.8296;RBI=0.0954586;REFB=-0.00865897;REVB=-0.0846489;RO=7;SAF=3;SAR=5;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0775671;STB=0.545344;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.00820519;OID=.;OPOS=22115990;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:15:7:7:8:8:0.533333:5:3:2:5:5:3:2:5
chr19	22153495	.	A	T	180.86	PASS	AF=0.392857;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=56;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=6;FWDB=-0.0459447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.3318;QD=12.9187;RBI=0.0487707;REFB=-0.0227345;REVB=-0.0163605;RO=32;SAF=13;SAR=9;SRF=27;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.292046;STB=0.654135;STBP=0.112;TYPE=snp;VARB=0.0205165;OID=.;OPOS=22153495;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:32:34:22:22:0.392857:9:13:27:5:9:13:28:6
chr19	22154732	.	T	C	128.88	PASS	AF=0.295082;AO=18;DP=61;FAO=18;FDP=61;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=25;FSRR=18;FWDB=-0.0304592;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.733;QD=8.45107;RBI=0.0337156;REFB=-0.0174511;REVB=-0.014456;RO=43;SAF=10;SAR=8;SRF=25;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309276;STB=0.518498;STBP=0.84;TYPE=snp;VARB=0.0301205;OID=.;OPOS=22154732;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:43:43:18:18:0.295082:8:10:25:18:8:10:25:18
chr19	22154954	.	C	T	172.12	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=-0.00430152;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.376;QD=18.1182;RBI=0.0412018;REFB=-0.019734;REVB=-0.0409766;RO=20;SAF=14;SAR=4;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152657;STB=0.587681;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.0148082;OID=.;OPOS=22154954;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:4:14:13:7:4:14:13:7
chr19	22156482	.	G	T	154.07	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=-0.0746888;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.5795;QD=14.3318;RBI=0.0766324;REFB=0.000311851;REVB=0.0171492;RO=25;SAF=9;SAR=8;SRF=20;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.289312;STB=0.672094;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.00270613;OID=.;OPOS=22156482;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:25:26:17:17:0.395349:8:9:20:5:8:9:21:5
chr19	22156585	.	G	T	115.05	PASS	AF=1;AO=8;DP=9;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100512;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.4061;QD=41.8349;RBI=0.102545;REFB=0;REVB=0.0203145;RO=0;SAF=3;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.46938e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0032582;OID=.;OPOS=22156585;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:11:0:0:8:11:1:5:3:0:0:6:5:0:0
chr19	22156992	.	C	T	61.38	PASS	AF=0.615385;AO=8;DP=13;FAO=8;FDP=13;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0614056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.092;QD=18.8866;RBI=0.0616252;REFB=-0.0273937;REVB=-0.00519796;RO=5;SAF=1;SAR=7;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.101851;STB=0.559836;STBP=0.764;TYPE=snp;VARB=0.0183127;OID=.;OPOS=22156992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:13:13:5:5:8:8:0.615385:7:1:1:4:7:1:1:4
chr19	22157302	.	G	A	393.47	PASS	AF=0.493827;AO=39;DP=83;FAO=40;FDP=81;FR=.;FRO=41;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=28;FWDB=-0.0206951;FXX=0.0240935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.4;QD=19.4305;RBI=0.0254568;REFB=-0.00509586;REVB=-0.0148244;RO=41;SAF=22;SAR=17;SRF=13;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.224432;STB=0.628353;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.00596157;OID=.;OPOS=22157302;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:81:41:41:39:40:0.493827:17:22:13:28:17:23:13:28
chr19	22363493	.	G	A	46.22	PASS	AF=0.304348;AO=8;DP=24;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0110714;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.6692;QD=8.03805;RBI=0.0232843;REFB=-0.00956105;REVB=-0.0204837;RO=15;SAF=5;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169958;STB=0.59233;STBP=0.61;TYPE=snp;VARB=0.0208421;OID=.;OPOS=22363493;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:24:23:15:16:8:7:0.304348:3:5:7:8:3:4:7:9
chr19	22363508	.	G	A	88.78	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0217866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.723;QD=14.7964;RBI=0.0413952;REFB=-0.00931043;REVB=0.0351981;RO=13;SAF=4;SAR=7;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.233296;STB=0.636116;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.00709249;OID=.;OPOS=22363508;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:13:13:11:11:0.458333:7:4:8:5:7:4:8:5
chr19	22363589	.	C	T	31.6	PASS	AF=0.555556;AO=5;DP=9;FAO=5;FDP=9;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.0529924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0605;QD=14.043;RBI=0.0616672;REFB=-0.0159759;REVB=-0.0315381;RO=4;SAF=1;SAR=4;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.268008;STB=0.665923;STBP=0.429;TYPE=snp;VARB=0.00332648;OID=.;OPOS=22363589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:9:9:4:4:5:5:0.555556:4:1:2:2:4:1:2:2
chr19	22363610	.	A	G	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.0187077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.135;QD=11.0924;RBI=0.0376633;REFB=0.0319728;REVB=-0.0326886;RO=6;SAF=1;SAR=4;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.308675;STB=0.694785;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=-0.00756693;OID=.;OPOS=22363610;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:4:1:3:3:4:1:3:3
chr19	22363615	.	T	C	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.021004;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.158;QD=10.0339;RBI=0.0234277;REFB=-0.0115148;REVB=-0.0103774;RO=7;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.378245;STB=0.7397;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.0532827;OID=.;OPOS=22363615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:4:1:4:3:4:1:4:3
chr19	22363631	.	G	A	30.49	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0268423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.25;QD=11.0872;RBI=0.0312449;REFB=-0.0149153;REVB=-0.0159917;RO=6;SAF=1;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.429493;STB=0.7681;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.0263939;OID=.;OPOS=22363631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:4:1:4:2:4:1:4:2
chr19	22575488	.	C	T	708.44	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00760432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.86;QD=62.9722;RBI=0.0146359;REFB=0;REVB=-0.0125053;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.97292e-05;OID=.;OPOS=22575488;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0
chr19	22586192	.	A	G	124.2	PASS	AF=1;AO=9;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105616;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=290.825;QD=41.3999;RBI=0.0677369;REFB=0;REVB=0.0669084;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000825469;OID=.;OPOS=22586192;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:9:12:1:0:9:0:0:2:10:0:0
chr19	22817278	.	T	G	107.32	PASS	AF=0.75;AO=11;DP=16;FAO=12;FDP=16;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0973505;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.738;QD=26.8297;RBI=0.127486;REFB=-0.110679;REVB=0.0823144;RO=4;SAF=5;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215993;STB=0.521241;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0461999;OID=.;OPOS=22817278;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:16:16:4:4:11:12:0.75:6:5:2:2:7:5:2:2
chr19	22846788	.	C	A	352.88	PASS	AF=0.62963;AO=34;DP=54;FAO=34;FDP=54;FR=.;FRO=20;FSAF=17;FSAR=17;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0087031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.006;QD=26.1395;RBI=0.0138387;REFB=-0.02181;REVB=0.0107594;RO=20;SAF=17;SAR=17;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0676363;STB=0.537015;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0161699;OID=.;OPOS=22846788;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:20:20:34:34:0.62963:17:17:8:12:17:17:8:12
chr19	22847072	.	G	C	38.15	PASS	AF=0.4;AO=6;DP=15;FAO=6;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=-0.00554432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.501;QD=10.1733;RBI=0.0552406;REFB=-0.00973415;REVB=0.0549617;RO=9;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114905;STB=0.571184;STBP=0.734;TYPE=snp;VARB=0.0189661;OID=.;OPOS=22847072;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:9:9:6:6:0.4:2:4:5:4:2:4:5:4
chr19	22848028	.	G	C	30.5	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.019349;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.044;QD=11.0923;RBI=0.0194771;REFB=-0.0146398;REVB=0.00222961;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0621951;STB=0.538311;STBP=0.816;TYPE=snp;VARB=0.0174036;OID=.;OPOS=22848028;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:11:11:6:6:5:5:0.454545:2:3:4:2:2:3:4:2
chr19	22868096	.	A	G	182.84	PASS	AF=0.377049;AO=23;DP=61;FAO=23;FDP=61;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.00640712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.459;QD=11.9894;RBI=0.00755431;REFB=-0.00481534;REVB=-0.00400205;RO=38;SAF=11;SAR=12;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0234563;STB=0.51354;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.005145;OID=.;OPOS=22868096;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:38:38:23:23:0.377049:12:11:19:19:12:11:19:19
chr19	22868147	.	G	A	150.39	PASS	AF=0.346939;AO=17;DP=49;FAO=17;FDP=49;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=-0.0142227;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.819;QD=12.2767;RBI=0.0269774;REFB=-0.0290185;REVB=0.0229237;RO=32;SAF=8;SAR=9;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326489;STB=0.519208;STBP=0.821;TYPE=snp;VARB=0.0395441;OID=.;OPOS=22868147;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:32:32:17:17:0.346939:9:8:16:16:9:8:16:16
chr19	22868205	.	T	C	74.67	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=0.020204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.6322;QD=10.6669;RBI=0.0744592;REFB=-0.00496019;REVB=0.0716657;RO=17;SAF=5;SAR=5;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.030867;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0176512;OID=.;OPOS=22868205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:17:18:10:10:0.357143:5:5:8:9:5:5:9:9
chr19	22868445	.	C	T	253.42	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=58;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=0.0220829;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.624;QD=17.4773;RBI=0.023577;REFB=-0.0187138;REVB=0.00825954;RO=30;SAF=6;SAR=22;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248702;STB=0.640994;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0200722;OID=.;OPOS=22868445;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:30:30:28:28:0.482759:22:6:13:17:22:6:13:17
chr19	22868470	.	G	T	227.0	PASS	AF=0.478261;AO=22;DP=48;FAO=22;FDP=46;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=17;FSRF=6;FSRR=18;FWDB=0.00921921;FXX=0.041658;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.821;QD=19.7389;RBI=0.0206525;REFB=0.00206576;REVB=0.0184806;RO=24;SAF=5;SAR=17;SRF=6;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0292463;STB=0.516559;STBP=0.854;TYPE=snp;VARB=-0.0030437;OID=.;OPOS=22868470;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:46:24:24:22:22:0.478261:17:5:6:18:17:5:6:18
chr19	22868479	.	C	T	194.51	PASS	AF=0.434783;AO=20;DP=46;FAO=20;FDP=46;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=16;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.0130447;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.865;QD=16.9138;RBI=0.0278625;REFB=-0.00769429;REVB=-0.0246202;RO=23;SAF=4;SAR=16;SRF=5;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0250702;STB=0.556902;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.0104574;OID=.;OPOS=22868479;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:26:20:20:0.434783:16:4:5:18:16:4:7:19
chr19	22868484	.	C	T	154.1	PASS	AF=0.395349;AO=17;DP=43;FAO=17;FDP=43;FR=.;FRO=26;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=-0.0245609;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.825;QD=14.3349;RBI=0.0367552;REFB=-0.0171085;REVB=-0.0273442;RO=26;SAF=4;SAR=13;SRF=7;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0474709;STB=0.527642;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0285092;OID=.;OPOS=22868484;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:26:17:17:0.395349:13:4:7:19:13:4:7:19
chr19	22868541	.	G	A	35.95	PASS	AF=0.26087;AO=6;DP=23;FAO=6;FDP=23;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.00523024;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.318;QD=6.25138;RBI=0.0402379;REFB=-0.00942;REVB=0.0398965;RO=17;SAF=2;SAR=4;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0247213;STB=0.516075;STBP=0.964;TYPE=snp;VARB=0.0286432;OID=.;OPOS=22868541;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:23:23:17:17:6:6:0.26087:4:2:6:11:4:2:6:11
chr19	22868896	.	A	T	50.46	PASS	AF=0.7;AO=5;DP=9;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0969236;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.6903;QD=20.1825;RBI=0.0971817;REFB=-0.0742823;REVB=0.00707829;RO=3;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.165639;STB=0.571224;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0497489;OID=.;OPOS=22868896;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:9:10:3:3:5:7:0.7:2:3:1:2:3:4:1:2
chr19	22868965	.	T	C	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.859;QD=39.2059;RBI=0.125488;REFB=0;REVB=0.0462166;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00269486;OID=.;OPOS=22868965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr19	22937148	.	G	A	108.85	PASS	AF=0.666667;AO=12;DP=18;FAO=12;FDP=18;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00981036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.368;QD=24.1898;RBI=0.0786772;REFB=-0.0179894;REVB=-0.0780631;RO=6;SAF=11;SAR=1;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137682;STB=0.578798;STBP=0.635;TYPE=snp;VARB=0.00768575;OID=.;OPOS=22937148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:18:18:6:6:12:12:0.666667:1:11:5:1:1:11:5:1
chr19	22937238	.	T	C	182.22	PASS	AF=0.365079;AO=23;DP=63;FAO=23;FDP=63;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=-0.00418096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.548;QD=11.5693;RBI=0.0313636;REFB=-0.00631116;REVB=0.0310837;RO=40;SAF=8;SAR=15;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117796;STB=0.568452;STBP=0.43;TYPE=snp;VARB=0.0121498;OID=.;OPOS=22937238;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:40:40:23:23:0.365079:15:8:18:22:15:8:18:22
chr19	22937334	.	G	T	489.49	PASS	AF=0.48;AO=47;DP=99;FAO=48;FDP=100;FR=.;FRO=52;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=23;FSRR=29;FWDB=-0.00546964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.002;QD=19.5795;RBI=0.00669075;REFB=-0.0236186;REVB=0.00385346;RO=52;SAF=21;SAR=26;SRF=23;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00429908;STB=0.502537;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=0.0237701;OID=.;OPOS=22937334;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:100:52:52:47:48:0.48:26:21:23:29:27:21:23:29
chr19	22937638	.	G	A	95.95	PASS	AF=0.733333;AO=11;DP=15;FAO=11;FDP=15;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0035439;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3322;QD=25.5878;RBI=0.108127;REFB=-0.0621844;REVB=0.108069;RO=4;SAF=6;SAR=5;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138896;STB=0.578172;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0675862;OID=.;OPOS=22937638;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:15:15:4:4:11:11:0.733333:5:6:1:3:5:6:1:3
chr19	22939096	.	T	G	220.56	PASS	AF=0.402985;AO=28;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=-0.0108506;FXX=0.0289813;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.4955;QD=13.1675;RBI=0.0155982;REFB=-0.00441299;REVB=-0.0112057;RO=38;SAF=12;SAR=16;SRF=28;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.306001;STB=0.649246;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.00160446;OID=.;OPOS=22939096;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:40:28:27:0.402985:16:12:28:10:15:12:28:12
chr19	22939326	.	G	A	123.4	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.035286;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.624;QD=16.4535;RBI=0.0363075;REFB=-0.0365752;REVB=-0.00855185;RO=16;SAF=9;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.193277;STB=0.611489;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0234334;OID=.;OPOS=22939326;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:5:9:7:9:5:9:7:9
chr19	22940046	.	C	A	132.09	PASS	AF=0.636364;AO=14;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.00517336;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.15;QD=24.0162;RBI=0.0277953;REFB=0.000700757;REVB=0.0273096;RO=8;SAF=5;SAR=9;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.398326;STB=0.72193;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=-0.000419112;OID=.;OPOS=22940046;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:8:8:14:14:0.636364:9:5:8:0:9:5:8:0
chr19	22940192	.	A	AG	30.52	PASS	AF=0.454545;AO=5;DP=11;FAO=5;FDP=11;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0805576;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=126.734;QD=11.0983;RBI=0.0877864;REFB=-0.0183205;REVB=0.0348845;RO=6;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369772;STB=0.723349;STBP=0.278;TYPE=ins;VARB=0.0455176;OID=.;OPOS=22940193;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.454545:5:11:5:11:6:3:2:1:5:30:6:3:2:1:5
chr19	22940659	.	C	T	145.7	PASS	AF=0.470588;AO=17;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.0535322;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=41.852;QD=17.1408;RBI=0.158624;REFB=-0.0215656;REVB=-0.149319;RO=17;SAF=12;SAR=5;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644334;STB=0.519206;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0151806;OID=.;OPOS=22940659;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:18:17:16:0.470588:5:12:13:4:4:12:13:5
chr19	22940694	.	C	T	144.57	PASS	AF=0.339286;AO=18;DP=55;FAO=19;FDP=56;FR=.;FRO=37;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=8;FWDB=0.00528615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.473;QD=10.3263;RBI=0.0365899;REFB=-0.0135082;REVB=-0.036206;RO=37;SAF=11;SAR=7;SRF=29;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.222437;STB=0.614453;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.0239699;OID=.;OPOS=22940694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:56:37:37:18:19:0.339286:7:11:29:8:7:12:29:8
chr19	22940899	.	G	A	73.64	PASS	AF=1;AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0314473;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.859;QD=36.8186;RBI=0.0359828;REFB=0;REVB=0.017488;RO=0;SAF=2;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000805367;OID=.;OPOS=22940899;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:7:8:1:5:2:0:0:5:3:0:0
chr19	22941191	.	T	A	32.4	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.0304464;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=284.373;QD=16.199;RBI=0.0390311;REFB=0.0206307;REVB=0.0244223;RO=3;SAF=1;SAR=4;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116878;STB=0.57112;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=-0.0119239;OID=.;OPOS=22941191;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:4:1:1:2:4:1:1:2
chr19	22942061	.	A	C	76.02	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=29;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.0705993;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.225;QD=10.86;RBI=0.0802761;REFB=-0.0105685;REVB=0.0382099;RO=18;SAF=4;SAR=6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.165991;STB=0.5998;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0146319;OID=.;OPOS=22942061;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:29:28:18:18:10:10:0.357143:6:4:10:8:6:4:10:8
chr19	22942325	.	G	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0375829;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.677;QD=54.5175;RBI=0.0488848;REFB=0;REVB=-0.031261;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.55152e-05;OID=.;OPOS=22942325;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr19	22942335	.	G	A	64.87	PASS	AF=0.36;AO=9;DP=25;FAO=9;FDP=25;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=-0.0432343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.806;QD=10.3791;RBI=0.0494213;REFB=-0.00974635;REVB=-0.0239429;RO=16;SAF=7;SAR=2;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433491;STB=0.763038;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.0255198;OID=.;OPOS=22942335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:25:25:16:16:9:9:0.36:2:7:6:10:2:7:6:10
chr19	22952111	.	A	G	235.54	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0393752;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=55.4082;QD=19.2278;RBI=0.0750498;REFB=-0.00739819;REVB=0.0638911;RO=26;SAF=14;SAR=9;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124536;STB=0.57;STBP=0.401;TYPE=snp;VARB=0.0163688;OID=.;OPOS=22952111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:9:14:19:7:9:14:19:7
chr19	23316947	.	C	T	157.84	PASS	AF=0.447368;AO=17;DP=38;FAO=17;FDP=38;FR=.;FRO=21;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0156821;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.49;QD=16.6149;RBI=0.016485;REFB=-0.00146079;REVB=0.00508198;RO=21;SAF=9;SAR=8;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968596;STB=0.555491;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00227031;OID=.;OPOS=23316947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:21:21:17:17:0.447368:8:9:9:12:8:9:9:12
chr19	23328940	.	G	A	573.18	PASS	AF=0.95122;AO=39;DP=41;FAO=39;FDP=41;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0398695;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.467;QD=55.9196;RBI=0.0399839;REFB=-0.0817982;REVB=0.00302335;RO=2;SAF=15;SAR=24;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0374761;STB=0.51999;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.00175955;OID=.;OPOS=23328940;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:41:2:2:39:39:0.95122:24:15:0:2:24:15:0:2
chr19	23405457	.	T	G	46.3	PASS	AF=0.636364;AO=6;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.237353;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=46.3361;QD=16.8358;RBI=0.23772;REFB=-0.12384;REVB=0.0132018;RO=5;SAF=3;SAR=3;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.229845;STB=0.699489;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0529564;OID=.;OPOS=23405457;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:5:4:6:7:0.636364:3:3:1:4:3:4:0:4
chr19	23406165	.	T	C	255.9	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00156132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.038;QD=51.1797;RBI=0.0697404;REFB=0;REVB=0.0697229;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000338864;OID=.;OPOS=23406165;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:13:7:0:0:13:7:0:0
chr19	23406801	.	G	C	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01527;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.992;QD=50.4135;RBI=0.015771;REFB=0;REVB=-0.00394339;RO=0;SAF=8;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.52511e-05;OID=.;OPOS=23406801;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:11:8:0:0:11:8:0:0
chr19	23837365	.	A	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7233;QD=48.7371;RBI=0.0447854;REFB=0;REVB=-0.0387445;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000556094;OID=.;OPOS=23837365;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr19	23927468	.	A	G	727.75	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0159338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.709;QD=63.2823;RBI=0.0278249;REFB=0;REVB=0.022811;RO=0;SAF=23;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000106635;OID=.;OPOS=23927468;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:23:23:0:0:23:23:0:0
chr19	24184114	.	A	G	52.6	PASS	AF=0.130952;AO=11;DP=84;FAO=11;FDP=84;FR=.;FRO=73;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=-0.013131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.02;QD=2.50486;RBI=0.0469201;REFB=-0.00699908;REVB=0.0450452;RO=71;SAF=5;SAR=6;SRF=40;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132979;STB=0.60367;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0463325;OID=.;OPOS=24184114;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:84:84:71:73:11:11:0.130952:6:5:40:31:6:5:42:31
chr19	29724086	.	A	C	740.69	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00390509;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.4006;QD=63.0376;RBI=0.00763852;REFB=0;REVB=-0.00656484;RO=0;SAF=13;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.19067e-06;OID=.;OPOS=29724086;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:34:13:0:0:34:13:0:0
chr19	29724111	.	T	G	1086.39	PASS	AF=1;AO=72;DP=74;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0265304;FXX=0.0270234;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.8857;QD=60.3552;RBI=0.0437094;REFB=0;REVB=-0.0347368;RO=0;SAF=24;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000111777;OID=.;OPOS=29724111;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:72:0:0:72:72:1:48:24:0:0:48:24:0:0
chr19	30102856	.	A	G	326.05	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=29;FSRR=11;FWDB=-0.00931012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.869;QD=17.3892;RBI=0.0178053;REFB=-0.00917176;REVB=0.0151773;RO=40;SAF=14;SAR=21;SRF=29;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.302185;STB=0.668302;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.0170409;OID=.;OPOS=30102856;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:40:35:35:0.466667:21:14:29:11:21:14:29:11
chr19	30193721	.	G	A	514.78	PASS	AF=0.348066;AO=63;DP=180;FAO=63;FDP=181;FR=.;FRO=118;FSAF=39;FSAR=24;FSRF=80;FSRR=38;FWDB=0.000276991;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.7228;QD=11.3764;RBI=0.0176407;REFB=-0.0169865;REVB=-0.0176385;RO=117;SAF=39;SAR=24;SRF=79;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0692122;STB=0.541512;STBP=0.444;TYPE=snp;VARB=0.0282212;OID=.;OPOS=30193721;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:181:117:118:63:63:0.348066:24:39:79:38:24:39:80:38
chr19	30500118	.	GTGATGATGATGATGATGATGATGAT	GTGATGATGATGATGATGATGAT,GTGATGATGATGATGATGATGATGAC	1372.24	PASS	AF=0.855556,0.144444;AO=72,11;DP=92;FAO=77,13;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=50,3;FSAR=27,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0443065,0.0178902;FXX=0.0217368;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=132.945,97.6005;QD=60.9884;RBI=0.0613474,0.0178935;REFB=0,0;REVB=0.0424315,0.00034239;RO=0;SAF=46,2;SAR=26,9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00992561,0.0339644;OID=.,.;OPOS=30500119,30500143;OREF=TGA,T;OALT=-,C;OMAPALT=GTGATGATGATGATGATGATGAT,GTGATGATGATGATGATGATGATGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.855556,0.144444:72,11:92:77,13:90:0:50,3:27,10:0:0:67:0:46,2:26,9:0:0
chr19	31038995	.	T	C	172.96	PASS	AF=0.388889;AO=21;DP=54;FAO=21;FDP=54;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0227812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.665;QD=12.8117;RBI=0.032312;REFB=-0.0204355;REVB=-0.0229146;RO=33;SAF=6;SAR=15;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.227405;STB=0.632052;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=0.028833;OID=.;OPOS=31038995;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:33:33:21:21:0.388889:15:6:16:17:15:6:16:17
chr19	31769763	.	G	A	684.82	PASS	AF=0.980392;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0120493;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.906;QD=53.7115;RBI=0.126814;REFB=-0.132713;REVB=0.12624;RO=0;SAF=32;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.513508;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.00213475;OID=.;OPOS=31769763;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:49:51:0:1:48:50:0.980392:16:32:0:0:18:32:0:1
chr19	32083696	.	T	C	2159.14	PASS	AF=1;AO=137;DP=137;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.621;QD=63.0405;RBI=0.0275352;REFB=0;REVB=0.0202691;RO=0;SAF=69;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.95742e-05;OID=.;OPOS=32083696;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:137:137:0:0:137:137:1:68:69:0:0:68:69:0:0
chr19	32873697	.	CA	C,CG	505.64	PASS	AF=0.114286,0.885714;AO=4,31;DP=35;FAO=4,31;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=1,19;FSAR=3,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012882,0.00624263;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=184.282,202.461;QD=57.7872;RBI=0.0398836,0.0394559;REFB=0,0;REVB=0.0377459,0.0389589;RO=0;SAF=1,19;SAR=3,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.86674e-08,5.47712e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0154374,-0.00300314;OID=.,.;OPOS=32873698,32873698;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.114286,0.885714:4,31:35:4,31:35:0:1,19:3,12:0:0:17:0:1,19:3,12:0:0
chr19	32930069	.	G	A	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00957641;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.6975;QD=55.6543;RBI=0.0693381;REFB=0;REVB=-0.0686736;RO=0;SAF=17;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00149455;OID=.;OPOS=32930069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:10:17:0:0:10:17:0:0
chr19	33076729	.	C	T	90.33	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=22;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=-0.0251514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.724;QD=16.4228;RBI=0.0746681;REFB=0.0093993;REVB=-0.0703045;RO=11;SAF=9;SAR=2;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.300456;STB=0.677055;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=-0.0444059;OID=.;OPOS=33076729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:22:22:11:11:11:11:0.5:2:9:6:5:2:9:6:5
chr19	33088126	.	TAG	T	721.01	PASS	AF=1;AO=44;DP=47;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116781;FXX=0.062487;HRUN=1;LEN=2;MLLD=151.262;QD=64.0897;RBI=0.0437933;REFB=0;REVB=0.0422075;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000152524;OID=.;OPOS=33088127;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:44:47:45:45:0:30:15:0:0:4:0:29:15:0:0
chr19	33096786	.	G	A	177.51	PASS	AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=15;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=-0.047162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3436;QD=14.4908;RBI=0.0653244;REFB=0.00364321;REVB=0.0451998;RO=29;SAF=15;SAR=4;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.294783;STB=0.685065;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.00668198;OID=.;OPOS=33096786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:30:19:19:0.387755:4:15:16:13:4:15:16:14
chr19	33099277	.	T	C	134.13	PASS	AF=0.454545;AO=15;DP=33;FAO=15;FDP=33;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.00760876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8783;QD=16.2576;RBI=0.0796092;REFB=-0.0031414;REVB=-0.0792448;RO=18;SAF=8;SAR=7;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211742;STB=0.512179;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=0.00362584;OID=.;OPOS=33099277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:18:18:15:15:0.454545:7:8:10:8:7:8:10:8
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chr19	33099336	.	A	G	177.47	PASS	AF=0.387755;AO=19;DP=49;FAO=19;FDP=49;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.010222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.224;QD=14.4872;RBI=0.0113711;REFB=-0.000325274;REVB=-0.00498114;RO=29;SAF=9;SAR=10;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0454997;STB=0.536442;STBP=0.704;TYPE=snp;VARB=0.000438857;OID=.;OPOS=33099336;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:29:30:19:19:0.387755:10:9:15:14:10:9:16:14
chr19	33117666	.	T	C	271.99	PASS	AF=0.46875;AO=23;DP=66;FAO=30;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=34;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0154527;FXX=0.0302984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.135;QD=16.9994;RBI=0.0210252;REFB=-0.0220404;REVB=0.0142573;RO=31;SAF=8;SAR=15;SRF=19;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.266625;STB=0.603743;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.0284591;OID=.;OPOS=33117666;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:64:31:34:23:30:0.46875:15:8:19:12:19:11:19:15
chr19	33168412	.	C	T	226.0	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00889941;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=230.84;QD=20.5458;RBI=0.00982127;REFB=-0.0349821;REVB=0.00415427;RO=22;SAF=7;SAR=15;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131399;STB=0.574254;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.0253007;OID=.;OPOS=33168412;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:15:7:10:12:15:7:10:12
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chr19	33444707	.	C	T	277.81	PASS	AF=0.581395;AO=25;DP=41;FAO=25;FDP=43;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=23;FSRF=6;FSRR=12;FWDB=-0.065624;FXX=0.0227221;HRUN=2;LEN=1;MLLD=262.723;QD=25.8429;RBI=0.06596;REFB=-0.0106222;REVB=-0.00664905;RO=15;SAF=2;SAR=23;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.426451;STB=0.724179;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0032066;OID=.;OPOS=33444707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:43:15:18:25:25:0.581395:23:2:6:9:23:2:6:12
chr19	33467357	.	G	A	283.52	PASS	AF=0.457143;AO=31;DP=69;FAO=32;FDP=70;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=-0.00470282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.064;QD=16.2009;RBI=0.00753191;REFB=-0.0175723;REVB=0.0058833;RO=36;SAF=17;SAR=14;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125457;STB=0.576465;STBP=0.256;TYPE=snp;VARB=0.0241049;OID=.;OPOS=33467357;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:70:36:38:31:32:0.457143:14:17:15:21:14:18:16:22
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chr19	33467576	.	G	A	217.79	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=17;FWDB=0.00982198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.496;QD=16.7531;RBI=0.037872;REFB=-0.0266918;REVB=0.0365762;RO=27;SAF=13;SAR=11;SRF=11;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125326;STB=0.579552;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0302483;OID=.;OPOS=33467576;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:27:28:24:24:0.461538:11:13:11:16:11:13:11:17
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chr19	33490585	.	G	A	92.18	PASS	AF=0.150794;AO=19;DP=126;FAO=19;FDP=126;FR=.;FRO=107;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=43;FSRR=64;FWDB=-0.0321061;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=180.998;QD=2.92637;RBI=0.0335518;REFB=0.00274554;REVB=0.00974303;RO=107;SAF=6;SAR=13;SRF=43;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117387;STB=0.579531;STBP=0.494;TYPE=snp;VARB=-0.0170073;OID=.;OPOS=33490585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:126:126:107:107:19:19:0.150794:13:6:43:64:13:6:43:64
chr19	33605300	.	A	G	168.86	PASS	AF=0.607143;AO=17;DP=28;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.0765466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.3602;QD=24.1224;RBI=0.0771371;REFB=-0.0199825;REVB=0.00952607;RO=11;SAF=11;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0758887;STB=0.54255;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0125886;OID=.;OPOS=33605300;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:86:28:28:11:11:17:17:0.607143:6:11:6:5:6:11:6:5
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chr19	33608733	.	C	A	112.0	PASS	AF=0.28;AO=14;DP=50;FAO=14;FDP=50;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.0440617;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=168.617;QD=8.96013;RBI=0.0457147;REFB=-0.0195299;REVB=-0.0121819;RO=32;SAF=4;SAR=10;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.444172;STB=0.789108;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0282494;OID=.;OPOS=33608733;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:32:36:14:14:0.28:10:4:22:10:10:4:26:10
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chr19	33873315	.	C	T	454.38	PASS	AF=0.471154;AO=49;DP=104;FAO=49;FDP=104;FR=.;FRO=55;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=28;FWDB=0.0104009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.25;QD=17.4762;RBI=0.0216747;REFB=0.00394125;REVB=-0.0190162;RO=55;SAF=28;SAR=21;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0771118;STB=0.542919;STBP=0.405;TYPE=snp;VARB=-0.00371069;OID=.;OPOS=33873315;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:55:55:49:49:0.471154:21:28:27:28:21:28:27:28
chr19	33878837	.	G	A	513.61	PASS	AF=0.393103;AO=56;DP=145;FAO=57;FDP=145;FR=.;FRO=88;FSAF=36;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=50;FWDB=0.0541213;FXX=0.00684885;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.3479;QD=14.1685;RBI=0.0878315;REFB=-0.00261527;REVB=0.0691755;RO=88;SAF=35;SAR=21;SRF=39;SRR=49;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197634;STB=0.621855;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.00561063;OID=.;OPOS=33878837;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:88:88:56:57:0.393103:21:35:39:49:21:36:38:50
chr19	34304260	.	A	AT	209.1	PASS	AF=0.618421;AO=35;DP=75;FAO=47;FDP=76;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.16974;FXX=0.0129853;HRUN=4;LEN=1;MLLD=10.8608;QD=11.0053;RBI=0.169924;REFB=-0.0119655;REVB=0.00791743;RO=33;SAF=16;SAR=19;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0507828;STB=0.50252;STBP=0.95;TYPE=ins;VARB=-0.00452077;OID=.;OPOS=34304261;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.618421:35:75:47:76:29:23:24:14:15:96:33:16:19:17:16
chr19	34842488	.	T	C	313.2	PASS	AF=0.515625;AO=33;DP=64;FAO=33;FDP=64;FR=.;FRO=31;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=19;FWDB=-0.0189588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.484;QD=19.5749;RBI=0.0194404;REFB=0.000953355;REVB=0.00430039;RO=31;SAF=15;SAR=18;SRF=12;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0596417;STB=0.533121;STBP=0.606;TYPE=snp;VARB=-0.00121593;OID=.;OPOS=34842488;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:31:31:33:33:0.515625:18:15:12:19:18:15:12:19
chr19	34959979	.	A	G	429.02	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0472757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.229;QD=57.2026;RBI=0.0472956;REFB=0;REVB=0.00137269;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142215;OID=.;OPOS=34959979;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:16:14:0:0:16:14:0:0
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chr19	35175775	.	C	T	834.66	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0744105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.8609;QD=57.563;RBI=0.0963732;REFB=0;REVB=0.0612443;RO=0;SAF=26;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0010245;OID=.;OPOS=35175775;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:58:0:0:57:58:1:31:26:0:0:32:26:0:0
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chr19	35420841	.	A	G	527.06	PASS	AF=0.5;AO=55;DP=110;FAO=55;FDP=110;FR=.;FRO=55;FSAF=25;FSAR=30;FSRF=36;FSRR=19;FWDB=-0.0181539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.1881;QD=19.1659;RBI=0.0323895;REFB=-0.00589413;REVB=0.0268238;RO=51;SAF=25;SAR=30;SRF=32;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.150075;STB=0.598983;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=0.00433079;OID=.;OPOS=35420841;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:110:110:51:55:55:55:0.5:30:25:32:19:30:25:36:19
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chr19	35449409	.	G	A	203.99	PASS	AF=0.526316;AO=20;DP=39;FAO=20;FDP=38;FR=.;FRO=18;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=-0.0070788;FXX=0.0256345;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.238;QD=21.4726;RBI=0.00717007;REFB=-0.000400674;REVB=0.0011404;RO=18;SAF=14;SAR=6;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.135243;STB=0.576391;STBP=0.356;TYPE=snp;VARB=0.000564137;OID=.;OPOS=35449409;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:38:18:18:20:20:0.526316:6:14:10:8:6:14:10:8
chr19	35449760	.	G	C	346.95	PASS	AF=0.45122;AO=36;DP=80;FAO=37;FDP=82;FR=.;FRO=45;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=22;FSRR=23;FWDB=0.0426411;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.947;QD=16.9246;RBI=0.0647245;REFB=0.0152341;REVB=-0.0486929;RO=44;SAF=20;SAR=16;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.054681;STB=0.54344;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=-0.0146068;OID=.;OPOS=35449760;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:82:44:45:36:37:0.45122:16:20:22:22:16:21:22:23
chr19	35450229	.	C	T	206.91	PASS	AF=0.384615;AO=25;DP=67;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=16;FWDB=0.0162202;FXX=0.0298463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=280.874;QD=12.7328;RBI=0.0393905;REFB=-0.00208136;REVB=-0.0358959;RO=38;SAF=17;SAR=8;SRF=23;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0867867;STB=0.554303;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.00263825;OID=.;OPOS=35450229;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:65:38:40:25:25:0.384615:8:17:23:15:8:17:24:16
chr19	35501051	.	T	C	483.35	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0301503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.75;QD=58.5877;RBI=0.0343312;REFB=0;REVB=0.0164193;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.68464e-05;OID=.;OPOS=35501051;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
chr19	35590180	.	T	A	127.33	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0287199;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.523;QD=11.8448;RBI=0.0309265;REFB=-0.00149766;REVB=-0.0114722;RO=26;SAF=10;SAR=5;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225901;STB=0.612749;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.00529473;OID=.;OPOS=35590180;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:26:28:15:15:0.348837:5:10:12:14:5:10:14:14
chr19	35597352	.	T	C,G	282.93	PASS	AF=0.909091,0.0909091;AO=20,2;DP=22;FAO=20,2;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=14,2;FSAR=6,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00131899,-0.00386891;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=135.576,110.311;QD=51.4426;RBI=0.0232581,0.0155791;REFB=0,0;REVB=0.0232207,0.015091;RO=0;SAF=14,2;SAR=6,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.5931e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00285534,0.0324628;OID=.,.;OPOS=35597352,35597352;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:22:22:0:0:20,2:20,2:0.909091,0.0909091:6,0:14,2:0:0:6,0:14,2:0:0
chr19	35610245	.	A	G	557.11	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00438681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.465;QD=60.2279;RBI=0.0225219;REFB=0;REVB=-0.0220905;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000182807;OID=.;OPOS=35610245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0
chr19	35612167	.	CT	AC,AT,CA	236.98	PASS	AF=0.0869565,0.0869565,0.73913;AO=2,4,7;DP=23;FAO=2,2,17;FDP=23;FR=.;FRO=2;FSAF=1,2,14;FSAR=1,0,3;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00943587,0.0336811,0.0248114;FXX=0;HRUN=5,5,3;LEN=2,1,1;MLLD=131.546,88.6957,95.6731;QD=41.2145;RBI=0.0244701,0.038756,0.0288783;REFB=-0.017292,-0.0281411,-0.0332152;REVB=0.0225776,0.0191732,0.0147769;RO=0;SAF=2,4,5;SAR=0,0,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,3.27427e-08;STB=0.5,0.992443,0.554387;STBP=1,0.312,0.343;TYPE=mnp,snp,snp;VARB=-0.0279434,0.0942182,0.0275782;OID=.,.,.;OPOS=35612167,35612167,35612168;OREF=CT,C,T;OALT=AC,A,A;OMAPALT=AC,AT,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	2/3:14:23:23:0:2:2,4,7:2,2,17:0.0869565,0.0869565,0.73913:0,0,2:2,4,5:0:0:1,0,3:1,2,14:1:1
chr19	35614336	.	T	C	689.36	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0238467;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.8009;QD=62.6692;RBI=0.0448441;REFB=0;REVB=-0.037978;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000792498;OID=.;OPOS=35614336;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr19	35614532	.	TTA	T,TT,TTT	323.4	PASS	AF=0,1,0;AO=3,13,12;DP=29;FAO=0,29,0;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=0,13,0;FSAR=0,16,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.212702,-0.136176,-0.340254;FXX=0;HRUN=8,2,2;LEN=2,1,1;MLLD=14.8724,18.5476,16.2451;QD=44.6074;RBI=0.213725,0.14081,0.340263;REFB=-0.152303,-0.0480271,0.0798011;REVB=-0.0208882,-0.0358263,-0.00243875;RO=1;SAF=1,5,7;SAR=2,8,5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.163246,0.0533084,0.0818676;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=-0.0820156,0.000202238,-0.0972258;OID=.,.,.;OPOS=35614533,35614534,35614534;OREF=TA,A,A;OALT=-,-,T;OMAPALT=T,TT,TTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,1,0:3,13,12:29:0,29,0:29:0:0,13,0:0,16,0:0:0:3:1:1,5,7:2,8,5:0:1
chr19	35616315	.	GC	AT	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00339424;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=265.823;QD=55.0987;RBI=0.0219776;REFB=0;REVB=0.0217139;RO=0;SAF=18;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28381e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=5.5115e-05;OID=.;OPOS=35616315;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:8:18:0:0:8:18:0:0
chr19	35616663	.	A	G	728.93	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0558059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.368;QD=57.1713;RBI=0.0561721;REFB=0;REVB=-0.00640437;RO=0;SAF=23;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108121;OID=.;OPOS=35616663;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:28:23:0:0:28:23:0:0
chr19	35616692	.	C	T	770.56	PASS	AF=0.98;AO=48;DP=49;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0527508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.663;QD=61.6445;RBI=0.0571592;REFB=-0.127287;REVB=-0.0220118;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511107;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.00237208;OID=.;OPOS=35616692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:49:50:0:1:48:49:0.98:27:21:0:0:27:22:1:0
chr19	35617122	.	A	G	557.07	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0454985;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6433;QD=60.2236;RBI=0.0519133;REFB=0;REVB=-0.0249977;RO=0;SAF=11;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115809;OID=.;OPOS=35617122;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:26:11:0:0:26:11:0:0
chr19	35617270	.	T	C	255.89	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287445;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0474;QD=51.178;RBI=0.0287746;REFB=0;REVB=0.00131594;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000510746;OID=.;OPOS=35617270;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:12:8:0:0:12:8:0:0
chr19	35617639	.	C	G	61.11	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0871;QD=34.9224;RBI=0.0436247;REFB=0;REVB=-0.0170871;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0008856;OID=.;OPOS=35617639;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:2:4:0:0:2:5:0:0
chr19	35622695	.	A	G	594.52	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0553685;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.837;QD=60.9761;RBI=0.0558189;REFB=0;REVB=0.00707683;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000426653;OID=.;OPOS=35622695;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
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chr19	35719020	.	C	T	253.85	PASS	AF=0.510638;AO=24;DP=47;FAO=24;FDP=47;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=6;FWDB=0.0163348;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.875;QD=21.6045;RBI=0.0245806;REFB=-0.0323292;REVB=-0.0183679;RO=23;SAF=14;SAR=10;SRF=17;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.144323;STB=0.580461;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.029572;OID=.;OPOS=35719020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:23:23:24:24:0.510638:10:14:17:6:10:14:17:6
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chr19	35757427	.	G	A	131.79	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0338819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.867;QD=14.6438;RBI=0.0398491;REFB=-0.0152195;REVB=0.0209753;RO=21;SAF=8;SAR=7;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00960055;STB=0.505569;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0241955;OID=.;OPOS=35757427;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:7:8:11:10:7:8:11:10
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chr19	35843086	.	G	A	208.56	PASS	AF=0.76;AO=19;DP=25;FAO=19;FDP=25;FR=.;FRO=6;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=0.0227487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.4699;QD=33.3688;RBI=0.180116;REFB=-0.0701411;REVB=0.178673;RO=6;SAF=13;SAR=6;SRF=5;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0779026;STB=0.54267;STBP=0.506;TYPE=snp;VARB=0.0200243;OID=.;OPOS=35843086;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:35:25:25:6:6:19:19:0.76:6:13:5:1:6:13:5:1
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chr19	35998362	.	T	G	272.87	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.100814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0814;QD=51.9747;RBI=0.103743;REFB=0;REVB=-0.0244751;RO=0;SAF=5;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00165238;OID=.;OPOS=35998362;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:15:5:0:0:15:6:0:0
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chr19	36002393	.	C	T	137.61	PASS	AF=0.928571;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=14;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0246526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=147.524;QD=39.3167;RBI=0.0458686;REFB=-0.0547908;REVB=0.0386805;RO=1;SAF=7;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0603742;STB=0.533282;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0102605;OID=.;OPOS=36002393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:14:14:1:1:13:13:0.928571:6:7:1:0:6:7:1:0
chr19	36002409	.	ACTGCTGCTGCCA	ACTGCTGCCA,ACTGCTGCTG	237.24	PASS	AF=0.631579,0.368421;AO=12,7;DP=20;FAO=12,7;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12,0;FSAR=0,7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00907494,-0.000320925;FXX=0.049975;HRUN=1,2;LEN=3,3;MLLD=304.27,49.6073;QD=49.946;RBI=0.0619649,0.0773033;REFB=0,0;REVB=-0.0612968,0.0773027;RO=0;SAF=12,0;SAR=0,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,del;VARB=0.0043949,0.00207255;OID=.,.;OPOS=36002410,36002419;OREF=CTG,CCA;OALT=-,-;OMAPALT=ACTGCTGCCA,ACTGCTGCTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.631579,0.368421:12,7:20:12,7:19:0:12,0:0,7:0:0:48:0:12,0:0,7:0:0
chr19	36002710	.	C	A	327.65	PASS	AF=0.418605;AO=36;DP=86;FAO=36;FDP=86;FR=.;FRO=50;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.00372278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.117;QD=15.2395;RBI=0.00659799;REFB=-0.0149803;REVB=0.00544741;RO=47;SAF=19;SAR=17;SRF=29;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0906108;STB=0.565891;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.0181594;OID=.;OPOS=36002710;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:47:50:36:36:0.418605:17:19:29:18:17:19:32:18
chr19	36004106	.	A	G	538.51	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00220318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8218;QD=59.8344;RBI=0.0374081;REFB=0;REVB=-0.0373431;RO=0;SAF=8;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00043679;OID=.;OPOS=36004106;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:28:8:0:0:28:8:0:0
chr19	36017928	.	G	C	161.14	PASS	AF=1;AO=9;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.196404;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=358.983;QD=46.0414;RBI=0.197991;REFB=0;REVB=0.0250157;RO=0;SAF=0;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00111146;OID=.;OPOS=36017928;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:9:14:1:9:0:0:0:10:4:0:0
chr19	36033460	.	C	T	661.52	PASS	AF=0.623656;AO=57;DP=93;FAO=58;FDP=93;FR=.;FRO=35;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0197139;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.289;QD=28.4523;RBI=0.0201266;REFB=-0.00635913;REVB=0.00405491;RO=34;SAF=33;SAR=24;SRF=14;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.115515;STB=0.570445;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00461109;OID=.;OPOS=36033460;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:34:35:57:58:0.623656:24:33:14:20:24:34:14:21
chr19	36050969	.	A	G	61.76	PASS	AF=0.307692;AO=8;DP=26;FAO=8;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=17;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=15;FSRR=2;FWDB=-0.0117549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.741;QD=9.50117;RBI=0.0510528;REFB=-0.00930173;REVB=-0.0496811;RO=15;SAF=6;SAR=2;SRF=13;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189262;STB=0.636085;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.0222649;OID=.;OPOS=36050969;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:26:26:15:17:8:8:0.307692:2:6:13:2:2:6:15:2
chr19	36066570	.	A	G	3019.93	PASS	AF=0.912664;AO=208;DP=229;FAO=209;FDP=229;FR=.;FRO=20;FSAF=78;FSAR=131;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.00102262;FXX=0.00865763;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.797;QD=52.7499;RBI=0.00862119;REFB=0.00573849;REVB=0.00856033;RO=20;SAF=78;SAR=130;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0568177;STB=0.530035;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=-0.000303919;OID=.;OPOS=36066570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:229:229:20:20:208:209:0.912664:130:78:14:6:131:78:14:6
chr19	36066577	.	A	G	2838.39	PASS	AF=0.916667;AO=198;DP=216;FAO=198;FDP=216;FR=.;FRO=18;FSAF=79;FSAR=119;FSRF=13;FSRR=5;FWDB=-0.000708885;FXX=0.00460808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.218;QD=52.5629;RBI=0.084038;REFB=-0.0120517;REVB=0.084035;RO=18;SAF=79;SAR=119;SRF=13;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0526805;STB=0.527764;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.00129443;OID=.;OPOS=36066577;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:216:216:18:18:198:198:0.916667:119:79:13:5:119:79:13:5
chr19	36066634	.	A	G	2166.45	PASS	AF=0.932099;AO=151;DP=163;FAO=151;FDP=162;FR=.;FRO=11;FSAF=72;FSAR=79;FSRF=7;FSRR=4;FWDB=-0.0220746;FXX=0.00613459;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.1711;QD=53.4925;RBI=0.0257312;REFB=-0.0128845;REVB=0.0132216;RO=11;SAF=72;SAR=79;SRF=7;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0205758;STB=0.510844;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00186228;OID=.;OPOS=36066634;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:163:162:11:11:151:151:0.932099:79:72:7:4:79:72:7:4
chr19	36066642	.	A	G	1792.16	PASS	AF=0.925373;AO=123;DP=134;FAO=124;FDP=134;FR=.;FRO=10;FSAF=68;FSAR=56;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.0607565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.476;QD=53.4974;RBI=0.0610632;REFB=0.00232715;REVB=0.00611168;RO=10;SAF=67;SAR=56;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00794405;STB=0.50389;STBP=0.78;TYPE=snp;VARB=-0.000422068;OID=.;OPOS=36066642;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:134:134:10:10:123:124:0.925373:56:67:6:4:56:68:6:4
chr19	36066645	.	A	G	1672.63	PASS	AF=0.894737;AO=118;DP=132;FAO=119;FDP=133;FR=.;FRO=14;FSAF=68;FSAR=51;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.011327;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.31;QD=50.3048;RBI=0.0115363;REFB=-0.0364833;REVB=0.00218712;RO=13;SAF=67;SAR=51;SRF=6;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.020257;STB=0.507657;STBP=0.594;TYPE=snp;VARB=0.00441479;OID=.;OPOS=36066645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:132:133:13:14:118:119:0.894737:51:67:6:7:51:68:7:7
chr19	36066661	.	A	G	1109.05	PASS	AF=0.818182;AO=81;DP=99;FAO=81;FDP=99;FR=.;FRO=18;FSAF=53;FSAR=28;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.02263;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.554;QD=44.81;RBI=0.0234157;REFB=-0.0126037;REVB=-0.00601502;RO=18;SAF=53;SAR=28;SRF=9;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570609;STB=0.530422;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.00470973;OID=.;OPOS=36066661;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:18:18:81:81:0.818182:28:53:9:9:28:53:9:9
chr19	36066667	.	A	G	850.33	PASS	AF=0.752809;AO=67;DP=89;FAO=67;FDP=89;FR=.;FRO=22;FSAF=49;FSAR=18;FSRF=11;FSRR=11;FWDB=0.00163732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.046;QD=38.2171;RBI=0.0222269;REFB=-0.00695757;REVB=-0.0221665;RO=21;SAF=49;SAR=18;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110789;STB=0.568151;STBP=0.032;TYPE=snp;VARB=0.00234302;OID=.;OPOS=36066667;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:21:22:67:67:0.752809:18:49:11:10:18:49:11:11
chr19	36123872	.	A	AC	89.96	PASS	AF=0.466667;AO=12;DP=31;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=11;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0810959;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=24.6151;QD=11.9952;RBI=0.133106;REFB=-0.0243377;REVB=0.105549;RO=16;SAF=3;SAR=9;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377878;STB=0.761988;STBP=0.014;TYPE=ins;VARB=0.0799877;OID=.;OPOS=36123873;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.466667:12:31:14:30:16:3:11:11:5:89:16:3:9:10:6
chr19	36214632	.	A	AG	1073.1	PASS	AF=1;AO=79;DP=97;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.173984;FXX=0.0106372;HRUN=1;LEN=1;MLLD=22.1076;QD=46.1548;RBI=0.175974;REFB=0;REVB=-0.0263932;RO=18;SAF=48;SAR=31;SRF=8;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0587173;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00187762;OID=.;OPOS=36214633;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:79:97:93:93:0:53:40:0:0:20:18:48:31:8:10
chr19	36243089	.	T	C	684.48	PASS	AF=0.980769;AO=47;DP=49;FAO=51;FDP=52;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=38;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0428621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=42.6924;QD=52.6527;RBI=0.0432147;REFB=-0.138282;REVB=-0.00550923;RO=0;SAF=34;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506491;STBP=0.642;TYPE=snp;VARB=0.00668068;OID=.;OPOS=36243089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:49:52:0:1:47:51:0.980769:13:34:0:0:13:38:1:0
chr19	36243813	.	G	A	1490.71	PASS	AF=0.979381;AO=95;DP=98;FAO=95;FDP=97;FR=.;FRO=2;FSAF=42;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0140049;FXX=0.0202;HRUN=3;LEN=1;MLLD=141.053;QD=61.4724;RBI=0.0253795;REFB=-0.0657987;REVB=0.0211656;RO=2;SAF=42;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175562;STB=0.509257;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.000400728;OID=.;OPOS=36243813;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:98:97:2:2:95:95:0.979381:53:42:0:2:53:42:0:2
chr19	36258937	.	AGGG	AGG,AGGC	685.35	PASS	AF=0.960784,0.0392157;AO=41,2;DP=46;FAO=49,2;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=24,0;FSAR=25,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.229242,-0.131193;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=24.4966,5.34018;QD=53.7528;RBI=0.286638,0.13826;REFB=0,0;REVB=-0.172074,0.043635;RO=0;SAF=19,0;SAR=22,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.012689,-0.0220209;OID=.,.;OPOS=36258938,36258940;OREF=G,G;OALT=-,C;OMAPALT=AGG,AGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.960784,0.0392157:41,2:46:49,2:51:0:24,0:25,2:0:0:8:0:19,0:22,2:0:0
chr19	36268771	.	C	T	639.06	PASS	AF=0.575758;AO=57;DP=99;FAO=57;FDP=99;FR=.;FRO=42;FSAF=50;FSAR=7;FSRF=31;FSRR=11;FWDB=-0.0168164;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.043;QD=25.8208;RBI=0.0196139;REFB=-0.0364906;REVB=-0.0100953;RO=42;SAF=50;SAR=7;SRF=31;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.205119;STB=0.613451;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0270897;OID=.;OPOS=36268771;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:42:42:57:57:0.575758:7:50:31:11:7:50:31:11
chr19	36270052	.	A	G	323.38	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147092;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.224;QD=53.8968;RBI=0.0656343;REFB=0;REVB=-0.0639648;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000491418;OID=.;OPOS=36270052;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0
chr19	36273308	.	G	A	286.04	PASS	AF=0.535714;AO=30;DP=56;FAO=30;FDP=56;FR=.;FRO=26;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=11;FWDB=0.00392891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.288;QD=20.4312;RBI=0.0628874;REFB=-0.000328572;REVB=0.0627645;RO=26;SAF=18;SAR=12;SRF=15;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199844;STB=0.511104;STBP=0.857;TYPE=snp;VARB=0.00119553;OID=.;OPOS=36273308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:26:26:30:30:0.535714:12:18:15:11:12:18:15:11
chr19	36278470	.	C	G	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00115065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=166.922;QD=54.8231;RBI=0.0248624;REFB=-0.0126817;REVB=0.0248357;RO=1;SAF=25;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184579;STB=0.5098;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000269015;OID=.;OPOS=36278470;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:25:25:1:0:25:25:1:0
chr19	36278634	.	G	GC	32.64	PASS	AF=0.411765;AO=3;DP=18;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=8;FWDB=-0.0595441;FXX=0.0555247;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.34495;QD=7.67959;RBI=0.103734;REFB=-0.114868;REVB=0.0849425;RO=13;SAF=0;SAR=3;SRF=3;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.556789;STB=0.562306;STBP=0.806;TYPE=ins;VARB=0.113863;OID=.;OPOS=36278635;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.411765:3:18:7:17:10:1:6:2:8:29:13:0:3:3:10
chr19	36290977	.	C	T	217.73	PASS	AF=0.461538;AO=24;DP=52;FAO=24;FDP=52;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.0242104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=112.271;QD=16.7481;RBI=0.044835;REFB=-0.0213164;REVB=0.0377364;RO=27;SAF=15;SAR=9;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.103144;STB=0.569248;STBP=0.403;TYPE=snp;VARB=0.021883;OID=.;OPOS=36290977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:27:28:24:24:0.461538:9:15:14:13:9:15:14:14
chr19	36291105	.	C	T	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=8;FWDB=0.00263683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.393;QD=15.7004;RBI=0.00752455;REFB=0.0133742;REVB=-0.00704741;RO=19;SAF=8;SAR=7;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445112;STB=0.525658;STBP=0.799;TYPE=snp;VARB=-0.013887;OID=.;OPOS=36291105;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:7:8:11:8:7:8:11:8
chr19	36322270	.	C	T	243.33	PASS	AF=0.381579;AO=29;DP=76;FAO=29;FDP=76;FR=.;FRO=47;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.00629066;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=225.056;QD=12.8069;RBI=0.0169725;REFB=-0.0202596;REVB=-0.0157636;RO=47;SAF=12;SAR=17;SRF=23;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0825363;STB=0.547345;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0371675;OID=.;OPOS=36322270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:76:47:47:29:29:0.381579:17:12:23:24:17:12:23:24
chr19	36334419	.	G	A	198.3	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=8;FWDB=0.0275074;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.196;QD=19.3465;RBI=0.0278016;REFB=-0.0213796;REVB=-0.00403409;RO=21;SAF=14;SAR=6;SRF=13;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0835471;STB=0.547437;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0196872;OID=.;OPOS=36334419;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:6:14:13:8:6:14:13:8
chr19	36342212	.	C	T	153.61	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0909062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.927;QD=21.9443;RBI=0.0911837;REFB=0.0178832;REVB=-0.00710789;RO=12;SAF=10;SAR=6;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0341381;STB=0.519207;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=-0.00662913;OID=.;OPOS=36342212;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:6:10:8:4:6:10:8:4
chr19	36342267	.	G	A	186.21	PASS	AF=0.487179;AO=18;DP=38;FAO=19;FDP=39;FR=.;FRO=20;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.00422449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.426;QD=19.0981;RBI=0.0183935;REFB=-0.0145444;REVB=-0.0179018;RO=20;SAF=12;SAR=6;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171901;STB=0.519979;STBP=0.838;TYPE=snp;VARB=0.0150247;OID=.;OPOS=36342267;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:20:20:18:19:0.487179:6:12:13:7:6:13:13:7
chr19	36355595	.	A	G	657.74	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0626359;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.6232;QD=59.7943;RBI=0.0728818;REFB=0.019492;REVB=-0.0372626;RO=1;SAF=23;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0229007;STB=0.512189;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=-0.00219328;OID=.;OPOS=36355595;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:20:23:0:1:20:23:0:1
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chr19	36387881	.	A	G	98.36	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0144806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.961;QD=14.0515;RBI=0.0149904;REFB=-0.0162786;REVB=0.00387611;RO=16;SAF=9;SAR=3;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.02291;OID=.;OPOS=36387881;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:3:9:12:4:3:9:12:4
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chr19	36394272	.	T	C	102.56	PASS	AF=0.545455;AO=10;DP=20;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.00717391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.874;QD=18.6469;RBI=0.0194755;REFB=-0.0308433;REVB=0.018106;RO=10;SAF=3;SAR=7;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0969297;STB=0.533277;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.028754;OID=.;OPOS=36394272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:20:22:10:10:10:12:0.545455:7:3:4:6:8:4:4:6
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chr19	36642884	.	T	C	76.58	PASS	AF=0.37037;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=27;FR=.;FRO=17;FSAF=1;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0825712;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.378;QD=11.3456;RBI=0.0830009;REFB=-0.00752143;REVB=0.00843494;RO=17;SAF=1;SAR=9;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.352255;STB=0.719452;STBP=0.169;TYPE=snp;VARB=0.0118913;OID=.;OPOS=36642884;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:28:27:17:17:10:10:0.37037:9:1:5:12:9:1:5:12
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chr19	36885067	.	A	T	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0453693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.24;QD=44.6895;RBI=0.0454354;REFB=0;REVB=-0.00245131;RO=0;SAF=6;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000328487;OID=.;OPOS=36885067;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:7:6:0:0:7:6:0:0
chr19	36939572	.	C	T	164.4	PASS	AF=0.375;AO=18;DP=48;FAO=18;FDP=48;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.00505503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.526;QD=13.6997;RBI=0.0159357;REFB=-0.00577826;REVB=-0.0151127;RO=30;SAF=8;SAR=10;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0486333;STB=0.528271;STBP=0.785;TYPE=snp;VARB=0.00838271;OID=.;OPOS=36939572;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:30:30:18:18:0.375:10:8:12:18:10:8:12:18
chr19	36940698	.	A	G	142.02	PASS	AF=0.484848;AO=15;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=4;FWDB=0.0202105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.0046;QD=17.2145;RBI=0.0462065;REFB=-0.0326542;REVB=0.041552;RO=17;SAF=12;SAR=3;SRF=13;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490561;STB=0.510191;STBP=0.933;TYPE=snp;VARB=0.0285496;OID=.;OPOS=36940698;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:17:17:15:16:0.484848:3:12:13:4:4:12:13:4
chr19	36940760	.	G	T	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0292493;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7243;QD=53.9107;RBI=0.0294949;REFB=0;REVB=0.003798;RO=0;SAF=19;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000431332;OID=.;OPOS=36940760;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:5:19:0:0:5:19:0:0
chr19	37004938	.	T	C	382.35	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2289;QD=54.6212;RBI=0.104888;REFB=0;REVB=0.0984333;RO=0;SAF=20;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.41836e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000745854;OID=.;OPOS=37004938;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:7:20:0:0:7:21:0:0
chr19	37005998	.	A	G	124.9	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=13;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0233351;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.491;QD=16.653;RBI=0.0235291;REFB=-0.00902794;REVB=0.00301501;RO=15;SAF=13;SAR=1;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.510127;STB=0.797683;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0215804;OID=.;OPOS=37005998;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:30:15:16:14:14:0.466667:1:13:9:6:1:13:10:6
chr19	37038416	.	T	C	209.28	PASS	AF=0.409836;AO=24;DP=61;FAO=25;FDP=61;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=22;FSRR=14;FWDB=0.0657693;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.7324;QD=13.7233;RBI=0.0893684;REFB=-0.0246349;REVB=0.0605072;RO=37;SAF=16;SAR=8;SRF=22;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.082639;STB=0.518295;STBP=0.839;TYPE=snp;VARB=0.0387633;OID=.;OPOS=37038416;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:37:36:24:25:0.409836:8:16:22:15:9:16:22:14
chr19	37039069	.	A	C	1096.82	PASS	AF=0.961538;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=48;FSAR=27;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.0533829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=77.3569;QD=56.247;RBI=0.0541795;REFB=-0.0633953;REVB=-0.00925672;RO=3;SAF=48;SAR=27;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0240116;STB=0.512704;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.00230151;OID=.;OPOS=37039069;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:78:78:3:3:75:75:0.961538:27:48:1:2:27:48:1:2
chr19	37065732	.	A	C	129.42	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.00405017;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.661;QD=12.9416;RBI=0.0155584;REFB=-0.00825643;REVB=0.015022;RO=24;SAF=11;SAR=4;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13383;STB=0.569624;STBP=0.534;TYPE=snp;VARB=0.0132237;OID=.;OPOS=37065732;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:25:15:15:0.375:4:11:15:9:4:11:16:9
chr19	37068081	.	G	C	410.92	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0148055;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.3281;QD=56.6783;RBI=0.0194327;REFB=0;REVB=0.0125868;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.74677e-05;OID=.;OPOS=37068081;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:8:21:0:0:8:21:0:0
chr19	37117302	.	A	G	158.82	PASS	AF=0.435897;AO=15;DP=38;FAO=17;FDP=39;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.00477875;FXX=0.0249938;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.386;QD=16.2889;RBI=0.00984345;REFB=-0.0183353;REVB=-0.00860564;RO=23;SAF=9;SAR=6;SRF=13;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371963;STB=0.53394;STBP=0.722;TYPE=snp;VARB=0.0211908;OID=.;OPOS=37117302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:39:23:22:15:17:0.435897:6:9:13:10:6:11:13:9
chr19	37134737	.	T	C	583.53	PASS	AF=0.427586;AO=62;DP=145;FAO=62;FDP=145;FR=.;FRO=83;FSAF=36;FSAR=26;FSRF=40;FSRR=43;FWDB=0.0625147;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.4705;QD=16.0974;RBI=0.0671871;REFB=-0.021011;REVB=-0.0246175;RO=83;SAF=36;SAR=26;SRF=40;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101686;STB=0.556932;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0279646;OID=.;OPOS=37134737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:145:145:83:83:62:62:0.427586:26:36:40:43:26:36:40:43
chr19	37210529	.	A	G	149.3	PASS	AF=0.414634;AO=16;DP=39;FAO=17;FDP=41;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.115876;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.0757;QD=14.5662;RBI=0.124664;REFB=0.00774279;REVB=-0.0459769;RO=23;SAF=5;SAR=11;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.22245;STB=0.589178;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=-0.00492541;OID=.;OPOS=37210529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:41:23:24:16:17:0.414634:11:5:12:11:11:6:12:12
chr19	37210805	.	C	T	145.5	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.0051671;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.1218;QD=16.1661;RBI=0.0546702;REFB=0.00117098;REVB=-0.0544255;RO=20;SAF=12;SAR=4;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268942;STB=0.656041;STBP=0.122;TYPE=snp;VARB=-0.00706999;OID=.;OPOS=37210805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:4:12:10:10:4:12:10:10
chr19	37239278	.	C	A	153.58	PASS	AF=0.571429;AO=16;DP=28;FAO=16;FDP=28;FR=.;FRO=12;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=0.0408695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.3322;QD=21.9394;RBI=0.097011;REFB=-0.00973479;REVB=-0.0879819;RO=12;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0815107;STB=0.545815;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.00581968;OID=.;OPOS=37239278;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:12:12:16:16:0.571429:7:9:8:4:7:9:8:4
chr19	37240622	.	C	T	30.13	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0237359;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.768;QD=10.0418;RBI=0.0361799;REFB=-0.0301034;REVB=0.0273056;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274957;STB=0.517172;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.0301409;OID=.;OPOS=37240622;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:3:2:3:4:3:2:3:4
chr19	37241141	.	A	G	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.009147;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.78;QD=61.6837;RBI=0.011252;REFB=0;REVB=-0.00655282;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.00387e-05;OID=.;OPOS=37241141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:14:27:0:0:14:27:0:0
chr19	37310344	.	T	C	229.62	PASS	AF=0.480769;AO=25;DP=52;FAO=25;FDP=52;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=12;FWDB=-0.00531586;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.655;QD=17.6628;RBI=0.0183833;REFB=-0.0233858;REVB=0.0175979;RO=27;SAF=18;SAR=7;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170964;STB=0.596777;STBP=0.212;TYPE=snp;VARB=0.0231157;OID=.;OPOS=37310344;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:27:27:25:25:0.480769:7:18:15:12:7:18:15:12
chr19	37369454	.	T	G	220.39	PASS	AF=0.454545;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=55;FR=.;FRO=30;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=4;FWDB=0.0380558;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.1801;QD=16.0284;RBI=0.0720127;REFB=0.00350055;REVB=0.0611358;RO=29;SAF=13;SAR=12;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.336373;STB=0.692178;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=-0.00169925;OID=.;OPOS=37369454;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:29:30:25:25:0.454545:12:13:25:4:12:13:26:4
chr19	37369543	.	A	G	253.12	PASS	AF=0.432836;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=19;FSRR=19;FWDB=0.0254759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.0979;QD=15.1114;RBI=0.0573655;REFB=-0.0253274;REVB=0.0513983;RO=38;SAF=9;SAR=20;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.20164;STB=0.614627;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.0343176;OID=.;OPOS=37369543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:38:38:29:29:0.432836:20:9:19:19:20:9:19:19
chr19	37427675	.	G	T	74.2	PASS	AF=0.207547;AO=11;DP=53;FAO=11;FDP=53;FR=.;FRO=42;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0016642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=334.539;QD=5.60025;RBI=0.00733953;REFB=0.000991431;REVB=-0.00714836;RO=41;SAF=3;SAR=8;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.377919;STB=0.734271;STBP=0.108;TYPE=snp;VARB=-0.00425304;OID=.;OPOS=37427675;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:53:53:41:42:11:11:0.207547:8:3:24:17:8:3:24:18
chr19	37441111	.	C	T	1098.73	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.736;QD=60.2042;RBI=0.0337881;REFB=0;REVB=0.0313002;RO=0;SAF=34;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.95093e-05;OID=.;OPOS=37441111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:38:34:0:0:39:34:0:0
chr19	37441462	.	T	C	160.31	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.414;QD=45.8034;RBI=0.0842322;REFB=0;REVB=0.0832555;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000621149;OID=.;OPOS=37441462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:9:5:0:0:9:5:0:0
chr19	37441980	.	A	G	594.52	PASS	AF=1;AO=31;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0709649;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.2746;QD=60.9766;RBI=0.0709775;REFB=0;REVB=-0.00134033;RO=0;SAF=14;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000518472;OID=.;OPOS=37441980;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:31:39:1:17:14:0:0:17:22:0:0
chr19	37482151	.	A	G	1177.4	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0918244;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.652;QD=60.3797;RBI=0.0949781;REFB=0;REVB=0.0242718;RO=0;SAF=40;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224612;OID=.;OPOS=37482151;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:78:0:0:74:78:1:34:40:0:0:36:42:0:0
chr19	37487632	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.654;QD=52.6129;RBI=0.0568344;REFB=0;REVB=-0.0549962;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000326423;OID=.;OPOS=37487632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr19	37487723	.	G	A	743.03	PASS	AF=0.964286;AO=53;DP=55;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00184648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.462;QD=53.0737;RBI=0.0114928;REFB=-0.151367;REVB=0.0113435;RO=2;SAF=27;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336247;STB=0.517851;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.000905093;OID=.;OPOS=37487723;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:55:56:2:2:53:54:0.964286:26:27:2:0:27:27:2:0
chr19	37487866	.	A	T	727.8	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353515;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=216.241;QD=63.2865;RBI=0.0364904;REFB=0;REVB=0.00904516;RO=0;SAF=30;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000102313;OID=.;OPOS=37487866;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:45:46:1:15:30:0:0:15:31:0:0
chr19	37487873	.	C	A	654.56	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104414;FXX=0.0232504;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.242;QD=62.3394;RBI=0.0374488;REFB=0;REVB=0.0359638;RO=0;SAF=30;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000385308;OID=.;OPOS=37487873;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:11:30:0:0:11:31:0:0
chr19	37487975	.	G	A	324.43	PASS	AF=0.608696;AO=28;DP=47;FAO=28;FDP=46;FR=.;FRO=18;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=-0.0383043;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.198;QD=28.2113;RBI=0.0389575;REFB=-0.013612;REVB=0.00710409;RO=18;SAF=19;SAR=9;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0536084;STB=0.529595;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.0150694;OID=.;OPOS=37487975;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:18:18:28:28:0.608696:9:19:11:7:9:19:11:7
chr19	37488055	.	T	G	93.81	PASS	AF=0.324324;AO=12;DP=37;FAO=12;FDP=37;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=-0.0238927;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.225;QD=10.1417;RBI=0.0241124;REFB=-0.000812404;REVB=-0.00324786;RO=25;SAF=6;SAR=6;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673181;STB=0.540473;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.00122338;OID=.;OPOS=37488055;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:93:37:37:25:25:12:12:0.324324:6:6:11:14:6:6:11:14
chr19	37488197	.	G	A	1189.29	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0298434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.5093;QD=60.9891;RBI=0.0847832;REFB=0;REVB=0.0793572;RO=0;SAF=45;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000375838;OID=.;OPOS=37488197;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:77:78:1:32:45:0:0:32:46:0:0
chr19	37488299	.	A	G	1077.62	PASS	AF=0.9375;AO=75;DP=80;FAO=75;FDP=80;FR=.;FRO=5;FSAF=27;FSAR=48;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00530529;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.6534;QD=53.8811;RBI=0.0868943;REFB=-0.160071;REVB=0.0867322;RO=5;SAF=27;SAR=48;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00511366;STB=0.502708;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0112298;OID=.;OPOS=37488299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:80:80:5:5:75:75:0.9375:48:27:2:3:48:27:2:3
chr19	37488470	.	A	AG	183.62	PASS	AF=1;AO=3;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0383237;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.4653;QD=43.2054;RBI=0.0410364;REFB=0;REVB=-0.0146723;RO=14;SAF=0;SAR=3;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.705668;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00232069;OID=.;OPOS=37488471;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:3:17:17:17:0:10:7:0:0:4:14:0:3:10:4
chr19	37488472	.	C	G	143.7	PASS	AF=0.823529;AO=14;DP=17;FAO=14;FDP=17;FR=.;FRO=3;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.00954149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=62.5488;QD=33.8127;RBI=0.036097;REFB=-0.0262802;REVB=-0.0348131;RO=3;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.244872;STB=0.636159;STBP=0.037;TYPE=snp;VARB=0.00455485;OID=.;OPOS=37488472;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:17:17:3:3:14:14:0.823529:4:10:0:3:4:10:0:3
chr19	37488481	.	G	C	182.79	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0420748;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.964;QD=43.0089;RBI=0.0422969;REFB=-0.0678004;REVB=0.00432809;RO=1;SAF=9;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0608641;STB=0.533291;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00125458;OID=.;OPOS=37488481;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:7:9:0:1:7:9:0:1
chr19	37488499	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0242088;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.221;QD=44.6895;RBI=0.0345516;REFB=0;REVB=-0.0246525;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.75291e-06;OID=.;OPOS=37488499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr19	37619806	.	C	T	70.57	PASS	AF=0.5625;AO=9;DP=16;FAO=9;FDP=16;FR=.;FRO=7;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.016344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.994;QD=17.643;RBI=0.021676;REFB=-0.0166233;REVB=0.014238;RO=7;SAF=5;SAR=4;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0955156;STB=0.555432;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.0110279;OID=.;OPOS=37619806;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:7:7:9:9:0.5625:4:5:3:4:4:5:3:4
chr19	37642830	.	G	A	265.16	PASS	AF=0.434783;AO=30;DP=69;FAO=30;FDP=69;FR=.;FRO=39;FSAF=26;FSAR=4;FSRF=34;FSRR=5;FWDB=0.000409339;FXX=0.0142837;HRUN=2;LEN=1;MLLD=316.521;QD=15.3716;RBI=0.00684481;REFB=-0.00782904;REVB=-0.00683256;RO=39;SAF=26;SAR=4;SRF=34;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0112004;STB=0.506325;STBP=0.955;TYPE=snp;VARB=0.00824294;OID=.;OPOS=37642830;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:39:39:30:30:0.434783:4:26:34:5:4:26:34:5
chr19	37642917	.	G	A	242.55	PASS	AF=0.376623;AO=29;DP=77;FAO=29;FDP=77;FR=.;FRO=48;FSAF=26;FSAR=3;FSRF=41;FSRR=7;FWDB=0.0246215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.5566;QD=12.6;RBI=0.0250239;REFB=0.0155358;REVB=-0.00446944;RO=47;SAF=26;SAR=3;SRF=41;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065655;STB=0.563943;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=-0.02749;OID=.;OPOS=37642917;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:47:48:29:29:0.376623:3:26:41:6:3:26:41:7
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chr19	37677748	.	T	A	275.65	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=58;FAO=30;FDP=60;FR=.;FRO=30;FSAF=20;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=8;FWDB=0.0347777;FXX=0.0322529;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.663;QD=18.3767;RBI=0.0422735;REFB=-0.0431177;REVB=0.0240324;RO=32;SAF=13;SAR=10;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198853;STB=0.538437;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0418975;OID=.;OPOS=37677748;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:32:30:23:30:0.5:10:13:24:8:10:20:22:8
chr19	37690375	.	C	T	46.76	PASS	AF=0.388889;AO=7;DP=18;FAO=7;FDP=18;FR=.;FRO=11;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=7;FWDB=-0.000496225;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=243.863;QD=10.3903;RBI=0.00121644;REFB=-0.0165773;REVB=-0.00111062;RO=11;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0671836;STB=0.540869;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.0290667;OID=.;OPOS=37690375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:11:11:7:7:0.388889:4:3:4:7:4:3:4:7
chr19	37690420	.	C	T	87.46	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.00168157;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.38;QD=13.4559;RBI=0.0398273;REFB=-0.0160788;REVB=0.0397918;RO=14;SAF=6;SAR=5;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.17847;STB=0.583184;STBP=0.488;TYPE=snp;VARB=0.0138856;OID=.;OPOS=37690420;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:14:15:11:11:0.423077:5:6:5:9:5:6:6:9
chr19	37825633	.	A	T	172.07	PASS	AF=0.473684;AO=18;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.;FRO=20;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=6;FWDB=0.0112826;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6769;QD=18.1129;RBI=0.0159021;REFB=-0.00277858;REVB=0.0112063;RO=20;SAF=14;SAR=4;SRF=14;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968595;STB=0.55549;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.00261253;OID=.;OPOS=37825633;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:20:20:18:18:0.473684:4:14:14:6:4:14:14:6
chr19	37879589	.	A	G	49.59	PASS	AF=0.538462;AO=7;DP=13;FAO=7;FDP=13;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0166108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.698;QD=15.2588;RBI=0.0167736;REFB=-0.00434446;REVB=0.00233118;RO=6;SAF=4;SAR=3;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0767769;STB=0.545327;STBP=0.828;TYPE=snp;VARB=0.00430167;OID=.;OPOS=37879589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:13:13:6:6:7:7:0.538462:3:4:4:2:3:4:4:2
chr19	38030265	.	G	A	817.75	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00828434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.531;QD=57.3856;RBI=0.0160374;REFB=0;REVB=0.013732;RO=0;SAF=27;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.75033e-05;OID=.;OPOS=38030265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:30:27:0:0:30:27:0:0
chr19	38033251	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0266071;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.9483;QD=51.9164;RBI=0.0457749;REFB=0;REVB=-0.0372479;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00175894;OID=.;OPOS=38033251;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:12:9:0:0:12:9:0:0
chr19	38034016	.	TTAAAAAAAG	TAAAAAAG,TTAAAAAAG,TTAAAAAAGT,TTTAAAAAAG	120.97	PASS	AF=0.68,0,0,0;AO=5,6,2,2;DP=32;FAO=17,0,0,0;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=5,0,0,0;FSAR=12,0,0,0;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.0772032,0.16986,-0.0551051,0.0925877;FXX=0.137883;HRUN=5,7,7,7;LEN=2,1,2,1;MLLD=16.5404,8.67333,14.6622,11.1973;QD=19.3554;RBI=0.273698,0.197348,0.0566134,0.179973;REFB=-0.0876269,-0.00139439,0.0587064,0.0863768;REVB=0.262584,0.100469,0.0129809,-0.15433;RO=11;SAF=2,0,2,0;SAR=3,6,0,2;SRF=0;SRR=11;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.562032,0,0.831607,0;STB=0.517221,0.5,0.5,0.5;STBP=0.841,1,1,1;TYPE=del,del,mnp,snp;VARB=0.104293,0,0,0;OID=.,.,.,.;OPOS=38034017,38034018,38034024,38034018;OREF=TA,A,AG,A;OALT=-,-,GT,T;OMAPALT=TAAAAAAG,TTAAAAAAG,TTAAAAAAGT,TTTAAAAAAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.68,0,0,0:5,6,2,2:32:17,0,0,0:25:8:5,0,0,0:12,0,0,0:2:6:45:11:2,0,2,0:3,6,0,2:0:11
chr19	38046967	.	G	A	1283.44	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000747267;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.607;QD=61.8524;RBI=0.0318958;REFB=0;REVB=0.0318871;RO=0;SAF=63;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.38018e-05;OID=.;OPOS=38046967;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:20:63:0:0:20:63:0:0
chr19	38055612	.	A	T	1283.35	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291314;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.692;QD=61.8481;RBI=0.0322585;REFB=0;REVB=0.0138554;RO=0;SAF=55;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.22171e-05;OID=.;OPOS=38055612;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:28:55:0:0:28:55:0:0
chr19	38056574	.	T	A	1044.33	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0806615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.9161;QD=59.6758;RBI=0.0924173;REFB=0;REVB=-0.0451075;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000295782;OID=.;OPOS=38056574;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:34:36:0:0:34:36:0:0
chr19	38091932	.	A	T	801.29	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0273209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.338;QD=57.235;RBI=0.0274681;REFB=0;REVB=-0.00283981;RO=0;SAF=21;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000104429;OID=.;OPOS=38091932;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:35:21:0:0:35:21:0:0
chr19	38202516	.	A	C	215.91	PASS	AF=1;AO=17;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0043315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.461;QD=45.4538;RBI=0.155059;REFB=-0.0909806;REVB=0.154998;RO=1;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0436347;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00367749;OID=.;OPOS=38202516;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:18:19:1:0:17:19:1:10:7:0:1:12:7:0:0
chr19	38314767	.	A	G	1153.61	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00172744;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=310.921;QD=60.7162;RBI=0.0155706;REFB=0;REVB=0.0154745;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.51045e-06;OID=.;OPOS=38314767;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:36:40:0:0:36:40:0:0
chr19	38376485	.	T	A	884.44	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00138044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.526;QD=57.9959;RBI=0.0159309;REFB=0;REVB=0.0158709;RO=0;SAF=41;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31043e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13571e-05;OID=.;OPOS=38376485;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:19:41:0:0:19:42:0:0
chr19	38376925	.	A	G	227.34	PASS	AF=0.594595;AO=21;DP=36;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.00870139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4853;QD=24.5773;RBI=0.0194983;REFB=0.00527662;REVB=0.017449;RO=15;SAF=13;SAR=8;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116766;STB=0.571362;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=-0.00773762;OID=.;OPOS=38376925;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:15:15:21:22:0.594595:8:13:7:8:8:14:7:8
chr19	38377564	.	T	C	427.47	PASS	AF=0.939394;AO=31;DP=33;FAO=31;FDP=33;FR=.;FRO=2;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0504614;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=49.5358;QD=51.8147;RBI=0.121795;REFB=-0.0150396;REVB=0.11085;RO=2;SAF=13;SAR=18;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0664988;STB=0.535691;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.00453366;OID=.;OPOS=38377564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:33:33:2:2:31:31:0.939394:18:13:2:0:18:13:2:0
chr19	38377773	.	G	A	465.13	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0617063;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9827;QD=58.1408;RBI=0.0706374;REFB=0;REVB=0.0343799;RO=0;SAF=21;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00118326;OID=.;OPOS=38377773;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:11:21:0:0:11:21:0:0
chr19	38378107	.	G	A	708.46	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00111982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.6309;QD=62.9744;RBI=0.0508038;REFB=0;REVB=-0.0507915;RO=0;SAF=13;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000618618;OID=.;OPOS=38378107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:32:13:0:0:32:13:0:0
chr19	38378539	.	G	C	716.55	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261326;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.195;QD=57.3244;RBI=0.0304162;REFB=0;REVB=0.0155639;RO=0;SAF=27;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000131266;OID=.;OPOS=38378539;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:23:27:0:0:23:27:0:0
chr19	38379446	.	C	T	456.9	PASS	AF=1;AO=28;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0779844;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.978;QD=57.1123;RBI=0.0782767;REFB=0;REVB=0.00675853;RO=0;SAF=6;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000156255;OID=.;OPOS=38379446;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:28:32:1:22:6:0:0:24:8:0:0
chr19	38382328	.	C	T	1344.9	PASS	AF=0.988636;AO=87;DP=88;FAO=87;FDP=88;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0232487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.4604;QD=61.1317;RBI=0.0671767;REFB=-0.152631;REVB=-0.0630255;RO=1;SAF=30;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00824131;STB=0.504347;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00127871;OID=.;OPOS=38382328;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:88:88:1:1:87:87:0.988636:57:30:0:1:57:30:0:1
chr19	38384421	.	C	G	135.63	PASS	AF=1;AO=9;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0803717;FXX=0.0713776;HRUN=2;LEN=1;MLLD=40.1081;QD=41.733;RBI=0.085631;REFB=0.00940452;REVB=0.0295476;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00432068;OID=.;OPOS=38384421;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:14:13:0:0:9:13:1:5:4:0:0:7:6:0:0
chr19	38573149	.	G	C	263.51	PASS	AF=0.518519;AO=28;DP=54;FAO=28;FDP=54;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.000218576;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.753;QD=19.519;RBI=0.00236893;REFB=-0.0147833;REVB=-0.00235883;RO=26;SAF=11;SAR=17;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0945711;STB=0.552807;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0138316;OID=.;OPOS=38573149;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:26:26:28:28:0.518519:17:11:13:13:17:11:13:13
chr19	38610504	.	G	A	166.3	PASS	AF=0.391304;AO=17;DP=44;FAO=18;FDP=46;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=4;FWDB=0.00848252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.457;QD=14.4612;RBI=0.0176024;REFB=-0.0279447;REVB=0.0154237;RO=27;SAF=11;SAR=6;SRF=24;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.318051;STB=0.642724;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0316608;OID=.;OPOS=38610504;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:46:27:28:17:18:0.391304:6:11:24:3:6:12:24:4
chr19	38706989	.	G	A	45.37	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=-0.0325603;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.593;QD=8.24868;RBI=0.0335844;REFB=-0.00517763;REVB=-0.00823026;RO=15;SAF=5;SAR=2;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139608;STB=0.587971;STBP=0.632;TYPE=snp;VARB=0.00788707;OID=.;OPOS=38706989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:15:15:7:7:0.318182:2:5:9:6:2:5:9:6
chr19	38709568	.	C	T	70.27	PASS	AF=0.529412;AO=9;DP=18;FAO=9;FDP=17;FR=.,HEALED;FRO=8;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=0.0225577;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=77.9164;QD=16.5344;RBI=0.0581573;REFB=-0.0287435;REVB=0.0536043;RO=5;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.261101;STB=0.545357;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.0233953;OID=.;OPOS=38709568;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:18:17:5:8:9:9:0.529412:3:6:5:0:3:6:6:2
chr19	38743591	.	G	T	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.00117463;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.924;QD=16.4544;RBI=0.014784;REFB=-0.0292642;REVB=0.0147372;RO=4;SAF=2;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0648362;STB=0.538337;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.0152252;OID=.;OPOS=38743591;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:4:2:1:3:4:2:1:3
chr19	38794895	.	T	C	367.1	PASS	AF=0.411765;AO=42;DP=102;FAO=42;FDP=102;FR=.;FRO=60;FSAF=21;FSAR=21;FSRF=38;FSRR=22;FWDB=-0.0311786;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.107;QD=14.3961;RBI=0.0315207;REFB=-0.0123168;REVB=0.00463133;RO=59;SAF=21;SAR=21;SRF=37;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131919;STB=0.578395;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.020083;OID=.;OPOS=38794895;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:59:60:42:42:0.411765:21:21:37:22:21:21:38:22
chr19	38795550	.	G	GAAGAAGGAGAAGGGC	89.75	PASS	AF=0.266667;AO=10;DP=53;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0286275;FXX=0.150915;HRUN=2;LEN=15;MLLD=233.279;QD=7.97756;RBI=0.0492838;REFB=-0.0221997;REVB=-0.0401167;RO=37;SAF=5;SAR=5;SRF=21;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0824745;STB=0.57237;STBP=0.561;TYPE=ins;VARB=0.0574452;OID=.;OPOS=38795551;OREF=-;OALT=AAGAAGGAGAAGGGC;OMAPALT=GAAGAAGGAGAAGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.266667:10:53:12:45:33:5:7:17:16:89:37:5:5:21:16
chr19	38798086	.	T	C	196.13	PASS	AF=1;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0134775;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.95;QD=49.0335;RBI=0.0140436;REFB=0;REVB=0.00394707;RO=0;SAF=10;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175069;OID=.;OPOS=38798086;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:16:0:0:16:16:1:6:10:0:0:6:10:0:0
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chr19	38847431	.	T	C	263.69	PASS	AF=0.454545;AO=28;DP=64;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=21;FWDB=0.0142386;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.838;QD=15.981;RBI=0.0142469;REFB=-0.0226018;REVB=0.000486204;RO=36;SAF=13;SAR=15;SRF=15;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0477635;STB=0.545424;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.0354088;OID=.;OPOS=38847431;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:66:36:36:28:30:0.454545:15:13:15:21:15:15:15:21
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chr19	38912763	.	TA	T,TG	927.33	PASS	AF=0.0153846,0.984615;AO=20,45;DP=67;FAO=1,64;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=1,34;FSAR=0,30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0313144,-0.0575828;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=184.615,52.7551;QD=57.0665;RBI=0.0368975,0.061483;REFB=0,0;REVB=-0.019515,0.0215496;RO=0;SAF=9,25;SAR=11,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=3.0487e-08,5.09779e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0346537,-0.00114223;OID=.,.;OPOS=38912764,38912764;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0153846,0.984615:20,45:67:1,64:65:0:1,34:0,30:0:0:3:0:9,25:11,20:0:0
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chr19	39433299	.	A	G	520.03	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0311264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.954;QD=59.432;RBI=0.0350538;REFB=0;REVB=0.0161218;RO=0;SAF=20;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128454;OID=.;OPOS=39433299;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:15:20:0:0:15:20:0:0
chr19	39589189	.	C	T	2952.59	PASS	AF=0.975248;AO=197;DP=202;FAO=197;FDP=202;FR=.;FRO=5;FSAF=123;FSAR=74;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.00996273;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=287.406;QD=58.4672;RBI=0.0170915;REFB=-0.0373672;REVB=0.0138876;RO=4;SAF=123;SAR=74;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0050808;STB=0.504644;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.000134516;OID=.;OPOS=39589189;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:202:202:4:5:197:197:0.975248:74:123:3:1:74:123:4:1
chr19	39590955	.	G	A	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0231973;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.341;QD=55.6554;RBI=0.0286288;REFB=0;REVB=-0.0167777;RO=0;SAF=19;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.06954e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.9727e-05;OID=.;OPOS=39590955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:8:19:0:0:8:19:0:0
chr19	39688901	.	G	T	313.35	PASS	AF=0.96;AO=24;DP=25;FAO=24;FDP=25;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.124383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6774;QD=50.136;RBI=0.16337;REFB=-0.130771;REVB=0.105918;RO=0;SAF=14;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.52379;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00747622;OID=.;OPOS=39688901;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:25:25:0:1:24:24:0.96:10:14:0:0:10:14:0:1
chr19	39888511	.	G	A	146.39	PASS	AF=0.533333;AO=15;DP=32;FAO=16;FDP=30;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=0.0126273;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.128;QD=19.519;RBI=0.0156456;REFB=-0.0367918;REVB=0.00923765;RO=14;SAF=4;SAR=11;SRF=4;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0203786;STB=0.514688;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.0563367;OID=.;OPOS=39888511;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:30:14:14:15:16:0.533333:11:4:4:10:11:5:4:10
chr19	39891161	.	T	C	346.39	PASS	AF=0.440476;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=13;FWDB=-0.00406897;FXX=0.0117633;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.285;QD=16.4948;RBI=0.0180352;REFB=-0.0122248;REVB=0.0175702;RO=47;SAF=16;SAR=21;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.284064;STB=0.65864;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0244796;OID=.;OPOS=39891161;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:47:47:37:37:0.440476:21:16:34:13:21:16:34:13
chr19	39891219	.	C	T	350.66	PASS	AF=0.474359;AO=35;DP=76;FAO=37;FDP=78;FR=.;FRO=41;FSAF=16;FSAR=21;FSRF=25;FSRR=16;FWDB=-0.00917496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.8123;QD=17.9824;RBI=0.0163938;REFB=-0.0052848;REVB=-0.0135859;RO=41;SAF=14;SAR=21;SRF=25;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200823;STB=0.592517;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.00679316;OID=.;OPOS=39891219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:78:41:41:35:37:0.474359:21:14:25:16:21:16:25:16
chr19	39913634	.	G	A	133.13	PASS	AF=0.583333;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=24;FR=.;FRO=10;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.00237805;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.834;QD=22.1885;RBI=0.0409861;REFB=-0.027894;REVB=-0.0409171;RO=10;SAF=9;SAR=5;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.110077;STB=0.562409;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.00957023;OID=.;OPOS=39913634;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:25:24:10:10:14:14:0.583333:5:9:5:5:5:9:5:5
chr19	39914748	.	G	A	375.65	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00583528;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.126;QD=55.6522;RBI=0.0236522;REFB=0;REVB=0.0229211;RO=0;SAF=11;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.82038e-05;OID=.;OPOS=39914748;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:15:11:0:0:15:12:0:0
chr19	39915758	.	C	G	198.43	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0155526;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=230.076;QD=44.0946;RBI=0.0536665;REFB=-0.14545;REVB=0.0513635;RO=1;SAF=8;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482085;STB=0.526285;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00171557;OID=.;OPOS=39915758;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:9:8:0:1:9:8:0:1
chr19	39916110	.	GGGA	G	675.82	PASS	AF=1;AO=53;DP=56;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0395418;FXX=0.0526223;HRUN=3;LEN=3;MLLD=158.013;QD=50.061;RBI=0.0396867;REFB=0;REVB=0.00338827;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0.318824;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.00028846;OID=.;OPOS=39916111;OREF=GGA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:53:56:54:54:0:28:26:0:0:12:0:27:26:0:0
chr19	39926509	.	A	C	472.33	PASS	AF=1;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.694;QD=57.2518;RBI=0.0277769;REFB=0;REVB=0.0241023;RO=0;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000453615;OID=.;OPOS=39926509;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:32:33:1:15:17:0:0:15:18:0:0
chr19	39926521	.	G	A	446.68	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00346361;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.3826;QD=57.6363;RBI=0.0221387;REFB=0;REVB=0.0218661;RO=0;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.33668e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000113735;OID=.;OPOS=39926521;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:13:18:0:0:13:18:0:0
chr19	39932023	.	T	C	340.15	PASS	AF=0.383178;AO=41;DP=107;FAO=41;FDP=107;FR=.;FRO=66;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=32;FWDB=0.00430024;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.902;QD=12.7157;RBI=0.0269867;REFB=-0.00892945;REVB=0.0266418;RO=66;SAF=21;SAR=20;SRF=34;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00320583;STB=0.501824;STBP=0.954;TYPE=snp;VARB=0.0153;OID=.;OPOS=39932023;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:107:107:66:66:41:41:0.383178:20:21:34:32:20:21:34:32
chr19	39932066	.	T	C	1119.78	PASS	AF=0.986842;AO=71;DP=71;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=44;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0336432;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.856;QD=58.9357;RBI=0.0584807;REFB=-0.0127118;REVB=0.0478343;RO=0;SAF=30;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.21646e-08;STB=0.507934;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.000344171;OID=.;OPOS=39932066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:71:76:0:1:71:75:0.986842:41:30:0:0:44:31:1:0
chr19	39944082	.	C	T	538.52	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197255;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.3137;QD=59.8352;RBI=0.0642818;REFB=0;REVB=0.0611805;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000673922;OID=.;OPOS=39944082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0
chr19	39955533	.	G	A	170.42	PASS	AF=0.444444;AO=19;DP=45;FAO=20;FDP=45;FR=.;FRO=25;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=0.0390038;FXX=0.0217344;HRUN=5;LEN=1;MLLD=67.1774;QD=15.1483;RBI=0.102121;REFB=-0.0651408;REVB=0.0943796;RO=23;SAF=7;SAR=12;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.109198;STB=0.5;STBP=0.988;TYPE=snp;VARB=0.0400067;OID=.;OPOS=39955533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:23:25:19:20:0.444444:12:7:11:12:12:8:10:15
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chr19	39996027	.	C	T	588.28	PASS	AF=0.476562;AO=61;DP=128;FAO=61;FDP=128;FR=.;FRO=67;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=42;FSRR=25;FWDB=-0.00671646;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=139.771;QD=18.3836;RBI=0.0103543;REFB=-0.011362;REVB=0.00788039;RO=66;SAF=38;SAR=23;SRF=41;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00173512;STB=0.502183;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0149336;OID=.;OPOS=39996027;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:128:128:66:67:61:61:0.476562:23:38:41:25:23:38:42:25
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chr19	40023308	.	A	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.228;QD=49.5992;RBI=0.0212082;REFB=0;REVB=-0.00856294;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.32667e-05;OID=.;OPOS=40023308;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chr19	40030654	.	G	C	251.6	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=59;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=10;FWDB=-0.0324091;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.266;QD=17.0574;RBI=0.042629;REFB=-0.0242539;REVB=0.0276926;RO=31;SAF=19;SAR=9;SRF=21;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00123345;STB=0.500693;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.0322113;OID=.;OPOS=40030654;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:31:28:28:0.474576:9:19:21:10:9:19:21:10
chr19	40149297	.	T	A	1244.32	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163405;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.674;QD=61.4477;RBI=0.0439861;REFB=0;REVB=0.0408383;RO=0;SAF=47;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000340972;OID=.;OPOS=40149297;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:34:47:0:0:34:47:0:0
chr19	40174236	.	G	A	185.56	PASS	AF=0.407407;AO=22;DP=54;FAO=22;FDP=54;FR=.;FRO=32;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=-0.0917199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.4345;QD=13.7452;RBI=0.0943088;REFB=0.0188963;REVB=0.0219454;RO=32;SAF=4;SAR=18;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359336;STB=0.709329;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=-0.0293479;OID=.;OPOS=40174236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:32:32:22:22:0.407407:18:4:15:17:18:4:15:17
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chr19	40316137	.	AAG	A,AAA	46.36	PASS	AF=0.292683,0;AO=7,3;DP=52;FAO=12,0;FDP=41;FR=.;FRO=29;FSAF=10,0;FSAR=2,0;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=-0.00807967,0.0112394;FXX=0.0465008;HRUN=7,5;LEN=2,1;MLLD=19.4007,15.237;QD=4.52265;RBI=0.0112537,0.191172;REFB=-0.0463849,-0.0451623;REVB=-0.00783353,0.190841;RO=36;SAF=7,0;SAR=0,3;SRF=21;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.661741,-0.559149;STB=0.673825,0.5;STBP=0.223,1;TYPE=del,snp;VARB=0.125146,0;OID=.,.;OPOS=40316138,40316139;OREF=AG,G;OALT=-,A;OMAPALT=A,AAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.292683,0:7,3:52:12,0:41:29:10,0:2,0:19:10:47:36:7,0:0,3:21:15
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chr19	40368498	.	AA	CC	497.15	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146244;FXX=0;HRUN=3;LEN=2;MLLD=227.866;QD=58.4885;RBI=0.0162993;REFB=0;REVB=0.00719691;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=5.25166e-05;OID=.;OPOS=40368498;OREF=AA;OALT=CC;OMAPALT=CC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:18:15:0:0:18:16:0:0
chr19	40368520	.	G	C	88.52	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=24;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.047277;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.8818;QD=14.7533;RBI=0.0655176;REFB=0.0215701;REVB=0.045359;RO=12;SAF=5;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.115026;STB=0.586311;STBP=0.479;TYPE=snp;VARB=-0.018146;OID=.;OPOS=40368520;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:24:24:12:13:11:11:0.458333:6:5:7:5:6:5:8:5
chr19	40374034	.	A	G	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0109607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4777;QD=23.2181;RBI=0.0655056;REFB=0.0165011;REVB=0.0645821;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.00103224;OID=.;OPOS=40374034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:2:3:0:1:2:3:0:1
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chr19	40392631	.	G	A	188.68	PASS	AF=0.692308;AO=18;DP=26;FAO=18;FDP=26;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=0.0264251;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.939;QD=29.0271;RBI=0.0313188;REFB=-0.030054;REVB=0.01681;RO=7;SAF=7;SAR=11;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0948483;STB=0.535358;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0168889;OID=.;OPOS=40392631;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:26:26:7:8:18:18:0.692308:11:7:4:3:11:7:4:4
chr19	40406019	.	G	A	262.82	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=62;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0181716;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.496;QD=17.2338;RBI=0.0210706;REFB=-0.0192068;REVB=-0.010666;RO=32;SAF=15;SAR=14;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160881;STB=0.589918;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0190138;OID=.;OPOS=40406019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:32:32:29:29:0.47541:14:15:22:10:14:15:22:10
chr19	40408128	.	C	T	234.94	PASS	AF=0.46;AO=23;DP=50;FAO=23;FDP=50;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=14;FWDB=-0.00843656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.4562;QD=18.7953;RBI=0.046567;REFB=-0.00969863;REVB=0.0457964;RO=27;SAF=13;SAR=10;SRF=13;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0801687;STB=0.545415;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.00791496;OID=.;OPOS=40408128;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:27:27:23:23:0.46:10:13:13:14:10:13:13:14
chr19	40408821	.	C	G	127.75	PASS	AF=0.56;AO=14;DP=25;FAO=14;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=5;FWDB=0.136689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.0033;QD=20.4403;RBI=0.14784;REFB=-0.0232526;REVB=0.0563253;RO=11;SAF=8;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0204611;STB=0.511611;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0214062;OID=.;OPOS=40408821;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:25:25:11:11:14:14:0.56:6:8:6:5:6:8:6:5
chr19	40719076	.	T	C	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0125593;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.406;QD=11.9196;RBI=0.0744041;REFB=-0.0326341;REVB=-0.0733364;RO=9;SAF=4;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0922775;STB=0.555401;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0496621;OID=.;OPOS=40719076;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:3:4:6:3:3:4:6:3
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chr19	40739513	.	A	G	117.72	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=9;FWDB=0.0278799;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.73;QD=12.3912;RBI=0.0321048;REFB=-0.00535619;REVB=0.0159196;RO=24;SAF=10;SAR=4;SRF=15;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109875;STB=0.56512;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00693848;OID=.;OPOS=40739513;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:4:10:15:9:4:10:15:9
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chr19	41235120	.	A	G	82.7	PASS	AF=0.305556;AO=11;DP=36;FAO=11;FDP=36;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0154675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.597;QD=9.18857;RBI=0.0162962;REFB=-0.00756118;REVB=-0.00513044;RO=25;SAF=6;SAR=5;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167309;STB=0.510186;STBP=0.953;TYPE=snp;VARB=0.0199232;OID=.;OPOS=41235120;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:82:36:36:25:25:11:11:0.305556:5:6:14:11:5:6:14:11
chr19	41255500	.	C	G	51.54	PASS	AF=0.636364;AO=7;DP=11;FAO=7;FDP=11;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0336391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.558;QD=18.7433;RBI=0.0520684;REFB=-0.0551381;REVB=0.0397433;RO=4;SAF=3;SAR=4;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.197383;STB=0.615061;STBP=0.395;TYPE=snp;VARB=0.0225285;OID=.;OPOS=41255500;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:11:11:4:4:7:7:0.636364:4:3:3:1:4:3:3:1
chr19	41257396	.	C	T	125.82	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0107171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.5967;QD=18.6401;RBI=0.0132977;REFB=-0.00516988;REVB=0.00787224;RO=12;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186957;STB=0.625487;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.00800004;OID=.;OPOS=41257396;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:27:12:13:14:14:0.518519:9:5:7:5:9:5:8:5
chr19	41263403	.	A	G	127.71	PASS	AF=0.636364;AO=12;DP=22;FAO=14;FDP=22;FR=.;FRO=8;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0168569;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=204.958;QD=23.2191;RBI=0.0214798;REFB=-0.00188254;REVB=-0.0133126;RO=5;SAF=3;SAR=9;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312758;STB=0.675416;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.00109442;OID=.;OPOS=41263403;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:5:8:12:14:0.636364:9:3:4:1:10:4:6:2
chr19	41269551	.	C	T	147.23	PASS	AF=0.470588;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=34;FR=.;FRO=18;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=17;FSRR=1;FWDB=0.00515456;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.026;QD=17.3212;RBI=0.0292954;REFB=-0.0341558;REVB=0.0288384;RO=18;SAF=12;SAR=4;SRF=17;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.285898;STB=0.658936;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0155701;OID=.;OPOS=41269551;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:18:18:16:16:0.470588:4:12:17:1:4:12:17:1
chr19	41281700	.	C	T	393.36	PASS	AF=0.612903;AO=38;DP=62;FAO=38;FDP=62;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=-0.0307544;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.896;QD=25.3779;RBI=0.0310364;REFB=-0.00123896;REVB=0.00417438;RO=24;SAF=16;SAR=22;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172821;STB=0.594545;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.000496211;OID=.;OPOS=41281700;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:24:24:38:38:0.612903:22:16:16:8:22:16:16:8
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chr19	41350664	.	A	T	851.4	PASS	AF=0.925373;AO=61;DP=67;FAO=62;FDP=67;FR=.;FRO=5;FSAF=20;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.10301;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=186.787;QD=50.83;RBI=0.103018;REFB=-0.0316517;REVB=0.00130467;RO=5;SAF=19;SAR=42;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529559;STB=0.528081;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.00455809;OID=.;OPOS=41350664;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:67:67:5:5:61:62:0.925373:42:19:0:5:42:20:0:5
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chr19	41356310	.	G	A	353.69	PASS	AF=0.507246;AO=30;DP=69;FAO=35;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0235869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.543;QD=20.5035;RBI=0.0442688;REFB=-0.027926;REVB=0.0374618;RO=32;SAF=21;SAR=9;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198748;STB=0.595532;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0214545;OID=.;OPOS=41356310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:32:32:30:35:0.507246:9:21:16:16:11:24:16:16
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chr19	41381647	.	A	C	446.2	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373088;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.3752;QD=55.7748;RBI=0.299519;REFB=0;REVB=0.297187;RO=0;SAF=27;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00521904;OID=.;OPOS=41381647;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:32:0:0:28:32:1:1:27:0:0:4:28:0:0
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chr19	41622189	.	G	A	376.76	PASS	AF=0.481481;AO=39;DP=80;FAO=39;FDP=81;FR=.;FRO=42;FSAF=28;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.007971;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=291.349;QD=18.6052;RBI=0.00823735;REFB=-0.0167574;REVB=0.00207779;RO=41;SAF=28;SAR=11;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139678;STB=0.586659;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0137011;OID=.;OPOS=41622189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:81:41:42:39:39:0.481481:11:28:24:17:11:28:24:18
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chr19	41748153	.	A	G	72.7	PASS	AF=0.30303;AO=10;DP=33;FAO=10;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=-0.00443924;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=329.408;QD=8.81184;RBI=0.0263655;REFB=-0.0172066;REVB=-0.0259891;RO=23;SAF=8;SAR=2;SRF=16;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.160116;STB=0.599782;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=0.0377689;OID=.;OPOS=41748153;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:33:33:23:23:10:10:0.30303:2:8:16:7:2:8:16:7
chr19	41829581	.	T	A	83.57	PASS	AF=0.625;AO=10;DP=16;FAO=10;FDP=16;FR=.;FRO=6;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00628129;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.7356;QD=20.8915;RBI=0.00915105;REFB=0.0228262;REVB=-0.00665486;RO=6;SAF=5;SAR=5;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.219729;STB=0.624765;STBP=0.22;TYPE=snp;VARB=-0.00584357;OID=.;OPOS=41829581;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:6:6:10:10:0.625:5:5:1:5:5:5:1:5
chr19	41858921	.	G	A	74.48	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0165516;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.221;QD=22.9157;RBI=0.0179506;REFB=-0.00883487;REVB=0.00694755;RO=4;SAF=3;SAR=6;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.350345;STB=0.699568;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.00620631;OID=.;OPOS=41858921;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:6:3:4:0:6:3:4:0
chr19	41869392	.	T	C	201.02	PASS	AF=0.433962;AO=21;DP=51;FAO=23;FDP=53;FR=.;FRO=30;FSAF=18;FSAR=5;FSRF=23;FSRR=7;FWDB=0.011877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.838;QD=15.1715;RBI=0.0169653;REFB=-0.0135756;REVB=0.0121144;RO=30;SAF=17;SAR=4;SRF=23;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0673703;STB=0.513053;STBP=0.903;TYPE=snp;VARB=0.0162918;OID=.;OPOS=41869392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:53:30:30:21:23:0.433962:4:17:23:7:5:18:23:7
chr19	41889748	.	T	C	1714.99	PASS	AF=0.991304;AO=114;DP=115;FAO=114;FDP=115;FR=.;FRO=1;FSAF=46;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0763476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8058;QD=59.6518;RBI=0.0767381;REFB=-0.14397;REVB=0.00773164;RO=0;SAF=46;SAR=68;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505375;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.00626497;OID=.;OPOS=41889748;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:115:115:0:1:114:114:0.991304:68:46:0:0:68:46:1:0
chr19	41903220	.	G	A	310.31	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0622151;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.941;QD=53.9671;RBI=0.0644129;REFB=0;REVB=0.0166822;RO=0;SAF=9;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00039381;OID=.;OPOS=41903220;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:23:0:0:23:23:1:14:9:0:0:14:9:0:0
chr19	41916543	.	ACCCCCCCA	ACACCCCCCA,ACCCCCC,ACCCCCCA	94.15	PASS	AF=0,0,0.653846;AO=3,3,9;DP=28;FAO=0,0,17;FDP=26;FR=.;FRO=9;FSAF=0,0,9;FSAR=0,0,8;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=-0.0265679,-0.0879356,0.0996906;FXX=0.0370233;HRUN=0,7,7;LEN=1,2,1;MLLD=156.404,121.143,10.2677;QD=14.485;RBI=0.0983965,0.0881149,0.174791;REFB=-0.0171476,-0.0125404,-0.134488;REVB=-0.0947419,0.00561722,0.143574;RO=9;SAF=0,3,5;SAR=3,0,4;SRF=5;SRR=4;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.670564,0.640421,0;STB=0.5,0.5,0.587057;STBP=1,1,0.244;TYPE=ins,del,del;VARB=0,-0.00335539,0.108562;OID=.,.,.;OPOS=41916545,41916550,41916544;OREF=-,CA,C;OALT=A,-,-;OMAPALT=ACACCCCCCA,ACCCCCC,ACCCCCCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0,0.653846:3,3,9:28:0,0,17:26:9:0,0,9:0,0,8:7:2:34:9:0,3,5:3,0,4:5:4
chr19	41928652	.	C	T	288.69	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341608;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.3669;QD=52.4882;RBI=0.0373663;REFB=0;REVB=0.015142;RO=0;SAF=7;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00131407;OID=.;OPOS=41928652;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:15:7:0:0:15:7:0:0
chr19	41930396	.	A	G	547.3	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0562673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.1038;QD=59.1677;RBI=0.0563817;REFB=0;REVB=-0.00359074;RO=0;SAF=10;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133168;OID=.;OPOS=41930396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:35:37:1:25:10:0:0:25:12:0:0
chr19	41932084	.	G	T	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0148923;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.108;QD=52.6122;RBI=0.0296989;REFB=0;REVB=-0.0256952;RO=0;SAF=8;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.00332e-05;OID=.;OPOS=41932084;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:14:8:0:0:14:8:0:0
chr19	41932120	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226334;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=132.989;QD=45.8068;RBI=0.0637236;REFB=0;REVB=0.0595687;RO=0;SAF=6;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000829134;OID=.;OPOS=41932120;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:8:6:0:0:8:6:0:0
chr19	41932275	.	T	C	255.98	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0401431;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.6321;QD=51.1952;RBI=0.078224;REFB=0;REVB=0.0671381;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00224209;OID=.;OPOS=41932275;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:20:0:0:19:20:1:8:11:0:0:9:11:0:0
chr19	41949131	.	ACCCCCCCA	ACCCCCCA,ACCCCCCAG,GCCCCCCCA	36.18	PASS	AF=0.181818,0.0606061,0.0606061;AO=7,2,2;DP=34;FAO=6,2,2;FDP=33;FR=.;FRO=23;FSAF=3,1,0;FSAR=3,1,2;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=-0.111353,0.129291,-0.0377546;FXX=0.0571265;HRUN=7,7,1;LEN=1,2,1;MLLD=8.76372,24.2524,125.639;QD=4.38587;RBI=0.118675,0.140676,0.120853;REFB=-0.139695,-0.0705639,-0.0109335;REVB=0.0410409,-0.0554385,-0.114804;RO=18;SAF=4,0,0;SAR=3,2,2;SRF=6;SRR=12;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.265764,-0.461523,-0.461523;STB=0.620311,0.638718,0.993271;STBP=0.558,0.709,0.313;TYPE=del,mnp,snp;VARB=0.199127,0.12497,0.107063;OID=.,.,.;OPOS=41949132,41949138,41949131;OREF=C,CA,A;OALT=-,AG,G;OMAPALT=ACCCCCCA,ACCCCCCAG,GCCCCCCCA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:34:33:18:23:7,2,2:6,2,2:0.181818,0.0606061,0.0606061:3,2,2:4,0,0:6:12:3,1,2:3,1,0:8:15
chr19	41949870	.	T	C	594.54	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00204437;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.009;QD=60.9786;RBI=0.0244469;REFB=0;REVB=0.0243613;RO=0;SAF=18;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.3224e-05;OID=.;OPOS=41949870;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:21:18:0:0:21:18:0:0
chr19	42070360	.	C	T	238.21	PASS	AF=0.457627;AO=27;DP=59;FAO=27;FDP=59;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.0377743;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.27;QD=16.1501;RBI=0.0554449;REFB=-0.0226752;REVB=0.0405862;RO=32;SAF=17;SAR=10;SRF=16;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128246;STB=0.572484;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0272176;OID=.;OPOS=42070360;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:32:27:27:0.457627:10:17:16:16:10:17:16:16
chr19	42070528	.	G	C	381.42	PASS	AF=0.654545;AO=36;DP=55;FAO=36;FDP=55;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0189479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.416;QD=27.7393;RBI=0.0189616;REFB=-0.0262319;REVB=-0.000718623;RO=19;SAF=9;SAR=27;SRF=8;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.133178;STB=0.572991;STBP=0.16;TYPE=snp;VARB=0.00613876;OID=.;OPOS=42070528;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:19:19:36:36:0.654545:27:9:8:11:27:9:8:11
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chr19	42071289	.	T	C	2154.14	PASS	AF=1;AO=136;DP=138;FAO=137;FDP=137;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0154193;FXX=0.00724585;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.5527;QD=62.8947;RBI=0.017678;REFB=0;REVB=0.00864628;RO=0;SAF=103;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000350233;OID=.;OPOS=42071289;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:138:137:0:0:136:137:1:33:103:0:0:33:104:0:0
chr19	42083673	.	T	C	538.98	PASS	AF=0.515152;AO=51;DP=99;FAO=51;FDP=99;FR=.;FRO=48;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0130172;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=255.821;QD=21.7768;RBI=0.0190566;REFB=-0.0114304;REVB=0.0139178;RO=47;SAF=32;SAR=19;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0865407;STB=0.543479;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.011411;OID=.;OPOS=42083673;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:47:48:51:51:0.515152:19:32:25:22:19:32:26:22
chr19	42083739	.	A	AGAC	462.68	PASS	AF=0.5;AO=44;DP=93;FAO=46;FDP=92;FR=.;FRO=46;FSAF=27;FSAR=19;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0064652;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=3;MLLD=292.759;QD=20.1163;RBI=0.00646529;REFB=-0.0193728;REVB=-3.44599e-05;RO=47;SAF=25;SAR=19;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00595381;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0178004;OID=.;OPOS=42083740;OREF=-;OALT=GAC;OMAPALT=AGAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.5:44:93:46:92:46:27:19:27:19:99:47:25:19:27:20
chr19	42083820	.	C	G	279.2	PASS	AF=0.347368;AO=33;DP=95;FAO=33;FDP=95;FR=.;FRO=62;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=38;FSRR=24;FWDB=0.00932488;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.875;QD=11.7558;RBI=0.00959386;REFB=-0.0147258;REVB=-0.00225584;RO=62;SAF=23;SAR=10;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106439;STB=0.561743;STBP=0.397;TYPE=snp;VARB=0.0248602;OID=.;OPOS=42083820;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:62:62:33:33:0.347368:10:23:38:24:10:23:38:24
chr19	42083849	.	C	A	513.67	PASS	AF=0.578313;AO=48;DP=82;FAO=48;FDP=83;FR=.;FRO=35;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=13;FWDB=0.00720916;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=47.4231;QD=24.7554;RBI=0.00765542;REFB=-0.0569556;REVB=0.00257554;RO=34;SAF=28;SAR=20;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0501687;STB=0.519742;STBP=0.712;TYPE=snp;VARB=0.0312448;OID=.;OPOS=42083849;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:34:35:48:48:0.578313:20:28:22:12:20:28:22:13
chr19	42085873	.	A	G	165.06	PASS	AF=0.382979;AO=18;DP=47;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00865569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.774;QD=14.0472;RBI=0.0148399;REFB=-0.0117345;REVB=0.0120541;RO=28;SAF=12;SAR=6;SRF=13;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218007;STB=0.617513;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0154553;OID=.;OPOS=42085873;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:28:29:18:18:0.382979:6:12:13:15:6:12:14:15
chr19	42132273	.	C	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271703;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=278.533;QD=48.7373;RBI=0.0273756;REFB=0;REVB=-0.0033467;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.82856e-05;OID=.;OPOS=42132273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chr19	42132314	.	G	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0300469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.623;QD=44.6898;RBI=0.0480159;REFB=0;REVB=0.0374527;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000369309;OID=.;OPOS=42132314;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
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chr19	42315281	.	G	T	902.53	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0042253;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.763;QD=58.2277;RBI=0.0115091;REFB=0;REVB=0.0107054;RO=0;SAF=39;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.75648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.03284e-05;OID=.;OPOS=42315281;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:23:39:0:0:23:39:0:0
chr19	42342319	.	A	G	441.54	PASS	AF=0.96875;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0310618;FXX=0.0588062;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.463;QD=55.1927;RBI=0.0378706;REFB=0.0177826;REVB=0.0216643;RO=1;SAF=19;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0239259;STB=0.512812;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.000627205;OID=.;OPOS=42342319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:32:32:1:1:31:31:0.96875:12:19:1:0:12:19:1:0
chr19	42354629	.	T	C	753.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.112;QD=56.8642;RBI=0.0178102;REFB=0;REVB=0.00412119;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.08287e-05;OID=.;OPOS=42354629;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:53:0:0:48:53:1:26:22:0:0:31:22:0:0
chr19	42392130	.	T	C	108.71	PASS	AF=0.371429;AO=12;DP=35;FAO=13;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00249622;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.321;QD=12.4235;RBI=0.0108215;REFB=-0.0154789;REVB=-0.0105296;RO=23;SAF=7;SAR=5;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0288153;STB=0.533283;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0258109;OID=.;OPOS=42392130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:23:22:12:13:0.371429:5:7:14:9:6:7:13:9
chr19	42392310	.	C	T	262.41	PASS	AF=0.531915;AO=17;DP=47;FAO=25;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=22;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=10;FWDB=0.0934402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.3529;QD=22.3326;RBI=0.0935296;REFB=-0.0683614;REVB=0.00408788;RO=21;SAF=5;SAR=12;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.277875;STB=0.589401;STBP=0.196;TYPE=snp;VARB=0.0421036;OID=.;OPOS=42392310;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:21:22:17:25:0.531915:12:5:12:9:16:9:12:10
chr19	42402680	.	CA	AC,CAC	114.42	PASS	AF=0.0458015,0.183206;AO=11,31;DP=134;FAO=6,24;FDP=131;FR=.;FRO=101;FSAF=6,18;FSAR=0,6;FSRF=36;FSRR=65;FWDB=-0.0137716,-0.0228491;FXX=0.0150365;HRUN=6,0;LEN=2,1;MLLD=50.147,42.5121;QD=3.4938;RBI=0.0303071,0.0546796;REFB=-0.0126172,-0.015836;REVB=-0.0269974,-0.0496767;RO=87;SAF=11,20;SAR=0,11;SRF=26;SRR=61;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.734492,0.407366;STB=0.998694,0.797525;STBP=0.001,0.005;TYPE=mnp,ins;VARB=0.126676,0.141336;OID=.,.;OPOS=42402680,42402682;OREF=CA,-;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,CAC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:80:134:131:87:101:11,31:6,24:0.0458015,0.183206:0,11:11,20:26:61:0,6:6,18:36:65
chr19	42463447	.	C	T	817.93	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0925132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=260.618;QD=57.3985;RBI=0.109213;REFB=0;REVB=0.0580421;RO=0;SAF=21;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000221796;OID=.;OPOS=42463447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:57:0:0:55:57:1:34:21:0:0:36:21:0:0
chr19	42471050	.	G	C	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00948709;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=335.645;QD=40.7629;RBI=0.00948709;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=10;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.38279e-05;OID=.;OPOS=42471050;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:0:10:0:0:0:10:0:0
chr19	42489516	.	A	C	1640.07	PASS	AF=1;AO=109;DP=110;FAO=109;FDP=109;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.032324;FXX=0.00909008;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.976;QD=60.1862;RBI=0.0489292;REFB=0;REVB=0.0367319;RO=0;SAF=61;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.16988e-05;OID=.;OPOS=42489516;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:109:0:0:109:109:1:48:61:0:0:48:61:0:0
chr19	42736267	.	A	G	768.4	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.101912;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=184.932;QD=56.9188;RBI=0.10382;REFB=0;REVB=0.0198105;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00018414;OID=.;OPOS=42736267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:30:23:0:0:30:24:0:0
chr19	42830459	.	TCCCCT	GTCCCT,TCCC,TCCCGT,TCCCT	84.69	PASS	AF=0.0277778,0,0,0.444444;AO=3,4,2,7;DP=36;FAO=1,0,0,16;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=1,0,0,14;FSAR=0,0,0,2;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.136349,-0.0604358,-0.236118,-0.206673;FXX=0.0270197;HRUN=1,4,4,4;LEN=2,2,1,1;MLLD=20.3201,157.763,85.7798,11.3971;QD=9.40945;RBI=0.14337,0.0624811,0.236184,0.218906;REFB=-0.0609765,-0.014741,-0.0126111,-0.0578982;REVB=0.0443164,-0.0158558,-0.00555439,0.0721518;RO=15;SAF=3,4,2,5;SAR=0,0,0,2;SRF=4;SRR=11;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0.710857,0.745918,0.650927,0.461886;STB=0.992101,0.5,0.5,0.823072;STBP=0.258,1,1,0.007;TYPE=mnp,del,snp,del;VARB=0.0608668,0,0,0.0769448;OID=.,.,.,.;OPOS=42830459,42830463,42830463,42830460;OREF=TC,CT,C,C;OALT=GT,-,G,-;OMAPALT=GTCCCT,TCCC,TCCCGT,TCCCT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/4:80:36:36:15:19:3,4,2,7:1,0,0,16:0.0277778,0,0,0.444444:0,0,0,2:3,4,2,5:4:11:0,0,0,2:1,0,0,14:7:12
chr19	43407877	.	CAAAAAAAAAAAAAACCA	CAAAAAAAAAAAAACCA,CAAAAAAAAAAACAAATC,CAAAAAAAAAAACAATCA	81.05	PASS	AF=0.611111,0.388889,0;AO=5,2,2;DP=21;FAO=11,7,0;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=4,7,0;FSAR=7,0,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-1.52166,-0.256468,-0.267806;FXX=0.142789;HRUN=14,14,14;LEN=1,6,4;MLLD=2.2228,150.236,136.095;QD=18.01;RBI=1.5439,0.256894,0.268237;REFB=-0.806231,-0.0622577,-0.0595684;REVB=-0.261066,-0.0147784,-0.0152013;RO=1;SAF=0,2,2;SAR=5,0,0;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0.697199,0.697199;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,mnp,mnp;VARB=-0.657174,0.276031,0;OID=.,.,.;OPOS=43407878,43407889,43407889;OREF=A,AAACCA,AAAC;OALT=-,CAAATC,CAAT;OMAPALT=CAAAAAAAAAAAAACCA,CAAAAAAAAAAACAAATC,CAAAAAAAAAAACAATCA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.611111,0.388889,0:5,2,2:21:11,7,0:18:0:4,7,0:7,0,0:0:0:42:1:0,2,2:5,0,0:0:1
chr19	43439793	.	G	A	2091.83	PASS	AF=1;AO=133;DP=133;FAO=134;FDP=134;FR=.;FRO=0;FSAF=96;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00230085;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=117.367;QD=62.4427;RBI=0.0163974;REFB=0;REVB=0.0162352;RO=0;SAF=95;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000129856;OID=.;OPOS=43439793;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:133:134:0:0:133:134:1:38:95:0:0:38:96:0:0
chr19	43519270	.	A	G	392.65	PASS	AF=0.5;AO=40;DP=80;FAO=40;FDP=80;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=19;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=0.0252628;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.889;QD=19.6323;RBI=0.026431;REFB=-0.0169268;REVB=0.00777097;RO=40;SAF=21;SAR=19;SRF=22;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0225889;STB=0.512541;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.01531;OID=.;OPOS=43519270;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:40:40:40:40:0.5:19:21:22:18:19:21:22:18
chr19	43519362	.	C	T	2197.72	PASS	AF=1;AO=138;DP=138;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=84;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00191425;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=346.102;QD=63.2437;RBI=0.0110197;REFB=0;REVB=0.0108521;RO=0;SAF=84;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.64241e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.94675e-06;OID=.;OPOS=43519362;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:138:139:0:0:138:139:1:54:84:0:0:55:84:0:0
chr19	43519442	.	T	C	1701.97	PASS	AF=0.982759;AO=114;DP=116;FAO=114;FDP=116;FR=.;FRO=2;FSAF=69;FSAR=45;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.038495;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.157;QD=58.6887;RBI=0.0478413;REFB=-0.0785612;REVB=0.0284064;RO=2;SAF=69;SAR=45;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0135638;STB=0.507142;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.00142556;OID=.;OPOS=43519442;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:116:116:2:2:114:114:0.982759:45:69:2:0:45:69:2:0
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chr19	43529026	.	CA	TG	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0090098;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=216.393;QD=59.323;RBI=0.0209668;REFB=0;REVB=0.0189323;RO=0;SAF=38;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=6.75796e-05;OID=.;OPOS=43529026;OREF=CA;OALT=TG;OMAPALT=TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:30:38:0:0:30:38:0:0
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chr19	43680051	.	C	T	2311.54	PASS	AF=0.986577;AO=147;DP=149;FAO=147;FDP=149;FR=.;FRO=2;FSAF=108;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.00605155;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.852;QD=62.0549;RBI=0.0273991;REFB=-0.0999722;REVB=0.0267224;RO=1;SAF=108;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0043838;STB=0.504025;STBP=0.536;TYPE=snp;VARB=0.00034661;OID=.;OPOS=43680051;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:149:149:1:2:147:147:0.986577:39:108:1:0:39:108:1:1
chr19	43680145	.	G	GT	488.97	PASS	AF=1;AO=16;DP=157;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.163571;FXX=0.328648;HRUN=1;LEN=1;MLLD=9.11733;QD=20.3735;RBI=0.164715;REFB=0;REVB=0.0193848;RO=141;SAF=15;SAR=1;SRF=91;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.464504;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00192763;OID=.;OPOS=43680146;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:16:157:96:96:0:92:4:0:0:13:141:15:1:91:50
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chr19	43708978	.	TC	T,TT	114.21	PASS	AF=0.368421,0;AO=9,4;DP=38;FAO=14,0;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=8,0;FSAR=6,0;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=-0.00107282,-0.00264789;FXX=0.0256345;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=337.32,334.902;QD=12.0216;RBI=0.0290206,0.0261753;REFB=0.00696055,0.0057491;REVB=0.0290007,0.0260411;RO=24;SAF=6,2;SAR=3,2;SRF=17;SRR=7;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0559602,-0.246837;STB=0.590429,0.5;STBP=0.421,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0167133,-0.017807;OID=.,.;OPOS=43708979,43708979;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.368421,0:9,4:38:14,0:38:24:8,0:6,0:17:7:80:24:6,2:3,2:17:7
chr19	43709619	.	C	T	433.48	PASS	AF=0.621212;AO=41;DP=66;FAO=41;FDP=66;FR=.;FRO=25;FSAF=32;FSAR=9;FSRF=18;FSRR=7;FWDB=-0.00157547;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6109;QD=26.2712;RBI=0.0681577;REFB=0.0422564;REVB=0.0681395;RO=25;SAF=32;SAR=9;SRF=18;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0588109;STB=0.532208;STBP=0.547;TYPE=snp;VARB=-0.0302094;OID=.;OPOS=43709619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:25:25:41:41:0.621212:9:32:18:7:9:32:18:7
chr19	43709647	.	G	A	433.73	PASS	AF=0.518072;AO=42;DP=82;FAO=43;FDP=83;FR=.;FRO=40;FSAF=33;FSAR=10;FSRF=33;FSRR=7;FWDB=0.0483953;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.5477;QD=20.9025;RBI=0.0869764;REFB=-0.00441817;REVB=0.0722689;RO=40;SAF=33;SAR=9;SRF=33;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0532763;STB=0.540523;STBP=0.532;TYPE=snp;VARB=0.00717949;OID=.;OPOS=43709647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:40:40:42:43:0.518072:9:33:33:7:10:33:33:7
chr19	43709654	.	C	A	1271.17	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00795489;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.682;QD=62.0084;RBI=0.029767;REFB=0;REVB=0.0286844;RO=0;SAF=65;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.17264e-05;OID=.;OPOS=43709654;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:82:0:0:82:82:1:17:65:0:0:17:65:0:0
chr19	43709656	.	C	G	1286.79	PASS	AF=1;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0234768;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.555;QD=62.0141;RBI=0.0244809;REFB=0;REVB=0.00693952;RO=0;SAF=66;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.10007e-05;OID=.;OPOS=43709656;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:84:83:0:0:83:83:1:17:66:0:0:17:66:0:0
chr19	43763019	.	T	C	302.56	PASS	AF=0.353535;AO=35;DP=99;FAO=35;FDP=99;FR=.;FRO=64;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=46;FSRR=18;FWDB=-0.000432207;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=251.443;QD=12.2244;RBI=0.0177908;REFB=-0.0108267;REVB=-0.0177855;RO=63;SAF=25;SAR=10;SRF=46;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0219985;STB=0.503544;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.0201436;OID=.;OPOS=43763019;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:63:64:35:35:0.353535:10:25:46:17:10:25:46:18
chr19	43763023	.	A	G	290.0	PASS	AF=0.359223;AO=32;DP=98;FAO=37;FDP=103;FR=.;FRO=66;FSAF=26;FSAR=11;FSRF=47;FSRR=19;FWDB=-0.00336068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.521;QD=11.2623;RBI=0.0151622;REFB=-0.0210464;REVB=0.014785;RO=66;SAF=23;SAR=9;SRF=47;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00942996;STB=0.507261;STBP=0.914;TYPE=snp;VARB=0.0359926;OID=.;OPOS=43763023;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:103:66:66:32:37:0.359223:9:23:47:19:11:26:47:19
chr19	43773574	.	G	A	350.64	PASS	AF=0.413043;AO=39;DP=86;FAO=38;FDP=92;FR=.;FRO=54;FSAF=32;FSAR=6;FSRF=27;FSRR=27;FWDB=-0.00834228;FXX=0.0107515;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.8248;QD=15.2453;RBI=0.0208918;REFB=-0.0307567;REVB=-0.0191539;RO=45;SAF=32;SAR=7;SRF=21;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.4022;STB=0.748787;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.0516476;OID=.;OPOS=43773574;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:92:45:54:39:38:0.413043:7:32:21:24:6:32:27:27
chr19	43773599	.	T	C	362.76	PASS	AF=0.423913;AO=39;DP=92;FAO=39;FDP=92;FR=.;FRO=53;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=32;FWDB=-0.0319997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6669;QD=15.772;RBI=0.0338467;REFB=-0.0244494;REVB=-0.0110279;RO=53;SAF=27;SAR=12;SRF=21;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307042;STB=0.673379;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0377085;OID=.;OPOS=43773599;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:53:53:39:39:0.423913:12:27:21:32:12:27:21:32
chr19	43857873	.	G	C	306.31	PASS	AF=0.325;AO=33;DP=114;FAO=39;FDP=120;FR=.;FRO=81;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=51;FSRR=30;FWDB=0.0264378;FXX=0.0163921;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.68;QD=10.2102;RBI=0.0362538;REFB=-0.0212909;REVB=-0.0248068;RO=81;SAF=21;SAR=12;SRF=51;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00872062;STB=0.547801;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.0436735;OID=.;OPOS=43857873;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:114:120:81:81:33:39:0.325:12:21:51:30:12:27:51:30
chr19	43864548	.	C	A	1283.43	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0131294;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=156.945;QD=61.8523;RBI=0.0201009;REFB=0;REVB=0.0152205;RO=0;SAF=47;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.23758e-05;OID=.;OPOS=43864548;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:36:47:0:0:36:47:0:0
chr19	43910649	.	G	T	341.11	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=288.913;QD=54.5769;RBI=0.0253081;REFB=0;REVB=0.0218456;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.52729e-05;OID=.;OPOS=43910649;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:24:25:1:11:13:0:0:12:13:0:0
chr19	43910764	.	A	G	632.2	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00164716;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.893;QD=61.6783;RBI=0.0059047;REFB=0;REVB=0.00567031;RO=0;SAF=18;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.20298e-05;OID=.;OPOS=43910764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:23:18:0:0:23:18:0:0
chr19	43922061	.	A	G	859.98	PASS	AF=0.968254;AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0087841;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.0815;QD=54.6021;RBI=0.0112441;REFB=0.00412604;REVB=0.00701916;RO=2;SAF=32;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.028583;STB=0.515147;STBP=0.261;TYPE=snp;VARB=0.000120052;OID=.;OPOS=43922061;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:62:63:2:2:60:61:0.968254:28:32:2:0:29:32:2:0
chr19	43965029	.	G	A	360.1	PASS	AF=0.652174;AO=30;DP=47;FAO=30;FDP=46;FR=.;FRO=16;FSAF=18;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0407525;FXX=0.0212721;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.2294;QD=31.3132;RBI=0.0498082;REFB=-0.0278304;REVB=0.0286372;RO=15;SAF=18;SAR=12;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509085;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=0.0244023;OID=.;OPOS=43965029;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:46:15:16:30:30:0.652174:12:18:9:6:12:18:10:6
chr19	43979589	.	G	T	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0055347;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=272.589;QD=12.7298;RBI=0.00984891;REFB=-0.0182635;REVB=0.00814666;RO=12;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0535863;STB=0.531844;STBP=0.771;TYPE=snp;VARB=0.0266692;OID=.;OPOS=43979589;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:4:5:6:6:4:5:6:6
chr19	44047550	.	T	C	721.32	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0492359;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.0707;QD=62.7231;RBI=0.0663088;REFB=0;REVB=0.0444149;RO=0;SAF=18;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00185824;OID=.;OPOS=44047550;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:46:0:0:44:46:1:26:18:0:0:28:18:0:0
chr19	44047826	.	T	A	511.13	PASS	AF=0.972222;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=36;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.070848;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.68;QD=56.7926;RBI=0.0708559;REFB=-0.140783;REVB=-0.00105919;RO=1;SAF=12;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0373832;STB=0.519988;STBP=0.281;TYPE=snp;VARB=0.0014538;OID=.;OPOS=44047826;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:36:36:1:1:35:35:0.972222:23:12:1:0:23:12:1:0
chr19	44055726	.	T	C	318.05	PASS	AF=0.62;AO=25;DP=45;FAO=31;FDP=50;FR=.;FRO=19;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.0497001;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.902;QD=25.4436;RBI=0.051154;REFB=-0.0750555;REVB=0.0121092;RO=20;SAF=13;SAR=12;SRF=8;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956004;STB=0.593689;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0322828;OID=.;OPOS=44055726;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:50:20:19:25:31:0.62:12:13:8:12:12:19:7:12
chr19	44081288	.	A	C,G	700.42	PASS	AF=0.0222222,0.977778;AO=2,42;DP=44;FAO=1,44;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=1,27;FSAR=0,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00951253,0.0463893;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=151.068,56.2844;QD=62.2596;RBI=0.0175902,0.0584844;REFB=0,0;REVB=-0.0147962,0.0356154;RO=0;SAF=2,26;SAR=0,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0148822,0.0010012;OID=.,.;OPOS=44081288,44081288;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:44:45:0:0:2,42:1,44:0.0222222,0.977778:0,16:2,26:0:0:0,17:1,27:0:0
chr19	44082791	.	T	C	53.08	PASS	AF=0.258065;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=31;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=12;FWDB=-0.00522213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.373;QD=6.84905;RBI=0.0108297;REFB=-0.00307888;REVB=0.00948743;RO=22;SAF=6;SAR=2;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351349;STB=0.711313;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0114003;OID=.;OPOS=44082791;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:31:31:22:23:8:8:0.258065:2:6:10:12:2:6:11:12
chr19	44082945	.	T	C	279.26	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167436;FXX=0.0869187;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.608;QD=53.1928;RBI=0.0205128;REFB=0;REVB=0.0118502;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000200096;OID=.;OPOS=44082945;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:11:9:0:0:12:9:0:0
chr19	44098963	.	C	G	265.54	PASS	AF=0.333333;AO=32;DP=96;FAO=32;FDP=96;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.0318096;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=189.205;QD=11.0641;RBI=0.03238;REFB=-0.0228355;REVB=-0.00605085;RO=64;SAF=14;SAR=18;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.036666;STB=0.521263;STBP=0.778;TYPE=snp;VARB=0.0523068;OID=.;OPOS=44098963;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:64:64:32:32:0.333333:18:14:26:38:18:14:26:38
chr19	44126738	.	G	A	483.33	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0304084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.913;QD=58.5853;RBI=0.0357587;REFB=0;REVB=0.0188153;RO=0;SAF=27;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.86929e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.69655e-05;OID=.;OPOS=44126738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:6:27:0:0:6:27:0:0
chr19	44223931	.	C	A	341.2	PASS	AF=0.435294;AO=37;DP=85;FAO=37;FDP=85;FR=.;FRO=48;FSAF=15;FSAR=22;FSRF=26;FSRR=22;FWDB=0.0437793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.5526;QD=16.0566;RBI=0.044098;REFB=0.00921795;REVB=0.00529263;RO=47;SAF=15;SAR=22;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126882;STB=0.577423;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.0109531;OID=.;OPOS=44223931;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:47:48:37:37:0.435294:22:15:25:22:22:15:26:22
chr19	44302624	.	T	C	240.37	PASS	AF=0.647059;AO=22;DP=34;FAO=22;FDP=34;FR=.;FRO=12;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0200732;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=124.648;QD=28.279;RBI=0.0350866;REFB=-0.00583745;REVB=0.0287774;RO=12;SAF=15;SAR=7;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180237;STB=0.599906;STBP=0.115;TYPE=snp;VARB=0.00768715;OID=.;OPOS=44302624;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:34:34:12:12:22:22:0.647059:7:15:5:7:7:15:5:7
chr19	44303066	.	C	G	143.31	PASS	AF=0.410256;AO=16;DP=39;FAO=16;FDP=39;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=13;FWDB=-0.0112213;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.282;QD=14.6983;RBI=0.0386062;REFB=-0.0169397;REVB=0.0369394;RO=22;SAF=7;SAR=9;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0290181;STB=0.501627;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.025414;OID=.;OPOS=44303066;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:22:23:16:16:0.410256:9:7:9:13:9:7:10:13
chr19	44351107	.	G	A	106.11	PASS	AF=1;AO=9;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0303943;FXX=0.0908265;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.0667;QD=42.4432;RBI=0.093235;REFB=0;REVB=-0.0881417;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00574977;OID=.;OPOS=44351107;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:9:10:1:3:6:0:0:3:7:0:0
chr19	44351166	.	GGGAGAT	G	80.88	PASS	AF=0.48;AO=12;DP=26;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0132502;FXX=0.0384468;HRUN=3;LEN=6;MLLD=293.29;QD=12.9414;RBI=0.0215144;REFB=-0.0203984;REVB=0.01695;RO=14;SAF=5;SAR=7;SRF=9;SRR=5;SSEN=0.621918;SSEP=0;SSSB=-0.20736;STB=0.602479;STBP=0.337;TYPE=del;VARB=0.0166415;OID=.;OPOS=44351167;OREF=GGAGAT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.48:12:26:12:25:13:5:7:8:5:80:14:5:7:9:5
chr19	44351694	.	C	T	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026109;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.233;QD=42.1816;RBI=0.0276676;REFB=0;REVB=0.00915506;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000405628;OID=.;OPOS=44351694;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr19	44351836	.	G	A	328.67	PASS	AF=0.479452;AO=35;DP=73;FAO=35;FDP=73;FR=.;FRO=38;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=20;FSRR=18;FWDB=-0.00469252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.071;QD=18.009;RBI=0.0189131;REFB=-0.0307375;REVB=0.0183217;RO=37;SAF=18;SAR=17;SRF=20;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0242099;STB=0.506266;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0331661;OID=.;OPOS=44351836;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:37:38:35:35:0.479452:17:18:20:17:17:18:20:18
chr19	44352665	.	TG	CA	131.99	PASS	AF=0.416667;AO=15;DP=36;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=14;FSRR=7;FWDB=0.00971347;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=318.19;QD=14.6657;RBI=0.0166814;REFB=-0.00498996;REVB=0.0135616;RO=21;SAF=10;SAR=5;SRF=14;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.00758628;OID=.;OPOS=44352665;OREF=TG;OALT=CA;OMAPALT=CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:21:21:15:15:0.416667:5:10:14:7:5:10:14:7
chr19	44352688	.	G	A	113.19	PASS	AF=0.433333;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=30;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=4;FSRF=11;FSRR=6;FWDB=0.00412876;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.576;QD=15.0922;RBI=0.0207475;REFB=-0.0162436;REVB=-0.0203326;RO=18;SAF=9;SAR=4;SRF=12;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294597;STB=0.529366;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0241587;OID=.;OPOS=44352688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:30:18:17:13:13:0.433333:4:9:12:6:4:9:11:6
chr19	44377357	.	C	T	471.91	PASS	AF=0.970588;AO=33;DP=34;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0641869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.5817;QD=55.5184;RBI=0.0644678;REFB=0.0710664;REVB=-0.0060109;RO=1;SAF=17;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0266901;STB=0.514277;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.00208425;OID=.;OPOS=44377357;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:34:1:1:33:33:0.970588:16:17:1:0:16:17:1:0
chr19	44417575	.	A	G	236.59	PASS	AF=0.45;AO=27;DP=60;FAO=27;FDP=60;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=0.0392781;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.7188;QD=15.7723;RBI=0.0563507;REFB=0.0228135;REVB=-0.0404058;RO=33;SAF=16;SAR=11;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0445654;STB=0.525143;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=-0.0263536;OID=.;OPOS=44417575;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:33:33:27:27:0.45:11:16:21:12:11:16:21:12
chr19	44418077	.	C	T	538.67	PASS	AF=0.52381;AO=55;DP=105;FAO=55;FDP=105;FR=.;FRO=50;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=18;FWDB=0.031773;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6052;QD=20.5207;RBI=0.0317749;REFB=-0.0250233;REVB=-0.000345063;RO=50;SAF=30;SAR=25;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0832368;STB=0.545758;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=0.0324088;OID=.;OPOS=44418077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:50:50:55:55:0.52381:25:30:32:18:25:30:32:18
chr19	44418343	.	C	T	295.75	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00926977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.639;QD=20.3968;RBI=0.0313544;REFB=-0.0193213;REVB=-0.0299528;RO=27;SAF=15;SAR=16;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331252;STB=0.518383;STBP=0.777;TYPE=snp;VARB=0.0220461;OID=.;OPOS=44418343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:16:15:12:15:16:15:12:15
chr19	44418544	.	A	G	227.01	PASS	AF=0.402985;AO=27;DP=67;FAO=27;FDP=67;FR=.;FRO=40;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=22;FWDB=0.0562763;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7692;QD=13.5525;RBI=0.0572461;REFB=0.00150374;REVB=0.0104922;RO=40;SAF=14;SAR=13;SRF=18;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0715169;STB=0.540809;STBP=0.6;TYPE=snp;VARB=-0.00140462;OID=.;OPOS=44418544;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:40:40:27:27:0.402985:13:14:18:22:13:14:18:22
chr19	44418693	.	T	C	121.97	PASS	AF=0.3;AO=15;DP=51;FAO=15;FDP=50;FR=.;FRO=35;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=12;FSRR=23;FWDB=0.0438187;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.816;QD=9.75717;RBI=0.0483748;REFB=-0.0115904;REVB=-0.0204951;RO=35;SAF=8;SAR=7;SRF=12;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220417;STB=0.631413;STBP=0.251;TYPE=snp;VARB=0.0273444;OID=.;OPOS=44418693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:35:35:15:15:0.3:7:8:12:23:7:8:12:23
chr19	44418776	.	G	A	330.89	PASS	AF=0.433735;AO=36;DP=83;FAO=36;FDP=83;FR=.;FRO=47;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=21;FSRR=26;FWDB=-0.0337344;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.422;QD=15.9467;RBI=0.0359037;REFB=-0.0153567;REVB=0.012291;RO=47;SAF=18;SAR=18;SRF=21;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0534619;STB=0.530104;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.0204296;OID=.;OPOS=44418776;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:47:47:36:36:0.433735:18:18:21:26:18:18:21:26
chr19	44419030	.	A	G	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226701;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.038;QD=59.8368;RBI=0.040951;REFB=0;REVB=0.0341036;RO=0;SAF=30;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50008e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306744;OID=.;OPOS=44419030;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:6:30:0:0:6:30:0:0
chr19	44470189	.	T	A	661.4	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000287548;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.408;QD=60.1269;RBI=0.00961952;REFB=-0.14139;REVB=0.00961522;RO=1;SAF=11;SAR=32;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0407767;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00218205;OID=.;OPOS=44470189;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:44:44:1:0:43:44:1:32:11:1:0:32:12:0:0
chr19	44470420	.	T	C	789.29	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0112802;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7377;QD=64.4319;RBI=0.0547248;REFB=0;REVB=0.0535496;RO=0;SAF=17;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.70321e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000135972;OID=.;OPOS=44470420;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:49:0:0:49:49:1:32:17:0:0:32:17:0:0
chr19	44470548	.	A	G	758.56	PASS	AF=0.964912;AO=55;DP=57;FAO=55;FDP=57;FR=.;FRO=2;FSAF=32;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0142469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.9911;QD=53.2323;RBI=0.0143045;REFB=-0.132136;REVB=0.00128178;RO=2;SAF=32;SAR=23;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0392347;STB=0.520826;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0179826;OID=.;OPOS=44470548;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:57:57:2:2:55:55:0.964912:23:32:0:2:23:32:0:2
chr19	44470663	.	G	C	889.64	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0138996;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.293;QD=58.3369;RBI=0.0187733;REFB=0;REVB=0.012619;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121076;OID=.;OPOS=44470663;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0
chr19	44471209	.	T	A	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000783834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.4801;QD=53.2768;RBI=0.0226945;REFB=0;REVB=0.022681;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000316529;OID=.;OPOS=44471209;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr19	44471323	.	G	A	733.37	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00852441;FXX=0.0181785;HRUN=5;LEN=1;MLLD=200.786;QD=54.3239;RBI=0.0600161;REFB=0.161141;REVB=0.0594077;RO=1;SAF=22;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154433;STB=0.508194;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=-0.000353066;OID=.;OPOS=44471323;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:53:54:1:1:52:53:0.981481:30:22:0:1:30:23:0:1
chr19	44494215	.	T	C	427.34	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246072;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7582;QD=56.9787;RBI=0.0656496;REFB=0;REVB=0.0608634;RO=0;SAF=15;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000923598;OID=.;OPOS=44494215;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:15:15:0:0:15:15:0:0
chr19	44496070	.	A	G	897.51	PASS	AF=0.969231;AO=62;DP=65;FAO=63;FDP=65;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0298286;FXX=0.0151492;HRUN=3;LEN=1;MLLD=292.204;QD=55.2311;RBI=0.0430895;REFB=-0.0425243;REVB=0.031096;RO=2;SAF=37;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00592119;STB=0.50331;STBP=0.851;TYPE=snp;VARB=0.000672763;OID=.;OPOS=44496070;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:65:65:2:2:62:63:0.969231:25:37:1:1:25:38:1:1
chr19	44500478	.	A	T	972.83	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00212931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.043;QD=58.9594;RBI=0.0491953;REFB=0;REVB=0.0491492;RO=0;SAF=20;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.64434e-05;OID=.;OPOS=44500478;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:46:20:0:0:46:20:0:0
chr19	44500761	.	G	A	805.15	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000486872;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.054;QD=64.4119;RBI=0.0115018;REFB=0;REVB=0.0114914;RO=0;SAF=31;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.83761e-05;OID=.;OPOS=44500761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:19:31:0:0:19:31:0:0
chr19	44501116	.	A	G	453.83	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0512141;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=289.303;QD=55.0097;RBI=0.0512346;REFB=-0.173963;REVB=-0.00145135;RO=1;SAF=17;SAR=15;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0301077;STB=0.516119;STBP=0.318;TYPE=snp;VARB=0.00359336;OID=.;OPOS=44501116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:15:17:0:1:15:17:0:1
chr19	44501227	.	A	G	650.93	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000890557;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.2764;QD=61.9934;RBI=0.038714;REFB=0;REVB=0.0387037;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000568856;OID=.;OPOS=44501227;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:17:24:0:0:18:24:0:0
chr19	44501518	.	G	A	1659.24	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=110;FDP=110;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00297801;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.492;QD=60.3359;RBI=0.0271179;REFB=0;REVB=0.0269539;RO=0;SAF=49;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.98829e-05;OID=.;OPOS=44501518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:110:0:0:110:110:1:61:49:0:0:61:49:0:0
chr19	44511223	.	T	G	1338.99	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00495336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.4723;QD=62.2787;RBI=0.0461329;REFB=0;REVB=0.0458662;RO=0;SAF=54;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147894;OID=.;OPOS=44511223;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:32:54:0:0:32:54:0:0
chr19	44515352	.	T	G	1225.24	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00355489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.191;QD=61.2619;RBI=0.038932;REFB=0;REVB=0.0387693;RO=0;SAF=39;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.46517e-05;OID=.;OPOS=44515352;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:78:80:0:0:78:80:1:39:39:0:0:41:39:0:0
chr19	44515514	.	C	A	1098.4	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00140291;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8543;QD=60.1864;RBI=0.0252773;REFB=0;REVB=-0.0252383;RO=0;SAF=28;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1195e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000215668;OID=.;OPOS=44515514;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:73:73:1:45:28:0:0:45:28:0:0
chr19	44564981	.	G	A	1541.94	PASS	AF=0.981308;AO=105;DP=107;FAO=105;FDP=107;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=67;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00148598;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=320.893;QD=57.6425;RBI=0.0123014;REFB=-0.0604286;REVB=0.0122113;RO=2;SAF=38;SAR=67;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0139547;STB=0.507352;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.00105848;OID=.;OPOS=44564981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:107:107:2:2:105:105:0.981308:67:38:0:2:67:38:0:2
chr19	44570551	.	G	A	396.81	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188816;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.598;QD=56.6869;RBI=0.0230848;REFB=0;REVB=-0.0132813;RO=0;SAF=14;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000807597;OID=.;OPOS=44570551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:0:0:28:28:1:14:14:0:0:14:14:0:0
chr19	44591360	.	G	A	402.08	PASS	AF=0.685185;AO=37;DP=54;FAO=37;FDP=54;FR=.;FRO=17;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=0.016648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.795;QD=29.7835;RBI=0.0256004;REFB=-0.0091683;REVB=0.0194479;RO=17;SAF=13;SAR=24;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.073781;STB=0.540171;STBP=0.446;TYPE=snp;VARB=0.00553274;OID=.;OPOS=44591360;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:17:17:37:37:0.685185:24:13:8:9:24:13:8:9
chr19	44610665	.	A	G	221.8	PASS	AF=0.42623;AO=26;DP=61;FAO=26;FDP=61;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=12;FWDB=0.0102604;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.763;QD=14.5443;RBI=0.0110945;REFB=0.000984345;REVB=0.00422026;RO=35;SAF=12;SAR=14;SRF=23;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19589;STB=0.61089;STBP=0.159;TYPE=snp;VARB=-0.00130396;OID=.;OPOS=44610665;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:35:35:26:26:0.42623:14:12:23:12:14:12:23:12
chr19	44610798	.	A	T	255.94	PASS	AF=0.439394;AO=29;DP=67;FAO=29;FDP=66;FR=.;FRO=37;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=21;FWDB=0.00951242;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.557;QD=15.5112;RBI=0.00956573;REFB=-0.0352611;REVB=-0.00100853;RO=37;SAF=16;SAR=13;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.117926;STB=0.566621;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0181075;OID=.;OPOS=44610798;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:37:37:29:29:0.439394:13:16:16:21:13:16:16:21
chr19	44611066	.	T	C	73.83	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00160221;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3749;QD=9.84384;RBI=0.0166042;REFB=-0.00125398;REVB=0.0165268;RO=20;SAF=4;SAR=6;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21739;STB=0.63132;STBP=0.349;TYPE=snp;VARB=0.00504495;OID=.;OPOS=44611066;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:6:4:12:8:6:4:12:8
chr19	44611420	.	A	G	85.27	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0205276;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=313.191;QD=11.3693;RBI=0.0206784;REFB=-0.0132678;REVB=0.00249265;RO=19;SAF=4;SAR=7;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0559997;STB=0.533274;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.0249863;OID=.;OPOS=44611420;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:7:4:6:13:7:4:6:13
chr19	44612005	.	A	G	168.04	PASS	AF=0.314286;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=70;FR=.;FRO=48;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0126887;FXX=0.0410903;HRUN=1;LEN=1;MLLD=241.907;QD=9.60235;RBI=0.0165222;REFB=-0.0100095;REVB=0.0105821;RO=50;SAF=8;SAR=14;SRF=27;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.207993;STB=0.609398;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0212875;OID=.;OPOS=44612005;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:70:50:48:22:22:0.314286:14:8:27:23:14:8:25:23
chr19	44612014	.	A	T	186.59	PASS	AF=0.342857;AO=23;DP=70;FAO=24;FDP=70;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=23;FWDB=0.0662391;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.745;QD=10.6623;RBI=0.0662906;REFB=-0.00941043;REVB=-0.00261239;RO=46;SAF=9;SAR=14;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125509;STB=0.555242;STBP=0.486;TYPE=snp;VARB=0.0132036;OID=.;OPOS=44612014;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:46:46:23:24:0.342857:14:9:23:23:14:10:23:23
chr19	44612231	.	A	G	152.11	PASS	AF=0.369565;AO=17;DP=46;FAO=17;FDP=46;FR=.;FRO=29;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=9;FSRR=20;FWDB=-0.0240373;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.484;QD=13.2271;RBI=0.0268236;REFB=0.00518844;REVB=0.0119043;RO=29;SAF=8;SAR=9;SRF=9;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.176789;STB=0.602483;STBP=0.308;TYPE=snp;VARB=-0.0127659;OID=.;OPOS=44612231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:29:29:17:17:0.369565:9:8:9:20:9:8:9:20
chr19	44652954	.	G	A	380.27	PASS	AF=0.421569;AO=43;DP=102;FAO=43;FDP=102;FR=.;FRO=59;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.003275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.868;QD=14.9123;RBI=0.0167886;REFB=-0.0158266;REVB=0.016466;RO=59;SAF=25;SAR=18;SRF=29;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0931028;STB=0.552462;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0182557;OID=.;OPOS=44652954;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:59:59:43:43:0.421569:18:25:29:30:18:25:29:30
chr19	44660967	.	A	G	122.78	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.0558513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.2676;QD=16.37;RBI=0.0618148;REFB=0.000680316;REVB=-0.0264897;RO=16;SAF=5;SAR=9;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0786514;STB=0.545388;STBP=0.668;TYPE=snp;VARB=-0.00397523;OID=.;OPOS=44660967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:9:5:7:9:9:5:7:9
chr19	44721699	.	C	T	425.58	PASS	AF=0.472527;AO=43;DP=92;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=20;FSAR=23;FSRF=37;FSRR=11;FWDB=-0.00448805;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.684;QD=18.7068;RBI=0.0124567;REFB=-0.0302281;REVB=0.0116201;RO=48;SAF=20;SAR=23;SRF=37;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.286597;STB=0.658395;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0247417;OID=.;OPOS=44721699;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:48:48:43:43:0.472527:23:20:37:11:23:20:37:11
chr19	44764064	.	A	G	1694.73	PASS	AF=1;AO=112;DP=112;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=60;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0647833;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6355;QD=60.5261;RBI=0.0649776;REFB=0;REVB=0.00502149;RO=0;SAF=60;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000323258;OID=.;OPOS=44764064;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:112:112:0:0:112:112:1:52:60:0:0:52:60:0:0
chr19	44778405	.	A	C	198.42	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0623641;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=254.126;QD=44.0927;RBI=0.0881408;REFB=-0.0560366;REVB=0.0622858;RO=1;SAF=11;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0398535;STB=0.521714;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=0.0010896;OID=.;OPOS=44778405;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:1:1:17:17:0.944444:6:11:1:0:6:11:1:0
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chr19	44778797	.	T	A	165.16	PASS	AF=0.377358;AO=19;DP=52;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=0.0246262;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.534;QD=12.465;RBI=0.0257898;REFB=-0.0170325;REVB=0.00765902;RO=33;SAF=11;SAR=8;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231116;STB=0.644304;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0396674;OID=.;OPOS=44778797;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:33:33:19:20:0.377358:8:11:12:21:8:12:12:21
chr19	44778799	.	G	A	165.08	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=21;FWDB=-0.0190413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.501;QD=12.4588;RBI=0.0248338;REFB=-0.00666568;REVB=-0.0159419;RO=33;SAF=12;SAR=8;SRF=12;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.249896;STB=0.644304;STBP=0.116;TYPE=snp;VARB=0.0176968;OID=.;OPOS=44778799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:8:12:12:21:8:12:12:21
chr19	44792701	.	T	G	239.04	PASS	AF=0.490566;AO=25;DP=52;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=0.0498377;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.703;QD=18.0404;RBI=0.0771518;REFB=-0.0177781;REVB=0.0588949;RO=27;SAF=17;SAR=8;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159316;STB=0.596138;STBP=0.197;TYPE=snp;VARB=0.0210143;OID=.;OPOS=44792701;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:27:27:25:26:0.490566:8:17:14:13:8:18:14:13
chr19	44792969	.	G	A	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00245793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.803;QD=51.1845;RBI=0.0401993;REFB=0;REVB=0.0401241;RO=0;SAF=16;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00023538;OID=.;OPOS=44792969;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:4:16:0:0:4:16:0:0
chr19	44793230	.	G	C	211.87	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.00349484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.922;QD=16.6173;RBI=0.0215658;REFB=-0.0225641;REVB=-0.0212807;RO=26;SAF=12;SAR=11;SRF=12;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0564209;STB=0.550976;STBP=0.519;TYPE=snp;VARB=0.0269723;OID=.;OPOS=44793230;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:26:28:23:23:0.45098:11:12:12:14:11:12:12:16
chr19	44832684	.	T	G	1404.34	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491904;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.064;QD=62.4151;RBI=0.049193;REFB=0;REVB=-0.000502085;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.19745e-05;OID=.;OPOS=44832684;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:47:43:0:0:47:43:0:0
chr19	44832875	.	A	G	785.2	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00345658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8042;QD=57.1056;RBI=0.0582747;REFB=0;REVB=0.0581721;RO=0;SAF=13;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.70796e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000336871;OID=.;OPOS=44832875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:42:13:0:0:42:13:0:0
chr19	44832992	.	C	G	703.16	PASS	AF=1;AO=43;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390316;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=69.2926;QD=62.5031;RBI=0.0410811;REFB=0;REVB=0.0128137;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000790196;OID=.;OPOS=44832992;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:43:45:1:23:20:0:0:25:20:0:0
chr19	44833506	.	C	T	1225.95	PASS	AF=0.964706;AO=82;DP=85;FAO=82;FDP=85;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.065936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.9038;QD=57.6918;RBI=0.0883915;REFB=-0.027544;REVB=0.0588685;RO=3;SAF=40;SAR=42;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119482;STB=0.506313;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.00549066;OID=.;OPOS=44833506;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:85:85:3:3:82:82:0.964706:42:40:2:1:42:40:2:1
chr19	44833851	.	G	C	1142.19	PASS	AF=1;AO=73;DP=73;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.013381;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.733;QD=59.3343;RBI=0.0858033;REFB=0;REVB=0.0847535;RO=0;SAF=46;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000339045;OID=.;OPOS=44833851;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:77:0:0:73:77:1:27:46:0:0:31:46:0:0
chr19	44840789	.	T	C	755.61	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0208503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.27;QD=55.9709;RBI=0.0433194;REFB=0;REVB=0.0379715;RO=0;SAF=33;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.0907e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115511;OID=.;OPOS=44840789;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:52:54:1:19:33:0:0:19:35:0:0
chr19	44871287	.	T	C	276.07	PASS	AF=0.385542;AO=32;DP=83;FAO=32;FDP=83;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=16;FSRF=28;FSRR=23;FWDB=-0.0323781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=127.762;QD=13.3045;RBI=0.0331637;REFB=-0.00764193;REVB=0.00717555;RO=51;SAF=16;SAR=16;SRF=28;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0527203;STB=0.530102;STBP=0.706;TYPE=snp;VARB=0.0116293;OID=.;OPOS=44871287;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:83:51:51:32:32:0.385542:16:16:28:23:16:16:28:23
chr19	44871293	.	T	C	267.44	PASS	AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=27;FSRR=20;FWDB=0.00974191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.232;QD=13.7151;RBI=0.0273117;REFB=-0.00404054;REVB=-0.0255152;RO=47;SAF=15;SAR=16;SRF=27;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0955991;STB=0.554421;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.00587385;OID=.;OPOS=44871293;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:47:47:31:31:0.397436:16:15:27:20:16:15:27:20
chr19	44890697	.	A	G	508.79	PASS	AF=1;AO=34;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0139186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.462;QD=58.1472;RBI=0.0581639;REFB=0;REVB=0.056474;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00317557;OID=.;OPOS=44890697;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:34:35:1:15:19:0:0:16:19:0:0
chr19	44891784	.	T	C	205.09	PASS	AF=0.42;AO=21;DP=50;FAO=21;FDP=50;FR=.;FRO=29;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=4;FWDB=0.00191038;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.817;QD=16.407;RBI=0.0186667;REFB=-0.0060244;REVB=-0.0185687;RO=29;SAF=15;SAR=6;SRF=25;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204954;STB=0.61529;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.00930014;OID=.;OPOS=44891784;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:29:29:21:21:0.42:6:15:25:4:6:15:25:4
chr19	44892034	.	C	G	236.09	PASS	AF=0.469388;AO=23;DP=49;FAO=23;FDP=49;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0363954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.8227;QD=19.2728;RBI=0.0364792;REFB=-0.0276549;REVB=-0.00246983;RO=26;SAF=11;SAR=12;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.236174;STB=0.63258;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.0140563;OID=.;OPOS=44892034;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:26:26:23:23:0.469388:12:11:19:7:12:11:19:7
chr19	44930880	.	G	A	866.2	PASS	AF=0.399194;AO=99;DP=250;FAO=99;FDP=248;FR=.;FRO=149;FSAF=37;FSAR=62;FSRF=71;FSRR=78;FWDB=-0.0321087;FXX=0.0158724;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5718;QD=13.9709;RBI=0.05141;REFB=-0.0180682;REVB=-0.0401499;RO=145;SAF=37;SAR=62;SRF=67;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0971682;STB=0.563813;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0194171;OID=.;OPOS=44930880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:250:248:145:149:99:99:0.399194:62:37:67:78:62:37:71:78
chr19	44932972	.	C	T	182.24	PASS	AF=0.32;AO=24;DP=75;FAO=24;FDP=75;FR=.;FRO=51;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=-0.00412777;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.158;QD=9.71933;RBI=0.0129909;REFB=-0.00626268;REVB=-0.0123177;RO=51;SAF=15;SAR=9;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136137;STB=0.580137;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=0.0153284;OID=.;OPOS=44932972;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:51:51:24:24:0.32:9:15:26:25:9:15:26:25
chr19	44933947	.	G	A	360.14	PASS	AF=0.40625;AO=39;DP=96;FAO=39;FDP=96;FR=.;FRO=57;FSAF=24;FSAR=15;FSRF=27;FSRR=30;FWDB=-0.00778884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.939;QD=15.0056;RBI=0.0236553;REFB=0.013967;REVB=-0.0223362;RO=55;SAF=24;SAR=15;SRF=27;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.131256;STB=0.585322;STBP=0.183;TYPE=snp;VARB=-0.0145563;OID=.;OPOS=44933947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:55:57:39:39:0.40625:15:24:27:28:15:24:27:30
chr19	44934489	.	G	A	224.86	PASS	AF=0.358974;AO=28;DP=78;FAO=28;FDP=78;FR=.;FRO=50;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=29;FSRR=21;FWDB=0.0148981;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.2772;QD=11.5311;RBI=0.0304594;REFB=-0.0166883;REVB=0.0265673;RO=49;SAF=12;SAR=16;SRF=29;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.178752;STB=0.596295;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0364005;OID=.;OPOS=44934489;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:49:50:28:28:0.358974:16:12:29:20:16:12:29:21
chr19	44981318	.	G	A	90.33	PASS	AF=0.5;AO=11;DP=21;FAO=11;FDP=22;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=-0.00492462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.354;QD=16.424;RBI=0.0174919;REFB=0.0106779;REVB=0.0167843;RO=10;SAF=6;SAR=5;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119431;STB=0.545372;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=-0.0103864;OID=.;OPOS=44981318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:21:22:10:11:11:11:0.5:5:6:4:6:5:6:5:6
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chr19	45162189	.	C	A	630.8	PASS	AF=0.516393;AO=63;DP=124;FAO=63;FDP=122;FR=.;FRO=59;FSAF=35;FSAR=28;FSRF=38;FSRR=21;FWDB=-0.000208042;FXX=0.0161277;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.344;QD=20.682;RBI=0.0145173;REFB=0.00808784;REVB=0.0145158;RO=57;SAF=35;SAR=28;SRF=36;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0671343;STB=0.543748;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=-0.00742276;OID=.;OPOS=45162189;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:122:57:59:63:63:0.516393:28:35:36:21:28:35:38:21
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chr19	45448465	.	T	G	176.79	PASS	AF=0.68;AO=17;DP=26;FAO=17;FDP=25;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=0.00220188;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.215;QD=28.2856;RBI=0.0158007;REFB=-0.00462401;REVB=-0.0156465;RO=8;SAF=7;SAR=10;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.123511;STB=0.568639;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0029402;OID=.;OPOS=45448465;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:26:25:8:8:17:17:0.68:10:7:5:3:10:7:5:3
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chr19	45490570	.	A	G	330.05	PASS	AF=0.486111;AO=28;DP=72;FAO=35;FDP=72;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.00738416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.609;QD=18.3364;RBI=0.0278079;REFB=-0.0445935;REVB=-0.0268095;RO=35;SAF=17;SAR=11;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0933254;STB=0.561281;STBP=0.355;TYPE=snp;VARB=0.0405025;OID=.;OPOS=45490570;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:35:37:28:35:0.486111:11:17:18:17:13:22:19:18
chr19	45561063	.	A	G	1445.4	PASS	AF=1;AO=90;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283563;FXX=0.0107515;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.9415;QD=62.8434;RBI=0.043219;REFB=0;REVB=-0.0326161;RO=0;SAF=43;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.16558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.6431e-05;OID=.;OPOS=45561063;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:90:92:1:47:43:0:0:48:44:0:0
chr19	45655762	.	A	C	43.26	PASS	AF=0.195122;AO=6;DP=40;FAO=8;FDP=41;FR=.;FRO=33;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=9;FWDB=-0.0228886;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=144.109;QD=4.22093;RBI=0.0231329;REFB=-0.00337509;REVB=0.00335274;RO=32;SAF=3;SAR=3;SRF=24;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.313051;STB=0.762165;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0567419;OID=.;OPOS=45655762;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:43:40:41:32:33:6:8:0.195122:3:3:24:8:5:3:24:9
chr19	45801018	.	T	C	115.97	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0403375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.2752;QD=42.1693;RBI=0.0437103;REFB=0;REVB=-0.0168369;RO=0;SAF=10;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0026994;OID=.;OPOS=45801018;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:1:10:0:0:1:10:0:0
chr19	45806609	.	A	G	124.87	PASS	AF=0.5;AO=14;DP=28;FAO=14;FDP=28;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=0.0242987;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.6641;QD=17.8378;RBI=0.0243395;REFB=0.0606253;REVB=-0.00140911;RO=14;SAF=4;SAR=10;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732887;STB=0.542107;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=-0.0134589;OID=.;OPOS=45806609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:28:14:14:14:14:0.5:10:4:5:9:10:4:5:9
chr19	45810035	.	A	G	222.91	PASS	AF=0.462963;AO=25;DP=55;FAO=25;FDP=54;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=19;FWDB=0.0466896;FXX=0.0181785;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.15;QD=16.5116;RBI=0.0476326;REFB=-0.0127565;REVB=-0.00943124;RO=29;SAF=18;SAR=7;SRF=10;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.361827;STB=0.704653;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00674002;OID=.;OPOS=45810035;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:54:29:29:25:25:0.462963:7:18:10:19:7:18:10:19
chr19	45818835	.	A	G	192.0	PASS	AF=0.369231;AO=25;DP=65;FAO=24;FDP=65;FR=.;FRO=41;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=0.00739477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.785;QD=11.8156;RBI=0.00793726;REFB=0.00423511;REVB=-0.00288398;RO=39;SAF=8;SAR=17;SRF=20;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.213406;STB=0.616921;STBP=0.195;TYPE=snp;VARB=-0.00575609;OID=.;OPOS=45818835;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:41:25:24:0.369231:17:8:20:19:16:8:21:20
chr19	45853919	.	ACT	A	166.91	PASS	AF=0.607143;AO=15;DP=29;FAO=17;FDP=28;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.0318728;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=2;MLLD=213.343;QD=23.8438;RBI=0.0352625;REFB=-0.0401702;REVB=0.0150854;RO=11;SAF=3;SAR=12;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.244687;STB=0.606083;STBP=0.195;TYPE=del;VARB=0.024775;OID=.;OPOS=45853920;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.607143:15:29:17:28:11:4:13:5:6:88:11:3:12:5:6
chr19	45898694	.	CT	C	34.38	PASS	AF=0.461538;AO=11;DP=27;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=10;FWDB=-0.0812724;FXX=0.0370233;HRUN=2;LEN=1;MLLD=10.5156;QD=5.28969;RBI=0.249311;REFB=-0.0954337;REVB=0.235692;RO=14;SAF=11;SAR=0;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.837414;STB=0.810268;STBP=0.008;TYPE=del;VARB=0.118544;OID=.;OPOS=45898695;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.461538:11:27:12:26:14:10:2:4:10:34:14:11:0:3:11
chr19	45912736	.	C	A	199.72	PASS	AF=0.818182;AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0505572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.232;QD=36.3121;RBI=0.0873783;REFB=-0.0422245;REVB=0.0712667;RO=4;SAF=7;SAR=11;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0383221;STB=0.521029;STBP=0.688;TYPE=snp;VARB=0.00248882;OID=.;OPOS=45912736;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:22:22:4:4:18:18:0.818182:11:7:2:2:11:7:2:2
chr19	45923653	.	A	G	309.73	PASS	AF=0.507692;AO=33;DP=65;FAO=33;FDP=65;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=15;FSRR=17;FWDB=0.0883273;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.9759;QD=19.06;RBI=0.0886818;REFB=-0.0399857;REVB=-0.00792196;RO=31;SAF=17;SAR=16;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272385;STB=0.522819;STBP=0.738;TYPE=snp;VARB=0.0395369;OID=.;OPOS=45923653;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:31:32:33:33:0.507692:16:17:15:16:16:17:15:17
chr19	45978375	.	A	G	225.93	PASS	AF=0.5;AO=22;DP=44;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=8;FWDB=-0.00281606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.2518;QD=20.5388;RBI=0.0709627;REFB=-0.033695;REVB=-0.0709068;RO=22;SAF=10;SAR=12;SRF=14;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160305;STB=0.590083;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0116993;OID=.;OPOS=45978375;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:22:22:22:22:0.5:12:10:14:8:12:10:14:8
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chr19	46029981	.	T	C	878.06	PASS	AF=0.530488;AO=86;DP=163;FAO=87;FDP=164;FR=.;FRO=77;FSAF=26;FSAR=61;FSRF=31;FSRR=46;FWDB=-0.0160174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=74.9175;QD=21.4162;RBI=0.0226061;REFB=0.015424;REVB=0.0159525;RO=77;SAF=26;SAR=60;SRF=31;SRR=46;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0978504;STB=0.555507;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=-0.0101246;OID=.;OPOS=46029981;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:164:77:77:86:87:0.530488:60:26:31:46:61:26:31:46
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chr19	46095651	.	A	G	58.6	PASS	AF=0.5;AO=8;DP=16;FAO=8;FDP=16;FR=.;FRO=8;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=-0.00828164;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.207;QD=14.6498;RBI=0.0477711;REFB=-0.0122236;REVB=-0.0470477;RO=8;SAF=3;SAR=5;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404954;STB=0.734774;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=0.0180797;OID=.;OPOS=46095651;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:16:16:8:8:8:8:0.5:5:3:7:1:5:3:7:1
chr19	46124517	.	C	T	196.87	PASS	AF=0.75;AO=18;DP=25;FAO=18;FDP=24;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.0276337;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.918;QD=32.8123;RBI=0.0565418;REFB=-0.0398278;REVB=0.0493291;RO=6;SAF=9;SAR=9;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755808;STB=0.541621;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00955453;OID=.;OPOS=46124517;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:25:24:6:6:18:18:0.75:9:9:2:4:9:9:2:4
chr19	46129999	.	C	A	110.15	PASS	AF=0.444444;AO=9;DP=28;FAO=12;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=13;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.121045;FXX=0.0357015;HRUN=6;LEN=1;MLLD=59.4557;QD=16.3182;RBI=0.122083;REFB=-0.0322382;REVB=0.0158891;RO=8;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14199;STB=0.571306;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=-0.000233508;OID=.;OPOS=46129999;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:28:27:8:13:9:12:0.444444:3:6:4:4:4:8:7:6
chr19	46180358	.	T	A	218.89	PASS	AF=0.567568;AO=21;DP=37;FAO=21;FDP=37;FR=.;FRO=16;FSAF=17;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=8;FWDB=0.0203443;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.7556;QD=23.6634;RBI=0.0207184;REFB=-0.00781433;REVB=0.00391943;RO=16;SAF=17;SAR=4;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.302284;STB=0.67087;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0064809;OID=.;OPOS=46180358;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:16:16:21:21:0.567568:4:17:8:8:4:17:8:8
chr19	46180578	.	C	T	38.65	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=18;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=-0.011831;FXX=0.0555247;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.456;QD=9.0939;RBI=0.011831;REFB=0.0034389;REVB=0;RO=11;SAF=6;SAR=0;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00227668;OID=.;OPOS=46180578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:18:17:11:11:6:6:0.352941:0:6:11:0:0:6:11:0
chr19	46214823	.	T	C	108.61	PASS	AF=0.40625;AO=13;DP=32;FAO=13;FDP=32;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.0172163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.619;QD=13.5762;RBI=0.0179776;REFB=-0.0143486;REVB=0.00517622;RO=19;SAF=4;SAR=9;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00958068;STB=0.505609;STBP=0.971;TYPE=snp;VARB=0.0198088;OID=.;OPOS=46214823;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:19:19:13:13:0.40625:9:4:6:13:9:4:6:13
chr19	46269076	.	G	A	384.88	PASS	AF=0.90625;AO=29;DP=32;FAO=29;FDP=32;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=21;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.071826;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=184.316;QD=48.1094;RBI=0.082141;REFB=-0.100421;REVB=0.0398518;RO=3;SAF=8;SAR=21;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146073;STB=0.57889;STBP=0.024;TYPE=snp;VARB=0.000857957;OID=.;OPOS=46269076;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:32:32:3:3:29:29:0.90625:21:8:3:0:21:8:3:0
chr19	46269313	.	G	C	123.17	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0337312;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=163.284;QD=37.8978;RBI=0.0338523;REFB=-0.12458;REVB=-0.0028603;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.545378;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.00346593;OID=.;OPOS=46269313;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:0:1:12:12:0.923077:5:7:0:0:5:7:0:1
chr19	46287200	.	C	G	239.39	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00591099;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.211;QD=50.3977;RBI=0.00799629;REFB=0;REVB=0.00538524;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.29817e-05;OID=.;OPOS=46287200;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr19	46289392	.	G	C	581.11	PASS	AF=0.930233;AO=37;DP=48;FAO=40;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=30;FSAR=10;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0179155;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=239.746;QD=54.0566;RBI=0.0205427;REFB=-0.122025;REVB=0.0100518;RO=4;SAF=28;SAR=9;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00166904;STB=0.516121;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.00386781;OID=.;OPOS=46289392;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:48:43:4:2:37:40:0.930233:9:28:3:1:10:30:2:0
chr19	46319415	.	G	C	703.89	PASS	AF=1;AO=40;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0252178;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=274.649;QD=59.9059;RBI=0.0578688;REFB=-0.0685261;REVB=0.0520851;RO=1;SAF=29;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407263;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00226745;OID=.;OPOS=46319415;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:47:47:1:0:40:47:1:11:29:0:1:14:33:0:0
chr19	46327053	.	C	T	677.62	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000889427;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.005;QD=61.6022;RBI=0.00336938;REFB=0;REVB=0.00324986;RO=0;SAF=20;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000258997;OID=.;OPOS=46327053;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:24:20:0:0:24:20:0:0
chr19	46330809	.	G	A	1009.62	PASS	AF=0.958904;AO=69;DP=72;FAO=70;FDP=73;FR=.;FRO=3;FSAF=40;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=-0.0124875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0905;QD=55.3216;RBI=0.0689191;REFB=-0.186843;REVB=0.0677784;RO=3;SAF=39;SAR=30;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0449513;STB=0.523803;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00543541;OID=.;OPOS=46330809;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:72:73:3:3:69:70:0.958904:30:39:0:3:30:40:0:3
chr19	46375779	.	C	T	429.02	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000688113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.837;QD=57.202;RBI=0.0168919;REFB=0;REVB=0.0168779;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107956;OID=.;OPOS=46375779;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:13:16:0:0:13:17:0:0
chr19	46387503	.	T	C	115.99	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.822;QD=42.1791;RBI=0.102015;REFB=0;REVB=-0.101418;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0023932;OID=.;OPOS=46387503;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr19	46388379	.	C	G	604.67	PASS	AF=0.931818;AO=41;DP=44;FAO=41;FDP=44;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.056457;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.639;QD=54.9698;RBI=0.0567336;REFB=-0.143678;REVB=0.00559513;RO=2;SAF=16;SAR=25;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.010028;STB=0.519621;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.00134293;OID=.;OPOS=46388379;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:44:44:2:3:41:41:0.931818:25:16:1:1:25:16:2:1
chr19	46404579	.	A	G	587.36	PASS	AF=1;AO=35;DP=40;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392212;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.346;QD=60.2422;RBI=0.0398024;REFB=0;REVB=0.00677694;RO=0;SAF=8;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133405;OID=.;OPOS=46404579;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:39:0:0:35:39:1:27:8:0:0:30:9:0:0
chr19	46443389	.	C	G	266.45	PASS	AF=0.884615;AO=22;DP=26;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.4109;QD=40.9929;RBI=0.188296;REFB=-0.195229;REVB=0.188296;RO=4;SAF=0;SAR=22;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0443387;OID=.;OPOS=46443389;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:26:26:4:3:22:23:0.884615:22:0:0:4:23:0:0:3
chr19	46520026	.	A	G	311.25	PASS	AF=0.457831;AO=31;DP=80;FAO=38;FDP=83;FR=.;FRO=45;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=27;FWDB=-0.000795539;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.343;QD=15.0001;RBI=0.00750607;REFB=-0.0192339;REVB=0.0074638;RO=40;SAF=14;SAR=17;SRF=13;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129756;STB=0.502981;STBP=0.952;TYPE=snp;VARB=0.0218234;OID=.;OPOS=46520026;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:83:40:45:31:38:0.457831:17:14:13:27:23:15:18:27
chr19	46520027	.	GC	G,GG	67.23	PASS	AF=0.175676,0.0810811;AO=12,7;DP=76;FAO=13,6;FDP=74;FR=.;FRO=55;FSAF=1,1;FSAR=12,5;FSRF=25;FSRR=30;FWDB=0.0873124,0.0532941;FXX=0.0263123;HRUN=5,5;LEN=1,1;MLLD=10.6415,27.7192;QD=3.63397;RBI=0.144042,0.0634802;REFB=-0.0639094,-0.0414194;REVB=-0.114563,-0.0344888;RO=47;SAF=2,1;SAR=10,6;SRF=21;SRR=26;SSEN=0.511628,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.395221,-0.401852;STB=0.880664,0.78684;STBP=0.008,0.176;TYPE=del,snp;VARB=-0.032527,0.156861;OID=.,.;OPOS=46520028,46520028;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=G,GG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.175676,0.0810811:12,7:76:13,6:74:55:1,1:12,5:25:30:37:47:2,1:10,6:21:26
chr19	46543212	.	T	C	45.35	PASS	AF=0.318182;AO=7;DP=22;FAO=7;FDP=22;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.00709367;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.288;QD=8.24621;RBI=0.0351083;REFB=-0.0193921;REVB=-0.0343842;RO=14;SAF=5;SAR=2;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.538348;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.0273504;OID=.;OPOS=46543212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:22:14:15:7:7:0.318182:2:5:10:4:2:5:10:5
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chr19	46627592	.	G	A	132.09	PASS	AF=0.320755;AO=17;DP=53;FAO=17;FDP=53;FR=.;FRO=36;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=23;FWDB=0.0115105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3919;QD=9.96934;RBI=0.0490076;REFB=-0.00475605;REVB=-0.0476367;RO=32;SAF=7;SAR=10;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0063212;STB=0.535921;STBP=0.724;TYPE=snp;VARB=0.015859;OID=.;OPOS=46627592;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:32:36:17:17:0.320755:10:7:13:19:10:7:13:23
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chr19	46815310	.	G	A	117.52	PASS	AF=0.378378;AO=13;DP=36;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0136066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.994;QD=12.7047;RBI=0.013919;REFB=-0.00781117;REVB=0.00293248;RO=22;SAF=2;SAR=11;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.508664;STB=0.820015;STBP=0.006;TYPE=snp;VARB=0.0302159;OID=.;OPOS=46815310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:37:22:23:13:14:0.378378:11:2:13:9:12:2:14:9
chr19	46815499	.	T	C	538.49	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000108544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.1871;QD=59.8319;RBI=0.0463017;REFB=0;REVB=-0.0463015;RO=0;SAF=7;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000513025;OID=.;OPOS=46815499;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:29:7:0:0:29:7:0:0
chr19	46815703	.	ATATT	A,ATCTT	123.24	PASS	AF=0.833333,0.166667;AO=6,2;DP=13;FAO=10,2;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2,1;FSAR=8,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00825974,0.0048385;FXX=0.142755;HRUN=1,1;LEN=4,1;MLLD=179.297,35.0719;QD=41.0799;RBI=0.0196428,0.261108;REFB=0,0;REVB=-0.0178218,-0.261063;RO=0;SAF=2,1;SAR=4,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0136679,0.0736615;OID=.,.;OPOS=46815704,46815705;OREF=TATT,A;OALT=-,C;OMAPALT=A,ATCTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.833333,0.166667:6,2:13:10,2:12:0:2,1:8,1:0:0:10:0:2,1:4,1:0:0
chr19	46815711	.	C	T	112.2	PASS	AF=0.722222;AO=15;DP=15;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0329041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.33;QD=24.9329;RBI=0.0330472;REFB=-0.00323647;REVB=-0.00307226;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.646847;STBP=0.087;TYPE=snp;VARB=0.00163363;OID=.;OPOS=46815711;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:29:15:18:0:5:15:13:0.722222:10:5:0:0:6:7:0:5
chr19	46823702	.	A	G	786.76	PASS	AF=1;AO=47;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0120372;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0654;QD=62.9411;RBI=0.0685428;REFB=0;REVB=0.0674776;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000388484;OID=.;OPOS=46823702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:47:50:1:20:27:0:0:22:28:0:0
chr19	46823751	.	C	T	804.66	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0232484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.834;QD=64.3731;RBI=0.0236497;REFB=0;REVB=0.00433828;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108031;OID=.;OPOS=46823751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:50:0:0:47:50:1:28:19:0:0:29:21:0:0
chr19	46842834	.	CGGGGGC	CGGGG,CGGGGC	30.4	PASS	AF=0.116279,0.116279;AO=5,10;DP=50;FAO=5,5;FDP=43;FR=.;FRO=33;FSAF=4,0;FSAR=1,5;FSRF=8;FSRR=25;FWDB=-0.0770326,0.0702446;FXX=0;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=18.6907,10.4068;QD=2.82763;RBI=0.100371,0.0704292;REFB=-0.056313,-0.0841398;REVB=-0.0643459,0.00509539;RO=26;SAF=4,0;SAR=1,10;SRF=11;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.433987,-0.748197;STB=0.89543,0.996853;STBP=0.2,0.117;TYPE=del,del;VARB=0.111086,0.118017;OID=.,.;OPOS=46842839,46842835;OREF=GC,G;OALT=-,-;OMAPALT=CGGGG,CGGGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.116279,0.116279:5,10:50:5,5:43:33:4,0:1,5:8:25:14:26:4,0:1,10:11:15
chr19	46857015	.	C	T	296.06	PASS	AF=0.355769;AO=37;DP=104;FAO=37;FDP=104;FR=.;FRO=67;FSAF=20;FSAR=17;FSRF=40;FSRR=27;FWDB=0.0268108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.412;QD=11.387;RBI=0.0281222;REFB=-0.0106215;REVB=0.00848746;RO=66;SAF=20;SAR=17;SRF=39;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0569461;STB=0.536822;STBP=0.583;TYPE=snp;VARB=0.0226823;OID=.;OPOS=46857015;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:104:66:67:37:37:0.355769:17:20:39:27:17:20:40:27
chr19	46893810	.	G	A	37.52	PASS	AF=0.461538;AO=5;DP=13;FAO=6;FDP=13;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=0.0573113;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.0169;QD=11.5457;RBI=0.111589;REFB=-0.0146272;REVB=0.0957466;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0274957;STB=0.538334;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0360742;OID=.;OPOS=46893810;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:13:13:7:7:5:6:0.461538:3:2:3:4:3:3:3:4
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chr19	46971773	.	T	G	57.88	PASS	AF=0.4;AO=8;DP=21;FAO=8;FDP=20;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=0.016978;FXX=0.0475964;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.8752;QD=11.5767;RBI=0.0255956;REFB=0.00862867;REVB=0.0191541;RO=12;SAF=5;SAR=3;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206895;STB=0.624687;STBP=0.423;TYPE=snp;VARB=-0.00900666;OID=.;OPOS=46971773;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:21:20:12:12:8:8:0.4:3:5:5:7:3:5:5:7
chr19	46997522	.	C	T	348.32	PASS	AF=0.514286;AO=34;DP=68;FAO=36;FDP=70;FR=.;FRO=34;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=17;FSRR=17;FWDB=0.0698541;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=163.585;QD=19.9043;RBI=0.0743068;REFB=-0.0487082;REVB=0.0253359;RO=33;SAF=15;SAR=19;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0657832;STB=0.513506;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0327781;OID=.;OPOS=46997522;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:70:33:34:34:36:0.514286:19:15:17:16:19:17:17:17
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chr19	47177913	.	A	G	990.58	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0521153;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.672;QD=59.139;RBI=0.0522537;REFB=0;REVB=-0.00379993;RO=0;SAF=30;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159976;OID=.;OPOS=47177913;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:37:30:0:0:37:30:0:0
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chr19	47761646	.	G	C	129.51	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00833637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.728;QD=43.1699;RBI=0.040391;REFB=0;REVB=0.0395214;RO=0;SAF=4;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000311978;OID=.;OPOS=47761646;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:12:0:0:11:12:1:7:4:0:0:7:5:0:0
chr19	47768128	.	G	C	123.07	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=4;FWDB=-0.0258889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.4669;QD=16.4094;RBI=0.0481452;REFB=-0.0206963;REVB=0.0405922;RO=16;SAF=10;SAR=4;SRF=12;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0414199;STB=0.523776;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=0.0432455;OID=.;OPOS=47768128;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:4:10:12:4:4:10:12:4
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chr19	47823038	.	G	A	374.65	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0314526;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.9737;QD=55.5035;RBI=0.0314748;REFB=0;REVB=-0.00117965;RO=0;SAF=13;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39874e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000731987;OID=.;OPOS=47823038;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:14:13:0:0:14:13:0:0
chr19	47823484	.	T	C	919.82	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.022077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.627;QD=58.4014;RBI=0.0300499;REFB=0;REVB=0.0203863;RO=0;SAF=43;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.32015e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.33543e-05;OID=.;OPOS=47823484;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:62:63:1:19:43:0:0:20:43:0:0
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chr19	47858424	.	G	A	662.29	PASS	AF=0.507692;AO=66;DP=130;FAO=66;FDP=130;FR=.;FRO=64;FSAF=39;FSAR=27;FSRF=37;FSRR=27;FWDB=0.00407913;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.484;QD=20.378;RBI=0.0301351;REFB=-0.0104197;REVB=0.0298577;RO=64;SAF=39;SAR=27;SRF=37;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0117838;STB=0.506492;STBP=0.898;TYPE=snp;VARB=0.0099359;OID=.;OPOS=47858424;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:64:64:66:66:0.507692:27:39:37:27:27:39:37:27
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chr19	47935352	.	T	C	272.45	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229463;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=154.998;QD=51.8956;RBI=0.0737128;REFB=0;REVB=0.0700503;RO=0;SAF=19;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.98875e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000553636;OID=.;OPOS=47935352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:2:19:0:0:2:19:0:0
chr19	47980153	.	G	A	1135.19	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00260364;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.873;QD=60.5432;RBI=0.101837;REFB=0;REVB=0.101804;RO=0;SAF=38;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000144639;OID=.;OPOS=47980153;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:37:38:0:0:37:38:0:0
chr19	48244194	.	A	G	817.7	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00736402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.991;QD=57.3826;RBI=0.0525148;REFB=0;REVB=-0.051996;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.62461e-05;OID=.;OPOS=48244194;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:25:32:0:0:25:32:0:0
chr19	48244569	.	G	A	158.07	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.210293;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.7728;QD=45.1633;RBI=0.21078;REFB=0;REVB=-0.014314;RO=1;SAF=8;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0533084;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00856062;OID=.;OPOS=48244569;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:1:0:13:14:1:5:8:1:0:5:9:0:0
chr19	48255804	.	A	C,G	491.92	PASS	AF=0.0294118,0.970588;AO=2,32;DP=34;FAO=1,33;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=1,21;FSAR=0,12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0107158,-0.00664511;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=180.152,83.7677;QD=57.8726;RBI=0.0427129,0.0359852;REFB=0,0;REVB=-0.0413469,-0.0353663;RO=0;SAF=2,20;SAR=0,12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0828938,-0.0025114;OID=.,.;OPOS=48255804,48255804;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:6:34:34:0:0:2,32:1,33:0.0294118,0.970588:0,12:2,20:0:0:0,12:1,21:0:0
chr19	48282078	.	C	G	296.36	PASS	AF=0.634146;AO=26;DP=41;FAO=26;FDP=41;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=11;FWDB=0.0485813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=185.348;QD=28.9134;RBI=0.050919;REFB=0.0135911;REVB=-0.0152512;RO=15;SAF=9;SAR=17;SRF=4;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.059599;STB=0.532745;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=-0.000681576;OID=.;OPOS=48282078;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:15:15:26:26:0.634146:17:9:4:11:17:9:4:11
chr19	48282098	.	T	G	40.71	PASS	AF=0.269231;AO=6;DP=26;FAO=7;FDP=26;FR=.;FRO=19;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=-0.0544577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.959;QD=6.26284;RBI=0.0648209;REFB=-0.0157443;REVB=-0.0351582;RO=18;SAF=0;SAR=6;SRF=4;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.659427;STB=0.642386;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0676121;OID=.;OPOS=48282098;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:26:26:18:19:6:7:0.269231:6:0:4:14:6:1:5:14
chr19	48389425	.	A	G	1759.59	PASS	AF=0.983333;AO=117;DP=119;FAO=118;FDP=120;FR=.;FRO=2;FSAF=59;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0280571;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=164.428;QD=58.653;RBI=0.0288203;REFB=-0.156206;REVB=0.00658872;RO=2;SAF=58;SAR=59;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00013639;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000627013;OID=.;OPOS=48389425;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:119:120:2:2:117:118:0.983333:59:58:1:1:59:59:1:1
chr19	48484150	.	G	A	165.16	PASS	AF=0.377358;AO=20;DP=53;FAO=20;FDP=53;FR=.;FRO=33;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=18;FWDB=-0.031827;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.972;QD=12.4649;RBI=0.0318281;REFB=-0.00413514;REVB=0.000261736;RO=33;SAF=8;SAR=12;SRF=15;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0600467;STB=0.534849;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0023002;OID=.;OPOS=48484150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:33:20:20:0.377358:12:8:15:18:12:8:15:18
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chr19	48598823	.	A	G	370.93	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.478;QD=54.952;RBI=0.0308018;REFB=0;REVB=0.0281545;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000183773;OID=.;OPOS=48598823;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:12:14:0:0:12:15:0:0
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chr19	48621036	.	C	G	481.49	PASS	AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.090067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.487;QD=53.4989;RBI=0.0997438;REFB=-0.0244287;REVB=0.0428574;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.538438;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.00109572;OID=.;OPOS=48621036;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:36:0:2:34:34:0.944444:12:22:0:0:12:22:0:2
chr19	48622427	.	A	G	3745.88	PASS	AF=1;AO=233;DP=233;FAO=236;FDP=236;FR=.;FRO=0;FSAF=133;FSAR=103;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0423643;FXX=0.00421923;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.0255;QD=63.4896;RBI=0.0428679;REFB=0;REVB=0.00655187;RO=0;SAF=130;SAR=103;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.88784e-05;OID=.;OPOS=48622427;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:20:233:236:0:0:233:236:1:103:130:0:0:103:133:0:0
chr19	48654553	.	G	T	594.31	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0395619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0011;QD=60.9546;RBI=0.0559196;REFB=0;REVB=-0.0395203;RO=0;SAF=26;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00115495;OID=.;OPOS=48654553;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:13:26:0:0:13:26:0:0
chr19	48668795	.	G	A	704.21	PASS	AF=0.958333;AO=46;DP=48;FAO=46;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0627817;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.9828;QD=58.6845;RBI=0.129107;REFB=-0.0514659;REVB=0.112814;RO=2;SAF=25;SAR=21;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0034276;STB=0.501824;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00436475;OID=.;OPOS=48668795;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:48:48:2:2:46:46:0.958333:21:25:1:1:21:25:1:1
chr19	48697961	.	C	T	220.71	PASS	AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=24;FSRR=22;FWDB=8.54195e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3578;QD=12.0938;RBI=0.0138692;REFB=0.00515435;REVB=-0.0138689;RO=46;SAF=12;SAR=15;SRF=24;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0846174;STB=0.548744;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.0103924;OID=.;OPOS=48697961;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:46:46:27:27:0.369863:15:12:24:22:15:12:24:22
chr19	48715153	.	T	C	88.44	PASS	AF=0.407407;AO=11;DP=28;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0594772;FXX=0.0357015;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.7602;QD=13.1024;RBI=0.0601757;REFB=0.00118346;REVB=-0.00914183;RO=17;SAF=3;SAR=8;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0271342;STB=0.528872;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=-0.00608456;OID=.;OPOS=48715153;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:88:28:27:17:16:11:11:0.407407:8:3:5:12:8:3:5:11
chr19	48722180	.	C	T	198.04	PASS	AF=0.352113;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=0.00187077;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.395;QD=11.1573;RBI=0.00532304;REFB=-0.016182;REVB=0.00498346;RO=45;SAF=9;SAR=16;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.060165;STB=0.539969;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=0.0279999;OID=.;OPOS=48722180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:45:46:25:25:0.352113:16:9:14:31:16:9:14:32
chr19	48737706	.	A	T	254.79	PASS	AF=0.533333;AO=23;DP=44;FAO=24;FDP=45;FR=.;FRO=21;FSAF=4;FSAR=20;FSRF=6;FSRR=15;FWDB=0.0119562;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.518;QD=22.6476;RBI=0.0189451;REFB=-0.0130475;REVB=0.0146958;RO=21;SAF=3;SAR=20;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.230769;STB=0.588154;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.0137657;OID=.;OPOS=48737706;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:45:21:21:23:24:0.533333:20:3:6:15:20:4:6:15
chr19	48737764	.	A	G	233.7	PASS	AF=0.578947;AO=22;DP=38;FAO=22;FDP=38;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=15;FWDB=-0.0354111;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=257.836;QD=24.5996;RBI=0.0400726;REFB=-0.0172425;REVB=0.018758;RO=16;SAF=2;SAR=20;SRF=1;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0694903;STB=0.538429;STBP=0.797;TYPE=snp;VARB=0.0130899;OID=.;OPOS=48737764;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:16:16:22:22:0.578947:20:2:1:15:20:2:1:15
chr19	48823545	.	G	A	396.49	PASS	AF=0.460674;AO=41;DP=88;FAO=41;FDP=89;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.00832114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.054;QD=17.8198;RBI=0.0167542;REFB=-0.0162091;REVB=-0.0145418;RO=47;SAF=27;SAR=14;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128109;STB=0.57842;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0211577;OID=.;OPOS=48823545;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:89:47:48:41:41:0.460674:14:27:25:22:14:27:25:23
chr19	48835668	.	G	C	327.32	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=76;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=16;FSRR=24;FWDB=0.00674925;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.464;QD=17.457;RBI=0.00729825;REFB=-0.0157774;REVB=0.00277707;RO=40;SAF=17;SAR=18;SRF=16;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0819771;STB=0.545846;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0285561;OID=.;OPOS=48835668;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:75:40:40:35:35:0.466667:18:17:16:24:18:17:16:24
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chr19	48994699	.	G	A	124.65	PASS	AF=0.722222;AO=13;DP=18;FAO=13;FDP=18;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=0.0250167;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=204.736;QD=27.6991;RBI=0.0663045;REFB=-0.0493157;REVB=0.0614039;RO=4;SAF=11;SAR=2;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139462;STB=0.523772;STBP=0.895;TYPE=snp;VARB=0.00577824;OID=.;OPOS=48994699;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:18:18:4:5:13:13:0.722222:2:11:4:0:2:11:4:1
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chr19	49106995	.	G	A	159.81	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=3;FWDB=-0.033337;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=85.7143;QD=26.6357;RBI=0.0586582;REFB=-0.0699432;REVB=0.0482641;RO=8;SAF=10;SAR=6;SRF=5;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0385022;OID=.;OPOS=49106995;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:6:10:5:3:6:10:5:3
chr19	49116359	.	T	C	694.28	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000759353;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6668;QD=63.1162;RBI=0.0282131;REFB=0;REVB=-0.0282029;RO=0;SAF=17;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.54734e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000784319;OID=.;OPOS=49116359;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:27:17:0:0:27:17:0:0
chr19	49116438	.	A	G	270.89	PASS	AF=0.43662;AO=30;DP=69;FAO=31;FDP=71;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=18;FWDB=-0.0252998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.9564;QD=15.2615;RBI=0.0300283;REFB=-0.029525;REVB=-0.0161745;RO=39;SAF=16;SAR=14;SRF=21;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00514901;STB=0.500917;STBP=0.997;TYPE=snp;VARB=0.0314912;OID=.;OPOS=49116438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:71:39:40:30:31:0.43662:14:16:21:18:14:17:22:18
chr19	49116555	.	A	G	619.51	PASS	AF=0.907407;AO=47;DP=52;FAO=49;FDP=54;FR=.;FRO=5;FSAF=33;FSAR=16;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0445138;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=46.1469;QD=45.8895;RBI=0.0542738;REFB=-0.0852812;REVB=-0.0310509;RO=5;SAF=32;SAR=15;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0568753;STB=0.528211;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00627453;OID=.;OPOS=49116555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:23:52:54:5:5:47:49:0.907407:15:32:2:3:16:33:2:3
chr19	49119899	.	AC	ACCAGCA,CA	31.34	PASS	AF=0.857143,0.0952381;AO=14,2;DP=20;FAO=18,2;FDP=21;FR=.;FRO=1;FSAF=17,1;FSAR=1,1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0,-0.0504563;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=5,2;MLLD=24.9269,240.265;QD=5.96885;RBI=0.00914785,0.0504885;REFB=-0.0595689,-0.0115924;REVB=-0.00914785,0.00180103;RO=3;SAF=13,1;SAR=1,1;SRF=3;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0941597,-0.473628;STB=0.66643,0.665164;STBP=0.04,0.662;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0756586,0.0842594;OID=.,.;OPOS=49119901,49119899;OREF=-,AC;OALT=CAGCA,CA;OMAPALT=ACCAGCA,CA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:20:21:3:1:14,2:18,2:0.857143,0.0952381:1,1:13,1:3:0:1,1:17,1:0:1
chr19	49133761	.	C	T	337.91	PASS	AF=0.467532;AO=36;DP=77;FAO=36;FDP=77;FR=.;FRO=41;FSAF=25;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=20;FWDB=-0.00161421;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=218.337;QD=17.5537;RBI=0.0223151;REFB=-0.0373779;REVB=-0.0222567;RO=41;SAF=25;SAR=11;SRF=21;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.186735;STB=0.604935;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.0395602;OID=.;OPOS=49133761;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:77:41:41:36:36:0.467532:11:25:21:20:11:25:21:20
chr19	49183705	.	G	A	769.44	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0207888;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3502;QD=56.9958;RBI=0.0537436;REFB=0;REVB=0.0495601;RO=0;SAF=30;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000762913;OID=.;OPOS=49183705;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:24:30:0:0:24:30:0:0
chr19	49206603	.	C	T	695.52	PASS	AF=1;AO=34;DP=45;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044363;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.876;QD=63.2293;RBI=0.0455553;REFB=0;REVB=0.010354;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181564;OID=.;OPOS=49206603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:44:0:0:34:44:1:16:18:0:0:26:18:0:0
chr19	49206631	.	A	T	325.76	PASS	AF=0.603774;AO=32;DP=52;FAO=32;FDP=53;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.00262875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.69;QD=24.5857;RBI=0.00421526;REFB=-0.00709085;REVB=-0.00329516;RO=17;SAF=18;SAR=14;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.132549;STB=0.53442;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.00641129;OID=.;OPOS=49206631;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:53:17:21:32:32:0.603774:14:18:6:11:14:18:10:11
chr19	49207438	.	T	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.121331;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=323;QD=39.2068;RBI=0.121637;REFB=0;REVB=0.00862661;RO=0;SAF=1;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000761181;OID=.;OPOS=49207438;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:8:1:0:0:8:1:0:0
chr19	49217261	.	A	G	755.93	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0177644;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.425;QD=57.0512;RBI=0.0448372;REFB=0;REVB=-0.0411679;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.75933e-05;OID=.;OPOS=49217261;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:29:24:0:0:29:24:0:0
chr19	49217305	.	A	G	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0162579;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.513;QD=57.7124;RBI=0.0333111;REFB=0;REVB=0.0290742;RO=0;SAF=26;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.00382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.68348e-05;OID=.;OPOS=49217305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:33:26:0:0:33:26:0:0
chr19	49244219	.	CG	AA	1027.06	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126177;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=248.67;QD=59.5397;RBI=0.0496576;REFB=0;REVB=0.0480278;RO=0;SAF=55;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=8.67767e-05;OID=.;OPOS=49244219;OREF=CG;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:68:69:1:13:55:0:0:14:55:0:0
chr19	49247786	.	G	A	754.22	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189933;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.169;QD=62.8519;RBI=0.0589975;REFB=0;REVB=0.0558566;RO=0;SAF=25;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254938;OID=.;OPOS=49247786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:22:25:0:0:22:26:0:0
chr19	49259529	.	A	G	1490.3	PASS	AF=1;AO=90;DP=93;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419444;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.129;QD=59.6122;RBI=0.0522007;REFB=0;REVB=0.0310738;RO=0;SAF=61;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.71646e-05;OID=.;OPOS=49259529;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:100:0:0:90:100:1:29:61:0:0:31:69:0:0
chr19	49261368	.	T	C	371.54	PASS	AF=1;AO=24;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00897098;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=314.067;QD=55.043;RBI=0.0126306;REFB=0;REVB=-0.00889121;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00127292;OID=.;OPOS=49261368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:24:27:1:18:6:0:0:20:7:0:0
chr19	49299533	.	A	G	1199.89	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.043768;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.882;QD=59.9946;RBI=0.0483087;REFB=0;REVB=0.0204473;RO=0;SAF=39;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33478e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000181806;OID=.;OPOS=49299533;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:80:0:0:79:80:1:40:39:0:0:41:39:0:0
chr19	49376584	.	G	A	576.06	PASS	AF=0.542056;AO=56;DP=106;FAO=58;FDP=107;FR=.;FRO=49;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=17;FWDB=-0.00262576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.069;QD=21.5349;RBI=0.00650997;REFB=-0.0173275;REVB=-0.00595694;RO=47;SAF=33;SAR=23;SRF=30;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424646;STB=0.53189;STBP=0.473;TYPE=snp;VARB=0.0139203;OID=.;OPOS=49376584;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:107:47:49:56:58:0.542056:23:33:30:17:24:34:32:17
chr19	49416456	.	G	A	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=11;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=-0.0101292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.226;QD=14.1698;RBI=0.0217217;REFB=-0.0105336;REVB=0.0192155;RO=11;SAF=5;SAR=6;SRF=6;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0783488;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0158361;OID=.;OPOS=49416456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:11:12:11:10:0.454545:6:5:6:5:5:5:6:6
chr19	49421966	.	T	C	397.93	PASS	AF=0.506329;AO=39;DP=79;FAO=40;FDP=79;FR=.;FRO=39;FSAF=34;FSAR=6;FSRF=18;FSRR=21;FWDB=0.00652434;FXX=0.0124984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.197;QD=20.1485;RBI=0.0282919;REFB=-0.0207188;REVB=-0.0275293;RO=37;SAF=33;SAR=6;SRF=17;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427981;STB=0.746199;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0184958;OID=.;OPOS=49421966;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:37:39:39:40:0.506329:6:33:17:20:6:34:18:21
chr19	49438363	.	G	A	1389.79	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0261198;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=296.907;QD=62.4625;RBI=0.0449014;REFB=0;REVB=0.0365225;RO=0;SAF=43;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18592e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.37816e-05;OID=.;OPOS=49438363;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:89:0:0:81:89:1:38:43:0:0:46:43:0:0
chr19	49442933	.	T	C	972.86	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00961783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.336;QD=58.9609;RBI=0.0112584;REFB=0;REVB=-0.0058522;RO=0;SAF=29;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.21716e-06;OID=.;OPOS=49442933;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:37:29:0:0:37:29:0:0
chr19	49445817	.	T	C,G	1016.45	PASS	AF=0.928571,0.0714286;AO=65,5;DP=70;FAO=65,5;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=14,4;FSAR=51,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0091767,-0.0319911;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=98.3395,79.037;QD=58.0829;RBI=0.023191,0.0383206;REFB=0,0;REVB=0.0212982,-0.0210959;RO=0;SAF=14,4;SAR=51,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000258089,0.173873;OID=.,.;OPOS=49445817,49445817;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:16:70:70:0:0:65,5:65,5:0.928571,0.0714286:51,1:14,4:0:0:51,1:14,4:0:0
chr19	49513273	.	C	T	61.14	PASS	AF=0.321429;AO=9;DP=28;FAO=9;FDP=28;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.000267125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.9948;QD=8.73407;RBI=0.0254253;REFB=-0.011546;REVB=0.0254239;RO=19;SAF=6;SAR=3;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.217768;STB=0.633843;STBP=0.342;TYPE=snp;VARB=0.039692;OID=.;OPOS=49513273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:28:28:19:19:9:9:0.321429:3:6:9:10:3:6:9:10
chr19	49513349	.	C	G	95.65	PASS	AF=0.387097;AO=12;DP=31;FAO=12;FDP=31;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0644507;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=59.7772;QD=12.3416;RBI=0.067409;REFB=-0.0245771;REVB=-0.0197504;RO=19;SAF=8;SAR=4;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.306435;STB=0.680553;STBP=0.125;TYPE=snp;VARB=0.0289816;OID=.;OPOS=49513349;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:31:31:19:19:12:12:0.387097:4:8:7:12:4:8:7:12
chr19	49557572	.	T	C	288.57	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0331402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.663;QD=52.4669;RBI=0.0432498;REFB=0;REVB=0.0277898;RO=0;SAF=12;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.56032e-05;OID=.;OPOS=49557572;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:22:0:0:21:22:1:9:12:0:0:10:12:0:0
chr19	49558216	.	C	T	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0087;QD=33.4284;RBI=0.0395101;REFB=0;REVB=0.0395101;RO=0;SAF=0;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00383852;OID=.;OPOS=49558216;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:6:0:0:0:6:0:0:0
chr19	49559518	.	C	G	199.46	PASS	AF=0.818182;AO=18;DP=22;FAO=18;FDP=22;FR=.;FRO=4;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0482633;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.3862;QD=36.2658;RBI=0.0626162;REFB=-0.0571572;REVB=0.0398928;RO=4;SAF=8;SAR=10;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182451;STB=0.599891;STBP=0.076;TYPE=snp;VARB=0.0351848;OID=.;OPOS=49559518;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:22:22:4:4:18:18:0.818182:10:8:4:0:10:8:4:0
chr19	49559693	.	T	C	164.39	PASS	AF=0.473684;AO=16;DP=38;FAO=18;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=20;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=12;FWDB=-0.0309613;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=88.191;QD=17.3045;RBI=0.0629961;REFB=-0.168261;REVB=-0.0548626;RO=14;SAF=9;SAR=7;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00747459;STB=0.552574;STBP=0.52;TYPE=snp;VARB=0.024262;OID=.;OPOS=49559693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:14:20:16:18:0.473684:7:9:8:6:9:9:8:12
chr19	49560461	.	G	A	541.37	PASS	AF=1;AO=31;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346285;FXX=0.0263089;HRUN=3;LEN=1;MLLD=41.0929;QD=58.5266;RBI=0.183172;REFB=0;REVB=0.179869;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00435085;OID=.;OPOS=49560461;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:31:37:1:10:21:0:0:15:22:0:0
chr19	49573438	.	A	G	556.64	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0531612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.961;QD=60.1775;RBI=0.059393;REFB=0;REVB=0.0264842;RO=0;SAF=12;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000511754;OID=.;OPOS=49573438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:24:12:0:0:25:12:0:0
chr19	49574125	.	G	C	810.7	PASS	AF=0.983333;AO=58;DP=60;FAO=59;FDP=60;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0492698;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1309;QD=54.0464;RBI=0.0714092;REFB=-0.126908;REVB=-0.051689;RO=2;SAF=27;SAR=31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336634;STB=0.508769;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.00617146;OID=.;OPOS=49574125;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:60:60:2:1:58:59:0.983333:31:27:2:0:31:28:1:0
chr19	49621964	.	T	C	849.84	PASS	AF=1;AO=55;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142201;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.493;QD=56.6559;RBI=0.0635156;REFB=0;REVB=0.0619033;RO=0;SAF=35;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.67221e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000483381;OID=.;OPOS=49621964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:55:60:1:20:35:0:0:24:36:0:0
chr19	49649452	.	AG	A	53.13	PASS	AF=0.44;AO=9;DP=24;FAO=11;FDP=25;FR=.;FRO=14;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.153655;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=13.6631;QD=8.50095;RBI=0.154016;REFB=-0.0990868;REVB=0.0105249;RO=13;SAF=7;SAR=2;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0.34;SSSB=0.198262;STB=0.556415;STBP=0.66;TYPE=del;VARB=0.138739;OID=.;OPOS=49649453;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.44:9:24:11:25:14:8:3:9:5:53:13:7:2:8:5
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chr19	49658390	.	T	C	143.52	PASS	AF=0.327586;AO=19;DP=59;FAO=19;FDP=58;FR=.;FRO=39;FSAF=13;FSAR=6;FSRF=24;FSRR=15;FWDB=-0.00947624;FXX=0.0169463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.447;QD=9.89779;RBI=0.00981044;REFB=-0.00871954;REVB=-0.0025388;RO=40;SAF=13;SAR=6;SRF=25;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0756005;STB=0.551459;STBP=0.603;TYPE=snp;VARB=0.0130424;OID=.;OPOS=49658390;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:58:40:39:19:19:0.327586:6:13:25:15:6:13:24:15
chr19	49839015	.	T	C	39.61	PASS	AF=0.5;AO=6;DP=12;FAO=6;FDP=12;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=-0.0104979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.601;QD=13.2045;RBI=0.0283684;REFB=-0.00279229;REVB=0.0263545;RO=6;SAF=3;SAR=3;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0114346;OID=.;OPOS=49839015;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:12:12:6:6:6:6:0.5:3:3:3:3:3:3:3:3
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chr19	49878082	.	C	T	407.68	PASS	AF=0.456522;AO=42;DP=92;FAO=42;FDP=92;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=28;FSRR=22;FWDB=0.00863954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.744;QD=17.7252;RBI=0.0181046;REFB=0.00267733;REVB=0.0159102;RO=49;SAF=25;SAR=17;SRF=27;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.043761;STB=0.519713;STBP=0.729;TYPE=snp;VARB=-0.00402138;OID=.;OPOS=49878082;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:49:50:42:42:0.456522:17:25:27:22:17:25:28:22
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chr19	49930786	.	C	A	274.55	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=10;FWDB=0.00562553;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=303.047;QD=19.9671;RBI=0.00734871;REFB=-0.027232;REVB=-0.00472832;RO=26;SAF=17;SAR=12;SRF=16;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0256673;STB=0.514276;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0234364;OID=.;OPOS=49930786;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:12:17:16:10:12:17:16:10
chr19	49932762	.	G	T	937.14	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00182462;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3242;QD=58.5714;RBI=0.013749;REFB=0;REVB=0.0136274;RO=0;SAF=46;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.12145e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.58092e-05;OID=.;OPOS=49932762;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:18:46:0:0:18:46:0:0
chr19	49936785	.	C	G	171.1	PASS	AF=0.439024;AO=18;DP=42;FAO=18;FDP=41;FR=.;FRO=23;FSAF=5;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=-0.0173206;FXX=0.0238039;HRUN=3;LEN=1;MLLD=209.049;QD=16.6922;RBI=0.0204279;REFB=-0.0095076;REVB=0.0108304;RO=23;SAF=5;SAR=13;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128431;STB=0.574046;STBP=0.463;TYPE=snp;VARB=0.00716295;OID=.;OPOS=49936785;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:41:23:23:18:18:0.439024:13:5:9:14:13:5:9:14
chr19	49950298	.	C	T	300.0	PASS	AF=0.35;AO=34;DP=100;FAO=35;FDP=100;FR=.;FRO=65;FSAF=15;FSAR=20;FSRF=40;FSRR=25;FWDB=0.0316137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4042;QD=11.9998;RBI=0.0329009;REFB=0.00258512;REVB=0.00911259;RO=62;SAF=15;SAR=19;SRF=38;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.190758;STB=0.619651;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=-0.00530691;OID=.;OPOS=49950298;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:62:65:34:35:0.35:19:15:38:24:20:15:40:25
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chr19	50098260	.	A	AC,C	30.43	PASS	AF=0.4,0;AO=2,3;DP=15;FAO=6,0;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=1,0;FSAR=5,0;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0258099,0.0173139;FXX=0;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=39.1344,189.841;QD=8.11412;RBI=0.0283403,0.0209491;REFB=-0.0302072,-0.00140565;REVB=0.0117058,-0.0117939;RO=10;SAF=0,0;SAR=2,3;SRF=2;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.487131,-0.573898;STB=0.565019,0.5;STBP=0.828,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.183307,0;OID=.,.;OPOS=50098261,50098260;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:15:15:10:9:2,3:6,0:0.4,0:2,3:0,0:2:8:5,0:1,0:1:8
chr19	50140092	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00418389;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.257;QD=46.848;RBI=0.011208;REFB=0;REVB=0.0103978;RO=0;SAF=2;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.39072e-05;OID=.;OPOS=50140092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:13:2:0:0:13:2:0:0
chr19	50156896	.	T	C	851.14	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.808;QD=57.704;RBI=0.0534183;REFB=0;REVB=-0.0514184;RO=0;SAF=22;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000105784;OID=.;OPOS=50156896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:37:22:0:0:37:22:0:0
chr19	50306198	.	G	T	305.4	PASS	AF=0.478261;AO=31;DP=67;FAO=33;FDP=69;FR=.;FRO=36;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=0.000829693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.757;QD=17.7042;RBI=0.0108909;REFB=-0.0338783;REVB=-0.0108593;RO=36;SAF=19;SAR=12;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.162529;STB=0.602088;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.024493;OID=.;OPOS=50306198;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:69:36:36:31:33:0.478261:12:19:16:20:12:21:16:20
chr19	50312653	.	C	T	69.28	PASS	AF=0.888889;AO=8;DP=9;FAO=8;FDP=9;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0430942;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.959;QD=30.7901;RBI=0.0430942;REFB=-0.0954699;REVB=0;RO=1;SAF=8;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00522227;OID=.;OPOS=50312653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:9:9:1:1:8:8:0.888889:0:8:1:0:0:8:1:0
chr19	50333767	.	GGT	G	77.32	PASS	AF=0.526316;AO=9;DP=20;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=7;FWDB=-0.0977572;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=32.5929;QD=16.2774;RBI=0.180773;REFB=-0.075876;REVB=-0.15206;RO=9;SAF=8;SAR=1;SRF=2;SRR=7;SSEN=0.241135;SSEP=0;SSSB=0.614015;STB=0.866649;STBP=0.004;TYPE=del;VARB=0.0556972;OID=.;OPOS=50333768;OREF=GT;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.526316:9:20:10:19:9:9:1:2:7:65:9:8:1:2:7
chr19	50383591	.	A	G	1607.08	PASS	AF=1;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00267883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.954;QD=64.2833;RBI=0.00771868;REFB=0;REVB=0.00723892;RO=0;SAF=46;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21299e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22819e-05;OID=.;OPOS=50383591;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:100:100:0:0:100:100:1:54:46:0:0:54:46:0:0
chr19	50383636	.	T	C	486.25	PASS	AF=0.516484;AO=47;DP=91;FAO=47;FDP=91;FR=.;FRO=44;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=19;FSRR=25;FWDB=-0.0199028;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=200.181;QD=21.3736;RBI=0.0311941;REFB=-0.0361762;REVB=-0.0240198;RO=44;SAF=20;SAR=27;SRF=19;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00561925;STB=0.503104;STBP=0.965;TYPE=snp;VARB=0.0361621;OID=.;OPOS=50383636;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:91:91:44:44:47:47:0.516484:27:20:19:25:27:20:19:25
chr19	50399384	.	G	C,GC	924.38	PASS	AF=0,0.989247;AO=4,54;DP=93;FAO=0,92;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=0,49;FSAR=0,43;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0290457,0.0546791;FXX=0;HRUN=1,4;LEN=1,1;MLLD=164.743,14.3084;QD=39.7581;RBI=0.0295237,0.195465;REFB=0.0355343,-0.007331;REVB=0.00529104,0.187662;RO=33;SAF=1,23;SAR=3,31;SRF=22;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.436561,-0.167057;STB=0.5,0.505746;STBP=1,0.3;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0202475;OID=.,.;OPOS=50399384,50399385;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:3:93:93:33:1:4,54:0,92:0,0.989247:3,31:1,23:22:11:0,43:0,49:0:1
chr19	50411742	.	A	G	978.08	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0452835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.37;QD=58.3926;RBI=0.0565624;REFB=0;REVB=0.0338926;RO=0;SAF=31;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.41463e-05;OID=.;OPOS=50411742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:35:31:0:0:36:31:0:0
chr19	50412417	.	G	A	198.38	PASS	AF=0.944444;AO=17;DP=18;FAO=17;FDP=18;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0474926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.5032;QD=44.0838;RBI=0.108437;REFB=-0.107268;REVB=0.097484;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.533294;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0135469;OID=.;OPOS=50412417;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:18:18:0:1:17:17:0.944444:10:7:0:0:10:7:1:0
chr19	50455180	.	C	T	97.88	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=7;FWDB=-0.0296318;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0159;QD=13.5012;RBI=0.0509572;REFB=0.0409723;REVB=0.0414559;RO=17;SAF=10;SAR=2;SRF=10;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.320475;STB=0.69194;STBP=0.136;TYPE=snp;VARB=-0.0548603;OID=.;OPOS=50455180;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:2:10:10:7:2:10:10:7
chr19	50464023	.	C	G	85.69	PASS	AF=0.230769;AO=12;DP=52;FAO=12;FDP=52;FR=.;FRO=40;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=17;FSRR=23;FWDB=-0.0112579;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.4768;QD=6.59185;RBI=0.0204946;REFB=0.00733794;REVB=0.0171257;RO=40;SAF=6;SAR=6;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0915745;STB=0.557597;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=-0.0240413;OID=.;OPOS=50464023;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:52:52:40:40:12:12:0.230769:6:6:17:23:6:6:17:23
chr19	50475114	.	G	C	741.09	PASS	AF=0.981481;AO=52;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0198854;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.1607;QD=54.8957;RBI=0.0491892;REFB=-0.0160265;REVB=0.0449905;RO=0;SAF=24;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=1.71152e-05;OID=.;OPOS=50475114;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:0:1:52:53:0.981481:28:24:0:0:28:25:0:1
chr19	50484234	.	G	A	1256.81	PASS	AF=0.508065;AO=126;DP=251;FAO=126;FDP=248;FR=.;FRO=122;FSAF=70;FSAR=56;FSRF=60;FSRR=62;FWDB=0.0822446;FXX=0.0119517;HRUN=1;LEN=1;MLLD=48.1418;QD=20.2712;RBI=0.101456;REFB=-0.0656371;REVB=0.059407;RO=119;SAF=70;SAR=56;SRF=60;SRR=59;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0458628;STB=0.531527;STBP=0.321;TYPE=snp;VARB=0.064156;OID=.;OPOS=50484234;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:251:248:119:122:126:126:0.508065:56:70:60:59:56:70:60:62
chr19	50485454	.	A	G	158.69	PASS	AF=0.459459;AO=17;DP=37;FAO=17;FDP=37;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.0374704;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.3685;QD=17.1553;RBI=0.0384126;REFB=0.00252754;REVB=-0.00845586;RO=20;SAF=8;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0748639;STB=0.542807;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=-0.00702108;OID=.;OPOS=50485454;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:20:20:17:17:0.459459:9:8:11:9:9:8:11:9
chr19	50510991	.	AG	CC,GC	151.98	PASS	AF=0.2625,0;AO=20,3;DP=83;FAO=21,0;FDP=80;FR=.;FRO=59;FSAF=17,0;FSAR=4,0;FSRF=47;FSRR=12;FWDB=-0.0154511,0.0014779;FXX=0.215665;HRUN=1,1;LEN=2,2;MLLD=183.882,76.8724;QD=7.5992;RBI=0.0194978,0.0628542;REFB=-0.0155498,-0.00607747;REVB=-0.0118922,-0.0628368;RO=55;SAF=16,3;SAR=4,0;SRF=44;SRR=11;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0.349996;STB=0.515137,0.5;STBP=0.918,1;TYPE=mnp,mnp;VARB=0.0382085,0;OID=.,.;OPOS=50510991,50510991;OREF=AG,AG;OALT=CC,GC;OMAPALT=CC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:80:55:59:20,3:21,0:0.2625,0:4,0:16,3:44:11:4,0:17,0:47:12
chr19	50510998	.	CTT	CAC	82.88	PASS	AF=0.153846;AO=14;DP=87;FAO=14;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=76;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=58;FSRR=18;FWDB=-0.00751858;FXX=0.0714213;HRUN=2;LEN=2;MLLD=235.28;QD=3.64312;RBI=0.0307717;REFB=-0.0150332;REVB=-0.029839;RO=42;SAF=10;SAR=4;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0995244;STB=0.552774;STBP=0.745;TYPE=mnp;VARB=0.0666788;OID=.;OPOS=50510999;OREF=TT;OALT=AC;OMAPALT=CAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.153846:14:87:14:91:76:10:4:58:18:76:42:10:4:27:15
chr19	50562372	.	T	C	820.37	PASS	AF=0.983051;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=34;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0365489;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.776;QD=55.6183;RBI=0.047475;REFB=-0.148807;REVB=0.0302994;RO=1;SAF=34;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0136707;STB=0.507244;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.000365565;OID=.;OPOS=50562372;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:58:59:1:1:57:58:0.983051:23:34:1:0:24:34:1:0
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chr19	50760716	.	C	G	197.59	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0367402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.941;QD=18.8179;RBI=0.0367826;REFB=-0.00618229;REVB=-0.00176594;RO=22;SAF=12;SAR=8;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00872089;STB=0.504946;STBP=0.96;TYPE=snp;VARB=0.00776986;OID=.;OPOS=50760716;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:8:12:13:9:8:12:13:9
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chr19	50763889	.	C	T	239.34	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0117446;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.774;QD=20.8117;RBI=0.0149586;REFB=-0.00974283;REVB=0.00926412;RO=23;SAF=7;SAR=16;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0874144;STB=0.549312;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.00937436;OID=.;OPOS=50763889;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:23:23:23:23:0.5:16:7:9:14:16:7:9:14
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chr19	50926264	.	TG	CC,CG	790.58	PASS	AF=0.516667,0.45;AO=30,24;DP=57;FAO=31,27;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=17,17;FSAR=14,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250202,0.0105342;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=152.94,48.8339;QD=52.7056;RBI=0.0692821,0.0125236;REFB=0,0;REVB=0.0646065,0.00677287;RO=0;SAF=16,16;SAR=14,8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-5.56309e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0273025,-0.0061476;OID=.,.;OPOS=50926264,50926264;OREF=TG,T;OALT=CC,C;OMAPALT=CC,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:57:60:0:0:30,24:31,27:0.516667,0.45:14,8:16,16:0:0:14,10:17,17:0:0
chr19	50954584	.	C	T	230.88	PASS	AF=0.55;AO=22;DP=40;FAO=22;FDP=40;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0699758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.251;QD=23.0876;RBI=0.0701145;REFB=-0.0338562;REVB=0.00440707;RO=18;SAF=8;SAR=14;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0217906;STB=0.512184;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0176056;OID=.;OPOS=50954584;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:18:18:22:22:0.55:14:8:7:11:14:8:7:11
chr19	50957397	.	G	A	562.32	PASS	AF=0.464567;AO=59;DP=127;FAO=59;FDP=127;FR=.;FRO=68;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=34;FSRR=34;FWDB=0.00279467;FXX=0.00781189;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.39;QD=17.711;RBI=0.00944639;REFB=-0.00143114;REVB=0.00902353;RO=67;SAF=34;SAR=25;SRF=34;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0666414;STB=0.54127;STBP=0.396;TYPE=snp;VARB=0.00138636;OID=.;OPOS=50957397;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:127:127:67:68:59:59:0.464567:25:34:34:33:25:34:34:34
chr19	50963424	.	CA	C,CG	114.96	PASS	AF=0.566038,0;AO=19,3;DP=54;FAO=30,0;FDP=53;FR=.;FRO=23;FSAF=17,0;FSAR=13,0;FSRF=13;FSRR=10;FWDB=0.186321,0.0137407;FXX=0.0185151;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=8.22575,99.1814;QD=8.67606;RBI=0.188278,0.0566277;REFB=-0.114034,-0.00486799;REVB=0.0270762,-0.0549353;RO=22;SAF=11,0;SAR=8,3;SRF=13;SRR=9;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0115783,-0.621044;STB=0.50064,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.145222,0;OID=.,.;OPOS=50963425,50963425;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.566038,0:19,3:54:30,0:53:23:17,0:13,0:13:10:76:22:11,0:8,3:13:9
chr19	50965234	.	C	T	362.55	PASS	AF=0.681818;AO=30;DP=44;FAO=30;FDP=44;FR=.;FRO=14;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=0.0172972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=217.953;QD=32.9593;RBI=0.0254127;REFB=-0.0578345;REVB=0.0186174;RO=14;SAF=22;SAR=8;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.158772;STB=0.587127;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0265847;OID=.;OPOS=50965234;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:14:14:30:30:0.681818:8:22:7:7:8:22:7:7
chr19	50965272	.	T	C	496.42	PASS	AF=1;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0563964;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3731;QD=58.4026;RBI=0.0723061;REFB=0;REVB=0.0452506;RO=0;SAF=21;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000440686;OID=.;OPOS=50965272;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:33:34:1:12:21:0:0:13:21:0:0
chr19	50983930	.	C	T	287.3	PASS	AF=0.884615;AO=21;DP=27;FAO=23;FDP=26;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.00836587;FXX=0.0370233;HRUN=4;LEN=1;MLLD=118.947;QD=44.2;RBI=0.0353608;REFB=-0.0737928;REVB=0.034357;RO=0;SAF=15;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.547486;STBP=0.249;TYPE=snp;VARB=0.00196572;OID=.;OPOS=50983930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:27:26:0:3:21:23:0.884615:6:15:0:0:7:16:1:2
chr19	51015404	.	T	C	74.97	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0134835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.855;QD=37.4868;RBI=0.0822653;REFB=0;REVB=0.0811528;RO=0;SAF=7;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000866214;OID=.;OPOS=51015404;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:1:7:0:0:1:7:0:0
chr19	51020903	.	A	G	246.66	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=19;FSRR=15;FWDB=-0.0257668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.018;QD=15.9134;RBI=0.0422266;REFB=-0.0187511;REVB=-0.0334538;RO=34;SAF=18;SAR=10;SRF=19;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0862023;STB=0.548745;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.0278385;OID=.;OPOS=51020903;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:34:34:28:28:0.451613:10:18:19:15:10:18:19:15
chr19	51159571	.	T	G	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0270615;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.308;QD=58.1421;RBI=0.0307855;REFB=0;REVB=0.0146772;RO=0;SAF=11;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.98577e-05;OID=.;OPOS=51159571;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:21:11:0:0:21:11:0:0
chr19	51192607	.	GTC	CGT	88.73	PASS	AF=0.692308;AO=7;DP=14;FAO=9;FDP=13;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=0;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0577641;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=3;MLLD=66.1524;QD=27.3;RBI=0.151308;REFB=-0.0535413;REVB=0.139848;RO=2;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0273871;OID=.;OPOS=51192607;OREF=GTC;OALT=CGT;OMAPALT=CGT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:14:13:2:2:7:9:0.692308:7:0:0:2:9:0:0:2
chr19	51297825	.	GC	AA	1321.05	PASS	AF=1;AO=83;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0173223;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=163.479;QD=62.1671;RBI=0.033186;REFB=0;REVB=0.0283063;RO=0;SAF=42;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=9.49191e-06;OID=.;OPOS=51297825;OREF=GC;OALT=AA;OMAPALT=AA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:83:85:1:41:42:0:0:43:42:0:0
chr19	51301395	.	C	T	1829.41	PASS	AF=0.98374;AO=121;DP=123;FAO=121;FDP=123;FR=.;FRO=2;FSAF=69;FSAR=52;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.00704144;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=254.736;QD=59.4929;RBI=0.0304605;REFB=-0.0645098;REVB=0.0296355;RO=1;SAF=69;SAR=52;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00683535;STB=0.507142;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.000141513;OID=.;OPOS=51301395;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:123:123:1:2:121:121:0.98374:52:69:1:0:52:69:2:0
chr19	51301456	.	G	A	930.75	PASS	AF=0.970149;AO=65;DP=68;FAO=65;FDP=67;FR=.;FRO=2;FSAF=41;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0312829;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.088;QD=55.567;RBI=0.0358517;REFB=-0.165807;REVB=0.0175136;RO=1;SAF=41;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0113841;STB=0.50418;STBP=0.784;TYPE=snp;VARB=0.00287987;OID=.;OPOS=51301456;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:68:67:1:2:65:65:0.970149:24:41:1:0:24:41:1:1
chr19	51301538	.	T	C	76.69	PASS	AF=0.416667;AO=10;DP=24;FAO=10;FDP=24;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0405323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.314;QD=12.7822;RBI=0.0408973;REFB=-0.0020755;REVB=0.00545197;RO=14;SAF=3;SAR=7;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.396837;STB=0.733421;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=0.00347726;OID=.;OPOS=51301538;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:24:24:14:14:10:10:0.416667:7:3:10:4:7:3:10:4
chr19	51302066	.	A	G	482.72	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277565;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.796;QD=56.7906;RBI=0.0462344;REFB=0;REVB=0.0369755;RO=0;SAF=16;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00239143;OID=.;OPOS=51302066;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:34:0:0:32:34:1:16:16:0:0:18:16:0:0
chr19	51302154	.	G	A	385.92	PASS	AF=1;AO=28;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255531;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.833;QD=53.2296;RBI=0.106324;REFB=-0.126076;REVB=0.103207;RO=0;SAF=13;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00166839;OID=.;OPOS=51302154;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:29:29:0:0:28:29:1:15:13:0:0:16:13:0:0
chr19	51302202	.	T	A	149.8	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0728638;FXX=0.0713776;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.9833;QD=46.092;RBI=0.0861573;REFB=0;REVB=-0.0459775;RO=0;SAF=4;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00348935;OID=.;OPOS=51302202;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:13:0:0:13:13:1:9:4:0:0:9:4:0:0
chr19	51321813	.	A	G	722.79	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0284206;FXX=0.0192271;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.905;QD=56.6893;RBI=0.0333154;REFB=0;REVB=0.0173836;RO=0;SAF=33;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000168176;OID=.;OPOS=51321813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:16:33:0:0:18:33:0:0
chr19	51321961	.	G	A	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=281.641;QD=35.5759;RBI=0.0122173;REFB=0;REVB=0.0122173;RO=0;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010521;OID=.;OPOS=51321961;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:7:0:0:0:7:0:0:0
chr19	51323232	.	T	C	705.71	PASS	AF=0.959184;AO=38;DP=46;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0898451;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=126.792;QD=57.6085;RBI=0.0905349;REFB=-0.0563492;REVB=0.0111546;RO=0;SAF=19;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.500434;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.000468671;OID=.;OPOS=51323232;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:46:49:0:2:38:47:0.959184:19:19:0:0:23:24:1:1
chr19	51323473	.	C	G	402.91	PASS	AF=0.909091;AO=30;DP=33;FAO=30;FDP=33;FR=.;FRO=3;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0448744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.203;QD=48.8378;RBI=0.0492438;REFB=-0.0965328;REVB=0.0202792;RO=1;SAF=16;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0282472;STB=0.512187;STBP=0.72;TYPE=snp;VARB=0.00144591;OID=.;OPOS=51323473;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:33:33:1:3:30:30:0.909091:14:16:1:0:14:16:2:1
chr19	51323501	.	A	G	632.09	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175519;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.425;QD=61.667;RBI=0.0175519;REFB=0;REVB=3.13268e-05;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.28869e-05;OID=.;OPOS=51323501;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:24:17:0:0:24:17:0:0
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chr19	51359497	.	T	C	152.7	PASS	AF=0.358491;AO=19;DP=53;FAO=19;FDP=53;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=10;FWDB=-0.0290185;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.1131;QD=11.5247;RBI=0.0857356;REFB=-0.0112851;REVB=-0.0806754;RO=33;SAF=8;SAR=11;SRF=23;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294129;STB=0.676751;STBP=0.068;TYPE=snp;VARB=0.0174553;OID=.;OPOS=51359497;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:33:34:19:19:0.358491:11:8:23:10:11:8:24:10
chr19	51359503	.	A	G	189.28	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=25;FSRR=10;FWDB=-0.00469625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.177;QD=13.0536;RBI=0.0360695;REFB=-0.0194617;REVB=0.0357625;RO=34;SAF=12;SAR=11;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.195129;STB=0.617507;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.0234674;OID=.;OPOS=51359503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:35:23:23:0.396552:11:12:24:10:11:12:25:10
chr19	51379893	.	C	T	1347.12	PASS	AF=0.977778;AO=87;DP=89;FAO=88;FDP=90;FR=.;FRO=2;FSAF=49;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00261123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.0366;QD=59.8718;RBI=0.0487602;REFB=-0.078448;REVB=0.0486902;RO=2;SAF=49;SAR=38;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0242823;STB=0.512497;STBP=0.152;TYPE=snp;VARB=0.00852043;OID=.;OPOS=51379893;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:89:90:2:2:87:88:0.977778:38:49:0:2:39:49:0:2
chr19	51381777	.	C	T	1472.56	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0118949;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.305;QD=63.3358;RBI=0.01292;REFB=0;REVB=-0.00504355;RO=0;SAF=37;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.51152e-05;OID=.;OPOS=51381777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:93:0:0:92:93:1:55:37:0:0:55:38:0:0
chr19	51411636	.	G	T	581.5	PASS	AF=0.975;AO=38;DP=39;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0014622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.037;QD=58.1501;RBI=0.0310545;REFB=-0.139548;REVB=0.0310201;RO=0;SAF=16;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511105;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00138993;OID=.;OPOS=51411636;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:40:0:1:38:39:0.975:22:16:0:0:22:17:0:1
chr19	51412668	.	A	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0287259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=199.844;QD=45.8068;RBI=0.0543909;REFB=0;REVB=0.0461865;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143866;OID=.;OPOS=51412668;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr19	51452250	.	T	C	1026.27	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00524185;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=191.669;QD=59.4939;RBI=0.0053654;REFB=0;REVB=-0.00114477;RO=0;SAF=43;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.12501e-05;OID=.;OPOS=51452250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:26:43:0:0:26:43:0:0
chr19	51485622	.	A	G	3312.73	PASS	AF=1;AO=214;DP=215;FAO=214;FDP=214;FR=.;FRO=0;FSAF=117;FSAR=97;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194886;FXX=0.00465095;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7825;QD=61.9202;RBI=0.0321166;REFB=-0.0825669;REVB=-0.0255279;RO=1;SAF=117;SAR=97;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00405471;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000287707;OID=.;OPOS=51485622;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:14:215:214:1:0:214:214:1:97:117:1:0:97:117:0:0
chr19	51487175	.	T	G	68.88	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0184965;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.593;QD=39.3574;RBI=0.0195054;REFB=0;REVB=0.00619203;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00221167;OID=.;OPOS=51487175;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
chr19	51507020	.	T	G	464.89	PASS	AF=0.484211;AO=46;DP=95;FAO=46;FDP=95;FR=.;FRO=49;FSAF=26;FSAR=20;FSRF=31;FSRR=18;FWDB=-0.0286597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6607;QD=19.5743;RBI=0.041217;REFB=-0.0137305;REVB=-0.029622;RO=49;SAF=26;SAR=20;SRF=31;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0643553;STB=0.535699;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00550983;OID=.;OPOS=51507020;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:49:49:46:46:0.484211:20:26:31:18:20:26:31:18
chr19	51517731	.	A	G	1200.56	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00623909;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.961;QD=60.7877;RBI=0.0407203;REFB=0;REVB=0.0402395;RO=0;SAF=50;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.72821e-05;OID=.;OPOS=51517731;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:79:0:0:75:79:1:25:50:0:0:29:50:0:0
chr19	51519236	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=8;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0254345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.85;QD=48.7371;RBI=0.032578;REFB=0;REVB=0.0203571;RO=0;SAF=6;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.78368e-05;OID=.;OPOS=51519236;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:8:17:1:2:6:0:0:7:10:0:0
chr19	51519259	.	C	T	538.56	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392138;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.552;QD=59.8399;RBI=0.0516053;REFB=0;REVB=0.0335467;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000208586;OID=.;OPOS=51519259;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:19:16:0:0:19:17:0:0
chr19	51519346	.	G	C	197.68	PASS	AF=0.47619;AO=20;DP=42;FAO=20;FDP=42;FR=.;FRO=22;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00564644;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.65;QD=18.8271;RBI=0.0165319;REFB=-0.0308565;REVB=0.0155377;RO=22;SAF=7;SAR=13;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586231;STB=0.533299;STBP=0.687;TYPE=snp;VARB=0.0339132;OID=.;OPOS=51519346;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:22:20:20:0.47619:13:7:9:13:13:7:9:13
chr19	51519364	.	T	G	586.01	PASS	AF=1;AO=33;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0378371;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.4688;QD=60.1034;RBI=0.04417;REFB=0;REVB=-0.022789;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0009386;OID=.;OPOS=51519364;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:33:39:1:18:15:0:0:23:16:0:0
chr19	51520487	.	A	C	905.78	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00944573;FXX=0.0158705;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.6783;QD=58.4375;RBI=0.0166952;REFB=0;REVB=0.0137662;RO=0;SAF=27;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.46408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17957e-05;OID=.;OPOS=51520487;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:35:27:0:0:35:27:0:0
chr19	51530693	.	G	A	1688.32	PASS	AF=1;AO=107;DP=109;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0425843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.128;QD=60.2973;RBI=0.0688178;REFB=0;REVB=0.0540599;RO=0;SAF=60;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71637e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000121654;OID=.;OPOS=51530693;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:109:112:0:0:107:112:1:47:60:0:0:49:63:0:0
chr19	51535130	.	A	G	47.68	PASS	AF=0.4375;AO=7;DP=16;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=-0.0170402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.295;QD=11.9197;RBI=0.0378109;REFB=-0.000422181;REVB=-0.0337535;RO=9;SAF=6;SAR=1;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.52739;STB=0.82253;STBP=0.044;TYPE=snp;VARB=-0.00104512;OID=.;OPOS=51535130;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:16:16:9:9:7:7:0.4375:1:6:3:6:1:6:3:6
chr19	51537682	.	C	A	387.63	PASS	AF=1;AO=27;DP=29;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101936;FXX=0.0344709;HRUN=3;LEN=1;MLLD=93.0152;QD=55.3761;RBI=0.0237584;REFB=0;REVB=0.0214605;RO=1;SAF=23;SAR=4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197971;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00173765;OID=.;OPOS=51537682;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:28:1:0:27:28:1:4:23:1:0:4:24:0:0
chr19	51656454	.	A	T	311.65	PASS	AF=0.6;AO=24;DP=51;FAO=30;FDP=50;FR=.;FRO=20;FSAF=12;FSAR=18;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=0.0146817;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.689;QD=24.9316;RBI=0.0151998;REFB=-0.0167323;REVB=0.00393471;RO=16;SAF=6;SAR=18;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210767;STB=0.580591;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00832276;OID=.;OPOS=51656454;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:16:20:24:30:0.6:18:6:8:8:18:12:12:8
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chr19	51835892	.	T	TG	347.95	PASS	AF=1;AO=25;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.025172;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=11.2904;QD=34.7946;RBI=0.0562422;REFB=0;REVB=0.0502947;RO=14;SAF=16;SAR=9;SRF=2;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.317709;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.0137378;OID=.;OPOS=51835893;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:25:41:40:40:0:19:21:0:0:8:14:16:9:2:12
chr19	51841417	.	C	T	158.08	PASS	AF=0.472222;AO=17;DP=36;FAO=17;FDP=36;FR=.;FRO=19;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=11;FWDB=-0.0123063;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.977;QD=17.5642;RBI=0.0126324;REFB=-0.0139504;REVB=-0.0028516;RO=17;SAF=11;SAR=6;SRF=7;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.210219;STB=0.621118;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0136219;OID=.;OPOS=51841417;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:17:19:17:17:0.472222:6:11:7:10:6:11:8:11
chr19	51843808	.	C	T	180.21	PASS	AF=0.6;AO=18;DP=30;FAO=18;FDP=30;FR=.;FRO=12;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.118926;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4368;QD=24.0283;RBI=0.12386;REFB=-0.000695033;REVB=0.0346094;RO=12;SAF=8;SAR=10;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0992905;STB=0.555494;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00547407;OID=.;OPOS=51843808;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:30:30:12:12:18:18:0.6:10:8:7:5:10:8:7:5
chr19	51844978	.	G	T	296.57	PASS	AF=0.54386;AO=30;DP=57;FAO=31;FDP=57;FR=.;FRO=26;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0239786;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=169.718;QD=20.8119;RBI=0.0240896;REFB=-0.0328638;REVB=-0.00230998;RO=25;SAF=15;SAR=15;SRF=19;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214126;STB=0.598571;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.010972;OID=.;OPOS=51844978;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:25:26:30:31:0.54386:15:15:19:6:15:16:19:7
chr19	51845371	.	T	G	362.51	PASS	AF=0.528571;AO=37;DP=70;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=27;FSAR=10;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.0127624;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.359;QD=20.7146;RBI=0.0354915;REFB=0.0296831;REVB=-0.0331175;RO=33;SAF=27;SAR=10;SRF=22;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.065575;STB=0.536404;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=-0.0263237;OID=.;OPOS=51845371;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:33:33:37:37:0.528571:10:27:22:11:10:27:22:11
chr19	51850290	.	G	A	315.2	PASS	AF=0.596154;AO=31;DP=52;FAO=31;FDP=52;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=7;FSRR=14;FWDB=-0.0398913;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.243;QD=24.2459;RBI=0.0400869;REFB=-0.026596;REVB=0.00395528;RO=21;SAF=18;SAR=13;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180272;STB=0.599197;STBP=0.1;TYPE=snp;VARB=0.0204816;OID=.;OPOS=51850290;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:21:21:31:31:0.596154:13:18:7:14:13:18:7:14
chr19	51890568	.	G	C	142.22	PASS	AF=0.316667;AO=19;DP=64;FAO=19;FDP=60;FR=.;FRO=41;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.000902955;FXX=0.0624902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.744;QD=9.48141;RBI=0.0171845;REFB=-0.00783839;REVB=-0.0171608;RO=44;SAF=14;SAR=5;SRF=23;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.270807;STB=0.618341;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0161174;OID=.;OPOS=51890568;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:60:44:41:19:19:0.316667:5:14:23:21:5:14:24:17
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chr19	52000624	.	T	G	769.51	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=193.003;QD=57.0005;RBI=0.0482905;REFB=0;REVB=0.00766663;RO=0;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001308;OID=.;OPOS=52000624;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:26:27:0:0:27:27:0:0
chr19	52000672	.	G	A	990.63	PASS	AF=1;AO=67;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0245392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.285;QD=59.1423;RBI=0.0277344;REFB=0;REVB=0.0129236;RO=0;SAF=28;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.74073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000107185;OID=.;OPOS=52000672;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:67:67:1:39:28:0:0:39:28:0:0
chr19	52001485	.	G	A	52.37	PASS	AF=0.25;AO=8;DP=32;FAO=8;FDP=32;FR=.;FRO=24;FSAF=1;FSAR=7;FSRF=11;FSRR=13;FWDB=-0.0695027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.284;QD=6.5459;RBI=0.0708164;REFB=0.00306028;REVB=0.0135769;RO=23;SAF=1;SAR=7;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.480729;STB=0.806805;STBP=0.085;TYPE=snp;VARB=-0.0129814;OID=.;OPOS=52001485;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:32:32:23:24:8:8:0.25:7:1:11:12:7:1:11:13
chr19	52002488	.	C	A	1172.0	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142102;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.175;QD=60.8829;RBI=0.0598304;REFB=0;REVB=-0.0581184;RO=0;SAF=46;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64555e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.60255e-05;OID=.;OPOS=52002488;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:31:46:0:0:31:46:0:0
chr19	52002729	.	G	A	823.74	PASS	AF=1;AO=57;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0139323;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.812;QD=54.0157;RBI=0.14935;REFB=-0.0858624;REVB=0.148698;RO=0;SAF=38;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00250873;OID=.;OPOS=52002729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:61:61:0:0:57:61:1:19:38:0:0:23:38:0:0
chr19	52003331	.	G	C	2740.49	PASS	AF=1;AO=158;DP=181;FAO=177;FDP=177;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=104;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388267;FXX=0.0220982;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.855;QD=61.932;RBI=0.0416763;REFB=0;REVB=0.0151461;RO=0;SAF=86;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00237813;OID=.;OPOS=52003331;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:15:181:177:0:0:158:177:1:72:86:0:0:73:104:0:0
chr19	52004743	.	G	A	902.59	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0203276;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.518;QD=58.2313;RBI=0.0478533;REFB=0;REVB=0.0433212;RO=0;SAF=38;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000176789;OID=.;OPOS=52004743;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:23:38:0:0:24:38:0:0
chr19	52004759	.	C	T	162.45	PASS	AF=0.344262;AO=21;DP=61;FAO=21;FDP=61;FR=.;FRO=40;FSAF=11;FSAR=10;FSRF=26;FSRR=14;FWDB=-0.0144385;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.8362;QD=10.6522;RBI=0.0151009;REFB=-0.00415842;REVB=-0.00442335;RO=40;SAF=11;SAR=10;SRF=26;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143613;STB=0.583519;STBP=0.348;TYPE=snp;VARB=0.0123612;OID=.;OPOS=52004759;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:40:40:21:21:0.344262:10:11:26:14:10:11:26:14
chr19	52004794	.	C	CCT	605.48	PASS	AF=1;AO=6;DP=57;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0573247;FXX=0.079984;HRUN=3;LEN=2;MLLD=84.1482;QD=52.6508;RBI=0.0607745;REFB=0;REVB=0.0201847;RO=51;SAF=5;SAR=1;SRF=23;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.433916;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=7.57075e-05;OID=.;OPOS=52004795;OREF=-;OALT=CT;OMAPALT=CCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:6:57:46:46:0:21:25:0:0:4:51:5:1:23:28
chr19	52004795	.	G	C,T	711.6	PASS	AF=0.111111,0.888889;AO=5,45;DP=54;FAO=6,48;FDP=54;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=6,19;FSAR=0,29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0409759,-0.0234299;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=13.267,117.988;QD=52.7113;RBI=0.0437601,0.0234562;REFB=0,0;REVB=-0.0153596,0.00110936;RO=0;SAF=5,17;SAR=0,28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.209141,0.000288218;OID=.,.;OPOS=52004795,52004795;OREF=G,G;OALT=C,T;OMAPALT=C,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:28:54:54:0:0:5,45:6,48:0.111111,0.888889:0,28:5,17:0:0:0,29:6,19:0:0
chr19	52032963	.	TC	T,TG	372.98	PASS	AF=0.58209,0.358209;AO=21,9;DP=68;FAO=39,24;FDP=67;FR=.;FRO=4;FSAF=26,15;FSAR=13,9;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.313821,0.0334066;FXX=0.042851;HRUN=6,6;LEN=1,1;MLLD=6.6552,204.664;QD=22.2676;RBI=0.31396,0.0370886;REFB=-0.180484,-0.0532092;REVB=0.00936587,-0.016111;RO=18;SAF=13,3;SAR=8,6;SRF=11;SRR=7;SSEN=0.5,0;SSEP=0.833333,0;SSSB=0.00690758,-0.30003;STB=0.566631,0.590832;STBP=0.01,0.028;TYPE=del,snp;VARB=0.095314,0.0487339;OID=.,.;OPOS=52032964,52032964;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.58209,0.358209:21,9:68:39,24:67:4:26,15:13,9:0:4:99:18:13,3:8,6:11:7
chr19	52033742	.	G	A	328.77	PASS	AF=0.423529;AO=36;DP=85;FAO=36;FDP=85;FR=.;FRO=49;FSAF=24;FSAR=12;FSRF=36;FSRR=13;FWDB=0.00309837;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=294.539;QD=15.4716;RBI=0.0116718;REFB=-0.001669;REVB=0.0112531;RO=49;SAF=24;SAR=12;SRF=36;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0808123;STB=0.54543;STBP=0.54;TYPE=snp;VARB=0.00261743;OID=.;OPOS=52033742;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:49:49:36:36:0.423529:12:24:36:13:12:24:36:13
chr19	52076960	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0106468;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.619;QD=44.6898;RBI=0.069541;REFB=0;REVB=0.0687212;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000355695;OID=.;OPOS=52076960;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0
chr19	52076974	.	C	T	134.56	PASS	AF=1;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00785834;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.038;QD=44.8526;RBI=0.074644;REFB=0;REVB=0.0742292;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524035;OID=.;OPOS=52076974;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:12:0:0:12:12:1:2:10:0:0:2:10:0:0
chr19	52077069	.	G	A	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00777362;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.67;QD=56.1915;RBI=0.0112277;REFB=0;REVB=0.00810133;RO=0;SAF=15;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.88134e-05;OID=.;OPOS=52077069;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:13:15:0:0:13:15:0:0
chr19	52096033	.	GATAAA	G	63.35	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=3;FWDB=-0.0174224;FXX=0;HRUN=1;LEN=5;MLLD=323.949;QD=8.73786;RBI=0.043998;REFB=-0.00872785;REVB=-0.0404016;RO=18;SAF=8;SAR=1;SRF=16;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.561254;STBP=0.773;TYPE=del;VARB=0.0180197;OID=.;OPOS=52096034;OREF=ATAAA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.310345:9:29:9:29:20:8:1:17:3:63:18:8:1:16:2
chr19	52096053	.	T	A	52.64	PASS	AF=0.242424;AO=10;DP=30;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=-0.0831424;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=36.3685;QD=6.38056;RBI=0.150896;REFB=-0.00815339;REVB=-0.125925;RO=19;SAF=9;SAR=1;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.145782;STB=0.652882;STBP=0.432;TYPE=snp;VARB=-0.0186237;OID=.;OPOS=52096053;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:30:33:19:25:10:8:0.242424:1:9:16:3:1:7:19:6
chr19	52096270	.	C	G	32.39	PASS	AF=0.625;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=8;FR=.;FRO=3;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.0257232;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2453;QD=16.195;RBI=0.0508037;REFB=0.00175594;REVB=0.0438102;RO=3;SAF=4;SAR=1;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.116878;STB=0.57112;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=-0.00375653;OID=.;OPOS=52096270;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:8:8:3:3:5:5:0.625:1:4:2:1:1:4:2:1
chr19	52097461	.	A	C	221.65	PASS	AF=0.375;AO=27;DP=71;FAO=27;FDP=72;FR=.;FRO=45;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.022536;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.112;QD=12.3139;RBI=0.030977;REFB=-0.014404;REVB=-0.0212534;RO=44;SAF=12;SAR=15;SRF=29;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.228753;STB=0.623012;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.0218903;OID=.;OPOS=52097461;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:72:44:45:27:27:0.375:15:12:29:15:15:12:29:16
chr19	52115645	.	G	C	884.28	PASS	AF=0.927536;AO=64;DP=69;FAO=64;FDP=69;FR=.;FRO=5;FSAF=26;FSAR=38;FSRF=4;FSRR=1;FWDB=-0.00279976;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=244.763;QD=51.2624;RBI=0.0155117;REFB=-0.102538;REVB=0.015257;RO=5;SAF=26;SAR=38;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0550779;STB=0.529239;STBP=0.094;TYPE=snp;VARB=0.00269339;OID=.;OPOS=52115645;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:69:69:5:5:64:64:0.927536:38:26:4:1:38:26:4:1
chr19	52130488	.	G	A	660.15	PASS	AF=1;AO=40;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00609477;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=45.1712;QD=58.6803;RBI=0.0268187;REFB=0;REVB=0.026117;RO=0;SAF=21;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.17587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00212642;OID=.;OPOS=52130488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:40:45:1:19:21:0:0:23:22:0:0
chr19	52132325	.	A	T	958.66	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0174664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.169;QD=57.2335;RBI=0.0344047;REFB=0.133764;REVB=0.0296413;RO=1;SAF=43;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200972;STB=0.510635;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=-0.00078884;OID=.;OPOS=52132325;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:23:43:0:1:23:43:0:1
chr19	52220351	.	G	A	251.86	PASS	AF=0.42029;AO=28;DP=70;FAO=29;FDP=69;FR=.;FRO=40;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.00955975;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=204.72;QD=14.6006;RBI=0.00967323;REFB=-0.0227642;REVB=-0.00147738;RO=38;SAF=16;SAR=12;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00779225;STB=0.506676;STBP=0.956;TYPE=snp;VARB=0.0388606;OID=.;OPOS=52220351;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:69:38:40:28:29:0.42029:12:16:22:16:12:17:23:17
chr19	52223121	.	A	G	866.97	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.739;QD=57.7979;RBI=0.0494418;REFB=0;REVB=0.0479195;RO=0;SAF=41;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.31043e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00010886;OID=.;OPOS=52223121;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:19:41:0:0:19:41:0:0
chr19	52223180	.	A	G	1244.26	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0408181;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.897;QD=61.4447;RBI=0.0426717;REFB=0;REVB=0.0124403;RO=0;SAF=32;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.45895e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.26413e-05;OID=.;OPOS=52223180;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:81:0:0:79:81:1:47:32:0:0:49:32:0:0
chr19	52249211	.	T	G	1301.59	PASS	AF=1;AO=83;DP=85;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0243401;FXX=0.0232531;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.671;QD=61.9807;RBI=0.0321988;REFB=0;REVB=0.0210789;RO=0;SAF=64;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.28385e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000157586;OID=.;OPOS=52249211;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:84:0:0:83:84:1:19:64:0:0:19:65:0:0
chr19	52249702	.	G	T	84.79	PASS	AF=0.9;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=10;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00849266;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=344.296;QD=33.9151;RBI=0.0280603;REFB=-0.15849;REVB=0.0267443;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.599759;STBP=0.175;TYPE=snp;VARB=0.000879242;OID=.;OPOS=52249702;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:10:10:0:1:9:9:0.9:2:7:0:0:2:7:0:1
chr19	52249947	.	C	G	746.99	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=9.34117e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8076;QD=63.5734;RBI=0.0539061;REFB=0;REVB=-0.0539061;RO=0;SAF=28;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00067154;OID=.;OPOS=52249947;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:19:28:0:0:19:28:0:0
chr19	52249959	.	G	T	318.78	PASS	AF=0.592593;AO=31;DP=53;FAO=32;FDP=54;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=12;FWDB=-0.00203364;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=224.016;QD=23.6131;RBI=0.0106594;REFB=-0.0333386;REVB=0.0104636;RO=22;SAF=20;SAR=11;SRF=10;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.148821;STB=0.571383;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0202731;OID=.;OPOS=52249959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:54:22:22:31:32:0.592593:11:20:10:12:12:20:10:12
chr19	52250216	.	A	G	2030.86	PASS	AF=1;AO=130;DP=131;FAO=130;FDP=130;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=80;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154148;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.016;QD=62.4881;RBI=0.0236577;REFB=0;REVB=0.0179463;RO=0;SAF=50;SAR=80;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125504;OID=.;OPOS=52250216;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:131:130:0:0:130:130:1:80:50:0:0:80:50:0:0
chr19	52328133	.	G	A	104.94	PASS	AF=0.464286;AO=12;DP=27;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=10;FWDB=0.0702691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8113;QD=14.9913;RBI=0.0703887;REFB=-0.0329254;REVB=0.00410117;RO=13;SAF=7;SAR=5;SRF=4;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.243637;STB=0.608534;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0601939;OID=.;OPOS=52328133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:28:13:15:12:13:0.464286:5:7:4:9:6:7:5:10
chr19	52328213	.	C	A	32.69	PASS	AF=0.277778;AO=5;DP=20;FAO=5;FDP=18;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=13;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=0.0054146;FXX=0.09995;HRUN=3;LEN=1;MLLD=152.555;QD=7.26334;RBI=0.0340622;REFB=8.41076e-05;REVB=-0.0336291;RO=7;SAF=3;SAR=2;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0274957;STB=0.511582;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=0.00757728;OID=.;OPOS=52328213;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:20:18:7:13:5:5:0.277778:2:3:4:3:2:3:8:5
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chr19	52328616	.	T	C	141.32	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=13;FSRR=13;FWDB=0.0139719;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=254.83;QD=13.4591;RBI=0.0169071;REFB=0.00104929;REVB=0.0095203;RO=26;SAF=8;SAR=8;SRF=13;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00153468;OID=.;OPOS=52328616;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:8:8:13:13:8:8:13:13
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chr19	52383556	.	C	A	152.68	PASS	AF=0.3;AO=21;DP=70;FAO=21;FDP=70;FR=.;FRO=49;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=34;FSRR=15;FWDB=0.0305796;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.433;QD=8.72473;RBI=0.0310791;REFB=-0.0207853;REVB=-0.00554994;RO=49;SAF=14;SAR=7;SRF=34;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0366346;STB=0.521719;STBP=0.822;TYPE=snp;VARB=0.025133;OID=.;OPOS=52383556;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:49:49:21:21:0.3:7:14:34:15:7:14:34:15
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chr19	52497250	.	G	A	167.43	PASS	AF=0.586207;AO=17;DP=29;FAO=17;FDP=29;FR=.;FRO=12;FSAF=14;FSAR=3;FSRF=7;FSRR=5;FWDB=0.017877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.5185;QD=23.0944;RBI=0.036356;REFB=0.00331582;REVB=-0.0316571;RO=12;SAF=14;SAR=3;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.24588;STB=0.639814;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=-0.003001;OID=.;OPOS=52497250;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:12:12:17:17:0.586207:3:14:7:5:3:14:7:5
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chr19	52497943	.	G	A	235.22	PASS	AF=0.594595;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=37;FR=.;FRO=15;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=5;FWDB=-0.0184793;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.298;QD=25.4293;RBI=0.0194065;REFB=-0.0123052;REVB=0.00592693;RO=15;SAF=9;SAR=13;SRF=10;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.186955;STB=0.603818;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0057582;OID=.;OPOS=52497943;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:15:15:22:22:0.594595:13:9:10:5:13:9:10:5
chr19	52506985	.	T	C	483.24	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0525113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.0719;QD=58.5747;RBI=0.0557811;REFB=0;REVB=0.0188174;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317718;OID=.;OPOS=52506985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:10:23:0:0:10:23:0:0
chr19	52519608	.	C	T	368.06	PASS	AF=0.544118;AO=37;DP=68;FAO=37;FDP=68;FR=.;FRO=31;FSAF=13;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=18;FWDB=-0.0455747;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.098;QD=21.6503;RBI=0.05007;REFB=-0.0558169;REVB=0.0207352;RO=30;SAF=13;SAR=24;SRF=13;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0711208;STB=0.533315;STBP=0.602;TYPE=snp;VARB=0.0403438;OID=.;OPOS=52519608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:30:31:37:37:0.544118:24:13:13:17:24:13:13:18
chr19	52520607	.	C	T	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0200144;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=170.9;QD=48.7368;RBI=0.040355;REFB=0;REVB=0.0350421;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.01953e-05;OID=.;OPOS=52520607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:6:11:0:0:6:11:0:0
chr19	52521296	.	G	A	723.01	PASS	AF=0.978723;AO=46;DP=49;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0295923;FXX=0.040808;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.171;QD=61.5327;RBI=0.042521;REFB=-0.166541;REVB=0.0305341;RO=1;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0218604;STB=0.511623;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.00396979;OID=.;OPOS=52521296;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:49:47:1:1:46:46:0.978723:21:25:0:1:21:25:0:1
chr19	52537576	.	T	G	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.482;QD=59.0183;RBI=0.0200212;REFB=0;REVB=0.0101975;RO=0;SAF=22;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.75716e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.04245e-05;OID=.;OPOS=52537576;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:12:22:0:0:12:22:0:0
chr19	52619065	.	T	C	274.55	PASS	AF=0.527273;AO=29;DP=55;FAO=29;FDP=55;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0128511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.858;QD=19.9671;RBI=0.0216172;REFB=-0.00429908;REVB=0.0173825;RO=26;SAF=15;SAR=14;SRF=11;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0798218;STB=0.5444;STBP=0.526;TYPE=snp;VARB=0.00448063;OID=.;OPOS=52619065;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:26:26:29:29:0.527273:14:15:11:15:14:15:11:15
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chr19	52803669	.	CTG	C	906.02	PASS	AF=1;AO=58;DP=63;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00235981;FXX=0.0312451;HRUN=1;LEN=2;MLLD=199.053;QD=58.4527;RBI=0.0624488;REFB=0;REVB=0.0624042;RO=0;SAF=38;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.38905e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=8.22334e-05;OID=.;OPOS=52803670;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:58:63:62:62:0:40:22:0:0:5:0:38:20:0:0
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chr19	52869786	.	G	A	73.83	PASS	AF=0.333333;AO=10;DP=30;FAO=10;FDP=30;FR=.;FRO=20;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=12;FSRR=8;FWDB=-0.00331848;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.613;QD=9.84386;RBI=0.0131103;REFB=-0.00462649;REVB=-0.0126833;RO=20;SAF=6;SAR=4;SRF=12;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0105416;OID=.;OPOS=52869786;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:20:20:10:10:0.333333:4:6:12:8:4:6:12:8
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chr19	52887427	.	A	C	215.09	PASS	AF=0.525;AO=21;DP=40;FAO=21;FDP=40;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=13;FSRR=6;FWDB=-0.0242744;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.878;QD=21.5088;RBI=0.0288469;REFB=-0.0145078;REVB=0.0155851;RO=17;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.17346;STB=0.619607;STBP=0.135;TYPE=snp;VARB=0.0121581;OID=.;OPOS=52887427;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:17:19:21:21:0.525:12:9:11:6:12:9:13:6
chr19	52887437	.	A	C	216.2	PASS	AF=0.538462;AO=21;DP=39;FAO=21;FDP=39;FR=.;FRO=18;FSAF=9;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=7;FWDB=0.0183725;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.4242;QD=22.1745;RBI=0.0923602;REFB=-0.00901242;REVB=0.0905144;RO=18;SAF=9;SAR=12;SRF=11;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.149696;STB=0.583862;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.01088;OID=.;OPOS=52887437;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:18:21:21:0.538462:12:9:11:7:12:9:11:7
chr19	52887904	.	T	C	182.3	PASS	AF=0.772727;AO=17;DP=21;FAO=17;FDP=22;FR=.;FRO=5;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0619562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4303;QD=33.1452;RBI=0.0647866;REFB=-0.0508572;REVB=-0.0189403;RO=4;SAF=11;SAR=6;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0546481;STB=0.559251;STBP=0.341;TYPE=snp;VARB=0.0155337;OID=.;OPOS=52887904;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:21:22:4:5:17:17:0.772727:6:11:2:2:6:11:2:3
chr19	52888210	.	T	C	76.63	PASS	AF=0.555556;AO=9;DP=17;FAO=10;FDP=18;FR=.;FRO=8;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0042341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.594;QD=17.0295;RBI=0.0138155;REFB=-0.0219368;REVB=0.0131507;RO=8;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163174;STB=0.571292;STBP=0.586;TYPE=snp;VARB=0.0215141;OID=.;OPOS=52888210;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:17:18:8:8:9:10:0.555556:4:5:6:2:4:6:6:2
chr19	52888245	.	A	G	60.3	PASS	AF=0.571429;AO=8;DP=14;FAO=8;FDP=14;FR=.;FRO=6;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.037753;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8347;QD=17.2296;RBI=0.0801794;REFB=-0.0209238;REVB=0.0707351;RO=6;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122361;STB=0.571253;STBP=0.585;TYPE=snp;VARB=0.0227127;OID=.;OPOS=52888245;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:6:6:8:8:0.571429:4:4:4:2:4:4:4:2
chr19	52917590	.	G	A	568.35	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00826738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9305;QD=59.8266;RBI=0.0548555;REFB=0;REVB=0.054229;RO=0;SAF=24;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000701448;OID=.;OPOS=52917590;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:37:38:1:13:24:0:0:14:24:0:0
chr19	52934751	.	A	G	148.97	PASS	AF=0.28;AO=21;DP=75;FAO=21;FDP=75;FR=.;FRO=54;FSAF=14;FSAR=7;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.0244413;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=157.094;QD=7.94522;RBI=0.024764;REFB=-0.0200266;REVB=0.00398471;RO=54;SAF=14;SAR=7;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0956745;STB=0.557636;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0636737;OID=.;OPOS=52934751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:54:54:21:21:0.28:7:14:32:22:7:14:32:22
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chr19	52942159	.	A	G	48.8	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.116565;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.829;QD=13.9419;RBI=0.117552;REFB=-0.0166047;REVB=-0.0152032;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.119504;STB=0.571224;STBP=0.677;TYPE=snp;VARB=0.0249452;OID=.;OPOS=52942159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:4:3:4:3:4:3:4:3
chr19	52942495	.	G	A	74.67	PASS	AF=0.357143;AO=10;DP=28;FAO=10;FDP=28;FR=.;FRO=18;FSAF=2;FSAR=8;FSRF=7;FSRR=11;FWDB=0.0104243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.62;QD=10.6674;RBI=0.0279936;REFB=-0.0145379;REVB=-0.0259803;RO=18;SAF=2;SAR=8;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.251805;STB=0.654202;STBP=0.294;TYPE=snp;VARB=0.0354325;OID=.;OPOS=52942495;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:28:18:18:10:10:0.357143:8:2:7:11:8:2:7:11
chr19	52954507	.	T	C	1535.22	PASS	AF=0.58159;AO=139;DP=240;FAO=139;FDP=239;FR=.;FRO=100;FSAF=72;FSAR=67;FSRF=60;FSRR=40;FWDB=-0.0219605;FXX=0.00416649;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.937;QD=25.6941;RBI=0.0260794;REFB=-0.0301375;REVB=-0.0140667;RO=98;SAF=72;SAR=67;SRF=59;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0644436;STB=0.53444;STBP=0.219;TYPE=snp;VARB=0.0230316;OID=.;OPOS=52954507;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:240:239:98:100:139:139:0.58159:67:72:59:39:67:72:60:40
chr19	53014346	.	G	A	152.49	PASS	AF=0.485714;AO=17;DP=35;FAO=17;FDP=35;FR=.;FRO=18;FSAF=8;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00945115;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.983;QD=17.4273;RBI=0.028722;REFB=-0.0387725;REVB=0.0271225;RO=17;SAF=8;SAR=9;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0517331;STB=0.543573;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.016326;OID=.;OPOS=53014346;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:17:18:17:17:0.485714:9:8:9:8:9:8:10:8
chr19	53015384	.	A	G	90.68	PASS	AF=0.458333;AO=11;DP=25;FAO=11;FDP=24;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=-0.0166727;FXX=0.039984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.691;QD=15.1126;RBI=0.0212302;REFB=-0.0402856;REVB=-0.0131432;RO=13;SAF=5;SAR=6;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.218381;STB=0.626645;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0520426;OID=.;OPOS=53015384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:25:24:13:13:11:11:0.458333:6:5:9:4:6:5:9:4
chr19	53015864	.	T	G	64.23	PASS	AF=0.375;AO=9;DP=24;FAO=9;FDP=24;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0205287;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.2824;QD=10.7046;RBI=0.0506836;REFB=0.00279538;REVB=0.0463401;RO=15;SAF=8;SAR=1;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.426521;STB=0.766397;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=0.00111451;OID=.;OPOS=53015864;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:24:24:15:15:9:9:0.375:1:8:9:6:1:8:9:6
chr19	53015987	.	C	G	36.61	PASS	AF=0.3;AO=6;DP=20;FAO=6;FDP=20;FR=.;FRO=14;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.0235551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.6124;QD=7.32274;RBI=0.0520462;REFB=-0.00533109;REVB=0.0464108;RO=14;SAF=3;SAR=3;SRF=8;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0784305;STB=0.549835;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0171134;OID=.;OPOS=53015987;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:20:20:14:14:6:6:0.3:3:3:8:6:3:3:8:6
chr19	53057925	.	C	A	214.19	PASS	AF=0.666667;AO=20;DP=30;FAO=20;FDP=30;FR=.;FRO=10;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0155086;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1149;QD=28.5592;RBI=0.0490649;REFB=-0.015076;REVB=-0.0465494;RO=10;SAF=15;SAR=5;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0391935;STB=0.521717;STBP=0.792;TYPE=snp;VARB=0.00594297;OID=.;OPOS=53057925;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:30:30:10:10:20:20:0.666667:5:15:7:3:5:15:7:3
chr19	53059235	.	T	G	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0233341;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.033;QD=39.2042;RBI=0.0474818;REFB=0;REVB=0.0413526;RO=0;SAF=5;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000584098;OID=.;OPOS=53059235;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:4:5:0:0:4:5:0:0
chr19	53116643	.	T	C	182.08	PASS	AF=0.44186;AO=19;DP=43;FAO=19;FDP=43;FR=.;FRO=24;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0648517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.204;QD=16.938;RBI=0.0649981;REFB=-0.000644725;REVB=-0.00435863;RO=23;SAF=11;SAR=8;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294338;STB=0.50251;STBP=0.983;TYPE=snp;VARB=0.00133682;OID=.;OPOS=53116643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:23:24:19:19:0.44186:8:11:14:9:8:11:14:10
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chr19	53303527	.	A	G	255.91	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206419;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.3755;QD=51.1817;RBI=0.0212808;REFB=0;REVB=0.0051751;RO=0;SAF=17;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000567591;OID=.;OPOS=53303527;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:3:17:0:0:3:17:0:0
chr19	53303890	.	C	G	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0557186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=125.711;QD=54.516;RBI=0.0593664;REFB=0;REVB=0.0204892;RO=0;SAF=15;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000594472;OID=.;OPOS=53303890;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:10:15:0:0:10:15:0:0
chr19	53304468	.	CAT	C	227.36	PASS	AF=0.488889;AO=21;DP=47;FAO=22;FDP=45;FR=.;FRO=23;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=16;FWDB=0.0141473;FXX=0.0425441;HRUN=1;LEN=2;MLLD=197.849;QD=20.2098;RBI=0.0144117;REFB=-0.0155348;REVB=-0.00274785;RO=22;SAF=11;SAR=10;SRF=7;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185364;STB=0.621408;STBP=0.132;TYPE=del;VARB=0.0197241;OID=.;OPOS=53304469;OREF=AT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.488889:21:47:22:45:23:12:10:7:16:99:22:11:10:7:15
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chr19	53344118	.	C	G	95.88	PASS	AF=0.363636;AO=12;DP=32;FAO=12;FDP=33;FR=.;FRO=21;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=11;FWDB=0.0444416;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.2048;QD=11.6224;RBI=0.103272;REFB=0.0120733;REVB=-0.0932205;RO=20;SAF=5;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0886344;STB=0.538397;STBP=0.818;TYPE=snp;VARB=-0.0231864;OID=.;OPOS=53344118;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:32:33:20:21:12:12:0.363636:7:5:10:10:7:5:10:11
chr19	53345255	.	C	G	292.32	PASS	AF=0.352941;AO=35;DP=102;FAO=36;FDP=102;FR=.;FRO=66;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=37;FWDB=-0.00866983;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.447;QD=11.4636;RBI=0.0199075;REFB=-0.00670559;REVB=0.0179205;RO=65;SAF=16;SAR=19;SRF=29;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124989;STB=0.503309;STBP=0.979;TYPE=snp;VARB=0.0114028;OID=.;OPOS=53345255;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:102:65:66:35:36:0.352941:19:16:29:36:20:16:29:37
chr19	53345282	.	CA	TC	136.9	PASS	AF=0.263158;AO=22;DP=95;FAO=25;FDP=95;FR=.;FRO=70;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=40;FWDB=0.0385524;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=178.701;QD=5.76425;RBI=0.0446037;REFB=-0.0169238;REVB=0.0224322;RO=70;SAF=8;SAR=14;SRF=30;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0842674;STB=0.521722;STBP=0.799;TYPE=mnp;VARB=0.0401881;OID=.;OPOS=53345282;OREF=CA;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:70:70:22:25:0.263158:14:8:30:40:15:10:30:40
chr19	53345289	.	A	G	185.69	PASS	AF=0.280899;AO=25;DP=90;FAO=25;FDP=89;FR=.;FRO=64;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=26;FSRR=38;FWDB=-0.0524326;FXX=0.0111099;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.141;QD=8.3456;RBI=0.0524582;REFB=-0.00412126;REVB=0.00163821;RO=64;SAF=10;SAR=15;SRF=26;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0078236;STB=0.504669;STBP=0.967;TYPE=snp;VARB=0.00775975;OID=.;OPOS=53345289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:64:64:25:25:0.280899:15:10:26:38:15:10:26:38
chr19	53345321	.	T	G	572.15	PASS	AF=0.684932;AO=50;DP=73;FAO=50;FDP=73;FR=.;FRO=23;FSAF=19;FSAR=31;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0361563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.417;QD=31.3504;RBI=0.0505563;REFB=-0.0476185;REVB=0.0353364;RO=23;SAF=19;SAR=31;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0199854;STB=0.510808;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.0183983;OID=.;OPOS=53345321;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:23:23:50:50:0.684932:31:19:8:15:31:19:8:15
chr19	53453777	.	C	T	126.69	PASS	AF=0.333333;AO=15;DP=45;FAO=15;FDP=45;FR=.;FRO=30;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=-0.00517549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.794;QD=11.2612;RBI=0.00535949;REFB=-0.0124649;REVB=0.00139229;RO=30;SAF=5;SAR=10;SRF=12;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0810639;STB=0.548321;STBP=0.656;TYPE=snp;VARB=0.0250057;OID=.;OPOS=53453777;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:30:30:15:15:0.333333:10:5:12:18:10:5:12:18
chr19	53454475	.	C	CACT,T	666.11	PASS	AF=0.863636,0.136364;AO=38,6;DP=46;FAO=38,6;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19,1;FSAR=19,5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00847752,-0.0104098;FXX=0;HRUN=0,2;LEN=3,1;MLLD=205.105,95.9542;QD=60.5557;RBI=0.0187932,0.0587797;REFB=0,0;REVB=-0.0167725,-0.0578506;RO=2;SAF=19,1;SAR=19,5;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0467955,-0.418591;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00489501,0.0393635;OID=.,.;OPOS=53454476,53454475;OREF=-,C;OALT=ACT,T;OMAPALT=CACT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:32:46:44:2:0:38,6:38,6:0.863636,0.136364:19,5:19,1:2:0:19,5:19,1:0:0
chr19	53454543	.	G	A	371.54	PASS	AF=0.645833;AO=30;DP=47;FAO=31;FDP=48;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0105412;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3007;QD=30.962;RBI=0.0282111;REFB=-0.0506163;REVB=0.0261677;RO=17;SAF=9;SAR=21;SRF=8;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125972;STB=0.557484;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.0243579;OID=.;OPOS=53454543;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:48:17:17:30:31:0.645833:21:9:8:9:21:10:8:9
chr19	53454789	.	A	T	234.53	PASS	AF=0.442623;AO=27;DP=61;FAO=27;FDP=61;FR=.;FRO=34;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=8;FWDB=-0.0385046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.0787;QD=15.3787;RBI=0.0804688;REFB=-0.0416904;REVB=-0.0706586;RO=34;SAF=15;SAR=12;SRF=26;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.216186;STB=0.62113;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.0536881;OID=.;OPOS=53454789;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:34:34:27:27:0.442623:12:15:26:8:12:15:26:8
chr19	53576589	.	C	G,T	790.28	PASS	AF=0.96,0.04;AO=48,2;DP=50;FAO=48,2;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=28,2;FSAR=20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0360417,0.00439211;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=110.95,122.039;QD=63.2221;RBI=0.0401995,0.0144596;REFB=0,0;REVB=0.0178045,0.0137764;RO=0;SAF=28,2;SAR=20,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-4.56477e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00581977,0.0782432;OID=.,.;OPOS=53576589,53576589;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:50:50:0:0:48,2:48,2:0.96,0.04:20,0:28,2:0:0:20,0:28,2:0:0
chr19	53577419	.	G	C	755.36	PASS	AF=0.934426;AO=55;DP=60;FAO=57;FDP=61;FR=.;FRO=4;FSAF=30;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=-0.044588;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.8982;QD=49.5318;RBI=0.0470186;REFB=0.0263337;REVB=0.0149216;RO=4;SAF=28;SAR=27;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00115958;STB=0.501729;STBP=0.91;TYPE=snp;VARB=-0.0266052;OID=.;OPOS=53577419;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:60:61:4:4:55:57:0.934426:27:28:2:2:27:30:2:2
chr19	53612311	.	T	C	85.26	PASS	AF=0.366667;AO=11;DP=30;FAO=11;FDP=30;FR=.;FRO=19;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=0.015184;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.582;QD=11.3686;RBI=0.0233552;REFB=-0.0203923;REVB=0.0177458;RO=19;SAF=6;SAR=5;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.241378;STB=0.642612;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.0305672;OID=.;OPOS=53612311;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:30:30:19:19:11:11:0.366667:5:6:6:13:5:6:6:13
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chr19	53612757	.	T	G	322.92	PASS	AF=0.559322;AO=33;DP=59;FAO=33;FDP=59;FR=.;FRO=26;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=14;FSRR=12;FWDB=0.0291596;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=98.0677;QD=21.8928;RBI=0.0337593;REFB=-0.000963283;REVB=0.017012;RO=26;SAF=17;SAR=16;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0186133;STB=0.510282;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.00206133;OID=.;OPOS=53612757;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:26:26:33:33:0.559322:16:17:14:12:16:17:14:12
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chr19	53669492	.	A	G	141.96	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=0.00937252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.923;QD=13.8496;RBI=0.016689;REFB=-0.00652801;REVB=0.0138087;RO=25;SAF=5;SAR=11;SRF=13;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226393;STB=0.632417;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=0.00963914;OID=.;OPOS=53669492;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:11:5:13:12:11:5:13:12
chr19	53770074	.	G	C	242.15	PASS	AF=0.473684;AO=27;DP=57;FAO=27;FDP=57;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=13;FWDB=-0.011346;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.678;QD=16.9933;RBI=0.0212917;REFB=-0.0200488;REVB=0.0180169;RO=30;SAF=14;SAR=13;SRF=17;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0451952;STB=0.525405;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0190853;OID=.;OPOS=53770074;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:30:30:27:27:0.473684:13:14:17:13:13:14:17:13
chr19	53770261	.	T	C	102.78	PASS	AF=0.235294;AO=16;DP=68;FAO=16;FDP=68;FR=.;FRO=52;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=22;FSRR=30;FWDB=-0.00887869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.746;QD=6.04596;RBI=0.0167566;REFB=-0.00941811;REVB=0.014211;RO=50;SAF=5;SAR=11;SRF=20;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117025;STB=0.591515;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.0213648;OID=.;OPOS=53770261;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:50:52:16:16:0.235294:11:5:20:30:11:5:22:30
chr19	53784899	.	C	T	456.51	PASS	AF=0.480392;AO=49;DP=101;FAO=49;FDP=102;FR=.;FRO=53;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=19;FSRR=34;FWDB=0.0117758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.5;QD=17.9023;RBI=0.0120014;REFB=-0.0219139;REVB=0.00231602;RO=52;SAF=32;SAR=17;SRF=19;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267537;STB=0.652999;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0166852;OID=.;OPOS=53784899;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:102:52:53:49:49:0.480392:17:32:19:33:17:32:19:34
chr19	53787375	.	C	T	94.87	PASS	AF=0.333333;AO=12;DP=35;FAO=12;FDP=36;FR=.;FRO=24;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0191238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8721;QD=10.5412;RBI=0.0244034;REFB=-0.00803032;REVB=-0.0151593;RO=23;SAF=8;SAR=4;SRF=9;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.299736;STB=0.666389;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.00897831;OID=.;OPOS=53787375;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:94:35:36:23:24:12:12:0.333333:4:8:9:14:4:8:10:14
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chr19	54378789	.	C	G	2959.88	PASS	AF=1;AO=174;DP=178;FAO=191;FDP=191;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=87;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126497;FXX=0.0449978;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3157;QD=61.9871;RBI=0.0128847;REFB=0;REVB=0.00244968;RO=0;SAF=95;SAR=79;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000945256;OID=.;OPOS=54378789;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:178:191:0:0:174:191:1:79:95:0:0:87:104:0:0
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chr19	54378808	.	A	G	79.12	PASS	AF=0.179487;AO=14;DP=76;FAO=14;FDP=78;FR=.;FRO=64;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=20;FSRR=44;FWDB=-0.0956679;FXX=0;HRUN=15;LEN=1;MLLD=188.517;QD=4.0573;RBI=0.0964329;REFB=-0.0033782;REVB=-0.0121224;RO=62;SAF=5;SAR=9;SRF=20;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0481547;STB=0.54076;STBP=0.783;TYPE=snp;VARB=0.00959682;OID=.;OPOS=54378808;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:79:76:78:62:64:14:14:0.179487:9:5:20:42:9:5:20:44
chr19	54379573	.	C	T	629.24	PASS	AF=0.954545;AO=43;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0335697;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.9149;QD=57.2035;RBI=0.0467585;REFB=-0.0948569;REVB=-0.0325489;RO=1;SAF=25;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184156;STB=0.519991;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=0.0034224;OID=.;OPOS=54379573;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:44:1:2:43:42:0.954545:18:25:1:0:18:24:2:0
chr19	54385820	.	C	T	1819.85	PASS	AF=0.975806;AO=121;DP=124;FAO=121;FDP=124;FR=.;FRO=3;FSAF=66;FSAR=55;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0170615;FXX=0.00799936;HRUN=3;LEN=1;MLLD=317.933;QD=58.7048;RBI=0.0327788;REFB=-0.0626522;REVB=0.0279884;RO=3;SAF=66;SAR=55;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0211002;STB=0.511109;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.000172941;OID=.;OPOS=54385820;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:124:124:3:3:121:121:0.975806:55:66:3:0:55:66:3:0
chr19	54394965	.	T	C	592.02	PASS	AF=0.57;AO=56;DP=100;FAO=57;FDP=100;FR=.;FRO=43;FSAF=37;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.0086636;FXX=0.00990001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.425;QD=23.6809;RBI=0.0156729;REFB=-0.0028597;REVB=-0.0130607;RO=43;SAF=36;SAR=20;SRF=22;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.109298;STB=0.562454;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00301159;OID=.;OPOS=54394965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:43:43:56:57:0.57:20:36:22:21:20:37:22:21
chr19	54600232	.	A	C	441.92	PASS	AF=0.383459;AO=51;DP=133;FAO=51;FDP=133;FR=.;FRO=82;FSAF=18;FSAR=33;FSRF=41;FSRR=41;FWDB=-0.0229353;FXX=0.00746213;HRUN=3;LEN=1;MLLD=76.886;QD=13.2908;RBI=0.0332835;REFB=0.00314946;REVB=-0.0241197;RO=80;SAF=18;SAR=33;SRF=40;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.163684;STB=0.593741;STBP=0.106;TYPE=snp;VARB=-0.0103642;OID=.;OPOS=54600232;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:133:133:80:82:51:51:0.383459:33:18:40:40:33:18:41:41
chr19	54606209	.	T	G	36.16	PASS	AF=0.272727;AO=6;DP=22;FAO=6;FDP=22;FR=.;FRO=16;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=-0.0092866;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.432;QD=6.57399;RBI=0.0660757;REFB=-0.0119695;REVB=-0.0654198;RO=16;SAF=4;SAR=2;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267262;STB=0.517185;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.0325817;OID=.;OPOS=54606209;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:22:22:16:16:6:6:0.272727:2:4:11:5:2:4:11:5
chr19	54649671	.	T	C	130.29	PASS	AF=1;AO=10;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00498625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.984;QD=43.4287;RBI=0.0398042;REFB=0;REVB=0.0394907;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00181541;OID=.;OPOS=54649671;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:10:12:1:3:7:0:0:5:7:0:0
chr19	54674742	.	C	T	175.24	PASS	AF=0.27907;AO=24;DP=86;FAO=24;FDP=86;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=42;FWDB=-0.00783576;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=201.289;QD=8.1508;RBI=0.0280738;REFB=-0.0173067;REVB=-0.0269581;RO=62;SAF=16;SAR=8;SRF=20;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.398284;STB=0.735113;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0368988;OID=.;OPOS=54674742;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:62:62:24:24:0.27907:8:16:20:42:8:16:20:42
chr19	54676763	.	C	T	207.95	PASS	AF=0.403226;AO=25;DP=62;FAO=25;FDP=62;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=22;FWDB=-0.000351306;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=245.648;QD=13.4159;RBI=0.0159713;REFB=-0.0156255;REVB=-0.0159674;RO=37;SAF=10;SAR=15;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00586133;STB=0.503353;STBP=0.991;TYPE=snp;VARB=0.0223241;OID=.;OPOS=54676763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:37:37:25:25:0.403226:15:10:15:22:15:10:15:22
chr19	54676814	.	G	GC	100.25	PASS	AF=0.37931;AO=21;DP=59;FAO=22;FDP=58;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.0292117;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=15.7992;QD=6.91386;RBI=0.0685455;REFB=-0.00180464;REVB=0.0620094;RO=36;SAF=10;SAR=11;SRF=11;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.189435;STB=0.594774;STBP=0.304;TYPE=ins;VARB=0.000162001;OID=.;OPOS=54676815;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.37931:21:59:22:58:36:10:12:11:25:99:36:10:11:11:25
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chr19	54677759	.	T	C	771.92	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00059816;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.302;QD=57.1796;RBI=0.0425463;REFB=0;REVB=0.0425421;RO=0;SAF=36;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001104;OID=.;OPOS=54677759;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:54:0:0:54:54:1:18:36:0:0:18:36:0:0
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chr19	54746081	.	T	C	30.81	PASS	AF=0.0888889;AO=8;DP=90;FAO=8;FDP=90;FR=.;FRO=82;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=44;FSRR=38;FWDB=-0.0423907;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.76;QD=1.3694;RBI=0.0424513;REFB=-0.000759453;REVB=-0.00226723;RO=78;SAF=5;SAR=3;SRF=41;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114835;STB=0.582178;STBP=0.667;TYPE=snp;VARB=0.0113089;OID=.;OPOS=54746081;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:90:90:78:82:8:8:0.0888889:3:5:41:37:3:5:44:38
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chr19	54767879	.	T	C	416.96	PASS	AF=0.382812;AO=47;DP=126;FAO=49;FDP=128;FR=.;FRO=79;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=43;FSRR=36;FWDB=0.00556239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.31;QD=13.0301;RBI=0.0392652;REFB=-0.00474814;REVB=0.0388692;RO=79;SAF=30;SAR=17;SRF=43;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107957;STB=0.556863;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.00765127;OID=.;OPOS=54767879;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:126:128:79:79:47:49:0.382812:17:30:43:36:18:31:43:36
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chr19	54782919	.	C	T	214.39	PASS	AF=0.4;AO=26;DP=65;FAO=26;FDP=65;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=11;FWDB=0.009008;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.4586;QD=13.1933;RBI=0.0211424;REFB=-0.0150518;REVB=-0.0191274;RO=39;SAF=17;SAR=9;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0765532;STB=0.543592;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=0.0358602;OID=.;OPOS=54782919;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:39:39:26:26:0.4:9:17:28:11:9:17:28:11
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chr19	55045042	.	G	A	1150.07	PASS	AF=0.857143;AO=77;DP=97;FAO=84;FDP=98;FR=.;FRO=14;FSAF=51;FSAR=33;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.0584869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.15;QD=46.9417;RBI=0.0587299;REFB=-0.0612357;REVB=-0.00533749;RO=0;SAF=44;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.58027e-08;STB=0.526429;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0018168;OID=.;OPOS=55045042;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:97:98:0:14:77:84:0.857143:33:44:0:0:33:51:6:8
chr19	55048270	.	C	T	119.65	PASS	AF=0.283333;AO=15;DP=58;FAO=17;FDP=60;FR=.;FRO=43;FSAF=5;FSAR=12;FSRF=20;FSRR=23;FWDB=0.0102203;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8017;QD=7.97654;RBI=0.0257315;REFB=-0.01564;REVB=0.0236147;RO=41;SAF=4;SAR=11;SRF=18;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226794;STB=0.631417;STBP=0.231;TYPE=snp;VARB=0.0229323;OID=.;OPOS=55048270;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:60:41:43:15:17:0.283333:11:4:18:23:12:5:20:23
chr19	55085567	.	A	AC,C	149.48	PASS	AF=0.583333,0;AO=12,5;DP=39;FAO=21,0;FDP=36;FR=.;FRO=15;FSAF=8,0;FSAR=13,0;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.0620064,-0.033028;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=13.1454,163.344;QD=16.6085;RBI=0.18966,0.0334416;REFB=-0.18637,-0.0103237;REVB=0.179237,-0.0052433;RO=22;SAF=0,5;SAR=12,0;SRF=14;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.814046,0.63962;STB=0.592404,0.5;STBP=0.199,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.18006,0;OID=.,.;OPOS=55085568,55085567;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:60:39:36:22:15:12,5:21,0:0.583333,0:12,0:0,5:14:8:13,0:8,0:9:6
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chr19	55142739	.	A	C	137.33	PASS	AF=0.535714;AO=13;DP=26;FAO=15;FDP=28;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0185076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.306;QD=19.6191;RBI=0.0185098;REFB=-0.0104084;REVB=0.000283754;RO=13;SAF=8;SAR=5;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.200611;STB=0.599867;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0100409;OID=.;OPOS=55142739;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:28:13:13:13:15:0.535714:5:8:5:8:6:9:5:8
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chr19	55325455	.	G	A	136.51	PASS	AF=0.4;AO=15;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=0.00753297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.594;QD=13.6512;RBI=0.0488357;REFB=-0.00986039;REVB=-0.0482513;RO=23;SAF=5;SAR=10;SRF=8;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0167764;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0178564;OID=.;OPOS=55325455;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:23:24:15:16:0.4:10:5:8:15:10:6:9:15
chr19	55327930	.	A	G	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000207518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.1826;QD=42.1825;RBI=0.00250546;REFB=0;REVB=0.00249685;RO=0;SAF=7;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.86027e-05;OID=.;OPOS=55327930;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:4:7:0:0:4:7:0:0
chr19	55327960	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0561779;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=160.259;QD=43.486;RBI=0.0577867;REFB=0;REVB=0.0135405;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000823596;OID=.;OPOS=55327960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr19	55328959	.	G	T	453.96	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00942522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=201.918;QD=55.0258;RBI=0.0321852;REFB=-0.158491;REVB=0.0307742;RO=1;SAF=20;SAR=12;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0227759;STB=0.512188;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00118156;OID=.;OPOS=55328959;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:12:20:1:0:12:20:1:0
chr19	55328973	.	T	G	118.32	PASS	AF=0.378378;AO=14;DP=37;FAO=14;FDP=37;FR=.;FRO=23;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=11;FWDB=0.00264616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.45;QD=12.7914;RBI=0.017981;REFB=-0.0235053;REVB=-0.0177852;RO=23;SAF=11;SAR=3;SRF=12;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319567;STB=0.690285;STBP=0.103;TYPE=snp;VARB=0.0224714;OID=.;OPOS=55328973;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:23:23:14:14:0.378378:3:11:12:11:3:11:12:11
chr19	55328993	.	G	C	645.27	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0307555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.252;QD=61.4544;RBI=0.0901958;REFB=0;REVB=0.0847902;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000739896;OID=.;OPOS=55328993;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:14:27:0:0:15:27:0:0
chr19	55329021	.	A	G	617.49	PASS	AF=1;AO=39;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00446193;FXX=0.0243843;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.531;QD=61.7493;RBI=0.012962;REFB=0;REVB=0.0121698;RO=0;SAF=24;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.94162e-05;OID=.;OPOS=55329021;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:39:40:1:15:24:0:0:15:25:0:0
chr19	55329783	.	A	G	772.59	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=39;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.000324327;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=90.2217;QD=61.807;RBI=0.130962;REFB=-0.161188;REVB=-0.130961;RO=1;SAF=39;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0119172;STB=0.506327;STBP=0.645;TYPE=snp;VARB=0.00129998;OID=.;OPOS=55329783;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:10:39:1:0:10:39:1:0
chr19	55329901	.	A	G	601.12	PASS	AF=0.97561;AO=40;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0546362;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.114;QD=58.646;RBI=0.0559253;REFB=-0.0689251;REVB=0.0119386;RO=1;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022873;STB=0.512189;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00112002;OID=.;OPOS=55329901;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:1:1:40:40:0.97561:20:20:0:1:20:20:0:1
chr19	55329922	.	A	T	463.17	PASS	AF=0.942857;AO=33;DP=35;FAO=33;FDP=35;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00210667;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.3439;QD=52.9333;RBI=0.0801772;REFB=-0.0664639;REVB=0.0801496;RO=1;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0252499;STB=0.5263;STBP=0.242;TYPE=snp;VARB=0.0233423;OID=.;OPOS=55329922;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:35:35:1:2:33:33:0.942857:18:15:0:1:18:15:0:2
chr19	55333096	.	T	C	280.79	PASS	AF=0.625;AO=25;DP=39;FAO=25;FDP=40;FR=.;FRO=15;FSAF=22;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00995058;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.491;QD=28.0786;RBI=0.0154942;REFB=-0.0176685;REVB=0.0118767;RO=14;SAF=22;SAR=3;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.385387;STB=0.709474;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.0111419;OID=.;OPOS=55333096;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:14:15:25:25:0.625:3:22:7:7:3:22:8:7
chr19	55333193	.	C	A	266.56	PASS	AF=0.631579;AO=24;DP=38;FAO=24;FDP=38;FR=.;FRO=14;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00937593;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.5838;QD=28.0585;RBI=0.0351981;REFB=-0.0388793;REVB=0.0339264;RO=14;SAF=14;SAR=10;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104068;STB=0.557474;STBP=0.354;TYPE=snp;VARB=0.0249042;OID=.;OPOS=55333193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:14:14:24:24:0.631579:10:14:6:8:10:14:6:8
chr19	55340836	.	A	G	389.07	PASS	AF=0.481928;AO=40;DP=82;FAO=40;FDP=83;FR=.;FRO=43;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=21;FSRR=22;FWDB=-0.0136401;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.042;QD=18.7503;RBI=0.0140154;REFB=-0.0205881;REVB=0.00322192;RO=41;SAF=20;SAR=20;SRF=19;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0333037;STB=0.506021;STBP=0.941;TYPE=snp;VARB=0.0236105;OID=.;OPOS=55340836;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:83:41:43:40:40:0.481928:20:20:19:22:20:20:21:22
chr19	55341575	.	G	C	33.38	PASS	AF=0.15;AO=6;DP=40;FAO=6;FDP=40;FR=.;FRO=34;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=24;FWDB=-0.0446433;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.5055;QD=3.33845;RBI=0.0765722;REFB=-0.00424035;REVB=-0.0622116;RO=33;SAF=1;SAR=5;SRF=9;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179322;STB=0.654175;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.0109547;OID=.;OPOS=55341575;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:40:40:33:34:6:6:0.15:5:1:9:24:5:1:10:24
chr19	55349264	.	G	A	564.6	PASS	AF=0.475806;AO=59;DP=125;FAO=59;FDP=124;FR=.;FRO=65;FSAF=41;FSAR=18;FSRF=25;FSRR=40;FWDB=-0.0273799;FXX=0.00799936;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.702;QD=18.2129;RBI=0.0405762;REFB=-0.01208;REVB=-0.029946;RO=65;SAF=41;SAR=18;SRF=25;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.30018;STB=0.666796;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0192189;OID=.;OPOS=55349264;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:124:65:65:59:59:0.475806:18:41:25:40:18:41:25:40
chr19	55350948	.	A	T	166.61	PASS	AF=0.761905;AO=16;DP=21;FAO=16;FDP=21;FR=.;FRO=5;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=0;FWDB=0.014747;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.003;QD=31.7346;RBI=0.0233757;REFB=-0.117047;REVB=0.018137;RO=5;SAF=10;SAR=6;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.182147;STB=0.599885;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=0.00853979;OID=.;OPOS=55350948;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:21:21:5:5:16:16:0.761905:6:10:5:0:6:10:5:0
chr19	55350979	.	A	G	161.45	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=0.015011;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.3096;QD=18.9937;RBI=0.021047;REFB=0.00102808;REVB=-0.0147529;RO=16;SAF=11;SAR=6;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.234444;STB=0.646886;STBP=0.097;TYPE=snp;VARB=-0.00421121;OID=.;OPOS=55350979;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:16:17:17:17:0.5:6:11:6:10:6:11:6:11
chr19	55351022	.	A	C	284.57	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=17;FWDB=-0.0291216;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1749;QD=17.7857;RBI=0.0291217;REFB=-0.0158161;REVB=-9.93168e-05;RO=33;SAF=16;SAR=15;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0288079;STB=0.516119;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.0199024;OID=.;OPOS=55351022;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:33:31:31:0.484375:15:16:16:17:15:16:16:17
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chr19	55361942	.	G	T	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0244532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=126.014;QD=61.3359;RBI=0.0790915;REFB=0;REVB=0.0752164;RO=0;SAF=32;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000446233;OID=.;OPOS=55361942;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:8:32:0:0:8:32:0:0
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chr19	55399643	.	T	C	189.96	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=7;FSRR=28;FWDB=-0.0856515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.8206;QD=13.1006;RBI=0.0868547;REFB=0.0154994;REVB=-0.0144068;RO=34;SAF=11;SAR=12;SRF=6;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.325549;STB=0.670602;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=-0.0282677;OID=.;OPOS=55399643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:34:35:23:23:0.396552:12:11:6:28:12:11:7:28
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chr19	55420801	.	C	A	829.01	PASS	AF=0.967213;AO=59;DP=62;FAO=59;FDP=61;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0458423;FXX=0.0161264;HRUN=2;LEN=1;MLLD=176.306;QD=54.3615;RBI=0.0493203;REFB=-0.13866;REVB=0.0181928;RO=2;SAF=18;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014123;STB=0.507489;STBP=0.55;TYPE=snp;VARB=0.0041619;OID=.;OPOS=55420801;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:62:61:2:2:59:59:0.967213:41:18:1:1:41:18:1:1
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chr19	55501579	.	A	C	531.61	PASS	AF=0.666667;AO=46;DP=70;FAO=48;FDP=72;FR=.;FRO=24;FSAF=23;FSAR=25;FSRF=7;FSRR=17;FWDB=-0.0142759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.849;QD=29.5339;RBI=0.0154076;REFB=-0.0297001;REVB=0.00579598;RO=24;SAF=21;SAR=25;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106062;STB=0.562911;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=0.0152353;OID=.;OPOS=55501579;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:72:24:24:46:48:0.666667:25:21:7:17:25:23:7:17
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chr19	55512228	.	TGGGC	TGGC,TGGGA	328.94	PASS	AF=0.285714,0.6;AO=7,21;DP=35;FAO=10,21;FDP=35;FR=.;FRO=4;FSAF=5,12;FSAR=5,9;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.019943,0.00990873;FXX=0;HRUN=3,1;LEN=1,1;MLLD=16.5813,189.046;QD=37.5935;RBI=0.153781,0.0106586;REFB=-0.257283,-0.0374729;REVB=0.152482,0.0039273;RO=7;SAF=5,12;SAR=2,9;SRF=1;SRR=6;SSEN=0.341962,0;SSEP=0,0;SSSB=0.456174,0.193526;STB=0.571288,0.551675;STBP=0.418,0.256;TYPE=del,snp;VARB=0.197728,0.0161667;OID=.,.;OPOS=55512229,55512232;OREF=G,C;OALT=-,A;OMAPALT=TGGC,TGGGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.285714,0.6:7,21:35:10,21:35:4:5,12:5,9:1:3:63:7:5,12:2,9:1:6
chr19	55525596	.	T	C	54.16	PASS	AF=0.777778;AO=6;DP=8;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0164137;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=301.373;QD=24.0704;RBI=0.060216;REFB=-0.0316083;REVB=0.0579359;RO=2;SAF=3;SAR=3;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.215133;STB=0.624651;STBP=0.232;TYPE=snp;VARB=0.00505857;OID=.;OPOS=55525596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:9:2:2:6:7:0.777778:3:3:2:0:4:3:2:0
chr19	55525894	.	G	A	184.73	PASS	AF=0.475;AO=19;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=1;FSRF=18;FSRR=3;FWDB=-0.00175877;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=54.8854;QD=18.4734;RBI=0.0203969;REFB=0.0150121;REVB=0.020321;RO=21;SAF=18;SAR=1;SRF=18;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.283949;STB=0.666443;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=-0.0203781;OID=.;OPOS=55525894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:21:21:19:19:0.475:1:18:18:3:1:18:18:3
chr19	55526345	.	T	G	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0400537;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=233.413;QD=49.5992;RBI=0.0533816;REFB=0;REVB=-0.0352888;RO=0;SAF=9;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.18528e-05;OID=.;OPOS=55526345;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:9:9:0:0:9:9:0:0
chr19	55526359	.	A	T	95.99	PASS	AF=0.647059;AO=11;DP=17;FAO=11;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=2;FSAR=9;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.000346548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.34;QD=22.5856;RBI=0.0011981;REFB=-0.0196103;REVB=-0.00114688;RO=6;SAF=2;SAR=9;SRF=6;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.524932;STB=0.799434;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00628998;OID=.;OPOS=55526359;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:6:6:11:11:0.647059:9:2:6:0:9:2:6:0
chr19	55526373	.	G	C	115.33	PASS	AF=0.541667;AO=13;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=8;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.0157733;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.179;QD=19.2209;RBI=0.032874;REFB=-0.0853443;REVB=0.0288428;RO=11;SAF=5;SAR=8;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.403407;STB=0.726962;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00550971;OID=.;OPOS=55526373;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:84:24:24:11:11:13:13:0.541667:8:5:10:1:8:5:10:1
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chr19	55536607	.	C	T	239.12	PASS	AF=0.611111;AO=22;DP=37;FAO=22;FDP=36;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.00189555;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=281.816;QD=26.5688;RBI=0.0293326;REFB=-0.0368303;REVB=0.0292713;RO=15;SAF=12;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.105807;STB=0.545413;STBP=0.501;TYPE=snp;VARB=0.022601;OID=.;OPOS=55536607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:36:15:14:22:22:0.611111:10:12:6:9:10:12:6:8
chr19	55538980	.	T	C	938.62	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0106496;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.376;QD=57.7612;RBI=0.0267776;REFB=0;REVB=0.0245688;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148285;OID=.;OPOS=55538980;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:64:65:1:27:37:0:0:28:37:0:0
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chr19	55539072	.	T	G	1396.13	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000882314;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.488;QD=62.7473;RBI=0.00227598;REFB=0;REVB=-0.002098;RO=0;SAF=50;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.07156e-06;OID=.;OPOS=55539072;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:89:0:0:89:89:1:39:50:0:0:39:50:0:0
chr19	55568084	.	CG	TT	218.83	PASS	AF=0.440678;AO=19;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=20;FWDB=0.0278556;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=268.965;QD=14.8358;RBI=0.0285387;REFB=-0.0187436;REVB=0.0062068;RO=32;SAF=6;SAR=13;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.10715;STB=0.559277;STBP=0.425;TYPE=mnp;VARB=0.0248193;OID=.;OPOS=55568084;OREF=CG;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:32:33:19:26:0.440678:13:6:13:19:13:13:13:20
chr19	55570574	.	A	G	1581.35	PASS	AF=1;AO=96;DP=99;FAO=100;FDP=100;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0236229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.099;QD=63.2541;RBI=0.0283768;REFB=0;REVB=0.0157226;RO=0;SAF=59;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78952e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000845257;OID=.;OPOS=55570574;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:100:0:0:96:100:1:37:59:0:0:41:59:0:0
chr19	55598724	.	A	G	113.02	PASS	AF=0.5;AO=12;DP=25;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.0598714;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.197;QD=17.3869;RBI=0.0629105;REFB=-0.00693603;REVB=-0.0193172;RO=12;SAF=6;SAR=6;SRF=7;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0722214;STB=0.576354;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0040446;OID=.;OPOS=55598724;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:25:26:12:13:12:13:0.5:6:6:7:5:7:6:8:5
chr19	55614923	.	T	C	210.6	PASS	AF=0.947368;AO=17;DP=19;FAO=18;FDP=19;FR=.;FRO=1;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0715161;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.757;QD=44.3359;RBI=0.0717569;REFB=0.0130404;REVB=0.00587448;RO=1;SAF=6;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0398535;STB=0.521715;STBP=0.533;TYPE=snp;VARB=-0.00282875;OID=.;OPOS=55614923;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:19:19:1:1:17:18:0.947368:11:6:0:1:11:7:0:1
chr19	55644325	.	A	C	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.103761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.2576;QD=57.2018;RBI=0.114765;REFB=0;REVB=-0.0490366;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00157875;OID=.;OPOS=55644325;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0
chr19	55653297	.	A	C	103.13	PASS	AF=0.545455;AO=11;DP=21;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0305146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8092;QD=18.7515;RBI=0.0839321;REFB=-0.0388751;REVB=0.0781886;RO=10;SAF=7;SAR=4;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.154239;STB=0.571317;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0544552;OID=.;OPOS=55653297;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:21:22:10:10:11:12:0.545455:4:7:8:2:4:8:8:2
chr19	55660537	.	T	C	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00840957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.1452;QD=52.6124;RBI=0.0178161;REFB=0;REVB=0.0157065;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000177694;OID=.;OPOS=55660537;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr19	55668509	.	A	T	395.9	PASS	AF=0.5125;AO=40;DP=79;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=29;FWDB=0.0302017;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7644;QD=19.795;RBI=0.0302017;REFB=-0.0340762;REVB=3.05493e-05;RO=35;SAF=15;SAR=25;SRF=8;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137634;STB=0.581628;STBP=0.162;TYPE=snp;VARB=0.0541831;OID=.;OPOS=55668509;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:80:35:39:40:41:0.5125:25:15:8:27:24:17:10:29
chr19	55670989	.	G	A	105.86	PASS	AF=0.6;AO=12;DP=20;FAO=12;FDP=20;FR=.;FRO=8;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=2;FWDB=-0.0381123;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.165;QD=21.1725;RBI=0.0419382;REFB=-0.0135362;REVB=0.0175004;RO=8;SAF=7;SAR=5;SRF=6;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.12387;STB=0.570063;STBP=0.489;TYPE=snp;VARB=0.0101828;OID=.;OPOS=55670989;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:20:20:8:8:12:12:0.6:5:7:6:2:5:7:6:2
chr19	55671337	.	C	T	239.42	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0267777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.071;QD=50.4033;RBI=0.0388143;REFB=0;REVB=0.0280982;RO=0;SAF=9;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000700137;OID=.;OPOS=55671337;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:10:9:0:0:10:9:0:0
chr19	55672055	.	A	G	295.03	PASS	AF=0.534483;AO=30;DP=57;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=16;FSRR=11;FWDB=0.00662241;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.531;QD=20.3471;RBI=0.0116298;REFB=-0.034761;REVB=-0.00956011;RO=27;SAF=18;SAR=12;SRF=16;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00655688;STB=0.509912;STBP=0.89;TYPE=snp;VARB=0.0223116;OID=.;OPOS=55672055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:27:27:30:31:0.534483:12:18:16:11:12:19:16:11
chr19	55673145	.	C	T	162.19	PASS	AF=0.305556;AO=22;DP=72;FAO=22;FDP=72;FR=.;FRO=50;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=36;FSRR=14;FWDB=0.0156645;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=104.843;QD=9.01025;RBI=0.0346037;REFB=-0.0145312;REVB=0.0308552;RO=50;SAF=14;SAR=8;SRF=36;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110493;STB=0.564916;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.0226454;OID=.;OPOS=55673145;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:50:50:22:22:0.305556:8:14:36:14:8:14:36:14
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chr19	55872397	.	A	G	239.21	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.026889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.306;QD=50.3592;RBI=0.0809643;REFB=0;REVB=-0.0763688;RO=0;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.32e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00048454;OID=.;OPOS=55872397;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:3:15:0:0:3:16:0:0
chr19	55872531	.	C	G	381.6	PASS	AF=0.965517;AO=28;DP=29;FAO=28;FDP=29;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00482702;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=46.3978;QD=52.6338;RBI=0.0903139;REFB=-0.12005;REVB=0.0901848;RO=1;SAF=14;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.032084;STB=0.517229;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=0.00831595;OID=.;OPOS=55872531;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:29:1:1:28:28:0.965517:14:14:1:0:14:14:1:0
chr19	55872566	.	A	G	438.94	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0616242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.7679;QD=56.637;RBI=0.0616378;REFB=0;REVB=0.0012968;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113419;OID=.;OPOS=55872566;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:14:16:0:0:15:16:0:0
chr19	55873642	.	C	T	1087.91	PASS	AF=1;AO=67;DP=69;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01294;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.5;QD=59.6117;RBI=0.0534603;REFB=0;REVB=0.0518706;RO=0;SAF=37;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000254362;OID=.;OPOS=55873642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:73:0:0:67:73:1:30:37:0:0:31:42:0:0
chr19	55879872	.	C	T	1174.8	PASS	AF=0.963415;AO=79;DP=82;FAO=79;FDP=82;FR=.;FRO=3;FSAF=45;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0339867;FXX=0.0120467;HRUN=5;LEN=1;MLLD=192.824;QD=57.3071;RBI=0.043962;REFB=-0.11126;REVB=0.0278847;RO=3;SAF=45;SAR=34;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00685543;STB=0.503623;STBP=0.798;TYPE=snp;VARB=0.00025894;OID=.;OPOS=55879872;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:82:82:3:3:79:79:0.963415:34:45:2:1:34:45:2:1
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chr19	56056184	.	A	G	980.89	PASS	AF=0.56213;AO=94;DP=168;FAO=95;FDP=169;FR=.;FRO=74;FSAF=49;FSAR=46;FSRF=51;FSRR=23;FWDB=-0.0243125;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1164;QD=23.2163;RBI=0.133717;REFB=-0.0260719;REVB=-0.131488;RO=74;SAF=48;SAR=46;SRF=51;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.145204;STB=0.576353;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.0193726;OID=.;OPOS=56056184;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:168:169:74:74:94:95:0.56213:46:48:51:23:46:49:51:23
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chr19	56114045	.	C	T	97.83	PASS	AF=0.413793;AO=12;DP=29;FAO=12;FDP=29;FR=.;FRO=17;FSAF=10;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=5;FWDB=0.0252281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.964;QD=13.4936;RBI=0.0507817;REFB=-0.0351996;REVB=0.0440718;RO=17;SAF=10;SAR=2;SRF=12;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190811;STB=0.613822;STBP=0.383;TYPE=snp;VARB=0.0519335;OID=.;OPOS=56114045;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:29:29:17:17:12:12:0.413793:2:10:12:5:2:10:12:5
chr19	56114237	.	G	A	973.56	PASS	AF=1;AO=65;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12683;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.5269;QD=55.6322;RBI=0.187656;REFB=-0.118697;REVB=0.138307;RO=3;SAF=40;SAR=25;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00451443;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0139911;OID=.;OPOS=56114237;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:69:70:3:0:65:70:1:25:40:2:1:26:44:0:0
chr19	56125944	.	C	T	52.93	PASS	AF=0.7;AO=7;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.;FRO=3;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0305188;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=203.444;QD=21.1701;RBI=0.0313484;REFB=-0.035623;REVB=-0.00716415;RO=3;SAF=3;SAR=4;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122639;STB=0.571224;STBP=0.617;TYPE=snp;VARB=0.0232692;OID=.;OPOS=56125944;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:3:3:7:7:0.7:4:3:2:1:4:3:2:1
chr19	56127597	.	G	A	374.84	PASS	AF=0.631579;AO=36;DP=57;FAO=36;FDP=57;FR=.;FRO=21;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=8;FSRR=13;FWDB=-0.00110277;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=220.544;QD=26.3048;RBI=0.0195895;REFB=-0.0312634;REVB=0.0195585;RO=21;SAF=21;SAR=15;SRF=8;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136651;STB=0.574738;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.0181898;OID=.;OPOS=56127597;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:21:21:36:36:0.631579:15:21:8:13:15:21:8:13
chr19	56132661	.	G	A	46.8	PASS	AF=0.411765;AO=6;DP=16;FAO=7;FDP=17;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0246917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.3528;QD=11.0126;RBI=0.10579;REFB=0.00220542;REVB=0.102868;RO=10;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.173695;STB=0.542251;STBP=0.752;TYPE=snp;VARB=0.00823971;OID=.;OPOS=56132661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:16:17:10:10:6:7:0.411765:2:4:5:5:3:4:5:5
chr19	56160399	.	T	C	834.39	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143472;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.0963;QD=57.5441;RBI=0.0145179;REFB=0;REVB=0.00221953;RO=0;SAF=29;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128686;OID=.;OPOS=56160399;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:29:29:0:0:29:29:0:0
chr19	56162776	.	C	G,T	713.17	PASS	AF=0.0377358,0.943396;AO=2,49;DP=53;FAO=2,50;FDP=53;FR=.;FRO=1;FSAF=1,19;FSAR=1,31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0906997,0.197441;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=131.972,100.678;QD=53.8238;RBI=0.0907065,0.198308;REFB=-0.0429938,-0.138468;REVB=-0.0011065,0.0185245;RO=2;SAF=1,18;SAR=1,31;SRF=2;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.390188,-0.049451;STB=0.665164,0.512815;STBP=0.662,0.292;TYPE=snp,snp;VARB=0.134908,0.00636471;OID=.,.;OPOS=56162776,56162776;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:53:53:2:1:2,49:2,50:0.0377358,0.943396:1,31:1,18:2:0:1,31:1,19:1:0
chr19	56180968	.	C	T	1030.63	PASS	AF=0.985915;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=71;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0555847;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.893;QD=58.0637;RBI=0.0712897;REFB=-0.237392;REVB=0.044638;RO=1;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133173;STB=0.50704;STBP=0.538;TYPE=snp;VARB=0.000831318;OID=.;OPOS=56180968;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:71:71:1:1:70:70:0.985915:35:35:0:1:35:35:0:1
chr19	56228104	.	C	T	213.89	PASS	AF=0.512195;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=41;FR=.;FRO=20;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=13;FSRR=7;FWDB=0.0460612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.9761;QD=20.8672;RBI=0.0484286;REFB=-0.0260139;REVB=0.0149565;RO=20;SAF=8;SAR=13;SRF=13;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.231844;STB=0.630361;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.027083;OID=.;OPOS=56228104;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:20:20:21:21:0.512195:13:8:13:7:13:8:13:7
chr19	56241265	.	A	G	1042.87	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0182238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=182.184;QD=59.5926;RBI=0.0316316;REFB=0;REVB=0.0258544;RO=0;SAF=41;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.09174e-05;OID=.;OPOS=56241265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:70:0:0:69:70:1:28:41:0:0:28:42:0:0
chr19	56274424	.	C	A	40.18	PASS	AF=0.0916667;AO=11;DP=120;FAO=11;FDP=120;FR=.;FRO=109;FSAF=3;FSAR=8;FSRF=58;FSRR=51;FWDB=0.0182844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.254;QD=1.33945;RBI=0.018374;REFB=-0.0052511;REVB=-0.00181246;RO=108;SAF=3;SAR=8;SRF=58;SRR=50;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.304252;STB=0.733413;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.0223302;OID=.;OPOS=56274424;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:120:120:108:109:11:11:0.0916667:8:3:58:50:8:3:58:51
chr19	56283289	.	A	G	66.78	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=4;FWDB=-4.18943e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1696;QD=12.7199;RBI=0.0514035;REFB=-0.046942;REVB=-0.0514035;RO=12;SAF=6;SAR=3;SRF=8;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0530117;OID=.;OPOS=56283289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:3:6:8:4:3:6:8:4
chr19	56284090	.	G	A	332.28	PASS	AF=0.866667;AO=26;DP=31;FAO=26;FDP=30;FR=.;FRO=4;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0189038;FXX=0.0322477;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.49;QD=44.3042;RBI=0.0915158;REFB=-0.00438373;REVB=0.0895421;RO=4;SAF=16;SAR=10;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.102941;STB=0.555514;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.00135546;OID=.;OPOS=56284090;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:31:30:4:4:26:26:0.866667:10:16:4:0:10:16:4:0
chr19	56307553	.	G	A	291.29	PASS	AF=0.4125;AO=33;DP=80;FAO=33;FDP=80;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=23;FSRR=24;FWDB=-0.0779721;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.6195;QD=14.5647;RBI=0.0785534;REFB=-0.0429514;REVB=-0.00953881;RO=46;SAF=16;SAR=17;SRF=23;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.015575;STB=0.502652;STBP=0.963;TYPE=snp;VARB=0.0637891;OID=.;OPOS=56307553;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:46:47:33:33:0.4125:17:16:23:23:17:16:23:24
chr19	56307583	.	A	G	767.33	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0475971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.0753;QD=56.8391;RBI=0.0533438;REFB=0;REVB=0.0240848;RO=0;SAF=30;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000322758;OID=.;OPOS=56307583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:54:0:0:53:54:1:23:30:0:0:24:30:0:0
chr19	56321413	.	GC	G,GA	764.69	PASS	AF=0.0185185,0.981481;AO=9,45;DP=54;FAO=1,53;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=0,25;FSAR=1,28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010671,0.0142232;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=114.505,134.527;QD=56.6439;RBI=0.0152855,0.111764;REFB=0,0;REVB=0.0109443,0.110855;RO=0;SAF=0,25;SAR=9,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,5.09779e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.0905032,0.00503944;OID=.,.;OPOS=56321414,56321414;OREF=C,C;OALT=-,A;OMAPALT=G,GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.0185185,0.981481:9,45:54:1,53:54:0:0,25:1,28:0:0:4:0:0,25:9,20:0:0
chr19	56321517	.	T	C	225.78	PASS	AF=0.5;AO=20;DP=42;FAO=22;FDP=44;FR=.;FRO=22;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=0.00526035;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=255.308;QD=20.5251;RBI=0.0461739;REFB=-0.0318255;REVB=-0.0458733;RO=22;SAF=10;SAR=10;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.297604;STB=0.658961;STBP=0.058;TYPE=snp;VARB=0.0257343;OID=.;OPOS=56321517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:44:22:22:20:22:0.5:10:10:4:18:11:11:4:18
chr19	56329447	.	G	A	143.46	PASS	AF=0.390244;AO=16;DP=41;FAO=16;FDP=41;FR=.;FRO=25;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=10;FWDB=-0.0236619;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4218;QD=13.9964;RBI=0.0239087;REFB=0.00650304;REVB=-0.00342684;RO=25;SAF=7;SAR=9;SRF=15;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.168771;STB=0.598066;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=-0.0189408;OID=.;OPOS=56329447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:25:25:16:16:0.390244:9:7:15:10:9:7:15:10
chr19	56369189	.	G	A	768.3	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0255318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.641;QD=56.9108;RBI=0.0257834;REFB=0;REVB=0.00359298;RO=0;SAF=33;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.88914e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.16267e-05;OID=.;OPOS=56369189;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:20:33:0:0:21:33:0:0
chr19	56369215	.	C	T	712.43	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0188785;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.156;QD=63.3267;RBI=0.0510424;REFB=0;REVB=0.0474229;RO=0;SAF=28;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000140519;OID=.;OPOS=56369215;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:17:28:0:0:17:28:0:0
chr19	56369593	.	T	C	766.45	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00867845;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.116;QD=63.8712;RBI=0.0258819;REFB=0;REVB=0.0243836;RO=0;SAF=17;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.3526e-05;OID=.;OPOS=56369593;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:31:17:0:0:31:17:0:0
chr19	56370166	.	C	T	588.54	PASS	AF=0.564356;AO=57;DP=101;FAO=57;FDP=101;FR=.;FRO=44;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=20;FSRR=24;FWDB=-0.00600308;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.534;QD=23.3085;RBI=0.0110666;REFB=-0.0106601;REVB=-0.00929694;RO=44;SAF=28;SAR=29;SRF=20;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0292233;STB=0.515989;STBP=0.723;TYPE=snp;VARB=0.00755905;OID=.;OPOS=56370166;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:101:44:44:57:57:0.564356:29:28:20:24:29:28:20:24
chr19	56410222	.	C	T	189.87	PASS	AF=0.358209;AO=24;DP=67;FAO=24;FDP=67;FR=.;FRO=43;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=24;FSRR=19;FWDB=0.00914629;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.693;QD=11.3352;RBI=0.0280362;REFB=-0.00747176;REVB=-0.0265024;RO=43;SAF=13;SAR=11;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018387;STB=0.510656;STBP=0.922;TYPE=snp;VARB=0.0194227;OID=.;OPOS=56410222;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:43:43:24:24:0.358209:11:13:24:19:11:13:24:19
chr19	56423668	.	G	A	175.68	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.024991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.996;QD=46.847;RBI=0.0270841;REFB=0;REVB=-0.0104402;RO=0;SAF=5;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017918;OID=.;OPOS=56423668;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:9:5:0:0:10:5:0:0
chr19	56423692	.	C	T	142.9	PASS	AF=1;AO=12;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.239944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=188.06;QD=40.8291;RBI=0.240326;REFB=0;REVB=-0.0135502;RO=2;SAF=2;SAR=10;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.294912;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00299588;OID=.;OPOS=56423692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:2:0:12:14:1:10:2:2:0:10:4:0:0
chr19	56423728	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000772722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.003;QD=50.4133;RBI=0.00532522;REFB=0;REVB=-0.00526886;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.10945e-05;OID=.;OPOS=56423728;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr19	56423893	.	G	A	698.99	PASS	AF=0.980392;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=51;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.023972;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.751;QD=54.823;RBI=0.0368007;REFB=-0.0908605;REVB=-0.027922;RO=1;SAF=28;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0165169;STB=0.508768;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.00192621;OID=.;OPOS=56423893;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:51:51:1:1:50:50:0.980392:22:28:1:0:22:28:1:0
chr19	56424443	.	T	C	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358047;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=284.568;QD=44.6898;RBI=0.0375429;REFB=0;REVB=0.0112911;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285546;OID=.;OPOS=56424443;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:3:10:0:0:3:10:0:0
chr19	56424532	.	G	A	576.65	PASS	AF=0.909091;AO=40;DP=44;FAO=40;FDP=44;FR=.;FRO=4;FSAF=13;FSAR=27;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0444889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.9926;QD=52.4224;RBI=0.0457563;REFB=-0.0767545;REVB=0.0106948;RO=4;SAF=13;SAR=27;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124383;STB=0.566632;STBP=0.014;TYPE=snp;VARB=0.0175605;OID=.;OPOS=56424532;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:44:44:4:4:40:40:0.909091:27:13:4:0:27:13:4:0
chr19	56443601	.	T	C	95.76	PASS	AF=0.444444;AO=11;DP=26;FAO=12;FDP=27;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=0.000881423;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.914;QD=14.1862;RBI=0.0282739;REFB=-0.0392261;REVB=0.0282602;RO=15;SAF=8;SAR=3;SRF=7;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272488;STB=0.615187;STBP=0.297;TYPE=snp;VARB=0.0253617;OID=.;OPOS=56443601;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:26:27:15:15:11:12:0.444444:3:8:7:8:4:8:7:8
chr19	56459342	.	C	T	619.78	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0385798;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.287;QD=59.0269;RBI=0.0592238;REFB=-0.13972;REVB=0.044934;RO=0;SAF=17;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.2194e-08;STB=0.510199;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.0012806;OID=.;OPOS=56459342;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:0:1:41:41:0.97619:24:17:0:0:24:17:0:1
chr19	56459614	.	G	C	463.94	PASS	AF=0.970588;AO=32;DP=33;FAO=33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.110732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1857;QD=54.5813;RBI=0.123827;REFB=-0.130058;REVB=0.055422;RO=1;SAF=20;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0373149;STB=0.519988;STBP=0.276;TYPE=snp;VARB=0.0107832;OID=.;OPOS=56459614;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:34:1:1:32:33:0.970588:12:20:0:1:12:21:0:1
chr19	56473460	.	T	C	2184.94	PASS	AF=0.955414;AO=150;DP=157;FAO=150;FDP=157;FR=.;FRO=7;FSAF=90;FSAR=60;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.00458605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=300.315;QD=55.6673;RBI=0.0513324;REFB=0.0395475;REVB=0.0511271;RO=7;SAF=90;SAR=60;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0399717;STB=0.52105;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=-0.000518762;OID=.;OPOS=56473460;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:157:157:7:7:150:150:0.955414:60:90:1:6:60:90:1:6
chr19	56477687	.	A	G	753.47	PASS	AF=0.979592;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=49;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0279106;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=64.6218;QD=61.5074;RBI=0.0286286;REFB=0.0228607;REVB=0.00637125;RO=1;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0200087;STB=0.510634;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=-0.00018461;OID=.;OPOS=56477687;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:48:49:1:1:47:48:0.979592:23:24:0:1:23:25:0:1
chr19	56490778	.	C	T	638.52	PASS	AF=0.976744;AO=42;DP=43;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0129629;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.7725;QD=59.3969;RBI=0.0646842;REFB=-0.0273767;REVB=-0.063372;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.517233;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.0070709;OID=.;OPOS=56490778;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:43:43:0:1:42:42:0.976744:14:28:0:0:14:28:0:1
chr19	56499279	.	G	C	557.03	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0330406;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=234.151;QD=60.2196;RBI=0.0330437;REFB=0;REVB=-0.000451863;RO=0;SAF=9;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.80474e-05;OID=.;OPOS=56499279;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:28:9:0:0:28:9:0:0
chr19	56511082	.	C	G	1057.95	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000292853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.809;QD=59.6028;RBI=0.0131794;REFB=0;REVB=0.0131761;RO=0;SAF=31;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.90682e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.17239e-05;OID=.;OPOS=56511082;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:65:71:0:0:65:71:1:34:31:0:0:38:33:0:0
chr19	56549510	.	T	C	796.31	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000631998;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.087;QD=63.7047;RBI=0.03898;REFB=0;REVB=-0.0389749;RO=0;SAF=34;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000147672;OID=.;OPOS=56549510;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:50:0:0:48:50:1:14:34:0:0:14:36:0:0
chr19	56549532	.	A	G	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.497;QD=59.4357;RBI=0.039689;REFB=0;REVB=0.0244537;RO=0;SAF=23;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.55477e-05;OID=.;OPOS=56549532;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:12:23:0:0:12:23:0:0
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chr19	56572832	.	G	A	237.21	PASS	AF=0.371795;AO=27;DP=76;FAO=29;FDP=78;FR=.;FRO=49;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=38;FWDB=0.0172954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.497;QD=12.1645;RBI=0.0178371;REFB=-0.00449689;REVB=-0.00436245;RO=49;SAF=19;SAR=8;SRF=11;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.499698;STB=0.770958;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0122913;OID=.;OPOS=56572832;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:78:49:49:27:29:0.371795:8:19:11:38:9:20:11:38
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chr19	56694505	.	C	T	427.04	PASS	AF=0.46729;AO=44;DP=103;FAO=50;FDP=107;FR=.;FRO=57;FSAF=28;FSAR=22;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=0.00721664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.578;QD=15.9643;RBI=0.0133246;REFB=-0.0308747;REVB=-0.0112011;RO=50;SAF=28;SAR=16;SRF=32;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00375119;STB=0.510262;STBP=0.847;TYPE=snp;VARB=0.0398431;OID=.;OPOS=56694505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:107:50:57:44:50:0.46729:16:28:32:18:22:28:33:24
chr19	56702323	.	C	T	306.16	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=11;FSAR=23;FSRF=14;FSRR=32;FWDB=-0.0122949;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.859;QD=15.3079;RBI=0.0156656;REFB=-0.0155017;REVB=0.00970807;RO=45;SAF=11;SAR=23;SRF=14;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0144012;STB=0.512704;STBP=0.862;TYPE=snp;VARB=0.0165454;OID=.;OPOS=56702323;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:45:46:34:34:0.425:23:11:14:31:23:11:14:32
chr19	56717325	.	T	G	211.87	PASS	AF=0.45098;AO=23;DP=51;FAO=23;FDP=51;FR=.;FRO=28;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=20;FSRR=8;FWDB=0.0123449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=226.146;QD=16.6175;RBI=0.0420474;REFB=-0.000704986;REVB=0.0401943;RO=28;SAF=15;SAR=8;SRF=20;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.067977;STB=0.538429;STBP=0.666;TYPE=snp;VARB=0.00100835;OID=.;OPOS=56717325;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:28:28:23:23:0.45098:8:15:20:8:8:15:20:8
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chr19	56953863	.	T	C	1090.52	PASS	AF=1;AO=72;DP=72;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6499;QD=59.7544;RBI=0.0610862;REFB=0;REVB=0.0597549;RO=0;SAF=31;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000528616;OID=.;OPOS=56953863;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:73:0:0:72:73:1:41:31:0:0:41:32:0:0
chr19	57027673	.	A	G	417.15	PASS	AF=0.733333;AO=32;DP=44;FAO=33;FDP=45;FR=.;FRO=12;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.0149516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5207;QD=37.0796;RBI=0.0643511;REFB=-0.000719218;REVB=0.0625901;RO=12;SAF=20;SAR=12;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0656249;STB=0.52923;STBP=0.566;TYPE=snp;VARB=0.000441446;OID=.;OPOS=57027673;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:44:45:12:12:32:33:0.733333:12:20:6:6:13:20:6:6
chr19	57036012	.	G	T	332.65	PASS	AF=0.58;AO=29;DP=50;FAO=29;FDP=50;FR=.;FRO=21;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.0158238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.3284;QD=26.6122;RBI=0.0408098;REFB=0.0163405;REVB=-0.0376171;RO=21;SAF=20;SAR=9;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138104;STB=0.576576;STBP=0.227;TYPE=snp;VARB=-0.0170782;OID=.;OPOS=57036012;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:50:21:21:29:29:0.58:9:20:11:10:9:20:11:10
chr19	57036653	.	G	A	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=16;FSRR=3;FWDB=-0.00279523;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=197.302;QD=15.6999;RBI=0.0114424;REFB=-0.0124222;REVB=-0.0110957;RO=19;SAF=9;SAR=6;SRF=16;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263521;STB=0.649179;STBP=0.191;TYPE=snp;VARB=0.0309714;OID=.;OPOS=57036653;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:6:9:16:3:6:9:16:3
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chr19	57062073	.	T	C	754.62	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00697509;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=167.881;QD=54.8811;RBI=0.0131198;REFB=0.0665253;REVB=-0.011112;RO=0;SAF=37;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.08382e-08;STB=0.506664;STBP=0.626;TYPE=snp;VARB=-6.78481e-06;OID=.;OPOS=57062073;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:55:55:0:1:54:54:0.981818:17:37:0:0:17:37:1:0
chr19	57065189	.	T	C	608.04	PASS	AF=0.613636;AO=54;DP=88;FAO=54;FDP=88;FR=.;FRO=34;FSAF=26;FSAR=28;FSRF=15;FSRR=19;FWDB=-0.0366635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=59.0557;QD=27.6382;RBI=0.0499233;REFB=0.0249061;REVB=0.0338839;RO=34;SAF=26;SAR=28;SRF=15;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.028675;STB=0.515606;STBP=0.717;TYPE=snp;VARB=-0.0209962;OID=.;OPOS=57065189;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:34:34:54:54:0.613636:28:26:15:19:28:26:15:19
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chr19	57176820	.	C	A	389.97	PASS	AF=0.44086;AO=40;DP=93;FAO=41;FDP=93;FR=.;FRO=52;FSAF=20;FSAR=21;FSRF=30;FSRR=22;FWDB=0.0161881;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.644;QD=16.7728;RBI=0.0205495;REFB=-0.00811691;REVB=0.012658;RO=50;SAF=19;SAR=21;SRF=29;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.103675;STB=0.549714;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0100728;OID=.;OPOS=57176820;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:50:52:40:41:0.44086:21:19:29:21:21:20:30:22
chr19	57176838	.	C	G	305.45	PASS	AF=0.425;AO=34;DP=80;FAO=34;FDP=80;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=28;FSRR=18;FWDB=0.0812072;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=171.889;QD=15.2724;RBI=0.0812254;REFB=0.0101142;REVB=0.00171941;RO=46;SAF=15;SAR=19;SRF=28;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169166;STB=0.595426;STBP=0.167;TYPE=snp;VARB=-0.00985144;OID=.;OPOS=57176838;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:46:46:34:34:0.425:19:15:28:18:19:15:28:18
chr19	57293394	.	A	G	521.02	PASS	AF=0.5;AO=50;DP=100;FAO=50;FDP=100;FR=.;FRO=50;FSAF=40;FSAR=10;FSRF=35;FSRR=15;FWDB=-0.066274;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.3249;QD=20.8407;RBI=0.0693173;REFB=-0.0137275;REVB=0.0203138;RO=49;SAF=40;SAR=10;SRF=34;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134123;STB=0.571398;STBP=0.234;TYPE=snp;VARB=0.0182789;OID=.;OPOS=57293394;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:100:49:50:50:50:0.5:10:40:34:15:10:40:35:15
chr19	57293831	.	G	A	150.21	PASS	AF=0.357143;AO=20;DP=56;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=-0.0300813;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.2781;QD=10.729;RBI=0.0467705;REFB=-8.03558e-05;REVB=-0.0358134;RO=36;SAF=8;SAR=12;SRF=14;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0127921;STB=0.507455;STBP=0.95;TYPE=snp;VARB=-0.000612217;OID=.;OPOS=57293831;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:56:36:36:20:20:0.357143:12:8:14:22:12:8:14:22
chr19	57325083	.	C	T	176.38	PASS	AF=0.708333;AO=17;DP=24;FAO=17;FDP=24;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=-0.0246295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.076;QD=29.3973;RBI=0.042578;REFB=-0.0222748;REVB=-0.0347315;RO=7;SAF=11;SAR=6;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.194433;STB=0.607911;STBP=0.123;TYPE=snp;VARB=0.00374863;OID=.;OPOS=57325083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:41:24:24:7:7:17:17:0.708333:6:11:2:5:6:11:2:5
chr19	57330037	.	C	T	437.89	PASS	AF=0.478261;AO=44;DP=92;FAO=44;FDP=92;FR=.;FRO=48;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=14;FSRR=34;FWDB=0.0438607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3991;QD=19.0385;RBI=0.0446132;REFB=-0.00166184;REVB=-0.00815971;RO=48;SAF=19;SAR=25;SRF=14;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137208;STB=0.57602;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00232834;OID=.;OPOS=57330037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:48:48:44:44:0.478261:25:19:14:34:25:19:14:34
chr19	57433619	.	C	T	689.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0213693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.631;QD=62.6699;RBI=0.0218285;REFB=0;REVB=-0.00445354;RO=0;SAF=28;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.9044e-05;OID=.;OPOS=57433619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:16:28:0:0:16:28:0:0
chr19	57433712	.	T	C	90.76	PASS	AF=0.266667;AO=12;DP=45;FAO=12;FDP=45;FR=.;FRO=33;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.0246957;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.834;QD=8.06763;RBI=0.0254728;REFB=-0.0157132;REVB=0.00624407;RO=33;SAF=6;SAR=6;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162974;STB=0.59984;STBP=0.449;TYPE=snp;VARB=0.0277074;OID=.;OPOS=57433712;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:90:45:45:33:33:12:12:0.266667:6:6:21:12:6:6:21:12
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chr19	57641146	.	A	G	123.98	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=6;FWDB=0.00154087;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=198.282;QD=17.1002;RBI=0.0104055;REFB=-0.00998368;REVB=0.0102908;RO=15;SAF=2;SAR=12;SRF=9;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.488251;STB=0.785249;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.0128585;OID=.;OPOS=57641146;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:12:2:9:6:12:2:9:6
chr19	57641799	.	G	A	47.89	PASS	AF=0.4375;AO=6;DP=15;FAO=7;FDP=16;FR=.;FRO=9;FSAF=1;FSAR=6;FSRF=5;FSRR=4;FWDB=0.0415648;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.631;QD=11.9735;RBI=0.0473495;REFB=-0.0123853;REVB=-0.0226792;RO=9;SAF=0;SAR=6;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.760258;STB=0.781686;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.019731;OID=.;OPOS=57641799;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:15:16:9:9:6:7:0.4375:6:0:5:4:6:1:5:4
chr19	57642016	.	C	T	36.24	PASS	AF=0.12069;AO=7;DP=58;FAO=7;FDP=58;FR=.;FRO=51;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=21;FSRR=30;FWDB=-0.0282536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.852;QD=2.49949;RBI=0.0323287;REFB=-0.00271115;REVB=-0.0157124;RO=50;SAF=6;SAR=1;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.504285;STB=0.87223;STBP=0.064;TYPE=snp;VARB=0.0437005;OID=.;OPOS=57642016;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:58:58:50:51:7:7:0.12069:1:6:21:29:1:6:21:30
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chr19	57773447	.	T	G	36.38	PASS	AF=0.285714;AO=6;DP=21;FAO=6;FDP=21;FR=.;FRO=15;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0308521;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=253.45;QD=6.92898;RBI=0.0379854;REFB=-0.00511805;REVB=-0.0221594;RO=15;SAF=2;SAR=4;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225087;STB=0.644671;STBP=0.408;TYPE=snp;VARB=0.0136262;OID=.;OPOS=57773447;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:21:21:15:15:6:6:0.285714:4:2:8:7:4:2:8:7
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chr19	57839690	.	A	T	293.68	PASS	AF=0.525424;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=59;FR=.;FRO=28;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.00322186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.974;QD=19.9103;RBI=0.0095749;REFB=-0.0187843;REVB=0.00901656;RO=27;SAF=18;SAR=13;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0529193;STB=0.538777;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.0260126;OID=.;OPOS=57839690;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:59:27:28:31:31:0.525424:13:18:14:13:13:18:14:14
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chr19	57909872	.	G	A	1208.81	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0390202;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.2576;QD=61.2053;RBI=0.0421488;REFB=0;REVB=-0.0159356;RO=0;SAF=29;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.6597e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000150381;OID=.;OPOS=57909872;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:0:0:78:79:1:49:29:0:0:50:29:0:0
chr19	57955244	.	A	G	229.58	PASS	AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=14;FWDB=0.0351006;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.972;QD=22.3976;RBI=0.0386594;REFB=-0.0156495;REVB=0.0162017;RO=19;SAF=14;SAR=8;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.303421;STB=0.669415;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.00772828;OID=.;OPOS=57955244;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:8:14:5:14:8:14:5:14
chr19	57956828	.	T	G	253.05	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.0189501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9083;QD=19.0979;RBI=0.0308946;REFB=-0.0246736;REVB=0.0244001;RO=25;SAF=12;SAR=15;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0389473;STB=0.51063;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0309545;OID=.;OPOS=57956828;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:26:27:27:0.509434:15:12:10:15:15:12:11:15
chr19	57967049	.	G	T	1357.2	PASS	AF=0.967391;AO=89;DP=92;FAO=89;FDP=92;FR=.;FRO=3;FSAF=50;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.016431;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.6012;QD=59.0088;RBI=0.0191745;REFB=-0.123324;REVB=0.00988339;RO=1;SAF=50;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0119967;STB=0.50755;STBP=0.456;TYPE=snp;VARB=0.00534804;OID=.;OPOS=57967049;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:92:92:1:3:89:89:0.967391:39:50:0:1:39:50:1:2
chr19	57967133	.	G	A	1065.95	PASS	AF=0.986301;AO=72;DP=73;FAO=72;FDP=73;FR=.;FRO=1;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00795386;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4948;QD=58.4083;RBI=0.0112303;REFB=-0.00740993;REVB=0.00792824;RO=1;SAF=43;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0108729;STB=0.505746;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000269772;OID=.;OPOS=57967133;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:73:73:1:1:72:72:0.986301:29:43:1:0:29:43:1:0
chr19	57984426	.	C	A	747.07	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0218284;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.542;QD=63.5804;RBI=0.0244403;REFB=0;REVB=0.0109931;RO=0;SAF=19;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.70679e-05;OID=.;OPOS=57984426;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:28:19:0:0:28:19:0:0
chr19	57984918	.	A	G	791.78	PASS	AF=0.966102;AO=56;DP=58;FAO=57;FDP=59;FR=.;FRO=2;FSAF=24;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00502124;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=208.806;QD=53.6799;RBI=0.0400679;REFB=-0.123973;REVB=0.039752;RO=2;SAF=24;SAR=32;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00473428;STB=0.502741;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.000820033;OID=.;OPOS=57984918;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:58:59:2:2:56:57:0.966102:32:24:1:1:33:24:1:1
chr19	57985460	.	T	A	1266.8	PASS	AF=0.988095;AO=83;DP=84;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=50;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0259605;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1615;QD=60.3238;RBI=0.0656849;REFB=-0.120489;REVB=-0.060337;RO=1;SAF=50;SAR=33;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00937926;STB=0.504949;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00114603;OID=.;OPOS=57985460;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:84:84:1:1:83:83:0.988095:33:50:1:0:33:50:1:0
chr19	57985566	.	G	C	1453.49	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00384965;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=275.548;QD=63.1954;RBI=0.0189651;REFB=0;REVB=0.0185703;RO=0;SAF=50;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.18317e-05;OID=.;OPOS=57985566;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:92:0:0:92:92:1:42:50:0:0:42:50:0:0
chr19	57987905	.	G	A	1508.12	PASS	AF=0.990291;AO=102;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=55;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0233324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=204.388;QD=58.5676;RBI=0.0317331;REFB=-0.104987;REVB=0.0215078;RO=0;SAF=55;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05013e-08;STB=0.505262;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.000361624;OID=.;OPOS=57987905;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:103:103:0:1:102:102:0.990291:47:55:0:0:47:55:0:1
chr19	57988666	.	A	AGCC	286.69	PASS	AF=0.92;AO=22;DP=30;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0495914;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=192.012;QD=45.8699;RBI=0.057141;REFB=-0.191393;REVB=0.0283864;RO=8;SAF=9;SAR=13;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224043;STB=0.545415;STBP=0.153;TYPE=ins;VARB=0.0199302;OID=.;OPOS=57988667;OREF=-;OALT=GCC;OMAPALT=AGCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.92:22:30:23:25:2:10:13:2:0:10:8:9:13:7:1
chr19	58001512	.	T	A	1098.22	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00382407;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=268.627;QD=60.1765;RBI=0.0323718;REFB=0;REVB=0.0321451;RO=0;SAF=39;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.44583e-05;OID=.;OPOS=58001512;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:73:0:0:70:73:1:31:39:0:0:33:40:0:0
chr19	58003488	.	A	G	1008.4	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00333835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.023;QD=59.3175;RBI=0.0542108;REFB=0;REVB=0.0541079;RO=0;SAF=27;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.6787e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000289439;OID=.;OPOS=58003488;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:41:27:0:0:41:27:0:0
chr19	58003580	.	A	G	1884.91	PASS	AF=1;AO=120;DP=122;FAO=123;FDP=123;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00684068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.332;QD=61.2977;RBI=0.016024;REFB=0;REVB=0.0144905;RO=0;SAF=53;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.06382e-05;OID=.;OPOS=58003580;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:122:123:0:0:120:123:1:67:53:0:0:70:53:0:0
chr19	58003613	.	C	T	1559.33	PASS	AF=1;AO=100;DP=103;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=65;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0163122;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.6904;QD=59.4029;RBI=0.0242708;REFB=0;REVB=0.0179718;RO=0;SAF=35;SAR=65;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108218;OID=.;OPOS=58003613;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:103:105:0:0:100:105:1:65:35:0:0:65:40:0:0
chr19	58004346	.	G	C	786.9	PASS	AF=0.982456;AO=56;DP=57;FAO=56;FDP=57;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0596259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2494;QD=55.2211;RBI=0.0689171;REFB=0.0137014;REVB=0.034559;RO=1;SAF=35;SAR=21;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0219211;STB=0.511624;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.000339857;OID=.;OPOS=58004346;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:57:57:1:1:56:56:0.982456:21:35:0:1:21:35:0:1
chr19	58004931	.	A	G	62.21	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.117908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.2773;QD=35.5509;RBI=0.120187;REFB=0;REVB=0.0232984;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00683292;OID=.;OPOS=58004931;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr19	58011421	.	G	T	162.53	PASS	AF=0.882353;AO=15;DP=17;FAO=15;FDP=17;FR=.;FRO=2;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0506758;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.614;QD=38.2429;RBI=0.0634698;REFB=-0.0802846;REVB=0.038215;RO=1;SAF=4;SAR=11;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100822;STB=0.533934;STBP=0.564;TYPE=snp;VARB=0.00206016;OID=.;OPOS=58011421;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:17:17:1:2:15:15:0.882353:11:4:1:0:11:4:1:1
chr19	58038964	.	T	A	1604.65	PASS	AF=1;AO=100;DP=102;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0470195;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.6429;QD=59.4313;RBI=0.109313;REFB=0;REVB=0.0986834;RO=1;SAF=57;SAR=43;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00825052;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000855066;OID=.;OPOS=58038964;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:108:1:0:100:108:1:43:57:1:0:49:59:0:0
chr19	58058536	.	A	G	1587.75	PASS	AF=1;AO=99;DP=99;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0329044;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.2489;QD=64.1515;RBI=0.0426588;REFB=0;REVB=-0.0271491;RO=0;SAF=45;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000368602;OID=.;OPOS=58058536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:99:0:0:99:99:1:54:45:0:0:54:45:0:0
chr19	58058739	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0262898;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.149;QD=62.671;RBI=0.0720096;REFB=0;REVB=-0.067039;RO=0;SAF=29;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00021329;OID=.;OPOS=58058739;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:15:29:0:0:15:29:0:0
chr19	58352522	.	G	A	1517.83	PASS	AF=0.989691;AO=96;DP=98;FAO=96;FDP=97;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0307098;FXX=0.010203;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.947;QD=62.591;RBI=0.0522661;REFB=-0.0965271;REVB=0.0422925;RO=1;SAF=40;SAR=56;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00839387;STB=0.504424;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.00244715;OID=.;OPOS=58352522;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:98:97:1:1:96:96:0.989691:56:40:0:1:56:40:0:1
chr19	58352806	.	T	C	260.59	PASS	AF=0.571429;AO=24;DP=42;FAO=24;FDP=42;FR=.;FRO=18;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=10;FSRR=8;FWDB=0.00573507;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.374;QD=24.8184;RBI=0.0166049;REFB=-0.00557725;REVB=0.0155831;RO=18;SAF=11;SAR=13;SRF=10;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0749028;STB=0.541632;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0053342;OID=.;OPOS=58352806;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:18:18:24:24:0.571429:13:11:10:8:13:11:10:8
chr19	58374130	.	C	T	115.94	PASS	AF=0.35;AO=13;DP=39;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=10;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=3;FWDB=-0.0230233;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.449;QD=11.594;RBI=0.0273126;REFB=-0.0107605;REVB=0.0146936;RO=26;SAF=10;SAR=3;SRF=23;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.21079;STB=0.653289;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0246038;OID=.;OPOS=58374130;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:40:26:26:13:14:0.35:3:10:23:3:4:10:23:3
chr19	58385954	.	T	C	167.95	PASS	AF=0.432432;AO=9;DP=38;FAO=16;FDP=37;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=17;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=9;FWDB=-0.0343316;FXX=0.0263089;HRUN=8;LEN=1;MLLD=73.2913;QD=18.1567;RBI=0.148424;REFB=-0.0420255;REVB=0.144399;RO=11;SAF=6;SAR=3;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.202897;STB=0.581292;STBP=0.361;TYPE=snp;VARB=0.018946;OID=.;OPOS=58385954;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:37:11:17:9:16:0.432432:3:6:5:6:6:10:8:9
chr19	58420152	.	C	A	272.03	PASS	AF=0.363636;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=40;FWDB=0.00147346;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=183.851;QD=12.3648;RBI=0.0169736;REFB=-0.00958741;REVB=0.0169095;RO=56;SAF=19;SAR=13;SRF=16;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.331576;STB=0.688674;STBP=0.012;TYPE=snp;VARB=0.00784397;OID=.;OPOS=58420152;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:56:56:32:32:0.363636:13:19:16:40:13:19:16:40
chr19	58420162	.	T	C	270.08	PASS	AF=0.355556;AO=32;DP=89;FAO=32;FDP=90;FR=.;FRO=58;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=17;FSRR=41;FWDB=0.0189688;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.416;QD=12.0037;RBI=0.0203396;REFB=-0.00117408;REVB=0.00734056;RO=57;SAF=19;SAR=13;SRF=16;SRR=41;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338427;STB=0.686639;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00299108;OID=.;OPOS=58420162;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:90:57:58:32:32:0.355556:13:19:16:41:13:19:17:41
chr19	58420167	.	T	C	272.57	PASS	AF=0.367816;AO=32;DP=87;FAO=32;FDP=87;FR=.;FRO=55;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=39;FWDB=0.00211998;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.64;QD=12.5318;RBI=0.00759202;REFB=0.00555184;REVB=0.00729002;RO=55;SAF=19;SAR=13;SRF=16;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.32454;STB=0.684578;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=-0.00338125;OID=.;OPOS=58420167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:55:55:32:32:0.367816:13:19:16:39:13:19:16:39
chr19	58420699	.	C	A	229.97	PASS	AF=0.311828;AO=28;DP=92;FAO=29;FDP=93;FR=.;FRO=64;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=31;FSRR=33;FWDB=0.00999132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.424;QD=9.89101;RBI=0.0152412;REFB=-0.00983826;REVB=-0.0115095;RO=64;SAF=13;SAR=15;SRF=31;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0237905;STB=0.501113;STBP=0.981;TYPE=snp;VARB=0.0211883;OID=.;OPOS=58420699;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:64:64:28:29:0.311828:15:13:31:33:15:14:31:33
chr19	58439306	.	G	A	239.35	PASS	AF=0.5;AO=23;DP=46;FAO=23;FDP=46;FR=.;FRO=23;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=-0.0147962;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=125.086;QD=20.8129;RBI=0.0164217;REFB=-0.0321616;REVB=0.00712343;RO=21;SAF=14;SAR=9;SRF=12;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0330015;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0237461;OID=.;OPOS=58439306;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:21:23:23:23:0.5:9:14:12:9:9:14:14:9
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chr19	58455381	.	C	T	882.05	PASS	AF=1;AO=44;DP=58;FAO=61;FDP=61;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.119939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.045;QD=57.8394;RBI=0.121119;REFB=0;REVB=0.0168688;RO=0;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000530251;OID=.;OPOS=58455381;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:61:0:0:44:61:1:28:16:0:0:30:31:0:0
chr19	58718360	.	A	AG	420.57	PASS	AF=1;AO=34;DP=40;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132345;FXX=0.0540395;HRUN=1;LEN=1;MLLD=27.278;QD=48.0656;RBI=0.139592;REFB=0;REVB=-0.0443928;RO=4;SAF=13;SAR=21;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124026;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00440097;OID=.;OPOS=58718361;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:34:40:35:35:0:14:21:0:0:7:4:13:21:4:0
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chr19	58879965	.	A	G	41.01	PASS	AF=0.375;AO=5;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=1;FWDB=0.0109665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.38;QD=10.2519;RBI=0.106165;REFB=-0.0404417;REVB=0.105597;RO=7;SAF=5;SAR=0;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.683376;STB=0.583088;STBP=0.794;TYPE=snp;VARB=0.0517376;OID=.;OPOS=58879965;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:16:16:7:10:5:6:0.375:0:5:6:1:1:5:9:1
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chr19	59074653	.	T	C	37.77	PASS	AF=0.375;AO=6;DP=16;FAO=6;FDP=16;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=4;FWDB=-0.00479075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.789;QD=9.44202;RBI=0.0754471;REFB=-0.00954973;REVB=-0.0752948;RO=10;SAF=3;SAR=3;SRF=6;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100718;STB=0.562295;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.0344501;OID=.;OPOS=59074653;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:16:16:10:10:6:6:0.375:3:3:6:4:3:3:6:4
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chr20	746098	.	G	A	106.26	PASS	AF=0.361111;AO=13;DP=36;FAO=13;FDP=36;FR=.;FRO=23;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=4;FWDB=0.0102676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=42.4392;QD=11.8069;RBI=0.0587243;REFB=-0.0146129;REVB=0.0578197;RO=23;SAF=6;SAR=7;SRF=19;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.392058;STB=0.725854;STBP=0.071;TYPE=snp;VARB=0.0253068;OID=.;OPOS=746098;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:23:23:13:13:0.361111:7:6:19:4:7:6:19:4
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chr20	826492	.	G	C	369.88	PASS	AF=0.513514;AO=36;DP=72;FAO=38;FDP=74;FR=.;FRO=36;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=0.00380834;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.18;QD=19.9937;RBI=0.0364471;REFB=0.00593581;REVB=0.0362476;RO=36;SAF=15;SAR=21;SRF=18;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0758524;STB=0.552374;STBP=0.389;TYPE=snp;VARB=-0.00510227;OID=.;OPOS=826492;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:74:36:36:36:38:0.513514:21:15:18:18:23:15:18:18
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chr20	853433	.	GTT	GGT,GT,GTG	477.92	PASS	AF=0.114286,0.285714,0.6;AO=4,10,17;DP=35;FAO=4,10,21;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=0,8,18;FSAR=4,2,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0214507,-0.00764164,-0.0482762;FXX=0;HRUN=2,2,2;LEN=1,1,1;MLLD=10.2835,27.0302,29.2579;QD=54.6197;RBI=0.0218517,0.0702984,0.0486452;REFB=0,0,0;REVB=-0.0041671,-0.0698819,-0.00598048;RO=0;SAF=0,8,15;SAR=4,2,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,4.95117e-08;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,del,snp;VARB=0.00293035,0.000160931,0.0866705;OID=.,.,.;OPOS=853434,853434,853435;OREF=T,T,T;OALT=G,-,G;OMAPALT=GGT,GT,GTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0.114286,0.285714,0.6:4,10,17:35:4,10,21:35:0:0,8,18:4,2,3:0:0:18:0:0,8,15:4,2,2:0:0
chr20	854940	.	T	C	80.27	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=19;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=3;FWDB=-0.0330415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.8338;QD=16.8981;RBI=0.059878;REFB=0.00706898;REVB=0.0499363;RO=9;SAF=7;SAR=3;SRF=6;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0318185;STB=0.518481;STBP=0.966;TYPE=snp;VARB=-0.00501496;OID=.;OPOS=854940;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:19:19:9:9:10:10:0.526316:3:7:6:3:3:7:6:3
chr20	1099523	.	T	G	308.96	PASS	AF=0.561404;AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=11;FSRR=14;FWDB=0.00763333;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=232.124;QD=21.6814;RBI=0.00780889;REFB=-0.0270411;REVB=-0.00164653;RO=24;SAF=15;SAR=17;SRF=10;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407078;STB=0.512671;STBP=0.859;TYPE=snp;VARB=0.0214295;OID=.;OPOS=1099523;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:24:25:32:32:0.561404:17:15:10:14:17:15:11:14
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chr20	1221038	.	T	C	188.92	PASS	AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=0.0148401;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=238.34;QD=12.8079;RBI=0.0188207;REFB=-0.0124434;REVB=0.0115754;RO=36;SAF=12;SAR=11;SRF=23;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125616;STB=0.572004;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.019737;OID=.;OPOS=1221038;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:11:12:23:13:11:12:23:13
chr20	1285933	.	G	A	1419.46	PASS	AF=0.98913;AO=91;DP=92;FAO=91;FDP=92;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=40;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0160084;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=256.765;QD=61.7158;RBI=0.0342448;REFB=-0.103508;REVB=0.0302727;RO=0;SAF=51;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504853;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.000223552;OID=.;OPOS=1285933;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:92:92:0:1:91:91:0.98913:40:51:0:0:40:51:1:0
chr20	1291076	.	G	C	920.12	PASS	AF=1;AO=49;DP=62;FAO=63;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0763508;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.487;QD=58.4201;RBI=0.0801648;REFB=0;REVB=0.0244324;RO=0;SAF=16;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.95032e-05;OID=.;OPOS=1291076;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:63:0:0:49:63:1:33:16:0:0:33:30:0:0
chr20	1293008	.	C	T	1154.4	PASS	AF=0.91954;AO=80;DP=87;FAO=80;FDP=87;FR=.;FRO=7;FSAF=31;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=7;FWDB=0.0318514;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.098;QD=53.0761;RBI=0.0418238;REFB=-0.126034;REVB=0.0271058;RO=0;SAF=31;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.85194e-08;STB=0.533325;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.00169564;OID=.;OPOS=1293008;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:87:87:0:7:80:80:0.91954:49:31:0:0:49:31:0:7
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chr20	1457910	.	C	A	1845.0	PASS	AF=1;AO=120;DP=121;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=51;FSAR=70;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506502;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=133.405;QD=60.9918;RBI=0.0509117;REFB=0;REVB=-0.00515313;RO=0;SAF=50;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.00207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162569;OID=.;OPOS=1457910;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:121:121:0:0:120:121:1:70:50:0:0:70:51:0:0
chr20	1459060	.	T	G	1245.83	PASS	AF=1;AO=80;DP=80;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0226011;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.75;QD=61.5224;RBI=0.0328473;REFB=0;REVB=0.0238355;RO=0;SAF=46;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.3274e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.16169e-05;OID=.;OPOS=1459060;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:80:81:0:0:80:81:1:34:46:0:0:34:47:0:0
chr20	1532595	.	T	C	1608.24	PASS	AF=0.990826;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=47;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00557556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.386;QD=59.018;RBI=0.018179;REFB=-0.0239591;REVB=0.0173028;RO=0;SAF=61;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.504064;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000487405;OID=.;OPOS=1532595;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:109:0:1:108:108:0.990826:47:61:0:0:47:61:1:0
chr20	1546911	.	C	G	689.35	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00666852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.876;QD=62.668;RBI=0.031585;REFB=0;REVB=0.030873;RO=0;SAF=30;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000130074;OID=.;OPOS=1546911;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:13:30:0:0:14:30:0:0
chr20	1551485	.	C	T	608.04	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8534;QD=60.804;RBI=0.0371658;REFB=0;REVB=-0.024848;RO=0;SAF=26;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93291e-05;OID=.;OPOS=1551485;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:14:26:0:0:14:26:0:0
chr20	1552430	.	T	C	3870.3	PASS	AF=0.984556;AO=247;DP=250;FAO=255;FDP=259;FR=.;FRO=4;FSAF=129;FSAR=126;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0247828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.601;QD=59.773;RBI=0.0321764;REFB=-0.0805321;REVB=0.0205216;RO=1;SAF=126;SAR=121;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00392311;STB=0.503771;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.000356983;OID=.;OPOS=1552430;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:250:259:1:4:247:255:0.984556:121:126:0:1:126:129:3:1
chr20	1559101	.	T	G	4945.87	PASS	AF=1;AO=315;DP=316;FAO=317;FDP=317;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=172;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00474597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.093;QD=62.4084;RBI=0.0280784;REFB=-0.0531051;REVB=0.0276744;RO=0;SAF=143;SAR=172;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205611;OID=.;OPOS=1559101;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:24:316:317:0:0:315:317:1:172:143:0:0:172:145:0:0
chr20	1592265	.	A	G	88.2	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0013104;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9349;QD=39.1983;RBI=0.0139624;REFB=0;REVB=-0.0139008;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000904765;OID=.;OPOS=1592265;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr20	1592284	.	G	A	74.6	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0363853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.644;QD=37.2993;RBI=0.0623215;REFB=0;REVB=0.0505973;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000347495;OID=.;OPOS=1592284;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:8:0:0:7:8:1:3:4:0:0:4:4:0:0
chr20	1592312	.	T	C	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00850446;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.288;QD=35.5759;RBI=0.0394794;REFB=0;REVB=0.0385526;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000743953;OID=.;OPOS=1592312;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:4:3:0:0:4:3:0:0
chr20	1610894	.	G	A	340.47	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0392651;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.352;QD=54.4754;RBI=0.0411174;REFB=0;REVB=0.0122021;RO=0;SAF=11;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111754;OID=.;OPOS=1610894;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:25:0:0:23:25:1:12:11:0:0:12:13:0:0
chr20	1610939	.	G	A	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00648782;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.532;QD=45.8068;RBI=0.0196212;REFB=0;REVB=0.0185176;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00017402;OID=.;OPOS=1610939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chr20	1615959	.	T	C	1265.98	PASS	AF=1;AO=82;DP=84;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=44;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322172;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.336;QD=61.0112;RBI=0.034556;REFB=0;REVB=0.0124968;RO=0;SAF=44;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.11453e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.06375e-05;OID=.;OPOS=1615959;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:84:83:0:0:82:83:1:38:44:0:0:39:44:0:0
chr20	1616137	.	G	A	2197.29	PASS	AF=1;AO=139;DP=139;FAO=139;FDP=139;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0362495;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.5583;QD=63.2313;RBI=0.0544917;REFB=0;REVB=-0.0406856;RO=0;SAF=78;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.40132e-05;OID=.;OPOS=1616137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:139:139:0:0:139:139:1:61:78:0:0:61:78:0:0
chr20	1616206	.	A	G	1568.02	PASS	AF=1;AO=102;DP=107;FAO=105;FDP=105;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0267071;FXX=0.0277752;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.363;QD=59.734;RBI=0.0302711;REFB=0;REVB=-0.0142502;RO=0;SAF=47;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.05013e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142793;OID=.;OPOS=1616206;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:107:105:0:0:102:105:1:55:47:0:0:55:50:0:0
chr20	1616892	.	A	G	2944.92	PASS	AF=1;AO=185;DP=187;FAO=186;FDP=186;FR=.;FRO=0;FSAF=104;FSAR=82;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155956;FXX=0.00534731;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.639;QD=63.3317;RBI=0.0180279;REFB=0;REVB=-0.00904327;RO=0;SAF=104;SAR=81;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.54547e-05;OID=.;OPOS=1616892;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:16:187:186:0:0:185:186:1:81:104:0:0:82:104:0:0
chr20	1895984	.	C	A	76.09	PASS	AF=0.0995475;AO=22;DP=221;FAO=22;FDP=221;FR=.;FRO=199;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=99;FSRR=100;FWDB=-0.0303897;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=166.915;QD=1.37726;RBI=0.03039;REFB=-0.00281465;REVB=-0.00013275;RO=199;SAF=12;SAR=10;SRF=99;SRR=100;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.057842;STB=0.543171;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.0315795;OID=.;OPOS=1895984;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:221:221:199:199:22:22:0.0995475:10:12:99:100:10:12:99:100
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chr20	1896100	.	C	T	284.63	PASS	AF=0.362637;AO=33;DP=92;FAO=33;FDP=91;FR=.;FRO=58;FSAF=16;FSAR=17;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=-0.0414348;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=101.262;QD=12.5112;RBI=0.0415694;REFB=-0.0350903;REVB=-0.00334295;RO=58;SAF=16;SAR=17;SRF=35;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131306;STB=0.57527;STBP=0.288;TYPE=snp;VARB=0.0569562;OID=.;OPOS=1896100;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:58:58:33:33:0.362637:17:16:35:23:17:16:35:23
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chr20	2082732	.	C	G	145.22	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0263273;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=96.2294;QD=44.6816;RBI=0.0304842;REFB=0;REVB=-0.0153675;RO=0;SAF=3;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000727924;OID=.;OPOS=2082732;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:10:3:0:0:10:3:0:0
chr20	2127684	.	C	T	2431.41	PASS	AF=1;AO=158;DP=159;FAO=159;FDP=159;FR=.;FRO=0;FSAF=87;FSAR=72;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00679237;FXX=0.00624961;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.8772;QD=61.1675;RBI=0.0241146;REFB=0;REVB=0.0231383;RO=0;SAF=86;SAR=72;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.4078e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000224812;OID=.;OPOS=2127684;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:159:159:0:0:158:159:1:72:86:0:0:72:87:0:0
chr20	2127930	.	C	T	489.99	PASS	AF=0.971429;AO=33;DP=34;FAO=34;FDP=35;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.095911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1059;QD=55.9982;RBI=0.137257;REFB=-0.115896;REVB=0.0981869;RO=1;SAF=9;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0490904;STB=0.523795;STBP=0.179;TYPE=snp;VARB=0.0112085;OID=.;OPOS=2127930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:34:35:1:1:33:34:0.971429:24:9:1:0:24:10:1:0
chr20	2290333	.	C	A	667.7	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0729305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.599;QD=60.6999;RBI=0.0867959;REFB=0;REVB=0.0470603;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00425402;OID=.;OPOS=2290333;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:44:0:0:41:44:1:19:22:0:0:20:24:0:0
chr20	2321105	.	G	C	2244.56	PASS	AF=0.966667;AO=145;DP=150;FAO=145;FDP=150;FR=.;FRO=5;FSAF=75;FSAR=70;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.00236107;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=309.806;QD=59.8549;RBI=0.00831323;REFB=-0.136095;REVB=-0.00797089;RO=2;SAF=75;SAR=70;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000446584;STB=0.503911;STBP=0.572;TYPE=snp;VARB=0.000235261;OID=.;OPOS=2321105;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:150:150:2:5:145:145:0.966667:70:75:1:1:70:75:2:3
chr20	2375262	.	A	G	1767.31	PASS	AF=1;AO=115;DP=115;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0240631;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.973;QD=60.9416;RBI=0.0247728;REFB=0;REVB=-0.00588723;RO=0;SAF=61;SAR=54;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18616e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12947e-05;OID=.;OPOS=2375262;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:115:116:0:0:115:116:1:54:61:0:0:54:62:0:0
chr20	2539387	.	G	A	644.41	PASS	AF=1;AO=25;DP=40;FAO=41;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=16;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.072143;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.4471;QD=62.8696;RBI=0.235006;REFB=0;REVB=0.223658;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00452679;OID=.;OPOS=2539387;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:41:0:0:25:41:1:9:16:0:0:25:16:0:0
chr20	2559795	.	T	C	144.02	PASS	AF=0.421053;AO=16;DP=38;FAO=16;FDP=38;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=-0.00161506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.4271;QD=15.16;RBI=0.0469437;REFB=0.0192465;REVB=0.0469159;RO=22;SAF=9;SAR=7;SRF=13;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0290181;STB=0.516758;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=-0.00836641;OID=.;OPOS=2559795;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:22:22:16:16:0.421053:7:9:13:9:7:9:13:9
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chr20	4053254	.	A	G	2219.6	PASS	AF=0.992958;AO=141;DP=142;FAO=141;FDP=142;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=74;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.024097;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=300.151;QD=62.5239;RBI=0.0267371;REFB=-0.0716879;REVB=0.0115849;RO=1;SAF=67;SAR=74;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00704406;STB=0.503703;STBP=0.296;TYPE=snp;VARB=0.000168257;OID=.;OPOS=4053254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:142:142:1:1:141:141:0.992958:74:67:1:0:74:67:1:0
chr20	4124037	.	TACACACACACACACAC	T,TACACACACACAC,TACACACACACACAC	247.58	PASS	AF=0.5,0.1,0.4;AO=8,3,5;DP=23;FAO=10,2,8;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=8,2,4;FSAR=2,0,4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00097529,-0.0263683,0.00998393;FXX=0.130378;HRUN=1,1,1;LEN=16,4,2;MLLD=594.374,51.0984,43.0359;QD=49.5157;RBI=0.0105234,0.193527,0.078724;REFB=0,0,0;REVB=-0.0104782,-0.191723,-0.0780883;RO=0;SAF=6,2,3;SAR=2,1,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=5.58669e-08,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,del;VARB=0.00170438,0.0576049,0.0306068;OID=.,.,.;OPOS=4124038,4124038,4124038;OREF=ACACACACACACACAC,ACAC,AC;OALT=-,-,-;OMAPALT=T,TACACACACACAC,TACACACACACACAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.5,0.1,0.4:8,3,5:23:10,2,8:20:0:8,2,4:2,0,4:0:0:63:0:6,2,3:2,1,2:0:0
chr20	4163302	.	A	G	116.79	PASS	AF=0.35;AO=14;DP=40;FAO=14;FDP=40;FR=.;FRO=26;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=-0.0165869;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.507;QD=11.679;RBI=0.0200578;REFB=-0.0490057;REVB=-0.0112778;RO=26;SAF=12;SAR=2;SRF=21;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0999271;STB=0.559907;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0694871;OID=.;OPOS=4163302;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:26:26:14:14:0.35:2:12:21:5:2:12:21:5
chr20	4164283	.	A	G	885.09	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0336234;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.33;QD=58.0389;RBI=0.0434742;REFB=0;REVB=0.0275585;RO=0;SAF=30;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000142901;OID=.;OPOS=4164283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:31:30:0:0:31:30:0:0
chr20	4705718	.	C	T	57.08	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0068518;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.553;QD=28.5377;RBI=0.00692061;REFB=0.0292867;REVB=0.00097346;RO=1;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124421;STB=0.571224;STBP=0.543;TYPE=snp;VARB=-0.00217698;OID=.;OPOS=4705718;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:3:4:0:1:3:4:0:1
chr20	4705865	.	T	C	398.44	PASS	AF=0.5125;AO=39;DP=78;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=28;FSAR=13;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=0.00729402;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=289.814;QD=19.9219;RBI=0.010378;REFB=-0.0198713;REVB=-0.00738238;RO=39;SAF=26;SAR=13;SRF=27;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0262292;STB=0.505298;STBP=0.943;TYPE=snp;VARB=0.0204283;OID=.;OPOS=4705865;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:80:39:39:39:41:0.5125:13:26:27:12:13:28:27:12
chr20	4706310	.	T	C	269.6	PASS	AF=0.363636;AO=32;DP=88;FAO=32;FDP=88;FR=.;FRO=56;FSAF=17;FSAR=15;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.0265542;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6024;QD=12.2544;RBI=0.095912;REFB=-0.0227295;REVB=0.0921629;RO=55;SAF=17;SAR=15;SRF=28;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0244362;STB=0.508542;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=0.0511956;OID=.;OPOS=4706310;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:55:56:32:32:0.363636:15:17:28:27:15:17:29:27
chr20	4707388	.	G	T	323.83	PASS	AF=0.6;AO=29;DP=51;FAO=33;FDP=55;FR=.;FRO=22;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=0.00596689;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.94;QD=23.5513;RBI=0.0075629;REFB=-0.0430962;REVB=0.00464689;RO=22;SAF=19;SAR=10;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197311;STB=0.579661;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0346638;OID=.;OPOS=4707388;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:55:22:22:29:33:0.6:10:19:9:13:13:20:9:13
chr20	4707861	.	G	A	428.79	PASS	AF=0.545455;AO=41;DP=76;FAO=42;FDP=77;FR=.;FRO=35;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=14;FSRR=21;FWDB=-0.0402268;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.9148;QD=22.275;RBI=0.0542749;REFB=-0.00315655;REVB=-0.0364358;RO=35;SAF=24;SAR=17;SRF=14;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154656;STB=0.588922;STBP=0.098;TYPE=snp;VARB=0.0010861;OID=.;OPOS=4707861;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:76:77:35:35:41:42:0.545455:17:24:14:21:17:25:14:21
chr20	4708130	.	T	C	113.11	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=26;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=13;FSRR=0;FWDB=0.0583917;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9455;QD=17.4023;RBI=0.146191;REFB=0.0172853;REVB=0.134023;RO=13;SAF=10;SAR=3;SRF=13;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.356577;STB=0.696757;STBP=0.165;TYPE=snp;VARB=-0.00956588;OID=.;OPOS=4708130;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:13:13:13:13:0.5:3:10:13:0:3:10:13:0
chr20	4708713	.	T	C	85.07	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00659373;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.45;QD=37.8099;RBI=0.00681457;REFB=0;REVB=-0.0017208;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.36881e-05;OID=.;OPOS=4708713;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chr20	4708778	.	T	C	130.37	PASS	AF=1;AO=8;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.135238;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.325;QD=43.4564;RBI=0.135627;REFB=0;REVB=-0.0102738;RO=0;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.78849e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00228017;OID=.;OPOS=4708778;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:8:12:1:7:1:0:0:9:3:0:0
chr20	4708979	.	T	C	126.43	PASS	AF=0.348837;AO=15;DP=43;FAO=15;FDP=43;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=0.02176;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=109.368;QD=11.7609;RBI=0.125857;REFB=-0.00176729;REVB=0.123962;RO=27;SAF=5;SAR=10;SRF=15;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.2455;STB=0.634737;STBP=0.173;TYPE=snp;VARB=0.0128437;OID=.;OPOS=4708979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:27:28:15:15:0.348837:10:5:15:12:10:5:15:13
chr20	4762869	.	G	A	280.37	PASS	AF=0.316239;AO=37;DP=118;FAO=37;FDP=117;FR=.;FRO=80;FSAF=24;FSAR=13;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=-0.00312936;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.333;QD=9.58524;RBI=0.00356092;REFB=-0.00937279;REVB=0.00169919;RO=80;SAF=24;SAR=13;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220836;STB=0.628849;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0175321;OID=.;OPOS=4762869;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:117:80:80:37:37:0.316239:13:24:37:43:13:24:37:43
chr20	4764629	.	G	A	484.84	PASS	AF=0.51087;AO=47;DP=92;FAO=47;FDP=92;FR=.;FRO=45;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=29;FSRR=16;FWDB=-0.0114469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=89.8391;QD=21.0798;RBI=0.0342395;REFB=-0.00724789;REVB=-0.0322694;RO=44;SAF=22;SAR=25;SRF=28;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.146534;STB=0.585633;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=0.0114398;OID=.;OPOS=4764629;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:92:44:45:47:47:0.51087:25:22:28:16:25:22:29:16
chr20	4768844	.	CTGT	CT,CTG	276.93	PASS	AF=0,0.568182;AO=5,20;DP=44;FAO=0,25;FDP=44;FR=.;FRO=19;FSAF=0,12;FSAR=0,13;FSRF=9;FSRR=10;FWDB=-0.0144014,-0.00740375;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=236.716,253.931;QD=25.1757;RBI=0.0251425,0.053235;REFB=-0.0318352,-0.0280992;REVB=0.0206093,0.0527176;RO=19;SAF=2,10;SAR=3,10;SRF=9;SRR=10;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0862539,0.0227307;STB=0.5,0.50273;STBP=1,0.968;TYPE=del,del;VARB=0,0.0219918;OID=.,.;OPOS=4768845,4768847;OREF=TG,T;OALT=-,-;OMAPALT=CT,CTG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.568182:5,20:44:0,25:44:19:0,12:0,13:9:10:99:19:2,10:3,10:9:10
chr20	4834338	.	C	T	187.8	PASS	AF=0.411765;AO=22;DP=51;FAO=21;FDP=51;FR=.;FRO=30;FSAF=6;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=16;FWDB=-0.0814718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.691;QD=14.7292;RBI=0.0824158;REFB=-0.0159606;REVB=0.0124386;RO=29;SAF=7;SAR=15;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.140021;STB=0.617167;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0159941;OID=.;OPOS=4834338;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:29:30:22:21:0.411765:15:7:13:16:15:6:14:16
chr20	4880308	.	G	A	473.28	PASS	AF=0.516854;AO=46;DP=89;FAO=46;FDP=89;FR=.;FRO=43;FSAF=22;FSAR=24;FSRF=23;FSRR=20;FWDB=-0.00966602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.836;QD=21.2709;RBI=0.0303502;REFB=-0.0237492;REVB=0.0287698;RO=43;SAF=22;SAR=24;SRF=23;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0494692;STB=0.527332;STBP=0.597;TYPE=snp;VARB=0.0246422;OID=.;OPOS=4880308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:43:43:46:46:0.516854:24:22:23:20:24:22:23:20
chr20	5169799	.	C	T	249.58	PASS	AF=0.466667;AO=28;DP=60;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=0.00571906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.376;QD=16.6387;RBI=0.0101523;REFB=-0.00251061;REVB=-0.00838822;RO=32;SAF=12;SAR=16;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0976889;STB=0.554984;STBP=0.438;TYPE=snp;VARB=0.00247944;OID=.;OPOS=5169799;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:32:32:28:28:0.466667:16:12:17:15:16:12:17:15
chr20	5283256	.	C	G	771.85	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00569288;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.0127;QD=61.7481;RBI=0.0736996;REFB=0.0716371;REVB=-0.0734794;RO=1;SAF=27;SAR=22;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209097;STB=0.511107;STBP=0.337;TYPE=snp;VARB=-0.0022588;OID=.;OPOS=5283256;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:22:27:0:1:22:27:0:1
chr20	5283376	.	G	A	766.2	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00631984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.358;QD=63.8496;RBI=0.0236584;REFB=0;REVB=0.0227987;RO=0;SAF=30;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.13183e-05;OID=.;OPOS=5283376;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:47:48:1:17:30:0:0:18:30:0:0
chr20	5296798	.	T	C	3215.92	PASS	AF=0.977064;AO=212;DP=217;FAO=213;FDP=218;FR=.;FRO=5;FSAF=129;FSAR=84;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=-0.0307457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.0077;QD=59.0077;RBI=0.0336913;REFB=-0.00173303;REVB=-0.0137771;RO=5;SAF=128;SAR=84;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0093225;STB=0.504926;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=-0.000161125;OID=.;OPOS=5296798;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:217:218:5:5:212:213:0.977064:84:128:2:3:84:129:2:3
chr20	5454400	.	A	T	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0840479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1113;QD=51.1835;RBI=0.0959399;REFB=0;REVB=0.0462647;RO=0;SAF=10;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00370658;OID=.;OPOS=5454400;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:10:10:0:0:10:10:0:0
chr20	5527291	.	A	G	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00375137;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=291.403;QD=47.8224;RBI=0.0237967;REFB=0;REVB=0.0234992;RO=0;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.36667e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.66279e-05;OID=.;OPOS=5527291;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:5:11:0:0:5:11:0:0
chr20	5550862	.	G	A	608.0	PASS	AF=0.496;AO=62;DP=125;FAO=62;FDP=125;FR=.;FRO=63;FSAF=35;FSAR=27;FSRF=34;FSRR=29;FWDB=0.00159624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.425;QD=19.4559;RBI=0.0091922;REFB=-0.010057;REVB=-0.00905254;RO=61;SAF=35;SAR=27;SRF=33;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0214431;STB=0.512682;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=0.0104475;OID=.;OPOS=5550862;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:125:125:61:63:62:62:0.496:27:35:33:28:27:35:34:29
chr20	5753579	.	C	T	317.25	PASS	AF=0.571429;AO=28;DP=49;FAO=28;FDP=49;FR=.;FRO=21;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.0102002;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.32;QD=25.8982;RBI=0.0113626;REFB=-0.0126946;REVB=-0.00500645;RO=21;SAF=18;SAR=10;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.170427;STB=0.594526;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.0130825;OID=.;OPOS=5753579;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:21:21:28:28:0.571429:10:18:9:12:10:18:9:12
chr20	5843812	.	T	C	177.25	PASS	AF=0.545455;AO=18;DP=33;FAO=18;FDP=33;FR=.;FRO=15;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=0.00453873;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.9394;QD=21.4852;RBI=0.0415856;REFB=-0.038732;REVB=0.0413372;RO=15;SAF=8;SAR=10;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364952;STB=0.520525;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0650366;OID=.;OPOS=5843812;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:15:15:18:18:0.545455:10:8:6:9:10:8:6:9
chr20	5903067	.	T	A	122.65	PASS	AF=0.466667;AO=14;DP=30;FAO=14;FDP=30;FR=.;FRO=16;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=-0.0412929;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7035;QD=16.3536;RBI=0.04536;REFB=-0.013282;REVB=-0.0187731;RO=16;SAF=9;SAR=5;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178685;STB=0.510294;STBP=0.942;TYPE=snp;VARB=0.0148469;OID=.;OPOS=5903067;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:30:16:16:14:14:0.466667:5:9:10:6:5:9:10:6
chr20	5903323	.	G	A,GA	131.26	PASS	AF=0.833333,0.166667;AO=12,2;DP=14;FAO=10,2;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=2,0;FSAR=8,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0147793,0.0301907;FXX=0.076864;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=134.75,23.2622;QD=43.7528;RBI=0.015004,0.0807962;REFB=0,0;REVB=0.00258712,0.0749437;RO=0;SAF=2,0;SAR=10,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.00141472,0.0361469;OID=.,.;OPOS=5903323,5903324;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:14:12:0:0:12,2:10,2:0.833333,0.166667:10,2:2,0:0:0:8,2:2,0:0:0
chr20	5903517	.	A	G	752.83	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0419815;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.35;QD=56.8177;RBI=0.0610674;REFB=0;REVB=0.0443484;RO=0;SAF=10;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.05342e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204766;OID=.;OPOS=5903517;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:52:53:1:42:10:0:0:42:11:0:0
chr20	5903563	.	G	A	199.51	PASS	AF=0.655172;AO=18;DP=28;FAO=19;FDP=29;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=9;FWDB=-0.00549618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.3412;QD=27.5192;RBI=0.0248645;REFB=-0.0320758;REVB=0.0242495;RO=10;SAF=6;SAR=12;SRF=1;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181415;STB=0.591841;STBP=0.259;TYPE=snp;VARB=0.0206005;OID=.;OPOS=5903563;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:28:29:10:10:18:19:0.655172:12:6:1:9:13:6:1:9
chr20	5903848	.	C	G	439.31	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185034;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=41.5294;QD=56.6847;RBI=0.0293204;REFB=0;REVB=0.0227445;RO=0;SAF=14;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139896;OID=.;OPOS=5903848;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:31:0:0:30:31:1:16:14:0:0:17:14:0:0
chr20	5903894	.	A	G	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0190401;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.2679;QD=59.0169;RBI=0.0382385;REFB=0;REVB=0.0331611;RO=0;SAF=19;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000172903;OID=.;OPOS=5903894;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:15:19:0:0:15:19:0:0
chr20	5904028	.	C	T	55.4	PASS	AF=0.363636;AO=8;DP=22;FAO=8;FDP=22;FR=.;FRO=14;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=10;FSRR=4;FWDB=-0.0371358;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.0093;QD=10.0719;RBI=0.0534041;REFB=-0.0370541;REVB=-0.0383788;RO=14;SAF=4;SAR=4;SRF=10;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.226511;STB=0.636048;STBP=0.347;TYPE=snp;VARB=0.0742183;OID=.;OPOS=5904028;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:55:22:22:14:14:8:8:0.363636:4:4:10:4:4:4:10:4
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chr20	6064710	.	A	G	1476.36	PASS	AF=0.990385;AO=95;DP=96;FAO=103;FDP=104;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0274463;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=92.0435;QD=56.783;RBI=0.115802;REFB=0.0167702;REVB=0.112502;RO=1;SAF=70;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00672699;STB=0.503545;STBP=0.575;TYPE=snp;VARB=0.00147097;OID=.;OPOS=6064710;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:96:104:1:1:95:103:0.990385:25:70:1:0:33:70:1:0
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chr20	6065729	.	C	T	673.49	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109877;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.783;QD=59.8658;RBI=0.151064;REFB=0;REVB=0.10367;RO=0;SAF=27;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317637;OID=.;OPOS=6065729;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:18:27:0:0:18:27:0:0
chr20	6065731	.	T	C	519.09	PASS	AF=0.826087;AO=38;DP=46;FAO=38;FDP=46;FR=.;FRO=8;FSAF=27;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=8;FWDB=0.022835;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=239.623;QD=45.138;RBI=0.0248597;REFB=-0.0214886;REVB=0.00982678;RO=7;SAF=27;SAR=11;SRF=0;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.223843;STB=0.63326;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.000293398;OID=.;OPOS=6065731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:46:46:7:8:38:38:0.826087:11:27:0:7:11:27:0:8
chr20	6088265	.	G	A	122.34	PASS	AF=0.451613;AO=14;DP=31;FAO=14;FDP=31;FR=.;FRO=17;FSAF=0;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.2979;QD=15.7851;RBI=0.0235417;REFB=-0.00159561;REVB=-0.0235417;RO=17;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00193891;OID=.;OPOS=6088265;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:17:17:14:14:0.451613:14:0:0:17:14:0:0:17
chr20	6093177	.	A	G	497.24	PASS	AF=0.559524;AO=47;DP=84;FAO=47;FDP=84;FR=.;FRO=37;FSAF=34;FSAR=13;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=-0.00512572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.058;QD=23.6783;RBI=0.00878018;REFB=-0.0176574;REVB=-0.00712871;RO=36;SAF=34;SAR=13;SRF=20;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.152616;STB=0.579623;STBP=0.132;TYPE=snp;VARB=0.010537;OID=.;OPOS=6093177;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:36:37:47:47:0.559524:13:34:20:16:13:34:21:16
chr20	6096632	.	G	A	198.71	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=7;FSAR=13;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=0.00925103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.564;QD=19.3862;RBI=0.0092708;REFB=-0.00261571;REVB=-0.000605133;RO=21;SAF=7;SAR=13;SRF=11;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.162722;STB=0.592311;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.00280688;OID=.;OPOS=6096632;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:13:7:11:10:13:7:11:10
chr20	6100088	.	A	G	438.65	PASS	AF=0.416667;AO=50;DP=120;FAO=50;FDP=120;FR=.;FRO=70;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=41;FSRR=29;FWDB=-0.00970893;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.867;QD=14.6218;RBI=0.0707866;REFB=-0.00471038;REVB=0.0701176;RO=70;SAF=25;SAR=25;SRF=41;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0889585;STB=0.54998;STBP=0.384;TYPE=snp;VARB=0.00988364;OID=.;OPOS=6100088;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:120:120:70:70:50:50:0.416667:25:25:41:29:25:25:41:29
chr20	6751034	.	A	G	1193.07	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00297782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=221.395;QD=60.4085;RBI=0.0311368;REFB=0;REVB=0.0309941;RO=0;SAF=36;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.08968e-05;OID=.;OPOS=6751034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:79:0:0:76:79:1:40:36:0:0:42:37:0:0
chr20	6759115	.	A	T	820.18	PASS	AF=1;AO=57;DP=57;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00853789;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.3521;QD=57.5565;RBI=0.0347392;REFB=0;REVB=0.0336736;RO=0;SAF=31;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19358e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000260528;OID=.;OPOS=6759115;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:57:57:0:0:57:57:1:26:31:0:0:26:31:0:0
chr20	7863999	.	C	A	590.94	PASS	AF=0.627907;AO=49;DP=84;FAO=54;FDP=86;FR=.;FRO=32;FSAF=29;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=7;FWDB=0.0250774;FXX=0.0337041;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.6801;QD=27.4856;RBI=0.0333549;REFB=-0.0445201;REVB=0.0219926;RO=31;SAF=25;SAR=24;SRF=24;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189171;STB=0.592592;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0342869;OID=.;OPOS=7863999;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:86:31:32:49:54:0.627907:24:25:24:7:25:29:25:7
chr20	7962707	.	C	A	1047.67	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00654876;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=242.703;QD=59.8669;RBI=0.0194981;REFB=0;REVB=0.0183654;RO=0;SAF=35;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.44433e-05;OID=.;OPOS=7962707;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:35:35:0:0:35:35:0:0
chr20	7963041	.	C	T	407.21	PASS	AF=0.702128;AO=12;DP=44;FAO=33;FDP=47;FR=.;FRO=14;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0221601;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=74.2083;QD=34.6565;RBI=0.0299802;REFB=-0.0264803;REVB=-0.0201926;RO=0;SAF=10;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.626829;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0689193;OID=.;OPOS=7963041;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:47:0:14:12:33:0.702128:2:10:0:0:14:19:2:12
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chr20	8755243	.	T	C	476.93	PASS	AF=0.485714;AO=48;DP=101;FAO=51;FDP=105;FR=.;FRO=54;FSAF=19;FSAR=32;FSRF=28;FSRR=26;FWDB=0.00970305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.471;QD=18.1688;RBI=0.0305449;REFB=-0.0226649;REVB=0.0289628;RO=53;SAF=20;SAR=28;SRF=27;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0884714;STB=0.577099;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.0259051;OID=.;OPOS=8755243;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:105:53:54:48:51:0.485714:28:20:27:26:32:19:28:26
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chr20	16963522	.	G	C	940.99	PASS	AF=0.984848;AO=64;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=38;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0319838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.1317;QD=57.0294;RBI=0.0400161;REFB=-0.0438686;REVB=-0.0240482;RO=1;SAF=38;SAR=26;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178181;STB=0.509088;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=4.81068e-05;OID=.;OPOS=16963522;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:64:65:0.984848:26:38:0:1:27:38:0:1
chr20	16963542	.	A	G	1145.87	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.025311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.923;QD=60.3089;RBI=0.0740042;REFB=0;REVB=0.0695411;RO=0;SAF=43;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.45097e-05;OID=.;OPOS=16963542;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:76:0:0:70:76:1:27:43:0:0:31:45:0:0
chr20	17189761	.	C	G	439.96	PASS	AF=0.465347;AO=46;DP=100;FAO=47;FDP=101;FR=.;FRO=54;FSAF=20;FSAR=27;FSRF=30;FSRR=24;FWDB=-0.0673528;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.2917;QD=17.4241;RBI=0.0727102;REFB=-0.00606486;REVB=0.0273928;RO=54;SAF=20;SAR=26;SRF=30;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116829;STB=0.569591;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.00632153;OID=.;OPOS=17189761;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:100:101:54:54:46:47:0.465347:26:20:30:24:27:20:30:24
chr20	17474968	.	T	C	402.73	PASS	AF=0.436893;AO=45;DP=103;FAO=45;FDP=103;FR=.;FRO=58;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=26;FSRR=32;FWDB=-0.00869094;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.221;QD=15.6398;RBI=0.0160555;REFB=-0.021646;REVB=-0.0134999;RO=56;SAF=25;SAR=20;SRF=25;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.107936;STB=0.560318;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.0205205;OID=.;OPOS=17474968;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:103:103:56:58:45:45:0.436893:20:25:25:31:20:25:26:32
chr20	17475217	.	C	T	278.9	PASS	AF=0.455882;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=68;FR=.;FRO=37;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=12;FWDB=0.00808508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=107.96;QD=16.4059;RBI=0.0362867;REFB=-0.0262597;REVB=0.0353745;RO=37;SAF=19;SAR=12;SRF=25;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0651583;STB=0.536562;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0318731;OID=.;OPOS=17475217;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:37:37:31:31:0.455882:12:19:25:12:12:19:25:12
chr20	17477592	.	C	T	83.09	PASS	AF=0.314286;AO=11;DP=35;FAO=11;FDP=35;FR=.;FRO=24;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=19;FSRR=5;FWDB=0.021788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=120.938;QD=9.49611;RBI=0.0244791;REFB=0.00339455;REVB=0.0111582;RO=24;SAF=10;SAR=1;SRF=19;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275236;STB=0.673768;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=-0.0137059;OID=.;OPOS=17477592;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:83:35:35:24:24:11:11:0.314286:1:10:19:5:1:10:19:5
chr20	17489594	.	C	T	1223.03	PASS	AF=0.508475;AO=120;DP=236;FAO=120;FDP=236;FR=.;FRO=116;FSAF=53;FSAR=67;FSRF=49;FSRR=67;FWDB=0.0588045;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=87.5926;QD=20.7293;RBI=0.0590672;REFB=-0.0197533;REVB=-0.00556482;RO=114;SAF=53;SAR=67;SRF=47;SRR=67;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0265976;STB=0.509614;STBP=0.776;TYPE=snp;VARB=0.022865;OID=.;OPOS=17489594;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:236:236:114:116:120:120:0.508475:67:53:47:67:67:53:49:67
chr20	17594729	.	G	A	2015.85	PASS	AF=0.984962;AO=131;DP=133;FAO=131;FDP=133;FR=.;FRO=2;FSAF=43;FSAR=88;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.024632;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=282.998;QD=60.6269;RBI=0.024632;REFB=-0.10056;REVB=2.00727e-06;RO=1;SAF=43;SAR=88;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0109238;STB=0.502922;STBP=0.539;TYPE=snp;VARB=0.000126428;OID=.;OPOS=17594729;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:133:133:1:2:131:131:0.984962:88:43:1:0:88:43:1:1
chr20	17596155	.	C	A	1208.85	PASS	AF=1;AO=78;DP=78;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.019781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.507;QD=61.2074;RBI=0.0407151;REFB=0;REVB=0.0355869;RO=0;SAF=43;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.91087e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.95703e-05;OID=.;OPOS=17596155;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:78:79:0:0:78:79:1:35:43:0:0:36:43:0:0
chr20	17605240	.	A	T	1086.68	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00560511;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.973;QD=59.5444;RBI=0.0148741;REFB=0;REVB=0.0137776;RO=0;SAF=32;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05346e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.46831e-05;OID=.;OPOS=17605240;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:40:32:0:0:41:32:0:0
chr20	17705677	.	A	G	1561.0	PASS	AF=0.99;AO=97;DP=99;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=64;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00905079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.313;QD=62.44;RBI=0.00908952;REFB=-0.0858375;REVB=-0.000838148;RO=1;SAF=62;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133567;STB=0.507041;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.000434254;OID=.;OPOS=17705677;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:99:100:1:1:97:99:0.99:35:62:0:1:35:64:0:1
chr20	17716416	.	C	G	1513.23	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0477217;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.5072;QD=59.9301;RBI=0.0570844;REFB=0;REVB=0.0313252;RO=0;SAF=61;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000445239;OID=.;OPOS=17716416;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:40:61:0:0:40:61:0:0
chr20	18022362	.	G	T	304.01	PASS	AF=0.574468;AO=26;DP=46;FAO=27;FDP=47;FR=.;FRO=20;FSAF=18;FSAR=9;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=0.0479851;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.1804;QD=25.8731;RBI=0.108338;REFB=0.0204037;REVB=0.0971311;RO=20;SAF=17;SAR=9;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12691;STB=0.5757;STBP=0.233;TYPE=snp;VARB=-0.011455;OID=.;OPOS=18022362;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:20:20:26:27:0.574468:9:17:10:10:9:18:10:10
chr20	18122912	.	C	G	325.93	PASS	AF=0.466667;AO=35;DP=75;FAO=35;FDP=75;FR=.;FRO=40;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0977608;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.923;QD=17.3829;RBI=0.102263;REFB=0.0104578;REVB=-0.0300109;RO=40;SAF=21;SAR=14;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0246418;STB=0.513804;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=-0.00927757;OID=.;OPOS=18122912;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:40:40:35:35:0.466667:14:21:23:17:14:21:23:17
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chr20	18445963	.	A	G	652.08	PASS	AF=0.977273;AO=42;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0311602;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.6665;QD=59.2797;RBI=0.0423155;REFB=-0.0314442;REVB=0.0286294;RO=1;SAF=20;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228919;STB=0.511622;STBP=0.522;TYPE=snp;VARB=0.00213675;OID=.;OPOS=18445963;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:42:43:0.977273:22:20:1:0:22:21:1:0
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chr20	18523002	.	C	G	38.57	PASS	AF=0.428571;AO=6;DP=14;FAO=6;FDP=14;FR=.;FRO=8;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0373675;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3827;QD=11.0195;RBI=0.0591146;REFB=-0.00255708;REVB=-0.0458061;RO=8;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.474505;STB=0.781817;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.0026828;OID=.;OPOS=18523002;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:14:14:8:8:6:6:0.428571:4:2:7:1:4:2:7:1
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chr20	26061803	.	C	A	37.1	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=8;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0330902;FXX=0.124844;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.43;QD=21.202;RBI=0.0340841;REFB=-0.0104259;REVB=0.00817113;RO=2;SAF=3;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.212944;STB=0.62455;STBP=0.425;TYPE=snp;VARB=0.00934132;OID=.;OPOS=26061803;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:8:7:2:2:5:5:0.714286:2:3:2:0:2:3:2:0
chr20	26061859	.	G	T	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0848472;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.576;QD=23.2183;RBI=0.0916122;REFB=-0.000177289;REVB=0.0345507;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169284;STB=0.599598;STBP=0.517;TYPE=snp;VARB=0.0046664;OID=.;OPOS=26061859;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:3:2:1:0:3:2:1:0
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chr20	29652166	.	G	A	128.68	PASS	AF=0.167832;AO=24;DP=143;FAO=24;FDP=143;FR=.;FRO=119;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=24;FSRR=95;FWDB=-0.0392369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.584;QD=3.59946;RBI=0.0418723;REFB=-0.00133792;REVB=-0.0146205;RO=119;SAF=6;SAR=18;SRF=24;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.088186;STB=0.556606;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=0.0224542;OID=.;OPOS=29652166;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:143:143:119:119:24:24:0.167832:18:6:24:95:18:6:24:95
chr20	29652172	.	TG	CA,CG	1655.25	PASS	AF=0.316901,0.556338;AO=45,78;DP=143;FAO=45,79;FDP=142;FR=.;FRO=18;FSAF=9,20;FSAR=36,59;FSRF=2;FSRR=16;FWDB=-0.00100012,-0.0128601;FXX=0.0138879;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=153.069,107.798;QD=46.6268;RBI=0.00825614,0.0214656;REFB=-0.0438854,0.0283682;REVB=0.00819534,-0.017187;RO=18;SAF=9,20;SAR=36,58;SRF=2;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0773704,0.0695887;STB=0.541649,0.536088;STBP=0.438,0.213;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.00100963,-0.00540347;OID=.,.;OPOS=29652172,29652172;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:143:142:18:18:45,78:45,79:0.316901,0.556338:36,58:9,20:2:16:36,59:9,20:2:16
chr20	29652182	.	C	T	56.4	PASS	AF=0.107914;AO=14;DP=138;FAO=15;FDP=139;FR=.;FRO=124;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=22;FSRR=102;FWDB=0.011624;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.3368;QD=1.62301;RBI=0.0119055;REFB=-0.00189599;REVB=0.0025737;RO=122;SAF=8;SAR=6;SRF=21;SRR=101;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.505445;STB=0.839096;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.0142667;OID=.;OPOS=29652182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:138:139:122:124:14:15:0.107914:6:8:21:101:6:9:22:102
chr20	29652183	.	G	A	59.35	PASS	AF=0.107914;AO=15;DP=136;FAO=15;FDP=139;FR=.;FRO=124;FSAF=1;FSAR=14;FSRF=30;FSRR=94;FWDB=-0.0628304;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=145.853;QD=1.70801;RBI=0.0651772;REFB=-0.00270689;REVB=0.0173322;RO=121;SAF=1;SAR=14;SRF=28;SRR=93;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.359242;STB=0.800204;STBP=0.065;TYPE=snp;VARB=0.015636;OID=.;OPOS=29652183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:136:139:121:124:15:15:0.107914:14:1:28:93:14:1:30:94
chr20	29652190	.	T	G	66.44	PASS	AF=0.115942;AO=16;DP=138;FAO=16;FDP=138;FR=.;FRO=122;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=22;FSRR=100;FWDB=-0.009222;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.664;QD=1.92594;RBI=0.0146531;REFB=-0.00306909;REVB=0.0113872;RO=120;SAF=9;SAR=7;SRF=21;SRR=99;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.498917;STB=0.815844;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0308695;OID=.;OPOS=29652190;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:138:138:120:122:16:16:0.115942:7:9:21:99:7:9:22:100
chr20	29652191	.	C	T	1375.62	PASS	AF=0.769784;AO=105;DP=137;FAO=107;FDP=139;FR=.;FRO=32;FSAF=19;FSAR=88;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.0254214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.9789;QD=39.5863;RBI=0.0306622;REFB=-0.0271196;REVB=-0.0171442;RO=32;SAF=18;SAR=87;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159624;STB=0.580722;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00893674;OID=.;OPOS=29652191;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:137:139:32:32:105:107:0.769784:87:18:13:19:88:19:13:19
chr20	29652194	.	C	T	296.28	PASS	AF=0.285714;AO=39;DP=139;FAO=40;FDP=140;FR=.;FRO=100;FSAF=8;FSAR=32;FSRF=24;FSRR=76;FWDB=0.00287031;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.361;QD=8.465;RBI=0.0149581;REFB=-0.00313904;REVB=0.0146801;RO=100;SAF=8;SAR=31;SRF=24;SRR=76;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0618333;STB=0.542351;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=0.00951945;OID=.;OPOS=29652194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:139:140:100:100:39:40:0.285714:31:8:24:76:32:8:24:76
chr20	29652196	.	T	C	72.65	PASS	AF=0.120567;AO=17;DP=140;FAO=17;FDP=141;FR=.;FRO=124;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=29;FSRR=95;FWDB=-0.0467797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.084;QD=2.06102;RBI=0.0489422;REFB=-0.00115185;REVB=0.0143874;RO=123;SAF=3;SAR=14;SRF=28;SRR=95;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0966083;STB=0.577965;STBP=0.563;TYPE=snp;VARB=0.0118707;OID=.;OPOS=29652196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:72:140:141:123:124:17:17:0.120567:14:3:28:95:14:3:29:95
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chr20	30777860	.	A	G	416.35	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.4972;QD=55.5137;RBI=0.0309433;REFB=0;REVB=-0.0185459;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142794;OID=.;OPOS=30777860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:30:0:0:27:30:1:11:16:0:0:11:19:0:0
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chr20	32336755	.	G	A	252.3	PASS	AF=0.414286;AO=21;DP=74;FAO=29;FDP=70;FR=.;FRO=41;FSAF=7;FSAR=22;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.054367;FXX=0.0540468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.235;QD=14.417;RBI=0.0552491;REFB=-0.0124137;REVB=0.0098334;RO=31;SAF=3;SAR=18;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.494531;STB=0.713981;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0101898;OID=.;OPOS=32336755;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:70:31:41:21:29:0.414286:18:3:17:14:22:7:24:17
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chr20	32664864	.	C	CCAG	244.53	PASS	AF=1;AO=18;DP=45;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0692309;FXX=0.249896;HRUN=2;LEN=3;MLLD=206.865;QD=54.3395;RBI=0.0738566;REFB=0;REVB=0.025727;RO=27;SAF=10;SAR=8;SRF=9;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22768;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000589485;OID=.;OPOS=32664865;OREF=-;OALT=CAG;OMAPALT=CCAG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:18:45:18:18:0:10:8:0:0:3:27:10:8:9:18
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chr20	43348735	.	C	A	77.56	PASS	AF=0.692308;AO=8;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.039597;FXX=0.0713776;HRUN=2;LEN=1;MLLD=82.695;QD=23.8635;RBI=0.0453249;REFB=-0.0708687;REVB=0.0220551;RO=4;SAF=5;SAR=3;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0749496;STB=0.555429;STBP=0.629;TYPE=snp;VARB=0.0556824;OID=.;OPOS=43348735;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:13:13:4:4:8:9:0.692308:3:5:2:2:3:6:2:2
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chr20	44238741	.	T	G	1481.45	PASS	AF=1;AO=92;DP=92;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=50;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.010781;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.527;QD=62.3768;RBI=0.0235041;REFB=0;REVB=-0.0208858;RO=0;SAF=47;SAR=45;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.9386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000174608;OID=.;OPOS=44238741;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:92:95:0:0:92:95:1:45:47:0:0:45:50:0:0
chr20	44314609	.	A	G	689.17	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0169935;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.7628;QD=62.6515;RBI=0.0175115;REFB=0;REVB=-0.00422769;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143529;OID=.;OPOS=44314609;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:23:20:0:0:24:20:0:0
chr20	44352620	.	G	A	1608.18	PASS	AF=0.990826;AO=108;DP=109;FAO=108;FDP=109;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0127091;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.3487;QD=59.0158;RBI=0.0593667;REFB=-0.00322659;REVB=-0.0579904;RO=1;SAF=68;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.011718;STB=0.506172;STBP=0.255;TYPE=snp;VARB=-0.000179283;OID=.;OPOS=44352620;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:109:109:1:1:108:108:0.990826:40:68:0:1:40:68:0:1
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chr20	44691350	.	T	G	212.41	PASS	AF=0.423729;AO=25;DP=59;FAO=25;FDP=59;FR=.;FRO=34;FSAF=20;FSAR=5;FSRF=22;FSRR=12;FWDB=-0.0121302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=242.228;QD=14.4007;RBI=0.0154629;REFB=-0.00270044;REVB=-0.00958958;RO=34;SAF=20;SAR=5;SRF=22;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.204946;STB=0.618078;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=0.00268051;OID=.;OPOS=44691350;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:34:34:25:25:0.423729:5:20:22:12:5:20:22:12
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chr20	44757407	.	G	A	77.32	PASS	AF=0.434783;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=23;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.00686259;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.338;QD=13.4469;RBI=0.0515732;REFB=-0.0261095;REVB=-0.0511145;RO=11;SAF=5;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.122307;STB=0.565089;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.0221504;OID=.;OPOS=44757407;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:23:11:13:10:10:0.434783:5:5:4:7:5:5:5:8
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chr20	46365571	.	A	G	1695.26	PASS	AF=1;AO=111;DP=111;FAO=112;FDP=112;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0088079;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.376;QD=60.5448;RBI=0.0247271;REFB=0;REVB=0.0231052;RO=0;SAF=47;SAR=64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.26534e-05;OID=.;OPOS=46365571;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:111:112:0:0:111:112:1:64:47:0:0:64:48:0:0
chr20	47241618	.	A	G	717.53	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00253096;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.403;QD=56.2771;RBI=0.0111677;REFB=0;REVB=0.0108771;RO=0;SAF=33;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0015865;OID=.;OPOS=47241618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:51:0:0:48:51:1:15:33:0:0:17:34:0:0
chr20	47253043	.	G	A,C	1371.56	PASS	AF=0.967033,0.021978;AO=85,4;DP=90;FAO=88,2;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=62,1;FSAR=26,1;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0181655,-0.00613604;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=111.367,136.652;QD=60.2883;RBI=0.0328817,0.0157434;REFB=-0.0639915,-0.086791;REVB=0.0274084,-0.0144984;RO=1;SAF=59,3;SAR=26,1;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00796278,-0.119989;STB=0.503999,0.665164;STBP=0.599,0.662;TYPE=snp,snp;VARB=-0.00108309,0.0375586;OID=.,.;OPOS=47253043,47253043;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:90:91:1:1:85,4:88,2:0.967033,0.021978:26,1:59,3:1:0:26,1:62,1:1:0
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chr20	47256335	.	G	A	1711.41	PASS	AF=0.974576;AO=115;DP=119;FAO=115;FDP=118;FR=.;FRO=3;FSAF=68;FSAR=47;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.00467078;FXX=0.00840265;HRUN=3;LEN=1;MLLD=226.314;QD=58.014;RBI=0.00627636;REFB=-0.124682;REVB=0.00419242;RO=1;SAF=68;SAR=47;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00693286;STB=0.501983;STBP=0.793;TYPE=snp;VARB=4.25607e-05;OID=.;OPOS=47256335;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:119:118:1:3:115:115:0.974576:47:68:1:0:47:68:2:1
chr20	47258761	.	G	A	1671.55	PASS	AF=1;AO=110;DP=110;FAO=111;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00873823;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.2107;QD=60.2362;RBI=0.0262972;REFB=0;REVB=0.024803;RO=0;SAF=55;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.60418e-05;OID=.;OPOS=47258761;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:110:111:0:0:110:111:1:55:55:0:0:55:56:0:0
chr20	47261017	.	T	C	937.61	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193414;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.156;QD=58.6006;RBI=0.0225054;REFB=0;REVB=-0.0115068;RO=0;SAF=40;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.3845e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.39438e-06;OID=.;OPOS=47261017;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:24:40:0:0:24:40:0:0
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chr20	48522585	.	G	A	754.41	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460029;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.933;QD=56.9368;RBI=0.059292;REFB=0;REVB=0.037407;RO=0;SAF=37;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.33586e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000220991;OID=.;OPOS=48522585;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:16:37:0:0:16:37:0:0
chr20	48524827	.	A	G	954.77	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0291489;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.916;QD=58.7551;RBI=0.0347036;REFB=0;REVB=0.018833;RO=0;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.30166e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193196;OID=.;OPOS=48524827;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:25:39:0:0:25:40:0:0
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chr20	54961463	.	T	C	1380.38	PASS	AF=1;AO=86;DP=87;FAO=88;FDP=88;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.011558;FXX=0.0112347;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.804;QD=62.7447;RBI=0.0365636;REFB=0;REVB=0.0346888;RO=0;SAF=51;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000244594;OID=.;OPOS=54961463;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:88:0:0:86:88:1:35:51:0:0:36:52:0:0
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chr20	55108617	.	C	A	1026.86	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0494543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=276.407;QD=59.5279;RBI=0.0673071;REFB=0;REVB=0.0456566;RO=0;SAF=32;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000128958;OID=.;OPOS=55108617;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:64:69:0:0:64:69:1:32:32:0:0:35:34:0:0
chr20	55111273	.	C	T	441.19	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124858;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.546;QD=56.9277;RBI=0.0289571;REFB=0;REVB=0.026127;RO=0;SAF=22;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.15349e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134111;OID=.;OPOS=55111273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:9:22:0:0:9:22:0:0
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chr20	57833518	.	G	A	230.17	PASS	AF=0.490566;AO=23;DP=49;FAO=26;FDP=53;FR=.;FRO=27;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0147322;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=311.875;QD=17.3711;RBI=0.0166937;REFB=-0.0163794;REVB=0.0078513;RO=26;SAF=11;SAR=12;SRF=9;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.125279;STB=0.603371;STBP=0.19;TYPE=snp;VARB=0.0179578;OID=.;OPOS=57833518;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:53:26:27:23:26:0.490566:12:11:9:17:12:14:9:18
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chr20	58467393	.	A	G	307.82	PASS	AF=0.584906;AO=31;DP=55;FAO=31;FDP=53;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=25;FSRF=6;FSRR=16;FWDB=-0.0331756;FXX=0.036357;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.6024;QD=23.232;RBI=0.0532925;REFB=-0.0273449;REVB=0.0417069;RO=21;SAF=6;SAR=25;SRF=6;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.100271;STB=0.549417;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0142063;OID=.;OPOS=58467393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:53:21:22:31:31:0.584906:25:6:6:15:25:6:6:16
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chr20	60512295	.	AG	AA,GA	48.03	PASS	AF=0.285714,0.0952381;AO=4,3;DP=20;FAO=6,2;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=0,0;FSAR=6,2;FSRF=0;FSRR=13;FWDB=0,0;FXX=0.0454339;HRUN=1,19;LEN=1,2;MLLD=224.1,14.472;QD=9.14784;RBI=0.00575879,0.0307116;REFB=-0.00309789,-0.0834909;REVB=0.00575879,0.0307116;RO=13;SAF=0,0;SAR=4,3;SRF=0;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,mnp;VARB=0.01054,-0.0314018;OID=.,.;OPOS=60512296,60512295;OREF=G,AG;OALT=A,GA;OMAPALT=AA,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:32:20:21:13:13:4,3:6,2:0.285714,0.0952381:4,3:0,0:0:13:6,2:0,0:0:13
chr20	60572663	.	C	A	465.6	PASS	AF=0.47619;AO=50;DP=105;FAO=50;FDP=105;FR=.;FRO=55;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=32;FSRR=23;FWDB=0.0496984;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.0329;QD=17.7371;RBI=0.0588138;REFB=-0.0203736;REVB=0.0314505;RO=55;SAF=26;SAR=24;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0585399;STB=0.532504;STBP=0.545;TYPE=snp;VARB=0.0281113;OID=.;OPOS=60572663;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:55:55:50:50:0.47619:24:26:32:23:24:26:32:23
chr20	60712511	.	A	G	962.7	PASS	AF=0.944444;AO=68;DP=72;FAO=68;FDP=72;FR=.;FRO=4;FSAF=40;FSAR=28;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0144905;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.646;QD=53.4834;RBI=0.0200796;REFB=-0.0351586;REVB=0.0139001;RO=4;SAF=40;SAR=28;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0449512;STB=0.523803;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.00163818;OID=.;OPOS=60712511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:72:72:4:4:68:68:0.944444:28:40:4:0:28:40:4:0
chr20	60713311	.	G	A	761.14	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00426167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.2897;QD=56.3807;RBI=0.0129975;REFB=0;REVB=0.012279;RO=0;SAF=39;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000204784;OID=.;OPOS=60713311;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:15:39:0:0:15:39:0:0
chr20	60713332	.	A	G	593.77	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034296;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.4963;QD=60.8999;RBI=0.0986508;REFB=0;REVB=0.0924974;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00147724;OID=.;OPOS=60713332;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:39:0:0:36:39:1:10:26:0:0:12:27:0:0
chr20	60768496	.	TC	T,TT	911.02	PASS	AF=0.015873,0.984127;AO=11,52;DP=64;FAO=1,62;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=1,40;FSAR=0,22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189451,0.0251346;FXX=0.0156226;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=257.099,271.347;QD=57.8423;RBI=0.0448306,0.0461077;REFB=0,0;REVB=0.0406308,0.0386545;RO=0;SAF=5,36;SAR=6,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0719708,0.00124726;OID=.,.;OPOS=60768497,60768497;OREF=C,C;OALT=-,T;OMAPALT=T,TT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.015873,0.984127:11,52:64:1,62:63:0:1,40:0,22:0:0:3:0:5,36:6,16:0:0
chr20	60831300	.	G	A	727.27	PASS	AF=0.981481;AO=51;DP=52;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00472826;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=187.572;QD=53.8722;RBI=0.0100582;REFB=-0.0657349;REVB=0.00887754;RO=1;SAF=30;SAR=21;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154392;STB=0.507689;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.000932682;OID=.;OPOS=60831300;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:54:1:1:51:53:0.981481:21:30:1:0:21:32:1:0
chr20	60881330	.	G	A	1618.77	PASS	AF=0.991228;AO=110;DP=115;FAO=113;FDP=114;FR=.;FRO=1;FSAF=62;FSAR=51;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00523647;FXX=0.0086949;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.433;QD=56.799;RBI=0.126059;REFB=-0.155694;REVB=0.12595;RO=1;SAF=62;SAR=48;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0097874;STB=0.503999;STBP=0.492;TYPE=snp;VARB=0.000560983;OID=.;OPOS=60881330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:115:114:1:1:110:113:0.991228:48:62:0:1:51:62:1:0
chr20	60881780	.	T	C	1285.42	PASS	AF=1;AO=80;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0126487;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.1111;QD=61.948;RBI=0.0465354;REFB=0;REVB=0.0447834;RO=0;SAF=36;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.28538e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000174751;OID=.;OPOS=60881780;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:80:83:1:44:36:0:0:47:36:0:0
chr20	60887468	.	G	A	262.14	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=60;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=13;FSRR=19;FWDB=0.00769331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.142;QD=17.1896;RBI=0.00770958;REFB=-0.0355783;REVB=0.000500617;RO=31;SAF=13;SAR=16;SRF=13;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.027027;STB=0.522373;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0488023;OID=.;OPOS=60887468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:61:31:32:29:29:0.47541:16:13:13:18:16:13:13:19
chr20	60887581	.	G	A	272.97	PASS	AF=0.442857;AO=31;DP=70;FAO=31;FDP=70;FR=.;FRO=39;FSAF=11;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=22;FWDB=0.024348;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.7791;QD=15.5982;RBI=0.0259058;REFB=-0.0246662;REVB=0.00884778;RO=37;SAF=11;SAR=20;SRF=15;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523879;STB=0.547914;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.0287105;OID=.;OPOS=60887581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:37:39:31:31:0.442857:20:11:15:22:20:11:17:22
chr20	60892526	.	A	G	1072.49	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0295993;FXX=0.0533262;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.079;QD=60.4218;RBI=0.0320109;REFB=0;REVB=0.0121891;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000209527;OID=.;OPOS=60892526;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:71:0:0:70:71:1:29:41:0:0:30:41:0:0
chr20	60895697	.	C	T	159.36	PASS	AF=0.512821;AO=15;DP=37;FAO=20;FDP=39;FR=.;FRO=19;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.134622;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.9664;QD=16.3443;RBI=0.134645;REFB=-0.0443638;REVB=-0.00248549;RO=17;SAF=7;SAR=8;SRF=9;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.058016;STB=0.562437;STBP=0.439;TYPE=snp;VARB=0.0547164;OID=.;OPOS=60895697;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:39:17:19:15:20:0.512821:8:7:9:8:12:8:10:9
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chr20	60897488	.	G	A	157.62	PASS	AF=0.425;AO=15;DP=37;FAO=17;FDP=40;FR=.;FRO=23;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=15;FWDB=0.0626558;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.2;QD=15.7623;RBI=0.0636285;REFB=-0.00267476;REVB=0.0110832;RO=21;SAF=7;SAR=8;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.136602;STB=0.538417;STBP=0.702;TYPE=snp;VARB=0.0457451;OID=.;OPOS=60897488;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:40:21:23:15:17:0.425:8:7:7:14:10:7:8:15
chr20	60897772	.	T	C	569.96	PASS	AF=0.453901;AO=56;DP=140;FAO=64;FDP=141;FR=.;FRO=77;FSAF=47;FSAR=17;FSRF=42;FSRR=35;FWDB=-0.0284483;FXX=0.0208319;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.8331;QD=16.1691;RBI=0.0285407;REFB=-0.0477826;REVB=0.00229562;RO=64;SAF=41;SAR=15;SRF=38;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154787;STB=0.617601;STBP=0.021;TYPE=snp;VARB=0.0352329;OID=.;OPOS=60897772;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:141:64:77:56:64:0.453901:15:41:38:26:17:47:42:35
chr20	60899182	.	C	T	278.28	PASS	AF=0.564103;AO=19;DP=42;FAO=22;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0562567;FXX=0.0487686;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6717;QD=28.5418;RBI=0.0760182;REFB=-0.0320985;REVB=-0.0511268;RO=11;SAF=9;SAR=10;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126582;STB=0.514273;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.0583659;OID=.;OPOS=60899182;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:57:42:39:11:10:19:22:0.564103:10:9:5:6:10:12:5:5
chr20	60899206	.	C	T	203.37	PASS	AF=0.421053;AO=24;DP=57;FAO=24;FDP=57;FR=.;FRO=33;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=0.0324538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.8655;QD=14.2718;RBI=0.0525994;REFB=-0.0198539;REVB=-0.0413938;RO=33;SAF=9;SAR=15;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0524146;STB=0.529929;STBP=0.749;TYPE=snp;VARB=0.0231283;OID=.;OPOS=60899206;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:33:33:24:24:0.421053:15:9:14:19:15:9:14:19
chr20	60900481	.	A	G	2253.81	PASS	AF=1;AO=131;DP=132;FAO=146;FDP=146;FR=.;FRO=0;FSAF=63;FSAR=83;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0675455;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=32.5068;QD=61.7483;RBI=0.0760246;REFB=0;REVB=0.0348906;RO=1;SAF=54;SAR=77;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00871998;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000443956;OID=.;OPOS=60900481;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:132:146:1:0:131:146:1:77:54:1:0:83:63:0:0
chr20	60900579	.	C	A	868.27	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10197;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.85;QD=57.8846;RBI=0.104691;REFB=0;REVB=0.0237138;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000779675;OID=.;OPOS=60900579;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0
chr20	60904853	.	T	C	928.89	PASS	AF=0.788889;AO=70;DP=90;FAO=71;FDP=90;FR=.;FRO=19;FSAF=25;FSAR=46;FSRF=15;FSRR=4;FWDB=-0.0227217;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.076;QD=41.2839;RBI=0.0253144;REFB=0.00398993;REVB=0.0111599;RO=19;SAF=25;SAR=45;SRF=15;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.177532;STB=0.595442;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-0.00186014;OID=.;OPOS=60904853;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:19:19:70:71:0.788889:45:25:15:4:46:25:15:4
chr20	60904854	.	G	C	121.11	PASS	AF=0.215054;AO=19;DP=92;FAO=20;FDP=93;FR=.;FRO=73;FSAF=15;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=48;FWDB=-0.0333826;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.657;QD=5.20883;RBI=0.0379439;REFB=-0.024337;REVB=-0.0180373;RO=73;SAF=15;SAR=4;SRF=25;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.531852;STB=0.798721;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.166737;OID=.;OPOS=60904854;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:73:73:19:20:0.215054:4:15:25:48:5:15:25:48
chr20	60905878	.	A	G	93.85	PASS	AF=1;AO=9;DP=10;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00617746;FXX=0.0999001;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.542;QD=41.709;RBI=0.0837605;REFB=0;REVB=-0.0835324;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000830657;OID=.;OPOS=60905878;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:9:0:0:9:9:1:2:7:0:0:2:7:0:0
chr20	60907446	.	T	C	1589.87	PASS	AF=1;AO=106;DP=106;FAO=106;FDP=106;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195695;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=221.092;QD=59.9949;RBI=0.0585636;REFB=0;REVB=0.0551971;RO=0;SAF=78;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.79767e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.28876e-05;OID=.;OPOS=60907446;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:106:106:0:0:106:106:1:28:78:0:0:28:78:0:0
chr20	60907675	.	G	A	724.86	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00803735;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.093;QD=55.7581;RBI=0.0440239;REFB=0;REVB=0.043284;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143733;OID=.;OPOS=60907675;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:51:52:1:25:26:0:0:26:26:0:0
chr20	60908964	.	G	A	145.24	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0255883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7527;QD=44.6895;RBI=0.0289517;REFB=0;REVB=0.0135439;RO=0;SAF=11;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000532834;OID=.;OPOS=60908964;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:2:11:0:0:2:11:0:0
chr20	60908969	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0214166;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.3864;QD=45.8045;RBI=0.0395952;REFB=0;REVB=0.0333033;RO=0;SAF=12;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.00075e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00160445;OID=.;OPOS=60908969;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:14:0:0:13:14:1:1:12:0:0:2:12:0:0
chr20	60909060	.	A	G	628.2	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00551639;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.629;QD=61.2875;RBI=0.0208968;REFB=0;REVB=-0.0201555;RO=0;SAF=26;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.05056e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.72393e-05;OID=.;OPOS=60909060;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:41:0:0:38:41:1:12:26:0:0:14:27:0:0
chr20	60909322	.	G	A	312.78	PASS	AF=0.561404;AO=32;DP=57;FAO=32;FDP=57;FR=.;FRO=25;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=16;FSRR=9;FWDB=0.00255866;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.905;QD=21.9492;RBI=0.041021;REFB=-0.0109982;REVB=0.0409411;RO=25;SAF=13;SAR=19;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184849;STB=0.602122;STBP=0.095;TYPE=snp;VARB=0.00600249;OID=.;OPOS=60909322;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:25:25:32:32:0.561404:19:13:16:9:19:13:16:9
chr20	60911958	.	G	A	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0246642;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.11;QD=50.4134;RBI=0.026575;REFB=0;REVB=-0.00989495;RO=0;SAF=16;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.42408e-05;OID=.;OPOS=60911958;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:3:16:0:0:3:16:0:0
chr20	60912683	.	T	C	955.19	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0354665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.606;QD=58.781;RBI=0.0711247;REFB=0;REVB=-0.061651;RO=0;SAF=36;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000345659;OID=.;OPOS=60912683;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:29:36:0:0:29:36:0:0
chr20	60917294	.	G	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0484441;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.4861;QD=39.2062;RBI=0.0539944;REFB=0;REVB=-0.0238447;RO=0;SAF=3;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00204848;OID=.;OPOS=60917294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:6:3:0:0:6:3:0:0
chr20	60920624	.	A	G	191.14	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0567544;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6534;QD=47.7854;RBI=0.0645906;REFB=0;REVB=0.0308363;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00302238;OID=.;OPOS=60920624;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr20	60920887	.	G	A	622.19	PASS	AF=0.976744;AO=40;DP=41;FAO=42;FDP=43;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0342582;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.7542;QD=57.8779;RBI=0.0457437;REFB=-0.0440757;REVB=-0.0303127;RO=1;SAF=20;SAR=20;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.022873;STB=0.511106;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0015897;OID=.;OPOS=60920887;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:43:1:1:40:42:0.976744:20:20:0:1:22:20:0:1
chr20	60921643	.	T	C	323.33	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0286411;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.317;QD=53.8884;RBI=0.0822773;REFB=0;REVB=0.0771313;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000418968;OID=.;OPOS=60921643;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:9:15:0:0:9:15:0:0
chr20	60927349	.	C	T	769.35	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016238;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.001;QD=56.9889;RBI=0.02152;REFB=0;REVB=0.0141223;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.34328e-05;OID=.;OPOS=60927349;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:29:25:0:0:29:25:0:0
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chr20	60937597	.	A	G	109.11	PASS	AF=0.419355;AO=13;DP=31;FAO=13;FDP=31;FR=.;FRO=18;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=13;FWDB=-0.0175988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.6093;QD=14.0783;RBI=0.018792;REFB=-0.0237969;REVB=-0.00658953;RO=18;SAF=6;SAR=7;SRF=5;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.188529;STB=0.60898;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0466477;OID=.;OPOS=60937597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:18:18:13:13:0.419355:7:6:5:13:7:6:5:13
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chr20	61588159	.	A	G	1226.84	PASS	AF=1;AO=79;DP=79;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.084309;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.6319;QD=61.342;RBI=0.0880055;REFB=0;REVB=0.0252379;RO=0;SAF=36;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000235772;OID=.;OPOS=61588159;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:79:80:0:0:79:80:1:43:36:0:0:44:36:0:0
chr20	61594679	.	A	G	920.11	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109229;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=258.439;QD=58.4197;RBI=0.0287797;REFB=0;REVB=0.0266264;RO=0;SAF=29;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.45868e-05;OID=.;OPOS=61594679;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:34:29:0:0:34:29:0:0
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chr20	61869607	.	C	A	54.77	PASS	AF=0.777778;AO=6;DP=8;FAO=7;FDP=9;FR=.;FRO=2;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0212852;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.115;QD=24.3412;RBI=0.0738407;REFB=-0.0422227;REVB=0.0707064;RO=2;SAF=4;SAR=2;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173071;STB=0.583115;STBP=0.627;TYPE=snp;VARB=0.0161392;OID=.;OPOS=61869607;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:8:9:2:2:6:7:0.777778:2:4:2:0:2:5:2:0
chr20	61869826	.	C	T	519.91	PASS	AF=0.544444;AO=49;DP=90;FAO=49;FDP=90;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=20;FSRR=21;FWDB=-0.000358428;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.715;QD=23.107;RBI=0.025485;REFB=-0.00744654;REVB=0.0254825;RO=41;SAF=24;SAR=25;SRF=20;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00164988;STB=0.500907;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00905539;OID=.;OPOS=61869826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:90:41:41:49:49:0.544444:25:24:20:21:25:24:20:21
chr20	61873080	.	T	A	125.79	PASS	AF=0.518519;AO=14;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=12;FWDB=0.0717501;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.253;QD=18.6362;RBI=0.0724858;REFB=-0.025435;REVB=-0.010301;RO=13;SAF=8;SAR=6;SRF=1;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.405369;STB=0.726997;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0299465;OID=.;OPOS=61873080;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:13:14:14:0.518519:6:8:1:12:6:8:1:12
chr20	61878950	.	A	C	31.13	PASS	AF=0.5;AO=4;DP=9;FAO=5;FDP=10;FR=.;FRO=5;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=-0.00979803;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.1664;QD=12.45;RBI=0.169549;REFB=-0.00777568;REVB=0.169266;RO=5;SAF=1;SAR=3;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.386089;STB=0.691764;STBP=0.745;TYPE=snp;VARB=0.024341;OID=.;OPOS=61878950;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:28:9:10:5:5:4:5:0.5:3:1:0:5:4:1:0:5
chr20	61880169	.	T	G	165.96	PASS	AF=0.53125;AO=17;DP=33;FAO=17;FDP=32;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=9;FWDB=-0.0244456;FXX=0.0302939;HRUN=3;LEN=1;MLLD=243.566;QD=20.745;RBI=0.0246832;REFB=-0.0108899;REVB=-0.00341641;RO=15;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0420242;STB=0.523781;STBP=0.826;TYPE=snp;VARB=0.00946301;OID=.;OPOS=61880169;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:32:15:15:17:17:0.53125:11:6:6:9:11:6:6:9
chr20	61880182	.	G	A	161.5	PASS	AF=0.5;AO=17;DP=34;FAO=17;FDP=34;FR=.;FRO=17;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=-0.000612235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.029;QD=19.0002;RBI=0.0457952;REFB=0.00596585;REVB=0.0457911;RO=17;SAF=6;SAR=11;SRF=5;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0578869;STB=0.532781;STBP=0.744;TYPE=snp;VARB=-0.00593341;OID=.;OPOS=61880182;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:17:17:17:17:0.5:11:6:5:12:11:6:5:12
chr20	61881296	.	A	G	471.98	PASS	AF=0.505495;AO=46;DP=92;FAO=46;FDP=91;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=22;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.0137693;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.668;QD=20.7465;RBI=0.0170952;REFB=-0.0194308;REVB=0.0101317;RO=44;SAF=24;SAR=22;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0192271;STB=0.505261;STBP=0.947;TYPE=snp;VARB=0.01774;OID=.;OPOS=61881296;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:91:44:45:46:46:0.505495:22:24:22:22:22:24:23:22
chr20	61918164	.	C	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0143249;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.13;QD=50.4135;RBI=0.0358054;REFB=0;REVB=0.032815;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422049;OID=.;OPOS=61918164;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
chr20	61941747	.	A	G	325.5	PASS	AF=1;AO=22;DP=25;FAO=24;FDP=24;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.02865;FXX=0.039984;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.918;QD=54.2502;RBI=0.0748239;REFB=0;REVB=-0.0691216;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000297666;OID=.;OPOS=61941747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:24:0:0:22:24:1:10:12:0:0:9:15:0:0
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chr20	61981536	.	A	G	411.1	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00418271;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.3291;QD=56.7032;RBI=0.00593301;REFB=0;REVB=0.0042078;RO=0;SAF=27;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.75607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.88241e-07;OID=.;OPOS=61981536;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:2:27:0:0:2:27:0:0
chr20	61982085	.	A	G	1509.72	PASS	AF=0.990291;AO=101;DP=103;FAO=102;FDP=103;FR=.;FRO=1;FSAF=53;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0549009;FXX=0.00961446;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.452;QD=58.63;RBI=0.0602428;REFB=-0.0937941;REVB=-0.0248009;RO=1;SAF=52;SAR=49;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00903647;STB=0.504672;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.000800848;OID=.;OPOS=61982085;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:103:103:1:1:101:102:0.990291:49:52:1:0:49:53:1:0
chr20	61986863	.	C	G	685.15	PASS	AF=0.957447;AO=45;DP=47;FAO=45;FDP=47;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0122253;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=244.469;QD=58.3107;RBI=0.0355135;REFB=-0.192817;REVB=0.033343;RO=2;SAF=23;SAR=22;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.000888191;STB=0.500473;STBP=0.87;TYPE=snp;VARB=0.0010933;OID=.;OPOS=61986863;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:47:47:2:2:45:45:0.957447:22:23:1:1:22:23:1:1
chr20	61986949	.	T	C	207.11	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0666162;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.8413;QD=48.7312;RBI=0.0677589;REFB=0;REVB=-0.0123916;RO=0;SAF=7;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000976702;OID=.;OPOS=61986949;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:10:7:0:0:10:7:0:0
chr20	61990939	.	G	A	1412.68	PASS	AF=1;AO=89;DP=89;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=52;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023474;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.614;QD=62.7857;RBI=0.088218;REFB=0;REVB=0.0850376;RO=0;SAF=37;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000148688;OID=.;OPOS=61990939;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:90:0:0:89:90:1:52:37:0:0:52:38:0:0
chr20	62126185	.	A	G	187.68	PASS	AF=0.389831;AO=23;DP=59;FAO=23;FDP=59;FR=.;FRO=36;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=26;FSRR=10;FWDB=-0.0274537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=68.4463;QD=12.7239;RBI=0.0943921;REFB=0.00365685;REVB=-0.0903115;RO=36;SAF=12;SAR=11;SRF=26;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.217211;STB=0.623781;STBP=0.15;TYPE=snp;VARB=-0.0094358;OID=.;OPOS=62126185;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:36:36:23:23:0.389831:11:12:26:10:11:12:26:10
chr20	62126299	.	C	T	488.43	PASS	AF=0.456897;AO=52;DP=115;FAO=53;FDP=116;FR=.;FRO=63;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=-0.0024436;FXX=0.00854628;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.9154;QD=16.8423;RBI=0.0258382;REFB=-0.00508218;REVB=-0.0257224;RO=61;SAF=24;SAR=28;SRF=38;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.155483;STB=0.589512;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00480081;OID=.;OPOS=62126299;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:115:116:61:63:52:53:0.456897:28:24:38:23:29:24:39:24
chr20	62172219	.	G	A	1993.97	PASS	AF=1;AO=119;DP=119;FAO=129;FDP=129;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00104272;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.664;QD=61.8284;RBI=0.175061;REFB=0;REVB=0.175058;RO=0;SAF=67;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0287e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000120189;OID=.;OPOS=62172219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:119:129:0:0:119:129:1:52:67:0:0:62:67:0:0
chr20	62173562	.	G	T	1515.7	PASS	AF=1;AO=100;DP=101;FAO=102;FDP=102;FR=.;FRO=0;FSAF=57;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00652091;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.146;QD=59.4394;RBI=0.00676655;REFB=0;REVB=0.00180663;RO=0;SAF=57;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00034925;OID=.;OPOS=62173562;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:102:0:0:100:102:1:43:57:0:0:45:57:0:0
chr20	62174724	.	G	A	1010.1	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288658;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.2914;QD=59.4176;RBI=0.186687;REFB=0;REVB=0.184442;RO=0;SAF=34;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00155529;OID=.;OPOS=62174724;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:68:0:0:63:68:1:29:34:0:0:34:34:0:0
chr20	62187187	.	T	C	666.54	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0303053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.145;QD=62.004;RBI=0.0357041;REFB=0;REVB=0.0188778;RO=0;SAF=28;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140268;OID=.;OPOS=62187187;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:14:28:0:0:14:29:0:0
chr20	62187439	.	T	C	175.67	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0351354;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.129;QD=46.846;RBI=0.0381183;REFB=0;REVB=0.014782;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000396281;OID=.;OPOS=62187439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:5:10:0:0:5:10:0:0
chr20	62191321	.	A	G	655.21	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00163409;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.785;QD=60.9501;RBI=0.00908684;REFB=0;REVB=0.0089387;RO=0;SAF=21;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149515;OID=.;OPOS=62191321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:21:21:0:0:22:21:0:0
chr20	62191558	.	G	A	220.65	PASS	AF=0.44898;AO=22;DP=49;FAO=22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0170813;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.2746;QD=18.0123;RBI=0.0501855;REFB=-0.0392827;REVB=0.0471891;RO=27;SAF=9;SAR=13;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0351417;STB=0.519982;STBP=0.825;TYPE=snp;VARB=0.0490445;OID=.;OPOS=62191558;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:27:27:22:22:0.44898:13:9:12:15:13:9:12:15
chr20	62191937	.	G	A	229.51	PASS	AF=0.536585;AO=22;DP=41;FAO=22;FDP=41;FR=.;FRO=19;FSAF=20;FSAR=2;FSRF=10;FSRR=9;FWDB=0.0502141;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=121.749;QD=22.3914;RBI=0.0502141;REFB=0.00540872;REVB=1.35948e-05;RO=19;SAF=20;SAR=2;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.495756;STB=0.785385;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=-0.0182153;OID=.;OPOS=62191937;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:19:19:22:22:0.536585:2:20:10:9:2:20:10:9
chr20	62193019	.	C	T	187.34	PASS	AF=0.475;AO=15;DP=40;FAO=19;FDP=40;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=3;FSRR=18;FWDB=-0.00402599;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=167.157;QD=18.734;RBI=0.0042285;REFB=-0.0190121;REVB=0.0012929;RO=16;SAF=10;SAR=5;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413581;STB=0.697495;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0149349;OID=.;OPOS=62193019;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:16:21:15:19:0.475:5:10:3:13:9:10:3:18
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chr20	62194103	.	A	G	987.22	PASS	AF=0.985507;AO=67;DP=68;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00450694;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.605;QD=57.2304;RBI=0.0107679;REFB=-0.0388402;REVB=0.00977935;RO=1;SAF=32;SAR=35;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0133112;STB=0.506847;STBP=0.511;TYPE=snp;VARB=0.00109629;OID=.;OPOS=62194103;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:69:1:1:67:68:0.985507:35:32:0:1:36:32:0:1
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chr20	62196807	.	T	C	1453.33	PASS	AF=1;AO=91;DP=91;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00311243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.539;QD=63.1884;RBI=0.0219506;REFB=0;REVB=0.0217288;RO=0;SAF=64;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.02153e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.26587e-05;OID=.;OPOS=62196807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:91:92:0:0:91:92:1:27:64:0:0:27:65:0:0
chr20	62196884	.	A	G	2291.64	PASS	AF=1;AO=144;DP=144;FAO=144;FDP=144;FR=.;FRO=0;FSAF=98;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0037792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.363;QD=63.6566;RBI=0.0300007;REFB=0;REVB=-0.0297617;RO=0;SAF=98;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.83196e-05;OID=.;OPOS=62196884;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:144:144:0:0:144:144:1:46:98:0:0:46:98:0:0
chr20	62198236	.	G	A	294.34	PASS	AF=0.735294;AO=25;DP=34;FAO=25;FDP=34;FR=.;FRO=9;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=7;FSRR=2;FWDB=0.0308114;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.092;QD=34.6283;RBI=0.0308214;REFB=-0.0575103;REVB=-0.000782345;RO=9;SAF=18;SAR=7;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0353416;STB=0.519273;STBP=0.713;TYPE=snp;VARB=0.0361225;OID=.;OPOS=62198236;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:59:34:34:9:9:25:25:0.735294:7:18:7:2:7:18:7:2
chr20	62198348	.	C	T	1511.03	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0515611;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.032;QD=63.6225;RBI=0.0564021;REFB=0;REVB=0.0228615;RO=0;SAF=44;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.12136e-05;OID=.;OPOS=62198348;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:95:0:0:93:95:1:49:44:0:0:50:45:0:0
chr20	62198662	.	A	G	694.78	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00338899;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.4545;QD=61.7582;RBI=0.0192772;REFB=0;REVB=-0.018977;RO=0;SAF=33;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000140886;OID=.;OPOS=62198662;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:45:0:0:43:45:1:10:33:0:0:10:35:0:0
chr20	62200575	.	TG	CA,CG	737.56	PASS	AF=0.510204,0.489796;AO=25,23;DP=49;FAO=25,24;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=15,14;FSAR=10,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000184766,-0.00317451;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=71.9652,68.3823;QD=60.2092;RBI=0.103737,0.124773;REFB=0,0;REVB=0.103736,0.124733;RO=1;SAF=15,14;SAR=10,9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.044143,0.0486633;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=mnp,snp;VARB=-0.0298998,0.0259207;OID=.,.;OPOS=62200575,62200575;OREF=TG,T;OALT=CA,C;OMAPALT=CA,CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:99:49:49:1:0:25,23:25,24:0.510204,0.489796:10,9:15,14:0:1:10,10:15,14:0:0
chr20	62200860	.	A	G	978.96	PASS	AF=0.985507;AO=65;DP=66;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.040562;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.707;QD=56.7513;RBI=0.0699895;REFB=-0.0949091;REVB=0.0570373;RO=1;SAF=35;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0154862;STB=0.50769;STBP=0.32;TYPE=snp;VARB=0.00074662;OID=.;OPOS=62200860;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:69:1:1:65:68:0.985507:30:35:0:1:32:36:0:1
chr20	62221364	.	G	A	481.4	PASS	AF=0.944444;AO=34;DP=36;FAO=34;FDP=36;FR=.;FRO=2;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0536936;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=196.014;QD=53.4887;RBI=0.0655826;REFB=-0.0164466;REVB=0.0376574;RO=2;SAF=14;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622008;STB=0.533314;STBP=0.131;TYPE=snp;VARB=0.000403511;OID=.;OPOS=62221364;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:36:36:2:2:34:34:0.944444:20:14:2:0:20:14:2:0
chr20	62221610	.	T	C	1503.61	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.223;QD=63.3101;RBI=0.0317861;REFB=0;REVB=0.00962475;RO=0;SAF=65;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.24534e-05;OID=.;OPOS=62221610;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:95:0:0:94:95:1:29:65:0:0:30:65:0:0
chr20	62221766	.	C	G,T	687.95	PASS	AF=0.0625,0.895833;AO=5,41;DP=47;FAO=3,43;FDP=48;FR=.;FRO=2;FSAF=1,25;FSAR=2,18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0343618,-0.00605814;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=27.2195,157.68;QD=57.3292;RBI=0.0426399,0.023897;REFB=0.00318632,-0.0171017;REVB=-0.0252473,0.0231164;RO=1;SAF=3,23;SAR=2,18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.121807,-0.0199652;STB=0.74849,0.519222;STBP=0.297,0.286;TYPE=snp,snp;VARB=0.0426654,0.00168444;OID=.,.;OPOS=62221766,62221766;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:13:47:48:1:2:5,41:3,43:0.0625,0.895833:2,18:3,23:1:0:2,18:1,25:2:0
chr20	62227081	.	A	G	632.19	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.041822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.8963;QD=61.6772;RBI=0.0456096;REFB=0;REVB=0.0181976;RO=0;SAF=23;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000154656;OID=.;OPOS=62227081;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:18:23:0:0:18:23:0:0
chr20	62236148	.	T	C	596.07	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312042;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.449;QD=61.1357;RBI=0.1047;REFB=0;REVB=0.0999417;RO=0;SAF=26;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000359822;OID=.;OPOS=62236148;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:39:0:0:36:39:1:10:26:0:0:13:26:0:0
chr20	62309554	.	C	T	1097.79	PASS	AF=0.961538;AO=75;DP=78;FAO=75;FDP=78;FR=.;FRO=3;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00678148;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=253.265;QD=56.2971;RBI=0.0291451;REFB=-0.00634281;REVB=0.0283451;RO=3;SAF=44;SAR=31;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0311701;STB=0.516479;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=5.34078e-05;OID=.;OPOS=62309554;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:78:78:3:3:75:75:0.961538:31:44:3:0:31:44:3:0
chr20	62319464	.	T	C	738.25	PASS	AF=0.981481;AO=51;DP=52;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=37;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00322208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=128.949;QD=54.6849;RBI=0.00863997;REFB=-0.0820942;REVB=0.00801668;RO=1;SAF=37;SAR=14;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0324419;STB=0.515146;STBP=0.201;TYPE=snp;VARB=0.00181998;OID=.;OPOS=62319464;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:52:54:1:1:51:53:0.981481:14:37:0:1:16:37:0:1
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chr20	62737318	.	G	A	772.94	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0319577;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=294.986;QD=61.8352;RBI=0.0353678;REFB=-0.138623;REVB=0.0151521;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511623;STBP=0.325;TYPE=snp;VARB=0.000371668;OID=.;OPOS=62737318;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:50:50:0:1:49:49:0.98:21:28:0:0:21:28:0:1
chr21	9907271	.	A	G	856.3	PASS	AF=0.394309;AO=98;DP=241;FAO=97;FDP=246;FR=.;FRO=149;FSAF=56;FSAR=41;FSRF=55;FSRR=94;FWDB=-0.0536545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.5265;QD=13.9236;RBI=0.145384;REFB=-0.0254499;REVB=-0.135121;RO=143;SAF=56;SAR=42;SRF=55;SRR=88;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196075;STB=0.624201;STBP=0.004;TYPE=snp;VARB=0.0380622;OID=.;OPOS=9907271;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:241:246:143:149:98:97:0.394309:42:56:55:88:41:56:55:94
chr21	9907322	.	G	T	33.49	PASS	AF=0.0592334;AO=17;DP=287;FAO=17;FDP=287;FR=.;FRO=270;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=112;FSRR=158;FWDB=0.0316247;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.1238;QD=0.466827;RBI=0.0389779;REFB=0.00137859;REVB=0.022785;RO=270;SAF=13;SAR=4;SRF=112;SRR=158;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.351977;STB=0.807801;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.0134043;OID=.;OPOS=9907322;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:287:287:270:270:17:17:0.0592334:4:13:112:158:4:13:112:158
chr21	9907340	.	A	G	282.26	PASS	AF=0.190299;AO=51;DP=266;FAO=51;FDP=268;FR=.;FRO=217;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=83;FSRR=134;FWDB=-0.0322043;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.564;QD=4.2129;RBI=0.0349528;REFB=-0.00496202;REVB=-0.013586;RO=213;SAF=30;SAR=21;SRF=80;SRR=133;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269377;STB=0.66205;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0212717;OID=.;OPOS=9907340;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:266:268:213:217:51:51:0.190299:21:30:80:133:21:30:83:134
chr21	9907343	.	G	A	33.99	PASS	AF=0.0615385;AO=16;DP=260;FAO=16;FDP=260;FR=.;FRO=244;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=100;FSRR=144;FWDB=-0.0268242;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.339;QD=0.522886;RBI=0.0799841;REFB=-0.000886168;REVB=0.075352;RO=233;SAF=12;SAR=4;SRF=99;SRR=134;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.337277;STB=0.798219;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.0140568;OID=.;OPOS=9907343;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:260:260:233:244:16:16:0.0615385:4:12:99:134:4:12:100:144
chr21	9907345	.	C	T	345.04	PASS	AF=0.220472;AO=56;DP=253;FAO=56;FDP=254;FR=.;FRO=198;FSAF=24;FSAR=32;FSRF=86;FSRR=112;FWDB=0.00255978;FXX=0.00392141;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.982;QD=5.43365;RBI=0.0402017;REFB=-0.011128;REVB=-0.0401202;RO=196;SAF=24;SAR=32;SRF=86;SRR=110;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0132549;STB=0.504586;STBP=0.935;TYPE=snp;VARB=0.0389701;OID=.;OPOS=9907345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:253:254:196:198:56:56:0.220472:32:24:86:110:32:24:86:112
chr21	9907375	.	T	C	669.65	PASS	AF=0.372093;AO=80;DP=217;FAO=80;FDP=215;FR=.;FRO=135;FSAF=40;FSAR=40;FSRF=45;FSRR=90;FWDB=0.036761;FXX=0.00921617;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.5445;QD=12.4586;RBI=0.0432407;REFB=-0.000185999;REVB=-0.0227681;RO=134;SAF=40;SAR=40;SRF=45;SRR=89;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.182558;STB=0.604626;STBP=0.018;TYPE=snp;VARB=0.000172013;OID=.;OPOS=9907375;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:217:215:134:135:80:80:0.372093:40:40:45:89:40:40:45:90
chr21	9907384	.	GC	AA,AC	624.78	PASS	AF=0.040404,0.338384;AO=8,64;DP=199;FAO=8,67;FDP=198;FR=.;FRO=123;FSAF=5,33;FSAR=3,34;FSRF=43;FSRR=80;FWDB=-0.011794,-0.00253696;FXX=0.00502487;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=186.419,143.126;QD=12.6218;RBI=0.0132421,0.00684083;REFB=-0.00517594,-0.0221748;REVB=-0.00602119,0.00635302;RO=111;SAF=5,31;SAR=3,33;SRF=42;SRR=69;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.25616,0.119192;STB=0.741871,0.592788;STBP=0.214,0.076;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0260946,0.0292696;OID=.,.;OPOS=9907384,9907384;OREF=GC,G;OALT=AA,A;OMAPALT=AA,AC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:199:198:111:123:8,64:8,67:0.040404,0.338384:3,33:5,31:42:69:3,34:5,33:43:80
chr21	9907397	.	C	T	572.19	PASS	AF=0.356021;AO=68;DP=191;FAO=68;FDP=191;FR=.;FRO=123;FSAF=32;FSAR=36;FSRF=45;FSRR=78;FWDB=-0.0574993;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=128.684;QD=11.9831;RBI=0.0619516;REFB=-0.00526216;REVB=-0.0230615;RO=123;SAF=32;SAR=36;SRF=45;SRR=78;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.120111;STB=0.568205;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.0222163;OID=.;OPOS=9907397;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:191:191:123:123:68:68:0.356021:36:32:45:78:36:32:45:78
chr21	9907416	.	C	T	323.81	PASS	AF=0.288462;AO=45;DP=156;FAO=45;FDP=156;FR=.;FRO=111;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=45;FSRR=66;FWDB=-0.041923;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=190.483;QD=8.30283;RBI=0.0421151;REFB=-0.0178549;REVB=-0.00401782;RO=111;SAF=20;SAR=25;SRF=45;SRR=66;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0482115;STB=0.528289;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0366799;OID=.;OPOS=9907416;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:156:156:111:111:45:45:0.288462:25:20:45:66:25:20:45:66
chr21	9907419	.	A	G	63.06	PASS	AF=0.106667;AO=16;DP=150;FAO=16;FDP=150;FR=.;FRO=134;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=52;FSRR=82;FWDB=-0.0309013;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.788;QD=1.68171;RBI=0.0354412;REFB=-0.00776277;REVB=-0.0173547;RO=133;SAF=9;SAR=7;SRF=52;SRR=81;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.206702;STB=0.652101;STBP=0.228;TYPE=snp;VARB=0.0564409;OID=.;OPOS=9907419;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:150:150:133:134:16:16:0.106667:7:9:52:81:7:9:52:82
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chr21	9907431	.	G	A	74.47	PASS	AF=0.12782;AO=17;DP=133;FAO=17;FDP=133;FR=.;FRO=116;FSAF=2;FSAR=15;FSRF=50;FSRR=66;FWDB=0.00477768;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4654;QD=2.23982;RBI=0.0149613;REFB=0.00259697;REVB=0.0141779;RO=114;SAF=2;SAR=15;SRF=49;SRR=65;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.449251;STB=0.827585;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=-0.0169803;OID=.;OPOS=9907431;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:133:133:114:116:17:17:0.12782:15:2:49:65:15:2:50:66
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chr21	9909079	.	C	T	92.19	PASS	AF=0.102767;AO=26;DP=253;FAO=26;FDP=253;FR=.;FRO=227;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=113;FSRR=114;FWDB=0.00502274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.41;QD=1.45761;RBI=0.0569489;REFB=-0.00933971;REVB=-0.056727;RO=227;SAF=11;SAR=15;SRF=113;SRR=114;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0911733;STB=0.567194;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0638095;OID=.;OPOS=9909079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:92:253:253:227:227:26:26:0.102767:15:11:113:114:15:11:113:114
chr21	9909080	.	G	A	67.06	PASS	AF=0.0869565;AO=22;DP=253;FAO=22;FDP=253;FR=.;FRO=231;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=110;FSRR=121;FWDB=-0.0279839;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.192;QD=1.06025;RBI=0.0280351;REFB=-0.00752279;REVB=-0.00169226;RO=228;SAF=14;SAR=8;SRF=108;SRR=120;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190204;STB=0.64533;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.0601487;OID=.;OPOS=9909080;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:253:253:228:231:22:22:0.0869565:8:14:108:120:8:14:110:121
chr21	9909089	.	T	C	89.24	PASS	AF=0.0978261;AO=27;DP=273;FAO=27;FDP=276;FR=.;FRO=249;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=123;FSRR=126;FWDB=-0.0179706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=165.072;QD=1.29333;RBI=0.0333758;REFB=-0.00509678;REVB=-0.0281248;RO=245;SAF=11;SAR=16;SRF=119;SRR=126;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0953675;STB=0.578463;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0554922;OID=.;OPOS=9909089;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:273:276:245:249:27:27:0.0978261:16:11:119:126:16:11:123:126
chr21	9909103	.	G	A	189.31	PASS	AF=0.139159;AO=43;DP=310;FAO=43;FDP=309;FR=.;FRO=266;FSAF=29;FSAR=14;FSRF=125;FSRR=141;FWDB=-0.0142672;FXX=0.00643066;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0562;QD=2.45064;RBI=0.0502414;REFB=-0.0130331;REVB=0.0481731;RO=261;SAF=29;SAR=14;SRF=122;SRR=139;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.264695;STB=0.675756;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=0.0567464;OID=.;OPOS=9909103;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:310:309:261:266:43:43:0.139159:14:29:122:139:14:29:125:141
chr21	9909122	.	G	A	78.15	PASS	AF=0.0812325;AO=29;DP=356;FAO=29;FDP=357;FR=.;FRO=328;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=155;FSRR=173;FWDB=-0.0242513;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.204;QD=0.8756;RBI=0.0318376;REFB=-0.00392714;REVB=-0.0206279;RO=327;SAF=15;SAR=14;SRF=154;SRR=173;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.053602;STB=0.540955;STBP=0.671;TYPE=snp;VARB=0.0561778;OID=.;OPOS=9909122;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:78:356:357:327:328:29:29:0.0812325:14:15:154:173:14:15:155:173
chr21	9909124	.	C	T	95.8	PASS	AF=0.0898876;AO=32;DP=356;FAO=32;FDP=356;FR=.;FRO=324;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=162;FSRR=162;FWDB=0.00354132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9723;QD=1.07637;RBI=0.0124569;REFB=-0.00106642;REVB=0.0119429;RO=323;SAF=8;SAR=24;SRF=161;SRR=162;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.300448;STB=0.73261;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0169019;OID=.;OPOS=9909124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:356:356:323:324:32:32:0.0898876:24:8:161:162:24:8:162:162
chr21	9909149	.	G	A	70.2	PASS	AF=0.0765027;AO=28;DP=366;FAO=28;FDP=366;FR=.;FRO=338;FSAF=19;FSAR=9;FSRF=150;FSRR=188;FWDB=0.00341102;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=241.198;QD=0.767227;RBI=0.00342103;REFB=-0.0035017;REVB=-0.000261487;RO=338;SAF=19;SAR=9;SRF=150;SRR=188;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263262;STB=0.71091;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0407953;OID=.;OPOS=9909149;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:366:366:338:338:28:28:0.0765027:9:19:150:188:9:19:150:188
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chr21	9909179	.	C	A	307.89	PASS	AF=0.172619;AO=58;DP=338;FAO=58;FDP=336;FR=.;FRO=278;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=126;FSRR=152;FWDB=-0.0115201;FXX=0.0289009;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.524;QD=3.66539;RBI=0.0228726;REFB=-0.00788574;REVB=-0.0197596;RO=275;SAF=30;SAR=28;SRF=124;SRR=151;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0858482;STB=0.552807;STBP=0.385;TYPE=snp;VARB=0.048233;OID=.;OPOS=9909179;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:338:336:275:278:58:58:0.172619:28:30:124:151:28:30:126:152
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chr21	9909208	.	C	T	222.39	PASS	AF=0.155116;AO=44;DP=299;FAO=47;FDP=303;FR=.;FRO=256;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=125;FSRR=131;FWDB=0.0172735;FXX=0.00655716;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.792;QD=2.93579;RBI=0.0300323;REFB=-0.00757763;REVB=-0.0245676;RO=251;SAF=19;SAR=25;SRF=123;SRR=128;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0751776;STB=0.517089;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0554154;OID=.;OPOS=9909208;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:299:303:251:256:44:47:0.155116:25:19:123:128:25:22:125:131
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chr21	9909218	.	GT	AC,GC	300.19	PASS	AF=0.14717,0.0641509;AO=40,18;DP=266;FAO=39,17;FDP=265;FR=.;FRO=209;FSAF=14,9;FSAR=25,8;FSRF=100;FSRR=109;FWDB=-0.0426438,-0.134709;FXX=0.00375926;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=181.213,88.5132;QD=4.53123;RBI=0.0440277,0.134746;REFB=-0.0116171,-0.0150156;REVB=0.0109518,0.00313243;RO=206;SAF=15,10;SAR=25,8;SRF=98;SRR=108;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.132029,0.0909479;STB=0.602993,0.546958;STBP=0.154,0.694;TYPE=mnp,snp;VARB=0.0389309,0.0662517;OID=.,.;OPOS=9909218,9909219;OREF=GT,T;OALT=AC,C;OMAPALT=AC,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:266:265:206:209:40,18:39,17:0.14717,0.0641509:25,8:15,10:98:108:25,8:14,9:100:109
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chr21	9909273	.	C	T	73.01	PASS	AF=0.120567;AO=17;DP=143;FAO=17;FDP=141;FR=.;FRO=124;FSAF=4;FSAR=13;FSRF=47;FSRR=77;FWDB=0.0135736;FXX=0.013985;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.594;QD=2.0711;RBI=0.0238056;REFB=-0.0130304;REVB=-0.0195567;RO=117;SAF=4;SAR=13;SRF=46;SRR=71;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221293;STB=0.647906;STBP=0.224;TYPE=snp;VARB=0.0606818;OID=.;OPOS=9909273;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:73:143:141:117:124:17:17:0.120567:13:4:46:71:13:4:47:77
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chr21	10862599	.	C	T	1031.71	PASS	AF=0.502513;AO=100;DP=199;FAO=100;FDP=199;FR=.;FRO=99;FSAF=64;FSAR=36;FSRF=68;FSRR=31;FWDB=0.00152312;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=234.676;QD=20.7378;RBI=0.00333635;REFB=-0.0124432;REVB=-0.00296839;RO=99;SAF=64;SAR=36;SRF=68;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0467893;STB=0.525659;STBP=0.48;TYPE=snp;VARB=0.0118903;OID=.;OPOS=10862599;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:199:199:99:99:100:100:0.502513:36:64:68:31:36:64:68:31
chr21	10862618	.	T	C	1793.71	PASS	AF=0.712919;AO=149;DP=210;FAO=149;FDP=209;FR=.;FRO=60;FSAF=98;FSAR=51;FSRF=39;FSRR=21;FWDB=-0.00999682;FXX=0.00476168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.045;QD=34.3293;RBI=0.0246194;REFB=-0.0189904;REVB=0.0224984;RO=60;SAF=98;SAR=51;SRF=39;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00459482;STB=0.502456;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0107835;OID=.;OPOS=10862618;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:209:60:60:149:149:0.712919:51:98:39:21:51:98:39:21
chr21	10862846	.	A	T	1413.75	PASS	AF=0.73125;AO=103;DP=163;FAO=117;FDP=160;FR=.,HEALED;FRO=41;FSAF=60;FSAR=57;FSRF=18;FSRR=23;FWDB=0.060684;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=163.981;QD=35.3438;RBI=0.061025;REFB=-0.028028;REVB=-0.00644265;RO=40;SAF=43;SAR=60;SRF=17;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00403719;STB=0.51914;STBP=0.415;TYPE=snp;VARB=0.00941129;OID=.;OPOS=10862846;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:160:40:41:103:117:0.73125:60:43:17:23:57:60:18:23
chr21	10862853	.	G	A	443.36	PASS	AF=0.323864;AO=57;DP=176;FAO=57;FDP=176;FR=.;FRO=119;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=61;FSRR=58;FWDB=-0.0326209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2306;QD=10.0764;RBI=0.0512541;REFB=0.0135253;REVB=-0.0395331;RO=119;SAF=31;SAR=26;SRF=61;SRR=58;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0367394;STB=0.52121;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=-0.0390281;OID=.;OPOS=10862853;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:176:176:119:119:57:57:0.323864:26:31:61:58:26:31:61:58
chr21	10862874	.	A	G	1077.45	PASS	AF=0.561111;AO=101;DP=180;FAO=101;FDP=180;FR=.;FRO=79;FSAF=59;FSAR=42;FSRF=41;FSRR=38;FWDB=0.0403412;FXX=0.00552456;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.9874;QD=23.9433;RBI=0.082023;REFB=-0.0212241;REVB=-0.0714168;RO=78;SAF=59;SAR=42;SRF=40;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0581155;STB=0.529142;STBP=0.414;TYPE=snp;VARB=0.0168598;OID=.;OPOS=10862874;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:180:180:78:79:101:101:0.561111:42:59:40:38:42:59:41:38
chr21	10862947	.	G	A	1190.75	PASS	AF=0.646341;AO=103;DP=162;FAO=106;FDP=164;FR=.;FRO=58;FSAF=61;FSAR=45;FSRF=35;FSRR=23;FWDB=0.00785577;FXX=0.00606024;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.955;QD=29.0427;RBI=0.010605;REFB=-0.00414776;REVB=-0.00712408;RO=58;SAF=58;SAR=45;SRF=36;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0393032;STB=0.510154;STBP=0.727;TYPE=snp;VARB=0.00231729;OID=.;OPOS=10862947;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:164:58:58:103:106:0.646341:45:58:36:22:45:61:35:23
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chr21	10910347	.	A	G	1335.4	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193066;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.8856;QD=62.1114;RBI=0.0441881;REFB=0;REVB=0.0397472;RO=0;SAF=46;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0002554;OID=.;OPOS=10910347;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:86:86:0:0:86:86:1:40:46:0:0:40:46:0:0
chr21	10920098	.	T	C	727.69	PASS	AF=0.963636;AO=53;DP=55;FAO=53;FDP=55;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.00517052;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=218.868;QD=52.9227;RBI=0.0486062;REFB=-0.160212;REVB=0.0483304;RO=2;SAF=27;SAR=26;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0348675;STB=0.518512;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.000607707;OID=.;OPOS=10920098;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:55:55:2:2:53:53:0.963636:26:27:0:2:26:27:0:2
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chr21	11029653	.	C	T	68.24	PASS	AF=0.106509;AO=18;DP=169;FAO=18;FDP=169;FR=.;FRO=151;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=90;FSRR=61;FWDB=-0.0195444;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=223.704;QD=1.61511;RBI=0.0196105;REFB=0.00193591;REVB=-0.00160827;RO=150;SAF=6;SAR=12;SRF=90;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315839;STB=0.724294;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=-0.0106586;OID=.;OPOS=11029653;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:169:169:150:151:18:18:0.106509:12:6:90:60:12:6:90:61
chr21	11029679	.	C	G	74.58	PASS	AF=0.115385;AO=18;DP=157;FAO=18;FDP=156;FR=.;FRO=138;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=81;FSRR=57;FWDB=-0.00964486;FXX=0.00636902;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.889;QD=1.91237;RBI=0.0809206;REFB=-0.00176511;REVB=-0.0803438;RO=134;SAF=8;SAR=10;SRF=77;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.159803;STB=0.62399;STBP=0.278;TYPE=snp;VARB=0.016652;OID=.;OPOS=11029679;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:74:157:156:134:138:18:18:0.115385:10:8:77:57:10:8:81:57
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chr21	11038843	.	G	C	2493.73	PASS	AF=0.686869;AO=204;DP=297;FAO=204;FDP=297;FR=.;FRO=93;FSAF=153;FSAR=51;FSRF=39;FSRR=54;FWDB=0.0489031;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=83.7497;QD=33.5856;RBI=0.0542542;REFB=-0.0380211;REVB=0.0234947;RO=93;SAF=153;SAR=51;SRF=39;SRR=54;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.225637;STB=0.621289;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0225493;OID=.;OPOS=11038843;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:297:297:93:93:204:204:0.686869:51:153:39:54:51:153:39:54
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chr21	11097608	.	C	T	120.43	PASS	AF=0.211111;AO=18;DP=88;FAO=19;FDP=90;FR=.;FRO=71;FSAF=4;FSAR=15;FSRF=40;FSRR=31;FWDB=-0.0339679;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.1787;QD=5.35232;RBI=0.0340187;REFB=-0.00765042;REVB=0.00185808;RO=70;SAF=3;SAR=15;SRF=39;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.502455;STB=0.78169;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.0403014;OID=.;OPOS=11097608;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:90:70:71:18:19:0.211111:15:3:39:31:15:4:40:31
chr21	11098674	.	T	C	727.79	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474864;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.038;QD=63.2858;RBI=0.0633723;REFB=0;REVB=0.0419653;RO=0;SAF=25;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.85991e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196914;OID=.;OPOS=11098674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:21:25:0:0:21:25:0:0
chr21	11098679	.	C	T	40.7	PASS	AF=0.152174;AO=7;DP=46;FAO=7;FDP=46;FR=.;FRO=39;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=19;FWDB=0.0347019;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.7103;QD=3.53911;RBI=0.0441683;REFB=-0.0117122;REVB=0.0273243;RO=38;SAF=5;SAR=2;SRF=19;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.263143;STB=0.676898;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.0668694;OID=.;OPOS=11098679;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:46:46:38:39:7:7:0.152174:2:5:19:19:2:5:20:19
chr21	11098684	.	A	G	39.76	PASS	AF=0.137255;AO=7;DP=51;FAO=7;FDP=51;FR=.;FRO=44;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=24;FSRR=20;FWDB=0.0116311;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.9706;QD=3.1181;RBI=0.0351176;REFB=-0.0185588;REVB=-0.0331355;RO=43;SAF=5;SAR=2;SRF=24;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197653;STB=0.654302;STBP=0.431;TYPE=snp;VARB=0.0427858;OID=.;OPOS=11098684;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:51:51:43:44:7:7:0.137255:2:5:24:19:2:5:24:20
chr21	11098689	.	A	G	38.89	PASS	AF=0.132075;AO=7;DP=53;FAO=7;FDP=53;FR=.;FRO=46;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.0197452;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.162;QD=2.93478;RBI=0.0197454;REFB=-0.00346791;REVB=9.4149e-05;RO=46;SAF=6;SAR=1;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.392724;STB=0.796515;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0434502;OID=.;OPOS=11098689;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:53:53:46:46:7:7:0.132075:1:6:26:20:1:6:26:20
chr21	11098692	.	C	T	45.21	PASS	AF=0.142857;AO=8;DP=56;FAO=8;FDP=56;FR=.;FRO=48;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=27;FSRR=21;FWDB=0.00612429;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=121.352;QD=3.22904;RBI=0.0191434;REFB=-0.0084259;REVB=-0.0181373;RO=47;SAF=7;SAR=1;SRF=26;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.441411;STB=0.818243;STBP=0.09;TYPE=snp;VARB=0.0257233;OID=.;OPOS=11098692;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:56:56:47:48:8:8:0.142857:1:7:26:21:1:7:27:21
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chr21	11098763	.	C	T	114.83	PASS	AF=0.261538;AO=17;DP=65;FAO=17;FDP=65;FR=.;FRO=48;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=-0.0151699;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=135.671;QD=7.06655;RBI=0.0286552;REFB=-0.0160049;REVB=0.0243104;RO=48;SAF=3;SAR=14;SRF=25;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.451181;STB=0.77897;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0786723;OID=.;OPOS=11098763;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:48:48:17:17:0.261538:14:3:25:23:14:3:25:23
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chr21	15457339	.	T	G	58.39	PASS	AF=0.181818;AO=9;DP=55;FAO=10;FDP=55;FR=.;FRO=45;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=26;FSRR=19;FWDB=0.0300757;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.253;QD=4.24685;RBI=0.0301025;REFB=-0.00470004;REVB=0.00127043;RO=45;SAF=7;SAR=2;SRF=26;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.273167;STB=0.608469;STBP=0.485;TYPE=snp;VARB=0.0826334;OID=.;OPOS=15457339;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:55:55:45:45:9:10:0.181818:2:7:26:19:3:7:26:19
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chr21	15457374	.	G	C	77.27	PASS	AF=0.215686;AO=11;DP=51;FAO=11;FDP=51;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=3;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=-0.0275379;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=140.532;QD=6.06071;RBI=0.0297901;REFB=-0.0149606;REVB=-0.0113626;RO=40;SAF=8;SAR=3;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.203792;STB=0.632157;STBP=0.366;TYPE=snp;VARB=0.0547733;OID=.;OPOS=15457374;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:51:51:40:40:11:11:0.215686:3:8:23:17:3:8:23:17
chr21	15457399	.	G	C	65.0	PASS	AF=0.2;AO=10;DP=50;FAO=10;FDP=50;FR=.;FRO=40;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=19;FSRR=21;FWDB=-0.00658166;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=260.629;QD=5.19972;RBI=0.0264722;REFB=-0.00549349;REVB=-0.025641;RO=40;SAF=8;SAR=2;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.413665;STB=0.77254;STBP=0.083;TYPE=snp;VARB=0.0229785;OID=.;OPOS=15457399;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:50:50:40:40:10:10:0.2:2:8:19:21:2:8:19:21
chr21	15457410	.	C	G	40.49	PASS	AF=0.142857;AO=7;DP=50;FAO=7;FDP=49;FR=.;FRO=42;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=20;FSRR=22;FWDB=0.000587309;FXX=0.019996;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.1985;QD=3.30541;RBI=0.0169212;REFB=-0.00998797;REVB=-0.0169111;RO=42;SAF=5;SAR=2;SRF=20;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286813;STB=0.70529;STBP=0.301;TYPE=snp;VARB=0.095168;OID=.;OPOS=15457410;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:40:50:49:42:42:7:7:0.142857:2:5:20:22:2:5:20:22
chr21	15457463	.	CACACACAGT	C	82.76	PASS	AF=0.407407;AO=10;DP=28;FAO=11;FDP=27;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00291652;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=9;MLLD=286.617;QD=12.2609;RBI=0.00753999;REFB=-0.00354555;REVB=0.00695309;RO=13;SAF=6;SAR=4;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20469;STB=0.653058;STBP=0.182;TYPE=del;VARB=0.0031722;OID=.;OPOS=15457464;OREF=ACACACAGT;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.407407:10:28:11:27:16:7:4:6:10:82:13:6:4:5:8
chr21	15481365	.	G	T	585.34	PASS	AF=0.68;AO=48;DP=73;FAO=51;FDP=75;FR=.;FRO=24;FSAF=27;FSAR=24;FSRF=10;FSRR=14;FWDB=0.0245637;FXX=0.0131562;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.241;QD=31.2181;RBI=0.0245639;REFB=-0.0182426;REVB=0.000105007;RO=25;SAF=24;SAR=24;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0630968;STB=0.536036;STBP=0.364;TYPE=snp;VARB=0.00865349;OID=.;OPOS=15481365;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:75:25:24:48:51:0.68:24:24:10:15:24:27:10:14
chr21	15516948	.	C	T	191.64	PASS	AF=0.454545;AO=16;DP=41;FAO=20;FDP=44;FR=.;FRO=24;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=16;FSRR=8;FWDB=0.00736079;FXX=0.0222173;HRUN=1;LEN=1;MLLD=312.534;QD=17.4219;RBI=0.0257682;REFB=-0.0194828;REVB=0.0246945;RO=25;SAF=12;SAR=4;SRF=16;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.139619;STB=0.51004;STBP=0.888;TYPE=snp;VARB=0.0235259;OID=.;OPOS=15516948;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:44:25:24:16:20:0.454545:4:12:16:9:7:13:16:8
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chr21	15524921	.	C	T	98.53	PASS	AF=0.428571;AO=12;DP=28;FAO=12;FDP=28;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=7;FSRR=9;FWDB=-0.102834;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1696;QD=14.0764;RBI=0.111395;REFB=0.0311757;REVB=-0.0428251;RO=16;SAF=7;SAR=5;SRF=7;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.14236;STB=0.583194;STBP=0.49;TYPE=snp;VARB=-0.0461959;OID=.;OPOS=15524921;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:28:28:16:16:12:12:0.428571:5:7:7:9:5:7:7:9
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chr21	15596772	.	T	G	183.49	PASS	AF=0.370968;AO=23;DP=62;FAO=23;FDP=62;FR=.;FRO=39;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=20;FWDB=0.0860307;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.889;QD=11.8378;RBI=0.0879762;REFB=0.0189476;REVB=-0.0183996;RO=39;SAF=10;SAR=13;SRF=19;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.057402;STB=0.53321;STBP=0.655;TYPE=snp;VARB=-0.0345728;OID=.;OPOS=15596772;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:39:39:23:23:0.370968:13:10:19:20:13:10:19:20
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chr21	16339348	.	A	G	284.67	PASS	AF=0.526316;AO=30;DP=58;FAO=30;FDP=57;FR=.;FRO=27;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=10;FWDB=0.0160383;FXX=0.0172384;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.178;QD=19.977;RBI=0.0184562;REFB=-0.00859185;REVB=0.00913273;RO=27;SAF=19;SAR=11;SRF=17;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00338996;STB=0.501886;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00552705;OID=.;OPOS=16339348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:57:27:27:30:30:0.526316:11:19:17:10:11:19:17:10
chr21	16339570	.	T	A	374.1	PASS	AF=0.416667;AO=38;DP=94;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=0.00773957;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.17;QD=15.5873;RBI=0.00914318;REFB=-0.0269933;REVB=0.00486792;RO=55;SAF=18;SAR=20;SRF=29;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0559375;STB=0.510411;STBP=0.88;TYPE=snp;VARB=0.029599;OID=.;OPOS=16339570;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:96:55:56:38:40:0.416667:20:18:29:26:20:20:29:27
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chr21	16424607	.	C	T	79.41	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.031782;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=235.243;QD=15.8821;RBI=0.0333792;REFB=-0.00884549;REVB=0.0102016;RO=10;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.342855;STB=0.6996;STBP=0.111;TYPE=snp;VARB=0.0103012;OID=.;OPOS=16424607;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:3:7:3:7:3:7:3:7
chr21	16986637	.	G	A	766.43	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0414745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.909;QD=63.8692;RBI=0.0469165;REFB=0;REVB=0.0219323;RO=0;SAF=22;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.46901e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151724;OID=.;OPOS=16986637;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:26:22:0:0:26:22:0:0
chr21	17198541	.	C	T	677.9	PASS	AF=0.515385;AO=67;DP=130;FAO=67;FDP=130;FR=.;FRO=63;FSAF=39;FSAR=28;FSRF=39;FSRR=24;FWDB=0.0054519;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=171.437;QD=20.8586;RBI=0.0278181;REFB=0.0023056;REVB=-0.0272786;RO=63;SAF=39;SAR=28;SRF=39;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0336818;STB=0.518513;STBP=0.675;TYPE=snp;VARB=-0.00212387;OID=.;OPOS=17198541;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:130:130:63:63:67:67:0.515385:28:39:39:24:28:39:39:24
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chr21	19163707	.	C	T	1477.94	PASS	AF=1;AO=98;DP=99;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140359;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.345;QD=58.5323;RBI=0.0153338;REFB=0;REVB=-0.00617397;RO=0;SAF=45;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000545921;OID=.;OPOS=19163707;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:99:101:0:0:98:101:1:53:45:0:0:54:47:0:0
chr21	19165259	.	ACT	A	787.5	PASS	AF=1;AO=51;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0116383;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=2;MLLD=191.027;QD=56.2499;RBI=0.0374178;REFB=0;REVB=0.0355618;RO=0;SAF=26;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.000119998;OID=.;OPOS=19165260;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:51:56:56:56:0:27:29:0:0:4:0:26:25:0:0
chr21	19169218	.	G	C	880.25	PASS	AF=1;AO=43;DP=64;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00579704;FXX=0.0624902;HRUN=5;LEN=1;MLLD=300.133;QD=58.6835;RBI=0.010935;REFB=0;REVB=0.0092719;RO=0;SAF=41;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75439e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.02257e-05;OID=.;OPOS=19169218;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:60:0:0:43:60:1:2:41:0:0:17:43:0:0
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chr21	19666911	.	T	G	33.27	PASS	AF=0.146341;AO=6;DP=41;FAO=6;FDP=41;FR=.;FRO=35;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=0.014241;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=71.8041;QD=3.24612;RBI=0.0422639;REFB=0.0129816;REVB=0.0397924;RO=35;SAF=1;SAR=5;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.402116;STB=0.795403;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=-0.0145763;OID=.;OPOS=19666911;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:41:41:35:35:6:6:0.146341:5:1:17:18:5:1:17:18
chr21	19670118	.	G	A	105.21	PASS	AF=0.269231;AO=14;DP=52;FAO=14;FDP=52;FR=.;FRO=38;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0349738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.678;QD=8.09322;RBI=0.034989;REFB=-0.00184707;REVB=0.00102875;RO=38;SAF=5;SAR=9;SRF=17;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112078;STB=0.568865;STBP=0.577;TYPE=snp;VARB=0.00544061;OID=.;OPOS=19670118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:38:38:14:14:0.269231:9:5:17:21:9:5:17:21
chr21	19713821	.	C	T	828.25	PASS	AF=0.422018;AO=92;DP=218;FAO=92;FDP=218;FR=.;FRO=126;FSAF=44;FSAR=48;FSRF=63;FSRR=63;FWDB=-0.0101619;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.8829;QD=15.1973;RBI=0.0278184;REFB=-0.00993995;REVB=-0.025896;RO=126;SAF=44;SAR=48;SRF=63;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.022522;STB=0.512572;STBP=0.758;TYPE=snp;VARB=0.0140205;OID=.;OPOS=19713821;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:218:218:126:126:92:92:0.422018:48:44:63:63:48:44:63:63
chr21	19770562	.	T	C	195.59	PASS	AF=0.387097;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=62;FR=.;FRO=38;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=-0.00175098;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=256.05;QD=12.619;RBI=0.00191805;REFB=-0.0168492;REVB=-0.000782929;RO=37;SAF=11;SAR=13;SRF=24;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.19937;STB=0.604968;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.0275546;OID=.;OPOS=19770562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:37:38:24:24:0.387097:13:11:24:13:13:11:24:14
chr21	21728991	.	C	A	1465.85	PASS	AF=0.979167;AO=94;DP=96;FAO=94;FDP=96;FR=.;FRO=2;FSAF=37;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.00235001;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=86.3215;QD=61.077;RBI=0.0071028;REFB=-0.0784532;REVB=0.00670278;RO=1;SAF=37;SAR=57;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0082466;STB=0.508619;STBP=0.295;TYPE=snp;VARB=0.0029203;OID=.;OPOS=21728991;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:96:96:1:2:94:94:0.979167:57:37:0:1:57:37:0:2
chr21	24804558	.	T	C	842.4	PASS	AF=0.967742;AO=60;DP=62;FAO=60;FDP=62;FR=.;FRO=2;FSAF=17;FSAR=43;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0565879;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.566;QD=54.3481;RBI=0.0583555;REFB=0.0283777;REVB=0.0142539;RO=2;SAF=17;SAR=43;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0523295;STB=0.527768;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=-1.54916e-05;OID=.;OPOS=24804558;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:62:62:2:2:60:60:0.967742:43:17:2:0:43:17:2:0
chr21	26965148	.	G	A	563.74	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00191767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.761;QD=57.8196;RBI=0.0212747;REFB=-0.106308;REVB=-0.0211881;RO=0;SAF=20;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.51048e-08;STB=0.513506;STBP=0.328;TYPE=snp;VARB=0.000432624;OID=.;OPOS=26965148;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:0:1:38:38:0.974359:18:20:0:0:18:20:0:1
chr21	26965205	.	T	C	650.95	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0206777;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.546;QD=61.9954;RBI=0.0640739;REFB=0;REVB=0.0606457;RO=0;SAF=23;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000276002;OID=.;OPOS=26965205;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:19:23:0:0:19:23:0:0
chr21	26969703	.	T	C	765.26	PASS	AF=1;AO=54;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0341583;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=51.2002;QD=55.6555;RBI=0.0432322;REFB=0;REVB=0.0264997;RO=1;SAF=14;SAR=40;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0324675;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00174793;OID=.;OPOS=26969703;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:1:0:54:55:1:40:14:1:0:40:15:0:0
chr21	26976250	.	A	G	427.99	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000370332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.794;QD=57.0656;RBI=0.011646;REFB=0;REVB=0.0116401;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.175e-05;OID=.;OPOS=26976250;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr21	26978950	.	A	G	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.113312;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.591;QD=54.517;RBI=0.114193;REFB=0;REVB=-0.0141598;RO=0;SAF=12;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000950243;OID=.;OPOS=26978950;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:13:12:0:0:13:12:0:0
chr21	27563105	.	G	A	291.6	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=60;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=16;FSAR=15;FSRF=12;FSRR=17;FWDB=-0.0295955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.6579;QD=19.44;RBI=0.0452704;REFB=-0.0098425;REVB=-0.0342566;RO=29;SAF=16;SAR=15;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0886822;STB=0.549325;STBP=0.478;TYPE=snp;VARB=0.00719247;OID=.;OPOS=27563105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:29:29:31:31:0.516667:15:16:12:17:15:16:12:17
chr21	28212760	.	G	A	1594.36	PASS	AF=1;AO=81;DP=120;FAO=121;FDP=121;FR=.;FRO=0;FSAF=78;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0474942;FXX=0.00819605;HRUN=4;LEN=1;MLLD=188.589;QD=52.706;RBI=0.0517166;REFB=0;REVB=0.020467;RO=0;SAF=42;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00465598;OID=.;OPOS=28212760;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:120:121:0:0:81:121:1:39:42:0:0:43:78:0:0
chr21	28215826	.	C	CACA	779.07	PASS	AF=1;AO=54;DP=63;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0384674;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=287.352;QD=56.6595;RBI=0.0634761;REFB=0;REVB=0.0504924;RO=8;SAF=20;SAR=34;SRF=7;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.126129;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.000184733;OID=.;OPOS=28215827;OREF=-;OALT=ACA;OMAPALT=CACA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:54:63:55:55:0:20:35:0:0:4:8:20:34:7:1
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chr21	28216038	.	C	A	960.02	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=68;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=25;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00535264;FXX=0.0147037;HRUN=2;LEN=1;MLLD=212.349;QD=57.3147;RBI=0.046041;REFB=-0.0675367;REVB=-0.0457288;RO=1;SAF=41;SAR=25;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.011386;STB=0.506022;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=-8.49851e-06;OID=.;OPOS=28216038;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:68:67:1:1:66:66:0.985075:25:41:1:0:25:41:1:0
chr21	28216059	.	A	G	455.6	PASS	AF=0.597222;AO=43;DP=73;FAO=43;FDP=72;FR=.;FRO=29;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.00687404;FXX=0.0136968;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.0495;QD=25.3109;RBI=0.0110889;REFB=-0.0100243;REVB=-0.00870122;RO=28;SAF=25;SAR=18;SRF=16;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00737218;STB=0.501991;STBP=0.987;TYPE=snp;VARB=0.00860526;OID=.;OPOS=28216059;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:72:28:29:43:43:0.597222:18:25:16:12:18:25:17:12
chr21	28216066	.	C	T	1125.61	PASS	AF=1;AO=74;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0212104;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.55;QD=60.0324;RBI=0.0251911;REFB=0;REVB=0.0135909;RO=0;SAF=44;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.93382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000483117;OID=.;OPOS=28216066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:74:75:1:30:44:0:0:30:45:0:0
chr21	28216595	.	C	G	2083.08	PASS	AF=0.958904;AO=132;DP=139;FAO=140;FDP=146;FR=.;FRO=6;FSAF=68;FSAR=72;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.187372;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.2462;QD=57.0706;RBI=0.189536;REFB=-0.119129;REVB=-0.0285594;RO=7;SAF=60;SAR=72;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0249643;STB=0.507438;STBP=0.363;TYPE=snp;VARB=0.00861395;OID=.;OPOS=28216595;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:139:146:7:6:132:140:0.958904:72:60:5:2:72:68:4:2
chr21	28216674	.	G	C	181.28	PASS	AF=0.431818;AO=19;DP=44;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.046264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.439;QD=16.48;RBI=0.0498241;REFB=-0.00965164;REVB=-0.0184954;RO=24;SAF=5;SAR=14;SRF=16;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.397374;STB=0.736593;STBP=0.017;TYPE=snp;VARB=0.0372093;OID=.;OPOS=28216674;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:24:25:19:19:0.431818:14:5:16:8:14:5:17:8
chr21	28216692	.	G	T	519.86	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0513818;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.437;QD=59.4127;RBI=0.0525814;REFB=0;REVB=0.0111677;RO=0;SAF=18;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000352963;OID=.;OPOS=28216692;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:16:18:0:0:16:19:0:0
chr21	28295339	.	T	C	868.76	PASS	AF=0.447619;AO=94;DP=210;FAO=94;FDP=210;FR=.;FRO=116;FSAF=51;FSAR=43;FSRF=56;FSRR=60;FWDB=0.00196476;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.2256;QD=16.5479;RBI=0.0136508;REFB=-0.0115331;REVB=0.0135087;RO=116;SAF=51;SAR=43;SRF=56;SRR=60;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0595874;STB=0.533076;STBP=0.388;TYPE=snp;VARB=0.0157395;OID=.;OPOS=28295339;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:210:210:116:116:94:94:0.447619:43:51:56:60:43:51:56:60
chr21	28296324	.	A	G	343.47	PASS	AF=0.383838;AO=38;DP=99;FAO=38;FDP=99;FR=.;FRO=61;FSAF=21;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=25;FWDB=-0.00365602;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.87;QD=13.8775;RBI=0.0372091;REFB=0.0093583;REVB=0.037029;RO=60;SAF=21;SAR=17;SRF=35;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0335448;STB=0.523489;STBP=0.751;TYPE=snp;VARB=-0.0184012;OID=.;OPOS=28296324;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:99:60:61:38:38:0.383838:17:21:35:25:17:21:36:25
chr21	28302355	.	A	G	477.71	PASS	AF=0.552941;AO=41;DP=79;FAO=47;FDP=85;FR=.;FRO=38;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=14;FWDB=0.0103194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.108;QD=22.4807;RBI=0.0296383;REFB=-0.0257886;REVB=0.0277838;RO=38;SAF=23;SAR=18;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0628755;STB=0.554194;STBP=0.271;TYPE=snp;VARB=0.0194566;OID=.;OPOS=28302355;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:85:38:38:41:47:0.552941:18:23:24:14:23:24:24:14
chr21	28326276	.	G	A	1246.11	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=81;FDP=81;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154137;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.984;QD=61.5363;RBI=0.0154495;REFB=0;REVB=-0.00104998;RO=0;SAF=37;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03952e-06;OID=.;OPOS=28326276;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:81:0:0:81:81:1:44:37:0:0:44:37:0:0
chr21	30250555	.	T	C	689.38	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00984083;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=340.781;QD=62.6711;RBI=0.0319664;REFB=0;REVB=0.0304139;RO=0;SAF=24;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.30465e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.39814e-05;OID=.;OPOS=30250555;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:20:24:0:0:20:24:0:0
chr21	30250615	.	T	C	619.95	PASS	AF=0.97619;AO=41;DP=42;FAO=41;FDP=42;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0143216;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=206.661;QD=59.0424;RBI=0.0143873;REFB=0.026098;REVB=0.00137327;RO=1;SAF=21;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0218198;STB=0.511622;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=-6.04118e-05;OID=.;OPOS=30250615;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:42:42:1:1:41:41:0.97619:20:21:1:0:20:21:1:0
chr21	30257560	.	C	G	3067.42	PASS	AF=0.994898;AO=194;DP=196;FAO=195;FDP=196;FR=.;FRO=1;FSAF=67;FSAR=128;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0342105;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.8615;QD=62.6005;RBI=0.106225;REFB=-0.1387;REVB=0.100566;RO=2;SAF=67;SAR=127;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00331928;STB=0.503703;STBP=0.26;TYPE=snp;VARB=0.00143526;OID=.;OPOS=30257560;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:196:196:2:1:194:195:0.994898:127:67:1:1:128:67:1:0
chr21	30257566	.	GTT	GT,GTC	2822.6	PASS	AF=0.31746,0.68254;AO=60,122;DP=191;FAO=60,129;FDP=189;FR=.;FRO=0;FSAF=5,65;FSAR=55,64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.141811,-0.0641103;FXX=0.0104707;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=27.5514,37.6025;QD=59.7376;RBI=0.182842,0.0904;REFB=0,0;REVB=-0.115416,-0.063734;RO=0;SAF=5,58;SAR=55,64;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0122082,-0.00567368;OID=.,.;OPOS=30257567,30257568;OREF=T,T;OALT=-,C;OMAPALT=GT,GTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.31746,0.68254:60,122:191:60,129:189:0:5,65:55,64:0:0:99:0:5,58:55,64:0:0
chr21	30257570	.	A	C	429.61	PASS	AF=0.308458;AO=61;DP=203;FAO=62;FDP=201;FR=.;FRO=139;FSAF=5;FSAR=57;FSRF=69;FSRR=70;FWDB=-0.00276102;FXX=0.00985173;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.4938;QD=8.54939;RBI=0.00977055;REFB=-0.0546491;REVB=-0.00937232;RO=142;SAF=5;SAR=56;SRF=69;SRR=73;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.610235;STB=0.869011;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.145554;OID=.;OPOS=30257570;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:203:201:142:139:61:62:0.308458:56:5:69:73:57:5:69:70
chr21	30339120	.	C	A	178.73	PASS	AF=0.5625;AO=18;DP=32;FAO=18;FDP=32;FR=.;FRO=14;FSAF=1;FSAR=17;FSRF=7;FSRR=7;FWDB=-0.0327865;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=137.752;QD=22.3413;RBI=0.0335251;REFB=-0.0199922;REVB=-0.00699852;RO=14;SAF=1;SAR=17;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.599445;STB=0.849474;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.0132739;OID=.;OPOS=30339120;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:14:18:18:0.5625:17:1:7:7:17:1:7:7
chr21	30339234	.	T	C	171.32	PASS	AF=0.62963;AO=13;DP=26;FAO=17;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=10;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0500676;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.513;QD=25.3813;RBI=0.0505178;REFB=-0.0432121;REVB=0.00672861;RO=10;SAF=7;SAR=6;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0294478;STB=0.533294;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.0257063;OID=.;OPOS=30339234;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:26:27:10:10:13:17:0.62963:6:7:5:5:7:10:5:5
chr21	30341891	.	A	G	244.37	PASS	AF=0.4375;AO=21;DP=48;FAO=21;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=7;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=0.0130485;FXX=0.039992;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.324;QD=20.364;RBI=0.0143471;REFB=-0.0209295;REVB=-0.00596444;RO=24;SAF=7;SAR=14;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.23972;STB=0.636231;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=0.0227658;OID=.;OPOS=30341891;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:48:24:24:21:21:0.4375:14:7:14:10:14:7:14:10
chr21	30378938	.	G	A	423.59	PASS	AF=0.472527;AO=41;DP=89;FAO=43;FDP=91;FR=.;FRO=48;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=13;FWDB=-0.000593615;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.227;QD=18.6194;RBI=0.0324056;REFB=-0.0109715;REVB=-0.0324002;RO=47;SAF=23;SAR=18;SRF=34;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161995;STB=0.593395;STBP=0.113;TYPE=snp;VARB=0.0216262;OID=.;OPOS=30378938;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:91:47:48:41:43:0.472527:18:23:34:13:19:24:35:13
chr21	30464866	.	A	G	335.29	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=10;FSAR=26;FSRF=19;FSRR=24;FWDB=-0.0145223;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.016;QD=16.9767;RBI=0.0346724;REFB=0.00533085;REVB=0.0314846;RO=43;SAF=10;SAR=26;SRF=19;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179445;STB=0.601217;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=-0.00585352;OID=.;OPOS=30464866;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:43:43:36:36:0.455696:26:10:19:24:26:10:19:24
chr21	30481511	.	A	G	468.08	PASS	AF=0.463636;AO=51;DP=111;FAO=51;FDP=110;FR=.;FRO=59;FSAF=22;FSAR=29;FSRF=29;FSRR=30;FWDB=-0.00708633;FXX=0.0090082;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3068;QD=17.0212;RBI=0.0145302;REFB=-0.0302661;REVB=0.012685;RO=60;SAF=22;SAR=29;SRF=30;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0670957;STB=0.532576;STBP=0.553;TYPE=snp;VARB=0.0461652;OID=.;OPOS=30481511;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:111:110:60:59:51:51:0.463636:29:22:30:30:29:22:29:30
chr21	30714776	.	T	C	1097.69	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390591;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.5941;QD=60.1475;RBI=0.0393056;REFB=0;REVB=-0.00439478;RO=0;SAF=48;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000197318;OID=.;OPOS=30714776;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:24:48:0:0:24:49:0:0
chr21	30717151	.	C	T	911.44	PASS	AF=0.916667;AO=66;DP=72;FAO=66;FDP=72;FR=.;FRO=6;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.00113405;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.885;QD=50.6357;RBI=0.0536678;REFB=0.00462205;REVB=-0.0536558;RO=6;SAF=35;SAR=31;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0570785;STB=0.530294;STBP=0.102;TYPE=snp;VARB=-0.000206003;OID=.;OPOS=30717151;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:24:72:72:6:6:66:66:0.916667:31:35:1:5:31:35:1:5
chr21	30718201	.	G	A	483.65	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.648;QD=58.624;RBI=0.0394277;REFB=0;REVB=0.0375746;RO=0;SAF=14;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127816;OID=.;OPOS=30718201;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:33:0:0:32:33:1:18:14:0:0:18:15:0:0
chr21	30969901	.	T	C	766.34	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00578884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.0394;QD=63.8617;RBI=0.026615;REFB=0;REVB=-0.0259778;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000127177;OID=.;OPOS=30969901;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0
chr21	30971183	.	G	A	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0115536;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.342;QD=61.6839;RBI=0.0580129;REFB=0;REVB=-0.0568508;RO=0;SAF=19;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000210118;OID=.;OPOS=30971183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:22:19:0:0:22:19:0:0
chr21	31538422	.	C	T	301.11	PASS	AF=0.4;AO=34;DP=85;FAO=34;FDP=85;FR=.;FRO=51;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=26;FSRR=25;FWDB=0.0206315;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.936;QD=14.1698;RBI=0.0209737;REFB=-0.00487768;REVB=-0.00377321;RO=51;SAF=16;SAR=18;SRF=26;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0413986;STB=0.523532;STBP=0.736;TYPE=snp;VARB=0.00741882;OID=.;OPOS=31538422;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:85:85:51:51:34:34:0.4:18:16:26:25:18:16:26:25
chr21	31587793	.	A	G	185.85	PASS	AF=0.575758;AO=16;DP=30;FAO=19;FDP=33;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=9;FWDB=-0.00525876;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.771;QD=22.5273;RBI=0.0327537;REFB=-0.0414434;REVB=0.0323288;RO=14;SAF=10;SAR=6;SRF=5;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.220472;STB=0.571354;STBP=0.357;TYPE=snp;VARB=0.0297341;OID=.;OPOS=31587793;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:33:14:14:16:19:0.575758:6:10:5:9:9:10:5:9
chr21	31655212	.	A	C	1319.2	PASS	AF=1;AO=81;DP=81;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179326;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.334;QD=62.0798;RBI=0.0503129;REFB=0;REVB=0.0470086;RO=0;SAF=45;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.42691e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93325e-05;OID=.;OPOS=31655212;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:81:85:0:0:81:85:1:36:45:0:0:40:45:0:0
chr21	31709691	.	G	A	431.89	PASS	AF=0.56;AO=42;DP=75;FAO=42;FDP=75;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=30;FSRF=14;FSRR=19;FWDB=-0.013191;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.096;QD=23.0341;RBI=0.018086;REFB=-0.0394491;REVB=0.0123735;RO=33;SAF=12;SAR=30;SRF=14;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.127049;STB=0.570141;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0265056;OID=.;OPOS=31709691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:33:33:42:42:0.56:30:12:14:19:30:12:14:19
chr21	31744127	.	A	T	212.41	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=19;FSRR=10;FWDB=0.0577555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.325;QD=16.0312;RBI=0.0627816;REFB=-0.0210606;REVB=0.0246136;RO=28;SAF=10;SAR=14;SRF=19;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245425;STB=0.628379;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0256618;OID=.;OPOS=31744127;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:28:29:24:24:0.45283:14:10:19:9:14:10:19:10
chr21	31768539	.	G	C	256.64	PASS	AF=0.304348;AO=34;DP=113;FAO=35;FDP=115;FR=.;FRO=80;FSAF=17;FSAR=18;FSRF=36;FSRR=44;FWDB=-0.00830382;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.363;QD=8.92663;RBI=0.0227832;REFB=-0.0123775;REVB=-0.021216;RO=79;SAF=16;SAR=18;SRF=35;SRR=44;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0329919;STB=0.524886;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0392184;OID=.;OPOS=31768539;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:115:79:80:34:35:0.304348:18:16:35:44:18:17:36:44
chr21	31802648	.	C	T	170.03	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=9;FWDB=0.0166606;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.4446;QD=17.0025;RBI=0.0270954;REFB=-0.0215526;REVB=-0.0213678;RO=19;SAF=12;SAR=6;SRF=10;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.134812;STB=0.545403;STBP=0.622;TYPE=snp;VARB=0.0269439;OID=.;OPOS=31802648;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:19:22:18:18:0.45:6:12:10:9:6:12:13:9
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chr21	31964897	.	G	A	192.44	PASS	AF=0.59375;AO=18;DP=31;FAO=19;FDP=32;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.045626;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.458;QD=24.0555;RBI=0.0952326;REFB=-0.029045;REVB=0.0835913;RO=13;SAF=7;SAR=11;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.225464;STB=0.609007;STBP=0.149;TYPE=snp;VARB=0.0053082;OID=.;OPOS=31964897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:32:13:13:18:19:0.59375:11:7:9:4:11:8:9:4
chr21	31973516	.	T	A	762.45	PASS	AF=0.596639;AO=71;DP=119;FAO=71;FDP=119;FR=.;FRO=48;FSAF=47;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=24;FWDB=0.0202218;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.458;QD=25.6285;RBI=0.0220165;REFB=-0.035551;REVB=-0.00870672;RO=48;SAF=47;SAR=24;SRF=24;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.127883;STB=0.569677;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0200484;OID=.;OPOS=31973516;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:119:119:48:48:71:71:0.596639:24:47:24:24:24:47:24:24
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chr21	33346936	.	C	T	292.8	PASS	AF=0.516667;AO=31;DP=61;FAO=31;FDP=60;FR=.;FRO=29;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=0.00782554;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.954;QD=19.5202;RBI=0.0147975;REFB=-0.0154182;REVB=0.0125589;RO=29;SAF=17;SAR=14;SRF=15;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0272;STB=0.515142;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0129845;OID=.;OPOS=33346936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:29:29:31:31:0.516667:14:17:15:14:14:17:15:14
chr21	33368188	.	T	C	213.53	PASS	AF=0.45283;AO=24;DP=53;FAO=24;FDP=53;FR=.;FRO=29;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=-0.0313877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=110.633;QD=16.1155;RBI=0.0433338;REFB=-0.0115005;REVB=-0.0298769;RO=29;SAF=11;SAR=13;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0900295;STB=0.550978;STBP=0.537;TYPE=snp;VARB=0.0159127;OID=.;OPOS=33368188;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:29:29:24:24:0.45283:13:11:16:13:13:11:16:13
chr21	33370900	.	T	C	325.31	PASS	AF=0.568966;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=58;FR=.;FRO=25;FSAF=17;FSAR=16;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.02654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.3943;QD=22.4348;RBI=0.0281683;REFB=-0.000499277;REVB=0.00943825;RO=24;SAF=17;SAR=16;SRF=9;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.106841;STB=0.566627;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.000674745;OID=.;OPOS=33370900;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:24:25:33:33:0.568966:16:17:9:15:16:17:9:16
chr21	33372749	.	T	C	869.61	PASS	AF=0.429825;AO=78;DP=236;FAO=98;FDP=228;FR=.,HEALED;FRO=130;FSAF=43;FSAR=55;FSRF=64;FSRR=66;FWDB=0.0765161;FXX=0.0338969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=157.792;QD=15.2563;RBI=0.076688;REFB=-0.0139754;REVB=-0.00513163;RO=95;SAF=34;SAR=44;SRF=44;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0272763;STB=0.530748;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0178011;OID=.;OPOS=33372749;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:236:228:95:130:78:98:0.429825:44:34:44:51:55:43:64:66
chr21	33374318	.	C	T	255.68	PASS	AF=0.491228;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=57;FR=.;FRO=29;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=-0.0434036;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.968;QD=17.9425;RBI=0.0435452;REFB=-0.0013521;REVB=-0.00350887;RO=29;SAF=18;SAR=10;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180794;STB=0.601469;STBP=0.155;TYPE=snp;VARB=0.00318093;OID=.;OPOS=33374318;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:29:29:28:28:0.491228:10:18:13:16:10:18:13:16
chr21	33694224	.	C	G	534.51	PASS	AF=0.948718;AO=34;DP=37;FAO=37;FDP=39;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.2229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.2118;QD=54.8216;RBI=0.223297;REFB=-0.00858422;REVB=0.0133069;RO=0;SAF=29;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571387;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0022302;OID=.;OPOS=33694224;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:37:39:0:2:34:37:0.948718:5:29:0:0:6:31:0:2
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chr21	33756711	.	A	T	329.72	PASS	AF=0.539683;AO=34;DP=63;FAO=34;FDP=63;FR=.;FRO=29;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.0293738;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1287;QD=20.9344;RBI=0.0401313;REFB=-0.00026046;REVB=0.027344;RO=28;SAF=14;SAR=20;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0732215;STB=0.533314;STBP=0.581;TYPE=snp;VARB=0.000182312;OID=.;OPOS=33756711;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:63:28:29:34:34:0.539683:20:14:14:14:20:14:14:15
chr21	33887131	.	G	A	156.41	PASS	AF=0.344828;AO=20;DP=58;FAO=20;FDP=58;FR=.;FRO=38;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=22;FWDB=0.0252767;FXX=0.0169463;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.913;QD=10.7871;RBI=0.0267266;REFB=-0.0208721;REVB=0.00868325;RO=37;SAF=12;SAR=8;SRF=16;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.185452;STB=0.616323;STBP=0.209;TYPE=snp;VARB=0.0401287;OID=.;OPOS=33887131;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:37:38:20:20:0.344828:8:12:16:21:8:12:16:22
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chr21	34163742	.	A	G	623.0	PASS	AF=0.602151;AO=55;DP=93;FAO=56;FDP=93;FR=.;FRO=37;FSAF=22;FSAR=34;FSRF=9;FSRR=28;FWDB=0.0935471;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.42;QD=26.7957;RBI=0.0950714;REFB=-0.0324793;REVB=0.0169564;RO=37;SAF=21;SAR=34;SRF=9;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111734;STB=0.564081;STBP=0.171;TYPE=snp;VARB=0.0144105;OID=.;OPOS=34163742;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:93:93:37:37:55:56:0.602151:34:21:9:28:34:22:9:28
chr21	34166190	.	A	T	1825.06	PASS	AF=0.991935;AO=119;DP=121;FAO=123;FDP=124;FR=.;FRO=1;FSAF=68;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0391599;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.5448;QD=58.8728;RBI=0.0452647;REFB=-0.0795543;REVB=0.0227023;RO=2;SAF=66;SAR=53;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0175839;STB=0.504504;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00200901;OID=.;OPOS=34166190;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:121:124:2:1:119:123:0.991935:53:66:0:2:55:68:0:1
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chr21	34169317	.	C	CT,T	105.21	PASS	AF=0.371429,0;AO=11,3;DP=36;FAO=13,0;FDP=35;FR=.;FRO=22;FSAF=8,0;FSAR=5,0;FSRF=9;FSRR=13;FWDB=-0.00470734,-0.0458473;FXX=0.0540395;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=134.591,73.4791;QD=12.0241;RBI=0.0247152,0.0624499;REFB=0.000860902,0.00377919;REVB=-0.0242628,-0.042403;RO=22;SAF=6,3;SAR=5,0;SRF=9;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.149752,0.621044;STB=0.628624,0.5;STBP=0.275,1;TYPE=ins,snp;VARB=-0.00232378,0;OID=.,.;OPOS=34169318,34169317;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:35:22:22:11,3:13,0:0.371429,0:5,0:6,3:9:13:5,0:8,0:9:13
chr21	34400237	.	G	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0979186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2541;QD=33.4282;RBI=0.0979186;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=6;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00919524;OID=.;OPOS=34400237;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:0:6:0:0:0:6:0:0
chr21	34614250	.	T	C	148.62	PASS	AF=0.345455;AO=20;DP=55;FAO=19;FDP=55;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=23;FSRR=13;FWDB=-0.0125383;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.9689;QD=10.8087;RBI=0.0406501;REFB=-0.00384885;REVB=-0.0386681;RO=35;SAF=11;SAR=9;SRF=22;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0878425;STB=0.574392;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.00775584;OID=.;OPOS=34614250;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:35:36:20:19:0.345455:9:11:22:13:9:10:23:13
chr21	34614255	.	T	G	785.16	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0804539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.113;QD=57.1026;RBI=0.0816699;REFB=0;REVB=0.0140408;RO=0;SAF=34;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000317178;OID=.;OPOS=34614255;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:21:34:0:0:21:34:0:0
chr21	34634878	.	G	A	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0157453;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.1438;QD=40.7628;RBI=0.0517739;REFB=0;REVB=-0.0493216;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0033683;OID=.;OPOS=34634878;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
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chr21	34668747	.	A	G	56.78	PASS	AF=0.421053;AO=8;DP=19;FAO=8;FDP=19;FR=.;FRO=11;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=-0.0188512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=88.4561;QD=11.9537;RBI=0.147808;REFB=-0.00017335;REVB=0.146601;RO=11;SAF=5;SAR=3;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.332362;STB=0.691933;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00426082;OID=.;OPOS=34668747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:19:19:11:11:8:8:0.421053:3:5:10:1:3:5:10:1
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chr21	34821570	.	G	A	270.17	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00284256;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.397;QD=51.4613;RBI=0.0200067;REFB=0;REVB=0.0198037;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000139385;OID=.;OPOS=34821570;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:20:21:1:7:13:0:0:8:13:0:0
chr21	34822150	.	T	A	721.59	PASS	AF=0.964286;AO=53;DP=56;FAO=54;FDP=56;FR=.;FRO=2;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.051626;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=40.74;QD=51.542;RBI=0.0632383;REFB=-0.184217;REVB=0.0365216;RO=3;SAF=32;SAR=21;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0421452;STB=0.5147;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.00669337;OID=.;OPOS=34822150;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:56:56:3:2:53:54:0.964286:21:32:3:0:21:33:2:0
chr21	34822452	.	T	C	207.1	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0269503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.135;QD=48.7301;RBI=0.043273;REFB=0;REVB=0.0338561;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000566541;OID=.;OPOS=34822452;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chr21	34897113	.	C	T	1510.16	PASS	AF=0.980952;AO=102;DP=105;FAO=103;FDP=105;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=42;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.000346506;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=231.674;QD=57.53;RBI=0.0203758;REFB=-0.0187575;REVB=0.0203729;RO=2;SAF=61;SAR=41;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00371651;STB=0.501817;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=4.45903e-05;OID=.;OPOS=34897113;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:105:105:2:2:102:103:0.980952:41:61:1:1:42:61:1:1
chr21	34925142	.	C	T	854.27	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0511853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.635;QD=56.9514;RBI=0.0516108;REFB=0;REVB=-0.0066138;RO=0;SAF=23;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000325627;OID=.;OPOS=34925142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:58:60:1:35:23:0:0:36:24:0:0
chr21	34926260	.	C	T	1741.62	PASS	AF=0.991453;AO=116;DP=117;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=70;FSAR=46;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0206802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.64;QD=59.5427;RBI=0.0206882;REFB=-0.111142;REVB=-0.000574897;RO=0;SAF=70;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.25992e-08;STB=0.503545;STBP=0.512;TYPE=snp;VARB=0.00112793;OID=.;OPOS=34926260;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:117:117:0:1:116:116:0.991453:46:70:0:0:46:70:1:0
chr21	34939598	.	A	T	97.9	PASS	AF=0.145455;AO=7;DP=51;FAO=8;FDP=55;FR=.,HEALED,HEALED;FRO=39;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=15;FSRR=24;FWDB=0.00320038;FXX=0.0350816;HRUN=8;LEN=1;MLLD=30.1736;QD=7.11969;RBI=0.00669252;REFB=-0.00682469;REVB=0.0058777;RO=16;SAF=7;SAR=0;SRF=8;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.747644;STB=0.887403;STBP=0.027;TYPE=snp;VARB=0.0931903;OID=.;OPOS=34939598;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:51:55:16:39:7:8:0.145455:0:7:8:8:1:7:15:24
chr21	34948684	.	G	A,GA	931.46	PASS	AF=0.0153846,0.984615;AO=3,60;DP=67;FAO=1,64;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=1,24;FSAR=0,40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188265,0.0753173;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=4.67651,30.807;QD=57.3208;RBI=0.0242164,0.0797025;REFB=0,0;REVB=0.0152314,0.0260727;RO=4;SAF=2,23;SAR=1,37;SRF=1;SRR=3;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.348651,0.016672;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0505513,0.000297394;OID=.,.;OPOS=34948684,34948685;OREF=G,-;OALT=A,A;OMAPALT=A,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:3:67:65:4:0:3,60:1,64:0.0153846,0.984615:1,37:2,23:1:3:0,40:1,24:0:0
chr21	34948696	.	GA	G,GC	869.96	PASS	AF=0.95082,0.0491803;AO=57,6;DP=64;FAO=58,3;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23,2;FSAR=35,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0524106,0.0493419;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=109.427,94.335;QD=57.0462;RBI=0.0553216,0.0577421;REFB=0,0;REVB=0.0177089,0.029992;RO=0;SAF=23,2;SAR=34,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.00251326,-0.0396431;OID=.,.;OPOS=34948697,34948697;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=G,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.95082,0.0491803:57,6:64:58,3:61:0:23,2:35,1:0:0:12:0:23,2:34,4:0:0
chr21	34968503	.	A	G	125.78	PASS	AF=0.28125;AO=18;DP=64;FAO=18;FDP=64;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=18;FSRR=28;FWDB=0.00545612;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=103.978;QD=7.8613;RBI=0.0101884;REFB=-0.00899145;REVB=-0.00860434;RO=46;SAF=15;SAR=3;SRF=18;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.536113;STB=0.8241;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0550893;OID=.;OPOS=34968503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:46:46:18:18:0.28125:3:15:18:28:3:15:18:28
chr21	35201947	.	C	T	340.32	PASS	AF=0.48;AO=36;DP=75;FAO=36;FDP=75;FR=.;FRO=39;FSAF=22;FSAR=14;FSRF=26;FSRR=13;FWDB=-0.0104838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.4778;QD=18.1504;RBI=0.101955;REFB=-0.0138637;REVB=0.101414;RO=38;SAF=22;SAR=14;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0458772;STB=0.530789;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.013924;OID=.;OPOS=35201947;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:38:39:36:36:0.48:14:22:25:13:14:22:26:13
chr21	35237608	.	T	C	358.12	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.119076;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.28;QD=55.0956;RBI=0.119077;REFB=0;REVB=0.000451953;RO=0;SAF=13;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0012592;OID=.;OPOS=35237608;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:13:13:0:0:13:13:0:0
chr21	35260481	.	T	C	292.47	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=24;FWDB=0.027759;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.2253;QD=17.2043;RBI=0.0604116;REFB=-0.0188593;REVB=0.0536563;RO=36;SAF=19;SAR=13;SRF=12;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.242438;STB=0.635541;STBP=0.05;TYPE=snp;VARB=0.0201823;OID=.;OPOS=35260481;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:36:36:32:32:0.470588:13:19:12:24:13:19:12:24
chr21	35275955	.	G	A	428.86	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0115758;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.709;QD=57.1819;RBI=0.0394787;REFB=0;REVB=0.0377434;RO=0;SAF=16;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.56309e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00022798;OID=.;OPOS=35275955;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:14:16:0:0:14:16:0:0
chr21	35281393	.	A	G	405.48	PASS	AF=0.555556;AO=40;DP=72;FAO=40;FDP=72;FR=.;FRO=32;FSAF=25;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=0.00561459;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.647;QD=22.5267;RBI=0.0116676;REFB=-0.00972745;REVB=0.0102279;RO=32;SAF=25;SAR=15;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0827288;STB=0.545433;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.00795197;OID=.;OPOS=35281393;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:72:32:32:40:40:0.555556:15:25:23:9:15:25:23:9
chr21	35467645	.	A	G	2317.15	PASS	AF=0.993506;AO=153;DP=154;FAO=153;FDP=154;FR=.;FRO=1;FSAF=69;FSAR=84;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00401515;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.039;QD=60.1857;RBI=0.0102826;REFB=0.0229143;REVB=-0.00946628;RO=1;SAF=69;SAR=84;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00684433;STB=0.503597;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=-1.1427e-05;OID=.;OPOS=35467645;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:154:154:1:1:153:153:0.993506:84:69:1:0:84:69:1:0
chr21	35469193	.	C	A	463.05	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.9756;QD=57.8813;RBI=0.0785103;REFB=0;REVB=-0.0767367;RO=0;SAF=26;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000631712;OID=.;OPOS=35469193;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:6:26:0:0:6:26:0:0
chr21	35469708	.	G	GA,GAA	387.25	PASS	AF=1,0;AO=39,7;DP=66;FAO=62,0;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=35,0;FSAR=27,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.175908,0.0900984;FXX=0;HRUN=6,6;LEN=1,2;MLLD=8.75281,8.12819;QD=24.9839;RBI=0.260056,0.135123;REFB=0,0;REVB=-0.191536,-0.1007;RO=15;SAF=20,3;SAR=19,4;SRF=13;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.183101,-0.472327;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,ins;VARB=-6.12271e-05,-0.0025809;OID=.,.;OPOS=35469709,35469709;OREF=-,-;OALT=A,AA;OMAPALT=GA,GAA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:39,7:66:62,0:62:0:35,0:27,0:0:0:8:15:20,3:19,4:13:2
chr21	35469726	.	G	GT	649.04	PASS	AF=1;AO=62;DP=67;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0931022;FXX=0.0298463;HRUN=1;LEN=1;MLLD=14.6339;QD=39.9407;RBI=0.0932136;REFB=0;REVB=-0.00455747;RO=1;SAF=35;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0171646;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00106184;OID=.;OPOS=35469727;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:62:67:65:65:0:36:29:0:0:13:1:35:27:0:1
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chr21	37617576	.	G	C	34.44	PASS	AF=0.127273;AO=4;DP=54;FAO=7;FDP=55;FR=.;FRO=48;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.0708484;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8098;QD=2.5045;RBI=0.0720845;REFB=-0.00492559;REVB=-0.0132921;RO=49;SAF=4;SAR=0;SRF=33;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.471736;STB=0.727806;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0563319;OID=.;OPOS=37617576;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:54:55:49:48:4:7:0.127273:0:4:33:16:1:6:32:16
chr21	37617630	.	T	G	393.34	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.014585;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=173.966;QD=56.1912;RBI=0.0212421;REFB=0;REVB=0.0154437;RO=0;SAF=17;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.31638e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.11218e-06;OID=.;OPOS=37617630;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:11:17:0:0:11:17:0:0
chr21	37630745	.	G	A	46.36	PASS	AF=0.368421;AO=6;DP=18;FAO=7;FDP=19;FR=.;FRO=12;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=5;FSRR=7;FWDB=-0.0138718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.87;QD=9.76053;RBI=0.0461077;REFB=-0.0263111;REVB=-0.0439715;RO=12;SAF=5;SAR=1;SRF=5;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.469147;STB=0.812575;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.0280854;OID=.;OPOS=37630745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:19:12:12:6:7:0.368421:1:5:5:7:1:6:5:7
chr21	37661405	.	G	A	281.67	PASS	AF=0.462687;AO=31;DP=68;FAO=31;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=36;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=25;FWDB=-0.0207433;FXX=0.0147037;HRUN=5;LEN=1;MLLD=195.938;QD=16.8163;RBI=0.0444869;REFB=-0.0327356;REVB=-0.0393547;RO=26;SAF=17;SAR=14;SRF=4;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.319286;STB=0.628357;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0295246;OID=.;OPOS=37661405;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:67:26:36:31:31:0.462687:14:17:4:22:14:17:11:25
chr21	37692589	.	A	T	359.35	PASS	AF=1;AO=23;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=9;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0610394;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.446;QD=55.2841;RBI=0.0615576;REFB=0;REVB=-0.00797105;RO=0;SAF=6;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.9951e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000956685;OID=.;OPOS=37692589;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:23:26:1:17:6:0:0:17:9:0:0
chr21	37781046	.	C	T	305.54	PASS	AF=0.384615;AO=34;DP=90;FAO=35;FDP=91;FR=.;FRO=56;FSAF=18;FSAR=17;FSRF=36;FSRR=20;FWDB=0.051183;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.6076;QD=13.4303;RBI=0.106848;REFB=-0.0291415;REVB=0.0937915;RO=56;SAF=17;SAR=17;SRF=36;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.156001;STB=0.579501;STBP=0.221;TYPE=snp;VARB=0.0489799;OID=.;OPOS=37781046;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:91:56:56:34:35:0.384615:17:17:36:20:17:18:36:20
chr21	38081562	.	T	G	71.66	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=-0.0372783;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.8;QD=19.1085;RBI=0.0376767;REFB=-0.0542882;REVB=-0.00546428;RO=6;SAF=3;SAR=6;SRF=1;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.137772;STB=0.578784;STBP=0.569;TYPE=snp;VARB=0.0265063;OID=.;OPOS=38081562;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:6:3:1:5:6:3:1:5
chr21	38081577	.	C	G	68.24	PASS	AF=0.473684;AO=8;DP=18;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=5;FSRR=5;FWDB=0.0454663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.9;QD=14.3669;RBI=0.0553326;REFB=-0.0471412;REVB=0.031536;RO=10;SAF=4;SAR=4;SRF=5;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.529346;STBP=0.781;TYPE=snp;VARB=0.0563014;OID=.;OPOS=38081577;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:18:19:10:10:8:9:0.473684:4:4:5:5:5:4:5:5
chr21	38444863	.	C	T	1153.6	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.067623;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.058;QD=60.7158;RBI=0.0697162;REFB=0;REVB=0.0169554;RO=0;SAF=46;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000225746;OID=.;OPOS=38444863;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:30:46:0:0:30:46:0:0
chr21	38444890	.	A	G	253.2	PASS	AF=0.509434;AO=27;DP=53;FAO=27;FDP=53;FR=.;FRO=26;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=12;FSRR=14;FWDB=-0.0305568;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=121.823;QD=19.1094;RBI=0.0334962;REFB=0.00933248;REVB=-0.0137213;RO=25;SAF=21;SAR=6;SRF=11;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.330512;STB=0.679467;STBP=0.019;TYPE=snp;VARB=-0.0128416;OID=.;OPOS=38444890;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:25:26:27:27:0.509434:6:21:11:14:6:21:12:14
chr21	38468958	.	A	G	354.45	PASS	AF=0.583333;AO=35;DP=61;FAO=35;FDP=60;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=10;FSRR=15;FWDB=-0.0262456;FXX=0.0163908;HRUN=4;LEN=1;MLLD=97.1165;QD=23.6299;RBI=0.0282288;REFB=0.00163163;REVB=0.0103939;RO=25;SAF=20;SAR=15;SRF=10;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.129771;STB=0.571388;STBP=0.205;TYPE=snp;VARB=-0.00210163;OID=.;OPOS=38468958;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:25:25:35:35:0.583333:15:20:10:15:15:20:10:15
chr21	38495270	.	A	AT	624.34	PASS	AF=1;AO=57;DP=67;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.160268;FXX=0.0307645;HRUN=1;LEN=1;MLLD=16.963;QD=39.6403;RBI=0.16279;REFB=0;REVB=0.0285437;RO=5;SAF=22;SAR=35;SRF=5;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0958702;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00206181;OID=.;OPOS=38495271;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=AT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:57:67:63:63:0:27:36:0:0:12:5:22:35:5:0
chr21	38512956	.	A	G	271.08	PASS	AF=0.46875;AO=30;DP=64;FAO=30;FDP=64;FR=.;FRO=34;FSAF=16;FSAR=14;FSRF=27;FSRR=7;FWDB=-0.00759625;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.562;QD=16.9424;RBI=0.0141968;REFB=-0.00896296;REVB=0.0119936;RO=33;SAF=16;SAR=14;SRF=26;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.245453;STB=0.641706;STBP=0.062;TYPE=snp;VARB=0.0131124;OID=.;OPOS=38512956;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:33:34:30:30:0.46875:14:16:26:7:14:16:27:7
chr21	38525356	.	T	C	444.57	PASS	AF=0.36;AO=53;DP=151;FAO=54;FDP=150;FR=.;FRO=96;FSAF=34;FSAR=20;FSRF=48;FSRR=48;FWDB=0.0537784;FXX=0.013157;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.524;QD=11.8553;RBI=0.0537953;REFB=-0.000478745;REVB=0.00134985;RO=96;SAF=34;SAR=19;SRF=48;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163798;STB=0.584988;STBP=0.124;TYPE=snp;VARB=0.00126833;OID=.;OPOS=38525356;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:151:150:96:96:53:54:0.36:19:34:48:48:20:34:48:48
chr21	38532058	.	TG	T	524.32	PASS	AF=1;AO=44;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0352982;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=30.1761;QD=46.6064;RBI=0.0616848;REFB=0;REVB=-0.0505871;RO=0;SAF=32;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.000384753;OID=.;OPOS=38532059;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:44:45:45:45:0:33:12:0:0:10:0:32:12:0:0
chr21	38532068	.	G	GA	440.64	PASS	AF=1;AO=38;DP=45;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.182976;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=20.2832;QD=41.9658;RBI=0.207331;REFB=0;REVB=0.0974978;RO=7;SAF=26;SAR=12;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.110821;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00842646;OID=.;OPOS=38532069;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=GA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:38:45:42:42:0:30:12:0:0:8:7:26:12:7:0
chr21	38539844	.	G	A	110.66	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=10;FSRR=6;FWDB=0.0293982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.876;QD=15.2629;RBI=0.0295764;REFB=-0.00682655;REVB=0.00324255;RO=16;SAF=7;SAR=6;SRF=10;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0835315;STB=0.548314;STBP=0.689;TYPE=snp;VARB=0.00550643;OID=.;OPOS=38539844;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:6:7:10:6:6:7:10:6
chr21	38563725	.	G	A	503.99	PASS	AF=0.494949;AO=46;DP=97;FAO=49;FDP=99;FR=.;FRO=50;FSAF=20;FSAR=29;FSRF=13;FSRR=37;FWDB=0.0342798;FXX=0.009999;HRUN=2;LEN=1;MLLD=48.1019;QD=20.3633;RBI=0.0473706;REFB=0.0104512;REVB=-0.0326935;RO=51;SAF=18;SAR=28;SRF=13;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140584;STB=0.579679;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=-0.0108988;OID=.;OPOS=38563725;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:99:51:50:46:49:0.494949:28:18:13:38:29:20:13:37
chr21	38568009	.	G	C	1554.14	PASS	AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=52;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0173753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.2248;QD=58.6467;RBI=0.0206309;REFB=-0.134696;REVB=0.0111234;RO=1;SAF=52;SAR=53;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0088702;STB=0.504672;STBP=0.487;TYPE=snp;VARB=0.0010693;OID=.;OPOS=38568009;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:106:106:1:1:105:105:0.990566:53:52:0:1:53:52:0:1
chr21	38587916	.	A	G	444.63	PASS	AF=0.589041;AO=41;DP=73;FAO=43;FDP=73;FR=.;FRO=30;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=17;FWDB=-0.0249367;FXX=0.0135117;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9135;QD=24.3634;RBI=0.0676535;REFB=-0.0189716;REVB=0.0628901;RO=30;SAF=18;SAR=23;SRF=14;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0215219;STB=0.503554;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0142652;OID=.;OPOS=38587916;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:30:30:41:43:0.589041:23:18:14:16:24:19:13:17
chr21	38885442	.	A	G	990.6	PASS	AF=1;AO=66;DP=67;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00247932;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=252.758;QD=59.1401;RBI=0.0113264;REFB=0;REVB=0.0110517;RO=0;SAF=40;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00169e-05;OID=.;OPOS=38885442;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:67:67:0:0:66:67:1:26:40:0:0:27:40:0:0
chr21	38997701	.	G	A	618.84	PASS	AF=0.54386;AO=62;DP=113;FAO=62;FDP=114;FR=.;FRO=52;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=31;FSRR=21;FWDB=-0.0298449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=192.465;QD=21.7137;RBI=0.0299742;REFB=-0.012751;REVB=0.002781;RO=51;SAF=26;SAR=36;SRF=30;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139275;STB=0.580619;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0115531;OID=.;OPOS=38997701;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:114:51:52:62:62:0.54386:36:26:30:21:36:26:31:21
chr21	39086965	.	T	C	658.27	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00446416;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.302;QD=61.2342;RBI=0.00527439;REFB=0;REVB=-0.00280901;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000203819;OID=.;OPOS=39086965;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:41:43:1:20:21:0:0:21:22:0:0
chr21	39213020	.	G	A	670.16	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.034251;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.642;QD=62.3407;RBI=0.0395684;REFB=0;REVB=0.0198124;RO=0;SAF=18;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.65211e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000318102;OID=.;OPOS=39213020;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:25:18:0:0:25:18:0:0
chr21	39528455	.	A	T	390.93	PASS	AF=0.43617;AO=41;DP=94;FAO=41;FDP=94;FR=.;FRO=53;FSAF=18;FSAR=23;FSRF=18;FSRR=35;FWDB=-0.0258076;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=165.84;QD=16.6354;RBI=0.0261407;REFB=0.000755611;REVB=0.00415922;RO=51;SAF=18;SAR=23;SRF=16;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.12843;STB=0.557665;STBP=0.346;TYPE=snp;VARB=-0.00170543;OID=.;OPOS=39528455;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:94:51:53:41:41:0.43617:23:18:16:35:23:18:18:35
chr21	39671447	.	C	T	508.24	PASS	AF=0.514851;AO=52;DP=102;FAO=52;FDP=101;FR=.;FRO=49;FSAF=27;FSAR=25;FSRF=25;FSRR=24;FWDB=-0.0105724;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=169.482;QD=20.1281;RBI=0.0257084;REFB=-0.0210976;REVB=-0.0234339;RO=50;SAF=27;SAR=25;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.000683647;STB=0.504383;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.0175948;OID=.;OPOS=39671447;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:102:101:50:49:52:52:0.514851:25:27:26:24:25:27:25:24
chr21	39672624	.	C	G	715.01	PASS	AF=0.978723;AO=45;DP=47;FAO=46;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=25;FSAR=21;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0139046;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=172.687;QD=60.852;RBI=0.0140037;REFB=-0.084962;REVB=0.00166302;RO=1;SAF=25;SAR=20;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.018429;STB=0.5098;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.00211765;OID=.;OPOS=39672624;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:47:47:1:1:45:46:0.978723:20:25:1:0:21:25:1:0
chr21	39673219	.	G	A	371.11	PASS	AF=0.409524;AO=42;DP=105;FAO=43;FDP=105;FR=.;FRO=62;FSAF=25;FSAR=18;FSRF=30;FSRR=32;FWDB=-0.0137136;FXX=0.00943307;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.301;QD=14.1376;RBI=0.0270716;REFB=-0.00529688;REVB=0.0233411;RO=61;SAF=24;SAR=18;SRF=30;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0839413;STB=0.558009;STBP=0.334;TYPE=snp;VARB=0.00605444;OID=.;OPOS=39673219;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:105:61:62:42:43:0.409524:18:24:30:31:18:25:30:32
chr21	39870310	.	G	A	358.13	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00177117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=269.371;QD=55.0976;RBI=0.045115;REFB=0;REVB=-0.0450802;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000139787;OID=.;OPOS=39870310;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:9:16:0:0:10:16:0:0
chr21	40195277	.	T	A	3140.7	PASS	AF=0.995;AO=197;DP=200;FAO=199;FDP=200;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=142;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.071594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4258;QD=62.814;RBI=0.0721623;REFB=-0.133177;REVB=-0.00903883;RO=2;SAF=57;SAR=140;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00675497;STB=0.501754;STBP=0.592;TYPE=snp;VARB=0.0057801;OID=.;OPOS=40195277;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:200:200:2:1:197:199:0.995:140:57:0:2:142:57:0:1
chr21	40552307	.	A	G	1556.37	PASS	AF=1;AO=102;DP=102;FAO=104;FDP=104;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0712039;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.651;QD=59.8602;RBI=0.0794747;REFB=0;REVB=0.0353021;RO=0;SAF=54;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.03919e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000149579;OID=.;OPOS=40552307;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:102:104:0:0:102:104:1:48:54:0:0:48:56:0:0
chr21	40571246	.	A	G	1804.15	PASS	AF=1;AO=118;DP=118;FAO=118;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=65;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=257.816;QD=61.1577;RBI=0.0212979;REFB=0;REVB=0.0170429;RO=0;SAF=65;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.36349e-05;OID=.;OPOS=40571246;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:118:118:0:0:118:118:1:53:65:0:0:53:65:0:0
chr21	40574305	.	A	G	1499.15	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=95;FDP=95;FR=.;FRO=0;FSAF=73;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0285171;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.721;QD=63.1221;RBI=0.0522403;REFB=0;REVB=0.0437702;RO=0;SAF=71;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.50273e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00014955;OID=.;OPOS=40574305;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:95:0:0:92:95:1:21:71:0:0:22:73:0:0
chr21	40584598	.	C	T	885.72	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0195143;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9552;QD=58.0799;RBI=0.0250535;REFB=0;REVB=-0.0157121;RO=0;SAF=29;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.73709e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.78427e-05;OID=.;OPOS=40584598;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:61:0:0:60:61:1:31:29:0:0:31:30:0:0
chr21	40670460	.	G	C	1302.01	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=84;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-8.79901e-05;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=134.408;QD=62.0004;RBI=0.00955076;REFB=0;REVB=-0.00955036;RO=0;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14462e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.20095e-05;OID=.;OPOS=40670460;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:84:0:0:82:84:1:46:36:0:0:48:36:0:0
chr21	40686020	.	C	T	1491.7	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0185772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=269.858;QD=63.4765;RBI=0.0443794;REFB=0;REVB=0.0403041;RO=0;SAF=45;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.30166e-05;OID=.;OPOS=40686020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:94:94:1:49:45:0:0:49:45:0:0
chr21	40686078	.	G	C	1393.58	PASS	AF=1;AO=88;DP=88;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=194.388;QD=62.6328;RBI=0.0384801;REFB=0;REVB=0.020633;RO=0;SAF=47;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.34097e-05;OID=.;OPOS=40686078;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:88:89:0:0:88:89:1:41:47:0:0:41:48:0:0
chr21	40686327	.	T	C	1043.74	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0194806;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.936;QD=59.6422;RBI=0.0387803;REFB=0;REVB=0.0335324;RO=0;SAF=30;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123891;OID=.;OPOS=40686327;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:40:30:0:0:40:30:0:0
chr21	40823981	.	G	A	1264.69	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0101428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.735;QD=61.6924;RBI=0.0427797;REFB=0;REVB=0.0415599;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.04211e-05;OID=.;OPOS=40823981;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:42:40:0:0:42:40:0:0
chr21	40871810	.	T	C	299.7	PASS	AF=0.454545;AO=31;DP=73;FAO=35;FDP=77;FR=.;FRO=42;FSAF=12;FSAR=23;FSRF=24;FSRR=18;FWDB=-0.0122048;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.4675;QD=15.569;RBI=0.0607673;REFB=-0.0411489;REVB=0.0595291;RO=39;SAF=12;SAR=19;SRF=24;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.224127;STB=0.627199;STBP=0.052;TYPE=snp;VARB=0.0431935;OID=.;OPOS=40871810;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:77:39:42:31:35:0.454545:19:12:24:15:23:12:24:18
chr21	40883671	.	G	GAGA	140.14	PASS	AF=0.333333;AO=18;DP=54;FAO=18;FDP=54;FR=.;FRO=36;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=27;FSRR=9;FWDB=-0.0303769;FXX=0;HRUN=1;LEN=3;MLLD=235.796;QD=10.3808;RBI=0.0446184;REFB=-0.037493;REVB=-0.032681;RO=35;SAF=9;SAR=9;SRF=26;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.276538;STB=0.666502;STBP=0.096;TYPE=ins;VARB=0.0784989;OID=.;OPOS=40883672;OREF=-;OALT=AGA;OMAPALT=GAGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:18:54:18:54:36:9:9:27:9:99:35:9:9:26:9
chr21	40969826	.	G	C	1208.96	PASS	AF=1;AO=78;DP=79;FAO=79;FDP=79;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510534;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.414;QD=61.2131;RBI=0.0656589;REFB=0;REVB=0.0412873;RO=1;SAF=27;SAR=51;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0172063;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.6153e-05;OID=.;OPOS=40969826;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:79:79:1:0:78:79:1:51:27:1:0:51:28:0:0
chr21	41032740	.	T	C	145.6	PASS	AF=0.457143;AO=16;DP=34;FAO=16;FDP=35;FR=.;FRO=19;FSAF=12;FSAR=4;FSRF=14;FSRR=5;FWDB=-0.00956216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.505;QD=16.6402;RBI=0.0415307;REFB=-0.00815374;REVB=-0.0404149;RO=18;SAF=12;SAR=4;SRF=14;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0350097;STB=0.509422;STBP=0.957;TYPE=snp;VARB=0.0142404;OID=.;OPOS=41032740;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:18:19:16:16:0.457143:4:12:14:4:4:12:14:5
chr21	41032804	.	G	A	263.38	PASS	AF=0.454545;AO=29;DP=66;FAO=30;FDP=66;FR=.;FRO=36;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=25;FSRR=11;FWDB=-0.00236235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.952;QD=15.9624;RBI=0.0800421;REFB=-0.00895671;REVB=0.0800073;RO=36;SAF=17;SAR=12;SRF=25;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.112246;STB=0.572281;STBP=0.311;TYPE=snp;VARB=0.0120336;OID=.;OPOS=41032804;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:36:36:29:30:0.454545:12:17:25:11:13:17:25:11
chr21	41137499	.	A	G	142.39	PASS	AF=0.346154;AO=17;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=25;FSRR=9;FWDB=0.0119572;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=219.889;QD=10.9527;RBI=0.012912;REFB=-0.0118268;REVB=0.00487275;RO=34;SAF=6;SAR=11;SRF=25;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.411724;STB=0.74674;STBP=0.022;TYPE=snp;VARB=0.0140306;OID=.;OPOS=41137499;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:34:34:17:18:0.346154:11:6:25:9:12:6:25:9
chr21	41137507	.	G	C	146.83	PASS	AF=0.346154;AO=18;DP=52;FAO=18;FDP=52;FR=.;FRO=34;FSAF=6;FSAR=12;FSRF=23;FSRR=11;FWDB=-0.0399334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.9995;QD=11.2942;RBI=0.0400863;REFB=-0.0224828;REVB=0.00349746;RO=32;SAF=6;SAR=12;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.404526;STB=0.715821;STBP=0.031;TYPE=snp;VARB=0.0241698;OID=.;OPOS=41137507;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:32:34:18:18:0.346154:12:6:23:9:12:6:23:11
chr21	41165462	.	C	A	347.12	PASS	AF=0.564516;AO=34;DP=61;FAO=35;FDP=62;FR=.;FRO=27;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=10;FSRR=17;FWDB=-0.0037696;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.242;QD=22.3948;RBI=0.00844084;REFB=-0.0418611;REVB=0.00755234;RO=27;SAF=21;SAR=13;SRF=10;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.198771;STB=0.599943;STBP=0.08;TYPE=snp;VARB=0.02961;OID=.;OPOS=41165462;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:62:27:27:34:35:0.564516:13:21:10:17:14:21:10:17
chr21	41297992	.	C	T	415.08	PASS	AF=0.431193;AO=47;DP=109;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=34;FSRR=28;FWDB=0.074082;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=66.3943;QD=15.2324;RBI=0.102419;REFB=-0.0112061;REVB=0.0707213;RO=62;SAF=27;SAR=20;SRF=34;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0268945;STB=0.515097;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0325602;OID=.;OPOS=41297992;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:62:62:47:47:0.431193:20:27:34:28:20:27:34:28
chr21	41416066	.	C	T	462.53	PASS	AF=0.474227;AO=46;DP=97;FAO=46;FDP=97;FR=.;FRO=51;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=41;FSRR=10;FWDB=-0.00627916;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=236.499;QD=19.0736;RBI=0.0204514;REFB=-0.0203025;REVB=-0.0194636;RO=51;SAF=29;SAR=17;SRF=41;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.187003;STB=0.603102;STBP=0.101;TYPE=snp;VARB=0.0264877;OID=.;OPOS=41416066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:97:51:51:46:46:0.474227:17:29:41:10:17:29:41:10
chr21	41434841	.	T	C	358.58	PASS	AF=0.397959;AO=38;DP=97;FAO=39;FDP=98;FR=.;FRO=59;FSAF=15;FSAR=24;FSRF=24;FSRR=35;FWDB=-0.00269824;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.916;QD=14.6359;RBI=0.00296099;REFB=-0.0055085;REVB=0.00121939;RO=59;SAF=15;SAR=23;SRF=24;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0134297;STB=0.513996;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.00585251;OID=.;OPOS=41434841;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:97:98:59:59:38:39:0.397959:23:15:24:35:24:15:24:35
chr21	41447058	.	G	C	587.46	PASS	AF=0.580645;AO=54;DP=92;FAO=54;FDP=93;FR=.;FRO=39;FSAF=20;FSAR=34;FSRF=25;FSRR=14;FWDB=-0.0347772;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=73.4508;QD=25.2672;RBI=0.0396299;REFB=-0.0146753;REVB=-0.019002;RO=38;SAF=20;SAR=34;SRF=24;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199612;STB=0.614415;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00961147;OID=.;OPOS=41447058;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:92:93:38:39:54:54:0.580645:34:20:24:14:34:20:25:14
chr21	41455854	.	G	A	365.1	PASS	AF=0.416667;AO=39;DP=95;FAO=40;FDP=96;FR=.;FRO=56;FSAF=15;FSAR=25;FSRF=22;FSRR=34;FWDB=-0.0208126;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.29;QD=15.2123;RBI=0.0209936;REFB=-0.00718707;REVB=-0.00275106;RO=54;SAF=15;SAR=24;SRF=22;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0245841;STB=0.511044;STBP=0.843;TYPE=snp;VARB=0.0100626;OID=.;OPOS=41455854;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:96:54:56:39:40:0.416667:24:15:22:32:25:15:22:34
chr21	41684090	.	C	T	246.24	PASS	AF=0.311321;AO=33;DP=106;FAO=33;FDP=106;FR=.;FRO=73;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=62;FSRR=11;FWDB=0.00707923;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.412;QD=9.29216;RBI=0.117935;REFB=-0.0223736;REVB=-0.117722;RO=71;SAF=19;SAR=14;SRF=62;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.393904;STB=0.704688;STBP=0.023;TYPE=snp;VARB=0.0464445;OID=.;OPOS=41684090;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:106:106:71:73:33:33:0.311321:14:19:62:9:14:19:62:11
chr21	41725630	.	G	C	77.93	PASS	AF=0.454545;AO=10;DP=22;FAO=10;FDP=22;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=2;FWDB=-0.00453073;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=276.104;QD=14.1699;RBI=0.00509437;REFB=-0.0235839;REVB=-0.00232919;RO=12;SAF=3;SAR=7;SRF=10;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.467985;STB=0.770697;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0287433;OID=.;OPOS=41725630;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:12:12:10:10:0.454545:7:3:10:2:7:3:10:2
chr21	41885146	.	C	A	105.54	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=18;FAO=9;FDP=18;FR=.,HEALED;FRO=5;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0738819;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=35.9116;QD=23.4527;RBI=0.138436;REFB=-0.0280259;REVB=0.117073;RO=5;SAF=2;SAR=5;SRF=3;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.237226;STB=0.555432;STBP=0.657;TYPE=snp;VARB=0.0575521;OID=.;OPOS=41885146;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:18:18:5:5:7:9:0.5:5:2:3:2:5:4:3:2
chr21	42540356	.	C	T	62.26	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0510281;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.5791;QD=35.5755;RBI=0.185822;REFB=0;REVB=0.178678;RO=0;SAF=5;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.27427e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0182427;OID=.;OPOS=42540356;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:2:5:0:0:2:5:0:0
chr21	42622786	.	C	T	972.81	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0136285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.375;QD=58.9583;RBI=0.0191026;REFB=0;REVB=0.0133855;RO=0;SAF=33;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.18229e-05;OID=.;OPOS=42622786;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:66:66:1:33:33:0:0:33:33:0:0
chr21	42717662	.	T	C	937.48	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=120.704;QD=58.5924;RBI=0.0755786;REFB=0;REVB=0.0631033;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000275151;OID=.;OPOS=42717662;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:27:37:0:0:27:37:0:0
chr21	42775555	.	A	G	274.44	PASS	AF=0.956522;AO=21;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0797899;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=46.8399;QD=47.7288;RBI=0.0846457;REFB=-0.0825616;REVB=0.0282573;RO=2;SAF=6;SAR=15;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0411632;STB=0.538425;STBP=0.17;TYPE=snp;VARB=0.00417875;OID=.;OPOS=42775555;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:23:23:2:1:21:22:0.956522:15:6:1:1:16:6:1:0
chr21	42821113	.	T	C	197.62	PASS	AF=0.393443;AO=24;DP=62;FAO=24;FDP=61;FR=.;FRO=37;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=16;FWDB=0.0417123;FXX=0.0161264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.569;QD=12.959;RBI=0.0417216;REFB=-0.01038;REVB=0.000878899;RO=36;SAF=10;SAR=14;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173543;STB=0.591205;STBP=0.27;TYPE=snp;VARB=0.0133359;OID=.;OPOS=42821113;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:61:36:37:24:24:0.393443:14:10:21:15:14:10:21:16
chr21	42848560	.	CAG	C	123.03	PASS	AF=0.518519;AO=12;DP=27;FAO=14;FDP=27;FR=.;FRO=13;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.00346299;FXX=0.0357015;HRUN=1;LEN=2;MLLD=244.392;QD=18.2269;RBI=0.018652;REFB=-0.0210745;REVB=0.0183277;RO=14;SAF=3;SAR=9;SRF=7;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.259174;STB=0.590032;STBP=0.333;TYPE=del;VARB=0.0171088;OID=.;OPOS=42848561;OREF=AG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.518519:12:27:14:27:13:5:9:7:6:99:14:3:9:7:7
chr21	43161022	.	C	T	955.16	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0369177;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.478;QD=58.7789;RBI=0.0734775;REFB=0;REVB=0.0635298;RO=0;SAF=44;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000324844;OID=.;OPOS=43161022;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:64:65:1:20:44:0:0:20:45:0:0
chr21	43161357	.	T	C	891.82	PASS	AF=1;AO=60;DP=62;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0180778;FXX=0.031741;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.544;QD=58.4799;RBI=0.0191785;REFB=0;REVB=0.00640379;RO=0;SAF=35;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.89445e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000481093;OID=.;OPOS=43161357;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:61:0:0:60:61:1:25:35:0:0:26:35:0:0
chr21	43161805	.	G	A	1385.52	PASS	AF=1;AO=89;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0279506;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.404;QD=61.5787;RBI=0.0497226;REFB=-0.0839439;REVB=0.041123;RO=1;SAF=56;SAR=33;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0141437;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000348611;OID=.;OPOS=43161805;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:90:90:1:0:89:90:1:33:56:0:1:34:56:0:0
chr21	43161877	.	C	T	1126.88	PASS	AF=0.974359;AO=76;DP=78;FAO=76;FDP=78;FR=.;FRO=2;FSAF=47;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.11065;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.109;QD=57.7886;RBI=0.110934;REFB=-0.14823;REVB=0.00793065;RO=1;SAF=47;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160369;STB=0.503211;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=0.00169392;OID=.;OPOS=43161877;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:78:78:1:2:76:76:0.974359:29:47:0:1:29:47:1:1
chr21	43162150	.	G	A	1754.31	PASS	AF=0.983193;AO=116;DP=117;FAO=117;FDP=119;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=64;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0158597;FXX=0.00833264;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.953;QD=58.9684;RBI=0.0402096;REFB=-0.0660663;REVB=0.0369497;RO=1;SAF=53;SAR=63;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00887625;STB=0.509258;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.000344605;OID=.;OPOS=43162150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:117:119:1:2:116:117:0.983193:63:53:1:0:64:53:2:0
chr21	43164232	.	C	A	393.33	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.051767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.03;QD=56.1901;RBI=0.094359;REFB=0;REVB=0.0788911;RO=0;SAF=8;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.75204e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000641586;OID=.;OPOS=43164232;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:28:28:1:20:8:0:0:20:8:0:0
chr21	43218520	.	G	A	241.17	PASS	AF=0.424242;AO=28;DP=66;FAO=28;FDP=66;FR=.;FRO=38;FSAF=22;FSAR=6;FSRF=25;FSRR=13;FWDB=-0.00456102;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=281.341;QD=14.6164;RBI=0.00465306;REFB=-0.00837367;REVB=0.000920926;RO=38;SAF=22;SAR=6;SRF=25;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.169376;STB=0.597068;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0119069;OID=.;OPOS=43218520;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:38:38:28:28:0.424242:6:22:25:13:6:22:25:13
chr21	43218807	.	C	T	370.47	PASS	AF=0.487179;AO=38;DP=77;FAO=38;FDP=78;FR=.;FRO=40;FSAF=29;FSAR=9;FSRF=28;FSRR=12;FWDB=0.0573997;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=1;MLLD=89.9648;QD=18.9984;RBI=0.0578312;REFB=-0.00947172;REVB=0.0070512;RO=39;SAF=29;SAR=9;SRF=28;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0548936;STB=0.542757;STBP=0.535;TYPE=snp;VARB=0.00695885;OID=.;OPOS=43218807;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:78:39:40:38:38:0.487179:9:29:28:11:9:29:28:12
chr21	43219728	.	A	T	478.41	PASS	AF=0.484536;AO=46;DP=96;FAO=47;FDP=97;FR=.;FRO=50;FSAF=25;FSAR=22;FSRF=21;FSRR=29;FWDB=0.0262321;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.777;QD=19.7282;RBI=0.0262344;REFB=-0.00164891;REVB=-0.000347639;RO=50;SAF=24;SAR=22;SRF=21;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0950672;STB=0.557475;STBP=0.312;TYPE=snp;VARB=0.00164706;OID=.;OPOS=43219728;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:97:50:50:46:47:0.484536:22:24:21:29:22:25:21:29
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chr21	43221483	.	A	G	175.72	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.693;QD=46.8596;RBI=0.0347843;REFB=0;REVB=0.0316021;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000196034;OID=.;OPOS=43221483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:6:8:0:0:6:9:0:0
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chr21	43510427	.	T	C	221.4	PASS	AF=0.369863;AO=27;DP=73;FAO=27;FDP=73;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=20;FWDB=-0.010208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.6;QD=12.1317;RBI=0.0106187;REFB=-0.00846752;REVB=-0.00292459;RO=42;SAF=15;SAR=12;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339856;STB=0.506168;STBP=0.932;TYPE=snp;VARB=0.020951;OID=.;OPOS=43510427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:73:73:42:46:27:27:0.369863:12:15:22:20:12:15:26:20
chr21	43510437	.	A	C	224.75	PASS	AF=0.391304;AO=27;DP=69;FAO=27;FDP=69;FR=.;FRO=42;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=22;FSRR=20;FWDB=-0.0374844;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.5485;QD=13.0287;RBI=0.0385522;REFB=0.0190958;REVB=0.0090105;RO=42;SAF=15;SAR=12;SRF=22;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0339856;STB=0.519466;STBP=0.788;TYPE=snp;VARB=-0.0318712;OID=.;OPOS=43510437;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:69:42:42:27:27:0.391304:12:15:22:20:12:15:22:20
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chr21	43547788	.	T	C	764.54	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0220947;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.41;QD=63.7114;RBI=0.022544;REFB=0;REVB=0.00447864;RO=0;SAF=23;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.56898e-05;OID=.;OPOS=43547788;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:48:0:0:45:48:1:22:23:0:0:22:26:0:0
chr21	43547873	.	G	A	1513.16	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0340612;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.162;QD=59.927;RBI=0.0361137;REFB=0;REVB=0.0120015;RO=0;SAF=55;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.03216e-05;OID=.;OPOS=43547873;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:46:55:0:0:46:55:0:0
chr21	43557559	.	T	A	472.1	PASS	AF=0.468468;AO=51;DP=113;FAO=52;FDP=111;FR=.;FRO=59;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=26;FSRR=33;FWDB=0.0222583;FXX=0.0176975;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.7764;QD=17.0126;RBI=0.0227449;REFB=0.0131316;REVB=0.00467969;RO=58;SAF=26;SAR=25;SRF=24;SRR=34;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0917259;STB=0.531519;STBP=0.552;TYPE=snp;VARB=-0.0115064;OID=.;OPOS=43557559;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:111:58:59:51:52:0.468468:25:26:24:34:26:26:26:33
chr21	43557698	.	A	C	300.05	PASS	AF=0.452055;AO=32;DP=72;FAO=33;FDP=73;FR=.;FRO=40;FSAF=19;FSAR=14;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0327338;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.9509;QD=16.4411;RBI=0.0524634;REFB=0.0288052;REVB=0.0409989;RO=40;SAF=18;SAR=14;SRF=23;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0125391;STB=0.500425;STBP=0.998;TYPE=snp;VARB=-0.0340851;OID=.;OPOS=43557698;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:72:73:40:40:32:33:0.452055:14:18:23:17:14:19:23:17
chr21	43641347	.	G	A	410.19	PASS	AF=0.431193;AO=46;DP=109;FAO=47;FDP=109;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=31;FSRF=31;FSRR=31;FWDB=-0.0189546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=231.077;QD=15.0527;RBI=0.0197692;REFB=0.0102824;REVB=0.00561643;RO=62;SAF=16;SAR=30;SRF=31;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.161351;STB=0.594895;STBP=0.105;TYPE=snp;VARB=-0.0122626;OID=.;OPOS=43641347;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:109:109:62:62:46:47:0.431193:30:16:31:31:31:16:31:31
chr21	43691232	.	G	A	523.0	PASS	AF=0.459016;AO=56;DP=122;FAO=56;FDP=122;FR=.;FRO=66;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=38;FSRR=28;FWDB=0.0147457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.141;QD=17.1476;RBI=0.022873;REFB=-0.00944944;REVB=0.0174853;RO=65;SAF=27;SAR=29;SRF=37;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0839572;STB=0.550508;STBP=0.329;TYPE=snp;VARB=0.00960203;OID=.;OPOS=43691232;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:122:122:65:66:56:56:0.459016:29:27:37:28:29:27:38:28
chr21	43716734	.	GTTT	GTTG,GTT	151.73	PASS	AF=0.111111,0.888889;AO=4,19;DP=53;FAO=7,56;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=0,21;FSAR=7,35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0539446,0.892524;FXX=0.0596926;HRUN=13,13;LEN=1,1;MLLD=157.31,2.88808;QD=9.6334;RBI=0.237619,1.58229;REFB=0,0;REVB=-0.231414,-1.30654;RO=7;SAF=0,8;SAR=4,11;SRF=5;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.751977,-0.143169;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,del;VARB=0.26314,-0.161405;OID=.,.;OPOS=43716737,43716735;OREF=T,T;OALT=G,-;OMAPALT=GTTG,GTT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.111111,0.888889:4,19:53:7,56:63:0:0,21:7,35:0:0:34:7:0,8:4,11:5:2
chr21	43732346	.	CGGGGGCA	CGGGGCA,CGGGGCAG,CGGGGCGA	260.97	PASS	AF=0.565789,0.118421,0.0131579;AO=32,5,4;DP=73;FAO=43,9,1;FDP=76;FR=.;FRO=23;FSAF=9,8,1;FSAR=34,1,0;FSRF=4;FSRR=19;FWDB=0.239804,0.120126,-0.0856001;FXX=0.0256377;HRUN=5,5,5;LEN=1,3,2;MLLD=9.33658,18.4126,155.304;QD=13.7353;RBI=0.246803,0.125732,0.0897063;REFB=-0.169337,-0.0757963,-0.0150923;REVB=-0.0583572,-0.0371248,-0.0268299;RO=25;SAF=2,4,4;SAR=30,1,0;SRF=7;SRR=18;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.416853,0.55623,0.715561;STB=0.519034,0.929482,0.995849;STBP=0.748,0.022,0.088;TYPE=del,mnp,mnp;VARB=0.142255,0.145096,0.0245892;OID=.,.,.;OPOS=43732347,43732351,43732351;OREF=G,GCA,GC;OALT=-,CAG,CG;OMAPALT=CGGGGCA,CGGGGCAG,CGGGGCGA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.565789,0.118421,0.0131579:32,5,4:73:43,9,1:76:23:9,8,1:34,1,0:4:19:77:25:2,4,4:30,1,0:7:18
chr21	43786512	.	C	T	126.19	PASS	AF=0.326087;AO=13;DP=45;FAO=15;FDP=46;FR=.;FRO=31;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=14;FWDB=-0.042597;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.056;QD=10.9732;RBI=0.0442661;REFB=-0.00874414;REVB=-0.0120409;RO=31;SAF=3;SAR=10;SRF=17;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.384438;STB=0.64686;STBP=0.166;TYPE=snp;VARB=0.0143713;OID=.;OPOS=43786512;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:46:31:31:13:15:0.326087:10:3:17:14:10:5:17:14
chr21	43786606	.	G	A	282.87	PASS	AF=0.469697;AO=31;DP=67;FAO=31;FDP=66;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=12;FSRF=15;FSRR=20;FWDB=-0.0118152;FXX=0.0149231;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.754;QD=17.1433;RBI=0.025717;REFB=0.00264413;REVB=-0.0228422;RO=35;SAF=19;SAR=12;SRF=15;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.175219;STB=0.598361;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=-0.00188648;OID=.;OPOS=43786606;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:66:35:35:31:31:0.469697:12:19:15:20:12:19:15:20
chr21	43792869	.	C	T	1583.0	PASS	AF=1;AO=94;DP=94;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=54;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0254901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=308.117;QD=63.9597;RBI=0.0534133;REFB=0;REVB=0.0469386;RO=0;SAF=54;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.40591e-05;OID=.;OPOS=43792869;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:99:0:0:94:99:1:40:54:0:0:45:54:0:0
chr21	43803167	.	T	C	249.71	PASS	AF=0.5;AO=27;DP=54;FAO=27;FDP=54;FR=.;FRO=27;FSAF=13;FSAR=14;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=-0.00731317;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.896;QD=18.4974;RBI=0.0171567;REFB=-0.0424795;REVB=-0.01552;RO=27;SAF=13;SAR=14;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0331541;STB=0.518556;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.048689;OID=.;OPOS=43803167;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:27:27:27:27:0.5:14:13:12:15:14:13:12:15
chr21	43803308	.	C	CTA	278.17	PASS	AF=0.410256;AO=31;DP=80;FAO=32;FDP=78;FR=.;FRO=46;FSAF=9;FSAR=23;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0302331;FXX=0.0249969;HRUN=1;LEN=2;MLLD=227.633;QD=14.265;RBI=0.0304112;REFB=-0.00819535;REVB=-0.00328699;RO=46;SAF=9;SAR=22;SRF=17;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0958152;STB=0.560936;STBP=0.422;TYPE=ins;VARB=0.0110634;OID=.;OPOS=43803309;OREF=-;OALT=TA;OMAPALT=CTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.410256:31:80:32:78:46:9:23:17:29:99:46:9:22:17:29
chr21	43805637	.	C	T	361.63	PASS	AF=0.580645;AO=36;DP=62;FAO=36;FDP=62;FR=.;FRO=26;FSAF=11;FSAR=25;FSRF=19;FSRR=7;FWDB=0.0389487;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.5789;QD=23.3312;RBI=0.0440158;REFB=-0.0191116;REVB=0.0205034;RO=26;SAF=11;SAR=25;SRF=19;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.327805;STB=0.680479;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.0143343;OID=.;OPOS=43805637;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:26:26:36:36:0.580645:25:11:19:7:25:11:19:7
chr21	43852232	.	C	T	526.63	PASS	AF=0.569767;AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=86;FR=.;FRO=37;FSAF=28;FSAR=21;FSRF=19;FSRR=18;FWDB=-0.0153164;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=250.692;QD=24.4946;RBI=0.0270485;REFB=-0.0354715;REVB=0.0222942;RO=37;SAF=28;SAR=21;SRF=19;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0460499;STB=0.525242;STBP=0.621;TYPE=snp;VARB=0.0254075;OID=.;OPOS=43852232;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:37:37:49:49:0.569767:21:28:19:18:21:28:19:18
chr21	43854985	.	A	C	461.02	PASS	AF=0.480769;AO=47;DP=101;FAO=50;FDP=104;FR=.;FRO=54;FSAF=25;FSAR=25;FSRF=32;FSRR=22;FWDB=0.0352908;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=53.4731;QD=17.7314;RBI=0.0510264;REFB=0.000171442;REVB=0.0368544;RO=54;SAF=24;SAR=23;SRF=32;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0788595;STB=0.548058;STBP=0.351;TYPE=snp;VARB=0.00118706;OID=.;OPOS=43854985;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:101:104:54:54:47:50:0.480769:23:24:32:22:25:25:32:22
chr21	43863521	.	A	G	151.46	PASS	AF=0.361702;AO=17;DP=47;FAO=17;FDP=47;FR=.;FRO=30;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=12;FSRR=18;FWDB=0.0767117;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4379;QD=12.8904;RBI=0.0767356;REFB=0.00525552;REVB=-0.00191443;RO=29;SAF=9;SAR=8;SRF=12;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124217;STB=0.581995;STBP=0.402;TYPE=snp;VARB=-0.00339653;OID=.;OPOS=43863521;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:29:30:17:17:0.361702:8:9:12:17:8:9:12:18
chr21	43913125	.	T	C	467.38	PASS	AF=0.429752;AO=52;DP=121;FAO=52;FDP=121;FR=.;FRO=69;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=24;FSRR=45;FWDB=0.00669272;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=167.111;QD=15.4504;RBI=0.00710542;REFB=-0.0174198;REVB=-0.00238633;RO=69;SAF=26;SAR=26;SRF=24;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155268;STB=0.586744;STBP=0.104;TYPE=snp;VARB=0.0218357;OID=.;OPOS=43913125;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:69:69:52:52:0.429752:26:26:24:45:26:26:24:45
chr21	44180443	.	C	T	335.45	PASS	AF=0.455696;AO=36;DP=79;FAO=36;FDP=79;FR=.;FRO=43;FSAF=15;FSAR=21;FSRF=27;FSRR=16;FWDB=0.0112108;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.407;QD=16.985;RBI=0.013895;REFB=-0.00801247;REVB=-0.00820906;RO=42;SAF=15;SAR=21;SRF=27;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.214991;STB=0.613716;STBP=0.07;TYPE=snp;VARB=0.0141121;OID=.;OPOS=44180443;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:79:79:42:43:36:36:0.455696:21:15:27:15:21:15:27:16
chr21	44323529	.	G	A	210.28	PASS	AF=0.444444;AO=24;DP=54;FAO=24;FDP=54;FR=.;FRO=30;FSAF=12;FSAR=12;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0144282;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=119.586;QD=15.5764;RBI=0.0203966;REFB=-0.0141468;REVB=-0.014417;RO=30;SAF=12;SAR=12;SRF=10;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163745;STB=0.592518;STBP=0.254;TYPE=snp;VARB=0.0151022;OID=.;OPOS=44323529;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:30:30:24:24:0.444444:12:12:10:20:12:12:10:20
chr21	44371114	.	T	C	191.29	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=99.441;QD=47.8223;RBI=0.0267979;REFB=0;REVB=-0.0222431;RO=0;SAF=7;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000196013;OID=.;OPOS=44371114;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:9:7:0:0:9:7:0:0
chr21	44430325	.	T	C	393.34	PASS	AF=1;AO=27;DP=28;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00628683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.274;QD=56.1915;RBI=0.0256762;REFB=0;REVB=0.0248946;RO=0;SAF=5;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.85892e-05;OID=.;OPOS=44430325;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:28:0:0:27:28:1:22:5:0:0:22:6:0:0
chr21	44437142	.	A	G	490.35	PASS	AF=0.923077;AO=35;DP=39;FAO=36;FDP=39;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=-0.00870465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.9145;QD=50.2918;RBI=0.0688085;REFB=0.0839405;REVB=0.0682557;RO=2;SAF=14;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0622358;STB=0.54836;STBP=0.069;TYPE=snp;VARB=-0.00611716;OID=.;OPOS=44437142;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:39:39:2:3:35:36:0.923077:21:14:2:0:22:14:3:0
chr21	44450392	.	T	C	227.13	PASS	AF=0.8;AO=20;DP=25;FAO=20;FDP=25;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.195492;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=98.5266;QD=36.3414;RBI=0.196177;REFB=0.0657455;REVB=0.0163834;RO=5;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.267694;STB=0.646906;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=-0.00606357;OID=.;OPOS=44450392;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:25:25:5:5:20:20:0.8:6:14:0:5:6:14:0:5
chr21	44450394	.	T	C	196.37	PASS	AF=0.782609;AO=18;DP=23;FAO=18;FDP=23;FR=.;FRO=5;FSAF=14;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.126883;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=75.2554;QD=34.1509;RBI=0.130209;REFB=-0.0149252;REVB=-0.0292421;RO=5;SAF=14;SAR=4;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.346797;STB=0.692076;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0167989;OID=.;OPOS=44450394;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:27:23:23:5:5:18:18:0.782609:4:14:0:5:4:14:0:5
chr21	44450404	.	C	T	94.57	PASS	AF=0.611111;AO=11;DP=18;FAO=11;FDP=18;FR=.;FRO=7;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=2;FSRR=5;FWDB=0.021837;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.568;QD=21.0152;RBI=0.0457142;REFB=-0.0514173;REVB=-0.0401613;RO=7;SAF=9;SAR=2;SRF=2;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.41657;STB=0.74069;STBP=0.028;TYPE=snp;VARB=0.00344619;OID=.;OPOS=44450404;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:46:18:18:7:7:11:11:0.611111:2:9:2:5:2:9:2:5
chr21	44480616	.	G	A	735.03	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0645549;FXX=0.020829;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.1326;QD=62.556;RBI=0.0673112;REFB=0;REVB=0.0190647;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00142497;OID=.;OPOS=44480616;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:47:0:0:45:47:1:24:21:0:0:25:22:0:0
chr21	44592483	.	T	G	174.56	PASS	AF=0.461538;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=21;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=5;FSRR=16;FWDB=0.0136478;FXX=0.0249938;HRUN=6;LEN=1;MLLD=248.36;QD=17.904;RBI=0.0275956;REFB=-0.0241653;REVB=-0.0239845;RO=16;SAF=10;SAR=8;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.301636;STB=0.666496;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0234662;OID=.;OPOS=44592483;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:39:16:21:18:18:0.461538:8:10:3:13:8:10:5:16
chr21	44835508	.	A	G	191.25	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.022756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.4694;QD=47.8112;RBI=0.044112;REFB=0;REVB=0.0377893;RO=0;SAF=8;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000379307;OID=.;OPOS=44835508;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:8:8:0:0:8:8:0:0
chr21	44837551	.	G	A	203.62	PASS	AF=0.857143;AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0430045;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=117.647;QD=38.7838;RBI=0.0430307;REFB=-0.106551;REVB=-0.00150135;RO=1;SAF=15;SAR=3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.130187;STB=0.666454;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.00299514;OID=.;OPOS=44837551;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:21:21:1:3:18:18:0.857143:3:15:0:1:3:15:0:3
chr21	44837555	.	G	A	288.97	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0706942;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=226.09;QD=52.5403;RBI=0.0828776;REFB=0;REVB=0.0432553;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000306816;OID=.;OPOS=44837555;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr21	44839085	.	G	A	30.09	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=2;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=6;FWDB=-0.110643;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.3293;QD=10.0309;RBI=0.111412;REFB=-0.0188337;REVB=-0.0130662;RO=7;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.275355;STB=0.666109;STBP=0.442;TYPE=snp;VARB=0.0618738;OID=.;OPOS=44839085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:3:2:1:6:3:2:1:6
chr21	44840138	.	G	A	329.1	PASS	AF=0.682927;AO=27;DP=41;FAO=28;FDP=41;FR=.;FRO=13;FSAF=18;FSAR=10;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=-0.000272906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=214.754;QD=32.1072;RBI=0.0358507;REFB=-0.0322316;REVB=0.0358497;RO=13;SAF=18;SAR=9;SRF=7;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0827337;STB=0.53529;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0153705;OID=.;OPOS=44840138;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:13:13:27:28:0.682927:9:18:7:6:10:18:7:6
chr21	45092257	.	T	A,C	789.14	PASS	AF=0.96,0.04;AO=48,2;DP=50;FAO=48,2;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=32,1;FSAR=16,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0415895,0.0379342;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=159.997,71.7038;QD=63.1314;RBI=0.0557603,0.040406;REFB=0,0;REVB=0.0371419,-0.0139153;RO=0;SAF=32,1;SAR=16,1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000734223,0.188791;OID=.,.;OPOS=45092257,45092257;OREF=T,T;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:50:50:0:0:48,2:48,2:0.96,0.04:16,1:32,1:0:0:16,1:32,1:0:0
chr21	45096206	.	G	A	670.96	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00348056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.334;QD=62.4148;RBI=0.106825;REFB=0;REVB=0.106768;RO=0;SAF=22;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000266345;OID=.;OPOS=45096206;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:43:0:0:42:43:1:20:22:0:0:21:22:0:0
chr21	45107518	.	A	G	1029.68	PASS	AF=1;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258443;FXX=0.0142837;HRUN=1;LEN=1;MLLD=216.391;QD=59.6916;RBI=0.03074;REFB=0;REVB=0.0166439;RO=0;SAF=46;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.45471e-05;OID=.;OPOS=45107518;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:69:0:0:69:69:1:23:46:0:0:23:46:0:0
chr21	45107562	.	T	C	754.4	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101019;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.159;QD=56.9359;RBI=0.0543558;REFB=0;REVB=0.0534088;RO=0;SAF=35;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.31071e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.95131e-05;OID=.;OPOS=45107562;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:17:35:0:0:17:36:0:0
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chr21	45210932	.	G	A	183.86	PASS	AF=0.4;AO=22;DP=56;FAO=22;FDP=55;FR=.;FRO=33;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=17;FSRR=16;FWDB=-0.0162111;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.026;QD=13.3714;RBI=0.0166019;REFB=-0.00649245;REVB=-0.00358079;RO=33;SAF=12;SAR=10;SRF=17;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317698;STB=0.518256;STBP=0.848;TYPE=snp;VARB=0.0168955;OID=.;OPOS=45210932;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:33:33:22:22:0.4:10:12:17:16:10:12:17:16
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chr21	45217559	.	T	C	1419.72	PASS	AF=0.978723;AO=90;DP=93;FAO=92;FDP=94;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0301659;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.76;QD=60.4137;RBI=0.0302365;REFB=-0.125303;REVB=0.00206444;RO=2;SAF=38;SAR=52;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0178795;STB=0.509089;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00248909;OID=.;OPOS=45217559;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:93:94:2:2:90:92:0.978723:52:38:0:2:54:38:0:2
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chr21	45219524	.	T	C	111.4	PASS	AF=0.464286;AO=12;DP=27;FAO=13;FDP=28;FR=.;FRO=15;FSAF=11;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=4;FWDB=-0.0223539;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1325;QD=15.9144;RBI=0.0408967;REFB=0.00608457;REVB=0.0342468;RO=15;SAF=10;SAR=2;SRF=11;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149152;STB=0.599828;STBP=0.448;TYPE=snp;VARB=-0.00606887;OID=.;OPOS=45219524;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:28:15:15:12:13:0.464286:2:10:11:4:2:11:11:4
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chr21	45223409	.	GC	G	33.63	PASS	AF=0.26506;AO=27;DP=84;FAO=22;FDP=83;FR=.;FRO=61;FSAF=1;FSAR=21;FSRF=13;FSRR=48;FWDB=0.020446;FXX=0.0119033;HRUN=5;LEN=1;MLLD=9.08012;QD=1.62086;RBI=0.0292976;REFB=-0.0865516;REVB=-0.0209836;RO=49;SAF=1;SAR=26;SRF=10;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.512538;STB=0.80952;STBP=0.038;TYPE=del;VARB=0.115246;OID=.;OPOS=45223410;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.26506:27:84:22:83:61:1:21:13:48:33:49:1:26:10:39
chr21	45528919	.	G	A	1801.71	PASS	AF=1;AO=120;DP=125;FAO=125;FDP=125;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145413;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.4065;QD=57.6548;RBI=0.0857278;REFB=-0.164529;REVB=0.0844855;RO=0;SAF=61;SAR=59;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00251014;OID=.;OPOS=45528919;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:125:125:0:0:120:125:1:59:61:0:0:64:61:0:0
chr21	45538647	.	T	C	955.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=65;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104511;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=171.243;QD=58.7817;RBI=0.0112067;REFB=0;REVB=0.00404527;RO=0;SAF=28;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.99207e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.99446e-05;OID=.;OPOS=45538647;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:65:65:0:0:65:65:1:37:28:0:0:37:28:0:0
chr21	45538725	.	C	A	1000.76	PASS	AF=0.985507;AO=68;DP=71;FAO=68;FDP=69;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=45;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0421827;FXX=0.028165;HRUN=5;LEN=1;MLLD=248.507;QD=58.015;RBI=0.0421828;REFB=0.170242;REVB=7.82937e-05;RO=1;SAF=23;SAR=45;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0201037;STB=0.510635;STBP=0.283;TYPE=snp;VARB=-0.000196906;OID=.;OPOS=45538725;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:71:69:1:1:68:68:0.985507:45:23:1:0:45:23:1:0
chr21	45540919	.	A	G	1568.29	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0358211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.782;QD=64.0118;RBI=0.0382977;REFB=0;REVB=-0.0135485;RO=0;SAF=66;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.9206e-05;OID=.;OPOS=45540919;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:32:66:0:0:32:66:0:0
chr21	45544594	.	T	C	1466.22	PASS	AF=0.962264;AO=102;DP=106;FAO=102;FDP=106;FR=.;FRO=4;FSAF=60;FSAR=42;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.00528065;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=238.899;QD=55.3292;RBI=0.0150745;REFB=-0.054778;REVB=0.0141194;RO=4;SAF=60;SAR=42;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00650542;STB=0.503432;STBP=0.747;TYPE=snp;VARB=0.00198213;OID=.;OPOS=45544594;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:106:106:4:4:102:102:0.962264:42:60:2:2:42:60:2:2
chr21	45553596	.	T	C	428.59	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0127522;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.3963;QD=57.1452;RBI=0.111258;REFB=0;REVB=0.110525;RO=0;SAF=9;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00095841;OID=.;OPOS=45553596;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:30:0:0:29:30:1:20:9:0:0:21:9:0:0
chr21	45565473	.	C	T	158.34	PASS	AF=0.833333;AO=15;DP=18;FAO=15;FDP=18;FR=.;FRO=3;FSAF=0;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=232.721;QD=35.187;RBI=0.0224546;REFB=-0.166642;REVB=0.0224546;RO=3;SAF=0;SAR=15;SRF=0;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00323952;OID=.;OPOS=45565473;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:18:18:3:3:15:15:0.833333:15:0:0:3:15:0:0:3
chr21	45648880	.	C	T	293.26	PASS	AF=0.568627;AO=28;DP=50;FAO=29;FDP=51;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=5;FWDB=0.0179938;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.758;QD=23.0011;RBI=0.0609557;REFB=0.00119239;REVB=0.0582393;RO=22;SAF=9;SAR=19;SRF=17;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.353405;STB=0.697851;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=-3.55149e-05;OID=.;OPOS=45648880;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:50:51:22:22:28:29:0.568627:19:9:17:5:20:9:17:5
chr21	45649494	.	A	G	411.08	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.112782;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=117.885;QD=56.7;RBI=0.114027;REFB=0;REVB=0.0168069;RO=0;SAF=11;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00053418;OID=.;OPOS=45649494;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:18:11:0:0:18:11:0:0
chr21	45649499	.	G	A	53.69	PASS	AF=0.296296;AO=8;DP=27;FAO=8;FDP=27;FR=.;FRO=19;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=-0.0230093;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=203.166;QD=7.95469;RBI=0.0231271;REFB=-0.0206097;REVB=-0.00233208;RO=19;SAF=2;SAR=6;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157867;STB=0.599733;STBP=0.582;TYPE=snp;VARB=0.0385299;OID=.;OPOS=45649499;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:53:27:27:19:19:8:8:0.296296:6:2:7:12:6:2:7:12
chr21	45649640	.	C	T	66.82	PASS	AF=0.45;AO=7;DP=19;FAO=9;FDP=20;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=11;FSRR=0;FWDB=0.0114067;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8604;QD=13.3633;RBI=0.295614;REFB=0.0158404;REVB=0.295394;RO=11;SAF=6;SAR=1;SRF=11;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.423661;STB=0.738775;STBP=0.189;TYPE=snp;VARB=7.33604e-05;OID=.;OPOS=45649640;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:19:20:11:11:7:9:0.45:1:6:11:0:3:6:11:0
chr21	45649778	.	A	G	471.69	PASS	AF=0.472222;AO=51;DP=108;FAO=51;FDP=108;FR=.;FRO=57;FSAF=44;FSAR=7;FSRF=33;FSRR=24;FWDB=0.0105486;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.7132;QD=17.47;RBI=0.0117067;REFB=-0.0199794;REVB=-0.00507681;RO=53;SAF=44;SAR=7;SRF=31;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.369459;STB=0.716662;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0342855;OID=.;OPOS=45649778;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:108:53:57:51:51:0.472222:7:44:31:22:7:44:33:24
chr21	45649848	.	T	C	408.35	PASS	AF=0.5125;AO=41;DP=80;FAO=41;FDP=80;FR=.;FRO=39;FSAF=38;FSAR=3;FSRF=27;FSRR=12;FWDB=-0.0017776;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=295.345;QD=20.4176;RBI=0.00631362;REFB=-0.0044355;REVB=0.00605821;RO=38;SAF=38;SAR=3;SRF=26;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.435029;STB=0.744942;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00331658;OID=.;OPOS=45649848;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:38:39:41:41:0.5125:3:38:26:12:3:38:27:12
chr21	45656774	.	C	T	261.78	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=0.0181989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.522;QD=17.166;RBI=0.0348269;REFB=-0.00569606;REVB=-0.0296937;RO=32;SAF=18;SAR=11;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0356535;STB=0.519986;STBP=0.786;TYPE=snp;VARB=0.00434296;OID=.;OPOS=45656774;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:11:18:21:11:11:18:21:11
chr21	45709906	.	C	G	148.76	PASS	AF=0.357143;AO=18;DP=54;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=16;FSAR=4;FSRF=24;FSRR=12;FWDB=-0.00690566;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=272.602;QD=10.6254;RBI=0.0311513;REFB=-0.0161717;REVB=-0.0303762;RO=34;SAF=15;SAR=3;SRF=24;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.208744;STB=0.615258;STBP=0.258;TYPE=snp;VARB=0.030164;OID=.;OPOS=45709906;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:56:34:36:18:20:0.357143:3:15:24:10:4:16:24:12
chr21	45732116	.	C	T	1527.81	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=103;FDP=103;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=48;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015679;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.62;QD=59.3324;RBI=0.0163833;REFB=0;REVB=0.00475193;RO=0;SAF=55;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.13729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.27368e-05;OID=.;OPOS=45732116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:101:103:0:0:101:103:1:46:55:0:0:48:55:0:0
chr21	45750112	.	C	T	292.62	PASS	AF=0.470588;AO=32;DP=68;FAO=32;FDP=68;FR=.;FRO=36;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=19;FSRR=17;FWDB=-0.0102673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=99.1414;QD=17.2129;RBI=0.0155243;REFB=-0.034586;REVB=0.0116442;RO=34;SAF=13;SAR=19;SRF=18;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.11462;STB=0.565015;STBP=0.322;TYPE=snp;VARB=0.0234244;OID=.;OPOS=45750112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:68:68:34:36:32:32:0.470588:19:13:18:16:19:13:19:17
chr21	45750145	.	T	C	342.23	PASS	AF=0.507042;AO=36;DP=71;FAO=36;FDP=71;FR=.;FRO=35;FSAF=12;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=18;FWDB=-0.0831369;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.597;QD=19.2807;RBI=0.0856832;REFB=-0.00781752;REVB=-0.0207332;RO=35;SAF=12;SAR=24;SRF=17;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.143458;STB=0.579954;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0074961;OID=.;OPOS=45750145;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:35:35:36:36:0.507042:24:12:17:18:24:12:17:18
chr21	45751822	.	G	A	337.03	PASS	AF=0.383178;AO=40;DP=108;FAO=41;FDP=107;FR=.;FRO=66;FSAF=3;FSAR=38;FSRF=14;FSRR=52;FWDB=-0.0496928;FXX=0.0092584;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.0836;QD=12.5992;RBI=0.0497052;REFB=-0.0209925;REVB=-0.0011091;RO=65;SAF=2;SAR=38;SRF=14;SRR=51;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.458671;STB=0.705112;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.0459426;OID=.;OPOS=45751822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:108:107:65:66:40:41:0.383178:38:2:14:51:38:3:14:52
chr21	45844751	.	A	G	4339.56	PASS	AF=1;AO=274;DP=277;FAO=276;FDP=276;FR=.;FRO=0;FSAF=145;FSAR=131;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0404392;FXX=0.0107523;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.868;QD=62.8922;RBI=0.0404479;REFB=-0.068511;REVB=0.000835942;RO=1;SAF=143;SAR=131;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00362601;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.97118e-05;OID=.;OPOS=45844751;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:18:277:276:1:0:274:276:1:131:143:0:1:131:145:0:0
chr21	45878388	.	CT	TC	32.83	PASS	AF=0.545455;AO=5;DP=11;FAO=6;FDP=11;FR=.;FRO=5;FSAF=0;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=71.1902;QD=11.9381;RBI=0.078999;REFB=-0.0770463;REVB=0.078999;RO=5;SAF=0;SAR=5;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0108754;OID=.;OPOS=45878388;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:11:11:5:5:5:6:0.545455:5:0:0:5:6:0:0:5
chr21	45878637	.	A	G	192.19	PASS	AF=1;AO=12;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0507905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.494;QD=48.0473;RBI=0.0925768;REFB=0;REVB=0.0774003;RO=0;SAF=4;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00107899;OID=.;OPOS=45878637;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:16:0:0:12:16:1:8:4:0:0:12:4:0:0
chr21	46011468	.	G	A	182.93	PASS	AF=0.941176;AO=16;DP=17;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.052499;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=124.198;QD=43.0412;RBI=0.064236;REFB=-0.160866;REVB=0.0370151;RO=1;SAF=11;SAR=5;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0828326;STB=0.545396;STBP=0.263;TYPE=snp;VARB=0.00777674;OID=.;OPOS=46011468;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:17:17:1:1:16:16:0.941176:5:11:0:1:5:11:0:1
chr21	46011745	.	C	T	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.449;QD=50.4132;RBI=0.0559556;REFB=0;REVB=0.0338046;RO=0;SAF=11;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.41338e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000589586;OID=.;OPOS=46011745;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:8:11:0:0:8:11:0:0
chr21	46011751	.	C	T	239.27	PASS	AF=1;AO=18;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106819;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.114;QD=50.3723;RBI=0.108931;REFB=0;REVB=0.0213471;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00078149;OID=.;OPOS=46011751;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:18:19:1:8:10:0:0:8:11:0:0
chr21	46020527	.	C	T	340.86	PASS	AF=0.84375;AO=27;DP=32;FAO=27;FDP=32;FR=.;FRO=5;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0475324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=148.697;QD=42.6072;RBI=0.0477722;REFB=-0.101805;REVB=-0.00478072;RO=4;SAF=23;SAR=4;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.231535;STB=0.657008;STBP=0.003;TYPE=snp;VARB=0.00559696;OID=.;OPOS=46020527;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:32:32:4:5:27:27:0.84375:4:23:1:3:4:23:1:4
chr21	46021317	.	A	T	53.67	PASS	AF=0.7;AO=3;DP=10;FAO=7;FDP=10;FR=.,HEALED;FRO=3;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.199878;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=42.8664;QD=21.4684;RBI=0.201547;REFB=-0.180976;REVB=0.0258811;RO=2;SAF=0;SAR=3;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.692188;STB=0.517191;STBP=0.975;TYPE=snp;VARB=0.105842;OID=.;OPOS=46021317;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:10:10:2:3:3:7:0.7:3:0:1:1:5:2:1:2
chr21	46021370	.	T	C	64.18	PASS	AF=1;AO=7;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0773313;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.007;QD=32.0901;RBI=0.0978123;REFB=-0.0635867;REVB=0.0598925;RO=0;SAF=6;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00742231;OID=.;OPOS=46021370;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:8:8:0:0:7:8:1:1:6:0:0:2:6:0:0
chr21	46021607	.	A	G	191.25	PASS	AF=1;AO=16;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0346753;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5073;QD=47.8128;RBI=0.0773348;REFB=0;REVB=0.0691252;RO=0;SAF=13;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78418e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00164413;OID=.;OPOS=46021607;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:16:0:0:16:16:1:3:13:0:0:3:13:0:0
chr21	46021759	.	A	G	1264.75	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0355535;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=127.158;QD=61.6949;RBI=0.0355553;REFB=0;REVB=0.000360366;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.34657e-05;OID=.;OPOS=46021759;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:40:42:0:0:40:42:0:0
chr21	46021934	.	C	T	715.46	PASS	AF=1;AO=50;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.023919;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.386;QD=57.2364;RBI=0.0308266;REFB=0;REVB=0.0194462;RO=0;SAF=20;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.77133e-05;OID=.;OPOS=46021934;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:50:0:0:50:50:1:30:20:0:0:30:20:0:0
chr21	46021946	.	C	G	804.99	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172621;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9877;QD=64.3993;RBI=0.0403368;REFB=0;REVB=-0.0364565;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000121114;OID=.;OPOS=46021946;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:28:22:0:0:28:22:0:0
chr21	46021954	.	CTG	C	713.57	PASS	AF=1;AO=48;DP=51;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00565249;FXX=0.019604;HRUN=1;LEN=2;MLLD=294.94;QD=57.0853;RBI=0.0057429;REFB=0;REVB=0.001015;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=1.1564e-05;OID=.;OPOS=46021955;OREF=TG;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:48:51:50:50:0:22:28:0:0:4:0:21:27:0:0
chr21	46032094	.	A	G	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0293736;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=142.256;QD=60.9779;RBI=0.0307999;REFB=0;REVB=0.00926444;RO=0;SAF=33;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000222;OID=.;OPOS=46032094;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:6:33:0:0:6:33:0:0
chr21	46233836	.	C	A	1073.33	PASS	AF=1;AO=64;DP=65;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=40;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.085175;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.2214;QD=59.6295;RBI=0.128717;REFB=0;REVB=0.0965053;RO=0;SAF=37;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.1743e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000622871;OID=.;OPOS=46233836;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:65:72:0:0:64:72:1:27:37:0:0:32:40:0:0
chr21	46311813	.	A	G	880.65	PASS	AF=0.984375;AO=62;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0692819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7379;QD=55.0406;RBI=0.0701049;REFB=-0.116527;REVB=-0.0107105;RO=2;SAF=39;SAR=23;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0235969;STB=0.506171;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0259537;OID=.;OPOS=46311813;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:64:64:2:1:62:63:0.984375:23:39:2:0:23:40:1:0
chr21	46314907	.	T	A	885.38	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0114111;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=153.604;QD=58.0576;RBI=0.015361;REFB=0;REVB=0.0102834;RO=0;SAF=33;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.00732e-06;OID=.;OPOS=46314907;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:28:33:0:0:28:33:0:0
chr21	46328099	.	T	C	574.88	PASS	AF=0.416149;AO=60;DP=155;FAO=67;FDP=161;FR=.;FRO=94;FSAF=37;FSAR=30;FSRF=37;FSRR=57;FWDB=-0.0397264;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.302;QD=14.2828;RBI=0.0403456;REFB=-0.00811414;REVB=-0.0070418;RO=92;SAF=32;SAR=28;SRF=35;SRR=57;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163094;STB=0.59181;STBP=0.057;TYPE=snp;VARB=0.0130914;OID=.;OPOS=46328099;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:155:161:92:94:60:67:0.416149:28:32:35:57:30:37:37:57
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chr21	46353678	.	G	A	801.66	PASS	AF=0.451613;AO=83;DP=184;FAO=84;FDP=186;FR=.;FRO=102;FSAF=50;FSAR=34;FSRF=57;FSRR=45;FWDB=0.0343556;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.297;QD=17.24;RBI=0.0568233;REFB=-0.00020194;REVB=0.0452612;RO=101;SAF=49;SAR=34;SRF=56;SRR=45;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0364015;STB=0.520554;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.000371334;OID=.;OPOS=46353678;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:184:186:101:102:83:84:0.451613:34:49:56:45:34:50:57:45
chr21	46353949	.	C	G	103.1	PASS	AF=0.302326;AO=13;DP=43;FAO=13;FDP=43;FR=.;FRO=30;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=14;FWDB=0.0117835;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.992;QD=9.59042;RBI=0.0501835;REFB=-0.0165036;REVB=-0.0487805;RO=30;SAF=8;SAR=5;SRF=16;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0968897;STB=0.558732;STBP=0.57;TYPE=snp;VARB=0.0220052;OID=.;OPOS=46353949;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:43:30:30:13:13:0.302326:5:8:16:14:5:8:16:14
chr21	46353981	.	CAAAA	CAAAG,GCAAA	62.99	PASS	AF=0.232558,0;AO=8,2;DP=43;FAO=10,0;FDP=43;FR=.,HEALED;FRO=32;FSAF=5,0;FSAR=5,0;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=0.057268,-0.0455307;FXX=0;HRUN=4,1;LEN=1,2;MLLD=32.7674,82.2535;QD=5.85928;RBI=0.0665724,0.0509576;REFB=-0.00498833,0.0122018;REVB=-0.033945,-0.0228831;RO=26;SAF=5,0;SAR=3,2;SRF=18;SRR=8;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.0882301,-0.577457;STB=0.571289,0.5;STBP=0.634,1;TYPE=snp,mnp;VARB=-0.00194072,0;OID=.,.;OPOS=46353985,46353981;OREF=A,CA;OALT=G,GC;OMAPALT=CAAAG,GCAAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:58:43:43:26:32:8,2:10,0:0.232558,0:3,2:5,0:18:8:5,0:5,0:19:13
chr21	46354055	.	A	G	1286.2	PASS	AF=0.988372;AO=70;DP=86;FAO=85;FDP=86;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0301662;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.4968;QD=59.8234;RBI=0.165649;REFB=0;REVB=-0.162879;RO=0;SAF=41;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00107565;OID=.;OPOS=46354055;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:86:86:0:0:70:85:0.988372:29:41:0:0:40:45:0:0
chr21	46354056	.	C	G	63.01	PASS	AF=0.147727;AO=10;DP=85;FAO=13;FDP=88;FR=.;FRO=75;FSAF=3;FSAR=10;FSRF=43;FSRR=32;FWDB=0.0513536;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.4601;QD=2.86431;RBI=0.0521028;REFB=-0.0563829;REVB=-0.00880408;RO=75;SAF=3;SAR=7;SRF=43;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.322202;STB=0.784556;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.0563491;OID=.;OPOS=46354056;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:85:88:75:75:10:13:0.147727:7:3:43:32:10:3:43:32
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chr21	46641968	.	G	A	526.25	PASS	AF=0.461538;AO=48;DP=118;FAO=60;FDP=130;FR=.;FRO=70;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=37;FSRR=33;FWDB=0.0160507;FXX=0.00763301;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.179;QD=16.1923;RBI=0.0172325;REFB=-0.0292391;REVB=-0.0062716;RO=69;SAF=27;SAR=21;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0124868;STB=0.568858;STBP=0.181;TYPE=snp;VARB=0.0472847;OID=.;OPOS=46641968;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:130:69:70:48:60:0.461538:21:27:38:31:21:39:37:33
chr21	46875564	.	T	C	1415.36	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.115991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.57;QD=62.9051;RBI=0.116078;REFB=0;REVB=-0.00449859;RO=0;SAF=39;SAR=51;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.24868e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000160438;OID=.;OPOS=46875564;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:51:39:0:0:51:39:0:0
chr21	46876083	.	A	C,G	464.75	PASS	AF=0.0606061,0.939394;AO=2,28;DP=30;FAO=2,31;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=0,14;FSAR=2,17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0232876,0.067426;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=59.9524,115.102;QD=56.3335;RBI=0.023571,0.0680944;REFB=0,0;REVB=0.00364456,0.00951775;RO=0;SAF=0,11;SAR=2,17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.31638e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.224293,-0.00181985;OID=.,.;OPOS=46876083,46876083;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:30:33:0:0:2,28:2,31:0.0606061,0.939394:2,17:0,11:0:0:2,17:0,14:0:0
chr21	46876580	.	C	T	321.81	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.257243;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.6692;QD=51.4889;RBI=0.261552;REFB=0;REVB=0.0472802;RO=1;SAF=10;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440445;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00845834;OID=.;OPOS=46876580;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:24:25:1:0:23:25:1:13:10:1:0:13:12:0:0
chr21	46896303	.	C	G	1491.44	PASS	AF=1;AO=84;DP=98;FAO=96;FDP=96;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=46;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0793976;FXX=0.0103082;HRUN=6;LEN=1;MLLD=34.1862;QD=62.1432;RBI=0.139832;REFB=0;REVB=0.115104;RO=1;SAF=40;SAR=44;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116948;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00479011;OID=.;OPOS=46896303;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:96:1:0:84:96:1:44:40:1:0:50:46:0:0
chr21	46896312	.	G	T	1536.53	PASS	AF=1;AO=96;DP=98;FAO=96;FDP=96;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0530811;FXX=0.0204061;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.376;QD=64.0219;RBI=0.0799021;REFB=0;REVB=0.0597223;RO=0;SAF=47;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.53995e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.69424e-05;OID=.;OPOS=46896312;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:96:0:0:96:96:1:49:47:0:0:49:47:0:0
chr21	46902273	.	A	G	670.63	PASS	AF=1;AO=32;DP=38;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0132732;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.501;QD=62.3841;RBI=0.0222339;REFB=0;REVB=0.0178373;RO=0;SAF=15;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.1306e-05;OID=.;OPOS=46902273;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:43:0:0:32:43:1:17:15:0:0:24:19:0:0
chr21	46912658	.	G	GCCCGCCACTGCCCT	233.59	PASS	AF=0.666667;AO=21;DP=35;FAO=22;FDP=33;FR=.;FRO=11;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=1;FWDB=0.00920551;FXX=0;HRUN=3;LEN=14;MLLD=261.656;QD=28.3143;RBI=0.00975424;REFB=-0.0312328;REVB=-0.00322549;RO=13;SAF=14;SAR=7;SRF=11;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.147662;STB=0.593144;STBP=0.23;TYPE=ins;VARB=0.0133437;OID=.;OPOS=46912659;OREF=-;OALT=CCCGCCACTGCCCT;OMAPALT=GCCCGCCACTGCCCT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.666667:21:35:22:33:11:15:7:10:1:84:13:14:7:11:2
chr21	46923906	.	G	A	281.25	PASS	AF=0.54717;AO=29;DP=53;FAO=29;FDP=53;FR=.;FRO=24;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=17;FSRR=7;FWDB=0.00660709;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9282;QD=21.2264;RBI=0.0463505;REFB=0.00576125;REVB=0.0458771;RO=24;SAF=21;SAR=8;SRF=17;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0159883;STB=0.508879;STBP=0.926;TYPE=snp;VARB=-0.00110523;OID=.;OPOS=46923906;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:24:24:29:29:0.54717:8:21:17:7:8:21:17:7
chr21	46951556	.	A	G	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0383798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.808;QD=64.1534;RBI=0.0407964;REFB=0;REVB=0.0138324;RO=0;SAF=35;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.22152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.25689e-05;OID=.;OPOS=46951556;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:14:35:0:0:14:35:0:0
chr21	46957794	.	T	C	2336.6	PASS	AF=1;AO=153;DP=154;FAO=153;FDP=153;FR=.;FRO=0;FSAF=92;FSAR=61;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0187622;FXX=0.00649309;HRUN=1;LEN=1;MLLD=131.098;QD=61.0877;RBI=0.0609905;REFB=0;REVB=0.0580329;RO=0;SAF=92;SAR=61;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.32225e-05;OID=.;OPOS=46957794;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:154:153:0:0:153:153:1:61:92:0:0:61:92:0:0
chr21	47329352	.	T	C	1882.45	PASS	AF=0.992063;AO=120;DP=122;FAO=125;FDP=126;FR=.;FRO=1;FSAF=63;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0189753;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.883;QD=59.7604;RBI=0.0388356;REFB=0.090346;REVB=0.0338843;RO=0;SAF=63;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.503936;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=0.000213596;OID=.;OPOS=47329352;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:122:126:0:1:120:125:0.992063:57:63:0:0:62:63:1:0
chr21	47409503	.	A	G	958.32	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=52;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00555578;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=290.872;QD=58.0797;RBI=0.0140507;REFB=0;REVB=0.0129056;RO=0;SAF=52;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000461211;OID=.;OPOS=47409503;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:66:0:0:65:66:1:13:52:0:0:14:52:0:0
chr21	47417415	.	C	A	556.66	PASS	AF=0.888889;AO=38;DP=43;FAO=40;FDP=45;FR=.;FRO=5;FSAF=9;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=4;FWDB=0.0369853;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=36.678;QD=49.481;RBI=0.058902;REFB=-0.174973;REVB=0.0458425;RO=5;SAF=7;SAR=31;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00567341;STB=0.503998;STBP=0.916;TYPE=snp;VARB=0.0226155;OID=.;OPOS=47417415;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:43:45:5:5:38:40:0.888889:31:7:1:4:31:9:1:4
chr21	47420725	.	TC	T,TG	1153.94	PASS	AF=1,0;AO=12,52;DP=85;FAO=84,0;FDP=84;FR=.;FRO=0;FSAF=51,0;FSAR=33,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0218961,-0.564519;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=40.098,34.726;QD=54.9495;RBI=0.0376932,0.564826;REFB=0,0;REVB=0.0306812,0.0186215;RO=2;SAF=1,43;SAR=11,9;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0753549,0.0937833;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=0.000732521,0;OID=.,.;OPOS=47420726,47420726;OREF=C,C;OALT=-,G;OMAPALT=T,TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1,0:12,52:85:84,0:84:0:51,0:33,0:0:0:6:2:1,43:11,9:0:2
chr21	47536546	.	C	G,T	1059.03	PASS	AF=0.0675676,0.918919;AO=5,67;DP=74;FAO=5,68;FDP=74;FR=.;FRO=1;FSAF=0,33;FSAR=5,35;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.016672,0.0357275;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=27.1845,119.341;QD=57.2448;RBI=0.0389703,0.0557792;REFB=-0.0836321,-0.158766;REVB=-0.035224,-0.0428353;RO=0;SAF=0,33;SAR=5,34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-4.61397e-08;STB=0.5,0.50704;STBP=1,0.508;TYPE=snp,snp;VARB=0.0585728,-0.00215196;OID=.,.;OPOS=47536546,47536546;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:17:74:74:0:1:5,67:5,68:0.0675676,0.918919:5,34:0,33:0:0:5,35:0,33:0:1
chr21	47538960	.	G	A	388.26	PASS	AF=1;AO=25;DP=28;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0468781;FXX=0.0624805;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.436;QD=51.7676;RBI=0.0958014;REFB=-0.114885;REVB=0.0835484;RO=1;SAF=14;SAR=11;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0403161;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00521749;OID=.;OPOS=47538960;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:28:30:1:0:25:30:1:11:14:0:1:15:15:0:0
chr21	47542861	.	A	C,G	800.72	PASS	AF=0.0350877,0.964912;AO=2,55;DP=57;FAO=2,55;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=2,30;FSAR=0,25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0247424,0.00644322;FXX=0.0172384;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=162.65,75.8313;QD=56.1909;RBI=0.0248958,0.0300968;REFB=0,0;REVB=0.00275963,-0.029399;RO=0;SAF=2,30;SAR=0,25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.204063,-0.000417161;OID=.,.;OPOS=47542861,47542861;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:4:57:57:0:0:2,55:2,55:0.0350877,0.964912:0,25:2,30:0:0:0,25:2,30:0:0
chr21	47545155	.	A	G	1506.52	PASS	AF=1;AO=101;DP=101;FAO=101;FDP=101;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=55;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0181012;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=64.6884;QD=59.6643;RBI=0.0850055;REFB=0;REVB=-0.0830559;RO=0;SAF=46;SAR=55;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.13729e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000200078;OID=.;OPOS=47545155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:101:101:0:0:101:101:1:55:46:0:0:55:46:0:0
chr21	47545768	.	G	A	352.39	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0127188;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.1879;QD=54.2137;RBI=0.0296286;REFB=0;REVB=-0.0267598;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000738114;OID=.;OPOS=47545768;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:26:0:0:25:26:1:9:16:0:0:9:17:0:0
chr21	47545823	.	G	A	740.74	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=36;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00296265;FXX=0.0181785;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.54;QD=54.8699;RBI=0.0638463;REFB=-0.0461477;REVB=0.0637775;RO=1;SAF=36;SAR=17;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0269038;STB=0.51428;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.000384534;OID=.;OPOS=47545823;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:17:36:0:1:17:36:0:1
chr21	47545826	.	C	T	772.82	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0650079;FXX=0.0181785;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.3033;QD=57.2457;RBI=0.0650089;REFB=0;REVB=-0.000367774;RO=0;SAF=36;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00133126;OID=.;OPOS=47545826;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:54:54:1:18:36:0:0:18:36:0:0
chr21	47545913	.	G	A	1491.92	PASS	AF=0.990196;AO=101;DP=102;FAO=101;FDP=102;FR=.;FRO=1;FSAF=60;FSAR=41;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0296682;FXX=0.0097078;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.559;QD=58.5067;RBI=0.0363226;REFB=-0.0949883;REVB=0.0209555;RO=0;SAF=60;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.25502e-08;STB=0.504131;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=0.000296349;OID=.;OPOS=47545913;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:102:102:0:1:101:101:0.990196:41:60:0:0:41:60:1:0
chr21	47556793	.	C	T	422.05	PASS	AF=0.967742;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=22;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0366666;FXX=0.0312402;HRUN=3;LEN=1;MLLD=196.886;QD=54.4583;RBI=0.0527118;REFB=0.023715;REVB=0.0378695;RO=0;SAF=21;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=7.4007e-08;STB=0.529392;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=7.43063e-05;OID=.;OPOS=47556793;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:31:0:1:29:30:0.967742:8:21:0:0:8:22:0:1
chr21	47558473	.	G	C	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0135013;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=187.033;QD=23.2183;RBI=0.0135013;REFB=-0.0682839;REVB=0;RO=1;SAF=5;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0216766;OID=.;OPOS=47558473;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:0:5:1:0:0:5:1:0
chr21	47575372	.	C	T	330.84	PASS	AF=0.961538;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=26;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.105418;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7777;QD=50.8988;RBI=0.119745;REFB=-0.18547;REVB=0.0567962;RO=1;SAF=12;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0370998;STB=0.519984;STBP=0.531;TYPE=snp;VARB=0.0122273;OID=.;OPOS=47575372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:26:26:1:1:25:25:0.961538:13:12:1:0:13:12:1:0
chr21	47613570	.	T	C	31.65	PASS	AF=0.12963;AO=7;DP=54;FAO=7;FDP=54;FR=.;FRO=47;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=19;FSRR=28;FWDB=-0.0860378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.14;QD=2.34409;RBI=0.09506;REFB=-0.029728;REVB=-0.0404217;RO=47;SAF=4;SAR=3;SRF=19;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.19718;STB=0.642098;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.168515;OID=.;OPOS=47613570;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:31:54:54:47:47:7:7:0.12963:3:4:19:28:3:4:19:28
chr21	47613621	.	C	T	136.85	PASS	AF=0.357143;AO=22;DP=57;FAO=20;FDP=56;FR=.;FRO=36;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=18;FWDB=-0.0103342;FXX=0.0175408;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.8933;QD=9.77473;RBI=0.0336388;REFB=-0.0429019;REVB=0.0320121;RO=34;SAF=7;SAR=15;SRF=17;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.201251;STB=0.636222;STBP=0.133;TYPE=snp;VARB=0.138905;OID=.;OPOS=47613621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:56:34:36:22:20:0.357143:15:7:17:17:14:6:18:18
chr21	47676711	.	G	A	289.18	PASS	AF=0.92;AO=23;DP=25;FAO=23;FDP=25;FR=.;FRO=2;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0628572;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.0445;QD=46.2687;RBI=0.0642831;REFB=-0.0367637;REVB=0.0134646;RO=2;SAF=15;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0245642;STB=0.513296;STBP=0.775;TYPE=snp;VARB=0.0290042;OID=.;OPOS=47676711;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:25:25:2:2:23:23:0.92:8:15:1:1:8:15:1:1
chr21	47685939	.	A	G	1233.94	PASS	AF=1;AO=80;DP=82;FAO=80;FDP=80;FR=.;FRO=0;FSAF=48;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0223055;FXX=0.0243873;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.003;QD=61.6972;RBI=0.0324879;REFB=0;REVB=0.0236205;RO=0;SAF=48;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.88655e-07;OID=.;OPOS=47685939;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:80:0:0:80:80:1:32:48:0:0:32:48:0:0
chr21	47687032	.	G	A	176.06	PASS	AF=0.413043;AO=16;DP=43;FAO=19;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=9;FSAR=10;FSRF=12;FSRR=15;FWDB=0.0106837;FXX=0.0212721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.442;QD=15.3095;RBI=0.0158614;REFB=-0.0244378;REVB=0.0117237;RO=27;SAF=9;SAR=7;SRF=12;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126225;STB=0.517223;STBP=0.868;TYPE=snp;VARB=0.0256496;OID=.;OPOS=47687032;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:43:46:27:27:16:19:0.413043:7:9:12:15:10:9:12:15
chr21	47721983	.	GCA	GCATGG,TGG	282.3	PASS	AF=0.733333,0.0666667;AO=19,3;DP=32;FAO=22,2;FDP=30;FR=.;FRO=6;FSAF=22,2;FSAR=0,0;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=0.041204,-0.0209271;FXX=0.0322477;HRUN=1,1;LEN=3,3;MLLD=73.6872,292.738;QD=37.6394;RBI=0.041204,0.0209271;REFB=-0.154562,-0.0354663;REVB=0,0;RO=5;SAF=19,3;SAR=0,0;SRF=5;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,mnp;VARB=0.0623168,0.0437597;OID=.,.;OPOS=47721986,47721983;OREF=-,GCA;OALT=TGG,TGG;OMAPALT=GCATGG,TGG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:33:32:30:5:6:19,3:22,2:0.733333,0.0666667:0,0:19,3:5:0:0,0:22,2:6:0
chr21	47734659	.	G	A	621.29	PASS	AF=0.933333;AO=42;DP=45;FAO=42;FDP=45;FR=.;FRO=3;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0325086;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=223.784;QD=55.2261;RBI=0.0401876;REFB=-0.0904809;REVB=0.023627;RO=1;SAF=20;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0228919;STB=0.534867;STBP=0.138;TYPE=snp;VARB=0.000726046;OID=.;OPOS=47734659;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:45:45:1:3:42:42:0.933333:22:20:1:0:22:20:3:0
chr21	47738035	.	C	T	266.84	PASS	AF=0.397436;AO=31;DP=78;FAO=31;FDP=78;FR=.;FRO=47;FSAF=23;FSAR=8;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=0.00708199;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=105.064;QD=13.6842;RBI=0.0224155;REFB=-0.0186598;REVB=-0.0212674;RO=46;SAF=23;SAR=8;SRF=26;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.211854;STB=0.62975;STBP=0.081;TYPE=snp;VARB=0.0350567;OID=.;OPOS=47738035;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:46:47:31:31:0.397436:8:23:26:20:8:23:26:21
chr21	47777063	.	G	A	520.06	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00729025;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=331.454;QD=59.4357;RBI=0.0256771;REFB=0;REVB=0.0246204;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.72864e-05;OID=.;OPOS=47777063;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:10:25:0:0:10:25:0:0
chr21	47783796	.	T	C	1008.49	PASS	AF=1;AO=68;DP=68;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00462805;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.44;QD=59.3228;RBI=0.0112084;REFB=0;REVB=-0.0102083;RO=0;SAF=36;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.49594e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-7.0394e-05;OID=.;OPOS=47783796;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:68:68:0:0:68:68:1:32:36:0:0:32:36:0:0
chr21	47786817	.	C	G	1072.13	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0754195;FXX=0.0399947;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.5951;QD=59.563;RBI=0.104469;REFB=0;REVB=0.0722885;RO=0;SAF=42;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0034226;OID=.;OPOS=47786817;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:71:72:1:29:42:0:0:29:43:0:0
chr21	47787002	.	T	C	689.19	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.019598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.688;QD=62.654;RBI=0.0208989;REFB=0;REVB=0.00725829;RO=0;SAF=19;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000145064;OID=.;OPOS=47787002;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:25:19:0:0:25:19:0:0
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chr21	47848310	.	G	C	69.19	PASS	AF=0.0798479;AO=21;DP=270;FAO=21;FDP=263;FR=.,HEALED;FRO=238;FSAF=18;FSAR=3;FSRF=132;FSRR=106;FWDB=-0.113986;FXX=0.00378774;HRUN=3;LEN=1;MLLD=130.847;QD=1.05232;RBI=0.115326;REFB=-0.00163002;REVB=-0.0175276;RO=215;SAF=18;SAR=3;SRF=109;SRR=106;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.427567;STB=0.813105;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0741611;OID=.;OPOS=47848310;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:270:263:215:238:21:21:0.0798479:3:18:109:106:3:18:132:106
chr21	47970581	.	G	A	1059.69	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.017741;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.833;QD=59.701;RBI=0.0417626;REFB=0;REVB=0.037807;RO=0;SAF=43;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.30751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000169967;OID=.;OPOS=47970581;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:28:43:0:0:28:43:0:0
chr21	47974582	.	A	G	820.21	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0151688;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.9124;QD=55.6072;RBI=0.027854;REFB=-0.116453;REVB=0.0233613;RO=0;SAF=18;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506171;STBP=0.616;TYPE=snp;VARB=0.00254925;OID=.;OPOS=47974582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:59:59:0:1:58:58:0.983051:40:18:0:0:40:18:0:1
chr21	47978321	.	G	GC	1047.5	PASS	AF=1;AO=78;DP=97;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=60;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00721768;FXX=0.0212743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=25.6831;QD=45.5436;RBI=0.124318;REFB=0;REVB=0.124108;RO=8;SAF=24;SAR=54;SRF=8;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.134428;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-1.88521e-05;OID=.;OPOS=47978322;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:78:97:92:92:0:32:60:0:0:19:8:24:54:8:0
chr21	48022230	.	C	G	766.46	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00964163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.456;QD=63.8714;RBI=0.0101371;REFB=0;REVB=-0.00313057;RO=0;SAF=30;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.09316e-05;OID=.;OPOS=48022230;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:18:30:0:0:18:30:0:0
chr21	48063476	.	C	G	1009.85	PASS	AF=0.985714;AO=69;DP=70;FAO=69;FDP=70;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00809071;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.5369;QD=57.7055;RBI=0.00909127;REFB=-0.130398;REVB=0.00414626;RO=1;SAF=32;SAR=37;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0126057;STB=0.506665;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.0084614;OID=.;OPOS=48063476;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:70:70:1:1:69:69:0.985714:37:32:0:1:37:32:0:1
chr22	16287372	.	C	T	52.04	PASS	AF=0.242424;AO=8;DP=33;FAO=8;FDP=33;FR=.;FRO=25;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=12;FSRR=13;FWDB=-0.000215875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.554;QD=6.30823;RBI=0.0142271;REFB=-0.00443038;REVB=-0.0142255;RO=25;SAF=5;SAR=3;SRF=12;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.171963;STB=0.610409;STBP=0.509;TYPE=snp;VARB=0.0262821;OID=.;OPOS=16287372;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:52:33:33:25:25:8:8:0.242424:3:5:12:13:3:5:12:13
chr22	17072483	.	A	G	871.0	PASS	AF=0.983871;AO=61;DP=62;FAO=61;FDP=62;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0220587;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=151.615;QD=56.1937;RBI=0.0221011;REFB=0.0106034;REVB=-0.00136814;RO=1;SAF=30;SAR=31;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154749;STB=0.508194;STBP=0.549;TYPE=snp;VARB=-3.55444e-05;OID=.;OPOS=17072483;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:62:62:1:1:61:61:0.983871:31:30:1:0:31:30:1:0
chr22	17073065	.	CA	C,CG	487.47	PASS	AF=0.117647,0.882353;AO=4,30;DP=34;FAO=4,30;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=0,16;FSAR=4,14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0619209,0.0438692;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=101.691,125.385;QD=57.349;RBI=0.0709888,0.0542852;REFB=0,0;REVB=0.0347161,0.0319746;RO=0;SAF=0,16;SAR=4,14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.56309e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.010575,0.001849;OID=.,.;OPOS=17073066,17073066;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.117647,0.882353:4,30:34:4,30:34:0:0,16:4,14:0:0:19:0:0,16:4,14:0:0
chr22	17073133	.	T	A	202.05	PASS	AF=0.446809;AO=20;DP=48;FAO=21;FDP=47;FR=.;FRO=26;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=6;FWDB=-0.0209139;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.514;QD=17.1956;RBI=0.0356186;REFB=-0.0120916;REVB=0.0288322;RO=26;SAF=14;SAR=6;SRF=20;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0850672;STB=0.538426;STBP=0.672;TYPE=snp;VARB=0.0283827;OID=.;OPOS=17073133;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:48:47:26:26:20:21:0.446809:6:14:20:6:6:15:20:6
chr22	17073475	.	C	T	289.34	PASS	AF=0.545455;AO=31;DP=56;FAO=30;FDP=55;FR=.;FRO=25;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00190268;FXX=0.017854;HRUN=1;LEN=1;MLLD=222.075;QD=21.0429;RBI=0.01588;REFB=-0.0119963;REVB=0.0157656;RO=25;SAF=20;SAR=11;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0309986;STB=0.523102;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=0.0107616;OID=.;OPOS=17073475;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:25:25:31:30:0.545455:11:20:17:8:11:19:17:8
chr22	17264565	.	G	T	310.67	PASS	AF=0.447368;AO=33;DP=75;FAO=34;FDP=76;FR=.;FRO=42;FSAF=13;FSAR=21;FSRF=21;FSRR=21;FWDB=0.00232919;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.548;QD=16.3509;RBI=0.00412843;REFB=-0.0166;REVB=0.00340864;RO=42;SAF=12;SAR=21;SRF=21;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.139708;STB=0.566627;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.0168914;OID=.;OPOS=17264565;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:76:42:42:33:34:0.447368:21:12:21:21:21:13:21:21
chr22	17265124	.	A	C	218.91	PASS	AF=0.689655;AO=20;DP=28;FAO=20;FDP=29;FR=.;FRO=9;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=1;FSRR=8;FWDB=-0.0131436;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=247.958;QD=30.195;RBI=0.0280102;REFB=-0.00302783;REVB=0.0247349;RO=8;SAF=13;SAR=7;SRF=1;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.272123;STB=0.665365;STBP=0.008;TYPE=snp;VARB=0.00145233;OID=.;OPOS=17265124;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:28:29:8:9:20:20:0.689655:7:13:1:7:7:13:1:8
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chr22	17469026	.	G	A	220.83	PASS	AF=0.740741;AO=18;DP=26;FAO=20;FDP=27;FR=.;FRO=7;FSAF=11;FSAR=9;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=0.00177214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.139;QD=32.7153;RBI=0.0400919;REFB=-0.0141924;REVB=0.0400527;RO=7;SAF=10;SAR=8;SRF=4;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00814684;STB=0.505612;STBP=0.962;TYPE=snp;VARB=0.00380097;OID=.;OPOS=17469026;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:26:27:7:7:18:20:0.740741:8:10:4:3:9:11:4:3
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chr22	17602839	.	G	A	755.78	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00595396;FXX=0.0185151;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.51;QD=57.0397;RBI=0.020743;REFB=0;REVB=-0.0198701;RO=0;SAF=35;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.37132e-05;OID=.;OPOS=17602839;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:53:0:0:53:53:1:18:35:0:0:18:35:0:0
chr22	17603477	.	A	G	1556.58	PASS	AF=0.990566;AO=105;DP=106;FAO=105;FDP=106;FR=.;FRO=1;FSAF=75;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0220918;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.093;QD=58.739;RBI=0.0268857;REFB=-0.115711;REVB=0.0153228;RO=1;SAF=75;SAR=30;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0155537;STB=0.508195;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.000357346;OID=.;OPOS=17603477;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:106:106:1:1:105:105:0.990566:30:75:0:1:30:75:0:1
chr22	17630486	.	C	A	395.46	PASS	AF=0.695652;AO=32;DP=46;FAO=32;FDP=46;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=11;FSRR=3;FWDB=0.0161823;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=272.104;QD=34.388;RBI=0.0243966;REFB=-0.0100513;REVB=0.0182573;RO=14;SAF=12;SAR=20;SRF=11;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.229319;STB=0.624922;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.00578862;OID=.;OPOS=17630486;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:46:14:14:32:32:0.695652:20:12:11:3:20:12:11:3
chr22	17640399	.	G	GGGC	179.35	PASS	AF=0.271739;AO=22;DP=104;FAO=25;FDP=92;FR=.;FRO=67;FSAF=12;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=47;FWDB=-0.0184048;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=3;MLLD=184.032;QD=7.79783;RBI=0.043574;REFB=-0.0206786;REVB=-0.0394963;RO=80;SAF=11;SAR=11;SRF=28;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.190685;STB=0.633704;STBP=0.134;TYPE=ins;VARB=0.0596878;OID=.;OPOS=17640400;OREF=-;OALT=GGC;OMAPALT=GGGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.271739:22:104:25:92:67:12:13:20:47:99:80:11:11:28:52
chr22	17662793	.	A	G	250.42	PASS	AF=0.408451;AO=29;DP=71;FAO=29;FDP=71;FR=.;FRO=42;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=15;FSRR=27;FWDB=0.0226408;FXX=0.0273935;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9768;QD=14.1081;RBI=0.0268175;REFB=-0.0204144;REVB=0.0143727;RO=42;SAF=18;SAR=11;SRF=15;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.269869;STB=0.653192;STBP=0.042;TYPE=snp;VARB=0.0341653;OID=.;OPOS=17662793;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:42:42:29:29:0.408451:11:18:15:27:11:18:15:27
chr22	17690430	.	C	G	212.28	PASS	AF=0.44;AO=18;DP=51;FAO=22;FDP=50;FR=.,HEALED;FRO=26;FSAF=11;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=19;FWDB=0.0333025;FXX=0.019604;HRUN=7;LEN=1;MLLD=111.385;QD=16.9825;RBI=0.0338163;REFB=-0.0159114;REVB=0.00587254;RO=21;SAF=9;SAR=9;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157753;STB=0.624893;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.0173902;OID=.;OPOS=17690430;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:50:21:26:18:22:0.44:9:9:7:14:11:11:7:19
chr22	17990852	.	G	A	140.11	PASS	AF=0.363636;AO=16;DP=44;FAO=16;FDP=44;FR=.;FRO=28;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=-0.0279755;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.133;QD=12.737;RBI=0.0287934;REFB=-0.00348065;REVB=-0.00681413;RO=28;SAF=10;SAR=6;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.138288;STB=0.581292;STBP=0.421;TYPE=snp;VARB=0.00868572;OID=.;OPOS=17990852;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:44:44:28:28:16:16:0.363636:6:10:14:14:6:10:14:14
chr22	18209612	.	CA	C,CG	323.16	PASS	AF=0.36,0.64;AO=7,16;DP=23;FAO=9,16;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=9,0;FSAR=0,16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0616775,-0.0709076;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=55.904,64.2829;QD=51.7052;RBI=0.0621288,0.0788948;REFB=0,0;REVB=-0.00747542,-0.0345905;RO=0;SAF=7,0;SAR=0,16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.00716904,0.000384997;OID=.,.;OPOS=18209613,18209613;OREF=A,A;OALT=-,G;OMAPALT=C,CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.36,0.64:7,16:23:9,16:25:0:9,0:0,16:0:0:54:0:7,0:0,16:0:0
chr22	18364030	.	CT	C,GC	276.3	PASS	AF=0.536145,0;AO=47,9;DP=163;FAO=89,0;FDP=166;FR=.;FRO=77;FSAF=38,0;FSAR=51,0;FSRF=33;FSRR=44;FWDB=-0.0330644,-0.0579544;FXX=0.00598767;HRUN=6,1;LEN=1,2;MLLD=6.95216,42.3433;QD=6.65772;RBI=0.0340786,0.122265;REFB=-0.177316,-0.0264267;REVB=-0.00825172,-0.107657;RO=69;SAF=23,1;SAR=24,8;SRF=29;SRR=40;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0729824,-0.427874;STB=0.50076,0.5;STBP=0.994,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.185945,0.0789719;OID=.,.;OPOS=18364031,18364030;OREF=T,CT;OALT=-,GC;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:163:166:69:77:47,9:89,0:0.536145,0:24,8:23,1:29:40:51,0:38,0:33:44
chr22	18570851	.	C	T	207.64	PASS	AF=0.436364;AO=24;DP=55;FAO=24;FDP=55;FR=.;FRO=31;FSAF=16;FSAR=8;FSRF=16;FSRR=15;FWDB=-0.0181729;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=187.727;QD=15.1011;RBI=0.0182354;REFB=-0.019538;REVB=-0.00150793;RO=31;SAF=16;SAR=8;SRF=16;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.157233;STB=0.589667;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0493283;OID=.;OPOS=18570851;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:55:31:31:24:24:0.436364:8:16:16:15:8:16:16:15
chr22	18571008	.	G	A	253.61	PASS	AF=0.482759;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=58;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=14;FSRF=21;FSRR=9;FWDB=-0.00377355;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=150.137;QD=17.4906;RBI=0.0427424;REFB=-0.0228574;REVB=0.0425755;RO=29;SAF=14;SAR=14;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.172826;STB=0.603378;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0280492;OID=.;OPOS=18571008;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:58:29:30:28:28:0.482759:14:14:20:9:14:14:21:9
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chr22	18870981	.	G	C	71.72	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=40;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=15;FSRR=14;FWDB=-0.00411309;FXX=0.0249938;HRUN=2;LEN=1;MLLD=230.613;QD=7.3556;RBI=0.0453608;REFB=-0.0117822;REVB=0.045174;RO=28;SAF=6;SAR=4;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.118809;STB=0.562374;STBP=0.652;TYPE=snp;VARB=0.0298043;OID=.;OPOS=18870981;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:40:39:28:29:10:10:0.25641:4:6:14:14:4:6:15:14
chr22	18900750	.	G	A	453.4	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0818262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.042;QD=56.6753;RBI=0.0839989;REFB=0;REVB=0.0189813;RO=0;SAF=19;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0014718;OID=.;OPOS=18900750;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:32:0:0:29:32:1:10:19:0:0:10:22:0:0
chr22	18901004	.	C	T	262.99	PASS	AF=0.954545;AO=21;DP=22;FAO=21;FDP=22;FR=.;FRO=1;FSAF=5;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.019657;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=143.893;QD=47.8165;RBI=0.0419415;REFB=-0.102476;REVB=0.0370498;RO=0;SAF=5;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.78933e-08;STB=0.545409;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00220729;OID=.;OPOS=18901004;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:22:22:0:1:21:21:0.954545:16:5:0:0:16:5:1:0
chr22	18904414	.	A	G	564.51	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0326189;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=72.618;QD=59.4216;RBI=0.0643559;REFB=0;REVB=-0.0554769;RO=0;SAF=20;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00257572;OID=.;OPOS=18904414;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:17:20:0:0:18:20:0:0
chr22	18905977	.	C	T	434.36	PASS	AF=0.567568;AO=42;DP=74;FAO=42;FDP=74;FR=.;FRO=32;FSAF=17;FSAR=25;FSRF=18;FSRR=14;FWDB=0.0365686;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.294;QD=23.4791;RBI=0.040787;REFB=-0.0126349;REVB=0.0180642;RO=32;SAF=17;SAR=25;SRF=18;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.125307;STB=0.568888;STBP=0.188;TYPE=snp;VARB=0.00533304;OID=.;OPOS=18905977;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:74:74:32:32:42:42:0.567568:25:17:18:14:25:17:18:14
chr22	18907124	.	G	A	973.96	PASS	AF=0.932432;AO=69;DP=74;FAO=69;FDP=74;FR=.;FRO=5;FSAF=42;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=3;FWDB=0.0286736;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=208.179;QD=52.6463;RBI=0.0307564;REFB=-0.227011;REVB=0.0111256;RO=0;SAF=42;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.56939e-08;STB=0.514702;STBP=0.382;TYPE=snp;VARB=0.0012723;OID=.;OPOS=18907124;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:74:74:0:5:69:69:0.932432:27:42:0:0:27:42:2:3
chr22	18908875	.	A	G	725.81	PASS	AF=1;AO=51;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.080641;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.8256;QD=55.8313;RBI=0.0829;REFB=0;REVB=-0.0192211;RO=1;SAF=15;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0303527;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00183826;OID=.;OPOS=18908875;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:1:0:51:52:1:36:15:1:0:36:16:0:0
chr22	18912678	.	A	G	1493.77	PASS	AF=0.989583;AO=93;DP=94;FAO=95;FDP=96;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0418678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.953;QD=62.2403;RBI=0.0419859;REFB=-0.135479;REVB=-0.00314745;RO=0;SAF=47;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505262;STBP=0.53;TYPE=snp;VARB=0.000318304;OID=.;OPOS=18912678;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:94:96:0:1:93:95:0.989583:46:47:0:0:47:48:0:1
chr22	18913201	.	C	T	250.82	PASS	AF=0.466667;AO=28;DP=61;FAO=28;FDP=60;FR=.;FRO=32;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=11;FSRR=21;FWDB=0.00311888;FXX=0.0163908;HRUN=2;LEN=1;MLLD=158.372;QD=16.7216;RBI=0.00664597;REFB=-0.0302407;REVB=0.00586869;RO=32;SAF=16;SAR=12;SRF=11;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213205;STB=0.619635;STBP=0.107;TYPE=snp;VARB=0.0295404;OID=.;OPOS=18913201;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:60:32:32:28:28:0.466667:12:16:11:21:12:16:11:21
chr22	19026613	.	A	G	200.9	PASS	AF=0.40678;AO=25;DP=59;FAO=24;FDP=59;FR=.;FRO=35;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00891722;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.2592;QD=13.6201;RBI=0.03082;REFB=-0.0162872;REVB=-0.0295018;RO=31;SAF=11;SAR=14;SRF=15;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0431906;STB=0.558356;STBP=0.483;TYPE=snp;VARB=0.0361581;OID=.;OPOS=19026613;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:31:35:25:24:0.40678:14:11:15:16:14:10:18:17
chr22	19034240	.	A	G	394.29	PASS	AF=0.428571;AO=44;DP=104;FAO=45;FDP=105;FR=.;FRO=60;FSAF=30;FSAR=15;FSRF=23;FSRR=37;FWDB=0.0230555;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.3763;QD=15.0207;RBI=0.0279974;REFB=-0.0244625;REVB=0.0158838;RO=60;SAF=30;SAR=14;SRF=23;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.307819;STB=0.662348;STBP=0.007;TYPE=snp;VARB=0.0212629;OID=.;OPOS=19034240;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:105:60:60:44:45:0.428571:14:30:23:37:15:30:23:37
chr22	19048413	.	A	G	602.1	PASS	AF=0.48062;AO=61;DP=129;FAO=62;FDP=129;FR=.;FRO=67;FSAF=32;FSAR=30;FSRF=39;FSRR=28;FWDB=0.0214538;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=154.748;QD=18.6696;RBI=0.021531;REFB=-0.0180287;REVB=0.00182222;RO=67;SAF=31;SAR=30;SRF=39;SRR=28;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0699271;STB=0.534359;STBP=0.453;TYPE=snp;VARB=0.0261094;OID=.;OPOS=19048413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:129:129:67:67:61:62:0.48062:30:31:39:28:30:32:39:28
chr22	19048436	.	G	A	528.51	PASS	AF=0.526316;AO=50;DP=95;FAO=50;FDP=95;FR=.;FRO=45;FSAF=24;FSAR=26;FSRF=23;FSRR=22;FWDB=-0.068342;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.322;QD=22.253;RBI=0.0684022;REFB=-0.0189786;REVB=-0.00286881;RO=44;SAF=24;SAR=26;SRF=22;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0170093;STB=0.514737;STBP=0.77;TYPE=snp;VARB=0.0177882;OID=.;OPOS=19048436;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:44:45:50:50:0.526316:26:24:22:22:26:24:23:22
chr22	19132061	.	C	T	582.49	PASS	AF=0.382022;AO=68;DP=177;FAO=68;FDP=178;FR=.;FRO=110;FSAF=61;FSAR=7;FSRF=71;FSRR=39;FWDB=0.0945853;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9321;QD=13.0896;RBI=0.102757;REFB=-0.00818153;REVB=-0.0401573;RO=109;SAF=60;SAR=8;SRF=71;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.388075;STB=0.752187;STBP=0.001;TYPE=snp;VARB=0.022126;OID=.;OPOS=19132061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:177:178:109:110:68:68:0.382022:8:60:71:38:7:61:71:39
chr22	19163577	.	C	CAT	1321.28	PASS	AF=0.988506;AO=84;DP=90;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0434365;FXX=0.0224694;HRUN=0;LEN=2;MLLD=279.697;QD=60.7486;RBI=0.0452598;REFB=-0.0149489;REVB=0.0127166;RO=4;SAF=47;SAR=37;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.026902;STB=0.506492;STBP=0.301;TYPE=ins;VARB=9.6817e-05;OID=.;OPOS=19163578;OREF=-;OALT=AT;OMAPALT=CAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:0.988506:84:90:86:87:1:48:38:0:1:3:4:47:37:1:3
chr22	19165478	.	A	G	66.83	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=2;FSRR=10;FWDB=0.0597532;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=201.749;QD=12.7299;RBI=0.0636718;REFB=-0.0142457;REVB=-0.0219919;RO=12;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197653;STB=0.615159;STBP=0.462;TYPE=snp;VARB=0.023675;OID=.;OPOS=19165478;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:66:21:21:12:12:9:9:0.428571:6:3:2:10:6:3:2:10
chr22	19167385	.	C	A	394.16	PASS	AF=0.471264;AO=40;DP=83;FAO=41;FDP=87;FR=.;FRO=46;FSAF=17;FSAR=24;FSRF=17;FSRR=29;FWDB=0.0334315;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.6721;QD=18.1223;RBI=0.123991;REFB=-0.00397272;REVB=-0.119399;RO=43;SAF=17;SAR=23;SRF=17;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283504;STB=0.524741;STBP=0.691;TYPE=snp;VARB=0.00381842;OID=.;OPOS=19167385;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:87:43:46:40:41:0.471264:23:17:17:26:24:17:17:29
chr22	19167409	.	T	C	412.96	PASS	AF=0.47191;AO=42;DP=90;FAO=42;FDP=89;FR=.;FRO=47;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.00781875;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.9301;QD=18.5599;RBI=0.0320412;REFB=0.00796468;REVB=0.0310726;RO=47;SAF=15;SAR=27;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0263888;STB=0.514724;STBP=0.823;TYPE=snp;VARB=-0.00784845;OID=.;OPOS=19167409;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:90:89:47:47:42:42:0.47191:27:15:18:29:27:15:18:29
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chr22	19189003	.	A	AC,C	408.17	PASS	AF=1,0;AO=19,12;DP=35;FAO=32,0;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13,0;FSAR=19,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0852911,-0.282624;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=1,1;MLLD=20.3215,4.27511;QD=51.0211;RBI=0.178952,0.282669;REFB=0,0;REVB=0.157319,-0.00506164;RO=4;SAF=2,11;SAR=17,1;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.362489,0.19444;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00922953,0;OID=.,.;OPOS=19189004,19189003;OREF=-,A;OALT=C,C;OMAPALT=AC,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:32:4:0:19,12:32,0:1,0:17,1:2,11:3:1:19,0:13,0:0:0
chr22	19197896	.	T	C	740.75	PASS	AF=1;AO=52;DP=53;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0479734;FXX=0.0188644;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.483;QD=56.981;RBI=0.0517012;REFB=0;REVB=0.0192761;RO=0;SAF=28;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000188604;OID=.;OPOS=19197896;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:52:0:0:52:52:1:24:28:0:0:24:28:0:0
chr22	19230365	.	T	C	277.6	PASS	AF=0.537037;AO=29;DP=54;FAO=29;FDP=54;FR=.;FRO=25;FSAF=20;FSAR=9;FSRF=14;FSRR=11;FWDB=-0.0640805;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.7382;QD=20.5627;RBI=0.0820516;REFB=-0.00497634;REVB=-0.051246;RO=25;SAF=20;SAR=9;SRF=14;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119296;STB=0.566525;STBP=0.339;TYPE=snp;VARB=0.00210159;OID=.;OPOS=19230365;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:25:25:29:29:0.537037:9:20:14:11:9:20:14:11
chr22	19486600	.	C	T	766.43	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0388399;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.527;QD=63.8692;RBI=0.0388939;REFB=0;REVB=0.00204814;RO=0;SAF=28;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.56477e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011434;OID=.;OPOS=19486600;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:20:28:0:0:20:28:0:0
chr22	19709845	.	A	AG	37.09	PASS	AF=0.380952;AO=9;DP=21;FAO=8;FDP=21;FR=.;FRO=13;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=12;FSRR=1;FWDB=0.0148635;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=14.7418;QD=7.06548;RBI=0.129565;REFB=-0.104038;REVB=0.12871;RO=12;SAF=8;SAR=1;SRF=11;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0728013;STB=0.57559;STBP=0.794;TYPE=ins;VARB=0.144659;OID=.;OPOS=19709846;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.380952:9:21:8:21:13:7:1:12:1:37:12:8:1:11:1
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chr22	20905575	.	G	A	225.2	PASS	AF=0.440678;AO=26;DP=59;FAO=26;FDP=59;FR=.;FRO=33;FSAF=11;FSAR=15;FSRF=18;FSRR=15;FWDB=-0.00796741;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=226.863;QD=15.2681;RBI=0.00862828;REFB=-0.00380534;REVB=0.00331173;RO=33;SAF=11;SAR=15;SRF=18;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121005;STB=0.568575;STBP=0.367;TYPE=snp;VARB=0.00702978;OID=.;OPOS=20905575;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:59:59:33:33:26:26:0.440678:15:11:18:15:15:11:18:15
chr22	20940085	.	G	A	36.48	PASS	AF=0.1875;AO=6;DP=32;FAO=6;FDP=32;FR=.;FRO=26;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=9;FSRR=17;FWDB=-0.00518506;FXX=0.0588062;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.783;QD=4.56024;RBI=0.018356;REFB=-0.0127109;REVB=0.0176084;RO=24;SAF=2;SAR=4;SRF=7;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0571423;STB=0.511589;STBP=0.968;TYPE=snp;VARB=0.0749977;OID=.;OPOS=20940085;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:36:32:32:24:26:6:6:0.1875:4:2:7:17:4:2:9:17
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chr22	21066789	.	A	G	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00433937;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.836;QD=61.3364;RBI=0.00539999;REFB=0;REVB=0.00321399;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.48417e-05;OID=.;OPOS=21066789;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr22	21066897	.	G	A	101.9	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.106338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=56.3999;QD=40.7602;RBI=0.136602;REFB=0;REVB=0.0857459;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0105538;OID=.;OPOS=21066897;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:4:6:0:0:4:6:0:0
chr22	21079909	.	A	G	785.84	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0253055;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.529;QD=64.1498;RBI=0.0460304;REFB=0;REVB=0.0384503;RO=0;SAF=23;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175366;OID=.;OPOS=21079909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:26:23:0:0:26:23:0:0
chr22	21141300	.	T	C	1062.43	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229588;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.474;QD=59.8551;RBI=0.053016;REFB=0;REVB=0.0477869;RO=0;SAF=33;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.12164e-05;OID=.;OPOS=21141300;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:38:33:0:0:38:33:0:0
chr22	21167787	.	G	A	231.15	PASS	AF=0.373333;AO=28;DP=75;FAO=28;FDP=75;FR=.;FRO=47;FSAF=16;FSAR=12;FSRF=26;FSRR=21;FWDB=-0.0128745;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.096;QD=12.3281;RBI=0.0250168;REFB=-0.0165794;REVB=0.0214497;RO=46;SAF=16;SAR=12;SRF=25;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0307037;STB=0.51162;STBP=0.882;TYPE=snp;VARB=0.0271049;OID=.;OPOS=21167787;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:75:75:46:47:28:28:0.373333:12:16:25:21:12:16:26:21
chr22	21301005	.	T	C	288.6	PASS	AF=1;AO=14;DP=19;FAO=22;FDP=22;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111392;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=277.988;QD=52.4727;RBI=0.113178;REFB=0;REVB=0.0200242;RO=0;SAF=0;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00643858;OID=.;OPOS=21301005;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:22:0:0:14:22:1:14:0:0:0:18:4:0:0
chr22	21304408	.	A	G	728.38	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142281;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.894;QD=57.1281;RBI=0.0345513;REFB=0;REVB=0.0314858;RO=0;SAF=30;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000187534;OID=.;OPOS=21304408;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:21:30:0:0:21:30:0:0
chr22	21306743	.	A	G	163.9	PASS	AF=0.372549;AO=18;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=11;FWDB=-0.0119914;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.2455;QD=12.8546;RBI=0.0432865;REFB=-0.0113547;REVB=0.0415923;RO=32;SAF=9;SAR=9;SRF=21;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.171859;STB=0.58238;STBP=0.42;TYPE=snp;VARB=0.0269201;OID=.;OPOS=21306743;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:18:19:0.372549:9:9:21:11:9:10:21:11
chr22	21307388	.	T	C	202.8	PASS	AF=0.384615;AO=19;DP=63;FAO=25;FDP=65;FR=.;FRO=40;FSAF=18;FSAR=7;FSRF=23;FSRR=17;FWDB=0.0952495;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=44.5078;QD=12.4801;RBI=0.098579;REFB=-0.0156581;REVB=-0.0254039;RO=27;SAF=15;SAR=4;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.119827;STB=0.60075;STBP=0.237;TYPE=snp;VARB=0.0349591;OID=.;OPOS=21307388;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:63:65:27:40:19:25:0.384615:4:15:19:8:7:18:23:17
chr22	21307710	.	T	A	34.71	PASS	AF=0.2;AO=8;DP=28;FAO=6;FDP=30;FR=.;FRO=24;FSAF=2;FSAR=4;FSRF=13;FSRR=11;FWDB=-0.105162;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=25.7423;QD=4.62858;RBI=0.114564;REFB=-0.00293056;REVB=-0.0454537;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296329;STB=0.666112;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.00948159;OID=.;OPOS=21307710;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:28:30:19:24:8:6:0.2:4:4:9:10:4:2:13:11
chr22	21307712	.	AAAC	A,AAACAAC,AACAAC,ACAAC	267.67	PASS	AF=0.304348,0.0869565,0.565217,0;AO=4,6,3,5;DP=27;FAO=7,2,13,0;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=6,1,3,0;FSAR=1,1,10,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0488163,0.0667924,0.0602384,0.0462413;FXX=0.148093;HRUN=4,2,0,0;LEN=3,3,2,1;MLLD=151.69,131.788,136.601,127.878;QD=46.5511;RBI=0.0575118,0.070991,0.0622579,0.0462536;REFB=-0.0865375,-0.102033,-0.136036,-0.140158;REVB=0.0304067,-0.024052,-0.0157281,-0.00106613;RO=1;SAF=3,1,2,1;SAR=1,5,1,4;SRF=1;SRR=0;SSEN=0.325513,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=-0.119989,-0.281147,-0.163246,-0.277405;STB=0.538356,0.665164,0.571311,0.5;STBP=0.653,0.662,0.155,1;TYPE=del,ins,ins,ins;VARB=0.0206656,0.054505,-0.00136782,0;OID=.,.,.,.;OPOS=21307713,21307713,21307713,21307713;OREF=AAC,-,-,-;OALT=-,AAC,AC,C;OMAPALT=A,AAACAAC,AACAAC,ACAAC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/3:0.304348,0.0869565,0.565217,0:4,6,3,5:27:7,2,13,0:23:1:6,1,3,0:1,1,10,0:1:0:47:1:3,1,2,1:1,5,1,4:1:0
chr22	21327589	.	C	T	282.38	PASS	AF=0.492063;AO=30;DP=58;FAO=31;FDP=63;FR=.;FRO=32;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=16;FWDB=0.00366158;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=212.675;QD=17.929;RBI=0.0475624;REFB=-0.0247486;REVB=-0.0474212;RO=28;SAF=21;SAR=9;SRF=14;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18804;STB=0.596006;STBP=0.157;TYPE=snp;VARB=0.0190803;OID=.;OPOS=21327589;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:63:28:32:30:31:0.492063:9:21:14:14:10:21:16:16
chr22	21331043	.	A	T	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.058;QD=53.2763;RBI=0.0471267;REFB=0;REVB=0.0444468;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000375484;OID=.;OPOS=21331043;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:9:14:0:0:9:14:0:0
chr22	21335606	.	C	T	411.09	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.047575;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=92.7252;QD=56.7017;RBI=0.0572368;REFB=0;REVB=-0.0318225;RO=0;SAF=12;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000151186;OID=.;OPOS=21335606;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:17:12:0:0:17:12:0:0
chr22	21335611	.	A	G	447.03	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.01967;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=172.595;QD=57.6807;RBI=0.0254777;REFB=0;REVB=0.0161928;RO=0;SAF=12;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.47712e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000116836;OID=.;OPOS=21335611;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:19:12:0:0:19:12:0:0
chr22	21337325	.	G	A	214.5	PASS	AF=0.3375;AO=26;DP=81;FAO=27;FDP=80;FR=.;FRO=53;FSAF=22;FSAR=5;FSRF=38;FSRR=15;FWDB=0.0357518;FXX=0.0123442;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.577;QD=10.7248;RBI=0.0357797;REFB=-0.0214771;REVB=-0.00141197;RO=53;SAF=22;SAR=4;SRF=38;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.226765;STB=0.594518;STBP=0.331;TYPE=snp;VARB=0.0569196;OID=.;OPOS=21337325;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:80:53:53:26:27:0.3375:4:22:38:15:5:22:38:15
chr22	21337378	.	GGTGA	G	108.41	PASS	AF=0.338983;AO=18;DP=55;FAO=20;FDP=59;FR=.;FRO=39;FSAF=17;FSAR=3;FSRF=33;FSRR=6;FWDB=7.03748e-05;FXX=0.0327815;HRUN=3;LEN=4;MLLD=242.035;QD=7.34979;RBI=0.0309637;REFB=-0.0278392;REVB=-0.0309636;RO=32;SAF=16;SAR=2;SRF=27;SRR=5;SSEN=0.547619;SSEP=0;SSSB=0.110654;STB=0.504945;STBP=0.985;TYPE=del;VARB=0.048376;OID=.;OPOS=21337379;OREF=GTGA;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.338983:18:55:20:59:39:17:3:33:6:99:32:16:2:27:5
chr22	21354970	.	C	G	1007.58	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0135563;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.497;QD=59.2695;RBI=0.0576129;REFB=0;REVB=0.0559953;RO=0;SAF=38;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.95187e-05;OID=.;OPOS=21354970;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:68:0:0:60:68:1:22:38:0:0:26:42:0:0
chr22	21377301	.	C	A	1471.87	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00383039;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=127.356;QD=63.3062;RBI=0.00473958;REFB=0;REVB=-0.00279136;RO=0;SAF=49;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.17366e-05;OID=.;OPOS=21377301;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:44:49:0:0:44:49:0:0
chr22	21384578	.	C	T	358.11	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.151977;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.0499;QD=55.0941;RBI=0.153045;REFB=0;REVB=0.018043;RO=0;SAF=6;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.14057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00172657;OID=.;OPOS=21384578;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:20:6:0:0:20:6:0:0
chr22	21385805	.	C	T	141.32	PASS	AF=0.380952;AO=16;DP=42;FAO=16;FDP=42;FR=.;FRO=26;FSAF=13;FSAR=3;FSRF=21;FSRR=5;FWDB=0.00377524;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=240.895;QD=13.459;RBI=0.0418314;REFB=-0.0290806;REVB=0.0416607;RO=26;SAF=13;SAR=3;SRF=21;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00829916;STB=0.504848;STBP=0.986;TYPE=snp;VARB=0.0431001;OID=.;OPOS=21385805;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:26:26:16:16:0.380952:3:13:21:5:3:13:21:5
chr22	21386019	.	G	A	145.22	PASS	AF=1;AO=13;DP=13;FAO=13;FDP=13;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0191329;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.852;QD=44.6832;RBI=0.0215308;REFB=0;REVB=0.00987462;RO=0;SAF=7;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000376788;OID=.;OPOS=21386019;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:13:13:0:0:13:13:1:6:7:0:0:6:7:0:0
chr22	21570340	.	G	A	54.64	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=5;FSAR=3;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.0256728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.1622;QD=9.10741;RBI=0.0275484;REFB=-0.0254955;REVB=0.00999108;RO=16;SAF=5;SAR=3;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.266321;STB=0.662868;STBP=0.287;TYPE=snp;VARB=0.0388178;OID=.;OPOS=21570340;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:3:5:6:10:3:5:6:10
chr22	21797094	.	C	G	68.29	PASS	AF=0.692308;AO=8;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.103032;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=25.5434;QD=21.0117;RBI=0.198903;REFB=-0.0418208;REVB=0.170138;RO=5;SAF=4;SAR=4;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199671;STB=0.666324;STBP=0.134;TYPE=snp;VARB=0.0301093;OID=.;OPOS=21797094;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:5:4:8:9:0.692308:4:4:4:1:5:4:4:0
chr22	21800444	.	T	C	1434.44	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0337494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.696;QD=63.0523;RBI=0.0404519;REFB=0;REVB=0.0223008;RO=0;SAF=44;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.15792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.3224e-05;OID=.;OPOS=21800444;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:90:91:0:0:90:91:1:46:44:0:0:46:45:0:0
chr22	21801588	.	T	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0101397;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=274.986;QD=61.3363;RBI=0.0105889;REFB=0;REVB=-0.00305151;RO=0;SAF=23;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.4817e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.17892e-05;OID=.;OPOS=21801588;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:17:23:0:0:17:23:0:0
chr22	21805509	.	G	C	110.76	PASS	AF=0.368421;AO=14;DP=38;FAO=14;FDP=38;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=21;FSRR=3;FWDB=-0.0112673;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=228.572;QD=11.6594;RBI=0.0240016;REFB=-0.0096372;REVB=0.0211925;RO=24;SAF=5;SAR=9;SRF=21;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.518914;STB=0.795588;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0240679;OID=.;OPOS=21805509;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:38:38:24:24:14:14:0.368421:9:5:21:3:9:5:21:3
chr22	21822725	.	T	C	1189.51	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=78;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=68;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0893619;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1623;QD=61.0003;RBI=0.0903466;REFB=0;REVB=0.0133024;RO=0;SAF=10;SAR=66;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000477322;OID=.;OPOS=21822725;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:78:0:0:76:78:1:66:10:0:0:68:10:0:0
chr22	21982892	.	C	T	130.46	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0156577;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=147.447;QD=43.4859;RBI=0.0398898;REFB=0;REVB=0.0366884;RO=0;SAF=7;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000487621;OID=.;OPOS=21982892;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:5:7:0:0:5:7:0:0
chr22	21984205	.	A	G	1955.31	PASS	AF=1;AO=126;DP=127;FAO=126;FDP=126;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=58;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0071452;FXX=0.0078734;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.9542;QD=62.0732;RBI=0.0327735;REFB=0;REVB=-0.0319851;RO=0;SAF=68;SAR=58;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.33106e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000609322;OID=.;OPOS=21984205;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:127:126:0:0:126:126:1:58:68:0:0:58:68:0:0
chr22	21989621	.	C	T	363.95	PASS	AF=0.376068;AO=43;DP=117;FAO=44;FDP=117;FR=.;FRO=73;FSAF=32;FSAR=12;FSRF=42;FSRR=31;FWDB=0.044963;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.0937;QD=12.4427;RBI=0.0449876;REFB=-0.0157589;REVB=0.00148753;RO=73;SAF=32;SAR=11;SRF=42;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.213353;STB=0.607722;STBP=0.089;TYPE=snp;VARB=0.0400942;OID=.;OPOS=21989621;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:117:117:73:73:43:44:0.376068:11:32:42:31:12:32:42:31
chr22	21991072	.	T	C	48.82	PASS	AF=0.5;AO=7;DP=14;FAO=7;FDP=14;FR=.;FRO=7;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.069517;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.664;QD=13.9484;RBI=0.0695339;REFB=-0.03564;REVB=0.00153013;RO=7;SAF=3;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.235769;STB=0.639615;STBP=0.37;TYPE=snp;VARB=0.0287034;OID=.;OPOS=21991072;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:14:14:7:7:7:7:0.5:4:3:5:2:4:3:5:2
chr22	21991120	.	G	A	67.06	PASS	AF=0.428571;AO=9;DP=21;FAO=9;FDP=21;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=2;FSRF=11;FSRR=1;FWDB=-0.00592466;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.777;QD=12.7728;RBI=0.0267353;REFB=-0.0211705;REVB=0.0260706;RO=11;SAF=7;SAR=2;SRF=10;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.204722;STB=0.63134;STBP=0.427;TYPE=snp;VARB=0.022701;OID=.;OPOS=21991120;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:21:21:11:12:9:9:0.428571:2:7:10:1:2:7:11:1
chr22	21991350	.	T	C	56.7	PASS	AF=0.444444;AO=7;DP=17;FAO=8;FDP=18;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=6;FWDB=0.0442156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.645;QD=12.6004;RBI=0.0495117;REFB=-0.0231763;REVB=0.0222796;RO=10;SAF=3;SAR=4;SRF=4;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283636;STB=0.514669;STBP=0.937;TYPE=snp;VARB=0.0241572;OID=.;OPOS=21991350;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:17:18:10:10:7:8:0.444444:4:3:4:6:5:3:4:6
chr22	22049783	.	C	T	288.63	PASS	AF=0.450704;AO=32;DP=71;FAO=32;FDP=71;FR=.;FRO=39;FSAF=12;FSAR=20;FSRF=23;FSRR=16;FWDB=-0.0241784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.147;QD=16.2607;RBI=0.0298817;REFB=-0.00618587;REVB=-0.0175591;RO=38;SAF=12;SAR=20;SRF=22;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.198171;STB=0.6183;STBP=0.078;TYPE=snp;VARB=0.00704794;OID=.;OPOS=22049783;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:38:39:32:32:0.450704:20:12:22:16:20:12:23:16
chr22	22115260	.	AT	GA,GT	156.6	PASS	AF=0,0.377778;AO=2,15;DP=47;FAO=0,17;FDP=45;FR=.;FRO=28;FSAF=0,11;FSAR=0,6;FSRF=14;FSRR=14;FWDB=0.00831979,0.013523;FXX=0.0425441;HRUN=1,1;LEN=2,1;MLLD=81.8469,127.044;QD=13.9199;RBI=0.0192716,0.0135331;REFB=-0.00220701,-0.00732117;REVB=-0.0173832,-0.00052183;RO=27;SAF=0,11;SAR=2,4;SRF=14;SRR=13;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.479823,0.254632;STB=0.5,0.594481;STBP=1,0.335;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.00902881;OID=.,.;OPOS=22115260,22115260;OREF=AT,A;OALT=GA,G;OMAPALT=GA,GT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:47:45:27:28:2,15:0,17:0,0.377778:2,4:0,11:14:13:0,6:0,11:14:14
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chr22	23040462	.	T	C	295.76	PASS	AF=0.534483;AO=31;DP=58;FAO=31;FDP=58;FR=.;FRO=27;FSAF=18;FSAR=13;FSRF=19;FSRR=8;FWDB=0.008814;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=197.394;QD=20.3971;RBI=0.0135267;REFB=-0.0202546;REVB=0.0102608;RO=27;SAF=18;SAR=13;SRF=19;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.108295;STB=0.559916;STBP=0.353;TYPE=snp;VARB=0.0163366;OID=.;OPOS=23040462;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:27:27:31:31:0.534483:13:18:19:8:13:18:19:8
chr22	23040767	.	G	T	827.13	PASS	AF=0.614754;AO=75;DP=124;FAO=75;FDP=122;FR=.;FRO=47;FSAF=38;FSAR=37;FSRF=18;FSRR=29;FWDB=-0.0557056;FXX=0.0161277;HRUN=3;LEN=1;MLLD=146.312;QD=27.119;RBI=0.0568116;REFB=-0.0114718;REVB=0.0111555;RO=47;SAF=38;SAR=37;SRF=18;SRR=29;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0878087;STB=0.547586;STBP=0.186;TYPE=snp;VARB=0.00871719;OID=.;OPOS=23040767;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:122:47:47:75:75:0.614754:37:38:18:29:37:38:18:29
chr22	23047046	.	G	A	205.94	PASS	AF=0.571429;AO=20;DP=34;FAO=20;FDP=35;FR=.;FRO=15;FSAF=6;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=8;FWDB=-0.00709992;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=264.158;QD=23.5361;RBI=0.00982139;REFB=-0.0187916;REVB=-0.00678608;RO=14;SAF=6;SAR=14;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.107084;STB=0.579535;STBP=0.302;TYPE=snp;VARB=0.0112794;OID=.;OPOS=23047046;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:35:14:15:20:20:0.571429:14:6:6:8:14:6:7:8
chr22	23055421	.	G	A	252.08	PASS	AF=0.474576;AO=28;DP=57;FAO=28;FDP=59;FR=.;FRO=31;FSAF=12;FSAR=16;FSRF=23;FSRR=8;FWDB=-0.0211043;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=238.361;QD=17.0899;RBI=0.0223752;REFB=-0.0131271;REVB=-0.00743357;RO=29;SAF=12;SAR=16;SRF=21;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.263662;STB=0.66027;STBP=0.026;TYPE=snp;VARB=0.0182218;OID=.;OPOS=23055421;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:59:29:31:28:28:0.474576:16:12:21:8:16:12:23:8
chr22	23055440	.	C	A	863.16	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0600766;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.984;QD=57.5436;RBI=0.0702955;REFB=0;REVB=0.0365002;RO=0;SAF=29;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205382;OID=.;OPOS=23055440;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:60:0:0:55:60:1:26:29:0:0:27:33:0:0
chr22	23055533	.	G	A	798.54	PASS	AF=0.6875;AO=65;DP=96;FAO=66;FDP=96;FR=.;FRO=30;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.00573925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=218.804;QD=33.2724;RBI=0.0203123;REFB=-0.0237161;REVB=0.0194846;RO=29;SAF=32;SAR=33;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0537097;STB=0.535929;STBP=0.319;TYPE=snp;VARB=0.0109867;OID=.;OPOS=23055533;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:96:96:29:30:65:66:0.6875:33:32:17:12:34:32:18:12
chr22	23055539	.	G	T	809.66	PASS	AF=0.696078;AO=69;DP=99;FAO=71;FDP=102;FR=.;FRO=31;FSAF=35;FSAR=36;FSRF=19;FSRR=12;FWDB=0.0097618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.5353;QD=31.7513;RBI=0.0164695;REFB=0.00975992;REVB=0.0132647;RO=29;SAF=35;SAR=34;SRF=18;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0624775;STB=0.536414;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=-0.00488323;OID=.;OPOS=23055539;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:102:29:31:69:71:0.696078:34:35:18:11:36:35:19:12
chr22	23055691	.	G	A	439.1	PASS	AF=0.591549;AO=40;DP=69;FAO=42;FDP=71;FR=.;FRO=29;FSAF=22;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=13;FWDB=0.0434653;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.9037;QD=24.7378;RBI=0.0435499;REFB=-0.0571675;REVB=-0.00271425;RO=29;SAF=20;SAR=20;SRF=16;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0395849;STB=0.511435;STBP=0.829;TYPE=snp;VARB=0.0448037;OID=.;OPOS=23055691;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:71:29:29:40:42:0.591549:20:20:16:13:20:22:16:13
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chr22	23089941	.	ACT	A	113.32	PASS	AF=0.294118;AO=12;DP=53;FAO=15;FDP=51;FR=.;FRO=36;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=20;FWDB=-0.0313083;FXX=0.0727141;HRUN=1;LEN=2;MLLD=187.649;QD=8.88755;RBI=0.0366726;REFB=-0.0249393;REVB=-0.0190963;RO=32;SAF=3;SAR=9;SRF=13;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.210608;STB=0.639338;STBP=0.214;TYPE=del;VARB=0.049668;OID=.;OPOS=23089942;OREF=CT;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.294118:12:53:15:51:36:4:11:16:20:99:32:3:9:13:19
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chr22	23101221	.	A	G	447.0	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0186158;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.765;QD=57.6778;RBI=0.0366723;REFB=0;REVB=0.031596;RO=0;SAF=10;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178781;OID=.;OPOS=23101221;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:21:10:0:0:21:10:0:0
chr22	23101247	.	GC	AT	121.18	PASS	AF=0.382353;AO=12;DP=34;FAO=13;FDP=34;FR=.,HEALED;FRO=19;FSAF=2;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=12;FWDB=0.032212;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=133.768;QD=14.2568;RBI=0.0410066;REFB=-0.026734;REVB=0.0253757;RO=19;SAF=2;SAR=10;SRF=7;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.283998;STB=0.682432;STBP=0.146;TYPE=mnp;VARB=0.0308294;OID=.;OPOS=23101247;OREF=GC;OALT=AT;OMAPALT=AT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:12:13:0.382353:10:2:7:12:11:2:7:12
chr22	23101280	.	C	G,T	601.64	PASS	AF=0.05,0.95;AO=2,37;DP=39;FAO=2,38;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=0,17;FSAR=2,21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00497656,0.00802208;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=163.447,141.704;QD=60.1641;RBI=0.00498146,0.0239219;REFB=0,0;REVB=0.000220765,0.0225367;RO=0;SAF=0,17;SAR=2,20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,3.71161e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0575426,-0.00207541;OID=.,.;OPOS=23101280,23101280;OREF=C,C;OALT=G,T;OMAPALT=G,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:9:39:40:0:0:2,37:2,38:0.05,0.95:2,20:0,17:0:0:2,21:0,17:0:0
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chr22	23114993	.	G	A	529.25	PASS	AF=0.576471;AO=49;DP=86;FAO=49;FDP=85;FR=.;FRO=36;FSAF=23;FSAR=26;FSRF=14;FSRR=22;FWDB=0.0022142;FXX=0.0116266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.111;QD=24.9058;RBI=0.0194079;REFB=-0.0149945;REVB=-0.0192812;RO=35;SAF=23;SAR=26;SRF=13;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0753237;STB=0.534352;STBP=0.472;TYPE=snp;VARB=0.00972445;OID=.;OPOS=23114993;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:85:35:36:49:49:0.576471:26:23:13:22:26:23:14:22
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chr22	23241754	.	G	A	61.44	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=27;FAO=9;FDP=27;FR=.;FRO=18;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=9;FWDB=-0.0187766;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=57.3883;QD=9.10293;RBI=0.0969073;REFB=-0.00282988;REVB=0.0950708;RO=19;SAF=4;SAR=4;SRF=9;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0296329;STB=0.537107;STBP=0.795;TYPE=snp;VARB=0.00183008;OID=.;OPOS=23241754;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:61:27:27:19:18:8:9:0.333333:4:4:9:10:5:4:9:9
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chr22	24108238	.	C	T	251.96	PASS	AF=0.621622;AO=23;DP=37;FAO=23;FDP=37;FR=.;FRO=14;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=0.0397336;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.555;QD=27.2384;RBI=0.0450257;REFB=-0.0389085;REVB=0.0211792;RO=13;SAF=12;SAR=11;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0615279;STB=0.54606;STBP=0.457;TYPE=snp;VARB=0.019827;OID=.;OPOS=24108238;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:37:37:13:14:23:23:0.621622:11:12:8:5:11:12:9:5
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chr22	24143502	.	C	G	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0430604;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=288.502;QD=53.9112;RBI=0.0499164;REFB=0;REVB=0.0252478;RO=0;SAF=6;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000178073;OID=.;OPOS=24143502;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:18:6:0:0:18:6:0:0
chr22	24158899	.	C	A	272.77	PASS	AF=0.555556;AO=25;DP=45;FAO=25;FDP=45;FR=.;FRO=20;FSAF=15;FSAR=10;FSRF=11;FSRR=9;FWDB=0.00580186;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=113.87;QD=24.2461;RBI=0.0247248;REFB=0.00924397;REVB=-0.0240345;RO=19;SAF=15;SAR=10;SRF=11;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0169656;STB=0.522917;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=-0.00854256;OID=.;OPOS=24158899;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:19:20:25:25:0.555556:10:15:11:8:10:15:11:9
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chr22	24579049	.	G	A	111.46	PASS	AF=0.206897;AO=18;DP=87;FAO=18;FDP=87;FR=.;FRO=69;FSAF=15;FSAR=3;FSRF=47;FSRR=22;FWDB=-0.0207424;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.002;QD=5.12454;RBI=0.0232694;REFB=-0.00389972;REVB=-0.0105461;RO=69;SAF=15;SAR=3;SRF=47;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.258637;STB=0.668235;STBP=0.174;TYPE=snp;VARB=0.0168239;OID=.;OPOS=24579049;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:87:87:69:69:18:18:0.206897:3:15:47:22:3:15:47:22
chr22	24579157	.	GA	TC	67.24	PASS	AF=0.127119;AO=15;DP=118;FAO=15;FDP=118;FR=.;FRO=103;FSAF=13;FSAR=2;FSRF=64;FSRR=39;FWDB=-0.00206495;FXX=0;HRUN=2;LEN=2;MLLD=294.496;QD=2.27923;RBI=0.0151328;REFB=-0.00579668;REVB=-0.0149912;RO=103;SAF=13;SAR=2;SRF=64;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.372463;STB=0.775408;STBP=0.054;TYPE=mnp;VARB=0.0371601;OID=.;OPOS=24579157;OREF=GA;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:67:118:118:103:103:15:15:0.127119:2:13:64:39:2:13:64:39
chr22	24717850	.	A	G	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016045;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.677;QD=59.8393;RBI=0.0218146;REFB=0;REVB=0.0147796;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000175159;OID=.;OPOS=24717850;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:18:18:0:0:18:18:0:0
chr22	24761467	.	G	A	708.42	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00656838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.408;QD=62.971;RBI=0.0635189;REFB=0;REVB=0.0631784;RO=0;SAF=22;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000163298;OID=.;OPOS=24761467;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:0:0:45:45:1:23:22:0:0:23:22:0:0
chr22	24837105	.	G	A	137.38	PASS	AF=0.326531;AO=16;DP=49;FAO=16;FDP=49;FR=.;FRO=33;FSAF=10;FSAR=6;FSRF=20;FSRR=13;FWDB=0.0202141;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.583;QD=11.2146;RBI=0.0213984;REFB=0.00562023;REVB=0.00702002;RO=33;SAF=10;SAR=6;SRF=20;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0227087;STB=0.513497;STBP=0.883;TYPE=snp;VARB=-0.0111649;OID=.;OPOS=24837105;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:49:33:33:16:16:0.326531:6:10:20:13:6:10:20:13
chr22	24964128	.	T	C	465.14	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0194365;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=198.06;QD=58.142;RBI=0.0222432;REFB=0;REVB=-0.0108159;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000132154;OID=.;OPOS=24964128;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr22	25003922	.	G	A	171.73	PASS	AF=0.381818;AO=21;DP=53;FAO=21;FDP=55;FR=.;FRO=34;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=12;FSRR=22;FWDB=0.00247287;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=75.061;QD=12.4895;RBI=0.0172272;REFB=-0.0261614;REVB=0.0170488;RO=32;SAF=8;SAR=13;SRF=12;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00662365;STB=0.518501;STBP=0.833;TYPE=snp;VARB=0.0305406;OID=.;OPOS=25003922;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:55:32:34:21:21:0.381818:13:8:12:20:13:8:12:22
chr22	25003934	.	G	A	102.86	PASS	AF=0.258621;AO=12;DP=55;FAO=15;FDP=58;FR=.;FRO=43;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=16;FSRR=27;FWDB=-0.00384383;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.228;QD=7.09391;RBI=0.00841573;REFB=-0.0116427;REVB=-0.00748662;RO=43;SAF=4;SAR=8;SRF=16;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0520832;STB=0.591269;STBP=0.459;TYPE=snp;VARB=0.032532;OID=.;OPOS=25003934;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:55:58:43:43:12:15:0.258621:8:4:16:27:11:4:16:27
chr22	25145453	.	C	T	468.99	PASS	AF=1;AO=32;DP=32;FAO=32;FDP=32;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0210749;FXX=0.0302939;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.803;QD=58.6233;RBI=0.0220266;REFB=0;REVB=0.00640447;RO=0;SAF=13;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.87686e-05;OID=.;OPOS=25145453;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:32:0:0:32:32:1:19:13:0:0:19:13:0:0
chr22	25145471	.	A	G	112.23	PASS	AF=0.481481;AO=13;DP=27;FAO=13;FDP=27;FR=.;FRO=14;FSAF=10;FSAR=3;FSRF=2;FSRR=12;FWDB=0.0506614;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=253.084;QD=16.6268;RBI=0.050804;REFB=-0.00545979;REVB=0.00380271;RO=13;SAF=10;SAR=3;SRF=2;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.516755;STB=0.806012;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.0068562;OID=.;OPOS=25145471;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:13:14:13:13:0.481481:3:10:2:11:3:10:2:12
chr22	25151842	.	TG	GT,TT	269.67	PASS	AF=0.445946,0;AO=10,8;DP=77;FAO=33,0;FDP=74;FR=.,HEALED;FRO=37;FSAF=32,0;FSAR=1,0;FSRF=13;FSRR=24;FWDB=0.172101,-0.0735276;FXX=0.0133316;HRUN=5,1;LEN=2,1;MLLD=25.2048,215.689;QD=14.5769;RBI=0.174467,0.0737976;REFB=-0.104884,-0.00378425;REVB=0.0286345,0.0063068;RO=38;SAF=10,8;SAR=0,0;SRF=13;SRR=25;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.777965,0.752232;STB=0.946406,0.5;STBP=0,1;TYPE=mnp,snp;VARB=0.107964,0;OID=.,.;OPOS=25151842,25151843;OREF=TG,G;OALT=GT,T;OMAPALT=GT,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:77:74:38:37:10,8:33,0:0.445946,0:0,0:10,8:13:25:1,0:32,0:13:24
chr22	25435140	.	G	A	110.65	PASS	AF=0.448276;AO=13;DP=29;FAO=13;FDP=29;FR=.;FRO=16;FSAF=8;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=13;FWDB=-0.0128731;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=200.215;QD=15.2622;RBI=0.0143399;REFB=-0.00638354;REVB=0.00631791;RO=16;SAF=8;SAR=5;SRF=3;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.391002;STB=0.723311;STBP=0.063;TYPE=snp;VARB=0.0103374;OID=.;OPOS=25435140;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:16:16:13:13:0.448276:5:8:3:13:5:8:3:13
chr22	25466323	.	G	C	69.95	PASS	AF=0.238095;AO=10;DP=42;FAO=10;FDP=42;FR=.;FRO=32;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=15;FWDB=-0.00474522;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=303.685;QD=6.66158;RBI=0.00528364;REFB=-0.0160832;REVB=-0.00232373;RO=32;SAF=9;SAR=1;SRF=17;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.527938;STB=0.846251;STBP=0.029;TYPE=snp;VARB=0.051286;OID=.;OPOS=25466323;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:69:42:42:32:32:10:10:0.238095:1:9:17:15:1:9:17:15
chr22	25466395	.	G	T	70.78	PASS	AF=0.25641;AO=10;DP=39;FAO=10;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=1;FSRF=17;FSRR=12;FWDB=-0.0105162;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=223.013;QD=7.25975;RBI=0.0298341;REFB=-0.00947826;REVB=-0.0279193;RO=29;SAF=9;SAR=1;SRF=17;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.485553;STB=0.817411;STBP=0.048;TYPE=snp;VARB=0.0223006;OID=.;OPOS=25466395;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:70:39:39:29:29:10:10:0.25641:1:9:17:12:1:9:17:12
chr22	25577688	.	G	A	480.99	PASS	AF=0.875;AO=33;DP=38;FAO=35;FDP=40;FR=.;FRO=5;FSAF=21;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0539017;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=50.1741;QD=48.0985;RBI=0.0802637;REFB=-0.0686502;REVB=0.0594716;RO=5;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149774;STB=0.575714;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0109404;OID=.;OPOS=25577688;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:38:40:5:5:33:35:0.875:13:20:0:5:14:21:0:5
chr22	25577733	.	T	C	427.14	PASS	AF=0.864865;AO=31;DP=36;FAO=32;FDP=37;FR=.;FRO=5;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=5;FWDB=0.0369464;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=170.833;QD=46.1776;RBI=0.118715;REFB=0.040416;REVB=-0.11282;RO=5;SAF=18;SAR=13;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.149597;STB=0.580594;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=-0.00188926;OID=.;OPOS=25577733;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:26:36:37:5:5:31:32:0.864865:13:18:0:5:13:19:0:5
chr22	25601196	.	C	G	1034.58	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.9193;QD=58.2861;RBI=0.0259431;REFB=-0.0507596;REVB=0.0225455;RO=0;SAF=31;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00120228;OID=.;OPOS=25601196;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:71:71:0:0:70:71:1:39:31:0:0:40:31:0:0
chr22	25627604	.	G	A	1890.89	PASS	AF=0.968992;AO=125;DP=132;FAO=125;FDP=129;FR=.;FRO=4;FSAF=66;FSAR=59;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0227241;FXX=0.0227256;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.574;QD=58.6324;RBI=0.0346949;REFB=-0.12557;REVB=0.0262174;RO=2;SAF=66;SAR=59;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0158317;STB=0.508637;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=0.000557517;OID=.;OPOS=25627604;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:132:129:2:4:125:125:0.968992:59:66:0:2:59:66:1:3
chr22	25714218	.	AC	CC,TC,TT	615.29	PASS	AF=0.0714286,0.880952,0.047619;AO=3,36,2;DP=42;FAO=3,37,2;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=2,17,2;FSAR=1,20,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00122779,0.0278471,0.0311815;FXX=0;HRUN=1,1,1;LEN=1,1,2;MLLD=114.486,122.174,81.7887;QD=58.5986;RBI=0.0086003,0.0372863,0.0395275;REFB=0,0,0;REVB=0.00851221,0.0247953,0.0242926;RO=0;SAF=2,16,2;SAR=1,20,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,3.9376e-08,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=snp,snp,mnp;VARB=0.0417792,-0.00272958,0.0228686;OID=.,.,.;OPOS=25714218,25714218,25714218;OREF=A,A,AC;OALT=C,T,TT;OMAPALT=CC,TC,TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:14:42:42:0:0:3,36,2:3,37,2:0.0714286,0.880952,0.047619:1,20,0:2,16,2:0:0:1,20,0:2,17,2:0:0
chr22	25753231	.	G	A	750.14	PASS	AF=1;AO=47;DP=48;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0364904;FXX=0.020829;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.9477;QD=63.8413;RBI=0.0499372;REFB=0;REVB=0.0340907;RO=0;SAF=24;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-6.47892e-05;OID=.;OPOS=25753231;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:47:0:0:47:47:1:23:24:0:0:23:24:0:0
chr22	26159289	.	G	A	145.55	PASS	AF=0.444444;AO=16;DP=36;FAO=16;FDP=36;FR=.;FRO=20;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=10;FSRR=10;FWDB=-0.00363439;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=330.937;QD=16.1724;RBI=0.00546819;REFB=0.00495089;REVB=0.00408563;RO=20;SAF=9;SAR=7;SRF=10;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607014;STB=0.534921;STBP=0.682;TYPE=snp;VARB=-0.00567378;OID=.;OPOS=26159289;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:36:36:20:20:16:16:0.444444:7:9:10:10:7:9:10:10
chr22	26164079	.	C	T	151.84	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=29;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=8;FSRR=5;FWDB=-0.00874484;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=102.708;QD=20.9438;RBI=0.0105883;REFB=-0.0889886;REVB=-0.00596985;RO=13;SAF=8;SAR=8;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.09158;STB=0.55166;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=0.0582036;OID=.;OPOS=26164079;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:13:13:16:16:0.551724:8:8:8:5:8:8:8:5
chr22	26166900	.	G	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0546321;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=252.41;QD=56.7057;RBI=0.0595509;REFB=0;REVB=0.0236989;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000166267;OID=.;OPOS=26166900;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:15:14:0:0:15:14:0:0
chr22	26173661	.	T	C	312.62	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00939343;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.12;QD=54.369;RBI=0.0305718;REFB=0;REVB=0.0290929;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000594312;OID=.;OPOS=26173661;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:23:0:0:24:23:1:11:13:0:0:10:13:0:0
chr22	26193982	.	C	G	828.85	PASS	AF=1;AO=51;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0349395;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7698;QD=55.2564;RBI=0.0800717;REFB=0;REVB=0.0720465;RO=0;SAF=32;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.2152e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000985202;OID=.;OPOS=26193982;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:51:60:1:19:32:0:0:28:32:0:0
chr22	26194045	.	T	C	227.26	PASS	AF=0.511111;AO=21;DP=45;FAO=23;FDP=45;FR=.;FRO=22;FSAF=6;FSAR=17;FSRF=4;FSRR=18;FWDB=-0.00629885;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.816;QD=20.2008;RBI=0.0101722;REFB=-0.0158966;REVB=-0.00798744;RO=22;SAF=5;SAR=16;SRF=4;SRR=18;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0736326;STB=0.552588;STBP=0.554;TYPE=snp;VARB=0.0148742;OID=.;OPOS=26194045;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:45:45:22:22:21:23:0.511111:16:5:4:18:17:6:4:18
chr22	26239850	.	C	A	296.35	PASS	AF=0.958333;AO=23;DP=24;FAO=23;FDP=24;FR=.;FRO=1;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00772396;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=65.5699;QD=49.3914;RBI=0.0398611;REFB=-0.00195825;REVB=-0.0391056;RO=1;SAF=10;SAR=13;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0440445;STB=0.523789;STBP=0.315;TYPE=snp;VARB=0.000427153;OID=.;OPOS=26239850;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:24:1:1:23:23:0.958333:13:10:1:0:13:10:1:0
chr22	26706697	.	G	A	486.18	PASS	AF=0.421875;AO=54;DP=124;FAO=54;FDP=128;FR=.;FRO=74;FSAF=33;FSAR=21;FSRF=43;FSRR=31;FWDB=-0.0106113;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.375;QD=15.1931;RBI=0.0133054;REFB=-0.0156558;REVB=0.00802704;RO=69;SAF=33;SAR=21;SRF=38;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0626474;STB=0.518109;STBP=0.742;TYPE=snp;VARB=0.0190956;OID=.;OPOS=26706697;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:124:128:69:74:54:54:0.421875:21:33:38:31:21:33:43:31
chr22	26853905	.	C	A	905.93	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0253577;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=211.511;QD=56.6207;RBI=0.0310308;REFB=0.102036;REVB=0.0178856;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.50769;STBP=0.505;TYPE=snp;VARB=-0.000283392;OID=.;OPOS=26853905;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:0:1:63:63:0.984375:32:31:0:0:32:31:0:1
chr22	26854441	.	G	A	666.01	PASS	AF=1;AO=43;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0354355;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.209;QD=60.5467;RBI=0.043274;REFB=0;REVB=0.0248388;RO=0;SAF=21;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.7736e-05;OID=.;OPOS=26854441;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:44:44:0:0:43:44:1:22:21:0:0:23:21:0:0
chr22	26859942	.	C	T	400.21	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0152842;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=227.559;QD=53.3619;RBI=0.0249772;REFB=-0.0321448;REVB=0.0197548;RO=1;SAF=19;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0238907;STB=0.512812;STBP=0.624;TYPE=snp;VARB=0.000317033;OID=.;OPOS=26859942;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:29:29:0.966667:10:19:1:0:10:19:1:0
chr22	26860269	.	G	C	190.26	PASS	AF=0.542857;AO=19;DP=35;FAO=19;FDP=35;FR=.;FRO=16;FSAF=14;FSAR=5;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.00450809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5882;QD=21.7439;RBI=0.0095229;REFB=-0.00619523;REVB=0.00838825;RO=16;SAF=14;SAR=5;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.313621;STB=0.677223;STBP=0.033;TYPE=snp;VARB=0.00717784;OID=.;OPOS=26860269;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:35:16:16:19:19:0.542857:5:14:6:10:5:14:6:10
chr22	26862212	.	T	C	738.54	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0299208;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.668;QD=62.8545;RBI=0.0539769;REFB=0;REVB=0.0449249;RO=0;SAF=26;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.95793e-05;OID=.;OPOS=26862212;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:47:0:0:44:47:1:18:26:0:0:21:26:0:0
chr22	26879958	.	C	G	41.14	PASS	AF=0.6;AO=6;DP=10;FAO=6;FDP=10;FR=.;FRO=4;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0149138;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=242.687;QD=16.4544;RBI=0.0449209;REFB=-0.0117048;REVB=-0.042373;RO=4;SAF=5;SAR=1;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.248791;STB=0.642482;STBP=0.731;TYPE=snp;VARB=0.0195113;OID=.;OPOS=26879958;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:10:10:4:4:6:6:0.6:1:5:4:0:1:5:4:0
chr22	26879962	.	G	C	74.46	PASS	AF=0.692308;AO=9;DP=13;FAO=9;FDP=13;FR=.;FRO=4;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.00534836;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=222.531;QD=22.912;RBI=0.0386604;REFB=-0.0452938;REVB=0.0382886;RO=4;SAF=6;SAR=3;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.221916;STB=0.624758;STBP=0.33;TYPE=snp;VARB=0.0248964;OID=.;OPOS=26879962;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:13:13:4:4:9:9:0.692308:3:6:4:0:3:6:4:0
chr22	26879967	.	A	G	102.07	PASS	AF=0.785714;AO=11;DP=14;FAO=11;FDP=14;FR=.;FRO=3;FSAF=6;FSAR=5;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0108142;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=258.136;QD=29.1641;RBI=0.0726183;REFB=-0.0357589;REVB=0.0718085;RO=3;SAF=6;SAR=5;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.179011;STB=0.599828;STBP=0.199;TYPE=snp;VARB=0.00826036;OID=.;OPOS=26879967;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:14:14:3:3:11:11:0.785714:5:6:3:0:5:6:3:0
chr22	26884039	.	G	A	259.38	PASS	AF=0.453125;AO=29;DP=66;FAO=29;FDP=64;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=16;FSRR=19;FWDB=-0.0109337;FXX=0.0302984;HRUN=2;LEN=1;MLLD=169.348;QD=16.2111;RBI=0.017538;REFB=-0.00768154;REVB=-0.0137126;RO=35;SAF=19;SAR=10;SRF=16;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.197298;STB=0.611464;STBP=0.119;TYPE=snp;VARB=0.00923085;OID=.;OPOS=26884039;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:64:35:35:29:29:0.453125:10:19:16:19:10:19:16:19
chr22	26887051	.	A	G	30.1	PASS	AF=0.416667;AO=5;DP=12;FAO=5;FDP=12;FR=.;FRO=7;FSAF=1;FSAR=4;FSRF=5;FSRR=2;FWDB=-0.0779512;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=101.139;QD=10.0339;RBI=0.0779524;REFB=-0.00351745;REVB=-0.000435102;RO=7;SAF=1;SAR=4;SRF=5;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.478981;STB=0.798799;STBP=0.145;TYPE=snp;VARB=-0.000711848;OID=.;OPOS=26887051;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:30:12:12:7:7:5:5:0.416667:4:1:5:2:4:1:5:2
chr22	26892132	.	A	AG,G	54.83	PASS	AF=0.118812,0.019802;AO=14,5;DP=105;FAO=12,2;FDP=101;FR=.;FRO=87;FSAF=11,2;FSAR=1,0;FSRF=44;FSRR=43;FWDB=-0.0287964,-0.0297496;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=23.6512,198.675;QD=2.17148;RBI=0.109468,0.0470925;REFB=-0.0146082,-0.000723672;REVB=-0.105613,-0.0365058;RO=86;SAF=11,5;SAR=3,0;SRF=44;SRR=42;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.356688,0.484161;STB=0.897238,0.99488;STBP=0.006,0.188;TYPE=ins,snp;VARB=0.0933198,0.0215378;OID=.,.;OPOS=26892133,26892132;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:47:105:101:86:87:14,5:12,2:0.118812,0.019802:3,0:11,5:44:42:1,0:11,2:44:43
chr22	26895337	.	G	A	1026.39	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.016968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.139;QD=59.501;RBI=0.0531388;REFB=0;REVB=0.050357;RO=0;SAF=45;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000125211;OID=.;OPOS=26895337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:24:45:0:0:24:45:0:0
chr22	26932150	.	G	A	213.92	PASS	AF=0.431034;AO=25;DP=58;FAO=25;FDP=58;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=21;FSRR=12;FWDB=-0.028079;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.4338;QD=14.7528;RBI=0.0932051;REFB=0.0151042;REVB=-0.088875;RO=33;SAF=13;SAR=12;SRF=21;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.117542;STB=0.566615;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=-0.022645;OID=.;OPOS=26932150;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:33:33:25:25:0.431034:12:13:21:12:12:13:21:12
chr22	26936766	.	G	A	129.42	PASS	AF=0.375;AO=15;DP=40;FAO=15;FDP=40;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=16;FWDB=0.022073;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.298;QD=12.9421;RBI=0.0221801;REFB=-0.01361;REVB=0.0021772;RO=25;SAF=12;SAR=3;SRF=9;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.480987;STB=0.783116;STBP=0.016;TYPE=snp;VARB=0.0230545;OID=.;OPOS=26936766;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:25:25:15:15:0.375:3:12:9:16:3:12:9:16
chr22	26937327	.	C	G	650.29	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0544963;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=283.68;QD=61.9323;RBI=0.0703038;REFB=0;REVB=0.0444159;RO=0;SAF=27;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126268;OID=.;OPOS=26937327;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:42:0:0:41:42:1:14:27:0:0:14:28:0:0
chr22	27021457	.	T	C,G	678.29	PASS	AF=0.93617,0.0425532;AO=43,3;DP=47;FAO=44,2;FDP=47;FR=.;FRO=1;FSAF=25,0;FSAR=19,2;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00397986,-0.0645633;FXX=0;HRUN=3,3;LEN=1,1;MLLD=195.378,9.23818;QD=57.7272;RBI=0.0350192,0.127666;REFB=-0.149328,-0.161181;REVB=0.0347923,-0.110137;RO=1;SAF=25,0;SAR=18,3;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0253725,0;STB=0.512815,0.5;STBP=0.312,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000675118,0.264131;OID=.,.;OPOS=27021457,27021457;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:47:47:1:1:43,3:44,2:0.93617,0.0425532:18,3:25,0:0:1:19,2:25,0:0:1
chr22	28146768	.	A	AG	222.26	PASS	AF=1;AO=5;DP=31;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00510133;FXX=0.241296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=17.5435;QD=40.4105;RBI=0.0120847;REFB=0;REVB=0.0109552;RO=26;SAF=0;SAR=5;SRF=14;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.675518;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00091971;OID=.;OPOS=28146769;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:5:31:22:22:0:9:13:0:0:4:26:0:5:14:12
chr22	28146770	.	A	G	225.58	PASS	AF=0.793103;AO=8;DP=22;FAO=23;FDP=29;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=5;FWDB=0.0306505;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=66.374;QD=31.1138;RBI=0.084629;REFB=-0.10236;REVB=0.0788836;RO=5;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.260045;STB=0.564899;STBP=0.211;TYPE=snp;VARB=0.011933;OID=.;OPOS=28146770;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:22:22:29:5:6:8:23:0.793103:6:2:0:5:12:11:1:5
chr22	28316591	.	T	TG	375.68	PASS	AF=1;AO=32;DP=41;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0495167;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=15.6444;QD=37.5684;RBI=0.16392;REFB=0;REVB=-0.156262;RO=5;SAF=15;SAR=17;SRF=1;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0680537;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=-0.00208184;OID=.;OPOS=28316592;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:32:41:40:40:0:16:24:0:0:7:5:15:17:1:4
chr22	29130458	.	T	C	239.71	PASS	AF=0.3625;AO=29;DP=80;FAO=29;FDP=80;FR=.;FRO=51;FSAF=19;FSAR=10;FSRF=25;FSRR=26;FWDB=0.00448317;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=213.683;QD=11.9856;RBI=0.0260261;REFB=-0.0168735;REVB=-0.0256371;RO=51;SAF=19;SAR=10;SRF=25;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.187692;STB=0.608464;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0232626;OID=.;OPOS=29130458;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:51:51:29:29:0.3625:10:19:25:26:10:19:25:26
chr22	29182500	.	C	A	1046.56	PASS	AF=1;AO=70;DP=71;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0110793;FXX=0.0140825;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.559;QD=59.8036;RBI=0.0128617;REFB=0;REVB=0.00653236;RO=0;SAF=46;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.69565e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144025;OID=.;OPOS=29182500;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:70:0:0:70:70:1:24:46:0:0:24:46:0:0
chr22	29446611	.	A	C	662.03	PASS	AF=0.482014;AO=49;DP=138;FAO=67;FDP=139;FR=.,HEALED;FRO=72;FSAF=56;FSAR=11;FSRF=58;FSRR=14;FWDB=0.0377707;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.1;QD=19.0513;RBI=0.0392796;REFB=-0.0273817;REVB=0.0107824;RO=69;SAF=40;SAR=9;SRF=56;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00814194;STB=0.527497;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0298636;OID=.;OPOS=29446611;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:138:139:69:72:49:67:0.482014:9:40:56:13:11:56:58:14
chr22	29449691	.	AAT	A,ATT	88.35	PASS	AF=0.647059,0;AO=6,2;DP=24;FAO=11,0;FDP=17;FR=.;FRO=6;FSAF=5,0;FSAR=6,0;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.00721357,0.280854;FXX=0.149925;HRUN=6,6;LEN=2,1;MLLD=22.2064,10.6161;QD=20.7871;RBI=0.171198,0.302736;REFB=-0.0255771,-0.0203386;REVB=-0.171046,-0.113006;RO=9;SAF=2,2;SAR=4,0;SRF=7;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.41225,0.502622;STB=0.5434,0.5;STBP=0.684,1;TYPE=del,snp;VARB=-0.0150428,0;OID=.,.;OPOS=29449692,29449692;OREF=AT,A;OALT=-,T;OMAPALT=A,ATT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.647059,0:6,2:24:11,0:17:6:5,0:6,0:2:4:36:9:2,2:4,0:7:2
chr22	29450923	.	A	G	261.79	PASS	AF=0.47541;AO=29;DP=61;FAO=29;FDP=61;FR=.;FRO=32;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=10;FWDB=0.0679657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.189;QD=17.1667;RBI=0.0681938;REFB=-0.0205814;REVB=0.00557283;RO=32;SAF=15;SAR=14;SRF=22;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.160881;STB=0.589918;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.0178583;OID=.;OPOS=29450923;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:32:32:29:29:0.47541:14:15:22:10:14:15:22:10
chr22	29453027	.	A	G	37.45	PASS	AF=0.352941;AO=6;DP=17;FAO=6;FDP=17;FR=.;FRO=11;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.00865877;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.53;QD=8.81077;RBI=0.0113624;REFB=0.00578291;REVB=0.00735729;RO=11;SAF=4;SAR=2;SRF=5;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.22268;STB=0.639526;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=-0.0217406;OID=.;OPOS=29453027;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:37:17:17:11:11:6:6:0.352941:2:4:5:6:2:4:5:6
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chr22	29454778	.	G	A	308.25	PASS	AF=0.435897;AO=34;DP=78;FAO=34;FDP=78;FR=.;FRO=44;FSAF=16;FSAR=18;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=0.00688479;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.893;QD=15.8074;RBI=0.00689289;REFB=-0.00676732;REVB=-0.000334217;RO=43;SAF=16;SAR=18;SRF=26;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.132391;STB=0.580163;STBP=0.238;TYPE=snp;VARB=0.00900853;OID=.;OPOS=29454778;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:78:43:44:34:34:0.435897:18:16:26:17:18:16:27:17
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chr22	29542182	.	AT	A	438.33	PASS	AF=0.59434;AO=56;DP=106;FAO=63;FDP=106;FR=.;FRO=43;FSAF=32;FSAR=31;FSRF=22;FSRR=21;FWDB=0.124634;FXX=0.0185168;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.3311;QD=16.5408;RBI=0.131216;REFB=-0.0379969;REVB=0.0410355;RO=40;SAF=27;SAR=29;SRF=19;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00545709;STB=0.501497;STBP=0.973;TYPE=del;VARB=0.0324847;OID=.;OPOS=29542183;OREF=T;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.59434:56:106:63:106:43:32:31:22:21:99:40:27:29:19:21
chr22	29542748	.	C	A	1300.96	PASS	AF=0.977273;AO=84;DP=86;FAO=86;FDP=88;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=59;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0433252;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3112;QD=59.1344;RBI=0.0488443;REFB=-0.0889506;REVB=-0.0225542;RO=2;SAF=25;SAR=59;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0157861;STB=0.508331;STBP=0.399;TYPE=snp;VARB=0.000834858;OID=.;OPOS=29542748;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:86:88:2:2:84:86:0.977273:59:25:0:2:59:27:0:2
chr22	29621128	.	C	G	405.54	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0158718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=182.276;QD=55.937;RBI=0.0632198;REFB=0;REVB=0.061195;RO=0;SAF=17;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.0947e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184726;OID=.;OPOS=29621128;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:12:17:0:0:12:17:0:0
chr22	29630337	.	G	A	629.2	PASS	AF=0.954545;AO=42;DP=44;FAO=42;FDP=44;FR=.;FRO=2;FSAF=25;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.00377244;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=150.522;QD=57.2;RBI=0.0136777;REFB=-0.0384268;REVB=0.0131472;RO=1;SAF=25;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0184086;STB=0.504482;STBP=0.837;TYPE=snp;VARB=0.000515959;OID=.;OPOS=29630337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:44:44:1:2:42:42:0.954545:17:25:1:0:17:25:1:1
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chr22	29659960	.	C	T	452.48	PASS	AF=0.916667;AO=31;DP=36;FAO=33;FDP=36;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.145756;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.2123;QD=50.2759;RBI=0.152582;REFB=-0.0411949;REVB=0.045128;RO=3;SAF=14;SAR=17;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0354941;STB=0.520535;STBP=0.482;TYPE=snp;VARB=0.00969894;OID=.;OPOS=29659960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:36:36:3:3:31:33:0.916667:17:14:2:1:19:14:2:1
chr22	29704125	.	C	T	1282.21	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280989;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.98;QD=61.7932;RBI=0.0292775;REFB=0;REVB=0.00822316;RO=0;SAF=36;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.14462e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.93202e-05;OID=.;OPOS=29704125;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:83:0:0:82:83:1:46:36:0:0:46:37:0:0
chr22	29727886	.	T	C	116.0	PASS	AF=1;AO=11;DP=11;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=0;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=211.173;QD=42.1825;RBI=0.0127069;REFB=0;REVB=0.0127069;RO=0;SAF=0;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.73597e-05;OID=.;OPOS=29727886;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:11:11:0:0:11:11:1:11:0:0:0:11:0:0:0
chr22	29885861	.	T	C	56.51	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0445211;FXX=0.142653;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.914;QD=37.6704;RBI=0.0769831;REFB=0;REVB=0.0628034;RO=0;SAF=4;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00423803;OID=.;OPOS=29885861;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:2:4:0:0:2:4:0:0
chr22	29886413	.	A	G	563.75	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0471345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.018;QD=57.8207;RBI=0.0841157;REFB=-0.0549512;REVB=0.0696691;RO=0;SAF=24;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.76123e-08;STB=0.517232;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.008981;OID=.;OPOS=29886413;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:39:0:1:38:38:0.974359:14:24:0:0:14:24:0:1
chr22	29886893	.	G	T	283.49	PASS	AF=0.956522;AO=21;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=8;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0125692;FXX=0.0416493;HRUN=2;LEN=1;MLLD=210.058;QD=49.3021;RBI=0.0125718;REFB=0.00456764;REVB=0.000255444;RO=1;SAF=7;SAR=14;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0614156;STB=0.529385;STBP=0.28;TYPE=snp;VARB=-0.000279327;OID=.;OPOS=29886893;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:21:22:0.956522:14:7:1:0:14:8:1:0
chr22	29904519	.	T	C	362.65	PASS	AF=0.528571;AO=36;DP=70;FAO=37;FDP=70;FR=.;FRO=33;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=25;FSRR=8;FWDB=0.00884988;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.107;QD=20.7231;RBI=0.0385744;REFB=-0.024707;REVB=0.0375455;RO=32;SAF=17;SAR=19;SRF=25;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.260782;STB=0.638227;STBP=0.025;TYPE=snp;VARB=0.0130365;OID=.;OPOS=29904519;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:70:32:33:36:37:0.528571:19:17:25:7:20:17:25:8
chr22	29908072	.	C	T	871.86	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00449498;FXX=0.0163908;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.107;QD=58.1243;RBI=0.00982946;REFB=0;REVB=-0.00874147;RO=0;SAF=26;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.00587e-05;OID=.;OPOS=29908072;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:60:0:0:60:60:1:34:26:0:0:34:26:0:0
chr22	29913272	.	C	T	803.42	PASS	AF=0.982759;AO=57;DP=58;FAO=57;FDP=58;FR=.;FRO=1;FSAF=28;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0312173;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.77;QD=55.4083;RBI=0.0312862;REFB=0.0327632;REVB=-0.00207443;RO=1;SAF=28;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.016546;STB=0.508769;STBP=0.557;TYPE=snp;VARB=-0.000145319;OID=.;OPOS=29913272;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:58:58:1:1:57:57:0.982759:29:28:1:0:29:28:1:0
chr22	29925221	.	C	T	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0109657;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.614;QD=59.6793;RBI=0.0123683;REFB=0;REVB=0.00572083;RO=0;SAF=36;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.47421e-05;OID=.;OPOS=29925221;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:34:36:0:0:34:36:0:0
chr22	29951982	.	AGGGGGAC	AGGGGAC,AGGGGACG,AGGGGGACG	37.44	PASS	AF=0,0.0384615,0.115385;AO=7,3,6;DP=51;FAO=0,2,6;FDP=52;FR=.;FRO=44;FSAF=0,2,5;FSAR=0,0,1;FSRF=27;FSRR=17;FWDB=-0.0544281,-0.0417401,-0.0385601;FXX=0;HRUN=5,5,0;LEN=1,3,1;MLLD=12.151,154.938,149.272;QD=2.87997;RBI=0.134139,0.0640167,0.0556417;REFB=-0.00975206,-0.00279549,-0.00139214;REVB=-0.122601,-0.0485377,-0.0401138;RO=32;SAF=4,3,5;SAR=3,0,1;SRF=19;SRR=13;SSEN=0,0,0;SSEP=0.355556,0,0;SSSB=-0.0275699,0.501025,0.332144;STB=0.5,0.993765,0.736809;STBP=1,0.204,0.27;TYPE=del,mnp,ins;VARB=0,0.148911,0.102907;OID=.,.,.;OPOS=29951983,29951987,29951990;OREF=G,GAC,-;OALT=-,ACG,G;OMAPALT=AGGGGAC,AGGGGACG,AGGGGGACG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/3:0,0.0384615,0.115385:7,3,6:51:0,2,6:52:44:0,2,5:0,0,1:27:17:25:32:4,3,5:3,0,1:19:13
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chr22	30421961	.	TCCCCCT	TCCCCT,TCCCCTC	49.52	PASS	AF=0.235294,0.0470588;AO=23,11;DP=88;FAO=20,4;FDP=85;FR=.;FRO=61;FSAF=17,4;FSAR=3,0;FSRF=24;FSRR=37;FWDB=-0.106774,-0.0676041;FXX=0.034087;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=11.6972,100.05;QD=2.33055;RBI=0.10903,0.0692495;REFB=-0.140327,-0.0119315;REVB=-0.0220643,-0.0150057;RO=43;SAF=17,11;SAR=6,0;SRF=9;SRR=34;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.548178,0.820256;STB=0.846475,0.997853;STBP=0.002,0.01;TYPE=del,mnp;VARB=0.120227,0.200515;OID=.,.;OPOS=30421962,30421966;OREF=C,CT;OALT=-,TC;OMAPALT=TCCCCT,TCCCCTC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.235294,0.0470588:23,11:88:20,4:85:61:17,4:3,0:24:37:40:43:17,11:6,0:9:34
chr22	30681257	.	C	G	180.94	PASS	AF=1;AO=9;DP=16;FAO=15;FDP=15;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0491023;FXX=0.062461;HRUN=1;LEN=1;MLLD=282.521;QD=48.2499;RBI=0.102085;REFB=0;REVB=0.0895004;RO=0;SAF=7;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000762478;OID=.;OPOS=30681257;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:16:15:0:0:9:15:1:2:7:0:0:5:10:0:0
chr22	30691732	.	C	G	66.56	PASS	AF=0.174603;AO=10;DP=63;FAO=11;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=49;FSAF=9;FSAR=2;FSRF=30;FSRR=19;FWDB=0.0342801;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=28.7878;QD=4.22605;RBI=0.0468494;REFB=-0.0301455;REVB=0.0319334;RO=41;SAF=8;SAR=2;SRF=26;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.247602;STB=0.70744;STBP=0.172;TYPE=snp;VARB=0.0728633;OID=.;OPOS=30691732;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:63:63:41:49:10:11:0.174603:2:8:26:15:2:9:30:19
chr22	30714684	.	A	C	587.09	PASS	AF=1;AO=21;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0192503;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.818;QD=61.7993;RBI=0.180369;REFB=0;REVB=0.179339;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000572729;OID=.;OPOS=30714684;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:21:38:1:7:14:0:0:24:14:0:0
chr22	30770603	.	T	A	1304.48	PASS	AF=0.988235;AO=84;DP=85;FAO=84;FDP=85;FR=.;FRO=1;FSAF=35;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.00350895;FXX=0.0449388;HRUN=4;LEN=1;MLLD=266.087;QD=61.3873;RBI=0.0035126;REFB=0.0207434;REVB=0.000159919;RO=1;SAF=35;SAR=49;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00956961;STB=0.505049;STBP=0.507;TYPE=snp;VARB=0.000399564;OID=.;OPOS=30770603;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:85:1:1:84:84:0.988235:49:35:0:1:49:35:0:1
chr22	30771554	.	T	G	1153.38	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0197332;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.513;QD=60.7039;RBI=0.102847;REFB=0;REVB=-0.100937;RO=0;SAF=45;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000125362;OID=.;OPOS=30771554;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:31:45:0:0:31:45:0:0
chr22	30772686	.	C	T	473.85	PASS	AF=0.918919;AO=34;DP=37;FAO=34;FDP=37;FR=.;FRO=3;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=-0.00171353;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=75.9964;QD=51.2266;RBI=0.0159049;REFB=-0.0531025;REVB=0.0158123;RO=3;SAF=22;SAR=12;SRF=1;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0510379;STB=0.527381;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00266972;OID=.;OPOS=30772686;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:37:37:3:3:34:34:0.918919:12:22:1:2:12:22:1:2
chr22	30782089	.	A	G	801.26	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000831676;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.1817;QD=57.2326;RBI=0.0303969;REFB=0;REVB=-0.0303855;RO=0;SAF=27;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000306768;OID=.;OPOS=30782089;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:29:27:0:0:29:27:0:0
chr22	30793137	.	G	A	379.4	PASS	AF=0.878788;AO=29;DP=33;FAO=29;FDP=33;FR=.;FRO=4;FSAF=1;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0298594;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=49.0599;QD=45.9877;RBI=0.0806575;REFB=-0.0321542;REVB=0.0749269;RO=4;SAF=1;SAR=28;SRF=1;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.26156;STB=0.643553;STBP=0.109;TYPE=snp;VARB=0.0226572;OID=.;OPOS=30793137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:19:33:33:4:4:29:29:0.878788:28:1:1:3:28:1:1:3
chr22	30819758	.	G	A	1456.36	PASS	AF=0.989362;AO=92;DP=93;FAO=93;FDP=94;FR=.;FRO=1;FSAF=57;FSAR=36;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0406713;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=56.8972;QD=61.9726;RBI=0.10508;REFB=-0.0316865;REVB=-0.0968896;RO=1;SAF=56;SAR=36;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00839106;STB=0.504347;STBP=0.497;TYPE=snp;VARB=-0.000451943;OID=.;OPOS=30819758;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:93:94:1:1:92:93:0.989362:36:56:1:0:36:57:1:0
chr22	30823196	.	T	C	984.96	PASS	AF=1;AO=63;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=32;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0465945;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.316;QD=58.8036;RBI=0.0492659;REFB=0;REVB=0.0160024;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000208233;OID=.;OPOS=30823196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:63:67:1:35:28:0:0:35:32:0:0
chr22	30857373	.	A	C	854.75	PASS	AF=1;AO=59;DP=60;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0364516;FXX=0.0166639;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.912;QD=57.9492;RBI=0.0494342;REFB=0;REVB=0.0333919;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.22292e-05;OID=.;OPOS=30857373;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:59:0:0:59:59:1:31:28:0:0:31:28:0:0
chr22	30857448	.	A	G	613.14	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0204403;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=195.943;QD=61.3138;RBI=0.0299859;REFB=0;REVB=0.0219396;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000124841;OID=.;OPOS=30857448;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr22	30860830	.	C	T	501.63	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.8032;QD=59.0155;RBI=0.0672231;REFB=0;REVB=-0.0594822;RO=0;SAF=15;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.40663e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000482927;OID=.;OPOS=30860830;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:19:15:0:0:19:15:0:0
chr22	30862400	.	T	A	754.12	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00909298;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.075;QD=62.8434;RBI=0.013452;REFB=0;REVB=-0.00991326;RO=0;SAF=26;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.71771e-05;OID=.;OPOS=30862400;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:48:0:0:47:48:1:21:26:0:0:21:27:0:0
chr22	30863040	.	C	T	198.33	PASS	AF=0.4;AO=24;DP=60;FAO=24;FDP=60;FR=.;FRO=36;FSAF=10;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=16;FWDB=0.00391285;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.6848;QD=13.2222;RBI=0.00525827;REFB=-0.0100648;REVB=-0.0035127;RO=35;SAF=10;SAR=14;SRF=19;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.131069;STB=0.583264;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.0119053;OID=.;OPOS=30863040;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:60:60:35:36:24:24:0.4:14:10:19:16:14:10:20:16
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chr22	30927975	.	C	T	294.85	PASS	AF=1;AO=22;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.109985;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=44.1471;QD=51.2775;RBI=0.145236;REFB=0;REVB=0.094852;RO=0;SAF=9;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00543141;OID=.;OPOS=30927975;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:22:23:1:13:9:0:0:13:10:0:0
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chr22	31333631	.	T	C	307.5	PASS	AF=0.368421;AO=35;DP=95;FAO=35;FDP=95;FR=.;FRO=60;FSAF=16;FSAR=19;FSRF=37;FSRR=23;FWDB=-0.0122781;FXX=0.0206164;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.2151;QD=12.9473;RBI=0.022927;REFB=-0.00133804;REVB=-0.0193622;RO=55;SAF=16;SAR=19;SRF=32;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.13307;STB=0.599706;STBP=0.146;TYPE=snp;VARB=0.00242315;OID=.;OPOS=31333631;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:95:55:60:35:35:0.368421:19:16:32:23:19:16:37:23
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chr22	31663842	.	C	G	582.36	PASS	AF=0.975;AO=39;DP=40;FAO=39;FDP=40;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0233109;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=159.764;QD=58.2362;RBI=0.0419874;REFB=-0.0304495;REVB=0.0349219;RO=1;SAF=17;SAR=22;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0267753;STB=0.514278;STBP=0.314;TYPE=snp;VARB=0.00128421;OID=.;OPOS=31663842;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:40:40:1:1:39:39:0.975:22:17:1:0:22:17:1:0
chr22	31673111	.	A	G	154.95	PASS	AF=0.404762;AO=17;DP=42;FAO=17;FDP=42;FR=.;FRO=25;FSAF=6;FSAR=11;FSRF=7;FSRR=18;FWDB=-0.0213792;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.407;QD=14.7575;RBI=0.0237278;REFB=-0.00331126;REVB=0.0102927;RO=23;SAF=6;SAR=11;SRF=6;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.104704;STB=0.54884;STBP=0.649;TYPE=snp;VARB=0.00348595;OID=.;OPOS=31673111;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:23:25:17:17:0.404762:11:6:6:17:11:6:7:18
chr22	31673116	.	A	G	133.45	PASS	AF=0.441176;AO=15;DP=34;FAO=15;FDP=34;FR=.;FRO=19;FSAF=4;FSAR=11;FSRF=6;FSRR=13;FWDB=-0.0201627;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.502;QD=15.7005;RBI=0.0204317;REFB=-0.0207961;REVB=0.00330466;RO=19;SAF=4;SAR=11;SRF=6;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0586033;STB=0.533934;STBP=0.757;TYPE=snp;VARB=0.0213078;OID=.;OPOS=31673116;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:34:34:19:19:15:15:0.441176:11:4:6:13:11:4:6:13
chr22	31679110	.	G	C,GC	757.16	PASS	AF=0.0185185,0.981481;AO=44,8;DP=54;FAO=1,53;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=1,27;FSAR=0,26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.016463,0.0168574;FXX=0;HRUN=2,0;LEN=1,1;MLLD=120.939,140.896;QD=56.0858;RBI=0.316036,0.0574566;REFB=0,0;REVB=-0.315607,0.054928;RO=2;SAF=24,4;SAR=20,4;SRF=0;SRR=2;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0446823,0.175673;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,ins;VARB=0.0310681,0.000534366;OID=.,.;OPOS=31679110,31679111;OREF=G,-;OALT=C,C;OMAPALT=C,GC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:54:54:2:0:44,8:1,53:0.0185185,0.981481:20,4:24,4:0:2:0,26:1,27:0:0
chr22	31685256	.	C	G	170.3	PASS	AF=0.45;AO=18;DP=40;FAO=18;FDP=40;FR=.;FRO=22;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=15;FSRR=7;FWDB=-0.00555479;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.458;QD=17.0302;RBI=0.0326957;REFB=-0.0263791;REVB=0.0322204;RO=22;SAF=9;SAR=9;SRF=15;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.175572;STB=0.599893;STBP=0.264;TYPE=snp;VARB=0.0302929;OID=.;OPOS=31685256;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:22:22:18:18:0.45:9:9:15:7:9:9:15:7
chr22	31722886	.	T	G	84.36	PASS	AF=0.526316;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=19;FR=.;FRO=9;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=3;FSRR=6;FWDB=0.0101003;FXX=0.049975;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.0327;QD=17.7592;RBI=0.0101417;REFB=-0.00209441;REVB=0.000915393;RO=9;SAF=7;SAR=3;SRF=3;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304629;STB=0.677057;STBP=0.158;TYPE=snp;VARB=0.0054799;OID=.;OPOS=31722886;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:68:20:19:9:9:10:10:0.526316:3:7:3:6:3:7:3:6
chr22	31723034	.	AG	A	142.35	PASS	AF=1;AO=8;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0310019;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=7.16361;QD=19.6342;RBI=0.289973;REFB=0.0307301;REVB=0.288311;RO=3;SAF=1;SAR=7;SRF=0;SRR=3;SSEN=0.30137;SSEP=0;SSSB=0.156255;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.03028;OID=.;OPOS=31723035;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=A	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:1:8:27:29:29:0:4:25:0:0:3:3:1:7:0:3
chr22	31744072	.	G	A	62.69	PASS	AF=0.290323;AO=9;DP=31;FAO=9;FDP=31;FR=.;FRO=22;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=16;FSRR=6;FWDB=-0.0155822;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=303.593;QD=8.08966;RBI=0.0185048;REFB=-0.0045186;REVB=0.00998114;RO=22;SAF=4;SAR=5;SRF=16;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.319852;STB=0.694061;STBP=0.203;TYPE=snp;VARB=0.0210035;OID=.;OPOS=31744072;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:62:31:31:22:22:9:9:0.290323:5:4:16:6:5:4:16:6
chr22	31859859	.	A	G	401.38	PASS	AF=0.6;AO=38;DP=62;FAO=39;FDP=65;FR=.;FRO=26;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=11;FSRR=15;FWDB=-0.00472973;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=119.755;QD=24.7005;RBI=0.0614183;REFB=-0.016586;REVB=-0.0612359;RO=24;SAF=24;SAR=14;SRF=11;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126563;STB=0.589863;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00943073;OID=.;OPOS=31859859;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:65:24:26:38:39:0.6:14:24:11:13:14:25:11:15
chr22	31971258	.	T	C	723.75	PASS	AF=1;AO=43;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00729088;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.3078;QD=59.0819;RBI=0.211302;REFB=0;REVB=0.211177;RO=4;SAF=33;SAR=10;SRF=0;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155359;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00427995;OID=.;OPOS=31971258;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:49:49:4:0:43:49:1:10:33:0:4:15:34:0:0
chr22	32011225	.	T	C	100.84	PASS	AF=0.444444;AO=9;DP=27;FAO=12;FDP=27;FR=.,HEALED;FRO=15;FSAF=9;FSAR=3;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.14672;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.3164;QD=14.9395;RBI=0.201468;REFB=-0.00721845;REVB=-0.138067;RO=11;SAF=7;SAR=2;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.403938;STB=0.638051;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=-0.00412184;OID=.;OPOS=32011225;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:27:27:11:15:9:12:0.444444:2:7:4:7:3:9:8:7
chr22	32015450	.	T	G	192.81	PASS	AF=0.423077;AO=22;DP=52;FAO=22;FDP=52;FR=.;FRO=30;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=18;FSRR=12;FWDB=-0.0225584;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7689;QD=14.8312;RBI=0.0230046;REFB=-0.0138814;REVB=-0.00450915;RO=30;SAF=14;SAR=8;SRF=18;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0390982;STB=0.522367;STBP=0.827;TYPE=snp;VARB=0.0240265;OID=.;OPOS=32015450;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:30:30:22:22:0.423077:8:14:18:12:8:14:18:12
chr22	32110163	.	G	A	273.36	PASS	AF=0.52;AO=25;DP=49;FAO=26;FDP=50;FR=.;FRO=24;FSAF=16;FSAR=10;FSRF=14;FSRR=10;FWDB=-0.0128663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=82.6659;QD=21.8686;RBI=0.0534426;REFB=-0.0123013;REVB=-0.0518707;RO=24;SAF=15;SAR=10;SRF=14;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.015115;STB=0.516117;STBP=0.846;TYPE=snp;VARB=0.0116148;OID=.;OPOS=32110163;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:49:50:24:24:25:26:0.52:10:15:14:10:10:16:14:10
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chr22	32174124	.	C	T	125.55	PASS	AF=0.319149;AO=15;DP=47;FAO=15;FDP=47;FR=.;FRO=32;FSAF=11;FSAR=4;FSRF=23;FSRR=9;FWDB=-0.0529248;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.52;QD=10.685;RBI=0.0535229;REFB=-0.00374991;REVB=0.0079792;RO=32;SAF=11;SAR=4;SRF=23;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0209488;STB=0.512528;STBP=0.913;TYPE=snp;VARB=0.0127369;OID=.;OPOS=32174124;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:47:47:32:32:15:15:0.319149:4:11:23:9:4:11:23:9
chr22	32211371	.	CT	TC	53.15	PASS	AF=1;AO=2;DP=39;FAO=11;FDP=11;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=11;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0953416;FXX=0.214133;HRUN=1;LEN=2;MLLD=19.2849;QD=19.3268;RBI=0.0953416;REFB=0;REVB=-7.68644e-11;RO=27;SAF=2;SAR=0;SRF=21;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.375613;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0199364;OID=.;OPOS=32211371;OREF=CT;OALT=TC;OMAPALT=TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:39:11:27:0:2:11:1:0:2:21:6:0:11:0:0
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chr22	32754306	.	T	C	471.03	PASS	AF=0.440678;AO=52;DP=118;FAO=52;FDP=118;FR=.;FRO=66;FSAF=32;FSAR=20;FSRF=28;FSRR=38;FWDB=0.0533572;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.314;QD=15.9672;RBI=0.0571884;REFB=-0.0178497;REVB=-0.0205795;RO=65;SAF=32;SAR=20;SRF=28;SRR=37;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.18448;STB=0.607288;STBP=0.051;TYPE=snp;VARB=0.0365321;OID=.;OPOS=32754306;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:118:65:66:52:52:0.440678:20:32:28:37:20:32:28:38
chr22	32756407	.	A	G	419.35	PASS	AF=0.452632;AO=43;DP=94;FAO=43;FDP=95;FR=.;FRO=52;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=28;FSRR=24;FWDB=-0.0338179;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=106.682;QD=17.6568;RBI=0.0846059;REFB=-0.0145882;REVB=-0.0775532;RO=50;SAF=22;SAR=21;SRF=28;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.046659;STB=0.514699;STBP=0.817;TYPE=snp;VARB=0.0261183;OID=.;OPOS=32756407;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:94:95:50:52:43:43:0.452632:21:22:28:22:21:22:28:24
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chr22	32909251	.	G	A	501.66	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140828;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.227;QD=59.0186;RBI=0.0174026;REFB=0;REVB=0.0102237;RO=0;SAF=21;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127399;OID=.;OPOS=32909251;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:13:21:0:0:13:21:0:0
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chr22	35463162	.	A	G	1096.37	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0174339;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=233.99;QD=60.0753;RBI=0.0327273;REFB=0;REVB=0.0276971;RO=0;SAF=41;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.21646e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.27496e-05;OID=.;OPOS=35463162;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:73:0:0:71:73:1:30:41:0:0:30:43:0:0
chr22	35463179	.	T	C	1172.0	PASS	AF=1;AO=77;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0275586;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=93.1034;QD=60.883;RBI=0.0278355;REFB=0;REVB=-0.00391666;RO=0;SAF=46;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.64555e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000144853;OID=.;OPOS=35463179;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:77:77:1:31:46:0:0:31:46:0:0
chr22	35463249	.	C	T	1200.58	PASS	AF=0.952941;AO=81;DP=85;FAO=81;FDP=85;FR=.;FRO=4;FSAF=49;FSAR=32;FSRF=2;FSRR=2;FWDB=0.0129388;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=201.671;QD=56.4981;RBI=0.0273535;REFB=0.0229443;REVB=0.0240999;RO=4;SAF=49;SAR=32;SRF=2;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00974591;STB=0.505153;STBP=0.669;TYPE=snp;VARB=-0.000121566;OID=.;OPOS=35463249;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:85:85:4:4:81:81:0.952941:32:49:2:2:32:49:2:2
chr22	35679951	.	T	C	920.09	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0373823;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=130.59;QD=58.4184;RBI=0.0634799;REFB=0;REVB=-0.0513055;RO=0;SAF=31;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.61057e-05;OID=.;OPOS=35679951;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:32:31:0:0:32:31:0:0
chr22	35777185	.	G	C	165.02	PASS	AF=0.382979;AO=17;DP=46;FAO=18;FDP=47;FR=.;FRO=29;FSAF=12;FSAR=6;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=-0.00834262;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=164.394;QD=14.0443;RBI=0.0359234;REFB=-0.0250842;REVB=0.0349412;RO=29;SAF=11;SAR=6;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.181259;STB=0.617513;STBP=0.217;TYPE=snp;VARB=0.0261768;OID=.;OPOS=35777185;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:29:29:17:18:0.382979:6:11:14:15:6:12:14:15
chr22	35813772	.	CGC	GCG,GGC	221.82	PASS	AF=0,0.44898;AO=2,17;DP=46;FAO=0,22;FDP=49;FR=.;FRO=27;FSAF=0,11;FSAR=0,11;FSRF=7;FSRR=20;FWDB=0.0282285,0.00137686;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=3,1;MLLD=112.629,207.075;QD=18.1077;RBI=0.0352468,0.0196641;REFB=-0.0366382,-0.036932;REVB=-0.0211066,0.0196159;RO=26;SAF=0,11;SAR=2,6;SRF=7;SRR=19;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.394221,0.37911;STB=0.5,0.632541;STBP=1,0.118;TYPE=mnp,snp;VARB=0,0.0434181;OID=.,.;OPOS=35813772,35813772;OREF=CGC,C;OALT=GCG,G;OMAPALT=GCG,GGC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:46:49:26:27:2,17:0,22:0,0.44898:2,6:0,11:7:19:0,11:0,11:7:20
chr22	35817553	.	C	T	265.03	PASS	AF=0.422535;AO=26;DP=67;FAO=30;FDP=71;FR=.;FRO=41;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=33;FSRR=8;FWDB=-0.0224246;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=220.417;QD=14.9315;RBI=0.0840021;REFB=-0.0367433;REVB=0.0809536;RO=36;SAF=17;SAR=9;SRF=28;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.14808;STB=0.645396;STBP=0.082;TYPE=snp;VARB=0.0503925;OID=.;OPOS=35817553;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:71:36:41:26:30:0.422535:9:17:28:8:13:17:33:8
chr22	36007045	.	G	A	957.81	PASS	AF=0.957143;AO=67;DP=71;FAO=67;FDP=70;FR=.;FRO=3;FSAF=29;FSAR=38;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0302629;FXX=0.0140825;HRUN=2;LEN=1;MLLD=149.256;QD=54.7319;RBI=0.0703862;REFB=-0.00535407;REVB=0.0635482;RO=3;SAF=29;SAR=38;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0464069;STB=0.524583;STBP=0.077;TYPE=snp;VARB=0.00044428;OID=.;OPOS=36007045;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:71:70:3:3:67:67:0.957143:38:29:3:0:38:29:3:0
chr22	36007075	.	C	T	918.96	PASS	AF=1;AO=63;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0432037;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8427;QD=58.3466;RBI=0.0478545;REFB=0;REVB=-0.0205788;RO=0;SAF=28;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000481164;OID=.;OPOS=36007075;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:63:63:1:35:28:0:0:35:28:0:0
chr22	36122517	.	T	C	135.8	PASS	AF=0.483871;AO=15;DP=31;FAO=15;FDP=31;FR=.;FRO=16;FSAF=12;FSAR=3;FSRF=9;FSRR=7;FWDB=0.0174942;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=275.031;QD=17.5231;RBI=0.0364025;REFB=-0.00738086;REVB=-0.0319233;RO=16;SAF=12;SAR=3;SRF=9;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.268023;STB=0.655507;STBP=0.13;TYPE=snp;VARB=0.0091075;OID=.;OPOS=36122517;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:31:31:16:16:15:15:0.483871:3:12:9:7:3:12:9:7
chr22	36122930	.	C	T	497.41	PASS	AF=0.5;AO=52;DP=105;FAO=52;FDP=104;FR=.;FRO=52;FSAF=30;FSAR=22;FSRF=25;FSRR=27;FWDB=0.00806753;FXX=0.0095229;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.616;QD=19.1313;RBI=0.0277108;REFB=-0.0174256;REVB=-0.0265104;RO=52;SAF=30;SAR=22;SRF=25;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0876277;STB=0.548489;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0124723;OID=.;OPOS=36122930;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:105:104:52:52:52:52:0.5:22:30:25:27:22:30:25:27
chr22	36123083	.	C	T	51.67	PASS	AF=0.228571;AO=8;DP=35;FAO=8;FDP=35;FR=.;FRO=27;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=25;FSRR=2;FWDB=-0.0029838;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.349;QD=5.90496;RBI=0.0176408;REFB=-0.00332667;REVB=0.0173866;RO=27;SAF=3;SAR=5;SRF=25;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.634267;STB=0.86905;STBP=0.177;TYPE=snp;VARB=0.0109322;OID=.;OPOS=36123083;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:51:35:35:27:27:8:8:0.228571:5:3:25:2:5:3:25:2
chr22	36124860	.	C	G	246.77	PASS	AF=0.451613;AO=28;DP=62;FAO=28;FDP=62;FR=.;FRO=34;FSAF=13;FSAR=15;FSRF=16;FSRR=18;FWDB=-0.0209447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.719;QD=15.9203;RBI=0.0275147;REFB=-0.0104697;REVB=-0.0178432;RO=33;SAF=13;SAR=15;SRF=16;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0197961;STB=0.50347;STBP=0.974;TYPE=snp;VARB=0.00843043;OID=.;OPOS=36124860;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:62:62:33:34:28:28:0.451613:15:13:16:17:15:13:16:18
chr22	36537500	.	A	T	155.86	PASS	AF=0.551724;AO=16;DP=30;FAO=16;FDP=29;FR=.;FRO=13;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=8;FWDB=-0.0408315;FXX=0.0333222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=229.717;QD=21.4983;RBI=0.0434745;REFB=-0.0116197;REVB=-0.0149273;RO=13;SAF=9;SAR=7;SRF=5;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.140495;STB=0.5793;STBP=0.386;TYPE=snp;VARB=0.0125938;OID=.;OPOS=36537500;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:30:29:13:13:16:16:0.551724:7:9:5:8:7:9:5:8
chr22	36545137	.	A	T	729.0	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00689209;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.737;QD=57.1767;RBI=0.0164502;REFB=0;REVB=0.0149368;RO=0;SAF=28;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.97956e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.16906e-05;OID=.;OPOS=36545137;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:51:0:0:51:51:1:23:28:0:0:23:28:0:0
chr22	36556823	.	G	T	1066.66	PASS	AF=1;AO=71;DP=72;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0283679;FXX=0.013887;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.1973;QD=60.0933;RBI=0.0454247;REFB=0;REVB=0.0354777;RO=0;SAF=37;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12261e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000154349;OID=.;OPOS=36556823;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:72:71:0:0:71:71:1:34:37:0:0:34:37:0:0
chr22	36573945	.	A	G	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0302968;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=80.6982;QD=57.2018;RBI=0.0512667;REFB=0;REVB=0.0413568;RO=0;SAF=23;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000134356;OID=.;OPOS=36573945;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:7:23:0:0:7:23:0:0
chr22	36575664	.	G	A	1898.93	PASS	AF=0.992;AO=123;DP=124;FAO=124;FDP=125;FR=.;FRO=1;FSAF=56;FSAR=68;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00616789;FXX=0.00793588;HRUN=2;LEN=1;MLLD=178.802;QD=60.7658;RBI=0.00833108;REFB=-0.0708418;REVB=0.00560037;RO=1;SAF=56;SAR=67;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00840822;STB=0.504424;STBP=0.309;TYPE=snp;VARB=0.000200298;OID=.;OPOS=36575664;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:124:125:1:1:123:124:0.992:67:56:1:0:68:56:1:0
chr22	36587202	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.020784;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.161;QD=52.6132;RBI=0.0464309;REFB=0;REVB=0.0415193;RO=0;SAF=15;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.79751e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000235739;OID=.;OPOS=36587202;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:7:15:0:0:7:15:0:0
chr22	36587223	.	G	T	207.92	PASS	AF=1;AO=13;DP=19;FAO=17;FDP=17;FR=.,HEALED,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0154673;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=307.369;QD=48.9233;RBI=0.0422272;REFB=0;REVB=0.0392925;RO=0;SAF=10;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000332101;OID=.;OPOS=36587223;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:17:0:0:13:17:1:3:10:0:0:7:10:0:0
chr22	36587279	.	A	G	612.97	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0436361;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=78.3984;QD=61.2966;RBI=0.0471716;REFB=0;REVB=-0.017918;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00046012;OID=.;OPOS=36587279;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
chr22	36587486	.	A	G	1477.17	PASS	AF=0.96;AO=96;DP=100;FAO=96;FDP=100;FR=.;FRO=4;FSAF=36;FSAR=60;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.00862593;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=56.2838;QD=59.0866;RBI=0.0177278;REFB=-0.094371;REVB=0.0154877;RO=3;SAF=36;SAR=60;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177788;STB=0.51587;STBP=0.142;TYPE=snp;VARB=0.00255016;OID=.;OPOS=36587486;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:100:100:3:4:96:96:0.96:60:36:2:1:60:36:3:1
chr22	36587511	.	C	T	1342.99	PASS	AF=1;AO=85;DP=87;FAO=86;FDP=86;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0333837;FXX=0.0114929;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7231;QD=62.4649;RBI=0.0366703;REFB=0;REVB=-0.0151735;RO=0;SAF=37;SAR=48;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.11403e-05;OID=.;OPOS=36587511;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:86:0:0:85:86:1:48:37:0:0:49:37:0:0
chr22	36587845	.	A	ACT,T	231.38	PASS	AF=0.62963,0.148148;AO=17,3;DP=26;FAO=17,4;FDP=27;FR=.;FRO=6;FSAF=6,4;FSAR=11,0;FSRF=5;FSRR=1;FWDB=-0.00043857,-0.0139994;FXX=0;HRUN=1,3;LEN=2,1;MLLD=294.223,189.208;QD=34.2784;RBI=0.00613986,0.0144987;REFB=-0.0140825,-0.0208755;REVB=0.00612418,0.00377224;RO=6;SAF=6,3;SAR=11,0;SRF=5;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.229195,0.606014;STB=0.626792,0.995436;STBP=0.059,0.319;TYPE=ins,snp;VARB=0.00812597,0.00978411;OID=.,.;OPOS=36587846,36587845;OREF=-,A;OALT=CT,T;OMAPALT=ACT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:39:26:27:6:6:17,3:17,4:0.62963,0.148148:11,0:6,3:5:1:11,0:6,4:5:1
chr22	36587952	.	C	T	130.44	PASS	AF=1;AO=12;DP=12;FAO=12;FDP=12;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.110616;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.354;QD=43.4798;RBI=0.116986;REFB=0;REVB=-0.0380755;RO=0;SAF=5;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00758399;OID=.;OPOS=36587952;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:12:12:0:0:12:12:1:7:5:0:0:7:5:0:0
chr22	36591380	.	A	G	724.8	PASS	AF=0.959184;AO=47;DP=49;FAO=47;FDP=49;FR=.;FRO=2;FSAF=19;FSAR=28;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0315566;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=158.244;QD=59.1677;RBI=0.0492225;REFB=-0.190617;REVB=0.0377762;RO=1;SAF=19;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.024107;STB=0.524989;STBP=0.161;TYPE=snp;VARB=0.00166858;OID=.;OPOS=36591380;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:49:49:1:2:47:47:0.959184:28:19:1:0:28:19:2:0
chr22	36598049	.	C	G	414.89	PASS	AF=0.967742;AO=29;DP=30;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.118029;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=51.9786;QD=53.5344;RBI=0.122756;REFB=-0.0513882;REVB=0.0337383;RO=0;SAF=20;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526298;STBP=0.187;TYPE=snp;VARB=0.00525382;OID=.;OPOS=36598049;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:31:0:1:29:30:0.967742:9:20:0:0:9:21:0:1
chr22	36598058	.	T	C	435.38	PASS	AF=0.969697;AO=25;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0534447;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=98.0666;QD=52.7728;RBI=0.0565802;REFB=-0.0408331;REVB=-0.0185739;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.511621;STBP=0.611;TYPE=snp;VARB=0.0059032;OID=.;OPOS=36598058;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:33:33:0:1:25:32:0.969697:9:16:0:0:11:21:1:0
chr22	36623731	.	T	C	993.76	PASS	AF=1;AO=66;DP=66;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00140368;FXX=0.0147037;HRUN=1;LEN=1;MLLD=215.801;QD=59.3291;RBI=0.0375081;REFB=0;REVB=0.0374819;RO=0;SAF=35;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.769e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.78221e-05;OID=.;OPOS=36623731;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:67:0:0:66:67:1:31:35:0:0:32:35:0:0
chr22	36661330	.	G	A	1283.27	PASS	AF=1;AO=83;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0460465;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.487;QD=61.8444;RBI=0.0507608;REFB=0;REVB=-0.0213631;RO=0;SAF=36;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.51183e-05;OID=.;OPOS=36661330;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:83:83:1:47:36:0:0:47:36:0:0
chr22	36661536	.	C	A	657.76	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0019469;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.4023;QD=59.7965;RBI=0.00494145;REFB=-0.0698106;REVB=-0.00454175;RO=1;SAF=16;SAR=27;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0170778;STB=0.509087;STBP=0.51;TYPE=snp;VARB=0.00473478;OID=.;OPOS=36661536;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:27:16:0:1:27:16:0:1
chr22	36661566	.	G	A	676.78	PASS	AF=0.977778;AO=44;DP=45;FAO=44;FDP=45;FR=.;FRO=1;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0433832;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.447;QD=60.1581;RBI=0.0440111;REFB=-0.0869455;REVB=0.00740783;RO=1;SAF=16;SAR=28;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0164853;STB=0.508768;STBP=0.529;TYPE=snp;VARB=0.00212907;OID=.;OPOS=36661566;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:45:45:1:1:44:44:0.977778:28:16:0:1:28:16:0:1
chr22	36661646	.	G	A	587.29	PASS	AF=0.952381;AO=39;DP=41;FAO=40;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0235026;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=51.5836;QD=55.9321;RBI=0.065092;REFB=-0.126766;REVB=0.0607009;RO=2;SAF=17;SAR=22;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0407263;STB=0.521728;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.00838359;OID=.;OPOS=36661646;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:42:2:2:39:40:0.952381:22:17:0:2:22:18:0:2
chr22	36661842	.	G	A	334.33	PASS	AF=0.896552;AO=26;DP=29;FAO=26;FDP=29;FR=.;FRO=3;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0194633;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=283.866;QD=46.1146;RBI=0.0591069;REFB=-0.130596;REVB=0.0558104;RO=1;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0371368;STB=0.513359;STBP=0.705;TYPE=snp;VARB=0.00161551;OID=.;OPOS=36661842;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:29:29:1:3:26:26:0.896552:12:14:0:1:12:14:2:1
chr22	36678389	.	G	A	240.71	PASS	AF=0.490909;AO=22;DP=56;FAO=27;FDP=55;FR=.,HEALED;FRO=28;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=15;FSRR=13;FWDB=-0.0319203;FXX=0.017854;HRUN=5;LEN=1;MLLD=51.8252;QD=17.5063;RBI=0.0411362;REFB=-0.00553656;REVB=-0.0259476;RO=22;SAF=11;SAR=11;SRF=12;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0403423;STB=0.546524;STBP=0.502;TYPE=snp;VARB=-0.00515247;OID=.;OPOS=36678389;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:56:55:22:28:22:27:0.490909:11:11:12:10:15:12:15:13
chr22	36684331	.	C	T	142.62	PASS	AF=0.4;AO=16;DP=40;FAO=16;FDP=40;FR=.;FRO=24;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=3;FSRR=21;FWDB=0.012601;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=213.635;QD=14.2621;RBI=0.0182458;REFB=-0.0248366;REVB=-0.0131956;RO=24;SAF=5;SAR=11;SRF=3;SRR=21;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.255871;STB=0.645011;STBP=0.235;TYPE=snp;VARB=0.0274705;OID=.;OPOS=36684331;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:40:40:24:24:16:16:0.4:11:5:3:21:11:5:3:21
chr22	36691607	.	A	C	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133941;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=165.354;QD=56.7057;RBI=0.0165566;REFB=0;REVB=-0.00973237;RO=0;SAF=18;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.12878e-05;OID=.;OPOS=36691607;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:11:18:0:0:11:18:0:0
chr22	36897427	.	T	C	553.65	PASS	AF=0.479339;AO=58;DP=121;FAO=58;FDP=121;FR=.;FRO=63;FSAF=22;FSAR=36;FSRF=27;FSRR=36;FWDB=-0.00562426;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6157;QD=18.3024;RBI=0.025248;REFB=0.0056884;REVB=0.0246136;RO=63;SAF=22;SAR=36;SRF=27;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0484365;STB=0.526872;STBP=0.595;TYPE=snp;VARB=-0.00337317;OID=.;OPOS=36897427;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:63:63:58:58:0.479339:36:22:27:36:36:22:27:36
chr22	36900271	.	T	C	648.28	PASS	AF=0.471429;AO=66;DP=140;FAO=66;FDP=140;FR=.;FRO=74;FSAF=30;FSAR=36;FSRF=38;FSRR=36;FWDB=-0.00416921;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=162.059;QD=18.5224;RBI=0.0126099;REFB=-0.017671;REVB=-0.0119007;RO=74;SAF=30;SAR=36;SRF=38;SRR=36;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0563584;STB=0.531241;STBP=0.466;TYPE=snp;VARB=0.0261229;OID=.;OPOS=36900271;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:140:140:74:74:66:66:0.471429:36:30:38:36:36:30:38:36
chr22	36900806	.	A	G	159.8	PASS	AF=0.666667;AO=16;DP=24;FAO=16;FDP=24;FR=.;FRO=8;FSAF=8;FSAR=8;FSRF=4;FSRR=4;FWDB=-0.0113904;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=58.7441;QD=26.6332;RBI=0.0599986;REFB=0.0180378;REVB=-0.0589075;RO=8;SAF=8;SAR=8;SRF=4;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0122963;OID=.;OPOS=36900806;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:8:8:16:16:0.666667:8:8:4:4:8:8:4:4
chr22	37163865	.	G	A	752.32	PASS	AF=0.503268;AO=76;DP=153;FAO=77;FDP=153;FR=.;FRO=76;FSAF=42;FSAR=35;FSRF=43;FSRR=33;FWDB=0.0129546;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.656;QD=19.6685;RBI=0.021163;REFB=-0.0317847;REVB=0.0167347;RO=76;SAF=42;SAR=34;SRF=43;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0120963;STB=0.510201;STBP=0.802;TYPE=snp;VARB=0.024864;OID=.;OPOS=37163865;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:153:153:76:76:76:77:0.503268:34:42:43:33:35:42:43:33
chr22	37196971	.	C	A	145.36	PASS	AF=0.4375;AO=10;DP=32;FAO=14;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=16;FSAF=5;FSAR=9;FSRF=5;FSRR=11;FWDB=-0.0126434;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.221;QD=18.1702;RBI=0.0515337;REFB=-0.022832;REVB=0.0499587;RO=14;SAF=5;SAR=5;SRF=3;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.286058;STB=0.526279;STBP=0.849;TYPE=snp;VARB=0.0335857;OID=.;OPOS=37196971;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:32:32:14:16:10:14:0.4375:5:5:3:11:9:5:5:11
chr22	37267767	.	A	C,G	600.14	PASS	AF=0.05,0.95;AO=2,38;DP=40;FAO=2,38;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=1,19;FSAR=1,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0197559,0.0110714;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=76.1804,174.708;QD=60.014;RBI=0.0207133,0.0163897;REFB=0,0;REVB=-0.00622466,0.012085;RO=0;SAF=1,19;SAR=1,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.17426,0.00012641;OID=.,.;OPOS=37267767,37267767;OREF=A,A;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:8:40:40:0:0:2,38:2,38:0.05,0.95:1,19:1,19:0:0:1,19:1,19:0:0
chr22	37268257	.	C	T	941.03	PASS	AF=0.984848;AO=65;DP=66;FAO=65;FDP=66;FR=.;FRO=1;FSAF=18;FSAR=47;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0374964;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.663;QD=57.0323;RBI=0.044447;REFB=-0.0133762;REVB=-0.0238652;RO=1;SAF=18;SAR=47;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00994696;STB=0.505262;STBP=0.605;TYPE=snp;VARB=4.3658e-05;OID=.;OPOS=37268257;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:66:66:1:1:65:65:0.984848:47:18:0:1:47:18:0:1
chr22	37271882	.	T	C	557.13	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0281854;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=191.759;QD=60.2304;RBI=0.0911921;REFB=0;REVB=-0.086727;RO=0;SAF=22;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.82408e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000100549;OID=.;OPOS=37271882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:15:22:0:0:15:22:0:0
chr22	37332670	.	GC	CG	113.63	PASS	AF=0.276596;AO=13;DP=47;FAO=13;FDP=47;FR=.,HEALED;FRO=30;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=10;FSRR=20;FWDB=-0.0809771;FXX=0.020829;HRUN=4;LEN=2;MLLD=48.4337;QD=9.67101;RBI=0.0909507;REFB=-0.0185658;REVB=-0.0414095;RO=28;SAF=12;SAR=1;SRF=8;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.710793;STB=0.91905;STBP=0.001;TYPE=mnp;VARB=0.00539418;OID=.;OPOS=37332670;OREF=GC;OALT=CG;OMAPALT=CG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:47:47:28:30:13:13:0.276596:1:12:8:20:1:12:10:20
chr22	37333794	.	A	G	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0122514;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=177.283;QD=55.0976;RBI=0.0125704;REFB=0;REVB=-0.00281379;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.44524e-05;OID=.;OPOS=37333794;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:12:14:0:0:12:14:0:0
chr22	37453452	.	C	T	860.07	PASS	AF=0.968254;AO=61;DP=63;FAO=61;FDP=63;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0847551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.42;QD=54.6077;RBI=0.0897856;REFB=-0.16649;REVB=0.0296313;RO=1;SAF=27;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0171613;STB=0.501844;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00182665;OID=.;OPOS=37453452;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:63:63:1:2:61:61:0.968254:34:27:1:0:34:27:1:1
chr22	37465114	.	G	A	33.49	PASS	AF=0.714286;AO=5;DP=7;FAO=5;FDP=7;FR=.;FRO=2;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.055379;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=130.794;QD=19.1378;RBI=0.0615683;REFB=-0.10285;REVB=0.0269039;RO=2;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0491618;STB=0.529293;STBP=0.911;TYPE=snp;VARB=0.0122617;OID=.;OPOS=37465114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:10:7:7:2:2:5:5:0.714286:2:3:1:1:2:3:1:1
chr22	37485724	.	T	C	1085.5	PASS	AF=0.451362;AO=116;DP=260;FAO=116;FDP=257;FR=.;FRO=141;FSAF=77;FSAR=39;FSRF=71;FSRR=70;FWDB=0.0046063;FXX=0.011538;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.307;QD=16.895;RBI=0.00498193;REFB=-0.00636363;REVB=0.00189779;RO=134;SAF=77;SAR=39;SRF=65;SRR=69;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.180991;STB=0.5925;STBP=0.009;TYPE=snp;VARB=0.0103539;OID=.;OPOS=37485724;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:260:257:134:141:116:116:0.451362:39:77:65:69:39:77:71:70
chr22	37578388	.	C	T	189.14	PASS	AF=0.396552;AO=23;DP=58;FAO=23;FDP=58;FR=.;FRO=35;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.020841;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.85;QD=13.0439;RBI=0.0251437;REFB=-0.0345214;REVB=0.0140661;RO=35;SAF=11;SAR=12;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0378247;STB=0.52172;STBP=0.836;TYPE=snp;VARB=0.0530911;OID=.;OPOS=37578388;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:35:35:23:23:0.396552:12:11:18:17:12:11:18:17
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chr22	37578652	.	G	A	575.57	PASS	AF=0.540541;AO=56;DP=104;FAO=60;FDP=111;FR=.;FRO=51;FSAF=39;FSAR=21;FSRF=34;FSRR=17;FWDB=0.00140534;FXX=0.0263135;HRUN=4;LEN=1;MLLD=119.362;QD=20.7413;RBI=0.0288314;REFB=-0.0322639;REVB=0.0287972;RO=48;SAF=39;SAR=17;SRF=34;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118912;STB=0.508455;STBP=0.884;TYPE=snp;VARB=0.0384697;OID=.;OPOS=37578652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:104:111:48:51:56:60:0.540541:17:39:34:14:21:39:34:17
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chr22	37581485	.	C	A	133.25	PASS	AF=0.384615;AO=13;DP=39;FAO=15;FDP=39;FR=.,HEALED;FRO=24;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=9;FSRR=15;FWDB=-0.0177593;FXX=0.0249938;HRUN=4;LEN=1;MLLD=173.136;QD=13.6671;RBI=0.0371928;REFB=-0.0147541;REVB=-0.0326789;RO=18;SAF=9;SAR=4;SRF=7;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.304843;STB=0.636186;STBP=0.193;TYPE=snp;VARB=0.0242181;OID=.;OPOS=37581485;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:39:39:18:24:13:15:0.384615:4:9:7:11:6:9:9:15
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chr22	38035851	.	A	G	130.23	PASS	AF=0.416667;AO=14;DP=35;FAO=15;FDP=36;FR=.;FRO=21;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=-0.0838103;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=43.2611;QD=14.4699;RBI=0.0955446;REFB=0.0389815;REVB=-0.045876;RO=21;SAF=9;SAR=5;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.221397;STB=0.641318;STBP=0.168;TYPE=snp;VARB=-0.0533578;OID=.;OPOS=38035851;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:35:36:21:21:14:15:0.416667:5:9:9:12:5:10:9:12
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chr22	38615536	.	A	T	203.32	PASS	AF=1;AO=5;DP=17;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031175;FXX=0;HRUN=12;LEN=1;MLLD=152.117;QD=40.6633;RBI=0.103683;REFB=0;REVB=0.0988851;RO=1;SAF=2;SAR=3;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.169284;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00606642;OID=.;OPOS=38615536;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:17:20:1:0:5:20:1:3:2:1:0:11:9:0:0
chr22	38823136	.	T	C	409.65	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0093752;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.7446;QD=56.5033;RBI=0.0151719;REFB=0;REVB=0.0119286;RO=0;SAF=12;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.9174e-05;OID=.;OPOS=38823136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:16:12:0:0:16:13:0:0
chr22	38877461	.	T	G	313.88	PASS	AF=0.367347;AO=35;DP=98;FAO=36;FDP=98;FR=.;FRO=62;FSAF=16;FSAR=20;FSRF=22;FSRR=40;FWDB=-0.0260368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.237;QD=12.8115;RBI=0.0261287;REFB=-0.0220791;REVB=-0.00218946;RO=63;SAF=15;SAR=20;SRF=23;SRR=40;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0734897;STB=0.558108;STBP=0.433;TYPE=snp;VARB=0.0330317;OID=.;OPOS=38877461;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:98:98:63:62:35:36:0.367347:20:15:23:40:20:16:22:40
chr22	38993370	.	C	T	493.06	PASS	AF=0.439024;AO=54;DP=123;FAO=54;FDP=123;FR=.;FRO=69;FSAF=17;FSAR=37;FSRF=34;FSRR=35;FWDB=0.0101927;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=267.827;QD=16.0344;RBI=0.0102116;REFB=-0.00597018;REVB=0.000622099;RO=69;SAF=17;SAR=37;SRF=34;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.189784;STB=0.606516;STBP=0.038;TYPE=snp;VARB=0.00599476;OID=.;OPOS=38993370;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:69:69:54:54:0.439024:37:17:34:35:37:17:34:35
chr22	39069181	.	T	C	333.71	PASS	AF=0.557377;AO=34;DP=61;FAO=34;FDP=61;FR=.;FRO=27;FSAF=22;FSAR=12;FSRF=14;FSRR=13;FWDB=-3.64397e-05;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=245.503;QD=21.8825;RBI=0.0206387;REFB=-0.00561717;REVB=0.0206387;RO=27;SAF=22;SAR=12;SRF=14;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108506;STB=0.560045;STBP=0.333;TYPE=snp;VARB=0.00377196;OID=.;OPOS=39069181;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:61:61:27:27:34:34:0.557377:12:22:14:13:12:22:14:13
chr22	39079964	.	T	C	108.87	PASS	AF=0.541667;AO=12;DP=24;FAO=13;FDP=24;FR=.;FRO=11;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=3;FSRR=8;FWDB=0.0383874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.709;QD=18.1452;RBI=0.0443125;REFB=-0.019796;REVB=-0.022136;RO=11;SAF=5;SAR=7;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0457974;STB=0.588105;STBP=0.393;TYPE=snp;VARB=0.0191742;OID=.;OPOS=39079964;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:89:24:24:11:11:12:13:0.541667:7:5:4:7:7:6:3:8
chr22	39130843	.	C	G	213.05	PASS	AF=0.5;AO=21;DP=41;FAO=21;FDP=42;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=9;FSRF=11;FSRR=10;FWDB=-0.00728339;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=205.196;QD=20.2905;RBI=0.00769008;REFB=-0.0134711;REVB=-0.00246773;RO=20;SAF=12;SAR=9;SRF=11;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.018883;STB=0.524115;STBP=0.743;TYPE=snp;VARB=0.0135947;OID=.;OPOS=39130843;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:42:20:21:21:21:0.5:9:12:11:9:9:12:11:10
chr22	39134715	.	T	C	63.65	PASS	AF=0.180328;AO=10;DP=55;FAO=11;FDP=61;FR=.;FRO=50;FSAF=10;FSAR=1;FSRF=37;FSRR=13;FWDB=-0.0305415;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=47.8789;QD=4.1739;RBI=0.0549208;REFB=-0.0124582;REVB=-0.0456455;RO=45;SAF=10;SAR=0;SRF=36;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.644326;STB=0.74809;STBP=0.147;TYPE=snp;VARB=0.0247552;OID=.;OPOS=39134715;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:55:61:45:50:10:11:0.180328:0:10:36:9:1:10:37:13
chr22	39178701	.	A	G	613.1	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.10654;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.7724;QD=61.3103;RBI=0.110676;REFB=0;REVB=0.0299729;RO=0;SAF=20;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.3303e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00108083;OID=.;OPOS=39178701;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:40:0:0:39:40:1:19:20:0:0:20:20:0:0
chr22	39222652	.	G	A	1497.96	PASS	AF=1;AO=94;DP=97;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=56;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00284016;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.0477;QD=61.7715;RBI=0.0273432;REFB=-0.119995;REVB=0.0271953;RO=1;SAF=55;SAR=39;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.012002;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00464132;OID=.;OPOS=39222652;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:97:97:1:0:94:97:1:39:55:0:1:41:56:0:0
chr22	39358104	.	A	G	49.25	PASS	AF=0.106195;AO=12;DP=114;FAO=12;FDP=113;FR=.;FRO=101;FSAF=5;FSAR=7;FSRF=67;FSRR=34;FWDB=-0.0297582;FXX=0.00877116;HRUN=2;LEN=1;MLLD=70.8462;QD=1.74319;RBI=0.0323351;REFB=-0.00222381;REVB=-0.0126493;RO=97;SAF=5;SAR=7;SRF=66;SRR=31;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.315676;STB=0.71055;STBP=0.182;TYPE=snp;VARB=0.0452533;OID=.;OPOS=39358104;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:49:114:113:97:101:12:12:0.106195:7:5:66:31:7:5:67:34
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chr22	39381826	.	A	G	785.88	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00512331;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=245.063;QD=64.1538;RBI=0.0157475;REFB=0;REVB=0.0148907;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.43518e-05;OID=.;OPOS=39381826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:49:49:1:25:24:0:0:25:24:0:0
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chr22	39445554	.	G	A	785.06	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0212454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.3212;QD=57.0956;RBI=0.0226623;REFB=0;REVB=-0.00788764;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000172587;OID=.;OPOS=39445554;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0
chr22	39477123	.	T	C	371.95	PASS	AF=0.62069;AO=36;DP=58;FAO=36;FDP=58;FR=.;FRO=22;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=7;FSRR=15;FWDB=-0.0985694;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=142.072;QD=25.6518;RBI=0.0998727;REFB=0.0172625;REVB=0.0160817;RO=21;SAF=17;SAR=19;SRF=7;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0944875;STB=0.558962;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=-0.00830527;OID=.;OPOS=39477123;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:58:58:21:22:36:36:0.62069:19:17:7:14:19:17:7:15
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chr22	39709009	.	G	A	286.16	PASS	AF=0.484375;AO=31;DP=64;FAO=31;FDP=64;FR=.;FRO=33;FSAF=13;FSAR=18;FSRF=22;FSRR=11;FWDB=0.023497;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=222.679;QD=17.885;RBI=0.024352;REFB=-0.0354629;REVB=0.00639599;RO=31;SAF=13;SAR=18;SRF=20;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.200409;STB=0.625541;STBP=0.054;TYPE=snp;VARB=0.0336485;OID=.;OPOS=39709009;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:64:64:31:33:31:31:0.484375:18:13:20:11:18:13:22:11
chr22	39712981	.	A	G	821.52	PASS	AF=0.983051;AO=58;DP=59;FAO=58;FDP=59;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0552931;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=273.308;QD=55.6964;RBI=0.0558578;REFB=-0.148766;REVB=0.00792296;RO=0;SAF=30;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508769;STBP=0.338;TYPE=snp;VARB=0.000285827;OID=.;OPOS=39712981;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:59:59:0:1:58:58:0.983051:28:30:0:0:28:30:0:1
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chr22	40574169	.	TTAA	AAAT,AATA,TAAA,TTAAA	336.18	PASS	AF=0,0,0.925926,0.0740741;AO=2,2,13,4;DP=28;FAO=0,0,25,2;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,7,1;FSAR=0,0,18,1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142047,-0.0906642,0.113093,0.153145;FXX=0.0357015;HRUN=8,8,8,2;LEN=4,3,1,1;MLLD=59.9582,172.788,24.0531,16.6905;QD=49.8038;RBI=0.0146203,0.0911153,0.133503,0.157095;REFB=0,0,0,0;REVB=0.00346118,0.00905575,0.0709446,-0.0350064;RO=0;SAF=0,2,2,0;SAR=2,0,11,4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0,0;SSEP=0,0,0,0;SSSB=0,0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1,1;TYPE=mnp,mnp,snp,ins;VARB=0,0,0.0228127,0.0930846;OID=.,.,.,.;OPOS=40574169,40574169,40574170,40574171;OREF=TTAA,TTA,T,-;OALT=AAAT,AAT,A,A;OMAPALT=AAAT,AATA,TAAA,TTAAA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	3/4:8:28:27:0:0:2,2,13,4:0,0,25,2:0,0,0.925926,0.0740741:2,0,11,4:0,2,2,0:0:0:0,0,18,1:0,0,7,1:0:0
chr22	40661916	.	C	A	54.09	PASS	AF=0.333333;AO=8;DP=24;FAO=8;FDP=24;FR=.;FRO=16;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=11;FSRR=5;FWDB=0.0385156;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.8002;QD=9.01567;RBI=0.0756162;REFB=-0.0217258;REVB=-0.065072;RO=16;SAF=2;SAR=6;SRF=11;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.458431;STB=0.779333;STBP=0.073;TYPE=snp;VARB=0.0667488;OID=.;OPOS=40661916;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:24:24:16:16:8:8:0.333333:6:2:11:5:6:2:11:5
chr22	40673999	.	C	T	732.88	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0381875;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=37.2198;QD=56.3753;RBI=0.0419244;REFB=0;REVB=0.0173022;RO=0;SAF=33;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000682598;OID=.;OPOS=40673999;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:52:0:0:47:52:1:14:33:0:0:15:37:0:0
chr22	40697319	.	A	G	164.12	PASS	AF=0.372549;AO=19;DP=51;FAO=19;FDP=51;FR=.;FRO=32;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=19;FSRR=13;FWDB=-0.0154512;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=92.1919;QD=12.8718;RBI=0.0217392;REFB=-0.011547;REVB=0.0152922;RO=32;SAF=8;SAR=11;SRF=19;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.184798;STB=0.60725;STBP=0.269;TYPE=snp;VARB=0.0165676;OID=.;OPOS=40697319;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:51:51:32:32:19:19:0.372549:11:8:19:13:11:8:19:13
chr22	40720704	.	A	G	2273.14	PASS	AF=0.973333;AO=145;DP=149;FAO=146;FDP=150;FR=.;FRO=4;FSAF=77;FSAR=69;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=-0.0355492;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=57.6396;QD=60.6171;RBI=0.0517291;REFB=-0.0131527;REVB=-0.0375787;RO=4;SAF=76;SAR=69;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0243681;STB=0.512657;STBP=0.067;TYPE=snp;VARB=0.00172137;OID=.;OPOS=40720704;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:149:150:4:4:145:146:0.973333:69:76:4:0:69:77:4:0
chr22	40722293	.	A	G	269.29	PASS	AF=0.380952;AO=31;DP=83;FAO=32;FDP=84;FR=.;FRO=52;FSAF=8;FSAR=24;FSRF=13;FSRR=39;FWDB=0.0374735;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=53.3481;QD=12.8232;RBI=0.0523274;REFB=0.0100168;REVB=0.0365225;RO=52;SAF=8;SAR=23;SRF=13;SRR=39;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115788;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0134929;OID=.;OPOS=40722293;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:83:84:52:52:31:32:0.380952:23:8:13:39:24:8:13:39
chr22	40722745	.	A	G	400.13	PASS	AF=0.966667;AO=29;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=15;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0456313;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=221.079;QD=53.3504;RBI=0.0593836;REFB=0.0593694;REVB=0.0380026;RO=0;SAF=14;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92057e-08;STB=0.517229;STBP=0.548;TYPE=snp;VARB=-0.000139185;OID=.;OPOS=40722745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:0:1:29:29:0.966667:15:14:0:0:15:14:1:0
chr22	40819586	.	T	C	71.65	PASS	AF=0.6;AO=9;DP=15;FAO=9;FDP=15;FR=.;FRO=6;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=3;FWDB=0.012632;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.0979;QD=19.1073;RBI=0.0330873;REFB=-0.0087718;REVB=-0.0305811;RO=6;SAF=3;SAR=6;SRF=3;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.122922;STB=0.571265;STBP=0.578;TYPE=snp;VARB=0.0108881;OID=.;OPOS=40819586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:15:15:6:6:9:9:0.6:6:3:3:3:6:3:3:3
chr22	41075543	.	A	G	175.67	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0229117;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.7123;QD=46.846;RBI=0.0913718;REFB=0;REVB=-0.0884526;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00445966;OID=.;OPOS=41075543;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:5:9:0:0:5:10:0:0
chr22	41075695	.	C	T	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0264954;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.737;QD=55.0981;RBI=0.0341894;REFB=0;REVB=0.0216081;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185391;OID=.;OPOS=41075695;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0
chr22	41313134	.	ACC	ACCTA,AC	38.12	PASS	AF=0.4,0;AO=5,2;DP=15;FAO=6,0;FDP=15;FR=.;FRO=9;FSAF=4,0;FSAR=2,0;FSRF=8;FSRR=1;FWDB=-0.0254919,-0.2487;FXX=0;HRUN=1,2;LEN=2,1;MLLD=217.832,22.5694;QD=10.1648;RBI=0.0518161,0.249052;REFB=-0.0453598,-0.0778065;REVB=0.0451117,0.0132293;RO=4;SAF=4,2;SAR=1,0;SRF=3;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.0543107,0.569412;STB=0.66622,0.5;STBP=0.437,1;TYPE=ins,del;VARB=0.061846,0;OID=.,.;OPOS=41313137,41313135;OREF=-,C;OALT=TA,-;OMAPALT=ACCTA,AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.4,0:5,2:15:6,0:15:9:4,0:2,0:8:1:38:4:4,2:1,0:3:1
chr22	41551039	.	T	A	827.59	PASS	AF=0.885714;AO=60;DP=68;FAO=62;FDP=70;FR=.;FRO=8;FSAF=27;FSAR=35;FSRF=8;FSRR=0;FWDB=-0.00036735;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=195.271;QD=47.2907;RBI=0.00934541;REFB=-0.214915;REVB=-0.00933818;RO=7;SAF=26;SAR=34;SRF=7;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.111478;STB=0.564495;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.00340291;OID=.;OPOS=41551039;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:25:68:70:7:8:60:62:0.885714:34:26:7:0:35:27:8:0
chr22	41573260	.	TC	T	42.78	PASS	AF=0.533333;AO=5;DP=15;FAO=8;FDP=15;FR=.;FRO=7;FSAF=7;FSAR=1;FSRF=3;FSRR=4;FWDB=-0.0112972;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.9039;QD=11.4087;RBI=0.29154;REFB=-0.091591;REVB=0.291321;RO=7;SAF=4;SAR=1;SRF=3;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.378245;STB=0.776953;STBP=0.058;TYPE=del;VARB=0.124897;OID=.;OPOS=41573261;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.533333:5:15:8:15:7:7:1:3:4:26:7:4:1:3:4
chr22	41604399	.	G	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0057665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.299;QD=39.2065;RBI=0.0723835;REFB=0;REVB=-0.0721534;RO=0;SAF=4;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00188605;OID=.;OPOS=41604399;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:5:4:0:0:5:4:0:0
chr22	41617318	.	G	C	162.9	PASS	AF=0.261364;AO=23;DP=88;FAO=23;FDP=88;FR=.;FRO=65;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=32;FSRR=33;FWDB=-0.0269848;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.475;QD=7.40442;RBI=0.0349226;REFB=-0.0222157;REVB=-0.0221676;RO=65;SAF=19;SAR=4;SRF=32;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.448228;STB=0.774823;STBP=0.005;TYPE=snp;VARB=0.0476694;OID=.;OPOS=41617318;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:88:65:65:23:23:0.261364:4:19:32:33:4:19:32:33
chr22	41625704	.	G	A	611.23	PASS	AF=0.435374;AO=64;DP=147;FAO=64;FDP=147;FR=.;FRO=83;FSAF=38;FSAR=26;FSRF=41;FSRR=42;FWDB=0.0099975;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.3313;QD=16.632;RBI=0.0104913;REFB=-0.010058;REVB=-0.00318068;RO=83;SAF=38;SAR=26;SRF=41;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102198;STB=0.557119;STBP=0.25;TYPE=snp;VARB=0.0141179;OID=.;OPOS=41625704;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:147:147:83:83:64:64:0.435374:26:38:41:42:26:38:41:42
chr22	41632647	.	G	A	44.79	PASS	AF=0.291667;AO=7;DP=24;FAO=7;FDP=24;FR=.;FRO=17;FSAF=0;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=17;FWDB=0;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.6835;QD=7.46527;RBI=0.0165194;REFB=0.0326295;REVB=0.0165194;RO=17;SAF=0;SAR=7;SRF=0;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0694087;OID=.;OPOS=41632647;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:44:24:24:17:17:7:7:0.291667:7:0:0:17:7:0:0:17
chr22	41635614	.	A	AG	30.98	PASS	AF=0.170732;AO=12;DP=86;FAO=14;FDP=82;FR=.;FRO=68;FSAF=11;FSAR=3;FSRF=38;FSRR=30;FWDB=-0.0328657;FXX=0.0238067;HRUN=1;LEN=1;MLLD=16.3952;QD=1.51146;RBI=0.117526;REFB=-0.0391754;REVB=-0.112838;RO=74;SAF=12;SAR=0;SRF=39;SRR=35;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.681962;STB=0.711437;STBP=0.121;TYPE=ins;VARB=0.080378;OID=.;OPOS=41635615;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.170732:12:86:14:82:68:11:3:38:30:30:74:12:0:39:35
chr22	41829794	.	C	G	483.34	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00805226;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=256.201;QD=58.5871;RBI=0.0111437;REFB=0;REVB=-0.00770341;RO=0;SAF=15;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.64315e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.49671e-07;OID=.;OPOS=41829794;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:18:15:0:0:18:15:0:0
chr22	41833116	.	C	T	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0140182;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.087;QD=53.911;RBI=0.0375242;REFB=0;REVB=0.0348074;RO=0;SAF=17;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184106;OID=.;OPOS=41833116;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:7:17:0:0:7:17:0:0
chr22	41903813	.	A	C	506.14	PASS	AF=0.505155;AO=47;DP=95;FAO=49;FDP=97;FR=.;FRO=48;FSAF=27;FSAR=22;FSRF=29;FSRR=19;FWDB=-0.00978558;FXX=0.010203;HRUN=1;LEN=1;MLLD=287.347;QD=20.8718;RBI=0.0140761;REFB=-0.0241777;REVB=-0.0101182;RO=48;SAF=27;SAR=20;SRF=29;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0278143;STB=0.52671;STBP=0.615;TYPE=snp;VARB=0.0235995;OID=.;OPOS=41903813;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:95:97:48:48:47:49:0.505155:20:27:29:19:22:27:29:19
chr22	41911525	.	C	T	79.36	PASS	AF=0.5;AO=10;DP=20;FAO=10;FDP=20;FR=.;FRO=10;FSAF=6;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=3;FWDB=-0.0455646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.424;QD=15.872;RBI=0.049549;REFB=-0.00481185;REVB=-0.0194672;RO=10;SAF=6;SAR=4;SRF=7;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0916023;STB=0.553088;STBP=0.695;TYPE=snp;VARB=0.00935605;OID=.;OPOS=41911525;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:76:20:20:10:10:10:10:0.5:4:6:7:3:4:6:7:3
chr22	42089623	.	T	C	984.2	PASS	AF=1;AO=65;DP=66;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0111251;FXX=0.0144907;HRUN=1;LEN=1;MLLD=176.629;QD=57.894;RBI=0.0148854;REFB=0;REVB=-0.00988972;RO=0;SAF=38;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04073e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000956169;OID=.;OPOS=42089623;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:66:68:0:0:65:68:1:27:38:0:0:29:39:0:0
chr22	42159229	.	G	T	669.95	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0344894;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.8241;QD=62.3205;RBI=0.0555203;REFB=0;REVB=0.0435085;RO=0;SAF=19;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00011049;OID=.;OPOS=42159229;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:24:19:0:0:24:19:0:0
chr22	42336172	.	G	A	112.15	PASS	AF=0.283019;AO=15;DP=53;FAO=15;FDP=53;FR=.;FRO=38;FSAF=8;FSAR=7;FSRF=15;FSRR=23;FWDB=0.0177882;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.345;QD=8.46436;RBI=0.0262147;REFB=-0.01246;REVB=-0.019256;RO=38;SAF=8;SAR=7;SRF=15;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.163044;STB=0.598376;STBP=0.411;TYPE=snp;VARB=0.0288416;OID=.;OPOS=42336172;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:53:53:38:38:15:15:0.283019:7:8:15:23:7:8:15:23
chr22	42416056	.	A	G	1026.37	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0506812;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.62;QD=59.4996;RBI=0.050683;REFB=0;REVB=-0.000429174;RO=0;SAF=35;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.43163e-05;OID=.;OPOS=42416056;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:68:69:1:33:35:0:0:34:35:0:0
chr22	42423110	.	G	C	538.53	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190909;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.256;QD=59.8362;RBI=0.0445439;REFB=0;REVB=-0.0402454;RO=0;SAF=19;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000109962;OID=.;OPOS=42423110;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:17:19:0:0:17:19:0:0
chr22	42428727	.	A	T	1719.73	PASS	AF=0.991453;AO=114;DP=116;FAO=116;FDP=117;FR=.;FRO=1;FSAF=58;FSAR=58;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0484392;FXX=0.00847386;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.8046;QD=58.7942;RBI=0.0673315;REFB=-0.106012;REVB=0.0467673;RO=2;SAF=56;SAR=58;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0166547;STB=0.504273;STBP=0.5;TYPE=snp;VARB=0.00288737;OID=.;OPOS=42428727;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:116:117:2:1:114:116:0.991453:58:56:2:0:58:58:1:0
chr22	42463814	.	C	T	787.45	PASS	AF=1;AO=55;DP=56;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0161567;FXX=0.017854;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.896;QD=57.2694;RBI=0.0186624;REFB=0;REVB=0.00934047;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.88196e-05;OID=.;OPOS=42463814;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:55:0:0:55:55:1:29:26:0:0:29:26:0:0
chr22	42473603	.	C	T	354.73	PASS	AF=0.553846;AO=35;DP=65;FAO=36;FDP=65;FR=.;FRO=29;FSAF=23;FSAR=13;FSRF=20;FSRR=9;FWDB=-0.00833407;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.744;QD=21.8295;RBI=0.0131971;REFB=-0.0317131;REVB=-0.0102326;RO=29;SAF=23;SAR=12;SRF=20;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0298976;STB=0.524869;STBP=0.721;TYPE=snp;VARB=0.0308501;OID=.;OPOS=42473603;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:29:29:35:36:0.553846:12:23:20:9:13:23:20:9
chr22	42522613	.	G	C	123.98	PASS	AF=0.482759;AO=14;DP=29;FAO=14;FDP=29;FR=.;FRO=15;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.00900768;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=185.059;QD=17.1002;RBI=0.0109666;REFB=-0.0269325;REVB=-0.00625531;RO=15;SAF=7;SAR=7;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0299972;STB=0.517217;STBP=0.881;TYPE=snp;VARB=0.019996;OID=.;OPOS=42522613;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:29:29:15:15:14:14:0.482759:7:7:8:7:7:7:8:7
chr22	42523505	.	C	T	34.18	PASS	AF=0.0582524;AO=18;DP=309;FAO=18;FDP=309;FR=.;FRO=291;FSAF=9;FSAR=9;FSRF=146;FSRR=145;FWDB=0.000838988;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=262.773;QD=0.442453;RBI=0.00216395;REFB=-0.000817863;REVB=0.00199469;RO=289;SAF=9;SAR=9;SRF=145;SRR=144;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0017888;STB=0.501616;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0159918;OID=.;OPOS=42523505;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:309:309:289:291:18:18:0.0582524:9:9:145:144:9:9:146:145
chr22	42523636	.	C	A	85.02	PASS	AF=0.127517;AO=19;DP=149;FAO=19;FDP=149;FR=.;FRO=130;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=67;FSRR=63;FWDB=0.00149275;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=96.4829;QD=2.28249;RBI=0.0159567;REFB=-0.00191365;REVB=-0.0158867;RO=130;SAF=10;SAR=9;SRF=67;SRR=63;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0136518;STB=0.509544;STBP=0.969;TYPE=snp;VARB=0.0327942;OID=.;OPOS=42523636;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:85:149:149:130:130:19:19:0.127517:9:10:67:63:9:10:67:63
chr22	42523943	.	A	G	851.24	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0260654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=149.697;QD=57.7115;RBI=0.0262814;REFB=0;REVB=0.00336254;RO=0;SAF=28;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.4411e-05;OID=.;OPOS=42523943;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:31:28:0:0:31:28:0:0
chr22	42524795	.	A	G	65.29	PASS	AF=0.164706;AO=11;DP=78;FAO=14;FDP=85;FR=.;FRO=71;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=44;FSRR=27;FWDB=-0.0542456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=38.7167;QD=3.07232;RBI=0.0546453;REFB=-0.0328114;REVB=-0.00659719;RO=67;SAF=9;SAR=2;SRF=42;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.282736;STB=0.520766;STBP=0.886;TYPE=snp;VARB=0.0985363;OID=.;OPOS=42524795;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:65:78:85:67:71:11:14:0.164706:2:9:42:25:5:9:44:27
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chr22	42525132	.	G	C	45.47	PASS	AF=0.333333;AO=7;DP=21;FAO=7;FDP=21;FR=.;FRO=14;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=9;FSRR=5;FWDB=-0.0463669;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.726;QD=8.66138;RBI=0.0478798;REFB=-0.0198287;REVB=-0.0119411;RO=13;SAF=6;SAR=1;SRF=8;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.343745;STB=0.70519;STBP=0.291;TYPE=snp;VARB=0.0517276;OID=.;OPOS=42525132;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:21:21:13:14:7:7:0.333333:1:6:8:5:1:6:9:5
chr22	42525756	.	G	A	677.37	PASS	AF=0.670455;AO=49;DP=81;FAO=59;FDP=88;FR=.;FRO=29;FSAF=34;FSAR=25;FSRF=13;FSRR=16;FWDB=0.0133906;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.746;QD=30.7895;RBI=0.120247;REFB=-0.039382;REVB=0.119499;RO=29;SAF=30;SAR=19;SRF=13;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.114497;STB=0.542609;STBP=0.247;TYPE=snp;VARB=0.0124651;OID=.;OPOS=42525756;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:88:29:29:49:59:0.670455:19:30:13:16:25:34:13:16
chr22	42526694	.	G	A	1120.68	PASS	AF=0.641892;AO=93;DP=148;FAO=95;FDP=148;FR=.;FRO=53;FSAF=41;FSAR=54;FSRF=25;FSRR=28;FWDB=0.0477057;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=258.465;QD=30.2888;RBI=0.0479905;REFB=-0.0280388;REVB=0.00522066;RO=48;SAF=41;SAR=52;SRF=21;SRR=27;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00215362;STB=0.51458;STBP=0.628;TYPE=snp;VARB=0.0145163;OID=.;OPOS=42526694;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:148:148:48:53:93:95:0.641892:52:41:21:27:54:41:25:28
chr22	42536313	.	G	A	501.73	PASS	AF=0.681818;AO=45;DP=66;FAO=45;FDP=66;FR=.;FRO=21;FSAF=25;FSAR=20;FSRF=16;FSRR=5;FWDB=0.00474843;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=205.793;QD=30.4077;RBI=0.0485734;REFB=0.000442426;REVB=0.0483407;RO=21;SAF=25;SAR=20;SRF=16;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.124747;STB=0.567445;STBP=0.12;TYPE=snp;VARB=-0.000242626;OID=.;OPOS=42536313;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:21:21:45:45:0.681818:20:25:16:5:20:25:16:5
chr22	42537196	.	T	C	389.54	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=28;FDP=28;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010189;FXX=0.0344709;HRUN=1;LEN=1;MLLD=145.735;QD=55.6487;RBI=0.0260267;REFB=0;REVB=0.0239494;RO=0;SAF=10;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000979738;OID=.;OPOS=42537196;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:28:0:0:27:28:1:17:10:0:0:17:11:0:0
chr22	42537404	.	G	C	689.32	PASS	AF=1;AO=44;DP=44;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0411167;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.6744;QD=62.6653;RBI=0.044196;REFB=0;REVB=-0.0162082;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000355773;OID=.;OPOS=42537404;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:44:44:0:0:44:44:1:21:23:0:0:21:23:0:0
chr22	42537597	.	A	G	327.83	PASS	AF=0.578947;AO=33;DP=57;FAO=33;FDP=57;FR=.;FRO=24;FSAF=24;FSAR=9;FSRF=12;FSRR=12;FWDB=0.0155743;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=139.709;QD=23.0053;RBI=0.0255378;REFB=0.0013082;REVB=-0.0202391;RO=24;SAF=24;SAR=9;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.196084;STB=0.608626;STBP=0.096;TYPE=snp;VARB=-0.00126804;OID=.;OPOS=42537597;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:57:57:24:24:33:33:0.578947:9:24:12:12:9:24:12:12
chr22	42538029	.	A	G	840.18	PASS	AF=1;AO=56;DP=57;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.392;QD=56.012;RBI=0.0194508;REFB=0.00999857;REVB=0.0146374;RO=1;SAF=24;SAR=32;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0145081;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.25488e-05;OID=.;OPOS=42538029;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:57:60:1:0:56:60:1:32:24:0:1:34:26:0:0
chr22	42538508	.	AG	GA	283.4	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=24;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=16;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0127717;FXX=0.0416493;HRUN=1;LEN=2;MLLD=157.634;QD=49.287;RBI=0.0158172;REFB=-0.0319353;REVB=0.00933102;RO=1;SAF=6;SAR=16;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0709088;STB=0.538425;STBP=0.17;TYPE=mnp;VARB=0.00271198;OID=.;OPOS=42538508;OREF=AG;OALT=GA;OMAPALT=GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:24:23:1:1:22:22:0.956522:16:6:1:0:16:6:1:0
chr22	42538514	.	T	TC	221.44	PASS	AF=1;AO=22;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.102918;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=19.463;QD=36.9059;RBI=0.123908;REFB=-0.0111102;REVB=-0.0690001;RO=2;SAF=5;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.152852;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.018057;OID=.;OPOS=42538515;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:22:24:24:24:0:7:17:0:0:3:2:5:17:2:0
chr22	42538618	.	A	G	45.37	PASS	AF=0.304348;AO=6;DP=22;FAO=7;FDP=23;FR=.;FRO=16;FSAF=6;FSAR=1;FSRF=6;FSRR=10;FWDB=0.017691;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=55.1919;QD=7.8899;RBI=0.0420063;REFB=-0.00472428;REVB=-0.0380993;RO=16;SAF=5;SAR=1;SRF=6;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.515236;STB=0.845135;STBP=0.04;TYPE=snp;VARB=0.0127262;OID=.;OPOS=42538618;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:45:22:23:16:16:6:7:0.304348:1:5:6:10:1:6:6:10
chr22	42538669	.	C	T	87.22	PASS	AF=0.423077;AO=11;DP=26;FAO=11;FDP=26;FR=.;FRO=15;FSAF=5;FSAR=6;FSRF=8;FSRR=7;FWDB=-0.0160176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=186.383;QD=13.419;RBI=0.0253504;REFB=-0.0202072;REVB=-0.0196489;RO=15;SAF=5;SAR=6;SRF=8;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0771943;STB=0.545372;STBP=0.746;TYPE=snp;VARB=0.0373292;OID=.;OPOS=42538669;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:87:26:26:15:15:11:11:0.423077:6:5:8:7:6:5:8:7
chr22	42538670	.	G	T	126.86	PASS	AF=0.538462;AO=14;DP=26;FAO=14;FDP=26;FR=.;FRO=12;FSAF=7;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=6;FWDB=0.000335728;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=112.756;QD=19.5174;RBI=0.0127505;REFB=-0.0376219;REVB=0.0127461;RO=9;SAF=7;SAR=7;SRF=5;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0385055;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0385825;OID=.;OPOS=42538670;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:26:26:9:12:14:14:0.538462:7:7:5:4:7:7:6:6
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chr22	42610947	.	TG	T	46.19	PASS	AF=0.431818;AO=7;DP=45;FAO=19;FDP=44;FR=.;FRO=25;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=19;FSRR=6;FWDB=0.0250185;FXX=0.0222173;HRUN=7;LEN=1;MLLD=6.8144;QD=4.19943;RBI=0.0327424;REFB=-0.0951852;REVB=0.0211221;RO=20;SAF=3;SAR=4;SRF=15;SRR=5;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.365795;STB=0.581689;STBP=0.411;TYPE=del;VARB=0.129409;OID=.;OPOS=42610948;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.431818:7:45:19:44:25:12:7:19:6:46:20:3:4:15:5
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chr22	42961214	.	C	T	397.4	PASS	AF=1;AO=26;DP=27;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0268318;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=97.1461;QD=54.8139;RBI=0.0595019;REFB=0;REVB=0.0531087;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0015097;OID=.;OPOS=42961214;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:29:0:0:26:29:1:9:17:0:0:12:17:0:0
chr22	42961277	.	T	C	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0149483;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.71;QD=48.7362;RBI=0.0225231;REFB=0;REVB=0.0168475;RO=0;SAF=13;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.72863e-05;OID=.;OPOS=42961277;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:4:13:0:0:4:13:0:0
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chr22	42970032	.	T	C	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0289637;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.556;QD=54.5175;RBI=0.0457014;REFB=0;REVB=0.0353514;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.89253e-05;OID=.;OPOS=42970032;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:12:13:0:0:12:13:0:0
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chr22	43278220	.	C	T	433.6	PASS	AF=0.621212;AO=41;DP=66;FAO=41;FDP=66;FR=.;FRO=25;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=-0.00170748;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=160.94;QD=26.2785;RBI=0.0250997;REFB=-0.00554942;REVB=-0.0250416;RO=25;SAF=30;SAR=11;SRF=17;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0445398;STB=0.524367;STBP=0.653;TYPE=snp;VARB=0.00362611;OID=.;OPOS=43278220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:66:66:25:25:41:41:0.621212:11:30:17:8:11:30:17:8
chr22	43289473	.	G	A	96.22	PASS	AF=0.25;AO=14;DP=56;FAO=14;FDP=56;FR=.;FRO=42;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=26;FSRR=16;FWDB=-0.0135516;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.925;QD=6.87272;RBI=0.0200571;REFB=-0.0197051;REVB=0.0147866;RO=42;SAF=8;SAR=6;SRF=26;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0596526;STB=0.53679;STBP=0.791;TYPE=snp;VARB=0.0372218;OID=.;OPOS=43289473;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:96:56:56:42:42:14:14:0.25:6:8:26:16:6:8:26:16
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chr22	44223502	.	C	T	457.09	PASS	AF=0.428571;AO=50;DP=118;FAO=51;FDP=119;FR=.;FRO=68;FSAF=28;FSAR=23;FSRF=20;FSRR=48;FWDB=-0.010098;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=144.67;QD=15.3644;RBI=0.0102414;REFB=-0.000477682;REVB=-0.00170807;RO=67;SAF=28;SAR=22;SRF=19;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.27734;STB=0.642897;STBP=0.015;TYPE=snp;VARB=0.000585843;OID=.;OPOS=44223502;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:118:119:67:68:50:51:0.428571:22:28:19:48:23:28:20:48
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chr22	44282307	.	G	A	769.81	PASS	AF=1;AO=48;DP=49;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00411101;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.3602;QD=64.1509;RBI=0.0127898;REFB=0;REVB=0.0121111;RO=0;SAF=31;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90775e-05;OID=.;OPOS=44282307;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:48:0:0:48:48:1:17:31:0:0:17:31:0:0
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chr22	44546582	.	A	G	575.79	PASS	AF=1;AO=38;DP=38;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0137163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=175.701;QD=60.6094;RBI=0.0208122;REFB=0;REVB=0.0156528;RO=0;SAF=18;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000105273;OID=.;OPOS=44546582;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:38:0:0:38:38:1:20:18:0:0:20:18:0:0
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chr22	45277909	.	A	G	785.17	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=180.631;QD=57.1034;RBI=0.0595908;REFB=0;REVB=0.0571743;RO=0;SAF=30;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000184452;OID=.;OPOS=45277909;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:25:30:0:0:25:30:0:0
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chr22	45278187	.	A	T	724.98	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0124718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.461;QD=56.8613;RBI=0.0192352;REFB=0;REVB=0.014644;RO=0;SAF=28;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.25011e-05;OID=.;OPOS=45278187;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:21:28:0:0:22:29:0:0
chr22	45566843	.	A	G	198.04	PASS	AF=0.352113;AO=25;DP=71;FAO=25;FDP=71;FR=.;FRO=46;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=30;FSRR=16;FWDB=0.00680083;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=292.072;QD=11.1572;RBI=0.00946824;REFB=0.00126839;REVB=0.00658759;RO=46;SAF=10;SAR=15;SRF=30;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.275961;STB=0.659218;STBP=0.055;TYPE=snp;VARB=-0.00229197;OID=.;OPOS=45566843;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:71:71:46:46:25:25:0.352113:15:10:30:16:15:10:30:16
chr22	45566912	.	C	A	197.78	PASS	AF=0.425926;AO=23;DP=54;FAO=23;FDP=54;FR=.;FRO=31;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=22;FSRR=9;FWDB=-0.000212378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=304.87;QD=14.6506;RBI=0.00897843;REFB=-0.00536227;REVB=0.00897592;RO=31;SAF=9;SAR=14;SRF=22;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.312271;STB=0.676921;STBP=0.043;TYPE=snp;VARB=0.00997532;OID=.;OPOS=45566912;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:54:54:31:31:23:23:0.425926:14:9:22:9:14:9:22:9
chr22	45577231	.	T	C	42.4	PASS	AF=0.2;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=5;FSAR=2;FSRF=12;FSRR=16;FWDB=0.0167655;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=153.057;QD=4.84572;RBI=0.0190953;REFB=-0.000943604;REVB=-0.00914057;RO=28;SAF=5;SAR=2;SRF=12;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.338253;STB=0.72517;STBP=0.253;TYPE=snp;VARB=0.00500746;OID=.;OPOS=45577231;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:35:35:28:28:7:7:0.2:2:5:12:16:2:5:12:16
chr22	45579396	.	A	G	255.92	PASS	AF=0.432836;AO=29;DP=69;FAO=29;FDP=67;FR=.;FRO=38;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=17;FSRR=21;FWDB=-0.0120965;FXX=0.0289813;HRUN=2;LEN=1;MLLD=132.95;QD=15.2786;RBI=0.0260212;REFB=-0.0022851;REVB=-0.0230386;RO=36;SAF=15;SAR=14;SRF=16;SRR=20;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0713018;STB=0.539541;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.00430951;OID=.;OPOS=45579396;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:69:67:36:38:29:29:0.432836:14:15:16:20:14:15:17:21
chr22	45579422	.	A	G	294.2	PASS	AF=0.477612;AO=32;DP=67;FAO=32;FDP=67;FR=.;FRO=35;FSAF=19;FSAR=13;FSRF=18;FSRR=17;FWDB=0.00576809;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.229;QD=17.5643;RBI=0.0182407;REFB=-0.00716795;REVB=0.0173047;RO=35;SAF=19;SAR=13;SRF=18;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0755152;STB=0.542314;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00567955;OID=.;OPOS=45579422;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:67:67:35:35:32:32:0.477612:13:19:18:17:13:19:18:17
chr22	45580836	.	G	C	344.01	PASS	AF=0.440476;AO=37;DP=84;FAO=37;FDP=84;FR=.;FRO=47;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=25;FSRR=22;FWDB=0.0150538;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=229.05;QD=16.3816;RBI=0.0490243;REFB=-0.00865567;REVB=-0.0466558;RO=47;SAF=21;SAR=16;SRF=25;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0359092;STB=0.520198;STBP=0.74;TYPE=snp;VARB=0.0100202;OID=.;OPOS=45580836;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:84:84:47:47:37:37:0.440476:16:21:25:22:16:21:25:22
chr22	45583740	.	G	C	137.25	PASS	AF=0.484848;AO=15;DP=33;FAO=16;FDP=33;FR=.;FRO=17;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=5;FSRR=12;FWDB=0.0641523;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3408;QD=16.6358;RBI=0.0653883;REFB=-0.0409223;REVB=0.0126532;RO=16;SAF=8;SAR=7;SRF=4;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.253531;STB=0.635525;STBP=0.141;TYPE=snp;VARB=0.0520849;OID=.;OPOS=45583740;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:33:33:16:17:15:16:0.484848:7:8:4:12:7:9:5:12
chr22	45583803	.	A	G	182.99	PASS	AF=0.452381;AO=19;DP=42;FAO=19;FDP=42;FR=.;FRO=23;FSAF=8;FSAR=11;FSRF=9;FSRR=14;FWDB=0.0184508;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.127;QD=17.4271;RBI=0.0185501;REFB=-0.0186772;REVB=0.0019168;RO=22;SAF=8;SAR=11;SRF=9;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0115783;STB=0.516778;STBP=0.841;TYPE=snp;VARB=0.0309847;OID=.;OPOS=45583803;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:42:42:22:23:19:19:0.452381:11:8:9:13:11:8:9:14
chr22	45583898	.	A	G	557.05	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0710541;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=164.08;QD=60.2212;RBI=0.0774464;REFB=0;REVB=0.0308099;RO=0;SAF=14;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000285331;OID=.;OPOS=45583898;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:23:14:0:0:23:14:0:0
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chr22	45683304	.	G	C	223.2	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00240991;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.571;QD=49.5992;RBI=0.00448629;REFB=0;REVB=0.00378407;RO=0;SAF=2;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.90851e-06;OID=.;OPOS=45683304;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:16:2:0:0:16:2:0:0
chr22	45685002	.	A	G	198.71	PASS	AF=0.487805;AO=20;DP=41;FAO=20;FDP=41;FR=.;FRO=21;FSAF=12;FSAR=8;FSRF=9;FSRR=12;FWDB=0.00454038;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=261.306;QD=19.3862;RBI=0.0138834;REFB=-0.0106885;REVB=-0.0131199;RO=21;SAF=12;SAR=8;SRF=9;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.155711;STB=0.588147;STBP=0.336;TYPE=snp;VARB=0.0092685;OID=.;OPOS=45685002;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:41:41:21:21:20:20:0.487805:8:12:9:12:8:12:9:12
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chr22	46759956	.	T	TC	30.75	PASS	AF=0.0795455;AO=30;DP=183;FAO=14;FDP=176;FR=.;FRO=162;FSAF=1;FSAR=13;FSRF=99;FSRR=63;FWDB=-0.131178;FXX=0.0382493;HRUN=0;LEN=1;MLLD=44.4026;QD=0.698861;RBI=0.131251;REFB=-0.00670273;REVB=-0.00437605;RO=139;SAF=7;SAR=23;SRF=87;SRR=52;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.48202;STB=0.94421;STBP=0.001;TYPE=ins;VARB=0.123766;OID=.;OPOS=46759957;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=TC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.0795455:30:183:14:176:162:1:13:99:63:30:139:7:23:87:52
chr22	46929692	.	A	G	1491.47	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=94;FDP=94;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0196009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=113.766;QD=63.4668;RBI=0.024189;REFB=0;REVB=-0.0141744;RO=0;SAF=52;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.90048e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.35758e-05;OID=.;OPOS=46929692;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:94:0:0:93:94:1:41:52:0:0:41:53:0:0
chr22	46931077	.	G	C	670.27	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0190176;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=243.605;QD=62.3508;RBI=0.019026;REFB=0;REVB=0.000566966;RO=0;SAF=24;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75463e-05;OID=.;OPOS=46931077;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:19:24:0:0:19:24:0:0
chr22	46931793	.	G	C	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00636788;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=174.773;QD=55.6561;RBI=0.00641183;REFB=0;REVB=0.000749383;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.5023e-05;OID=.;OPOS=46931793;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr22	46931838	.	G	A	289.37	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029905;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.196;QD=52.6132;RBI=0.0312771;REFB=0;REVB=-0.0091622;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000241193;OID=.;OPOS=46931838;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:9:13:0:0:9:13:0:0
chr22	47058992	.	T	C	3130.57	PASS	AF=0.976526;AO=206;DP=217;FAO=208;FDP=213;FR=.;FRO=5;FSAF=134;FSAR=74;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0184116;FXX=0.0229347;HRUN=3;LEN=1;MLLD=60.1524;QD=58.79;RBI=0.0195454;REFB=-0.0288963;REVB=-0.00656019;RO=6;SAF=133;SAR=73;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00123875;STB=0.501132;STBP=0.856;TYPE=snp;VARB=0.00161847;OID=.;OPOS=47058992;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:217:213:6:5:206:208:0.976526:73:133:4:2:74:134:3:2
chr22	47075462	.	C	T	317.99	PASS	AF=0.426829;AO=35;DP=81;FAO=35;FDP=82;FR=.;FRO=47;FSAF=24;FSAR=11;FSRF=32;FSRR=15;FWDB=0.00266697;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.114;QD=15.5117;RBI=0.0529998;REFB=-0.0223181;REVB=-0.0529326;RO=46;SAF=24;SAR=11;SRF=32;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116685;STB=0.503224;STBP=0.984;TYPE=snp;VARB=0.0428492;OID=.;OPOS=47075462;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:81:82:46:47:35:35:0.426829:11:24:32:14:11:24:32:15
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chr22	47185265	.	G	T	103.51	PASS	AF=0.545455;AO=12;DP=22;FAO=12;FDP=22;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=9;FSRF=8;FSRR=2;FWDB=0.0274761;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.6252;QD=18.8203;RBI=0.0642333;REFB=-0.0115407;REVB=0.0580601;RO=10;SAF=3;SAR=9;SRF=8;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.435938;STB=0.749583;STBP=0.02;TYPE=snp;VARB=0.0110778;OID=.;OPOS=47185265;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:77:22:22:10:10:12:12:0.545455:9:3:8:2:9:3:8:2
chr22	47188703	.	TG	T	42.75	PASS	AF=0.461538;AO=13;DP=27;FAO=12;FDP=26;FR=.;FRO=14;FSAF=2;FSAR=10;FSRF=8;FSRR=6;FWDB=0.131034;FXX=0.0370233;HRUN=5;LEN=1;MLLD=10.9463;QD=6.57626;RBI=0.131387;REFB=-0.10515;REVB=0.00961916;RO=12;SAF=2;SAR=11;SRF=8;SRR=4;SSEN=0.320144;SSEP=0;SSSB=-0.491152;STB=0.757095;STBP=0.038;TYPE=del;VARB=0.152558;OID=.;OPOS=47188704;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.461538:13:27:12:26:14:2:10:8:6:42:12:2:11:8:4
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chr22	47569571	.	G	C	375.52	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0528378;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.6284;QD=55.6326;RBI=0.056191;REFB=0;REVB=0.0191203;RO=0;SAF=16;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000644058;OID=.;OPOS=47569571;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:11:16:0:0:11:16:0:0
chr22	47569605	.	G	C	182.94	PASS	AF=0.941176;AO=15;DP=16;FAO=16;FDP=17;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.17891;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=40.518;QD=43.0446;RBI=0.183577;REFB=-0.141786;REVB=0.0411318;RO=1;SAF=8;SAR=7;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0607183;STB=0.533291;STBP=0.293;TYPE=snp;VARB=0.0199588;OID=.;OPOS=47569605;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:16:17:1:1:15:16:0.941176:7:8:0:1:7:9:0:1
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chr22	48940553	.	T	C,G	1163.1	PASS	AF=0.948718,0.0512821;AO=74,4;DP=78;FAO=74,4;FDP=78;FR=.;FRO=0;FSAF=42,4;FSAR=32,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.036881,0.0470171;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=203.281,160.842;QD=59.646;RBI=0.0392419,0.0486343;REFB=0,0;REVB=0.0134058,0.0124373;RO=0;SAF=42,4;SAR=32,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000158218,0.0914576;OID=.,.;OPOS=48940553,48940553;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:11:78:78:0:0:74,4:74,4:0.948718,0.0512821:32,0:42,4:0:0:32,0:42,4:0:0
chr22	48940644	.	C	T	621.43	PASS	AF=0.548673;AO=61;DP=113;FAO=62;FDP=113;FR=.;FRO=51;FSAF=24;FSAR=38;FSRF=27;FSRR=24;FWDB=-0.00523569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0949;QD=21.9976;RBI=0.011565;REFB=0.00795164;REVB=0.0103119;RO=50;SAF=24;SAR=37;SRF=26;SRR=24;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.106162;STB=0.565653;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=-0.00416343;OID=.;OPOS=48940644;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:113:113:50:51:61:62:0.548673:37:24:26:24:38:24:27:24
chr22	48942315	.	T	G	236.01	PASS	AF=0.295918;AO=23;DP=99;FAO=29;FDP=98;FR=.,HEALED;FRO=67;FSAF=17;FSAR=12;FSRF=58;FSRR=9;FWDB=-0.0600149;FXX=0.0101;HRUN=5;LEN=1;MLLD=37.6483;QD=9.63322;RBI=0.255268;REFB=-0.0190249;REVB=-0.248113;RO=50;SAF=17;SAR=6;SRF=48;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.434365;STB=0.715878;STBP=0.035;TYPE=snp;VARB=0.0242206;OID=.;OPOS=48942315;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:99:98:50:67:23:29:0.295918:6:17:48:2:12:17:58:9
chr22	49246723	.	A	C	616.69	PASS	AF=0.43949;AO=68;DP=162;FAO=69;FDP=157;FR=.,HEALED;FRO=87;FSAF=19;FSAR=50;FSRF=39;FSRR=48;FWDB=-0.140893;FXX=0.0125778;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.366;QD=15.7119;RBI=0.141046;REFB=-0.0249895;REVB=-0.00656084;RO=70;SAF=18;SAR=50;SRF=22;SRR=48;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0566395;STB=0.608954;STBP=0.036;TYPE=snp;VARB=0.0104205;OID=.;OPOS=49246723;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:162:157:70:87:68:69:0.43949:50:18:22:48:50:19:39:48
chr22	49834747	.	C	T	666.06	PASS	AF=0.459459;AO=66;DP=146;FAO=68;FDP=148;FR=.;FRO=80;FSAF=26;FSAR=42;FSRF=37;FSRR=43;FWDB=-0.00291682;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.993;QD=18.0016;RBI=0.0166928;REFB=-0.043166;REVB=0.016436;RO=80;SAF=26;SAR=40;SRF=37;SRR=43;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0694573;STB=0.54488;STBP=0.344;TYPE=snp;VARB=0.0475278;OID=.;OPOS=49834747;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:146:148:80:80:66:68:0.459459:40:26:37:43:42:26:37:43
chr22	50017234	.	A	G	563.68	PASS	AF=0.974359;AO=36;DP=37;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.021274;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=62.5542;QD=57.8138;RBI=0.158443;REFB=-0.117304;REVB=0.157009;RO=1;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0239982;STB=0.511622;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.00387242;OID=.;OPOS=50017234;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:39:1:1:36:38:0.974359:19:17:0:1:21:17:0:1
chr22	50018045	.	GG	AG,GA	264.4	PASS	AF=0.909091,0.0909091;AO=12,2;DP=22;FAO=20,2;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=15,2;FSAR=5,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0100986,-0.0231117;FXX=0;HRUN=4,4;LEN=1,1;MLLD=81.7717,86.316;QD=48.0733;RBI=0.1681,0.105547;REFB=-0.143679,-0.0430966;REVB=0.167796,0.102986;RO=0;SAF=7,2;SAR=5,0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.108505,0.0138115;OID=.,.;OPOS=50018045,50018046;OREF=G,G;OALT=A,A;OMAPALT=AG,GA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:5:22:22:0:0:12,2:20,2:0.909091,0.0909091:5,0:7,2:0:0:5,0:15,2:0:0
chr22	50018069	.	A	G	412.63	PASS	AF=1;AO=25;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.048081;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.56;QD=56.9148;RBI=0.0506383;REFB=0;REVB=0.0158889;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000259038;OID=.;OPOS=50018069;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:25:29:1:8:17:0:0:8:21:0:0
chr22	50018497	.	G	A	2278.84	PASS	AF=0.993464;AO=140;DP=141;FAO=152;FDP=153;FR=.;FRO=1;FSAF=90;FSAR=62;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0407082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.2197;QD=59.5774;RBI=0.0433152;REFB=-0.0368778;REVB=0.0148002;RO=0;SAF=78;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.35543e-08;STB=0.502762;STBP=0.498;TYPE=snp;VARB=0.000322535;OID=.;OPOS=50018497;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:141:153:0:1:140:152:0.993464:62:78:0:0:62:90:1:0
chr22	50277835	.	T	C	237.26	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0372146;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.925;QD=49.9493;RBI=0.0406902;REFB=0;REVB=0.0164548;RO=0;SAF=11;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000647992;OID=.;OPOS=50277835;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:19:0:0:18:19:1:7:11:0:0:7:12:0:0
chr22	50277883	.	A	G	339.74	PASS	AF=1;AO=24;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.12656;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.605;QD=54.3591;RBI=0.126561;REFB=0;REVB=-0.000298117;RO=0;SAF=15;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00103724;OID=.;OPOS=50277883;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:24:25:1:9:15:0:0:9:16:0:0
chr22	50278438	.	A	G	785.15	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0282082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=217.993;QD=57.1015;RBI=0.0282229;REFB=0;REVB=0.000910908;RO=0;SAF=23;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.72004e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.95165e-05;OID=.;OPOS=50278438;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:55:0:0:53:55:1:30:23:0:0:31:24:0:0
chr22	50278568	.	A	G	207.13	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0122607;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.478;QD=48.7369;RBI=0.0137812;REFB=0;REVB=-0.00629274;RO=0;SAF=3;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.53656e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.46276e-05;OID=.;OPOS=50278568;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:14:3:0:0:14:3:0:0
chr22	50278642	.	C	T	156.62	PASS	AF=1;AO=13;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.115093;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.0245;QD=44.7472;RBI=0.11547;REFB=0;REVB=-0.00931844;RO=1;SAF=3;SAR=10;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.128507;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00444962;OID=.;OPOS=50278642;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:1:0:13:14:1:10:3:1:0:10:4:0:0
chr22	50280136	.	T	C	909.58	PASS	AF=0.984375;AO=63;DP=64;FAO=63;FDP=64;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=33;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0330228;FXX=0.0153822;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.882;QD=56.8489;RBI=0.0368296;REFB=-0.0541868;REVB=0.0163068;RO=0;SAF=30;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.000758005;OID=.;OPOS=50280136;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:64:64:0:1:63:63:0.984375:33:30:0:0:33:30:1:0
chr22	50281917	.	A	G	683.0	PASS	AF=0.961538;AO=50;DP=52;FAO=50;FDP=52;FR=.;FRO=2;FSAF=26;FSAR=24;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0190149;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=297.35;QD=52.5382;RBI=0.0190406;REFB=0.0868478;REVB=0.000989459;RO=1;SAF=26;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0177622;STB=0.518511;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.000195462;OID=.;OPOS=50281917;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:52:52:1:2:50:50:0.961538:24:26:1:0:24:26:2:0
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chr22	50356693	.	T	C	1472.38	PASS	AF=1;AO=80;DP=94;FAO=94;FDP=94;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=61;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199971;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.6583;QD=62.6547;RBI=0.043;REFB=0;REVB=0.0380672;RO=0;SAF=51;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.51863e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417457;OID=.;OPOS=50356693;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:94:94:0:0:80:94:1:29:51:0:0:33:61:0:0
chr22	50439194	.	C	T	736.85	PASS	AF=0.979167;AO=28;DP=48;FAO=47;FDP=48;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=36;FSAR=11;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0512773;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=165.061;QD=61.404;RBI=0.0768351;REFB=-0.0968925;REVB=0.0572212;RO=0;SAF=27;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.506846;STBP=0.639;TYPE=snp;VARB=-0.000141601;OID=.;OPOS=50439194;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:48:48:0:1:28:47:0.979167:1:27:0:0:11:36:1:0
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chr22	50547247	.	A	G	1568.43	PASS	AF=1;AO=98;DP=98;FAO=98;FDP=98;FR=.;FRO=0;FSAF=45;FSAR=53;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00720082;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=109.624;QD=64.0176;RBI=0.0336415;REFB=0;REVB=0.0328618;RO=0;SAF=45;SAR=53;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.76416e-05;OID=.;OPOS=50547247;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:98:98:0:0:98:98:1:53:45:0:0:53:45:0:0
chr22	50555619	.	C	T	1480.23	PASS	AF=0.990099;AO=100;DP=100;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=52;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0203606;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.055;QD=58.623;RBI=0.0264539;REFB=-0.0738441;REVB=0.0168896;RO=0;SAF=48;SAR=52;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.19274e-08;STB=0.505154;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.000607868;OID=.;OPOS=50555619;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:101:0:1:100:100:0.990099:52:48:0:0:52:48:1:0
chr22	50555686	.	A	C	329.67	PASS	AF=0.356522;AO=41;DP=116;FAO=41;FDP=115;FR=.;FRO=74;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=35;FSRR=39;FWDB=-0.0231224;FXX=0.00861995;HRUN=2;LEN=1;MLLD=185.069;QD=11.4666;RBI=0.0372375;REFB=-0.025206;REVB=-0.0291887;RO=70;SAF=22;SAR=19;SRF=32;SRR=38;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0875269;STB=0.540887;STBP=0.555;TYPE=snp;VARB=0.0445383;OID=.;OPOS=50555686;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:116:115:70:74:41:41:0.356522:19:22:32:38:19:22:35:39
chr22	50582626	.	A	G	1170.94	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0323435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=143.276;QD=60.8279;RBI=0.0330309;REFB=0;REVB=0.00670336;RO=0;SAF=40;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.60877e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.73567e-05;OID=.;OPOS=50582626;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:77:0:0:76:77:1:36:40:0:0:36:41:0:0
chr22	50585528	.	G	A	95.36	PASS	AF=0.48;AO=11;DP=23;FAO=12;FDP=25;FR=.;FRO=13;FSAF=8;FSAR=4;FSRF=7;FSRR=6;FWDB=0.0030411;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=103.218;QD=15.2568;RBI=0.00975691;REFB=-0.0209531;REVB=-0.00927087;RO=12;SAF=7;SAR=4;SRF=6;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.126336;STB=0.571306;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.00975293;OID=.;OPOS=50585528;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:95:23:25:12:13:11:12:0.48:4:7:6:6:4:8:7:6
chr22	50589196	.	C	A	452.44	PASS	AF=0.646154;AO=42;DP=65;FAO=42;FDP=65;FR=.;FRO=23;FSAF=20;FSAR=22;FSRF=14;FSRR=9;FWDB=0.0211609;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.8887;QD=27.8425;RBI=0.0326928;REFB=-0.0143271;REVB=0.0249206;RO=23;SAF=20;SAR=22;SRF=14;SRR=9;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0859122;STB=0.546761;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0103182;OID=.;OPOS=50589196;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:65:65:23:23:42:42:0.646154:22:20:14:9:22:20:14:9
chr22	50618738	.	G	A	71.28	PASS	AF=0.473684;AO=9;DP=19;FAO=9;FDP=19;FR=.;FRO=10;FSAF=3;FSAR=6;FSRF=3;FSRR=7;FWDB=-0.0104908;FXX=0.0951928;HRUN=4;LEN=1;MLLD=261.672;QD=15.0055;RBI=0.0106736;REFB=-0.00811386;REVB=0.00196682;RO=9;SAF=3;SAR=6;SRF=2;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.112036;STB=0.519956;STBP=0.902;TYPE=snp;VARB=0.0080498;OID=.;OPOS=50618738;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:71:19:19:9:10:9:9:0.473684:6:3:2:7:6:3:3:7
chr22	50637597	.	G	C	174.41	PASS	AF=0.323944;AO=22;DP=70;FAO=23;FDP=71;FR=.;FRO=48;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=32;FSRR=16;FWDB=-0.0186681;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.854;QD=9.82595;RBI=0.0256779;REFB=-0.00338335;REVB=0.0176311;RO=48;SAF=13;SAR=9;SRF=32;SRR=16;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0932221;STB=0.541849;STBP=0.644;TYPE=snp;VARB=0.00845808;OID=.;OPOS=50637597;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:70:71:48:48:22:23:0.323944:9:13:32:16:9:14:32:16
chr22	50646936	.	G	C	204.94	PASS	AF=0.442308;AO=23;DP=52;FAO=23;FDP=52;FR=.;FRO=29;FSAF=9;FSAR=14;FSRF=14;FSRR=15;FWDB=0.00153635;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.0592;QD=15.7646;RBI=0.0467939;REFB=-0.025741;REVB=-0.0467686;RO=29;SAF=9;SAR=14;SRF=14;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0918505;STB=0.55227;STBP=0.558;TYPE=snp;VARB=0.0317341;OID=.;OPOS=50646936;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:52:52:29:29:23:23:0.442308:14:9:14:15:14:9:14:15
chr22	50657010	.	C	G	1213.18	PASS	AF=0.953488;AO=82;DP=86;FAO=82;FDP=86;FR=.;FRO=4;FSAF=28;FSAR=54;FSRF=4;FSRR=0;FWDB=0.0912647;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.5784;QD=56.4268;RBI=0.0940399;REFB=-0.132822;REVB=0.0226772;RO=2;SAF=28;SAR=54;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0326237;STB=0.533325;STBP=0.01;TYPE=snp;VARB=0.00393;OID=.;OPOS=50657010;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:86:86:2:4:82:82:0.953488:54:28:2:0:54:28:4:0
chr22	50658424	.	T	C	370.43	PASS	AF=0.448276;AO=39;DP=88;FAO=39;FDP=87;FR=.;FRO=48;FSAF=25;FSAR=14;FSRF=25;FSRR=23;FWDB=0.00118111;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.3246;QD=17.0313;RBI=0.0265217;REFB=-0.00599917;REVB=-0.0264954;RO=44;SAF=25;SAR=14;SRF=21;SRR=23;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.159941;STB=0.569194;STBP=0.299;TYPE=snp;VARB=0.00820065;OID=.;OPOS=50658424;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:88:87:44:48:39:39:0.448276:14:25:21:23:14:25:25:23
chr22	50664612	.	A	G	354.45	PASS	AF=0.426966;AO=38;DP=89;FAO=38;FDP=89;FR=.;FRO=51;FSAF=22;FSAR=16;FSRF=38;FSRR=13;FWDB=-0.0135683;FXX=0.0111099;HRUN=2;LEN=1;MLLD=68.5384;QD=15.9302;RBI=0.0394933;REFB=0.0130607;REVB=0.0370894;RO=51;SAF=22;SAR=16;SRF=38;SRR=13;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.180104;STB=0.600702;STBP=0.144;TYPE=snp;VARB=-0.011956;OID=.;OPOS=50664612;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:89:89:51:51:38:38:0.426966:16:22:38:13:16:22:38:13
chr22	50688348	.	A	G	1264.72	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0119447;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=86.7405;QD=61.6937;RBI=0.0448331;REFB=0;REVB=0.0432127;RO=0;SAF=32;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000103867;OID=.;OPOS=50688348;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:50:32:0:0:50:32:0:0
chr22	50693538	.	G	A	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00579433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=116.395;QD=39.2035;RBI=0.00579433;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=9;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.37679e-05;OID=.;OPOS=50693538;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:0:9:0:0:0:9:0:0
chr22	50693554	.	A	G	255.26	PASS	AF=1;AO=17;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0066551;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=248.515;QD=51.052;RBI=0.0534698;REFB=0;REVB=0.0530541;RO=0;SAF=11;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000249632;OID=.;OPOS=50693554;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:17:20:1:6:11:0:0:7:13:0:0
chr22	50694297	.	A	G	453.8	PASS	AF=0.969697;AO=33;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0212297;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=293.232;QD=55.0066;RBI=0.0427884;REFB=-0.0329142;REVB=0.0371504;RO=0;SAF=23;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.526299;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.000290391;OID=.;OPOS=50694297;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:0:1:33:32:0.969697:10:23:0:0:9:23:0:1
chr22	50695002	.	A	AC	42.76	PASS	AF=0.235294;AO=10;DP=69;FAO=16;FDP=68;FR=.;FRO=52;FSAF=15;FSAR=1;FSRF=29;FSRR=23;FWDB=-0.0128162;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=29.0177;QD=2.51556;RBI=0.0473474;REFB=-0.013376;REVB=-0.0455798;RO=56;SAF=9;SAR=1;SRF=34;SRR=22;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.450532;STB=0.890488;STBP=0.002;TYPE=ins;VARB=0.165476;OID=.;OPOS=50695003;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=AC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.235294:10:69:16:68:52:15:1:29:23:42:56:9:1:34:22
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chr22	50877166	.	G	C	768.72	PASS	AF=1;AO=15;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.,HEALED,HEALED,HEALED;FRO=0;FSAF=31;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0780084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=152.608;QD=64.0599;RBI=0.0832196;REFB=0;REVB=0.0289863;RO=0;SAF=10;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00497956;OID=.;OPOS=50877166;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:15:48:1:5:10:0:0:17:31:0:0
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chr22	50960682	.	C	T	461.78	PASS	AF=0.523256;AO=45;DP=86;FAO=45;FDP=86;FR=.;FRO=41;FSAF=24;FSAR=21;FSRF=24;FSRR=17;FWDB=-0.0158663;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.2103;QD=21.4781;RBI=0.0197403;REFB=-0.0116643;REVB=0.0117447;RO=41;SAF=24;SAR=21;SRF=24;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0452798;STB=0.524989;STBP=0.658;TYPE=snp;VARB=0.0080642;OID=.;OPOS=50960682;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:41:41:45:45:0.523256:21:24:24:17:21:24:24:17
chr22	50961169	.	A	G	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0324214;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=232.549;QD=39.2068;RBI=0.0891684;REFB=0;REVB=-0.0830654;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.0002468;OID=.;OPOS=50961169;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:1:8:0:0:1:8:0:0
chr22	50962208	.	T	G	507.64	PASS	AF=0.38;AO=57;DP=150;FAO=57;FDP=150;FR=.;FRO=93;FSAF=42;FSAR=15;FSRF=59;FSRR=34;FWDB=0.0201961;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.81;QD=13.537;RBI=0.020324;REFB=-0.00328211;REVB=-0.00227621;RO=92;SAF=42;SAR=15;SRF=59;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.124476;STB=0.575958;STBP=0.18;TYPE=snp;VARB=0.00526855;OID=.;OPOS=50962208;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:150:150:92:93:57:57:0.38:15:42:59:33:15:42:59:34
chr22	50962782	.	C	G	222.83	PASS	AF=0.468085;AO=21;DP=46;FAO=22;FDP=47;FR=.;FRO=25;FSAF=16;FSAR=6;FSRF=13;FSRR=12;FWDB=-0.0109844;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=55.6854;QD=18.9642;RBI=0.0369724;REFB=-0.0125068;REVB=-0.035303;RO=24;SAF=15;SAR=6;SRF=12;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.218916;STB=0.623258;STBP=0.121;TYPE=snp;VARB=0.00801843;OID=.;OPOS=50962782;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:46:47:24:25:21:22:0.468085:6:15:12:12:6:16:13:12
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chr22	51015838	.	T	C	362.34	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00749882;FXX=0.0370233;HRUN=1;LEN=1;MLLD=70.6007;QD=55.7452;RBI=0.0452318;REFB=0;REVB=0.0446059;RO=0;SAF=17;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000230617;OID=.;OPOS=51015838;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:25:26:1:8:17:0:0:8:18:0:0
chr22	51043278	.	G	A	727.78	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0585889;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.48;QD=63.285;RBI=0.0720518;REFB=0;REVB=0.0419382;RO=0;SAF=10;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.54368e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000226508;OID=.;OPOS=51043278;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:36:10:0:0:36:10:0:0
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chrX	228879	.	G	C	157.77	PASS	AF=0.214876;AO=26;DP=121;FAO=26;FDP=121;FR=.;FRO=95;FSAF=3;FSAR=23;FSRF=65;FSRR=30;FWDB=-0.0215229;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=169.159;QD=5.21558;RBI=0.0215592;REFB=-0.0169061;REVB=0.00125044;RO=95;SAF=3;SAR=23;SRF=65;SRR=30;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.669322;STB=0.907437;STBP=0;TYPE=snp;VARB=0.0515759;OID=.;OPOS=228879;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:121:121:95:95:26:26:0.214876:23:3:65:30:23:3:65:30
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chrX	228934	.	A	G	613.87	PASS	AF=0.864407;AO=46;DP=55;FAO=51;FDP=59;FR=.;FRO=8;FSAF=37;FSAR=14;FSRF=7;FSRR=1;FWDB=0.0221961;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=52.3679;QD=41.6181;RBI=0.0300343;REFB=-0.0337076;REVB=0.0202335;RO=9;SAF=35;SAR=11;SRF=7;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00712456;STB=0.526036;STBP=0.39;TYPE=snp;VARB=0.0108278;OID=.;OPOS=228934;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:38:55:59:9:8:46:51:0.864407:11:35:7:2:14:37:7:1
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chrX	6451872	.	C	G	75.87	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=11;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=1;FSAR=8;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=-0.172726;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.073;QD=25.2899;RBI=0.17359;REFB=-0.0962172;REVB=0.0172961;RO=2;SAF=1;SAR=8;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.241727;STB=0.72665;STBP=0.06;TYPE=snp;VARB=0.0120211;OID=.;OPOS=6451872;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:11:12:2:3:9:9:0.75:8:1:1:1:8:1:2:1
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chrX	8138080	.	G	C	88.21	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0104938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=114.002;QD=39.2046;RBI=0.112833;REFB=0;REVB=0.112344;RO=0;SAF=8;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00417046;OID=.;OPOS=8138080;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:1:8:0:0:1:8:0:0
chrX	8138160	.	T	C	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0362499;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.7169;QD=23.2181;RBI=0.075631;REFB=-0.00874917;REVB=-0.0663776;RO=0;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.66592;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0138643;OID=.;OPOS=8138160;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:0:1:5:5:0.833333:1:4:0:0:1:4:0:1
chrX	8138165	.	C	G	34.86	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=4;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0427284;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4838;QD=23.2412;RBI=0.056774;REFB=-0.201927;REVB=0.037384;RO=0;SAF=4;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.66592;STBP=0.23;TYPE=snp;VARB=0.0355233;OID=.;OPOS=8138165;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:0:1:5:5:0.833333:1:4:0:0:1:4:0:1
chrX	8497510	.	C	T	2348.99	PASS	AF=1;AO=151;DP=151;FAO=154;FDP=154;FR=.;FRO=0;FSAF=85;FSAR=69;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00517166;FXX=0.0064512;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.465;QD=61.0127;RBI=0.0177405;REFB=0;REVB=0.01697;RO=0;SAF=84;SAR=67;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.74685e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.6717e-05;OID=.;OPOS=8497510;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:13:151:154:0:0:151:154:1:67:84:0:0:69:85:0:0
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chrX	8504833	.	C	T	756.39	PASS	AF=0.981818;AO=54;DP=55;FAO=54;FDP=55;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=24;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0900497;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=58.9482;QD=55.0104;RBI=0.0961585;REFB=-0.0701165;REVB=-0.0337269;RO=1;SAF=30;SAR=24;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0154512;STB=0.508194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00219062;OID=.;OPOS=8504833;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:55:55:1:1:54:54:0.981818:24:30:1:0:24:30:1:0
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chrX	9842669	.	G	A	255.86	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0109735;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.746;QD=51.171;RBI=0.0298793;REFB=0;REVB=0.0277912;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000191099;OID=.;OPOS=9842669;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:7:13:0:0:7:13:0:0
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chrX	9863112	.	A	G	426.42	PASS	AF=0.96875;AO=26;DP=32;FAO=31;FDP=32;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0496343;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.59;QD=53.3023;RBI=0.0496625;REFB=-0.0925846;REVB=0.00167325;RO=0;SAF=16;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-7.71087e-08;STB=0.514277;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00416678;OID=.;OPOS=9863112;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:32:32:0:1:26:31:0.96875:10:16:0:0:14:17:1:0
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chrX	9912792	.	A	G	1044.37	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0179739;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=246.154;QD=59.6783;RBI=0.0263732;REFB=0;REVB=0.0192999;RO=0;SAF=47;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.79556e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90439e-05;OID=.;OPOS=9912792;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:23:47:0:0:23:47:0:0
chrX	9914947	.	G	C	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00173445;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=94.5444;QD=57.2017;RBI=0.0111912;REFB=0;REVB=-0.011056;RO=0;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.63861e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000130511;OID=.;OPOS=9914947;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:13:17:0:0:13:17:0:0
chrX	9915165	.	C	T	222.29	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0116651;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=65.6659;QD=49.3985;RBI=0.0134445;REFB=0;REVB=-0.00668429;RO=0;SAF=10;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000244932;OID=.;OPOS=9915165;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:8:10:0:0:8:10:0:0
chrX	10085674	.	T	C	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0155211;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=189.301;QD=45.8066;RBI=0.0441124;REFB=0;REVB=0.0412916;RO=0;SAF=8;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000159459;OID=.;OPOS=10085674;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:6:8:0:0:6:8:0:0
chrX	10202343	.	C	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0295944;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.475;QD=46.8479;RBI=0.0305335;REFB=0;REVB=0.00751462;RO=0;SAF=6;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000363489;OID=.;OPOS=10202343;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:9:6:0:0:9:6:0:0
chrX	10204812	.	A	G	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0276952;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=58.2651;QD=48.7336;RBI=0.0277316;REFB=0;REVB=0.00142046;RO=0;SAF=12;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000931698;OID=.;OPOS=10204812;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:5:12:0:0:5:12:0:0
chrX	11187692	.	GCCCG	GCCC,GCC,GCCG,GC,GCG	484.77	PASS	AF=0,0.941176,0,0,0;AO=6,13,13,6,6;DP=50;FAO=0,48,0,0,0;FDP=51;FR=.;FRO=3;FSAF=0,30,0,0,0;FSAR=0,18,0,0,0;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.559908,0.041443,-0.47549,-0.0812742,-0.244482;FXX=0.0192271;HRUN=3,3,3,3,3;LEN=1,2,1,3,2;MLLD=11.5819,22.9724,11.8323,14.4616,9.65483;QD=38.021;RBI=0.56171,0.237331,0.62828,0.198416,0.325131;REFB=-0.0788635,-0.186425,-0.227936,-0.149725,-0.155994;REVB=0.0449635,0.233685,0.410664,0.181007,0.214333;RO=5;SAF=0,3,13,6,6;SAR=6,10,0,0,0;SRF=0;SRR=5;SSEN=0.440455,0,0,0,0;SSEP=0,0.440455,0.440455,0.440455,0.440455;SSSB=0,0.181061,0.851553,0.819749,0.819749;STB=0.5,0.538445,0.5,0.5,0.5;STBP=1,0.038,1,1,1;TYPE=del,del,del,del,del;VARB=0,0.0274085,0,0,0;OID=.,.,.,.,.;OPOS=11187696,11187695,11187693,11187694,11187693;OREF=G,CG,C,CCG,CC;OALT=-,-,-,-,-;OMAPALT=GCCC,GCC,GCCG,GC,GCG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0,0.941176,0,0,0:6,13,13,6,6:50:0,48,0,0,0:51:3:0,30,0,0,0:0,18,0,0,0:0:3:3:5:0,3,13,6,6:6,10,0,0,0:0:5
chrX	12725701	.	C	G	1480.34	PASS	AF=0.990099;AO=100;DP=101;FAO=100;FDP=101;FR=.;FRO=1;FSAF=51;FSAR=49;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.016844;FXX=0.00980296;HRUN=1;LEN=1;MLLD=126.079;QD=58.6275;RBI=0.0517469;REFB=-0.0143968;REVB=0.0489287;RO=0;SAF=51;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.18771e-08;STB=0.504853;STBP=0.47;TYPE=snp;VARB=0.000188293;OID=.;OPOS=12725701;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:101:101:0:1:100:100:0.990099:49:51:0:0:49:51:1:0
chrX	12809661	.	G	A	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0306598;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=118.991;QD=33.4285;RBI=0.0322964;REFB=0;REVB=-0.0101505;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00155755;OID=.;OPOS=12809661;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
chrX	12924826	.	A	G	876.12	PASS	AF=0.940299;AO=62;DP=66;FAO=63;FDP=67;FR=.;FRO=4;FSAF=48;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=4;FWDB=0.00858668;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=265.19;QD=52.3056;RBI=0.0103294;REFB=-0.133955;REVB=0.00574146;RO=0;SAF=47;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.558804;STBP=0.002;TYPE=snp;VARB=0.000902319;OID=.;OPOS=12924826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:66:67:0:4:62:63:0.940299:15:47:0:0:15:48:0:4
chrX	12937513	.	C	T	167.44	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00457368;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=150.31;QD=44.6508;RBI=0.0527265;REFB=0;REVB=0.0525277;RO=0;SAF=10;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.63386e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000991992;OID=.;OPOS=12937513;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:15:0:0:14:15:1:4:10:0:0:5:10:0:0
chrX	12937804	.	C	T	1328.28	PASS	AF=0.988506;AO=86;DP=88;FAO=86;FDP=87;FR=.;FRO=1;FSAF=59;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0097382;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7865;QD=61.0703;RBI=0.0269571;REFB=-0.126623;REVB=0.0251367;RO=0;SAF=59;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.509089;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.00118013;OID=.;OPOS=12937804;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:88:87:0:1:86:86:0.988506:27:59:0:0:27:59:0:1
chrX	12939112	.	G	C	1364.18	PASS	AF=1;AO=87;DP=89;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00669596;FXX=0.0224694;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.6403;QD=62.721;RBI=0.0667789;REFB=0;REVB=0.0664424;RO=0;SAF=41;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000242856;OID=.;OPOS=12939112;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:89:87:0:0:87:87:1:46:41:0:0:46:41:0:0
chrX	12939412	.	C	A	574.84	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=2.57225e-06;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=178.344;QD=60.5093;RBI=0.014025;REFB=0;REVB=0.014025;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.75047e-05;OID=.;OPOS=12939412;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:14:23:0:0:14:24:0:0
chrX	12939928	.	T	C	304.65	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000762644;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=297.857;QD=52.9828;RBI=0.0115653;REFB=0;REVB=0.0115401;RO=0;SAF=11;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.51176e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.00833e-05;OID=.;OPOS=12939928;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:10:11:0:0:11:12:0:0
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chrX	15333632	.	CA	C,CC	33.25	PASS	AF=0.153846,0.102564;AO=6,4;DP=39;FAO=6,4;FDP=39;FR=.;FRO=29;FSAF=4,3;FSAR=2,1;FSRF=11;FSRR=18;FWDB=-0.0434031,0.020442;FXX=0;HRUN=7,7;LEN=1,1;MLLD=8.91184,24.1443;QD=3.41047;RBI=0.107012,0.0740564;REFB=-0.088724,-0.0505004;REVB=0.097815,0.0711792;RO=21;SAF=3,3;SAR=3,1;SRF=5;SRR=16;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.318726,0.539208;STB=0.726565,0.801445;STBP=0.282,0.267;TYPE=del,snp;VARB=0.0644434,0.0701573;OID=.,.;OPOS=15333633,15333633;OREF=A,A;OALT=-,C;OMAPALT=C,CC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.153846,0.102564:6,4:39:6,4:39:29:4,3:2,1:11:18:18:21:3,3:3,1:5:16
chrX	15415583	.	C	T	1434.3	PASS	AF=0.93578;AO=103;DP=109;FAO=102;FDP=109;FR=.;FRO=7;FSAF=59;FSAR=43;FSRF=4;FSRR=3;FWDB=-0.0142155;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=64.363;QD=52.6348;RBI=0.0859538;REFB=0.0457037;REVB=0.0847701;RO=6;SAF=59;SAR=44;SRF=4;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0100126;STB=0.500461;STBP=0.999;TYPE=snp;VARB=-0.00212559;OID=.;OPOS=15415583;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:109:109:6:7:103:102:0.93578:44:59:4:2:43:59:4:3
chrX	15800751	.	G	A	1395.41	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=89;FDP=89;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172484;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.16;QD=62.7151;RBI=0.0637241;REFB=0;REVB=0.0613454;RO=0;SAF=52;SAR=33;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.83613e-05;OID=.;OPOS=15800751;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:89:0:0:85:89:1:33:52:0:0:36:53:0:0
chrX	16168706	.	A	G	728.96	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0764266;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.986;QD=57.1735;RBI=0.102209;REFB=0;REVB=0.0678649;RO=0;SAF=22;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.15703e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000360329;OID=.;OPOS=16168706;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:51:0:0:50:51:1:28:22:0:0:28:23:0:0
chrX	16859628	.	G	A	1044.39	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=70;FDP=70;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0037982;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=299.725;QD=59.6795;RBI=0.0228403;REFB=0;REVB=0.0225223;RO=0;SAF=34;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.36125e-05;OID=.;OPOS=16859628;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:70:0:0:70:70:1:36:34:0:0:36:34:0:0
chrX	16860134	.	T	C	74.98	PASS	AF=1;AO=8;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374706;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.534;QD=37.4876;RBI=0.0934721;REFB=0;REVB=0.0856328;RO=0;SAF=2;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.58669e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00910302;OID=.;OPOS=16860134;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:8:8:1:6:2:0:0:6:2:0:0
chrX	17166219	.	C	T	1170.95	PASS	AF=1;AO=76;DP=77;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251458;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=124.039;QD=60.8284;RBI=0.0321234;REFB=0;REVB=0.01999;RO=0;SAF=46;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.03737e-06;OID=.;OPOS=17166219;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:77:77:0:0:76:77:1:30:46:0:0:31:46:0:0
chrX	17376079	.	G	T	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0701884;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=83.7038;QD=46.8479;RBI=0.0718954;REFB=0;REVB=0.0155734;RO=0;SAF=9;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00125728;OID=.;OPOS=17376079;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:6:9:0:0:6:9:0:0
chrX	17705850	.	C	CT,T	1416.57	PASS	AF=1,0;AO=95,5;DP=112;FAO=111,0;FDP=111;FR=.;FRO=0;FSAF=64,0;FSAR=47,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0590397,0.0163459;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=20.2804,238.125;QD=51.0476;RBI=0.0604625,0.0169062;REFB=0,0;REVB=-0.0130396,-0.00431641;RO=10;SAF=58,0;SAR=37,5;SRF=6;SRR=4;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.00199001,-0.745952;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.00508357,0;OID=.,.;OPOS=17705851,17705850;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:112:111:10:0:95,5:111,0:1,0:37,5:58,0:6:4:47,0:64,0:0:0
chrX	17746244	.	T	C	3930.31	PASS	AF=0.973684;AO=259;DP=266;FAO=259;FDP=266;FR=.;FRO=7;FSAF=128;FSAR=131;FSRF=6;FSRR=1;FWDB=0.0374314;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=69.7001;QD=59.1024;RBI=0.0422328;REFB=-0.0603501;REVB=0.0195578;RO=7;SAF=128;SAR=131;SRF=6;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0181933;STB=0.509549;STBP=0.084;TYPE=snp;VARB=0.00104126;OID=.;OPOS=17746244;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:266:266:7:7:259:259:0.973684:131:128:6:1:131:128:6:1
chrX	17819377	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=1;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0756334;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.88;QD=33.4285;RBI=0.0777166;REFB=0;REVB=-0.0178733;RO=0;SAF=1;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0024073;OID=.;OPOS=17819377;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:5:1:0:0:5:1:0:0
chrX	19375782	.	A	C	801.29	PASS	AF=1;AO=56;DP=56;FAO=56;FDP=56;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0045712;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=196.538;QD=57.2353;RBI=0.0167478;REFB=0;REVB=0.0161119;RO=0;SAF=29;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.88256e-05;OID=.;OPOS=19375782;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:56:56:0:0:56:56:1:27:29:0:0:27:29:0:0
chrX	19482476	.	C	T	321.93	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0596125;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=81.7153;QD=53.6548;RBI=0.0611937;REFB=0;REVB=0.0138208;RO=0;SAF=9;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00113309;OID=.;OPOS=19482476;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:15:9:0:0:15:9:0:0
chrX	20470345	.	C	T	879.87	PASS	AF=0.984127;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=63;FR=.;FRO=1;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0232278;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.931;QD=55.8645;RBI=0.0239987;REFB=-0.141467;REVB=0.0060337;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.508194;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00147289;OID=.;OPOS=20470345;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:62:63:0:1:61:62:0.984127:32:29:0:0:32:30:1:0
chrX	21508666	.	A	G	446.97	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0401062;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=67.7003;QD=57.6741;RBI=0.0401429;REFB=0;REVB=0.00171548;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000568113;OID=.;OPOS=21508666;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0
chrX	23019317	.	G	T	483.2	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00688007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=237.104;QD=58.5701;RBI=0.0110293;REFB=0;REVB=-0.00862033;RO=0;SAF=20;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.82173e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.30064e-05;OID=.;OPOS=23019317;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:13:20:0:0:13:20:0:0
chrX	23019346	.	G	T	747.1	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0243144;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=108.534;QD=63.5829;RBI=0.0248958;REFB=0;REVB=0.00534926;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.74651e-05;OID=.;OPOS=23019346;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:20:27:0:0:20:27:0:0
chrX	23858452	.	G	A	685.46	PASS	AF=0.944444;AO=52;DP=54;FAO=51;FDP=54;FR=.;FRO=3;FSAF=32;FSAR=19;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0104838;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1606;QD=50.7746;RBI=0.0166392;REFB=-0.0061853;REVB=0.0129211;RO=2;SAF=32;SAR=20;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0285316;STB=0.502332;STBP=0.951;TYPE=snp;VARB=0.00362355;OID=.;OPOS=23858452;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:54:54:2:3:52:51:0.944444:20:32:2:0:19:32:2:1
chrX	23925834	.	A	T	1012.56	PASS	AF=1;AO=68;DP=69;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=34;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0224189;FXX=0.0285673;HRUN=1;LEN=1;MLLD=93.1458;QD=59.5622;RBI=0.0238689;REFB=0;REVB=0.00819263;RO=0;SAF=34;SAR=34;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000292243;OID=.;OPOS=23925834;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:69:68:0:0:68:68:1:34:34:0:0:34:34:0:0
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chrX	24329516	.	GA	G	113.58	PASS	AF=0.727273;AO=14;DP=22;FAO=16;FDP=22;FR=.;FRO=6;FSAF=11;FSAR=5;FSRF=2;FSRR=4;FWDB=0.172573;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=12.3481;QD=20.6509;RBI=0.187957;REFB=-0.146034;REVB=0.0744723;RO=6;SAF=10;SAR=4;SRF=2;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.222221;STB=0.603524;STBP=0.154;TYPE=del;VARB=0.0924823;OID=.;OPOS=24329517;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=G	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.727273:14:22:16:22:6:11:5:2:4:17:6:10:4:2:4
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chrX	24383061	.	C	T	712.51	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00394059;FXX=0.0217344;HRUN=2;LEN=1;MLLD=181.476;QD=63.3345;RBI=0.0190981;REFB=0;REVB=-0.0186872;RO=0;SAF=20;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.09779e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000115088;OID=.;OPOS=24383061;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:25:20:0:0:25:20:0:0
chrX	24578803	.	C	T	575.87	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=38;FDP=38;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0612269;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.3245;QD=60.6174;RBI=0.0641929;REFB=0;REVB=-0.0192871;RO=0;SAF=16;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.7558e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000299789;OID=.;OPOS=24578803;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:38:0:0:37:38:1:21:16:0:0:22:16:0:0
chrX	24751958	.	T	C	1081.02	PASS	AF=1;AO=70;DP=70;FAO=72;FDP=72;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00797131;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=271.403;QD=60.0568;RBI=0.0744116;REFB=0;REVB=0.0739834;RO=0;SAF=43;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.22155e-05;OID=.;OPOS=24751958;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:70:72:0:0:70:72:1:27:43:0:0:29:43:0:0
chrX	26157220	.	C	T	1572.14	PASS	AF=0.981818;AO=107;DP=110;FAO=108;FDP=110;FR=.;FRO=2;FSAF=79;FSAR=29;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0220479;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=267.227;QD=57.1688;RBI=0.0237952;REFB=-0.170685;REVB=0.00895007;RO=2;SAF=79;SAR=28;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0118644;STB=0.506249;STBP=0.435;TYPE=snp;VARB=0.000463544;OID=.;OPOS=26157220;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:3:110:110:2:2:107:108:0.981818:28:79:2:0:29:79:2:0
chrX	26157792	.	C	T	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0757013;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=95.5489;QD=63.5817;RBI=0.0757243;REFB=0;REVB=0.00186715;RO=0;SAF=27;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000500692;OID=.;OPOS=26157792;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:20:27:0:0:20:27:0:0
chrX	26213219	.	T	C	557.72	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0998748;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2898;QD=60.2941;RBI=0.0999038;REFB=0;REVB=-0.00240326;RO=0;SAF=17;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00110434;OID=.;OPOS=26213219;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:37:0:0:36:37:1:19:17:0:0:20:17:0:0
chrX	26213364	.	T	C,TTGTC,TTTGTC	588.69	PASS	AF=0.0238095,0,0.928571;AO=4,5,33;DP=46;FAO=1,0,39;FDP=42;FR=.;FRO=2;FSAF=1,0,25;FSAR=0,0,14;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=-0.0449511,0.0263043,0.0414295;FXX=0.0454442;HRUN=4,4,4;LEN=1,4,5;MLLD=130.706,189.959,206.596;QD=56.0656;RBI=0.0619048,0.0450572,0.0551216;REFB=0.0236696,0.090575,0.15352;REVB=0.0425629,0.0365819,0.0363591;RO=3;SAF=4,4,20;SAR=0,1,13;SRF=2;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0.705357,0.116878,-0.00987718;STB=0.5,0.5,0.519221;STBP=1,1,0.302;TYPE=snp,ins,ins;VARB=0.0656424,0,-1.90006e-05;OID=.,.,.;OPOS=26213364,26213365,26213365;OREF=T,-,-;OALT=C,TGTC,TTGTC;OMAPALT=C,TTGTC,TTTGTC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/3:9:46:42:3:2:4,5,33:1,0,39:0.0238095,0,0.928571:0,1,13:4,4,20:2:1:0,0,14:1,0,25:2:0
chrX	27479339	.	A	G	323.4	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0309007;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=166.373;QD=53.9003;RBI=0.0333433;REFB=0;REVB=0.0125267;RO=0;SAF=8;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000281434;OID=.;OPOS=27479339;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:16:8:0:0:16:8:0:0
chrX	27999491	.	A	G	342.71	PASS	AF=0.870968;AO=27;DP=31;FAO=27;FDP=31;FR=.;FRO=4;FSAF=17;FSAR=10;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=-0.0244182;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=34.9186;QD=44.2211;RBI=0.0284243;REFB=-0.0438746;REVB=0.0145496;RO=3;SAF=17;SAR=10;SRF=2;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00737355;STB=0.516784;STBP=0.693;TYPE=snp;VARB=0.00877352;OID=.;OPOS=27999491;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:16:31:31:3:4:27:27:0.870968:10:17:2:1:10:17:3:1
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chrX	30255520	.	C	T	1410.89	PASS	AF=1;AO=77;DP=92;FAO=91;FDP=91;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=46;FSAR=45;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0105824;FXX=0.0108684;HRUN=1;LEN=1;MLLD=210.805;QD=62.0173;RBI=0.0311756;REFB=0;REVB=0.0293245;RO=0;SAF=36;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.52206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139818;OID=.;OPOS=30255520;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:92:91:0:0:77:91:1:41:36:0:0:45:46:0:0
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chrX	34962909	.	A	C	429.01	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0716637;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=71.5384;QD=57.2019;RBI=0.0742121;REFB=0;REVB=0.0192807;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00124078;OID=.;OPOS=34962909;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:19:11:0:0:19:11:0:0
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chrX	41588169	.	T	C	1400.41	PASS	AF=0.989011;AO=91;DP=91;FAO=90;FDP=91;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=46;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00388874;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=225.608;QD=61.5567;RBI=0.049152;REFB=0.042715;REVB=0.0489979;RO=0;SAF=44;SAR=47;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.04952e-08;STB=0.505375;STBP=0.513;TYPE=snp;VARB=-1.87798e-05;OID=.;OPOS=41588169;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:91:91:0:1:91:90:0.989011:47:44:0:0:46:44:0:1
chrX	44202890	.	G	GC	859.99	PASS	AF=1;AO=69;DP=93;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=64;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.064521;FXX=0.0113623;HRUN=1;LEN=1;MLLD=15.6291;QD=39.5398;RBI=0.074556;REFB=0;REVB=0.0373583;RO=19;SAF=21;SAR=48;SRF=5;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0198077;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00142792;OID=.;OPOS=44202891;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:69:93:87:87:0:23:64:0:0:18:19:21:48:5:14
chrX	44929077	.	C	A	272.35	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00740049;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.793;QD=51.8767;RBI=0.0236775;REFB=0;REVB=0.0224912;RO=0;SAF=15;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.81548e-05;OID=.;OPOS=44929077;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:21:0:0:20:21:1:5:15:0:0:6:15:0:0
chrX	45051111	.	C	T	1028.15	PASS	AF=1;AO=60;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=37;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=234.061;QD=59.6031;RBI=0.0708662;REFB=0;REVB=0.069773;RO=0;SAF=37;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.03034e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000243104;OID=.;OPOS=45051111;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:60:69:1:23:37:0:0:32:37:0:0
chrX	46472826	.	G	A	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00700457;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=294.903;QD=59.8392;RBI=0.0197653;REFB=0;REVB=0.0184825;RO=0;SAF=9;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.27111e-05;OID=.;OPOS=46472826;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:27:9:0:0:27:9:0:0
chrX	46618321	.	C	G	739.28	PASS	AF=0.981481;AO=53;DP=54;FAO=53;FDP=54;FR=.;FRO=1;FSAF=24;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0898309;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.1536;QD=54.7613;RBI=0.090612;REFB=-0.0969656;REVB=0.0118722;RO=1;SAF=24;SAR=29;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0192259;STB=0.5102;STBP=0.304;TYPE=snp;VARB=0.00306599;OID=.;OPOS=46618321;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:54:54:1:1:53:53:0.981481:29:24:1:0:29:24:1:0
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chrX	47445940	.	C	T	860.1	PASS	AF=1;AO=60;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0612445;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=48.1459;QD=56.4001;RBI=0.0672536;REFB=-0.0657611;REVB=0.0277878;RO=1;SAF=33;SAR=27;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0140874;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00501273;OID=.;OPOS=47445940;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:61:61:1:0:60:61:1:27:33:1:0:27:34:0:0
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chrX	53563589	.	A	G	358.81	PASS	AF=1;AO=20;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0860292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=90.9726;QD=53.157;RBI=0.0900192;REFB=0;REVB=0.0265032;RO=0;SAF=4;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00148143;OID=.;OPOS=53563589;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:20:27:1:16:4:0:0:17:10:0:0
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chrX	53652852	.	T	G	1172.0	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=77;FDP=77;FR=.;FRO=0;FSAF=59;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0113027;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=294.531;QD=60.8831;RBI=0.0264076;REFB=0;REVB=0.0238666;RO=0;SAF=57;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.12054e-05;OID=.;OPOS=53652852;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:77:0:0:75:77:1:18:57:0:0:18:59:0:0
chrX	53659047	.	C	A,T	1552.32	PASS	AF=0.121495,0.878505;AO=13,94;DP=107;FAO=13,94;FDP=107;FR=.;FRO=0;FSAF=12,45;FSAR=1,49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.014554,0.0272918;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=156.467,65.8744;QD=58.0308;RBI=0.0220152,0.0289624;REFB=0,0;REVB=-0.0165182,-0.00969418;RO=0;SAF=12,45;SAR=1,49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-3.00075e-08,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.0787728,-0.00472458;OID=.,.;OPOS=53659047,53659047;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:52:107:107:0:0:13,94:13,94:0.121495,0.878505:1,49:12,45:0:0:1,49:12,45:0:0
chrX	54040987	.	G	A	203.65	PASS	AF=0.857143;AO=18;DP=21;FAO=18;FDP=21;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=3;FWDB=0.0644369;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=179.451;QD=38.7899;RBI=0.064449;REFB=0.0209795;REVB=0.00124778;RO=0;SAF=8;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.565147;STBP=0.194;TYPE=snp;VARB=-0.00772194;OID=.;OPOS=54040987;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:14:21:21:0:3:18:18:0.857143:10:8:0:0:10:8:0:3
chrX	54275428	.	C	CT,T	33.68	PASS	AF=0.2,0;AO=4,2;DP=35;FAO=7,0;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=5,0;FSAR=2,0;FSRF=9;FSRR=19;FWDB=-0.100505,-0.0227106;FXX=0;HRUN=2,1;LEN=1,1;MLLD=20.4776,287.173;QD=3.8493;RBI=0.113259,0.0227364;REFB=-0.0408028,0.0015852;REVB=-0.0522138,-0.00108328;RO=29;SAF=4,1;SAR=0,1;SRF=9;SRR=20;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.689774,0.181313;STB=0.788743,0.5;STBP=0.121,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.116286,0;OID=.,.;OPOS=54275429,54275428;OREF=-,C;OALT=T,T;OMAPALT=CT,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:34:35:35:29:28:4,2:7,0:0.2,0:0,1:4,1:9:20:2,0:5,0:9:19
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chrX	54836505	.	A	G	446.46	PASS	AF=0.941176;AO=32;DP=34;FAO=32;FDP=34;FR=.;FRO=2;FSAF=27;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0234892;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=271.731;QD=52.5247;RBI=0.0349003;REFB=-0.140294;REVB=-0.0258125;RO=2;SAF=27;SAR=5;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.154328;STB=0.583276;STBP=0.011;TYPE=snp;VARB=0.00100469;OID=.;OPOS=54836505;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:34:34:2:2:32:32:0.941176:5:27:0:2:5:27:0:2
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chrX	54838077	.	C	T	452.98	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=23;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0182911;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=45.8418;QD=54.907;RBI=0.0279797;REFB=-0.11145;REVB=-0.0211731;RO=1;SAF=23;SAR=9;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0490584;STB=0.526299;STBP=0.164;TYPE=snp;VARB=0.0193551;OID=.;OPOS=54838077;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:9:23:0:1:9:23:0:1
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chrX	55116466	.	C	G	937.19	PASS	AF=1;AO=64;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0288521;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=61.7681;QD=58.5746;RBI=0.0841883;REFB=0;REVB=0.07909;RO=0;SAF=47;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.23474e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00083188;OID=.;OPOS=55116466;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:64:64:1:17:47:0:0:17:47:0:0
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chrX	55514818	.	C	T	565.05	PASS	AF=0.928571;AO=38;DP=41;FAO=39;FDP=42;FR=.;FRO=3;FSAF=17;FSAR=22;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.100261;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.1103;QD=53.8142;RBI=0.101779;REFB=-0.0156917;REVB=0.0175115;RO=3;SAF=17;SAR=21;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0757762;STB=0.54052;STBP=0.075;TYPE=snp;VARB=0.00493236;OID=.;OPOS=55514818;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:41:42:3:3:38:39:0.928571:21:17:3:0:22:17:3:0
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chrX	57163183	.	G	A	74.98	PASS	AF=1;AO=6;DP=8;FAO=8;FDP=8;FR=.;FRO=0;FSAF=3;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000527428;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=228.98;QD=37.4885;RBI=0.0227889;REFB=0;REVB=0.0227828;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000269404;OID=.;OPOS=57163183;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:8:8:0:0:6:8:1:3:3:0:0:5:3:0:0
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chrX	57622607	.	G	A	613.36	PASS	AF=1;AO=40;DP=40;FAO=40;FDP=40;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00589363;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=238.887;QD=61.3363;RBI=0.0320399;REFB=0;REVB=0.0314932;RO=0;SAF=18;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.19993e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.41348e-05;OID=.;OPOS=57622607;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:40:40:0:0:40:40:1:22:18:0:0:22:18:0:0
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chrX	69258515	.	T	G	973.63	PASS	AF=0.971429;AO=68;DP=70;FAO=68;FDP=70;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0824037;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=40.2707;QD=55.6357;RBI=0.0826685;REFB=-0.153093;REVB=0.00661055;RO=1;SAF=39;SAR=29;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0160186;STB=0.502145;STBP=0.877;TYPE=snp;VARB=0.00605666;OID=.;OPOS=69258515;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:70:70:1:2:68:68:0.971429:29:39:0:1:29:39:1:1
chrX	69478749	.	G	T	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.111649;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.828;QD=40.7629;RBI=0.120231;REFB=0;REVB=0.0446085;RO=0;SAF=7;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00326874;OID=.;OPOS=69478749;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:3:7:0:0:3:7:0:0
chrX	69478942	.	T	G	1358.49	PASS	AF=1;AO=87;DP=87;FAO=87;FDP=87;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00979094;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=63.3832;QD=62.4595;RBI=0.0345794;REFB=0;REVB=0.0331643;RO=0;SAF=55;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.92665e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000296582;OID=.;OPOS=69478942;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:87:87:0:0:87:87:1:32:55:0:0:32:55:0:0
chrX	69489530	.	C	T	62.23	PASS	AF=1;AO=7;DP=7;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=4;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00810254;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=94.9675;QD=35.5612;RBI=0.0386226;REFB=0;REVB=-0.0377632;RO=0;SAF=4;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000774423;OID=.;OPOS=69489530;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:7:7:0:0:7:7:1:3:4:0:0:3:4:0:0
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chrX	71522726	.	GCC	GCA,GC	247.19	PASS	AF=0.0588235,0.607843;AO=2,31;DP=51;FAO=3,31;FDP=51;FR=.;FRO=17;FSAF=0,19;FSAR=3,12;FSRF=9;FSRR=8;FWDB=-0.0688053,-0.0534934;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=166.611,15.5319;QD=19.3874;RBI=0.0809175,0.0585173;REFB=-0.0213082,-0.223344;REVB=-0.0425848,-0.0237221;RO=17;SAF=0,18;SAR=2,13;SRF=9;SRR=8;SSEN=0,0.302763;SSEP=0,0;SSSB=-0.540081,0.0337771;STB=0.996349,0.530706;STBP=0.078,0.579;TYPE=snp,del;VARB=0.04105,0.156016;OID=.,.;OPOS=71522728,71522727;OREF=C,C;OALT=A,-;OMAPALT=GCA,GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.0588235,0.607843:2,31:51:3,31:51:17:0,19:3,12:9:8:99:17:0,18:2,13:9:8
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chrX	73066439	.	T	C	375.94	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0277156;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.935;QD=55.6952;RBI=0.0308377;REFB=0;REVB=0.0135207;RO=0;SAF=19;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.63811e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000288617;OID=.;OPOS=73066439;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:7:19:0:0:7:20:0:0
chrX	73462520	.	T	C,G	742.17	PASS	AF=0.962264,0.0377358;AO=51,2;DP=53;FAO=51,2;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=21,0;FSAR=30,2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.010034,0.000723315;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=141.929,169.689;QD=56.0131;RBI=0.0365531,0.0046289;REFB=0,0;REVB=0.0351489,-0.00457204;RO=0;SAF=21,0;SAR=30,2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.000495252,0.0626405;OID=.,.;OPOS=73462520,73462520;OREF=T,T;OALT=C,G;OMAPALT=C,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:53:53:0:0:51,2:51,2:0.962264,0.0377358:30,2:21,0:0:0:30,2:21,0:0:0
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chrX	73812586	.	T	C	1055.39	PASS	AF=0.972973;AO=71;DP=75;FAO=72;FDP=74;FR=.;FRO=2;FSAF=38;FSAR=34;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0348216;FXX=0.038956;HRUN=1;LEN=1;MLLD=141.225;QD=57.0482;RBI=0.051929;REFB=-0.197408;REVB=0.0385238;RO=2;SAF=37;SAR=34;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0248734;STB=0.512817;STBP=0.241;TYPE=snp;VARB=0.0027445;OID=.;OPOS=73812586;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:4:75:74:2:2:71:72:0.972973:34:37:2:0:34:38:2:0
chrX	74494470	.	T	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0507925;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=302.919;QD=55.6561;RBI=0.0569607;REFB=0;REVB=0.0257806;RO=0;SAF=11;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5146e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190471;OID=.;OPOS=74494470;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:16:11:0:0:16:11:0:0
chrX	74511202	.	G	C	1535.29	PASS	AF=1;AO=96;DP=96;FAO=97;FDP=97;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0522059;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.4727;QD=63.3111;RBI=0.0593463;REFB=0;REVB=0.028223;RO=0;SAF=46;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.54587e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000631154;OID=.;OPOS=74511202;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:96:97:0:0:96:97:1:50:46:0:0:51:46:0:0
chrX	74513283	.	A	G	260.44	PASS	AF=1;AO=20;DP=21;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044363;FXX=0.0475964;HRUN=4;LEN=1;MLLD=150.875;QD=52.087;RBI=0.0569287;REFB=0;REVB=0.0356763;RO=0;SAF=9;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.0487e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000411031;OID=.;OPOS=74513283;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:20:0:0:20:20:1:11:9:0:0:11:9:0:0
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chrX	75004529	.	C	A	865.56	PASS	AF=1;AO=58;DP=60;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=33;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0550345;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.4432;QD=57.7037;RBI=0.0741329;REFB=0;REVB=-0.0496678;RO=0;SAF=27;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.07727e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000370926;OID=.;OPOS=75004529;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:60:0:0:58:60:1:31:27:0:0:33:27:0:0
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chrX	77528317	.	G	A	747.09	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0203435;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=181.136;QD=63.5822;RBI=0.0214857;REFB=0;REVB=0.00691193;RO=0;SAF=23;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.43037e-05;OID=.;OPOS=77528317;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:24:23:0:0:24:23:0:0
chrX	78011737	.	T	C	648.73	PASS	AF=1;AO=41;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0515976;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=73.2165;QD=61.7835;RBI=0.0979741;REFB=0;REVB=0.0832864;RO=0;SAF=24;SAR=17;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-6.2194e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205851;OID=.;OPOS=78011737;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:41:42:1:17:24:0:0:18:24:0:0
chrX	78426988	.	T	C	896.14	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0438346;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.942;QD=57.8153;RBI=0.0455822;REFB=0;REVB=0.0125007;RO=0;SAF=29;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.03186e-05;OID=.;OPOS=78426988;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:62:0:0:61:62:1:32:29:0:0:32:30:0:0
chrX	79943569	.	T	C	1749.71	PASS	AF=1;AO=112;DP=113;FAO=116;FDP=116;FR=.;FRO=0;FSAF=67;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00382456;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=56.516;QD=60.3349;RBI=0.0649486;REFB=0;REVB=0.0648359;RO=0;SAF=63;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.39806e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00075353;OID=.;OPOS=79943569;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:113:116:0:0:112:116:1:49:63:0:0:49:67:0:0
chrX	79989018	.	C	G	589.47	PASS	AF=1;AO=37;DP=38;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0286041;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=107.081;QD=60.458;RBI=0.0297237;REFB=0;REVB=0.00808117;RO=0;SAF=17;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.71161e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000318213;OID=.;OPOS=79989018;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:39:0:0:37:39:1:20:17:0:0:20:19:0:0
chrX	79991499	.	GTTTTTA	GTTTTA,GTTTTAT	913.11	PASS	AF=0.94958,0.0504202;AO=19,6;DP=122;FAO=113,6;FDP=119;FR=.;FRO=0;FSAF=40,6;FSAR=73,0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.379156,-0.0484943;FXX=0.0555511;HRUN=5,5;LEN=1,2;MLLD=9.32944,234.826;QD=30.6929;RBI=0.986015,0.088855;REFB=0,0;REVB=0.910202,0.0744548;RO=80;SAF=14,6;SAR=5,0;SRF=13;SRR=67;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.645901,0.742124;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=del,mnp;VARB=0.0286849,-0.171485;OID=.,.;OPOS=79991500,79991504;OREF=T,TA;OALT=-,AT;OMAPALT=GTTTTA,GTTTTAT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/2:0.94958,0.0504202:19,6:122:113,6:119:0:40,6:73,0:0:0:10:80:14,6:5,0:13:67
chrX	80185294	.	G	A	739.86	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=52;FDP=52;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00568174;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4216;QD=56.9124;RBI=0.0470274;REFB=0;REVB=-0.0466829;RO=0;SAF=26;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00033606;OID=.;OPOS=80185294;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:52:0:0:52:52:1:26:26:0:0:26:26:0:0
chrX	80370171	.	CT	C,TC	79.26	PASS	AF=0.458333,0.0208333;AO=22,2;DP=49;FAO=22,1;FDP=48;FR=.;FRO=25;FSAF=20,0;FSAR=2,1;FSRF=17;FSRR=8;FWDB=0.0723815,-0.0036856;FXX=0.020404;HRUN=7,1;LEN=1,2;MLLD=8.24496,17.0037;QD=6.60512;RBI=0.242048,0.116146;REFB=-0.0644121,-0.0334411;REVB=0.230972,0.116087;RO=18;SAF=20,1;SAR=2,1;SRF=12;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.372972,-0.170612;STB=0.729662,0.993153;STBP=0.033,0.256;TYPE=del,mnp;VARB=0.115919,-0.106333;OID=.,.;OPOS=80370172,80370171;OREF=T,CT;OALT=-,TC;OMAPALT=C,TC	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:49:48:18:25:22,2:22,1:0.458333,0.0208333:2,1:20,1:12:6:2,1:20,0:17:8
chrX	83371299	.	TA	T	40.76	PASS	AF=0.333333;AO=25;DP=69;FAO=23;FDP=69;FR=.;FRO=46;FSAF=15;FSAR=8;FSRF=27;FSRR=19;FWDB=-0.0562821;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=7.76693;QD=2.36313;RBI=0.0606982;REFB=-0.0793875;REVB=-0.0227289;RO=34;SAF=17;SAR=8;SRF=20;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.101811;STB=0.546517;STBP=0.582;TYPE=del;VARB=0.0778414;OID=.;OPOS=83371300;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.333333:25:69:23:69:46:15:8:27:19:40:34:17:8:20:14
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chrX	84563135	.	T	A	2170.15	PASS	AF=1;AO=133;DP=133;FAO=138;FDP=138;FR=.;FRO=0;FSAF=88;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0157946;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=326.493;QD=62.9028;RBI=0.0308599;REFB=0;REVB=0.0265115;RO=0;SAF=87;SAR=46;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000282099;OID=.;OPOS=84563135;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:133:138:0:0:133:138:1:46:87:0:0:50:88:0:0
chrX	88008423	.	A	C	1125.05	PASS	AF=0.986842;AO=75;DP=77;FAO=75;FDP=76;FR=.;FRO=1;FSAF=44;FSAR=31;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0711069;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=53.3044;QD=59.2133;RBI=0.0935061;REFB=-0.126602;REVB=0.0607224;RO=0;SAF=44;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505616;STBP=0.528;TYPE=snp;VARB=0.00329792;OID=.;OPOS=88008423;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:77:76:0:1:75:75:0.986842:31:44:0:0:31:44:1:0
chrX	88009322	.	A	G	1456.58	PASS	AF=1;AO=92;DP=93;FAO=92;FDP=92;FR=.;FRO=0;FSAF=53;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216435;FXX=0.0107515;HRUN=3;LEN=1;MLLD=268.355;QD=63.3297;RBI=0.021654;REFB=0;REVB=0.000672966;RO=0;SAF=53;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-1.40242e-05;OID=.;OPOS=88009322;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:92:0:0:92:92:1:39:53:0:0:39:53:0:0
chrX	88009687	.	CCAGA	C	270.67	PASS	AF=1;AO=22;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0178455;FXX=0;HRUN=2;LEN=4;MLLD=355.541;QD=45.1115;RBI=0.0222646;REFB=0;REVB=0.0133135;RO=0;SAF=13;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2029e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-9.59514e-06;OID=.;OPOS=88009688;OREF=CAGA;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:22:24:24:24:0:14:10:0:0:5:0:13:9:0:0
chrX	88009700	.	T	C	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0356504;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.314;QD=55.6549;RBI=0.0369585;REFB=0;REVB=0.00974575;RO=0;SAF=15;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000165889;OID=.;OPOS=88009700;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:12:15:0:0:12:15:0:0
chrX	89177673	.	G	A	195.37	PASS	AF=1;AO=15;DP=17;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00305922;FXX=0.0587889;HRUN=1;LEN=1;MLLD=235.941;QD=48.8422;RBI=0.00611077;REFB=0;REVB=0.00528986;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.58115e-06;OID=.;OPOS=89177673;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:16:0:0:15:16:1:10:5:0:0:10:6:0:0
chrX	91585410	.	A	G	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0319298;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=248.856;QD=23.2186;RBI=0.0421424;REFB=0.0236022;REVB=0.0275039;RO=0;SAF=3;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571154;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=3.53943e-05;OID=.;OPOS=91585410;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:0:1:5:5:0.833333:2:3:0:0:2:3:1:0
chrX	91873533	.	C	T	340.73	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0263053;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=214.046;QD=54.5175;RBI=0.0671742;REFB=0;REVB=0.0618094;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000377685;OID=.;OPOS=91873533;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0
chrX	92966191	.	T	A	64.13	PASS	AF=0.132867;AO=25;DP=127;FAO=19;FDP=143;FR=.;FRO=124;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=52;FSRR=72;FWDB=-0.0766983;FXX=0;HRUN=8;LEN=1;MLLD=34.2305;QD=1.79393;RBI=0.0767757;REFB=-0.00336779;REVB=-0.00344675;RO=96;SAF=23;SAR=2;SRF=32;SRR=64;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.701596;STB=0.678902;STBP=0.099;TYPE=snp;VARB=0.0578458;OID=.;OPOS=92966191;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:127:143:96:124:25:19:0.132867:2:23:32:64:7:12:52:72
chrX	99355146	.	C	T	549.14	PASS	AF=1;AO=36;DP=38;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00123335;FXX=0.0263089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.801;QD=59.3668;RBI=0.00396837;REFB=0;REVB=-0.00377185;RO=0;SAF=18;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000459836;OID=.;OPOS=99355146;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:38:37:0:0:36:37:1:18:18:0:0:18:19:0:0
chrX	99548478	.	C	T	306.64	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0126032;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=100.435;QD=53.3283;RBI=0.0526632;REFB=0;REVB=0.0511329;RO=0;SAF=20;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.80459e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000413598;OID=.;OPOS=99548478;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:23:0:0:22:23:1:2:20:0:0:2:21:0:0
chrX	99663194	.	G	T	687.09	PASS	AF=1;AO=43;DP=45;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0488295;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=72.1572;QD=61.075;RBI=0.0894689;REFB=0;REVB=0.0749692;RO=1;SAF=27;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284424;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00171553;OID=.;OPOS=99663194;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:45:1:0:43:45:1:16:27:0:1:17:28:0:0
chrX	99941705	.	T	C	255.92	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=20;FDP=20;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0424053;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.444;QD=51.1842;RBI=0.0958494;REFB=0;REVB=0.0859587;RO=0;SAF=13;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00248963;OID=.;OPOS=99941705;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:20:0:0:20:20:1:7:13:0:0:7:13:0:0
chrX	100243459	.	G	T	1089.3	PASS	AF=1;AO=72;DP=73;FAO=73;FDP=73;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.000873182;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=132.823;QD=59.6877;RBI=0.013113;REFB=0;REVB=0.0130839;RO=0;SAF=33;SAR=39;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.32189e-05;OID=.;OPOS=100243459;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:73:73:0:0:72:73:1:39:33:0:0:39:34:0:0
chrX	100245606	.	A	G	703.83	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.029594;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.823;QD=61.2025;RBI=0.0446331;REFB=0;REVB=0.0334112;RO=1;SAF=29;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0284632;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000553992;OID=.;OPOS=100245606;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:46:46:1:0:45:46:1:16:29:0:1:17:29:0:0
chrX	100543990	.	T	C	395.18	PASS	AF=0.966667;AO=28;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=9;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0131829;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=54.279;QD=52.6908;RBI=0.0995691;REFB=-0.0389961;REVB=0.0986925;RO=1;SAF=9;SAR=19;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0489106;STB=0.526297;STBP=0.268;TYPE=snp;VARB=0.0124295;OID=.;OPOS=100543990;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:28:29:0.966667:19:9:1:0:20:9:1:0
chrX	100547933	.	A	G	1194.37	PASS	AF=0.9875;AO=79;DP=80;FAO=79;FDP=80;FR=.;FRO=1;FSAF=40;FSAR=39;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0207059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=72.5912;QD=59.7187;RBI=0.0249591;REFB=-0.1308;REVB=-0.0139362;RO=1;SAF=40;SAR=39;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0116883;STB=0.506171;STBP=0.523;TYPE=snp;VARB=0.0014052;OID=.;OPOS=100547933;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:80:80:1:1:79:79:0.9875:39:40:1:0:39:40:1:0
chrX	100608191	.	G	A	1116.97	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=31;FSAR=43;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00310302;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.151;QD=60.3766;RBI=0.0196781;REFB=0;REVB=-0.0194319;RO=0;SAF=31;SAR=43;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-3.10055e-05;OID=.;OPOS=100608191;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:74:0:0:74:74:1:43:31:0:0:43:31:0:0
chrX	100743037	.	C	T	724.92	PASS	AF=1;AO=49;DP=49;FAO=51;FDP=51;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0271089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=244.223;QD=56.8565;RBI=0.0282951;REFB=0;REVB=0.00810669;RO=0;SAF=24;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.49836e-05;OID=.;OPOS=100743037;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:51:0:0:49:51:1:25:24:0:0:25:26:0:0
chrX	100743826	.	A	G	371.33	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0251169;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=88.8357;QD=55.0117;RBI=0.0791964;REFB=0;REVB=0.075108;RO=0;SAF=23;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34264e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000488791;OID=.;OPOS=100743826;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:25:27:1:2:23:0:0:4:23:0:0
chrX	100745825	.	T	C	175.68	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0123499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.538;QD=46.848;RBI=0.0266807;REFB=0;REVB=0.0236504;RO=0;SAF=5;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.33037e-05;OID=.;OPOS=100745825;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:15:0:0:15:15:1:10:5:0:0:10:5:0:0
chrX	100748078	.	A	G	289.32	PASS	AF=1;AO=22;DP=22;FAO=22;FDP=22;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0431623;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=78.5383;QD=52.603;RBI=0.0435482;REFB=0;REVB=-0.00578452;RO=0;SAF=12;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000617158;OID=.;OPOS=100748078;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:22:22:0:0:22:22:1:10:12:0:0:10:12:0:0
chrX	100749127	.	A	G	165.62	PASS	AF=1;AO=12;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=14;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00784582;FXX=0.0666222;HRUN=1;LEN=1;MLLD=240.668;QD=47.3202;RBI=0.00784582;REFB=0;REVB=0;RO=0;SAF=12;SAR=0;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00231043;OID=.;OPOS=100749127;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:12:14:1:0:12:0:0:0:14:0:0
chrX	100911066	.	C	T	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0210056;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=136.206;QD=51.9163;RBI=0.0330785;REFB=0;REVB=0.025553;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.08223e-05;OID=.;OPOS=100911066;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0
chrX	101092507	.	C	T	1135.26	PASS	AF=1;AO=74;DP=74;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=46;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00733767;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=262.233;QD=60.5471;RBI=0.0264492;REFB=0;REVB=0.025411;RO=0;SAF=45;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.97903e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.35813e-05;OID=.;OPOS=101092507;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:74:75:0:0:74:75:1:29:45:0:0:29:46:0:0
chrX	101138792	.	T	C	306.3	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0418804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.905;QD=53.2695;RBI=0.0614852;REFB=0;REVB=0.0450163;RO=0;SAF=8;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000524223;OID=.;OPOS=101138792;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:15:8:0:0:15:8:0:0
chrX	101265309	.	T	G	671.8	PASS	AF=0.960784;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=51;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=18;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0525812;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=61.3855;QD=52.69;RBI=0.0528006;REFB=-0.0139058;REVB=-0.00480762;RO=1;SAF=31;SAR=18;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.014941;STB=0.515619;STBP=0.31;TYPE=snp;VARB=0.00260765;OID=.;OPOS=101265309;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:8:50:51:1:2:49:49:0.960784:18:31:1:0:18:31:2:0
chrX	101395780	.	T	G,TG	355.51	PASS	AF=0,0.970588;AO=4,22;DP=36;FAO=0,33;FDP=34;FR=.;FRO=1;FSAF=0,18;FSAR=0,15;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0672485,0.262945;FXX=0;HRUN=2,3;LEN=1,1;MLLD=7.98384,15.2402;QD=41.8251;RBI=0.067668,0.267537;REFB=-0.00162497,-0.000738346;REVB=-0.0075229,-0.0493546;RO=10;SAF=2,9;SAR=2,13;SRF=9;SRR=1;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.464453,-0.273261;STB=0.5,0.516119;STBP=1,0.324;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.0109583;OID=.,.;OPOS=101395780,101395781;OREF=T,-;OALT=G,G;OMAPALT=G,TG	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:4:36:34:10:1:4,22:0,33:0,0.970588:2,13:2,9:9:1:0,15:0,18:0:1
chrX	101396157	.	C	T	328.29	PASS	AF=0.964286;AO=21;DP=29;FAO=27;FDP=28;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=9;FSAR=18;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.152876;FXX=0.0344709;HRUN=2;LEN=1;MLLD=36.1245;QD=46.8981;RBI=0.15306;REFB=-0.0832402;REVB=0.0074915;RO=2;SAF=4;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.18273;STB=0.526296;STBP=0.282;TYPE=snp;VARB=0.0206206;OID=.;OPOS=101396157;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:29:28:2:1:21:27:0.964286:17:4:2:0:18:9:1:0
chrX	101913525	.	T	C	1062.44	PASS	AF=1;AO=71;DP=71;FAO=71;FDP=71;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012908;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.822;QD=59.8556;RBI=0.029259;REFB=0;REVB=0.0262579;RO=0;SAF=36;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.11607e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.81427e-05;OID=.;OPOS=101913525;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:71:0:0:71:71:1:35:36:0:0:35:36:0:0
chrX	101913805	.	G	C	323.47	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00966816;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.597;QD=53.9112;RBI=0.0174597;REFB=0;REVB=0.0145385;RO=0;SAF=11;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.09658e-05;OID=.;OPOS=101913805;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:13:11:0:0:13:11:0:0
chrX	102529190	.	C	G	670.15	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=43;FDP=43;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00290444;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=57.435;QD=62.3394;RBI=0.00402527;REFB=0;REVB=-0.00278693;RO=0;SAF=22;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.39256e-06;OID=.;OPOS=102529190;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:43:0:0:43:43:1:21:22:0:0:21:22:0:0
chrX	102564583	.	A	G	542.16	PASS	AF=1;AO=36;DP=37;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0165976;FXX=0.0270197;HRUN=3;LEN=1;MLLD=217.99;QD=60.24;RBI=0.0169494;REFB=0;REVB=0.00343526;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000112272;OID=.;OPOS=102564583;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0
chrX	102979486	.	T	C	754.82	PASS	AF=1;AO=52;DP=52;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0312469;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=134.1;QD=56.9672;RBI=0.0623461;REFB=0;REVB=0.0539506;RO=0;SAF=38;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000358349;OID=.;OPOS=102979486;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:52:53:0:0:52:53:1:14:38:0:0:15:38:0:0
chrX	103046526	.	TG	T	430.31	PASS	AF=1;AO=35;DP=41;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0319151;FXX=0.0232504;HRUN=5;LEN=1;MLLD=18.707;QD=40.9821;RBI=0.0716856;REFB=-0.0222494;REVB=0.0641892;RO=1;SAF=27;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0549101;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0035814;OID=.;OPOS=103046527;OREF=G;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:35:41:42:42:0:28:14:0:0:7:1:27:8:0:1
chrX	103267865	.	C	T	1120.78	PASS	AF=1;AO=74;DP=76;FAO=74;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=38;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0648956;FXX=0.0263123;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.2197;QD=60.5827;RBI=0.0942835;REFB=0;REVB=0.0683955;RO=0;SAF=38;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.79579e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000404672;OID=.;OPOS=103267865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:74:0:0:74:74:1:36:38:0:0:36:38:0:0
chrX	103268333	.	G	A	529.43	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0297593;FXX=0.0270197;HRUN=1;LEN=1;MLLD=194.126;QD=58.825;RBI=0.0305633;REFB=0;REVB=-0.00696398;RO=0;SAF=16;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.1382e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000350158;OID=.;OPOS=103268333;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:36:0:0:35:36:1:19:16:0:0:19:17:0:0
chrX	104464276	.	CA	C	172.22	PASS	AF=1;AO=14;DP=15;FAO=15;FDP=15;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0910324;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=26.8674;QD=45.9254;RBI=0.155146;REFB=0;REVB=-0.125632;RO=0;SAF=7;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=-0.0162396;OID=.;OPOS=104464277;OREF=A;OALT=-;OMAPALT=C	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:14:15:15:15:0:7:8:0:0:4:0:7:7:0:0
chrX	104464281	.	TC	T	149.27	PASS	AF=1;AO=12;DP=16;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.194633;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=14.5693;QD=37.3163;RBI=0.235577;REFB=0;REVB=0.13272;RO=2;SAF=5;SAR=7;SRF=1;SRR=1;SSEN=0.30137;SSEP=0;SSSB=-0.0218866;STB=0.5;STBP=1;TYPE=del;VARB=0.0294038;OID=.;OPOS=104464282;OREF=C;OALT=-;OMAPALT=T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:12:16:16:16:0:7:9:0:0:3:2:5:7:1:1
chrX	104992963	.	T	C	910.41	PASS	AF=1;AO=55;DP=63;FAO=63;FDP=63;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=33;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0024449;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=171.586;QD=57.8038;RBI=0.0986641;REFB=0;REVB=0.0986338;RO=0;SAF=33;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000109885;OID=.;OPOS=104992963;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:63:63:0:0:55:63:1:22:33:0:0:30:33:0:0
chrX	105011105	.	G	T	632.24	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0130375;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=96.9199;QD=61.6818;RBI=0.0171584;REFB=0;REVB=-0.0111551;RO=0;SAF=21;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.02085e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.30101e-06;OID=.;OPOS=105011105;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:20:21:0:0:20:21:0:0
chrX	105152282	.	G	A	1624.41	PASS	AF=1;AO=108;DP=108;FAO=108;FDP=108;FR=.;FRO=0;FSAF=66;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133678;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=184.99;QD=60.1635;RBI=0.0151902;REFB=0;REVB=-0.00721425;RO=0;SAF=66;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.02184e-06;OID=.;OPOS=105152282;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:108:108:0:0:108:108:1:42:66:0:0:42:66:0:0
chrX	105153001	.	A	G	406.68	PASS	AF=0.9375;AO=30;DP=32;FAO=30;FDP=32;FR=.;FRO=2;FSAF=11;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0725139;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=45.3139;QD=50.8354;RBI=0.0827676;REFB=-0.145521;REVB=0.0399026;RO=0;SAF=11;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.524984;STBP=0.352;TYPE=snp;VARB=0.0135354;OID=.;OPOS=105153001;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:32:32:0:2:30:30:0.9375:19:11:0:0:19:11:0:2
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chrX	111698613	.	T	C	632.26	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00503912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.287;QD=61.6835;RBI=0.0231083;REFB=0;REVB=0.0225522;RO=0;SAF=22;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001347;OID=.;OPOS=111698613;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:19:22:0:0:19:22:0:0
chrX	111699028	.	T	C	340.74	PASS	AF=1;AO=25;DP=25;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0144187;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=277.574;QD=54.5177;RBI=0.0147501;REFB=0;REVB=-0.00310912;RO=0;SAF=16;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.67642e-05;OID=.;OPOS=111699028;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:25:25:0:0:25:25:1:9:16:0:0:9:16:0:0
chrX	111700104	.	GC	TT	294.88	PASS	AF=1;AO=20;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0990514;FXX=0;HRUN=1;LEN=2;MLLD=218.754;QD=51.2836;RBI=0.124812;REFB=0;REVB=0.0759398;RO=0;SAF=7;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=mnp;VARB=0.0073194;OID=.;OPOS=111700104;OREF=GC;OALT=TT;OMAPALT=TT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:20:23:1:13:7:0:0:13:10:0:0
chrX	114425400	.	G	A	57.08	PASS	AF=0.875;AO=7;DP=8;FAO=7;FDP=8;FR=.;FRO=1;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0326373;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=97.9052;QD=28.5382;RBI=0.0571096;REFB=-0.136532;REVB=0.0468649;RO=1;SAF=2;SAR=5;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.173072;STB=0.599698;STBP=0.285;TYPE=snp;VARB=0.0175392;OID=.;OPOS=114425400;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:8:8:1:1:7:7:0.875:5:2:1:0:5:2:1:0
chrX	114426171	.	C	T	45.6	PASS	AF=0.857143;AO=6;DP=7;FAO=6;FDP=7;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=3;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0367495;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=51.3885;QD=26.0547;RBI=0.0475862;REFB=0.00255072;REVB=0.0302312;RO=0;SAF=3;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.571194;STBP=0.516;TYPE=snp;VARB=0.00369753;OID=.;OPOS=114426171;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:7:7:0:1:6:6:0.857143:3:3:0:0:3:3:1:0
chrX	114426917	.	C	T	384.61	PASS	AF=0.935484;AO=28;DP=31;FAO=29;FDP=31;FR=.;FRO=2;FSAF=23;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0519566;FXX=0.0312402;HRUN=1;LEN=1;MLLD=144.645;QD=49.6271;RBI=0.0680115;REFB=-0.125098;REVB=0.043887;RO=2;SAF=22;SAR=6;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0507935;STB=0.527849;STBP=0.343;TYPE=snp;VARB=0.00250329;OID=.;OPOS=114426917;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:31:31:2:2:28:29:0.935484:6:22:1:1:6:23:1:1
chrX	115304830	.	A	G	766.44	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0173948;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=207.956;QD=63.8698;RBI=0.0270481;REFB=0;REVB=0.0207128;RO=0;SAF=21;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.96795e-05;OID=.;OPOS=115304830;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:27:21:0:0:27:21:0:0
chrX	115305126	.	A	C	237.33	PASS	AF=0.869565;AO=20;DP=22;FAO=20;FDP=23;FR=.;FRO=3;FSAF=8;FSAR=12;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0598122;FXX=0;HRUN=6;LEN=1;MLLD=201.592;QD=41.2755;RBI=0.0608367;REFB=-0.185246;REVB=0.0111178;RO=0;SAF=8;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.535678;STBP=0.469;TYPE=snp;VARB=0.00140141;OID=.;OPOS=115305126;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:22:23:0:3:20:20:0.869565:12:8:0:0:12:8:2:1
chrX	115590299	.	C	G	898.84	PASS	AF=1;AO=61;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.01979;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.3525;QD=57.9898;RBI=0.043162;REFB=0;REVB=0.0383577;RO=0;SAF=26;SAR=35;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000185697;OID=.;OPOS=115590299;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:61:62:1:35:26:0:0:36:26:0:0
chrX	117527020	.	C	T	805.19	PASS	AF=1;AO=50;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=37;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0104545;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=131.434;QD=64.4154;RBI=0.0105568;REFB=0;REVB=-0.0014666;RO=0;SAF=37;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.32377e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.10299e-05;OID=.;OPOS=117527020;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:50:50:1:13:37:0:0:13:37:0:0
chrX	117528142	.	C	T	692.53	PASS	AF=0.978261;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=46;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00262669;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=268.098;QD=60.2199;RBI=0.0189089;REFB=-0.0996331;REVB=0.0187256;RO=1;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0191802;STB=0.5102;STBP=0.514;TYPE=snp;VARB=0.000327892;OID=.;OPOS=117528142;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:46:46:1:1:45:45:0.978261:24:21:0:1:24:21:0:1
chrX	117700141	.	A	G	549.66	PASS	AF=0.95;AO=37;DP=40;FAO=38;FDP=40;FR=.;FRO=2;FSAF=16;FSAR=22;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.108494;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=50.5641;QD=54.9664;RBI=0.14091;REFB=-0.063781;REVB=0.0899146;RO=2;SAF=16;SAR=21;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0549974;STB=0.529396;STBP=0.154;TYPE=snp;VARB=0.0190499;OID=.;OPOS=117700141;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:40:40:2:2:37:38:0.95:21:16:2:0:22:16:2:0
chrX	118148229	.	A	G	789.88	PASS	AF=1;AO=47;DP=49;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.030266;FXX=0.019996;HRUN=1;LEN=1;MLLD=162.269;QD=64.48;RBI=0.037161;REFB=0;REVB=0.0215618;RO=0;SAF=33;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000162502;OID=.;OPOS=118148229;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:49:49:0:0:47:49:1:14:33:0:0:14:35:0:0
chrX	118219347	.	T	C	516.83	PASS	AF=1;AO=32;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=25;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0199454;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=227.398;QD=59.0659;RBI=0.06641;REFB=0;REVB=0.0633441;RO=0;SAF=25;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0001425;OID=.;OPOS=118219347;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:32:35:1:7:25:0:0:10:25:0:0
chrX	118220720	.	A	G	594.53	PASS	AF=1;AO=39;DP=39;FAO=39;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0258204;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=79.8958;QD=60.9772;RBI=0.0404764;REFB=0;REVB=-0.0311713;RO=0;SAF=21;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.34792e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.9212e-05;OID=.;OPOS=118220720;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:39:39:0:0:39:39:1:18:21:0:0:18:21:0:0
chrX	118222360	.	T	A	545.11	PASS	AF=0.973684;AO=37;DP=38;FAO=37;FDP=38;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0511092;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=60.9272;QD=57.3798;RBI=0.0581433;REFB=-0.0344565;REVB=-0.0277219;RO=1;SAF=21;SAR=16;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0283678;STB=0.515143;STBP=0.284;TYPE=snp;VARB=0.0137287;OID=.;OPOS=118222360;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:38:38:1:1:37:37:0.973684:16:21:0:1:16:21:0:1
chrX	118281538	.	C	A	727.45	PASS	AF=1;AO=45;DP=45;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00497476;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=81.3293;QD=63.2569;RBI=0.0441109;REFB=0;REVB=0.0438295;RO=0;SAF=33;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000417321;OID=.;OPOS=118281538;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:45:46:0:0:45:46:1:12:33:0:0:12:34:0:0
chrX	118587003	.	C	A,T	203.14	PASS	AF=0.117647,0.882353;AO=2,15;DP=17;FAO=2,15;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=2,5;FSAR=0,10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0230738,0.0202725;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=89.8559,177.235;QD=47.7983;RBI=0.0231601,0.0217105;REFB=0,0;REVB=-0.00199695,0.00777005;RO=0;SAF=2,5;SAR=0,10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=0.113913,0.000556174;OID=.,.;OPOS=118587003,118587003;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:10:17:17:0:0:2,15:2,15:0.117647,0.882353:0,10:2,5:0:0:0,10:2,5:0:0
chrX	118587321	.	A	G	411.08	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0333537;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=66.7523;QD=56.7008;RBI=0.0662025;REFB=0;REVB=0.0571865;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00139491;OID=.;OPOS=118587321;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:13:16:0:0:13:16:0:0
chrX	118603844	.	T	G	808.6	PASS	AF=0.966667;AO=58;DP=60;FAO=58;FDP=60;FR=.;FRO=2;FSAF=31;FSAR=27;FSRF=2;FSRR=0;FWDB=0.0017742;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=161.548;QD=53.9066;RBI=0.00913845;REFB=-0.0798182;REVB=-0.00896457;RO=2;SAF=31;SAR=27;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294628;STB=0.51562;STBP=0.223;TYPE=snp;VARB=0.00208381;OID=.;OPOS=118603844;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:60:60:2:2:58:58:0.966667:27:31:2:0:27:31:2:0
chrX	118604436	.	T	C	885.39	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=23;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0140665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=115.725;QD=58.0584;RBI=0.0150747;REFB=0;REVB=0.00542045;RO=0;SAF=23;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.89903e-05;OID=.;OPOS=118604436;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:38:23:0:0:38:23:0:0
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chrX	118893390	.	A	G	766.42	PASS	AF=1;AO=48;DP=48;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444282;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=80.2684;QD=63.868;RBI=0.049713;REFB=0;REVB=0.0223052;RO=0;SAF=18;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.73384e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000458558;OID=.;OPOS=118893390;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:48:48:0:0:48:48:1:30:18:0:0:30:18:0:0
chrX	119005705	.	C	G	375.68	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=6;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0444347;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.139;QD=55.6561;RBI=0.0444849;REFB=0;REVB=-0.00211457;RO=0;SAF=21;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000119557;OID=.;OPOS=119005705;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:6:21:0:0:6:21:0:0
chrX	119387833	.	C	A,CTGA	171.11	PASS	AF=0,0.73913;AO=3,12;DP=31;FAO=0,17;FDP=23;FR=.;FRO=6;FSAF=0,9;FSAR=0,8;FSRF=6;FSRR=0;FWDB=-0.061925,0.0421689;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,3;MLLD=57.0433,198.519;QD=29.7585;RBI=0.0968236,0.0445907;REFB=-0.00672951,0.000872596;REVB=-0.0744318,0.0144955;RO=16;SAF=3,5;SAR=0,7;SRF=11;SRR=5;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0.55716,-0.259872;STB=0.5,0.624864;STBP=1,0.057;TYPE=snp,ins;VARB=0,0.000760223;OID=.,.;OPOS=119387833,119387834;OREF=C,-;OALT=A,TGA;OMAPALT=A,CTGA	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:31:31:23:16:6:3,12:0,17:0,0.73913:0,7:3,5:11:5:0,8:0,9:6:0
chrX	119389966	.	C	T	207.12	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0250875;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=174.056;QD=48.7332;RBI=0.0285109;REFB=0;REVB=0.0135459;RO=0;SAF=9;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.126e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000193142;OID=.;OPOS=119389966;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:8:9:0:0:8:9:0:0
chrX	119390465	.	A	G	113.84	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=11;FDP=11;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.116163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=190.464;QD=41.3977;RBI=0.116165;REFB=0;REVB=0.000668586;RO=0;SAF=6;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00102338;OID=.;OPOS=119390465;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:11:0:0:10:11:1:4:6:0:0:4:7:0:0
chrX	119391880	.	G	A	428.99	PASS	AF=1;AO=30;DP=30;FAO=30;FDP=30;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00230717;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.87;QD=57.1984;RBI=0.0401428;REFB=0;REVB=0.0400765;RO=0;SAF=19;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000273148;OID=.;OPOS=119391880;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:30:0:0:30:30:1:11:19:0:0:11:19:0:0
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chrX	120008979	.	T	C	290.14	PASS	AF=1;AO=20;DP=20;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0322997;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=212.893;QD=50.4596;RBI=0.0553356;REFB=0;REVB=0.0449305;RO=0;SAF=14;SAR=6;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.5931e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000902377;OID=.;OPOS=120008979;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:20:23:0:0:20:23:1:6:14:0:0:7:16:0:0
chrX	122318386	.	A	AG,G	1455.36	PASS	AF=0.989247,0;AO=91,4;DP=97;FAO=92,0;FDP=93;FR=.;FRO=1;FSAF=55,0;FSAR=37,0;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0238149,-0.00641716;FXX=0.0412329;HRUN=0,1;LEN=1,1;MLLD=233.017,99.7897;QD=62.5963;RBI=0.0286126,0.00826898;REFB=-0.147382,-0.129321;REVB=0.0158597,0.00521499;RO=1;SAF=55,2;SAR=36,2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.00854135,-0.166656;STB=0.504503,0.5;STBP=0.509,1;TYPE=ins,snp;VARB=0.000129614,0;OID=.,.;OPOS=122318387,122318386;OREF=-,A;OALT=G,G;OMAPALT=AG,G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:97:93:1:1:91,4:92,0:0.989247,0:36,2:55,2:1:0:37,0:55,0:1:0
chrX	122336600	.	T	TG	557.08	PASS	AF=1;AO=47;DP=52;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=39;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0129679;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=22.0514;QD=44.5665;RBI=0.0465829;REFB=0;REVB=0.0447415;RO=5;SAF=9;SAR=38;SRF=4;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.157721;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.00178655;OID=.;OPOS=122336601;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=TG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:47:52:50:50:0:11:39:0:0:10:5:9:38:4:1
chrX	122338337	.	A	G	950.88	PASS	AF=1;AO=63;DP=64;FAO=65;FDP=65;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172756;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.012;QD=58.5155;RBI=0.0220587;REFB=0;REVB=0.0137163;RO=0;SAF=32;SAR=31;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000126691;OID=.;OPOS=122338337;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:65:0:0:63:65:1:31:32:0:0:32:33:0:0
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chrX	125298690	.	G	A	1482.18	PASS	AF=1;AO=99;DP=102;FAO=99;FDP=99;FR=.;FRO=0;FSAF=61;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.044278;FXX=0.0294089;HRUN=1;LEN=1;MLLD=185.499;QD=59.886;RBI=0.137168;REFB=0;REVB=0.129825;RO=0;SAF=61;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.5137e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000115522;OID=.;OPOS=125298690;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:102:99:0:0:99:99:1:38:61:0:0:38:61:0:0
chrX	125299188	.	T	G	272.56	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0111804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=146.65;QD=51.916;RBI=0.0317641;REFB=0;REVB=0.0297314;RO=0;SAF=8;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.14699e-05;OID=.;OPOS=125299188;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:13:8:0:0:13:8:0:0
chrX	125299467	.	G	T	1243.47	PASS	AF=0.965116;AO=83;DP=86;FAO=83;FDP=86;FR=.;FRO=3;FSAF=49;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=2;FWDB=0.054583;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=52.1665;QD=57.8359;RBI=0.0662294;REFB=-0.186583;REVB=0.0375103;RO=1;SAF=49;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00956859;STB=0.509236;STBP=0.412;TYPE=snp;VARB=0.00716043;OID=.;OPOS=125299467;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:7:86:86:1:3:83:83:0.965116:34:49:1:0:34:49:1:2
chrX	125954900	.	C	T	756.35	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=48;FDP=48;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0149947;FXX=0.020404;HRUN=1;LEN=1;MLLD=119.073;QD=63.029;RBI=0.0207052;REFB=0;REVB=0.0142781;RO=0;SAF=20;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000304629;OID=.;OPOS=125954900;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:46:48:0:0:46:48:1:26:20:0:0:27:21:0:0
chrX	125955199	.	T	C	759.67	PASS	AF=1;AO=53;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=30;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133569;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=249.219;QD=56.2719;RBI=0.026178;REFB=0;REVB=0.022514;RO=0;SAF=24;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000190691;OID=.;OPOS=125955199;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:53:54:1:29:24:0:0:30:24:0:0
chrX	128780176	.	A	AAGC	136.05	PASS	AF=0.7;AO=13;DP=25;FAO=14;FDP=20;FR=.;FRO=6;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=4;FSRR=2;FWDB=0.0580224;FXX=0;HRUN=2;LEN=3;MLLD=253.156;QD=27.2106;RBI=0.0919102;REFB=-0.0923312;REVB=0.0712804;RO=11;SAF=8;SAR=5;SRF=4;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.201895;STB=0.507801;STBP=0.961;TYPE=ins;VARB=0.0320311;OID=.;OPOS=128780177;OREF=-;OALT=AGC;OMAPALT=AAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.7:13:25:14:20:6:9:5:4:2:36:11:8:5:4:7
chrX	128781864	.	C	A	567.47	PASS	AF=0.926829;AO=35;DP=41;FAO=38;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=2;FSAF=18;FSAR=20;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=-0.0360555;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=109.775;QD=55.3631;RBI=0.0406377;REFB=-0.0624424;REVB=0.0187464;RO=2;SAF=15;SAR=20;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00735457;STB=0.501319;STBP=0.866;TYPE=snp;VARB=0.00447902;OID=.;OPOS=128781864;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:9:41:41:2:2:35:38:0.926829:20:15:1:1:20:18:1:1
chrX	128880614	.	T	C	1472.57	PASS	AF=1;AO=93;DP=93;FAO=93;FDP=93;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=44;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0374808;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=313.887;QD=63.3365;RBI=0.0379261;REFB=0;REVB=0.00579485;RO=0;SAF=49;SAR=44;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84593e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.71642e-05;OID=.;OPOS=128880614;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:93:93:0:0:93:93:1:44:49:0:0:44:49:0:0
chrX	129058882	.	T	C	302.3	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0347408;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.928;QD=52.5736;RBI=0.0588763;REFB=0;REVB=0.0475342;RO=0;SAF=14;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000319711;OID=.;OPOS=129058882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:7:14:0:0:9:14:0:0
chrX	129147079	.	T	C	668.66	PASS	AF=0.943396;AO=50;DP=54;FAO=50;FDP=53;FR=.;FRO=3;FSAF=37;FSAR=13;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.0147855;FXX=0.0185151;HRUN=2;LEN=1;MLLD=59.6112;QD=50.4647;RBI=0.0159386;REFB=-0.0506681;REVB=0.00595229;RO=4;SAF=37;SAR=13;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00180914;STB=0.505364;STBP=0.874;TYPE=snp;VARB=0.0106543;OID=.;OPOS=129147079;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:12:54:53:4:3:50:50:0.943396:13:37:3:1:13:37:2:1
chrX	129200301	.	C	G	411.12	PASS	AF=1;AO=29;DP=29;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429616;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=102.757;QD=56.7062;RBI=0.0444899;REFB=0;REVB=0.0115606;RO=0;SAF=15;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.92057e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000697481;OID=.;OPOS=129200301;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:29:29:0:0:29:29:1:14:15:0:0:14:15:0:0
chrX	130223137	.	G	A	971.98	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=67;FDP=67;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0153683;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=239.813;QD=58.0284;RBI=0.0244515;REFB=0;REVB=0.0190181;RO=0;SAF=25;SAR=36;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000504577;OID=.;OPOS=130223137;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:67:0:0:61:67:1:36:25:0:0:41:26:0:0
chrX	130408745	.	G	A	971.31	PASS	AF=0.945205;AO=68;DP=73;FAO=69;FDP=73;FR=.;FRO=4;FSAF=40;FSAR=29;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0563939;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=44.7668;QD=53.2227;RBI=0.0869674;REFB=-0.0328731;REVB=-0.0662047;RO=5;SAF=39;SAR=29;SRF=2;SRR=3;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0228217;STB=0.518423;STBP=0.21;TYPE=snp;VARB=0.00963608;OID=.;OPOS=130408745;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:13:73:73:5:4:68:69:0.945205:29:39:2:3:29:40:1:3
chrX	130415818	.	T	C	557.09	PASS	AF=1;AO=37;DP=37;FAO=37;FDP=37;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119938;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=84.8021;QD=60.2261;RBI=0.0327526;REFB=0;REVB=0.0304776;RO=0;SAF=29;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00027408;OID=.;OPOS=130415818;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:37:37:0:0:37:37:1:8:29:0:0:8:29:0:0
chrX	130416958	.	C	T	1582.12	PASS	AF=0.933333;AO=102;DP=110;FAO=112;FDP=120;FR=.;FRO=8;FSAF=73;FSAR=39;FSRF=2;FSRR=6;FWDB=0.129955;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=52.6431;QD=52.7373;RBI=0.134395;REFB=-0.143481;REVB=0.0342605;RO=8;SAF=63;SAR=39;SRF=2;SRR=6;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0528249;STB=0.52898;STBP=0.034;TYPE=snp;VARB=0.00632091;OID=.;OPOS=130416958;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:110:120:8:8:102:112:0.933333:39:63:2:6:39:73:2:6
chrX	130420006	.	T	C	754.43	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0429194;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=219.02;QD=56.9381;RBI=0.04397;REFB=0;REVB=0.0095544;RO=0;SAF=29;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.63852e-05;OID=.;OPOS=130420006;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:24:29:0:0:24:29:0:0
chrX	130420415	.	T	C	353.93	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0451488;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=69.5094;QD=54.4505;RBI=0.0692513;REFB=0;REVB=0.0525103;RO=0;SAF=17;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000123608;OID=.;OPOS=130420415;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:9:17:0:0:9:17:0:0
chrX	130678467	.	A	G	1133.43	PASS	AF=1;AO=75;DP=75;FAO=75;FDP=75;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0662968;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=110.525;QD=60.4498;RBI=0.068121;REFB=0;REVB=0.0156591;RO=0;SAF=43;SAR=32;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000119809;OID=.;OPOS=130678467;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:75:75:0:0:75:75:1:32:43:0:0:32:43:0:0
chrX	130678844	.	A	C	189.42	PASS	AF=1;AO=15;DP=15;FAO=16;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410979;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=230.281;QD=47.356;RBI=0.0414934;REFB=0;REVB=-0.00571536;RO=0;SAF=4;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.33019e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000435081;OID=.;OPOS=130678844;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:15:16:0:0:15:16:1:11:4:0:0:11:5:0:0
chrX	132437337	.	G	A	772.64	PASS	AF=0.98;AO=49;DP=50;FAO=49;FDP=50;FR=.;FRO=1;FSAF=21;FSAR=28;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0246719;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=170.507;QD=61.8115;RBI=0.0515276;REFB=-0.0361983;REVB=-0.0452371;RO=1;SAF=21;SAR=28;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021881;STB=0.511623;STBP=0.306;TYPE=snp;VARB=0.00172388;OID=.;OPOS=132437337;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:50:50:1:1:49:49:0.98:28:21:1:0:28:21:1:0
chrX	132438872	.	C	A	272.55	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=21;FDP=21;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00852912;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.7446;QD=51.9149;RBI=0.027583;REFB=0;REVB=-0.0262312;RO=0;SAF=13;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000471543;OID=.;OPOS=132438872;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:21:0:0:21:21:1:8:13:0:0:8:13:0:0
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chrX	134807349	.	T	C	50.14	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0480645;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=247.873;QD=33.4284;RBI=0.0498258;REFB=0;REVB=0.0131306;RO=0;SAF=5;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.18042e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000727016;OID=.;OPOS=134807349;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:6:6:1:1:5:0:0:1:5:0:0
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chrX	134807372	.	A	G	101.91	PASS	AF=1;AO=10;DP=10;FAO=10;FDP=10;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=2;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0234048;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=183.601;QD=40.7622;RBI=0.0250129;REFB=0;REVB=0.00882397;RO=0;SAF=8;SAR=2;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000398382;OID=.;OPOS=134807372;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:10:10:0:0:10:10:1:2:8:0:0:2:8:0:0
chrX	134807868	.	A	T	536.58	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0299092;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=71.9945;QD=59.6201;RBI=0.0358239;REFB=0;REVB=-0.0197177;RO=0;SAF=14;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000250402;OID=.;OPOS=134807868;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:22:14:0:0:22:14:0:0
chrX	134807875	.	T	C	519.95	PASS	AF=1;AO=35;DP=35;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0937625;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=86.12;QD=59.4234;RBI=0.0941006;REFB=0;REVB=0.00797013;RO=0;SAF=13;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.39865e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000595696;OID=.;OPOS=134807875;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:35:35:0:0:35:35:1:22:13:0:0:22:13:0:0
chrX	134948034	.	A	G	239.46	PASS	AF=1;AO=19;DP=19;FAO=19;FDP=19;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0215789;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=135.506;QD=50.4135;RBI=0.0343776;REFB=0;REVB=0.0267613;RO=0;SAF=10;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.33753e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.95649e-05;OID=.;OPOS=134948034;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:19:19:0:0:19:19:1:9:10:0:0:9:10:0:0
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chrX	135474420	.	C	A	902.67	PASS	AF=1;AO=62;DP=62;FAO=62;FDP=62;FR=.;FRO=0;FSAF=43;FSAR=19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0193884;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=143.76;QD=58.2366;RBI=0.0199906;REFB=0;REVB=-0.00486944;RO=0;SAF=43;SAR=19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=6.32015e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.90824e-05;OID=.;OPOS=135474420;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:62:62:0:0:62:62:1:19:43:0:0:19:43:0:0
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chrX	138067202	.	A	G	1269.34	PASS	AF=0.988095;AO=82;DP=83;FAO=83;FDP=84;FR=.;FRO=1;FSAF=41;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0113922;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=55.6245;QD=60.445;RBI=0.0325056;REFB=-0.12421;REVB=0.030444;RO=0;SAF=40;SAR=42;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.505881;STBP=0.524;TYPE=snp;VARB=0.00224552;OID=.;OPOS=138067202;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:83:84:0:1:82:83:0.988095:42:40:0:0:42:41:0:1
chrX	138774209	.	C	T	2351.37	PASS	AF=1;AO=143;DP=144;FAO=148;FDP=148;FR=.;FRO=0;FSAF=74;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0128338;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=279.757;QD=63.5507;RBI=0.0303693;REFB=0;REVB=0.0275244;RO=0;SAF=73;SAR=70;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.12326e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.00012e-05;OID=.;OPOS=138774209;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:12:144:148:0:0:143:148:1:70:73:0:0:74:74:0:0
chrX	138811003	.	G	A	754.4	PASS	AF=1;AO=53;DP=53;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00400229;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=95.2355;QD=56.9355;RBI=0.0640226;REFB=0;REVB=0.0638973;RO=0;SAF=32;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.81969e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000547095;OID=.;OPOS=138811003;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:53:53:0:0:53:53:1:21:32:0:0:21:32:0:0
chrX	138869368	.	T	C	1419.23	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=41;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0351191;FXX=0.0109878;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.243;QD=63.0768;RBI=0.0923919;REFB=0;REVB=0.0854571;RO=0;SAF=49;SAR=41;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000305108;OID=.;OPOS=138869368;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:41:49:0:0:41:49:0:0
chrX	138897130	.	A	C	1293.93	PASS	AF=1;AO=67;DP=83;FAO=83;FDP=83;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=45;FSAR=38;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.15121;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=85.9033;QD=62.358;RBI=0.155582;REFB=0;REVB=0.0366239;RO=0;SAF=29;SAR=38;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000599986;OID=.;OPOS=138897130;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:83:83:0:0:67:83:1:38:29:0:0:38:45:0:0
chrX	138967742	.	T	G	1362.81	PASS	AF=0.988764;AO=88;DP=89;FAO=88;FDP=89;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.00284856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=278.958;QD=61.25;RBI=0.0428118;REFB=-0.130584;REVB=0.042717;RO=1;SAF=48;SAR=40;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0116996;STB=0.506171;STBP=0.313;TYPE=snp;VARB=0.000184074;OID=.;OPOS=138967742;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:89:89:1:1:88:88:0.988764:40:48:0:1:40:48:0:1
chrX	139038443	.	G	A	827.33	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=32;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0302797;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=146.764;QD=57.0573;RBI=0.0567666;REFB=0;REVB=0.0480165;RO=0;SAF=26;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.40922e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000167596;OID=.;OPOS=139038443;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:55:58:0:0:55:58:1:29:26:0:0:32:26:0:0
chrX	139099828	.	T	A	959.37	PASS	AF=1;AO=44;DP=71;FAO=72;FDP=72;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=36;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0510622;FXX=0.0136968;HRUN=2;LEN=1;MLLD=24.7624;QD=53.2986;RBI=0.0566603;REFB=0;REVB=-0.024557;RO=0;SAF=23;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.2717e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.00251853;OID=.;OPOS=139099828;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:71:72:0:0:44:72:1:21:23:0:0:36:36:0:0
chrX	140008385	.	G	T	2129.05	PASS	AF=0.985612;AO=135;DP=139;FAO=137;FDP=139;FR=.;FRO=2;FSAF=67;FSAR=70;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0650808;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=177.342;QD=61.2676;RBI=0.0659056;REFB=0.00333168;REVB=0.0103936;RO=1;SAF=65;SAR=70;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00674279;STB=0.500158;STBP=0.872;TYPE=snp;VARB=-9.36688e-06;OID=.;OPOS=140008385;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:139:139:1:2:135:137:0.985612:70:65:0:1:70:67:1:1
chrX	140270418	.	T	C	227.05	PASS	AF=1;AO=18;DP=18;FAO=18;FDP=18;FR=.;FRO=0;FSAF=7;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000428041;FXX=0.0526039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=140.437;QD=50.4553;RBI=0.0019469;REFB=0;REVB=0.00189926;RO=0;SAF=7;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.43115e-05;OID=.;OPOS=140270418;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:18:18:0:0:18:18:1:11:7:0:0:11:7:0:0
chrX	140714231	.	A	G	447.02	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280527;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.378;QD=57.6803;RBI=0.0524437;REFB=0;REVB=0.0443101;RO=0;SAF=17;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000423981;OID=.;OPOS=140714231;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:14:17:0:0:14:17:0:0
chrX	140714251	.	A	G	417.86	PASS	AF=0.967742;AO=30;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0104173;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.3837;QD=53.917;RBI=0.0389262;REFB=-0.101721;REVB=0.0375064;RO=1;SAF=17;SAR=13;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0345091;STB=0.518506;STBP=0.303;TYPE=snp;VARB=0.0140292;OID=.;OPOS=140714251;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:30:30:0.967742:13:17:0:1:13:17:0:1
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chrX	140785714	.	C	G	119.94	PASS	AF=0.178862;AO=19;DP=123;FAO=22;FDP=123;FR=.;FRO=101;FSAF=13;FSAR=9;FSRF=59;FSRR=42;FWDB=0.00674819;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=155.683;QD=3.90041;RBI=0.00736015;REFB=-0.00280886;REVB=-0.00293832;RO=101;SAF=13;SAR=6;SRF=59;SRR=42;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.13549;STB=0.505716;STBP=0.958;TYPE=snp;VARB=0.0116816;OID=.;OPOS=140785714;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:123:123:101:101:19:22:0.178862:6:13:59:42:9:13:59:42
chrX	140983064	.	G	A	2210.36	PASS	AF=0.986667;AO=146;DP=149;FAO=148;FDP=150;FR=.;FRO=2;FSAF=81;FSAR=67;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.106566;FXX=0.00662208;HRUN=1;LEN=1;MLLD=54.1242;QD=58.9431;RBI=0.151696;REFB=-0.169768;REVB=0.107961;RO=2;SAF=79;SAR=67;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00106324;STB=0.500636;STBP=0.869;TYPE=snp;VARB=0.00266695;OID=.;OPOS=140983064;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:149:150:2:2:146:148:0.986667:67:79:1:1:67:81:1:1
chrX	140983127	.	G	A	3271.75	PASS	AF=0.981818;AO=204;DP=212;FAO=216;FDP=220;FR=.;FRO=4;FSAF=110;FSAR=106;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=0.0220015;FXX=0.00452468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=224.128;QD=59.4863;RBI=0.0274046;REFB=0.000702296;REVB=0.0163385;RO=1;SAF=101;SAR=103;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00469289;STB=0.504714;STBP=0.286;TYPE=snp;VARB=5.32938e-05;OID=.;OPOS=140983127;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:212:220:1:4:204:216:0.981818:103:101:1:0:106:110:1:3
chrX	140993852	.	C	G	64.29	PASS	AF=0.391304;AO=9;DP=23;FAO=9;FDP=23;FR=.;FRO=14;FSAF=5;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=8;FWDB=0.102548;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=63.3543;QD=11.1808;RBI=0.109282;REFB=-0.0387068;REVB=-0.0377668;RO=14;SAF=5;SAR=4;SRF=6;SRR=8;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.128213;STB=0.576753;STBP=0.601;TYPE=snp;VARB=0.10516;OID=.;OPOS=140993852;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:64:23:23:14:14:9:9:0.391304:4:5:6:8:4:5:6:8
chrX	140994171	.	C	G	123.16	PASS	AF=0.923077;AO=12;DP=13;FAO=12;FDP=13;FR=.;FRO=1;FSAF=6;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.0918239;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=84.0381;QD=37.8964;RBI=0.0928756;REFB=-0.164755;REVB=-0.0139375;RO=1;SAF=6;SAR=6;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.069361;STB=0.538398;STBP=0.542;TYPE=snp;VARB=0.0111149;OID=.;OPOS=140994171;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:13:13:1:1:12:12:0.923077:6:6:1:0:6:6:1:0
chrX	140994280	.	A	G	68.02	PASS	AF=0.666667;AO=9;DP=12;FAO=8;FDP=12;FR=.;FRO=4;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=1;FSRR=3;FWDB=-0.0179336;FXX=0.076864;HRUN=1;LEN=1;MLLD=59.0062;QD=22.6727;RBI=0.0528647;REFB=-0.060314;REVB=-0.0497299;RO=2;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.11124;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0492772;OID=.;OPOS=140994280;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:17:12:12:2:4:9:8:0.666667:7:2:0:2:6:2:1:3
chrX	141290865	.	C	T	1319.07	PASS	AF=1;AO=85;DP=85;FAO=85;FDP=85;FR=.;FRO=0;FSAF=69;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0167292;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=57.3113;QD=62.0739;RBI=0.031326;REFB=0;REVB=0.026485;RO=0;SAF=69;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000248258;OID=.;OPOS=141290865;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:85:85:0:0:85:85:1:16:69:0:0:16:69:0:0
chrX	142285253	.	C	T	951.64	PASS	AF=1;AO=60;DP=60;FAO=66;FDP=66;FR=.;FRO=0;FSAF=35;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0402665;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=267.129;QD=57.6751;RBI=0.0726503;REFB=0;REVB=0.0604704;RO=0;SAF=32;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000143526;OID=.;OPOS=142285253;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:60:66:0:0:60:66:1:28:32:0:0:31:35:0:0
chrX	142517782	.	C	T	279.6	PASS	AF=0.956522;AO=22;DP=23;FAO=22;FDP=23;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0189976;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=224.218;QD=48.626;RBI=0.0259011;REFB=-0.0754737;REVB=0.0176056;RO=1;SAF=14;SAR=8;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0542958;STB=0.529385;STBP=0.3;TYPE=snp;VARB=0.00465244;OID=.;OPOS=142517782;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:23:23:1:1:22:22:0.956522:8:14:0:1:8:14:0:1
chrX	142596941	.	C	G	306.34	PASS	AF=1;AO=23;DP=23;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=4;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00794075;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=76.4936;QD=53.2766;RBI=0.0383716;REFB=0;REVB=0.037541;RO=0;SAF=19;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000697087;OID=.;OPOS=142596941;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:23:23:0:0:23:23:1:4:19:0:0:4:19:0:0
chrX	142716114	.	G	A	784.76	PASS	AF=0.921875;AO=58;DP=64;FAO=59;FDP=64;FR=.;FRO=5;FSAF=31;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=-0.0103628;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=292.019;QD=49.0475;RBI=0.0103903;REFB=0.026593;REVB=0.000755233;RO=3;SAF=31;SAR=27;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0434874;STB=0.505843;STBP=0.773;TYPE=snp;VARB=-0.000481627;OID=.;OPOS=142716114;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:20:64:64:3:5:58:59:0.921875:27:31:3:0:28:31:3:2
chrX	142716660	.	G	A	453.8	PASS	AF=0.969697;AO=32;DP=33;FAO=32;FDP=33;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.00442131;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=115.761;QD=55.0056;RBI=0.0411351;REFB=-0.0630564;REVB=-0.0408968;RO=1;SAF=15;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0301077;STB=0.516119;STBP=0.323;TYPE=snp;VARB=0.00921921;OID=.;OPOS=142716660;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:33:33:1:1:32:32:0.969697:17:15:1:0:17:15:1:0
chrX	142795225	.	G	A	118.56	PASS	AF=0.5;AO=13;DP=28;FAO=13;FDP=26;FR=.;FRO=13;FSAF=6;FSAR=7;FSRF=9;FSRR=4;FWDB=0.0256779;FXX=0.103413;HRUN=1;LEN=1;MLLD=259.373;QD=18.2401;RBI=0.027684;REFB=-0.0297051;REVB=-0.0103466;RO=13;SAF=6;SAR=7;SRF=9;SRR=4;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.199178;STB=0.613866;STBP=0.292;TYPE=snp;VARB=0.0305783;OID=.;OPOS=142795225;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:28:26:13:13:13:13:0.5:7:6:9:4:7:6:9:4
chrX	142795438	.	G	T	689.31	PASS	AF=1;AO=42;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=16;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0366129;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=95.9369;QD=62.6641;RBI=0.0414243;REFB=0;REVB=0.019377;RO=0;SAF=16;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-9.21848e-05;OID=.;OPOS=142795438;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:42:44:1:26:16:0:0:28:16:0:0
chrX	142967468	.	T	G	365.07	PASS	AF=0.964286;AO=27;DP=28;FAO=27;FDP=28;FR=.;FRO=1;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0312026;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=82.3979;QD=52.1529;RBI=0.031256;REFB=-0.108361;REVB=0.0018261;RO=0;SAF=14;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39874e-08;STB=0.518505;STBP=0.56;TYPE=snp;VARB=0.00183762;OID=.;OPOS=142967468;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:28:28:0:1:27:27:0.964286:13:14:0:0:13:14:0:1
chrX	142968082	.	A	C	358.14	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0146062;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=338.076;QD=55.0987;RBI=0.0202723;REFB=0;REVB=-0.014058;RO=0;SAF=15;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.20282e-07;OID=.;OPOS=142968082;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:26:0:0:26:26:1:11:15:0:0:11:15:0:0
chrX	144337289	.	A	G	959.51	PASS	AF=0.985075;AO=66;DP=67;FAO=66;FDP=67;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=34;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0295896;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=68.5699;QD=57.284;RBI=0.0296569;REFB=0.035667;REVB=0.00199704;RO=1;SAF=32;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0145365;STB=0.50769;STBP=0.326;TYPE=snp;VARB=-0.00013883;OID=.;OPOS=144337289;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:67:67:1:1:66:66:0.985075:34:32:1:0:34:32:1:0
chrX	144904882	.	T	C	88.22	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00601105;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=316.44;QD=39.2068;RBI=0.0234991;REFB=0;REVB=-0.0227172;RO=0;SAF=6;SAR=3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000112797;OID=.;OPOS=144904882;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:3:6:0:0:3:6:0:0
chrX	144910142	.	G	A	1159.36	PASS	AF=1;AO=76;DP=76;FAO=76;FDP=76;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=62;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00053516;FXX=0.0129853;HRUN=1;LEN=1;MLLD=286.734;QD=61.0192;RBI=0.00279641;REFB=0;REVB=-0.00274473;RO=0;SAF=14;SAR=62;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=2.99345e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.98391e-05;OID=.;OPOS=144910142;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:76:76:0:0:76:76:1:62:14:0:0:62:14:0:0
chrX	144910936	.	C	T	375.68	PASS	AF=1;AO=26;DP=26;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0321005;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=236.987;QD=55.656;RBI=0.0321187;REFB=0;REVB=0.00108117;RO=0;SAF=14;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=7.03044e-05;OID=.;OPOS=144910936;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:27:0:0:26:27:1:12:14:0:0:13:14:0:0
chrX	147014960	.	C	T	1723.92	PASS	AF=0.982906;AO=115;DP=117;FAO=115;FDP=117;FR=.;FRO=2;FSAF=61;FSAR=54;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=-0.0420947;FXX=0.00847386;HRUN=3;LEN=1;MLLD=49.3102;QD=58.9373;RBI=0.0450967;REFB=-0.103625;REVB=-0.0161787;RO=2;SAF=61;SAR=54;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0172607;STB=0.509089;STBP=0.156;TYPE=snp;VARB=0.00148313;OID=.;OPOS=147014960;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:117:117:2:2:115:115:0.982906:54:61:0:2:54:61:0:2
chrX	147088249	.	C	A,T	1095.2	PASS	AF=0.0405405,0.959459;AO=3,69;DP=72;FAO=3,71;FDP=74;FR=.;FRO=0;FSAF=0,52;FSAR=3,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00141726,0.00270839;FXX=0.0133316;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=111.268,252.642;QD=59.1998;RBI=0.00465627,0.00333524;REFB=0,0;REVB=-0.00443533,-0.0019464;RO=0;SAF=0,50;SAR=3,19;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,-5.45441e-08;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.0106935,0.000631025;OID=.,.;OPOS=147088249,147088249;OREF=C,C;OALT=A,T;OMAPALT=A,T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:7:72:74:0:0:3,69:3,71:0.0405405,0.959459:3,19:0,50:0:0:3,19:0,52:0:0
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chrX	147903927	.	C	T	511.86	PASS	AF=0.972973;AO=35;DP=37;FAO=36;FDP=37;FR=.;FRO=1;FSAF=19;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0778089;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=133.103;QD=55.3364;RBI=0.0779717;REFB=-0.120001;REVB=0.00503549;RO=2;SAF=18;SAR=17;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0491765;STB=0.512813;STBP=0.515;TYPE=snp;VARB=0.00207992;OID=.;OPOS=147903927;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:37:37:2:1:35:36:0.972973:17:18:2:0:17:19:1:0
chrX	148627384	.	A	G	50.54	PASS	AF=1;AO=2;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=5;FSAR=1;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.174305;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=114.48;QD=33.6934;RBI=0.177102;REFB=0;REVB=-0.0313526;RO=0;SAF=1;SAR=1;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00637351;OID=.;OPOS=148627384;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:6:0:0:2:6:1:1:1:0:0:1:5:0:0
chrX	148628490	.	A	T	88.36	PASS	AF=1;AO=7;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=4;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.04549;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.628;QD=39.2719;RBI=0.118464;REFB=0;REVB=0.109381;RO=0;SAF=3;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00313277;OID=.;OPOS=148628490;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:7:9:1:4:3:0:0:5:4:0:0
chrX	148798223	.	T	C	524.19	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0145433;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=202.878;QD=58.243;RBI=0.0408362;REFB=0;REVB=-0.0381588;RO=0;SAF=25;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-5.03206e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.57379e-05;OID=.;OPOS=148798223;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:35:36:1:10:25:0:0:10:26:0:0
chrX	149013727	.	A	G	446.97	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0142388;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=91.2385;QD=57.6737;RBI=0.0227715;REFB=0;REVB=0.0177707;RO=0;SAF=15;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000422482;OID=.;OPOS=149013727;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:16:15:0:0:16:15:0:0
chrX	149931106	.	C	T	669.84	PASS	AF=0.918367;AO=45;DP=49;FAO=45;FDP=49;FR=.;FRO=4;FSAF=22;FSAR=23;FSRF=3;FSRR=1;FWDB=0.0286505;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=160.907;QD=54.6811;RBI=0.0297602;REFB=-0.0540252;REVB=-0.00805083;RO=4;SAF=22;SAR=23;SRF=3;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0399299;STB=0.521296;STBP=0.362;TYPE=snp;VARB=0.00519452;OID=.;OPOS=149931106;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:18:49:49:4:4:45:45:0.918367:23:22:3:1:23:22:3:1
chrX	149933313	.	GTTTTTA	GTTTT,GTTTTA	91.58	PASS	AF=0.413043,0;AO=9,7;DP=48;FAO=19,0;FDP=46;FR=.;FRO=27;FSAF=8,0;FSAR=11,0;FSRF=9;FSRR=18;FWDB=0.0420588,0.0155967;FXX=0.041658;HRUN=5,5;LEN=2,1;MLLD=24.7753,13.1925;QD=7.96379;RBI=0.0706075,0.0800849;REFB=0.00719025,0.0130271;REVB=0.0567139,0.0785514;RO=24;SAF=1,6;SAR=8,1;SRF=9;SRR=15;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.422759,0.55898;STB=0.553644,0.5;STBP=0.59,1;TYPE=del,del;VARB=0.0103741,0.0300131;OID=.,.;OPOS=149933318,149933314;OREF=TA,T;OALT=-,-;OMAPALT=GTTTT,GTTTTA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.413043,0:9,7:48:19,0:46:27:8,0:11,0:9:18:87:24:1,6:8,1:9:15
chrX	149933341	.	T	C	851.26	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=22;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0280791;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=275.507;QD=57.7124;RBI=0.0513916;REFB=0;REVB=0.0430425;RO=0;SAF=22;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000111774;OID=.;OPOS=149933341;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:37:22:0:0:37:22:0:0
chrX	150840185	.	T	C	915.41	PASS	AF=0.969697;AO=64;DP=67;FAO=64;FDP=66;FR=.;FRO=2;FSAF=39;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0227724;FXX=0.0149231;HRUN=3;LEN=1;MLLD=274.861;QD=55.4793;RBI=0.0435615;REFB=-0.128655;REVB=0.0371352;RO=1;SAF=39;SAR=25;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0185161;STB=0.519225;STBP=0.118;TYPE=snp;VARB=0.000559474;OID=.;OPOS=150840185;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:67:66:1:2:64:64:0.969697:25:39:0:1:25:39:0:2
chrX	150869267	.	A	G	603.39	PASS	AF=0.97561;AO=37;DP=41;FAO=40;FDP=41;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=23;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.00402008;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=136.252;QD=58.8675;RBI=0.055601;REFB=-0.1373;REVB=0.0554555;RO=0;SAF=23;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.91909e-08;STB=0.510633;STBP=0.504;TYPE=snp;VARB=0.00122432;OID=.;OPOS=150869267;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:41:41:0:1:37:40:0.97561:14:23:0:0:17:23:1:0
chrX	150909307	.	G	T	480.35	PASS	AF=1;AO=32;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.176089;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=43.5086;QD=56.5113;RBI=0.189246;REFB=0;REVB=-0.0693312;RO=2;SAF=7;SAR=25;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.116053;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00213032;OID=.;OPOS=150909307;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:2:0:32:34:1:25:7:2:0:25:9:0:0
chrX	151125971	.	A	G	1398.85	PASS	AF=1;AO=90;DP=90;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=33;FSAR=57;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188499;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=125.08;QD=62.1711;RBI=0.0252806;REFB=0;REVB=0.0168461;RO=0;SAF=33;SAR=57;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.26408e-05;OID=.;OPOS=151125971;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:90:90:0:0:90:90:1:57:33:0:0:57:33:0:0
chrX	151129822	.	G	A	1572.23	PASS	AF=0.99;AO=99;DP=100;FAO=99;FDP=100;FR=.;FRO=1;FSAF=48;FSAR=51;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0152869;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=192.129;QD=62.8891;RBI=0.0264727;REFB=0.00109966;REVB=-0.0216128;RO=1;SAF=48;SAR=51;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00921056;STB=0.504853;STBP=0.499;TYPE=snp;VARB=-4.63066e-05;OID=.;OPOS=151129822;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:100:100:1:1:99:99:0.99:51:48:0:1:51:48:0:1
chrX	151303393	.	C	T	207.05	PASS	AF=1;AO=17;DP=17;FAO=17;FDP=17;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00540654;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=213.04;QD=48.7168;RBI=0.0131283;REFB=0;REVB=0.0119634;RO=0;SAF=10;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.41082e-05;OID=.;OPOS=151303393;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:17:17:0:0:17:17:1:7:10:0:0:7:10:0:0
chrX	151303596	.	C	T	356.67	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=26;FDP=26;FR=.;FRO=0;FSAF=18;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0313068;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=251.347;QD=54.8721;RBI=0.0329793;REFB=0;REVB=0.0103693;RO=0;SAF=16;SAR=8;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.68712e-05;OID=.;OPOS=151303596;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:26:0:0:24:26:1:8:16:0:0:8:18:0:0
chrX	151899913	.	T	C	410.66	PASS	AF=1;AO=28;DP=28;FAO=29;FDP=29;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=8;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00430567;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.784;QD=56.6432;RBI=0.00505609;REFB=0;REVB=0.00265052;RO=0;SAF=21;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-8.16912e-06;OID=.;OPOS=151899913;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:28:29:0:0:28:29:1:7:21:0:0:8:21:0:0
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chrX	152083089	.	T	G	323.47	PASS	AF=1;AO=23;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=9;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0119856;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=237.079;QD=53.9112;RBI=0.0120363;REFB=0;REVB=0.00110428;RO=0;SAF=14;SAR=9;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.84921e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.77991e-05;OID=.;OPOS=152083089;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:23:24:1:9:14:0:0:9:15:0:0
chrX	152226542	.	T	C	446.96	PASS	AF=1;AO=31;DP=31;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=10;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0325328;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=77.7681;QD=57.672;RBI=0.0423732;REFB=0;REVB=0.0271497;RO=0;SAF=21;SAR=10;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000450317;OID=.;OPOS=152226542;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:31:0:0:31:31:1:10:21:0:0:10:21:0:0
chrX	152227929	.	C	T	2121.3	PASS	AF=1;AO=135;DP=135;FAO=135;FDP=135;FR=.;FRO=0;FSAF=62;FSAR=73;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0110423;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=142.34;QD=62.8534;RBI=0.0111369;REFB=0;REVB=-0.00144853;RO=0;SAF=62;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.651e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.02041e-06;OID=.;OPOS=152227929;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:11:135:135:0:0:135:135:1:73:62:0:0:73:62:0:0
chrX	152228447	.	G	A	482.29	PASS	AF=1;AO=29;DP=30;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=13;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0547798;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=105.041;QD=58.4593;RBI=0.0548092;REFB=0;REVB=0.00179389;RO=0;SAF=16;SAR=13;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000255062;OID=.;OPOS=152228447;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:30:33:0:0:29:33:1:13:16:0:0:13:20:0:0
chrX	152228523	.	T	C	62.17	PASS	AF=1;AO=6;DP=6;FAO=7;FDP=7;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00204448;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=47.4001;QD=35.527;RBI=0.0429249;REFB=0;REVB=0.0428761;RO=0;SAF=2;SAR=4;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00374295;OID=.;OPOS=152228523;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:6:7:0:0:6:7:1:4:2:0:0:5:2:0:0
chrX	152228548	.	G	A	88.17	PASS	AF=1;AO=9;DP=9;FAO=9;FDP=9;FR=.;FRO=0;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00817501;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=103.934;QD=39.1862;RBI=0.0771163;REFB=0;REVB=0.0766818;RO=0;SAF=2;SAR=7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000902253;OID=.;OPOS=152228548;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:9:9:0:0:9:9:1:7:2:0:0:7:2:0:0
chrX	152482796	.	C	T	867.73	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=60;FDP=60;FR=.;FRO=0;FSAF=29;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00575804;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=71.8681;QD=57.8488;RBI=0.0177901;REFB=0;REVB=0.0168325;RO=0;SAF=29;SAR=30;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000127205;OID=.;OPOS=152482796;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:60:0:0:59:60:1:30:29:0:0:31:29:0:0
chrX	152482917	.	T	C	455.58	PASS	AF=1;AO=31;DP=32;FAO=31;FDP=31;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=23;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0461652;FXX=0.0605877;HRUN=1;LEN=1;MLLD=129.304;QD=58.7844;RBI=0.0488683;REFB=0;REVB=0.0160276;RO=0;SAF=8;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.39343e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000870558;OID=.;OPOS=152482917;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:32:31:0:0:31:31:1:23:8:0:0:23:8:0:0
chrX	152483030	.	G	A	519.94	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00588698;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=280.23;QD=59.4218;RBI=0.0515103;REFB=0;REVB=0.0511728;RO=0;SAF=20;SAR=14;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=9.11325e-05;OID=.;OPOS=152483030;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:35:0:0:34:35:1:14:20:0:0:15:20:0:0
chrX	152609668	.	T	C	1430.55	PASS	AF=1;AO=86;DP=86;FAO=91;FDP=91;FR=.;FRO=0;FSAF=49;FSAR=42;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00201543;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.241;QD=62.8814;RBI=0.0400065;REFB=0;REVB=0.0399557;RO=0;SAF=49;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=6.32324e-05;OID=.;OPOS=152609668;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:8:86:91:0:0:86:91:1:37:49:0:0:42:49:0:0
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chrX	152610985	.	T	C	751.69	PASS	AF=1;AO=51;DP=54;FAO=54;FDP=54;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0410738;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=264.774;QD=55.6804;RBI=0.0428597;REFB=0;REVB=0.0122433;RO=0;SAF=40;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=2.69092e-05;OID=.;OPOS=152610985;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:54:0:0:51:54:1:11:40:0:0:12:42:0:0
chrX	152613112	.	C	T	651.19	PASS	AF=1;AO=42;DP=42;FAO=42;FDP=42;FR=.;FRO=0;FSAF=15;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.132116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.935;QD=62.0176;RBI=0.132866;REFB=0;REVB=0.0140909;RO=0;SAF=15;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.13648e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000771084;OID=.;OPOS=152613112;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:42:42:0:0:42:42:1:27:15:0:0:27:15:0:0
chrX	152613702	.	A	G	1611.84	PASS	AF=0.981982;AO=109;DP=111;FAO=109;FDP=111;FR=.;FRO=2;FSAF=53;FSAR=56;FSRF=0;FSRR=2;FWDB=0.0160215;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=273.183;QD=58.0842;RBI=0.0174339;REFB=0.0130484;REVB=-0.00687416;RO=2;SAF=53;SAR=56;SRF=0;SRR=2;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0166497;STB=0.50877;STBP=0.244;TYPE=snp;VARB=-0.00010051;OID=.;OPOS=152613702;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:111:111:2:2:109:109:0.981982:56:53:0:2:56:53:0:2
chrX	152616261	.	T	C	795.17	PASS	AF=1;AO=54;DP=54;FAO=57;FDP=57;FR=.;FRO=0;FSAF=26;FSAR=31;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0353131;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=50.1813;QD=55.8011;RBI=0.0695359;REFB=0;REVB=0.0599018;RO=0;SAF=25;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.002037;OID=.;OPOS=152616261;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:54:57:0:0:54:57:1:29:25:0:0:31:26:0:0
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chrX	153010092	.	G	A	54.32	PASS	AF=0.32;AO=8;DP=25;FAO=8;FDP=25;FR=.;FRO=17;FSAF=2;FSAR=6;FSRF=6;FSRR=11;FWDB=-0.021664;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.277;QD=8.69177;RBI=0.0267688;REFB=-0.00908561;REVB=0.0157239;RO=17;SAF=2;SAR=6;SRF=6;SRR=11;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.136257;STB=0.585139;STBP=0.643;TYPE=snp;VARB=0.0193008;OID=.;OPOS=153010092;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:54:25:25:17:17:8:8:0.32:6:2:6:11:6:2:6:11
chrX	153039502	.	G	C	552.86	PASS	AF=0.974359;AO=38;DP=39;FAO=38;FDP=39;FR=.;FRO=1;FSAF=15;FSAR=23;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.061763;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=78.0977;QD=56.7035;RBI=0.0620968;REFB=0.00484232;REVB=0.00643021;RO=1;SAF=15;SAR=23;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0302093;STB=0.51612;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=-0.000397817;OID=.;OPOS=153039502;OREF=G;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:39:39:1:1:38:38:0.974359:23:15:1:0:23:15:1:0
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chrX	153045812	.	C	T	1258.78	PASS	AF=0.987952;AO=82;DP=85;FAO=82;FDP=83;FR=.;FRO=1;FSAF=32;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0143504;FXX=0.0235266;HRUN=1;LEN=1;MLLD=202.116;QD=60.6641;RBI=0.023593;REFB=-0.0678849;REVB=0.0187269;RO=1;SAF=32;SAR=50;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00937821;STB=0.504949;STBP=0.518;TYPE=snp;VARB=0.000255188;OID=.;OPOS=153045812;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:3:85:83:1:1:82:82:0.987952:50:32:0:1:50:32:0:1
chrX	153048655	.	CCA	C,CC,CCC	188.53	PASS	AF=0,0.0625,0.9375;AO=2,7,7;DP=16;FAO=0,1,15;FDP=16;FR=.;FRO=0;FSAF=0,0,0;FSAR=0,1,15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0,0,0;FXX=0;HRUN=8,1,1;LEN=2,1,1;MLLD=336.676,342.698,344.176;QD=47.1318;RBI=0.0404602,0.0389381,0.0374936;REFB=0,0,0;REVB=0.0404602,0.0389381,0.0374936;RO=0;SAF=0,0,0;SAR=2,7,7;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0,0;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=del,del,snp;VARB=0.00418469,-0.0139901,0.00700442;OID=.,.,.;OPOS=153048656,153048657,153048657;OREF=CA,A,A;OALT=-,-,C;OMAPALT=C,CC,CCC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.0625,0.9375:2,7,7:16:0,1,15:16:0:0,0,0:0,1,15:0:0:9:0:0,0,0:2,7,7:0:0
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chrX	153050983	.	T	TA	597.0	PASS	AF=1;AO=15;DP=124;FAO=68;FDP=68;FR=.;FRO=0;FSAF=47;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0399986;FXX=0.423693;HRUN=0;LEN=1;MLLD=72.1192;QD=35.1174;RBI=0.0510456;REFB=0;REVB=0.0317137;RO=109;SAF=12;SAR=3;SRF=41;SRR=68;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.494108;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0181527;OID=.;OPOS=153050984;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=TA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:15:124:68:68:0:47:21:0:0:5:109:12:3:41:68
chrX	153050984	.	G	A,C	1738.77	PASS	AF=0.872881,0.127119;AO=102,15;DP=118;FAO=103,15;FDP=118;FR=.;FRO=0;FSAF=35,12;FSAR=68,3;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0188599,0.00249468;FXX=0;HRUN=1,1;LEN=1,1;MLLD=69.7288,21.5494;QD=58.9414;RBI=0.0188602,0.0570479;REFB=0,0;REVB=0.000112035,-0.0569933;RO=0;SAF=34,12;SAR=68,3;SRF=0;SRR=0;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=0,0;STB=0.5,0.5;STBP=1,1;TYPE=snp,snp;VARB=-0.000312599,0.126328;OID=.,.;OPOS=153050984,153050984;OREF=G,G;OALT=A,C;OMAPALT=A,C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/2:65:118:118:0:0:102,15:103,15:0.872881,0.127119:68,3:34,12:0:0:68,3:35,12:0:0
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chrX	153073319	.	G	A	2113.55	PASS	AF=0.992647;AO=134;DP=138;FAO=135;FDP=136;FR=.;FRO=1;FSAF=61;FSAR=74;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=-0.0495604;FXX=0.0215812;HRUN=3;LEN=1;MLLD=128.225;QD=62.1634;RBI=0.0513433;REFB=-0.0908817;REVB=0.0134125;RO=0;SAF=61;SAR=73;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.72667e-08;STB=0.503355;STBP=0.503;TYPE=snp;VARB=0.000194844;OID=.;OPOS=153073319;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:138:136:0:1:134:135:0.992647:73:61:0:0:74:61:0:1
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chrX	153149715	.	C	G	885.42	PASS	AF=1;AO=61;DP=61;FAO=61;FDP=61;FR=.;FRO=0;FSAF=24;FSAR=37;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00906795;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=152.079;QD=58.0601;RBI=0.0091485;REFB=0;REVB=-0.0012113;RO=0;SAF=24;SAR=37;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.61498e-05;OID=.;OPOS=153149715;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:61:61:0:0:61:61:1:37:24:0:0:37:24:0:0
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chrX	153176254	.	A	G	1026.38	PASS	AF=1;AO=69;DP=69;FAO=69;FDP=69;FR=.;FRO=0;FSAF=19;FSAR=50;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.015009;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=179.119;QD=59.5003;RBI=0.0429693;REFB=0;REVB=0.0402628;RO=0;SAF=19;SAR=50;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=5.45441e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.35224e-05;OID=.;OPOS=153176254;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:69:69:0:0:69:69:1:50:19:0:0:50:19:0:0
chrX	153178453	.	GCCCCAG	GCCCAGC,GCCCAG,GCCCCAGC	427.41	PASS	AF=0,0.025641,0.974359;AO=2,4,29;DP=39;FAO=0,1,38;FDP=39;FR=.;FRO=0;FSAF=0,1,19;FSAR=0,0,19;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0152787,0.151605,-0.12383;FXX=0;HRUN=4,4,3;LEN=3,1,1;MLLD=3.95144,15.966,14.9974;QD=43.8365;RBI=0.0689088,0.202854,0.292802;REFB=0,0,0;REVB=0.0671937,-0.134781,0.265328;RO=1;SAF=0,1,17;SAR=2,3,12;SRF=0;SRR=1;SSEN=0,0,0;SSEP=0,0,0;SSSB=0,0.119989,0.037234;STB=0.5,0.5,0.5;STBP=1,1,1;TYPE=mnp,del,ins;VARB=0,0.0890377,0.010865;OID=.,.,.;OPOS=153178457,153178454,153178460;OREF=CAG,C,-;OALT=AGC,-,C;OMAPALT=GCCCAGC,GCCCAG,GCCCCAGC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	2/3:0,0.025641,0.974359:2,4,29:39:0,1,38:39:0:0,1,19:0,0,19:0:0:4:1:0,1,17:2,3,12:0:1
chrX	153218365	.	C	A	774.08	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=49;FDP=49;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=17;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0657846;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.781;QD=63.1902;RBI=0.0957752;REFB=0;REVB=0.0696079;RO=0;SAF=31;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00201912;OID=.;OPOS=153218365;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:49:0:0:47:49:1:16:31:0:0:17:32:0:0
chrX	153219665	.	C	T	160.32	PASS	AF=1;AO=14;DP=14;FAO=14;FDP=14;FR=.;FRO=0;FSAF=9;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0335556;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.0088;QD=45.8063;RBI=0.0339631;REFB=0;REVB=0.00524515;RO=0;SAF=9;SAR=5;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00116092;OID=.;OPOS=153219665;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:14:14:0:0:14:14:1:5:9:0:0:5:9:0:0
chrX	153221657	.	T	C	418.02	PASS	AF=0.967742;AO=28;DP=31;FAO=30;FDP=31;FR=.,HEALED;FRO=1;FSAF=25;FSAR=5;FSRF=0;FSRR=1;FWDB=0.0149425;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=76.3432;QD=53.9379;RBI=0.0196983;REFB=0.0172767;REVB=0.0128352;RO=1;SAF=24;SAR=4;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.102852;STB=0.545422;STBP=0.086;TYPE=snp;VARB=-3.3004e-05;OID=.;OPOS=153221657;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:31:31:1:1:28:30:0.967742:4:24:0:1:5:25:0:1
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chrX	153223623	.	C	T	851.25	PASS	AF=1;AO=59;DP=59;FAO=59;FDP=59;FR=.;FRO=0;FSAF=41;FSAR=18;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00379882;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=203.994;QD=57.7121;RBI=0.0177613;REFB=0;REVB=0.0173503;RO=0;SAF=41;SAR=18;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.49224e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.0563e-05;OID=.;OPOS=153223623;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:59:59:0:0:59:59:1:18:41:0:0:18:41:0:0
chrX	153247720	.	G	GT	133.88	PASS	AF=1;AO=8;DP=32;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0952208;FXX=0.107105;HRUN=1;LEN=1;MLLD=6.52836;QD=21.4202;RBI=0.103126;REFB=0;REVB=-0.0395974;RO=23;SAF=6;SAR=2;SRF=11;SRR=12;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.329763;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0144915;OID=.;OPOS=153247721;OREF=-;OALT=T;OMAPALT=GT	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:8:32:25:25:0:13:12:0:0:3:23:6:2:11:12
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chrX	153247745	.	A	G	375.67	PASS	AF=1;AO=27;DP=27;FAO=27;FDP=27;FR=.;FRO=0;FSAF=12;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.00240163;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=158.221;QD=55.6554;RBI=0.00454058;REFB=0;REVB=0.00385344;RO=0;SAF=12;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.57837e-06;OID=.;OPOS=153247745;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:27:27:0:0:27:27:1:15:12:0:0:15:12:0:0
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chrX	153629155	.	A	G	656.82	PASS	AF=0.977273;AO=43;DP=44;FAO=43;FDP=44;FR=.;FRO=1;FSAF=17;FSAR=26;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=-0.000226421;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=106.247;QD=59.711;RBI=0.0568238;REFB=-0.0314417;REVB=-0.0568233;RO=1;SAF=17;SAR=26;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0268199;STB=0.514279;STBP=0.275;TYPE=snp;VARB=0.00235798;OID=.;OPOS=153629155;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:44:44:1:1:43:43:0.977273:26:17:1:0:26:17:1:0
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chrX	153759821	.	A	AG	47.18	PASS	AF=1;AO=4;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.201506;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=19.4672;QD=31.4512;RBI=0.201506;REFB=0;REVB=0;RO=1;SAF=4;SAR=0;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0336986;OID=.;OPOS=153759822;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=AG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:4:6:6:6:0:6:0:0:0:4:1:4:0:1:0
chrX	153759824	.	C	CG	30.65	PASS	AF=1;AO=3;DP=6;FAO=6;FDP=6;FR=.;FRO=0;FSAF=6;FSAR=0;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.289276;FXX=0;HRUN=0;LEN=1;MLLD=6.87384;QD=20.4302;RBI=0.289276;REFB=0;REVB=0;RO=3;SAF=3;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=ins;VARB=0.0661581;OID=.;OPOS=153759825;OREF=-;OALT=G;OMAPALT=CG	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	1/1:1:3:6:6:6:0:6:0:0:0:3:3:3:0:3:0
chrX	153908497	.	C	G	780.19	PASS	AF=1;AO=55;DP=55;FAO=55;FDP=55;FR=.;FRO=0;FSAF=28;FSAR=27;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.012618;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=108.456;QD=56.7412;RBI=0.0144412;REFB=0;REVB=0.00702387;RO=0;SAF=28;SAR=27;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.4002e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=8.05127e-05;OID=.;OPOS=153908497;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:55:55:0:0:55:55:1:27:28:0:0:27:28:0:0
chrX	153994596	.	G	T	1264.49	PASS	AF=1;AO=82;DP=82;FAO=82;FDP=82;FR=.;FRO=0;FSAF=42;FSAR=40;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0121967;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=206.391;QD=61.6824;RBI=0.0122513;REFB=0;REVB=-0.00115499;RO=0;SAF=42;SAR=40;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.31006e-05;OID=.;OPOS=153994596;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:7:82:82:0:0:82:82:1:40:42:0:0:40:42:0:0
chrX	154158201	.	T	G	788.14	PASS	AF=0.923077;AO=61;DP=65;FAO=60;FDP=65;FR=.;FRO=5;FSAF=32;FSAR=28;FSRF=3;FSRR=2;FWDB=0.0446288;FXX=0;HRUN=7;LEN=1;MLLD=36.2237;QD=48.5011;RBI=0.106003;REFB=-0.114605;REVB=0.0961502;RO=2;SAF=34;SAR=27;SRF=1;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00348075;STB=0.505153;STBP=0.812;TYPE=snp;VARB=0.0111767;OID=.;OPOS=154158201;OREF=T;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:21:65:65:2:5:61:60:0.923077:27:34:1:1:28:32:3:2
chrX	154456747	.	A	G	482.91	PASS	AF=1;AO=33;DP=33;FAO=33;FDP=33;FR=.;FRO=0;FSAF=8;FSAR=25;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0730276;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=130.545;QD=58.5352;RBI=0.075113;REFB=0;REVB=0.0175762;RO=0;SAF=8;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000351008;OID=.;OPOS=154456747;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:33:33:0:0:33:33:1:25:8:0:0:25:8:0:0
chrX	155004437	.	G	T	501.64	PASS	AF=1;AO=34;DP=34;FAO=34;FDP=34;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=20;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0477693;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=67.836;QD=59.0169;RBI=0.0508056;REFB=0;REVB=-0.0173006;RO=0;SAF=14;SAR=20;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.48532e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000949779;OID=.;OPOS=155004437;OREF=G;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:34:34:0:0:34:34:1:20:14:0:0:20:14:0:0
chrX	155005254	.	C	T	1382.34	PASS	AF=1;AO=87;DP=88;FAO=90;FDP=90;FR=.;FRO=0;FSAF=55;FSAR=35;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.031897;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=87.7712;QD=61.4375;RBI=0.0404191;REFB=-0.0324089;REVB=0.024825;RO=1;SAF=53;SAR=34;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.00885716;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000570886;OID=.;OPOS=155005254;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:6:88:90:1:0:87:90:1:34:53:1:0:35:55:0:0
chrX	155006050	.	C	T	397.39	PASS	AF=0.966667;AO=28;DP=30;FAO=29;FDP=30;FR=.;FRO=1;FSAF=12;FSAR=17;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0321889;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=62.1984;QD=52.985;RBI=0.0997877;REFB=-0.0626327;REVB=-0.0944535;RO=1;SAF=11;SAR=17;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0404293;STB=0.519986;STBP=0.289;TYPE=snp;VARB=0.00119403;OID=.;OPOS=155006050;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:5:30:30:1:1:28:29:0.966667:17:11:1:0:17:12:1:0
chrX	155006982	.	A	T	522.15	PASS	AF=1;AO=35;DP=36;FAO=35;FDP=35;FR=.;FRO=0;FSAF=14;FSAR=21;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0142996;FXX=0.0277701;HRUN=1;LEN=1;MLLD=103.038;QD=59.6741;RBI=0.0174547;REFB=0;REVB=0.0100094;RO=0;SAF=14;SAR=21;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-4.27896e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000205379;OID=.;OPOS=155006982;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:35:0:0:35:35:1:21:14:0:0:21:14:0:0
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chrX	155008583	.	G	A	296.73	PASS	AF=1;AO=21;DP=21;FAO=23;FDP=23;FR=.;FRO=0;FSAF=11;FSAR=12;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0175836;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=168.776;QD=51.6054;RBI=0.0287281;REFB=0;REVB=0.0227183;RO=0;SAF=9;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000614946;OID=.;OPOS=155008583;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:21:23:0:0:21:23:1:12:9:0:0:12:11:0:0
chrX	155008671	.	G	A	727.8	PASS	AF=1;AO=46;DP=46;FAO=46;FDP=46;FR=.;FRO=0;FSAF=17;FSAR=29;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.00720139;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=219.597;QD=63.2867;RBI=0.0199812;REFB=0;REVB=0.0186383;RO=0;SAF=17;SAR=29;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=4.92798e-05;OID=.;OPOS=155008671;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:46:0:0:46:46:1:29:17:0:0:29:17:0:0
chrX	155009102	.	G	A	822.85	PASS	AF=1;AO=57;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.084216;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=155.9;QD=56.748;RBI=0.0871083;REFB=0;REVB=0.0222601;RO=0;SAF=29;SAR=28;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000368879;OID=.;OPOS=155009102;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:57:58:1:28:29:0:0:28:30:0:0
chrX	155009225	.	C	T	538.55	PASS	AF=1;AO=36;DP=36;FAO=36;FDP=36;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0241802;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=111.499;QD=59.839;RBI=0.0243689;REFB=0;REVB=-0.00302656;RO=0;SAF=21;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000199828;OID=.;OPOS=155009225;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:36:36:0:0:36:36:1:15:21:0:0:15:21:0:0
chrX	155009661	.	A	C	751.08	PASS	AF=1;AO=51;DP=51;FAO=53;FDP=53;FR=.;FRO=0;FSAF=27;FSAR=26;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0189352;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=183.346;QD=56.6855;RBI=0.019173;REFB=0;REVB=-0.0030108;RO=0;SAF=25;SAR=26;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.94283e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=3.73247e-05;OID=.;OPOS=155009661;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:51:53:0:0:51:53:1:26:25:0:0:26:27:0:0
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chrX	155009856	.	T	C	747.04	PASS	AF=1;AO=47;DP=47;FAO=47;FDP=47;FR=.;FRO=0;FSAF=32;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0102393;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=116.711;QD=63.5782;RBI=0.0151051;REFB=0;REVB=-0.0111051;RO=0;SAF=32;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-2.61183e-06;OID=.;OPOS=155009856;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:47:47:0:0:47:47:1:15:32:0:0:15:32:0:0
chrX	155009935	.	C	A	834.41	PASS	AF=1;AO=58;DP=58;FAO=58;FDP=58;FR=.;FRO=0;FSAF=36;FSAR=22;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0229912;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=264.878;QD=57.5453;RBI=0.0662985;REFB=0;REVB=0.0621844;RO=0;SAF=36;SAR=22;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000108781;OID=.;OPOS=155009935;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:58:58:0:0:58:58:1:22:36:0:0:22:36:0:0
chrX	155010062	.	G	A	712.31	PASS	AF=1;AO=45;DP=46;FAO=45;FDP=45;FR=.;FRO=0;FSAF=21;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0572893;FXX=0.0217344;HRUN=1;LEN=1;MLLD=138.114;QD=63.3162;RBI=0.0585343;REFB=0;REVB=0.0120086;RO=0;SAF=21;SAR=24;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-0.000282411;OID=.;OPOS=155010062;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:46:45:0:0:45:45:1:24:21:0:0:24:21:0:0
chrX	155010077	.	G	A	689.84	PASS	AF=1;AO=43;DP=43;FAO=44;FDP=44;FR=.;FRO=0;FSAF=20;FSAR=24;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0216939;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=266.798;QD=62.7123;RBI=0.0276905;REFB=0;REVB=0.0172087;RO=0;SAF=20;SAR=23;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.995e-05;OID=.;OPOS=155010077;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:43:44:0:0:43:44:1:23:20:0:0:24:20:0:0
chrX	155010230	.	A	C	635.37	PASS	AF=1;AO=41;DP=41;FAO=41;FDP=41;FR=.;FRO=0;FSAF=30;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0807416;FXX=0.0238039;HRUN=1;LEN=1;MLLD=65.4138;QD=61.9868;RBI=0.123431;REFB=0;REVB=0.09336;RO=0;SAF=30;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.00248989;OID=.;OPOS=155010230;OREF=A;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:41:41:0:0:41:41:1:11:30:0:0:11:30:0:0
chrX	155010308	.	G	A	796.77	PASS	AF=1;AO=49;DP=50;FAO=50;FDP=50;FR=.;FRO=0;FSAF=34;FSAR=16;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0390661;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=60.6058;QD=63.7414;RBI=0.0655427;REFB=0;REVB=-0.0526278;RO=0;SAF=33;SAR=16;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-5.78381e-05;OID=.;OPOS=155010308;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:50:50:0:0:49:50:1:16:33:0:0:16:34:0:0
chrX	155011012	.	T	C	934.11	PASS	AF=1;AO=57;DP=64;FAO=64;FDP=64;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=36;FSAR=28;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=-0.0221116;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=122.469;QD=58.3818;RBI=0.0236228;REFB=0;REVB=-0.00831351;RO=0;SAF=32;SAR=25;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0184789;OID=.;OPOS=155011012;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:5:64:64:0:0:57:64:1:25:32:0:0:28:36:0:0
chrX	155011216	.	T	A	345.52	PASS	AF=1;AO=25;DP=26;FAO=25;FDP=25;FR=.;FRO=0;FSAF=10;FSAR=15;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0172706;FXX=0.0384468;HRUN=1;LEN=1;MLLD=223.225;QD=55.2827;RBI=0.0339596;REFB=0;REVB=-0.02924;RO=0;SAF=10;SAR=15;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=-4.58787e-05;OID=.;OPOS=155011216;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:26:25:0:0:25:25:1:15:10:0:0:15:10:0:0
chrX	155011276	.	C	T	323.46	PASS	AF=1;AO=24;DP=24;FAO=24;FDP=24;FR=.;FRO=0;FSAF=13;FSAR=11;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.000409459;FXX=0;HRUN=5;LEN=1;MLLD=293.146;QD=53.9106;RBI=0.0255086;REFB=0;REVB=0.0255054;RO=0;SAF=13;SAR=11;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=5.64886e-05;OID=.;OPOS=155011276;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:24:24:0:0:24:24:1:11:13:0:0:11:13:0:0
chrX	155011472	.	T	A	781.81	PASS	AF=0.95;AO=57;DP=60;FAO=57;FDP=60;FR=.;FRO=3;FSAF=31;FSAR=26;FSRF=2;FSRR=1;FWDB=0.00101206;FXX=0;HRUN=4;LEN=1;MLLD=215.46;QD=52.1208;RBI=0.0349929;REFB=-0.0972271;REVB=0.0349783;RO=2;SAF=31;SAR=26;SRF=2;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0294565;STB=0.506193;STBP=0.726;TYPE=snp;VARB=0.000715087;OID=.;OPOS=155011472;OREF=T;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:11:60:60:2:3:57:57:0.95:26:31:2:0:26:31:2:1
chrX	155011926	.	T	C	1779.37	PASS	AF=1;AO=117;DP=117;FAO=117;FDP=117;FR=.;FRO=0;FSAF=68;FSAR=49;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0133718;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=151.751;QD=60.8332;RBI=0.0178256;REFB=0;REVB=-0.0117876;RO=0;SAF=68;SAR=49;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-3.15086e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=1.98118e-06;OID=.;OPOS=155011926;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:10:117:117:0:0:117:117:1:49:68:0:0:49:68:0:0
chrX	155227464	.	C	T	3514.78	PASS	AF=0.991379;AO=206;DP=208;FAO=230;FDP=232;FR=.;FRO=2;FSAF=96;FSAR=134;FSRF=1;FSRR=1;FWDB=0.0446054;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=137.337;QD=60.5996;RBI=0.0604191;REFB=-0.133781;REVB=0.0407532;RO=1;SAF=79;SAR=127;SRF=0;SRR=1;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.00373621;STB=0.500732;STBP=0.852;TYPE=snp;VARB=0.000241944;OID=.;OPOS=155227464;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:9:208:232:1:2:206:230:0.991379:127:79:0:1:134:96:1:1
chrX	155235014	.	C	T	2684.0	PASS	AF=0.983425;AO=167;DP=172;FAO=178;FDP=181;FR=.;FRO=3;FSAF=90;FSAR=88;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.00336084;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=148.768;QD=59.315;RBI=0.0271549;REFB=-0.110169;REVB=0.0269462;RO=4;SAF=87;SAR=80;SRF=4;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.021374;STB=0.508196;STBP=0.117;TYPE=snp;VARB=0.000246467;OID=.;OPOS=155235014;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:172:181:4:3:167:178:0.983425:80:87:4:0:88:90:3:0
chrX	155239824	.	A	G	34.83	PASS	AF=0.833333;AO=5;DP=6;FAO=5;FDP=6;FR=.;FRO=1;FSAF=3;FSAR=2;FSRF=1;FSRR=0;FWDB=0.0520084;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=80.4825;QD=23.218;RBI=0.0669055;REFB=-0.102009;REVB=0.0420889;RO=1;SAF=3;SAR=2;SRF=1;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.121807;STB=0.571154;STBP=0.62;TYPE=snp;VARB=0.0238109;OID=.;OPOS=155239824;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:6:6:6:1:1:5:5:0.833333:2:3:1:0:2:3:1:0
chrX	155252758	.	A	G	462.08	PASS	AF=1;AO=25;DP=31;FAO=32;FDP=32;FR=.,HEALED;FRO=0;FSAF=18;FSAR=14;FSRF=0;FSRR=0;FWDB=0.0948235;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.71;QD=57.76;RBI=0.099107;REFB=0;REVB=0.0288218;RO=0;SAF=13;SAR=12;SRF=0;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=3.94263e-08;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.000397703;OID=.;OPOS=155252758;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	1/1:4:31:32:0:0:25:32:1:12:13:0:0:14:18:0:0
chrY	4968180	.	TA	TAA,T	77.35	PASS	AF=0.16,0.4;AO=4,10;DP=25;FAO=4,10;FDP=25;FR=.;FRO=11;FSAF=0,9;FSAR=4,1;FSRF=5;FSRR=6;FWDB=0.217525,-0.217525;FXX=0;HRUN=2,2;LEN=1,1;MLLD=16.175,18.3903;QD=12.3758;RBI=0.243242,0.243242;REFB=0.0149854,-0.0149854;REVB=0.108855,-0.108855;RO=9;SAF=0,10;SAR=4,0;SRF=3;SRR=6;SSEN=0,0;SSEP=0,0;SSSB=-0.663921,0.818725;STB=0.996673,0.81741;STBP=0.074,0.014;TYPE=ins,del;VARB=0.167054,0.0622831;OID=.,.;OPOS=4968181,4968181;OREF=-,A;OALT=A,-;OMAPALT=TAA,T	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/2:0.16,0.4:4,10:25:4,10:25:11:0,9:4,1:5:6:57:9:0,10:4,0:3:6
chrY	10034888	.	C	G	42.39	PASS	AF=0.2;AO=7;DP=35;FAO=7;FDP=35;FR=.;FRO=28;FSAF=3;FSAR=4;FSRF=21;FSRR=7;FWDB=0.0229059;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=91.344;QD=4.84411;RBI=0.0287791;REFB=0.00378377;REVB=0.0174228;RO=27;SAF=3;SAR=4;SRF=20;SRR=7;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.369498;STB=0.743615;STBP=0.202;TYPE=snp;VARB=-0.0208441;OID=.;OPOS=10034888;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:42:35:35:27:28:7:7:0.2:4:3:20:7:4:3:21:7
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chrY	10037807	.	T	C	2934.97	PASS	AF=0.780488;AO=222;DP=286;FAO=224;FDP=287;FR=.;FRO=63;FSAF=130;FSAR=94;FSRF=43;FSRR=20;FWDB=0.0233976;FXX=0.0034721;HRUN=1;LEN=1;MLLD=172.698;QD=40.9055;RBI=0.0269006;REFB=-0.0278769;REVB=0.0132739;RO=60;SAF=129;SAR=93;SRF=41;SRR=19;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0424302;STB=0.523195;STBP=0.139;TYPE=snp;VARB=0.0065117;OID=.;OPOS=10037807;OREF=T;OALT=C;OMAPALT=C	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:286:287:60:63:222:224:0.780488:93:129:41:19:94:130:43:20
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chrY	10037877	.	G	GC	1207.24	PASS	AF=0.890476;AO=152;DP=253;FAO=187;FDP=210;FR=.;FRO=23;FSAF=114;FSAR=73;FSRF=16;FSRR=7;FWDB=0.0154031;FXX=0.0829658;HRUN=3;LEN=1;MLLD=11.244;QD=22.995;RBI=0.0537668;REFB=-0.0174365;REVB=0.0515132;RO=96;SAF=90;SAR=62;SRF=64;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.0560253;STB=0.50994;STBP=0.396;TYPE=ins;VARB=0.0344465;OID=.;OPOS=10037878;OREF=-;OALT=C;OMAPALT=GC	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.890476:152:253:187:210:23:114:73:16:7:12:96:90:62:64:32
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chrY	13262908	.	C	G	76.4	PASS	AF=0.75;AO=9;DP=12;FAO=9;FDP=12;FR=.;FRO=3;FSAF=9;FSAR=0;FSRF=3;FSRR=0;FWDB=0.0147366;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=126.848;QD=25.467;RBI=0.0147366;REFB=-0.025075;REVB=0;RO=3;SAF=9;SAR=0;SRF=3;SRR=0;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0;STB=0.5;STBP=1;TYPE=snp;VARB=0.0231218;OID=.;OPOS=13262908;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:15:12:12:3:3:9:9:0.75:0:9:3:0:0:9:3:0
chrY	13262996	.	C	G	75.83	PASS	AF=0.191176;AO=13;DP=68;FAO=13;FDP=68;FR=.;FRO=55;FSAF=12;FSAR=1;FSRF=45;FSRR=10;FWDB=-0.0404666;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=209.661;QD=4.46037;RBI=0.0450498;REFB=-0.0107949;REVB=0.0197975;RO=55;SAF=12;SAR=1;SRF=45;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.287527;STB=0.698025;STBP=0.298;TYPE=snp;VARB=0.0735587;OID=.;OPOS=13262996;OREF=C;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:75:68:68:55:55:13:13:0.191176:1:12:45:10:1:12:45:10
chrY	13263010	.	G	A	105.19	PASS	AF=0.2125;AO=17;DP=80;FAO=17;FDP=80;FR=.;FRO=63;FSAF=15;FSAR=2;FSRF=53;FSRR=10;FWDB=-0.0218563;FXX=0;HRUN=2;LEN=1;MLLD=284.593;QD=5.25949;RBI=0.0218564;REFB=-0.0081642;REVB=8.9894e-05;RO=63;SAF=15;SAR=2;SRF=53;SRR=10;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108196;STB=0.56953;STBP=0.692;TYPE=snp;VARB=0.0295023;OID=.;OPOS=13263010;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:80:80:63:63:17:17:0.2125:2:15:53:10:2:15:53:10
chrY	13263061	.	CTG	CCT,CT,GCT	439.15	PASS	AF=0,0.725,0;AO=3,9,3;DP=84;FAO=0,58,0;FDP=80;FR=.;FRO=22;FSAF=0,32,0;FSAR=0,26,0;FSRF=19;FSRR=3;FWDB=-0.0196037,0.0213706,-0.0114539;FXX=0.0123442;HRUN=1,3,1;LEN=2,1,3;MLLD=15.3756,15.3308,17.0724;QD=21.9574;RBI=0.0963595,0.142637,0.0314218;REFB=-0.00982732,-0.0526913,-0.0365667;REVB=0.0943443,0.141027,-0.0292599;RO=68;SAF=1,2,3;SAR=2,7,0;SRF=48;SRR=20;SSEN=0,0.539233,0;SSEP=0,0,0;SSSB=-0.313441,-0.533296,0.34114;STB=0.5,0.588259,0.5;STBP=1,0.024,1;TYPE=mnp,del,mnp;VARB=0,0.0395769,0;OID=.,.,.;OPOS=13263062,13263063,13263061;OREF=TG,G,CTG;OALT=CT,-,GCT;OMAPALT=CCT,CT,GCT	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/2:99:84:80:68:22:3,9,3:0,58,0:0,0.725,0:2,7,0:1,2,3:48:20:0,26,0:0,32,0:19:3
chrY	13263067	.	A	T	219.71	PASS	AF=0.554217;AO=36;DP=78;FAO=46;FDP=83;FR=.;FRO=37;FSAF=32;FSAR=14;FSRF=20;FSRR=17;FWDB=0.0567768;FXX=0.0119033;HRUN=1;LEN=1;MLLD=104.455;QD=10.5884;RBI=0.0611507;REFB=-0.0823205;REVB=0.0227113;RO=36;SAF=25;SAR=11;SRF=21;SRR=15;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.111498;STB=0.57671;STBP=0.137;TYPE=snp;VARB=0.0848385;OID=.;OPOS=13263067;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:78:83:36:37:36:46:0.554217:11:25:21:15:14:32:20:17
chrY	13263091	.	G	A	541.83	PASS	AF=0.581395;AO=50;DP=86;FAO=50;FDP=86;FR=.;FRO=36;FSAF=30;FSAR=20;FSRF=17;FSRR=19;FWDB=-0.0197646;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=139.519;QD=25.2014;RBI=0.0212511;REFB=-0.0350301;REVB=0.00780841;RO=32;SAF=30;SAR=20;SRF=15;SRR=17;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0957069;STB=0.55448;STBP=0.277;TYPE=snp;VARB=0.0207676;OID=.;OPOS=13263091;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:86:86:32:36:50:50:0.581395:20:30:15:17:20:30:17:19
chrY	13263103	.	C	A	123.8	PASS	AF=0.231707;AO=19;DP=82;FAO=19;FDP=82;FR=.;FRO=63;FSAF=12;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=34;FWDB=-0.0224132;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=123.466;QD=6.03878;RBI=0.0224602;REFB=-0.00691949;REVB=0.00145209;RO=62;SAF=12;SAR=7;SRF=29;SRR=33;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.20341;STB=0.63144;STBP=0.213;TYPE=snp;VARB=0.0509177;OID=.;OPOS=13263103;OREF=C;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:99:82:82:62:63:19:19:0.231707:7:12:29:33:7:12:29:34
chrY	13263115	.	C	T	97.33	PASS	AF=0.207792;AO=16;DP=77;FAO=16;FDP=77;FR=.;FRO=61;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=32;FWDB=0.0135534;FXX=0;HRUN=3;LEN=1;MLLD=169.053;QD=5.05605;RBI=0.0135998;REFB=-0.0104526;REVB=-0.001123;RO=61;SAF=9;SAR=7;SRF=29;SRR=32;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.108584;STB=0.568796;STBP=0.525;TYPE=snp;VARB=0.0290427;OID=.;OPOS=13263115;OREF=C;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:97:77:77:61:61:16:16:0.207792:7:9:29:32:7:9:29:32
chrY	13263118	.	G	A	98.43	PASS	AF=0.222222;AO=16;DP=72;FAO=16;FDP=72;FR=.;FRO=56;FSAF=9;FSAR=7;FSRF=29;FSRR=27;FWDB=-0.079215;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=159.735;QD=5.46807;RBI=0.0838641;REFB=-0.00612553;REVB=-0.0275351;RO=54;SAF=9;SAR=7;SRF=29;SRR=25;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0317675;STB=0.534921;STBP=0.737;TYPE=snp;VARB=0.0666649;OID=.;OPOS=13263118;OREF=G;OALT=A;OMAPALT=A	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:98:72:72:54:56:16:16:0.222222:7:9:29:25:7:9:29:27
chrY	13263170	.	A	T	56.59	PASS	AF=0.285714;AO=8;DP=31;FAO=8;FDP=28;FR=.;FRO=20;FSAF=4;FSAR=4;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=0.0168;FXX=0.096743;HRUN=1;LEN=1;MLLD=156.62;QD=8.08429;RBI=0.0360067;REFB=-0.00789719;REVB=0.0318471;RO=20;SAF=4;SAR=4;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.23131;STB=0.642529;STBP=0.404;TYPE=snp;VARB=0.019099;OID=.;OPOS=13263170;OREF=A;OALT=T;OMAPALT=T	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:56:31:28:20:20:8:8:0.285714:4:4:6:14:4:4:6:14
chrY	13263175	.	A	G	63.34	PASS	AF=0.310345;AO=9;DP=29;FAO=9;FDP=29;FR=.;FRO=20;FSAF=2;FSAR=7;FSRF=6;FSRR=14;FWDB=-0.0192901;FXX=0;HRUN=1;LEN=1;MLLD=100.173;QD=8.7364;RBI=0.0508659;REFB=-0.0124849;REVB=-0.0470663;RO=20;SAF=2;SAR=7;SRF=6;SRR=14;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=-0.114488;STB=0.57126;STBP=0.623;TYPE=snp;VARB=0.039497;OID=.;OPOS=13263175;OREF=A;OALT=G;OMAPALT=G	GT:GQ:DP:FDP:RO:FRO:AO:FAO:AF:SAR:SAF:SRF:SRR:FSAR:FSAF:FSRF:FSRR	0/1:63:29:29:20:20:9:9:0.310345:7:2:6:14:7:2:6:14
chrY	14518306	.	C	CA	48.51	PASS	AF=0.33871;AO=7;DP=69;FAO=21;FDP=62;FR=.;FRO=41;FSAF=13;FSAR=8;FSRF=19;FSRR=22;FWDB=-0.101496;FXX=0.0605969;HRUN=6;LEN=1;MLLD=8.35132;QD=3.12945;RBI=0.103944;REFB=-0.0921627;REVB=-0.0224239;RO=58;SAF=4;SAR=3;SRF=32;SRR=26;SSEN=0;SSEP=0;SSSB=0.0232062;STB=0.603616;STBP=0.257;TYPE=ins;VARB=0.0814258;OID=.;OPOS=14518307;OREF=-;OALT=A;OMAPALT=CA	GT:AF:AO:DP:FAO:FDP:FRO:FSAF:FSAR:FSRF:FSRR:GQ:RO:SAF:SAR:SRF:SRR	0/1:0.33871:7:69:21:62:41:13:8:19:22:48:58:4:3:32:26
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